
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [24366837,24388441] =>     21605 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    4537] =>      4537 nucs 'mol-32-20fa-095420_4537'

Score:        4514
Aligned:      4540        nucs
Identic:      4536 (100%) nucs =>      2462 (100%)      2074 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [24374376,24376837] EXCISED REGION [24378442,24380519]
 second seq =>  [       1,    2462] EXCISED REGION [    2464,    4537]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1604 nucs [24376838,24378441]
 second seq =>         1 nucs [2463,2463]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [24376838,24376839] to [24378442,24378443]
 second seq =>         1 nucs [2462,2462] to [2463,2463]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [24376838,24376839] to [24378440,24378441]
 second seq =>         0 nucs

 24374376 CTTGCCTTCTGGTCTTCAGTGCAAGTCAAAAGTCTTATTGGAAAGGGTAAGATTTCTAGC 24374435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGCCTTCTGGTCTTCAGTGCAAGTCAAAAGTCTTATTGGAAAGGGTAAGATTTCTAGC 60

 24374436 CCACGGCCACCAATAATGGGCCCCATTGTGGGTACTGTGTCTGCCCTGCTACTCTGTTCA 24374495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCACGGCCACCAATAATGGGCCCCATTGTGGGTACTGTGTCTGCCCTGCTACTCTGTTCA 120

 24374496 TCATGGTGCCCAGGAATAGCCTGGAAAGTCTCTAGCACCCTTGACCATGAATATCTATCA 24374555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCATGGTGCCCAGGAATAGCCTGGAAAGTCTCTAGCACCCTTGACCATGAATATCTATCA 180

 24374556 GCCTCTTCACCCCATACCACAGATAAATACACACAATTTCAGTTAAAAAAAAAAAAGTGC 24374615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCTCTTCACCCCATACCACAGATAAATACACACAATTTCAGTTAAAAAAAAAAAAGTGC 240

 24374616 TGGCTGGGAGGCATGGTAGCTCACGCCTATGGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGG 24374675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGCTGGGAGGCATGGTAGCTCACGCCTATGGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGG 300

 24374676 CAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTAGGTAACATGGCAAAATCACGTCTC 24374735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTAGGTAACATGGCAAAATCACGTCTC 360

 24374736 TACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATAACTGCATGTGCCTGTTGTCTCAGCTACTTG 24374795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATAACTGCATGTGCCTGTTGTCTCAGCTACTTG 420

 24374796 GGAGGCTGAGGTGAGAGGATCACTTAAGCAGAGGAGGTTGAGGCTGCGGTGGGCCAAGAT 24374855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAGGCTGAGGTGAGAGGATCACTTAAGCAGAGGAGGTTGAGGCTGCGGTGGGCCAAGAT 480

 24374856 TATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGTG 24374915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGTG 540

 24374916 TTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGACTGCTCCTCCCTGCCCCACTACACACCC 24374975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGACTGCTCCTCCCTGCCCCACTACACACCC 600

 24374976 CCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCCCTCAGCCTCCTACTTAGAAATTGGAGCA 24375035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCCCTCAGCCTCCTACTTAGAAATTGGAGCA 660

 24375036 CCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACATGGTGCCTGGTCTTGATTGTTAATAGAG 24375095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACATGGTGCCTGGTCTTGATTGTTAATAGAG 720

 24375096 GAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGTGGAAGTGACTCTGAAAAGGAGCCTCA 24375155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGTGGAAGTGACTCTGAAAAGGAGCCTCA 780

 24375156 ACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCTGCCTTCAGCAGTTGAGCAAATGAAACAT 24375215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCTGCCTTCAGCAGTTGAGCAAATGAAACAT 840

 24375216 TCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGAGTAGCCACCCTCATGTTTTGAGAGTACA 24375275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGAGTAGCCACCCTCATGTTTTGAGAGTACA 900

 24375276 GACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCCAGAATATTTTAATGTCAACAAAGACATG 24375335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCCAGAATATTTTAATGTCAACAAAGACATG 960

 24375336 TGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGTCCCCTTTGGAAGTCTCCATGTGTATCAG 24375395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGTCCCCTTTGGAAGTCTCCATGTGTATCAG 1020

 24375396 ATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTTTGTTGTTGTTGTTACTGTAAGAATTCTG 24375455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTTTGTTGTTGTTGTTACTGTAAGAATTCTG 1080

 24375456 AATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTTGGAAGAAAGCTTTAGTTTCATATTTTCT 24375515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTTGGAAGAAAGCTTTAGTTTCATATTTTCT 1140

 24375516 GGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCTGTTTAATGGAGAGTATGTTTTTTTAAAT 24375575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCTGTTTAATGGAGAGTATGTTTTTTTAAAT 1200

 24375576 GTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAAGAAGAGAGAATAATGGAGAAATGCCATC 24375635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAAGAAGAGAGAATAATGGAGAAATGCCATC 1260

 24375636 TCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAAAATAGAAGTTTCTTATCAGGAGTGGGAG 24375695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAAAATAGAAGTTTCTTATCAGGAGTGGGAG 1320

 24375696 GGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAGTCTGATCTTTGCTCCTGGTTTCCTATGA 24375755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAGTCTGATCTTTGCTCCTGGTTTCCTATGA 1380

 24375756 GGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTTCCACTGCTTCATGCCTGTTTCCTCCATT 24375815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTTCCACTGCTTCATGCCTGTTTCCTCCATT 1440

 24375816 TGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATTAAGTAACATTTAGATTTCCAGCTGGTAC 24375875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATTAAGTAACATTTAGATTTCCAGCTGGTAC 1500

 24375876 AGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATGGCCTTAGGTCATCCTCATGCCCCCATTG 24375935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATGGCCTTAGGTCATCCTCATGCCCCCATTG 1560

 24375936 TCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTGATATTCATAGTATCCAAATTCAGTAAGT 24375995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTGATATTCATAGTATCCAAATTCAGTAAGT 1620

 24375996 CTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAGGAAAATCTCTAACACCAATGATGACTTA 24376055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAGGAAAATCTCTAACACCAATGATGACTTA 1680

 24376056 GAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTGGACTCAGAAAAAAATTTAAGACAGTAGT 24376115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTGGACTCAGAAAAAAATTTAAGACAGTAGT 1740

 24376116 TTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGGATCAAGTTAAATCCTGGCCTAATGGCAA 24376175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGGATCAAGTTAAATCCTGGCCTAATGGCAA 1800

 24376176 TTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTTAAGAATGGTCTGTTTTTAATATATTGTC 24376235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTTAAGAATGGTCTGTTTTTAATATATTGTC 1860

 24376236 TTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGAGGGTTCATGAAAACTGCCTTACATAATT 24376295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGAGGGTTCATGAAAACTGCCTTACATAATT 1920

 24376296 TAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGTCATTGGTTTACTAAGAAATTATTTTAAT 24376355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGTCATTGGTTTACTAAGAAATTATTTTAAT 1980

 24376356 GTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAACTAGAGGGGCCCAAATACATGAGGTTTT 24376415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAACTAGAGGGGCCCAAATACATGAGGTTTT 2040

 24376416 ATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGGTTTTCTCTGCTCACAGAGTGCTTGGCAA 24376475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGGTTTTCTCTGCTCACAGAGTGCTTGGCAA 2100

 24376476 ACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATAAATGAATTAGCGAAAGGCTGTAGATCTA 24376535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATAAATGAATTAGCGAAAGGCTGTAGATCTA 2160

 24376536 ACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGTGTGGAGACAGAATCCCTGATCCTGAACA 24376595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGTGTGGAGACAGAATCCCTGATCCTGAACA 2220

 24376596 CCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGTACAGTCTAGCCCATGAAGAAAAGCATAT 24376655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGTACAGTCTAGCCCATGAAGAAAAGCATAT 2280

 24376656 GACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCGTGGTAGTCTTCTTGCTCACAGTGACAGA 24376715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCGTGGTAGTCTTCTTGCTCACAGTGACAGA 2340

 24376716 CTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTAATCAAAGAGTTAGGGAATGCGTACACTT 24376775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTAATCAAAGAGTTAGGGAATGCGTACACTT 2400

 24376776 CCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTCGTGGATTTTCTCTTTATGCCAGATCAGA 24376835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTCGTGGATTTTCTCTTTATGCCAGATCAGA 2460

 24376836 GC 24376837
          ||
     2461 GC 2462

EXCISED REGION

 24378442 TGGCTAGCCAGTTTTCCTGGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGT 24378501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TGGCTAGCCAGTTTTCCTGGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGT 2523

 24378502 TTTTGTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATAGTTGTAGATGTGTGGCATTATTTCTGAGGGCT 24378561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 TTTTGTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATAGTTGTAGATGTGTGGCATTATTTCTGAGGGCT 2583

 24378562 CTGTTCTTTTCCATTGGTCTGTATCTCTGTTTGGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTA 24378621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 CTGTTCTTTTCCATTGGTCTGTATCTCTGTTTGGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTA 2643

 24378622 CTGTAGCCTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAGCGTGACAAAGGATGTAAAGGACCCTT 24378681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 CTGTAGCCTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAGCGTGACAAAGGATGTAAAGGACCCTT 2703

 24378682 TCAAGGAGAACTACAAACCACTGCTCAATGAAATAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGA 24378741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 TCAAGGAGAACTACAAACCACTGCTCAATGAAATAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGA 2763

 24378742 ACATTCCATGCTCATGGATAGGAAGAATCAATGTCATGAAAATGGCCATACTGCCCAAGG 24378801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 ACATTCCATGCTCATGGATAGGAAGAATCAATGTCATGAAAATGGCCATACTGCCCAAGG 2823

 24378802 TAATTTATAGATTCATTGCCATCCCTGTCAAGCTACCAATGACTTTCTTCACAGAGTTAG 24378861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 TAATTTATAGATTCATTGCCATCCCTGTCAAGCTACCAATGACTTTCTTCACAGAGTTAG 2883

 24378862 AAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAAAAAGGTCCTGCATTGCCAAGTCAATCC 24378921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 AAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAAAAAGGTCCTGCATTGCCAAGTCAATCC 2943

 24378922 TAAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCAGGCTCTCTATTTTAACACATCTTGACCACT 24378981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 TAAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCAGGCTCTCTATTTTAACACATCTTGACCACT 3003

 24378982 CTGATTGTCTTTCTTGCTCTCCTCTGCCGTCTAAAGTGGGGAGATCCTGCTCAGTTGCTG 24379041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 CTGATTGTCTTTCTTGCTCTCCTCTGCCGTCTAAAGTGGGGAGATCCTGCTCAGTTGCTG 3063

 24379042 GAATTTAGTAGTCATGGAAGCTTTCTTTTTTCTTTCTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTT 24379101
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     3064 GAATTTAGTAGTCATGGAAGCTTTCTTTTTTCTTTCTTTCTTTTTCTTTTTC-TTTTTTT 3122

 24379102 TTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCGCTCTCTTGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGAT 24379161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 TTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCGCTCTCTTGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGAT 3182

 24379162 CGTGGCTCACTGCAGCCTTGAACTCCTGGTTTCACACAATCCTTCCTCCTTAGCCTCCTA 24379221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 CGTGGCTCACTGCAGCCTTGAACTCCTGGTTTCACACAATCCTTCCTCCTTAGCCTCCTA 3242

 24379222 AGTAGCTTGAACTACAGGCATGCACCCTCACATCCTGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 24379281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||
     3243 AGTAGCTTGAACTACAGGCATGCACCCTCACATCCTGCTC---TTTTTTTTTTTTTTTTT 3299

 24379282 TTTTTTTTGAAGAGACAGGGTCTTGCTATATTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGGCCT 24379341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TTTTTTTTGAAGAGACAGGGTCTTGCTATATTACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGGCCT 3359

 24379342 CAAGCAGTCCTCCCACCTCAGGCTCCCAAAGTCCTAGGATTACAGGCATGAGCCACTGCA 24379401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 CAAGCAGTCCTCCCACCTCAGGCTCCCAAAGTCCTAGGATTACAGGCATGAGCCACTGCA 3419

 24379402 CCCAGCCAAAACTTTCTTAAACACATCTCCAAACAGAGCTAATCTTTCCTTTCTGTGCTC 24379461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 CCCAGCCAAAACTTTCTTAAACACATCTCCAAACAGAGCTAATCTTTCCTTTCTGTGCTC 3479

 24379462 CCAAGGACTCAAATCACAGTGGACACAAAGTCTCTGCTTTCCAGTTTTTCTCAAAGAGCA 24379521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 CCAAGGACTCAAATCACAGTGGACACAAAGTCTCTGCTTTCCAGTTTTTCTCAAAGAGCA 3539

 24379522 TTTTTGAGGAGGGACTGTGAGCATTTCGAAGAGGAGAAGTGATCTTTAATCCACAGTGGA 24379581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TTTTTGAGGAGGGACTGTGAGCATTTCGAAGAGGAGAAGTGATCTTTAATCCACAGTGGA 3599

 24379582 TCCCCATTCCCCAGCATAGACCAACTTCTCTGTAAAAGTCTGCAAATGAGTCAAAATCAA 24379641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TCCCCATTCCCCAGCATAGACCAACTTCTCTGTAAAAGTCTGCAAATGAGTCAAAATCAA 3659

 24379642 GCAACAACTTCACAATCGCAGAGCTGCTTCCTAGCATTCTTAACTCTGGTATCAATGGTG 24379701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 GCAACAACTTCACAATCGCAGAGCTGCTTCCTAGCATTCTTAACTCTGGTATCAATGGTG 3719

 24379702 CTAAGTATTCTAGAATAAATTTCTCAAAAGGATAGCAATCTTATTTCTAATATGGCAGCC 24379761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 CTAAGTATTCTAGAATAAATTTCTCAAAAGGATAGCAATCTTATTTCTAATATGGCAGCC 3779

 24379762 TTCCAATAAATAACATGGCAGCTGAGAAAAGGAAAACAATAGTCAAATGTCATTGAAACA 24379821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TTCCAATAAATAACATGGCAGCTGAGAAAAGGAAAACAATAGTCAAATGTCATTGAAACA 3839

 24379822 CTAGTTACCTATGTAGATTATGTCTGGATTCACAGCCCAACTCACCATCGGCAAAACTCT 24379881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 CTAGTTACCTATGTAGATTATGTCTGGATTCACAGCCCAACTCACCATCGGCAAAACTCT 3899

 24379882 TCCCTGATTATATTACACTTATGATGGTCTCAAAGCCTTTTCCAAAAATAAGAAAGTACA 24379941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TCCCTGATTATATTACACTTATGATGGTCTCAAAGCCTTTTCCAAAAATAAGAAAGTACA 3959

 24379942 TTTTCTGACTTAAAACTTGTAGCATTTTCAGATCTATTAAGATGAGATTACCACAGTAAG 24380001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 TTTTCTGACTTAAAACTTGTAGCATTTTCAGATCTATTAAGATGAGATTACCACAGTAAG 4019

 24380002 TACTTCTGTATAGAACCATTCCACAAAACATTTATTGGTTCCTATGAGTTTTTAAGGCGT 24380061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 TACTTCTGTATAGAACCATTCCACAAAACATTTATTGGTTCCTATGAGTTTTTAAGGCGT 4079

 24380062 TAAATCTGATATCCAACAACTGACTGTGTTATTATCAGTCCTGCCTCACAAATTGCTCTG 24380121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 TAAATCTGATATCCAACAACTGACTGTGTTATTATCAGTCCTGCCTCACAAATTGCTCTG 4139

 24380122 CTACATAACAAAACGAGGTTTTACAGATCAGAGTGATCAGCTGGAGTCATTTCAGGTATT 24380181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 CTACATAACAAAACGAGGTTTTACAGATCAGAGTGATCAGCTGGAGTCATTTCAGGTATT 4199

 24380182 TCCCTGAAGGTCTTAAAATGGCAACTTCTTAAACAATGCACCCAGCGACTGGCATCCTCA 24380241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 TCCCTGAAGGTCTTAAAATGGCAACTTCTTAAACAATGCACCCAGCGACTGGCATCCTCA 4259

 24380242 TCATATTGGCTAAAACAACTGCTATTTTTCTTATTCTGTCTTTATGGTAGATACCATTTT 24380301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TCATATTGGCTAAAACAACTGCTATTTTTCTTATTCTGTCTTTATGGTAGATACCATTTT 4319

 24380302 CTTTTTAACAGATGGAATATAGGGAGAAAAATTCTAGCCTGTTTTACTCATTAATGAGTC 24380361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 CTTTTTAACAGATGGAATATAGGGAGAAAAATTCTAGCCTGTTTTACTCATTAATGAGTC 4379

 24380362 AGAGGAAAAGTCCCCACTGCTTCTAATTATCAGGAGTCATTGTCAAGATCTCTAGCAAGG 24380421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 AGAGGAAAAGTCCCCACTGCTTCTAATTATCAGGAGTCATTGTCAAGATCTCTAGCAAGG 4439

 24380422 AAATGTGTTTACGTTATCAAGAAAGTTAACAAATTGCCAAACTGTACACAGTAAGGGAAC 24380481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 AAATGTGTTTACGTTATCAAGAAAGTTAACAAATTGCCAAACTGTACACAGTAAGGGAAC 4499

 24380482 TTTCATGAGCATGCTGCTTGTCCCCAACTCCTGTACCT 24380519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 TTTCATGAGCATGCTGCTTGTCCCCAACTCCTGTACCT 4537

Alignment time is 3.81458 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [24366837,24388441] =>     21605 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2074] =>      2074 nucs 'mol-32-20fa-095420_2074'

Score:        2064
Aligned:      2075        nucs
Identic:      2074 (100%) nucs =>       819 (100%)      1255 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [24378442,24379261] EXCISED REGION [24379265,24380519]
 second seq =>  [       1,     819] EXCISED REGION [     820,    2074]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [24379262,24379264]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [24379262,24379286] to [24379265,24379289]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [24379262,24379262] to [24379264,24379264]
 second seq =>         0 nucs

 24378442 TGGCTAGCCAGTTTTCCTGGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGT 24378501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGCTAGCCAGTTTTCCTGGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGT 60

 24378502 TTTTGTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATAGTTGTAGATGTGTGGCATTATTTCTGAGGGCT 24378561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTGTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATAGTTGTAGATGTGTGGCATTATTTCTGAGGGCT 120

 24378562 CTGTTCTTTTCCATTGGTCTGTATCTCTGTTTGGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTA 24378621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGTTCTTTTCCATTGGTCTGTATCTCTGTTTGGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTA 180

 24378622 CTGTAGCCTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAGCGTGACAAAGGATGTAAAGGACCCTT 24378681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGTAGCCTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAGCGTGACAAAGGATGTAAAGGACCCTT 240

 24378682 TCAAGGAGAACTACAAACCACTGCTCAATGAAATAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGA 24378741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCAAGGAGAACTACAAACCACTGCTCAATGAAATAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGA 300

 24378742 ACATTCCATGCTCATGGATAGGAAGAATCAATGTCATGAAAATGGCCATACTGCCCAAGG 24378801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACATTCCATGCTCATGGATAGGAAGAATCAATGTCATGAAAATGGCCATACTGCCCAAGG 360

 24378802 TAATTTATAGATTCATTGCCATCCCTGTCAAGCTACCAATGACTTTCTTCACAGAGTTAG 24378861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAATTTATAGATTCATTGCCATCCCTGTCAAGCTACCAATGACTTTCTTCACAGAGTTAG 420

 24378862 AAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAAAAAGGTCCTGCATTGCCAAGTCAATCC 24378921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAAAAAGGTCCTGCATTGCCAAGTCAATCC 480

 24378922 TAAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCAGGCTCTCTATTTTAACACATCTTGACCACT 24378981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCAGGCTCTCTATTTTAACACATCTTGACCACT 540

 24378982 CTGATTGTCTTTCTTGCTCTCCTCTGCCGTCTAAAGTGGGGAGATCCTGCTCAGTTGCTG 24379041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGATTGTCTTTCTTGCTCTCCTCTGCCGTCTAAAGTGGGGAGATCCTGCTCAGTTGCTG 600

 24379042 GAATTTAGTAGTCATGGAAGCTTTCTTTTTTCTTTCTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTT 24379101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAATTTAGTAGTCATGGAAGCTTTCTTTTTTCTTTCTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTT 660

 24379102 TTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCGCTCTCTTGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGAT 24379161
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTTTTTTTT-GAGACAGGGTCTCGCTCTCTTGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGAT 719

 24379162 CGTGGCTCACTGCAGCCTTGAACTCCTGGTTTCACACAATCCTTCCTCCTTAGCCTCCTA 24379221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CGTGGCTCACTGCAGCCTTGAACTCCTGGTTTCACACAATCCTTCCTCCTTAGCCTCCTA 779

 24379222 AGTAGCTTGAACTACAGGCATGCACCCTCACATCCTGCTC 24379261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 AGTAGCTTGAACTACAGGCATGCACCCTCACATCCTGCTC 819

EXCISED REGION

 24379265 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAGAGACAGGGTCTTGCTATATTACCCAGGCTGG 24379324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAGAGACAGGGTCTTGCTATATTACCCAGGCTGG 879

 24379325 TCTCAAACTCCCGGCCTCAAGCAGTCCTCCCACCTCAGGCTCCCAAAGTCCTAGGATTAC 24379384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 TCTCAAACTCCCGGCCTCAAGCAGTCCTCCCACCTCAGGCTCCCAAAGTCCTAGGATTAC 939

 24379385 AGGCATGAGCCACTGCACCCAGCCAAAACTTTCTTAAACACATCTCCAAACAGAGCTAAT 24379444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 AGGCATGAGCCACTGCACCCAGCCAAAACTTTCTTAAACACATCTCCAAACAGAGCTAAT 999

 24379445 CTTTCCTTTCTGTGCTCCCAAGGACTCAAATCACAGTGGACACAAAGTCTCTGCTTTCCA 24379504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 CTTTCCTTTCTGTGCTCCCAAGGACTCAAATCACAGTGGACACAAAGTCTCTGCTTTCCA 1059

 24379505 GTTTTTCTCAAAGAGCATTTTTGAGGAGGGACTGTGAGCATTTCGAAGAGGAGAAGTGAT 24379564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 GTTTTTCTCAAAGAGCATTTTTGAGGAGGGACTGTGAGCATTTCGAAGAGGAGAAGTGAT 1119

 24379565 CTTTAATCCACAGTGGATCCCCATTCCCCAGCATAGACCAACTTCTCTGTAAAAGTCTGC 24379624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 CTTTAATCCACAGTGGATCCCCATTCCCCAGCATAGACCAACTTCTCTGTAAAAGTCTGC 1179

 24379625 AAATGAGTCAAAATCAAGCAACAACTTCACAATCGCAGAGCTGCTTCCTAGCATTCTTAA 24379684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 AAATGAGTCAAAATCAAGCAACAACTTCACAATCGCAGAGCTGCTTCCTAGCATTCTTAA 1239

 24379685 CTCTGGTATCAATGGTGCTAAGTATTCTAGAATAAATTTCTCAAAAGGATAGCAATCTTA 24379744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 CTCTGGTATCAATGGTGCTAAGTATTCTAGAATAAATTTCTCAAAAGGATAGCAATCTTA 1299

 24379745 TTTCTAATATGGCAGCCTTCCAATAAATAACATGGCAGCTGAGAAAAGGAAAACAATAGT 24379804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 TTTCTAATATGGCAGCCTTCCAATAAATAACATGGCAGCTGAGAAAAGGAAAACAATAGT 1359

 24379805 CAAATGTCATTGAAACACTAGTTACCTATGTAGATTATGTCTGGATTCACAGCCCAACTC 24379864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 CAAATGTCATTGAAACACTAGTTACCTATGTAGATTATGTCTGGATTCACAGCCCAACTC 1419

 24379865 ACCATCGGCAAAACTCTTCCCTGATTATATTACACTTATGATGGTCTCAAAGCCTTTTCC 24379924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 ACCATCGGCAAAACTCTTCCCTGATTATATTACACTTATGATGGTCTCAAAGCCTTTTCC 1479

 24379925 AAAAATAAGAAAGTACATTTTCTGACTTAAAACTTGTAGCATTTTCAGATCTATTAAGAT 24379984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 AAAAATAAGAAAGTACATTTTCTGACTTAAAACTTGTAGCATTTTCAGATCTATTAAGAT 1539

 24379985 GAGATTACCACAGTAAGTACTTCTGTATAGAACCATTCCACAAAACATTTATTGGTTCCT 24380044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 GAGATTACCACAGTAAGTACTTCTGTATAGAACCATTCCACAAAACATTTATTGGTTCCT 1599

 24380045 ATGAGTTTTTAAGGCGTTAAATCTGATATCCAACAACTGACTGTGTTATTATCAGTCCTG 24380104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 ATGAGTTTTTAAGGCGTTAAATCTGATATCCAACAACTGACTGTGTTATTATCAGTCCTG 1659

 24380105 CCTCACAAATTGCTCTGCTACATAACAAAACGAGGTTTTACAGATCAGAGTGATCAGCTG 24380164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 CCTCACAAATTGCTCTGCTACATAACAAAACGAGGTTTTACAGATCAGAGTGATCAGCTG 1719

 24380165 GAGTCATTTCAGGTATTTCCCTGAAGGTCTTAAAATGGCAACTTCTTAAACAATGCACCC 24380224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 GAGTCATTTCAGGTATTTCCCTGAAGGTCTTAAAATGGCAACTTCTTAAACAATGCACCC 1779

 24380225 AGCGACTGGCATCCTCATCATATTGGCTAAAACAACTGCTATTTTTCTTATTCTGTCTTT 24380284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 AGCGACTGGCATCCTCATCATATTGGCTAAAACAACTGCTATTTTTCTTATTCTGTCTTT 1839

 24380285 ATGGTAGATACCATTTTCTTTTTAACAGATGGAATATAGGGAGAAAAATTCTAGCCTGTT 24380344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 ATGGTAGATACCATTTTCTTTTTAACAGATGGAATATAGGGAGAAAAATTCTAGCCTGTT 1899

 24380345 TTACTCATTAATGAGTCAGAGGAAAAGTCCCCACTGCTTCTAATTATCAGGAGTCATTGT 24380404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 TTACTCATTAATGAGTCAGAGGAAAAGTCCCCACTGCTTCTAATTATCAGGAGTCATTGT 1959

 24380405 CAAGATCTCTAGCAAGGAAATGTGTTTACGTTATCAAGAAAGTTAACAAATTGCCAAACT 24380464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 CAAGATCTCTAGCAAGGAAATGTGTTTACGTTATCAAGAAAGTTAACAAATTGCCAAACT 2019

 24380465 GTACACAGTAAGGGAACTTTCATGAGCATGCTGCTTGTCCCCAACTCCTGTACCT 24380519
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 GTACACAGTAAGGGAACTTTCATGAGCATGCTGCTTGTCCCCAACTCCTGTACCT 2074

Alignment time is 1.593 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [24366837,24388441] =>     21605 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2793] =>      2793 nucs 'mol-32-211b-017067_2793'

Score:        2792
Aligned:      2792        nucs
Identic:      2792 (100%) nucs =>      2296 (100%)       496 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [24374542,24376837] EXCISED REGION [24378442,24378937]
 second seq =>  [       1,    2296] EXCISED REGION [    2298,    2793]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1604 nucs [24376838,24378441]
 second seq =>         1 nucs [2297,2297]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [24376838,24376839] to [24378442,24378443]
 second seq =>         1 nucs [2296,2296] to [2297,2297]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [24376838,24376839] to [24378440,24378441]
 second seq =>         0 nucs

 24374542 ATGAATATCTATCAGCCTCTTCACCCCATACCACAGATAAATACACACAATTTCAGTTAA 24374601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGAATATCTATCAGCCTCTTCACCCCATACCACAGATAAATACACACAATTTCAGTTAA 60

 24374602 AAAAAAAAAAGTGCTGGCTGGGAGGCATGGTAGCTCACGCCTATGGTCCCAGCACTTTGG 24374661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAAAAAAAAGTGCTGGCTGGGAGGCATGGTAGCTCACGCCTATGGTCCCAGCACTTTGG 120

 24374662 GAGGCTGAGGCAGGCAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTAGGTAACATGG 24374721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGGCTGAGGCAGGCAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTAGGTAACATGG 180

 24374722 CAAAATCACGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATAACTGCATGTGCCTGTT 24374781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAAATCACGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATAACTGCATGTGCCTGTT 240

 24374782 GTCTCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATCACTTAAGCAGAGGAGGTTGAGGCTG 24374841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCTCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATCACTTAAGCAGAGGAGGTTGAGGCTG 300

 24374842 CGGTGGGCCAAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCGAGACCCTGTCTC 24374901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGGTGGGCCAAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCGAGACCCTGTCTC 360

 24374902 AAAAAAAAAAAGTGTTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGACTGCTCCTCCCTGC 24374961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAAAAAAAAGTGTTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGACTGCTCCTCCCTGC 420

 24374962 CCCACTACACACCCCCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCCCTCAGCCTCCTACT 24375021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCACTACACACCCCCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCCCTCAGCCTCCTACT 480

 24375022 TAGAAATTGGAGCACCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACATGGTGCCTGGTCTT 24375081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGAAATTGGAGCACCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACATGGTGCCTGGTCTT 540

 24375082 GATTGTTAATAGAGGAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGTGGAAGTGACTCT 24375141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATTGTTAATAGAGGAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGTGGAAGTGACTCT 600

 24375142 GAAAAGGAGCCTCAACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCTGCCTTCAGCAGTTG 24375201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAAAGGAGCCTCAACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCTGCCTTCAGCAGTTG 660

 24375202 AGCAAATGAAACATTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGAGTAGCCACCCTCAT 24375261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCAAATGAAACATTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGAGTAGCCACCCTCAT 720

 24375262 GTTTTGAGAGTACAGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCCAGAATATTTTAATG 24375321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTTTGAGAGTACAGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCCAGAATATTTTAATG 780

 24375322 TCAACAAAGACATGTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGTCCCCTTTGGAAGTC 24375381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAACAAAGACATGTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGTCCCCTTTGGAAGTC 840

 24375382 TCCATGTGTATCAGATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTTTGTTGTTGTTGTTA 24375441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCATGTGTATCAGATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTTTGTTGTTGTTGTTA 900

 24375442 CTGTAAGAATTCTGAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTTGGAAGAAAGCTTTA 24375501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGTAAGAATTCTGAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTTGGAAGAAAGCTTTA 960

 24375502 GTTTCATATTTTCTGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCTGTTTAATGGAGAGT 24375561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTTCATATTTTCTGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCTGTTTAATGGAGAGT 1020

 24375562 ATGTTTTTTTAAATGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAAGAAGAGAGAATAAT 24375621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGTTTTTTTAAATGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAAGAAGAGAGAATAAT 1080

 24375622 GGAGAAATGCCATCTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAAAATAGAAGTTTCTT 24375681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGAGAAATGCCATCTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAAAATAGAAGTTTCTT 1140

 24375682 ATCAGGAGTGGGAGGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAGTCTGATCTTTGCTC 24375741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATCAGGAGTGGGAGGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAGTCTGATCTTTGCTC 1200

 24375742 CTGGTTTCCTATGAGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTTCCACTGCTTCATGC 24375801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGGTTTCCTATGAGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTTCCACTGCTTCATGC 1260

 24375802 CTGTTTCCTCCATTTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATTAAGTAACATTTAGA 24375861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGTTTCCTCCATTTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATTAAGTAACATTTAGA 1320

 24375862 TTTCCAGCTGGTACAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATGGCCTTAGGTCATCC 24375921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTCCAGCTGGTACAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATGGCCTTAGGTCATCC 1380

 24375922 TCATGCCCCCATTGTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTGATATTCATAGTATC 24375981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCATGCCCCCATTGTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTGATATTCATAGTATC 1440

 24375982 CAAATTCAGTAAGTCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAGGAAAATCTCTAACA 24376041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAATTCAGTAAGTCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAGGAAAATCTCTAACA 1500

 24376042 CCAATGATGACTTAGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTGGACTCAGAAAAAAA 24376101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCAATGATGACTTAGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTGGACTCAGAAAAAAA 1560

 24376102 TTTAAGACAGTAGTTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGGATCAAGTTAAATCC 24376161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTAAGACAGTAGTTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGGATCAAGTTAAATCC 1620

 24376162 TGGCCTAATGGCAATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTTAAGAATGGTCTGTT 24376221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGCCTAATGGCAATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTTAAGAATGGTCTGTT 1680

 24376222 TTTAATATATTGTCTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGAGGGTTCATGAAAAC 24376281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTAATATATTGTCTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGAGGGTTCATGAAAAC 1740

 24376282 TGCCTTACATAATTTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGTCATTGGTTTACTAA 24376341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCCTTACATAATTTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGTCATTGGTTTACTAA 1800

 24376342 GAAATTATTTTAATGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAACTAGAGGGGCCCAA 24376401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAAATTATTTTAATGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAACTAGAGGGGCCCAA 1860

 24376402 ATACATGAGGTTTTATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGGTTTTCTCTGCTCAC 24376461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATACATGAGGTTTTATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGGTTTTCTCTGCTCAC 1920

 24376462 AGAGTGCTTGGCAAACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATAAATGAATTAGCGAA 24376521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGAGTGCTTGGCAAACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATAAATGAATTAGCGAA 1980

 24376522 AGGCTGTAGATCTAACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGTGTGGAGACAGAATC 24376581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGGCTGTAGATCTAACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGTGTGGAGACAGAATC 2040

 24376582 CCTGATCCTGAACACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGTACAGTCTAGCCCAT 24376641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCTGATCCTGAACACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGTACAGTCTAGCCCAT 2100

 24376642 GAAGAAAAGCATATGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCGTGGTAGTCTTCTTG 24376701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAAGAAAAGCATATGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCGTGGTAGTCTTCTTG 2160

 24376702 CTCACAGTGACAGACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTAATCAAAGAGTTAGG 24376761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTCACAGTGACAGACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTAATCAAAGAGTTAGG 2220

 24376762 GAATGCGTACACTTCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTCGTGGATTTTCTCTT 24376821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAATGCGTACACTTCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTCGTGGATTTTCTCTT 2280

 24376822 TATGCCAGATCAGAGC 24376837
          ||||||||||||||||
     2281 TATGCCAGATCAGAGC 2296

EXCISED REGION

 24378442 TGGCTAGCCAGTTTTCCTGGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGT 24378501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 TGGCTAGCCAGTTTTCCTGGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGT 2357

 24378502 TTTTGTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATAGTTGTAGATGTGTGGCATTATTTCTGAGGGCT 24378561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 TTTTGTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATAGTTGTAGATGTGTGGCATTATTTCTGAGGGCT 2417

 24378562 CTGTTCTTTTCCATTGGTCTGTATCTCTGTTTGGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTA 24378621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 CTGTTCTTTTCCATTGGTCTGTATCTCTGTTTGGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTA 2477

 24378622 CTGTAGCCTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAGCGTGACAAAGGATGTAAAGGACCCTT 24378681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 CTGTAGCCTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAGCGTGACAAAGGATGTAAAGGACCCTT 2537

 24378682 TCAAGGAGAACTACAAACCACTGCTCAATGAAATAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGA 24378741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 TCAAGGAGAACTACAAACCACTGCTCAATGAAATAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGA 2597

 24378742 ACATTCCATGCTCATGGATAGGAAGAATCAATGTCATGAAAATGGCCATACTGCCCAAGG 24378801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 ACATTCCATGCTCATGGATAGGAAGAATCAATGTCATGAAAATGGCCATACTGCCCAAGG 2657

 24378802 TAATTTATAGATTCATTGCCATCCCTGTCAAGCTACCAATGACTTTCTTCACAGAGTTAG 24378861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 TAATTTATAGATTCATTGCCATCCCTGTCAAGCTACCAATGACTTTCTTCACAGAGTTAG 2717

 24378862 AAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAAAAAGGTCCTGCATTGCCAAGTCAATCC 24378921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 AAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAAAAAGGTCCTGCATTGCCAAGTCAATCC 2777

 24378922 TAAGCCAAAAGAACAA 24378937
          ||||||||||||||||
     2778 TAAGCCAAAAGAACAA 2793

Alignment time is 2.13813 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [24366837,24388441] =>     21605 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2994] =>      2994 nucs 'mol-32-2291-065670_2994'

Score:        2944
Aligned:      2966        nucs
Identic:      2964 (100%) nucs =>      2953 (100%)        11 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [24374075,24377029] EXCISED REGION [24378429,24378439]
 second seq =>  [       1,    2955] EXCISED REGION [    2959,    2969]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1399 nucs [24377030,24378428]
 second seq =>         3 nucs [2956,2958]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [24377029,24377029] to [24378428,24378428]
 second seq =>         1 nucs [2956,2956] to [2959,2959]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [24377030,24377031] to [24378427,24378428]
 second seq =>         0 nucs

 24374075 CCGCGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACCGCGTGAGCCACCGCG 24374134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCGCGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACCGCGTGAGCCACCGCG 60

 24374135 CCCGGCCCAGAGTTTACTTTTAAGCAAGACATAGATGATGATAGATAGTTCAGTGGTTCG 24374194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCGGCCCAGAGTTTACTTTTAAGCAAGACATAGATGATGATAGATAGTTCAGTGGTTCG 120

 24374195 CAGACTTTGGAATTTCATAAACTGATAACATTTGAGGGGTTTAAGGGAGTCACTGAAATA 24374254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGACTTTGGAATTTCATAAACTGATAACATTTGAGGGGTTTAAGGGAGTCACTGAAATA 180

 24374255 ATAGACCAACTTACCAGTCCTCTGAATCATTCTACTCAATTCATTAAGGATGACCTGACC 24374314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAGACCAACTTACCAGTCCTCTGAATCATTCTACTCAATTCATTAAGGATGACCTGACC 240

 24374315 AGAGGAAACGAATAAACTGAGAATTGTTCAGGAGATGTGAAACCCAGTCAAGACCATTTG 24374374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAGGAAACGAATAAACTGAGAATTGTTCAGGAGATGTGAAACCCAGTCAAGACCATTTG 300

 24374375 TCTTGCCTTCTGGTCTTCAGTGCAAGTCAAAAGTCTTATTGGAAAGGGTAAGATTTCTAG 24374434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTTGCCTTCTGGTCTTCAGTGCAAGTCAAAAGTCTTATTGGAAAGGGTAAGATTTCTAG 360

 24374435 CCCACGGCCACCAATAATGGGCCCCATTGTGGGTACTGTGTCTGCCCTGCTACTCTGTTC 24374494
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCACGGCCACCAATAATGGGCCCCATTGAGGGTACTGTGTCTGCCCTGCTACTCTGTTC 420

 24374495 ATCATGGTGCCCAGGAATAGCCTGGAAAGTCTCTAGCACCCTTGACCATGAATATCTATC 24374554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCATGGTGCCCAGGAATAGCCTGGAAAGTCTCTAGCACCCTTGACCATGAATATCTATC 480

 24374555 AGCCTCTTCACCCCATACCACAGATAAATACACACAATTTCAGTTAAAAAAAAAAAAGTG 24374614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCCTCTTCACCCCATACCACAGATAAATACACACAATTTCAGTTAAAAAAAAAAAAGTG 540

 24374615 CTGGCTGGGAGGCATGGTAGCTCACGCCTATGGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAG 24374674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGGCTGGGAGGCATGGTAGCTCACGCCTATGGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAG 600

 24374675 GCAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTAGGTAACATGGCAAAATCACGTCT 24374734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTAGGTAACATGGCAAAATCACGTCT 660

 24374735 CTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATAACTGCATGTGCCTGTTGTCTCAGCTACTT 24374794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATAACTGCATGTGCCTGTTGTCTCAGCTACTT 720

 24374795 GGGAGGCTGAGGTGAGAGGATCACTTAAGCAGAGGAGGTTGAGGCTGCGGTGGGCCAAGA 24374854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGAGGCTGAGGTGAGAGGATCACTTAAGCAGAGGAGGTTGAGGCTGCGGTGGGCCAAGA 780

 24374855 TTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGT 24374914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGT 840

 24374915 GTTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGACTGCTCCTCCCTGCCCCACTACACACC 24374974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGACTGCTCCTCCCTGCCCCACTACACACC 900

 24374975 CCCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCCCTCAGCCTCCTACTTAGAAATTGGAGC 24375034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCCCTCAGCCTCCTACTTAGAAATTGGAGC 960

 24375035 ACCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACATGGTGCCTGGTCTTGATTGTTAATAGA 24375094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACATGGTGCCTGGTCTTGATTGTTAATAGA 1020

 24375095 GGAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGTGGAAGTGACTCTGAAAAGGAGCCTC 24375154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGTGGAAGTGACTCTGAAAAGGAGCCTC 1080

 24375155 AACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCTGCCTTCAGCAGTTGAGCAAATGAAACA 24375214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCTGCCTTCAGCAGTTGAGCAAATGAAACA 1140

 24375215 TTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGAGTAGCCACCCTCATGTTTTGAGAGTAC 24375274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGAGTAGCCACCCTCATGTTTTGAGAGTAC 1200

 24375275 AGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCCAGAATATTTTAATGTCAACAAAGACAT 24375334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCCAGAATATTTTAATGTCAACAAAGACAT 1260

 24375335 GTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGTCCCCTTTGGAAGTCTCCATGTGTATCA 24375394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGTCCCCTTTGGAAGTCTCCATGTGTATCA 1320

 24375395 GATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTTTGTTGTTGTTGTTACTGTAAGAATTCT 24375454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTTTGTTGTTGTTGTTACTGTAAGAATTCT 1380

 24375455 GAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTTGGAAGAAAGCTTTAGTTTCATATTTTC 24375514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTTGGAAGAAAGCTTTAGTTTCATATTTTC 1440

 24375515 TGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCTGTTTAATGGAGAGTATGTTTTTTTAAA 24375574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCTGTTTAATGGAGAGTATGTTTTTTTAAA 1500

 24375575 TGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAAGAAGAGAGAATAATGGAGAAATGCCAT 24375634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAAGAAGAGAGAATAATGGAGAAATGCCAT 1560

 24375635 CTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAAAATAGAAGTTTCTTATCAGGAGTGGGA 24375694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAAAATAGAAGTTTCTTATCAGGAGTGGGA 1620

 24375695 GGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAGTCTGATCTTTGCTCCTGGTTTCCTATG 24375754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAGTCTGATCTTTGCTCCTGGTTTCCTATG 1680

 24375755 AGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTTCCACTGCTTCATGCCTGTTTCCTCCAT 24375814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTTCCACTGCTTCATGCCTGTTTCCTCCAT 1740

 24375815 TTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATTAAGTAACATTTAGATTTCCAGCTGGTA 24375874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATTAAGTAACATTTAGATTTCCAGCTGGTA 1800

 24375875 CAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATGGCCTTAGGTCATCCTCATGCCCCCATT 24375934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATGGCCTTAGGTCATCCTCATGCCCCCATT 1860

 24375935 GTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTGATATTCATAGTATCCAAATTCAGTAAG 24375994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTGATATTCATAGTATCCAAATTCAGTAAG 1920

 24375995 TCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAGGAAAATCTCTAACACCAATGATGACTT 24376054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAGGAAAATCTCTAACACCAATGATGACTT 1980

 24376055 AGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTGGACTCAGAAAAAAATTTAAGACAGTAG 24376114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTGGACTCAGAAAAAAATTTAAGACAGTAG 2040

 24376115 TTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGGATCAAGTTAAATCCTGGCCTAATGGCA 24376174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGGATCAAGTTAAATCCTGGCCTAATGGCA 2100

 24376175 ATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTTAAGAATGGTCTGTTTTTAATATATTGT 24376234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTTAAGAATGGTCTGTTTTTAATATATTGT 2160

 24376235 CTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGAGGGTTCATGAAAACTGCCTTACATAAT 24376294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGAGGGTTCATGAAAACTGCCTTACATAAT 2220

 24376295 TTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGTCATTGGTTTACTAAGAAATTATTTTAA 24376354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGTCATTGGTTTACTAAGAAATTATTTTAA 2280

 24376355 TGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAACTAGAGGGGCCCAAATACATGAGGTTT 24376414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAACTAGAGGGGCCCAAATACATGAGGTTT 2340

 24376415 TATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGGTTTTCTCTGCTCACAGAGTGCTTGGCA 24376474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGGTTTTCTCTGCTCACAGAGTGCTTGGCA 2400

 24376475 AACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATAAATGAATTAGCGAAAGGCTGTAGATCT 24376534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATAAATGAATTAGCGAAAGGCTGTAGATCT 2460

 24376535 AACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGTGTGGAGACAGAATCCCTGATCCTGAAC 24376594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGTGTGGAGACAGAATCCCTGATCCTGAAC 2520

 24376595 ACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGTACAGTCTAGCCCATGAAGAAAAGCATA 24376654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGTACAGTCTAGCCCATGAAGAAAAGCATA 2580

 24376655 TGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCGTGGTAGTCTTCTTGCTCACAGTGACAG 24376714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCGTGGTAGTCTTCTTGCTCACAGTGACAG 2640

 24376715 ACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTAATCAAAGAGTTAGGGAATGCGTACACT 24376774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTAATCAAAGAGTTAGGGAATGCGTACACT 2700

 24376775 TCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTCGTGGATTTTCTCTTTATGCCAGATCAG 24376834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTCGTGGATTTTCTCTTTATGCCAGATCAG 2760

 24376835 AGCTGTGGTGGCCTCCCAAGCCTTCCCATGATGAAAAGTAAATAGAGCAGGGCATCTACC 24376894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGCTGTGGTGGCCTCCCAAGCCTTCCCATGATGAAAAGTAAATAGAGCAGGGCATCTACC 2820

 24376895 AGATTCCCAAACCAAGTTAGTGGACCATCCATTGCAGATGGTAGCCCAAATGAAGTAGTC 24376954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGATTCCCAAACCAAGTTAGTGGACCATCCATTGCAGATGGTAGCCCAAATGAAGTAGTC 2880

 24376955 CTTTCTCTGGGCTTACTGGGCCATTCCCATTCCACATCTCACAGTGGTCCTACAACTATA 24377014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2881 CTTTCTCTGGGCTTACTGGGCCATTCCCATTCCACAGCTCACAGTGGTCCTACAACTATA 2940

 24377015 TTGCATACAGTAAAC 24377029
          |||||||||||||||
     2941 TTGCATACAGTAAAC 2955

EXCISED REGION

 24378429 AGCTTTCTACA 24378439
          |||||||||||
     2959 AGCTTTCTACA 2969

Alignment time is 2.3054 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [24366837,24388441] =>     21605 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2211] =>      2211 nucs 'mol-32-23c5-016167_2211'

Score:        2210
Aligned:      2210        nucs
Identic:      2210 (100%) nucs =>      2130 (100%)        80 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [24374708,24376837] EXCISED REGION [24378442,24378521]
 second seq =>  [       1,    2130] EXCISED REGION [    2132,    2211]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1604 nucs [24376838,24378441]
 second seq =>         1 nucs [2131,2131]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [24376838,24376839] to [24378442,24378443]
 second seq =>         1 nucs [2130,2130] to [2131,2131]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [24376838,24376839] to [24378440,24378441]
 second seq =>         0 nucs

 24374708 CCTAGGTAACATGGCAAAATCACGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATAAC 24374767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTAGGTAACATGGCAAAATCACGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATAAC 60

 24374768 TGCATGTGCCTGTTGTCTCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATCACTTAAGCAGA 24374827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCATGTGCCTGTTGTCTCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATCACTTAAGCAGA 120

 24374828 GGAGGTTGAGGCTGCGGTGGGCCAAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAG 24374887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAGGTTGAGGCTGCGGTGGGCCAAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAG 180

 24374888 CGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGTGTTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGA 24374947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGTGTTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGA 240

 24374948 CTGCTCCTCCCTGCCCCACTACACACCCCCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCC 24375007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGCTCCTCCCTGCCCCACTACACACCCCCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCC 300

 24375008 CTCAGCCTCCTACTTAGAAATTGGAGCACCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACA 24375067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCAGCCTCCTACTTAGAAATTGGAGCACCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACA 360

 24375068 TGGTGCCTGGTCTTGATTGTTAATAGAGGAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGG 24375127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGTGCCTGGTCTTGATTGTTAATAGAGGAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGG 420

 24375128 GTGGAAGTGACTCTGAAAAGGAGCCTCAACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCT 24375187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGGAAGTGACTCTGAAAAGGAGCCTCAACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCT 480

 24375188 GCCTTCAGCAGTTGAGCAAATGAAACATTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGA 24375247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCTTCAGCAGTTGAGCAAATGAAACATTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGA 540

 24375248 GTAGCCACCCTCATGTTTTGAGAGTACAGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCC 24375307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTAGCCACCCTCATGTTTTGAGAGTACAGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCC 600

 24375308 AGAATATTTTAATGTCAACAAAGACATGTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGT 24375367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAATATTTTAATGTCAACAAAGACATGTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGT 660

 24375368 CCCCTTTGGAAGTCTCCATGTGTATCAGATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTT 24375427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCCTTTGGAAGTCTCCATGTGTATCAGATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTT 720

 24375428 TGTTGTTGTTGTTACTGTAAGAATTCTGAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTT 24375487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTTGTTGTTGTTACTGTAAGAATTCTGAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTT 780

 24375488 GGAAGAAAGCTTTAGTTTCATATTTTCTGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCT 24375547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAAGAAAGCTTTAGTTTCATATTTTCTGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCT 840

 24375548 GTTTAATGGAGAGTATGTTTTTTTAAATGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAA 24375607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTTAATGGAGAGTATGTTTTTTTAAATGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAA 900

 24375608 GAAGAGAGAATAATGGAGAAATGCCATCTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAA 24375667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAGAGAGAATAATGGAGAAATGCCATCTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAA 960

 24375668 AATAGAAGTTTCTTATCAGGAGTGGGAGGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAG 24375727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATAGAAGTTTCTTATCAGGAGTGGGAGGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAG 1020

 24375728 TCTGATCTTTGCTCCTGGTTTCCTATGAGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTT 24375787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTGATCTTTGCTCCTGGTTTCCTATGAGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTT 1080

 24375788 CCACTGCTTCATGCCTGTTTCCTCCATTTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATT 24375847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCACTGCTTCATGCCTGTTTCCTCCATTTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATT 1140

 24375848 AAGTAACATTTAGATTTCCAGCTGGTACAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATG 24375907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAGTAACATTTAGATTTCCAGCTGGTACAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATG 1200

 24375908 GCCTTAGGTCATCCTCATGCCCCCATTGTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTG 24375967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCCTTAGGTCATCCTCATGCCCCCATTGTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTG 1260

 24375968 ATATTCATAGTATCCAAATTCAGTAAGTCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAG 24376027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATATTCATAGTATCCAAATTCAGTAAGTCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAG 1320

 24376028 GAAAATCTCTAACACCAATGATGACTTAGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTG 24376087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAAAATCTCTAACACCAATGATGACTTAGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTG 1380

 24376088 GACTCAGAAAAAAATTTAAGACAGTAGTTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGG 24376147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GACTCAGAAAAAAATTTAAGACAGTAGTTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGG 1440

 24376148 ATCAAGTTAAATCCTGGCCTAATGGCAATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTT 24376207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCAAGTTAAATCCTGGCCTAATGGCAATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTT 1500

 24376208 AAGAATGGTCTGTTTTTAATATATTGTCTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGA 24376267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGAATGGTCTGTTTTTAATATATTGTCTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGA 1560

 24376268 GGGTTCATGAAAACTGCCTTACATAATTTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGT 24376327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGGTTCATGAAAACTGCCTTACATAATTTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGT 1620

 24376328 CATTGGTTTACTAAGAAATTATTTTAATGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAA 24376387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CATTGGTTTACTAAGAAATTATTTTAATGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAA 1680

 24376388 CTAGAGGGGCCCAAATACATGAGGTTTTATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGG 24376447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTAGAGGGGCCCAAATACATGAGGTTTTATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGG 1740

 24376448 TTTTCTCTGCTCACAGAGTGCTTGGCAAACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATA 24376507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTTCTCTGCTCACAGAGTGCTTGGCAAACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATA 1800

 24376508 AATGAATTAGCGAAAGGCTGTAGATCTAACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGT 24376567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATGAATTAGCGAAAGGCTGTAGATCTAACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGT 1860

 24376568 GTGGAGACAGAATCCCTGATCCTGAACACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGT 24376627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGGAGACAGAATCCCTGATCCTGAACACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGT 1920

 24376628 ACAGTCTAGCCCATGAAGAAAAGCATATGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCG 24376687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACAGTCTAGCCCATGAAGAAAAGCATATGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCG 1980

 24376688 TGGTAGTCTTCTTGCTCACAGTGACAGACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTA 24376747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGTAGTCTTCTTGCTCACAGTGACAGACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTA 2040

 24376748 ATCAAAGAGTTAGGGAATGCGTACACTTCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTC 24376807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCAAAGAGTTAGGGAATGCGTACACTTCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTC 2100

 24376808 GTGGATTTTCTCTTTATGCCAGATCAGAGC 24376837
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTGGATTTTCTCTTTATGCCAGATCAGAGC 2130

EXCISED REGION

 24378442 TGGCTAGCCAGTTTTCCTGGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGT 24378501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 TGGCTAGCCAGTTTTCCTGGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGT 2191

 24378502 TTTTGTCAGGTTTGTCAAAG 24378521
          ||||||||||||||||||||
     2192 TTTTGTCAGGTTTGTCAAAG 2211

Alignment time is 1.75741 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [24366837,24388441] =>     21605 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2088] =>      2088 nucs 'mol-32-2af2-011115_2088'

Score:        2061
Aligned:      2072        nucs
Identic:      2071 (100%) nucs =>      1984 (100%)        87 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [24374853,24376837] EXCISED REGION [24378442,24378528]
 second seq =>  [      16,    2000] EXCISED REGION [    2002,    2088]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1604 nucs [24376838,24378441]
 second seq =>         1 nucs [2001,2001]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [24376838,24376839] to [24378442,24378443]
 second seq =>         1 nucs [2000,2000] to [2001,2001]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [24376838,24376839] to [24378440,24378441]
 second seq =>         0 nucs

 24374853 GATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAA 24374912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       16 GATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAA 75

 24374913 GTGTTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGACTGCTCCTCCCTGCCCCACTACACA 24374972
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       76 GGGTTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGACTGCTCCTCCCTGCCCCACTACACA 135

 24374973 CCCCCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCCCTCAGCCTCCTACTTAGAAATTGGA 24375032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      136 CCCCCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCCCTCAGCCTCCTACTTAGAAATTGGA 195

 24375033 GCACCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACATGGTGCCTGGTCTTGATTGTTAATA 24375092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      196 GCACCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACATGGTGCCTGGTCTTGATTGTTAATA 255

 24375093 GAGGAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGTGGAAGTGACTCTGAAAAGGAGCC 24375152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      256 GAGGAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGTGGAAGTGACTCTGAAAAGGAGCC 315

 24375153 TCAACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCTGCCTTCAGCAGTTGAGCAAATGAAA 24375212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      316 TCAACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCTGCCTTCAGCAGTTGAGCAAATGAAA 375

 24375213 CATTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGAGTAGCCACCCTCATGTTTTGAGAGT 24375272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      376 CATTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGAGTAGCCACCCTCATGTTTTGAGAGT 435

 24375273 ACAGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCCAGAATATTTTAATGTCAACAAAGAC 24375332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      436 ACAGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCCAGAATATTTTAATGTCAACAAAGAC 495

 24375333 ATGTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGTCCCCTTTGGAAGTCTCCATGTGTAT 24375392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      496 ATGTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGTCCCCTTTGGAAGTCTCCATGTGTAT 555

 24375393 CAGATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTTTGTTGTTGTTGTTACTGTAAGAATT 24375452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      556 CAGATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTTTGTTGTTGTTGTTACTGTAAGAATT 615

 24375453 CTGAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTTGGAAGAAAGCTTTAGTTTCATATTT 24375512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 CTGAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTTGGAAGAAAGCTTTAGTTTCATATTT 675

 24375513 TCTGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCTGTTTAATGGAGAGTATGTTTTTTTA 24375572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 TCTGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCTGTTTAATGGAGAGTATGTTTTTTTA 735

 24375573 AATGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAAGAAGAGAGAATAATGGAGAAATGCC 24375632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      736 AATGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAAGAAGAGAGAATAATGGAGAAATGCC 795

 24375633 ATCTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAAAATAGAAGTTTCTTATCAGGAGTGG 24375692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 ATCTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAAAATAGAAGTTTCTTATCAGGAGTGG 855

 24375693 GAGGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAGTCTGATCTTTGCTCCTGGTTTCCTA 24375752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 GAGGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAGTCTGATCTTTGCTCCTGGTTTCCTA 915

 24375753 TGAGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTTCCACTGCTTCATGCCTGTTTCCTCC 24375812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 TGAGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTTCCACTGCTTCATGCCTGTTTCCTCC 975

 24375813 ATTTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATTAAGTAACATTTAGATTTCCAGCTGG 24375872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 ATTTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATTAAGTAACATTTAGATTTCCAGCTGG 1035

 24375873 TACAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATGGCCTTAGGTCATCCTCATGCCCCCA 24375932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 TACAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATGGCCTTAGGTCATCCTCATGCCCCCA 1095

 24375933 TTGTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTGATATTCATAGTATCCAAATTCAGTA 24375992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 TTGTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTGATATTCATAGTATCCAAATTCAGTA 1155

 24375993 AGTCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAGGAAAATCTCTAACACCAATGATGAC 24376052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 AGTCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAGGAAAATCTCTAACACCAATGATGAC 1215

 24376053 TTAGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTGGACTCAGAAAAAAATTTAAGACAGT 24376112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 TTAGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTGGACTCAGAAAAAAATTTAAGACAGT 1275

 24376113 AGTTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGGATCAAGTTAAATCCTGGCCTAATGG 24376172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 AGTTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGGATCAAGTTAAATCCTGGCCTAATGG 1335

 24376173 CAATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTTAAGAATGGTCTGTTTTTAATATATT 24376232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 CAATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTTAAGAATGGTCTGTTTTTAATATATT 1395

 24376233 GTCTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGAGGGTTCATGAAAACTGCCTTACATA 24376292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 GTCTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGAGGGTTCATGAAAACTGCCTTACATA 1455

 24376293 ATTTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGTCATTGGTTTACTAAGAAATTATTTT 24376352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 ATTTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGTCATTGGTTTACTAAGAAATTATTTT 1515

 24376353 AATGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAACTAGAGGGGCCCAAATACATGAGGT 24376412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 AATGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAACTAGAGGGGCCCAAATACATGAGGT 1575

 24376413 TTTATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGGTTTTCTCTGCTCACAGAGTGCTTGG 24376472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 TTTATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGGTTTTCTCTGCTCACAGAGTGCTTGG 1635

 24376473 CAAACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATAAATGAATTAGCGAAAGGCTGTAGAT 24376532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 CAAACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATAAATGAATTAGCGAAAGGCTGTAGAT 1695

 24376533 CTAACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGTGTGGAGACAGAATCCCTGATCCTGA 24376592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 CTAACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGTGTGGAGACAGAATCCCTGATCCTGA 1755

 24376593 ACACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGTACAGTCTAGCCCATGAAGAAAAGCA 24376652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 ACACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGTACAGTCTAGCCCATGAAGAAAAGCA 1815

 24376653 TATGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCGTGGTAGTCTTCTTGCTCACAGTGAC 24376712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 TATGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCGTGGTAGTCTTCTTGCTCACAGTGAC 1875

 24376713 AGACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTAATCAAAGAGTTAGGGAATGCGTACA 24376772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 AGACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTAATCAAAGAGTTAGGGAATGCGTACA 1935

 24376773 CTTCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTCGTGGATTTTCTCTTTATGCCAGATC 24376832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 CTTCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTCGTGGATTTTCTCTTTATGCCAGATC 1995

 24376833 AGAGC 24376837
          |||||
     1996 AGAGC 2000

EXCISED REGION

 24378442 TGGCTAGCCAGTTTTCCTGGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGT 24378501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 TGGCTAGCCAGTTTTCCTGGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGT 2061

 24378502 TTTTGTCAGGTTTGTCAAAGATCAGAT 24378528
          |||||||||||||||||||||||||||
     2062 TTTTGTCAGGTTTGTCAAAGATCAGAT 2088

Alignment time is 1.63175 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [24366837,24388441] =>     21605 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3815] =>      3815 nucs 'mol-32-2afd-092733_3815'

Score:        3815
Aligned:      3815        nucs
Identic:      3815 (100%) nucs =>       289 (100%)      3526 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [24374613,24374901] EXCISED REGION [24374903,24378428]
 second seq =>  [       1,     289] EXCISED REGION [     290,    3815]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [24374902,24374902]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [24374902,24374911] to [24374903,24374912]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 24374613 TGCTGGCTGGGAGGCATGGTAGCTCACGCCTATGGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGC 24374672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTGGCTGGGAGGCATGGTAGCTCACGCCTATGGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGC 60

 24374673 AGGCAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTAGGTAACATGGCAAAATCACGT 24374732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGCAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTAGGTAACATGGCAAAATCACGT 120

 24374733 CTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATAACTGCATGTGCCTGTTGTCTCAGCTAC 24374792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATAACTGCATGTGCCTGTTGTCTCAGCTAC 180

 24374793 TTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATCACTTAAGCAGAGGAGGTTGAGGCTGCGGTGGGCCAA 24374852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATCACTTAAGCAGAGGAGGTTGAGGCTGCGGTGGGCCAA 240

 24374853 GATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCGAGACCCTGTCTC 24374901
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCGAGACCCTGTCTC 289

EXCISED REGION

 24374903 AAAAAAAAAAGTGTTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGACTGCTCCTCCCTGCC 24374962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      290 AAAAAAAAAAGTGTTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGACTGCTCCTCCCTGCC 349

 24374963 CCACTACACACCCCCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCCCTCAGCCTCCTACTT 24375022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      350 CCACTACACACCCCCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCCCTCAGCCTCCTACTT 409

 24375023 AGAAATTGGAGCACCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACATGGTGCCTGGTCTTG 24375082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      410 AGAAATTGGAGCACCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACATGGTGCCTGGTCTTG 469

 24375083 ATTGTTAATAGAGGAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGTGGAAGTGACTCTG 24375142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      470 ATTGTTAATAGAGGAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGTGGAAGTGACTCTG 529

 24375143 AAAAGGAGCCTCAACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCTGCCTTCAGCAGTTGA 24375202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      530 AAAAGGAGCCTCAACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCTGCCTTCAGCAGTTGA 589

 24375203 GCAAATGAAACATTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGAGTAGCCACCCTCATG 24375262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      590 GCAAATGAAACATTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGAGTAGCCACCCTCATG 649

 24375263 TTTTGAGAGTACAGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCCAGAATATTTTAATGT 24375322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      650 TTTTGAGAGTACAGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCCAGAATATTTTAATGT 709

 24375323 CAACAAAGACATGTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGTCCCCTTTGGAAGTCT 24375382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      710 CAACAAAGACATGTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGTCCCCTTTGGAAGTCT 769

 24375383 CCATGTGTATCAGATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTTTGTTGTTGTTGTTAC 24375442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      770 CCATGTGTATCAGATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTTTGTTGTTGTTGTTAC 829

 24375443 TGTAAGAATTCTGAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTTGGAAGAAAGCTTTAG 24375502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      830 TGTAAGAATTCTGAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTTGGAAGAAAGCTTTAG 889

 24375503 TTTCATATTTTCTGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCTGTTTAATGGAGAGTA 24375562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      890 TTTCATATTTTCTGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCTGTTTAATGGAGAGTA 949

 24375563 TGTTTTTTTAAATGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAAGAAGAGAGAATAATG 24375622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      950 TGTTTTTTTAAATGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAAGAAGAGAGAATAATG 1009

 24375623 GAGAAATGCCATCTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAAAATAGAAGTTTCTTA 24375682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 GAGAAATGCCATCTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAAAATAGAAGTTTCTTA 1069

 24375683 TCAGGAGTGGGAGGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAGTCTGATCTTTGCTCC 24375742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 TCAGGAGTGGGAGGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAGTCTGATCTTTGCTCC 1129

 24375743 TGGTTTCCTATGAGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTTCCACTGCTTCATGCC 24375802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 TGGTTTCCTATGAGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTTCCACTGCTTCATGCC 1189

 24375803 TGTTTCCTCCATTTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATTAAGTAACATTTAGAT 24375862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 TGTTTCCTCCATTTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATTAAGTAACATTTAGAT 1249

 24375863 TTCCAGCTGGTACAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATGGCCTTAGGTCATCCT 24375922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 TTCCAGCTGGTACAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATGGCCTTAGGTCATCCT 1309

 24375923 CATGCCCCCATTGTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTGATATTCATAGTATCC 24375982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 CATGCCCCCATTGTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTGATATTCATAGTATCC 1369

 24375983 AAATTCAGTAAGTCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAGGAAAATCTCTAACAC 24376042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 AAATTCAGTAAGTCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAGGAAAATCTCTAACAC 1429

 24376043 CAATGATGACTTAGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTGGACTCAGAAAAAAAT 24376102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 CAATGATGACTTAGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTGGACTCAGAAAAAAAT 1489

 24376103 TTAAGACAGTAGTTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGGATCAAGTTAAATCCT 24376162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 TTAAGACAGTAGTTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGGATCAAGTTAAATCCT 1549

 24376163 GGCCTAATGGCAATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTTAAGAATGGTCTGTTT 24376222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 GGCCTAATGGCAATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTTAAGAATGGTCTGTTT 1609

 24376223 TTAATATATTGTCTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGAGGGTTCATGAAAACT 24376282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 TTAATATATTGTCTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGAGGGTTCATGAAAACT 1669

 24376283 GCCTTACATAATTTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGTCATTGGTTTACTAAG 24376342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 GCCTTACATAATTTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGTCATTGGTTTACTAAG 1729

 24376343 AAATTATTTTAATGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAACTAGAGGGGCCCAAA 24376402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 AAATTATTTTAATGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAACTAGAGGGGCCCAAA 1789

 24376403 TACATGAGGTTTTATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGGTTTTCTCTGCTCACA 24376462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 TACATGAGGTTTTATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGGTTTTCTCTGCTCACA 1849

 24376463 GAGTGCTTGGCAAACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATAAATGAATTAGCGAAA 24376522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 GAGTGCTTGGCAAACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATAAATGAATTAGCGAAA 1909

 24376523 GGCTGTAGATCTAACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGTGTGGAGACAGAATCC 24376582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 GGCTGTAGATCTAACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGTGTGGAGACAGAATCC 1969

 24376583 CTGATCCTGAACACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGTACAGTCTAGCCCATG 24376642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 CTGATCCTGAACACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGTACAGTCTAGCCCATG 2029

 24376643 AAGAAAAGCATATGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCGTGGTAGTCTTCTTGC 24376702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 AAGAAAAGCATATGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCGTGGTAGTCTTCTTGC 2089

 24376703 TCACAGTGACAGACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTAATCAAAGAGTTAGGG 24376762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 TCACAGTGACAGACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTAATCAAAGAGTTAGGG 2149

 24376763 AATGCGTACACTTCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTCGTGGATTTTCTCTTT 24376822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 AATGCGTACACTTCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTCGTGGATTTTCTCTTT 2209

 24376823 ATGCCAGATCAGAGCTGTGGTGGCCTCCCAAGCCTTCCCATGATGAAAAGTAAATAGAGC 24376882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 ATGCCAGATCAGAGCTGTGGTGGCCTCCCAAGCCTTCCCATGATGAAAAGTAAATAGAGC 2269

 24376883 AGGGCATCTACCAGATTCCCAAACCAAGTTAGTGGACCATCCATTGCAGATGGTAGCCCA 24376942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 AGGGCATCTACCAGATTCCCAAACCAAGTTAGTGGACCATCCATTGCAGATGGTAGCCCA 2329

 24376943 AATGAAGTAGTCCTTTCTCTGGGCTTACTGGGCCATTCCCATTCCACATCTCACAGTGGT 24377002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 AATGAAGTAGTCCTTTCTCTGGGCTTACTGGGCCATTCCCATTCCACATCTCACAGTGGT 2389

 24377003 CCTACAACTATATTGCATACAGTAAACTCTAAGGGTTATGTAGATAATGAGTTCTTTTTT 24377062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 CCTACAACTATATTGCATACAGTAAACTCTAAGGGTTATGTAGATAATGAGTTCTTTTTT 2449

 24377063 CATGCAGAAGAAGCTAATGACTTTGAGAAGTCAGAGATGCCTGGAGGCACATGGATCTCC 24377122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 CATGCAGAAGAAGCTAATGACTTTGAGAAGTCAGAGATGCCTGGAGGCACATGGATCTCC 2509

 24377123 TCTGCCCAGGCTCAAGGAACATCCCAAACTTGTGTCCTCCCAGGCTCTGTTTTTTTAATA 24377182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 TCTGCCCAGGCTCAAGGAACATCCCAAACTTGTGTCCTCCCAGGCTCTGTTTTTTTAATA 2569

 24377183 TACATATATATATATATATATACACACATATATGTGTATATATATATATATATTTATTAT 24377242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 TACATATATATATATATATATACACACATATATGTGTATATATATATATATATTTATTAT 2629

 24377243 ACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACGTGCAGGTTTGTTACATATGTATACATGTG 24377302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 ACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACGTGCAGGTTTGTTACATATGTATACATGTG 2689

 24377303 CCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCT 24377362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 CCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCT 2749

 24377363 ATCCCTCCCCCCTCCCCCTACTCAACAACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCTTCCTGT 24377422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 ATCCCTCCCCCCTCCCCCTACTCAACAACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCTTCCTGT 2809

 24377423 GTCCAAGTGTTCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGACTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTT 24377482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 GTCCAAGTGTTCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGACTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTT 2869

 24377483 TTTGTCCTTGCGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTCATCCATGTCCCTACAA 24377542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 TTTGTCCTTGCGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTCATCCATGTCCCTACAA 2929

 24377543 AGGACATGAACTTATCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACA 24377602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 AGGACATGAACTTATCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACA 2989

 24377603 TTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTG 24377662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 TTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTG 3049

 24377663 TGAATAGTCCGCATTAAACATACGTATGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAAGC 24377722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 TGAATAGTCCGCATTAAACATACGTATGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAAGC 3109

 24377723 CTTTGGGTATATATCCAGTAATGGGATGGCTGGGTGAAATGGTATTTCCAGTTCTAGATC 24377782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 CTTTGGGTATATATCCAGTAATGGGATGGCTGGGTGAAATGGTATTTCCAGTTCTAGATC 3169

 24377783 CCTGAGGAATCGCCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACA 24377842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 CCTGAGGAATCGCCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACA 3229

 24377843 GTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCTAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTT 24377902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 GTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCTAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTT 3289

 24377903 AATGATTGCTGTTCTAACTAGTGTGAGATGATATCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTC 24377962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 AATGATTGCTGTTCTAACTAGTGTGAGATGATATCTCACTGTGGTTTTGATTTGCATTTC 3349

 24377963 TCTGATGGCCAGTGGTGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGCCTGCATAAATGTCTTC 24378022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 TCTGATGGCCAGTGGTGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGCCTGCATAAATGTCTTC 3409

 24378023 TTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCGCCCAGTTGCTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTT 24378082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 TTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCGCCCAGTTGCTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTT 3469

 24378083 CTTGTAAATTTGTTTGTGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGAGTA 24378142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3470 CTTGTAAATTTGTTTGTGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGAGTA 3529

 24378143 GACTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAAGTTGCCTATTCACTCTGATGGTAGTTTCTTT 24378202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3530 GACTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAAGTTGCCTATTCACTCTGATGGTAGTTTCTTT 3589

 24378203 TGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCAATTTTGGCTTTTGTTGC 24378262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3590 TGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCAATTTTGGCTTTTGTTGC 3649

 24378263 CATTGCTTTTGGTGTTTTAGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCCGAATGGTATT 24378322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3650 CATTGCTTTTGGTGTTTTAGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCCGAATGGTATT 3709

 24378323 TCCTAGGTTTTCTTCTAAGGTTTTTATGGTTTTAGGTCTAACATTTAAGTCTTTAATCCA 24378382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3710 TCCTAGGTTTTCTTCTAAGGTTTTTATGGTTTTAGGTCTAACATTTAAGTCTTTAATCCA 3769

 24378383 TCTTGAATTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAAGGGATCCAGTTTC 24378428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3770 TCTTGAATTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAAGGGATCCAGTTTC 3815

Alignment time is 2.93687 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [24366837,24388441] =>     21605 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    5022] =>      5022 nucs 'mol-32-2f3e-069723_5022'

Score:        5010
Aligned:      5023        nucs
Identic:      5021 (100%) nucs =>      4385 (100%)       636 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [24372451,24376837] EXCISED REGION [24378442,24379077]
 second seq =>  [       1,    4385] EXCISED REGION [    4387,    5022]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1604 nucs [24376838,24378441]
 second seq =>         1 nucs [4386,4386]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [24376838,24376839] to [24378442,24378443]
 second seq =>         1 nucs [4385,4385] to [4386,4386]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [24376838,24376839] to [24378440,24378441]
 second seq =>         0 nucs

 24372451 GGTTCTTCATATATACACATACATATATGCTGGCAAAGAATTAATTTCCACATTCTTATC 24372510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTTCTTCATATATACACATACATATATGCTGGCAAAGAATTAATTTCCACATTCTTATC 60

 24372511 TAGCACTTCTTTGCAATGGAGAAATAGCACTTTAAATTTTGGAGTACTTTGACACACATT 24372570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGCACTTCTTTGCAATGGAGAAATAGCACTTTAAATTTTGGAGTACTTTGACACACATT 120

 24372571 TCTAAATATGTTTTCCATCCAATGTTAATGAGATTATGGTGGCCTAATAGGTGAAGGCAT 24372630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTAAATATGTTTTCCATCCAATGTTAATGAGATTATGGTGGCCTAATAGGTGAAGGCAT 180

 24372631 TGAGTGAAATTTAAAGTAAAATAAAATTATAAAATTACTACATTAAGAACATGCAATTAA 24372690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAGTGAAATTTAAAGTAAAATAAAATTATAAAATTACTACATTAAGAACATGCAATTAA 240

 24372691 CTAGATAGTGGGGAGAGGGAGAGGGAGGAATTGAGGCTGCCTCCTAGATTTCTGCCTTGT 24372750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAGATAGTGGGGAGAGGGAGAGGGAGGAATTGAGGCTGCCTCCTAGATTTCTGCCTTGT 300

 24372751 GTAATGAGTGCATGATGATGCAATTGACCAAGCCAAGGACCACCAGGGAATAGCAGGTCA 24372810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTAATGAGTGCATGATGATGCAATTGACCAAGCCAAGGACCACCAGGGAATAGCAGGTCA 360

 24372811 AGCAAGTAAATGATCAGTTCCTTTGAGGGCCTGTCGCATTTCAGGCATCCTTGGAACACC 24372870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCAAGTAAATGATCAGTTCCTTTGAGGGCCTGTCGCATTTCAGGCATCCTTGGAACACC 420

 24372871 TGAAGATGTCTAATGAGGAGCTAGGCTTCAGGAGAGAAACCTAAGAGCTAAGAAAATATT 24372930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAAGATGTCTAATGAGGAGCTAGGCTTCAGGAGAGAAACCTAAGAGCTAAGAAAATATT 480

 24372931 ACAGAGAGTTGTTGAGGTCTTTTCACTTGCTCTCCCTCTGGTCTGGAACACTGTTTCTCC 24372990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAGAGAGTTGTTGAGGTCTTTTCACTTGCTCTCCCTCTGGTCTGGAACACTGTTTCTCC 540

 24372991 AGGTATCTGCATATTTCACTCCCCATATCCTTCAAGGTCTTTGCTCAAAACATCATCTTT 24373050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGTATCTGCATATTTCACTCCCCATATCCTTCAAGGTCTTTGCTCAAAACATCATCTTT 600

 24373051 GCAGTAAGACTCTCCTGGCCACCCAATTATAAATGCAGAATGCTTGCTACCCCAGCTCTT 24373110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCAGTAAGACTCTCCTGGCCACCCAATTATAAATGCAGAATGCTTGCTACCCCAGCTCTT 660

 24373111 CCTCTCTACCTTCTTTGTGCTATATTTTGACATAGTAGACATAACATTATCTAACCTACT 24373170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTCTCTACCTTCTTTGTGCTATATTTTGACATAGTAGACATAACATTATCTAACCTACT 720

 24373171 ATATATTTTACTTACTTTCACTTATTTGGTTCACGATGTTTCACCTATTAGAATGTAAGC 24373230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATATATTTTACTTACTTTCACTTATTTGGTTCACGATGTTTCACCTATTAGAATGTAAGC 780

 24373231 CCCACGTGGGCAAGGATTTTTGTGTTTTTGTGTATTTCGTTTACATCTCTATCCTCAGTA 24373290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCACGTGGGCAAGGATTTTTGTGTTTTTGTGTATTTCGTTTACATCTCTATCCTCAGTA 840

 24373291 GCCAGAAAGGTACATATAATCACTCAAGAAATACTTGTTGAATTAGAGAATGTGCCCTTC 24373350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCCAGAAAGGTACATATAATCACTCAAGAAATACTTGTTGAATTAGAGAATGTGCCCTTC 900

 24373351 CTATGTGCCTGACACGAAGTGCTTTTTGTGTATTATCTCATTTAATCCAAGTAAGCAATG 24373410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTATGTGCCTGACACGAAGTGCTTTTTGTGTATTATCTCATTTAATCCAAGTAAGCAATG 960

 24373411 GGTTTATAGATAGTAATGAGAGCCATGAAAATGAATGAGATTTGCAAGGAGAGTATTTAA 24373470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTTTATAGATAGTAATGAGAGCCATGAAAATGAATGAGATTTGCAAGGAGAGTATTTAA 1020

 24373471 CAAAAAAGAGAAGACTGAGAGCAGAGACCTAAAGAATACTATTATTTTAGAGACTGGCAA 24373530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAAAAAAGAGAAGACTGAGAGCAGAGACCTAAAGAATACTATTATTTTAGAGACTGGCAA 1080

 24373531 GGGAAATGGACCCTGCAGAGGAAGTCACAAAAAGCCACACAGAGAGGAGGAGGAAAACCA 24373590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGGAAATGGACCCTGCAGAGGAAGTCACAAAAAGCCACACAGAGAGGAGGAGGAAAACCA 1140

 24373591 GGCTACTGTGGTGCTATGGCAATGAACTGAGGGAACATTTCCAAAGGGAGGAAGTGATCC 24373650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCTACTGTGGTGCTATGGCAATGAACTGAGGGAACATTTCCAAAGGGAGGAAGTGATCC 1200

 24373651 AAGGTGTCAGACTAGGTAAGGAGCAAAAAGTAATTGAGAGAGAAGTACAAGCAAAGCCCC 24373710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGGTGTCAGACTAGGTAAGGAGCAAAAAGTAATTGAGAGAGAAGTACAAGCAAAGCCCC 1260

 24373711 TCTGCCTTCCTTTGCCGCATCTGACTCAGATTCACTGCCGACAAGCCTCTCACCAAAATA 24373770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTGCCTTCCTTTGCCGCATCTGACTCAGATTCACTGCCGACAAGCCTCTCACCAAAATA 1320

 24373771 GGTAGAACTATTTTTATTACTATCTCCTCTGACAGAGTATATTGCAAAGCTATAAATGGC 24373830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTAGAACTATTTTTATTACTATCTCCTCTGACAGAGTATATTGCAAAGCTATAAATGGC 1380

 24373831 AGAGTTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCT 24373890
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAGTTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTT--GAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCT 1438

 24373891 GGAGTGCAGTGGTGCCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCGGGTTCACGCCATTC 24373950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 GGAGTGCAGTGGTGCCATCTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCGGGTTCACGCCATTC 1498

 24373951 TCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCTCGGCTAAT 24374010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCTCGGCTAAT 1558

 24374011 TTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGCGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTC 24374070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGCGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTC 1618

 24374071 CTGACCGCGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACCGCGTGAGCCAC 24374130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 CTGACCGCGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACCGCGTGAGCCAC 1678

 24374131 CGCGCCCGGCCCAGAGTTTACTTTTAAGCAAGACATAGATGATGATAGATAGTTCAGTGG 24374190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CGCGCCCGGCCCAGAGTTTACTTTTAAGCAAGACATAGATGATGATAGATAGTTCAGTGG 1738

 24374191 TTCGCAGACTTTGGAATTTCATAAACTGATAACATTTGAGGGGTTTAAGGGAGTCACTGA 24374250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TTCGCAGACTTTGGAATTTCATAAACTGATAACATTTGAGGGGTTTAAGGGAGTCACTGA 1798

 24374251 AATAATAGACCAACTTACCAGTCCTCTGAATCATTCTACTCAATTCATTAAGGATGACCT 24374310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 AATAATAGACCAACTTACCAGTCCTCTGAATCATTCTACTCAATTCATTAAGGATGACCT 1858

 24374311 GACCAGAGGAAACGAATAAACTGAGAATTGTTCAGGAGATGTGAAACCCAGTCAAGACCA 24374370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GACCAGAGGAAACGAATAAACTGAGAATTGTTCAGGAGATGTGAAACCCAGTCAAGACCA 1918

 24374371 TTTGTCTTGCCTTCTGGTCTTCAGTGCAAGTCAAAAGTCTTATTGGAAAGGGTAAGATTT 24374430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TTTGTCTTGCCTTCTGGTCTTCAGTGCAAGTCAAAAGTCTTATTGGAAAGGGTAAGATTT 1978

 24374431 CTAGCCCACGGCCACCAATAATGGGCCCCATTGTGGGTACTGTGTCTGCCCTGCTACTCT 24374490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CTAGCCCACGGCCACCAATAATGGGCCCCATTGTGGGTACTGTGTCTGCCCTGCTACTCT 2038

 24374491 GTTCATCATGGTGCCCAGGAATAGCCTGGAAAGTCTCTAGCACCCTTGACCATGAATATC 24374550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GTTCATCATGGTGCCCAGGAATAGCCTGGAAAGTCTCTAGCACCCTTGACCATGAATATC 2098

 24374551 TATCAGCCTCTTCACCCCATACCACAGATAAATACACACAATTTCAGTTAAAAAAAAAAA 24374610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TATCAGCCTCTTCACCCCATACCACAGATAAATACACACAATTTCAGTTAAAAAAAAAAA 2158

 24374611 AGTGCTGGCTGGGAGGCATGGTAGCTCACGCCTATGGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAG 24374670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AGTGCTGGCTGGGAGGCATGGTAGCTCACGCCTATGGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAG 2218

 24374671 GCAGGCAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTAGGTAACATGGCAAAATCAC 24374730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 GCAGGCAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTAGGTAACATGGCAAAATCAC 2278

 24374731 GTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATAACTGCATGTGCCTGTTGTCTCAGCT 24374790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATAACTGCATGTGCCTGTTGTCTCAGCT 2338

 24374791 ACTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATCACTTAAGCAGAGGAGGTTGAGGCTGCGGTGGGCC 24374850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 ACTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATCACTTAAGCAGAGGAGGTTGAGGCTGCGGTGGGCC 2398

 24374851 AAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAA 24374910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 AAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAA 2458

 24374911 AAGTGTTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGACTGCTCCTCCCTGCCCCACTACA 24374970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AAGTGTTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGACTGCTCCTCCCTGCCCCACTACA 2518

 24374971 CACCCCCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCCCTCAGCCTCCTACTTAGAAATTG 24375030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 CACCCCCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCCCTCAGCCTCCTACTTAGAAATTG 2578

 24375031 GAGCACCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACATGGTGCCTGGTCTTGATTGTTAA 24375090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 GAGCACCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACATGGTGCCTGGTCTTGATTGTTAA 2638

 24375091 TAGAGGAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGTGGAAGTGACTCTGAAAAGGAG 24375150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TAGAGGAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGTGGAAGTGACTCTGAAAAGGAG 2698

 24375151 CCTCAACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCTGCCTTCAGCAGTTGAGCAAATGA 24375210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 CCTCAACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCTGCCTTCAGCAGTTGAGCAAATGA 2758

 24375211 AACATTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGAGTAGCCACCCTCATGTTTTGAGA 24375270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 AACATTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGAGTAGCCACCCTCATGTTTTGAGA 2818

 24375271 GTACAGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCCAGAATATTTTAATGTCAACAAAG 24375330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GTACAGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCCAGAATATTTTAATGTCAACAAAG 2878

 24375331 ACATGTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGTCCCCTTTGGAAGTCTCCATGTGT 24375390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 ACATGTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGTCCCCTTTGGAAGTCTCCATGTGT 2938

 24375391 ATCAGATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTTTGTTGTTGTTGTTACTGTAAGAA 24375450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ATCAGATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTTTGTTGTTGTTGTTACTGTAAGAA 2998

 24375451 TTCTGAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTTGGAAGAAAGCTTTAGTTTCATAT 24375510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TTCTGAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTTGGAAGAAAGCTTTAGTTTCATAT 3058

 24375511 TTTCTGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCTGTTTAATGGAGAGTATGTTTTTT 24375570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 TTTCTGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCTGTTTAATGGAGAGTATGTTTTTT 3118

 24375571 TAAATGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAAGAAGAGAGAATAATGGAGAAATG 24375630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TAAATGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAAGAAGAGAGAATAATGGAGAAATG 3178

 24375631 CCATCTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAAAATAGAAGTTTCTTATCAGGAGT 24375690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CCATCTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAAAATAGAAGTTTCTTATCAGGAGT 3238

 24375691 GGGAGGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAGTCTGATCTTTGCTCCTGGTTTCC 24375750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 GGGAGGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAGTCTGATCTTTGCTCCTGGTTTCC 3298

 24375751 TATGAGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTTCCACTGCTTCATGCCTGTTTCCT 24375810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TATGAGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTTCCACTGCTTCATGCCTGTTTCCT 3358

 24375811 CCATTTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATTAAGTAACATTTAGATTTCCAGCT 24375870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 CCATTTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATTAAGTAACATTTAGATTTCCAGCT 3418

 24375871 GGTACAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATGGCCTTAGGTCATCCTCATGCCCC 24375930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 GGTACAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATGGCCTTAGGTCATCCTCATGCCCC 3478

 24375931 CATTGTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTGATATTCATAGTATCCAAATTCAG 24375990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 CATTGTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTGATATTCATAGTATCCAAATTCAG 3538

 24375991 TAAGTCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAGGAAAATCTCTAACACCAATGATG 24376050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 TAAGTCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAGGAAAATCTCTAACACCAATGATG 3598

 24376051 ACTTAGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTGGACTCAGAAAAAAATTTAAGACA 24376110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 ACTTAGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTGGACTCAGAAAAAAATTTAAGACA 3658

 24376111 GTAGTTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGGATCAAGTTAAATCCTGGCCTAAT 24376170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 GTAGTTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGGATCAAGTTAAATCCTGGCCTAAT 3718

 24376171 GGCAATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTTAAGAATGGTCTGTTTTTAATATA 24376230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 GGCAATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTTAAGAATGGTCTGTTTTTAATATA 3778

 24376231 TTGTCTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGAGGGTTCATGAAAACTGCCTTACA 24376290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TTGTCTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGAGGGTTCATGAAAACTGCCTTACA 3838

 24376291 TAATTTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGTCATTGGTTTACTAAGAAATTATT 24376350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TAATTTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGTCATTGGTTTACTAAGAAATTATT 3898

 24376351 TTAATGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAACTAGAGGGGCCCAAATACATGAG 24376410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TTAATGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAACTAGAGGGGCCCAAATACATGAG 3958

 24376411 GTTTTATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGGTTTTCTCTGCTCACAGAGTGCTT 24376470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GTTTTATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGGTTTTCTCTGCTCACAGAGTGCTT 4018

 24376471 GGCAAACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATAAATGAATTAGCGAAAGGCTGTAG 24376530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 GGCAAACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATAAATGAATTAGCGAAAGGCTGTAG 4078

 24376531 ATCTAACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGTGTGGAGACAGAATCCCTGATCCT 24376590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 ATCTAACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGTGTGGAGACAGAATCCCTGATCCT 4138

 24376591 GAACACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGTACAGTCTAGCCCATGAAGAAAAG 24376650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 GAACACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGTACAGTCTAGCCCATGAAGAAAAG 4198

 24376651 CATATGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCGTGGTAGTCTTCTTGCTCACAGTG 24376710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 CATATGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCGTGGTAGTCTTCTTGCTCACAGTG 4258

 24376711 ACAGACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTAATCAAAGAGTTAGGGAATGCGTA 24376770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 ACAGACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTAATCAAAGAGTTAGGGAATGCGTA 4318

 24376771 CACTTCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTCGTGGATTTTCTCTTTATGCCAGA 24376830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 CACTTCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTCGTGGATTTTCTCTTTATGCCAGA 4378

 24376831 TCAGAGC 24376837
          |||||||
     4379 TCAGAGC 4385

EXCISED REGION

 24378442 TGGCTAGCCAGTTTTCCTGGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGT 24378501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 TGGCTAGCCAGTTTTCCTGGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGT 4446

 24378502 TTTTGTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATAGTTGTAGATGTGTGGCATTATTTCTGAGGGCT 24378561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 TTTTGTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATAGTTGTAGATGTGTGGCATTATTTCTGAGGGCT 4506

 24378562 CTGTTCTTTTCCATTGGTCTGTATCTCTGTTTGGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTA 24378621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 CTGTTCTTTTCCATTGGTCTGTATCTCTGTTTGGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTA 4566

 24378622 CTGTAGCCTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAGCGTGACAAAGGATGTAAAGGACCCTT 24378681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 CTGTAGCCTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGGTAGCGTGACAAAGGATGTAAAGGACCCTT 4626

 24378682 TCAAGGAGAACTACAAACCACTGCTCAATGAAATAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGA 24378741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 TCAAGGAGAACTACAAACCACTGCTCAATGAAATAAAAGAGGATACAAACAAATGGAAGA 4686

 24378742 ACATTCCATGCTCATGGATAGGAAGAATCAATGTCATGAAAATGGCCATACTGCCCAAGG 24378801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 ACATTCCATGCTCATGGATAGGAAGAATCAATGTCATGAAAATGGCCATACTGCCCAAGG 4746

 24378802 TAATTTATAGATTCATTGCCATCCCTGTCAAGCTACCAATGACTTTCTTCACAGAGTTAG 24378861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 TAATTTATAGATTCATTGCCATCCCTGTCAAGCTACCAATGACTTTCTTCACAGAGTTAG 4806

 24378862 AAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAAAAAGGTCCTGCATTGCCAAGTCAATCC 24378921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 AAAAAACTACTTTAAAGTTCATATGGAACCAAAAAAGGTCCTGCATTGCCAAGTCAATCC 4866

 24378922 TAAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCAGGCTCTCTATTTTAACACATCTTGACCACT 24378981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 TAAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCAGGCTCTCTATTTTAACACATCTTGACCACT 4926

 24378982 CTGATTGTCTTTCTTGCTCTCCTCTGCCGTCTAAAGTGGGGAGATCCTGCTCAGTTGCTG 24379041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 CTGATTGTCTTTCTTGCTCTCCTCTGCCGTCTAAAGTGGGGAGATCCTGCTCAGTTGCTG 4986

 24379042 GAATTTAGTAGTCATGGAAGCTTTCTTTTTTCTTTC 24379077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 GAATTTAGTAGTCATGGAAGCTTTCTTTTTTCTTTC 5022

Alignment time is 3.88752 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [24366837,24388441] =>     21605 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2610] =>      2610 nucs 'mol-32-3025-074770_2610'

Score:        2609
Aligned:      2609        nucs
Identic:      2609 (100%) nucs =>       590 (100%)      2019 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [24374597,24375186] EXCISED REGION [24375188,24377206]
 second seq =>  [       1,     590] EXCISED REGION [     592,    2610]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [24375187,24375187]
 second seq =>         1 nucs [591,591]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [590,590] to [591,591]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 24374597 GTTAAAAAAAAAAAAGTGCTGGCTGGGAGGCATGGTAGCTCACGCCTATGGTCCCAGCAC 24374656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTAAAAAAAAAAAAGTGCTGGCTGGGAGGCATGGTAGCTCACGCCTATGGTCCCAGCAC 60

 24374657 TTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTAGGTAA 24374716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTAGGTAA 120

 24374717 CATGGCAAAATCACGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATAACTGCATGTGC 24374776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATGGCAAAATCACGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATAACTGCATGTGC 180

 24374777 CTGTTGTCTCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATCACTTAAGCAGAGGAGGTTGA 24374836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGTTGTCTCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATCACTTAAGCAGAGGAGGTTGA 240

 24374837 GGCTGCGGTGGGCCAAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCGAGACCCT 24374896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCTGCGGTGGGCCAAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCGAGACCCT 300

 24374897 GTCTCAAAAAAAAAAAGTGTTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGACTGCTCCTC 24374956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCTCAAAAAAAAAAAGTGTTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGACTGCTCCTC 360

 24374957 CCTGCCCCACTACACACCCCCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCCCTCAGCCTC 24375016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTGCCCCACTACACACCCCCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCCCTCAGCCTC 420

 24375017 CTACTTAGAAATTGGAGCACCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACATGGTGCCTG 24375076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTACTTAGAAATTGGAGCACCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACATGGTGCCTG 480

 24375077 GTCTTGATTGTTAATAGAGGAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGTGGAAGTG 24375136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTCTTGATTGTTAATAGAGGAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGTGGAAGTG 540

 24375137 ACTCTGAAAAGGAGCCTCAACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTC 24375186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTCTGAAAAGGAGCCTCAACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTC 590

EXCISED REGION

 24375188 GCCTTCAGCAGTTGAGCAAATGAAACATTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGA 24375247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      592 GCCTTCAGCAGTTGAGCAAATGAAACATTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGA 651

 24375248 GTAGCCACCCTCATGTTTTGAGAGTACAGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCC 24375307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      652 GTAGCCACCCTCATGTTTTGAGAGTACAGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCC 711

 24375308 AGAATATTTTAATGTCAACAAAGACATGTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGT 24375367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      712 AGAATATTTTAATGTCAACAAAGACATGTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGT 771

 24375368 CCCCTTTGGAAGTCTCCATGTGTATCAGATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTT 24375427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 CCCCTTTGGAAGTCTCCATGTGTATCAGATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTT 831

 24375428 TGTTGTTGTTGTTACTGTAAGAATTCTGAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTT 24375487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 TGTTGTTGTTGTTACTGTAAGAATTCTGAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTT 891

 24375488 GGAAGAAAGCTTTAGTTTCATATTTTCTGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCT 24375547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 GGAAGAAAGCTTTAGTTTCATATTTTCTGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCT 951

 24375548 GTTTAATGGAGAGTATGTTTTTTTAAATGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAA 24375607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 GTTTAATGGAGAGTATGTTTTTTTAAATGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAA 1011

 24375608 GAAGAGAGAATAATGGAGAAATGCCATCTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAA 24375667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 GAAGAGAGAATAATGGAGAAATGCCATCTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAA 1071

 24375668 AATAGAAGTTTCTTATCAGGAGTGGGAGGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAG 24375727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 AATAGAAGTTTCTTATCAGGAGTGGGAGGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAG 1131

 24375728 TCTGATCTTTGCTCCTGGTTTCCTATGAGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTT 24375787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 TCTGATCTTTGCTCCTGGTTTCCTATGAGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTT 1191

 24375788 CCACTGCTTCATGCCTGTTTCCTCCATTTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATT 24375847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 CCACTGCTTCATGCCTGTTTCCTCCATTTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATT 1251

 24375848 AAGTAACATTTAGATTTCCAGCTGGTACAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATG 24375907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 AAGTAACATTTAGATTTCCAGCTGGTACAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATG 1311

 24375908 GCCTTAGGTCATCCTCATGCCCCCATTGTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTG 24375967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 GCCTTAGGTCATCCTCATGCCCCCATTGTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTG 1371

 24375968 ATATTCATAGTATCCAAATTCAGTAAGTCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAG 24376027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 ATATTCATAGTATCCAAATTCAGTAAGTCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAG 1431

 24376028 GAAAATCTCTAACACCAATGATGACTTAGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTG 24376087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 GAAAATCTCTAACACCAATGATGACTTAGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTG 1491

 24376088 GACTCAGAAAAAAATTTAAGACAGTAGTTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGG 24376147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 GACTCAGAAAAAAATTTAAGACAGTAGTTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGG 1551

 24376148 ATCAAGTTAAATCCTGGCCTAATGGCAATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTT 24376207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 ATCAAGTTAAATCCTGGCCTAATGGCAATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTT 1611

 24376208 AAGAATGGTCTGTTTTTAATATATTGTCTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGA 24376267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 AAGAATGGTCTGTTTTTAATATATTGTCTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGA 1671

 24376268 GGGTTCATGAAAACTGCCTTACATAATTTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGT 24376327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 GGGTTCATGAAAACTGCCTTACATAATTTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGT 1731

 24376328 CATTGGTTTACTAAGAAATTATTTTAATGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAA 24376387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 CATTGGTTTACTAAGAAATTATTTTAATGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAA 1791

 24376388 CTAGAGGGGCCCAAATACATGAGGTTTTATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGG 24376447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 CTAGAGGGGCCCAAATACATGAGGTTTTATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGG 1851

 24376448 TTTTCTCTGCTCACAGAGTGCTTGGCAAACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATA 24376507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 TTTTCTCTGCTCACAGAGTGCTTGGCAAACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATA 1911

 24376508 AATGAATTAGCGAAAGGCTGTAGATCTAACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGT 24376567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 AATGAATTAGCGAAAGGCTGTAGATCTAACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGT 1971

 24376568 GTGGAGACAGAATCCCTGATCCTGAACACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGT 24376627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 GTGGAGACAGAATCCCTGATCCTGAACACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGT 2031

 24376628 ACAGTCTAGCCCATGAAGAAAAGCATATGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCG 24376687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 ACAGTCTAGCCCATGAAGAAAAGCATATGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCG 2091

 24376688 TGGTAGTCTTCTTGCTCACAGTGACAGACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTA 24376747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 TGGTAGTCTTCTTGCTCACAGTGACAGACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTA 2151

 24376748 ATCAAAGAGTTAGGGAATGCGTACACTTCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTC 24376807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 ATCAAAGAGTTAGGGAATGCGTACACTTCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTC 2211

 24376808 GTGGATTTTCTCTTTATGCCAGATCAGAGCTGTGGTGGCCTCCCAAGCCTTCCCATGATG 24376867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 GTGGATTTTCTCTTTATGCCAGATCAGAGCTGTGGTGGCCTCCCAAGCCTTCCCATGATG 2271

 24376868 AAAAGTAAATAGAGCAGGGCATCTACCAGATTCCCAAACCAAGTTAGTGGACCATCCATT 24376927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 AAAAGTAAATAGAGCAGGGCATCTACCAGATTCCCAAACCAAGTTAGTGGACCATCCATT 2331

 24376928 GCAGATGGTAGCCCAAATGAAGTAGTCCTTTCTCTGGGCTTACTGGGCCATTCCCATTCC 24376987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 GCAGATGGTAGCCCAAATGAAGTAGTCCTTTCTCTGGGCTTACTGGGCCATTCCCATTCC 2391

 24376988 ACATCTCACAGTGGTCCTACAACTATATTGCATACAGTAAACTCTAAGGGTTATGTAGAT 24377047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 ACATCTCACAGTGGTCCTACAACTATATTGCATACAGTAAACTCTAAGGGTTATGTAGAT 2451

 24377048 AATGAGTTCTTTTTTCATGCAGAAGAAGCTAATGACTTTGAGAAGTCAGAGATGCCTGGA 24377107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 AATGAGTTCTTTTTTCATGCAGAAGAAGCTAATGACTTTGAGAAGTCAGAGATGCCTGGA 2511

 24377108 GGCACATGGATCTCCTCTGCCCAGGCTCAAGGAACATCCCAAACTTGTGTCCTCCCAGGC 24377167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 GGCACATGGATCTCCTCTGCCCAGGCTCAAGGAACATCCCAAACTTGTGTCCTCCCAGGC 2571

 24377168 TCTGTTTTTTTAATATACATATATATATATATATATACA 24377206
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 TCTGTTTTTTTAATATACATATATATATATATATATACA 2610

Alignment time is 2.00988 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [24366837,24388441] =>     21605 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3253] =>      3253 nucs 'mol-32-3025-107251_3253'

Score:        3252
Aligned:      3252        nucs
Identic:      3252 (100%) nucs =>      1116 (100%)      2136 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [24374025,24375140] EXCISED REGION [24375142,24377277]
 second seq =>  [       1,    1116] EXCISED REGION [    1118,    3253]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [24375141,24375141]
 second seq =>         1 nucs [1117,1117]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1116,1116] to [1117,1117]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 24374025 AGTAGAGACGGCGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCGCGTGATC 24374084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTAGAGACGGCGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCGCGTGATC 60

 24374085 CGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACCGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCAG 24374144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACCGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCAG 120

 24374145 AGTTTACTTTTAAGCAAGACATAGATGATGATAGATAGTTCAGTGGTTCGCAGACTTTGG 24374204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTTTACTTTTAAGCAAGACATAGATGATGATAGATAGTTCAGTGGTTCGCAGACTTTGG 180

 24374205 AATTTCATAAACTGATAACATTTGAGGGGTTTAAGGGAGTCACTGAAATAATAGACCAAC 24374264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTTCATAAACTGATAACATTTGAGGGGTTTAAGGGAGTCACTGAAATAATAGACCAAC 240

 24374265 TTACCAGTCCTCTGAATCATTCTACTCAATTCATTAAGGATGACCTGACCAGAGGAAACG 24374324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTACCAGTCCTCTGAATCATTCTACTCAATTCATTAAGGATGACCTGACCAGAGGAAACG 300

 24374325 AATAAACTGAGAATTGTTCAGGAGATGTGAAACCCAGTCAAGACCATTTGTCTTGCCTTC 24374384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATAAACTGAGAATTGTTCAGGAGATGTGAAACCCAGTCAAGACCATTTGTCTTGCCTTC 360

 24374385 TGGTCTTCAGTGCAAGTCAAAAGTCTTATTGGAAAGGGTAAGATTTCTAGCCCACGGCCA 24374444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGTCTTCAGTGCAAGTCAAAAGTCTTATTGGAAAGGGTAAGATTTCTAGCCCACGGCCA 420

 24374445 CCAATAATGGGCCCCATTGTGGGTACTGTGTCTGCCCTGCTACTCTGTTCATCATGGTGC 24374504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAATAATGGGCCCCATTGTGGGTACTGTGTCTGCCCTGCTACTCTGTTCATCATGGTGC 480

 24374505 CCAGGAATAGCCTGGAAAGTCTCTAGCACCCTTGACCATGAATATCTATCAGCCTCTTCA 24374564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAGGAATAGCCTGGAAAGTCTCTAGCACCCTTGACCATGAATATCTATCAGCCTCTTCA 540

 24374565 CCCCATACCACAGATAAATACACACAATTTCAGTTAAAAAAAAAAAAGTGCTGGCTGGGA 24374624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCCATACCACAGATAAATACACACAATTTCAGTTAAAAAAAAAAAAGTGCTGGCTGGGA 600

 24374625 GGCATGGTAGCTCACGCCTATGGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCGCT 24374684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCATGGTAGCTCACGCCTATGGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCGCT 660

 24374685 TGAGCCCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTAGGTAACATGGCAAAATCACGTCTCTACAAAAAA 24374744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAGCCCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTAGGTAACATGGCAAAATCACGTCTCTACAAAAAA 720

 24374745 TACAAAAATTAGCTGGGCATAACTGCATGTGCCTGTTGTCTCAGCTACTTGGGAGGCTGA 24374804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACAAAAATTAGCTGGGCATAACTGCATGTGCCTGTTGTCTCAGCTACTTGGGAGGCTGA 780

 24374805 GGTGAGAGGATCACTTAAGCAGAGGAGGTTGAGGCTGCGGTGGGCCAAGATTATGCCACT 24374864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGTGAGAGGATCACTTAAGCAGAGGAGGTTGAGGCTGCGGTGGGCCAAGATTATGCCACT 840

 24374865 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGTGTTTGTTGAG 24374924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGTGTTTGTTGAG 900

 24374925 TCACTTTAAGACAAATCCCCTGACTGCTCCTCCCTGCCCCACTACACACCCCCACCACAC 24374984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCACTTTAAGACAAATCCCCTGACTGCTCCTCCCTGCCCCACTACACACCCCCACCACAC 960

 24374985 AGAAACACCCCTGATTGATGCCCCTCAGCCTCCTACTTAGAAATTGGAGCACCACACCTG 24375044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAAACACCCCTGATTGATGCCCCTCAGCCTCCTACTTAGAAATTGGAGCACCACACCTG 1020

 24375045 AGCAGGTGAGATTCTATGTGACATGGTGCCTGGTCTTGATTGTTAATAGAGGAAGGCTTT 24375104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCAGGTGAGATTCTATGTGACATGGTGCCTGGTCTTGATTGTTAATAGAGGAAGGCTTT 1080

 24375105 AAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGTGGAAGTGACTC 24375140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGTGGAAGTGACTC 1116

EXCISED REGION

 24375142 GAAAAGGAGCCTCAACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCTGCCTTCAGCAGTTG 24375201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 GAAAAGGAGCCTCAACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCTGCCTTCAGCAGTTG 1177

 24375202 AGCAAATGAAACATTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGAGTAGCCACCCTCAT 24375261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 AGCAAATGAAACATTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGAGTAGCCACCCTCAT 1237

 24375262 GTTTTGAGAGTACAGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCCAGAATATTTTAATG 24375321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 GTTTTGAGAGTACAGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCCAGAATATTTTAATG 1297

 24375322 TCAACAAAGACATGTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGTCCCCTTTGGAAGTC 24375381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 TCAACAAAGACATGTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGTCCCCTTTGGAAGTC 1357

 24375382 TCCATGTGTATCAGATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTTTGTTGTTGTTGTTA 24375441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 TCCATGTGTATCAGATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTTTGTTGTTGTTGTTA 1417

 24375442 CTGTAAGAATTCTGAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTTGGAAGAAAGCTTTA 24375501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 CTGTAAGAATTCTGAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTTGGAAGAAAGCTTTA 1477

 24375502 GTTTCATATTTTCTGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCTGTTTAATGGAGAGT 24375561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 GTTTCATATTTTCTGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCTGTTTAATGGAGAGT 1537

 24375562 ATGTTTTTTTAAATGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAAGAAGAGAGAATAAT 24375621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 ATGTTTTTTTAAATGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAAGAAGAGAGAATAAT 1597

 24375622 GGAGAAATGCCATCTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAAAATAGAAGTTTCTT 24375681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 GGAGAAATGCCATCTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAAAATAGAAGTTTCTT 1657

 24375682 ATCAGGAGTGGGAGGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAGTCTGATCTTTGCTC 24375741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 ATCAGGAGTGGGAGGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAGTCTGATCTTTGCTC 1717

 24375742 CTGGTTTCCTATGAGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTTCCACTGCTTCATGC 24375801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 CTGGTTTCCTATGAGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTTCCACTGCTTCATGC 1777

 24375802 CTGTTTCCTCCATTTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATTAAGTAACATTTAGA 24375861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 CTGTTTCCTCCATTTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATTAAGTAACATTTAGA 1837

 24375862 TTTCCAGCTGGTACAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATGGCCTTAGGTCATCC 24375921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 TTTCCAGCTGGTACAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATGGCCTTAGGTCATCC 1897

 24375922 TCATGCCCCCATTGTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTGATATTCATAGTATC 24375981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 TCATGCCCCCATTGTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTGATATTCATAGTATC 1957

 24375982 CAAATTCAGTAAGTCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAGGAAAATCTCTAACA 24376041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 CAAATTCAGTAAGTCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAGGAAAATCTCTAACA 2017

 24376042 CCAATGATGACTTAGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTGGACTCAGAAAAAAA 24376101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 CCAATGATGACTTAGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTGGACTCAGAAAAAAA 2077

 24376102 TTTAAGACAGTAGTTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGGATCAAGTTAAATCC 24376161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 TTTAAGACAGTAGTTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGGATCAAGTTAAATCC 2137

 24376162 TGGCCTAATGGCAATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTTAAGAATGGTCTGTT 24376221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 TGGCCTAATGGCAATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTTAAGAATGGTCTGTT 2197

 24376222 TTTAATATATTGTCTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGAGGGTTCATGAAAAC 24376281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TTTAATATATTGTCTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGAGGGTTCATGAAAAC 2257

 24376282 TGCCTTACATAATTTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGTCATTGGTTTACTAA 24376341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 TGCCTTACATAATTTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGTCATTGGTTTACTAA 2317

 24376342 GAAATTATTTTAATGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAACTAGAGGGGCCCAA 24376401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 GAAATTATTTTAATGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAACTAGAGGGGCCCAA 2377

 24376402 ATACATGAGGTTTTATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGGTTTTCTCTGCTCAC 24376461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 ATACATGAGGTTTTATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGGTTTTCTCTGCTCAC 2437

 24376462 AGAGTGCTTGGCAAACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATAAATGAATTAGCGAA 24376521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 AGAGTGCTTGGCAAACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATAAATGAATTAGCGAA 2497

 24376522 AGGCTGTAGATCTAACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGTGTGGAGACAGAATC 24376581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 AGGCTGTAGATCTAACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGTGTGGAGACAGAATC 2557

 24376582 CCTGATCCTGAACACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGTACAGTCTAGCCCAT 24376641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 CCTGATCCTGAACACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGTACAGTCTAGCCCAT 2617

 24376642 GAAGAAAAGCATATGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCGTGGTAGTCTTCTTG 24376701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 GAAGAAAAGCATATGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCGTGGTAGTCTTCTTG 2677

 24376702 CTCACAGTGACAGACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTAATCAAAGAGTTAGG 24376761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 CTCACAGTGACAGACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTAATCAAAGAGTTAGG 2737

 24376762 GAATGCGTACACTTCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTCGTGGATTTTCTCTT 24376821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 GAATGCGTACACTTCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTCGTGGATTTTCTCTT 2797

 24376822 TATGCCAGATCAGAGCTGTGGTGGCCTCCCAAGCCTTCCCATGATGAAAAGTAAATAGAG 24376881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 TATGCCAGATCAGAGCTGTGGTGGCCTCCCAAGCCTTCCCATGATGAAAAGTAAATAGAG 2857

 24376882 CAGGGCATCTACCAGATTCCCAAACCAAGTTAGTGGACCATCCATTGCAGATGGTAGCCC 24376941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 CAGGGCATCTACCAGATTCCCAAACCAAGTTAGTGGACCATCCATTGCAGATGGTAGCCC 2917

 24376942 AAATGAAGTAGTCCTTTCTCTGGGCTTACTGGGCCATTCCCATTCCACATCTCACAGTGG 24377001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 AAATGAAGTAGTCCTTTCTCTGGGCTTACTGGGCCATTCCCATTCCACATCTCACAGTGG 2977

 24377002 TCCTACAACTATATTGCATACAGTAAACTCTAAGGGTTATGTAGATAATGAGTTCTTTTT 24377061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 TCCTACAACTATATTGCATACAGTAAACTCTAAGGGTTATGTAGATAATGAGTTCTTTTT 3037

 24377062 TCATGCAGAAGAAGCTAATGACTTTGAGAAGTCAGAGATGCCTGGAGGCACATGGATCTC 24377121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 TCATGCAGAAGAAGCTAATGACTTTGAGAAGTCAGAGATGCCTGGAGGCACATGGATCTC 3097

 24377122 CTCTGCCCAGGCTCAAGGAACATCCCAAACTTGTGTCCTCCCAGGCTCTGTTTTTTTAAT 24377181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 CTCTGCCCAGGCTCAAGGAACATCCCAAACTTGTGTCCTCCCAGGCTCTGTTTTTTTAAT 3157

 24377182 ATACATATATATATATATATATACACACATATATGTGTATATATATATATATATTTATTA 24377241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 ATACATATATATATATATATATACACACATATATGTGTATATATATATATATATTTATTA 3217

 24377242 TACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACGTGCA 24377277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 TACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACGTGCA 3253

Alignment time is 2.52307 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [24366837,24388441] =>     21605 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3080] =>      3080 nucs 'mol-32-3332-085260_3080'

Score:        3080
Aligned:      3080        nucs
Identic:      3080 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [24374110,24377189]
 second seq =>  [       1,    3080]

 24374110 TGGGATTACCGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCAGAGTTTACTTTTAAGCAAGACATAGA 24374169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGATTACCGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCAGAGTTTACTTTTAAGCAAGACATAGA 60

 24374170 TGATGATAGATAGTTCAGTGGTTCGCAGACTTTGGAATTTCATAAACTGATAACATTTGA 24374229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGATGATAGATAGTTCAGTGGTTCGCAGACTTTGGAATTTCATAAACTGATAACATTTGA 120

 24374230 GGGGTTTAAGGGAGTCACTGAAATAATAGACCAACTTACCAGTCCTCTGAATCATTCTAC 24374289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGGTTTAAGGGAGTCACTGAAATAATAGACCAACTTACCAGTCCTCTGAATCATTCTAC 180

 24374290 TCAATTCATTAAGGATGACCTGACCAGAGGAAACGAATAAACTGAGAATTGTTCAGGAGA 24374349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAATTCATTAAGGATGACCTGACCAGAGGAAACGAATAAACTGAGAATTGTTCAGGAGA 240

 24374350 TGTGAAACCCAGTCAAGACCATTTGTCTTGCCTTCTGGTCTTCAGTGCAAGTCAAAAGTC 24374409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTGAAACCCAGTCAAGACCATTTGTCTTGCCTTCTGGTCTTCAGTGCAAGTCAAAAGTC 300

 24374410 TTATTGGAAAGGGTAAGATTTCTAGCCCACGGCCACCAATAATGGGCCCCATTGTGGGTA 24374469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATTGGAAAGGGTAAGATTTCTAGCCCACGGCCACCAATAATGGGCCCCATTGTGGGTA 360

 24374470 CTGTGTCTGCCCTGCTACTCTGTTCATCATGGTGCCCAGGAATAGCCTGGAAAGTCTCTA 24374529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGTGTCTGCCCTGCTACTCTGTTCATCATGGTGCCCAGGAATAGCCTGGAAAGTCTCTA 420

 24374530 GCACCCTTGACCATGAATATCTATCAGCCTCTTCACCCCATACCACAGATAAATACACAC 24374589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCACCCTTGACCATGAATATCTATCAGCCTCTTCACCCCATACCACAGATAAATACACAC 480

 24374590 AATTTCAGTTAAAAAAAAAAAAGTGCTGGCTGGGAGGCATGGTAGCTCACGCCTATGGTC 24374649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATTTCAGTTAAAAAAAAAAAAGTGCTGGCTGGGAGGCATGGTAGCTCACGCCTATGGTC 540

 24374650 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGAGCAGCC 24374709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGAGCAGCC 600

 24374710 TAGGTAACATGGCAAAATCACGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATAACTG 24374769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGGTAACATGGCAAAATCACGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATAACTG 660

 24374770 CATGTGCCTGTTGTCTCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATCACTTAAGCAGAGG 24374829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATGTGCCTGTTGTCTCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGAGAGGATCACTTAAGCAGAGG 720

 24374830 AGGTTGAGGCTGCGGTGGGCCAAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCG 24374889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGTTGAGGCTGCGGTGGGCCAAGATTATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCG 780

 24374890 AGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGTGTTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGACT 24374949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGTGTTTGTTGAGTCACTTTAAGACAAATCCCCTGACT 840

 24374950 GCTCCTCCCTGCCCCACTACACACCCCCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCCCT 24375009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTCCTCCCTGCCCCACTACACACCCCCACCACACAGAAACACCCCTGATTGATGCCCCT 900

 24375010 CAGCCTCCTACTTAGAAATTGGAGCACCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACATG 24375069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGCCTCCTACTTAGAAATTGGAGCACCACACCTGAGCAGGTGAGATTCTATGTGACATG 960

 24375070 GTGCCTGGTCTTGATTGTTAATAGAGGAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGT 24375129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTGCCTGGTCTTGATTGTTAATAGAGGAAGGCTTTAAAAGGAGATTACTAAAAACAGGGT 1020

 24375130 GGAAGTGACTCTGAAAAGGAGCCTCAACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCTGC 24375189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAAGTGACTCTGAAAAGGAGCCTCAACAAAGGGAGGCTTTTATCTAGGGTCAGCTCTGC 1080

 24375190 CTTCAGCAGTTGAGCAAATGAAACATTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGAGT 24375249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTCAGCAGTTGAGCAAATGAAACATTCCTTTTGCTTTTGACAATATTTCAAACTGGAGT 1140

 24375250 AGCCACCCTCATGTTTTGAGAGTACAGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCCAG 24375309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCCACCCTCATGTTTTGAGAGTACAGACACTCGTTCATTATCAGACTGACATTAGCCAG 1200

 24375310 AATATTTTAATGTCAACAAAGACATGTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGTCC 24375369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATATTTTAATGTCAACAAAGACATGTGAATGATTGTTGGCCTGATTATTTCTTATGTCC 1260

 24375370 CCTTTGGAAGTCTCCATGTGTATCAGATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTTTG 24375429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTTTGGAAGTCTCCATGTGTATCAGATTTTAAATAAGGAATACTTCCAGGTTGATTTTG 1320

 24375430 TTGTTGTTGTTACTGTAAGAATTCTGAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTTGG 24375489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGTTGTTGTTACTGTAAGAATTCTGAATCTTATCAAGGATGCAGTCTAAGTGAACTTGG 1380

 24375490 AAGAAAGCTTTAGTTTCATATTTTCTGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCTGT 24375549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGAAAGCTTTAGTTTCATATTTTCTGGCTAATGTTCCATAAATGTCATAACTTGGCTGT 1440

 24375550 TTAATGGAGAGTATGTTTTTTTAAATGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAAGA 24375609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTAATGGAGAGTATGTTTTTTTAAATGTAATAAATTTGCCAAACATTAATGAAGGGAAGA 1500

 24375610 AGAGAGAATAATGGAGAAATGCCATCTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAAAA 24375669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAGAGAATAATGGAGAAATGCCATCTCAAGCTTGAAAACATCAAAATTAGCAATAAAAA 1560

 24375670 TAGAAGTTTCTTATCAGGAGTGGGAGGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAGTC 24375729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGAAGTTTCTTATCAGGAGTGGGAGGGAGATCATTATAGGCATTAAAATAGACACAGTC 1620

 24375730 TGATCTTTGCTCCTGGTTTCCTATGAGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTTCC 24375789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGATCTTTGCTCCTGGTTTCCTATGAGGGACTCATGGGGTAACCTTGACCCAGCAGTTCC 1680

 24375790 ACTGCTTCATGCCTGTTTCCTCCATTTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATTAA 24375849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTGCTTCATGCCTGTTTCCTCCATTTGTCCCGTGGGAACTGTAATATTCATTTGATTAA 1740

 24375850 GTAACATTTAGATTTCCAGCTGGTACAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATGGC 24375909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTAACATTTAGATTTCCAGCTGGTACAGGGAAGTTGTAACAGTCCTGCAGATGACATGGC 1800

 24375910 CTTAGGTCATCCTCATGCCCCCATTGTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTGAT 24375969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTAGGTCATCCTCATGCCCCCATTGTCCAGTATGGCTCTGAGCAGAAGACTCGTGTGAT 1860

 24375970 ATTCATAGTATCCAAATTCAGTAAGTCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAGGA 24376029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTCATAGTATCCAAATTCAGTAAGTCTACTCATCCTTAAATGAAAGCTGCTTTGTAGGA 1920

 24376030 AAATCTCTAACACCAATGATGACTTAGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTGGA 24376089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAATCTCTAACACCAATGATGACTTAGAATGGGAGAAAAAATTAGTGAGATTTAGTTGGA 1980

 24376090 CTCAGAAAAAAATTTAAGACAGTAGTTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGGAT 24376149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTCAGAAAAAAATTTAAGACAGTAGTTTTATTACTTAGAAAGATTCATGTTAACTAGGAT 2040

 24376150 CAAGTTAAATCCTGGCCTAATGGCAATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTTAA 24376209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAAGTTAAATCCTGGCCTAATGGCAATTTTTTCACAGAAACTACTTTGACACATCTTTAA 2100

 24376210 GAATGGTCTGTTTTTAATATATTGTCTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGAGG 24376269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAATGGTCTGTTTTTAATATATTGTCTTTGCATTCTTCTGAAGGTGCTTCTAAAGTGAGG 2160

 24376270 GTTCATGAAAACTGCCTTACATAATTTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGTCA 24376329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTTCATGAAAACTGCCTTACATAATTTAAGCTTTCTTCTGCAACCATATGTACGGTGTCA 2220

 24376330 TTGGTTTACTAAGAAATTATTTTAATGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAACT 24376389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTGGTTTACTAAGAAATTATTTTAATGTTAAATTTTATGTACTTTTTAAAATTCTTAACT 2280

 24376390 AGAGGGGCCCAAATACATGAGGTTTTATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGGTT 24376449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGAGGGGCCCAAATACATGAGGTTTTATTATTGTGGTTCTTTTATGTTTTGTTACAGGTT 2340

 24376450 TTCTCTGCTCACAGAGTGCTTGGCAAACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATAAA 24376509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTCTCTGCTCACAGAGTGCTTGGCAAACATAATAAATGCTTGAGTTAACTGATAAATAAA 2400

 24376510 TGAATTAGCGAAAGGCTGTAGATCTAACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGTGT 24376569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGAATTAGCGAAAGGCTGTAGATCTAACCCTCATAGTTAGCCTTACTTTATTCTATGTGT 2460

 24376570 GGAGACAGAATCCCTGATCCTGAACACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGTAC 24376629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGAGACAGAATCCCTGATCCTGAACACCCATTCAATACCATTTGCAAAGGCCATTTGTAC 2520

 24376630 AGTCTAGCCCATGAAGAAAAGCATATGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCGTG 24376689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGTCTAGCCCATGAAGAAAAGCATATGACTGCAATGAGATGTGGGGTTTATTCCATCGTG 2580

 24376690 GTAGTCTTCTTGCTCACAGTGACAGACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTAAT 24376749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTAGTCTTCTTGCTCACAGTGACAGACTTCAGCACTCTTTCCACACTTATGCATTCTAAT 2640

 24376750 CAAAGAGTTAGGGAATGCGTACACTTCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTCGT 24376809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAAAGAGTTAGGGAATGCGTACACTTCCTGCCTGCAGCGGTGTTAGAAAGAGTGTGTCGT 2700

 24376810 GGATTTTCTCTTTATGCCAGATCAGAGCTGTGGTGGCCTCCCAAGCCTTCCCATGATGAA 24376869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGATTTTCTCTTTATGCCAGATCAGAGCTGTGGTGGCCTCCCAAGCCTTCCCATGATGAA 2760

 24376870 AAGTAAATAGAGCAGGGCATCTACCAGATTCCCAAACCAAGTTAGTGGACCATCCATTGC 24376929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGTAAATAGAGCAGGGCATCTACCAGATTCCCAAACCAAGTTAGTGGACCATCCATTGC 2820

 24376930 AGATGGTAGCCCAAATGAAGTAGTCCTTTCTCTGGGCTTACTGGGCCATTCCCATTCCAC 24376989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGATGGTAGCCCAAATGAAGTAGTCCTTTCTCTGGGCTTACTGGGCCATTCCCATTCCAC 2880

 24376990 ATCTCACAGTGGTCCTACAACTATATTGCATACAGTAAACTCTAAGGGTTATGTAGATAA 24377049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATCTCACAGTGGTCCTACAACTATATTGCATACAGTAAACTCTAAGGGTTATGTAGATAA 2940

 24377050 TGAGTTCTTTTTTCATGCAGAAGAAGCTAATGACTTTGAGAAGTCAGAGATGCCTGGAGG 24377109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGAGTTCTTTTTTCATGCAGAAGAAGCTAATGACTTTGAGAAGTCAGAGATGCCTGGAGG 3000

 24377110 CACATGGATCTCCTCTGCCCAGGCTCAAGGAACATCCCAAACTTGTGTCCTCCCAGGCTC 24377169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CACATGGATCTCCTCTGCCCAGGCTCAAGGAACATCCCAAACTTGTGTCCTCCCAGGCTC 3060

 24377170 TGTTTTTTTAATATACATAT 24377189
          ||||||||||||||||||||
     3061 TGTTTTTTTAATATACATAT 3080

Alignment time is 2.0799 s

