
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    5034] =>      5034 nucs 'mol-32-1f00-033380_5034'

Score:        4945
Aligned:      5037        nucs
Identic:      5027 (100%) nucs =>      2302 (100%)      2725 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89473600,89475908] EXCISED REGION [89478625,89481352]
 second seq =>  [       1,    2306] EXCISED REGION [    2307,    5034]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89473600 TTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTT 89473659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTT 60

 89473660 GATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCT 89473719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCT 120

 89473720 ATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTC 89473779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTC 180

 89473780 CCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATC 89473839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATC 240

 89473840 TTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATAC 89473899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATAC 300

 89473900 ACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGG 89473959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGG 360

 89473960 AAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAAT 89474019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAAT 420

 89474020 CCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTG 89474079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTG 480

 89474080 TGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGG 89474139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGG 540

 89474140 GAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAA 89474199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAA 600

 89474200 AATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGA 89474259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGA 660

 89474260 CACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGAT 89474319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGAT 720

 89474320 AAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCC 89474379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCC 780

 89474380 TAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTG 89474439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTG 840

 89474440 CAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAA 89474499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAA 900

 89474500 CAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCAT 89474559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCAT 960

 89474560 ACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGC 89474619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGC 1020

 89474620 ATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCC 89474679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCC 1080

 89474680 TCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCT 89474739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCT 1140

 89474740 CTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTG 89474799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTG 1200

 89474800 CAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATC 89474859
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGATTCAGCTTTTACACGTTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATC 1260

 89474860 TTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCC 89474919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCC 1320

 89474920 CTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGT 89474979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGT 1380

 89474980 TTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGC 89475039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGC 1440

 89475040 TTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGT 89475099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGT 1500

 89475100 GAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGT 89475159
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCATAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGT 1560

 89475160 CTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCT 89475219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCT 1620

 89475220 GTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTG 89475279
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTAAGCAGGTGTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTG 1680

 89475280 GCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCT 89475339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCT 1740

 89475340 GGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGG 89475399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGG 1800

 89475400 AAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATA 89475459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATA 1860

 89475460 TGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGA 89475519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGA 1920

 89475520 TAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGA 89475579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGA 1980

 89475580 CAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACC 89475639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACC 2040

 89475640 TAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAAC 89475699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAAC 2100

 89475700 AGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAA 89475759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAA 2160

 89475760 TTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTT 89475819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTT 2220

 89475820 TTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACA 89475879
          |   ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 T---GAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACA 2277

 89475880 CTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          |||||||||||||||||||||||||||||
     2278 CTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 2306

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 2366

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 2426

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 2486

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2487 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 2546

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 2606

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 2666

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 2726

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 2786

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 2846

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 2906

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 2966

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 3026

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 3086

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 3146

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 3206

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 3266

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 3326

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 3386

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3387 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 3446

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 3506

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 3566

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 3626

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 3686

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 3746

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 3806

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 3866

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 3926

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 3986

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 4046

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4047 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 4106

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4107 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 4166

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4167 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 4226

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4227 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 4286

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4287 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 4346

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4347 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 4406

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4407 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 4466

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4467 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 4526

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4527 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 4586

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4587 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 4646

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4647 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 4706

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4707 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 4766

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4767 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 4826

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4827 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 4886

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4887 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 4946

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4947 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 5006

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCA 89481352
          ||||||||||||||||||||||||||||
     5007 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCA 5034

Alignment time is 6.59017 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2346] =>      2346 nucs 'mol-32-1f00-033380_2346'

Score:        2290
Aligned:      2349        nucs
Identic:      2342 (100%) nucs =>      2302 (100%)        40 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89473600,89475908] EXCISED REGION [89478625,89478664]
 second seq =>  [       1,    2306] EXCISED REGION [    2307,    2346]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89473600 TTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTT 89473659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTT 60

 89473660 GATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCT 89473719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCT 120

 89473720 ATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTC 89473779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTC 180

 89473780 CCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATC 89473839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATC 240

 89473840 TTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATAC 89473899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATAC 300

 89473900 ACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGG 89473959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGG 360

 89473960 AAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAAT 89474019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAAT 420

 89474020 CCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTG 89474079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTG 480

 89474080 TGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGG 89474139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGG 540

 89474140 GAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAA 89474199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAA 600

 89474200 AATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGA 89474259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGA 660

 89474260 CACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGAT 89474319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGAT 720

 89474320 AAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCC 89474379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCC 780

 89474380 TAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTG 89474439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTG 840

 89474440 CAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAA 89474499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAA 900

 89474500 CAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCAT 89474559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCAT 960

 89474560 ACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGC 89474619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGC 1020

 89474620 ATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCC 89474679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCC 1080

 89474680 TCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCT 89474739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCT 1140

 89474740 CTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTG 89474799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTG 1200

 89474800 CAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATC 89474859
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGATTCAGCTTTTACACGTTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATC 1260

 89474860 TTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCC 89474919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCC 1320

 89474920 CTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGT 89474979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGT 1380

 89474980 TTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGC 89475039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGC 1440

 89475040 TTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGT 89475099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGT 1500

 89475100 GAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGT 89475159
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCATAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGT 1560

 89475160 CTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCT 89475219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCT 1620

 89475220 GTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTG 89475279
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTAAGCAGGTGTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTG 1680

 89475280 GCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCT 89475339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCT 1740

 89475340 GGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGG 89475399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGG 1800

 89475400 AAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATA 89475459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATA 1860

 89475460 TGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGA 89475519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGA 1920

 89475520 TAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGA 89475579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGA 1980

 89475580 CAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACC 89475639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACC 2040

 89475640 TAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAAC 89475699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAAC 2100

 89475700 AGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAA 89475759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAA 2160

 89475760 TTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTT 89475819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTT 2220

 89475820 TTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACA 89475879
          |   ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 T---GAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACA 2277

 89475880 CTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          |||||||||||||||||||||||||||||
     2278 CTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 2306

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGG 89478664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGG 2346

Alignment time is 3.10751 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    6365] =>      6365 nucs 'mol-32-1f16-135052_6365'

Score:        6365
Aligned:      6365        nucs
Identic:      6365 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89470843,89477207]
 second seq =>  [       1,    6365]

 89470843 GCTCCTGGCTGAATAAAGCCCTTCCTTCTTTAACTCAGTGTCTGAGGGGTTTTGTTGGTG 89470902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTCCTGGCTGAATAAAGCCCTTCCTTCTTTAACTCAGTGTCTGAGGGGTTTTGTTGGTG 60

 89470903 GCTTGTCCTCCTACAATACCAGTGCCTGTTCCAGTGGAGGTGGTGGAGGGTGAAATGGAC 89470962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTTGTCCTCCTACAATACCAGTGCCTGTTCCAGTGGAGGTGGTGGAGGGTGAAATGGAC 120

 89470963 TTCATGAGGGTCCTTGGTTTTGGTGGTTTAATGCTCTATTTTTGTGCTGGTTGGCCTCCT 89471022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCATGAGGGTCCTTGGTTTTGGTGGTTTAATGCTCTATTTTTGTGCTGGTTGGCCTCCT 180

 89471023 GAAAGGAGGTGGCACTTTCCAGAAAGTATCAGTGGGAGAGGGACTGGTGGTGGGCAGGGT 89471082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAAGGAGGTGGCACTTTCCAGAAAGTATCAGTGGGAGAGGGACTGGTGGTGGGCAGGGT 240

 89471083 CCTAGAACTCCCAAGATTAAATGACCTTTGTCTTCAGCTACCAGGGTGGATGGAGAAGGA 89471142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTAGAACTCCCAAGATTAAATGACCTTTGTCTTCAGCTACCAGGGTGGATGGAGAAGGA 300

 89471143 CCATCAGGTCAGGGCGGGGCTAGGAGTGTCTGAGCTCAGACTCTCCATGGCTGGATCTTG 89471202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCATCAGGTCAGGGCGGGGCTAGGAGTGTCTGAGCTCAGACTCTCCATGGCTGGATCTTG 360

 89471203 CTATGGCTGCTGTGGGGGATGGGGGTGAGATTCCCAGGTCACTGGAGTTGTGTACCTAGG 89471262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTATGGCTGCTGTGGGGGATGGGGGTGAGATTCCCAGGTCACTGGAGTTGTGTACCTAGG 420

 89471263 AGGATTATGGCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGTTGTCAGGGGAGTGGGAGAAGCTGGCA 89471322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGATTATGGCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGTTGTCAGGGGAGTGGGAGAAGCTGGCA 480

 89471323 GTCACAGGCCTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGGAAGGCCGGTCTCACTCCCACTGTGCC 89471382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTCACAGGCCTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGGAAGGCCGGTCTCACTCCCACTGTGCC 540

 89471383 CTTCTCCCTGCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCAGGCAGAGGGCAAGAGGGGCGGGCTTA 89471442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTCTCCCTGCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCAGGCAGAGGGCAAGAGGGGCGGGCTTA 600

 89471443 AAATTTGGCTGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAGAAAAGGACTTTAGTTCTTCACCAGCC 89471502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAATTTGGCTGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAGAAAAGGACTTTAGTTCTTCACCAGCC 660

 89471503 TGTGAAGTTTGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCCGAGTTCTGGCAGGAGGCTTCTCGCCC 89471562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTGAAGTTTGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCCGAGTTCTGGCAGGAGGCTTCTCGCCC 720

 89471563 CATTCAAATTGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATTTCTTCTTTCTGTGGAGTTTTACCTGT 89471622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATTCAAATTGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATTTCTTCTTTCTGTGGAGTTTTACCTGT 780

 89471623 TGCTCCTCTGGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGTGGTGCCAGGCAGGAATGGCCTGCCTG 89471682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCTCCTCTGGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGTGGTGCCAGGCAGGAATGGCCTGCCTG 840

 89471683 GGGACACAGTGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGCTTCCTCTACCCCTGTATTTTGCTCGG 89471742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGACACAGTGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGCTTCCTCTACCCCTGTATTTTGCTCGG 900

 89471743 CTCTCTAACTTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGGAAACTCCTCCTGCACACAAACCTTCA 89471802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCTCTAACTTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGGAAACTCCTCCTGCACACAAACCTTCA 960

 89471803 GCTTCTCCAGTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGAGGGTCTCCCTTTCCCACTTCTGCAGT 89471862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTTCTCCAGTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGAGGGTCTCCCTTTCCCACTTCTGCAGT 1020

 89471863 TGGGGCAGTCAGAATATTTGGAGTGTTTCCTGGGTCCTGCAGGAGCAGTCTGCCTCCTTC 89471922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGGGCAGTCAGAATATTTGGAGTGTTTCCTGGGTCCTGCAGGAGCAGTCTGCCTCCTTC 1080

 89471923 AGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTGTAATATTTTGAAACACTACATAATTA 89471982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTGTAATATTTTGAAACACTACATAATTA 1140

 89471983 TTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATCCTTATGATTCTTATAAATGTAAGTAAAATA 89472042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATCCTTATGATTCTTATAAATGTAAGTAAAATA 1200

 89472043 AGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAATGTTTCTATAAACAAAGGTCTGCAAACTATA 89472102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAATGTTTCTATAAACAAAGGTCTGCAAACTATA 1260

 89472103 GCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGTGTTATTGGCACATAGCCCCACCCATT 89472162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGTGTTATTGGCACATAGCCCCACCCATT 1320

 89472163 TACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTGTATGCAGAGTTTAGTAGTTGAGACAG 89472222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTGTATGCAGAGTTTAGTAGTTGAGACAG 1380

 89472223 TTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTATCTGGTATTTTACAGAAAAGTTAGCCAACCA 89472282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTATCTGGTATTTTACAGAAAAGTTAGCCAACCA 1440

 89472283 CTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTGGTGAAAAACTAAAAAAAAAAAAATGGAAAT 89472342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTGGTGAAAAACTAAAAAAAAAAAAATGGAAAT 1500

 89472343 AAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTATTTCTAGTTCAAAAATAAT 89472402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTATTTCTAGTTCAAAAATAAT 1560

 89472403 CTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTGACAATTGGGATGAAG 89472462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTGACAATTGGGATGAAG 1620

 89472463 TCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTCAAAAAA 89472522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTCAAAAAA 1680

 89472523 ATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGAATCAGG 89472582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGAATCAGG 1740

 89472583 AAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAATTTTC 89472642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAATTTTC 1800

 89472643 TAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAAAATTA 89472702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAAAATTA 1860

 89472703 CACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTC 89472762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTC 1920

 89472763 AGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCAT 89472822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCAT 1980

 89472823 TAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATG 89472882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATG 2040

 89472883 GAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAG 89472942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAG 2100

 89472943 TGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCT 89473002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCT 2160

 89473003 TGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATA 89473062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATA 2220

 89473063 TTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCT 89473122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCT 2280

 89473123 AAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACT 89473182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACT 2340

 89473183 CATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCT 89473242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCT 2400

 89473243 TTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGT 89473302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGT 2460

 89473303 TATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTG 89473362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTG 2520

 89473363 TTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTA 89473422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTA 2580

 89473423 TGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTT 89473482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTT 2640

 89473483 TGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAA 89473542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAA 2700

 89473543 GGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTT 89473602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTT 2760

 89473603 CCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGAT 89473662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGAT 2820

 89473663 TTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATA 89473722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATA 2880

 89473723 GCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCC 89473782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCC 2940

 89473783 CTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTC 89473842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTC 3000

 89473843 CCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACA 89473902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACA 3060

 89473903 TAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAA 89473962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAA 3120

 89473963 TTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCG 89474022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCG 3180

 89474023 AGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGA 89474082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGA 3240

 89474083 GTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAG 89474142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAG 3300

 89474143 TCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAAT 89474202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAAT 3360

 89474203 ATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACAC 89474262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACAC 3420

 89474263 TATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAA 89474322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAA 3480

 89474323 GTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAG 89474382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAG 3540

 89474383 CATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAA 89474442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAA 3600

 89474443 ATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAA 89474502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAA 3660

 89474503 GAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACT 89474562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACT 3720

 89474563 AAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATT 89474622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATT 3780

 89474623 TGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCT 89474682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCT 3840

 89474683 CCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTT 89474742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTT 3900

 89474743 CCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAG 89474802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAG 3960

 89474803 ATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTG 89474862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTG 4020

 89474863 TTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTA 89474922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTA 4080

 89474923 CTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTA 89474982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTA 4140

 89474983 TCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTT 89475042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTT 4200

 89475043 AGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAG 89475102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAG 4260

 89475103 AATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTG 89475162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTG 4320

 89475163 CAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTA 89475222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTA 4380

 89475223 AGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCC 89475282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCC 4440

 89475283 CTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGC 89475342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGC 4500

 89475343 CAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAA 89475402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAA 4560

 89475403 TAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGG 89475462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGG 4620

 89475463 GCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAG 89475522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAG 4680

 89475523 AGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAG 89475582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAG 4740

 89475583 ATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAA 89475642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAA 4800

 89475643 AACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGA 89475702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGA 4860

 89475703 AAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTT 89475762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTT 4920

 89475763 ATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTT 89475822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTT 4980

 89475823 TGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTG 89475882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTG 5040

 89475883 CAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAAT 89475942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAAT 5100

 89475943 TACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCA 89476002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCA 5160

 89476003 CCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCC 89476062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCC 5220

 89476063 AAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAA 89476122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAA 5280

 89476123 GACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAA 89476182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAA 5340

 89476183 CCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCAT 89476242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCAT 5400

 89476243 GTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCT 89476302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCT 5460

 89476303 CAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTA 89476362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 CAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTA 5520

 89476363 GGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGA 89476422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGA 5580

 89476423 CATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTA 89476482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 CATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTA 5640

 89476483 TACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAG 89476542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAG 5700

 89476543 GTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTT 89476602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTT 5760

 89476603 GGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCC 89476662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 GGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCC 5820

 89476663 CCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGA 89476722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGA 5880

 89476723 AGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGC 89476782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 AGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGC 5940

 89476783 TTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGG 89476842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGG 6000

 89476843 ATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCC 89476902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 ATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCC 6060

 89476903 GGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACT 89476962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 GGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACT 6120

 89476963 GAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACT 89477022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 GAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACT 6180

 89477023 GTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGG 89477082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 GTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGG 6240

 89477083 CTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAAT 89477142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 CTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAAT 6300

 89477143 ATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTA 89477202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 ATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTA 6360

 89477203 TATGA 89477207
          |||||
     6361 TATGA 6365

Alignment time is 7.35823 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2158] =>      2158 nucs 'mol-32-1f21-004464_2158'

Score:        2104
Aligned:      2159        nucs
Identic:      2154 (100%) nucs =>      1412 (100%)       742 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89477396,89478809] EXCISED REGION [89478812,89479556]
 second seq =>  [       1,    1413] EXCISED REGION [    1414,    2158]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [89478810,89478811]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89478809,89478809] to [89478812,89478812]
 second seq =>         1 nucs [1413,1413] to [1414,1414]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89477396 ATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGT 89477455
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATCACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGT 60

 89477456 CCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGT 89477515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGT 120

 89477516 GCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCT 89477575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCT 180

 89477576 GGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCA 89477635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCA 240

 89477636 GGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCA 89477695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCA 300

 89477696 CTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAA 89477755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAA 360

 89477756 CTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAA 89477815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAA 420

 89477816 GGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGAT 89477875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGAT 480

 89477876 CTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAAC 89477935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAAC 540

 89477936 ATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATT 89477995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATT 600

 89477996 TCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTC 89478055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTC 660

 89478056 AGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAA 89478115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAA 720

 89478116 AAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATG 89478175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATG 780

 89478176 GTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAG 89478235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAG 840

 89478236 CCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACA 89478295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACA 900

 89478296 TTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGT 89478355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGT 960

 89478356 TTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCAC 89478415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCAC 1020

 89478416 CAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAA 89478475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAA 1080

 89478476 ATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCT 89478535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCT 1140

 89478536 TTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCA 89478595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCA 1200

 89478596 CTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 89478655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 1260

 89478656 GATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTT 89478715
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT-TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTT 1319

 89478716 TTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGC 89478775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGC 1379

 89478776 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCAT 89478809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCAT 1413

EXCISED REGION

 89478812 TGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTACGAGG 89478871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1414 TGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTACGAGG 1473

 89478872 CCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGA 89478931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1474 CCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGA 1533

 89478932 ACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTC 89478991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 ACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTC 1593

 89478992 AAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGG 89479051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 AAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGG 1653

 89479052 GAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACC 89479111
          |||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 GAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACC 1713

 89479112 TAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGT 89479171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1714 TAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGT 1773

 89479172 AAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTG 89479231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 AAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTG 1833

 89479232 GAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAA 89479291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 GAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAA 1893

 89479292 ACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGT 89479351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 ACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGT 1953

 89479352 TCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATC 89479411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1954 TCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATC 2013

 89479412 CATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAA 89479471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2014 CATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAA 2073

 89479472 ATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACA 89479531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 ATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACA 2133

 89479532 GGAGAATATAATTTAAAATCTAATC 89479556
          |||||||||||||||||||||||||
     2134 GGAGAATATAATTTAAAATCTAATC 2158

Alignment time is 3.27155 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    5984] =>      5984 nucs 'mol-32-1f21-093942_5984'

Score:        5874
Aligned:      5986        nucs
Identic:      5975 (100%) nucs =>      3195 (100%)      2780 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89472707,89475908] EXCISED REGION [89478625,89481408]
 second seq =>  [       1,    3200] EXCISED REGION [    3201,    5984]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89472707 GTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGT 89472766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGT 60

 89472767 GTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGC 89472826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGC 120

 89472827 CAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAA 89472886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAA 180

 89472887 ATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAG 89472946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAG 240

 89472947 AATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGAT 89473006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGAT 300

 89473007 ATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGG 89473066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGG 360

 89473067 GACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGA 89473126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGA 420

 89473127 CTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATG 89473186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      421 CTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGCGGCAACTCATG 480

 89473187 ATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTT 89473246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTT 540

 89473247 AAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATG 89473306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATG 600

 89473307 ATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTC 89473366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTC 660

 89473367 AGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCG 89473426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCG 720

 89473427 ACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAA 89473486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAA 780

 89473487 GTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGA 89473546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGA 840

 89473547 CAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCAC 89473606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCAC 900

 89473607 ATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTA 89473666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTA 960

 89473667 ATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCA 89473726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCA 1020

 89473727 AAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTAT 89473786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTAT 1080

 89473787 TAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTA 89473846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTA 1140

 89473847 TGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAAT 89473906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAAT 1200

 89473907 ACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTG 89473966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTG 1260

 89473967 ATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTG 89474026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTG 1320

 89474027 CCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAG 89474086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAG 1380

 89474087 GGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCT 89474146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCT 1440

 89474147 TCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTA 89474206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTA 1500

 89474207 CTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATA 89474266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATA 1560

 89474267 AAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTC 89474326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTC 1620

 89474327 TCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATA 89474386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATA 1680

 89474387 TGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAA 89474446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAA 1740

 89474447 ACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAA 89474506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAA 1800

 89474507 GTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGT 89474566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGT 1860

 89474567 TTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGA 89474626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGA 1920

 89474627 TACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCT 89474686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCT 1980

 89474687 CTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCAT 89474746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCAT 2040

 89474747 CATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTC 89474806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTC 2100

 89474807 AGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGC 89474866
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGCTTTTACACGTTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGC 2160

 89474867 CTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCA 89474926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCA 2220

 89474927 GAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCA 89474986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCA 2280

 89474987 GTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGA 89475046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGA 2340

 89475047 TAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATC 89475106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATC 2400

 89475107 TGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGA 89475166
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCATAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGA 2460

 89475167 ATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCA 89475226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCA 2520

 89475227 GGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGG 89475286
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGTGTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGG 2580

 89475287 TGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAAT 89475346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAAT 2640

 89475347 CAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAG 89475406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAG 2700

 89475407 ATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTG 89475466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTG 2760

 89475467 AGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGG 89475526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGG 2820

 89475527 AGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCA 89475586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCA 2880

 89475587 TGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACG 89475646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACG 2940

 89475647 ATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAA 89475706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAA 3000

 89475707 AATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAA 89475766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAA 3060

 89475767 CTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAG 89475826
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
     3061 CTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTT--GAG 3118

 89475827 ACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAAC 89475886
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 ACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAAC 3178

 89475887 CTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          ||||||||||||||||||||||
     3179 CTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 3200

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 3260

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 3320

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 3380

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3381 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 3440

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3441 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 3500

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3501 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 3560

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3561 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 3620

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3621 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 3680

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3681 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 3740

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3741 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 3800

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3801 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 3860

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3861 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 3920

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3921 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 3980

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3981 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 4040

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4041 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 4100

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4101 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 4160

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4161 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 4220

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4221 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 4280

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4281 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 4340

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4341 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 4400

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4401 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 4460

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4461 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 4520

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4521 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 4580

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4581 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 4640

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4641 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 4700

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4701 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 4760

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4761 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 4820

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4821 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 4880

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4881 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 4940

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4941 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 5000

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5001 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 5060

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5061 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 5120

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5121 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 5180

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5181 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 5240

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5241 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 5300

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5301 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 5360

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5361 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 5420

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5421 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 5480

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5481 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 5540

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5541 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 5600

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5601 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 5660

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5661 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 5720

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5721 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 5780

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5781 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 5840

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5841 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 5900

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5901 ACTGAGGAAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 5960

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAC 89481408
          ||||||||||||||||||||||||
     5961 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAC 5984

Alignment time is 7.71991 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2847] =>      2847 nucs 'mol-32-1f21-093942_2847'

Score:        2803
Aligned:      2847        nucs
Identic:      2843 (100%) nucs =>        63 (100%)      2780 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475846,89475908] EXCISED REGION [89478625,89481408]
 second seq =>  [       1,      63] EXCISED REGION [      64,    2847]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89475846 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 89475905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 60

 89475906 GTG 89475908
          |||
       61 GTG 63

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       64 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 123

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 183

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      184 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 243

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      244 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 303

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 363

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 423

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 483

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 543

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 603

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 663

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 723

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 783

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 843

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 903

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 963

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 1023

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 1083

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 1143

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1144 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 1203

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 1263

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 1323

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 1383

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 1443

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 1503

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 1563

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 1623

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 1683

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 1743

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 1803

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 1863

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 1923

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 1983

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 2043

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 2103

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 2163

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 2223

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 2283

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 2343

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 2403

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 2463

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 2523

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 2583

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 2643

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 2703

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 2763

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 ACTGAGGAAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 2823

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAC 89481408
          ||||||||||||||||||||||||
     2824 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAC 2847

Alignment time is 3.92087 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    4871] =>      4871 nucs 'mol-32-2076-051881_4871'

Score:        4761
Aligned:      4877        nucs
Identic:      4864 (100%) nucs =>       233 ( 99%)      4631 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475673,89475908] EXCISED REGION [89478625,89483264]
 second seq =>  [       1,     234] EXCISED REGION [     235,    4871]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89475673 CATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAAC 89475732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAAC 60

 89475733 AACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTC 89475792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTC 120

 89475793 TAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCT 89475852
          |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||.||||||||||
      121 TAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTT--GAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCT 178

 89475853 GGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 GGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 234

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      235 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 294

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      295 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 354

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      355 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 414

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      415 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 474

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      475 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 534

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      535 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 594

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      595 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 654

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      655 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 714

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 774

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      775 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 834

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      835 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 894

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 954

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 1014

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 1074

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 1134

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 1194

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 1254

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 1314

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1315 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 1374

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 1434

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 1494

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 1554

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 1614

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 1674

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 1734

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 1794

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 1854

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 1914

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 1974

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 2034

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 2094

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 2154

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 2214

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 2274

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 2334

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 2394

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 2454

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 2514

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 2574

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 2634

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 2694

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 2754

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 2814

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 2874

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 2934

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 2994

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTT-AAAAAAAAAAAAAAAA 89481443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
     2995 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-TGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 3053

 89481444 AAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGA 89481503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 AAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGA 3113

 89481504 AAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGG 89481563
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 AAAATCCACAGCCTGCTACATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGG 3173

 89481564 AACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATC 89481623
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 AACAAGGAAAAGATGCCCATTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATC 3233

 89481624 CAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAA 89481683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 CAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAA 3293

 89481684 ATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACT 89481743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 ATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACT 3353

 89481744 GTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAAT 89481803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 GTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAAT 3413

 89481804 CTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCC 89481863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 CTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCC 3473

 89481864 CATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGG 89481923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 CATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGG 3533

 89481924 CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGA 89481983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGA 3593

 89481984 TCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACA 89482043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 TCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACA 3653

 89482044 CACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTG 89482103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 CACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTG 3713

 89482104 AGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCAC 89482163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 AGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCAC 3773

 89482164 TGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAA 89482223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 TGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAA 3833

 89482224 AAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTG 89482283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 AAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTG 3893

 89482284 GAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTG 89482343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 GAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTG 3953

 89482344 ACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCA 89482403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 ACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCA 4013

 89482404 CGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTG 89482463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 CGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTG 4073

 89482464 TCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTG 89482523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 TCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTG 4133

 89482524 CTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAA 89482583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 CTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAA 4193

 89482584 GAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTA 89482643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 GAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTA 4253

 89482644 TCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCA 89482703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 TCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCA 4313

 89482704 TATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTC 89482763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 TATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTC 4373

 89482764 AGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTT 89482823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 AGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTT 4433

 89482824 TGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAA 89482883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 TGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAA 4493

 89482884 CTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAATCATTCAACGCAGAAA 89482943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 CTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAATCATTCAACGCAGAAA 4553

 89482944 GAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCACATGCTCACATGCCAA 89483003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     4554 GAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCACATGCTCACATGCC-- 4611

 89483004 AAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACGTAACTCAAAATGGATC 89483063
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 -AAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACGTAACTCAAAATGGATC 4670

 89483064 AAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGAAAACAAAGGGGAAAAA 89483123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 AAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGAAAACAAAGGGGAAAAA 4730

 89483124 CAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAATGAAAAACTTTTGTGCA 89483183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 CAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAATGAAAAACTTTTGTGCA 4790

 89483184 TCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATGGAAGAAAACATTTGCT 89483243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 TCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATGGAAGAAAACATTTGCT 4850

 89483244 AAACGTGTATCTGATAAGGAA 89483264
          |||||||||||||||||||||
     4851 AAACGTGTATCTGATAAGGAA 4871

Alignment time is 6.42148 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3948] =>      3948 nucs 'mol-32-20fa-030191_3948'

Score:        3893
Aligned:      3948        nucs
Identic:      3943 (100%) nucs =>       532 (100%)      3411 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89476042,89476573] EXCISED REGION [89476575,89479990]
 second seq =>  [       1,     532] EXCISED REGION [     534,    3948]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89476574,89476574]
 second seq =>         1 nucs [533,533]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>        12 nucs [89479063,89479074]
 second seq =>        12 nucs [3021,3032]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [533,534] to [534,535]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89476042 ATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGC 89476101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGC 60

 89476102 CTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAG 89476161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAG 120

 89476162 GTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTG 89476221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTG 180

 89476222 AGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGA 89476281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGA 240

 89476282 GACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCT 89476341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCT 300

 89476342 GCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACT 89476401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACT 360

 89476402 CTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTAT 89476461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTAT 420

 89476462 TGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGG 89476521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGG 480

 89476522 TCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGAT 89476573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGAT 532

EXCISED REGION

 89476575 AATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTG 89476634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 AATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTG 593

 89476635 TAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTC 89476694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 TAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTC 653

 89476695 TTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTC 89476754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 TTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTC 713

 89476755 TTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAAT 89476814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 TTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAAT 773

 89476815 AGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGA 89476874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 AGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGA 833

 89476875 CTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCAC 89476934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 CTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCAC 893

 89476935 GCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAG 89476994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 GCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAG 953

 89476995 GGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGA 89477054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 GGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGA 1013

 89477055 CTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGAT 89477114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 CTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGAT 1073

 89477115 GAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAA 89477174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 GAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAA 1133

 89477175 TTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTG 89477234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 TTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTG 1193

 89477235 ATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTA 89477294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 ATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTA 1253

 89477295 TGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAAT 89477354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 TGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAAT 1313

 89477355 AAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATG 89477414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 AAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATG 1373

 89477415 TGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTT 89477474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTT 1433

 89477475 CTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTG 89477534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 CTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTG 1493

 89477535 GAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGC 89477594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 GAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGC 1553

 89477595 CTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCA 89477654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 CTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCA 1613

 89477655 GGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTAC 89477714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 GGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTAC 1673

 89477715 ATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATT 89477774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 ATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATT 1733

 89477775 CTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGG 89477834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 CTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGG 1793

 89477835 AAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTT 89477894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 AAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTT 1853

 89477895 TCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCT 89477954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 TCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCT 1913

 89477955 AGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCA 89478014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 AGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCA 1973

 89478015 GGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCAT 89478074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 GGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCAT 2033

 89478075 TTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGT 89478134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 TTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGT 2093

 89478135 TTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGT 89478194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 TTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGT 2153

 89478195 GCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATG 89478254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 GCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATG 2213

 89478255 TGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCC 89478314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 TGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCC 2273

 89478315 ACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAG 89478374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 ACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAG 2333

 89478375 TAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAA 89478434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 TAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAA 2393

 89478435 AATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGA 89478494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 AATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGA 2453

 89478495 TTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCT 89478554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 TTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCT 2513

 89478555 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 89478614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 2573

 89478615 GGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCAC 89478674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 GGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCAC 2633

 89478675 CATGCCTCATTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTT 89478734
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 CATGCCTCATTT-TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTT 2692

 89478735 GGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 89478794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 GGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 2752

 89478795 ACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAC 89478854
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2753 ACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAG 2812

 89478855 GAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAA 89478914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 GAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAA 2872

 89478915 TTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCT 89478974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 TTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCT 2932

 89478975 TCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACA 89479034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 TCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACA 2992

 89479035 AAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTA 89479094
          ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||
     2993 AAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTA 3052

 89479095 TCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCC 89479154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 TCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCC 3112

 89479155 GTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGT 89479214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 GTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGT 3172

 89479215 ACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCAT 89479274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 ACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCAT 3232

 89479275 AGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCAT 89479334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 AGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCAT 3292

 89479335 TTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATG 89479394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 TTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATG 3352

 89479395 TTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACC 89479454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 TTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACC 3412

 89479455 CTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAA 89479514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 CTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAA 3472

 89479515 ACTTATTTTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCA 89479574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 ACTTATTTTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCA 3532

 89479575 GCAAGCATTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGC 89479634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 GCAAGCATTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGC 3592

 89479635 ATTAATTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATC 89479694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 ATTAATTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATC 3652

 89479695 AATAGTAAACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTAC 89479754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 AATAGTAAACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTAC 3712

 89479755 GTCTCTGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGG 89479814
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 GTCCCTGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGG 3772

 89479815 TTGTCCATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAA 89479874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 TTGTCCATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAA 3832

 89479875 GAAGCTCACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCG 89479934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 GAAGCTCACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCG 3892

 89479935 GATTCGATGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACA 89479990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 GATTCGATGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACA 3948

Alignment time is 5.04194 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2811] =>      2811 nucs 'mol-32-22a7-024142_2811'

Score:        2770
Aligned:      2803        nucs
Identic:      2800 (100%) nucs =>        66 (100%)      2734 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475843,89475908] EXCISED REGION [89478625,89481361]
 second seq =>  [       9,      74] EXCISED REGION [      75,    2811]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89475843 TTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTT 89475902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        9 TTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTT 68

 89475903 CAAGTG 89475908
          ||||||
       69 CAAGTG 74

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       75 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 134

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      135 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 194

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      195 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 254

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      255 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 314

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      315 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 374

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      375 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 434

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      435 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 494

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      495 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 554

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      555 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 614

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      615 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 674

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      675 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 734

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 794

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      795 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 854

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 914

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 974

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 1034

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 1094

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 1154

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1155 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 1214

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 1274

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 1334

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 1394

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 1454

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 1514

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 1574

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 1634

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 1694

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 1754

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 1814

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 1874

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 1934

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 1994

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 2054

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 2114

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 2174

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 2234

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 2294

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 2354

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 2414

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 2474

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 2534

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 2594

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 2654

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 2714

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 2774

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGA 89481361
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGA 2811

Alignment time is 3.63665 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2219] =>      2219 nucs 'mol-32-22b2-064634_2219'

Score:        2219
Aligned:      2219        nucs
Identic:      2219 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475021,89477239]
 second seq =>  [       1,    2219]

 89475021 TATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAA 89475080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAA 60

 89475081 TCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACT 89475140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACT 120

 89475141 CCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAG 89475200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAG 180

 89475201 TGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTT 89475260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTT 240

 89475261 CTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGC 89475320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGC 300

 89475321 CAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGA 89475380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGA 360

 89475381 GGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAAT 89475440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAAT 420

 89475441 TTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAG 89475500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAG 480

 89475501 CAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGG 89475560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGG 540

 89475561 AGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCT 89475620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCT 600

 89475621 TTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTG 89475680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTG 660

 89475681 GGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGT 89475740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGT 720

 89475741 GGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAAT 89475800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAAT 780

 89475801 TAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCA 89475860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCA 840

 89475861 GTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 89475920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 900

 89475921 CAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTAT 89475980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTAT 960

 89475981 TTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGT 89476040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGT 1020

 89476041 GATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGG 89476100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGG 1080

 89476101 CCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGA 89476160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGA 1140

 89476161 GGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCT 89476220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCT 1200

 89476221 GAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAG 89476280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAG 1260

 89476281 AGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCC 89476340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCC 1320

 89476341 TGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCAC 89476400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCAC 1380

 89476401 TCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTA 89476460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTA 1440

 89476461 TTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTG 89476520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTG 1500

 89476521 GTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTT 89476580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTT 1560

 89476581 GGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTT 89476640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTT 1620

 89476641 CTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTC 89476700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTC 1680

 89476701 TAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATT 89476760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATT 1740

 89476761 CTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAG 89476820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAG 1800

 89476821 TAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCG 89476880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCG 1860

 89476881 AAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTT 89476940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTT 1920

 89476941 ACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGA 89477000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGA 1980

 89477001 GATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATG 89477060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATG 2040

 89477061 ATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAAT 89477120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAAT 2100

 89477121 TTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGAT 89477180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGAT 2160

 89477181 TAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAG 89477239
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAG 2219

Alignment time is 2.52916 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    4956] =>      4956 nucs 'mol-32-288a-089294_4956'

Score:        4845
Aligned:      4959        nucs
Identic:      4947 (100%) nucs =>      3322 (100%)      1625 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89472578,89475908] EXCISED REGION [89478625,89480252]
 second seq =>  [       1,    3328] EXCISED REGION [    3329,    4956]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89472578 TCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAA 89472637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAA 60

 89472638 TTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAA 89472697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAA 120

 89472698 AATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAG 89472757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAG 180

 89472758 GTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTC 89472817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTC 240

 89472818 TTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTC 89472877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTC 300

 89472878 CTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCC 89472937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCC 360

 89472938 ATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGT 89472997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGT 420

 89472998 AGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTC 89473057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTC 480

 89473058 TGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTT 89473117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTT 540

 89473118 TACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGG 89473177
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      541 TACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGCGG 600

 89473178 CAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTAC 89473237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTAC 660

 89473238 AATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTT 89473297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTT 720

 89473298 AGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAA 89473357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAA 780

 89473358 AATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTA 89473417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTA 840

 89473418 GCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCT 89473477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCT 900

 89473478 CATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCT 89473537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCT 960

 89473538 AAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCT 89473597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCT 1020

 89473598 AGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCC 89473657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCC 1080

 89473658 TTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTT 89473717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTT 1140

 89473718 CTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTT 89473777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTT 1200

 89473778 TCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAA 89473837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAA 1260

 89473838 TCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATAT 89473897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATAT 1320

 89473898 ACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCA 89473957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCA 1380

 89473958 GGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAA 89474017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAA 1440

 89474018 ATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAAC 89474077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAAC 1500

 89474078 TGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTA 89474137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTA 1560

 89474138 GGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAA 89474197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAA 1620

 89474198 AAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGT 89474257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGT 1680

 89474258 GACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGG 89474317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGG 1740

 89474318 ATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATG 89474377
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATAAAGTTCTCGCTTCATATGGCATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATG 1800

 89474378 CCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCC 89474437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCC 1860

 89474438 TGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGA 89474497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGA 1920

 89474498 AACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCC 89474557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCC 1980

 89474558 ATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGAT 89474617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGAT 2040

 89474618 GCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGC 89474677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGC 2100

 89474678 CCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTT 89474737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTT 2160

 89474738 CTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTG 89474797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTG 2220

 89474798 TGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTA 89474857
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGCAGATTCAGCTTTTACACGTTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTA 2280

 89474858 TCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATG 89474917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATG 2340

 89474918 CCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAG 89474977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAG 2400

 89474978 GTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAA 89475037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAA 2460

 89475038 GCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCT 89475097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCT 2520

 89475098 GTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTAT 89475157
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2521 GTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCATAGACTCCTTGGATTTCAAGTAT 2580

 89475158 GTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGG 89475217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGG 2640

 89475218 CTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCT 89475277
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTGTAAGCAGGTGTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCT 2700

 89475278 TGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAG 89475337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAG 2760

 89475338 CTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTG 89475397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTG 2820

 89475398 GGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCA 89475457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCA 2880

 89475458 TATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCA 89475517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCA 2940

 89475518 GATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGA 89475577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGA 3000

 89475578 GACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAA 89475637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAA 3060

 89475638 CCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGA 89475697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGA 3120

 89475698 ACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTG 89475757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTG 3180

 89475758 AATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTT 89475817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTT 3240

 89475818 TTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCA 89475877
          |||   ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTT---GAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCA 3297

 89475878 CACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 3328

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3329 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 3388

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3389 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 3448

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3449 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 3508

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3509 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 3568

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3569 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 3628

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3629 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 3688

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3689 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 3748

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3749 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 3808

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3809 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 3868

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3869 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 3928

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3929 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 3988

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3989 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 4048

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4049 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 4108

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4109 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 4168

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4169 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 4228

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4229 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 4288

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4289 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 4348

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4349 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 4408

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4409 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 4468

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4469 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 4528

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4529 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 4588

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4589 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 4648

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4649 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 4708

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4709 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 4768

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4769 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 4828

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4829 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 4888

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4889 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 4948

 89480245 GCCTGCTG 89480252
          ||||||||
     4949 GCCTGCTG 4956

Alignment time is 6.61931 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    7817] =>      7817 nucs 'mol-32-2895-082903_7817'

Score:        7675
Aligned:      7820        nucs
Identic:      7806 (100%) nucs =>      3504 (100%)      4302 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89472398,89475908] EXCISED REGION [89478625,89482933]
 second seq =>  [       1,    3509] EXCISED REGION [    3510,    7817]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89472398 ATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTGACAATTGGGA 89472457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTGACAATTGGGA 60

 89472458 TGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTCA 89472517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTCA 120

 89472518 AAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGAA 89472577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGAA 180

 89472578 TCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAA 89472637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAA 240

 89472638 TTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAA 89472697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAA 300

 89472698 AATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAG 89472757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAG 360

 89472758 GTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTC 89472817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTC 420

 89472818 TTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTC 89472877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTC 480

 89472878 CTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCC 89472937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCC 540

 89472938 ATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGT 89472997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGT 600

 89472998 AGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTC 89473057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTC 660

 89473058 TGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTT 89473117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTT 720

 89473118 TACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGG 89473177
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      721 TACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGCGG 780

 89473178 CAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTAC 89473237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTAC 840

 89473238 AATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTT 89473297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTT 900

 89473298 AGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAA 89473357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAA 960

 89473358 AATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTA 89473417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTA 1020

 89473418 GCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCT 89473477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCT 1080

 89473478 CATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCT 89473537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCT 1140

 89473538 AAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCT 89473597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCT 1200

 89473598 AGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCC 89473657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCC 1260

 89473658 TTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTT 89473717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTT 1320

 89473718 CTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTT 89473777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTT 1380

 89473778 TCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAA 89473837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAA 1440

 89473838 TCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATAT 89473897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATAT 1500

 89473898 ACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCA 89473957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCA 1560

 89473958 GGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAA 89474017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAA 1620

 89474018 ATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAAC 89474077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAAC 1680

 89474078 TGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTA 89474137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTA 1740

 89474138 GGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAA 89474197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAA 1800

 89474198 AAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGT 89474257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGT 1860

 89474258 GACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGG 89474317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGG 1920

 89474318 ATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATG 89474377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATG 1980

 89474378 CCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCC 89474437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCC 2040

 89474438 TGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGA 89474497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGA 2100

 89474498 AACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCC 89474557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCC 2160

 89474558 ATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGAT 89474617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGAT 2220

 89474618 GCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGC 89474677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGC 2280

 89474678 CCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTT 89474737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTT 2340

 89474738 CTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTG 89474797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTG 2400

 89474798 TGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTA 89474857
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGCAGATTCAGCTTTTACACGTTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTA 2460

 89474858 TCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATG 89474917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATG 2520

 89474918 CCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAG 89474977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAG 2580

 89474978 GTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAA 89475037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAA 2640

 89475038 GCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCT 89475097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCT 2700

 89475098 GTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTAT 89475157
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2701 GTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCATAGACTCCTTGGATTTCAAGTAT 2760

 89475158 GTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGG 89475217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGG 2820

 89475218 CTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCT 89475277
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTGTAAGCAGGTGTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCT 2880

 89475278 TGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAG 89475337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAG 2940

 89475338 CTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTG 89475397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTG 3000

 89475398 GGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCA 89475457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCA 3060

 89475458 TATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCA 89475517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCA 3120

 89475518 GATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGA 89475577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGA 3180

 89475578 GACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAA 89475637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAA 3240

 89475638 CCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGA 89475697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGA 3300

 89475698 ACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTG 89475757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTG 3360

 89475758 AATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTT 89475817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTT 3420

 89475818 TTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCA 89475877
          ||||  ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTT--GAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCA 3478

 89475878 CACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 CACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 3509

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 3569

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 3629

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 3689

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3690 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 3749

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 3809

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3810 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGAGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 3869

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3870 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 3929

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3930 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 3989

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3990 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 4049

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4050 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 4109

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4110 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 4169

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4170 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 4229

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4230 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 4289

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4290 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 4349

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4350 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 4409

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4410 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 4469

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4470 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 4529

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4530 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 4589

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4590 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 4649

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4650 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 4709

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4710 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 4769

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4770 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGGTGT 4829

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4830 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 4889

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4890 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 4949

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4950 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 5009

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5010 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 5069

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5070 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 5129

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5130 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 5189

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5190 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 5249

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5250 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 5309

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5310 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 5369

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5370 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 5429

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5430 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 5489

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5490 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 5549

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5550 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 5609

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5610 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 5669

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5670 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 5729

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5730 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 5789

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5790 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 5849

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5850 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 5909

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5910 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 5969

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5970 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 6029

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6030 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 6089

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6090 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 6149

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6150 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 6209

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6210 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 6269

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 89481444
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     6270 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-TGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 6328

 89481445 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 89481504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6329 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 6388

 89481505 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 89481564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6389 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 6448

 89481565 ACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 89481624
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6449 ACAAGGAAAAGATGCCCATTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 6508

 89481625 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 89481684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6509 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 6568

 89481685 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 89481744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6569 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 6628

 89481745 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 89481804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6629 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 6688

 89481805 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 89481864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6689 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 6748

 89481865 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 89481924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6749 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 6808

 89481925 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 89481984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6809 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 6868

 89481985 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 89482044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6869 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 6928

 89482045 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 89482104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6929 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 6988

 89482105 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACT 89482164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6989 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACT 7048

 89482165 GCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAA 89482224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7049 GCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAA 7108

 89482225 AACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGG 89482284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7109 AACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGG 7168

 89482285 AGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGA 89482344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7169 AGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGA 7228

 89482345 CCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCAC 89482404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7229 CCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCAC 7288

 89482405 GTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTGT 89482464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7289 GTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTGT 7348

 89482465 CCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTGC 89482524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7349 CCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTGC 7408

 89482525 TGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAAG 89482584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7409 TGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAAG 7468

 89482585 AGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTAT 89482644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7469 AGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTAT 7528

 89482645 CAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCAT 89482704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7529 CAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCAT 7588

 89482705 ATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTCA 89482764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7589 ATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTCA 7648

 89482765 GAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTTT 89482824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7649 GAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTTT 7708

 89482825 GGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAAC 89482884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7709 GGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAAC 7768

 89482885 TCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAATCATTC 89482933
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7769 TCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAATCATTC 7817

Alignment time is 10.0681 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3549] =>      3549 nucs 'mol-32-2895-082903_3549'

Score:        3483
Aligned:      3551        nucs
Identic:      3544 (100%) nucs =>      3504 (100%)        40 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89472398,89475908] EXCISED REGION [89478625,89478664]
 second seq =>  [       1,    3509] EXCISED REGION [    3510,    3549]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89472398 ATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTGACAATTGGGA 89472457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTGACAATTGGGA 60

 89472458 TGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTCA 89472517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTCA 120

 89472518 AAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGAA 89472577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGAA 180

 89472578 TCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAA 89472637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAA 240

 89472638 TTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAA 89472697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAA 300

 89472698 AATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAG 89472757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAG 360

 89472758 GTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTC 89472817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTC 420

 89472818 TTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTC 89472877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTC 480

 89472878 CTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCC 89472937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCC 540

 89472938 ATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGT 89472997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGT 600

 89472998 AGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTC 89473057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTC 660

 89473058 TGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTT 89473117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTT 720

 89473118 TACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGG 89473177
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      721 TACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGCGG 780

 89473178 CAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTAC 89473237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTAC 840

 89473238 AATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTT 89473297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTT 900

 89473298 AGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAA 89473357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAA 960

 89473358 AATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTA 89473417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTA 1020

 89473418 GCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCT 89473477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCT 1080

 89473478 CATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCT 89473537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCT 1140

 89473538 AAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCT 89473597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCT 1200

 89473598 AGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCC 89473657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCC 1260

 89473658 TTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTT 89473717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTT 1320

 89473718 CTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTT 89473777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTT 1380

 89473778 TCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAA 89473837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAA 1440

 89473838 TCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATAT 89473897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATAT 1500

 89473898 ACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCA 89473957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCA 1560

 89473958 GGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAA 89474017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAA 1620

 89474018 ATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAAC 89474077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAAC 1680

 89474078 TGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTA 89474137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTA 1740

 89474138 GGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAA 89474197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAA 1800

 89474198 AAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGT 89474257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGT 1860

 89474258 GACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGG 89474317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGG 1920

 89474318 ATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATG 89474377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATG 1980

 89474378 CCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCC 89474437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCC 2040

 89474438 TGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGA 89474497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGA 2100

 89474498 AACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCC 89474557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCC 2160

 89474558 ATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGAT 89474617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGAT 2220

 89474618 GCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGC 89474677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGC 2280

 89474678 CCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTT 89474737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTT 2340

 89474738 CTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTG 89474797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTG 2400

 89474798 TGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTA 89474857
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGCAGATTCAGCTTTTACACGTTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTA 2460

 89474858 TCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATG 89474917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATG 2520

 89474918 CCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAG 89474977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAG 2580

 89474978 GTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAA 89475037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAA 2640

 89475038 GCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCT 89475097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCT 2700

 89475098 GTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTAT 89475157
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2701 GTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCATAGACTCCTTGGATTTCAAGTAT 2760

 89475158 GTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGG 89475217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGG 2820

 89475218 CTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCT 89475277
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTGTAAGCAGGTGTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCT 2880

 89475278 TGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAG 89475337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAG 2940

 89475338 CTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTG 89475397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTG 3000

 89475398 GGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCA 89475457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCA 3060

 89475458 TATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCA 89475517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCA 3120

 89475518 GATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGA 89475577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGA 3180

 89475578 GACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAA 89475637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAA 3240

 89475638 CCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGA 89475697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGA 3300

 89475698 ACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTG 89475757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTG 3360

 89475758 AATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTT 89475817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTT 3420

 89475818 TTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCA 89475877
          ||||  ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTT--GAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCA 3478

 89475878 CACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 CACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 3509

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGG 89478664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGG 3549

Alignment time is 4.63338 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2037] =>      2037 nucs 'mol-32-29b3-012917_2037'

Score:        1993
Aligned:      2037        nucs
Identic:      2033 (100%) nucs =>       101 (100%)      1932 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89477488,89477588] EXCISED REGION [89477590,89479525]
 second seq =>  [       1,     101] EXCISED REGION [     103,    2037]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89477589,89477589]
 second seq =>         1 nucs [102,102]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>        12 nucs [89479063,89479074]
 second seq =>        12 nucs [1575,1586]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89477589,89477589] to [89477590,89477590]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89477488 TCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCG 89477547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCG 60

 89477548 GGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGC 89477588
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGC 101

EXCISED REGION

 89477590 ATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCC 89477649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      103 ATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCC 162

 89477650 ATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGA 89477709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      163 ATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGA 222

 89477710 CCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTG 89477769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      223 CCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTG 282

 89477770 TAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCA 89477829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      283 TAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCA 342

 89477830 TCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAG 89477889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      343 TCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAG 402

 89477890 TTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTT 89477949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      403 TTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTT 462

 89477950 GTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCAC 89478009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      463 GTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCAC 522

 89478010 CATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGT 89478069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      523 CATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGT 582

 89478070 AGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGT 89478129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      583 AGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGT 642

 89478130 TTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTG 89478189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      643 TTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTG 702

 89478190 TATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAG 89478249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      703 TATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAG 762

 89478250 CCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATA 89478309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      763 CCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATA 822

 89478310 GCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATT 89478369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      823 GCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATT 882

 89478370 TTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACC 89478429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      883 TTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACC 942

 89478430 AACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGAT 89478489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      943 AACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGAT 1002

 89478490 TGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTT 89478549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1003 TGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTT 1062

 89478550 TTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCC 89478609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1063 TTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCC 1122

 89478610 TCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGT 89478669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 TCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGT 1182

 89478670 GCCACCATGCCTCATTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCT 89478729
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1183 GCCACCATGCCTCATTT-TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCT 1241

 89478730 AGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 89478789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 AGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 1301

 89478790 GGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGT 89478849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 GGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGT 1361

 89478850 ACTACGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTT 89478909
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 ACTAGGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTT 1421

 89478910 TGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCA 89478969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 TGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCA 1481

 89478970 GCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGA 89479029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 GCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGA 1541

 89479030 AGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAAT 89479089
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||
     1542 AGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAAT 1601

 89479090 TTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTG 89479149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 TTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTG 1661

 89479150 TTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTC 89479209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 TTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTC 1721

 89479210 CAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATG 89479269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 CAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATG 1781

 89479270 GGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCC 89479329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 GGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCC 1841

 89479330 ATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAAT 89479389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 ATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAAT 1901

 89479390 CTATGTTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCAC 89479449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 CTATGTTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCAC 1961

 89479450 GAACCCTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAA 89479509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 GAACCCTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAA 2021

 89479510 AAGAAACTTATTTTAG 89479525
          ||||||||||||||||
     2022 AAGAAACTTATTTTAG 2037

Alignment time is 2.62459 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    5355] =>      5355 nucs 'mol-32-29be-032547_5355'

Score:        5235
Aligned:      5358        nucs
Identic:      5346 (100%) nucs =>       996 ( 99%)      4350 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89474907,89475908] EXCISED REGION [89478625,89482979]
 second seq =>  [       1,    1000] EXCISED REGION [    1001,    5355]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89474907 GACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTT 89474966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTT 60

 89474967 ATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTA 89475026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTA 120

 89475027 AAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCT 89475086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCT 180

 89475087 TTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGG 89475146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      181 TTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCATAGACTCCTTGG 240

 89475147 ATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAA 89475206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAA 300

 89475207 GTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGA 89475266
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTGTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGA 360

 89475267 ATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATA 89475326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATA 420

 89475327 CATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGA 89475386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGA 480

 89475387 TACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATG 89475446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATG 540

 89475447 CTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATC 89475506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATC 600

 89475507 AGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATA 89475566
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAGTGATTCAGATAGACGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATA 660

 89475567 TCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAAT 89475626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAAT 720

 89475627 CCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTC 89475686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTC 780

 89475687 TGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAA 89475746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAA 840

 89475747 TCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTA 89475806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTA 900

 89475807 ATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCG 89475866
          |||||||||||||||  ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      901 ATTTTTTTTTTTTTT--GAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCG 958

 89475867 TGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 TGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 1000

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 1060

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 1120

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 1180

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1181 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 1240

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 1300

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 1360

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 1420

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 1480

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 1540

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 1600

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 1660

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 1720

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 1780

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 1840

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 1900

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 1960

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 2020

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 2080

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2081 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 2140

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 2200

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 2260

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 2320

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 2380

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 2440

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 2500

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 2560

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 2620

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 2680

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 2740

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 2800

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 2860

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 2920

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 2980

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 3040

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 3100

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 3160

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 3220

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 3280

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 3340

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 3400

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 3460

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 3520

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 3580

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 3640

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 3700

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 3760

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTT-AAAAAAAAAAAAAAAA 89481443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
     3761 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-TGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 3819

 89481444 AAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGA 89481503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3820 AAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGA 3879

 89481504 AAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGG 89481563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3880 AAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGG 3939

 89481564 AACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATC 89481623
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3940 AACAAGGAAAAGATGCCCATTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATC 3999

 89481624 CAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAA 89481683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4000 CAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAA 4059

 89481684 ATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACT 89481743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4060 ATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACT 4119

 89481744 GTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAAT 89481803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4120 GTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAAT 4179

 89481804 CTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCC 89481863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4180 CTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCC 4239

 89481864 CATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGG 89481923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4240 CATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGG 4299

 89481924 CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGA 89481983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4300 CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGA 4359

 89481984 TCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACA 89482043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4360 TCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACA 4419

 89482044 CACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTG 89482103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4420 CACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTG 4479

 89482104 AGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCAC 89482163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4480 AGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCAC 4539

 89482164 TGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAA 89482223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4540 TGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAA 4599

 89482224 AAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTG 89482283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4600 AAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTG 4659

 89482284 GAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTG 89482343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4660 GAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTG 4719

 89482344 ACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCA 89482403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4720 ACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCA 4779

 89482404 CGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTG 89482463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4780 CGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTG 4839

 89482464 TCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTG 89482523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4840 TCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTG 4899

 89482524 CTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAA 89482583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4900 CTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAA 4959

 89482584 GAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTA 89482643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4960 GAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTA 5019

 89482644 TCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCA 89482703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5020 TCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCA 5079

 89482704 TATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTC 89482763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5080 TATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTC 5139

 89482764 AGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTT 89482823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5140 AGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTT 5199

 89482824 TGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAA 89482883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5200 TGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAA 5259

 89482884 CTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAATCATTCAACGCAGAAA 89482943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5260 CTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAATCATTCAACGCAGAAA 5319

 89482944 GAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTG 89482979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5320 GAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTG 5355

Alignment time is 7.15334 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    5155] =>      5155 nucs 'mol-32-29be-037686_5155'

Score:        5118
Aligned:      5140        nucs
Identic:      5138 (100%) nucs =>      1984 (100%)      3154 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89473824,89475807] EXCISED REGION [89475809,89478964]
 second seq =>  [       1,    1984] EXCISED REGION [    1985,    5139]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89475808,89475808]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [89478854,89478854]
 second seq =>         1 nucs [5029,5029]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [89475808,89475822] to [89475809,89475823]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89473824 TATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACA 89473883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACA 60

 89473884 TATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATA 89473943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATA 120

 89473944 TGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGA 89474003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGA 180

 89474004 AGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCC 89474063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCC 240

 89474064 AACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTAC 89474123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTAC 300

 89474124 AGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATAC 89474183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATAC 360

 89474184 TAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATA 89474243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATA 420

 89474244 TTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCT 89474303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCT 480

 89474304 CCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAG 89474363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAG 540

 89474364 GCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGAC 89474423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGAC 600

 89474424 TGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAA 89474483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAA 660

 89474484 GTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTT 89474543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTT 720

 89474544 ATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACG 89474603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACG 780

 89474604 AACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCT 89474663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCT 840

 89474664 TCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGA 89474723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGA 900

 89474724 TAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATT 89474783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATT 960

 89474784 TTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACA 89474843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACA 1020

 89474844 TTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCT 89474903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCT 1080

 89474904 GCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAG 89474963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAG 1140

 89474964 TTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTAT 89475023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTAT 1200

 89475024 TTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCT 89475083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCT 1260

 89475084 CCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCT 89475143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCT 1320

 89475144 TGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGA 89475203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGA 1380

 89475204 GAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTG 89475263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTG 1440

 89475264 AGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAG 89475323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAG 1500

 89475324 ATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGA 89475383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGA 1560

 89475384 TGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTG 89475443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTG 1620

 89475444 ATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAA 89475503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAA 1680

 89475504 ATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGG 89475563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGG 1740

 89475564 ATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTA 89475623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTA 1800

 89475624 AATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGT 89475683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGT 1860

 89475684 TTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGT 89475743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGT 1920

 89475744 TAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAA 89475803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAA 1980

 89475804 CTAA 89475807
          ||||
     1981 CTAA 1984

EXCISED REGION

 89475809 TTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTG 89475868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 TTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTG 2044

 89475869 ATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 89475928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 ATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 2104

 89475929 TGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTA 89475988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 TGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTA 2164

 89475989 GAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCC 89476048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 GAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCC 2224

 89476049 TGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTA 89476108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 TGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTA 2284

 89476109 ACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAAT 89476168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 ACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAAT 2344

 89476169 CTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCT 89476228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 CTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCT 2404

 89476229 GGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGT 89476288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 GGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGT 2464

 89476289 TTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTG 89476348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 TTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTG 2524

 89476349 CCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTG 89476408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 CCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTG 2584

 89476409 ATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGA 89476468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 ATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGA 2644

 89476469 AAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTT 89476528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 AAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTT 2704

 89476529 GGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCT 89476588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 GGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCT 2764

 89476589 GTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAA 89476648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 GTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAA 2824

 89476649 AGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGAC 89476708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 AGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGAC 2884

 89476709 TGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTAC 89476768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 TGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTAC 2944

 89476769 AAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGA 89476828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 AAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGA 3004

 89476829 GTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAA 89476888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 GTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAA 3064

 89476889 CAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGA 89476948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 CAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGA 3124

 89476949 CCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACA 89477008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 CCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACA 3184

 89477009 GCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATA 89477068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 GCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATA 3244

 89477069 TGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTG 89477128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 TGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTG 3304

 89477129 CATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCC 89477188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3305 CATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCC 3364

 89477189 CTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTT 89477248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3365 CTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTT 3424

 89477249 TAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAAC 89477308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3425 TAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAAC 3484

 89477309 TAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCA 89477368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3485 TAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCA 3544

 89477369 TTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTA 89477428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3545 TTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTA 3604

 89477429 CCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTT 89477488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 CCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTT 3664

 89477489 CAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGG 89477548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 CAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGG 3724

 89477549 GCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGG 89477608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 GCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGG 3784

 89477609 CTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTC 89477668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3785 CTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTC 3844

 89477669 TGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAA 89477728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3845 TGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAA 3904

 89477729 TGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAAT 89477788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 TGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAAT 3964

 89477789 TTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAA 89477848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 TTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAA 4024

 89477849 TGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGAT 89477908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 TGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGAT 4084

 89477909 CCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCC 89477968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 CCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCC 4144

 89477969 TGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCAT 89478028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4145 TGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCAT 4204

 89478029 AGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTA 89478088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 AGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTA 4264

 89478089 TGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAG 89478148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 TGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAG 4324

 89478149 CATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGC 89478208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 CATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGC 4384

 89478209 TAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTA 89478268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 TAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTA 4444

 89478269 ATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGC 89478328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 ATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGC 4504

 89478329 TACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTT 89478388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 TACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTT 4564

 89478389 TCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAAT 89478448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 TCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAAT 4624

 89478449 GTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGA 89478508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 GTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGA 4684

 89478509 TACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCT 89478568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4685 TACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCT 4744

 89478569 GGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTC 89478628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 GGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTC 4804

 89478629 TCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTTAT 89478688
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     4805 TCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT-T 4863

 89478689 TTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCT 89478748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4864 TTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCT 4923

 89478749 GGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCA 89478808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4924 GGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCA 4983

 89478809 TCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTACG 89478868
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4984 TCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTACG 5043

 89478869 AGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTA 89478928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5044 AGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTA 5103

 89478929 GGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGG 89478964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5104 GGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGG 5139

Alignment time is 6.64504 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2755] =>      2755 nucs 'mol-32-2afd-032015_2755'

Score:        2722
Aligned:      2755        nucs
Identic:      2752 (100%) nucs =>        21 (100%)      2731 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475888,89475908] EXCISED REGION [89478625,89481358]
 second seq =>  [       1,      21] EXCISED REGION [      22,    2755]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89475888 TCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          |||||||||||||||||||||
        1 TCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 21

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       22 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 81

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       82 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 141

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      142 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 201

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      202 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 261

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      262 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 321

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      322 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 381

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      382 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 441

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      442 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 501

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      502 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 561

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      562 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 621

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      622 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 681

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      682 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 741

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      742 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 801

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      802 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 861

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      862 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 921

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      922 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 981

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      982 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 1041

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1042 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 1101

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1102 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 1161

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1162 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 1221

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1222 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 1281

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1282 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 1341

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1342 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 1401

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1402 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 1461

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1462 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 1521

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1522 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 1581

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1582 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 1641

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1642 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 1701

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 1761

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 1821

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 1881

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 1941

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 2001

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 2061

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 2121

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 2181

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 2241

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 2301

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 2361

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 2421

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 2481

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 2541

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 2601

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 2661

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 2721

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGC 89481358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGC 2755

Alignment time is 3.54965 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    4886] =>      4886 nucs 'mol-32-2afd-032200_4886'

Score:        4798
Aligned:      4886        nucs
Identic:      4878 (100%) nucs =>      4784 (100%)        94 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89471017,89475807] EXCISED REGION [89475810,89475904]
 second seq =>  [       1,    4791] EXCISED REGION [    4792,    4886]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [89475808,89475809]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [89475808,89475821] to [89475810,89475823]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475808,89475808] to [89475809,89475809]
 second seq =>         0 nucs

 89471017 CCTCCTGAAAGGAGGTGGCACTTTCCAGAAAGTATCAGTGGGAGAGGGACTGGTGGTGGG 89471076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCCTGAAAGGAGGTGGCACTTTCCAGAAAGTATCAGTGGGAGAGGGACTGGTGGTGGG 60

 89471077 CAGGGTCCTAGAACTCCCAAGATTAAATGACCTTTGTCTTCAGCTACCAGGGTGGATGGA 89471136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGGGTCCTAGAACTCCCAAGATTAAATGACCTTTGTCTTCAGCTACCAGGGTGGATGGA 120

 89471137 GAAGGACCATCAGGTCAGGGCGGGGCTAGGAGTGTCTGAGCTCAGACTCTCCATGGCTGG 89471196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAGGACCATCAGGTCAGGGCGGGGCTAGGAGTGTCTGAGCTCAGACTCTCCATGGCTGG 180

 89471197 ATCTTGCTATGGCTGCTGTGGGGGATGGGGGTGAGATTCCCAGGTCACTGGAGTTGTGTA 89471256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCTTGCTATGGCTGCTGTGGGGGATGGGGGTGAGATTCCCAGGTCACTGGAGTTGTGTA 240

 89471257 CCTAGGAGGATTATGGCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGTTGTCAGGGGAGTGGGAGAAG 89471316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTAGGAGGATTATGGCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGTTGTCAGGGGAGTGGGAGAAG 300

 89471317 CTGGCAGTCACAGGCCTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGGAAGGCCGGTCTCACTCCCAC 89471376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGGCAGTCACAGGCCTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGGAAGGCCGGTCTCACTCCCAC 360

 89471377 TGTGCCCTTCTCCCTGCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCAGGCAGAGGGCAAGAGGGGCG 89471436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTGCCCTTCTCCCTGCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCAGGCAGAGGGCAAGAGGGGCG 420

 89471437 GGCTTAAAATTTGGCTGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAGAAAAGGACTTTAGTTCTTCA 89471496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCTTAAAATTTGGCTGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAGAAAAGGACTTTAGTTCTTCA 480

 89471497 CCAGCCTGTGAAGTTTGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCCGAGTTCTGGCAGGAGGCTTC 89471556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAGCCTGTGAAGTTTGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCCGAGTTCTGGCAGGAGGCTTC 540

 89471557 TCGCCCCATTCAAATTGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATTTCTTCTTTCTGTGGAGTTTT 89471616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCGCCCCATTCAAATTGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATTTCTTCTTTCTGTGGAGTTTT 600

 89471617 ACCTGTTGCTCCTCTGGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGTGGTGCCAGGCAGGAATGGCC 89471676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCTGTTGCTCCTCTGGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGTGGTGCCAGGCAGGAATGGCC 660

 89471677 TGCCTGGGGACACAGTGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGCTTCCTCTACCCCTGTATTTT 89471736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCCTGGGGACACAGTGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGCTTCCTCTACCCCTGTATTTT 720

 89471737 GCTCGGCTCTCTAACTTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGGAAACTCCTCCTGCACACAAA 89471796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTCGGCTCTCTAACTTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGGAAACTCCTCCTGCACACAAA 780

 89471797 CCTTCAGCTTCTCCAGTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGAGGGTCTCCCTTTCCCACTTC 89471856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTTCAGCTTCTCCAGTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGAGGGTCTCCCTTTCCCACTTC 840

 89471857 TGCAGTTGGGGCAGTCAGAATATTTGGAGTGTTTCCTGGGTCCTGCAGGAGCAGTCTGCC 89471916
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      841 TGCAGTTGGGGCAGTCAGAATATTTGGAGTGTTTCTTGGGTCCTGCAGGAGCAGTCTGCC 900

 89471917 TCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTGTAATATTTTGAAACACTACA 89471976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTGTAATATTTTGAAACACTACA 960

 89471977 TAATTATTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATCCTTATGATTCTTATAAATGTAAGT 89472036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAATTATTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATCCTTATGATTCTTATAAATGTAAGT 1020

 89472037 AAAATAAGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAATGTTTCTATAAACAAAGGTCTGCAA 89472096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAATAAGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAATGTTTCTATAAACAAAGGTCTGCAA 1080

 89472097 ACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGTGTTATTGGCACATAGCCCCA 89472156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGTGTTATTGGCACATAGCCCCA 1140

 89472157 CCCATTTACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTGTATGCAGAGTTTAGTAGTTG 89472216
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1141 CCCATTTACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTATATGCAGAGTTTAGTAGTTG 1200

 89472217 AGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTATCTGGTATTTTACAGAAAAGTTAGC 89472276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTATCTGGTATTTTACAGAAAAGTTAGC 1260

 89472277 CAACCACTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTGGTGAAAAACTAAAAAAAAAAAAAT 89472336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAACCACTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTGGTGAAAAACTAAAAAAAAAAAAAT 1320

 89472337 GGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTATTTCTAGTTCAAA 89472396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTATTTCTAGTTCAAA 1380

 89472397 AATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTGACAATTGGG 89472456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTGACAATTGGG 1440

 89472457 ATGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTC 89472516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTC 1500

 89472517 AAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGA 89472576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGA 1560

 89472577 ATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCA 89472636
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATCAGGAAGAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCA 1620

 89472637 ATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTA 89472696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTA 1680

 89472697 AAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAA 89472756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAA 1740

 89472757 GGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTT 89472816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTT 1800

 89472817 CTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTT 89472876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTT 1860

 89472877 CCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATC 89472936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATC 1920

 89472937 CATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTG 89472996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTG 1980

 89472997 TAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTT 89473056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTT 2040

 89473057 CTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTT 89473116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTT 2100

 89473117 TTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTG 89473176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2101 TTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGCG 2160

 89473177 GCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTA 89473236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTA 2220

 89473237 CAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTT 89473296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTT 2280

 89473297 TAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTA 89473356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTA 2340

 89473357 AAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTT 89473416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTT 2400

 89473417 AGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATC 89473476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATC 2460

 89473477 TCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCC 89473536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCC 2520

 89473537 TAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATC 89473596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATC 2580

 89473597 TAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACC 89473656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACC 2640

 89473657 CTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTT 89473716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTT 2700

 89473717 TCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTT 89473776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTT 2760

 89473777 TTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAA 89473836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAA 2820

 89473837 ATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATA 89473896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATA 2880

 89473897 TACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATC 89473956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATC 2940

 89473957 AGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGA 89474016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGA 3000

 89474017 AATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAA 89474076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAA 3060

 89474077 CTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTT 89474136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTT 3120

 89474137 AGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGA 89474196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGA 3180

 89474197 AAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTG 89474256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTG 3240

 89474257 TGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGG 89474316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGG 3300

 89474317 GATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGAT 89474376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGAT 3360

 89474377 GCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACC 89474436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACC 3420

 89474437 CTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAG 89474496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAG 3480

 89474497 AAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGC 89474556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGC 3540

 89474557 CATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGA 89474616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGA 3600

 89474617 TGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGG 89474676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGG 3660

 89474677 CCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTT 89474736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTT 3720

 89474737 TCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCT 89474796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCT 3780

 89474797 GTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTT 89474856
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GTGCAGATTCAGCTTTTACACGTTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTT 3840

 89474857 ATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATAT 89474916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATAT 3900

 89474917 GCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTA 89474976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTA 3960

 89474977 GGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAA 89475036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAA 4020

 89475037 AGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTC 89475096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTC 4080

 89475097 TGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTA 89475156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4081 TGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCATAGACTCCTTGGATTTCAAGTA 4140

 89475157 TGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATG 89475216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATG 4200

 89475217 GCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTC 89475276
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GCTGTAAGCAGGTGTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTC 4260

 89475277 TTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAA 89475336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAA 4320

 89475337 GCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACT 89475396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACT 4380

 89475397 GGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCC 89475456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCC 4440

 89475457 ATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTC 89475516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTC 4500

 89475517 AGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAG 89475576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAG 4560

 89475577 AGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAA 89475636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAA 4620

 89475637 ACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGG 89475696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 ACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGG 4680

 89475697 AACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATT 89475756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATT 4740

 89475757 GAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAA 89475807
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAA 4791

EXCISED REGION

 89475810 TTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGA 89475869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4792 TTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGA 4851

 89475870 TCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCA 89475904
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4852 TCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCA 4886

Alignment time is 6.58668 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    4096] =>      4096 nucs 'mol-32-2b4a-023469_4096'

Score:        4051
Aligned:      4084        nucs
Identic:      4081 (100%) nucs =>      3318 (100%)       763 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475369,89478686] EXCISED REGION [89478688,89479453]
 second seq =>  [       1,    3318] EXCISED REGION [    3319,    4084]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89478687,89478687]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>        12 nucs [89479063,89479074]
 second seq =>        12 nucs [3694,3705]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [89478684,89478686] to [89478688,89478690]
 second seq =>         3 nucs [3316,3318] to [3319,3321]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89475369 TCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTG 89475428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTG 60

 89475429 AGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCC 89475488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCC 120

 89475489 TCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGT 89475548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGT 180

 89475549 GGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGA 89475608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGA 240

 89475609 TCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAG 89475668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAG 300

 89475669 CAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGA 89475728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGA 360

 89475729 CAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCAC 89475788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCAC 420

 89475789 TCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCA 89475848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCA 480

 89475849 GGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 540

 89475909 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGC 89475968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGC 600

 89475969 TAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATC 89476028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATC 660

 89476029 TCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGC 89476088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGC 720

 89476089 CACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGG 89476148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGG 780

 89476149 CCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTG 89476208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTG 840

 89476209 CCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTA 89476268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTA 900

 89476269 TATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTC 89476328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTC 960

 89476329 AAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACC 89476388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACC 1020

 89476389 CGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCC 89476448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCC 1080

 89476449 CTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTG 89476508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTG 1140

 89476509 CAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGA 89476568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGA 1200

 89476569 CAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAG 89476628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAG 1260

 89476629 GTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTT 89476688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTT 1320

 89476689 CACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGA 89476748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGA 1380

 89476749 TGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGT 89476808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGT 1440

 89476809 AAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGG 89476868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGG 1500

 89476869 GAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAG 89476928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAG 1560

 89476929 GACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAG 89476988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAG 1620

 89476989 GTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCAT 89477048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCAT 1680

 89477049 ATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAAC 89477108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAAC 1740

 89477109 TAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGC 89477168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGC 1800

 89477169 ATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCAT 89477228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCAT 1860

 89477229 TTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGA 89477288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGA 1920

 89477289 TTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCT 89477348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCT 1980

 89477349 CAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATG 89477408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATG 2040

 89477409 TAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAA 89477468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAA 2100

 89477469 AGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAG 89477528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAG 2160

 89477529 CTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGC 89477588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGC 2220

 89477589 AATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTC 89477648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTC 2280

 89477649 CATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAG 89477708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAG 2340

 89477709 ACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGT 89477768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGT 2400

 89477769 GTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATC 89477828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATC 2460

 89477829 ATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGA 89477888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGA 2520

 89477889 GTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCT 89477948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCT 2580

 89477949 TGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCA 89478008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCA 2640

 89478009 CCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAG 89478068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAG 2700

 89478069 TAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCG 89478128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCG 2760

 89478129 TTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCT 89478188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCT 2820

 89478189 GTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATA 89478248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATA 2880

 89478249 GCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGAT 89478308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGAT 2940

 89478309 AGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAAT 89478368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAAT 3000

 89478369 TTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGAC 89478428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGAC 3060

 89478429 CAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGA 89478488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGA 3120

 89478489 TTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTT 89478548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTT 3180

 89478549 TTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGC 89478608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGC 3240

 89478609 CTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATG 89478668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATG 3300

 89478669 TGCCACCATGCCTCATTT 89478686
          ||||||||||||||||||
     3301 TGCCACCATGCCTCATTT 3318

EXCISED REGION

 89478688 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 89478747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 3378

 89478748 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACC 89478807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACC 3438

 89478808 ATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTAC 89478867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3439 ATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTAC 3498

 89478868 GAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGT 89478927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 GAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGT 3558

 89478928 AGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTT 89478987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 AGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTT 3618

 89478988 TCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCT 89479047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 TCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCT 3678

 89479048 TTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGG 89479107
          |||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 TTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGG 3738

 89479108 TACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAA 89479167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 TACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAA 3798

 89479168 TAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTT 89479227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 TAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTT 3858

 89479228 ATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCA 89479287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 ATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCA 3918

 89479288 AAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTG 89479347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 AAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTG 3978

 89479348 CAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAA 89479407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 CAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAA 4038

 89479408 TATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAAC 89479453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 TATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAAC 4084

Alignment time is 6.08324 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2887] =>      2887 nucs 'mol-32-2b55-031858_2887'

Score:        2843
Aligned:      2887        nucs
Identic:      2883 (100%) nucs =>       174 (100%)      2709 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89478513,89478686] EXCISED REGION [89478688,89481400]
 second seq =>  [       1,     174] EXCISED REGION [     175,    2887]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89478687,89478687]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>        12 nucs [89479063,89479074]
 second seq =>        12 nucs [550,561]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [89478684,89478686] to [89478688,89478690]
 second seq =>         3 nucs [172,174] to [175,177]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89478513 AGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAG 89478572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAG 60

 89478573 TGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCT 89478632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCT 120

 89478633 GCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT 89478686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT 174

EXCISED REGION

 89478688 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 89478747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      175 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 234

 89478748 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACC 89478807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      235 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACC 294

 89478808 ATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTAC 89478867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      295 ATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTAC 354

 89478868 GAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGT 89478927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      355 GAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGT 414

 89478928 AGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTT 89478987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      415 AGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTT 474

 89478988 TCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCT 89479047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      475 TCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCT 534

 89479048 TTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGG 89479107
          |||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      535 TTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGG 594

 89479108 TACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAA 89479167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      595 TACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAA 654

 89479168 TAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTT 89479227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      655 TAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTT 714

 89479228 ATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCA 89479287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 ATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCA 774

 89479288 AAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTG 89479347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      775 AAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTG 834

 89479348 CAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAA 89479407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      835 CAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAA 894

 89479408 TATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGA 89479467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 TATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGA 954

 89479468 TAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAA 89479527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 TAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAA 1014

 89479528 CACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATT 89479587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 CACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATT 1074

 89479588 CCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAG 89479647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 CCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAG 1134

 89479648 AATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAA 89479707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 AATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAA 1194

 89479708 AAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTACCT 89479767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1195 AAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTACCT 1254

 89479768 TGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCT 89479827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 TGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCT 1314

 89479828 TCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAG 89479887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 TCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAG 1374

 89479888 TCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTC 89479947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTC 1434

 89479948 AGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTC 89480007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 AGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTC 1494

 89480008 ATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGT 89480067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 ATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGT 1554

 89480068 GTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTC 89480127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 GTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTC 1614

 89480128 TCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTG 89480187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 TCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTG 1674

 89480188 TCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCC 89480247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 TCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCC 1734

 89480248 TGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGG 89480307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 TGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGG 1794

 89480308 GTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGG 89480367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 GTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGG 1854

 89480368 AGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTT 89480427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 AGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTT 1914

 89480428 AGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTG 89480487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 AGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTG 1974

 89480488 TTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTC 89480547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 TTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTC 2034

 89480548 TCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATG 89480607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 TCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATG 2094

 89480608 GGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTT 89480667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 GGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTT 2154

 89480668 TGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAAC 89480727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAAC 2214

 89480728 TCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTA 89480787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 TCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTA 2274

 89480788 GGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATG 89480847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 GGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATG 2334

 89480848 TACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTA 89480907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 TACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTA 2394

 89480908 AATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTT 89480967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 AATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTT 2454

 89480968 ACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTT 89481027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 ACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTT 2514

 89481028 TTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCC 89481087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 TTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCC 2574

 89481088 AGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTAC 89481147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 AGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTAC 2634

 89481148 TTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCA 89481207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 TTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCA 2694

 89481208 CAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACAT 89481267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 CAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACAT 2754

 89481268 AAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACT 89481327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 AAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACT 2814

 89481328 GAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCA 89481387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 GAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCA 2874

 89481388 CTGCACTCCAGCC 89481400
          |||||||||||||
     2875 CTGCACTCCAGCC 2887

Alignment time is 4.37749 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    8196] =>      8196 nucs 'mol-32-2b55-152785_8196'

Score:        8011
Aligned:      8200        nucs
Identic:      8182 (100%) nucs =>      4655 (100%)      3527 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89471243,89475908] EXCISED REGION [89478625,89482158]
 second seq =>  [       1,    4664] EXCISED REGION [    4665,    8196]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89471243 ACTGGAGTTGTGTACCTAGGAGGATTATGGCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGTTGTCAG 89471302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTGGAGTTGTGTACCTAGGAGGATTATGGCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGTTGTCAG 60

 89471303 GGGAGTGGGAGAAGCTGGCAGTCACAGGCCTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGGAAGGCC 89471362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGAGTGGGAGAAGCTGGCAGTCACAGGCCTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGGAAGGCC 120

 89471363 GGTCTCACTCCCACTGTGCCCTTCTCCCTGCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCAGGCAGA 89471422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTCTCACTCCCACTGTGCCCTTCTCCCTGCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCAGGCAGA 180

 89471423 GGGCAAGAGGGGCGGGCTTAAAATTTGGCTGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAGAAAAGG 89471482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGCAAGAGGGGCGGGCTTAAAATTTGGCTGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAGAAAAGG 240

 89471483 ACTTTAGTTCTTCACCAGCCTGTGAAGTTTGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCCGAGTTC 89471542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTTTAGTTCTTCACCAGCCTGTGAAGTTTGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCCGAGTTC 300

 89471543 TGGCAGGAGGCTTCTCGCCCCATTCAAATTGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATTTCTTCT 89471602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGCAGGAGGCTTCTCGCCCCATTCAAATTGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATTTCTTCT 360

 89471603 TTCTGTGGAGTTTTACCTGTTGCTCCTCTGGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGTGGTGCC 89471662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTGTGGAGTTTTACCTGTTGCTCCTCTGGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGTGGTGCC 420

 89471663 AGGCAGGAATGGCCTGCCTGGGGACACAGTGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGCTTCCTC 89471722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGCAGGAATGGCCTGCCTGGGGACACAGTGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGCTTCCTC 480

 89471723 TACCCCTGTATTTTGCTCGGCTCTCTAACTTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGGAAACTC 89471782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACCCCTGTATTTTGCTCGGCTCTCTAACTTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGGAAACTC 540

 89471783 CTCCTGCACACAAACCTTCAGCTTCTCCAGTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGAGGGTCT 89471842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCCTGCACACAAACCTTCAGCTTCTCCAGTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGAGGGTCT 600

 89471843 CCCTTTCCCACTTCTGCAGTTGGGGCAGTCAGAATATTTGGAGTGTTTCCTGGGTCCTGC 89471902
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      601 CCCTTTCCCACTTCTGCAGTTGGGGCAGTCAGAATATTTGGAGTGTTTCTTGGGTCCTGC 660

 89471903 AGGAGCAGTCTGCCTCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTGTAATAT 89471962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      661 AGGAGCAGTCTGCCTCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTGCAATAT 720

 89471963 TTTGAAACACTACATAATTATTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATCCTTATGATTC 89472022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTGAAACACTACATAATTATTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATCCTTATGATTC 780

 89472023 TTATAAATGTAAGTAAAATAAGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAATGTTTCTATAA 89472082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTATAAATGTAAGTAAAATAAGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAATGTTTCTATAA 840

 89472083 ACAAAGGTCTGCAAACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGTGTTATT 89472142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAAAGGTCTGCAAACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGTGTTATT 900

 89472143 GGCACATAGCCCCACCCATTTACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTGTATGCA 89472202
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      901 GGCACATAGCCCCACCCATTTACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTATATGCA 960

 89472203 GAGTTTAGTAGTTGAGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTATCTGGTATTTT 89472262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGTTTAGTAGTTGAGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTATCTGGTATTTT 1020

 89472263 ACAGAAAAGTTAGCCAACCACTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTGGTGAAAAACT 89472322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACAGAAAAGTTAGCCAACCACTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTGGTGAAAAACT 1080

 89472323 AAAAAAAAAAAAATGGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTT 89472382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAAAAAAAAAAATGGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTT 1140

 89472383 ATTTCTAGTTCAAAAATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGAT 89472442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTTCTAGTTCAAAAATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGAT 1200

 89472443 GTTTGACAATTGGGATGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTG 89472502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTTGACAATTGGGATGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTG 1260

 89472503 CTCAAAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAG 89472562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCAAAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAG 1320

 89472563 TATGACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATA 89472622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATGACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATA 1380

 89472623 ATTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCAT 89472682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCAT 1440

 89472683 GTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGG 89472742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGG 1500

 89472743 GTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAA 89472802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAA 1560

 89472803 GAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAAT 89472862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAAT 1620

 89472863 GATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGC 89472922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGC 1680

 89472923 TTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATT 89472982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATT 1740

 89472983 GCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGC 89473042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGC 1800

 89473043 TAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAAT 89473102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAAT 1860

 89473103 ATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAA 89473162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAA 1920

 89473163 ACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTT 89473222
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACTTCTGAGTGGCGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTT 1980

 89473223 TGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATG 89473282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATG 2040

 89473283 TTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACT 89473342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACT 2100

 89473343 TGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTG 89473402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTG 2160

 89473403 TTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCT 89473462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCT 2220

 89473463 GTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTA 89473522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTA 2280

 89473523 CTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAAT 89473582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAAT 2340

 89473583 CTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTG 89473642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTG 2400

 89473643 AAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTA 89473702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTA 2460

 89473703 TTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATG 89473762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATG 2520

 89473763 AAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAAT 89473822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2521 AAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTGACAAT 2580

 89473823 ATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACAC 89473882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACAC 2640

 89473883 ATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTAT 89473942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTAT 2700

 89473943 ATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAG 89474002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAG 2760

 89474003 AAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCC 89474062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCC 2820

 89474063 CAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTA 89474122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTA 2880

 89474123 CAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATA 89474182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATA 2940

 89474183 CTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGAT 89474242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGAT 3000

 89474243 ATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTC 89474302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTC 3060

 89474303 TCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAA 89474362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAA 3120

 89474363 GGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGA 89474422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGA 3180

 89474423 CTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCA 89474482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCA 3240

 89474483 AGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTT 89474542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTT 3300

 89474543 TATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAAC 89474602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAAC 3360

 89474603 GAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTC 89474662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTC 3420

 89474663 TTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTG 89474722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTG 3480

 89474723 ATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCAT 89474782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCAT 3540

 89474783 TTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAAC 89474842
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACGTTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAAC 3600

 89474843 ATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGC 89474902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGC 3660

 89474903 TGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTA 89474962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTA 3720

 89474963 GTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTA 89475022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTA 3780

 89475023 TTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATC 89475082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATC 3840

 89475083 TCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCC 89475142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3841 TCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCATAGACTCC 3900

 89475143 TTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTG 89475202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTG 3960

 89475203 AGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCT 89475262
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTGTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCT 4020

 89475263 GAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCA 89475322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCA 4080

 89475323 GATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGG 89475382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGG 4140

 89475383 ATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTT 89475442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTT 4200

 89475443 GATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCA 89475502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCA 4260

 89475503 AATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAG 89475562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAG 4320

 89475563 GATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTT 89475622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTT 4380

 89475623 AAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGG 89475682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGG 4440

 89475683 TTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGG 89475742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGG 4500

 89475743 TTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTA 89475802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTA 4560

 89475803 ACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGT 89475862
          |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4561 ACTAATTTTTTTTTTTTTT--GAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGT 4618

 89475863 GGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 GGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 4664

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4665 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 4724

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4725 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 4784

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4785 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 4844

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4845 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 4904

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4905 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 4964

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4965 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 5024

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5025 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 5084

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5085 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 5144

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5145 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 5204

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5205 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 5264

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5265 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 5324

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5325 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 5384

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5385 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 5444

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5445 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 5504

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5505 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 5564

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5565 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 5624

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5625 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 5684

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5685 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 5744

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5745 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 5804

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5805 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 5864

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5865 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 5924

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5925 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 5984

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5985 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 6044

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6045 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 6104

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6105 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 6164

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6165 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 6224

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6225 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 6284

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6285 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 6344

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6345 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 6404

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6405 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 6464

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6465 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 6524

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6525 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 6584

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6585 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 6644

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6645 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 6704

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6705 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 6764

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6765 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 6824

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6825 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 6884

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6885 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 6944

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6945 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 7004

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7005 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 7064

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7065 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 7124

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7125 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 7184

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7185 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 7244

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7245 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 7304

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7305 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 7364

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7365 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 7424

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 89481444
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
     7425 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-TGTCTT-AAAAAAAAAAAAAAAA 7482

 89481445 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 89481504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7483 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 7542

 89481505 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 89481564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7543 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 7602

 89481565 ACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 89481624
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7603 ACAAGGAAAAGATGCCCATTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 7662

 89481625 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 89481684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7663 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 7722

 89481685 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 89481744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7723 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 7782

 89481745 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 89481804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7783 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 7842

 89481805 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 89481864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7843 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 7902

 89481865 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 89481924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7903 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 7962

 89481925 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 89481984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7963 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 8022

 89481985 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 89482044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8023 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 8082

 89482045 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 89482104
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     8083 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCCGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 8142

 89482105 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGT 89482158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8143 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGT 8196

Alignment time is 11.167 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3595] =>      3595 nucs 'mol-32-2b55-152785_3595'

Score:        3520
Aligned:      3597        nucs
Identic:      3590 (100%) nucs =>        63 (100%)      3527 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475846,89475908] EXCISED REGION [89478625,89482158]
 second seq =>  [       1,      63] EXCISED REGION [      64,    3595]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89475846 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 89475905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 60

 89475906 GTG 89475908
          |||
       61 GTG 63

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       64 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 123

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 183

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      184 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 243

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      244 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 303

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 363

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 423

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 483

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 543

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 603

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 663

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 723

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 783

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 843

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 903

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 963

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 1023

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 1083

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 1143

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1144 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 1203

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 1263

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 1323

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 1383

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 1443

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 1503

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 1563

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 1623

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 1683

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 1743

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 1803

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 1863

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 1923

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 1983

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 2043

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 2103

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 2163

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 2223

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 2283

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 2343

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 2403

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 2463

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 2523

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 2583

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 2643

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 2703

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 2763

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 2823

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 89481444
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
     2824 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-TGTCTT-AAAAAAAAAAAAAAAA 2881

 89481445 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 89481504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2882 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 2941

 89481505 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 89481564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2942 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 3001

 89481565 ACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 89481624
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3002 ACAAGGAAAAGATGCCCATTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 3061

 89481625 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 89481684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3062 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 3121

 89481685 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 89481744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3122 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 3181

 89481745 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 89481804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3182 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 3241

 89481805 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 89481864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 3301

 89481865 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 89481924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3302 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 3361

 89481925 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 89481984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3362 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 3421

 89481985 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 89482044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3422 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 3481

 89482045 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 89482104
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3482 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCCGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 3541

 89482105 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGT 89482158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3542 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGT 3595

Alignment time is 5.10791 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,   10007] =>     10007 nucs 'mol-32-2dff-007208_10007'

Score:        9941
Aligned:     10007        nucs
Identic:     10001 (100%) nucs =>       466 (100%)      9535 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89470720,89471185] EXCISED REGION [89471187,89480727]
 second seq =>  [       1,     466] EXCISED REGION [     468,   10007]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89471186,89471186]
 second seq =>         1 nucs [467,467]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>        12 nucs [89479063,89479074]
 second seq =>        12 nucs [8343,8354]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [466,468] to [467,469]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89471185,89471185] to [89471187,89471187]
 second seq =>         1 nucs [466,466] to [468,468]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89470720 CCCCTGCTTGCTCAATCAATCACGACCCTCTCACGTGGACCCCCTTAGAGTTGTGAGCCC 89470779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCCTGCTTGCTCAATCAATCACGACCCTCTCACGTGGACCCCCTTAGAGTTGTGAGCCC 60

 89470780 TTAAAAGGGACAGGAATTGCTCACTCAGGGAGCTCGGTTGTTGGAGACGTGAGTCTTACC 89470839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAAAAGGGACAGGAATTGCTCACTCAGGGAGCTCGGTTGTTGGAGACGTGAGTCTTACC 120

 89470840 AAAGCTCCTGGCTGAATAAAGCCCTTCCTTCTTTAACTCAGTGTCTGAGGGGTTTTGTTG 89470899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGCTCCTGGCTGAATAAAGCCCTTCCTTCTTTAACTCAGTGTCTGAGGGGTTTTGTTG 180

 89470900 GTGGCTTGTCCTCCTACAATACCAGTGCCTGTTCCAGTGGAGGTGGTGGAGGGTGAAATG 89470959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGGCTTGTCCTCCTACAATACCAGTGCCTGTTCCAGTGGAGGTGGTGGAGGGTGAAATG 240

 89470960 GACTTCATGAGGGTCCTTGGTTTTGGTGGTTTAATGCTCTATTTTTGTGCTGGTTGGCCT 89471019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACTTCATGAGGGTCCTTGGTTTTGGTGGTTTAATGCTCTATTTTTGTGCTGGTTGGCCT 300

 89471020 CCTGAAAGGAGGTGGCACTTTCCAGAAAGTATCAGTGGGAGAGGGACTGGTGGTGGGCAG 89471079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTGAAAGGAGGTGGCACTTTCCAGAAAGTATCAGTGGGAGAGGGACTGGTGGTGGGCAG 360

 89471080 GGTCCTAGAACTCCCAAGATTAAATGACCTTTGTCTTCAGCTACCAGGGTGGATGGAGAA 89471139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTCCTAGAACTCCCAAGATTAAATGACCTTTGTCTTCAGCTACCAGGGTGGATGGAGAA 420

 89471140 GGACCATCAGGTCAGGGCGGGGCTAGGAGTGTCTGAGCTCAGACTC 89471185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGACCATCAGGTCAGGGCGGGGCTAGGAGTGTCTGAGCTCAGACTC 466

EXCISED REGION

 89471187 CCATGGCTGGATCTTGCTATGGCTGCTGTGGGGGATGGGGGTGAGATTCCCAGGTCACTG 89471246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      468 CCATGGCTGGATCTTGCTATGGCTGCTGTGGGGGATGGGGGTGAGATTCCCAGGTCACTG 527

 89471247 GAGTTGTGTACCTAGGAGGATTATGGCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGTTGTCAGGGGA 89471306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      528 GAGTTGTGTACCTAGGAGGATTATGGCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGTTGTCAGGGGA 587

 89471307 GTGGGAGAAGCTGGCAGTCACAGGCCTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGGAAGGCCGGTC 89471366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      588 GTGGGAGAAGCTGGCAGTCACAGGCCTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGGAAGGCCGGTC 647

 89471367 TCACTCCCACTGTGCCCTTCTCCCTGCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCAGGCAGAGGGC 89471426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      648 TCACTCCCACTGTGCCCTTCTCCCTGCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCAGGCAGAGGGC 707

 89471427 AAGAGGGGCGGGCTTAAAATTTGGCTGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAGAAAAGGACTT 89471486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      708 AAGAGGGGCGGGCTTAAAATTTGGCTGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAGAAAAGGACTT 767

 89471487 TAGTTCTTCACCAGCCTGTGAAGTTTGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCCGAGTTCTGGC 89471546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      768 TAGTTCTTCACCAGCCTGTGAAGTTTGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCCGAGTTCTGGC 827

 89471547 AGGAGGCTTCTCGCCCCATTCAAATTGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATTTCTTCTTTCT 89471606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      828 AGGAGGCTTCTCGCCCCATTCAAATTGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATTTCTTCTTTCT 887

 89471607 GTGGAGTTTTACCTGTTGCTCCTCTGGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGTGGTGCCAGGC 89471666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      888 GTGGAGTTTTACCTGTTGCTCCTCTGGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGTGGTGCCAGGC 947

 89471667 AGGAATGGCCTGCCTGGGGACACAGTGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGCTTCCTCTACC 89471726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      948 AGGAATGGCCTGCCTGGGGACACAGTGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGCTTCCTCTACC 1007

 89471727 CCTGTATTTTGCTCGGCTCTCTAACTTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGGAAACTCCTCC 89471786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1008 CCTGTATTTTGCTCGGCTCTCTAACTTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGGAAACTCCTCC 1067

 89471787 TGCACACAAACCTTCAGCTTCTCCAGTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGAGGGTCTCCCT 89471846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1068 TGCACACAAACCTTCAGCTTCTCCAGTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGAGGGTCTCCCT 1127

 89471847 TTCCCACTTCTGCAGTTGGGGCAGTCAGAATATTTGGAGTGTTTCCTGGGTCCTGCAGGA 89471906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1128 TTCCCACTTCTGCAGTTGGGGCAGTCAGAATATTTGGAGTGTTTCCTGGGTCCTGCAGGA 1187

 89471907 GCAGTCTGCCTCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTGTAATATTTTG 89471966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1188 GCAGTCTGCCTCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTGTAATATTTTG 1247

 89471967 AAACACTACATAATTATTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATCCTTATGATTCTTAT 89472026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1248 AAACACTACATAATTATTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATCCTTATGATTCTTAT 1307

 89472027 AAATGTAAGTAAAATAAGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAATGTTTCTATAAACAA 89472086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 AAATGTAAGTAAAATAAGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAATGTTTCTATAAACAA 1367

 89472087 AGGTCTGCAAACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGTGTTATTGGCA 89472146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 AGGTCTGCAAACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGTGTTATTGGCA 1427

 89472147 CATAGCCCCACCCATTTACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTGTATGCAGAGT 89472206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 CATAGCCCCACCCATTTACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTGTATGCAGAGT 1487

 89472207 TTAGTAGTTGAGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTATCTGGTATTTTACAG 89472266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 TTAGTAGTTGAGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTATCTGGTATTTTACAG 1547

 89472267 AAAAGTTAGCCAACCACTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTGGTGAAAAACTAAAA 89472326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 AAAAGTTAGCCAACCACTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTGGTGAAAAACTAAAA 1607

 89472327 AAAAAAAAATGGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTATTT 89472386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 AAAAAAAAATGGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTATTT 1667

 89472387 CTAGTTCAAAAATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTT 89472446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 CTAGTTCAAAAATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTT 1727

 89472447 GACAATTGGGATGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCA 89472506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 GACAATTGGGATGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCA 1787

 89472507 AAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATG 89472566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 AAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATG 1847

 89472567 ACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTA 89472626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 ACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTA 1907

 89472627 AATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTA 89472686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 AATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTA 1967

 89472687 TACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCA 89472746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 TACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCA 2027

 89472747 ACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAA 89472806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 ACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAA 2087

 89472807 GAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATT 89472866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 GAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATT 2147

 89472867 TCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTA 89472926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 TCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTA 2207

 89472927 GCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTC 89472986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 GCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTC 2267

 89472987 ATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGG 89473046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2268 ATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGG 2327

 89473047 ATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGT 89473106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 ATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGT 2387

 89473107 CCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTT 89473166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2388 CCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTT 2447

 89473167 CTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTT 89473226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 CTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTT 2507

 89473227 GCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCT 89473286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 GCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCT 2567

 89473287 TGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTT 89473346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 TGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTT 2627

 89473347 CCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGT 89473406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2628 CCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGT 2687

 89473407 TTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAG 89473466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2688 TTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAG 2747

 89473467 CTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCG 89473526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2748 CTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCG 2807

 89473527 GGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCT 89473586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 GGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCT 2867

 89473587 GTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAAT 89473646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 GTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAAT 2927

 89473647 TTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTC 89473706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 TTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTC 2987

 89473707 TCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGG 89473766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 TCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGG 3047

 89473767 TCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATAT 89473826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 TCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATAT 3107

 89473827 TTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATAT 89473886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 TTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATAT 3167

 89473887 TATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGA 89473946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 TATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGA 3227

 89473947 ATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGA 89474006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 ATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGA 3287

 89474007 TAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAAC 89474066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 TAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAAC 3347

 89474067 TCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGG 89474126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 TCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGG 3407

 89474127 TGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAG 89474186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 TGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAG 3467

 89474187 ATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTT 89474246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 ATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTT 3527

 89474247 ACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCT 89474306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 ACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCT 3587

 89474307 AAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCA 89474366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 AAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCA 3647

 89474367 TTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGA 89474426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 TTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGA 3707

 89474427 ATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTC 89474486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 ATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTC 3767

 89474487 AGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATG 89474546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 AGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATG 3827

 89474547 TTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAAC 89474606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 TTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAAC 3887

 89474607 CACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCC 89474666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 CACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCC 3947

 89474667 AGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAA 89474726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 AGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAA 4007

 89474727 CTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTT 89474786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 CTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTT 4067

 89474787 GCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTT 89474846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 GCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTT 4127

 89474847 GTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCT 89474906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4128 GTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCT 4187

 89474907 GACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTT 89474966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4188 GACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTT 4247

 89474967 ATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTA 89475026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4248 ATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTA 4307

 89475027 AAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCT 89475086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4308 AAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCT 4367

 89475087 TTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGG 89475146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4368 TTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGG 4427

 89475147 ATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAA 89475206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4428 ATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAA 4487

 89475207 GTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGA 89475266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4488 GTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGA 4547

 89475267 ATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATA 89475326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4548 ATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATA 4607

 89475327 CATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGA 89475386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4608 CATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGA 4667

 89475387 TACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATG 89475446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4668 TACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATG 4727

 89475447 CTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATC 89475506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4728 CTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATC 4787

 89475507 AGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATA 89475566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4788 AGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATA 4847

 89475567 TCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAAT 89475626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4848 TCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAAT 4907

 89475627 CCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTC 89475686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4908 CCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTC 4967

 89475687 TGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAA 89475746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4968 TGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAA 5027

 89475747 TCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTA 89475806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5028 TCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTA 5087

 89475807 ATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCG 89475866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5088 ATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCG 5147

 89475867 TGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCT 89475926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5148 TGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCT 5207

 89475927 CCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAG 89475986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5208 CCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAG 5267

 89475987 TAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTG 89476046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5268 TAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTG 5327

 89476047 CCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGT 89476106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5328 CCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGT 5387

 89476107 TAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCA 89476166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5388 TAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCA 5447

 89476167 ATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAG 89476226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5448 ATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAG 5507

 89476227 CTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACAT 89476286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5508 CTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACAT 5567

 89476287 GTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTC 89476346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5568 GTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTC 5627

 89476347 TGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTT 89476406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5628 TGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTT 5687

 89476407 TGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAAT 89476466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5688 TGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAAT 5747

 89476467 GAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACT 89476526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5748 GAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACT 5807

 89476527 TTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTAC 89476586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5808 TTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTAC 5867

 89476587 CTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAAT 89476646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5868 CTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAAT 5927

 89476647 AAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGG 89476706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5928 AAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGG 5987

 89476707 ACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTT 89476766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5988 ACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTT 6047

 89476767 ACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAA 89476826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6048 ACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAA 6107

 89476827 GAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATA 89476886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6108 GAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATA 6167

 89476887 AACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCT 89476946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6168 AACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCT 6227

 89476947 GACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGA 89477006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6228 GACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGA 6287

 89477007 CAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCA 89477066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6288 CAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCA 6347

 89477067 TATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTT 89477126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6348 TATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTT 6407

 89477127 TGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAG 89477186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6408 TGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAG 6467

 89477187 CCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTT 89477246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6468 CCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTT 6527

 89477247 TTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGA 89477306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6528 TTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGA 6587

 89477307 ACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTT 89477366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6588 ACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTT 6647

 89477367 CATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAAT 89477426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6648 CATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAAT 6707

 89477427 TACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGAC 89477486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6708 TACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGAC 6767

 89477487 TTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGC 89477546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6768 TTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGC 6827

 89477547 GGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGC 89477606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6828 GGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGC 6887

 89477607 GGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCC 89477666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6888 GGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCC 6947

 89477667 TCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGA 89477726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6948 TCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGA 7007

 89477727 AATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCA 89477786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7008 AATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCA 7067

 89477787 ATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGA 89477846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7068 ATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGA 7127

 89477847 AATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAG 89477906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7128 AATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAG 7187

 89477907 ATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGT 89477966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7188 ATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGT 7247

 89477967 CCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCC 89478026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7248 CCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCC 7307

 89478027 ATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACT 89478086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7308 ATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACT 7367

 89478087 TATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCAC 89478146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7368 TATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCAC 7427

 89478147 AGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTAT 89478206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     7428 AGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTCTGTGCTGTTCAGTAT 7487

 89478207 GCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTT 89478266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7488 GCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTT 7547

 89478267 TAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTG 89478326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7548 TAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTG 7607

 89478327 GCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTT 89478386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7608 GCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTT 7667

 89478387 TTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAA 89478446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7668 TTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAA 7727

 89478447 ATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCT 89478506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7728 ATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCT 7787

 89478507 GATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGG 89478566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7788 GATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGG 7847

 89478567 CTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 89478626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7848 CTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 7907

 89478627 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT 89478686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7908 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT 7967

 89478687 ATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTC 89478746
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7968 -TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTC 8026

 89478747 CTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAAC 89478806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8027 CTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAAC 8086

 89478807 CATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTA 89478866
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     8087 CATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTA 8146

 89478867 CGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATG 89478926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8147 CGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATG 8206

 89478927 TAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGT 89478986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8207 TAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGT 8266

 89478987 TTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTC 89479046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8267 TTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTC 8326

 89479047 TTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTG 89479106
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     8327 TTTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTG 8386

 89479107 GTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAA 89479166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8387 GTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAA 8446

 89479167 ATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGT 89479226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8447 ATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGT 8506

 89479227 TATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCC 89479286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8507 TATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCC 8566

 89479287 AAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCT 89479346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8567 AAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCT 8626

 89479347 GCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAA 89479406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8627 GCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAA 8686

 89479407 ATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAG 89479466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8687 ATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAG 8746

 89479467 ATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGA 89479526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8747 ATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGA 8806

 89479527 ACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCAT 89479586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8807 ACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCAT 8866

 89479587 TCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAA 89479646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8867 TCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAA 8926

 89479647 GAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTA 89479706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8927 GAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTA 8986

 89479707 AAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTACC 89479766
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     8987 AAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTACC 9046

 89479767 TTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGC 89479826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9047 TTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGC 9106

 89479827 TTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAA 89479886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9107 TTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAA 9166

 89479887 GTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGT 89479946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9167 GTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGT 9226

 89479947 CAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCT 89480006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9227 CAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCT 9286

 89480007 CATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAG 89480066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9287 CATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAG 9346

 89480067 TGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTT 89480126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9347 TGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTT 9406

 89480127 CTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGT 89480186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9407 CTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGT 9466

 89480187 GTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGC 89480246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9467 GTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGC 9526

 89480247 CTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAG 89480306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9527 CTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAG 9586

 89480307 GGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAG 89480366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9587 GGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAG 9646

 89480367 GAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGT 89480426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9647 GAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGT 9706

 89480427 TAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATT 89480486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9707 TAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATT 9766

 89480487 GTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATT 89480546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9767 GTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATT 9826

 89480547 CTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAAT 89480606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9827 CTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAAT 9886

 89480607 GGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCT 89480666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9887 GGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCT 9946

 89480667 TTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAA 89480726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9947 TTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAA 10006

 89480727 C 89480727
          |
    10007 C 10007

Alignment time is 12.9417 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    4372] =>      4372 nucs 'mol-32-2dff-039612_4372'

Score:        4263
Aligned:      4375        nucs
Identic:      4364 (100%) nucs =>       830 ( 99%)      3534 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475074,89475908] EXCISED REGION [89478625,89482163]
 second seq =>  [       1,     833] EXCISED REGION [     834,    4372]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89475074 CCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTC 89475133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTC 60

 89475134 ACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAA 89475193
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAA 120

 89475194 CACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATC 89475253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      121 CACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTGTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATC 180

 89475254 TTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATC 89475313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATC 240

 89475314 ACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTA 89475373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTA 300

 89475374 TTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGC 89475433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGC 360

 89475434 TCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTT 89475493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTT 420

 89475494 GAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGA 89475553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGA 480

 89475554 TGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAG 89475613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAG 540

 89475614 ATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACC 89475673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACC 600

 89475674 ATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACA 89475733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACA 660

 89475734 ACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCT 89475793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCT 720

 89475794 AATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTG 89475853
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||.|||||||||||
      721 AATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTT--GAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTG 778

 89475854 GAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 833

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 893

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 953

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 1013

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1014 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 1073

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 1133

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 1193

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 1253

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 1313

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 1373

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 1433

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 1493

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 1553

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 1613

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 1673

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 1733

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 1793

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 1853

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 1913

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1914 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 1973

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 2033

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 2093

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 2153

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 2213

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 2273

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 2333

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 2393

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 2453

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 2513

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 2573

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 2633

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 2693

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 2753

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 2813

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 2873

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 2933

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 2993

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 3053

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 3113

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 3173

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 3233

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 3293

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 3353

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 3413

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 3473

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 3533

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 3593

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTT-AAAAAAAAAAAAAAAA 89481443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
     3594 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-TGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 3652

 89481444 AAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGA 89481503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 AAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGA 3712

 89481504 AAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGG 89481563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 AAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGG 3772

 89481564 AACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATC 89481623
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 AACAAGGAAAAGATGCCCATTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATC 3832

 89481624 CAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAA 89481683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 CAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAA 3892

 89481684 ATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACT 89481743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 ATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACT 3952

 89481744 GTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAAT 89481803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 GTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAAT 4012

 89481804 CTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCC 89481863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 CTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCC 4072

 89481864 CATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGG 89481923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 CATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGG 4132

 89481924 CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGA 89481983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGA 4192

 89481984 TCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACA 89482043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 TCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACA 4252

 89482044 CACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTG 89482103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 CACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTG 4312

 89482104 AGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCAC 89482163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 AGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCAC 4372

Alignment time is 5.68815 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    9761] =>      9761 nucs 'mol-32-2dff-134981_9761'

Score:        9593
Aligned:      9760        nucs
Identic:      9744 (100%) nucs =>      4412 (100%)      5332 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89477005,89481421] EXCISED REGION [89481430,89486772]
 second seq =>  [       1,    4416] EXCISED REGION [    4422,    9761]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [89481422,89481429]
 second seq =>         5 nucs [4417,4421]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4416,4416] to [4421,4421]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89477005 GACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTT 89477064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTT 60

 89477065 CATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTC 89477124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTC 120

 89477125 TTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGA 89477184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGA 180

 89477185 AGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATG 89477244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATG 240

 89477245 TTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAA 89477304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAA 300

 89477305 GAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAAT 89477364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAAT 360

 89477365 TTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAA 89477424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAA 420

 89477425 ATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAG 89477484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAG 480

 89477485 ACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCT 89477544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCT 540

 89477545 GCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACT 89477604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACT 600

 89477605 GCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCC 89477664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCC 660

 89477665 CCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAA 89477724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAA 720

 89477725 GAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGT 89477784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGT 780

 89477785 CAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTG 89477844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTG 840

 89477845 GAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTA 89477904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTA 900

 89477905 AGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTA 89477964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTA 960

 89477965 GTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAAC 89478024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAAC 1020

 89478025 CCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATA 89478084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATA 1080

 89478085 CTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGC 89478144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGC 1140

 89478145 ACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGT 89478204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGT 1200

 89478205 ATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACC 89478264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACC 1260

 89478265 TTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAG 89478324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAG 1320

 89478325 TGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACT 89478384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACT 1380

 89478385 TTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAG 89478444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAG 1440

 89478445 AAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATG 89478504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATG 1500

 89478505 CTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCA 89478564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCA 1560

 89478565 GGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCA 89478624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCA 1620

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 1680

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TT-TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 1739

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 1799

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1800 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 1859

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 1919

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 1979

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 2039

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TCTTTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 2099

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 2159

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 2219

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 2279

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 2339

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 2399

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 2459

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 2519

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 2579

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 2639

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 2699

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2700 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 2759

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 2819

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 2879

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 2939

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 2999

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 3059

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 3119

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 3179

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 3239

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 3299

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 3359

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 3419

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 3479

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 3539

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 3599

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 3659

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 3719

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 3779

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 3839

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 3899

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 3959

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 4019

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 4079

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 4139

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 4199

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 4259

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 4319

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 4379

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCT 89481421
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCT 4416

EXCISED REGION

 89481430 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACA 89481489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACA 4481

 89481490 AAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTT 89481549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 AAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTT 4541

 89481550 TCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTA 89481609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 TCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTA 4601

 89481610 CTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGA 89481669
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 CTAGAGGTCCTATCCAGAGTAGTTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGA 4661

 89481670 AAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAA 89481729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 AAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAA 4721

 89481730 TATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAAT 89481789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 TATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAAT 4781

 89481790 TAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAAT 89481849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4782 TAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAAT 4841

 89481850 TTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTG 89481909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4842 TTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTG 4901

 89481910 GCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATC 89481969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4902 GCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATC 4961

 89481970 ACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAC 89482029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4962 ACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAC 5021

 89482030 TACACACACACACACACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGC 89482089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5022 TACACACACACACACACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGC 5081

 89482090 TACTCGGGTGGCTGAGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGC 89482149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5082 TACTCGGGTGGCTGAGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGC 5141

 89482150 CGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAA 89482209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5142 CGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAA 5201

 89482210 ACAAAAAACCCAAAAAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAA 89482269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5202 ACAAAAAACCCAAAAAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAA 5261

 89482270 ATTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGA 89482329
          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5262 A-TTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGA 5320

 89482330 TCACTGTAGTCTTGACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGC 89482389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 TCACTGTAGTCTTGACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGC 5380

 89482390 TGAGACTACAGGCACGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGG 89482449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 TGAGACTACAGGCACGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGG 5440

 89482450 GTTTCCCCGTGTTGTCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTC 89482509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 GTTTCCCCGTGTTGTCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTC 5500

 89482510 AGCTTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAA 89482569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5501 AGCTTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAA 5560

 89482570 AAGAAATTAAGGAAGAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATT 89482629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 AAGAAATTAAGGAAGAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATT 5620

 89482630 CAATGCAATCCCTATCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATC 89482689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5621 CAATGCAATCCCTATCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATC 5680

 89482690 CACACTAACTTTCATATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAA 89482749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5681 CACACTAACTTTCATATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAA 5740

 89482750 GGAAGAAGAAAGTCAGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGA 89482809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5741 GGAAGAAGAAAGTCAGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGA 5800

 89482810 TAATCAACACAGTTTGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAG 89482869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5801 TAATCAACACAGTTTGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAG 5860

 89482870 AGCCTAGAAATGAACTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAATC 89482929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5861 AGCCTAGAAATGAACTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAATC 5920

 89482930 ATTCAACGCAGAAAGAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCACA 89482989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5921 ATTCAACGCAGAAAGAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCACA 5980

 89482990 TGCTCACATGCCAAAAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACGTA 89483049
          ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5981 TGCTCACATGCC--AAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACGTA 6038

 89483050 ACTCAAAATGGATCAAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGAAA 89483109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6039 ACTCAAAATGGATCAAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGAAA 6098

 89483110 ACAAAGGGGAAAAACAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAATGA 89483169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6099 ACAAAGGGGAAAAACAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAATGA 6158

 89483170 AAAACTTTTGTGCATCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATGGA 89483229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6159 AAAACTTTTGTGCATCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATGGA 6218

 89483230 AGAAAACATTTGCTAAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGAAT 89483289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6219 AGAAAACATTTGCTAAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGAAT 6278

 89483290 TCCTACAATGCAACACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTCTC 89483349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6279 TCCTACAATGCAACACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTCTC 6338

 89483350 TAAAGAATGGCCAATAAGCACCTGAAAAGATGCTCAACATTACTAGTCATTAGGAAAATG 89483409
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     6339 TAAAGAATGGCCAATAAGCACCTGAAAAGATGCTCAATATTACTAGTCATTAGGAAAATG 6398

 89483410 CAAATTAAAGCCATAGTGAGATACTACTTCACATCCATTAGTATGGTGACTATCAAAAAA 89483469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6399 CAAATTAAAGCCATAGTGAGATACTACTTCACATCCATTAGTATGGTGACTATCAAAAAA 6458

 89483470 AATTGAAAAGGGCTGGGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGA 89483529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6459 AATTGAAAAGGGCTGGGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGA 6518

 89483530 GGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCAAATATGGAGAAACCC 89483589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6519 GGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCAAATATGGAGAAACCC 6578

 89483590 CATTTACACTAAAAATACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCACC 89483649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6579 CATTTACACTAAAAATACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCACC 6638

 89483650 TACTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGC 89483709
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6639 TACTTGGGAGGCTGAGGTAGAAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGC 6698

 89483710 TGGGGTCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTGTGTCTCAAAAAAAA 89483769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6699 TGGGGTCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTGTGTCTCAAAAAAAA 6758

 89483770 AAAAAATTAAAATAACTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATTGCTATGGAATAAAAGATGA 89483829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6759 AAAAAATTAAAATAACTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATTGCTATGGAATAAAAGATGA 6818

 89483830 AATGCTCCTGATTATTGTAAATACAAAATTGCATGCAGGATTGTGCAAAGACAGTGCCAG 89483889
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6819 AATGCTCCTGATTATTGTAAATACAAAATTGCATGCAGGATTGTGCAAAGACAATGCCAG 6878

 89483890 GTTGGACTGCCAGAATGAGCCAACGGGACGTGATGTGCTTCCCCCTGCAGAGAGCCTATG 89483949
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     6879 GTTGGACTGCCAGAATGAGCCAACGGCACGTGATGTGCTTCCCCCTGCAGAGAGCCTATG 6938

 89483950 AATGGATGTGCAGTCAGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTCCTATCCCAGAAAAGCAGAT 89484009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6939 AATGGATGTGCAGTCAGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTCCTATCCCAGAAAAGCAGAT 6998

 89484010 GTTCATAGCTCTGGGAATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGAGGGGGCACCTGTCCATGTG 89484069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6999 GTTCATAGCTCTGGGAATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGAGGGGGCACCTGTCCATGTG 7058

 89484070 GATAAGATAGGGCCATAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTCTTCTAGGCCTCTTTAGGGT 89484129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7059 GATAAGATAGGGCCATAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTCTTCTAGGCCTCTTTAGGGT 7118

 89484130 TAAGGCATACTCCCTTCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTTGTCTAGCTTCACGTCTTGT 89484189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7119 TAAGGCATACTCCCTTCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTTGTCTAGCTTCACGTCTTGT 7178

 89484190 TTCTATGGATTGTTTGTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTACTGCTGATTAATATCTTGC 89484249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7179 TTCTATGGATTGTTTGTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTACTGCTGATTAATATCTTGC 7238

 89484250 TAATCATAGGTTATGAAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCTCTGTTAGAAATTACTGATG 89484309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7239 TAATCATAGGTTATGAAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCTCTGTTAGAAATTACTGATG 7298

 89484310 CACACACTATATTGTAAATTCTTATCTCTGTATACTGTACTTCTGCATACAGATGTTATG 89484369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7299 CACACACTATATTGTAAATTCTTATCTCTGTATACTGTACTTCTGCATACAGATGTTATG 7358

 89484370 TTAAAGAATTACTTCATCCCCATGTGACCATCTCACCTCATAATCAAACGACCCTAAATC 89484429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7359 TTAAAGAATTACTTCATCCCCATGTGACCATCTCACCTCATAATCAAACGACCCTAAATC 7418

 89484430 CCTCACTAACCTTCCCCCACCCTCACTAAACTTAATAATAAATGCTGGCATATCCAGTGC 89484489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7419 CCTCACTAACCTTCCCCCACCCTCACTAAACTTAATAATAAATGCTGGCATATCCAGTGC 7478

 89484490 ATTGGCAGCACCACGGGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGGACCCAGCTTTCACTATCTT 89484549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7479 ATTGGCAGCACCACGGGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGGACCCAGCTTTCACTATCTT 7538

 89484550 GTGTGTATCTATTATTTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGAACAAAGAGAGAGCCCCGTT 89484609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7539 GTGTGTATCTATTATTTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGAACAAAGAGAGAGCCCCGTT 7598

 89484610 GCATTGCAGGCTGCTGGCCAGATCCCGCAATAAATAACAAATGTTGGTGAATATGAAGAG 89484669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7599 GCATTGCAGGCTGCTGGCCAGATCCCGCAATAAATAACAAATGTTGGTGAATATGAAGAG 7658

 89484670 AAATTAGAACCCTTGTGCATTTCTGTTGGGAATGCTAAATGGTGCAGTCACTGTGGAAAA 89484729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7659 AAATTAGAACCCTTGTGCATTTCTGTTGGGAATGCTAAATGGTGCAGTCACTGTGGAAAA 7718

 89484730 TGATACAGCAATTCCTTAAAAAATTTAACATGGAATGACTATATGAGCCATCAGTTCCAC 89484789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7719 TGATACAGCAATTCCTTAAAAAATTTAACATGGAATGACTATATGAGCCATCAGTTCCAC 7778

 89484790 TTCTGGGTGTATACTGAAAAGGAGTGAAAGCAGGGACTCGAACAGATATTCAGACACCCA 89484849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7779 TTCTGGGTGTATACTGAAAAGGAGTGAAAGCAGGGACTCGAACAGATATTCAGACACCCA 7838

 89484850 TGATCCTATCAGCATTATTTGTAATAGCCAAAAGGTGTAAGCAACCCAAGTGTCAACTGA 89484909
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     7839 TGATCCTATCAGCATTATTTGTAATAGCCAAAAGGTGTAAGCAACACAAGTGTCAACTGA 7898

 89484910 CAAGCGAACAGATAAATTAGTATACACATATAATTACTTAGCCTTGAAAAGGAAGAATTT 89484969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7899 CAAGCGAACAGATAAATTAGTATACACATATAATTACTTAGCCTTGAAAAGGAAGAATTT 7958

 89484970 TTTATTTCTTTATTTATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTATGCCCAGGCTGGAGTGCAAA 89485029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7959 TTTATTTCTTTATTTATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTATGCCCAGGCTGGAGTGCAAA 8018

 89485030 GGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCTGTTTCCCAGATTCAAGTGATTCTCCTGCCCCA 89485089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8019 GGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCTGTTTCCCAGATTCAAGTGATTCTCCTGCCCCA 8078

 89485090 GCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTATTTT 89485149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8079 GCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTATTTT 8138

 89485150 TAGTAAAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTG 89485209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8139 TAGTAAAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTG 8198

 89485210 ATCTGCCTGCATTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCCATGAGTGCCCAGCCAAAAA 89485269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8199 ATCTGCCTGCATTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCCATGAGTGCCCAGCCAAAAA 8258

 89485270 GGAAAAATTTTGACACATGCTACCACACTGAACCTTGAAGACATTATGTGAATTAGAATA 89485329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8259 GGAAAAATTTTGACACATGCTACCACACTGAACCTTGAAGACATTATGTGAATTAGAATA 8318

 89485330 AGCCAGTCACCAAAGGACAAATATTGAATGACTCCACTTATATAACATTCCTAGAGTAGT 89485389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8319 AGCCAGTCACCAAAGGACAAATATTGAATGACTCCACTTATATAACATTCCTAGAGTAGT 8378

 89485390 CAAATTAATAGAGATGGAATGTAGAATTGTGGCAGGAGATGGGTGTAGGTGGGGCTTTTG 89485449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8379 CAAATTAATAGAGATGGAATGTAGAATTGTGGCAGGAGATGGGTGTAGGTGGGGCTTTTG 8438

 89485450 TTTAATTGGCACAGAGTTTCTTTTGGGGAAGATTAAAAAGTTCTGGAAATAGATGGTAGT 89485509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8439 TTTAATTGGCACAGAGTTTCTTTTGGGGAAGATTAAAAAGTTCTGGAAATAGATGGTAGT 8498

 89485510 GATGGTTGCACAACAATTTGAATTTAATTAATACCACAGAACTACATACTTAATAATGGT 89485569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8499 GATGGTTGCACAACAATTTGAATTTAATTAATACCACAGAACTACATACTTAATAATGGT 8558

 89485570 TACAAGGATAAATTTTATGTTTATATATTTTTTAAAACAATAAACAAGAAAATCCAATAC 89485629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8559 TACAAGGATAAATTTTATGTTTATATATTTTTTAAAACAATAAACAAGAAAATCCAATAC 8618

 89485630 AGACTGAAACATTTTTTCAACCTTAAAGATCAGTGTAAACTTGCTGTTACTATGTGAACA 89485689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8619 AGACTGAAACATTTTTTCAACCTTAAAGATCAGTGTAAACTTGCTGTTACTATGTGAACA 8678

 89485690 TGGGCAGGCGATCTCTTGAGCCCAGGAGCTTGAGACCTGCATGGGCAACATGATGAAACC 89485749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8679 TGGGCAGGCGATCTCTTGAGCCCAGGAGCTTGAGACCTGCATGGGCAACATGATGAAACC 8738

 89485750 CTGTGTCTACCAAAAATACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGCATCTGTAGTCCTACC 89485809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8739 CTGTGTCTACCAAAAATACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGCATCTGTAGTCCTACC 8798

 89485810 TACTCAGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGACTGTGGTGAGC 89485869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8799 TACTCAGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGACTGTGGTGAGC 8858

 89485870 TGAGATCTTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGGAAAGAGCAAGACCTTGTCTCAAGAAAAAA 89485929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8859 TGAGATCTTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGGAAAGAGCAAGACCTTGTCTCAAGAAAAAA 8918

 89485930 AAAGACTAGTCAAGTGCAGTCAGTAGTGAGAAGGGTGAGGAGAAAGAGTAGAACAAGGAG 89485989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8919 AAAGACTAGTCAAGTGCAGTCAGTAGTGAGAAGGGTGAGGAGAAAGAGTAGAACAAGGAG 8978

 89485990 TTCAACTGTAACTCATGGTGAACAGTCAATTGAGATAACTCACTACCCTCAGAACAGCTG 89486049
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     8979 TTCAACTGTAACTCATGGTGAACAGTCAATTGAGATAACTCACTACCTTCAGAACAGCTG 9038

 89486050 TGAGCTGATGCTTATCCCCTAGAAGAGTGAAGATAAGGAGCCCAACTGTGAATGGAAAGT 89486109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9039 TGAGCTGATGCTTATCCCCTAGAAGAGTGAAGATAAGGAGCCCAACTGTGAATGGAAAGT 9098

 89486110 TAGCTTATTCCCAGTGCCAGCTTTCTCTCCTCACATCCTCATAATGGATGCTGACTGTGT 89486169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9099 TAGCTTATTCCCAGTGCCAGCTTTCTCTCCTCACATCCTCATAATGGATGCTGACTGTGT 9158

 89486170 TGGGGGACAGAAGGGACTTGGCAGAGCTTTGCTCATGCCACTCACCCTTATTCTTCCCAG 89486229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9159 TGGGGGACAGAAGGGACTTGGCAGAGCTTTGCTCATGCCACTCACCCTTATTCTTCCCAG 9218

 89486230 CTAGCTTGTTCATCAGGTAGGATTTTCCTGTGCGGTAGAGGCCCACAATTGCCACCACCA 89486289
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     9219 CTAGCTTGTTCATCAGGTAGGATTTTCCTGTGCGGTAGAGGCCAACAATTGCCACCACCA 9278

 89486290 CCACAGGCTGTGTAATGGCAGACAGGATTTTCAGAGCTTCTGGATTCGCCACCAGTTCCC 89486349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9279 CCACAGGCTGTGTAATGGCAGACAGGATTTTCAGAGCTTCTGGATTCGCCACCAGTTCCC 9338

 89486350 CATTAGTGTTCTCAATGAGGCACATTGGGCCTGTCATGTGGATCTCTGGAGCCATGTCCA 89486409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9339 CATTAGTGTTCTCAATGAGGCACATTGGGCCTGTCATGTGGATCTCTGGAGCCATGTCCA 9398

 89486410 GGGCATTGTTCTCTTGTCTGCAAGGGAAGAGTTGGAATGAATTAGAATTTCCAGTCTTTT 89486469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9399 GGGCATTGTTCTCTTGTCTGCAAGGGAAGAGTTGGAATGAATTAGAATTTCCAGTCTTTT 9458

 89486470 GCATTTAGAGGATAGAGTCACAGAATTCCCCAGGATGGCCAAAAGTTTTGTGTGTGTCAG 89486529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9459 GCATTTAGAGGATAGAGTCACAGAATTCCCCAGGATGGCCAAAAGTTTTGTGTGTGTCAG 9518

 89486530 TGAGAGAGATGAGGGAAAATGTGTATCATTTTAAAAAATTATGGAAGTATTATCATCAAA 89486589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9519 TGAGAGAGATGAGGGAAAATGTGTATCATTTTAAAAAATTATGGAAGTATTATCATCAAA 9578

 89486590 TTAAATATTGGTATGACAGTAACTTATCAACAGTCAACTACTCTTGCAACCTAGAACTTT 89486649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9579 TTAAATATTGGTATGACAGTAACTTATCAACAGTCAACTACTCTTGCAACCTAGAACTTT 9638

 89486650 CATTTAATTTATTATGGAAAAGCTTCCCTTGGATTCTCATTAAAAAATTTACACTAGACA 89486709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9639 CATTTAATTTATTATGGAAAAGCTTCCCTTGGATTCTCATTAAAAAATTTACACTAGACA 9698

 89486710 ATAAATGGAAGATAAAATAGGATATAGAGAATTTTTTTTACATCCTGGCTATATGTAAGA 89486769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9699 ATAAATGGAAGATAAAATAGGATATAGAGAATTTTTTTTACATCCTGGCTATATGTAAGA 9758

 89486770 AAT 89486772
          |||
     9759 AAT 9761

Alignment time is 12.7416 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    5995] =>      5995 nucs 'mol-32-2e0a-022405_5995'

Score:        5898
Aligned:      5968        nucs
Identic:      5960 (100%) nucs =>      5384 (100%)       576 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89476031,89481421] EXCISED REGION [89481429,89482004]
 second seq =>  [      26,    5414] EXCISED REGION [    5420,    5995]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [89481422,89481428]
 second seq =>         5 nucs [5415,5419]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [5414,5414] to [5419,5419]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89476031 CTGACCTTGTGATCTG-CCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCC 89476089
          ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       26 CTGACCTTGTGATC--ACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCC 83

 89476090 ACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGC 89476149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       84 ACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGC 143

 89476150 CAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGC 89476209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      144 CAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGC 203

 89476210 CTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTAT 89476269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      204 CTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTAT 263

 89476270 ATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCA 89476329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      264 ATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCA 323

 89476330 AGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCC 89476389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      324 AGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCC 383

 89476390 GCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCC 89476449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      384 GCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCC 443

 89476450 TGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGC 89476509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      444 TGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGC 503

 89476510 AGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGAC 89476569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      504 AGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGAC 563

 89476570 AGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGG 89476629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      564 AGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGG 623

 89476630 TCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTC 89476689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      624 TCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTC 683

 89476690 ACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGAT 89476749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      684 ACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGAT 743

 89476750 GCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTA 89476809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      744 GCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTA 803

 89476810 AAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGG 89476869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      804 AAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGG 863

 89476870 AAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGG 89476929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      864 AAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGG 923

 89476930 ACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGG 89476989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      924 ACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGG 983

 89476990 TTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATA 89477049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 TTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATA 1043

 89477050 TTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACT 89477109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1044 TTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACT 1103

 89477110 AAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCA 89477169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1104 AAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCA 1163

 89477170 TGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATT 89477229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 TGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATT 1223

 89477230 TATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGAT 89477289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 TATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGAT 1283

 89477290 TATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTC 89477349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 TATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTC 1343

 89477350 AAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGT 89477409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 AAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGT 1403

 89477410 AAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAA 89477469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 AAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAA 1463

 89477470 GAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGC 89477529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 GAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGC 1523

 89477530 TCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCA 89477589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 TCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCA 1583

 89477590 ATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCC 89477649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 ATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCC 1643

 89477650 ATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGA 89477709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 ATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGA 1703

 89477710 CCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTG 89477769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 CCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTG 1763

 89477770 TAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCA 89477829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 TAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCA 1823

 89477830 TCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAG 89477889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 TCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAG 1883

 89477890 TTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTT 89477949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 TTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTT 1943

 89477950 GTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCAC 89478009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 GTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCAC 2003

 89478010 CATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGT 89478069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 CATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGT 2063

 89478070 AGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGT 89478129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 AGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGT 2123

 89478130 TTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTG 89478189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 TTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTG 2183

 89478190 TATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAG 89478249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 TATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAG 2243

 89478250 CCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATA 89478309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 CCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATA 2303

 89478310 GCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATT 89478369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 GCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATT 2363

 89478370 TTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACC 89478429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 TTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACC 2423

 89478430 AACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGAT 89478489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 AACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGAT 2483

 89478490 TGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTT 89478549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 TGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTT 2543

 89478550 TTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCC 89478609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 TTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCC 2603

 89478610 TCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGT 89478669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 TCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGT 2663

 89478670 GCCACCATGCCTCATTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCT 89478729
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 GCCACCATGCCTCATTT-TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCT 2722

 89478730 AGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 89478789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 AGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 2782

 89478790 GGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGT 89478849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 GGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGT 2842

 89478850 ACTACGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTT 89478909
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2843 ACTAGGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTT 2902

 89478910 TGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCA 89478969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2903 TGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCA 2962

 89478970 GCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGA 89479029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 GCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGA 3022

 89479030 AGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAAT 89479089
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||
     3023 AGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAAT 3082

 89479090 TTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTG 89479149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3083 TTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTG 3142

 89479150 TTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTC 89479209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3143 TTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTC 3202

 89479210 CAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATG 89479269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3203 CAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATG 3262

 89479270 GGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCC 89479329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3263 GGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCC 3322

 89479330 ATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAAT 89479389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3323 ATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAAT 3382

 89479390 CTATGTTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCAC 89479449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3383 CTATGTTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCAC 3442

 89479450 GAACCCTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAA 89479509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3443 GAACCCTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAA 3502

 89479510 AAGAAACTTATTTTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGAT 89479569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3503 AAGAAACTTATTTTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGAT 3562

 89479570 ATTCAGCAAGCATTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAG 89479629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3563 ATTCAGCAAGCATTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAG 3622

 89479630 CAAGCATTAATTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAA 89479689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3623 CAAGCATTAATTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAA 3682

 89479690 CTATCAATAGTAAACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAAT 89479749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3683 CTATCAATAGTAAACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAAT 3742

 89479750 GGTACGTCTCTGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTG 89479809
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3743 GGTACGTCCCTGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTG 3802

 89479810 AGGGGTTGTCCATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCT 89479869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3803 AGGGGTTGTCCATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCT 3862

 89479870 GGGAAGAAGCTCACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTT 89479929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3863 GGGAAGAAGCTCACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTT 3922

 89479930 GATCGGATTCGATGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGAC 89479989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3923 GATCGGATTCGATGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGAC 3982

 89479990 AAAATGAACAGGAACCTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCC 89480049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3983 AAAATGAACAGGAACCTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCC 4042

 89480050 TTTGATCCTAACCTAAGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTT 89480109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4043 TTTGATCCTAACCTAAGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTT 4102

 89480110 GCATTATTTTTTGTTTTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCT 89480169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4103 GCATTATTTTTTGTTTTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCT 4162

 89480170 GGTTTATGAATACAGGTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATAC 89480229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4163 GGTTTATGAATACAGGTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATAC 4222

 89480230 TACAGTTGGTCCATAGCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTG 89480289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4223 TACAGTTGGTCCATAGCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTG 4282

 89480290 CTCAGGAGGACGGCCAGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCA 89480349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4283 CTCAGGAGGACGGCCAGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCA 4342

 89480350 AGACACACTGGAGTCAGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGT 89480409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4343 AGACACACTGGAGTCAGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGT 4402

 89480410 AAAAGTATATCATAAGTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAA 89480469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4403 AAAAGTATATCATAAGTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAA 4462

 89480470 ATCCAAACAAAATGATTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTT 89480529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4463 ATCCAAACAAAATGATTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTT 4522

 89480530 TTTGGTATACACTGATTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAAT 89480589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4523 TTTGGTATACACTGATTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAAT 4582

 89480590 AAACATTCAAGGTTAATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCT 89480649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4583 AAACATTCAAGGTTAATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCT 4642

 89480650 ACTGAATTATAAGTTCTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCT 89480709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4643 ACTGAATTATAAGTTCTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCT 4702

 89480710 TTATGCATCTGTGTTAACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTT 89480769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4703 TTATGCATCTGTGTTAACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTT 4762

 89480770 GACCACCATGCTTTGCTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAA 89480829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4763 GACCACCATGCTTTGCTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAA 4822

 89480830 GTTTGGCCTTATGACATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTC 89480889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4823 GTTTGGCCTTATGACATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTC 4882

 89480890 TTCTTTAAGAAAAAACTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAA 89480949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4883 TTCTTTAAGAAAAAACTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAA 4942

 89480950 ATTGAATCTTTGACCCTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACT 89481009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4943 ATTGAATCTTTGACCCTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACT 5002

 89481010 AAGGTGTGTTCTGGCTTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGA 89481069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5003 AAGGTGTGTTCTGGCTTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGA 5062

 89481070 GATTTCACTGTGGAGCCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGG 89481129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5063 GATTTCACTGTGGAGCCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGG 5122

 89481130 AGGTTTAATAGCAGGTACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAA 89481189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5123 AGGTTTAATAGCAGGTACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAA 5182

 89481190 GAGAGATAACCAAAACCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAA 89481249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5183 GAGAGATAACCAAAACCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAA 5242

 89481250 TTTGAATATCCAGTACATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAAT 89481309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5243 TTTGAATATCCAGTACATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAAT 5302

 89481310 TAGAAATAGAAAAAAACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAG 89481369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5303 TAGAAATAGAAAAAAACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAG 5362

 89481370 TGAGCTGAGATAGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCT 89481421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5363 TGAGCTGAGATAGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCT 5414

EXCISED REGION

 89481429 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAAC 89481488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5420 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAAC 5479

 89481489 AAAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATT 89481548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5480 AAAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATT 5539

 89481549 TTCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGT 89481608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5540 TTCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGT 5599

 89481609 ACTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGG 89481668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5600 ACTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGG 5659

 89481669 AAAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAA 89481728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5660 AAAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAA 5719

 89481729 ATATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAA 89481788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5720 ATATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAA 5779

 89481789 TTAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAA 89481848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5780 TTAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAA 5839

 89481849 TTTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATT 89481908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5840 TTTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATT 5899

 89481909 GGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGAT 89481968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5900 GGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGAT 5959

 89481969 CACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGT 89482004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5960 CACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGT 5995

Alignment time is 8.27054 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    6117] =>      6117 nucs 'mol-32-2e15-073221_6117'

Score:        6029
Aligned:      6119        nucs
Identic:      6110 (100%) nucs =>      6058 (100%)        52 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89469842,89475908] EXCISED REGION [89478625,89478676]
 second seq =>  [       1,    6065] EXCISED REGION [    6066,    6117]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89469842 TACTTGTTCAATTCTGTTGCTGAGACTTTCCAAAGCATTTTGCATTTCTAAAAGCGTGTC 89469901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACTTGTTCAATTCTGTTGCTGAGACTTTCCAAAGCATTTTGCATTTCTAAAAGCGTGTC 60

 89469902 CAAAGTTTCCTGAATTGTGGATTGTTTTCCTTTAAGCTGTCTATTTCATTGAATATTTAT 89469961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAAGTTTCCTGAATTGTGGATTGTTTTCCTTTAAGCTGTCTATTTCATTGAATATTTAT 120

 89469962 CCCTTCACTTCTTGTATCATTTTTTTGGATTTCCTTGCATTGGGCTTCACCTTTCTCTGG 89470021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCTTCACTTCTTGTATCATTTTTTTGGATTTCCTTGCATTGGGCTTCACCTTTCTCTGG 180

 89470022 TCCTTCCCTGATTAGCTTAGTAACTAACCTCCTGAATTCTTTTTCAGATAAATCGGGATT 89470081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCTTCCCTGATTAGCTTAGTAACTAACCTCCTGAATTCTTTTTCAGATAAATCGGGATT 240

 89470082 TCTTCTTGGTTTGGATCCATTGCTGGTGAACCAGGATGATTTTTGGGGGGTGTTGAAGGG 89470141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTTCTTGGTTTGGATCCATTGCTGGTGAACCAGGATGATTTTTGGGGGGTGTTGAAGGG 300

 89470142 CCTTGTTTTGTCATATAACCAGAGTTGGTTTTCTGGTTCCTTCTCATTTGGGTAGGCTCT 89470201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTTGTTTTGTCATATAACCAGAGTTGGTTTTCTGGTTCCTTCTCATTTGGGTAGGCTCT 360

 89470202 GTCAGAGAGAAGGTCTAAGGCTGAAGGCTGTTGTTCAGATTCTTTTGTCCCATGGGGTGT 89470261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCAGAGAGAAGGTCTAAGGCTGAAGGCTGTTGTTCAGATTCTTTTGTCCCATGGGGTGT 420

 89470262 TCCCCTGATGTAGTACTCTCCCCCTTTTCCTATGGGTATGGCTTCCTGTGAGCCAAACTG 89470321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCCCTGATGTAGTACTCTCCCCCTTTTCCTATGGGTATGGCTTCCTGTGAGCCAAACTG 480

 89470322 CAGTGATTGTCGTCTCTCTTCTGAGTCTAGCCAGCCAGTGTGTCTGCCCAGCTCTGGGCT 89470381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGTGATTGTCGTCTCTCTTCTGAGTCTAGCCAGCCAGTGTGTCTGCCCAGCTCTGGGCT 540

 89470382 GGTATTGGGGGTTTTCTGTACAGAGTCCTGTGATGTGGACCATCTATGGGTCTCTGAGCC 89470441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTATTGGGGGTTTTCTGTACAGAGTCCTGTGATGTGGACCATCTATGGGTCTCTGAGCC 600

 89470442 ATGGATACTAAGGGAAGAAAACACCCCTCATATTGTCTTATGCCCAATTTCTGCCTCCAA 89470501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGGATACTAAGGGAAGAAAACACCCCTCATATTGTCTTATGCCCAATTTCTGCCTCCAA 660

 89470502 AGAAAGAAGAAGTAAAAATTAAAAGGCAGAAATGAAATCCACAAGCAGACAGTTCAGCGC 89470561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAAAGAAGAAGTAAAAATTAAAAGGCAGAAATGAAATCCACAAGCAGACAGTTCAGCGC 720

 89470562 CACACCCTGGGCCTGGTAATTAAAGATTGACCCCTGACCTAATTGGTTATGCTATCTACA 89470621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACACCCTGGGCCTGGTAATTAAAGATTGACCCCTGACCTAATTGGTTATGCTATCTACA 780

 89470622 GATTACAGACATTGTATAGAAAAGCACTGTGAAAATCCCTGTCCTGTTCTGTTCCGTTCC 89470681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GATTACAGACATTGTATAGAAAAGCACTGTGAAAATCCCTGTCCTGTTCTGTTCCGTTCC 840

 89470682 GTTCTAATTACCAGTGCATGTAGCCCGCAGTCATGTACCCCCTGCTTGCTCAATCAATCA 89470741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTCTAATTACCAGTGCATGTAGCCCGCAGTCATGTACCCCCTGCTTGCTCAATCAATCA 900

 89470742 CGACCCTCTCACGTGGACCCCCTTAGAGTTGTGAGCCCTTAAAAGGGACAGGAATTGCTC 89470801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CGACCCTCTCACGTGGACCCCCTTAGAGTTGTGAGCCCTTAAAAGGGACAGGAATTGCTC 960

 89470802 ACTCAGGGAGCTCGGTTGTTGGAGACGTGAGTCTTACCAAAGCTCCTGGCTGAATAAAGC 89470861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTCAGGGAGCTCGGTTGTTGGAGACGTGAGTCTTACCAAAGCTCCTGGCTGAATAAAGC 1020

 89470862 CCTTCCTTCTTTAACTCAGTGTCTGAGGGGTTTTGTTGGTGGCTTGTCCTCCTACAATAC 89470921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTTCCTTCTTTAACTCAGTGTCTGAGGGGTTTTGTTGGTGGCTTGTCCTCCTACAATAC 1080

 89470922 CAGTGCCTGTTCCAGTGGAGGTGGTGGAGGGTGAAATGGACTTCATGAGGGTCCTTGGTT 89470981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGTGCCTGTTCCAGTGGAGGTGGTGGAGGGTGAAATGGACTTCATGAGGGTCCTTGGTT 1140

 89470982 TTGGTGGTTTAATGCTCTATTTTTGTGCTGGTTGGCCTCCTGAAAGGAGGTGGCACTTTC 89471041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGGTGGTTTAATGCTCTATTTTTGTGCTGGTTGGCCTCCTGAAAGGAGGTGGCACTTTC 1200

 89471042 CAGAAAGTATCAGTGGGAGAGGGACTGGTGGTGGGCAGGGTCCTAGAACTCCCAAGATTA 89471101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGAAAGTATCAGTGGGAGAGGGACTGGTGGTGGGCAGGGTCCTAGAACTCCCAAGATTA 1260

 89471102 AATGACCTTTGTCTTCAGCTACCAGGGTGGATGGAGAAGGACCATCAGGTCAGGGCGGGG 89471161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATGACCTTTGTCTTCAGCTACCAGGGTGGATGGAGAAGGACCATCAGGTCAGGGCGGGG 1320

 89471162 CTAGGAGTGTCTGAGCTCAGACTCTCCATGGCTGGATCTTGCTATGGCTGCTGTGGGGGA 89471221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTAGGAGTGTCTGAGCTCAGACTCTCCATGGCTGGATCTTGCTATGGCTGCTGTGGGGGA 1380

 89471222 TGGGGGTGAGATTCCCAGGTCACTGGAGTTGTGTACCTAGGAGGATTATGGCTGCCTCTC 89471281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGGGGTGAGATTCCCAGGTCACTGGAGTTGTGTACCTAGGAGGATTATGGCTGCCTCTC 1440

 89471282 CTGAGTCATGCAGGTTGTCAGGGGAGTGGGAGAAGCTGGCAGTCACAGGCCTCACCCAGC 89471341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGAGTCATGCAGGTTGTCAGGGGAGTGGGAGAAGCTGGCAGTCACAGGCCTCACCCAGC 1500

 89471342 TCCGATGCAAACTGGAAGGCCGGTCTCACTCCCACTGTGCCCTTCTCCCTGCCAACAGCT 89471401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCGATGCAAACTGGAAGGCCGGTCTCACTCCCACTGTGCCCTTCTCCCTGCCAACAGCT 1560

 89471402 CTGAGTCTGTTTCCAGGCAGAGGGCAAGAGGGGCGGGCTTAAAATTTGGCTGAGGCTTTC 89471461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGAGTCTGTTTCCAGGCAGAGGGCAAGAGGGGCGGGCTTAAAATTTGGCTGAGGCTTTC 1620

 89471462 TGCTCAGCCAAAAAGAAAAGGACTTTAGTTCTTCACCAGCCTGTGAAGTTTGCATGCTGG 89471521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGCTCAGCCAAAAAGAAAAGGACTTTAGTTCTTCACCAGCCTGTGAAGTTTGCATGCTGG 1680

 89471522 ATTTGTGCCCTCCCCGAGTTCTGGCAGGAGGCTTCTCGCCCCATTCAAATTGTTACAAAG 89471581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTTGTGCCCTCCCCGAGTTCTGGCAGGAGGCTTCTCGCCCCATTCAAATTGTTACAAAG 1740

 89471582 TTTGGTTGGAGAATTTCTTCTTTCTGTGGAGTTTTACCTGTTGCTCCTCTGGCTGACCTC 89471641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTGGTTGGAGAATTTCTTCTTTCTGTGGAGTTTTACCTGTTGCTCCTCTGGCTGACCTC 1800

 89471642 CCGATAGATCCCTGTGGTGCCAGGCAGGAATGGCCTGCCTGGGGACACAGTGAGCTCCCA 89471701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCGATAGATCCCTGTGGTGCCAGGCAGGAATGGCCTGCCTGGGGACACAGTGAGCTCCCA 1860

 89471702 GGGCCTTCCAACTGCTTCCTCTACCCCTGTATTTTGCTCGGCTCTCTAACTTGACTCAGC 89471761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGGCCTTCCAACTGCTTCCTCTACCCCTGTATTTTGCTCGGCTCTCTAACTTGACTCAGC 1920

 89471762 TTCAGGTAAAGTCGGAAACTCCTCCTGCACACAAACCTTCAGCTTCTCCAGTGGGGGTGT 89471821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCAGGTAAAGTCGGAAACTCCTCCTGCACACAAACCTTCAGCTTCTCCAGTGGGGGTGT 1980

 89471822 GTGTTCCAGAGAGGAGGGTCTCCCTTTCCCACTTCTGCAGTTGGGGCAGTCAGAATATTT 89471881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTGTTCCAGAGAGGAGGGTCTCCCTTTCCCACTTCTGCAGTTGGGGCAGTCAGAATATTT 2040

 89471882 GGAGTGTTTCCTGGGTCCTGCAGGAGCAGTCTGCCTCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTC 89471941
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGAGTGTTTCTTGGGTCCTGCAGGAGCAGTCTGCCTCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTC 2100

 89471942 TTGGGATTCATCGTGTAATATTTTGAAACACTACATAATTATTTCAAGATTCTAACATAT 89472001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGGGATTCATCGTGTAATATTTTGAAACACTACATAATTATTTCAAGATTCTAACATAT 2160

 89472002 ACAATCTAATCCTTATGATTCTTATAAATGTAAGTAAAATAAGGCAGATATAAAATGAAA 89472061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACAATCTAATCCTTATGATTCTTATAAATGTAAGTAAAATAAGGCAGATATAAAATGAAA 2220

 89472062 CTTTGACCAATGTTTCTATAAACAAAGGTCTGCAAACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGG 89472121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTTGACCAATGTTTCTATAAACAAAGGTCTGCAAACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGG 2280

 89472122 TTTTGAAAATTAAGTGTTATTGGCACATAGCCCCACCCATTTACTTATGTATTGTCTATG 89472181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTTGAAAATTAAGTGTTATTGGCACATAGCCCCACCCATTTACTTATGTATTGTCTATG 2340

 89472182 GCTGCATTTGTACTGTATGCAGAGTTTAGTAGTTGAGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAA 89472241
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCTGCATTTGTACTATATGCAGAGTTTAGTAGTTGAGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAA 2400

 89472242 ATAATCACTATCTGGTATTTTACAGAAAAGTTAGCCAACCACTGCTATAAAGACTCAAAC 89472301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATAATCACTATCTGGTATTTTACAGAAAAGTTAGCCAACCACTGCTATAAAGACTCAAAC 2460

 89472302 CTTATTATTTGGTGAAAAACTAAAAAAAAAAAAATGGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTT 89472361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTTATTATTTGGTGAAAAACTAAAAAAAAAAAAATGGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTT 2520

 89472362 ATTTTATTTCTAGTTTAGTTTATTTCTAGTTCAAAAATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAA 89472421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTTTATTTCTAGTTTAGTTTATTTCTAGTTCAAAAATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAA 2580

 89472422 TGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTGACAATTGGGATGAAGTCTACATATACTAAGTAAT 89472481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTGACAATTGGGATGAAGTCTACATATACTAAGTAAT 2640

 89472482 GGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGG 89472541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGG 2700

 89472542 GAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTT 89472601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTT 2760

 89472602 TAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTC 89472661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTC 2820

 89472662 AGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTAC 89472721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTAC 2880

 89472722 CATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTA 89472781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTA 2940

 89472782 TAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGAT 89472841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGAT 3000

 89472842 TCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGA 89472901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGA 3060

 89472902 TCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCA 89472961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCA 3120

 89472962 ATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGT 89473021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGT 3180

 89473022 ACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACT 89473081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACT 3240

 89473082 TGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCC 89473141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCC 3300

 89473142 ACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTG 89473201
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3301 ACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGCGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTG 3360

 89473202 GTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGA 89473261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGA 3420

 89473262 TTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATT 89473321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATT 3480

 89473322 ATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGT 89473381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGT 3540

 89473382 TAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGG 89473441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGG 3600

 89473442 TTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCAC 89473501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCAC 3660

 89473502 CTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAA 89473561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAA 3720

 89473562 TAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATT 89473621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATT 3780

 89473622 TAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTG 89473681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTG 3840

 89473682 GGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGT 89473741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGT 3900

 89473742 ATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACC 89473801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACC 3960

 89473802 TTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTT 89473861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTT 4020

 89473862 TTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTAC 89473921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTAC 4080

 89473922 TCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACT 89473981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACT 4140

 89473982 CCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATAT 89474041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATAT 4200

 89474042 AGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGG 89474101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGG 4260

 89474102 CAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGT 89474161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGT 4320

 89474162 TCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTA 89474221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTA 4380

 89474222 AGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATAT 89474281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATAT 4440

 89474282 TTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTA 89474341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTA 4500

 89474342 TTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTG 89474401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTG 4560

 89474402 GAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCAC 89474461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCAC 4620

 89474462 ATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAG 89474521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 ATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAG 4680

 89474522 CAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGA 89474581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGA 4740

 89474582 ACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACT 89474641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACT 4800

 89474642 AGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGT 89474701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGT 4860

 89474702 CAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTT 89474761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTT 4920

 89474762 TATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTC 89474821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4921 TATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACGTTC 4980

 89474822 CACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTAT 89474881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTAT 5040

 89474882 ACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACA 89474941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 ACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACA 5100

 89474942 AGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAA 89475001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAA 5160

 89475002 ATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTG 89475061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTG 5220

 89475062 ACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGA 89475121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGA 5280

 89475122 ATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTA 89475181
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 ATTGCATCGGTCATAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTA 5340

 89475182 GGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTT 89475241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5341 GGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTGTTCCTGTTCTT 5400

 89475242 CTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCA 89475301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCA 5460

 89475302 AGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTT 89475361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTT 5520

 89475362 AGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTT 89475421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTT 5580

 89475422 CAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAAT 89475481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 CAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAAT 5640

 89475482 GAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGA 89475541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGA 5700

 89475542 GAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAA 89475601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAA 5760

 89475602 TCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTT 89475661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTT 5820

 89475662 TTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATG 89475721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATG 5880

 89475722 ATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTG 89475781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 ATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTG 5940

 89475782 ACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCT 89475841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||
     5941 ACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTT--GAGACAGAGTCTTGCTCT 5998

 89475842 ATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGT 89475901
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 GTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGT 6058

 89475902 TCAAGTG 89475908
          |||||||
     6059 TCAAGTG 6065

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCA 89478676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6066 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCA 6117

Alignment time is 8.48424 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3580] =>      3580 nucs 'mol-32-2e15-073404_3580'

Score:        3516
Aligned:      3582        nucs
Identic:      3576 (100%) nucs =>        19 (100%)      3557 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475890,89475908] EXCISED REGION [89478625,89482187]
 second seq =>  [       1,      19] EXCISED REGION [      20,    3580]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89475890 CGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          |||||||||||||||||||
        1 CGCCTCCTGGGTTCAAGTG 19

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       20 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 79

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       80 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 139

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      140 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 199

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      200 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 259

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      260 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 319

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      320 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 379

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      380 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 439

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      440 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 499

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      500 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 559

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      560 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 619

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      620 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 679

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      680 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 739

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 799

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 859

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 919

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 979

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 1039

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 1099

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1100 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 1159

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 1219

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 1279

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 1339

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 1399

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 1459

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 1519

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 1579

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 1639

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 1699

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 1759

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 1819

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 1879

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 1939

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 1999

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 2059

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 2119

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 2179

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 2239

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 2299

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 2359

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 2419

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 2479

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 2539

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 2599

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 2659

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 2719

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 2779

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 89481444
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
     2780 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-TGTCTT-AAAAAAAAAAAAAAAA 2837

 89481445 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 89481504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 2897

 89481505 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 89481564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2898 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 2957

 89481565 ACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 89481624
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2958 ACAAGGAAAAGATGCCCATTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 3017

 89481625 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 89481684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 3077

 89481685 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 89481744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 3137

 89481745 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 89481804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 3197

 89481805 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 89481864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 3257

 89481865 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 89481924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3258 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 3317

 89481925 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 89481984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3318 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 3377

 89481985 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 89482044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3378 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 3437

 89482045 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 89482104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3438 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 3497

 89482105 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACT 89482164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3498 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACT 3557

 89482165 GCACTCCAGGCTGGTGACACAGC 89482187
          |||||||||||||||||||||||
     3558 GCACTCCAGGCTGGTGACACAGC 3580

Alignment time is 5.03936 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2763] =>      2763 nucs 'mol-32-2e20-131562_2763'

Score:        2763
Aligned:      2763        nucs
Identic:      2763 (100%) nucs =>      2649 (100%)       114 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89476038,89478686] EXCISED REGION [89478688,89478801]
 second seq =>  [       1,    2649] EXCISED REGION [    2650,    2763]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89478687,89478687]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [89478684,89478686] to [89478688,89478690]
 second seq =>         3 nucs [2647,2649] to [2650,2652]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89476038 TGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCC 89476097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCC 60

 89476098 CGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGC 89476157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGC 120

 89476158 TGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCT 89476217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCT 180

 89476218 TCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTAC 89476277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTAC 240

 89476278 TAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCT 89476337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCT 300

 89476338 GCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTG 89476397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTG 360

 89476398 CACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATG 89476457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATG 420

 89476458 TTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGC 89476517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGC 480

 89476518 TTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAAT 89476577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAAT 540

 89476578 CTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAG 89476637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAG 600

 89476638 CTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTC 89476697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTC 660

 89476698 TTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTG 89476757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTG 720

 89476758 ATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGG 89476817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGG 780

 89476818 AAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTT 89476877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTT 840

 89476878 CCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCT 89476937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCT 900

 89476938 CTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGC 89476997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGC 960

 89476998 TGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTA 89477057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTA 1020

 89477058 ATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAA 89477117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAA 1080

 89477118 AATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTT 89477177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTT 1140

 89477178 GATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATA 89477237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATA 1200

 89477238 AGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGA 89477297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGA 1260

 89477298 TTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAA 89477357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAA 1320

 89477358 TACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGA 89477417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGA 1380

 89477418 TAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTT 89477477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTT 1440

 89477478 CATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAG 89477537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAG 1500

 89477538 GGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTT 89477597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTT 1560

 89477598 TTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGG 89477657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGG 1620

 89477658 CAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATA 89477717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATA 1680

 89477718 CAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTG 89477777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTG 1740

 89477778 AACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAG 89477837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAG 1800

 89477838 CTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCT 89477897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCT 1860

 89477898 TTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGA 89477957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGA 1920

 89477958 TGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGA 89478017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGA 1980

 89478018 AAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTG 89478077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTG 2040

 89478078 ATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTA 89478137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTA 2100

 89478138 TTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCT 89478197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCT 2160

 89478198 GTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGA 89478257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGA 2220

 89478258 ATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACT 89478317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACT 2280

 89478318 TGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAA 89478377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAA 2340

 89478378 TAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAAT 89478437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAAT 2400

 89478438 CTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTT 89478497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTT 2460

 89478498 TTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTG 89478557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTG 2520

 89478558 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGT 89478617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGT 2580

 89478618 TCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCAT 89478677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCAT 2640

 89478678 GCCTCATTT 89478686
          |||||||||
     2641 GCCTCATTT 2649

EXCISED REGION

 89478688 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 89478747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 2709

 89478748 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCA 89478801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCA 2763

Alignment time is 3.98786 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    7050] =>      7050 nucs 'mol-32-2e4c-118226_7050'

Score:        6995
Aligned:      7050        nucs
Identic:      7045 (100%) nucs =>      2115 (100%)      4930 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89472798,89474912] EXCISED REGION [89474914,89479848]
 second seq =>  [       1,    2115] EXCISED REGION [    2117,    7050]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89474913,89474913]
 second seq =>         1 nucs [2116,2116]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>        12 nucs [89479063,89479074]
 second seq =>        12 nucs [6265,6276]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2116,2116] to [2117,2117]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89472798 AACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTG 89472857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTG 60

 89472858 CTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGG 89472917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGG 120

 89472918 TTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACA 89472977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACA 180

 89472978 TTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAG 89473037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAG 240

 89473038 GAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCC 89473097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCC 300

 89473098 CAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAG 89473157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAG 360

 89473158 AATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGC 89473217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGC 420

 89473218 ATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACT 89473277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACT 480

 89473278 GCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTG 89473337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTG 540

 89473338 ACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAG 89473397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAG 600

 89473398 CTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGT 89473457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGT 660

 89473458 CTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTT 89473517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTT 720

 89473518 TAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAG 89473577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAG 780

 89473578 TAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTT 89473637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTT 840

 89473638 TCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGT 89473697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGT 900

 89473698 GATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTAT 89473757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTAT 960

 89473758 TGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTA 89473817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTA 1020

 89473818 ACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTA 89473877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTA 1080

 89473878 CACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTA 89473937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTA 1140

 89473938 GGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGT 89473997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGT 1200

 89473998 AGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATA 89474057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATA 1260

 89474058 GCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTG 89474117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTG 1320

 89474118 CCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAG 89474177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAG 1380

 89474178 TCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGT 89474237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGT 1440

 89474238 CAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTT 89474297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTT 1500

 89474298 TCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATA 89474357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATA 1560

 89474358 GATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAA 89474417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAA 1620

 89474418 CGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCA 89474477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCA 1680

 89474478 TTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTG 89474537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTG 1740

 89474538 GGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGA 89474597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGA 1800

 89474598 AAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCT 89474657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCT 1860

 89474658 TGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGT 89474717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGT 1920

 89474718 TCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCC 89474777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCC 1980

 89474778 ACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAA 89474837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAA 2040

 89474838 GAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATT 89474897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATT 2100

 89474898 GTTGCTGCTGACTGC 89474912
          |||||||||||||||
     2101 GTTGCTGCTGACTGC 2115

EXCISED REGION

 89474914 TATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAAC 89474973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 TATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAAC 2176

 89474974 TTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTG 89475033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 TTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTG 2236

 89475034 AAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTT 89475093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 AAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTT 2296

 89475094 TTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAA 89475153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 TTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAA 2356

 89475154 GTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAA 89475213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 GTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAA 2416

 89475214 ATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTC 89475273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 ATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTC 2476

 89475274 CTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTC 89475333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 CTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTC 2536

 89475334 CAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGAT 89475393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 CAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGAT 2596

 89475394 ACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGT 89475453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 ACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGT 2656

 89475454 TCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGA 89475513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 TCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGA 2716

 89475514 TTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCA 89475573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 TTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCA 2776

 89475574 GAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTT 89475633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 GAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTT 2836

 89475634 GAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCT 89475693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 GAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCT 2896

 89475694 TGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATA 89475753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 TGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATA 2956

 89475754 ATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTT 89475813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 ATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTT 3016

 89475814 TTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTT 89475873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 TTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTT 3076

 89475874 GGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGT 89475933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3077 GGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGT 3136

 89475934 AGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAC 89475993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 AGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAC 3196

 89475994 GGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCT 89476053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 GGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCT 3256

 89476054 CAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAG 89476113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 CAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAG 3316

 89476114 TATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGG 89476173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 TATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGG 3376

 89476174 CTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGAC 89476233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3377 CTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGAC 3436

 89476234 TACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCAC 89476293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3437 TACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCAC 3496

 89476294 CATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTC 89476353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3497 CATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTC 3556

 89476354 AAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAG 89476413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3557 AAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAG 3616

 89476414 CACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCA 89476473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3617 CACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCA 3676

 89476474 TGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGT 89476533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3677 TGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGT 3736

 89476534 TCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATC 89476593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3737 TCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATC 3796

 89476594 CCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGA 89476653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3797 CCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGA 3856

 89476654 CAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAA 89476713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3857 CAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAA 3916

 89476714 ATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAG 89476773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3917 ATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAG 3976

 89476774 TCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAAC 89476833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3977 TCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAAC 4036

 89476834 AGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTC 89476893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4037 AGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTC 4096

 89476894 AATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCA 89476953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4097 AATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCA 4156

 89476954 CTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTT 89477013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 CTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTT 4216

 89477014 ATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAA 89477073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 ATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAA 4276

 89477074 TAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTT 89477133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 TAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTT 4336

 89477134 GGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGAT 89477193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4337 GGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGAT 4396

 89477194 TGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAAC 89477253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4397 TGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAAC 4456

 89477254 TTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTT 89477313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4457 TTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTT 4516

 89477314 GTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCT 89477373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4517 GTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCT 4576

 89477374 TAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCT 89477433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4577 TAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCT 4636

 89477434 AATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTG 89477493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4637 AATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTG 4696

 89477494 GCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGC 89477553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4697 GCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGC 4756

 89477554 TGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAG 89477613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4757 TGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAG 4816

 89477614 TTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTG 89477673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4817 TTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTG 4876

 89477674 ATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATA 89477733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4877 ATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATA 4936

 89477734 ATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCA 89477793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4937 ATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCA 4996

 89477794 CCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCT 89477853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4997 CCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCT 5056

 89477854 ATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTA 89477913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5057 ATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTA 5116

 89477914 GATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGT 89477973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5117 GATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGT 5176

 89477974 TAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTA 89478033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5177 TAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTA 5236

 89478034 TTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAA 89478093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5237 TTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAA 5296

 89478094 CAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTG 89478153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5297 CAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTG 5356

 89478154 TCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCC 89478213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5357 TCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCC 5416

 89478214 ACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTT 89478273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5417 ACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTT 5476

 89478274 TCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTG 89478333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5477 TCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTG 5536

 89478334 TACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTT 89478393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5537 TACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTT 5596

 89478394 TGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGG 89478453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5597 TGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGG 5656

 89478454 TGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTA 89478513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5657 TGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTA 5716

 89478514 GGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGT 89478573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5717 GGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGT 5776

 89478574 GCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTG 89478633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5777 GCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTG 5836

 89478634 CCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTTATTTTTG 89478693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     5837 CCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT-TTTTTG 5895

 89478694 TATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCT 89478753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5896 TATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCT 5955

 89478754 CAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCATG 89478813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5956 CAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCATG 6015

 89478814 CCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTACGAGGCC 89478873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     6016 CCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTACGAGGCC 6075

 89478874 CATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGAAC 89478933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6076 CATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGAAC 6135

 89478934 AGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAA 89478993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6136 AGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAA 6195

 89478994 GCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGGGA 89479053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6196 GCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGGGA 6255

 89479054 AGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACCTA 89479113
          |||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6256 AGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACCTA 6315

 89479114 GAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAA 89479173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6316 GAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAA 6375

 89479174 ATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTGGA 89479233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6376 ATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTGGA 6435

 89479234 GCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAAAC 89479293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6436 GCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAAAC 6495

 89479294 CTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTC 89479353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6496 CTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTC 6555

 89479354 GCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATCCA 89479413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6556 GCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATCCA 6615

 89479414 TTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAAAT 89479473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6616 TTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAAAT 6675

 89479474 TTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACAGG 89479533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6676 TTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACAGG 6735

 89479534 AGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTCCTTTT 89479593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6736 AGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTCCTTTT 6795

 89479594 TTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAATAGC 89479653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6796 TTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAATAGC 6855

 89479654 AAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAAAAATG 89479713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6856 AAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAAAAATG 6915

 89479714 ATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTACCTTGCGTT 89479773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     6916 ATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTACCTTGCGTT 6975

 89479774 AGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTCCAAG 89479833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6976 AGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTCCAAG 7035

 89479834 TCCAGGGAGAAATCT 89479848
          |||||||||||||||
     7036 TCCAGGGAGAAATCT 7050

Alignment time is 9.63121 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    9394] =>      9394 nucs 'mol-32-2ef1-114791_9394'

Score:        9278
Aligned:      9390        nucs
Identic:      9379 (100%) nucs =>      6194 (100%)      3185 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475223,89481421] EXCISED REGION [89481428,89484618]
 second seq =>  [       1,    6198] EXCISED REGION [    6206,    9394]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [89481422,89481427]
 second seq =>         7 nucs [6199,6205]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89481421,89481421] to [89481427,89481427]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89481422,89481422] to [89481427,89481427]
 second seq =>         0 nucs

 89475223 AGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCC 89475282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCC 60

 89475283 CTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGC 89475342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGC 120

 89475343 CAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAA 89475402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAA 180

 89475403 TAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGG 89475462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGG 240

 89475463 GCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAG 89475522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAG 300

 89475523 AGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAG 89475582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAG 360

 89475583 ATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAA 89475642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAA 420

 89475643 AACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGA 89475702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGA 480

 89475703 AAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTT 89475762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTT 540

 89475763 ATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTT 89475822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTT 600

 89475823 TGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTG 89475882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTG 660

 89475883 CAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAAT 89475942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAAT 720

 89475943 TACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCA 89476002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCA 780

 89476003 CCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCC 89476062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCC 840

 89476063 AAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAA 89476122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAA 900

 89476123 GACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAA 89476182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAA 960

 89476183 CCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCAT 89476242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCAT 1020

 89476243 GTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCT 89476302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCT 1080

 89476303 CAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTA 89476362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTA 1140

 89476363 GGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGA 89476422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGA 1200

 89476423 CATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTA 89476482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTA 1260

 89476483 TACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAG 89476542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAG 1320

 89476543 GTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTT 89476602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTT 1380

 89476603 GGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCC 89476662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCC 1440

 89476663 CCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGA 89476722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGA 1500

 89476723 AGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGC 89476782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGC 1560

 89476783 TTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGG 89476842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGG 1620

 89476843 ATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCC 89476902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCC 1680

 89476903 GGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACT 89476962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACT 1740

 89476963 GAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACT 89477022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACT 1800

 89477023 GTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGG 89477082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGG 1860

 89477083 CTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAAT 89477142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAAT 1920

 89477143 ATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTA 89477202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTA 1980

 89477203 TATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCT 89477262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCT 2040

 89477263 GAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATT 89477322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATT 2100

 89477323 TTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTAC 89477382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTAC 2160

 89477383 TTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTT 89477442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTT 2220

 89477443 TGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTC 89477502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTC 2280

 89477503 TCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTC 89477562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTC 2340

 89477563 TGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATC 89477622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATC 2400

 89477623 TGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTG 89477682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTG 2460

 89477683 ATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTT 89477742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTT 2520

 89477743 GTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTC 89477802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTC 2580

 89477803 CTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGC 89477862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGC 2640

 89477863 CTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATG 89477922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATG 2700

 89477923 TATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAAT 89477982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAAT 2760

 89477983 GTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATA 89478042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATA 2820

 89478043 TGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATA 89478102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATA 2880

 89478103 CTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAA 89478162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAA 2940

 89478163 ACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTAC 89478222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTAC 3000

 89478223 ATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTT 89478282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTT 3060

 89478283 TAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACA 89478342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACA 3120

 89478343 GTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCC 89478402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCC 3180

 89478403 TATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTA 89478462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTA 3240

 89478463 GAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTT 89478522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTT 3300

 89478523 ATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCG 89478582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCG 3360

 89478583 TGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCT 89478642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCT 3420

 89478643 CCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTTATTTTTGTATTTTTAG 89478702
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     3421 CCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT-TTTTTGTATTTTTAG 3479

 89478703 TAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATC 89478762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATC 3539

 89478763 TGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCAT 89478822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCAT 3599

 89478823 CCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCT 89478882
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3600 CCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCT 3659

 89478883 TGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTG 89478942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTG 3719

 89478943 CTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAA 89479002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 CTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAA 3779

 89479003 GCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCC 89479062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 GCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCC 3839

 89479063 GGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACAT 89479122
          .||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 AGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACAT 3899

 89479123 AATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAG 89479182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 AATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAG 3959

 89479183 GCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAA 89479242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 GCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAA 4019

 89479243 CAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAG 89479302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 CAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAG 4079

 89479303 AAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATT 89479362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 AAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATT 4139

 89479363 TGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTC 89479422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTC 4199

 89479423 ATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAA 89479482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 ATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAA 4259

 89479483 TTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACAGGAGAATATAA 89479542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACAGGAGAATATAA 4319

 89479543 TTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTCCTTTTTTCCTTTTT 89479602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 TTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTCCTTTTTTCCTTTTT 4379

 89479603 TCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAG 89479662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 TCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAG 4439

 89479663 ATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAAAAATGATAATTTCT 89479722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 ATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAAAAATGATAATTTCT 4499

 89479723 AGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGG 89479782
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4500 AGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGG 4559

 89479783 GAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAG 89479842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 GAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAG 4619

 89479843 AAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGTCAGCTGAATCCTCA 89479902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 AAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGTCAGCTGAATCCTCA 4679

 89479903 TTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCAGCTCTGTCACATAG 89479962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 TTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCAGCTCTGTCACATAG 4739

 89479963 CTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCATCCCATATTAGTTC 89480022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 CTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCATCCCATATTAGTTC 4799

 89480023 AACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTGTCAATTCTAAAGTG 89480082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 AACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTGTCAATTCTAAAGTG 4859

 89480083 GATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCTCCTTTTGAGCTTGA 89480142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 GATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCTCCTTTTGAGCTTGA 4919

 89480143 TTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGTCCCCTCTGACCTTG 89480202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 TTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGTCCCCTCTGACCTTG 4979

 89480203 GTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCTGCTGGTTGATGGTT 89480262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 GTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCTGCTGGTTGATGGTT 5039

 89480263 CCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGGTGAAGATCCAGGAG 89480322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 CCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGGTGAAGATCCAGGAG 5099

 89480323 TCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGAGCAAGTTTCATCAT 89480382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 TCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGAGCAAGTTTCATCAT 5159

 89480383 CACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTTAGAGTTTTCTTTTAA 89480442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 CACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTTAGAGTTTTCTTTTAA 5219

 89480443 GACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTGTTACTCAGCTGTGGA 89480502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 GACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTGTTACTCAGCTGTGGA 5279

 89480503 ATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTCTCACCAGGTCCTCTT 89480562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 ATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTCTCACCAGGTCCTCTT 5339

 89480563 ATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATGGGCATTCTAAGGCCT 89480622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 ATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATGGGCATTCTAAGGCCT 5399

 89480623 GAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTTTGCAGGATAGGACTC 89480682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 GAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTTTGCAGGATAGGACTC 5459

 89480683 GTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAACTCACATAGCTTACAA 89480742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 GTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAACTCACATAGCTTACAA 5519

 89480743 CCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTAGGATTCTGTCTTATG 89480802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 CCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTAGGATTCTGTCTTATG 5579

 89480803 AATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATGTACACAGAAATGAAA 89480862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 AATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATGTACACAGAAATGAAA 5639

 89480863 AGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTAAATGGTGCTTAAAAT 89480922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 AGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTAAATGGTGCTTAAAAT 5699

 89480923 ATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTTACCTTCTTTACATCT 89480982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 ATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTTACCTTCTTTACATCT 5759

 89480983 CCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTTTTGGGGTGAGGCACA 89481042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 CCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTTTTGGGGTGAGGCACA 5819

 89481043 CACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCCAGAGAGAAGCCTGTA 89481102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 CACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCCAGAGAGAAGCCTGTA 5879

 89481103 AAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTACTTCAGGAAATTGAGG 89481162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 AAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTACTTCAGGAAATTGAGG 5939

 89481163 CAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCACAATCAGTACTTACG 89481222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 CAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCACAATCAGTACTTACG 5999

 89481223 TTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACATAAATGGATTCAGGAC 89481282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 TTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACATAAATGGATTCAGGAC 6059

 89481283 CTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACTGAGGAAGGAGAATCA 89481342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 CTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACTGAGGAAGGAGAATCA 6119

 89481343 CTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCACTGCACTCCAGCCTG 89481402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 CTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCACTGCACTCCAGCCTG 6179

 89481403 GGCAACAGAGCGAGACTCT 89481421
          |||||||||||||||||||
     6180 GGCAACAGAGCGAGACTCT 6198

EXCISED REGION

 89481428 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAA 89481487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAA 6265

 89481488 CAAAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAAT 89481547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 CAAAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAAT 6325

 89481548 TTTCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAG 89481607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6326 TTTCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAG 6385

 89481608 TACTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTG 89481667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 TACTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTG 6445

 89481668 GAAAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTA 89481727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6446 GAAAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTA 6505

 89481728 AATATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAA 89481787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6506 AATATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAA 6565

 89481788 ATTAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAA 89481847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6566 ATTAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAA 6625

 89481848 ATTTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAAT 89481907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6626 ATTTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAAT 6685

 89481908 TGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGA 89481967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6686 TGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGA 6745

 89481968 TCACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAA 89482027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6746 TCACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAA 6805

 89482028 ACTACACACACACACACACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCA 89482087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6806 ACTACACACACACACACACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCA 6865

 89482088 GCTACTCGGGTGGCTGAGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 89482147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6866 GCTACTCGGGTGGCTGAGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 6925

 89482148 GCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAAC 89482207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6926 GCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAAC 6985

 89482208 AAACAAAAAACCCAAAAAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACA 89482267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6986 AAACAAAAAACCCAAAAAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACA 7045

 89482268 AAATTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACT 89482327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7046 AAATTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACT 7105

 89482328 GATCACTGTAGTCTTGACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTA 89482387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7106 GATCACTGTAGTCTTGACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTA 7165

 89482388 GCTGAGACTACAGGCACGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATG 89482447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7166 GCTGAGACTACAGGCACGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATG 7225

 89482448 GGGTTTCCCCGTGTTGTCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCC 89482507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7226 GGGTTTCCCCGTGTTGTCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCC 7285

 89482508 TCAGCTTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTT 89482567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7286 TCAGCTTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTT 7345

 89482568 AAAAGAAATTAAGGAAGAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGA 89482627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7346 AAAAGAAATTAAGGAAGAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGA 7405

 89482628 TTCAATGCAATCCCTATCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATA 89482687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7406 TTCAATGCAATCCCTATCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATA 7465

 89482688 TCCACACTAACTTTCATATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAA 89482747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7466 TCCACACTAACTTTCATATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAA 7525

 89482748 AAGGAAGAAGAAAGTCAGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAG 89482807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7526 AAGGAAGAAGAAAGTCAGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAG 7585

 89482808 GATAATCAACACAGTTTGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAG 89482867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7586 GATAATCAACACAGTTTGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAG 7645

 89482868 AGAGCCTAGAAATGAACTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAA 89482927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7646 AGAGCCTAGAAATGAACTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAA 7705

 89482928 TCATTCAACGCAGAAAGAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCA 89482987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7706 TCATTCAACGCAGAAAGAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCA 7765

 89482988 CATGCTCACATGCCAAAAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACG 89483047
          ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7766 CATGCTCACATGCC--AAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACG 7823

 89483048 TAACTCAAAATGGATCAAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGA 89483107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7824 TAACTCAAAATGGATCAAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGA 7883

 89483108 AAACAAAGGGGAAAAACAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAAT 89483167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7884 AAACAAAGGGGAAAAACAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAAT 7943

 89483168 GAAAAACTTTTGTGCATCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATG 89483227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7944 GAAAAACTTTTGTGCATCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATG 8003

 89483228 GAAGAAAACATTTGCTAAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGA 89483287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8004 GAAGAAAACATTTGCTAAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGA 8063

 89483288 ATTCCTACAATGCAACACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTC 89483347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8064 ATTCCTACAATGCAACACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTC 8123

 89483348 TCTAAAGAATGGCCAATAAGCACCTGAAAAGATGCTCAACATTACTAGTCATTAGGAAAA 89483407
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     8124 TCTAAAGAATGGCCAATAAGCACCTGAAAAGATGCTCAATATTACTAGTCATTAGGAAAA 8183

 89483408 TGCAAATTAAAGCCATAGTGAGATACTACTTCACATCCATTAGTATGGTGACTATCAAAA 89483467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8184 TGCAAATTAAAGCCATAGTGAGATACTACTTCACATCCATTAGTATGGTGACTATCAAAA 8243

 89483468 AAAATTGAAAAGGGCTGGGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCT 89483527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8244 AAAATTGAAAAGGGCTGGGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCT 8303

 89483528 GAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCAAATATGGAGAAAC 89483587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8304 GAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCAAATATGGAGAAAC 8363

 89483588 CCCATTTACACTAAAAATACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCA 89483647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8364 CCCATTTACACTAAAAATACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCA 8423

 89483648 CCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 89483707
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8424 CCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGAAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 8483

 89483708 GCTGGGGTCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTGTGTCTCAAAAAA 89483767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8484 GCTGGGGTCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTGTGTCTCAAAAAA 8543

 89483768 AAAAAAAATTAAAATAACTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATTGCTATGGAATAAAAGAT 89483827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8544 AAAAAAAATTAAAATAACTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATTGCTATGGAATAAAAGAT 8603

 89483828 GAAATGCTCCTGATTATTGTAAATACAAAATTGCATGCAGGATTGTGCAAAGACAGTGCC 89483887
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     8604 GAAATGCTCCTGATTATTGTAAATACAAAATTGCATGCAGGATTGTGCAAAGACAATGCC 8663

 89483888 AGGTTGGACTGCCAGAATGAGCCAACGGGACGTGATGTGCTTCCCCCTGCAGAGAGCCTA 89483947
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     8664 AGGTTGGACTGCCAGAATGAGCCAACGGCACGTGATGTGCTTCCCCCTGCAGAGAGCCTA 8723

 89483948 TGAATGGATGTGCAGTCAGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTCCTATCCCAGAAAAGCAG 89484007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8724 TGAATGGATGTGCAGTCAGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTCCTATCCCAGAAAAGCAG 8783

 89484008 ATGTTCATAGCTCTGGGAATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGAGGGGGCACCTGTCCATG 89484067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8784 ATGTTCATAGCTCTGGGAATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGAGGGGGCACCTGTCCATG 8843

 89484068 TGGATAAGATAGGGCCATAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTCTTCTAGGCCTCTTTAGG 89484127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8844 TGGATAAGATAGGGCCATAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTCTTCTAGGCCTCTTTAGG 8903

 89484128 GTTAAGGCATACTCCCTTCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTTGTCTAGCTTCACGTCTT 89484187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8904 GTTAAGGCATACTCCCTTCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTTGTCTAGCTTCACGTCTT 8963

 89484188 GTTTCTATGGATTGTTTGTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTACTGCTGATTAATATCTT 89484247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8964 GTTTCTATGGATTGTTTGTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTACTGCTGATTAATATCTT 9023

 89484248 GCTAATCATAGGTTATGAAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCTCTGTTAGAAATTACTGA 89484307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9024 GCTAATCATAGGTTATGAAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCTCTGTTAGAAATTACTGA 9083

 89484308 TGCACACACTATATTGTAAATTCTTATCTCTGTATACTGTACTTCTGCATACAGATGTTA 89484367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9084 TGCACACACTATATTGTAAATTCTTATCTCTGTATACTGTACTTCTGCATACAGATGTTA 9143

 89484368 TGTTAAAGAATTACTTCATCCCCATGTGACCATCTCACCTCATAATCAAACGACCCTAAA 89484427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9144 TGTTAAAGAATTACTTCATCCCCATGTGACCATCTCACCTCATAATCAAACGACCCTAAA 9203

 89484428 TCCCTCACTAACCTTCCCCCACCCTCACTAAACTTAATAATAAATGCTGGCATATCCAGT 89484487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9204 TCCCTCACTAACCTTCCCCCACCCTCACTAAACTTAATAATAAATGCTGGCATATCCAGT 9263

 89484488 GCATTGGCAGCACCACGGGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGGACCCAGCTTTCACTATC 89484547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9264 GCATTGGCAGCACCACGGGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGGACCCAGCTTTCACTATC 9323

 89484548 TTGTGTGTATCTATTATTTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGAACAAAGAGAGAGCCCCG 89484607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9324 TTGTGTGTATCTATTATTTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGAACAAAGAGAGAGCCCCG 9383

 89484608 TTGCATTGCAG 89484618
          |||||||||||
     9384 TTGCATTGCAG 9394

Alignment time is 12.4016 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    7896] =>      7896 nucs 'mol-32-2fd8-033045_7896'

Score:        7831
Aligned:      7897        nucs
Identic:      7891 (100%) nucs =>      3216 (100%)      4675 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89472592,89475807] EXCISED REGION [89475809,89480489]
 second seq =>  [       1,    3216] EXCISED REGION [    3217,    7896]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89475808,89475808]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>        12 nucs [89479063,89479074]
 second seq =>        12 nucs [6470,6481]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [89475808,89475822] to [89475809,89475823]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89472592 ACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGT 89472651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGT 60

 89472652 CTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCA 89472711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCA 120

 89472712 TAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCAC 89472771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCAC 180

 89472772 ATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATT 89472831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATT 240

 89472832 TGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATA 89472891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATA 300

 89472892 AGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTA 89472951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTA 360

 89472952 TCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAAT 89473011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAAT 420

 89473012 GGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCC 89473071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCC 480

 89473072 ATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTC 89473131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTC 540

 89473132 CTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCC 89473191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCC 600

 89473192 TCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGA 89473251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGA 660

 89473252 AAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCA 89473311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCA 720

 89473312 AGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTA 89473371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTA 780

 89473372 TGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATA 89473431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATA 840

 89473432 TATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGG 89473491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGG 900

 89473492 GTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAAT 89473551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAAT 960

 89473552 GGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCA 89473611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCA 1020

 89473612 TTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTAT 89473671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTAT 1080

 89473672 AGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGA 89473731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGA 1140

 89473732 GTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATT 89473791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATT 1200

 89473792 ATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCAT 89473851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCAT 1260

 89473852 TATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGA 89473911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGA 1320

 89473912 GATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTA 89473971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTA 1380

 89473972 AGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGA 89474031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGA 1440

 89474032 CTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCAC 89474091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCAC 1500

 89474092 AGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGC 89474151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGC 1560

 89474152 TCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATG 89474211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATG 1620

 89474212 GATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGT 89474271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGT 1680

 89474272 TATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCT 89474331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCT 1740

 89474332 TCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACA 89474391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACA 1800

 89474392 GCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTT 89474451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTT 1860

 89474452 TAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACA 89474511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACA 1920

 89474512 AGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTG 89474571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTG 1980

 89474572 ATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCT 89474631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCT 2040

 89474632 GAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCA 89474691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCA 2100

 89474692 TCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCT 89474751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCT 2160

 89474752 GCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTT 89474811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTT 2220

 89474812 TTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCAT 89474871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCAT 2280

 89474872 TCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGAT 89474931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGAT 2340

 89474932 GACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAA 89474991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAA 2400

 89474992 ATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATC 89475051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATC 2460

 89475052 TGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTC 89475111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTC 2520

 89475112 TGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTC 89475171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTC 2580

 89475172 TTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTT 89475231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTT 2640

 89475232 TCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGC 89475291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGC 2700

 89475292 CTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGAT 89475351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGAT 2760

 89475352 GACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCC 89475411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCC 2820

 89475412 CTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTG 89475471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTG 2880

 89475472 ACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAA 89475531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAA 2940

 89475532 GAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACA 89475591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACA 3000

 89475592 TTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAA 89475651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAA 3060

 89475652 TTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCC 89475711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCC 3120

 89475712 AGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAA 89475771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAA 3180

 89475772 TAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAA 89475807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAA 3216

EXCISED REGION

 89475809 TTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTG 89475868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 TTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTG 3276

 89475869 ATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 89475928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 ATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 3336

 89475929 TGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTA 89475988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 TGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTA 3396

 89475989 GAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCC 89476048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 GAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCC 3456

 89476049 TGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTA 89476108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 TGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTA 3516

 89476109 ACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAAT 89476168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 ACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAAT 3576

 89476169 CTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCT 89476228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 CTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCT 3636

 89476229 GGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGT 89476288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 GGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGT 3696

 89476289 TTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTG 89476348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 TTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTG 3756

 89476349 CCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTG 89476408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 CCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTG 3816

 89476409 ATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGA 89476468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 ATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGA 3876

 89476469 AAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTT 89476528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 AAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTT 3936

 89476529 GGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCT 89476588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 GGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCT 3996

 89476589 GTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAA 89476648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 GTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAA 4056

 89476649 AGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGAC 89476708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 AGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGAC 4116

 89476709 TGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTAC 89476768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 TGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTAC 4176

 89476769 AAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGA 89476828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 AAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGA 4236

 89476829 GTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAA 89476888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 GTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAA 4296

 89476889 CAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGA 89476948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 CAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGA 4356

 89476949 CCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACA 89477008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 CCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACA 4416

 89477009 GCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATA 89477068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 GCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATA 4476

 89477069 TGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTG 89477128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 TGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTG 4536

 89477129 CATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCC 89477188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 CATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCC 4596

 89477189 CTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTT 89477248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 CTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTT 4656

 89477249 TAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAAC 89477308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 TAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAAC 4716

 89477309 TAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCA 89477368
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 TGGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCA 4776

 89477369 TTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTA 89477428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 TTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTA 4836

 89477429 CCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTT 89477488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 CCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTT 4896

 89477489 CAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGG 89477548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 CAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGG 4956

 89477549 GCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGG 89477608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 GCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGG 5016

 89477609 CTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTC 89477668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 CTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTC 5076

 89477669 TGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAA 89477728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5077 TGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAA 5136

 89477729 TGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAAT 89477788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 TGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAAT 5196

 89477789 TTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAA 89477848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 TTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAA 5256

 89477849 TGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGAT 89477908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5257 TGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGAT 5316

 89477909 CCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCC 89477968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5317 CCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCC 5376

 89477969 TGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCAT 89478028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5377 TGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCAT 5436

 89478029 AGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTA 89478088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5437 AGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTA 5496

 89478089 TGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAG 89478148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5497 TGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAG 5556

 89478149 CATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGC 89478208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5557 CATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGC 5616

 89478209 TAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTA 89478268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5617 TAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTA 5676

 89478269 ATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGC 89478328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5677 ATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGC 5736

 89478329 TACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTT 89478388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5737 TACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTT 5796

 89478389 TCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAAT 89478448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5797 TCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAAT 5856

 89478449 GTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGA 89478508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5857 GTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGA 5916

 89478509 TACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCT 89478568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5917 TACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCT 5976

 89478569 GGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTC 89478628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5977 GGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTC 6036

 89478629 TCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTTAT 89478688
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     6037 TCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT-T 6095

 89478689 TTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCT 89478748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6096 TTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCT 6155

 89478749 GGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCA 89478808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6156 GGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCA 6215

 89478809 TCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTACG 89478868
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     6216 TCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTACG 6275

 89478869 AGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTA 89478928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6276 AGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTA 6335

 89478929 GGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTT 89478988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6336 GGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTT 6395

 89478989 CTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTT 89479048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6396 CTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTT 6455

 89479049 TGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGT 89479108
          ||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6456 TGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGT 6515

 89479109 ACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAAT 89479168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6516 ACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAAT 6575

 89479169 AGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTA 89479228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6576 AGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTA 6635

 89479229 TTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAA 89479288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6636 TTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAA 6695

 89479289 AAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGC 89479348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6696 AAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGC 6755

 89479349 AGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAAT 89479408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6756 AGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAAT 6815

 89479409 ATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGAT 89479468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6816 ATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGAT 6875

 89479469 AAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAAC 89479528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6876 AAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAAC 6935

 89479529 ACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTC 89479588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6936 ACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTC 6995

 89479589 CTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGA 89479648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6996 CTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGA 7055

 89479649 ATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAA 89479708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7056 ATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAA 7115

 89479709 AAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTACCTT 89479768
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     7116 AAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTACCTT 7175

 89479769 GCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTT 89479828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7176 GCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTT 7235

 89479829 CCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGT 89479888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7236 CCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGT 7295

 89479889 CAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCA 89479948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7296 CAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCA 7355

 89479949 GCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCA 89480008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7356 GCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCA 7415

 89480009 TCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTG 89480068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7416 TCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTG 7475

 89480069 TCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCT 89480128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7476 TCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCT 7535

 89480129 CCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGT 89480188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7536 CCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGT 7595

 89480189 CCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCT 89480248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7596 CCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCT 7655

 89480249 GCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGG 89480308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7656 GCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGG 7715

 89480309 TGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGA 89480368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7716 TGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGA 7775

 89480369 GCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTTA 89480428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7776 GCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTTA 7835

 89480429 GAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTGT 89480488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7836 GAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTGT 7895

 89480489 T 89480489
          |
     7896 T 7896

Alignment time is 10.6505 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2811] =>      2811 nucs 'mol-32-2fe3-060118_2811'

Score:        2767
Aligned:      2811        nucs
Identic:      2807 (100%) nucs =>       124 (100%)      2683 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89478563,89478686] EXCISED REGION [89478688,89481374]
 second seq =>  [       1,     124] EXCISED REGION [     125,    2811]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89478687,89478687]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>        12 nucs [89479063,89479074]
 second seq =>        12 nucs [500,511]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [89478684,89478686] to [89478688,89478690]
 second seq =>         3 nucs [122,124] to [125,127]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89478563 CAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAG 89478622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAG 60

 89478623 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTC 89478682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTC 120

 89478683 ATTT 89478686
          ||||
      121 ATTT 124

EXCISED REGION

 89478688 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 89478747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      125 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 184

 89478748 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACC 89478807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      185 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACC 244

 89478808 ATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTAC 89478867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      245 ATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTAC 304

 89478868 GAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGT 89478927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      305 GAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGT 364

 89478928 AGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTT 89478987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      365 AGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTT 424

 89478988 TCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCT 89479047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      425 TCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCT 484

 89479048 TTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGG 89479107
          |||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 TTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGG 544

 89479108 TACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAA 89479167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 TACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAA 604

 89479168 TAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTT 89479227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 TAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTT 664

 89479228 ATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCA 89479287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 ATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCA 724

 89479288 AAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTG 89479347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 AAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTG 784

 89479348 CAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAA 89479407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 CAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAA 844

 89479408 TATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGA 89479467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 TATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGA 904

 89479468 TAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAA 89479527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 TAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAA 964

 89479528 CACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATT 89479587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 CACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATT 1024

 89479588 CCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAG 89479647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 CCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAG 1084

 89479648 AATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAA 89479707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 AATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAA 1144

 89479708 AAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTACCT 89479767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1145 AAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTACCT 1204

 89479768 TGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCT 89479827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 TGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCT 1264

 89479828 TCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAG 89479887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 TCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAG 1324

 89479888 TCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTC 89479947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 TCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTC 1384

 89479948 AGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTC 89480007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 AGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTC 1444

 89480008 ATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGT 89480067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 ATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGT 1504

 89480068 GTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTC 89480127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 GTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTC 1564

 89480128 TCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTG 89480187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 TCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTG 1624

 89480188 TCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCC 89480247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 TCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCC 1684

 89480248 TGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGG 89480307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 TGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGG 1744

 89480308 GTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGG 89480367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 GTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGG 1804

 89480368 AGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTT 89480427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 AGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTT 1864

 89480428 AGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTG 89480487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 AGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTG 1924

 89480488 TTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTC 89480547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 TTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTC 1984

 89480548 TCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATG 89480607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 TCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATG 2044

 89480608 GGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTT 89480667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 GGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTT 2104

 89480668 TGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAAC 89480727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 TGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAAC 2164

 89480728 TCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTA 89480787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 TCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTA 2224

 89480788 GGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATG 89480847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 GGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATG 2284

 89480848 TACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTA 89480907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 TACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTA 2344

 89480908 AATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTT 89480967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 AATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTT 2404

 89480968 ACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTT 89481027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 ACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTT 2464

 89481028 TTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCC 89481087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 TTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCC 2524

 89481088 AGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTAC 89481147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 AGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTAC 2584

 89481148 TTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCA 89481207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 TTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCA 2644

 89481208 CAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACAT 89481267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 CAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACAT 2704

 89481268 AAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACT 89481327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 AAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACT 2764

 89481328 GAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGC 89481374
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 GAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGC 2811

Alignment time is 4.29302 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    7417] =>      7417 nucs 'mol-32-2ff9-217342_7417'

Score:        7347
Aligned:      7413        nucs
Identic:      7407 (100%) nucs =>      6394 (100%)      1013 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475022,89481421] EXCISED REGION [89481428,89482440]
 second seq =>  [       1,    6398] EXCISED REGION [    6405,    7417]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [89481422,89481427]
 second seq =>         6 nucs [6399,6404]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89481421,89481421] to [89481427,89481427]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89481422,89481422] to [89481427,89481427]
 second seq =>         0 nucs

 89475022 ATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAAT 89475081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAAT 60

 89475082 CTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTC 89475141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTC 120

 89475142 CTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGT 89475201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGT 180

 89475202 GAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTC 89475261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTC 240

 89475262 TGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCC 89475321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCC 300

 89475322 AGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAG 89475381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAG 360

 89475382 GATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATT 89475441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATT 420

 89475442 TGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGC 89475501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGC 480

 89475502 AAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGA 89475561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGA 540

 89475562 GGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTT 89475621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTT 600

 89475622 TAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGG 89475681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGG 660

 89475682 GTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTG 89475741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTG 720

 89475742 GTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATT 89475801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATT 780

 89475802 AACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAG 89475861
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACTAATTTTTTTTTTTTTTT-GAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAG 839

 89475862 TGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTC 89475921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTC 899

 89475922 AGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATT 89475981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATT 959

 89475982 TTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTG 89476041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTG 1019

 89476042 ATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGC 89476101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGC 1079

 89476102 CTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAG 89476161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAG 1139

 89476162 GTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTG 89476221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTG 1199

 89476222 AGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGA 89476281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGA 1259

 89476282 GACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCT 89476341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCT 1319

 89476342 GCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACT 89476401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACT 1379

 89476402 CTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTAT 89476461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTAT 1439

 89476462 TGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGG 89476521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGG 1499

 89476522 TCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTG 89476581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTG 1559

 89476582 GTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTC 89476641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTC 1619

 89476642 TGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCT 89476701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCT 1679

 89476702 AGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTC 89476761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTC 1739

 89476762 TGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGT 89476821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGT 1799

 89476822 AAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGA 89476881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGA 1859

 89476882 AAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTA 89476941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTA 1919

 89476942 CTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAG 89477001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAG 1979

 89477002 ATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGA 89477061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGA 2039

 89477062 TTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATT 89477121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATT 2099

 89477122 TTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATT 89477181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATT 2159

 89477182 AGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCA 89477241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCA 2219

 89477242 ATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTAC 89477301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 ATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTAC 2279

 89477302 CAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACC 89477361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACC 2339

 89477362 AATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGA 89477421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGA 2399

 89477422 AAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATA 89477481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATA 2459

 89477482 TAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTT 89477541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTT 2519

 89477542 TCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGC 89477601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGC 2579

 89477602 ACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGA 89477661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 ACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGA 2639

 89477662 TCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAA 89477721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAA 2699

 89477722 GAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACA 89477781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACA 2759

 89477782 TGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTG 89477841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTG 2819

 89477842 CTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGG 89477901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGG 2879

 89477902 GTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGAC 89477961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 GTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGAC 2939

 89477962 CTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGG 89478021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGG 2999

 89478022 AACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCA 89478081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 AACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCA 3059

 89478082 ATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTT 89478141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 ATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTT 3119

 89478142 AGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTC 89478201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 AGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTC 3179

 89478202 AGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTG 89478261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 AGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTG 3239

 89478262 ACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTC 89478321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 ACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTC 3299

 89478322 TAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAA 89478381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAA 3359

 89478382 ACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTAT 89478441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 ACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTAT 3419

 89478442 TAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCA 89478501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCA 3479

 89478502 ATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCAC 89478561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 ATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCAC 3539

 89478562 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAA 89478621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAA 3599

 89478622 GCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCT 89478681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 GCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCT 3659

 89478682 CATTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCA 89478741
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 CATTT-TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCA 3718

 89478742 AACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCA 89478801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 AACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCA 3778

 89478802 TGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGG 89478861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3779 TGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGG 3838

 89478862 ACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAA 89478921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 ACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAA 3898

 89478922 AGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTT 89478981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 AGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTT 3958

 89478982 GTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATT 89479041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATT 4018

 89479042 TTTTCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTT 89479101
          |||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4019 TTTTCTTTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTT 4078

 89479102 GACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGC 89479161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 GACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGC 4138

 89479162 GTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAAC 89479221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 GTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAAC 4198

 89479222 TTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTC 89479281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 TTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTC 4258

 89479282 TTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTT 89479341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTT 4318

 89479342 AGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTA 89479401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 AGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTA 4378

 89479402 AGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATA 89479461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 AGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATA 4438

 89479462 AGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATT 89479521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 AGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATT 4498

 89479522 TTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCA 89479581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 TTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCA 4558

 89479582 TTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATT 89479641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 TTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATT 4618

 89479642 CTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTA 89479701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 CTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTA 4678

 89479702 AACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTG 89479761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4679 AACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTG 4738

 89479762 TTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCA 89479821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 TTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCA 4798

 89479822 TCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTC 89479881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 TCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTC 4858

 89479882 ACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGA 89479941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 ACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGA 4918

 89479942 TGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGG 89480001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 TGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGG 4978

 89480002 AACCTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAAC 89480061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 AACCTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAAC 5038

 89480062 CTAAGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTT 89480121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 CTAAGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTT 5098

 89480122 GTTTTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATA 89480181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 GTTTTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATA 5158

 89480182 CAGGTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCC 89480241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 CAGGTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCC 5218

 89480242 ATAGCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACG 89480301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 ATAGCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACG 5278

 89480302 GCCAGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGA 89480361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 GCCAGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGA 5338

 89480362 GTCAGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCA 89480421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 GTCAGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCA 5398

 89480422 TAAGTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAA 89480481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 TAAGTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAA 5458

 89480482 TGATTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACAC 89480541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 TGATTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACAC 5518

 89480542 TGATTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGG 89480601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 TGATTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGG 5578

 89480602 TTAATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAA 89480661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 TTAATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAA 5638

 89480662 GTTCTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGT 89480721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 GTTCTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGT 5698

 89480722 GTTAACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCT 89480781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 GTTAACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCT 5758

 89480782 TTGCTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTAT 89480841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 TTGCTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTAT 5818

 89480842 GACATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAA 89480901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 GACATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAA 5878

 89480902 AAACTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTG 89480961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 AAACTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTG 5938

 89480962 ACCCTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCT 89481021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 ACCCTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCT 5998

 89481022 GGCTTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTG 89481081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 GGCTTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTG 6058

 89481082 GAGCCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGC 89481141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 GAGCCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGC 6118

 89481142 AGGTACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCA 89481201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 AGGTACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCA 6178

 89481202 AAACCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCA 89481261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 AAACCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCA 6238

 89481262 GTACATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAA 89481321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 GTACATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAA 6298

 89481322 AAAACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATA 89481381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 AAAACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATA 6358

 89481382 GCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCT 89481421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 GCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCT 6398

EXCISED REGION

 89481428 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAA 89481487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6405 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAA 6464

 89481488 CAAAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAAT 89481547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6465 CAAAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAAT 6524

 89481548 TTTCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAG 89481607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6525 TTTCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAG 6584

 89481608 TACTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTG 89481667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6585 TACTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTG 6644

 89481668 GAAAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTA 89481727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6645 GAAAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTA 6704

 89481728 AATATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAA 89481787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6705 AATATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAA 6764

 89481788 ATTAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAA 89481847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6765 ATTAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAA 6824

 89481848 ATTTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAAT 89481907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6825 ATTTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAAT 6884

 89481908 TGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGA 89481967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6885 TGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGA 6944

 89481968 TCACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAA 89482027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6945 TCACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAA 7004

 89482028 ACTACACACACACACACACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCA 89482087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7005 ACTACACACACACACACACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCA 7064

 89482088 GCTACTCGGGTGGCTGAGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 89482147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7065 GCTACTCGGGTGGCTGAGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 7124

 89482148 GCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAAC 89482207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7125 GCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAAC 7184

 89482208 AAACAAAAAACCCAAAAAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACA 89482267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7185 AAACAAAAAACCCAAAAAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACA 7244

 89482268 AAATTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACT 89482327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7245 AAATTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACT 7304

 89482328 GATCACTGTAGTCTTGACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTA 89482387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7305 GATCACTGTAGTCTTGACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTA 7364

 89482388 GCTGAGACTACAGGCACGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGT 89482440
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7365 GCTGAGACTACAGGCACGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGT 7417

Alignment time is 10.0044 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    9610] =>      9610 nucs 'mol-32-3025-109594_9610'

Score:        9475
Aligned:      9607        nucs
Identic:      9595 (100%) nucs =>      4257 (100%)      5338 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89477160,89481421] EXCISED REGION [89481429,89486773]
 second seq =>  [       1,    4261] EXCISED REGION [    4267,    9610]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [89481422,89481428]
 second seq =>         5 nucs [4262,4266]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4261,4261] to [4266,4266]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89477160 AGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGG 89477219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGG 60

 89477220 GAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTT 89477279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTT 120

 89477280 TTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAAT 89477339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAAT 180

 89477340 TATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCC 89477399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCC 240

 89477400 AAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCAC 89477459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCAC 300

 89477460 ATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAG 89477519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAG 360

 89477520 GTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTC 89477579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTC 420

 89477580 ATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGAC 89477639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGAC 480

 89477640 TGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAG 89477699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAG 540

 89477700 GCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCT 89477759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCT 600

 89477760 CTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTC 89477819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTC 660

 89477820 CTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTAC 89477879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTAC 720

 89477880 TGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTT 89477939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTT 780

 89477940 GAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAA 89477999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAA 840

 89478000 CCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCT 89478059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCT 900

 89478060 TATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGG 89478119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGG 960

 89478120 AGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGG 89478179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGG 1020

 89478180 AAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTT 89478239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTT 1080

 89478240 TGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTA 89478299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTA 1140

 89478300 CATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTAC 89478359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTAC 1200

 89478360 TGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAG 89478419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAG 1260

 89478420 AAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGT 89478479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGT 1320

 89478480 AGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCA 89478539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCA 1380

 89478540 TATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGC 89478599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGC 1440

 89478600 AACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATT 89478659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATT 1500

 89478660 ACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGC 89478719
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT-TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGC 1559

 89478720 CATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCC 89478779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCC 1619

 89478780 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAAT 89478839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAAT 1679

 89478840 GAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGA 89478899
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGA 1739

 89478900 GTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAAT 89478959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAAT 1799

 89478960 TCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATG 89479019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATG 1859

 89479020 GGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGC 89479079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
     1860 GGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGC 1919

 89479080 AGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCT 89479139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCT 1979

 89479140 AATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTG 89479199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 AATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTG 2039

 89479200 GTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATG 89479259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATG 2099

 89479260 TAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGC 89479319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGC 2159

 89479320 AGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTT 89479379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTT 2219

 89479380 CATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAAT 89479439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAAT 2279

 89479440 ACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAA 89479499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 ACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAA 2339

 89479500 ATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTAT 89479559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 ATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTAT 2399

 89479560 TAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTA 89479619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTA 2459

 89479620 TTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAA 89479679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAA 2519

 89479680 TGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTC 89479739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTC 2579

 89479740 ATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTC 89479799
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 ATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTC 2639

 89479800 ATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCA 89479859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 ATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCA 2699

 89479860 CACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGG 89479919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGG 2759

 89479920 TGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAG 89479979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAG 2819

 89479980 GAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCT 89480039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCT 2879

 89480040 TCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTC 89480099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTC 2939

 89480100 CTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAG 89480159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAG 2999

 89480160 TCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCAC 89480219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCAC 3059

 89480220 AAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACAC 89480279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACAC 3119

 89480280 GAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACC 89480339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACC 3179

 89480340 CTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAG 89480399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAG 3239

 89480400 TGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAA 89480459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAA 3299

 89480460 AAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTG 89480519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 AAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTG 3359

 89480520 ATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACA 89480579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 ATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACA 3419

 89480580 ATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACT 89480639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 ATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACT 3479

 89480640 TGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATT 89480699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATT 3539

 89480700 TGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAAT 89480759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAAT 3599

 89480760 ACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTC 89480819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 ACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTC 3659

 89480820 TGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAA 89480879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAA 3719

 89480880 ATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGC 89480939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 ATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGC 3779

 89480940 TTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTC 89480999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTC 3839

 89481000 AAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCC 89481059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 AAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCC 3899

 89481060 TTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAA 89481119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAA 3959

 89481120 GAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGA 89481179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 GAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGA 4019

 89481180 TTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAA 89481239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 TTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAA 4079

 89481240 AATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACA 89481299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 AATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACA 4139

 89481300 ATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCG 89481359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 ATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCG 4199

 89481360 GAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACT 89481419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 GAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACT 4259

 89481420 CT 89481421
          ||
     4260 CT 4261

EXCISED REGION

 89481429 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAAC 89481488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAAC 4326

 89481489 AAAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATT 89481548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 AAAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATT 4386

 89481549 TTCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGT 89481608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 TTCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGT 4446

 89481609 ACTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGG 89481668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 ACTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGG 4506

 89481669 AAAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAA 89481728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 AAAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAA 4566

 89481729 ATATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAA 89481788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 ATATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAA 4626

 89481789 TTAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAA 89481848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 TTAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAA 4686

 89481849 TTTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATT 89481908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 TTTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATT 4746

 89481909 GGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGAT 89481968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 GGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGAT 4806

 89481969 CACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAA 89482028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 CACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAA 4866

 89482029 CTACACACACACACACACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAG 89482088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 CTACACACACACACACACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAG 4926

 89482089 CTACTCGGGTGGCTGAGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 89482148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 CTACTCGGGTGGCTGAGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 4986

 89482149 CCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACA 89482208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 CCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACA 5046

 89482209 AACAAAAAACCCAAAAAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAA 89482268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 AACAAAAAACCCAAAAAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAA 5106

 89482269 AATTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTG 89482328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 AATTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTG 5166

 89482329 ATCACTGTAGTCTTGACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAG 89482388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 ATCACTGTAGTCTTGACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAG 5226

 89482389 CTGAGACTACAGGCACGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGG 89482448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 CTGAGACTACAGGCACGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGG 5286

 89482449 GGTTTCCCCGTGTTGTCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCT 89482508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 GGTTTCCCCGTGTTGTCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCT 5346

 89482509 CAGCTTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTA 89482568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 CAGCTTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTA 5406

 89482569 AAAGAAATTAAGGAAGAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGAT 89482628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 AAAGAAATTAAGGAAGAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGAT 5466

 89482629 TCAATGCAATCCCTATCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATAT 89482688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 TCAATGCAATCCCTATCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATAT 5526

 89482689 CCACACTAACTTTCATATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAA 89482748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 CCACACTAACTTTCATATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAA 5586

 89482749 AGGAAGAAGAAAGTCAGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGG 89482808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 AGGAAGAAGAAAGTCAGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGG 5646

 89482809 ATAATCAACACAGTTTGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGA 89482868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 ATAATCAACACAGTTTGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGA 5706

 89482869 GAGCCTAGAAATGAACTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAAT 89482928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 GAGCCTAGAAATGAACTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAAT 5766

 89482929 CATTCAACGCAGAAAGAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCAC 89482988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 CATTCAACGCAGAAAGAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCAC 5826

 89482989 ATGCTCACATGCCAAAAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACGT 89483048
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 ATGCTCACATGCC-AAAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACGT 5885

 89483049 AACTCAAAATGGATCAAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGAA 89483108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5886 AACTCAAAATGGATCAAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGAA 5945

 89483109 AACAAAGGGGAAAAACAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAATG 89483168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5946 AACAAAGGGGAAAAACAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAATG 6005

 89483169 AAAAACTTTTGTGCATCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATGG 89483228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6006 AAAAACTTTTGTGCATCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATGG 6065

 89483229 AAGAAAACATTTGCTAAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGAA 89483288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6066 AAGAAAACATTTGCTAAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGAA 6125

 89483289 TTCCTACAATGCAACACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTCT 89483348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6126 TTCCTACAATGCAACACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTCT 6185

 89483349 CTAAAGAATGGCCAATAAGCACCTGAAAAGATGCTCAACATTACTAGTCATTAGGAAAAT 89483408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6186 CTAAAGAATGGCCAATAAGCACCTGAAAAGATGCTCAATATTACTAGTCATTAGGAAAAT 6245

 89483409 GCAAATTAAAGCCATAGTGAGATACTACTTCACATCCATTAGTATGGTGACTATCAAAAA 89483468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6246 GCAAATTAAAGCCATAGTGAGATACTACTTCACATCCATTAGTATGGTGACTATCAAAAA 6305

 89483469 AAATTGAAAAGGGCTGGGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTG 89483528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6306 AAATTGAAAAGGGCTGGGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTG 6365

 89483529 AGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCAAATATGGAGAAACC 89483588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6366 AGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCAAATATGGAGAAACC 6425

 89483589 CCATTTACACTAAAAATACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCAC 89483648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6426 CCATTTACACTAAAAATACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCAC 6485

 89483649 CTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 89483708
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6486 CTACTTGGGAGGCTGAGGTAGAAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 6545

 89483709 CTGGGGTCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTGTGTCTCAAAAAAA 89483768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6546 CTGGGGTCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTGTGTCTCAAAAAAA 6605

 89483769 AAAAAAATTAAAATAACTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATTGCTATGGAATAAAAGATG 89483828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6606 AAAAAAATTAAAATAACTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATTGCTATGGAATAAAAGATG 6665

 89483829 AAATGCTCCTGATTATTGTAAATACAAAATTGCATGCAGGATTGTGCAAAGACAGTGCCA 89483888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     6666 AAATGCTCCTGATTATTGTAAATACAAAATTGCATGCAGGATTGTGCAAAGACAATGCCA 6725

 89483889 GGTTGGACTGCCAGAATGAGCCAACGGGACGTGATGTGCTTCCCCCTGCAGAGAGCCTAT 89483948
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6726 GGTTGGACTGCCAGAATGAGCCAACGGCACGTGATGTGCTTCCCCCTGCAGAGAGCCTAT 6785

 89483949 GAATGGATGTGCAGTCAGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTCCTATCCCAGAAAAGCAGA 89484008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6786 GAATGGATGTGCAGTCAGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTCCTATCCCAGAAAAGCAGA 6845

 89484009 TGTTCATAGCTCTGGGAATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGAGGGGGCACCTGTCCATGT 89484068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6846 TGTTCATAGCTCTGGGAATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGAGGGGGCACCTGTCCATGT 6905

 89484069 GGATAAGATAGGGCCATAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTCTTCTAGGCCTCTTTAGGG 89484128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6906 GGATAAGATAGGGCCATAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTCTTCTAGGCCTCTTTAGGG 6965

 89484129 TTAAGGCATACTCCCTTCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTTGTCTAGCTTCACGTCTTG 89484188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6966 TTAAGGCATACTCCCTTCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTTGTCTAGCTTCACGTCTTG 7025

 89484189 TTTCTATGGATTGTTTGTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTACTGCTGATTAATATCTTG 89484248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7026 TTTCTATGGATTGTTTGTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTACTGCTGATTAATATCTTG 7085

 89484249 CTAATCATAGGTTATGAAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCTCTGTTAGAAATTACTGAT 89484308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7086 CTAATCATAGGTTATGAAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCTCTGTTAGAAATTACTGAT 7145

 89484309 GCACACACTATATTGTAAATTCTTATCTCTGTATACTGTACTTCTGCATACAGATGTTAT 89484368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7146 GCACACACTATATTGTAAATTCTTATCTCTGTATACTGTACTTCTGCATACAGATGTTAT 7205

 89484369 GTTAAAGAATTACTTCATCCCCATGTGACCATCTCACCTCATAATCAAACGACCCTAAAT 89484428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7206 GTTAAAGAATTACTTCATCCCCATGTGACCATCTCACCTCATAATCAAACGACCCTAAAT 7265

 89484429 CCCTCACTAACCTTCCCCCACCCTCACTAAACTTAATAATAAATGCTGGCATATCCAGTG 89484488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7266 CCCTCACTAACCTTCCCCCACCCTCACTAAACTTAATAATAAATGCTGGCATATCCAGTG 7325

 89484489 CATTGGCAGCACCACGGGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGGACCCAGCTTTCACTATCT 89484548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7326 CATTGGCAGCACCACGGGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGGACCCAGCTTTCACTATCT 7385

 89484549 TGTGTGTATCTATTATTTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGAACAAAGAGAGAGCCCCGT 89484608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7386 TGTGTGTATCTATTATTTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGAACAAAGAGAGAGCCCCGT 7445

 89484609 TGCATTGCAGGCTGCTGGCCAGATCCCGCAATAAATAACAAATGTTGGTGAATATGAAGA 89484668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7446 TGCATTGCAGGCTGCTGGCCAGATCCCGCAATAAATAACAAATGTTGGTGAATATGAAGA 7505

 89484669 GAAATTAGAACCCTTGTGCATTTCTGTTGGGAATGCTAAATGGTGCAGTCACTGTGGAAA 89484728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7506 GAAATTAGAACCCTTGTGCATTTCTGTTGGGAATGCTAAATGGTGCAGTCACTGTGGAAA 7565

 89484729 ATGATACAGCAATTCCTTAAAAAATTTAACATGGAATGACTATATGAGCCATCAGTTCCA 89484788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7566 ATGATACAGCAATTCCTTAAAAAATTTAACATGGAATGACTATATGAGCCATCAGTTCCA 7625

 89484789 CTTCTGGGTGTATACTGAAAAGGAGTGAAAGCAGGGACTCGAACAGATATTCAGACACCC 89484848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7626 CTTCTGGGTGTATACTGAAAAGGAGTGAAAGCAGGGACTCGAACAGATATTCAGACACCC 7685

 89484849 ATGATCCTATCAGCATTATTTGTAATAGCCAAAAGGTGTAAGCAACCCAAGTGTCAACTG 89484908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     7686 ATGATCCTATCAGCATTATTTGTAATAGCCAAAAGGTGTAAGCAACACAAGTGTCAACTG 7745

 89484909 ACAAGCGAACAGATAAATTAGTATACACATATAATTACTTAGCCTTGAAAAGGAAGAATT 89484968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7746 ACAAGCGAACAGATAAATTAGTATACACATATAATTACTTAGCCTTGAAAAGGAAGAATT 7805

 89484969 TTTTATTTCTTTATTTATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTATGCCCAGGCTGGAGTGCAA 89485028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7806 TTTTATTTCTTTATTTATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTATGCCCAGGCTGGAGTGCAA 7865

 89485029 AGGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCTGTTTCCCAGATTCAAGTGATTCTCCTGCCCC 89485088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7866 AGGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCTGTTTCCCAGATTCAAGTGATTCTCCTGCCCC 7925

 89485089 AGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTATTT 89485148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7926 AGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTATTT 7985

 89485149 TTAGTAAAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGT 89485208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7986 TTAGTAAAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGT 8045

 89485209 GATCTGCCTGCATTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCCATGAGTGCCCAGCCAAAA 89485268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8046 GATCTGCCTGCATTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCCATGAGTGCCCAGCCAAAA 8105

 89485269 AGGAAAAATTTTGACACATGCTACCACACTGAACCTTGAAGACATTATGTGAATTAGAAT 89485328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8106 AGGAAAAATTTTGACACATGCTACCACACTGAACCTTGAAGACATTATGTGAATTAGAAT 8165

 89485329 AAGCCAGTCACCAAAGGACAAATATTGAATGACTCCACTTATATAACATTCCTAGAGTAG 89485388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8166 AAGCCAGTCACCAAAGGACAAATATTGAATGACTCCACTTATATAACATTCCTAGAGTAG 8225

 89485389 TCAAATTAATAGAGATGGAATGTAGAATTGTGGCAGGAGATGGGTGTAGGTGGGGCTTTT 89485448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8226 TCAAATTAATAGAGATGGAATGTAGAATTGTGGCAGGAGATGGGTGTAGGTGGGGCTTTT 8285

 89485449 GTTTAATTGGCACAGAGTTTCTTTTGGGGAAGATTAAAAAGTTCTGGAAATAGATGGTAG 89485508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8286 GTTTAATTGGCACAGAGTTTCTTTTGGGGAAGATTAAAAAGTTCTGGAAATAGATGGTAG 8345

 89485509 TGATGGTTGCACAACAATTTGAATTTAATTAATACCACAGAACTACATACTTAATAATGG 89485568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8346 TGATGGTTGCACAACAATTTGAATTTAATTAATACCACAGAACTACATACTTAATAATGG 8405

 89485569 TTACAAGGATAAATTTTATGTTTATATATTTTTTAAAACAATAAACAAGAAAATCCAATA 89485628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8406 TTACAAGGATAAATTTTATGTTTATATATTTTTTAAAACAATAAACAAGAAAATCCAATA 8465

 89485629 CAGACTGAAACATTTTTTCAACCTTAAAGATCAGTGTAAACTTGCTGTTACTATGTGAAC 89485688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8466 CAGACTGAAACATTTTTTCAACCTTAAAGATCAGTGTAAACTTGCTGTTACTATGTGAAC 8525

 89485689 ATGGGCAGGCGATCTCTTGAGCCCAGGAGCTTGAGACCTGCATGGGCAACATGATGAAAC 89485748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8526 ATGGGCAGGCGATCTCTTGAGCCCAGGAGCTTGAGACCTGCATGGGCAACATGATGAAAC 8585

 89485749 CCTGTGTCTACCAAAAATACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGCATCTGTAGTCCTAC 89485808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8586 CCTGTGTCTACCAAAAATACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGCATCTGTAGTCCTAC 8645

 89485809 CTACTCAGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGACTGTGGTGAG 89485868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8646 CTACTCAGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGACTGTGGTGAG 8705

 89485869 CTGAGATCTTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGGAAAGAGCAAGACCTTGTCTCAAGAAAAA 89485928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8706 CTGAGATCTTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGGAAAGAGCAAGACCTTGTCTCAAGAAAAA 8765

 89485929 AAAAGACTAGTCAAGTGCAGTCAGTAGTGAGAAGGGTGAGGAGAAAGAGTAGAACAAGGA 89485988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8766 AAAAGACTAGTCAAGTGCAGTCAGTAGTGAGAAGGGTGAGGAGAAAGAGTAGAACAAGGA 8825

 89485989 GTTCAACTGTAACTCATGGTGAACAGTCAATTGAGATAACTCACTACCCTCAGAACAGCT 89486048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     8826 GTTCAACTGTAACTCATGGTGAACAGTCAATTGAGATAACTCACTACCTTCAGAACAGCT 8885

 89486049 GTGAGCTGATGCTTATCCCCTAGAAGAGTGAAGATAAGGAGCCCAACTGTGAATGGAAAG 89486108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8886 GTGAGCTGATGCTTATCCCCTAGAAGAGTGAAGATAAGGAGCCCAACTGTGAATGGAAAG 8945

 89486109 TTAGCTTATTCCCAGTGCCAGCTTTCTCTCCTCACATCCTCATAATGGATGCTGACTGTG 89486168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8946 TTAGCTTATTCCCAGTGCCAGCTTTCTCTCCTCACATCCTCATAATGGATGCTGACTGTG 9005

 89486169 TTGGGGGACAGAAGGGACTTGGCAGAGCTTTGCTCATGCCACTCACCCTTATTCTTCCCA 89486228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9006 TTGGGGGACAGAAGGGACTTGGCAGAGCTTTGCTCATGCCACTCACCCTTATTCTTCCCA 9065

 89486229 GCTAGCTTGTTCATCAGGTAGGATTTTCCTGTGCGGTAGAGGCCCACAATTGCCACCACC 89486288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9066 GCTAGCTTGTTCATCAGGTAGGATTTTCCTGTGCGGTAGAGGCCCACAATTGCCACCACC 9125

 89486289 ACCACAGGCTGTGTAATGGCAGACAGGATTTTCAGAGCTTCTGGATTCGCCACCAGTTCC 89486348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9126 ACCACAGGCTGTGTAATGGCAGACAGGATTTTCAGAGCTTCTGGATTCGCCACCAGTTCC 9185

 89486349 CCATTAGTGTTCTCAATGAGGCACATTGGGCCTGTCATGTGGATCTCTGGAGCCATGTCC 89486408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9186 CCATTAGTGTTCTCAATGAGGCACATTGGGCCTGTCATGTGGATCTCTGGAGCCATGTCC 9245

 89486409 AGGGCATTGTTCTCTTGTCTGCAAGGGAAGAGTTGGAATGAATTAGAATTTCCAGTCTTT 89486468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9246 AGGGCATTGTTCTCTTGTCTGCAAGGGAAGAGTTGGAATGAATTAGAATTTCCAGTCTTT 9305

 89486469 TGCATTTAGAGGATAGAGTCACAGAATTCCCCAGGATGGCCAAAAGTTTTGTGTGTGTCA 89486528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9306 TGCATTTAGAGGATAGAGTCACAGAATTCCCCAGGATGGCCAAAAGTTTTGTGTGTGTCA 9365

 89486529 GTGAGAGAGATGAGGGAAAATGTGTATCATTTTAAAAAATTATGGAAGTATTATCATCAA 89486588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9366 GTGAGAGAGATGAGGGAAAATGTGTATCATTTTAAAAAATTATGGAAGTATTATCATCAA 9425

 89486589 ATTAAATATTGGTATGACAGTAACTTATCAACAGTCAACTACTCTTGCAACCTAGAACTT 89486648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9426 ATTAAATATTGGTATGACAGTAACTTATCAACAGTCAACTACTCTTGCAACCTAGAACTT 9485

 89486649 TCATTTAATTTATTATGGAAAAGCTTCCCTTGGATTCTCATTAAAAAATTTACACTAGAC 89486708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9486 TCATTTAATTTATTATGGAAAAGCTTCCCTTGGATTCTCATTAAAAAATTTACACTAGAC 9545

 89486709 AATAAATGGAAGATAAAATAGGATATAGAGAATTTTTTTTACATCCTGGCTATATGTAAG 89486768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9546 AATAAATGGAAGATAAAATAGGATATAGAGAATTTTTTTTACATCCTGGCTATATGTAAG 9605

 89486769 AAATT 89486773
          |||||
     9606 AAATT 9610

Alignment time is 12.75 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2904] =>      2904 nucs 'mol-32-3025-115843_2904'

Score:        2834
Aligned:      2889        nucs
Identic:      2884 (100%) nucs =>       126 (100%)      2758 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89478561,89478686] EXCISED REGION [89478688,89481450]
 second seq =>  [      17,     142] EXCISED REGION [     143,    2904]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89478687,89478687]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>        12 nucs [89479063,89479074]
 second seq =>        12 nucs [518,529]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [89478684,89478686] to [89478688,89478690]
 second seq =>         3 nucs [140,142] to [143,145]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89478561 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCA 89478620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       17 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCA 76

 89478621 AGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCC 89478680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       77 AGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCC 136

 89478681 TCATTT 89478686
          ||||||
      137 TCATTT 142

EXCISED REGION

 89478688 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 89478747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      143 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 202

 89478748 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACC 89478807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      203 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACC 262

 89478808 ATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTAC 89478867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      263 ATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTAC 322

 89478868 GAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGT 89478927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      323 GAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGT 382

 89478928 AGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTT 89478987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      383 AGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTT 442

 89478988 TCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCT 89479047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      443 TCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCT 502

 89479048 TTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGG 89479107
          |||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      503 TTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGG 562

 89479108 TACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAA 89479167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      563 TACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAA 622

 89479168 TAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTT 89479227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      623 TAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTT 682

 89479228 ATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCA 89479287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      683 ATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCA 742

 89479288 AAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTG 89479347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      743 AAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTG 802

 89479348 CAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAA 89479407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      803 CAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAA 862

 89479408 TATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGA 89479467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      863 TATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGA 922

 89479468 TAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAA 89479527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      923 TAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAA 982

 89479528 CACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATT 89479587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      983 CACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATT 1042

 89479588 CCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAG 89479647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1043 CCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAG 1102

 89479648 AATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAA 89479707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1103 AATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAA 1162

 89479708 AAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTACCT 89479767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1163 AAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTACCT 1222

 89479768 TGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCT 89479827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1223 TGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCT 1282

 89479828 TCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAG 89479887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1283 TCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAG 1342

 89479888 TCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTC 89479947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1343 TCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTC 1402

 89479948 AGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTC 89480007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 AGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTC 1462

 89480008 ATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGT 89480067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 ATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGT 1522

 89480068 GTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTC 89480127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 GTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTC 1582

 89480128 TCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTG 89480187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 TCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTG 1642

 89480188 TCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCC 89480247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 TCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCC 1702

 89480248 TGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGG 89480307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 TGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGG 1762

 89480308 GTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGG 89480367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 GTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGG 1822

 89480368 AGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTT 89480427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 AGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTT 1882

 89480428 AGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTG 89480487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 AGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTG 1942

 89480488 TTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTC 89480547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 TTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTC 2002

 89480548 TCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATG 89480607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 TCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATG 2062

 89480608 GGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTT 89480667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 GGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTT 2122

 89480668 TGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAAC 89480727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 TGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAAC 2182

 89480728 TCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTA 89480787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 TCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTA 2242

 89480788 GGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATG 89480847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 GGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATG 2302

 89480848 TACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTA 89480907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 TACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTA 2362

 89480908 AATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTT 89480967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 AATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTT 2422

 89480968 ACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTT 89481027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 ACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTT 2482

 89481028 TTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCC 89481087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 TTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCC 2542

 89481088 AGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTAC 89481147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 AGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTAC 2602

 89481148 TTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCA 89481207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 TTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCA 2662

 89481208 CAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACAT 89481267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 CAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACAT 2722

 89481268 AAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACT 89481327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 AAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACT 2782

 89481328 GAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCA 89481387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 GAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCA 2842

 89481388 CTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 89481447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     2843 CTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-TGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2901

 89481448 AAG 89481450
          |||
     2902 AAG 2904

Alignment time is 4.35681 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3004] =>      3004 nucs 'mol-32-303b-004433_3004'

Score:        2938
Aligned:      2971        nucs
Identic:      2968 (100%) nucs =>      2060 (100%)       908 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89476627,89478686] EXCISED REGION [89478688,89479598]
 second seq =>  [       1,    2060] EXCISED REGION [    2061,    2971]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89478687,89478687]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 3
 first  seq =>      5979 nucs [89479599,89485577]
 second seq =>        15 nucs [2972,2986]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [89478684,89478686] to [89478688,89478690]
 second seq =>         3 nucs [2058,2060] to [2061,2063]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89476627 AGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCC 89476686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCC 60

 89476687 TTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGAT 89476746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGAT 120

 89476747 GATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAAT 89476806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAAT 180

 89476807 GTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTT 89476866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTT 240

 89476867 GGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGC 89476926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGC 300

 89476927 AGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTG 89476986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTG 360

 89476987 AGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGC 89477046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGC 420

 89477047 ATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATA 89477106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATA 480

 89477107 ACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGG 89477166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGG 540

 89477167 GCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACC 89477226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACC 600

 89477227 ATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCT 89477286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCT 660

 89477287 GATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGT 89477346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGT 720

 89477347 CTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCA 89477406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCA 780

 89477407 TGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTG 89477466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTG 840

 89477467 AAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGC 89477526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGC 900

 89477527 AGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGG 89477586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGG 960

 89477587 GCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTC 89477646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTC 1020

 89477647 TCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCT 89477706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCT 1080

 89477707 AGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCT 89477766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCT 1140

 89477767 GTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAA 89477826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAA 1200

 89477827 TCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTA 89477886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTA 1260

 89477887 GAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATC 89477946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATC 1320

 89477947 CTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAG 89478006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAG 1380

 89478007 CACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCAC 89478066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCAC 1440

 89478067 AGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTC 89478126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTC 1500

 89478127 CGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTT 89478186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTT 1560

 89478187 CTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATA 89478246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATA 1620

 89478247 TAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAG 89478306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAG 1680

 89478307 ATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCA 89478366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCA 1740

 89478367 ATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTG 89478426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTG 1800

 89478427 ACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTA 89478486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTA 1860

 89478487 GATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTT 89478546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTT 1920

 89478547 TTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCT 89478606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCT 1980

 89478607 GCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTA 89478666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTA 2040

 89478667 TGTGCCACCATGCCTCATTT 89478686
          ||||||||||||||||||||
     2041 TGTGCCACCATGCCTCATTT 2060

EXCISED REGION

 89478688 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 89478747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 2120

 89478748 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACC 89478807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACC 2180

 89478808 ATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTAC 89478867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2181 ATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTAC 2240

 89478868 GAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGT 89478927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 GAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGT 2300

 89478928 AGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTT 89478987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 AGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTT 2360

 89478988 TCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCT 89479047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 TCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCT 2420

 89479048 TTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGG 89479107
          |||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 TTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGG 2480

 89479108 TACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAA 89479167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 TACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAA 2540

 89479168 TAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTT 89479227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 TAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTT 2600

 89479228 ATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCA 89479287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 ATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCA 2660

 89479288 AAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTG 89479347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 AAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTG 2720

 89479348 CAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAA 89479407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 CAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAA 2780

 89479408 TATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGA 89479467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 TATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGA 2840

 89479468 TAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAA 89479527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 TAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAA 2900

 89479528 CACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATT 89479587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 CACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATT 2960

 89479588 CCTTTTTTCCT 89479598
          |||||||||||
     2961 CCTTTTTTCCT 2971

Alignment time is 4.42118 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    4808] =>      4808 nucs 'mol-32-303b-004605_4808'

Score:        4807
Aligned:      4807        nucs
Identic:      4807 (100%) nucs =>      3060 (100%)      1747 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89471893,89474952] EXCISED REGION [89474954,89476700]
 second seq =>  [       1,    3060] EXCISED REGION [    3062,    4808]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89474953,89474953]
 second seq =>         1 nucs [3061,3061]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3061,3061] to [3062,3062]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89471893 TGGGTCCTGCAGGAGCAGTCTGCCTCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCAT 89471952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGTCCTGCAGGAGCAGTCTGCCTCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCAT 60

 89471953 CGTGTAATATTTTGAAACACTACATAATTATTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATC 89472012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGTGTAATATTTTGAAACACTACATAATTATTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATC 120

 89472013 CTTATGATTCTTATAAATGTAAGTAAAATAAGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAAT 89472072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTATGATTCTTATAAATGTAAGTAAAATAAGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAAT 180

 89472073 GTTTCTATAAACAAAGGTCTGCAAACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATT 89472132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTTCTATAAACAAAGGTCTGCAAACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATT 240

 89472133 AAGTGTTATTGGCACATAGCCCCACCCATTTACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGT 89472192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGTGTTATTGGCACATAGCCCCACCCATTTACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGT 300

 89472193 ACTGTATGCAGAGTTTAGTAGTTGAGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTAT 89472252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTGTATGCAGAGTTTAGTAGTTGAGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTAT 360

 89472253 CTGGTATTTTACAGAAAAGTTAGCCAACCACTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTG 89472312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGGTATTTTACAGAAAAGTTAGCCAACCACTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTG 420

 89472313 GTGAAAAACTAAAAAAAAAAAAATGGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCT 89472372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGAAAAACTAAAAAAAAAAAAATGGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCT 480

 89472373 AGTTTAGTTTATTTCTAGTTCAAAAATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACT 89472432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTTTAGTTTATTTCTAGTTCAAAAATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACT 540

 89472433 TACCTAGGATGTTTGACAATTGGGATGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAAT 89472492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TACCTAGGATGTTTGACAATTGGGATGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAAT 600

 89472493 TATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCA 89472552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCA 660

 89472553 GGATTTCAAGTATGACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAA 89472612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGATTTCAAGTATGACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAA 720

 89472613 CAATCAAATAATTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGC 89472672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAATCAAATAATTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGC 780

 89472673 ATCATTGCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTAT 89472732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCATTGCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTAT 840

 89472733 TTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATG 89472792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATG 900

 89472793 AATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTAC 89472852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTAC 960

 89472853 TCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAA 89472912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAA 1020

 89472913 GATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAA 89472972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAA 1080

 89472973 TCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTC 89473032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTC 1140

 89473033 CCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCA 89473092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCA 1200

 89473093 GTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCT 89473152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCT 1260

 89473153 GGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTA 89473212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTA 1320

 89473213 AATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATT 89473272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATT 1380

 89473273 GAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATA 89473332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATA 1440

 89473333 TAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAG 89473392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAG 1500

 89473393 AAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTC 89473452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTC 1560

 89473453 AGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTC 89473512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTC 1620

 89473513 TCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCA 89473572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCA 1680

 89473573 TTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGT 89473632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGT 1740

 89473633 TTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGC 89473692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGC 1800

 89473693 TGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGC 89473752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGC 1860

 89473753 TCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAA 89473812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAA 1920

 89473813 TCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCT 89473872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCT 1980

 89473873 ACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCT 89473932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCT 2040

 89473933 GATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCA 89473992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCA 2100

 89473993 GGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGC 89474052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGC 2160

 89474053 ACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTA 89474112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTA 2220

 89474113 GACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGC 89474172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGC 2280

 89474173 CAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGA 89474232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGA 2340

 89474233 TGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCT 89474292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCT 2400

 89474293 CTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAG 89474352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAG 2460

 89474353 ATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACAC 89474412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACAC 2520

 89474413 TAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGT 89474472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGT 2580

 89474473 GGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTC 89474532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTC 2640

 89474533 CCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAA 89474592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAA 2700

 89474593 ACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCT 89474652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCT 2760

 89474653 TCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCA 89474712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCA 2820

 89474713 CATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTT 89474772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTT 2880

 89474773 CCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGG 89474832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGG 2940

 89474833 AAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCT 89474892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCT 3000

 89474893 CCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATG 89474952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATG 3060

EXCISED REGION

 89474954 CTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTT 89475013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3062 CTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTT 3121

 89475014 GAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCA 89475073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3122 GAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCA 3181

 89475074 CCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTC 89475133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3182 CCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTC 3241

 89475134 ACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAA 89475193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 ACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAA 3301

 89475194 CACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATC 89475253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3302 CACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATC 3361

 89475254 TTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATC 89475313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3362 TTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATC 3421

 89475314 ACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTA 89475373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3422 ACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTA 3481

 89475374 TTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGC 89475433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3482 TTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGC 3541

 89475434 TCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTT 89475493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3542 TCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTT 3601

 89475494 GAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGA 89475553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3602 GAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGA 3661

 89475554 TGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAG 89475613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3662 TGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAG 3721

 89475614 ATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACC 89475673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3722 ATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACC 3781

 89475674 ATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACA 89475733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3782 ATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACA 3841

 89475734 ACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCT 89475793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3842 ACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCT 3901

 89475794 AATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTG 89475853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3902 AATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTG 3961

 89475854 GAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCT 89475913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3962 GAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCT 4021

 89475914 CCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATT 89475973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4022 CCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATT 4081

 89475974 TTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTG 89476033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4082 TTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTG 4141

 89476034 ACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTG 89476093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4142 ACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTG 4201

 89476094 CGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGA 89476153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4202 CGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGA 4261

 89476154 GTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCA 89476213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4262 GTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCA 4321

 89476214 GCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTC 89476273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4322 GCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTC 4381

 89476274 TTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCA 89476333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4382 TTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCA 4441

 89476334 ATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCG 89476393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4442 ATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCG 4501

 89476394 ACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCA 89476453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4502 ACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCA 4561

 89476454 TATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTG 89476513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4562 TATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTG 4621

 89476514 AAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGAT 89476573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4622 AAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGAT 4681

 89476574 GAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTT 89476633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4682 GAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTT 4741

 89476634 GTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTT 89476693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4742 GTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTT 4801

 89476694 CTTCTTC 89476700
          |||||||
     4802 CTTCTTC 4808

Alignment time is 6.63208 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3061] =>      3061 nucs 'mol-32-303b-257252_3061'

Score:        2995
Aligned:      3061        nucs
Identic:      3055 (100%) nucs =>      1764 (100%)      1291 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89476240,89478003] EXCISED REGION [89478005,89479301]
 second seq =>  [       1,    1764] EXCISED REGION [    1766,    3061]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89478004,89478004]
 second seq =>         1 nucs [1765,1765]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>        12 nucs [89479063,89479074]
 second seq =>        12 nucs [2823,2834]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89478004,89478004] to [89478005,89478005]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89476240 CATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTT 89476299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTT 60

 89476300 GCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTG 89476359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTG 120

 89476360 TTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTG 89476419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTG 180

 89476420 GGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATG 89476479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATG 240

 89476480 TTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAG 89476539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAG 300

 89476540 GAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTC 89476599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTC 360

 89476600 CTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAG 89476659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAG 420

 89476660 CCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACC 89476719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACC 480

 89476720 TGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCC 89476779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCC 540

 89476780 CGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAA 89476839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAA 600

 89476840 AGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGAT 89476899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGAT 660

 89476900 GCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCT 89476959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCT 720

 89476960 ACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCA 89477019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCA 780

 89477020 ACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATG 89477079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATG 840

 89477080 TGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAG 89477139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAG 900

 89477140 AATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAG 89477199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAG 960

 89477200 TTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAG 89477259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAG 1020

 89477260 TCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACC 89477319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACC 1080

 89477320 ATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAG 89477379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAG 1140

 89477380 TACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTC 89477439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTC 1200

 89477440 TTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCC 89477499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCC 1260

 89477500 CTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACC 89477559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACC 1320

 89477560 TTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCT 89477619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCT 1380

 89477620 ATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCA 89477679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCA 1440

 89477680 TTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTT 89477739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTT 1500

 89477740 CTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATT 89477799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATT 1560

 89477800 TTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTT 89477859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTT 1620

 89477860 AGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGAT 89477919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGAT 1680

 89477920 ATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTG 89477979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTG 1740

 89477980 AATGTTTGCATCCATTTCAACCCC 89478003
          ||||||||||||||||||||||||
     1741 AATGTTTGCATCCATTTCAACCCC 1764

EXCISED REGION

 89478005 AGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTC 89478064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 AGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTC 1825

 89478065 ACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCC 89478124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 ACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCC 1885

 89478125 TCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTG 89478184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 TCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTG 1945

 89478185 TTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAA 89478244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 TTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAA 2005

 89478245 TATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTT 89478304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 TATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTT 2065

 89478305 AGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGG 89478364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 AGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGG 2125

 89478365 CAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGT 89478424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 CAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGT 2185

 89478425 TGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAG 89478484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 TGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAG 2245

 89478485 TAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTT 89478544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 TAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTT 2305

 89478545 TTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCT 89478604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 TTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCT 2365

 89478605 CTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGG 89478664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 CTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGG 2425

 89478665 TATGTGCCACCATGCCTCATTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGT 89478724
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 TATGTGCCACCATGCCTCATTT-TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGT 2484

 89478725 GGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAG 89478784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 GGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAG 2544

 89478785 TGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTG 89478844
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 TGCTGGGATTACAGGCATGTACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTG 2604

 89478845 GAAGTACTACGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTT 89478904
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 GAAGTACTAGGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTT 2664

 89478905 AGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGG 89478964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 AGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGG 2724

 89478965 GTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAG 89479024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 GTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAG 2784

 89479025 ATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATT 89479084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||
     2785 ATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATT 2844

 89479085 AAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATAT 89479144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 AAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATAT 2904

 89479145 AAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTC 89479204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 AAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTC 2964

 89479205 TTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAAT 89479264
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2965 TTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAACATGTAAAT 3024

 89479265 GAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTA 89479301
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 GAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTA 3061

Alignment time is 4.56665 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    6268] =>      6268 nucs 'mol-32-303b-292193_6268'

Score:        5484
Aligned:      5561        nucs
Identic:      5554 (100%) nucs =>      5539 (100%)        15 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89474880,89480425] EXCISED REGION [89485223,89485237]
 second seq =>  [       1,    5544] EXCISED REGION [    6154,    6168]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4797 nucs [89480426,89485222]
 second seq =>       609 nucs [5545,6153]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>      4586 nucs [89480426,89485011]
 second seq =>       397 nucs [5545,5941]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89480425,89480425] to [89485223,89485223]
 second seq =>         1 nucs [5544,5544] to [6154,6154]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [89480426,89480427] to [89485221,89485222]
 second seq =>         1 nucs [5545,5545] to [6153,6153]

 89474880 ATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAA 89474939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAA 60

 89474940 CAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTA 89474999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTA 120

 89475000 AAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTT 89475059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTT 180

 89475060 TGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTA 89475119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTA 240

 89475120 GAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCT 89475179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCT 300

 89475180 TAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTC 89475239
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGGACCCAGAGTACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTC 360

 89475240 TTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGT 89475299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGT 420

 89475300 CAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTAC 89475359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTAC 480

 89475360 TTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTT 89475419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTT 540

 89475420 TTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGA 89475479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGA 600

 89475480 ATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGA 89475539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGA 660

 89475540 GAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGA 89475599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGA 720

 89475600 AATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATT 89475659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATT 780

 89475660 TTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAA 89475719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAA 840

 89475720 TGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAAT 89475779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAAT 900

 89475780 TGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCT 89475839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
      901 TGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTT-GAGACAGAGTCTTGCT 959

 89475840 CTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGG 89475899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGG 1019

 89475900 GTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACC 89475959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACC 1079

 89475960 ACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATG 89476019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATG 1139

 89476020 GTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 89476079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 1199

 89476080 GGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTG 89476139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTG 1259

 89476140 TTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCA 89476199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCA 1319

 89476200 ATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGC 89476259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 ATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGC 1379

 89476260 TAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACT 89476319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACT 1439

 89476320 CCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGC 89476379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGC 1499

 89476380 CACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAG 89476439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAG 1559

 89476440 TCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCAC 89476499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCAC 1619

 89476500 ATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTC 89476559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 ATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTC 1679

 89476560 CATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTT 89476619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTT 1739

 89476620 TTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAAT 89476679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAAT 1799

 89476680 TCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACG 89476739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACG 1859

 89476740 ATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGC 89476799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 ATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGC 1919

 89476800 CTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCA 89476859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCA 1979

 89476860 GAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACT 89476919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACT 2039

 89476920 CCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTT 89476979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTT 2099

 89476980 AGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTG 89477039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTG 2159

 89477040 CTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCT 89477099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCT 2219

 89477100 CAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGA 89477159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGA 2279

 89477160 AGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGG 89477219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGG 2339

 89477220 GAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTT 89477279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTT 2399

 89477280 TTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAAT 89477339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAAT 2459

 89477340 TATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCC 89477399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCC 2519

 89477400 AAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCAC 89477459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 AAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCAC 2579

 89477460 ATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAG 89477519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 ATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAG 2639

 89477520 GTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTC 89477579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTC 2699

 89477580 ATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGAC 89477639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGAC 2759

 89477640 TGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAG 89477699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAG 2819

 89477700 GCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCT 89477759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCT 2879

 89477760 CTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTC 89477819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTC 2939

 89477820 CTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTAC 89477879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTAC 2999

 89477880 TGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTT 89477939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTT 3059

 89477940 GAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAA 89477999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 GAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAA 3119

 89478000 CCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCT 89478059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 CCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCT 3179

 89478060 TATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGG 89478119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGG 3239

 89478120 AGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGG 89478179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 AGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGG 3299

 89478180 AAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTT 89478239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 AAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTT 3359

 89478240 TGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTA 89478299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTA 3419

 89478300 CATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTAC 89478359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 CATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTAC 3479

 89478360 TGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAG 89478419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAG 3539

 89478420 AAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGT 89478479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGT 3599

 89478480 AGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCA 89478539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 AGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCA 3659

 89478540 TATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGC 89478599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGC 3719

 89478600 AACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATT 89478659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 AACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATT 3779

 89478660 ACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGC 89478719
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 ACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT-TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGC 3838

 89478720 CATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCC 89478779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 CATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCC 3898

 89478780 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAAT 89478839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAAT 3958

 89478840 GAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGA 89478899
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGA 4018

 89478900 GTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAAT 89478959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 GTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAAT 4078

 89478960 TCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATG 89479019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 TCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATG 4138

 89479020 GGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGC 89479079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
     4139 GGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGC 4198

 89479080 AGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCT 89479139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCT 4258

 89479140 AATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTG 89479199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 AATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTG 4318

 89479200 GTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATG 89479259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 GTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATG 4378

 89479260 TAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGC 89479319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 TAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGC 4438

 89479320 AGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTT 89479379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 AGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTT 4498

 89479380 CATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAAT 89479439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 CATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAAT 4558

 89479440 ACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAA 89479499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 ACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAA 4618

 89479500 ATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTAT 89479559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 ATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTAT 4678

 89479560 TAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTA 89479619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 TAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTA 4738

 89479620 TTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAA 89479679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 TTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAA 4798

 89479680 TGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTC 89479739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 TGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTC 4858

 89479740 ATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTC 89479799
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 ATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTC 4918

 89479800 ATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCA 89479859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 ATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCA 4978

 89479860 CACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGG 89479919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 CACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGG 5038

 89479920 TGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAG 89479979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 TGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAG 5098

 89479980 GAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCT 89480039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 GAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCT 5158

 89480040 TCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTC 89480099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 TCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTC 5218

 89480100 CTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAG 89480159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 CTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAG 5278

 89480160 TCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCAC 89480219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 TCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCAC 5338

 89480220 AAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACAC 89480279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 AAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACAC 5398

 89480280 GAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACC 89480339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 GAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACC 5458

 89480340 CTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAG 89480399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 CTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAG 5518

 89480400 TGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAG 89480425
          ||||||||||||||||||||||||||
     5519 TGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAG 5544

EXCISED REGION

 89485223 GGCCTCCCAAAGTGC 89485237
          |||||||||||||||
     6154 GGCCTCCCAAAGTGC 6168

Alignment time is 8.51638 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    6187] =>      6187 nucs 'mol-32-3046-207115_6187'

Score:        6086
Aligned:      6191        nucs
Identic:      6179 (100%) nucs =>      3420 (100%)      2759 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89472480,89475908] EXCISED REGION [89478625,89481386]
 second seq =>  [       1,    3425] EXCISED REGION [    3426,    6187]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89472480 ATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATATTCCCTTTG 89472539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATATTCCCTTTG 60

 89472540 GGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTAACTTATGC 89472599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTAACTTATGC 120

 89472600 TTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCT 89472659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCT 180

 89472660 TCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTT 89472719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTT 240

 89472720 ACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGT 89472779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGT 300

 89472780 TATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATG 89472839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATG 360

 89472840 ATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTA 89472899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTA 420

 89472900 GATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGG 89472959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGG 480

 89472960 CAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACT 89473019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACT 540

 89473020 GTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACA 89473079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACA 600

 89473080 CTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTAT 89473139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTAT 660

 89473140 CCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGT 89473199
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      661 CCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGCGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGT 720

 89473200 TGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACAT 89473259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACAT 780

 89473260 GATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAA 89473319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAA 840

 89473320 TTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGG 89473379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGG 900

 89473380 GTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTT 89473439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTT 960

 89473440 GGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTC 89473499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTC 1020

 89473500 ACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTA 89473559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTA 1080

 89473560 AATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTA 89473619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTA 1140

 89473620 TTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTC 89473679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTC 1200

 89473680 TGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGC 89473739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGC 1260

 89473740 GTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAA 89473799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAA 1320

 89473800 CCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACT 89473859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACT 1380

 89473860 TTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTT 89473919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTT 1440

 89473920 ACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTA 89473979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTA 1500

 89473980 CTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCAT 89474039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCAT 1560

 89474040 ATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACA 89474099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACA 1620

 89474100 GGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAA 89474159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAA 1680

 89474160 GTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCAC 89474219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCAC 1740

 89474220 TAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAAT 89474279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAAT 1800

 89474280 ATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGG 89474339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGG 1860

 89474340 TATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAG 89474399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAG 1920

 89474400 TGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACC 89474459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACC 1980

 89474460 ACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCA 89474519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCA 2040

 89474520 AGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAA 89474579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAA 2100

 89474580 GAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTA 89474639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTA 2160

 89474640 CTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCA 89474699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCA 2220

 89474700 GTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATAC 89474759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATAC 2280

 89474760 TTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACAT 89474819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2281 TTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACGT 2340

 89474820 TCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTT 89474879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTT 2400

 89474880 ATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAA 89474939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAA 2460

 89474940 CAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTA 89474999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTA 2520

 89475000 AAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTT 89475059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTT 2580

 89475060 TGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTA 89475119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTA 2640

 89475120 GAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCT 89475179
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GAATTGCATCGGTCATAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCT 2700

 89475180 TAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTC 89475239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2701 TAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTGTTCCTGTTC 2760

 89475240 TTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGT 89475299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGT 2820

 89475300 CAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTAC 89475359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTAC 2880

 89475360 TTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTT 89475419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTT 2940

 89475420 TTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGA 89475479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGA 3000

 89475480 ATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGA 89475539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGA 3060

 89475540 GAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGA 89475599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGA 3120

 89475600 AATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATT 89475659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATT 3180

 89475660 TTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAA 89475719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAA 3240

 89475720 TGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAAT 89475779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAAT 3300

 89475780 TGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCT 89475839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||
     3301 TGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTT----GAGACAGAGTCTTGCT 3356

 89475840 CTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGG 89475899
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 CTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGG 3416

 89475900 GTTCAAGTG 89475908
          |||||||||
     3417 GTTCAAGTG 3425

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 3485

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 3545

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 3605

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3606 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 3665

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 3725

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 3785

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 3845

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 3905

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 3965

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 4025

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 4085

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4086 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 4145

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 4205

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 4265

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 4325

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 4385

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4386 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 4445

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4446 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 4505

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4506 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 4565

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4566 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 4625

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4626 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 4685

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4686 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 4745

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4746 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 4805

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4806 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 4865

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4866 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 4925

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4926 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 4985

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4986 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 5045

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5046 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 5105

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5106 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 5165

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5166 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 5225

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5226 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 5285

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5286 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 5345

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5346 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 5405

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5406 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 5465

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5466 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 5525

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5526 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 5585

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5586 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 5645

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5646 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 5705

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5706 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 5765

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5766 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 5825

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5826 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 5885

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5886 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 5945

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5946 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 6005

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6006 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 6065

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6066 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 6125

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6126 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 6185

 89481385 CC 89481386
          ||
     6186 CC 6187

Alignment time is 8.44623 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2825] =>      2825 nucs 'mol-32-3046-207115_2825'

Score:        2792
Aligned:      2825        nucs
Identic:      2822 (100%) nucs =>        63 (100%)      2759 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475846,89475908] EXCISED REGION [89478625,89481386]
 second seq =>  [       1,      63] EXCISED REGION [      64,    2825]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89475846 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 89475905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 60

 89475906 GTG 89475908
          |||
       61 GTG 63

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       64 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 123

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 183

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      184 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 243

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      244 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 303

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 363

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 423

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 483

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 543

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 603

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 663

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 723

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 783

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 843

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 903

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 963

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 1023

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 1083

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 1143

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1144 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 1203

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 1263

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 1323

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 1383

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 1443

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 1503

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 1563

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 1623

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 1683

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 1743

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 1803

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 1863

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 1923

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 1983

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 2043

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 2103

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 2163

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 2223

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 2283

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 2343

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 2403

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 2463

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 2523

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 2583

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 2643

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 2703

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 2763

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 2823

 89481385 CC 89481386
          ||
     2824 CC 2825

Alignment time is 4.31304 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    9124] =>      9124 nucs 'mol-32-310c-114338_9124'

Score:        9113
Aligned:      9124        nucs
Identic:      9123 (100%) nucs =>      3300 (100%)      5823 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89469023,89472322] EXCISED REGION [89472324,89478147]
 second seq =>  [       1,    3300] EXCISED REGION [    3301,    9124]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89472323,89472323]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [89474837,89474837]
 second seq =>         1 nucs [5814,5814]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [89472323,89472334] to [89472324,89472335]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89469023 ATTTACATTCAATGTTAGTATTGAAATGTGAGGTAATCCTTGCGTTCATCGTACTCTTTG 89469082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTACATTCAATGTTAGTATTGAAATGTGAGGTAATCCTTGCGTTCATCGTACTCTTTG 60

 89469083 TTGCCTGTGTACTTTGTTATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTGCTTTTGCTTTTTACCTTGTA 89469142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGCCTGTGTACTTTGTTATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTGCTTTTGCTTTTTACCTTGTA 120

 89469143 TTTTTGTTTTGTAGGTCCTGTATGATTTATGCTTTAAAGAGGTTCTGTTTTGGTGTGTTT 89469202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTGTTTTGTAGGTCCTGTATGATTTATGCTTTAAAGAGGTTCTGTTTTGGTGTGTTT 180

 89469203 CCAGGCTTCGTTTCAAGATTTAGACCTCCTTTTAGCAGTTCTTATAGTGGTGGCTTGGTA 89469262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAGGCTTCGTTTCAAGATTTAGACCTCCTTTTAGCAGTTCTTATAGTGGTGGCTTGGTA 240

 89469263 ATGGTGAATTCTCTCAGCAATTTTGTCTGAAAATGACTGTTTCTTTCCTTTACGTTTGAT 89469322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGGTGAATTCTCTCAGCAATTTTGTCTGAAAATGACTGTTTCTTTCCTTTACGTTTGAT 300

 89469323 GCTTAGTTTTGCTGGAAACAGAATTCTTGGCTGATAATTGTTTTGTTTGAAGAGGCTAAA 89469382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTTAGTTTTGCTGGAAACAGAATTCTTGGCTGATAATTGTTTTGTTTGAAGAGGCTAAA 360

 89469383 GATAGGGCCGCATTGCCTTCTGGCTTGTACGGTTTCTGCTGAGAAATCTGCTAGGTTAGT 89469442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATAGGGCCGCATTGCCTTCTGGCTTGTACGGTTTCTGCTGAGAAATCTGCTAGGTTAGT 420

 89469443 CTGATATGTTTTCCTTTATAGGTTACCTGGTGCTTCTGTCTCACAGCTCTTAAGATTTTT 89469502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGATATGTTTTCCTTTATAGGTTACCTGGTGCTTCTGTCTCACAGCTCTTAAGATTTTT 480

 89469503 TTCCTTCATCTTAACTTTGGATAACCTGATGACAATGTGCCTAGGTGAAGATCTTTTTGT 89469562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCCTTCATCTTAACTTTGGATAACCTGATGACAATGTGCCTAGGTGAAGATCTTTTTGT 540

 89469563 GATGAATTTCCCAGGTATTCTTTGTGCTTCTTATATTTGCATGTGTAGGTCTCTAGCTAG 89469622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATGAATTTCCCAGGTATTCTTTGTGCTTCTTATATTTGCATGTGTAGGTCTCTAGCTAG 600

 89469623 GTTGGGGAAGTTTTCCTCAATTATTCCCCCAAATATGTTTTCCAAGCTTTTAGAATTCTC 89469682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTGGGGAAGTTTTCCTCAATTATTCCCCCAAATATGTTTTCCAAGCTTTTAGAATTCTC 660

 89469683 TTCTTCCCCAGGAACACCCATTATTCTTAGGTTTGGTCATTTAACATGATCCCAGACTTC 89469742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCTTCCCCAGGAACACCCATTATTCTTAGGTTTGGTCATTTAACATGATCCCAGACTTC 720

 89469743 TTGGAGGATTTGTTCATATTTTCGTATTCTTTTTTCTTTGTCTTTGTTGGATTGGGTTAA 89469802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGGAGGATTTGTTCATATTTTCGTATTCTTTTTTCTTTGTCTTTGTTGGATTGGGTTAA 780

 89469803 TTCAAAGACCTTGTCTTTGAGCTCTGAATTTCTTTCTTGTACTTGTTCAATTCTGTTGCT 89469862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCAAAGACCTTGTCTTTGAGCTCTGAATTTCTTTCTTGTACTTGTTCAATTCTGTTGCT 840

 89469863 GAGACTTTCCAAAGCATTTTGCATTTCTAAAAGCGTGTCCAAAGTTTCCTGAATTGTGGA 89469922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGACTTTCCAAAGCATTTTGCATTTCTAAAAGCGTGTCCAAAGTTTCCTGAATTGTGGA 900

 89469923 TTGTTTTCCTTTAAGCTGTCTATTTCATTGAATATTTATCCCTTCACTTCTTGTATCATT 89469982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGTTTTCCTTTAAGCTGTCTATTTCATTGAATATTTATCCCTTCACTTCTTGTATCATT 960

 89469983 TTTTTGGATTTCCTTGCATTGGGCTTCACCTTTCTCTGGTCCTTCCCTGATTAGCTTAGT 89470042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTTGGATTTCCTTGCATTGGGCTTCACCTTTCTCTGGTCCTTCCCTGATTAGCTTAGT 1020

 89470043 AACTAACCTCCTGAATTCTTTTTCAGATAAATCGGGATTTCTTCTTGGTTTGGATCCATT 89470102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACTAACCTCCTGAATTCTTTTTCAGATAAATCGGGATTTCTTCTTGGTTTGGATCCATT 1080

 89470103 GCTGGTGAACCAGGATGATTTTTGGGGGGTGTTGAAGGGCCTTGTTTTGTCATATAACCA 89470162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTGGTGAACCAGGATGATTTTTGGGGGGTGTTGAAGGGCCTTGTTTTGTCATATAACCA 1140

 89470163 GAGTTGGTTTTCTGGTTCCTTCTCATTTGGGTAGGCTCTGTCAGAGAGAAGGTCTAAGGC 89470222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGTTGGTTTTCTGGTTCCTTCTCATTTGGGTAGGCTCTGTCAGAGAGAAGGTCTAAGGC 1200

 89470223 TGAAGGCTGTTGTTCAGATTCTTTTGTCCCATGGGGTGTTCCCCTGATGTAGTACTCTCC 89470282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAAGGCTGTTGTTCAGATTCTTTTGTCCCATGGGGTGTTCCCCTGATGTAGTACTCTCC 1260

 89470283 CCCTTTTCCTATGGGTATGGCTTCCTGTGAGCCAAACTGCAGTGATTGTCGTCTCTCTTC 89470342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCCTTTTCCTATGGGTATGGCTTCCTGTGAGCCAAACTGCAGTGATTGTCGTCTCTCTTC 1320

 89470343 TGAGTCTAGCCAGCCAGTGTGTCTGCCCAGCTCTGGGCTGGTATTGGGGGTTTTCTGTAC 89470402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGAGTCTAGCCAGCCAGTGTGTCTGCCCAGCTCTGGGCTGGTATTGGGGGTTTTCTGTAC 1380

 89470403 AGAGTCCTGTGATGTGGACCATCTATGGGTCTCTGAGCCATGGATACTAAGGGAAGAAAA 89470462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAGTCCTGTGATGTGGACCATCTATGGGTCTCTGAGCCATGGATACTAAGGGAAGAAAA 1440

 89470463 CACCCCTCATATTGTCTTATGCCCAATTTCTGCCTCCAAAGAAAGAAGAAGTAAAAATTA 89470522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACCCCTCATATTGTCTTATGCCCAATTTCTGCCTCCAAAGAAAGAAGAAGTAAAAATTA 1500

 89470523 AAAGGCAGAAATGAAATCCACAAGCAGACAGTTCAGCGCCACACCCTGGGCCTGGTAATT 89470582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAGGCAGAAATGAAATCCACAAGCAGACAGTTCAGCGCCACACCCTGGGCCTGGTAATT 1560

 89470583 AAAGATTGACCCCTGACCTAATTGGTTATGCTATCTACAGATTACAGACATTGTATAGAA 89470642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAGATTGACCCCTGACCTAATTGGTTATGCTATCTACAGATTACAGACATTGTATAGAA 1620

 89470643 AAGCACTGTGAAAATCCCTGTCCTGTTCTGTTCCGTTCCGTTCTAATTACCAGTGCATGT 89470702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGCACTGTGAAAATCCCTGTCCTGTTCTGTTCCGTTCCGTTCTAATTACCAGTGCATGT 1680

 89470703 AGCCCGCAGTCATGTACCCCCTGCTTGCTCAATCAATCACGACCCTCTCACGTGGACCCC 89470762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGCCCGCAGTCATGTACCCCCTGCTTGCTCAATCAATCACGACCCTCTCACGTGGACCCC 1740

 89470763 CTTAGAGTTGTGAGCCCTTAAAAGGGACAGGAATTGCTCACTCAGGGAGCTCGGTTGTTG 89470822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTTAGAGTTGTGAGCCCTTAAAAGGGACAGGAATTGCTCACTCAGGGAGCTCGGTTGTTG 1800

 89470823 GAGACGTGAGTCTTACCAAAGCTCCTGGCTGAATAAAGCCCTTCCTTCTTTAACTCAGTG 89470882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAGACGTGAGTCTTACCAAAGCTCCTGGCTGAATAAAGCCCTTCCTTCTTTAACTCAGTG 1860

 89470883 TCTGAGGGGTTTTGTTGGTGGCTTGTCCTCCTACAATACCAGTGCCTGTTCCAGTGGAGG 89470942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCTGAGGGGTTTTGTTGGTGGCTTGTCCTCCTACAATACCAGTGCCTGTTCCAGTGGAGG 1920

 89470943 TGGTGGAGGGTGAAATGGACTTCATGAGGGTCCTTGGTTTTGGTGGTTTAATGCTCTATT 89471002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGTGGAGGGTGAAATGGACTTCATGAGGGTCCTTGGTTTTGGTGGTTTAATGCTCTATT 1980

 89471003 TTTGTGCTGGTTGGCCTCCTGAAAGGAGGTGGCACTTTCCAGAAAGTATCAGTGGGAGAG 89471062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTGTGCTGGTTGGCCTCCTGAAAGGAGGTGGCACTTTCCAGAAAGTATCAGTGGGAGAG 2040

 89471063 GGACTGGTGGTGGGCAGGGTCCTAGAACTCCCAAGATTAAATGACCTTTGTCTTCAGCTA 89471122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGACTGGTGGTGGGCAGGGTCCTAGAACTCCCAAGATTAAATGACCTTTGTCTTCAGCTA 2100

 89471123 CCAGGGTGGATGGAGAAGGACCATCAGGTCAGGGCGGGGCTAGGAGTGTCTGAGCTCAGA 89471182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCAGGGTGGATGGAGAAGGACCATCAGGTCAGGGCGGGGCTAGGAGTGTCTGAGCTCAGA 2160

 89471183 CTCTCCATGGCTGGATCTTGCTATGGCTGCTGTGGGGGATGGGGGTGAGATTCCCAGGTC 89471242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTCTCCATGGCTGGATCTTGCTATGGCTGCTGTGGGGGATGGGGGTGAGATTCCCAGGTC 2220

 89471243 ACTGGAGTTGTGTACCTAGGAGGATTATGGCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGTTGTCAG 89471302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACTGGAGTTGTGTACCTAGGAGGATTATGGCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGTTGTCAG 2280

 89471303 GGGAGTGGGAGAAGCTGGCAGTCACAGGCCTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGGAAGGCC 89471362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGGAGTGGGAGAAGCTGGCAGTCACAGGCCTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGGAAGGCC 2340

 89471363 GGTCTCACTCCCACTGTGCCCTTCTCCCTGCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCAGGCAGA 89471422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGTCTCACTCCCACTGTGCCCTTCTCCCTGCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCAGGCAGA 2400

 89471423 GGGCAAGAGGGGCGGGCTTAAAATTTGGCTGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAGAAAAGG 89471482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGGCAAGAGGGGCGGGCTTAAAATTTGGCTGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAGAAAAGG 2460

 89471483 ACTTTAGTTCTTCACCAGCCTGTGAAGTTTGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCCGAGTTC 89471542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACTTTAGTTCTTCACCAGCCTGTGAAGTTTGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCCGAGTTC 2520

 89471543 TGGCAGGAGGCTTCTCGCCCCATTCAAATTGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATTTCTTCT 89471602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGGCAGGAGGCTTCTCGCCCCATTCAAATTGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATTTCTTCT 2580

 89471603 TTCTGTGGAGTTTTACCTGTTGCTCCTCTGGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGTGGTGCC 89471662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCTGTGGAGTTTTACCTGTTGCTCCTCTGGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGTGGTGCC 2640

 89471663 AGGCAGGAATGGCCTGCCTGGGGACACAGTGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGCTTCCTC 89471722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGGCAGGAATGGCCTGCCTGGGGACACAGTGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGCTTCCTC 2700

 89471723 TACCCCTGTATTTTGCTCGGCTCTCTAACTTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGGAAACTC 89471782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TACCCCTGTATTTTGCTCGGCTCTCTAACTTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGGAAACTC 2760

 89471783 CTCCTGCACACAAACCTTCAGCTTCTCCAGTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGAGGGTCT 89471842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTCCTGCACACAAACCTTCAGCTTCTCCAGTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGAGGGTCT 2820

 89471843 CCCTTTCCCACTTCTGCAGTTGGGGCAGTCAGAATATTTGGAGTGTTTCCTGGGTCCTGC 89471902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCCTTTCCCACTTCTGCAGTTGGGGCAGTCAGAATATTTGGAGTGTTTCCTGGGTCCTGC 2880

 89471903 AGGAGCAGTCTGCCTCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTGTAATAT 89471962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGGAGCAGTCTGCCTCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTGTAATAT 2940

 89471963 TTTGAAACACTACATAATTATTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATCCTTATGATTC 89472022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTGAAACACTACATAATTATTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATCCTTATGATTC 3000

 89472023 TTATAAATGTAAGTAAAATAAGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAATGTTTCTATAA 89472082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTATAAATGTAAGTAAAATAAGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAATGTTTCTATAA 3060

 89472083 ACAAAGGTCTGCAAACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGTGTTATT 89472142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACAAAGGTCTGCAAACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGTGTTATT 3120

 89472143 GGCACATAGCCCCACCCATTTACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTGTATGCA 89472202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGCACATAGCCCCACCCATTTACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTGTATGCA 3180

 89472203 GAGTTTAGTAGTTGAGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTATCTGGTATTTT 89472262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAGTTTAGTAGTTGAGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTATCTGGTATTTT 3240

 89472263 ACAGAAAAGTTAGCCAACCACTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTGGTGAAAAACT 89472322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACAGAAAAGTTAGCCAACCACTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTGGTGAAAAACT 3300

EXCISED REGION

 89472324 AAAAAAAAAAAATGGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTA 89472383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAAAAAAAAAAATGGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTA 3360

 89472384 TTTCTAGTTCAAAAATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATG 89472443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTTCTAGTTCAAAAATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATG 3420

 89472444 TTTGACAATTGGGATGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGC 89472503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTGACAATTGGGATGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGC 3480

 89472504 TCAAAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGT 89472563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCAAAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGT 3540

 89472564 ATGACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAA 89472623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATGACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAA 3600

 89472624 TTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATG 89472683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATG 3660

 89472684 TTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGG 89472743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGG 3720

 89472744 TCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAG 89472803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAG 3780

 89472804 AAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATG 89472863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATG 3840

 89472864 ATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCT 89472923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCT 3900

 89472924 TTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTG 89472983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTG 3960

 89472984 CTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCT 89473043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCT 4020

 89473044 AGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATA 89473103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATA 4080

 89473104 TGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAA 89473163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAA 4140

 89473164 CTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTT 89473223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTT 4200

 89473224 GTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGT 89473283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGT 4260

 89473284 TCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTT 89473343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTT 4320

 89473344 GTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGT 89473403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGT 4380

 89473404 TGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTG 89473463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTG 4440

 89473464 TAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTAC 89473523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTAC 4500

 89473524 TCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATC 89473583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATC 4560

 89473584 TCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGA 89473643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGA 4620

 89473644 AATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTAT 89473703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTAT 4680

 89473704 TTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGA 89473763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGA 4740

 89473764 AGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATA 89473823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATA 4800

 89473824 TATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACA 89473883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACA 4860

 89473884 TATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATA 89473943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATA 4920

 89473944 TGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGA 89474003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGA 4980

 89474004 AGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCC 89474063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCC 5040

 89474064 AACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTAC 89474123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTAC 5100

 89474124 AGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATAC 89474183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATAC 5160

 89474184 TAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATA 89474243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATA 5220

 89474244 TTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCT 89474303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCT 5280

 89474304 CCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAG 89474363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAG 5340

 89474364 GCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGAC 89474423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGAC 5400

 89474424 TGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAA 89474483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAA 5460

 89474484 GTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTT 89474543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTT 5520

 89474544 ATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACG 89474603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 ATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACG 5580

 89474604 AACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCT 89474663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCT 5640

 89474664 TCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGA 89474723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGA 5700

 89474724 TAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATT 89474783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATT 5760

 89474784 TTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACA 89474843
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5761 TTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAGGAAACA 5820

 89474844 TTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCT 89474903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCT 5880

 89474904 GCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAG 89474963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 GCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAG 5940

 89474964 TTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTAT 89475023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTAT 6000

 89475024 TTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCT 89475083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCT 6060

 89475084 CCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCT 89475143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCT 6120

 89475144 TGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGA 89475203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGA 6180

 89475204 GAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTG 89475263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 GAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTG 6240

 89475264 AGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAG 89475323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 AGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAG 6300

 89475324 ATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGA 89475383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 ATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGA 6360

 89475384 TGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTG 89475443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 TGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTG 6420

 89475444 ATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAA 89475503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 ATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAA 6480

 89475504 ATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGG 89475563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 ATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGG 6540

 89475564 ATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTA 89475623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 ATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTA 6600

 89475624 AATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGT 89475683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 AATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGT 6660

 89475684 TTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGT 89475743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 TTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGT 6720

 89475744 TAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAA 89475803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 TAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAA 6780

 89475804 CTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTG 89475863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 CTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTG 6840

 89475864 GCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAG 89475923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 GCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAG 6900

 89475924 CCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTT 89475983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 CCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTT 6960

 89475984 TAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGAT 89476043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 TAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGAT 7020

 89476044 CTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCT 89476103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 CTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCT 7080

 89476104 AGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGT 89476163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 AGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGT 7140

 89476164 GCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAG 89476223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 GCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAG 7200

 89476224 TAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGA 89476283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 TAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGA 7260

 89476284 CATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGC 89476343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 CATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGC 7320

 89476344 CTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCT 89476403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 CTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCT 7380

 89476404 CTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTG 89476463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 CTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTG 7440

 89476464 AATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTC 89476523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 AATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTC 7500

 89476524 ACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGT 89476583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 ACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGT 7560

 89476584 TACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTG 89476643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 TACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTG 7620

 89476644 AATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAG 89476703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 AATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAG 7680

 89476704 AGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTG 89476763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 AGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTG 7740

 89476764 TTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAA 89476823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 TTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAA 7800

 89476824 AAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAA 89476883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 AAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAA 7860

 89476884 ATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACT 89476943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 ATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACT 7920

 89476944 CCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGAT 89477003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 CCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGAT 7980

 89477004 TGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATT 89477063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 TGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATT 8040

 89477064 TCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTT 89477123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 TCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTT 8100

 89477124 CTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAG 89477183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 CTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAG 8160

 89477184 AAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAAT 89477243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 AAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAAT 8220

 89477244 GTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCA 89477303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 GTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCA 8280

 89477304 AGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAA 89477363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 AGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAA 8340

 89477364 TTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAA 89477423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8341 TTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAA 8400

 89477424 AATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATA 89477483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 AATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATA 8460

 89477484 GACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTC 89477543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8461 GACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTC 8520

 89477544 TGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCAC 89477603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8521 TGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCAC 8580

 89477604 TGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATC 89477663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8581 TGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATC 8640

 89477664 CCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGA 89477723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8641 CCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGA 8700

 89477724 AGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATG 89477783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 AGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATG 8760

 89477784 TCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCT 89477843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8761 TCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCT 8820

 89477844 GGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGT 89477903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8821 GGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGT 8880

 89477904 AAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCT 89477963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8881 AAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCT 8940

 89477964 AGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAA 89478023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8941 AGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAA 9000

 89478024 CCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAAT 89478083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9001 CCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAAT 9060

 89478084 ACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAG 89478143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9061 ACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAG 9120

 89478144 CACA 89478147
          ||||
     9121 CACA 9124

Alignment time is 12.036 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,   12867] =>     12867 nucs 'mol-32-310c-211059_12867'

Score:       12693
Aligned:     12864        nucs
Identic:     12846 (100%) nucs =>      6950 (100%)      5896 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89474465,89481421] EXCISED REGION [89481428,89487330]
 second seq =>  [       1,    6955] EXCISED REGION [    6962,   12867]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [89481422,89481427]
 second seq =>         6 nucs [6956,6961]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89481421,89481421] to [89481427,89481427]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89481422,89481422] to [89481427,89481427]
 second seq =>         0 nucs

 89474465 TAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAA 89474524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAA 60

 89474525 AATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACA 89474584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACA 120

 89474585 GAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGT 89474644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGT 180

 89474645 GAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAA 89474704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAA 240

 89474705 TTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTAT 89474764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTAT 300

 89474765 TTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCAC 89474824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCAC 360

 89474825 TGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACA 89474884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACA 420

 89474885 CTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGT 89474944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGT 480

 89474945 AAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATT 89475004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATT 540

 89475005 TTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACT 89475064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACT 600

 89475065 TGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATT 89475124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATT 660

 89475125 GCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGA 89475184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGA 720

 89475185 CCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTG 89475244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTG 780

 89475245 CCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGA 89475304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGA 840

 89475305 TTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGC 89475364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGC 900

 89475365 AGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAA 89475424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAA 960

 89475425 ATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAA 89475484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAA 1020

 89475485 GCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAA 89475544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAA 1080

 89475545 CTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCT 89475604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCT 1140

 89475605 TGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTT 89475664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTT 1200

 89475665 TAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATC 89475724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATC 1260

 89475725 ATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACT 89475784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACT 1320

 89475785 GCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATT 89475844
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     1321 GCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTT-GAGACAGAGTCTTGCTCTATT 1379

 89475845 GCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCA 89475904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCA 1439

 89475905 AGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCT 89475964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCT 1499

 89475965 CAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTT 89476024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTT 1559

 89476025 GATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 89476084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 1619

 89476085 GAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCC 89476144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCC 1679

 89476145 CAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCT 89476204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCT 1739

 89476205 CCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATT 89476264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATT 1799

 89476265 TTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGA 89476324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGA 1859

 89476325 GCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCG 89476384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCG 1919

 89476385 CACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCC 89476444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCC 1979

 89476445 CTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTG 89476504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTG 2039

 89476505 TGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAA 89476564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAA 2099

 89476565 TCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCT 89476624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCT 2159

 89476625 CCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCG 89476684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCG 2219

 89476685 CCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTG 89476744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTG 2279

 89476745 ATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTA 89476804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 ATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTA 2339

 89476805 ATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATT 89476864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 ATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATT 2399

 89476865 TTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCA 89476924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCA 2459

 89476925 GCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGG 89476984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGG 2519

 89476985 TGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTT 89477044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTT 2579

 89477045 GCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGA 89477104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGA 2639

 89477105 TAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGT 89477164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGT 2699

 89477165 GGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGA 89477224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGA 2759

 89477225 CCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGT 89477284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGT 2819

 89477285 CTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTT 89477344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTT 2879

 89477345 GTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATC 89477404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 GTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATC 2939

 89477405 CATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCT 89477464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCT 2999

 89477465 TGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCA 89477524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCA 3059

 89477525 GCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGT 89477584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 GCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGT 3119

 89477585 GGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGT 89477644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGT 3179

 89477645 TCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCT 89477704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCT 3239

 89477705 CTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATT 89477764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 CTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATT 3299

 89477765 CTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAG 89477824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 CTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAG 3359

 89477825 AATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAAT 89477884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 AATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAAT 3419

 89477885 TAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAA 89477944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAA 3479

 89477945 TCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCA 89478004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCA 3539

 89478005 AGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTC 89478064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTC 3599

 89478065 ACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCC 89478124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 ACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCC 3659

 89478125 TCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTG 89478184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTG 3719

 89478185 TTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAA 89478244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAA 3779

 89478245 TATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTT 89478304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTT 3839

 89478305 AGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGG 89478364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 AGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGG 3899

 89478365 CAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGT 89478424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 CAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGT 3959

 89478425 TGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAG 89478484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 TGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAG 4019

 89478485 TAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTT 89478544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 TAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTT 4079

 89478545 TTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCT 89478604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 TTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCT 4139

 89478605 CTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGG 89478664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 CTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGG 4199

 89478665 TATGTGCCACCATGCCTCATTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGT 89478724
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 TATGTGCCACCATGCCTCATTT-TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGT 4258

 89478725 GGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAG 89478784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 GGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAG 4318

 89478785 TGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTG 89478844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTG 4378

 89478845 GAAGTACTACGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTT 89478904
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 GAAGTACTAGGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTT 4438

 89478905 AGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGG 89478964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 AGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGG 4498

 89478965 GTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAG 89479024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 GTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAG 4558

 89479025 ATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATT 89479084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||
     4559 ATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATT 4618

 89479085 AAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATAT 89479144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 AAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATAT 4678

 89479145 AAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTC 89479204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 AAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTC 4738

 89479205 TTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAAT 89479264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 TTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAAT 4798

 89479265 GAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAAT 89479324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 GAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAAT 4858

 89479325 TGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGT 89479384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 TGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGT 4918

 89479385 TCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGA 89479444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 TCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGA 4978

 89479445 ATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAA 89479504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 ATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAA 5038

 89479505 AGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATT 89479564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 AGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATT 5098

 89479565 TAGATATTCAGCAAGCATTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCT 89479624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 TAGATATTCAGCAAGCATTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCT 5158

 89479625 AATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGA 89479684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 AATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGA 5218

 89479685 GAAAACTATCAATAGTAAACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTA 89479744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 GAAAACTATCAATAGTAAACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTA 5278

 89479745 TCAATGGTACGTCTCTGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTG 89479804
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 TCAATGGTACGTCCCTGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTG 5338

 89479805 GTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAA 89479864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 GTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAA 5398

 89479865 AATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGG 89479924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 AATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGG 5458

 89479925 ATTTTGATCGGATTCGATGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAAT 89479984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 ATTTTGATCGGATTCGATGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAAT 5518

 89479985 GTGACAAAATGAACAGGAACCTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCAT 89480044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 GTGACAAAATGAACAGGAACCTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCAT 5578

 89480045 TTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTG 89480104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 TTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTG 5638

 89480105 TACTTGCATTATTTTTTGTTTTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGG 89480164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 TACTTGCATTATTTTTTGTTTTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGG 5698

 89480165 CAGCTGGTTTATGAATACAGGTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAG 89480224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 CAGCTGGTTTATGAATACAGGTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAG 5758

 89480225 GATACTACAGTTGGTCCATAGCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAG 89480284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 GATACTACAGTTGGTCCATAGCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAG 5818

 89480285 TGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGA 89480344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 TGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGA 5878

 89480345 AGTCAAGACACACTGGAGTCAGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACA 89480404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 AGTCAAGACACACTGGAGTCAGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACA 5938

 89480405 GTAGTAAAAGTATATCATAAGTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAA 89480464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 GTAGTAAAAGTATATCATAAGTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAA 5998

 89480465 CCCAAATCCAAACAAAATGATTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAG 89480524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 CCCAAATCCAAACAAAATGATTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAG 6058

 89480525 TGTTTTTTGGTATACACTGATTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGC 89480584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 TGTTTTTTGGTATACACTGATTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGC 6118

 89480585 AAAATAAACATTCAAGGTTAATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTC 89480644
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6119 AAAATAAACATTCAAGGTTAATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAATTTGCTC 6178

 89480645 AGGCTACTGAATTATAAGTTCTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGC 89480704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 AGGCTACTGAATTATAAGTTCTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGC 6238

 89480705 TCCCTTTATGCATCTGTGTTAACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGT 89480764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 TCCCTTTATGCATCTGTGTTAACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGT 6298

 89480765 GTGTTGACCACCATGCTTTGCTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTT 89480824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 GTGTTGACCACCATGCTTTGCTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTT 6358

 89480825 GCTAAGTTTGGCCTTATGACATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCA 89480884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 GCTAAGTTTGGCCTTATGACATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCA 6418

 89480885 AACTCTTCTTTAAGAAAAAACTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATT 89480944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 AACTCTTCTTTAAGAAAAAACTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATT 6478

 89480945 TCAAAATTGAATCTTTGACCCTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCA 89481004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 TCAAAATTGAATCTTTGACCCTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCA 6538

 89481005 GGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGG 89481064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 GGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGG 6598

 89481065 TGTGAGATTTCACTGTGGAGCCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGG 89481124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 TGTGAGATTTCACTGTGGAGCCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGG 6658

 89481125 GCTGGAGGTTTAATAGCAGGTACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAAT 89481184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 GCTGGAGGTTTAATAGCAGGTACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAAT 6718

 89481185 GTTAAGAGAGATAACCAAAACCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAG 89481244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 GTTAAGAGAGATAACCAAAACCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAG 6778

 89481245 AAAAATTTGAATATCCAGTACATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAA 89481304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 AAAAATTTGAATATCCAGTACATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAA 6838

 89481305 CAAATTAGAAATAGAAAAAAACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGT 89481364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 CAAATTAGAAATAGAAAAAAACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGT 6898

 89481365 TGCAGTGAGCTGAGATAGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCT 89481421
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6899 TGCAGTGAGCTGAGATAGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCT 6955

EXCISED REGION

 89481428 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAA 89481487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6962 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAA 7021

 89481488 CAAAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAAT 89481547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7022 CAAAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAAT 7081

 89481548 TTTCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAG 89481607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7082 TTTCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAG 7141

 89481608 TACTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTG 89481667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7142 TACTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTG 7201

 89481668 GAAAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTA 89481727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7202 GAAAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTA 7261

 89481728 AATATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAA 89481787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7262 AATATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAA 7321

 89481788 ATTAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAA 89481847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7322 ATTAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAA 7381

 89481848 ATTTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAAT 89481907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7382 ATTTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAAT 7441

 89481908 TGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGA 89481967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7442 TGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGA 7501

 89481968 TCACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAA 89482027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7502 TCACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAA 7561

 89482028 ACTACACACACACACACACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCA 89482087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7562 ACTACACACACACACACACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCA 7621

 89482088 GCTACTCGGGTGGCTGAGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 89482147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7622 GCTACTCGGGTGGCTGAGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 7681

 89482148 GCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAAC 89482207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7682 GCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAAC 7741

 89482208 AAACAAAAAACCCAAAAAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACA 89482267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7742 AAACAAAAAACCCAAAAAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACA 7801

 89482268 AAATTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACT 89482327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7802 AAATTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACT 7861

 89482328 GATCACTGTAGTCTTGACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTA 89482387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7862 GATCACTGTAGTCTTGACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTA 7921

 89482388 GCTGAGACTACAGGCACGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATG 89482447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7922 GCTGAGACTACAGGCACGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATG 7981

 89482448 GGGTTTCCCCGTGTTGTCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCC 89482507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7982 GGGTTTCCCCGTGTTGTCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCC 8041

 89482508 TCAGCTTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTT 89482567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8042 TCAGCTTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTT 8101

 89482568 AAAAGAAATTAAGGAAGAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGA 89482627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8102 AAAAGAAATTAAGGAAGAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGA 8161

 89482628 TTCAATGCAATCCCTATCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATA 89482687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8162 TTCAATGCAATCCCTATCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATA 8221

 89482688 TCCACACTAACTTTCATATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAA 89482747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8222 TCCACACTAACTTTCATATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAA 8281

 89482748 AAGGAAGAAGAAAGTCAGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAG 89482807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8282 AAGGAAGAAGAAAGTCAGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAG 8341

 89482808 GATAATCAACACAGTTTGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAG 89482867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8342 GATAATCAACACAGTTTGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAG 8401

 89482868 AGAGCCTAGAAATGAACTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAA 89482927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8402 AGAGCCTAGAAATGAACTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAA 8461

 89482928 TCATTCAACGCAGAAAGAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCA 89482987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8462 TCATTCAACGCAGAAAGAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCA 8521

 89482988 CATGCTCACATGCCAAAAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACG 89483047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8522 CATGCTCACATGCCAAAAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACG 8581

 89483048 TAACTCAAAATGGATCAAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGA 89483107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8582 TAACTCAAAATGGATCAAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGA 8641

 89483108 AAACAAAGGGGAAAAACAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAAT 89483167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8642 AAACAAAGGGGAAAAACAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAAT 8701

 89483168 GAAAAACTTTTGTGCATCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATG 89483227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8702 GAAAAACTTTTGTGCATCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATG 8761

 89483228 GAAGAAAACATTTGCTAAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGA 89483287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8762 GAAGAAAACATTTGCTAAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGA 8821

 89483288 ATTCCTACAATGCAACACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTC 89483347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8822 ATTCCTACAATGCAACACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTC 8881

 89483348 TCTAAAGAATGGCCAATAAGCACCTGAAAAGATGCTCAACATTACTAGTCATTAGGAAAA 89483407
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     8882 TCTAAAGAATGGCCAATAAGCACCTGAAAAGATGCTCAATATTACTAGTCATTAGGAAAA 8941

 89483408 TGCAAATTAAAGCCATAGTGAGATACTACTTCACATCCATTAGTATGGTGACTATCAAAA 89483467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8942 TGCAAATTAAAGCCATAGTGAGATACTACTTCACATCCATTAGTATGGTGACTATCAAAA 9001

 89483468 AAAATTGAAAAGGGCTGGGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCT 89483527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9002 AAAATTGAAAAGGGCTGGGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCT 9061

 89483528 GAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCAAATATGGAGAAAC 89483587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9062 GAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCAAATATGGAGAAAC 9121

 89483588 CCCATTTACACTAAAAATACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCA 89483647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9122 CCCATTTACACTAAAAATACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCA 9181

 89483648 CCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 89483707
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9182 CCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGAAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 9241

 89483708 GCTGGGGTCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTGTGTCTCAAAAAA 89483767
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     9242 GCTGGGGTCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTGTGTCTC-AAAAA 9300

 89483768 AAAAAAAATTAAAATAACTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATTGCTATGGAATAAAAGAT 89483827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9301 AAAAAAAATTAAAATAACTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATTGCTATGGAATAAAAGAT 9360

 89483828 GAAATGCTCCTGATTATTGTAAATACAAAATTGCATGCAGGATTGTGCAAAGACAGTGCC 89483887
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     9361 GAAATGCTCCTGATTATTGTAAATACAAAATTGCATGCAGGATTGTGCAAAGACAATGCC 9420

 89483888 AGGTTGGACTGCCAGAATGAGCCAACGGGACGTGATGTGCTTCCCCCTGCAGAGAGCCTA 89483947
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     9421 AGGTTGGACTGCCAGAATGAGCCAACGGCACGTGATGTGCTTCCCCCTGCAGAGAGCCTA 9480

 89483948 TGAATGGATGTGCAGTCAGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTCCTATCCCAGAAAAGCAG 89484007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9481 TGAATGGATGTGCAGTCAGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTCCTATCCCAGAAAAGCAG 9540

 89484008 ATGTTCATAGCTCTGGGAATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGAGGGGGCACCTGTCCATG 89484067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9541 ATGTTCATAGCTCTGGGAATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGAGGGGGCACCTGTCCATG 9600

 89484068 TGGATAAGATAGGGCCATAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTCTTCTAGGCCTCTTTAGG 89484127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9601 TGGATAAGATAGGGCCATAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTCTTCTAGGCCTCTTTAGG 9660

 89484128 GTTAAGGCATACTCCCTTCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTTGTCTAGCTTCACGTCTT 89484187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9661 GTTAAGGCATACTCCCTTCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTTGTCTAGCTTCACGTCTT 9720

 89484188 GTTTCTATGGATTGTTTGTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTACTGCTGATTAATATCTT 89484247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9721 GTTTCTATGGATTGTTTGTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTACTGCTGATTAATATCTT 9780

 89484248 GCTAATCATAGGTTATGAAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCTCTGTTAGAAATTACTGA 89484307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9781 GCTAATCATAGGTTATGAAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCTCTGTTAGAAATTACTGA 9840

 89484308 TGCACACACTATATTGTAAATTCTTATCTCTGTATACTGTACTTCTGCATACAGATGTTA 89484367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9841 TGCACACACTATATTGTAAATTCTTATCTCTGTATACTGTACTTCTGCATACAGATGTTA 9900

 89484368 TGTTAAAGAATTACTTCATCCCCATGTGACCATCTCACCTCATAATCAAACGACCCTAAA 89484427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9901 TGTTAAAGAATTACTTCATCCCCATGTGACCATCTCACCTCATAATCAAACGACCCTAAA 9960

 89484428 TCCCTCACTAACCTTCCCCCACCCTCACTAAACTTAATAATAAATGCTGGCATATCCAGT 89484487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9961 TCCCTCACTAACCTTCCCCCACCCTCACTAAACTTAATAATAAATGCTGGCATATCCAGT 10020

 89484488 GCATTGGCAGCACCACGGGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGGACCCAGCTTTCACTATC 89484547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10021 GCATTGGCAGCACCACGGGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGGACCCAGCTTTCACTATC 10080

 89484548 TTGTGTGTATCTATTATTTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGAACAAAGAGAGAGCCCCG 89484607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10081 TTGTGTGTATCTATTATTTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGAACAAAGAGAGAGCCCCG 10140

 89484608 TTGCATTGCAGGCTGCTGGCCAGATCCCGCAATAAATAACAAATGTTGGTGAATATGAAG 89484667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10141 TTGCATTGCAGGCTGCTGGCCAGATCCCGCAATAAATAACAAATGTTGGTGAATATGAAG 10200

 89484668 AGAAATTAGAACCCTTGTGCATTTCTGTTGGGAATGCTAAATGGTGCAGTCACTGTGGAA 89484727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10201 AGAAATTAGAACCCTTGTGCATTTCTGTTGGGAATGCTAAATGGTGCAGTCACTGTGGAA 10260

 89484728 AATGATACAGCAATTCCTTAAAAAATTTAACATGGAATGACTATATGAGCCATCAGTTCC 89484787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10261 AATGATACAGCAATTCCTTAAAAAATTTAACATGGAATGACTATATGAGCCATCAGTTCC 10320

 89484788 ACTTCTGGGTGTATACTGAAAAGGAGTGAAAGCAGGGACTCGAACAGATATTCAGACACC 89484847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10321 ACTTCTGGGTGTATACTGAAAAGGAGTGAAAGCAGGGACTCGAACAGATATTCAGACACC 10380

 89484848 CATGATCCTATCAGCATTATTTGTAATAGCCAAAAGGTGTAAGCAACCCAAGTGTCAACT 89484907
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
    10381 CATGATCCTATCAGCATTATTTGTAATAGCCAAAAGGTGTAAGCAACACAAGTGTCAACT 10440

 89484908 GACAAGCGAACAGATAAATTAGTATACACATATAATTACTTAGCCTTGAAAAGGAAGAAT 89484967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10441 GACAAGCGAACAGATAAATTAGTATACACATATAATTACTTAGCCTTGAAAAGGAAGAAT 10500

 89484968 TTTTTATTTCTTTATTTATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTATGCCCAGGCTGGAGTGCA 89485027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10501 TTTTTATTTCTTTATTTATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTATGCCCAGGCTGGAGTGCA 10560

 89485028 AAGGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCTGTTTCCCAGATTCAAGTGATTCTCCTGCCC 89485087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10561 AAGGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCTGTTTCCCAGATTCAAGTGATTCTCCTGCCC 10620

 89485088 CAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTATT 89485147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10621 CAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTATT 10680

 89485148 TTTAGTAAAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTTGAACTCCCGACCTCAGG 89485207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10681 TTTAGTAAAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTTGAACTCCCGACCTCAGG 10740

 89485208 TGATCTGCCTGCATTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCCATGAGTGCCCAGCCAAA 89485267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10741 TGATCTGCCTGCATTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCCATGAGTGCCCAGCCAAA 10800

 89485268 AAGGAAAAATTTTGACACATGCTACCACACTGAACCTTGAAGACATTATGTGAATTAGAA 89485327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10801 AAGGAAAAATTTTGACACATGCTACCACACTGAACCTTGAAGACATTATGTGAATTAGAA 10860

 89485328 TAAGCCAGTCACCAAAGGACAAATATTGAATGACTCCACTTATATAACATTCCTAGAGTA 89485387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10861 TAAGCCAGTCACCAAAGGACAAATATTGAATGACTCCACTTATATAACATTCCTAGAGTA 10920

 89485388 GTCAAATTAATAGAGATGGAATGTAGAATTGTGGCAGGAGATGGGTGTAGGTGGGGCTTT 89485447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10921 GTCAAATTAATAGAGATGGAATGTAGAATTGTGGCAGGAGATGGGTGTAGGTGGGGCTTT 10980

 89485448 TGTTTAATTGGCACAGAGTTTCTTTTGGGGAAGATTAAAAAGTTCTGGAAATAGATGGTA 89485507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10981 TGTTTAATTGGCACAGAGTTTCTTTTGGGGAAGATTAAAAAGTTCTGGAAATAGATGGTA 11040

 89485508 GTGATGGTTGCACAACAATTTGAATTTAATTAATACCACAGAACTACATACTTAATAATG 89485567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11041 GTGATGGTTGCACAACAATTTGAATTTAATTAATACCACAGAACTACATACTTAATAATG 11100

 89485568 GTTACAAGGATAAATTTTATGTTTATATATTTTTTAAAACAATAAACAAGAAAATCCAAT 89485627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11101 GTTACAAGGATAAATTTTATGTTTATATATTTTTTAAAACAATAAACAAGAAAATCCAAT 11160

 89485628 ACAGACTGAAACATTTTTTCAACCTTAAAGATCAGTGTAAACTTGCTGTTACTATGTGAA 89485687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11161 ACAGACTGAAACATTTTTTCAACCTTAAAGATCAGTGTAAACTTGCTGTTACTATGTGAA 11220

 89485688 CATGGGCAGGCGATCTCTTGAGCCCAGGAGCTTGAGACCTGCATGGGCAACATGATGAAA 89485747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11221 CATGGGCAGGCGATCTCTTGAGCCCAGGAGCTTGAGACCTGCATGGGCAACATGATGAAA 11280

 89485748 CCCTGTGTCTACCAAAAATACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGCATCTGTAGTCCTA 89485807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11281 CCCTGTGTCTACCAAAAATACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGCATCTGTAGTCCTA 11340

 89485808 CCTACTCAGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGACTGTGGTGA 89485867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11341 CCTACTCAGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGACTGTGGTGA 11400

 89485868 GCTGAGATCTTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGGAAAGAGCAAGACCTTGTCTCAAGAAAA 89485927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11401 GCTGAGATCTTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGGAAAGAGCAAGACCTTGTCTCAAGAAAA 11460

 89485928 AAAAAGACTAGTCAAGTGCAGTCAGTAGTGAGAAGGGTGAGGAGAAAGAGTAGAACAAGG 89485987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11461 AAAAAGACTAGTCAAGTGCAGTCAGTAGTGAGAAGGGTGAGGAGAAAGAGTAGAACAAGG 11520

 89485988 AGTTCAACTGTAACTCATGGTGAACAGTCAATTGAGATAACTCACTACCCTCAGAACAGC 89486047
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
    11521 AGTTCAACTGTAACTCATGGTGAACAGTCAATTGAGATAACTCACTACCTTCAGAACAGC 11580

 89486048 TGTGAGCTGATGCTTATCCCCTAGAAGAGTGAAGATAAGGAGCCCAACTGTGAATGGAAA 89486107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11581 TGTGAGCTGATGCTTATCCCCTAGAAGAGTGAAGATAAGGAGCCCAACTGTGAATGGAAA 11640

 89486108 GTTAGCTTATTCCCAGTGCCAGCTTTCTCTCCTCACATCCTCATAATGGATGCTGACTGT 89486167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11641 GTTAGCTTATTCCCAGTGCCAGCTTTCTCTCCTCACATCCTCATAATGGATGCTGACTGT 11700

 89486168 GTTGGGGGACAGAAGGGACTTGGCAGAGCTTTGCTCATGCCACTCACCCTTATTCTTCCC 89486227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11701 GTTGGGGGACAGAAGGGACTTGGCAGAGCTTTGCTCATGCCACTCACCCTTATTCTTCCC 11760

 89486228 AGCTAGCTTGTTCATCAGGTAGGATTTTCCTGTGCGGTAGAGGCCCACAATTGCCACCAC 89486287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11761 AGCTAGCTTGTTCATCAGGTAGGATTTTCCTGTGCGGTAGAGGCCCACAATTGCCACCAC 11820

 89486288 CACCACAGGCTGTGTAATGGCAGACAGGATTTTCAGAGCTTCTGGATTCGCCACCAGTTC 89486347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11821 CACCACAGGCTGTGTAATGGCAGACAGGATTTTCAGAGCTTCTGGATTCGCCACCAGTTC 11880

 89486348 CCCATTAGTGTTCTCAATGAGGCACATTGGGCCTGTCATGTGGATCTCTGGAGCCATGTC 89486407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11881 CCCATTAGTGTTCTCAATGAGGCACATTGGGCCTGTCATGTGGATCTCTGGAGCCATGTC 11940

 89486408 CAGGGCATTGTTCTCTTGTCTGCAAGGGAAGAGTTGGAATGAATTAGAATTTCCAGTCTT 89486467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11941 CAGGGCATTGTTCTCTTGTCTGCAAGGGAAGAGTTGGAATGAATTAGAATTTCCAGTCTT 12000

 89486468 TTGCATTTAGAGGATAGAGTCACAGAATTCCCCAGGATGGCCAAAAGTTTTGTGTGTGTC 89486527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12001 TTGCATTTAGAGGATAGAGTCACAGAATTCCCCAGGATGGCCAAAAGTTTTGTGTGTGTC 12060

 89486528 AGTGAGAGAGATGAGGGAAAATGTGTATCATTTTAAAAAATTATGGAAGTATTATCATCA 89486587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12061 AGTGAGAGAGATGAGGGAAAATGTGTATCATTTTAAAAAATTATGGAAGTATTATCATCA 12120

 89486588 AATTAAATATTGGTATGACAGTAACTTATCAACAGTCAACTACTCTTGCAACCTAGAACT 89486647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12121 AATTAAATATTGGTATGACAGTAACTTATCAACAGTCAACTACTCTTGCAACCTAGAACT 12180

 89486648 TTCATTTAATTTATTATGGAAAAGCTTCCCTTGGATTCTCATTAAAAAATTTACACTAGA 89486707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12181 TTCATTTAATTTATTATGGAAAAGCTTCCCTTGGATTCTCATTAAAAAATTTACACTAGA 12240

 89486708 CAATAAATGGAAGATAAAATAGGATATAGAGAATTTTTTTTACATCCTGGCTATATGTAA 89486767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12241 CAATAAATGGAAGATAAAATAGGATATAGAGAATTTTTTTTACATCCTGGCTATATGTAA 12300

 89486768 GAAATTAAATATTGATTTGTTTATTCATGAATTCTTATGATGAATAAAGACCCCCATGAG 89486827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12301 GAAATTAAATATTGATTTGTTTATTCATGAATTCTTATGATGAATAAAGACCCCCATGAG 12360

 89486828 TAAATGTTTCATTGTTTGACATATGCCCTTAGGACAATTTCCAGAGATTTATAAATGTGT 89486887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12361 TAAATGTTTCATTGTTTGACATATGCCCTTAGGACAATTTCCAGAGATTTATAAATGTGT 12420

 89486888 TCCTTCCTCCATTTTCAACTGGTTATGCTTATTTCACTGTAATGAGGATCCACAAAACTT 89486947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12421 TCCTTCCTCCATTTTCAACTGGTTATGCTTATTTCACTGTAATGAGGATCCACAAAACTT 12480

 89486948 CTCACAGTGCCATTCTGGAAGTGGAACCAATGTAACATACTTTTGCAAATTCTATACAAC 89487007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12481 CTCACAGTGCCATTCTGGAAGTGGAACCAATGTAACATACTTTTGCAAATTCTATACAAC 12540

 89487008 TACATAACCATGTGAAACACATGGCTAGGGACCTTTCCAAGGGCTTTGAAGGGGCACGTG 89487067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12541 TACATAACCATGTGAAACACATGGCTAGGGACCTTTCCAAGGGCTTTGAAGGGGCACGTG 12600

 89487068 CAAGAGAGGGGCCCTGAAACTTAAGCTTCATTAGCGTCATGATAAGGTAGCCTCTAACTC 89487127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12601 CAAGAGAGGGGCCCTGAAACTTAAGCTTCATTAGCGTCATGATAAGGTAGCCTCTAACTC 12660

 89487128 AGTGTGGGTATAAATGCAAAACTGCCAATACTGAATGTTGCTAAGAAACACGCATGCGCG 89487187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12661 AGTGTGGGTATAAATGCAAAACTGCCAATACTGAATGTTGCTAAGAAACACGCATGCGCG 12720

 89487188 CGCGCGCACACACACACACACACACACACACACACACACA----CCCCAAAAAAACCAAA 89487243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||
    12721 CGCGCGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACCCCCCAAAAAAACCAAA 12780

 89487244 CCAAACAAACAACAGCAACAACAAAAAACCCCATGAAATAAGGACTGAAAGACCAGGAAG 89487303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12781 CCAAACAAACAACAGCAACAACAAAAAACCCCATGAAATAAGGACTGAAAGACCAGGAAG 12840

 89487304 CACATAAAGAGAGCTACATGGGAAGAT 89487330
          |||||||||||||||||||||||||||
    12841 CACATAAAGAGAGCTACATGGGAAGAT 12867

Alignment time is 16.6363 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3638] =>      3638 nucs 'mol-32-317a-144472_3638'

Score:        3561
Aligned:      3640        nucs
Identic:      3632 (100%) nucs =>       856 ( 99%)      2776 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475048,89475908] EXCISED REGION [89478625,89481403]
 second seq =>  [       1,     859] EXCISED REGION [     860,    3638]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89475048 AATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCT 89475107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCT 60

 89475108 GGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAA 89475167
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCATAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAA 120

 89475168 TCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAG 89475227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAG 180

 89475228 GTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGT 89475287
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGT 240

 89475288 GTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATC 89475347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATC 300

 89475348 AGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGA 89475407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGA 360

 89475408 TTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGA 89475467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGA 420

 89475468 GCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGA 89475527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGA 480

 89475528 GGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCAT 89475587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCAT 540

 89475588 GACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGA 89475647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGA 600

 89475648 TGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAA 89475707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAA 660

 89475708 ATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAAC 89475767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAAC 720

 89475768 TCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGA 89475827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||
      721 TCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTT--GAGA 778

 89475828 CAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACC 89475887
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 CAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACC 838

 89475888 TCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          |||||||||||||||||||||
      839 TCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 859

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 919

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 979

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 1039

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1040 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 1099

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 1159

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 1219

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 1279

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 1339

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 1399

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 1459

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 1519

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 1579

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 1639

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 1699

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 1759

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 1819

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 1879

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 1939

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1940 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 1999

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 2059

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 2119

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 2179

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 2239

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 2299

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 2359

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 2419

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 2479

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 2539

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 2599

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 2659

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 2719

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 2779

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 2839

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 2899

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 2959

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 3019

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 3079

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 3139

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 3199

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 3259

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 3319

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 3379

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 3439

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 3499

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 3559

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 3619

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGG 89481403
          |||||||||||||||||||
     3620 CCACTGCACTCCAGCCTGG 3638

Alignment time is 5.34608 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,   13535] =>     13535 nucs 'mol-32-321f-028200_13535'

Score:       13387
Aligned:     13530        nucs
Identic:     13517 (100%) nucs =>      8736 (100%)      4781 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89472681,89481421] EXCISED REGION [89481428,89486215]
 second seq =>  [       1,    8741] EXCISED REGION [    8748,   13535]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [89481422,89481427]
 second seq =>         6 nucs [8742,8747]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89481421,89481421] to [89481427,89481427]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89481422,89481422] to [89481427,89481427]
 second seq =>         0 nucs

 89472681 ATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCA 89472740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCA 60

 89472741 GGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAAC 89472800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAAC 120

 89472801 AAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTA 89472860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTA 180

 89472861 ATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTT 89472920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTT 240

 89472921 GCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTA 89472980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTA 300

 89472981 TTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAA 89473040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAA 360

 89473041 GCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAA 89473100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAA 420

 89473101 ATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAAT 89473160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAAT 480

 89473161 AAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATC 89473220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATC 540

 89473221 TTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCA 89473280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCA 600

 89473281 TGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACA 89473340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACA 660

 89473341 CTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTC 89473400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTC 720

 89473401 TGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTT 89473460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTT 780

 89473461 CTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAG 89473520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAG 840

 89473521 TACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAA 89473580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAA 900

 89473581 ATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCT 89473640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCT 960

 89473641 TGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGAT 89473700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGAT 1020

 89473701 TATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGA 89473760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGA 1080

 89473761 TGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACA 89473820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACA 1140

 89473821 ATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACAC 89473880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACAC 1200

 89473881 ACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGT 89473940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGT 1260

 89473941 ATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGC 89474000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGC 1320

 89474001 AGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCT 89474060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCT 1380

 89474061 CCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCC 89474120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCC 1440

 89474121 TACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCA 89474180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCA 1500

 89474181 TACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAG 89474240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAG 1560

 89474241 ATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCC 89474300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCC 1620

 89474301 TCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGAT 89474360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGAT 1680

 89474361 AAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGG 89474420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGG 1740

 89474421 GACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTT 89474480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTT 1800

 89474481 CAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGC 89474540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGC 1860

 89474541 TTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAA 89474600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAA 1920

 89474601 ACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGC 89474660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGC 1980

 89474661 TCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCT 89474720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCT 2040

 89474721 TGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACC 89474780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACC 2100

 89474781 ATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAA 89474840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAA 2160

 89474841 ACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTT 89474900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTT 2220

 89474901 GCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTT 89474960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTT 2280

 89474961 TAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAAT 89475020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAAT 2340

 89475021 TATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAA 89475080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAA 2400

 89475081 TCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACT 89475140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACT 2460

 89475141 CCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAG 89475200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAG 2520

 89475201 TGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTT 89475260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTT 2580

 89475261 CTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGC 89475320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGC 2640

 89475321 CAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGA 89475380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGA 2700

 89475381 GGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAAT 89475440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAAT 2760

 89475441 TTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAG 89475500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAG 2820

 89475501 CAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGG 89475560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGG 2880

 89475561 AGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCT 89475620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCT 2940

 89475621 TTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTG 89475680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTG 3000

 89475681 GGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGT 89475740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGT 3060

 89475741 GGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAAT 89475800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAAT 3120

 89475801 TAACTAATTTTTTTTTTTTTTTT-GAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGC 89475859
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGC 3180

 89475860 AGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCC 89475919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCC 3240

 89475920 TCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTA 89475979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTA 3300

 89475980 TTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTG 89476039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTG 3360

 89476040 TGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCG 89476099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCG 3420

 89476100 GCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTG 89476159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTG 3480

 89476160 AGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTC 89476219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTC 3540

 89476220 TGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTA 89476279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTA 3600

 89476280 GAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGC 89476339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGC 3660

 89476340 CTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCA 89476399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCA 3720

 89476400 CTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTT 89476459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTT 3780

 89476460 ATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTT 89476519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTT 3840

 89476520 GGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCT 89476579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCT 3900

 89476580 TGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCT 89476639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCT 3960

 89476640 TCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTT 89476699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTT 4020

 89476700 CTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGAT 89476759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGAT 4080

 89476760 TCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAA 89476819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAA 4140

 89476820 GTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCC 89476879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCC 4200

 89476880 GAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCT 89476939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCT 4260

 89476940 TACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTG 89476999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTG 4320

 89477000 AGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAAT 89477059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAAT 4380

 89477060 GATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAA 89477119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAA 4440

 89477120 TTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGA 89477179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGA 4500

 89477180 TTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAG 89477239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAG 4560

 89477240 CAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATT 89477299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATT 4620

 89477300 ACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATA 89477359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 ACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATA 4680

 89477360 CCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATA 89477419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATA 4740

 89477420 GAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCA 89477479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCA 4800

 89477480 TATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGG 89477539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGG 4860

 89477540 TTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTT 89477599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTT 4920

 89477600 GCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCA 89477659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCA 4980

 89477660 GATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACA 89477719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACA 5040

 89477720 AAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAA 89477779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAA 5100

 89477780 CATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCT 89477839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCT 5160

 89477840 TGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTT 89477899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTT 5220

 89477900 GGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATG 89477959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATG 5280

 89477960 ACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAA 89478019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 ACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAA 5340

 89478020 GGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGAT 89478079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGAT 5400

 89478080 CAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATT 89478139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATT 5460

 89478140 TTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGT 89478199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGT 5520

 89478200 TCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAAT 89478259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAAT 5580

 89478260 TGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTG 89478319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTG 5640

 89478320 TCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATA 89478379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATA 5700

 89478380 AAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCT 89478439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCT 5760

 89478440 ATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTT 89478499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 ATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTT 5820

 89478500 CAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTC 89478559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTC 5880

 89478560 ACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTC 89478619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 ACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTC 5940

 89478620 AAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGC 89478679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 AAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGC 6000

 89478680 CTCATTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCT 89478739
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CTCATTT-TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCT 6059

 89478740 CAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 89478799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 CAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 6119

 89478800 CATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGG 89478859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     6120 CATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGG 6179

 89478860 GGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCT 89478919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 GGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCT 6239

 89478920 AAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATC 89478979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 AAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATC 6299

 89478980 TTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACA 89479039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 TTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACA 6359

 89479040 TTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTT 89479099
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     6360 TTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTT 6419

 89479100 TTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAA 89479159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 TTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAA 6479

 89479160 GCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCA 89479219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 GCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCA 6539

 89479220 ACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCAT 89479279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 ACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCAT 6599

 89479280 TCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTC 89479339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 TCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTC 6659

 89479340 TTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTT 89479399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 TTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTT 6719

 89479400 TAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACA 89479459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 TAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACA 6779

 89479460 TAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTA 89479519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6780 TAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTA 6839

 89479520 TTTTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAG 89479579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6840 TTTTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAG 6899

 89479580 CATTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAA 89479639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6900 CATTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAA 6959

 89479640 TTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAG 89479699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6960 TTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAG 7019

 89479700 TAAACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTC 89479759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     7020 TAAACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCC 7079

 89479760 TGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTC 89479819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7080 TGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTC 7139

 89479820 CATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGC 89479879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7140 CATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGC 7199

 89479880 TCACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTC 89479939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7200 TCACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTC 7259

 89479940 GATGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACA 89479999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7260 GATGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACA 7319

 89480000 GGAACCTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTA 89480059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7320 GGAACCTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTA 7379

 89480060 ACCTAAGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTT 89480119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7380 ACCTAAGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTT 7439

 89480120 TTGTTTTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAA 89480179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7440 TTGTTTTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAA 7499

 89480180 TACAGGTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGT 89480239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7500 TACAGGTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGT 7559

 89480240 CCATAGCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGA 89480299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7560 CCATAGCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGA 7619

 89480300 CGGCCAGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTG 89480359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7620 CGGCCAGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTG 7679

 89480360 GAGTCAGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATAT 89480419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7680 GAGTCAGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATAT 7739

 89480420 CATAAGTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAA 89480479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7740 CATAAGTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAA 7799

 89480480 AATGATTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATAC 89480539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7800 AATGATTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATAC 7859

 89480540 ACTGATTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAA 89480599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7860 ACTGATTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAA 7919

 89480600 GGTTAATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTAT 89480659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7920 GGTTAATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTAT 7979

 89480660 AAGTTCTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCT 89480719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7980 AAGTTCTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCT 8039

 89480720 GTGTTAACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATG 89480779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8040 GTGTTAACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATG 8099

 89480780 CTTTGCTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTT 89480839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8100 CTTTGCTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTT 8159

 89480840 ATGACATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGA 89480899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8160 ATGACATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGA 8219

 89480900 AAAAACTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTT 89480959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8220 AAAAACTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTT 8279

 89480960 TGACCCTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTT 89481019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8280 TGACCCTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTT 8339

 89481020 CTGGCTTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTG 89481079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8340 CTGGCTTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTG 8399

 89481080 TGGAGCCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATA 89481139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8400 TGGAGCCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATA 8459

 89481140 GCAGGTACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAAC 89481199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8460 GCAGGTACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAAC 8519

 89481200 CAAAACCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATC 89481259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8520 CAAAACCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATC 8579

 89481260 CAGTACATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGA 89481319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8580 CAGTACATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGA 8639

 89481320 AAAAAACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGA 89481379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8640 AAAAAACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGA 8699

 89481380 TAGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCT 89481421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8700 TAGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCT 8741

EXCISED REGION

 89481428 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAA 89481487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8748 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAA 8807

 89481488 CAAAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAAT 89481547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8808 CAAAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAAT 8867

 89481548 TTTCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAG 89481607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8868 TTTCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAG 8927

 89481608 TACTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTG 89481667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8928 TACTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTG 8987

 89481668 GAAAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTA 89481727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8988 GAAAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTA 9047

 89481728 AATATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAA 89481787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9048 AATATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAA 9107

 89481788 ATTAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAA 89481847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9108 ATTAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAA 9167

 89481848 ATTTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAAT 89481907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9168 ATTTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAAT 9227

 89481908 TGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGA 89481967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9228 TGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGA 9287

 89481968 TCACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAA 89482027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9288 TCACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAA 9347

 89482028 ACTACACACACACACACACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCA 89482087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9348 ACTACACACACACACACACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCA 9407

 89482088 GCTACTCGGGTGGCTGAGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 89482147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9408 GCTACTCGGGTGGCTGAGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 9467

 89482148 GCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAAC 89482207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9468 GCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAAC 9527

 89482208 AAACAAAAAACCCAAAAAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACA 89482267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9528 AAACAAAAAACCCAAAAAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACA 9587

 89482268 AAATTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACT 89482327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9588 AAATTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACT 9647

 89482328 GATCACTGTAGTCTTGACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTA 89482387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9648 GATCACTGTAGTCTTGACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTA 9707

 89482388 GCTGAGACTACAGGCACGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATG 89482447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9708 GCTGAGACTACAGGCACGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATG 9767

 89482448 GGGTTTCCCCGTGTTGTCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCC 89482507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9768 GGGTTTCCCCGTGTTGTCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCC 9827

 89482508 TCAGCTTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTT 89482567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9828 TCAGCTTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTT 9887

 89482568 AAAAGAAATTAAGGAAGAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGA 89482627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9888 AAAAGAAATTAAGGAAGAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGA 9947

 89482628 TTCAATGCAATCCCTATCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATA 89482687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9948 TTCAATGCAATCCCTATCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATA 10007

 89482688 TCCACACTAACTTTCATATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAA 89482747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10008 TCCACACTAACTTTCATATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAA 10067

 89482748 AAGGAAGAAGAAAGTCAGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAG 89482807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10068 AAGGAAGAAGAAAGTCAGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAG 10127

 89482808 GATAATCAACACAGTTTGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAG 89482867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10128 GATAATCAACACAGTTTGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAG 10187

 89482868 AGAGCCTAGAAATGAACTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAA 89482927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10188 AGAGCCTAGAAATGAACTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAA 10247

 89482928 TCATTCAACGCAGAAAGAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCA 89482987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10248 TCATTCAACGCAGAAAGAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCA 10307

 89482988 CATGCTCACATGCCAAAAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACG 89483047
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10308 CATGCCCACATGCCAAAAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACG 10367

 89483048 TAACTCAAAATGGATCAAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGA 89483107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10368 TAACTCAAAATGGATCAAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGA 10427

 89483108 AAACAAAGGGGAAAAACAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAAT 89483167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10428 AAACAAAGGGGAAAAACAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAAT 10487

 89483168 GAAAAACTTTTGTGCATCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATG 89483227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10488 GAAAAACTTTTGTGCATCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATG 10547

 89483228 GAAGAAAACATTTGCTAAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGA 89483287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10548 GAAGAAAACATTTGCTAAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGA 10607

 89483288 ATTCCTACAATGCAACACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTC 89483347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10608 ATTCCTACAATGCAACACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTC 10667

 89483348 TCTAAAGAATGGCCAATAAGCACCTGAAAAGATGCTCAACATTACTAGTCATTAGGAAAA 89483407
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
    10668 TCTAAAGAATGGCCAATAAGCACCTGAAAAGATGCTCAATATTACTAGTCATTAGGAAAA 10727

 89483408 TGCAAATTAAAGCCATAGTGAGATACTACTTCACATCCATTAGTATGGTGACTATCAAAA 89483467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10728 TGCAAATTAAAGCCATAGTGAGATACTACTTCACATCCATTAGTATGGTGACTATCAAAA 10787

 89483468 AAAATTGAAAAGGGCTGGGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCT 89483527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10788 AAAATTGAAAAGGGCTGGGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCT 10847

 89483528 GAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCAAATATGGAGAAAC 89483587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10848 GAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCAAATATGGAGAAAC 10907

 89483588 CCCATTTACACTAAAAATACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCA 89483647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10908 CCCATTTACACTAAAAATACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCA 10967

 89483648 CCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 89483707
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10968 CCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGAAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 11027

 89483708 GCTGGGGTCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTGTGTCTCAAAAAA 89483767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11028 GCTGGGGTCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTGTGTCTCAAAAAA 11087

 89483768 AAAAAAAATTAAAATAACTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATTGCTATGGAATAAAAGAT 89483827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11088 AAAAAAAATTAAAATAACTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATTGCTATGGAATAAAAGAT 11147

 89483828 GAAATGCTCCTGATTATTGTAAATACAAAATTGCATGCAGGATTGTGCAAAGACAGTGCC 89483887
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
    11148 GAAATGCTCCTGATTATTGTAAATACAAAATTGCATGCAGGATTGTGCAAAGACAATGCC 11207

 89483888 AGGTTGGACTGCCAGAATGAGCCAACGGGACGTGATGTGCTTCCCCCTGCAGAGAGCCTA 89483947
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
    11208 AGGTTGGACTGCCAGAATGAGCCAACGGCACGTGATGTGCTTCCCCCTGCAGAGAGCCTA 11267

 89483948 TGAATGGATGTGCAGTCAGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTCCTATCCCAGAAAAGCAG 89484007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11268 TGAATGGATGTGCAGTCAGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTCCTATCCCAGAAAAGCAG 11327

 89484008 ATGTTCATAGCTCTGGGAATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGAGGGGGCACCTGTCCATG 89484067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11328 ATGTTCATAGCTCTGGGAATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGAGGGGGCACCTGTCCATG 11387

 89484068 TGGATAAGATAGGGCCATAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTCTTCTAGGCCTCTTTAGG 89484127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11388 TGGATAAGATAGGGCCATAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTCTTCTAGGCCTCTTTAGG 11447

 89484128 GTTAAGGCATACTCCCTTCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTTGTCTAGCTTCACGTCTT 89484187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11448 GTTAAGGCATACTCCCTTCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTTGTCTAGCTTCACGTCTT 11507

 89484188 GTTTCTATGGATTGTTTGTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTACTGCTGATTAATATCTT 89484247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11508 GTTTCTATGGATTGTTTGTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTACTGCTGATTAATATCTT 11567

 89484248 GCTAATCATAGGTTATGAAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCTCTGTTAGAAATTACTGA 89484307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11568 GCTAATCATAGGTTATGAAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCTCTGTTAGAAATTACTGA 11627

 89484308 TGCACACACTATATTGTAAATTCTTATCTCTGTATACTGTACTTCTGCATACAGATGTTA 89484367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11628 TGCACACACTATATTGTAAATTCTTATCTCTGTATACTGTACTTCTGCATACAGATGTTA 11687

 89484368 TGTTAAAGAATTACTTCATCCCCATGTGACCATCTCACCTCATAATCAAACGACCCTAAA 89484427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11688 TGTTAAAGAATTACTTCATCCCCATGTGACCATCTCACCTCATAATCAAACGACCCTAAA 11747

 89484428 TCCCTCACTAACCTTCCCCCACCCTCACTAAACTTAATAATAAATGCTGGCATATCCAGT 89484487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11748 TCCCTCACTAACCTTCCCCCACCCTCACTAAACTTAATAATAAATGCTGGCATATCCAGT 11807

 89484488 GCATTGGCAGCACCACGGGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGGACCCAGCTTTCACTATC 89484547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11808 GCATTGGCAGCACCACGGGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGGACCCAGCTTTCACTATC 11867

 89484548 TTGTGTGTATCTATTATTTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGAACAAAGAGAGAGCCCCG 89484607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11868 TTGTGTGTATCTATTATTTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGAACAAAGAGAGAGCCCCG 11927

 89484608 TTGCATTGCAGGCTGCTGGCCAGATCCCGCAATAAATAACAAATGTTGGTGAATATGAAG 89484667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11928 TTGCATTGCAGGCTGCTGGCCAGATCCCGCAATAAATAACAAATGTTGGTGAATATGAAG 11987

 89484668 AGAAATTAGAACCCTTGTGCATTTCTGTTGGGAATGCTAAATGGTGCAGTCACTGTGGAA 89484727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11988 AGAAATTAGAACCCTTGTGCATTTCTGTTGGGAATGCTAAATGGTGCAGTCACTGTGGAA 12047

 89484728 AATGATACAGCAATTCCTTAAAAAATTTAACATGGAATGACTATATGAGCCATCAGTTCC 89484787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12048 AATGATACAGCAATTCCTTAAAAAATTTAACATGGAATGACTATATGAGCCATCAGTTCC 12107

 89484788 ACTTCTGGGTGTATACTGAAAAGGAGTGAAAGCAGGGACTCGAACAGATATTCAGACACC 89484847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12108 ACTTCTGGGTGTATACTGAAAAGGAGTGAAAGCAGGGACTCGAACAGATATTCAGACACC 12167

 89484848 CATGATCCTATCAGCATTATTTGTAATAGCCAAAAGGTGTAAGCAACCCAAGTGTCAACT 89484907
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
    12168 CATGATCCTATCAGCATTATTTGTAATAGCCAAAAGGTGTAAGCAACACAAGTGTCAACT 12227

 89484908 GACAAGCGAACAGATAAATTAGTATACACATATAATTACTTAGCCTTGAAAAGGAAGAAT 89484967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12228 GACAAGCGAACAGATAAATTAGTATACACATATAATTACTTAGCCTTGAAAAGGAAGAAT 12287

 89484968 TTTTTATTTCTTTATTTATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTATGCCCAGGCTGGAGTGCA 89485027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12288 TTTTTATTTCTTTATTTATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTATGCCCAGGCTGGAGTGCA 12347

 89485028 AAGGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCTGTTTCCCAGATTCAAGTGATTCTCCTGCCC 89485087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12348 AAGGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCTGTTTCCCAGATTCAAGTGATTCTCCTGCCC 12407

 89485088 CAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTATT 89485147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12408 CAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTATT 12467

 89485148 TTTAGTAAAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTTGAACTCCCGACCTCAGG 89485207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12468 TTTAGTAAAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTTGAACTCCCGACCTCAGG 12527

 89485208 TGATCTGCCTGCATTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCCATGAGTGCCCAGCCAAA 89485267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12528 TGATCTGCCTGCATTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCCATGAGTGCCCAGCCAAA 12587

 89485268 AAGGAAAAATTTTGACACATGCTACCACACTGAACCTTGAAGACATTATGTGAATTAGAA 89485327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12588 AAGGAAAAATTTTGACACATGCTACCACACTGAACCTTGAAGACATTATGTGAATTAGAA 12647

 89485328 TAAGCCAGTCACCAAAGGACAAATATTGAATGACTCCACTTATATAACATTCCTAGAGTA 89485387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12648 TAAGCCAGTCACCAAAGGACAAATATTGAATGACTCCACTTATATAACATTCCTAGAGTA 12707

 89485388 GTCAAATTAATAGAGATGGAATGTAGAATTGTGGCAGGAGATGGGTGTAGGTGGGGCTTT 89485447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12708 GTCAAATTAATAGAGATGGAATGTAGAATTGTGGCAGGAGATGGGTGTAGGTGGGGCTTT 12767

 89485448 TGTTTAATTGGCACAGAGTTTCTTTTGGGGAAGATTAAAAAGTTCTGGAAATAGATGGTA 89485507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12768 TGTTTAATTGGCACAGAGTTTCTTTTGGGGAAGATTAAAAAGTTCTGGAAATAGATGGTA 12827

 89485508 GTGATGGTTGCACAACAATTTGAATTTAATTAATACCACAGAACTACATACTTAATAATG 89485567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12828 GTGATGGTTGCACAACAATTTGAATTTAATTAATACCACAGAACTACATACTTAATAATG 12887

 89485568 GTTACAAGGATAAATTTTATGTTTATATATTTTTTAAAACAATAAACAAGAAAATCCAAT 89485627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12888 GTTACAAGGATAAATTTTATGTTTATATATTTTTTAAAACAATAAACAAGAAAATCCAAT 12947

 89485628 ACAGACTGAAACATTTTTTCAACCTTAAAGATCAGTGTAAACTTGCTGTTACTATGTGAA 89485687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12948 ACAGACTGAAACATTTTTTCAACCTTAAAGATCAGTGTAAACTTGCTGTTACTATGTGAA 13007

 89485688 CATGGGCAGGCGATCTCTTGAGCCCAGGAGCTTGAGACCTGCATGGGCAACATGATGAAA 89485747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13008 CATGGGCAGGCGATCTCTTGAGCCCAGGAGCTTGAGACCTGCATGGGCAACATGATGAAA 13067

 89485748 CCCTGTGTCTACCAAAAATACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGCATCTGTAGTCCTA 89485807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13068 CCCTGTGTCTACCAAAAATACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGCATCTGTAGTCCTA 13127

 89485808 CCTACTCAGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGACTGTGGTGA 89485867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13128 CCTACTCAGGAGGCTGAGGTGAGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGACTGTGGTGA 13187

 89485868 GCTGAGATCTTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGGAAAGAGCAAGACCTTGTCTCAAGAAAA 89485927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13188 GCTGAGATCTTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGGAAAGAGCAAGACCTTGTCTCAAGAAAA 13247

 89485928 AAAAAGACTAGTCAAGTGCAGTCAGTAGTGAGAAGGGTGAGGAGAAAGAGTAGAACAAGG 89485987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13248 AAAAAGACTAGTCAAGTGCAGTCAGTAGTGAGAAGGGTGAGGAGAAAGAGTAGAACAAGG 13307

 89485988 AGTTCAACTGTAACTCATGGTGAACAGTCAATTGAGATAACTCACTACCCTCAGAACAGC 89486047
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
    13308 AGTTCAACTGTAACTCATGGTGAACAGTCAATTGAGATAACTCACTACCTTCAGAACAGC 13367

 89486048 TGTGAGCTGATGCTTATCCCCTAGAAGAGTGAAGATAAGGAGCCCAACTGTGAATGGAAA 89486107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13368 TGTGAGCTGATGCTTATCCCCTAGAAGAGTGAAGATAAGGAGCCCAACTGTGAATGGAAA 13427

 89486108 GTTAGCTTATTCCCAGTGCCAGCTTTCTCTCCTCACATCCTCATAATGGATGCTGACTGT 89486167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13428 GTTAGCTTATTCCCAGTGCCAGCTTTCTCTCCTCACATCCTCATAATGGATGCTGACTGT 13487

 89486168 GTTGGGGGACAGAAGGGACTTGGCAGAGCTTTGCTCATGCCACTCACC 89486215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13488 GTTGGGGGACAGAAGGGACTTGGCAGAGCTTTGCTCATGCCACTCACC 13535

Alignment time is 17.2982 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    6511] =>      6511 nucs 'mol-32-3235-059527_6511'

Score:        6501
Aligned:      6501        nucs
Identic:      6501 (100%) nucs =>      6335 (100%)       166 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89472352,89478686] EXCISED REGION [89478688,89478853]
 second seq =>  [       1,    6335] EXCISED REGION [    6336,    6501]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89478687,89478687]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [89478684,89478686] to [89478688,89478690]
 second seq =>         3 nucs [6333,6335] to [6336,6338]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89472352 AGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTATTTCTAGTTCAAAAATAATCTGTAATTG 89472411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTATTTCTAGTTCAAAAATAATCTGTAATTG 60

 89472412 CTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTGACAATTGGGATGAAGTCTACATAT 89472471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTGACAATTGGGATGAAGTCTACATAT 120

 89472472 ACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATAT 89472531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATAT 180

 89472532 TCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTA 89472591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTA 240

 89472592 ACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGT 89472651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGT 300

 89472652 CTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCA 89472711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCA 360

 89472712 TAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCAC 89472771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCAC 420

 89472772 ATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATT 89472831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATT 480

 89472832 TGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATA 89472891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATA 540

 89472892 AGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTA 89472951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTA 600

 89472952 TCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAAT 89473011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAAT 660

 89473012 GGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCC 89473071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCC 720

 89473072 ATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTC 89473131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTC 780

 89473132 CTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCC 89473191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCC 840

 89473192 TCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGA 89473251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGA 900

 89473252 AAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCA 89473311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCA 960

 89473312 AGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTA 89473371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTA 1020

 89473372 TGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATA 89473431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATA 1080

 89473432 TATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGG 89473491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGG 1140

 89473492 GTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAAT 89473551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAAT 1200

 89473552 GGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCA 89473611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCA 1260

 89473612 TTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTAT 89473671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTAT 1320

 89473672 AGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGA 89473731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGA 1380

 89473732 GTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATT 89473791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATT 1440

 89473792 ATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCAT 89473851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCAT 1500

 89473852 TATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGA 89473911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGA 1560

 89473912 GATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTA 89473971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTA 1620

 89473972 AGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGA 89474031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGA 1680

 89474032 CTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCAC 89474091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCAC 1740

 89474092 AGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGC 89474151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGC 1800

 89474152 TCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATG 89474211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATG 1860

 89474212 GATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGT 89474271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGT 1920

 89474272 TATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCT 89474331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCT 1980

 89474332 TCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACA 89474391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACA 2040

 89474392 GCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTT 89474451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTT 2100

 89474452 TAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACA 89474511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACA 2160

 89474512 AGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTG 89474571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTG 2220

 89474572 ATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCT 89474631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCT 2280

 89474632 GAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCA 89474691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCA 2340

 89474692 TCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCT 89474751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCT 2400

 89474752 GCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTT 89474811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTT 2460

 89474812 TTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCAT 89474871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCAT 2520

 89474872 TCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGAT 89474931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGAT 2580

 89474932 GACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAA 89474991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAA 2640

 89474992 ATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATC 89475051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATC 2700

 89475052 TGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTC 89475111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTC 2760

 89475112 TGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTC 89475171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTC 2820

 89475172 TTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTT 89475231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTT 2880

 89475232 TCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGC 89475291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGC 2940

 89475292 CTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGAT 89475351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGAT 3000

 89475352 GACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCC 89475411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCC 3060

 89475412 CTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTG 89475471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTG 3120

 89475472 ACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAA 89475531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAA 3180

 89475532 GAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACA 89475591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACA 3240

 89475592 TTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAA 89475651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAA 3300

 89475652 TTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCC 89475711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCC 3360

 89475712 AGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAA 89475771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAA 3420

 89475772 TAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGA 89475831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGA 3480

 89475832 GTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCG 89475891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCG 3540

 89475892 CCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGC 89475951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGC 3600

 89475952 CTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGG 89476011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGG 3660

 89476012 CCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTG 89476071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTG 3720

 89476072 GGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTC 89476131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTC 3780

 89476132 TGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGG 89476191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGG 3840

 89476192 CTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAG 89476251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAG 3900

 89476252 TGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGT 89476311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGT 3960

 89476312 CTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAG 89476371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAG 4020

 89476372 GCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGA 89476431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGA 4080

 89476432 TATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAA 89476491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAA 4140

 89476492 AAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAG 89476551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAG 4200

 89476552 CAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCA 89476611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCA 4260

 89476612 TAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTC 89476671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTC 4320

 89476672 GAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCT 89476731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCT 4380

 89476732 GAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCT 89476791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCT 4440

 89476792 AGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCT 89476851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCT 4500

 89476852 TGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACT 89476911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACT 4560

 89476912 GACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCT 89476971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCT 4620

 89476972 TTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGA 89477031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGA 4680

 89477032 AAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGA 89477091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGA 4740

 89477092 AGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCA 89477151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCA 4800

 89477152 GTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTT 89477211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTT 4860

 89477212 AATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATA 89477271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATA 4920

 89477272 AAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCT 89477331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCT 4980

 89477332 AGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTC 89477391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTC 5040

 89477392 CAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGA 89477451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGA 5100

 89477452 TGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACC 89477511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACC 5160

 89477512 CTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATC 89477571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATC 5220

 89477572 TGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAG 89477631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAG 5280

 89477632 GCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTC 89477691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTC 5340

 89477692 AGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAG 89477751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAG 5400

 89477752 AAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCA 89477811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 AAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCA 5460

 89477812 TCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCC 89477871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCC 5520

 89477872 AGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATAT 89477931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATAT 5580

 89477932 CAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATC 89477991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 CAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATC 5640

 89477992 CATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTAT 89478051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTAT 5700

 89478052 CCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAA 89478111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 CCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAA 5760

 89478112 TCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGT 89478171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGT 5820

 89478172 AATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATA 89478231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 AATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATA 5880

 89478232 TAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATT 89478291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATT 5940

 89478292 TACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCC 89478351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCC 6000

 89478352 CAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTC 89478411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTC 6060

 89478412 CCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGC 89478471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGC 6120

 89478472 ACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGC 89478531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 ACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGC 6180

 89478532 TCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGT 89478591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGT 6240

 89478592 CTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAG 89478651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 CTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAG 6300

 89478652 CTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT 89478686
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 CTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT 6335

EXCISED REGION

 89478688 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 89478747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6336 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 6395

 89478748 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACC 89478807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6396 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACC 6455

 89478808 ATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTA 89478853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6456 ATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTA 6501

Alignment time is 8.90414 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,   13319] =>     13319 nucs 'mol-32-3235-199513_13319'

Score:       13179
Aligned:     13322        nucs
Identic:     13309 (100%) nucs =>      9168 (100%)      4141 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89473827,89483001] EXCISED REGION [89483004,89487150]
 second seq =>  [       1,    9172] EXCISED REGION [    9173,   13319]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [89483002,89483003]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [89483002,89483014] to [89483004,89483016]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89483002,89483002] to [89483003,89483003]
 second seq =>         0 nucs

 89473827 TTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATAT 89473886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATAT 60

 89473887 TATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGA 89473946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGA 120

 89473947 ATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGA 89474006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGA 180

 89474007 TAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAAC 89474066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAAC 240

 89474067 TCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGG 89474126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGG 300

 89474127 TGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAG 89474186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAG 360

 89474187 ATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTT 89474246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTT 420

 89474247 ACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCT 89474306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCT 480

 89474307 AAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCA 89474366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCA 540

 89474367 TTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGA 89474426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGA 600

 89474427 ATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTC 89474486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTC 660

 89474487 AGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATG 89474546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATG 720

 89474547 TTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAAC 89474606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAAC 780

 89474607 CACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCC 89474666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCC 840

 89474667 AGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAA 89474726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAA 900

 89474727 CTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTT 89474786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTT 960

 89474787 GCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTT 89474846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTT 1020

 89474847 GTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCT 89474906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCT 1080

 89474907 GACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTT 89474966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTT 1140

 89474967 ATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTA 89475026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTA 1200

 89475027 AAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCT 89475086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCT 1260

 89475087 TTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGG 89475146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGG 1320

 89475147 ATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAA 89475206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAA 1380

 89475207 GTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGA 89475266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGA 1440

 89475267 ATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATA 89475326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATA 1500

 89475327 CATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGA 89475386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGA 1560

 89475387 TACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATG 89475446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATG 1620

 89475447 CTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATC 89475506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATC 1680

 89475507 AGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATA 89475566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATA 1740

 89475567 TCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAAT 89475626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAAT 1800

 89475627 CCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTC 89475686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTC 1860

 89475687 TGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAA 89475746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAA 1920

 89475747 TCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTA 89475806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTA 1980

 89475807 ATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCG 89475866
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTTTTTTTTTTTTTT-GAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCG 2039

 89475867 TGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCT 89475926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCT 2099

 89475927 CCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAG 89475986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAG 2159

 89475987 TAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTG 89476046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTG 2219

 89476047 CCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGT 89476106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGT 2279

 89476107 TAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCA 89476166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCA 2339

 89476167 ATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAG 89476226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 ATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAG 2399

 89476227 CTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACAT 89476286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACAT 2459

 89476287 GTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTC 89476346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTC 2519

 89476347 TGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTT 89476406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTT 2579

 89476407 TGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAAT 89476466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAAT 2639

 89476467 GAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACT 89476526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACT 2699

 89476527 TTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTAC 89476586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTAC 2759

 89476587 CTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAAT 89476646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAAT 2819

 89476647 AAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGG 89476706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGG 2879

 89476707 ACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTT 89476766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 ACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTT 2939

 89476767 ACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAA 89476826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 ACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAA 2999

 89476827 GAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATA 89476886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 GAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATA 3059

 89476887 AACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCT 89476946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCT 3119

 89476947 GACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGA 89477006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGA 3179

 89477007 CAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCA 89477066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCA 3239

 89477067 TATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTT 89477126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTT 3299

 89477127 TGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAG 89477186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAG 3359

 89477187 CCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTT 89477246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 CCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTT 3419

 89477247 TTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGA 89477306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGA 3479

 89477307 ACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTT 89477366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 ACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTT 3539

 89477367 CATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAAT 89477426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 CATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAAT 3599

 89477427 TACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGAC 89477486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGAC 3659

 89477487 TTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGC 89477546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGC 3719

 89477547 GGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGC 89477606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 GGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGC 3779

 89477607 GGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCC 89477666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 GGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCC 3839

 89477667 TCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGA 89477726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGA 3899

 89477727 AATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCA 89477786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 AATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCA 3959

 89477787 ATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGA 89477846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 ATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGA 4019

 89477847 AATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAG 89477906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 AATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAG 4079

 89477907 ATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGT 89477966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 ATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGT 4139

 89477967 CCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCC 89478026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 CCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCC 4199

 89478027 ATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACT 89478086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 ATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACT 4259

 89478087 TATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCAC 89478146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCAC 4319

 89478147 AGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTAT 89478206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 AGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTAT 4379

 89478207 GCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTT 89478266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 GCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTT 4439

 89478267 TAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTG 89478326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTG 4499

 89478327 GCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTT 89478386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 GCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTT 4559

 89478387 TTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAA 89478446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 TTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAA 4619

 89478447 ATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCT 89478506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 ATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCT 4679

 89478507 GATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGG 89478566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 GATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGG 4739

 89478567 CTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 89478626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 CTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 4799

 89478627 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT 89478686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT 4859

 89478687 ATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTC 89478746
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 -TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTC 4918

 89478747 CTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAAC 89478806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 CTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAAC 4978

 89478807 CATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTA 89478866
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4979 CATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTA 5038

 89478867 CGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATG 89478926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 CGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATG 5098

 89478927 TAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGT 89478986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 TAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGT 5158

 89478987 TTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTC 89479046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 TTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTC 5218

 89479047 TTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTG 89479106
          ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 TTTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTG 5278

 89479107 GTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAA 89479166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 GTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAA 5338

 89479167 ATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGT 89479226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 ATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGT 5398

 89479227 TATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCC 89479286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 TATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCC 5458

 89479287 AAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCT 89479346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 AAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCT 5518

 89479347 GCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAA 89479406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 GCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAA 5578

 89479407 ATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAG 89479466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 ATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAG 5638

 89479467 ATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGA 89479526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 ATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGA 5698

 89479527 ACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCAT 89479586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 ACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCAT 5758

 89479587 TCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAA 89479646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 TCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAA 5818

 89479647 GAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTA 89479706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 GAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTA 5878

 89479707 AAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTACC 89479766
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     5879 AAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTACC 5938

 89479767 TTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGC 89479826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 TTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGC 5998

 89479827 TTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAA 89479886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 TTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAA 6058

 89479887 GTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGT 89479946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 GTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGT 6118

 89479947 CAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCT 89480006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 CAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCT 6178

 89480007 CATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAG 89480066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 CATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAG 6238

 89480067 TGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTT 89480126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 TGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTT 6298

 89480127 CTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGT 89480186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 CTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGT 6358

 89480187 GTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGC 89480246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 GTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGC 6418

 89480247 CTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAG 89480306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 CTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAG 6478

 89480307 GGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAG 89480366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 GGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAG 6538

 89480367 GAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGT 89480426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 GAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGT 6598

 89480427 TAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATT 89480486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 TAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATT 6658

 89480487 GTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATT 89480546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 GTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATT 6718

 89480547 CTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAAT 89480606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 CTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAAT 6778

 89480607 GGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCT 89480666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 GGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCT 6838

 89480667 TTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAA 89480726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 TTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAA 6898

 89480727 CTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCT 89480786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6899 CTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCT 6958

 89480787 AGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACAT 89480846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6959 AGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACAT 7018

 89480847 GTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACT 89480906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7019 GTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACT 7078

 89480907 AAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCT 89480966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7079 AAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCT 7138

 89480967 TACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTT 89481026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7139 TACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTT 7198

 89481027 TTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCC 89481086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7199 TTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCC 7258

 89481087 CAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTA 89481146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7259 CAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTA 7318

 89481147 CTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACC 89481206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7319 CTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACC 7378

 89481207 ACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACA 89481266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7379 ACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACA 7438

 89481267 TAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAAC 89481326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7439 TAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAAC 7498

 89481327 TGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACC 89481386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7499 TGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACC 7558

 89481387 ACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 89481446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     7559 ACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCT-GTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 7617

 89481447 AAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAAAA 89481506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7618 AAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAAAA 7677

 89481507 ATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGAAC 89481566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7678 ATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGAAC 7737

 89481567 AAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCCAG 89481626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7738 AAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCCAG 7797

 89481627 AGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAATA 89481686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7798 AGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAATA 7857

 89481687 ATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTGTT 89481746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7858 ATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTGTT 7917

 89481747 AGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATCTG 89481806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7918 AGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATCTG 7977

 89481807 TTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCCAT 89481866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7978 TTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCCAT 8037

 89481867 TTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGCTC 89481926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8038 TTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGCTC 8097

 89481927 ACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGATCG 89481986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8098 ACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGATCG 8157

 89481987 AGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACACAC 89482046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8158 AGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACACAC 8217

 89482047 ACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGAGG 89482106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8218 ACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGAGG 8277

 89482107 CATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGC 89482166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8278 CATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGC 8337

 89482167 ACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAAAA 89482226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8338 ACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAAAA 8397

 89482227 CGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGGAG 89482286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8398 CGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGGAG 8457

 89482287 ACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGACC 89482346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8458 ACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGACC 8517

 89482347 TCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCACGT 89482406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8518 TCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCACGT 8577

 89482407 GACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTGTCC 89482466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8578 GACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTGTCC 8637

 89482467 AAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTGCTG 89482526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8638 AAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTGCTG 8697

 89482527 GGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAAGAG 89482586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8698 GGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAAGAG 8757

 89482587 TTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTATCA 89482646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8758 TTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTATCA 8817

 89482647 AAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCATAT 89482706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8818 AAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCATAT 8877

 89482707 GAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTCAGA 89482766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8878 GAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTCAGA 8937

 89482767 GGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTTTGG 89482826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8938 GGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTTTGG 8997

 89482827 TATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAACTC 89482886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8998 TATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAACTC 9057

 89482887 TCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAATCATTCAACGCAGAAAGAG 89482946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9058 TCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAATCATTCAACGCAGAAAGAG 9117

 89482947 GAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCACATGCTCACATGCC 89483001
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9118 GAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCACATGCTCACATGCC 9172

EXCISED REGION

 89483004 AAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACGTAACTCAAAATGGATC 89483063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9173 AAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACGTAACTCAAAATGGATC 9232

 89483064 AAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGAAAACAAAGGGGAAAAA 89483123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9233 AAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGAAAACAAAGGGGAAAAA 9292

 89483124 CAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAATGAAAAACTTTTGTGCA 89483183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9293 CAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAATGAAAAACTTTTGTGCA 9352

 89483184 TCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATGGAAGAAAACATTTGCT 89483243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9353 TCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATGGAAGAAAACATTTGCT 9412

 89483244 AAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGAATTCCTACAATGCAAC 89483303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9413 AAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGAATTCCTACAATGCAAC 9472

 89483304 ACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTCTCTAAAGAATGGCCAA 89483363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9473 ACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTCTCTAAAGAATGGCCAA 9532

 89483364 TAAGCACCTGAAAAGATGCTCAACATTACTAGTCATTAGGAAAATGCAAATTAAAGCCAT 89483423
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9533 TAAGCACCTGAAAAGATGCTCAATATTACTAGTCATTAGGAAAATGCAAATTAAAGCCAT 9592

 89483424 AGTGAGATACTACTTCACATCCATTAGTATGGTGACTATCAAAAAAAATTGAAAAGGGCT 89483483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9593 AGTGAGATACTACTTCACATCCATTAGTATGGTGACTATCAAAAAAAATTGAAAAGGGCT 9652

 89483484 GGGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCAC 89483543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9653 GGGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCAC 9712

 89483544 CTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCAAATATGGAGAAACCCCATTTACACTAAAA 89483603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9713 CTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCAAATATGGAGAAACCCCATTTACACTAAAA 9772

 89483604 ATACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCACCTACTTGGGAGGCTG 89483663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9773 ATACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCACCTACTTGGGAGGCTG 9832

 89483664 AGGTAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGGTCGTGCCAC 89483723
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9833 AGGTAGAAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGGTCGTGCCAC 9892

 89483724 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTGTGTCTCAAAAAAAAAAAAAATTAAAATA 89483783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9893 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTGTGTCTCAAAAAAAAAAAAAATTAAAATA 9952

 89483784 ACTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATTGCTATGGAATAAAAGATGAAATGCTCCTGATTA 89483843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9953 ACTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATTGCTATGGAATAAAAGATGAAATGCTCCTGATTA 10012

 89483844 TTGTAAATACAAAATTGCATGCAGGATTGTGCAAAGACAGTGCCAGGTTGGACTGCCAGA 89483903
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
    10013 TTGTAAATACAAAATTGCATGCAGGATTGTGCAAAGACAATGCCAGGTTGGACTGCCAGA 10072

 89483904 ATGAGCCAACGGGACGTGATGTGCTTCCCCCTGCAGAGAGCCTATGAATGGATGTGCAGT 89483963
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10073 ATGAGCCAACGGCACGTGATGTGCTTCCCCCTGCAGAGAGCCTATGAATGGATGTGCAGT 10132

 89483964 CAGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTCCTATCCCAGAAAAGCAGATGTTCATAGCTCTGG 89484023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10133 CAGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTCCTATCCCAGAAAAGCAGATGTTCATAGCTCTGG 10192

 89484024 GAATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGAGGGGGCACCTGTCCATGTGGATAAGATAGGGCC 89484083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10193 GAATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGAGGGGGCACCTGTCCATGTGGATAAGATAGGGCC 10252

 89484084 ATAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTCTTCTAGGCCTCTTTAGGGTTAAGGCATACTCCC 89484143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10253 ATAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTCTTCTAGGCCTCTTTAGGGTTAAGGCATACTCCC 10312

 89484144 TTCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTTGTCTAGCTTCACGTCTTGTTTCTATGGATTGTT 89484203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10313 TTCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTTGTCTAGCTTCACGTCTTGTTTCTATGGATTGTT 10372

 89484204 TGTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTACTGCTGATTAATATCTTGCTAATCATAGGTTAT 89484263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10373 TGTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTACTGCTGATTAATATCTTGCTAATCATAGGTTAT 10432

 89484264 GAAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCTCTGTTAGAAATTACTGATGCACACACTATATTG 89484323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10433 GAAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCTCTGTTAGAAATTACTGATGCACACACTATATTG 10492

 89484324 TAAATTCTTATCTCTGTATACTGTACTTCTGCATACAGATGTTATGTTAAAGAATTACTT 89484383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10493 TAAATTCTTATCTCTGTATACTGTACTTCTGCATACAGATGTTATGTTAAAGAATTACTT 10552

 89484384 CATCCCCATGTGACCATCTCACCTCATAATCAAACGACCCTAAATCCCTCACTAACCTTC 89484443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10553 CATCCCCATGTGACCATCTCACCTCATAATCAAACGACCCTAAATCCCTCACTAACCTTC 10612

 89484444 CCCCACCCTCACTAAACTTAATAATAAATGCTGGCATATCCAGTGCATTGGCAGCACCAC 89484503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10613 CCCCACCCTCACTAAACTTAATAATAAATGCTGGCATATCCAGTGCATTGGCAGCACCAC 10672

 89484504 GGGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGGACCCAGCTTTCACTATCTTGTGTGTATCTATTA 89484563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10673 GGGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGGACCCAGCTTTCACTATCTTGTGTGTATCTATTA 10732

 89484564 TTTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGAACAAAGAGAGAGCCCCGTTGCATTGCAGGCTGC 89484623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10733 TTTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGAACAAAGAGAGAGCCCCGTTGCATTGCAGGCTGC 10792

 89484624 TGGCCAGATCCCGCAATAAATAACAAATGTTGGTGAATATGAAGAGAAATTAGAACCCTT 89484683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10793 TGGCCAGATCCCGCAATAAATAACAAATGTTGGTGAATATGAAGAGAAATTAGAACCCTT 10852

 89484684 GTGCATTTCTGTTGGGAATGCTAAATGGTGCAGTCACTGTGGAAAATGATACAGCAATTC 89484743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10853 GTGCATTTCTGTTGGGAATGCTAAATGGTGCAGTCACTGTGGAAAATGATACAGCAATTC 10912

 89484744 CTTAAAAAATTTAACATGGAATGACTATATGAGCCATCAGTTCCACTTCTGGGTGTATAC 89484803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10913 CTTAAAAAATTTAACATGGAATGACTATATGAGCCATCAGTTCCACTTCTGGGTGTATAC 10972

 89484804 TGAAAAGGAGTGAAAGCAGGGACTCGAACAGATATTCAGACACCCATGATCCTATCAGCA 89484863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10973 TGAAAAGGAGTGAAAGCAGGGACTCGAACAGATATTCAGACACCCATGATCCTATCAGCA 11032

 89484864 TTATTTGTAATAGCCAAAAGGTGTAAGCAACCCAAGTGTCAACTGACAAGCGAACAGATA 89484923
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
    11033 TTATTTGTAATAGCCAAAAGGTGTAAGCAACACAAGTGTCAACTGACAAGCGAACAGATA 11092

 89484924 AATTAGTATACACATATAATTACTTAGCCTTGAAAAGGAAGAATTTTTTATTTCTTTATT 89484983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11093 AATTAGTATACACATATAATTACTTAGCCTTGAAAAGGAAGAATTTTTTATTTCTTTATT 11152

 89484984 TATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTATGCCCAGGCTGGAGTGCAAAGGCACGATCTTGGC 89485043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11153 TATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTATGCCCAGGCTGGAGTGCAAAGGCACGATCTTGGC 11212

 89485044 TCACCGCAACCTCTGTTTCCCAGATTCAAGTGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGC 89485103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11213 TCACCGCAACCTCTGTTTCCCAGATTCAAGTGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGC 11272

 89485104 TGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAAAGACGGGG 89485163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11273 TGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAAAGACGGGG 11332

 89485164 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCCTGCATTG 89485223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11333 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCCTGCATTG 11392

 89485224 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCCATGAGTGCCCAGCCAAAAAGGAAAAATTTTGAC 89485283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11393 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCCATGAGTGCCCAGCCAAAAAGGAAAAATTTTGAC 11452

 89485284 ACATGCTACCACACTGAACCTTGAAGACATTATGTGAATTAGAATAAGCCAGTCACCAAA 89485343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11453 ACATGCTACCACACTGAACCTTGAAGACATTATGTGAATTAGAATAAGCCAGTCACCAAA 11512

 89485344 GGACAAATATTGAATGACTCCACTTATATAACATTCCTAGAGTAGTCAAATTAATAGAGA 89485403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11513 GGACAAATATTGAATGACTCCACTTATATAACATTCCTAGAGTAGTCAAATTAATAGAGA 11572

 89485404 TGGAATGTAGAATTGTGGCAGGAGATGGGTGTAGGTGGGGCTTTTGTTTAATTGGCACAG 89485463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11573 TGGAATGTAGAATTGTGGCAGGAGATGGGTGTAGGTGGGGCTTTTGTTTAATTGGCACAG 11632

 89485464 AGTTTCTTTTGGGGAAGATTAAAAAGTTCTGGAAATAGATGGTAGTGATGGTTGCACAAC 89485523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11633 AGTTTCTTTTGGGGAAGATTAAAAAGTTCTGGAAATAGATGGTAGTGATGGTTGCACAAC 11692

 89485524 AATTTGAATTTAATTAATACCACAGAACTACATACTTAATAATGGTTACAAGGATAAATT 89485583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11693 AATTTGAATTTAATTAATACCACAGAACTACATACTTAATAATGGTTACAAGGATAAATT 11752

 89485584 TTATGTTTATATATTTTTTAAAACAATAAACAAGAAAATCCAATACAGACTGAAACATTT 89485643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11753 TTATGTTTATATATTTTTTAAAACAATAAACAAGAAAATCCAATACAGACTGAAACATTT 11812

 89485644 TTTCAACCTTAAAGATCAGTGTAAACTTGCTGTTACTATGTGAACATGGGCAGGCGATCT 89485703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11813 TTTCAACCTTAAAGATCAGTGTAAACTTGCTGTTACTATGTGAACATGGGCAGGCGATCT 11872

 89485704 CTTGAGCCCAGGAGCTTGAGACCTGCATGGGCAACATGATGAAACCCTGTGTCTACCAAA 89485763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11873 CTTGAGCCCAGGAGCTTGAGACCTGCATGGGCAACATGATGAAACCCTGTGTCTACCAAA 11932

 89485764 AATACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGCATCTGTAGTCCTACCTACTCAGGAGGCTG 89485823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11933 AATACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGCATCTGTAGTCCTACCTACTCAGGAGGCTG 11992

 89485824 AGGTGAGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGACTGTGGTGAGCTGAGATCTTGCCAC 89485883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11993 AGGTGAGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGACTGTGGTGAGCTGAGATCTTGCCAC 12052

 89485884 TGTACTCCAGCCTGGGGAAAGAGCAAGACCTTGTCTCAAGAAAAAAAAAGACTAGTCAAG 89485943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12053 TGTACTCCAGCCTGGGGAAAGAGCAAGACCTTGTCTCAAGAAAAAAAAAGACTAGTCAAG 12112

 89485944 TGCAGTCAGTAGTGAGAAGGGTGAGGAGAAAGAGTAGAACAAGGAGTTCAACTGTAACTC 89486003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12113 TGCAGTCAGTAGTGAGAAGGGTGAGGAGAAAGAGTAGAACAAGGAGTTCAACTGTAACTC 12172

 89486004 ATGGTGAACAGTCAATTGAGATAACTCACTACCCTCAGAACAGCTGTGAGCTGATGCTTA 89486063
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
    12173 ATGGTGAACAGTCAATTGAGATAACTCACTACCTTCAGAACAGCTGTGAGCTGATGCTTA 12232

 89486064 TCCCCTAGAAGAGTGAAGATAAGGAGCCCAACTGTGAATGGAAAGTTAGCTTATTCCCAG 89486123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12233 TCCCCTAGAAGAGTGAAGATAAGGAGCCCAACTGTGAATGGAAAGTTAGCTTATTCCCAG 12292

 89486124 TGCCAGCTTTCTCTCCTCACATCCTCATAATGGATGCTGACTGTGTTGGGGGACAGAAGG 89486183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12293 TGCCAGCTTTCTCTCCTCACATCCTCATAATGGATGCTGACTGTGTTGGGGGACAGAAGG 12352

 89486184 GACTTGGCAGAGCTTTGCTCATGCCACTCACCCTTATTCTTCCCAGCTAGCTTGTTCATC 89486243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12353 GACTTGGCAGAGCTTTGCTCATGCCACTCACCCTTATTCTTCCCAGCTAGCTTGTTCATC 12412

 89486244 AGGTAGGATTTTCCTGTGCGGTAGAGGCCCACAATTGCCACCACCACCACAGGCTGTGTA 89486303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12413 AGGTAGGATTTTCCTGTGCGGTAGAGGCCCACAATTGCCACCACCACCACAGGCTGTGTA 12472

 89486304 ATGGCAGACAGGATTTTCAGAGCTTCTGGATTCGCCACCAGTTCCCCATTAGTGTTCTCA 89486363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12473 ATGGCAGACAGGATTTTCAGAGCTTCTGGATTCGCCACCAGTTCCCCATTAGTGTTCTCA 12532

 89486364 ATGAGGCACATTGGGCCTGTCATGTGGATCTCTGGAGCCATGTCCAGGGCATTGTTCTCT 89486423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12533 ATGAGGCACATTGGGCCTGTCATGTGGATCTCTGGAGCCATGTCCAGGGCATTGTTCTCT 12592

 89486424 TGTCTGCAAGGGAAGAGTTGGAATGAATTAGAATTTCCAGTCTTTTGCATTTAGAGGATA 89486483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12593 TGTCTGCAAGGGAAGAGTTGGAATGAATTAGAATTTCCAGTCTTTTGCATTTAGAGGATA 12652

 89486484 GAGTCACAGAATTCCCCAGGATGGCCAAAAGTTTTGTGTGTGTCAGTGAGAGAGATGAGG 89486543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12653 GAGTCACAGAATTCCCCAGGATGGCCAAAAGTTTTGTGTGTGTCAGTGAGAGAGATGAGG 12712

 89486544 GAAAATGTGTATCATTTTAAAAAATTATGGAAGTATTATCATCAAATTAAATATTGGTAT 89486603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12713 GAAAATGTGTATCATTTTAAAAAATTATGGAAGTATTATCATCAAATTAAATATTGGTAT 12772

 89486604 GACAGTAACTTATCAACAGTCAACTACTCTTGCAACCTAGAACTTTCATTTAATTTATTA 89486663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12773 GACAGTAACTTATCAACAGTCAACTACTCTTGCAACCTAGAACTTTCATTTAATTTATTA 12832

 89486664 TGGAAAAGCTTCCCTTGGATTCTCATTAAAAAATTTACACTAGACAATAAATGGAAGATA 89486723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12833 TGGAAAAGCTTCCCTTGGATTCTCATTAAAAAATTTACACTAGACAATAAATGGAAGATA 12892

 89486724 AAATAGGATATAGAGAATTTTTTTTACATCCTGGCTATATGTAAGAAATTAAATATTGAT 89486783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12893 AAATAGGATATAGAGAATTTTTTTTACATCCTGGCTATATGTAAGAAATTAAATATTGAT 12952

 89486784 TTGTTTATTCATGAATTCTTATGATGAATAAAGACCCCCATGAGTAAATGTTTCATTGTT 89486843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12953 TTGTTTATTCATGAATTCTTATGATGAATAAAGACCCCCATGAGTAAATGTTTCATTGTT 13012

 89486844 TGACATATGCCCTTAGGACAATTTCCAGAGATTTATAAATGTGTTCCTTCCTCCATTTTC 89486903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13013 TGACATATGCCCTTAGGACAATTTCCAGAGATTTATAAATGTGTTCCTTCCTCCATTTTC 13072

 89486904 AACTGGTTATGCTTATTTCACTGTAATGAGGATCCACAAAACTTCTCACAGTGCCATTCT 89486963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13073 AACTGGTTATGCTTATTTCACTGTAATGAGGATCCACAAAACTTCTCACAGTGCCATTCT 13132

 89486964 GGAAGTGGAACCAATGTAACATACTTTTGCAAATTCTATACAACTACATAACCATGTGAA 89487023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13133 GGAAGTGGAACCAATGTAACATACTTTTGCAAATTCTATACAACTACATAACCATGTGAA 13192

 89487024 ACACATGGCTAGGGACCTTTCCAAGGGCTTTGAAGGGGCACGTGCAAGAGAGGGGCCCTG 89487083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13193 ACACATGGCTAGGGACCTTTCCAAGGGCTTTGAAGGGGCACGTGCAAGAGAGGGGCCCTG 13252

 89487084 AAACTTAAGCTTCATTAGCGTCATGATAAGGTAGCCTCTAACTCAGTGTGGGTATAAATG 89487143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13253 AAACTTAAGCTTCATTAGCGTCATGATAAGGTAGCCTCTAACTCAGTGTGGGTATAAATG 13312

 89487144 CAAAACT 89487150
          |||||||
    13313 CAAAACT 13319

Alignment time is 17.0806 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    6057] =>      6057 nucs 'mol-32-32f0-041839_6057'

Score:        5947
Aligned:      6059        nucs
Identic:      6048 (100%) nucs =>      3283 (100%)      2765 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89472619,89475908] EXCISED REGION [89478625,89481393]
 second seq =>  [       1,    3288] EXCISED REGION [    3289,    6057]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89472619 AATAATTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATT 89472678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATAATTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATT 60

 89472679 GCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATT 89472738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATT 120

 89472739 CAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGA 89472798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGA 180

 89472799 ACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGC 89472858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGC 240

 89472859 TAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGT 89472918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGT 300

 89472919 TTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACAT 89472978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACAT 360

 89472979 TATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGG 89473038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGG 420

 89473039 AAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCC 89473098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCC 480

 89473099 AAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGA 89473158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGA 540

 89473159 ATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCA 89473218
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAAACTTCTGAGTGGCGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCA 600

 89473219 TCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTG 89473278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTG 660

 89473279 CATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGA 89473338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGA 720

 89473339 CACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGC 89473398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGC 780

 89473399 TCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTC 89473458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTC 840

 89473459 TTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTT 89473518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTT 900

 89473519 AGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGT 89473578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGT 960

 89473579 AAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTT 89473638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTT 1020

 89473639 CTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTG 89473698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTG 1080

 89473699 ATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATT 89473758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATT 1140

 89473759 GATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAA 89473818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAA 1200

 89473819 CAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTAC 89473878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTAC 1260

 89473879 ACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAG 89473938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAG 1320

 89473939 GTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTA 89473998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTA 1380

 89473999 GCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAG 89474058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAG 1440

 89474059 CTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGC 89474118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGC 1500

 89474119 CCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGT 89474178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGT 1560

 89474179 CATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTC 89474238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTC 1620

 89474239 AGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTT 89474298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTT 1680

 89474299 CCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAG 89474358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAG 1740

 89474359 ATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAAC 89474418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAAC 1800

 89474419 GGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCAT 89474478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCAT 1860

 89474479 TTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGG 89474538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGG 1920

 89474539 GCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAA 89474598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAA 1980

 89474599 AAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTT 89474658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTT 2040

 89474659 GCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTT 89474718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTT 2100

 89474719 CTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCA 89474778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCA 2160

 89474779 CCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAG 89474838
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2161 CCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACGTTCCACTGTGGAGGAAGAAG 2220

 89474839 AAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTG 89474898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTG 2280

 89474899 TTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGC 89474958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGC 2340

 89474959 TTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAA 89475018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAA 2400

 89475019 ATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTC 89475078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTC 2460

 89475079 AATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGA 89475138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2461 AATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCATAGA 2520

 89475139 CTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAG 89475198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAG 2580

 89475199 AGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTC 89475258
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTGTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTC 2640

 89475259 TTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGG 89475318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGG 2700

 89475319 GCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAG 89475378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAG 2760

 89475379 GAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAA 89475438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAA 2820

 89475439 ATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAG 89475498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAG 2880

 89475499 AGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAG 89475558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAG 2940

 89475559 GGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTC 89475618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTC 3000

 89475619 CTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCAT 89475678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCAT 3060

 89475679 TGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTG 89475738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTG 3120

 89475739 GTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTA 89475798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTA 3180

 89475799 ATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTG 89475858
          |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3181 ATTAACTAATTTTTTTTTTTTTT--GAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTG 3238

 89475859 CAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 CAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 3288

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 3348

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 3408

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 3468

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3469 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 3528

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 3588

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 3648

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 3708

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 3768

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 3828

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 3888

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 3948

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 4008

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 4068

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 4128

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 4188

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 4248

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 4308

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 4368

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4369 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 4428

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 4488

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4489 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 4548

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4549 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 4608

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4609 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 4668

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4669 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 4728

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 4788

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4789 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 4848

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 4908

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4909 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 4968

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4969 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 5028

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5029 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 5088

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5089 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 5148

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5149 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 5208

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5209 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGCCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 5268

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5269 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 5328

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5329 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 5388

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5389 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 5448

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5449 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 5508

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5509 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 5568

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5569 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 5628

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5629 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 5688

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5689 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 5748

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5749 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 5808

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5809 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 5868

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5869 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 5928

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5929 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 5988

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5989 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 6048

 89481385 CCACTGCAC 89481393
          |||||||||
     6049 CCACTGCAC 6057

Alignment time is 7.81366 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2832] =>      2832 nucs 'mol-32-32f0-041839_2832'

Score:        2788
Aligned:      2832        nucs
Identic:      2828 (100%) nucs =>        63 (100%)      2765 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475846,89475908] EXCISED REGION [89478625,89481393]
 second seq =>  [       1,      63] EXCISED REGION [      64,    2832]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89475846 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 89475905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 60

 89475906 GTG 89475908
          |||
       61 GTG 63

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       64 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 123

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 183

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      184 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 243

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      244 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 303

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 363

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 423

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 483

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 543

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 603

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 663

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 723

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 783

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 843

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 903

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 963

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 1023

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 1083

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 1143

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1144 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 1203

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 1263

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 1323

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 1383

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 1443

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 1503

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 1563

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 1623

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 1683

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 1743

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 1803

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 1863

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 1923

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 1983

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGCCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 2043

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 2103

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 2163

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 2223

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 2283

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 2343

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 2403

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 2463

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 2523

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 2583

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 2643

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 2703

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 2763

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 2823

 89481385 CCACTGCAC 89481393
          |||||||||
     2824 CCACTGCAC 2832

Alignment time is 3.65575 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    9641] =>      9641 nucs 'mol-32-32f0-077317_9641'

Score:        9488
Aligned:      9644        nucs
Identic:      9629 (100%) nucs =>      5587 (100%)      4042 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89470312,89475908] EXCISED REGION [89478625,89482671]
 second seq =>  [       1,    5595] EXCISED REGION [    5596,    9641]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89470312 AGCCAAACTGCAGTGATTGTCGTCTCTCTTCTGAGTCTAGCCAGCCAGTGTGTCTGCCCA 89470371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCCAAACTGCAGTGATTGTCGTCTCTCTTCTGAGTCTAGCCAGCCAGTGTGTCTGCCCA 60

 89470372 GCTCTGGGCTGGTATTGGGGGTTTTCTGTACAGAGTCCTGTGATGTGGACCATCTATGGG 89470431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTCTGGGCTGGTATTGGGGGTTTTCTGTACAGAGTCCTGTGATGTGGACCATCTATGGG 120

 89470432 TCTCTGAGCCATGGATACTAAGGGAAGAAAACACCCCTCATATTGTCTTATGCCCAATTT 89470491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTCTGAGCCATGGATACTAAGGGAAGAAAACACCCCTCATATTGTCTTATGCCCAATTT 180

 89470492 CTGCCTCCAAAGAAAGAAGAAGTAAAAATTAAAAGGCAGAAATGAAATCCACAAGCAGAC 89470551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGCCTCCAAAGAAAGAAGAAGTAAAAATTAAAAGGCAGAAATGAAATCCACAAGCAGAC 240

 89470552 AGTTCAGCGCCACACCCTGGGCCTGGTAATTAAAGATTGACCCCTGACCTAATTGGTTAT 89470611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTTCAGCGCCACACCCTGGGCCTGGTAATTAAAGATTGACCCCTGACCTAATTGGTTAT 300

 89470612 GCTATCTACAGATTACAGACATTGTATAGAAAAGCACTGTGAAAATCCCTGTCCTGTTCT 89470671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTATCTACAGATTACAGACATTGTATAGAAAAGCACTGTGAAAATCCCTGTCCTGTTCT 360

 89470672 GTTCCGTTCCGTTCTAATTACCAGTGCATGTAGCCCGCAGTCATGTACCCCCTGCTTGCT 89470731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTCCGTTCCGTTCTAATTACCAGTGCATGTAGCCCGCAGTCATGTACCCCCTGCTTGCT 420

 89470732 CAATCAATCACGACCCTCTCACGTGGACCCCCTTAGAGTTGTGAGCCCTTAAAAGGGACA 89470791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAATCAATCACGACCCTCTCACGTGGACCCCCTTAGAGTTGTGAGCCCTTAAAAGGGACA 480

 89470792 GGAATTGCTCACTCAGGGAGCTCGGTTGTTGGAGACGTGAGTCTTACCAAAGCTCCTGGC 89470851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGAATTGCTCACTCAGGGAGCTCGGTTGTTGGAGACGTGAGTCTTACCAAAGCTCCTGGC 540

 89470852 TGAATAAAGCCCTTCCTTCTTTAACTCAGTGTCTGAGGGGTTTTGTTGGTGGCTTGTCCT 89470911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAATAAAGCCCTTCCTTCTTTAACTCAGTGTCTGAGGGGTTTTGTTGGTGGCTTGTCCT 600

 89470912 CCTACAATACCAGTGCCTGTTCCAGTGGAGGTGGTGGAGGGTGAAATGGACTTCATGAGG 89470971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTACAATACCAGTGCCTGTTCCAGTGGAGGTGGTGGAGGGTGAAATGGACTTCATGAGG 660

 89470972 GTCCTTGGTTTTGGTGGTTTAATGCTCTATTTTTGTGCTGGTTGGCCTCCTGAAAGGAGG 89471031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTCCTTGGTTTTGGTGGTTTAATGCTCTATTTTTGTGCTGGTTGGCCTCCTGAAAGGAGG 720

 89471032 TGGCACTTTCCAGAAAGTATCAGTGGGAGAGGGACTGGTGGTGGGCAGGGTCCTAGAACT 89471091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGCACTTTCCAGAAAGTATCAGTGGGAGAGGGACTGGTGGTGGGCAGGGTCCTAGAACT 780

 89471092 CCCAAGATTAAATGACCTTTGTCTTCAGCTACCAGGGTGGATGGAGAAGGACCATCAGGT 89471151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCAAGATTAAATGACCTTTGTCTTCAGCTACCAGGGTGGATGGAGAAGGACCATCAGGT 840

 89471152 CAGGGCGGGGCTAGGAGTGTCTGAGCTCAGACTCTCCATGGCTGGATCTTGCTATGGCTG 89471211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGGGCGGGGCTAGGAGTGTCTGAGCTCAGACTCTCCATGGCTGGATCTTGCTATGGCTG 900

 89471212 CTGTGGGGGATGGGGGTGAGATTCCCAGGTCACTGGAGTTGTGTACCTAGGAGGATTATG 89471271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGTGGGGGATGGGGGTGAGATTCCCAGGTCACTGGAGTTGTGTACCTAGGAGGATTATG 960

 89471272 GCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGTTGTCAGGGGAGTGGGAGAAGCTGGCAGTCACAGGC 89471331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGTTGTCAGGGGAGTGGGAGAAGCTGGCAGTCACAGGC 1020

 89471332 CTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGGAAGGCCGGTCTCACTCCCACTGTGCCCTTCTCCCT 89471391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGGAAGGCCGGTCTCACTCCCACTGTGCCCTTCTCCCT 1080

 89471392 GCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCAGGCAGAGGGCAAGAGGGGCGGGCTTAAAATTTGGC 89471451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCAGGCAGAGGGCAAGAGGGGCGGGCTTAAAATTTGGC 1140

 89471452 TGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAGAAAAGGACTTTAGTTCTTCACCAGCCTGTGAAGTT 89471511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAGAAAAGGACTTTAGTTCTTCACCAGCCTGTGAAGTT 1200

 89471512 TGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCCGAGTTCTGGCAGGAGGCTTCTCGCCCCATTCAAAT 89471571
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCTGAGTTCTGGCAGGAGGCTTCTCGCCCCATTCAAAT 1260

 89471572 TGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATTTCTTCTTTCTGTGGAGTTTTACCTGTTGCTCCTCT 89471631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATTTCTTCTTTCTGTGGAGTTTTACCTGTTGCTCCTCT 1320

 89471632 GGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGTGGTGCCAGGCAGGAATGGCCTGCCTGGGGACACAG 89471691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGTGGTGCCAGGCAGGAATGGCCTGCCTGGGGACACAG 1380

 89471692 TGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGCTTCCTCTACCCCTGTATTTTGCTCGGCTCTCTAAC 89471751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGCTTCCTCTACCCCTGTATTTTGCTCGGCTCTCTAAC 1440

 89471752 TTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGGAAACTCCTCCTGCACACAAACCTTCAGCTTCTCCA 89471811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGGAAACTCCTCCTGCACACAAACCTTCAGCTTCTCCA 1500

 89471812 GTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGAGGGTCTCCCTTTCCCACTTCTGCAGTTGGGGCAGT 89471871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGAGGGTCTCCCTTTCCCACTTCTGCAGTTGGGGCAGT 1560

 89471872 CAGAATATTTGGAGTGTTTCCTGGGTCCTGCAGGAGCAGTCTGCCTCCTTCAGAGGGTCT 89471931
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGAATATTTGGAGTGTTTCTTGGGTCCTGCAGGAGCAGTCTGCCTCCTTCAGAGGGTCT 1620

 89471932 GTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTGTAATATTTTGAAACACTACATAATTATTTCAAGAT 89471991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTGTAATATTTTGAAACACTACATAATTATTTCAAGAT 1680

 89471992 TCTAACATATACAATCTAATCCTTATGATTCTTATAAATGTAAGTAAAATAAGGCAGATA 89472051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTAACATATACAATCTAATCCTTATGATTCTTATAAATGTAAGTAAAATAAGGCAGATA 1740

 89472052 TAAAATGAAACTTTGACCAATGTTTCTATAAACAAAGGTCTGCAAACTATAGCTTGTGTG 89472111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAAAATGAAACTTTGACCAATGTTTCTATAAACAAAGGTCTGCAAACTATAGCTTGTGTG 1800

 89472112 TGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGTGTTATTGGCACATAGCCCCACCCATTTACTTATGT 89472171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGTGTTATTGGCACATAGCCCCACCCATTTACTTATGT 1860

 89472172 ATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTGTATGCAGAGTTTAGTAGTTGAGACAGTTGACCTGC 89472231
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTATATGCAGAGTTTAGTAGTTGAGACAGTTGACCTGC 1920

 89472232 AAAGCCATAAATAATCACTATCTGGTATTTTACAGAAAAGTTAGCCAACCACTGCTATAA 89472291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAGCCATAAATAATCACTATCTGGTATTTTACAGAAAAGTTAGCCAACCACTGCTATAA 1980

 89472292 AGACTCAAACCTTATTATTTGGTGAAAAACTAAAAAAAAAAAAATGGAAATAAAAAAACT 89472351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGACTCAAACCTTATTATTTGGTGAAAAACTAAAAAAAAAAAAATGGAAATAAAAAAACT 2040

 89472352 AGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTATTTCTAGTTCAAAAATAATCTGTAATTG 89472411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTATTTCTAGTTCAAAAATAATCTGTAATTG 2100

 89472412 CTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTGACAATTGGGATGAAGTCTACATAT 89472471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTGACAATTGGGATGAAGTCTACATAT 2160

 89472472 ACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATAT 89472531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATAT 2220

 89472532 TCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTA 89472591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTA 2280

 89472592 ACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGT 89472651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGT 2340

 89472652 CTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCA 89472711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCA 2400

 89472712 TAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCAC 89472771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCAC 2460

 89472772 ATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATT 89472831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATT 2520

 89472832 TGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATA 89472891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATA 2580

 89472892 AGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTA 89472951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTA 2640

 89472952 TCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAAT 89473011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAAT 2700

 89473012 GGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCC 89473071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCC 2760

 89473072 ATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTC 89473131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTC 2820

 89473132 CTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCC 89473191
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2821 CTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGCGGCAACTCATGATCCC 2880

 89473192 TCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGA 89473251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGA 2940

 89473252 AAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCA 89473311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCA 3000

 89473312 AGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTA 89473371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTA 3060

 89473372 TGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATA 89473431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATA 3120

 89473432 TATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGG 89473491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGG 3180

 89473492 GTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAAT 89473551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAAT 3240

 89473552 GGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCA 89473611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCA 3300

 89473612 TTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTAT 89473671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTAT 3360

 89473672 AGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGA 89473731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGA 3420

 89473732 GTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATT 89473791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATT 3480

 89473792 ATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCAT 89473851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCAT 3540

 89473852 TATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGA 89473911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGA 3600

 89473912 GATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTA 89473971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTA 3660

 89473972 AGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGA 89474031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGA 3720

 89474032 CTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCAC 89474091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCAC 3780

 89474092 AGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGC 89474151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGC 3840

 89474152 TCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATG 89474211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATG 3900

 89474212 GATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGT 89474271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGT 3960

 89474272 TATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCT 89474331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCT 4020

 89474332 TCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACA 89474391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACA 4080

 89474392 GCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTT 89474451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTT 4140

 89474452 TAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACA 89474511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACA 4200

 89474512 AGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTG 89474571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTG 4260

 89474572 ATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCT 89474631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCT 4320

 89474632 GAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCA 89474691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCA 4380

 89474692 TCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCT 89474751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCT 4440

 89474752 GCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTT 89474811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTT 4500

 89474812 TTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCAT 89474871
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTACACGTTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCAT 4560

 89474872 TCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGAT 89474931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGAT 4620

 89474932 GACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAA 89474991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAA 4680

 89474992 ATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATC 89475051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATC 4740

 89475052 TGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTC 89475111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTC 4800

 89475112 TGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTC 89475171
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TGTCTGTAGAATTGCATCGGTCATAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTC 4860

 89475172 TTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTT 89475231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4861 TTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTGT 4920

 89475232 TCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGC 89475291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGC 4980

 89475292 CTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGAT 89475351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGAT 5040

 89475352 GACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCC 89475411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCC 5100

 89475412 CTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTG 89475471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTG 5160

 89475472 ACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAA 89475531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAA 5220

 89475532 GAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACA 89475591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACA 5280

 89475592 TTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAA 89475651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAA 5340

 89475652 TTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCC 89475711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCC 5400

 89475712 AGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAA 89475771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 AGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAA 5460

 89475772 TAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGA 89475831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||
     5461 TAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTT--GAGACAGA 5518

 89475832 GTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCG 89475891
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 GTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCG 5578

 89475892 CCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          |||||||||||||||||
     5579 CCTCCTGGGTTCAAGTG 5595

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5596 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 5655

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5656 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 5715

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5716 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 5775

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     5776 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 5835

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5836 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 5895

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5896 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 5955

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5956 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 6015

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6016 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 6075

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6076 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 6135

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6136 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 6195

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6196 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 6255

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6256 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 6315

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6316 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 6375

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6376 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 6435

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6436 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 6495

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6496 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 6555

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6556 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 6615

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6616 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 6675

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6676 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 6735

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6736 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 6795

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6796 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 6855

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6856 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 6915

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6916 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 6975

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6976 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 7035

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7036 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 7095

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7096 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 7155

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7156 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 7215

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7216 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 7275

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7276 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 7335

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7336 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 7395

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7396 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 7455

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7456 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 7515

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7516 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 7575

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7576 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 7635

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7636 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 7695

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7696 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 7755

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7756 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 7815

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7816 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 7875

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7876 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 7935

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7936 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 7995

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7996 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 8055

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8056 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 8115

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8116 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 8175

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8176 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 8235

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8236 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 8295

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8296 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 8355

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 89481444
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     8356 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-TGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 8414

 89481445 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 89481504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8415 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 8474

 89481505 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 89481564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8475 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 8534

 89481565 ACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 89481624
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8535 ACAAGGAAAAGATGCCCATTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 8594

 89481625 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 89481684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8595 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 8654

 89481685 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 89481744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8655 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 8714

 89481745 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 89481804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8715 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 8774

 89481805 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 89481864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8775 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 8834

 89481865 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 89481924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8835 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 8894

 89481925 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 89481984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8895 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 8954

 89481985 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 89482044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8955 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 9014

 89482045 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 89482104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9015 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 9074

 89482105 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACT 89482164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9075 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACT 9134

 89482165 GCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAA 89482224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9135 GCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAA 9194

 89482225 AACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGG 89482284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9195 AACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGG 9254

 89482285 AGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGA 89482344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9255 AGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGA 9314

 89482345 CCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCAC 89482404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9315 CCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCAC 9374

 89482405 GTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTGT 89482464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9375 GTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTGT 9434

 89482465 CCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTGC 89482524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9435 CCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTGC 9494

 89482525 TGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAAG 89482584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9495 TGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAAG 9554

 89482585 AGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTAT 89482644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9555 AGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTAT 9614

 89482645 CAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAAT 89482671
          |||||||||||||||||||||||||||
     9615 CAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAAT 9641

Alignment time is 12.4616 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    4109] =>      4109 nucs 'mol-32-32f0-077317_4109'

Score:        4055
Aligned:      4110        nucs
Identic:      4105 (100%) nucs =>        63 (100%)      4042 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475846,89475908] EXCISED REGION [89478625,89482671]
 second seq =>  [       1,      63] EXCISED REGION [      64,    4109]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89475846 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 89475905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 60

 89475906 GTG 89475908
          |||
       61 GTG 63

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       64 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 123

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 183

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      184 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 243

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      244 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 303

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 363

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 423

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 483

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 543

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 603

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 663

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 723

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 783

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 843

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 903

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 963

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 1023

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 1083

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 1143

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1144 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 1203

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 1263

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 1323

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 1383

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 1443

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 1503

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 1563

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 1623

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 1683

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 1743

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 1803

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 1863

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 1923

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 1983

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 2043

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 2103

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 2163

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 2223

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 2283

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 2343

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 2403

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 2463

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 2523

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 2583

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 2643

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 2703

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 2763

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 2823

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 89481444
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2824 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-TGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 2882

 89481445 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 89481504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 2942

 89481505 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 89481564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 3002

 89481565 ACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 89481624
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 ACAAGGAAAAGATGCCCATTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 3062

 89481625 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 89481684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 3122

 89481685 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 89481744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 3182

 89481745 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 89481804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 3242

 89481805 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 89481864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 3302

 89481865 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 89481924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 3362

 89481925 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 89481984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 3422

 89481985 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 89482044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 3482

 89482045 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 89482104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 3542

 89482105 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACT 89482164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACT 3602

 89482165 GCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAA 89482224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 GCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAA 3662

 89482225 AACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGG 89482284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 AACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGG 3722

 89482285 AGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGA 89482344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 AGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGA 3782

 89482345 CCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCAC 89482404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 CCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCAC 3842

 89482405 GTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTGT 89482464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 GTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTGT 3902

 89482465 CCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTGC 89482524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 CCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTGC 3962

 89482525 TGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAAG 89482584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 TGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAAG 4022

 89482585 AGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTAT 89482644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 AGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTAT 4082

 89482645 CAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAAT 89482671
          |||||||||||||||||||||||||||
     4083 CAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAAT 4109

Alignment time is 5.97712 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,   11706] =>     11706 nucs 'mol-32-3306-057541_11706'

Score:       11651
Aligned:     11706        nucs
Identic:     11701 (100%) nucs =>     10379 (100%)      1322 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89468308,89478686] EXCISED REGION [89478688,89480014]
 second seq =>  [       1,   10379] EXCISED REGION [   10380,   11706]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89478687,89478687]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>        12 nucs [89479063,89479074]
 second seq =>        12 nucs [10755,10766]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [89478684,89478686] to [89478688,89478690]
 second seq =>         3 nucs [10377,10379] to [10380,10382]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89468308 GCAGGTTATTTAATTTCCATGTATTTGCATGGTTTTGAAGATTCCCTTTGGAGTTGATTT 89468367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCAGGTTATTTAATTTCCATGTATTTGCATGGTTTTGAAGATTCCCTTTGGAGTTGATTT 60

 89468368 CCAGTTTTATTCCACTGTGGTCCGATAGTGTGTTTGATATAATTTTAATTTTCTTAAATT 89468427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGTTTTATTCCACTGTGGTCCGATAGTGTGTTTGATATAATTTTAATTTTCTTAAATT 120

 89468428 TATTGAGGCTCATTTTATGGCCTATCATGTGGTCCATTTTGGAGAAAGTTCCATGCACGG 89468487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTGAGGCTCATTTTATGGCCTATCATGTGGTCCATTTTGGAGAAAGTTCCATGCACGG 180

 89468488 TTGAATAGAATGTGTATTGTGAGGTTGTTGGAAGAAATTTTCTGTATGTATCTGTTAAGT 89468547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGAATAGAATGTGTATTGTGAGGTTGTTGGAAGAAATTTTCTGTATGTATCTGTTAAGT 240

 89468548 CCATTTGTTCCAAAGTATAGTTAATCCATTGTTTATTTGTTGATTTTCTGTCTTAATGAC 89468607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCATTTGTTCCAAAGTATAGTTAATCCATTGTTTATTTGTTGATTTTCTGTCTTAATGAC 300

 89468608 CTGTCTAGTGTTGTCAGTGGAGTATTGAAGTCCTCCAGCATTATTGTATTGCAGTCTATC 89468667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGTCTAGTGTTGTCAGTGGAGTATTGAAGTCCTCCAGCATTATTGTATTGCAGTCTATC 360

 89468668 TCATTTCTTAGGTCTATTAGTAATTATTTTATAAATTTGGGAGCTCCAGTGTTAGGTGCA 89468727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCATTTCTTAGGTCTATTAGTAATTATTTTATAAATTTGGGAGCTCCAGTGTTAGGTGCA 420

 89468728 TATATGTTTAGGATTGTGATATTTTCCTGTTGGACAAGCCTTTTATCATTATATAATGTC 89468787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATATGTTTAGGATTGTGATATTTTCCTGTTGGACAAGCCTTTTATCATTATATAATGTC 480

 89468788 CCTCTTTGTCTCTTTTAACCACTGTTGCTTTAAAGTTTGTTTTGTCTGATATAAGAATAG 89468847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTCTTTGTCTCTTTTAACCACTGTTGCTTTAAAGTTTGTTTTGTCTGATATAAGAATAG 540

 89468848 TTACCTCTGGTCGCTTTTGGTGTCCATTTGCATGAAATGGCTTTTTCCACCCATTTACTT 89468907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTACCTCTGGTCGCTTTTGGTGTCCATTTGCATGAAATGGCTTTTTCCACCCATTTACTT 600

 89468908 TAACTTTATGTGAGTCCTTATGTGTTCGGTGAGTCTCCTGAAGACAGTGGATAGTTGATT 89468967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAACTTTATGTGAGTCCTTATGTGTTCGGTGAGTCTCCTGAAGACAGTGGATAGTTGATT 660

 89468968 GGTGAGTTCTTATCTGTTCTGCAGTTCTGTATCTTTTAAGTGGAGCATTTAGGTGATTTA 89469027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTGAGTTCTTATCTGTTCTGCAGTTCTGTATCTTTTAAGTGGAGCATTTAGGTGATTTA 720

 89469028 CATTCAATGTTAGTATTGAAATGTGAGGTAATCCTTGCGTTCATCGTACTCTTTGTTGCC 89469087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATTCAATGTTAGTATTGAAATGTGAGGTAATCCTTGCGTTCATCGTACTCTTTGTTGCC 780

 89469088 TGTGTACTTTGTTATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTGCTTTTGCTTTTTACCTTGTATTTTT 89469147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTGTACTTTGTTATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTGCTTTTGCTTTTTACCTTGTATTTTT 840

 89469148 GTTTTGTAGGTCCTGTATGATTTATGCTTTAAAGAGGTTCTGTTTTGGTGTGTTTCCAGG 89469207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTTTGTAGGTCCTGTATGATTTATGCTTTAAAGAGGTTCTGTTTTGGTGTGTTTCCAGG 900

 89469208 CTTCGTTTCAAGATTTAGACCTCCTTTTAGCAGTTCTTATAGTGGTGGCTTGGTAATGGT 89469267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTCGTTTCAAGATTTAGACCTCCTTTTAGCAGTTCTTATAGTGGTGGCTTGGTAATGGT 960

 89469268 GAATTCTCTCAGCAATTTTGTCTGAAAATGACTGTTTCTTTCCTTTACGTTTGATGCTTA 89469327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAATTCTCTCAGCAATTTTGTCTGAAAATGACTGTTTCTTTCCTTTACGTTTGATGCTTA 1020

 89469328 GTTTTGCTGGAAACAGAATTCTTGGCTGATAATTGTTTTGTTTGAAGAGGCTAAAGATAG 89469387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTTTGCTGGAAACAGAATTCTTGGCTGATAATTGTTTTGTTTGAAGAGGCTAAAGATAG 1080

 89469388 GGCCGCATTGCCTTCTGGCTTGTACGGTTTCTGCTGAGAAATCTGCTAGGTTAGTCTGAT 89469447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCCGCATTGCCTTCTGGCTTGTACGGTTTCTGCTGAGAAATCTGCTAGGTTAGTCTGAT 1140

 89469448 ATGTTTTCCTTTATAGGTTACCTGGTGCTTCTGTCTCACAGCTCTTAAGATTTTTTTCCT 89469507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGTTTTCCTTTATAGGTTACCTGGTGCTTCTGTCTCACAGCTCTTAAGATTTTTTTCCT 1200

 89469508 TCATCTTAACTTTGGATAACCTGATGACAATGTGCCTAGGTGAAGATCTTTTTGTGATGA 89469567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCATCTTAACTTTGGATAACCTGATGACAATGTGCCTAGGTGAAGATCTTTTTGTGATGA 1260

 89469568 ATTTCCCAGGTATTCTTTGTGCTTCTTATATTTGCATGTGTAGGTCTCTAGCTAGGTTGG 89469627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTTCCCAGGTATTCTTTGTGCTTCTTATATTTGCATGTGTAGGTCTCTAGCTAGGTTGG 1320

 89469628 GGAAGTTTTCCTCAATTATTCCCCCAAATATGTTTTCCAAGCTTTTAGAATTCTCTTCTT 89469687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGAAGTTTTCCTCAATTATTCCCCCAAATATGTTTTCCAAGCTTTTAGAATTCTCTTCTT 1380

 89469688 CCCCAGGAACACCCATTATTCTTAGGTTTGGTCATTTAACATGATCCCAGACTTCTTGGA 89469747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCCCAGGAACACCCATTATTCTTAGGTTTGGTCATTTAACATGATCCCAGACTTCTTGGA 1440

 89469748 GGATTTGTTCATATTTTCGTATTCTTTTTTCTTTGTCTTTGTTGGATTGGGTTAATTCAA 89469807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGATTTGTTCATATTTTCGTATTCTTTTTTCTTTGTCTTTGTTGGATTGGGTTAATTCAA 1500

 89469808 AGACCTTGTCTTTGAGCTCTGAATTTCTTTCTTGTACTTGTTCAATTCTGTTGCTGAGAC 89469867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGACCTTGTCTTTGAGCTCTGAATTTCTTTCTTGTACTTGTTCAATTCTGTTGCTGAGAC 1560

 89469868 TTTCCAAAGCATTTTGCATTTCTAAAAGCGTGTCCAAAGTTTCCTGAATTGTGGATTGTT 89469927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTCCAAAGCATTTTGCATTTCTAAAAGCGTGTCCAAAGTTTCCTGAATTGTGGATTGTT 1620

 89469928 TTCCTTTAAGCTGTCTATTTCATTGAATATTTATCCCTTCACTTCTTGTATCATTTTTTT 89469987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCCTTTAAGCTGTCTATTTCATTGAATATTTATCCCTTCACTTCTTGTATCATTTTTTT 1680

 89469988 GGATTTCCTTGCATTGGGCTTCACCTTTCTCTGGTCCTTCCCTGATTAGCTTAGTAACTA 89470047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGATTTCCTTGCATTGGGCTTCACCTTTCTCTGGTCCTTCCCTGATTAGCTTAGTAACTA 1740

 89470048 ACCTCCTGAATTCTTTTTCAGATAAATCGGGATTTCTTCTTGGTTTGGATCCATTGCTGG 89470107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACCTCCTGAATTCTTTTTCAGATAAATCGGGATTTCTTCTTGGTTTGGATCCATTGCTGG 1800

 89470108 TGAACCAGGATGATTTTTGGGGGGTGTTGAAGGGCCTTGTTTTGTCATATAACCAGAGTT 89470167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGAACCAGGATGATTTTTGGGGGGTGTTGAAGGGCCTTGTTTTGTCATATAACCAGAGTT 1860

 89470168 GGTTTTCTGGTTCCTTCTCATTTGGGTAGGCTCTGTCAGAGAGAAGGTCTAAGGCTGAAG 89470227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGTTTTCTGGTTCCTTCTCATTTGGGTAGGCTCTGTCAGAGAGAAGGTCTAAGGCTGAAG 1920

 89470228 GCTGTTGTTCAGATTCTTTTGTCCCATGGGGTGTTCCCCTGATGTAGTACTCTCCCCCTT 89470287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTGTTGTTCAGATTCTTTTGTCCCATGGGGTGTTCCCCTGATGTAGTACTCTCCCCCTT 1980

 89470288 TTCCTATGGGTATGGCTTCCTGTGAGCCAAACTGCAGTGATTGTCGTCTCTCTTCTGAGT 89470347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCCTATGGGTATGGCTTCCTGTGAGCCAAACTGCAGTGATTGTCGTCTCTCTTCTGAGT 2040

 89470348 CTAGCCAGCCAGTGTGTCTGCCCAGCTCTGGGCTGGTATTGGGGGTTTTCTGTACAGAGT 89470407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTAGCCAGCCAGTGTGTCTGCCCAGCTCTGGGCTGGTATTGGGGGTTTTCTGTACAGAGT 2100

 89470408 CCTGTGATGTGGACCATCTATGGGTCTCTGAGCCATGGATACTAAGGGAAGAAAACACCC 89470467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCTGTGATGTGGACCATCTATGGGTCTCTGAGCCATGGATACTAAGGGAAGAAAACACCC 2160

 89470468 CTCATATTGTCTTATGCCCAATTTCTGCCTCCAAAGAAAGAAGAAGTAAAAATTAAAAGG 89470527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTCATATTGTCTTATGCCCAATTTCTGCCTCCAAAGAAAGAAGAAGTAAAAATTAAAAGG 2220

 89470528 CAGAAATGAAATCCACAAGCAGACAGTTCAGCGCCACACCCTGGGCCTGGTAATTAAAGA 89470587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAGAAATGAAATCCACAAGCAGACAGTTCAGCGCCACACCCTGGGCCTGGTAATTAAAGA 2280

 89470588 TTGACCCCTGACCTAATTGGTTATGCTATCTACAGATTACAGACATTGTATAGAAAAGCA 89470647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGACCCCTGACCTAATTGGTTATGCTATCTACAGATTACAGACATTGTATAGAAAAGCA 2340

 89470648 CTGTGAAAATCCCTGTCCTGTTCTGTTCCGTTCCGTTCTAATTACCAGTGCATGTAGCCC 89470707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTGTGAAAATCCCTGTCCTGTTCTGTTCCGTTCCGTTCTAATTACCAGTGCATGTAGCCC 2400

 89470708 GCAGTCATGTACCCCCTGCTTGCTCAATCAATCACGACCCTCTCACGTGGACCCCCTTAG 89470767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCAGTCATGTACCCCCTGCTTGCTCAATCAATCACGACCCTCTCACGTGGACCCCCTTAG 2460

 89470768 AGTTGTGAGCCCTTAAAAGGGACAGGAATTGCTCACTCAGGGAGCTCGGTTGTTGGAGAC 89470827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGTTGTGAGCCCTTAAAAGGGACAGGAATTGCTCACTCAGGGAGCTCGGTTGTTGGAGAC 2520

 89470828 GTGAGTCTTACCAAAGCTCCTGGCTGAATAAAGCCCTTCCTTCTTTAACTCAGTGTCTGA 89470887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTGAGTCTTACCAAAGCTCCTGGCTGAATAAAGCCCTTCCTTCTTTAACTCAGTGTCTGA 2580

 89470888 GGGGTTTTGTTGGTGGCTTGTCCTCCTACAATACCAGTGCCTGTTCCAGTGGAGGTGGTG 89470947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGGGTTTTGTTGGTGGCTTGTCCTCCTACAATACCAGTGCCTGTTCCAGTGGAGGTGGTG 2640

 89470948 GAGGGTGAAATGGACTTCATGAGGGTCCTTGGTTTTGGTGGTTTAATGCTCTATTTTTGT 89471007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GAGGGTGAAATGGACTTCATGAGGGTCCTTGGTTTTGGTGGTTTAATGCTCTATTTTTGT 2700

 89471008 GCTGGTTGGCCTCCTGAAAGGAGGTGGCACTTTCCAGAAAGTATCAGTGGGAGAGGGACT 89471067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCTGGTTGGCCTCCTGAAAGGAGGTGGCACTTTCCAGAAAGTATCAGTGGGAGAGGGACT 2760

 89471068 GGTGGTGGGCAGGGTCCTAGAACTCCCAAGATTAAATGACCTTTGTCTTCAGCTACCAGG 89471127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGTGGTGGGCAGGGTCCTAGAACTCCCAAGATTAAATGACCTTTGTCTTCAGCTACCAGG 2820

 89471128 GTGGATGGAGAAGGACCATCAGGTCAGGGCGGGGCTAGGAGTGTCTGAGCTCAGACTCTC 89471187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTGGATGGAGAAGGACCATCAGGTCAGGGCGGGGCTAGGAGTGTCTGAGCTCAGACTCTC 2880

 89471188 CATGGCTGGATCTTGCTATGGCTGCTGTGGGGGATGGGGGTGAGATTCCCAGGTCACTGG 89471247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CATGGCTGGATCTTGCTATGGCTGCTGTGGGGGATGGGGGTGAGATTCCCAGGTCACTGG 2940

 89471248 AGTTGTGTACCTAGGAGGATTATGGCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGTTGTCAGGGGAG 89471307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGTTGTGTACCTAGGAGGATTATGGCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGTTGTCAGGGGAG 3000

 89471308 TGGGAGAAGCTGGCAGTCACAGGCCTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGGAAGGCCGGTCT 89471367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGGGAGAAGCTGGCAGTCACAGGCCTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGGAAGGCCGGTCT 3060

 89471368 CACTCCCACTGTGCCCTTCTCCCTGCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCAGGCAGAGGGCA 89471427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CACTCCCACTGTGCCCTTCTCCCTGCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCAGGCAGAGGGCA 3120

 89471428 AGAGGGGCGGGCTTAAAATTTGGCTGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAGAAAAGGACTTT 89471487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGAGGGGCGGGCTTAAAATTTGGCTGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAGAAAAGGACTTT 3180

 89471488 AGTTCTTCACCAGCCTGTGAAGTTTGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCCGAGTTCTGGCA 89471547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGTTCTTCACCAGCCTGTGAAGTTTGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCCGAGTTCTGGCA 3240

 89471548 GGAGGCTTCTCGCCCCATTCAAATTGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATTTCTTCTTTCTG 89471607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGAGGCTTCTCGCCCCATTCAAATTGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATTTCTTCTTTCTG 3300

 89471608 TGGAGTTTTACCTGTTGCTCCTCTGGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGTGGTGCCAGGCA 89471667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGGAGTTTTACCTGTTGCTCCTCTGGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGTGGTGCCAGGCA 3360

 89471668 GGAATGGCCTGCCTGGGGACACAGTGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGCTTCCTCTACCC 89471727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGAATGGCCTGCCTGGGGACACAGTGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGCTTCCTCTACCC 3420

 89471728 CTGTATTTTGCTCGGCTCTCTAACTTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGGAAACTCCTCCT 89471787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTGTATTTTGCTCGGCTCTCTAACTTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGGAAACTCCTCCT 3480

 89471788 GCACACAAACCTTCAGCTTCTCCAGTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGAGGGTCTCCCTT 89471847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GCACACAAACCTTCAGCTTCTCCAGTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGAGGGTCTCCCTT 3540

 89471848 TCCCACTTCTGCAGTTGGGGCAGTCAGAATATTTGGAGTGTTTCCTGGGTCCTGCAGGAG 89471907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCCCACTTCTGCAGTTGGGGCAGTCAGAATATTTGGAGTGTTTCCTGGGTCCTGCAGGAG 3600

 89471908 CAGTCTGCCTCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTGTAATATTTTGA 89471967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CAGTCTGCCTCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTGTAATATTTTGA 3660

 89471968 AACACTACATAATTATTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATCCTTATGATTCTTATA 89472027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AACACTACATAATTATTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATCCTTATGATTCTTATA 3720

 89472028 AATGTAAGTAAAATAAGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAATGTTTCTATAAACAAA 89472087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AATGTAAGTAAAATAAGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAATGTTTCTATAAACAAA 3780

 89472088 GGTCTGCAAACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGTGTTATTGGCAC 89472147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGTCTGCAAACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGTGTTATTGGCAC 3840

 89472148 ATAGCCCCACCCATTTACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTGTATGCAGAGTT 89472207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATAGCCCCACCCATTTACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTGTATGCAGAGTT 3900

 89472208 TAGTAGTTGAGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTATCTGGTATTTTACAGA 89472267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TAGTAGTTGAGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTATCTGGTATTTTACAGA 3960

 89472268 AAAGTTAGCCAACCACTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTGGTGAAAAACTAAAAA 89472327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAAGTTAGCCAACCACTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTGGTGAAAAACTAAAAA 4020

 89472328 AAAAAAAATGGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTATTTC 89472387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AAAAAAAATGGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTATTTC 4080

 89472388 TAGTTCAAAAATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTG 89472447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TAGTTCAAAAATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTG 4140

 89472448 ACAATTGGGATGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAA 89472507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ACAATTGGGATGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAA 4200

 89472508 AAGAAAGTCAAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGA 89472567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAGAAAGTCAAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGA 4260

 89472568 CCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAA 89472627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAA 4320

 89472628 ATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTAT 89472687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTAT 4380

 89472688 ACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAA 89472747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAA 4440

 89472748 CTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAG 89472807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAG 4500

 89472808 AAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTT 89472867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTT 4560

 89472868 CTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAG 89472927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAG 4620

 89472928 CTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCA 89472987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCA 4680

 89472988 TAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGA 89473047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGA 4740

 89473048 TGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTC 89473107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTC 4800

 89473108 CCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTC 89473167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTC 4860

 89473168 TGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTG 89473227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTG 4920

 89473228 CACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTT 89473287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTT 4980

 89473288 GTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTC 89473347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTC 5040

 89473348 CAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTT 89473407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTT 5100

 89473408 TAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGC 89473467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGC 5160

 89473468 TTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGG 89473527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGG 5220

 89473528 GCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTG 89473587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTG 5280

 89473588 TAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATT 89473647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATT 5340

 89473648 TTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCT 89473707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCT 5400

 89473708 CCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGT 89473767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGT 5460

 89473768 CTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATT 89473827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 CTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATT 5520

 89473828 TGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATT 89473887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATT 5580

 89473888 ATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAA 89473947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 ATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAA 5640

 89473948 TCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGAT 89474007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGAT 5700

 89474008 AGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACT 89474067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACT 5760

 89474068 CAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGT 89474127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGT 5820

 89474128 GTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGA 89474187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 GTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGA 5880

 89474188 TGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTA 89474247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTA 5940

 89474248 CTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTA 89474307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 CTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTA 6000

 89474308 AGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCAT 89474367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 AGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCAT 6060

 89474368 TTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAA 89474427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAA 6120

 89474428 TGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCA 89474487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCA 6180

 89474488 GACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGT 89474547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 GACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGT 6240

 89474548 TCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACC 89474607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACC 6300

 89474608 ACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCA 89474667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 ACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCA 6360

 89474668 GCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAAC 89474727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 GCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAAC 6420

 89474728 TCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTG 89474787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 TCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTG 6480

 89474788 CTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTG 89474847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTG 6540

 89474848 TGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTG 89474907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 TGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTG 6600

 89474908 ACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTA 89474967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 ACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTA 6660

 89474968 TGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAA 89475027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 TGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAA 6720

 89475028 AATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTT 89475087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 AATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTT 6780

 89475088 TTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGA 89475147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 TTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGA 6840

 89475148 TTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAG 89475207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 TTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAG 6900

 89475208 TAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAA 89475267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 TAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAA 6960

 89475268 TTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATAC 89475327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 TTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATAC 7020

 89475328 ATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGAT 89475387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 ATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGAT 7080

 89475388 ACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGC 89475447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 ACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGC 7140

 89475448 TGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCA 89475507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 TGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCA 7200

 89475508 GAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATAT 89475567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 GAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATAT 7260

 89475568 CAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATC 89475627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 CAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATC 7320

 89475628 CAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCT 89475687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 CAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCT 7380

 89475688 GTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAAT 89475747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 GTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAAT 7440

 89475748 CTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAA 89475807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 CTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAA 7500

 89475808 TTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGT 89475867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 TTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGT 7560

 89475868 GATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTC 89475927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 GATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTC 7620

 89475928 CTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGT 89475987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 CTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGT 7680

 89475988 AGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGC 89476047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 AGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGC 7740

 89476048 CTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTT 89476107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 CTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTT 7800

 89476108 AACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAA 89476167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 AACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAA 7860

 89476168 TCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGC 89476227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 TCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGC 7920

 89476228 TGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATG 89476287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 TGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATG 7980

 89476288 TTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCT 89476347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 TTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCT 8040

 89476348 GCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTT 89476407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 GCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTT 8100

 89476408 GATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATG 89476467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 GATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATG 8160

 89476468 AAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTT 89476527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 AAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTT 8220

 89476528 TGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACC 89476587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 TGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACC 8280

 89476588 TGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATA 89476647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 TGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATA 8340

 89476648 AAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGA 89476707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8341 AAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGA 8400

 89476708 CTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTA 89476767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 CTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTA 8460

 89476768 CAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAG 89476827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8461 CAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAG 8520

 89476828 AGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAA 89476887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8521 AGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAA 8580

 89476888 ACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTG 89476947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8581 ACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTG 8640

 89476948 ACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGAC 89477007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8641 ACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGAC 8700

 89477008 AGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCAT 89477067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 AGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCAT 8760

 89477068 ATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTT 89477127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8761 ATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTT 8820

 89477128 GCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGC 89477187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8821 GCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGC 8880

 89477188 CCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTT 89477247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8881 CCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTT 8940

 89477248 TTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAA 89477307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8941 TTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAA 9000

 89477308 CTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTC 89477367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9001 CTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTC 9060

 89477368 ATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATT 89477427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9061 ATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATT 9120

 89477428 ACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACT 89477487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9121 ACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACT 9180

 89477488 TCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCG 89477547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9181 TCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCG 9240

 89477548 GGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCG 89477607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9241 GGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCG 9300

 89477608 GCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCT 89477667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9301 GCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCT 9360

 89477668 CTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAA 89477727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9361 CTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAA 9420

 89477728 ATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAA 89477787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9421 ATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAA 9480

 89477788 TTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAA 89477847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9481 TTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAA 9540

 89477848 ATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGA 89477907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9541 ATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGA 9600

 89477908 TCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTC 89477967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9601 TCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTC 9660

 89477968 CTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCA 89478027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9661 CTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCA 9720

 89478028 TAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTT 89478087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9721 TAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTT 9780

 89478088 ATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACA 89478147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9781 ATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACA 9840

 89478148 GCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATG 89478207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9841 GCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATG 9900

 89478208 CTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTT 89478267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9901 CTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTT 9960

 89478268 AATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGG 89478327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9961 AATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGG 10020

 89478328 CTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTT 89478387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10021 CTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTT 10080

 89478388 TTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAA 89478447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10081 TTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAA 10140

 89478448 TGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTG 89478507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10141 TGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTG 10200

 89478508 ATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGC 89478567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10201 ATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGC 10260

 89478568 TGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATT 89478627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10261 TGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATT 10320

 89478628 CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT 89478686
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10321 CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT 10379

EXCISED REGION

 89478688 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 89478747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10380 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 10439

 89478748 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACC 89478807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10440 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACC 10499

 89478808 ATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTAC 89478867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
    10500 ATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTAC 10559

 89478868 GAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGT 89478927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10560 GAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGT 10619

 89478928 AGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTT 89478987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10620 AGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTT 10679

 89478988 TCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCT 89479047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10680 TCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCT 10739

 89479048 TTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGG 89479107
          |||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
    10740 TTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGG 10799

 89479108 TACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAA 89479167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10800 TACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAA 10859

 89479168 TAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTT 89479227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10860 TAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTT 10919

 89479228 ATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCA 89479287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10920 ATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCA 10979

 89479288 AAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTG 89479347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10980 AAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTG 11039

 89479348 CAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAA 89479407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11040 CAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAA 11099

 89479408 TATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGA 89479467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11100 TATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGA 11159

 89479468 TAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAA 89479527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11160 TAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAA 11219

 89479528 CACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATT 89479587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11220 CACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATT 11279

 89479588 CCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAG 89479647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11280 CCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAG 11339

 89479648 AATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAA 89479707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11340 AATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAA 11399

 89479708 AAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTACCT 89479767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
    11400 AAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTACCT 11459

 89479768 TGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCT 89479827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11460 TGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCT 11519

 89479828 TCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAG 89479887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11520 TCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAG 11579

 89479888 TCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTC 89479947
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11580 TCAGCTGAACCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTC 11639

 89479948 AGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTC 89480007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11640 AGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTC 11699

 89480008 ATCCCAT 89480014
          |||||||
    11700 ATCCCAT 11706

Alignment time is 15.3707 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    8279] =>      8279 nucs 'mol-32-3311-040532_8279'

Score:        8193
Aligned:      8281        nucs
Identic:      8273 (100%) nucs =>      1193 (100%)      7080 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89474615,89475807] EXCISED REGION [89475809,89482896]
 second seq =>  [       1,    1193] EXCISED REGION [    1194,    8279]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89475808,89475808]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>        12 nucs [89479063,89479074]
 second seq =>        12 nucs [4447,4458]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [89475808,89475822] to [89475809,89475823]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89474615 GATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTG 89474674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTG 60

 89474675 GGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTC 89474734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTC 120

 89474735 TTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGC 89474794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGC 180

 89474795 CTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAG 89474854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAG 240

 89474855 TTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCAT 89474914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCAT 300

 89474915 ATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACT 89474974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACT 360

 89474975 TAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGA 89475034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGA 420

 89475035 AAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTT 89475094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTT 480

 89475095 TCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAG 89475154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAG 540

 89475155 TATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAA 89475214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAA 600

 89475215 TGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCC 89475274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCC 660

 89475275 TCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCC 89475334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCC 720

 89475335 AAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATA 89475394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATA 780

 89475395 CTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTT 89475454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTT 840

 89475455 CCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGAT 89475514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGAT 900

 89475515 TCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAG 89475574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAG 960

 89475575 AGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTG 89475634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTG 1020

 89475635 AAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTT 89475694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTT 1080

 89475695 GGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAA 89475754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAA 1140

 89475755 TTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAA 89475807
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAA 1193

EXCISED REGION

 89475809 TTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTG 89475868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 TTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTG 1253

 89475869 ATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 89475928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 ATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCC 1313

 89475929 TGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTA 89475988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 TGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTA 1373

 89475989 GAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCC 89476048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 GAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCC 1433

 89476049 TGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTA 89476108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 TGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTA 1493

 89476109 ACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAAT 89476168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 ACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAAT 1553

 89476169 CTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCT 89476228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 CTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCT 1613

 89476229 GGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGT 89476288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 GGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGT 1673

 89476289 TTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTG 89476348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 TTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTG 1733

 89476349 CCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTG 89476408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 CCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTG 1793

 89476409 ATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGA 89476468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 ATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGA 1853

 89476469 AAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTT 89476528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 AAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTT 1913

 89476529 GGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCT 89476588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 GGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCT 1973

 89476589 GTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAA 89476648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 GTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAA 2033

 89476649 AGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGAC 89476708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 AGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGAC 2093

 89476709 TGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTAC 89476768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 TGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTAC 2153

 89476769 AAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGA 89476828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 AAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGA 2213

 89476829 GTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAA 89476888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 GTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAA 2273

 89476889 CAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGA 89476948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2274 CAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCCCTTACTCCTGA 2333

 89476949 CCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACA 89477008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 CCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACA 2393

 89477009 GCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATA 89477068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 GCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATA 2453

 89477069 TGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTG 89477128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 TGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTG 2513

 89477129 CATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCC 89477188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 CATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCC 2573

 89477189 CTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTT 89477248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 CTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTT 2633

 89477249 TAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAAC 89477308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 TAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAAC 2693

 89477309 TAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCA 89477368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 TAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCA 2753

 89477369 TTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTA 89477428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 TTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTA 2813

 89477429 CCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTT 89477488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 CCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTT 2873

 89477489 CAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGG 89477548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 CAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGG 2933

 89477549 GCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGG 89477608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 GCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGG 2993

 89477609 CTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTC 89477668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 CTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTC 3053

 89477669 TGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAA 89477728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 TGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAA 3113

 89477729 TGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAAT 89477788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 TGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAAT 3173

 89477789 TTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAA 89477848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 TTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAA 3233

 89477849 TGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGAT 89477908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 TGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGAT 3293

 89477909 CCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCC 89477968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 CCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCC 3353

 89477969 TGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCAT 89478028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 TGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCAT 3413

 89478029 AGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTA 89478088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 AGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTA 3473

 89478089 TGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAG 89478148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 TGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAG 3533

 89478149 CATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGC 89478208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 CATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGC 3593

 89478209 TAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTA 89478268
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 TAGCGACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTA 3653

 89478269 ATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGC 89478328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 ATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGC 3713

 89478329 TACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTT 89478388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 TACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTT 3773

 89478389 TCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAAT 89478448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 TCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAAT 3833

 89478449 GTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGA 89478508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 GTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGA 3893

 89478509 TACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCT 89478568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 TACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCT 3953

 89478569 GGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTC 89478628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 GGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTC 4013

 89478629 TCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTTAT 89478688
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     4014 TCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT-T 4072

 89478689 TTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCT 89478748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 TTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCT 4132

 89478749 GGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCA 89478808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 GGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCA 4192

 89478809 TCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTACG 89478868
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4193 TCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTACG 4252

 89478869 AGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTA 89478928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 AGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTA 4312

 89478929 GGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTT 89478988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 GGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTT 4372

 89478989 CTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTT 89479048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 CTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTT 4432

 89479049 TGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGT 89479108
          ||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 TGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGT 4492

 89479109 ACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAAT 89479168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 ACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAAT 4552

 89479169 AGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTA 89479228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 AGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTA 4612

 89479229 TTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAA 89479288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 TTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAA 4672

 89479289 AAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGC 89479348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 AAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGC 4732

 89479349 AGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAAT 89479408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 AGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAAT 4792

 89479409 ATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGAT 89479468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 ATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGAT 4852

 89479469 AAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAAC 89479528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 AAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAAC 4912

 89479529 ACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTC 89479588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 ACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTC 4972

 89479589 CTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGA 89479648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 CTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGA 5032

 89479649 ATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAA 89479708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 ATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAA 5092

 89479709 AAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTACCTT 89479768
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     5093 AAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTACCTT 5152

 89479769 GCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTT 89479828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 GCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTT 5212

 89479829 CCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGT 89479888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 CCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGT 5272

 89479889 CAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCA 89479948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 CAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCA 5332

 89479949 GCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCA 89480008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 GCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCA 5392

 89480009 TCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTG 89480068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 TCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTG 5452

 89480069 TCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCT 89480128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 TCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCT 5512

 89480129 CCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGT 89480188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5513 CCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGT 5572

 89480189 CCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCT 89480248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5573 CCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCT 5632

 89480249 GCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGG 89480308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5633 GCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGG 5692

 89480309 TGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGA 89480368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5693 TGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGA 5752

 89480369 GCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTTA 89480428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5753 GCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTTA 5812

 89480429 GAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTGT 89480488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5813 GAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTGT 5872

 89480489 TACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTCT 89480548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5873 TACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTCT 5932

 89480549 CACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATGG 89480608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5933 CACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATGG 5992

 89480609 GCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTTT 89480668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5993 GCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTTT 6052

 89480669 GCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAACT 89480728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6053 GCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAACT 6112

 89480729 CACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTAG 89480788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6113 CACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTAG 6172

 89480789 GATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATGT 89480848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6173 GATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATGT 6232

 89480849 ACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTAA 89480908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6233 ACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTAA 6292

 89480909 ATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTTA 89480968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6293 ATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTTA 6352

 89480969 CCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTTT 89481028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6353 CCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTTT 6412

 89481029 TGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCCA 89481088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6413 TGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCCA 6472

 89481089 GAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTACT 89481148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6473 GAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTACT 6532

 89481149 TCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCAC 89481208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6533 TCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCAC 6592

 89481209 AATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACATA 89481268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6593 AATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACATA 6652

 89481269 AATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACTG 89481328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6653 AATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACTG 6712

 89481329 AGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCAC 89481388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6713 AGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCAC 6772

 89481389 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 89481448
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     6773 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-TGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 6831

 89481449 AGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAAAAAT 89481508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6832 AGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAAAAAT 6891

 89481509 CCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGAACAA 89481568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6892 CCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGAACAA 6951

 89481569 GGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCCAGAG 89481628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6952 GGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCCAGAG 7011

 89481629 TAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAATAAT 89481688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7012 TAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAATAAT 7071

 89481689 CTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTGTTAG 89481748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7072 CTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTGTTAG 7131

 89481749 AACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATCTGTT 89481808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7132 AACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATCTGTT 7191

 89481809 GCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCCATTT 89481868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7192 GCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCCATTT 7251

 89481869 AACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGCTCAC 89481928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7252 AACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGCTCAC 7311

 89481929 GCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGATCGAG 89481988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7312 GCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGATCGAG 7371

 89481989 ACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACACACAC 89482048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7372 ACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACACACAC 7431

 89482049 AAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGAGGCA 89482108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7432 AAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGAGGCA 7491

 89482109 TGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCAC 89482168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7492 TGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCAC 7551

 89482169 TCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAAAACG 89482228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7552 TCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAAAACG 7611

 89482229 TAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGGAGAC 89482288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7612 TAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGGAGAC 7671

 89482289 AGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGACCTC 89482348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7672 AGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGACCTC 7731

 89482349 CCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCACGTGA 89482408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7732 CCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCACGTGA 7791

 89482409 CACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTGTCCAA 89482468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7792 CACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTGTCCAA 7851

 89482469 GTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTGCTGGG 89482528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7852 GTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTGCTGGG 7911

 89482529 ATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAAGAGTT 89482588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7912 ATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAAGAGTT 7971

 89482589 AAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTATCAAA 89482648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7972 AAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTATCAAA 8031

 89482649 ATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCATATGA 89482708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8032 ATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCATATGA 8091

 89482709 AATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTCAGAGG 89482768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8092 AATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTCAGAGG 8151

 89482769 CTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTTTGGTA 89482828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8152 CTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTTTGGTA 8211

 89482829 TTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAACTCTC 89482888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8212 TTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAACTCTC 8271

 89482889 ACATCTAT 89482896
          ||||||||
     8272 ACATCTAT 8279

Alignment time is 10.9998 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    6869] =>      6869 nucs 'mol-32-3311-302323_6869'

Score:        6836
Aligned:      6869        nucs
Identic:      6866 (100%) nucs =>      5978 (100%)       888 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89472709,89478686] EXCISED REGION [89478688,89479578]
 second seq =>  [       1,    5978] EXCISED REGION [    5979,    6869]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89478687,89478687]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>        12 nucs [89479063,89479074]
 second seq =>        12 nucs [6354,6365]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [89478684,89478686] to [89478688,89478690]
 second seq =>         3 nucs [5976,5978] to [5979,5981]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89472709 GCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGT 89472768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGT 60

 89472769 CACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCA 89472828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCA 120

 89472829 ATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAAT 89472888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAAT 180

 89472889 ATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAA 89472948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAA 240

 89472949 TTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATAT 89473008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATAT 300

 89473009 AATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGA 89473068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGA 360

 89473069 CCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACT 89473128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACT 420

 89473129 TTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGAT 89473188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGAT 480

 89473189 CCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAA 89473248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAA 540

 89473249 GGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGAT 89473308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGAT 600

 89473309 GCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAG 89473368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAG 660

 89473369 TTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGAC 89473428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGAC 720

 89473429 ATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGT 89473488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGT 780

 89473489 TGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACA 89473548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACA 840

 89473549 AATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACAT 89473608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACAT 900

 89473609 GCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAAT 89473668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAAT 960

 89473669 TATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAA 89473728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAA 1020

 89473729 AGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTA 89473788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTA 1080

 89473789 ATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATG 89473848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATG 1140

 89473849 CATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATAC 89473908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATAC 1200

 89473909 AGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGAT 89473968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGAT 1260

 89473969 CTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCC 89474028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCC 1320

 89474029 AGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGG 89474088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGG 1380

 89474089 CACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTC 89474148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTC 1440

 89474149 TGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACT 89474208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACT 1500

 89474209 ATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAA 89474268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAA 1560

 89474269 AGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTC 89474328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTC 1620

 89474329 GCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATG 89474388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATG 1680

 89474389 ACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAAC 89474448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAAC 1740

 89474449 TTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGT 89474508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGT 1800

 89474509 ACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTT 89474568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTT 1860

 89474569 GTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATA 89474628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATA 1920

 89474629 CCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCT 89474688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCT 1980

 89474689 CCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCA 89474748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCA 2040

 89474749 TCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAG 89474808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAG 2100

 89474809 CTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCT 89474868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCT 2160

 89474869 CATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGA 89474928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGA 2220

 89474929 GATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGT 89474988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGT 2280

 89474989 CAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATA 89475048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATA 2340

 89475049 ATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTG 89475108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTG 2400

 89475109 GTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAAT 89475168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAAT 2460

 89475169 CTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGG 89475228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGG 2520

 89475229 TTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTG 89475288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTG 2580

 89475289 TGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCA 89475348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCA 2640

 89475349 GATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGAT 89475408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGAT 2700

 89475409 TCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAG 89475468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAG 2760

 89475469 CTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAG 89475528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAG 2820

 89475529 GAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATG 89475588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATG 2880

 89475589 ACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGAT 89475648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGAT 2940

 89475649 GAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAA 89475708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAA 3000

 89475709 TCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACT 89475768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACT 3060

 89475769 CAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGAC 89475828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGAC 3120

 89475829 AGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCT 89475888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCT 3180

 89475889 CCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGG 89475948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGG 3240

 89475949 CGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGT 89476008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGT 3300

 89476009 TGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTG 89476068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTG 3360

 89476069 CTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGG 89476128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGG 3420

 89476129 GTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCC 89476188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCC 3480

 89476189 GGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAA 89476248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAA 3540

 89476249 CAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCT 89476308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCT 3600

 89476309 GGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTA 89476368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTA 3660

 89476369 CAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACC 89476428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACC 3720

 89476429 TGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGA 89476488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGA 3780

 89476489 CAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGT 89476548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGT 3840

 89476549 CAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCC 89476608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCC 3900

 89476609 TCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGT 89476668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGT 3960

 89476669 TTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAA 89476728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAA 4020

 89476729 GCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTG 89476788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTG 4080

 89476789 TCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTA 89476848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTA 4140

 89476849 GCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAA 89476908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAA 4200

 89476909 ACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATC 89476968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATC 4260

 89476969 GCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGA 89477028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGA 4320

 89477029 GGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAAC 89477088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAAC 4380

 89477089 AGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAA 89477148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAA 4440

 89477149 TCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAA 89477208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAA 4500

 89477209 TTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTA 89477268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTA 4560

 89477269 ATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAA 89477328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAA 4620

 89477329 TCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCC 89477388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCC 4680

 89477389 TTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAAC 89477448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAAC 4740

 89477449 AGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTA 89477508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTA 4800

 89477509 ACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCC 89477568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCC 4860

 89477569 ATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCC 89477628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 ATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCC 4920

 89477629 AAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAG 89477688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAG 4980

 89477689 GTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTA 89477748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTA 5040

 89477749 AAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACA 89477808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACA 5100

 89477809 GCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGT 89477868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGT 5160

 89477869 CCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCA 89477928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCA 5220

 89477929 TATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGC 89477988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGC 5280

 89477989 ATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTG 89478048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 ATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTG 5340

 89478049 TATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCC 89478108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCC 5400

 89478109 TAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTC 89478168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTC 5460

 89478169 TGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAA 89478228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAA 5520

 89478229 ATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTA 89478288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 ATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTA 5580

 89478289 ATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAG 89478348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 ATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAG 5640

 89478349 GCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTT 89478408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTT 5700

 89478409 TTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTT 89478468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTT 5760

 89478469 AGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTA 89478528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 AGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTA 5820

 89478529 TGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCT 89478588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCT 5880

 89478589 CGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAG 89478648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 CGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAG 5940

 89478649 TAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT 89478686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT 5978

EXCISED REGION

 89478688 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 89478747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5979 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCC 6038

 89478748 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACC 89478807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6039 TGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACC 6098

 89478808 ATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTAC 89478867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     6099 ATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTAC 6158

 89478868 GAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGT 89478927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6159 GAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGT 6218

 89478928 AGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTT 89478987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6219 AGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTT 6278

 89478988 TCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCT 89479047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6279 TCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCT 6338

 89479048 TTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGG 89479107
          |||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     6339 TTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGG 6398

 89479108 TACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAA 89479167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6399 TACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAA 6458

 89479168 TAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTT 89479227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6459 TAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTT 6518

 89479228 ATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCA 89479287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6519 ATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCA 6578

 89479288 AAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTG 89479347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6579 AAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTG 6638

 89479348 CAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAA 89479407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6639 CAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAA 6698

 89479408 TATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGA 89479467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6699 TATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGA 6758

 89479468 TAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAA 89479527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6759 TAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAA 6818

 89479528 CACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAA 89479578
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6819 CACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAA 6869

Alignment time is 9.39448 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    6007] =>      6007 nucs 'mol-32-331c-040962_6007'

Score:        5908
Aligned:      6009        nucs
Identic:      5999 (100%) nucs =>      3226 (100%)      2773 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89472676,89475908] EXCISED REGION [89478625,89481400]
 second seq =>  [       1,    3231] EXCISED REGION [    3232,    6007]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89472676 ATTGCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTA 89472735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTGCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTA 60

 89472736 ATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAAT 89472795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAAT 120

 89472796 TGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCT 89472855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCT 180

 89472856 TGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGAT 89472915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGAT 240

 89472916 GGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCA 89472975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCA 300

 89472976 CATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCT 89473035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCT 360

 89473036 AGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTG 89473095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTG 420

 89473096 CCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGA 89473155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGA 480

 89473156 AGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAAT 89473215
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAATAAACTTCTGAGTGGCGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAAT 540

 89473216 GCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAA 89473275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAA 600

 89473276 CTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAG 89473335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAG 660

 89473336 TGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAA 89473395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAA 720

 89473396 AGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGG 89473455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGG 780

 89473456 GTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCC 89473515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCC 840

 89473516 TTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTA 89473575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTA 900

 89473576 AGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTT 89473635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTT 960

 89473636 TTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGT 89473695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGT 1020

 89473696 GTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCT 89473755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCT 1080

 89473756 ATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCT 89473815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCT 1140

 89473816 TAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACC 89473875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACC 1200

 89473876 TACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGAT 89473935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGAT 1260

 89473936 TAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGG 89473995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGG 1320

 89473996 GTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACA 89474055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACA 1380

 89474056 TAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGAC 89474115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGAC 1440

 89474116 TGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAA 89474175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAA 1500

 89474176 AGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGG 89474235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGG 1560

 89474236 GTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTG 89474295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTG 1620

 89474296 TTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATA 89474355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATA 1680

 89474356 TAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAA 89474415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAA 1740

 89474416 AACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGC 89474475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGC 1800

 89474476 CATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCC 89474535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCC 1860

 89474536 TGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACA 89474595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACA 1920

 89474596 GAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCT 89474655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCT 1980

 89474656 CTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACAT 89474715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACAT 2040

 89474716 GTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCT 89474775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCT 2100

 89474776 CCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAG 89474835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2101 CCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACGTTCCACTGTGGAGGAAG 2160

 89474836 AAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCA 89474895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCA 2220

 89474896 TTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCT 89474955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCT 2280

 89474956 TGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGA 89475015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGA 2340

 89475016 AAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACC 89475075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACC 2400

 89475076 TTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCAC 89475135
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2401 TTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCAT 2460

 89475136 AGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACA 89475195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACA 2520

 89475196 CAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTT 89475255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2521 CAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTGTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTT 2580

 89475256 TTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCAC 89475315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCAC 2640

 89475316 AGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATT 89475375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATT 2700

 89475376 TAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTC 89475435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTC 2760

 89475436 TAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGA 89475495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGA 2820

 89475496 GAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATG 89475555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATG 2880

 89475556 CAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGAT 89475615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGAT 2940

 89475616 GTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCAT 89475675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCAT 3000

 89475676 CATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAAC 89475735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAAC 3060

 89475736 GTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAA 89475795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAA 3120

 89475796 TTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGA 89475855
          ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3121 TTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTT--GAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGA 3178

 89475856 GTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 3231

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 3291

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3292 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 3351

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3352 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 3411

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3412 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 3471

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3472 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 3531

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3532 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 3591

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3592 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 3651

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 3711

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 3771

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 3831

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 3891

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 3951

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 4011

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4012 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 4071

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4072 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 4131

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4132 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 4191

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4192 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 4251

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 4311

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4312 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 4371

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4372 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 4431

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 4491

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4492 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 4551

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4552 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 4611

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 4671

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4672 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 4731

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4732 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 4791

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4792 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 4851

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4852 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 4911

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4912 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 4971

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4972 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 5031

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5032 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 5091

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5092 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 5151

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5152 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 5211

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5212 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 5271

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5272 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 5331

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5332 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 5391

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5392 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 5451

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5452 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 5511

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5512 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 5571

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5572 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 5631

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5632 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 5691

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5692 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 5751

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5752 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 5811

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5812 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 5871

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5872 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 5931

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5932 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 5991

 89481385 CCACTGCACTCCAGCC 89481400
          ||||||||||||||||
     5992 CCACTGCACTCCAGCC 6007

Alignment time is 7.78737 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2839] =>      2839 nucs 'mol-32-331c-040962_2839'

Score:        2806
Aligned:      2839        nucs
Identic:      2836 (100%) nucs =>        63 (100%)      2773 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475846,89475908] EXCISED REGION [89478625,89481400]
 second seq =>  [       1,      63] EXCISED REGION [      64,    2839]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89475846 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 89475905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 60

 89475906 GTG 89475908
          |||
       61 GTG 63

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       64 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 123

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 183

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      184 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 243

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      244 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 303

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 363

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 423

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 483

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 543

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 603

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 663

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 723

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 783

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 843

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 903

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 963

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 1023

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 1083

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 1143

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1144 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 1203

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 1263

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 1323

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 1383

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 1443

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 1503

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 1563

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 1623

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 1683

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 1743

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 1803

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 1863

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 1923

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 1983

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 2043

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 2103

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 2163

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 2223

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 2283

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 2343

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 2403

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 2463

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 2523

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 2583

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 2643

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 2703

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 2763

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 2823

 89481385 CCACTGCACTCCAGCC 89481400
          ||||||||||||||||
     2824 CCACTGCACTCCAGCC 2839

Alignment time is 3.88225 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,   10977] =>     10977 nucs 'mol-32-331c-138260_10977'

Score:       10686
Aligned:     10990        nucs
Identic:     10937 (100%) nucs =>      1430 (100%)      9507 (100%)
Gaps:           39 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89474473,89475908] EXCISED REGION [89478625,89488152]
 second seq =>  [       1,    1434] EXCISED REGION [    1435,   10977]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89474473 GGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTC 89474532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTC 60

 89474533 CCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAA 89474592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAA 120

 89474593 ACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCT 89474652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCT 180

 89474653 TCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCA 89474712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCA 240

 89474713 CATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTT 89474772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTT 300

 89474773 CCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGG 89474832
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      301 CCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACGTTCCACTGTGGAGG 360

 89474833 AAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCT 89474892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCT 420

 89474893 CCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATG 89474952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATG 480

 89474953 TCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATT 89475012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATT 540

 89475013 TGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTC 89475072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTC 600

 89475073 ACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGT 89475132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGT 660

 89475133 CACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGA 89475192
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGA 720

 89475193 ACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCAT 89475252
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      721 ACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTGTTCCTGTTCTTCTGCCCACCAT 780

 89475253 CTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTAT 89475312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTAT 840

 89475313 CACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTT 89475372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTT 900

 89475373 ATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGG 89475432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGG 960

 89475433 CTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCT 89475492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCT 1020

 89475493 TGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGG 89475552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGG 1080

 89475553 ATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCA 89475612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCA 1140

 89475613 GATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAAC 89475672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAAC 1200

 89475673 CATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAAC 89475732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAAC 1260

 89475733 AACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTC 89475792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTC 1320

 89475793 TAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCT 89475852
          |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||.||||||||||
     1321 TAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTT--GAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCT 1378

 89475853 GGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 GGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 1434

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 1494

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 1554

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 1614

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1615 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 1674

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 1734

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 1794

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 1854

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 1914

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 1974

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 2034

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 2094

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 2154

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 2214

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 2274

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 2334

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 2394

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 2454

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 2514

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2515 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 2574

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 2634

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 2694

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 2754

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 2814

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 2874

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 2934

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 2994

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 3054

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 3114

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 3174

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 3234

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 3294

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 3354

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 3414

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 3474

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 3534

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 3594

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 3654

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 3714

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 3774

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 3834

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 3894

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 3954

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 4014

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 4074

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 4134

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 4194

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 89481444
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     4195 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-TGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 4253

 89481445 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 89481504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 4313

 89481505 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 89481564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 4373

 89481565 ACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 89481624
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 ACAAGGAAAAGATGCCCATTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 4433

 89481625 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 89481684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 4493

 89481685 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 89481744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 4553

 89481745 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 89481804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 4613

 89481805 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 89481864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 4673

 89481865 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 89481924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 4733

 89481925 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 89481984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 4793

 89481985 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 89482044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 4853

 89482045 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 89482104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 4913

 89482105 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACT 89482164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACT 4973

 89482165 GCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAA 89482224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 GCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAA 5033

 89482225 AACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGG 89482284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 AACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGG 5093

 89482285 AGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGA 89482344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 AGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGA 5153

 89482345 CCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCAC 89482404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 CCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCAC 5213

 89482405 GTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTGT 89482464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 GTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTGT 5273

 89482465 CCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTGC 89482524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 CCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTGC 5333

 89482525 TGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAAG 89482584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 TGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAAG 5393

 89482585 AGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTAT 89482644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 AGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTAT 5453

 89482645 CAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCAT 89482704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 CAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCAT 5513

 89482705 ATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTCA 89482764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 ATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTCA 5573

 89482765 GAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTTT 89482824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 GAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTTT 5633

 89482825 GGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAAC 89482884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 GGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAAC 5693

 89482885 TCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAATCATTCAACGCAGAAAG 89482944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 TCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAATCATTCAACGCAGAAAG 5753

 89482945 AGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCACATGCTCACATGCCAAA 89483004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     5754 AGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCACATGCTCACATGCC-AA 5812

 89483005 AAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACGTAACTCAAAATGGATCA 89483064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5813 AAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACGTAACTCAAAATGGATCA 5872

 89483065 AAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGAAAACAAAGGGGAAAAAC 89483124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5873 AAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGAAAACAAAGGGGAAAAAC 5932

 89483125 AGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAATGAAAAACTTTTGTGCAT 89483184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5933 AGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAATGAAAAACTTTTGTGCAT 5992

 89483185 CAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATGGAAGAAAACATTTGCTA 89483244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5993 CAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATGGAAGAAAACATTTGCTA 6052

 89483245 AACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGAATTCCTACAATGCAACA 89483304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6053 AACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGAATTCCTACAATGCAACA 6112

 89483305 CAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTCTCTAAAGAATGGCCAAT 89483364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6113 CAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTCTCTAAAGAATGGCCAAT 6172

 89483365 AAGCACCTGAAAAGATGCTCAACATTACTAGTCATTAGGAAAATGCAAATTAAAGCCATA 89483424
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6173 AAGCACCTGAAAAGATGCTCAATATTACTAGTCATTAGGAAAATGCAAATTAAAGCCATA 6232

 89483425 GTGAGATACTACTTCACATCCATTAGTATGGTGACTATCAAAAAAAATTGAAAAGGGCTG 89483484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6233 GTGAGATACTACTTCACATCCATTAGTATGGTGACTATCAAAAAAAATTGAAAAGGGCTG 6292

 89483485 GGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCACC 89483544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6293 GGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCACC 6352

 89483545 TGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCAAATATGGAGAAACCCCATTTACACTAAAAA 89483604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6353 TGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCAAATATGGAGAAACCCCATTTACACTAAAAA 6412

 89483605 TACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCACCTACTTGGGAGGCTGA 89483664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6413 TACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCACCTACTTGGGAGGCTGA 6472

 89483665 GGTAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGGTCGTGCCACT 89483724
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6473 GGTAGAAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGGTCGTGCCACT 6532

 89483725 GCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTGTGTCTCAAAAAAAAAAAAAATTAAAATAA 89483784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6533 GCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTGTGTCTCAAAAAAAAAAAAAATTAAAATAA 6592

 89483785 CTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATTGCTATGGAATAAAAGATGAAATGCTCCTGATTAT 89483844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6593 CTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATTGCTATGGAATAAAAGATGAAATGCTCCTGATTAT 6652

 89483845 TGTAAATACAAAATTGCATGCAGGATTGTGCAAAGACAGTGCCAGGTTGGACTGCCAGAA 89483904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6653 TGTAAATACAAAATTGCATGCAGGATTGTGCAAAGACAATGCCAGGTTGGACTGCCAGAA 6712

 89483905 TGAGCCAACGGGACGTGATGTGCTTCCCCCTGCAGAGAGCCTATGAATGGATGTGCAGTC 89483964
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6713 TGAGCCAACGGCACGTGATGTGCTTCCCCCTGCAGAGAGCCTATGAATGGATGTGCAGTC 6772

 89483965 AGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTCCTATCCCAGAAAAGCAGATGTTCATAGCTCTGGG 89484024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6773 AGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTCCTATCCCAGAAAAGCAGATGTTCATAGCTCTGGG 6832

 89484025 AATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGAGGGGGCACCTGTCCATGTGGATAAGATAGGGCCA 89484084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6833 AATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGAGGGGGCACCTGTCCATGTGGATAAGATAGGGCCA 6892

 89484085 TAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTCTTCTAGGCCTCTTTAGGGTTAAGGCATACTCCCT 89484144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6893 TAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTCTTCTAGGCCTCTTTAGGGTTAAGGCATACTCCCT 6952

 89484145 TCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTTGTCTAGCTTCACGTCTTGTTTCTATGGATTGTTT 89484204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6953 TCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTTGTCTAGCTTCACGTCTTGTTTCTATGGATTGTTT 7012

 89484205 GTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTACTGCTGATTAATATCTTGCTAATCATAGGTTATG 89484264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7013 GTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTACTGCTGATTAATATCTTGCTAATCATAGGTTATG 7072

 89484265 AAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCTCTGTTAGAAATTACTGATGCACACACTATATTGT 89484324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7073 AAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCTCTGTTAGAAATTACTGATGCACACACTATATTGT 7132

 89484325 AAATTCTTATCTCTGTATACTGTACTTCTGCATACAGATGTTATGTTAAAGAATTACTTC 89484384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7133 AAATTCTTATCTCTGTATACTGTACTTCTGCATACAGATGTTATGTTAAAGAATTACTTC 7192

 89484385 ATCCCCATGTGACCATCTCACCTCATAATCAAACGACCCTAAATCCCTCACTAACCTTCC 89484444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7193 ATCCCCATGTGACCATCTCACCTCATAATCAAACGACCCTAAATCCCTCACTAACCTTCC 7252

 89484445 CCCACCCTCACTAAACTTAATAATAAATGCTGGCATATCCAGTGCATTGGCAGCACCACG 89484504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7253 CCCACCCTCACTAAACTTAATAATAAATGCTGGCATATCCAGTGCATTGGCAGCACCACG 7312

 89484505 GGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGGACCCAGCTTTCACTATCTTGTGTGTATCTATTAT 89484564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7313 GGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGGACCCAGCTTTCACTATCTTGTGTGTATCTATTAT 7372

 89484565 TTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGAACAAAGAGAGAGCCCCGTTGCATTGCAGGCTGCT 89484624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7373 TTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGAACAAAGAGAGAGCCCCGTTGCATTGCAGGCTGCT 7432

 89484625 GGCCAGATCCCGCAATAAATAACAAATGTTGGTGAATATGAAGAGAAATTAGAACCCTTG 89484684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7433 GGCCAGATCCCGCAATAAATAACAAATGTTGGTGAATATGAAGAGAAATTAGAACCCTTG 7492

 89484685 TGCATTTCTGTTGGGAATGCTAAATGGTGCAGTCACTGTGGAAAATGATACAGCAATTCC 89484744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7493 TGCATTTCTGTTGGGAATGCTAAATGGTGCAGTCACTGTGGAAAATGATACAGCAATTCC 7552

 89484745 TTAAAAAATTTAACATGGAATGACTATATGAGCCATCAGTTCCACTTCTGGGTGTATACT 89484804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7553 TTAAAAAATTTAACATGGAATGACTATATGAGCCATCAGTTCCACTTCTGGGTGTATACT 7612

 89484805 GAAAAGGAGTGAAAGCAGGGACTCGAACAGATATTCAGACACCCATGATCCTATCAGCAT 89484864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7613 GAAAAGGAGTGAAAGCAGGGACTCGAACAGATATTCAGACACCCATGATCCTATCAGCAT 7672

 89484865 TATTTGTAATAGCCAAAAGGTGTAAGCAACCCAAGTGTCAACTGACAAGCGAACAGATAA 89484924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7673 TATTTGTAATAGCCAAAAGGTGTAAGCAACCCAAGTGTCAACTGACAAGCGAACAGATAA 7732

 89484925 ATTAGTATACACATATAATTACTTAGCCTTGAAAAGGAAGAATTTTTTATTTCTTTATTT 89484984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7733 ATTAGTATACACATATAATTACTTAGCCTTGAAAAGGAAGAATTTTTTATTTCTTTATTT 7792

 89484985 ATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTATGCCCAGGCTGGAGTGCAAAGGCACGATCTTGGCT 89485044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7793 ATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTATGCCCAGGCTGGAGTGCAAAGGCACGATCTTGGCT 7852

 89485045 CACCGCAACCTCTGTTTCCCAGATTCAAGTGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCT 89485104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7853 CACCGCAACCTCTGTTTCCCAGATTCAAGTGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCT 7912

 89485105 GGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAAAGACGGGGT 89485164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7913 GGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAAAGACGGGGT 7972

 89485165 TTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCCTGCATTGG 89485224
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     7973 TTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCATTGG 8032

 89485225 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCCATGAGTGCCCAGCCAAAAAGGAAAAATTTTGACA 89485284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8033 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCCATGAGTGCCCAGCCAAAAAGGAAAAATTTTGACA 8092

 89485285 CATGCTACCACACTGAACCTTGAAGACATTATGTGAATTAGAATAAGCCAGTCACCAAAG 89485344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8093 CATGCTACCACACTGAACCTTGAAGACATTATGTGAATTAGAATAAGCCAGTCACCAAAG 8152

 89485345 GACAAATATTGAATGACTCCACTTATATAACATTCCTAGAGTAGTCAAATTAATAGAGAT 89485404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8153 GACAAATATTGAATGACTCCACTTATATAACATTCCTAGAGTAGTCAAATTAATAGAGAT 8212

 89485405 GGAATGTAGAATTGTGGCAGGAGATGGGTGTAGGTGGGGCTTTTGTTTAATTGGCACAGA 89485464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8213 GGAATGTAGAATTGTGGCAGGAGATGGGTGTAGGTGGGGCTTTTGTTTAATTGGCACAGA 8272

 89485465 GTTTCTTTTGGGGAAGATTAAAAAGTTCTGGAAATAGATGGTAGTGATGGTTGCACAACA 89485524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8273 GTTTCTTTTGGGGAAGATTAAAAAGTTCTGGAAATAGATGGTAGTGATGGTTGCACAACA 8332

 89485525 ATTTGAATTTAATTAATACCACAGAACTACATACTTAATAATGGTTACAAGGATAAATTT 89485584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8333 ATTTGAATTTAATTAATACCACAGAACTACATACTTAATAATGGTTACAAGGATAAATTT 8392

 89485585 TATGTTTATATATTTTTTAAAACAATAAACAAGAAAATCCAATACAGACTGAAACATTTT 89485644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8393 TATGTTTATATATTTTTTAAAACAATAAACAAGAAAATCCAATACAGACTGAAACATTTT 8452

 89485645 TTCAACCTTAAAGATCAGTGTAAACTTGCTGTTACTATGTGAACATGGGCAGGCGATCTC 89485704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8453 TTCAACCTTAAAGATCAGTGTAAACTTGCTGTTACTATGTGAACATGGGCAGGCGATCTC 8512

 89485705 TTGAGCCCAGGAGCTTGAGACCTGCATGGGCAACATGATGAAACCCTGTGTCTACCAAAA 89485764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8513 TTGAGCCCAGGAGCTTGAGACCTGCATGGGCAACATGATGAAACCCTGTGTCTACCAAAA 8572

 89485765 ATACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGCATCTGTAGTCCTACCTACTCAGGAGGCTGA 89485824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8573 ATACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGCATCTGTAGTCCTACCTACTCAGGAGGCTGA 8632

 89485825 GGTGAGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGACTGTGGTGAGCTGAGATCTTGCCACT 89485884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8633 GGTGAGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGACTGTGGTGAGCTGAGATCTTGCCACT 8692

 89485885 GTACTCCAGCCTGGGGAAAGAGCAAGACCTTGTCTCAAGAAAAAAAAAGACTAGTCAAGT 89485944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8693 GTACTCCAGCCTGGGGAAAGAGCAAGACCTTGTCTCAAGAAAAAAAAAGACTAGTCAAGT 8752

 89485945 GCAGTCAGTAGTGAGAAGGGTGAGGAGAAAGAGTAGAACAAGGAGTTCAACTGTAACTCA 89486004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8753 GCAGTCAGTAGTGAGAAGGGTGAGGAGAAAGAGTAGAACAAGGAGTTCAACTGTAACTCA 8812

 89486005 TGGTGAACAGTCAATTGAGATAACTCACTACCCTCAGAACAGCTGTGAGCTGATGCTTAT 89486064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     8813 TGGTGAACAGTCAATTGAGATAACTCACTACCTTCAGAACAGCTGTGAGCTGATGCTTAT 8872

 89486065 CCCCTAGAAGAGTGAAGATAAGGAGCCCAACTGTGAATGGAAAGTTAGCTTATTCCCAGT 89486124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8873 CCCCTAGAAGAGTGAAGATAAGGAGCCCAACTGTGAATGGAAAGTTAGCTTATTCCCAGT 8932

 89486125 GCCAGCTTTCTCTCCTCACATCCTCATAATGGATGCTGACTGTGTTGGGGGACAGAAGGG 89486184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8933 GCCAGCTTTCTCTCCTCACATCCTCATAATGGATGCTGACTGTGTTGGGGGACAGAAGGG 8992

 89486185 ACTTGGCAGAGCTTTGCTCATGCCACTCACCCTTATTCTTCCCAGCTAGCTTGTTCATCA 89486244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8993 ACTTGGCAGAGCTTTGCTCATGCCACTCACCCTTATTCTTCCCAGCTAGCTTGTTCATCA 9052

 89486245 GGTAGGATTTTCCTGTGCGGTAGAGGCCCACAATTGCCACCACCACCACAGGCTGTGTAA 89486304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9053 GGTAGGATTTTCCTGTGCGGTAGAGGCCCACAATTGCCACCACCACCACAGGCTGTGTAA 9112

 89486305 TGGCAGACAGGATTTTCAGAGCTTCTGGATTCGCCACCAGTTCCCCATTAGTGTTCTCAA 89486364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9113 TGGCAGACAGGATTTTCAGAGCTTCTGGATTCGCCACCAGTTCCCCATTAGTGTTCTCAA 9172

 89486365 TGAGGCACATTGGGCCTGTCATGTGGATCTCTGGAGCCATGTCCAGGGCATTGTTCTCTT 89486424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9173 TGAGGCACATTGGGCCTGTCATGTGGATCTCTGGAGCCATGTCCAGGGCATTGTTCTCTT 9232

 89486425 GTCTGCAAGGGAAGAGTTGGAATGAATTAGAATTTCCAGTCTTTTGCATTTAGAGGATAG 89486484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9233 GTCTGCAAGGGAAGAGTTGGAATGAATTAGAATTTCCAGTCTTTTGCATTTAGAGGATAG 9292

 89486485 AGTCACAGAATTCCCCAGGATGGCCAAAAGTTTTGTGTGTGTCAGTGAGAGAGATGAGGG 89486544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9293 AGTCACAGAATTCCCCAGGATGGCCAAAAGTTTTGTGTGTGTCAGTGAGAGAGATGAGGG 9352

 89486545 AAAATGTGTATCATTTTAAAAAATTATGGAAGTATTATCATCAAATTAAATATTGGTATG 89486604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9353 AAAATGTGTATCATTTTAAAAAATTATGGAAGTATTATCATCAAATTAAATATTGGTATG 9412

 89486605 ACAGTAACTTATCAACAGTCAACTACTCTTGCAACCTAGAACTTTCATTTAATTTATTAT 89486664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9413 ACAGTAACTTATCAACAGTCAACTACTCTTGCAACCTAGAACTTTCATTTAATTTATTAT 9472

 89486665 GGAAAAGCTTCCCTTGGATTCTCATTAAAAAATTTACACTAGACAATAAATGGAAGATAA 89486724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9473 GGAAAAGCTTCCCTTGGATTCTCATTAAAAAATTTACACTAGACAATAAATGGAAGATAA 9532

 89486725 AATAGGATATAGAGAATTTTTTTTACATCCTGGCTATATGTAAGAAATTAAATATTGATT 89486784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9533 AATAGGATATAGAGAATTTTTTTTACATCCTGGCTATATGTAAGAAATTAAATATTGATT 9592

 89486785 TGTTTATTCATGAATTCTTATGATGAATAAAGACCCCCATGAGTAAATGTTTCATTGTTT 89486844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9593 TGTTTATTCATGAATTCTTATGATGAATAAAGACCCCCATGAGTAAATGTTTCATTGTTT 9652

 89486845 GACATATGCCCTTAGGACAATTTCCAGAGATTTATAAATGTGTTCCTTCCTCCATTTTCA 89486904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9653 GACATATGCCCTTAGGACAATTTCCAGAGATTTATAAATGTGTTCCTTCCTCCATTTTCA 9712

 89486905 ACTGGTTATGCTTATTTCACTGTAATGAGGATCCACAAAACTTCTCACAGTGCCATTCTG 89486964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9713 ACTGGTTATGCTTATTTCACTGTAATGAGGATCCACAAAACTTCTCACAGTGCCATTCTG 9772

 89486965 GAAGTGGAACCAATGTAACATACTTTTGCAAATTCTATACAACTACATAACCATGTGAAA 89487024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9773 GAAGTGGAACCAATGTAACATACTTTTGCAAATTCTATACAACTACATAACCATGTGAAA 9832

 89487025 CACATGGCTAGGGACCTTTCCAAGGGCTTTGAAGGGGCACGTGCAAGAGAGGGGCCCTGA 89487084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9833 CACATGGCTAGGGACCTTTCCAAGGGCTTTGAAGGGGCACGTGCAAGAGAGGGGCCCTGA 9892

 89487085 AACTTAAGCTTCATTAGCGTCATGATAAGGTAGCCTCTAACTCAGTGTGGGTATAAATGC 89487144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9893 AACTTAAGCTTCATTAGCGTCATGATAAGGTAGCCTCTAACTCAGTGTGGGTATAAATGC 9952

 89487145 AAAACTGCCAATACTGAATGTTGCTAAGAAACACGCAT----GCGCGCGCGCGCACACAC 89487200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||
     9953 AAAACTGCCAATACTGAATGTTGCTAAGAAACACGCATGCGCGCGCGCGCGCGCACACAC 10012

 89487201 ACACACACACACACACACACACACACA------CCCCAAAAAAACCAAACCAAACAAACA 89487254
          |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||
    10013 ACACACACACACACACACACACACACACACACCCCCCAAAAAAACCAAACCAAACAAACA 10072

 89487255 ACAGCAACAACAAAAAACCCCATGAAATAAGGACTGAAAGACCAGGAAGCACATAAAGAG 89487314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10073 ACAGCAACAACAAAAAACCCCATGAAATAAGGACTGAAAGACCAGGAAGCACATAAAGAG 10132

 89487315 AGCTACATGGGAAGATGTGAAAAGAAAATAAATTTCCAGCAATACAGCTTTAGGTTTTCT 89487374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10133 AGCTACATGGGAAGATGTGAAAAGAAAATAAATTTCCAGCAATACAGCTTTAGGTTTTCT 10192

 89487375 GTTTTGTTCTGTTTTTCCATTTTGTAGAGTAGGAGAAAGAGAAATGGGAAGAGGAGAAAT 89487434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10193 GTTTTGTTCTGTTTTTCCATTTTGTAGAGTAGGAGAAAGAGAAATGGGAAGAGGAGAAAT 10252

 89487435 AGAAGTGAGGAGGACGAGGAGAAAGGGCTGGAAAGATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG 89487494
          ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||
    10253 AGAAGTGAGGAGGACGAGGAGAAAGGGCTG-------GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG 10305

 89487495 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGTGCCAG----------------CAAGGGAGATGTCA 89487538
          ||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||||
    10306 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGTGCCAGCAAGGGAGATGTCAGACAAGGGAGATGTCA 10365

 89487539 GACAAGGTGATGAGTGAAGCTAGTGTTTTGCCAAGGAATTCAGGGGAGGAGTTTTCAGAA 89487598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10366 GACAAGGTGATGAGTGAAGCTAGTGTTTTGCCAAGGAATTCAGGGGAGGAGTTTTCAGAA 10425

 89487599 GGTGGGATCTAAGTCGTCTGAGTGCGTGGGAGAGGTTAAAGTAAGCAAAGATACCGGCTT 89487658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10426 GGTGGGATCTAAGTCGTCTGAGTGCGTGGGAGAGGTTAAAGTAAGCAAAGATACCGGCTT 10485

 89487659 TAGTAGTGATGCATTACAGGAAATTCTCCTGTAAATTCTCCAGAGGAAAAACTAGGCCAC 89487718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10486 TAGTAGTGATGCATTACAGGAAATTCTCCTGTAAATTCTCCAGAGGAAAAACTAGGCCAC 10545

 89487719 CGCCCTCTCTCTCTCTCAAAAAAAAAAAAGAAGAAAAAAAAGGAGAGGAAGCTCTTTAGC 89487778
          |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10546 CGCCCTCTCTCTCTCTC--AAAAAAAAAAGAAGAAAAAAAAGGAGAGGAAGCTCTTTAGC 10603

 89487779 CTGGATTATTTCTAGAGAAACAATCTGAAACAAAGTTCAAATGTGTAATAAAAAGTATAC 89487838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10604 CTGGATTATTTCTAGAGAAACAATCTGAAACAAAGTTCAAATGTGTAATAAAAAGTATAC 10663

 89487839 TGTTTTCATGAATGTTCCTCTTTGATGCTGGGTTTCAGTTTTTTCTTTGTCTATAACCGT 89487898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10664 TGTTTTCATGAATGTTCCTCTTTGATGCTGGGTTTCAGTTTTTTCTTTGTCTATAACCGT 10723

 89487899 GTCAGTGGGCTGCTAGTACTCTGCATTACCTTTGCTGTTCTTTCCTTCTGGTGAAAAGAA 89487958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10724 GTCAGTGGGCTGCTAGTACTCTGCATTACCTTTGCTGTTCTTTCCTTCTGGTGAAAAGAA 10783

 89487959 CCCATTTGTAGCTCTTTCCATTTCTTAGCTGCATAGGAGCAGGATTCAGCAAGCTCCATC 89488018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10784 CCCATTTGTAGCTCTTTCCATTTCTTAGCTGCATAGGAGCAGGATTCAGCAAGCTCCATC 10843

 89488019 ACTGACAATGGAAATGTAATCATGTCCCTAGTCAACACAGACAATGTCAACAAAGAGAAA 89488078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10844 ACTGACAATGGAAATGTAATCATGTCCCTAGTCAACACAGACAATGTCAACAAAGAGAAA 10903

 89488079 GACTATCCTAGTGCATTTCAAACTCTCAGTTTAGTTGCTGTCTGCTGGTGCCTAATTCAA 89488138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10904 GACTATCCTAGTGCATTTCAAACTCTCAGTTTAGTTGCTGTCTGCTGGTGCCTAATTCAA 10963

 89488139 CACAAGCACTGTAG 89488152
          ||||||||||||||
    10964 CACAAGCACTGTAG 10977

Alignment time is 14.2364 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    5774] =>      5774 nucs 'mol-32-338a-103351_5774'

Score:        5665
Aligned:      5777        nucs
Identic:      5766 (100%) nucs =>      1507 (100%)      4259 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89474396,89475908] EXCISED REGION [89478625,89482888]
 second seq =>  [       1,    1511] EXCISED REGION [    1512,    5774]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89474396 TAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGT 89474455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGT 60

 89474456 GACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTG 89474515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTG 120

 89474516 AGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCA 89474575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCA 180

 89474576 GGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAG 89474635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAG 240

 89474636 TTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTT 89474695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTT 300

 89474696 CTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTG 89474755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTG 360

 89474756 ATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTAC 89474815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTAC 420

 89474816 ACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTT 89474875
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACGTTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTT 480

 89474876 AGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACC 89474935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACC 540

 89474936 TCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTA 89474995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTA 600

 89474996 TTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGAT 89475055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGAT 660

 89475056 CCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTC 89475115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTC 720

 89475116 TGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCA 89475175
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTAGAATTGCATCGGTCATAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCA 780

 89475176 GCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCT 89475235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      781 GCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTGTTCCT 840

 89475236 GTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGG 89475295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGG 900

 89475296 TGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACC 89475355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACC 960

 89475356 CTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGT 89475415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGT 1020

 89475416 CCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTG 89475475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTG 1080

 89475476 GAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGA 89475535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGA 1140

 89475536 GGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTAT 89475595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTAT 1200

 89475596 TTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTAC 89475655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTAC 1260

 89475656 CATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCT 89475715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCT 1320

 89475716 GTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGT 89475775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGT 1380

 89475776 TAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCT 89475835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
     1381 TAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTT--GAGACAGAGTCT 1438

 89475836 TGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTC 89475895
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTC 1498

 89475896 CTGGGTTCAAGTG 89475908
          |||||||||||||
     1499 CTGGGTTCAAGTG 1511

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 1571

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 1631

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 1691

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1692 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 1751

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 1811

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 1871

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 1931

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 1991

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 2051

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 2111

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 2171

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 2231

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 2291

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 2351

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 2411

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 2471

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 2531

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 2591

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2592 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 2651

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 2711

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 2771

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 2831

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 2891

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 2951

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 3011

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 3071

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 3131

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 3191

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 3251

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 3311

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 3371

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 3431

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 3491

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 3551

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 3611

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 3671

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 3731

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 3791

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3792 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 3851

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 3911

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 3971

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 4031

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 4091

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4092 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 4151

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 4211

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 4271

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 89481444
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     4272 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-TGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 4330

 89481445 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 89481504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4331 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 4390

 89481505 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 89481564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4391 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 4450

 89481565 ACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 89481624
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4451 ACAAGGAAAAGATGCCCATTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 4510

 89481625 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 89481684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4511 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 4570

 89481685 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 89481744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4571 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 4630

 89481745 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 89481804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4631 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 4690

 89481805 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 89481864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4691 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 4750

 89481865 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 89481924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4751 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 4810

 89481925 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 89481984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4811 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 4870

 89481985 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 89482044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4871 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 4930

 89482045 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 89482104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4931 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 4990

 89482105 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACT 89482164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4991 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACT 5050

 89482165 GCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAA 89482224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5051 GCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAA 5110

 89482225 AACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGG 89482284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5111 AACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGG 5170

 89482285 AGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGA 89482344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5171 AGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGA 5230

 89482345 CCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCAC 89482404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5231 CCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCAC 5290

 89482405 GTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTGT 89482464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5291 GTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTGT 5350

 89482465 CCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTGC 89482524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5351 CCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTGC 5410

 89482525 TGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAAG 89482584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5411 TGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAAG 5470

 89482585 AGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTAT 89482644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5471 AGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTAT 5530

 89482645 CAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCAT 89482704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5531 CAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCAT 5590

 89482705 ATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTCA 89482764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5591 ATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTCA 5650

 89482765 GAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTTT 89482824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5651 GAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTTT 5710

 89482825 GGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAAC 89482884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5711 GGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAAC 5770

 89482885 TCTC 89482888
          ||||
     5771 TCTC 5774

Alignment time is 7.67265 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    4128] =>      4128 nucs 'mol-32-338a-111909_4128'

Score:        4128
Aligned:      4128        nucs
Identic:      4128 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89472717,89476844]
 second seq =>  [       1,    4128]

 89472717 GTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAA 89472776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAA 60

 89472777 GGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTT 89472836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTT 120

 89472837 ATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATT 89472896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATT 180

 89472897 CTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCAT 89472956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCAT 240

 89472957 GGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGA 89473016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGA 300

 89473017 ACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGT 89473076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGT 360

 89473077 ACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAG 89473136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAG 420

 89473137 TATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTC 89473196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTC 480

 89473197 TGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAA 89473256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAA 540

 89473257 CATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATC 89473316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATC 600

 89473317 TAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCT 89473376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCT 660

 89473377 TGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCT 89473436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCT 720

 89473437 CTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACT 89473496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACT 780

 89473497 TTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGG 89473556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGG 840

 89473557 CTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGAT 89473616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGAT 900

 89473617 TTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTT 89473676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTT 960

 89473677 TTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTC 89473736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTC 1020

 89473737 AGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACA 89473796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACA 1080

 89473797 AAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAG 89473856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAG 1140

 89473857 ACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAA 89473916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAA 1200

 89473917 GTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCT 89473976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCT 1260

 89473977 CTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTAC 89474036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTAC 1320

 89474037 CATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAA 89474096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAA 1380

 89474097 ACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATA 89474156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATA 1440

 89474157 AAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTC 89474216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTC 1500

 89474217 CACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTT 89474276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTT 1560

 89474277 AATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATA 89474336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATA 1620

 89474337 TGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGT 89474396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGT 1680

 89474397 AAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTG 89474456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTG 1740

 89474457 ACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGA 89474516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGA 1800

 89474517 GCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAG 89474576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAG 1860

 89474577 GAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGT 89474636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGT 1920

 89474637 TTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTC 89474696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTC 1980

 89474697 TCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGA 89474756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGA 2040

 89474757 TACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACA 89474816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACA 2100

 89474817 CATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTA 89474876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTA 2160

 89474877 GTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCT 89474936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCT 2220

 89474937 CAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTAT 89474996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTAT 2280

 89474997 TTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATC 89475056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATC 2340

 89475057 CTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCT 89475116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCT 2400

 89475117 GTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAG 89475176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAG 2460

 89475177 CCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTG 89475236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTG 2520

 89475237 TTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGT 89475296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGT 2580

 89475297 GGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCC 89475356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCC 2640

 89475357 TACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTC 89475416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTC 2700

 89475417 CTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGG 89475476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGG 2760

 89475477 AGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAG 89475536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAG 2820

 89475537 GGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATT 89475596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATT 2880

 89475597 TGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACC 89475656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACC 2940

 89475657 ATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTG 89475716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTG 3000

 89475717 TAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTT 89475776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTT 3060

 89475777 AATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTT 89475836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTT 3120

 89475837 GCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCC 89475896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCC 3180

 89475897 TGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCC 89475956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCC 3240

 89475957 ACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGG 89476016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGG 3300

 89476017 ATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 89476076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 3360

 89476077 ACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCT 89476136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCT 3420

 89476137 CTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAA 89476196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAA 3480

 89476197 GCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCC 89476256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCC 3540

 89476257 AGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAA 89476316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAA 3600

 89476317 ACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTG 89476376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTG 3660

 89476377 AGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAA 89476436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAA 3720

 89476437 CAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAG 89476496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAG 3780

 89476497 CACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGT 89476556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGT 3840

 89476557 TTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTA 89476616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTA 3900

 89476617 CTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATA 89476676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATA 3960

 89476677 AATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCA 89476736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCA 4020

 89476737 ACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTG 89476796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTG 4080

 89476797 GGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGAT 89476844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGAT 4128

Alignment time is 4.66802 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    4891] =>      4891 nucs 'mol-32-338a-158183_4891'

Score:        4792
Aligned:      4893        nucs
Identic:      4883 (100%) nucs =>      3216 (100%)      1667 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89472686,89475908] EXCISED REGION [89478625,89480294]
 second seq =>  [       1,    3221] EXCISED REGION [    3222,    4891]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89472686 ATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTC 89472745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTC 60

 89472746 AACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAA 89472805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAA 120

 89472806 AGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGAT 89472865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGAT 180

 89472866 TTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTT 89472925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTT 240

 89472926 AGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCT 89472985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCT 300

 89472986 CATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAG 89473045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAG 360

 89473046 GATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATG 89473105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATG 420

 89473106 TCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACT 89473165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACT 480

 89473166 TCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGT 89473225
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTGAGTGGCGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGT 540

 89473226 TGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTC 89473285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTC 600

 89473286 TTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGT 89473345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGT 660

 89473346 TCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTG 89473405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTG 720

 89473406 TTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTA 89473465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTA 780

 89473466 GCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTC 89473525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTC 840

 89473526 GGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTC 89473585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTC 900

 89473586 TGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAA 89473645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAA 960

 89473646 TTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTT 89473705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTT 1020

 89473706 CTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAG 89473765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAG 1080

 89473766 GTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATA 89473825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATA 1140

 89473826 TTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATA 89473885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATA 1200

 89473886 TTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATG 89473945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATG 1260

 89473946 AATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAG 89474005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAG 1320

 89474006 ATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAA 89474065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAA 1380

 89474066 CTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAG 89474125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAG 1440

 89474126 GTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTA 89474185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTA 1500

 89474186 GATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATT 89474245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATT 1560

 89474246 TACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCC 89474305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCC 1620

 89474306 TAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGC 89474365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGC 1680

 89474366 ATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTG 89474425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTG 1740

 89474426 AATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGT 89474485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGT 1800

 89474486 CAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTAT 89474545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTAT 1860

 89474546 GTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAA 89474605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAA 1920

 89474606 CCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTC 89474665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTC 1980

 89474666 CAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATA 89474725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATA 2040

 89474726 ACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTT 89474785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTT 2100

 89474786 TGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATT 89474845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACGTTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATT 2160

 89474846 TGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGC 89474905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGC 2220

 89474906 TGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTT 89474965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTT 2280

 89474966 TATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTT 89475025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTT 2340

 89475026 AAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCC 89475085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCC 2400

 89475086 TTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTG 89475145
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2401 TTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCATAGACTCCTTG 2460

 89475146 GATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGA 89475205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGA 2520

 89475206 AGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAG 89475265
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTGTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAG 2580

 89475266 AATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGAT 89475325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGAT 2640

 89475326 ACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATG 89475385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATG 2700

 89475386 ATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGAT 89475445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGAT 2760

 89475446 GCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAAT 89475505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAAT 2820

 89475506 CAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGAT 89475565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGAT 2880

 89475566 ATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAA 89475625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAA 2940

 89475626 TCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTT 89475685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTT 3000

 89475686 CTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTA 89475745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTA 3060

 89475746 ATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACT 89475805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACT 3120

 89475806 AATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 89475865
          ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3121 AATTTTTTTTTTTTTT--GAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 3178

 89475866 GTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 3221

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 3281

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 3341

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 3401

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3402 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 3461

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 3521

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 3581

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 3641

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 3701

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 3761

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 3821

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 3881

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 3941

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 4001

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 4061

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 4121

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 4181

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 4241

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4242 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 4301

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4302 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 4361

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 4421

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 4481

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 4541

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 4601

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 4661

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 4721

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 4781

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4782 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 4841

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAG 89480294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4842 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAG 4891

Alignment time is 6.33005 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,   11595] =>     11595 nucs 'mol-32-338a-186759_11595'

Score:       11465
Aligned:     11597        nucs
Identic:     11585 (100%) nucs =>      1784 (100%)      9801 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89473446,89475229] EXCISED REGION [89475231,89485043]
 second seq =>  [       1,    1784] EXCISED REGION [    1786,   11595]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89475230,89475230]
 second seq =>         1 nucs [1785,1785]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [89475808,89475808]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [89475229,89475231] to [89475230,89475232]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475229,89475229] to [89475231,89475231]
 second seq =>         1 nucs [1784,1784] to [1786,1786]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89473446 TTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTG 89473505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTG 60

 89473506 GCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAG 89473565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAG 120

 89473566 TGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGT 89473625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGT 180

 89473626 ACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCA 89473685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCA 240

 89473686 TTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGC 89473745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGC 300

 89473746 CTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTG 89473805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTG 360

 89473806 TGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAA 89473865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAA 420

 89473866 CACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTC 89473925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTC 480

 89473926 AAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCT 89473985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCT 540

 89473986 GTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAA 89474045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAA 600

 89474046 TTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGG 89474105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGG 660

 89474106 AGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTC 89474165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTC 720

 89474166 TTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTG 89474225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTG 780

 89474226 ATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTC 89474285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTC 840

 89474286 TGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAA 89474345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAA 900

 89474346 GCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAG 89474405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAG 960

 89474406 GATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGT 89474465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGT 1020

 89474466 AGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAA 89474525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAA 1080

 89474526 ATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAG 89474585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAG 1140

 89474586 AGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTG 89474645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTG 1200

 89474646 AGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAAT 89474705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAAT 1260

 89474706 TGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATT 89474765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATT 1320

 89474766 TGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACT 89474825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACT 1380

 89474826 GTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACAC 89474885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACAC 1440

 89474886 TTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTA 89474945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTA 1500

 89474946 AGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTT 89475005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTT 1560

 89475006 TAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTT 89475065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTT 1620

 89475066 GCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTG 89475125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTG 1680

 89475126 CATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGAC 89475185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGAC 1740

 89475186 CCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGT 89475229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGT 1784

EXCISED REGION

 89475231 TTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTG 89475290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 TTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTG 1845

 89475291 CCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGA 89475350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 CCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGA 1905

 89475351 TGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTC 89475410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 TGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTC 1965

 89475411 CCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCT 89475470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 CCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCT 2025

 89475471 GACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGA 89475530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 GACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGA 2085

 89475531 AGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGAC 89475590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 AGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGAC 2145

 89475591 ATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGA 89475650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 ATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGA 2205

 89475651 ATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATC 89475710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 ATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATC 2265

 89475711 CAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCA 89475770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 CAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCA 2325

 89475771 ATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAG 89475830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     2326 ATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAA-TTTTTTTTTTTTTTTGAGACAG 2384

 89475831 AGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCC 89475890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 AGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCC 2444

 89475891 GCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCG 89475950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 GCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCG 2504

 89475951 CCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTG 89476010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 CCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTG 2564

 89476011 GCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 89476070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 GCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 2624

 89476071 GGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGT 89476130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 GGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGT 2684

 89476131 CTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGG 89476190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 CTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGG 2744

 89476191 GCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACA 89476250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 GCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACA 2804

 89476251 GTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGG 89476310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 GTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGG 2864

 89476311 TCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACA 89476370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 TCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACA 2924

 89476371 GGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTG 89476430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 GGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTG 2984

 89476431 ATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACA 89476490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 ATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAATGTTATACAGACA 3044

 89476491 AAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCA 89476550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 AAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCA 3104

 89476551 GCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTC 89476610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 GCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTC 3164

 89476611 ATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTT 89476670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 ATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTT 3224

 89476671 CGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGC 89476730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 CGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGC 3284

 89476731 TGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTC 89476790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 TGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTC 3344

 89476791 TAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGC 89476850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 TAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGC 3404

 89476851 TTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAAC 89476910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 TTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAAC 3464

 89476911 TGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGC 89476970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 TGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGC 3524

 89476971 TTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGG 89477030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 TTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGG 3584

 89477031 AAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAG 89477090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 AAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAG 3644

 89477091 AAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATC 89477150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 AAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATC 3704

 89477151 AGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATT 89477210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 AGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATT 3764

 89477211 TAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAAT 89477270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 TAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAAT 3824

 89477271 AAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATC 89477330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 AAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATC 3884

 89477331 TAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTT 89477390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 TAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTT 3944

 89477391 CCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAG 89477450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 CCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAG 4004

 89477451 ATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAAC 89477510
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 ATGGTCCACATCCTTGAAAGGGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAAC 4064

 89477511 CCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCAT 89477570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 CCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCAT 4124

 89477571 CTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAA 89477630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 CTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAA 4184

 89477631 GGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGT 89477690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 GGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGT 4244

 89477691 CAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAA 89477750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 CAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAA 4304

 89477751 GAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGC 89477810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 GAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGC 4364

 89477811 ATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCC 89477870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4365 ATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCC 4424

 89477871 CAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATA 89477930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4425 CAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATGATATGTATGCATA 4484

 89477931 TCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCAT 89477990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4485 TCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCAT 4544

 89477991 CCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTA 89478050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4545 CCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGCTATTCCATATATGACTGTA 4604

 89478051 TCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTA 89478110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4605 TCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTA 4664

 89478111 ATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTG 89478170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4665 ATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTG 4724

 89478171 TAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAAT 89478230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4725 TAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAAT 4784

 89478231 ATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAAT 89478290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4785 ATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAAT 4844

 89478291 TTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGC 89478350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4845 TTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGC 4904

 89478351 CCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTT 89478410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4905 CCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTT 4964

 89478411 CCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAG 89478470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4965 CCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAG 5024

 89478471 CACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATG 89478530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5025 CACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATG 5084

 89478531 CTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCG 89478590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5085 CTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCG 5144

 89478591 TCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTA 89478650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5145 TCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTA 5204

 89478651 GCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACA 89478710
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     5205 GCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT-TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACA 5263

 89478711 TGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCC 89478770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5264 TGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCC 5323

 89478771 TCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGT 89478830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5324 TCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGT 5383

 89478831 TTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCT 89478890
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5384 TTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCT 5443

 89478891 CCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGT 89478950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5444 CCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGT 5503

 89478951 TGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTG 89479010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5504 TGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTG 5563

 89479011 CGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAG 89479070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5564 CGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAG 5623

 89479071 AGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGA 89479130
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5624 AGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGA 5683

 89479131 AATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCA 89479190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5684 AATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCA 5743

 89479191 GGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTA 89479250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5744 GGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTA 5803

 89479251 GACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAG 89479310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5804 GACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAG 5863

 89479311 CTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAG 89479370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5864 CTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAG 5923

 89479371 TACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTA 89479430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5924 TACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTA 5983

 89479431 CAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAA 89479490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5984 CAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAA 6043

 89479491 TAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAAT 89479550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6044 TAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAAT 6103

 89479551 CTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAA 89479610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6104 CTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAA 6163

 89479611 CCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAA 89479670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6164 CCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAA 6223

 89479671 AACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTT 89479730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6224 AACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTT 6283

 89479731 GTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTC 89479790
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6284 GTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTC 6343

 89479791 CAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCT 89479850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6344 CAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCT 6403

 89479851 CAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATT 89479910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6404 CAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATT 6463

 89479911 CTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAG 89479970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6464 CTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAG 6523

 89479971 CTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCATCCCATATTAGTTCAACACATT 89480030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6524 CTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCATCCCATATTAGTTCAACACATT 6583

 89480031 CCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATG 89480090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6584 CCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATG 6643

 89480091 GGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAG 89480150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6644 GGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAG 6703

 89480151 GATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTT 89480210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6704 GATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTT 6763

 89480211 CTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCT 89480270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6764 CTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCT 6823

 89480271 ATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTG 89480330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6824 ATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTG 6883

 89480331 GTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCAC 89480390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6884 GTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCAC 6943

 89480391 TTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATG 89480450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6944 TTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATG 7003

 89480451 ACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTAT 89480510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7004 ACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTAT 7063

 89480511 AGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCAT 89480570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7064 AGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCAT 7123

 89480571 TGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATA 89480630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7124 TGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATA 7183

 89480631 ATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATT 89480690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7184 ATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATT 7243

 89480691 GGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAACTCACATAGCTTACAACCTATGGT 89480750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7244 GGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAACTCACATAGCTTACAACCTATGGT 7303

 89480751 TAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTT 89480810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7304 TAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTT 7363

 89480811 TCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATGTACACAGAAATGAAAAGACAAAT 89480870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7364 TCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATGTACACAGAAATGAAAAGACAAAT 7423

 89480871 TATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAG 89480930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7424 TATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAG 7483

 89480931 ATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCC 89480990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7484 ATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCC 7543

 89480991 CTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTTTTGGGGTGAGGCACACACCACAT 89481050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7544 CTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTTTTGGGGTGAGGCACACACCACAT 7603

 89481051 CCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAG 89481110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7604 CCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAG 7663

 89481111 ATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTA 89481170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7664 ATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTA 7723

 89481171 GCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCACAATCAGTACTTACGTTACTTAT 89481230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7724 GCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCACAATCAGTACTTACGTTACTTAT 7783

 89481231 AATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACATAAATGGATTCAGGACCTTTCATG 89481290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7784 AATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACATAAATGGATTCAGGACCTTTCATG 7843

 89481291 ATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACC 89481350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7844 ATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACC 7903

 89481351 CAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG 89481410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7904 CAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAG 7963

 89481411 AGCGAGACTCTTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAA 89481470
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7964 AGCGAGACTC-TGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAA 8022

 89481471 AAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAA 89481530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8023 AAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAA 8082

 89481531 TGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCC 89481590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     8083 TGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCATTTTTGCC 8142

 89481591 ACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAAC 89481650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8143 ACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAAC 8202

 89481651 AGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGAT 89481710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8203 AGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGAT 8262

 89481711 CTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCA 89481770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8263 CTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCA 8322

 89481771 AAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAG 89481830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8323 AAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAG 8382

 89481831 AACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAA 89481890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8383 AACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAA 8442

 89481891 CTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG 89481950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8443 CTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG 8502

 89481951 GAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAA 89482010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8503 GAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAA 8562

 89482011 ACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACACACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGC 89482070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8563 ACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACACACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGC 8622

 89482071 GGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGAGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGA 89482130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8623 GGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGAGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGA 8682

 89482131 GGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAG 89482190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8683 GGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAG 8742

 89482191 ACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAAAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTT 89482250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8743 ACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAAAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTT 8802

 89482251 GTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAG 89482310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8803 GTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAG 8862

 89482311 GCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCA 89482370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8863 GCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCA 8922

 89482371 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCACGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTG 89482430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8923 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCACGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTG 8982

 89482431 TATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTGTCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCT 89482490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8983 TATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTGTCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCT 9042

 89482491 CAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTG 89482550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9043 CAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTG 9102

 89482551 CTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAAGAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTG 89482610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9103 CTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAAGAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTG 9162

 89482611 TAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTATCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAA 89482670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9163 TAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTATCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAA 9222

 89482671 TAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCATATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATT 89482730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9223 TAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCATATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATT 9282

 89482731 GTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTCAGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAA 89482790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9283 GTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTCAGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAA 9342

 89482791 ACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTTTGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAA 89482850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9343 ACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTTTGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAA 9402

 89482851 CTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAACTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTT 89482910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9403 CTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAACTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTT 9462

 89482911 CAACATGGATGCTAAAATCATTCAACGCAGAAAGAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTG 89482970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9463 CAACATGGATGCTAAAATCATTCAACGCAGAAAGAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTG 9522

 89482971 GGAAAACTGGATATTCACATGCTCACATGCCAAAAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGC 89483030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9523 GGAAAACTGGATATTCACATGCTCACATGCCAAAAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGC 9582

 89483031 TTACACAATCCAAAACGTAACTCAAAATGGATCAAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACT 89483090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9583 TTACACAATCCAAAACGTAACTCAAAATGGATCAAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACT 9642

 89483091 ATAAAACTCATGGGAGAAAACAAAGGGGAAAAACAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAAC 89483150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9643 ATAAAACTCATGGGAGAAAACAAAGGGGAAAAACAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAAC 9702

 89483151 TTTGACTTCATCAAAATGAAAAACTTTTGTGCATCAAATGACACTATCAACAGAATAAAA 89483210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9703 TTTGACTTCATCAAAATGAAAAACTTTTGTGCATCAAATGACACTATCAACAGAATAAAA 9762

 89483211 AGGCAACACATGGAATGGAAGAAAACATTTGCTAAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATG 89483270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9763 AGGCAACACATGGAATGGAAGAAAACATTTGCTAAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATG 9822

 89483271 TCTAGCAAATATAAAGAATTCCTACAATGCAACACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGA 89483330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9823 TCTAGCAAATATAAAGAATTCCTACAATGCAACACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGA 9882

 89483331 ACTTGAATAGACATTTCTCTAAAGAATGGCCAATAAGCACCTGAAAAGATGCTCAACATT 89483390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     9883 ACTTGAATAGACATTTCTCTAAAGAATGGCCAATAAGCACCTGAAAAGATGCTCAATATT 9942

 89483391 ACTAGTCATTAGGAAAATGCAAATTAAAGCCATAGTGAGATACTACTTCACATCCATTAG 89483450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9943 ACTAGTCATTAGGAAAATGCAAATTAAAGCCATAGTGAGATACTACTTCACATCCATTAG 10002

 89483451 TATGGTGACTATCAAAAAAAATTGAAAAGGGCTGGGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCC 89483510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10003 TATGGTGACTATCAAAAAAAATTGAAAAGGGCTGGGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCC 10062

 89483511 CAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCT 89483570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10063 CAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCT 10122

 89483571 GGCAAATATGGAGAAACCCCATTTACACTAAAAATACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGC 89483630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10123 GGCAAATATGGAGAAACCCCATTTACACTAAAAATACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGC 10182

 89483631 AGGTGCCTGTAATCTCACCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGA 89483690
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
    10183 AGGTGCCTGTAATCTCACCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGAAGAATCGCTTGAACCCGGGA 10242

 89483691 GGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGGTCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGA 89483750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10243 GGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGGTCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGA 10302

 89483751 GACTGTGTCTCAAAAAAAAAAAAAATTAAAATAACTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATT 89483810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10303 GACTGTGTCTCAAAAAAAAAAAAAATTAAAATAACTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATT 10362

 89483811 GCTATGGAATAAAAGATGAAATGCTCCTGATTATTGTAAATACAAAATTGCATGCAGGAT 89483870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10363 GCTATGGAATAAAAGATGAAATGCTCCTGATTATTGTAAATACAAAATTGCATGCAGGAT 10422

 89483871 TGTGCAAAGACAGTGCCAGGTTGGACTGCCAGAATGAGCCAACGGGACGTGATGTGCTTC 89483930
          ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
    10423 TGTGCAAAGACAATGCCAGGTTGGACTGCCAGAATGAGCCAACGGCACGTGATGTGCTTC 10482

 89483931 CCCCTGCAGAGAGCCTATGAATGGATGTGCAGTCAGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTC 89483990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10483 CCCCTGCAGAGAGCCTATGAATGGATGTGCAGTCAGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTC 10542

 89483991 CTATCCCAGAAAAGCAGATGTTCATAGCTCTGGGAATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGA 89484050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10543 CTATCCCAGAAAAGCAGATGTTCATAGCTCTGGGAATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGA 10602

 89484051 GGGGGCACCTGTCCATGTGGATAAGATAGGGCCATAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTC 89484110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10603 GGGGGCACCTGTCCATGTGGATAAGATAGGGCCATAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTC 10662

 89484111 TTCTAGGCCTCTTTAGGGTTAAGGCATACTCCCTTCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTT 89484170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10663 TTCTAGGCCTCTTTAGGGTTAAGGCATACTCCCTTCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTT 10722

 89484171 GTCTAGCTTCACGTCTTGTTTCTATGGATTGTTTGTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTA 89484230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10723 GTCTAGCTTCACGTCTTGTTTCTATGGATTGTTTGTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTA 10782

 89484231 CTGCTGATTAATATCTTGCTAATCATAGGTTATGAAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCT 89484290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10783 CTGCTGATTAATATCTTGCTAATCATAGGTTATGAAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCT 10842

 89484291 CTGTTAGAAATTACTGATGCACACACTATATTGTAAATTCTTATCTCTGTATACTGTACT 89484350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10843 CTGTTAGAAATTACTGATGCACACACTATATTGTAAATTCTTATCTCTGTATACTGTACT 10902

 89484351 TCTGCATACAGATGTTATGTTAAAGAATTACTTCATCCCCATGTGACCATCTCACCTCAT 89484410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10903 TCTGCATACAGATGTTATGTTAAAGAATTACTTCATCCCCATGTGACCATCTCACCTCAT 10962

 89484411 AATCAAACGACCCTAAATCCCTCACTAACCTTCCCCCACCCTCACTAAACTTAATAATAA 89484470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10963 AATCAAACGACCCTAAATCCCTCACTAACCTTCCCCCACCCTCACTAAACTTAATAATAA 11022

 89484471 ATGCTGGCATATCCAGTGCATTGGCAGCACCACGGGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGG 89484530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11023 ATGCTGGCATATCCAGTGCATTGGCAGCACCACGGGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGG 11082

 89484531 ACCCAGCTTTCACTATCTTGTGTGTATCTATTATTTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGA 89484590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11083 ACCCAGCTTTCACTATCTTGTGTGTATCTATTATTTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGA 11142

 89484591 ACAAAGAGAGAGCCCCGTTGCATTGCAGGCTGCTGGCCAGATCCCGCAATAAATAACAAA 89484650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11143 ACAAAGAGAGAGCCCCGTTGCATTGCAGGCTGCTGGCCAGATCCCGCAATAAATAACAAA 11202

 89484651 TGTTGGTGAATATGAAGAGAAATTAGAACCCTTGTGCATTTCTGTTGGGAATGCTAAATG 89484710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11203 TGTTGGTGAATATGAAGAGAAATTAGAACCCTTGTGCATTTCTGTTGGGAATGCTAAATG 11262

 89484711 GTGCAGTCACTGTGGAAAATGATACAGCAATTCCTTAAAAAATTTAACATGGAATGACTA 89484770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11263 GTGCAGTCACTGTGGAAAATGATACAGCAATTCCTTAAAAAATTTAACATGGAATGACTA 11322

 89484771 TATGAGCCATCAGTTCCACTTCTGGGTGTATACTGAAAAGGAGTGAAAGCAGGGACTCGA 89484830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11323 TATGAGCCATCAGTTCCACTTCTGGGTGTATACTGAAAAGGAGTGAAAGCAGGGACTCGA 11382

 89484831 ACAGATATTCAGACACCCATGATCCTATCAGCATTATTTGTAATAGCCAAAAGGTGTAAG 89484890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11383 ACAGATATTCAGACACCCATGATCCTATCAGCATTATTTGTAATAGCCAAAAGGTGTAAG 11442

 89484891 CAACCCAAGTGTCAACTGACAAGCGAACAGATAAATTAGTATACACATATAATTACTTAG 89484950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11443 CAACCCAAGTGTCAACTGACAAGCGAACAGATAAATTAGTATACACATATAATTACTTAG 11502

 89484951 CCTTGAAAAGGAAGAATTTTTTATTTCTTTATTTATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTAT 89485010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11503 CCTTGAAAAGGAAGAATTTTTTATTTCTTTATTTATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTAT 11562

 89485011 GCCCAGGCTGGAGTGCAAAGGCACGATCTTGGC 89485043
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
    11563 GCCCAGGCTGGAGTGCAAAGGCACGATCTTGGC 11595

Alignment time is 14.8849 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,   10348] =>     10348 nucs 'mol-32-3395-020362_10348'

Score:       10273
Aligned:     10350        nucs
Identic:     10343 (100%) nucs =>      3006 (100%)      7337 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89469317,89472322] EXCISED REGION [89472324,89479667]
 second seq =>  [       1,    3006] EXCISED REGION [    3007,   10348]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89472323,89472323]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>        12 nucs [89479063,89479074]
 second seq =>        12 nucs [9744,9755]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [89472323,89472334] to [89472324,89472335]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89469317 TTTGATGCTTAGTTTTGCTGGAAACAGAATTCTTGGCTGATAATTGTTTTGTTTGAAGAG 89469376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGATGCTTAGTTTTGCTGGAAACAGAATTCTTGGCTGATAATTGTTTTGTTTGAAGAG 60

 89469377 GCTAAAGATAGGGCCGCATTGCCTTCTGGCTTGTACGGTTTCTGCTGAGAAATCTGCTAG 89469436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTAAAGATAGGGCCGCATTGCCTTCTGGCTTGTACGGTTTCTGCTGAGAAATCTGCTAG 120

 89469437 GTTAGTCTGATATGTTTTCCTTTATAGGTTACCTGGTGCTTCTGTCTCACAGCTCTTAAG 89469496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTAGTCTGATATGTTTTCCTTTATAGGTTACCTGGTGCTTCTGTCTCACAGCTCTTAAG 180

 89469497 ATTTTTTTCCTTCATCTTAACTTTGGATAACCTGATGACAATGTGCCTAGGTGAAGATCT 89469556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTTTTTCCTTCATCTTAACTTTGGATAACCTGATGACAATGTGCCTAGGTGAAGATCT 240

 89469557 TTTTGTGATGAATTTCCCAGGTATTCTTTGTGCTTCTTATATTTGCATGTGTAGGTCTCT 89469616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTGTGATGAATTTCCCAGGTATTCTTTGTGCTTCTTATATTTGCATGTGTAGGTCTCT 300

 89469617 AGCTAGGTTGGGGAAGTTTTCCTCAATTATTCCCCCAAATATGTTTTCCAAGCTTTTAGA 89469676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCTAGGTTGGGGAAGTTTTCCTCAATTATTCCCCCAAATATGTTTTCCAAGCTTTTAGA 360

 89469677 ATTCTCTTCTTCCCCAGGAACACCCATTATTCTTAGGTTTGGTCATTTAACATGATCCCA 89469736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCTCTTCTTCCCCAGGAACACCCATTATTCTTAGGTTTGGTCATTTAACATGATCCCA 420

 89469737 GACTTCTTGGAGGATTTGTTCATATTTTCGTATTCTTTTTTCTTTGTCTTTGTTGGATTG 89469796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACTTCTTGGAGGATTTGTTCATATTTTCGTATTCTTTTTTCTTTGTCTTTGTTGGATTG 480

 89469797 GGTTAATTCAAAGACCTTGTCTTTGAGCTCTGAATTTCTTTCTTGTACTTGTTCAATTCT 89469856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTTAATTCAAAGACCTTGTCTTTGAGCTCTGAATTTCTTTCTTGTACTTGTTCAATTCT 540

 89469857 GTTGCTGAGACTTTCCAAAGCATTTTGCATTTCTAAAAGCGTGTCCAAAGTTTCCTGAAT 89469916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTGCTGAGACTTTCCAAAGCATTTTGCATTTCTAAAAGCGTGTCCAAAGTTTCCTGAAT 600

 89469917 TGTGGATTGTTTTCCTTTAAGCTGTCTATTTCATTGAATATTTATCCCTTCACTTCTTGT 89469976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTGGATTGTTTTCCTTTAAGCTGTCTATTTCATTGAATATTTATCCCTTCACTTCTTGT 660

 89469977 ATCATTTTTTTGGATTTCCTTGCATTGGGCTTCACCTTTCTCTGGTCCTTCCCTGATTAG 89470036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCATTTTTTTGGATTTCCTTGCATTGGGCTTCACCTTTCTCTGGTCCTTCCCTGATTAG 720

 89470037 CTTAGTAACTAACCTCCTGAATTCTTTTTCAGATAAATCGGGATTTCTTCTTGGTTTGGA 89470096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTAGTAACTAACCTCCTGAATTCTTTTTCAGATAAATCGGGATTTCTTCTTGGTTTGGA 780

 89470097 TCCATTGCTGGTGAACCAGGATGATTTTTGGGGGGTGTTGAAGGGCCTTGTTTTGTCATA 89470156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCATTGCTGGTGAACCAGGATGATTTTTGGGGGGTGTTGAAGGGCCTTGTTTTGTCATA 840

 89470157 TAACCAGAGTTGGTTTTCTGGTTCCTTCTCATTTGGGTAGGCTCTGTCAGAGAGAAGGTC 89470216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAACCAGAGTTGGTTTTCTGGTTCCTTCTCATTTGGGTAGGCTCTGTCAGAGAGAAGGTC 900

 89470217 TAAGGCTGAAGGCTGTTGTTCAGATTCTTTTGTCCCATGGGGTGTTCCCCTGATGTAGTA 89470276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAGGCTGAAGGCTGTTGTTCAGATTCTTTTGTCCCATGGGGTGTTCCCCTGATGTAGTA 960

 89470277 CTCTCCCCCTTTTCCTATGGGTATGGCTTCCTGTGAGCCAAACTGCAGTGATTGTCGTCT 89470336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCTCCCCCTTTTCCTATGGGTATGGCTTCCTGTGAGCCAAACTGCAGTGATTGTCGTCT 1020

 89470337 CTCTTCTGAGTCTAGCCAGCCAGTGTGTCTGCCCAGCTCTGGGCTGGTATTGGGGGTTTT 89470396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCTTCTGAGTCTAGCCAGCCAGTGTGTCTGCCCAGCTCTGGGCTGGTATTGGGGGTTTT 1080

 89470397 CTGTACAGAGTCCTGTGATGTGGACCATCTATGGGTCTCTGAGCCATGGATACTAAGGGA 89470456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGTACAGAGTCCTGTGATGTGGACCATCTATGGGTCTCTGAGCCATGGATACTAAGGGA 1140

 89470457 AGAAAACACCCCTCATATTGTCTTATGCCCAATTTCTGCCTCCAAAGAAAGAAGAAGTAA 89470516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAAAACACCCCTCATATTGTCTTATGCCCAATTTCTGCCTCCAAAGAAAGAAGAAGTAA 1200

 89470517 AAATTAAAAGGCAGAAATGAAATCCACAAGCAGACAGTTCAGCGCCACACCCTGGGCCTG 89470576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAATTAAAAGGCAGAAATGAAATCCACAAGCAGACAGTTCAGCGCCACACCCTGGGCCTG 1260

 89470577 GTAATTAAAGATTGACCCCTGACCTAATTGGTTATGCTATCTACAGATTACAGACATTGT 89470636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTAATTAAAGATTGACCCCTGACCTAATTGGTTATGCTATCTACAGATTACAGACATTGT 1320

 89470637 ATAGAAAAGCACTGTGAAAATCCCTGTCCTGTTCTGTTCCGTTCCGTTCTAATTACCAGT 89470696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATAGAAAAGCACTGTGAAAATCCCTGTCCTGTTCTGTTCCGTTCCGTTCTAATTACCAGT 1380

 89470697 GCATGTAGCCCGCAGTCATGTACCCCCTGCTTGCTCAATCAATCACGACCCTCTCACGTG 89470756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCATGTAGCCCGCAGTCATGTACCCCCTGCTTGCTCAATCAATCACGACCCTCTCACGTG 1440

 89470757 GACCCCCTTAGAGTTGTGAGCCCTTAAAAGGGACAGGAATTGCTCACTCAGGGAGCTCGG 89470816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GACCCCCTTAGAGTTGTGAGCCCTTAAAAGGGACAGGAATTGCTCACTCAGGGAGCTCGG 1500

 89470817 TTGTTGGAGACGTGAGTCTTACCAAAGCTCCTGGCTGAATAAAGCCCTTCCTTCTTTAAC 89470876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTGTTGGAGACGTGAGTCTTACCAAAGCTCCTGGCTGAATAAAGCCCTTCCTTCTTTAAC 1560

 89470877 TCAGTGTCTGAGGGGTTTTGTTGGTGGCTTGTCCTCCTACAATACCAGTGCCTGTTCCAG 89470936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCAGTGTCTGAGGGGTTTTGTTGGTGGCTTGTCCTCCTACAATACCAGTGCCTGTTCCAG 1620

 89470937 TGGAGGTGGTGGAGGGTGAAATGGACTTCATGAGGGTCCTTGGTTTTGGTGGTTTAATGC 89470996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGAGGTGGTGGAGGGTGAAATGGACTTCATGAGGGTCCTTGGTTTTGGTGGTTTAATGC 1680

 89470997 TCTATTTTTGTGCTGGTTGGCCTCCTGAAAGGAGGTGGCACTTTCCAGAAAGTATCAGTG 89471056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTATTTTTGTGCTGGTTGGCCTCCTGAAAGGAGGTGGCACTTTCCAGAAAGTATCAGTG 1740

 89471057 GGAGAGGGACTGGTGGTGGGCAGGGTCCTAGAACTCCCAAGATTAAATGACCTTTGTCTT 89471116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGAGAGGGACTGGTGGTGGGCAGGGTCCTAGAACTCCCAAGATTAAATGACCTTTGTCTT 1800

 89471117 CAGCTACCAGGGTGGATGGAGAAGGACCATCAGGTCAGGGCGGGGCTAGGAGTGTCTGAG 89471176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGCTACCAGGGTGGATGGAGAAGGACCATCAGGTCAGGGCGGGGCTAGGAGTGTCTGAG 1860

 89471177 CTCAGACTCTCCATGGCTGGATCTTGCTATGGCTGCTGTGGGGGATGGGGGTGAGATTCC 89471236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTCAGACTCTCCATGGCTGGATCTTGCTATGGCTGCTGTGGGGGATGGGGGTGAGATTCC 1920

 89471237 CAGGTCACTGGAGTTGTGTACCTAGGAGGATTATGGCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGT 89471296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGGTCACTGGAGTTGTGTACCTAGGAGGATTATGGCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGT 1980

 89471297 TGTCAGGGGAGTGGGAGAAGCTGGCAGTCACAGGCCTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGG 89471356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTCAGGGGAGTGGGAGAAGCTGGCAGTCACAGGCCTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGG 2040

 89471357 AAGGCCGGTCTCACTCCCACTGTGCCCTTCTCCCTGCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCA 89471416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGGCCGGTCTCACTCCCACTGTGCCCTTCTCCCTGCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCA 2100

 89471417 GGCAGAGGGCAAGAGGGGCGGGCTTAAAATTTGGCTGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAG 89471476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGCAGAGGGCAAGAGGGGCGGGCTTAAAATTTGGCTGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAG 2160

 89471477 AAAAGGACTTTAGTTCTTCACCAGCCTGTGAAGTTTGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCC 89471536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAAGGACTTTAGTTCTTCACCAGCCTGTGAAGTTTGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCC 2220

 89471537 GAGTTCTGGCAGGAGGCTTCTCGCCCCATTCAAATTGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATT 89471596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAGTTCTGGCAGGAGGCTTCTCGCCCCATTCAAATTGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATT 2280

 89471597 TCTTCTTTCTGTGGAGTTTTACCTGTTGCTCCTCTGGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGT 89471656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTTCTTTCTGTGGAGTTTTACCTGTTGCTCCTCTGGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGT 2340

 89471657 GGTGCCAGGCAGGAATGGCCTGCCTGGGGACACAGTGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGC 89471716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGTGCCAGGCAGGAATGGCCTGCCTGGGGACACAGTGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGC 2400

 89471717 TTCCTCTACCCCTGTATTTTGCTCGGCTCTCTAACTTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGG 89471776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTCCTCTACCCCTGTATTTTGCTCGGCTCTCTAACTTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGG 2460

 89471777 AAACTCCTCCTGCACACAAACCTTCAGCTTCTCCAGTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGA 89471836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAACTCCTCCTGCACACAAACCTTCAGCTTCTCCAGTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGA 2520

 89471837 GGGTCTCCCTTTCCCACTTCTGCAGTTGGGGCAGTCAGAATATTTGGAGTGTTTCCTGGG 89471896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGGTCTCCCTTTCCCACTTCTGCAGTTGGGGCAGTCAGAATATTTGGAGTGTTTCCTGGG 2580

 89471897 TCCTGCAGGAGCAGTCTGCCTCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTG 89471956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCCTGCAGGAGCAGTCTGCCTCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTG 2640

 89471957 TAATATTTTGAAACACTACATAATTATTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATCCTTA 89472016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAATATTTTGAAACACTACATAATTATTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATCCTTA 2700

 89472017 TGATTCTTATAAATGTAAGTAAAATAAGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAATGTTT 89472076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGATTCTTATAAATGTAAGTAAAATAAGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAATGTTT 2760

 89472077 CTATAAACAAAGGTCTGCAAACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGT 89472136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTATAAACAAAGGTCTGCAAACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGT 2820

 89472137 GTTATTGGCACATAGCCCCACCCATTTACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTG 89472196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTTATTGGCACATAGCCCCACCCATTTACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTG 2880

 89472197 TATGCAGAGTTTAGTAGTTGAGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTATCTGG 89472256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TATGCAGAGTTTAGTAGTTGAGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTATCTGG 2940

 89472257 TATTTTACAGAAAAGTTAGCCAACCACTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTGGTGA 89472316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TATTTTACAGAAAAGTTAGCCAACCACTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTGGTGA 3000

 89472317 AAAACT 89472322
          ||||||
     3001 AAAACT 3006

EXCISED REGION

 89472324 AAAAAAAAAAAATGGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTA 89472383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 AAAAAAAAAAAATGGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTA 3066

 89472384 TTTCTAGTTCAAAAATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATG 89472443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 TTTCTAGTTCAAAAATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATG 3126

 89472444 TTTGACAATTGGGATGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGC 89472503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 TTTGACAATTGGGATGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGC 3186

 89472504 TCAAAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGT 89472563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 TCAAAAGAAAGTCAAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGT 3246

 89472564 ATGACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAA 89472623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 ATGACCTTTAAGAATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAA 3306

 89472624 TTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATG 89472683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 TTAAATTAGTTCAATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATG 3366

 89472684 TTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGG 89472743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 TTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGG 3426

 89472744 TCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAG 89472803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 TCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAG 3486

 89472804 AAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATG 89472863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 AAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATG 3546

 89472864 ATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCT 89472923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 ATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCT 3606

 89472924 TTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTG 89472983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 TTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTG 3666

 89472984 CTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCT 89473043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 CTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCT 3726

 89473044 AGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATA 89473103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 AGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATA 3786

 89473104 TGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAA 89473163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 TGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAA 3846

 89473164 CTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTT 89473223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 CTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTT 3906

 89473224 GTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGT 89473283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 GTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGT 3966

 89473284 TCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTT 89473343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 TCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTT 4026

 89473344 GTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGT 89473403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 GTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGT 4086

 89473404 TGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTG 89473463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 TGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTG 4146

 89473464 TAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTAC 89473523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 TAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTAC 4206

 89473524 TCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATC 89473583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 TCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATC 4266

 89473584 TCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGA 89473643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 TCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGA 4326

 89473644 AATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTAT 89473703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 AATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTAT 4386

 89473704 TTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGA 89473763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 TTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGA 4446

 89473764 AGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATA 89473823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 AGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATA 4506

 89473824 TATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACA 89473883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 TATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACA 4566

 89473884 TATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATA 89473943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 TATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATA 4626

 89473944 TGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGA 89474003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 TGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGA 4686

 89474004 AGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCC 89474063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 AGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCC 4746

 89474064 AACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTAC 89474123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 AACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTAC 4806

 89474124 AGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATAC 89474183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 AGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATAC 4866

 89474184 TAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATA 89474243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 TAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATA 4926

 89474244 TTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCT 89474303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 TTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCT 4986

 89474304 CCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAG 89474363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 CCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAG 5046

 89474364 GCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGAC 89474423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 GCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGAC 5106

 89474424 TGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAA 89474483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 TGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAA 5166

 89474484 GTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTT 89474543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 GTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTT 5226

 89474544 ATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACG 89474603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 ATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACG 5286

 89474604 AACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCT 89474663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 AACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCT 5346

 89474664 TCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGA 89474723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 TCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGA 5406

 89474724 TAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATT 89474783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 TAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATT 5466

 89474784 TTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACA 89474843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 TTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACA 5526

 89474844 TTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCT 89474903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 TTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCT 5586

 89474904 GCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAG 89474963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 GCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAG 5646

 89474964 TTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTAT 89475023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 TTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTAT 5706

 89475024 TTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCT 89475083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 TTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCT 5766

 89475084 CCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCT 89475143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 CCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCT 5826

 89475144 TGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGA 89475203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 TGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGA 5886

 89475204 GAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTG 89475263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 GAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTG 5946

 89475264 AGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAG 89475323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 AGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAG 6006

 89475324 ATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGA 89475383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 ATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGA 6066

 89475384 TGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTG 89475443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 TGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTG 6126

 89475444 ATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAA 89475503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 ATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAA 6186

 89475504 ATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGG 89475563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 ATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGG 6246

 89475564 ATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTA 89475623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 ATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTA 6306

 89475624 AATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGT 89475683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 AATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGT 6366

 89475684 TTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGT 89475743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 TTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGT 6426

 89475744 TAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAA 89475803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 TAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAA 6486

 89475804 CTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTG 89475863
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 CTAA-TTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTG 6545

 89475864 GCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAG 89475923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6546 GCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAG 6605

 89475924 CCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTT 89475983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6606 CCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTT 6665

 89475984 TAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGAT 89476043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6666 TAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGAT 6725

 89476044 CTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCT 89476103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6726 CTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCT 6785

 89476104 AGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGT 89476163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6786 AGTTAACTAGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGT 6845

 89476164 GCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAG 89476223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6846 GCAATCTTGGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAG 6905

 89476224 TAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGA 89476283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6906 TAGCTGGGACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGA 6965

 89476284 CATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGC 89476343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6966 CATGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGC 7025

 89476344 CTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCT 89476403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7026 CTCTGCCCTCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCT 7085

 89476404 CTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTG 89476463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7086 CTTTGATGAGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTG 7145

 89476464 AATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTC 89476523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7146 AATGAAAGCATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTC 7205

 89476524 ACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGT 89476583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7206 ACTTTGGTGTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGT 7265

 89476584 TACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTG 89476643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7266 TACCTGTATCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTG 7325

 89476644 AATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAG 89476703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7326 AATAAAGAGACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAG 7385

 89476704 AGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTG 89476763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7386 AGGACTGAAAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTG 7445

 89476764 TTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAA 89476823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7446 TTTACAAAAGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAA 7505

 89476824 AAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAA 89476883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7506 AAAGAGTAACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAA 7565

 89476884 ATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACT 89476943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7566 ATAAACAGTCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACT 7625

 89476944 CCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGAT 89477003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7626 CCTGACCCCACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGAT 7685

 89477004 TGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATT 89477063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7686 TGACAGCTTTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATT 7745

 89477064 TCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTT 89477123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7746 TCATATGGAATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTT 7805

 89477124 CTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAG 89477183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7806 CTTTGCATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAG 7865

 89477184 AAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAAT 89477243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7866 AAGCCCTGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAAT 7925

 89477244 GTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCA 89477303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7926 GTTTTTAAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCA 7985

 89477304 AGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAA 89477363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7986 AGAACTAGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAA 8045

 89477364 TTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAA 89477423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8046 TTTCATTTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAA 8105

 89477424 AATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATA 89477483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8106 AATTACCGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATA 8165

 89477484 GACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTC 89477543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8166 GACTTCAGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTC 8225

 89477544 TGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCAC 89477603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8226 TGCGGGCAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCAC 8285

 89477604 TGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATC 89477663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8286 TGCGGCTGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATC 8345

 89477664 CCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGA 89477723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8346 CCCTCTGCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGA 8405

 89477724 AGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATG 89477783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8406 AGAAATGATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATG 8465

 89477784 TCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCT 89477843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8466 TCAATTTCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCT 8525

 89477844 GGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGT 89477903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8526 GGAAATGCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGT 8585

 89477904 AAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCT 89477963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     8586 AAGATCCCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACTT 8645

 89477964 AGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAA 89478023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8646 AGTCCTGTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAA 8705

 89478024 CCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAAT 89478083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8706 CCCATAGCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAAT 8765

 89478084 ACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAG 89478143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8766 ACTTATGGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAG 8825

 89478144 CACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAG 89478203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8826 CACAGCATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAG 8885

 89478204 TATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGAC 89478263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8886 TATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGAC 8945

 89478264 CTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTA 89478323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8946 CTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTA 9005

 89478324 GTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAAC 89478383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9006 GTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAAC 9065

 89478384 TTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTA 89478443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9066 TTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTA 9125

 89478444 GAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAAT 89478503
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9126 GAAATGTTGGTGTCATCTAGAGTTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAAT 9185

 89478504 GCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCC 89478563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9186 GCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCC 9245

 89478564 AGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGC 89478623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9246 AGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGC 9305

 89478624 AATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCA 89478683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9306 AATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCA 9365

 89478684 TTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAA 89478743
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9366 TTT-TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAA 9424

 89478744 CTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATG 89478803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9425 CTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATG 9484

 89478804 AACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGAC 89478863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     9485 AACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGAC 9544

 89478864 TTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAG 89478923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9545 TTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAG 9604

 89478924 ATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGT 89478983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9605 ATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGT 9664

 89478984 AGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTT 89479043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9665 AGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTT 9724

 89479044 TTCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGA 89479103
          |||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     9725 TTCTTTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGA 9784

 89479104 CTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGT 89479163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9785 CTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGT 9844

 89479164 CAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTT 89479223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9845 CAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTT 9904

 89479224 TGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTT 89479283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9905 TGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTT 9964

 89479284 CCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAG 89479343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9965 CCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAG 10024

 89479344 GCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAG 89479403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10025 GCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAG 10084

 89479404 TAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAG 89479463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10085 TAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAG 10144

 89479464 GAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTT 89479523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10145 GAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTT 10204

 89479524 AGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATT 89479583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10205 AGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATT 10264

 89479584 CATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCT 89479643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10265 CATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCT 10324

 89479644 TAAGAATAGCAAGCTAGAGATATA 89479667
          ||||||||||||||||||||||||
    10325 TAAGAATAGCAAGCTAGAGATATA 10348

Alignment time is 13.2905 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    4126] =>      4126 nucs 'mol-32-33a0-183386_4126'

Score:        4125
Aligned:      4125        nucs
Identic:      4125 (100%) nucs =>      4101 (100%)        24 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89473898,89477998] EXCISED REGION [89478000,89478023]
 second seq =>  [       1,    4101] EXCISED REGION [    4103,    4126]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89477999,89477999]
 second seq =>         1 nucs [4102,4102]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89477998,89477998] to [89477999,89477999]
 second seq =>         4 nucs [4102,4105] to [4103,4106]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89473898 ACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCA 89473957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCA 60

 89473958 GGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAA 89474017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAA 120

 89474018 ATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAAC 89474077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAAC 180

 89474078 TGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTA 89474137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTA 240

 89474138 GGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAA 89474197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAA 300

 89474198 AAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGT 89474257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGT 360

 89474258 GACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGG 89474317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGG 420

 89474318 ATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATG 89474377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATG 480

 89474378 CCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCC 89474437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCC 540

 89474438 TGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGA 89474497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGA 600

 89474498 AACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCC 89474557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCC 660

 89474558 ATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGAT 89474617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGAT 720

 89474618 GCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGC 89474677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGC 780

 89474678 CCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTT 89474737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTT 840

 89474738 CTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTG 89474797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTG 900

 89474798 TGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTA 89474857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTA 960

 89474858 TCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATG 89474917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATG 1020

 89474918 CCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAG 89474977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAG 1080

 89474978 GTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAA 89475037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAA 1140

 89475038 GCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCT 89475097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCT 1200

 89475098 GTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTAT 89475157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTAT 1260

 89475158 GTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGG 89475217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGG 1320

 89475218 CTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCT 89475277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCT 1380

 89475278 TGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAG 89475337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAG 1440

 89475338 CTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTG 89475397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTG 1500

 89475398 GGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCA 89475457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCA 1560

 89475458 TATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCA 89475517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCA 1620

 89475518 GATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGA 89475577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGA 1680

 89475578 GACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAA 89475637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAA 1740

 89475638 CCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGA 89475697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGA 1800

 89475698 ACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTG 89475757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTG 1860

 89475758 AATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTT 89475817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTT 1920

 89475818 TTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCA 89475877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCA 1980

 89475878 CACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCT 89475937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCT 2040

 89475938 GGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGG 89475997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGG 2100

 89475998 TTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGC 89476057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGCCTCAGC 2160

 89476058 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATT 89476117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACTAGTATT 2220

 89476118 TGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCA 89476177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTTGGCTCA 2280

 89476178 CTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACA 89476237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACA 2340

 89476238 GGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATG 89476297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTCACCATG 2400

 89476298 TTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAG 89476357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCCTCAAAG 2460

 89476358 TGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACC 89476417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATGAGCACC 2520

 89476418 TGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAA 89476477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAGCATGAA 2580

 89476478 TGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGT 89476537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGTGTTCGT 2640

 89476538 AGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCT 89476597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTATCCCCT 2700

 89476598 TCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAAT 89476657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGAGACAAT 2760

 89476658 AGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGA 89476717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGAAAATGA 2820

 89476718 CCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCAT 89476777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAAAGTCAT 2880

 89476778 CCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGG 89476837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTAACAGGG 2940

 89476838 AAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATG 89476897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAGTCAATG 3000

 89476898 ATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTT 89476957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCCCACTTT 3060

 89476958 CTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGT 89477017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCTTTATGT 3120

 89477018 CAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAA 89477077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGGAATAAA 3180

 89477078 TGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCT 89477137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCATTTGGCT 3240

 89477138 AGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTC 89477197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTGATTGTC 3300

 89477198 AGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTG 89477257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAAACTTTG 3360

 89477258 AGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCA 89477317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAGTTGTCA 3420

 89477318 CCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGT 89477377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTTCTTAGT 3480

 89477378 AGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATT 89477437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCGCTAATT 3540

 89477438 TCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCT 89477497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAGTGGCCT 3600

 89477498 CCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCA 89477557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCAGCTGCA 3660

 89477558 CCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCT 89477617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTGAGTTCT 3720

 89477618 CTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAG 89477677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGCTGATAG 3780

 89477678 CATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGT 89477737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGATAATGT 3840

 89477738 TTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTA 89477797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTCCACCTA 3900

 89477798 TTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTG 89477857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGCCTATTG 3960

 89477858 TTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATG 89477917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCCTAGATG 4020

 89477918 ATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGT 89477977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGTGTTAGT 4080

 89477978 TGAATGTTTGCATCCATTTCA 89477998
          |||||||||||||||||||||
     4081 TGAATGTTTGCATCCATTTCA 4101

EXCISED REGION

 89478000 CCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAA 89478023
          ||||||||||||||||||||||||
     4103 CCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAA 4126

Alignment time is 5.34315 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    6012] =>      6012 nucs 'mol-32-33ab-007501_6012'

Score:        5913
Aligned:      6014        nucs
Identic:      6004 (100%) nucs =>      3236 (100%)      2768 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89472666,89475908] EXCISED REGION [89478625,89481395]
 second seq =>  [       1,    3241] EXCISED REGION [    3242,    6012]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89472666 AAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATG 89472725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTAAAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATG 60

 89472726 TGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAAT 89472785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAAGGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAAT 120

 89472786 CTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAA 89472845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTTCTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAA 180

 89472846 TTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTC 89472905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTC 240

 89472906 TGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGT 89472965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGT 300

 89472966 CCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACAC 89473025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACAC 360

 89473026 TGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGC 89473085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGC 420

 89473086 CAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTG 89473145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTG 480

 89473146 GTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTAC 89473205
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGCGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTAC 540

 89473206 AGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTT 89473265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTT 600

 89473266 GATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTA 89473325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTA 660

 89473326 TCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGG 89473385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGG 720

 89473386 ATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTT 89473445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTT 780

 89473446 TTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTG 89473505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTG 840

 89473506 GCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAG 89473565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAG 900

 89473566 TGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGT 89473625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGT 960

 89473626 ACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCA 89473685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCA 1020

 89473686 TTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGC 89473745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGC 1080

 89473746 CTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTG 89473805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTG 1140

 89473806 TGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAA 89473865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAA 1200

 89473866 CACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTC 89473925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACACCTACCTACACACATATTATTATTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTC 1260

 89473926 AAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCT 89473985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCT 1320

 89473986 GTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAA 89474045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAA 1380

 89474046 TTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGG 89474105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGG 1440

 89474106 AGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTC 89474165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTC 1500

 89474166 TTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTG 89474225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTG 1560

 89474226 ATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTC 89474285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTC 1620

 89474286 TGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAA 89474345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAA 1680

 89474346 GCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAG 89474405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAG 1740

 89474406 GATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGT 89474465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGT 1800

 89474466 AGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAA 89474525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAA 1860

 89474526 ATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAG 89474585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAG 1920

 89474586 AGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTG 89474645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTG 1980

 89474646 AGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAAT 89474705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAAT 2040

 89474706 TGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATT 89474765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATT 2100

 89474766 TGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACT 89474825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2101 TGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACGTTCCACT 2160

 89474826 GTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACAC 89474885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACAC 2220

 89474886 TTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTA 89474945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTA 2280

 89474946 AGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTT 89475005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTT 2340

 89475006 TAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTT 89475065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTT 2400

 89475066 GCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTG 89475125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTG 2460

 89475126 CATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGAC 89475185
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CATCGGTCATAGACTCCTTGGATTTCAAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGAC 2520

 89475186 CCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGC 89475245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2521 CCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATGGCTGTAAGCAGGTGTTCCTGTTCTTCTGC 2580

 89475246 CCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGAT 89475305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGAT 2640

 89475306 TCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCA 89475365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCA 2700

 89475366 GAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAA 89475425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAA 2760

 89475426 TTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAG 89475485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAG 2820

 89475486 CCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAAC 89475545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAAC 2880

 89475546 TGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTT 89475605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTT 2940

 89475606 GGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTT 89475665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTT 3000

 89475666 AAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCA 89475725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCA 3060

 89475726 TGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTG 89475785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTG 3120

 89475786 CACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTG 89475845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||.|||
     3121 CACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTTTTTTT--GAGACAGAGTCTTGCTCTGTTG 3178

 89475846 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 89475905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 3238

 89475906 GTG 89475908
          |||
     3239 GTG 3241

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 3301

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3302 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 3361

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3362 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 3421

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3422 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 3481

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3482 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 3541

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3542 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 3601

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3602 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 3661

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3662 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 3721

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3722 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 3781

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3782 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 3841

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3842 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 3901

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3902 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 3961

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3962 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 4021

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4022 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 4081

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4082 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 4141

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4142 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 4201

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4202 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 4261

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4262 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 4321

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4322 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 4381

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4382 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 4441

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4442 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 4501

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4502 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 4561

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4562 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 4621

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4622 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 4681

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4682 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 4741

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4742 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 4801

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4802 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 4861

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4862 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 4921

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4922 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 4981

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4982 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 5041

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5042 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 5101

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5102 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 5161

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5162 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 5221

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5222 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 5281

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5282 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 5341

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5342 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 5401

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5402 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 5461

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5462 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 5521

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5522 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 5581

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5582 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 5641

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5642 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 5701

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5702 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 5761

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5762 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 5821

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5822 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 5881

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5882 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 5941

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5942 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 6001

 89481385 CCACTGCACTC 89481395
          |||||||||||
     6002 CCACTGCACTC 6012

Alignment time is 7.78214 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2834] =>      2834 nucs 'mol-32-33ab-007501_2834'

Score:        2801
Aligned:      2834        nucs
Identic:      2831 (100%) nucs =>        63 (100%)      2768 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475846,89475908] EXCISED REGION [89478625,89481395]
 second seq =>  [       1,      63] EXCISED REGION [      64,    2834]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89475846 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 89475905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 60

 89475906 GTG 89475908
          |||
       61 GTG 63

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       64 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 123

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 183

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      184 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 243

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      244 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 303

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 363

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 423

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 483

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 543

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 603

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 663

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 723

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 783

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 843

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 903

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 963

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 1023

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 1083

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 1143

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1144 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 1203

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 1263

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 1323

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 1383

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 1443

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 1503

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 1563

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 1623

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 1683

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 1743

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 1803

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 1863

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 1923

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 1983

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 2043

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 2103

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 2163

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 2223

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 2283

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 2343

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 2403

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 2463

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 2523

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 2583

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 2643

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 2703

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 2763

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 2823

 89481385 CCACTGCACTC 89481395
          |||||||||||
     2824 CCACTGCACTC 2834

Alignment time is 3.67976 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    9187] =>      9187 nucs 'mol-32-33ab-105458_9187'

Score:        9003
Aligned:      9195        nucs
Identic:      9171 (100%) nucs =>       584 ( 99%)      8587 (100%)
Gaps:           13 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475322,89475908] EXCISED REGION [89478625,89487228]
 second seq =>  [       1,     585] EXCISED REGION [     586,    9186]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89475322 AGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAG 89475381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATACATGCTCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAG 60

 89475382 GATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATT 89475441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATGATACAGATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATT 120

 89475442 TGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGC 89475501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGATGCTGTGGTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGC 180

 89475502 AAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGA 89475561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATCAGAGTGATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGA 240

 89475562 GGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTT 89475621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGATATCAGGCAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTT 300

 89475622 TAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGG 89475681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAATCCAGTTTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGG 360

 89475682 GTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTG 89475741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTTCTGTCTCTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTG 420

 89475742 GTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATT 89475801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTAATCTGATAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATT 480

 89475802 AACTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAG 89475861
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      481 AACTAATTTTTTTTTTTTTT--GAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAG 538

 89475862 TGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 TGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 585

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      586 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 645

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      646 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 705

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      706 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 765

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      766 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 825

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      826 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 885

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      886 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 945

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      946 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 1005

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1006 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 1065

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1066 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 1125

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1126 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 1185

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1186 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 1245

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1246 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 1305

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1306 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 1365

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1366 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 1425

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 1485

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 1545

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 1605

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 1665

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1666 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 1725

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 1785

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 1845

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 1905

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 1965

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 2025

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 2085

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 2145

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 2205

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 2265

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 2325

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 2385

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 2445

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 2505

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 2565

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 2625

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 2685

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 2745

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 2805

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 2865

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 2925

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 2985

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 3045

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 3105

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 3165

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 3225

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 3285

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 3345

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTT-AAAAAAAAAAAAAAAA 89481443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
     3346 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-TGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 3404

 89481444 AAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGA 89481503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 AAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGA 3464

 89481504 AAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGG 89481563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 AAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGG 3524

 89481564 AACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATC 89481623
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 AACAAGGAAAAGATGCCCATTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATC 3584

 89481624 CAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAA 89481683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 CAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAA 3644

 89481684 ATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACT 89481743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 ATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACT 3704

 89481744 GTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAAT 89481803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 GTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAAT 3764

 89481804 CTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCC 89481863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 CTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCC 3824

 89481864 CATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGG 89481923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 CATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGG 3884

 89481924 CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGA 89481983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGA 3944

 89481984 TCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACA 89482043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 TCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACA 4004

 89482044 CACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTG 89482103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 CACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTG 4064

 89482104 AGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCAC 89482163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 AGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCAC 4124

 89482164 TGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAA 89482223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 TGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAA 4184

 89482224 AAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTG 89482283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 AAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTG 4244

 89482284 GAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTG 89482343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 GAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTG 4304

 89482344 ACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCA 89482403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 ACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCA 4364

 89482404 CGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTG 89482463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4365 CGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATGGGGTTTCCCCGTGTTG 4424

 89482464 TCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTG 89482523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4425 TCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCCTCAGCTTCTCAAAGTG 4484

 89482524 CTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAA 89482583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4485 CTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTTAAAAGAAATTAAGGAA 4544

 89482584 GAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTA 89482643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4545 GAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGATTCAATGCAATCCCTA 4604

 89482644 TCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCA 89482703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4605 TCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATATCCACACTAACTTTCA 4664

 89482704 TATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTC 89482763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4665 TATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAAAAGGAAGAAGAAAGTC 4724

 89482764 AGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTT 89482823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4725 AGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAGGATAATCAACACAGTT 4784

 89482824 TGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAA 89482883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4785 TGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAGAGAGCCTAGAAATGAA 4844

 89482884 CTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAATCATTCAACGCAGAAA 89482943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4845 CTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAATCATTCAACGCAGAAA 4904

 89482944 GAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCACATGCTCACATGCCAA 89483003
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     4905 GAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCACATGCTCACATGCC-A 4963

 89483004 AAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACGTAACTCAAAATGGATC 89483063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4964 AAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACGTAACTCAAAATGGATC 5023

 89483064 AAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGAAAACAAAGGGGAAAAA 89483123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5024 AAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGAAAACAAAGGGGAAAAA 5083

 89483124 CAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAATGAAAAACTTTTGTGCA 89483183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5084 CAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAATGAAAAACTTTTGTGCA 5143

 89483184 TCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATGGAAGAAAACATTTGCT 89483243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5144 TCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATGGAAGAAAACATTTGCT 5203

 89483244 AAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGAATTCCTACAATGCAAC 89483303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5204 AAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGAATTCCTACAATGCAAC 5263

 89483304 ACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTCTCTAAAGAATGGCCAA 89483363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5264 ACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTCTCTAAAGAATGGCCAA 5323

 89483364 TAAGCACCTGAAAAGATGCTCAACATTACTAGTCATTAGGAAAATGCAAATTAAAGCCAT 89483423
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5324 TAAGCACCTGAAAAGATGCTCAATATTACTAGTCATTAGGAAAATGCAAATTAAAGCCAT 5383

 89483424 AGTGAGATACTACTTCACATCCATTAGTATGGTGACTATCAAAAAAAATTGAAAAGGGCT 89483483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5384 AGTGAGATACTACTTCACATCCATTAGTATGGTGACTATCAAAAAAAATTGAAAAGGGCT 5443

 89483484 GGGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCAC 89483543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5444 GGGTGCAGTGGCTCAAGCCTGAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCAC 5503

 89483544 CTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCAAATATGGAGAAACCCCATTTACACTAAAA 89483603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5504 CTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCAAATATGGAGAAACCCCATTTACACTAAAA 5563

 89483604 ATACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCACCTACTTGGGAGGCTG 89483663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5564 ATACAAAACTGAGCCATGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCACCTACTTGGGAGGCTG 5623

 89483664 AGGTAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGGTCGTGCCAC 89483723
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5624 AGGTAGAAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGGTCGTGCCAC 5683

 89483724 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTGTGTCTCAAAAAAAAAAAAAATTAAAATA 89483783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5684 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTGTGTCTCAAAAAAAAAAAAAATTAAAATA 5743

 89483784 ACTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATTGCTATGGAATAAAAGATGAAATGCTCCTGATTA 89483843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5744 ACTGTAGGGAGACCCCGTGAAACTATTGCTATGGAATAAAAGATGAAATGCTCCTGATTA 5803

 89483844 TTGTAAATACAAAATTGCATGCAGGATTGTGCAAAGACAGTGCCAGGTTGGACTGCCAGA 89483903
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5804 TTGTAAATACAAAATTGCATGCAGGATTGTGCAAAGACAATGCCAGGTTGGACTGCCAGA 5863

 89483904 ATGAGCCAACGGGACGTGATGTGCTTCCCCCTGCAGAGAGCCTATGAATGGATGTGCAGT 89483963
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5864 ATGAGCCAACGGCACGTGATGTGCTTCCCCCTGCAGAGAGCCTATGAATGGATGTGCAGT 5923

 89483964 CAGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTCCTATCCCAGAAAAGCAGATGTTCATAGCTCTGG 89484023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5924 CAGGGAGGTTTCACATCACCAAGATTCCTATCCCAGAAAAGCAGATGTTCATAGCTCTGG 5983

 89484024 GAATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGAGGGGGCACCTGTCCATGTGGATAAGATAGGGCC 89484083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5984 GAATGGAATGAGACCCTTGTGGAGAGAGGGGGCACCTGTCCATGTGGATAAGATAGGGCC 6043

 89484084 ATAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTCTTCTAGGCCTCTTTAGGGTTAAGGCATACTCCC 89484143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6044 ATAAACGCATTCATCTTGCCATGGCTCTTCTAGGCCTCTTTAGGGTTAAGGCATACTCCC 6103

 89484144 TTCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTTGTCTAGCTTCACGTCTTGTTTCTATGGATTGTT 89484203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6104 TTCTGAGAATTTCTGGTCTAACCGGTTGTCTAGCTTCACGTCTTGTTTCTATGGATTGTT 6163

 89484204 TGTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTACTGCTGATTAATATCTTGCTAATCATAGGTTAT 89484263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6164 TGTAACCAGCTTTTGCTGCAACTGTTACTGCTGATTAATATCTTGCTAATCATAGGTTAT 6223

 89484264 GAAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCTCTGTTAGAAATTACTGATGCACACACTATATTG 89484323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6224 GAAAGACTGCATTTCTGTTTTAAGGCTCTGTTAGAAATTACTGATGCACACACTATATTG 6283

 89484324 TAAATTCTTATCTCTGTATACTGTACTTCTGCATACAGATGTTATGTTAAAGAATTACTT 89484383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6284 TAAATTCTTATCTCTGTATACTGTACTTCTGCATACAGATGTTATGTTAAAGAATTACTT 6343

 89484384 CATCCCCATGTGACCATCTCACCTCATAATCAAACGACCCTAAATCCCTCACTAACCTTC 89484443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6344 CATCCCCATGTGACCATCTCACCTCATAATCAAACGACCCTAAATCCCTCACTAACCTTC 6403

 89484444 CCCCACCCTCACTAAACTTAATAATAAATGCTGGCATATCCAGTGCATTGGCAGCACCAC 89484503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6404 CCCCACCCTCACTAAACTTAATAATAAATGCTGGCATATCCAGTGCATTGGCAGCACCAC 6463

 89484504 GGGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGGACCCAGCTTTCACTATCTTGTGTGTATCTATTA 89484563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6464 GGGACCAGAAGGCTGTGACCCCCCTGGACCCAGCTTTCACTATCTTGTGTGTATCTATTA 6523

 89484564 TTTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGAACAAAGAGAGAGCCCCGTTGCATTGCAGGCTGC 89484623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6524 TTTCTCGACCTGCCGGTCTGCCTGGGAACAAAGAGAGAGCCCCGTTGCATTGCAGGCTGC 6583

 89484624 TGGCCAGATCCCGCAATAAATAACAAATGTTGGTGAATATGAAGAGAAATTAGAACCCTT 89484683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6584 TGGCCAGATCCCGCAATAAATAACAAATGTTGGTGAATATGAAGAGAAATTAGAACCCTT 6643

 89484684 GTGCATTTCTGTTGGGAATGCTAAATGGTGCAGTCACTGTGGAAAATGATACAGCAATTC 89484743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6644 GTGCATTTCTGTTGGGAATGCTAAATGGTGCAGTCACTGTGGAAAATGATACAGCAATTC 6703

 89484744 CTTAAAAAATTTAACATGGAATGACTATATGAGCCATCAGTTCCACTTCTGGGTGTATAC 89484803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6704 CTTAAAAAATTTAACATGGAATGACTATATGAGCCATCAGTTCCACTTCTGGGTGTATAC 6763

 89484804 TGAAAAGGAGTGAAAGCAGGGACTCGAACAGATATTCAGACACCCATGATCCTATCAGCA 89484863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6764 TGAAAAGGAGTGAAAGCAGGGACTCGAACAGATATTCAGACACCCATGATCCTATCAGCA 6823

 89484864 TTATTTGTAATAGCCAAAAGGTGTAAGCAACCCAAGTGTCAACTGACAAGCGAACAGATA 89484923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6824 TTATTTGTAATAGCCAAAAGGTGTAAGCAACCCAAGTGTCAACTGACAAGCGAACAGATA 6883

 89484924 AATTAGTATACACATATAATTACTTAGCCTTGAAAAGGAAGAATTTTTTATTTCTTTATT 89484983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6884 AATTAGTATACACATATAATTACTTAGCCTTGAAAAGGAAGAATTTTTTATTTCTTTATT 6943

 89484984 TATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTATGCCCAGGCTGGAGTGCAAAGGCACGATCTTGGC 89485043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6944 TATTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTATGCCCAGGCTGGAGTGCAAAGGCACGATCTTGGC 7003

 89485044 TCACCGCAACCTCTGTTTCCCAGATTCAAGTGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGC 89485103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7004 TCACCGCAACCTCTGTTTCCCAGATTCAAGTGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGC 7063

 89485104 TGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAAAGACGGGG 89485163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7064 TGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAAAGACGGGG 7123

 89485164 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCCTGCATTG 89485223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     7124 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCATTG 7183

 89485224 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCCATGAGTGCCCAGCCAAAAAGGAAAAATTTTGAC 89485283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7184 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCCATGAGTGCCCAGCCAAAAAGGAAAAATTTTGAC 7243

 89485284 ACATGCTACCACACTGAACCTTGAAGACATTATGTGAATTAGAATAAGCCAGTCACCAAA 89485343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7244 ACATGCTACCACACTGAACCTTGAAGACATTATGTGAATTAGAATAAGCCAGTCACCAAA 7303

 89485344 GGACAAATATTGAATGACTCCACTTATATAACATTCCTAGAGTAGTCAAATTAATAGAGA 89485403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7304 GGACAAATATTGAATGACTCCACTTATATAACATTCCTAGAGTAGTCAAATTAATAGAGA 7363

 89485404 TGGAATGTAGAATTGTGGCAGGAGATGGGTGTAGGTGGGGCTTTTGTTTAATTGGCACAG 89485463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7364 TGGAATGTAGAATTGTGGCAGGAGATGGGTGTAGGTGGGGCTTTTGTTTAATTGGCACAG 7423

 89485464 AGTTTCTTTTGGGGAAGATTAAAAAGTTCTGGAAATAGATGGTAGTGATGGTTGCACAAC 89485523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7424 AGTTTCTTTTGGGGAAGATTAAAAAGTTCTGGAAATAGATGGTAGTGATGGTTGCACAAC 7483

 89485524 AATTTGAATTTAATTAATACCACAGAACTACATACTTAATAATGGTTACAAGGATAAATT 89485583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7484 AATTTGAATTTAATTAATACCACAGAACTACATACTTAATAATGGTTACAAGGATAAATT 7543

 89485584 TTATGTTTATATATTTTTTAAAACAATAAACAAGAAAATCCAATACAGACTGAAACATTT 89485643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7544 TTATGTTTATATATTTTTTAAAACAATAAACAAGAAAATCCAATACAGACTGAAACATTT 7603

 89485644 TTTCAACCTTAAAGATCAGTGTAAACTTGCTGTTACTATGTGAACATGGGCAGGCGATCT 89485703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7604 TTTCAACCTTAAAGATCAGTGTAAACTTGCTGTTACTATGTGAACATGGGCAGGCGATCT 7663

 89485704 CTTGAGCCCAGGAGCTTGAGACCTGCATGGGCAACATGATGAAACCCTGTGTCTACCAAA 89485763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7664 CTTGAGCCCAGGAGCTTGAGACCTGCATGGGCAACATGATGAAACCCTGTGTCTACCAAA 7723

 89485764 AATACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGCATCTGTAGTCCTACCTACTCAGGAGGCTG 89485823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7724 AATACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATGCATCTGTAGTCCTACCTACTCAGGAGGCTG 7783

 89485824 AGGTGAGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGACTGTGGTGAGCTGAGATCTTGCCAC 89485883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7784 AGGTGAGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGACTGTGGTGAGCTGAGATCTTGCCAC 7843

 89485884 TGTACTCCAGCCTGGGGAAAGAGCAAGACCTTGTCTCAAGAAAAAAAAAGACTAGTCAAG 89485943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7844 TGTACTCCAGCCTGGGGAAAGAGCAAGACCTTGTCTCAAGAAAAAAAAAGACTAGTCAAG 7903

 89485944 TGCAGTCAGTAGTGAGAAGGGTGAGGAGAAAGAGTAGAACAAGGAGTTCAACTGTAACTC 89486003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7904 TGCAGTCAGTAGTGAGAAGGGTGAGGAGAAAGAGTAGAACAAGGAGTTCAACTGTAACTC 7963

 89486004 ATGGTGAACAGTCAATTGAGATAACTCACTACCCTCAGAACAGCTGTGAGCTGATGCTTA 89486063
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     7964 ATGGTGAACAGTCAATTGAGATAACTCACTACCTTCAGAACAGCTGTGAGCTGATGCTTA 8023

 89486064 TCCCCTAGAAGAGTGAAGATAAGGAGCCCAACTGTGAATGGAAAGTTAGCTTATTCCCAG 89486123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8024 TCCCCTAGAAGAGTGAAGATAAGGAGCCCAACTGTGAATGGAAAGTTAGCTTATTCCCAG 8083

 89486124 TGCCAGCTTTCTCTCCTCACATCCTCATAATGGATGCTGACTGTGTTGGGGGACAGAAGG 89486183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8084 TGCCAGCTTTCTCTCCTCACATCCTCATAATGGATGCTGACTGTGTTGGGGGACAGAAGG 8143

 89486184 GACTTGGCAGAGCTTTGCTCATGCCACTCACCCTTATTCTTCCCAGCTAGCTTGTTCATC 89486243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8144 GACTTGGCAGAGCTTTGCTCATGCCACTCACCCTTATTCTTCCCAGCTAGCTTGTTCATC 8203

 89486244 AGGTAGGATTTTCCTGTGCGGTAGAGGCCCACAATTGCCACCACCACCACAGGCTGTGTA 89486303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8204 AGGTAGGATTTTCCTGTGCGGTAGAGGCCCACAATTGCCACCACCACCACAGGCTGTGTA 8263

 89486304 ATGGCAGACAGGATTTTCAGAGCTTCTGGATTCGCCACCAGTTCCCCATTAGTGTTCTCA 89486363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8264 ATGGCAGACAGGATTTTCAGAGCTTCTGGATTCGCCACCAGTTCCCCATTAGTGTTCTCA 8323

 89486364 ATGAGGCACATTGGGCCTGTCATGTGGATCTCTGGAGCCATGTCCAGGGCATTGTTCTCT 89486423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8324 ATGAGGCACATTGGGCCTGTCATGTGGATCTCTGGAGCCATGTCCAGGGCATTGTTCTCT 8383

 89486424 TGTCTGCAAGGGAAGAGTTGGAATGAATTAGAATTTCCAGTCTTTTGCATTTAGAGGATA 89486483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8384 TGTCTGCAAGGGAAGAGTTGGAATGAATTAGAATTTCCAGTCTTTTGCATTTAGAGGATA 8443

 89486484 GAGTCACAGAATTCCCCAGGATGGCCAAAAGTTTTGTGTGTGTCAGTGAGAGAGATGAGG 89486543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8444 GAGTCACAGAATTCCCCAGGATGGCCAAAAGTTTTGTGTGTGTCAGTGAGAGAGATGAGG 8503

 89486544 GAAAATGTGTATCATTTTAAAAAATTATGGAAGTATTATCATCAAATTAAATATTGGTAT 89486603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8504 GAAAATGTGTATCATTTTAAAAAATTATGGAAGTATTATCATCAAATTAAATATTGGTAT 8563

 89486604 GACAGTAACTTATCAACAGTCAACTACTCTTGCAACCTAGAACTTTCATTTAATTTATTA 89486663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8564 GACAGTAACTTATCAACAGTCAACTACTCTTGCAACCTAGAACTTTCATTTAATTTATTA 8623

 89486664 TGGAAAAGCTTCCCTTGGATTCTCATTAAAAAATTTACACTAGACAATAAATGGAAGATA 89486723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8624 TGGAAAAGCTTCCCTTGGATTCTCATTAAAAAATTTACACTAGACAATAAATGGAAGATA 8683

 89486724 AAATAGGATATAGAGAATTTTTTTTACATCCTGGCTATATGTAAGAAATTAAATATTGAT 89486783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8684 AAATAGGATATAGAGAATTTTTTTTACATCCTGGCTATATGTAAGAAATTAAATATTGAT 8743

 89486784 TTGTTTATTCATGAATTCTTATGATGAATAAAGACCCCCATGAGTAAATGTTTCATTGTT 89486843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8744 TTGTTTATTCATGAATTCTTATGATGAATAAAGACCCCCATGAGTAAATGTTTCATTGTT 8803

 89486844 TGACATATGCCCTTAGGACAATTTCCAGAGATTTATAAATGTGTTCCTTCCTCCATTTTC 89486903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8804 TGACATATGCCCTTAGGACAATTTCCAGAGATTTATAAATGTGTTCCTTCCTCCATTTTC 8863

 89486904 AACTGGTTATGCTTATTTCACTGTAATGAGGATCCACAAAACTTCTCACAGTGCCATTCT 89486963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8864 AACTGGTTATGCTTATTTCACTGTAATGAGGATCCACAAAACTTCTCACAGTGCCATTCT 8923

 89486964 GGAAGTGGAACCAATGTAACATACTTTTGCAAATTCTATACAACTACATAACCATGTGAA 89487023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8924 GGAAGTGGAACCAATGTAACATACTTTTGCAAATTCTATACAACTACATAACCATGTGAA 8983

 89487024 ACACATGGCTAGGGACCTTTCCAAGGGCTTTGAAGGGGCACGTGCAAGAGAGGGGCCCTG 89487083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8984 ACACATGGCTAGGGACCTTTCCAAGGGCTTTGAAGGGGCACGTGCAAGAGAGGGGCCCTG 9043

 89487084 AAACTTAAGCTTCATTAGCGTCATGATAAGGTAGCCTCTAACTCAGTGTGGGTATAAATG 89487143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9044 AAACTTAAGCTTCATTAGCGTCATGATAAGGTAGCCTCTAACTCAGTGTGGGTATAAATG 9103

 89487144 CAAAACTGCCAATACTGAATGTTGCTAAGAAACACGCATGCGCGCGCGCGCACACA---C 89487200
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |
     9104 CAAAACTGCCAATACTGAATGTTGCTAAGAAACACGCATGCGCGCGCGCGC-----GCGC 9158

 89487201 ACACACACACACACACACACACACACAC 89487228
          ||||||||||||||||||||||||||||
     9159 ACACACACACACACACACACACACACAC 9186

Alignment time is 12.0039 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3248] =>      3248 nucs 'mol-32-3419-005514_3248'

Score:        3184
Aligned:      3250        nucs
Identic:      3244 (100%) nucs =>       360 (100%)      2884 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89478182,89478541] EXCISED REGION [89478543,89481432]
 second seq =>  [       1,     360] EXCISED REGION [     361,    3248]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [89478542,89478542]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>        12 nucs [89479063,89479074]
 second seq =>        12 nucs [880,891]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [89478542,89478550] to [89478543,89478551]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89478182 GTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTG 89478241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTG 60

 89478242 AAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACA 89478301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACA 120

 89478302 TTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTG 89478361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTG 180

 89478362 TGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAA 89478421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAA 240

 89478422 GGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAG 89478481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAG 300

 89478482 CAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATA 89478541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATA 360

EXCISED REGION

 89478543 TTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAAC 89478602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAAC 420

 89478603 CTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACA 89478662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACA 480

 89478663 GGTATGTGCCACCATGCCTCATTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCAT 89478722
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTATGTGCCACCATGCCTCATTT-TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCAT 539

 89478723 GTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAA 89478782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAA 599

 89478783 AGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAG 89478842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 AGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAG 659

 89478843 TGGAAGTACTACGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTT 89478902
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTT 719

 89478903 TTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCA 89478962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCA 779

 89478963 GGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGC 89479022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGC 839

 89479023 AGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGA 89479082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||
      840 AGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGA 899

 89479083 TTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAAT 89479142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAAT 959

 89479143 ATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTC 89479202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 ATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTC 1019

 89479203 TCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAA 89479262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAA 1079

 89479263 ATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGA 89479322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGA 1139

 89479323 ATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCAT 89479382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 ATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCAT 1199

 89479383 GTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACA 89479442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACA 1259

 89479443 GAATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATG 89479502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GAATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATG 1319

 89479503 AAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAA 89479562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAA 1379

 89479563 TTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTG 89479622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTG 1439

 89479623 CTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGT 89479682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGT 1499

 89479683 GAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATT 89479742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATT 1559

 89479743 TATCAATGGTACGTCTCTGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATC 89479802
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TATCAATGGTACGTCCCTGTTACCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATC 1619

 89479803 TGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACAC 89479862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACAC 1679

 89479863 AAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGA 89479922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGA 1739

 89479923 GGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAA 89479982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAA 1799

 89479983 ATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCC 89480042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 ATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCC 1859

 89480043 ATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTC 89480102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 ATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTC 1919

 89480103 TGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCA 89480162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCA 1979

 89480163 GGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAA 89480222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAA 2039

 89480223 AGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAG 89480282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 AGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAG 2099

 89480283 AGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTG 89480342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTG 2159

 89480343 GAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGA 89480402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 GAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGA 2219

 89480403 CAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAG 89480462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAG 2279

 89480463 AACCCAAATCCAAACAAAATGATTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATT 89480522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AACCCAAATCCAAACAAAATGATTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATT 2339

 89480523 AGTGTTTTTTGGTATACACTGATTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATT 89480582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AGTGTTTTTTGGTATACACTGATTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATT 2399

 89480583 GCAAAATAAACATTCAAGGTTAATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGC 89480642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 GCAAAATAAACATTCAAGGTTAATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGC 2459

 89480643 TCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGT 89480702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGT 2519

 89480703 GCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACT 89480762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACT 2579

 89480763 GTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGG 89480822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGG 2639

 89480823 TTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATG 89480882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATG 2699

 89480883 CAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTA 89480942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTA 2759

 89480943 TTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAG 89481002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAG 2819

 89481003 CAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTT 89481062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTT 2879

 89481063 GGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAA 89481122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 GGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAA 2939

 89481123 GGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTA 89481182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTA 2999

 89481183 ATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAAT 89481242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 ATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAAT 3059

 89481243 AGAAAAATTTGAATATCCAGTACATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATC 89481302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AGAAAAATTTGAATATCCAGTACATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATC 3119

 89481303 AACAAATTAGAAATAGAAAAAAACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAG 89481362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 AACAAATTAGAAATAGAAAAAAACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAG 3179

 89481363 GTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTT 89481422
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     3180 GTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-T 3238

 89481423 GTCTTAAAAA 89481432
          ||||||||||
     3239 GTCTTAAAAA 3248

Alignment time is 4.18352 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    6266] =>      6266 nucs 'mol-32-3492-165527_6266'

Score:        6196
Aligned:      6251        nucs
Identic:      6246 (100%) nucs =>      4287 (100%)      1959 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89477130,89481421] EXCISED REGION [89481428,89483386]
 second seq =>  [       1,    4291] EXCISED REGION [    4302,    6260]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [89481422,89481427]
 second seq =>        10 nucs [4292,4301]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89481421,89481421] to [89481427,89481427]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89481422,89481422] to [89481427,89481427]
 second seq =>         0 nucs

 89477130 ATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCC 89477189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCC 60

 89477190 TGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTT 89477249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTT 120

 89477250 AAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACT 89477309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACT 180

 89477310 AGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCAT 89477369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCAT 240

 89477370 TTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTAC 89477429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTAC 300

 89477430 CGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTC 89477489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGCTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTC 360

 89477490 AGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGG 89477549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGG 420

 89477550 CAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGC 89477609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGC 480

 89477610 TGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCT 89477669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCT 540

 89477670 GCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAAT 89477729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAAT 600

 89477730 GATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATT 89477789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATT 660

 89477790 TCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAAT 89477849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAAT 720

 89477850 GCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATC 89477909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATC 780

 89477910 CCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCT 89477969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCT 840

 89477970 GTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATA 89478029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATA 900

 89478030 GCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTAT 89478089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTAT 960

 89478090 GGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGC 89478149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGC 1020

 89478150 ATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCT 89478209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCT 1080

 89478210 AGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAA 89478269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGCCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAA 1140

 89478270 TTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCT 89478329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCT 1200

 89478330 ACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTT 89478389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTT 1260

 89478390 CCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATG 89478449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATG 1320

 89478450 TTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGAT 89478509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGAT 1380

 89478510 ACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTG 89478569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTG 1440

 89478570 GAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCT 89478629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCT 1500

 89478630 CCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTTATT 89478689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     1501 CCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT-TT 1559

 89478690 TTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTG 89478749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTG 1619

 89478750 GCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCAT 89478809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCAT 1679

 89478810 CATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTACGA 89478869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1680 CATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTACGA 1739

 89478870 GGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAG 89478929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAG 1799

 89478930 GAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTC 89478989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTC 1859

 89478990 TCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTT 89479049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTT 1919

 89479050 GGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTA 89479109
          |||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GGGAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTA 1979

 89479110 CCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATA 89479169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATA 2039

 89479170 GTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTAT 89479229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTAT 2099

 89479230 TGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAA 89479289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAA 2159

 89479290 AAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCA 89479349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCA 2219

 89479350 GTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATA 89479409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATA 2279

 89479410 TCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGATA 89479469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGATA 2339

 89479470 AAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACA 89479529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACA 2399

 89479530 CAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTCC 89479589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTCC 2459

 89479590 TTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAA 89479649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAA 2519

 89479650 TAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAAA 89479709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAAA 2579

 89479710 AATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTACCTTG 89479769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2580 AATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTACCTTG 2639

 89479770 CGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTC 89479829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTC 2699

 89479830 CAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGTC 89479889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGTC 2759

 89479890 AGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCAG 89479949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 AGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCAG 2819

 89479950 CTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCAT 89480009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCAT 2879

 89480010 CCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTGT 89480069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTGT 2939

 89480070 CAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCTC 89480129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCTC 2999

 89480130 CTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGTC 89480189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGTC 3059

 89480190 CCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCTG 89480249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCTG 3119

 89480250 CTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGGT 89480309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 CTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGGT 3179

 89480310 GAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGAG 89480369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGAG 3239

 89480370 CAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTTAG 89480429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 CAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTTAG 3299

 89480430 AGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTGTT 89480489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 AGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTGTT 3359

 89480490 ACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTCTC 89480549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 ACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTCTC 3419

 89480550 ACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATGGG 89480609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 ACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATGGG 3479

 89480610 CATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTTTG 89480669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 CATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTTTG 3539

 89480670 CAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAACTC 89480729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 CAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAACTC 3599

 89480730 ACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTAGG 89480789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 ACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTAGG 3659

 89480790 ATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATGTA 89480849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 ATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATGTA 3719

 89480850 CACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTAAA 89480909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 CACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTAAA 3779

 89480910 TGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTTAC 89480969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTTAC 3839

 89480970 CTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTTTT 89481029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 CTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTTTT 3899

 89481030 GGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCCAG 89481089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 GGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCCAG 3959

 89481090 AGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTACTT 89481149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 AGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTACTT 4019

 89481150 CAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCACA 89481209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 CAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCACA 4079

 89481210 ATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACATAA 89481269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 ATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACATAA 4139

 89481270 ATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACTGA 89481329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 ATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACTGA 4199

 89481330 GGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCACT 89481389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 GGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCACT 4259

 89481390 GCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCT 89481421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 GCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCT 4291

EXCISED REGION

 89481428 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAA 89481487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAA 4361

 89481488 CAAAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAAT 89481547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 CAAAGGACATACATGAAAAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAAT 4421

 89481548 TTTCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAG 89481607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 TTTCCTCTAATATGGGAACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAG 4481

 89481608 TACTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTG 89481667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 TACTAGAGGTCCTATCCAGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTG 4541

 89481668 GAAAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTA 89481727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 GAAAGGAAGATGTAAAATAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTA 4601

 89481728 AATATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAA 89481787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 AATATTACACAGAACTGTTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAA 4661

 89481788 ATTAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAA 89481847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 ATTAACATGCAGAAATCTGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAA 4721

 89481848 ATTTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAAT 89481907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 ATTTTGAAAGCAATCCCATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAAT 4781

 89481908 TGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGA 89481967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4782 TGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGA 4841

 89481968 TCACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAA 89482027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4842 TCACAAGGTCAGCAGATCGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAA 4901

 89482028 ACTACACACACACACACACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCA 89482087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4902 ACTACACACACACACACACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCA 4961

 89482088 GCTACTCGGGTGGCTGAGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 89482147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4962 GCTACTCGGGTGGCTGAGGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGA 5021

 89482148 GCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAAC 89482207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5022 GCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAAC 5081

 89482208 AAACAAAAAACCCAAAAAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACA 89482267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5082 AAACAAAAAACCCAAAAAACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACA 5141

 89482268 AAATTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACT 89482327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5142 AAATTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACT 5201

 89482328 GATCACTGTAGTCTTGACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTA 89482387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5202 GATCACTGTAGTCTTGACCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTA 5261

 89482388 GCTGAGACTACAGGCACGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATG 89482447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5262 GCTGAGACTACAGGCACGTGACACCAGGCCTGTCTAATTTTTGTATATTTTGTAGAGATG 5321

 89482448 GGGTTTCCCCGTGTTGTCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCC 89482507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5322 GGGTTTCCCCGTGTTGTCCAAGTTGGTCTCAAATTCTTGAGCTCAAGTGATCTGCTGGCC 5381

 89482508 TCAGCTTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTT 89482567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5382 TCAGCTTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGTGCTTGGCCAAACATTCTT 5441

 89482568 AAAAGAAATTAAGGAAGAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGA 89482627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5442 AAAAGAAATTAAGGAAGAGTTAAATAATTAGAAAGACATCCTGTAAAAGTGACATACAGA 5501

 89482628 TTCAATGCAATCCCTATCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATA 89482687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5502 TTCAATGCAATCCCTATCAAAATTCCAATGATTTTTTTATAAATAAAAACATCAAAAATA 5561

 89482688 TCCACACTAACTTTCATATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAA 89482747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5562 TCCACACTAACTTTCATATGAAATTTCAAGAGATCCCCAAATTGTCAAAATAATCTCAAA 5621

 89482748 AAGGAAGAAGAAAGTCAGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAG 89482807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5622 AAGGAAGAAGAAAGTCAGAGGCTCACAGTTTCTGAGTTCTGAAACTTACTACAAAATCAG 5681

 89482808 GATAATCAACACAGTTTGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAG 89482867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5682 GATAATCAACACAGTTTGGTATTGGCTTAAACACTGTTATCAACTAATGGAGTAAAGTAG 5741

 89482868 AGAGCCTAGAAATGAACTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAA 89482927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5742 AGAGCCTAGAAATGAACTCTCACATCTATAGTCAAAAAATTTTCAACATGGATGCTAAAA 5801

 89482928 TCATTCAACGCAGAAAGAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCA 89482987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5802 TCATTCAACGCAGAAAGAGGAGTCTCTACAACAAATGACATTGGGAAAACTGGATATTCA 5861

 89482988 CATGCTCACATGCCAAAAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACG 89483047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5862 CATGCTCACATGCCAAAAAAAAAAAAAAAGTTGGACTGTTAGCTTACACAATCCAAAACG 5921

 89483048 TAACTCAAAATGGATCAAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGA 89483107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5922 TAACTCAAAATGGATCAAAGAACTAACCATTAGAGCTAAAACTATAAAACTCATGGGAGA 5981

 89483108 AAACAAAGGGGAAAAACAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAAT 89483167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5982 AAACAAAGGGGAAAAACAGACAGTAAAAGGAAAAACAGATAACTTTGACTTCATCAAAAT 6041

 89483168 GAAAAACTTTTGTGCATCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATG 89483227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6042 GAAAAACTTTTGTGCATCAAATGACACTATCAACAGAATAAAAAGGCAACACATGGAATG 6101

 89483228 GAAGAAAACATTTGCTAAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGA 89483287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6102 GAAGAAAACATTTGCTAAACGTGTATCTGATAAGGAATTGATGTCTAGCAAATATAAAGA 6161

 89483288 ATTCCTACAATGCAACACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTC 89483347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6162 ATTCCTACAATGCAACACAAACAGATTAAAAAGTAAAGAAAGAACTTGAATAGACATTTC 6221

 89483348 TCTAAAGAATGGCCAATAAGCACCTGAAAAGATGCTCAA 89483386
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6222 TCTAAAGAATGGCCAATAAGCACCTGAAAAGATGCTCAA 6260

Alignment time is 8.08481 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    8593] =>      8593 nucs 'mol-32-34c9-078807_8593'

Score:        8501
Aligned:      8589        nucs
Identic:      8581 (100%) nucs =>      8569 (100%)        12 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89472872,89481448] EXCISED REGION [89485921,89485932]
 second seq =>  [       1,    8575] EXCISED REGION [    8581,    8592]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4472 nucs [89481449,89485920]
 second seq =>         5 nucs [8576,8580]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89481449,89481449] to [89485921,89485921]
 second seq =>         1 nucs [8575,8575] to [8580,8580]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [89481447,89481448] to [89485921,89485922]
 second seq =>         2 nucs [8574,8575] to [8581,8582]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 89472872 ACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTG 89472931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCTTCCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTG 60

 89472932 AGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGA 89472991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGATCCATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGA 120

 89472992 CCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGT 89473051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTTGTAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGT 180

 89473052 TGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAA 89473111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTTTCTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAA 240

 89473112 GATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAG 89473171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATTTTTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAG 300

 89473172 TGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACA 89473231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGTGGCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACA 360

 89473232 ATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAA 89473291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTACAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAA 420

 89473292 ACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAA 89473351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTTTTAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAA 480

 89473352 TTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGA 89473411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTAAAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGA 540

 89473412 TCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTT 89473471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTTAGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTT 600

 89473472 GTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCT 89473531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTATCTCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCT 660

 89473532 GTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAG 89473591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTCCTAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAG 720

 89473592 CTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCT 89473651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTATCTAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCT 780

 89473652 CTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTG 89473711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTACCCTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTG 840

 89473712 GGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTG 89473771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTTTTCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTG 900

 89473772 CTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGAC 89473831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTTTTTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGAC 960

 89473832 TTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTA 89473891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCAAATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTA 1020

 89473892 TTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTT 89473951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTATATACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTT 1080

 89473952 AGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGC 89474011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGATCAGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGC 1140

 89474012 AAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAAC 89474071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAGGAAATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAAC 1200

 89474072 ACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGA 89474131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACAAACTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGA 1260

 89474132 GGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGG 89474191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGGTTAGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGG 1320

 89474192 ATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAG 89474251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATAGAAAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAG 1380

 89474252 CTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTA 89474311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGTGTGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTA 1440

 89474312 ATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTT 89474371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATAGGGATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTT 1500

 89474372 ATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTG 89474431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGATGCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTG 1560

 89474432 ACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACA 89474491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACACCCTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACA 1620

 89474492 GACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGC 89474551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GACAGAAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGC 1680

 89474552 TCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAA 89474611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTGCCATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAA 1740

 89474612 GGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAA 89474671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGTGATGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAA 1800

 89474672 CTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTT 89474731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGGGCCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTT 1860

 89474732 CTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGA 89474791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTCTTTCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGA 1920

 89474792 AGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTG 89474851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGCCTGTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTG 1980

 89474852 GAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTG 89474911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAGTTATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTG 2040

 89474912 CATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGA 89474971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATATGCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGA 2100

 89474972 ACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATT 89475031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACTTAGGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATT 2160

 89475032 TGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCC 89475091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGAAAAGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCC 2220

 89475092 TTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTC 89475151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTTCTGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTC 2280

 89475152 AAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGG 89475211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGTATGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGG 2340

 89475212 AAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCT 89475271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAATGGCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCT 2400

 89475272 TCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGC 89475331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCCTCTTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGC 2460

 89475332 TCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAG 89475391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCCAAGCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAG 2520

 89475392 ATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTG 89475451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATACTGGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTG 2580

 89475452 GTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGT 89475511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTTCCATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGT 2640

 89475512 GATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGG 89475571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GATTCAGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGG 2700

 89475572 CAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGT 89475631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAGAGAGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGT 2760

 89475632 TTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCT 89475691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGAAACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCT 2820

 89475692 CTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGA 89475751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTTGGAACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGA 2880

 89475752 TAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTT 89475811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAATTGAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTT 2940

 89475812 TTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATC 89475871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATC 3000

 89475872 TTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGA 89475931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGA 3060

 89475932 GTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAG 89475991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTAGCTGGAATTACAGGCGCCTGCCACCACGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAG 3120

 89475992 ACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGC 89476051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCTGC 3180

 89476052 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACT 89476111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTAGTTAACT 3240

 89476112 AGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTT 89476171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGTATTTGAAAGACAGGGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCCAGAGTGCTGAGGTGCAATCTT 3300

 89476172 GGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGG 89476231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGCTCACTGAACCTCCCGGGCTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGG 3360

 89476232 ACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTC 89476291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ACTACAGGCATGTGCAACAGTGCCCAGCTAATTTTTATATTCTTACTAGAGACATGTTTC 3420

 89476292 ACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCC 89476351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTAAACTCCTGAGCTCAAGCAATCTGCCTGCCTCTGCCC 3480

 89476352 TCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATG 89476411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCAAAGTGTTAGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCACCCGCCGACTGCACTCTCTTTGATG 3540

 89476412 AGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAG 89476471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGCACCTGGGACATACCTGATATAACAGTCTCCCTCCCTGCATATGTTATTGAATGAAAG 3600

 89476472 CATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGT 89476531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CATGAATGTTATACAGACAAAAAAGCACATCTGTGTGCAGTGAAGCTTGGTCACTTTGGT 3660

 89476532 GTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTA 89476591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GTTCGTAGGAGGTAGGTCAGCAGGTTTCCATAATCGACAGATGAATCTTGGTTACCTGTA 3720

 89476592 TCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGA 89476651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCCCCTTCCTTGGTTCCTCATAGTACTTTTTCTCCAGGTCTTGTAGCTTCTGAATAAAGA 3780

 89476652 GACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGA 89476711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GACAATAGCCCCCTGGTTTCGAATAAATTCCCGCCTTCACTTCTTCTTCTAGAGGACTGA 3840

 89476712 AAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAA 89476771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AAATGACCTGAAGTAAAGCTGAGCAACGATCTGATGATGCTTCTTGATTCTGTTTACAAA 3900

 89476772 AGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTA 89476831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGTCATCCCGCTTTTTGTCTAGCTGGGCCTTTAATGTAAAAATAGGAAGTAAAAAGAGTA 3960

 89476832 ACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAG 89476891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACAGGGAAAGGATGTTAGCTTGACCTCAGAATTTTGGGAAAGACTTCCGAAAATAAACAG 4020

 89476892 TCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCC 89476951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TCAATGATGCCGGAGAAACTGACAGACTCCTCAGCAGGACCACGCTCTTACTCCTGACCC 4080

 89476952 CACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCT 89477011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CACTTTCTACTGAAATCGCTTTCTCTTTAGAGGTGAGGTTCAGGGCTGAGATTGACAGCT 4140

 89477012 TTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGG 89477071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTATGTCAACTGTTAGAGGAAAGCTCTGCTTTTGCATATTGGACTAATGATTTCATATGG 4200

 89477072 AATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCAT 89477131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AATAAATGTGGCTGAACAGAAGCCTGCTCAAGATAACTAAGATGAAAATTTTCTTTGCAT 4260

 89477132 TTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTG 89477191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTGGCTAGAATATCAAATCAGTCTGAGAAGAGTGGGCATGTAATTTGATTAGAAGCCCTG 4320

 89477192 ATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAA 89477251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ATTGTCAGTTATATGAATTTAATAAAGGGAAGACCATTTATTGATAAGCAATGTTTTTAA 4380

 89477252 ACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAG 89477311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ACTTTGAGTCTGAAGTAATAAAATTGTTTTTGTCTGATTATTATGATTACCAAGAACTAG 4440

 89477312 TTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTT 89477371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTGTCACCATTTTAAAATCTAGAATAATTATTTGTCTCAAAATAAATACCAATTTCATTT 4500

 89477372 CTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCG 89477431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CTTAGTAGTACTTTGCCTTCCAAAATCCAAATCCATGTAAATGTGATAGAAAAATTACCG 4560

 89477432 CTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAG 89477491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CTAATTTCTTTTGAAACAGATGGTCCACATCCTTGAAAGAGTTCTTCATATAGACTTCAG 4620

 89477492 TGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCA 89477551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TGGCCTCCCTCTCACTAACCCTGTGCAGGTCCAGCAGCTCCTGGAGGGTTTCTGCGGGCA 4680

 89477552 GCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTG 89477611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GCTGCACCTTCTGGCCCATCTGCTGGTCATAGTGGGCAATAGCCTTTTGCACTGCGGCTG 4740

 89477612 AGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGC 89477671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AGTTCTCTATCTGGGCCAAGGCCAGGACTGCGTTCTCCATGCAGGGCAGATCCCCTCTGC 4800

 89477672 TGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGA 89477731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TGATAGCATTGATATAGGTCAGCACTAGGCTCTCTAGACCTACATACAAAGAAGAAATGA 4860

 89477732 TAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTC 89477791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TAATGTTTCTTGTACTAAAGAAAACTCTCTATTCTGTGTAATTCTGAACATGTCAATTTC 4920

 89477792 CACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGC 89477851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CACCTATTTTCCTCACAGCATCAAGGTCCTCAGAATCATCTGGAAGCTTGCTGGAAATGC 4980

 89477852 CTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCC 89477911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CTATTGTTAGCCTCTGTCCCAGATCTACTGAATTAGAGTTTTTTCTTTGGGTAAGATCCC 5040

 89477912 TAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGT 89477971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TAGATGATATGTATGCATATCAACATTTGAGAATCCTTGTTCTAGATGACCTAGTCCTGT 5100

 89477972 GTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGC 89478031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GTTAGTTGAATGTTTGCATCCATTTCAACCCCAAGCACCATCAGGAAAGGAACCCATAGC 5160

 89478032 TATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGG 89478091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TATTCCATATATGACTGTATCCTCAGCTTATTCACAGTAGCATTTGATCAATACTTATGG 5220

 89478092 AACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCAT 89478151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AACAAATGATACTCTCCTAATCAAAAGGAGCCCTCCGTTTGGTTTATTTTAGCACAGCAT 5280

 89478152 TGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAG 89478211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TGTCCAAGAAAACTTTCTGTAATGGTGGAAGTGTTCTGTATGTGCTGTTCAGTATGCTAG 5340

 89478212 CCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATT 89478271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CCACTAAGTACATGTAAATATAAGCCTTTGAAATATAGCCATGTGAATTGACCTTTAATT 5400

 89478272 TTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTAC 89478331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TTTCCTTATTTTAATTAATTTACATTTACATTTAGATAGCCCCACTTGTCTAGTGGCTAC 5460

 89478332 TGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCC 89478391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TGTACTGTACAGTGCAGGCCCAGTTTACTGTGGCAATTTTAAGTAATAAAACTTTTTTCC 5520

 89478392 TTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTT 89478451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TTTGCTTTTCCTATCTTTTCCCACCAAGAAGGTTGACCAACAAAATCTATTAGAAATGTT 5580

 89478452 GGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATAC 89478511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 GGTGTCATCTAGAATTTAGCACAAATGTAGCAGTAGATTGGGATTTTTCAATGCTGATAC 5640

 89478512 TAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGA 89478571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TAGGTGGAGTTATTCTATGCTCCTTTCATATTTTTTTTTTCCTCTGTCACCCAGGCTGGA 5700

 89478572 GTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCC 89478631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCC 5760

 89478632 TGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTTATTTT 89478691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     5761 TGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCATTT-TTTT 5819

 89478692 TGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGC 89478751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 TGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAACTCCTGGC 5879

 89478752 CTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCA 89478811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 CTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCATCA 5939

 89478812 TGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACTTACGAGG 89478871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     5940 TGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACTTACGAGG 5999

 89478872 CCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGA 89478931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 CCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGATGTAGGA 6059

 89478932 ACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTAGTTTCTC 89478991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6060 ACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCCTCATCTTGTAGTTTCTC 6119

 89478992 AAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGG 89479051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 AAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTTTCTTTGG 6179

 89479052 GAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACC 89479111
          |||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 GAAGAACTTCCAGATACAGAGTTGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGACTGGTACC 6239

 89479112 TAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGT 89479171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     6240 TAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGCGTTTCCGTAAAGCGTCAAATAGT 6299

 89479172 AAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTG 89479231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 AAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTTGTTATTG 6359

 89479232 GAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAA 89479291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 GAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTCCCAAAAA 6419

 89479292 ACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGT 89479351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 ACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGGCTGCAGT 6479

 89479352 TCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATC 89479411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 TCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGTAAATATC 6539

 89479412 CATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAA 89479471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 CATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGGAGATAAA 6599

 89479472 ATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACA 89479531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 ATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTAGAACACA 6659

 89479532 GGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTCCTT 89479591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 GGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTCATTCCTT 6719

 89479592 TTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAATA 89479651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 TTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTTAAGAATA 6779

 89479652 GCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAAAAA 89479711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6780 GCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAACTAAAAAA 6839

 89479712 TGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTACCTTGCG 89479771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     6840 TGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTACCTTGCG 6899

 89479772 TTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTCCA 89479831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6900 TTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCTGCTTCCA 6959

 89479832 AGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGTCAG 89479891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6960 AGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACAAAGTCAG 7019

 89479892 CTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCAGCT 89479951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7020 CTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGTGTCAGCT 7079

 89479952 CTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCATCC 89480011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7080 CTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAACCTCATCC 7139

 89480012 CATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTGTCA 89480071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7140 CATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTAAGTGTCA 7199

 89480072 ATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCTCCT 89480131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7200 ATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTTTTCTCCT 7259

 89480132 TTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGTCCC 89480191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7260 TTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAGGTGTCCC 7319

 89480192 CTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCTGCT 89480251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7320 CTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATAGCCTGCT 7379

 89480252 GGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGGTGA 89480311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7380 GGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCCAGGGTGA 7439

 89480312 AGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGAGCA 89480371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7440 AGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTCAGGAGCA 7499

 89480372 AGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTTAGAG 89480431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7500 AGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAAGTTAGAG 7559

 89480432 TTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTGTTAC 89480491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7560 TTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGATTGTTAC 7619

 89480492 TCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTCTCAC 89480551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7620 TCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGATTCTCAC 7679

 89480552 CAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATGGGCA 89480611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7680 CAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTAATGGGCA 7739

 89480612 TTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTTTGCA 89480671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7740 TTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTTCTTTGCA 7799

 89480672 GGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAACTCAC 89480731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7800 GGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTTAACTCAC 7859

 89480732 ATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTAGGAT 89480791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7860 ATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTGCTAGGAT 7919

 89480792 TCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATGTACA 89480851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7920 TCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGACATGTACA 7979

 89480852 CAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTAAATG 89480911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7980 CAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAACTAAATG 8039

 89480912 GTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTTACCT 89480971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8040 GTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACCCTTACCT 8099

 89480972 TCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTTTTGG 89481031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8100 TCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGCTTTTTGG 8159

 89481032 GGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCCAGAG 89481091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8160 GGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAGCCCAGAG 8219

 89481092 AGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTACTTCA 89481151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8220 AGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGGTACTTCA 8279

 89481152 GGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCACAAT 89481211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8280 GGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAACCACAAT 8339

 89481212 CAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACATAAAT 89481271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8340 CAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTACATAAAT 8399

 89481272 GGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACTGAGG 89481331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8400 GGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAAACTGAGG 8459

 89481332 AAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCACTGC 89481391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8460 AAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCACCACTGC 8519

 89481392 ACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 89481448
          |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     8520 ACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCT-GTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8575

EXCISED REGION

 89485921 AAGAAAAAAAAA 89485932
          ||||||||||||
     8581 AAGAAAAAAAAA 8592

Alignment time is 10.9742 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,   11022] =>     11022 nucs 'mol-32-34d4-147676_11022'

Score:       10869
Aligned:     11027        nucs
Identic:     11011 (100%) nucs =>      7223 (100%)      3788 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89468677,89475908] EXCISED REGION [89478625,89482419]
 second seq =>  [       1,    7230] EXCISED REGION [    7231,   11022]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89468677 AGGTCTATTAGTAATTATTTTATAAATTTGGGAGCTCCAGTGTTAGGTGCATATATGTTT 89468736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGTCTATTAGTAATTATTTTATAAATTTGGGAGCTCCAGTGTTAGGTGCATATATGTTT 60

 89468737 AGGATTGTGATATTTTCCTGTTGGACAAGCCTTTTATCATTATATAATGTCCCTCTTTGT 89468796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGATTGTGATATTTTCCTGTTGGACAAGCCTTTTATCATTATATAATGTCCCTCTTTGT 120

 89468797 CTCTTTTAACCACTGTTGCTTTAAAGTTTGTTTTGTCTGATATAAGAATAGTTACCTCTG 89468856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCTTTTAACCACTGTTGCTTTAAAGTTTGTTTTGTCTGATATAAGAATAGTTACCTCTG 180

 89468857 GTCGCTTTTGGTGTCCATTTGCATGAAATGGCTTTTTCCACCCATTTACTTTAACTTTAT 89468916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCGCTTTTGGTGTCCATTTGCATGAAATGGCTTTTTCCACCCATTTACTTTAACTTTAT 240

 89468917 GTGAGTCCTTATGTGTTCGGTGAGTCTCCTGAAGACAGTGGATAGTTGATTGGTGAGTTC 89468976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGAGTCCTTATGTGTTCGGTGAGTCTCCTGAAGACAGTGGATAGTTGATTGGTGAGTTC 300

 89468977 TTATCTGTTCTGCAGTTCTGTATCTTTTAAGTGGAGCATTTAGGTGATTTACATTCAATG 89469036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATCTGTTCTGCAGTTCTGTATCTTTTAAGTGGAGCATTTAGGTGATTTACATTCAATG 360

 89469037 TTAGTATTGAAATGTGAGGTAATCCTTGCGTTCATCGTACTCTTTGTTGCCTGTGTACTT 89469096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAGTATTGAAATGTGAGGTAATCCTTGCGTTCATCGTACTCTTTGTTGCCTGTGTACTT 420

 89469097 TGTTATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTGCTTTTGCTTTTTACCTTGTATTTTTGTTTTGTAG 89469156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTTATTTTTTTGTTTTTGTTTTTTGCTTTTGCTTTTTACCTTGTATTTTTGTTTTGTAG 480

 89469157 GTCCTGTATGATTTATGCTTTAAAGAGGTTCTGTTTTGGTGTGTTTCCAGGCTTCGTTTC 89469216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTCCTGTATGATTTATGCTTTAAAGAGGTTCTGTTTTGGTGTGTTTCCAGGCTTCGTTTC 540

 89469217 AAGATTTAGACCTCCTTTTAGCAGTTCTTATAGTGGTGGCTTGGTAATGGTGAATTCTCT 89469276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGATTTAGACCTCCTTTTAGCAGTTCTTATAGTGGTGGCTTGGTAATGGTGAATTCTCT 600

 89469277 CAGCAATTTTGTCTGAAAATGACTGTTTCTTTCCTTTACGTTTGATGCTTAGTTTTGCTG 89469336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGCAATTTTGTCTGAAAATGACTGTTTCTTTCCTTTACGTTTGATGCTTAGTTTTGCTG 660

 89469337 GAAACAGAATTCTTGGCTGATAATTGTTTTGTTTGAAGAGGCTAAAGATAGGGCCGCATT 89469396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAACAGAATTCTTGGCTGATAATTGTTTTGTTTGAAGAGGCTAAAGATAGGGCCGCATT 720

 89469397 GCCTTCTGGCTTGTACGGTTTCTGCTGAGAAATCTGCTAGGTTAGTCTGATATGTTTTCC 89469456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCTTCTGGCTTGTACGGTTTCTGCTGAGAAATCTGCTAGGTTAGTCTGATATGTTTTCC 780

 89469457 TTTATAGGTTACCTGGTGCTTCTGTCTCACAGCTCTTAAGATTTTTTTCCTTCATCTTAA 89469516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTATAGGTTACCTGGTGCTTCTGTCTCACAGCTCTTAAGATTTTTTTCCTTCATCTTAA 840

 89469517 CTTTGGATAACCTGATGACAATGTGCCTAGGTGAAGATCTTTTTGTGATGAATTTCCCAG 89469576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTTGGATAACCTGATGACAATGTGCCTAGGTGAAGATCTTTTTGTGATGAATTTCCCAG 900

 89469577 GTATTCTTTGTGCTTCTTATATTTGCATGTGTAGGTCTCTAGCTAGGTTGGGGAAGTTTT 89469636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTATTCTTTGTGCTTCTTATATTTGCATGTGTAGGTCTCTAGCTAGGTTGGGGAAGTTTT 960

 89469637 CCTCAATTATTCCCCCAAATATGTTTTCCAAGCTTTTAGAATTCTCTTCTTCCCCAGGAA 89469696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTCAATTATTCCCCCAAATATGTTTTCCAAGCTTTTAGAATTCTCTTCTTCCCCAGGAA 1020

 89469697 CACCCATTATTCTTAGGTTTGGTCATTTAACATGATCCCAGACTTCTTGGAGGATTTGTT 89469756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACCCATTATTCTTAGGTTTGGTCATTTAACATGATCCCAGACTTCTTGGAGGATTTGTT 1080

 89469757 CATATTTTCGTATTCTTTTTTCTTTGTCTTTGTTGGATTGGGTTAATTCAAAGACCTTGT 89469816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATATTTTCGTATTCTTTTTTCTTTGTCTTTGTTGGATTGGGTTAATTCAAAGACCTTGT 1140

 89469817 CTTTGAGCTCTGAATTTCTTTCTTGTACTTGTTCAATTCTGTTGCTGAGACTTTCCAAAG 89469876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTTGAGCTCTGAATTTCTTTCTTGTACTTGTTCAATTCTGTTGCTGAGACTTTCCAAAG 1200

 89469877 CATTTTGCATTTCTAAAAGCGTGTCCAAAGTTTCCTGAATTGTGGATTGTTTTCCTTTAA 89469936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATTTTGCATTTCTAAAAGCGTGTCCAAAGTTTCCTGAATTGTGGATTGTTTTCCTTTAA 1260

 89469937 GCTGTCTATTTCATTGAATATTTATCCCTTCACTTCTTGTATCATTTTTTTGGATTTCCT 89469996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTGTCTATTTCATTGAATATTTATCCCTTCACTTCTTGTATCATTTTTTTGGATTTCCT 1320

 89469997 TGCATTGGGCTTCACCTTTCTCTGGTCCTTCCCTGATTAGCTTAGTAACTAACCTCCTGA 89470056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCATTGGGCTTCACCTTTCTCTGGTCCTTCCCTGATTAGCTTAGTAACTAACCTCCTGA 1380

 89470057 ATTCTTTTTCAGATAAATCGGGATTTCTTCTTGGTTTGGATCCATTGCTGGTGAACCAGG 89470116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTCTTTTTCAGATAAATCGGGATTTCTTCTTGGTTTGGATCCATTGCTGGTGAACCAGG 1440

 89470117 ATGATTTTTGGGGGGTGTTGAAGGGCCTTGTTTTGTCATATAACCAGAGTTGGTTTTCTG 89470176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGATTTTTGGGGGGTGTTGAAGGGCCTTGTTTTGTCATATAACCAGAGTTGGTTTTCTG 1500

 89470177 GTTCCTTCTCATTTGGGTAGGCTCTGTCAGAGAGAAGGTCTAAGGCTGAAGGCTGTTGTT 89470236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTCCTTCTCATTTGGGTAGGCTCTGTCAGAGAGAAGGTCTAAGGCTGAAGGCTGTTGTT 1560

 89470237 CAGATTCTTTTGTCCCATGGGGTGTTCCCCTGATGTAGTACTCTCCCCCTTTTCCTATGG 89470296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGATTCTTTTGTCCCATGGGGTGTTCCCCTGATGTAGTACTCTCCCCCTTTTCCTATGG 1620

 89470297 GTATGGCTTCCTGTGAGCCAAACTGCAGTGATTGTCGTCTCTCTTCTGAGTCTAGCCAGC 89470356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTATGGCTTCCTGTGAGCCAAACTGCAGTGATTGTCGTCTCTCTTCTGAGTCTAGCCAGC 1680

 89470357 CAGTGTGTCTGCCCAGCTCTGGGCTGGTATTGGGGGTTTTCTGTACAGAGTCCTGTGATG 89470416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGTGTGTCTGCCCAGCTCTGGGCTGGTATTGGGGGTTTTCTGTACAGAGTCCTGTGATG 1740

 89470417 TGGACCATCTATGGGTCTCTGAGCCATGGATACTAAGGGAAGAAAACACCCCTCATATTG 89470476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGACCATCTATGGGTCTCTGAGCCATGGATACTAAGGGAAGAAAACACCCCTCATATTG 1800

 89470477 TCTTATGCCCAATTTCTGCCTCCAAAGAAAGAAGAAGTAAAAATTAAAAGGCAGAAATGA 89470536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTTATGCCCAATTTCTGCCTCCAAAGAAAGAAGAAGTAAAAATTAAAAGGCAGAAATGA 1860

 89470537 AATCCACAAGCAGACAGTTCAGCGCCACACCCTGGGCCTGGTAATTAAAGATTGACCCCT 89470596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATCCACAAGCAGACAGTTCAGCGCCACACCCTGGGCCTGGTAATTAAAGATTGACCCCT 1920

 89470597 GACCTAATTGGTTATGCTATCTACAGATTACAGACATTGTATAGAAAAGCACTGTGAAAA 89470656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GACCTAATTGGTTATGCTATCTACAGATTACAGACATTGTATAGAAAAGCACTGTGAAAA 1980

 89470657 TCCCTGTCCTGTTCTGTTCCGTTCCGTTCTAATTACCAGTGCATGTAGCCCGCAGTCATG 89470716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCCCTGTCCTGTTCTGTTCCGTTCCGTTCTAATTACCAGTGCATGTAGCCCGCAGTCATG 2040

 89470717 TACCCCCTGCTTGCTCAATCAATCACGACCCTCTCACGTGGACCCCCTTAGAGTTGTGAG 89470776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TACCCCCTGCTTGCTCAATCAATCACGACCCTCTCACGTGGACCCCCTTAGAGTTGTGAG 2100

 89470777 CCCTTAAAAGGGACAGGAATTGCTCACTCAGGGAGCTCGGTTGTTGGAGACGTGAGTCTT 89470836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCCTTAAAAGGGACAGGAATTGCTCACTCAGGGAGCTCGGTTGTTGGAGACGTGAGTCTT 2160

 89470837 ACCAAAGCTCCTGGCTGAATAAAGCCCTTCCTTCTTTAACTCAGTGTCTGAGGGGTTTTG 89470896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACCAAAGCTCCTGGCTGAATAAAGCCCTTCCTTCTTTAACTCAGTGTCTGAGGGGTTTTG 2220

 89470897 TTGGTGGCTTGTCCTCCTACAATACCAGTGCCTGTTCCAGTGGAGGTGGTGGAGGGTGAA 89470956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTGGTGGCTTGTCCTCCTACAATACCAGTGCCTGTTCCAGTGGAGGTGGTGGAGGGTGAA 2280

 89470957 ATGGACTTCATGAGGGTCCTTGGTTTTGGTGGTTTAATGCTCTATTTTTGTGCTGGTTGG 89471016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATGGACTTCATGAGGGTCCTTGGTTTTGGTGGTTTAATGCTCTATTTTTGTGCTGGTTGG 2340

 89471017 CCTCCTGAAAGGAGGTGGCACTTTCCAGAAAGTATCAGTGGGAGAGGGACTGGTGGTGGG 89471076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCTCCTGAAAGGAGGTGGCACTTTCCAGAAAGTATCAGTGGGAGAGGGACTGGTGGTGGG 2400

 89471077 CAGGGTCCTAGAACTCCCAAGATTAAATGACCTTTGTCTTCAGCTACCAGGGTGGATGGA 89471136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGGGTCCTAGAACTCCCAAGATTAAATGACCTTTGTCTTCAGCTACCAGGGTGGATGGA 2460

 89471137 GAAGGACCATCAGGTCAGGGCGGGGCTAGGAGTGTCTGAGCTCAGACTCTCCATGGCTGG 89471196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAAGGACCATCAGGTCAGGGCGGGGCTAGGAGTGTCTGAGCTCAGACTCTCCATGGCTGG 2520

 89471197 ATCTTGCTATGGCTGCTGTGGGGGATGGGGGTGAGATTCCCAGGTCACTGGAGTTGTGTA 89471256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATCTTGCTATGGCTGCTGTGGGGGATGGGGGTGAGATTCCCAGGTCACTGGAGTTGTGTA 2580

 89471257 CCTAGGAGGATTATGGCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGTTGTCAGGGGAGTGGGAGAAG 89471316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCTAGGAGGATTATGGCTGCCTCTCCTGAGTCATGCAGGTTGTCAGGGGAGTGGGAGAAG 2640

 89471317 CTGGCAGTCACAGGCCTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGGAAGGCCGGTCTCACTCCCAC 89471376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTGGCAGTCACAGGCCTCACCCAGCTCCGATGCAAACTGGAAGGCCGGTCTCACTCCCAC 2700

 89471377 TGTGCCCTTCTCCCTGCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCAGGCAGAGGGCAAGAGGGGCG 89471436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGTGCCCTTCTCCCTGCCAACAGCTCTGAGTCTGTTTCCAGGCAGAGGGCAAGAGGGGCG 2760

 89471437 GGCTTAAAATTTGGCTGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAGAAAAGGACTTTAGTTCTTCA 89471496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGCTTAAAATTTGGCTGAGGCTTTCTGCTCAGCCAAAAAGAAAAGGACTTTAGTTCTTCA 2820

 89471497 CCAGCCTGTGAAGTTTGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCCGAGTTCTGGCAGGAGGCTTC 89471556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCAGCCTGTGAAGTTTGCATGCTGGATTTGTGCCCTCCCCGAGTTCTGGCAGGAGGCTTC 2880

 89471557 TCGCCCCATTCAAATTGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATTTCTTCTTTCTGTGGAGTTTT 89471616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCGCCCCATTCAAATTGTTACAAAGTTTGGTTGGAGAATTTCTTCTTTCTGTGGAGTTTT 2940

 89471617 ACCTGTTGCTCCTCTGGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGTGGTGCCAGGCAGGAATGGCC 89471676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACCTGTTGCTCCTCTGGCTGACCTCCCGATAGATCCCTGTGGTGCCAGGCAGGAATGGCC 3000

 89471677 TGCCTGGGGACACAGTGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGCTTCCTCTACCCCTGTATTTT 89471736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGCCTGGGGACACAGTGAGCTCCCAGGGCCTTCCAACTGCTTCCTCTACCCCTGTATTTT 3060

 89471737 GCTCGGCTCTCTAACTTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGGAAACTCCTCCTGCACACAAA 89471796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GCTCGGCTCTCTAACTTGACTCAGCTTCAGGTAAAGTCGGAAACTCCTCCTGCACACAAA 3120

 89471797 CCTTCAGCTTCTCCAGTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGAGGGTCTCCCTTTCCCACTTC 89471856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCTTCAGCTTCTCCAGTGGGGGTGTGTGTTCCAGAGAGGAGGGTCTCCCTTTCCCACTTC 3180

 89471857 TGCAGTTGGGGCAGTCAGAATATTTGGAGTGTTTCCTGGGTCCTGCAGGAGCAGTCTGCC 89471916
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3181 TGCAGTTGGGGCAGTCAGAATATTTGGAGTGTTTCTTGGGTCCTGCAGGAGCAGTCTGCC 3240

 89471917 TCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTGTAATATTTTGAAACACTACA 89471976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCCTTCAGAGGGTCTGTGGGTCCTCTTGGGATTCATCGTGTAATATTTTGAAACACTACA 3300

 89471977 TAATTATTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATCCTTATGATTCTTATAAATGTAAGT 89472036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TAATTATTTCAAGATTCTAACATATACAATCTAATCCTTATGATTCTTATAAATGTAAGT 3360

 89472037 AAAATAAGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAATGTTTCTATAAACAAAGGTCTGCAA 89472096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAAATAAGGCAGATATAAAATGAAACTTTGACCAATGTTTCTATAAACAAAGGTCTGCAA 3420

 89472097 ACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGTGTTATTGGCACATAGCCCCA 89472156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ACTATAGCTTGTGTGTGCCACCTGGTTTTGAAAATTAAGTGTTATTGGCACATAGCCCCA 3480

 89472157 CCCATTTACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTGTATGCAGAGTTTAGTAGTTG 89472216
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3481 CCCATTTACTTATGTATTGTCTATGGCTGCATTTGTACTATATGCAGAGTTTAGTAGTTG 3540

 89472217 AGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTATCTGGTATTTTACAGAAAAGTTAGC 89472276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGACAGTTGACCTGCAAAGCCATAAATAATCACTATCTGGTATTTTACAGAAAAGTTAGC 3600

 89472277 CAACCACTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTGGTGAAAAACTAAAAAAAAAAAAAT 89472336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CAACCACTGCTATAAAGACTCAAACCTTATTATTTGGTGAAAAACTAAAAAAAAAAAAAT 3660

 89472337 GGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTATTTCTAGTTCAAA 89472396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGAAATAAAAAAACTAGTGAAACTTATTTTATTTCTAGTTTAGTTTATTTCTAGTTCAAA 3720

 89472397 AATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTGACAATTGGG 89472456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AATAATCTGTAATTGCTGTAAGAAATGTCAACCACTTACCTAGGATGTTTGACAATTGGG 3780

 89472457 ATGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTC 89472516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ATGAAGTCTACATATACTAAGTAATGGCAAGACAATTATTTTATTGCTCAAAAGAAAGTC 3840

 89472517 AAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGA 89472576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AAAAAAATTCCATATTCCCTTTGGGGAAAATTGGCAGGATTTCAAGTATGACCTTTAAGA 3900

 89472577 ATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCA 89472636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ATCAGGAAAAGACTAACTTATGCTTTAGGATTAAAACAATCAAATAATTAAATTAGTTCA 3960

 89472637 ATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTA 89472696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ATTTTCTAACATAGTCTCTATCTTCAGTTAAAGTGCATCATTGCATGTTATACATTACTA 4020

 89472697 AAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAA 89472756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AAATTACACAGTGCATAATTGTTACCATGTGACTATTTAATTCAGGGTCAACTGTCTAAA 4080

 89472757 GGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTT 89472816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GGTCTCAGGTGTCACATTAAGGTTATAATCTAGATGAATTGAACAAGAAAGAAAAGATTT 4140

 89472817 CTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTT 89472876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CTTCATTAGCCAATTTGTTTATGATTCAATTCCTACTCTTGCTAATGATTTCTTTACCTT 4200

 89472877 CCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATC 89472936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CCTATGGAAAATATAAGATTCTAGATCTCTGTATAAGATGGTTTGCTTTAGCTTGAGATC 4260

 89472937 CATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTG 89472996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CATCAGTGAGAATTATCCATGGGCAATGTCCAGAAATCACATTATTGCTCATAGACCTTG 4320

 89472997 TAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTT 89473056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TAGCCTTGATATAATGGAGAACTGTACACTGTCTTCCCTAGGAAGCTAGGATGGTTGTTT 4380

 89473057 CTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTT 89473116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CTGATATTGGGACCCATTGTACACTTGGCCAAACCAGTGCCCAAATATGTCCCAAGATTT 4440

 89473117 TTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGTG 89473176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4441 TTACCTAAGACTTTCCTCAGTATCCACTGGTCGTCTGGAAGAATAAACTTCTGAGTGGCG 4500

 89473177 GCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTA 89473236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GCAACTCATGATCCCTCCTCTGTTGGTACAGAGGTAAATGCATCTTTGTTGCACAATTTA 4560

 89473237 CAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTT 89473296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CAATCTTTTTAAGGAAAAAACATGATTTTGATCATTGAACTGCATGTTCTTGTAAACTTT 4620

 89473297 TAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTA 89473356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TAGTGTTATGATGCAAGATCTAATTATTATCAAATATAGTGACACTTGTTCCAAATTCTA 4680

 89473357 AAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTT 89473416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AAATTGTTTCAGTTATGCCTTGGGTTAGGATGACAGAAAAGCTCTGTTGTTTAGATCTTT 4740

 89473417 AGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATC 89473476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AGCTTATGCGACATATATCTCTTGGTTTTTTTTTTCAGGGTCTTCTGTAGCTTTTGTATC 4800

 89473477 TCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCC 89473536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TCATTTTGAAGTTGGGTACTTTCACCTTGGCATCTCTCCTTTAGTACTCGGGCCTGTTCC 4860

 89473537 TAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATC 89473596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TAAAAAGGGACAAATGGAGGCTAAATAAGTGTAGCATTAAGTAAATCTCTGTAAGCTATC 4920

 89473597 TAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACC 89473656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TAGTTTCCACATGCATTGATTTATTTAGTACTTAGTTTTTTTCTTGAAATTTTCTCTACC 4980

 89473657 CTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTT 89473716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CTTGATTTTAATTATAGTTTTTCTGGGCATTTGGGCTGTGTGATTATTTCTCCTGGGTTT 5040

 89473717 TCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTT 89473776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TCTATAGCCAAAAGAGTTTCAGCGTATGCCTTCTGCTCTATTGATGAAGGTCTTGCTTTT 5100

 89473777 TTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAA 89473836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TTCCCCCTATTAATTATACAAAACCTTTGTGGGAAATCTTAACAATATATTTGACTTCAA 5160

 89473837 ATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATA 89473896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ATCTTCCCTATGCATTATAGACTTTTTAACACACCTACCTACACACATATTATTATTATA 5220

 89473897 TACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATC 89473956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TACACATAATACAGAGATAAGTTACTCTCAAAATCTGATTAGGTATATGAATCTTAGATC 5280

 89473957 AGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGA 89474016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AGGAAATTTGATCTAAGTCTCTACTCCCTGTTGGCAGGGGTAGCAGAAGATAGGCAAGGA 5340

 89474017 AATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAA 89474076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AATCCGAGTGCCAGACTTACCATATAGAATTTCTGCACATAGCTCCCAACTCAACACAAA 5400

 89474077 CTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTT 89474136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CTGTGAGTAGGGCACAGAAAACAGGCAGGAGTGGTAGACTGCCCTACAGGTGTGAGGGTT 5460

 89474137 AGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGA 89474196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AGGGAGTCCTTCTGCTCATAAAAGTTCTCTTAGAGCCAAAGTCATACTAGATGGGATAGA 5520

 89474197 AAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTG 89474256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AAAAATATTACTATGGATTCCACTAAGTGATGAAGATGGGTCAGATATTTACTAGCTGTG 5580

 89474257 TGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGG 89474316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TGACACTATAAAAGTTATTTAATATTTTCTGAACCTCTGTTTCCTCTCCTAAGTAATAGG 5640

 89474317 GATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGAT 89474376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GATAAAGTTCTCGCTTCATATGGTATTAAGCAAGAGATATAGATAAGGCATTTTTATGAT 5700

 89474377 GCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACC 89474436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GCCTAGCATATGACAGCCGTAAGTGGAAGGATACACTAAAACGGGACTGAATGTGACACC 5760

 89474437 CTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAG 89474496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CTGCAAATAAACTTTTAGTGACCACATGTAGGCAGTGGCCATTTCAAGTCAGACAGACAG 5820

 89474497 AAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGC 89474556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 AAACAAGAAAGTACAAGTGAGCAAGCAAAATCCTTCCCCTGGGCTTTATGTTCGCTCTGC 5880

 89474557 CATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGA 89474616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 CATACTAAGTTTGTGATCAGGAAGAACAGAGAGAAAACAGAAAAACGAACCACAAGGTGA 5940

 89474617 TGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGG 89474676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TGCATTTGGATACCTGAAGTTTACTAGTGAGGGTCTTCTCTTGCTCTTCCAGCAACTGGG 6000

 89474677 CCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTT 89474736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CCCTCTCCCTCTCCATCTTCTCAGTCAATTGTTTCACATGTTCTTGATAACTCTTCTCTT 6060

 89474737 TCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCT 89474796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TCTCTTCCATCATCTGCTGATACTTTATTTGCATTTCCTCCACCATTTTTGCTGAAGCCT 6120

 89474797 GTGCAGATTCAGCTTTTACACATTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTT 89474856
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 GTGCAGATTCAGCTTTTACACGTTCCACTGTGGAGGAAGAAGAAACATTTGTGTGGAGTT 6180

 89474857 ATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATAT 89474916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 ATCTTGTTGCCTCATTCTTAGTTATACACTTACCCTCCATTGTTGCTGCTGACTGCATAT 6240

 89474917 GCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTA 89474976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 GCCCTACTCAGAGATGACCTCAACAAGTAAGACATGTCTTGCTTTAGTTTATGGAACTTA 6300

 89474977 GGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAA 89475036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 GGTTTATCCAGTCAAATTATTTAAAATTTTAAAATTTGAAAAATTATTTAAAATTTGAAA 6360

 89475037 AGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTC 89475096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 AGCTTTAGGATAATCTGATCCTTTGACTTGCTCCTCACCTTCAATCTCCTTTTCCTTTTC 6420

 89475097 TGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCACAGACTCCTTGGATTTCAAGTA 89475156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6421 TGTGAGAATCTGGTCTGTCTGTAGAATTGCATCGGTCATAGACTCCTTGGATTTCAAGTA 6480

 89475157 TGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATG 89475216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 TGTCTGCAGAATCTCTTCAGCCTTAGGACCCAGAGAACACAGAGTGAGAAGTAGGAAATG 6540

 89475217 GCTGTAAGCAGGTTTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTC 89475276
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 GCTGTAAGCAGGTGTTCCTGTTCTTCTGCCCACCATCTTTTCTTCTGAGAATTCTTCCTC 6600

 89475277 TTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAA 89475336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 TTGGCCCTGGTGTGCCTGGTGGTCAAGATTCCCTATCACAGGGCCAGATACATGCTCCAA 6660

 89475337 GCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACT 89475396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 GCTGGCCAATCAGATGACCCTACTTAGCAGAGTCTTATTTAGGAGGATGATACAGATACT 6720

 89475397 GGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCC 89475456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 GGGAAATAAGATTCCCTGTCCTTTTCAAATTGAGGGCTCTAAATTTGATGCTGTGGTTCC 6780

 89475457 ATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTC 89475516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 ATATGGGCTGAGCTGACTGGAGAATGAAGCCCTCCTTGAGAGAGCAAATCAGAGTGATTC 6840

 89475517 AGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAG 89475576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 AGATAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGAGAACTGTGGGGATGCAGGGAGGATATCAGGCAGAG 6900

 89475577 AGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAA 89475636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 AGACAGATCATGACATTATTTGAAATCTTGGATCCAGATGTCCTTTAAATCCAGTTTGAA 6960

 89475637 ACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGG 89475696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 ACCTAAAACGATGAATTACCATTTTTTTTAAGCAACCATCATTGGGTTTCTGTCTCTTGG 7020

 89475697 AACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATT 89475756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 AACAGAAAAAAATCCAGCTGTAATGATCATGACAACAACGTGGTGGTTAATCTGATAATT 7080

 89475757 GAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTT 89475816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 GAATTTATAACTCAATAGTTAATTGACTGCACTCTCTAATTAATTAACTAATTTTTTTTT 7140

 89475817 TTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTATTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGC 89475876
          |||||  ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 TTTTT--GAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGC 7198

 89475877 ACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 89475908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     7199 ACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTG 7230

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7231 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 7290

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7291 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 7350

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7351 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 7410

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     7411 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 7470

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7471 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 7530

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7531 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 7590

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7591 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 7650

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7651 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 7710

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7711 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 7770

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7771 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 7830

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7831 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 7890

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7891 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 7950

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7951 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 8010

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8011 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 8070

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8071 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 8130

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8131 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 8190

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8191 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 8250

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8251 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 8310

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     8311 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 8370

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8371 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 8430

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8431 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 8490

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8491 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 8550

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8551 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 8610

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8611 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 8670

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8671 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 8730

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8731 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 8790

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8791 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 8850

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8851 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 8910

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8911 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 8970

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8971 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 9030

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9031 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 9090

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9091 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 9150

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9151 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 9210

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9211 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 9270

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9271 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 9330

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9331 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 9390

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9391 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 9450

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9451 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 9510

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9511 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 9570

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9571 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 9630

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9631 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 9690

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9691 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 9750

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9751 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 9810

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9811 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 9870

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9871 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 9930

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9931 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 9990

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 89481444
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||
     9991 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-TGTCTT--AAAAAAAAAAAAAAA 10047

 89481445 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 89481504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10048 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 10107

 89481505 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 89481564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10108 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 10167

 89481565 ACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 89481624
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10168 ACAAGGAAAAGATGCCCATTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 10227

 89481625 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 89481684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10228 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 10287

 89481685 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 89481744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10288 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 10347

 89481745 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 89481804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10348 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 10407

 89481805 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 89481864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10408 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 10467

 89481865 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 89481924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10468 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 10527

 89481925 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 89481984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10528 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 10587

 89481985 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 89482044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10588 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 10647

 89482045 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 89482104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10648 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 10707

 89482105 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACT 89482164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10708 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACT 10767

 89482165 GCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAA 89482224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10768 GCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAA 10827

 89482225 AACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGG 89482284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10828 AACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGG 10887

 89482285 AGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGA 89482344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10888 AGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGA 10947

 89482345 CCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCAC 89482404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10948 CCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCAC 11007

 89482405 GTGACACCAGGCCTG 89482419
          |||||||||||||||
    11008 GTGACACCAGGCCTG 11022

Alignment time is 14.3331 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [89465908,89488624] =>     22717 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3855] =>      3855 nucs 'mol-32-34d4-147676_3855'

Score:        3790
Aligned:      3858        nucs
Identic:      3851 (100%) nucs =>        63 (100%)      3788 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [89475846,89475908] EXCISED REGION [89478625,89482419]
 second seq =>  [       1,      63] EXCISED REGION [      64,    3855]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2716 nucs [89475909,89478624]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [89475909,89475928] to [89478625,89478644]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [89475909,89475909] to [89478624,89478624]
 second seq =>         0 nucs

 89475846 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 89475905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCACACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAA 60

 89475906 GTG 89475908
          |||
       61 GTG 63

EXCISED REGION

 89478625 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 89478684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       64 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTATGTGCCACCATGCCTCAT 123

 89478685 TTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 89478744
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 TTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACATGGTTTTGCCATGTGGGCTAGGTTGGTCTCAAAC 183

 89478745 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 89478804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      184 TCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 243

 89478805 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTACGAAGGGGACT 89478864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      244 ACCATCATGCCTGGCCATCCTTTAGTTTTAACAATGAGTGGAAGTACTAGGAAGGGGACT 303

 89478865 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 89478924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 TACGAGGCCCATTGACCTTGATGCCTCCTGAAAGAGTTTTAGTTTTGGAATTGCTAAAGA 363

 89478925 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 89478984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 TGTAGGAACAGAAGTCTGCTACTTGTTGCACAAATTCAGGGTCCAGCTCTTCATCTTGTA 423

 89478985 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 89479044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 GTTTCTCAAGCTGGGCAAGCTTCCTGCGGTGAATGGGCAGATCGAAGACAAAACATTTTT 483

 89479045 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 89479104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 TCTTTGGGAAGAACTTCCGGATACAGAGTCGGGGCAGATTAAAATTTTTATCTTTTTGAC 543

 89479105 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 89479164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 TGGTACCTAGAGAAACATAATAAAGAAATTTGCCTAATATAAGTGTTTCCGTAAAGCGTC 603

 89479165 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 89479224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 AAATAGTAAATATTTTAGGCTCTGCAGGCTAGGTGGTCTCTTTTCCAAGTACTCAACTTT 663

 89479225 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 89479284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 GTTATTGGAGCATGACAACAGCTTTAGACAATATGTAAATGAATGGGCATAGCATTCTTC 723

 89479285 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 89479344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 CCAAAAAACCTCACTTAGAAAGACAGCTGGCAGGCAGAATTGGCCATCATTTGTCTTAGG 783

 89479345 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 89479404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 CTGCAGTTCGCCAGCATTTGGACTAGTACACTGTTCATGTTCAATCTATGTTCTTTAAGT 843

 89479405 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 89479464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 AAATATCCATTGTCCTTCATATTTTACAGGTAAATACAGAATCACGAACCCTACATAAGG 903

 89479465 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 89479524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 AGATAAAATTTACCTAAATTGTAAAATAGGAAAAAATGAAAGAAAAAGAAACTTATTTTA 963

 89479525 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 89479584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 GAACACAGGAGAATATAATTTAAAATCTAATCTATTAATTTAGATATTCAGCAAGCATTC 1023

 89479585 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 89479644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 ATTCCTTTTTTCCTTTTTTCAAAAAACCTTTTCTATTGCTAATAGCAAGCATTAATTCTT 1083

 89479645 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 89479704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 AAGAATAGCAAGCTAGAGATATAGAAAACTGTAAATGTGAGAAAACTATCAATAGTAAAC 1143

 89479705 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCTCTGTTA 89479764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1144 TAAAAAATGATAATTTCTAGTGTTTTGTCGTCCTCATTTATCAATGGTACGTCCCTGTTA 1203

 89479765 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 89479824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 CCTTGCGTTAGCTTCAGGGAATACTCCAGGTACTCATCTGGTGTGAGGGGTTGTCCATCT 1263

 89479825 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 89479884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 GCTTCCAAGTCCAGGGAGAAATCTCTCAGTGTCCACACAAAATCTGGGAAGAAGCTCACA 1323

 89479885 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 89479944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 AAGTCAGCTGAATCCTCATTCTCATTCTCATCAGGTGAGGATTTTGATCGGATTCGATGT 1383

 89479945 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 89480004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 GTCAGCTCTGTCACATAGCTGAGTAGCTAACTAAGGAAATGTGACAAAATGAACAGGAAC 1443

 89480005 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 89480064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 CTCATCCCATATTAGTTCAACACATTCCCAAACCTTCCATTTTCCTTTGATCCTAACCTA 1503

 89480065 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 89480124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 AGTGTCAATTCTAAAGTGGATACATGGGATCTCTCCTCTGTACTTGCATTATTTTTTGTT 1563

 89480125 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 89480184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 TTCTCCTTTTGAGCTTGATTCATCAGGATTCACAGTCAGGCAGCTGGTTTATGAATACAG 1623

 89480185 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 89480244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 GTGTCCCCTCTGACCTTGGTGCTGTTCTGGGTCACAAAAGGATACTACAGTTGGTCCATA 1683

 89480245 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 89480304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 GCCTGCTGGTTGATGGTTCCCATGCTATTGTACACGAGAGTGCTGCTCAGGAGGACGGCC 1743

 89480305 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 89480364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 AGGGTGAAGATCCAGGAGTCATTCTGGTTGTCACCCTGGAAGTCAAGACACACTGGAGTC 1803

 89480365 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 89480424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 AGGAGCAAGTTTCATCATCACAGCACTTTCCAGAGTGACAGTAGTAAAAGTATATCATAA 1863

 89480425 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 89480484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 GTTAGAGTTTTCTTTTAAGACTAATGACCTATGAAAAGAACCCAAATCCAAACAAAATGA 1923

 89480485 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 89480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TTGTTACTCAGCTGTGGAATGTGTATAGTTTTTTGATTAGTGTTTTTTGGTATACACTGA 1983

 89480545 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 89480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTCTCACCAGGTCCTCTTATGATCATTGGCAGACAATTGCAAAATAAACATTCAAGGTTA 2043

 89480605 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 89480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 ATGGGCATTCTAAGGCCTGAAGTATAATTTAAACTTGCTCAGGCTACTGAATTATAAGTT 2103

 89480665 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 89480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CTTTGCAGGATAGGACTCGTGACATTGGATTTATTTGTGCTCCCTTTATGCATCTGTGTT 2163

 89480725 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 89480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 AACTCACATAGCTTACAACCTATGGTTAGTAGAATACTGTGTGTTGACCACCATGCTTTG 2223

 89480785 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 89480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 CTAGGATTCTGTCTTATGAATATTTTTCTCACTTCTGGTTGCTAAGTTTGGCCTTATGAC 2283

 89480845 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 89480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 ATGTACACAGAAATGAAAAGACAAATTATAGTTAAATGCAAACTCTTCTTTAAGAAAAAA 2343

 89480905 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 89480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CTAAATGGTGCTTAAAATATTCAGAGATGAGGGGCTTATTTCAAAATTGAATCTTTGACC 2403

 89480965 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 89481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CTTACCTTCTTTACATCTCCCAGGCCCTCAGTGTCAAGCAGGACTAAGGTGTGTTCTGGC 2463

 89481025 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 89481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TTTTTGGGGTGAGGCACACACCACATCCAGATTCCTTTGGTGTGAGATTTCACTGTGGAG 2523

 89481085 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 89481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 CCCAGAGAGAAGCCTGTAAAGGAGAGATGGGATAAGAAGGGCTGGAGGTTTAATAGCAGG 2583

 89481145 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 89481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 TACTTCAGGAAATTGAGGCAAATGTAGCATCATGATTAATGTTAAGAGAGATAACCAAAA 2643

 89481205 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 89481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 CCACAATCAGTACTTACGTTACTTATAATCAGAAAAATAGAAAAATTTGAATATCCAGTA 2703

 89481265 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 89481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 CATAAATGGATTCAGGACCTTTCATGATAAAAACAATCAACAAATTAGAAATAGAAAAAA 2763

 89481325 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 89481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 ACTGAGGAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATAGCA 2823

 89481385 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTTGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 89481444
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||
     2824 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTC-TGTCTT--AAAAAAAAAAAAAAA 2880

 89481445 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 89481504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAAAAGAGGGATAGAGAAACAGAAAAAAATTACCTCAACAAAACAAAGGACATACATGAA 2940

 89481505 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 89481564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAATCCACAGCCTGCTTCATACTCAATGGTGAAGACTGAAAATTTTCCTCTAATATGGGA 3000

 89481565 ACAAGGAAAAGATGCCCACTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 89481624
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACAAGGAAAAGATGCCCATTTTTGCCACTTCTTTTCCACAAAGTACTAGAGGTCCTATCC 3060

 89481625 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 89481684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGAGTAATTAGGTGAGAAAAGGAAACAGAAAGCATCTAAATTGGAAAGGAAGATGTAAAA 3120

 89481685 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 89481744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TAATCTCTATTTACTGATGATATGATCTCTGCAGAAAACTTTAAATATTACACAGAACTG 3180

 89481745 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 89481804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTAGAACTAATAAAAAGAATTCAGCAAAGTTGCAGCATACAAAATTAACATGCAGAAATC 3240

 89481805 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 89481864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGTTGCATTTGTATACAGTAGCAAAGAACAATCCACAAAGGAAATTTTGAAAGCAATCCC 3300

 89481865 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 89481924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATTTAACATACCACCAAAAGGGCAAACTACTTCAGAATAAAATTGGCCAGGCACAGTGGC 3360

 89481925 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 89481984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGATCACAAGGTCAGCAGAT 3420

 89481985 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 89482044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CGAGACCATCTGGCCAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAACTACACACACACACAC 3480

 89482045 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 89482104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ACACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGTGGCTGA 3540

 89482105 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACT 89482164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GGCATGAGAATTGCCTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACT 3600

 89482165 GCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAA 89482224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GCACTCCAGGCTGGTGACACAGCAAGACTGTCACAAAACAAACAAACAAAAAACCCAAAA 3660

 89482225 AACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGG 89482284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AACGTAACCATAGAGGGGAATGACTTGTATAATGAAAATTACAAAATTTTTTTTTTTTGG 3720

 89482285 AGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGA 89482344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AGACAGAGTCTCACGGTGTCATCCAGGCTAGACTGTGATCACTGATCACTGTAGTCTTGA 3780

 89482345 CCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCAC 89482404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CCTCCCAGGCTCAAGCAATACTCCCACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGAGACTACAGGCAC 3840

 89482405 GTGACACCAGGCCTG 89482419
          |||||||||||||||
     3841 GTGACACCAGGCCTG 3855

Alignment time is 4.95666 s

