
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     4635] =>      4635 nucs 'mol-32-1f0b-005360_4635'

Score:        3160
Aligned:      3239        nucs
Identic:      3231 (100%) nucs =>        21 (100%)      3210 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100490785,100490805] EXCISED REGION [100495008,100498223]
 second seq =>  [      292,      312] EXCISED REGION [     1418,     4635]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4202 nucs [100490806,100495007]
 second seq =>      1105 nucs [313,1417]
ALTERNATIVE REGION(S): 3
 first  seq =>      1849 nucs [100493159,100495007]
 second seq =>       394 nucs [1024,1417]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [312,312] to [1417,1417]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100490805,100490805] to [100495008,100495008]
 second seq =>         1 nucs [312,312] to [1418,1418]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100490785 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 100490805
          |||||||||||||||||||||
      292 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 312

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 1477

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 1537

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 1597

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1657

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1717

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1777

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1837

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 GAGATATGGAATCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 1897

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 1957

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 2017

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 2077

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 2137

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 2197

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 2257

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 2317

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 2377

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 2437

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 2497

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 2557

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 2617

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 2677

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 2737

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 2797

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 2857

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 2917

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 2977

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 3037

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 3097

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 3157

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 3217

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 3277

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 3337

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 3397

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3398 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 3457

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3458 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGATCCC 3517

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3518 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 3577

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 3637

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 100497285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 3697

100497286 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 100497345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3698 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 3757

100497346 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 100497405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 3817

100497406 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 100497465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 3877

100497466 TAAACTCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 100497525
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3878 TAAACTCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 3937

100497526 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 100497585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 3997

100497586 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 100497645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 4057

100497646 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 100497705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 4117

100497706 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 100497765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 4177

100497766 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 100497825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4178 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 4237

100497826 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAA 100497885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4238 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAA 4297

100497886 CAGATATATAGACCAATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAA 100497945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4298 CAGATATATAGACCAATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAA 4357

100497946 CCATCTGTTCTTTGATAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAA 100498005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4358 CCATCTGTTCTTTGATAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAA 4417

100498006 TAAATGGTGTTGGGATAATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACC 100498065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4418 TAAATGGTGTTGGGATAATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACC 4477

100498066 TTAAACAAAAATTAACTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAA 100498125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4478 TTAAACAAAAATTAACTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAA 4537

100498126 AACCCTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCAT 100498185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4538 AACCCTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCAT 4597

100498186 GTCTAAAACACCAAAATCAATTGCAACAAAAGCCAAAA 100498223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4598 GTCTAAAACACCAAAATCAATTGCAACAAAAGCCAAAA 4635

Alignment time is 3.73344 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     2067] =>      2067 nucs 'mol-32-22a7-025990_2067'

Score:        2021
Aligned:      2065        nucs
Identic:      2061 (100%) nucs =>       179 (100%)      1882 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100495792,100495970] EXCISED REGION [100495971,100497856]
 second seq =>  [        1,      179] EXCISED REGION [      182,     2067]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [180,181]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        11 nucs [180,190] to [182,192]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [180,180] to [181,181]

100495792 GCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTTGTGG 100495851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTTGTGG 60

100495852 GAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCTCATG 100495911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCTCATG 120

100495912 GTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCTTGG 100495970
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCTTGG 179

EXCISED REGION

100495971 TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTCTGCCA 100496030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      182 TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTCTGCCA 241

100496031 TGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTCTTTAT 100496090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      242 TGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTCTTTAT 301

100496091 AAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATACAGCAG 100496150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      302 AAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATACAGCAG 361

100496151 CTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTAGTGAG 100496210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      362 CTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTAGTGAG 421

100496211 AGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACTTCACT 100496270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      422 AGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACTTCACT 481

100496271 CACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTATGAAT 100496330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      482 CACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTATGAAT 541

100496331 TTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTTTAACA 100496390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      542 TTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTTTAACA 601

100496391 ATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTCTAGCA 100496450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      602 ATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTCTAGCA 661

100496451 TATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGATACTAA 100496510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      662 TATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGATACTAA 721

100496511 ACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATGTTATG 100496570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      722 ACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATGTTATG 781

100496571 CCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCATTTCAC 100496630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      782 CCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCATTTCAC 841

100496631 ACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTAAATAC 100496690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      842 ACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTAAATAC 901

100496691 CATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAGGTTGA 100496750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      902 CATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAGGTTGA 961

100496751 AGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTATATGG 100496810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      962 AGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTATATGG 1021

100496811 TTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAAACTCT 100496870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1022 TTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAAACTCT 1081

100496871 ATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAATAATTG 100496930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1082 ATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAATAATTG 1141

100496931 ACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATATACACA 100496990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 ACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATATACACA 1201

100496991 TAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGAACATA 100497050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1202 TAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGAACATA 1261

100497051 AATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAA 100497110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 AATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAA 1321

100497111 GACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCATCTCAT 100497170
          |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1322 GACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCATCTCAT 1381

100497171 TGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCACTATCC 100497230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 TGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCACTATCC 1441

100497231 ATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACCCCTTG 100497290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 ATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACCCCTTG 1501

100497291 CACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAGCCCCA 100497350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 CACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAGCCCCA 1561

100497351 AAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGTGCAAA 100497410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 AAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGTGCAAA 1621

100497411 AATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAGTAAAC 100497470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 AATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAGTAAAC 1681

100497471 TCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATG 100497530
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 TCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATG 1741

100497531 TGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGACACAA 100497590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 TGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGACACAA 1801

100497591 ACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAATGACCA 100497650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 ACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAATGACCA 1861

100497651 TACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGACTTTCT 100497710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 TACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGACTTTCT 1921

100497711 TCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAAGAGCC 100497770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 TCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAAGAGCC 1981

100497771 CATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACCTGACT 100497830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 CATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACCTGACT 2041

100497831 TCAAACTATACTACAAGGCTACAGTA 100497856
          ||||||||||||||||||||||||||
     2042 TCAAACTATACTACAAGGCTACAGTA 2067

Alignment time is 1.50508 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     2710] =>      2710 nucs 'mol-32-2383-150260_2710'

Score:        2653
Aligned:      2708        nucs
Identic:      2703 (100%) nucs =>       434 (100%)      2269 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100495537,100495970] EXCISED REGION [100495971,100498244]
 second seq =>  [        1,      434] EXCISED REGION [      437,     2710]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [435,436]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        11 nucs [435,445] to [437,447]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [435,435] to [436,436]

100495537 ATTTGGAACAGCTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAAC 100495596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTGGAACAGCTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAAC 60

100495597 TTGCTTTTGATTTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCT 100495656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGCTTTTGATTTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCT 120

100495657 TGGACTGTGTACTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGA 100495716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGACTGTGTACTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGA 180

100495717 AGGCATGATTGGTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATG 100495776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGCATGATTGGTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATG 240

100495777 ATATGGTTTGGTTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAAT 100495836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATGGTTTGGTTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAAT 300

100495837 TCCCATGTGTTGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCC 100495896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCCATGTGTTGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCC 360

100495897 CATACTGTTCTCATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTT 100495956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATACTGTTCTCATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTT 420

100495957 CCCCTTTTGCTTGG 100495970
          ||||||||||||||
      421 CCCCTTTTGCTTGG 434

EXCISED REGION

100495971 TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTCTGCCA 100496030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      437 TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTCTGCCA 496

100496031 TGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTCTTTAT 100496090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      497 TGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTCTTTAT 556

100496091 AAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATACAGCAG 100496150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      557 AAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATACAGCAG 616

100496151 CTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTAGTGAG 100496210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      617 CTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTAGTGAG 676

100496211 AGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACTTCACT 100496270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      677 AGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACTTCACT 736

100496271 CACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTATGAAT 100496330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      737 CACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTATGAAT 796

100496331 TTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTTTAACA 100496390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      797 TTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTTTAACA 856

100496391 ATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTCTAGCA 100496450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      857 ATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTCTAGCA 916

100496451 TATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGATACTAA 100496510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      917 TATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGATACTAA 976

100496511 ACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATGTTATG 100496570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      977 ACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATGTTATG 1036

100496571 CCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCATTTCAC 100496630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1037 CCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCATTTCAC 1096

100496631 ACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTAAATAC 100496690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1097 ACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTAAATAC 1156

100496691 CATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAGGTTGA 100496750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1157 CATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAGGTTGA 1216

100496751 AGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTATATGG 100496810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1217 AGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTATATGG 1276

100496811 TTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAAACTCT 100496870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 TTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAAACTCT 1336

100496871 ATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAATAATTG 100496930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 ATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAATAATTG 1396

100496931 ACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATATACACA 100496990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 ACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATATACACA 1456

100496991 TAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGAACATA 100497050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1457 TAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGAACATA 1516

100497051 AATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAA 100497110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 AATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAA 1576

100497111 GACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCATCTCAT 100497170
          |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1577 GACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCATCTCAT 1636

100497171 TGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCACTATCC 100497230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 TGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCACTATCC 1696

100497231 ATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACCCCTTG 100497290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 ATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACCCCTTG 1756

100497291 CACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAGCCCCA 100497350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 CACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAGCCCCA 1816

100497351 AAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGTGCAAA 100497410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 AAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGTGCAAA 1876

100497411 AATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAGTAAAC 100497470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 AATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAGTAAAC 1936

100497471 TCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATG 100497530
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 TCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATG 1996

100497531 TGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGACACAA 100497590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 TGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGACACAA 2056

100497591 ACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAATGACCA 100497650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 ACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAATGACCA 2116

100497651 TACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGACTTTCT 100497710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 TACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGACTTTCT 2176

100497711 TCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAAGAGCC 100497770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 TCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAAGAGCC 2236

100497771 CATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACCTGACT 100497830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2237 CATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATAACACTACCTGACT 2296

100497831 TCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAACAGAT 100497890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 TCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAACAGAT 2356

100497891 ATATAGACCAATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAACCATC 100497950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 ATATAGACCAATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAACCATC 2416

100497951 TGTTCTTTGATAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAAT 100498010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 TGTTCTTTGATAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAAT 2476

100498011 GGTGTTGGGATAATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAA 100498070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 GGTGTTGGGATAATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAA 2536

100498071 CAAAAATTAACTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAAAACCC 100498130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 CAAAAATTAACTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAAAACCC 2596

100498131 TAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCATGTCTA 100498190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 TAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCATGTCTA 2656

100498191 AAACACCAAAATCAATTGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTA 100498244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 AAACACCAAAATCAATTGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTA 2710

Alignment time is 1.95819 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     7408] =>      7408 nucs 'mol-32-2874-074122_7408'

Score:        7297
Aligned:      7409        nucs
Identic:      7398 (100%) nucs =>      6084 (100%)      1314 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100496458,100502549] EXCISED REGION [100502550,100503866]
 second seq =>  [        1,     6091] EXCISED REGION [     6094,     7408]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [6092,6093]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         2 nucs [100502732,100502733]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        26 nucs [6092,6117] to [6094,6119]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100496458 GTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGATACTAAACTCCTG 100496517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGATACTAAACTCCTG 60

100496518 GAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATGTTATGCCAAGCT 100496577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATGTTATGCCAAGCT 120

100496578 ATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCATTTCACACTTGGC 100496637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCATTTCACACTTGGC 180

100496638 ATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTAAATACCATGAGA 100496697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTAAATACCATGAGA 240

100496698 GTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAGGTTGAAGGAGAG 100496757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAGGTTGAAGGAGAG 300

100496758 AAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTATATGGTTTCTTG 100496817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTATATGGTTTCTTG 360

100496818 TTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAAACTCTATGTTCT 100496877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAAACTCTATGTTCT 420

100496878 GAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAATAATTGACAATAT 100496937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAATAATTGACAATAT 480

100496938 GTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATATACACATAAAAAT 100496997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATATACACATAAAAAT 540

100496998 ACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGAACATAAATGCAA 100497057
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      541 ACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGAACATAAATGCAA 600

100497058 TTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAAGACCAAC 100497117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAAGACCAAC 660

100497118 ACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCATCTCATTGGGACT 100497177
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      661 ACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCATCTCATTGGGACT 720

100497178 GGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCACTATCCATCACAG 100497237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCACTATCCATCACAG 780

100497238 CATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACCCCTTGCACTTCC 100497297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACCCCTTGCACTTCC 840

100497298 TGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAGCCCCAAAACTCC 100497357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAGCCCCAAAACTCC 900

100497358 TTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGTGCAAAAATCACA 100497417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGTGCAAAAATCACA 960

100497418 AGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAGTAAACTCCCATT 100497477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAGTAAACTCCCATT 1020

100497478 CACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATGTGAAGGA 100497537
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATGTGAAGGA 1080

100497538 CTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAGTG 100497597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAGTG 1140

100497598 GAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCC 100497657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCC 1200

100497658 CAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGACTTTCTTCACAGA 100497717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGACTTTCTTCACAGA 1260

100497718 AGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAAGAGCCCATATAG 100497777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAAGAGCCCATATAG 1320

100497778 TCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACCTGACTTCAAACT 100497837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACCTGACTTCAAACT 1380

100497838 ATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAACAGATATATAGA 100497897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAACAGATATATAGA 1440

100497898 CCAATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAACCATCTGTTCTT 100497957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCAATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAACCATCTGTTCTT 1500

100497958 TGATAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGTTG 100498017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGATAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGTTG 1560

100498018 GGATAATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAAAAAT 100498077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGATAATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAAAAAT 1620

100498078 TAACTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAAAACCCTAGAAGA 100498137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAACTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAAAACCCTAGAAGA 1680

100498138 AAACCTAGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCATGTCTAAAACACC 100498197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAACCTAGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCATGTCTAAAACACC 1740

100498198 AAAATCAATTGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTT 100498257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAATCAATTGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTT 1800

100498258 CTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGAGAGAAAAT 100498317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGAGAGAAAAT 1860

100498318 TTTTGCAATCTATCCATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAAAGAACTTAAACA 100498377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTGCAATCTATCCATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAAAGAACTTAAACA 1920

100498378 AATTTACAAGAAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTTT 100498437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATTTACAAGAAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTTT 1980

100498438 CAAAAGAAGACATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCATCATCAGTGGTCA 100498497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAAAAGAAGACATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCATCATCAGTGGTCA 2040

100498498 TTAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAGTTAGAATTATGA 100498557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAGTTAGAATTATGA 2100

100498558 TCATTAAAAAGTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAATAGGAATGCTTT 100498617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCATTAAAAAGTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAATAGGAATGCTTT 2160

100498618 TACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCC 100498677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCC 2220

100498678 TCAAGGATCTAGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGATATGTACC 100498737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCAAGGATCTAGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGATATGTACC 2280

100498738 CAAAGGATTATAAACCATTCTTCCATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCAGCAC 100498797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAAAGGATTATAAACCATTCTTCCATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCAGCAC 2340

100498798 TATTCACAATAGCAAAAACTTGGAACGAACCCAAATGCCCGTCAGTGATAGACTAGAAAA 100498857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TATTCACAATAGCAAAAACTTGGAACGAACCCAAATGCCCGTCAGTGATAGACTAGAAAA 2400

100498858 AGAGAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAAGAATGAGTTCA 100498917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGAGAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAAGAATGAGTTCA 2460

100498918 TGTCCTTTGCAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAGCAAACTAACACAGG 100498977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGTCCTTTGCAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAGCAAACTAACACAGG 2520

100498978 AACAGAAAATCAAACACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGGTGAATAATGAGAACAT 100499037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AACAGAAAATCAAACACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGGTGAATAATGAGAACAT 2580

100499038 ATGGGCACAGGGAGGGAAACATCACACACTGTGGTCTGTCGTGGGGAGTGGGGTAGGGGA 100499097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATGGGCACAGGGAGGGAAACATCACACACTGTGGTCTGTCGTGGGGAGTGGGGTAGGGGA 2640

100499098 GCGATATCATTAGGACAAATACCTAGTGTAGATGACAGGTTGATGGGTACAGCAAACCAC 100499157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCGATATCATTAGGACAAATACCTAGTGTAGATGACAGGTTGATGGGTACAGCAAACCAC 2700

100499158 CATGGCACATGTATACCTATATAACAAGCCTGCCCATTCTGCACATGTAAAAAAAAAAAG 100499217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CATGGCACATGTATACCTATATAACAAGCCTGCCCATTCTGCACATGTAAAAAAAAAAAG 2760

100499218 AAGAAGAAAAAAAGAAAAAAAAGTACATAAATACATCATACATTTATCCACCTAAACTCA 100499277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGAAGAAAAAAAGAAAAAAAAGTACATAAATACATCATACATTTATCCACCTAAACTCA 2820

100499278 GGCTAAAAGCTTAATAAATATTGAGGGAATGCATTAATCAAGCTGTGCTGCCAGAATCAT 100499337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGCTAAAAGCTTAATAAATATTGAGGGAATGCATTAATCAAGCTGTGCTGCCAGAATCAT 2880

100499338 AAGAATCATCATCTCTGACTTTCTAAGGTCAGAAACTTGATTTTACAAAATTACTTAGTA 100499397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAGAATCATCATCTCTGACTTTCTAAGGTCAGAAACTTGATTTTACAAAATTACTTAGTA 2940

100499398 GACAGGCTCCAGAGAACTGAGTCATATAACTAATTCTTATAAAAGAATAACATGTGAATG 100499457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GACAGGCTCCAGAGAACTGAGTCATATAACTAATTCTTATAAAAGAATAACATGTGAATG 3000

100499458 TATATAGGTCAGGTTATGGGTATGAATATATAATATTGATTCAATAATTAATTATAGTAG 100499517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TATATAGGTCAGGTTATGGGTATGAATATATAATATTGATTCAATAATTAATTATAGTAG 3060

100499518 CTTTTACTTGCTTATAGAAATGGGCAGATATATTTGGGAAGCACATTTATAGTTCATAAT 100499577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTTTTACTTGCTTATAGAAATGGGCAGATATATTTGGGAAGCACATTTATAGTTCATAAT 3120

100499578 GTAGTTCAGTGTTCATTCAATTAGAGGTATTACATTATCTTAAGGTAATTTTTGTGATTA 100499637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTAGTTCAGTGTTCATTCAATTAGAGGTATTACATTATCTTAAGGTAATTTTTGTGATTA 3180

100499638 AGTATAGCTCTCTAGAGAACAAACACCATTTCCCTGAAATGGAGTTGGACTAGAATTTAT 100499697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGTATAGCTCTCTAGAGAACAAACACCATTTCCCTGAAATGGAGTTGGACTAGAATTTAT 3240

100499698 ATACACTTCCAGAGTTTGAGTCCCAGCTTCAAAAATTTCTCCAGTTCTTTCTTACTTTAG 100499757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATACACTTCCAGAGTTTGAGTCCCAGCTTCAAAAATTTCTCCAGTTCTTTCTTACTTTAG 3300

100499758 ATTCACCAATGGTTAATATAAATGTAAAAATCTGTAATCATTACATTAATCAGTTACAGA 100499817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATTCACCAATGGTTAATATAAATGTAAAAATCTGTAATCATTACATTAATCAGTTACAGA 3360

100499818 GTTTACAATTTATGGACATTTAGGGAAATATGTTATATCCAAAGAAAGTAATTGTAAAAA 100499877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GTTTACAATTTATGGACATTTAGGGAAATATGTTATATCCAAAGAAAGTAATTGTAAAAA 3420

100499878 AGTATGGTGTCAAGAAAGTCATTTTTTTTTGTTTTGCTTTTGATTTTCTTTTCTTTTGTC 100499937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGTATGGTGTCAAGAAAGTCATTTTTTTTTGTTTTGCTTTTGATTTTCTTTTCTTTTGTC 3480

100499938 TTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACCATGTCACCCAGGTTCAAGAACAGTAGCATGA 100499997
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTTTTTTTTTTT-GAGACAGGGTCTCACCATGTCACCCAGGTTCAAGAACAGTAGCATGA 3539

100499998 TCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGACCCTCCAGCCTCAGTCTCCC 100500057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGACCCTCCAGCCTCAGTCTCCC 3599

100500058 AAGTACCCAGGATCACAGGTGCATGCTACCACGCCCAGCTAATTTTCTAGTTTTTTGTAG 100500117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 AAGTACCCAGGATCACAGGTGCATGCTACCACGCCCAGCTAATTTTCTAGTTTTTTGTAG 3659

100500118 AGATGGGGTCTTGCTATGCTGTGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCCTCCCA 100500177
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 AGATGGGGTCTTGCTATACTGTGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCCTCCCA 3719

100500178 TCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACCATGCCTGGCCGAAGAAAG 100500237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACCATGCCTGGCCGAAGAAAG 3779

100500238 TCATTCTTTCATATTCTTTAACATCCTAACCTTTCTCATCTTTGCCTCTTGATATTGGGT 100500297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TCATTCTTTCATATTCTTTAACATCCTAACCTTTCTCATCTTTGCCTCTTGATATTGGGT 3839

100500298 ATATCTTGCTTTTGTGGTCTGTAGCCCACACTATTCACTGCTTTCAAAGAAGAGGAAAAG 100500357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 ATATCTTGCTTTTGTGGTCTGTAGCCCACACTATTCACTGCTTTCAAAGAAGAGGAAAAG 3899

100500358 AGGTAGGTTAGTCACTTAAAGTTTAGCCACTCTAGAAGAAACAATCACAGAAACTTATAC 100500417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 AGGTAGGTTAGTCACTTAAAGTTTAGCCACTCTAGAAGAAACAATCACAGAAACTTATAC 3959

100500418 TTTGTTTTTTCCAATGCTAGATTTGCTCTAGAGATAAAATACTTGTTAACATGGTGTAGG 100500477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 TTTGTTTTTTCCAATGCTAGATTTGCTCTAGAGATAAAATACTTGTTAACATGGTGTAGG 4019

100500478 TATATGGAAAGATGAGTGATAAGAAGACTGACCTGTTCTATTGTCCTTTCCTGAATGTGA 100500537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 TATATGGAAAGATGAGTGATAAGAAGACTGACCTGTTCTATTGTCCTTTCCTGAATGTGA 4079

100500538 ATATAATGATTAAATGATTACCTCTGTCCAAAAAGATAAGGTTACAAAGCAGAAATGGCT 100500597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 ATATAATGATTAAATGATTACCTCTGTCCAAAAAGATAAGGTTACAAAGCAGAAATGGCT 4139

100500598 AGAATATTGGAGAAACATGTCTACCATGAAAATATTTTGAGGGGGAAGAGGCTCAATATA 100500657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 AGAATATTGGAGAAACATGTCTACCATGAAAATATTTTGAGGGGGAAGAGGCTCAATATA 4199

100500658 CAACACAGAATAGTTTTGAGCAGAATACTGTACATTGGATATCTTAAGAGAGATGATTCT 100500717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 CAACACAGAATAGTTTTGAGCAGAATACTGTACATTGGATATCTTAAGAGAGATGATTCT 4259

100500718 AGTACAAGAAAAACTATCAGTAGTTGTAAAATGAATTAGAGAAACAGCAAAATAAATCTT 100500777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 AGTACAAGAAAAACTATCAGTAGTTGTAAAATGAATTAGAGAAACAGCAAAATAAATCTT 4319

100500778 CAAACAATAAAATGTATTCTTTAGACTCTAAAATGTAGCTTTAATAAATGATTATTTATC 100500837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 CAAACAATAAAATGTATTCTTTAGACTCTAAAATGTAGCTTTAATAAATGATTATTTATC 4379

100500838 ATTAATAATCATTTATTATTTATTAATCATTTATTATGGTTACAGAAAAAATAGAAAGGC 100500897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 ATTAATAATCATTTATTATTTATTAATCATTTATTATGGTTACAGAAAAAATAGAAAGGC 4439

100500898 ACTCTAAGGGGAAAACACTAAATCTAGATTTTCTGACGAGATTCATAATGACCTATAGAA 100500957
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 ACTTTAAGGGGAAAACACTAAATCTAGATTTTCTGACGAGATTCATAATGACCTATAGAA 4499

100500958 ATACACATTATTGGCTATTTTTCACTTTATTGAGTTTTTTTTGTTCTTTTCCTATCTATA 100501017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 ATACACATTATTGGCTATTTTTCACTTTATTGAGTTTTTTTTGTTCTTTTCCTATCTATA 4559

100501018 TTCCTATTTTCTTATCAATGACAGTGCCCTTTCTCCTCTTTATAAATAATTCTTTGTTGT 100501077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 TTCCTATTTTCTTATCAATGACAGTGCCCTTTCTCCTCTTTATAAATAATTCTTTGTTGT 4619

100501078 TGTTAACCCCTGAGGAGGCACTTTAAAAGACAATGATGGGAACCAAATGATGTGTGGTTA 100501137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 TGTTAACCCCTGAGGAGGCACTTTAAAAGACAATGATGGGAACCAAATGATGTGTGGTTA 4679

100501138 AGGTGTCTAAATAACATTTTTTTAAGTGTAATTAGCTCCCTTTCTGAACTATGTAGCACA 100501197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 AGGTGTCTAAATAACATTTTTTTAAGTGTAATTAGCTCCCTTTCTGAACTATGTAGCACA 4739

100501198 GTCTGAAGGAAGGAGGTTGATGGGGAGGGGCAAGTTCTTACTTGTCTGGAACAGATATAT 100501257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 GTCTGAAGGAAGGAGGTTGATGGGGAGGGGCAAGTTCTTACTTGTCTGGAACAGATATAT 4799

100501258 ACAGAAAGATGTATATATTCTCTTCTCCAACCCACCCCCGCCACAAAATCACTCCAATTA 100501317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 ACAGAAAGATGTATATATTCTCTTCTCCAACCCACCCCCGCCACAAAATCACTCCAATTA 4859

100501318 TGCCAGTTGTAGATTTATTTAATTTAACAAGCTCCCACATTCAGAGATGCCAAAAACCCT 100501377
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4860 TGCCAGTTGTAGATTTATTTAATTTAACAAGCTCCCACACTCAGAGATGCCAAAAACCCT 4919

100501378 AGAATAATTATTCCCATCAATCACTTGTAGGTAAGTTTTAATTGCTTTGGGCGTATCTAT 100501437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 AGAATAATTATTCCCATCAATCACTTGTAGGTAAGTTTTAATTGCTTTGGGCGTATCTAT 4979

100501438 TATTAGTTGAGATGTTTTACAAACCAGTTTTATGTAGGCAGCACAATATTTTTACAAGAA 100501497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 TATTAGTTGAGATGTTTTACAAACCAGTTTTATGTAGGCAGCACAATATTTTTACAAGAA 5039

100501498 AACCAAACAAAGCCTTTGGGCATGTATTCTCCAGTTCAACAAAAGCCCCACCATTCTTTA 100501557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 AACCAAACAAAGCCTTTGGGCATGTATTCTCCAGTTCAACAAAAGCCCCACCATTCTTTA 5099

100501558 GTGTCTGATACTCACCTCTTTTAACCATTATGCCTAATTGGTCTCTCATGGCAGGTGTCA 100501617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 GTGTCTGATACTCACCTCTTTTAACCATTATGCCTAATTGGTCTCTCATGGCAGGTGTCA 5159

100501618 TGCCCTGTTTGAAGAATATTTTGCCCTGTTTGGAGAATAAAGCTAAGTTGGGCAGAGCCT 100501677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 TGCCCTGTTTGAAGAATATTTTGCCCTGTTTGGAGAATAAAGCTAAGTTGGGCAGAGCCT 5219

100501678 GATATTTGAGGAGGGTAAGGTTAGGTGAGTGGTCATGAGTATACAACATAAAATACCAAA 100501737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 GATATTTGAGGAGGGTAAGGTTAGGTGAGTGGTCATGAGTATACAACATAAAATACCAAA 5279

100501738 AAATGTCAAAAAATATAAATAGAAGATGGGATGGAAAGGGATCAGTAAAAGACTTTACTG 100501797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 AAATGTCAAAAAATATAAATAGAAGATGGGATGGAAAGGGATCAGTAAAAGACTTTACTG 5339

100501798 ACAATGTAATACTTTTGCCTACTTCAAAGCTGATCATATCATTCCTGCTTTTGTTGTCAA 100501857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 ACAATGTAATACTTTTGCCTACTTCAAAGCTGATCATATCATTCCTGCTTTTGTTGTCAA 5399

100501858 ATGTATGATACTCAGGCAAGTCTGGAATACGAAAAACTTCAGGCTACCCTAGTTGAGACT 100501917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 ATGTATGATACTCAGGCAAGTCTGGAATACGAAAAACTTCAGGCTACCCTAGTTGAGACT 5459

100501918 CCTACAGTCATGGTATCCTGAGTTTAACTCAACAGGTCTCCATTTGGTCAACTAACTATC 100501977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 CCTACAGTCATGGTATCCTGAGTTTAACTCAACAGGTCTCCATTTGGTCAACTAACTATC 5519

100501978 CCCAAATTTCCACAGGTAAAGAAGAGAGAAAAGCAGAGAAAGAGGAAAGAAACTGAGGGC 100502037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 CCCAAATTTCCACAGGTAAAGAAGAGAGAAAAGCAGAGAAAGAGGAAAGAAACTGAGGGC 5579

100502038 TACGTTCCAGTTAGTGGCTACTGGTAGGAAAGTTGGACATTTATTCTTTTCTTCCCTTGC 100502097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 TACGTTCCAGTTAGTGGCTACTGGTAGGAAAGTTGGACATTTATTCTTTTCTTCCCTTGC 5639

100502098 CATCTTATTTTGAGAAATCCAAATTCCAAGATGCAATAAATACACATGGGCACACACACA 100502157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 CATCTTATTTTGAGAAATCCAAATTCCAAGATGCAATAAATACACATGGGCACACACACA 5699

100502158 CACTCACACATATAGTGCTCCAAACAAATATGGGTTAGCTAGAGACATATAAGACTGTTA 100502217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 CACTCACACATATAGTGCTCCAAACAAATATGGGTTAGCTAGAGACATATAAGACTGTTA 5759

100502218 ATGAAAATGTTGGAATCAATTTGCATCAGTAATTTTAAGAGAATTCTTGGTTTGTTCGAT 100502277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 ATGAAAATGTTGGAATCAATTTGCATCAGTAATTTTAAGAGAATTCTTGGTTTGTTCGAT 5819

100502278 TCAATTGTTTTGTTCTAAAGTATACCAAAAGGTCTTTTAATTTGAGAATCACATATTTTC 100502337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 TCAATTGTTTTGTTCTAAAGTATACCAAAAGGTCTTTTAATTTGAGAATCACATATTTTC 5879

100502338 ATATCTATACTATCAATAATTTTAACTATAATCCATATTGACTCAATATTACAGATTCAT 100502397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 ATATCTATACTATCAATAATTTTAACTATAATCCATATTGACTCAATATTACAGATTCAT 5939

100502398 GAAATCTACAGAATAACATATGTCACAAATAAATATATATCATTGAGAAAATAGCACGAT 100502457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 GAAATCTACAGAATAACATATGTCACAAATAAATATATATCATTGAGAAAATAGCACGAT 5999

100502458 TTAGGAAATATTTCTCCAAATTGTGTTCCATGGAGTATTGTTCCATGGAATGAATGATAA 100502517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 TTAGGAAATATTTCTCCAAATTGTGTTCCATGGAGTATTGTTCCATGGAATGAATGATAA 6059

100502518 CTTATGTTACACATACACACACACACATACAT 100502549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 CTTATGTTACACATACACACACACACATACAT 6091

EXCISED REGION

100502550 ACACACACACACACACACACACACACTTTAATGATTAAACAGGACTGGCTACATAATTTT 100502609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6094 ACACACACACACACACACACACACACTTTAATGATTAAACAGGACTGGCTACATAATTTT 6153

100502610 CAGGTCCCCATGAAAAATGAAACTATGAGTCCCCTCGTTAAAACATTATTATGAATTTCA 100502669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6154 CAGGTCCCCATGAAAAATGAAACTATGAGTCCCCTCGTTAAAACATTATTATGAATTTCA 6213

100502670 AGATGGTGACTGCAGAGAATGAAACCAAGAATGGGTCTCTTCTTTTTTTTCCTTTTCTTT 100502729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     6214 AGATGGTGACTGCAGAGAATGAAACCAAGAATGGGTCTCTTCTTTTTTTTTCTTTTCTTT 6273

100502730 TCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTAGTGG 100502789
          ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6274 TC--TTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTAGTGG 6331

100502790 CATGATCTCAGCTCACTGCAACCTTCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGC 100502849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6332 CATGATCTCAGCTCACTGCAACCTTCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGC 6391

100502850 CTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCGGCTGCCACCACGTCTGGCTAATTTTTGTATTTTT 100502909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6392 CTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCGGCTGCCACCACGTCTGGCTAATTTTTGTATTTTT 6451

100502910 AATAGAGTCGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCAAATTCCTGACCTCGTGATC 100502969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6452 AATAGAGTCGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCAAATTCCTGACCTCGTGATC 6511

100502970 CGCCTACCTAGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTACAGGCCTGAGCCACCACGCCCAGCCAA 100503029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6512 CGCCTACCTAGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTACAGGCCTGAGCCACCACGCCCAGCCAA 6571

100503030 GAATGGGTCTCTTCTAAGCATGGGCCCTATGTGACTGCACAGGCTGCACACCCTTGAAAC 100503089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6572 GAATGGGTCTCTTCTAAGCATGGGCCCTATGTGACTGCACAGGCTGCACACCCTTGAAAC 6631

100503090 TAGCCTCGGTTAAATTGTTTAAGAAATGCTGGGTTAAAAAATGTCTAACAGATTTCTTTG 100503149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6632 TAGCCTCGGTTAAATTGTTTAAGAAATGCTGGGTTAAAAAATGTCTAACAGATTTCTTTG 6691

100503150 CAACAAGACTTCTTATAGCCTTTTATATACTAATGTGCACTGTGAACCTTCAGGAGGTTC 100503209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6692 CAACAAGACTTCTTATAGCCTTTTATATACTAATGTGCACTGTGAACCTTCAGGAGGTTC 6751

100503210 ACATACTGTATAAAGGTCCTCAAATATATTTGACCAAAGCTCTTTTCAATTATTATTTTA 100503269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6752 ACATACTGTATAAAGGTCCTCAAATATATTTGACCAAAGCTCTTTTCAATTATTATTTTA 6811

100503270 GAAGGATCATCTTGTAGGACCAATGTTCCACAGAACACACATTGTAAAAGGCAGCTCAGG 100503329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6812 GAAGGATCATCTTGTAGGACCAATGTTCCACAGAACACACATTGTAAAAGGCAGCTCAGG 6871

100503330 CTGTGCAAACAGGTTATAAAATCAATTTGTTAGTCATAAATCACTATATATTTCCCATTT 100503389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6872 CTGTGCAAACAGGTTATAAAATCAATTTGTTAGTCATAAATCACTATATATTTCCCATTT 6931

100503390 TGTGGCATTTTCCCCATATTTGGAATGAGGTAACTAGAGATAACTATAGATGCAAATGGT 100503449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6932 TGTGGCATTTTCCCCATATTTGGAATGAGGTAACTAGAGATAACTATAGATGCAAATGGT 6991

100503450 GTGTATTCACTAAATATACTGTCCTTCACTATTTGGTCTTCTACCATTTGGATAGTCAAC 100503509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6992 GTGTATTCACTAAATATACTGTCCTTCACTATTTGGTCTTCTACCATTTGGATAGTCAAC 7051

100503510 TCAGTGGCCAAACATCACAAACGTTTTCTGGGCCAGGGTACTAGAGATGGTCTGATTGAG 100503569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7052 TCAGTGGCCAAACATCACAAACGTTTTCTGGGCCAGGGTACTAGAGATGGTCTGATTGAG 7111

100503570 ACTGTATCACAAGCCAACTTATTTTTCCCCTTTATTTTGTCAATTCAGAGGAAGTAACAT 100503629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7112 ACTGTATCACAAGCCAACTTATTTTTCCCCTTTATTTTGTCAATTCAGAGGAAGTAACAT 7171

100503630 CCTTACTTACCATTACCCAGTTCCCAAGAAATGTTGTACTTTTTGCTGGCGCTGTACTTC 100503689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7172 CCTTACTTACCATTACCCAGTTCCCAAGAAATGTTGTACTTTTTGCTGGCGCTGTACTTC 7231

100503690 AACAGACTCAGGGCACTAGAACTGTTCCAGGAGTTATTGGGATTACGACGCAGTGCATTT 100503749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7232 AACAGACTCAGGGCACTAGAACTGTTCCAGGAGTTATTGGGATTACGACGCAGTGCATTT 7291

100503750 AGAGCAAATATCAGGTGGAGTCCAGAGCAATCAGCAAAGTTATAAAGTTTGTCTAGAGAC 100503809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7292 AGAGCAAATATCAGGTGGAGTCCAGAGCAATCAGCAAAGTTATAAAGTTTGTCTAGAGAC 7351

100503810 CTGGCTGGGAAGAAGCAGAGAAAGGCTTGTAACTTTCAAATCAACATTCCAACAAAA 100503866
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7352 CTGGCTGGGAAGAAGCAGAGAAAGGCTTGTAACTTTCAAATCAACATTCCAACAAAA 7408

Alignment time is 5.83211 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     3056] =>      3056 nucs 'mol-32-29b3-063622_3056'

Score:        2790
Aligned:      2858        nucs
Identic:      2851 (100%) nucs =>        12 (100%)      2839 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100492288,100492299] EXCISED REGION [100495008,100497851]
 second seq =>  [       99,      110] EXCISED REGION [      211,     3056]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2708 nucs [100492300,100495007]
 second seq =>       100 nucs [111,210]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100492299,100492299] to [100495007,100495007]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100492288 GGAAAAAATGGT 100492299
          ||||||||||||
       99 GGAAAAAATGGT 110

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      211 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGC 270

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      271 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 330

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      331 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 390

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      391 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 450

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      451 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 510

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      511 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 570

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      571 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 630

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      631 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 690

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      691 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 750

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      751 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 810

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      811 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 870

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      871 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 930

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      931 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 990

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      991 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 1050

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1051 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 1110

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1111 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 1170

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1171 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 1230

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1231 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 1290

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1291 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 1350

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1351 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 1410

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 1470

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 1530

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 1590

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 1650

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 1710

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 1770

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 1830

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 1890

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 1950

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 2010

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 2070

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 2130

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 2190

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2191 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 2250

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 2310

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2311 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 2370

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 2430

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 100497285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 2490

100497286 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 100497345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 2550

100497346 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 100497405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 2610

100497406 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 100497465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 2670

100497466 TAAACTCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 100497525
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 TAAACTCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 2730

100497526 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 100497585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 2790

100497586 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 100497645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2791 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 2850

100497646 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 100497705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 2910

100497706 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 100497765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 2970

100497766 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 100497825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 3030

100497826 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTA 100497851
          ||||||||||||||||||||||||||
     3031 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTA 3056

Alignment time is 2.57119 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     2216] =>      2216 nucs 'mol-32-29df-001582_2216'

Score:        2157
Aligned:      2201        nucs
Identic:      2197 (100%) nucs =>        12 (100%)      2185 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100493522,100493533] EXCISED REGION [100496108,100498296]
 second seq =>  [        9,       20] EXCISED REGION [       28,     2216]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2574 nucs [100493534,100496107]
 second seq =>         7 nucs [21,27]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [19,21] to [26,28]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100493533,100493533] to [100496108,100496108]
 second seq =>         1 nucs [20,20] to [28,28]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [21,21] to [27,27]

100493522 ACTAAGTCTTTG 100493533
          ||||||||||||
        9 ACTAAGTCTTTG 20

EXCISED REGION

100496108 GTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATACAGCAGCTGTCCCACAAATGTTT 100496167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       28 GTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATACAGCAGCTGTCCCACAAATGTTT 87

100496168 TCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTAGTGAGAGAACATGATTCTCCAC 100496227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       88 TCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTAGTGAGAGAACATGATTCTCCAC 147

100496228 CATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACTTCACTCACTTCCCTTAATAATC 100496287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      148 CATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACTTCACTCACTTCCCTTAATAATC 207

100496288 AAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTATGAATTTATGAATACATTTGTG 100496347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      208 AAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTATGAATTTATGAATACATTTGTG 267

100496348 CATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTTTAACAATTTTCCTGATTCAGTT 100496407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      268 CATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTTTAACAATTTTCCTGATTCAGTT 327

100496408 CTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTCTAGCATATAAGAGTTTAATAGT 100496467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      328 CTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTCTAGCATATAAGAGTTTAATAGT 387

100496468 TTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGATACTAAACTCCTGGAGACTAGAA 100496527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      388 TTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGATACTAAACTCCTGGAGACTAGAA 447

100496528 TTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATGTTATGCCAAGCTATAAAGTAGT 100496587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      448 TTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATGTTATGCCAAGCTATAAAGTAGT 507

100496588 GGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCATTTCACACTTGGCATATTTTGCA 100496647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      508 GGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCATTTCACACTTGGCATATTTTGCA 567

100496648 GGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTAAATACCATGAGAGTATGTTTCT 100496707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      568 GGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTAAATACCATGAGAGTATGTTTCT 627

100496708 GGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAGGTTGAAGGAGAGAAGCAGACAG 100496767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      628 GGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAGGTTGAAGGAGAGAAGCAGACAG 687

100496768 GAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTATATGGTTTCTTGTTTTTTTCTT 100496827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      688 GAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTATATGGTTTCTTGTTTTTTTCTT 747

100496828 CCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAAACTCTATGTTCTGAAAATACAG 100496887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      748 CCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAAACTCTATGTTCTGAAAATACAG 807

100496888 TTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAATAATTGACAATATGTGTGAAGAC 100496947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      808 TTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAATAATTGACAATATGTGTGAAGAC 867

100496948 TGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATATACACATAAAAATACAGGACCAA 100497007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      868 TGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATATACACATAAAAATACAGGACCAA 927

100497008 AATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGAACATAAATGCAATTCCCTGGCA 100497067
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      928 AATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGAACATAAATGCAATTCCCTGGCA 987

100497068 AGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAAGACCAACACAGAAGGAA 100497127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      988 AGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAAGACCAACACAGAAGGCA 1047

100497128 GGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCATCTCATTGGGACTGGTTAGACAG 100497187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1048 GGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCATCTCATTGGGACTGGTTAGACAG 1107

100497188 TGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCACTATCCATCACAGCATAGTCCCT 100497247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1108 TGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCACTATCCATCACAGCATAGTCCCT 1167

100497248 CATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACCCCTTGCACTTCCTGGGTGAGGT 100497307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1168 CATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACCCCTTGCACTTCCTGGGTGAGGT 1227

100497308 GATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAGCCCCAAAACTCCTTAAGCTGAT 100497367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1228 GATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAGCCCCAAAACTCCTTAAGCTGAT 1287

100497368 AGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGTGCAAAAATCACAAGCATTCCTA 100497427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 AGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGTGCAAAAATCACAAGCATTCCTA 1347

100497428 TACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAGTAAACTCCCATTCACAATTGCT 100497487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1348 TACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAGTAAACTCCCATTTACAATTGCT 1407

100497488 ACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATGTGAAGGACTTCTTCCAG 100497547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 ACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATGTGAAGGACTTCTTCCAG 1467

100497548 GAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAGTGGAAAAACCTT 100497607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 GAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAGTGGAAAAACCTT 1527

100497608 CCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCCAAAGTAATT 100497667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 CCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCCAAAGTAATT 1587

100497668 TATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGACTTTCTTCACAGAAGTAGAAAAA 100497727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 TATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGACTTTCTTCACAGAAGTAGAAAAA 1647

100497728 ACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAAGAGCCCATATAGTCAAGACAAT 100497787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 ACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAAGAGCCCATATAGTCAAGACAAT 1707

100497788 CTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACCTGACTTCAAACTATACTACAAG 100497847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 CTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACCTGACTTCAAACTATACTACAAG 1767

100497848 GCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAACAGATATATAGACCAATGGAAC 100497907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 GCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAACAGATATATAGACCAATGGAAC 1827

100497908 AGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAACCATCTGTTCTTTGATAAACCT 100497967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 AGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAACCATCTGTTCTTTGATAAACCT 1887

100497968 GACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGTTGGGATAATTGG 100498027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 GACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGTTGGGATAATTGG 1947

100498028 CTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAAAAATTAACTCAAGA 100498087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 CTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAAAAATTAACTCAAGA 2007

100498088 TGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAAAACCCTAGAAGAAAACCTAGGC 100498147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 TGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAAAACCCTAGAAGAAAACCTAGGC 2067

100498148 AATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCATGTCTAAAACACCAAAATCAATT 100498207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 AATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCATGTCTAAAACACCAAAATCAATT 2127

100498208 GCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCA 100498267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 GCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCA 2187

100498268 AAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCA 100498296
          |||||||||||||||||||||||||||||
     2188 AAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCA 2216

Alignment time is 1.59936 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     3264] =>      3264 nucs 'mol-32-2af2-015482_3264'

Score:        2629
Aligned:      2697        nucs
Identic:      2690 (100%) nucs =>        21 (100%)      2669 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100493138,100493158] EXCISED REGION [100495008,100497681]
 second seq =>  [      174,      194] EXCISED REGION [      589,     3264]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1849 nucs [100493159,100495007]
 second seq =>       394 nucs [195,588]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [100493157,100493158] to [100495008,100495009]
 second seq =>         2 nucs [193,194] to [589,590]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100493138 CAAAGTGCTGGGATTACAGGC 100493158
          |||||||||||||||||||||
      174 CAAAGTGCTGGGATTACAGGC 194

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      589 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 648

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      649 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 708

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      709 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 768

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 828

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      829 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 888

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 948

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1008

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 GAGATATGGAATCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 1068

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 1128

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 1188

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 1248

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 1308

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 1368

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 1428

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 1488

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 1548

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 1608

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 1668

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 1728

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 1788

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 1848

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 1908

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 1968

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 2028

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 2088

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 2148

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 2208

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 2268

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 2328

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 2388

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 2448

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 2508

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 2568

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2569 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 2628

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 2688

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2689 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 2748

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 2808

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 100497285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 2868

100497286 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 100497345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 2928

100497346 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 100497405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 2988

100497406 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 100497465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 3048

100497466 TAAACTCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 100497525
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 TAAACTCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 3108

100497526 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 100497585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 3168

100497586 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 100497645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 3228

100497646 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGC 100497681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGC 3264

Alignment time is 2.35243 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     7534] =>      7534 nucs 'mol-32-2b13-100037_7534'

Score:        7407
Aligned:      7532        nucs
Identic:      7519 (100%) nucs =>      6396 (100%)      1123 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100496341,100502747] EXCISED REGION [100502754,100503876]
 second seq =>  [        1,     6407] EXCISED REGION [     6412,     7534]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [100502748,100502753]
 second seq =>         4 nucs [6408,6411]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100502748,100502748] to [100502754,100502754]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100502747,100502747] to [100502754,100502754]
 second seq =>         1 nucs [6407,6407] to [6412,6412]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [6408,6408] to [6411,6411]

100496341 ATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTTTAACAATTTTCCTGA 100496400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTTTAACAATTTTCCTGA 60

100496401 TTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTCTAGCATATAAGAGTT 100496460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTCTAGCATATAAGAGTT 120

100496461 TAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGATACTAAACTCCTGGAG 100496520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGATACTAAACTCCTGGAG 180

100496521 ACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATGTTATGCCAAGCTATA 100496580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATGTTATGCCAAGCTATA 240

100496581 AAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCATTTCACACTTGGCATA 100496640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCATTTCACACTTGGCATA 300

100496641 TTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTAAATACCATGAGAGTA 100496700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTAAATACCATGAGAGTA 360

100496701 TGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAGGTTGAAGGAGAGAAG 100496760
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTCTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAGGTTGAAGGAGAGAAG 420

100496761 CAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTATATGGTTTCTTGTTT 100496820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTATATGGTTTCTTGTTT 480

100496821 TTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAAACTCTATGTTCTGAA 100496880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAAACTCTATGTTCTGAA 540

100496881 AATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAATAATTGACAATATGTG 100496940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAATAATTGACAATATGTG 600

100496941 TGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATATACACATAAAAATACA 100497000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATATACACATAAAAATACA 660

100497001 GGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGAACATAAATGCAATTC 100497060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      661 GGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGAACATAAATGCAATTC 720

100497061 CCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAAGACCAACACA 100497120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAAGACCAACACA 780

100497121 GAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCATCTCATTGGGACTGGT 100497180
          |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      781 GAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCATCTCATTGGGACTGGT 840

100497181 TAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCACTATCCATCACAGCAT 100497240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCACTATCCATCACAGCAT 900

100497241 AGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACCCCTTGCACTTCCTGG 100497300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACCCCTTGCACTTCCTGG 960

100497301 GTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAGCCCCAAAACTCCTTA 100497360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAGCCCCAAAACTCCTTA 1020

100497361 AGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGTGCAAAAATCACAAGC 100497420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGTGCAAAAATCACAAGC 1080

100497421 ATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAGTAAACTCCCATTCAC 100497480
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1081 ATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAGTAAACTCCCATTTAC 1140

100497481 AATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATGTGAAGGACTT 100497540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATGTGAAGGACTT 1200

100497541 CTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAGTGGAA 100497600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAGTGGAA 1260

100497601 AAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCCAA 100497660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCCAA 1320

100497661 AGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGACTTTCTTCACAGAAGT 100497720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGACTTTCTTCACAGAAGT 1380

100497721 AGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAAGAGCCCATATAGTCA 100497780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAAGAGCCCATATAGTCA 1440

100497781 AGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACCTGACTTCAAACTATA 100497840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACCTGACTTCAAACTATA 1500

100497841 CTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAACAGATATATAGACCA 100497900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAACAGATATATAGACCA 1560

100497901 ATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAACCATCTGTTCTTTGA 100497960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAACCATCTGTTCTTTGA 1620

100497961 TAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGTTGGGA 100498020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGTTGGGA 1680

100498021 TAATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAAAAATTAA 100498080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAAAAATTAA 1740

100498081 CTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAAAACCCTAGAAGAAAA 100498140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAAAACCCTAGAAGAAAA 1800

100498141 CCTAGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCATGTCTAAAACACCAAA 100498200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCTAGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCATGTCTAAAACACCAAA 1860

100498201 ATCAATTGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTG 100498260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATCAATTGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTG 1920

100498261 CACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGAGAGAAAATTTT 100498320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGAGAGAAAATTTT 1980

100498321 TGCAATCTATCCATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAAAGAACTTAAACAAAT 100498380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGCAATCTATCCATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAAAGAACTTAAACAAAT 2040

100498381 TTACAAGAAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTTTCAA 100498440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTACAAGAAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTTTCAA 2100

100498441 AAGAAGACATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCATCATCAGTGGTCATTA 100498500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGAAGACATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCATCATCAGTGGTCATTA 2160

100498501 GAGAAATGCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAGTTAGAATTATGATCA 100498560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAGAAATGCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAGTTAGAATTATGATCA 2220

100498561 TTAAAAAGTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAATAGGAATGCTTTTAC 100498620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTAAAAAGTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAATAGGAATGCTTTTAC 2280

100498621 ACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCA 100498680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCA 2340

100498681 AGGATCTAGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGATATGTACCCAA 100498740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGGATCTAGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGATATGTACCCAA 2400

100498741 AGGATTATAAACCATTCTTCCATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCAGCACTAT 100498800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGGATTATAAACCATTCTTCCATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCAGCACTAT 2460

100498801 TCACAATAGCAAAAACTTGGAACGAACCCAAATGCCCGTCAGTGATAGACTAGAAAAAGA 100498860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCACAATAGCAAAAACTTGGAACGAACCCAAATGCCCGTCAGTGATAGACTAGAAAAAGA 2520

100498861 GAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAAGAATGAGTTCATGT 100498920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAAGAATGAGTTCATGT 2580

100498921 CCTTTGCAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAGCAAACTAACACAGGAAC 100498980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCTTTGCAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAGCAAACTAACACAGGAAC 2640

100498981 AGAAAATCAAACACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGGTGAATAATGAGAACATATG 100499040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGAAAATCAAACACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGGTGAATAATGAGAACATATG 2700

100499041 GGCACAGGGAGGGAAACATCACACACTGTGGTCTGTCGTGGGGAGTGGGGTAGGGGAGCG 100499100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGCACAGGGAGGGAAACATCACACACTGTGGTCTGTCGTGGGGAGTGGGGTAGGGGAGCG 2760

100499101 ATATCATTAGGACAAATACCTAGTGTAGATGACAGGTTGATGGGTACAGCAAACCACCAT 100499160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATATCATTAGGACAAATACCTAGTGTAGATGACAGGTTGATGGGTACAGCAAACCACCAT 2820

100499161 GGCACATGTATACCTATATAACAAGCCTGCCCATTCTGCACATGTAAAAAAAAAAAGAAG 100499220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGCACATGTATACCTATATAACAAGCCTGCCCATTCTGCACATGTAAAAAAAAAAAGAAG 2880

100499221 AAGAAAAAAAGAAAAAAAAGTACATAAATACATCATACATTTATCCACCTAAACTCAGGC 100499280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAGAAAAAAAGAAAAAAAAGTACATAAATACATCATACATTTATCCACCTAAACTCAGGC 2940

100499281 TAAAAGCTTAATAAATATTGAGGGAATGCATTAATCAAGCTGTGCTGCCAGAATCATAAG 100499340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAAAAGCTTAATAAATATTGAGGGAATGCATTAATCAAGCTGTGCTGCCAGAATCATAAG 3000

100499341 AATCATCATCTCTGACTTTCTAAGGTCAGAAACTTGATTTTACAAAATTACTTAGTAGAC 100499400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AATCATCATCTCTGACTTTCTAAGGTCAGAAACTTGATTTTACAAAATTACTTAGTAGAC 3060

100499401 AGGCTCCAGAGAACTGAGTCATATAACTAATTCTTATAAAAGAATAACATGTGAATGTAT 100499460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGGCTCCAGAGAACTGAGTCATATAACTAATTCTTATAAAAGAATAACATGTGAATGTAT 3120

100499461 ATAGGTCAGGTTATGGGTATGAATATATAATATTGATTCAATAATTAATTATAGTAGCTT 100499520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATAGGTCAGGTTATGGGTATGAATATATAATATTGATTCAATAATTAATTATAGTAGCTT 3180

100499521 TTACTTGCTTATAGAAATGGGCAGATATATTTGGGAAGCACATTTATAGTTCATAATGTA 100499580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTACTTGCTTATAGAAATGGGCAGATATATTTGGGAAGCACATTTATAGTTCATAATGTA 3240

100499581 GTTCAGTGTTCATTCAATTAGAGGTATTACATTATCTTAAGGTAATTTTTGTGATTAAGT 100499640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTTCAGTGTTCATTCAATTAGAGGTATTACATTATCTTAAGGTAATTTTTGTGATTAAGT 3300

100499641 ATAGCTCTCTAGAGAACAAACACCATTTCCCTGAAATGGAGTTGGACTAGAATTTATATA 100499700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATAGCTCTCTAGAGAACAAACACCATTTCCCTGAAATGGAGTTGGACTAGAATTTATATA 3360

100499701 CACTTCCAGAGTTTGAGTCCCAGCTTCAAAAATTTCTCCAGTTCTTTCTTACTTTAGATT 100499760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CACTTCCAGAGTTTGAGTCCCAGCTTCAAAAATTTCTCCAGTTCTTTCTTACTTTAGATT 3420

100499761 CACCAATGGTTAATATAAATGTAAAAATCTGTAATCATTACATTAATCAGTTACAGAGTT 100499820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CACCAATGGTTAATATAAATGTAAAAATCTGTAATCATTACATTAATCAGTTACAGAGTT 3480

100499821 TACAATTTATGGACATTTAGGGAAATATGTTATATCCAAAGAAAGTAATTGTAAAAAAGT 100499880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TACAATTTATGGACATTTAGGGAAATATGTTATATCCAAAGAAAGTAATTGTAAAAAAGT 3540

100499881 ATGGTGTCAAGAAAGTCATTTTTTTTTGTTTTGCTTTTGATTTTCTTTTCTTTTGTCTTT 100499940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATGGTGTCAAGAAAGTCATTTTTTTTTGTTTTGCTTTTGATTTTCTTTTCTTTTGTCTTT 3600

100499941 TTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACCATGTCACCCAGGTTCAAGAACAGTAGCATGATCA 100500000
          ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTTTTTTT--GAGACAGGGTCTCACCATGTCACCCAGGTTCAAGAACAGTAGCATGATCA 3658

100500001 TGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGACCCTCCAGCCTCAGTCTCCCAAG 100500060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGACCCTCCAGCCTCAGTCTCCCAAG 3718

100500061 TACCCAGGATCACAGGTGCATGCTACCACGCCCAGCTAATTTTCTAGTTTTTTGTAGAGA 100500120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TACCCAGGATCACAGGTGCATGCTACCACGCCCAGCTAATTTTCTAGTTTTTTGTAGAGA 3778

100500121 TGGGGTCTTGCTATGCTGTGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCCTCCCATCT 100500180
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TGGGGTCTTGCTATACTGTGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCCTCCCATCT 3838

100500181 TGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACCATGCCTGGCCGAAGAAAGTCA 100500240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACCATGCCTGGCCGAAGAAAGTCA 3898

100500241 TTCTTTCATATTCTTTAACATCCTAACCTTTCTCATCTTTGCCTCTTGATATTGGGTATA 100500300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TTCTTTCATATTCTTTAACATCCTAACCTTTCTCATCTTTGCCTCTTGATATTGGGTATA 3958

100500301 TCTTGCTTTTGTGGTCTGTAGCCCACACTATTCACTGCTTTCAAAGAAGAGGAAAAGAGG 100500360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TCTTGCTTTTGTGGTCTGTAGCCCACACTATTCACTGCTTTCAAAGAAGAGGAAAAGAGG 4018

100500361 TAGGTTAGTCACTTAAAGTTTAGCCACTCTAGAAGAAACAATCACAGAAACTTATACTTT 100500420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 TAGGTTAGTCACTTAAAGTTTAGCCACTCTAGAAGAAACAATCACAGAAACTTATACTTT 4078

100500421 GTTTTTTCCAATGCTAGATTTGCTCTAGAGATAAAATACTTGTTAACATGGTGTAGGTAT 100500480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 GTTTTTTCCAATGCTAGATTTGCTCTAGAGATAAAATACTTGTTAACATGGTGTAGGTAT 4138

100500481 ATGGAAAGATGAGTGATAAGAAGACTGACCTGTTCTATTGTCCTTTCCTGAATGTGAATA 100500540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 ATGGAAAGATGAGTGATAAGAAGACTGACCTGTTCTATTGTCCTTTCCTGAATGTGAATA 4198

100500541 TAATGATTAAATGATTACCTCTGTCCAAAAAGATAAGGTTACAAAGCAGAAATGGCTAGA 100500600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 TAATGATTAAATGATTACCTCTGTCCAAAAAGATAAGGTTACAAAGCAGAAATGGCTAGA 4258

100500601 ATATTGGAGAAACATGTCTACCATGAAAATATTTTGAGGGGGAAGAGGCTCAATATACAA 100500660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 ATATTGGAGAAACATGTCTACCATGAAAATATTTTGAGGGGGAAGAGGCTCAATATACAA 4318

100500661 CACAGAATAGTTTTGAGCAGAATACTGTACATTGGATATCTTAAGAGAGATGATTCTAGT 100500720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 CACAGAATAGTTTTGAGCAGAATACTGTACATTGGATATCTTAAGAGAGATGATTCTAGT 4378

100500721 ACAAGAAAAACTATCAGTAGTTGTAAAATGAATTAGAGAAACAGCAAAATAAATCTTCAA 100500780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 ACAAGAAAAACTATCAGTAGTTGTAAAATGAATTAGAGAAACAGCAAAATAAATCTTCAA 4438

100500781 ACAATAAAATGTATTCTTTAGACTCTAAAATGTAGCTTTAATAAATGATTATTTATCATT 100500840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 ACAATAAAATGTATTCTTTAGACTCTAAAATGTAGCTTTAATAAATGATTATTTATCATT 4498

100500841 AATAATCATTTATTATTTATTAATCATTTATTATGGTTACAGAAAAAATAGAAAGGCACT 100500900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 AATAATCATTTATTATTTATTAATCATTTATTATGGTTACAGAAAAAATAGAAAGGCACT 4558

100500901 CTAAGGGGAAAACACTAAATCTAGATTTTCTGACGAGATTCATAATGACCTATAGAAATA 100500960
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 TTAAGGGGAAAACACTAAATCTAGATTTTCTGACGAGATTCATAATGACCTATAGAAATA 4618

100500961 CACATTATTGGCTATTTTTCACTTTATTGAGTTTTTTTTGTTCTTTTCCTATCTATATTC 100501020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 CACATTATTGGCTATTTTTCACTTTATTGAGTTTTTTTTGTTCTTTTCCTATCTATATTC 4678

100501021 CTATTTTCTTATCAATGACAGTGCCCTTTCTCCTCTTTATAAATAATTCTTTGTTGTTGT 100501080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 CTATTTTCTTATCAATGACAGTGCCCTTTCTCCTCTTTATAAATAATTCTTTGTTGTTGT 4738

100501081 TAACCCCTGAGGAGGCACTTTAAAAGACAATGATGGGAACCAAATGATGTGTGGTTAAGG 100501140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 TAACCCCTGAGGAGGCACTTTAAAAGACAATGATGGGAACCAAATGATGTGTGGTTAAGG 4798

100501141 TGTCTAAATAACATTTTTTTAAGTGTAATTAGCTCCCTTTCTGAACTATGTAGCACAGTC 100501200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 TGTCTAAATAACATTTTTTTAAGTGTAATTAGCTCCCTTTCTGAACTATGTAGCACAGTC 4858

100501201 TGAAGGAAGGAGGTTGATGGGGAGGGGCAAGTTCTTACTTGTCTGGAACAGATATATACA 100501260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 TGAAGGAAGGAGGTTGATGGGGAGGGGCAAGTTCTTACTTGTCTGGAACAGATATATACA 4918

100501261 GAAAGATGTATATATTCTCTTCTCCAACCCACCCCCGCCACAAAATCACTCCAATTATGC 100501320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 GAAAGATGTATATATTCTCTTCTCCAACCCACCCCCGCCACAAAATCACTCCAATTATGC 4978

100501321 CAGTTGTAGATTTATTTAATTTAACAAGCTCCCACATTCAGAGATGCCAAAAACCCTAGA 100501380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4979 CAGTTGTAGATTTATTTAATTTAACAAGCTCCCACACTCAGAGATGCCAAAAACCCTAGA 5038

100501381 ATAATTATTCCCATCAATCACTTGTAGGTAAGTTTTAATTGCTTTGGGCGTATCTATTAT 100501440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 ATAATTATTCCCATCAATCACTTGTAGGTAAGTTTTAATTGCTTTGGGCGTATCTATTAT 5098

100501441 TAGTTGAGATGTTTTACAAACCAGTTTTATGTAGGCAGCACAATATTTTTACAAGAAAAC 100501500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 TAGTTGAGATGTTTTACAAACCAGTTTTATGTAGGCAGCACAATATTTTTACAAGAAAAC 5158

100501501 CAAACAAAGCCTTTGGGCATGTATTCTCCAGTTCAACAAAAGCCCCACCATTCTTTAGTG 100501560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 CAAACAAAGCCTTTGGGCATGTATTCTCCAGTTCAACAAAAGCCCCACCATTCTTTAGTG 5218

100501561 TCTGATACTCACCTCTTTTAACCATTATGCCTAATTGGTCTCTCATGGCAGGTGTCATGC 100501620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 TCTGATACTCACCTCTTTTAACCATTATGCCTAATTGGTCTCTCATGGCAGGTGTCATGC 5278

100501621 CCTGTTTGAAGAATATTTTGCCCTGTTTGGAGAATAAAGCTAAGTTGGGCAGAGCCTGAT 100501680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 CCTGTTTGAAGAATATTTTGCCCTGTTTGGAGAATAAAGCTAAGTTGGGCAGAGCCTGAT 5338

100501681 ATTTGAGGAGGGTAAGGTTAGGTGAGTGGTCATGAGTATACAACATAAAATACCAAAAAA 100501740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 ATTTGAGGAGGGTAAGGTTAGGTGAGTGGTCATGAGTATACAACATAAAATACCAAAAAA 5398

100501741 TGTCAAAAAATATAAATAGAAGATGGGATGGAAAGGGATCAGTAAAAGACTTTACTGACA 100501800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 TGTCAAAAAATATAAATAGAAGATGGGATGGAAAGGGATCAGTAAAAGACTTTACTGACA 5458

100501801 ATGTAATACTTTTGCCTACTTCAAAGCTGATCATATCATTCCTGCTTTTGTTGTCAAATG 100501860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 ATGTAATACTTTTGCCTACTTCAAAGCTGATCATATCATTCCTGCTTTTGTTGTCAAATG 5518

100501861 TATGATACTCAGGCAAGTCTGGAATACGAAAAACTTCAGGCTACCCTAGTTGAGACTCCT 100501920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 TATGATACTCAGGCAAGTCTGGAATACGAAAAACTTCAGGCTACCCTAGTTGAGACTCCT 5578

100501921 ACAGTCATGGTATCCTGAGTTTAACTCAACAGGTCTCCATTTGGTCAACTAACTATCCCC 100501980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 ACAGTCATGGTATCCTGAGTTTAACTCAACAGGTCTCCATTTGGTCAACTAACTATCCCC 5638

100501981 AAATTTCCACAGGTAAAGAAGAGAGAAAAGCAGAGAAAGAGGAAAGAAACTGAGGGCTAC 100502040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 AAATTTCCACAGGTAAAGAAGAGAGAAAAGCAGAGAAAGAGGAAAGAAACTGAGGGCTAC 5698

100502041 GTTCCAGTTAGTGGCTACTGGTAGGAAAGTTGGACATTTATTCTTTTCTTCCCTTGCCAT 100502100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 GTTCCAGTTAGTGGCTACTGGTAGGAAAGTTGGACATTTATTCTTTTCTTCCCTTGCCAT 5758

100502101 CTTATTTTGAGAAATCCAAATTCCAAGATGCAATAAATACACATGGGCACACACACACAC 100502160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 CTTATTTTGAGAAATCCAAATTCCAAGATGCAATAAATACACATGGGCACACACACACAC 5818

100502161 TCACACATATAGTGCTCCAAACAAATATGGGTTAGCTAGAGACATATAAGACTGTTAATG 100502220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 TCACACATATAGTGCTCCAAACAAATATGGGTTAGCTAGAGACATATAAGACTGTTAATG 5878

100502221 AAAATGTTGGAATCAATTTGCATCAGTAATTTTAAGAGAATTCTTGGTTTGTTCGATTCA 100502280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 AAAATGTTGGAATCAATTTGCATCAGTAATTTTAAGAGAATTCTTGGTTTGTTCGATTCA 5938

100502281 ATTGTTTTGTTCTAAAGTATACCAAAAGGTCTTTTAATTTGAGAATCACATATTTTCATA 100502340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 ATTGTTTTGTTCTAAAGTATACCAAAAGGTCTTTTAATTTGAGAATCACATATTTTCATA 5998

100502341 TCTATACTATCAATAATTTTAACTATAATCCATATTGACTCAATATTACAGATTCATGAA 100502400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 TCTATACTATCAATAATTTTAACTATAATCCATATTGACTCAATATTACAGATTCATGAA 6058

100502401 ATCTACAGAATAACATATGTCACAAATAAATATATATCATTGAGAAAATAGCACGATTTA 100502460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 ATCTACAGAATAACATATGTCACAAATAAATATATATCATTGAGAAAATAGCACGATTTA 6118

100502461 GGAAATATTTCTCCAAATTGTGTTCCATGGAGTATTGTTCCATGGAATGAATGATAACTT 100502520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 GGAAATATTTCTCCAAATTGTGTTCCATGGAGTATTGTTCCATGGAATGAATGATAACTT 6178

100502521 ATGTTACACATACACACACACACATACATACACACACACACACACACACACACAC--TTT 100502578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
     6179 ATGTTACACATACACACACACACATACATACACACACACACACACACACACACACACTTT 6238

100502579 AATGATTAAACAGGACTGGCTACATAATTTTCAGGTCCCCATGAAAAATGAAACTATGAG 100502638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 AATGATTAAACAGGACTGGCTACATAATTTTCAGGTCCCCATGAAAAATGAAACTATGAG 6298

100502639 TCCCCTCGTTAAAACATTATTATGAATTTCAAGATGGTGACTGCAGAGAATGAAACCAAG 100502698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 TCCCCTCGTTAAAACATTATTATGAATTTCAAGATGGTGACTGCAGAGAATGAAACCAAG 6358

100502699 AATGGGTCTCTTCTTTTTTTTCCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTT 100502747
          |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6359 AATGGGTCTCTTCTTTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTT 6407

EXCISED REGION

100502754 TGGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACCT 100502813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6412 TGGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACCT 6471

100502814 TCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGG 100502873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6472 TCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGG 6531

100502874 CGGCTGCCACCACGTCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGTCGGGGTTTCACCATGT 100502933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6532 CGGCTGCCACCACGTCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGTCGGGGTTTCACCATGT 6591

100502934 TGGCCAGGCTGGTATCAAATTCCTGACCTCGTGATCCGCCTACCTAGGCCTCCCAAAGTG 100502993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6592 TGGCCAGGCTGGTATCAAATTCCTGACCTCGTGATCCGCCTACCTAGGCCTCCCAAAGTG 6651

100502994 CTGGTATTACAGGCCTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGAATGGGTCTCTTCTAAGCATGGG 100503053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6652 CTGGTATTACAGGCCTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGAATGGGTCTCTTCTAAGCATGGG 6711

100503054 CCCTATGTGACTGCACAGGCTGCACACCCTTGAAACTAGCCTCGGTTAAATTGTTTAAGA 100503113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6712 CCCTATGTGACTGCACAGGCTGCACACCCTTGAAACTAGCCTCGGTTAAATTGTTTAAGA 6771

100503114 AATGCTGGGTTAAAAAATGTCTAACAGATTTCTTTGCAACAAGACTTCTTATAGCCTTTT 100503173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6772 AATGCTGGGTTAAAAAATGTCTAACAGATTTCTTTGCAACAAGACTTCTTATAGCCTTTT 6831

100503174 ATATACTAATGTGCACTGTGAACCTTCAGGAGGTTCACATACTGTATAAAGGTCCTCAAA 100503233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6832 ATATACTAATGTGCACTGTGAACCTTCAGGAGGTTCACATACTGTATAAAGGTCCTCAAA 6891

100503234 TATATTTGACCAAAGCTCTTTTCAATTATTATTTTAGAAGGATCATCTTGTAGGACCAAT 100503293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6892 TATATTTGACCAAAGCTCTTTTCAATTATTATTTTAGAAGGATCATCTTGTAGGACCAAT 6951

100503294 GTTCCACAGAACACACATTGTAAAAGGCAGCTCAGGCTGTGCAAACAGGTTATAAAATCA 100503353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6952 GTTCCACAGAACACACATTGTAAAAGGCAGCTCAGGCTGTGCAAACAGGTTATAAAATCA 7011

100503354 ATTTGTTAGTCATAAATCACTATATATTTCCCATTTTGTGGCATTTTCCCCATATTTGGA 100503413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7012 ATTTGTTAGTCATAAATCACTATATATTTCCCATTTTGTGGCATTTTCCCCATATTTGGA 7071

100503414 ATGAGGTAACTAGAGATAACTATAGATGCAAATGGTGTGTATTCACTAAATATACTGTCC 100503473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7072 ATGAGGTAACTAGAGATAACTATAGATGCAAATGGTGTGTATTCACTAAATATACTGTCC 7131

100503474 TTCACTATTTGGTCTTCTACCATTTGGATAGTCAACTCAGTGGCCAAACATCACAAACGT 100503533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7132 TTCACTATTTGGTCTTCTACCATTTGGATAGTCAACTCAGTGGCCAAACATCACAAACGT 7191

100503534 TTTCTGGGCCAGGGTACTAGAGATGGTCTGATTGAGACTGTATCACAAGCCAACTTATTT 100503593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7192 TTTCTGGGCCAGGGTACTAGAGATGGTCTGATTGAGACTGTATCACAAGCCAACTTATTT 7251

100503594 TTCCCCTTTATTTTGTCAATTCAGAGGAAGTAACATCCTTACTTACCATTACCCAGTTCC 100503653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7252 TTCCCCTTTATTTTGTCAATTCAGAGGAAGTAACATCCTTACTTACCATTACCCAGTTCC 7311

100503654 CAAGAAATGTTGTACTTTTTGCTGGCGCTGTACTTCAACAGACTCAGGGCACTAGAACTG 100503713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7312 CAAGAAATGTTGTACTTTTTGCTGGCGCTGTACTTCAACAGACTCAGGGCACTAGAACTG 7371

100503714 TTCCAGGAGTTATTGGGATTACGACGCAGTGCATTTAGAGCAAATATCAGGTGGAGTCCA 100503773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7372 TTCCAGGAGTTATTGGGATTACGACGCAGTGCATTTAGAGCAAATATCAGGTGGAGTCCA 7431

100503774 GAGCAATCAGCAAAGTTATAAAGTTTGTCTAGAGACCTGGCTGGGAAGAAGCAGAGAAAG 100503833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7432 GAGCAATCAGCAAAGTTATAAAGTTTGTCTAGAGACCTGGCTGGGAAGAAGCAGAGAAAG 7491

100503834 GCTTGTAACTTTCAAATCAACATTCCAACAAAAGGAAAATAGT 100503876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7492 GCTTGTAACTTTCAAATCAACATTCCAACAAAAGGAAAATAGT 7534

Alignment time is 5.47545 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     3233] =>      3233 nucs 'mol-32-2b34-004961_3233'

Score:        2216
Aligned:      2262        nucs
Identic:      2257 (100%) nucs =>        21 (100%)      2236 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100493138,100493158] EXCISED REGION [100495008,100497246]
 second seq =>  [      554,      574] EXCISED REGION [      969,     3209]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1849 nucs [100493159,100495007]
 second seq =>       394 nucs [575,968]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [100493157,100493158] to [100495008,100495009]
 second seq =>         2 nucs [573,574] to [969,970]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100493138 CAAAGTGCTGGGATTACAGGC 100493158
          |||||||||||||||||||||
      554 CAAAGTGCTGGGATTACAGGC 574

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 1028

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 1088

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 1148

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1208

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1268

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1328

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1388

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 1448

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 1508

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 1568

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 1628

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 1688

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 1748

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 1808

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 1868

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 1928

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 1988

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 2048

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 2108

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 2168

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 2228

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 2288

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 2348

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 2408

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 2468

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 2528

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 2588

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 2648

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 2708

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 2768

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 2828

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 2888

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 2948

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2949 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 3008

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 3068

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3069 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 3128

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 3188

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCC 100497246
          |||||||||||||||||||||
     3189 TATCCATCACAGCATAGTCCC 3209

Alignment time is 2.31047 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     3631] =>      3631 nucs 'mol-32-2e15-021087_3631'

Score:        3576
Aligned:      3631        nucs
Identic:      3626 (100%) nucs =>        40 (100%)      3586 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100497086,100497125] EXCISED REGION [100497127,100500717]
 second seq =>  [        1,       40] EXCISED REGION [       42,     3631]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [100497126,100497126]
 second seq =>         1 nucs [41,41]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [100499938,100499938]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100497126,100497126] to [100497127,100497127]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [100497123,100497125] to [100497127,100497129]
 second seq =>         3 nucs [38,40] to [42,44]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100497086 AGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAAGACCAACACAGAAGG 100497125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAAGACCAACACAGAAGG 40

EXCISED REGION

100497127 AGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCATCTCATTGGGACTGGTTAGACA 100497186
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
       42 AGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCATCTCATTGGGACTGGTTAGACA 101

100497187 GTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCACTATCCATCACAGCATAGTCCC 100497246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      102 GTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCACTATCCATCACAGCATAGTCCC 161

100497247 TCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACCCCTTGCACTTCCTGGGTGAGG 100497306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      162 TCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACCCCTTGCACTTCCTGGGTGAGG 221

100497307 TGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAGCCCCAAAACTCCTTAAGCTGA 100497366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      222 TGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAGCCCCAAAACTCCTTAAGCTGA 281

100497367 TAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGTGCAAAAATCACAAGCATTCCT 100497426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      282 TAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGTGCAAAAATCACAAGCATTCCT 341

100497427 ATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAGTAAACTCCCATTCACAATTGC 100497486
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      342 ATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAGTAAACTCCCATTTACAATTGC 401

100497487 TACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATGTGAAGGACTTCTTCCA 100497546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      402 TACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATGTGAAGGACTTCTTCCA 461

100497547 GGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAGTGGAAAAACCT 100497606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      462 GGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAGTGGAAAAACCT 521

100497607 TCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCCAAAGTAAT 100497666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      522 TCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCCAAAGTAAT 581

100497667 TTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGACTTTCTTCACAGAAGTAGAAAA 100497726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      582 TTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGACTTTCTTCACAGAAGTAGAAAA 641

100497727 AACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAAGAGCCCATATAGTCAAGACAA 100497786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      642 AACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAAGAGCCCATATAGTCAAGACAA 701

100497787 TCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACCTGACTTCAAACTATACTACAA 100497846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      702 TCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACCTGACTTCAAACTATACTACAA 761

100497847 GGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAACAGATATATAGACCAATGGAA 100497906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      762 GGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAACAGATATATAGACCAATGGAA 821

100497907 CAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAACCATCTGTTCTTTGATAAACC 100497966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 CAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAACCATCTGTTCTTTGATAAACC 881

100497967 TGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGTTGGGATAATTG 100498026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 TGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGTTGGGATAATTG 941

100498027 GCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAAAAATTAACTCAAG 100498086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 GCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAAAAATTAACTCAAG 1001

100498087 ATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAAAACCCTAGAAGAAAACCTAGG 100498146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 ATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAAAACCCTAGAAGAAAACCTAGG 1061

100498147 CAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCATGTCTAAAACACCAAAATCAAT 100498206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 CAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCATGTCTAAAACACCAAAATCAAT 1121

100498207 TGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGC 100498266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 TGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGC 1181

100498267 AAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGAGAGAAAATTTTTGCAAT 100498326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 AAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGAGAGAAAATTTTTGCAAT 1241

100498327 CTATCCATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAAAGAACTTAAACAAATTTACAA 100498386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 CTATCCATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAAAGAACTTAAACAAATTTACAA 1301

100498387 GAAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 100498446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 GAAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAG 1361

100498447 ACATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCATCATCAGTGGTCATTAGAGAAA 100498506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 ACATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCATCATCAGTGGTCATTAGAGAAA 1421

100498507 TGCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAGTTAGAATTATGATCATTAAAA 100498566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 TGCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAGTTAGAATTATGATCATTAAAA 1481

100498567 AGTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAATAGGAATGCTTTTACACTGTT 100498626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 AGTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAATAGGAATGCTTTTACACTGTT 1541

100498627 GGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATC 100498686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 GGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATC 1601

100498687 TAGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGATATGTACCCAAAGGATT 100498746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 TAGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGATATGTACCCAAAGGATT 1661

100498747 ATAAACCATTCTTCCATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCAGCACTATTCACAA 100498806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 ATAAACCATTCTTCCATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCAGCACTATTCACAA 1721

100498807 TAGCAAAAACTTGGAACGAACCCAAATGCCCGTCAGTGATAGACTAGAAAAAGAGAATGT 100498866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 TAGCAAAAACTTGGAACGAACCCAAATGCCCGTCAGTGATAGACTAGAAAAAGAGAATGT 1781

100498867 GGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAAGAATGAGTTCATGTCCTTTG 100498926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 GGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAAGAATGAGTTCATGTCCTTTG 1841

100498927 CAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAA 100498986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 CAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAA 1901

100498987 TCAAACACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGGTGAATAATGAGAACATATGGGCACA 100499046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 TCAAACACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGGTGAATAATGAGAACATATGGGCACA 1961

100499047 GGGAGGGAAACATCACACACTGTGGTCTGTCGTGGGGAGTGGGGTAGGGGAGCGATATCA 100499106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 GGGAGGGAAACATCACACACTGTGGTCTGTCGTGGGGAGTGGGGTAGGGGAGCGATATCA 2021

100499107 TTAGGACAAATACCTAGTGTAGATGACAGGTTGATGGGTACAGCAAACCACCATGGCACA 100499166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2022 TTAGGACAAATACCTAGTGTAGATGACAGGTTGATGGGTACAGCAAACCACCGTGGCACA 2081

100499167 TGTATACCTATATAACAAGCCTGCCCATTCTGCACATGTAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAA 100499226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 TGTATACCTATATAACAAGCCTGCCCATTCTGCACATGTAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAA 2141

100499227 AAAAGAAAAAAAAGTACATAAATACATCATACATTTATCCACCTAAACTCAGGCTAAAAG 100499286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 AAAAGAAAAAAAAGTACATAAATACATCATACATTTATCCACCTAAACTCAGGCTAAAAG 2201

100499287 CTTAATAAATATTGAGGGAATGCATTAATCAAGCTGTGCTGCCAGAATCATAAGAATCAT 100499346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 CTTAATAAATATTGAGGGAATGCATTAATCAAGCTGTGCTGCCAGAATCATAAGAATCAT 2261

100499347 CATCTCTGACTTTCTAAGGTCAGAAACTTGATTTTACAAAATTACTTAGTAGACAGGCTC 100499406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 CATCTCTGACTTTCTAAGGTCAGAAACTTGATTTTACAAAATTACTTAGTAGACAGGCTC 2321

100499407 CAGAGAACTGAGTCATATAACTAATTCTTATAAAAGAATAACATGTGAATGTATATAGGT 100499466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 CAGAGAACTGAGTCATATAACTAATTCTTATAAAAGAATAACATGTGAATGTATATAGGT 2381

100499467 CAGGTTATGGGTATGAATATATAATATTGATTCAATAATTAATTATAGTAGCTTTTACTT 100499526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 CAGGTTATGGGTATGAATATATAATATTGATTCAATAATTAATTATAGTAGCTTTTACTT 2441

100499527 GCTTATAGAAATGGGCAGATATATTTGGGAAGCACATTTATAGTTCATAATGTAGTTCAG 100499586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 GCTTATAGAAATGGGCAGATATATTTGGGAAGCACATTTATAGTTCATAATGTAGTTCAG 2501

100499587 TGTTCATTCAATTAGAGGTATTACATTATCTTAAGGTAATTTTTGTGATTAAGTATAGCT 100499646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 TGTTCATTCAATTAGAGGTATTACATTATCTTAAGGTAATTTTTGTGATTAAGTATAGCT 2561

100499647 CTCTAGAGAACAAACACCATTTCCCTGAAATGGAGTTGGACTAGAATTTATATACACTTC 100499706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 CTCTAGAGAACAAACACCATTTCCCTGAAATGGAGTTGGACTAGAATTTATATACACTTC 2621

100499707 CAGAGTTTGAGTCCCAGCTTCAAAAATTTCTCCAGTTCTTTCTTACTTTAGATTCACCAA 100499766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 CAGAGTTTGAGTCCCAGCTTCAAAAATTTCTCCAGTTCTTTCTTACTTTAGATTCACCAA 2681

100499767 TGGTTAATATAAATGTAAAAATCTGTAATCATTACATTAATCAGTTACAGAGTTTACAAT 100499826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 TGGTTAATATAAATGTAAAAATCTGTAATCATTACATTAATCAGTTACAGAGTTTACAAT 2741

100499827 TTATGGACATTTAGGGAAATATGTTATATCCAAAGAAAGTAATTGTAAAAAAGTATGGTG 100499886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 TTATGGACATTTAGGGAAATATGTTATATCCAAAGAAAGTAATTGTAAAAAAGTATGGTG 2801

100499887 TCAAGAAAGTCATTTTTTTTTGTTTTGCTTTTGATTTTCTTTTCTTTTGTCTTTTTTTTT 100499946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     2802 TCAAGAAAGTCATTTTTTTTTGTTTTGCTTTTGATTTTCTTTTCTTTTGTC-TTTTTTTT 2860

100499947 TTTTGAGACAGGGTCTCACCATGTCACCCAGGTTCAAGAACAGTAGCATGATCATGGCTC 100500006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 TTTTGAGACAGGGTCTCACCATGTCACCCAGGTTCAAGAACAGTAGCATGATCATGGCTC 2920

100500007 ACTGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGACCCTCCAGCCTCAGTCTCCCAAGTACCCA 100500066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 ACTGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGACCCTCCAGCCTCAGTCTCCCAAGTACCCA 2980

100500067 GGATCACAGGTGCATGCTACCACGCCCAGCTAATTTTCTAGTTTTTTGTAGAGATGGGGT 100500126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 GGATCACAGGTGCATGCTACCACGCCCAGCTAATTTTCTAGTTTTTTGTAGAGATGGGGT 3040

100500127 CTTGCTATGCTGTGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCCTCCCATCTTGGCCT 100500186
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 CTTGCTATACTGTGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCCTCCCATCTTGGCCT 3100

100500187 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACCATGCCTGGCCGAAGAAAGTCATTCTTT 100500246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACCATGCCTGGCCGAAGAAAGTCATTCTTT 3160

100500247 CATATTCTTTAACATCCTAACCTTTCTCATCTTTGCCTCTTGATATTGGGTATATCTTGC 100500306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 CATATTCTTTAACATCCTAACCTTTCTCATCTTTGCCTCTTGATATTGGGTATATCTTGC 3220

100500307 TTTTGTGGTCTGTAGCCCACACTATTCACTGCTTTCAAAGAAGAGGAAAAGAGGTAGGTT 100500366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 TTTTGTGGTCTGTAGCCCACACTATTCACTGCTTTCAAAGAAGAGGAAAAGAGGTAGGTT 3280

100500367 AGTCACTTAAAGTTTAGCCACTCTAGAAGAAACAATCACAGAAACTTATACTTTGTTTTT 100500426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 AGTCACTTAAAGTTTAGCCACTCTAGAAGAAACAATCACAGAAACTTATACTTTGTTTTT 3340

100500427 TCCAATGCTAGATTTGCTCTAGAGATAAAATACTTGTTAACATGGTGTAGGTATATGGAA 100500486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 TCCAATGCTAGATTTGCTCTAGAGATAAAATACTTGTTAACATGGTGTAGGTATATGGAA 3400

100500487 AGATGAGTGATAAGAAGACTGACCTGTTCTATTGTCCTTTCCTGAATGTGAATATAATGA 100500546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 AGATGAGTGATAAGAAGACTGACCTGTTCTATTGTCCTTTCCTGAATGTGAATATAATGA 3460

100500547 TTAAATGATTACCTCTGTCCAAAAAGATAAGGTTACAAAGCAGAAATGGCTAGAATATTG 100500606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 TTAAATGATTACCTCTGTCCAAAAAGATAAGGTTACAAAGCAGAAATGGCTAGAATATTG 3520

100500607 GAGAAACATGTCTACCATGAAAATATTTTGAGGGGGAAGAGGCTCAATATACAACACAGA 100500666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 GAGAAACATGTCTACCATGAAAATATTTTGAGGGGGAAGAGGCTCAATATACAACACAGA 3580

100500667 ATAGTTTTGAGCAGAATACTGTACATTGGATATCTTAAGAGAGATGATTCT 100500717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 ATAGTTTTGAGCAGAATACTGTACATTGGATATCTTAAGAGAGATGATTCT 3631

Alignment time is 2.60666 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     3446] =>      3446 nucs 'mol-32-2f1d-064233_3446'

Score:        2817
Aligned:      2874        nucs
Identic:      2868 (100%) nucs =>        21 (100%)      2847 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100493138,100493158] EXCISED REGION [100495008,100497858]
 second seq =>  [      179,      199] EXCISED REGION [      594,     3446]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1849 nucs [100493159,100495007]
 second seq =>       394 nucs [200,593]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [100493157,100493158] to [100495008,100495009]
 second seq =>         2 nucs [198,199] to [594,595]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100493138 CAAAGTGCTGGGATTACAGGC 100493158
          |||||||||||||||||||||
      179 CAAAGTGCTGGGATTACAGGC 199

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 653

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 713

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 773

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 833

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 893

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 953

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1013

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 1073

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 1133

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 1193

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 1253

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 1313

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 1373

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 1433

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 1493

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 1553

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 1613

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 1673

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 1733

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 1793

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 1853

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 1913

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 1973

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 2033

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 2093

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 2153

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 2213

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 2273

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 2333

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 2393

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 2453

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 2513

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 2573

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2574 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 2633

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 2693

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2694 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 2753

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 2813

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 100497285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 2873

100497286 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 100497345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 2933

100497346 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 100497405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 2993

100497406 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 100497465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 3053

100497466 TAAACTCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 100497525
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 TAAACTCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 3113

100497526 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 100497585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 3173

100497586 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 100497645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 3233

100497646 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 100497705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 3293

100497706 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 100497765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 3353

100497766 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 100497825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 3413

100497826 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAAC 100497858
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAAC 3446

Alignment time is 2.49364 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     3338] =>      3338 nucs 'mol-32-2ff9-029639_3338'

Score:        2106
Aligned:      2141        nucs
Identic:      2137 (100%) nucs =>        21 (100%)      2116 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100490785,100490805] EXCISED REGION [100495008,100497125]
 second seq =>  [       86,      106] EXCISED REGION [     1212,     3331]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4202 nucs [100490806,100495007]
 second seq =>      1105 nucs [107,1211]
ALTERNATIVE REGION(S): 3
 first  seq =>      1849 nucs [100493159,100495007]
 second seq =>       394 nucs [818,1211]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [106,106] to [1211,1211]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100490805,100490805] to [100495008,100495008]
 second seq =>         1 nucs [106,106] to [1212,1212]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100490785 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 100490805
          |||||||||||||||||||||
       86 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 106

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 1271

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 1331

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 1391

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1451

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1511

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1571

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1631

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 GAGATATGGAATCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 1691

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 1751

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 1811

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 1871

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 1931

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 1991

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 2051

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 2111

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 2171

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 2231

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 2291

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 2351

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 2411

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 2471

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 2531

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 2591

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 2651

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 2711

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 2771

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 2831

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 2891

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 2951

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 3011

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 3071

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 3131

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 3191

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3192 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 3251

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 3311

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGG 100497125
          ||||||||||||||||||||
     3312 AGCAAGACCAACACAGAAGG 3331

Alignment time is 2.41296 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     3975] =>      3975 nucs 'mol-32-3004-272804_3975'

Score:        2942
Aligned:      3021        nucs
Identic:      3013 (100%) nucs =>      2856 (100%)       157 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100495008,100497868] EXCISED REGION [100497954,100498110]
 second seq =>  [      870,     3733] EXCISED REGION [     3819,     3975]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        85 nucs [100497869,100497953]
 second seq =>        85 nucs [3734,3818]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>        74 nucs [100497880,100497953]
 second seq =>        74 nucs [3745,3818]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [3733,3734] to [3818,3819]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 929

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 989

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 1049

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1109

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1169

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1229

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1289

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 GAGATATGGAATCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 1349

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 1409

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 1469

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 1529

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 1589

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 1649

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 1709

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 1769

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 1829

100495968 TGGTTTTTTTTTTT--ATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 1889

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 1949

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 2009

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 2069

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 2129

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 2189

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 2249

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 2309

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 2369

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 2429

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 2489

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 2549

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 2609

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 2669

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 2729

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 2789

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 2849

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2850 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 2909

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 2969

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2970 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 3029

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 3089

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 100497285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 3149

100497286 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 100497345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 3209

100497346 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 100497405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 3269

100497406 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 100497465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 3329

100497466 TAAACTCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 100497525
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 TAAACTCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 3389

100497526 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 100497585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 3449

100497586 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 100497645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3450 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 3509

100497646 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 100497705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 3569

100497706 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 100497765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 3629

100497766 GAGCCCATATAGTCAAGACAATC-TAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTAC 100497824
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTAC 3689

100497825 CTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCA 100497868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3690 CTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCA 3733

EXCISED REGION

100497954 TCTTTGATAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGT 100498013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3819 TCTTTGATAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGT 3878

100498014 GTTGGGATAATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAA 100498073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3879 GTTGGGATAATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAA 3938

100498074 AAATTAACTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAG 100498110
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3939 AAATTAACTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAG 3975

Alignment time is 2.86093 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     2953] =>      2953 nucs 'mol-32-3004-349634_2953'

Score:        2777
Aligned:      2944        nucs
Identic:      2928 ( 99%) nucs =>      2769 ( 99%)       159 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100495173,100497952] EXCISED REGION [100497962,100498121]
 second seq =>  [        1,     2784] EXCISED REGION [     2794,     2953]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         9 nucs [100497953,100497961]
 second seq =>         9 nucs [2785,2793]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2785,2785] to [2794,2794]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100497953,100497953] to [100497961,100497961]
 second seq =>         0 nucs

100495173 TCACAAAGAACCTCTGTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAA 100495232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCACAAAGAACCTCTGTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAA 60

100495233 AGAGTCCCCACTGGGGCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGA 100495292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAGTCCCCACTGGGGCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGA 120

100495293 CCTCAGAAAAGCTCCAGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGT 100495352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTCAGAAAAGCTCCAGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGT 180

100495353 ACTCTGTAAAGCCACAGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTG 100495412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTCTGTAAAGCCACAGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTG 240

100495413 GCGTGACCTGGATGTGAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGA 100495472
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||
      241 GCGTGACCTGGATGTGAGATATGGAATCAAAGGAGATCATTTGGGGGCTTTACGATTTGA 300

100495473 CTGCCCTGCTTGATTTCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTC 100495532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGCCCTGCTTGATTTCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTC 360

100495533 TCCCATTTGGAACAGCTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAAC 100495592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCCATTTGGAACAGCTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAAC 420

100495593 TAACTTGCTTTTGATTTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAG 100495652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAACTTGCTTTTGATTTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAG 480

100495653 ACCTTGGACTGTGTACTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTT 100495712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCTTGGACTGTGTACTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTT 540

100495713 GGGAAGGCATGATTGGTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAG 100495772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGAAGGCATGATTGGTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAG 600

100495773 AATGATATGGTTTGGTTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCA 100495832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATGATATGGTTTGGTTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCA 660

100495833 TAATTCCCATGTGTTGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTT 100495892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAATTCCCATGTGTTGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTT 720

100495893 CCCCCATACTGTTCTCATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGG 100495952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCCCATACTGTTCTCATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGG 780

100495953 GTTTCCCCTTTTGCTTGGTTTTTTTTTTT--ATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGAC 100496010
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTTCCCCTTTTGCTTGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGAC 840

100496011 ATGCCTTTCACCTTCTGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGC 100496070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGCCTTTCACCTTCTGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGC 900

100496071 TTTAAACTCTTTTTCTTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGA 100496130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTAAACTCTTTTTCTTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGA 960

100496131 AAATGGACTTTATACAGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACA 100496190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATGGACTTTATACAGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACA 1020

100496191 GTAACCAGAATTTTAGTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACC 100496250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTAACCAGAATTTTAGTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACC 1080

100496251 AATGTAATTCAAACTTCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCT 100496310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATGTAATTCAAACTTCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCT 1140

100496311 TAAAAATGTAAGCTATGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATA 100496370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAAAAATGTAAGCTATGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATA 1200

100496371 TATTATTTGTTGGTTTAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAG 100496430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATTATTTGTTGGTTTAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAG 1260

100496431 AGATTCCTCCAGTTCTAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTA 100496490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGATTCCTCCAGTTCTAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTA 1320

100496491 ACTTTACCTTTAGATACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACT 100496550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTTTACCTTTAGATACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACT 1380

100496551 CTGTGTCATAGTATGTTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGAT 100496610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGTGTCATAGTATGTTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGAT 1440

100496611 TCCTCCAACTCCCATTTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTA 100496670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCTCCAACTCCCATTTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTA 1500

100496671 ATGCAAGAATGACTAAATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGA 100496730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGCAAGAATGACTAAATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGA 1560

100496731 ATTGAGAAGATGAAGGTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAG 100496790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTGAGAAGATGAAGGTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAG 1620

100496791 CAGGTAAAAAGACTATATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTC 100496850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGGTAAAAAGACTATATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTC 1680

100496851 TCCTTCCCTATCAAAACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGA 100496910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCCTTCCCTATCAAAACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGA 1740

100496911 CCTACCCTCATAAATAATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGC 100496970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTACCCTCATAAATAATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGC 1800

100496971 TTTCACCTGTTATATACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATAT 100497030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTCACCTGTTATATACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATAT 1860

100497031 ATTAAACATAAAGGAACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTC 100497090
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTATACATAAAGGAACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTC 1920

100497091 CAGTCTGCAGCTCCCAGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTG 100497150
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGTCTGCAGCTCCCAGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTG 1980

100497151 AGGTACCCACTTCATCTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATC 100497210
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGGTACCCAGTTCATCTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATC 2040

100497211 TGGGCCAGCAAGCACTATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGA 100497270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGGGCCAGCAAGCACTATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGA 2100

100497271 GGGAGTTCTCTGACCCCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTC 100497330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGGAGTTCTCTGACCCCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTC 2160

100497331 ACCCCATCATCTCAGCCCCAAAACTCCTTAAGCTGATA-GCAACTTCAGCAAAGTCTCAG 100497389
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     2161 ACCCCATCATCTCAGCCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAG 2220

100497390 GATACAAAATCAGAGTGCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACAC 100497449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GATACAAAATCAGAGTGCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACAC 2280

100497450 AGAGCCAAATCATGAGTAAACTCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAG 100497509
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGAGCCAAATCATGAGTAAACTCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAG 2340

100497510 GAATCCAACTTACAAGGGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCA 100497569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAATCCAACTTACAAGGGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCA 2400

100497570 AGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAA 100497629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAA 2460

100497630 TCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCA 100497689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCA 2520

100497690 TCAAGCTACCATTGACTTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTC 100497749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCAAGCTACCATTGACTTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTC 2580

100497750 ATATGGAAACAAAAAAGAGCCCATATAGTCAAGACAATC-TAAGCAAAAAGAACAAAGCT 100497808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     2581 ATATGGAAACAAAAAAGAGCCCATATAGTCAAGACAATCCTAAGCAAAAAGAACAAAGCT 2640

100497809 GGAGGCATCACACTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCA 100497868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGAGGCATCACACTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCA 2700

100497869 CGGTACTGGTACCAAAACAGATATATAGACCAATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATA 100497928
          .||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2701 TGGTACTGGTACCAAAACAGAGATATAGACCAATGGAACAGAACAGAGCCCTCAGAAATA 2760

100497929 ACACCACACATTTACAACCATCTG 100497952
          |.|||||||||.||||||||||||
     2761 ATACCACACATCTACAACCATCTG 2784

EXCISED REGION

100497962 AAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGTTGGGAT 100498021
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 AAACCTGACAAAAACAAGAAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGTTGGGAT 2853

100498022 AATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAAAAATTAAC 100498081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 AATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAAAAATTAAC 2913

100498082 TCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCA 100498121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 TCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCA 2953

Alignment time is 2.49576 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     2236] =>      2236 nucs 'mol-32-301a-093838_2236'

Score:        2179
Aligned:      2223        nucs
Identic:      2219 (100%) nucs =>      1249 (100%)       970 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100496700,100497952] EXCISED REGION [100497962,100498931]
 second seq =>  [        1,     1253] EXCISED REGION [     1267,     2236]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         9 nucs [100497953,100497961]
 second seq =>        13 nucs [1254,1266]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1254,1254] to [1267,1267]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100497953,100497953] to [100497961,100497961]
 second seq =>         0 nucs

100496700 ATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAGGTTGAAGGAGAGAA 100496759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAGGTTGAAGGAGAGAA 60

100496760 GCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTATATGGTTTCTTGTT 100496819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTATATGGTTTCTTGTT 120

100496820 TTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAAACTCTATGTTCTGA 100496879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAAACTCTATGTTCTGA 180

100496880 AAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAATAATTGACAATATGT 100496939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAATAATTGACAATATGT 240

100496940 GTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATATACACATAAAAATAC 100496999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATATACACATAAAAATAC 300

100497000 AGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGAACATAAATGCAATT 100497059
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      301 AGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGAACATAAATGCAATT 360

100497060 CCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAAGACCAACAC 100497119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAAGACCAACAC 420

100497120 AGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCATCTCATTGGGACTGG 100497179
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      421 AGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCATCTCATTGGGACTGG 480

100497180 TTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCACTATCCATCACAGCA 100497239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCACTATCCATCACAGCA 540

100497240 TAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACCCCTTGCACTTCCTG 100497299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACCCCTTGCACTTCCTG 600

100497300 GGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAGCCCCAAAACTCCTT 100497359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAGCCCCAAAACTCCTT 660

100497360 AAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGTGCAAAAATCACAAG 100497419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGTGCAAAAATCACAAG 720

100497420 CATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAGTAAACTCCCATTCA 100497479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      721 CATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAGTAAACTCCCATTTA 780

100497480 CAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATGTGAAGGACT 100497539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATGTGAAGGACT 840

100497540 TCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAGTGGA 100497599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAGTGGA 900

100497600 AAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCCA 100497659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCCA 960

100497660 AAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGACTTTCTTCACAGAAG 100497719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGACTTTCTTCACAGAAG 1020

100497720 TAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAAGAGCCCATATAGTC 100497779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAAGAGCCCATATAGTC 1080

100497780 AAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACCTGACTTCAAACTAT 100497839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACCTGACTTCAAACTAT 1140

100497840 ACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAACAGATATATAGACC 100497899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAACAGATATATAGACC 1200

100497900 AATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAACCATCTG 100497952
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAACCATCTG 1253

EXCISED REGION

100497962 AAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGTTGGGAT 100498021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 AAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGTTGGGAT 1326

100498022 AATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAAAAATTAAC 100498081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 AATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAAAAATTAAC 1386

100498082 TCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAAAACCCTAGAAGAAAAC 100498141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 TCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAAAACCCTAGAAGAAAAC 1446

100498142 CTAGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCATGTCTAAAACACCAAAA 100498201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 CTAGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCATGTCTAAAACACCAAAA 1506

100498202 TCAATTGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGC 100498261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 TCAATTGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGC 1566

100498262 ACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGAGAGAAAATTTTT 100498321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 ACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGAGAGAAAATTTTT 1626

100498322 GCAATCTATCCATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAAAGAACTTAAACAAATT 100498381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 GCAATCTATCCATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAAAGAACTTAAACAAATT 1686

100498382 TACAAGAAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAA 100498441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 TACAAGAAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAA 1746

100498442 AGAAGACATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCATCATCAGTGGTCATTAG 100498501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 AGAAGACATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCATCATCAGTGGTCATTAG 1806

100498502 AGAAATGCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAGTTAGAATTATGATCAT 100498561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 AGAAATGCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAGTTAGAATTATGATCAT 1866

100498562 TAAAAAGTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAATAGGAATGCTTTTACA 100498621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 TAAAAAGTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAATAGGAATGCTTTTACA 1926

100498622 CTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAA 100498681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 CTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAA 1986

100498682 GGATCTAGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGATATGTACCCAAA 100498741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 GGATCTAGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGATATGTACCCAAA 2046

100498742 GGATTATAAACCATTCTTCCATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCAGCACTATT 100498801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 GGATTATAAACCATTCTTCCATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCAGCACTATT 2106

100498802 CACAATAGCAAAAACTTGGAACGAACCCAAATGCCCGTCAGTGATAGACTAGAAAAAGAG 100498861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 CACAATAGCAAAAACTTGGAACGAACCCAAATGCCCGTCAGTGATAGACTAGAAAAAGAG 2166

100498862 AATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAAGAATGAGTTCATGTC 100498921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 AATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAAGAATGAGTTCATGTC 2226

100498922 CTTTGCAGGG 100498931
          ||||||||||
     2227 CTTTGCAGGG 2236

Alignment time is 2.48314 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     4318] =>      4318 nucs 'mol-32-3046-040899_4318'

Score:        2819
Aligned:      2876        nucs
Identic:      2870 (100%) nucs =>        21 (100%)      2849 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100490785,100490805] EXCISED REGION [100495008,100497860]
 second seq =>  [      338,      358] EXCISED REGION [     1464,     4318]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4202 nucs [100490806,100495007]
 second seq =>      1105 nucs [359,1463]
ALTERNATIVE REGION(S): 3
 first  seq =>      1849 nucs [100493159,100495007]
 second seq =>       394 nucs [1070,1463]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [358,358] to [1463,1463]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100490805,100490805] to [100495008,100495008]
 second seq =>         1 nucs [358,358] to [1464,1464]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100490785 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 100490805
          |||||||||||||||||||||
      338 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 358

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 1523

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 1583

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 1643

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1703

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1763

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1823

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1883

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 1943

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 2003

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 2063

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 2123

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 2183

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 2243

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 2303

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 2363

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 2423

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 2483

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 2543

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 2603

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 2663

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 2723

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 2783

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 2843

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 2903

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 2963

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 3023

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 3083

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 3143

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 3203

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 3263

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 3323

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 3383

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 3443

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3444 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 3503

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 3563

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3564 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 3623

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 3683

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 100497285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 3743

100497286 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 100497345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 3803

100497346 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 100497405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3804 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 3863

100497406 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 100497465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3864 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 3923

100497466 TAAACTCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 100497525
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 TAAACTCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 3983

100497526 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 100497585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 4043

100497586 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 100497645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 4103

100497646 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 100497705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 4163

100497706 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 100497765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4164 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 4223

100497766 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 100497825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 4283

100497826 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCA 100497860
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCA 4318

Alignment time is 3.10306 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     4552] =>      4552 nucs 'mol-32-3101-065357_4552'

Score:        2974
Aligned:      3031        nucs
Identic:      3025 (100%) nucs =>        47 (100%)      2978 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100494961,100495007] EXCISED REGION [100495008,100497989]
 second seq =>  [        1,       47] EXCISED REGION [     1569,     4552]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>      1521 nucs [48,1568]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [48,49] to [1569,1570]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [48,48] to [1568,1568]

100494961 ACTGCCATAAAGATACCCGAAATGCGAAAGCAAGTTTGAAACCTGTT 100495007
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTGCCATAAAGATACCCGAAATGCGAAAGCAAGTTTGAAACCTGTT 47

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 1628

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 1688

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 1748

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1808

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1868

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1928

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1988

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 2048

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 2108

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 2168

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 2228

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 2288

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 2348

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 2408

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 2468

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 2528

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 2588

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 2648

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 2708

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 2768

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 2828

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 2888

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 2948

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 3008

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 3068

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 3128

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 3188

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 3248

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 3308

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 3368

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 3428

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 3488

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 3548

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3549 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 3608

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 3668

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3669 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 3728

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 3788

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 100497285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 3848

100497286 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 100497345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 3908

100497346 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 100497405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 3968

100497406 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 100497465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 4028

100497466 TAAACTCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 100497525
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 TAAACTCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 4088

100497526 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 100497585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4089 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 4148

100497586 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 100497645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4149 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 4208

100497646 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 100497705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4209 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 4268

100497706 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 100497765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4269 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 4328

100497766 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 100497825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4329 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 4388

100497826 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAA 100497885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4389 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAA 4448

100497886 CAGATATATAGACCAATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAA 100497945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4449 CAGATATATAGACCAATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAA 4508

100497946 CCATCTGTTCTTTGATAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAA 100497989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4509 CCATCTGTTCTTTGATAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAA 4552

Alignment time is 3.23652 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     3876] =>      3876 nucs 'mol-32-3143-151035_3876'

Score:        2792
Aligned:      2871        nucs
Identic:      2863 (100%) nucs =>        21 (100%)      2842 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100487255,100487275] EXCISED REGION [100495008,100497855]
 second seq =>  [        6,       26] EXCISED REGION [     1027,     3876]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      7732 nucs [100487276,100495007]
 second seq =>      1000 nucs [27,1026]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>      1849 nucs [100493159,100495007]
 second seq =>       394 nucs [633,1026]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [26,26] to [1026,1026]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100487275,100487275] to [100495008,100495008]
 second seq =>         1 nucs [26,26] to [1027,1027]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100487276,100487276] to [100495007,100495007]
 second seq =>         0 nucs

100487255 AAAATTAGCTGGGCATGGTGG 100487275
          |||||||||||||||||||||
        6 AAAATTAGCTGGGCATGGTGG 26

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 1086

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 1146

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 1206

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1266

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1326

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1386

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1446

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 GAGATATGGAATCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 1506

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 1566

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 1626

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 1686

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 1746

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 1806

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 1866

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 1926

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 1986

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 2046

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 2106

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 2166

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 2226

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 2286

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 2346

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 2406

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 2466

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 2526

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 2586

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 2646

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 2706

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 2766

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 2826

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 2886

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 2946

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGCGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 3006

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3007 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 3066

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 3126

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3127 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 3186

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 3246

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 100497285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 3306

100497286 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 100497345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 3366

100497346 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 100497405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 3426

100497406 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 100497465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 3486

100497466 TAAACTCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 100497525
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 TAAACTCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 3546

100497526 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 100497585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 3606

100497586 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 100497645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 3666

100497646 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 100497705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 3726

100497706 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 100497765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 3786

100497766 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 100497825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 3846

100497826 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGT 100497855
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGT 3876

Alignment time is 3.21362 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     4091] =>      4091 nucs 'mol-32-316f-104498_4091'

Score:        2513
Aligned:      2570        nucs
Identic:      2564 (100%) nucs =>        60 (100%)      2504 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100494948,100495007] EXCISED REGION [100495008,100497515]
 second seq =>  [        1,       60] EXCISED REGION [     1582,     4091]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>      1521 nucs [61,1581]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [61,62] to [1582,1583]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [61,61] to [1581,1581]

100494948 CGGGTAGTGGGCCACTGCCATAAAGATACCCGAAATGCGAAAGCAAGTTTGAAACCTGTT 100495007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGGGTAGTGGGCCACTGCCATAAAGATACCCGAAATGCGAAAGCAAGTTTGAAACCTGTT 60

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1582 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 1641

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1642 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 1701

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 1761

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1821

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1881

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1941

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 2001

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 2061

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 2121

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 2181

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 2241

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 2301

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 2361

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 2421

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 2481

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 2541

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 2601

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 2661

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 2721

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 2781

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 2841

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 2901

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 2961

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 3021

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 3081

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 3141

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 3201

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 3261

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 3321

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 3381

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 3441

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 3501

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 3561

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3562 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 3621

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 3681

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3682 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 3741

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 3801

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 100497285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 3861

100497286 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 100497345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 3921

100497346 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 100497405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 3981

100497406 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 100497465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 4041

100497466 TAAACTCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCC 100497515
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 TAAACTCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCC 4091

Alignment time is 3.23543 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     2071] =>      2071 nucs 'mol-32-317a-054156_2071'

Score:        2036
Aligned:      2069        nucs
Identic:      2066 (100%) nucs =>       914 (100%)      1152 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100495057,100495970] EXCISED REGION [100495971,100497125]
 second seq =>  [        1,      914] EXCISED REGION [      916,     2070]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [915,915]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [100496275,100496275]
 second seq =>         1 nucs [1220,1220]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        11 nucs [915,925] to [916,926]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100495057 AGCCTGCAGGTGCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGA 100495116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCCTGCAGGTGCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGA 60

100495117 GGATGTATAGAAATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCAC 100495176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGATGTATAGAAATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCAC 120

100495177 AAAGAACCTCTGTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAG 100495236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGAACCTCTGTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAG 180

100495237 TCCCCACTGGGGCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTC 100495296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCCCACTGGGGCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTC 240

100495297 AGAAAAGCTCCAGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTC 100495356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAAAAGCTCCAGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTC 300

100495357 TGTAAAGCCACAGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGT 100495416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTAAAGCCACAGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGT 360

100495417 GACCTGGATGTGAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGC 100495476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACCTGGATGTGAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGC 420

100495477 CCTGCTTGATTTCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCC 100495536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTGCTTGATTTCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCC 480

100495537 ATTTGGAACAGCTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAAC 100495596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTGGAACAGCTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAAC 540

100495597 TTGCTTTTGATTTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCT 100495656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGCTTTTGATTTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCT 600

100495657 TGGACTGTGTACTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGA 100495716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGACTGTGTACTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGA 660

100495717 AGGCATGATTGGTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATG 100495776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGCATGATTGGTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATG 720

100495777 ATATGGTTTGGTTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAAT 100495836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATATGGTTTGGTTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAAT 780

100495837 TCCCATGTGTTGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCC 100495896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCCATGTGTTGTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCC 840

100495897 CATACTGTTCTCATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTT 100495956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATACTGTTCTCATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTT 900

100495957 CCCCTTTTGCTTGG 100495970
          ||||||||||||||
      901 CCCCTTTTGCTTGG 914

EXCISED REGION

100495971 TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTCTGCCA 100496030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTCTGCCA 975

100496031 TGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTCTTTAT 100496090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 TGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTCTTTAT 1035

100496091 AAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATACAGCAG 100496150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 AAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATACAGCAG 1095

100496151 CTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTAGTGAG 100496210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 CTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTAGTGAG 1155

100496211 AGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACTTCACT 100496270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 AGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACTTCACT 1215

100496271 CACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTATGAAT 100496330
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 CACTCCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTATGAAT 1275

100496331 TTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTTTAACA 100496390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 TTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTTTAACA 1335

100496391 ATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTCTAGCA 100496450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 ATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTCTAGCA 1395

100496451 TATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGATACTAA 100496510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 TATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGATACTAA 1455

100496511 ACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATGTTATG 100496570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 ACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATGTTATG 1515

100496571 CCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCATTTCAC 100496630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 CCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCATTTCAC 1575

100496631 ACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTAAATAC 100496690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 ACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTAAATAC 1635

100496691 CATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAGGTTGA 100496750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 CATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAGGTTGA 1695

100496751 AGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTATATGG 100496810
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 AGGAGGGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTATATGG 1755

100496811 TTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAAACTCT 100496870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 TTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAAACTCT 1815

100496871 ATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAATAATTG 100496930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 ATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAATAATTG 1875

100496931 ACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATATACACA 100496990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 ACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATATACACA 1935

100496991 TAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGAACATA 100497050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1936 TAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGAACATA 1995

100497051 AATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAA 100497110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 AATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAA 2055

100497111 GACCAACACAGAAGG 100497125
          |||||||||||||||
     2056 GACCAACACAGAAGG 2070

Alignment time is 1.85057 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     2464] =>      2464 nucs 'mol-32-3190-146842_2464'

Score:        2090
Aligned:      2125        nucs
Identic:      2121 (100%) nucs =>        12 (100%)      2109 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100492288,100492299] EXCISED REGION [100495008,100497118]
 second seq =>  [      225,      236] EXCISED REGION [      337,     2449]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2708 nucs [100492300,100495007]
 second seq =>       100 nucs [237,336]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100492299,100492299] to [100495007,100495007]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100492288 GGAAAAAATGGT 100492299
          ||||||||||||
      225 GGAAAAAATGGT 236

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      337 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 396

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      397 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 456

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      457 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 516

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      517 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 576

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      577 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 636

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      637 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 696

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      697 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 756

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      757 GAGATATGGAATCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 816

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      817 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 876

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 936

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 996

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 1056

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 1116

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 1176

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 1236

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 1296

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 1356

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 1416

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 1476

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 1536

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 1596

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 1656

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 1716

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 1776

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 1836

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 1896

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 1956

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 2016

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 2076

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 2136

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 2196

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 2256

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 2316

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2317 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 2376

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 2436

100497106 AGCAAGACCAACA 100497118
          |||||||||||||
     2437 AGCAAGACCAACA 2449

Alignment time is 1.74939 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     4132] =>      4132 nucs 'mol-32-331c-006256_4132'

Score:        2823
Aligned:      2902        nucs
Identic:      2894 (100%) nucs =>        21 (100%)      2873 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100490785,100490805] EXCISED REGION [100495008,100497886]
 second seq =>  [      126,      146] EXCISED REGION [     1252,     4132]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4202 nucs [100490806,100495007]
 second seq =>      1105 nucs [147,1251]
ALTERNATIVE REGION(S): 3
 first  seq =>      1849 nucs [100493159,100495007]
 second seq =>       394 nucs [858,1251]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [146,146] to [1251,1251]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100490805,100490805] to [100495008,100495008]
 second seq =>         1 nucs [146,146] to [1252,1252]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100490785 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 100490805
          |||||||||||||||||||||
      126 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 146

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 1311

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 1371

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 1431

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1491

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1551

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1611

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1671

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 GAGATATGGAATCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 1731

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 1791

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 1851

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 1911

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 1971

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 2031

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 2091

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 2151

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 2211

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 2271

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 2331

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 2391

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 2451

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 2511

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 2571

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 2631

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 2691

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 2751

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 2811

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 2871

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 2931

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 2991

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 3051

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 3111

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 3171

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 3231

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3232 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 3291

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3292 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 3351

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
     3352 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTTTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 3411

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3412 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 3471

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 100497285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3472 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 3531

100497286 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 100497345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3532 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 3591

100497346 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 100497405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3592 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 3651

100497406 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 100497465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 3711

100497466 TAAACTCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 100497525
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 TAAACTCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 3771

100497526 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 100497585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 3831

100497586 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 100497645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 3891

100497646 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 100497705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 3951

100497706 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 100497765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 4011

100497766 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 100497825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4012 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 4071

100497826 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAA 100497885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4072 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAA 4131

100497886 C 100497886
          |
     4132 C 4132

Alignment time is 3.2789 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     3996] =>      3996 nucs 'mol-32-3327-018120_3996'

Score:        2435
Aligned:      2492        nucs
Identic:      2486 (100%) nucs =>        21 (100%)      2465 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100490785,100490805] EXCISED REGION [100495008,100497476]
 second seq =>  [      400,      420] EXCISED REGION [     1526,     3996]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4202 nucs [100490806,100495007]
 second seq =>      1105 nucs [421,1525]
ALTERNATIVE REGION(S): 3
 first  seq =>      1849 nucs [100493159,100495007]
 second seq =>       394 nucs [1132,1525]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [420,420] to [1525,1525]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100490805,100490805] to [100495008,100495008]
 second seq =>         1 nucs [420,420] to [1526,1526]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100490785 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 100490805
          |||||||||||||||||||||
      400 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 420

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1526 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 1585

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1586 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 1645

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1646 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 1705

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1765

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1825

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1885

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1945

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 2005

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 2065

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 2125

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 2185

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 2245

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 2305

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 2365

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 2425

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 2485

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 2545

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 2605

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCATTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 2665

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 2725

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 2785

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 2845

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 2905

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 2965

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 3025

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 3085

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 3145

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 3205

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 3265

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 3325

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 3385

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 3445

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 3505

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3506 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 3565

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 3625

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3626 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 3685

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 3745

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 100497285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 3805

100497286 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 100497345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3806 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 3865

100497346 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 100497405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 3925

100497406 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 100497465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 3985

100497466 TAAACTCCCAT 100497476
          |||||||||||
     3986 TAAACTCCCAT 3996

Alignment time is 2.88502 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     3126] =>      3126 nucs 'mol-32-3487-122697_3126'

Score:        2295
Aligned:      2354        nucs
Identic:      2347 (100%) nucs =>        21 (100%)      2326 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100493138,100493158] EXCISED REGION [100495008,100497337]
 second seq =>  [      379,      399] EXCISED REGION [      794,     3126]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1849 nucs [100493159,100495007]
 second seq =>       394 nucs [400,793]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [100493157,100493158] to [100495008,100495009]
 second seq =>         2 nucs [398,399] to [794,795]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100493138 CAAAGTGCTGGGATTACAGGC 100493158
          |||||||||||||||||||||
      379 CAAAGTGCTGGGATTACAGGC 399

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      794 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 853

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      854 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 913

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      914 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 973

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      974 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1033

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1034 GCACTGCCTGGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1093

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1094 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1153

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1154 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1213

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1214 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 1273

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1274 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 1333

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1334 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 1393

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 1453

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1454 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 1513

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 1573

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 1633

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 1693

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 1753

100495968 TGG---TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTT 100496024
          |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 TGGTTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTT 1813

100496025 CTGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTT 100496084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 CTGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTT 1873

100496085 CTTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATA 100496144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 CTTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATA 1933

100496145 CAGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTT 100496204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 CAGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTT 1993

100496205 AGTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAAC 100496264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 AGTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAAC 2053

100496265 TTCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCT 100496324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 TTCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCT 2113

100496325 ATGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGT 100496384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 ATGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGT 2173

100496385 TTAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTT 100496444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 TTAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTT 2233

100496445 CTAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGA 100496504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 CTAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGA 2293

100496505 TACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTAT 100496564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 TACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTAT 2353

100496565 GTTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCA 100496624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 GTTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCA 2413

100496625 TTTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACT 100496684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 TTTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACT 2473

100496685 AAATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAA 100496744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 AAATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAA 2533

100496745 GGTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACT 100496804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 GGTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACT 2593

100496805 ATATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAA 100496864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 ATATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAA 2653

100496865 AACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAA 100496924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2654 AACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAA 2713

100496925 TAATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATA 100496984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 TAATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATA 2773

100496985 TACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGG 100497044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2774 TACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGG 2833

100497045 AACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCC 100497104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 AACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCC 2893

100497105 CAGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCA 100497164
          |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2894 CAGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCA 2953

100497165 TCTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCA 100497224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2954 TCTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCA 3013

100497225 CTATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGAC 100497284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3014 CTATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGAC 3073

100497285 CCCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCAT 100497337
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3074 CCCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCAT 3126

Alignment time is 2.78568 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     3860] =>      3860 nucs 'mol-32-3492-121581_3860'

Score:        2330
Aligned:      2387        nucs
Identic:      2381 (100%) nucs =>        21 (100%)      2360 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100490785,100490805] EXCISED REGION [100495008,100497371]
 second seq =>  [      369,      389] EXCISED REGION [     1495,     3860]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4202 nucs [100490806,100495007]
 second seq =>      1105 nucs [390,1494]
ALTERNATIVE REGION(S): 3
 first  seq =>      1849 nucs [100493159,100495007]
 second seq =>       394 nucs [1101,1494]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [389,389] to [1494,1494]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100490805,100490805] to [100495008,100495008]
 second seq =>         1 nucs [389,389] to [1495,1495]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100490785 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 100490805
          |||||||||||||||||||||
      369 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 389

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 1554

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 1614

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 1674

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1734

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1794

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1854

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1914

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 1974

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 2034

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 2094

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 2154

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 2214

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 2274

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 2334

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 2394

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 2454

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 2514

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 2574

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 2634

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 2694

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 2754

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 2814

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 2874

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 2934

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 2994

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 3054

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 3114

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 3174

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 3234

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 3294

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 3354

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 3414

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 3474

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3475 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 3534

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGACGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 3594

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3595 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 3654

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 3714

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 100497285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 3774

100497286 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 100497345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 3834

100497346 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCA 100497371
          ||||||||||||||||||||||||||
     3835 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCA 3860

Alignment time is 2.77961 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     5309] =>      5309 nucs 'mol-32-34b3-055210_5309'

Score:        3897
Aligned:      3965        nucs
Identic:      3958 (100%) nucs =>        21 (100%)      3937 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100490785,100490805] EXCISED REGION [100495008,100498949]
 second seq =>  [      240,      260] EXCISED REGION [     1366,     5309]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4202 nucs [100490806,100495007]
 second seq =>      1105 nucs [261,1365]
ALTERNATIVE REGION(S): 3
 first  seq =>      1849 nucs [100493159,100495007]
 second seq =>       394 nucs [972,1365]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [260,260] to [1365,1365]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100490805,100490805] to [100495008,100495008]
 second seq =>         1 nucs [260,260] to [1366,1366]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100490785 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 100490805
          |||||||||||||||||||||
      240 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 260

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1366 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 1425

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 1485

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 1545

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1605

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1665

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1725

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1785

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 GAGATATGGAATCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 1845

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 1905

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 1965

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 2025

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 2085

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 2145

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 2205

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 2265

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 2325

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 2385

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 2445

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 2505

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 2565

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 2625

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 2685

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 2745

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 2805

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 2865

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 2925

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 2985

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 3045

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 3105

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 3165

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 3225

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 3285

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 3345

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3346 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 3405

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 3465

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3466 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 3525

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 3585

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 100497285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 3645

100497286 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 100497345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 3705

100497346 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 100497405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 3765

100497406 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 100497465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 3825

100497466 TAAACTCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 100497525
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3826 TAAACTCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 3885

100497526 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 100497585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 3945

100497586 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 100497645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3946 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 4005

100497646 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 100497705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 4065

100497706 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 100497765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4066 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 4125

100497766 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 100497825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4126 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 4185

100497826 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAA 100497885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4186 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAA 4245

100497886 CAGATATATAGACCAATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAA 100497945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4246 CAGATATATAGACCAATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAA 4305

100497946 CCATCTGTTCTTTGATAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAA 100498005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4306 CCATCTGTTCTTTGATAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAA 4365

100498006 TAAATGGTGTTGGGATAATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACC 100498065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4366 TAAATGGTGTTGGGATAATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACC 4425

100498066 TTAAACAAAAATTAACTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAA 100498125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4426 TTAAACAAAAATTAACTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAA 4485

100498126 AACCCTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCAT 100498185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4486 AACCCTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCAT 4545

100498186 GTCTAAAACACCAAAATCAATTGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAA 100498245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4546 GTCTAAAACACCAAAATCAATTGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAA 4605

100498246 ACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGA 100498305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4606 ACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGA 4665

100498306 ATGAGAGAAAATTTTTGCAATCTATCCATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAA 100498365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4666 ATGAGAGAAAATTTTTGCAATCTATCCATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAA 4725

100498366 AGAACTTAAACAAATTTACAAGAAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGA 100498425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4726 AGAACTTAAACAAATTTACAAGAAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGA 4785

100498426 ACAGACACTTTTCAAAAGAAGACATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCAT 100498485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4786 ACAGACACTTTTCAAAAGAAGACATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCAT 4845

100498486 CATCAGTGGTCATTAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAG 100498545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4846 CATCAGTGGTCATTAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAG 4905

100498546 TTAGAATTATGATCATTAAAAAGTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAA 100498605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4906 TTAGAATTATGATCATTAAAAAGTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAA 4965

100498606 TAGGAATGCTTTTACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAG 100498665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4966 TAGGAATGCTTTTACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAG 5025

100498666 TGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTAC 100498725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5026 TGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTAC 5085

100498726 TGGATATGTACCCAAAGGATTATAAACCATTCTTCCATAAAGACACATGCACACGTATGT 100498785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5086 TGGATATGTACCCAAAGGATTATAAACCATTCTTCCATAAAGACACATGCACACGTATGT 5145

100498786 TTATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACTTGGAACGAACCCAAATGCCCGTCAGTGA 100498845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5146 TTATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACTTGGAACGAACCCAAATGCCCGTCAGTGA 5205

100498846 TAGACTAGAAAAAGAGAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAA 100498905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5206 TAGACTAGAAAAAGAGAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAA 5265

100498906 AGAATGAGTTCATGTCCTTTGCAGGGACATGGATGAAGCTGGAA 100498949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5266 AGAATGAGTTCATGTCCTTTGCAGGGACATGGATGAAGCTGGAA 5309

Alignment time is 4.46754 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     5118] =>      5118 nucs 'mol-32-34b3-101941_5118'

Score:        3449
Aligned:      3714        nucs
Identic:      3685 ( 99%) nucs =>      2914 (100%)       771 ( 98%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100495008,100497930] EXCISED REGION [100497971,100498755]
 second seq =>  [     1366,     4291] EXCISED REGION [     4332,     5116]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        40 nucs [100497931,100497970]
 second seq =>        40 nucs [4292,4331]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [100497929,100497931] to [100497969,100497971]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [100497931,100497932] to [100497969,100497970]
 second seq =>         1 nucs [4292,4292] to [4331,4331]

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1366 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 1425

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 1485

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 1545

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1605

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1665

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1725

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1785

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 1845

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 1905

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 1965

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 2025

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 2085

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 2145

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 2205

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 2265

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 2325

100495968 TGGTTTTTTTTTTT--ATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 2385

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 2445

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 2505

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 2565

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 2625

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 2685

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 2745

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 2805

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 2865

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 2925

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 2985

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 3045

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 3105

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 3165

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 3225

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 3285

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 3345

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3346 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 3405

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 3465

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3466 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 3525

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 3585

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 100497285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 3645

100497286 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 100497345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 3705

100497346 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 100497405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 3765

100497406 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 100497465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 3825

100497466 TAAACTCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 100497525
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3826 TAAACTCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 3885

100497526 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 100497585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 3945

100497586 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 100497645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3946 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 4005

100497646 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 100497705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 4065

100497706 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 100497765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4066 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCGTATGGAAACAAAAAA 4125

100497766 GAGCCCATATAGTCAAGACAATC-TAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTAC 100497824
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4126 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTAC 4185

100497825 CTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAA 100497884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4186 CTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCATGGTACTGGTACCAAA 4245

100497885 ACAGATATATAGACCAATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAAC 100497930
          |||||.|||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4246 ACAGAGATATAGATCAATGGAACAGAACAGAGCCCTCAGAAATAAC 4291

EXCISED REGION

100497971 AAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGTTGGGATAATTGGCTA 100498030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4332 AAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGTTGGGATAATTGGCTA 4391

100498031 GCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAAAAATTAACTCAAGATGG 100498090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4392 GCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAAAAATTAACTCAAGATGG 4451

100498091 ATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAAAACCCTAGAAGAAAACCTAGGCAAT 100498150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4452 ATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAAAACCCTAGAAGAAAACCTAGGCAAT 4511

100498151 ACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCATGTCTAAAACACCAAAATCAATTGCA 100498210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4512 ACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCATGTCTAAAACACCAAAATCAATTGCA 4571

100498211 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAA 100498270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4572 ACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCATAGCAAAA 4631

100498271 GAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGAGAGAAAATTTTTGCAATCTAT 100498330
          |||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||.||  
     4632 GAAACTACCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAAAATGGGAGAAAATTTTTGCAACCT-- 4689

100498331 C---CATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAAAGAACTTAAACAAATTTACAAG 100498387
              |||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
     4690 -ACTCATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAATTTACAAG 4748

100498388 AAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAGA 100498447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4749 AAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAGAAGA 4808

100498448 CATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCATCATCAGTGGTCATTAGAGAAAT 100498507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4809 CATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCATCATCAGTGGTCATTAGAGAAAT 4868

100498508 GCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAGTTAGAATTATGATCATTAAAAA 100498567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4869 GCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAGTTAGAATTATGATCATTAAAAA 4928

100498568 GTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAATAGGAATGCTTTTACACTGTTG 100498627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4929 GTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAATAGGAATGCTTTTACACTGTTG 4988

100498628 GTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 100498687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4989 GTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCT 5048

100498688 AGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGATATGTACCCAAAGGATTA 100498747
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||
     5049 AGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGGATTA 5108

100498748 TAAACCAT 100498755
          ||||||||
     5109 TAAACCAT 5116

Alignment time is 3.68192 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,    10328] =>     10328 nucs 'mol-32-34c9-007097_10328'

Score:        8727
Aligned:      8876        nucs
Identic:      8860 (100%) nucs =>        21 (100%)      8839 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100490785,100490805] EXCISED REGION [100495008,100503858]
 second seq =>  [      351,      371] EXCISED REGION [     1477,    10328]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4202 nucs [100490806,100495007]
 second seq =>      1105 nucs [372,1476]
ALTERNATIVE REGION(S): 3
 first  seq =>      1849 nucs [100493159,100495007]
 second seq =>       394 nucs [1083,1476]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [371,371] to [1476,1476]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100490805,100490805] to [100495008,100495008]
 second seq =>         1 nucs [371,371] to [1477,1477]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100490785 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 100490805
          |||||||||||||||||||||
      351 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 371

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 1536

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 1596

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 1656

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1716

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1776

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1836

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1896

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 GAGATATGGAATCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 1956

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 2016

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 2076

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 2136

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 2196

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 2256

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 2316

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 2376

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 2436

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 2496

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 2556

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 2616

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 2676

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 2736

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 2796

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 2856

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 2916

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 2976

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 3036

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 3096

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 3156

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 3216

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 3276

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 3336

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 3396

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 3456

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3457 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 3516

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 3576

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3577 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 3636

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 3696

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 100497285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 3756

100497286 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 100497345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 3816

100497346 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 100497405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 3876

100497406 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 100497465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 3936

100497466 TAAACTCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 100497525
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 TAAACTCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 3996

100497526 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 100497585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 4056

100497586 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 100497645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 4116

100497646 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 100497705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 4176

100497706 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 100497765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 4236

100497766 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 100497825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 4296

100497826 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAA 100497885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAA 4356

100497886 CAGATATATAGACCAATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAA 100497945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 CAGATATATAGACCAATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAA 4416

100497946 CCATCTGTTCTTTGATAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAA 100498005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 CCATCTGTTCTTTGATAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAA 4476

100498006 TAAATGGTGTTGGGATAATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACC 100498065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 TAAATGGTGTTGGGATAATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACC 4536

100498066 TTAAACAAAAATTAACTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAA 100498125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 TTAAACAAAAATTAACTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAA 4596

100498126 AACCCTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCAT 100498185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 AACCCTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCAT 4656

100498186 GTCTAAAACACCAAAATCAATTGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAA 100498245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 GTCTAAAACACCAAAATCAATTGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAA 4716

100498246 ACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGA 100498305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 ACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGA 4776

100498306 ATGAGAGAAAATTTTTGCAATCTATCCATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAA 100498365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 ATGAGAGAAAATTTTTGCAATCTATCCATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAA 4836

100498366 AGAACTTAAACAAATTTACAAGAAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGA 100498425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 AGAACTTAAACAAATTTACAAGAAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGA 4896

100498426 ACAGACACTTTTCAAAAGAAGACATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCAT 100498485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 ACAGACACTTTTCAAAAGAAGACATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCAT 4956

100498486 CATCAGTGGTCATTAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAG 100498545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 CATCAGTGGTCATTAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAG 5016

100498546 TTAGAATTATGATCATTAAAAAGTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAA 100498605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 TTAGAATTATGATCATTAAAAAGTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAA 5076

100498606 TAGGAATGCTTTTACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAG 100498665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5077 TAGGAATGCTTTTACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAG 5136

100498666 TGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTAC 100498725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 TGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTAC 5196

100498726 TGGATATGTACCCAAAGGATTATAAACCATTCTTCCATAAAGACACATGCACACGTATGT 100498785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 TGGATATGTACCCAAAGGATTATAAACCATTCTTCCATAAAGACACATGCACACGTATGT 5256

100498786 TTATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACTTGGAACGAACCCAAATGCCCGTCAGTGA 100498845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5257 TTATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACTTGGAACGAACCCAAATGCCCGTCAGTGA 5316

100498846 TAGACTAGAAAAAGAGAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAA 100498905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5317 TAGACTAGAAAAAGAGAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAA 5376

100498906 AGAATGAGTTCATGTCCTTTGCAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAGCA 100498965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5377 AGAATGAGTTCATGTCCTTTGCAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAGCA 5436

100498966 AACTAACACAGGAACAGAAAATCAAACACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGGTGAA 100499025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5437 AACTAACACAGGAACAGAAAATCAAACACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGGTGAA 5496

100499026 TAATGAGAACATATGGGCACAGGGAGGGAAACATCACACACTGTGGTCTGTCGTGGGGAG 100499085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5497 TAATGAGAACATATGGGCACAGGGAGGGAAACATCACACACTGTGGTCTGTCGTGGGGAG 5556

100499086 TGGGGTAGGGGAGCGATATCATTAGGACAAATACCTAGTGTAGATGACAGGTTGATGGGT 100499145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5557 TGGGGTAGGGGAGCGATATCATTAGGACAAATACCTAGTGTAGATGACAGGTTGATGGGT 5616

100499146 ACAGCAAACCACCATGGCACATGTATACCTATATAACAAGCCTGCCCATTCTGCACATGT 100499205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5617 ACAGCAAACCACCATGGCACATGTATACCTATATAACAAGCCTGCCCATTCTGCACATGT 5676

100499206 AAAAAAAAAAAGAAGAAGAAAAAAAGAAAAAAAAGTACATAAATACATCATACATTTATC 100499265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5677 AAAAAAAAAAAGAAGAAGAAAAAAAGAAAAAAAAGTACATAAATACATCATACATTTATC 5736

100499266 CACCTAAACTCAGGCTAAAAGCTTAATAAATATTGAGGGAATGCATTAATCAAGCTGTGC 100499325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5737 CACCTAAACTCAGGCTAAAAGCTTAATAAATATTGAGGGAATGCATTAATCAAGCTGTGC 5796

100499326 TGCCAGAATCATAAGAATCATCATCTCTGACTTTCTAAGGTCAGAAACTTGATTTTACAA 100499385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5797 TGCCAGAATCATAAGAATCATCATCTCTGACTTTCTAAGGTCAGAAACTTGATTTTACAA 5856

100499386 AATTACTTAGTAGACAGGCTCCAGAGAACTGAGTCATATAACTAATTCTTATAAAAGAAT 100499445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5857 AATTACTTAGTAGACAGGCTCCAGAGAACTGAGTCATATAACTAATTCTTATAAAAGAAT 5916

100499446 AACATGTGAATGTATATAGGTCAGGTTATGGGTATGAATATATAATATTGATTCAATAAT 100499505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5917 AACATGTGAATGTATATAGGTCAGGTTATGGGTATGAATATATAATATTGATTCAATAAT 5976

100499506 TAATTATAGTAGCTTTTACTTGCTTATAGAAATGGGCAGATATATTTGGGAAGCACATTT 100499565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5977 TAATTATAGTAGCTTTTACTTGCTTATAGAAATGGGCAGATATATTTGGGAAGCACATTT 6036

100499566 ATAGTTCATAATGTAGTTCAGTGTTCATTCAATTAGAGGTATTACATTATCTTAAGGTAA 100499625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6037 ATAGTTCATAATGTAGTTCAGTGTTCATTCAATTAGAGGTATTACATTATCTTAAGGTAA 6096

100499626 TTTTTGTGATTAAGTATAGCTCTCTAGAGAACAAACACCATTTCCCTGAAATGGAGTTGG 100499685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6097 TTTTTGTGATTAAGTATAGCTCTCTAGAGAACAAACACCATTTCCCTGAAATGGAGTTGG 6156

100499686 ACTAGAATTTATATACACTTCCAGAGTTTGAGTCCCAGCTTCAAAAATTTCTCCAGTTCT 100499745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6157 ACTAGAATTTATATACACTTCCAGAGTTTGAGTCCCAGCTTCAAAAATTTCTCCAGTTCT 6216

100499746 TTCTTACTTTAGATTCACCAATGGTTAATATAAATGTAAAAATCTGTAATCATTACATTA 100499805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6217 TTCTTACTTTAGATTCACCAATGGTTAATATAAATGTAAAAATCTGTAATCATTACATTA 6276

100499806 ATCAGTTACAGAGTTTACAATTTATGGACATTTAGGGAAATATGTTATATCCAAAGAAAG 100499865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6277 ATCAGTTACAGAGTTTACAATTTATGGACATTTAGGGAAATATGTTATATCCAAAGAAAG 6336

100499866 TAATTGTAAAAAAGTATGGTGTCAAGAAAGTCATTTTTTTTTGTTTTGCTTTTGATTTTC 100499925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6337 TAATTGTAAAAAAGTATGGTGTCAAGAAAGTCATTTTTTTTTGTTTTGCTTTTGATTTTC 6396

100499926 TTTTCTTTTGTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACCATGTCACCCAGGTTCAAGA 100499985
          ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6397 TTTTCTTTTGTC--TTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACCATGTCACCCAGGTTCAAGA 6454

100499986 ACAGTAGCATGATCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGACCCTCCAG 100500045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6455 ACAGTAGCATGATCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGACCCTCCAG 6514

100500046 CCTCAGTCTCCCAAGTACCCAGGATCACAGGTGCATGCTACCACGCCCAGCTAATTTTCT 100500105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6515 CCTCAGTCTCCCAAGTACCCAGGATCACAGGTGCATGCTACCACGCCCAGCTAATTTTCT 6574

100500106 AGTTTTTTGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGCTGTGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAA 100500165
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6575 AGTTTTTTGTAGAGATGGGGTCTTGCTATACTGTGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAA 6634

100500166 GAAATCCTCCCATCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACCATGCCT 100500225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6635 GAAATCCTCCCATCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACCATGCCT 6694

100500226 GGCCGAAGAAAGTCATTCTTTCATATTCTTTAACATCCTAACCTTTCTCATCTTTGCCTC 100500285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6695 GGCCGAAGAAAGTCATTCTTTCATATTCTTTAACATCCTAACCTTTCTCATCTTTGCCTC 6754

100500286 TTGATATTGGGTATATCTTGCTTTTGTGGTCTGTAGCCCACACTATTCACTGCTTTCAAA 100500345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6755 TTGATATTGGGTATATCTTGCTTTTGTGGTCTGTAGCCCACACTATTCACTGCTTTCAAA 6814

100500346 GAAGAGGAAAAGAGGTAGGTTAGTCACTTAAAGTTTAGCCACTCTAGAAGAAACAATCAC 100500405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6815 GAAGAGGAAAAGAGGTAGGTTAGTCACTTAAAGTTTAGCCACTCTAGAAGAAACAATCAC 6874

100500406 AGAAACTTATACTTTGTTTTTTCCAATGCTAGATTTGCTCTAGAGATAAAATACTTGTTA 100500465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6875 AGAAACTTATACTTTGTTTTTTCCAATGCTAGATTTGCTCTAGAGATAAAATACTTGTTA 6934

100500466 ACATGGTGTAGGTATATGGAAAGATGAGTGATAAGAAGACTGACCTGTTCTATTGTCCTT 100500525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6935 ACATGGTGTAGGTATATGGAAAGATGAGTGATAAGAAGACTGACCTGTTCTATTGTCCTT 6994

100500526 TCCTGAATGTGAATATAATGATTAAATGATTACCTCTGTCCAAAAAGATAAGGTTACAAA 100500585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6995 TCCTGAATGTGAATATAATGATTAAATGATTACCTCTGTCCAAAAAGATAAGGTTACAAA 7054

100500586 GCAGAAATGGCTAGAATATTGGAGAAACATGTCTACCATGAAAATATTTTGAGGGGGAAG 100500645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7055 GCAGAAATGGCTAGAATATTGGAGAAACATGTCTACCATGAAAATATTTTGAGGGGGAAG 7114

100500646 AGGCTCAATATACAACACAGAATAGTTTTGAGCAGAATACTGTACATTGGATATCTTAAG 100500705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7115 AGGCTCAATATACAACACAGAATAGTTTTGAGCAGAATACTGTACATTGGATATCTTAAG 7174

100500706 AGAGATGATTCTAGTACAAGAAAAACTATCAGTAGTTGTAAAATGAATTAGAGAAACAGC 100500765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7175 AGAGATGATTCTAGTACAAGAAAAACTATCAGTAGTTGTAAAATGAATTAGAGAAACAGC 7234

100500766 AAAATAAATCTTCAAACAATAAAATGTATTCTTTAGACTCTAAAATGTAGCTTTAATAAA 100500825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7235 AAAATAAATCTTCAAACAATAAAATGTATTCTTTAGACTCTAAAATGTAGCTTTAATAAA 7294

100500826 TGATTATTTATCATTAATAATCATTTATTATTTATTAATCATTTATTATGGTTACAGAAA 100500885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7295 TGATTATTTATCATTAATAATCATTTATTATTTATTAATCATTTATTATGGTTACAGAAA 7354

100500886 AAATAGAAAGGCACTCTAAGGGGAAAACACTAAATCTAGATTTTCTGACGAGATTCATAA 100500945
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7355 AAATAGAAAGGCACTTTAAGGGGAAAACACTAAATCTAGATTTTCTGACGAGATTCATAA 7414

100500946 TGACCTATAGAAATACACATTATTGGCTATTTTTCACTTTATTGAGTTTTTTTTGTTCTT 100501005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7415 TGACCTATAGAAATACACATTATTGGCTATTTTTCACTTTATTGAGTTTTTTTTGTTCTT 7474

100501006 TTCCTATCTATATTCCTATTTTCTTATCAATGACAGTGCCCTTTCTCCTCTTTATAAATA 100501065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7475 TTCCTATCTATATTCCTATTTTCTTATCAATGACAGTGCCCTTTCTCCTCTTTATAAATA 7534

100501066 ATTCTTTGTTGTTGTTAACCCCTGAGGAGGCACTTTAAAAGACAATGATGGGAACCAAAT 100501125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7535 ATTCTTTGTTGTTGTTAACCCCTGAGGAGGCACTTTAAAAGACAATGATGGGAACCAAAT 7594

100501126 GATGTGTGGTTAAGGTGTCTAAATAACATTTTTTTAAGTGTAATTAGCTCCCTTTCTGAA 100501185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7595 GATGTGTGGTTAAGGTGTCTAAATAACATTTTTTTAAGTGTAATTAGCTCCCTTTCTGAA 7654

100501186 CTATGTAGCACAGTCTGAAGGAAGGAGGTTGATGGGGAGGGGCAAGTTCTTACTTGTCTG 100501245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7655 CTATGTAGCACAGTCTGAAGGAAGGAGGTTGATGGGGAGGGGCAAGTTCTTACTTGTCTG 7714

100501246 GAACAGATATATACAGAAAGATGTATATATTCTCTTCTCCAACCCACCCCCGCCACAAAA 100501305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7715 GAACAGATATATACAGAAAGATGTATATATTCTCTTCTCCAACCCACCCCCGCCACAAAA 7774

100501306 TCACTCCAATTATGCCAGTTGTAGATTTATTTAATTTAACAAGCTCCCACATTCAGAGAT 100501365
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     7775 TCACTCCAATTATGCCAGTTGTAGATTTATTTAATTTAACAAGCTCCCACACTCAGAGAT 7834

100501366 GCCAAAAACCCTAGAATAATTATTCCCATCAATCACTTGTAGGTAAGTTTTAATTGCTTT 100501425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7835 GCCAAAAACCCTAGAATAATTATTCCCATCAATCACTTGTAGGTAAGTTTTAATTGCTTT 7894

100501426 GGGCGTATCTATTATTAGTTGAGATGTTTTACAAACCAGTTTTATGTAGGCAGCACAATA 100501485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7895 GGGCGTATCTATTATTAGTTGAGATGTTTTACAAACCAGTTTTATGTAGGCAGCACAATA 7954

100501486 TTTTTACAAGAAAACCAAACAAAGCCTTTGGGCATGTATTCTCCAGTTCAACAAAAGCCC 100501545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7955 TTTTTACAAGAAAACCAAACAAAGCCTTTGGGCATGTATTCTCCAGTTCAACAAAAGCCC 8014

100501546 CACCATTCTTTAGTGTCTGATACTCACCTCTTTTAACCATTATGCCTAATTGGTCTCTCA 100501605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8015 CACCATTCTTTAGTGTCTGATACTCACCTCTTTTAACCATTATGCCTAATTGGTCTCTCA 8074

100501606 TGGCAGGTGTCATGCCCTGTTTGAAGAATATTTTGCCCTGTTTGGAGAATAAAGCTAAGT 100501665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8075 TGGCAGGTGTCATGCCCTGTTTGAAGAATATTTTGCCCTGTTTGGAGAATAAAGCTAAGT 8134

100501666 TGGGCAGAGCCTGATATTTGAGGAGGGTAAGGTTAGGTGAGTGGTCATGAGTATACAACA 100501725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8135 TGGGCAGAGCCTGATATTTGAGGAGGGTAAGGTTAGGTGAGTGGTCATGAGTATACAACA 8194

100501726 TAAAATACCAAAAAATGTCAAAAAATATAAATAGAAGATGGGATGGAAAGGGATCAGTAA 100501785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8195 TAAAATACCAAAAAATGTCAAAAAATATAAATAGAAGATGGGATGGAAAGGGATCAGTAA 8254

100501786 AAGACTTTACTGACAATGTAATACTTTTGCCTACTTCAAAGCTGATCATATCATTCCTGC 100501845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8255 AAGACTTTACTGACAATGTAATACTTTTGCCTACTTCAAAGCTGATCATATCATTCCTGC 8314

100501846 TTTTGTTGTCAAATGTATGATACTCAGGCAAGTCTGGAATACGAAAAACTTCAGGCTACC 100501905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8315 TTTTGTTGTCAAATGTATGATACTCAGGCAAGTCTGGAATACGAAAAACTTCAGGCTACC 8374

100501906 CTAGTTGAGACTCCTACAGTCATGGTATCCTGAGTTTAACTCAACAGGTCTCCATTTGGT 100501965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8375 CTAGTTGAGACTCCTACAGTCATGGTATCCTGAGTTTAACTCAACAGGTCTCCATTTGGT 8434

100501966 CAACTAACTATCCCCAAATTTCCACAGGTAAAGAAGAGAGAAAAGCAGAGAAAGAGGAAA 100502025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8435 CAACTAACTATCCCCAAATTTCCACAGGTAAAGAAGAGAGAAAAGCAGAGAAAGAGGAAA 8494

100502026 GAAACTGAGGGCTACGTTCCAGTTAGTGGCTACTGGTAGGAAAGTTGGACATTTATTCTT 100502085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8495 GAAACTGAGGGCTACGTTCCAGTTAGTGGCTACTGGTAGGAAAGTTGGACATTTATTCTT 8554

100502086 TTCTTCCCTTGCCATCTTATTTTGAGAAATCCAAATTCCAAGATGCAATAAATACACATG 100502145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8555 TTCTTCCCTTGCCATCTTATTTTGAGAAATCCAAATTCCAAGATGCAATAAATACACATG 8614

100502146 GGCACACACACACACTCACACATATAGTGCTCCAAACAAATATGGGTTAGCTAGAGACAT 100502205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8615 GGCACACACACACACTCACACATATAGTGCTCCAAACAAATATGGGTTAGCTAGAGACAT 8674

100502206 ATAAGACTGTTAATGAAAATGTTGGAATCAATTTGCATCAGTAATTTTAAGAGAATTCTT 100502265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8675 ATAAGACTGTTAATGAAAATGTTGGAATCAATTTGCATCAGTAATTTTAAGAGAATTCTT 8734

100502266 GGTTTGTTCGATTCAATTGTTTTGTTCTAAAGTATACCAAAAGGTCTTTTAATTTGAGAA 100502325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8735 GGTTTGTTCGATTCAATTGTTTTGTTCTAAAGTATACCAAAAGGTCTTTTAATTTGAGAA 8794

100502326 TCACATATTTTCATATCTATACTATCAATAATTTTAACTATAATCCATATTGACTCAATA 100502385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8795 TCACATATTTTCATATCTATACTATCAATAATTTTAACTATAATCCATATTGACTCAATA 8854

100502386 TTACAGATTCATGAAATCTACAGAATAACATATGTCACAAATAAATATATATCATTGAGA 100502445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8855 TTACAGATTCATGAAATCTACAGAATAACATATGTCACAAATAAATATATATCATTGAGA 8914

100502446 AAATAGCACGATTTAGGAAATATTTCTCCAAATTGTGTTCCATGGAGTATTGTTCCATGG 100502505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8915 AAATAGCACGATTTAGGAAATATTTCTCCAAATTGTGTTCCATGGAGTATTGTTCCATGG 8974

100502506 AATGAATGATAACTTATGTTACACATACACACACACACATACAT--ACACACACACACAC 100502563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||
     8975 AATGAATGATAACTTATGTTACACATACACACACACACATACATACACACACACACACAC 9034

100502564 ACACACACACACTTTAATGATTAAACAGGACTGGCTACATAATTTTCAGGTCCCCATGAA 100502623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9035 ACACACACACACTTTAATGATTAAACAGGACTGGCTACATAATTTTCAGGTCCCCATGAA 9094

100502624 AAATGAAACTATGAGTCCCCTCGTTAAAACATTATTATGAATTTCAAGATGGTGACTGCA 100502683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9095 AAATGAAACTATGAGTCCCCTCGTTAAAACATTATTATGAATTTCAAGATGGTGACTGCA 9154

100502684 GAGAATGAAACCAAGAATGGGTCTCTTCTTTTTTTTCCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTT 100502743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||| |||||||||||
     9155 GAGAATGAAACCAAGAATGGGTCTCTTCTTTTTTTTTCTTTTCTTTTC-TTTTTTTTTTT 9213

100502744 TTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCATGATCTCAGCTC 100502803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9214 TTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTAGTGGCATGATCTCAGCTC 9273

100502804 ACTGCAACCTTCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTG 100502863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9274 ACTGCAACCTTCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTG 9333

100502864 GGATTATAGGCGGCTGCCACCACGTCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGTCGGGGT 100502923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9334 GGATTATAGGCGGCTGCCACCACGTCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGTCGGGGT 9393

100502924 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCAAATTCCTGACCTCGTGATCCGCCTACCTAGGCC 100502983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9394 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCAAATTCCTGACCTCGTGATCCGCCTACCTAGGCC 9453

100502984 TCCCAAAGTGCTGGTATTACAGGCCTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGAATGGGTCTCTTC 100503043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9454 TCCCAAAGTGCTGGTATTACAGGCCTGAGCCACCACGCCCAGCCAAGAATGGGTCTCTTC 9513

100503044 TAAGCATGGGCCCTATGTGACTGCACAGGCTGCACACCCTTGAAACTAGCCTCGGTTAAA 100503103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9514 TAAGCATGGGCCCTATGTGACTGCACAGGCTGCACACCCTTGAAACTAGCCTCGGTTAAA 9573

100503104 TTGTTTAAGAAATGCTGGGTTAAAAAATGTCTAACAGATTTCTTTGCAACAAGACTTCTT 100503163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9574 TTGTTTAAGAAATGCTGGGTTAAAAAATGTCTAACAGATTTCTTTGCAACAAGACTTCTT 9633

100503164 ATAGCCTTTTATATACTAATGTGCACTGTGAACCTTCAGGAGGTTCACATACTGTATAAA 100503223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9634 ATAGCCTTTTATATACTAATGTGCACTGTGAACCTTCAGGAGGTTCACATACTGTATAAA 9693

100503224 GGTCCTCAAATATATTTGACCAAAGCTCTTTTCAATTATTATTTTAGAAGGATCATCTTG 100503283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9694 GGTCCTCAAATATATTTGACCAAAGCTCTTTTCAATTATTATTTTAGAAGGATCATCTTG 9753

100503284 TAGGACCAATGTTCCACAGAACACACATTGTAAAAGGCAGCTCAGGCTGTGCAAACAGGT 100503343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9754 TAGGACCAATGTTCCACAGAACACACATTGTAAAAGGCAGCTCAGGCTGTGCAAACAGGT 9813

100503344 TATAAAATCAATTTGTTAGTCATAAATCACTATATATTTCCCATTTTGTGGCATTTTCCC 100503403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9814 TATAAAATCAATTTGTTAGTCATAAATCACTATATATTTCCCATTTTGTGGCATTTTCCC 9873

100503404 CATATTTGGAATGAGGTAACTAGAGATAACTATAGATGCAAATGGTGTGTATTCACTAAA 100503463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9874 CATATTTGGAATGAGGTAACTAGAGATAACTATAGATGCAAATGGTGTGTATTCACTAAA 9933

100503464 TATACTGTCCTTCACTATTTGGTCTTCTACCATTTGGATAGTCAACTCAGTGGCCAAACA 100503523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9934 TATACTGTCCTTCACTATTTGGTCTTCTACCATTTGGATAGTCAACTCAGTGGCCAAACA 9993

100503524 TCACAAACGTTTTCTGGGCCAGGGTACTAGAGATGGTCTGATTGAGACTGTATCACAAGC 100503583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9994 TCACAAACGTTTTCTGGGCCAGGGTACTAGAGATGGTCTGATTGAGACTGTATCACAAGC 10053

100503584 CAACTTATTTTTCCCCTTTATTTTGTCAATTCAGAGGAAGTAACATCCTTACTTACCATT 100503643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10054 CAACTTATTTTTCCCCTTTATTTTGTCAATTCAGAGGAAGTAACATCCTTACTTACCATT 10113

100503644 ACCCAGTTCCCAAGAAATGTTGTACTTTTTGCTGGCGCTGTACTTCAACAGACTCAGGGC 100503703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10114 ACCCAGTTCCCAAGAAATGTTGTACTTTTTGCTGGCGCTGTACTTCAACAGACTCAGGGC 10173

100503704 ACTAGAACTGTTCCAGGAGTTATTGGGATTACGACGCAGTGCATTTAGAGCAAATATCAG 100503763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10174 ACTAGAACTGTTCCAGGAGTTATTGGGATTACGACGCAGTGCATTTAGAGCAAATATCAG 10233

100503764 GTGGAGTCCAGAGCAATCAGCAAAGTTATAAAGTTTGTCTAGAGACCTGGCTGGGAAGAA 100503823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10234 GTGGAGTCCAGAGCAATCAGCAAAGTTATAAAGTTTGTCTAGAGACCTGGCTGGGAAGAA 10293

100503824 GCAGAGAAAGGCTTGTAACTTTCAAATCAACATTC 100503858
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10294 GCAGAGAAAGGCTTGTAACTTTCAAATCAACATTC 10328

Alignment time is 7.87896 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     3521] =>      3521 nucs 'mol-32-34c9-151371_3521'

Score:        2016
Aligned:      2029        nucs
Identic:      2027 (100%) nucs =>        21 (100%)      2006 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100490785,100490805] EXCISED REGION [100495008,100497013]
 second seq =>  [      388,      408] EXCISED REGION [     1514,     3521]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4202 nucs [100490806,100495007]
 second seq =>      1105 nucs [409,1513]
ALTERNATIVE REGION(S): 3
 first  seq =>      1849 nucs [100493159,100495007]
 second seq =>       394 nucs [1120,1513]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [408,408] to [1513,1513]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100490805,100490805] to [100495008,100495008]
 second seq =>         1 nucs [408,408] to [1514,1514]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100490785 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 100490805
          |||||||||||||||||||||
      388 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 408

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 1573

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 1633

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 1693

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1753

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1813

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1873

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1933

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 1993

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 2053

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 2113

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 2173

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 2233

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 2293

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 2353

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 2413

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 2473

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 2533

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 2593

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 2653

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2654 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 2713

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 2773

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2774 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 2833

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 2893

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2894 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 2953

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2954 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 3013

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3014 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 3073

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3074 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 3133

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3134 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 3193

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3194 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 3253

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3254 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 3313

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3314 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 3373

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3374 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 3433

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3434 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 3493

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATA 100497013
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3494 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATA 3521

Alignment time is 2.53516 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     7056] =>      7056 nucs 'mol-32-34c9-169300_7056'

Score:        5623
Aligned:      5713        nucs
Identic:      5704 (100%) nucs =>        21 (100%)      5683 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100490785,100490805] EXCISED REGION [100495008,100500697]
 second seq =>  [      240,      260] EXCISED REGION [     1366,     7056]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4202 nucs [100490806,100495007]
 second seq =>      1105 nucs [261,1365]
ALTERNATIVE REGION(S): 3
 first  seq =>      1849 nucs [100493159,100495007]
 second seq =>       394 nucs [972,1365]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [260,260] to [1365,1365]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [100490805,100490805] to [100495008,100495008]
 second seq =>         1 nucs [260,260] to [1366,1366]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

100490785 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 100490805
          |||||||||||||||||||||
      240 TAATCCCAACACTTTGGGAGG 260

EXCISED REGION

100495008 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 100495067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1366 GCTCCAGAAGGTGCAAGCCCCAAGCCTTGGCAGCTTCCACATGGTATTGAGCCTGCAGGT 1425

100495068 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 100495127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 GCATAGAAGTCAAGAATTGAGGTTTGGGAGCCTCTGCCTAGATTTCAGAGGATGTATAGA 1485

100495128 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 100495187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 AATGCCTGTATATCCAGGCAAAAGTTTGCTACAGGGGTGAAGCCCTCACAAAGAACCTCT 1545

100495188 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 100495247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 GTTAGGGCAGTGTGGAAGGGAGAAGTGGGGTTGAAGCCCCCATAAAGAGTCCCCACTGGG 1605

100495248 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 100495307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 GCACTGCCTAGTAGAGCCATGAGAAGAGGGCCACCACCCTTTAGACCTCAGAAAAGCTCC 1665

100495308 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 100495367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 AGAGACTCAATGCCAGCCCATGAAGGCAGCCAGGAATGGGGCTGTACTCTGTAAAGCCAC 1725

100495368 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 100495427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 AGGGGCAGAACTGCCCAAGACCACGGGAACCCATCTTTTGCATTGGCGTGACCTGGATGT 1785

100495428 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 100495487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 GAGATATGGAGTCAAAGGAGATCATTTGGGAGCTTTACGATTTGACTGCCCTGCTTGATT 1845

100495488 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 100495547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 TCAGACTTGCATGTGGCCATTAGCCCCTTTATTTTGGCTAATTTCTCCCATTTGGAACAG 1905

100495548 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 100495607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 CTGTATTTATCCAATGCCTGTTCTACCATTTATCTAGGAAGTAACTAACTTGCTTTTGAT 1965

100495608 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 100495667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 TTTACAGGCTCATAGGCAGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTA 2025

100495668 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 100495727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 CTTTTGAGTTAATGCTGAAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTG 2085

100495728 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 100495787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 GTTTTTAAAAATGAGGACATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGG 2145

100495788 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 100495847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 TTTGGCTGTGTCCCCACTCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTT 2205

100495848 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 100495907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 GTGGGAGGGACCCAGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCT 2265

100495908 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 100495967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 CATGGTAGTGAATAAGTCTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCT 2325

100495968 TGG--TTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 100496025
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 TGGTTTTTTTTTTTTTATTCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTC 2385

100496026 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 100496085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 TGCCATGATTGTGAGGCCACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTC 2445

100496086 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 100496145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 TTTATAAATTACCTAGTCTCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATAC 2505

100496146 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 100496205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 AGCAGCTGTCCCACAAATGTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTA 2565

100496206 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 100496265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 GTGAGAGAACATGATTCTCCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACT 2625

100496266 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 100496325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 TCACTCACTTCCCTTAATAATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTA 2685

100496326 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 100496385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 TGAATTTATGAATACATTTGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTT 2745

100496386 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 100496445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 TAACAATTTTCCTGATTCAGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTC 2805

100496446 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 100496505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 TAGCATATAAGAGTTTAATAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGAT 2865

100496506 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 100496565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 ACTAAACTCCTGGAGACTAGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATG 2925

100496566 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 100496625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 TTATGCCAAGCTATAAAGTAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCAT 2985

100496626 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 100496685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 TTCACACTTGGCATATTTTGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTA 3045

100496686 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 100496745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 AATACCATGAGAGTATGTTTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAG 3105

100496746 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 100496805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 GTTGAAGGAGAGAAGCAGACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTA 3165

100496806 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 100496865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 TATGGTTTCTTGTTTTTTTCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAA 3225

100496866 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 100496925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 ACTCTATGTTCTGAAAATACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAAT 3285

100496926 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 100496985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 AATTGACAATATGTGTGAAGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATAT 3345

100496986 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGA 100497045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3346 ACACATAAAAATACAGGACCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGA 3405

100497046 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 100497105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 ACATAAATGCAATTCCCTGGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCC 3465

100497106 AGCAAGACCAACACAGAAGGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCAT 100497165
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3466 AGCAAGACCAACACAGAAGGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCAT 3525

100497166 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 100497225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 CTCATTGGGACTGGTTAGACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCAC 3585

100497226 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 100497285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 TATCCATCACAGCATAGTCCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACC 3645

100497286 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 100497345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 CCTTGCACTTCCTGGGTGAGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAG 3705

100497346 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 100497405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 CCCCAAAACTCCTTAAGCTGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGT 3765

100497406 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 100497465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 GCAAAAATCACAAGCATTCCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAG 3825

100497466 TAAACTCCCATTCACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 100497525
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3826 TAAACTCCCATTTACAATTGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAG 3885

100497526 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 100497585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 GGATGTGAAGGACTTCTTCCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGA 3945

100497586 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 100497645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3946 CACAAACAAGTGGAAAAACCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAAT 4005

100497646 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 100497705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 GACCATACTGCCCAAAGTAATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGAC 4065

100497706 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 100497765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4066 TTTCTTCACAGAAGTAGAAAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAA 4125

100497766 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 100497825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4126 GAGCCCATATAGTCAAGACAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACC 4185

100497826 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAA 100497885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4186 TGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAA 4245

100497886 CAGATATATAGACCAATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAA 100497945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4246 CAGATATATAGACCAATGGAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAA 4305

100497946 CCATCTGTTCTTTGATAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAA 100498005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4306 CCATCTGTTCTTTGATAAACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAA 4365

100498006 TAAATGGTGTTGGGATAATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACC 100498065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4366 TAAATGGTGTTGGGATAATTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACC 4425

100498066 TTAAACAAAAATTAACTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAA 100498125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4426 TTAAACAAAAATTAACTCAAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAA 4485

100498126 AACCCTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCAT 100498185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4486 AACCCTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCAT 4545

100498186 GTCTAAAACACCAAAATCAATTGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAA 100498245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4546 GTCTAAAACACCAAAATCAATTGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAA 4605

100498246 ACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGA 100498305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4606 ACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGA 4665

100498306 ATGAGAGAAAATTTTTGCAATCTATCCATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAA 100498365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4666 ATGAGAGAAAATTTTTGCAATCTATCCATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAA 4725

100498366 AGAACTTAAACAAATTTACAAGAAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGA 100498425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4726 AGAACTTAAACAAATTTACAAGAAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGA 4785

100498426 ACAGACACTTTTCAAAAGAAGACATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCAT 100498485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4786 ACAGACACTTTTCAAAAGAAGACATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCAT 4845

100498486 CATCAGTGGTCATTAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAG 100498545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4846 CATCAGTGGTCATTAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAG 4905

100498546 TTAGAATTATGATCATTAAAAAGTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAA 100498605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4906 TTAGAATTATGATCATTAAAAAGTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAA 4965

100498606 TAGGAATGCTTTTACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAG 100498665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4966 TAGGAATGCTTTTACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAG 5025

100498666 TGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTAC 100498725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5026 TGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTAC 5085

100498726 TGGATATGTACCCAAAGGATTATAAACCATTCTTCCATAAAGACACATGCACACGTATGT 100498785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5086 TGGATATGTACCCAAAGGATTATAAACCATTCTTCCATAAAGACACATGCACACGTATGT 5145

100498786 TTATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACTTGGAACGAACCCAAATGCCCGTCAGTGA 100498845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5146 TTATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAAACTTGGAACGAACCCAAATGCCCGTCAGTGA 5205

100498846 TAGACTAGAAAAAGAGAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAA 100498905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5206 TAGACTAGAAAAAGAGAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAA 5265

100498906 AGAATGAGTTCATGTCCTTTGCAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAGCA 100498965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5266 AGAATGAGTTCATGTCCTTTGCAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAGCA 5325

100498966 AACTAACACAGGAACAGAAAATCAAACACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGGTGAA 100499025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5326 AACTAACACAGGAACAGAAAATCAAACACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGGTGAA 5385

100499026 TAATGAGAACATATGGGCACAGGGAGGGAAACATCACACACTGTGGTCTGTCGTGGGGAG 100499085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5386 TAATGAGAACATATGGGCACAGGGAGGGAAACATCACACACTGTGGTCTGTCGTGGGGAG 5445

100499086 TGGGGTAGGGGAGCGATATCATTAGGACAAATACCTAGTGTAGATGACAGGTTGATGGGT 100499145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5446 TGGGGTAGGGGAGCGATATCATTAGGACAAATACCTAGTGTAGATGACAGGTTGATGGGT 5505

100499146 ACAGCAAACCACCATGGCACATGTATACCTATATAACAAGCCTGCCCATTCTGCACATGT 100499205
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5506 ACAGCAAACCACCGTGGCACATGTATACCTATATAACAAGCCTGCCCATTCTGCACATGT 5565

100499206 AAAAAAAAAAAGAAGAAGAAAAAAAGAAAAAAAAGTACATAAATACATCATACATTTATC 100499265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5566 AAAAAAAAAAAGAAGAAGAAAAAAAGAAAAAAAAGTACATAAATACATCATACATTTATC 5625

100499266 CACCTAAACTCAGGCTAAAAGCTTAATAAATATTGAGGGAATGCATTAATCAAGCTGTGC 100499325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5626 CACCTAAACTCAGGCTAAAAGCTTAATAAATATTGAGGGAATGCATTAATCAAGCTGTGC 5685

100499326 TGCCAGAATCATAAGAATCATCATCTCTGACTTTCTAAGGTCAGAAACTTGATTTTACAA 100499385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5686 TGCCAGAATCATAAGAATCATCATCTCTGACTTTCTAAGGTCAGAAACTTGATTTTACAA 5745

100499386 AATTACTTAGTAGACAGGCTCCAGAGAACTGAGTCATATAACTAATTCTTATAAAAGAAT 100499445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5746 AATTACTTAGTAGACAGGCTCCAGAGAACTGAGTCATATAACTAATTCTTATAAAAGAAT 5805

100499446 AACATGTGAATGTATATAGGTCAGGTTATGGGTATGAATATATAATATTGATTCAATAAT 100499505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5806 AACATGTGAATGTATATAGGTCAGGTTATGGGTATGAATATATAATATTGATTCAATAAT 5865

100499506 TAATTATAGTAGCTTTTACTTGCTTATAGAAATGGGCAGATATATTTGGGAAGCACATTT 100499565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5866 TAATTATAGTAGCTTTTACTTGCTTATAGAAATGGGCAGATATATTTGGGAAGCACATTT 5925

100499566 ATAGTTCATAATGTAGTTCAGTGTTCATTCAATTAGAGGTATTACATTATCTTAAGGTAA 100499625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5926 ATAGTTCATAATGTAGTTCAGTGTTCATTCAATTAGAGGTATTACATTATCTTAAGGTAA 5985

100499626 TTTTTGTGATTAAGTATAGCTCTCTAGAGAACAAACACCATTTCCCTGAAATGGAGTTGG 100499685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5986 TTTTTGTGATTAAGTATAGCTCTCTAGAGAACAAACACCATTTCCCTGAAATGGAGTTGG 6045

100499686 ACTAGAATTTATATACACTTCCAGAGTTTGAGTCCCAGCTTCAAAAATTTCTCCAGTTCT 100499745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6046 ACTAGAATTTATATACACTTCCAGAGTTTGAGTCCCAGCTTCAAAAATTTCTCCAGTTCT 6105

100499746 TTCTTACTTTAGATTCACCAATGGTTAATATAAATGTAAAAATCTGTAATCATTACATTA 100499805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6106 TTCTTACTTTAGATTCACCAATGGTTAATATAAATGTAAAAATCTGTAATCATTACATTA 6165

100499806 ATCAGTTACAGAGTTTACAATTTATGGACATTTAGGGAAATATGTTATATCCAAAGAAAG 100499865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6166 ATCAGTTACAGAGTTTACAATTTATGGACATTTAGGGAAATATGTTATATCCAAAGAAAG 6225

100499866 TAATTGTAAAAAAGTATGGTGTCAAGAAAGTCATTTTTTTTTGTTTTGCTTTTGATTTTC 100499925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6226 TAATTGTAAAAAAGTATGGTGTCAAGAAAGTCATTTTTTTTTGTTTTGCTTTTGATTTTC 6285

100499926 TTTTCTTTTGTCTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACCATGTCACCCAGGTTCAAGA 100499985
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6286 TTTTCTTTTGTC-TTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTCACCATGTCACCCAGGTTCAAGA 6344

100499986 ACAGTAGCATGATCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGACCCTCCAG 100500045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6345 ACAGTAGCATGATCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGACCCTCCAG 6404

100500046 CCTCAGTCTCCCAAGTACCCAGGATCACAGGTGCATGCTACCACGCCCAGCTAATTTTCT 100500105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6405 CCTCAGTCTCCCAAGTACCCAGGATCACAGGTGCATGCTACCACGCCCAGCTAATTTTCT 6464

100500106 AGTTTTTTGTAGAGATGGGGTCTTGCTATGCTGTGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAA 100500165
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6465 AGTTTTTTGTAGAGATGGGGTCTTGCTATACTGTGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAA 6524

100500166 GAAATCCTCCCATCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACCATGCCT 100500225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6525 GAAATCCTCCCATCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACCATGCCT 6584

100500226 GGCCGAAGAAAGTCATTCTTTCATATTCTTTAACATCCTAACCTTTCTCATCTTTGCCTC 100500285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6585 GGCCGAAGAAAGTCATTCTTTCATATTCTTTAACATCCTAACCTTTCTCATCTTTGCCTC 6644

100500286 TTGATATTGGGTATATCTTGCTTTTGTGGTCTGTAGCCCACACTATTCACTGCTTTCAAA 100500345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6645 TTGATATTGGGTATATCTTGCTTTTGTGGTCTGTAGCCCACACTATTCACTGCTTTCAAA 6704

100500346 GAAGAGGAAAAGAGGTAGGTTAGTCACTTAAAGTTTAGCCACTCTAGAAGAAACAATCAC 100500405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6705 GAAGAGGAAAAGAGGTAGGTTAGTCACTTAAAGTTTAGCCACTCTAGAAGAAACAATCAC 6764

100500406 AGAAACTTATACTTTGTTTTTTCCAATGCTAGATTTGCTCTAGAGATAAAATACTTGTTA 100500465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6765 AGAAACTTATACTTTGTTTTTTCCAATGCTAGATTTGCTCTAGAGATAAAATACTTGTTA 6824

100500466 ACATGGTGTAGGTATATGGAAAGATGAGTGATAAGAAGACTGACCTGTTCTATTGTCCTT 100500525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6825 ACATGGTGTAGGTATATGGAAAGATGAGTGATAAGAAGACTGACCTGTTCTATTGTCCTT 6884

100500526 TCCTGAATGTGAATATAATGATTAAATGATTACCTCTGTCCAAAAAGATAAGGTTACAAA 100500585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6885 TCCTGAATGTGAATATAATGATTAAATGATTACCTCTGTCCAAAAAGATAAGGTTACAAA 6944

100500586 GCAGAAATGGCTAGAATATTGGAGAAACATGTCTACCATGAAAATATTTTGAGGGGGAAG 100500645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6945 GCAGAAATGGCTAGAATATTGGAGAAACATGTCTACCATGAAAATATTTTGAGGGGGAAG 7004

100500646 AGGCTCAATATACAACACAGAATAGTTTTGAGCAGAATACTGTACATTGGAT 100500697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7005 AGGCTCAATATACAACACAGAATAGTTTTGAGCAGAATACTGTACATTGGAT 7056

Alignment time is 5.03172 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [100486979,100507287] =>     20309 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [        1,     9108] =>      9108 nucs 'mol-32-34d4-190322_9108'

Score:        8909
Aligned:      9107        nucs
Identic:      9089 (100%) nucs =>      6913 (100%)      2176 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [100495625,100502549] EXCISED REGION [100502550,100504730]
 second seq =>  [        1,     6925] EXCISED REGION [     6930,     9108]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [6926,6929]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        26 nucs [6926,6951] to [6930,6955]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [6926,6927] to [6928,6929]

100495625 AGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTACTTTTGAGTTAATGCTG 100495684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAAGGGAATTGCCTTGTCTCAGATGAGACCTTGGACTGTGTACTTTTGAGTTAATGCTG 60

100495685 AAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTGGTTTTTAAAAATGAGGA 100495744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATGGGTTAAGACTTTGGGGTACTGTTGGGAAGGCATGATTGGTTTTTAAAAATGAGGA 120

100495745 CATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGGTTTGGCTGTGTCCCCAC 100495804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATGAGGTTTGGGAGGAGCCAGGGGTAGAATGATATGGTTTGGTTTGGCTGTGTCCCCAC 180

100495805 TCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTTGTGGGAGGGACCCAGTG 100495864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAAATCTCATCTTAATTGTAGCTTCCATAATTCCCATGTGTTGTGGGAGGGACCCAGTG 240

100495865 GGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCTCATGGTAGTGAATAAGT 100495924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAGATAATTGAATCATGGGGTCAGTTTCCCCCATACTGTTCTCATGGTAGTGAATAAGT 300

100495925 CTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCTTGGTTTTTTTTTTT-AT 100495983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
      301 CTCGCAAGAGCTGAGGATTTTATAAGGGGTTTCCCCTTTTGCTTGGTTTTTTTTTTTTAT 360

100495984 TCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTCTGCCATGATTGTGAGGCC 100496043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAGTTCTGGCTGCTGCCATTTAAGACATGCCTTTCACCTTCTGCCATGATTGTGAGGCC 420

100496044 ACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTCTTTATAAATTACCTAGTC 100496103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCCCAGTCACATGGAACTGTGAGTGCTTTAAACTCTTTTTCTTTATAAATTACCTAGTC 480

100496104 TCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATACAGCAGCTGTCCCACAAAT 100496163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCGAGTATGTCTTTATCAGCAGCATGAAAATGGACTTTATACAGCAGCTGTCCCACAAAT 540

100496164 GTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTAGTGAGAGAACATGATTCT 100496223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTTTCTGTAACTATCTAACTGTGACAGTAACCAGAATTTTAGTGAGAGAACATGATTCT 600

100496224 CCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACTTCACTCACTTCCCTTAAT 100496283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCACCATGATAATGAACTCCAAGAACCAATGTAATTCAAACTTCACTCACTTCCCTTAAT 660

100496284 AATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTATGAATTTATGAATACATT 100496343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATCAAAGGATAATTAACTTAAGTGCTTAAAAATGTAAGCTATGAATTTATGAATACATT 720

100496344 TGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTTTAACAATTTTCCTGATTC 100496403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTGCATTAATTTATACTTTTATTATATATTATTTGTTGGTTTAACAATTTTCCTGATTC 780

100496404 AGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTCTAGCATATAAGAGTTTAA 100496463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTTCTTCACTTCTTTCAAACTATAAGAGATTCCTCCAGTTCTAGCATATAAGAGTTTAA 840

100496464 TAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGATACTAAACTCCTGGAGACT 100496523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGTTTAATAGTTTTAAGTTTATCCTAACTTTACCTTTAGATACTAAACTCCTGGAGACT 900

100496524 AGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATGTTATGCCAAGCTATAAAG 100496583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGAATTTCTTTGTTCTGTATATTCACTCTGTGTCATAGTATGTTATGCCAAGCTATAAAG 960

100496584 TAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCATTTCACACTTGGCATATTT 100496643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGTGGCCAGAGAAGGAATTCAAGGATTCCTCCAACTCCCATTTCACACTTGGCATATTT 1020

100496644 TGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTAAATACCATGAGAGTATGT 100496703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCAGGTGCTCCACACATACATAGTTAATGCAAGAATGACTAAATACCATGAGAGTATGT 1080

100496704 TTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAGGTTGAAGGAGAGAAGCAG 100496763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCTGGATAAGAGTCTGTGGGGAAAGAATTGAGAAGATGAAGGTTGAAGGAGAGAAGCAG 1140

100496764 ACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTATATGGTTTCTTGTTTTTT 100496823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAGGAAGAGAAAACTGAGAAAAGAAGCAGGTAAAAAGACTATATGGTTTCTTGTTTTTT 1200

100496824 TCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAAACTCTATGTTCTGAAAAT 100496883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTTCCTCCTCCTCTTTTCCCCTCCTCTCCTTCCCTATCAAAACTCTATGTTCTGAAAAT 1260

100496884 ACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAATAATTGACAATATGTGTGA 100496943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACAGTTTTCTAAAGCTCTTAGCTGTGACCTACCCTCATAAATAATTGACAATATGTGTGA 1320

100496944 AGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATATACACATAAAAATACAGGA 100497003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGACTGTGACTGAATCTTATGTTTGGCTTTCACCTGTTATATACACATAAAAATACAGGA 1380

100497004 CCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTAAACATAAAGGAACATAAATGCAATTCCCT 100497063
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCAAAATATATAAATGCACATTTATATATTATACATAAAGGAACATAAATGCAATTCCCT 1440

100497064 GGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAAGACCAACACAGAA 100497123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTGCAGCTCCCAGCAAGACCAACACAGAA 1500

100497124 GGAAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCACTTCATCTCATTGGGACTGGTTAG 100497183
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1501 GGCAGGTGATTTCTGCATTTCCAACTGAGGTACCCAGTTCATCTCATTGGGACTGGTTAG 1560

100497184 ACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCACTATCCATCACAGCATAGT 100497243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAGTGGGTGCAGCCCAGTGTTGTATCTGGGCCAGCAAGCACTATCCATCACAGCATAGT 1620

100497244 CCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACCCCTTGCACTTCCTGGGTG 100497303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCTCATGGCTTCTCTTGGCTAGGGGAGGGAGTTCTCTGACCCCTTGCACTTCCTGGGTG 1680

100497304 AGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAGCCCCAAAACTCCTTAAGC 100497363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGTGATGCCCCACCCTGCTTCTGCTCACCCCATCATCTCAGCCCCAAAACTCCTTAAGC 1740

100497364 TGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGTGCAAAAATCACAAGCATT 100497423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGATAGCAACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAGAGTGCAAAAATCACAAGCATT 1800

100497424 CCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAGTAAACTCCCATTCACAAT 100497483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1801 CCTATACATCAATAATACACAAACACAGAGCCAAATCATGAGTAAACTCCCATTTACAAT 1860

100497484 TGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATGTGAAGGACTTCTT 100497543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGCTACAAAGAGAAAAAACCACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATGTGAAGGACTTCTT 1920

100497544 CCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAGTGGAAAAA 100497603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCAGGAGAACTACAAACCATTGCTCAAGGAAATAAGAGAGGACACAAACAAGTGGAAAAA 1980

100497604 CCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCCAAAGT 100497663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCTTCCATACTCATGAATAGGAAGAATCAATATTGTGAAAATGACCATACTGCCCAAAGT 2040

100497664 AATTTATACATTCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGACTTTCTTCACAGAAGTAGA 100497723
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATTTATACATCCAATGCTATGCTCATCAAGCTACCATTGACTTTCTTCACAGAAGTAGA 2100

100497724 AAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAAGAGCCCATATAGTCAAGA 100497783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAAACTACTTTAAATTTCATATTTCATATGGAAACAAAAAAGAGCCCATATAGTCAAGA 2160

100497784 CAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACCTGACTTCAAACTATACTA 100497843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAATCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACCTGACTTCAAACTATACTA 2220

100497844 CAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAACAGATATATAGACCAATG 100497903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAAGGCTACAGTAACCAAAACAGCACGGTACTGGTACCAAAACAGATATATAGACCAATG 2280

100497904 GAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAACCATCTGTTCTTTGATAA 100497963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAACAGAACAGAGGCCTCAGAAATAACACCACACATTTACAACCATCTGTTCTTTGATAA 2340

100497964 ACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGTTGGGATAA 100498023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACCTGACAAAAACAAGCAATGGGGAAAGGATTCCCTATTTAATAAATGGTGTTGGGATAA 2400

100498024 TTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAAAAATTAACTC 100498083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTGGCTAGCCATATTCATAAAACTGGACCCCTTACTTATACCTTAAACAAAAATTAACTC 2460

100498084 AAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAAAACCCTAGAAGAAAACCT 100498143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAGATGGATTAAAGAGTTAAACGTAAGACCTAAAGCCATAAAAACCCTAGAAGAAAACCT 2520

100498144 AGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCATGTCTAAAACACCAAAATC 100498203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGGCAATACCATTCAGGACAAAGGCATGGGCAAAGACTTCATGTCTAAAACACCAAAATC 2580

100498204 AATTGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCAC 100498263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATTGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCAC 2640

100498264 AGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGAGAGAAAATTTTTGC 100498323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGCAAAAGAAACTATCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGAGAGAAAATTTTTGC 2700

100498324 AATCTATCCATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAAAGAACTTAAACAAATTTA 100498383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AATCTATCCATCTGACAAAGGGCGAATATCCAGAATCTACAAAGAACTTAAACAAATTTA 2760

100498384 CAAGAAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAG 100498443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAAGAAAAAAAACCCCCATCAAGAAGTGGGTGAAGGATATGAACAGACACTTTTCAAAAG 2820

100498444 AAGACATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCATCATCAGTGGTCATTAGAG 100498503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAGACATTTATGCAGCCAACAAAGATATGAAAAAACGCTCATCATCAGTGGTCATTAGAG 2880

100498504 AAATGCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAGTTAGAATTATGATCATTA 100498563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAATGCAAATCAAAACCACAACAAGATACTATTTCATGCCAGTTAGAATTATGATCATTA 2940

100498564 AAAAGTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAATAGGAATGCTTTTACACT 100498623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAAAGTCAGAGAACAACTGATGCTAGAGAAGATGTGGAGAAATAGGAATGCTTTTACACT 3000

100498624 GTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGG 100498683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGG 3060

100498684 ATCTAGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGATATGTACCCAAAGG 100498743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATCTAGAATTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGATATGTACCCAAAGG 3120

100498744 ATTATAAACCATTCTTCCATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCAGCACTATTCA 100498803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATTATAAACCATTCTTCCATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCAGCACTATTCA 3180

100498804 CAATAGCAAAAACTTGGAACGAACCCAAATGCCCGTCAGTGATAGACTAGAAAAAGAGAA 100498863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CAATAGCAAAAACTTGGAACGAACCCAAATGCCCGTCAGTGATAGACTAGAAAAAGAGAA 3240

100498864 TGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAAGAATGAGTTCATGTCCT 100498923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAAGAATGAGTTCATGTCCT 3300

100498924 TTGCAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAGCAAACTAACACAGGAACAGA 100498983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTGCAGGGACATGGATGAAGCTGGAAACCATCATTCTCAGCAAACTAACACAGGAACAGA 3360

100498984 AAATCAAACACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGGTGAATAATGAGAACATATGGGC 100499043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAATCAAACACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGGTGAATAATGAGAACATATGGGC 3420

100499044 ACAGGGAGGGAAACATCACACACTGTGGTCTGTCGTGGGGAGTGGGGTAGGGGAGCGATA 100499103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ACAGGGAGGGAAACATCACACACTGTGGTCTGTCGTGGGGAGTGGGGTAGGGGAGCGATA 3480

100499104 TCATTAGGACAAATACCTAGTGTAGATGACAGGTTGATGGGTACAGCAAACCACCATGGC 100499163
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3481 TCATTAGGACAAATACCTAGTGTAGATGACAGGTTGATGGGTACAGCAAACCACCGTGGC 3540

100499164 ACATGTATACCTATATAACAAGCCTGCCCATTCTGCACATGTAAAAAAAAAAAGAAGAAG 100499223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ACATGTATACCTATATAACAAGCCTGCCCATTCTGCACATGTAAAAAAAAAAAGAAGAAG 3600

100499224 AAAAAAAGAAAAAAAAGTACATAAATACATCATACATTTATCCACCTAAACTCAGGCTAA 100499283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AAAAAAAGAAAAAAAAGTACATAAATACATCATACATTTATCCACCTAAACTCAGGCTAA 3660

100499284 AAGCTTAATAAATATTGAGGGAATGCATTAATCAAGCTGTGCTGCCAGAATCATAAGAAT 100499343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAGCTTAATAAATATTGAGGGAATGCATTAATCAAGCTGTGCTGCCAGAATCATAAGAAT 3720

100499344 CATCATCTCTGACTTTCTAAGGTCAGAAACTTGATTTTACAAAATTACTTAGTAGACAGG 100499403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CATCATCTCTGACTTTCTAAGGTCAGAAACTTGATTTTACAAAATTACTTAGTAGACAGG 3780

100499404 CTCCAGAGAACTGAGTCATATAACTAATTCTTATAAAAGAATAACATGTGAATGTATATA 100499463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTCCAGAGAACTGAGTCATATAACTAATTCTTATAAAAGAATAACATGTGAATGTATATA 3840

100499464 GGTCAGGTTATGGGTATGAATATATAATATTGATTCAATAATTAATTATAGTAGCTTTTA 100499523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GGTCAGGTTATGGGTATGAATATATAATATTGATTCAATAATTAATTATAGTAGCTTTTA 3900

100499524 CTTGCTTATAGAAATGGGCAGATATATTTGGGAAGCACATTTATAGTTCATAATGTAGTT 100499583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CTTGCTTATAGAAATGGGCAGATATATTTGGGAAGCACATTTATAGTTCATAATGTAGTT 3960

100499584 CAGTGTTCATTCAATTAGAGGTATTACATTATCTTAAGGTAATTTTTGTGATTAAGTATA 100499643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CAGTGTTCATTCAATTAGAGGTATTACATTATCTTAAGGTAATTTTTGTGATTAAGTATA 4020

100499644 GCTCTCTAGAGAACAAACACCATTTCCCTGAAATGGAGTTGGACTAGAATTTATATACAC 100499703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GCTCTCTAGAGAACAAACACCATTTCCCTGAAATGGAGTTGGACTAGAATTTATATACAC 4080

100499704 TTCCAGAGTTTGAGTCCCAGCTTCAAAAATTTCTCCAGTTCTTTCTTACTTTAGATTCAC 100499763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTCCAGAGTTTGAGTCCCAGCTTCAAAAATTTCTCCAGTTCTTTCTTACTTTAGATTCAC 4140

100499764 CAATGGTTAATATAAATGTAAAAATCTGTAATCATTACATTAATCAGTTACAGAGTTTAC 100499823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CAATGGTTAATATAAATGTAAAAATCTGTAATCATTACATTAATCAGTTACAGAGTTTAC 4200

100499824 AATTTATGGACATTTAGGGAAATATGTTATATCCAAAGAAAGTAATTGTAAAAAAGTATG 100499883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AATTTATGGACATTTAGGGAAATATGTTATATCCAAAGAAAGTAATTGTAAAAAAGTATG 4260

100499884 GTGTCAAGAAAGTCATTTTTTTTTGTTTTGCTTTTGATTTTCTTTTCTTTTGTCTTTTTT 100499943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GTGTCAAGAAAGTCATTTTTTTTTGTTTTGCTTTTGATTTTCTTTTCTTTTGTCTTTTTT 4320

100499944 TTTTTTTGAGACAGGGTCTCACCATGTCACCCAGGTTCAAGAACAGTAGCATGATCATGG 100500003
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTTTTT-GAGACAGGGTCTCACCATGTCACCCAGGTTCAAGAACAGTAGCATGATCATGG 4379

100500004 CTCACTGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGACCCTCCAGCCTCAGTCTCCCAAGTAC 100500063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 CTCACTGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGACCCTCCAGCCTCAGTCTCCCAAGTAC 4439

100500064 CCAGGATCACAGGTGCATGCTACCACGCCCAGCTAATTTTCTAGTTTTTTGTAGAGATGG 100500123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 CCAGGATCACAGGTGCATGCTACCACGCCCAGCTAATTTTCTAGTTTTTTGTAGAGATGG 4499

100500124 GGTCTTGCTATGCTGTGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCCTCCCATCTTGG 100500183
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 GGTCTTGCTATACTGTGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGAAATCCTCCCATCTTGG 4559

100500184 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACCATGCCTGGCCGAAGAAAGTCATTC 100500243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCAACCATGCCTGGCCGAAGAAAGTCATTC 4619

100500244 TTTCATATTCTTTAACATCCTAACCTTTCTCATCTTTGCCTCTTGATATTGGGTATATCT 100500303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 TTTCATATTCTTTAACATCCTAACCTTTCTCATCTTTGCCTCTTGATATTGGGTATATCT 4679

100500304 TGCTTTTGTGGTCTGTAGCCCACACTATTCACTGCTTTCAAAGAAGAGGAAAAGAGGTAG 100500363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 TGCTTTTGTGGTCTGTAGCCCACACTATTCACTGCTTTCAAAGAAGAGGAAAAGAGGTAG 4739

100500364 GTTAGTCACTTAAAGTTTAGCCACTCTAGAAGAAACAATCACAGAAACTTATACTTTGTT 100500423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 GTTAGTCACTTAAAGTTTAGCCACTCTAGAAGAAACAATCACAGAAACTTATACTTTGTT 4799

100500424 TTTTCCAATGCTAGATTTGCTCTAGAGATAAAATACTTGTTAACATGGTGTAGGTATATG 100500483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 TTTTCCAATGCTAGATTTGCTCTAGAGATAAAATACTTGTTAACATGGTGTAGGTATATG 4859

100500484 GAAAGATGAGTGATAAGAAGACTGACCTGTTCTATTGTCCTTTCCTGAATGTGAATATAA 100500543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 GAAAGATGAGTGATAAGAAGACTGACCTGTTCTATTGTCCTTTCCTGAATGTGAATATAA 4919

100500544 TGATTAAATGATTACCTCTGTCCAAAAAGATAAGGTTACAAAGCAGAAATGGCTAGAATA 100500603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 TGATTAAATGATTACCTCTGTCCAAAAAGATAAGGTTACAAAGCAGAAATGGCTAGAATA 4979

100500604 TTGGAGAAACATGTCTACCATGAAAATATTTTGAGGGGGAAGAGGCTCAATATACAACAC 100500663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 TTGGAGAAACATGTCTACCATGAAAATATTTTGAGGGGGAAGAGGCTCAATATACAACAC 5039

100500664 AGAATAGTTTTGAGCAGAATACTGTACATTGGATATCTTAAGAGAGATGATTCTAGTACA 100500723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 AGAATAGTTTTGAGCAGAATACTGTACATTGGATATCTTAAGAGAGATGATTCTAGTACA 5099

100500724 AGAAAAACTATCAGTAGTTGTAAAATGAATTAGAGAAACAGCAAAATAAATCTTCAAACA 100500783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 AGAAAAACTATCAGTAGTTGTAAAATGAATTAGAGAAACAGCAAAATAAATCTTCAAACA 5159

100500784 ATAAAATGTATTCTTTAGACTCTAAAATGTAGCTTTAATAAATGATTATTTATCATTAAT 100500843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 ATAAAATGTATTCTTTAGACTCTAAAATGTAGCTTTAATAAATGATTATTTATCATTAAT 5219

100500844 AATCATTTATTATTTATTAATCATTTATTATGGTTACAGAAAAAATAGAAAGGCACTCTA 100500903
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     5220 AATCATTTATTATTTATTAATCATTTATTATGGTTACAGAAAAAATAGAAAGGCACTTTA 5279

100500904 AGGGGAAAACACTAAATCTAGATTTTCTGACGAGATTCATAATGACCTATAGAAATACAC 100500963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 AGGGGAAAACACTAAATCTAGATTTTCTGACGAGATTCATAATGACCTATAGAAATACAC 5339

100500964 ATTATTGGCTATTTTTCACTTTATTGAGTTTTTTTTGTTCTTTTCCTATCTATATTCCTA 100501023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 ATTATTGGCTATTTTTCACTTTATTGAGTTTTTTTTGTTCTTTTCCTATCTATATTCCTA 5399

100501024 TTTTCTTATCAATGACAGTGCCCTTTCTCCTCTTTATAAATAATTCTTTGTTGTTGTTAA 100501083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 TTTTCTTATCAATGACAGTGCCCTTTCTCCTCTTTATAAATAATTCTTTGTTGTTGTTAA 5459

100501084 CCCCTGAGGAGGCACTTTAAAAGACAATGATGGGAACCAAATGATGTGTGGTTAAGGTGT 100501143
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5460 CCCCTGAGGAGGCACTTTAAAAGACAATGATGGGAACCAAATGATGTGTGGTTCAGGTGT 5519

100501144 CTAAATAACATTTTTTTAAGTGTAATTAGCTCCCTTTCTGAACTATGTAGCACAGTCTGA 100501203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 CTAAATAACATTTTTTTAAGTGTAATTAGCTCCCTTTCTGAACTATGTAGCACAGTCTGA 5579

100501204 AGGAAGGAGGTTGATGGGGAGGGGCAAGTTCTTACTTGTCTGGAACAGATATATACAGAA 100501263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 AGGAAGGAGGTTGATGGGGAGGGGCAAGTTCTTACTTGTCTGGAACAGATATATACAGAA 5639

100501264 AGATGTATATATTCTCTTCTCCAACCCACCCCCGCCACAAAATCACTCCAATTATGCCAG 100501323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 AGATGTATATATTCTCTTCTCCAACCCACCCCCGCCACAAAATCACTCCAATTATGCCAG 5699

100501324 TTGTAGATTTATTTAATTTAACAAGCTCCCACATTCAGAGATGCCAAAAACCCTAGAATA 100501383
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5700 TTGTAGATTTATTTAATTTAACAAGCTCCCACACTCAGAGATGCCAAAAACCCTAGAATA 5759

100501384 ATTATTCCCATCAATCACTTGTAGGTAAGTTTTAATTGCTTTGGGCGTATCTATTATTAG 100501443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 ATTATTCCCATCAATCACTTGTAGGTAAGTTTTAATTGCTTTGGGCGTATCTATTATTAG 5819

100501444 TTGAGATGTTTTACAAACCAGTTTTATGTAGGCAGCACAATATTTTTACAAGAAAACCAA 100501503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 TTGAGATGTTTTACAAACCAGTTTTATGTAGGCAGCACAATATTTTTACAAGAAAACCAA 5879

100501504 ACAAAGCCTTTGGGCATGTATTCTCCAGTTCAACAAAAGCCCCACCATTCTTTAGTGTCT 100501563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 ACAAAGCCTTTGGGCATGTATTCTCCAGTTCAACAAAAGCCCCACCATTCTTTAGTGTCT 5939

100501564 GATACTCACCTCTTTTAACCATTATGCCTAATTGGTCTCTCATGGCAGGTGTCATGCCCT 100501623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 GATACTCACCTCTTTTAACCATTATGCCTAATTGGTCTCTCATGGCAGGTGTCATGCCCT 5999

100501624 GTTTGAAGAATATTTTGCCCTGTTTGGAGAATAAAGCTAAGTTGGGCAGAGCCTGATATT 100501683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     6000 GTTTGAAGAATATTTTGCCCTGTTTGGAGAATAAAGCTAAGTTGGGCAGAGCCTAATATT 6059

100501684 TGAGGAGGGTAAGGTTAGGTGAGTGGTCATGAGTATACAACATAAAATACCAAAAAATGT 100501743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 TGAGGAGGGTAAGGTTAGGTGAGTGGTCATGAGTATACAACATAAAATACCAAAAAATGT 6119

100501744 CAAAAAATATAAATAGAAGATGGGATGGAAAGGGATCAGTAAAAGACTTTACTGACAATG 100501803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 CAAAAAATATAAATAGAAGATGGGATGGAAAGGGATCAGTAAAAGACTTTACTGACAATG 6179

100501804 TAATACTTTTGCCTACTTCAAAGCTGATCATATCATTCCTGCTTTTGTTGTCAAATGTAT 100501863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 TAATACTTTTGCCTACTTCAAAGCTGATCATATCATTCCTGCTTTTGTTGTCAAATGTAT 6239

100501864 GATACTCAGGCAAGTCTGGAATACGAAAAACTTCAGGCTACCCTAGTTGAGACTCCTACA 100501923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 GATACTCAGGCAAGTCTGGAATACGAAAAACTTCAGGCTACCCTAGTTGAGACTCCTACA 6299

100501924 GTCATGGTATCCTGAGTTTAACTCAACAGGTCTCCATTTGGTCAACTAACTATCCCCAAA 100501983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 GTCATGGTATCCTGAGTTTAACTCAACAGGTCTCCATTTGGTCAACTAACTATCCCCAAA 6359

100501984 TTTCCACAGGTAAAGAAGAGAGAAAAGCAGAGAAAGAGGAAAGAAACTGAGGGCTACGTT 100502043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 TTTCCACAGGTAAAGAAGAGAGAAAAGCAGAGAAAGAGGAAAGAAACTGAGGGCTACGTT 6419

100502044 CCAGTTAGTGGCTACTGGTAGGAAAGTTGGACATTTATTCTTTTCTTCCCTTGCCATCTT 100502103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 CCAGTTAGTGGCTACTGGTAGGAAAGTTGGACATTTATTCTTTTCTTCCCTTGCCATCTT 6479

100502104 ATTTTGAGAAATCCAAATTCCAAGATGCAATAAATACACATGGGCACACACACACACTCA 100502163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 ATTTTGAGAAATCCAAATTCCAAGATGCAATAAATACACATGGGCACACACACACACTCA 6539

100502164 CACATATAGTGCTCCAAACAAATATGGGTTAGCTAGAGACATATAAGACTGTTAATGAAA 100502223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 CACATATAGTGCTCCAAACAAATATGGGTTAGCTAGAGACATATAAGACTGTTAATGAAA 6599

100502224 ATGTTGGAATCAATTTGCATCAGTAATTTTAAGAGAATTCTTGGTTTGTTCGATTCAATT 100502283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 ATGTTGGAATCAATTTGCATCAGTAATTTTAAGAGAATTCTTGGTTTGTTCGATTCAATT 6659

100502284 GTTTTGTTCTAAAGTATACCAAAAGGTCTTTTAATTTGAGAATCACATATTTTCATATCT 100502343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 GTTTTGTTCTAAAGTATACCAAAAGGTCTTTTAATTTGAGAATCACATATTTTCATATCT 6719

100502344 ATACTATCAATAATTTTAACTATAATCCATATTGACTCAATATTACAGATTCATGAAATC 100502403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 ATACTATCAATAATTTTAACTATAATCCATATTGACTCAATATTACAGATTCATGAAATC 6779

100502404 TACAGAATAACATATGTCACAAATAAATATATATCATTGAGAAAATAGCACGATTTAGGA 100502463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6780 TACAGAATAACATATGTCACAAATAAATATATATCATTGAGAAAATAGCACGATTTAGGA 6839

100502464 AATATTTCTCCAAATTGTGTTCCATGGAGTATTGTTCCATGGAATGAATGATAACTTATG 100502523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6840 AATATTTCTCCAAATTGTGTTCCATGGAGTATTGTTCCATGGAATGAATGATAACTTATG 6899

100502524 TTACACATACACACACACACATACAT 100502549
          ||||||||||||||||||||||||||
     6900 TTACACATACACACACACACATACAT 6925

EXCISED REGION

100502550 ACACACACACACACACACACACACACTTTAATGATTAAACAGGACTGGCTACATAATTTT 100502609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6930 ACACACACACACACACACACACACACTTTAATGATTAAACAGGACTGGCTACATAATTTT 6989

100502610 CAGGTCCCCATGAAAAATGAAACTATGAGTCCCCTCGTTAAAACATTATTATGAATTTCA 100502669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6990 CAGGTCCCCATGAAAAATGAAACTATGAGTCCCCTCGTTAAAACATTATTATGAATTTCA 7049

100502670 AGATGGTGACTGCAGAGAATGAAACCAAGAATGGGTCTCTTCTTTTTTTTCCTTTTCTTT 100502729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     7050 AGATGGTGACTGCAGAGAATGAAACCAAGAATGGGTCTCTTCTTTTTTTTTCTTTTCTTT 7109

100502730 TCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTAGTGG 100502789
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7110 TC-TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTAGTGG 7168

100502790 CATGATCTCAGCTCACTGCAACCTTCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGC 100502849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7169 CATGATCTCAGCTCACTGCAACCTTCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGC 7228

100502850 CTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCGGCTGCCACCACGTCTGGCTAATTTTTGTATTTTT 100502909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7229 CTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCGGCTGCCACCACGTCTGGCTAATTTTTGTATTTTT 7288

100502910 AATAGAGTCGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCAAATTCCTGACCTCGTGATC 100502969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7289 AATAGAGTCGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCAAATTCCTGACCTCGTGATC 7348

100502970 CGCCTACCTAGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTACAGGCCTGAGCCACCACGCCCAGCCAA 100503029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7349 CGCCTACCTAGGCCTCCCAAAGTGCTGGTATTACAGGCCTGAGCCACCACGCCCAGCCAA 7408

100503030 GAATGGGTCTCTTCTAAGCATGGGCCCTATGTGACTGCACAGGCTGCACACCCTTGAAAC 100503089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7409 GAATGGGTCTCTTCTAAGCATGGGCCCTATGTGACTGCACAGGCTGCACACCCTTGAAAC 7468

100503090 TAGCCTCGGTTAAATTGTTTAAGAAATGCTGGGTTAAAAAATGTCTAACAGATTTCTTTG 100503149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7469 TAGCCTCGGTTAAATTGTTTAAGAAATGCTGGGTTAAAAAATGTCTAACAGATTTCTTTG 7528

100503150 CAACAAGACTTCTTATAGCCTTTTATATACTAATGTGCACTGTGAACCTTCAGGAGGTTC 100503209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7529 CAACAAGACTTCTTATAGCCTTTTATATACTAATGTGCACTGTGAACCTTCAGGAGGTTC 7588

100503210 ACATACTGTATAAAGGTCCTCAAATATATTTGACCAAAGCTCTTTTCAATTATTATTTTA 100503269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7589 ACATACTGTATAAAGGTCCTCAAATATATTTGACCAAAGCTCTTTTCAATTATTATTTTA 7648

100503270 GAAGGATCATCTTGTAGGACCAATGTTCCACAGAACACACATTGTAAAAGGCAGCTCAGG 100503329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7649 GAAGGATCATCTTGTAGGACCAATGTTCCACAGAACACACATTGTAAAAGGCAGCTCAGG 7708

100503330 CTGTGCAAACAGGTTATAAAATCAATTTGTTAGTCATAAATCACTATATATTTCCCATTT 100503389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7709 CTGTGCAAACAGGTTATAAAATCAATTTGTTAGTCATAAATCACTATATATTTCCCATTT 7768

100503390 TGTGGCATTTTCCCCATATTTGGAATGAGGTAACTAGAGATAACTATAGATGCAAATGGT 100503449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7769 TGTGGCATTTTCCCCATATTTGGAATGAGGTAACTAGAGATAACTATAGATGCAAATGGT 7828

100503450 GTGTATTCACTAAATATACTGTCCTTCACTATTTGGTCTTCTACCATTTGGATAGTCAAC 100503509
          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7829 G-GTATTCACTAAATATACTGTCCTTCACTATTTGGTCTTCTACCATTTGGATAGTCAAC 7887

100503510 TCAGTGGCCAAACATCACAAACGTTTTCTGGGCCAGGGTACTAGAGATGGTCTGATTGAG 100503569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7888 TCAGTGGCCAAACATCACAAACGTTTTCTGGGCCAGGGTACTAGAGATGGTCTGATTGAG 7947

100503570 ACTGTATCACAAGCCAACTTATTTTTCCCCTTTATTTTGTCAATTCAGAGGAAGTAACAT 100503629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7948 ACTGTATCACAAGCCAACTTATTTTTCCCCTTTATTTTGTCAATTCAGAGGAAGTAACAT 8007

100503630 CCTTACTTACCATTACCCAGTTCCCAAGAAATGTTGTACTTTTTGCTGGCGCTGTACTTC 100503689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8008 CCTTACTTACCATTACCCAGTTCCCAAGAAATGTTGTACTTTTTGCTGGCGCTGTACTTC 8067

100503690 AACAGACTCAGGGCACTAGAACTGTTCCAGGAGTTATTGGGATTACGACGCAGTGCATTT 100503749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8068 AACAGACTCAGGGCACTAGAACTGTTCCAGGAGTTATTGGGATTACGACGCAGTGCATTT 8127

100503750 AGAGCAAATATCAGGTGGAGTCCAGAGCAATCAGCAAAGTTATAAAGTTTGTCTAGAGAC 100503809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8128 AGAGCAAATATCAGGTGGAGTCCAGAGCAATCAGCAAAGTTATAAAGTTTGTCTAGAGAC 8187

100503810 CTGGCTGGGAAGAAGCAGAGAAAGGCTTGTAACTTTCAAATCAACATTCCAACAAAAGGA 100503869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8188 CTGGCTGGGAAGAAGCAGAGAAAGGCTTGTAACTTTCAAATCAACATTCCAACAAAAGGA 8247

100503870 AAATAGTAGCTAATATAAAAAGCCTTTCTATGAGCTTCCCACTAATAAGGAATAACACAG 100503929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8248 AAATAGTAGCTAATATAAAAAGCCTTTCTATGAGCTTCCCACTAATAAGGAATAACACAG 8307

100503930 ACAGGCTTCTAAAAGGGACTATTACCTTTTGGTCTGGGTACATTTCAAGTTGACTTTAGA 100503989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8308 ACAGGCTTCTAAAAGGGACTATTACCTTTTGGTCTGGGTACATTTCAAGTTGACTTTAGA 8367

100503990 AAGCAGCAGACAGGGCTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGC 100504049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     8368 AAGCAGCAGACAGGGCTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGAC 8427

100504050 CGAGGTGGGCAGATCACCTAAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACCTGGAGAAA 100504109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8428 CGAGGTGGGCAGATCACCTAAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACCTGGAGAAA 8487

100504110 CCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTTGCTGGGCGTGGTGGTGTATGCCTGTAGTCCCA 100504169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8488 CCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTTGCTGGGCGTGGTGGTGTATGCCTGTAGTCCCA 8547

100504170 GCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGCTGAGGTTGTGGTGA 100504229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8548 GCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAAGCTGAGGTTGTGGTGA 8607

100504230 GCCGAGATTGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCAAAAA 100504289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8608 GCCGAGATTGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCAAAAA 8667

100504290 CAAAACAAAACAAAAAAACAAAACAAACAAAAAAAAACAAGCAGCAGAGAGAATTCCAGA 100504349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8668 CAAAACAAAACAAAAAAACAAAACAAACAAAAAAAAACAAGCAGCAGAGAGAATTCCAGA 8727

100504350 CAGAGGTTGCAAATTGGCAACCAAATCTAGTCCATCATATGTTTTATTTAACAAAGTTAA 100504409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8728 CAGAGGTTGCAAATTGGCAACCAAATCTAGTCCATCATATGTTTTATTTAACAAAGTTAA 8787

100504410 ATTGCTGATGTTTGAAAATGGGAAGATTTCACAAAGTAGCTGAATTTCTTAATTTTCCTT 100504469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8788 ATTGCTGATGTTTGAAAATGGGAAGATTTCACAAAGTAGCTGAATTTCTTAATTTTCCTT 8847

100504470 GAAAAGTCAGACAATATGGCACTGCTAGGTCCATATTCCTACAGGACATAAGATGAATAA 100504529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8848 GAAAAGTCAGACAATATGGCACTGCTAGGTCCATATTCCTACAGGACATAAGATGAATAA 8907

100504530 TAGGGTACAAGGCCAGGAAGGATAACTGGCTGGTGAGTCTTGGAAAATAGCTCAGCCTAG 100504589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8908 TAGGGTACAAGGCCAGGAAGGATAACTGGCTGGTGAGTCTTGGAAAATAGCTCAGCCTAG 8967

100504590 TATGATTTCCAAAAATTTTCACTGAAGTCCAGATTTCTAATATTTCTGACAATGGAAATA 100504649
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8968 TATGATTTCCAAACATTTTCACTGAAGTCCAGATTTCTAATATTTCTGACAATGGAAATA 9027

100504650 CTATGACCACTACTACAAATACGTTCATTGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCC 100504709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9028 CTATGACCACTACTACAAATACGTTCATTGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATTCC 9087

100504710 AGCACTTTGGGAGGCCGAGGC 100504730
          |||||||||||||||||||||
     9088 AGCACTTTGGGAGGCCGAGGC 9108

Alignment time is 6.43096 s

