
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2792] =>      2792 nucs 'mol-32-1e87-088360_2792'

Score:        2747
Aligned:      2791        nucs
Identic:      2787 (100%) nucs =>        90 (100%)      2697 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31245416,31245505] EXCISED REGION [31245507,31248207]
 second seq =>  [       1,      90] EXCISED REGION [      92,    2792]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31245506,31245506]
 second seq =>         1 nucs [91,91]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31245506,31245507] to [31245507,31245508]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31245503,31245505] to [31245507,31245509]
 second seq =>         3 nucs [88,90] to [92,94]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31245416 ACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAA 31245475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAA 60

 31245476 CCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCA 31245505
          ||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCA 90

EXCISED REGION

 31245507 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 31245566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       92 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 151

 31245567 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 31245626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      152 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 211

 31245627 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 31245686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      212 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 271

 31245687 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 31245746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      272 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 331

 31245747 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 31245806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      332 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 391

 31245807 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 31245866
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      392 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 451

 31245867 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 31245926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      452 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 511

 31245927 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 31245986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      512 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 571

 31245987 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 31246046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      572 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 631

 31246047 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 31246106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      632 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 691

 31246107 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 31246166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      692 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 751

 31246167 TTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 31246226
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 TTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 811

 31246227 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 31246286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      812 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 871

 31246287 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 31246346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      872 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 931

 31246347 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 31246406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 991

 31246407 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 31246466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 1051

 31246467 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 31246526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 1111

 31246527 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 31246586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 1171

 31246587 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 31246646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 1231

 31246647 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 31246706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 1291

 31246707 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 31246766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 1351

 31246767 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 31246826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 1411

 31246827 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 31246886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 1471

 31246887 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 31246946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 1531

 31246947 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 31247006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 1591

 31247007 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 31247066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 1651

 31247067 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 31247126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 1711

 31247127 TGTTAGGCTACCAGACTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 31247186
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 TGTTAGGCTACCAGATTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 1771

 31247187 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 31247246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 1831

 31247247 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 31247306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 1891

 31247307 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 31247366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 1951

 31247367 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 31247426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 2011

 31247427 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 31247486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 2071

 31247487 TTTATATGCCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTA 31247546
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TTTATATACCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTA 2131

 31247547 GTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTT 31247606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 GTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTT 2191

 31247607 TCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTA 31247666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 TCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTA 2251

 31247667 GTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGT 31247726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 GTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGT 2311

 31247727 GAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTT 31247786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 GAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTT 2371

 31247787 AGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTA 31247846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 AGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTA 2431

 31247847 TTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCAT 31247906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 TTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCAT 2491

 31247907 TTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAA 31247966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 TTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAA 2551

 31247967 GTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCT 31248026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 GTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCT 2611

 31248027 GAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCA 31248086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 GAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCA 2671

 31248087 GATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGC 31248146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 GATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGC 2731

 31248147 ATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCAT 31248206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 ATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCAT 2791

 31248207 C 31248207
          |
     2792 C 2792

Alignment time is 2.66796 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    8806] =>      8806 nucs 'mol-32-1f0b-203463_8806'

Score:        8687
Aligned:      8805        nucs
Identic:      8791 (100%) nucs =>        28 (100%)      8763 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31246720,31246747] EXCISED REGION [31251770,31260545]
 second seq =>  [       1,      28] EXCISED REGION [      36,    8806]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5022 nucs [31246748,31251769]
 second seq =>         7 nucs [29,35]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [27,28] to [34,35]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246748,31246748] to [31251769,31251769]
 second seq =>         0 nucs

 31246720 TTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          ||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 28

EXCISED REGION

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       36 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 95

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       96 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 155

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      156 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 215

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      216 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 275

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      276 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 335

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31252129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      336 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 395

 31252130 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 31252189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      396 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 455

 31252190 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31252249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      456 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 515

 31252250 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 31252309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      516 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 575

 31252310 AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 31252369
          ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      576 AAACTCCATCTC---AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 632

 31252370 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 31252429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      633 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 692

 31252430 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 31252489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      693 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 752

 31252490 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 31252549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      753 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 812

 31252550 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 31252609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      813 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 872

 31252610 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 31252669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      873 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 932

 31252670 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 31252729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      933 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 992

 31252730 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 31252789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      993 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 1052

 31252790 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 31252849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1053 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 1112

 31252850 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 31252909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 1172

 31252910 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 31252969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 1232

 31252970 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 31253029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 1292

 31253030 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 31253089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 1352

 31253090 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 31253149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1353 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 1412

 31253150 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 31253209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 1472

 31253210 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 31253269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 1532

 31253270 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 31253329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 1592

 31253330 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 31253389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 1652

 31253390 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 31253449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 1712

 31253450 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 31253509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 1772

 31253510 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 31253569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 1832

 31253570 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 31253629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 1892

 31253630 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 31253689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 1952

 31253690 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 31253749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 2012

 31253750 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 31253809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 2072

 31253810 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 31253869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 2132

 31253870 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 31253929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 2192

 31253930 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 31253989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 2252

 31253990 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 31254049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 2312

 31254050 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 31254109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 2372

 31254110 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 31254169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 2432

 31254170 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 31254229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 2492

 31254230 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 31254289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 2552

 31254290 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 31254349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 2612

 31254350 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 31254409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 2672

 31254410 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAA 31254469
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2673 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAA 2732

 31254470 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 31254529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 2792

 31254530 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 31254589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 2852

 31254590 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 31254649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 2912

 31254650 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 31254709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 2972

 31254710 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 31254769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 3032

 31254770 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 31254829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 3092

 31254830 AACCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 31254889
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 ACCCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 3152

 31254890 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAAT 31254949
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3153 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAACATAGAATCTACAAAAGTAAT 3212

 31254950 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 31255009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 3272

 31255010 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 31255069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 3332

 31255070 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 31255129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3333 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 3392

 31255130 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 31255189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3393 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 3452

 31255190 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 31255249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 3512

 31255250 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 31255309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 3572

 31255310 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 31255369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 3632

 31255370 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 31255429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 3692

 31255430 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 31255489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 3752

 31255490 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 31255549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 3812

 31255550 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAA 31255609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAA 3872

 31255610 AAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAA 31255669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 AAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAA 3932

 31255670 GGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTTA 31255729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3933 GGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTTA 3992

 31255730 ATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACAC 31255789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 ATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACAC 4052

 31255790 TAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTA 31255849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4053 TAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTA 4112

 31255850 GCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCA 31255909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4113 GCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCA 4172

 31255910 AGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAA 31255969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4173 AGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAA 4232

 31255970 TAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCAT 31256029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4233 TAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCAT 4292

 31256030 TGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGC 31256089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4293 TGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGC 4352

 31256090 GTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAAC 31256149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4353 GTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAAC 4412

 31256150 CACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAA 31256209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4413 CACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAA 4472

 31256210 CCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGAC 31256269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 CCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGAC 4532

 31256270 TAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACT 31256329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4533 TAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACT 4592

 31256330 TAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTT 31256389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4593 TAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTT 4652

 31256390 TAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATG 31256449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4653 TAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATG 4712

 31256450 GCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATC 31256509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4713 GCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATC 4772

 31256510 TACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTT 31256569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4773 TACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTT 4832

 31256570 ACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATAT 31256629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4833 ACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATAT 4892

 31256630 TTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTAC 31256689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4893 TTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTAC 4952

 31256690 AAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGG 31256749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4953 AAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGG 5012

 31256750 AATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAA 31256809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5013 AATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAA 5072

 31256810 ATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAG 31256869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5073 ATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAG 5132

 31256870 TCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAA 31256929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5133 TCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAA 5192

 31256930 GGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCA 31256989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5193 GGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCA 5252

 31256990 TGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATA 31257049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5253 TGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATA 5312

 31257050 TCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGC 31257109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5313 TCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGC 5372

 31257110 AGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTAT 31257169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5373 AGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTAT 5432

 31257170 AAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGT 31257229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5433 AAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGT 5492

 31257230 CTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCAT 31257289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5493 CTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCAT 5552

 31257290 CCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATTT 31257349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5553 CCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATTT 5612

 31257350 AACTGAATGTAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTG 31257409
          ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5613 AACTGAATGTAAAC---TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTG 5669

 31257410 TTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTCGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCGGGT 31257469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5670 TTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTCGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCGGGT 5729

 31257470 TCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGAAGCTGGGATTACAAACATGCACCACCAC 31257529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5730 TCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGAAGCTGGGATTACAAACATGCACCACCAC 5789

 31257530 ACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCTGGCTAGCT 31257589
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     5790 ACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCTGGCTAGCT 5849

 31257590 CAAACTCCCGACCTCAGGTTATCCGCCCACCTAGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 31257649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5850 CAAACTCCCGACCTCAGGTTATCCGCCCACCTAGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 5909

 31257650 CGTGAGCCACCGTGCCCAGCCTCTGATTGTAAACTTTATTATAGCCTAGCTATAGTGAAG 31257709
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5910 CGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTCTGATTGTAAACTTTATTATAGCCTAGCTATAGTGAAG 5969

 31257710 GCATGGTAAAATATTTCTAGCTGTTACTTGGAAAAGCAGATGTGACCATACAGATCTTAG 31257769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5970 GCATGGTAAAATATTTCTAGCTGTTACTTGGAAAAGCAGATGTGACCATACAGATCTTAG 6029

 31257770 ATACCTTTAGAGACCCGTGGTTGGGATCTGAAGAAAACAAGACACTTACCACAACTGCCT 31257829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6030 ATACCTTTAGAGACCCGTGGTTGGGATCTGAAGAAAACAAGACACTTACCACAACTGCCT 6089

 31257830 CTGGATAAAGGGGAAATGCTCAGTTTCCACAAACCAGTGAGTATGAGAGCTATTAACTGT 31257889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6090 CTGGATAAAGGGGAAATGCTCAGTTTCCACAAACCAGTGAGTATGAGAGCTATTAATTGT 6149

 31257890 AAAAATACACACAGTCCTCAGATGGTGAGGGCATGGGTTAGGGTAACAAAAATACAATGG 31257949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6150 AAAAATACACACAGTCCTCAGATGGTGAGGGCATGGGTTAGGGTAACAAAAATACAATGG 6209

 31257950 AGAAAAAAGTGGCATTTCCAATGTGACACATTTAAAATATGGAATGGAATTTCATGGGTC 31258009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6210 AGAAAAAAGTGGCATTTCCAATGTGACACATTTAAAATATGGAATGGAATTTCATGGGTC 6269

 31258010 ACTTGGAAATAAGATTTTTTTTTCATTGGTATAACTTCAGGCTAGAGATGGTTTGCCACA 31258069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6270 ACTTGGAAATAAGATTTTTTTTTCATTGGTATAACTTCAGGCTAGAGATGGTTTGCCACA 6329

 31258070 GAGTAAGTCAAAAAAAATAAAAGAATATGGAGATGACGATGAAAATGACAACTGCCAATA 31258129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6330 GAGTAAGTCAAAAAAAATAAAAGAATATGGAGATGACGATGAAAATGACAACTGCCAATA 6389

 31258130 AAAGTCAAAAGGATAGATTTTGAGAACTCTCCAGAAGAGGGAACAAAAAAATCAAAAGAT 31258189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6390 AAAGTCAAAAGGATAGATTTTGAGAACTCTCCAGAAGAGGGAACAAAAAAATCAAAAGAT 6449

 31258190 TTTTTCCCTTGGCAAAGTGCCCCCTCCAAAGCACACATAGTCTGCTTCAACCAACAGCCT 31258249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6450 TTTTTCCCTTGGCAAAGTGCCCCCTCCAAAGCACACATAGTCTGCTTCAACCAACAGCCT 6509

 31258250 ATACCCACAGTGTTTTCATATACTAAATGGCATATCACTAAATAACAGTAAATGAGATTA 31258309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6510 ATACCCACAGTGTTTTCATATACTAAATGGCATATCACTAAATAACAGTAAATGAGATTA 6569

 31258310 AACTGTAGACTTCCTAGTTGCCTTAAACAACTGATGGTTAATTTCTTGAACACTGAATAA 31258369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6570 AACTGTAGACTTCCTAGTTGCCTTAAACAACTGATGGTTAATTTCTTGAACACTGAATAA 6629

 31258370 CAAATATGCAGTCTCATGACACTGTAAGAAGCTAAAGGTGCTCATTCTTTCCATGAATTC 31258429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6630 CAAATATGCAGTCTCATGACACTGTAAGAAGCTAAAGGTGCTCATTCTTTCCATGAATTC 6689

 31258430 TAAATTGCTATAATACTTATATTAGGAAAACAGAACAGTGGGAAGGAAAATTTTAAACAA 31258489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6690 TAAATTGCTATAATACTTATATTAGGAAAACAGAACAGTGGGAAGGAAAATTTTAAACAA 6749

 31258490 ACCCAGAATAAACCACACTTTTGATTGGGTTTCCAGCAATAATCAGTTCCCCATTAGAAT 31258549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6750 ACCCAGAATAAACCACACTTTTGATTGGGTTTCCAGCAATAATCAGTTCCCCATTAGAAT 6809

 31258550 GTGGACCCCGAAGTATACCAAATGCAAGCTCAGTGGAGCTCAGTCTCCTCAGCTGAAAAT 31258609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6810 GTGGACCCCGAAGTATACCAAATGCAAGCTCAGTGGAGCTCAGTCTCCTCAGCTGAAAAT 6869

 31258610 GAGAGCTTACTCTGGAAATGAGCACTTCTTAACATTTTTAACCCATGTTCCATCCTATTA 31258669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6870 GAGAGCTTACTCTGGAAATGAGCACTTCTTAACATTTTTAACCCATGTTCCATCCTATTA 6929

 31258670 AACATAAAAACCTCATACTCCCATTGAATGTTATTTGTGACTTCATAACCAAAACCAAAA 31258729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6930 AACATAAAAACCTCATACTCCCATTGAATGTTATTTGTGACTTCATAACCAAAACCAAAA 6989

 31258730 CCAAACCAAAGCAAGGTAAGTTTTTATTG-TTTTTTTTTCAGTGTCTCATCATAACCATT 31258788
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     6990 CCAAACCAAAGCAAGGTAAGTTTTTATTGTTTTTTTTTTCAGTGTCTCATCATAACCATT 7049

 31258789 TACAAATTCATTTATTTACAAATACTTGCATAAATGGACAGATATTAATAATTAATGCTT 31258848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7050 TACAAATTCATTTATTTACAAATACTTGCATAAATGGACAGATATTAATAATTAATGCTT 7109

 31258849 TTTTAAATCTTGAAGACAAAAAAGATTTTAAAAAGCCTATGAAGAATAATGATGACAATG 31258908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7110 TTTTAAATCTTGAAGACAAAAAAGATTTTAAAAAGCCTATGAAGAATAATGATGACAATG 7169

 31258909 AAATGATATTTACTGAGACCTTTGGCAAATGATATTTACTGGGACCTTCTTCTCTCCTCC 31258968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7170 AAATGATATTTACTGAGACCTTTGGCAAATGATATTTACTGGGACCTTCTTCTCTCCTCC 7229

 31258969 AGAGTTACTATTAATATAAATGATCCTTTCTTTACTAGCATTCAGCCAGAAGAAATGCTG 31259028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7230 AGAGTTACTATTAATATAAATGATCCTTTCTTTACTAGCATTCAGCCAGAAGAAATGCTG 7289

 31259029 GCTGATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACACACAC 31259088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7290 GCTGATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACACACAC 7349

 31259089 ATATATTAGGCCTTCAATATTTGTTAAATGTTAAAAGAGGTGATAGGTCCTCTTTTACTA 31259148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7350 ATATATTAGGCCTTCAATATTTGTTAAATGTTAAAAGAGGTGATAGGTCCTCTTTTACTA 7409

 31259149 TTCTGAAAATAACAGAACCCTAATATAGTAACCTTTCTCAAGTAATAAAGGATAGAAGCA 31259208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7410 TTCTGAAAATAACAGAACCCTAATATAGTAACCTTTCTCAAGTAATAAAGGATAGAAGCA 7469

 31259209 AGTAGGTTAAGTCTTTGGTATAGAGGTGAACTGTAGAAGCTTTTGACAACAGTTATGTTA 31259268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7470 AGTAGGTTAAGTCTTTGGTATAGAGGTGAACTGTAGAAGCTTTTGACAACAGTTATGTTA 7529

 31259269 ATGAAAACAGTAAGAACACCACCTAATACTAGCACATTTATAAAACACTTAGCAATGTCT 31259328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7530 ATGAAAACAGTAAGAACACCACCTAATACTAGCACATTTATAAAACACTTAGCAATGTCT 7589

 31259329 AACGTACTTTATGTAATTTCGACCCTACAGCTGTATGAAGTGAATATTATTATTTGATTA 31259388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7590 AACGTACTTTATGTAATTTCGACCCTACAGCTGTATGAAGTGAATATTATTATTTGATTA 7649

 31259389 AAACAGTGTCATGAAGCTGTTCAAAGTCACACAGCTAGTTAAGCAGCAGAGCTCAGACTT 31259448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7650 AAACAGTGTCATGAAGCTGTTCAAAGTCACACAGCTAGTTAAGCAGCAGAGCTCAGACTT 7709

 31259449 AAAACTCTCTGAGAGCTATCCCATTCACTAACAGCTCTTTATTTTGTCATGAAATGTGGA 31259508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7710 AAAACTCTCTGAGAGCTATCCCATTCACTAACAGCTCTTTATTTTGTCATGAAATGTGGA 7769

 31259509 AAATATCCTCATCCAAACTCCAAAATCAGCATATACATAAGCACAACCTTTTTTTCTCTC 31259568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7770 AAATATCCTCATCCAAACTCCAAAATCAGCATATACATAAGCACAACCTTTTTTTCTCTC 7829

 31259569 AACCTACCCAATACCCCTTTCTACCAATTCCCATAAAAATTCTTGGAGTTCCTATTGCAG 31259628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7830 AACCTACCCAATACCCCTTTCTACCAATTCCCATAAAAATTCTTGGAGTTCCTATTGCAG 7889

 31259629 CGTCTTTATGTCTTCATACTGGTATGACCAAGGGCACAATGGAAGACTTCTTTCAAAAGG 31259688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7890 CGTCTTTATGTCTTCATACTGGTATGACCAAGGGCACAATGGAAGACTTCTTTCAAAAGG 7949

 31259689 GAACCACCTTCAATCTAAGTCTTGTCTCCTATAACTGTCCCCAAAATGGACATCATCACA 31259748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7950 GAACCACCTTCAATCTAAGTCTTGTCTCCTATAACTGTCCCCAAAATGGACATCATCACA 8009

 31259749 GGCATAGGCTTTTCAAACCATTAACTAGTGAGGAAATGTCTGGGGTTGTCTGTTCCTCAT 31259808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8010 GGCATAGGCTTTTCAAACCATTAACTAGTGAGGAAATGTCTGGGGTTGTCTGTTCCTCAT 8069

 31259809 TTAAAATCAGTCAAATAGGACACATACTACCACTTCATTCCTAAAAGTTGAGCAAGAATC 31259868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8070 TTAAAATCAGTCAAATAGGACACATACTACCACTTCATTCCTAAAAGTTGAGCAAGAATC 8129

 31259869 ATCCTCATATCTCCAGCTTTCTGGTTTAGCAAGCAGACACCCGACTCTGGGGACTTGGTA 31259928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8130 ATCCTCATATCTCCAGCTTTCTGGTTTAGCAAGCAGACACCCGACTCTGGGGACTTGGTA 8189

 31259929 AAGGCCAACTGCACAAGAATAAAAAGTGTAACAGAACTGGCAGTTACAGTCTTAGCAATT 31259988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8190 AAGGCCAACTGCACAAGAATAAAAAGTGTAACAGAACTGGCAGTTACAGTCTTAGCAATT 8249

 31259989 TTAAAAAATCATTCCAAATGTTTTGGTAGAAATCTTATTAAAGAATGCTAAACTACTGGC 31260048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8250 TTAAAAAATCATTCCAAATGTTTTGGTAGAAATCTTATTAAAGAATGCTAAACTACTGGC 8309

 31260049 ATTAGTAATTTACTGTAAATGAAAGGTATACTAAAGGTAGAATTTTATTCATATAAAATA 31260108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8310 ATTAGTAATTTACTGTAAATGAAAGGTATACTAAAGGTAGAATTTTATTCATATAAAATA 8369

 31260109 AACTATTTTACTTCTGAAGGTTATTATGAAGATGAGGCTAAATTATATGAAAAATGCTAA 31260168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8370 AACTATTTTACTTCTGAAGGTTATTATGAAGATGAGGCTAAATTATATGAAAAATGCTAA 8429

 31260169 GCATCCCGCCTAGCTCATAGTAACTACGCAGTAAGTGTCAGCTGCTATTAGTAATACTGC 31260228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8430 GCATCCCGCCTAGCTCATAGTAACTACGCAGTAAGTGTCAGCTGCTATTAGTAATACTGC 8489

 31260229 AGAAGTATTAAAAATAAAACATAACAACGGAAGGCCATATTTAAAATGAACCAGCAATCA 31260288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8490 AGAAGTATTAAAAATAAAACATAACAACGGAAGGCCATATTTAAAATGAACCAGCAATCA 8549

 31260289 ACATTCTGTGTTTAAACATCAACAAAAAACATATCCATCTGTGGTATGTATACATATATA 31260348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8550 ACATTCTGTGTTTAAACATCAACAAAAAACATATCCATCTGTGGTATGTATACATATATA 8609

 31260349 TGCATAAAAATATTTAGAAGACAATTTGGAAGAATAAATAGCAAAATGATGATCTCTGGG 31260408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8610 TGCATAAAAATATTTAGAAGACAATTTGGAAGAATAAATAGCAAAATGATGATCTCTGGG 8669

 31260409 GAGACAGAAGGGTGGTAGTCAAATGGAACTTTAGCCTGACATAAATGCTTTTTGTTTTTT 31260468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8670 GAGACAGAAGGGTGGTAGTCAAATGGAACTTTAGCCTGACATAAATGCTTTTTGTTTTTT 8729

 31260469 AACAAAGTATTCATGAATTTCCTCTGTAAATAATTTTATTTTAAAAAGAAAAATCATAGT 31260528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8730 AACAAAGTATTCATGAATTTCCTCTGTAAATAATTTTATTTTAAAAAGAAAAATCATAGT 8789

 31260529 TTCTTCAATTCCATAGT 31260545
          |||||||||||||||||
     8790 TTCTTCAATTCCATAGT 8806

Alignment time is 8.47466 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2641] =>      2641 nucs 'mol-32-1f21-108828_2641'

Score:        2618
Aligned:      2640        nucs
Identic:      2638 (100%) nucs =>       328 (100%)      2310 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31245857,31246184] EXCISED REGION [31246186,31248497]
 second seq =>  [       1,     328] EXCISED REGION [     330,    2641]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31246185,31246185]
 second seq =>         1 nucs [329,329]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246185,31246185] to [31246186,31246186]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31245857 ATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTG 31245916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTG 60

 31245917 TACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTG 31245976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTG 120

 31245977 CCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCT 31246036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCT 180

 31246037 CATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTC 31246096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTC 240

 31246097 TGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGC 31246156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGC 300

 31246157 ATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTA 31246184
          ||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTA 328

EXCISED REGION

 31246186 TGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAG 31246245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      330 TGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAG 389

 31246246 CTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATA 31246305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      390 CTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATA 449

 31246306 GAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTG 31246365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      450 GAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTG 509

 31246366 AAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATT 31246425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      510 AAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATT 569

 31246426 CTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTA 31246485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      570 CTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTA 629

 31246486 TCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCT 31246545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      630 TCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCT 689

 31246546 TTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTC 31246605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      690 TTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTC 749

 31246606 TGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGT 31246665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 TGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGT 809

 31246666 TTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTA 31246725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 TTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTA 869

 31246726 TTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCT 31246785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 TTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCT 929

 31246786 TATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATG 31246845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 TATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATG 989

 31246846 ATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTT 31246905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 ATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTT 1049

 31246906 CTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGC 31246965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 CTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGC 1109

 31246966 TTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGG 31247025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 TTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGG 1169

 31247026 GACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCC 31247085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 GACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCC 1229

 31247086 CTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGACTGT 31247145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1230 CTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGATTGT 1289

 31247146 ATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAG 31247205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 ATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAG 1349

 31247206 GATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCT 31247265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 GATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCT 1409

 31247266 TTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACA 31247325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 TTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACA 1469

 31247326 GAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATC 31247385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 GAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATC 1529

 31247386 CACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACTCCA 31247445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 CACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACTCCA 1589

 31247446 TTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAATTTATATGCCATAAAATTA 31247505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1590 TTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAATTTATATACCATAAAATTA 1649

 31247506 ATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGACCA 31247565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 ATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGACCA 1709

 31247566 GAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCAATT 31247625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 GAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCAATT 1769

 31247626 CCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTCCTT 31247685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 CCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTCCTT 1829

 31247686 GCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATGTAG 31247745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 GCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATGTAG 1889

 31247746 TCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTTAGTTTCATCCATGCTGCAG 31247805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 TCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTTAGTTTCATCCATGCTGCAG 1949

 31247806 CATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTATTCCAATGTATAGATATGC 31247865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 CATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTATTCCAATGTATAGATATGC 2009

 31247866 CTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCATTTTTTCTTGTTTTTATTAA 31247925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 CTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCATTTTTTCTTGTTTTTATTAA 2069

 31247926 TATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAAGTCTTTGTGTGAACATATG 31247985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 TATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAAGTCTTTGTGTGAACATATG 2129

 31247986 TTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTTTATATGGCACAATG 31248045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 TTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTTTATATGGCACAATG 2189

 31248046 ATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCAGATATTTGGTCAAACATTA 31248105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 ATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCAGATATTTGGTCAAACATTA 2249

 31248106 TTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGCATTTAGACTGTTAGACTTT 31248165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 TTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGCATTTAGACTGTTAGACTTT 2309

 31248166 GAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCATCTAATGAGTTGATGGCCTG 31248225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 GAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCATCTAATGAGTTGATGGCCTG 2369

 31248226 AATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTCCCCAGCAGACTCCCTTCAG 31248285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 AATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTCCCCAGCAGACTCCCTTCAG 2429

 31248286 ACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGACTGCCTTTAGACTCAAACTG 31248345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 ACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGACTGCCTTTAGACTCAAACTG 2489

 31248346 CAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCAC 31248405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 CAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCAC 2549

 31248406 ACCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATTGA 31248465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 ACCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATTGA 2609

 31248466 GACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTC 31248497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 GACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTC 2641

Alignment time is 2.54709 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    6736] =>      6736 nucs 'mol-32-1f21-164982_6736'

Score:        6607
Aligned:      6732        nucs
Identic:      6719 (100%) nucs =>      2501 (100%)      4218 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31244243,31246747] EXCISED REGION [31251770,31255995]
 second seq =>  [       1,    2505] EXCISED REGION [    2513,    6736]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5022 nucs [31246748,31251769]
 second seq =>         7 nucs [2506,2512]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2504,2505] to [2511,2512]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246748,31246748] to [31251769,31251769]
 second seq =>         0 nucs

 31244243 AAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTG 31244302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTG 60

 31244303 GAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTT 31244362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTT 120

 31244363 TCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTC 31244422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTC 180

 31244423 TAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGT 31244482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGT 240

 31244483 CATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCT 31244542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCT 300

 31244543 CCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCA 31244602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCA 360

 31244603 ACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAA 31244662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAA 420

 31244663 TGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTA 31244722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTA 480

 31244723 TTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAAT 31244782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAAT 540

 31244783 GTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGC 31244842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGC 600

 31244843 AGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCT 31244902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCT 660

 31244903 AAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAAT 31244962
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGATATTCTAAAACAAACAATTTTCCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAAT 720

 31244963 TATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATT 31245022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATT 780

 31245023 CATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTG 31245082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTG 840

 31245083 AAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGA 31245142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGA 900

 31245143 TTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGA 31245202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGA 960

 31245203 CTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTT 31245262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTT 1020

 31245263 TTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGT 31245322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGT 1080

 31245323 GGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAA 31245382
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTATTTTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAA 1140

 31245383 ATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTC 31245442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTC 1200

 31245443 CTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCC 31245502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCC 1260

 31245503 CCACCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTC 31245562
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCAGCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTC 1320

 31245563 CACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCA 31245622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCA 1380

 31245623 TGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGT 31245682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGT 1440

 31245683 ATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATA 31245742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATA 1500

 31245743 TCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAAC 31245802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAAC 1560

 31245803 ATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGG 31245862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGG 1620

 31245863 TAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAA 31245922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAA 1680

 31245923 TTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGA 31245982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGA 1740

 31245983 CTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTAC 31246042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTAC 1800

 31246043 TGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGC 31246102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGC 1860

 31246103 CATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAG 31246162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAG 1920

 31246163 ATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAA 31246222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAA 1980

 31246223 CCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCAC 31246282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCAC 2040

 31246283 TCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTT 31246342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTT 2100

 31246343 TTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTC 31246402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTC 2160

 31246403 ATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAG 31246462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAG 2220

 31246463 TTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCC 31246522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCC 2280

 31246523 CCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAG 31246582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAG 2340

 31246583 CTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTG 31246642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTG 2400

 31246643 TTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTT 31246702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTT 2460

 31246703 GAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 2505

EXCISED REGION

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 2572

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 2632

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 2692

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 2752

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 2812

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31252129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 2872

 31252130 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 31252189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 2932

 31252190 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31252249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 2992

 31252250 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 31252309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 3052

 31252310 AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 31252369
          ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 AAACTCCATCTC---AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 3109

 31252370 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 31252429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 3169

 31252430 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 31252489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 3229

 31252490 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 31252549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 3289

 31252550 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 31252609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 3349

 31252610 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 31252669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 3409

 31252670 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 31252729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 3469

 31252730 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 31252789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3470 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 3529

 31252790 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 31252849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3530 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 3589

 31252850 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 31252909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3590 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 3649

 31252910 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 31252969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3650 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 3709

 31252970 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 31253029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3710 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 3769

 31253030 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 31253089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3770 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 3829

 31253090 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 31253149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3830 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 3889

 31253150 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 31253209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3890 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 3949

 31253210 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 31253269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3950 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 4009

 31253270 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 31253329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4010 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 4069

 31253330 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 31253389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4070 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 4129

 31253390 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 31253449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4130 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 4189

 31253450 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 31253509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4190 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 4249

 31253510 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 31253569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4250 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 4309

 31253570 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 31253629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4310 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 4369

 31253630 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 31253689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4370 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 4429

 31253690 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 31253749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4430 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 4489

 31253750 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 31253809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4490 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 4549

 31253810 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 31253869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4550 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 4609

 31253870 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 31253929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4610 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 4669

 31253930 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 31253989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4670 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 4729

 31253990 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 31254049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4730 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 4789

 31254050 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 31254109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4790 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 4849

 31254110 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 31254169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4850 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 4909

 31254170 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 31254229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4910 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 4969

 31254230 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 31254289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4970 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 5029

 31254290 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 31254349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5030 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 5089

 31254350 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 31254409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5090 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 5149

 31254410 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAA 31254469
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5150 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAA 5209

 31254470 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 31254529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5210 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 5269

 31254530 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 31254589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5270 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 5329

 31254590 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 31254649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5330 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 5389

 31254650 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 31254709
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5390 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGGGAGAGGGAGGAGGGAG 5449

 31254710 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 31254769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5450 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 5509

 31254770 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 31254829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5510 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 5569

 31254830 AACCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 31254889
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5570 ACCCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 5629

 31254890 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAAT 31254949
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5630 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAACATAGAATCTACAAAAGTAAT 5689

 31254950 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 31255009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5690 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 5749

 31255010 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 31255069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5750 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 5809

 31255070 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 31255129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5810 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 5869

 31255130 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 31255189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5870 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 5929

 31255190 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 31255249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5930 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 5989

 31255250 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 31255309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5990 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 6049

 31255310 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 31255369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6050 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 6109

 31255370 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 31255429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6110 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 6169

 31255430 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 31255489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6170 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 6229

 31255490 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 31255549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6230 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 6289

 31255550 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTC-AAAAAAAAAA 31255608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     6290 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAA 6349

 31255609 AAAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAA 31255668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6350 AAAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAA 6409

 31255669 AGGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTT 31255728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     6410 AGGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTT 6469

 31255729 AATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACA 31255788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6470 AATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACA 6529

 31255789 CTAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACT 31255848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6530 CTAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACT 6589

 31255849 AGCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCC 31255908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6590 AGCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCC 6649

 31255909 AAGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGA 31255968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6650 AAGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGA 6709

 31255969 ATAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCA 31255995
          |||||||||||||||||||||||||||
     6710 ATAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCA 6736

Alignment time is 6.49916 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2505] =>      2505 nucs 'mol-32-1f21-164982_2505'

Score:        2471
Aligned:      2504        nucs
Identic:      2501 (100%) nucs =>       685 (100%)      1816 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31244243,31244927] EXCISED REGION [31244929,31246747]
 second seq =>  [       1,     685] EXCISED REGION [     687,    2505]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31244928,31244928]
 second seq =>         1 nucs [686,686]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [31244924,31244927] to [31244925,31244928]
 second seq =>         1 nucs [686,686] to [687,687]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31244243 AAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTG 31244302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTG 60

 31244303 GAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTT 31244362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTT 120

 31244363 TCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTC 31244422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTC 180

 31244423 TAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGT 31244482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGT 240

 31244483 CATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCT 31244542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCT 300

 31244543 CCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCA 31244602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCA 360

 31244603 ACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAA 31244662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAA 420

 31244663 TGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTA 31244722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTA 480

 31244723 TTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAAT 31244782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAAT 540

 31244783 GTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGC 31244842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGC 600

 31244843 AGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCT 31244902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCT 660

 31244903 AAGATATTCTAAAACAAACAATTTT 31244927
          |||||||||||||||||||||||||
      661 AAGATATTCTAAAACAAACAATTTT 685

EXCISED REGION

 31244929 CAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATA 31244988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      687 CAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATA 746

 31244989 AACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCAT 31245048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 AACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCAT 806

 31245049 TTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAA 31245108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      807 TTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAA 866

 31245109 AATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACC 31245168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      867 AATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACC 926

 31245169 AATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTT 31245228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 AATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTT 986

 31245229 TACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACA 31245288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 TACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACA 1046

 31245289 CATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTA 31245348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1047 CATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTTTGATACTTGTCATTTTTTA 1106

 31245349 ATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACC 31245408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 ATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACC 1166

 31245409 CTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGT 31245468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 CTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGT 1226

 31245469 TGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTATTCTAC 31245528
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1227 TGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTATTCTAC 1286

 31245529 TTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTA 31245588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 TTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTA 1346

 31245589 TTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCA 31245648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 TTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCA 1406

 31245649 TTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCAT 31245708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 TTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCAT 1466

 31245709 TCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCA 31245768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 TCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCA 1526

 31245769 ATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATAT 31245828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 ATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATAT 1586

 31245829 ATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGA 31245888
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 ATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGA 1646

 31245889 ACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAT 31245948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 ACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAT 1706

 31245949 TAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGC 31246008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 TAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGC 1766

 31246009 CATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGT 31246068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 CATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGT 1826

 31246069 AGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAAT 31246128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 AGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAAT 1886

 31246129 ATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGA 31246188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 ATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGA 1946

 31246189 GTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTA 31246248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 GTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTA 2006

 31246249 ATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAG 31246308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 ATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAG 2066

 31246309 CTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAG 31246368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 CTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAG 2126

 31246369 TCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTA 31246428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 TCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTA 2186

 31246429 ATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCT 31246488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 ATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCT 2246

 31246489 AGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTC 31246548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 AGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTC 2306

 31246549 CCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGG 31246608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 CCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGG 2366

 31246609 GTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTT 31246668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 GTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTT 2426

 31246669 GGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTT 31246728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 GGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTT 2486

 31246729 TAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          |||||||||||||||||||
     2487 TAAATGTTCAACAGGAAAA 2505

Alignment time is 2.45195 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3424] =>      3424 nucs 'mol-32-2076-079611_3424'

Score:        3392
Aligned:      3425        nucs
Identic:      3422 (100%) nucs =>      1518 (100%)      1904 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31250802,31252321] EXCISED REGION [31252324,31254228]
 second seq =>  [       1,    1519] EXCISED REGION [    1520,    3424]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [31252322,31252323]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [31252322,31252340] to [31252324,31252342]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31252322,31252322] to [31252323,31252323]
 second seq =>         0 nucs

 31250802 GTGAGACTCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTC 31250861
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
        1 GTGAGACTCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAA-GTTTTACAAATTTTGGTACTTTC 59

 31250862 TAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGA 31250921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       60 TAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGA 119

 31250922 AATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCT 31250981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 AATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCT 179

 31250982 TCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTATTTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCA 31251041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 TCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTATTTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCA 239

 31251042 TAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGA 31251101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 TAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGA 299

 31251102 AGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATACTCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATA 31251161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 AGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATACTCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATA 359

 31251162 TAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGT 31251221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 TAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGT 419

 31251222 TACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAA 31251281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 TACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAA 479

 31251282 AGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACAT 31251341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 AGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACAT 539

 31251342 TCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAG 31251401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAG 599

 31251402 GAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGG 31251461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGG 659

 31251462 GAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCC 31251521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCC 719

 31251522 CACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATC 31251581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATC 779

 31251582 TTGAAAGAATCTAGGTCTTTACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCC 31251641
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TTGAAAGAATCTAGGTCTTCACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCC 839

 31251642 GGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAA 31251701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAA 899

 31251702 CATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATT 31251761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATT 959

 31251762 AAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTT 31251821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTT 1019

 31251822 CTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACT 31251881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACT 1079

 31251882 CTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATA 31251941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATA 1139

 31251942 AATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTA 31252001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTA 1199

 31252002 ATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTC 31252061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTC 1259

 31252062 ACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAG 31252121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAG 1319

 31252122 ACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGC 31252181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 ACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGC 1379

 31252182 ATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGA 31252241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGA 1439

 31252242 ACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGA 31252301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 ACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGA 1499

 31252302 CAAGAGTGAAACTCCATCTC 31252321
          ||||||||||||||||||||
     1500 CAAGAGTGAAACTCCATCTC 1519

EXCISED REGION

 31252324 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGA 31252383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGA 1579

 31252384 TATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAAC 31252443
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 TATTTATCTATAGTGACAAATATCGGTAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAAC 1639

 31252444 TTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACT 31252503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 TTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACT 1699

 31252504 AGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 31252563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 AGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 1759

 31252564 AGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAA 31252623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 AGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAA 1819

 31252624 GATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCG 31252683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 GATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCG 1879

 31252684 CCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAG 31252743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 CCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAG 1939

 31252744 AGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAA 31252803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 AGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAA 1999

 31252804 AAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTC 31252863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 AAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTC 2059

 31252864 ATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGT 31252923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 ATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGT 2119

 31252924 GAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGC 31252983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 GAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGC 2179

 31252984 ATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAG 31253043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 ATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAG 2239

 31253044 TCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCT 31253103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 TCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCT 2299

 31253104 TCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATA 31253163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 TCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATA 2359

 31253164 GCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCAT 31253223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 GCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCAT 2419

 31253224 TAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCT 31253283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 TAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCT 2479

 31253284 GATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTG 31253343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 GATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTG 2539

 31253344 TTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCA 31253403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 TTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCA 2599

 31253404 GGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACAC 31253463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 GGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACAC 2659

 31253464 TAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATA 31253523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 TAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATA 2719

 31253524 AGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTC 31253583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 AGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTC 2779

 31253584 TATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCA 31253643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 TATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCA 2839

 31253644 CAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCA 31253703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 CAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCA 2899

 31253704 TTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGAC 31253763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 TTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGAC 2959

 31253764 CTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTG 31253823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 CTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTG 3019

 31253824 GCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAAT 31253883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 GCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAAT 3079

 31253884 TAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGA 31253943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 TAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGA 3139

 31253944 ATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAA 31254003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 ATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAA 3199

 31254004 GGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAAC 31254063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 GGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAAC 3259

 31254064 AAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACA 31254123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 AAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACA 3319

 31254124 TCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTG 31254183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 TCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTG 3379

 31254184 AGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGG 31254228
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 AGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGG 3424

Alignment time is 3.32204 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    4154] =>      4154 nucs 'mol-32-20fa-013491_4154'

Score:        4121
Aligned:      4154        nucs
Identic:      4151 (100%) nucs =>       863 (100%)      3288 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31246279,31247141] EXCISED REGION [31247143,31250433]
 second seq =>  [       1,     863] EXCISED REGION [     865,    4154]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31247142,31247142]
 second seq =>         1 nucs [864,864]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31250171,31250171]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [864,864] to [865,865]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31246279 TCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTA 31246338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTA 60

 31246339 TTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAA 31246398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAA 120

 31246399 TGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTT 31246458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTT 180

 31246459 TGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCT 31246518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCT 240

 31246519 AGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAA 31246578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAA 300

 31246579 TCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTG 31246638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTG 360

 31246639 TCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATA 31246698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATA 420

 31246699 TTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTT 31246758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTT 480

 31246759 TGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGC 31246818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGC 540

 31246819 TGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACC 31246878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACC 600

 31246879 TTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTT 31246938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTT 660

 31246939 GAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACT 31246998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACT 720

 31246999 CGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCT 31247058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCT 780

 31247059 GGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGT 31247118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGT 840

 31247119 GCCTTTGATGTTAGGCTACCAGA 31247141
          |||||||||||||||||||||||
      841 GCCTTTGATGTTAGGCTACCAGA 863

EXCISED REGION

 31247143 TGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTAT 31247202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 TGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTAT 924

 31247203 GAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTT 31247262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 GAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTT 984

 31247263 CCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACA 31247322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 CCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACA 1044

 31247323 ACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATG 31247382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 ACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATG 1104

 31247383 ATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACT 31247442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 ATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACT 1164

 31247443 CCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAATTTATATGCCATAAAA 31247502
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1165 CCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAATTTATATACCATAAAA 1224

 31247503 TTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGA 31247562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 TTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGA 1284

 31247563 CCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCA 31247622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 CCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCA 1344

 31247623 ATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTC 31247682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 ATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTC 1404

 31247683 CTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATG 31247742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 CTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATG 1464

 31247743 TAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTTAGTTTCATCCATGCTG 31247802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 TAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTTAGTTTCATCCATGCTG 1524

 31247803 CAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTATTCCAATGTATAGATA 31247862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 CAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTATTCCAATGTATAGATA 1584

 31247863 TGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCATTTTTTCTTGTTTTTAT 31247922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 TGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCATTTTTTCTTGTTTTTAT 1644

 31247923 TAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAAGTCTTTGTGTGAACAT 31247982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 TAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAAGTCTTTGTGTGAACAT 1704

 31247983 ATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTTTATATGGCACA 31248042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 ATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTTTATATGGCACA 1764

 31248043 ATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCAGATATTTGGTCAAACA 31248102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 ATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCAGATATTTGGTCAAACA 1824

 31248103 TTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGCATTTAGACTGTTAGAC 31248162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 TTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGCATTTAGACTGTTAGAC 1884

 31248163 TTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCATCTAATGAGTTGATGGC 31248222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 TTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCATCTAATGAGTTGATGGC 1944

 31248223 CTGAATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTCCCCAGCAGACTCCCTT 31248282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 CTGAATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTCCCCAGCAGACTCCCTT 2004

 31248283 CAGACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGACTGCCTTTAGACTCAAA 31248342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 CAGACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGACTGCCTTTAGACTCAAA 2064

 31248343 CTGCAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 31248402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 CTGCAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 2124

 31248403 CACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGAT 31248462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 CACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGAT 2184

 31248463 TGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAA 31248522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 TGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAA 2244

 31248523 AAAAATTAGCCGGGCGTGTTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGC 31248582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 AAAAATTAGCCGGGCGTGTTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGC 2304

 31248583 AGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGTAATGAGCCGAGATCGCACCACTGCA 31248642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 AGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGTAATGAGCCGAGATCGCACCACTGCA 2364

 31248643 CTCCAGCCTGGGTGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAATAAATAAATTTCTTCACACACACA 31248702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 CTCCAGCCTGGGTGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAATAAATAAATTTCTTCACACACACA 2424

 31248703 CACATACCTGATTCATTCTGTCTCTCTGGAGAACCTTACTACATATGGTAAGTTGGTTTA 31248762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 CACATACCTGATTCATTCTGTCTCTCTGGAGAACCTTACTACATATGGTAAGTTGGTTTA 2484

 31248763 ACTTTAAAAGAAATAGCCAAACTATTTTCCAAAGTGGTTATAACAATTTACATTCCTACC 31248822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 ACTTTAAAAGAAATAGCCAAACTATTTTCCAAAGTGGTTATAACAATTTACATTCCTACC 2544

 31248823 AACAATGTATAATATGAGAGTTCCTGTTTCTCCACATCCTAGACACTATATACTGTCTTT 31248882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 AACAATGTATAATATGAGAGTTCCTGTTTCTCCACATCCTAGACACTATATACTGTCTTT 2604

 31248883 TTTATTACAGCCATCCTAGGGGATGTAATCTCATTGTGGTATCTCATTGTGTTTTTAATG 31248942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 TTTATTACAGCCATCCTAGGGGATGTAATCTCATTGTGGTATCTCATTGTGTTTTTAATG 2664

 31248943 TGTATCTTCCTAATGACTAATGATGCTCACTGTGCTTACATGTGGCTATTAATCACTCTC 31249002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 TGTATCTTCCTAATGACTAATGATGCTCACTGTGCTTACATGTGGCTATTAATCACTCTC 2724

 31249003 ATGTCTTTTCAGATGAAGTGTCTATTCTGTTCTTTTGCTCACTGTTAAGTTGGGTTGTTT 31249062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 ATGTCTTTTCAGATGAAGTGTCTATTCTGTTCTTTTGCTCACTGTTAAGTTGGGTTGTTT 2784

 31249063 GCCTTATTATTTACTTATAATTCTTTACATGTTTTGGATACAAGTCCTTTATCACACATG 31249122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 GCCTTATTATTTACTTATAATTCTTTACATGTTTTGGATACAAGTCCTTTATCACACATG 2844

 31249123 ATTTGCAAATATTTTCTCCCAGTCTGCAGCCTATCTTTTCAGTTTCTTCCCAATGTCTTT 31249182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 ATTTGCAAATATTTTCTCCCAGTCTGCAGCCTATCTTTTCAGTTTCTTCCCAATGTCTTT 2904

 31249183 TGTAGCATAAAAATGTTAATTTTAATTAAGTCAAATTCATCAATTTTTTATCTTATGGCT 31249242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 TGTAGCATAAAAATGTTAATTTTAATTAAGTCAAATTCATCAATTTTTTATCTTATGGCT 2964

 31249243 CATGCTTCTGGTGTCATACCTAACAACTCTGCCTAATCCAAGGTCATAAAGTTTCTTCTA 31249302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 CATGCTTCTGGTGTCATACCTAACAACTCTGCCTAATCCAAGGTCATAAAGTTTCTTCTA 3024

 31249303 TGCTTTCTTTTAGAAGTTTTATAATTTTAGCTCTTACATTTAGGCCCCTAATTCATTGTC 31249362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 TGCTTTCTTTTAGAAGTTTTATAATTTTAGCTCTTACATTTAGGCCCCTAATTCATTGTC 3084

 31249363 AGCTAATTTTTGTGTATTGTTATTGTGAGGAAGTTAATTTTTGTATATGATATCCAATTT 31249422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 AGCTAATTTTTGTGTATTGTTATTGTGAGGAAGTTAATTTTTGTATATGATATCCAATTT 3144

 31249423 TTCCAGCACCATTTGTTGAAAAAATAACCCTTTCTCTATTTGTCTTAGCAGCTCTTCCAA 31249482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 TTCCAGCACCATTTGTTGAAAAAATAACCCTTTCTCTATTTGTCTTAGCAGCTCTTCCAA 3204

 31249483 AAATCAATGGACCAAAAATGTAAATGTTTATTTCTGGACTCTCAATTCCTCTCCATTGAT 31249542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 AAATCAATGGACCAAAAATGTAAATGTTTATTTCTGGACTCTCAATTCCTCTCCATTGAT 3264

 31249543 TTATATGCTTATCCTATGCCACGGCCACGTTGTCCTGAATACTGTCACCTTAGATTGAGT 31249602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 TTATATGCTTATCCTATGCCACGGCCACGTTGTCCTGAATACTGTCACCTTAGATTGAGT 3324

 31249603 TTTGAAATGGGGATGTATAAATCCTCCAATTTTGTTCTTTTACTCATTTATTTTAAATTT 31249662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 TTTGAAATGGGGATGTATAAATCCTCCAATTTTGTTCTTTTACTCATTTATTTTAAATTT 3384

 31249663 TATTTGATCCCACTGTACTAAGTGTACTTAGTAATACCACCTTAAATCCTTTCTTAGACA 31249722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 TATTTGATCCCACTGTACTAAGTGTACTTAGTAATACCACCTTAAATCCTTTCTTAGACA 3444

 31249723 AGATAGATATAAATATAAAAATAAAATAGGCTATATTTTAAAGACGTTTTCAAAATAACA 31249782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 AGATAGATATAAATATAAAAATAAAATAGGCTATATTTTAAAGACGTTTTCAAAATAACA 3504

 31249783 TAATCCTTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTAAAATTAAGT 31249842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 TAATCCTTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTAAAATTAAGT 3564

 31249843 TTTCCCACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTACTGAATGCCTACTATGTACCAGGC 31249902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 TTTCCCACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTACTGAATGCCTACTATGTACCAGGC 3624

 31249903 ACAGTGCAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGC 31249962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 ACAGTGCAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGC 3684

 31249963 ACTTAAATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACA 31250022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 ACTTAAATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACA 3744

 31250023 AAAGATATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAA 31250082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 AAAGATATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAA 3804

 31250083 AAAAAAAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACAT 31250142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 AAAAAAAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACAT 3864

 31250143 GTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAATAAAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAATTTTTTA 31250202
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||.|||||||
     3865 GTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAAT-AAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAATTTTTTTA 3923

 31250203 ATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTAGAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTG 31250262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 ATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTAGAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTG 3983

 31250263 GAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATCATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCT 31250322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 GAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATCATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCT 4043

 31250323 CAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTG 31250382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 CAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTG 4103

 31250383 CCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAACTTCTACCAGCTTTAATGTTCTT 31250433
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 CCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAACTTCTACCAGCTTTAATGTTCTT 4154

Alignment time is 4.00744 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3957] =>      3957 nucs 'mol-32-2218-019928_3957'

Score:        3904
Aligned:      3959        nucs
Identic:      3954 (100%) nucs =>      2396 (100%)      1558 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31249922,31252321] EXCISED REGION [31252324,31253882]
 second seq =>  [       1,    2398] EXCISED REGION [    2399,    3957]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [31252322,31252323]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [31252322,31252340] to [31252324,31252342]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31252322,31252322] to [31252323,31252323]
 second seq =>         0 nucs

 31249922 CAAAGATACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGCACTTAAATAGACAATGATG 31249981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAAGATACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGCACTTAAATAGACAATGATG 60

 31249982 GCATAGTATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCT 31250041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCATAGTATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCT 120

 31250042 TACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTA 31250101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTA 180

 31250102 CATATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGT 31250161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGT 240

 31250162 ATAATAAATAAAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAATTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAA 31250221
          |||||||||||||||||||| ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAATAAATAAAAAAAAAAA-TTAAAAAAAAAATTTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAA 299

 31250222 AAAATTATTAGAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCAC 31250281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 AAAATTATTAGAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCAC 359

 31250282 AGGCATGATCATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCC 31250341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 AGGCATGATCATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCC 419

 31250342 AGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGA 31250401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 AGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGA 479

 31250402 TTTGTGAAACTTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTT 31250461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TTTGTGAAACTTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTT 539

 31250462 TAAACAAAAAGTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGA 31250521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TAAACAAAAAGTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGA 599

 31250522 AGACAAGAATAGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCC 31250581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 AGACAAGAATAGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCC 659

 31250582 AAGGTGAGTGAATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC 31250641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 AAGGTGAGTGAATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC 719

 31250642 CCCGTCTCTATTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCT 31250701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CCCGTCTCTATTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCT 779

 31250702 AGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTG 31250761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 AGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTG 839

 31250762 GGCCGAGATTGCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAG 31250821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GGCCGAGATTGCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAG 899

 31250822 AAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAA 31250881
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AAAAAAAAAAAAAAAA-GTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAA 958

 31250882 CTACCAGAGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTG 31250941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 CTACCAGAGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTG 1018

 31250942 GTTCTCTCCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGA 31251001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 GTTCTCTCCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGA 1078

 31251002 AAAGTCTTATTTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATG 31251061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 AAAGTCTTATTTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATG 1138

 31251062 CTCTGTCAACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACT 31251121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 CTCTGTCAACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACT 1198

 31251122 CTTAAAATACTCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCC 31251181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CTTAAAATACTCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCC 1258

 31251182 ACTAAACTTGACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCT 31251241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 ACTAAACTTGACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCT 1318

 31251242 CCCAACCTATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTA 31251301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 CCCAACCTATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTA 1378

 31251302 AATAACGTGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAA 31251361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 AATAACGTGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAA 1438

 31251362 GAGATTTTAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGA 31251421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 GAGATTTTAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGA 1498

 31251422 AAGACAGGGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAA 31251481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 AAGACAGGGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAA 1558

 31251482 ATACCAATATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCA 31251541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 ATACCAATATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCA 1618

 31251542 AACCACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTT 31251601
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1619 AACCACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTC 1678

 31251602 ACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCA 31251661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 ACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCA 1738

 31251662 GCAATTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAA 31251721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GCAATTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAA 1798

 31251722 TTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCA 31251781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCA 1858

 31251782 AGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCC 31251841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 AGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCC 1918

 31251842 TTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTT 31251901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTT 1978

 31251902 TGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAAT 31251961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAAT 2038

 31251962 CTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATT 31252021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATT 2098

 31252022 GTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGG 31252081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 GTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGG 2158

 31252082 AGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGT 31252141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGT 2218

 31252142 GAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAA 31252201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 GAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAA 2278

 31252202 TCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGA 31252261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGA 2338

 31252262 AGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCTC 31252321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCTC 2398

EXCISED REGION

 31252324 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGA 31252383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGA 2458

 31252384 TATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAAC 31252443
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TATTTATCTATAGTGACAAATATCGGTAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAAC 2518

 31252444 TTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACT 31252503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACT 2578

 31252504 AGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 31252563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 AGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 2638

 31252564 AGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAA 31252623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 AGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAA 2698

 31252624 GATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCG 31252683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCG 2758

 31252684 CCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAG 31252743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 CCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAG 2818

 31252744 AGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAA 31252803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAA 2878

 31252804 AAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTC 31252863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 AAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTC 2938

 31252864 ATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGT 31252923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGT 2998

 31252924 GAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGC 31252983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 GAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGC 3058

 31252984 ATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAG 31253043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 ATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAG 3118

 31253044 TCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCT 31253103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCT 3178

 31253104 TCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATA 31253163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATA 3238

 31253164 GCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCAT 31253223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 GCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCAT 3298

 31253224 TAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCT 31253283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCT 3358

 31253284 GATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTG 31253343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 GATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTG 3418

 31253344 TTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCA 31253403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCA 3478

 31253404 GGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACAC 31253463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 GGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACAC 3538

 31253464 TAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATA 31253523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 TAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATA 3598

 31253524 AGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTC 31253583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 AGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTC 3658

 31253584 TATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCA 31253643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCA 3718

 31253644 CAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCA 31253703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 CAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCA 3778

 31253704 TTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGAC 31253763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGAC 3838

 31253764 CTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTG 31253823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 CTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTG 3898

 31253824 GCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAA 31253882
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 GCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAA 3957

Alignment time is 3.77772 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    4414] =>      4414 nucs 'mol-32-22d3-020405_4414'

Score:        4369
Aligned:      4413        nucs
Identic:      4409 (100%) nucs =>       188 (100%)      4221 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31242418,31242605] EXCISED REGION [31242609,31246833]
 second seq =>  [       1,     188] EXCISED REGION [     190,    4414]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [31242606,31242608]
 second seq =>         1 nucs [189,189]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [31242599,31242605] to [31242602,31242608]
 second seq =>         1 nucs [189,189] to [190,190]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31242606,31242606] to [31242608,31242608]
 second seq =>         0 nucs

 31242418 GCTATATTACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAAACATGAGATAATACTAGCAGTATTGAG 31242477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTATATTACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAAACATGAGATAATACTAGCAGTATTGAG 60

 31242478 AAATATTTCATAATGATGTAAGAATCAATTATACATATGTAACTAACCTGCACAACGTGC 31242537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATATTTCATAATGATGTAAGAATCAATTATACATATGTAACTAACCTGCACAACGTGC 120

 31242538 ACATGTACCCTAAAACTTAAAATATAATAATAAAAAAAAAAACATACACACACACACACA 31242597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACATGTACCCTAAAACTTAAAATATAATAATAAAAAAAAAAACATACACACACACACACA 180

 31242598 CAAAAAAA 31242605
          ||||||||
      181 CAAAAAAA 188

EXCISED REGION

 31242609 CAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTGAGCAGAAGCTGGAAGTGACTTAAGAA 31242668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      190 CAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTGAGCAGAAGCTGGAAGTGACTTAAGAA 249

 31242669 GACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAAAACCTTATGGTGGATAGATGAATAAC 31242728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      250 GACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAAAACCTTATGGTGGATAGATGAATAAC 309

 31242729 TCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTTCCTCACATGAAATAGAAAAGACAAAA 31242788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 TCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTTCCTCACATGAAATAGAAAAGACAAAA 369

 31242789 TAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATG 31242848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 TAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATG 429

 31242849 GATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACT 31242908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 GATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACT 489

 31242909 GAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAA 31242968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 GAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAA 549

 31242969 GGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGC 31243028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 GGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGC 609

 31243029 ACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATA 31243088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 ACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATA 669

 31243089 CCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGG 31243148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 CCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGG 729

 31243149 TCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTT 31243208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 TCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTT 789

 31243209 CAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAAC 31243268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 CAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAAC 849

 31243269 AGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAA 31243328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 AGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAA 909

 31243329 TTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTA 31243388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 TTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTA 969

 31243389 CAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTT 31243448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 CAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTT 1029

 31243449 CTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAAT 31243508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 CTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAAT 1089

 31243509 CTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGG 31243568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 CTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGG 1149

 31243569 TGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAAT 31243628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 TGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAAT 1209

 31243629 GTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAG 31243688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 GTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAG 1269

 31243689 TTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAAC 31243748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 TTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAAC 1329

 31243749 AGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAA 31243808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 AGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAA 1389

 31243809 AAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGC 31243868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 AAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGC 1449

 31243869 CAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATAT 31243928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 CAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATAT 1509

 31243929 CAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAA 31243988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 CAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAA 1569

 31243989 TGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTC 31244048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 TGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTC 1629

 31244049 AGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACT 31244108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 AGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACT 1689

 31244109 TTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAG 31244168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 TTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAG 1749

 31244169 TAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGA 31244228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 TAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGA 1809

 31244229 TTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTC 31244288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 TTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTC 1869

 31244289 TCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGA 31244348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 TCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGA 1929

 31244349 TATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCC 31244408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 TATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCC 1989

 31244409 ACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTAC 31244468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 ACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTAC 2049

 31244469 CATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATAT 31244528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 CATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATAT 2109

 31244529 GTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGT 31244588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 GTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGT 2169

 31244589 CAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAG 31244648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 CAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAG 2229

 31244649 AACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAG 31244708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 AACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAG 2289

 31244709 GTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTT 31244768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 GTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTT 2349

 31244769 CCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAA 31244828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 CCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAA 2409

 31244829 CCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGA 31244888
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2410 CCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGG 2469

 31244889 GGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAAC 31244948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 GGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAAC 2529

 31244949 TAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAAT 31245008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 TAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAAT 2589

 31245009 CAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCA 31245068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 CAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCA 2649

 31245069 CTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTA 31245128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 CTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTA 2709

 31245129 CTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAA 31245188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 CTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAA 2769

 31245189 ATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGAC 31245248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 ATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGAC 2829

 31245249 CAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTT 31245308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 CAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTT 2889

 31245309 ATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTC 31245368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 ATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTC 2949

 31245369 TCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACC 31245428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 TCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACC 3009

 31245429 AGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCT 31245488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 AGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCT 3069

 31245489 CTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAA 31245548
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 CTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAA 3129

 31245549 ACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACC 31245608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 ACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACC 3189

 31245609 TCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATA 31245668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 TCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATA 3249

 31245669 GTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTT 31245728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 GTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTT 3309

 31245729 AGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGT 31245788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 AGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGT 3369

 31245789 ATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACT 31245848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3370 ATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACT 3429

 31245849 GTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTAT 31245908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 GTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTAT 3489

 31245909 TATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCA 31245968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 TATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCA 3549

 31245969 CATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGAT 31246028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 CATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGAT 3609

 31246029 GATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTT 31246088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 GATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTT 3669

 31246089 CATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCC 31246148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 CATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCC 3729

 31246149 ACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACAC 31246208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3730 ACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTCAGATTCCTTACAC 3789

 31246209 ATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACA 31246268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 ATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACA 3849

 31246269 GATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCC 31246328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3850 GATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCC 3909

 31246329 CATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTA 31246388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3910 CATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTA 3969

 31246389 TCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTT 31246448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3970 TCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTT 4029

 31246449 TAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTC 31246508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4030 TAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTC 4089

 31246509 CAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCA 31246568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 CAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCA 4149

 31246569 TGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACT 31246628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4150 TGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACT 4209

 31246629 GTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATT 31246688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4210 GTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATT 4269

 31246689 CTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAG 31246748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 CTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAG 4329

 31246749 CATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGAC 31246808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 CATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGAC 4389

 31246809 TCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTC 31246833
          |||||||||||||||||||||||||
     4390 TCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTC 4414

Alignment time is 4.26308 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    7892] =>      7892 nucs 'mol-32-2399-055700_7892'

Score:        7774
Aligned:      7888        nucs
Identic:      7876 (100%) nucs =>      2317 (100%)      5559 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31244426,31246747] EXCISED REGION [31251770,31257335]
 second seq =>  [       1,    2322] EXCISED REGION [    2330,    7892]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5022 nucs [31246748,31251769]
 second seq =>         7 nucs [2323,2329]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2321,2322] to [2328,2329]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246748,31246748] to [31251769,31251769]
 second seq =>         0 nucs

 31244426 AAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCAT 31244485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCAT 60

 31244486 GTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCA 31244545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCA 120

 31244546 GAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACC 31244605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACC 180

 31244606 AAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGA 31244665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGA 240

 31244666 GACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTA 31244725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTA 300

 31244726 CAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTC 31244785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTC 360

 31244786 CCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGA 31244845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGA 420

 31244846 AGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAG 31244905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAG 480

 31244906 ATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTAT 31244965
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATATTCTAAAACAAACAATTTTCCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTAT 540

 31244966 AACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCAT 31245025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCAT 600

 31245026 GCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAG 31245085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAG 660

 31245086 CAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTT 31245145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTT 720

 31245146 TCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTG 31245205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTG 780

 31245206 TTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTT 31245265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTT 840

 31245266 AAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGT 31245325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGT 900

 31245326 ATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATA 31245385
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTTTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATA 960

 31245386 TGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTA 31245445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTA 1020

 31245446 TGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCA 31245505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCA 1080

 31245506 CCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCAC 31245565
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCAC 1140

 31245566 ATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGT 31245625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGT 1200

 31245626 TCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATA 31245685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATA 1260

 31245686 TATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCT 31245745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCT 1320

 31245746 TGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATA 31245805
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGCTGTTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATA 1380

 31245806 CTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAG 31245865
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAG 1440

 31245866 TTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTT 31245925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTT 1500

 31245926 ACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTT 31245985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTT 1560

 31245986 GTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGT 31246045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGT 1620

 31246046 TTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCAT 31246105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCAT 1680

 31246106 TTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATT 31246165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATT 1740

 31246166 GTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCC 31246225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCC 1800

 31246226 CTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCT 31246285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCT 1860

 31246286 GTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTC 31246345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTC 1920

 31246346 TTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATG 31246405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATG 1980

 31246406 AAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTG 31246465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTG 2040

 31246466 ATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCA 31246525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCA 2100

 31246526 TTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTG 31246585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTG 2160

 31246586 GCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTT 31246645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTT 2220

 31246646 TTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAG 31246705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAG 2280

 31246706 GAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 2322

EXCISED REGION

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 2389

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 2449

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 2509

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 2569

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 2629

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31252129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 2689

 31252130 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 31252189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 2749

 31252190 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31252249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 2809

 31252250 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 31252309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 2869

 31252310 AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 31252369
          ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 AAACTCCATCTC---AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 2926

 31252370 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 31252429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 2986

 31252430 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 31252489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 3046

 31252490 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 31252549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 3106

 31252550 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 31252609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 3166

 31252610 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 31252669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 3226

 31252670 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 31252729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 3286

 31252730 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 31252789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 3346

 31252790 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 31252849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 3406

 31252850 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 31252909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 3466

 31252910 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 31252969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 3526

 31252970 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 31253029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 3586

 31253030 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 31253089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 3646

 31253090 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 31253149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 3706

 31253150 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 31253209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 3766

 31253210 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 31253269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 3826

 31253270 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 31253329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 3886

 31253330 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 31253389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3887 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 3946

 31253390 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 31253449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 4006

 31253450 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 31253509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4007 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 4066

 31253510 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 31253569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 4126

 31253570 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 31253629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4127 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 4186

 31253630 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 31253689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4187 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 4246

 31253690 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 31253749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4247 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 4306

 31253750 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 31253809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4307 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 4366

 31253810 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 31253869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4367 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 4426

 31253870 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 31253929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4427 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 4486

 31253930 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 31253989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4487 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 4546

 31253990 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 31254049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4547 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 4606

 31254050 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 31254109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4607 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 4666

 31254110 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 31254169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4667 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 4726

 31254170 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 31254229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4727 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 4786

 31254230 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 31254289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4787 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 4846

 31254290 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 31254349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4847 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 4906

 31254350 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 31254409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4907 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 4966

 31254410 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAA 31254469
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4967 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAA 5026

 31254470 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 31254529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5027 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 5086

 31254530 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 31254589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5087 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 5146

 31254590 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 31254649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5147 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 5206

 31254650 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 31254709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5207 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 5266

 31254710 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 31254769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5267 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 5326

 31254770 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 31254829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5327 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 5386

 31254830 AACCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 31254889
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5387 ACCCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 5446

 31254890 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAAT 31254949
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5447 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAACATAGAATCTACAAAAGTAAT 5506

 31254950 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 31255009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5507 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 5566

 31255010 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 31255069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5567 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 5626

 31255070 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 31255129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5627 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 5686

 31255130 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 31255189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5687 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 5746

 31255190 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 31255249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5747 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 5806

 31255250 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 31255309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5807 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 5866

 31255310 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 31255369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5867 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 5926

 31255370 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 31255429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5927 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 5986

 31255430 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 31255489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5987 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 6046

 31255490 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 31255549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6047 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 6106

 31255550 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAA 31255609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6107 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAA 6166

 31255610 AAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAA 31255669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6167 AAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAA 6226

 31255670 GGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTTA 31255729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     6227 GGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTTA 6286

 31255730 ATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACAC 31255789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6287 ATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACAC 6346

 31255790 TAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTA 31255849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6347 TAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTA 6406

 31255850 GCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCA 31255909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6407 GCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCA 6466

 31255910 AGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAA 31255969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6467 AGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAA 6526

 31255970 TAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCAT 31256029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6527 TAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCAT 6586

 31256030 TGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGC 31256089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6587 TGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGC 6646

 31256090 GTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAAC 31256149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6647 GTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAAC 6706

 31256150 CACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAA 31256209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6707 CACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAA 6766

 31256210 CCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGAC 31256269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6767 CCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGAC 6826

 31256270 TAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACT 31256329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6827 TAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACT 6886

 31256330 TAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTT 31256389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6887 TAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTT 6946

 31256390 TAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATG 31256449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6947 TAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATG 7006

 31256450 GCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATC 31256509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7007 GCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATC 7066

 31256510 TACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTT 31256569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7067 TACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTT 7126

 31256570 ACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATAT 31256629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7127 ACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATAT 7186

 31256630 TTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTAC 31256689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7187 TTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTAC 7246

 31256690 AAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGG 31256749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7247 AAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGG 7306

 31256750 AATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAA 31256809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7307 AATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAA 7366

 31256810 ATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAG 31256869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7367 ATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAG 7426

 31256870 TCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAA 31256929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7427 TCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAA 7486

 31256930 GGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCA 31256989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7487 GGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCA 7546

 31256990 TGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATA 31257049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7547 TGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATA 7606

 31257050 TCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGC 31257109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7607 TCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGC 7666

 31257110 AGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTAT 31257169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7667 AGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTAT 7726

 31257170 AAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGT 31257229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7727 AAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGT 7786

 31257230 CTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCAT 31257289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7787 CTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCAT 7846

 31257290 CCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGA 31257335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7847 CCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGA 7892

Alignment time is 7.41036 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2322] =>      2322 nucs 'mol-32-2399-055700_2322'

Score:        2277
Aligned:      2321        nucs
Identic:      2317 (100%) nucs =>       502 (100%)      1815 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31244426,31244927] EXCISED REGION [31244929,31246747]
 second seq =>  [       1,     502] EXCISED REGION [     504,    2322]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31244928,31244928]
 second seq =>         1 nucs [503,503]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [31244924,31244927] to [31244925,31244928]
 second seq =>         1 nucs [503,503] to [504,504]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31244426 AAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCAT 31244485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCAT 60

 31244486 GTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCA 31244545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCA 120

 31244546 GAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACC 31244605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACC 180

 31244606 AAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGA 31244665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGA 240

 31244666 GACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTA 31244725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTA 300

 31244726 CAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTC 31244785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTC 360

 31244786 CCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGA 31244845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGA 420

 31244846 AGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAG 31244905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAG 480

 31244906 ATATTCTAAAACAAACAATTTT 31244927
          ||||||||||||||||||||||
      481 ATATTCTAAAACAAACAATTTT 502

EXCISED REGION

 31244929 CAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATA 31244988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      504 CAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATA 563

 31244989 AACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCAT 31245048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      564 AACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCAT 623

 31245049 TTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAA 31245108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      624 TTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAA 683

 31245109 AATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACC 31245168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      684 AATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACC 743

 31245169 AATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTT 31245228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      744 AATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTT 803

 31245229 TACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACA 31245288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      804 TACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACA 863

 31245289 CATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTA 31245348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      864 CATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTTTGATACTTGTCATTTTTTA 923

 31245349 ATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACC 31245408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      924 ATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACC 983

 31245409 CTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGT 31245468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 CTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGT 1043

 31245469 TGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTATTCTAC 31245528
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1044 TGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTATTCTAC 1103

 31245529 TTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTA 31245588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1104 TTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTA 1163

 31245589 TTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCA 31245648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 TTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCA 1223

 31245649 TTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCAT 31245708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 TTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCAT 1283

 31245709 TCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCA 31245768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1284 TCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTGTTGTAACTAGTGCTGCA 1343

 31245769 ATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATAT 31245828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 ATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATAT 1403

 31245829 ATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGA 31245888
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 ATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGA 1463

 31245889 ACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAT 31245948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 ACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAAT 1523

 31245949 TAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGC 31246008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 TAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGC 1583

 31246009 CATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGT 31246068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 CATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGT 1643

 31246069 AGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAAT 31246128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 AGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAAT 1703

 31246129 ATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGA 31246188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 ATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGA 1763

 31246189 GTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTA 31246248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 GTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTA 1823

 31246249 ATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAG 31246308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 ATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAG 1883

 31246309 CTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAG 31246368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 CTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAG 1943

 31246369 TCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTA 31246428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 TCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTA 2003

 31246429 ATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCT 31246488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 ATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCT 2063

 31246489 AGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTC 31246548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 AGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTC 2123

 31246549 CCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGG 31246608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 CCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGG 2183

 31246609 GTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTT 31246668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 GTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTT 2243

 31246669 GGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTT 31246728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 GGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTT 2303

 31246729 TAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          |||||||||||||||||||
     2304 TAAATGTTCAACAGGAAAA 2322

Alignment time is 2.16249 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    4154] =>      4154 nucs 'mol-32-23a4-088686_4154'

Score:        4090
Aligned:      4156        nucs
Identic:      4150 (100%) nucs =>      2927 (100%)      1223 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31249389,31252320] EXCISED REGION [31252325,31253548]
 second seq =>  [       1,    2930] EXCISED REGION [    2931,    4154]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [31252321,31252324]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31249389 GAGGAAGTTAATTTTTGTATATGATATCCAATTTTTCCAGCACCATTTGTTGAAAAAATA 31249448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGGAAGTTAATTTTTGTATATGATATCCAATTTTTCCAGCACCATTTGTTGAAAAAATA 60

 31249449 ACCCTTTCTCTATTTGTCTTAGCAGCTCTTCCAAAAATCAATGGACCAAAAATGTAAATG 31249508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCCTTTCTCTATTTGTCTTAGCAGCTCTTCCAAAAATCAATGGACCAAAAATGTAAATG 120

 31249509 TTTATTTCTGGACTCTCAATTCCTCTCCATTGATTTATATGCTTATCCTATGCCACGGCC 31249568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTATTTCTGGACTCTCAATTCCTCTCCATTGATTTATATGCTTATCCTATGCCACGGCC 180

 31249569 ACGTTGTCCTGAATACTGTCACCTTAGATTGAGTTTTGAAATGGGGATGTATAAATCCTC 31249628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACGTTGTCCTGAATACTGTCACCTTAGATTGAGTTTTGAAATGGGGATGTATAAATCCTC 240

 31249629 CAATTTTGTTCTTTTACTCATTTATTTTAAATTTTATTTGATCCCACTGTACTAAGTGTA 31249688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAATTTTGTTCTTTTACTCATTTATTTTAAATTTTATTTGATCCCACTGTACTAAGTGTA 300

 31249689 CTTAGTAATACCACCTTAAATCCTTTCTTAGACAAGATAGATATAAATATAAAAATAAAA 31249748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTAGTAATACCACCTTAAATCCTTTCTTAGACAAGATAGATATAAATATAAAAATAAAA 360

 31249749 TAGGCTATATTTTAAAGACGTTTTCAAAATAACATAATCCTTTTAAGATTTCAACCATTA 31249808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGGCTATATTTTAAAGACGTTTTCAAAATAACATAATCCTTTTAAGATTTCAACCATTA 420

 31249809 ACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTAAAATTAAGTTTTCCCACCCCCGACACTCACATCAA 31249868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTAAAATTAAGTTTTCCCACCCCCGACACTCACATCAA 480

 31249869 CAAACATTTACTGAATGCCTACTATGTACCAGGCACAGTGCAAGGTTAGGTGCCAAAGAT 31249928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAACATTTACTGAATGCCTACTATGTACCAGGCACAGTGCAAGGTTAGGTGCCAAAGAT 540

 31249929 ACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGCACTTAAATAGACAATGATGGCATAGT 31249988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGCACTTAAATAGACAATGATGGCATAGT 600

 31249989 ATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCTTACCAGA 31250048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCTTACCAGA 660

 31250049 TTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTACATATGT 31250108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTACATATGT 720

 31250109 ATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAA 31250168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAA 780

 31250169 ATAAAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAATTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTA 31250228
          ||||||||||||| ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAAAAAAAAAAA-TTAAAAAAAAAATTTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTA 839

 31250229 TTAGAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATG 31250288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TTAGAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATG 899

 31250289 ATCATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCC 31250348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 ATCATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCC 959

 31250349 TGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGA 31250408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGA 1019

 31250409 AACTTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAA 31250468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 AACTTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAA 1079

 31250469 AAAGTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAG 31250528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AAAGTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAG 1139

 31250529 AATAGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGA 31250588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AATAGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGA 1199

 31250589 GTGAATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCT 31250648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GTGAATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCT 1259

 31250649 CTATTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACT 31250708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CTATTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACT 1319

 31250709 CAGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAG 31250768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CAGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAG 1379

 31250769 ATTGCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAGAAAAAAA 31250828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATTGCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAGAAAAAAA 1439

 31250829 AAAAAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAG 31250888
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AAAAAAAAA-GTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAG 1498

 31250889 AGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCT 31250948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 AGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCT 1558

 31250949 CCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCT 31251008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 CCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCT 1618

 31251009 TATTTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTC 31251068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TATTTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTC 1678

 31251069 AACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAA 31251128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAA 1738

 31251129 TACTCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAAC 31251188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TACTCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAAC 1798

 31251189 TTGACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACC 31251248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TTGACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACC 1858

 31251249 TATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACG 31251308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACG 1918

 31251309 TGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTT 31251368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTT 1978

 31251369 TAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAG 31251428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAG 2038

 31251429 GGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAA 31251488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAA 2098

 31251489 TATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACC 31251548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACC 2158

 31251549 AAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTTACAAAAA 31251608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2159 AAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTCACAAAAA 2218

 31251609 TACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTC 31251668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTC 2278

 31251669 ATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTA 31251728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 ATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTA 2338

 31251729 CTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCC 31251788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCC 2398

 31251789 ATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCT 31251848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCT 2458

 31251849 ATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTT 31251908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 ATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTT 2518

 31251909 AATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTT 31251968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 AATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTT 2578

 31251969 ACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAG 31252028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAG 2638

 31252029 AAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAA 31252088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 AAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAA 2698

 31252089 GGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCC 31252148
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GGTGGGCAGATCACCCGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCC 2758

 31252149 TGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCCAGC 31252208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCCAGC 2818

 31252209 TACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGC 31252268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 TACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGC 2878

 31252269 CGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCT 31252320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCT 2930

EXCISED REGION

 31252325 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGAT 31252384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGAT 2990

 31252385 ATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACT 31252444
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 ATTTATCTATAGTGACAAATATCGGTAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACT 3050

 31252445 TGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTA 31252504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 TGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTA 3110

 31252505 GTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 31252564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 GTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 3170

 31252565 GGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAG 31252624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 GGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAG 3230

 31252625 ATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGC 31252684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 ATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGC 3290

 31252685 CTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGA 31252744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 CTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGA 3350

 31252745 GGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAA 31252804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 GGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAA 3410

 31252805 AAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTCA 31252864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 AAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTCA 3470

 31252865 TGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGTG 31252924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 TGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGTG 3530

 31252925 AAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGCA 31252984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 AAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGCA 3590

 31252985 TGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAGT 31253044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 TGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAGT 3650

 31253045 CACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCTT 31253104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 CACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCTT 3710

 31253105 CATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATAG 31253164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 CATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATAG 3770

 31253165 CCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCATT 31253224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 CCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCATT 3830

 31253225 AAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCTG 31253284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 AAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCTG 3890

 31253285 ATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTGT 31253344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 ATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTGT 3950

 31253345 TTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCAG 31253404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 TTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCAG 4010

 31253405 GAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACACT 31253464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 GAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACACT 4070

 31253465 AGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATAA 31253524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 AGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATAA 4130

 31253525 GTGTTCAGGAAATGTTAACAGATT 31253548
          ||||||||||||||||||||||||
     4131 GTGTTCAGGAAATGTTAACAGATT 4154

Alignment time is 4.3196 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    7402] =>      7402 nucs 'mol-32-288a-130506_7402'

Score:        7252
Aligned:      7397        nucs
Identic:      7383 (100%) nucs =>      2850 (100%)      4533 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31243892,31246747] EXCISED REGION [31251770,31256309]
 second seq =>  [       1,    2856] EXCISED REGION [    2864,    7402]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5022 nucs [31246748,31251769]
 second seq =>         7 nucs [2857,2863]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2855,2856] to [2862,2863]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246748,31246748] to [31251769,31251769]
 second seq =>         0 nucs

 31243892 CAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCAAAATTTCTATGGACCAGTAAA 31243951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCAAAATTTCTATGGACCAGTAAA 60

 31243952 GCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATGTTTACTGCAGCTATTCTATGA 31244011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATGTTTACTGCAGCTATTCTATGA 120

 31244012 CTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTG 31244071
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGCCTCTTCATTTTATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTG 180

 31244072 AACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAG 31244131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAG 240

 31244132 TTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGA 31244191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGA 300

 31244192 CTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTT 31244251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTT 360

 31244252 GATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTC 31244311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTC 420

 31244312 TGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTA 31244371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTA 480

 31244372 GGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCG 31244431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCG 540

 31244432 GAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGAC 31244491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGAC 600

 31244492 TTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAAT 31244551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAAT 660

 31244552 TCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAAT 31244611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAAT 720

 31244612 CACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTG 31244671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTG 780

 31244672 CTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGT 31244731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGT 840

 31244732 TGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTA 31244791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTA 900

 31244792 CCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAAT 31244851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      901 CCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACGTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAAT 960

 31244852 TTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTC 31244911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTC 1020

 31244912 TAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCAT 31244971
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAAACAAACAATTTTCCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCAT 1080

 31244972 TTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAG 31245031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAG 1140

 31245032 GCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAG 31245091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAG 1200

 31245092 TGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAAC 31245151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAAC 1260

 31245152 ACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTG 31245211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTG 1320

 31245212 AAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTT 31245271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTT 1380

 31245272 TTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTG 31245331
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1381 TTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTTTG 1440

 31245332 ATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTAT 31245391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTAT 1500

 31245392 TATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGAC 31245451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGAC 1560

 31245452 TGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCACCCAGT 31245511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1561 TGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGT 1620

 31245512 GGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAA 31245571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAA 1680

 31245572 ATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTG 31245631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTG 1740

 31245632 CAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGAC 31245691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGAC 1800

 31245692 ATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTA 31245751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTA 1860

 31245752 TTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATT 31245811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATT 1920

 31245812 TCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGT 31245871
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGT 1980

 31245872 TATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTC 31245931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTC 2040

 31245932 CCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATT 31245991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATT 2100

 31245992 GTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGAT 31246051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGAT 2160

 31246052 TTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCAT 31246111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCAT 2220

 31246112 GTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGC 31246171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGC 2280

 31246172 TTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTC 31246231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTC 2340

 31246232 AGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTT 31246291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTT 2400

 31246292 TCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCT 31246351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCT 2460

 31246352 TGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGT 31246411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGT 2520

 31246412 TTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTG 31246471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTG 2580

 31246472 GTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATT 31246531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATT 2640

 31246532 TCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTA 31246591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTA 2700

 31246592 AATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGT 31246651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGT 2760

 31246652 GTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAAT 31246711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAAT 2820

 31246712 TGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 2856

EXCISED REGION

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 2923

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 2983

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 3043

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3044 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 3103

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 3163

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31252129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 3223

 31252130 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 31252189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 3283

 31252190 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31252249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 3343

 31252250 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 31252309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 3403

 31252310 AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 31252369
          ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 AAACTCCATCTC--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 3461

 31252370 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 31252429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 3521

 31252430 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 31252489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 3581

 31252490 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 31252549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 3641

 31252550 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 31252609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 3701

 31252610 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 31252669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 3761

 31252670 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 31252729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 3821

 31252730 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 31252789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 3881

 31252790 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 31252849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 3941

 31252850 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 31252909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 4001

 31252910 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 31252969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 4061

 31252970 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 31253029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 4121

 31253030 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 31253089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 4181

 31253090 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 31253149
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCCCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 4241

 31253150 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 31253209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4242 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 4301

 31253210 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 31253269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 4361

 31253270 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 31253329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 4421

 31253330 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 31253389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 4481

 31253390 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 31253449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 4541

 31253450 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 31253509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 4601

 31253510 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 31253569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 4661

 31253570 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 31253629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 4721

 31253630 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 31253689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 4781

 31253690 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 31253749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4782 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 4841

 31253750 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 31253809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4842 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 4901

 31253810 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 31253869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4902 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 4961

 31253870 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 31253929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4962 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 5021

 31253930 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 31253989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5022 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 5081

 31253990 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 31254049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5082 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 5141

 31254050 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 31254109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5142 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 5201

 31254110 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 31254169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5202 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 5261

 31254170 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 31254229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5262 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 5321

 31254230 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 31254289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5322 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 5381

 31254290 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 31254349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5382 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 5441

 31254350 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 31254409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5442 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 5501

 31254410 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAA 31254469
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5502 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAA 5561

 31254470 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 31254529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5562 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 5621

 31254530 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 31254589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5622 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 5681

 31254590 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 31254649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5682 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 5741

 31254650 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 31254709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5742 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 5801

 31254710 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 31254769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5802 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 5861

 31254770 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 31254829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5862 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 5921

 31254830 AACCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 31254889
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5922 ACCCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 5981

 31254890 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAAT 31254949
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5982 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAACATAGAATCTACAAAAGTAAT 6041

 31254950 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 31255009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6042 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 6101

 31255010 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 31255069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6102 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 6161

 31255070 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 31255129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6162 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 6221

 31255130 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 31255189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6222 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 6281

 31255190 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 31255249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6282 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 6341

 31255250 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 31255309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6342 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 6401

 31255310 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 31255369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6402 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 6461

 31255370 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 31255429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6462 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 6521

 31255430 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 31255489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6522 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 6581

 31255490 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 31255549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6582 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 6641

 31255550 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTC-AAAAAAAAAA 31255608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     6642 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAA 6701

 31255609 AAAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAA 31255668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6702 AAAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAA 6761

 31255669 AGGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTT 31255728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     6762 AGGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTT 6821

 31255729 AATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACA 31255788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6822 AATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACA 6881

 31255789 CTAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACT 31255848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6882 CTAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACT 6941

 31255849 AGCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCC 31255908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6942 AGCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCC 7001

 31255909 AAGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGA 31255968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7002 AAGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGA 7061

 31255969 ATAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCA 31256028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7062 ATAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCA 7121

 31256029 TTGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGG 31256088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7122 TTGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGG 7181

 31256089 CGTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAA 31256148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7182 CGTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAA 7241

 31256149 CCACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAA 31256208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7242 CCACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAA 7301

 31256209 ACCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGA 31256268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7302 ACCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGA 7361

 31256269 CTAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCT 31256309
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7362 CTAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCT 7402

Alignment time is 7.02043 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2856] =>      2856 nucs 'mol-32-288a-130506_2856'

Score:        2800
Aligned:      2855        nucs
Identic:      2850 (100%) nucs =>       133 (100%)      2717 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31243892,31244024] EXCISED REGION [31244026,31246747]
 second seq =>  [       1,     133] EXCISED REGION [     135,    2856]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31244025,31244025]
 second seq =>         1 nucs [134,134]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [132,134] to [133,135]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31244024,31244024] to [31244026,31244026]
 second seq =>         1 nucs [133,133] to [135,135]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31243892 CAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCAAAATTTCTATGGACCAGTAAA 31243951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCAAAATTTCTATGGACCAGTAAA 60

 31243952 GCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATGTTTACTGCAGCTATTCTATGA 31244011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATGTTTACTGCAGCTATTCTATGA 120

 31244012 CTGCCTCTTCATT 31244024
          |||||||||||||
      121 CTGCCTCTTCATT 133

EXCISED REGION

 31244026 TATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGT 31244085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      135 TATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGT 194

 31244086 TGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTT 31244145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      195 TGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTT 254

 31244146 TGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTG 31244205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      255 TGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTG 314

 31244206 ACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCAC 31244265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      315 ACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCAC 374

 31244266 TGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGA 31244325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      375 TGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGA 434

 31244326 CCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCT 31244385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      435 CCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCT 494

 31244386 GGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAAT 31244445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      495 GGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAAT 554

 31244446 AAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCT 31244505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      555 AAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCT 614

 31244506 CTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCA 31244565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      615 CTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCA 674

 31244566 GAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGAC 31244625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      675 GAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGAC 734

 31244626 CTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCAC 31244685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 CTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCAC 794

 31244686 TGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACT 31244745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      795 TGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACT 854

 31244746 TATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAAC 31244805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 TATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAAC 914

 31244806 CTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATT 31244865
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 CTAACTGAAAGCAGAAACGTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATT 974

 31244866 ATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATT 31244925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 ATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATT 1034

 31244926 TTTCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAA 31244985
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 TTCCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAA 1094

 31244986 ATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTT 31245045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 ATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTT 1154

 31245046 CATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATA 31245105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 CATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATA 1214

 31245106 GAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAAT 31245165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 GAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAAT 1274

 31245166 ACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTAT 31245225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 ACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTAT 1334

 31245226 GTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTG 31245285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 GTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTG 1394

 31245286 ACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTT 31245345
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1395 ACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTTTGATACTTGTCATTTT 1454

 31245346 TTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTC 31245405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 TTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTC 1514

 31245406 ACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACT 31245465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 ACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACT 1574

 31245466 TGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTATTC 31245525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1575 TGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTATTC 1634

 31245526 TACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGC 31245585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 TACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGC 1694

 31245586 TTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATT 31245645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 TTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATT 1754

 31245646 TCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATC 31245705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 TCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATC 1814

 31245706 CATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCT 31245765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 CATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCT 1874

 31245766 GCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGA 31245825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 GCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGA 1934

 31245826 TATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAA 31245885
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 TATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAA 1994

 31245886 AGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTA 31245945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 AGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTA 2054

 31245946 AATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAAT 31246005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 AATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAAT 2114

 31246006 AGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGA 31246065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 AGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGA 2174

 31246066 TGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGA 31246125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 TGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGA 2234

 31246126 AATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTAT 31246185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 AATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTAT 2294

 31246186 TGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAG 31246245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 TGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAG 2354

 31246246 CTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATA 31246305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 CTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATA 2414

 31246306 GAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTG 31246365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 GAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTG 2474

 31246366 AAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATT 31246425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 AAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATT 2534

 31246426 CTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTA 31246485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 CTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTA 2594

 31246486 TCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCT 31246545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 TCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCT 2654

 31246546 TTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTC 31246605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 TTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTC 2714

 31246606 TGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGT 31246665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 TGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGT 2774

 31246666 TTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTA 31246725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 TTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTA 2834

 31246726 TTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          ||||||||||||||||||||||
     2835 TTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 2856

Alignment time is 2.70462 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    6019] =>      6019 nucs 'mol-32-2895-069660_6019'

Score:        5952
Aligned:      6018        nucs
Identic:      6012 (100%) nucs =>       514 (100%)      5498 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31242091,31242605] EXCISED REGION [31242609,31248111]
 second seq =>  [       1,     515] EXCISED REGION [     517,    6019]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [31242606,31242608]
 second seq =>         1 nucs [516,516]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [31242599,31242605] to [31242602,31242608]
 second seq =>         1 nucs [516,516] to [517,517]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31242606,31242606] to [31242608,31242608]
 second seq =>         0 nucs

 31242091 AAACACCGCATATTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACATGGACACAGG 31242150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAACACCGCATATTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACATGGACACAGG 60

 31242151 AAGGGGAATATCACACTCTGGGGACTGTTGTGTGGTGGGGGTAGAGGGGAGGGATAACAT 31242210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGGGGAATATCACACTCTGGGGACTGTTGTGTGGTGGGGGTAGAGGGGAGGGATAACAT 120

 31242211 TGGGAGATATACCTAATGCTAGATGACGAGTTAGTGGGTGCAGCGCACCAGCGTGGCACA 31242270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGGAGATATACCTAATGCTAGATGACGAGTTAGTGGGTGCAGCGCACCAGCGTGGCACA 180

 31242271 TGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAA 31242330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAA 240

 31242331 TAAAAAAAATTTAAAAAATTAAAAAAAAAAGTAAAAGAATCCAAAGAGATACCATGCAGA 31242390
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAAAAAAATTAAAAAAATTAAAAAAAAAAGTAAAAGAATCCAAAGAGATACCATGCAGA 300

 31242391 TACTAATCATTAAGAAAACTGGAGGGAGCTATATTACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAA 31242450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACTAATCATTAAGAAAACTGGAGGGAGCTATATTACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAA 360

 31242451 ACATGAGATAATACTAGCAGTATTGAGAAATATTTCATAATGATGTAAGAATCAATTATA 31242510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACATGAGATAATACTAGCAGTATTGAGAAATATTTCATAATGATGTAAGAATCAATTATA 420

 31242511 CATATGTAACTAACCTGCACAACGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAATATAATAATAA 31242570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATATGTAACTAACCTGCACAACGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAATATAATAATAA 480

 31242571 AAAAAAAAACATACACACACACACACACAAAAAAA 31242605
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAAAAAACATACACACACACACACACAAAAAAA 515

EXCISED REGION

 31242609 CAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTGAGCAGAAGCTGGAAGTGACTTAAGAA 31242668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      517 CAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTGAGCAGAAGCTGGAAGTGACTTAAGAA 576

 31242669 GACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAAAACCTTATGGTGGATAGATGAATAAC 31242728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      577 GACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAAAACCTTATGGTGGATAGATGAATAAC 636

 31242729 TCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTTCCTCACATGAAATAGAAAAGACAAAA 31242788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      637 TCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTTCCTCACATGAAATAGAAAAGACAAAA 696

 31242789 TAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATG 31242848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      697 TAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATG 756

 31242849 GATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACT 31242908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      757 GATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACT 816

 31242909 GAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAA 31242968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      817 GAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAA 876

 31242969 GGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGC 31243028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 GGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGC 936

 31243029 ACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATA 31243088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 ACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATA 996

 31243089 CCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGG 31243148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 CCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGG 1056

 31243149 TCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTT 31243208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 TCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTT 1116

 31243209 CAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAAC 31243268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 CAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAAC 1176

 31243269 AGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAA 31243328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 AGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAA 1236

 31243329 TTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTA 31243388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 TTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTA 1296

 31243389 CAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTT 31243448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 CAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTT 1356

 31243449 CTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAAT 31243508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 CTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAAT 1416

 31243509 CTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGG 31243568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 CTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGG 1476

 31243569 TGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAAT 31243628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 TGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAAT 1536

 31243629 GTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAG 31243688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 GTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAG 1596

 31243689 TTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAAC 31243748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 TTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAAC 1656

 31243749 AGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAA 31243808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 AGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAA 1716

 31243809 AAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGC 31243868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 AAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGC 1776

 31243869 CAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATAT 31243928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 CAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATAT 1836

 31243929 CAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAA 31243988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 CAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAA 1896

 31243989 TGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTC 31244048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 TGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTC 1956

 31244049 AGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACT 31244108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 AGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACT 2016

 31244109 TTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAG 31244168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 TTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAG 2076

 31244169 TAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGA 31244228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 TAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGA 2136

 31244229 TTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTC 31244288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 TTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTC 2196

 31244289 TCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGA 31244348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 TCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGA 2256

 31244349 TATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCC 31244408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 TATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCC 2316

 31244409 ACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTAC 31244468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 ACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTAC 2376

 31244469 CATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATAT 31244528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 CATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATAT 2436

 31244529 GTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGT 31244588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 GTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGT 2496

 31244589 CAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAG 31244648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 CAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAG 2556

 31244649 AACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAG 31244708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 AACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAG 2616

 31244709 GTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTT 31244768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 GTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTT 2676

 31244769 CCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAA 31244828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 CCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAA 2736

 31244829 CCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGA 31244888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 CCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGA 2796

 31244889 GGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAAC 31244948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 GGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAAC 2856

 31244949 TAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAAT 31245008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 TAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAAT 2916

 31245009 CAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCA 31245068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 CAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCA 2976

 31245069 CTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTA 31245128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 CTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTA 3036

 31245129 CTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAA 31245188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 CTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAA 3096

 31245189 ATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGAC 31245248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 ATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGAC 3156

 31245249 CAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTT 31245308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 CAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTT 3216

 31245309 ATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTC 31245368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 ATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTC 3276

 31245369 TCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACC 31245428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 TCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACC 3336

 31245429 AGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCT 31245488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 AGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCT 3396

 31245489 CTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAA 31245548
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 CTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAA 3456

 31245549 ACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACC 31245608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 ACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACC 3516

 31245609 TCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATA 31245668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 TCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATA 3576

 31245669 GTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTT 31245728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 GTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTT 3636

 31245729 AGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGT 31245788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 AGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGT 3696

 31245789 ATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACT 31245848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3697 ATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACT 3756

 31245849 GTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTAT 31245908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 GTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTAT 3816

 31245909 TATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCA 31245968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 TATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCA 3876

 31245969 CATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGAT 31246028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 CATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGAT 3936

 31246029 GATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTT 31246088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 GATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTT 3996

 31246089 CATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCC 31246148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 CATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCC 4056

 31246149 ACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACAC 31246208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4057 ACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTCAGATTCCTTACAC 4116

 31246209 ATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACA 31246268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 ATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACA 4176

 31246269 GATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCC 31246328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 GATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCC 4236

 31246329 CATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTA 31246388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 CATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTA 4296

 31246389 TCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTT 31246448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 TCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTT 4356

 31246449 TAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTC 31246508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 TAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTC 4416

 31246509 CAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCA 31246568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 CAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCA 4476

 31246569 TGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACT 31246628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 TGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACT 4536

 31246629 GTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATT 31246688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 GTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATT 4596

 31246689 CTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAG 31246748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 CTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAG 4656

 31246749 CATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGAC 31246808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 CATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGAC 4716

 31246809 TCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATG 31246868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 TCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATG 4776

 31246869 ACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGT 31246928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 ACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGT 4836

 31246929 AGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGC 31246988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 AGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGC 4896

 31246989 TTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAA 31247048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 TTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAA 4956

 31247049 TAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTAT 31247108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 TAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTAT 5016

 31247109 TTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGACTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACA 31247168
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5017 TTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGATTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACA 5076

 31247169 GGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTG 31247228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5077 GGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTG 5136

 31247229 ATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCT 31247288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 ATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCT 5196

 31247289 CCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAG 31247348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 CCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAG 5256

 31247349 ATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGC 31247408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5257 ATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGC 5316

 31247409 TTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTG 31247468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5317 TTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTG 5376

 31247469 ATATGGATTGAAGTGCAATTTATATGCCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGA 31247528
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5377 ATATGGATTGAAGTGCAATTTATATACCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGA 5436

 31247529 CAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATC 31247588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5437 CAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATC 5496

 31247589 ATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAA 31247648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5497 ATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAA 5556

 31247649 TTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTT 31247708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5557 TTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTT 5616

 31247709 TCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCA 31247768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5617 TCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCA 5676

 31247769 CTCAACACTATATTTTTTAGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTT 31247828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5677 CTCAACACTATATTTTTTAGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTT 5736

 31247829 TTTCATTGCTGAATAGTATTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACC 31247888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5737 TTTCATTGCTGAATAGTATTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACC 5796

 31247889 AGGTTATGGACATTGCATTTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCC 31247948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5797 AGGTTATGGACATTGCATTTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCC 5856

 31247949 AAGAGCAATTACATACAAGTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATT 31248008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5857 AAGAGCAATTACATACAAGTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATT 5916

 31248009 CCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTG 31248068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5917 CCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTG 5976

 31248069 GCTGGACCACAGCACTCAGATATTTGGTCAAACATTATTCTCG 31248111
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5977 GCTGGACCACAGCACTCAGATATTTGGTCAAACATTATTCTCG 6019

Alignment time is 5.42238 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    5350] =>      5350 nucs 'mol-32-29b3-065479_5350'

Score:        5305
Aligned:      5349        nucs
Identic:      5345 (100%) nucs =>      2356 (100%)      2989 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31243150,31245505] EXCISED REGION [31245507,31248499]
 second seq =>  [       1,    2356] EXCISED REGION [    2358,    5350]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31245506,31245506]
 second seq =>         1 nucs [2357,2357]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31245506,31245507] to [31245507,31245508]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31245503,31245505] to [31245507,31245509]
 second seq =>         3 nucs [2354,2356] to [2358,2360]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31243150 CTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTTC 31243209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTTC 60

 31243210 AAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAACA 31243269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAACA 120

 31243270 GTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAAT 31243329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAAT 180

 31243330 TACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTAC 31243389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTAC 240

 31243390 AGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTTC 31243449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTTC 300

 31243450 TAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAATC 31243509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAATC 360

 31243510 TTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGGT 31243569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGGT 420

 31243570 GTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAATG 31243629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAATG 480

 31243630 TGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAGT 31243689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAGT 540

 31243690 TTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAACA 31243749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAACA 600

 31243750 GGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAAA 31243809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAAA 660

 31243810 AAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGCC 31243869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGCC 720

 31243870 AGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATC 31243929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATC 780

 31243930 AAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAAT 31243989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAAT 840

 31243990 GTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCA 31244049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCA 900

 31244050 GCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACTT 31244109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACTT 960

 31244110 TAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGT 31244169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGT 1020

 31244170 AAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGAT 31244229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGAT 1080

 31244230 TAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCT 31244289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCT 1140

 31244290 CTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGAT 31244349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGAT 1200

 31244350 ATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCA 31244409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCA 1260

 31244410 CGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACC 31244469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACC 1320

 31244470 ATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATG 31244529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATG 1380

 31244530 TATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTC 31244589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTC 1440

 31244590 AACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGA 31244649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGA 1500

 31244650 ACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGG 31244709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGG 1560

 31244710 TAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTC 31244769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTC 1620

 31244770 CAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAAC 31244829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAAC 1680

 31244830 CTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAG 31244889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAG 1740

 31244890 GCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAACT 31244949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAACT 1800

 31244950 AAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATC 31245009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATC 1860

 31245010 AAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCAC 31245069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCAC 1920

 31245070 TTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTAC 31245129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTAC 1980

 31245130 TCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAA 31245189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAA 2040

 31245190 TATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACC 31245249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACC 2100

 31245250 AAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTA 31245309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTA 2160

 31245310 TGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCT 31245369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCT 2220

 31245370 CTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCA 31245429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCA 2280

 31245430 GAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTC 31245489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTC 2340

 31245490 TCCTATCTCTTCCCCA 31245505
          ||||||||||||||||
     2341 TCCTATCTCTTCCCCA 2356

EXCISED REGION

 31245507 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 31245566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 2417

 31245567 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 31245626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 2477

 31245627 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 31245686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 2537

 31245687 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 31245746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 2597

 31245747 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 31245806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 2657

 31245807 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 31245866
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 2717

 31245867 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 31245926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 2777

 31245927 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 31245986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 2837

 31245987 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 31246046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 2897

 31246047 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 31246106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2898 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 2957

 31246107 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 31246166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2958 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 3017

 31246167 TTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 31246226
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 TTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 3077

 31246227 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 31246286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 3137

 31246287 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 31246346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 3197

 31246347 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 31246406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 3257

 31246407 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 31246466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3258 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 3317

 31246467 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 31246526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3318 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 3377

 31246527 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 31246586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3378 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 3437

 31246587 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 31246646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3438 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 3497

 31246647 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 31246706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3498 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 3557

 31246707 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 31246766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3558 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 3617

 31246767 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 31246826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3618 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 3677

 31246827 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 31246886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3678 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 3737

 31246887 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 31246946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3738 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 3797

 31246947 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 31247006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3798 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 3857

 31247007 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 31247066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3858 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 3917

 31247067 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 31247126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3918 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 3977

 31247127 TGTTAGGCTACCAGACTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 31247186
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3978 TGTTAGGCTACCAGATTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 4037

 31247187 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 31247246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4038 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 4097

 31247247 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 31247306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4098 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 4157

 31247307 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 31247366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4158 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 4217

 31247367 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 31247426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4218 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 4277

 31247427 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 31247486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4278 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 4337

 31247487 TTTATATGCCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTA 31247546
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4338 TTTATATACCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTA 4397

 31247547 GTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTT 31247606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4398 GTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTT 4457

 31247607 TCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTA 31247666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4458 TCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTA 4517

 31247667 GTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGT 31247726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4518 GTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGT 4577

 31247727 GAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTT 31247786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4578 GAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTT 4637

 31247787 AGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTA 31247846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4638 AGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTA 4697

 31247847 TTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCAT 31247906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4698 TTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCAT 4757

 31247907 TTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAA 31247966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4758 TTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAA 4817

 31247967 GTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCT 31248026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4818 GTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCT 4877

 31248027 GAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCA 31248086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4878 GAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCA 4937

 31248087 GATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGC 31248146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4938 GATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGC 4997

 31248147 ATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCAT 31248206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4998 ATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCAT 5057

 31248207 CTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTC 31248266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5058 CTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTC 5117

 31248267 CCCAGCAGACTCCCTTCAGACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGAC 31248326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5118 CCCAGCAGACTCCCTTCAGACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGAC 5177

 31248327 TGCCTTTAGACTCAAACTGCAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTG 31248386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5178 TGCCTTTAGACTCAAACTGCAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTG 5237

 31248387 GCCGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGCGGAT 31248446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5238 GCCGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGCGGAT 5297

 31248447 CACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTC 31248499
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5298 CACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTC 5350

Alignment time is 5.01331 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2802] =>      2802 nucs 'mol-32-2e20-025456_2802'

Score:        2729
Aligned:      2795        nucs
Identic:      2789 (100%) nucs =>      2431 (100%)       358 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31244312,31246747] EXCISED REGION [31251770,31252128]
 second seq =>  [       1,    2436] EXCISED REGION [    2444,    2802]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5022 nucs [31246748,31251769]
 second seq =>         7 nucs [2437,2443]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2435,2436] to [2442,2443]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246748,31246748] to [31251769,31251769]
 second seq =>         0 nucs

 31244312 TGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTA 31244371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTA 60

 31244372 GGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCG 31244431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCG 120

 31244432 GAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGAC 31244491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGAC 180

 31244492 TTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAAT 31244551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAAT 240

 31244552 TCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAAT 31244611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAAT 300

 31244612 CACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTG 31244671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTG 360

 31244672 CTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGT 31244731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGT 420

 31244732 TGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTA 31244791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTA 480

 31244792 CCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAAT 31244851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      481 CCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATCTTGCAGAAGCAAT 540

 31244852 TTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTC 31244911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTC 600

 31244912 TAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCAT 31244971
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAAACAAACAATTTTCCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCAT 660

 31244972 TTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAG 31245031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAG 720

 31245032 GCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAG 31245091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAG 780

 31245092 TGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAAC 31245151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAAC 840

 31245152 ACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTG 31245211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTG 900

 31245212 AAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTT 31245271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTT 960

 31245272 TTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTG 31245331
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      961 TTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTTTG 1020

 31245332 ATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTAT 31245391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTAT 1080

 31245392 TATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGAC 31245451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGAC 1140

 31245452 TGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCACCCAGT 31245511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1141 TGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGT 1200

 31245512 GGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAA 31245571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAA 1260

 31245572 ATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTG 31245631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTG 1320

 31245632 CAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGAC 31245691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGAC 1380

 31245692 ATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTA 31245751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTA 1440

 31245752 TTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATT 31245811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATT 1500

 31245812 TCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGT 31245871
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGT 1560

 31245872 TATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTC 31245931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTC 1620

 31245932 CCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATT 31245991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATT 1680

 31245992 GTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGAT 31246051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGAT 1740

 31246052 TTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCAT 31246111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCAT 1800

 31246112 GTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGC 31246171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGC 1860

 31246172 TTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTC 31246231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTC 1920

 31246232 AGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTT 31246291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTT 1980

 31246292 TCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCT 31246351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCT 2040

 31246352 TGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGT 31246411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGT 2100

 31246412 TTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTG 31246471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTG 2160

 31246472 GTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATT 31246531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATT 2220

 31246532 TCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTA 31246591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTA 2280

 31246592 AATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGT 31246651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGT 2340

 31246652 GTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAAT 31246711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAAT 2400

 31246712 TGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 2436

EXCISED REGION

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 2503

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 2563

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 2623

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 2683

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 GCATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 2743

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 31252128
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 2802

Alignment time is 2.54193 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    7244] =>      7244 nucs 'mol-32-2f28-011470_7244'

Score:        7156
Aligned:      7244        nucs
Identic:      7236 (100%) nucs =>       846 (100%)      6390 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31244660,31245505] EXCISED REGION [31245507,31251903]
 second seq =>  [       1,     846] EXCISED REGION [     848,    7244]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31245506,31245506]
 second seq =>         1 nucs [847,847]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [31250171,31250171]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31245506,31245507] to [31245507,31245508]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31245503,31245505] to [31245507,31245509]
 second seq =>         3 nucs [844,846] to [848,850]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31244660 AAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATA 31244719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATA 60

 31244720 TTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCAC 31244779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCAC 120

 31244780 AATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTT 31244839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTT 180

 31244840 TGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTC 31244899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTC 240

 31244900 TCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGC 31244959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGC 300

 31244960 AATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGG 31245019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGG 360

 31245020 ATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGA 31245079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGA 420

 31245080 TTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAG 31245139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAG 480

 31245140 TGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAG 31245199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAG 540

 31245200 AGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACAT 31245259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACAT 600

 31245260 CTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAG 31245319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAG 660

 31245320 TGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTT 31245379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTT 720

 31245380 GAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTC 31245439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTC 780

 31245440 CTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCT 31245499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCT 840

 31245500 TCCCCA 31245505
          ||||||
      841 TCCCCA 846

EXCISED REGION

 31245507 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 31245566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      848 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 907

 31245567 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 31245626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      908 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 967

 31245627 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 31245686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 1027

 31245687 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 31245746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1028 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 1087

 31245747 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 31245806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 1147

 31245807 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 31245866
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 1207

 31245867 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 31245926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 1267

 31245927 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 31245986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 1327

 31245987 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 31246046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 1387

 31246047 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 31246106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 1447

 31246107 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 31246166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 1507

 31246167 TTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 31246226
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 TTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 1567

 31246227 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 31246286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 1627

 31246287 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 31246346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 1687

 31246347 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 31246406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 1747

 31246407 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 31246466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 1807

 31246467 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 31246526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 1867

 31246527 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 31246586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 1927

 31246587 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 31246646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 1987

 31246647 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 31246706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 2047

 31246707 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 31246766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 2107

 31246767 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 31246826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 2167

 31246827 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 31246886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 2227

 31246887 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 31246946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 2287

 31246947 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 31247006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 2347

 31247007 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 31247066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 2407

 31247067 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 31247126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 2467

 31247127 TGTTAGGCTACCAGACTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 31247186
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 TGTTAGGCTACCAGATTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 2527

 31247187 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 31247246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 2587

 31247247 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 31247306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 2647

 31247307 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 31247366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 2707

 31247367 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 31247426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 2767

 31247427 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 31247486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 2827

 31247487 TTTATATGCCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTA 31247546
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 TTTATATACCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTA 2887

 31247547 GTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTT 31247606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 GTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTT 2947

 31247607 TCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTA 31247666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 TCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTA 3007

 31247667 GTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGT 31247726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 GTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGT 3067

 31247727 GAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTT 31247786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 GAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTT 3127

 31247787 AGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTA 31247846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 AGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTA 3187

 31247847 TTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCAT 31247906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 TTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCAT 3247

 31247907 TTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAA 31247966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 TTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAA 3307

 31247967 GTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCT 31248026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 GTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCT 3367

 31248027 GAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCA 31248086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 GAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCA 3427

 31248087 GATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGC 31248146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 GATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGC 3487

 31248147 ATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCAT 31248206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 ATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCAT 3547

 31248207 CTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTC 31248266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 CTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTC 3607

 31248267 CCCAGCAGACTCCCTTCAGACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGAC 31248326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 CCCAGCAGACTCCCTTCAGACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGAC 3667

 31248327 TGCCTTTAGACTCAAACTGCAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTG 31248386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 TGCCTTTAGACTCAAACTGCAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTG 3727

 31248387 GCCGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGCGGAT 31248446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 GCCGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGCGGAT 3787

 31248447 CACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAA 31248506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 CACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAA 3847

 31248507 AATAC-AAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCGGGCGTGTTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCT 31248565
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 AATACAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCGGGCGTGTTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCT 3907

 31248566 ACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGTAATGAGCC 31248625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 ACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGTAATGAGCC 3967

 31248626 GAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAATAAATAA 31248685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 GAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAATAAATAA 4027

 31248686 ATTTCTTCACACACACACACATACCTGATTCATTCTGTCTCTCTGGAGAACCTTACTACA 31248745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 ATTTCTTCACACACACACACATACCTGATTCATTCTGTCTCTCTGGAGAACCTTACTACA 4087

 31248746 TATGGTAAGTTGGTTTAACTTTAAAAGAAATAGCCAAACTATTTTCCAAAGTGGTTATAA 31248805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 TATGGTAAGTTGGTTTAACTTTAAAAGAAATAGCCAAACTATTTTCCAAAGTGGTTATAA 4147

 31248806 CAATTTACATTCCTACCAACAATGTATAATATGAGAGTTCCTGTTTCTCCACATCCTAGA 31248865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 CAATTTACATTCCTACCAACAATGTATAATATGAGAGTTCCTGTTTCTCCACATCCTAGA 4207

 31248866 CACTATATACTGTCTTTTTTATTACAGCCATCCTAGGGGATGTAATCTCATTGTGGTATC 31248925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 CACTATATACTGTCTTTTTTATTACAGCCATCCTAGGGGATGTAATCTCATTGTGGTATC 4267

 31248926 TCATTGTGTTTTTAATGTGTATCTTCCTAATGACTAATGATGCTCACTGTGCTTACATGT 31248985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 TCATTGTGTTTTTAATGTGTATCTTCCTAATGACTAATGATGCTCACTGTGCTTACATGT 4327

 31248986 GGCTATTAATCACTCTCATGTCTTTTCAGATGAAGTGTCTATTCTGTTCTTTTGCTCACT 31249045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 GGCTATTAATCACTCTCATGTCTTTTCAGATGAAGTGTCTATTCTGTTCTTTTGCTCACT 4387

 31249046 GTTAAGTTGGGTTGTTTGCCTTATTATTTACTTATAATTCTTTACATGTTTTGGATACAA 31249105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 GTTAAGTTGGGTTGTTTGCCTTATTATTTACTTATAATTCTTTACATGTTTTGGATACAA 4447

 31249106 GTCCTTTATCACACATGATTTGCAAATATTTTCTCCCAGTCTGCAGCCTATCTTTTCAGT 31249165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 GTCCTTTATCACACATGATTTGCAAATATTTTCTCCCAGTCTGCAGCCTATCTTTTCAGT 4507

 31249166 TTCTTCCCAATGTCTTTTGTAGCATAAAAATGTTAATTTTAATTAAGTCAAATTCATCAA 31249225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 TTCTTCCCAATGTCTTTTGTAGCATAAAAATGTTAATTTTAATTAAGTCAAATTCATCAA 4567

 31249226 TTTTTTATCTTATGGCTCATGCTTCTGGTGTCATACCTAACAACTCTGCCTAATCCAAGG 31249285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 TTTTTTATCTTATGGCTCATGCTTCTGGTGTCATACCTAACAACTCTGCCTAATCCAAGG 4627

 31249286 TCATAAAGTTTCTTCTATGCTTTCTTTTAGAAGTTTTATAATTTTAGCTCTTACATTTAG 31249345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 TCATAAAGTTTCTTCTATGCTTTCTTTTAGAAGTTTTATAATTTTAGCTCTTACATTTAG 4687

 31249346 GCCCCTAATTCATTGTCAGCTAATTTTTGTGTATTGTTATTGTGAGGAAGTTAATTTTTG 31249405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 GCCCCTAATTCATTGTCAGCTAATTTTTGTGTATTGTTATTGTGAGGAAGTTAATTTTTG 4747

 31249406 TATATGATATCCAATTTTTCCAGCACCATTTGTTGAAAAAATAACCCTTTCTCTATTTGT 31249465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 TATATGATATCCAATTTTTCCAGCACCATTTGTTGAAAAAATAACCCTTTCTCTATTTGT 4807

 31249466 CTTAGCAGCTCTTCCAAAAATCAATGGACCAAAAATGTAAATGTTTATTTCTGGACTCTC 31249525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 CTTAGCAGCTCTTCCAAAAATCAATGGACCAAAAATGTAAATGTTTATTTCTGGACTCTC 4867

 31249526 AATTCCTCTCCATTGATTTATATGCTTATCCTATGCCACGGCCACGTTGTCCTGAATACT 31249585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 AATTCCTCTCCATTGATTTATATGCTTATCCTATGCCACGGCCACGTTGTCCTGAATACT 4927

 31249586 GTCACCTTAGATTGAGTTTTGAAATGGGGATGTATAAATCCTCCAATTTTGTTCTTTTAC 31249645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 GTCACCTTAGATTGAGTTTTGAAATGGGGATGTATAAATCCTCCAATTTTGTTCTTTTAC 4987

 31249646 TCATTTATTTTAAATTTTATTTGATCCCACTGTACTAAGTGTACTTAGTAATACCACCTT 31249705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 TCATTTATTTTAAATTTTATTTGATCCCACTGTACTAAGTGTACTTAGTAATACCACCTT 5047

 31249706 AAATCCTTTCTTAGACAAGATAGATATAAATATAAAAATAAAATAGGCTATATTTTAAAG 31249765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 AAATCCTTTCTTAGACAAGATAGATATAAATATAAAAATAAAATAGGCTATATTTTAAAG 5107

 31249766 ACGTTTTCAAAATAACATAATCCTTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCCTAGGAT 31249825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5108 ACGTTTTCAAAATAACATAATCCTTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCCTAGGAT 5167

 31249826 TGACTGTAAAATTAAGTTTTCCCACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTACTGAATG 31249885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5168 TGACTGTAAAATTAAGTTTTCCCACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTACTGAATG 5227

 31249886 CCTACTATGTACCAGGCACAGTGCAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAATAATAT 31249945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5228 CCTACTATGTACCAGGCACAGTGCAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAATAATAT 5287

 31249946 ATACTTACTCACTTAGCACTTAAATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAACAGGTAT 31250005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5288 ATACTTACTCACTTAGCACTTAAATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAACAGGTAT 5347

 31250006 GTACAAGATAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATAT 31250065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5348 GTACAAGATAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATAT 5407

 31250066 AAGCCTGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAAC 31250125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5408 AAGCCTGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAAC 5467

 31250126 CTGCACAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAATAAAAAAAAAAAATTA 31250185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     5468 CTGCACAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAAT-AAAAAAAAAAATTA 5526

 31250186 AAAAAAAAAATTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTAGAAATGAGGTCTCG 31250245
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 AAAAAAAAATTTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTAGAAATGAGGTCTCG 5586

 31250246 CTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATCATAGCGCACTATAG 31250305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 CTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATCATAGCGCACTATAG 5646

 31250306 CCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTAC 31250365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 CCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTAC 5706

 31250366 AGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAACTTCTACCAGCTTTA 31250425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 AGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAACTTCTACCAGCTTTA 5766

 31250426 ATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAAGTGCTAAATTTTAA 31250485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 ATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAAGTGCTAAATTTTAA 5826

 31250486 ATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAATAGGGCTGGGCACAG 31250545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 ATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAATAGGGCTGGGCACAG 5886

 31250546 TGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTGAATCACTTGAGATC 31250605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 TGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTGAATCACTTGAGATC 5946

 31250606 AGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAGA 31250665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 AGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAGA 6006

 31250666 GATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGC 31250725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 GATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGC 6066

 31250726 AGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACTGCTCTC 31250785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 AGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACTGCTCTC 6126

 31250786 CAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTTAC 31250845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 CAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTTAC 6186

 31250846 AAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGAGGCTAGTACTTACA 31250905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 AAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGAGGCTAGTACTTACA 6246

 31250906 AAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCATCAGTTTAGGTCTT 31250965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 AAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCATCAGTTTAGGTCTT 6306

 31250966 TTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTATTTCACCTCCAACCC 31251025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 TTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTATTTCACCTCCAACCC 6366

 31251026 ACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAACTCCTGCTTGTACAG 31251085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 ACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAACTCCTGCTTGTACAG 6426

 31251086 AGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATACTCAGATCAATCTCA 31251145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 AGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATACTCAGATCAATCTCA 6486

 31251146 AACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACATCAGAATAACT 31251205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 AACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACATCAGAATAACT 6546

 31251206 AGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCCCCAGAAAAGTT 31251265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 AGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCCCCAGAAAAGTT 6606

 31251266 GGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGCATGTGTGTATGAAA 31251325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 GGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGCATGTGTGTATGAAA 6666

 31251326 GTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAAGTGTTCTTTAA 31251385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 GTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAAGTGTTCTTTAA 6726

 31251386 AAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTGGGTGTTCCCAA 31251445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 AAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTGGGTGTTCCCAA 6786

 31251446 GTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATATACACTACGTAATAT 31251505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 GTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATATACACTACGTAATAT 6846

 31251506 ACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACCTTTAATCACGG 31251565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6847 ACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACCTTTAATCACGG 6906

 31251566 ATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTTACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAA 31251625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     6907 ATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTCACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAA 6966

 31251626 GTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATACAGCTGAACAACTG 31251685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6967 GTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATACAGCTGAACAACTG 7026

 31251686 TGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAA 31251745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7027 TGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAA 7086

 31251746 ATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGA 31251805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7087 ATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGA 7146

 31251806 AAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATAC 31251865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7147 AAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATAC 7206

 31251866 AAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTG 31251903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7207 AAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTG 7244

Alignment time is 6.79843 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    6195] =>      6195 nucs 'mol-32-2f3e-011431_6195'

Score:        6096
Aligned:      6195        nucs
Identic:      6186 (100%) nucs =>      1172 (100%)      5014 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31251146,31252320] EXCISED REGION [31252326,31257344]
 second seq =>  [       1,    1175] EXCISED REGION [    1176,    6195]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [31252321,31252325]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31251146 AACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACATCAGAATAACT 31251205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACATCAGAATAACT 60

 31251206 AGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCCCCAGAAAAGTT 31251265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCCCCAGAAAAGTT 120

 31251266 GGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGCATGTGTGTATGAAA 31251325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGCATGTGTGTATGAAA 180

 31251326 GTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAAGTGTTCTTTAA 31251385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAAGTGTTCTTTAA 240

 31251386 AAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTGGGTGTTCCCAA 31251445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTGGGTGTTCCCAA 300

 31251446 GTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATATACACTACGTAATAT 31251505
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTCAAATACATTTGGGAAACACTGAGTTAAATAAAATACCAATATACACTACGTAATAT 360

 31251506 ACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACCTTTAATCACGG 31251565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACCTTTAATCACGG 420

 31251566 ATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTTACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAA 31251625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      421 ATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTCACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAA 480

 31251626 GTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATACAGCTGAACAACTG 31251685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATACAGCTGAACAACTG 540

 31251686 TGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAA 31251745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAA 600

 31251746 ATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGA 31251805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGA 660

 31251806 AAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATAC 31251865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATAC 720

 31251866 AAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATC 31251925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      721 AAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATCTAATC 780

 31251926 AAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGG 31251985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGG 840

 31251986 ACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGG 31252045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGG 900

 31252046 CCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTG 31252105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTG 960

 31252106 AAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATA 31252165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATA 1020

 31252166 CAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGG 31252225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGG 1080

 31252226 CAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGC 31252285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGC 1140

 31252286 ACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCT 31252320
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCT 1175

EXCISED REGION

 31252326 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGATA 31252385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGATA 1235

 31252386 TTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACTT 31252445
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 TTTATCTATAGTGACAAATATCGGTAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACTT 1295

 31252446 GGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTAG 31252505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 GGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTAG 1355

 31252506 TATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 31252565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 TATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 1415

 31252566 GCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAGA 31252625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 GCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAGA 1475

 31252626 TGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGCC 31252685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 TGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGCC 1535

 31252686 TGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGAG 31252745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 TGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGAG 1595

 31252746 GTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAAA 31252805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 GTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAAA 1655

 31252806 AAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTCAT 31252865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 AAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTCAT 1715

 31252866 GAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGTGA 31252925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 GAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGTGA 1775

 31252926 AAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGCAT 31252985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 AAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGCAT 1835

 31252986 GTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAGTC 31253045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 GTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAGTC 1895

 31253046 ACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCTTC 31253105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 ACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCTTC 1955

 31253106 ATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATAGC 31253165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 ATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATAGC 2015

 31253166 CTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCATTA 31253225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 CTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCATTA 2075

 31253226 AATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCTGA 31253285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 AATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCTGA 2135

 31253286 TTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTGTT 31253345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 TTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTGTT 2195

 31253346 TAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCAGG 31253405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 TAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCAGG 2255

 31253406 AACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACACTA 31253465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 AACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACACTA 2315

 31253466 GCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATAAG 31253525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 GCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATAAG 2375

 31253526 TGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTCTA 31253585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 TGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTCTA 2435

 31253586 TGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCACA 31253645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 TGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCACA 2495

 31253646 GAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCATT 31253705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 GAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCATT 2555

 31253706 ACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGACCT 31253765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 ACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGACCT 2615

 31253766 CAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTGGC 31253825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 CAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTGGC 2675

 31253826 AAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAATTA 31253885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 AAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAATTA 2735

 31253886 AACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGAAT 31253945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 AACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGAAT 2795

 31253946 GGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAAGG 31254005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 GGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAAGG 2855

 31254006 AACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAACAA 31254065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 AACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAACAA 2915

 31254066 ACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACATC 31254125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 ACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACATC 2975

 31254126 ACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTGAG 31254185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 ACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTGAG 3035

 31254186 AAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGCAA 31254245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 AAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGCAA 3095

 31254246 TTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTGGA 31254305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 TTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTGGA 3155

 31254306 GAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAAAG 31254365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 GAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAAAG 3215

 31254366 GAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTATGT 31254425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 GAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTATGT 3275

 31254426 ACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATATAC 31254485
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 ACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATATAC 3335

 31254486 ATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATGGAT 31254545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 ATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATGGAT 3395

 31254546 GCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTGCAT 31254605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 GCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTGCAT 3455

 31254606 GTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAGCAA 31254665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 GTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAGCAA 3515

 31254666 TAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAAAAG 31254725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 TAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAAAAG 3575

 31254726 TTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAACCTT 31254785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 TTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAACCTT 3635

 31254786 AGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGTAACCCCTGAATCTAAA 31254845
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3636 AGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGTACCCCCTGAATCTAAA 3695

 31254846 ATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTCTTT 31254905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 ATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTCTTT 3755

 31254906 ACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAATCTGGCAGTCTCATTCA 31254965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 ACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAATCTGGCAGTCTCATTCA 3815

 31254966 TTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTACCCAGCACTTTGGAGGC 31255025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 TTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTACCCAGCACTTTGGAGGC 3875

 31255026 CAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCTGAGCAATATAGCGAGA 31255085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 CAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCTGAGCAATATAGCGAGA 3935

 31255086 CCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCATTTGCCTGTAATCTCAG 31255145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 CCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCATTTGCCTGTAATCTCAG 3995

 31255146 GTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAG 31255205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 GTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAG 4055

 31255206 CTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGCTCCTGTTTCAAAAAAA 31255265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 CTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGCTCCTGTTTCAAAAAAA 4115

 31255266 AGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAGAATCAAGGGGCCGGGC 31255325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 AGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAGAATCAAGGGGCCGGGC 4175

 31255326 GTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGAGA 31255385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 GTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGAGA 4235

 31255386 TCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAATACAA 31255445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 TCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAATACAA 4295

 31255446 AAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA 31255505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4296 AAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA 4355

 31255506 GCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCAC 31255565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4356 GCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCAC 4415

 31255566 TCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTC-AAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGGA 31255624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     4416 TCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGGA 4475

 31255625 AACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAAGGTAAATGATTAATA 31255684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4476 AACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAAGGTAAATGATTAATA 4535

 31255685 TCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTTAATCCAAAAATTCATC 31255744
          ||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4536 TCAGCAATTCGTGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTTAATCCAAAAATTCATC 4595

 31255745 TACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACACTAAAAATATTTTATC 31255804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 TACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACACTAAAAATATTTTATC 4655

 31255805 TCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTAGCAAACTTAAAATTA 31255864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 TCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTAGCAAACTTAAAATTA 4715

 31255865 TCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCAAGTCCCTAGGTTCCC 31255924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4716 TCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCAAGTCCCTAGGTTCCC 4775

 31255925 AAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAATAAACTTACCCTTGG 31255984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4776 AAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAATAAACTTACCCTTGG 4835

 31255985 AGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCATTGGCAAAAGTACTCC 31256044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4836 AGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCATTGGCAAAAGTACTCC 4895

 31256045 TTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGCGTAATATTTTCTTCT 31256104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4896 TTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGCGTAATATTTTCTTCT 4955

 31256105 AAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAACCACAAAAATTTATAT 31256164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4956 AAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAACCACAAAAATTTATAT 5015

 31256165 ACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAACCAGAGAAAAAGGAA 31256224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5016 ACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAACCAGAGAAAAAGGAA 5075

 31256225 ATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGACTAGTAAAGAAAAGCA 31256284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5076 ATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGACTAGTAAAGAAAAGCA 5135

 31256285 GAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACTTAAAATGATCTACTG 31256344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5136 GAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACTTAAAATGATCTACTG 5195

 31256345 ATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTTTAGAATTAAAACTCA 31256404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5196 ATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTTTAGAATTAAAACTCA 5255

 31256405 TTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATGGCAATAGGGTTTCAT 31256464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5256 TTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATGGCAATAGGGTTTCAT 5315

 31256465 TCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATCTACAAAATTAACCTG 31256524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5316 TCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATCTACAAAATTAACCTG 5375

 31256525 ACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTTACTGCTCTGGTGTTG 31256584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5376 ACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTTACTGCTCTGGTGTTG 5435

 31256585 TTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATATTTAGCCTATCTCATG 31256644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5436 TTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATATTTAGCCTATCTCATG 5495

 31256645 AAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTACAAGATCACCTGGGAC 31256704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5496 AAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTACAAGATCACCTGGGAC 5555

 31256705 ACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGGAATGTTTAACATCAA 31256764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5556 ACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGGAATGTTTAACATCAA 5615

 31256765 GAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAAATGTGAACAGTAACC 31256824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5616 GAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAAATGTGAACAGTAACC 5675

 31256825 CTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAGTCCTGCTGCTGCCCA 31256884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5676 CTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAGTCCTGCTGCTGCCCA 5735

 31256885 GTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAAGGGGAAAAAAAGACA 31256944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5736 GTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAAGGGGAAAAAAAGACA 5795

 31256945 TTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCATGATAAAATCATGCT 31257004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5796 TTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCATGATAAAATCATGCT 5855

 31257005 GTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATATCACTGCCTTACCCA 31257064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5856 GTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATATCACTGCCTTACCCA 5915

 31257065 ACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGCAGCGGTAGGTTGATG 31257124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5916 ACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGCAGCGGTAGGTTGATG 5975

 31257125 GGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTATAAAGCTGACCAAACA 31257184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5976 GGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTATAAAGCTGACCAAACA 6035

 31257185 GGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGTCTGTAGGGAAAGCAT 31257244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6036 GGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGTCTGTAGGGAAAGCAT 6095

 31257245 TCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCATCCTTTATCTACTCTA 31257304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6096 TCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCATCCTTTATCTACTCTA 6155

 31257305 TGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAG 31257344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6156 TGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAG 6195

Alignment time is 5.51061 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    6839] =>      6839 nucs 'mol-32-2fee-066039_6839'

Score:        6734
Aligned:      6833        nucs
Identic:      6824 (100%) nucs =>      3581 (100%)      3243 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31243162,31246747] EXCISED REGION [31251770,31255016]
 second seq =>  [       1,    3586] EXCISED REGION [    3594,    6839]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5022 nucs [31246748,31251769]
 second seq =>         7 nucs [3587,3593]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [3585,3586] to [3592,3593]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246748,31246748] to [31251769,31251769]
 second seq =>         0 nucs

 31243162 TCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTTCAAGTAGAAGTTA 31243221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTTCAAGTAGAAGTTA 60

 31243222 GAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAACAGTTTCTCATCCC 31243281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAACAGTTTCTCATCCC 120

 31243282 CATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAATTACTATTAAGGC 31243341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAATTACTATTAAGGC 180

 31243342 TTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTACAGCATGGCTGTA 31243401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTACAGCATGGCTGTA 240

 31243402 AAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTTCTAAGAATCTTAA 31243461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTTCTAAGAATCTTAA 300

 31243462 GAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAATCTTGATGATGTGC 31243521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAATCTTGATGATGTGC 360

 31243522 ACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGGTGTTGTTTCAAAA 31243581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGGTGTTGTTTCAAAA 420

 31243582 TACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAATGTGGGTGGGCCTC 31243641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAATGTGGGTGGGCCTC 480

 31243642 TGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAGTTTTAAAAAACAT 31243701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAGTTTTAAAAAACAT 540

 31243702 TATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAACAGGCTTTTGGACT 31243761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAACAGGCTTTTGGACT 600

 31243762 CTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAAAAAATGACCATTT 31243821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAAAAAATGACCATTT 660

 31243822 CTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGCCAGGGAGAATCAT 31243881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGCCAGGGAGAATCAT 720

 31243882 TATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCAAAATTTCTATG 31243941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCAAAATTTCTATG 780

 31243942 GACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATGTTTACTGCAGC 31244001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATGTTTACTGCAGC 840

 31244002 TATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAG 31244061
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATTCTATGACTGCCTCTTCATTTTATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAG 900

 31244062 AAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGG 31244121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGG 960

 31244122 TAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACA 31244181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACA 1020

 31244182 TAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCA 31244241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCA 1080

 31244242 CAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACT 31244301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACT 1140

 31244302 GGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTT 31244361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTT 1200

 31244362 TTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCT 31244421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCT 1260

 31244422 CTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGG 31244481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGG 1320

 31244482 TCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCC 31244541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCC 1380

 31244542 TCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGC 31244601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGC 1440

 31244602 AACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAA 31244661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAA 1500

 31244662 ATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATT 31244721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATT 1560

 31244722 ATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAA 31244781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAA 1620

 31244782 TGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTG 31244841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTG 1680

 31244842 CAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTC 31244901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTC 1740

 31244902 TAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAA 31244961
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTCCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAA 1800

 31244962 TTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGAT 31245021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGAT 1860

 31245022 TCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATT 31245081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATT 1920

 31245082 GAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTG 31245141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTG 1980

 31245142 ATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAG 31245201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAG 2040

 31245202 ACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCT 31245261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCT 2100

 31245262 TTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTG 31245321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTG 2160

 31245322 TGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGA 31245381
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGGTATTTTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGA 2220

 31245382 AATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCT 31245441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCT 2280

 31245442 CCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTC 31245501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTC 2340

 31245502 CCCACCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATT 31245561
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCCAGCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATT 2400

 31245562 CCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCC 31245621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCC 2460

 31245622 ATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTG 31245681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTG 2520

 31245682 TATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCAT 31245741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCAT 2580

 31245742 ATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAA 31245801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAA 2640

 31245802 CATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATG 31245861
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2641 CATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATG 2700

 31245862 GTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTA 31245921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTA 2760

 31245922 ATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGG 31245981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGG 2820

 31245982 ACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTA 31246041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTA 2880

 31246042 CTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTG 31246101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTG 2940

 31246102 CCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCA 31246161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCA 3000

 31246162 GATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTA 31246221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTA 3060

 31246222 ACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCA 31246281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCA 3120

 31246282 CTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTT 31246341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTT 3180

 31246342 TTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGT 31246401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGT 3240

 31246402 CATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGA 31246461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGA 3300

 31246462 GTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGC 31246521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGC 3360

 31246522 CCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCA 31246581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCA 3420

 31246582 GCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCT 31246641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCT 3480

 31246642 GTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTT 31246701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTT 3540

 31246702 TGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 3586

EXCISED REGION

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 3653

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 3713

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 3773

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 3833

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 3893

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31252129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 3953

 31252130 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 31252189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 4013

 31252190 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31252249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 4073

 31252250 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 31252309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 4133

 31252310 AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 31252369
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 AAACTCCATCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 4192

 31252370 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 31252429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 4252

 31252430 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 31252489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 4312

 31252490 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 31252549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 4372

 31252550 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 31252609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 4432

 31252610 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 31252669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 4492

 31252670 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 31252729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 4552

 31252730 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 31252789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 4612

 31252790 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 31252849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 4672

 31252850 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 31252909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 4732

 31252910 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 31252969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 4792

 31252970 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 31253029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 4852

 31253030 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 31253089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 4912

 31253090 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 31253149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 4972

 31253150 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 31253209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 5032

 31253210 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 31253269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 5092

 31253270 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 31253329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 5152

 31253330 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 31253389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 5212

 31253390 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 31253449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 5272

 31253450 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 31253509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 5332

 31253510 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 31253569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 5392

 31253570 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 31253629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 5452

 31253630 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 31253689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 5512

 31253690 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 31253749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5513 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 5572

 31253750 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 31253809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5573 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 5632

 31253810 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 31253869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5633 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 5692

 31253870 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 31253929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5693 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 5752

 31253930 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 31253989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5753 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 5812

 31253990 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 31254049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5813 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 5872

 31254050 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 31254109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5873 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 5932

 31254110 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 31254169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5933 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 5992

 31254170 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 31254229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5993 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 6052

 31254230 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 31254289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6053 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 6112

 31254290 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 31254349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6113 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 6172

 31254350 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 31254409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6173 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 6232

 31254410 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAA 31254469
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     6233 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAA 6292

 31254470 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 31254529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6293 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 6352

 31254530 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 31254589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6353 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 6412

 31254590 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 31254649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6413 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 6472

 31254650 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 31254709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6473 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 6532

 31254710 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 31254769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6533 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 6592

 31254770 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 31254829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6593 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 6652

 31254830 AACCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 31254889
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6653 ACCCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 6712

 31254890 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAAT 31254949
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     6713 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAACATAGAATCTACAAAAGTAAT 6772

 31254950 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 31255009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6773 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 6832

 31255010 CCAGCAC 31255016
          |||||||
     6833 CCAGCAC 6839

Alignment time is 6.5389 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3246] =>      3246 nucs 'mol-32-2fee-066039_3246'

Score:        3213
Aligned:      3246        nucs
Identic:      3243 (100%) nucs =>       552 (100%)      2691 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31251770,31252321] EXCISED REGION [31252323,31255016]
 second seq =>  [       1,     552] EXCISED REGION [     553,    3246]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31252322,31252322]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31254455,31254455]
 second seq =>         1 nucs [2685,2685]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [31252322,31252341] to [31252323,31252342]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 60

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 120

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 180

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 240

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 300

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31252129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 360

 31252130 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 31252189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 420

 31252190 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31252249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 480

 31252250 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 31252309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 540

 31252310 AAACTCCATCTC 31252321
          ||||||||||||
      541 AAACTCCATCTC 552

EXCISED REGION

 31252323 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATG 31252382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      553 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATG 612

 31252383 ATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAA 31252442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      613 ATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAA 672

 31252443 CTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCAC 31252502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      673 CTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCAC 732

 31252503 TAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG 31252562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      733 TAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG 792

 31252563 GAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCA 31252622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      793 GAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCA 852

 31252623 AGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGC 31252682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      853 AGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGC 912

 31252683 GCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCA 31252742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      913 GCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCA 972

 31252743 GAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAA 31252802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      973 GAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAA 1032

 31252803 AAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGT 31252862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1033 AAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGT 1092

 31252863 CATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGG 31252922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 CATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGG 1152

 31252923 TGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTG 31252982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 TGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTG 1212

 31252983 CATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAA 31253042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 CATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAA 1272

 31253043 GTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTC 31253102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 GTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTC 1332

 31253103 TTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGAT 31253162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 TTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGAT 1392

 31253163 AGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCA 31253222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1393 AGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCA 1452

 31253223 TTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACC 31253282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1453 TTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACC 1512

 31253283 TGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCT 31253342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1513 TGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCT 1572

 31253343 GTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGC 31253402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 GTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGC 1632

 31253403 AGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACA 31253462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 AGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACA 1692

 31253463 CTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATAT 31253522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 CTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATAT 1752

 31253523 AAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTT 31253582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 AAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTT 1812

 31253583 CTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGC 31253642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 CTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGC 1872

 31253643 ACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACC 31253702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 ACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACC 1932

 31253703 ATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGA 31253762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 ATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGA 1992

 31253763 CCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTT 31253822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 CCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTT 2052

 31253823 GGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAA 31253882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 GGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAA 2112

 31253883 TTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAG 31253942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 TTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAG 2172

 31253943 AATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATA 31254002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 AATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATA 2232

 31254003 AGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAA 31254062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 AGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAA 2292

 31254063 CAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAAC 31254122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 CAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAAC 2352

 31254123 ATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGT 31254182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 ATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGT 2412

 31254183 GAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGG 31254242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 GAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGG 2472

 31254243 CAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTT 31254302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 CAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTT 2532

 31254303 GGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTA 31254362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 GGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTA 2592

 31254363 AAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTA 31254422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 AAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTA 2652

 31254423 TGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATA 31254482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2653 TGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATA 2712

 31254483 TACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATG 31254542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 TACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATG 2772

 31254543 GATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTG 31254602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 GATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTG 2832

 31254603 CATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAG 31254662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 CATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAG 2892

 31254663 CAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAA 31254722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 CAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAA 2952

 31254723 AAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAAC 31254782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 AAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAAC 3012

 31254783 CTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGTAACCCCTGAATCT 31254842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3013 CTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGTACCCCCTGAATCT 3072

 31254843 AAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTC 31254902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 AAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTC 3132

 31254903 TTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAATCTGGCAGTCTCAT 31254962
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 TTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAACATAGAATCTACAAAAGTAATCTGGCAGTCTCAT 3192

 31254963 TCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTACCCAGCAC 31255016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 TCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTACCCAGCAC 3246

Alignment time is 2.99785 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2377] =>      2377 nucs 'mol-32-2fee-206073_2377'

Score:        2332
Aligned:      2376        nucs
Identic:      2372 (100%) nucs =>       111 (100%)      2261 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31245395,31245505] EXCISED REGION [31245507,31247771]
 second seq =>  [       1,     111] EXCISED REGION [     113,    2377]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31245506,31245506]
 second seq =>         1 nucs [112,112]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31245506,31245507] to [31245507,31245508]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31245503,31245505] to [31245507,31245509]
 second seq =>         3 nucs [109,111] to [113,115]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31245395 TAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGT 31245454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGT 60

 31245455 AGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCA 31245505
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCA 111

EXCISED REGION

 31245507 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 31245566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      113 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 172

 31245567 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 31245626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      173 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 232

 31245627 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 31245686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      233 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 292

 31245687 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 31245746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      293 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 352

 31245747 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 31245806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      353 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 412

 31245807 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 31245866
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      413 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 472

 31245867 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 31245926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      473 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 532

 31245927 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 31245986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      533 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 592

 31245987 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 31246046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 652

 31246047 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 31246106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 712

 31246107 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 31246166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 772

 31246167 TTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 31246226
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 832

 31246227 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 31246286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 892

 31246287 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 31246346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 952

 31246347 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 31246406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 1012

 31246407 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 31246466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 1072

 31246467 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 31246526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 1132

 31246527 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 31246586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 1192

 31246587 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 31246646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 1252

 31246647 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 31246706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 1312

 31246707 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 31246766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 1372

 31246767 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 31246826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 1432

 31246827 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 31246886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 1492

 31246887 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 31246946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 1552

 31246947 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 31247006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 1612

 31247007 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 31247066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 1672

 31247067 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 31247126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 1732

 31247127 TGTTAGGCTACCAGACTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 31247186
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 TGTTAGGCTACCAGATTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 1792

 31247187 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 31247246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 1852

 31247247 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 31247306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 1912

 31247307 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 31247366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 1972

 31247367 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 31247426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 2032

 31247427 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 31247486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 2092

 31247487 TTTATATGCCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTA 31247546
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 TTTATATACCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTA 2152

 31247547 GTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTT 31247606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 GTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTT 2212

 31247607 TCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTA 31247666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 TCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTA 2272

 31247667 GTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGT 31247726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 GTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGT 2332

 31247727 GAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTC 31247771
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 GAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTC 2377

Alignment time is 2.18553 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    6757] =>      6757 nucs 'mol-32-2ff9-165426_6757'

Score:        6681
Aligned:      6760        nucs
Identic:      6752 (100%) nucs =>      1721 (100%)      5031 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31250599,31252321] EXCISED REGION [31252326,31257362]
 second seq =>  [       1,    1722] EXCISED REGION [    1723,    6757]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [31252322,31252325]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [31252322,31252338] to [31252326,31252342]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31252322,31252323] to [31252324,31252325]
 second seq =>         0 nucs

 31250599 TGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAA 31250658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAA 60

 31250659 TACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAGGAGGCTG 31250718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAGGAGGCTG 120

 31250719 AGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCAC 31250778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCAC 180

 31250779 TGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAA 31250838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
      181 TGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAA- 239

 31250839 GTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGAGGCTAGT 31250898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 GTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGAGGCTAGT 299

 31250899 ACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCATCAGTTT 31250958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 ACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCATCAGTTT 359

 31250959 AGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTATTTCACCT 31251018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 AGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTATTTCACCT 419

 31251019 CCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAACTCCTGCT 31251078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 CCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAACTCCTGCT 479

 31251079 TGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATACTCAGATC 31251138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATACTCAGATC 539

 31251139 AATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACATCAG 31251198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 AATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACATCAG 599

 31251199 AATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCCCCAG 31251258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 AATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCCCCAG 659

 31251259 AAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGCATGTGTG 31251318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 AAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGCATGTGTG 719

 31251319 TATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAAGTGT 31251378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAAGTGT 779

 31251379 TCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTGGGTG 31251438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTGGGTG 839

 31251439 TTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATATACACTAC 31251498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATATACACTAC 899

 31251499 GTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACCTTTA 31251558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACCTTTA 959

 31251559 ATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTTACAAAAATACAGTGTGA 31251618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      960 ATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTCACAAAAATACAGTGTGA 1019

 31251619 GAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATACAGCTGA 31251678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATACAGCTGA 1079

 31251679 ACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCCAGAA 31251738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCCAGAA 1139

 31251739 GACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTG 31251798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTG 1199

 31251799 TTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAA 31251858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAA 1259

 31251859 ATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAA 31251918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAA 1319

 31251919 TATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAA 31251978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAA 1379

 31251979 AAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAG 31252038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 AAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAG 1439

 31252039 AGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGA 31252098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGA 1499

 31252099 TCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACC 31252158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACC 1559

 31252159 AAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAG 31252218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAG 1619

 31252219 GCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTG 31252278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTG 1679

 31252279 ATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCTC 31252321
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 ATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCTC 1722

EXCISED REGION

 31252326 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGATA 31252385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGATA 1782

 31252386 TTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACTT 31252445
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 TTTATCTATAGTGACAAATATCGGTAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACTT 1842

 31252446 GGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTAG 31252505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 GGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTAG 1902

 31252506 TATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 31252565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 TATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 1962

 31252566 GCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAGA 31252625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 GCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAGA 2022

 31252626 TGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGCC 31252685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 TGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGCC 2082

 31252686 TGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGAG 31252745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 TGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGAG 2142

 31252746 GTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAAA 31252805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 GTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAAA 2202

 31252806 AAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTCAT 31252865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 AAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTCAT 2262

 31252866 GAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGTGA 31252925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 GAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGTGA 2322

 31252926 AAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGCAT 31252985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 AAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGCAT 2382

 31252986 GTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAGTC 31253045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 GTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAGTC 2442

 31253046 ACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCTTC 31253105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 ACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCTTC 2502

 31253106 ATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATAGC 31253165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 ATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATAGC 2562

 31253166 CTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCATTA 31253225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 CTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCATTA 2622

 31253226 AATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCTGA 31253285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 AATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCTGA 2682

 31253286 TTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTGTT 31253345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 TTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTGTT 2742

 31253346 TAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCAGG 31253405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 TAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCAGG 2802

 31253406 AACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACACTA 31253465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 AACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACACTA 2862

 31253466 GCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATAAG 31253525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 GCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATAAG 2922

 31253526 TGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTCTA 31253585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 TGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTCTA 2982

 31253586 TGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCACA 31253645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 TGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCACA 3042

 31253646 GAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCATT 31253705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 GAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCATT 3102

 31253706 ACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGACCT 31253765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 ACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGACCT 3162

 31253766 CAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTGGC 31253825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 CAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTGGC 3222

 31253826 AAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAATTA 31253885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 AAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAATTA 3282

 31253886 AACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGAAT 31253945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 AACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGAAT 3342

 31253946 GGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAAGG 31254005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 GGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAAGG 3402

 31254006 AACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAACAA 31254065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 AACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAACAA 3462

 31254066 ACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACATC 31254125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 ACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACATC 3522

 31254126 ACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTGAG 31254185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 ACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTGAG 3582

 31254186 AAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGCAA 31254245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 AAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGCAA 3642

 31254246 TTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTGGA 31254305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 TTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTGGA 3702

 31254306 GAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAAAG 31254365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 GAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAAAG 3762

 31254366 GAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTATGT 31254425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 GAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTATGT 3822

 31254426 ACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATATAC 31254485
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 ACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATATAC 3882

 31254486 ATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATGGAT 31254545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 ATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATGGAT 3942

 31254546 GCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTGCAT 31254605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 GCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTGCAT 4002

 31254606 GTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAGCAA 31254665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 GTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAGCAA 4062

 31254666 TAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAAAAG 31254725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 TAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAAAAG 4122

 31254726 TTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAACCTT 31254785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 TTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAACCTT 4182

 31254786 AGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGTAACCCCTGAATCTAAA 31254845
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4183 AGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGTACCCCCTGAATCTAAA 4242

 31254846 ATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTCTTT 31254905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4243 ATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTCTTT 4302

 31254906 ACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAATCTGGCAGTCTCATTCA 31254965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 ACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAATCTGGCAGTCTCATTCA 4362

 31254966 TTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTACCCAGCACTTTGGAGGC 31255025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 TTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTACCCAGCACTTTGGAGGC 4422

 31255026 CAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCTGAGCAATATAGCGAGA 31255085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 CAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCTGAGCAATATAGCGAGA 4482

 31255086 CCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCATTTGCCTGTAATCTCAG 31255145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4483 CCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCATTTGCCTGTAATCTCAG 4542

 31255146 GTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAG 31255205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 GTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAG 4602

 31255206 CTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGCTCCTGTTTCAAAAAAA 31255265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 CTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGCTCCTGTTTCAAAAAAA 4662

 31255266 AGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAGAATCAAGGGGCCGGGC 31255325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4663 AGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAGAATCAAGGGGCCGGGC 4722

 31255326 GTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGAGA 31255385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 GTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGAGA 4782

 31255386 TCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAATACAA 31255445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4783 TCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAATACAA 4842

 31255446 AAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA 31255505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4843 AAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA 4902

 31255506 GCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCAC 31255565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4903 GCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCAC 4962

 31255566 TCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGGAA 31255625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     4963 TCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTC--AAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGGAA 5020

 31255626 ACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAAGGTAAATGATTAATAT 31255685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 ACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAAGGTAAATGATTAATAT 5080

 31255686 CAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTTAATCCAAAAATTCATCT 31255745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5081 CAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTTAATCCAAAAATTCATCT 5140

 31255746 ACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACACTAAAAATATTTTATCT 31255805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 ACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACACTAAAAATATTTTATCT 5200

 31255806 CATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTAGCAAACTTAAAATTAT 31255865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 CATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTAGCAAACTTAAAATTAT 5260

 31255866 CCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCAAGTCCCTAGGTTCCCA 31255925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 CCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCAAGTCCCTAGGTTCCCA 5320

 31255926 AGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAATAAACTTACCCTTGGA 31255985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 AGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAATAAACTTACCCTTGGA 5380

 31255986 GCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCATTGGCAAAAGTACTCCT 31256045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 GCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCATTGGCAAAAGTACTCCT 5440

 31256046 TTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGCGTAATATTTTCTTCTA 31256105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 TTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGCGTAATATTTTCTTCTA 5500

 31256106 AAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAACCACAAAAATTTATATA 31256165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5501 AAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAACCACAAAAATTTATATA 5560

 31256166 CTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAACCAGAGAAAAAGGAAA 31256225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 CTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAACCAGAGAAAAAGGAAA 5620

 31256226 TAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGACTAGTAAAGAAAAGCAG 31256285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5621 TAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGACTAGTAAAGAAAAGCAG 5680

 31256286 AAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACTTAAAATGATCTACTGA 31256345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5681 AAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACTTAAAATGATCTACTGA 5740

 31256346 TAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTTTAGAATTAAAACTCAT 31256405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5741 TAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTTTAGAATTAAAACTCAT 5800

 31256406 TTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATGGCAATAGGGTTTCATT 31256465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5801 TTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATGGCAATAGGGTTTCATT 5860

 31256466 CAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATCTACAAAATTAACCTGA 31256525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5861 CAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATCTACAAAATTAACCTGA 5920

 31256526 CAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTTACTGCTCTGGTGTTGT 31256585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5921 CAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTTACTGCTCTGGTGTTGT 5980

 31256586 TTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATATTTAGCCTATCTCATGA 31256645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5981 TTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATATTTAGCCTATCTCATGA 6040

 31256646 AGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTACAAGATCACCTGGGACA 31256705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6041 AGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTACAAGATCACCTGGGACA 6100

 31256706 CACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGGAATGTTTAACATCAAG 31256765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6101 CACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGGAATGTTTAACATCAAG 6160

 31256766 AAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAAATGTGAACAGTAACCC 31256825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6161 AAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAAATGTGAACAGTAACCC 6220

 31256826 TTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAGTCCTGCTGCTGCCCAG 31256885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6221 TTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAGTCCTGCTGCTGCCCAG 6280

 31256886 TTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAAGGGGAAAAAAAGACAT 31256945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6281 TTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAAGGGGAAAAAAAGACAT 6340

 31256946 TTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCATGATAAAATCATGCTG 31257005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6341 TTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCATGATAAAATCATGCTG 6400

 31257006 TTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATATCACTGCCTTACCCAA 31257065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6401 TTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATATCACTGCCTTACCCAA 6460

 31257066 CAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGCAGCGGTAGGTTGATGG 31257125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6461 CAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGCAGCGGTAGGTTGATGG 6520

 31257126 GATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTATAAAGCTGACCAAACAG 31257185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6521 GATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTATAAAGCTGACCAAACAG 6580

 31257186 GTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGTCTGTAGGGAAAGCATT 31257245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6581 GTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGTCTGTAGGGAAAGCATT 6640

 31257246 CTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCATCCTTTATCTACTCTAT 31257305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6641 CTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCATCCTTTATCTACTCTAT 6700

 31257306 GTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATTTAACTGAATGTAAA 31257362
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6701 GTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATTTAACTGAATGTAAA 6757

Alignment time is 6.46602 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    9746] =>      9746 nucs 'mol-32-3004-199058_9746'

Score:        9571
Aligned:      9746        nucs
Identic:      9726 (100%) nucs =>      4636 (100%)      5090 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31242104,31246747] EXCISED REGION [31251770,31256869]
 second seq =>  [       1,    4644] EXCISED REGION [    4652,    9746]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5022 nucs [31246748,31251769]
 second seq =>         7 nucs [4645,4651]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [4643,4644] to [4650,4651]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246748,31246748] to [31251769,31251769]
 second seq =>         0 nucs

 31242104 TCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACATGGACACAGGAAGGGGAATATCA 31242163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACATGGACACAGGAAGGGGAATATCA 60

 31242164 CACTCTGGGGACTGTTGTGTGGTGGGGGTAGAGGGGAGGGATAACATTGGGAGATATACC 31242223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACTCTGGGGACTGTTGTGTGGTGGGGGTAGAGGGGAGGGATAACATTGGGAGATATACC 120

 31242224 TAATGCTAGATGACGAGTTAGTGGGTGCAGCGCACCAGCGTGGCACATGTATACATATGT 31242283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATGCTAGATGACGAGTTAGTGGGTGCAGCGCACCAGCGTGGCACATGTATACATATGT 180

 31242284 AACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAAAAAAA-TTT 31242342
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
      181 AACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAAAAAAAATTT 240

 31242343 AAAAAA-TTAAAAAAAAAAGTAAAAGAATCCAAAGAGATACCATGCAGATACTAATCATT 31242401
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAAAATTAAAAAAAAAAGTAAAAGAATCCAAAGAGATACCATGCAGATACTAATCATT 300

 31242402 AAGAAAACTGGAGGGAGCTATATTACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAAACATGAGATAA 31242461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAAAACTGGAGGGAGCTATATTACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAAACATGAGATAA 360

 31242462 TACTAGCAGTATTGAGAAATATTTCATAATGATGTAAGAATCAATTATACATATGTAACT 31242521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACTAGCAGTATTGAGAAATATTTCATAATGATGTAAGAATCAATTATACATATGTAACT 420

 31242522 AACCTGCACAACGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAATATAATAATAAAAAAAAAAACA 31242581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACCTGCACAACGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAATATAATAATAAAAAAAAAAACA 480

 31242582 TACACACACACACACACAAAAAAAAAACAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGT 31242641
          ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACACACACACACACA--AAAAAAAAACAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGT 538

 31242642 GAGCAGAAGCTGGAAGTGACTTAAGAAGACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGA 31242701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 GAGCAGAAGCTGGAAGTGACTTAAGAAGACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGA 598

 31242702 AAACCTTATGGTGGATAGATGAATAACTCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGT 31242761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 AAACCTTATGGTGGATAGATGAATAACTCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGT 658

 31242762 TCCTCACATGAAATAGAAAAGACAAAATAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCC 31242821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 TCCTCACATGAAATAGAAAAGACAAAATAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCC 718

 31242822 CAACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGG 31242881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 CAACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGG 778

 31242882 CCAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACTGAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCG 31242941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 CCAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACTGAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCG 838

 31242942 GGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAT 31243001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 GGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAT 898

 31243002 GTGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAG 31243061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 GTGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAG 958

 31243062 ACTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATACCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGAT 31243121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 ACTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATACCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGAT 1018

 31243122 TTCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGGTCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACAC 31243181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 TTCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGGTCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACAC 1078

 31243182 AAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTTCAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAAC 31243241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 AAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTTCAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAAC 1138

 31243242 CAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAACAGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAAT 31243301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 CAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAACAGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAAT 1198

 31243302 GTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAATTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAA 31243361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 GTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAATTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAA 1258

 31243362 AGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTACAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGA 31243421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 AGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTACAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGA 1318

 31243422 AAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTTCTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCT 31243481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 AAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTTCTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCT 1378

 31243482 GTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAATCTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGA 31243541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 GTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAATCTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGA 1438

 31243542 CAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGGTGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAA 31243601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 CAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGGTGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAA 1498

 31243602 GAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAATGTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTAC 31243661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAATGTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTAC 1558

 31243662 AATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAGTTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAA 31243721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 AATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAGTTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAA 1618

 31243722 GGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAACAGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGA 31243781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 GGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAACAGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGA 1678

 31243782 AAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAAAAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACT 31243841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAAAAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACT 1738

 31243842 CTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGCCAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGC 31243901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 CTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGCCAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGC 1798

 31243902 CTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTT 31243961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTT 1858

 31243962 TCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTC 31244021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTC 1918

 31244022 ATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTAC 31244081
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ATTTTATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTAC 1978

 31244082 TTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATA 31244141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATA 2038

 31244142 ATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATT 31244201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 ATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATT 2098

 31244202 TGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTT 31244261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTT 2158

 31244262 CCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCT 31244321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCT 2218

 31244322 TTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGA 31244381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGA 2278

 31244382 CGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAA 31244441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2279 CGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGGAGCCGGAAGCCACAA 2338

 31244442 TAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCC 31244501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCC 2398

 31244502 ACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACC 31244561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACC 2458

 31244562 AGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTG 31244621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTG 2518

 31244622 GGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACA 31244681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 GGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACA 2578

 31244682 CCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGT 31244741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGT 2638

 31244742 AACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTA 31244801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 AACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTA 2698

 31244802 CAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTT 31244861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 CAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTT 2758

 31244862 CATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAAC 31244921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 CATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAAC 2818

 31244922 AATTTTTCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTA 31244981
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AATTTTCCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTA 2878

 31244982 CTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTC 31245041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTC 2938

 31245042 AGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACA 31245101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 AGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACA 2998

 31245102 AATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAA 31245161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 AATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAA 3058

 31245162 AAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAA 31245221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAA 3118

 31245222 CTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATT 31245281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 CTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATT 3178

 31245282 TTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCA 31245341
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3179 TTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTTTGATACTTGTCA 3238

 31245342 TTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAA 31245401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 TTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAA 3298

 31245402 AGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTG 31245461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 AGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTG 3358

 31245462 CACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACT 31245521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3359 CACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACT 3418

 31245522 ATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCC 31245581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 ATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCC 3478

 31245582 TGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAG 31245641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAG 3538

 31245642 AATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATT 31245701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 AATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATT 3598

 31245702 TATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAG 31245761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAG 3658

 31245762 TGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTT 31245821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTT 3718

 31245822 TGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATT 31245881
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATT 3778

 31245882 TTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAG 31245941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAG 3838

 31245942 TGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGG 31246001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGG 3898

 31246002 TAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCC 31246061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCC 3958

 31246062 CTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTT 31246121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 CTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTT 4018

 31246122 GAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTG 31246181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 GAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTG 4078

 31246182 CTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAG 31246241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 CTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAG 4138

 31246242 TTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTG 31246301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 TTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTG 4198

 31246302 TATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCT 31246361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 TATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCT 4258

 31246362 TTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTG 31246421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTG 4318

 31246422 TATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACA 31246481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACA 4378

 31246482 GGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATG 31246541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 GGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATG 4438

 31246542 TCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGA 31246601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 TCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGA 4498

 31246602 TTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATG 31246661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 TTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATG 4558

 31246662 CTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATT 31246721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 CTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATT 4618

 31246722 ACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          ||||||||||||||||||||||||||
     4619 ACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 4644

EXCISED REGION

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4652 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 4711

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4712 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 4771

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4772 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 4831

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4832 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 4891

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4892 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 4951

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31252129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4952 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 5011

 31252130 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 31252189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5012 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 5071

 31252190 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31252249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5072 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 5131

 31252250 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 31252309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5132 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 5191

 31252310 AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 31252369
          ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5192 AAACTCCATCTC-----AAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 5246

 31252370 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 31252429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5247 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 5306

 31252430 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 31252489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5307 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 5366

 31252490 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 31252549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5367 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 5426

 31252550 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 31252609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5427 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 5486

 31252610 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 31252669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5487 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 5546

 31252670 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 31252729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5547 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 5606

 31252730 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 31252789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5607 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 5666

 31252790 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 31252849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5667 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 5726

 31252850 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 31252909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5727 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 5786

 31252910 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 31252969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5787 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 5846

 31252970 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 31253029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5847 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 5906

 31253030 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 31253089
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5907 AAGGAGCAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 5966

 31253090 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 31253149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5967 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 6026

 31253150 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 31253209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6027 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 6086

 31253210 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 31253269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6087 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 6146

 31253270 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 31253329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6147 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 6206

 31253330 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 31253389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6207 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 6266

 31253390 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 31253449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6267 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 6326

 31253450 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 31253509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6327 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 6386

 31253510 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 31253569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6387 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 6446

 31253570 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 31253629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6447 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 6506

 31253630 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 31253689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6507 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 6566

 31253690 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 31253749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6567 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 6626

 31253750 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 31253809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6627 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 6686

 31253810 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 31253869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6687 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 6746

 31253870 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 31253929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6747 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 6806

 31253930 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 31253989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6807 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 6866

 31253990 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 31254049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6867 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 6926

 31254050 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 31254109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6927 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 6986

 31254110 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 31254169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6987 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 7046

 31254170 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 31254229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7047 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 7106

 31254230 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 31254289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7107 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 7166

 31254290 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 31254349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7167 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 7226

 31254350 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 31254409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7227 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 7286

 31254410 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAA 31254469
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     7287 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAA 7346

 31254470 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 31254529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7347 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 7406

 31254530 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 31254589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7407 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 7466

 31254590 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 31254649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7467 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 7526

 31254650 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 31254709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7527 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 7586

 31254710 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 31254769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7587 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 7646

 31254770 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 31254829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7647 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 7706

 31254830 AACCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 31254889
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7707 ACCCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 7766

 31254890 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAAT 31254949
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     7767 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAACATAGAATCTACAAAAGTAAT 7826

 31254950 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 31255009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7827 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 7886

 31255010 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 31255069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7887 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 7946

 31255070 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 31255129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7947 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 8006

 31255130 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 31255189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8007 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 8066

 31255190 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 31255249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8067 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 8126

 31255250 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 31255309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8127 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 8186

 31255310 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 31255369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8187 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 8246

 31255370 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 31255429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8247 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 8306

 31255430 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 31255489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8307 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 8366

 31255490 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 31255549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8367 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 8426

 31255550 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAA 31255609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8427 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAA 8486

 31255610 AAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAA 31255669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8487 AAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAA 8546

 31255670 GGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTTA 31255729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     8547 GGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTTA 8606

 31255730 ATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACAC 31255789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8607 ATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACAC 8666

 31255790 TAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTA 31255849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8667 TAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTA 8726

 31255850 GCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCA 31255909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8727 GCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCA 8786

 31255910 AGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAA 31255969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8787 AGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAA 8846

 31255970 TAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCAT 31256029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8847 TAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCAT 8906

 31256030 TGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGC 31256089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8907 TGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGC 8966

 31256090 GTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAAC 31256149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8967 GTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAAC 9026

 31256150 CACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAA 31256209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9027 CACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAA 9086

 31256210 CCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGAC 31256269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9087 CCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGAC 9146

 31256270 TAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACT 31256329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9147 TAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACT 9206

 31256330 TAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTT 31256389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9207 TAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTT 9266

 31256390 TAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATG 31256449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9267 TAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATG 9326

 31256450 GCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATC 31256509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9327 GCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATC 9386

 31256510 TACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTT 31256569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9387 TACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTT 9446

 31256570 ACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATAT 31256629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9447 ACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATAT 9506

 31256630 TTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTAC 31256689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9507 TTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTAC 9566

 31256690 AAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGG 31256749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9567 AAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGG 9626

 31256750 AATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAA 31256809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9627 AATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAA 9686

 31256810 ATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAG 31256869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9687 ATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAG 9746

Alignment time is 16.8158 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    4644] =>      4644 nucs 'mol-32-3004-199058_4644'

Score:        4562
Aligned:      4641        nucs
Identic:      4633 (100%) nucs =>       236 (100%)      4397 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31242104,31242339] EXCISED REGION [31242343,31246747]
 second seq =>  [       1,     236] EXCISED REGION [     242,    4644]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [31242340,31242342]
 second seq =>         5 nucs [237,241]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [236,237] to [241,242]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [31242334,31242339] to [31242343,31242348]
 second seq =>         6 nucs [231,236] to [242,247]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31242340,31242340] to [31242342,31242342]
 second seq =>         1 nucs [237,237] to [241,241]

 31242104 TCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACATGGACACAGGAAGGGGAATATCA 31242163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACATGGACACAGGAAGGGGAATATCA 60

 31242164 CACTCTGGGGACTGTTGTGTGGTGGGGGTAGAGGGGAGGGATAACATTGGGAGATATACC 31242223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACTCTGGGGACTGTTGTGTGGTGGGGGTAGAGGGGAGGGATAACATTGGGAGATATACC 120

 31242224 TAATGCTAGATGACGAGTTAGTGGGTGCAGCGCACCAGCGTGGCACATGTATACATATGT 31242283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATGCTAGATGACGAGTTAGTGGGTGCAGCGCACCAGCGTGGCACATGTATACATATGT 180

 31242284 AACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAAAAAAA 31242339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAAAAAAA 236

EXCISED REGION

 31242343 AAAAAATTAAAAAAAAAAGTAAAAGAATCCAAAGAGATACCATGCAGATACTAATCATTA 31242402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      242 AAAAAATTAAAAAAAAAAGTAAAAGAATCCAAAGAGATACCATGCAGATACTAATCATTA 301

 31242403 AGAAAACTGGAGGGAGCTATATTACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAAACATGAGATAAT 31242462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      302 AGAAAACTGGAGGGAGCTATATTACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAAACATGAGATAAT 361

 31242463 ACTAGCAGTATTGAGAAATATTTCATAATGATGTAAGAATCAATTATACATATGTAACTA 31242522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      362 ACTAGCAGTATTGAGAAATATTTCATAATGATGTAAGAATCAATTATACATATGTAACTA 421

 31242523 ACCTGCACAACGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAATATAATAATAAAAAAAAAAACAT 31242582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      422 ACCTGCACAACGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAATATAATAATAAAAAAAAAAACAT 481

 31242583 ACACACACACACACACAAAAAAAAAACAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTG 31242642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      482 --ACACACACACACACAAAAAAAAAACAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTG 539

 31242643 AGCAGAAGCTGGAAGTGACTTAAGAAGACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAA 31242702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 AGCAGAAGCTGGAAGTGACTTAAGAAGACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAA 599

 31242703 AACCTTATGGTGGATAGATGAATAACTCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTT 31242762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 AACCTTATGGTGGATAGATGAATAACTCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTT 659

 31242763 CCTCACATGAAATAGAAAAGACAAAATAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCC 31242822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CCTCACATGAAATAGAAAAGACAAAATAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCC 719

 31242823 AACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGC 31242882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 AACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGC 779

 31242883 CAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACTGAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGG 31242942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACTGAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGG 839

 31242943 GCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATG 31243002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATG 899

 31243003 TGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGA 31243062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGA 959

 31243063 CTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATACCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATT 31243122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATACCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATT 1019

 31243123 TCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGGTCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACA 31243182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGGTCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACA 1079

 31243183 AACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTTCAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACC 31243242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTTCAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACC 1139

 31243243 AGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAACAGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATG 31243302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAACAGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATG 1199

 31243303 TAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAATTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAA 31243362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAATTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAA 1259

 31243363 GCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTACAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAA 31243422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTACAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAA 1319

 31243423 AGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTTCTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTG 31243482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTTCTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTG 1379

 31243483 TTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAATCTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGAC 31243542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAATCTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGAC 1439

 31243543 AGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGGTGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAG 31243602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGGTGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAG 1499

 31243603 AAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAATGTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACA 31243662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 AAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAATGTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACA 1559

 31243663 ATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAGTTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAG 31243722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAGTTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAG 1619

 31243723 GGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAACAGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAA 31243782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAACAGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAA 1679

 31243783 AGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAAAAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTC 31243842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAAAAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTC 1739

 31243843 TAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGCCAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCC 31243902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGCCAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCC 1799

 31243903 TAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTT 31243962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTT 1859

 31243963 CCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCA 31244022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 CCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCA 1919

 31244023 TTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACT 31244082
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TTTTATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACT 1979

 31244083 TGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAA 31244142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAA 2039

 31244143 TTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTT 31244202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTT 2099

 31244203 GTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTC 31244262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTC 2159

 31244263 CACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTT 31244322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTT 2219

 31244323 TGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGAC 31244382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGAC 2279

 31244383 GCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAAT 31244442
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2280 GCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGGAGCCGGAAGCCACAAT 2339

 31244443 AATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCA 31244502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCA 2399

 31244503 CCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCA 31244562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCA 2459

 31244563 GCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGG 31244622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGG 2519

 31244623 GACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACAC 31244682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACAC 2579

 31244683 CACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTA 31244742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTA 2639

 31244743 ACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTAC 31244802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 ACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTAC 2699

 31244803 AACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTC 31244862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 AACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTC 2759

 31244863 ATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACA 31244922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 ATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACA 2819

 31244923 ATTTTTCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTAC 31244982
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 ATTTTCCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTAC 2879

 31244983 TAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCA 31245042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCA 2939

 31245043 GTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAA 31245102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAA 2999

 31245103 ATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAA 31245162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 ATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAA 3059

 31245163 AATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAAC 31245222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAAC 3119

 31245223 TATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTT 31245282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTT 3179

 31245283 TTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCAT 31245342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3180 TTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTTTGATACTTGTCAT 3239

 31245343 TTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAA 31245402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAA 3299

 31245403 GTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGC 31245462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGC 3359

 31245463 ACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTA 31245522
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3360 ACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTA 3419

 31245523 TTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCT 31245582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCT 3479

 31245583 GGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGA 31245642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 GGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGA 3539

 31245643 ATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTT 31245702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 ATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTT 3599

 31245703 ATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGT 31245762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 ATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGT 3659

 31245763 GCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTT 31245822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 GCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTT 3719

 31245823 GGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTT 31245882
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 GGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTT 3779

 31245883 TAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGT 31245942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGT 3839

 31245943 GTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGT 31246002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 GTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGT 3899

 31246003 AATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCC 31246062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 AATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCC 3959

 31246063 TGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTG 31246122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 TGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTG 4019

 31246123 AGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGC 31246182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 AGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGC 4079

 31246183 TATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGT 31246242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 TATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGT 4139

 31246243 TAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGT 31246302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGT 4199

 31246303 ATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTT 31246362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 ATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTT 4259

 31246363 TTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGT 31246422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGT 4319

 31246423 ATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAG 31246482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 ATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAG 4379

 31246483 GTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGT 31246542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 GTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGT 4439

 31246543 CCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGAT 31246602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 CCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGAT 4499

 31246603 TTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGC 31246662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 TTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGC 4559

 31246663 TGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTA 31246722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 TGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTA 4619

 31246723 CTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          |||||||||||||||||||||||||
     4620 CTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 4644

Alignment time is 4.29012 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2524] =>      2524 nucs 'mol-32-300f-260353_2524'

Score:        2502
Aligned:      2524        nucs
Identic:      2522 (100%) nucs =>       384 (100%)      2138 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31249787,31250170] EXCISED REGION [31250172,31252311]
 second seq =>  [       1,     384] EXCISED REGION [     385,    2524]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31250171,31250171]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31250195,31250195]
 second seq =>         1 nucs [408,408]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [31250171,31250181] to [31250172,31250182]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31249787 CCTTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTAAAATTAAGTTTTC 31249846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTAAAATTAAGTTTTC 60

 31249847 CCACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTACTGAATGCCTACTATGTACCAGGCACAG 31249906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTACTGAATGCCTACTATGTACCAGGCACAG 120

 31249907 TGCAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGCACTT 31249966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGCACTT 180

 31249967 AAATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACAAAAG 31250026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACAAAAG 240

 31250027 ATATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAAAAA 31250086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAAAAA 300

 31250087 AAAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACATGTAC 31250146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACATGTAC 360

 31250147 CCTAAAACTTAGAGTATAATAAAT 31250170
          ||||||||||||||||||||||||
      361 CCTAAAACTTAGAGTATAATAAAT 384

EXCISED REGION

 31250172 AAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAATTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTA 31250231
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 AAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAATTTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTA 444

 31250232 GAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATC 31250291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 GAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATC 504

 31250292 ATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGA 31250351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      505 ATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGA 564

 31250352 GTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAAC 31250411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 GTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAAC 624

 31250412 TTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAA 31250471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 TTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAA 684

 31250472 GTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAAT 31250531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 GTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAAT 744

 31250532 AGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTG 31250591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 AGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTG 804

 31250592 AATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTA 31250651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 AATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTA 864

 31250652 TTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAG 31250711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 TTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAG 924

 31250712 GAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATT 31250771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 GAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATT 984

 31250772 GCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAA 31250831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 GCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAA 1044

 31250832 AAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGA 31250891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 AAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGA 1104

 31250892 GGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCA 31250951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 GGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCA 1164

 31250952 TCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTAT 31251011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 TCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTAT 1224

 31251012 TTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAAC 31251071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 TTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAAC 1284

 31251072 TCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATAC 31251131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 TCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATAC 1344

 31251132 TCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTG 31251191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 TCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTG 1404

 31251192 ACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTAT 31251251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 ACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTAT 1464

 31251252 GCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGC 31251311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 GCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGC 1524

 31251312 ATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAG 31251371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 ATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAG 1584

 31251372 TAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGG 31251431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 TAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGG 1644

 31251432 GTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATAT 31251491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 GTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATAT 1704

 31251492 ACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAA 31251551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 ACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAA 1764

 31251552 ACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTTACAAAAATAC 31251611
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1765 ACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTCACAAAAATAC 1824

 31251612 AGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATA 31251671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 AGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATA 1884

 31251672 CAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTG 31251731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 CAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTG 1944

 31251732 GCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATC 31251791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 GCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATC 2004

 31251792 TTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATA 31251851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 TTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATA 2064

 31251852 TAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAAT 31251911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 TAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAAT 2124

 31251912 AAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACA 31251971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 AAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACA 2184

 31251972 AAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAA 31252031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 AAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAA 2244

 31252032 CTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGT 31252091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 CTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGT 2304

 31252092 GGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGT 31252151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 GGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGT 2364

 31252152 CTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCCAGCTAC 31252211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 CTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCCAGCTAC 2424

 31252212 TCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGA 31252271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 TCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGA 2484

 31252272 GATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAA 31252311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 GATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAA 2524

Alignment time is 2.29003 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    5828] =>      5828 nucs 'mol-32-30f6-184850_5828'

Score:        5738
Aligned:      5821        nucs
Identic:      5811 (100%) nucs =>       346 (100%)      5465 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31248172,31248517] EXCISED REGION [31248542,31254016]
 second seq =>  [       1,     346] EXCISED REGION [     361,    5828]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        24 nucs [31248518,31248541]
 second seq =>        14 nucs [347,360]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [347,347] to [361,361]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31248172 AGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCATCTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGA 31248231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCATCTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGA 60

 31248232 ACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTCCCCAGCAGACTCCCTTCAGACTTCA 31248291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTCCCCAGCAGACTCCCTTCAGACTTCA 120

 31248292 TCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGACTGCCTTTAGACTCAAACTGCAACTC 31248351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGACTGCCTTTAGACTCAAACTGCAACTC 180

 31248352 TTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCACACCTGT 31248411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCACACCTGT 240

 31248412 AATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCAT 31248471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCAT 300

 31248472 CCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA 31248517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA 346

EXCISED REGION

 31248542 TGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCC 31248601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCC 420

 31248602 GGGAGGCGGAGCTTGTAATGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGA 31248661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGAGGCGGAGCTTGTAATGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGA 480

 31248662 GCCAGACTCCGTCTCAATAAATAAATTTCTTCACACACACACACATACCTGATTCATTCT 31248721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCAGACTCCGTCTCAATAAATAAATTTCTTCACACACACACACATACCTGATTCATTCT 540

 31248722 GTCTCTCTGGAGAACCTTACTACATATGGTAAGTTGGTTTAACTTTAAAAGAAATAGCCA 31248781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCTCTCTGGAGAACCTTACTACATATGGTAAGTTGGTTTAACTTTAAAAGAAATAGCCA 600

 31248782 AACTATTTTCCAAAGTGGTTATAACAATTTACATTCCTACCAACAATGTATAATATGAGA 31248841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACTATTTTCCAAAGTGGTTATAACAATTTACATTCCTACCAACAATGTATAATATGAGA 660

 31248842 GTTCCTGTTTCTCCACATCCTAGACACTATATACTGTCTTTTTTATTACAGCCATCCTAG 31248901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTCCTGTTTCTCCACATCCTAGACACTATATACTGTCTTTTTTATTACAGCCATCCTAG 720

 31248902 GGGATGTAATCTCATTGTGGTATCTCATTGTGTTTTTAATGTGTATCTTCCTAATGACTA 31248961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGATGTAATCTCATTGTGGTATCTCATTGTGTTTTTAATGTGTATCTTCCTAATGACTA 780

 31248962 ATGATGCTCACTGTGCTTACATGTGGCTATTAATCACTCTCATGTCTTTTCAGATGAAGT 31249021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGATGCTCACTGTGCTTACATGTGGCTATTAATCACTCTCATGTCTTTTCAGATGAAGT 840

 31249022 GTCTATTCTGTTCTTTTGCTCACTGTTAAGTTGGGTTGTTTGCCTTATTATTTACTTATA 31249081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCTATTCTGTTCTTTTGCTCACTGTTAAGTTGGGTTGTTTGCCTTATTATTTACTTATA 900

 31249082 ATTCTTTACATGTTTTGGATACAAGTCCTTTATCACACATGATTTGCAAATATTTTCTCC 31249141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTCTTTACATGTTTTGGATACAAGTCCTTTATCACACATGATTTGCAAATATTTTCTCC 960

 31249142 CAGTCTGCAGCCTATCTTTTCAGTTTCTTCCCAATGTCTTTTGTAGCATAAAAATGTTAA 31249201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGTCTGCAGCCTATCTTTTCAGTTTCTTCCCAATGTCTTTTGTAGCATAAAAATGTTAA 1020

 31249202 TTTTAATTAAGTCAAATTCATCAATTTTTTATCTTATGGCTCATGCTTCTGGTGTCATAC 31249261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTAATTAAGTCAAATTCATCAATTTTTTATCTTATGGCTCATGCTTCTGGTGTCATAC 1080

 31249262 CTAACAACTCTGCCTAATCCAAGGTCATAAAGTTTCTTCTATGCTTTCTTTTAGAAGTTT 31249321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTAACAACTCTGCCTAATCCAAGGTCATAAAGTTTCTTCTATGCTTTCTTTTAGAAGTTT 1140

 31249322 TATAATTTTAGCTCTTACATTTAGGCCCCTAATTCATTGTCAGCTAATTTTTGTGTATTG 31249381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATAATTTTAGCTCTTACATTTAGGCCCCTAATTCATTGTCAGCTAATTTTTGTGTATTG 1200

 31249382 TTATTGTGAGGAAGTTAATTTTTGTATATGATATCCAATTTTTCCAGCACCATTTGTTGA 31249441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTATTGTGAGGAAGTTAATTTTTGTATATGATATCCAATTTTTCCAGCACCATTTGTTGA 1260

 31249442 AAAAATAACCCTTTCTCTATTTGTCTTAGCAGCTCTTCCAAAAATCAATGGACCAAAAAT 31249501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAAATAACCCTTTCTCTATTTGTCTTAGCAGCTCTTCCAAAAATCAATGGACCAAAAAT 1320

 31249502 GTAAATGTTTATTTCTGGACTCTCAATTCCTCTCCATTGATTTATATGCTTATCCTATGC 31249561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTAAATGTTTATTTCTGGACTCTCAATTCCTCTCCATTGATTTATATGCTTATCCTATGC 1380

 31249562 CACGGCCACGTTGTCCTGAATACTGTCACCTTAGATTGAGTTTTGAAATGGGGATGTATA 31249621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACGGCCACGTTGTCCTGAATACTGTCACCTTAGATTGAGTTTTGAAATGGGGATGTATA 1440

 31249622 AATCCTCCAATTTTGTTCTTTTACTCATTTATTTTAAATTTTATTTGATCCCACTGTACT 31249681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATCCTCCAATTTTGTTCTTTTACTCATTTATTTTAAATTTTATTTGATCCCACTGTACT 1500

 31249682 AAGTGTACTTAGTAATACCACCTTAAATCCTTTCTTAGACAAGATAGATATAAATATAAA 31249741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGTGTACTTAGTAATACCACCTTAAATCCTTTCTTAGACAAGATAGATATAAATATAAA 1560

 31249742 AATAAAATAGGCTATATTTTAAAGACGTTTTCAAAATAACATAATCCTTTTAAGATTTCA 31249801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATAAAATAGGCTATATTTTAAAGACGTTTTCAAAATAACATAATCCTTTTAAGATTTCA 1620

 31249802 ACCATTAACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTAAAATTAAGTTTTCCCACCCCCGACACTC 31249861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACCATTAACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTAAAATTAAGTTTTCCCACCCCCGACACTC 1680

 31249862 ACATCAACAAACATTTACTGAATGCCTACTATGTACCAGGCACAGTGCAAGGTTAGGTGC 31249921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACATCAACAAACATTTACTGAATGCCTACTATGTACCAGGCACAGTGCAAGGTTAGGTGC 1740

 31249922 CAAAGATACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGCACTTAAATAGACAATGATG 31249981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAAAGATACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGCACTTAAATAGACAATGATG 1800

 31249982 GCATAGTATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCT 31250041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCATAGTATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCT 1860

 31250042 TACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTA 31250101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTA 1920

 31250102 CATATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGT 31250161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CATATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGT 1980

 31250162 ATAATAAATAAAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAATTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAA 31250221
          ||||||||| |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATAATAAAT-AAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAATTTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAA 2039

 31250222 AAAATTATTAGAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCAC 31250281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 AAAATTATTAGAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCAC 2099

 31250282 AGGCATGATCATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCC 31250341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AGGCATGATCATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCC 2159

 31250342 AGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGA 31250401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGA 2219

 31250402 TTTGTGAAACTTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTT 31250461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TTTGTGAAACTTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTT 2279

 31250462 TAAACAAAAAGTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGA 31250521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TAAACAAAAAGTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGA 2339

 31250522 AGACAAGAATAGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCC 31250581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AGACAAGAATAGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCC 2399

 31250582 AAGGTGAGTGAATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC 31250641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AAGGTGAGTGAATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC 2459

 31250642 CCCGTCTCTATTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCT 31250701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 CCCGTCTCTATTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCT 2519

 31250702 AGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTG 31250761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 AGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTG 2579

 31250762 GGCCGAGATTGCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAG 31250821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GGCCGAGATTGCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAG 2639

 31250822 AAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAA 31250881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 --AAAAAAAAAAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAA 2697

 31250882 CTACCAGAGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTG 31250941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 CTACCAGAGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTG 2757

 31250942 GTTCTCTCCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGA 31251001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 GTTCTCTCCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGA 2817

 31251002 AAAGTCTTATTTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATG 31251061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 AAAGTCTTATTTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATG 2877

 31251062 CTCTGTCAACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACT 31251121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 CTCTGTCAACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACT 2937

 31251122 CTTAAAATACTCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCC 31251181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 CTTAAAATACTCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCC 2997

 31251182 ACTAAACTTGACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCT 31251241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 ACTAAACTTGACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCT 3057

 31251242 CCCAACCTATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTA 31251301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 CCCAACCTATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTA 3117

 31251302 AATAACGTGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAA 31251361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 AATAACGTGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAA 3177

 31251362 GAGATTTTAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGA 31251421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 GAGATTTTAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGA 3237

 31251422 AAGACAGGGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAA 31251481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 AAGACAGGGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAA 3297

 31251482 ATACCAATATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCA 31251541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 ATACCAATATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCA 3357

 31251542 AACCACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTT 31251601
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3358 AACCACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTC 3417

 31251602 ACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCA 31251661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 ACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCA 3477

 31251662 GCAATTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAA 31251721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 GCAATTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAA 3537

 31251722 TTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCA 31251781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 TTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCA 3597

 31251782 AGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCC 31251841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 AGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCC 3657

 31251842 TTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTT 31251901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 TTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTT 3717

 31251902 TGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAAT 31251961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAAT 3777

 31251962 CTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATT 31252021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 CTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATT 3837

 31252022 GTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGG 31252081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 GTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGG 3897

 31252082 AGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGT 31252141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 AGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGT 3957

 31252142 GAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAA 31252201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 GAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAA 4017

 31252202 TCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGA 31252261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 TCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGA 4077

 31252262 AGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCTC 31252321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 AGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCTC 4137

 31252322 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTAT 31252381
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 ---AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTAT 4194

 31252382 GATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGA 31252441
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 GATATTTATCTATAGTGACAAATATCGGTAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGA 4254

 31252442 ACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCA 31252501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 ACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCA 4314

 31252502 CTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTG 31252561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 CTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTG 4374

 31252562 GGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCC 31252621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 GGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCC 4434

 31252622 AAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGG 31252681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 AAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGG 4494

 31252682 CGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGC 31252741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 CGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGC 4554

 31252742 AGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCA 31252801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     4555 AGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTC- 4613

 31252802 AAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAG 31252861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 AAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAG 4673

 31252862 TCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGG 31252921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 TCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGG 4733

 31252922 GTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCT 31252981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 GTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCT 4793

 31252982 GCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATA 31253041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 GCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATA 4853

 31253042 AGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTT 31253101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 AGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTT 4913

 31253102 CTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGA 31253161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 CTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGA 4973

 31253162 TAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCC 31253221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 TAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCC 5033

 31253222 ATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTAC 31253281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 ATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTAC 5093

 31253282 CTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGC 31253341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 CTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGC 5153

 31253342 TGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGG 31253401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 TGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGG 5213

 31253402 CAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTAC 31253461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 CAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTAC 5273

 31253462 ACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATA 31253521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 ACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATA 5333

 31253522 TAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTT 31253581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 TAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTT 5393

 31253582 TCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGG 31253641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 TCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGG 5453

 31253642 CACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTAC 31253701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 CACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTAC 5513

 31253702 CATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATG 31253761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 CATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATG 5573

 31253762 ACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCT 31253821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 ACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCT 5633

 31253822 TGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTA 31253881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 TGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTA 5693

 31253882 ATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACA 31253941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 ATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACA 5753

 31253942 GAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCAT 31254001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 GAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCAT 5813

 31254002 AAGGAACTTAAGCAA 31254016
          |||||||||||||||
     5814 AAGGAACTTAAGCAA 5828

Alignment time is 5.37947 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2397] =>      2397 nucs 'mol-32-314e-008177_2397'

Score:        2363
Aligned:      2396        nucs
Identic:      2393 (100%) nucs =>       165 (100%)      2228 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31246020,31246184] EXCISED REGION [31246186,31248416]
 second seq =>  [       1,     165] EXCISED REGION [     167,    2397]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31246185,31246185]
 second seq =>         1 nucs [166,166]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246185,31246185] to [31246186,31246186]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31246020 GGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGA 31246079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGA 60

 31246080 ACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGA 31246139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGA 120

 31246140 TCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTA 31246184
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTA 165

EXCISED REGION

 31246186 TGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAG 31246245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      167 TGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAG 226

 31246246 CTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATA 31246305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      227 CTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATA 286

 31246306 GAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTG 31246365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      287 GAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTG 346

 31246366 AAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATT 31246425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      347 AAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATT 406

 31246426 CTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTA 31246485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      407 CTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTA 466

 31246486 TCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCT 31246545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      467 TCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCT 526

 31246546 TTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTC 31246605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      527 TTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTC 586

 31246606 TGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGT 31246665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      587 TGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGT 646

 31246666 TTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTA 31246725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      647 TTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTA 706

 31246726 TTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCT 31246785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      707 TTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCT 766

 31246786 TATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATG 31246845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      767 TATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATG 826

 31246846 ATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTT 31246905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      827 ATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTT 886

 31246906 CTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGC 31246965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      887 CTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGC 946

 31246966 TTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGG 31247025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      947 TTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGG 1006

 31247026 GACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCC 31247085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1007 GACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCC 1066

 31247086 CTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGACTGT 31247145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1067 CTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGATTGT 1126

 31247146 ATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAG 31247205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 ATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAG 1186

 31247206 GATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCT 31247265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 GATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCT 1246

 31247266 TTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACA 31247325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 TTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACA 1306

 31247326 GAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATC 31247385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 GAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATC 1366

 31247386 CACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACTCCA 31247445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 CACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACTCCA 1426

 31247446 TTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAATTTATATGCCATAAAATTA 31247505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1427 TTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAATTTATATACCATAAAATTA 1486

 31247506 ATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGACCA 31247565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 ATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGACCA 1546

 31247566 GAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCAATT 31247625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 GAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCAATT 1606

 31247626 CCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTCCTT 31247685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 CCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTCCTT 1666

 31247686 GCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATGTAG 31247745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 GCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATGTAG 1726

 31247746 TCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTTAGTTTCATCCATGCTGCAG 31247805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 TCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTTAGTTTCATCCATGCTGCAG 1786

 31247806 CATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTATTCCAATGTATAGATATGC 31247865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 CATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTATTCCAATGTATAGATATGC 1846

 31247866 CTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCATTTTTTCTTGTTTTTATTAA 31247925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 CTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCATTTTTTCTTGTTTTTATTAA 1906

 31247926 TATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAAGTCTTTGTGTGAACATATG 31247985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 TATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAAGTCTTTGTGTGAACATATG 1966

 31247986 TTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTTTATATGGCACAATG 31248045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 TTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTTTATATGGCACAATG 2026

 31248046 ATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCAGATATTTGGTCAAACATTA 31248105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 ATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCAGATATTTGGTCAAACATTA 2086

 31248106 TTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGCATTTAGACTGTTAGACTTT 31248165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 TTCTCGACATTTCTGCAAGAATAATTTTGGACAAGATCTGCATTTAGACTGTTAGACTTT 2146

 31248166 GAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCATCTAATGAGTTGATGGCCTG 31248225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 GAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCATCTAATGAGTTGATGGCCTG 2206

 31248226 AATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTCCCCAGCAGACTCCCTTCAG 31248285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 AATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTCCCCAGCAGACTCCCTTCAG 2266

 31248286 ACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGACTGCCTTTAGACTCAAACTG 31248345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 ACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGACTGCCTTTAGACTCAAACTG 2326

 31248346 CAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCAC 31248405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 CAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCAC 2386

 31248406 ACCTGTAATCC 31248416
          |||||||||||
     2387 ACCTGTAATCC 2397

Alignment time is 2.18331 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2089] =>      2089 nucs 'mol-32-314e-008200_2089'

Score:        2046
Aligned:      2090        nucs
Identic:      2086 (100%) nucs =>       696 (100%)      1390 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31250124,31250821] EXCISED REGION [31250825,31252216]
 second seq =>  [       1,     697] EXCISED REGION [     698,    2089]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [31250822,31250824]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [31250822,31250835] to [31250825,31250838]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31250822,31250822] to [31250824,31250824]
 second seq =>         0 nucs

 31250124 ACCTGCACAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAATAAAAAAAAAAAAT 31250183
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
        1 ACCTGCACAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAATAAAAAAAAAAA-T 59

 31250184 TAAAAAAAAAAATTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTAGAAATGAGGTCT 31250243
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       60 TAAAAAAAAAATTTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTAGAAATGAGGTCT 119

 31250244 CGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATCATAGCGCACTAT 31250303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 CGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATCATAGCGCACTAT 179

 31250304 AGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACT 31250363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 AGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACT 239

 31250364 ACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAACTTCTACCAGCTT 31250423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 ACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAACTTCTACCAGCTT 299

 31250424 TAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAAGTGCTAAATTTT 31250483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 TAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAAGTGCTAAATTTT 359

 31250484 AAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAATAGGGCTGGGCAC 31250543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 AAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAATAGGGCTGGGCAC 419

 31250544 AGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTGAATCACTTGAGA 31250603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 AGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTGAATCACTTGAGA 479

 31250604 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAA 31250663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAA 539

 31250664 GAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCA 31250723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCA 599

 31250724 GCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACTGCTC 31250783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACTGCTC 659

 31250784 TCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAG 31250821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAG 697

EXCISED REGION

 31250825 AAAAAAAAAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTA 31250884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      698 AAAAAAAAAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTA 757

 31250885 CCAGAGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTT 31250944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      758 CCAGAGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTT 817

 31250945 CTCTCCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAA 31251004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      818 CTCTCCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAA 877

 31251005 GTCTTATTTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTC 31251064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      878 GTCTTATTTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTC 937

 31251065 TGTCAACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTT 31251124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      938 TGTCAACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTT 997

 31251125 AAAATACTCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACT 31251184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 AAAATACTCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACT 1057

 31251185 AAACTTGACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCC 31251244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 AAACTTGACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCC 1117

 31251245 AACCTATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAAT 31251304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 AACCTATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAAT 1177

 31251305 AACGTGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAG 31251364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 AACGTGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAG 1237

 31251365 ATTTTAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAG 31251424
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 ATTTTAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGCAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAG 1297

 31251425 ACAGGGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATA 31251484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 ACAGGGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATA 1357

 31251485 CCAATATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAAC 31251544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 CCAATATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAAC 1417

 31251545 CACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTTACA 31251604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1418 CACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTCACA 1477

 31251605 AAAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCA 31251664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 AAAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCA 1537

 31251665 ATTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTT 31251724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 ATTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTT 1597

 31251725 GCTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGA 31251784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 GCTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGA 1657

 31251785 TTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTT 31251844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 TTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTT 1717

 31251845 AGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGC 31251904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 AGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGC 1777

 31251905 TTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTC 31251964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 TTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTC 1837

 31251965 CTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTG 31252024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 CTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTG 1897

 31252025 AAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGG 31252084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 AAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGG 1957

 31252085 CCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAA 31252144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 CCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAA 2017

 31252145 ACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCC 31252204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 ACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCC 2077

 31252205 CAGCTACTCAGG 31252216
          ||||||||||||
     2078 CAGCTACTCAGG 2089

Alignment time is 1.90192 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    8469] =>      8469 nucs 'mol-32-3159-067794_8469'

Score:        8331
Aligned:      8465        nucs
Identic:      8452 (100%) nucs =>      2866 (100%)      5586 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31243877,31246747] EXCISED REGION [31251770,31257363]
 second seq =>  [       1,    2871] EXCISED REGION [    2879,    8469]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5022 nucs [31246748,31251769]
 second seq =>         7 nucs [2872,2878]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2870,2871] to [2877,2878]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246748,31246748] to [31251769,31251769]
 second seq =>         0 nucs

 31243877 ATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCAAAATTT 31243936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCAAAATTT 60

 31243937 CTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATGTTTACT 31243996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATGTTTACT 120

 31243997 GCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACAC 31244056
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTTTATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACAC 180

 31244057 CTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACT 31244116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACT 240

 31244117 CAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAG 31244176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAG 300

 31244177 GAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGAT 31244236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGAT 360

 31244237 GGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTA 31244296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTA 420

 31244297 AAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTAC 31244356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTAC 480

 31244357 CATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAAT 31244416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAAT 540

 31244417 TCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAG 31244476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAG 600

 31244477 AAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTG 31244536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTG 660

 31244537 AATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAA 31244596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAA 720

 31244597 CATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGA 31244656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGA 780

 31244657 GCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAAC 31244716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAAC 840

 31244717 ATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGC 31244776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGC 900

 31244777 CACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGA 31244836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGA 960

 31244837 TTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATT 31244896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATT 1020

 31244897 TTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAACTAAATCAC 31244956
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTCCAAACACAATATACTCCAACTAAATCAC 1080

 31244957 TGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAA 31245016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAA 1140

 31245017 AGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCA 31245076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCA 1200

 31245077 TGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAG 31245136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAG 1260

 31245137 CAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAA 31245196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAA 1320

 31245197 GAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGA 31245256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGA 1380

 31245257 CATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATA 31245316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATA 1440

 31245317 CAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTAT 31245376
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGTGTGGTATTTTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTAT 1500

 31245377 TTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTA 31245436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTA 1560

 31245437 TTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATC 31245496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATC 1620

 31245497 TCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTT 31245556
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTT 1680

 31245557 AGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTT 31245616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTT 1740

 31245617 CATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCA 31245676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCA 1800

 31245677 TTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGAT 31245736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGAT 1860

 31245737 TCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTC 31245796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTC 1920

 31245797 AACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATC 31245856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1921 AACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATC 1980

 31245857 ATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTG 31245916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTG 2040

 31245917 TACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTG 31245976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTG 2100

 31245977 CCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCT 31246036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCT 2160

 31246037 CATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTC 31246096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTC 2220

 31246097 TGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGC 31246156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGC 2280

 31246157 ATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGA 31246216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGA 2340

 31246217 TGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCT 31246276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCT 2400

 31246277 CTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTT 31246336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTT 2460

 31246337 TATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACC 31246396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACC 2520

 31246397 AATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCAT 31246456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCAT 2580

 31246457 TTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTC 31246516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTC 2640

 31246517 CTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATC 31246576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATC 2700

 31246577 AATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATG 31246636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATG 2760

 31246637 TGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGA 31246696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGA 2820

 31246697 TATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 2871

EXCISED REGION

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 2938

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 2998

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 3058

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 3118

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 3178

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31252129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 3238

 31252130 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 31252189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 3298

 31252190 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31252249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 3358

 31252250 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 31252309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 3418

 31252310 AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 31252369
          ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AAACTCCATCTC--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 3476

 31252370 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 31252429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 3536

 31252430 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 31252489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 3596

 31252490 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 31252549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 3656

 31252550 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 31252609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 3716

 31252610 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 31252669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 3776

 31252670 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 31252729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 3836

 31252730 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 31252789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 3896

 31252790 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 31252849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 3956

 31252850 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 31252909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 4016

 31252910 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 31252969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 4076

 31252970 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 31253029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 4136

 31253030 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 31253089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 4196

 31253090 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 31253149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 4256

 31253150 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 31253209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 4316

 31253210 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 31253269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 4376

 31253270 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 31253329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 4436

 31253330 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 31253389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 4496

 31253390 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 31253449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 4556

 31253450 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 31253509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 4616

 31253510 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 31253569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 4676

 31253570 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 31253629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 4736

 31253630 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 31253689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 4796

 31253690 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 31253749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 4856

 31253750 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 31253809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 4916

 31253810 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 31253869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 4976

 31253870 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 31253929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 5036

 31253930 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 31253989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 5096

 31253990 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 31254049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 5156

 31254050 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 31254109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 5216

 31254110 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 31254169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 5276

 31254170 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 31254229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 5336

 31254230 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 31254289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 5396

 31254290 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 31254349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 5456

 31254350 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 31254409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 5516

 31254410 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAA 31254469
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5517 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAA 5576

 31254470 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 31254529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 5636

 31254530 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 31254589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 5696

 31254590 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 31254649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 5756

 31254650 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 31254709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 5816

 31254710 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 31254769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 5876

 31254770 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 31254829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 5936

 31254830 AACCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 31254889
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 ACCCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 5996

 31254890 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAAT 31254949
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5997 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAACATAGAATCTACAAAAGTAAT 6056

 31254950 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 31255009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 6116

 31255010 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 31255069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 6176

 31255070 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 31255129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 6236

 31255130 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 31255189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 6296

 31255190 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 31255249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 6356

 31255250 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 31255309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 6416

 31255310 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 31255369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 6476

 31255370 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 31255429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 6536

 31255430 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 31255489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 6596

 31255490 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 31255549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 6656

 31255550 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAA 31255609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     6657 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTC-AAAAAAAAAA 6715

 31255610 AAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAA 31255669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6716 AAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAA 6775

 31255670 GGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTTA 31255729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     6776 GGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTTA 6835

 31255730 ATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACAC 31255789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6836 ATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACAC 6895

 31255790 TAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTA 31255849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     6896 TAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTAATTTGCCTACACACTA 6955

 31255850 GCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCA 31255909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6956 GCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCA 7015

 31255910 AGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAA 31255969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7016 AGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAA 7075

 31255970 TAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCAT 31256029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7076 TAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCAT 7135

 31256030 TGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGC 31256089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7136 TGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGC 7195

 31256090 GTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAAC 31256149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7196 GTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAAC 7255

 31256150 CACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAA 31256209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7256 CACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAA 7315

 31256210 CCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGAC 31256269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7316 CCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGAC 7375

 31256270 TAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACT 31256329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7376 TAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACT 7435

 31256330 TAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTT 31256389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7436 TAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTT 7495

 31256390 TAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATG 31256449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7496 TAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATG 7555

 31256450 GCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATC 31256509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7556 GCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATC 7615

 31256510 TACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTT 31256569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7616 TACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTT 7675

 31256570 ACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATAT 31256629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7676 ACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATAT 7735

 31256630 TTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTAC 31256689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7736 TTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTAC 7795

 31256690 AAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGG 31256749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7796 AAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGG 7855

 31256750 AATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAA 31256809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7856 AATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAA 7915

 31256810 ATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAG 31256869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7916 ATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAG 7975

 31256870 TCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAA 31256929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7976 TCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAA 8035

 31256930 GGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCA 31256989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8036 GGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCA 8095

 31256990 TGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATA 31257049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8096 TGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATA 8155

 31257050 TCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGC 31257109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8156 TCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGC 8215

 31257110 AGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTAT 31257169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8216 AGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTAT 8275

 31257170 AAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGT 31257229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8276 AAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGT 8335

 31257230 CTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCAT 31257289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8336 CTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCAT 8395

 31257290 CCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATTT 31257349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8396 CCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATTT 8455

 31257350 AACTGAATGTAAAC 31257363
          ||||||||||||||
     8456 AACTGAATGTAAAC 8469

Alignment time is 7.68649 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2871] =>      2871 nucs 'mol-32-3159-067794_2871'

Score:        2826
Aligned:      2870        nucs
Identic:      2866 (100%) nucs =>       148 (100%)      2718 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31243877,31244024] EXCISED REGION [31244026,31246747]
 second seq =>  [       1,     148] EXCISED REGION [     150,    2871]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31244025,31244025]
 second seq =>         1 nucs [149,149]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [147,149] to [148,150]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31244024,31244024] to [31244026,31244026]
 second seq =>         1 nucs [148,148] to [150,150]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31243877 ATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCAAAATTT 31243936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCAAAATTT 60

 31243937 CTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATGTTTACT 31243996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATGTTTACT 120

 31243997 GCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATT 31244024
          ||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATT 148

EXCISED REGION

 31244026 TATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGT 31244085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      150 TATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGT 209

 31244086 TGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTT 31244145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      210 TGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTT 269

 31244146 TGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTG 31244205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      270 TGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTG 329

 31244206 ACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCAC 31244265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      330 ACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCAC 389

 31244266 TGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGA 31244325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      390 TGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGA 449

 31244326 CCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCT 31244385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      450 CCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCT 509

 31244386 GGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAAT 31244445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      510 GGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAAT 569

 31244446 AAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCT 31244505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      570 AAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCT 629

 31244506 CTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCA 31244565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      630 CTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCA 689

 31244566 GAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGAC 31244625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      690 GAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGAC 749

 31244626 CTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCAC 31244685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 CTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCAC 809

 31244686 TGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACT 31244745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 TGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACT 869

 31244746 TATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAAC 31244805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 TATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAAC 929

 31244806 CTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATT 31244865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 CTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATT 989

 31244866 ATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATT 31244925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 ATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATT 1049

 31244926 TTTCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAA 31244985
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 TTCCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAA 1109

 31244986 ATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTT 31245045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 ATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTT 1169

 31245046 CATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATA 31245105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 CATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATA 1229

 31245106 GAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAAT 31245165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 GAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAAT 1289

 31245166 ACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTAT 31245225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 ACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTAT 1349

 31245226 GTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTG 31245285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 GTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTG 1409

 31245286 ACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTT 31245345
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1410 ACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTTTGATACTTGTCATTTT 1469

 31245346 TTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTC 31245405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 TTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTC 1529

 31245406 ACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACT 31245465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 ACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACT 1589

 31245466 TGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTATTC 31245525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1590 TGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTATTC 1649

 31245526 TACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGC 31245585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 TACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGC 1709

 31245586 TTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATT 31245645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 TTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATT 1769

 31245646 TCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATC 31245705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 TCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATC 1829

 31245706 CATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCT 31245765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 CATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCT 1889

 31245766 GCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGA 31245825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 GCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGA 1949

 31245826 TATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAA 31245885
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 TATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAA 2009

 31245886 AGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTA 31245945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 AGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTA 2069

 31245946 AATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAAT 31246005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 AATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAAT 2129

 31246006 AGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGA 31246065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 AGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGA 2189

 31246066 TGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGA 31246125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 TGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGA 2249

 31246126 AATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTAT 31246185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 AATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTAT 2309

 31246186 TGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAG 31246245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 TGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAG 2369

 31246246 CTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATA 31246305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 CTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATA 2429

 31246306 GAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTG 31246365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 GAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTG 2489

 31246366 AAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATT 31246425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 AAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATT 2549

 31246426 CTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTA 31246485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 CTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTA 2609

 31246486 TCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCT 31246545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 TCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCT 2669

 31246546 TTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTC 31246605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 TTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTC 2729

 31246606 TGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGT 31246665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 TGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGT 2789

 31246666 TTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTA 31246725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 TTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTA 2849

 31246726 TTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          ||||||||||||||||||||||
     2850 TTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 2871

Alignment time is 3.62066 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2613] =>      2613 nucs 'mol-32-3164-119910_2613'

Score:        2579
Aligned:      2612        nucs
Identic:      2609 (100%) nucs =>       164 (100%)      2445 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31245671,31245834] EXCISED REGION [31245836,31248283]
 second seq =>  [       1,     164] EXCISED REGION [     166,    2613]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31245835,31245835]
 second seq =>         1 nucs [165,165]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31245834,31245834] to [31245835,31245835]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31245671 ATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAG 31245730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAG 60

 31245731 GTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTAT 31245790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTAT 120

 31245791 CTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGC 31245834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGC 164

EXCISED REGION

 31245836 GTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCA 31245895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      166 GTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCA 225

 31245896 TGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGT 31245955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      226 TGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGT 285

 31245956 TCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTA 31246015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      286 TCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTA 345

 31246016 ACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATG 31246075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      346 ACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATG 405

 31246076 TTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATT 31246135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      406 TTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATT 465

 31246136 CAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTC 31246195
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      466 CAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTC 525

 31246196 AGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTT 31246255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      526 AGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTT 585

 31246256 CTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAG 31246315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      586 CTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAG 645

 31246316 TTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACC 31246375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      646 TTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACC 705

 31246376 CATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTT 31246435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      706 CATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTT 765

 31246436 CATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCT 31246495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      766 CATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCT 825

 31246496 GCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATG 31246555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      826 GCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATG 885

 31246556 TGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCT 31246615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      886 TGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCT 945

 31246616 ATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACT 31246675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      946 ATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACT 1005

 31246676 ATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGT 31246735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1006 ATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGT 1065

 31246736 TCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGAT 31246795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1066 TCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGAT 1125

 31246796 TCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTT 31246855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1126 TCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTT 1185

 31246856 GGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTT 31246915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1186 GGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTT 1245

 31246916 GGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTT 31246975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1246 GGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTT 1305

 31246976 TTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCA 31247035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1306 TTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCA 1365

 31247036 TACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTC 31247095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1366 TACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTC 1425

 31247096 AACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGACTGTATAGAAAGGG 31247155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1426 AACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGATTGTATAGAAAGGG 1485

 31247156 GGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTT 31247215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 GGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTT 1545

 31247216 AAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAA 31247275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 AAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAA 1605

 31247276 TTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAAT 31247335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 TTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAAT 1665

 31247336 TTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGC 31247395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 TTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGC 1725

 31247396 AAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTAC 31247455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 AAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTAC 1785

 31247456 TTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAATTTATATGCCATAAAATTAATCATTGTCC 31247515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1786 TTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAATTTATATACCATAAAATTAATCATTGTCC 1845

 31247516 ATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTA 31247575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 ATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTA 1905

 31247576 AATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTT 31247635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 AATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTT 1965

 31247636 CATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAA 31247695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 CATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAA 2025

 31247696 TCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGT 31247755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 TCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGT 2085

 31247756 CTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTTAGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAA 31247815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 CTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTTAGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAA 2145

 31247816 TATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTATTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGT 31247875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 TATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTATTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGT 2205

 31247876 TTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCATTTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTAC 31247935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 TTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCATTTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTAC 2265

 31247936 AAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAAGTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTC 31247995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 AAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAAGTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTC 2325

 31247996 TCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATT 31248055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 TCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATT 2385

 31248056 ATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCAGATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACAT 31248115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 ATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCAGATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACAT 2445

 31248116 TTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGCATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCA 31248175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 TTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGCATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCA 2505

 31248176 GATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCATCTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAACAA 31248235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 GATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCATCTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAACAA 2565

 31248236 AAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTCCCCAGCAGACTCCCTTC 31248283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 AAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTCCCCAGCAGACTCCCTTC 2613

Alignment time is 2.49925 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    5038] =>      5038 nucs 'mol-32-3164-124212_5038'

Score:        4954
Aligned:      5031        nucs
Identic:      5024 (100%) nucs =>      1744 (100%)      3280 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31245001,31246747] EXCISED REGION [31251770,31255052]
 second seq =>  [       1,    1747] EXCISED REGION [    1755,    5038]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5022 nucs [31246748,31251769]
 second seq =>         7 nucs [1748,1754]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1746,1747] to [1753,1754]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246748,31246748] to [31251769,31251769]
 second seq =>         0 nucs

 31245001 TAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTA 31245060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTA 60

 31245061 TTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCT 31245120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCT 120

 31245121 TTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAA 31245180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAA 180

 31245181 GTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATG 31245240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATG 240

 31245241 TGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGT 31245300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGT 300

 31245301 ATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTC 31245360
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTTTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTC 360

 31245361 AAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCAT 31245420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCAT 420

 31245421 AGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCT 31245480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCT 480

 31245481 CTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTA 31245540
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTA 540

 31245541 TGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATA 31245600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATA 600

 31245601 TAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATG 31245660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATG 660

 31245661 GCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAAT 31245720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAAT 720

 31245721 AAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGA 31245780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGA 780

 31245781 GGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACA 31245840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      781 GGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACA 840

 31245841 GTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTG 31245900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTG 900

 31245901 TTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCT 31245960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCT 960

 31245961 TTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGG 31246020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGG 1020

 31246021 GGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAA 31246080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAA 1080

 31246081 CATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGAT 31246140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGAT 1140

 31246141 CTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATT 31246200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATT 1200

 31246201 CCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCC 31246260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCC 1260

 31246261 ATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGA 31246320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGA 1320

 31246321 TGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATAC 31246380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATAC 1380

 31246381 AAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAG 31246440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAG 1440

 31246441 TCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACA 31246500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACA 1500

 31246501 TGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGC 31246560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGC 1560

 31246561 TCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCT 31246620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCT 1620

 31246621 GTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGG 31246680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGG 1680

 31246681 TTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAAC 31246740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAAC 1740

 31246741 AGGAAAA 31246747
          |||||||
     1741 AGGAAAA 1747

EXCISED REGION

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 1814

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 1874

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 1934

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 1994

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 2054

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31252129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 2114

 31252130 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 31252189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 2174

 31252190 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31252249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 2234

 31252250 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 31252309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 2294

 31252310 AAACTCCATCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACT 31252368
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACT 2354

 31252369 CCTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGT 31252428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 CCTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGT 2414

 31252429 AAAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAAC 31252488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 AAAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAAC 2474

 31252489 TCAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAA 31252548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 TCAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAA 2534

 31252549 TCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAA 31252608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 TCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAA 2594

 31252609 GACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGG 31252668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 GACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGG 2654

 31252669 GTACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTT 31252728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 GTACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTT 2714

 31252729 GAATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTG 31252788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 GAATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTG 2774

 31252789 AGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTAT 31252848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 AGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTAT 2834

 31252849 TATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTG 31252908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 TATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTG 2894

 31252909 AAATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGC 31252968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 AAATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGC 2954

 31252969 TGAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAA 31253028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 TGAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAA 3014

 31253029 TAAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCT 31253088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 TAAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCT 3074

 31253089 TTTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACT 31253148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3075 TTTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACT 3134

 31253149 TATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCC 31253208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3135 TATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCC 3194

 31253209 TATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCT 31253268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3195 TATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCT 3254

 31253269 TCCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACA 31253328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 TCCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACA 3314

 31253329 TACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGG 31253388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 TACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGG 3374

 31253389 ACACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCA 31253448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3375 ACACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCA 3434

 31253449 CAATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTC 31253508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3435 CAATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTC 3494

 31253509 CTGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAA 31253568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3495 CTGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAA 3554

 31253569 TGAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCAC 31253628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3555 TGAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCAC 3614

 31253629 CTAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCT 31253688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3615 CTAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCT 3674

 31253689 GAACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGC 31253748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3675 GAACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGC 3734

 31253749 ATATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTC 31253808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3735 ATATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTC 3794

 31253809 TGGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGA 31253868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3795 TGGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGA 3854

 31253869 CAAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATA 31253928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3855 CAAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATA 3914

 31253929 AACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAAT 31253988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3915 AACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAAT 3974

 31253989 ATCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGG 31254048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3975 ATCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGG 4034

 31254049 GCAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATG 31254108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4035 GCAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATG 4094

 31254109 AAAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATAC 31254168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4095 AAAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATAC 4154

 31254169 CATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGG 31254228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4155 CATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGG 4214

 31254229 CTGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACT 31254288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4215 CTGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACT 4274

 31254289 GTGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGC 31254348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4275 GTGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGC 4334

 31254349 AATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGT 31254408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4335 AATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGT 4394

 31254409 TCATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGA 31254468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4395 TCATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGA 4454

 31254469 AAACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCC 31254528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4455 AAACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCC 4514

 31254529 TTGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAG 31254588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4515 TTGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAG 4574

 31254589 AAAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAA 31254648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4575 AAAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAA 4634

 31254649 CACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGA 31254708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4635 CACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGA 4694

 31254709 GGCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCA 31254768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4695 GGCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCA 4754

 31254769 TCCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATG 31254828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4755 TCCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATG 4814

 31254829 TAACCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTAC 31254888
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4815 TACCCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTAC 4874

 31254889 TAAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAA 31254948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4875 TAAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAACATAGAATCTACAAAAGTAA 4934

 31254949 TCTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTA 31255008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4935 TCTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTA 4994

 31255009 CCCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAG 31255052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4995 CCCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAG 5038

Alignment time is 4.55323 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    4931] =>      4931 nucs 'mol-32-3164-243976_4931'

Score:        4856
Aligned:      4933        nucs
Identic:      4926 (100%) nucs =>       809 (100%)      4117 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31250011,31250821] EXCISED REGION [31250826,31254947]
 second seq =>  [       1,     810] EXCISED REGION [     811,    4931]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [31250822,31250825]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [31250822,31250834] to [31250826,31250838]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31250822,31250823] to [31250824,31250825]
 second seq =>         0 nucs

 31250011 AGATAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCC 31250070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCC 60

 31250071 TGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAACCTGCA 31250130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAACCTGCA 120

 31250131 CAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAATAAAAAAAAAAAATTAAAAAA 31250190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
      121 CAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAATAAAAAAAAAAA-TTAAAAAA 179

 31250191 AAAAATTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTAGAAATGAGGTCTCGCTATG 31250250
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 AAAATTTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTAGAAATGAGGTCTCGCTATG 239

 31250251 TTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATCATAGCGCACTATAGCCATG 31250310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 TTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATCATAGCGCACTATAGCCATG 299

 31250311 AACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTG 31250370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 AACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTG 359

 31250371 TGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAACTTCTACCAGCTTTAATGTT 31250430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 TGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAACTTCTACCAGCTTTAATGTT 419

 31250431 CTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAAGTGCTAAATTTTAAATTTG 31250490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 CTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAAGTGCTAAATTTTAAATTTG 479

 31250491 ATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAATAGGGCTGGGCACAGTGGCT 31250550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 ATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAATAGGGCTGGGCACAGTGGCT 539

 31250551 CACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTGAATCACTTGAGATCAGGAG 31250610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 CACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTGAATCACTTGAGATCAGGAG 599

 31250611 TTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAGAGATTG 31250670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 TTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAGAGATTG 659

 31250671 GCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGCAGAAT 31250730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGCAGAAT 719

 31250731 CGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACTGCTCTCCAGCC 31250790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACTGCTCTCCAGCC 779

 31250791 TGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAG 31250821
          |||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAG 810

EXCISED REGION

 31250826 AAAAAAAAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTAC 31250885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      811 AAAAAAAAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTAC 870

 31250886 CAGAGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTC 31250945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      871 CAGAGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTC 930

 31250946 TCTCCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAG 31251005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      931 TCTCCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAG 990

 31251006 TCTTATTTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCT 31251065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      991 TCTTATTTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCT 1050

 31251066 GTCAACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTA 31251125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1051 GTCAACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTA 1110

 31251126 AAATACTCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTA 31251185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1111 AAATACTCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTA 1170

 31251186 AACTTGACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCA 31251245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1171 AACTTGACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCA 1230

 31251246 ACCTATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATA 31251305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1231 ACCTATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATA 1290

 31251306 ACGTGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGA 31251365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1291 ACGTGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGA 1350

 31251366 TTTTAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGA 31251425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1351 TTTTAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGA 1410

 31251426 CAGGGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATAC 31251485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 CAGGGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATAC 1470

 31251486 CAATATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACC 31251545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 CAATATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACC 1530

 31251546 ACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTTACAA 31251605
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1531 ACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTCACAA 1590

 31251606 AAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAA 31251665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 AAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAA 1650

 31251666 TTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTG 31251725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 TTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTG 1710

 31251726 CTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGAT 31251785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 CTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGAT 1770

 31251786 TCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTA 31251845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 TCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTA 1830

 31251846 GCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCT 31251905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 GCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCT 1890

 31251906 TTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCC 31251965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 TTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCC 1950

 31251966 TTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGA 31252025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 TTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGA 2010

 31252026 AAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGC 31252085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 AAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGC 2070

 31252086 CAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAA 31252145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 CAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAA 2130

 31252146 CCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCC 31252205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 CCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCC 2190

 31252206 AGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTG 31252265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 AGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTG 2250

 31252266 AGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAA 31252325
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     2251 AGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCTC-AAA 2309

 31252326 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGATA 31252385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGATA 2369

 31252386 TTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACTT 31252445
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 TTTATCTATAGTGACAAATATCGGTAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACTT 2429

 31252446 GGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTAG 31252505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 GGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTAG 2489

 31252506 TATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 31252565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 TATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 2549

 31252566 GCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAGA 31252625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 GCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAGA 2609

 31252626 TGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGCC 31252685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 TGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGCC 2669

 31252686 TGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGAG 31252745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 TGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGAG 2729

 31252746 GTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAAA 31252805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 GTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAAA 2789

 31252806 AAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTCAT 31252865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 AAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTCAT 2849

 31252866 GAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGTGA 31252925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 GAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGTGA 2909

 31252926 AAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGCAT 31252985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 AAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGCAT 2969

 31252986 GTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAGTC 31253045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 GTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAGTC 3029

 31253046 ACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCTTC 31253105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 ACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCTTC 3089

 31253106 ATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATAGC 31253165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 ATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATAGC 3149

 31253166 CTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCATTA 31253225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 CTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCATTA 3209

 31253226 AATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCTGA 31253285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 AATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCTGA 3269

 31253286 TTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTGTT 31253345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 TTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTGTT 3329

 31253346 TAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCAGG 31253405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 TAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCAGG 3389

 31253406 AACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACACTA 31253465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 AACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACACTA 3449

 31253466 GCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATAAG 31253525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3450 GCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATAAG 3509

 31253526 TGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTCTA 31253585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 TGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTCTA 3569

 31253586 TGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCACA 31253645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 TGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCACA 3629

 31253646 GAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCATT 31253705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 GAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCATT 3689

 31253706 ACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGACCT 31253765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3690 ACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGACCT 3749

 31253766 CAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTGGC 31253825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 CAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTGGC 3809

 31253826 AAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAATTA 31253885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3810 AAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAATTA 3869

 31253886 AACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGAAT 31253945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3870 AACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGAAT 3929

 31253946 GGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAAGG 31254005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3930 GGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAAGG 3989

 31254006 AACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAACAA 31254065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3990 AACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAACAA 4049

 31254066 ACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACATC 31254125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4050 ACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACATC 4109

 31254126 ACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTGAG 31254185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4110 ACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTGAG 4169

 31254186 AAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGCAA 31254245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4170 AAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGCAA 4229

 31254246 TTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTGGA 31254305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4230 TTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTGGA 4289

 31254306 GAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAAAG 31254365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4290 GAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAAAG 4349

 31254366 GAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTATGT 31254425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4350 GAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTATGT 4409

 31254426 ACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATATAC 31254485
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4410 ACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATATAC 4469

 31254486 ATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATGGAT 31254545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4470 ATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATGGAT 4529

 31254546 GCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTGCAT 31254605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4530 GCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTGCAT 4589

 31254606 GTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAGCAA 31254665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4590 GTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAGCAA 4649

 31254666 TAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAAAAG 31254725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4650 TAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAAAAG 4709

 31254726 TTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAACCTT 31254785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4710 TTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAACCTT 4769

 31254786 AGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGTAACCCCTGAATCTAAA 31254845
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4770 AGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGTACCCCCTGAATCTAAA 4829

 31254846 ATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTCTTT 31254905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4830 ATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTCTTT 4889

 31254906 ACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTA 31254947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4890 ACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTA 4931

Alignment time is 4.4538 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    9241] =>      9241 nucs 'mol-32-317a-041629_9241'

Score:        9078
Aligned:      9243        nucs
Identic:      9228 (100%) nucs =>      2591 (100%)      6637 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31249728,31252321] EXCISED REGION [31252325,31258972]
 second seq =>  [       1,    2594] EXCISED REGION [    2595,    9241]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [31252322,31252324]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31252322,31252339] to [31252325,31252342]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31252322,31252322] to [31252324,31252324]
 second seq =>         0 nucs

 31249728 GATATAAATATAAAAATAAAATAGGCTATATTTTAAAGACGTTTTCAAAATAACATAATC 31249787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATATAAATATAAAAATAAAATAGGCTATATTTTAAAGACGTTTTCAAAATAACATAATC 60

 31249788 CTTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTAAAATTAAGTTTTCC 31249847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTAAAATTAAGTTTTCC 120

 31249848 CACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTACTGAATGCCTACTATGTACCAGGCACAGT 31249907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTACTGAATGCCTACTATGTACCAGGCACAGT 180

 31249908 GCAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGCACTTA 31249967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGCACTTA 240

 31249968 AATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACAAAAGA 31250027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACAAAAGA 300

 31250028 TATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAAAAAA 31250087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAAAAAA 360

 31250088 AAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACATGTACC 31250147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACATGTACC 420

 31250148 CTAAAACTTAGAGTATAATAAATAAAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAATTTTTTAATTTA 31250207
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||.||||||||||||
      421 CTAAAACTTAGAGTATAATAAATAAAAAAAAAAA-TTAAAAAAAAAATTTTTTTAATTTA 479

 31250208 TTATACCTTTTTAAAAAATTATTAGAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAA 31250267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TTATACCTTTTTAAAAAATTATTAGAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAA 539

 31250268 CAGCGGCTATTCACAGGCATGATCATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGC 31250327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 CAGCGGCTATTCACAGGCATGATCATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGC 599

 31250328 GATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGG 31250387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGG 659

 31250388 CCTGAAACAAATGATTTGTGAAACTTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCG 31250447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CCTGAAACAAATGATTTGTGAAACTTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCG 719

 31250448 CATTTTATTTTTTTTAAACAAAAAGTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAAC 31250507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CATTTTATTTTTTTTAAACAAAAAGTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAAC 779

 31250508 CTGCCTGTATTAGAAGACAAGAATAGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAG 31250567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CTGCCTGTATTAGAAGACAAGAATAGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAG 839

 31250568 CACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTGAATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGC 31250627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTGAATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGC 899

 31250628 CAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGT 31250687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGT 959

 31250688 GCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGG 31250747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGG 1019

 31250748 TGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGA 31250807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGA 1079

 31250808 CTCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAA-GTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAAC 31250866
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CTCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAAC 1139

 31250867 AAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTC 31250926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTC 1199

 31250927 TGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTA 31250986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTA 1259

 31250987 AGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTATTTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAG 31251046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 AGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTATTTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAG 1319

 31251047 GTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATA 31251106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATA 1379

 31251107 CAGATAGTAAGAACTCTTAAAATACTCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGC 31251166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CAGATAGTAAGAACTCTTAAAATACTCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGC 1439

 31251167 TTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTC 31251226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTC 1499

 31251227 ACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACA 31251286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 ACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACA 1559

 31251287 TAAGCAACACATCTAAATAACGTGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTG 31251346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TAAGCAACACATCTAAATAACGTGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTG 1619

 31251347 AAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGG 31251406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGG 1679

 31251407 AATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAAC 31251466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAAC 1739

 31251467 ACTGGGTTAAATAAAATACCAATATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTT 31251526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ACTGGGTTAAATAAAATACCAATATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTT 1799

 31251527 TTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAA 31251586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAA 1859

 31251587 AGAATCTAGGTCTTTACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTC 31251646
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AGAATCTAGGTCTTCACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTC 1919

 31251647 ATTGTCACACTGGCAGCAATTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGC 31251706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 ATTGTCACACTGGCAGCAATTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGC 1979

 31251707 ACAAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGT 31251766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ACAAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGT 2039

 31251767 GAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTG 31251826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTG 2099

 31251827 TGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAA 31251886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAA 2159

 31251887 ATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTA 31251946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTA 2219

 31251947 TATTCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATT 31252006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TATTCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATT 2279

 31252007 AGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACC 31252066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACC 2339

 31252067 TGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAG 31252126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAG 2399

 31252127 CCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGT 31252186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGT 2459

 31252187 GGCGGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCA 31252246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GGCGGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCA 2519

 31252247 GGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGA 31252306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGA 2579

 31252307 GTGAAACTCCATCTC 31252321
          |||||||||||||||
     2580 GTGAAACTCCATCTC 2594

EXCISED REGION

 31252325 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGAT 31252384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGAT 2654

 31252385 ATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACT 31252444
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 ATTTATCTATAGTGACAAATATCGGTAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACT 2714

 31252445 TGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTA 31252504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 TGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTA 2774

 31252505 GTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 31252564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 GTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 2834

 31252565 GGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAG 31252624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 GGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAG 2894

 31252625 ATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGC 31252684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 ATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGC 2954

 31252685 CTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGA 31252744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 CTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGA 3014

 31252745 GGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAA 31252804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 GGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAA 3074

 31252805 AAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTCA 31252864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3075 AAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTCA 3134

 31252865 TGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGTG 31252924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3135 TGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGTG 3194

 31252925 AAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGCA 31252984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3195 AAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGCA 3254

 31252985 TGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAGT 31253044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 TGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAGT 3314

 31253045 CACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCTT 31253104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 CACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCTT 3374

 31253105 CATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATAG 31253164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3375 CATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATAG 3434

 31253165 CCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCATT 31253224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3435 CCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCATT 3494

 31253225 AAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCTG 31253284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3495 AAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCTG 3554

 31253285 ATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTGT 31253344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3555 ATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTGT 3614

 31253345 TTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCAG 31253404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3615 TTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCAG 3674

 31253405 GAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACACT 31253464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3675 GAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACACT 3734

 31253465 AGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATAA 31253524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3735 AGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATAA 3794

 31253525 GTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTCT 31253584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3795 GTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTCT 3854

 31253585 ATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCAC 31253644
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3855 ATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGATTTGGGCAC 3914

 31253645 AGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCAT 31253704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3915 AGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCAT 3974

 31253705 TACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGACC 31253764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3975 TACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGACC 4034

 31253765 TCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTGG 31253824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4035 TCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTGG 4094

 31253825 CAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAATT 31253884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4095 CAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAATT 4154

 31253885 AAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGAA 31253944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4155 AAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGAA 4214

 31253945 TGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAAG 31254004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4215 TGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAAG 4274

 31254005 GAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAACA 31254064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4275 GAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAACA 4334

 31254065 AACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACAT 31254124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4335 AACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACAT 4394

 31254125 CACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTGA 31254184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4395 CACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTGA 4454

 31254185 GAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGCA 31254244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4455 GAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGCA 4514

 31254245 ATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTGG 31254304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4515 ATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTGG 4574

 31254305 AGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAAA 31254364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4575 AGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAAA 4634

 31254365 GGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTATG 31254424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4635 GGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTATG 4694

 31254425 TACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATATA 31254484
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4695 TACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATATA 4754

 31254485 CATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATGGA 31254544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4755 CATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATGGA 4814

 31254545 TGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTGCA 31254604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4815 TGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTGCA 4874

 31254605 TGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAGCA 31254664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4875 TGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAGCA 4934

 31254665 ATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAAAA 31254724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4935 ATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAAAA 4994

 31254725 GTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAACCT 31254784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4995 GTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAACCT 5054

 31254785 TAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGTAACCCCTGAATCTAA 31254844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     5055 TAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGTACCCCCTGAATCTAA 5114

 31254845 AATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTCTT 31254904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5115 AATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTCTT 5174

 31254905 TACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAATCTGGCAGTCTCATTC 31254964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5175 TACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAATCTGGCAGTCTCATTC 5234

 31254965 ATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTACCCAGCACTTTGGAGG 31255024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5235 ATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTACCCAGCACTTTGGAGG 5294

 31255025 CCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCTGAGCAATATAGCGAG 31255084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5295 CCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCTGAGCAATATAGCGAG 5354

 31255085 ACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCATTTGCCTGTAATCTCA 31255144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5355 ACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCATTTGCCTGTAATCTCA 5414

 31255145 GGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGA 31255204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5415 GGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGA 5474

 31255205 GCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGCTCCTGTTTCAAAAAA 31255264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5475 GCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGCTCCTGTTTCAAAAAA 5534

 31255265 AAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAGAATCAAGGGGCCGGG 31255324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5535 AAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAGAATCAAGGGGCCGGG 5594

 31255325 CGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGAG 31255384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5595 CGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGAG 5654

 31255385 ATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAATACA 31255444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5655 ATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAATACA 5714

 31255445 AAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC 31255504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5715 AAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC 5774

 31255505 AGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCA 31255564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5775 AGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCA 5834

 31255565 CTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGGA 31255624
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     5835 CTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTC-AAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGGA 5893

 31255625 AACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAAGGTAAATGATTAATA 31255684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5894 AACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAAGGTAAATGATTAATA 5953

 31255685 TCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTTAATCCAAAAATTCATC 31255744
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5954 TCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTTAATCCAAAAATTCATC 6013

 31255745 TACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACACTAAAAATATTTTATC 31255804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6014 TACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACACTAAAAATATTTTATC 6073

 31255805 TCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTAGCAAACTTAAAATTA 31255864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6074 TCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTAGCAAACTTAAAATTA 6133

 31255865 TCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCAAGTCCCTAGGTTCCC 31255924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6134 TCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCAAGTCCCTAGGTTCCC 6193

 31255925 AAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAATAAACTTACCCTTGG 31255984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6194 AAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAATAAACTTACCCTTGG 6253

 31255985 AGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCATTGGCAAAAGTACTCC 31256044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6254 AGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCATTGGCAAAAGTACTCC 6313

 31256045 TTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGCGTAATATTTTCTTCT 31256104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6314 TTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGCGTAATATTTTCTTCT 6373

 31256105 AAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAACCACAAAAATTTATAT 31256164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6374 AAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAACCACAAAAATTTATAT 6433

 31256165 ACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAACCAGAGAAAAAGGAA 31256224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6434 ACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAACCAGAGAAAAAGGAA 6493

 31256225 ATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGACTAGTAAAGAAAAGCA 31256284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6494 ATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGACTAGTAAAGAAAAGCA 6553

 31256285 GAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACTTAAAATGATCTACTG 31256344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6554 GAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACTTAAAATGATCTACTG 6613

 31256345 ATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTTTAGAATTAAAACTCA 31256404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6614 ATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTTTAGAATTAAAACTCA 6673

 31256405 TTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATGGCAATAGGGTTTCAT 31256464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6674 TTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATGGCAATAGGGTTTCAT 6733

 31256465 TCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATCTACAAAATTAACCTG 31256524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6734 TCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATCTACAAAATTAACCTG 6793

 31256525 ACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTTACTGCTCTGGTGTTG 31256584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6794 ACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTTACTGCTCTGGTGTTG 6853

 31256585 TTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATATTTAGCCTATCTCATG 31256644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6854 TTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATATTTAGCCTATCTCATG 6913

 31256645 AAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTACAAGATCACCTGGGAC 31256704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6914 AAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTACAAGATCACCTGGGAC 6973

 31256705 ACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGGAATGTTTAACATCAA 31256764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6974 ACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGGAATGTTTAACATCAA 7033

 31256765 GAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAAATGTGAACAGTAACC 31256824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7034 GAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAAATGTGAACAGTAACC 7093

 31256825 CTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAGTCCTGCTGCTGCCCA 31256884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7094 CTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAGTCCTGCTGCTGCCCA 7153

 31256885 GTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAAGGGGAAAAAAAGACA 31256944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7154 GTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAAGGGGAAAAAAAGACA 7213

 31256945 TTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCATGATAAAATCATGCT 31257004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7214 TTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCATGATAAAATCATGCT 7273

 31257005 GTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATATCACTGCCTTACCCA 31257064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7274 GTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATATCACTGCCTTACCCA 7333

 31257065 ACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGCAGCGGTAGGTTGATG 31257124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7334 ACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGCAGCGGTAGGTTGATG 7393

 31257125 GGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTATAAAGCTGACCAAACA 31257184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7394 GGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTATAAAGCTGACCAAACA 7453

 31257185 GGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGTCTGTAGGGAAAGCAT 31257244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7454 GGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGTCTGTAGGGAAAGCAT 7513

 31257245 TCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCATCCTTTATCTACTCTA 31257304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7514 TCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCATCCTTTATCTACTCTA 7573

 31257305 TGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATTTAACTGAATGTAAACT 31257364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7574 TGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATTTAACTGAATGTAAACT 7633

 31257365 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAG 31257424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7634 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAG 7693

 31257425 TGCAATGGTGTGATCTCGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCT 31257484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7694 TGCAATGGTGTGATCTCGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCT 7753

 31257485 GTCTCAGCCTCCTGAGAAGCTGGGATTACAAACATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTG 31257544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7754 GTCTCAGCCTCCTGAGAAGCTGGGATTACAAACATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTG 7813

 31257545 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCTGGCTAGCTCAAACTCCCGACCTC 31257604
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7814 TATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCTGGCTAGCTCAAACTCCCGACCTC 7873

 31257605 AGGTTATCCGCCCACCTAGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGC 31257664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7874 AGGTTATCCGCCCACCTAGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGC 7933

 31257665 CCAGCCTCTGATTGTAAACTTTATTATAGCCTAGCTATAGTGAAGGCATGGTAAAATATT 31257724
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7934 CCGGCCTCTGATTGTAAACTTTATTATAGCCTAGCTATAGTGAAGGCATGGTAAAATATT 7993

 31257725 TCTAGCTGTTACTTGGAAAAGCAGATGTGACCATACAGATCTTAGATACCTTTAGAGACC 31257784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7994 TCTAGCTGTTACTTGGAAAAGCAGATGTGACCATACAGATCTTAGATACCTTTAGAGACC 8053

 31257785 CGTGGTTGGGATCTGAAGAAAACAAGACACTTACCACAACTGCCTCTGGATAAAGGGGAA 31257844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8054 CGTGGTTGGGATCTGAAGAAAACAAGACACTTACCACAACTGCCTCTGGATAAAGGGGAA 8113

 31257845 ATGCTCAGTTTCCACAAACCAGTGAGTATGAGAGCTATTAACTGTAAAAATACACACAGT 31257904
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     8114 ATGCTCAGTTTCCACAAACCAGTGAGTATGAGAGCTATTAATTGTAAAAATACACACAGT 8173

 31257905 CCTCAGATGGTGAGGGCATGGGTTAGGGTAACAAAAATACAATGGAGAAAAAAGTGGCAT 31257964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8174 CCTCAGATGGTGAGGGCATGGGTTAGGGTAACAAAAATACAATGGAGAAAAAAGTGGCAT 8233

 31257965 TTCCAATGTGACACATTTAAAATATGGAATGGAATTTCATGGGTCACTTGGAAATAAGAT 31258024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8234 TTCCAATGTGACACATTTAAAATATGGAATGGAATTTCATGGGTCACTTGGAAATAAGAT 8293

 31258025 TTTTTTTTCATTGGTATAACTTCAGGCTAGAGATGGTTTGCCACAGAGTAAGTCAAAAAA 31258084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8294 TTTTTTTTCATTGGTATAACTTCAGGCTAGAGATGGTTTGCCACAGAGTAAGTCAAAAAA 8353

 31258085 AATAAAAGAATATGGAGATGACGATGAAAATGACAACTGCCAATAAAAGTCAAAAGGATA 31258144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8354 AATAAAAGAATATGGAGATGACGATGAAAATGACAACTGCCAATAAAAGTCAAAAGGATA 8413

 31258145 GATTTTGAGAACTCTCCAGAAGAGGGAACAAAAAAATCAAAAGATTTTTTCCCTTGGCAA 31258204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8414 GATTTTGAGAACTCTCCAGAAGAGGGAACAAAAAAATCAAAAGATTTTTTCCCTTGGCAA 8473

 31258205 AGTGCCCCCTCCAAAGCACACATAGTCTGCTTCAACCAACAGCCTATACCCACAGTGTTT 31258264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8474 AGTGCCCCCTCCAAAGCACACATAGTCTGCTTCAACCAACAGCCTATACCCACAGTGTTT 8533

 31258265 TCATATACTAAATGGCATATCACTAAATAACAGTAAATGAGATTAAACTGTAGACTTCCT 31258324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8534 TCATATACTAAATGGCATATCACTAAATAACAGTAAATGAGATTAAACTGTAGACTTCCT 8593

 31258325 AGTTGCCTTAAACAACTGATGGTTAATTTCTTGAACACTGAATAACAAATATGCAGTCTC 31258384
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8594 AGTTGCCTTAAACAACTGATGTTTAATTTCTTGAACACTGAATAACAAATATGCAGTCTC 8653

 31258385 ATGACACTGTAAGAAGCTAAAGGTGCTCATTCTTTCCATGAATTCTAAATTGCTATAATA 31258444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8654 ATGACACTGTAAGAAGCTAAAGGTGCTCATTCTTTCCATGAATTCTAAATTGCTATAATA 8713

 31258445 CTTATATTAGGAAAACAGAACAGTGGGAAGGAAAATTTTAAACAAACCCAGAATAAACCA 31258504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8714 CTTATATTAGGAAAACAGAACAGTGGGAAGGAAAATTTTAAACAAACCCAGAATAAACCA 8773

 31258505 CACTTTTGATTGGGTTTCCAGCAATAATCAGTTCCCCATTAGAATGTGGACCCCGAAGTA 31258564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8774 CACTTTTGATTGGGTTTCCAGCAATAATCAGTTCCCCATTAGAATGTGGACCCCGAAGTA 8833

 31258565 TACCAAATGCAAGCTCAGTGGAGCTCAGTCTCCTCAGCTGAAAATGAGAGCTTACTCTGG 31258624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8834 TACCAAATGCAAGCTCAGTGGAGCTCAGTCTCCTCAGCTGAAAATGAGAGCTTACTCTGG 8893

 31258625 AAATGAGCACTTCTTAACATTTTTAACCCATGTTCCATCCTATTAAACATAAAAACCTCA 31258684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8894 AAATGAGCACTTCTTAACATTTTTAACCCATGTTCCATCCTATTAAACATAAAAACCTCA 8953

 31258685 TACTCCCATTGAATGTTATTTGTGACTTCATAACCAAAACCAAAACCAAACCAAAGCAAG 31258744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8954 TACTCCCATTGAATGTTATTTGTGACTTCATAACCAAAACCAAAACCAAACCAAAGCAAG 9013

 31258745 GTAAGTTTTTATTGTTTTTTTTTCAGTGTCTCATCATAACCATTTACAAATTCATTTATT 31258804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9014 GTAAGTTTTTATTGTTTTTTTTTCAGTGTCTCATCATAACCATTTACAAATTCATTTATT 9073

 31258805 TACAAATACTTGCATAAATGGACAGATATTAATAATTAATGCTTTTTTAAATCTTGAAGA 31258864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9074 TACAAATACTTGCATAAATGGACAGATATTAATAATTAATGCTTTTTTAAATCTTGAAGA 9133

 31258865 CAAAAAAGATTTTAAAAAGCCTATGAAGAATAATGATGACAATGAAATGATATTTACTGA 31258924
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     9134 CAAAAAAGATTTTAAAAAGCCTATGAAGACTAATGATGACAATGAAATGATATTTACTGA 9193

 31258925 GACCTTTGGCAAATGATATTTACTGGGACCTTCTTCTCTCCTCCAGAG 31258972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9194 GACCTTTGGCAAATGATATTTACTGGGACCTTCTTCTCTCCTCCAGAG 9241

Alignment time is 8.45443 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    5877] =>      5877 nucs 'mol-32-3190-139223_5877'

Score:        5787
Aligned:      5877        nucs
Identic:      5868 (100%) nucs =>       841 (100%)      5027 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31251480,31252321] EXCISED REGION [31252326,31257358]
 second seq =>  [       1,     842] EXCISED REGION [     843,    5877]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [31252322,31252325]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [31252322,31252338] to [31252326,31252342]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31252322,31252323] to [31252324,31252325]
 second seq =>         0 nucs

 31251480 AAATACCAATATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAG 31251539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATACCAATATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAG 60

 31251540 CAAACCACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCT 31251599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAACCACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCT 120

 31251600 TTACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGG 31251659
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGG 180

 31251660 CAGCAATTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATC 31251719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGCAATTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATC 240

 31251720 AATTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCT 31251779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCT 300

 31251780 CAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTT 31251839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTT 360

 31251840 CCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGG 31251899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGG 420

 31251900 TTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAA 31251959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAA 480

 31251960 ATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTA 31252019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTA 540

 31252020 TTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTG 31252079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTG 600

 31252080 GGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGA 31252139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGA 660

 31252140 GTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGT 31252199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGT 720

 31252200 AATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTT 31252259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTT 780

 31252260 GAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATC 31252319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATC 840

 31252320 TC 31252321
          ||
      841 TC 842

EXCISED REGION

 31252326 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGATA 31252385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGATA 902

 31252386 TTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACTT 31252445
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 TTTATCTATAGTGACAAATATCGGTAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACTT 962

 31252446 GGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTAG 31252505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 GGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTAG 1022

 31252506 TATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 31252565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 TATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 1082

 31252566 GCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAGA 31252625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 GCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAGA 1142

 31252626 TGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGCC 31252685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 TGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGCC 1202

 31252686 TGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGAG 31252745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 TGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGAG 1262

 31252746 GTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTC--AAA 31252803
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
     1263 GTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAAA 1322

 31252804 AAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTC 31252863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 AAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTC 1382

 31252864 ATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGT 31252923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 ATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGT 1442

 31252924 GAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGC 31252983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 GAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGC 1502

 31252984 ATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAG 31253043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 ATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAG 1562

 31253044 TCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCT 31253103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 TCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCT 1622

 31253104 TCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATA 31253163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 TCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATA 1682

 31253164 GCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCAT 31253223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 GCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCAT 1742

 31253224 TAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCT 31253283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 TAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCT 1802

 31253284 GATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTG 31253343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 GATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTG 1862

 31253344 TTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCA 31253403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 TTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCA 1922

 31253404 GGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACAC 31253463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 GGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACAC 1982

 31253464 TAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATA 31253523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 TAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATA 2042

 31253524 AGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTC 31253583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 AGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTC 2102

 31253584 TATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCA 31253643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 TATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCA 2162

 31253644 CAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCA 31253703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 CAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCA 2222

 31253704 TTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGAC 31253763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 TTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGAC 2282

 31253764 CTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTG 31253823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 CTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTG 2342

 31253824 GCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAAT 31253883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 GCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAAT 2402

 31253884 TAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGA 31253943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 TAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGA 2462

 31253944 ATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAA 31254003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 ATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAA 2522

 31254004 GGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAAC 31254063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 GGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAAC 2582

 31254064 AAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACA 31254123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 AAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACA 2642

 31254124 TCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTG 31254183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 TCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTG 2702

 31254184 AGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGC 31254243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 AGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGC 2762

 31254244 AATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTG 31254303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 AATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTG 2822

 31254304 GAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAA 31254363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 GAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAA 2882

 31254364 AGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTAT 31254423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 AGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTAT 2942

 31254424 GTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATAT 31254483
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2943 GTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATAT 3002

 31254484 ACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATGG 31254543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 ACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATGG 3062

 31254544 ATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTGC 31254603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 ATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTGC 3122

 31254604 ATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAGC 31254663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 ATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAGC 3182

 31254664 AATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAAA 31254723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 AATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAAA 3242

 31254724 AGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAACC 31254783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 AGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAACC 3302

 31254784 TTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGTAACCCCTGAATCTA 31254843
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3303 TTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGTACCCCCTGAATCTA 3362

 31254844 AAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTCT 31254903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 AAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTCT 3422

 31254904 TTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAATCTGGCAGTCTCATT 31254963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 TTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAATCTGGCAGTCTCATT 3482

 31254964 CATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTACCCAGCACTTTGGAG 31255023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 CATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTACCCAGCACTTTGGAG 3542

 31255024 GCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCTGAGCAATATAGCGA 31255083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 GCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCTGAGCAATATAGCGA 3602

 31255084 GACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCATTTGCCTGTAATCTC 31255143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 GACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCATTTGCCTGTAATCTC 3662

 31255144 AGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTG 31255203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 AGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTG 3722

 31255204 AGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGCTCCTGTTTCAAAAA 31255263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 AGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGCTCCTGTTTCAAAAA 3782

 31255264 AAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAGAATCAAGGGGCCGG 31255323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 AAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAGAATCAAGGGGCCGG 3842

 31255324 GCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGA 31255383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 GCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGA 3902

 31255384 GATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAATAC 31255443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 GATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAATAC 3962

 31255444 AAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG 31255503
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3963 AAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTACTTGGGAGGCTGAGG 4022

 31255504 CAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGC 31255563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 CAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGC 4082

 31255564 ACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGG 31255623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4083 ACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGG 4142

 31255624 AAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAAGGTAAATGATTAAT 31255683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 AAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAAGGTAAATGATTAAT 4202

 31255684 ATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTTAATCCAAAAATTCAT 31255743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4203 ATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTTAATCCAAAAATTCAT 4262

 31255744 CTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACACTAAAAATATTTTAT 31255803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4263 CTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACACTAAAAATATTTTAT 4322

 31255804 CTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTAGCAAACTTAAAATT 31255863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 CTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTAGCAAACTTAAAATT 4382

 31255864 ATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCAAGTCCCTAGGTTCC 31255923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 ATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCAAGTCCCTAGGTTCC 4442

 31255924 CAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAATAAACTTACCCTTG 31255983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 CAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAATAAACTTACCCTTG 4502

 31255984 GAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCATTGGCAAAAGTACTC 31256043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 GAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCATTGGCAAAAGTACTC 4562

 31256044 CTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGCGTAATATTTTCTTC 31256103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 CTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGCGTAATATTTTCTTC 4622

 31256104 TAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAACCACAAAAATTTATA 31256163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4623 TAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAACCACAAAAATTTATA 4682

 31256164 TACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAACCAGAGAAAAAGGA 31256223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 TACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAACCAGAGAAAAAGGA 4742

 31256224 AATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGACTAGTAAAGAAAAGC 31256283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 AATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGACTAGTAAAGAAAAGC 4802

 31256284 AGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACTTAAAATGATCTACT 31256343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4803 AGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACTTAAAATGATCTACT 4862

 31256344 GATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTTTAGAATTAAAACTC 31256403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4863 GATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTTTAGAATTAAAACTC 4922

 31256404 ATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATGGCAATAGGGTTTCA 31256463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4923 ATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATGGCAATAGGGTTTCA 4982

 31256464 TTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATCTACAAAATTAACCT 31256523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 TTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATCTACAAAATTAACCT 5042

 31256524 GACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTTACTGCTCTGGTGTT 31256583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5043 GACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTTACTGCTCTGGTGTT 5102

 31256584 GTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATATTTAGCCTATCTCAT 31256643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 GTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATATTTAGCCTATCTCAT 5162

 31256644 GAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTACAAGATCACCTGGGA 31256703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5163 GAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTACAAGATCACCTGGGA 5222

 31256704 CACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGGAATGTTTAACATCA 31256763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5223 CACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGGAATGTTTAACATCA 5282

 31256764 AGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAAATGTGAACAGTAAC 31256823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5283 AGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAAATGTGAACAGTAAC 5342

 31256824 CCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAGTCCTGCTGCTGCCC 31256883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5343 CCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAGTCCTGCTGCTGCCC 5402

 31256884 AGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAAGGGGAAAAAAAGAC 31256943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5403 AGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAAGGGGAAAAAAAGAC 5462

 31256944 ATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCATGATAAAATCATGC 31257003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5463 ATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCATGATAAAATCATGC 5522

 31257004 TGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATATCACTGCCTTACCC 31257063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5523 TGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATATCACTGCCTTACCC 5582

 31257064 AACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGCAGCGGTAGGTTGAT 31257123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5583 AACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGCAGCGGTAGGTTGAT 5642

 31257124 GGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTATAAAGCTGACCAAAC 31257183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5643 GGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTATAAAGCTGACCAAAC 5702

 31257184 AGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGTCTGTAGGGAAAGCA 31257243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5703 AGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGTCTGTAGGGAAAGCA 5762

 31257244 TTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCATCCTTTATCTACTCT 31257303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5763 TTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCATCCTTTATCTACTCT 5822

 31257304 ATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATTTAACTGAATG 31257358
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5823 ATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATTTAACTGAATG 5877

Alignment time is 5.29411 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    7163] =>      7163 nucs 'mol-32-321f-269434_7163'

Score:        6921
Aligned:      7015        nucs
Identic:      7004 (100%) nucs =>       235 (100%)      6769 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31241810,31242044] EXCISED REGION [31242054,31248832]
 second seq =>  [     143,     377] EXCISED REGION [     387,    7163]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         9 nucs [31242045,31242053]
 second seq =>         9 nucs [378,386]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31242045,31242046] to [31242052,31242053]
 second seq =>         0 nucs

 31241810 ACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGACTATAAATCATGCTGCTATAAAG 31241869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      143 ACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGACTATAAATCATGCTGCTATAAAG 202

 31241870 ACACATGCACACGTATGTTTATTGTGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAAC 31241929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      203 ACACATGCACACGTATGTTTATTGTGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAAC 262

 31241930 CCAAATGTCCAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGGAAT 31241989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      263 CCAAATGTCCAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGGAAT 322

 31241990 ACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCACGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAA 31242044
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      323 ACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCACGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAA 377

EXCISED REGION

 31242054 CATCATTCTCAGTAAACTGTCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATATTCTCACTCAT 31242113
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      387 CATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATATTCTCACTCAT 446

 31242114 AGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACATGGACACAGGAAGGGGAATATCACACTCTGGGG 31242173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      447 AGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACATGGACACAGGAAGGGGAATATCACACTCTGGGG 506

 31242174 ACTGTTGTGTGGTGGGGGTAGAGGGGAGGGATAACATTGGGAGATATACCTAATGCTAGA 31242233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      507 ACTGTTGTGTGGTGGGGGTAGAGGGGAGGGATAACATTGGGAGATATACCTAATGCTAGA 566

 31242234 TGACGAGTTAGTGGGTGCAGCGCACCAGCGTGGCACATGTATACATATGTAACTAACCTG 31242293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      567 TGACGAGTTAGTGGGTGCAGCGCACCAGCGTGGCACATGTATACATATGTAACTAACCTG 626

 31242294 CACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAAAAAAATTTAAAAAATTAAA 31242353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      627 CACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAAAAAAATTAAAAAAATTAAA 686

 31242354 AAAAAAAGTAAAAGAATCCAAAGAGATACCATGCAGATACTAATCATTAAGAAAACTGGA 31242413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      687 AAAAAAAGTAAAAGAATCCAAAGAGATACCATGCAGATACTAATCATTAAGAAAACTGGA 746

 31242414 GGGAGCTATATTACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAAACATGAGATAATACTAGCAGTAT 31242473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 GGGAGCTATATTACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAAACATGAGATAATACTAGCAGTAT 806

 31242474 TGAGAAATATTTCATAATGATGTAAGAATCAATTATACATATGTAACTAACCTGCACAAC 31242533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      807 TGAGAAATATTTCATAATGATGTAAGAATCAATTATACATATGTAACTAACCTGCACAAC 866

 31242534 GTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAATATAATAATAAAAAAAAAAACATACACACACACA 31242593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      867 GTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAATATAATAATAAAAAAAAAAACATACACACACACA 926

 31242594 CACACAAAAAAAAAA-CAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTGAGCAGAAGCT 31242652
          ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 CACACAAAAAAA---CCAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTGAGCAGAAGCT 983

 31242653 GGAAGTGACTTAAGAAGACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAAAACCTTATGG 31242712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 GGAAGTGACTTAAGAAGACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAAAACCTTATGG 1043

 31242713 TGGATAGATGAATAACTCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTTCCTCACATGA 31242772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1044 TGGATAGATGAATAACTCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTTCCTCACATGA 1103

 31242773 AATAGAAAAGACAAAATAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGG 31242832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1104 AATAGAAAAGACAAAATAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGG 1163

 31242833 GAGGCCAATGCGGATGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 31242892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 GAGGCCAATGCGGATGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 1223

 31242893 TAATCCCTTCTCTACTGAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAA 31242952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 TAATCCCTTCTCTACTGAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAA 1283

 31242953 TCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGC 31243012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 TCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGC 1343

 31243013 ATTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAA 31243072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 ATTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAA 1403

 31243073 AAAAAGACAAAATATACCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAA 31243132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 AAAAAGACAAAATATACCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAA 1463

 31243133 AGGTTGAAAGTGGTGGTCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAA 31243192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 AGGTTGAAAGTGGTGGTCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAA 1523

 31243193 AGAACTGTTTCATTTTCAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGAT 31243252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 AGAACTGTTTCATTTTCAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGAT 1583

 31243253 CTTTTCAAAACTAAACAGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAG 31243312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 CTTTTCAAAACTAAACAGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAG 1643

 31243313 CTTCAGAGTTACAGAATTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTC 31243372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 CTTCAGAGTTACAGAATTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTC 1703

 31243373 AGGATAAAAATCTCTACAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAAT 31243432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 AGGATAAAAATCTCTACAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAAT 1763

 31243433 CGTATCTAGTTCAGTTCTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCA 31243492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 CGTATCTAGTTCAGTTCTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCA 1823

 31243493 AAAGGCCTCTAAGAATCTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTC 31243552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 AAAGGCCTCTAAGAATCTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTC 1883

 31243553 ATAGGAATATTATGGGTGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATG 31243612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 ATAGGAATATTATGGGTGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATG 1943

 31243613 CCTCTCTAAAATAAATGTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACA 31243672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 CCTCTCTAAAATAAATGTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACA 2003

 31243673 CAGGAAGCCCACAAAGTTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGAT 31243732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 CAGGAAGCCCACAAAGTTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGAT 2063

 31243733 AGTGCAAAATGAAAACAGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAA 31243792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 AGTGCAAAATGAAAACAGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAA 2123

 31243793 GGCTACTCAGTTGCAAAAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGA 31243852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 GGCTACTCAGTTGCAAAAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGA 2183

 31243853 GAGCAAAACCTCGAGCCAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGA 31243912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 GAGCAAAACCTCGAGCCAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGA 2243

 31243913 ACTAACATCAGTATATCAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCC 31243972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 ACTAACATCAGTATATCAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCC 2303

 31243973 TATTTGTGAATGGGAATGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTT 31244032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 TATTTGTGAATGGGAATGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTT 2363

 31244033 GGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAAT 31244092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 GGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAAT 2423

 31244093 AACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATT 31244152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 AACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATT 2483

 31244153 CTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGAT 31244212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 CTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGAT 2543

 31244213 AGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGG 31244272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 AGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGG 2603

 31244273 TCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAG 31244332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 TCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAG 2663

 31244333 AATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCG 31244392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 AATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCG 2723

 31244393 TCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTG 31244452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 TCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTG 2783

 31244453 ACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCA 31244512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 ACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCA 2843

 31244513 GGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACC 31244572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 GGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACC 2903

 31244573 ACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTG 31244632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 ACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTG 2963

 31244633 AATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATAT 31244692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 AATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATAT 3023

 31244693 TGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATT 31244752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 TGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATT 3083

 31244753 ATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTG 31244812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 ATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTG 3143

 31244813 AAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGT 31244872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 AAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGT 3203

 31244873 AAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAA 31244932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 AAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAA 3263

 31244933 CACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACT 31244992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 CACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACT 3323

 31244993 ATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAA 31245052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 ATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAA 3383

 31245053 CACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATT 31245112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 CACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATT 3443

 31245113 AAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATG 31245172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 AAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATG 3503

 31245173 TGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACG 31245232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 TGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACG 3563

 31245233 TAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATA 31245292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 TAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATA 3623

 31245293 ATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGA 31245352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 ATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGA 3683

 31245353 GAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTAC 31245412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 GAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTAC 3743

 31245413 TGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGAC 31245472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 TGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGAC 3803

 31245473 CAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTC 31245532
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3804 CAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTC 3863

 31245533 TACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTC 31245592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3864 TACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTC 3923

 31245593 ACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCT 31245652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 ACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCT 3983

 31245653 TTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCAT 31245712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 TTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCAT 4043

 31245713 ACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAA 31245772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 ACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAA 4103

 31245773 ACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAA 31245832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 ACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAA 4163

 31245833 GCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTT 31245892
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4164 GCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTT 4223

 31245893 CCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAAC 31245952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 CCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAAC 4283

 31245953 AGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATT 31246012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 AGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATT 4343

 31246013 CTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTG 31246072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4344 CTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTG 4403

 31246073 ATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCT 31246132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4404 ATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCT 4463

 31246133 ATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTG 31246192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4464 ATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTG 4523

 31246193 TTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATAT 31246252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4524 TTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATAT 4583

 31246253 TTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTT 31246312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4584 TTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTT 4643

 31246313 AAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTT 31246372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4644 AAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTT 4703

 31246373 ACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAG 31246432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4704 ACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAG 4763

 31246433 TTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTT 31246492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4764 TTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTT 4823

 31246493 TCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCA 31246552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4824 TCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCA 4883

 31246553 ATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTC 31246612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4884 ATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTC 4943

 31246613 TCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTT 31246672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4944 TCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTT 5003

 31246673 ACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAA 31246732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5004 ACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAA 5063

 31246733 TGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACT 31246792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5064 TGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACT 5123

 31246793 GATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGT 31246852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5124 GATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGT 5183

 31246853 CTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGG 31246912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5184 CTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGG 5243

 31246913 TTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTC 31246972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5244 TTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTC 5303

 31246973 TTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAG 31247032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5304 TTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAG 5363

 31247033 TCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCA 31247092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5364 TCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCA 5423

 31247093 CTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGACTGTATAGAAA 31247152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     5424 CTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGATTGTATAGAAA 5483

 31247153 GGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTA 31247212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5484 GGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTA 5543

 31247213 TTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATA 31247272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5544 TTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATA 5603

 31247273 TAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGA 31247332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5604 TAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGA 5663

 31247333 AATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCA 31247392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5664 AATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCA 5723

 31247393 AGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTAC 31247452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5724 AGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTAC 5783

 31247453 TACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAATTTATATGCCATAAAATTAATCATTG 31247512
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     5784 TACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAATTTATATACCATAAAATTAATCATTG 5843

 31247513 TCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTA 31247572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5844 TCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTA 5903

 31247573 CTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGA 31247632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5904 CTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGA 5963

 31247633 GTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACT 31247692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5964 GTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACT 6023

 31247693 CAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATGTAGTCTATTG 31247752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6024 CAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATGTAGTCTATTG 6083

 31247753 AGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTTAGTTTCATCCATGCTGCAGCATATAT 31247812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6084 AGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTTAGTTTCATCCATGCTGCAGCATATAT 6143

 31247813 CAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTATTCCAATGTATAGATATGCCTCATTT 31247872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6144 CAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTATTCCAATGTATAGATATGCCTCATTT 6203

 31247873 TGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCATTTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTAT 31247932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6204 TGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCATTTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTAT 6263

 31247933 TACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAAGTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCAT 31247992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6264 TACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAAGTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCAT 6323

 31247993 TTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTTTATATGGCACAATGATTAAAA 31248052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6324 TTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTTTATATGGCACAATGATTAAAA 6383

 31248053 ATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCAGATATTTGGTCAAACATTATTCTCGA 31248112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6384 ATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCAGATATTTGGTCAAACATTATTCTCGA 6443

 31248113 CATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGCATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGA 31248172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6444 CATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGCATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGA 6503

 31248173 GCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCATCTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAA 31248232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6504 GCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCATCTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAA 6563

 31248233 CAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTCCCCAGCAGACTCCCTTCAGACTTCAT 31248292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6564 CAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTCCCCAGCAGACTCCCTTCAGACTTCAT 6623

 31248293 CTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGACTGCCTTTAGACTCAAACTGCAACTCT 31248352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6624 CTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGACTGCCTTTAGACTCAAACTGCAACTCT 6683

 31248353 TTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTA 31248412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6684 TTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTA 6743

 31248413 ATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATC 31248472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6744 ATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATC 6803

 31248473 CTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATTAGC 31248532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6804 CTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAATTAGC 6863

 31248533 CGGGCGTGTTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGG 31248592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6864 CGGGCGTGTTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGG 6923

 31248593 CGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGTAATGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTG 31248652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6924 CGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGTAATGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTG 6983

 31248653 GGTGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAATAAATAAATTTCTTCACACACACACACATACCTG 31248712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6984 GGTGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAATAAATAAATTTCTTCACACACACACACATACCTG 7043

 31248713 ATTCATTCTGTCTCTCTGGAGAACCTTACTACATATGGTAAGTTGGTTTAACTTTAAAAG 31248772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7044 ATTCATTCTGTCTCTCTGGAGAACCTTACTACATATGGTAAGTTGGTTTAACTTTAAAAG 7103

 31248773 AAATAGCCAAACTATTTTCCAAAGTGGTTATAACAATTTACATTCCTACCAACAATGTAT 31248832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7104 AAATAGCCAAACTATTTTCCAAAGTGGTTATAACAATTTACATTCCTACCAACAATGTAT 7163

Alignment time is 6.3872 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    9595] =>      9595 nucs 'mol-32-3235-181268_9595'

Score:        9456
Aligned:      9592        nucs
Identic:      9578 (100%) nucs =>      3952 (100%)      5626 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31242791,31246747] EXCISED REGION [31251770,31257404]
 second seq =>  [       1,    3957] EXCISED REGION [    3965,    9595]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5022 nucs [31246748,31251769]
 second seq =>         7 nucs [3958,3964]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [3956,3957] to [3963,3964]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246748,31246748] to [31251769,31251769]
 second seq =>         0 nucs

 31242791 GGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATGGA 31242850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATGGA 60

 31242851 TCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACTGA 31242910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACTGA 120

 31242911 AAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGG 31242970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGG 180

 31242971 CTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGCAC 31243030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGCAC 240

 31243031 CACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATACC 31243090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATACC 300

 31243091 CCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGGTC 31243150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGGTC 360

 31243151 TCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTTCA 31243210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTTCA 420

 31243211 AGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAACAG 31243270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAACAG 480

 31243271 TTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAATT 31243330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAATT 540

 31243331 ACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTACA 31243390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTACA 600

 31243391 GCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTTCT 31243450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTTCT 660

 31243451 AAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAATCT 31243510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAATCT 720

 31243511 TGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGGTG 31243570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGGTG 780

 31243571 TTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAATGT 31243630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAATGT 840

 31243631 GGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAGTT 31243690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAGTT 900

 31243691 TTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAACAG 31243750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAACAG 960

 31243751 GCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAAAA 31243810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAAAA 1020

 31243811 AATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGCCA 31243870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGCCA 1080

 31243871 GGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCA 31243930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCA 1140

 31243931 AAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATG 31243990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATG 1200

 31243991 TTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAG 31244050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTTTATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAG 1260

 31244051 CTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTT 31244110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTT 1320

 31244111 AAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTA 31244170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTA 1380

 31244171 AATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATT 31244230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATT 1440

 31244231 AAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTC 31244290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTC 1500

 31244291 TCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATA 31244350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATA 1560

 31244351 TGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCAC 31244410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCAC 1620

 31244411 GAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCA 31244470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCA 1680

 31244471 TGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGT 31244530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGT 1740

 31244531 ATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCA 31244590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCA 1800

 31244591 ACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAA 31244650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAA 1860

 31244651 CGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGT 31244710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGT 1920

 31244711 AGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCC 31244770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCC 1980

 31244771 AGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACC 31244830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACC 2040

 31244831 TAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGG 31244890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGG 2100

 31244891 CCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAACTA 31244950
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2101 CCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTCCAAACACAATATACTCCAACTA 2160

 31244951 AATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCA 31245010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCA 2220

 31245011 AGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACT 31245070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACT 2280

 31245071 TTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACT 31245130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACT 2340

 31245131 CTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAAT 31245190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAAT 2400

 31245191 ATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCA 31245250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCA 2460

 31245251 AACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTAT 31245310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTAT 2520

 31245311 GGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTC 31245370
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGAATACAGTGTGGTATTTTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTC 2580

 31245371 TTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAG 31245430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAG 2640

 31245431 AACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCT 31245490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCT 2700

 31245491 CCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAAC 31245550
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAAC 2760

 31245551 GTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTC 31245610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTC 2820

 31245611 TGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGT 31245670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGT 2880

 31245671 ATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAG 31245730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAG 2940

 31245731 GTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTAT 31245790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTAT 3000

 31245791 CTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGT 31245850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3001 CTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGT 3060

 31245851 TAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTA 31245910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTA 3120

 31245911 TGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACA 31245970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACA 3180

 31245971 TCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGA 31246030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGA 3240

 31246031 TAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCA 31246090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCA 3300

 31246091 TATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCAC 31246150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCAC 3360

 31246151 TTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACAT 31246210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACAT 3420

 31246211 TCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGA 31246270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGA 3480

 31246271 TTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCA 31246330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCA 3540

 31246331 TTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATC 31246390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATC 3600

 31246391 TAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTA 31246450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTA 3660

 31246451 ATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCA 31246510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCA 3720

 31246511 GTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATG 31246570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATG 3780

 31246571 TTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGT 31246630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGT 3840

 31246631 CCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCT 31246690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCT 3900

 31246691 TTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 3957

EXCISED REGION

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 4024

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 4084

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 4144

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4145 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 4204

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 4264

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31252129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 4324

 31252130 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 31252189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 4384

 31252190 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31252249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 4444

 31252250 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 31252309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 4504

 31252310 AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 31252369
          ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 AAACTCCATCTC---AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 4561

 31252370 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 31252429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4562 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 4621

 31252430 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 31252489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4622 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 4681

 31252490 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 31252549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4682 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 4741

 31252550 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 31252609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4742 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 4801

 31252610 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 31252669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4802 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 4861

 31252670 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 31252729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4862 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 4921

 31252730 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 31252789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4922 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 4981

 31252790 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 31252849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4982 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 5041

 31252850 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 31252909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5042 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 5101

 31252910 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 31252969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5102 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 5161

 31252970 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 31253029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5162 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 5221

 31253030 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 31253089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5222 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 5281

 31253090 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 31253149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5282 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 5341

 31253150 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 31253209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5342 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 5401

 31253210 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 31253269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5402 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 5461

 31253270 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 31253329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5462 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 5521

 31253330 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 31253389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5522 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 5581

 31253390 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 31253449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5582 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 5641

 31253450 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 31253509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5642 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 5701

 31253510 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 31253569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5702 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 5761

 31253570 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 31253629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5762 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 5821

 31253630 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 31253689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5822 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 5881

 31253690 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 31253749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5882 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 5941

 31253750 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 31253809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5942 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 6001

 31253810 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 31253869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6002 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 6061

 31253870 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 31253929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6062 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 6121

 31253930 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 31253989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6122 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 6181

 31253990 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 31254049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6182 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 6241

 31254050 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 31254109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6242 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 6301

 31254110 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 31254169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6302 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 6361

 31254170 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 31254229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6362 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 6421

 31254230 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 31254289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6422 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 6481

 31254290 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 31254349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6482 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 6541

 31254350 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 31254409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6542 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 6601

 31254410 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAA 31254469
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     6602 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAA 6661

 31254470 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 31254529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     6662 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAACCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 6721

 31254530 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 31254589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6722 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 6781

 31254590 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 31254649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6782 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 6841

 31254650 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 31254709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6842 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 6901

 31254710 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 31254769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6902 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 6961

 31254770 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 31254829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6962 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 7021

 31254830 AACCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 31254889
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7022 ACCCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 7081

 31254890 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAAT 31254949
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     7082 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAACATAGAATCTACAAAAGTAAT 7141

 31254950 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 31255009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7142 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 7201

 31255010 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 31255069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7202 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 7261

 31255070 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 31255129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7262 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 7321

 31255130 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 31255189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7322 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 7381

 31255190 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 31255249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7382 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 7441

 31255250 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 31255309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7442 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 7501

 31255310 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 31255369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7502 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 7561

 31255370 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 31255429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7562 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 7621

 31255430 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 31255489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7622 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 7681

 31255490 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 31255549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7682 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 7741

 31255550 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAA 31255609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     7742 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTC-AAAAAAAAAA 7800

 31255610 AAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAA 31255669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 AAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAA 7860

 31255670 GGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTTA 31255729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     7861 GGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTTA 7920

 31255730 ATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACAC 31255789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 ATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACAC 7980

 31255790 TAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTA 31255849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 TAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTA 8040

 31255850 GCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCA 31255909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 GCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCA 8100

 31255910 AGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAA 31255969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 AGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAA 8160

 31255970 TAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCAT 31256029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 TAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCAT 8220

 31256030 TGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGC 31256089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 TGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGC 8280

 31256090 GTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAAC 31256149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 GTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAAC 8340

 31256150 CACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAA 31256209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8341 CACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAA 8400

 31256210 CCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGAC 31256269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 CCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGAC 8460

 31256270 TAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACT 31256329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8461 TAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACT 8520

 31256330 TAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTT 31256389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8521 TAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTT 8580

 31256390 TAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATG 31256449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8581 TAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATG 8640

 31256450 GCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATC 31256509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8641 GCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATC 8700

 31256510 TACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTT 31256569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 TACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTT 8760

 31256570 ACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATAT 31256629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8761 ACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATAT 8820

 31256630 TTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTAC 31256689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8821 TTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTAC 8880

 31256690 AAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGG 31256749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8881 AAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGG 8940

 31256750 AATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAA 31256809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8941 AATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAA 9000

 31256810 ATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAG 31256869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9001 ATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAG 9060

 31256870 TCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAA 31256929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9061 TCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAA 9120

 31256930 GGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCA 31256989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9121 GGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCA 9180

 31256990 TGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATA 31257049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9181 TGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATA 9240

 31257050 TCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGC 31257109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9241 TCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGC 9300

 31257110 AGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTAT 31257169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9301 AGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTAT 9360

 31257170 AAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGT 31257229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9361 AAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGT 9420

 31257230 CTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCAT 31257289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9421 CTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCAT 9480

 31257290 CCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATTT 31257349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9481 CCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATTT 9540

 31257350 AACTGAATGTAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGC 31257404
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9541 AACTGAATGTAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGC 9595

Alignment time is 8.57854 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3957] =>      3957 nucs 'mol-32-3235-181268_3957'

Score:        3912
Aligned:      3956        nucs
Identic:      3952 (100%) nucs =>      1234 (100%)      2718 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31242791,31244024] EXCISED REGION [31244026,31246747]
 second seq =>  [       1,    1234] EXCISED REGION [    1236,    3957]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31244025,31244025]
 second seq =>         1 nucs [1235,1235]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [1233,1235] to [1234,1236]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31244024,31244024] to [31244026,31244026]
 second seq =>         1 nucs [1234,1234] to [1236,1236]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31242791 GGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATGGA 31242850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATGGA 60

 31242851 TCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACTGA 31242910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACTGA 120

 31242911 AAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGG 31242970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGG 180

 31242971 CTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGCAC 31243030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGCAC 240

 31243031 CACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATACC 31243090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATACC 300

 31243091 CCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGGTC 31243150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGGTC 360

 31243151 TCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTTCA 31243210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTTCA 420

 31243211 AGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAACAG 31243270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAACAG 480

 31243271 TTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAATT 31243330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAATT 540

 31243331 ACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTACA 31243390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTACA 600

 31243391 GCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTTCT 31243450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTTCT 660

 31243451 AAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAATCT 31243510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAATCT 720

 31243511 TGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGGTG 31243570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGGTG 780

 31243571 TTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAATGT 31243630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAATGT 840

 31243631 GGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAGTT 31243690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAGTT 900

 31243691 TTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAACAG 31243750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAACAG 960

 31243751 GCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAAAA 31243810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAAAA 1020

 31243811 AATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGCCA 31243870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGCCA 1080

 31243871 GGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCA 31243930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATATCA 1140

 31243931 AAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATG 31243990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATG 1200

 31243991 TTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATT 31244024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATT 1234

EXCISED REGION

 31244026 TATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGT 31244085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 TATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGT 1295

 31244086 TGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTT 31244145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 TGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTT 1355

 31244146 TGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTG 31244205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 TGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTG 1415

 31244206 ACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCAC 31244265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 ACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCAC 1475

 31244266 TGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGA 31244325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 TGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGA 1535

 31244326 CCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCT 31244385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 CCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCT 1595

 31244386 GGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAAT 31244445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 GGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAAT 1655

 31244446 AAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCT 31244505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 AAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCT 1715

 31244506 CTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCA 31244565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 CTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCA 1775

 31244566 GAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGAC 31244625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 GAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGAC 1835

 31244626 CTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCAC 31244685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 CTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCAC 1895

 31244686 TGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACT 31244745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 TGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACT 1955

 31244746 TATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAAC 31244805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 TATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAAC 2015

 31244806 CTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATT 31244865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 CTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATT 2075

 31244866 ATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATT 31244925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 ATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATT 2135

 31244926 TTTCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAA 31244985
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 TTCCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAA 2195

 31244986 ATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTT 31245045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 ATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTT 2255

 31245046 CATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATA 31245105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 CATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATA 2315

 31245106 GAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAAT 31245165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 GAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAAT 2375

 31245166 ACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTAT 31245225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 ACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTAT 2435

 31245226 GTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTG 31245285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 GTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTG 2495

 31245286 ACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTT 31245345
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2496 ACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTTTGATACTTGTCATTTT 2555

 31245346 TTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTC 31245405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 TTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTC 2615

 31245406 ACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACT 31245465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 ACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACT 2675

 31245466 TGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTATTC 31245525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2676 TGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTATTC 2735

 31245526 TACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGC 31245585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 TACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGC 2795

 31245586 TTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATT 31245645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 TTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATT 2855

 31245646 TCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATC 31245705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 TCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATC 2915

 31245706 CATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCT 31245765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 CATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCT 2975

 31245766 GCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGA 31245825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 GCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGA 3035

 31245826 TATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAA 31245885
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 TATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAA 3095

 31245886 AGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTA 31245945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 AGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTA 3155

 31245946 AATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAAT 31246005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 AATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAAT 3215

 31246006 AGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGA 31246065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 AGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGA 3275

 31246066 TGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGA 31246125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 TGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGA 3335

 31246126 AATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTAT 31246185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 AATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTAT 3395

 31246186 TGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAG 31246245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 TGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAG 3455

 31246246 CTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATA 31246305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 CTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATA 3515

 31246306 GAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTG 31246365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 GAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTG 3575

 31246366 AAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATT 31246425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 AAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATT 3635

 31246426 CTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTA 31246485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 CTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTA 3695

 31246486 TCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCT 31246545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 TCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCT 3755

 31246546 TTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTC 31246605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 TTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTC 3815

 31246606 TGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGT 31246665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 TGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGT 3875

 31246666 TTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTA 31246725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 TTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTA 3935

 31246726 TTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          ||||||||||||||||||||||
     3936 TTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 3957

Alignment time is 4.39613 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2738] =>      2738 nucs 'mol-32-3235-257041_2738'

Score:        2704
Aligned:      2737        nucs
Identic:      2734 (100%) nucs =>       303 (100%)      2431 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31245532,31245834] EXCISED REGION [31245836,31248269]
 second seq =>  [       1,     303] EXCISED REGION [     305,    2738]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31245835,31245835]
 second seq =>         1 nucs [304,304]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31245834,31245834] to [31245835,31245835]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31245532 CTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTT 31245591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTT 60

 31245592 CACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTC 31245651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTC 120

 31245652 TTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCA 31245711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCA 180

 31245712 TACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATA 31245771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATA 240

 31245772 AACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATA 31245831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATA 300

 31245832 AGC 31245834
          |||
      301 AGC 303

EXCISED REGION

 31245836 GTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCA 31245895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      305 GTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCA 364

 31245896 TGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGT 31245955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      365 TGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGT 424

 31245956 TCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTA 31246015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      425 TCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTA 484

 31246016 ACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATG 31246075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 ACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATG 544

 31246076 TTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATT 31246135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 TTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATT 604

 31246136 CAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTC 31246195
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      605 CAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTC 664

 31246196 AGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTT 31246255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 AGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTT 724

 31246256 CTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAG 31246315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 CTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAG 784

 31246316 TTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACC 31246375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 TTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACC 844

 31246376 CATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTT 31246435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 CATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTT 904

 31246436 CATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCT 31246495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 CATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCT 964

 31246496 GCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATG 31246555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 GCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATG 1024

 31246556 TGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCT 31246615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 TGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCT 1084

 31246616 ATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACT 31246675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 ATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACT 1144

 31246676 ATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGT 31246735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 ATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGT 1204

 31246736 TCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGAT 31246795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 TCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGAT 1264

 31246796 TCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTT 31246855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 TCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTT 1324

 31246856 GGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTT 31246915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 GGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTT 1384

 31246916 GGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTT 31246975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 GGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTT 1444

 31246976 TTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCA 31247035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 TTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCA 1504

 31247036 TACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTC 31247095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 TACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTC 1564

 31247096 AACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGACTGTATAGAAAGGG 31247155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1565 AACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGATTGTATAGAAAGGG 1624

 31247156 GGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTT 31247215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 GGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTT 1684

 31247216 AAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAA 31247275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 AAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAA 1744

 31247276 TTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAAT 31247335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 TTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAAT 1804

 31247336 TTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGC 31247395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 TTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGC 1864

 31247396 AAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTAC 31247455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 AAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTAC 1924

 31247456 TTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAATTTATATGCCATAAAATTAATCATTGTCC 31247515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1925 TTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAATTTATATACCATAAAATTAATCATTGTCC 1984

 31247516 ATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTA 31247575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 ATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTA 2044

 31247576 AATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTT 31247635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 AATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTT 2104

 31247636 CATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAA 31247695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 CATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAA 2164

 31247696 TCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGT 31247755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 TCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGT 2224

 31247756 CTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTTAGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAA 31247815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 CTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTTAGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAA 2284

 31247816 TATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTATTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGT 31247875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 TATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTATTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGT 2344

 31247876 TTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCATTTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTAC 31247935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 TTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCATTTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTAC 2404

 31247936 AAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAAGTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTC 31247995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 AAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAAGTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTC 2464

 31247996 TCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATT 31248055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 TCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATT 2524

 31248056 ATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCAGATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACAT 31248115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 ATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCAGATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACAT 2584

 31248116 TTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGCATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCA 31248175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 TTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGCATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCA 2644

 31248176 GATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCATCTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAACAA 31248235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 GATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCATCTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAACAA 2704

 31248236 AAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTCCCC 31248269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 AAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTCCCC 2738

Alignment time is 2.48387 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    9296] =>      9296 nucs 'mol-32-3240-286372_9296'

Score:        9175
Aligned:      9297        nucs
Identic:      9281 (100%) nucs =>       723 (100%)      8558 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31246025,31246747] EXCISED REGION [31251770,31260342]
 second seq =>  [       1,     723] EXCISED REGION [     731,    9296]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5022 nucs [31246748,31251769]
 second seq =>         7 nucs [724,730]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [722,723] to [729,730]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246748,31246748] to [31251769,31251769]
 second seq =>         0 nucs

 31246025 AGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATT 31246084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATT 60

 31246085 TTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTT 31246144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTT 120

 31246145 TCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTT 31246204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTT 180

 31246205 ACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTC 31246264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTC 240

 31246265 TACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTA 31246324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTA 300

 31246325 ATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAAC 31246384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAAC 360

 31246385 CTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTG 31246444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTG 420

 31246445 TCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGA 31246504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGA 480

 31246505 TGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTT 31246564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTT 540

 31246565 AGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTAC 31246624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTAC 600

 31246625 CACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAA 31246684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAA 660

 31246685 TATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGA 31246744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGA 720

 31246745 AAA 31246747
          |||
      721 AAA 723

EXCISED REGION

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 790

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 850

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 910

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 970

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 1030

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31252129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 1090

 31252130 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 31252189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 1150

 31252190 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31252249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 1210

 31252250 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 31252309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 1270

 31252310 AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 31252369
          ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 AAACTCCATCTC----AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 1326

 31252370 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 31252429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 1386

 31252430 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 31252489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 1446

 31252490 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 31252549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 1506

 31252550 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 31252609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 1566

 31252610 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 31252669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 1626

 31252670 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 31252729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 1686

 31252730 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 31252789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 1746

 31252790 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 31252849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 1806

 31252850 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 31252909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 1866

 31252910 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 31252969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 1926

 31252970 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 31253029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 1986

 31253030 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 31253089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 2046

 31253090 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 31253149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 2106

 31253150 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 31253209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 2166

 31253210 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 31253269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 2226

 31253270 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 31253329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 2286

 31253330 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 31253389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 2346

 31253390 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 31253449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 2406

 31253450 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 31253509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 2466

 31253510 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 31253569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 2526

 31253570 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 31253629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 2586

 31253630 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 31253689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 2646

 31253690 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 31253749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 2706

 31253750 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 31253809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 2766

 31253810 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 31253869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 2826

 31253870 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 31253929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 2886

 31253930 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 31253989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 2946

 31253990 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 31254049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 3006

 31254050 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 31254109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 3066

 31254110 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 31254169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 3126

 31254170 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 31254229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 3186

 31254230 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 31254289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 3246

 31254290 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 31254349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 3306

 31254350 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 31254409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 3366

 31254410 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAA 31254469
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3367 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAA 3426

 31254470 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 31254529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 3486

 31254530 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 31254589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 3546

 31254590 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 31254649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 3606

 31254650 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 31254709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 3666

 31254710 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 31254769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 3726

 31254770 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 31254829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 3786

 31254830 AACCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 31254889
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 ACCCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 3846

 31254890 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAAT 31254949
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3847 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAACATAGAATCTACAAAAGTAAT 3906

 31254950 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 31255009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 3966

 31255010 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 31255069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 4026

 31255070 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 31255129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 4086

 31255130 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 31255189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 4146

 31255190 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 31255249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 4206

 31255250 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 31255309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 4266

 31255310 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 31255369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 4326

 31255370 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 31255429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 4386

 31255430 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 31255489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 4446

 31255490 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 31255549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 4506

 31255550 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAA 31255609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAA 4566

 31255610 AAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAA 31255669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 AAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAA 4626

 31255670 GGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTTA 31255729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4627 GGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTTA 4686

 31255730 ATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACAC 31255789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 ATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACAC 4746

 31255790 TAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTA 31255849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 TAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTA 4806

 31255850 GCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCA 31255909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 GCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCA 4866

 31255910 AGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAA 31255969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 AGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAA 4926

 31255970 TAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCAT 31256029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 TAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCAT 4986

 31256030 TGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGC 31256089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 TGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGC 5046

 31256090 GTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAAC 31256149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 GTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAAC 5106

 31256150 CACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAA 31256209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 CACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAA 5166

 31256210 CCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGAC 31256269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 CCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGAC 5226

 31256270 TAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACT 31256329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 TAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACT 5286

 31256330 TAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTT 31256389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 TAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTT 5346

 31256390 TAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATG 31256449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 TAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATG 5406

 31256450 GCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATC 31256509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 GCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATC 5466

 31256510 TACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTT 31256569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 TACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTT 5526

 31256570 ACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATAT 31256629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 ACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATAT 5586

 31256630 TTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTAC 31256689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 TTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTAC 5646

 31256690 AAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGG 31256749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 AAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGG 5706

 31256750 AATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAA 31256809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 AATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAA 5766

 31256810 ATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAG 31256869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 ATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAG 5826

 31256870 TCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAA 31256929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 TCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAA 5886

 31256930 GGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCA 31256989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 GGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCA 5946

 31256990 TGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATA 31257049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 TGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATA 6006

 31257050 TCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGC 31257109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 TCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGC 6066

 31257110 AGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTAT 31257169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 AGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTAT 6126

 31257170 AAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGT 31257229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 AAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGT 6186

 31257230 CTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCAT 31257289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 CTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCAT 6246

 31257290 CCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATTT 31257349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 CCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATTT 6306

 31257350 AACTGAATGTAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTG 31257409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 AACTGAATGTAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTG 6366

 31257410 TTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTCGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCGGGT 31257469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 TTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTCGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCGGGT 6426

 31257470 TCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGAAGCTGGGATTACAAACATGCACCACCAC 31257529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 TCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGAAGCTGGGATTACAAACATGCACCACCAC 6486

 31257530 ACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCTGGCTAGCT 31257589
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     6487 ACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCTGGCTAGCT 6546

 31257590 CAAACTCCCGACCTCAGGTTATCCGCCCACCTAGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 31257649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 CAAACTCCCGACCTCAGGTTATCCGCCCACCTAGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 6606

 31257650 CGTGAGCCACCGTGCCCAGCCTCTGATTGTAAACTTTATTATAGCCTAGCTATAGTGAAG 31257709
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 CGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTCTGATTGTAAACTTTATTATAGCCTAGCTATAGTGAAG 6666

 31257710 GCATGGTAAAATATTTCTAGCTGTTACTTGGAAAAGCAGATGTGACCATACAGATCTTAG 31257769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 GCATGGTAAAATATTTCTAGCTGTTACTTGGAAAAGCAGATGTGACCATACAGATCTTAG 6726

 31257770 ATACCTTTAGAGACCCGTGGTTGGGATCTGAAGAAAACAAGACACTTACCACAACTGCCT 31257829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 ATACCTTTAGAGACCCGTGGTTGGGATCTGAAGAAAACAAGACACTTACCACAACTGCCT 6786

 31257830 CTGGATAAAGGGGAAATGCTCAGTTTCCACAAACCAGTGAGTATGAGAGCTATTAACTGT 31257889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6787 CTGGATAAAGGGGAAATGCTCAGTTTCCACAAACCAGTGAGTATGAGAGCTATTAATTGT 6846

 31257890 AAAAATACACACAGTCCTCAGATGGTGAGGGCATGGGTTAGGGTAACAAAAATACAATGG 31257949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6847 AAAAATACACACAGTCCTCAGATGGTGAGGGCATGGGTTAGGGTAACAAAAATACAATGG 6906

 31257950 AGAAAAAAGTGGCATTTCCAATGTGACACATTTAAAATATGGAATGGAATTTCATGGGTC 31258009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6907 AGAAAAAAGTGGCATTTCCAATGTGACACATTTAAAATATGGAATGGAATTTCATGGGTC 6966

 31258010 ACTTGGAAATAAGATTTTTTTTTCATTGGTATAACTTCAGGCTAGAGATGGTTTGCCACA 31258069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6967 ACTTGGAAATAAGATTTTTTTTTCATTGGTATAACTTCAGGCTAGAGATGGTTTGCCACA 7026

 31258070 GAGTAAGTCAAAAAAAATAAAAGAATATGGAGATGACGATGAAAATGACAACTGCCAATA 31258129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7027 GAGTAAGTCAAAAAAAATAAAAGAATATGGAGATGACGATGAAAATGACAACTGCCAATA 7086

 31258130 AAAGTCAAAAGGATAGATTTTGAGAACTCTCCAGAAGAGGGAACAAAAAAATCAAAAGAT 31258189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7087 AAAGTCAAAAGGATAGATTTTGAGAACTCTCCAGAAGAGGGAACAAAAAAATCAAAAGAT 7146

 31258190 TTTTTCCCTTGGCAAAGTGCCCCCTCCAAAGCACACATAGTCTGCTTCAACCAACAGCCT 31258249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7147 TTTTTCCCTTGGCAAAGTGCCCCCTCCAAAGCACACATAGTCTGCTTCAACCAACAGCCT 7206

 31258250 ATACCCACAGTGTTTTCATATACTAAATGGCATATCACTAAATAACAGTAAATGAGATTA 31258309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7207 ATACCCACAGTGTTTTCATATACTAAATGGCATATCACTAAATAACAGTAAATGAGATTA 7266

 31258310 AACTGTAGACTTCCTAGTTGCCTTAAACAACTGATGGTTAATTTCTTGAACACTGAATAA 31258369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7267 AACTGTAGACTTCCTAGTTGCCTTAAACAACTGATGGTTAATTTCTTGAACACTGAATAA 7326

 31258370 CAAATATGCAGTCTCATGACACTGTAAGAAGCTAAAGGTGCTCATTCTTTCCATGAATTC 31258429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7327 CAAATATGCAGTCTCATGACACTGTAAGAAGCTAAAGGTGCTCATTCTTTCCATGAATTC 7386

 31258430 TAAATTGCTATAATACTTATATTAGGAAAACAGAACAGTGGGAAGGAAAATTTTAAACAA 31258489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7387 TAAATTGCTATAATACTTATATTAGGAAAACAGAACAGTGGGAAGGAAAATTTTAAACAA 7446

 31258490 ACCCAGAATAAACCACACTTTTGATTGGGTTTCCAGCAATAATCAGTTCCCCATTAGAAT 31258549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7447 ACCCAGAATAAACCACACTTTTGATTGGGTTTCCAGCAATAATCAGTTCCCCATTAGAAT 7506

 31258550 GTGGACCCCGAAGTATACCAAATGCAAGCTCAGTGGAGCTCAGTCTCCTCAGCTGAAAAT 31258609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7507 GTGGACCCCGAAGTATACCAAATGCAAGCTCAGTGGAGCTCAGTCTCCTCAGCTGAAAAT 7566

 31258610 GAGAGCTTACTCTGGAAATGAGCACTTCTTAACATTTTTAACCCATGTTCCATCCTATTA 31258669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7567 GAGAGCTTACTCTGGAAATGAGCACTTCTTAACATTTTTAACCCATGTTCCATCCTATTA 7626

 31258670 AACATAAAAACCTCATACTCCCATTGAATGTTATTTGTGACTTCATAACCAAAACCAAAA 31258729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7627 AACATAAAAACCTCATACTCCCATTGAATGTTATTTGTGACTTCATAACCAAAACCAAAA 7686

 31258730 CCAAACCAAAGCAAGGTAAGTTTTTATTG-TTTTTTTTTCAGTGTCTCATCATAACCATT 31258788
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     7687 CCAAACCAAAGCAAGGTAAGTTTTTATTGTTTTTTTTTTCAGTGTCTCATCATAACCATT 7746

 31258789 TACAAATTCATTTATTTACAAATACTTGCATAAATGGACAGATATTAATAATTAATGCTT 31258848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7747 TACAAATTCATTTATTTACAAATACTTGCATAAATGGACAGATATTAATAATTAATGCTT 7806

 31258849 TTTTAAATCTTGAAGACAAAAAAGATTTTAAAAAGCCTATGAAGAATAATGATGACAATG 31258908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7807 TTTTAAATCTTGAAGACAAAAAAGATTTTAAAAAGCCTATGAAGAATAATGATGACAATG 7866

 31258909 AAATGATATTTACTGAGACCTTTGGCAAATGATATTTACTGGGACCTTCTTCTCTCCTCC 31258968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7867 AAATGATATTTACTGAGACCTTTGGCAAATGATATTTACTGGGACCTTCTTCTCTCCTCC 7926

 31258969 AGAGTTACTATTAATATAAATGATCCTTTCTTTACTAGCATTCAGCCAGAAGAAATGCTG 31259028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7927 AGAGTTACTATTAATATAAATGATCCTTTCTTTACTAGCATTCAGCCAGAAGAAATGCTG 7986

 31259029 GCTGATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACACACAC 31259088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||
     7987 GCTGATACACACACACACACACACACACACACACACACACAC----ATACACACACACAC 8042

 31259089 ATATATTAGGCCTTCAATATTTGTTAAATGTTAAAAGAGGTGATAGGTCCTCTTTTACTA 31259148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8043 ATATATTAGGCCTTCAATATTTGTTAAATGTTAAAAGAGGTGATAGGTCCTCTTTTACTA 8102

 31259149 TTCTGAAAATAACAGAACCCTAATATAGTAACCTTTCTCAAGTAATAAAGGATAGAAGCA 31259208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8103 TTCTGAAAATAACAGAACCCTAATATAGTAACCTTTCTCAAGTAATAAAGGATAGAAGCA 8162

 31259209 AGTAGGTTAAGTCTTTGGTATAGAGGTGAACTGTAGAAGCTTTTGACAACAGTTATGTTA 31259268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8163 AGTAGGTTAAGTCTTTGGTATAGAGGTGAACTGTAGAAGCTTTTGACAACAGTTATGTTA 8222

 31259269 ATGAAAACAGTAAGAACACCACCTAATACTAGCACATTTATAAAACACTTAGCAATGTCT 31259328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8223 ATGAAAACAGTAAGAACACCACCTAATACTAGCACATTTATAAAACACTTAGCAATGTCT 8282

 31259329 AACGTACTTTATGTAATTTCGACCCTACAGCTGTATGAAGTGAATATTATTATTTGATTA 31259388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8283 AACGTACTTTATGTAATTTCGACCCTACAGCTGTATGAAGTGAATATTATTATTTGATTA 8342

 31259389 AAACAGTGTCATGAAGCTGTTCAAAGTCACACAGCTAGTTAAGCAGCAGAGCTCAGACTT 31259448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8343 AAACAGTGTCATGAAGCTGTTCAAAGTCACACAGCTAGTTAAGCAGCAGAGCTCAGACTT 8402

 31259449 AAAACTCTCTGAGAGCTATCCCATTCACTAACAGCTCTTTATTTTGTCATGAAATGTGGA 31259508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8403 AAAACTCTCTGAGAGCTATCCCATTCACTAACAGCTCTTTATTTTGTCATGAAATGTGGA 8462

 31259509 AAATATCCTCATCCAAACTCCAAAATCAGCATATACATAAGCACAACCTTTTTTTCTCTC 31259568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8463 AAATATCCTCATCCAAACTCCAAAATCAGCATATACATAAGCACAACCTTTTTTTCTCTC 8522

 31259569 AACCTACCCAATACCCCTTTCTACCAATTCCCATAAAAATTCTTGGAGTTCCTATTGCAG 31259628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8523 AACCTACCCAATACCCCTTTCTACCAATTCCCATAAAAATTCTTGGAGTTCCTATTGCAG 8582

 31259629 CGTCTTTATGTCTTCATACTGGTATGACCAAGGGCACAATGGAAGACTTCTTTCAAAAGG 31259688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8583 CGTCTTTATGTCTTCATACTGGTATGACCAAGGGCACAATGGAAGACTTCTTTCAAAAGG 8642

 31259689 GAACCACCTTCAATCTAAGTCTTGTCTCCTATAACTGTCCCCAAAATGGACATCATCACA 31259748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8643 GAACCACCTTCAATCTAAGTCTTGTCTCCTATAACTGTCCCCAAAATGGACATCATCACA 8702

 31259749 GGCATAGGCTTTTCAAACCATTAACTAGTGAGGAAATGTCTGGGGTTGTCTGTTCCTCAT 31259808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8703 GGCATAGGCTTTTCAAACCATTAACTAGTGAGGAAATGTCTGGGGTTGTCTGTTCCTCAT 8762

 31259809 TTAAAATCAGTCAAATAGGACACATACTACCACTTCATTCCTAAAAGTTGAGCAAGAATC 31259868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8763 TTAAAATCAGTCAAATAGGACACATACTACCACTTCATTCCTAAAAGTTGAGCAAGAATC 8822

 31259869 ATCCTCATATCTCCAGCTTTCTGGTTTAGCAAGCAGACACCCGACTCTGGGGACTTGGTA 31259928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8823 ATCCTCATATCTCCAGCTTTCTGGTTTAGCAAGCAGACACCCGACTCTGGGGACTTGGTA 8882

 31259929 AAGGCCAACTGCACAAGAATAAAAAGTGTAACAGAACTGGCAGTTACAGTCTTAGCAATT 31259988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8883 AAGGCCAACTGCACAAGAATAAAAAGTGTAACAGAACTGGCAGTTACAGTCTTAGCAATT 8942

 31259989 TTAAAAAATCATTCCAAATGTTTTGGTAGAAATCTTATTAAAGAATGCTAAACTACTGGC 31260048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8943 TTAAAAAATCATTCCAAATGTTTTGGTAGAAATCTTATTAAAGAATGCTAAACTACTGGC 9002

 31260049 ATTAGTAATTTACTGTAAATGAAAGGTATACTAAAGGTAGAATTTTATTCATATAAAATA 31260108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9003 ATTAGTAATTTACTGTAAATGAAAGGTATACTAAAGGTAGAATTTTATTCATATAAAATA 9062

 31260109 AACTATTTTACTTCTGAAGGTTATTATGAAGATGAGGCTAAATTATATGAAAAATGCTAA 31260168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9063 AACTATTTTACTTCTGAAGGTTATTATGAAGATGAGGCTAAATTATATGAAAAATGCTAA 9122

 31260169 GCATCCCGCCTAGCTCATAGTAACTACGCAGTAAGTGTCAGCTGCTATTAGTAATACTGC 31260228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9123 GCATCCCGCCTAGCTCATAGTAACTACGCAGTAAGTGTCAGCTGCTATTAGTAATACTGC 9182

 31260229 AGAAGTATTAAAAATAAAACATAACAACGGAAGGCCATATTTAAAATGAACCAGCAATCA 31260288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9183 AGAAGTATTAAAAATAAAACATAACAACGGAAGGCCATATTTAAAATGAACCAGCAATCA 9242

 31260289 ACATTCTGTGTTTAAACATCAACAAAAAACATATCCATCTGTGGTATGTATACA 31260342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9243 ACATTCTGTGTTTAAACATCAACAAAAAACATATCCATCTGTGGTATGTATACA 9296

Alignment time is 8.67745 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3558] =>      3558 nucs 'mol-32-32f0-139993_3558'

Score:        3526
Aligned:      3559        nucs
Identic:      3556 (100%) nucs =>      1527 (100%)      2029 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31248644,31250170] EXCISED REGION [31250172,31252203]
 second seq =>  [       1,    1527] EXCISED REGION [    1528,    3558]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31250171,31250171]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31250195,31250195]
 second seq =>         1 nucs [1551,1551]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [31250171,31250181] to [31250172,31250182]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31248644 TCCAGCCTGGGTGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAATAAATAAATTTCTTCACACACACAC 31248703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCAGCCTGGGTGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAATAAATAAATTTCTTCACACACACAC 60

 31248704 ACATACCTGATTCATTCTGTCTCTCTGGAGAACCTTACTACATATGGTAAGTTGGTTTAA 31248763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATACCTGATTCATTCTGTCTCTCTGGAGAACCTTACTACATATGGTAAGTTGGTTTAA 120

 31248764 CTTTAAAAGAAATAGCCAAACTATTTTCCAAAGTGGTTATAACAATTTACATTCCTACCA 31248823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTTAAAAGAAATAGCCAAACTATTTTCCAAAGTGGTTATAACAATTTACATTCCTACCA 180

 31248824 ACAATGTATAATATGAGAGTTCCTGTTTCTCCACATCCTAGACACTATATACTGTCTTTT 31248883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAATGTATAATATGAGAGTTCCTGTTTCTCCACATCCTAGACACTATATACTGTCTTTT 240

 31248884 TTATTACAGCCATCCTAGGGGATGTAATCTCATTGTGGTATCTCATTGTGTTTTTAATGT 31248943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATTACAGCCATCCTAGGGGATGTAATCTCATTGTGGTATCTCATTGTGTTTTTAATGT 300

 31248944 GTATCTTCCTAATGACTAATGATGCTCACTGTGCTTACATGTGGCTATTAATCACTCTCA 31249003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTATCTTCCTAATGACTAATGATGCTCACTGTGCTTACATGTGGCTATTAATCACTCTCA 360

 31249004 TGTCTTTTCAGATGAAGTGTCTATTCTGTTCTTTTGCTCACTGTTAAGTTGGGTTGTTTG 31249063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTCTTTTCAGATGAAGTGTCTATTCTGTTCTTTTGCTCACTGTTAAGTTGGGTTGTTTG 420

 31249064 CCTTATTATTTACTTATAATTCTTTACATGTTTTGGATACAAGTCCTTTATCACACATGA 31249123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTTATTATTTACTTATAATTCTTTACATGTTTTGGATACAAGTCCTTTATCACACATGA 480

 31249124 TTTGCAAATATTTTCTCCCAGTCTGCAGCCTATCTTTTCAGTTTCTTCCCAATGTCTTTT 31249183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGCAAATATTTTCTCCCAGTCTGCAGCCTATCTTTTCAGTTTCTTCCCAATGTCTTTT 540

 31249184 GTAGCATAAAAATGTTAATTTTAATTAAGTCAAATTCATCAATTTTTTATCTTATGGCTC 31249243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTAGCATAAAAATGTTAATTTTAATTAAGTCAAATTCATCAATTTTTTATCTTATGGCTC 600

 31249244 ATGCTTCTGGTGTCATACCTAACAACTCTGCCTAATCCAAGGTCATAAAGTTTCTTCTAT 31249303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGCTTCTGGTGTCATACCTAACAACTCTGCCTAATCCAAGGTCATAAAGTTTCTTCTAT 660

 31249304 GCTTTCTTTTAGAAGTTTTATAATTTTAGCTCTTACATTTAGGCCCCTAATTCATTGTCA 31249363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTTTCTTTTAGAAGTTTTATAATTTTAGCTCTTACATTTAGGCCCCTAATTCATTGTCA 720

 31249364 GCTAATTTTTGTGTATTGTTATTGTGAGGAAGTTAATTTTTGTATATGATATCCAATTTT 31249423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTAATTTTTGTGTATTGTTATTGTGAGGAAGTTAATTTTTGTATATGATATCCAATTTT 780

 31249424 TCCAGCACCATTTGTTGAAAAAATAACCCTTTCTCTATTTGTCTTAGCAGCTCTTCCAAA 31249483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCAGCACCATTTGTTGAAAAAATAACCCTTTCTCTATTTGTCTTAGCAGCTCTTCCAAA 840

 31249484 AATCAATGGACCAAAAATGTAAATGTTTATTTCTGGACTCTCAATTCCTCTCCATTGATT 31249543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATCAATGGACCAAAAATGTAAATGTTTATTTCTGGACTCTCAATTCCTCTCCATTGATT 900

 31249544 TATATGCTTATCCTATGCCACGGCCACGTTGTCCTGAATACTGTCACCTTAGATTGAGTT 31249603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATATGCTTATCCTATGCCACGGCCACGTTGTCCTGAATACTGTCACCTTAGATTGAGTT 960

 31249604 TTGAAATGGGGATGTATAAATCCTCCAATTTTGTTCTTTTACTCATTTATTTTAAATTTT 31249663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGAAATGGGGATGTATAAATCCTCCAATTTTGTTCTTTTACTCATTTATTTTAAATTTT 1020

 31249664 ATTTGATCCCACTGTACTAAGTGTACTTAGTAATACCACCTTAAATCCTTTCTTAGACAA 31249723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTGATCCCACTGTACTAAGTGTACTTAGTAATACCACCTTAAATCCTTTCTTAGACAA 1080

 31249724 GATAGATATAAATATAAAAATAAAATAGGCTATATTTTAAAGACGTTTTCAAAATAACAT 31249783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATAGATATAAATATAAAAATAAAATAGGCTATATTTTAAAGACGTTTTCAAAATAACAT 1140

 31249784 AATCCTTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTAAAATTAAGTT 31249843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATCCTTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTAAAATTAAGTT 1200

 31249844 TTCCCACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTACTGAATGCCTACTATGTACCAGGCA 31249903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCCCACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTACTGAATGCCTACTATGTACCAGGCA 1260

 31249904 CAGTGCAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGCA 31249963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGTGCAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGCA 1320

 31249964 CTTAAATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACAA 31250023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTAAATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACAA 1380

 31250024 AAGATATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAA 31250083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGATATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAA 1440

 31250084 AAAAAAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACATG 31250143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAAAAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACATG 1500

 31250144 TACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAAT 31250170
          |||||||||||||||||||||||||||
     1501 TACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAAT 1527

EXCISED REGION

 31250172 AAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAATTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTA 31250231
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 AAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAATTTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTA 1587

 31250232 GAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATC 31250291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 GAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATC 1647

 31250292 ATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGA 31250351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 ATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGA 1707

 31250352 GTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAAC 31250411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 GTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAAC 1767

 31250412 TTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAA 31250471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 TTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAA 1827

 31250472 GTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAAT 31250531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 GTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAAT 1887

 31250532 AGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTG 31250591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 AGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTG 1947

 31250592 AATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTA 31250651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 AATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTA 2007

 31250652 TTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAG 31250711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 TTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAG 2067

 31250712 GAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATT 31250771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 GAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATT 2127

 31250772 GCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAA 31250831
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     2128 GCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAG-AAAAAAAAA 2186

 31250832 AAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGA 31250891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 AAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGA 2246

 31250892 GGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCA 31250951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 GGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCA 2306

 31250952 TCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTAT 31251011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 TCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTAT 2366

 31251012 TTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAAC 31251071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 TTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAAC 2426

 31251072 TCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATAC 31251131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 TCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATAC 2486

 31251132 TCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTG 31251191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 TCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTG 2546

 31251192 ACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTAT 31251251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 ACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTAT 2606

 31251252 GCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGC 31251311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 GCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGC 2666

 31251312 ATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAG 31251371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 ATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAG 2726

 31251372 TAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGG 31251431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 TAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGG 2786

 31251432 GTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATAT 31251491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 GTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATAT 2846

 31251492 ACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAA 31251551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 ACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAA 2906

 31251552 ACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTTACAAAAATAC 31251611
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2907 ACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTCACAAAAATAC 2966

 31251612 AGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATA 31251671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 AGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATA 3026

 31251672 CAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTG 31251731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 CAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTG 3086

 31251732 GCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATC 31251791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 GCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATC 3146

 31251792 TTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATA 31251851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 TTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATA 3206

 31251852 TAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAAT 31251911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 TAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAAT 3266

 31251912 AAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACA 31251971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 AAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACA 3326

 31251972 AAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAA 31252031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 AAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAA 3386

 31252032 CTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGT 31252091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 CTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGT 3446

 31252092 GGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGT 31252151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 GGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGT 3506

 31252152 CTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATC 31252203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 CTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATC 3558

Alignment time is 3.5331 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3588] =>      3588 nucs 'mol-32-32f0-139994_3588'

Score:        3543
Aligned:      3587        nucs
Identic:      3583 (100%) nucs =>       681 (100%)      2902 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31244825,31245505] EXCISED REGION [31245507,31248412]
 second seq =>  [       1,     681] EXCISED REGION [     683,    3588]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31245506,31245506]
 second seq =>         1 nucs [682,682]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31245506,31245507] to [31245507,31245508]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31245503,31245505] to [31245507,31245509]
 second seq =>         3 nucs [679,681] to [683,685]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31244825 TGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCT 31244884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCT 60

 31244885 GAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTC 31244944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTC 120

 31244945 CAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGA 31245004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGA 180

 31245005 TAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCA 31245064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCA 240

 31245065 GTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTAT 31245124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTAT 300

 31245125 GGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGA 31245184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGA 360

 31245185 TGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTG 31245244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTG 420

 31245245 TGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATAT 31245304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATAT 480

 31245305 ATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAG 31245364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAG 540

 31245365 CTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAA 31245424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAA 600

 31245425 CACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTC 31245484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTC 660

 31245485 ATCTCTCCTATCTCTTCCCCA 31245505
          |||||||||||||||||||||
      661 ATCTCTCCTATCTCTTCCCCA 681

EXCISED REGION

 31245507 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 31245566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      683 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 742

 31245567 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 31245626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      743 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 802

 31245627 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 31245686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      803 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 862

 31245687 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 31245746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      863 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 922

 31245747 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 31245806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      923 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 982

 31245807 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 31245866
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      983 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 1042

 31245867 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 31245926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1043 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 1102

 31245927 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 31245986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1103 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 1162

 31245987 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 31246046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1163 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 1222

 31246047 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 31246106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1223 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 1282

 31246107 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 31246166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1283 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 1342

 31246167 TTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 31246226
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1343 TTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 1402

 31246227 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 31246286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 1462

 31246287 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 31246346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 1522

 31246347 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 31246406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 1582

 31246407 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 31246466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 1642

 31246467 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 31246526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 1702

 31246527 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 31246586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 1762

 31246587 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 31246646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 1822

 31246647 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 31246706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 1882

 31246707 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 31246766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 1942

 31246767 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 31246826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 2002

 31246827 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 31246886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 2062

 31246887 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 31246946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 2122

 31246947 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 31247006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 2182

 31247007 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 31247066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 2242

 31247067 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 31247126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 2302

 31247127 TGTTAGGCTACCAGACTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 31247186
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 TGTTAGGCTACCAGATTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 2362

 31247187 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 31247246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 2422

 31247247 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 31247306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 2482

 31247307 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 31247366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 2542

 31247367 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 31247426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 2602

 31247427 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 31247486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 2662

 31247487 TTTATATGCCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTA 31247546
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 TTTATATACCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTA 2722

 31247547 GTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTT 31247606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 GTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTT 2782

 31247607 TCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTA 31247666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 TCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTA 2842

 31247667 GTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGT 31247726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2843 GTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGT 2902

 31247727 GAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTT 31247786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2903 GAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTT 2962

 31247787 AGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTA 31247846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 AGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTA 3022

 31247847 TTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCAT 31247906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3023 TTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCAT 3082

 31247907 TTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAA 31247966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3083 TTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAA 3142

 31247967 GTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCT 31248026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3143 GTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCT 3202

 31248027 GAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCA 31248086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3203 GAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCA 3262

 31248087 GATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGC 31248146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3263 GATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGC 3322

 31248147 ATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCAT 31248206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3323 ATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCAT 3382

 31248207 CTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTC 31248266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3383 CTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTC 3442

 31248267 CCCAGCAGACTCCCTTCAGACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGAC 31248326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3443 CCCAGCAGACTCCCTTCAGACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGAC 3502

 31248327 TGCCTTTAGACTCAAACTGCAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTG 31248386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3503 TGCCTTTAGACTCAAACTGCAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTG 3562

 31248387 GCCGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTA 31248412
          ||||||||||||||||||||||||||
     3563 GCCGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTA 3588

Alignment time is 3.27424 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3750] =>      3750 nucs 'mol-32-32f0-175283_3750'

Score:        3705
Aligned:      3749        nucs
Identic:      3745 (100%) nucs =>      1157 (100%)      2588 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31244349,31245505] EXCISED REGION [31245507,31248098]
 second seq =>  [       1,    1157] EXCISED REGION [    1159,    3750]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31245506,31245506]
 second seq =>         1 nucs [1158,1158]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31245506,31245507] to [31245507,31245508]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31245503,31245505] to [31245507,31245509]
 second seq =>         3 nucs [1155,1157] to [1159,1161]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31244349 TATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCC 31244408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCC 60

 31244409 ACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTAC 31244468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTAC 120

 31244469 CATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATAT 31244528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATAT 180

 31244529 GTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGT 31244588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGT 240

 31244589 CAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAG 31244648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAG 300

 31244649 AACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAG 31244708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAG 360

 31244709 GTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTT 31244768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTT 420

 31244769 CCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAA 31244828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAA 480

 31244829 CCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGA 31244888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGA 540

 31244889 GGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAAC 31244948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAAC 600

 31244949 TAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAAT 31245008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAAT 660

 31245009 CAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCA 31245068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCA 720

 31245069 CTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTA 31245128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTA 780

 31245129 CTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAA 31245188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAA 840

 31245189 ATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGAC 31245248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGAC 900

 31245249 CAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTT 31245308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTT 960

 31245309 ATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTC 31245368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTC 1020

 31245369 TCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACC 31245428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACC 1080

 31245429 AGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCT 31245488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCT 1140

 31245489 CTCCTATCTCTTCCCCA 31245505
          |||||||||||||||||
     1141 CTCCTATCTCTTCCCCA 1157

EXCISED REGION

 31245507 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 31245566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 1218

 31245567 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 31245626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 1278

 31245627 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 31245686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 1338

 31245687 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 31245746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 1398

 31245747 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 31245806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 1458

 31245807 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 31245866
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 1518

 31245867 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 31245926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 1578

 31245927 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 31245986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 1638

 31245987 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 31246046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 1698

 31246047 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 31246106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 1758

 31246107 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 31246166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 1818

 31246167 TTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 31246226
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 TTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 1878

 31246227 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 31246286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 1938

 31246287 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 31246346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 1998

 31246347 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 31246406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 2058

 31246407 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 31246466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 2118

 31246467 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 31246526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 2178

 31246527 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 31246586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 2238

 31246587 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 31246646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 2298

 31246647 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 31246706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 2358

 31246707 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 31246766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 2418

 31246767 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 31246826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 2478

 31246827 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 31246886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 2538

 31246887 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 31246946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 2598

 31246947 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 31247006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 2658

 31247007 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 31247066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 2718

 31247067 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 31247126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 2778

 31247127 TGTTAGGCTACCAGACTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 31247186
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 TGTTAGGCTACCAGATTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 2838

 31247187 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 31247246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 2898

 31247247 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 31247306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 2958

 31247307 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 31247366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 3018

 31247367 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 31247426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 3078

 31247427 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 31247486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 3138

 31247487 TTTATATGCCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTA 31247546
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 TTTATATACCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTA 3198

 31247547 GTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTT 31247606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 GTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTT 3258

 31247607 TCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTA 31247666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 TCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTA 3318

 31247667 GTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGT 31247726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 GTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGT 3378

 31247727 GAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTT 31247786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 GAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTT 3438

 31247787 AGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTA 31247846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 AGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTA 3498

 31247847 TTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCAT 31247906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 TTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCAT 3558

 31247907 TTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAA 31247966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 TTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAA 3618

 31247967 GTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCT 31248026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 GTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCT 3678

 31248027 GAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCA 31248086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 GAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCA 3738

 31248087 GATATTTGGTCA 31248098
          ||||||||||||
     3739 GATATTTGGTCA 3750

Alignment time is 3.34912 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,   11703] =>     11703 nucs 'mol-32-3306-037436_11703'

Score:       11541
Aligned:     11697        nucs
Identic:     11682 (100%) nucs =>      2696 (100%)      8986 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31245812,31248511] EXCISED REGION [31248514,31257509]
 second seq =>  [      11,    2710] EXCISED REGION [    2711,   11703]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [31248512,31248513]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [31248512,31248525] to [31248514,31248527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31248512,31248512] to [31248513,31248513]
 second seq =>         0 nucs

 31245812 TCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGT 31245871
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       11 TCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGT 70

 31245872 TATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTC 31245931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       71 TATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTC 130

 31245932 CCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATT 31245991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      131 CCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATT 190

 31245992 GTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGAT 31246051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      191 GTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGAT 250

 31246052 TTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCAT 31246111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      251 TTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCAT 310

 31246112 GTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGC 31246171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      311 GTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGC 370

 31246172 TTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTC 31246231
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      371 TTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTC 430

 31246232 AGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTT 31246291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      431 AGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTT 490

 31246292 TCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCT 31246351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 TCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCT 550

 31246352 TGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGT 31246411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 TGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGT 610

 31246412 TTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTG 31246471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 TTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTG 670

 31246472 GTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATT 31246531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 GTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATT 730

 31246532 TCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTA 31246591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 TCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTA 790

 31246592 AATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGT 31246651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 AATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGT 850

 31246652 GTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAAT 31246711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 GTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAAT 910

 31246712 TGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTT 31246771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 TGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTT 970

 31246772 GATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCAGGTGT 31246831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 GATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCAGGTGT 1030

 31246832 TCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGG 31246891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 TCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGG 1090

 31246892 ATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAGGTAGT 31246951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 ATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAGGTAGT 1150

 31246952 GTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGT 31247011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 GTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGT 1210

 31247012 AGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGTACTTT 31247071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 AGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGTACTTT 1270

 31247072 TGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGATGTTA 31247131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 TGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGATGTTA 1330

 31247132 GGCTACCAGACTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAG 31247191
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 GGCTACCAGATTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAG 1390

 31247192 TTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAACAAAAA 31247251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 TTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAACAAAAA 1450

 31247252 GAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAATTTTGA 31247311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 GAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAATTTTGA 1510

 31247312 TCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAG 31247371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 TCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAG 1570

 31247372 CAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGTGTGTC 31247431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 CAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGTGTGTC 1630

 31247432 CCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAATTTAT 31247491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 CCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAATTTAT 1690

 31247492 ATGCCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTAGTCCA 31247551
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 ATACCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTAGTCCA 1750

 31247552 TTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTTTCCAT 31247611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 TTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTTTCCAT 1810

 31247612 TATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCC 31247671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 TATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCC 1870

 31247672 CCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGTGAAAT 31247731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 CCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGTGAAAT 1930

 31247732 CATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTTAGTTT 31247791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 CATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTTAGTTT 1990

 31247792 CATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTATTCCA 31247851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 CATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTATTCCA 2050

 31247852 ATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCATTTTTT 31247911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 ATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCATTTTTT 2110

 31247912 CTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAAGTCTT 31247971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 CTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAAGTCTT 2170

 31247972 TGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTT 31248031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 TGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTT 2230

 31248032 TATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCAGATAT 31248091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 TATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCAGATAT 2290

 31248092 TTGGTCAAACATTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGCATTTA 31248151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 TTGGTCAAACATTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGCATTTA 2350

 31248152 GACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCATCTAAT 31248211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 GACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCATCTAAT 2410

 31248212 GAGTTGATGGCCTGAATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTCCCCAG 31248271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 GAGTTGATGGCCTGAATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTCCCCAG 2470

 31248272 CAGACTCCCTTCAGACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGACTGCCT 31248331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 CAGACTCCCTTCAGACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGACTGCCT 2530

 31248332 TTAGACTCAAACTGCAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTGGCCGG 31248391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 TTAGACTCAAACTGCAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTGGCCGG 2590

 31248392 GCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGA 31248451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 GCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGA 2650

 31248452 GGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATAC 31248511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 GGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATAC 2710

EXCISED REGION

 31248514 AAAAAAAAAAAAAATTAGCCGGGCGTGTTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGA 31248573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 AAAAAAAAAAAAAATTAGCCGGGCGTGTTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGA 2770

 31248574 GGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGTAATGAGCCGAGATCGC 31248633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 GGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGTAATGAGCCGAGATCGC 2830

 31248634 ACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAATAAATAAATTTCTTC 31248693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 ACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAATAAATAAATTTCTTC 2890

 31248694 ACACACACACACATACCTGATTCATTCTGTCTCTCTGGAGAACCTTACTACATATGGTAA 31248753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 ACACACACACACATACCTGATTCATTCTGTCTCTCTGGAGAACCTTACTACATATGGTAA 2950

 31248754 GTTGGTTTAACTTTAAAAGAAATAGCCAAACTATTTTCCAAAGTGGTTATAACAATTTAC 31248813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 GTTGGTTTAACTTTAAAAGAAATAGCCAAACTATTTTCCAAAGTGGTTATAACAATTTAC 3010

 31248814 ATTCCTACCAACAATGTATAATATGAGAGTTCCTGTTTCTCCACATCCTAGACACTATAT 31248873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 ATTCCTACCAACAATGTATAATATGAGAGTTCCTGTTTCTCCACATCCTAGACACTATAT 3070

 31248874 ACTGTCTTTTTTATTACAGCCATCCTAGGGGATGTAATCTCATTGTGGTATCTCATTGTG 31248933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 ACTGTCTTTTTTATTACAGCCATCCTAGGGGATGTAATCTCATTGTGGTATCTCATTGTG 3130

 31248934 TTTTTAATGTGTATCTTCCTAATGACTAATGATGCTCACTGTGCTTACATGTGGCTATTA 31248993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 TTTTTAATGTGTATCTTCCTAATGACTAATGATGCTCACTGTGCTTACATGTGGCTATTA 3190

 31248994 ATCACTCTCATGTCTTTTCAGATGAAGTGTCTATTCTGTTCTTTTGCTCACTGTTAAGTT 31249053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 ATCACTCTCATGTCTTTTCAGATGAAGTGTCTATTCTGTTCTTTTGCTCACTGTTAAGTT 3250

 31249054 GGGTTGTTTGCCTTATTATTTACTTATAATTCTTTACATGTTTTGGATACAAGTCCTTTA 31249113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 GGGTTGTTTGCCTTATTATTTACTTATAATTCTTTACATGTTTTGGATACAAGTCCTTTA 3310

 31249114 TCACACATGATTTGCAAATATTTTCTCCCAGTCTGCAGCCTATCTTTTCAGTTTCTTCCC 31249173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 TCACACATGATTTGCAAATATTTTCTCCCAGTCTGCAGCCTATCTTTTCAGTTTCTTCCC 3370

 31249174 AATGTCTTTTGTAGCATAAAAATGTTAATTTTAATTAAGTCAAATTCATCAATTTTTTAT 31249233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3371 AATGTCTTTTGTAGCATAAAAATGTTAATTTTAATTAAGTCAAATTCATCAATTTTTTAT 3430

 31249234 CTTATGGCTCATGCTTCTGGTGTCATACCTAACAACTCTGCCTAATCCAAGGTCATAAAG 31249293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 CTTATGGCTCATGCTTCTGGTGTCATACCTAACAACTCTGCCTAATCCAAGGTCATAAAG 3490

 31249294 TTTCTTCTATGCTTTCTTTTAGAAGTTTTATAATTTTAGCTCTTACATTTAGGCCCCTAA 31249353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 TTTCTTCTATGCTTTCTTTTAGAAGTTTTATAATTTTAGCTCTTACATTTAGGCCCCTAA 3550

 31249354 TTCATTGTCAGCTAATTTTTGTGTATTGTTATTGTGAGGAAGTTAATTTTTGTATATGAT 31249413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3551 TTCATTGTCAGCTAATTTTTGTGTATTGTTATTGTGAGGAAGTTAATTTTTGTATATGAT 3610

 31249414 ATCCAATTTTTCCAGCACCATTTGTTGAAAAAATAACCCTTTCTCTATTTGTCTTAGCAG 31249473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 ATCCAATTTTTCCAGCACCATTTGTTGAAAAAATAACCCTTTCTCTATTTGTCTTAGCAG 3670

 31249474 CTCTTCCAAAAATCAATGGACCAAAAATGTAAATGTTTATTTCTGGACTCTCAATTCCTC 31249533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3671 CTCTTCCAAAAATCAATGGACCAAAAATGTAAATGTTTATTTCTGGACTCTCAATTCCTC 3730

 31249534 TCCATTGATTTATATGCTTATCCTATGCCACGGCCACGTTGTCCTGAATACTGTCACCTT 31249593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3731 TCCATTGATTTATATGCTTATCCTATGCCACGGCCACGTTGTCCTGAATACTGTCACCTT 3790

 31249594 AGATTGAGTTTTGAAATGGGGATGTATAAATCCTCCAATTTTGTTCTTTTACTCATTTAT 31249653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3791 AGATTGAGTTTTGAAATGGGGATGTATAAATCCTCCAATTTTGTTCTTTTACTCATTTAT 3850

 31249654 TTTAAATTTTATTTGATCCCACTGTACTAAGTGTACTTAGTAATACCACCTTAAATCCTT 31249713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3851 TTTAAATTTTATTTGATCCCACTGTACTAAGTGTACTTAGTAATACCACCTTAAATCCTT 3910

 31249714 TCTTAGACAAGATAGATATAAATATAAAAATAAAATAGGCTATATTTTAAAGACGTTTTC 31249773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3911 TCTTAGACAAGATAGATATAAATATAAAAATAAAATAGGCTATATTTTAAAGACGTTTTC 3970

 31249774 AAAATAACATAATCCTTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTA 31249833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3971 AAAATAACATAATCCTTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTA 4030

 31249834 AAATTAAGTTTTCCCACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTACTGAATGCCTACTAT 31249893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4031 AAATTAAGTTTTCCCACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTACTGAATGCCTACTAT 4090

 31249894 GTACCAGGCACAGTGCAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAATAATATATACTTAC 31249953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4091 GTACCAGGCACAGTGCAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAATAATATATACTTAC 4150

 31249954 TCACTTAGCACTTAAATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAACAGGTATGTACAAGA 31250013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4151 TCACTTAGCACTTAAATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAACAGGTATGTACAAGA 4210

 31250014 TAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGT 31250073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4211 TAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGT 4270

 31250074 TTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAA 31250133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4271 TTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAA 4330

 31250134 TGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAATAAAAAAAAAAAATTAAAAAAAAA 31250193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     4331 TGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAAT-AAAAAAAAAAATTAAAAAAAAA 4389

 31250194 AATTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTAGAAATGAGGTCTCGCTATGTTG 31250253
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 ATTTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTAGAAATGAGGTCTCGCTATGTTG 4449

 31250254 CCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATCATAGCGCACTATAGCCATGAAC 31250313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4450 CCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATCATAGCGCACTATAGCCATGAAC 4509

 31250314 TCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGC 31250373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4510 TCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGC 4569

 31250374 ACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAACTTCTACCAGCTTTAATGTTCTT 31250433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4570 ACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAACTTCTACCAGCTTTAATGTTCTT 4629

 31250434 TGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAAGTGCTAAATTTTAAATTTGATA 31250493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4630 TGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAAGTGCTAAATTTTAAATTTGATA 4689

 31250494 GAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAATAGGGCTGGGCACAGTGGCTCAC 31250553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4690 GAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAATAGGGCTGGGCACAGTGGCTCAC 4749

 31250554 GCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTGAATCACTTGAGATCAGGAGTTC 31250613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4750 GCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTGAATCACTTGAGATCAGGAGTTC 4809

 31250614 GAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAGAGATTGGCC 31250673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4810 GAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAGAGATTGGCC 4869

 31250674 GGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGC 31250733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4870 GGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGC 4929

 31250734 TTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACTGCTCTCCAGCCTGG 31250793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4930 TTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACTGCTCTCCAGCCTGG 4989

 31250794 GTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTTACAAATTTTG 31250853
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     4990 GTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAG-AAAAAAAAAAAAAAAAGTTTTACAAATTTTG 5048

 31250854 GTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTG 31250913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5049 GTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTG 5108

 31250914 AAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTG 31250973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5109 AAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTG 5168

 31250974 CTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTATTTCACCTCCAACCCACCTTACT 31251033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5169 CTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTATTTCACCTCCAACCCACCTTACT 5228

 31251034 CTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAA 31251093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5229 CTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAA 5288

 31251094 ACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATACTCAGATCAATCTCAAACCTTAT 31251153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5289 ACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATACTCAGATCAATCTCAAACCTTAT 5348

 31251154 TTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACATCAGAATAACTAGTAAAAC 31251213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5349 TTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACATCAGAATAACTAGTAAAAC 5408

 31251214 TTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTA 31251273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5409 TTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTA 5468

 31251274 ATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATA 31251333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5469 ATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATA 5528

 31251334 GTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAG 31251393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5529 GTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAG 5588

 31251394 TAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAAT 31251453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5589 TAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAAT 5648

 31251454 ACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATATACACTACGTAATATACATTGTG 31251513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5649 ACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATATACACTACGTAATATACATTGTG 5708

 31251514 ATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTA 31251573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5709 ATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTA 5768

 31251574 GTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTTACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATA 31251633
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5769 GTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTCACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATA 5828

 31251634 TAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATT 31251693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5829 TAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATT 5888

 31251694 CAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAA 31251753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5889 CAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAA 5948

 31251754 TAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGG 31251813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5949 TAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGG 6008

 31251814 TTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGAT 31251873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6009 TTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGAT 6068

 31251874 GTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTC 31251933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6069 GTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTC 6128

 31251934 TCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAAT 31251993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6129 TCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAAT 6188

 31251994 AGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCAC 31252053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6189 AGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCAC 6248

 31252054 AGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGG 31252113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6249 AGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGG 6308

 31252114 AGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATT 31252173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6309 AGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATT 6368

 31252174 AGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 31252233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6369 AGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 6428

 31252234 TTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGC 31252293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6429 TTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGC 6488

 31252294 CTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAG 31252353
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
     6489 CTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCTC--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAG 6546

 31252354 AGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGC 31252413
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     6547 AGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGGTAGC 6606

 31252414 CACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTC 31252473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 CACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTC 6666

 31252474 AAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGT 31252533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 AAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGT 6726

 31252534 GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGG 31252593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGG 6786

 31252594 AGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACT 31252653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 AGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACT 6846

 31252654 ACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAG 31252713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6847 ACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAG 6906

 31252714 GCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGC 31252773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6907 GCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGC 6966

 31252774 CTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATT 31252833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6967 CTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATT 7026

 31252834 GAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATT 31252893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7027 GAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATT 7086

 31252894 CCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGT 31252953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7087 CCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGT 7146

 31252954 GATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTC 31253013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7147 GATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTC 7206

 31253014 TACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACA 31253073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7207 TACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACA 7266

 31253074 CTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATA 31253133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7267 CTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATA 7326

 31253134 ACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACT 31253193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7327 ACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACT 7386

 31253194 ATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTA 31253253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7387 ATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTA 7446

 31253254 AAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCA 31253313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7447 AAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCA 7506

 31253314 TAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTC 31253373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7507 TAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTC 7566

 31253374 GTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGT 31253433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7567 GTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGT 7626

 31253434 CCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACG 31253493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7627 CCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACG 7686

 31253494 GACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTT 31253553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7687 GACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTT 7746

 31253554 TAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAG 31253613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7747 TAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAG 7806

 31253614 CCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAA 31253673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7807 CCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAA 7866

 31253674 TGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATG 31253733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7867 TGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATG 7926

 31253734 CACACAGTCATATGCATATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACC 31253793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7927 CACACAGTCATATGCATATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACC 7986

 31253794 TAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTG 31253853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7987 TAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTG 8046

 31253854 CAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGA 31253913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8047 CAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGA 8106

 31253914 ACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATC 31253973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8107 ACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATC 8166

 31253974 CAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAAC 31254033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8167 CAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAAC 8226

 31254034 CTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACA 31254093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8227 CTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACA 8286

 31254094 GCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAA 31254153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8287 GCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAA 8346

 31254154 ACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAAT 31254213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8347 ACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAAT 8406

 31254214 AATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAA 31254273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8407 AATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAA 8466

 31254274 ATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAAC 31254333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8467 ATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAAC 8526

 31254334 TACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACA 31254393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8527 TACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACA 8586

 31254394 CATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAA 31254453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8587 CATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAA 8646

 31254454 GGTGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAA 31254513
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8647 GATGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAA 8706

 31254514 AATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAA 31254573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8707 AATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAA 8766

 31254574 TTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACA 31254633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8767 TTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACA 8826

 31254634 TTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGA 31254693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8827 TTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGA 8886

 31254694 GAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACC 31254753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8887 GAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACC 8946

 31254754 TAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAA 31254813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8947 TAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAA 9006

 31254814 ATCTTGTGGCACATGTAACCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATA 31254873
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9007 ATCTTGTGGCACATGTACCCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATA 9066

 31254874 CAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAG 31254933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9067 CAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAG 9126

 31254934 AATCTACAAAAGTAATCTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACC 31254993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9127 AATCTACAAAAGTAATCTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACC 9186

 31254994 CACTGCCTAAAATTACCCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGG 31255053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9187 CACTGCCTAAAATTACCCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGG 9246

 31255054 AGTTCTAGACAAGCCTGAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAG 31255113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9247 AGTTCTAGACAAGCCTGAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAG 9306

 31255114 TAGGGCTTGGTGGCATTTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGC 31255173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9307 TAGGGCTTGGTGGCATTTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGC 9366

 31255174 ACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCT 31255233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9367 ACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCT 9426

 31255234 GGGTGACAGAGTGAGCTCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAAC 31255293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9427 GGGTGACAGAGTGAGCTCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAAC 9486

 31255294 TTTTGCTGTTAAAAAGAATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCA 31255353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9487 TTTTGCTGTTAAAAAGAATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCA 9546

 31255354 CTTTAGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAAC 31255413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9547 CTTTAGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAAC 9606

 31255414 ACGGTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCAC 31255473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9607 ACGGTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCAC 9666

 31255474 CTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGA 31255533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9667 CTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGA 9726

 31255534 GTTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCC 31255593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9727 GTTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCC 9786

 31255594 ATCTC-AAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTA 31255652
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9787 ATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTA 9846

 31255653 GGCACTGGGGAACTAAAGGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGC 31255712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9847 GGCACTGGGGAACTAAAGGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGC 9906

 31255713 AGATTTAGACAGATTTAATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCC 31255772
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9907 AGATTTAAACAGATTTAATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCC 9966

 31255773 AGACAGTTAAGGTACACTAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTT 31255832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9967 AGACAGTTAAGGTACACTAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTT 10026

 31255833 ACTTTGCCTACACACTAGCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTG 31255892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10027 ACTTTGCCTACACACTAGCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTG 10086

 31255893 TTTCGTTTCAGTCCCCAAGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGT 31255952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10087 TTTCGTTTCAGTCCCCAAGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGT 10146

 31255953 GCTATAAGCAGTAAGAATAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACC 31256012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10147 GCTATAAGCAGTAAGAATAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACC 10206

 31256013 TGAGATTAAGGCAGCATTGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCA 31256072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10207 TGAGATTAAGGCAGCATTGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCA 10266

 31256073 TTCTTATGCTCCATGGCGTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAG 31256132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10267 TTCTTATGCTCCATGGCGTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAG 10326

 31256133 AAAGCCTTTTTGCCAACCACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCC 31256192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10327 AAAGCCTTTTTGCCAACCACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCC 10386

 31256193 AGTATATACTTTTAAAACCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACA 31256252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10387 AGTATATACTTTTAAAACCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACA 10446

 31256253 AACTTCTAACAGCTGACTAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCT 31256312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10447 AACTTCTAACAGCTGACTAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCT 10506

 31256313 TTGCATCTGAGGCAACTTAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGG 31256372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10507 TTGCATCTGAGGCAACTTAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGG 10566

 31256373 GCCAAAATTTATCCTTTTAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAG 31256432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10567 GCCAAAATTTATCCTTTTAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAG 10626

 31256433 ATGTAATCTTTAATATGGCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAAT 31256492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10627 ATGTAATCTTTAATATGGCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAAT 10686

 31256493 GAATAGATTCAAAAATCTACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAAT 31256552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10687 GAATAGATTCAAAAATCTACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAAT 10746

 31256553 TTTAAAACTAATATGTTACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGAC 31256612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10747 TTTAAAACTAATATGTTACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGAC 10806

 31256613 TGCAAAGGAATGAATATTTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAA 31256672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10807 TGCAAAGGAATGAATATTTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAA 10866

 31256673 ACAGGAGGTTCGCCTACAAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAA 31256732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10867 ACAGGAGGTTCGCCTACAAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAA 10926

 31256733 GGTTACTGGAGCCTGGGAATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAG 31256792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10927 GGTTACTGGAGCCTGGGAATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAG 10986

 31256793 AAGGAACTACACAGGAAATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACT 31256852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10987 AAGGAACTACACAGGAAATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACT 11046

 31256853 GCCTGTGATAAATGAAGTCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAG 31256912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11047 GCCTGTGATAAATGAAGTCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAG 11106

 31256913 AGAGGGATGGAGAAAAAGGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGC 31256972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11107 AGAGGGATGGAGAAAAAGGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGC 11166

 31256973 ATAAATTTATAACGGCATGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATT 31257032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11167 ATAAATTTATAACGGCATGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATT 11226

 31257033 GCTACATATGTACTATATCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGA 31257092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11227 GCTACATATGTACTATATCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGA 11286

 31257093 CACTTGAAGGATCAGGCAGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAG 31257152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11287 CACTTGAAGGATCAGGCAGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAG 11346

 31257153 GGAAACGTGGCTCCTATAAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACA 31257212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11347 GGAAACGTGGCTCCTATAAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACA 11406

 31257213 TCTTGTTCCTAGTCAGTCTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATC 31257272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11407 TCTTGTTCCTAGTCAGTCTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATC 11466

 31257273 AGAAATTCCTACTCCATCCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCC 31257332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11467 AGAAATTCCTACTCCATCCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCC 11526

 31257333 AGAAGCTTAGAGAATTTAACTGAATGTAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAG 31257392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11527 AGAAGCTTAGAGAATTTAACTGAATGTAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAG 11586

 31257393 ACGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTCGGCTCACCACA 31257452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11587 ACGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTCGGCTCACCACA 11646

 31257453 ACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGAAGCTGGGA 31257509
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11647 ACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGAAGCTGGGA 11703

Alignment time is 10.718 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    9109] =>      9109 nucs 'mol-32-3306-078133_9109'

Score:        8977
Aligned:      9110        nucs
Identic:      9093 (100%) nucs =>       541 (100%)      8552 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31246207,31246747] EXCISED REGION [31251770,31260336]
 second seq =>  [       1,     541] EXCISED REGION [     549,    9109]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5022 nucs [31246748,31251769]
 second seq =>         7 nucs [542,548]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [540,541] to [547,548]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246748,31246748] to [31251769,31251769]
 second seq =>         0 nucs

 31246207 ACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTA 31246266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTA 60

 31246267 CAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAAT 31246326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAAT 120

 31246327 CCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCT 31246386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCT 180

 31246387 TATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTC 31246446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTC 240

 31246447 TTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATG 31246506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATG 300

 31246507 TCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAG 31246566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAG 360

 31246567 CATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCA 31246626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCA 420

 31246627 CTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATA 31246686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATA 480

 31246687 TTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAA 31246746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAA 540

 31246747 A 31246747
          |
      541 A 541

EXCISED REGION

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      549 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 608

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      609 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 668

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      669 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 728

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      729 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 788

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      789 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 848

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31252129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 908

 31252130 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 31252189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 968

 31252190 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31252249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 1028

 31252250 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 31252309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 1088

 31252310 AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 31252369
          ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 AAACTCCATCTC--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 1146

 31252370 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 31252429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 1206

 31252430 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 31252489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 1266

 31252490 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 31252549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 1326

 31252550 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 31252609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 1386

 31252610 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 31252669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 1446

 31252670 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 31252729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 1506

 31252730 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 31252789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 1566

 31252790 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 31252849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 1626

 31252850 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 31252909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 1686

 31252910 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 31252969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 1746

 31252970 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 31253029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 1806

 31253030 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 31253089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 1866

 31253090 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 31253149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 1926

 31253150 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 31253209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 1986

 31253210 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 31253269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 2046

 31253270 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 31253329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 2106

 31253330 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 31253389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 2166

 31253390 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 31253449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 2226

 31253450 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 31253509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 2286

 31253510 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 31253569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 2346

 31253570 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 31253629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 2406

 31253630 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 31253689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 2466

 31253690 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 31253749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 2526

 31253750 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 31253809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 2586

 31253810 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 31253869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 2646

 31253870 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 31253929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 2706

 31253930 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 31253989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 2766

 31253990 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 31254049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 2826

 31254050 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 31254109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 2886

 31254110 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 31254169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 2946

 31254170 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 31254229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 3006

 31254230 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 31254289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 3066

 31254290 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 31254349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 3126

 31254350 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 31254409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 3186

 31254410 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAA 31254469
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3187 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAA 3246

 31254470 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 31254529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 3306

 31254530 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 31254589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 3366

 31254590 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 31254649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 3426

 31254650 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 31254709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 3486

 31254710 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 31254769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 3546

 31254770 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 31254829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 3606

 31254830 AACCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 31254889
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 ACCCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 3666

 31254890 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAAT 31254949
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3667 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAACATAGAATCTACAAAAGTAAT 3726

 31254950 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 31255009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 3786

 31255010 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 31255069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 3846

 31255070 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 31255129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 3906

 31255130 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 31255189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 3966

 31255190 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 31255249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 4026

 31255250 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 31255309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 4086

 31255310 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 31255369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 4146

 31255370 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 31255429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 4206

 31255430 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 31255489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 4266

 31255490 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 31255549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 4326

 31255550 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTC-AAAAAAAAAA 31255608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     4327 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAA 4386

 31255609 AAAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAA 31255668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 AAAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAA 4446

 31255669 AGGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTT 31255728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4447 AGGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTT 4506

 31255729 AATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACA 31255788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 AATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACA 4566

 31255789 CTAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACT 31255848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 CTAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACT 4626

 31255849 AGCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCC 31255908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 AGCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCC 4686

 31255909 AAGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGA 31255968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 AAGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGA 4746

 31255969 ATAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCA 31256028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 ATAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCA 4806

 31256029 TTGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGG 31256088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 TTGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGG 4866

 31256089 CGTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAA 31256148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 CGTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAA 4926

 31256149 CCACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAA 31256208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 CCACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAA 4986

 31256209 ACCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGA 31256268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 ACCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGA 5046

 31256269 CTAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAAC 31256328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 CTAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAAC 5106

 31256329 TTAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTT 31256388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 TTAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTT 5166

 31256389 TTAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATAT 31256448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 TTAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATAT 5226

 31256449 GGCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAAT 31256508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 GGCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAAT 5286

 31256509 CTACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGT 31256568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 CTACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGT 5346

 31256569 TACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATA 31256628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 TACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATA 5406

 31256629 TTTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTA 31256688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 TTTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTA 5466

 31256689 CAAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGG 31256748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 CAAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGG 5526

 31256749 GAATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGA 31256808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 GAATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGA 5586

 31256809 AATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAA 31256868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 AATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAA 5646

 31256869 GTCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAA 31256928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 GTCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAA 5706

 31256929 AGGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGC 31256988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 AGGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGC 5766

 31256989 ATGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTAT 31257048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 ATGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTAT 5826

 31257049 ATCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGG 31257108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 ATCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGG 5886

 31257109 CAGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTA 31257168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 CAGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTA 5946

 31257169 TAAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAG 31257228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 TAAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAG 6006

 31257229 TCTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCA 31257288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 TCTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCA 6066

 31257289 TCCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATT 31257348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 TCCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATT 6126

 31257349 TAACTGAATGTAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTT 31257408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 TAACTGAATGTAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTT 6186

 31257409 GTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTCGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCGGG 31257468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 GTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTCGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCGGG 6246

 31257469 TTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGAAGCTGGGATTACAAACATGCACCACCA 31257528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 TTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGAAGCTGGGATTACAAACATGCACCACCA 6306

 31257529 CACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCTGGCTAGC 31257588
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     6307 CACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCTGGCTAGC 6366

 31257589 TCAAACTCCCGACCTCAGGTTATCCGCCCACCTAGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 31257648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 TCAAACTCCCGACCTCAGGTTATCCGCCCACCTAGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 6426

 31257649 GCGTGAGCCACCGTGCCCAGCCTCTGATTGTAAACTTTATTATAGCCTAGCTATAGTGAA 31257708
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 GCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTCTGATTGTAAACTTTATTATAGCCTAGCTATAGTGAA 6486

 31257709 GGCATGGTAAAATATTTCTAGCTGTTACTTGGAAAAGCAGATGTGACCATACAGATCTTA 31257768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 GGCATGGTAAAATATTTCTAGCTGTTACTTGGAAAAGCAGATGTGACCATACAGATCTTA 6546

 31257769 GATACCTTTAGAGACCCGTGGTTGGGATCTGAAGAAAACAAGACACTTACCACAACTGCC 31257828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 GATACCTTTAGAGACCCGTGGTTGGGATCTGAAGAAAACAAGACACTTACCACAACTGCC 6606

 31257829 TCTGGATAAAGGGGAAATGCTCAGTTTCCACAAACCAGTGAGTATGAGAGCTATTAACTG 31257888
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     6607 TCTGGATAAAGGGGAAATGCTCAGTTTCCACAAACCAGTGAGTATGAGAGCTATTAATTG 6666

 31257889 TAAAAATACACACAGTCCTCAGATGGTGAGGGCATGGGTTAGGGTAACAAAAATACAATG 31257948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 TAAAAATACACACAGTCCTCAGATGGTGAGGGCATGGGTTAGGGTAACAAAAATACAATG 6726

 31257949 GAGAAAAAAGTGGCATTTCCAATGTGACACATTTAAAATATGGAATGGAATTTCATGGGT 31258008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 GAGAAAAAAGTGGCATTTCCAATGTGACACATTTAAAATATGGAATGGAATTTCATGGGT 6786

 31258009 CACTTGGAAATAAGATTTTTTTTTCATTGGTATAACTTCAGGCTAGAGATGGTTTGCCAC 31258068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 CACTTGGAAATAAGATTTTTTTTTCATTGGTATAACTTCAGGCTAGAGATGGTTTGCCAC 6846

 31258069 AGAGTAAGTCAAAAAAAATAAAAGAATATGGAGATGACGATGAAAATGACAACTGCCAAT 31258128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6847 AGAGTAAGTCAAAAAAAATAAAAGAATATGGAGATGACGATGAAAATGACAACTGCCAAT 6906

 31258129 AAAAGTCAAAAGGATAGATTTTGAGAACTCTCCAGAAGAGGGAACAAAAAAATCAAAAGA 31258188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6907 AAAAGTCAAAAGGATAGATTTTGAGAACTCTCCAGAAGAGGGAACAAAAAAATCAAAAGA 6966

 31258189 TTTTTTCCCTTGGCAAAGTGCCCCCTCCAAAGCACACATAGTCTGCTTCAACCAACAGCC 31258248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6967 TTTTTTCCCTTGGCAAAGTGCCCCCTCCAAAGCACACATAGTCTGCTTCAACCAACAGCC 7026

 31258249 TATACCCACAGTGTTTTCATATACTAAATGGCATATCACTAAATAACAGTAAATGAGATT 31258308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7027 TATACCCACAGTGTTTTCATATACTAAATGGCATATCACTAAATAACAGTAAATGAGATT 7086

 31258309 AAACTGTAGACTTCCTAGTTGCCTTAAACAACTGATGGTTAATTTCTTGAACACTGAATA 31258368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7087 AAACTGTAGACTTCCTAGTTGCCTTAAACAACTGATGGTTAATTTCTTGAACACTGAATA 7146

 31258369 ACAAATATGCAGTCTCATGACACTGTAAGAAGCTAAAGGTGCTCATTCTTTCCATGAATT 31258428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7147 ACAAATATGCAGTCTCATGACACTGTAAGAAGCTAAAGGTGCTCATTCTTTCCATGAATT 7206

 31258429 CTAAATTGCTATAATACTTATATTAGGAAAACAGAACAGTGGGAAGGAAAATTTTAAACA 31258488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7207 CTAAATTGCTATAATACTTATATTAGGAAAACAGAACAGTGGGAAGGAAAATTTTAAACA 7266

 31258489 AACCCAGAATAAACCACACTTTTGATTGGGTTTCCAGCAATAATCAGTTCCCCATTAGAA 31258548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7267 AACCCAGAATAAACCACACTTTTGATTGGGTTTCCAGCAATAATCAGTTCCCCATTAGAA 7326

 31258549 TGTGGACCCCGAAGTATACCAAATGCAAGCTCAGTGGAGCTCAGTCTCCTCAGCTGAAAA 31258608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7327 TGTGGACCCCGAAGTATACCAAATGCAAGCTCAGTGGAGCTCAGTCTCCTCAGCTGAAAA 7386

 31258609 TGAGAGCTTACTCTGGAAATGAGCACTTCTTAACATTTTTAACCCATGTTCCATCCTATT 31258668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7387 TGAGAGCTTACTCTGGAAATGAGCACTTCTTAACATTTTTAACCCATGTTCCATCCTATT 7446

 31258669 AAACATAAAAACCTCATACTCCCATTGAATGTTATTTGTGACTTCATAACCAAAACCAAA 31258728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7447 AAACATAAAAACCTCATACTCCCATTGAATGTTATTTGTGACTTCATAACCAAAACCAAA 7506

 31258729 ACCAAACCAAAGCAAGGTAAGTTTTTATTG-TTTTTTTTTCAGTGTCTCATCATAACCAT 31258787
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     7507 ACCAAACCAAAGCAAGGTAAGTTTTTATTGTTTTTTTTTTCAGTGTCTCATCATAACCAT 7566

 31258788 TTACAAATTCATTTATTTACAAATACTTGCATAAATGGACAGATATTAATAATTAATGCT 31258847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7567 TTACAAATTCATTTATTTACAAATACTTGCATAAATGGACAGATATTAATAATTAATGCT 7626

 31258848 TTTTTAAATCTTGAAGACAAAAAAGATTTTAAAAAGCCTATGAAGAATAATGATGACAAT 31258907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7627 TTTTTAAATCTTGAAGACAAAAAAGATTTTAAAAAGCCTATGAAGAATAATGATGACAAT 7686

 31258908 GAAATGATATTTACTGAGACCTTTGGCAAATGATATTTACTGGGACCTTCTTCTCTCCTC 31258967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7687 GAAATGATATTTACTGAGACCTTTGGCAAATGATATTTACTGGGACCTTCTTCTCTCCTC 7746

 31258968 CAGAGTTACTATTAATATAAATGATCCTTTCTTTACTAGCATTCAGCCAGAAGAAATGCT 31259027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7747 CAGAGTTACTATTAATATAAATGATCCTTTCTTTACTAGCATTCAGCCAGAAGAAATGCT 7806

 31259028 GGCTGATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACACACA 31259087
          |||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7807 GGCTGAT------ACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACACACA 7860

 31259088 CATATATTAGGCCTTCAATATTTGTTAAATGTTAAAAGAGGTGATAGGTCCTCTTTTACT 31259147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 CATATATTAGGCCTTCAATATTTGTTAAATGTTAAAAGAGGTGATAGGTCCTCTTTTACT 7920

 31259148 ATTCTGAAAATAACAGAACCCTAATATAGTAACCTTTCTCAAGTAATAAAGGATAGAAGC 31259207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 ATTCTGAAAATAACAGAACCCTAATATAGTAACCTTTCTCAAGTAATAAAGGATAGAAGC 7980

 31259208 AAGTAGGTTAAGTCTTTGGTATAGAGGTGAACTGTAGAAGCTTTTGACAACAGTTATGTT 31259267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 AAGTAGGTTAAGTCTTTGGTATAGAGGTGAACTGTAGAAGCTTTTGACAACAGTTATGTT 8040

 31259268 AATGAAAACAGTAAGAACACCACCTAATACTAGCACATTTATAAAACACTTAGCAATGTC 31259327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 AATGAAAACAGTAAGAACACCACCTAATACTAGCACATTTATAAAACACTTAGCAATGTC 8100

 31259328 TAACGTACTTTATGTAATTTCGACCCTACAGCTGTATGAAGTGAATATTATTATTTGATT 31259387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 TAACGTACTTTATGTAATTTCGACCCTACAGCTGTATGAAGTGAATATTATTATTTGATT 8160

 31259388 AAAACAGTGTCATGAAGCTGTTCAAAGTCACACAGCTAGTTAAGCAGCAGAGCTCAGACT 31259447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 AAAACAGTGTCATGAAGCTGTTCAAAGTCACACAGCTAGTTAAGCAGCAGAGCTCAGACT 8220

 31259448 TAAAACTCTCTGAGAGCTATCCCATTCACTAACAGCTCTTTATTTTGTCATGAAATGTGG 31259507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 TAAAACTCTCTGAGAGCTATCCCATTCACTAACAGCTCTTTATTTTGTCATGAAATGTGG 8280

 31259508 AAAATATCCTCATCCAAACTCCAAAATCAGCATATACATAAGCACAACCTTTTTTTCTCT 31259567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 AAAATATCCTCATCCAAACTCCAAAATCAGCATATACATAAGCACAACCTTTTTTTCTCT 8340

 31259568 CAACCTACCCAATACCCCTTTCTACCAATTCCCATAAAAATTCTTGGAGTTCCTATTGCA 31259627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8341 CAACCTACCCAATACCCCTTTCTACCAATTCCCATAAAAATTCTTGGAGTTCCTATTGCA 8400

 31259628 GCGTCTTTATGTCTTCATACTGGTATGACCAAGGGCACAATGGAAGACTTCTTTCAAAAG 31259687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 GCGTCTTTATGTCTTCATACTGGTATGACCAAGGGCACAATGGAAGACTTCTTTCAAAAG 8460

 31259688 GGAACCACCTTCAATCTAAGTCTTGTCTCCTATAACTGTCCCCAAAATGGACATCATCAC 31259747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8461 GGAACCACCTTCAATCTAAGTCTTGTCTCCTATAACTGTCCCCAAAATGGACATCATCAC 8520

 31259748 AGGCATAGGCTTTTCAAACCATTAACTAGTGAGGAAATGTCTGGGGTTGTCTGTTCCTCA 31259807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8521 AGGCATAGGCTTTTCAAACCATTAACTAGTGAGGAAATGTCTGGGGTTGTCTGTTCCTCA 8580

 31259808 TTTAAAATCAGTCAAATAGGACACATACTACCACTTCATTCCTAAAAGTTGAGCAAGAAT 31259867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8581 TTTAAAATCAGTCAAATAGGACACATACTACCACTTCATTCCTAAAAGTTGAGCAAGAAT 8640

 31259868 CATCCTCATATCTCCAGCTTTCTGGTTTAGCAAGCAGACACCCGACTCTGGGGACTTGGT 31259927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8641 CATCCTCATATCTCCAGCTTTCTGGTTTAGCAAGCAGACACCCGACTCTGGGGACTTGGT 8700

 31259928 AAAGGCCAACTGCACAAGAATAAAAAGTGTAACAGAACTGGCAGTTACAGTCTTAGCAAT 31259987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 AAAGGCCAACTGCACAAGAATAAAAAGTGTAACAGAACTGGCAGTTACAGTCTTAGCAAT 8760

 31259988 TTTAAAAAATCATTCCAAATGTTTTGGTAGAAATCTTATTAAAGAATGCTAAACTACTGG 31260047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8761 TTTAAAAAATCATTCCAAATGTTTTGGTAGAAATCTTATTAAAGAATGCTAAACTACTGG 8820

 31260048 CATTAGTAATTTACTGTAAATGAAAGGTATACTAAAGGTAGAATTTTATTCATATAAAAT 31260107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8821 CATTAGTAATTTACTGTAAATGAAAGGTATACTAAAGGTAGAATTTTATTCATATAAAAT 8880

 31260108 AAACTATTTTACTTCTGAAGGTTATTATGAAGATGAGGCTAAATTATATGAAAAATGCTA 31260167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8881 AAACTATTTTACTTCTGAAGGTTATTATGAAGATGAGGCTAAATTATATGAAAAATGCTA 8940

 31260168 AGCATCCCGCCTAGCTCATAGTAACTACGCAGTAAGTGTCAGCTGCTATTAGTAATACTG 31260227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8941 AGCATCCCGCCTAGCTCATAGTAACTACGCAGTAAGTGTCAGCTGCTATTAGTAATACTG 9000

 31260228 CAGAAGTATTAAAAATAAAACATAACAACGGAAGGCCATATTTAAAATGAACCAGCAATC 31260287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9001 CAGAAGTATTAAAAATAAAACATAACAACGGAAGGCCATATTTAAAATGAACCAGCAATC 9060

 31260288 AACATTCTGTGTTTAAACATCAACAAAAAACATATCCATCTGTGGTATG 31260336
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9061 AACATTCTGTGTTTAAACATCAACAAAAAACATATCCATCTGTGGTATG 9109

Alignment time is 8.65222 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3051] =>      3051 nucs 'mol-32-3311-120073_3051'

Score:        3029
Aligned:      3051        nucs
Identic:      3049 (100%) nucs =>      1061 (100%)      1988 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31249110,31250170] EXCISED REGION [31250172,31252161]
 second seq =>  [       1,    1061] EXCISED REGION [    1062,    3051]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31250171,31250171]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31250195,31250195]
 second seq =>         1 nucs [1085,1085]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [31250171,31250181] to [31250172,31250182]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31249110 TTTATCACACATGATTTGCAAATATTTTCTCCCAGTCTGCAGCCTATCTTTTCAGTTTCT 31249169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTATCACACATGATTTGCAAATATTTTCTCCCAGTCTGCAGCCTATCTTTTCAGTTTCT 60

 31249170 TCCCAATGTCTTTTGTAGCATAAAAATGTTAATTTTAATTAAGTCAAATTCATCAATTTT 31249229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCCAATGTCTTTTGTAGCATAAAAATGTTAATTTTAATTAAGTCAAATTCATCAATTTT 120

 31249230 TTATCTTATGGCTCATGCTTCTGGTGTCATACCTAACAACTCTGCCTAATCCAAGGTCAT 31249289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTATCTTATGGCTCATGCTTCTGGTGTCATACCTAACAACTCTGCCTAATCCAAGGTCAT 180

 31249290 AAAGTTTCTTCTATGCTTTCTTTTAGAAGTTTTATAATTTTAGCTCTTACATTTAGGCCC 31249349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAGTTTCTTCTATGCTTTCTTTTAGAAGTTTTATAATTTTAGCTCTTACATTTAGGCCC 240

 31249350 CTAATTCATTGTCAGCTAATTTTTGTGTATTGTTATTGTGAGGAAGTTAATTTTTGTATA 31249409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAATTCATTGTCAGCTAATTTTTGTGTATTGTTATTGTGAGGAAGTTAATTTTTGTATA 300

 31249410 TGATATCCAATTTTTCCAGCACCATTTGTTGAAAAAATAACCCTTTCTCTATTTGTCTTA 31249469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGATATCCAATTTTTCCAGCACCATTTGTTGAAAAAATAACCCTTTCTCTATTTGTCTTA 360

 31249470 GCAGCTCTTCCAAAAATCAATGGACCAAAAATGTAAATGTTTATTTCTGGACTCTCAATT 31249529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCAGCTCTTCCAAAAATCAATGGACCAAAAATGTAAATGTTTATTTCTGGACTCTCAATT 420

 31249530 CCTCTCCATTGATTTATATGCTTATCCTATGCCACGGCCACGTTGTCCTGAATACTGTCA 31249589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTCTCCATTGATTTATATGCTTATCCTATGCCACGGCCACGTTGTCCTGAATACTGTCA 480

 31249590 CCTTAGATTGAGTTTTGAAATGGGGATGTATAAATCCTCCAATTTTGTTCTTTTACTCAT 31249649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTTAGATTGAGTTTTGAAATGGGGATGTATAAATCCTCCAATTTTGTTCTTTTACTCAT 540

 31249650 TTATTTTAAATTTTATTTGATCCCACTGTACTAAGTGTACTTAGTAATACCACCTTAAAT 31249709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTATTTTAAATTTTATTTGATCCCACTGTACTAAGTGTACTTAGTAATACCACCTTAAAT 600

 31249710 CCTTTCTTAGACAAGATAGATATAAATATAAAAATAAAATAGGCTATATTTTAAAGACGT 31249769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTTTCTTAGACAAGATAGATATAAATATAAAAATAAAATAGGCTATATTTTAAAGACGT 660

 31249770 TTTCAAAATAACATAATCCTTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCCTAGGATTGAC 31249829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTCAAAATAACATAATCCTTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCCTAGGATTGAC 720

 31249830 TGTAAAATTAAGTTTTCCCACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTACTGAATGCCTA 31249889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTAAAATTAAGTTTTCCCACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTACTGAATGCCTA 780

 31249890 CTATGTACCAGGCACAGTGCAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAATAATATATAC 31249949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTATGTACCAGGCACAGTGCAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAATAATATATAC 840

 31249950 TTACTCACTTAGCACTTAAATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAACAGGTATGTAC 31250009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTACTCACTTAGCACTTAAATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAACAGGTATGTAC 900

 31250010 AAGATAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGC 31250069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGATAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGC 960

 31250070 CTGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAACCTGC 31250129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAACCTGC 1020

 31250130 ACAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAAT 31250170
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAAT 1061

EXCISED REGION

 31250172 AAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAATTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTA 31250231
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 AAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAATTTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTA 1121

 31250232 GAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATC 31250291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 GAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATC 1181

 31250292 ATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGA 31250351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 ATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGA 1241

 31250352 GTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAAC 31250411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 GTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAAC 1301

 31250412 TTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAA 31250471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 TTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAA 1361

 31250472 GTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAAT 31250531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 GTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAAT 1421

 31250532 AGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTG 31250591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 AGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTG 1481

 31250592 AATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTA 31250651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 AATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTA 1541

 31250652 TTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAG 31250711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 TTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAG 1601

 31250712 GAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATT 31250771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 GAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATT 1661

 31250772 GCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAA 31250831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 GCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAA 1721

 31250832 AAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGA 31250891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 AAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGA 1781

 31250892 GGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCA 31250951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 GGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCA 1841

 31250952 TCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTAT 31251011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 TCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTAT 1901

 31251012 TTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAAC 31251071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 TTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAAC 1961

 31251072 TCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATAC 31251131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 TCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATAC 2021

 31251132 TCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTG 31251191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 TCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTG 2081

 31251192 ACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTAT 31251251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 ACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTAT 2141

 31251252 GCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGC 31251311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 GCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGC 2201

 31251312 ATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAG 31251371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 ATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAG 2261

 31251372 TAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGG 31251431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 TAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGG 2321

 31251432 GTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATAT 31251491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 GTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATAT 2381

 31251492 ACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAA 31251551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 ACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAA 2441

 31251552 ACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTTACAAAAATAC 31251611
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2442 ACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTCACAAAAATAC 2501

 31251612 AGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATA 31251671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 AGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATA 2561

 31251672 CAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTG 31251731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 CAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTG 2621

 31251732 GCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATC 31251791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 GCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATC 2681

 31251792 TTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATA 31251851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 TTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATA 2741

 31251852 TAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAAT 31251911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 TAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAAT 2801

 31251912 AAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACA 31251971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 AAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACA 2861

 31251972 AAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAA 31252031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 AAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAA 2921

 31252032 CTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGT 31252091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 CTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGT 2981

 31252092 GGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGT 31252151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 GGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGT 3041

 31252152 CTCTACCAAA 31252161
          ||||||||||
     3042 CTCTACCAAA 3051

Alignment time is 3.1178 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,   13333] =>     13333 nucs 'mol-32-3311-214410_13333'

Score:       10613
Aligned:     10813        nucs
Identic:     10794 (100%) nucs =>      8068 (100%)      2726 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31250955,31259034] EXCISED REGION [31259039,31261769]
 second seq =>  [       1,    8079] EXCISED REGION [    8080,   10810]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [31259035,31259038]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        35 nucs [31259035,31259069] to [31259039,31259073]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31259035,31259036] to [31259037,31259038]
 second seq =>         0 nucs

 31250955 GTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTATTTC 31251014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTATTTC 60

 31251015 ACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAACTCC 31251074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAACTCC 120

 31251075 TGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATACTCA 31251134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATACTCA 180

 31251135 GATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACA 31251194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACA 240

 31251195 TCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCC 31251254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCC 300

 31251255 CCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGCATG 31251314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGCATG 360

 31251315 TGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAA 31251374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAA 420

 31251375 GTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTG 31251434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTG 480

 31251435 GGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATATACA 31251494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATATACA 540

 31251495 CTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACC 31251554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACC 600

 31251555 TTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTTACAAAAATACAGT 31251614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      601 TTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTCACAAAAATACAGT 660

 31251615 GTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATACAG 31251674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATACAG 720

 31251675 CTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCC 31251734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCC 780

 31251735 AGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTT 31251794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTT 840

 31251795 ACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAA 31251854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAA 900

 31251855 TAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAG 31251914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAG 960

 31251915 TAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAA 31251974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAA 1020

 31251975 CAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTT 31252034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTT 1080

 31252035 TAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGG 31252094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGG 1140

 31252095 CAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTC 31252154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTC 1200

 31252155 TACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCA 31252214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCA 1260

 31252215 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGAT 31252274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGAT 1320

 31252275 CGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAA 31252334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAA 1380

 31252335 AAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGATATTTATCTAT 31252394
          ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAAAA--GAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGATATTTATCTAT 1438

 31252395 AGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACTTGGAAATATC 31252454
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 AGTGACAAATATCGGTAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACTTGGAAATATC 1498

 31252455 TCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTAGTATATATGC 31252514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTAGTATATATGC 1558

 31252515 CAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCG 31252574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 CAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCG 1618

 31252575 AGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAAC 31252634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 AGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAAC 1678

 31252635 TCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCC 31252694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCC 1738

 31252695 AGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGAT 31252754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 AGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGAT 1798

 31252755 TGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAT 31252814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAT 1858

 31252815 TTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTCATGAACAATAA 31252874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTCATGAACAATAA 1918

 31252875 CTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGG 31252934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGG 1978

 31252935 GAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGT 31252994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 GAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGT 2038

 31252995 GGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAGTCACTGATGAA 31253054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAGTCACTGATGAA 2098

 31253055 GAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCT 31253114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 GAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCT 2158

 31253115 CGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTT 31253174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTT 2218

 31253175 TTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGA 31253234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGA 2278

 31253235 TCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCC 31253294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCC 2338

 31253295 ATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGAT 31253354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 ATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGAT 2398

 31253355 TAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTG 31253414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTG 2458

 31253415 ATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACACTAGCATTCTGC 31253474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 ATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACACTAGCATTCTGC 2518

 31253475 AAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGA 31253534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 AAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGA 2578

 31253535 AATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGC 31253594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 AATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGC 2638

 31253595 AGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGT 31253654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 AGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGT 2698

 31253655 GAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCATTACAGATTAA 31253714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCATTACAGATTAA 2758

 31253715 CAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGACCTCAAACTATA 31253774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 CAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGACCTCAAACTATA 2818

 31253775 AAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTT 31253834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTT 2878

 31253835 GTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGA 31253894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGA 2938

 31253895 GCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAA 31253954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAA 2998

 31253955 TATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGC 31254014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGC 3058

 31254015 AATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAACAAACACTTCTC 31254074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAACAAACACTTCTC 3118

 31254075 AAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACATCACTGATCAT 31254134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 AAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACATCACTGATCAT 3178

 31254135 CGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTAT 31254194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTAT 3238

 31254195 TATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATAC 31254254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 TATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATAC 3298

 31254255 ACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCA 31254314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 ACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCA 3358

 31254315 AAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAA 31254374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 AAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAA 3418

 31254375 TCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTATGTACAATAGCA 31254434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTATGTACAATAGCA 3478

 31254435 AAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATATACATCATGGAA 31254494
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 AAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATATACATCATGGAA 3538

 31254495 TACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGA 31254554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 TACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGA 3598

 31254555 GGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTGCATGTCCTCACT 31254614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 GGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTGCATGTCCTCACT 3658

 31254615 TATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAGCAATAGACACCG 31254674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAGCAATAGACACCG 3718

 31254675 GGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATT 31254734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 GGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATT 3778

 31254735 GGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAACCTTAGCATCACA 31254794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 GGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAACCTTAGCATCACA 3838

 31254795 CAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGTAACCCCTGAATCTAAAATAAAAGTT 31254854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3839 CAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGTACCCCCTGAATCTAAAATAAAAGTT 3898

 31254855 GAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTCTTTACTATTAGC 31254914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 GAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTCTTTACTATTAGC 3958

 31254915 AATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAATCTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAA 31254974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 AATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAATCTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAA 4018

 31254975 CAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTACCCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGG 31255034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 CAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTACCCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGG 4078

 31255035 AGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCTGAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTC 31255094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 AGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCTGAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTC 4138

 31255095 TACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCATTTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGG 31255154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 TACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCATTTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGG 4198

 31255155 AGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCA 31255214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCA 4258

 31255215 TGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGCTCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAA 31255274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGCTCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAA 4318

 31255275 TGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAGAATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCT 31255334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAGAATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCT 4378

 31255335 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCT 31255394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCT 4438

 31255395 CAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAATACAAAAAATTAGC 31255454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 CAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAATACAAAAAATTAGC 4498

 31255455 CAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCG 31255514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 CAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCG 4558

 31255515 CTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTG 31255574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 CTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTG 4618

 31255575 GGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGT 31255634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 GGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGT 4678

 31255635 GTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAAGGTAAATGATTAATATCAGCAATTC 31255694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 GTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAAGGTAAATGATTAATATCAGCAATTC 4738

 31255695 ATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTTAATCCAAAAATTCATCTACCCACCCC 31255754
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 ATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTTAATCCAAAAATTCATCTACCCACCCC 4798

 31255755 CCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACACTAAAAATATTTTATCTCATTGCTTA 31255814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 CCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACACTAAAAATATTTTATCTCATTGCTTA 4858

 31255815 GAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTAGCAAACTTAAAATTATCCTAGAAAC 31255874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 GAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTAGCAAACTTAAAATTATCCTAGAAAC 4918

 31255875 TCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCAAGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGA 31255934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 TCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCAAGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGA 4978

 31255935 CTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAATAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCC 31255994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 CTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAATAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCC 5038

 31255995 AAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCATTGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGT 31256054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 AAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCATTGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGT 5098

 31256055 AAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGCGTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAG 31256114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 AAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGCGTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAG 5158

 31256115 AGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAACCACAAAAATTTATATACTTTAAATT 31256174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 AGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAACCACAAAAATTTATATACTTTAAATT 5218

 31256175 GTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAACCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCT 31256234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 GTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAACCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCT 5278

 31256235 CCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGACTAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGT 31256294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 CCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGACTAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGT 5338

 31256295 AGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACTTAAAATGATCTACTGATAAGTAGGC 31256354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 AGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACTTAAAATGATCTACTGATAAGTAGGC 5398

 31256355 TAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTTTAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGT 31256414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 TAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTTTAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGT 5458

 31256415 GTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATGGCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAA 31256474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 GTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATATGGCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAA 5518

 31256475 AGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATCTACAAAATTAACCTGACAACAAATA 31256534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 AGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAATCTACAAAATTAACCTGACAACAAATA 5578

 31256535 TGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTTACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTA 31256594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 TGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGTTACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTA 5638

 31256595 AAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATATTTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAG 31256654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 AAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATATTTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAG 5698

 31256655 CGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTACAAGATCACCTGGGACACACTTGGCC 31256714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 CGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTACAAGATCACCTGGGACACACTTGGCC 5758

 31256715 AGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGGAATGTTTAACATCAAGAAAGGAATT 31256774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 AGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGGGAATGTTTAACATCAAGAAAGGAATT 5818

 31256775 ACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAAATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGC 31256834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 ACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGAAATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGC 5878

 31256835 TCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAGTCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAA 31256894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 TCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAAGTCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAA 5938

 31256895 TATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAAGGGGAAAAAAAGACATTTTATATAT 31256954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 TATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAAAGGGGAAAAAAAGACATTTTATATAT 5998

 31256955 ATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCATGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAA 31257014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 ATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGCATGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAA 6058

 31257015 ACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATATCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCT 31257074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 ACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTATATCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCT 6118

 31257075 AAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGCAGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGG 31257134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 AAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGGCAGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGG 6178

 31257135 CAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTATAAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACC 31257194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 CAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTATAAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACC 6238

 31257195 CTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGTCTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACA 31257254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 CTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAGTCTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACA 6298

 31257255 ATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCATCCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTT 31257314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 ATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCATCCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTT 6358

 31257315 TCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATTTAACTGAATGTAAACTTTTTTTTTTT 31257374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 TCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATTTAACTGAATGTAAACTTTTTTTTTTT 6418

 31257375 TTTTTTTTTTTTTTT-GAGACGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGT 31257433
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 TTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGT 6478

 31257434 GTGATCTCGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCC 31257493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 GTGATCTCGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCC 6538

 31257494 TCCTGAGAAGCTGGGATTACAAACATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAG 31257553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 TCCTGAGAAGCTGGGATTACAAACATGCACCACCACACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAG 6598

 31257554 TAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCTGGCTAGCTCAAACTCCCGACCTCAGGTTATCC 31257613
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 TAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCTGGCTAGCTCAAACTCCCGACCTCAGGTTATCC 6658

 31257614 GCCCACCTAGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCAGCCTCT 31257673
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6659 GCCCACCTAGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTCT 6718

 31257674 GATTGTAAACTTTATTATAGCCTAGCTATAGTGAAGGCATGGTAAAATATTTCTAGCTGT 31257733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 GATTGTAAACTTTATTATAGCCTAGCTATAGTGAAGGCATGGTAAAATATTTCTAGCTGT 6778

 31257734 TACTTGGAAAAGCAGATGTGACCATACAGATCTTAGATACCTTTAGAGACCCGTGGTTGG 31257793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 TACTTGGAAAAGCAGATGTGACCATACAGATCTTAGATACCTTTAGAGACCCGTGGTTGG 6838

 31257794 GATCTGAAGAAAACAAGACACTTACCACAACTGCCTCTGGATAAAGGGGAAATGCTCAGT 31257853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 GATCTGAAGAAAACAAGACACTTACCACAACTGCCTCTGGATAAAGGGGAAATGCTCAGT 6898

 31257854 TTCCACAAACCAGTGAGTATGAGAGCTATTAACTGTAAAAATACACACAGTCCTCAGATG 31257913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6899 TTCCACAAACCAGTGAGTATGAGAGCTATTAATTGTAAAAATACACACAGTCCTCAGATG 6958

 31257914 GTGAGGGCATGGGTTAGGGTAACAAAAATACAATGGAGAAAAAAGTGGCATTTCCAATGT 31257973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6959 GTGAGGGCATGGGTTAGGGTAACAAAAATACAATGGAGAAAAAAGTGGCATTTCCAATGT 7018

 31257974 GACACATTTAAAATATGGAATGGAATTTCATGGGTCACTTGGAAATAAGATTTTTTTTTC 31258033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7019 GACACATTTAAAATATGGAATGGAATTTCATGGGTCACTTGGAAATAAGATTTTTTTTTC 7078

 31258034 ATTGGTATAACTTCAGGCTAGAGATGGTTTGCCACAGAGTAAGTCAAAAAAAATAAAAGA 31258093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7079 ATTGGTATAACTTCAGGCTAGAGATGGTTTGCCACAGAGTAAGTCAAAAAAAATAAAAGA 7138

 31258094 ATATGGAGATGACGATGAAAATGACAACTGCCAATAAAAGTCAAAAGGATAGATTTTGAG 31258153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7139 ATATGGAGATGACGATGAAAATGACAACTGCCAATAAAAGTCAAAAGGATAGATTTTGAG 7198

 31258154 AACTCTCCAGAAGAGGGAACAAAAAAATCAAAAGATTTTTTCCCTTGGCAAAGTGCCCCC 31258213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7199 AACTCTCCAGAAGAGGGAACAAAAAAATCAAAAGATTTTTTCCCTTGGCAAAGTGCCCCC 7258

 31258214 TCCAAAGCACACATAGTCTGCTTCAACCAACAGCCTATACCCACAGTGTTTTCATATACT 31258273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7259 TCCAAAGCACACATAGTCTGCTTCAACCAACAGCCTATACCCACAGTGTTTTCATATACT 7318

 31258274 AAATGGCATATCACTAAATAACAGTAAATGAGATTAAACTGTAGACTTCCTAGTTGCCTT 31258333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7319 AAATGGCATATCACTAAATAACAGTAAATGAGATTAAACTGTAGACTTCCTAGTTGCCTT 7378

 31258334 AAACAACTGATGGTTAATTTCTTGAACACTGAATAACAAATATGCAGTCTCATGACACTG 31258393
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7379 AAACAACTGATGTTTAATTTCTTGAACACTGAATAACAAATATGCAGTCTCATGACACTG 7438

 31258394 TAAGAAGCTAAAGGTGCTCATTCTTTCCATGAATTCTAAATTGCTATAATACTTATATTA 31258453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7439 TAAGAAGCTAAAGGTGCTCATTCTTTCCATGAATTCTAAATTGCTATAATACTTATATTA 7498

 31258454 GGAAAACAGAACAGTGGGAAGGAAAATTTTAAACAAACCCAGAATAAACCACACTTTTGA 31258513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7499 GGAAAACAGAACAGTGGGAAGGAAAATTTTAAACAAACCCAGAATAAACCACACTTTTGA 7558

 31258514 TTGGGTTTCCAGCAATAATCAGTTCCCCATTAGAATGTGGACCCCGAAGTATACCAAATG 31258573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7559 TTGGGTTTCCAGCAATAATCAGTTCCCCATTAGAATGTGGACCCCGAAGTATACCAAATG 7618

 31258574 CAAGCTCAGTGGAGCTCAGTCTCCTCAGCTGAAAATGAGAGCTTACTCTGGAAATGAGCA 31258633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7619 CAAGCTCAGTGGAGCTCAGTCTCCTCAGCTGAAAATGAGAGCTTACTCTGGAAATGAGCA 7678

 31258634 CTTCTTAACATTTTTAACCCATGTTCCATCCTATTAAACATAAAAACCTCATACTCCCAT 31258693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7679 CTTCTTAACATTTTTAACCCATGTTCCATCCTATTAAACATAAAAACCTCATACTCCCAT 7738

 31258694 TGAATGTTATTTGTGACTTCATAACCAAAACCAAAACCAAACCAAAGCAAGGTAAGTTTT 31258753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7739 TGAATGTTATTTGTGACTTCATAACCAAAACCAAAACCAAACCAAAGCAAGGTAAGTTTT 7798

 31258754 TATTGTTTTTTTTTCAGTGTCTCATCATAACCATTTACAAATTCATTTATTTACAAATAC 31258813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7799 TATTGTTTTTTTTTCAGTGTCTCATCATAACCATTTACAAATTCATTTATTTACAAATAC 7858

 31258814 TTGCATAAATGGACAGATATTAATAATTAATGCTTTTTTAAATCTTGAAGACAAAAAAGA 31258873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7859 TTGCATAAATGGACAGATATTAATAATTAATGCTTTTTTAAATCTTGAAGACAAAAAAGA 7918

 31258874 TTTTAAAAAGCCTATGAAGAATAATGATGACAATGAAATGATATTTACTGAGACCTTTGG 31258933
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7919 TTTTAAAAAGCCTATGAAGACTAATGATGACAATGAAATGATATTTACTGAGACCTTTGG 7978

 31258934 CAAATGATATTTACTGGGACCTTCTTCTCTCCTCCAGAGTTACTATTAATATAAATGATC 31258993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7979 CAAATGATATTTACTGGGACCTTCTTCTCTCCTCCAGAGTTACTATTAATATAAATGATC 8038

 31258994 CTTTCTTTACTAGCATTCAGCCAGAAGAAATGCTGGCTGAT 31259034
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8039 CTTTCTTTACTAGCATTCAGCCAGAAGAAATGCTGGCTGAT 8079

EXCISED REGION

 31259039 ACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACACACACATATATTAGG 31259098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8080 ACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACACACACATATATTAGG 8139

 31259099 CCTTCAATATTTGTTAAATGTTAAAAGAGGTGATAGGTCCTCTTTTACTATTCTGAAAAT 31259158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8140 CCTTCAATATTTGTTAAATGTTAAAAGAGGTGATAGGTCCTCTTTTACTATTCTGAAAAT 8199

 31259159 AACAGAACCCTAATATAGTAACCTTTCTCAAGTAATAAAGGATAGAAGCAAGTAGGTTAA 31259218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8200 AACAGAACCCTAATATAGTAACCTTTCTCAAGTAATAAAGGATAGAAGCAAGTAGGTTAA 8259

 31259219 GTCTTTGGTATAGAGGTGAACTGTAGAAGCTTTTGACAACAGTTATGTTAATGAAAACAG 31259278
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     8260 GTCTTTGGTATAGAGGTGAACTGTAGAAGATTTTGACAACAGTTATGTTAATGAAAACAG 8319

 31259279 TAAGAACACCACCTAATACTAGCACATTTATAAAACACTTAGCAATGTCTAACGTACTTT 31259338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8320 TAAGAACACCACCTAATACTAGCACATTTATAAAACACTTAGCAATGTCTAACGTACTTT 8379

 31259339 ATGTAATTTCGACCCTACAGCTGTATGAAGTGAATATTATTATTTGATTAAAACAGTGTC 31259398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8380 ATGTAATTTCGACCCTACAGCTGTATGAAGTGAATATTATTATTTGATTAAAACAGTGTC 8439

 31259399 ATGAAGCTGTTCAAAGTCACACAGCTAGTTAAGCAGCAGAGCTCAGACTTAAAACTCTCT 31259458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8440 ATGAAGCTGTTCAAAGTCACACAGCTAGTTAAGCAGCAGAGCTCAGACTTAAAACTCTCT 8499

 31259459 GAGAGCTATCCCATTCACTAACAGCTCTTTATTTTGTCATGAAATGTGGAAAATATCCTC 31259518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8500 GAGAGCTATCCCATTCACTAACAGCTCTTTATTTTGTCATGAAATGTGGAAAATATCCTC 8559

 31259519 ATCCAAACTCCAAAATCAGCATATACATAAGCACAACCTTTTTTTCTCTCAACCTACCCA 31259578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8560 ATCCAAACTCCAAAATCAGCATATACATAAGCACAACCTTTTTTTCTCTCAACCTACCCA 8619

 31259579 ATACCCCTTTCTACCAATTCCCATAAAAATTCTTGGAGTTCCTATTGCAGCGTCTTTATG 31259638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8620 ATACCCCTTTCTACCAATTCCCATAAAAATTCTTGGAGTTCCTATTGCAGCGTCTTTATG 8679

 31259639 TCTTCATACTGGTATGACCAAGGGCACAATGGAAGACTTCTTTCAAAAGGGAACCACCTT 31259698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8680 TCTTCATACTGGTATGACCAAGGGCACAATGGAAGACTTCTTTCAAAAGGGAACCACCTT 8739

 31259699 CAATCTAAGTCTTGTCTCCTATAACTGTCCCCAAAATGGACATCATCACAGGCATAGGCT 31259758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8740 CAATCTAAGTCTTGTCTCCTATAACTGTCCCCAAAATGGACATCATCACAGGCATAGGCT 8799

 31259759 TTTCAAACCATTAACTAGTGAGGAAATGTCTGGGGTTGTCTGTTCCTCATTTAAAATCAG 31259818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     8800 TTTCAAACCATTAACTAGTGAGGAAATGTCTGAGGTTGTCTGTTCCTCATTTAAAATCAG 8859

 31259819 TCAAATAGGACACATACTACCACTTCATTCCTAAAAGTTGAGCAAGAATCATCCTCATAT 31259878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8860 TCAAATAGGACACATACTACCACTTCATTCCTAAAAGTTGAGCAAGAATCATCCTCATAT 8919

 31259879 CTCCAGCTTTCTGGTTTAGCAAGCAGACACCCGACTCTGGGGACTTGGTAAAGGCCAACT 31259938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8920 CTCCAGCTTTCTGGTTTAGCAAGCAGACACCCGACTCTGGGGACTTGGTAAAGGCCAACT 8979

 31259939 GCACAAGAATAAAAAGTGTAACAGAACTGGCAGTTACAGTCTTAGCAATTTTAAAAAATC 31259998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8980 GCACAAGAATAAAAAGTGTAACAGAACTGGCAGTTACAGTCTTAGCAATTTTAAAAAATC 9039

 31259999 ATTCCAAATGTTTTGGTAGAAATCTTATTAAAGAATGCTAAACTACTGGCATTAGTAATT 31260058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9040 ATTCCAAATGTTTTGGTAGAAATCTTATTAAAGAATGCTAAACTACTGGCATTAGTAATT 9099

 31260059 TACTGTAAATGAAAGGTATACTAAAGGTAGAATTTTATTCATATAAAATAAACTATTTTA 31260118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9100 TACTGTAAATGAAAGGTATACTAAAGGTAGAATTTTATTCATATAAAATAAACTATTTTA 9159

 31260119 CTTCTGAAGGTTATTATGAAGATGAGGCTAAATTATATGAAAAATGCTAAGCATCCCGCC 31260178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9160 CTTCTGAAGGTTATTATGAAGATGAGGCTAAATTATATGAAAAATGCTAAGCATCCCGCC 9219

 31260179 TAGCTCATAGTAACTACGCAGTAAGTGTCAGCTGCTATTAGTAATACTGCAGAAGTATTA 31260238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9220 TAGCTCATAGTAACTACGCAGTAAGTGTCAGCTGCTATTAGTAATACTGCAGAAGTATTA 9279

 31260239 AAAATAAAACATAACAACGGAAGGCCATATTTAAAATGAACCAGCAATCAACATTCTGTG 31260298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9280 AAAATAAAACATAACAACGGAAGGCCATATTTAAAATGAACCAGCAATCAACATTCTGTG 9339

 31260299 TTTAAACATCAACAAAAAACATATCCATCTGTGGTATGTATACATATATATGCATAAAAA 31260358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9340 TTTAAACATCAACAAAAAACATATCCATCTGTGGTATGTATACATATATATGCATAAAAA 9399

 31260359 TATTTAGAAGACAATTTGGAAGAATAAATAGCAAAATGATGATCTCTGGGGAGACAGAAG 31260418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9400 TATTTAGAAGACAATTTGGAAGAATAAATAGCAAAATGATGATCTCTGGGGAGACAGAAG 9459

 31260419 GGTGGTAGTCAAATGGAACTTTAGCCTGACATAAATGCTTTTTGTTTTTTAACAAAGTAT 31260478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9460 GGTGGTAGTCAAATGGAACTTTAGCCTGACATAAATGCTTTTTGTTTTTTAACAAAGTAT 9519

 31260479 TCATGAATTTCCTCTGTAAATAATTTTATTTTAAAAAGAAAAATCATAGTTTCTTCAATT 31260538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9520 TCATGAATTTCCTCTGTAAATAATTTTATTTTAAAAAGAAAAATCATAGTTTCTTCAATT 9579

 31260539 CCATAGTTGATTTCAGTATTACATGAAAAAAAGTTTACTTTTTTTATAGTTAACGTGTTC 31260598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9580 CCATAGTTGATTTCAGTATTACATGAAAAAAAGTTTACTTTTTTTATAGTTAACGTGTTC 9639

 31260599 AAATTTCTAAAACCTCATTTTCTTTATTTAGTAATACTATTCAAGGCTTATGTTACAAAC 31260658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9640 AAATTTCTAAAACCTCATTTTCTTTATTTAGTAATACTATTCAAGGCTTATGTTACAAAC 9699

 31260659 TGCTTTAATCTTCTTTATGATATTCCTAATTGCTATATTAAAAATATCTGCCTATGCCAC 31260718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9700 TGCTTTAATCTTCTTTATGATATTCCTAATTGCTATATTAAAAATATCTGCCTATGCCAC 9759

 31260719 CCCCCAACAATTTTATTAGGTTTTAAAACCACTCGGTGTATTTAATCAAGGTGCAAAGAG 31260778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9760 CCCCCAACAATTTTATTAGGTTTTAAAACCACTCGGTGTATTTAATCAAGGTGCAAAGAG 9819

 31260779 GCTTTCAAAGTCTCGGAAGCCATAAATCAAAACAGTTTCACATAAAAAGATTACCTTTTC 31260838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9820 GCTTTCAAAGTCTCGGAAGCCATAAATCAAAACAGTTTCACATAAAAAGATTACCTTTTC 9879

 31260839 CCCTTAAATTTTGTATGTGTTTACATTTAATAAACTACACACAGAAAGTAGAGCCCTTGA 31260898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9880 CCCTTAAATTTTGTATGTGTTTACATTTAATAAACTACACACAGAAAGTAGAGCCCTTGA 9939

 31260899 TTCTTTTTTTTTTTTTCTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 31260958
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9940 TTC-TTTTTTTTTTTTCTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 9998

 31260959 CACAATCTTGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTGTCCTGCTTCAGT 31261018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9999 CACAATCTTGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTGTCCTGCTTCAGT 10058

 31261019 CTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCACCACCACGCCTGGCTAA-TTTTTTGTATTT 31261077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
    10059 CTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTT 10118

 31261078 TTAGTAGATACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTTACCTCGTGA 31261137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10119 TTAGTAGATACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTTACCTCGTGA 10178

 31261138 TCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCGCCACGCCCGGCC 31261197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10179 TCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCGCCACGCCCGGCC 10238

 31261198 CCTTGATTCCTTTTAAGACCAAAAGTTTACCTATTTGAAATCATTATAACAATTTAAAAT 31261257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10239 CCTTGATTCCTTTTAAGACCAAAAGTTTACCTATTTGAAATCATTATAACAATTTAAAAT 10298

 31261258 GTCTTAAGGAGTGCTATAATTAAAAAACCTCTGCTTCTGTGCTCTTGCTAATTTCTAATT 31261317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10299 GTCTTAAGGAGTGCTATAATTAAAAAACCTCTGCTTCTGTGCTCTTGCTAATTTCTAATT 10358

 31261318 CTCGTTTGTACCATTTGTGACAGTTTTTATATTTTTAACTTTTCTTCTAGTTCACAGCCA 31261377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10359 CTCGTTTGTACCATTTGTGACAGTTTTTATATTTTTAACTTTTCTTCTAGTTCACAGCCA 10418

 31261378 TAACTTTGACTTTTGCAACGTATTCTTTTTCCTTCAGATCATCTAGATTTTAGCCAATAA 31261437
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10419 TAACTTTGACTTTTGCAACGTACTCTTTTTCCTTCAGATCATCTAGATTTTAGCCAATAA 10478

 31261438 AGTGTGTATGAACTATGTCACAAAAGCTCTTATTAACTCCCTAAAAACAGCAAATAGTGG 31261497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10479 AGTGTGTATGAACTATGTCACAAAAGCTCTTATTAACTCCCTAAAAACAGCAAATAGTGG 10538

 31261498 GCCTTTTGTGGCTCAGGCATGGAGGTAAGCCACATGCACCATGGGCCAGACTCAGCCTGG 31261557
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10539 GCTTTTTGTGGCTCAGGCATGGAGGTAAGCCACATGCACCATGGGCCAGACTCAGCCTGG 10598

 31261558 GCCCCTTCAATTTACAAATCCAGCTTAAAATATATTACAGGCCTCTACTGTTGTCCAAAA 31261617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10599 GCCCCTTCAATTTACAAATCCAGCTTAAAATATATTACAGGCCTCTACTGTTGTCCAAAA 10658

 31261618 AGACCAAGACTTCAATGATGACAGAGAGAAAGCAGCCTCATACTTGAATAGGAGGACACT 31261677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10659 AGACCAAGACTTCAATGATGACAGAGAGAAAGCAGCCTCATACTTGAATAGGAGGACACT 10718

 31261678 GGGCTGAATAGGAAATCCCTACCTCAAAGAGCCATGGGATTCAATGATTATGGGAGGCCA 31261737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10719 GGGCTGAATAGGAAATCCCTACCTCAAAGAGCCATGGGATTCAATGATTATGGGAGGCCA 10778

 31261738 TGCAATCTCTTTTTAATAGATTTAAAGTTCAA 31261769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
    10779 TGCAATCTCTTTTTAATAGATTTAAAGTTCAA 10810

Alignment time is 12.4078 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2981] =>      2981 nucs 'mol-32-3311-292875_2981'

Score:        2930
Aligned:      2974        nucs
Identic:      2970 (100%) nucs =>      2488 (100%)       482 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31244256,31246747] EXCISED REGION [31251770,31252251]
 second seq =>  [       1,    2492] EXCISED REGION [    2500,    2981]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5022 nucs [31246748,31251769]
 second seq =>         7 nucs [2493,2499]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2491,2492] to [2498,2499]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246748,31246748] to [31251769,31251769]
 second seq =>         0 nucs

 31244256 CTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTG 31244315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTG 60

 31244316 ACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCT 31244375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCT 120

 31244376 TTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAG 31244435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAG 180

 31244436 CCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAG 31244495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAG 240

 31244496 CCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCA 31244555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCA 300

 31244556 TCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACC 31244615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACC 360

 31244616 AAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGT 31244675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGT 420

 31244676 TTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGAT 31244735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGAT 480

 31244736 TTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCAC 31244795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCAC 540

 31244796 CTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGC 31244855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGC 600

 31244856 AAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAA 31244915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAA 660

 31244916 ACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTC 31244975
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAAACAATTTTCCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTC 720

 31244976 GTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTC 31245035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTC 780

 31245036 TCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGG 31245095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGG 840

 31245096 ATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAA 31245155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAA 900

 31245156 CATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAAT 31245215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAAT 960

 31245216 GATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTAT 31245275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTAT 1020

 31245276 TTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATAC 31245335
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1021 TTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTTTGATAC 1080

 31245336 TTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATT 31245395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATT 1140

 31245396 AACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTA 31245455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTA 1200

 31245456 GGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTA 31245515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1201 GGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTA 1260

 31245516 ACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGA 31245575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGA 1320

 31245576 GATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAA 31245635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAA 1380

 31245636 TGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATAT 31245695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATAT 1440

 31245696 TTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGT 31245755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGT 1500

 31245756 AACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCAC 31245815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCAC 1560

 31245816 TTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATT 31245875
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATT 1620

 31245876 AATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCAC 31245935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCAC 1680

 31245936 CAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCT 31245995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCT 1740

 31245996 TTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGC 31246055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGC 1800

 31246056 GTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCT 31246115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCT 1860

 31246116 TCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGC 31246175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGC 1920

 31246176 TTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGAT 31246235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGAT 1980

 31246236 GTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCT 31246295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCT 2040

 31246296 TTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTC 31246355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTC 2100

 31246356 TGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCT 31246415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCT 2160

 31246416 CCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAA 31246475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAA 2220

 31246476 GAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAG 31246535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAG 2280

 31246536 AGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATA 31246595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATA 2340

 31246596 CATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGT 31246655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGT 2400

 31246656 ACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGAC 31246715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGAC 2460

 31246716 ATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 2492

EXCISED REGION

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 2559

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 2619

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 2679

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2680 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 2739

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 2799

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31252129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 2859

 31252130 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 31252189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 2919

 31252190 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31252249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 2979

 31252250 GG 31252251
          ||
     2980 GG 2981

Alignment time is 2.74402 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    6026] =>      6026 nucs 'mol-32-331c-112670_6026'

Score:        5944
Aligned:      6021        nucs
Identic:      6014 (100%) nucs =>       445 (100%)      5569 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31246303,31246747] EXCISED REGION [31251770,31257344]
 second seq =>  [       1,     445] EXCISED REGION [     453,    6026]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5022 nucs [31246748,31251769]
 second seq =>         7 nucs [446,452]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [444,445] to [451,452]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246748,31246748] to [31251769,31251769]
 second seq =>         0 nucs

 31246303 ATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTT 31246362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTT 60

 31246363 TTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGT 31246422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGT 120

 31246423 ATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAG 31246482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAG 180

 31246483 GTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGT 31246542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGT 240

 31246543 CCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGAT 31246602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGAT 300

 31246603 TTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGC 31246662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGC 360

 31246663 TGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTA 31246722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTA 420

 31246723 CTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          |||||||||||||||||||||||||
      421 CTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 445

EXCISED REGION

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      453 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 512

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      513 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 572

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      573 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 632

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      633 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 692

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      693 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 752

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31252129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      753 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 812

 31252130 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 31252189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      813 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 872

 31252190 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31252249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      873 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 932

 31252250 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 31252309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      933 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 992

 31252310 AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 31252369
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      993 AAACTCCATCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 1051

 31252370 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 31252429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 1111

 31252430 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 31252489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 1171

 31252490 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 31252549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 1231

 31252550 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 31252609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 1291

 31252610 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 31252669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 1351

 31252670 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 31252729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 1411

 31252730 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 31252789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 1471

 31252790 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 31252849
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 GACTCCATCTC-AAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 1530

 31252850 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 31252909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 1590

 31252910 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 31252969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 1650

 31252970 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 31253029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 1710

 31253030 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 31253089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 1770

 31253090 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 31253149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 1830

 31253150 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 31253209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 1890

 31253210 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 31253269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 1950

 31253270 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 31253329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 2010

 31253330 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 31253389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 2070

 31253390 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 31253449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 2130

 31253450 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 31253509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 2190

 31253510 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 31253569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 2250

 31253570 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 31253629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 2310

 31253630 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 31253689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 2370

 31253690 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 31253749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 2430

 31253750 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 31253809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 2490

 31253810 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 31253869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 2550

 31253870 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 31253929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 2610

 31253930 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 31253989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 2670

 31253990 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 31254049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 2730

 31254050 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 31254109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 2790

 31254110 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 31254169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2791 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 2850

 31254170 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 31254229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 2910

 31254230 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 31254289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 2970

 31254290 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 31254349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 3030

 31254350 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 31254409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 3090

 31254410 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAA 31254469
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3091 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAA 3150

 31254470 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 31254529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 3210

 31254530 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 31254589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 3270

 31254590 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 31254649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 3330

 31254650 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 31254709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 3390

 31254710 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 31254769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 3450

 31254770 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 31254829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 3510

 31254830 AACCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 31254889
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 ACCCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 3570

 31254890 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAAT 31254949
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3571 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAACATAGAATCTACAAAAGTAAT 3630

 31254950 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 31255009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 3690

 31255010 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 31255069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 3750

 31255070 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 31255129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 3810

 31255130 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 31255189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 3870

 31255190 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 31255249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 3930

 31255250 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 31255309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 3990

 31255310 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 31255369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 4050

 31255370 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 31255429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 4110

 31255430 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 31255489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 4170

 31255490 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 31255549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 4230

 31255550 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTC-AAAAAAAAAA 31255608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     4231 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAA 4290

 31255609 AAAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAA 31255668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 AAAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAA 4350

 31255669 AGGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTT 31255728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4351 AGGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTT 4410

 31255729 AATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACA 31255788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4411 AATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACA 4470

 31255789 CTAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACT 31255848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4471 CTAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACT 4530

 31255849 AGCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCC 31255908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4531 AGCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCC 4590

 31255909 AAGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGA 31255968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4591 AAGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGA 4650

 31255969 ATAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCA 31256028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4651 ATAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCA 4710

 31256029 TTGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGG 31256088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4711 TTGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGG 4770

 31256089 CGTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAA 31256148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4771 CGTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAA 4830

 31256149 CCACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAA 31256208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4831 CCACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAA 4890

 31256209 ACCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGA 31256268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4891 ACCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGA 4950

 31256269 CTAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAAC 31256328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4951 CTAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAAC 5010

 31256329 TTAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTT 31256388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5011 TTAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTT 5070

 31256389 TTAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATAT 31256448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5071 TTAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATAT 5130

 31256449 GGCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAAT 31256508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5131 GGCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAAT 5190

 31256509 CTACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGT 31256568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5191 CTACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGT 5250

 31256569 TACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATA 31256628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5251 TACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATA 5310

 31256629 TTTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTA 31256688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5311 TTTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTA 5370

 31256689 CAAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGG 31256748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5371 CAAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGG 5430

 31256749 GAATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGA 31256808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5431 GAATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGA 5490

 31256809 AATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAA 31256868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5491 AATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAA 5550

 31256869 GTCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAA 31256928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5551 GTCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAA 5610

 31256929 AGGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGC 31256988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5611 AGGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGC 5670

 31256989 ATGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTAT 31257048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5671 ATGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTAT 5730

 31257049 ATCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGG 31257108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5731 ATCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGG 5790

 31257109 CAGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTA 31257168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5791 CAGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTA 5850

 31257169 TAAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAG 31257228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5851 TAAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAG 5910

 31257229 TCTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCA 31257288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5911 TCTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCA 5970

 31257289 TCCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAG 31257344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5971 TCCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAG 6026

Alignment time is 5.74626 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3897] =>      3897 nucs 'mol-32-331c-160552_3897'

Score:        3841
Aligned:      3896        nucs
Identic:      3891 (100%) nucs =>       405 (100%)      3486 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31245101,31245505] EXCISED REGION [31245507,31248996]
 second seq =>  [       1,     405] EXCISED REGION [     407,    3897]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31245506,31245506]
 second seq =>         1 nucs [406,406]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3412,3412]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31245506,31245507] to [31245507,31245508]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31245503,31245505] to [31245507,31245509]
 second seq =>         3 nucs [403,405] to [407,409]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31245101 AAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAA 31245160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAA 60

 31245161 AAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAA 31245220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAA 120

 31245221 ACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTAT 31245280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTAT 180

 31245281 TTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTC 31245340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTC 240

 31245341 ATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTA 31245400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTA 300

 31245401 AAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTT 31245460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTT 360

 31245461 GCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCA 31245505
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCA 405

EXCISED REGION

 31245507 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 31245566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      407 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 466

 31245567 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 31245626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      467 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 526

 31245627 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 31245686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      527 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 586

 31245687 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 31245746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      587 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 646

 31245747 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 31245806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      647 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 706

 31245807 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 31245866
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      707 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 766

 31245867 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 31245926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      767 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 826

 31245927 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 31245986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      827 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 886

 31245987 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 31246046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      887 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 946

 31246047 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 31246106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      947 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 1006

 31246107 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 31246166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1007 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 1066

 31246167 TTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 31246226
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1067 TTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 1126

 31246227 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 31246286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 1186

 31246287 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 31246346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 1246

 31246347 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 31246406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 1306

 31246407 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 31246466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 1366

 31246467 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 31246526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 1426

 31246527 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 31246586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 1486

 31246587 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 31246646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 1546

 31246647 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 31246706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 1606

 31246707 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 31246766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 1666

 31246767 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 31246826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 1726

 31246827 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 31246886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 1786

 31246887 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 31246946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 1846

 31246947 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 31247006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 1906

 31247007 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 31247066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 1966

 31247067 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 31247126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 2026

 31247127 TGTTAGGCTACCAGACTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 31247186
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 TGTTAGGCTACCAGATTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 2086

 31247187 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 31247246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 2146

 31247247 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 31247306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 2206

 31247307 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 31247366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 2266

 31247367 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 31247426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 2326

 31247427 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 31247486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 2386

 31247487 TTTATATGCCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTA 31247546
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 TTTATATACCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTA 2446

 31247547 GTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTT 31247606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 GTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTT 2506

 31247607 TCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTA 31247666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 TCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTA 2566

 31247667 GTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGT 31247726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 GTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGT 2626

 31247727 GAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTT 31247786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 GAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTT 2686

 31247787 AGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTA 31247846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 AGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTA 2746

 31247847 TTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCAT 31247906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 TTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCAT 2806

 31247907 TTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAA 31247966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 TTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAA 2866

 31247967 GTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCT 31248026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 GTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCT 2926

 31248027 GAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCA 31248086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 GAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCA 2986

 31248087 GATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGC 31248146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 GATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGC 3046

 31248147 ATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCAT 31248206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 ATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCAT 3106

 31248207 CTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTC 31248266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 CTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTC 3166

 31248267 CCCAGCAGACTCCCTTCAGACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGAC 31248326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 CCCAGCAGACTCCCTTCAGACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGAC 3226

 31248327 TGCCTTTAGACTCAAACTGCAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTG 31248386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 TGCCTTTAGACTCAAACTGCAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTG 3286

 31248387 GCCGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGCGGAT 31248446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 GCCGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGCGGAT 3346

 31248447 CACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAA 31248506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 CACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAA 3406

 31248507 AATAC-AAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCGGGCGTGTTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCT 31248565
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 AATACAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCGGGCGTGTTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCT 3466

 31248566 ACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGTAATGAGCC 31248625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 ACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGTAATGAGCC 3526

 31248626 GAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAATAAATAA 31248685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 GAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAATAAATAA 3586

 31248686 ATTTCTTCACACACACACACATACCTGATTCATTCTGTCTCTCTGGAGAACCTTACTACA 31248745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 ATTTCTTCACACACACACACATACCTGATTCATTCTGTCTCTCTGGAGAACCTTACTACA 3646

 31248746 TATGGTAAGTTGGTTTAACTTTAAAAGAAATAGCCAAACTATTTTCCAAAGTGGTTATAA 31248805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 TATGGTAAGTTGGTTTAACTTTAAAAGAAATAGCCAAACTATTTTCCAAAGTGGTTATAA 3706

 31248806 CAATTTACATTCCTACCAACAATGTATAATATGAGAGTTCCTGTTTCTCCACATCCTAGA 31248865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 CAATTTACATTCCTACCAACAATGTATAATATGAGAGTTCCTGTTTCTCCACATCCTAGA 3766

 31248866 CACTATATACTGTCTTTTTTATTACAGCCATCCTAGGGGATGTAATCTCATTGTGGTATC 31248925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 CACTATATACTGTCTTTTTTATTACAGCCATCCTAGGGGATGTAATCTCATTGTGGTATC 3826

 31248926 TCATTGTGTTTTTAATGTGTATCTTCCTAATGACTAATGATGCTCACTGTGCTTACATGT 31248985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 TCATTGTGTTTTTAATGTGTATCTTCCTAATGACTAATGATGCTCACTGTGCTTACATGT 3886

 31248986 GGCTATTAATC 31248996
          |||||||||||
     3887 GGCTATTAATC 3897

Alignment time is 3.80043 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2399] =>      2399 nucs 'mol-32-331c-160839_2399'

Score:        2367
Aligned:      2400        nucs
Identic:      2397 (100%) nucs =>       484 (100%)      1913 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31249687,31250170] EXCISED REGION [31250172,31252087]
 second seq =>  [       1,     484] EXCISED REGION [     485,    2399]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31250171,31250171]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31250195,31250195]
 second seq =>         1 nucs [508,508]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [31250171,31250181] to [31250172,31250182]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31249687 TACTTAGTAATACCACCTTAAATCCTTTCTTAGACAAGATAGATATAAATATAAAAATAA 31249746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACTTAGTAATACCACCTTAAATCCTTTCTTAGACAAGATAGATATAAATATAAAAATAA 60

 31249747 AATAGGCTATATTTTAAAGACGTTTTCAAAATAACATAATCCTTTTAAGATTTCAACCAT 31249806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATAGGCTATATTTTAAAGACGTTTTCAAAATAACATAATCCTTTTAAGATTTCAACCAT 120

 31249807 TAACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTAAAATTAAGTTTTCCCACCCCCGACACTCACATC 31249866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTAAAATTAAGTTTTCCCACCCCCGACACTCACATC 180

 31249867 AACAAACATTTACTGAATGCCTACTATGTACCAGGCACAGTGCAAGGTTAGGTGCCAAAG 31249926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACAAACATTTACTGAATGCCTACTATGTACCAGGCACAGTGCAAGGTTAGGTGCCAAAG 240

 31249927 ATACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGCACTTAAATAGACAATGATGGCATA 31249986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGCACTTAAATAGACAATGATGGCATA 300

 31249987 GTATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCTTACCA 31250046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCTTACCA 360

 31250047 GATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTACATAT 31250106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTACATAT 420

 31250107 GTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAAT 31250166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAAT 480

 31250167 AAAT 31250170
          ||||
      481 AAAT 484

EXCISED REGION

 31250172 AAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAATTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTA 31250231
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 AAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAATTTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTA 544

 31250232 GAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATC 31250291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 GAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATC 604

 31250292 ATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGA 31250351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 ATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGA 664

 31250352 GTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAAC 31250411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 GTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAAC 724

 31250412 TTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAA 31250471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 TTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAA 784

 31250472 GTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAAT 31250531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 GTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAAT 844

 31250532 AGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTG 31250591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 AGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTG 904

 31250592 AATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTA 31250651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 AATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTA 964

 31250652 TTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAG 31250711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 TTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAG 1024

 31250712 GAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATT 31250771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 GAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATT 1084

 31250772 GCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAA 31250831
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     1085 GCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAG-AAAAAAAAA 1143

 31250832 AAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGA 31250891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 AAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGA 1203

 31250892 GGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCA 31250951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 GGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCA 1263

 31250952 TCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTAT 31251011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 TCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTAT 1323

 31251012 TTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAAC 31251071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 TTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAAC 1383

 31251072 TCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATAC 31251131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 TCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATAC 1443

 31251132 TCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTG 31251191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 TCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTG 1503

 31251192 ACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTAT 31251251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 ACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTAT 1563

 31251252 GCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGC 31251311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 GCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGC 1623

 31251312 ATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAG 31251371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 ATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAG 1683

 31251372 TAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGG 31251431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 TAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGG 1743

 31251432 GTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATAT 31251491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 GTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATAT 1803

 31251492 ACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAA 31251551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 ACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAA 1863

 31251552 ACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTTACAAAAATAC 31251611
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1864 ACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTCACAAAAATAC 1923

 31251612 AGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATA 31251671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 AGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATA 1983

 31251672 CAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTG 31251731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 CAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTG 2043

 31251732 GCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATC 31251791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 GCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATC 2103

 31251792 TTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATA 31251851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 TTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATA 2163

 31251852 TAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAAT 31251911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 TAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAAT 2223

 31251912 AAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACA 31251971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 AAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACA 2283

 31251972 AAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAA 31252031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 AAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAA 2343

 31252032 CTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCA 31252087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCA 2399

Alignment time is 2.19146 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    5660] =>      5660 nucs 'mol-32-3332-079948_5660'

Score:        5593
Aligned:      5659        nucs
Identic:      5653 (100%) nucs =>       507 (100%)      5146 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31242098,31242605] EXCISED REGION [31242609,31247759]
 second seq =>  [       1,     508] EXCISED REGION [     510,    5660]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [31242606,31242608]
 second seq =>         1 nucs [509,509]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [31242599,31242605] to [31242602,31242608]
 second seq =>         1 nucs [509,509] to [510,510]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31242606,31242606] to [31242608,31242608]
 second seq =>         0 nucs

 31242098 GCATATTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACATGGACACAGGAAGGGGA 31242157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCATATTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACATGGACACAGGAAGGGGA 60

 31242158 ATATCACACTCTGGGGACTGTTGTGTGGTGGGGGTAGAGGGGAGGGATAACATTGGGAGA 31242217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATCACACTCTGGGGACTGTTGTGTGGTGGGGGTAGAGGGGAGGGATAACATTGGGAGA 120

 31242218 TATACCTAATGCTAGATGACGAGTTAGTGGGTGCAGCGCACCAGCGTGGCACATGTATAC 31242277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATACCTAATGCTAGATGACGAGTTAGTGGGTGCAGCGCACCAGCGTGGCACATGTATAC 180

 31242278 ATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAAAAA 31242337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAAAAA 240

 31242338 AATTTAAAAAATTAAAAAAAAAAGTAAAAGAATCCAAAGAGATACCATGCAGATACTAAT 31242397
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTAAAAAAATTAAAAAAAAAAGTAAAAGAATCCAAAGAGATACCATGCAGATACTAAT 300

 31242398 CATTAAGAAAACTGGAGGGAGCTATATTACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAAACATGAG 31242457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATTAAGAAAACTGGAGGGAGCTATATTACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAAACATGAG 360

 31242458 ATAATACTAGCAGTATTGAGAAATATTTCATAATGATGTAAGAATCAATTATACATATGT 31242517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAATACTAGCAGTATTGAGAAATATTTCATAATGATGTAAGAATCAATTATACATATGT 420

 31242518 AACTAACCTGCACAACGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAATATAATAATAAAAAAAAA 31242577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACTAACCTGCACAACGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAATATAATAATAAAAAAAAA 480

 31242578 AACATACACACACACACACACAAAAAAA 31242605
          ||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACATACACACACACACACACAAAAAAA 508

EXCISED REGION

 31242609 CAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTGAGCAGAAGCTGGAAGTGACTTAAGAA 31242668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      510 CAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTGAGCAGAAGCTGGAAGTGACTTAAGAA 569

 31242669 GACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAAAACCTTATGGTGGATAGATGAATAAC 31242728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      570 GACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAAAACCTTATGGTGGATAGATGAATAAC 629

 31242729 TCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTTCCTCACATGAAATAGAAAAGACAAAA 31242788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      630 TCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTTCCTCACATGAAATAGAAAAGACAAAA 689

 31242789 TAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATG 31242848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      690 TAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATG 749

 31242849 GATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACT 31242908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 GATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACT 809

 31242909 GAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAA 31242968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 GAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAA 869

 31242969 GGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGC 31243028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 GGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGC 929

 31243029 ACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATA 31243088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 ACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATA 989

 31243089 CCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGG 31243148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 CCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGG 1049

 31243149 TCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTT 31243208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 TCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTT 1109

 31243209 CAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAAC 31243268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 CAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAAC 1169

 31243269 AGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAA 31243328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 AGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAA 1229

 31243329 TTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTA 31243388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 TTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTA 1289

 31243389 CAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTT 31243448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 CAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTT 1349

 31243449 CTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAAT 31243508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 CTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAAT 1409

 31243509 CTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGG 31243568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 CTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGG 1469

 31243569 TGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAAT 31243628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 TGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAAT 1529

 31243629 GTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAG 31243688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 GTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAG 1589

 31243689 TTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAAC 31243748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 TTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAAC 1649

 31243749 AGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAA 31243808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 AGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAA 1709

 31243809 AAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGC 31243868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 AAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGC 1769

 31243869 CAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATAT 31243928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 CAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATAT 1829

 31243929 CAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAA 31243988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 CAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAA 1889

 31243989 TGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTC 31244048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 TGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTC 1949

 31244049 AGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACT 31244108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 AGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACT 2009

 31244109 TTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAG 31244168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 TTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAG 2069

 31244169 TAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGA 31244228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 TAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGA 2129

 31244229 TTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTC 31244288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 TTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTC 2189

 31244289 TCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGA 31244348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 TCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGA 2249

 31244349 TATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCC 31244408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 TATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCC 2309

 31244409 ACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTAC 31244468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 ACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTAC 2369

 31244469 CATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATAT 31244528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 CATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATAT 2429

 31244529 GTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGT 31244588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 GTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGT 2489

 31244589 CAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAG 31244648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 CAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAG 2549

 31244649 AACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAG 31244708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 AACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAG 2609

 31244709 GTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTT 31244768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 GTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTT 2669

 31244769 CCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAA 31244828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 CCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAA 2729

 31244829 CCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGA 31244888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 CCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGA 2789

 31244889 GGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAAC 31244948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 GGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAAC 2849

 31244949 TAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAAT 31245008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 TAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAAT 2909

 31245009 CAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCA 31245068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 CAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCA 2969

 31245069 CTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTA 31245128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 CTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTA 3029

 31245129 CTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAA 31245188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 CTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAA 3089

 31245189 ATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGAC 31245248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 ATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGAC 3149

 31245249 CAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTT 31245308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 CAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTT 3209

 31245309 ATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTC 31245368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 ATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTC 3269

 31245369 TCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACC 31245428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 TCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACC 3329

 31245429 AGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCT 31245488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 AGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCT 3389

 31245489 CTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAA 31245548
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 CTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAA 3449

 31245549 ACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACC 31245608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3450 ACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACC 3509

 31245609 TCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATA 31245668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 TCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATA 3569

 31245669 GTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTT 31245728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 GTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTT 3629

 31245729 AGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGT 31245788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 AGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGT 3689

 31245789 ATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACT 31245848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3690 ATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACT 3749

 31245849 GTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTAT 31245908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 GTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTAT 3809

 31245909 TATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCA 31245968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3810 TATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCA 3869

 31245969 CATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGAT 31246028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3870 CATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGAT 3929

 31246029 GATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTT 31246088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3930 GATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTT 3989

 31246089 CATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCC 31246148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3990 CATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCC 4049

 31246149 ACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACAC 31246208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4050 ACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTCAGATTCCTTACAC 4109

 31246209 ATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACA 31246268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4110 ATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACA 4169

 31246269 GATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCC 31246328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4170 GATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCC 4229

 31246329 CATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTA 31246388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4230 CATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTA 4289

 31246389 TCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTT 31246448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4290 TCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTT 4349

 31246449 TAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTC 31246508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4350 TAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTC 4409

 31246509 CAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCA 31246568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4410 CAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCA 4469

 31246569 TGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACT 31246628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4470 TGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACT 4529

 31246629 GTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATT 31246688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4530 GTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATT 4589

 31246689 CTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAG 31246748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4590 CTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAG 4649

 31246749 CATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGAC 31246808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4650 CATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGAC 4709

 31246809 TCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATG 31246868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4710 TCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATG 4769

 31246869 ACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGT 31246928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4770 ACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGT 4829

 31246929 AGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGC 31246988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4830 AGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGC 4889

 31246989 TTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAA 31247048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4890 TTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAA 4949

 31247049 TAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTAT 31247108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4950 TAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTAT 5009

 31247109 TTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGACTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACA 31247168
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5010 TTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGATTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACA 5069

 31247169 GGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTG 31247228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5070 GGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTG 5129

 31247229 ATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCT 31247288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5130 ATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCT 5189

 31247289 CCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAG 31247348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5190 CCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAG 5249

 31247349 ATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGC 31247408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5250 ATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGC 5309

 31247409 TTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTG 31247468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5310 TTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTG 5369

 31247469 ATATGGATTGAAGTGCAATTTATATGCCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGA 31247528
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5370 ATATGGATTGAAGTGCAATTTATATACCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGA 5429

 31247529 CAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATC 31247588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5430 CAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATC 5489

 31247589 ATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAA 31247648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5490 ATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAA 5549

 31247649 TTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTT 31247708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5550 TTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTT 5609

 31247709 TCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAG 31247759
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5610 TCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAG 5660

Alignment time is 5.86667 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    4896] =>      4896 nucs 'mol-32-33a0-104435_4896'

Score:        4812
Aligned:      4891        nucs
Identic:      4883 (100%) nucs =>      1540 (100%)      3343 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31245205,31246747] EXCISED REGION [31251770,31255117]
 second seq =>  [       1,    1543] EXCISED REGION [    1551,    4896]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5022 nucs [31246748,31251769]
 second seq =>         7 nucs [1544,1550]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1542,1543] to [1549,1550]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246748,31246748] to [31251769,31251769]
 second seq =>         0 nucs

 31245205 GTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTT 31245264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTT 60

 31245265 TAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGG 31245324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGG 120

 31245325 TATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAAT 31245384
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTTTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAAT 180

 31245385 ATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCT 31245444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCT 240

 31245445 ATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCC 31245504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCC 300

 31245505 ACCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCA 31245564
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCA 360

 31245565 CATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATG 31245624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATG 420

 31245625 TTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTAT 31245684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTAT 480

 31245685 ATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATC 31245744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATC 540

 31245745 TTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACAT 31245804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACAT 600

 31245805 ACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTA 31245864
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTA 660

 31245865 GTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATT 31245924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATT 720

 31245925 TACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACT 31245984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACT 780

 31245985 TGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTG 31246044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTG 840

 31246045 TTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCA 31246104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCA 900

 31246105 TTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGAT 31246164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGAT 960

 31246165 TGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACC 31246224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACC 1020

 31246225 CCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTC 31246284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTC 1080

 31246285 TGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTT 31246344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTT 1140

 31246345 CTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCAT 31246404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCAT 1200

 31246405 GAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTT 31246464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTT 1260

 31246465 GATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCC 31246524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCC 1320

 31246525 ATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCT 31246584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCT 1380

 31246585 GGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTT 31246644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTT 1440

 31246645 TTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGA 31246704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGA 1500

 31246705 GGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 1543

EXCISED REGION

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 1610

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 1670

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 1730

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 1790

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 1850

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31252129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 1910

 31252130 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 31252189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 1970

 31252190 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31252249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 2030

 31252250 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 31252309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 2090

 31252310 AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 31252369
          ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 AAACTCCATCTC--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 2148

 31252370 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 31252429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 2208

 31252430 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 31252489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 2268

 31252490 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 31252549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 2328

 31252550 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 31252609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 2388

 31252610 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 31252669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 2448

 31252670 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 31252729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 2508

 31252730 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 31252789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 2568

 31252790 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 31252849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 2628

 31252850 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 31252909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 2688

 31252910 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 31252969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 2748

 31252970 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 31253029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 2808

 31253030 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 31253089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 2868

 31253090 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 31253149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 2928

 31253150 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 31253209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 2988

 31253210 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 31253269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 3048

 31253270 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 31253329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 3108

 31253330 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 31253389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 3168

 31253390 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 31253449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 3228

 31253450 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 31253509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 3288

 31253510 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 31253569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 3348

 31253570 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 31253629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 3408

 31253630 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 31253689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 3468

 31253690 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 31253749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 3528

 31253750 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 31253809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 3588

 31253810 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 31253869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 3648

 31253870 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 31253929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 3708

 31253930 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 31253989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 3768

 31253990 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 31254049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 3828

 31254050 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 31254109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 3888

 31254110 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 31254169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 3948

 31254170 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 31254229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 4008

 31254230 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 31254289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 4068

 31254290 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 31254349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 4128

 31254350 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 31254409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 4188

 31254410 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAA 31254469
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4189 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAA 4248

 31254470 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 31254529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 4308

 31254530 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 31254589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 4368

 31254590 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 31254649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4369 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 4428

 31254650 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 31254709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 4488

 31254710 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 31254769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4489 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 4548

 31254770 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 31254829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4549 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 4608

 31254830 AACCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 31254889
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4609 ACCCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 4668

 31254890 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAAT 31254949
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4669 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAACATAGAATCTACAAAAGTAAT 4728

 31254950 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 31255009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 4788

 31255010 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 31255069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4789 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 4848

 31255070 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGG 31255117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGG 4896

Alignment time is 5.08756 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    7148] =>      7148 nucs 'mol-32-3492-019311_7148'

Score:        7064
Aligned:      7141        nucs
Identic:      7134 (100%) nucs =>      3062 (100%)      4072 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31249249,31252313] EXCISED REGION [31252324,31256399]
 second seq =>  [       1,    3064] EXCISED REGION [    3073,    7148]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [31252314,31252323]
 second seq =>         8 nucs [3065,3072]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3064,3064] to [3072,3072]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3065,3065] to [3072,3072]

 31249249 TCTGGTGTCATACCTAACAACTCTGCCTAATCCAAGGTCATAAAGTTTCTTCTATGCTTT 31249308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTGGTGTCATACCTAACAACTCTGCCTAATCCAAGGTCATAAAGTTTCTTCTATGCTTT 60

 31249309 CTTTTAGAAGTTTTATAATTTTAGCTCTTACATTTAGGCCCCTAATTCATTGTCAGCTAA 31249368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTTAGAAGTTTTATAATTTTAGCTCTTACATTTAGGCCCCTAATTCATTGTCAGCTAA 120

 31249369 TTTTTGTGTATTGTTATTGTGAGGAAGTTAATTTTTGTATATGATATCCAATTTTTCCAG 31249428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTGTGTATTGTTATTGTGAGGAAGTTAATTTTTGTATATGATATCCAATTTTTCCAG 180

 31249429 CACCATTTGTTGAAAAAATAACCCTTTCTCTATTTGTCTTAGCAGCTCTTCCAAAAATCA 31249488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACCATTTGTTGAAAAAATAACCCTTTCTCTATTTGTCTTAGCAGCTCTTCCAAAAATCA 240

 31249489 ATGGACCAAAAATGTAAATGTTTATTTCTGGACTCTCAATTCCTCTCCATTGATTTATAT 31249548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGGACCAAAAATGTAAATGTTTATTTCTGGACTCTCAATTCCTCTCCATTGATTTATAT 300

 31249549 GCTTATCCTATGCCACGGCCACGTTGTCCTGAATACTGTCACCTTAGATTGAGTTTTGAA 31249608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTTATCCTATGCCACGGCCACGTTGTCCTGAATACTGTCACCTTAGATTGAGTTTTGAA 360

 31249609 ATGGGGATGTATAAATCCTCCAATTTTGTTCTTTTACTCATTTATTTTAAATTTTATTTG 31249668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGGGGATGTATAAATCCTCCAATTTTGTTCTTTTACTCATTTATTTTAAATTTTATTTG 420

 31249669 ATCCCACTGTACTAAGTGTACTTAGTAATACCACCTTAAATCCTTTCTTAGACAAGATAG 31249728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCCCACTGTACTAAGTGTACTTAGTAATACCACCTTAAATCCTTTCTTAGACAAGATAG 480

 31249729 ATATAAATATAAAAATAAAATAGGCTATATTTTAAAGACGTTTTCAAAATAACATAATCC 31249788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATATAAATATAAAAATAAAATAGGCTATATTTTAAAGACGTTTTCAAAATAACATAATCC 540

 31249789 TTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTAAAATTAAGTTTTCCC 31249848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCCTAGGATTGACTGTAAAATTAAGTTTTCCC 600

 31249849 ACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTACTGAATGCCTACTATGTACCAGGCACAGTG 31249908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTACTGAATGCCTACTATGTACCAGGCACAGTG 660

 31249909 CAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGCACTTAA 31249968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAATAATATATACTTACTCACTTAGCACTTAA 720

 31249969 ATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACAAAAGAT 31250028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAACAGGTATGTACAAGATAAAGAACAAAAGAT 780

 31250029 ATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAAAAAAA 31250088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACTTTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAAAAAAA 840

 31250089 AAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACATGTACCC 31250148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGCGCACATGTACCC 900

 31250149 TAAAACTTAGAGTATAATAAATAAAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAATTTTTTAATTTAT 31250208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||.|||||||||||||
      901 TAAAACTTAGAGTATAATAAATAAAAAAAAAAA-TTAAAAAAAAAATTTTTTTAATTTAT 959

 31250209 TATACCTTTTTAAAAAATTATTAGAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAAC 31250268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TATACCTTTTTAAAAAATTATTAGAAATGAGGTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAAC 1019

 31250269 AGCGGCTATTCACAGGCATGATCATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCG 31250328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 AGCGGCTATTCACAGGCATGATCATAGCGCACTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCG 1079

 31250329 ATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGC 31250388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGC 1139

 31250389 CTGAAACAAATGATTTGTGAAACTTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGC 31250448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CTGAAACAAATGATTTGTGAAACTTCTACCAGCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGC 1199

 31250449 ATTTTATTTTTTTTAAACAAAAAGTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACC 31250508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ATTTTATTTTTTTTAAACAAAAAGTGCTAAATTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACC 1259

 31250509 TGCCTGTATTAGAAGACAAGAATAGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGC 31250568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TGCCTGTATTAGAAGACAAGAATAGGGCTGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGC 1319

 31250569 ACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTGAATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCC 31250628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 ACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTGAATCACTTGAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCC 1379

 31250629 AACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTG 31250688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 AACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTG 1439

 31250689 CGCCTGTGATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGT 31250748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CGCCTGTGATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGT 1499

 31250749 GGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC 31250808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAC 1559

 31250809 TCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAA 31250868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAA 1619

 31250869 AATGCGTTTAAAACTACCAGAGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTG 31250928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AATGCGTTTAAAACTACCAGAGAGGCTAGTACTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTG 1679

 31250929 TTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAG 31250988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCATCAGTTTAGGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAG 1739

 31250989 GTTACAAAAGCGAAAAGTCTTATTTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGT 31251048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GTTACAAAAGCGAAAAGTCTTATTTCACCTCCAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGT 1799

 31251049 AACTTCTGTTATGCTCTGTCAACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACA 31251108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AACTTCTGTTATGCTCTGTCAACTCCTGCTTGTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACA 1859

 31251109 GATAGTAAGAACTCTTAAAATACTCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTT 31251168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GATAGTAAGAACTCTTAAAATACTCAGATCAATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTT 1919

 31251169 CAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCAC 31251228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACATCAGAATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCAC 1979

 31251229 TTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATA 31251288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCCCCAGAAAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATA 2039

 31251289 AGCAACACATCTAAATAACGTGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAA 31251348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 AGCAACACATCTAAATAACGTGCATGTGTGTATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAA 2099

 31251349 ACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAA 31251408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAAGTGTTCTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAA 2159

 31251409 TTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACAC 31251468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTGGGTGTTCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACAC 2219

 31251469 TGGGTTAAATAAAATACCAATATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTT 31251528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TGGGTTAAATAAAATACCAATATACACTACGTAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTT 2279

 31251529 CCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAG 31251588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACCTTTAATCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAG 2339

 31251589 AATCTAGGTCTTTACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCAT 31251648
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AATCTAGGTCTTCACAAAAATACAGTGTGAGAAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCAT 2399

 31251649 TGTCACACTGGCAGCAATTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCAC 31251708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TGTCACACTGGCAGCAATTCATACAGCTGAACAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCAC 2459

 31251709 AAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGA 31251768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 AAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCCAGAAGACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGA 2519

 31251769 GCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTG 31251828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTG 2579

 31251829 GCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAAT 31251888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAAT 2639

 31251889 GCACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATA 31251948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GCACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATA 2699

 31251949 TTCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAG 31252008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TTCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAG 2759

 31252009 TACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTG 31252068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTG 2819

 31252069 TAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 31252128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCC 2879

 31252129 TGGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGG 31252188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TGGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGG 2939

 31252189 CGGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGG 31252248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CGGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGG 2999

 31252249 AGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGT 31252308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 AGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGT 3059

 31252309 GAAAC 31252313
          |||||
     3060 GAAAC 3064

EXCISED REGION

 31252324 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGA 31252383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGA 3132

 31252384 TATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAAC 31252443
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 TATTTATCTATAGTGACAAATATCGGTAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAAC 3192

 31252444 TTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACT 31252503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 TTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACT 3252

 31252504 AGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 31252563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3253 AGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 3312

 31252564 AGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAA 31252623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3313 AGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAA 3372

 31252624 GATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCG 31252683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 GATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCG 3432

 31252684 CCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAG 31252743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 CCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAG 3492

 31252744 AGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAA 31252803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3493 AGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAA 3552

 31252804 AAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTC 31252863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3553 AAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTC 3612

 31252864 ATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGT 31252923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3613 ATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGT 3672

 31252924 GAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGC 31252983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3673 GAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGC 3732

 31252984 ATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAG 31253043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 ATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAG 3792

 31253044 TCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCT 31253103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 TCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCT 3852

 31253104 TCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATA 31253163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3853 TCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATA 3912

 31253164 GCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCAT 31253223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3913 GCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCAT 3972

 31253224 TAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCT 31253283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3973 TAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCT 4032

 31253284 GATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTG 31253343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4033 GATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTG 4092

 31253344 TTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCA 31253403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4093 TTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCA 4152

 31253404 GGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACAC 31253463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4153 GGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACAC 4212

 31253464 TAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATA 31253523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4213 TAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATA 4272

 31253524 AGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTC 31253583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4273 AGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTC 4332

 31253584 TATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCA 31253643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4333 TATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCA 4392

 31253644 CAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCA 31253703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4393 CAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCA 4452

 31253704 TTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGAC 31253763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4453 TTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGAC 4512

 31253764 CTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTG 31253823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4513 CTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTG 4572

 31253824 GCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAAT 31253883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4573 GCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAAT 4632

 31253884 TAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGA 31253943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4633 TAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGA 4692

 31253944 ATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAA 31254003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4693 ATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAA 4752

 31254004 GGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAAC 31254063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4753 GGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAAC 4812

 31254064 AAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACA 31254123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4813 AAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACA 4872

 31254124 TCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTG 31254183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4873 TCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTG 4932

 31254184 AGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGC 31254243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4933 AGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGC 4992

 31254244 AATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTG 31254303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4993 AATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTG 5052

 31254304 GAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAA 31254363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5053 GAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAA 5112

 31254364 AGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTAT 31254423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5113 AGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTAT 5172

 31254424 GTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATAT 31254483
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     5173 GTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAAAACGTGGTATATAT 5232

 31254484 ACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATGG 31254543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5233 ACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCTTGGCAGCAACATGG 5292

 31254544 ATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTGC 31254603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5293 ATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGAAAATTAAGTACTGC 5352

 31254604 ATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAGC 31254663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5353 ATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAACACAAAGATGGCAGC 5412

 31254664 AATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAAA 31254723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5413 AATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAGGCAAGAGTTGAAAA 5472

 31254724 AGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAACC 31254783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5473 AGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCATCCATAACCCAAACC 5532

 31254784 TTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGTAACCCCTGAATCTA 31254843
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     5533 TTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGTACCCCCTGAATCTA 5592

 31254844 AAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTCT 31254903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5593 AAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACTAAATGCATCACTCT 5652

 31254904 TTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAATCTGGCAGTCTCATT 31254963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5653 TTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAATCTGGCAGTCTCATT 5712

 31254964 CATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTACCCAGCACTTTGGAG 31255023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5713 CATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTACCCAGCACTTTGGAG 5772

 31255024 GCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCTGAGCAATATAGCGA 31255083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5773 GCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCTGAGCAATATAGCGA 5832

 31255084 GACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCATTTGCCTGTAATCTC 31255143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5833 GACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCATTTGCCTGTAATCTC 5892

 31255144 AGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTG 31255203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5893 AGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTACAGTG 5952

 31255204 AGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGCTCCTGTTTCAAAAA 31255263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5953 AGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGCTCCTGTTTCAAAAA 6012

 31255264 AAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAGAATCAAGGGGCCGG 31255323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6013 AAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAGAATCAAGGGGCCGG 6072

 31255324 GCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGA 31255383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6073 GCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGA 6132

 31255384 GATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAATAC 31255443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6133 GATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCCACTAAAAATAC 6192

 31255444 AAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG 31255503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6193 AAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG 6252

 31255504 CAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGC 31255563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6253 CAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGC 6312

 31255564 ACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGG 31255623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6313 ACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGG 6372

 31255624 AAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAAGGTAAATGATTAAT 31255683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6373 AAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAAAGGTAAATGATTAAT 6432

 31255684 ATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTTAATCCAAAAATTCAT 31255743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     6433 ATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTTAATCCAAAAATTCAT 6492

 31255744 CTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACACTAAAAATATTTTAT 31255803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6493 CTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACACTAAAAATATTTTAT 6552

 31255804 CTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTAGCAAACTTAAAATT 31255863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6553 CTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACTAGCAAACTTAAAATT 6612

 31255864 ATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCAAGTCCCTAGGTTCC 31255923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6613 ATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCCAAGTCCCTAGGTTCC 6672

 31255924 CAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAATAAACTTACCCTTG 31255983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6673 CAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGAATAAACTTACCCTTG 6732

 31255984 GAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCATTGGCAAAAGTACTC 31256043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6733 GAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCATTGGCAAAAGTACTC 6792

 31256044 CTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGCGTAATATTTTCTTC 31256103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6793 CTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGGCGTAATATTTTCTTC 6852

 31256104 TAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAACCACAAAAATTTATA 31256163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6853 TAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAACCACAAAAATTTATA 6912

 31256164 TACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAACCAGAGAAAAAGGA 31256223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6913 TACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAAACCAGAGAAAAAGGA 6972

 31256224 AATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGACTAGTAAAGAAAAGC 31256283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6973 AATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGACTAGTAAAGAAAAGC 7032

 31256284 AGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACTTAAAATGATCTACT 31256343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7033 AGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAACTTAAAATGATCTACT 7092

 31256344 GATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTTTAGAATTAAA 31256399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7093 GATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTTTTAGAATTAAA 7148

Alignment time is 6.95604 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    6187] =>      6187 nucs 'mol-32-3492-088983_6187'

Score:        6098
Aligned:      6186        nucs
Identic:      6178 (100%) nucs =>       531 (100%)      5647 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31242074,31242605] EXCISED REGION [31242609,31248262]
 second seq =>  [       1,     532] EXCISED REGION [     534,    6187]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [31242606,31242608]
 second seq =>         1 nucs [533,533]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [31242599,31242605] to [31242602,31242608]
 second seq =>         1 nucs [533,533] to [534,534]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31242606,31242606] to [31242608,31242608]
 second seq =>         0 nucs

 31242074 CGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATATTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGA 31242133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATATTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGA 60

 31242134 GATCACATGGACACAGGAAGGGGAATATCACACTCTGGGGACTGTTGTGTGGTGGGGGTA 31242193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATCACATGGACACAGGAAGGGGAATATCACACTCTGGGGACTGTTGTGTGGTGGGGGTA 120

 31242194 GAGGGGAGGGATAACATTGGGAGATATACCTAATGCTAGATGACGAGTTAGTGGGTGCAG 31242253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGGGGAGGGATAACATTGGGAGATATACCTAATGCTAGATGACGAGTTAGTGGGTGCAG 180

 31242254 CGCACCAGCGTGGCACATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCC 31242313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CGCACCAGCGTGGCACATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCC 240

 31242314 TAAAACTTAAAGTATAATAAAAAAAATTTAAAAAATTAAAAAAAAAAGTAAAAGAATCCA 31242373
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAAACTTAAAGTATAATAAAAAAAATTAAAAAAATTAAAAAAAAAAGTAAAAGAATCCA 300

 31242374 AAGAGATACCATGCAGATACTAATCATTAAGAAAACTGGAGGGAGCTATATTACTAGCCA 31242433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAGATACCATGCAGATACTAATCATTAAGAAAACTGGAGGGAGCTATATTACTAGCCA 360

 31242434 ATAAAATAAACTTCAAAACATGAGATAATACTAGCAGTATTGAGAAATATTTCATAATGA 31242493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAAAATAAACTTCAAAACATGAGATAATACTAGCAGTATTGAGAAATATTTCATAATGA 420

 31242494 TGTAAGAATCAATTATACATATGTAACTAACCTGCACAACGTGCACATGTACCCTAAAAC 31242553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTAAGAATCAATTATACATATGTAACTAACCTGCACAACGTGCACATGTACCCTAAAAC 480

 31242554 TTAAAATATAATAATAAAAAAAAAAACATACACACACACACACACAAAAAAA 31242605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAAAATATAATAATAAAAAAAAAAACATACACACACACACACACAAAAAAA 532

EXCISED REGION

 31242609 CAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTGAGCAGAAGCTGGAAGTGACTTAAGAA 31242668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 CAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTGAGCAGAAGCTGGAAGTGACTTAAGAA 593

 31242669 GACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAAAACCTTATGGTGGATAGATGAATAAC 31242728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 GACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAAAACCTTATGGTGGATAGATGAATAAC 653

 31242729 TCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTTCCTCACATGAAATAGAAAAGACAAAA 31242788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 TCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTTCCTCACATGAAATAGAAAAGACAAAA 713

 31242789 TAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATG 31242848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 TAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATG 773

 31242849 GATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACT 31242908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 GATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACT 833

 31242909 GAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAA 31242968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 GAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAA 893

 31242969 GGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGC 31243028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 GGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGC 953

 31243029 ACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATA 31243088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 ACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATA 1013

 31243089 CCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGG 31243148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 CCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGG 1073

 31243149 TCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTT 31243208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 TCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTT 1133

 31243209 CAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAAC 31243268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 CAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAAC 1193

 31243269 AGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAA 31243328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 AGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAA 1253

 31243329 TTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTA 31243388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 TTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTA 1313

 31243389 CAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTT 31243448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 CAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTT 1373

 31243449 CTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAAT 31243508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 CTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAAT 1433

 31243509 CTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGG 31243568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 CTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGG 1493

 31243569 TGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAAT 31243628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 TGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAAT 1553

 31243629 GTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAG 31243688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 GTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAG 1613

 31243689 TTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAAC 31243748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 TTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAAC 1673

 31243749 AGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAA 31243808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 AGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAA 1733

 31243809 AAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGC 31243868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 AAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGC 1793

 31243869 CAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATAT 31243928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 CAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATAT 1853

 31243929 CAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAA 31243988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 CAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAA 1913

 31243989 TGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTC 31244048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 TGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTC 1973

 31244049 AGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACT 31244108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 AGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACT 2033

 31244109 TTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAG 31244168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 TTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAG 2093

 31244169 TAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGA 31244228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 TAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGA 2153

 31244229 TTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTC 31244288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 TTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTC 2213

 31244289 TCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGA 31244348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 TCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGA 2273

 31244349 TATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCC 31244408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 TATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCC 2333

 31244409 ACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTAC 31244468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 ACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTAC 2393

 31244469 CATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATAT 31244528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 CATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATAT 2453

 31244529 GTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGT 31244588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 GTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGT 2513

 31244589 CAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAG 31244648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 CAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAG 2573

 31244649 AACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAG 31244708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 AACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAG 2633

 31244709 GTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTT 31244768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 GTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTT 2693

 31244769 CCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAA 31244828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 CCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAA 2753

 31244829 CCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGA 31244888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 CCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGA 2813

 31244889 GGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAAC 31244948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 GGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAAC 2873

 31244949 TAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAAT 31245008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 TAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAAT 2933

 31245009 CAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCA 31245068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 CAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCA 2993

 31245069 CTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTA 31245128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 CTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTA 3053

 31245129 CTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAA 31245188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 CTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAA 3113

 31245189 ATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGAC 31245248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 ATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGAC 3173

 31245249 CAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTT 31245308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 CAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTT 3233

 31245309 ATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTC 31245368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 ATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTC 3293

 31245369 TCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACC 31245428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 TCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACC 3353

 31245429 AGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCT 31245488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 AGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCT 3413

 31245489 CTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAA 31245548
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 CTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAA 3473

 31245549 ACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACC 31245608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 ACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACC 3533

 31245609 TCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATA 31245668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 TCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATA 3593

 31245669 GTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTT 31245728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 GTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTT 3653

 31245729 AGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGT 31245788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 AGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGT 3713

 31245789 ATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACT 31245848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3714 ATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACT 3773

 31245849 GTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTAT 31245908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 GTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTAT 3833

 31245909 TATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCA 31245968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 TATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCA 3893

 31245969 CATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGAT 31246028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 CATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGAT 3953

 31246029 GATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTT 31246088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 GATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTT 4013

 31246089 CATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCC 31246148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 CATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCC 4073

 31246149 ACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACAC 31246208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4074 ACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTCAGATTCCTTACAC 4133

 31246209 ATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACA 31246268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 ATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACA 4193

 31246269 GATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCC 31246328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 GATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCC 4253

 31246329 CATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTA 31246388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 CATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTA 4313

 31246389 TCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTT 31246448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 TCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTT 4373

 31246449 TAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTC 31246508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 TAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTC 4433

 31246509 CAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCA 31246568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 CAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCA 4493

 31246569 TGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACT 31246628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 TGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACT 4553

 31246629 GTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATT 31246688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 GTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATT 4613

 31246689 CTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAG 31246748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 CTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAG 4673

 31246749 CATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGAC 31246808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 CATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGAC 4733

 31246809 TCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATG 31246868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 TCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATG 4793

 31246869 ACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGT 31246928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 ACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGT 4853

 31246929 AGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGC 31246988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 AGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGC 4913

 31246989 TTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAA 31247048
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 TTTAGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAA 4973

 31247049 TAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTAT 31247108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 TAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTAT 5033

 31247109 TTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGACTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACA 31247168
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5034 TTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGATTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACA 5093

 31247169 GGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTG 31247228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 GGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTG 5153

 31247229 ATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCT 31247288
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 ATTACACTGCACTATTACAAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCT 5213

 31247289 CCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAG 31247348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 CCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAG 5273

 31247349 ATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGC 31247408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 ATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGC 5333

 31247409 TTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTG 31247468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 TTTTATAAGATATAATGTGTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTG 5393

 31247469 ATATGGATTGAAGTGCAATTTATATGCCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGA 31247528
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 ATATGGATTGAAGTGCAATTTATATACCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGA 5453

 31247529 CAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATC 31247588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 CAGTTCAATGACGTTTTAGTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATC 5513

 31247589 ATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAA 31247648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 ATCACTACAATCCAGTTTTCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAA 5573

 31247649 TTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTT 31247708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 TTCCTGCTCCAACCCCTAGTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTT 5633

 31247709 TCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCA 31247768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 TCTAGAAATTTCATAAGTGAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCA 5693

 31247769 CTCAACACTATATTTTTTAGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTT 31247828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 CTCAACACTATATTTTTTAGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTT 5753

 31247829 TTTCATTGCTGAATAGTATTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACC 31247888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 TTTCATTGCTGAATAGTATTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACC 5813

 31247889 AGGTTATGGACATTGCATTTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCC 31247948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 AGGTTATGGACATTGCATTTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCC 5873

 31247949 AAGAGCAATTACATACAAGTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATT 31248008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 AAGAGCAATTACATACAAGTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATT 5933

 31248009 CCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTG 31248068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 CCAAGAAGTGGAATTGCTGAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTG 5993

 31248069 GCTGGACCACAGCACTCAGATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTA 31248128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 GCTGGACCACAGCACTCAGATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTA 6053

 31248129 ATTTTGGACAAGATCTGCATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCAT 31248188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 ATTTTGGACAAGATCTGCATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCAT 6113

 31248189 TATATGGGGGAGCTTCATCTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAACAAAAGGATGACCTCC 31248248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 TATATGGGGGAGCTTCATCTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAACAAAAGGATGACCTCC 6173

 31248249 CTGGGCAAAAGGGA 31248262
          ||||||||||||||
     6174 CTGGGCAAAAGGGA 6187

Alignment time is 6.1094 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    5528] =>      5528 nucs 'mol-32-34a8-076666_5528'

Score:        5472
Aligned:      5527        nucs
Identic:      5522 (100%) nucs =>       720 (100%)      4802 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31241885,31242605] EXCISED REGION [31242609,31247414]
 second seq =>  [       1,     721] EXCISED REGION [     723,    5528]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [31242606,31242608]
 second seq =>         1 nucs [722,722]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [31242599,31242605] to [31242602,31242608]
 second seq =>         1 nucs [722,722] to [723,723]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31242606,31242606] to [31242608,31242608]
 second seq =>         0 nucs

 31241885 TGTTTATTGTGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCAACAA 31241944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTTTATTGTGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCAACAA 60

 31241945 TGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAA 31242004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAA 120

 31242005 AAAATGATGAGTTCACGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAAATCATCATTCTCA 31242064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAATGATGAGTTCACGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAAATCATCATTCTCA 180

 31242065 GTAAACTGTCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATATTCTCACTCATAGGTGGGAATT 31242124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTAAACTGTCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATATTCTCACTCATAGGTGGGAATT 240

 31242125 GAACAATGAGATCACATGGACACAGGAAGGGGAATATCACACTCTGGGGACTGTTGTGTG 31242184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAACAATGAGATCACATGGACACAGGAAGGGGAATATCACACTCTGGGGACTGTTGTGTG 300

 31242185 GTGGGGGTAGAGGGGAGGGATAACATTGGGAGATATACCTAATGCTAGATGACGAGTTAG 31242244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGGGGGTAGAGGGGAGGGATAACATTGGGAGATATACCTAATGCTAGATGACGAGTTAG 360

 31242245 TGGGTGCAGCGCACCAGCGTGGCACATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCA 31242304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGGTGCAGCGCACCAGCGTGGCACATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCA 420

 31242305 CATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAAAAAAATTTAAAAAATTAAAAAAAAAAGTAA 31242364
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      421 CATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAAAAAAATTAAAAAAATTAAAAAAAAAAGTAA 480

 31242365 AAGAATCCAAAGAGATACCATGCAGATACTAATCATTAAGAAAACTGGAGGGAGCTATAT 31242424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGAATCCAAAGAGATACCATGCAGATACTAATCATTAAGAAAACTGGAGGGAGCTATAT 540

 31242425 TACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAAACATGAGATAATACTAGCAGTATTGAGAAATATT 31242484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAAACATGAGATAATACTAGCAGTATTGAGAAATATT 600

 31242485 TCATAATGATGTAAGAATCAATTATACATATGTAACTAACCTGCACAACGTGCACATGTA 31242544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCATAATGATGTAAGAATCAATTATACATATGTAACTAACCTGCACAACGTGCACATGTA 660

 31242545 CCCTAAAACTTAAAATATAATAATAAAAAAAAAAACATACACACACACACACACAAAAAA 31242604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCTAAAACTTAAAATATAATAATAAAAAAAAAAACATACACACACACACACACAAAAAA 720

 31242605 A 31242605
          |
      721 A 721

EXCISED REGION

 31242609 CAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTGAGCAGAAGCTGGAAGTGACTTAAGAA 31242668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 CAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTGAGCAGAAGCTGGAAGTGACTTAAGAA 782

 31242669 GACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAAAACCTTATGGTGGATAGATGAATAAC 31242728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 GACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAAAACCTTATGGTGGATAGATGAATAAC 842

 31242729 TCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTTCCTCACATGAAATAGAAAAGACAAAA 31242788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 TCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTTCCTCACATGAAATAGAAAAGACAAAA 902

 31242789 TAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATG 31242848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 TAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGGGAGGCCAATGCGGATG 962

 31242849 GATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACT 31242908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 GATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGTAATCCCTTCTCTACT 1022

 31242909 GAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAA 31242968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 GAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAA 1082

 31242969 GGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGC 31243028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 GGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGC 1142

 31243029 ACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATA 31243088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 ACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAAAAAAAGACAAAATATA 1202

 31243089 CCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGG 31243148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 CCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGG 1262

 31243149 TCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTT 31243208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 TCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAAGAACTGTTTCATTTT 1322

 31243209 CAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAAC 31243268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 CAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATCTTTTCAAAACTAAAC 1382

 31243269 AGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAA 31243328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 AGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAA 1442

 31243329 TTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTA 31243388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 TTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTA 1502

 31243389 CAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTT 31243448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 CAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTT 1562

 31243449 CTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAAT 31243508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 CTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAAT 1622

 31243509 CTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGG 31243568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 CTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCATAGGAATATTATGGG 1682

 31243569 TGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAAT 31243628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 TGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGCCTCTCTAAAATAAAT 1742

 31243629 GTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAG 31243688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 GTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACACAGGAAGCCCACAAAG 1802

 31243689 TTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAAC 31243748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 TTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAAATGAAAAC 1862

 31243749 AGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAA 31243808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 AGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAA 1922

 31243809 AAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGC 31243868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 AAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGC 1982

 31243869 CAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATAT 31243928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 CAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACATCAGTATAT 2042

 31243929 CAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAA 31243988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 CAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAA 2102

 31243989 TGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTC 31244048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 TGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTC 2162

 31244049 AGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACT 31244108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 AGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTTCTTGAACT 2222

 31244109 TTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAG 31244168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 TTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAG 2282

 31244169 TAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGA 31244228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 TAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACTGTGGTGGA 2342

 31244229 TTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTC 31244288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 TTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTC 2402

 31244289 TCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGA 31244348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 TCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGTGGAAGTGA 2462

 31244349 TATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCC 31244408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 TATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCC 2522

 31244409 ACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTAC 31244468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 ACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCTAAGACTAC 2582

 31244469 CATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATAT 31244528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 CATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCTGTATATAT 2642

 31244529 GTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGT 31244588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 GTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTGATCTCAGT 2702

 31244589 CAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAG 31244648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 CAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCAACCCATAG 2762

 31244649 AACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAG 31244708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 AACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCATTTTATTAG 2822

 31244709 GTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTT 31244768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 GTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTTTAGTTGTT 2882

 31244769 CCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAA 31244828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 CCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAA 2942

 31244829 CCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGA 31244888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 CCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTATTTCTGAGA 3002

 31244889 GGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAAC 31244948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 GGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATATACTCCAAC 3062

 31244949 TAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAAT 31245008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 TAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACATAGATAAT 3122

 31245009 CAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCA 31245068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 CAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTATTCAGTCA 3182

 31245069 CTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTA 31245128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 CTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCTTTATGGTA 3242

 31245129 CTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAA 31245188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 CTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGAA 3302

 31245189 ATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGAC 31245248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 ATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGAC 3362

 31245249 CAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTT 31245308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 CAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATTT 3422

 31245309 ATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTC 31245368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 ATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTTC 3482

 31245369 TCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACC 31245428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 TCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACACC 3542

 31245429 AGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCT 31245488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 AGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATCT 3602

 31245489 CTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAA 31245548
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 CTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAA 3662

 31245549 ACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACC 31245608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 ACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACC 3722

 31245609 TCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATA 31245668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 TCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATA 3782

 31245669 GTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTT 31245728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 GTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTT 3842

 31245729 AGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGT 31245788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 AGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGT 3902

 31245789 ATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACT 31245848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3903 ATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACT 3962

 31245849 GTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTAT 31245908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 GTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTAT 4022

 31245909 TATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCA 31245968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 TATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCA 4082

 31245969 CATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGAT 31246028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4083 CATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGAT 4142

 31246029 GATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTT 31246088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 GATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTT 4202

 31246089 CATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCC 31246148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4203 CATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCC 4262

 31246149 ACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACAC 31246208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4263 ACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTCAGATTCCTTACAC 4322

 31246209 ATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACA 31246268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 ATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACA 4382

 31246269 GATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCC 31246328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 GATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCC 4442

 31246329 CATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTA 31246388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 CATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTA 4502

 31246389 TCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTT 31246448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 TCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTT 4562

 31246449 TAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTC 31246508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 TAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTC 4622

 31246509 CAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCA 31246568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4623 CAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCA 4682

 31246569 TGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACT 31246628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 TGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACT 4742

 31246629 GTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATT 31246688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 GTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATT 4802

 31246689 CTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAG 31246748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4803 CTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAG 4862

 31246749 CATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGAC 31246808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4863 CATCAGGGTTTGGGCTGTTCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGAC 4922

 31246809 TCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATG 31246868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4923 TCATTATTGCTGTACTCAGGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATG 4982

 31246869 ACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGT 31246928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 ACCTTTGACCTTCCTGTGCCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGT 5042

 31246929 AGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGC 31246988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5043 AGTATAATTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGC 5102

 31246989 TTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAA 31247048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 TTTGGCTACTCGAGGTCTTTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAA 5162

 31247049 TAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTAT 31247108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5163 TAGCATTCCTGGCCTTGTACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTAT 5222

 31247109 TTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGACTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACA 31247168
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5223 TTATCAATGTGCCTTTGATGTTAGGCTACCAGATTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACA 5282

 31247169 GGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTG 31247228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5283 GGTCTTCAGAAGAGAGTCTTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTG 5342

 31247229 ATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCT 31247288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5343 ATTACACTGCACTATAACAAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCT 5402

 31247289 CCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAG 31247348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5403 CCTAAAATATTGATAAATTTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAG 5462

 31247349 ATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGC 31247408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5463 ATGTCTTCTTAGAGAGCTTAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGC 5522

 31247409 TTTTAT 31247414
          ||||||
     5523 TTTTAT 5528

Alignment time is 5.53074 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2393] =>      2393 nucs 'mol-32-34a8-100385_2393'

Score:        2348
Aligned:      2392        nucs
Identic:      2388 (100%) nucs =>       378 (100%)      2010 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31245128,31245505] EXCISED REGION [31245507,31247520]
 second seq =>  [       1,     378] EXCISED REGION [     380,    2393]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31245506,31245506]
 second seq =>         1 nucs [379,379]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31245506,31245507] to [31245507,31245508]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31245503,31245505] to [31245507,31245509]
 second seq =>         3 nucs [376,378] to [380,382]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31245128 ACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGA 31245187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAAGTGATGA 60

 31245188 AATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGA 31245247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATGTGTGTGA 120

 31245248 CCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATT 31245307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGTATATATT 180

 31245308 TATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTT 31245367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTCAAAGCTT 240

 31245368 CTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACAC 31245427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCATAGAACAC 300

 31245428 CAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATC 31245487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCTCTTCATC 360

 31245488 TCTCCTATCTCTTCCCCA 31245505
          ||||||||||||||||||
      361 TCTCCTATCTCTTCCCCA 378

EXCISED REGION

 31245507 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 31245566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      380 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 439

 31245567 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 31245626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      440 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 499

 31245627 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 31245686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      500 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 559

 31245687 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 31245746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      560 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 619

 31245747 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 31245806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      620 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 679

 31245807 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 31245866
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      680 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 739

 31245867 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 31245926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 799

 31245927 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 31245986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 859

 31245987 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 31246046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 919

 31246047 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 31246106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 979

 31246107 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 31246166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 1039

 31246167 TTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 31246226
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 TTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 1099

 31246227 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 31246286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 1159

 31246287 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 31246346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 1219

 31246347 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 31246406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 1279

 31246407 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 31246466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 1339

 31246467 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 31246526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 1399

 31246527 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 31246586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 1459

 31246587 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 31246646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 1519

 31246647 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 31246706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 1579

 31246707 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 31246766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 1639

 31246767 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 31246826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 1699

 31246827 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 31246886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 1759

 31246887 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 31246946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 1819

 31246947 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 31247006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 1879

 31247007 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 31247066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 1939

 31247067 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 31247126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 1999

 31247127 TGTTAGGCTACCAGACTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 31247186
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 TGTTAGGCTACCAGATTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 2059

 31247187 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 31247246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 2119

 31247247 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 31247306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 2179

 31247307 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 31247366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 2239

 31247367 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 31247426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 2299

 31247427 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 31247486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 2359

 31247487 TTTATATGCCATAAAATTAATCATTGTCCATTGA 31247520
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2360 TTTATATACCATAAAATTAATCATTGTCCATTGA 2393

Alignment time is 2.61444 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    5891] =>      5891 nucs 'mol-32-34d4-074159_5891'

Score:        5826
Aligned:      5892        nucs
Identic:      5886 (100%) nucs =>      3757 (100%)      2129 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31248560,31252321] EXCISED REGION [31252325,31254454]
 second seq =>  [       1,    3760] EXCISED REGION [    3761,    5890]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [31252322,31252324]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31252322,31252339] to [31252325,31252342]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31252322,31252322] to [31252324,31252324]
 second seq =>         0 nucs

 31248560 CCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGTAA 31248619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGTAA 60

 31248620 TGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAAT 31248679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCCAGACTCCGTCTCAAT 120

 31248680 AAATAAATTTCTTCACACACACACACATACCTGATTCATTCTGTCTCTCTGGAGAACCTT 31248739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATAAATTTCTTCACACACACACACATACCTGATTCATTCTGTCTCTCTGGAGAACCTT 180

 31248740 ACTACATATGGTAAGTTGGTTTAACTTTAAAAGAAATAGCCAAACTATTTTCCAAAGTGG 31248799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTACATATGGTAAGTTGGTTTAACTTTAAAAGAAATAGCCAAACTATTTTCCAAAGTGG 240

 31248800 TTATAACAATTTACATTCCTACCAACAATGTATAATATGAGAGTTCCTGTTTCTCCACAT 31248859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATAACAATTTACATTCCTACCAACAATGTATAATATGAGAGTTCCTGTTTCTCCACAT 300

 31248860 CCTAGACACTATATACTGTCTTTTTTATTACAGCCATCCTAGGGGATGTAATCTCATTGT 31248919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTAGACACTATATACTGTCTTTTTTATTACAGCCATCCTAGGGGATGTAATCTCATTGT 360

 31248920 GGTATCTCATTGTGTTTTTAATGTGTATCTTCCTAATGACTAATGATGCTCACTGTGCTT 31248979
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      361 GGTATCTCATTGTGTTTTTAATGTGTATCTTCCTAATGACTAATGATGCTCGCTGTGCTT 420

 31248980 ACATGTGGCTATTAATCACTCTCATGTCTTTTCAGATGAAGTGTCTATTCTGTTCTTTTG 31249039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACATGTGGCTATTAATCACTCTCATGTCTTTTCAGATGAAGTGTCTATTCTGTTCTTTTG 480

 31249040 CTCACTGTTAAGTTGGGTTGTTTGCCTTATTATTTACTTATAATTCTTTACATGTTTTGG 31249099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCACTGTTAAGTTGGGTTGTTTGCCTTATTATTTACTTATAATTCTTTACATGTTTTGG 540

 31249100 ATACAAGTCCTTTATCACACATGATTTGCAAATATTTTCTCCCAGTCTGCAGCCTATCTT 31249159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATACAAGTCCTTTATCACACATGATTTGCAAATATTTTCTCCCAGTCTGCAGCCTATCTT 600

 31249160 TTCAGTTTCTTCCCAATGTCTTTTGTAGCATAAAAATGTTAATTTTAATTAAGTCAAATT 31249219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCAGTTTCTTCCCAATGTCTTTTGTAGCATAAAAATGTTAATTTTAATTAAGTCAAATT 660

 31249220 CATCAATTTTTTATCTTATGGCTCATGCTTCTGGTGTCATACCTAACAACTCTGCCTAAT 31249279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATCAATTTTTTATCTTATGGCTCATGCTTCTGGTGTCATACCTAACAACTCTGCCTAAT 720

 31249280 CCAAGGTCATAAAGTTTCTTCTATGCTTTCTTTTAGAAGTTTTATAATTTTAGCTCTTAC 31249339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCAAGGTCATAAAGTTTCTTCTATGCTTTCTTTTAGAAGTTTTATAATTTTAGCTCTTAC 780

 31249340 ATTTAGGCCCCTAATTCATTGTCAGCTAATTTTTGTGTATTGTTATTGTGAGGAAGTTAA 31249399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTAGGCCCCTAATTCATTGTCAGCTAATTTTTGTGTATTGTTATTGTGAGGAAGTTAA 840

 31249400 TTTTTGTATATGATATCCAATTTTTCCAGCACCATTTGTTGAAAAAATAACCCTTTCTCT 31249459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTTGTATATGATATCCAATTTTTCCAGCACCATTTGTTGAAAAAATAACCCTTTCTCT 900

 31249460 ATTTGTCTTAGCAGCTCTTCCAAAAATCAATGGACCAAAAATGTAAATGTTTATTTCTGG 31249519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTTGTCTTAGCAGCTCTTCCAAAAATCAATGGACCAAAAATGTAAATGTTTATTTCTGG 960

 31249520 ACTCTCAATTCCTCTCCATTGATTTATATGCTTATCCTATGCCACGGCCACGTTGTCCTG 31249579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTCTCAATTCCTCTCCATTGATTTATATGCTTATCCTATGCCACGGCCACGTTGTCCTG 1020

 31249580 AATACTGTCACCTTAGATTGAGTTTTGAAATGGGGATGTATAAATCCTCCAATTTTGTTC 31249639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATACTGTCACCTTAGATTGAGTTTTGAAATGGGGATGTATAAATCCTCCAATTTTGTTC 1080

 31249640 TTTTACTCATTTATTTTAAATTTTATTTGATCCCACTGTACTAAGTGTACTTAGTAATAC 31249699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTACTCATTTATTTTAAATTTTATTTGATCCCACTGTACTAAGTGTACTTAGTAATAC 1140

 31249700 CACCTTAAATCCTTTCTTAGACAAGATAGATATAAATATAAAAATAAAATAGGCTATATT 31249759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACCTTAAATCCTTTCTTAGACAAGATAGATATAAATATAAAAATAAAATAGGCTATATT 1200

 31249760 TTAAAGACGTTTTCAAAATAACATAATCCTTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCC 31249819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTAAAGACGTTTTCAAAATAACATAATCCTTTTAAGATTTCAACCATTAACGTATTCCCC 1260

 31249820 TAGGATTGACTGTAAAATTAAGTTTTCCCACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTAC 31249879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGGATTGACTGTAAAATTAAGTTTTCCCACCCCCGACACTCACATCAACAAACATTTAC 1320

 31249880 TGAATGCCTACTATGTACCAGGCACAGTGCAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAA 31249939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGAATGCCTACTATGTACCAGGCACAGTGCAAGGTTAGGTGCCAAAGATACAGAGAAAAA 1380

 31249940 TAATATATACTTACTCACTTAGCACTTAAATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAAC 31249999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAATATATACTTACTCACTTAGCACTTAAATAGACAATGATGGCATAGTATATTAATAAC 1440

 31250000 AGGTATGTACAAGATAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACT 31250059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGTATGTACAAGATAAAGAACAAAAGATATTAATCTTATCTTACCAGATTTATCTTACT 1500

 31250060 TTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTA 31250119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTATATAAGCCTGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTACATATGTATACATATGTA 1560

 31250120 ACTAACCTGCACAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAATAAAAAAAAA 31250179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTAACCTGCACAATGCGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAATAAAAAAAAA 1620

 31250180 AAATTAAAAAAAAAAATTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTAGAAATGAG 31250239
          || ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AA-TTAAAAAAAAAATTTTTTTAATTTATTATACCTTTTTAAAAAATTATTAGAAATGAG 1679

 31250240 GTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATCATAGCGCA 31250299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GTCTCGCTATGTTGCCCAGGCTGGAGAACAGCGGCTATTCACAGGCATGATCATAGCGCA 1739

 31250300 CTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGG 31250359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CTATAGCCATGAACTCCTGGGCTCAGGCGATCCTTCCGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGG 1799

 31250360 GACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAACTTCTACCA 31250419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GACTACAGGTGTGCACAACTGTGCCTGGCCTGAAACAAATGATTTGTGAAACTTCTACCA 1859

 31250420 GCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAAGTGCTAAA 31250479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GCTTTAATGTTCTTTGATTGTATAATCGCATTTTATTTTTTTTAAACAAAAAGTGCTAAA 1919

 31250480 TTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAATAGGGCTGG 31250539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TTTTAAATTTGATAGAATCCCTTCTAACCTGCCTGTATTAGAAGACAAGAATAGGGCTGG 1979

 31250540 GCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTGAATCACTT 31250599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGAGTGAATCACTT 2039

 31250600 GAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAAT 31250659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GAGATCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAAT 2099

 31250660 ACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGA 31250719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ACAAGAGATTGGCCGGGTGTGGTGGCGTGCGCCTGTGATCCTAGCTACTCAGGAGGCTGA 2159

 31250720 GGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACT 31250779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 GGCAGCAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGCACCACT 2219

 31250780 GCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAG 31250839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     2220 GCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCATCCCAAAA-AAAAAAAAAAAAAAAAAG 2278

 31250840 TTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGAGGCTAGTA 31250899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TTTTACAAATTTTGGTACTTTCTAAACAAAATGCGTTTAAAACTACCAGAGAGGCTAGTA 2338

 31250900 CTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCATCAGTTTA 31250959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CTTACAAAAGCTTGAAATAAGAAATTCTGTTGTAAAGTACTGGTTCTCTCCATCAGTTTA 2398

 31250960 GGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTATTTCACCTC 31251019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GGTCTTTTAATTTGCTTTTTCTTCTTAAGGTTACAAAAGCGAAAAGTCTTATTTCACCTC 2458

 31251020 CAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAACTCCTGCTT 31251079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CAACCCACCTTACTCTTTCCCATAAAGGTAACTTCTGTTATGCTCTGTCAACTCCTGCTT 2518

 31251080 GTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATACTCAGATCA 31251139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 GTACAGAGCAACAAACTATAGAAGATACAGATAGTAAGAACTCTTAAAATACTCAGATCA 2578

 31251140 ATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACATCAGA 31251199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ATCTCAAACCTTATTTTAGATATAAGCTTCAGCCTCTTTCCCACTAAACTTGACATCAGA 2638

 31251200 ATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCCCCAGA 31251259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 ATAACTAGTAAAACTTGTAAGTTACTCACTTTCCTTCTTCCTCCCAACCTATGCCCCAGA 2698

 31251260 AAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGCATGTGTGT 31251319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 AAAGTTGGAGATTAATAGAAAAAGACATAAGCAACACATCTAAATAACGTGCATGTGTGT 2758

 31251320 ATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAAGTGTT 31251379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 ATGAAAGTTTCATAGTGCACATTCCTGAAACTTGTTCTATAAGAGATTTTAGTAAGTGTT 2818

 31251380 CTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTGGGTGT 31251439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CTTTAAAAATAAAGTAAGAAAGGAAGGAATTTGGAAGGAAGAAAGACAGGGGGTGGGTGT 2878

 31251440 TCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATATACACTACG 31251499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TCCCAAGTTCAAATACATTTGGGAAACACTGGGTTAAATAAAATACCAATATACACTACG 2938

 31251500 TAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACCTTTAA 31251559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TAATATACATTGTGATTGCTCCCACTTTTCCTAAAATTAGCAAACCACCAAAACCTTTAA 2998

 31251560 TCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTTACAAAAATACAGTGTGAG 31251619
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2999 TCACGGATCACTTAGTAATATCTTGAAAGAATCTAGGTCTTCACAAAAATACAGTGTGAG 3058

 31251620 AAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATACAGCTGAA 31251679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AAGCAAGTTGGATATAGCTTCCGGCTCATTGTCACACTGGCAGCAATTCATACAGCTGAA 3118

 31251680 CAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCCAGAAG 31251739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 CAACTGTGGATATTCAGAGAAACATGCACAAGGTCACATCAATTTGCTACTGGCCAGAAG 3178

 31251740 ACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGT 31251799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 ACTAAAATATAAAATAAAAATTAAAGTGAGCAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGT 3238

 31251800 TTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAA 31251859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 TTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGGCATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAA 3298

 31251860 TAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAAT 31251919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATGCACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAAT 3358

 31251920 ATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAA 31251979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 ATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATATTCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAA 3418

 31251980 AATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGA 31252039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGTACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGA 3478

 31252040 GGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGAT 31252099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 GGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGAT 3538

 31252100 CACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCA 31252159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 CACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCA 3598

 31252160 AAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGG 31252219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 AAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGG 3658

 31252220 CTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGA 31252279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 CTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGA 3718

 31252280 TACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCTC 31252321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTGAAACTCCATCTC 3760

EXCISED REGION

 31252325 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGAT 31252384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTCCTATCAAATTATGAT 3820

 31252385 ATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACT 31252444
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 ATTTATCTATAGTGACAAATATCGGTAGCCACCTATCTACGTGTAAAAAAATAGTGAACT 3880

 31252445 TGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTA 31252504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 TGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACTCAGCAGTGAGCACTA 3940

 31252505 GTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 31252564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 GTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 4000

 31252565 GGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAG 31252624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 GGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGCCAAG 4060

 31252625 ATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGC 31252684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 ATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGGTACGGTGGCAGGCGC 4120

 31252685 CTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGA 31252744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 CTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTGAATCTGGGCAGCAGA 4180

 31252745 GGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAA 31252804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 GGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGAGACTCCATCTCAAAA 4240

 31252805 AAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTCA 31252864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 AAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATTATCAAACTGTAGTCA 4300

 31252865 TGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGTG 31252924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 TGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGAAATTTTACTTGGGTG 4360

 31252925 AAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGCA 31252984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 AAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCTGAAATAGCTGCTGCA 4420

 31252985 TGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAGT 31253044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 TGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAATAAGGAACAAATAAGT 4480

 31253045 CACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCTT 31253104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 CACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTTTTTTAGTTGTTTCTT 4540

 31253105 CATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATAG 31253164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 CATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTTATAAATGTCAGATAG 4600

 31253165 CCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCATT 31253224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 CCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCTATTCAAGCTTCCATT 4660

 31253225 AAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCTG 31253284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 AAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTTCCTCAAAGCTACCTG 4720

 31253285 ATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTGT 31253344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 ATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACATACTTTAGGTTGCTGT 4780

 31253345 TTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCAG 31253404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 TTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGACACTTCAGATGGCAG 4840

 31253405 GAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACACT 31253464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 GAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCACAATGCTGTTTACACT 4900

 31253465 AGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATAA 31253524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 AGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCCTGGGGGAAAATATAA 4960

 31253525 GTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTCT 31253584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 GTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAATGAAATCTTTTTTTCT 5020

 31253585 ATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCAC 31253644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 ATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACCTAAGGACTTGGGCAC 5080

 31253645 AGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCAT 31253704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 AGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTGAACAGGACCTACCAT 5140

 31253705 TACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGACC 31253764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 TACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCATATGGAACAATGACC 5200

 31253765 TCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTGG 31253824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 TCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCTGGACACTGGCCTTGG 5260

 31253825 CAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAATT 31253884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 CAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGACAAGTGAGGCCTAATT 5320

 31253885 AAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGAA 31253944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 AAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAAACAGACCTTACAGAA 5380

 31253945 TGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAAG 31254004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 TGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATATCCAGAATCCATAAG 5440

 31254005 GAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAACA 31254064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 GAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGGCAAAGGACATAAACA 5500

 31254065 AACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACAT 31254124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5501 AACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGAAAAAATGTTTAACAT 5560

 31254125 CACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTGA 31254184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 CACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACCATCTCATGCCAGTGA 5620

 31254185 GAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGCA 31254244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5621 GAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGCTGCAGAGAAAAGGCA 5680

 31254245 ATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTGG 31254304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5681 ATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTGTGGACAGCAGTTTGG 5740

 31254305 AGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAAA 31254364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5741 AGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCAATCCCATTTCCTAAA 5800

 31254365 GGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTATG 31254424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5801 GGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTTCATGACAGCACTATG 5860

 31254425 TACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAG 31254454
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     5861 TACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAG 5890

Alignment time is 5.7341 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    4715] =>      4715 nucs 'mol-32-34d4-074160_4715'

Score:        4668
Aligned:      4712        nucs
Identic:      4708 (100%) nucs =>      1825 (100%)      2883 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31243681,31245505] EXCISED REGION [31245507,31248393]
 second seq =>  [       1,    1825] EXCISED REGION [    1827,    4713]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31245506,31245506]
 second seq =>         1 nucs [1826,1826]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31245506,31245507] to [31245507,31245508]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31245503,31245505] to [31245507,31245509]
 second seq =>         3 nucs [1823,1825] to [1827,1829]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31243681 CCACAAAGTTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAA 31243740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCACAAAGTTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATAGTGCAAA 60

 31243741 ATGAAAACAGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTC 31243800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGAAAACAGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAGGCTACTC 120

 31243801 AGTTGCAAAAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAA 31243860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTTGCAAAAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAGAGCAAAA 180

 31243861 CCTCGAGCCAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACAT 31243920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTCGAGCCAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAACTAACAT 240

 31243921 CAGTATATCAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTG 31243980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGTATATCAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCTATTTGTG 300

 31243981 AATGGGAATGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTT 31244040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATGGGAATGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTGGGTAGTT 360

 31244041 GTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTT 31244100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATAACAAGTT 420

 31244101 CTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGG 31244160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTCTTGGAGG 480

 31244161 TGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACT 31244220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATAGTGGACT 540

 31244221 GTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCT 31244280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGTCATGCCT 600

 31244281 ATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGT 31244340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGAATATAGT 660

 31244341 GGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTT 31244400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGTCCACTTT 720

 31244401 CTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCT 31244460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGACTATGCT 780

 31244461 AAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCT 31244520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAGGCACCCT 840

 31244521 GTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTG 31244580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCACCCAGTG 900

 31244581 ATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCA 31244640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGAATTTTCA 960

 31244641 ACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCAT 31244700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATTGGGGCAT 1020

 31244701 TTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTT 31244760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTATTTTTTT 1080

 31244761 TAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGA 31244820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGAAAGCAGA 1140

 31244821 AACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTAT 31244880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTAAAATTAT 1200

 31244881 TTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATAT 31244940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAACACAATAT 1260

 31244941 ACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACA 31245000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTATTGTACA 1320

 31245001 TAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTA 31245060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAACACAGTTA 1380

 31245061 TTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCT 31245120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTAAGACCCT 1440

 31245121 TTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAA 31245180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGTGAGATAA 1500

 31245181 GTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATG 31245240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGTAAATATG 1560

 31245241 TGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGT 31245300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAATAATTGT 1620

 31245301 ATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTC 31245360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAGAACATTC 1680

 31245361 AAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCAT 31245420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACTGTACCAT 1740

 31245421 AGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCT 31245480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACCAACCTCT 1800

 31245481 CTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCA 31245505
          |||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCA 1825

EXCISED REGION

 31245507 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 31245566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 CCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACA 1886

 31245567 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 31245626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 TATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTT 1946

 31245627 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 31245686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 CACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATAT 2006

 31245687 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 31245746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 ATGACATATTTTATTTATCCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTT 2066

 31245747 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 31245806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 GGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATAC 2126

 31245807 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 31245866
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 TGATTTCACTTATTTTGGATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGT 2186

 31245867 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 31245926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 TCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTA 2246

 31245927 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 31245986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 CATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTG 2306

 31245987 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 31246046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 TTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTT 2366

 31246047 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 31246106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 TTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATT 2426

 31246107 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 31246166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 TGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTG 2486

 31246167 TTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 31246226
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 TTTGCTTGCTTTTTGCTACTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCC 2546

 31246227 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 31246286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 TTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTG 2606

 31246287 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 31246346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 TTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCT 2666

 31246347 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 31246406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 TTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGA 2726

 31246407 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 31246466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 AGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGA 2786

 31246467 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 31246526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 TGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCAT 2846

 31246527 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 31246586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 TTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGG 2906

 31246587 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 31246646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 CTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTT 2966

 31246647 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 31246706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 TATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGG 3026

 31246707 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 31246766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 AGAATTGACATTATTACTATTTTAAATGTTCAACAGGAAAAGCATCAGGGTTTGGGCTGT 3086

 31246767 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 31246826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 TCTTTGATGGACTAATTCTTATTACTGATTCAATTTTGTGACTCATTATTGCTGTACTCA 3146

 31246827 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 31246886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 GGTGTTCTATTCCATTATGATTTGGTCTTGGTAGGCTGTATGACCTTTGACCTTCCTGTG 3206

 31246887 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 31246946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 CCTGGATATTTATATTTTTCTTGAGGTTTGGAAATGCTTTGTAGTATAATTTGAAGTCAG 3266

 31246947 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 31247006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 GTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTCCCAATGTTGCTTTGGCTACTCGAGGTCT 3326

 31247007 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 31247066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 TTTGTAGTTCCATTTTTGGGACTGAGTCATACGACCAAAGAATAGCATTCCTGGCCTTGT 3386

 31247067 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 31247126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 ACTTTTGCTGATCTCCTCCCTATTCACTCAACAGGGCTGTATTTATCAATGTGCCTTTGA 3446

 31247127 TGTTAGGCTACCAGACTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 31247186
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 TGTTAGGCTACCAGATTGTATAGAAAGGGGGCTCAAGAAACAGGTCTTCAGAAGAGAGTC 3506

 31247187 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 31247246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 TTCAGTTATTTACTATGAGGATGTTATTTAAGGACAGACTTGATTACACTGCACTATAAC 3566

 31247247 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 31247306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 AAAAAGAATACATTTTCCTTTGAATATAATTATTAGGCTTCTCCTAAAATATTGATAAAT 3626

 31247307 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 31247366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 TTTGATCTTGTGAACAACAGAAAAGAAATTTCATATTGAGAGATGTCTTCTTAGAGAGCT 3686

 31247367 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 31247426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 TAGAGCAAAATCCATGATCCACCTCAAGCAAAATATAGGAGCTTTTATAAGATATAATGT 3746

 31247427 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 31247486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 GTGTCCCATCCTTACTCCATTTGTACTACTTTTATAATTTTGATATGGATTGAAGTGCAA 3806

 31247487 TTTATATGCCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTA 31247546
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 TTTATATACCATAAAATTAATCATTGTCCATTGAACAGGGGACAGTTCAATGACGTTTTA 3866

 31247547 GTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTT 31247606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 GTCCATTTATAGAGGACCAGAATGTACTAAATGGATGCAATCATCACTACAATCCAGTTT 3926

 31247607 TCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTA 31247666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 TCCATTATCTCTCCCAATTCCCTTGAGTTCATATGCAGTCAATTCCTGCTCCAACCCCTA 3986

 31247667 GTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGT 31247726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 GTTCCCCTCTAATCTCCTTGCTAACTCAATCAGTTTCCCTTTTCTAGAAATTTCATAAGT 4046

 31247727 GAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTT 31247786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4047 GAAATCATATAATATGTAGTCTATTGAGTCTAGTTCCTTTCACTCAACACTATATTTTTT 4106

 31247787 AGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTA 31247846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4107 AGTTTCATCCATGCTGCAGCATATATCAATATTTTCTTCCTTTTTCATTGCTGAATAGTA 4166

 31247847 TTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCAT 31247906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4167 TTCCAATGTATAGATATGCCTCATTTTGTTTATCCATTTACCAGGTTATGGACATTGCAT 4226

 31247907 TTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAA 31247966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4227 TTTTTCTTGTTTTTATTAATATCTATTACAAATAATGTTGCCAAGAGCAATTACATACAA 4286

 31247967 GTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCT 31248026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4287 GTCTTTGTGTGAACATATGTTTTCATTTCTCTTGGGCAGATTCCAAGAAGTGGAATTGCT 4346

 31248027 GAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCA 31248086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4347 GAGTTTATATGGCACAATGATTAAAAATTATGTATCAGTTTGGCTGGACCACAGCACTCA 4406

 31248087 GATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGC 31248146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4407 GATATTTGGTCAAACATTATTCTCGACATTTCTGCAAGAGTAATTTTGGACAAGATCTGC 4466

 31248147 ATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCAT 31248206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4467 ATTTAGACTGTTAGACTTTGAGTAGAGCAGATGGTTCTCCATTATATGGGGGAGCTTCAT 4526

 31248207 CTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTC 31248266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4527 CTAATGAGTTGATGGCCTGAATAGAACAAAAGGATGACCTCCCTGGGCAAAAGGGAAGTC 4586

 31248267 CCCAGCAGACTCCCTTCAGACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGAC 31248326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4587 CCCAGCAGACTCCCTTCAGACTTCATCTGCAACATTGGCTCTTCTGGTTTTCCAGCTGAC 4646

 31248327 TGCCTTTAGACTCAAACTGCAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTG 31248386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4647 TGCCTTTAGACTCAAACTGCAACTCTTTCTGAGCCAATTAATTCCTTAAAATAAATTTTG 4706

 31248387 GCCGGGC 31248393
          |||||||
     4707 GCCGGGC 4713

Alignment time is 4.58657 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,   10953] =>     10953 nucs 'mol-32-34d4-164973_10953'

Score:       10759
Aligned:     10952        nucs
Identic:     10932 (100%) nucs =>      4387 (100%)      6545 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31242354,31246747] EXCISED REGION [31251770,31258326]
 second seq =>  [       1,    4392] EXCISED REGION [    4400,   10953]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      5022 nucs [31246748,31251769]
 second seq =>         7 nucs [4393,4399]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [4391,4392] to [4398,4399]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31246748,31246748] to [31251769,31251769]
 second seq =>         0 nucs

 31242354 AAAAAAAGTAAAAGAATCCAAAGAGATACCATGCAGATACTAATCATTAAGAAAACTGGA 31242413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAAAGTAAAAGAATCCAAAGAGATACCATGCAGATACTAATCATTAAGAAAACTGGA 60

 31242414 GGGAGCTATATTACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAAACATGAGATAATACTAGCAGTAT 31242473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGAGCTATATTACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAAACATGAGATAATACTAGCAGTAT 120

 31242474 TGAGAAATATTTCATAATGATGTAAGAATCAATTATACATATGTAACTAACCTGCACAAC 31242533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAGAAATATTTCATAATGATGTAAGAATCAATTATACATATGTAACTAACCTGCACAAC 180

 31242534 GTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAATATAATAATAAAAAAAAAAACATACACACACACA 31242593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAATATAATAATAAAAAAAAAAACATACACACACACA 240

 31242594 CACACAAAAAAAAAACAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTGAGCAGAAGCTG 31242653
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACA--AAAAAAAAACAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTGAGCAGAAGCTG 298

 31242654 GAAGTGACTTAAGAAGACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAAAACCTTATGGT 31242713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 GAAGTGACTTAAGAAGACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAAAACCTTATGGT 358

 31242714 GGATAGATGAATAACTCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTTCCTCACATGAA 31242773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 GGATAGATGAATAACTCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTTCCTCACATGAA 418

 31242774 ATAGAAAAGACAAAATAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGGG 31242833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 ATAGAAAAGACAAAATAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAACACTTTGGG 478

 31242834 AGGCCAATGCGGATGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGT 31242893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 AGGCCAATGCGGATGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGT 538

 31242894 AATCCCTTCTCTACTGAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAAT 31242953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 AATCCCTTCTCTACTGAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGCACCTGTAAT 598

 31242954 CCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGCA 31243013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 CCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTGGAGGTTGCA 658

 31243014 TTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAAA 31243073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 TTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACTGTTTAAAAA 718

 31243074 AAAAGACAAAATATACCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAAA 31243133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 AAAAGACAAAATATACCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTCTAGGCGAAA 778

 31243134 GGTTGAAAGTGGTGGTCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAA 31243193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GGTTGAAAGTGGTGGTCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAACTGATGAAA 838

 31243194 GAACTGTTTCATTTTCAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATC 31243253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 GAACTGTTTCATTTTCAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAGGACTTGATC 898

 31243254 TTTTCAAAACTAAACAGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGC 31243313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 TTTTCAAAACTAAACAGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTAAGAAAAAGC 958

 31243314 TTCAGAGTTACAGAATTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCA 31243373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 TTCAGAGTTACAGAATTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGCGTGGTTTCA 1018

 31243374 GGATAAAAATCTCTACAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATC 31243433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 GGATAAAAATCTCTACAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAGACTAAAATC 1078

 31243434 GTATCTAGTTCAGTTCTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAA 31243493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 GTATCTAGTTCAGTTCTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTTCTAAGGCAA 1138

 31243494 AAGGCCTCTAAGAATCTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCA 31243553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 AAGGCCTCTAAGAATCTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAGAAAAGCTCA 1198

 31243554 TAGGAATATTATGGGTGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGC 31243613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TAGGAATATTATGGGTGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAAAAAAAATGC 1258

 31243614 CTCTCTAAAATAAATGTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACAC 31243673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CTCTCTAAAATAAATGTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAATTTGATACAC 1318

 31243674 AGGAAGCCCACAAAGTTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATA 31243733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 AGGAAGCCCACAAAGTTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGGACAGAGATA 1378

 31243734 GTGCAAAATGAAAACAGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAG 31243793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 GTGCAAAATGAAAACAGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAGGCTGAAAAG 1438

 31243794 GCTACTCAGTTGCAAAAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAG 31243853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 GCTACTCAGTTGCAAAAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTAAATTGAGAG 1498

 31243854 AGCAAAACCTCGAGCCAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAA 31243913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 AGCAAAACCTCGAGCCAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTAATAAAAGAA 1558

 31243914 CTAACATCAGTATATCAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCT 31243973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 CTAACATCAGTATATCAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCCTGTTTCCCT 1618

 31243974 ATTTGTGAATGGGAATGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTATATTGTTG 31244033
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1619 ATTTGTGAATGGGAATGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATTTTATTGTTG 1678

 31244034 GGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATA 31244093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 GGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTGTTGTAAATA 1738

 31244094 ACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTC 31244153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 ACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATTTTGGGATTC 1798

 31244154 TTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATA 31244213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGTGACCAGATA 1858

 31244214 GTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGT 31244273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCACTGGAAGGT 1918

 31244274 CATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGA 31244333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTGACCAACAGA 1978

 31244334 ATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGT 31244393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 ATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGCTGGCAGCGT 2038

 31244394 CCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGA 31244453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAATAAGTCTGA 2098

 31244454 CTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAG 31244513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACCTCTGCCCAG 2158

 31244514 GCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCA 31244573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGCAGAATACCA 2218

 31244574 CCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGA 31244633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGACCTGCCTGA 2278

 31244634 ATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATT 31244693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 ATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCACTGAATATT 2338

 31244694 GGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTA 31244753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAACTTATTATTA 2398

 31244754 TTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGA 31244813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAACCTAACTGA 2458

 31244814 AAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTA 31244873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCATTATAAGGTA 2518

 31244874 AAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTTCAAAC 31244933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2519 AAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAATTTTCCAAAC 2578

 31244934 ACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTA 31244993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTAAATAAACTA 2638

 31244994 TTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAAC 31245053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGTTCATTTAAC 2698

 31245054 ACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTA 31245113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 ACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAATAGAAAATTA 2758

 31245114 AGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGT 31245173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 AGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAATACCAATGT 2818

 31245174 GAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGT 31245233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTATGTTTACGT 2878

 31245234 AAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAA 31245293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 AAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTTGACACATAA 2938

 31245294 TAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTTTTTAATGAG 31245353
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2939 TAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTTTGATACTTGTCATTTTTTAATGAG 2998

 31245354 AACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACT 31245413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 AACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGTCACCCTACT 3058

 31245414 GTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACC 31245473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 GTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCACTTGTTGACC 3118

 31245474 AACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCT 31245533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3119 AACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTATTCTACTTTCT 3178

 31245534 ACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCA 31245593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 ACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGGCTTATTTCA 3238

 31245594 CTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTT 31245653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 CTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAATTTCATTCTT 3298

 31245654 TTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATA 31245713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTATCCATTCATA 3358

 31245714 CACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAA 31245773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 CACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGCTGCAATAAA 3418

 31245774 CATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAG 31245833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 CATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGGATATATAAG 3478

 31245834 CCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTC 31245893
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 CAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTAAAGAACTTC 3538

 31245894 CATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACA 31245953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 CATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTAAATTAACA 3598

 31245954 GTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTC 31246013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 GTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAATAGCCATTC 3658

 31246014 TAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGA 31246073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTGATGTAGTGA 3718

 31246074 TGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTA 31246133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAGAAATATCTA 3778

 31246134 TTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGT 31246193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTATTGAGTTGT 3838

 31246194 TCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATT 31246253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTAGCTAATATT 3898

 31246254 TTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTA 31246313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTATAGAGCTTTA 3958

 31246314 AGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTA 31246373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 AGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTTGAAGTCTTA 4018

 31246374 CCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGT 31246433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 CCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTATTCTAATAGT 4078

 31246434 TTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTT 31246493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 TTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGTATCTAGTTT 4138

 31246494 CTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAA 31246553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 CTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCCTTTCCCCAA 4198

 31246554 TGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCT 31246613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 TGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTTCTGGGTTCT 4258

 31246614 CTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTA 31246673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 CTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTGTTTTGGTTA 4318

 31246674 CTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAAT 31246733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 CTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACTATTTTAAAT 4378

 31246734 GTTCAACAGGAAAA 31246747
          ||||||||||||||
     4379 GTTCAACAGGAAAA 4392

EXCISED REGION

 31251770 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 31251829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4400 CAGACTGTCTCAAGATTCCATCTTTACTGTTTTGGAAAAACTGGTTTCGTTTCTGTGTGG 4459

 31251830 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 31251889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4460 CATTATTTTTCCTTTAGCTATATAATAAAATAATACAAGTAGATGTTTGACTCTAAAATG 4519

 31251890 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 31251949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4520 CACTAATGGGTTTGCTTTTAATAAGTAAATATAATCAAAGGGTCTCAATATAAATTATAT 4579

 31251950 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 31252009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4580 TCATTTTAAAATCTCCTTTACAAAACAAAAAATAGGACTAAAATAGTTTGTAATATTAGT 4639

 31252010 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 31252069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4640 ACATGCTTTATTGTGAAAGAAACTTTAAGAGGTTGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGT 4699

 31252070 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 31252129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4700 AAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCT 4759

 31252130 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 31252189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 GGCCAACAGAGTGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGC 4819

 31252190 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31252249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4820 GGGCATCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 4879

 31252250 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 31252309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4880 GGTGGAAGTTGAAGTGAGCCGAGATCGTGATACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGTG 4939

 31252310 AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 31252369
          ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4940 AAACTCCATCTC---AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTAAGAGGTTAATAGAAACTC 4996

 31252370 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 31252429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4997 CTATCAAATTATGATATTTATCTATAGTGACAAATATCGATAGCCACCTATCTACGTGTA 5056

 31252430 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 31252489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5057 AAAAAATAGTGAACTTGGAAATATCTCCTTATATGTTAGGATTCAAATCAAGATATAACT 5116

 31252490 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 31252549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5117 CAGCAGTGAGCACTAGTATATATGCCAATGAGGCCAGGCCCTGTGGCTCACGCCTGTAAT 5176

 31252550 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 31252609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5177 CCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGAGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAGGAGTTTAAG 5236

 31252610 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 31252669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5237 ACCAGCCCGGCCAAGATGGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAACTACAAAAATTAGCCGGG 5296

 31252670 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 31252729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5297 TACGGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTAATCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCCCTTG 5356

 31252730 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 31252789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5357 AATCTGGGCAGCAGAGGTTGCAGATTGCAGCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACATAGTGA 5416

 31252790 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 31252849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5417 GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTGCCAATGAGATTGAATCAAGCTTTTATT 5476

 31252850 ATCAAACTGTAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 31252909
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5477 ATCAAACTGCAGTCATGAACAATAACTTTTCAGTGTATCTTATTCCTGTCTTCCTGCTGA 5536

 31252910 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 31252969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5537 AATTTTACTTGGGTGAAAAGTCTGGGAGGATTTCCTACTAAAGTGATCCTTATAGTAGCT 5596

 31252970 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 31253029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5597 GAAATAGCTGCTGCATGTCCTAGGTGGAAGCTTTTCTGAAATTCTACTTTAGGAGAAAAT 5656

 31253030 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 31253089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5657 AAGGAACAAATAAGTCACTGATGAAGAAAAGTTTCCACCACACACTTCAAGCATTCTCTT 5716

 31253090 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 31253149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5717 TTTTAGTTGTTTCTTCATTGCTGCTCGGCACAGGAAGTGTGATAACTGTCACCCTTACTT 5776

 31253150 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 31253209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5777 ATAAATGTCAGATAGCCTTACTCTTTTATACTCAAACCCCAACTATTTGTTTAATGCCCT 5836

 31253210 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 31253269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5837 ATTCAAGCTTCCATTAAATCTTTGATCACTCTCTAATTCAAGTAAAAATGATTTCTCCTT 5896

 31253270 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 31253329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5897 CCTCAAAGCTACCTGATTCTTGTCCATGCCTCTCACTTAGCTCATAACTATATTTAACAT 5956

 31253330 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 31253389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5957 ACTTTAGGTTGCTGTTTAACTTGATTAGTGTCCATATCCTCTTCGTTGAGAAGTCTAGGA 6016

 31253390 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 31253449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6017 CACTTCAGATGGCAGGAACAAGGTGATGCACATCTCTGGAGAGTCCACAATACCAGGCAC 6076

 31253450 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 31253509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6077 AATGCTGTTTACACTAGCATTCTGCAAGTATTTGTTGACTGACGGACATTAGTATTTTCC 6136

 31253510 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 31253569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6137 TGGGGGAAAATATAAGTGTTCAGGAAATGTTAACAGATTATCTTTAATCGATAACTAAAT 6196

 31253570 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 31253629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6197 GAAATCTTTTTTTCTATGACCAAGCAGTGTCACGGATAGGTCAGCCAAGTATAGATCACC 6256

 31253630 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 31253689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6257 TAAGGACTTGGGCACAGAATGTTGTGAGGAAATTAACTGTTCAATGACAAAAGGACTCTG 6316

 31253690 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 31253749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6317 AACAGGACCTACCATTACAGATTAACAGGAAGGATGTAGACATGCACACAGTCATATGCA 6376

 31253750 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 31253809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6377 TATGGAACAATGACCTCAAACTATAAAAATCCGAGAAAAAAACCTAGGAAATACCATTCT 6436

 31253810 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 31253869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6437 GGACACTGGCCTTGGCAAGGAATTTGTAGCTAAGACCTCAATTGCAACAAAAAAATTGAC 6496

 31253870 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 31253929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6497 AAGTGAGGCCTAATTAAACTAAAGAGCTTTTGCACAGCAAAAGAACTATCAACAGCATAA 6556

 31253930 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 31253989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6557 ACAGACCTTACAGAATGGGAGAAAATATTCAAAAACTATGCATCCAACAAAGGTCTAATA 6616

 31253990 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 31254049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6617 TCCAGAATCCATAAGGAACTTAAGCAATTCAACAAGCAAATAACCTCATTAAAAAGTGGG 6676

 31254050 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 31254109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6677 CAAAGGACATAAACAAACACTTCTCAAAAGAATACATAAAAACAGCCAACAAACATATGA 6736

 31254110 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 31254169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6737 AAAAATGTTTAACATCACTGATCATCGGAGAAATGCAAATCAAAACCAAAATGAGATACC 6796

 31254170 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 31254229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6797 ATCTCATGCCAGTGAGAAGAGCTATTATTAAAAAGTCGAAAAATAATATGCTGGTGAGGC 6856

 31254230 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 31254289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6857 TGCAGAGAAAAGGCAATTCTTATACACTGCTGGTGGGAATGTAAATTAGCTCAGCCACTG 6916

 31254290 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 31254349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6917 TGGACAGCAGTTTGGAGAGTTCTCAAAGAACTTAAAAACAGAACTACCATCCAACCAGCA 6976

 31254350 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 31254409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6977 ATCCCATTTCCTAAAGGAAAATAAATCGTTCTACAAACAAGACACATGAACTCCTATGTT 7036

 31254410 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGGTGTCCATCAAAGAA 31254469
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     7037 CATGACAGCACTATGTACAATAGCAAAGACATGGAATCAACCAAGATGTCCATCAAAGAA 7096

 31254470 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 31254529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7097 AACGTGGTATATATACATCATGGAATACTATGTAGCCATAAAAAAATAAAATCATGTCCT 7156

 31254530 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 31254589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7157 TGGCAGCAACATGGATGCAGCTGGAGGCCATTATCCTAAGTGAATTAACTTAGGAACAGA 7216

 31254590 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 31254649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7217 AAATTAAGTACTGCATGTCCTCACTTATAAGTGGGAGTGAAACATTACGTACACATGAAC 7276

 31254650 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 31254709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7277 ACAAAGATGGCAGCAATAGACACCGGGGACTACTAGAGGAAGGAGAGAGGGAGGAGGGAG 7336

 31254710 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 31254769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7337 GCAAGAGTTGAAAAAGTTAACTATTGGGTACTATGCTCAGTACCTAGGTGACAGGATCAT 7396

 31254770 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 31254829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7397 CCATAACCCAAACCTTAGCATCACACAATATACTCATGTAACAAATCTTGTGGCACATGT 7456

 31254830 AACCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 31254889
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7457 ACCCCCTGAATCTAAAATAAAAGTTGAAATGATTTTTAAAAATACAAAGATGTACGTACT 7516

 31254890 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAAAATAGAATCTACAAAAGTAAT 31254949
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     7517 AAATGCATCACTCTTTACTATTAGCAATACTGTAAAAAACATAGAATCTACAAAAGTAAT 7576

 31254950 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 31255009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7577 CTGGCAGTCTCATTCATTCATTCAACAAACCATTATTGAAAACCCACTGCCTAAAATTAC 7636

 31255010 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 31255069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7637 CCAGCACTTTGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCACTTGAGAACAGGAGTTCTAGACAAGCCT 7696

 31255070 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 31255129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7697 GAGCAATATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAATGAAAAAATAAGTAGGGCTTGGTGGCAT 7756

 31255130 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 31255189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7757 TTGCCTGTAATCTCAGGTACTTAGGAGGCTGAGGTGGGAGGAGCACTTGAGCCCAGGAGT 7816

 31255190 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 31255249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7817 TTGAGGCTACAGTGAGCTATGATCATGCCACTGTACTACAGTCTGGGTGACAGAGTGAGC 7876

 31255250 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 31255309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7877 TCCTGTTTCAAAAAAAAGAAAAAAATGATTTTAAATAGGCAAACTTTTGCTGTTAAAAAG 7936

 31255310 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 31255369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7937 AATCAAGGGGCCGGGCGTGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTAGAAGGCCGAGG 7996

 31255370 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 31255429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7997 CGGGTGGATCATGAGATCAGGGGCTCAAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTC 8056

 31255430 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 31255489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8057 TCCACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCACGCACCTGTAGTCTCAGCTAC 8116

 31255490 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 31255549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8117 TCGGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGTTTGCAGTGAGCTGA 8176

 31255550 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTC-AAAAAAAAAA 31255608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     8177 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAA 8236

 31255609 AAAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAA 31255668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8237 AAAAAGAAAGAAAGGAAACCTATTGTGTGACAGGCTCTGTATTAGGCACTGGGGAACTAA 8296

 31255669 AGGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAGACAGATTT 31255728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     8297 AGGTAAATGATTAATATCAGCAATTCATGTTGGCTCTTTAAAGCAGATTTAAACAGATTT 8356

 31255729 AATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACA 31255788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8357 AATCCAAAAATTCATCTACCCACCCCCCTGTAAAACTGTATTCCAGACAGTTAAGGTACA 8416

 31255789 CTAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACT 31255848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8417 CTAAAAATATTTTATCTCATTGCTTAGAGCAATGCAGACAGTTTACTTTGCCTACACACT 8476

 31255849 AGCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCC 31255908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8477 AGCAAACTTAAAATTATCCTAGAAACTCTTTCAAAGAGATACTGTTTCGTTTCAGTCCCC 8536

 31255909 AAGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGA 31255968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8537 AAGTCCCTAGGTTCCCAAGTTGATGACTGAGGACAAAGAGATGTGCTATAAGCAGTAAGA 8596

 31255969 ATAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCA 31256028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8597 ATAAACTTACCCTTGGAGCCTTGTCCAAACAAAAGCTCTTTACCTGAGATTAAGGCAGCA 8656

 31256029 TTGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGG 31256088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8657 TTGGCAAAAGTACTCCTTTTCCCTGTAAATTAGCTGCTGACCCATTCTTATGCTCCATGG 8716

 31256089 CGTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAA 31256148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8717 CGTAATATTTTCTTCTAAAACTTTAGAGGAAAAGGCAAAAACAGAAAGCCTTTTTGCCAA 8776

 31256149 CCACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAA 31256208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8777 CCACAAAAATTTATATACTTTAAATTGTGGGGAAAAGAAGAGCCAGTATATACTTTTAAA 8836

 31256209 ACCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGA 31256268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8837 ACCAGAGAAAAAGGAAATAAGTATCTCCCCAACGCTCAACTACAAACTTCTAACAGCTGA 8896

 31256269 CTAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAAC 31256328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8897 CTAGTAAAGAAAAGCAGAAATATTGTAGTTACAGTTAAGCTGCTTTGCATCTGAGGCAAC 8956

 31256329 TTAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTT 31256388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8957 TTAAAATGATCTACTGATAAGTAGGCTAAAAGTAAGATGGTAGGGCCAAAATTTATCCTT 9016

 31256389 TTAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATAT 31256448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9017 TTAGAATTAAAACTCATTTTTAAAGTGTGTTTTAAGAAGAAAAGATGTAATCTTTAATAT 9076

 31256449 GGCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAAT 31256508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9077 GGCAATAGGGTTTCATTCAACCAGAAAGTCACTAAACTACGAATGAATAGATTCAAAAAT 9136

 31256509 CTACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGT 31256568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9137 CTACAAAATTAACCTGACAACAAATATGGCTGCTAAATTTTAATTTTAAAACTAATATGT 9196

 31256569 TACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATA 31256628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9197 TACTGCTCTGGTGTTGTTTTAAATTAAAGGATTTCTTCTGGGACTGCAAAGGAATGAATA 9256

 31256629 TTTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTA 31256688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9257 TTTAGCCTATCTCATGAAGGAAGGAGCGATTTCTTGTCTTAAAAACAGGAGGTTCGCCTA 9316

 31256689 CAAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGG 31256748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9317 CAAGATCACCTGGGACACACTTGGCCAGTGCAAGCAGGCCAGAAGGTTACTGGAGCCTGG 9376

 31256749 GAATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGA 31256808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9377 GAATGTTTAACATCAAGAAAGGAATTACAACTCAGTAAGATCAGAAGGAACTACACAGGA 9436

 31256809 AATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAA 31256868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9437 AATGTGAACAGTAACCCTTTCATAGCTCTGTACCCCCTCCCACTGCCTGTGATAAATGAA 9496

 31256869 GTCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAA 31256928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9497 GTCCTGCTGCTGCCCAGTTATGTGAATATACAAGCCAGGAGCAGAGAGGGATGGAGAAAA 9556

 31256929 AGGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGC 31256988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9557 AGGGGAAAAAAAGACATTTTATATATATATACACAGAGCACAGCATAAATTTATAACGGC 9616

 31256989 ATGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTAT 31257048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9617 ATGATAAAATCATGCTGTTCCGCAAAACAGCCTCTAGCCTAATTGCTACATATGTACTAT 9676

 31257049 ATCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGG 31257108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9677 ATCACTGCCTTACCCAACAGTGCCCTAAGTAAAAATTCCAAAGACACTTGAAGGATCAGG 9736

 31257109 CAGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTA 31257168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9737 CAGCGGTAGGTTGATGGGATAGTTGGCAAACTCATCCTAAGTAGGGAAACGTGGCTCCTA 9796

 31257169 TAAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAG 31257228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9797 TAAAGCTGACCAAACAGGTCTCCACCCTGGCTTATGTTTAAACATCTTGTTCCTAGTCAG 9856

 31257229 TCTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCA 31257288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9857 TCTGTAGGGAAAGCATTCTTTCCACAATAACACACAATCAAATCAGAAATTCCTACTCCA 9916

 31257289 TCCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATT 31257348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9917 TCCTTTATCTACTCTATGTAAAAGTTTCTTCAATATTCTAAGCCAGAAGCTTAGAGAATT 9976

 31257349 TAACTGAATGTAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTT 31257408
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9977 TAACTGAATGTAAAC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTT 10035

 31257409 GTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTCGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCGGG 31257468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10036 GTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTCGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCGGG 10095

 31257469 TTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGAAGCTGGGATTACAAACATGCACCACCA 31257528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10096 TTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGAAGCTGGGATTACAAACATGCACCACCA 10155

 31257529 CACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCTGGCTAGC 31257588
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
    10156 CACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCTGGCTAGC 10215

 31257589 TCAAACTCCCGACCTCAGGTTATCCGCCCACCTAGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 31257648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10216 TCAAACTCCCGACCTCAGGTTATCCGCCCACCTAGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 10275

 31257649 GCGTGAGCCACCGTGCCCAGCCTCTGATTGTAAACTTTATTATAGCCTAGCTATAGTGAA 31257708
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10276 GCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCTCTGATTGTAAACTTTATTATAGCCTAGCTATAGTGAA 10335

 31257709 GGCATGGTAAAATATTTCTAGCTGTTACTTGGAAAAGCAGATGTGACCATACAGATCTTA 31257768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10336 GGCATGGTAAAATATTTCTAGCTGTTACTTGGAAAAGCAGATGTGACCATACAGATCTTA 10395

 31257769 GATACCTTTAGAGACCCGTGGTTGGGATCTGAAGAAAACAAGACACTTACCACAACTGCC 31257828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10396 GATACCTTTAGAGACCCGTGGTTGGGATCTGAAGAAAACAAGACACTTACCACAACTGCC 10455

 31257829 TCTGGATAAAGGGGAAATGCTCAGTTTCCACAAACCAGTGAGTATGAGAGCTATTAACTG 31257888
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
    10456 TCTGGATAAAGGGGAAATGCTCAGTTTCCACAAACCAGTGAGTATGAGAGCTATTAATTG 10515

 31257889 TAAAAATACACACAGTCCTCAGATGGTGAGGGCATGGGTTAGGGTAACAAAAATACAATG 31257948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10516 TAAAAATACACACAGTCCTCAGATGGTGAGGGCATGGGTTAGGGTAACAAAAATACAATG 10575

 31257949 GAGAAAAAAGTGGCATTTCCAATGTGACACATTTAAAATATGGAATGGAATTTCATGGGT 31258008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10576 GAGAAAAAAGTGGCATTTCCAATGTGACACATTTAAAATATGGAATGGAATTTCATGGGT 10635

 31258009 CACTTGGAAATAAGATTTTTTTTTCATTGGTATAACTTCAGGCTAGAGATGGTTTGCCAC 31258068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10636 CACTTGGAAATAAGATTTTTTTTTCATTGGTATAACTTCAGGCTAGAGATGGTTTGCCAC 10695

 31258069 AGAGTAAGTCAAAAAAAATAAAAGAATATGGAGATGACGATGAAAATGACAACTGCCAAT 31258128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10696 AGAGTAAGTCAAAAAAAATAAAAGAATATGGAGATGACGATGAAAATGACAACTGCCAAT 10755

 31258129 AAAAGTCAAAAGGATAGATTTTGAGAACTCTCCAGAAGAGGGAACAAAAAAATCAAAAGA 31258188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10756 AAAAGTCAAAAGGATAGATTTTGAGAACTCTCCAGAAGAGGGAACAAAAAAATCAAAAGA 10815

 31258189 TTTTTTCCCTTGGCAAAGTGCCCCCTCCAAAGCACACATAGTCTGCTTCAACCAACAGCC 31258248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10816 TTTTTTCCCTTGGCAAAGTGCCCCCTCCAAAGCACACATAGTCTGCTTCAACCAACAGCC 10875

 31258249 TATACCCACAGTGTTTTCATATACTAAATGGCATATCACTAAATAACAGTAAATGAGATT 31258308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10876 TATACCCACAGTGTTTTCATATACTAAATGGCATATCACTAAATAACAGTAAATGAGATT 10935

 31258309 AAACTGTAGACTTCCTAG 31258326
          ||||||||||||||||||
    10936 AAACTGTAGACTTCCTAG 10953

Alignment time is 10.4117 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31236747,31261769] =>     25023 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    4392] =>      4392 nucs 'mol-32-34d4-164973_4392'

Score:        4337
Aligned:      4392        nucs
Identic:      4387 (100%) nucs =>       229 (100%)      4158 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31242354,31242582] EXCISED REGION [31242585,31246747]
 second seq =>  [       1,     229] EXCISED REGION [     230,    4392]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [31242583,31242584]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31242583,31242597] to [31242585,31242599]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31242354 AAAAAAAGTAAAAGAATCCAAAGAGATACCATGCAGATACTAATCATTAAGAAAACTGGA 31242413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAAAGTAAAAGAATCCAAAGAGATACCATGCAGATACTAATCATTAAGAAAACTGGA 60

 31242414 GGGAGCTATATTACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAAACATGAGATAATACTAGCAGTAT 31242473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGAGCTATATTACTAGCCAATAAAATAAACTTCAAAACATGAGATAATACTAGCAGTAT 120

 31242474 TGAGAAATATTTCATAATGATGTAAGAATCAATTATACATATGTAACTAACCTGCACAAC 31242533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAGAAATATTTCATAATGATGTAAGAATCAATTATACATATGTAACTAACCTGCACAAC 180

 31242534 GTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAATATAATAATAAAAAAAAAAACAT 31242582
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAATATAATAATAAAAAAAAAAACAT 229

EXCISED REGION

 31242585 ACACACACACACACAAAAAAAAAACAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTGAG 31242644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      230 ACACACACACACACAAAAAAAAAACAAACATGTGGCATTGGCTTTGGGACCAGAGGTGAG 289

 31242645 CAGAAGCTGGAAGTGACTTAAGAAGACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAAAA 31242704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      290 CAGAAGCTGGAAGTGACTTAAGAAGACTGTTAGTGAAGGTTTGAACAACATTAATGAAAA 349

 31242705 CCTTATGGTGGATAGATGAATAACTCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTTCC 31242764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      350 CCTTATGGTGGATAGATGAATAACTCTTCTTATGCAGTGGGAAGTTTGTAACACTGTTCC 409

 31242765 TCACATGAAATAGAAAAGACAAAATAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAA 31242824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      410 TCACATGAAATAGAAAAGACAAAATAGGCCGGGCACAGTGGCTCACACCTGTACTCCCAA 469

 31242825 CACTTTGGGAGGCCAATGCGGATGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 31242884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      470 CACTTTGGGAGGCCAATGCGGATGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 529

 31242885 ACATGGTGTAATCCCTTCTCTACTGAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGC 31242944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      530 ACATGGTGTAATCCCTTCTCTACTGAAAATACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCGGGC 589

 31242945 ACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTG 31243004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      590 ACCTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGATGTG 649

 31243005 GAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACT 31243064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      650 GAGGTTGCATTGAGCCAAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCCAGGCGACAGTGCGAGACT 709

 31243065 GTTTAAAAAAAAAGACAAAATATACCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTC 31243124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      710 GTTTAAAAAAAAAGACAAAATATACCCCCATAAAGTGGTAAATTTGGCTAAGAAGATTTC 769

 31243125 TAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGGTCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAA 31243184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      770 TAGGCGAAAGGTTGAAAGTGGTGGTCTCCTTTAGCTATCTATAAGTTATGGATACACAAA 829

 31243185 CTGATGAAAGAACTGTTTCATTTTCAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAG 31243244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      830 CTGATGAAAGAACTGTTTCATTTTCAAGTAGAAGTTAGAGGAAAATTTTTAAAGAACCAG 889

 31243245 GACTTGATCTTTTCAAAACTAAACAGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTA 31243304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      890 GACTTGATCTTTTCAAAACTAAACAGTTTCTCATCCCCATTATCTCTAGAGAGAAATGTA 949

 31243305 AGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAATTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGC 31243364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      950 AGAAAAAGCTTCAGAGTTACAGAATTACTATTAAGGCTTGGGGCCTACTACCAGTAAAGC 1009

 31243365 GTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTACAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAG 31243424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 GTGGTTTCAGGATAAAAATCTCTACAGCATGGCTGTAAAACACCTTGTTGAGACTGAAAG 1069

 31243425 ACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTTCTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTT 31243484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 ACTAAAATCGTATCTAGTTCAGTTCTAAGAATCTTAAGAGTATGACACTTAGATTCTGTT 1129

 31243485 CTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAATCTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAG 31243544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 CTAAGGCAAAAGGCCTCTAAGAATCTTGATGATGTGCACTTTGGACTCTTAAATAGACAG 1189

 31243545 AAAAGCTCATAGGAATATTATGGGTGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAA 31243604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 AAAAGCTCATAGGAATATTATGGGTGTTGTTTCAAAATACCTTGACTCAGTATGAAAGAA 1249

 31243605 AAAAAATGCCTCTCTAAAATAAATGTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAAT 31243664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 AAAAAATGCCTCTCTAAAATAAATGTGGGTGGGCCTCTGATTAATGGAGCGGGCTACAAT 1309

 31243665 TTGATACACAGGAAGCCCACAAAGTTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGG 31243724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 TTGATACACAGGAAGCCCACAAAGTTTTAAAAAACATTATATCAGCTTGCACTGAAAGGG 1369

 31243725 ACAGAGATAGTGCAAAATGAAAACAGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAG 31243784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 ACAGAGATAGTGCAAAATGAAAACAGGCTTTTGGACTCTCAAATTTCTACAGGCAGAAAG 1429

 31243785 GCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAAAAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTA 31243844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 GCTGAAAAGGCTACTCAGTTGCAAAAAATGACCATTTCTTACAGAAAAAGGATGACTCTA 1489

 31243845 AATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGCCAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTA 31243904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 AATTGAGAGAGCAAAACCTCGAGCCAGGGAGAATCATTATCAGGAGGCAAGAATAGCCTA 1549

 31243905 ATAAAAGAACTAACATCAGTATATCAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCC 31243964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 ATAAAAGAACTAACATCAGTATATCAAAATTTCTATGGACCAGTAAAGCTGTATGTTTCC 1609

 31243965 TGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATT 31244024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 TGTTTCCCTATTTGTGAATGGGAATGTTTACTGCAGCTATTCTATGACTGCCTCTTCATT 1669

 31244025 ATATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTG 31244084
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 TTATTGTTGGGTAGTTGTCTCTTCAGCTACACCTGAGAAGATTCCTGAACAGTGTACTTG 1729

 31244085 TTGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATT 31244144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 TTGTAAATAACAAGTTCTTGAACTTTAAGACTCAGGGTAAAGAAGAGTTGGAAAATAATT 1789

 31244145 TTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGT 31244204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 TTGGGATTCTTGGAGGTGGGTGAGTAAATAAGGAACATAGGAAGAGACTGAATCATTTGT 1849

 31244205 GACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCA 31244264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 GACCAGATAGTGGACTGTGGTGGATTAAAGATGGCCACAAATGTTTTGATACTTCTTCCA 1909

 31244265 CTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTG 31244324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 CTGGAAGGTCATGCCTATGTCTTCTCTCACTAAAACTGGAAGAACTCTGTGACTCCTTTG 1969

 31244325 ACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGC 31244384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 ACCAACAGAATATAGTGGAAGTGATATGGTACCATTTTTCAGTTTTAGGCTTTAAGACGC 2029

 31244385 TGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAA 31244444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 TGGCAGCGTCCACTTTCTATCTCCACGAAAATTCTCTCTAGAAGCCGGAAGCCACAATAA 2089

 31244445 TAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACC 31244504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 TAAGTCTGACTATGCTAAGACTACCATGCTAGAAAGGTCATGTAGACTTAGCCTTCCACC 2149

 31244505 TCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGC 31244564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 TCTGCCCAGGCACCCTGTATATATGTATCTTGAATCCTCCAGAGAATTCCATCCACCAGC 2209

 31244565 AGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGA 31244624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 AGAATACCACCCAGTGATCTCAGTCAACGAAACATGCAACCAAAAATCACCAAGCTGGGA 2269

 31244625 CCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCA 31244684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 CCTGCCTGAATTTTCAACCCATAGAACGATGAGCTAAATGAGACTTGCTGTTTCACACCA 2329

 31244685 CTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAAC 31244744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 CTGAATATTGGGGCATTTTATTAGGTAGTAACATATTATTACAACGTTGATTTTTGTAAC 2389

 31244745 TTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAA 31244804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 TTATTATTATTTTTTTTAGTTGTTCCAGAAGCCACAATGTCCCATTACCACCTTCTACAA 2449

 31244805 CCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCAT 31244864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 CCTAACTGAAAGCAGAAACCTGAACCTAGTGATTTTGCAGAAGCAATTTGCAAAGTTCAT 2509

 31244865 TATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAAT 31244924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 TATAAGGTAAAATTATTTCTGAGAGGCCAATTTTCTCTAAGATATTCTAAAACAAACAAT 2569

 31244925 TTTTCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTA 31244984
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 TTTCCAAACACAATATACTCCAACTAAATCACTGCAATTATAACCATTTTCGTCTTACTA 2629

 31244985 AATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGT 31245044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 AATAAACTATTGTACATAGATAATCAAGCCAAAGGATTCATGCTCAGGCTCTCCTTCAGT 2689

 31245045 TCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAAT 31245104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 TCATTTAACACAGTTATTCAGTCACTTTCTCATGATTGAAGCAAGAGTGGGATTACAAAT 2749

 31245105 AGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAA 31245164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 AGAAAATTAAGACCCTTTATGGTACTCTACAGCAGTGATTTTCAAACACAACATAAAAAA 2809

 31245165 TACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTA 31245224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 TACCAATGTGAGATAAGTGATGAAATATAAAAGAGAGACTGTTAGTGAAATGATAAACTA 2869

 31245225 TGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTT 31245284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 TGTTTACGTAAATATGTGTGTGACCAAACTGACATCTTTTTAAAGTTTTATTTTATTTTT 2929

 31245285 GACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTCTGATACTTGTCATTT 31245344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2930 GACACATAATAATTGTATATATTTATGGAATACAGTGTGGTATTTTGATACTTGTCATTT 2989

 31245345 TTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGT 31245404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 TTTAATGAGAACATTCAAAGCTTCTCTTGTATTTTGAAATATGTTATTATTAACTAAAGT 3049

 31245405 CACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCAC 31245464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 CACCCTACTGTACCATAGAACACCAGAACTTATTCCTCCTATGTGACTGTAGGTTTGCAC 3109

 31245465 TTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCACCCAGTGGTAACCACTATT 31245524
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3110 TTGTTGACCAACCTCTCTTCATCTCTCCTATCTCTTCCCCAGCCAGTGGTAACCACTATT 3169

 31245525 CTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGG 31245584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 CTACTTTCTACTTCTATGAGATAAACGTTTTTAGATTCCACATATAAATGAGATGCCTGG 3229

 31245585 CTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAAT 31245644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 CTTATTTCACTTAATATAATGACCTCTGGGTTCATCCATGTTCACTGCAAATGATAGAAT 3289

 31245645 TTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTAT 31245704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 TTCATTCTTTTCTATGGCTGAATAGTATTCCATTGTGTATATATGACATATTTTATTTAT 3349

 31245705 CCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGC 31245764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 CCATTCATACACTAATAAACACTTAGGTTGATTCCATATCTTGGCTATTGTAACTAGTGC 3409

 31245765 TGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGG 31245824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 TGCAATAAACATAGGAGGGCAGGTATCTCTTCAACAACATACTGATTTCACTTATTTTGG 3469

 31245825 ATATATAAGCCGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTA 31245884
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3470 ATATATAAGCAGTACAGTGAAACTGTTAGATCATATGGTAGTTCTGTTATTAATATTTTA 3529

 31245885 AAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGT 31245944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3530 AAGAACTTCCATGCTGTTTTTTATTATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACCAACAGTGT 3589

 31245945 AAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAA 31246004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3590 AAATTAACAGTTCCCTTTTCTCCACATCCTTGCCAGGACTTGTTATTGTCTTTTTGGTAA 3649

 31246005 TAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTG 31246064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3650 TAGCCATTCTAACTGGGGTAAGATGATAATCTCATTACTGTTTTGATTTGCGTTTCCCTG 3709

 31246065 ATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAG 31246124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3710 ATGTAGTGATGTTGAACATTTTTTCATATGTCTGTTGCCATTTGCATGTCTTCTTTTGAG 3769

 31246125 AAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTA 31246184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3770 AAATATCTATTCAGATCTTTTCCCACTTTAGCATTCAGATTGTTTGCTTGCTTTTTGCTA 3829

 31246185 TTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTA 31246244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3830 TTGAGTTGTTCAGATTCCTTACACATTCTGGATGTTAACCCCTTGTCAGATGTGTAGTTA 3889

 31246245 GCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTAT 31246304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3890 GCTAATATTTTCTCCCATTCTACAGATTGTCTCTTCACTCTGTTGTTTCCTTTGCTGTAT 3949

 31246305 AGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTT 31246364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3950 AGAGCTTTAAGTTTGATGTAATCCCATTTGTTTATTTTTTCTTTCCTTGTCTGTGCTTTT 4009

 31246365 GAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTAT 31246424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4010 GAAGTCTTACCCATACAAACCTTATCTAGACCAATGTCATGAAGTGTTTCTCCTGTGTAT 4069

 31246425 TCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGT 31246484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4070 TCTAATAGTTTCATAGTCTGTCTTTAATCCATTTTGAGTTGATGTTGGTAAGAAACAGGT 4129

 31246485 ATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCC 31246544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4130 ATCTAGTTTCTGCACATGGATGTCCAGTTTTCCTAGCCCCATTTATTTCAGAGGATGTCC 4189

 31246545 TTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTT 31246604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4190 TTTCCCCAATGTGTGCTCTTAGCATGTTCATCAATCAGCTGGCTGTAAATACATGGATTT 4249

 31246605 CTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTG 31246664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4250 CTGGGTTCTCTATTCTGTACCACTGTCCTATGTGTCTGTTTTTATGTGTGTACCATGCTG 4309

 31246665 TTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACT 31246724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4310 TTTTGGTTACTATTGGTTAATATTCTTTGGGATATTTTGAGGAGAATTGACATTATTACT 4369

 31246725 ATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 31246747
          |||||||||||||||||||||||
     4370 ATTTTAAATGTTCAACAGGAAAA 4392

Alignment time is 4.62394 s

