
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31565065,31587331] =>     22267 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3403] =>      3403 nucs 'mol-32-1eea-085735_3403'

Score:        3372
Aligned:      3405        nucs
Identic:      3402 (100%) nucs =>       796 (100%)      2606 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31575427,31576222] EXCISED REGION [31576224,31578832]
 second seq =>  [       1,     796] EXCISED REGION [     797,    3403]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31576223,31576223]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31576533,31576533]
 second seq =>         1 nucs [1106,1106]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [31576223,31576235] to [31576224,31576236]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31575427 TGATTCTCCCACAAAACACCTGACCCTGAGACCTTCCCAGGGAGTTGCACAAATTCGTTT 31575486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGATTCTCCCACAAAACACCTGACCCTGAGACCTTCCCAGGGAGTTGCACAAATTCGTTT 60

 31575487 TATAACCAGCAAAGCAATTCTGAGGGTTTTAGAGTGGGAAGGGCTTGCTCCTAGTTCTCC 31575546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATAACCAGCAAAGCAATTCTGAGGGTTTTAGAGTGGGAAGGGCTTGCTCCTAGTTCTCC 120

 31575547 TAAGACTGTCTACTGTTTAATTACGAAAGCCACTGTTGTGCTCAACAGCTGAGGAAACAC 31575606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAGACTGTCTACTGTTTAATTACGAAAGCCACTGTTGTGCTCAACAGCTGAGGAAACAC 180

 31575607 AGGAAGGATCAAGAAGTGAACTTTCCCTGACTCCACCTCCCCATACTGCCTCAGAGACCC 31575666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGAAGGATCAAGAAGTGAACTTTCCCTGACTCCACCTCCCCATACTGCCTCAGAGACCC 240

 31575667 AGGAACAGGCTGTCCCCCAGAAAGGGATGCCTGGGAGGACTGAGCAGGCACTGACCGCTC 31575726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGAACAGGCTGTCCCCCAGAAAGGGATGCCTGGGAGGACTGAGCAGGCACTGACCGCTC 300

 31575727 ATGCTAGGGAACCAGGCCAGTGAATGCAGCTTTGAATCTACGCTGGATCACCTCCATGTC 31575786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGCTAGGGAACCAGGCCAGTGAATGCAGCTTTGAATCTACGCTGGATCACCTCCATGTC 360

 31575787 CTCATCTGTAAAATCATGCCAGGCACGTCACATGCTTGGTACACATTCATTCATTGCATT 31575846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCATCTGTAAAATCATGCCAGGCACGTCACATGCTTGGTACACATTCATTCATTGCATT 420

 31575847 TGGGCCACAACCCTATGAGGGAGGTGTTATTATCATCTTTGTTTTACCGAGAAACCTAAG 31575906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGGCCACAACCCTATGAGGGAGGTGTTATTATCATCTTTGTTTTACCGAGAAACCTAAG 480

 31575907 GCACAGAGAGGGTAAGAATGTTACTGGGCCAGGTGCAGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAG 31575966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCACAGAGAGGGTAAGAATGTTACTGGGCCAGGTGCAGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAG 540

 31575967 CACTTTGGGAGGCTGAGGCTGAGCCTGGAGTATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAG 31576026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACTTTGGGAGGCTGAGGCTGAGCCTGGAGTATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAG 600

 31576027 CTTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATTTCTACAAAAAGTAGAAAAATTAGCTGGGCTGTT 31576086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATTTCTACAAAAAGTAGAAAAATTAGCTGGGCTGTT 660

 31576087 GCACGAGACTGTGGTCCCAGCCACTTGGGAGGCTGAACAGGAGGATGAGGATCACTTGAG 31576146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCACGAGACTGTGGTCCCAGCCACTTGGGAGGCTGAACAGGAGGATGAGGATCACTTGAG 720

 31576147 CCCAGGAGGTAGAGGCTGCAGGGAGCCATGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCCAGTGAG 31576206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCAGGAGGTAGAGGCTGCAGGGAGCCATGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCCAGTGAG 780

 31576207 AGTGAGACCATGTCTC 31576222
          ||||||||||||||||
      781 AGTGAGACCATGTCTC 796

EXCISED REGION

 31576224 AAAAAAAAAAAAAGTTACTAAGGCCATATATCTTGTGCATGTATACCTGAAATTTGAGAC 31576283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      797 AAAAAAAAAAAAAGTTACTAAGGCCATATATCTTGTGCATGTATACCTGAAATTTGAGAC 856

 31576284 CAGGCAACCGGGTACCACTAGGCTGTACTGCTCCTATGAGGAGCACACACTTACCTGTAC 31576343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      857 CAGGCAACCGGGTACCACTAGGCTGTACTGCTCCTATGAGGAGCACACACTTACCTGTAC 916

 31576344 CTGTCTCAGAGAATCTCTTCGAATTAAAGGAGATAATGCACGTAAGGTGCTCTGAACAGA 31576403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      917 CTGTCTCAGAGAATCTCTTCGAATTAAAGGAGATAATGCACGTAAGGTGCTCTGAACAGA 976

 31576404 GTCTGGGACTTAGTACTCTCAGTAAACACAAGTCCAACATCATCATCATCATCAATAGTC 31576463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      977 GTCTGGGACTTAGTACTCTCAGTAAACACAAGTCCAACATCATCATCATCATCAATAGTC 1036

 31576464 TTACCTATTCAGAATTCTTTATTATTATTATTGTTATAGAAAGGGTCTCACTGTGTCACC 31576523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1037 TTACCTATTCAGAATTCTTTATTATTATTATTGTTATAGAAAGGGTCTCACTGTGTCACC 1096

 31576524 CAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTTCATAGCTCACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAG 31576583
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1097 CAGGCTGGAATGCAGTGGCATGTTCATAGCTCACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAG 1156

 31576584 CTATCCTCCCATCCCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACACCAAACCTGGCCCAGTCAGA 31576643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1157 CTATCCTCCCATCCCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACACCAAACCTGGCCCAGTCAGA 1216

 31576644 ATTCTGAAGCAGTCGCACTCCTGGTCCTGGCTGCACAAACATGGTGGAAACTTATATGCT 31576703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1217 ATTCTGAAGCAGTCGCACTCCTGGTCCTGGCTGCACAAACATGGTGGAAACTTATATGCT 1276

 31576704 TAAAAAAAAAATTGTACTGGGGCCGGGCACGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTT 31576763
          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 T-AAAAAAAAATTGTACTGGGGCCGGGCACGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTT 1335

 31576764 GGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGTTCGAGACCAGCTTGGCCAACATGG 31576823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 GGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGTTCGAGACCAGCTTGGCCAACATGG 1395

 31576824 CGAAACCCTGTGTCTACTAAAAATACAAAATTTAGCCTGGCATGGTGGTGGGCACCTGTA 31576883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 CGAAACCCTGTGTCTACTAAAAATACAAAATTTAGCCTGGCATGGTGGTGGGCACCTGTA 1455

 31576884 ATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGACAGAAGTTG 31576943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 ATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGACAGAAGTTG 1515

 31576944 CAGTGAGCCAAGATCACACCACTGTACTCTAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGTCTC 31577003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 CAGTGAGCCAAGATCACACCACTGTACTCTAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGTCTC 1575

 31577004 AAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAAACCAAATTGCTTTTAGTGGTTATTGCCAAGCAGGG 31577063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 AAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAAACCAAATTGCTTTTAGTGGTTATTGCCAAGCAGGG 1635

 31577064 TTGTAGGGGAAACTCATTTTCATAGACCTCTATAATCATAACTATTTTATATAGTAATCA 31577123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 TTGTAGGGGAAACTCATTTTCATAGACCTCTATAATCATAACTATTTTATATAGTAATCA 1695

 31577124 TGTATTATTTTGTAATTAGAAAAATATGCATAGATAGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCT 31577183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 TGTATTATTTTGTAATTAGAAAAATATGCATAGATAGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCT 1755

 31577184 ATAATCCTAGCATTTAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTCAGGTCAGGAAGTCGAGACCAG 31577243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 ATAATCCTAGCATTTAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTCAGGTCAGGAAGTCGAGACCAG 1815

 31577244 CCTGGCCAAAATGGTGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGAT 31577303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 CCTGGCCAAAATGGTGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGAT 1875

 31577304 GGCATGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCA 31577363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 GGCATGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCA 1935

 31577364 GGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTAGGAGACAGAGTGAGA 31577423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 GGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTAGGAGACAGAGTGAGA 1995

 31577424 CTCCATCTAAAAAAGAAAAAAGAAAGAAAAAGAAAAAATAATAATATGCATAGATGAAGA 31577483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 CTCCATCTAAAAAAGAAAAAAGAAAGAAAAAGAAAAAATAATAATATGCATAGATGAAGA 2055

 31577484 CATAATATATAAATGCCAAGTGCATGTACTGAGCACTCAGTTCACTTGTTTGTGTATGTT 31577543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 CATAATATATAAATGCCAAGTGCATGTACTGAGCACTCAGTTCACTTGTTTGTGTATGTT 2115

 31577544 TCTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGTCTCTCTCTGTCACCCAGGC 31577603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     2116 TCTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTT-AGACAGTCTCTCTCTGTCACCCAGGC 2174

 31577604 TGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTTACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAACAGTT 31577663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 TGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTTACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAACAGTT 2234

 31577664 CTTCTGCCTCAGCCTCCCTCATAGCTGGAATCACAGGTGCCCGCCACCTTGCTCAGTTTT 31577723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 CTTCTGCCTCAGCCTCCCTCATAGCTGGAATCACAGGTGCCCGCCACCTTGCTCAGTTTT 2294

 31577724 TTTTTGTATTTTTAATAGAGATGAGGTTTTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCC 31577783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 TTTTTGTATTTTTAATAGAGATGAGGTTTTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCC 2354

 31577784 TGACCTCAGGTGATCTGCCCAGCTTGGCCTCCCAAGCTGCTGGGGTTACAGGCGTGAGCC 31577843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 TGACCTCAGGTGATCTGCCCAGCTTGGCCTCCCAAGCTGCTGGGGTTACAGGCGTGAGCC 2414

 31577844 ACCGCACCCAGCCCCTCTGTTTGCTTTTTTTTCTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGA 31577903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 ACCGCACCCAGCCCCTCTGTTTGCTTTTTTTTCTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGA 2474

 31577904 CTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGGCCTCAAGTGGTTCACCGGCCTCG 31577963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 CTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCTAACTCCTGGCCTCAAGTGGTTCACCGGCCTCG 2534

 31577964 GCCTCCCAAAGTTCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCTTGTTCATGTGTTT 31578023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 GCCTCCCAAAGTTCTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCTTGTTCATGTGTTT 2594

 31578024 CTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTTTTCTTTTTGAGACAGAGTTTTGTTCTTGTTGCCCA 31578083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 CTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTTTTCTTTTTGAGACAGAGTTTTGTTCTTGTTGCCCA 2654

 31578084 GGCTAGAGTGCAGTGGCGGGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCAAGTG 31578143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 GGCTAGAGTGCAGTGGCGGGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCAAGTG 2714

 31578144 ATTCTCTTGCCTCAGTGTCCTGAGTAGCTGGGATTATGGGTGCCCACCACCATGCCCGGA 31578203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 ATTCTCTTGCCTCAGTGTCCTGAGTAGCTGGGATTATGGGTGCCCACCACCATGCCCGGA 2774

 31578204 CACTTTTTTTGTATTTTTAGAAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAA 31578263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 CACTTTTTTTGTATTTTTAGAAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAA 2834

 31578264 ACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAACCTCCCAAAGTGCTGTGATTACAGGCAT 31578323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 ACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAACCTCCCAAAGTGCTGTGATTACAGGCAT 2894

 31578324 AAGCCACCGCGGCCAGCCCATGTATGTTTCTATTCACCATTTATGGAGCATCTATTGGCT 31578383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 AAGCCACCGCGGCCAGCCCATGTATGTTTCTATTCACCATTTATGGAGCATCTATTGGCT 2954

 31578384 ACCAGGCCTTGGCTACAGGAACTGCCATGTGGCGTCAGAACCCTGAAGAAGTTCCCAGTG 31578443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 ACCAGGCCTTGGCTACAGGAACTGCCATGTGGCGTCAGAACCCTGAAGAAGTTCCCAGTG 3014

 31578444 TGATTCACTGGATGGGGTGGGAAGAATCTTCTATCTGCTATGGTAGGAACAGAGGGCTGT 31578503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 TGATTCACTGGATGGGGTGGGAAGAATCTTCTATCTGCTATGGTAGGAACAGAGGGCTGT 3074

 31578504 GTGCAGGTGACAGGCCAGGCCTGGAATGTGAACCTCTAATTCCCCATCAAGTGTGATAGA 31578563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3075 GTGCAGGTGACAGGCCAGGCCTGGAATGTGAACCTCTAATTCCCCATCAAGTGTGATAGA 3134

 31578564 AGATGCTGAGTGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAAACCAAGGCAGGC 31578623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3135 AGATGCTGAGTGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAAACCAAGGCAGGC 3194

 31578624 GGATTGCTCGAGCTCAGGAGTTGAAGACTGGCCCAGGCAACATGGCAAAACCTCATCTCT 31578683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3195 GGATTGCTCGAGCTCAGGAGTTGAAGACTGGCCCAGGCAACATGGCAAAACCTCATCTCT 3254

 31578684 ACACAAAATACAAAAATTAGTCAGGCATGGTGACTCGTGCCCGTGGTCCCAGCTATTTGT 31578743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 ACACAAAATACAAAAATTAGTCAGGCATGGTGACTCGTGCCCGTGGTCCCAGCTATTTGT 3314

 31578744 GGGGCTGAGATGGGAGGATCGCTTGAACCCAGGAGGTCCAGGCTATGGTGAACTGTGGAA 31578803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 GGGGCTGAGATGGGAGGATCGCTTGAACCCAGGAGGTCCAGGCTATGGTGAACTGTGGAA 3374

 31578804 GCACCACAGCACTCCAGTCTGGACGACAA 31578832
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3375 GCACCACAGCACTCCAGTCTGGACGACAA 3403

Alignment time is 2.68666 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31565065,31587331] =>     22267 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2857] =>      2857 nucs 'mol-32-2105-067223_2857'

Score:        2857
Aligned:      2857        nucs
Identic:      2857 (100%) nucs =>      1356 (100%)      1501 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31573710,31575065] EXCISED REGION [31577332,31578832]
 second seq =>  [       1,    1356] EXCISED REGION [    1357,    2857]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2266 nucs [31575066,31577331]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [31575066,31575085] to [31577332,31577351]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31575065,31575065] to [31577332,31577332]
 second seq =>         1 nucs [1356,1356] to [1357,1357]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31573710 AGAGTGGGGAGAGAATGAAGATGTGAGGTGACAGATGAGGTCTCTTCCCCAGCCAGAGGG 31573769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGTGGGGAGAGAATGAAGATGTGAGGTGACAGATGAGGTCTCTTCCCCAGCCAGAGGG 60

 31573770 TGCAGAAAGCCCCAACATAACACATGTCCTGAAACCCAAAGAGAAGACAGAAATTGTCAG 31573829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCAGAAAGCCCCAACATAACACATGTCCTGAAACCCAAAGAGAAGACAGAAATTGTCAG 120

 31573830 CAAAGGTTAGCTAGCTCCTGAGGTCATAAGCAACCTTATTTTTATTTTGTGTTCCCAAAT 31573889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAAGGTTAGCTAGCTCCTGAGGTCATAAGCAACCTTATTTTTATTTTGTGTTCCCAAAT 180

 31573890 GTGTTGTCTGGAACATGTATACATATTACGTATTAAAGCAAAAGCAAAATCAGAATAAAT 31573949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGTTGTCTGGAACATGTATACATATTACGTATTAAAGCAAAAGCAAAATCAGAATAAAT 240

 31573950 ATTGTCTTCCAAGTTGTCTTTGTGTGTGTTTTGGTTTTGTGGTTTATTCCTCTTTCTTTT 31574009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTGTCTTCCAAGTTGTCTTTGTGTGTGTTTTGGTTTTGTGGTTTATTCCTCTTTCTTTT 300

 31574010 CAGTTGGATAGAAGCCAGGCTCCTTTCTCCCAGCACACGCACAGACTCAGCACACACAGA 31574069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGTTGGATAGAAGCCAGGCTCCTTTCTCCCAGCACACGCACAGACTCAGCACACACAGA 360

 31574070 AACCCCAGGAATTAAATGACTCTCCAAAATGATAAGTAGGAAGAAGGGGGTGGGGTAGAG 31574129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACCCCAGGAATTAAATGACTCTCCAAAATGATAAGTAGGAAGAAGGGGGTGGGGTAGAG 420

 31574130 AGGGAGGAAGGGGGAGAGAGGAGGCCTTTTCCCCTGACCTGGGGAGGAGCCCTAGTCCAG 31574189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGGAGGAAGGGGGAGAGAGGAGGCCTTTTCCCCTGACCTGGGGAGGAGCCCTAGTCCAG 480

 31574190 GAGAGGTCAGGGTGTGCAAAGGCCTCTGGGTAGGAATAGGAACAGGGCCATTGGCCAAGT 31574249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGAGGTCAGGGTGTGCAAAGGCCTCTGGGTAGGAATAGGAACAGGGCCATTGGCCAAGT 540

 31574250 GCCCTCTGCTCTGTTACTCCCAGAGCCGGCTCCTACCCTCAGGCCTGGGAGCCCGCCGTC 31574309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCCTCTGCTCTGTTACTCCCAGAGCCGGCTCCTACCCTCAGGCCTGGGAGCCCGCCGTC 600

 31574310 TGCTAGTAAGGGGCTTCAGGAGTTGGGGGAGTGCAGATGAGGAGTAGCTCTCTTTTTCTC 31574369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCTAGTAAGGGGCTTCAGGAGTTGGGGGAGTGCAGATGAGGAGTAGCTCTCTTTTTCTC 660

 31574370 ACATTCCCTCTTAAACCTCAGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTAAAGAAATGATTCTAAAAT 31574429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACATTCCCTCTTAAACCTCAGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTAAAGAAATGATTCTAAAAT 720

 31574430 TAGCCAGGTGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAAATGTGTTTCTACTTGGGAGGCTGAG 31574489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGCCAGGTGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAAATGTGTTTCTACTTGGGAGGCTGAG 780

 31574490 GTGGGAGAATTGCTTGAGCCTGGGAGGTTCAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCAGGCCACTG 31574549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGGGAGAATTGCTTGAGCCTGGGAGGTTCAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCAGGCCACTG 840

 31574550 CACTCCAGCTGGGGAGACAGAGGGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAATAATTT 31574609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACTCCAGCTGGGGAGACAGAGGGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAATAATTT 900

 31574610 TTGTCCTTTTTCTATAAGCATCTTTTAAAACTTTTTTCCAGGCAGGGAGCGGTGTCTCAC 31574669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGTCCTTTTTCTATAAGCATCTTTTAAAACTTTTTTCCAGGCAGGGAGCGGTGTCTCAC 960

 31574670 GCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTTAGGAGTTC 31574729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTTAGGAGTTC 1020

 31574730 GAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGG 31574789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGG 1080

 31574790 GCATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTT 31574849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTT 1140

 31574850 GAACCCGGGAGGTGAGCCGAGATTGCGCTATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAA 31574909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAACCCGGGAGGTGAGCCGAGATTGCGCTATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAA 1200

 31574910 ACTGTCTAAAAAAGAAAAAAGGCAGCATTTTGGGAGGTGGAGGTGAGAGGACAGGAGTTT 31574969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTGTCTAAAAAAGAAAAAAGGCAGCATTTTGGGAGGTGGAGGTGAGAGGACAGGAGTTT 1260

 31574970 GAGACCAGCCTGGCCAATGTGATGAAACCCCATCTCTATTAAAAACACAAAAATTAGCCG 31575029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGACCAGCCTGGCCAATGTGATGAAACCCCATCTCTATTAAAAACACAAAAATTAGCCG 1320

 31575030 GGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCG 31575065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCG 1356

EXCISED REGION

 31577332 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGATCGCAC 31577391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGATCGCAC 1416

 31577392 CATTGCACTCCAGCCTAGGAGACAGAGTGAGACTCCATCTAAAAAAGAAAAAAGAAAGAA 31577451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 CATTGCACTCCAGCCTAGGAGACAGAGTGAGACTCCATCTAAAAAAGAAAAAAGAAAGAA 1476

 31577452 AAAGAAAAAATAATAATATGCATAGATGAAGACATAATATATAAATGCCAAGTGCATGTA 31577511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 AAAGAAAAAATAATAATATGCATAGATGAAGACATAATATATAAATGCCAAGTGCATGTA 1536

 31577512 CTGAGCACTCAGTTCACTTGTTTGTGTATGTTTCTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTT 31577571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 CTGAGCACTCAGTTCACTTGTTTGTGTATGTTTCTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTT 1596

 31577572 TTTTTGAGACAGTCTCTCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTTA 31577631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 TTTTTGAGACAGTCTCTCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTTA 1656

 31577632 CTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAACAGTTCTTCTGCCTCAGCCTCCCTCATAGCTGG 31577691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 CTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAACAGTTCTTCTGCCTCAGCCTCCCTCATAGCTGG 1716

 31577692 AATCACAGGTGCCCGCCACCTTGCTCAGTTTTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGAGGTT 31577751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 AATCACAGGTGCCCGCCACCTTGCTCAGTTTTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGAGGTT 1776

 31577752 TTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCAGCTTGGC 31577811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 TTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCAGCTTGGC 1836

 31577812 CTCCCAAGCTGCTGGGGTTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCAGCCCCTCTGTTTGCTTTT 31577871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 CTCCCAAGCTGCTGGGGTTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCAGCCCCTCTGTTTGCTTTT 1896

 31577872 TTTTCTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGACTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCT 31577931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 TTTTCTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGACTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCT 1956

 31577932 AACTCCTGGCCTCAAGTGGTTCACCGGCCTCGGCCTCCCAAAGTTCTGGGATTATAGGTG 31577991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 AACTCCTGGCCTCAAGTGGTTCACCGGCCTCGGCCTCCCAAAGTTCTGGGATTATAGGTG 2016

 31577992 TGAGCCACCATGCCTGGCTTGTTCATGTGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTTTTC 31578051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 TGAGCCACCATGCCTGGCTTGTTCATGTGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTTTTC 2076

 31578052 TTTTTGAGACAGAGTTTTGTTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGGGATCTCGGC 31578111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 TTTTTGAGACAGAGTTTTGTTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGGGATCTCGGC 2136

 31578112 TCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGTGTCCTGAGTAGC 31578171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 TCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGTGTCCTGAGTAGC 2196

 31578172 TGGGATTATGGGTGCCCACCACCATGCCCGGACACTTTTTTTGTATTTTTAGAAGAGACG 31578231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 TGGGATTATGGGTGCCCACCACCATGCCCGGACACTTTTTTTGTATTTTTAGAAGAGACG 2256

 31578232 GGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCC 31578291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 GGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCC 2316

 31578292 TCAACCTCCCAAAGTGCTGTGATTACAGGCATAAGCCACCGCGGCCAGCCCATGTATGTT 31578351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 TCAACCTCCCAAAGTGCTGTGATTACAGGCATAAGCCACCGCGGCCAGCCCATGTATGTT 2376

 31578352 TCTATTCACCATTTATGGAGCATCTATTGGCTACCAGGCCTTGGCTACAGGAACTGCCAT 31578411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 TCTATTCACCATTTATGGAGCATCTATTGGCTACCAGGCCTTGGCTACAGGAACTGCCAT 2436

 31578412 GTGGCGTCAGAACCCTGAAGAAGTTCCCAGTGTGATTCACTGGATGGGGTGGGAAGAATC 31578471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 GTGGCGTCAGAACCCTGAAGAAGTTCCCAGTGTGATTCACTGGATGGGGTGGGAAGAATC 2496

 31578472 TTCTATCTGCTATGGTAGGAACAGAGGGCTGTGTGCAGGTGACAGGCCAGGCCTGGAATG 31578531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 TTCTATCTGCTATGGTAGGAACAGAGGGCTGTGTGCAGGTGACAGGCCAGGCCTGGAATG 2556

 31578532 TGAACCTCTAATTCCCCATCAAGTGTGATAGAAGATGCTGAGTGCGGTGGCTCACGCCTG 31578591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 TGAACCTCTAATTCCCCATCAAGTGTGATAGAAGATGCTGAGTGCGGTGGCTCACGCCTG 2616

 31578592 TAATCCCAGCACTTTAGGAAACCAAGGCAGGCGGATTGCTCGAGCTCAGGAGTTGAAGAC 31578651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 TAATCCCAGCACTTTAGGAAACCAAGGCAGGCGGATTGCTCGAGCTCAGGAGTTGAAGAC 2676

 31578652 TGGCCCAGGCAACATGGCAAAACCTCATCTCTACACAAAATACAAAAATTAGTCAGGCAT 31578711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 TGGCCCAGGCAACATGGCAAAACCTCATCTCTACACAAAATACAAAAATTAGTCAGGCAT 2736

 31578712 GGTGACTCGTGCCCGTGGTCCCAGCTATTTGTGGGGCTGAGATGGGAGGATCGCTTGAAC 31578771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 GGTGACTCGTGCCCGTGGTCCCAGCTATTTGTGGGGCTGAGATGGGAGGATCGCTTGAAC 2796

 31578772 CCAGGAGGTCCAGGCTATGGTGAACTGTGGAAGCACCACAGCACTCCAGTCTGGACGACA 31578831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 CCAGGAGGTCCAGGCTATGGTGAACTGTGGAAGCACCACAGCACTCCAGTCTGGACGACA 2856

 31578832 A 31578832
          |
     2857 A 2857

Alignment time is 2.24254 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31565065,31587331] =>     22267 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3360] =>      3360 nucs 'mol-32-2fb7-192418_3360'

Score:        3318
Aligned:      3364        nucs
Identic:      3359 (100%) nucs =>      3133 (100%)       226 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31571928,31575065] EXCISED REGION [31577332,31577557]
 second seq =>  [       1,    3134] EXCISED REGION [    3135,    3360]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2266 nucs [31575066,31577331]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [31575066,31575085] to [31577332,31577351]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31575065,31575065] to [31577332,31577332]
 second seq =>         1 nucs [3134,3134] to [3135,3135]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31571928 TAGAGATGAAGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATC 31571987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGAGATGAAGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATC 60

 31571988 CGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCAGCCAAT 31572047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCAGCCAAT 120

 31572048 TTTTTTATTTTTTGTAGAGACTGGATCTCACTTTGTTCCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCA 31572107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTTATTTTTTGTAGAGACTGGATCTCACTTTGTTCCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCA 180

 31572108 AGGCTTAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCACAAAATGCTGGGATTATAGGAGAGAGCCA 31572167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGCTTAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCACAAAATGCTGGGATTATAGGAGAGAGCCA 240

 31572168 CTACACGCAGCTATGTGTTCCTGAATTTGCCAACCTCTCCCTTTGACTCTCAGGACCCAA 31572227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTACACGCAGCTATGTGTTCCTGAATTTGCCAACCTCTCCCTTTGACTCTCAGGACCCAA 300

 31572228 ATTCTTGGCTCTCCAATCAGGTATGTCCTCTTCCCATTCCTGCACCCCTGCCCTTGCCAT 31572287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTCTTGGCTCTCCAATCAGGTATGTCCTCTTCCCATTCCTGCACCCCTGCCCTTGCCAT 360

 31572288 TCTGGTAAATAGAAATAGGTCACGTTCTACTGAGAGGCCTCTGGAGAGTGGCAAGGCCTG 31572347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGGTAAATAGAAATAGGTCACGTTCTACTGAGAGGCCTCTGGAGAGTGGCAAGGCCTG 420

 31572348 CCCTACTCCCTGCCTTCCCCACAGGCTTAACTGAAGGGACCCATGATAAACCCCCAAGGG 31572407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCTACTCCCTGCCTTCCCCACAGGCTTAACTGAAGGGACCCATGATAAACCCCCAAGGG 480

 31572408 CCAAGATTTCCTCACAATTTACTTTCCATAGTCTGCATTAAGAACAAAGTTAGAGTTTTG 31572467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAAGATTTCCTCACAATTTACTTTCCATAGTCTGCATTAAGAACAAAGTTAGAGTTTTG 540

 31572468 TTTTGCATTTTCCAAAGAAAAATGCTGTTGTAATATGTAATATTCTTTTACAAATTGTTC 31572527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTGCATTTTCCAAAGAAAAATGCTGTTGTAATATGTAATATTCTTTTACAAATTGTTC 600

 31572528 ACTCATGCGGGGAATACTGCTACACGCCCTTCCTTTCTCTCCCTTTTTCCTCCTCCCTTC 31572587
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTCATGCGGGGAATACTGCTACGCGCCCTTCCTTTCTCTCCCTTTTTCCTCCTCCCTTC 660

 31572588 CCCTGCTTTCCTTGGGCACATTTCTTGTATCTTACTTTCCCCAGGTCAGAAGCAGGCTGT 31572647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCTGCTTTCCTTGGGCACATTTCTTGTATCTTACTTTCCCCAGGTCAGAAGCAGGCTGT 720

 31572648 TGGAGGGCCCAGTTGGCAACTTCTCCACCTGAGAGGCCCCAGAGCCTGCCCAGGGTGGAC 31572707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGAGGGCCCAGTTGGCAACTTCTCCACCTGAGAGGCCCCAGAGCCTGCCCAGGGTGGAC 780

 31572708 AGCAGTTAATGTTTAATGAGTGAGTGAATGAATACATTTTAAAAGGTATGAAGGCCAGGC 31572767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGCAGTTAATGTTTAATGAGTGAGTGAATGAATACATTTTAAAAGGTATGAAGGCCAGGC 840

 31572768 CTGGTGCCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTCAGGAGGCCCAGGTGGGCAGATCACTTGA 31572827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGGTGCCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTCAGGAGGCCCAGGTGGGCAGATCACTTGA 900

 31572828 GCCTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAGCAATAGGGAGTCCCCTGACTCTACAGATAAT 31572887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCCTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAGCAATAGGGAGTCCCCTGACTCTACAGATAAT 960

 31572888 TTTTTTTTTGAGACGGATTCTTGCACTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTC 31572947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTTTTTTGAGACGGATTCTTGCACTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTC 1020

 31572948 AGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGT 31573007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGT 1080

 31573008 AGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCACACCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAG 31573067
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     1081 AGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCACACCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTT-AAG 1139

 31573068 ACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAA 31573127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 ACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAA 1199

 31573128 GCGTTGCCTCCCGACATCCGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGTAGACACAGGGATTTAC 31573187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GCGTTGCCTCCCGACATCCGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGTAGACACAGGGATTTAC 1259

 31573188 TATGTTGGCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCA 31573247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TATGTTGGCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCA 1319

 31573248 AAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCCAGATAATAAAAATTAGCCGG 31573307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCCAGATAATAAAAATTAGCCGG 1379

 31573308 ATATAGTGGCACATACCTCTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTT 31573367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATATAGTGGCACATACCTCTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTT 1439

 31573368 GAGCCTCGGAAGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGTGCCACTATACTCCAGCCTGGGT 31573427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 GAGCCTCGGAAGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGTGCCACTATACTCCAGCCTGGGT 1499

 31573428 GACAGAGCAAGACCATGTTTCAGAAAAAAAAGGAAAAAGATAAAAAATATAAAGGAAATT 31573487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GACAGAGCAAGACCATGTTTCAGAAAAAAAAGGAAAAAGATAAAAAATATAAAGGAAATT 1559

 31573488 GGGGAACTATGCTGTCTCCCCGGGGACCTTTCTGCTGAGTCAAGGTGGCCTCTCTGGGCA 31573547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GGGGAACTATGCTGTCTCCCCGGGGACCTTTCTGCTGAGTCAAGGTGGCCTCTCTGGGCA 1619

 31573548 GTAGGATGAAGCCCGACTCTCTGGTCAACTCATTGTTCACGAAGTCCTTTCCCACAGCAG 31573607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GTAGGATGAAGCCCGACTCTCTGGTCAACTCATTGTTCACGAAGTCCTTTCCCACAGCAG 1679

 31573608 CTGAGGGACAAAGTCACAGTCCCTGCCCAGTCCTCTGCACCAGCCACCCCTCTGGTTTAA 31573667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CTGAGGGACAAAGTCACAGTCCCTGCCCAGTCCTCTGCACCAGCCACCCCTCTGGTTTAA 1739

 31573668 CCTGTCCCAGGTCTTCCCCCTTGACTACACCCTCTAAATCCTAGAGTGGGGAGAGAATGA 31573727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CCTGTCCCAGGTCTTCCCCCTTGACTACACCCTCTAAATCCTAGAGTGGGGAGAGAATGA 1799

 31573728 AGATGTGAGGTGACAGATGAGGTCTCTTCCCCAGCCAGAGGGTGCAGAAAGCCCCAACAT 31573787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AGATGTGAGGTGACAGATGAGGTCTCTTCCCCAGCCAGAGGGTGCAGAAAGCCCCAACAT 1859

 31573788 AACACATGTCCTGAAACCCAAAGAGAAGACAGAAATTGTCAGCAAAGGTTAGCTAGCTCC 31573847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AACACATGTCCTGAAACCCAAAGAGAAGACAGAAATTGTCAGCAAAGGTTAGCTAGCTCC 1919

 31573848 TGAGGTCATAAGCAACCTTATTTTTATTTTGTGTTCCCAAATGTGTTGTCTGGAACATGT 31573907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TGAGGTCATAAGCAACCTTATTTTTATTTTGTGTTCCCAAATGTGTTGTCTGGAACATGT 1979

 31573908 ATACATATTACGTATTAAAGCAAAAGCAAAATCAGAATAAATATTGTCTTCCAAGTTGTC 31573967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ATACATATTACGTATTAAAGCAAAAGCAAAATCAGAATAAATATTGTCTTCCAAGTTGTC 2039

 31573968 TTTGTGTGTGTTTTGGTTTTGTGGTTTATTCCTCTTTCTTTTCAGTTGGATAGAAGCCAG 31574027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TTTGTGTGTGTTTTGGTTTTGTGGTTTATTCCTCTTTCTTTTCAGTTGGATAGAAGCCAG 2099

 31574028 GCTCCTTTCTCCCAGCACACGCACAGACTCAGCACACACAGAAACCCCAGGAATTAAATG 31574087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GCTCCTTTCTCCCAGCACACGCACAGACTCAGCACACACAGAAACCCCAGGAATTAAATG 2159

 31574088 ACTCTCCAAAATGATAAGTAGGAAGAAGGGGGTGGGGTAGAGAGGGAGGAAGGGGGAGAG 31574147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ACTCTCCAAAATGATAAGTAGGAAGAAGGGGGTGGGGTAGAGAGGGAGGAAGGGGGAGAG 2219

 31574148 AGGAGGCCTTTTCCCCTGACCTGGGGAGGAGCCCTAGTCCAGGAGAGGTCAGGGTGTGCA 31574207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AGGAGGCCTTTTCCCCTGACCTGGGGAGGAGCCCTAGTCCAGGAGAGGTCAGGGTGTGCA 2279

 31574208 AAGGCCTCTGGGTAGGAATAGGAACAGGGCCATTGGCCAAGTGCCCTCTGCTCTGTTACT 31574267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AAGGCCTCTGGGTAGGAATAGGAACAGGGCCATTGGCCAAGTGCCCTCTGCTCTGTTACT 2339

 31574268 CCCAGAGCCGGCTCCTACCCTCAGGCCTGGGAGCCCGCCGTCTGCTAGTAAGGGGCTTCA 31574327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CCCAGAGCCGGCTCCTACCCTCAGGCCTGGGAGCCCGCCGTCTGCTAGTAAGGGGCTTCA 2399

 31574328 GGAGTTGGGGGAGTGCAGATGAGGAGTAGCTCTCTTTTTCTCACATTCCCTCTTAAACCT 31574387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 GGAGTTGGGGGAGTGCAGATGAGGAGTAGCTCTCTTTTTCTCACATTCCCTCTTAAACCT 2459

 31574388 CAGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTAAAGAAATGATTCTAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCA 31574447
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 CAGTTTTTTTGTTTTTTTTTTT-AAAGAAATGATTCTAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCA 2518

 31574448 TGCGCCTGTAATCCCAAATGTGTTTCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAG 31574507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TGCGCCTGTAATCCCAAATGTGTTTCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAG 2578

 31574508 CCTGGGAGGTTCAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCAGGCCACTGCACTCCAGCTGGGGAGAC 31574567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CCTGGGAGGTTCAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCAGGCCACTGCACTCCAGCTGGGGAGAC 2638

 31574568 AGAGGGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAATAATTTTTGTCCTTTTTCTATAAG 31574627
          ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||
     2639 AGAGGGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAA--GAAATAATTTTTGTCCTTTTTCTATAAG 2696

 31574628 CATCTTTTAAAACTTTTTTCCAGGCAGGGAGCGGTGTCTCACGCCTATAATCTCAGCACT 31574687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 CATCTTTTAAAACTTTTTTCCAGGCAGGGAGCGGTGTCTCACGCCTATAATCTCAGCACT 2756

 31574688 TTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAAC 31574747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAAC 2816

 31574748 ATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGTGCCT 31574807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 ATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGTGCCT 2876

 31574808 GTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACCCGGGAGGTGAGCC 31574867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 GTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACCCGGGAGGTGAGCC 2936

 31574868 GAGATTGCGCTATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTGTCTAAAAAAGAAAA 31574927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 GAGATTGCGCTATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTGTCTAAAAAAGAAAA 2996

 31574928 AAGGCAGCATTTTGGGAGGTGGAGGTGAGAGGACAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAAT 31574987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 AAGGCAGCATTTTGGGAGGTGGAGGTGAGAGGACAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAAT 3056

 31574988 GTGATGAAACCCCATCTCTATTAAAAACACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGTGCACACC 31575047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 GTGATGAAACCCCATCTCTATTAAAAACACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGTGCACACC 3116

 31575048 TGTAATCCCAGCTACTCG 31575065
          ||||||||||||||||||
     3117 TGTAATCCCAGCTACTCG 3134

EXCISED REGION

 31577332 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGATCGCAC 31577391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3135 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGATCGCAC 3194

 31577392 CATTGCACTCCAGCCTAGGAGACAGAGTGAGACTCCATCTAAAAAAGAAAAAAGAAAGAA 31577451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3195 CATTGCACTCCAGCCTAGGAGACAGAGTGAGACTCCATCTAAAAAAGAAAAAAGAAAGAA 3254

 31577452 AAAGAAAAAATAATAATATGCATAGATGAAGACATAATATATAAATGCCAAGTGCATGTA 31577511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 AAAGAAAAAATAATAATATGCATAGATGAAGACATAATATATAAATGCCAAGTGCATGTA 3314

 31577512 CTGAGCACTCAGTTCACTTGTTTGTGTATGTTTCTTTCTTTTCTTT 31577557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 CTGAGCACTCAGTTCACTTGTTTGTGTATGTTTCTTTCTTTTCTTT 3360

Alignment time is 2.64623 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31565065,31587331] =>     22267 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2084] =>      2084 nucs 'mol-32-301a-193940_2084'

Score:        2074
Aligned:      2085        nucs
Identic:      2084 (100%) nucs =>       958 (100%)      1126 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31575265,31576222] EXCISED REGION [31576224,31577350]
 second seq =>  [       1,     958] EXCISED REGION [     959,    2084]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31576223,31576223]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        13 nucs [31576223,31576235] to [31576224,31576236]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31575265 AGAGCCCCCTTCCCTTTCATTTTCTGCCTGACTACCCACAACAGAGTCCCGGGTGGGGGT 31575324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGCCCCCTTCCCTTTCATTTTCTGCCTGACTACCCACAACAGAGTCCCGGGTGGGGGT 60

 31575325 GGGAGGGTCAGGGATGGGCTGTGGCGTCTGCATGCAGGCTTGCCTCCACTGGCCTGAATC 31575384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGAGGGTCAGGGATGGGCTGTGGCGTCTGCATGCAGGCTTGCCTCCACTGGCCTGAATC 120

 31575385 TCAGCAGGAAGAAGCAGCTCTTCCCTCAGGCCAAGCAGGAAATGATTCTCCCACAAAACA 31575444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAGCAGGAAGAAGCAGCTCTTCCCTCAGGCCAAGCAGGAAATGATTCTCCCACAAAACA 180

 31575445 CCTGACCCTGAGACCTTCCCAGGGAGTTGCACAAATTCGTTTTATAACCAGCAAAGCAAT 31575504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTGACCCTGAGACCTTCCCAGGGAGTTGCACAAATTCGTTTTATAACCAGCAAAGCAAT 240

 31575505 TCTGAGGGTTTTAGAGTGGGAAGGGCTTGCTCCTAGTTCTCCTAAGACTGTCTACTGTTT 31575564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGAGGGTTTTAGAGTGGGAAGGGCTTGCTCCTAGTTCTCCTAAGACTGTCTACTGTTT 300

 31575565 AATTACGAAAGCCACTGTTGTGCTCAACAGCTGAGGAAACACAGGAAGGATCAAGAAGTG 31575624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTACGAAAGCCACTGTTGTGCTCAACAGCTGAGGAAACACAGGAAGGATCAAGAAGTG 360

 31575625 AACTTTCCCTGACTCCACCTCCCCATACTGCCTCAGAGACCCAGGAACAGGCTGTCCCCC 31575684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTTTCCCTGACTCCACCTCCCCATACTGCCTCAGAGACCCAGGAACAGGCTGTCCCCC 420

 31575685 AGAAAGGGATGCCTGGGAGGACTGAGCAGGCACTGACCGCTCATGCTAGGGAACCAGGCC 31575744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAAAGGGATGCCTGGGAGGACTGAGCAGGCACTGACCGCTCATGCTAGGGAACCAGGCC 480

 31575745 AGTGAATGCAGCTTTGAATCTACGCTGGATCACCTCCATGTCCTCATCTGTAAAATCATG 31575804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTGAATGCAGCTTTGAATCTACGCTGGATCACCTCCATGTCCTCATCTGTAAAATCATG 540

 31575805 CCAGGCACGTCACATGCTTGGTACACATTCATTCATTGCATTTGGGCCACAACCCTATGA 31575864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAGGCACGTCACATGCTTGGTACACATTCATTCATTGCATTTGGGCCACAACCCTATGA 600

 31575865 GGGAGGTGTTATTATCATCTTTGTTTTACCGAGAAACCTAAGGCACAGAGAGGGTAAGAA 31575924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGAGGTGTTATTATCATCTTTGTTTTACCGAGAAACCTAAGGCACAGAGAGGGTAAGAA 660

 31575925 TGTTACTGGGCCAGGTGCAGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 31575984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTTACTGGGCCAGGTGCAGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 720

 31575985 CTGAGCCTGGAGTATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGGCAACATAGTGAG 31576044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGAGCCTGGAGTATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGGCAACATAGTGAG 780

 31576045 ACCCCCATTTCTACAAAAAGTAGAAAAATTAGCTGGGCTGTTGCACGAGACTGTGGTCCC 31576104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACCCCCATTTCTACAAAAAGTAGAAAAATTAGCTGGGCTGTTGCACGAGACTGTGGTCCC 840

 31576105 AGCCACTTGGGAGGCTGAACAGGAGGATGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTAGAGGCTG 31576164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCCACTTGGGAGGCTGAACAGGAGGATGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTAGAGGCTG 900

 31576165 CAGGGAGCCATGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCCAGTGAGAGTGAGACCATGTCTC 31576222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGGGAGCCATGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCCAGTGAGAGTGAGACCATGTCTC 958

EXCISED REGION

 31576224 AAAAAAAAAAAAAGTTACTAAGGCCATATATCTTGTGCATGTATACCTGAAATTTGAGAC 31576283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 AAAAAAAAAAAAAGTTACTAAGGCCATATATCTTGTGCATGTATACCTGAAATTTGAGAC 1018

 31576284 CAGGCAACCGGGTACCACTAGGCTGTACTGCTCCTATGAGGAGCACACACTTACCTGTAC 31576343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 CAGGCAACCGGGTACCACTAGGCTGTACTGCTCCTATGAGGAGCACACACTTACCTGTAC 1078

 31576344 CTGTCTCAGAGAATCTCTTCGAATTAAAGGAGATAATGCACGTAAGGTGCTCTGAACAGA 31576403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 CTGTCTCAGAGAATCTCTTCGAATTAAAGGAGATAATGCACGTAAGGTGCTCTGAACAGA 1138

 31576404 GTCTGGGACTTAGTACTCTCAGTAAACACAAGTCCAACATCATCATCATCATCAATAGTC 31576463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 GTCTGGGACTTAGTACTCTCAGTAAACACAAGTCCAACATCATCATCATCATCAATAGTC 1198

 31576464 TTACCTATTCAGAATTCTTTATTATTATTATTGTTATAGAAAGGGTCTCACTGTGTCACC 31576523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TTACCTATTCAGAATTCTTTATTATTATTATTGTTATAGAAAGGGTCTCACTGTGTCACC 1258

 31576524 CAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTTCATAGCTCACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAG 31576583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTTCATAGCTCACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAG 1318

 31576584 CTATCCTCCCATCCCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACACCAAACCTGGCCCAGTCAGA 31576643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 CTATCCTCCCATCCCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACACCAAACCTGGCCCAGTCAGA 1378

 31576644 ATTCTGAAGCAGTCGCACTCCTGGTCCTGGCTGCACAAACATGGTGGAAACTTATATGCT 31576703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 ATTCTGAAGCAGTCGCACTCCTGGTCCTGGCTGCACAAACATGGTGGAAACTTATATGCT 1438

 31576704 TAAAAAAAAAATTGTACTGGGGCCGGGCACGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTT 31576763
          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 T-AAAAAAAAATTGTACTGGGGCCGGGCACGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTT 1497

 31576764 GGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGTTCGAGACCAGCTTGGCCAACATGG 31576823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGTTCGAGACCAGCTTGGCCAACATGG 1557

 31576824 CGAAACCCTGTGTCTACTAAAAATACAAAATTTAGCCTGGCATGGTGGTGGGCACCTGTA 31576883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 CGAAACCCTGTGTCTACTAAAAATACAAAATTTAGCCTGGCATGGTGGTGGGCACCTGTA 1617

 31576884 ATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGACAGAAGTTG 31576943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 ATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGACAGAAGTTG 1677

 31576944 CAGTGAGCCAAGATCACACCACTGTACTCTAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGTCTC 31577003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CAGTGAGCCAAGATCACACCACTGTACTCTAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGTCTC 1737

 31577004 AAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAAACCAAATTGCTTTTAGTGGTTATTGCCAAGCAGGG 31577063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 AAAAAAAACAAAACAAAACAAAAAAACCAAATTGCTTTTAGTGGTTATTGCCAAGCAGGG 1797

 31577064 TTGTAGGGGAAACTCATTTTCATAGACCTCTATAATCATAACTATTTTATATAGTAATCA 31577123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TTGTAGGGGAAACTCATTTTCATAGACCTCTATAATCATAACTATTTTATATAGTAATCA 1857

 31577124 TGTATTATTTTGTAATTAGAAAAATATGCATAGATAGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCT 31577183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TGTATTATTTTGTAATTAGAAAAATATGCATAGATAGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCT 1917

 31577184 ATAATCCTAGCATTTAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTCAGGTCAGGAAGTCGAGACCAG 31577243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 ATAATCCTAGCATTTAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTCAGGTCAGGAAGTCGAGACCAG 1977

 31577244 CCTGGCCAAAATGGTGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGAT 31577303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 CCTGGCCAAAATGGTGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGAT 2037

 31577304 GGCATGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 31577350
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 GGCATGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 2084

Alignment time is 1.64427 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31565065,31587331] =>     22267 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2629] =>      2629 nucs 'mol-32-3306-285993_2629'

Score:        2629
Aligned:      2629        nucs
Identic:      2629 (100%) nucs =>      1905 (100%)       724 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31573266,31575170] EXCISED REGION [31575172,31575895]
 second seq =>  [       1,    1905] EXCISED REGION [    1906,    2629]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31575171,31575171]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [31575171,31575187] to [31575172,31575188]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31573266 CGTGAGCCACCGCACCTGGCCCAGATAATAAAAATTAGCCGGATATAGTGGCACATACCT 31573325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGTGAGCCACCGCACCTGGCCCAGATAATAAAAATTAGCCGGATATAGTGGCACATACCT 60

 31573326 CTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCTCGGAAGTTGAGG 31573385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCTCGGAAGTTGAGG 120

 31573386 CTGCAGTGAGCCATGATTGTGCCACTATACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCATGT 31573445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGCAGTGAGCCATGATTGTGCCACTATACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCATGT 180

 31573446 TTCAGAAAAAAAAGGAAAAAGATAAAAAATATAAAGGAAATTGGGGAACTATGCTGTCTC 31573505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCAGAAAAAAAAGGAAAAAGATAAAAAATATAAAGGAAATTGGGGAACTATGCTGTCTC 240

 31573506 CCCGGGGACCTTTCTGCTGAGTCAAGGTGGCCTCTCTGGGCAGTAGGATGAAGCCCGACT 31573565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCGGGGACCTTTCTGCTGAGTCAAGGTGGCCTCTCTGGGCAGTAGGATGAAGCCCGACT 300

 31573566 CTCTGGTCAACTCATTGTTCACGAAGTCCTTTCCCACAGCAGCTGAGGGACAAAGTCACA 31573625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTGGTCAACTCATTGTTCACGAAGTCCTTTCCCACAGCAGCTGAGGGACAAAGTCACA 360

 31573626 GTCCCTGCCCAGTCCTCTGCACCAGCCACCCCTCTGGTTTAACCTGTCCCAGGTCTTCCC 31573685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCCCTGCCCAGTCCTCTGCACCAGCCACCCCTCTGGTTTAACCTGTCCCAGGTCTTCCC 420

 31573686 CCTTGACTACACCCTCTAAATCCTAGAGTGGGGAGAGAATGAAGATGTGAGGTGACAGAT 31573745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTTGACTACACCCTCTAAATCCTAGAGTGGGGAGAGAATGAAGATGTGAGGTGACAGAT 480

 31573746 GAGGTCTCTTCCCCAGCCAGAGGGTGCAGAAAGCCCCAACATAACACATGTCCTGAAACC 31573805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGGTCTCTTCCCCAGCCAGAGGGTGCAGAAAGCCCCAACATAACACATGTCCTGAAACC 540

 31573806 CAAAGAGAAGACAGAAATTGTCAGCAAAGGTTAGCTAGCTCCTGAGGTCATAAGCAACCT 31573865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAAGAGAAGACAGAAATTGTCAGCAAAGGTTAGCTAGCTCCTGAGGTCATAAGCAACCT 600

 31573866 TATTTTTATTTTGTGTTCCCAAATGTGTTGTCTGGAACATGTATACATATTACGTATTAA 31573925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATTTTTATTTTGTGTTCCCAAATGTGTTGTCTGGAACATGTATACATATTACGTATTAA 660

 31573926 AGCAAAAGCAAAATCAGAATAAATATTGTCTTCCAAGTTGTCTTTGTGTGTGTTTTGGTT 31573985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCAAAAGCAAAATCAGAATAAATATTGTCTTCCAAGTTGTCTTTGTGTGTGTTTTGGTT 720

 31573986 TTGTGGTTTATTCCTCTTTCTTTTCAGTTGGATAGAAGCCAGGCTCCTTTCTCCCAGCAC 31574045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGTGGTTTATTCCTCTTTCTTTTCAGTTGGATAGAAGCCAGGCTCCTTTCTCCCAGCAC 780

 31574046 ACGCACAGACTCAGCACACACAGAAACCCCAGGAATTAAATGACTCTCCAAAATGATAAG 31574105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACGCACAGACTCAGCACACACAGAAACCCCAGGAATTAAATGACTCTCCAAAATGATAAG 840

 31574106 TAGGAAGAAGGGGGTGGGGTAGAGAGGGAGGAAGGGGGAGAGAGGAGGCCTTTTCCCCTG 31574165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGGAAGAAGGGGGTGGGGTAGAGAGGGAGGAAGGGGGAGAGAGGAGGCCTTTTCCCCTG 900

 31574166 ACCTGGGGAGGAGCCCTAGTCCAGGAGAGGTCAGGGTGTGCAAAGGCCTCTGGGTAGGAA 31574225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACCTGGGGAGGAGCCCTAGTCCAGGAGAGGTCAGGGTGTGCAAAGGCCTCTGGGTAGGAA 960

 31574226 TAGGAACAGGGCCATTGGCCAAGTGCCCTCTGCTCTGTTACTCCCAGAGCCGGCTCCTAC 31574285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGGAACAGGGCCATTGGCCAAGTGCCCTCTGCTCTGTTACTCCCAGAGCCGGCTCCTAC 1020

 31574286 CCTCAGGCCTGGGAGCCCGCCGTCTGCTAGTAAGGGGCTTCAGGAGTTGGGGGAGTGCAG 31574345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTCAGGCCTGGGAGCCCGCCGTCTGCTAGTAAGGGGCTTCAGGAGTTGGGGGAGTGCAG 1080

 31574346 ATGAGGAGTAGCTCTCTTTTTCTCACATTCCCTCTTAAACCTCAGTTTTTTTGTTTTTTT 31574405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGAGGAGTAGCTCTCTTTTTCTCACATTCCCTCTTAAACCTCAGTTTTTTTGTTTTTTT 1140

 31574406 TTTTTAAAGAAATGATTCTAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAAA 31574465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTTAAAGAAATGATTCTAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAAA 1200

 31574466 TGTGTTTCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCTGGGAGGTTCAGGCTG 31574525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTGTTTCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCTGGGAGGTTCAGGCTG 1260

 31574526 CAGTGAGCTGAGATCAGGCCACTGCACTCCAGCTGGGGAGACAGAGGGAGACCCTGTCTC 31574585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGTGAGCTGAGATCAGGCCACTGCACTCCAGCTGGGGAGACAGAGGGAGACCCTGTCTC 1320

 31574586 AAAAAAAAAAAAAAGAAATAATTTTTGTCCTTTTTCTATAAGCATCTTTTAAAACTTTTT 31574645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAAAAAAAAAAAAGAAATAATTTTTGTCCTTTTTCTATAAGCATCTTTTAAAACTTTTT 1380

 31574646 TCCAGGCAGGGAGCGGTGTCTCACGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGG 31574705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCAGGCAGGGAGCGGTGTCTCACGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGG 1440

 31574706 CGGATAACCTGAGGTTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTC 31574765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CGGATAACCTGAGGTTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTC 1500

 31574766 TACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGG 31574825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGG 1560

 31574826 GAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACCCGGGAGGTGAGCCGAGATTGCGCTATTGCAC 31574885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACCCGGGAGGTGAGCCGAGATTGCGCTATTGCAC 1620

 31574886 TCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTGTCTAAAAAAGAAAAAAGGCAGCATTTTGGGAG 31574945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTGTCTAAAAAAGAAAAAAGGCAGCATTTTGGGAG 1680

 31574946 GTGGAGGTGAGAGGACAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATGTGATGAAACCCCATCTC 31575005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGGAGGTGAGAGGACAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATGTGATGAAACCCCATCTC 1740

 31575006 TATTAAAAACACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCG 31575065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATTAAAAACACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCG 1800

 31575066 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGAT 31575125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGAT 1860

 31575126 CATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGCCAGAGCAAGACCCTGTATC 31575170
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGCCAGAGCAAGACCCTGTATC 1905

EXCISED REGION

 31575172 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAACTTTAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAA 31575231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAACTTTAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAA 1965

 31575232 TAAATAAATGATTTGCACAGCAACTTTGTGAACAGAGCCCCCTTCCCTTTCATTTTCTGC 31575291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 TAAATAAATGATTTGCACAGCAACTTTGTGAACAGAGCCCCCTTCCCTTTCATTTTCTGC 2025

 31575292 CTGACTACCCACAACAGAGTCCCGGGTGGGGGTGGGAGGGTCAGGGATGGGCTGTGGCGT 31575351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 CTGACTACCCACAACAGAGTCCCGGGTGGGGGTGGGAGGGTCAGGGATGGGCTGTGGCGT 2085

 31575352 CTGCATGCAGGCTTGCCTCCACTGGCCTGAATCTCAGCAGGAAGAAGCAGCTCTTCCCTC 31575411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 CTGCATGCAGGCTTGCCTCCACTGGCCTGAATCTCAGCAGGAAGAAGCAGCTCTTCCCTC 2145

 31575412 AGGCCAAGCAGGAAATGATTCTCCCACAAAACACCTGACCCTGAGACCTTCCCAGGGAGT 31575471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 AGGCCAAGCAGGAAATGATTCTCCCACAAAACACCTGACCCTGAGACCTTCCCAGGGAGT 2205

 31575472 TGCACAAATTCGTTTTATAACCAGCAAAGCAATTCTGAGGGTTTTAGAGTGGGAAGGGCT 31575531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 TGCACAAATTCGTTTTATAACCAGCAAAGCAATTCTGAGGGTTTTAGAGTGGGAAGGGCT 2265

 31575532 TGCTCCTAGTTCTCCTAAGACTGTCTACTGTTTAATTACGAAAGCCACTGTTGTGCTCAA 31575591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 TGCTCCTAGTTCTCCTAAGACTGTCTACTGTTTAATTACGAAAGCCACTGTTGTGCTCAA 2325

 31575592 CAGCTGAGGAAACACAGGAAGGATCAAGAAGTGAACTTTCCCTGACTCCACCTCCCCATA 31575651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 CAGCTGAGGAAACACAGGAAGGATCAAGAAGTGAACTTTCCCTGACTCCACCTCCCCATA 2385

 31575652 CTGCCTCAGAGACCCAGGAACAGGCTGTCCCCCAGAAAGGGATGCCTGGGAGGACTGAGC 31575711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 CTGCCTCAGAGACCCAGGAACAGGCTGTCCCCCAGAAAGGGATGCCTGGGAGGACTGAGC 2445

 31575712 AGGCACTGACCGCTCATGCTAGGGAACCAGGCCAGTGAATGCAGCTTTGAATCTACGCTG 31575771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 AGGCACTGACCGCTCATGCTAGGGAACCAGGCCAGTGAATGCAGCTTTGAATCTACGCTG 2505

 31575772 GATCACCTCCATGTCCTCATCTGTAAAATCATGCCAGGCACGTCACATGCTTGGTACACA 31575831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 GATCACCTCCATGTCCTCATCTGTAAAATCATGCCAGGCACGTCACATGCTTGGTACACA 2565

 31575832 TTCATTCATTGCATTTGGGCCACAACCCTATGAGGGAGGTGTTATTATCATCTTTGTTTT 31575891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 TTCATTCATTGCATTTGGGCCACAACCCTATGAGGGAGGTGTTATTATCATCTTTGTTTT 2625

 31575892 ACCG 31575895
          ||||
     2626 ACCG 2629

Alignment time is 2.15865 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31565065,31587331] =>     22267 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3652] =>      3652 nucs 'mol-32-3327-044277_3652'

Score:        3628
Aligned:      3658        nucs
Identic:      3652 (100%) nucs =>      1031 (100%)      2621 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31574035,31575065] EXCISED REGION [31577332,31579958]
 second seq =>  [       1,    1031] EXCISED REGION [    1032,    3652]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2266 nucs [31575066,31577331]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [31575066,31575085] to [31577332,31577351]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31575065,31575065] to [31577332,31577332]
 second seq =>         1 nucs [1031,1031] to [1032,1032]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31574035 TCTCCCAGCACACGCACAGACTCAGCACACACAGAAACCCCAGGAATTAAATGACTCTCC 31574094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCCCAGCACACGCACAGACTCAGCACACACAGAAACCCCAGGAATTAAATGACTCTCC 60

 31574095 AAAATGATAAGTAGGAAGAAGGGGGTGGGGTAGAGAGGGAGGAAGGGGGAGAGAGGAGGC 31574154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAATGATAAGTAGGAAGAAGGGGGTGGGGTAGAGAGGGAGGAAGGGGGAGAGAGGAGGC 120

 31574155 CTTTTCCCCTGACCTGGGGAGGAGCCCTAGTCCAGGAGAGGTCAGGGTGTGCAAAGGCCT 31574214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTTTCCCCTGACCTGGGGAGGAGCCCTAGTCCAGGAGAGGTCAGGGTGTGCAAAGGCCT 180

 31574215 CTGGGTAGGAATAGGAACAGGGCCATTGGCCAAGTGCCCTCTGCTCTGTTACTCCCAGAG 31574274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGGGTAGGAATAGGAACAGGGCCATTGGCCAAGTGCCCTCTGCTCTGTTACTCCCAGAG 240

 31574275 CCGGCTCCTACCCTCAGGCCTGGGAGCCCGCCGTCTGCTAGTAAGGGGCTTCAGGAGTTG 31574334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCGGCTCCTACCCTCAGGCCTGGGAGCCCGCCGTCTGCTAGTAAGGGGCTTCAGGAGTTG 300

 31574335 GGGGAGTGCAGATGAGGAGTAGCTCTCTTTTTCTCACATTCCCTCTTAAACCTCAGTTTT 31574394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGGAGTGCAGATGAGGAGTAGCTCTCTTTTTCTCACATTCCCTCTTAAACCTCAGTTTT 360

 31574395 TTTGTTTTTTTTTTTTAAAGAAATGATTCTAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCATGCGCCT 31574454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGTTTTTTTTTTTTAAAGAAATGATTCTAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCATGCGCCT 420

 31574455 GTAATCCCAAATGTGTTTCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCTGGGA 31574514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTAATCCCAAATGTGTTTCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCTGGGA 480

 31574515 GGTTCAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCAGGCCACTGCACTCCAGCTGGGGAGACAGAGGGA 31574574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTTCAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCAGGCCACTGCACTCCAGCTGGGGAGACAGAGGGA 540

 31574575 GACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAATAATTTTTGTCCTTTTTCTATAAGCATCTTT 31574634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAATAATTTTTGTCCTTTTTCTATAAGCATCTTT 600

 31574635 TAAAACTTTTTTCCAGGCAGGGAGCGGTGTCTCACGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAG 31574694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAAACTTTTTTCCAGGCAGGGAGCGGTGTCTCACGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAG 660

 31574695 GCCGAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGA 31574754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCCGAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGA 720

 31574755 AACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCC 31574814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCC 780

 31574815 CAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACCCGGGAGGTGAGCCGAGATTG 31574874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACCCGGGAGGTGAGCCGAGATTG 840

 31574875 CGCTATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTGTCTAAAAAAGAAAAAAGGCAG 31574934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CGCTATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTGTCTAAAAAAGAAAAAAGGCAG 900

 31574935 CATTTTGGGAGGTGGAGGTGAGAGGACAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATGTGATGA 31574994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATTTTGGGAGGTGGAGGTGAGAGGACAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATGTGATGA 960

 31574995 AACCCCATCTCTATTAAAAACACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATC 31575054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACCCCATCTCTATTAAAAACACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATC 1020

 31575055 CCAGCTACTCG 31575065
          |||||||||||
     1021 CCAGCTACTCG 1031

EXCISED REGION

 31577332 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGATCGCAC 31577391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGATCGCAC 1091

 31577392 CATTGCACTCCAGCCTAGGAGACAGAGTGAGACTCCATCTAAAAAAGAAAAAAGAAAGAA 31577451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 CATTGCACTCCAGCCTAGGAGACAGAGTGAGACTCCATCTAAAAAAGAAAAAAGAAAGAA 1151

 31577452 AAAGAAAAAATAATAATATGCATAGATGAAGACATAATATATAAATGCCAAGTGCATGTA 31577511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 AAAGAAAAAATAATAATATGCATAGATGAAGACATAATATATAAATGCCAAGTGCATGTA 1211

 31577512 CTGAGCACTCAGTTCACTTGTTTGTGTATGTTTCTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTT 31577571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 CTGAGCACTCAGTTCACTTGTTTGTGTATGTTTCTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTT 1271

 31577572 TTTTTGAGACAGTCTCTCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTTA 31577631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 TTTTTGAGACAGTCTCTCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTTA 1331

 31577632 CTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAACAGTTCTTCTGCCTCAGCCTCCCTCATAGCTGG 31577691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 CTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAACAGTTCTTCTGCCTCAGCCTCCCTCATAGCTGG 1391

 31577692 AATCACAGGTGCCCGCCACCTTGCTCAGTTTTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGAGGTT 31577751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 AATCACAGGTGCCCGCCACCTTGCTCAGTTTTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGAGGTT 1451

 31577752 TTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCAGCTTGGC 31577811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 TTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCAGCTTGGC 1511

 31577812 CTCCCAAGCTGCTGGGGTTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCAGCCCCTCTGTTTGCTTTT 31577871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 CTCCCAAGCTGCTGGGGTTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCAGCCCCTCTGTTTGCTTTT 1571

 31577872 TTTTCTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGACTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCT 31577931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 TTTTCTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGACTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCT 1631

 31577932 AACTCCTGGCCTCAAGTGGTTCACCGGCCTCGGCCTCCCAAAGTTCTGGGATTATAGGTG 31577991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 AACTCCTGGCCTCAAGTGGTTCACCGGCCTCGGCCTCCCAAAGTTCTGGGATTATAGGTG 1691

 31577992 TGAGCCACCATGCCTGGCTTGTTCATGTGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTTTTC 31578051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 TGAGCCACCATGCCTGGCTTGTTCATGTGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTTTTC 1751

 31578052 TTTTTGAGACAGAGTTTTGTTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGGGATCTCGGC 31578111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 TTTTTGAGACAGAGTTTTGTTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGGGATCTCGGC 1811

 31578112 TCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGTGTCCTGAGTAGC 31578171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 TCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGTGTCCTGAGTAGC 1871

 31578172 TGGGATTATGGGTGCCCACCACCATGCCCGGACACTTTTTTTGTATTTTTAGAAGAGACG 31578231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 TGGGATTATGGGTGCCCACCACCATGCCCGGACACTTTTTTTGTATTTTTAGAAGAGACG 1931

 31578232 GGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCC 31578291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 GGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCC 1991

 31578292 TCAACCTCCCAAAGTGCTGTGATTACAGGCATAAGCCACCGCGGCCAGCCCATGTATGTT 31578351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 TCAACCTCCCAAAGTGCTGTGATTACAGGCATAAGCCACCGCGGCCAGCCCATGTATGTT 2051

 31578352 TCTATTCACCATTTATGGAGCATCTATTGGCTACCAGGCCTTGGCTACAGGAACTGCCAT 31578411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 TCTATTCACCATTTATGGAGCATCTATTGGCTACCAGGCCTTGGCTACAGGAACTGCCAT 2111

 31578412 GTGGCGTCAGAACCCTGAAGAAGTTCCCAGTGTGATTCACTGGATGGGGTGGGAAGAATC 31578471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 GTGGCGTCAGAACCCTGAAGAAGTTCCCAGTGTGATTCACTGGATGGGGTGGGAAGAATC 2171

 31578472 TTCTATCTGCTATGGTAGGAACAGAGGGCTGTGTGCAGGTGACAGGCCAGGCCTGGAATG 31578531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TTCTATCTGCTATGGTAGGAACAGAGGGCTGTGTGCAGGTGACAGGCCAGGCCTGGAATG 2231

 31578532 TGAACCTCTAATTCCCCATCAAGTGTGATAGAAGATGCTGAGTGCGGTGGCTCACGCCTG 31578591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 TGAACCTCTAATTCCCCATCAAGTGTGATAGAAGATGCTGAGTGCGGTGGCTCACGCCTG 2291

 31578592 TAATCCCAGCACTTTAGGAAACCAAGGCAGGCGGATTGCTCGAGCTCAGGAGTTGAAGAC 31578651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 TAATCCCAGCACTTTAGGAAACCAAGGCAGGCGGATTGCTCGAGCTCAGGAGTTGAAGAC 2351

 31578652 TGGCCCAGGCAACATGGCAAAACCTCATCTCTACACAAAATACAAAAATTAGTCAGGCAT 31578711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 TGGCCCAGGCAACATGGCAAAACCTCATCTCTACACAAAATACAAAAATTAGTCAGGCAT 2411

 31578712 GGTGACTCGTGCCCGTGGTCCCAGCTATTTGTGGGGCTGAGATGGGAGGATCGCTTGAAC 31578771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 GGTGACTCGTGCCCGTGGTCCCAGCTATTTGTGGGGCTGAGATGGGAGGATCGCTTGAAC 2471

 31578772 CCAGGAGGTCCAGGCTATGGTGAACTGTGGAAGCACCACAGCACTCCAGTCTGGACGACA 31578831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 CCAGGAGGTCCAGGCTATGGTGAACTGTGGAAGCACCACAGCACTCCAGTCTGGACGACA 2531

 31578832 AAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGTGTGATAGAAATACTGA 31578891
          |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 AAGTGAGACCCTGTCTC----AAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGTGTGATAGAAATACTGA 2587

 31578892 AAGAAGCAGGCTCTCAGAACAAAGGTTAGGTTTTTGGTTTTTGTTTTATGTTTCTTTTTG 31578951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 AAGAAGCAGGCTCTCAGAACAAAGGTTAGGTTTTTGGTTTTTGTTTTATGTTTCTTTTTG 2647

 31578952 AGACAGAATCTCACTCTATTGCTGAGGCTGGAGTGCAGTGACATGTTCATAGCTCACTGC 31579011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 AGACAGAATCTCACTCTATTGCTGAGGCTGGAGTGCAGTGACATGTTCATAGCTCACTGC 2707

 31579012 ATCCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATTCTCCCACCCCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 31579071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 ATCCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATTCTCCCACCCCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 2767

 31579072 ATACCACACGTGCCCCAGTCAGAATTCCAAAGCAATCACACTCCTGGCCTTGGCTACACA 31579131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 ATACCACACGTGCCCCAGTCAGAATTCCAAAGCAATCACACTCCTGGCCTTGGCTACACA 2827

 31579132 AATATGGTGGCACCTTATATGCTTAAAAAAATTGTACCAGGCCGGGCGCAGTGGCTCACG 31579191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 AATATGGTGGCACCTTATATGCTTAAAAAAATTGTACCAGGCCGGGCGCAGTGGCTCACG 2887

 31579192 CCTGTAATCCCAACATTTTGGGAGGCCGAGGGGAGTTGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCG 31579251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 CCTGTAATCCCAACATTTTGGGAGGCCGAGGGGAGTTGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCG 2947

 31579252 AGACCAGTCTGGCCAAAGTGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAATATACAAAAAATTAGCCA 31579311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 AGACCAGTCTGGCCAAAGTGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAATATACAAAAAATTAGCCA 3007

 31579312 GGCATGGTGAGGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCT 31579371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 GGCATGGTGAGGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCT 3067

 31579372 TAAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGG 31579431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 TAAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGG 3127

 31579432 CAACAGATCAACACCTTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGGCCAGGAG 31579491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 CAACAGATCAACACCTTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGGCCAGGAG 3187

 31579492 CAGTGGCTTACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCACATCATGAGGT 31579551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 CAGTGGCTTACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCACATCATGAGGT 3247

 31579552 CAGGAATTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCTACTAAAAATACAAA 31579611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 CAGGAATTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCTACTAAAAATACAAA 3307

 31579612 AATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGCGCTCATAATCCCAACTAATTGAGAGGCTGAGGCAGG 31579671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 AATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGCGCTCATAATCCCAACTAATTGAGAGGCTGAGGCAGG 3367

 31579672 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGACGGAGGCAGTGAGCCTAGATCGTGCCATTGCACTCCAG 31579731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 AGAATCGCTTGAACCTGGGAGACGGAGGCAGTGAGCCTAGATCGTGCCATTGCACTCCAG 3427

 31579732 CCTGGGCGACAAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAACGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAA 31579791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||
     3428 CCTGGGCGACAAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAACG--AAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAA 3485

 31579792 GAGGAAGAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAGGAAGAAGAGGAGAACACTGGGGGA 31579851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 GAGGAAGAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAGGAAGAAGAGGAGAACACTGGGGGA 3545

 31579852 AAAGGAGAGAAGTACAGAATAGGAAAACAAAACTAGACTCTGGTGATTTAGGCAATCTGC 31579911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 AAAGGAGAGAAGTACAGAATAGGAAAACAAAACTAGACTCTGGTGATTTAGGCAATCTGC 3605

 31579912 TGAGTTTTTCTCCTTGGTTCTTATGTTTTATTTTTTTCTTTCTTATT 31579958
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 TGAGTTTTTCTCCTTGGTTCTTATGTTTTATTTTTTTCTTTCTTATT 3652

Alignment time is 2.94393 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31565065,31587331] =>     22267 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3226] =>      3226 nucs 'mol-32-3332-183420_3226'

Score:        3205
Aligned:      3227        nucs
Identic:      3225 (100%) nucs =>      1797 (100%)      1428 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31573267,31575065] EXCISED REGION [31577332,31578759]
 second seq =>  [       1,    1798] EXCISED REGION [    1799,    3226]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2266 nucs [31575066,31577331]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [31575066,31575085] to [31577332,31577351]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31575065,31575065] to [31577332,31577332]
 second seq =>         1 nucs [1798,1798] to [1799,1799]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31573267 GTGAGCCACCGCACCTGGCCCAGATAATAAAAATTAGCCGGATATAGTGGCACATACCTC 31573326
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGAGCCACCTCACCTGGCCCAGATAATAAAAATTAGCCGGATATAGTGGCACATACCTC 60

 31573327 TAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCTCGGAAGTTGAGGC 31573386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCTCGGAAGTTGAGGC 120

 31573387 TGCAGTGAGCCATGATTGTGCCACTATACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCATGTT 31573446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCAGTGAGCCATGATTGTGCCACTATACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCATGTT 180

 31573447 TCAGAAAAAAAAGGAAAAAGATAAAAAATATAAAGGAAATTGGGGAACTATGCTGTCTCC 31573506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCAGAAAAAAAAGGAAAAAGATAAAAAATATAAAGGAAATTGGGGAACTATGCTGTCTCC 240

 31573507 CCGGGGACCTTTCTGCTGAGTCAAGGTGGCCTCTCTGGGCAGTAGGATGAAGCCCGACTC 31573566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCGGGGACCTTTCTGCTGAGTCAAGGTGGCCTCTCTGGGCAGTAGGATGAAGCCCGACTC 300

 31573567 TCTGGTCAACTCATTGTTCACGAAGTCCTTTCCCACAGCAGCTGAGGGACAAAGTCACAG 31573626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTGGTCAACTCATTGTTCACGAAGTCCTTTCCCACAGCAGCTGAGGGACAAAGTCACAG 360

 31573627 TCCCTGCCCAGTCCTCTGCACCAGCCACCCCTCTGGTTTAACCTGTCCCAGGTCTTCCCC 31573686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCCTGCCCAGTCCTCTGCACCAGCCACCCCTCTGGTTTAACCTGTCCCAGGTCTTCCCC 420

 31573687 CTTGACTACACCCTCTAAATCCTAGAGTGGGGAGAGAATGAAGATGTGAGGTGACAGATG 31573746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTGACTACACCCTCTAAATCCTAGAGTGGGGAGAGAATGAAGATGTGAGGTGACAGATG 480

 31573747 AGGTCTCTTCCCCAGCCAGAGGGTGCAGAAAGCCCCAACATAACACATGTCCTGAAACCC 31573806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGTCTCTTCCCCAGCCAGAGGGTGCAGAAAGCCCCAACATAACACATGTCCTGAAACCC 540

 31573807 AAAGAGAAGACAGAAATTGTCAGCAAAGGTTAGCTAGCTCCTGAGGTCATAAGCAACCTT 31573866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAGAGAAGACAGAAATTGTCAGCAAAGGTTAGCTAGCTCCTGAGGTCATAAGCAACCTT 600

 31573867 ATTTTTATTTTGTGTTCCCAAATGTGTTGTCTGGAACATGTATACATATTACGTATTAAA 31573926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTTTATTTTGTGTTCCCAAATGTGTTGTCTGGAACATGTATACATATTACGTATTAAA 660

 31573927 GCAAAAGCAAAATCAGAATAAATATTGTCTTCCAAGTTGTCTTTGTGTGTGTTTTGGTTT 31573986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAAAAGCAAAATCAGAATAAATATTGTCTTCCAAGTTGTCTTTGTGTGTGTTTTGGTTT 720

 31573987 TGTGGTTTATTCCTCTTTCTTTTCAGTTGGATAGAAGCCAGGCTCCTTTCTCCCAGCACA 31574046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTGGTTTATTCCTCTTTCTTTTCAGTTGGATAGAAGCCAGGCTCCTTTCTCCCAGCACA 780

 31574047 CGCACAGACTCAGCACACACAGAAACCCCAGGAATTAAATGACTCTCCAAAATGATAAGT 31574106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CGCACAGACTCAGCACACACAGAAACCCCAGGAATTAAATGACTCTCCAAAATGATAAGT 840

 31574107 AGGAAGAAGGGGGTGGGGTAGAGAGGGAGGAAGGGGGAGAGAGGAGGCCTTTTCCCCTGA 31574166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGAAGAAGGGGGTGGGGTAGAGAGGGAGGAAGGGGGAGAGAGGAGGCCTTTTCCCCTGA 900

 31574167 CCTGGGGAGGAGCCCTAGTCCAGGAGAGGTCAGGGTGTGCAAAGGCCTCTGGGTAGGAAT 31574226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTGGGGAGGAGCCCTAGTCCAGGAGAGGTCAGGGTGTGCAAAGGCCTCTGGGTAGGAAT 960

 31574227 AGGAACAGGGCCATTGGCCAAGTGCCCTCTGCTCTGTTACTCCCAGAGCCGGCTCCTACC 31574286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGAACAGGGCCATTGGCCAAGTGCCCTCTGCTCTGTTACTCCCAGAGCCGGCTCCTACC 1020

 31574287 CTCAGGCCTGGGAGCCCGCCGTCTGCTAGTAAGGGGCTTCAGGAGTTGGGGGAGTGCAGA 31574346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCAGGCCTGGGAGCCCGCCGTCTGCTAGTAAGGGGCTTCAGGAGTTGGGGGAGTGCAGA 1080

 31574347 TGAGGAGTAGCTCTCTTTTTCTCACATTCCCTCTTAAACCTCAGTTTTTTTGTTTTTTTT 31574406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGAGGAGTAGCTCTCTTTTTCTCACATTCCCTCTTAAACCTCAGTTTTTTTGTTTTTTTT 1140

 31574407 TTTTAAAGAAATGATTCTAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAAAT 31574466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTAAAGAAATGATTCTAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAAAT 1200

 31574467 GTGTTTCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCTGGGAGGTTCAGGCTGC 31574526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGTTTCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCTGGGAGGTTCAGGCTGC 1260

 31574527 AGTGAGCTGAGATCAGGCCACTGCACTCCAGCTGGGGAGACAGAGGGAGACCCTGTCTCA 31574586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTGAGCTGAGATCAGGCCACTGCACTCCAGCTGGGGAGACAGAGGGAGACCCTGTCTCA 1320

 31574587 AAAAAAAAAAAAAGAAATAATTTTTGTCCTTTTTCTATAAGCATCTTTTAAAACTTTTTT 31574646
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAAAAAAAAAA-GAAATAATTTTTGTCCTTTTTCTATAAGCATCTTTTAAAACTTTTTT 1379

 31574647 CCAGGCAGGGAGCGGTGTCTCACGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGC 31574706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CCAGGCAGGGAGCGGTGTCTCACGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGC 1439

 31574707 GGATAACCTGAGGTTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCT 31574766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 GGATAACCTGAGGTTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCT 1499

 31574767 ACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGG 31574826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 ACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGG 1559

 31574827 AGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACCCGGGAGGTGAGCCGAGATTGCGCTATTGCACT 31574886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACCCGGGAGGTGAGCCGAGATTGCGCTATTGCACT 1619

 31574887 CCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTGTCTAAAAAAGAAAAAAGGCAGCATTTTGGGAGG 31574946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTGTCTAAAAAAGAAAAAAGGCAGCATTTTGGGAGG 1679

 31574947 TGGAGGTGAGAGGACAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATGTGATGAAACCCCATCTCT 31575006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TGGAGGTGAGAGGACAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATGTGATGAAACCCCATCTCT 1739

 31575007 ATTAAAAACACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCG 31575065
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ATTAAAAACACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCG 1798

EXCISED REGION

 31577332 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGATCGCAC 31577391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGATCGCAC 1858

 31577392 CATTGCACTCCAGCCTAGGAGACAGAGTGAGACTCCATCTAAAAAAGAAAAAAGAAAGAA 31577451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CATTGCACTCCAGCCTAGGAGACAGAGTGAGACTCCATCTAAAAAAGAAAAAAGAAAGAA 1918

 31577452 AAAGAAAAAATAATAATATGCATAGATGAAGACATAATATATAAATGCCAAGTGCATGTA 31577511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 AAAGAAAAAATAATAATATGCATAGATGAAGACATAATATATAAATGCCAAGTGCATGTA 1978

 31577512 CTGAGCACTCAGTTCACTTGTTTGTGTATGTTTCTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTT 31577571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CTGAGCACTCAGTTCACTTGTTTGTGTATGTTTCTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTT 2038

 31577572 TTTTTGAGACAGTCTCTCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTTA 31577631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TTTTTGAGACAGTCTCTCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTTA 2098

 31577632 CTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAACAGTTCTTCTGCCTCAGCCTCCCTCATAGCTGG 31577691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAACAGTTCTTCTGCCTCAGCCTCCCTCATAGCTGG 2158

 31577692 AATCACAGGTGCCCGCCACCTTGCTCAGTTTTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGAGGTT 31577751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AATCACAGGTGCCCGCCACCTTGCTCAGTTTTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGAGGTT 2218

 31577752 TTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCAGCTTGGC 31577811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCAGCTTGGC 2278

 31577812 CTCCCAAGCTGCTGGGGTTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCAGCCCCTCTGTTTGCTTTT 31577871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 CTCCCAAGCTGCTGGGGTTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCAGCCCCTCTGTTTGCTTTT 2338

 31577872 TTTTCTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGACTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCT 31577931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TTTTCTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGACTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCT 2398

 31577932 AACTCCTGGCCTCAAGTGGTTCACCGGCCTCGGCCTCCCAAAGTTCTGGGATTATAGGTG 31577991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 AACTCCTGGCCTCAAGTGGTTCACCGGCCTCGGCCTCCCAAAGTTCTGGGATTATAGGTG 2458

 31577992 TGAGCCACCATGCCTGGCTTGTTCATGTGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTTTTC 31578051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TGAGCCACCATGCCTGGCTTGTTCATGTGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTTTTC 2518

 31578052 TTTTTGAGACAGAGTTTTGTTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGGGATCTCGGC 31578111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TTTTTGAGACAGAGTTTTGTTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGGGATCTCGGC 2578

 31578112 TCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGTGTCCTGAGTAGC 31578171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGTGTCCTGAGTAGC 2638

 31578172 TGGGATTATGGGTGCCCACCACCATGCCCGGACACTTTTTTTGTATTTTTAGAAGAGACG 31578231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TGGGATTATGGGTGCCCACCACCATGCCCGGACACTTTTTTTGTATTTTTAGAAGAGACG 2698

 31578232 GGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCC 31578291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCC 2758

 31578292 TCAACCTCCCAAAGTGCTGTGATTACAGGCATAAGCCACCGCGGCCAGCCCATGTATGTT 31578351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TCAACCTCCCAAAGTGCTGTGATTACAGGCATAAGCCACCGCGGCCAGCCCATGTATGTT 2818

 31578352 TCTATTCACCATTTATGGAGCATCTATTGGCTACCAGGCCTTGGCTACAGGAACTGCCAT 31578411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 TCTATTCACCATTTATGGAGCATCTATTGGCTACCAGGCCTTGGCTACAGGAACTGCCAT 2878

 31578412 GTGGCGTCAGAACCCTGAAGAAGTTCCCAGTGTGATTCACTGGATGGGGTGGGAAGAATC 31578471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GTGGCGTCAGAACCCTGAAGAAGTTCCCAGTGTGATTCACTGGATGGGGTGGGAAGAATC 2938

 31578472 TTCTATCTGCTATGGTAGGAACAGAGGGCTGTGTGCAGGTGACAGGCCAGGCCTGGAATG 31578531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TTCTATCTGCTATGGTAGGAACAGAGGGCTGTGTGCAGGTGACAGGCCAGGCCTGGAATG 2998

 31578532 TGAACCTCTAATTCCCCATCAAGTGTGATAGAAGATGCTGAGTGCGGTGGCTCACGCCTG 31578591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TGAACCTCTAATTCCCCATCAAGTGTGATAGAAGATGCTGAGTGCGGTGGCTCACGCCTG 3058

 31578592 TAATCCCAGCACTTTAGGAAACCAAGGCAGGCGGATTGCTCGAGCTCAGGAGTTGAAGAC 31578651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 TAATCCCAGCACTTTAGGAAACCAAGGCAGGCGGATTGCTCGAGCTCAGGAGTTGAAGAC 3118

 31578652 TGGCCCAGGCAACATGGCAAAACCTCATCTCTACACAAAATACAAAAATTAGTCAGGCAT 31578711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TGGCCCAGGCAACATGGCAAAACCTCATCTCTACACAAAATACAAAAATTAGTCAGGCAT 3178

 31578712 GGTGACTCGTGCCCGTGGTCCCAGCTATTTGTGGGGCTGAGATGGGAG 31578759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GGTGACTCGTGCCCGTGGTCCCAGCTATTTGTGGGGCTGAGATGGGAG 3226

Alignment time is 2.59513 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31565065,31587331] =>     22267 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2006] =>      2006 nucs 'mol-32-33b6-010503_2006'

Score:        1974
Aligned:      2007        nucs
Identic:      2004 (100%) nucs =>       381 (100%)      1623 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31575543,31575923] EXCISED REGION [31575925,31577550]
 second seq =>  [       1,     381] EXCISED REGION [     383,    2006]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31575924,31575924]
 second seq =>         1 nucs [382,382]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31576223,31576223]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31575923,31575923] to [31575924,31575924]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31575543 CTCCTAAGACTGTCTACTGTTTAATTACGAAAGCCACTGTTGTGCTCAACAGCTGAGGAA 31575602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCCTAAGACTGTCTACTGTTTAATTACGAAAGCCACTGTTGTGCTCAACAGCTGAGGAA 60

 31575603 ACACAGGAAGGATCAAGAAGTGAACTTTCCCTGACTCCACCTCCCCATACTGCCTCAGAG 31575662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACACAGGAAGGATCAAGAAGTGAACTTTCCCTGACTCCACCTCCCCATACTGCCTCAGAG 120

 31575663 ACCCAGGAACAGGCTGTCCCCCAGAAAGGGATGCCTGGGAGGACTGAGCAGGCACTGACC 31575722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCCAGGAACAGGCTGTCCCCCAGAAAGGGATGCCTGGGAGGACTGAGCAGGCACTGACC 180

 31575723 GCTCATGCTAGGGAACCAGGCCAGTGAATGCAGCTTTGAATCTACGCTGGATCACCTCCA 31575782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTCATGCTAGGGAACCAGGCCAGTGAATGCAGCTTTGAATCTACGCTGGATCACCTCCA 240

 31575783 TGTCCTCATCTGTAAAATCATGCCAGGCACGTCACATGCTTGGTACACATTCATTCATTG 31575842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTCCTCATCTGTAAAATCATGCCAGGCACGTCACATGCTTGGTACACATTCATTCATTG 300

 31575843 CATTTGGGCCACAACCCTATGAGGGAGGTGTTATTATCATCTTTGTTTTACCGAGAAACC 31575902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATTTGGGCCACAACCCTATGAGGGAGGTGTTATTATCATCTTTGTTTTACCGAGAAACC 360

 31575903 TAAGGCACAGAGAGGGTAAGA 31575923
          |||||||||||||||||||||
      361 TAAGGCACAGAGAGGGTAAGA 381

EXCISED REGION

 31575925 TGTTACTGGGCCAGGTGCAGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 31575984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      383 TGTTACTGGGCCAGGTGCAGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 442

 31575985 CTGAGCCTGGAGTATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGGCAACATAGTGAG 31576044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      443 CTGAGCCTGGAGTATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGGCAACATAGTGAG 502

 31576045 ACCCCCATTTCTACAAAAAGTAGAAAAATTAGCTGGGCTGTTGCACGAGACTGTGGTCCC 31576104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      503 ACCCCCATTTCTACAAAAAGTAGAAAAATTAGCTGGGCTGTTGCACGAGACTGTGGTCCC 562

 31576105 AGCCACTTGGGAGGCTGAACAGGAGGATGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTAGAGGCTG 31576164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      563 AGCCACTTGGGAGGCTGAACAGGAGGATGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTAGAGGCTG 622

 31576165 CAGGGAGCCATGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCCAGTGAGAGTGAGACCATGTCTCAA 31576224
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
      623 CAGGGAGCCATGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCCAGTGAGAGTGAGACCATGTCTC-A 681

 31576225 AAAAAAAAAAAAGTTACTAAGGCCATATATCTTGTGCATGTATACCTGAAATTTGAGACC 31576284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      682 AAAAAAAAAAAAGTTACTAAGGCCATATATCTTGTGCATGTATACCTGAAATTTGAGACC 741

 31576285 AGGCAACCGGGTACCACTAGGCTGTACTGCTCCTATGAGGAGCACACACTTACCTGTACC 31576344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      742 AGGCAACCGGGTACCACTAGGCTGTACTGCTCCTATGAGGAGCACACACTTACCTGTACC 801

 31576345 TGTCTCAGAGAATCTCTTCGAATTAAAGGAGATAATGCACGTAAGGTGCTCTGAACAGAG 31576404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      802 TGTCTCAGAGAATCTCTTCGAATTAAAGGAGATAATGCACGTAAGGTGCTCTGAACAGAG 861

 31576405 TCTGGGACTTAGTACTCTCAGTAAACACAAGTCCAACATCATCATCATCATCAATAGTCT 31576464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      862 TCTGGGACTTAGTACTCTCAGTAAACACAAGTCCAACATCATCATCATCATCGATAGTCT 921

 31576465 TACCTATTCAGAATTCTTTATTATTATTATTGTTATAGAAAGGGTCTCACTGTGTCACCC 31576524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      922 TACCTATTCAGAATTCTTTATTATTATTATTGTTATAGAAAGGGTCTCACTGTGTCACCC 981

 31576525 AGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTTCATAGCTCACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAGC 31576584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      982 AGGCTGGAGTGCAGTGGCATGTTCATAGCTCACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAGC 1041

 31576585 TATCCTCCCATCCCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACACCAAACCTGGCCCAGTCAGAA 31576644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1042 TATCCTCCCATCCCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACACCAAACCTGGCCCAGTCAGAA 1101

 31576645 TTCTGAAGCAGTCGCACTCCTGGTCCTGGCTGCACAAACATGGTGGAAACTTATATGCTT 31576704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1102 TTCTGAAGCAGTCGCACTCCTGGTCCTGGCTGCACAAACATGGTGGAAACTTATATGCTT 1161

 31576705 AAAAAAAAAATTGTACTGGGGCCGGGCACGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTG 31576764
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1162 -AAAAAAAAATTGTACTGGGGCCGGGCACGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTG 1220

 31576765 GGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGTTCGAGACCAGCTTGGCCAACATGGC 31576824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1221 GGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGTTCGAGACCAGCTTGGCCAACATGGC 1280

 31576825 GAAACCCTGTGTCTACTAAAAATACAAAATTTAGCCTGGCATGGTGGTGGGCACCTGTAA 31576884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1281 GAAACCCTGTGTCTACTAAAAATACAAAATTTAGCCTGGCATGGTGGTGGGCACCTGTAA 1340

 31576885 TCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGACAGAAGTTGC 31576944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1341 TCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGACAGAAGTTGC 1400

 31576945 AGTGAGCCAAGATCACACCACTGTACTCTAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGTCTCA 31577004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1401 AGTGAGCCAAGATCACACCACTGTACTCTAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGTCTCA 1460

 31577005 AAAAAAACAAAACAAAACAAAAAAACCAAATTGCTTTTAGTGGTTATTGCCAAGCAGGGT 31577064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1461 AAAAAAACAAAACAAAACAAAAAAACCAAATTGCTTTTAGTGGTTATTGCCAAGCAGGGT 1520

 31577065 TGTAGGGGAAACTCATTTTCATAGACCTCTATAATCATAACTATTTTATATAGTAATCAT 31577124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1521 TGTAGGGGAAACTCATTTTCATAGACCTCTATAATCATAACTATTTTATATAGTAATCAT 1580

 31577125 GTATTATTTTGTAATTAGAAAAATATGCATAGATAGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTA 31577184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1581 GTATTATTTTGTAATTAGAAAAATATGCATAGATAGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTA 1640

 31577185 TAATCCTAGCATTTAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTCAGGTCAGGAAGTCGAGACCAGC 31577244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1641 TAATCCTAGCATTTAGGCCGAGGCAGGCAGATCACTTCAGGTCAGGAAGTCGAGACCAGC 1700

 31577245 CTGGCCAAAATGGTGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGATG 31577304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1701 CTGGCCAAAATGGTGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCAGGGTGTGATG 1760

 31577305 GCATGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAG 31577364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1761 GCATGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAG 1820

 31577365 GAGGCGGAGGTTGCAGCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTAGGAGACAGAGTGAGAC 31577424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1821 GAGGCGGAGGTTGCAGCGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTAGGAGACAGAGTGAGAC 1880

 31577425 TCCATCTAAAAAAGAAAAAAGAAAGAAAAAGAAAAAATAATAATATGCATAGATGAAGAC 31577484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1881 TCCATCTAAAAAAGAAAAAAGAAAGAAAAAGAAAAAATAATAATATGCATAGATGAAGAC 1940

 31577485 ATAATATATAAATGCCAAGTGCATGTACTGAGCACTCAGTTCACTTGTTTGTGTATGTTT 31577544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1941 ATAATATATAAATGCCAAGTGCATGTACTGAGCACTCAGTTCACTTGTTTGTGTATGTTT 2000

 31577545 CTTTCT 31577550
          ||||||
     2001 CTTTCT 2006

Alignment time is 1.93049 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31565065,31587331] =>     22267 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2083] =>      2083 nucs 'mol-32-33f8-046775_2083'

Score:        2061
Aligned:      2085        nucs
Identic:      2082 (100%) nucs =>       643 (100%)      1439 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31574423,31575065] EXCISED REGION [31577332,31578773]
 second seq =>  [       1,     643] EXCISED REGION [     644,    2083]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2266 nucs [31575066,31577331]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [31575066,31575085] to [31577332,31577351]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31575065,31575065] to [31577332,31577332]
 second seq =>         1 nucs [643,643] to [644,644]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31574423 CTAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAAATGTGTTTCTACTTGGGA 31574482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAAATGTGTTTCTACTTGGGA 60

 31574483 GGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCTGGGAGGTTCAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCAG 31574542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCTGGGAGGTTCAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCAG 120

 31574543 GCCACTGCACTCCAGCTGGGGAGACAGAGGGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAA 31574602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCACTGCACTCCAGCTGGGGAGACAGAGGGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAA 180

 31574603 ATAATTTTTGTCCTTTTTCTATAAGCATCTTTTAAAACTTTTTTCCAGGCAGGGAGCGGT 31574662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAATTTTTGTCCTTTTTCTATAAGCATCTTTTAAAACTTTTTTCCAGGCAGGGAGCGGT 240

 31574663 GTCTCACGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTTA 31574722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCTCACGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTTA 300

 31574723 GGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAT 31574782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAT 360

 31574783 TAGCTGGGCATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31574842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGCTGGGCATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 420

 31574843 ATCTCTTGAACCCGGGAGGTGAGCCGAGATTGCGCTATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAA 31574902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCTCTTGAACCCGGGAGGTGAGCCGAGATTGCGCTATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAA 480

 31574903 GAGCGAAACTGTCTAAAAAAGAAAAAAGGCAGCATTTTGGGAGGTGGAGGTGAGAGGACA 31574962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGCGAAACTGTCTAAAAAAGAAAAAAGGCAGCATTTTGGGAGGTGGAGGTGAGAGGACA 540

 31574963 GGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATGTGATGAAACCCCATCTCTATTAAAAACACAAAAA 31575022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATGTGATGAAACCCCATCTCTATTAAAAACACAAAAA 600

 31575023 TTAGCCGGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCG 31575065
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAGCCGGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCG 643

EXCISED REGION

 31577332 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGATCGCAC 31577391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      644 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGATCGCAC 703

 31577392 CATTGCACTCCAGCCTAGGAGACAGAGTGAGACTCCATCTAAAAAAGAAAAAAGAAAGAA 31577451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      704 CATTGCACTCCAGCCTAGGAGACAGAGTGAGACTCCATCTAAAAAAGAAAAAAGAAAGAA 763

 31577452 AAAGAAAAAATAATAATATGCATAGATGAAGACATAATATATAAATGCCAAGTGCATGTA 31577511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      764 AAAGAAAAAATAATAATATGCATAGATGAAGACATAATATATAAATGCCAAGTGCATGTA 823

 31577512 CTGAGCACTCAGTTCACTTGTTTGTGTATGTTTCTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTT 31577571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||
      824 CTGAGCACTCAGTTCACTTGTTTGTGTATGTTTCTTTCTTTTCTTTTC--TTTTTTTTTT 881

 31577572 TTTTTGAGACAGTCTCTCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTTA 31577631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 TTTTTGAGACAGTCTCTCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTTA 941

 31577632 CTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAACAGTTCTTCTGCCTCAGCCTCCCTCATAGCTGG 31577691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 CTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAACAGTTCTTCTGCCTCAGCCTCCCTCATAGCTGG 1001

 31577692 AATCACAGGTGCCCGCCACCTTGCTCAGTTTTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGAGGTT 31577751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 AATCACAGGTGCCCGCCACCTTGCTCAGTTTTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGAGGTT 1061

 31577752 TTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCAGCTTGGC 31577811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 TTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCAGCTTGGC 1121

 31577812 CTCCCAAGCTGCTGGGGTTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCAGCCCCTCTGTTTGCTTTT 31577871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 CTCCCAAGCTGCTGGGGTTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCAGCCCCTCTGTTTGCTTTT 1181

 31577872 TTTTCTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGACTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCT 31577931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 TTTTCTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGACTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCT 1241

 31577932 AACTCCTGGCCTCAAGTGGTTCACCGGCCTCGGCCTCCCAAAGTTCTGGGATTATAGGTG 31577991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 AACTCCTGGCCTCAAGTGGTTCACCGGCCTCGGCCTCCCAAAGTTCTGGGATTATAGGTG 1301

 31577992 TGAGCCACCATGCCTGGCTTGTTCATGTGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTTTTC 31578051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 TGAGCCACCATGCCTGGCTTGTTCATGTGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTTTTC 1361

 31578052 TTTTTGAGACAGAGTTTTGTTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGGGATCTCGGC 31578111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 TTTTTGAGACAGAGTTTTGTTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGGGATCTCGGC 1421

 31578112 TCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGTGTCCTGAGTAGC 31578171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 TCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGTGTCCTGAGTAGC 1481

 31578172 TGGGATTATGGGTGCCCACCACCATGCCCGGACACTTTTTTTGTATTTTTAGAAGAGACG 31578231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 TGGGATTATGGGTGCCCACCACCATGCCCGGACACTTTTTTTGTATTTTTAGAAGAGACG 1541

 31578232 GGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCC 31578291
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1542 GGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCCCCCGCC 1601

 31578292 TCAACCTCCCAAAGTGCTGTGATTACAGGCATAAGCCACCGCGGCCAGCCCATGTATGTT 31578351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 TCAACCTCCCAAAGTGCTGTGATTACAGGCATAAGCCACCGCGGCCAGCCCATGTATGTT 1661

 31578352 TCTATTCACCATTTATGGAGCATCTATTGGCTACCAGGCCTTGGCTACAGGAACTGCCAT 31578411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 TCTATTCACCATTTATGGAGCATCTATTGGCTACCAGGCCTTGGCTACAGGAACTGCCAT 1721

 31578412 GTGGCGTCAGAACCCTGAAGAAGTTCCCAGTGTGATTCACTGGATGGGGTGGGAAGAATC 31578471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 GTGGCGTCAGAACCCTGAAGAAGTTCCCAGTGTGATTCACTGGATGGGGTGGGAAGAATC 1781

 31578472 TTCTATCTGCTATGGTAGGAACAGAGGGCTGTGTGCAGGTGACAGGCCAGGCCTGGAATG 31578531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 TTCTATCTGCTATGGTAGGAACAGAGGGCTGTGTGCAGGTGACAGGCCAGGCCTGGAATG 1841

 31578532 TGAACCTCTAATTCCCCATCAAGTGTGATAGAAGATGCTGAGTGCGGTGGCTCACGCCTG 31578591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 TGAACCTCTAATTCCCCATCAAGTGTGATAGAAGATGCTGAGTGCGGTGGCTCACGCCTG 1901

 31578592 TAATCCCAGCACTTTAGGAAACCAAGGCAGGCGGATTGCTCGAGCTCAGGAGTTGAAGAC 31578651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 TAATCCCAGCACTTTAGGAAACCAAGGCAGGCGGATTGCTCGAGCTCAGGAGTTGAAGAC 1961

 31578652 TGGCCCAGGCAACATGGCAAAACCTCATCTCTACACAAAATACAAAAATTAGTCAGGCAT 31578711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 TGGCCCAGGCAACATGGCAAAACCTCATCTCTACACAAAATACAAAAATTAGTCAGGCAT 2021

 31578712 GGTGACTCGTGCCCGTGGTCCCAGCTATTTGTGGGGCTGAGATGGGAGGATCGCTTGAAC 31578771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 GGTGACTCGTGCCCGTGGTCCCAGCTATTTGTGGGGCTGAGATGGGAGGATCGCTTGAAC 2081

 31578772 CC 31578773
          ||
     2082 CC 2083

Alignment time is 1.65025 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31565065,31587331] =>     22267 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    8746] =>      8746 nucs 'mol-32-3492-021919_8746'

Score:        8695
Aligned:      8750        nucs
Identic:      8745 (100%) nucs =>      1470 (100%)      7275 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31573596,31575065] EXCISED REGION [31577332,31584610]
 second seq =>  [       1,    1470] EXCISED REGION [    1471,    8746]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2266 nucs [31575066,31577331]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [31575066,31575085] to [31577332,31577351]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31575065,31575065] to [31577332,31577332]
 second seq =>         1 nucs [1470,1470] to [1471,1471]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31573596 TTCCCACAGCAGCTGAGGGACAAAGTCACAGTCCCTGCCCAGTCCTCTGCACCAGCCACC 31573655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCCCACAGCAGCTGAGGGACAAAGTCACAGTCCCTGCCCAGTCCTCTGCACCAGCCACC 60

 31573656 CCTCTGGTTTAACCTGTCCCAGGTCTTCCCCCTTGACTACACCCTCTAAATCCTAGAGTG 31573715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTCTGGTTTAACCTGTCCCAGGTCTTCCCCCTTGACTACACCCTCTAAATCCTAGAGTG 120

 31573716 GGGAGAGAATGAAGATGTGAGGTGACAGATGAGGTCTCTTCCCCAGCCAGAGGGTGCAGA 31573775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGAGAGAATGAAGATGTGAGGTGACAGATGAGGTCTCTTCCCCAGCCAGAGGGTGCAGA 180

 31573776 AAGCCCCAACATAACACATGTCCTGAAACCCAAAGAGAAGACAGAAATTGTCAGCAAAGG 31573835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGCCCCAACATAACACATGTCCTGAAACCCAAAGAGAAGACAGAAATTGTCAGCAAAGG 240

 31573836 TTAGCTAGCTCCTGAGGTCATAAGCAACCTTATTTTTATTTTGTGTTCCCAAATGTGTTG 31573895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAGCTAGCTCCTGAGGTCATAAGCAACCTTATTTTTATTTTGTGTTCCCAAATGTGTTG 300

 31573896 TCTGGAACATGTATACATATTACGTATTAAAGCAAAAGCAAAATCAGAATAAATATTGTC 31573955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTGGAACATGTATACATATTACGTATTAAAGCAAAAGCAAAATCAGAATAAATATTGTC 360

 31573956 TTCCAAGTTGTCTTTGTGTGTGTTTTGGTTTTGTGGTTTATTCCTCTTTCTTTTCAGTTG 31574015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCCAAGTTGTCTTTGTGTGTGTTTTGGTTTTGTGGTTTATTCCTCTTTCTTTTCAGTTG 420

 31574016 GATAGAAGCCAGGCTCCTTTCTCCCAGCACACGCACAGACTCAGCACACACAGAAACCCC 31574075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATAGAAGCCAGGCTCCTTTCTCCCAGCACACGCACAGACTCAGCACACACAGAAACCCC 480

 31574076 AGGAATTAAATGACTCTCCAAAATGATAAGTAGGAAGAAGGGGGTGGGGTAGAGAGGGAG 31574135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGAATTAAATGACTCTCCAAAATGATAAGTAGGAAGAAGGGGGTGGGGTAGAGAGGGAG 540

 31574136 GAAGGGGGAGAGAGGAGGCCTTTTCCCCTGACCTGGGGAGGAGCCCTAGTCCAGGAGAGG 31574195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAGGGGGAGAGAGGAGGCCTTTTCCCCTGACCTGGGGAGGAGCCCTAGTCCAGGAGAGG 600

 31574196 TCAGGGTGTGCAAAGGCCTCTGGGTAGGAATAGGAACAGGGCCATTGGCCAAGTGCCCTC 31574255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAGGGTGTGCAAAGGCCTCTGGGTAGGAATAGGAACAGGGCCATTGGCCAAGTGCCCTC 660

 31574256 TGCTCTGTTACTCCCAGAGCCGGCTCCTACCCTCAGGCCTGGGAGCCCGCCGTCTGCTAG 31574315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCTCTGTTACTCCCAGAGCCGGCTCCTACCCTCAGGCCTGGGAGCCCGCCGTCTGCTAG 720

 31574316 TAAGGGGCTTCAGGAGTTGGGGGAGTGCAGATGAGGAGTAGCTCTCTTTTTCTCACATTC 31574375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAAGGGGCTTCAGGAGTTGGGGGAGTGCAGATGAGGAGTAGCTCTCTTTTTCTCACATTC 780

 31574376 CCTCTTAAACCTCAGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTAAAGAAATGATTCTAAAATTAGCCA 31574435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTCTTAAACCTCAGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTAAAGAAATGATTCTAAAATTAGCCA 840

 31574436 GGTGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAAATGTGTTTCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGA 31574495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAAATGTGTTTCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGA 900

 31574496 GAATTGCTTGAGCCTGGGAGGTTCAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCAGGCCACTGCACTCC 31574555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAATTGCTTGAGCCTGGGAGGTTCAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCAGGCCACTGCACTCC 960

 31574556 AGCTGGGGAGACAGAGGGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAATAATTTTTGTCC 31574615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGCTGGGGAGACAGAGGGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAATAATTTTTGTCC 1020

 31574616 TTTTTCTATAAGCATCTTTTAAAACTTTTTTCCAGGCAGGGAGCGGTGTCTCACGCCTAT 31574675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTTCTATAAGCATCTTTTAAAACTTTTTTCCAGGCAGGGAGCGGTGTCTCACGCCTAT 1080

 31574676 AATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTTAGGAGTTCGAGACC 31574735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTTAGGAGTTCGAGACC 1140

 31574736 AGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCATGG 31574795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCATGG 1200

 31574796 TGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACCC 31574855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACCC 1260

 31574856 GGGAGGTGAGCCGAGATTGCGCTATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTGTC 31574915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGGAGGTGAGCCGAGATTGCGCTATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTGTC 1320

 31574916 TAAAAAAGAAAAAAGGCAGCATTTTGGGAGGTGGAGGTGAGAGGACAGGAGTTTGAGACC 31574975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAAAAAGAAAAAAGGCAGCATTTTGGGAGGTGGAGGTGAGAGGACAGGAGTTTGAGACC 1380

 31574976 AGCCTGGCCAATGTGATGAAACCCCATCTCTATTAAAAACACAAAAATTAGCCGGGTGTG 31575035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGCCTGGCCAATGTGATGAAACCCCATCTCTATTAAAAACACAAAAATTAGCCGGGTGTG 1440

 31575036 GTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCG 31575065
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCG 1470

EXCISED REGION

 31577332 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGATCGCAC 31577391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGCGAGATCGCAC 1530

 31577392 CATTGCACTCCAGCCTAGGAGACAGAGTGAGACTCCATCTAAAAAAGAAAAAAGAAAGAA 31577451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 CATTGCACTCCAGCCTAGGAGACAGAGTGAGACTCCATCTAAAAAAGAAAAAAGAAAGAA 1590

 31577452 AAAGAAAAAATAATAATATGCATAGATGAAGACATAATATATAAATGCCAAGTGCATGTA 31577511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 AAAGAAAAAATAATAATATGCATAGATGAAGACATAATATATAAATGCCAAGTGCATGTA 1650

 31577512 CTGAGCACTCAGTTCACTTGTTTGTGTATGTTTCTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTT 31577571
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
     1651 CTGAGCACTCAGTTCACTTGTTTGTGTATGTTTCTTTCTTTTCTTTTC-TTTTTTTTTTT 1709

 31577572 TTTTTGAGACAGTCTCTCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTTA 31577631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 TTTTTGAGACAGTCTCTCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAGATCTCAGCTTA 1769

 31577632 CTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAACAGTTCTTCTGCCTCAGCCTCCCTCATAGCTGG 31577691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 CTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAACAGTTCTTCTGCCTCAGCCTCCCTCATAGCTGG 1829

 31577692 AATCACAGGTGCCCGCCACCTTGCTCAGTTTTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGAGGTT 31577751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 AATCACAGGTGCCCGCCACCTTGCTCAGTTTTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGAGGTT 1889

 31577752 TTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCAGCTTGGC 31577811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 TTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCAGCTTGGC 1949

 31577812 CTCCCAAGCTGCTGGGGTTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCAGCCCCTCTGTTTGCTTTT 31577871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 CTCCCAAGCTGCTGGGGTTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCAGCCCCTCTGTTTGCTTTT 2009

 31577872 TTTTCTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGACTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCT 31577931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 TTTTCTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGACTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCT 2069

 31577932 AACTCCTGGCCTCAAGTGGTTCACCGGCCTCGGCCTCCCAAAGTTCTGGGATTATAGGTG 31577991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 AACTCCTGGCCTCAAGTGGTTCACCGGCCTCGGCCTCCCAAAGTTCTGGGATTATAGGTG 2129

 31577992 TGAGCCACCATGCCTGGCTTGTTCATGTGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTTTTC 31578051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 TGAGCCACCATGCCTGGCTTGTTCATGTGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTTTTTTC 2189

 31578052 TTTTTGAGACAGAGTTTTGTTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGGGATCTCGGC 31578111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 TTTTTGAGACAGAGTTTTGTTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGGGATCTCGGC 2249

 31578112 TCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGTGTCCTGAGTAGC 31578171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 TCACTGCAACCTCCGCTTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGTGTCCTGAGTAGC 2309

 31578172 TGGGATTATGGGTGCCCACCACCATGCCCGGACACTTTTTTTGTATTTTTAGAAGAGACG 31578231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 TGGGATTATGGGTGCCCACCACCATGCCCGGACACTTTTTTTGTATTTTTAGAAGAGACG 2369

 31578232 GGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCC 31578291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 GGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCGCC 2429

 31578292 TCAACCTCCCAAAGTGCTGTGATTACAGGCATAAGCCACCGCGGCCAGCCCATGTATGTT 31578351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 TCAACCTCCCAAAGTGCTGTGATTACAGGCATAAGCCACCGCGGCCAGCCCATGTATGTT 2489

 31578352 TCTATTCACCATTTATGGAGCATCTATTGGCTACCAGGCCTTGGCTACAGGAACTGCCAT 31578411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 TCTATTCACCATTTATGGAGCATCTATTGGCTACCAGGCCTTGGCTACAGGAACTGCCAT 2549

 31578412 GTGGCGTCAGAACCCTGAAGAAGTTCCCAGTGTGATTCACTGGATGGGGTGGGAAGAATC 31578471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 GTGGCGTCAGAACCCTGAAGAAGTTCCCAGTGTGATTCACTGGATGGGGTGGGAAGAATC 2609

 31578472 TTCTATCTGCTATGGTAGGAACAGAGGGCTGTGTGCAGGTGACAGGCCAGGCCTGGAATG 31578531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 TTCTATCTGCTATGGTAGGAACAGAGGGCTGTGTGCAGGTGACAGGCCAGGCCTGGAATG 2669

 31578532 TGAACCTCTAATTCCCCATCAAGTGTGATAGAAGATGCTGAGTGCGGTGGCTCACGCCTG 31578591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 TGAACCTCTAATTCCCCATCAAGTGTGATAGAAGATGCTGAGTGCGGTGGCTCACGCCTG 2729

 31578592 TAATCCCAGCACTTTAGGAAACCAAGGCAGGCGGATTGCTCGAGCTCAGGAGTTGAAGAC 31578651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 TAATCCCAGCACTTTAGGAAACCAAGGCAGGCGGATTGCTCGAGCTCAGGAGTTGAAGAC 2789

 31578652 TGGCCCAGGCAACATGGCAAAACCTCATCTCTACACAAAATACAAAAATTAGTCAGGCAT 31578711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 TGGCCCAGGCAACATGGCAAAACCTCATCTCTACACAAAATACAAAAATTAGTCAGGCAT 2849

 31578712 GGTGACTCGTGCCCGTGGTCCCAGCTATTTGTGGGGCTGAGATGGGAGGATCGCTTGAAC 31578771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 GGTGACTCGTGCCCGTGGTCCCAGCTATTTGTGGGGCTGAGATGGGAGGATCGCTTGAAC 2909

 31578772 CCAGGAGGTCCAGGCTATGGTGAACTGTGGAAGCACCACAGCACTCCAGTCTGGACGACA 31578831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 CCAGGAGGTCCAGGCTATGGTGAACTGTGGAAGCACCACAGCACTCCAGTCTGGACGACA 2969

 31578832 AAGTGAGACCCTGTCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGTGTGATAGAAATACTG 31578890
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 AAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGTGTGATAGAAATACTG 3029

 31578891 AAAGAAGCAGGCTCTCAGAACAAAGGTTAGGTTTTTGGTTTTTGTTTTATGTTTCTTTTT 31578950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 AAAGAAGCAGGCTCTCAGAACAAAGGTTAGGTTTTTGGTTTTTGTTTTATGTTTCTTTTT 3089

 31578951 GAGACAGAATCTCACTCTATTGCTGAGGCTGGAGTGCAGTGACATGTTCATAGCTCACTG 31579010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 GAGACAGAATCTCACTCTATTGCTGAGGCTGGAGTGCAGTGACATGTTCATAGCTCACTG 3149

 31579011 CATCCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATTCTCCCACCCCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 31579070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 CATCCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATTCTCCCACCCCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 3209

 31579071 TATACCACACGTGCCCCAGTCAGAATTCCAAAGCAATCACACTCCTGGCCTTGGCTACAC 31579130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 TATACCACACGTGCCCCAGTCAGAATTCCAAAGCAATCACACTCCTGGCCTTGGCTACAC 3269

 31579131 AAATATGGTGGCACCTTATATGCTTAAAAAAATTGTACCAGGCCGGGCGCAGTGGCTCAC 31579190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 AAATATGGTGGCACCTTATATGCTTAAAAAAATTGTACCAGGCCGGGCGCAGTGGCTCAC 3329

 31579191 GCCTGTAATCCCAACATTTTGGGAGGCCGAGGGGAGTTGATCACCTGAGGTCAGGAGTTC 31579250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 GCCTGTAATCCCAACATTTTGGGAGGCCGAGGGGAGTTGATCACCTGAGGTCAGGAGTTC 3389

 31579251 GAGACCAGTCTGGCCAAAGTGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAATATACAAAAAATTAGCC 31579310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 GAGACCAGTCTGGCCAAAGTGGCAAAACCCCGTCTCTACTAAATATACAAAAAATTAGCC 3449

 31579311 AGGCATGGTGAGGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGC 31579370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3450 AGGCATGGTGAGGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGC 3509

 31579371 TTAAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGG 31579430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 TTAAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGG 3569

 31579431 GCAACAGATCAACACCTTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGGCCAGGA 31579490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 GCAACAGATCAACACCTTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGGCCAGGA 3629

 31579491 GCAGTGGCTTACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCACATCATGAGG 31579550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 GCAGTGGCTTACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCACATCATGAGG 3689

 31579551 TCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCTACTAAAAATACAA 31579610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3690 TCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCTACTAAAAATACAA 3749

 31579611 AAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGCGCTCATAATCCCAACTAATTGAGAGGCTGAGGCAG 31579670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 AAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGGCGCTCATAATCCCAACTAATTGAGAGGCTGAGGCAG 3809

 31579671 GAGAATCGCTTGAACCTGGGAGACGGAGGCAGTGAGCCTAGATCGTGCCATTGCACTCCA 31579730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3810 GAGAATCGCTTGAACCTGGGAGACGGAGGCAGTGAGCCTAGATCGTGCCATTGCACTCCA 3869

 31579731 GCCTGGGCGACAAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAACGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGA 31579790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     3870 GCCTGGGCGACAAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAACG-AAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGA 3928

 31579791 AGAGGAAGAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAGGAAGAAGAGGAGAACACTGGGGG 31579850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3929 AGAGGAAGAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAGGAAGAAGAGGAGAACACTGGGGG 3988

 31579851 AAAAGGAGAGAAGTACAGAATAGGAAAACAAAACTAGACTCTGGTGATTTAGGCAATCTG 31579910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3989 AAAAGGAGAGAAGTACAGAATAGGAAAACAAAACTAGACTCTGGTGATTTAGGCAATCTG 4048

 31579911 CTGAGTTTTTCTCCTTGGTTCTTATGTTTTATTTTTTTCTTTCTTATTTCTATTTATTTA 31579970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4049 CTGAGTTTTTCTCCTTGGTTCTTATGTTTTATTTTTTTCTTTCTTATTTCTATTTATTTA 4108

 31579971 TTTATTTATTTATTTATTTATTTTGAGATGGAGTCTCACTCTTCCAGACTGGAGTACAGT 31580030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4109 TTTATTTATTTATTTATTTATTTTGAGATGGAGTCTCACTCTTCCAGACTGGAGTACAGT 4168

 31580031 GGCATGATCTCTGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTTGTGCCTCC 31580090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4169 GGCATGATCTCTGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTTGTGCCTCC 4228

 31580091 GCCTTCCCTGTAGCACCTGCCACAGCTTGCCCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 31580150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4229 GCCTTCCCTGTAGCACCTGCCACAGCTTGCCCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 4288

 31580151 GAGAAAGAGCTTTATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTG 31580210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4289 GAGAAAGAGCTTTATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTG 4348

 31580211 CAAACTCCACCTCCCAGGTCAAGCAATTCTCCTATATCTGGAGTAGCTGGGACTACAGGC 31580270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4349 CAAACTCCACCTCCCAGGTCAAGCAATTCTCCTATATCTGGAGTAGCTGGGACTACAGGC 4408

 31580271 GTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATATGGATATAATTTTTGTATACTCTTTGTA 31580330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4409 GTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATATGGATATAATTTTTGTATACTCTTTGTA 4468

 31580331 CTTATCATTCTGTTGTATTGGAAATAACTTGTTACCAGTTTGGTGCCTTTGATAATTTTT 31580390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     4469 CTTATCATTCTGTTGTATTGGAAATAACTTGTTACCAGTTTGGTGCCTTTGATAA-TTTT 4527

 31580391 TTTTTTTTTTGAGAAGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGTCGCCCAGGCTGGC 31580450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 TTTTTTTTTTGAGAAGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGTCGCCCAGGCTGGC 4587

 31580451 TCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGC 31580510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 TCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGC 4647

 31580511 TGGGATTACGGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACG 31580570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4648 TGGGATTACGGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACG 4707

 31580571 GGGTTTCACCGAGTTAGCAAGCATGGTCTTGATCTCCGGACGTGATCTGCCCGCCTCGGC 31580630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4708 GGGTTTCACCGAGTTAGCAAGCATGGTCTTGATCTCCGGACGTGATCTGCCCGCCTCGGC 4767

 31580631 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCGGCCCAGTTTGGTGCCTCT 31580690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCGGCCCAGTTTGGTGCCTCT 4827

 31580691 GAAAGAAGAAAGGGAAGTAATCTATGTAAATAAATATATACTTAAAATGGTGACTGGGGA 31580750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4828 GAAAGAAGAAAGGGAAGTAATCTATGTAAATAAATATATACTTAAAATGGTGACTGGGGA 4887

 31580751 AAACAAACAAAAGAAATATATACAAATGCCATGTCCTGCGTTTGCATGAGGTTTGTTTCA 31580810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 AAACAAACAAAAGAAATATATACAAATGCCATGTCCTGCGTTTGCATGAGGTTTGTTTCA 4947

 31580811 CAGCAAAGTAGTTACGCTTGCAAACTCTAAACTCCTGGGATCAGACATTTGGGCTGAATT 31580870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4948 CAGCAAAGTAGTTACGCTTGCAAACTCTAAACTCCTGGGATCAGACATTTGGGCTGAATT 5007

 31580871 GTATTTGCTTATTATAATAGCATTTCTCACTATTTACCAACCTCCATTTTCATTTCCTTT 31580930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5008 GTATTTGCTTATTATAATAGCATTTCTCACTATTTACCAACCTCCATTTTCATTTCCTTT 5067

 31580931 TTTTTTTTCTTTTTAACAGCCCAGAGGTCTTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTAACACCTA 31580990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5068 TTTTTTTTCTTTTTAACAGCCCAGAGGTCTTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTAACACCTA 5127

 31580991 TTATGCCATGAATTCATGGGGAATAGGTTCCAGCAGCTCAGGCTCCTTCCCACTGGTTCT 31581050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5128 TTATGCCATGAATTCATGGGGAATAGGTTCCAGCAGCTCAGGCTCCTTCCCACTGGTTCT 5187

 31581051 CACAAAGTGCGTTTCTCTGGGTGGAACAGGCTGGCGCTTCAGTCGAACCCAGGTACCTTT 31581110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5188 CACAAAGTGCGTTTCTCTGGGTGGAACAGGCTGGCGCTTCAGTCGAACCCAGGTACCTTT 5247

 31581111 CTCTTTGGCTTCTTTCTTTTTCTGATCATTTTCCTTCATGCACTTCAGGAAGCTATCCTG 31581170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5248 CTCTTTGGCTTCTTTCTTTTTCTGATCATTTTCCTTCATGCACTTCAGGAAGCTATCCTG 5307

 31581171 ACTCTTAGAATGCTTAATATGCTCAATACGCACATCAATTCTCCGGCAAGAATCTTGCCC 31581230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5308 ACTCTTAGAATGCTTAATATGCTCAATACGCACATCAATTCTCCGGCAAGAATCTTGCCC 5367

 31581231 TTAACTTGTTTGTTTACAACAATGCCAACAGGACGCTGAGGAACATTGTAGACTCTTCCA 31581290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5368 TTAACTTGTTTGTTTACAACAATGCCAACAGGACGCTGAGGAACATTGTAGACTCTTCCA 5427

 31581291 GTTTAGACATGGTAACACTGTGGGGCATTCCTTTTTGAACAGTGCCCATTCCCTTGATGT 31581350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5428 GTTTAGACATGGTAACACTGTGGGGCATTCCTTTTTGAACAGTGCCCATTCCCTTGATGT 5487

 31581351 CTACAATATCACCTTTCTTATAGGTTTGCATATATGGGGCCAAAGGAACAACTCCATGTT 31581410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5488 CTACAATATCACCTTTCTTATAGGTTTGCATATATGGGGCCAAAGGAACAACTCCATGTT 5547

 31581411 TTCTCAAAGGCCTAGAGAACATATATCGGATGCCTCTCCTCTTTCCCTTTGTGTTCATCA 31581470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5548 TTCTCAAAGGCCTAGAGAACATATATCGGATGCCTCTCCTCTTTCCCTTTGTGTTCATCA 5607

 31581471 TTTTGGCAAATTACTGGAAGACGGCAGTTCTGGCCAAAAGACTCTATTTTCATTTCTCAC 31581530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5608 TTTTGGCAAATTACTGGAAGACGGCAGTTCTGGCCAAAAGACTCTATTTTCATTTCTCAC 5667

 31581531 CAATCTCTATTTTCATCTGTATATTTTTCATCTGTACATATTTTTCTTCTCATTTCTACT 31581590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5668 CAATCTCTATTTTCATCTGTATATTTTTCATCTGTACATATTTTTCTTCTCATTTCTACT 5727

 31581591 AAGCCTGTTTCAACTTTGAGCATTTTCCATGAGCAAAATTATTCTACAGCGCTTTACATT 31581650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5728 AAGCCTGTTTCAACTTTGAGCATTTTCCATGAGCAAAATTATTCTACAGCGCTTTACATT 5787

 31581651 CATAATCCCAGCATTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATTACCTGAGGTCAGGAGTTCGAG 31581710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5788 CATAATCCCAGCATTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATTACCTGAGGTCAGGAGTTCGAG 5847

 31581711 ACAAGCCTGACCACTATGGTGAAACCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATGCGTGGTGGC 31581770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5848 ACAAGCCTGACCACTATGGTGAAACCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATGCGTGGTGGC 5907

 31581771 GGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 31581830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5908 GGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGA 5967

 31581831 GACAGAAGTTGCAGTGAGCGGAGATTGCGCCACTCAACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAA 31581890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5968 GACAGAAGTTGCAGTGAGCGGAGATTGCGCCACTCAACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAA 6027

 31581891 GACTCCTTCTTGGGGAAAAAAAAAGAAAAAGAAATTGGACTTTTAAACTGAACACTCTTC 31581950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6028 GACTCCTTCTTGGGGAAAAAAAAAGAAAAAGAAATTGGACTTTTAAACTGAACACTCTTC 6087

 31581951 CTTTCCTTTGCTTTGCTTTGCTTTCCTTTCTTTCTTTCCTTTCCTTCCCTTCCTCCTTCT 31582010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6088 CTTTCCTTTGCTTTGCTTTGCTTTCCTTTCTTTCTTTCCTTTCCTTCCCTTCCTCCTTCT 6147

 31582011 CTTCCCTCCTTCCTTCTATTTCTTCCTTCTATTTGTTCTTTCTTTCACAGATTTATTGAG 31582070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6148 CTTCCCTCCTTCCTTCTATTTCTTCCTTCTATTTGTTCTTTCTTTCACAGATTTATTGAG 6207

 31582071 CTATAACTCACATTCATATAATTCACATATCTGAAGTGTACAGTTCATTGTTTTTTGGTA 31582130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6208 CTATAACTCACATTCATATAATTCACATATCTGAAGTGTACAGTTCATTGTTTTTTGGTA 6267

 31582131 TACTTGGAGTTGTGCAACCATCACCACAATCAAGTTCAGCATAATTTTTTTTTTTTTTGG 31582190
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     6268 TACTTGGAGTTGTGCAACCATCACCACAATCAAGTTCAGCATAA-TTTTTTTTTTTTTGG 6326

 31582191 GATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGAGCAATGGCTCGATCTCGGCTCACCAC 31582250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6327 GATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGAGCAATGGCTCGATCTCGGCTCACCAC 6386

 31582251 AAGCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTGGCTGGGATT 31582310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6387 AAGCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTGGCTGGGATT 6446

 31582311 ACTACAGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 31582370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6447 ACTACAGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 6506

 31582371 TCCGTGTTGGCCAGACTGGTCTCAAACTCCTACCCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCT 31582430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6507 TCCGTGTTGGCCAGACTGGTCTCAAACTCCTACCCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCT 6566

 31582431 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCCTTTTTTCCAGTCTTTTA 31582490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6567 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCTGGCCTTTTTTCCAGTCTTTTA 6626

 31582491 GATATTATCATGAACACTACATTTAAAAACATTTGTGCACAAGTTTTTGTATGGACGTAT 31582550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6627 GATATTATCATGAACACTACATTTAAAAACATTTGTGCACAAGTTTTTGTATGGACGTAT 6686

 31582551 GTCTTTAATTCTCTTCAGCATATTCTTAGGAGTGGAACTACTGGGTCACGTGGTAACTCT 31582610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6687 GTCTTTAATTCTCTTCAGCATATTCTTAGGAGTGGAACTACTGGGTCACGTGGTAACTCT 6746

 31582611 ATGTTTAACATTTTGAGGAAATGCTCAACTGTTTTCCAAAGTTGCTGCATCTGTTTTTTT 31582670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6747 ATGTTTAACATTTTGAGGAAATGCTCAACTGTTTTCCAAAGTTGCTGCATCTGTTTTTTT 6806

 31582671 TGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTGGACTGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTG 31582730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6807 TGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTGGACTGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTG 6866

 31582731 CAGTGGTGCAATCATGGGTCACTGCAGTCTCCACCTCCCAGGCTCAAGGGATCCTCCCAC 31582790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6867 CAGTGGTGCAATCATGGGTCACTGCAGTCTCCACCTCCCAGGCTCAAGGGATCCTCCCAC 6926

 31582791 TTAAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATTTTTGT 31582850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6927 TTAAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATTTTTGT 6986

 31582851 GTTTTGTGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTCACCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGACTA 31582910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6987 GTTTTGTGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTCACCCAGGTTGGTCTTGAACTCCTGGACTA 7046

 31582911 AAGCGATCTGCCTGCATCAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATAGGCATGAGTCACTGCAC 31582970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7047 AAGCGATCTGCCTGCATCAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTATAGGCATGAGTCACTGCAC 7106

 31582971 CCAGGCTAGCTGCATAAGTTTCTTTATTTATTTTTGAAATGGAGTCTCACTCTGTCCCCC 31583030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7107 CCAGGCTAGCTGCATAAGTTTCTTTATTTATTTTTGAAATGGAGTCTCACTCTGTCCCCC 7166

 31583031 AGGCTGGAGTACAGTGGCACTCTGCAACCTCTTGGCTTGCTGCAACCTCTGCCTCCCAGG 31583090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7167 AGGCTGGAGTACAGTGGCACTCTGCAACCTCTTGGCTTGCTGCAACCTCTGCCTCCCAGG 7226

 31583091 TTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAATAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCA 31583150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7227 TTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAATAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCA 7286

 31583151 CATCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGATATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGG 31583210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7287 CATCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGATATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGG 7346

 31583211 TCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGCTTAC 31583270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7347 TCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGCTTAC 7406

 31583271 AGGCATGAGCCCCCGCTCCCAGCCAGCAGTTACTCAATTCTAATGATGTAGTGCGGAAGC 31583330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7407 AGGCATGAGCCCCCGCTCCCAGCCAGCAGTTACTCAATTCTAATGATGTAGTGCGGAAGC 7466

 31583331 AGCCATAGACAATATAGAATGAGTGAGGTGTGACTGTTTCAATAAAACCTTATATATAAA 31583390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7467 AGCCATAGACAATATAGAATGAGTGAGGTGTGACTGTTTCAATAAAACCTTATATATAAA 7526

 31583391 ATTAGAGTGAGCAGATTTGGCCCATAGGCCATAGTTTACTGATCCTTCCAGTAGTCTGTT 31583450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7527 ATTAGAGTGAGCAGATTTGGCCCATAGGCCATAGTTTACTGATCCTTCCAGTAGTCTGTT 7586

 31583451 GTAATATGTCAAACTGGACACATCTTTAATAGCTGAAAGAGACTGAGAAGTTATGGAATC 31583510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7587 GTAATATGTCAAACTGGACACATCTTTAATAGCTGAAAGAGACTGAGAAGTTATGGAATC 7646

 31583511 TGATCTACATGTCATTAAAGACTCTATTACCGTCTGCGGCCATACCACCCAGAACGCACC 31583570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7647 TGATCTACATGTCATTAAAGACTCTATTACCGTCTGCGGCCATACCACCCAGAACGCACC 7706

 31583571 CAATCTCGTCTGACCTCAGAAGACTCTACTACCCGGGGTAAAGGGAAAAGATGGAAGAAA 31583630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7707 CAATCTCGTCTGACCTCAGAAGACTCTACTACCCGGGGTAAAGGGAAAAGATGGAAGAAA 7766

 31583631 TATGTAATTACCGTGTTTGTTTCACCAGCAATAACAGTGAAATGGGATAAGTGCTGTGAT 31583690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7767 TATGTAATTACCGTGTTTGTTTCACCAGCAATAACAGTGAAATGGGATAAGTGCTGTGAT 7826

 31583691 AACTCATTCTATGAGTGCCTTAACCTAGTTCAGGGTGGGGACAGAAATATGAGGGGAGAG 31583750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7827 AACTCATTCTATGAGTGCCTTAACCTAGTTCAGGGTGGGGACAGAAATATGAGGGGAGAG 7886

 31583751 GAGAGTGATGCGGAGGCTGAGGTCTGAAGGGTGAATGGGAGCTGGTGGTAGGAACAGGAG 31583810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7887 GAGAGTGATGCGGAGGCTGAGGTCTGAAGGGTGAATGGGAGCTGGTGGTAGGAACAGGAG 7946

 31583811 AGTGTTCAGGTGAAGAAAACCGGTGGCAAGAACAGGATTACTGTGTTGAAAGGAACTGAG 31583870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7947 AGTGTTCAGGTGAAGAAAACCGGTGGCAAGAACAGGATTACTGTGTTGAAAGGAACTGAG 8006

 31583871 AAAACGTCAGTGTTGCTGGAGCCCACAGTGTGTGAGGTGAGTTCAGAGCTGTAGAGGCCA 31583930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8007 AAAACGTCAGTGTTGCTGGAGCCCACAGTGTGTGAGGTGAGTTCAGAGCTGTAGAGGCCA 8066

 31583931 GGCGATGAGTCTCTTGTAAACCAAGTTAAGGAATTTTTACTTTGATTTTTATTCTGAGGG 31583990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8067 GGCGATGAGTCTCTTGTAAACCAAGTTAAGGAATTTTTACTTTGATTTTTATTCTGAGGG 8126

 31583991 CAACAGAAAGCTATGAAAGGGTCGGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCCCTTTG 31584050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8127 CAACAGAAAGCTATGAAAGGGTCGGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCCCTTTG 8186

 31584051 CAAGACCAAGGCGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCACATGG 31584110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8187 CAAGACCAAGGCGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCACATGG 8246

 31584111 CAAAACCCCGTCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGAGCATGGTGGTGTGTGCCTGTA 31584170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8247 CAAAACCCCGTCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGAGCATGGTGGTGTGTGCCTGTA 8306

 31584171 GTCCCAGTTACTCAGGAGGCTGAGACAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTT 31584230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8307 GTCCCAGTTACTCAGGAGGCTGAGACAAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTT 8366

 31584231 GCCATGAGCCAAGATTGCACAACTGCACTCCAGCCAAGATTGCGCAACTGCATTCCAGCC 31584290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8367 GCCATGAGCCAAGATTGCACAACTGCACTCCAGCCAAGATTGCGCAACTGCATTCCAGCC 8426

 31584291 TGGGCGGCAGAGTAAGACTCTGCCTCAAACAAAAGAGAAAAGAGAAAAGAAAGAAAGCTG 31584350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8427 TGGGCGGCAGAGTAAGACTCTGCCTCAAACAAAAGAGAAAAGAGAAAAGAAAGAAAGCTG 8486

 31584351 TGAAAGGACTTGGGGTTTTAAGAGCTGTGTTTCAAAAGGATGACTCTGGCTAGGCAGACG 31584410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8487 TGAAAGGACTTGGGGTTTTAAGAGCTGTGTTTCAAAAGGATGACTCTGGCTAGGCAGACG 8546

 31584411 CACTCACCTATAAAATGGAAATAATACCTACTTCCCAGTGTTGCTGTGGCAATGAAATAA 31584470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8547 CACTCACCTATAAAATGGAAATAATACCTACTTCCCAGTGTTGCTGTGGCAATGAAATAA 8606

 31584471 ATATGAGCACAATGGCTCATAGTAAATACACAGTAGAATTGTCATCAGAAGCAGTAGTAG 31584530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8607 ATATGAGCACAATGGCTCATAGTAAATACACAGTAGAATTGTCATCAGAAGCAGTAGTAG 8666

 31584531 GAAAAGTGACCCATAAATCAGATTTTGATTAGACACCTAAGAGAGTAAATCAGAAGTAAC 31584590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8667 GAAAAGTGACCCATAAATCAGATTTTGATTAGACACCTAAGAGAGTAAATCAGAAGTAAC 8726

 31584591 AACTGTGGCTGGGCACGGTG 31584610
          ||||||||||||||||||||
     8727 AACTGTGGCTGGGCACGGTG 8746

Alignment time is 6.84488 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31565065,31587331] =>     22267 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    8891] =>      8891 nucs 'mol-32-34be-092342_8891'

Score:        8803
Aligned:      8891        nucs
Identic:      8883 (100%) nucs =>       911 (100%)      7972 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31567882,31568792] EXCISED REGION [31568794,31576771]
 second seq =>  [       1,     911] EXCISED REGION [     913,    8891]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31568793,31568793]
 second seq =>         1 nucs [912,912]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [31576705,31576705]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31568792,31568792] to [31568793,31568793]
 second seq =>         1 nucs [912,912] to [913,913]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31567882 CTTGTTTTCTGTGTCCACATAGCCATCACCTTTCTTCTTAGAGTGAATCAACTTCCCAGC 31567941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGTTTTCTGTGTCCACATAGCCATCACCTTTCTTCTTAGAGTGAATCAACTTCCCAGC 60

 31567942 TACCATTACGTCAAAGAACCCGGTGGCCTGGGGAGTTCCCTTGCTGCAGATGTCCAAAGT 31568001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACCATTACGTCAAAGAACCCGGTGGCCTGGGGAGTTCCCTTGCTGCAGATGTCCAAAGT 120

 31568002 CCAGAGGAACTCATCTTCTTTTTCTTTTTTTTTCTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGCTGC 31568061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAGAGGAACTCATCTTCTTTTTCTTTTTTTTTCTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGCTGC 180

 31568062 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCGACCTCCTGGGTTCAA 31568121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCGACCTCCTGGGTTCAA 240

 31568122 GTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGTGCCA 31568181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGTGCCA 300

 31568182 GGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAATACAAACGGTGTTTCATTATGTTGGCCAACATGGTC 31568241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAATACAAACGGTGTTTCATTATGTTGGCCAACATGGTC 360

 31568242 TCGAACTCCTGACCTCATGGTCTGCCCACCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACATGC 31568301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCGAACTCCTGACCTCATGGTCTGCCCACCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACATGC 420

 31568302 GTGAGCCACTGTGCCGGCCGGGGGAACTCATCTTCTAACTTCTTCTTGAGCTGAAGATAC 31568361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGAGCCACTGTGCCGGCCGGGGGAACTCATCTTCTAACTTCTTCTTGAGCTGAAGATAC 480

 31568362 TTGGACTTGTAGCCTCAAGTGCCACATAAACCACTCGCGAGAGCCATGGCTCTGGGCTGC 31568421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGGACTTGTAGCCTCAAGTGCCACATAAACCACTCGCGAGAGCCATGGCTCTGGGCTGC 540

 31568422 CACCCTCGCTGGGGAGCAGAGACCTGGGTCACAGAGACCTCCTGCCTGGACGCATGAGGT 31568481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACCCTCGCTGGGGAGCAGAGACCTGGGTCACAGAGACCTCCTGCCTGGACGCATGAGGT 600

 31568482 CTGCACCACAAATTTATTTAAAAAGGAATTTTATTCATTTAAAATATATGCATACAGTTG 31568541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGCACCACAAATTTATTTAAAAAGGAATTTTATTCATTTAAAATATATGCATACAGTTG 660

 31568542 CTTACTATAATCTAGGCACTGTCTTAAGCATTTGTTTCCACCAGCTACACTAAATGACTC 31568601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTACTATAATCTAGGCACTGTCTTAAGCATTTGTTTCCACCAGCTACACTAAATGACTC 720

 31568602 ATCTACATCACCAGATTTCAGGAGAAATTAGATGCACTGCCAGAAGAAAAGGAAATACTT 31568661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCTACATCACCAGATTTCAGGAGAAATTAGATGCACTGCCAGAAGAAAAGGAAATACTT 780

 31568662 TAGATACTAGTTTTAGCAAAACATGGCATTAATACATTGCAGATGGAGCAGGATGTGAAT 31568721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGATACTAGTTTTAGCAAAACATGGCATTAATACATTGCAGATGGAGCAGGATGTGAAT 840

 31568722 TTACCTACAACTTCCACACTCTGTAACTGATGGATTTTGAGAAAAACTAGGAAAAAACAG 31568781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTACCTACAACTTCCACACTCTGTAACTGATGGATTTTGAGAAAAACTAGGAAAAAACAG 900

 31568782 TGACAAAGAAT 31568792
          |||||||||||
      901 TGACAAAGAAT 911

EXCISED REGION

 31568794 CATTAAACCAAATTACTTTTTGACTATATATCTACTTGGCCACATAATTTTGCATATTAA 31568853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      913 CATTAAACCAAATTACTTTTTGACTATATATCTACTTGGCCACATAATTTTGCATATTAA 972

 31568854 ACAGCAACTGTAGTTAAAATTATCTATCTCAGATAAGAATCTTTTTCTTTTTAGTTTGTA 31568913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      973 ACAGCAACTGTAGTTAAAATTATCTATCTCAGATAAGAATCTTTTTCTTTTTAGTTTGTA 1032

 31568914 TGTATGTATGTATGTATGTATTTTGAGGCAGGGTCTCACTCTCTTACCTAGGCTGGAGTG 31568973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1033 TGTATGTATGTATGTATGTATTTTGAGGCAGGGTCTCACTCTCTTACCTAGGCTGGAGTG 1092

 31568974 CTGGAGTGCGATCACAGCGCACCGAGGCTTTCCCTCCCAGGCTCAAGTGATCCTCCCACC 31569033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 CTGGAGTGCGATCACAGCGCACCGAGGCTTTCCCTCCCAGGCTCAAGTGATCCTCCCACC 1152

 31569034 TCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGTACACAGGCAAGGATCACCACATCTAGCTAATCGTGTTA 31569093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 TCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGTACACAGGCAAGGATCACCACATCTAGCTAATCGTGTTA 1212

 31569094 CTTTGTGTAGTGACAGGTTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAACTCTTGGGCTCA 31569153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 CTTTGTGTAGTGACAGGTTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAACTCTTGGGCTCA 1272

 31569154 AACAATCCTCCTGCCCCAGTCTCTCAAAGTGCTGGATTACAGGCATGAGCCTCTGTGCCC 31569213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 AACAATCCTCCTGCCCCAGTCTCTCAAAGTGCTGGATTACAGGCATGAGCCTCTGTGCCC 1332

 31569214 GGTCTTTTTTTATTTTAGGTATTTTTGTATTTATTTATTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCT 31569273
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 GGTCTTTTTTTATTTTATGTATTTTTGTATTTATTTATTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCT 1392

 31569274 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTTTCTCCCGGG 31569333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1393 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTTTCTCCCGGG 1452

 31569334 TTCACAACATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGATTGGGACTACAGGCGTCCGCCACC 31569393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1453 TTCACAACATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGATTGGGACTACAGGCGTCCGCCACC 1512

 31569394 ACGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTTGACACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGA 31569453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1513 ACGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTTGACACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGA 1572

 31569454 TGGTCTCAATCTCCTGACCTTGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 31569513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 TGGTCTCAATCTCCTGACCTTGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 1632

 31569514 CAGGCATGAGCCACTGTGCCCGGCCGCCTTTTTTTTTATTAATAAGAGATGGAGTTTTGC 31569573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 CAGGCATGAGCCACTGTGCCCGGCCGCCTTTTTTTTTATTAATAAGAGATGGAGTTTTGC 1692

 31569574 TTAATTGCCCAGGCTGGTGTGCAGTGGTCTGATCATGGCTCACTGCAGCCTTGAACTCCT 31569633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 TTAATTGCCCAGGCTGGTGTGCAGTGGTCTGATCATGGCTCACTGCAGCCTTGAACTCCT 1752

 31569634 GGACTAAAGCAATCTTCCTGTTCCAGCCTCCCCAGTACCTAGGACTACAAGCATGTGCCA 31569693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 GGACTAAAGCAATCTTCCTGTTCCAGCCTCCCCAGTACCTAGGACTACAAGCATGTGCCA 1812

 31569694 CCACGCAGGGTGATTTTTAAAAATCTTTTTGGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAAT 31569753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 CCACGCAGGGTGATTTTTAAAAATCTTTTTGGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAAT 1872

 31569754 CACAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCT 31569813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 CACAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCT 1932

 31569814 GGCTAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAACTTAGCTGGGCATGGTGG 31569873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 GGCTAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAACTTAGCTGGGCATGGTGG 1992

 31569874 CACACGCATGTAGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGTTTGAACCCAGG 31569933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 CACACGCATGTAGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGTTTGAACCCAGG 2052

 31569934 AGTCGGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATGGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTG 31569993
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2053 AGTCGGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATGGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAATG 2112

 31569994 AGACTCCATCTTAAAAAAAAAAACAAAAAAAACTGTAGATATGTGGTCTTGCCATATTGG 31570053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 AGACTCCATCTTAAAAAAAAAAACAAAAAAAACTGTAGATATGTGGTCTTGCCATATTGG 2172

 31570054 CCAGGCTGGTCTCAAAATCTTGATTGCCCAGGATGCCAAAAATCTTGTTATTTTCTAGAA 31570113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 CCAGGCTGGTCTCAAAATCTTGATTGCCCAGGATGCCAAAAATCTTGTTATTTTCTAGAA 2232

 31570114 TCTAATATGAGAACCATTGAATAATTACAACATATTTGCAACAATGATAATTTTCTATTA 31570173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 TCTAATATGAGAACCATTGAATAATTACAACATATTTGCAACAATGATAATTTTCTATTA 2292

 31570174 CCTTATATTCAATATTTGATTTGTATAATTTTTACAGAATGATTTAATGCTTGTCATAAT 31570233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 CCTTATATTCAATATTTGATTTGTATAATTTTTACAGAATGATTTAATGCTTGTCATAAT 2352

 31570234 TGTTATTCTTTAAAAAAATTTTTTTGTAGAGCTCTTACTATGTTGCTGAGGCTGGTCTGG 31570293
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2353 TGTTATTCTTTAAAAAAATTTTTTTGTAGAGATCTTACTATGTTGCTGAGGCTGGTCTGG 2412

 31570294 AACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTCACCCTTCCAAAATGTTGGGATTATAGATG 31570353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 AACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTCACCCTTCCAAAATGTTGGGATTATAGATG 2472

 31570354 TGAGCCAGTTCTATGCCCAGGTATGCCCAGTCTTATAATTGTTATTCCCCAGAAATAATA 31570413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 TGAGCCAGTTCTATGCCCAGGTATGCCCAGTCTTATAATTGTTATTCCCCAGAAATAATA 2532

 31570414 AACTAACTTATATAATGTCTTACTGGAGGATGGAGCAACTTTTTGTAATTCTCTAAAACA 31570473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 AACTAACTTATATAATGTCTTACTGGAGGATGGAGCAACTTTTTGTAATTCTCTAAAACA 2592

 31570474 GGGATCAGCAAGTACAGGCCACAAGCTAAATTCTCAGCTTGCTTCCTGTTTTCTTTTCTT 31570533
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 GGGATCAGCAAGTACAGGCCACAGGCTAAATTCTCAGCTTGCTTCCTGTTTTCTTTTCTT 2652

 31570534 TCTTTCTTCTTCTTTTTTTAATAGGCTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTGAGATGGA 31570593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 TCTTTCTTCTTCTTTTTTTAATAGGCTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTGAGATGGA 2712

 31570594 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGTTGGGGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAGTCTCT 31570653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGTTGGGGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAGTCTCT 2772

 31570654 GCCTCCTGGGTTCAAGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTTCACC 31570713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 GCCTCCTGGGTTCAAGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTTTTCACC 2832

 31570714 ATGTTGGCCAGGCTGGTCCTGAACTCCTGACCTCAAGTGGTCTGCCCGCCTCGGCCTCTC 31570773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 ATGTTGGCCAGGCTGGTCCTGAACTCCTGACCTCAAGTGGTCTGCCCGCCTCGGCCTCTC 2892

 31570774 AAAGTGCCGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCGGCCTATTTATTTTTTGAGATGGA 31570833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 AAAGTGCCGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCGGCCTATTTATTTTTTGAGATGGA 2952

 31570834 GTATTGCTCTCGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTC 31570893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 GTATTGCTCTCGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTC 3012

 31570894 TGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGC 31570953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 TGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGC 3072

 31570954 GTATGCCACCGTGCCTGACTAATTTTGTA-TTTTTTTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACC 31571012
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 GTATGCCACCGTGCCTGACTAATTTTGTATTTTTTTTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACC 3132

 31571013 ATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGA-TCCCCCCCCCAACCTTGGC 31571071
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     3133 ATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATTCCCCCCCCCAACCTTGGC 3192

 31571072 CTCCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAACTACCGCACCTGGAAGACAGGCTTTATTTTT 31571131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 CTCCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAACTACCGCACCTGGAAGACAGGCTTTATTTTT 3252

 31571132 TAAGATCAGTTTTAGGTTTGTGGCAAAATTGAGCAGAAGATACCATATTTCCTGTATACT 31571191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3253 TAAGATCAGTTTTAGGTTTGTGGCAAAATTGAGCAGAAGAAACCATATTTCCTGTATACT 3312

 31571192 TCCTACCCCTATACATGAATAGCCTCCTCCGTTTTCAATATATCCCCCATCAGAGTGGTA 31571251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3313 TCCTACCCCTATACATGAATAGCCTCCTCCGTTTTCAATATATCCCCCATCAGAGTGGTA 3372

 31571252 CATTTGTGACAACTGATGAATCTACATTGACACGTCATTACCACCTGACTCCCTGTTTTT 31571311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 CATTTGTGACAACTGATGAATCTACATTGACACGTCATTACCACCTGACTCCCTGTTTTT 3432

 31571312 GTAGGACCCCTGCAAGCCAAGAATGATTGTAACATTTTTAAAGGTGGGGAAAAAACTTTA 31571371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 GTAGGACCCCTGCAAGCCAAGAATGATTGTAACATTTTTAAAGGTGGGGAAAAAACTTTA 3492

 31571372 AGAGTACTATTTCTTGACATTTTTCTGCAAATGATATGAAATTCAAATTTCAGTGTCCAT 31571431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3493 AGAGTACTATTTCTTGACATTTTTCTGCAAATGATATGAAATTCAAATTTCAGTGTCCAT 3552

 31571432 AAATAAAGTTTTGTTGGAACACAGTCAGACCCAGTTGATTAAGTAGTGCCTGTGGCTCCT 31571491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3553 AAATAAAGTTTTGTTGGAACACAGTCAGACCCAGTTGATTAAGTAGTGCCTGTGGCTCCT 3612

 31571492 TTTGTGCCCCACAGCTGAGTTGAGTAGGTACCACCATGACCATATGGCCTACAAAGCCTT 31571551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3613 TTTGTGCCCCACAGCTGAGTTGAGTAGGTACCACCATGACCATATGGCCTACAAAGCCTT 3672

 31571552 TGGGAGGCCGAAGTAGGCAGACCAGTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACA 31571611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3673 TGGGAGGCCGAAGTAGGCAGACCAGTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACA 3732

 31571612 TGGTGGCCATGCTCTCCAGCCTGTGTGACAGAGGCTGGATCATAGTTCACTGCAACCTTG 31571671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 TGGTGGCCATGCTCTCCAGCCTGTGTGACAGAGGCTGGATCATAGTTCACTGCAACCTTG 3792

 31571672 AACTCCCACCTTGATCCTCCCACCTCAGTCTCCCACGTAGCTGGGACCAGGCACACGCCA 31571731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 AACTCCCACCTTGATCCTCCCACCTCAGTCTCCCACGTAGCTGGGACCAGGCACACGCCA 3852

 31571732 CAGTGCCCAGACAATTTTTTTTTTTATTTTTTGAGATGGAGTTTCGTTCTTGTTGCCCAG 31571791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3853 CAGTGCCCAGACAATTTTTTTTTTTATTTTTTGAGATGGAGTTTCGTTCTTGTTGCCCAG 3912

 31571792 GCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGA 31571851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3913 GCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGA 3972

 31571852 TTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGATTACAGGCACGCTCCACCACGCCCAGCT 31571911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3973 TTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGATTACAGGCACGCTCCACCACGCCCAGCT 4032

 31571912 AATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGAAGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTC 31571971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4033 AATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGAAGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTC 4092

 31571972 CTGACCTCAGGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACAGGTGTGAGC 31572031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4093 CTGACCTCAGGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACAGGTGTGAGC 4152

 31572032 CACTGTGCCAGCCAATTTTTTTATTTTTTGTAGAGACTGGATCTCACTTTGTTCCCCAGG 31572091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4153 CACTGTGCCAGCCAATTTTTTTATTTTTTGTAGAGACTGGATCTCACTTTGTTCCCCAGG 4212

 31572092 CTGGTCTTGAACTCCAAGGCTTAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCACAAAATGCTGGGA 31572151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4213 CTGGTCTTGAACTCCAAGGCTTAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCACAAAATGCTGGGA 4272

 31572152 TTATAGGAGAGAGCCACTACACGCAGCTATGTGTTCCTGAATTTGCCAACCTCTCCCTTT 31572211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4273 TTATAGGAGAGAGCCACTACACGCAGCTATGTGTTCCTGAATTTGCCAACCTCTCCCTTT 4332

 31572212 GACTCTCAGGACCCAAATTCTTGGCTCTCCAATCAGGTATGTCCTCTTCCCATTCCTGCA 31572271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4333 GACTCTCAGGACCCAAATTCTTGGCTCTCCAATCAGGTATGTCCTCTTCCCATTCCTGCA 4392

 31572272 CCCCTGCCCTTGCCATTCTGGTAAATAGAAATAGGTCACGTTCTACTGAGAGGCCTCTGG 31572331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4393 CCCCTGCCCTTGCCATTCTGGTAAATAGAAATAGGTCACGTTCTACTGAGAGGCCTCTGG 4452

 31572332 AGAGTGGCAAGGCCTGCCCTACTCCCTGCCTTCCCCACAGGCTTAACTGAAGGGACCCAT 31572391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4453 AGAGTGGCAAGGCCTGCCCTACTCCCTGCCTTCCCCACAGGCTTAACTGAAGGGACCCAT 4512

 31572392 GATAAACCCCCAAGGGCCAAGATTTCCTCACAATTTACTTTCCATAGTCTGCATTAAGAA 31572451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4513 GATAAACCCCCAAGGGCCAAGATTTCCTCACAATTTACTTTCCATAGTCTGCATTAAGAA 4572

 31572452 CAAAGTTAGAGTTTTGTTTTGCATTTTCCAAAGAAAAATGCTGTTGTAATATGTAATATT 31572511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4573 CAAAGTTAGAGTTTTGTTTTGCATTTTCCAAAGAAAAATGCTGTTGTAATATGTAATATT 4632

 31572512 CTTTTACAAATTGTTCACTCATGCGGGGAATACTGCTACACGCCCTTCCTTTCTCTCCCT 31572571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4633 CTTTTACAAATTGTTCACTCATGCGGGGAATACTGCTACACGCCCTTCCTTTCTCTCCCT 4692

 31572572 TTTTCCTCCTCCCTTCCCCTGCTTTCCTTGGGCACATTTCTTGTATCTTACTTTCCCCAG 31572631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4693 TTTTCCTCCTCCCTTCCCCTGCTTTCCTTGGGCACATTTCTTGTATCTTACTTTCCCCAG 4752

 31572632 GTCAGAAGCAGGCTGTTGGAGGGCCCAGTTGGCAACTTCTCCACCTGAGAGGCCCCAGAG 31572691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4753 GTCAGAAGCAGGCTGTTGGAGGGCCCAGTTGGCAACTTCTCCACCTGAGAGGCCCCAGAG 4812

 31572692 CCTGCCCAGGGTGGACAGCAGTTAATGTTTAATGAGTGAGTGAATGAATACATTTTAAAA 31572751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4813 CCTGCCCAGGGTGGACAGCAGTTAATGTTTAATGAGTGAGTGAATGAATACATTTTAAAA 4872

 31572752 GGTATGAAGGCCAGGCCTGGTGCCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTCAGGAGGCCCAGG 31572811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4873 GGTATGAAGGCCAGGCCTGGTGCCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTCAGGAGGCCCAGG 4932

 31572812 TGGGCAGATCACTTGAGCCTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAGCAATAGGGAGTCCCC 31572871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4933 TGGGCAGATCACTTGAGCCTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAGCAATAGGGAGTCCCC 4992

 31572872 TGACTCTACAGATAATTTTTTTTTTGAGACGGATTCTTGCACTGTTGCCTGGGCTGGAGT 31572931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4993 TGACTCTACAGATAATTTTTTTTTTGAGACGGATTCTTGCACTGTTGCCTGGGCTGGAGT 5052

 31572932 GCAATGGCATGATCTCAGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTG 31572991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5053 GCAATGGCATGATCTCAGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTG 5112

 31572992 CCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCACACCTGGCTAATTTTTT 31573051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5113 CCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCACACCTGGCTAATTTTTT 5172

 31573052 TTTTTTTTTTTTTAAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCACGA 31573111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5173 TTTTTTTTTTTTTAAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTCCAGTGGCACGA 5232

 31573112 TCTCGGCTCACTGCAAGCGTTGCCTCCCGACATCCGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGT 31573171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5233 TCTCGGCTCACTGCAAGCGTTGCCTCCCGACATCCGGCTAATTTTTTTTGCATTTTTAGT 5292

 31573172 AGACACAGGGATTTACTATGTTGGCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCCAC 31573231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5293 AGACACAGGGATTTACTATGTTGGCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCCAC 5352

 31573232 CTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCCAGAT 31573291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5353 CTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCCAGAT 5412

 31573292 AATAAAAATTAGCCGGATATAGTGGCACATACCTCTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGA 31573351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5413 AATAAAAATTAGCCGGATATAGTGGCACATACCTCTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGA 5472

 31573352 GGCAGGAGGATTGCTTGAGCCTCGGAAGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGTGCCACT 31573411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5473 GGCAGGAGGATTGCTTGAGCCTCGGAAGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGTGCCACT 5532

 31573412 ATACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCATGTTTCAGAAAAAAAAGGAAAAAGATAAA 31573471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5533 ATACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCATGTTTCAGAAAAAAAAGGAAAAAGATAAA 5592

 31573472 AAATATAAAGGAAATTGGGGAACTATGCTGTCTCCCCGGGGACCTTTCTGCTGAGTCAAG 31573531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5593 AAATATAAAGGAAATTGGGGAACTATGCTGTCTCCCCGGGGACCTTTCTGCTGAGTCAAG 5652

 31573532 GTGGCCTCTCTGGGCAGTAGGATGAAGCCCGACTCTCTGGTCAACTCATTGTTCACGAAG 31573591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5653 GTGGCCTCTCTGGGCAGTAGGATGAAGCCCGACTCTCTGGTCAACTCATTGTTCACGAAG 5712

 31573592 TCCTTTCCCACAGCAGCTGAGGGACAAAGTCACAGTCCCTGCCCAGTCCTCTGCACCAGC 31573651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5713 TCCTTTCCCACAGCAGCTGAGGGACAAAGTCACAGTCCCTGCCCAGTCCTCTGCACCAGC 5772

 31573652 CACCCCTCTGGTTTAACCTGTCCCAGGTCTTCCCCCTTGACTACACCCTCTAAATCCTAG 31573711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5773 CACCCCTCTGGTTTAACCTGTCCCAGGTCTTCCCCCTTGACTACACCCTCTAAATCCTAG 5832

 31573712 AGTGGGGAGAGAATGAAGATGTGAGGTGACAGATGAGGTCTCTTCCCCAGCCAGAGGGTG 31573771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5833 AGTGGGGAGAGAATGAAGATGTGAGGTGACAGATGAGGTCTCTTCCCCAGCCAGAGGGTG 5892

 31573772 CAGAAAGCCCCAACATAACACATGTCCTGAAACCCAAAGAGAAGACAGAAATTGTCAGCA 31573831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5893 CAGAAAGCCCCAACATAACACATGTCCTGAAACCCAAAGAGAAGACAGAAATTGTCAGCA 5952

 31573832 AAGGTTAGCTAGCTCCTGAGGTCATAAGCAACCTTATTTTTATTTTGTGTTCCCAAATGT 31573891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5953 AAGGTTAGCTAGCTCCTGAGGTCATAAGCAACCTTATTTTTATTTTGTGTTCCCAAATGT 6012

 31573892 GTTGTCTGGAACATGTATACATATTACGTATTAAAGCAAAAGCAAAATCAGAATAAATAT 31573951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6013 GTTGTCTGGAACATGTATACATATTACGTATTAAAGCAAAAGCAAAATCAGAATAAATAT 6072

 31573952 TGTCTTCCAAGTTGTCTTTGTGTGTGTTTTGGTTTTGTGGTTTATTCCTCTTTCTTTTCA 31574011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6073 TGTCTTCCAAGTTGTCTTTGTGTGTGTTTTGGTTTTGTGGTTTATTCCTCTTTCTTTTCA 6132

 31574012 GTTGGATAGAAGCCAGGCTCCTTTCTCCCAGCACACGCACAGACTCAGCACACACAGAAA 31574071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6133 GTTGGATAGAAGCCAGGCTCCTTTCTCCCAGCACACGCACAGACTCAGCACACACAGAAA 6192

 31574072 CCCCAGGAATTAAATGACTCTCCAAAATGATAAGTAGGAAGAAGGGGGTGGGGTAGAGAG 31574131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6193 CCCCAGGAATTAAATGACTCTCCAAAATGATAAGTAGGAAGAAGGGGGTGGGGTAGAGAG 6252

 31574132 GGAGGAAGGGGGAGAGAGGAGGCCTTTTCCCCTGACCTGGGGAGGAGCCCTAGTCCAGGA 31574191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6253 GGAGGAAGGGGGAGAGAGGAGGCCTTTTCCCCTGACCTGGGGAGGAGCCCTAGTCCAGGA 6312

 31574192 GAGGTCAGGGTGTGCAAAGGCCTCTGGGTAGGAATAGGAACAGGGCCATTGGCCAAGTGC 31574251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6313 GAGGTCAGGGTGTGCAAAGGCCTCTGGGTAGGAATAGGAACAGGGCCATTGGCCAAGTGC 6372

 31574252 CCTCTGCTCTGTTACTCCCAGAGCCGGCTCCTACCCTCAGGCCTGGGAGCCCGCCGTCTG 31574311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6373 CCTCTGCTCTGTTACTCCCAGAGCCGGCTCCTACCCTCAGGCCTGGGAGCCCGCCGTCTG 6432

 31574312 CTAGTAAGGGGCTTCAGGAGTTGGGGGAGTGCAGATGAGGAGTAGCTCTCTTTTTCTCAC 31574371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6433 CTAGTAAGGGGCTTCAGGAGTTGGGGGAGTGCAGATGAGGAGTAGCTCTCTTTTTCTCAC 6492

 31574372 ATTCCCTCTTAAACCTCAGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTAAAGAAATGATTCTAAAATTA 31574431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6493 ATTCCCTCTTAAACCTCAGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTAAAGAAATGATTCTAAAATTA 6552

 31574432 GCCAGGTGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAAATGTGTTTCTACTTGGGAGGCTGAGGT 31574491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6553 GCCAGGTGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAAATGTGTTTCTACTTGGGAGGCTGAGGT 6612

 31574492 GGGAGAATTGCTTGAGCCTGGGAGGTTCAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCAGGCCACTGCA 31574551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6613 GGGAGAATTGCTTGAGCCTGGGAGGTTCAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCAGGCCACTGCA 6672

 31574552 CTCCAGCTGGGGAGACAGAGGGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAATAATTTTT 31574611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6673 CTCCAGCTGGGGAGACAGAGGGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAATAATTTTT 6732

 31574612 GTCCTTTTTCTATAAGCATCTTTTAAAACTTTTTTCCAGGCAGGGAGCGGTGTCTCACGC 31574671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6733 GTCCTTTTTCTATAAGCATCTTTTAAAACTTTTTTCCAGGCAGGGAGCGGTGTCTCACGC 6792

 31574672 CTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTTAGGAGTTCGA 31574731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6793 CTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTTAGGAGTTCGA 6852

 31574732 GACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGC 31574791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6853 GACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGC 6912

 31574792 ATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGA 31574851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6913 ATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGA 6972

 31574852 ACCCGGGAGGTGAGCCGAGATTGCGCTATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAAC 31574911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6973 ACCCGGGAGGTGAGCCGAGATTGCGCTATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAAC 7032

 31574912 TGTCTAAAAAAGAAAAAAGGCAGCATTTTGGGAGGTGGAGGTGAGAGGACAGGAGTTTGA 31574971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7033 TGTCTAAAAAAGAAAAAAGGCAGCATTTTGGGAGGTGGAGGTGAGAGGACAGGAGTTTGA 7092

 31574972 GACCAGCCTGGCCAATGTGATGAAACCCCATCTCTATTAAAAACACAAAAATTAGCCGGG 31575031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7093 GACCAGCCTGGCCAATGTGATGAAACCCCATCTCTATTAAAAACACAAAAATTAGCCGGG 7152

 31575032 TGTGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTG 31575091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7153 TGTGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTG 7212

 31575092 AACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGC 31575151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7213 AACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGC 7272

 31575152 CAGAGCAAGACCCTGTATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACTTTAAAATAAATAAATAAA 31575211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7273 CAGAGCAAGACCCTGTATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACTTTAAAATAAATAAATAAA 7332

 31575212 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATGATTTGCACAGCAACTTTGTGAACAGAGCCC 31575271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7333 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATGATTTGCACAGCAACTTTGTGAACAGAGCCC 7392

 31575272 CCTTCCCTTTCATTTTCTGCCTGACTACCCACAACAGAGTCCCGGGTGGGGGTGGGAGGG 31575331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7393 CCTTCCCTTTCATTTTCTGCCTGACTACCCACAACAGAGTCCCGGGTGGGGGTGGGAGGG 7452

 31575332 TCAGGGATGGGCTGTGGCGTCTGCATGCAGGCTTGCCTCCACTGGCCTGAATCTCAGCAG 31575391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7453 TCAGGGATGGGCTGTGGCGTCTGCATGCAGGCTTGCCTCCACTGGCCTGAATCTCAGCAG 7512

 31575392 GAAGAAGCAGCTCTTCCCTCAGGCCAAGCAGGAAATGATTCTCCCACAAAACACCTGACC 31575451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7513 GAAGAAGCAGCTCTTCCCTCAGGCCAAGCAGGAAATGATTCTCCCACAAAACACCTGACC 7572

 31575452 CTGAGACCTTCCCAGGGAGTTGCACAAATTCGTTTTATAACCAGCAAAGCAATTCTGAGG 31575511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7573 CTGAGACCTTCCCAGGGAGTTGCACAAATTCGTTTTATAACCAGCAAAGCAATTCTGAGG 7632

 31575512 GTTTTAGAGTGGGAAGGGCTTGCTCCTAGTTCTCCTAAGACTGTCTACTGTTTAATTACG 31575571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7633 GTTTTAGAGTGGGAAGGGCTTGCTCCTAGTTCTCCTAAGACTGTCTACTGTTTAATTACG 7692

 31575572 AAAGCCACTGTTGTGCTCAACAGCTGAGGAAACACAGGAAGGATCAAGAAGTGAACTTTC 31575631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7693 AAAGCCACTGTTGTGCTCAACAGCTGAGGAAACACAGGAAGGATCAAGAAGTGAACTTTC 7752

 31575632 CCTGACTCCACCTCCCCATACTGCCTCAGAGACCCAGGAACAGGCTGTCCCCCAGAAAGG 31575691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7753 CCTGACTCCACCTCCCCATACTGCCTCAGAGACCCAGGAACAGGCTGTCCCCCAGAAAGG 7812

 31575692 GATGCCTGGGAGGACTGAGCAGGCACTGACCGCTCATGCTAGGGAACCAGGCCAGTGAAT 31575751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7813 GATGCCTGGGAGGACTGAGCAGGCACTGACCGCTCATGCTAGGGAACCAGGCCAGTGAAT 7872

 31575752 GCAGCTTTGAATCTACGCTGGATCACCTCCATGTCCTCATCTGTAAAATCATGCCAGGCA 31575811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7873 GCAGCTTTGAATCTACGCTGGATCACCTCCATGTCCTCATCTGTAAAATCATGCCAGGCA 7932

 31575812 CGTCACATGCTTGGTACACATTCATTCATTGCATTTGGGCCACAACCCTATGAGGGAGGT 31575871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7933 CGTCACATGCTTGGTACACATTCATTCATTGCATTTGGGCCACAACCCTATGAGGGAGGT 7992

 31575872 GTTATTATCATCTTTGTTTTACCGAGAAACCTAAGGCACAGAGAGGGTAAGAATGTTACT 31575931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7993 GTTATTATCATCTTTGTTTTACCGAGAAACCTAAGGCACAGAGAGGGTAAGAATGTTACT 8052

 31575932 GGGCCAGGTGCAGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGAGCC 31575991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8053 GGGCCAGGTGCAGTGGTTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGAGCC 8112

 31575992 TGGAGTATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGGCAACATAGTGAGACCCCCA 31576051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8113 TGGAGTATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCTTGGGCAACATAGTGAGACCCCCA 8172

 31576052 TTTCTACAAAAAGTAGAAAAATTAGCTGGGCTGTTGCACGAGACTGTGGTCCCAGCCACT 31576111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8173 TTTCTACAAAAAGTAGAAAAATTAGCTGGGCTGTTGCACGAGACTGTGGTCCCAGCCACT 8232

 31576112 TGGGAGGCTGAACAGGAGGATGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTAGAGGCTGCAGGGAG 31576171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8233 TGGGAGGCTGAACAGGAGGATGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTAGAGGCTGCAGGGAG 8292

 31576172 CCATGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCCAGTGAGAGTGAGACCATGTCTCAAAAAAAAA 31576231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8293 CCATGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCCCAGTGAGAGTGAGACCATGTCTCAAAAAAAAA 8352

 31576232 AAAAAGTTACTAAGGCCATATATCTTGTGCATGTATACCTGAAATTTGAGACCAGGCAAC 31576291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8353 AAAAAGTTACTAAGGCCATATATCTTGTGCATGTATACCTGAAATTTGAGACCAGGCAAC 8412

 31576292 CGGGTACCACTAGGCTGTACTGCTCCTATGAGGAGCACACACTTACCTGTACCTGTCTCA 31576351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8413 CGGGTACCACTAGGCTGTACTGCTCCTATGAGGAGCACACACTTACCTGTACCTGTCTCA 8472

 31576352 GAGAATCTCTTCGAATTAAAGGAGATAATGCACGTAAGGTGCTCTGAACAGAGTCTGGGA 31576411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8473 GAGAATCTCTTCGAATTAAAGGAGATAATGCACGTAAGGTGCTCTGAACAGAGTCTGGGA 8532

 31576412 CTTAGTACTCTCAGTAAACACAAGTCCAACATCATCATCATCATCAATAGTCTTACCTAT 31576471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8533 CTTAGTACTCTCAGTAAACACAAGTCCAACATCATCATCATCATCAATAGTCTTACCTAT 8592

 31576472 TCAGAATTCTTTATTATTATTATTGTTATAGAAAGGGTCTCACTGTGTCACCCAGGCTGG 31576531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8593 TCAGAATTCTTTATTATTATTATTGTTATAGAAAGGGTCTCACTGTGTCACCCAGGCTGG 8652

 31576532 AGTGCAGTGGCATGTTCATAGCTCACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCTATCCTC 31576591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8653 AGTGCAGTGGCATGTTCATAGCTCACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCTATCCTC 8712

 31576592 CCATCCCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACACCAAACCTGGCCCAGTCAGAATTCTGAA 31576651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8713 CCATCCCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACACCAAACCTGGCCCAGTCAGAATTCTGAA 8772

 31576652 GCAGTCGCACTCCTGGTCCTGGCTGCACAAACATGGTGGAAACTTATATGCTTAAAAAAA 31576711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     8773 GCAGTCGCACTCCTGGTCCTGGCTGCACAAACATGGTGGAAACTTATATGCTT-AAAAAA 8831

 31576712 AAATTGTACTGGGGCCGGGCACGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 31576771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8832 AAATTGTACTGGGGCCGGGCACGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 8891

Alignment time is 6.95219 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31565065,31587331] =>     22267 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    9501] =>      9501 nucs 'mol-32-34d4-093367_9501'

Score:        9359
Aligned:      9502        nucs
Identic:      9489 (100%) nucs =>       363 (100%)      9126 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31565603,31565965] EXCISED REGION [31565968,31575104]
 second seq =>  [       1,     363] EXCISED REGION [     364,    9501]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [31565966,31565967]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31565966,31565966] to [31565968,31565968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [31565963,31565965] to [31565968,31565970]
 second seq =>         3 nucs [361,363] to [364,366]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31565603 TAATTTTGACTATTATAATTATCTTATATAAGTAGAGTCATATAGTATTTGTTGTTTTGT 31565662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATTTTGACTATTATAATTATCTTATATAAGTAGAGTCATATAGTATTTGTTGTTTTGT 60

 31565663 GATTGGCTTATTTCATTTAGCATAATGTCCTAAAGTTTCATACGTGTTGTAGCATACTAC 31565722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATTGGCTTATTTCATTTAGCATAATGTCCTAAAGTTTCATACGTGTTGTAGCATACTAC 120

 31565723 AAAATCTCCTTCCTTTTTAAGCCCAAATCATAGTAGTTCATTGTGTGTATCTATCACATT 31565782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAATCTCCTTCCTTTTTAAGCCCAAATCATAGTAGTTCATTGTGTGTATCTATCACATT 180

 31565783 TTGCTTGTTCATTCATCTCTAGATGGACACTTGGATTGTTTCCATATGTTAGCTATTTCG 31565842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGCTTGTTCATTCATCTCTAGATGGACACTTGGATTGTTTCCATATGTTAGCTATTTCG 240

 31565843 AATAATGCTACTATGAACATGGGAATACAAATATATATTGGAGACTCTGCTTTCAATTCT 31565902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATAATGCTACTATGAACATGGGAATACAAATATATATTGGAGACTCTGCTTTCAATTCT 300

 31565903 TCTGGGTATATACCTAGAAGTGGAATTGCTGAATTATAGAGTTAAACTTCTATTTTTTTT 31565962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTGGGTATATACCTAGAAGTGGAATTGCTGAATTATAGAGTTAAACTTCTATTTTTTTT 360

 31565963 TTT 31565965
          |||
      361 TTT 363

EXCISED REGION

 31565968 TTTGTTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTGATCTCGGC 31566027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 TTTGTTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTTGATCTCGGC 423

 31566028 TCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTGGC 31566087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 TCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTGGC 483

 31566088 TGGGACTACAGGCGCCTGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 31566147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 TGGGACTACAGGCGCCTGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 543

 31566148 GGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGGTCTCCTGACCTCGTAAATTCGCCTGCATC 31566207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 GGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGGTCTCCTGACCTCGTAAATTCGCCTGCATC 603

 31566208 GGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTACCGCGCCCGGCCTAAACATCTATT 31566267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 GGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTACCGCGCCCGGCCTAAACATCTATT 663

 31566268 TTTAATTTTTTTGAGGAACCATCATACTGTTTTCCACAGCAGCTGCACCATTTTACATTT 31566327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 TTTAATTTTTTTGAGGAACCATCATACTGTTTTCCACAGCAGCTGCACCATTTTACATTT 723

 31566328 TCATCAAAAGTGCACCAAGGTTCCACTTTCACCACATCCTCACCAACACTTATTTTCTGT 31566387
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 TCATCAAAAGTGCACCAGGGTTCCACTTTCACCACATCCTCACCAACACTTATTTTCTGT 783

 31566388 TTTTTGAAAGTAGCCATCCTAATGGGTGTGAGGACACTGATATTATTTTAGACTGTTGTA 31566447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 TTTTTGAAAGTAGCCATCCTAATGGGTGTGAGGACACTGATATTATTTTAGACTGTTGTA 843

 31566448 AATAATAAAATCCTAAATCACGAAATAATTTCTCCCCAGACATCAGAAAAAAATGTTTAC 31566507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 AATAATAAAATCCTAAATCACGAAATAATTTCTCCCCAGACATCAGAAAAAAATGTTTAC 903

 31566508 TTAATTTGTTTTCCATTTAAAACTTTTTTTTTTCTTTGGAGGCAGTCTTGCCATGTCTCC 31566567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 TTAATTTGTTTTCCATTTAAAACTTTTTTTTTTCTTTGGAGGCAGTCTTGCCATGTCTCC 963

 31566568 CAGGCTGGAGTAGAGTGGTGCAGTCATCGCTTATCACAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAGG 31566627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 CAGGCTGGAGTAGAGTGGTGCAGTCATCGCTTATCACAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAGG 1023

 31566628 CAATCCTCTAGCCTCAGCACCCTGAGTAGCAAGGACTACAAGCACATGCCACCACACTTG 31566687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 CAATCCTCTAGCCTCAGCACCCTGAGTAGCAAGGACTACAAGCACATGCCACCACACTTG 1083

 31566688 GCTAATTTAAAATTTTTTTCTTGCGTAGAGATGAGGTCTTGCTGTGTTACCCTGGCTGAT 31566747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 GCTAATTTAAAATTTTTTTCTTGCGTAGAGATGAGGTCTTGCTGTGTTACCCTGGCTGAT 1143

 31566748 CTTAAGGTCCTGCCTTCAAGCGATCCTCCCTCCTTTGGCATTCCAAAGTGCTGGGATTAC 31566807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 CTTAAGGTCCTGCCTTCAAGCGATCCTCCCTCCTTTGGCATTCCAAAGTGCTGGGATTAC 1203

 31566808 AGGTATGAGCTACAGTGCCCAACAACAACAAAAAAATTTTAAATCATGAGATCCAGGAAA 31566867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 AGGTATGAGCTACAGTGCCCAACAACAACAAAAAAATTTTAAATCATGAGATCCAGGAAA 1263

 31566868 AAAAAAAAAAGCCTGTTAAAAAAATTTTATTGGCCGGACATAGTGGCTCACACCTGTAAT 31566927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 AAAAAAAAAAGCCTGTTAAAAAAATTTTATTGGCCGGACATAGTGGCTCACACCTGTAAT 1323

 31566928 CCTAGCACTTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCCGGAGGCCAGGTGTTTGAGACCAGC 31566987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 CCTAGCACTTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCCGGAGGCCAGGTGTTTGAGACCAGC 1383

 31566988 TTGAGCAACATAGCAAGACTCCATCTCTACTGTGTAAAAACATGGGCCAGGAACGGTGGC 31567047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 TTGAGCAACATAGCAAGACTCCATCTCTACTGTGTAAAAACATGGGCCAGGAACGGTGGC 1443

 31567048 TCACACCTGTAATCCCAGCACCTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATTGCTTGAGTTCAGGG 31567107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 TCACACCTGTAATCCCAGCACCTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATTGCTTGAGTTCAGGG 1503

 31567108 GTTTGAGACCAGCCTGGGCAACACGGCAAAAACCCATCTCTACCAAAAAAAAAAAAAGAA 31567167
          |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     1504 GTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGCAAAAACCCATCTCTACC-AAAAAAAAAAAAGAA 1562

 31567168 AAAAGAAGGAGAAGAAAATTAGTGGGGTGTGGGGGCATTCCTCTGTGGTCCCAGGTACTC 31567227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 AAAAGAAGGAGAAGAAAATTAGTGGGGTGTGGGGGCATTCCTCTGTGGTCCCAGGTACTC 1622

 31567228 AAGAGGGTGAGGTAGGAATGGATCACTTGAGCCAGCGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCCA 31567287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 AAGAGGGTGAGGTAGGAATGGATCACTTGAGCCAGCGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCCA 1682

 31567288 GATGGTGCCACTACACTCCTGCCTGGGTGACAGAGTAAACCCTGTCTCAAAAATAAATAA 31567347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 GATGGTGCCACTACACTCCTGCCTGGGTGACAGAGTAAACCCTGTCTCAAAAATAAATAA 1742

 31567348 ATGCATACATACATAAATACATAAATAAATGCAAGAAACTTATTTTTCTCTAGACAGCAG 31567407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 ATGCATACATACATAAATACATAAATAAATGCAAGAAACTTATTTTTCTCTAGACAGCAG 1802

 31567408 GGCAAATTTCTTTTTTTTTTTTTTTCGGTTAAATTCGTCCAATATTTGTTGAATTGTGAA 31567467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 GGCAAATTTCTTTTTTTTTTTTTTTCGGTTAAATTCGTCCAATATTTGTTGAATTGTGAA 1862

 31567468 TGGTTGCAAACGTTGCTGCAATCAGAGACTCACCCATCCTGTTGCCTCTCCTGGCTTCCC 31567527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1863 TGGTTGCAAACGTTGCTGCAATCAGAGACTCACCCATCCTGTTGCCTCTCTTGGCTTCCC 1922

 31567528 TTTGAGAAGGAAGCCTGAGGCGGGACATCCCCCAAACTCTGGGAGACAACTGGGGAGACA 31567587
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 TTTGAGAAGGAAGCCTGAGGCAGGACATCCCCCAAACTCTGGGAGACAACTGGGGAGACA 1982

 31567588 TGGGGTATGCATAGAGATATGATGAAATCGGGGAACAGGTAGGGCGGTGTGGATTCCGGG 31567647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 TGGGGTATGCATAGAGATATGATGAAATCGGGGAACAGGTAGGGCGGTGTGGATTCCGGG 2042

 31567648 GAAGACACATACAAACAGACTCTACCACACAGAGGTAAAGACCAGGGGTGTCAACCTCTG 31567707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 GAAGACACATACAAACAGACTCTACCACACAGAGGTAAAGACCAGGGGTGTCAACCTCTG 2102

 31567708 CCCCCAACAGCAGCTGCGAGAACAGGGGAAGACCAGGCGTCCATGAGACATTTCAGTTCT 31567767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 CCCCCAACAGCAGCTGCGAGAACAGGGGAAGACCAGGCGTCCATGAGACATTTCAGTTCT 2162

 31567768 TCCTGTCATGAAGCATCTGCTGAGAGGAGCTGGGTCAAGGTCCCTGGACTCTGCCTTCAG 31567827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 TCCTGTCATGAAGCATCTGCTGAGAGGAGCTGGGTCAAGGTCCCTGGACTCTGCCTTCAG 2222

 31567828 GGCACATTAGCCCTGAGCCAAGGCAGCTTTGATGGCAGCCACCAGCTTCAGAAACTTGTT 31567887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 GGCACATTAGCCCTGAGCCAAGGCAGCTTTGATGGCAGCCACCAGCTTCAGAAACTTGTT 2282

 31567888 TTCTGTGTCCACATAGCCATCACCTTTCTTCTTAGAGTGAATCAACTTCCCAGCTACCAT 31567947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 TTCTGTGTCCACATAGCCATCACCTTTCTTCTTAGAGTGAATCAACTTCCCAGCTACCAT 2342

 31567948 TACGTCAAAGAACCCGGTGGCCTGGGGAGTTCCCTTGCTGCAGATGTCCAAAGTCCAGAG 31568007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 TACGTCAAAGAACCCGGTGGCCTGGGGAGTTCCCTTGCTGCAGATGTCCAAAGTCCAGAG 2402

 31568008 GAACTCATCTTCTTTTTCTTTTTTTTTCTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGCTGCCCAGGC 31568067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 GAACTCATCTTCTTTTTCTTTTTTTTTCTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGCTGCCCAGGC 2462

 31568068 TGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCGACCTCCTGGGTTCAAGTGATT 31568127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 TGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCGACCTCCTGGGTTCAAGTGATT 2522

 31568128 CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGTGCCAGGCTAA 31568187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGTGCCAGGCTAA 2582

 31568188 TTTTTTTTGTATTTTTAATACAAACGGTGTTTCATTATGTTGGCCAACATGGTCTCGAAC 31568247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 TTTTTTTTGTATTTTTAATACAAACGGTGTTTCATTATGTTGGCCAACATGGTCTCGAAC 2642

 31568248 TCCTGACCTCATGGTCTGCCCACCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACATGCGTGAGC 31568307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 TCCTGACCTCATGGTCTGCCCACCTTGGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACATGCGTGAGC 2702

 31568308 CACTGTGCCGGCCGGGGGAACTCATCTTCTAACTTCTTCTTGAGCTGAAGATACTTGGAC 31568367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 CACTGTGCCGGCCGGGGGAACTCATCTTCTAACTTCTTCTTGAGCTGAAGATACTTGGAC 2762

 31568368 TTGTAGCCTCAAGTGCCACATAAACCACTCGCGAGAGCCATGGCTCTGGGCTGCCACCCT 31568427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 TTGTAGCCTCAAGTGCCACATAAACCACTCGCGAGAGCCATGGCTCTGGGCTGCCACCCT 2822

 31568428 CGCTGGGGAGCAGAGACCTGGGTCACAGAGACCTCCTGCCTGGACGCATGAGGTCTGCAC 31568487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 CGCTGGGGAGCAGAGACCTGGGTCACAGAGACCTCCTGCCTGGACGCATGAGGTCTGCAC 2882

 31568488 CACAAATTTATTTAAAAAGGAATTTTATTCATTTAAAATATATGCATACAGTTGCTTACT 31568547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 CACAAATTTATTTAAAAAGGAATTTTATTCATTTAAAATATATGCATACAGTTGCTTACT 2942

 31568548 ATAATCTAGGCACTGTCTTAAGCATTTGTTTCCACCAGCTACACTAAATGACTCATCTAC 31568607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 ATAATCTAGGCACTGTCTTAAGCATTTGTTTCCACCAGCTACACTAAATGACTCATCTAC 3002

 31568608 ATCACCAGATTTCAGGAGAAATTAGATGCACTGCCAGAAGAAAAGGAAATACTTTAGATA 31568667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 ATCACCAGATTTCAGGAGAAATTAGATGCACTGCCAGAAGAAAAGGAAATACTTTAGATA 3062

 31568668 CTAGTTTTAGCAAAACATGGCATTAATACATTGCAGATGGAGCAGGATGTGAATTTACCT 31568727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 CTAGTTTTAGCAAAACATGGCATTAATACATTGCAGATGGAGCAGGATGTGAATTTACCT 3122

 31568728 ACAACTTCCACACTCTGTAACTGATGGATTTTGAGAAAAACTAGGAAAAAACAGTGACAA 31568787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 ACAACTTCCACACTCTGTAACTGATGGATTTTGAGAAAAACTAGGAAAAAACAGTGACAA 3182

 31568788 AGAATTCATTAAACCAAATTACTTTTTGACTATATATCTACTTGGCCACATAATTTTGCA 31568847
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 AGAATCCATTAAACCAAATTACTTTTTGACTATATATCTACTTGGCCACATAATTTTGCA 3242

 31568848 TATTAAACAGCAACTGTAGTTAAAATTATCTATCTCAGATAAGAATCTTTTTCTTTTTAG 31568907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 TATTAAACAGCAACTGTAGTTAAAATTATCTATCTCAGATAAGAATCTTTTTCTTTTTAG 3302

 31568908 TTTGTATGTATGTATGTATGTATGTATTTTGAGGCAGGGTCTCACTCTCTTACCTAGGCT 31568967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 TTTGTATGTATGTATGTATGTATGTATTTTGAGGCAGGGTCTCACTCTCTTACCTAGGCT 3362

 31568968 GGAGTGCTGGAGTGCGATCACAGCGCACCGAGGCTTTCCCTCCCAGGCTCAAGTGATCCT 31569027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 GGAGTGCTGGAGTGCGATCACAGCGCACCGAGGCTTTCCCTCCCAGGCTCAAGTGATCCT 3422

 31569028 CCCACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGTACACAGGCAAGGATCACCACATCTAGCTAATC 31569087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 CCCACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGTACACAGGCAAGGATCACCACATCTAGCTAATC 3482

 31569088 GTGTTACTTTGTGTAGTGACAGGTTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAACTCTTG 31569147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 GTGTTACTTTGTGTAGTGACAGGTTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTAGTCTCGAACTCTTG 3542

 31569148 GGCTCAAACAATCCTCCTGCCCCAGTCTCTCAAAGTGCTGGATTACAGGCATGAGCCTCT 31569207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 GGCTCAAACAATCCTCCTGCCCCAGTCTCTCAAAGTGCTGGATTACAGGCATGAGCCTCT 3602

 31569208 GTGCCCGGTCTTTTTTTATTTTAGGTATTTTTGTATTTATTTATTTTTGAGACGGAGTCT 31569267
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 GTGCCCGGTCTTTTTTTATTTTATGTATTTTTGTATTTATTTATTTTTGAGACGGAGTCT 3662

 31569268 TGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTTTCT 31569327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 TGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAAGCTCTTTCT 3722

 31569328 CCCGGGTTCACAACATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGATTGGGACTACAGGCGTCC 31569387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 CCCGGGTTCACAACATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAGTAGATTGGGACTACAGGCGTCC 3782

 31569388 GCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTTGACACGGGGTTTCACCGTGTTAG 31569447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 GCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTTGACACGGGGTTTCACCGTGTTAG 3842

 31569448 CCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTTGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTG 31569507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 CCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTTGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTG 3902

 31569508 GGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCGGCCGCCTTTTTTTTTATTAATAAGAGATGGAG 31569567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 GGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCGGCCGCCTTTTTTTTTATTAATAAGAGATGGAG 3962

 31569568 TTTTGCTTAATTGCCCAGGCTGGTGTGCAGTGGTCTGATCATGGCTCACTGCAGCCTTGA 31569627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 TTTTGCTTAATTGCCCAGGCTGGTGTGCAGTGGTCTGATCATGGCTCACTGCAGCCTTGA 4022

 31569628 ACTCCTGGACTAAAGCAATCTTCCTGTTCCAGCCTCCCCAGTACCTAGGACTACAAGCAT 31569687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 ACTCCTGGACTAAAGCAATCTTCCTGTTCCAGCCTCCCCAGTACCTAGGACTACAAGCAT 4082

 31569688 GTGCCACCACGCAGGGTGATTTTTAAAAATCTTTTTGGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCC 31569747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4083 GTGCCACCACGCAGGGTGATTTTTAAAAATCTTTTTGGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCC 4142

 31569748 TGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGAC 31569807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 TGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGAC 4202

 31569808 CATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAACTTAGCTGGGCA 31569867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4203 CATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAACTTAGCTGGGCA 4262

 31569868 TGGTGGCACACGCATGTAGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGTTTGAA 31569927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4263 TGGTGGCACACGCATGTAGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGTTTGAA 4322

 31569928 CCCAGGAGTCGGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATGGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAAC 31569987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 CCCAGGAGTCGGAGGTTGCAGCGAGCCAAGATGGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAAC 4382

 31569988 AGAGTGAGACTCCATCTTAAAAAAAAAAACAAAAAAAACTGTAGATATGTGGTCTTGCCA 31570047
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 AGAATGAGACTCCATCTTAAAAAAAAAAACAAAAAAAACTGTAGATATGTGGTCTTGCCA 4442

 31570048 TATTGGCCAGGCTGGTCTCAAAATCTTGATTGCCCAGGATGCCAAAAATCTTGTTATTTT 31570107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 TATTGGCCAGGCTGGTCTCAAAATCTTGATTGCCCAGGATGCCAAAAATCTTGTTATTTT 4502

 31570108 CTAGAATCTAATATGAGAACCATTGAATAATTACAACATATTTGCAACAATGATAATTTT 31570167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 CTAGAATCTAATATGAGAACCATTGAATAATTACAACATATTTGCAACAATGATAATTTT 4562

 31570168 CTATTACCTTATATTCAATATTTGATTTGTATAATTTTTACAGAATGATTTAATGCTTGT 31570227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 CTATTACCTTATATTCAATATTTGATTTGTATAATTTTTACAGAATGATTTAATGCTTGT 4622

 31570228 CATAATTGTTATTCTTTAAAAAAATTTTTTTGTAGAGCTCTTACTATGTTGCTGAGGCTG 31570287
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4623 CATAATTGTTATTCTTTAAAAAAATTTTTTTGTAGAGATCTTACTATGTTGCTGAGGCTG 4682

 31570288 GTCTGGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTCACCCTTCCAAAATGTTGGGATTA 31570347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 GTCTGGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCTGCCTCACCCTTCCAAAATGTTGGGATTA 4742

 31570348 TAGATGTGAGCCAGTTCTATGCCCAGGTATGCCCAGTCTTATAATTGTTATTCCCCAGAA 31570407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 TAGATGTGAGCCAGTTCTATGCCCAGGTATGCCCAGTCTTATAATTGTTATTCCCCAGAA 4802

 31570408 ATAATAAACTAACTTATATAATGTCTTACTGGAGGATGGAGCAACTTTTTGTAATTCTCT 31570467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4803 ATAATAAACTAACTTATATAATGTCTTACTGGAGGATGGAGCAACTTTTTGTAATTCTCT 4862

 31570468 AAAACAGGGATCAGCAAGTACAGGCCACAAGCTAAATTCTCAGCTTGCTTCCTGTTTTCT 31570527
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4863 AAAACAGGGATCAGCAAGTACAGGCCACAGGCTAAATTCTCAGCTTGCTTCCTGTTTTCT 4922

 31570528 TTTCTTTCTTTCTTCTTCTTTTTTTAATAGGCTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTGA 31570587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4923 TTTCTTTCTTTCTTCTTCTTTTTTTAATAGGCTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTGA 4982

 31570588 GATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGTTGGGGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCA 31570647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 GATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGTTGGGGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCA 5042

 31570648 GTCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTT 31570707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5043 GTCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGTT 5102

 31570708 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCCTGAACTCCTGACCTCAAGTGGTCTGCCCGCCTCGG 31570767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCCTGAACTCCTGACCTCAAGTGGTCTGCCCGCCTCGG 5162

 31570768 CCTCTCAAAGTGCCGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCGGCCTATTTATTTTTTGA 31570827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5163 CCTCTCAAAGTGCCGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCGGCCTATTTATTTTTTGA 5222

 31570828 GATGGAGTATTGCTCTCGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGC 31570887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5223 GATGGAGTATTGCTCTCGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTCGGCTCACTGC 5282

 31570888 AACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATT 31570947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5283 AACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATT 5342

 31570948 ACAGGCGTATGCCACCGTGCCTGACTAATTTTGTA-TTTTTTTTTTAATAGAGATGGGGT 31571006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     5343 ACAGGCGTATGCCACCGTGCCTGACTAATTTTGTATTTTTTTTTTTAATAGAGATGGGGT 5402

 31571007 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGA-TCCCCCCCCCAAC 31571065
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     5403 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATTCCCCCCCCCAAC 5462

 31571066 CTTGGCCTCCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAACTACCGCACCTGGAAGACAGGCTTT 31571125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5463 CTTGGCCTCCCAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAACTACCGCACCTGGAAGACAGGCTTT 5522

 31571126 ATTTTTTAAGATCAGTTTTAGGTTTGTGGCAAAATTGAGCAGAAGATACCATATTTCCTG 31571185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     5523 ATTTTTTAAGATCAGTTTTAGGTTTGTGGCAAAATTGAGCAGAAGAAACCATATTTCCTG 5582

 31571186 TATACTTCCTACCCCTATACATGAATAGCCTCCTCCGTTTTCAATATATCCCCCATCAGA 31571245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5583 TATACTTCCTACCCCTATACATGAATAGCCTCCTCCGTTTTCAATATATCCCCCATCAGA 5642

 31571246 GTGGTACATTTGTGACAACTGATGAATCTACATTGACACGTCATTACCACCTGACTCCCT 31571305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5643 GTGGTACATTTGTGACAACTGATGAATCTACATTGACACGTCATTACCACCTGACTCCCT 5702

 31571306 GTTTTTGTAGGACCCCTGCAAGCCAAGAATGATTGTAACATTTTTAAAGGTGGGGAAAAA 31571365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5703 GTTTTTGTAGGACCCCTGCAAGCCAAGAATGATTGTAACATTTTTAAAGGTGGGGAAAAA 5762

 31571366 ACTTTAAGAGTACTATTTCTTGACATTTTTCTGCAAATGATATGAAATTCAAATTTCAGT 31571425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5763 ACTTTAAGAGTACTATTTCTTGACATTTTTCTGCAAATGATATGAAATTCAAATTTCAGT 5822

 31571426 GTCCATAAATAAAGTTTTGTTGGAACACAGTCAGACCCAGTTGATTAAGTAGTGCCTGTG 31571485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5823 GTCCATAAATAAAGTTTTGTTGGAACACAGTCAGACCCAGTTGATTAAGTAGTGCCTGTG 5882

 31571486 GCTCCTTTTGTGCCCCACAGCTGAGTTGAGTAGGTACCACCATGACCATATGGCCTACAA 31571545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5883 GCTCCTTTTGTGCCCCACAGCTGAGTTGAGTAGGTACCACCATGACCATATGGCCTACAA 5942

 31571546 AGCCTTTGGGAGGCCGAAGTAGGCAGACCAGTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGG 31571605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5943 AGCCTTTGGGAGGCCGAAGTAGGCAGACCAGTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGG 6002

 31571606 CCAACATGGTGGCCATGCTCTCCAGCCTGTGTGACAGAGGCTGGATCATAGTTCACTGCA 31571665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6003 CCAACATGGTGGCCATGCTCTCCAGCCTGTGTGACAGAGGCTGGATCATAGTTCACTGCA 6062

 31571666 ACCTTGAACTCCCACCTTGATCCTCCCACCTCAGTCTCCCACGTAGCTGGGACCAGGCAC 31571725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6063 ACCTTGAACTCCCACCTTGATCCTCCCACCTCAGTCTCCCACGTAGCTGGGACCAGGCAC 6122

 31571726 ACGCCACAGTGCCCAGACAATTTTTTTTTTTATTTTTTGAGATGGAGTTTCGTTCTTGTT 31571785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6123 ACGCCACAGTGCCCAGACAATTTTTTTTTTTATTTTTTGAGATGGAGTTTCGTTCTTGTT 6182

 31571786 GCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTC 31571845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6183 GCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTC 6242

 31571846 AAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGATTACAGGCACGCTCCACCACGC 31571905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6243 AAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGATTACAGGCACGCTCCACCACGC 6302

 31571906 CCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGAAGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTC 31571965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6303 CCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGAAGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTC 6362

 31571966 GAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACAGGT 31572025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6363 GAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCTCCTCAGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACAGGT 6422

 31572026 GTGAGCCACTGTGCCAGCCAATTTTTTTATTTTTTGTAGAGACTGGATCTCACTTTGTTC 31572085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6423 GTGAGCCACTGTGCCAGCCAATTTTTTTATTTTTTGTAGAGACTGGATCTCACTTTGTTC 6482

 31572086 CCCAGGCTGGTCTTGAACTCCAAGGCTTAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCACAAAATG 31572145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6483 CCCAGGCTGGTCTTGAACTCCAAGGCTTAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCACAAAATG 6542

 31572146 CTGGGATTATAGGAGAGAGCCACTACACGCAGCTATGTGTTCCTGAATTTGCCAACCTCT 31572205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6543 CTGGGATTATAGGAGAGAGCCACTACACGCAGCTATGTGTTCCTGAATTTGCCAACCTCT 6602

 31572206 CCCTTTGACTCTCAGGACCCAAATTCTTGGCTCTCCAATCAGGTATGTCCTCTTCCCATT 31572265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6603 CCCTTTGACTCTCAGGACCCAAATTCTTGGCTCTCCAATCAGGTATGTCCTCTTCCCATT 6662

 31572266 CCTGCACCCCTGCCCTTGCCATTCTGGTAAATAGAAATAGGTCACGTTCTACTGAGAGGC 31572325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6663 CCTGCACCCCTGCCCTTGCCATTCTGGTAAATAGAAATAGGTCACGTTCTACTGAGAGGC 6722

 31572326 CTCTGGAGAGTGGCAAGGCCTGCCCTACTCCCTGCCTTCCCCACAGGCTTAACTGAAGGG 31572385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6723 CTCTGGAGAGTGGCAAGGCCTGCCCTACTCCCTGCCTTCCCCACAGGCTTAACTGAAGGG 6782

 31572386 ACCCATGATAAACCCCCAAGGGCCAAGATTTCCTCACAATTTACTTTCCATAGTCTGCAT 31572445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6783 ACCCATGATAAACCCCCAAGGGCCAAGATTTCCTCACAATTTACTTTCCATAGTCTGCAT 6842

 31572446 TAAGAACAAAGTTAGAGTTTTGTTTTGCATTTTCCAAAGAAAAATGCTGTTGTAATATGT 31572505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6843 TAAGAACAAAGTTAGAGTTTTGTTTTGCATTTTCCAAAGAAAAATGCTGTTGTAATATGT 6902

 31572506 AATATTCTTTTACAAATTGTTCACTCATGCGGGGAATACTGCTACACGCCCTTCCTTTCT 31572565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6903 AATATTCTTTTACAAATTGTTCACTCATGCGGGGAATACTGCTACACGCCCTTCCTTTCT 6962

 31572566 CTCCCTTTTTCCTCCTCCCTTCCCCTGCTTTCCTTGGGCACATTTCTTGTATCTTACTTT 31572625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6963 CTCCCTTTTTCCTCCTCCCTTCCCCTGCTTTCCTTGGGCACATTTCTTGTATCTTACTTT 7022

 31572626 CCCCAGGTCAGAAGCAGGCTGTTGGAGGGCCCAGTTGGCAACTTCTCCACCTGAGAGGCC 31572685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7023 CCCCAGGTCAGAAGCAGGCTGTTGGAGGGCCCAGTTGGCAACTTCTCCACCTGAGAGGCC 7082

 31572686 CCAGAGCCTGCCCAGGGTGGACAGCAGTTAATGTTTAATGAGTGAGTGAATGAATACATT 31572745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7083 CCAGAGCCTGCCCAGGGTGGACAGCAGTTAATGTTTAATGAGTGAGTGAATGAATACATT 7142

 31572746 TTAAAAGGTATGAAGGCCAGGCCTGGTGCCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTCAGGAGG 31572805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7143 TTAAAAGGTATGAAGGCCAGGCCTGGTGCCTCACGCCTGTAATCCTAGCACTTCAGGAGG 7202

 31572806 CCCAGGTGGGCAGATCACTTGAGCCTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAGCAATAGGGA 31572865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7203 CCCAGGTGGGCAGATCACTTGAGCCTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAGCAATAGGGA 7262

 31572866 GTCCCCTGACTCTACAGATAATTTTTTTTTTGAGACGGATTCTTGCACTGTTGCCTGGGC 31572925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7263 GTCCCCTGACTCTACAGATAATTTTTTTTTTGAGACGGATTCTTGCACTGTTGCCTGGGC 7322

 31572926 TGGAGTGCAATGGCATGATCTCAGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATT 31572985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7323 TGGAGTGCAATGGCATGATCTCAGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATT 7382

 31572986 CTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCACACCTGGCTAA 31573045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7383 CTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACACCACCACACCTGGCTAA 7442

 31573046 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTCCAGTG 31573105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7443 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTCCAGTG 7502

 31573106 GCACGATCTCGGCTCACTGCAAGCGTTGCCTCCCGACATCCGGCTAATTTTTTTTGCATT 31573165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7503 GCACGATCTCGGCTCACTGCAAGCGTTGCCTCCCGACATCCGGCTAATTTTTTTTGCATT 7562

 31573166 TTTAGTAGACACAGGGATTTACTATGTTGGCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATG 31573225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7563 TTTAGTAGACACAGGGATTTACTATGTTGGCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATG 7622

 31573226 ATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGC 31573285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7623 ATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGC 7682

 31573286 CCAGATAATAAAAATTAGCCGGATATAGTGGCACATACCTCTAGTCCTAGCTACTTGGGA 31573345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7683 CCAGATAATAAAAATTAGCCGGATATAGTGGCACATACCTCTAGTCCTAGCTACTTGGGA 7742

 31573346 GGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCTCGGAAGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGT 31573405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7743 GGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCTCGGAAGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGT 7802

 31573406 GCCACTATACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCATGTTTCAGAAAAAAAAGGAAAAA 31573465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7803 GCCACTATACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCATGTTTCAGAAAAAAAAGGAAAAA 7862

 31573466 GATAAAAAATATAAAGGAAATTGGGGAACTATGCTGTCTCCCCGGGGACCTTTCTGCTGA 31573525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7863 GATAAAAAATATAAAGGAAATTGGGGAACTATGCTGTCTCCCCGGGGACCTTTCTGCTGA 7922

 31573526 GTCAAGGTGGCCTCTCTGGGCAGTAGGATGAAGCCCGACTCTCTGGTCAACTCATTGTTC 31573585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7923 GTCAAGGTGGCCTCTCTGGGCAGTAGGATGAAGCCCGACTCTCTGGTCAACTCATTGTTC 7982

 31573586 ACGAAGTCCTTTCCCACAGCAGCTGAGGGACAAAGTCACAGTCCCTGCCCAGTCCTCTGC 31573645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7983 ACGAAGTCCTTTCCCACAGCAGCTGAGGGACAAAGTCACAGTCCCTGCCCAGTCCTCTGC 8042

 31573646 ACCAGCCACCCCTCTGGTTTAACCTGTCCCAGGTCTTCCCCCTTGACTACACCCTCTAAA 31573705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8043 ACCAGCCACCCCTCTGGTTTAACCTGTCCCAGGTCTTCCCCCTTGACTACACCCTCTAAA 8102

 31573706 TCCTAGAGTGGGGAGAGAATGAAGATGTGAGGTGACAGATGAGGTCTCTTCCCCAGCCAG 31573765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8103 TCCTAGAGTGGGGAGAGAATGAAGATGTGAGGTGACAGATGAGGTCTCTTCCCCAGCCAG 8162

 31573766 AGGGTGCAGAAAGCCCCAACATAACACATGTCCTGAAACCCAAAGAGAAGACAGAAATTG 31573825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8163 AGGGTGCAGAAAGCCCCAACATAACACATGTCCTGAAACCCAAAGAGAAGACAGAAATTG 8222

 31573826 TCAGCAAAGGTTAGCTAGCTCCTGAGGTCATAAGCAACCTTATTTTTATTTTGTGTTCCC 31573885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8223 TCAGCAAAGGTTAGCTAGCTCCTGAGGTCATAAGCAACCTTATTTTTATTTTGTGTTCCC 8282

 31573886 AAATGTGTTGTCTGGAACATGTATACATATTACGTATTAAAGCAAAAGCAAAATCAGAAT 31573945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8283 AAATGTGTTGTCTGGAACATGTATACATATTACGTATTAAAGCAAAAGCAAAATCAGAAT 8342

 31573946 AAATATTGTCTTCCAAGTTGTCTTTGTGTGTGTTTTGGTTTTGTGGTTTATTCCTCTTTC 31574005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8343 AAATATTGTCTTCCAAGTTGTCTTTGTGTGTGTTTTGGTTTTGTGGTTTATTCCTCTTTC 8402

 31574006 TTTTCAGTTGGATAGAAGCCAGGCTCCTTTCTCCCAGCACACGCACAGACTCAGCACACA 31574065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8403 TTTTCAGTTGGATAGAAGCCAGGCTCCTTTCTCCCAGCACACGCACAGACTCAGCACACA 8462

 31574066 CAGAAACCCCAGGAATTAAATGACTCTCCAAAATGATAAGTAGGAAGAAGGGGGTGGGGT 31574125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8463 CAGAAACCCCAGGAATTAAATGACTCTCCAAAATGATAAGTAGGAAGAAGGGGGTGGGGT 8522

 31574126 AGAGAGGGAGGAAGGGGGAGAGAGGAGGCCTTTTCCCCTGACCTGGGGAGGAGCCCTAGT 31574185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8523 AGAGAGGGAGGAAGGGGGAGAGAGGAGGCCTTTTCCCCTGACCTGGGGAGGAGCCCTAGT 8582

 31574186 CCAGGAGAGGTCAGGGTGTGCAAAGGCCTCTGGGTAGGAATAGGAACAGGGCCATTGGCC 31574245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8583 CCAGGAGAGGTCAGGGTGTGCAAAGGCCTCTGGGTAGGAATAGGAACAGGGCCATTGGCC 8642

 31574246 AAGTGCCCTCTGCTCTGTTACTCCCAGAGCCGGCTCCTACCCTCAGGCCTGGGAGCCCGC 31574305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8643 AAGTGCCCTCTGCTCTGTTACTCCCAGAGCCGGCTCCTACCCTCAGGCCTGGGAGCCCGC 8702

 31574306 CGTCTGCTAGTAAGGGGCTTCAGGAGTTGGGGGAGTGCAGATGAGGAGTAGCTCTCTTTT 31574365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8703 CGTCTGCTAGTAAGGGGCTTCAGGAGTTGGGGGAGTGCAGATGAGGAGTAGCTCTCTTTT 8762

 31574366 TCTCACATTCCCTCTTAAACCTCAGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTAAAGAAATGATTCTA 31574425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8763 TCTCACATTCCCTCTTAAACCTCAGTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTAAAGAAATGATTCTA 8822

 31574426 AAATTAGCCAGGTGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAAATGTGTTTCTACTTGGGAGGC 31574485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8823 AAATTAGCCAGGTGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAAATGTGTTTCTACTTGGGAGGC 8882

 31574486 TGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCTGGGAGGTTCAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCAGGCC 31574545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8883 TGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCTGGGAGGTTCAGGCTGCAGTGAGCTGAGATCAGGCC 8942

 31574546 ACTGCACTCCAGCTGGGGAGACAGAGGGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAATA 31574605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8943 ACTGCACTCCAGCTGGGGAGACAGAGGGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAATA 9002

 31574606 ATTTTTGTCCTTTTTCTATAAGCATCTTTTAAAACTTTTTTCCAGGCAGGGAGCGGTGTC 31574665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9003 ATTTTTGTCCTTTTTCTATAAGCATCTTTTAAAACTTTTTTCCAGGCAGGGAGCGGTGTC 9062

 31574666 TCACGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTTAGGA 31574725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9063 TCACGCCTATAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATAACCTGAGGTTAGGA 9122

 31574726 GTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAG 31574785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9123 GTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAG 9182

 31574786 CTGGGCATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATC 31574845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9183 CTGGGCATGGTGGCGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATC 9242

 31574846 TCTTGAACCCGGGAGGTGAGCCGAGATTGCGCTATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAG 31574905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9243 TCTTGAACCCGGGAGGTGAGCCGAGATTGCGCTATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAG 9302

 31574906 CGAAACTGTCTAAAAAAGAAAAAAGGCAGCATTTTGGGAGGTGGAGGTGAGAGGACAGGA 31574965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9303 CGAAACTGTCTAAAAAAGAAAAAAGGCAGCATTTTGGGAGGTGGAGGTGAGAGGACAGGA 9362

 31574966 GTTTGAGACCAGCCTGGCCAATGTGATGAAACCCCATCTCTATTAAAAACACAAAAATTA 31575025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9363 GTTTGAGACCAGCCTGGCCAATGTGATGAAACCCCATCTCTATTAAAAACACAAAAATTA 9422

 31575026 GCCGGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT 31575085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9423 GCCGGGTGTGGTGGTGCACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT 9482

 31575086 TGCTTGAACCTGGGAGGCG 31575104
          |||||||||||||||||||
     9483 TGCTTGAACCTGGGAGGCG 9501

Alignment time is 7.51864 s

