
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [53584097,53604948] =>     20852 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3752] =>      3752 nucs 'mol-32-1eea-056787_3752'

Score:        3663
Aligned:      3751        nucs
Identic:      3743 (100%) nucs =>       174 (100%)      3569 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [53594684,53594857] EXCISED REGION [53594858,53598433]
 second seq =>  [       1,     174] EXCISED REGION [     176,    3752]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [175,175]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [53595174,53595174]
 second seq =>         1 nucs [492,492]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        11 nucs [175,185] to [176,186]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 53594684 CTACTAAGAATTCAAAAATTTGCTGGTCATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTT 53594743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTACTAAGAATTCAAAAATTTGCTGGTCATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTT 60

 53594744 GGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCTGAGA 53594803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCTGAGA 120

 53594804 TCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTATGTCTCAAAAAAG 53594857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTATGTCTCAAAAAAG 174

EXCISED REGION

 53594858 AAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAACATGGGACATCCATAACGTACCAGGAGCCATGCTGG 53594917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      176 AAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAACATGGGACATCCATAACGTACCAGGAGCCATGCTGG 235

 53594918 GTCTTCACGTACATTCTCTTACTTACTTTTCGTAATAACCTCGTGAAGGAGGTATTCTTC 53594977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      236 GTCTTCACGTACATTCTCTTACTTACTTTTCGTAATAACCTCGTGAAGGAGGTATTCTTC 295

 53594978 CCACTTTATAGATAAGGACACTGAGGCTCAGATGCTAAAAGGCTTGTTTACATTTGCACA 53595037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      296 CCACTTTATAGATAAGGACACTGAGGCTCAGATGCTAAAAGGCTTGTTTACATTTGCACA 355

 53595038 TCTAGAGGGTGACTCCAAAGCCCTGTTCCTGCCCTGTAGCCTTTGCAGATTTCAACCACC 53595097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      356 TCTAGAGGGTGACTCCAAAGCCCTGTTCCTGCCCTGTAGCCTTTGCAGATTTCAACCACC 415

 53595098 CCCGCCCATGCTTCCTGCTCCCCCGCCACATTGTGACAGATGAAGCCACCACTGGTCAAG 53595157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      416 CCCGCCCATGCTTCCTGCTCCCCCGCCACATTGTGACAGATGAAGCCACCACTGGTCAAG 475

 53595158 CGTGGGCTGCACTCAGTTGGACTGAAGCACACATGTCTGAGGAGGGACTTGGGCCAGGGG 53595217
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      476 CGTGGGCTGCACTCAGCTGGACTGAAGCACACATGTCTGAGGAGGGACTTGGGCCAGGGG 535

 53595218 CTGGGTTGGAGAAATTCTAGAAAAAAAAGAGCCCACAGCTGGAAGATGCCAGATTATGGG 53595277
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      536 CTGGGTTGGAGAAATTCTAGAAAAAAAAGAGCCCACATCTGGAAGATGCCAGATTATGGG 595

 53595278 AAGAGTGACTGAACTCAGCTCCAACCCCGCTGGCCCCACTGCCCTCCCACTGGGCCTCCT 53595337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 AAGAGTGACTGAACTCAGCTCCAACCCCGCTGGCCCCACTGCCCTCCCACTGGGCCTCCT 655

 53595338 TTCTCCAGAGCAAGGTGTGCCTGTGACCCCTCCATGGCAGCCCAGGGGCCTTTCAGCCCT 53595397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 TTCTCCAGAGCAAGGTGTGCCTGTGACCCCTCCATGGCAGCCCAGGGGCCTTTCAGCCCT 715

 53595398 CACGTCCACCCTTGCAGTCACCCACACTTCTTTACACCTCACCACCTCCCTTTGCTTGTT 53595457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 CACGTCCACCCTTGCAGTCACCCACACTTCTTTACACCTCACCACCTCCCTTTGCTTGTT 775

 53595458 GTTTAGATCTCCAACTTCTGAACGAATCTGTCACGCTGAGTACCAGGCAGAGGTCAGTGT 53595517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 GTTTAGATCTCCAACTTCTGAACGAATCTGTCACGCTGAGTACCAGGCAGAGGTCAGTGT 835

 53595518 GAAAGACAAGGGGGTCAATGACCTGATCCCCTCCTGGGATCTCAGAAAAAAACAAAGATG 53595577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 GAAAGACAAGGGGGTCAATGACCTGATCCCCTCCTGGGATCTCAGAAAAAAACAAAGATG 895

 53595578 CACACGACCCTGCCCACGGAGGGGGCCATGCCGCTGGCCCGACCCCTTGACAGTGGCTTT 53595637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 CACACGACCCTGCCCACGGAGGGGGCCATGCCGCTGGCCCGACCCCTTGACAGTGGCTTT 955

 53595638 CTTGTTCAGTGAGATGAGTGGCTCTTCCGAATAGGGATACTAGTTGGTTTGCTCACATAG 53595697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 CTTGTTCAGTGAGATGAGTGGCTCTTCCGAATAGGGATACTAGTTGGTTTGCTCACATAG 1015

 53595698 ATGTCACTACTGGACTAAAAGATGCCTGTCCCCCATTGTGTGGCATGCCAGCTGCGACCG 53595757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 ATGTCACTACTGGACTAAAAGATGCCTGTCCCCCATTGTGTGGCATGCCAGCTGCGACCG 1075

 53595758 TGAGGTCACTGAGCTAACGACACTCAGCTCATGCAGGTCACACACAGCGTCAGCATTGGA 53595817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 TGAGGTCACTGAGCTAACGACACTCAGCTCATGCAGGTCACACACAGCGTCAGCATTGGA 1135

 53595818 GACAGATCATCATCCATTTTACCAACAAATGGGGAGGTGGAAGGACTTCCCACACAGAAC 53595877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 GACAGATCATCATCCATTTTACCAACAAATGGGGAGGTGGAAGGACTTCCCACACAGAAC 1195

 53595878 CTTGAGCTAGGTCTTGAATACAGAGTGAGACTTTAAATTAAAAGAATTAAAAGAGGGCGT 53595937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 CTTGAGCTAGGTCTTGAATACAGAGTGAGACTTTAAATTAAAAGAATTAAAAGAGGGCGT 1255

 53595938 GCATGGCAGGGGCTGGGCAGGAGCAGGAGTGTGGAGATAGACCCTTGTGGCATGCTGTGG 53595997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 GCATGGCAGGGGCTGGGCAGGAGCAGGAGTGTGGAGATAGACCCTTGTGGCATGCTGTGG 1315

 53595998 GACTAGTGGGTGACCAGCCTGGTTCCAGGGCTTGGCATGGGGAAAGGGTGGCTGTTTGTC 53596057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 GACTAGTGGGTGACCAGCCTGGTTCCAGGGCTTGGCATGGGGAAAGGGTGGCTGTTTGTC 1375

 53596058 CTGGAGAGGAGGTGGGAACAGATGTCATGGGAGCCAGGCTTCGAGGCCCAGACCTGCAGA 53596117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 CTGGAGAGGAGGTGGGAACAGATGTCATGGGAGCCAGGCTTCGAGGCCCAGACCTGCAGA 1435

 53596118 TGGTTGGAACTGGAAGCTGGTGAGCCCAAATGTAACCCCCTGCCCCCATCCCCCCACTCC 53596177
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TGGTTGGAACTGGAAGCTGGTGAGCCCAAAGGTAACCCCCTGCCCCCATCCCCCCACTCC 1495

 53596178 CCCGCTACTGCCCTGTAGCCAGGACACACTGCAGAAAACCCTTGCCTTCCTGGGTCACAG 53596237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 CCCGCTACTGCCCTGTAGCCAGGACACACTGCAGAAAACCCTTGCCTTCCTGGGTCACAG 1555

 53596238 CTTGGAGCCCCTGGGGATGGGAGCACCACAGCCTCCTGCTGGGCTCCTAAGCTGTGGAGC 53596297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 CTTGGAGCCCCTGGGGATGGGAGCACCACAGCCTCCTGCTGGGCTCCTAAGCTGTGGAGC 1615

 53596298 CAGAAGGTCTGACCCCAGGACAATCAAGAGATTTAAAATCCTCAGAATACTTTCGGAGCT 53596357
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1616 CAGAAGGTCTGACCCCAGGACAATCAAGAGGTTTAAAATCCTCAGAATACTTTCGGAGCT 1675

 53596358 CTGAAAGCAAACCTCTGCTTGGACCCTTTGGGGTTCTAGCTCAGTCAGCTCAGGGTCAGG 53596417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 CTGAAAGCAAACCTCTGCTTGGACCCTTTGGGGTTCTAGCTCAGTCAGCTCAGGGTCAGG 1735

 53596418 CCTGACATCTGAATTTTTCAAAGCAGCTCTGGTGATTTTGCTCTGCCCTGAGTAACAACC 53596477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 CCTGACATCTGAATTTTTCAAAGCAGCTCTGGTGATTTTGCTCTGCCCTGAGTAACAACC 1795

 53596478 TCACACCAGAGTGGCTGTTCCTCAAAGGCAGGGACACCCAGCCCTGGGCTGGCCAGGAGC 53596537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 TCACACCAGAGTGGCTGTTCCTCAAAGGCAGGGACACCCAGCCCTGGGCTGGCCAGGAGC 1855

 53596538 AAGAGCTCAGGGGACAGTGTGGATGGACTCCTGGCCAGGATGGATAATAGGCCAGTTTGA 53596597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 AAGAGCTCAGGGGACAGTGTGGATGGACTCCTGGCCAGGATGGATAATAGGCCAGTTTGA 1915

 53596598 GGCCAAAGGAGGGAGAGTTCAGGAACGAGGGGTTTTAGGACTCAGAAATGCGTCATATCT 53596657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 GGCCAAAGGAGGGAGAGTTCAGGAACGAGGGGTTTTAGGACTCAGAAATGCGTCATATCT 1975

 53596658 CCCCCCTGAAGGTTTAATTTTCCCTTCATAGGAAAATGTTAAAGCGGTTCCATTTCTTAG 53596717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 CCCCCCTGAAGGTTTAATTTTCCCTTCATAGGAAAATGTTAAAGCGGTTCCATTTCTTAG 2035

 53596718 TGACACGGTTGCTCTGCACCAGTCCAAACTCTATAATAAACAAATGAAATGTATGAACAC 53596777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 TGACACGGTTGCTCTGCACCAGTCCAAACTCTATAATAAACAAATGAAATGTATGAACAC 2095

 53596778 GTCCTGGCTTTTCTCAACTTAATATCACATGCATTTCCAGCCAAGAGAACACTGAGTCTG 53596837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 GTCCTGGCTTTTCTCAACTTAATATCACATGCATTTCCAGCCAAGAGAACACTGAGTCTG 2155

 53596838 GTGGAGGGAGACCAGGCATTTGAGAGCCAGAAGGTGGAGAGCTGGACGGGCCTTCGTTGC 53596897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 GTGGAGGGAGACCAGGCATTTGAGAGCCAGAAGGTGGAGAGCTGGACGGGCCTTCGTTGC 2215

 53596898 TGGGTAAAGAAGCCCAGGGTTGGGGGCCTCACCTCAGATCACATGATCGCTTGTGGTGGA 53596957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 TGGGTAAAGAAGCCCAGGGTTGGGGGCCTCACCTCAGATCACATGATCGCTTGTGGTGGA 2275

 53596958 GGCAGGTCGAGGACCCTGGCCTCTGACTTCTGAACAGGATTTTTTTGTTTTGAGTGACTT 53597017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 GGCAGGTCGAGGACCCTGGCCTCTGACTTCTGAACAGGATTTTTTTGTTTTGAGTGACTT 2335

 53597018 GTCCAAGGCCACACAGCTAATACATAGCAAGGCCAGGCTGTGTGACACCAGGGTCCATAC 53597077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 GTCCAAGGCCACACAGCTAATACATAGCAAGGCCAGGCTGTGTGACACCAGGGTCCATAC 2395

 53597078 AATGGCCTCTAAGGTGCCTCTGTTCTGAGAGAGGGGCAATGCCCAGGCAGTTAGGACAGT 53597137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 AATGGCCTCTAAGGTGCCTCTGTTCTGAGAGAGGGGCAATGCCCAGGCAGTTAGGACAGT 2455

 53597138 CAGCAGGAAAGGGCAGACAGAACTGCCTGCCAAGGGTCCTGGCTTCCTCCACCAGTGCAC 53597197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 CAGCAGGAAAGGGCAGACAGAACTGCCTGCCAAGGGTCCTGGCTTCCTCCACCAGTGCAC 2515

 53597198 TTATTTAGCTGTTCTGTGATTGTCTATTTTCCTGTCAGTCTCCCCAGCAGTCTGTGAACA 53597257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 TTATTTAGCTGTTCTGTGATTGTCTATTTTCCTGTCAGTCTCCCCAGCAGTCTGTGAACA 2575

 53597258 CCACAGGACAGTCTCTCCATCATCTCTGTGTCTGCAGCACCCAGCACAGGGCCAAGTGTC 53597317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 CCACAGGACAGTCTCTCCATCATCTCTGTGTCTGCAGCACCCAGCACAGGGCCAAGTGTC 2635

 53597318 CAGAAAGCACAATGCATGATTGCAGGATCCATTAATTAATTCACTTGACCAGTATTAATG 53597377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 CAGAAAGCACAATGCATGATTGCAGGATCCATTAATTAATTCACTTGACCAGTATTAATG 2695

 53597378 AGCACCTACTATGTGCCTGGCACTTGGCTAGGTGCTGACAACACAGAGTTGAATCTAGGC 53597437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 AGCACCTACTATGTGCCTGGCACTTGGCTAGGTGCTGACAACACAGAGTTGAATCTAGGC 2755

 53597438 AGAGTAGCCTCGTTAACTTTGCAAAGCTTACAGCCCAGTGGATAAAGAAACCAGTTAACA 53597497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 AGAGTAGCCTCGTTAACTTTGCAAAGCTTACAGCCCAGTGGATAAAGAAACCAGTTAACA 2815

 53597498 AGTGAATGCATATAGAATGACAACATATGATATGTGCTGTGGCCGGGAGGGAACAGGGTA 53597557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 AGTGAATGCATATAGAATGACAACATATGATATGTGCTGTGGCCGGGAGGGAACAGGGTA 2875

 53597558 CAGTAAGGGAGAGCCAGGGTGGCATGAAGGGGTTGGTGGGGAGGGCCTTCCTAAGAAGAT 53597617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 CAGTAAGGGAGAGCCAGGGTGGCATGAAGGGGTTGGTGGGGAGGGCCTTCCTAAGAAGAT 2935

 53597618 GATGTGCAAGTTGAGATGGAAAAAAAGAGGAAGAAGAAGAGATGTAAGATGTTGGGGAAG 53597677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 GATGTGCAAGTTGAGATGGAAAAAAAGAGGAAGAAGAAGAGATGTAAGATGTTGGGGAAG 2995

 53597678 CATGTTCCAGAGGAAGGAACAGCACGTGTGGAGGCCCTGAGATGGTAAGGGCTTGGTCTG 53597737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 CATGTTCCAGAGGAAGGAACAGCACGTGTGGAGGCCCTGAGATGGTAAGGGCTTGGTCTG 3055

 53597738 CTTAGGGAACTTGAGGCTGGTGGGACTGGAGTATGTGACATGGGATGAGGTGGGGTGGGC 53597797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 CTTAGGGAACTTGAGGCTGGTGGGACTGGAGTATGTGACATGGGATGAGGTGGGGTGGGC 3115

 53597798 GAGGCAGATCATGCAGGGCCTCCTAGACCAGGTTAATGGTCTGCAGGTTGATTCTACATG 53597857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3116 GAGGCAGATCATGCAGGGCCTCCTAGACCAGGTTAACGGTCTGCAGGTTGATTCTACATG 3175

 53597858 TCATGGAAGCTGTTGAAGGTAAATGAGGGGCAGGGCCCAATCTGCTTTTCTCAAGATCCT 53597917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 TCATGGAAGCTGTTGAAGGTAAATGAGGGGCAGGGCCCAATCTGCTTTTCTCAAGATCCT 3235

 53597918 TCTGGCCACTGGGTGGAATAGATGGGACGGGGACAAGAAGTGAGGCGAGGAGACCAGTGA 53597977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 TCTGGCCACTGGGTGGAATAGATGGGACGGGGACAAGAAGTGAGGCGAGGAGACCAGTGA 3295

 53597978 GGTGGCGGTGGAGTCTGGACGTGAGAAGAGAGTGCCCGGGCCTGTAGGGTTGGGAGGAAG 53598037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3296 GGTGGCGGTGGAGTCTGGACGTGAGAAGAGAGTGCCCGGGCCTGTAGGGTGGGGAGGAAG 3355

 53598038 CTCCATTCTTCGACTGAGTAGGCAGAATCCACTGGAACTGTGGATGGGGCTGTGGGGTTG 53598097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 CTCCATTCTTCGACTGAGTAGGCAGAATCCACTGGAACTGTGGATGGGGCTGTGGGGTTG 3415

 53598098 AGAGAAAGAGGATAGCCAATGACAGGCCCGATGGAAGACCTGGGTGATGGAGCTGCCATT 53598157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 AGAGAAAGAGGATAGCCAATGACAGGCCCGATGGAAGACCTGGGTGATGGAGCTGCCATT 3475

 53598158 TGCAGACAAGAAGAAAACAGGAAAAGGAGGCAGTTTTCTGGGTGGAACTTCAAGTTGGTG 53598217
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 TGCGGACAAGAAGAAAACAGGAAAAGGAGGCAGTTTTCTGGGTGGAACTTCAAGTTGGTG 3535

 53598218 ACATTAAACTTGAAGTGTGGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTATAATTCCCGCACTTTGG 53598277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 ACATTAAACTTGAAGTGTGGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTATAATTCCCGCACTTTGG 3595

 53598278 GAGGCTGAGGCAGGTGGATTGCTGGAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGG 53598337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 GAGGCTGAGGCAGGTGGATTGCTGGAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGG 3655

 53598338 TGAGACCCCGCCTCTACAAAAAATACAAAAAATAATTAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTG 53598397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 TGAGACCCCGCCTCTACAAAAAATACAAAAAATAATTAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTG 3715

 53598398 GTCCCAGCTACTT-GGGGGGCTGAGGTAGGAGGATCA 53598433
          ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     3716 GTCCCAGCTACTTGGGGGGGCTGAGGTAGGAGGATCA 3752

Alignment time is 2.8182 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [53584097,53604948] =>     20852 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    8106] =>      8106 nucs 'mol-32-1eea-090913_8106'

Score:        7897
Aligned:      8106        nucs
Identic:      8087 (100%) nucs =>       169 (100%)      7918 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [53592848,53593016] EXCISED REGION [53593018,53600951]
 second seq =>  [       1,     169] EXCISED REGION [     171,    8106]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [53593017,53593017]
 second seq =>         1 nucs [170,170]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [53600637,53600637]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [53593016,53593016] to [53593017,53593017]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 53592848 ACTTTCCCTGAACTCTGCTGCCGCTGCCCTCTGCTGCTTCTTATTCATTGAAAATGTATT 53592907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTTTCCCTGAACTCTGCTGCCGCTGCCCTCTGCTGCTTCTTATTCATTGAAAATGTATT 60

 53592908 GATCAGGCACAGGCAGTAGCAGGCCCTGTATGGGGCAGTGAGAAATCAGATGAAAGGGGG 53592967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATCAGGCACAGGCAGTAGCAGGCCCTGTATGGGGCAGTGAGAAATCAGATGAAAGGGGG 120

 53592968 AGAGTTATATTCTTCAGAATTATTTTTACAGTAAGGGAGCAGTCCTTAT 53593016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAGTTATATTCTTCAGAATTATTTTTACAGTAAGGGAGCAGTCCTTAT 169

EXCISED REGION

 53593018 CAGAAGAAAGTTCTTGATGAACTACTTGGACAGAAGCTGAGCAGTGGCTCCACTCAACCC 53593077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      171 CAGAAGAAAGTTCTTGATGAACTACTTGGACAGAAGCTGAGCAGTGGCTCCACTCAACCC 230

 53593078 AAGCCGGCTCCAGGGAGAGAGGTGAGCAGAAGTGACTTCTGAAAGACATCCAGCTGCTCT 53593137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      231 AAGCCGGCTCCAGGGAGAGAGGTGAGCAGAAGTGACTTCTGAAAGACATCCAGCTGCTCT 290

 53593138 GGGGACAGAGGAAGAGAGAAGGAAGGTTCCAGGAGAGAGAAGGAGGTGGACAGGCCCTCA 53593197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      291 GGGGACAGAGGAAGAGAGAAGGAAGGTTCCAGGAGAGAGAAGGAGGTGGACAGGCCCTCA 350

 53593198 GGCCACCCCGATGACCCAAGCCCTGGTATATCCTCCTCCCGCAGTGTGGCAGTGCCTGTG 53593257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      351 GGCCACCCCGATGACCCAAGCCCTGGTATATCCTCCTCCCGCAGTGTGGCAGTGCCTGTG 410

 53593258 ACTTCTATGAGAACACAACAAGGTGGTGGGATGTCTCCCTGTGGTTATGTGGTAGAAGAC 53593317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      411 ACTTCTATGAGAACACAACAAGGTGGTGGGATGTCTCCCTGTGGTTATGTGGTAGAAGAC 470

 53593318 TTTGACTCAGAAGACTGGTGAGGACCGGGCTTCCTGCTGGCCTTGATGACCTACAGTGCT 53593377
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      471 TTTGACTCAGAAGACTGGTGAGAACCGGGCTTCCTGCTGGCCTTGATGACCTACAGTGCT 530

 53593378 ATGCTGTGAGCTGCCTGTGGAGACAGCTGGGTGGGGAGCTGCAGGCAGCCTCTAGAACCT 53593437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      531 ATGCTGTGAGCTGCCTGTGGAGACAGCTGGGTGGGGAGCTGCAGGCAGCCTCTAGAACCT 590

 53593438 GAGTGGCTCCACTGCACAGCTGTCAATGCTGGGCCCTCAGGCAGCAGCCATGGGGAATCA 53593497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      591 GAGTGGCTCCACTGCACAGCTGTCAATGCTGGGCCCTCAGGCAGCAGCCATGGGGAATCA 650

 53593498 CTTCTGTCCATGCCTGAGGGAGCATGGAGGCGGATTCTCCCTGGTTGGGCCTCCGGATGA 53593557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      651 CTTCTGTCCATGCCTGAGGGAGCATGGAGGCGGATTCTCCCTGGTTGGGCCTCCGGATGA 710

 53593558 GAACAGAGCCCAGCGGACACCTGGATTGCAGCCTAAGACTCTGAGCAGAGGACTCAGCCA 53593617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      711 GAACAGAGCCCAGCGGACACCTGGATTGCAGCCTAAGACTCTGAGCAGAGGACTCAGCCA 770

 53593618 AGCCCGCCCAGACTGCTGGCCCAGGGACTGAGGCAACCATGAAGTGTGTTTATGTCACTA 53593677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      771 AGCCCGCCCAGACTGCTGGCCCAGGGACTGAGGCAACCATGAAGTGTGTTTATGTCACTA 830

 53593678 AGTTTGTGATAATTTGTTACACGGCAATGATAACGAATACACACAGACACACACACAGAG 53593737
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      831 AGTTTGTGATAATTTGTTACACGGCAGTGATAACGAATACACACAGACACACACACAGAG 890

 53593738 AACCAGGAGATAACTGAAGGCACTACTTGAAGCAAGGAATGCTGGTGTGAATGGGAAGCT 53593797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      891 AACCAGGAGATAACTGAAGGCACTACTTGAAGCAAGGAATGCTGGTGTGAATGGGAAGCT 950

 53593798 GATGAAGGCTGCTTGGTTGTAGGAGTGAAGGGCATAGAAAAGCAAGAGGCAGTAAGAATA 53593857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      951 GATGAAGGCTGCTTGGTTGTAGGAGTGAAGGGCATAGAAAAGCAAGAGGCAGTAAGAATA 1010

 53593858 GGAATTGGGCAGGGTGCGGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGC 53593917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 GGAATTGGGCAGGGTGCGGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGC 1070

 53593918 AGGAGGATGCCTCGAGCCCAGGAATTCAAGGCCAGCCTTGGCAACATAGTGAGAGCCCCA 53593977
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 AGGAGGATGCCTTGAGCCCAGGAATTCAAGGCCAGCCTTGGCAACATAGTGAGAGCCCCA 1130

 53593978 TGTCTACCCAAAATTTAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCT 53594037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 TGTCTACCCAAAATTTAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCT 1190

 53594038 AATTGGGAGGCTAAGTCGGGAGGATCGATTGAGCCCTGGAGTTGAAAGTTACAGTGAGCT 53594097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 AATTGGGAGGCTAAGTCGGGAGGATCGATTGAGCCCTGGAGTTGAAAGTTACAGTGAGCT 1250

 53594098 GTGGTCATGCCACTGCACTCCAGCCTGAGGGACAGAGTAAGACCCTGTCTCAATTAAAAA 53594157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 GTGGTCATGCCACTGCACTCCAGCCTGAGGGACAGAGTAAGACCCTGTCTCAATTAAAAA 1310

 53594158 CAAAAAAGAATAGGAATTCATGACAGATAAGGAGGCTCTGACTGTCATGGCGCAAGGAAT 53594217
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1311 CAAAAAAGAATAGGAATTCATGACAGATAAGGAAGCTCTGACTGTCATGGCGCAAGGAAT 1370

 53594218 GGCTCTGGGTGCCAGGTGAGTGCATCATGGAGAAGTGGGCAGGACCTGGCCAGGGCCCCT 53594277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 GGCTCTGGGTGCCAGGTGAGTGCATCATGGAGAAGTGGGCAGGACCTGGCCAGGGCCCCT 1430

 53594278 GCGGAGGCCCTGTGGATGTGCAGGTGTGCACGACTCAGGTGAAGCAGGGCATGCTGCATG 53594337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 GCGGAGGCCCTGTGGATGTGCAGGTGTGCACGACTCAGGTGAAGCAGGGCATGCTGCATG 1490

 53594338 GTCTGTACCAGTGTTGAGGGAGCACCCGGGTGTGCCTCAGTCAAGGGTGGCTTTCCAGGG 53594397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 GTCTGTACCAGTGTTGAGGGAGCACCCGGGTGTGCCTCAGTCAAGGGTGGCTTTCCAGGG 1550

 53594398 CAGGGGACAGGTGAGCTGCAGGTGCTAATTAGAACCATGAAGATGGAAGAAGCCATCCAA 53594457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1551 CAGGGGACAGGTGAGCTGCAGGTGCTAATTAGAACCATGAAGATGGAAGAGGCCATCCAA 1610

 53594458 GGGGCTTCCTGCTGAGAGCAGTGACAGAGGTGGCCACGGGCTGGGGGAGCATTCATGACA 53594517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 GGGGCTTCCTGCTGAGAGCAGTGACAGAGGTGGCCACGGGCTGGGGGAGCATTCATGACA 1670

 53594518 CATCTGAGGAGCCTGGTGATGCTTTAATAAGTTAGAAAAACATGGGACATCTGCCAGGCA 53594577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 CATCTGAGGAGCCTGGTGATGCTTTAATAAGTTAGAAAAACATGGGACATCTGCCAGGCA 1730

 53594578 TGGTGGCTCACGCATGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACCTGAG 53594637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 TGGTGGCTCACGCATGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACCTGAG 1790

 53594638 GTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAGAATTCA 53594697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 GTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAGAATTCA 1850

 53594698 AAAATTTGCTGGTCATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCA 53594757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 AAAATTTGCTGGTCATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCA 1910

 53594758 GGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCAC 53594817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 GGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGATTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCAC 1970

 53594818 TCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTATGTCTCAAAAAAG-AAAAAAAAAAAGAAAAAAG 53594876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     1971 TCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTATGTCTCAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGAAAAAAG 2030

 53594877 AAAAACATGGGACATCCATAACGTACCAGGAGCCATGCTGGGTCTTCACGTACATTCTCT 53594936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 AAAAACATGGGACATCCATAACGTACCAGGAGCCATGCTGGGTCTTCACGTACATTCTCT 2090

 53594937 TACTTACTTTTCGTAATAACCTCGTGAAGGAGGTATTCTTCCCACTTTATAGATAAGGAC 53594996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 TACTTACTTTTCGTAATAACCTCGTGAAGGAGGTATTCTTCCCACTTTATAGATAAGGAC 2150

 53594997 ACTGAGGCTCAGATGCTAAAAGGCTTGTTTACATTTGCACATCTAGAGGGTGACTCCAAA 53595056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 ACTGAGGCTCAGATGCTAAAAGGCTTGTTTACATTTGCACATCTAGAGGGTGACTCCAAA 2210

 53595057 GCCCTGTTCCTGCCCTGTAGCCTTTGCAGATTTCAACCACCCCCGCCCATGCTTCCTGCT 53595116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 GCCCTGTTCCTGCCCTGTAGCCTTTGCAGATTTCAACCACCCCCGCCCATGCTTCCTGCT 2270

 53595117 CCCCCGCCACATTGTGACAGATGAAGCCACCACTGGTCAAGCGTGGGCTGCACTCAGTTG 53595176
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2271 CCCCCGCCACATTGTGACAGATGAAGCCACCACTGGTCAAGCGTGGGCTGCACTCAGCTG 2330

 53595177 GACTGAAGCACACATGTCTGAGGAGGGACTTGGGCCAGGGGCTGGGTTGGAGAAATTCTA 53595236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 GACTGAAGCACACATGTCTGAGGAGGGACTTGGGCCAGGGGCTGGGTTGGAGAAATTCTA 2390

 53595237 GAAAAAAAAGAGCCCACAGCTGGAAGATGCCAGATTATGGGAAGAGTGACTGAACTCAGC 53595296
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 GAAAAAAAAGAGCCCACATCTGGAAGATGCCAGATTATGGGAAGAGTGACTGAACTCAGC 2450

 53595297 TCCAACCCCGCTGGCCCCACTGCCCTCCCACTGGGCCTCCTTTCTCCAGAGCAAGGTGTG 53595356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 TCCAACCCCGCTGGCCCCACTGCCCTCCCACTGGGCCTCCTTTCTCCAGAGCAAGGTGTG 2510

 53595357 CCTGTGACCCCTCCATGGCAGCCCAGGGGCCTTTCAGCCCTCACGTCCACCCTTGCAGTC 53595416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 CCTGTGACCCCTCCATGGCAGCCCAGGGGCCTTTCAGCCCTCACGTCCACCCTTGCAGTC 2570

 53595417 ACCCACACTTCTTTACACCTCACCACCTCCCTTTGCTTGTTGTTTAGATCTCCAACTTCT 53595476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 ACCCACACTTCTTTACACCTCACCACCTCCCTTTGCTTGTTGTTTAGATCTCCAACTTCT 2630

 53595477 GAACGAATCTGTCACGCTGAGTACCAGGCAGAGGTCAGTGTGAAAGACAAGGGGGTCAAT 53595536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 GAACGAATCTGTCACGCTGAGTACCAGGCAGAGGTCAGTGTGAAAGACAAGGGGGTCAAT 2690

 53595537 GACCTGATCCCCTCCTGGGATCTCAGAAAAAAACAAAGATGCACACGACCCTGCCCACGG 53595596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 GACCTGATCCCCTCCTGGGATCTCAGAAAAAAACAAAGATGCACACGACCCTGCCCACGG 2750

 53595597 AGGGGGCCATGCCGCTGGCCCGACCCCTTGACAGTGGCTTTCTTGTTCAGTGAGATGAGT 53595656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 AGGGGGCCATGCCGCTGGCCCGACCCCTTGACAGTGGCTTTCTTGTTCAGTGAGATGAGT 2810

 53595657 GGCTCTTCCGAATAGGGATACTAGTTGGTTTGCTCACATAGATGTCACTACTGGACTAAA 53595716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 GGCTCTTCCGAATAGGGATACTAGTTGGTTTGCTCACATAGATGTCACTACTGGACTAAA 2870

 53595717 AGATGCCTGTCCCCCATTGTGTGGCATGCCAGCTGCGACCGTGAGGTCACTGAGCTAACG 53595776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 AGATGCCTGTCCCCCATTGTGTGGCATGCCAGCTGCGACCGTGAGGTCACTGAGCTAACG 2930

 53595777 ACACTCAGCTCATGCAGGTCACACACAGCGTCAGCATTGGAGACAGATCATCATCCATTT 53595836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 ACACTCAGCTCATGCAGGTCACACACAGCGTCAGCATTGGAGACAGATCATCATCCATTT 2990

 53595837 TACCAACAAATGGGGAGGTGGAAGGACTTCCCACACAGAACCTTGAGCTAGGTCTTGAAT 53595896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 TACCAACAAATGGGGAGGTGGAAGGACTTCCCACACAGAACCTTGAGCTAGGTCTTGAAT 3050

 53595897 ACAGAGTGAGACTTTAAATTAAAAGAATTAAAAGAGGGCGTGCATGGCAGGGGCTGGGCA 53595956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 ACAGAGTGAGACTTTAAATTAAAAGAATTAAAAGAGGGCGTGCATGGCAGGGGCTGGGCA 3110

 53595957 GGAGCAGGAGTGTGGAGATAGACCCTTGTGGCATGCTGTGGGACTAGTGGGTGACCAGCC 53596016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 GGAGCAGGAGTGTGGAGATAGACCCTTGTGGCATGCTGTGGGACTAGTGGGTGACCAGCC 3170

 53596017 TGGTTCCAGGGCTTGGCATGGGGAAAGGGTGGCTGTTTGTCCTGGAGAGGAGGTGGGAAC 53596076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 TGGTTCCAGGGCTTGGCATGGGGAAAGGGTGGCTGTTTGTCCTGGAGAGGAGGTGGGAAC 3230

 53596077 AGATGTCATGGGAGCCAGGCTTCGAGGCCCAGACCTGCAGATGGTTGGAACTGGAAGCTG 53596136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 AGATGTCATGGGAGCCAGGCTTCGAGGCCCAGACCTGCAGATGGTTGGAACTGGAAGCTG 3290

 53596137 GTGAGCCCAAATGTAACCCCCTGCCCCCATCCCCCCACTCCCCCGCTACTGCCCTGTAGC 53596196
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 GTGAGCCCAAAGGTAACCCCCTGCCCCCATCCCCCCACTCCCCCGCTACTGCCCTGTAGC 3350

 53596197 CAGGACACACTGCAGAAAACCCTTGCCTTCCTGGGTCACAGCTTGGAGCCCCTGGGGATG 53596256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 CAGGACACACTGCAGAAAACCCTTGCCTTCCTGGGTCACAGCTTGGAGCCCCTGGGGATG 3410

 53596257 GGAGCACCACAGCCTCCTGCTGGGCTCCTAAGCTGTGGAGCCAGAAGGTCTGACCCCAGG 53596316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 GGAGCACCACAGCCTCCTGCTGGGCTCCTAAGCTGTGGAGCCAGAAGGTCTGACCCCAGG 3470

 53596317 ACAATCAAGAGATTTAAAATCCTCAGAATACTTTCGGAGCTCTGAAAGCAAACCTCTGCT 53596376
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 ACAATCAAGAGGTTTAAAATCCTCAGAATACTTTCGGAGCTCTGAAAGCAAACCTCTGCT 3530

 53596377 TGGACCCTTTGGGGTTCTAGCTCAGTCAGCTCAGGGTCAGGCCTGACATCTGAATTTTTC 53596436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 TGGACCCTTTGGGGTTCTAGCTCAGTCAGCTCAGGGTCAGGCCTGACATCTGAATTTTTC 3590

 53596437 AAAGCAGCTCTGGTGATTTTGCTCTGCCCTGAGTAACAACCTCACACCAGAGTGGCTGTT 53596496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 AAAGCAGCTCTGGTGATTTTGCTCTGCCCTGAGTAACAACCTCACACCAGAGTGGCTGTT 3650

 53596497 CCTCAAAGGCAGGGACACCCAGCCCTGGGCTGGCCAGGAGCAAGAGCTCAGGGGACAGTG 53596556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 CCTCAAAGGCAGGGACACCCAGCCCTGGGCTGGCCAGGAGCAAGAGCTCAGGGGACAGTG 3710

 53596557 TGGATGGACTCCTGGCCAGGATGGATAATAGGCCAGTTTGAGGCCAAAGGAGGGAGAGTT 53596616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 TGGATGGACTCCTGGCCAGGATGGATAATAGGCCAGTTTGAGGCCAAAGGAGGGAGAGTT 3770

 53596617 CAGGAACGAGGGGTTTTAGGACTCAGAAATGCGTCATATCTCCCCCCTGAAGGTTTAATT 53596676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 CAGGAACGAGGGGTTTTAGGACTCAGAAATGCGTCATATCTCCCCCCTGAAGGTTTAATT 3830

 53596677 TTCCCTTCATAGGAAAATGTTAAAGCGGTTCCATTTCTTAGTGACACGGTTGCTCTGCAC 53596736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 TTCCCTTCATAGGAAAATGTTAAAGCGGTTCCATTTCTTAGTGACACGGTTGCTCTGCAC 3890

 53596737 CAGTCCAAACTCTATAATAAACAAATGAAATGTATGAACACGTCCTGGCTTTTCTCAACT 53596796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 CAGTCCAAACTCTATAATAAACAAATGAAATGTATGAACACGTCCTGGCTTTTCTCAACT 3950

 53596797 TAATATCACATGCATTTCCAGCCAAGAGAACACTGAGTCTGGTGGAGGGAGACCAGGCAT 53596856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 TAATATCACATGCATTTCCAGCCAAGAGAACACTGAGTCTGGTGGAGGGAGACCAGGCAT 4010

 53596857 TTGAGAGCCAGAAGGTGGAGAGCTGGACGGGCCTTCGTTGCTGGGTAAAGAAGCCCAGGG 53596916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 TTGAGAGCCAGAAGGTGGAGAGCTGGACGGGCCTTCGTTGCTGGGTAAAGAAGCCCAGGG 4070

 53596917 TTGGGGGCCTCACCTCAGATCACATGATCGCTTGTGGTGGAGGCAGGTCGAGGACCCTGG 53596976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 TTGGGGGCCTCACCTCAGATCACATGATCGCTTGTGGTGGAGGCAGGTCGAGGACCCTGG 4130

 53596977 CCTCTGACTTCTGAACAGGATTTTTTTGTTTTGAGTGACTTGTCCAAGGCCACACAGCTA 53597036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 CCTCTGACTTCTGAACAGGATTTTTTTGTTTTGAGTGACTTGTCCAAGGCCACACAGCTA 4190

 53597037 ATACATAGCAAGGCCAGGCTGTGTGACACCAGGGTCCATACAATGGCCTCTAAGGTGCCT 53597096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 ATACATAGCAAGGCCAGGCTGTGTGACACCAGGGTCCATACAATGGCCTCTAAGGTGCCT 4250

 53597097 CTGTTCTGAGAGAGGGGCAATGCCCAGGCAGTTAGGACAGTCAGCAGGAAAGGGCAGACA 53597156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 CTGTTCTGAGAGAGGGGCAATGCCCAGGCAGTTAGGACAGTCAGCAGGAAAGGGCAGACA 4310

 53597157 GAACTGCCTGCCAAGGGTCCTGGCTTCCTCCACCAGTGCACTTATTTAGCTGTTCTGTGA 53597216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 GAACTGCCTGCCAAGGGTCCTGGCTTCCTCCACCAGTGCACTTATTTAGCTGTTCTGTGA 4370

 53597217 TTGTCTATTTTCCTGTCAGTCTCCCCAGCAGTCTGTGAACACCACAGGACAGTCTCTCCA 53597276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 TTGTCTATTTTCCTGTCAGTCTCCCCAGCAGTCTGTGAACACCACAGGACAGTCTCTCCA 4430

 53597277 TCATCTCTGTGTCTGCAGCACCCAGCACAGGGCCAAGTGTCCAGAAAGCACAATGCATGA 53597336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 TCATCTCTGTGTCTGCAGCACCCAGCACAGGGCCAAGTGTCCAGAAAGCACAATGCATGA 4490

 53597337 TTGCAGGATCCATTAATTAATTCACTTGACCAGTATTAATGAGCACCTACTATGTGCCTG 53597396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 TTGCAGGATCCATTAATTAATTCACTTGACCAGTATTAATGAGCACCTACTATGTGCCTG 4550

 53597397 GCACTTGGCTAGGTGCTGACAACACAGAGTTGAATCTAGGCAGAGTAGCCTCGTTAACTT 53597456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 GCACTTGGCTAGGTGCTGACAACACAGAGTTGAATCTAGGCAGAGTAGCCTCGTTAACTT 4610

 53597457 TGCAAAGCTTACAGCCCAGTGGATAAAGAAACCAGTTAACAAGTGAATGCATATAGAATG 53597516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 TGCAAAGCTTACAGCCCAGTGGATAAAGAAACCAGTTAACAAGTGAATGCATATAGAATG 4670

 53597517 ACAACATATGATATGTGCTGTGGCCGGGAGGGAACAGGGTACAGTAAGGGAGAGCCAGGG 53597576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 ACAACATATGATATGTGCTGTGGCCGGGAGGGAACAGGGTACAGTAAGGGAGAGCCAGGG 4730

 53597577 TGGCATGAAGGGGTTGGTGGGGAGGGCCTTCCTAAGAAGATGATGTGCAAGTTGAGATGG 53597636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 TGGCATGAAGGGGTTGGTGGGGAGGGCCTTCCTAAGAAGATGATGTGCAAGTTGAGATGG 4790

 53597637 AAAAAAAGAGGAAGAAGAAGAGATGTAAGATGTTGGGGAAGCATGTTCCAGAGGAAGGAA 53597696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 AAAAAAAGAGGAAGAAGAAGAGATGTAAGATGTTGGGGAAGCATGTTCCAGAGGAAGGAA 4850

 53597697 CAGCACGTGTGGAGGCCCTGAGATGGTAAGGGCTTGGTCTGCTTAGGGAACTTGAGGCTG 53597756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 CAGCACGTGTGGAGGCCCTGAGATGGTAAGGGCTTGGTCTGCTTAGGGAACTTGAGGCTG 4910

 53597757 GTGGGACTGGAGTATGTGACATGGGATGAGGTGGGGTGGGCGAGGCAGATCATGCAGGGC 53597816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4911 GTGGGACTGGAGTATGTGACATGGGATGAGGTGGGGTGGGCGAGGCAGATCATGCAGGGC 4970

 53597817 CTCCTAGACCAGGTTAATGGTCTGCAGGTTGATTCTACATGTCATGGAAGCTGTTGAAGG 53597876
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4971 CTCCTAGACCAGGTTAACGGTCTGCAGGTTGATTCTACATGTCATGGAAGCTGTTGAAGG 5030

 53597877 TAAATGAGGGGCAGGGCCCAATCTGCTTTTCTCAAGATCCTTCTGGCCACTGGGTGGAAT 53597936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5031 TAAATGAGGGGCAGGGCCCAATCTGCTTTTCTCAAGATCCTTCTGGCCACTGGGTGGAAT 5090

 53597937 AGATGGGACGGGGACAAGAAGTGAGGCGAGGAGACCAGTGAGGTGGCGGTGGAGTCTGGA 53597996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5091 AGATGGGACGGGGACAAGAAGTGAGGCGAGGAGACCAGTGAGGTGGCGGTGGAGTCTGGA 5150

 53597997 CGTGAGAAGAGAGTGCCCGGGCCTGTAGGGTTGGGAGGAAGCTCCATTCTTCGACTGAGT 53598056
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     5151 CGTGAGAAGAGAGTGCCCGGGCCTGTAGGGTGGGGAGGAAGCTCCATTCTTCGACTGAGT 5210

 53598057 AGGCAGAATCCACTGGAACTGTGGATGGGGCTGTGGGGTTGAGAGAAAGAGGATAGCCAA 53598116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5211 AGGCAGAATCCACTGGAACTGTGGATGGGGCTGTGGGGTTGAGAGAAAGAGGATAGCCAA 5270

 53598117 TGACAGGCCCGATGGAAGACCTGGGTGATGGAGCTGCCATTTGCAGACAAGAAGAAAACA 53598176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5271 TGACAGGCCCGATGGAAGACCTGGGTGATGGAGCTGCCATTTGCGGACAAGAAGAAAACA 5330

 53598177 GGAAAAGGAGGCAGTTTTCTGGGTGGAACTTCAAGTTGGTGACATTAAACTTGAAGTGTG 53598236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5331 GGAAAAGGAGGCAGTTTTCTGGGTGGAACTTCAAGTTGGTGACATTAAACTTGAAGTGTG 5390

 53598237 GCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTATAATTCCCGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGAT 53598296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5391 GCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTATAATTCCCGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGAT 5450

 53598297 TGCTGGAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAGACCCCGCCTCTACAA 53598356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5451 TGCTGGAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAGACCCCGCCTCTACAA 5510

 53598357 AAAATACAAAAAATAATTAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTT-GGGGG 53598415
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     5511 AAAATACAAAAAATAATTAGGTGTGGTGGTGTGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTTGGGGGG 5570

 53598416 GCTGAGGTAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAAGCCGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATTGTG 53598475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5571 GCTGAGGTAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAAGCCGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATTGTG 5630

 53598476 CCACTGCACTCTAGCCTGGGCGACAGGGCAAGATCCTATCTCAAACAAAACAAAACTTGA 53598535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5631 CCACTGCACTCTAGCCTGGGCGACAGGGCAAGATCCTATCTCAAACAAAACAAAACTTGA 5690

 53598536 AACGTTTGTGAAACATCCAAGTGGAGATGTCAAATAGGCAGTTGGTTAATGAAGTATGGA 53598595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5691 AACGTTTGTGAAACATCCAAGTGGAGATGTCAAATAGGCAGTTGGTTAATGAAGTATGGA 5750

 53598596 GCTCACAGGAGAGGTCTGGGGAGATCTCCATCTGGGGGCATTGGGCTTGTAGGTGGTATG 53598655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5751 GCTCACAGGAGAGGTCTGGGGAGATCTCCATCTGGGGGCATTGGGCTTGTAGGTGGTATG 5810

 53598656 TTAAAGCTATGAAATTAGATGAGAAAAGGCTGGAGAAGCTGAACATTTGGAGGTTGAGTA 53598715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5811 TTAAAGCTATGAAATTAGATGAGAAAAGGCTGGAGAAGCTGAACATTTGGAGGTTGAGTA 5870

 53598716 GAAGGAGAGAGACCAAGATGGAGGGGCAGAAAGCAGGCAAAAAGTTAGAAGAGTGTGAGT 53598775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5871 GAAGGAGAGAGACCAAGATGGAGGGGCAGAAAGCAGGCAAAAAGTTAGAAGAGTGTGAGT 5930

 53598776 CCATAGGGAAGGGCATTTCATGAGGGCAAGAGTAATCAGCTGCACCCATGGCTGTGGAGA 53598835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5931 CCATAGGGAAGGGCATTTCATGAGGGCAAGAGTAATCAGCTGCACCCATGGCTGTGGAGA 5990

 53598836 GGCCGTGTGGAAGAACTGGACGTGTCGTACAGATTCAGCAACACAGAGGACTGCTGACCC 53598895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5991 GGCCGTGTGGAAGAACTGGACGTGTCGTACAGATTCAGCAACACAGAGGACTGCTGACCC 6050

 53598896 TGACAGATTCACAGGCTCAGTGAATGACTCCAAAGATGCAGAAAGAGGAGACAGTCACTA 53598955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6051 TGACAGATTCACAGGCTCAGTGAATGACTCCAAAGATGCAGAAAGAGGAGACAGTCACTA 6110

 53598956 GAGTGAGTTGAGGAGTCAGGGAAGGCTTCCTGAGGGAGGTAGCATTTCAGCAGAGCCTTG 53599015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6111 GAGTGAGTTGAGGAGTCAGGGAAGGCTTCCTGAGGGAGGTAGCATTTCAGCAGAGCCTTG 6170

 53599016 AAGGCTGAGTCCTGAGAAATTTAAATGCTGCTTGCAAAGGCCTCTGTGCAGAAAATACAA 53599075
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6171 AAGGCTGAGTCCTGAGAGATTTAAATGCTGCTTGCAAAGGCCTCTGTGCAGAAAATACAA 6230

 53599076 AGCGCCCTTGGCCTGGGGATTATCTCCACTTCACAAAGGGGGGAGGTCCAAGGAGCTGGC 53599135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6231 AGCGCCCTTGGCCTGGGGATTATCTCCACTTCACAAAGGGGGGAGGTCCAAGGAGCTGGC 6290

 53599136 TCACTGCTCAGCAGCAGGGAGGCTGGGAGGCAGAACGCATGCAGAGGCTCATCCTCTTTC 53599195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6291 TCACTGCTCAGCAGCAGGGAGGCTGGGAGGCAGAACGCATGCAGAGGCTCATCCTCTTTC 6350

 53599196 CTCTCTGCAGAGGAGTCCTGGAAGATGAAGATTTCTCATGGCCTCAGAGCAAAAGGCTCT 53599255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6351 CTCTCTGCAGAGGAGTCCTGGAAGATGAAGATTTCTCATGGCCTCAGAGCAAAAGGCTCT 6410

 53599256 TAGACACCACCTGGAGCAGCCACTCATTATACATCTGGAATACTCAAGACCTGGACAGGG 53599315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6411 TAGACACCACCTGGAGCAGCCACTCATTATACATCTGGAATACTCAAGACCTGGACAGGG 6470

 53599316 ATAGGGTTGCTCAAGTTCACCTAGCACATCAGTGAAAGGGACCAAGTGATCTCCCATGAT 53599375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6471 ATAGGGTTGCTCAAGTTCACCTAGCACATCAGTGAAAGGGACCAAGTGATCTCCCATGAT 6530

 53599376 TTCCATGGCCCGCACCCTACTGGGTAAGGTCTGAATTCTTCAGCCTGGTGTTCAAGGTCG 53599435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6531 TTCCATGGCCCGCACCCTACTGGGTAAGGTCTGAATTCTTCAGCCTGGTGTTCAAGGTCG 6590

 53599436 TTCATGATTGGGCAAGAGCTCACCGTCCAAATTCATCTCGCACCATCCCGCCCTTGTCCC 53599495
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6591 TTCATGATTGGGCAAGAGCTCACCCTCCAAATTCATCTCGCACCATCCCGCCCTTGTCCC 6650

 53599496 CAAGTCCCAACCTCCTGAGTGCTCAGCATACACAA-CATATAGTCTTCATGACAACCCTT 53599554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     6651 CAAGTCCCAACCTCCTGAGTGCTCAGCATACACAAGCATATAGTCTTCATGACAACCCTT 6710

 53599555 CGAAGTAGGTGTTGTTATTCCCATTTTACAGATGAGGAAACTGAGGCGTAGAGAGGTGAG 53599614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6711 CGAAGTAGGTGTTGTTATTCCCATTTTACAGATGAGGAAACTGAGGCGTAGAGAGGTGAG 6770

 53599615 GTAATATGTCCAAGGTTACACAGCCAAGCCAGGCTGTGATCACTGGAGTATCCTCAGAGT 53599674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6771 GTAATATGTCCAAGGTTACACAGCCAAGCCAGGCTGTGATCACTGGAGTATCCTCAGAGT 6830

 53599675 TAGTTCTCTTTTCCCCAGGCCTTGCTGCATTACCATGAACAGCCCCTCCTCTGGGAAGCC 53599734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6831 TAGTTCTCTTTTCCCCAGGCCTTGCTGCATTACCATGAACAGCCCCTCCTCTGGGAAGCC 6890

 53599735 AACCCTCAACTCCCTGGCCTTGAGCTATCTTGGAGTCGGGTCATATCCGTTGATTCCAAA 53599794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6891 AACCCTCAACTCCCTGGCCTTGAGCTATCTTGGAGTCGGGTCATATCCGTTGATTCCAAA 6950

 53599795 TCACCTGTTCTATCCACTAAAAATTCTACTGGATGGAACCAACAACTGGGGCCACTGAAT 53599854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6951 TCACCTGTTCTATCCACTAAAAATTCTACTGGATGGAACCAACAACTGGGGCCACTGAAT 7010

 53599855 GACTCAGAAGCCGGCAGCCCACGGCACTGCCCATAAAGGCCCCACGGTCACACTCATCCC 53599914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7011 GACTCAGAAGCCGGCAGCCCACGGCACTGCCCATAAAGGCCCCACGGTCACACTCATCCC 7070

 53599915 AGGGCCTGTGGTTGCTCTCCAGCCACCCACAGCAGGAGCAGGGCAGCAACAGAAGCCATC 53599974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7071 AGGGCCTGTGGTTGCTCTCCAGCCACCCACAGCAGGAGCAGGGCAGCAACAGAAGCCATC 7130

 53599975 CTCTACCCTCCTGGTTCCGGACCACCTGGTCAAACCCCCGCTCTCACCTGGAGACCACCA 53600034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7131 CTCTACCCTCCTGGTTCCGGACCACCTGGTCAAACCCCCGCTCTCACCTGGAGACCACCA 7190

 53600035 GTGGCAGGATCATCATCTTCAGCATCCTCATCAGGAGCTCTCCAGGGAACTGGAAGTAAC 53600094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7191 GTGGCAGGATCATCATCTTCAGCATCCTCATCAGGAGCTCTCCAGGGAACTGGAAGTAAC 7250

 53600095 TAATTTCCTGAAAACACAGTAAGAACTGGGGTTATAGCAAGAGATGCAGACTGCACAGTG 53600154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7251 TAATTTCCTGAAAACACAGTAAGAACTGGGGTTATAGCAAGAGATGCAGACTGCACAGTG 7310

 53600155 GTTCCGTTCTTCACAGTCTTTGAAGCACTATCCCATCTGACTCCCCTGTCTAGCACATGG 53600214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7311 GTTCCGTTCTTCACAGTCTTTGAAGCACTATCCCATCTGACTCCCCTGTCTAGCACATGG 7370

 53600215 CAGCAGAGACCATGGAGAAAGAACTGGCTTTGGAGCCACAGAACTGGGTTCCAATCCTGG 53600274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7371 CAGCAGAGACCATGGAGAAAGAACTGGCTTTGGAGCCACAGAACTGGGTTCCAATCCTGG 7430

 53600275 TAAACACCCCGCCTCCACCAATCCCCCACAAGCTGTGTGGCCTTAAGCATCTTCTGTGAC 53600334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7431 TAAACACCCCGCCTCCACCAATCCCCCACAAGCTGTGTGGCCTTAAGCATCTTCTGTGAC 7490

 53600335 CACTCTGAGTTTTGTATTTTTCTCATCTGTAACATGAGGGTAATAACTACAGTAGTCCCT 53600394
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7491 CACTCTGAGTTTTGTGTTTTTCTCATCTGTAACATGAGGGTAATAACTACAGTAGTCCCT 7550

 53600395 ACTTATTCTCAGCGGACAGGTTCCGAGACCGCCAGTGGATGCCTGAAACCACAGAGACTG 53600454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7551 ACTTATTCTCAGCGGACAGGTTCCGAGACCGCCAGTGGATGCCTGAAACCACAGAGACTG 7610

 53600455 AACCCTGTGGACGTTGTTTTTTTCCTATATGTACATACCTACGATAAAATGTAATTCATA 53600514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7611 AACCCTGTGGACGTTGTTTTTTTCCTATATGTACATACCTACGATAAAATGTAATTCATA 7670

 53600515 AATTAGACACAGTAAGAGATTAACAGTAACTAATAATCAAATGGAGCGATTAGAATATAC 53600574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7671 AATTAGACACAGTAAGAGATTAACAGTAACTAATAATCAAATGGAGCGATTAGAATATAC 7730

 53600575 TGTAATAAAAGTTATGTGAATGTGGTCTCTCTTAAAATATCTTCCAGTACTGTTCTCACC 53600634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7731 TGTAATAAAAGTTATGTGAATGTGGTCTCTCTTAAAATATCTTCCAGTACTGTTCTCACC 7790

 53600635 CATTTTTCAGACCATCGGTAACTGAAATCACAGAAAGCGAAATGGCGGATAAGGGGGGAC 53600694
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7791 CA-TTTTCAGACCATCGGTAACTGAAATCACAGAAAGCGAAATGGCGGATAAGGGGGGAC 7849

 53600695 TGCTCTGCCTCACAGGGTCATTGGGGGGCTTAAACGGGAGAATGCACGCAAGCACTTAGC 53600754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7850 TGCTCTGCCTCACAGGGTCATTGGGGGGCTTAAACGGGAGAATGCACGCAAGCACTTAGC 7909

 53600755 ACAGCGCCTGGATGACAGCCAATGTTTGGTAATCCTGAAAATAACAGCTCTCCTCCATCT 53600814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7910 ACAGCGCCTGGATGACAGCCAATGTTTGGTAATCCTGAAAATAACAGCTCTCCTCCATCT 7969

 53600815 GCACCACGCATCTGCCTAGCCATGGAATAAAATCTCTCTCGTGTAGCAGATGGCAGGTGA 53600874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7970 GCACCACGCATCTGCCTAGCCATGGAATAAAATCTCTCTCGTGTAGCAGATGGCAGGTGA 8029

 53600875 CCAGAGGACAGAGCCGAGTACTGTTCATGCATTCATTCAACCCGCATCGTGCCACGCATC 53600934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8030 CCAGAGGACAGAGCCGAGTACTGTTCATGCATTCATTCAACCCGCATCGTGCCACGCATC 8089

 53600935 ACAGTGGGTACCCCAAC 53600951
          |||||||||||||||||
     8090 ACAGTGGGTACCCCAAC 8106

Alignment time is 5.99974 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [53584097,53604948] =>     20852 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,   11660] =>     11660 nucs 'mol-32-1ef5-071039_11660'

Score:        9801
Aligned:     10191        nucs
Identic:     10140 ( 99%) nucs =>      9960 ( 99%)       180 (100%)
Gaps:           24 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [53584097,53594097] EXCISED REGION [53594949,53595128]
 second seq =>  [    1317,   11313] EXCISED REGION [   11314,   11493]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       851 nucs [53594098,53594948]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [53594098,53594099] to [53594949,53594950]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 53584097 TGACACCTCCTGGAGGACCCAGCAGCCTCAGAAGCCATCATCTCTCTGGGACTTTACTGT 53584156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 TGACACCTCCTGGAGGACCCAGCAGCCTCAGAAGCCATCATCTCTCTGGGACTTTACTGT 1376

 53584157 TCCCCAGACACCTGAACACCCAGCCCAGTGGATCCTTAACCTTCTGAGTGAAGCACTGTG 53584216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TCCCCAGACACCTGAACACCCAGCCCAGTGGATCCTTAACCTTCTGAGTGAAGCACTGTG 1436

 53584217 GAGTTCCACTGCGAGCCACATTTGTAATTTAGAATTTTCTAGTGGTCACATTAAAAAGTA 53584276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 GAGTTCCACTGCGAGCCACATTTGTAATTTAGAATTTTCTAGTGGTCACATTAAAAAGTA 1496

 53584277 AAAAGAAACAGGTGAAATTAGTTTTTTGGTGAAATTAAGTTTAATACTTTATTTAACCTA 53584336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 AAAAGAAACAGGTGAAATTAGTTTTTTGGTGAAATTAAGTTTAATACTTTATTTAACCTA 1556

 53584337 GTTTATCCCAAATATTATCATTTCAATATGTCATCAATATAAAAATTTTTAGGCCAGGCA 53584396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 GTTTATCCCAAATATTATCATTTCAATATGTCATCAATATAAAAATTTTTAGGCCAGGCA 1616

 53584397 CGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACAGGTGGATCACCTGAG 53584456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 CGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACAGGTGGATCACCTGAG 1676

 53584457 GTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACACGGTGAAGCCCCATCTCTACTAAAAATACA 53584516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 GTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACACGGTGAAGCCCCATCTCTACTAAAAATACA 1736

 53584517 AAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCTAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGCAG 53584576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 AAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCTAGCTTCTTGGGAGGCTGAGGCAG 1796

 53584577 GAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGGCCACGCCATTGCACT 53584636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 GAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGGCCACGCCATTGCACT 1856

 53584637 CCATCCTGAGCAACAAGAGTGAAACTCCGTTTCAAAAAAAAATTTATATTGCTTCAGGTT 53584696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 CCATCCTGAGCAACAAGAGTGAAACTCCGTTTCAAAAAAAAATTTATATTGCTTCAGGTT 1916

 53584697 TTAAATTTTAAATTAAATTAAATAAAAGTTCAGTTCCTCAGTTGCACTGCCTGC-TTTTG 53584755
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     1917 TTAAATTTTAAATTAAATTAAATAAAAGTTCAGTTCCTCAGTTGCACTGCCTGCATTTTG 1976

 53584756 GGTCTCAGAGGCCTCCTCTGACTCGTGGCTGTTGTATTGGACAGCCCAATACAATAGTTC 53584815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 GGTCTCAGAGGCCTCCTCTGACTCGTGGCTGTTGTATTGGACAGCCCAATACAATAGTTC 2036

 53584816 TGAGTTACAGATGGGGAAAATGGAGCACAGGGAGATGGAGGCAACTGGCCAGGCCCTCCA 53584875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 TGAGTTACAGATGGGGAAAATGGAGCACAGGGAGATGGAGGCAACTGGCCAGGCCCTCCA 2096

 53584876 GTTGGTGAACCATAATGTCAAGATTGGAACAGGGATTTCTGATTCAGAACCTTGTGGGGT 53584935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 GTTGGTGAACCATAATGTCAAGATTGGAACAGGGATTTCTGATTCAGAACCTTGTGGGGT 2156

 53584936 TCCCACTCCCACAGTGCCTGTCTGTGGCACAAACCTGGTTTAACTCTGGTGGTGGGGGAA 53584995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 TCCCACTCCCACAGTGCCTGTCTGTGGCACAAACCTGGTTTAACTCTGGTGGTGGGGGAA 2216

 53584996 AAGATCTGGTTTGGGCTATGATTTTATTTTTTATTAATTCTTTGAAACAGGGTTTCACTC 53585055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 AAGATCTGGTTTGGGCTATGATTTTATTTTTTATTAATTCTTTGAAACAGGGTTTCACTC 2276

 53585056 TGTTGCCCAGGCTGGGGCTCAGTGGCACGATCATGGCTCACTGCAGCCTTGACCTCCTAG 53585115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TGTTGCCCAGGCTGGGGCTCAGTGGCACGATCATGGCTCACTGCAGCCTTGACCTCCTAG 2336

 53585116 GCTCAAATGATTCTCTCACATCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACTCGACACC 53585175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 GCTCAAATGATTCTCTCACATCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACTCGACACC 2396

 53585176 ATGCCTGGCTAATTTTTAAAAATTTTTAGTAGAGATGGGGGTATCTTGATGATGCCCAAT 53585235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 ATGCCTGGCTAATTTTTAAAAATTTTTAGTAGAGATGGGGGTATCTTGATGATGCCCAAT 2456

 53585236 CTGGTCTGGAACTCCTGAGCCCAAATGATCCTCCTGTCTTCACCTCCCAAAGTGCTGGGA 53585295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 CTGGTCTGGAACTCCTGAGCCCAAATGATCCTCCTGTCTTCACCTCCCAAAGTGCTGGGA 2516

 53585296 TTACAGGTGTGAGCCACCCAGCCCAGCTGACTATGATTTTAATGTGATCCAGCCCATGTA 53585355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TTACAGGTGTGAGCCACCCAGCCCAGCTGACTATGATTTTAATGTGATCCAGCCCATGTA 2576

 53585356 AAGCCATTTTAGTTCAATCTCGGAGTTCACAGCCTGCCCTTGGTAATGAGCCTCAGATTT 53585415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 AAGCCATTTTAGTTCAATCTCGGAGTTCACAGCCTGCCCTTGGTAATGAGCCTCAGATTT 2636

 53585416 GTGGTGGTGAGCTTCCCATTGTTGGAGGCATCCAGGTGGATCCTGGATGGCCACCTGTTG 53585475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 GTGGTGGTGAGCTTCCCATTGTTGGAGGCATCCAGGTGGATCCTGGATGGCCACCTGTTG 2696

 53585476 AGATGCTAGATGGAGGCTTCCAGATAGAGTGGGAGGTTCCATGAGGATGACTTCAAACAT 53585535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 AGATGCTAGATGGAGGCTTCCAGATAGAGTGGGAGGTTCCATGAGGATGACTTCAAACAT 2756

 53585536 TCCTTCTGGCTCTGTGATTTATGGTGAGGGGAGAATAGGCAACCACCTCTCTCCCACACC 53585595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TCCTTCTGGCTCTGTGATTTATGGTGAGGGGAGAATAGGCAACCACCTCTCTCCCACACC 2816

 53585596 ACGCTTGGCTGGGTGCTCCTGGGAGCACCTGCGGTGTTTGAGGGCCCCAGGGAAGAGCCT 53585655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 ACGCTTGGCTGGGTGCTCCTGGGAGCACCTGCGGTGTTTGAGGGCCCCAGGGAAGAGCCT 2876

 53585656 CTGGGAGTCTGGAGGCTGGAACTCCCTCCTAAGCCATCTGGCCACCACTCAGAGCCCAGG 53585715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 CTGGGAGTCTGGAGGCTGGAACTCCCTCCTAAGCCATCTGGCCACCACTCAGAGCCCAGG 2936

 53585716 GATTGTGGATCAAGAGATTGCAGTGATTAGAGACATTAACCCGCAGAGGCAGTGGGAAGG 53585775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 GATTGTGGATCAAGAGATTGCAGTGATTAGAGACATTAACCCGCAGAGGCAGTGGGAAGG 2996

 53585776 CCCAGCCTGTCTCAATCTGGTAATTGCTCCACTTGCAGGGGTGGGGGAAGGGAGGCAAAG 53585835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 CCCAGCCTGTCTCAATCTGGTAATTGCTCCACTTGCAGGGGTGGGGGAAGGGAGGCAAAG 3056

 53585836 ACTGCCAGGCTCCCGGTGGAAGGAGAAAAAGGCTGCTGACTGACCCTCCCCTGGTTCTCG 53585895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 ACTGCCAGGCTCCCGGTGGAAGGAGAAAAAGGCTGCTGACTGACCCTCCCCTGGTTCTCG 3116

 53585896 CACCAACCCCTGAGGTGGGACTCCTGACCCCATCTCACACTGGGAGGTGCAGGGCAGCTC 53585955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 CACCAACCCCTGAGGTGGGACTCCTGACCCCATCTCACACTGGGAGGTGCAGGGCAGCTC 3176

 53585956 TGCCATTTGCCAAGCGCTGGTTACAAAGGTGAGGGATTAGAAACCACGCCCCCACGAAGT 53586015
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3177 TGCCATTTGCCAAGCGCTGGTTACAAAGGTGAGGGATTAGAAACCACGCCCCCACAAAGT 3236

 53586016 CGAAGTTGTAGTCGCACCTCCCTACAGAGAGAGCCAAGAGAGCCTGCAGGCTGCCCAGCT 53586075
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3237 CGAAGTTGTAGTCGCACCTCCCTACAGAGAGAGCCAACAGAGCCTGCAGGCTGCCCAGCT 3296

 53586076 GCCGGATGCCCCTCCCCCAGTTTGGGGTGACTCCCCATTGCCCTCCGCAACCATCCCAGC 53586135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 GCCGGATGCCCCTCCCCCAGTTTGGGGTGACTCCCCATTGCCCTCCGCAACCATCCCAGC 3356

 53586136 TCCTTCCCTGCCCTGCGTCCCCTGGGGCTGGGCCGCTCTCCTCCTCGTCCACTCTGCTCC 53586195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 TCCTTCCCTGCCCTGCGTCCCCTGGGGCTGGGCCGCTCTCCTCCTCGTCCACTCTGCTCC 3416

 53586196 TGGAAGTACCTTTGCACTGGATGTTCCTCCCGCCTGGAACTCTCCATCCACCATCCCTTC 53586255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TGGAAGTACCTTTGCACTGGATGTTCCTCCCGCCTGGAACTCTCCATCCACCATCCCTTC 3476

 53586256 CCCAACCCTGGCCCAATGTCCCCAACCCTGGGTCAGCTTAGACATCACTGCCTCTGGGAA 53586315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 CCCAACCCTGGCCCAATGTCCCCAACCCTGGGTCAGCTTAGACATCACTGCCTCTGGGAA 3536

 53586316 GCCTTCCCTGACTGCAGCCATCTCACCCACTTCCCCAGGGCACCCTGTGCTTCCCAGTTT 53586375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 GCCTTCCCTGACTGCAGCCATCTCACCCACTTCCCCAGGGCACCCTGTGCTTCCCAGTTT 3596

 53586376 GTTACGGAGCACCCTGCTAGTGGGCTCAACCCGAATCCCCAGGGCCTGACCCAGCACCTG 53586435
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3597 GTTACGGAGCACCCTGCTAGTGGGCTCAACCCGAATCCCCAGGGCCTGACCCAGCGCCTG 3656

 53586436 GCACAGGACGGGCTGGCACGGAGTGCCGGGAGCCCAGTCCCCGCCTTCTTCTCCTTTCCT 53586495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 GCACAGGACGGGCTGGCACGGAGTGCCGGGAGCCCAGTCCCCGCCTTCTTCTCCTTTCCT 3716

 53586496 GTCCTGTGGATGCTGCTCAGCTCTGAAGTCTCCACTCAGGCACCACCGCCCTCTGAAGGC 53586555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 GTCCTGTGGATGCTGCTCAGCTCTGAAGTCTCCACTCAGGCACCACCGCCCTCTGAAGGC 3776

 53586556 TGCCCTGGCCCTAGGCAAGGCGAGGAAGCTCCCGTAAGCATCCCTCACTCACTGCGAGCC 53586615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 TGCCCTGGCCCTAGGCAAGGCGAGGAAGCTCCCGTAAGCATCCCTCACTCACTGCGAGCC 3836

 53586616 CTTGGGCATGTGACTGGGCCTGGGTGTGCCTCAGTTTCCACTGAGGATGAGTGCGGATGA 53586675
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3837 CTTGGGCATGTGACTGGGCCTGGGTGTGCCTCAGTTTCCACTGAGGATGAGTGGGGATGA 3896

 53586676 TGCCGGTTTGCTGTGAGGCCAAATCTTGGGTTGGAGTGGTACATGGCATGTGATAAGTAC 53586735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 TGCCGGTTTGCTGTGAGGCCAAATCTTGGGTTGGAGTGGTACATGGCATGTGATAAGTAC 3956

 53586736 GCACTGCATTTCAATTGTTATAATTTCCTCTGTCTTCACTGTCTGTCTGTGACCACCTGT 53586795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 GCACTGCATTTCAATTGTTATAATTTCCTCTGTCTTCACTGTCTGTCTGTGACCACCTGT 4016

 53586796 CCCAGCAGACTGGAACTCCTCCAAGGCAAGGCTAAGTCTAGTTTGGCTCTAGGTCCTTAA 53586855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 CCCAGCAGACTGGAACTCCTCCAAGGCAAGGCTAAGTCTAGTTTGGCTCTAGGTCCTTAA 4076

 53586856 AACCCAAGGTCTGGCACAGGCCTGGGTGCAGGGTTGCTGATGTGTGTGATGCTGAACCAG 53586915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 AACCCAAGGTCTGGCACAGGCCTGGGTGCAGGGTTGCTGATGTGTGTGATGCTGAACCAG 4136

 53586916 GGTGACATTCTAGATCAGACGTGAAAAGGACGACTTGTGTGCCCAGGTGACTGAGCAGCC 53586975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 GGTGACATTCTAGATCAGACGTGAAAAGGACGACTTGTGTGCCCAGGTGACTGAGCAGCC 4196

 53586976 ATTGAAGGTTTCCTGAGAACAGATCACCAGTACCAGCCTTGGTCCCCGGATGGGCTTAGG 53587035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 ATTGAAGGTTTCCTGAGAACAGATCACCAGTACCAGCCTTGGTCCCCGGATGGGCTTAGG 4256

 53587036 GGAATGCCCACGGTGTTGTGTGTCTGTGTGACATCGAGACAGTTGGCACCAGAAATCTGG 53587095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 GGAATGCCCACGGTGTTGTGTGTCTGTGTGACATCGAGACAGTTGGCACCAGAAATCTGG 4316

 53587096 GAAGAGATGGGGGCTTGGTGAAGGGACAAGGAGCTGAATGTCCTGGGCAGTAGAGAGGGT 53587155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 GAAGAGATGGGGGCTTGGTGAAGGGACAAGGAGCTGAATGTCCTGGGCAGTAGAGAGGGT 4376

 53587156 GTCTAGAGATCAGCTTCAGGACTCTGCTTTCGGCCCTCTCCTTTCTGGTCATTTTAATCA 53587215
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 GTCTAGAGATCAGCTTCAGGACTTTGCTTTCGGCCCTCTCCTTTCTGGTCATTTTAATCA 4436

 53587216 ATGGCTTGGCCAAGGCCCCCGACAGCATGTGGAGCAGATTTGTAGAGGACAGGAAGCTGG 53587275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 ATGGCTTGGCCAAGGCCCCCGACAGCATGTGGAGCAGATTTGTAGAGGACAGGAAGCTGG 4496

 53587276 GAGGAATAGCTAATGTGCTGGATGAGGGAGTTGGGAATCCAAGCAGACCCCAGCAGTCAA 53587335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 GAGGAATAGCTAATGTGCTGGATGAGGGAGTTGGGAATCCAAGCAGACCCCAGCAGTCAA 4556

 53587336 TTCTGACACAATGAGCCTGAACACAGACATGTGTTGGGCCGCACTTGGCTTCCACAGCTT 53587395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 TTCTGACACAATGAGCCTGAACACAGACATGTGTTGGGCCGCACTTGGCTTCCACAGCTT 4616

 53587396 GGAGTGCACAAACACCGGGGTGGGAGGGGGAGGCTGAGCCGTGGCTGCACACGTGGGGAG 53587455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 GGAGTGCACAAACACCGGGGTGGGAGGGGGAGGCTGAGCCGTGGCTGCACACGTGGGGAG 4676

 53587456 GGGACTTTGGGCTTTGTTTGCTGCCAGCTGGTGAGTCACCTGGGACGCGGGGCTGCCAAA 53587515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 GGGACTTTGGGCTTTGTTTGCTGCCAGCTGGTGAGTCACCTGGGACGCGGGGCTGCCAAA 4736

 53587516 GGGCTGGTGGGCCCCCTGCCTGTGGCTTCAGAAGCCCGGGGGCTGGTGGAGGCTGCTGCA 53587575
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 GGGCTGGTGGGCCCCCCGCCTGTGGCTTCAGAAGCCCGGGGGCTGGTGGAGGCTGCTGCA 4796

 53587576 GACCTGCTTTGACTCATTGAGAAAGGGACGGGGCGGGGTGTGTGTGTCCTGTAGAGGGCA 53587635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 GACCTGCTTTGACTCATTGAGAAAGGGACGGGGCGGGGTGTGTGTGTCCTGTAGAGGGCA 4856

 53587636 GCTGGGTAGGCAGCAGGTGATAGAGGCACGTGCCTGGTTGCGGGGAGCAGCTGGGGGGCT 53587695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 GCTGGGTAGGCAGCAGGTGATAGAGGCACGTGCCTGGTTGCGGGGAGCAGCTGGGGGGCT 4916

 53587696 GGGGGGCAGGTGCTGTGTGGTCCGGAGCGGAGCAGACCTGGGAATGCTGGGGATGATGGG 53587755
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 GGGGGGCAGGTGCTGTGTGGTCCGGAGGGGAGCAGACCTGGGAATGCTGGGGATGATGGG 4976

 53587756 AAAAGCCCTAGGGCTCTCAGCTCAGCACCAGGAATAACTTTCTGGCAGAGCTGTCCTGCT 53587815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 AAAAGCCCTAGGGCTCTCAGCTCAGCACCAGGAATAACTTTCTGGCAGAGCTGTCCTGCT 5036

 53587816 CTGGCAGGAACTACCTTGAGAAGTGGTGACCTCCCAGTCACTGGAGGTGTGCAAGCAACT 53587875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 CTGGCAGGAACTACCTTGAGAAGTGGTGACCTCCCAGTCACTGGAGGTGTGCAAGCAACT 5096

 53587876 TGCTAAAGTCACACAATAAGTGGGTTCAAGCCCTAGTCTGCTGGCATGACAGCATCCAGT 53587935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 TGCTAAAGTCACACAATAAGTGGGTTCAAGCCCTAGTCTGCTGGCATGACAGCATCCAGT 5156

 53587936 CACAACCTCCTGGCAGTGGGAGGACCTGAGGGACAGTGAGGAGCCCCAAGCCCTGCAGCC 53587995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 CACAACCTCCTGGCAGTGGGAGGACCTGAGGGACAGTGAGGAGCCCCAAGCCCTGCAGCC 5216

 53587996 AAGTCCTTGGGCTCTGGCCTTGGCTGACCTAGCCACAGAGGCTCTCCCCAGCTGGCCCTG 53588055
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 AAGTCCTTGGGCTCTGGCCTCGGCTGACCTAGCCACAGAGGCTCTCCCCAGCTGGCCCTG 5276

 53588056 GGATGCAGCTGCAGGAAGTCTACCAGACAGGCCGCAGGAAGGAGGCTTCGGGGGTCTGCG 53588115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 GGATGCAGCTGCAGGAAGTCTACCAGACAGGCCGCAGGAAGGAGGCTTCGGGGGTCTGCG 5336

 53588116 GGCAAGAGGGGTCCCTTCAGTCCATCTGAGCATCATGGCTTACTCTTCTTTTCCCCTGAG 53588175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 GGCAAGAGGGGTCCCTTCAGTCCATCTGAGCATCATGGCTTACTCTTCTTTTCCCCTGAG 5396

 53588176 CAGAAGGCAGGCCCAACAGCTGACAGCCAGTGCCATGCCCATTAGCGCCAGCTCCAAGTC 53588235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 CAGAAGGCAGGCCCAACAGCTGACAGCCAGTGCCATGCCCATTAGCGCCAGCTCCAAGTC 5456

 53588236 ATGCTTCCCAGACGGCTCTGCCAAAGCCCCACACTCAAGCCGACTCCTCCTGAGGCCTAA 53588295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 ATGCTTCCCAGACGGCTCTGCCAAAGCCCCACACTCAAGCCGACTCCTCCTGAGGCCTAA 5516

 53588296 GGCAGCATGCCCAGACTCCCACTCAGCTAAAGTCTGGGCCATCTCGTCTCAGCACACCCT 53588355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 GGCAGCATGCCCAGACTCCCACTCAGCTAAAGTCTGGGCCATCTCGTCTCAGCACACCCT 5576

 53588356 CCCAAGGGCAGAAATTCCTCCACCACCTCTGCTTGCATATCTCAGAGGACAGAGCACTCA 53588415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 CCCAAGGGCAGAAATTCCTCCACCACCTCTGCTTGCATATCTCAGAGGACAGAGCACTCA 5636

 53588416 CTACCTTCTGAGTCAGCCCCTCCACTAAGAGCTCGTGATGCTTATTAGGAAGTCCTTCCT 53588475
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 CTACCTTCTGAGTCAGCCCCTCCACTATGAGCTCGTGATGCTTATTAGGAAGTCCTTCCT 5696

 53588476 GGTGTCACAATGAAATCCGCCTCCGGGGAAGAGCATTGGGCCACACTGGGCCCAGCCAGC 53588535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 GGTGTCACAATGAAATCCGCCTCCGGGGAAGAGCATTGGGCCACACTGGGCCCAGCCAGC 5756

 53588536 CCTCTGGAGCCACATGGACCAAACCTCTTGGCCTCCACCTTGATTTCCATGGAGGGAAGG 53588595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 CCTCTGGAGCCACATGGACCAAACCTCTTGGCCTCCACCTTGATTTCCATGGAGGGAAGG 5816

 53588596 TGGGAGAGAGTGTGGGGCTCAGAGTGTGGGCGGTGGGTGCTGCTACCCTGGCATGCCCTG 53588655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 TGGGAGAGAGTGTGGGGCTCAGAGTGTGGGCGGTGGGTGCTGCTACCCTGGCATGCCCTG 5876

 53588656 CTGCCCTCTGAAGGTCCCTCCTTCCCAGGCCTGGGTGCCAAGAGGGCGCTCCACTGGGAC 53588715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 CTGCCCTCTGAAGGTCCCTCCTTCCCAGGCCTGGGTGCCAAGAGGGCGCTCCACTGGGAC 5936

 53588716 CTGTGAGAATGATAAGCTTGAACTGGATCAAAAGCAGAAGCTGGAGGAGCCACAGCTGCA 53588775
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     5937 CTGTGAGAATGACAAGCTTGAACTGGATCAAAAGCAAAAGCTGGAGGAGCCACAGCTGCA 5996

 53588776 GCCCTCAGAGCTCACTGTCAGACTGCCGGCCATTCTCAACCATTCTCCACCAAGAAGGCT 53588835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 GCCCTCAGAGCTCACTGTCAGACTGCCGGCCATTCTCAACCATTCTCCACCAAGAAGGCT 6056

 53588836 GCATTCCCTAAGGCAGTCAGGGCCAGGTCCAGTTTCCAACTCCACGTGAACTGAATCCCC 53588895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 GCATTCCCTAAGGCAGTCAGGGCCAGGTCCAGTTTCCAACTCCACGTGAACTGAATCCCC 6116

 53588896 CACCCCTTCCTTGCCCATGTGGCAAAGATCATGAGGAGTCAGGGGAACTCAGGTCTCCTG 53588955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 CACCCCTTCCTTGCCCATGTGGCAAAGATCATGAGGAGTCAGGGGAACTCAGGTCTCCTG 6176

 53588956 CCTCCCCTCCCTGCACCAGCAGGGCCCCTGGAGTCTGCCCCGCACAGGGCTCAGGCGGGG 53589015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 CCTCCCCTCCCTGCACCAGCAGGGCCCCTGGAGTCTGCCCCGCACAGGGCTCAGGCGGGG 6236

 53589016 CCATCCTGTGGGCCTCTCTCCAGTGCAGCGGTTCTCCACAGAGAAGGGCGGCAGCACAGT 53589075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 CCATCCTGTGGGCCTCTCTCCAGTGCAGCGGTTCTCCACAGAGAAGGGCGGCAGCACAGT 6296

 53589076 TTTCAAAACCTCACCCACCTTCCCAGGCTCTGAGATATGTGCCCACCCTGCCCGGTGTTG 53589135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 TTTCAAAACCTCACCCACCTTCCCAGGCTCTGAGATATGTGCCCACCCTGCCCGGTGTTG 6356

 53589136 AACATTTGCACTGGGTGCTGTGGGGCTCAGAAGGGAATGAGGTGGGTCTGTGTTCTTCCT 53589195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 AACATTTGCACTGGGTGCTGTGGGGCTCAGAAGGGAATGAGGTGGGTCTGTGTTCTTCCT 6416

 53589196 GGTGCTCTGGCCAGCGGGTGGGGAGACCAGCAGCAGAGCAACACCAACCCGGGGGTGGGG 53589255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 GGTGCTCTGGCCAGCGGGTGGGGAGACCAGCAGCAGAGCAACACCAACCCGGGGGTGGGG 6476

 53589256 GTAGCTGTGACTGAGCGCCAGAGCAGGGCCAGCCCTCCGGGCATCGGGCTGGGCCTCCCA 53589315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 GTAGCTGTGACTGAGCGCCAGAGCAGGGCCAGCCCTCCGGGCATCGGGCTGGGCCTCCCA 6536

 53589316 GAGGAGGGCACAGCTGGATGGAGCCTCGAAGGCCAAGTAGGAATTCTCTAACTGGAAGGG 53589375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 GAGGAGGGCACAGCTGGATGGAGCCTCGAAGGCCAAGTAGGAATTCTCTAACTGGAAGGG 6596

 53589376 AGCGAGAGCATGGAAGTCTGTGGTGCAGGATAAAGCCTGGGAGCTTTTCGGAGTCACCAG 53589435
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6597 AGCGAGAGCATGGAAGTCTGTGGTGCAGGATAAAGCCTGGGAGTTTTTCGGAGTCACCAG 6656

 53589436 GCTGGAGGTCTGACCCCACCCGCAGCCCACAGCGGGCCACGTTTCCCCTCTTGATGAGTA 53589495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 GCTGGAGGTCTGACCCCACCCGCAGCCCACAGCGGGCCACGTTTCCCCTCTTGATGAGTA 6716

 53589496 AGGCAAATCATCTGACTGGGCAGAAGGGCCAAAGGCAGGTCCCAGGGCTCACACCAGAAG 53589555
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 AGGCAAATCATCTGACTGGGCAGGAGGGCCAAAGGCAGGTCCCAGGGCTCACACCAGAAG 6776

 53589556 GTTCAGTGGAGCTCGCCAAACTGTGGCTACCCCCTGACTCGGAGGGCAGCATCCGAAGCA 53589615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 GTTCAGTGGAGCTCGCCAAACTGTGGCTACCCCCTGACTCGGAGGGCAGCATCCGAAGCA 6836

 53589616 CAGGCTGTACCGGTTTGGCCCTCTGGCCACCCGCTCCTCTGCCTCCTCCTGCTCACGGCC 53589675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 CAGGCTGTACCGGTTTGGCCCTCTGGCCACCCGCTCCTCTGCCTCCTCCTGCTCACGGCC 6896

 53589676 TGTCCTGGGGAGTCTGGGCAGCCCCCTGCACACTGGCTCCCAAACCAGACTTTGACGGCT 53589735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 TGTCCTGGGGAGTCTGGGCAGCCCCCTGCACACTGGCTCCCAAACCAGACTTTGACGGCT 6956

 53589736 GCTTGGCCCAGGCCCATTTCCAATAAGTTAGAATGTGGGTGTTTGGGAATTTTCTGCCAC 53589795
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     6957 GCTTGGCCCAGGCCCATTTCCAATAAGTTAGAATGTGGGTGTTTGGGAATTTTCTGCCAA 7016

 53589796 ACTAGAGTTCCTCAGGAAGGGGAGAAGGGAGTGTTGAGTTTCTCTGGCCAAACATGATTT 53589855
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     7017 ACTAGAGTTCCTCAGGAAGGGGAGAAGGGATTGTTGAGTTTCTCTGGCCAAACATGATTT 7076

 53589856 CCTGATTCTAAGAAAAATCAGTTTAAAGTCCTTACAAGAAATAGGAAGGAAAACAATACA 53589915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 CCTGATTCTAAGAAAAATCAGTTTAAAGTCCTTACAAGAAATAGGAAGGAAAACAATACA 7136

 53589916 TACACAACACACAC-ACACACACACACACACACACACACACACACACAACACAGCTTCAC 53589974
          |||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 TACACAA-------TACA-ACACACACACACACACACACACACACACAACACAGCTTCAC 7188

 53589975 AGACAAACCCACACCCACGCTTGGCTGTCTTTGCTATGTTGTGGAGCTCACAGAACACTC 53590034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7189 AGACAAACCCACACCCACGCTTGGCTGTCTTTGCTATGTTGTGGAGCTCACAGAACACTC 7248

 53590035 TATCATGCACAGCCCTAGTGAATCACAAACACATGGATTCAGTTTCCCCTGAAGGACGCC 53590094
          ||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7249 TACCATGCGCAGCCCTAGTGAATCACAAACACATGGATTCAGTTTCCCCTGAAGGACGCC 7308

 53590095 TGGTTTAAGAAACTGAAGAATGAGGGGAGAGAAGGGTTTGGCAAAAAGCAAGTGGAGAAT 53590154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7309 TGGTTTAAGAAACTGAAGAATGAGGGGAGAGAAGGGTTTGGCAAAAAGCAAGTGGAGAAT 7368

 53590155 TGGAGGCTCTAGCTGGATCCAGATGCTGGTCTGACTTACCCCTAATTCCTTGTGTCAAGC 53590214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7369 TGGAGGCTCTAGCTGGATCCAGATGCTGGTCTGACTTACCCCTAATTCCTTGTGTCAAGC 7428

 53590215 TTGTCTGGGGATGTGTGAAAACAAGGCTCAGTTGACCTCCCAAGGTGAGGTGCAAAGTCT 53590274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7429 TTGTCTGGGGATGTGTGAAAACAAGGCTCAGTTGACCTCCCAAGGTGAGGTGCAAAGTCT 7488

 53590275 AGCCTCAGTGGAATGGGGCCATAATGGGCCACACACACAAACACACATGGGCACACAAAC 53590334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7489 AGCCTCAGTGGAATGGGGCCATAATGGGCCACACACACAAACACACATGGGCACACAAAC 7548

 53590335 ACACACACAGAGCACCTGCCGGGACCTGCTTTGTAAATTAGCAGACAGCATTGTGCCTAT 53590394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7549 ACACACACAGAGCACCTGCCGGGACCTGCTTTGTAAATTAGCAGACAGCATTGTGCCTAT 7608

 53590395 TTTATGGCTGAGGCTAAGAGGGTGAACTCGAGGTGAGACCACAGTCCCGAGGCAGGGCAG 53590454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7609 TTTATGGCTGAGGCTAAGAGGGTGAACTCGAGGTGAGACCACAGTCCCGAGGCAGGGCAG 7668

 53590455 CTCCCTCAAGAGTCTAGCAGCCTCCCAAGTGCCTTGTGACAGGCAAAAGACTTTGCAAAC 53590514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7669 CTCCCTCAAGAGTCTAGCAGCCTCCCAAGTGCCTTGTGACAGGCAAAAGACTTTGCAAAC 7728

 53590515 TCTGTGCCTCCCGAGTGGGTGAGTAAAACAGGATCACCAAGGTGAAGGTGCAGCGTGGAA 53590574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7729 TCTGTGCCTCCCGAGTGGGTGAGTAAAACAGGATCACCAAGGTGAAGGTGCAGCGTGGAA 7788

 53590575 ATTCTTATGACATCACATTGGGGGAAAACCAAAGCAAGCAGGCTACAGATTTATTTTTGT 53590634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7789 ATTCTTATGACATCACATTGGGGGAAAACCAAAGCAAGCAGGCTACAGATTTATTTTTGT 7848

 53590635 GGAAGATACTTTTTGGGTTATACTGTAAGTTGAAAGCAAAAAGGATTGGGGTAGTGACAA 53590694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7849 GGAAGATACTTTTTGGGTTATACTGTAAGTTGAAAGCAAAAAGGATTGGGGTAGTGACAA 7908

 53590695 GTGGCCTGCTCGGGGAAGAATGGGAAAGTAAGGCTCCCAGGCCCTGAAGGCTTGACTTTT 53590754
          ||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7909 GTGGCCTGCTGGGGGGAGAATGGGAAAGTAAGGCTCCCAGGCCCTGAAGGCTTGACTTTT 7968

 53590755 CTAAATAAAGATATAATTGGCATGGCGTTAGTGAACTGTGGCAGCACACGGAAGACGGCT 53590814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7969 CTAAATAAAGATATAATTGGCATGGCGTTAGTGAACTGTGGCAGCACACGGAAGACGGCT 8028

 53590815 GAGGAGGGCAAAACCATGGGAGGGGGGCCCCAATGCAGGTCCCGTCCAGATGATTCGTTC 53590874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8029 GAGGAGGGCAAAACCATGGGAGGGGGGCCCCAATGCAGGTCCCGTCCAGATGATTCGTTC 8088

 53590875 CTATACTAATGTAATGTGAGGCAGAATTTTCTAATTTTTGTCCAAGGCGTCTCTGTTCCT 53590934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8089 CTATACTAATGTAATGTGAGGCAGAATTTTCTAATTTTTGTCCAAGGCGTCTCTGTTCCT 8148

 53590935 GGGTGGACAGAGCAAGTTCCCCTGCAGGCAATTTTATTTTGCAAAGAATCTTTTGAGCAG 53590994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8149 GGGTGGACAGAGCAAGTTCCCCTGCAGGCAATTTTATTTTGCAAAGAATCTTTTGAGCAG 8208

 53590995 CAAATGTCGGATGAGAAGGCAGCACTGTCAGGGGAAGGGAGGAGCTGTTGTGGCTTGATG 53591054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8209 CAAATGTCGGATGAGAAGGCAGCACTGTCAGGGGAAGGGAGGAGCTGTTGTGGCTTGATG 8268

 53591055 AATGCCTCCTCCTTGAGAACTTGAGATCTGCAGAGTTATGGAAAACTGTGCCCATTTGCA 53591114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8269 AATGCCTCCTCCTTGAGAACTTGAGATCTGCAGAGTTATGGAAAACTGTGCCCATTTGCA 8328

 53591115 CCAGAGGATCAGGGCCTTCTGAGAGGAAAAAGACTAAGACCTGAGCCCCAGTTCCCTGTG 53591174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8329 CCAGAGGATCAGGGCCTTCTGAGAGGAAAAAGACTAAGACCTGAGCCCCAGTTCCCTGTG 8388

 53591175 ATTTGAAGTTAGCACCAGGGTACGCTAGAGTCCCCCAGCCGAGATGGCCTGGCATTCAAG 53591234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8389 ATTTGAAGTTAGCACCAGGGTACGCTAGAGTCCCCCAGCCGAGATGGCCTGGCATTCAAG 8448

 53591235 GCCTCCAAAATGAACCCAGTAGGAGGGAAAAGGGAATTGGGGCTCAACTCCCGGGGAGCT 53591294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8449 GCCTCCAAAATGAACCCAGTAGGAGGGAAAAGGGAATTGGGGCTCAACTCCCGGGGAGCT 8508

 53591295 GATCTCAGGACATGACTGAGGCTGCTTTAGGAACAATTATTGAGCACTTCGGGGGGACCT 53591354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8509 GATCTCAGGACATGACTGAGGCTGCTTTAGGAACAATTATTGAGCACTTCGGGGGGACCT 8568

 53591355 AGGGGTCTGGAGGCATCCCTGTGGCCTGAGCAGCGTTGTGCACCTGCAAGGGGCAGTGTG 53591414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8569 AGGGGTCTGGAGGCATCCCTGTGGCCTGAGCAGCGTTGTGCACCTGCAAGGGGCAGTGTG 8628

 53591415 CAGACTTCCACCAGAGCGTGCGGGACCTGCGTTCCACAGGGCCACCCCGTGGAGGGAACC 53591474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8629 CAGACTTCCACCAGAGCGTGCGGGACCTGCGTTCCACAGGGCCACCCCGTGGAGGGAACC 8688

 53591475 AGAGCAGCAGGGCTGGTGGCAGGACCCCATGTTCCAGCTCTGTTTACACCAGAAGCTTCC 53591534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8689 AGAGCAGCAGGGCTGGTGGCAGGACCCCATGTTCCAGCTCTGTTTACACCAGAAGCTTCC 8748

 53591535 ACTGAATGAAATAAGCTGACTGTGGCCACGGGGTGGAGGCCTCCAGAGGGACACACTGGG 53591594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8749 ACTGAATGAAATAAGCTGACTGTGGCCACGGGGTGGAGGCCTCCAGAGGGACACACTGGG 8808

 53591595 CTTCCTGCTAGTACAGGGGAGTAGGACCATATTCAGTGTATTCAGTTTCAAGTCAGTAAA 53591654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8809 CTTCCTGCTAGTACAGGGGAGTAGGACCATATTCAGTGTATTCAGTTTCAAGTCAGTAAA 8868

 53591655 GCAAAAACAAAGTGTAATTAATTTTGCCTTTGAAAATCTCTTAAGTTGCCCATAGAGTCC 53591714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8869 GCAAAAACAAAGTGTAATTAATTTTGCCTTTGAAAATCTCTTAAGTTGCCCATAGAGTCC 8928

 53591715 AGGAGGTATAGTTTTGTGTAAGTTCATTCAAGACAGTTTCCCTTCCAGCCTTGGAGTGGG 53591774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8929 AGGAGGTATAGTTTTGTGTAAGTTCATTCAAGACAGTTTCCCTTCCAGCCTTGGAGTGGG 8988

 53591775 TTGCTGTTTCTTTAAGCAAACACCAGATGAGAGCATCAGCATACACTCAGAGGCCGTGAT 53591834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8989 TTGCTGTTTCTTTAAGCAAACACCAGATGAGAGCATCAGCATACACTCAGAGGCCGTGAT 9048

 53591835 CTAAAACACCCACCCCTCTGCAGGCCCTAGAAACTCTCTGGCTTCAGGGAGGTGCTCACT 53591894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9049 CTAAAACACCCACCCCTCTGCAGGCCCTAGAAACTCTCTGGCTTCAGGGAGGTGCTCACT 9108

 53591895 GTTCAGGAGGTGCCTGGGCACAGCGGCTGGTGGAGGCAATTCAGGCCCTCCTCTCTCGTG 53591954
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9109 GTTCAGGAGGTGCCTGGGCACAGAGGCTGGTGGAGGCAATTCAGGCCCTCCTCTCTCGTG 9168

 53591955 GCCCTCACCTGGGGAAGAGCCCTTGGAAGGAGGAGTCTCCTGTCTCATTTAAATGATTTT 53592014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9169 GCCCTCACCTGGGGAAGAGCCCTTGGAAGGAGGAGTCTCCTGTCTCATTTAAATGATTTT 9228

 53592015 CTCCCTTTTTCAGAGCACATGTAATTGAATTCACTTAAGTTAAATGCACATATGATGGGA 53592074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9229 CTCCCTTTTTCAGAGCACATGTAATTGAATTCACTTAAGTTAAATGCACATATGATGGGA 9288

 53592075 CTCCACTATAAGGCGGGGGTGGTGGGAGGGCTGAAATAAACTGAAAACCGCAAACCTGGA 53592134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9289 CTCCACTATAAGGCGGGGGTGGTGGGAGGGCTGAAATAAACTGAAAACCGCAAACCTGGA 9348

 53592135 GTTACGCCGGGTTATACAGTTAAATAACTAAATGTACCCACCAGCAAGCAGATTTCACCA 53592194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9349 GTTACGCCGGGTTATACAGTTAAATAACTAAATGTACCCACCAGCAAGCAGATTTCACCA 9408

 53592195 GTGGGTTCCCTGCATGGTAAGCCCACAGAGAGGCTCTGGCCAGAGCCTGCATATGACTGT 53592254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9409 GTGGGTTCCCTGCATGGTAAGCCCACAGAGAGGCTCTGGCCAGAGCCTGCATATGACTGT 9468

 53592255 CCTTGCTGGCAAGTGTCTTGATCTCTGGGAATGAATAAATCAGTATGTGGCATATTTGAT 53592314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9469 CCTTGCTGGCAAGTGTCTTGATCTCTGGGAATGAATAAATCAGTATGTGGCATATTTGAT 9528

 53592315 TGCCCCTTGCTAGCATCGGGGGACAGGCCCAACCAGCTCTGGGGCCCAGACAGTTGGGCT 53592374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9529 TGCCCCTTGCTAGCATCGGGGGACAGGCCCAACCAGCTCTGGGGCCCAGACAGTTGGGCT 9588

 53592375 TCTGATCCCATCAGCCAAGGACCTCACCTCACATCTGGTGAATTCACCAGTAAGAATAAG 53592434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9589 TCTGATCCCATCAGCCAAGGACCTCACCTCACATCTGGTGAATTCACCAGTAAGAATAAG 9648

 53592435 AACAAACCTTGTAGAGAAGAAATCACAGTGGCAGAATTAGCAATGTGGAGTGAGAGGATG 53592494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9649 AACAAACCTTGTAGAGAAGAAATCACAGTGGCAGAATTAGCAATGTGGAGTGAGAGGATG 9708

 53592495 GTTTCTTCTCTGTTATCCAAAATGTTTGTAATTTGCTTATCTAATTTTTTTTTTTTATGA 53592554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||
     9709 GTTTCTTCTCTGTTATCCAAAATGTTTGTAATTTGCTTATCTAATTTTTTTTTT--ATGA 9766

 53592555 GATAAGGTCTTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGAACATGGCTCACTGCA 53592614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9767 GATAAGGTCTTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGAACATGGCTCACTGCA 9826

 53592615 GGCTCAACCTTCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCCAGGACTA 53592674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9827 GGCTCAACCTTCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCCAGGACTA 9886

 53592675 CAGGTGCCCACCATCATGCCTGGCTAATTTTAAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAG- 53592733
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
     9887 CAGGTGCCCACCATCATGCCTGGCTAATTTTAAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----T 9942

 53592734 -------AGATGGGGTCTCACTATGTTGCCAGGGCTTTATCTAATTTTTTAAAATATGAA 53592786
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9943 TTTTTTTAGATGGGGTCTCACTATGTTGCCAGGGCTTTATCTAATTTTTTAAAATATGAA 10002

 53592787 AACATCTTTAAAGTTCAGCTCCTAACTGTCCTCCAGGGCCCATACAAATGCTGATGGTGA 53592846
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||
    10003 AACATCTTTAAAGTTCAGCTCCTAACTGTCCTCCAGGGCCCATGCAAATGCTGGTGGTGA 10062

 53592847 GACTTTCCCTGAACTCTGCTGCCGCTGCCCTCTGCTGCTTCTTATTCATTGAAAATGTAT 53592906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10063 GACTTTCCCTGAACTCTGCTGCCGCTGCCCTCTGCTGCTTCTTATTCATTGAAAATGTAT 10122

 53592907 TGATCAGGCACAGGCAGTAGCAGGCCCTGTATGGGGCAGTGAGAAATCAGATGAAAGGGG 53592966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
    10123 TGATCAGGCACAGGCAGTAGCAGGCCCTGTATGGGGCAGTGAGAAATCAGATGAAAAGGG 10182

 53592967 GAGAGTTATATTCTTCAGAATTATTTTTACAGTAAGGGAGCAGTCCTTATTCAGAAGAAA 53593026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10183 GAGAGTTATATTCTTCAGAATTATTTTTACAGTAAGGGAGCAGTCCTTATTCAGAAGAAA 10242

 53593027 GTTCTTGATGAACTACTTGGACAGAAGCTGAGCAGTGGCTCCACTCAACCCAAGCCGGCT 53593086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10243 GTTCTTGATGAACTACTTGGACAGAAGCTGAGCAGTGGCTCCACTCAACCCAAGCCGGCT 10302

 53593087 CCAGGGAGAGAGGTGAGCAGAAGTGACTTCTGAAAGACATCCAGCTGCTCTGGGGACAGA 53593146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10303 CCAGGGAGAGAGGTGAGCAGAAGTGACTTCTGAAAGACATCCAGCTGCTCTGGGGACAGA 10362

 53593147 GGAAGAGAGAAGGAAGGTTCCAGGAGAGAGAAGGAGGTGGACAGGCCCTCAGGCCACCCC 53593206
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10363 GGAAGAGAGAAGGAAGATTCCAGGAGAGAGAAGGAGGTGGACAGGCCCTCAGGCCACCCC 10422

 53593207 GATGACCCAAGCCCTGGTATATCCTCCTCCCGCAGTGTGGCAGTGCCTGTGACTTCTATG 53593266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10423 GATGACCCAAGCCCTGGTATATCCTCCTCCCGCAGTGTGGCAGTGCCTGTGACTTCTATG 10482

 53593267 AGAACACAACAAGGTGGTGGGATGTCTCCCTGTGGTTATGTGGTAGAAGACTTTGACTCA 53593326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10483 AGAACACAACAAGGTGGTGGGATGTCTCCCTGTGGTTATGTGGTAGAAGACTTTGACTCA 10542

 53593327 GAAGACTGGTGAGGACCGGGCTTCCTGCTGGCCTTGATGACCTACAGTGCTATGCTGTGA 53593386
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10543 GAAGACTGGTGAGAACCGGGCTTCCTGCTGGCCTTGATGACCTACAGTGCTATGCTGTGA 10602

 53593387 GCTGCCTGTGGAGACAGCTGGGTGGGGAGCTGCAGGCAGCCTCTAGAACCTGAGTGGCTC 53593446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10603 GCTGCCTGTGGAGACAGCTGGGTGGGGAGCTGCAGGCAGCCTCTAGAACCTGAGTGGCTC 10662

 53593447 CACTGCACAGCTGTCAATGCTGGGCCCTCAGGCAGCAGCCATGGGGAATCACTTCTGTCC 53593506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10663 CACTGCACAGCTGTCAATGCTGGGCCCTCAGGCAGCAGCCATGGGGAATCACTTCTGTCC 10722

 53593507 ATGCCTGAGGGAGCATGGAGGCGGATTCTCCCTGGTTGGGCCTCCGGATGAGAACAGAGC 53593566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10723 ATGCCTGAGGGAGCATGGAGGCGGATTCTCCCTGGTTGGGCCTCCGGATGAGAACAGAGC 10782

 53593567 CCAGCGGACACCTGGATTGCAGCCTAAGACTCTGAGCAGAGGACTCAGCCAAGCCCGCCC 53593626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10783 CCAGCGGACACCTGGATTGCAGCCTAAGACTCTGAGCAGAGGACTCAGCCAAGCCCGCCC 10842

 53593627 AGACTGCTGGCCCAGGGACTGAGGCAACCATGAAGTGTGTTTATGTCACTAAGTTTGTGA 53593686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10843 AGACTGCTGGCCCAGGGACTGAGGCAACCATGAAGTGTGTTTATGTCACTAAGTTTGTGA 10902

 53593687 TAATTTGTTACACGGCAATGATAACGAATACACACAGACACACACACAGAGAACCAGGAG 53593746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10903 TAATTTGTTACACGGCAATGATAACGAATACACACAGACACACACACAGAGAACCAGGAG 10962

 53593747 ATAACTGAAGGCACTACTTGAAGCAAGGAATGCTGGTGTGAATGGGAAGCTGATGAAGGC 53593806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10963 ATAACTGAAGGCACTACTTGAAGCAAGGAATGCTGGTGTGAATGGGAAGCTGATGAAGGC 11022

 53593807 TGCTTGGTTGTAGGAGTGAAGGGCATAGAAAAGCAAGAGGCAGTAAGAATAGGAATTGGG 53593866
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11023 TGCTTGATTGTAGGAGTGAAGGGCATAGAAAAGCAAGAGGCAGTAAGAATAGGAATTGGG 11082

 53593867 CAGGGTGCGGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCAGGAGGATG 53593926
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11083 CAGGGTGTGGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCAGGAGGATG 11142

 53593927 CCTCGAGCCCAGGAATTCAAGGCCAGCCTTGGCAACATAGTGAGAGCCCCATGTCTACCC 53593986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11143 CCTCGAGCCCAGGAATTCAAGGCCAGCCTTGGCAACATAGTGAGAGCCCCATGTCTACCC 11202

 53593987 AAAATTTAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTAATTGGGAG 53594046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11203 AAAATTTAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTAATTGGGAG 11262

 53594047 GCTAAGTCGGGAGGATCGATTGAGCCCTGGAGTTGAAAGTTACAGTGAGCT 53594097
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11263 GCTAAGTCGGGAGGATCGATTGAGCCCTGGAGTTGAAAGTTACAGTGAGCT 11313

EXCISED REGION

 53594949 GTAATAACCTCGTGAAGGAGGTATTCTTCCCACTTTATAGATAAGGACACTGAGGCTCAG 53595008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11314 GTAATAACCTCGTGAAGGAGGTATTCTTCCCACTTTATAGATAAGGACACTGAGGCTCAG 11373

 53595009 ATGCTAAAAGGCTTGTTTACATTTGCACATCTAGAGGGTGACTCCAAAGCCCTGTTCCTG 53595068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11374 ATGCTAAAAGGCTTGTTTACATTTGCACATCTAGAGGGTGACTCCAAAGCCCTGTTCCTG 11433

 53595069 CCCTGTAGCCTTTGCAGATTTCAACCACCCCCGCCCATGCTTCCTGCTCCCCCGCCACAT 53595128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11434 CCCTGTAGCCTTTGCAGATTTCAACCACCCCCGCCCATGCTTCCTGCTCCCCCGCCACAT 11493

Alignment time is 8.70755 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [53584097,53604948] =>     20852 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2076] =>      2076 nucs 'mol-32-1f00-117880_2076'

Score:        1823
Aligned:      1900        nucs
Identic:      1893 (100%) nucs =>      1357 ( 99%)       536 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [53592736,53594099] EXCISED REGION [53595604,53596139]
 second seq =>  [       2,    1365] EXCISED REGION [    1541,    2076]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1504 nucs [53594100,53595603]
 second seq =>       175 nucs [1366,1540]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1366,1366] to [1540,1540]

 53592736 ATGGGGTCTCACTATGTTGCCAGGGCTTTATCTAATTTTTTAAAATATGAAAACATCTTT 53592795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        2 ATGGGGTCTCACTATGTTGCCAGGGCTTTATCTAATTTTTTAAAATATGAAAACATCTTT 61

 53592796 AAAGTTCAGCTCCTAACTGTCCTCCAGGGCCCATACAAATGCTGATGGTGAGACTTTCCC 53592855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||
       62 AAAGTTCAGCTCCTAACTGTCCTCCAGGGCCCATGCAAATGCTGGTGGTGAGACTTTCCC 121

 53592856 TGAACTCTGCTGCCGCTGCCCTCTGCTGCTTCTTATTCATTGAAAATGTATTGATCAGGC 53592915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      122 TGAACTCTGCTGCCGCTGCCCTCTGCTGCTTCTTATTCATTGAAAATGTATTGATCAGGC 181

 53592916 ACAGGCAGTAGCAGGCCCTGTATGGGGCAGTGAGAAATCAGATGAAAGGGGGAGAGTTAT 53592975
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      182 ACAGGCAGTAGCAGGCCCTGTATGGGGCAGTGAGAAATCAGATGAAAAGGGGAGAGTTAT 241

 53592976 ATTCTTCAGAATTATTTTTACAGTAAGGGAGCAGTCCTTATTCAGAAGAAAGTTCTTGAT 53593035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      242 ATTCTTCAGAATTATTTTTACAGTAAGGGAGCAGTCCTTATTCAGAAGAAAGTTCTTGAT 301

 53593036 GAACTACTTGGACAGAAGCTGAGCAGTGGCTCCACTCAACCCAAGCCGGCTCCAGGGAGA 53593095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      302 GAACTACTTGGACAGAAGCTGAGCAGTGGCTCCACTCAACCCAAGCCGGCTCCAGGGAGA 361

 53593096 GAGGTGAGCAGAAGTGACTTCTGAAAGACATCCAGCTGCTCTGGGGACAGAGGAAGAGAG 53593155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      362 GAGGTGAGCAGAAGTGACTTCTGAAAGACATCCAGCTGCTCTGGGGACAGAGGAAGAGAG 421

 53593156 AAGGAAGGTTCCAGGAGAGAGAAGGAGGTGGACAGGCCCTCAGGCCACCCCGATGACCCA 53593215
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      422 AAGGAAGATTCCAGGAGAGAGAAGGAGGTGGACAGGCCCTCAGGCCACCCCGATGACCCA 481

 53593216 AGCCCTGGTATATCCTCCTCCCGCAGTGTGGCAGTGCCTGTGACTTCTATGAGAACACAA 53593275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      482 AGCCCTGGTATATCCTCCTCCCGCAGTGTGGCAGTGCCTGTGACTTCTATGAGAACACAA 541

 53593276 CAAGGTGGTGGGATGTCTCCCTGTGGTTATGTGGTAGAAGACTTTGACTCAGAAGACTGG 53593335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      542 CAAGGTGGTGGGATGTCTCCCTGTGGTTATGTGGTAGAAGACTTTGACTCAGAAGACTGG 601

 53593336 TGAGGACCGGGCTTCCTGCTGGCCTTGATGACCTACAGTGCTATGCTGTGAGCTGCCTGT 53593395
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      602 TGAGAACCGGGCTTCCTGCTGGCCTTGATGACCTACAGTGCTATGCTGTGAGCTGCCTGT 661

 53593396 GGAGACAGCTGGGTGGGGAGCTGCAGGCAGCCTCTAGAACCTGAGTGGCTCCACTGCACA 53593455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      662 GGAGACAGCTGGGTGGGGAGCTGCAGGCAGCCTCTAGAACCTGAGTGGCTCCACTGCACA 721

 53593456 GCTGTCAATGCTGGGCCCTCAGGCAGCAGCCATGGGGAATCACTTCTGTCCATGCCTGAG 53593515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      722 GCTGTCAATGCTGGGCCCTCAGGCAGCAGCCATGGGGAATCACTTCTGTCCATGCCTGAG 781

 53593516 GGAGCATGGAGGCGGATTCTCCCTGGTTGGGCCTCCGGATGAGAACAGAGCCCAGCGGAC 53593575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      782 GGAGCATGGAGGCGGATTCTCCCTGGTTGGGCCTCCGGATGAGAACAGAGCCCAGCGGAC 841

 53593576 ACCTGGATTGCAGCCTAAGACTCTGAGCAGAGGACTCAGCCAAGCCCGCCCAGACTGCTG 53593635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      842 ACCTGGATTGCAGCCTAAGACTCTGAGCAGAGGACTCAGCCAAGCCCGCCCAGACTGCTG 901

 53593636 GCCCAGGGACTGAGGCAACCATGAAGTGTGTTTATGTCACTAAGTTTGTGATAATTTGTT 53593695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      902 GCCCAGGGACTGAGGCAACCATGAAGTGTGTTTATGTCACTAAGTTTGTGATAATTTGTT 961

 53593696 ACACGGCAATGATAACGAATACACACAGACACACACACAGAGAACCAGGAGATAACTGAA 53593755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      962 ACACGGCAATGATAACGAATACACACAGACACACACACAGAGAACCAGGAGATAACTGAA 1021

 53593756 GGCACTACTTGAAGCAAGGAATGCTGGTGTGAATGGGAAGCTGATGAAGGCTGCTTGGTT 53593815
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1022 GGCACTACTTGAAGCAAGGAATGCTGGTGTGAATGGGAAGCTGATGAAGGCTGCTTGATT 1081

 53593816 GTAGGAGTGAAGGGCATAGAAAAGCAAGAGGCAGTAAGAATAGGAATTGGGCAGGGTGCG 53593875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1082 GTAGGAGTGAAGGGCATAGAAAAGCAAGAGGCAGTAAGAATAGGAATTGGGCAGGGTGTG 1141

 53593876 GTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCAGGAGGATGCCTCGAGCC 53593935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 GTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCAGGAGGATGCCTCGAGCC 1201

 53593936 CAGGAATTCAAGGCCAGCCTTGGCAACATAGTGAGAGCCCCATGTCTACCCAAAATTTAA 53593995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 CAGGAATTCAAGGCCAGCCTTGGCAACATAGTGAGAGCCCCATGTCTACCCAAAATTTAA 1261

 53593996 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTAATTGGGAGGCTAAGTCG 53594055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTAATTGGGAGGCTAAGTCG 1321

 53594056 GGAGGATCGATTGAGCCCTGGAGTTGAAAGTTACAGTGAGCTGT 53594099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 GGAGGATCGATTGAGCCCTGGAGTTGAAAGTTACAGTGAGCTGT 1365

EXCISED REGION

 53595604 CATGCCGCTGGCCCGACCCCTTGACAGTGGCTTTCTTGTTCAGTGAGATGAGTGGCTCTT 53595663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 CATGCCGCTGGCCCGACCCCTTGACAGTGGCTTTCTTGTTCAGTGAGATGAGTGGCTCTT 1600

 53595664 CCGAATAGGGATACTAGTTGGTTTGCTCACATAGATGTCACTACTGGACTAAAAGATGCC 53595723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 CCGAATAGGGATACTAGTTGGTTTGCTCACATAGATGTCACTACTGGACTAAAAGATGCC 1660

 53595724 TGTCCCCCATTGTGTGGCATGCCAGCTGCGACCGTGAGGTCACTGAGCTAACGACACTCA 53595783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 TGTCCCCCATTGTGTGGCATGCCAGCTGCGACCGTGAGGTCACTGAGCTAACGACACTCA 1720

 53595784 GCTCATGCAGGTCACACACAGCGTCAGCATTGGAGACAGATCATCATCCATTTTACCAAC 53595843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 GCTCATGCAGGTCACACACAGCGTCAGCATTGGAGACAGATCATCATCCATTTTACCAAC 1780

 53595844 AAATGGGGAGGTGGAAGGACTTCCCACACAGAACCTTGAGCTAGGTCTTGAATACAGAGT 53595903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 AAATGGGGAGGTGGAAGGACTTCCCACACAGAACCTTGAGCTAGGTCTTGAATACAGAGT 1840

 53595904 GAGACTTTAAATTAAAAGAATTAAAAGAGGGCGTGCATGGCAGGGGCTGGGCAGGAGCAG 53595963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 GAGACTTTAAATTAAAAGAATTAAAAGAGGGCGTGCATGGCAGGGGCTGGGCAGGAGCAG 1900

 53595964 GAGTGTGGAGATAGACCCTTGTGGCATGCTGTGGGACTAGTGGGTGACCAGCCTGGTTCC 53596023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 GAGTGTGGAGATAGACCCTTGTGGCATGCTGTGGGACTAGTGGGTGACCAGCCTGGTTCC 1960

 53596024 AGGGCTTGGCATGGGGAAAGGGTGGCTGTTTGTCCTGGAGAGGAGGTGGGAACAGATGTC 53596083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 AGGGCTTGGCATGGGGAAAGGGTGGCTGTTTGTCCTGGAGAGGAGGTGGGAACAGATGTC 2020

 53596084 ATGGGAGCCAGGCTTCGAGGCCCAGACCTGCAGATGGTTGGAACTGGAAGCTGGTG 53596139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 ATGGGAGCCAGGCTTCGAGGCCCAGACCTGCAGATGGTTGGAACTGGAAGCTGGTG 2076

Alignment time is 1.57944 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [53584097,53604948] =>     20852 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2344] =>      2344 nucs 'mol-32-20fa-044627_2344'

Score:        2262
Aligned:      2341        nucs
Identic:      2333 (100%) nucs =>       934 (100%)      1399 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [53591774,53592710] EXCISED REGION [53592711,53594114]
 second seq =>  [       1,     935] EXCISED REGION [     941,    2344]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         5 nucs [936,940]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        19 nucs [936,954] to [941,959]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [936,937] to [939,940]

 53591774 GTTGCTGTTTCTTTAAGCAAACACCAGATGAGAGCATCAGCATACACTCAGAGGCCGTGA 53591833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGCTGTTTCTTTAAGCAAACACCAGATGAGAGCATCAGCATACACTCAGAGGCCGTGA 60

 53591834 TCTAAAACACCCACCCCTCTGCAGGCCCTAGAAACTCTCTGGCTTCAGGGAGGTGCTCAC 53591893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTAAAACACCCACCCCTCTGCAGGCCCTAGAAACTCTCTGGCTTCAGGGAGGTGCTCAC 120

 53591894 TGTTCAGGAGGTGCCTGGGCACAGCGGCTGGTGGAGGCAATTCAGGCCCTCCTCTCTCGT 53591953
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTCAGGAGGTGCCTGGGCACAGAGGCTGGTGGAGGCAATTCAGGCCCTCCTCTCTCGT 180

 53591954 GGCCCTCACCTGGGGAAGAGCCCTTGGAAGGAGGAGTCTCCTGTCTCATTTAAATGATTT 53592013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCCCTCACCTGGGGAAGAGCCCTTGGAAGGAGGAGTCTCCTGTCTCATTTAAATGATTT 240

 53592014 TCTCCCTTTTTCAGAGCACATGTAATTGAATTCACTTAAGTTAAATGCACATATGATGGG 53592073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCCCTTTTTCAGAGCACATGTAATTGAATTCACTTAAGTTAAATGCACATATGATGGG 300

 53592074 ACTCCACTATAAGGCGGGGGTGGTGGGAGGGCTGAAATAAACTGAAAACCGCAAACCTGG 53592133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTCCACTATAAGGCGGGGGTGGTGGGAGGGCTGAAATAAACTGAAAACCGCAAACCTGG 360

 53592134 AGTTACGCCGGGTTATACAGTTAAATAACTAAATGTACCCACCAGCAAGCAGATTTCACC 53592193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTTACGCCGGGTTATACAGTTAAATAACTAAATGTACCCACCAGCAAGCAGATTTCACC 420

 53592194 AGTGGGTTCCCTGCATGGTAAGCCCACAGAGAGGCTCTGGCCAGAGCCTGCATATGACTG 53592253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTGGGTTCCCTGCATGGTAAGCCCACAGAGAGGCTCTGGCCAGAGCCTGCATATGACTG 480

 53592254 TCCTTGCTGGCAAGTGTCTTGATCTCTGGGAATGAATAAATCAGTATGTGGCATATTTGA 53592313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTTGCTGGCAAGTGTCTTGATCTCTGGGAATGAATAAATCAGTATGTGGCATATTTGA 540

 53592314 TTGCCCCTTGCTAGCATCGGGGGACAGGCCCAACCAGCTCTGGGGCCCAGACAGTTGGGC 53592373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGCCCCTTGCTAGCATCGGGGGACAGGCCCAACCAGCTCTGGGGCCCAGACAGTTGGGC 600

 53592374 TTCTGATCCCATCAGCCAAGGACCTCACCTCACATCTGGTGAATTCACCAGTAAGAATAA 53592433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCTGATCCCATCAGCCAAGGACCTCACCTCACATCTGGTGAATTCACCAGTAAGAATAA 660

 53592434 GAACAAACCTTGTAGAGAAGAAATCACAGTGGCAGAATTAGCAATGTGGAGTGAGAGGAT 53592493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAACAAACCTTGTAGAGAAGAAATCACAGTGGCAGAATTAGCAATGTGGAGTGAGAGGAT 720

 53592494 GGTTTCTTCTCTGTTATCCAAAATGTTTGTAATTTGCTTATCTAATTTTTTTTTTTTATG 53592553
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
      721 GGTTTCTTCTCTGTTATCCAAAATGTTTGTAATTTGCTTATCTAATTTTTTTTTT--ATG 778

 53592554 AGATAAGGTCTTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGAACATGGCTCACTGC 53592613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 AGATAAGGTCTTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGAACATGGCTCACTGC 838

 53592614 AGGCTCAACCTTCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCCAGGACT 53592673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 AGGCTCAACCTTCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCCAGGACT 898

 53592674 ACAGGTGCCCACCATCATGCCTGGCTAATTTTAAAAG 53592710
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 ACAGGTGCCCACCATCATGCCTGGCTAATTTTAAAAG 935

EXCISED REGION

 53592711 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGCCAGGGCTTTATCTAA 53592770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATGGGGTCTCACTATGTTGCCAGGGCTTTATCTAA 1000

 53592771 TTTTTTAAAATATGAAAACATCTTTAAAGTTCAGCTCCTAACTGTCCTCCAGGGCCCATA 53592830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 TTTTTTAAAATATGAAAACATCTTTAAAGTTCAGCTCCTAACTGTCCTCCAGGGCCCATA 1060

 53592831 CAAATGCTGATGGTGAGACTTTCCCTGAACTCTGCTGCCGCTGCCCTCTGCTGCTTCTTA 53592890
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 CAAATGCTGGTGGTGAGACTTTCCCTGAACTCTGCTGCCGCTGCCCTCTGCTGCTTCTTA 1120

 53592891 TTCATTGAAAATGTATTGATCAGGCACAGGCAGTAGCAGGCCCTGTATGGGGCAGTGAGA 53592950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 TTCATTGAAAATGTATTGATCAGGCACAGGCAGTAGCAGGCCCTGTATGGGGCAGTGAGA 1180

 53592951 AATCAGATGAAAGGGGGAGAGTTATATTCTTCAGAATTATTTTTACAGTAAGGGAGCAGT 53593010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 AATCAGATGAAAGGGGGAGAGTTATATTCTTCAGAATTATTTTTACAGTAAGGGAGCAGT 1240

 53593011 CCTTATTCAGAAGAAAGTTCTTGATGAACTACTTGGACAGAAGCTGAGCAGTGGCTCCAC 53593070
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 CCTTATACAGAAGAAAGTTCTTGATGAACTACTTGGACAGAAGCTGAGCAGTGGCTCCAC 1300

 53593071 TCAACCCAAGCCGGCTCCAGGGAGAGAGGTGAGCAGAAGTGACTTCTGAAAGACATCCAG 53593130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 TCAACCCAAGCCGGCTCCAGGGAGAGAGGTGAGCAGAAGTGACTTCTGAAAGACATCCAG 1360

 53593131 CTGCTCTGGGGACAGAGGAAGAGAGAAGGAAGGTTCCAGGAGAGAGAAGGAGGTGGACAG 53593190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 CTGCTCTGGGGACAGAGGAAGAGAGAAGGAAGGTTCCAGGAGAGAGAAGGAGGTGGACAG 1420

 53593191 GCCCTCAGGCCACCCCGATGACCCAAGCCCTGGTATATCCTCCTCCCGCAGTGTGGCAGT 53593250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 GCCCTCAGGCCACCCCGATGACCCAAGCCCTGGTATATCCTCCTCCCGCAGTGTGGCAGT 1480

 53593251 GCCTGTGACTTCTATGAGAACACAACAAGGTGGTGGGATGTCTCCCTGTGGTTATGTGGT 53593310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 GCCTGTGACTTCTATGAGAACACAACAAGGTGGTGGGATGTCTCCCTGTGGTTATGTGGT 1540

 53593311 AGAAGACTTTGACTCAGAAGACTGGTGAGGACCGGGCTTCCTGCTGGCCTTGATGACCTA 53593370
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 AGAAGACTTTGACTCAGAAGACTGGTGAGAACCGGGCTTCCTGCTGGCCTTGATGACCTA 1600

 53593371 CAGTGCTATGCTGTGAGCTGCCTGTGGAGACAGCTGGGTGGGGAGCTGCAGGCAGCCTCT 53593430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 CAGTGCTATGCTGTGAGCTGCCTGTGGAGACAGCTGGGTGGGGAGCTGCAGGCAGCCTCT 1660

 53593431 AGAACCTGAGTGGCTCCACTGCACAGCTGTCAATGCTGGGCCCTCAGGCAGCAGCCATGG 53593490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 AGAACCTGAGTGGCTCCACTGCACAGCTGTCAATGCTGGGCCCTCAGGCAGCAGCCATGG 1720

 53593491 GGAATCACTTCTGTCCATGCCTGAGGGAGCATGGAGGCGGATTCTCCCTGGTTGGGCCTC 53593550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 GGAATCACTTCTGTCCATGCCTGAGGGAGCATGGAGGCGGATTCTCCCTGGTTGGGCCTC 1780

 53593551 CGGATGAGAACAGAGCCCAGCGGACACCTGGATTGCAGCCTAAGACTCTGAGCAGAGGAC 53593610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 CGGATGAGAACAGAGCCCAGCGGACACCTGGATTGCAGCCTAAGACTCTGAGCAGAGGAC 1840

 53593611 TCAGCCAAGCCCGCCCAGACTGCTGGCCCAGGGACTGAGGCAACCATGAAGTGTGTTTAT 53593670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 TCAGCCAAGCCCGCCCAGACTGCTGGCCCAGGGACTGAGGCAACCATGAAGTGTGTTTAT 1900

 53593671 GTCACTAAGTTTGTGATAATTTGTTACACGGCAATGATAACGAATACACACAGACACACA 53593730
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1901 GTCACTAAGTTTGTGATAATTTGTTACACGGCAGTGATAACGAATACACACAGACACACA 1960

 53593731 CACAGAGAACCAGGAGATAACTGAAGGCACTACTTGAAGCAAGGAATGCTGGTGTGAATG 53593790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 CACAGAGAACCAGGAGATAACTGAAGGCACTACTTGAAGCAAGGAATGCTGGTGTGAATG 2020

 53593791 GGAAGCTGATGAAGGCTGCTTGGTTGTAGGAGTGAAGGGCATAGAAAAGCAAGAGGCAGT 53593850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 GGAAGCTGATGAAGGCTGCTTGGTTGTAGGAGTGAAGGGCATAGAAAAGCAAGAGGCAGT 2080

 53593851 AAGAATAGGAATTGGGCAGGGTGCGGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGG 53593910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 AAGAATAGGAATTGGGCAGGGTGCGGTGACTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGG 2140

 53593911 CCAAGGCAGGAGGATGCCTCGAGCCCAGGAATTCAAGGCCAGCCTTGGCAACATAGTGAG 53593970
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 CCAAGGCAGGAGGATGCCTTGAGCCCAGGAATTCAAGGCCAGCCTTGGCAACATAGTGAG 2200

 53593971 AGCCCCATGTCTACCCAAAATTTAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGTGTGCCTGTAGT 53594030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 AGCCCCATGTCTACCCAAAATTTAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGTGTGCCTGTAGT 2260

 53594031 CCCAGCTAATTGGGAGGCTAAGTCGGGAGGATCGATTGAGCCCTGGAGTTGAAAGTTACA 53594090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 CCCAGCTAATTGGGAGGCTAAGTCGGGAGGATCGATTGAGCCCTGGAGTTGAAAGTTACA 2320

 53594091 GTGAGCTGTGGTCATGCCACTGCA 53594114
          ||||||||||||||||||||||||
     2321 GTGAGCTGTGGTCATGCCACTGCA 2344

Alignment time is 1.77087 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [53584097,53604948] =>     20852 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    5349] =>      5349 nucs 'mol-32-32f0-048977_5349'

Score:        5121
Aligned:      5347        nucs
Identic:      5324 (100%) nucs =>       887 ( 99%)      4437 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [53589030,53589922] EXCISED REGION [53589938,53594388]
 second seq =>  [       1,     893] EXCISED REGION [     898,    5349]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [53589923,53589937]
 second seq =>         4 nucs [894,897]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [893,893] to [897,897]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [53589922,53589922] to [53589938,53589938]
 second seq =>         1 nucs [893,893] to [898,898]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         7 nucs [53589923,53589929] to [53589931,53589937]
 second seq =>         0 nucs

 53589030 TCTCTCCAGTGCAGCGGTTCTCCACAGAGAAGGGCGGCAGCACAGTTTTCAAAACCTCAC 53589089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCTCCAGTGCAGCGGTTCTCCACAGAGAAGGGCGGCAGCACAGTTTTCAAAACCTCAC 60

 53589090 CCACCTTCCCAGGCTCTGAGATATGTGCCCACCCTGCCCGGTGTTGAACATTTGCACTGG 53589149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCACCTTCCCAGGCTCTGAGATATGTGCCCACCCTGCCCGGTGTTGAACATTTGCACTGG 120

 53589150 GTGCTGTGGGGCTCAGAAGGGAATGAGGTGGGTCTGTGTTCTTCCTGGTGCTCTGGCCAG 53589209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGCTGTGGGGCTCAGAAGGGAATGAGGTGGGTCTGTGTTCTTCCTGGTGCTCTGGCCAG 180

 53589210 CGGGTGGGGAGACCAGCAGCAGAGCAACACCAACCCGGGGGTGGGGGTAGCTGTGACTGA 53589269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CGGGTGGGGAGACCAGCAGCAGAGCAACACCAACCCGGGGGTGGGGGTAGCTGTGACTGA 240

 53589270 GCGCCAGAGCAGGGCCAGCCCTCCGGGCATCGGGCTGGGCCTCCCAGAGGAGGGCACAGC 53589329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCGCCAGAGCAGGGCCAGCCCTCCGGGCATCGGGCTGGGCCTCCCAGAGGAGGGCACAGC 300

 53589330 TGGATGGAGCCTCGAAGGCCAAGTAGGAATTCTCTAACTGGAAGGGAGCGAGAGCATGGA 53589389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGATGGAGCCTCGAAGGCCAAGTAGGAATTCTCTAACTGGAAGGGAGCGAGAGCATGGA 360

 53589390 AGTCTGTGGTGCAGGATAAAGCCTGGGAGCTTTTCGGAGTCACCAGGCTGGAGGTCTGAC 53589449
          |||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTTTGTGGTGCAGGATAAAGCCTGGGAGTTTTTCGGAGTCACCAGGCTGGAGGTCTGAC 420

 53589450 CCCACCCGCAGCCCACAGCGGGCCACGTTTCCCCTCTTGATGAGTAAGGCAAATCATCTG 53589509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCACCCGCAGCCCACAGCGGGCCACGTTTCCCCTCTTGATGAGTAAGGCAAATCATCTG 480

 53589510 ACTGGGCAGAAGGGCCAAAGGCAGGTCCCAGGGCTCACACCAGAAGGTTCAGTGGAGCTC 53589569
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTGGGCAGGAGGGCCAAAGGCAGGTCCCAGGGCTCACACCAGAAGGTTCAGTGGAGCTC 540

 53589570 GCCAAACTGTGGCTACCCCCTGACTCGGAGGGCAGCATCCGAAGCACAGGCTGTACCGGT 53589629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCAAACTGTGGCTACCCCCTGACTCGGAGGGCAGCATCCGAAGCACAGGCTGTACCGGT 600

 53589630 TTGGCCCTCTGGCCACCCGCTCCTCTGCCTCCTCCTGCTCACGGCCTGTCCTGGGGAGTC 53589689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGGCCCTCTGGCCACCCGCTCCTCTGCCTCCTCCTGCTCACGGCCTGTCCTGGGGAGTC 660

 53589690 TGGGCAGCCCCCTGCACACTGGCTCCCAAACCAGACTTTGACGGCTGCTTGGCCCAGGCC 53589749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGGCAGCCCCCTGCACACTGGCTCCCAAACCAGACTTTGACGGCTGCTTGGCCCAGGCC 720

 53589750 CATTTCCAATAAGTTAGAATGTGGGTGTTTGGGAATTTTCTGCCACACTAGAGTTCCTCA 53589809
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
      721 CATTTCCAATAAGTTAGAATGTGGGTGTTTGGGAATTTTCTGCCAAACTAGGGTTCCTCA 780

 53589810 GGAAGGGGAGAAGGGAGTGTTGAGTTTCTCTGGCCAAACATGATTTCCTGATTCTAAGAA 53589869
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAAGGGGAGAAGGGATTGTTGAGTTTCTCTGGCCAAACATGATTTCCTGATTCTAAGAA 840

 53589870 AAATCAGTTTAAAGTCCTTACAAGAAATAGGAAGGAAAACAATACATACACAA 53589922
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATCAGTTTAAAGTCCTTACAAGAAATAGGAAGGAAAACAATACATACACAA 893

EXCISED REGION

 53589938 ACACACACACACACACACACACACAACACAGCTTCACAGACAAACCCACACCCACGCTTG 53589997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 ACACACACACACACACACACACACAACACAGCTTCACAGACAAACCCACACCCACGCTTG 957

 53589998 GCTGTCTTTGCTATGTTGTGGAGCTCACAGAACACTCTATCATGCACAGCCCTAGTGAAT 53590057
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
      958 GCTGTCTTTGCTATGTTGTGGAGCTCACAGAACACTCTACCATGCGCAGCCCTAGTGAAT 1017

 53590058 CACAAACACATGGATTCAGTTTCCCCTGAAGGACGCCTGGTTTAAGAAACTGAAGAATGA 53590117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 CACAAACACATGGATTCAGTTTCCCCTGAAGGACGCCTGGTTTAAGAAACTGAAGAATGA 1077

 53590118 GGGGAGAGAAGGGTTTGGCAAAAAGCAAGTGGAGAATTGGAGGCTCTAGCTGGATCCAGA 53590177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 GGGGAGAGAAGGGTTTGGCAAAAAGCAAGTGGAGAATTGGAGGCTCTAGCTGGATCCAGA 1137

 53590178 TGCTGGTCTGACTTACCCCTAATTCCTTGTGTCAAGCTTGTCTGGGGATGTGTGAAAACA 53590237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 TGCTGGTCTGACTTACCCCTAATTCCTTGTGTCAAGCTTGTCTGGGGATGTGTGAAAACA 1197

 53590238 AGGCTCAGTTGACCTCCCAAGGTGAGGTGCAAAGTCTAGCCTCAGTGGAATGGGGCCATA 53590297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 AGGCTCAGTTGACCTCCCAAGGTGAGGTGCAAAGTCTAGCCTCAGTGGAATGGGGCCATA 1257

 53590298 ATGGGCCACACACACAAACACACATGGGCACACAAACACACACACAGAGCACCTGCCGGG 53590357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 ATGGGCCACACACACAAACACACATGGGCACACAAACACACACACAGAGCACCTGCCGGG 1317

 53590358 ACCTGCTTTGTAAATTAGCAGACAGCATTGTGCCTATTTTATGGCTGAGGCTAAGAGGGT 53590417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 ACCTGCTTTGTAAATTAGCAGACAGCATTGTGCCTATTTTATGGCTGAGGCTAAGAGGGT 1377

 53590418 GAACTCGAGGTGAGACCACAGTCCCGAGGCAGGGCAGCTCCCTCAAGAGTCTAGCAGCCT 53590477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 GAACTCGAGGTGAGACCACAGTCCCGAGGCAGGGCAGCTCCCTCAAGAGTCTAGCAGCCT 1437

 53590478 CCCAAGTGCCTTGTGACAGGCAAAAGACTTTGCAAACTCTGTGCCTCCCGAGTGGGTGAG 53590537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 CCCAAGTGCCTTGTGACAGGCAAAAGACTTTGCAAACTCTGTGCCTCCCGAGTGGGTGAG 1497

 53590538 TAAAACAGGATCACCAAGGTGAAGGTGCAGCGTGGAAATTCTTATGACATCACATTGGGG 53590597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TAAAACAGGATCACCAAGGTGAAGGTGCAGCGTGGAAATTCTTATGACATCACATTGGGG 1557

 53590598 GAAAACCAAAGCAAGCAGGCTACAGATTTATTTTTGTGGAAGATACTTTTTGGGTTATAC 53590657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 GAAAACCAAAGCAAGCAGGCTACAGATTTATTTTTGTGGAAGATACTTTTTGGGTTATAC 1617

 53590658 TGTAAGTTGAAAGCAAAAAGGATTGGGGTAGTGACAAGTGGCCTGCTCGGGGAAGAATGG 53590717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||
     1618 TGTAAGTTGAAAGCAAAAAGGATTGGGGTAGTGACAAGTGGCCTGCTGGGGGGAGAATGG 1677

 53590718 GAAAGTAAGGCTCCCAGGCCCTGAAGGCTTGACTTTTCTAAATAAAGATATAATTGGCAT 53590777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 GAAAGTAAGGCTCCCAGGCCCTGAAGGCTTGACTTTTCTAAATAAAGATATAATTGGCAT 1737

 53590778 GGCGTTAGTGAACTGTGGCAGCACACGGAAGACGGCTGAGGAGGGCAAAACCATGGGAGG 53590837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GGCGTTAGTGAACTGTGGCAGCACACGGAAGACGGCTGAGGAGGGCAAAACCATGGGAGG 1797

 53590838 GGGGCCCCAATGCAGGTCCCGTCCAGATGATTCGTTCCTATACTAATGTAATGTGAGGCA 53590897
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1798 GGGGCCCCAATGCAGGTCCCGTCCAGATGATTCATTCCTATACTAATGTAATGTGAGGCA 1857

 53590898 GAATTTTCTAATTTTTGTCCAAGGCGTCTCTGTTCCTGGGTGGACAGAGCAAGTTCCCCT 53590957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 GAATTTTCTAATTTTTGTCCAAGGCGTCTCTGTTCCTGGGTGGACAGAGCAAGTTCCCCT 1917

 53590958 GCAGGCAATTTTATTTTGCAAAGAATCTTTTGAGCAGCAAATGTCGGATGAGAAGGCAGC 53591017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 GCAGGCAATTTTATTTTGCAAAGAATCTTTTGAGCAGCAAATGTCGGATGAGAAGGCAGC 1977

 53591018 ACTGTCAGGGGAAGGGAGGAGCTGTTGTGGCTTGATGAATGCCTCCTCCTTGAGAACTTG 53591077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 ACTGTCAGGGGAAGGGAGGAGCTGTTGTGGCTTGATGAATGCCTCCTCCTTGAGAACTTG 2037

 53591078 AGATCTGCAGAGTTATGGAAAACTGTGCCCATTTGCACCAGAGGATCAGGGCCTTCTGAG 53591137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 AGATCTGCAGAGTTATGGAAAACTGTGCCCATTTGCACCAGAGGATCAGGGCCTTCTGAG 2097

 53591138 AGGAAAAAGACTAAGACCTGAGCCCCAGTTCCCTGTGATTTGAAGTTAGCACCAGGGTAC 53591197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 AGGAAAAAGACTAAGACCTGAGCCCCAGTTCCCTGTGATTTGAAGTTAGCACCAGGGTAC 2157

 53591198 GCTAGAGTCCCCCAGCCGAGATGGCCTGGCATTCAAGGCCTCCAAAATGAACCCAGTAGG 53591257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 GCTAGAGTCCCCCAGCCGAGATGGCCTGGCATTCAAGGCCTCCAAAATGAACCCAGTAGG 2217

 53591258 AGGGAAAAGGGAATTGGGGCTCAACTCCCGGGGAGCTGATCTCAGGACATGACTGAGGCT 53591317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 AGGGAAAAGGGAATTGGGGCTCAACTCCCGGGGAGCTGATCTCAGGACATGACTGAGGCT 2277

 53591318 GCTTTAGGAACAATTATTGAGCACTTCGGGGGGACCTAGGGGTCTGGAGGCATCCCTGTG 53591377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 GCTTTAGGAACAATTATTGAGCACTTCGGGGGGACCTAGGGGTCTGGAGGCATCCCTGTG 2337

 53591378 GCCTGAGCAGCGTTGTGCACCTGCAAGGGGCAGTGTGCAGACTTCCACCAGAGCGTGCGG 53591437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 GCCTGAGCAGCGTTGTGCACCTGCAAGGGGCAGTGTGCAGACTTCCACCAGAGCGTGCGG 2397

 53591438 GACCTGCGTTCCACAGGGCCACCCCGTGGAGGGAACCAGAGCAGCAGGGCTGGTGGCAGG 53591497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 GACCTGCGTTCCACAGGGCCACCCCGTGGAGGGAACCAGAGCAGCAGGGCTGGTGGCAGG 2457

 53591498 ACCCCATGTTCCAGCTCTGTTTACACCAGAAGCTTCCACTGAATGAAATAAGCTGACTGT 53591557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 ACCCCATGTTCCAGCTCTGTTTACACCAGAAGCTTCCACTGAATGAAATAAGCTGACTGT 2517

 53591558 GGCCACGGGGTGGAGGCCTCCAGAGGGACACACTGGGCTTCCTGCTAGTACAGGGGAGTA 53591617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GGCCACGGGGTGGAGGCCTCCAGAGGGACACACTGGGCTTCCTGCTAGTACAGGGGAGTA 2577

 53591618 GGACCATATTCAGTGTATTCAGTTTCAAGTCAGTAAAGCAAAAACAAAGTGTAATTAATT 53591677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 GGACCATATTCAGTGTATTCAGTTTCAAGTCAGTAAAGCAAAAACAAAGTGTAATTAATT 2637

 53591678 TTGCCTTTGAAAATCTCTTAAGTTGCCCATAGAGTCCAGGAGGTATAGTTTTGTGTAAGT 53591737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TTGCCTTTGAAAATCTCTTAAGTTGCCCATAGAGTCCAGGAGGTATAGTTTTGTGTAAGT 2697

 53591738 TCATTCAAGACAGTTTCCCTTCCAGCCTTGGAGTGGGTTGCTGTTTCTTTAAGCAAACAC 53591797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TCATTCAAGACAGTTTCCCTTCCAGCCTTGGAGTGGGTTGCTGTTTCTTTAAGCAAACAC 2757

 53591798 CAGATGAGAGCATCAGCATACACTCAGAGGCCGTGATCTAAAACACCCACCCCTCTGCAG 53591857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 CAGATGAGAGCATCAGCATACACTCAGAGGCCGTGATCTAAAACACCCACCCCTCTGCAG 2817

 53591858 GCCCTAGAAACTCTCTGGCTTCAGGGAGGTGCTCACTGTTCAGGAGGTGCCTGGGCACAG 53591917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GCCCTAGAAACTCTCTGGCTTCAGGGAGGTGCTCACTGTTCAGGAGGTGCCTGGGCACAG 2877

 53591918 CGGCTGGTGGAGGCAATTCAGGCCCTCCTCTCTCGTGGCCCTCACCTGGGGAAGAGCCCT 53591977
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 AGGCTGGTGGAGGCAATTCAGGCCCTCCTCTCTCGTGGCCCTCACCTGGGGAAGAGCCCT 2937

 53591978 TGGAAGGAGGAGTCTCCTGTCTCATTTAAATGATTTTCTCCCTTTTTCAGAGCACATGTA 53592037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TGGAAGGAGGAGTCTCCTGTCTCATTTAAATGATTTTCTCCCTTTTTCAGAGCACATGTA 2997

 53592038 ATTGAATTCACTTAAGTTAAATGCACATATGATGGGACTCCACTATAAGGCGGGGGTGGT 53592097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 ATTGAATTCACTTAAGTTAAATGCACATATGATGGGACTCCACTATAAGGCGGGGGTGGT 3057

 53592098 GGGAGGGCTGAAATAAACTGAAAACCGCAAACCTGGAGTTACGCCGGGTTATACAGTTAA 53592157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 GGGAGGGCTGAAATAAACTGAAAACCGCAAACCTGGAGTTACGCCGGGTTATACAGTTAA 3117

 53592158 ATAACTAAATGTACCCACCAGCAAGCAGATTTCACCAGTGGGTTCCCTGCATGGTAAGCC 53592217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 ATAACTAAATGTACCCACCAGCAAGCAGATTTCACCAGTGGGTTCCCTGCATGGTAAGCC 3177

 53592218 CACAGAGAGGCTCTGGCCAGAGCCTGCATATGACTGTCCTTGCTGGCAAGTGTCTTGATC 53592277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 CACAGAGAGGCTCTGGCCAGAGCCTGCATATGACTGTCCTTGCTGGCAAGTGTCTTGATC 3237

 53592278 TCTGGGAATGAATAAATCAGTATGTGGCATATTTGATTGCCCCTTGCTAGCATCGGGGGA 53592337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 TCTGGGAATGAATAAATCAGTATGTGGCATATTTGATTGCCCCTTGCTAGCATCGGGGGA 3297

 53592338 CAGGCCCAACCAGCTCTGGGGCCCAGACAGTTGGGCTTCTGATCCCATCAGCCAAGGACC 53592397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CAGGCCCAACCAGCTCTGGGGCCCAGACAGTTGGGCTTCTGATCCCATCAGCCAAGGACC 3357

 53592398 TCACCTCACATCTGGTGAATTCACCAGTAAGAATAAGAACAAACCTTGTAGAGAAGAAAT 53592457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 TCACCTCACATCTGGTGAATTCACCAGTAAGAATAAGAACAAACCTTGTAGAGAAGAAAT 3417

 53592458 CACAGTGGCAGAATTAGCAATGTGGAGTGAGAGGATGGTTTCTTCTCTGTTATCCAAAAT 53592517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CACAGTGGCAGAATTAGCAATGTGGAGTGAGAGGATGGTTTCTTCTCTGTTATCCAAAAT 3477

 53592518 GTTTGTAATTTGCTTATCTAATTTTTTTTTTTTATGAGATAAGGTCTTGCTTTGTTGCCC 53592577
          |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 GTTTGTAATTTGCTTATCTAA--TTTTTTTTTTATGAGATAAGGTCTTGCTTTGTTGCCC 3535

 53592578 AGGCTGGAGTGCAATGGCATGAACATGGCTCACTGCAGGCTCAACCTTCTGGGCTCAAGC 53592637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 AGGCTGGAGTGCAATGGCATGAACATGGCTCACTGCAGGCTCAACCTTCTGGGCTCAAGC 3595

 53592638 GATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCCAGGACTACAGGTGCCCACCATCATGCCTGG 53592697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 GATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCCAGGACTACAGGTGCCCACCATCATGCCTGG 3655

 53592698 CTAATTTTAAAAG---TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATGGGGTCTCACTATGTTG 53592754
          |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 CTAATTTTAAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATGGGGTCTCACTATGTTG 3715

 53592755 CCAGGGCTTTATCTAATTTTTTAAAATATGAAAACATCTTTAAAGTTCAGCTCCTAACTG 53592814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 CCAGGGCTTTATCTAATTTTTTAAAATATGAAAACATCTTTAAAGTTCAGCTCCTAACTG 3775

 53592815 TCCTCCAGGGCCCATACAAATGCTGATGGTGAGACTTTCCCTGAACTCTGCTGCCGCTGC 53592874
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 TCCTCCAGGGCCCATACAAATGCTGGTGGTGAGACTTTCCCTGAACTCTGCTGCCGCTGC 3835

 53592875 CCTCTGCTGCTTCTTATTCATTGAAAATGTATTGATCAGGCACAGGCAGTAGCAGGCCCT 53592934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 CCTCTGCTGCTTCTTATTCATTGAAAATGTATTGATCAGGCACAGGCAGTAGCAGGCCCT 3895

 53592935 GTATGGGGCAGTGAGAAATCAGATGAAAGGGGGAGAGTTATATTCTTCAGAATTATTTTT 53592994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 GTATGGGGCAGTGAGAAATCAGATGAAAGGGGGAGAGTTATATTCTTCAGAATTATTTTT 3955

 53592995 ACAGTAAGGGAGCAGTCCTTATTCAGAAGAAAGTTCTTGATGAACTACTTGGACAGAAGC 53593054
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 ACAGTAAGGGAGCAGTCCTTATACAGAAGAAAGTTCTTGATGAACTACTTGGACAGAAGC 4015

 53593055 TGAGCAGTGGCTCCACTCAACCCAAGCCGGCTCCAGGGAGAGAGGTGAGCAGAAGTGACT 53593114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 TGAGCAGTGGCTCCACTCAACCCAAGCCGGCTCCAGGGAGAGAGGTGAGCAGAAGTGACT 4075

 53593115 TCTGAAAGACATCCAGCTGCTCTGGGGACAGAGGAAGAGAGAAGGAAGGTTCCAGGAGAG 53593174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 TCTGAAAGACATCCAGCTGCTCTGGGGACAGAGGAAGAGAGAAGGAAGGTTCCAGGAGAG 4135

 53593175 AGAAGGAGGTGGACAGGCCCTCAGGCCACCCCGATGACCCAAGCCCTGGTATATCCTCCT 53593234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 AGAAGGAGGTGGACAGGCCCTCAGGCCACCCCGATGACCCAAGCCCTGGTATATCCTCCT 4195

 53593235 CCCGCAGTGTGGCAGTGCCTGTGACTTCTATGAGAACACAACAAGGTGGTGGGATGTCTC 53593294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 CCCGCAGTGTGGCAGTGCCTGTGACTTCTATGAGAACACAACAAGGTGGTGGGATGTCTC 4255

 53593295 CCTGTGGTTATGTGGTAGAAGACTTTGACTCAGAAGACTGGTGAGGACCGGGCTTCCTGC 53593354
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4256 CCTGTGGTTATGTGGTAGAAGACTTTGACTCAGAAGACTGGTGAGAACCGGGCTTCCTGC 4315

 53593355 TGGCCTTGATGACCTACAGTGCTATGCTGTGAGCTGCCTGTGGAGACAGCTGGGTGGGGA 53593414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 TGGCCTTGATGACCTACAGTGCTATGCTGTGAGCTGCCTGTGGAGACAGCTGGGTGGGGA 4375

 53593415 GCTGCAGGCAGCCTCTAGAACCTGAGTGGCTCCACTGCACAGCTGTCAATGCTGGGCCCT 53593474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 GCTGCAGGCAGCCTCTAGAACCTGAGTGGCTCCACTGCACAGCTGTCAATGCTGGGCCCT 4435

 53593475 CAGGCAGCAGCCATGGGGAATCACTTCTGTCCATGCCTGAGGGAGCATGGAGGCGGATTC 53593534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 CAGGCAGCAGCCATGGGGAATCACTTCTGTCCATGCCTGAGGGAGCATGGAGGCGGATTC 4495

 53593535 TCCCTGGTTGGGCCTCCGGATGAGAACAGAGCCCAGCGGACACCTGGATTGCAGCCTAAG 53593594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 TCCCTGGTTGGGCCTCCGGATGAGAACAGAGCCCAGCGGACACCTGGATTGCAGCCTAAG 4555

 53593595 ACTCTGAGCAGAGGACTCAGCCAAGCCCGCCCAGACTGCTGGCCCAGGGACTGAGGCAAC 53593654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 ACTCTGAGCAGAGGACTCAGCCAAGCCCGCCCAGACTGCTGGCCCAGGGACTGAGGCAAC 4615

 53593655 CATGAAGTGTGTTTATGTCACTAAGTTTGTGATAATTTGTTACACGGCAATGATAACGAA 53593714
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4616 CATGAAGTGTGTTTATGTCACTAAGTTTGTGATAATTTGTTACACGGCAGTGATAACGAA 4675

 53593715 TACACACAGACACACACACAGAGAACCAGGAGATAACTGAAGGCACTACTTGAAGCAAGG 53593774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4676 TACACACAGACACACACACAGAGAACCAGGAGATAACTGAAGGCACTACTTGAAGCAAGG 4735

 53593775 AATGCTGGTGTGAATGGGAAGCTGATGAAGGCTGCTTGGTTGTAGGAGTGAAGGGCATAG 53593834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 AATGCTGGTGTGAATGGGAAGCTGATGAAGGCTGCTTGGTTGTAGGAGTGAAGGGCATAG 4795

 53593835 AAAAGCAAGAGGCAGTAAGAATAGGAATTGGGCAGGGTGCGGTGACTCACACCTGTAATC 53593894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 AAAAGCAAGAGGCAGTAAGAATAGGAATTGGGCAGGGTGCGGTGACTCACACCTGTAATC 4855

 53593895 CCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCAGGAGGATGCCTCGAGCCCAGGAATTCAAGGCCAGCC 53593954
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4856 CCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCAGGAGGATGCCTTGAGCCCAGGAATTCAAGGCCAGCC 4915

 53593955 TTGGCAACATAGTGAGAGCCCCATGTCTACCCAAAATTTAAAAAATTAGCTGGGCATGGT 53594014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4916 TTGGCAACATAGTGAGAGCCCCATGTCTACCCAAAATTTAAAAAATTAGCTGGGCATGGT 4975

 53594015 GGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTAATTGGGAGGCTAAGTCGGGAGGATCGATTGAGCCCT 53594074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4976 GGCGTGTGCCTGTAGTCCCAGCTAATTGGGAGGCTAAGTCGGGAGGATCGATTGAGCCCT 5035

 53594075 GGAGTTGAAAGTTACAGTGAGCTGTGGTCATGCCACTGCACTCCAGCCTGAGGGACAGAG 53594134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5036 GGAGTTGAAAGTTACAGTGAGCTGTGGTCATGCCACTGCACTCCAGCCTGAGGGACAGAG 5095

 53594135 TAAGACCCTGTCTCAATTAAAAACAAAAAAGAATAGGAATTCATGACAGATAAGGAGGCT 53594194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5096 TAAGACCCTGTCTCAATTAAAAACAAAAAAGAATAGGAATTCATGACAGATAAGGAAGCT 5155

 53594195 CTGACTGTCATGGCGCAAGGAATGGCTCTGGGTGCCAGGTGAGTGCATCATGGAGAAGTG 53594254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 CTGACTGTCATGGCGCAAGGAATGGCTCTGGGTGCCAGGTGAGTGCATCATGGAGAAGTG 5215

 53594255 GGCAGGACCTGGCCAGGGCCCCTGCGGAGGCCCTGTGGATGTGCAGGTGTGCACGACTCA 53594314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5216 GGCAGGACCTGGCCAGGGCCCCTGCGGAGGCCCTGTGGATGTGCAGGTGTGCACGACTCA 5275

 53594315 GGTGAAGCAGGGCATGCTGCATGGTCTGTACCAGTGTTGAGGGAGCACCCGGGTGTGCCT 53594374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5276 GGTGAAGCAGGGCATGCTGCATGGTCTGTACCAGTGTTGAGGGAGCACCCGGGTGTGCCT 5335

 53594375 CAGTCAAGGGTGGC 53594388
          ||||||||||||||
     5336 CAGTCAAGGGTGGC 5349

Alignment time is 4.00525 s

