
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3474] =>      3474 nucs 'mol-32-1f00-144656_3474'

Score:        3452
Aligned:      3474        nucs
Identic:      3472 (100%) nucs =>       171 (100%)      3301 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229373026,229373196] EXCISED REGION [229373198,229376499]
 second seq =>  [        1,      171] EXCISED REGION [      173,     3474]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [229373197,229373197]
 second seq =>         1 nucs [172,172]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2859,2859]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [170,171] to [171,172]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229373026 AGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTG 229373085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTG 60

229373086 ACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTC 229373145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTC 120

229373146 CTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATT 229373196
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATT 171

EXCISED REGION

229373198 GGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAA 229373257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      173 GGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAA 232

229373258 GGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACC 229373317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      233 GGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACC 292

229373318 TGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTG 229373377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      293 TGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTG 352

229373378 ACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGTGAATAAACATATACAAATGTCCAAG 229373437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      353 ACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGTGAATAAACATATACAAATGTCCAAG 412

229373438 CTCACCAATACAGAAAAAAAAAAAAAACACAGCTCAATAACATTTTTCATTTATCAGTCT 229373497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      413 CTCACCAATACAGAAAAAAAAAAAAAACACAGCTCAATAACATTTTTCATTTATCAGTCT 472

229373498 GGCAAAGAGTTTCAAAATTTTTTAACAGCCAGTGGTGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTC 229373557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      473 GGCAAAGAGTTTCAAAATTTTTTAACAGCCAGTGGTGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTC 532

229373558 ACACACGGGGATGGAAGTTACTTTGGAAATAAGTTAAACGCTTTAACTCACACACACCCA 229373617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      533 ACACACGGGGATGGAAGTTACTTTGGAAATAAGTTAAACGCTTTAACTCACACACACCCA 592

229373618 TTGTTCGTTTTTGGAATTATCCAAAGGAAATATAGTGGATCCATGCAAAGACAGCAATTT 229373677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 TTGTTCGTTTTTGGAATTATCCAAAGGAAATATAGTGGATCCATGCAAAGACAGCAATTT 652

229373678 CAAGAGGCTCATCACAGGGTTATTTTTGATAGAAAAACCTAACAGTCCAACAATAGGATG 229373737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 CAAGAGGCTCATCACAGGGTTATTTTTGATAGAAAAACCTAACAGTCCAACAATAGGATG 712

229373738 CTGGTTAAATAAGGTATGATATACCCATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAA 229373797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
      713 CTGGTTAAATAAGGTATGATATACCCATCCATTCTGAAATGCTGT-AAAAAAAAAAAAAA 771

229373798 AAAAGTATTTAATGGCATGAAAAATGTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTAT 229373857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 AAAAGTATTTAATGGCATGAAAAATGTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTAT 831

229373858 AAACAATATGCAAAGTGTGTGAATATATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAAT 229373917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 AAACAATATGCAAAGTGTGTGAATATATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAAT 891

229373918 GTCAAAGACAGAATTACAACAAATTTTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGA 229373977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 GTCAAAGACAGAATTACAACAAATTTTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGA 951

229373978 ATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAAATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAAC 229374037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 ATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAAATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAAC 1011

229374038 CGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAAGGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAAC 229374097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 CGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAAGGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAAC 1071

229374098 ATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTGTAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATAT 229374157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 ATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTGTAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATAT 1131

229374158 ACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAATCTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAA 229374217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 ACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAATCTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAA 1191

229374218 ATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTAGTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCA 229374277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 ATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTAGTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCA 1251

229374278 TTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGAGCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCT 229374337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 TTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGAGCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCT 1311

229374338 CTCATAATTTTTGTTTAATGATAGAAAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGG 229374397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 CTCATAATTTTTGTTTAATGATAGAAAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGG 1371

229374398 AATATGGGATATTTAAATTTTCTTCCTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAA 229374457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 AATATGGGATATTTAAATTTTCTTCCTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAA 1431

229374458 TGAATACTCATTACTGCTGGATTAAGAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACA 229374517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 TGAATACTCATTACTGCTGGATTAAGAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACA 1491

229374518 AAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGCAGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAA 229374577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 AAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGCAGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAA 1551

229374578 GCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTCAGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCC 229374637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 GCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTCAGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCC 1611

229374638 CTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGAAAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGA 229374697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 CTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGAAAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGA 1671

229374698 CAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATGCTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATT 229374757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 CAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATGCTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATT 1731

229374758 TTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCACAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTAC 229374817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 TTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCACAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTAC 1791

229374818 TCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACATGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCC 229374877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 TCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACATGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCC 1851

229374878 AGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCATGCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATG 229374937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 AGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCATGCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATG 1911

229374938 AGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCTGGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTG 229374997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 AGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCTGGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTG 1971

229374998 TGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCCACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGC 229375057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 TGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCCACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGC 2031

229375058 TCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGACAGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCT 229375117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 TCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGACAGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCT 2091

229375118 TGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCACCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTC 229375177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 TGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCACCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTC 2151

229375178 TGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCCAAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCA 229375237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 TGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCCAAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCA 2211

229375238 CATGGATGAACTGAAGGATGGTGAAGGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCT 229375297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 CATGGATGAACTGAAGGATGGTGAAGGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCT 2271

229375298 CAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGGGATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGA 229375357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 CAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGGGATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGA 2331

229375358 TTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCATCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTC 229375417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 TTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCATCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTC 2391

229375418 TGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCCATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATA 229375477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 TGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCCATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATA 2451

229375478 GGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGCCGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGG 229375537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 GGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGCCGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGG 2511

229375538 TAAAAAGACATTATTCATAAAGAACCAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCT 229375597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 TAAAAAGACATTATTCATAAAGAACCAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCT 2571

229375598 CACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTTATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGT 229375657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 CACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTTATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGT 2631

229375658 GGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGTTTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCAT 229375717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 GGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGTTTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCAT 2691

229375718 CTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTAT 229375777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 CTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTAT 2751

229375778 TTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGA 229375837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 TTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGA 2811

229375838 GGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGAAACAGTACGAGACTGCCTC-AAAAAAAAAAAA 229375896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     2812 GGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGAAACAGTACGAGACTGCCTCAAAAAAAAAAAAA 2871

229375897 AAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGGGCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGTG 229375956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 AAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGGGCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGTG 2931

229375957 GGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGTCTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATCA 229376016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 GGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGTCTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATCA 2991

229376017 ATGAGATCTTACCAATATCTCTGAACCCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGCT 229376076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 ATGAGATCTTACCAATATCTCTGAACCCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGCT 3051

229376077 AACCTACAGTATTAATACTTCAGTCCACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGTG 229376136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 AACCTACAGTATTAATACTTCAGTCCACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGTG 3111

229376137 AGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGAGAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAAT 229376196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 AGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGAGAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAAT 3171

229376197 TAGACACTTTCAGCACCTAACATACAGGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAGT 229376256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 TAGACACTTTCAGCACCTAACATACAGGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAGT 3231

229376257 ACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCAGCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAGCTGTTCTCA 229376316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 ACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCAGCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAGCTGTTCTCA 3291

229376317 AAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTTTTGCTATTGTCCTGAAGTAGCAATCCCATGATGG 229376376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3292 AAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTTTTGCTATTGTCCTGAAGTAGCAATCCCATGATGG 3351

229376377 AAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCGTGGCTACATTATAATGGACTTGGTGAGCATGCAC 229376436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3352 AAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCGTGGCTACATTATAATGGACTTGGTGAGCATGCAC 3411

229376437 TGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAGTGGACATAGGGGCCCATCAACCCTGCTCCAGCCA 229376496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3412 TGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAGTGGACATAGGGGCCCATCAACCCTGCTCCAGCCA 3471

229376497 GCA 229376499
          |||
     3472 GCA 3474

Alignment time is 2.69891 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2349] =>      2349 nucs 'mol-32-208c-091017_2349'

Score:        2327
Aligned:      2351        nucs
Identic:      2348 (100%) nucs =>       819 (100%)      1529 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229372570,229373388] EXCISED REGION [229373763,229375294]
 second seq =>  [        1,      819] EXCISED REGION [      820,     2349]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [229373389,229373762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229372570 ATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAA 229372629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAA 60

229372630 AGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAA 229372689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAA 120

229372690 AATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGAC 229372749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGAC 180

229372750 AGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGG 229372809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGG 240

229372810 AGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAA 229372869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAA 300

229372870 CATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGA 229372929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGA 360

229372930 ATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAG 229372989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAG 420

229372990 TCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGG 229373049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGG 480

229373050 CTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTAT 229373109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTAT 540

229373110 TACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAA 229373169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAA 600

229373170 GGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTG 229373229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTG 660

229373230 AGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGG 229373289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGG 720

229373290 TGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAA 229373349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAA 780

229373350 AACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 229373388
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 819

EXCISED REGION

229373763 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 229373822
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 CATCCATTCTGAAATGCTGT--AAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 877

229373823 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 229373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      878 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 937

229373883 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 229373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      938 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 997

229373943 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 229374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 1057

229374003 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 229374062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 1117

229374063 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 229374122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 1177

229374123 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 229374182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 1237

229374183 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 229374242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 1297

229374243 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 229374302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 1357

229374303 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 229374362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 1417

229374363 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 229374422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 1477

229374423 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 229374482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 1537

229374483 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 229374542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 1597

229374543 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 229374602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1598 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTGAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 1657

229374603 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 229374662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 1717

229374663 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 229374722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 1777

229374723 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 229374782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 1837

229374783 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 229374842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 1897

229374843 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 229374902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 1957

229374903 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 229374962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 2017

229374963 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 229375022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 2077

229375023 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 229375082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 2137

229375083 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 229375142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 2197

229375143 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 229375202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 2257

229375203 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 229375262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 2317

229375263 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGAC 229375294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGAC 2349

Alignment time is 1.81768 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     4068] =>      4068 nucs 'mol-32-2378-027369_4068'

Score:        4057
Aligned:      4068        nucs
Identic:      4067 (100%) nucs =>      1826 (100%)      2241 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229371371,229373196] EXCISED REGION [229373198,229375439]
 second seq =>  [        1,     1826] EXCISED REGION [     1828,     4068]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [229373197,229373197]
 second seq =>         1 nucs [1827,1827]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [229373783,229373783]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1825,1826] to [1826,1827]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229371371 ATGTGATAAAGAGGCATCTGATGTACCTGCTTCTAGCATACAAGAAAACATATTTCTTGA 229371430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTGATAAAGAGGCATCTGATGTACCTGCTTCTAGCATACAAGAAAACATATTTCTTGA 60

229371431 GCATGCTGTTACATGCTTGACACTTTATATACACTATTTCATTTAACATCCCAACAATCC 229371490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCATGCTGTTACATGCTTGACACTTTATATACACTATTTCATTTAACATCCCAACAATCC 120

229371491 TAAAACCTGGGTTTTGTTATTGAAGAACCCAAGGCTCTGAGAGTTAACTAACTTGCCCAA 229371550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAAACCTGGGTTTTGTTATTGAAGAACCCAAGGCTCTGAGAGTTAACTAACTTGCCCAA 180

229371551 GGTCACACAGTTAGCAAGTTGTGTGGGCAGGATATAAGCCCAGTCTGGCTGCAAAGCTAT 229371610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTCACACAGTTAGCAAGTTGTGTGGGCAGGATATAAGCCCAGTCTGGCTGCAAAGCTAT 240

229371611 GTTCTTTACACTGTAACTTACTCCTGAAGGAAGGAGGCTTAAAAATAATCCATGCAGAAT 229371670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTCTTTACACTGTAACTTACTCCTGAAGGAAGGAGGCTTAAAAATAATCCATGCAGAAT 300

229371671 TTGTATCAGCTTGATATGTGTGCCTTATTATTATTATTATTATTATTATTTTGAGACGGA 229371730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTATCAGCTTGATATGTGTGCCTTATTATTATTATTATTATTATTATTTTGAGACGGA 360

229371731 GTCTTACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGGGGCGTAATCTCGGCTCACTGCAACCTCC 229371790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCTTACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGGGGCGTAATCTCGGCTCACTGCAACCTCC 420

229371791 ACCTCCTGGGTTCAAGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTATGGGCG 229371850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCTCCTGGGTTCAAGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTATGGGCG 480

229371851 CCCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACCGGGTTG 229371910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACCGGGTTG 540

229371911 GCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTG 229371970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTG 600

229371971 CTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGATTGCCATATTATTTTAATAGAATAGGA 229372030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGATTGCCATATTATTTTAATAGAATAGGA 660

229372031 TAGGACAAAACTTAGAAGGTATTGGATACCATTTTCCCTGTTGAAGGAGTATTGGTAAGA 229372090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGGACAAAACTTAGAAGGTATTGGATACCATTTTCCCTGTTGAAGGAGTATTGGTAAGA 720

229372091 CACCGTCAAAGAGAAATGCACCGCGTACACACGAAGAGGAACCATTTGTAGGTGGTACAT 229372150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACCGTCAAAGAGAAATGCACCGCGTACACACGAAGAGGAACCATTTGTAGGTGGTACAT 780

229372151 AAAAGGGTAAAAAATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 229372210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAAGGGTAAAAAATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 840

229372211 GGCCGAGGTGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAA 229372270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCCGAGGTGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAA 900

229372271 ACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTC 229372330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTC 960

229372331 CAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGT 229372390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGT 1020

229372391 GAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAA 229372450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAA 1080

229372451 CAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATT 229372510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATT 1140

229372511 AGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGA 229372570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGA 1200

229372571 TCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAA 229372630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAA 1260

229372631 GCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAA 229372690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAA 1320

229372691 ATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACA 229372750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACA 1380

229372751 GAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGA 229372810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGA 1440

229372811 GTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAAC 229372870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAAC 1500

229372871 ATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAA 229372930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAA 1560

229372931 TGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGT 229372990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGT 1620

229372991 CAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGC 229373050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGC 1680

229373051 TTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATT 229373110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATT 1740

229373111 ACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAG 229373170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAG 1800

229373171 GAAATATGTTAGGGACTCTGCACATT 229373196
          ||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAAATATGTTAGGGACTCTGCACATT 1826

EXCISED REGION

229373198 GGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAA 229373257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 GGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAA 1887

229373258 GGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACC 229373317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 GGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACC 1947

229373318 TGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTG 229373377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 TGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTG 2007

229373378 ACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGTGAATAAACATATACAAATGTCCAAG 229373437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 ACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGTGAATAAACATATACAAATGTCCAAG 2067

229373438 CTCACCAATACAGAAAAAAAAAAAAAACACAGCTCAATAACATTTTTCATTTATCAGTCT 229373497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 CTCACCAATACAGAAAAAAAAAAAAAACACAGCTCAATAACATTTTTCATTTATCAGTCT 2127

229373498 GGCAAAGAGTTTCAAAATTTTTTAACAGCCAGTGGTGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTC 229373557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 GGCAAAGAGTTTCAAAATTTTTTAACAGCCAGTGGTGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTC 2187

229373558 ACACACGGGGATGGAAGTTACTTTGGAAATAAGTTAAACGCTTTAACTCACACACACCCA 229373617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 ACACACGGGGATGGAAGTTACTTTGGAAATAAGTTAAACGCTTTAACTCACACACACCCA 2247

229373618 TTGTTCGTTTTTGGAATTATCCAAAGGAAATATAGTGGATCCATGCAAAGACAGCAATTT 229373677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 TTGTTCGTTTTTGGAATTATCCAAAGGAAATATAGTGGATCCATGCAAAGACAGCAATTT 2307

229373678 CAAGAGGCTCATCACAGGGTTATTTTTGATAGAAAAACCTAACAGTCCAACAATAGGATG 229373737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 CAAGAGGCTCATCACAGGGTTATTTTTGATAGAAAAACCTAACAGTCCAACAATAGGATG 2367

229373738 CTGGTTAAATAAGGTATGATATACCCATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAA 229373797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     2368 CTGGTTAAATAAGGTATGATATACCCATCCATTCTGAAATGCTGT-AAAAAAAAAAAAAA 2426

229373798 AAAAGTATTTAATGGCATGAAAAATGTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTAT 229373857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 AAAAGTATTTAATGGCATGAAAAATGTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTAT 2486

229373858 AAACAATATGCAAAGTGTGTGAATATATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAAT 229373917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 AAACAATATGCAAAGTGTGTGAATATATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAAT 2546

229373918 GTCAAAGACAGAATTACAACAAATTTTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGA 229373977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 GTCAAAGACAGAATTACAACAAATTTTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGA 2606

229373978 ATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAAATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAAC 229374037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 ATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAAATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAAC 2666

229374038 CGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAAGGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAAC 229374097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 CGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAAGGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAAC 2726

229374098 ATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTGTAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATAT 229374157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 ATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTGTAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATAT 2786

229374158 ACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAATCTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAA 229374217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 ACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAATCTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAA 2846

229374218 ATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTAGTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCA 229374277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 ATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTAGTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCA 2906

229374278 TTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGAGCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCT 229374337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 TTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGAGCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCT 2966

229374338 CTCATAATTTTTGTTTAATGATAGAAAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGG 229374397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 CTCATAATTTTTGTTTAATGATAGAAAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGG 3026

229374398 AATATGGGATATTTAAATTTTCTTCCTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAA 229374457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 AATATGGGATATTTAAATTTTCTTCCTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAA 3086

229374458 TGAATACTCATTACTGCTGGATTAAGAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACA 229374517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 TGAATACTCATTACTGCTGGATTAAGAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACA 3146

229374518 AAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGCAGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAA 229374577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 AAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGCAGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAA 3206

229374578 GCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTCAGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCC 229374637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 GCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTCAGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCC 3266

229374638 CTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGAAAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGA 229374697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 CTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGAAAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGA 3326

229374698 CAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATGCTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATT 229374757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 CAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATGCTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATT 3386

229374758 TTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCACAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTAC 229374817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 TTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCACAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTAC 3446

229374818 TCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACATGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCC 229374877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 TCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACATGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCC 3506

229374878 AGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCATGCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATG 229374937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 AGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCATGCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATG 3566

229374938 AGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCTGGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTG 229374997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 AGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCTGGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTG 3626

229374998 TGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCCACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGC 229375057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 TGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCCACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGC 3686

229375058 TCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGACAGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCT 229375117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 TCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGACAGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCT 3746

229375118 TGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCACCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTC 229375177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 TGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCACCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTC 3806

229375178 TGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCCAAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCA 229375237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 TGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCCAAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCA 3866

229375238 CATGGATGAACTGAAGGATGGTGAAGGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCT 229375297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 CATGGATGAACTGAAGGATGGTGAAGGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCT 3926

229375298 CAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGGGATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGA 229375357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 CAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGGGATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGA 3986

229375358 TTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCATCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTC 229375417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 TTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCATCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTC 4046

229375418 TGGCCATCTCCCCCAAAGTTCA 229375439
          ||||||||||||||||||||||
     4047 TGGCCATCTCCCCCAAAGTTCA 4068

Alignment time is 3.02276 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3317] =>      3317 nucs 'mol-32-2874-091638_3317'

Score:        3262
Aligned:      3332        nucs
Identic:      3315 ( 99%) nucs =>       801 (100%)      2514 ( 99%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229372588,229373388] EXCISED REGION [229373763,229376293]
 second seq =>  [        1,      801] EXCISED REGION [      802,     3317]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [229373389,229373762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229372588 AAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTATA 229372647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTATA 60

229372648 TGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATTA 229372707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATTA 120

229372708 AAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAG 229372767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAG 180

229372768 TGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTT 229372827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTT 240

229372828 GTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTCTGA 229372887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTCTGA 300

229372888 CCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAA 229372947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAA 360

229372948 GGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGT 229373007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGT 420

229373008 CAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATG 229373067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATG 480

229373068 ATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGT 229373127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGT 540

229373128 TCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACT 229373187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACT 600

229373188 CTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATT 229373247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATT 660

229373248 GCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAG 229373307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAG 720

229373308 TAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTT 229373367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTT 780

229373368 AAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 229373388
          |||||||||||||||||||||
      781 AAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 801

EXCISED REGION

229373763 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 229373822
          ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      802 CATCCATTCTGAAATGCTGT---AAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 858

229373823 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 229373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 918

229373883 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 229373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 978

229373943 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 229374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 1038

229374003 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 229374062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 1098

229374063 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 229374122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 1158

229374123 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 229374182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 1218

229374183 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 229374242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 1278

229374243 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 229374302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 1338

229374303 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 229374362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 1398

229374363 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 229374422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 1458

229374423 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 229374482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 1518

229374483 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 229374542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 1578

229374543 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 229374602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1579 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTGAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 1638

229374603 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 229374662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 1698

229374663 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 229374722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 1758

229374723 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 229374782
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCTGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 1818

229374783 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 229374842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 1878

229374843 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 229374902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 1938

229374903 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 229374962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 1998

229374963 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 229375022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 2058

229375023 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 229375082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 2118

229375083 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 229375142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 2178

229375143 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 229375202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 2238

229375203 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 229375262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 2298

229375263 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 229375322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 2358

229375323 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 229375382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 2418

229375383 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 229375442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 2478

229375443 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 229375502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 2538

229375503 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 229375562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 2598

229375563 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 229375622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 2658

229375623 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 229375682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 2718

229375683 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 229375742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 2778

229375743 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 229375802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 2838

229375803 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 229375862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 2898

229375863 GGAAACAGTACGAGACTGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGG 229375922
          ||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||
     2899 GGAAACAGTACGAGACTGCCTC------------AAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGG 2946

229375923 GCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGTGGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGT 229375982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 GCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGTGGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGT 3006

229375983 CTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATCAATGAGATCTTACCAATATCTCTGAAC 229376042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 CTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATCAATGAGATCTTACCAATATCTCTGAAC 3066

229376043 CCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGCTAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCC 229376102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 CCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGCTAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCC 3126

229376103 ACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGTGAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGA 229376162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 ACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGTGAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGA 3186

229376163 GAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAATTAGACACTTTCAGCACCTAACATACA 229376222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 GAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAATTAGACACTTTCAGCACCTAACATACA 3246

229376223 GGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAGTACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCA 229376282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 GGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAGTACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCA 3306

229376283 GCAATGAGGAT 229376293
          |||||||||||
     3307 GCAATGAGGAT 3317

Alignment time is 2.53174 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2178] =>      2178 nucs 'mol-32-2b08-080378_2178'

Score:        2167
Aligned:      2167        nucs
Identic:      2167 (100%) nucs =>       720 (100%)      1447 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229372477,229373196] EXCISED REGION [229373198,229374644]
 second seq =>  [       11,      730] EXCISED REGION [      732,     2178]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [229373197,229373197]
 second seq =>         1 nucs [731,731]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [729,730] to [730,731]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229372477 ATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAA 229372536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       11 ATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAA 70

229372537 GTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACA 229372596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       71 GTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACA 130

229372597 TATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTC 229372656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      131 TATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTC 190

229372657 AAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATA 229372716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      191 AAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATA 250

229372717 TAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTA 229372776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      251 TAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTA 310

229372777 AAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTG 229372836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      311 AAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTG 370

229372837 AGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAAT 229372896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      371 AGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAAT 430

229372897 CCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACA 229372956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      431 CCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACA 490

229372957 CCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCT 229373016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 CCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCT 550

229373017 GTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTAT 229373076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 GTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTAT 610

229373077 TGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAG 229373136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 TGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAG 670

229373137 GTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATT 229373196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 GTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATT 730

EXCISED REGION

229373198 GGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAA 229373257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      732 GGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAA 791

229373258 GGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACC 229373317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 GGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACC 851

229373318 TGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTG 229373377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 TGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTG 911

229373378 ACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGTGAATAAACATATACAAATGTCCAAG 229373437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 ACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGTGAATAAACATATACAAATGTCCAAG 971

229373438 CTCACCAATACAGAAAAAAAAAAAAAACACAGCTCAATAACATTTTTCATTTATCAGTCT 229373497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 CTCACCAATACAGAAAAAAAAAAAAAACACAGCTCAATAACATTTTTCATTTATCAGTCT 1031

229373498 GGCAAAGAGTTTCAAAATTTTTTAACAGCCAGTGGTGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTC 229373557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 GGCAAAGAGTTTCAAAATTTTTTAACAGCCAGTGGTGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTC 1091

229373558 ACACACGGGGATGGAAGTTACTTTGGAAATAAGTTAAACGCTTTAACTCACACACACCCA 229373617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 ACACACGGGGATGGAAGTTACTTTGGAAATAAGTTAAACGCTTTAACTCACACACACCCA 1151

229373618 TTGTTCGTTTTTGGAATTATCCAAAGGAAATATAGTGGATCCATGCAAAGACAGCAATTT 229373677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 TTGTTCGTTTTTGGAATTATCCAAAGGAAATATAGTGGATCCATGCAAAGACAGCAATTT 1211

229373678 CAAGAGGCTCATCACAGGGTTATTTTTGATAGAAAAACCTAACAGTCCAACAATAGGATG 229373737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 CAAGAGGCTCATCACAGGGTTATTTTTGATAGAAAAACCTAACAGTCCAACAATAGGATG 1271

229373738 CTGGTTAAATAAGGTATGATATACCCATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAA 229373797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 CTGGTTAAATAAGGTATGATATACCCATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAA 1331

229373798 AAAAGTATTTAATGGCATGAAAAATGTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTAT 229373857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 AAAAGTATTTAATGGCATGAAAAATGTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTAT 1391

229373858 AAACAATATGCAAAGTGTGTGAATATATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAAT 229373917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 AAACAATATGCAAAGTGTGTGAATATATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAAT 1451

229373918 GTCAAAGACAGAATTACAACAAATTTTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGA 229373977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 GTCAAAGACAGAATTACAACAAATTTTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGA 1511

229373978 ATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAAATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAAC 229374037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 ATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAAATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAAC 1571

229374038 CGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAAGGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAAC 229374097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 CGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAAGGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAAC 1631

229374098 ATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTGTAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATAT 229374157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 ATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTGTAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATAT 1691

229374158 ACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAATCTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAA 229374217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 ACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAATCTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAA 1751

229374218 ATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTAGTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCA 229374277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 ATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTAGTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCA 1811

229374278 TTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGAGCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCT 229374337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 TTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGAGCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCT 1871

229374338 CTCATAATTTTTGTTTAATGATAGAAAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGG 229374397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 CTCATAATTTTTGTTTAATGATAGAAAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGG 1931

229374398 AATATGGGATATTTAAATTTTCTTCCTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAA 229374457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 AATATGGGATATTTAAATTTTCTTCCTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAA 1991

229374458 TGAATACTCATTACTGCTGGATTAAGAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACA 229374517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 TGAATACTCATTACTGCTGGATTAAGAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACA 2051

229374518 AAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGCAGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAA 229374577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 AAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGCAGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAA 2111

229374578 GCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTCAGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCC 229374637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 GCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTCAGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCC 2171

229374638 CTGCCCT 229374644
          |||||||
     2172 CTGCCCT 2178

Alignment time is 1.67217 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     4293] =>      4293 nucs 'mol-32-2dff-064965_4293'

Score:        4195
Aligned:      4307        nucs
Identic:      4287 (100%) nucs =>      1364 (100%)      2923 ( 99%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229372021,229373388] EXCISED REGION [229373763,229376701]
 second seq =>  [        1,     1368] EXCISED REGION [     1369,     4293]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [229373389,229373762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229372021 TAGAATAGGATAGGACAAAACTTAGAAGGTATTGGATACCATTTTCCCTGTTGAAGGAGT 229372080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGAATAGGATAGGACAAAACTTAGAAGGTATTGGATACCATTTTCCCTGTTGAAGGAGT 60

229372081 ATTGGTAAGACACCGTCAAAGAGAAATGCACCGCGTACACACGAAGAGGAACCATTTGTA 229372140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTGGTAAGACACCGTCAAAGAGAAATGCACCACGTACACACGAAGAGGAACCATTTGTA 120

229372141 GGTGGTACATAAAAGGGTAAAAAATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAG 229372200
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      121 GGTGGTACATAAAAGGGTGAAAAATAGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAG 180

229372201 CACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCA 229372260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCA 240

229372261 ACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATG 229372320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATG 300

229372321 CCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGG 229372380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGG 360

229372381 AGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTC 229372440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTC 420

229372441 CTTCTCAAAACAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAG 229372500
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAG 480

229372501 TTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTAT 229372560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTAT 540

229372561 TATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGA 229372620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGA 600

229372621 AAATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATAT 229372680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATAT 660

229372681 AAAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAA 229372740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAA 720

229372741 TTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACC 229372800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACC 780

229372801 GCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACT 229372860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACT 840

229372861 CAAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAA 229372920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAA 900

229372921 ACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTAT 229372980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTAT 960

229372981 TTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCG 229373040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCG 1020

229373041 GTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCT 229373100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCT 1080

229373101 TGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGG 229373160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGG 1140

229373161 ATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGA 229373220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGA 1200

229373221 CAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCT 229373280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCT 1260

229373281 GGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTG 229373340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTG 1320

229373341 AATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 229373388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 1368

EXCISED REGION

229373763 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 229373822
          ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 CATCCATTCTGAAATGCTGT---AAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 1425

229373823 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 229373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 1485

229373883 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 229373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 1545

229373943 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 229374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 1605

229374003 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 229374062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 1665

229374063 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 229374122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 1725

229374123 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 229374182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 1785

229374183 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 229374242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 1845

229374243 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 229374302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 1905

229374303 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 229374362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 1965

229374363 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 229374422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 2025

229374423 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 229374482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 2085

229374483 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 229374542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 2145

229374543 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 229374602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2146 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTGAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 2205

229374603 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 229374662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 2265

229374663 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 229374722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 2325

229374723 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 229374782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 2385

229374783 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 229374842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 2445

229374843 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 229374902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 2505

229374903 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 229374962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 2565

229374963 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 229375022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 2625

229375023 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 229375082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 2685

229375083 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 229375142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 2745

229375143 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 229375202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 2805

229375203 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 229375262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 2865

229375263 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 229375322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 2925

229375323 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 229375382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 2985

229375383 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 229375442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 3045

229375443 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 229375502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 3105

229375503 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 229375562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 3165

229375563 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 229375622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 3225

229375623 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 229375682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 3285

229375683 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 229375742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 3345

229375743 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 229375802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 3405

229375803 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 229375862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 3465

229375863 GGAAACAGTACGAGACTGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGG 229375922
          ||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||
     3466 GGAAACAGTACGAGACTGCCTC-----------AAAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGG 3514

229375923 GCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGTGGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGT 229375982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 GCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGTGGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGT 3574

229375983 CTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATCAATGAGATCTTACCAATATCTCTGAAC 229376042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 CTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATCAATGAGATCTTACCAATATCTCTGAAC 3634

229376043 CCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGCTAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCC 229376102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 CCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGCTAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCC 3694

229376103 ACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGTGAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGA 229376162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 ACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGTGAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGA 3754

229376163 GAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAATTAGACACTTTCAGCACCTAACATACA 229376222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 GAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAATTAGACACTTTCAGCACCTAACATACA 3814

229376223 GGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAGTACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCA 229376282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 GGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAGTACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCA 3874

229376283 GCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAGCTGTTCTCAAAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTT 229376342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 GCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAGCTGTTCTCAAAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTT 3934

229376343 TTGCTATTGTCCTGAAGTAGCAATCCCATGATGGAAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCG 229376402
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 TTGCTATTGTCCTGCAGTAGCAATCCCATGATGGAAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCG 3994

229376403 TGGCTACATTATAATGGACTTGGTGAGCATGCACTGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAG 229376462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 TGGCTACATTATAATGGACTTGGTGAGCATGCACTGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAG 4054

229376463 TGGACATAGGGGCCCATCAACCCTGCTCCAGCCAGCACCTGGTCAGAGTCACTAACTACA 229376522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 TGGACATAGGGGCCCATCAACCCTGCTCCAGCCAGCACCTGGTCAGAGTCACTAACTACA 4114

229376523 ACAATGACACCATGGGGACCCCTGGGGCTGCTGTCTGTGGGGCTTTGTATCTTGGCCAGT 229376582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 ACAATGACACCATGGGGACCCCTGGGGCTGCTGTCTGTGGGGCTTTGTATCTTGGCCAGT 4174

229376583 AAAGCCATCCTAAGGTCAGGGCCAAAACCAGAAGCAGAGGGGGCCCGGCCTCAGCTAACA 229376642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 AAAGCCATCCTAAGGTCAGGGCCAAAACCAGAAGCAGAGGGGGCCCGGCCTCAGCTAACA 4234

229376643 ATACTGTGGGGAAGTTCAGCGAGGCTGTCAGCCCCCTCCAGCCCCCAGTCACTCTTGAA 229376701
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 ATACTGTGGGGAAGTTCAGCGAGGCTGTCAGCCCCCTCCAGCCCCCAGTCACTCTTGAA 4293

Alignment time is 3.21068 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     4205] =>      4205 nucs 'mol-32-2e15-009989_4205'

Score:        4183
Aligned:      4205        nucs
Identic:      4203 (100%) nucs =>       942 (100%)      3261 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229371510,229372451] EXCISED REGION [229372453,229375714]
 second seq =>  [        1,      942] EXCISED REGION [      943,     4205]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [229372452,229372452]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2273,2273]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [229372452,229372463] to [229372453,229372464]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229371510 TTGAAGAACCCAAGGCTCTGAGAGTTAACTAACTTGCCCAAGGTCACACAGTTAGCAAGT 229371569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGAAGAACCCAAGGCTCTGAGAGTTAACTAACTTGCCCAAGGTCACACAGTTAGCAAGT 60

229371570 TGTGTGGGCAGGATATAAGCCCAGTCTGGCTGCAAAGCTATGTTCTTTACACTGTAACTT 229371629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTGTGGGCAGGATATAAGCCCAGTCTGGCTGCAAAGCTATGTTCTTTACACTGTAACTT 120

229371630 ACTCCTGAAGGAAGGAGGCTTAAAAATAATCCATGCAGAATTTGTATCAGCTTGATATGT 229371689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTCCTGAAGGAAGGAGGCTTAAAAATAATCCATGCAGAATTTGTATCAGCTTGATATGT 180

229371690 GTGCCTTATTATTATTATTATTATTATTATTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTTGCCCAG 229371749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGCCTTATTATTATTATTATTATTATTATTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTTGCCCAG 240

229371750 GCTGGAGTGCAGGGGCGTAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCCA 229371809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTGGAGTGCAGGGGCGTAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCCA 300

229371810 TTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTATGGGCGCCCACCACCATGCCTGGCT 229371869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTATGGGCGCCCACCACCATGCCTGGCT 360

229371870 AATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACCGGGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACT 229371929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACCGGGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACT 420

229371930 CCTGACCTCAGGCGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAG 229371989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTGACCTCAGGCGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAG 480

229371990 CCACCACACCTGGATTGCCATATTATTTTAATAGAATAGGATAGGACAAAACTTAGAAGG 229372049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCACCACACCTGGATTGCCATATTATTTTAATAGAATAGGATAGGACAAAACTTAGAAGG 540

229372050 TATTGGATACCATTTTCCCTGTTGAAGGAGTATTGGTAAGACACCGTCAAAGAGAAATGC 229372109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATTGGATACCATTTTCCCTGTTGAAGGAGTATTGGTAAGACACCGTCAAAGAGAAATGC 600

229372110 ACCGCGTACACACGAAGAGGAACCATTTGTAGGTGGTACATAAAAGGGTAAAAAATAGGC 229372169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCGCGTACACACGAAGAGGAACCATTTGTAGGTGGTACATAAAAGGGTAAAAAATAGGC 660

229372170 CGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCA 229372229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCA 720

229372230 CAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAA 229372289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAA 780

229372290 TACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAA 229372349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAA 840

229372350 GGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACT 229372409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACT 900

229372410 GCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAAC 229372451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAAC 942

EXCISED REGION

229372453 AAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAG 229372512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      943 AAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAG 1002

229372513 AAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATC 229372572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1003 AAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATC 1062

229372573 AGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGC 229372632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1063 AGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGC 1122

229372633 AACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAAT 229372692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 AACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAAT 1182

229372693 CATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGA 229372752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1183 CATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGA 1242

229372753 AATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGT 229372812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1243 AATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGT 1302

229372813 GTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACAT 229372872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1303 GTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACAT 1362

229372873 ACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATG 229372932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1363 ACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATG 1422

229372933 CATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCA 229372992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1423 CATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCA 1482

229372993 AAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTT 229373052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 AAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTT 1542

229373053 TTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTAC 229373112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 TTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTAC 1602

229373113 CTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGA 229373172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 CTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGA 1662

229373173 AATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGG 229373232
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 AATATGTTAGGGACTCTGCACATTTGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGG 1722

229373233 GTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGT 229373292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 GTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGT 1782

229373293 TTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAAC 229373352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 TTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAAC 1842

229373353 AATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGT 229373412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 AATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGT 1902

229373413 GAATAAACATATACAAATGTCCAAGCTCACCAATACAGAAAAAAAAAAAAAACACAGCTC 229373472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 GAATAAACATATACAAATGTCCAAGCTCACCAATACAGAAAAAAAAAAAAAACACAGCTC 1962

229373473 AATAACATTTTTCATTTATCAGTCTGGCAAAGAGTTTCAAAATTTTTTAACAGCCAGTGG 229373532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 AATAACATTTTTCATTTATCAGTCTGGCAAAGAGTTTCAAAATTTTTTAACAGCCAGTGG 2022

229373533 TGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTCACACACGGGGATGGAAGTTACTTTGGAAATAAGTT 229373592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 TGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTCACACACGGGGATGGAAGTTACTTTGGAAATAAGTT 2082

229373593 AAACGCTTTAACTCACACACACCCATTGTTCGTTTTTGGAATTATCCAAAGGAAATATAG 229373652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 AAACGCTTTAACTCACACACACCCATTGTTCGTTTTTGGAATTATCCAAAGGAAATATAG 2142

229373653 TGGATCCATGCAAAGACAGCAATTTCAAGAGGCTCATCACAGGGTTATTTTTGATAGAAA 229373712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 TGGATCCATGCAAAGACAGCAATTTCAAGAGGCTCATCACAGGGTTATTTTTGATAGAAA 2202

229373713 AACCTAACAGTCCAACAATAGGATGCTGGTTAAATAAGGTATGATATACCCATCCATTCT 229373772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 AACCTAACAGTCCAACAATAGGATGCTGGTTAAATAAGGTATGATATACCCATCCATTCT 2262

229373773 GAAATGCTGT-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAATGTTCACAAC 229373831
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 GAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAATGTTCACAAC 2322

229373832 CCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATATATAGGTAC 229373891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 CCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATATATAGGTAC 2382

229373892 TGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATTTTGTTATAG 229373951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 TGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATTTTGTTATAG 2442

229373952 ATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAAATAGAATGA 229374011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 ATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAAATAGAATGA 2502

229374012 GAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAAGGAATAGAA 229374071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 GAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAAGGAATAGAA 2562

229374072 CAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTGTAATAAGGG 229374131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 CAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTGTAATAAGGG 2622

229374132 TTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAATCTCCTGTTT 229374191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 TTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAATCTCCTGTTT 2682

229374192 GCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTAGTCTGATTA 229374251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 GCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTAGTCTGATTA 2742

229374252 TGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGAGCCTAGTGC 229374311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 TGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGAGCCTAGTGC 2802

229374312 AGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGAAAAACACTG 229374371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 AGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGAAAAACACTG 2862

229374372 GAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTCCTTCTGCTT 229374431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 GAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTCCTTCTGCTT 2922

229374432 ATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAAGAAAAAGAA 229374491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 ATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAAGAAAAAGAA 2982

229374492 TAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGCAGCTTGGTA 229374551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 TAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGCAGCTTGGTA 3042

229374552 GTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTCAGGCCCAGA 229374611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 GTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTCAGGCCCAGA 3102

229374612 GCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGAAAGCCACAA 229374671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 GCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGAAAGCCACAA 3162

229374672 GTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATGCTTCTCCCA 229374731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 GTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATGCTTCTCCCA 3222

229374732 GGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCACAATGGTGG 229374791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 GGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCACAATGGTGG 3282

229374792 ATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACATGAGCAAGC 229374851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 ATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACATGAGCAAGC 3342

229374852 AAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCATGCAGGGCCC 229374911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 AAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCATGCAGGGCCC 3402

229374912 ATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCTGGGTGCCAG 229374971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 ATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCTGGGTGCCAG 3462

229374972 CAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCCACAACCCCA 229375031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 CAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCCACAACCCCA 3522

229375032 AAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGACAGTTATGTG 229375091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 AAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGACAGTTATGTG 3582

229375092 TTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCACCAGCAAGG 229375151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 TTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCACCAGCAAGG 3642

229375152 GCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCCAAGCTCTTG 229375211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 GCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCCAAGCTCTTG 3702

229375212 TCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAAGGCGGAGAA 229375271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 TCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAAGGCGGAGAA 3762

229375272 TTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGGGATGGGAAG 229375331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 TTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGGGATGGGAAG 3822

229375332 GGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCATCTCTCTCC 229375391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 GGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCATCTCTCTCC 3882

229375392 AAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCCATCTGTCTC 229375451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 AAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCCATCTGTCTC 3942

229375452 TACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGCCGTAGGTAG 229375511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 TACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGCCGTAGGTAG 4002

229375512 TTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAACCAATCAGGA 229375571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 TTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAACCAATCAGGA 4062

229375572 GAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTTATGCCGATA 229375631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 GAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTTATGCCGATA 4122

229375632 ATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGTTTGAGATGA 229375691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 ATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGTTTGAGATGA 4182

229375692 GCCTGGCCAACATGGTGAAACCT 229375714
          |||||||||||||||||||||||
     4183 GCCTGGCCAACATGGTGAAACCT 4205

Alignment time is 3.14863 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3131] =>      3131 nucs 'mol-32-2fb7-021929_3131'

Score:        3099
Aligned:      3132        nucs
Identic:      3129 (100%) nucs =>      1555 (100%)      1574 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229372225,229373782] EXCISED REGION [229373786,229375359]
 second seq =>  [        1,     1557] EXCISED REGION [     1558,     3131]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [229373783,229373785]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [229373783,229373798] to [229373786,229373801]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [229373783,229373783] to [229373785,229373785]
 second seq =>         0 nucs

229372225 GATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACT 229372284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
        1 GATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACT 60

229372285 ACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAG 229372344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAG 120

229372345 GCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCA 229372404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCA 180

229372405 CCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAACAAAAAAAAAAAAA 229372464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAACAAAAAAAAAAAAA 240

229372465 GGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTAT 229372524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTAT 300

229372525 AAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGA 229372584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGA 360

229372585 TATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATT 229372644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATT 420

229372645 ATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTA 229372704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTA 480

229372705 TTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGT 229372764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGT 540

229372765 CAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTT 229372824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTT 600

229372825 GTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTC 229372884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTC 660

229372885 TGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACG 229372944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACG 720

229372945 GAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATA 229373004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATA 780

229373005 AGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCC 229373064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCC 840

229373065 ATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCAC 229373124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCAC 900

229373125 AGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGG 229373184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGG 960

229373185 ACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTA 229373244
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTCTGCACATTTGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTA 1020

229373245 ATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAA 229373304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAA 1080

229373305 GAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATT 229373364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATT 1140

229373365 GTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGTGAATAAACATAT 229373424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGTGAATAAACATAT 1200

229373425 ACAAATGTCCAAGCTCACCAATACAGAAAAAAAAAAAAAACACAGCTCAATAACATTTTT 229373484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     1201 ACAAATGTCCAAGCTCACCAATACAGAAAAAAAAAAAAA-CACAGCTCAATAACATTTTT 1259

229373485 CATTTATCAGTCTGGCAAAGAGTTTCAAAATTTTTTAACAGCCAGTGGTGGAAAGGCGCA 229373544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CATTTATCAGTCTGGCAAAGAGTTTCAAAATTTTTTAACAGCCAGTGGTGGAAAGGCGCA 1319

229373545 GGTGAGCCTTCTCACACACGGGGATGGAAGTTACTTTGGAAATAAGTTAAACGCTTTAAC 229373604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GGTGAGCCTTCTCACACACGGGGATGGAAGTTACTTTGGAAATAAGTTAAACGCTTTAAC 1379

229373605 TCACACACACCCATTGTTCGTTTTTGGAATTATCCAAAGGAAATATAGTGGATCCATGCA 229373664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TCACACACACCCATTGTTCGTTTTTGGAATTATCCAAAGGAAATATAGTGGATCCATGCA 1439

229373665 AAGACAGCAATTTCAAGAGGCTCATCACAGGGTTATTTTTGATAGAAAAACCTAACAGTC 229373724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AAGACAGCAATTTCAAGAGGCTCATCACAGGGTTATTTTTGATAGAAAAACCTAACAGTC 1499

229373725 CAACAATAGGATGCTGGTTAAATAAGGTATGATATACCCATCCATTCTGAAATGCTGT 229373782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CAACAATAGGATGCTGGTTAAATAAGGTATGATATACCCATCCATTCTGAAATGCTGT 1557

EXCISED REGION

229373786 AAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAATGTTCACAACCCATTGTTTAATGA 229373845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 AAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAATGTTCACAACCCATTGTTTAATGA 1617

229373846 AGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATATATAGGTACTGTACATGTGCACA 229373905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 AGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATATATAGGTACTGTACATGTGCACA 1677

229373906 CATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATTTTGTTATAGATCTCATTGACTTT 229373965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATTTTGTTATAGATCTCATTGACTTT 1737

229373966 TATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAAATAGAATGAGAGCTTCCACCAGG 229374025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAAATAGAATGAGAGCTTCCACCAGG 1797

229374026 CAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAAGGAATAGAACAGTAGGAAAAAAC 229374085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 CAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAAGGAATAGAACAGTAGGAAAAAAC 1857

229374086 TGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTGTAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGG 229374145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTGTAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGG 1917

229374146 ACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAATCTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGG 229374205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 ACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAATCTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGG 1977

229374206 TCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTAGTCTGATTATGTGGCATTTAGCA 229374265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 TCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTAGTCTGATTATGTGGCATTTAGCA 2037

229374266 TGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGAGCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTA 229374325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGAGCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTA 2097

229374326 AGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGAAAAACACTGGAAGCCTATATTAC 229374385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 AGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGAAAAACACTGGAAGCCTATATTAC 2157

229374386 CAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTCCTTCTGCTTATCTATGTTTTCTA 229374445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 CAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTCCTTCTGCTTATCTATGTTTTCTA 2217

229374446 AGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAAGAAAAAGAATAAACATTATTATA 229374505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 AGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAAGAAAAAGAATAAACATTATTATA 2277

229374506 TTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGCAGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGG 229374565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGCAGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGG 2337

229374566 ACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTCAGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTC 229374625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 ACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTCAGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTC 2397

229374626 CTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGAAAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTC 229374685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 CTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGAAAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTC 2457

229374686 TGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATGCTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCA 229374745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 TGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATGCTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCA 2517

229374746 TGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCACAATGGTGGATCCCCATCTACTT 229374805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 TGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCACAATGGTGGATCCCCATCTACTT 2577

229374806 GGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACATGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCA 229374865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 GGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACATGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCA 2637

229374866 GCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCATGCAGGGCCCATGGCCAGACCAGG 229374925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 GCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCATGCAGGGCCCATGGCCAGACCAGG 2697

229374926 CATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCTGGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCC 229374985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 CATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCTGGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCC 2757

229374986 ATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCCACAACCCCAAAACCCCAGAGGGA 229375045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 ATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCCACAACCCCAAAACCCCAGAGGGA 2817

229375046 GTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGACAGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTT 229375105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGACAGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTT 2877

229375106 GGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCACCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTG 229375165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 GGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCACCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTG 2937

229375166 TGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCCAAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGA 229375225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCCAAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGA 2997

229375226 AGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAAGGCGGAGAATTTTATTAAGCAAT 229375285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 AGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAAGGCGGAGAATTTTATTAAGCAAT 3057

229375286 GAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGGGATGGGAAGGGCAGGTCACCTTC 229375345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 GAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGGGATGGGAAGGGCAGGTCACCTTC 3117

229375346 CACAAAGTCAGATT 229375359
          ||||||||||||||
     3118 CACAAAGTCAGATT 3131

Alignment time is 2.32242 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2473] =>      2473 nucs 'mol-32-2fd8-209335_2473'

Score:        2461
Aligned:      2472        nucs
Identic:      2471 (100%) nucs =>      1235 (100%)      1236 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229371962,229373196] EXCISED REGION [229373198,229374433]
 second seq =>  [        1,     1235] EXCISED REGION [     1237,     2473]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [229373197,229373197]
 second seq =>         1 nucs [1236,1236]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1822,1822]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1234,1235] to [1235,1236]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229371962 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGATTGCCATATTATTTTAAT 229372021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGATTGCCATATTATTTTAAT 60

229372022 AGAATAGGATAGGACAAAACTTAGAAGGTATTGGATACCATTTTCCCTGTTGAAGGAGTA 229372081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAATAGGATAGGACAAAACTTAGAAGGTATTGGATACCATTTTCCCTGTTGAAGGAGTA 120

229372082 TTGGTAAGACACCGTCAAAGAGAAATGCACCGCGTACACACGAAGAGGAACCATTTGTAG 229372141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGGTAAGACACCGTCAAAGAGAAATGCACCGCGTACACACGAAGAGGAACCATTTGTAG 180

229372142 GTGGTACATAAAAGGGTAAAAAATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGC 229372201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGGTACATAAAAGGGTAAAAAATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGC 240

229372202 ACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAA 229372261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAA 300

229372262 CATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGC 229372321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGC 360

229372322 CTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGA 229372381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGA 420

229372382 GGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCC 229372441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCC 480

229372442 TTCTCAAAACAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGT 229372501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTCAAAACAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGT 540

229372502 TTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATT 229372561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATT 600

229372562 ATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAA 229372621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAA 660

229372622 AATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATA 229372681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATA 720

229372682 AAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAAT 229372741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAAT 780

229372742 TAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCG 229372801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCG 840

229372802 CTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTC 229372861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTC 900

229372862 AAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAA 229372921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAA 960

229372922 CAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATT 229372981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATT 1020

229372982 TACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGG 229373041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGG 1080

229373042 TCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTT 229373101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTT 1140

229373102 GTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGA 229373161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGA 1200

229373162 TGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATT 229373196
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATT 1235

EXCISED REGION

229373198 GGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAA 229373257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 GGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAA 1296

229373258 GGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACC 229373317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 GGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACC 1356

229373318 TGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTG 229373377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 TGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTG 1416

229373378 ACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGTGAATAAACATATACAAATGTCCAAG 229373437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 ACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGTGAATAAACATATACAAATGTCCAAG 1476

229373438 CTCACCAATACAGAAAAAAAAAAAAAACACAGCTCAATAACATTTTTCATTTATCAGTCT 229373497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 CTCACCAATACAGAAAAAAAAAAAAAACACAGCTCAATAACATTTTTCATTTATCAGTCT 1536

229373498 GGCAAAGAGTTTCAAAATTTTTTAACAGCCAGTGGTGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTC 229373557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 GGCAAAGAGTTTCAAAATTTTTTAACAGCCAGTGGTGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTC 1596

229373558 ACACACGGGGATGGAAGTTACTTTGGAAATAAGTTAAACGCTTTAACTCACACACACCCA 229373617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 ACACACGGGGATGGAAGTTACTTTGGAAATAAGTTAAACGCTTTAACTCACACACACCCA 1656

229373618 TTGTTCGTTTTTGGAATTATCCAAAGGAAATATAGTGGATCCATGCAAAGACAGCAATTT 229373677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 TTGTTCGTTTTTGGAATTATCCAAAGGAAATATAGTGGATCCATGCAAAGACAGCAATTT 1716

229373678 CAAGAGGCTCATCACAGGGTTATTTTTGATAGAAAAACCTAACAGTCCAACAATAGGATG 229373737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 CAAGAGGCTCATCACAGGGTTATTTTTGATAGAAAAACCTAACAGTCCAACAATAGGATG 1776

229373738 CTGGTTAAATAAGGTATGATATACCCATCCATTCTGAAATGCTGT-AAAAAAAAAAAAAA 229373796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     1777 CTGGTTAAATAAGGTATGATATACCCATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAA 1836

229373797 AAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAATGTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTA 229373856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 AAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAATGTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTA 1896

229373857 TAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATATATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAA 229373916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 TAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATATATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAA 1956

229373917 TGTCAAAGACAGAATTACAACAAATTTTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATG 229373976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 TGTCAAAGACAGAATTACAACAAATTTTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATG 2016

229373977 AATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAAATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAA 229374036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 AATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAAATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAA 2076

229374037 CCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAAGGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAA 229374096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 CCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAAGGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAA 2136

229374097 CATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTGTAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATA 229374156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 CATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTGTAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATA 2196

229374157 TACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAATCTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGA 229374216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 TACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAATCTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGA 2256

229374217 AATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTAGTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTC 229374276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 AATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTAGTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTC 2316

229374277 ATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGAGCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCC 229374336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 ATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGAGCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCC 2376

229374337 TCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGAAAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGG 229374396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 TCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGAAAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGG 2436

229374397 GAATATGGGATATTTAAATTTTCTTCCTTCTGCTTAT 229374433
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 GAATATGGGATATTTAAATTTTCTTCCTTCTGCTTAT 2473

Alignment time is 1.8205 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2728] =>      2728 nucs 'mol-32-2fe3-351167_2728'

Score:        2705
Aligned:      2731        nucs
Identic:      2727 (100%) nucs =>       630 (100%)      2097 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229372759,229373388] EXCISED REGION [229373763,229375863]
 second seq =>  [        1,      630] EXCISED REGION [      631,     2728]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [229373389,229373762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229372759 ATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAAT 229372818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAAT 60

229372819 TTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCT 229372878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCT 120

229372879 ATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTG 229372938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTG 180

229372939 TCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACC 229372998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACC 240

229372999 AAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAG 229373058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAG 300

229373059 CCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAA 229373118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAA 360

229373119 GCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATG 229373178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATG 420

229373179 TTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGA 229373238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGA 480

229373239 GAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCT 229373298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCT 540

229373299 TTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCA 229373358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCA 600

229373359 GGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 229373388
          ||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 630

EXCISED REGION

229373763 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 229373822
          ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      631 CATCCATTCTGAAATGCTGT---AAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 687

229373823 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 229373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      688 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 747

229373883 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 229373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      748 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 807

229373943 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 229374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      808 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 867

229374003 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 229374062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      868 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 927

229374063 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 229374122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      928 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 987

229374123 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 229374182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      988 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 1047

229374183 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 229374242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1048 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 1107

229374243 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 229374302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1108 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 1167

229374303 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 229374362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1168 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 1227

229374363 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 229374422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1228 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 1287

229374423 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 229374482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 1347

229374483 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 229374542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 1407

229374543 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 229374602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1408 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTGAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 1467

229374603 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 229374662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 1527

229374663 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 229374722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 1587

229374723 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 229374782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 1647

229374783 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 229374842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 1707

229374843 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 229374902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 1767

229374903 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 229374962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 1827

229374963 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 229375022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 1887

229375023 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 229375082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 1947

229375083 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 229375142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 2007

229375143 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 229375202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 2067

229375203 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 229375262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 2127

229375263 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 229375322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 2187

229375323 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 229375382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 2247

229375383 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 229375442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 2307

229375443 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 229375502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 2367

229375503 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 229375562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 2427

229375563 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 229375622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 2487

229375623 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 229375682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 2547

229375683 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 229375742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 2607

229375743 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 229375802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 2667

229375803 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 229375862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 2727

229375863 G 229375863
          |
     2728 G 2728

Alignment time is 1.99988 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2835] =>      2835 nucs 'mol-32-300f-137747_2835'

Score:        2691
Aligned:      2808        nucs
Identic:      2790 ( 99%) nucs =>      2502 ( 99%)       288 ( 99%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229370874,229373388] EXCISED REGION [229373763,229374053]
 second seq =>  [       38,     2547] EXCISED REGION [     2548,     2835]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [229373389,229373762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229370874 TGCCTTTCTGCCATTCGTCTGCTTGTCTCCTTGTCTCCTTGTCTGCTTCTGGAGCCTGGG 229370933
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
       38 TGCCTTTCTGCCATTCGTCTGCTTGTCTCCTTGTCTCCTTGTCTGATTCTGGAGCCTGGG 97

229370934 GTTTGGGGTTTATATGGGTACAGGATGGCCAAAAGGCAACCTTTTGGGTGTGAAAACAGG 229370993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       98 GTTTGGGGTTTATATGGGTACAGGATGGCCAAAAGGCAACCTTTTGGGTGTGAAAACAGG 157

229370994 AATCCCTGTCCTCCTTTAGGGTCACGGGTATCTGGGCTTCAGGGTGGGGGCCTTTGCCGG 229371053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      158 AATCCCTGTCCTCCTTTAGGGTCACGGGTATCTGGGCTTCAGGGTGGGGGCCTTTGCCGG 217

229371054 AGAACCGCCCTCTTCTACCCAGTGTTTCCCTGTCTCCTGTCCGTATCACCAGCAGATGGT 229371113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      218 AGAACCGCCCTCTTCTACCCAGTGTTTCCCTGTCTCCTGTCCGTATCACCAGCAGATGGT 277

229371114 GCCTACTTTTTTAAAGCCATCATCTTATCTTCTAGCTGTACCTATTTTTTTAAATATATG 229371173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      278 GCCTACTTTTTTAAAGCCATCATCTTATCTTCTAGCTGTACCTATTTTTTTAAATATATG 337

229371174 TTTTATTTCAACAGCTTTTGGGATACAAGTGGTTTTTGGTTACATGGATGAATTGTCTAG 229371233
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      338 TTTTATTTCAACAGCTTTTGGGATACAAGTGGTTTTTGGTTACGTGGATGAATTGTCTAG 397

229371234 TGGTGAAGTCTGAGATTTTGCTACACTCTTCACCCGAGTGACCCCAGTAGTGTACATTGT 229371293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      398 TGGTGAAGTCTGAGATTTTGCTACACTCTTCACCCGAGTGACCCCAGTAGTGTACATTGT 457

229371294 ATCTAATATGTAGTTTTTTTATCCTTTATCCCCTCCCACCCTGTATCTATTTTTAATTGC 229371353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      458 ATCTAATATGTAGTTTTTTTATCCTTTATCCCCTCCCACCCTGTATCTATTTTTAATTGC 517

229371354 TTTGTGAACTAAGGCAAATGTGATAAAGAGGCATCTGATGTACCTGCTTCTAGCATACAA 229371413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      518 TTTGTGAACTAAGGCAAATGTGATAAAGAGGCATCTGATGTACCTGCTTCTAGCATACAA 577

229371414 GAAAACATATTTCTTGAGCATGCTGTTACATGCTTGACACTTTATATACACTATTTCATT 229371473
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      578 GAAAACATATTTCTTGAGCATGCTATTACATGCTTGACACTTTATATACACTATTTCATT 637

229371474 TAACATCCCAACAATCCTAAAACCTGGGTTTTGTTATTGAAGAACCCAAGGCTCTGAGAG 229371533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      638 TAACATCCCAACAATCCTAAAACCTGGGTTTTGTTATTGAAGAACCCAAGGCTCTGAGAG 697

229371534 TTAACTAACTTGCCCAAGGTCACACAGTTAGCAAGTTGTGTGGGCAGGATATAAGCCCAG 229371593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      698 TTAACTAACTTGCCCAAGGTCACACAGTTAGCAAGTTGTGTGGGCAGGATATAAGCCCAG 757

229371594 TCTGGCTGCAAAGCTATGTTCTTTACACTGTAACTTACTCCTGAAGGAAGGAGGCTTAAA 229371653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      758 TCTGGCTGCAAAGCTATGTTCTTTACACTGTAACTTACTCCTGAAGGAAGGAGGCTTAAA 817

229371654 AATAATCCATGCAGAATTTGTATCAGCTTGATATGTGTGCCTTATTATTATTATTATTAT 229371713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      818 AATAATCCATGCAGAATTTGTATCAGCTTGATATGTGTGCCTTATTATTATTATTATTAT 877

229371714 TATTATTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGGGGCGTAATCTC 229371773
          |      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      878 T------TTGAGACGGAGTCTTACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGGGGCGTAATCTC 931

229371774 GGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGT 229371833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 GGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGT 991

229371834 AGCTGGGATTATGGGCGCCCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAC 229371893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 AGCTGGGATTATGGGCGCCCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAC 1051

229371894 AAGGTTTCACCGGGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCGATCTGCCCAC 229371953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 AAGGTTTCACCGGGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCGATCTGCCCAC 1111

229371954 CTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGATTGCCATATT 229372013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 CTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGATTGCCATATT 1171

229372014 ATTTTAATAGAATAGGATAGGACAAAACTTAGAAGGTATTGGATACCATTTTCCCTGTTG 229372073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 ATTTTAATAGAATAGGATAGGACAAAACTTAGAAGGTATTGGATACCATTTTCCCTGTTG 1231

229372074 AAGGAGTATTGGTAAGACACCGTCAAAGAGAAATGCACCGCGTACACACGAAGAGGAACC 229372133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1232 AAGGAGTATTGGTAAGACACCGTCAAAGAGAAATGCACCACGTACACACGAAGAGGAACC 1291

229372134 ATTTGTAGGTGGTACATAAAAGGGTAAAAAATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTA 229372193
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1292 ATTTGTAGGTGGTACATAAAAGGGTGAAAAATAGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTA 1351

229372194 ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGC 229372253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGC 1411

229372254 CTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTG 229372313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 CTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTG 1471

229372314 GTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGG 229372373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 GTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGG 1531

229372374 GAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGT 229372433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 GAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGT 1591

229372434 GAGACTCCTTCTCAAAAC--AAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATA 229372491
          |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 GAGACTCCTTCTCAAAA-AAAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATA 1650

229372492 TACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTAT 229372551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 TACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTAT 1710

229372552 AAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAA 229372611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 AAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAA 1770

229372612 ACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAA 229372671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 ACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAA 1830

229372672 AAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAA 229372731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 AAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAA 1890

229372732 AAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTG 229372791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 AAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTG 1950

229372792 TGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACG 229372851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 TGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACG 2010

229372852 TTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAA 229372911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 TTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAA 2070

229372912 ATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACAC 229372971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 ATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACAC 2130

229372972 CAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAG 229373031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 CAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAG 2190

229373032 ATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAAT 229373091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 ATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAAT 2250

229373092 TTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGT 229373151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 TTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGT 2310

229373152 CCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCA 229373211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 CCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCA 2370

229373212 AAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTT 229373271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 AAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTT 2430

229373272 TATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACT 229373331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 TATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACT 2490

229373332 TTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 229373388
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 TTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 2547

EXCISED REGION

229373763 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 229373822
          ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 CATCCATTCTGAAATGCTGT---AAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 2604

229373823 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 229373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 2664

229373883 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 229373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 2724

229373943 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 229374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 2784

229374003 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGG 229374053
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGG 2835

Alignment time is 2.05515 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2678] =>      2678 nucs 'mol-32-303b-019357_2678'

Score:        2646
Aligned:      2679        nucs
Identic:      2676 (100%) nucs =>       630 (100%)      2046 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229372759,229373388] EXCISED REGION [229373763,229375811]
 second seq =>  [        1,      630] EXCISED REGION [      631,     2678]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [229373389,229373762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229372759 ATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAAT 229372818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAAT 60

229372819 TTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCT 229372878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCT 120

229372879 ATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTG 229372938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTG 180

229372939 TCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACC 229372998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACC 240

229372999 AAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAG 229373058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAG 300

229373059 CCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAA 229373118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAA 360

229373119 GCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATG 229373178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATG 420

229373179 TTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGA 229373238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGA 480

229373239 GAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCT 229373298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCT 540

229373299 TTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCA 229373358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCA 600

229373359 GGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 229373388
          ||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 630

EXCISED REGION

229373763 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 229373822
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      631 CATCCATTCTGAAATGCTGT-AAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 689

229373823 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 229373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      690 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 749

229373883 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 229373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 809

229373943 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 229374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 869

229374003 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 229374062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 929

229374063 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 229374122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 989

229374123 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 229374182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 1049

229374183 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 229374242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 1109

229374243 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 229374302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 1169

229374303 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 229374362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 1229

229374363 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 229374422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 1289

229374423 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 229374482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 1349

229374483 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 229374542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 1409

229374543 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 229374602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1410 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTGAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 1469

229374603 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 229374662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 1529

229374663 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 229374722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 1589

229374723 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 229374782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 1649

229374783 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 229374842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 1709

229374843 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 229374902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 1769

229374903 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 229374962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 1829

229374963 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 229375022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 1889

229375023 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 229375082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 1949

229375083 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 229375142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 2009

229375143 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 229375202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 2069

229375203 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 229375262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 2129

229375263 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 229375322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 2189

229375323 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 229375382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 2249

229375383 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 229375442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 2309

229375443 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 229375502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 2369

229375503 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 229375562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 2429

229375563 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 229375622
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 CAATCAGGAGAGAGTGGGCGAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 2489

229375623 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 229375682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 2549

229375683 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 229375742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 2609

229375743 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 229375802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 2669

229375803 CTTGAACCC 229375811
          |||||||||
     2670 CTTGAACCC 2678

Alignment time is 2.0071 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2079] =>      2079 nucs 'mol-32-30eb-174141_2079'

Score:        2016
Aligned:      2083        nucs
Identic:      2072 ( 99%) nucs =>      1442 ( 99%)       630 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229371943,229373388] EXCISED REGION [229373763,229374395]
 second seq =>  [        1,     1449] EXCISED REGION [     1450,     2079]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [229373389,229373762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229371943 GATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGG 229372002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGG 60

229372003 ATTGCCATATTATTTTAATAGAATAGGATAGGACAAAACTTAGAAGGTATTGGATACCAT 229372062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTGCCATATTATTTTAATAGAATAGGATAGGACAAAACTTAGAAGGTATTGGATACCAT 120

229372063 TTTCCCTGTTGAAGGAGTATTGGTAAGACACCGTCAAAGAGAAATGCACCGCGTACACAC 229372122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      121 TTTCCCTGTTGAAGGAGTATTGGTAAGACACCGTCAAAGAGAAATGCACCACGTACACAC 180

229372123 GAAGAGGAACCATTTGTAGGTGGTACATAAAAGGGTAAAAAATAGGCCGGGCGCGGTGGC 229372182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||
      181 GAAGAGGAACCATTTGTAGGTGGTACATAAAAGGGTGAAAAATAGGCCGGGCACGGTGGC 240

229372183 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGT 229372242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGT 300

229372243 TTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGC 229372302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGC 360

229372303 TGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCG 229372362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCG 420

229372363 CTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTG 229372422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTG 480

229372423 GAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAAC----AAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAAT 229372478
          ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAA-AAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAAT 539

229372479 TATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGT 229372538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGT 599

229372539 AGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATA 229372598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 AGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATA 659

229372599 TTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAA 229372658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAA 719

229372659 ATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATA 229372718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 ATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATA 779

229372719 AAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAA 229372778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 AAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAA 839

229372779 GCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAG 229372838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAG 899

229372839 AAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCC 229372898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCC 959

229372899 CACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACC 229372958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACC 1019

229372959 TGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGT 229373018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGT 1079

229373019 TAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTG 229373078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTG 1139

229373079 TTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGT 229373138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGT 1199

229373139 GAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCG 229373198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCG 1259

229373199 GGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAG 229373258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAG 1319

229373259 GTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCT 229373318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCT 1379

229373319 GGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGA 229373378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGA 1439

229373379 CTTAAGAAAG 229373388
          ||||||||||
     1440 CTTAAGAAAG 1449

EXCISED REGION

229373763 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 229373822
          ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 CATCCATTCTGAAATGCTGT---AAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 1506

229373823 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 229373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 1566

229373883 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 229373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 1626

229373943 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 229374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 1686

229374003 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 229374062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 1746

229374063 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 229374122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 1806

229374123 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 229374182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 1866

229374183 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 229374242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 1926

229374243 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 229374302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 1986

229374303 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 229374362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 2046

229374363 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTG 229374395
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTG 2079

Alignment time is 1.51256 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2344] =>      2344 nucs 'mol-32-3101-216491_2344'

Score:        2333
Aligned:      2344        nucs
Identic:      2343 (100%) nucs =>      1225 (100%)      1118 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229372225,229373450] EXCISED REGION [229373453,229374570]
 second seq =>  [        1,     1226] EXCISED REGION [     1227,     2344]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [229373451,229373452]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [229373451,229373462] to [229373453,229373464]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [229373451,229373451] to [229373452,229373452]
 second seq =>         0 nucs

229372225 GATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACT 229372284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACT 60

229372285 ACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAG 229372344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAG 120

229372345 GCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCA 229372404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCA 180

229372405 CCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAACAAAAAAAAAAAAA 229372464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAACAAAAAAAAAAAAA 240

229372465 GGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTAT 229372524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTAT 300

229372525 AAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGA 229372584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGA 360

229372585 TATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATT 229372644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATT 420

229372645 ATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTA 229372704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTA 480

229372705 TTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGT 229372764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGT 540

229372765 CAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTT 229372824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTT 600

229372825 GTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTC 229372884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTC 660

229372885 TGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACG 229372944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACG 720

229372945 GAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATA 229373004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATA 780

229373005 AGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCC 229373064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCC 840

229373065 ATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCAC 229373124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCAC 900

229373125 AGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGG 229373184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGG 960

229373185 ACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTA 229373244
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTCTGCACATTTGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTA 1020

229373245 ATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAA 229373304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAA 1080

229373305 GAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATT 229373364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATT 1140

229373365 GTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGTGAATAAACATAT 229373424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGTGAATAAACATAT 1200

229373425 ACAAATGTCCAAGCTCACCAATACAG 229373450
          ||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACAAATGTCCAAGCTCACCAATACAG 1226

EXCISED REGION

229373453 AAAAAAAAAAAACACAGCTCAATAACATTTTTCATTTATCAGTCTGGCAAAGAGTTTCAA 229373512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 AAAAAAAAAAAACACAGCTCAATAACATTTTTCATTTATCAGTCTGGCAAAGAGTTTCAA 1286

229373513 AATTTTTTAACAGCCAGTGGTGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTCACACACGGGGATGGA 229373572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 AATTTTTTAACAGCCAGTGGTGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTCACACACGGGGATGGA 1346

229373573 AGTTACTTTGGAAATAAGTTAAACGCTTTAACTCACACACACCCATTGTTCGTTTTTGGA 229373632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 AGTTACTTTGGAAATAAGTTAAACGCTTTAACTCACACACACCCATTGTTCGTTTTTGGA 1406

229373633 ATTATCCAAAGGAAATATAGTGGATCCATGCAAAGACAGCAATTTCAAGAGGCTCATCAC 229373692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 ATTATCCAAAGGAAATATAGTGGATCCATGCAAAGACAGCAATTTCAAGAGGCTCATCAC 1466

229373693 AGGGTTATTTTTGATAGAAAAACCTAACAGTCCAACAATAGGATGCTGGTTAAATAAGGT 229373752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 AGGGTTATTTTTGATAGAAAAACCTAACAGTCCAACAATAGGATGCTGGTTAAATAAGGT 1526

229373753 ATGATATACCCATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGG 229373812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 ATGATATACCCATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGG 1586

229373813 CATGAAAAATGTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAG 229373872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 CATGAAAAATGTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAG 1646

229373873 TGTGTGAATATATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATT 229373932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 TGTGTGAATATATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATT 1706

229373933 ACAACAAATTTTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCC 229373992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 ACAACAAATTTTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCC 1766

229373993 ATTCTACAAAATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAG 229374052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 ATTCTACAAAATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAG 1826

229374053 GTAGAAACAAGGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAG 229374112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 GTAGAAACAAGGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAG 1886

229374113 GTTGCTTTTGTAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGA 229374172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 GTTGCTTTTGTAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGA 1946

229374173 AGGCTGGAATCTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTT 229374232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 AGGCTGGAATCTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTT 2006

229374233 TAAAGTTTTAGTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTG 229374292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 TAAAGTTTTAGTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTG 2066

229374293 GTCTATTGGAGCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTT 229374352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 GTCTATTGGAGCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTT 2126

229374353 TAATGATAGAAAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTA 229374412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 TAATGATAGAAAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTA 2186

229374413 AATTTTCTTCCTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACT 229374472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 AATTTTCTTCCTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACT 2246

229374473 GCTGGATTAAGAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAG 229374532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 GCTGGATTAAGAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAG 2306

229374533 AACTGGATGCAGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACT 229374570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 AACTGGATGCAGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACT 2344

Alignment time is 1.73828 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2582] =>      2582 nucs 'mol-32-310c-018075_2582'

Score:        2571
Aligned:      2582        nucs
Identic:      2581 (100%) nucs =>       970 (100%)      1611 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229372227,229373196] EXCISED REGION [229373198,229374809]
 second seq =>  [        1,      970] EXCISED REGION [      972,     2582]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [229373197,229373197]
 second seq =>         1 nucs [971,971]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [229373783,229373783]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [969,970] to [970,971]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229372227 TCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTAC 229372286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTAC 60

229372287 AAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGC 229372346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGC 120

229372347 TAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACC 229372406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACC 180

229372407 ACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAACAAAAAAAAAAAAAGG 229372466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAACAAAAAAAAAAAAAGG 240

229372467 TTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAA 229372526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAA 300

229372527 AATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATA 229372586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATA 360

229372587 TAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTAT 229372646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTAT 420

229372647 ATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATT 229372706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATT 480

229372707 AAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCA 229372766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCA 540

229372767 GTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGT 229372826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGT 600

229372827 TGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTCTG 229372886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTCTG 660

229372887 ACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGA 229372946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGA 720

229372947 AGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAG 229373006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAG 780

229373007 TCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCAT 229373066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCAT 840

229373067 GATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAG 229373126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAG 900

229373127 TTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGAC 229373186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGAC 960

229373187 TCTGCACATT 229373196
          ||||||||||
      961 TCTGCACATT 970

EXCISED REGION

229373198 GGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAA 229373257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 GGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAA 1031

229373258 GGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACC 229373317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 GGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACC 1091

229373318 TGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTG 229373377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 TGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTG 1151

229373378 ACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGTGAATAAACATATACAAATGTCCAAG 229373437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 ACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGTGAATAAACATATACAAATGTCCAAG 1211

229373438 CTCACCAATACAGAAAAAAAAAAAAAACACAGCTCAATAACATTTTTCATTTATCAGTCT 229373497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 CTCACCAATACAGAAAAAAAAAAAAAACACAGCTCAATAACATTTTTCATTTATCAGTCT 1271

229373498 GGCAAAGAGTTTCAAAATTTTTTAACAGCCAGTGGTGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTC 229373557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 GGCAAAGAGTTTCAAAATTTTTTAACAGCCAGTGGTGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTC 1331

229373558 ACACACGGGGATGGAAGTTACTTTGGAAATAAGTTAAACGCTTTAACTCACACACACCCA 229373617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 ACACACGGGGATGGAAGTTACTTTGGAAATAAGTTAAACGCTTTAACTCACACACACCCA 1391

229373618 TTGTTCGTTTTTGGAATTATCCAAAGGAAATATAGTGGATCCATGCAAAGACAGCAATTT 229373677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 TTGTTCGTTTTTGGAATTATCCAAAGGAAATATAGTGGATCCATGCAAAGACAGCAATTT 1451

229373678 CAAGAGGCTCATCACAGGGTTATTTTTGATAGAAAAACCTAACAGTCCAACAATAGGATG 229373737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 CAAGAGGCTCATCACAGGGTTATTTTTGATAGAAAAACCTAACAGTCCAACAATAGGATG 1511

229373738 CTGGTTAAATAAGGTATGATATACCCATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAA 229373797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     1512 CTGGTTAAATAAGGTATGATATACCCATCCATTCTGAAATGCTGT-AAAAAAAAAAAAAA 1570

229373798 AAAAGTATTTAATGGCATGAAAAATGTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTAT 229373857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 AAAAGTATTTAATGGCATGAAAAATGTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTAT 1630

229373858 AAACAATATGCAAAGTGTGTGAATATATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAAT 229373917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 AAACAATATGCAAAGTGTGTGAATATATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAAT 1690

229373918 GTCAAAGACAGAATTACAACAAATTTTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGA 229373977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 GTCAAAGACAGAATTACAACAAATTTTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGA 1750

229373978 ATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAAATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAAC 229374037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 ATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAAATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAAC 1810

229374038 CGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAAGGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAAC 229374097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 CGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAAGGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAAC 1870

229374098 ATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTGTAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATAT 229374157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 ATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTGTAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATAT 1930

229374158 ACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAATCTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAA 229374217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 ACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAATCTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAA 1990

229374218 ATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTAGTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCA 229374277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 ATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTAGTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCA 2050

229374278 TTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGAGCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCT 229374337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 TTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGAGCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCT 2110

229374338 CTCATAATTTTTGTTTAATGATAGAAAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGG 229374397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 CTCATAATTTTTGTTTAATGATAGAAAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGG 2170

229374398 AATATGGGATATTTAAATTTTCTTCCTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAA 229374457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 AATATGGGATATTTAAATTTTCTTCCTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAA 2230

229374458 TGAATACTCATTACTGCTGGATTAAGAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACA 229374517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 TGAATACTCATTACTGCTGGATTAAGAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACA 2290

229374518 AAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGCAGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAA 229374577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 AAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGCAGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAA 2350

229374578 GCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTCAGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCC 229374637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 GCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTCAGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCC 2410

229374638 CTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGAAAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGA 229374697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 CTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGAAAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGA 2470

229374698 CAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATGCTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATT 229374757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 CAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATGCTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATT 2530

229374758 TTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCACAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCC 229374809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 TTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCACAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCC 2582

Alignment time is 1.90234 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3387] =>      3387 nucs 'mol-32-3240-135119_3387'

Score:        3336
Aligned:      3398        nucs
Identic:      3385 (100%) nucs =>       646 (100%)      2739 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229372743,229373388] EXCISED REGION [229373763,229376514]
 second seq =>  [        1,      646] EXCISED REGION [      647,     3387]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [229373389,229373762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229372743 AGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGC 229372802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGC 60

229372803 TGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCA 229372862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCA 120

229372863 AACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAAC 229372922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAAC 180

229372923 AAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTT 229372982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTT 240

229372983 ACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGT 229373042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGT 300

229373043 CTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTG 229373102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTG 360

229373103 TTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGAT 229373162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGAT 420

229373163 GTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACA 229373222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACA 480

229373223 AACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGG 229373282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGG 540

229373283 AGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAA 229373342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAA 600

229373343 TGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 229373388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 646

EXCISED REGION

229373763 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 229373822
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      647 CATCCATTCTGAAATGCTGT-AAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 705

229373823 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 229373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      706 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 765

229373883 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 229373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      766 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 825

229373943 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 229374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      826 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 885

229374003 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 229374062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      886 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 945

229374063 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 229374122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      946 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 1005

229374123 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 229374182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1006 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 1065

229374183 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 229374242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1066 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 1125

229374243 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 229374302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1126 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 1185

229374303 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 229374362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1186 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 1245

229374363 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 229374422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1246 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 1305

229374423 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 229374482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1306 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 1365

229374483 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 229374542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1366 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 1425

229374543 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 229374602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1426 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTGAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 1485

229374603 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 229374662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 1545

229374663 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 229374722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 1605

229374723 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 229374782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 1665

229374783 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 229374842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 1725

229374843 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 229374902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 1785

229374903 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 229374962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 1845

229374963 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 229375022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 1905

229375023 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 229375082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 1965

229375083 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 229375142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 2025

229375143 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 229375202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 2085

229375203 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 229375262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 2145

229375263 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 229375322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 2205

229375323 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 229375382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 2265

229375383 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 229375442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 2325

229375443 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 229375502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 2385

229375503 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 229375562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 2445

229375563 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 229375622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 2505

229375623 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 229375682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 2565

229375683 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 229375742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 2625

229375743 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 229375802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 2685

229375803 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 229375862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 2745

229375863 GGAAACAGTACGAGACTGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGG 229375922
          ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||
     2746 GGAAACAGTACGAGACTGCCTC----------AAAAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGG 2795

229375923 GCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGTGGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGT 229375982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 GCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGTGGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGT 2855

229375983 CTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATCAATGAGATCTTACCAATATCTCTGAAC 229376042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 CTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATCAATGAGATCTTACCAATATCTCTGAAC 2915

229376043 CCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGCTAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCC 229376102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 CCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGCTAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCC 2975

229376103 ACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGTGAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGA 229376162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 ACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGTGAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGA 3035

229376163 GAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAATTAGACACTTTCAGCACCTAACATACA 229376222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 GAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAATTAGACACTTTCAGCACCTAACATACA 3095

229376223 GGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAGTACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCA 229376282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 GGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAGTACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCA 3155

229376283 GCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAGCTGTTCTCAAAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTT 229376342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 GCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAGCTGTTCTCAAAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTT 3215

229376343 TTGCTATTGTCCTGAAGTAGCAATCCCATGATGGAAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCG 229376402
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 TTGCTATTGTCCTGCAGTAGCAATCCCATGATGGAAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCG 3275

229376403 TGGCTACATTATAATGGACTTGGTGAGCATGCACTGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAG 229376462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 TGGCTACATTATAATGGACTTGGTGAGCATGCACTGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAG 3335

229376463 TGGACATAGGGGCCCATCAACCCTGCTCCAGCCAGCACCTGGTCAGAGTCAC 229376514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 TGGACATAGGGGCCCATCAACCCTGCTCCAGCCAGCACCTGGTCAGAGTCAC 3387

Alignment time is 2.49445 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2954] =>      2954 nucs 'mol-32-32fb-050193_2954'

Score:        2943
Aligned:      2954        nucs
Identic:      2953 (100%) nucs =>       469 (100%)      2484 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229371983,229372451] EXCISED REGION [229372453,229374937]
 second seq =>  [        1,      469] EXCISED REGION [      470,     2954]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [229372452,229372452]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [229373197,229373197]
 second seq =>         1 nucs [1214,1214]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [229372452,229372463] to [229372453,229372464]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229371983 GCATGAGCCACCACACCTGGATTGCCATATTATTTTAATAGAATAGGATAGGACAAAACT 229372042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCATGAGCCACCACACCTGGATTGCCATATTATTTTAATAGAATAGGATAGGACAAAACT 60

229372043 TAGAAGGTATTGGATACCATTTTCCCTGTTGAAGGAGTATTGGTAAGACACCGTCAAAGA 229372102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGAAGGTATTGGATACCATTTTCCCTGTTGAAGGAGTATTGGTAAGACACCGTCAAAGA 120

229372103 GAAATGCACCGCGTACACACGAAGAGGAACCATTTGTAGGTGGTACATAAAAGGGTAAAA 229372162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAATGCACCGCGTACACACGAAGAGGAACCATTTGTAGGTGGTACATAAAAGGGTAAAA 180

229372163 AATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGG 229372222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGG 240

229372223 CAGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTA 229372282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTA 300

229372283 CTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGG 229372342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGG 360

229372343 AGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCG 229372402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCG 420

229372403 CACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAAC 229372451
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAAC 469

EXCISED REGION

229372453 AAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAG 229372512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      470 AAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAG 529

229372513 AAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATC 229372572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      530 AAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATC 589

229372573 AGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGC 229372632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      590 AGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGC 649

229372633 AACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAAT 229372692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      650 AACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAAT 709

229372693 CATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGA 229372752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      710 CATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGA 769

229372753 AATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGT 229372812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      770 AATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGT 829

229372813 GTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACAT 229372872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      830 GTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACAT 889

229372873 ACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATG 229372932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      890 ACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATG 949

229372933 CATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCA 229372992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      950 CATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCA 1009

229372993 AAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTT 229373052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 AAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTT 1069

229373053 TTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTAC 229373112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 TTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTAC 1129

229373113 CTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGA 229373172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 CTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGA 1189

229373173 AATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGG 229373232
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 AATATGTTAGGGACTCTGCACATTTGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGG 1249

229373233 GTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGT 229373292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 GTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGT 1309

229373293 TTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAAC 229373352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 TTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAAC 1369

229373353 AATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGT 229373412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 AATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAGGAAGCAGCCAATTCACAAAAGAGT 1429

229373413 GAATAAACATATACAAATGTCCAAGCTCACCAATACAGAAAAAAAAAAAAAACACAGCTC 229373472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 GAATAAACATATACAAATGTCCAAGCTCACCAATACAGAAAAAAAAAAAAAACACAGCTC 1489

229373473 AATAACATTTTTCATTTATCAGTCTGGCAAAGAGTTTCAAAATTTTTTAACAGCCAGTGG 229373532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 AATAACATTTTTCATTTATCAGTCTGGCAAAGAGTTTCAAAATTTTTTAACAGCCAGTGG 1549

229373533 TGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTCACACACGGGGATGGAAGTTACTTTGGAAATAAGTT 229373592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 TGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTCACACACGGGGATGGAAGTTACTTTGGAAATAAGTT 1609

229373593 AAACGCTTTAACTCACACACACCCATTGTTCGTTTTTGGAATTATCCAAAGGAAATATAG 229373652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 AAACGCTTTAACTCACACACACCCATTGTTCGTTTTTGGAATTATCCAAAGGAAATATAG 1669

229373653 TGGATCCATGCAAAGACAGCAATTTCAAGAGGCTCATCACAGGGTTATTTTTGATAGAAA 229373712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 TGGATCCATGCAAAGACAGCAATTTCAAGAGGCTCATCACAGGGTTATTTTTGATAGAAA 1729

229373713 AACCTAACAGTCCAACAATAGGATGCTGGTTAAATAAGGTATGATATACCCATCCATTCT 229373772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 AACCTAACAGTCCAACAATAGGATGCTGGTTAAATAAGGTATGATATACCCATCCATTCT 1789

229373773 GAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAATGTTCACAACC 229373832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 GAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAATGTTCACAACC 1849

229373833 CATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATATATAGGTACT 229373892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 CATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATATATAGGTACT 1909

229373893 GTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATTTTGTTATAGA 229373952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 GTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATTTTGTTATAGA 1969

229373953 TCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAAATAGAATGAG 229374012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 TCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAAATAGAATGAG 2029

229374013 AGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAAGGAATAGAAC 229374072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 AGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAAGGAATAGAAC 2089

229374073 AGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTGTAATAAGGGT 229374132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 AGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTGTAATAAGGGT 2149

229374133 TAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAATCTCCTGTTTG 229374192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 TAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAATCTCCTGTTTG 2209

229374193 CAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTAGTCTGATTAT 229374252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 CAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTAGTCTGATTAT 2269

229374253 GTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGAGCCTAGTGCA 229374312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 GTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGAGCCTAGTGCA 2329

229374313 GGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGAAAAACACTGG 229374372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 GGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGAAAAACACTGG 2389

229374373 AAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTCCTTCTGCTTA 229374432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 AAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTCCTTCTGCTTA 2449

229374433 TCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAAGAAAAAGAAT 229374492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 TCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAAGAAAAAGAAT 2509

229374493 AAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGCAGCTTGGTAG 229374552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 AAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGCAGCTTGGTAG 2569

229374553 TTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTCAGGCCCAGAG 229374612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 TTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTCAGGCCCAGAG 2629

229374613 CCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGAAAGCCACAAG 229374672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 CCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGAAAGCCACAAG 2689

229374673 TCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATGCTTCTCCCAG 229374732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 TCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATGCTTCTCCCAG 2749

229374733 GCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCACAATGGTGGA 229374792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 GCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCACAATGGTGGA 2809

229374793 TCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACATGAGCAAGCA 229374852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 TCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACATGAGCAAGCA 2869

229374853 AGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCATGCAGGGCCCA 229374912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 AGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCATGCAGGGCCCA 2929

229374913 TGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATG 229374937
          |||||||||||||||||||||||||
     2930 TGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATG 2954

Alignment time is 2.14322 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     6423] =>      6423 nucs 'mol-32-331c-088568_6423'

Score:        6387
Aligned:      6420        nucs
Identic:      6417 (100%) nucs =>      5603 (100%)       814 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229370279,229375884] EXCISED REGION [229375888,229376701]
 second seq =>  [        6,     5609] EXCISED REGION [     5610,     6423]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [229375885,229375887]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        22 nucs [229375885,229375906] to [229375888,229375909]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [229375885,229375885] to [229375887,229375887]
 second seq =>         0 nucs

229370279 AGGGGTTAGGTGGACTGGGCACCAGCACCTTAACCCTGGGGGTAGAGATAGATTTCTGGC 229370338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        6 AGGGGTTAGGTGGACTGGGCACCAGCACCTTAACCCTGGGGGTAGAGATAGATTTCTGGC 65

229370339 TTTTAGGAGTGAAGTTGATTTTAGAGTATAAAATGCTGCCCCCACCCCATTCCAGGGCTG 229370398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       66 TTTTAGGAGTGAAGTTGATTTTAGAGTATAAAATGCTGCCCCCACCCCATTCCAGGGCTG 125

229370399 CTGGGTGTAAAAGGAAAAGAAATCTTGGGACCCCAAAATCACTAAGCCAAAGGGAAAAGT 229370458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      126 CTGGGTGTAAAAGGAAAAGAAATCTTGGGACCCCAAAATCACTAAGCCAAAGGGAAAAGT 185

229370459 CAAGCTGGGAGCTGCTTAGGGCAAACCTGCCTCCCATTCTACTCCTGAAAATGATAGCTA 229370518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 CAAGCTGGGAGCTGCTTAGGGCAAACCTGCCTCCCATTCTACTCCTGAAAATGATAGCTA 245

229370519 CTAAGATCTTTTTTAAAAGCTACAAACCTCCCTCACAAGGCATTTCCTTACGGACAAAGG 229370578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 CTAAGATCTTTTTTAAAAGCTACAAACCTCCCTCACAAGGCATTTCCTTACGGACAAAGG 305

229370579 ACAGACAGAACTCGAAGTCATCCCTCTGCTCACTGAGATAAATGCATATCTGATTGCCTC 229370638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 ACAGACAGAACTCGAAGTCATCCCTCTGCTCACTGAGATAAATGCATATCTGATTGCCTC 365

229370639 CTTTGGAAAGGCTAATCAGAAACTCAAAAGAATGCAACCATTTTGTCTCTTATCTACCTA 229370698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 CTTTGGAAAGGCTAATCAGAAACTCAAAAGAATGCAACCATTTTGTCTCTTATCTACCTA 425

229370699 TAACCTGGAAGCCCCCTCCTCACTTCGAGTTGTCCGGCCTTCCCGTACAGAACCAATGAC 229370758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 TAACCTGGAAGCCCCCTCCTCACTTCGAGTTGTCCGGCCTTCCCGTACAGAACCAATGAC 485

229370759 GGAGTGGGAAGATGATCTTCCCCTGGAATTTGGACATCCAGTGGCCAAACTCCTCTTCGA 229370818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 GGAGTGGGAAGATGATCTTCCCCTGGAATTTGGACATCCAGTGGCCAAACTCCTCTTCGA 545

229370819 CTGCCCCGCAGCCGAATACCTCTCAGTGCTCAGACATTCTCCTCTTTCTCTGCCGTGCCT 229370878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 CTGCCCCGCAGCCGAATACCTCTCAGTGCTCAGACATTCTCCTCTTTCTCTGCCGTGCCT 605

229370879 TTCTGCCATTCGTCTGCTTGTCTCCTTGTCTCCTTGTCTGCTTCTGGAGCCTGGGGTTTG 229370938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 TTCTGCCATTCGTCTGCTTGTCTCCTTGTCTCCTTGTCTGCTTCTGGAGCCTGGGGTTTG 665

229370939 GGGTTTATATGGGTACAGGATGGCCAAAAGGCAACCTTTTGGGTGTGAAAACAGGAATCC 229370998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 GGGTTTATATGGGTACAGGATGGCCAAAAGGCAACCTTTTGGGTGTGAAAACAGGAATCC 725

229370999 CTGTCCTCCTTTAGGGTCACGGGTATCTGGGCTTCAGGGTGGGGGCCTTTGCCGGAGAAC 229371058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 CTGTCCTCCTTTAGGGTCACGGGTATCTGGGCTTCAGGGTGGGGGCCTTTGCCGGAGAAC 785

229371059 CGCCCTCTTCTACCCAGTGTTTCCCTGTCTCCTGTCCGTATCACCAGCAGATGGTGCCTA 229371118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 CGCCCTCTTCTACCCAGTGTTTCCCTGTCTCCTGTCCGTATCACCAGCAGATGGTGCCTA 845

229371119 CTTTTTTAAAGCCATCATCTTATCTTCTAGCTGTACCTATTTTTTTAAATATATGTTTTA 229371178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 CTTTTTTAAAGCCATCATCTTATCTTCTAGCTGTACCTATTTTTTTAAATATATGTTTTA 905

229371179 TTTCAACAGCTTTTGGGATACAAGTGGTTTTTGGTTACATGGATGAATTGTCTAGTGGTG 229371238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 TTTCAACAGCTTTTGGGATACAAGTGGTTTTTGGTTACATGGATGAATTGTCTAGTGGTG 965

229371239 AAGTCTGAGATTTTGCTACACTCTTCACCCGAGTGACCCCAGTAGTGTACATTGTATCTA 229371298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 AAGTCTGAGATTTTGCTACACTCTTCACCCGAGTGACCCCAGTAGTGTACATTGTATCTA 1025

229371299 ATATGTAGTTTTTTTATCCTTTATCCCCTCCCACCCTGTATCTATTTTTAATTGCTTTGT 229371358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 ATATGTAGTTTTTTTATCCTTTATCCCCTCCCACCCTGTATCTATTTTTAATTGCTTTGT 1085

229371359 GAACTAAGGCAAATGTGATAAAGAGGCATCTGATGTACCTGCTTCTAGCATACAAGAAAA 229371418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 GAACTAAGGCAAATGTGATAAAGAGGCATCTGATGTACCTGCTTCTAGCATACAAGAAAA 1145

229371419 CATATTTCTTGAGCATGCTGTTACATGCTTGACACTTTATATACACTATTTCATTTAACA 229371478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 CATATTTCTTGAGCATGCTGTTACATGCTTGACACTTTATATACACTATTTCATTTAACA 1205

229371479 TCCCAACAATCCTAAAACCTGGGTTTTGTTATTGAAGAACCCAAGGCTCTGAGAGTTAAC 229371538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 TCCCAACAATCCTAAAACCTGGGTTTTGTTATTGAAGAACCCAAGGCTCTGAGAGTTAAC 1265

229371539 TAACTTGCCCAAGGTCACACAGTTAGCAAGTTGTGTGGGCAGGATATAAGCCCAGTCTGG 229371598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 TAACTTGCCCAAGGTCACACAGTTAGCAAGTTGTGTGGGCAGGATATAAGCCCAGTCTGG 1325

229371599 CTGCAAAGCTATGTTCTTTACACTGTAACTTACTCCTGAAGGAAGGAGGCTTAAAAATAA 229371658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 CTGCAAAGCTATGTTCTTTACACTGTAACTTACTCCTGAAGGAAGGAGGCTTAAAAATAA 1385

229371659 TCCATGCAGAATTTGTATCAGCTTGATATGTGTGCCTTATTATTATTATTATTATTATTA 229371718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 TCCATGCAGAATTTGTATCAGCTTGATATGTGTGCCTTATTATTATTATTATTATTATTA 1445

229371719 TTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGGGGCGTAATCTCGGCTC 229371778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 TTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGGGGCGTAATCTCGGCTC 1505

229371779 ACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTG 229371838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 ACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTG 1565

229371839 GGATTATGGGCGCCCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAAGGT 229371898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 GGATTATGGGCGCCCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAAGGT 1625

229371899 TTCACCGGGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCGATCTGCCCACCTTGG 229371958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TTCACCGGGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCGATCTGCCCACCTTGG 1685

229371959 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGATTGCCATATTATTTT 229372018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGATTGCCATATTATTTT 1745

229372019 AATAGAATAGGATAGGACAAAACTTAGAAGGTATTGGATACCATTTTCCCTGTTGAAGGA 229372078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 AATAGAATAGGATAGGACAAAACTTAGAAGGTATTGGATACCATTTTCCCTGTTGAAGGA 1805

229372079 GTATTGGTAAGACACCGTCAAAGAGAAATGCACCGCGTACACACGAAGAGGAACCATTTG 229372138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 GTATTGGTAAGACACCGTCAAAGAGAAATGCACCGCGTACACACGAAGAGGAACCATTTG 1865

229372139 TAGGTGGTACATAAAAGGGTAAAAAATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCC 229372198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 TAGGTGGTACATAAAAGGGTAAAAAATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCC 1925

229372199 AGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGC 229372258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 AGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGC 1985

229372259 CAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCA 229372318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 CAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCA 2045

229372319 TGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGC 229372378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 TGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGC 2105

229372379 GGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGAC 229372438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 GGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGAC 2165

229372439 TCCTTCTCAAAACAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAG 229372498
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 TCCTTCTCAAAACAAAAAAAAAAAA-GGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAG 2224

229372499 AGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGT 229372558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 AGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGT 2284

229372559 ATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAAT 229372618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 ATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAAT 2344

229372619 GAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAAT 229372678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 GAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAAT 2404

229372679 ATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAA 229372738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 ATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAA 2464

229372739 AATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACA 229372798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 AATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACA 2524

229372799 CCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTA 229372858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 CCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTA 2584

229372859 CTCAAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCA 229372918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 CTCAAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCA 2644

229372919 AAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGT 229372978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 AAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGT 2704

229372979 ATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTT 229373038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 ATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTT 2764

229373039 CGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTT 229373098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 CGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTT 2824

229373099 CTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACT 229373158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 CTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACT 2884

229373159 GGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATG 229373218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2885 GGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTTGGGCAGCTGGGTCAAAGGATG 2944

229373219 GACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGC 229373278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 GACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGC 3004

229373279 CTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTT 229373338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 CTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTT 3064

229373339 TGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAGGAAGCAGCCA 229373398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 TGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAGGAAGCAGCCA 3124

229373399 ATTCACAAAAGAGTGAATAAACATATACAAATGTCCAAGCTCACCAATACAGAAAAAAAA 229373458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 ATTCACAAAAGAGTGAATAAACATATACAAATGTCCAAGCTCACCAATACAGAAAAAAAA 3184

229373459 AAAAAACACAGCTCAATAACATTTTTCATTTATCAGTCTGGCAAAGAGTTTCAAAATTTT 229373518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 AAAAAACACAGCTCAATAACATTTTTCATTTATCAGTCTGGCAAAGAGTTTCAAAATTTT 3244

229373519 TTAACAGCCAGTGGTGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTCACACACGGGGATGGAAGTTAC 229373578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 TTAACAGCCAGTGGTGGAAAGGCGCAGGTGAGCCTTCTCACACACGGGGATGGAAGTTAC 3304

229373579 TTTGGAAATAAGTTAAACGCTTTAACTCACACACACCCATTGTTCGTTTTTGGAATTATC 229373638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3305 TTTGGAAATAAGTTAAACGCTTTAACTCACACACACCCATTGTTCGTTTTTGGAATTATC 3364

229373639 CAAAGGAAATATAGTGGATCCATGCAAAGACAGCAATTTCAAGAGGCTCATCACAGGGTT 229373698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3365 CAAAGGAAATATAGTGGATCCATGCAAAGACAGCAATTTCAAGAGGCTCATCACAGGGTT 3424

229373699 ATTTTTGATAGAAAAACCTAACAGTCCAACAATAGGATGCTGGTTAAATAAGGTATGATA 229373758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3425 ATTTTTGATAGAAAAACCTAACAGTCCAACAATAGGATGCTGGTTAAATAAGGTATGATA 3484

229373759 TACCCATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAA 229373818
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     3485 TACCCATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAA-GTATTTAATGGCATGAA 3543

229373819 AAATGTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTG 229373878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3544 AAATGTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTG 3603

229373879 AATATATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACA 229373938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3604 AATATATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACA 3663

229373939 AATTTTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTA 229373998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3664 AATTTTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTA 3723

229373999 CAAAATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAA 229374058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3724 CAAAATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAA 3783

229374059 ACAAGGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCT 229374118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 ACAAGGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCT 3843

229374119 TTTGTAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTG 229374178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3844 TTTGTAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTG 3903

229374179 GAATCTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGT 229374238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3904 GAATCTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGT 3963

229374239 TTTAGTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTAT 229374298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3964 TTTAGTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTAT 4023

229374299 TGGAGCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGA 229374358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4024 TGGAGCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGA 4083

229374359 TAGAAAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTT 229374418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4084 TAGAAAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTT 4143

229374419 CTTCCTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGA 229374478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4144 CTTCCTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGA 4203

229374479 TTAAGAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGG 229374538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4204 TTAAGAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGG 4263

229374539 ATGCAGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATC 229374598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4264 ATGCAGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATC 4323

229374599 CCTCAGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACC 229374658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4324 CCTCAGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACC 4383

229374659 TTGAAAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCT 229374718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4384 TTGAAAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCT 4443

229374719 GATGCTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGA 229374778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4444 GATGCTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGA 4503

229374779 CTCACAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAG 229374838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4504 CTCACAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAG 4563

229374839 CACATGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCT 229374898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4564 CACATGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCT 4623

229374899 CCATGCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTG 229374958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4624 CCATGCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTG 4683

229374959 CTCTGGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGC 229375018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4684 CTCTGGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGC 4743

229375019 ACCCACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGC 229375078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4744 ACCCACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGC 4803

229375079 AGACAGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTC 229375138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4804 AGACAGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTC 4863

229375139 TTCACCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGG 229375198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4864 TTCACCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGG 4923

229375199 TCCCAAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGG 229375258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4924 TCCCAAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGG 4983

229375259 TGAAGGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAA 229375318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4984 TGAAGGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAA 5043

229375319 AAGGGATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAA 229375378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5044 AAGGGATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAA 5103

229375379 GCCATCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTC 229375438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5104 GCCATCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTC 5163

229375439 AGCCATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGT 229375498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5164 AGCCATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGT 5223

229375499 GGGCCGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAA 229375558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5224 GGGCCGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAA 5283

229375559 GAACCAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTG 229375618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5284 GAACCAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTG 5343

229375619 GCTTATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAG 229375678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5344 GCTTATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAG 5403

229375679 CTGTTTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAAT 229375738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5404 CTGTTTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAAT 5463

229375739 TAGCCAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGA 229375798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5464 TAGCCAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGA 5523

229375799 ATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAG 229375858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5524 ATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAG 5583

229375859 CCTGGGAAACAGTACGAGACTGCCTC 229375884
          ||||||||||||||||||||||||||
     5584 CCTGGGAAACAGTACGAGACTGCCTC 5609

EXCISED REGION

229375888 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGGGCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGC 229375947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5610 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGGGCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGC 5669

229375948 TTGAAGGTGGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGTCTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTG 229376007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5670 TTGAAGGTGGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGTCTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTG 5729

229376008 TTTCTATCAATGAGATCTTACCAATATCTCTGAACCCATGATGTTCCCTCCATATGCTCG 229376067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5730 TTTCTATCAATGAGATCTTACCAATATCTCTGAACCCATGATGTTCCCTCCATATGCTCG 5789

229376068 TCAGGTGCTAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCCACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTG 229376127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5790 TCAGGTGCTAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCCACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTG 5849

229376128 AGCTGGGTGAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGAGAGTACATTCCAGGATCCAAACAGT 229376187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5850 AGCTGGGTGAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGAGAGTACATTCCAGGATCCAAACAGT 5909

229376188 TGGCTTAATTAGACACTTTCAGCACCTAACATACAGGTAATTGAGAATTGCCTTTACACA 229376247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5910 TGGCTTAATTAGACACTTTCAGCACCTAACATACAGGTAATTGAGAATTGCCTTTACACA 5969

229376248 GCTTTCAGTACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCAGCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAG 229376307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5970 GCTTTCAGTACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCAGCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAG 6029

229376308 CTGTTCTCAAAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTTTTGCTATTGTCCTGAAGTAGCAATC 229376367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6030 CTGTTCTCAAAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTTTTGCTATTGTCCTGAAGTAGCAATC 6089

229376368 CCATGATGGAAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCGTGGCTACATTATAATGGACTTGGTG 229376427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6090 CCATGATGGAAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCGTGGCTACATTATAATGGACTTGGTG 6149

229376428 AGCATGCACTGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAGTGGACATAGGGGCCCATCAACCCTG 229376487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6150 AGCATGCACTGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAGTGGACATAGGGGCCCATCAACCCTG 6209

229376488 CTCCAGCCAGCACCTGGTCAGAGTCACTAACTACAACAATGACACCATGGGGACCCCTGG 229376547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6210 CTCCAGCCAGCACCTGGTCAGAGTCACTAACTACAACAATGACACCATGGGGACCCCTGG 6269

229376548 GGCTGCTGTCTGTGGGGCTTTGTATCTTGGCCAGTAAAGCCATCCTAAGGTCAGGGCCAA 229376607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6270 GGCTGCTGTCTGTGGGGCTTTGTATCTTGGCCAGTAAAGCCATCCTAAGGTCAGGGCCAA 6329

229376608 AACCAGAAGCAGAGGGGGCCCGGCCTCAGCTAACAATACTGTGGGGAAGTTCAGCGAGGC 229376667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6330 AACCAGAAGCAGAGGGGGCCCGGCCTCAGCTAACAATACTGTGGGGAAGTTCAGCGAGGC 6389

229376668 TGTCAGCCCCCTCCAGCCCCCAGTCACTCTTGAA 229376701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6390 TGTCAGCCCCCTCCAGCCCCCAGTCACTCTTGAA 6423

Alignment time is 4.72123 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5626] =>      5626 nucs 'mol-32-338a-231330_5626'

Score:        5527
Aligned:      5643        nucs
Identic:      5621 (100%) nucs =>      1123 (100%)      4498 (100%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229372263,229373388] EXCISED REGION [229373763,229378279]
 second seq =>  [        1,     1123] EXCISED REGION [     1124,     5626]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [229373389,229373762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229372263 ATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCC 229372322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCC 60

229372323 TGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAG 229372382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAG 120

229372383 GTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCT 229372442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCT 180

229372443 TCTCAAAACAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTT 229372502
          ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCAAAA---AAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTT 237

229372503 TTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTA 229372562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      238 TTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTA 297

229372563 TCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAA 229372622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 TCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAA 357

229372623 ATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAA 229372682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 ATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAA 417

229372683 AATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATT 229372742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 AATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATT 477

229372743 AGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGC 229372802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 AGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGC 537

229372803 TGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCA 229372862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 TGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCA 597

229372863 AACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAAC 229372922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 AACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAAC 657

229372923 AAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTT 229372982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 AAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTT 717

229372983 ACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGT 229373042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 ACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGT 777

229373043 CTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTG 229373102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 CTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTG 837

229373103 TTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGAT 229373162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 TTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGAT 897

229373163 GTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACA 229373222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 GTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACA 957

229373223 AACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGG 229373282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 AACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGG 1017

229373283 AGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAA 229373342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 AGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAA 1077

229373343 TGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 229373388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 TGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 1123

EXCISED REGION

229373763 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 229373822
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 CATCCATTCTGAAATGCTGT--AAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 1181

229373823 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 229373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 1241

229373883 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 229373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 1301

229373943 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 229374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 1361

229374003 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 229374062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 1421

229374063 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 229374122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 1481

229374123 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 229374182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 1541

229374183 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 229374242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 1601

229374243 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 229374302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 1661

229374303 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 229374362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 1721

229374363 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 229374422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 1781

229374423 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 229374482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 1841

229374483 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 229374542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 1901

229374543 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 229374602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1902 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTGAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 1961

229374603 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 229374662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 2021

229374663 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 229374722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 2081

229374723 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 229374782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 2141

229374783 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 229374842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 2201

229374843 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 229374902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 2261

229374903 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 229374962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 2321

229374963 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 229375022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 2381

229375023 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 229375082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 2441

229375083 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 229375142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 2501

229375143 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 229375202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 2561

229375203 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 229375262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 2621

229375263 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 229375322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 2681

229375323 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 229375382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 2741

229375383 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 229375442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 2801

229375443 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 229375502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 2861

229375503 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 229375562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 2921

229375563 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 229375622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 2981

229375623 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 229375682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 3041

229375683 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 229375742
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 TTGAGATGAGCCTGGACAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 3101

229375743 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 229375802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 3161

229375803 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 229375862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 3221

229375863 GGAAACAGTACGAGACTGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGG 229375922
          ||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||
     3222 GGAAACAGTACGAGACTGCCTC------------AAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGG 3269

229375923 GCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGTGGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGT 229375982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 GCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGTGGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGT 3329

229375983 CTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATCAATGAGATCTTACCAATATCTCTGAAC 229376042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 CTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATCAATGAGATCTTACCAATATCTCTGAAC 3389

229376043 CCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGCTAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCC 229376102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 CCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGCTAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCC 3449

229376103 ACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGTGAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGA 229376162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3450 ACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGTGAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGA 3509

229376163 GAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAATTAGACACTTTCAGCACCTAACATACA 229376222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 GAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAATTAGACACTTTCAGCACCTAACATACA 3569

229376223 GGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAGTACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCA 229376282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 GGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAGTACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCA 3629

229376283 GCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAGCTGTTCTCAAAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTT 229376342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 GCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAGCTGTTCTCAAAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTT 3689

229376343 TTGCTATTGTCCTGAAGTAGCAATCCCATGATGGAAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCG 229376402
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3690 TTGCTATTGTCCTGCAGTAGCAATCCCATGATGGAAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCG 3749

229376403 TGGCTACATTATAATGGACTTGGTGAGCATGCACTGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAG 229376462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 TGGCTACATTATAATGGACTTGGTGAGCATGCACTGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAG 3809

229376463 TGGACATAGGGGCCCATCAACCCTGCTCCAGCCAGCACCTGGTCAGAGTCACTAACTACA 229376522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3810 TGGACATAGGGGCCCATCAACCCTGCTCCAGCCAGCACCTGGTCAGAGTCACTAACTACA 3869

229376523 ACAATGACACCATGGGGACCCCTGGGGCTGCTGTCTGTGGGGCTTTGTATCTTGGCCAGT 229376582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3870 ACAATGACACCATGGGGACCCCTGGGGCTGCTGTCTGTGGGGCTTTGTATCTTGGCCAGT 3929

229376583 AAAGCCATCCTAAGGTCAGGGCCAAAACCAGAAGCAGAGGGGGCCCGGCCTCAGCTAACA 229376642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3930 AAAGCCATCCTAAGGTCAGGGCCAAAACCAGAAGCAGAGGGGGCCCGGCCTCAGCTAACA 3989

229376643 ATACTGTGGGGAAGTTCAGCGAGGCTGTCAGCCCCCTCCAGCCCCCAGTCACTCTTGAAG 229376702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3990 ATACTGTGGGGAAGTTCAGCGAGGCTGTCAGCCCCCTCCAGCCCCCAGTCACTCTTGAAG 4049

229376703 GGTTGTGACAGTCACCCCCTGCTGCTGGCTCTGAAACTACCCTCCCACCCACCCCCCTCA 229376762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4050 GGTTGTGACAGTCACCCCCTGCTGCTGGCTCTGAAACTACCCTCCCACCCACCCCCCTCA 4109

229376763 ACTGACTCCTTTAGGGACTGCTTACCCACATAAAAACAAAGAAATTTTTCTTTTTTCCCC 229376822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4110 ACTGACTCCTTTAGGGACTGCTTACCCACATAAAAACAAAGAAATTTTTCTTTTTTCCCC 4169

229376823 AAAGTAGGTAAATATGGATGTGAAAAGTGGGCAGTGGTCCAAAAGGAAAAATGATGAACG 229376882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4170 AAAGTAGGTAAATATGGATGTGAAAAGTGGGCAGTGGTCCAAAAGGAAAAATGATGAACG 4229

229376883 ACTAGAGGCCTGTGCTTAGAGCTGTCCACCCACTGCAAGTGTTTGGCAGGGCCCTGGAGT 229376942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4230 ACTAGAGGCCTGTGCTTAGAGCTGTCCACCCACTGCAAGTGTTTGGCAGGGCCCTGGAGT 4289

229376943 CTAGGCACTTCCATTTTGTTTCCCAAGTGACCATGATTGGTCAATACCTAGGATATCTTT 229377002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4290 CTAGGCACTTCCATTTTGTTTCCCAAGTGACCATGATTGGTCAATACCTAGGATATCTTT 4349

229377003 TCTTTAAATGCTTGATAATGAACATACCTGTACCTACCCATCATCATCCTTAGAAAACAC 229377062
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4350 TCTTTAAATGCTTGATAATGAACATACCTGTACCTGCCCATCATCATCCTTAGAAAACAC 4409

229377063 CACTTTACCAAAAGAGAGAAGGGGGTGATTATTCGTCCCCTAAAGAAGGAACTCCTGAAG 229377122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4410 CACTTTACCAAAAGAGAGAAGGGGGTGATTATTCGTCCCCTAAAGAAGGAACTCCTGAAG 4469

229377123 CCCCCTTTAAGTATTAACTTGTCTCCTATACCTGGTTTTGAGTGGTTTATTGAGATAAGA 229377182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4470 CCCCCTTTAAGTATTAACTTGTCTCCTATACCTGGTTTTGAGTGGTTTATTGAGATAAGA 4529

229377183 TCCCAGGCCAAATCAGGGCCCTGAACAGTCCCCTAGACTAGGGGGCCCAACAAACTATGG 229377242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4530 TCCCAGGCCAAATCAGGGCCCTGAACAGTCCCCTAGACTAGGGGGCCCAACAAACTATGG 4589

229377243 CCCAAGGGCCTTTTTATAAATAAAGTTTTATTGAAACGCAGACACTCCCATTTGTTAACT 229377302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4590 CCCAAGGGCCTTTTTATAAATAAAGTTTTATTGAAACGCAGACACTCCCATTTGTTAACT 4649

229377303 ATTGTCTATGGCTGCTTTTGTGCCACAGTAGCAGATGCGAGGAGTTGTGAAAAAGGTCAC 229377362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4650 ATTGTCTATGGCTGCTTTTGTGCCACAGTAGCAGATGCGAGGAGTTGTGAAAAAGGTCAC 4709

229377363 ATGACCTGCAAAGTTGATAAGGTTTGGCTCCATGTCCCCACCCACATCCCATCTCAAGTT 229377422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4710 ATGACCTGCAAAGTTGATAAGGTTTGGCTCCATGTCCCCACCCACATCCCATCTCAAGTT 4769

229377423 GTGATCCTTAGTGTTGAAGGAGGGAGGTGACTGGACAATGGGAGCGGACTTCCCACTTGC 229377482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4770 GTGATCCTTAGTGTTGAAGGAGGGAGGTGACTGGACAATGGGAGCGGACTTCCCACTTGC 4829

229377483 TATTCTCGTGATAGCATTCTCATTAGACCTGGTGGTTTGAAAGTGTGCAGCACCTCCCAC 229377542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4830 TATTCTCGTGATAGCATTCTCATTAGACCTGGTGGTTTGAAAGTGTGCAGCACCTCCCAC 4889

229377543 CCCCACCTCCTGCTCTGCCATGTGAAGATGTGCCTGCCTCCCCTTCGCCTTCCGCCGTGA 229377602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4890 CCCCACCTCCTGCTCTGCCATGTGAAGATGTGCCTGCCTCCCCTTCGCCTTCCGCCGTGA 4949

229377603 TTGTAAGCTTCCTGAGGCCTCCCTAGTCATGCCTTCTGTTCAGCCTGCAGAACTGTGACT 229377662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4950 TTGTAAGCTTCCTGAGGCCTCCCTAGTCATGCCTTCTGTTCAGCCTGCAGAACTGTGACT 5009

229377663 CAAGTAAACCTCTTTCCTTCATTAATTACCCAGTCTCGGGTATGTCTTTATAACAGTGTG 229377722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5010 CAAGTAAACCTCTTTCCTTCATTAATTACCCAGTCTCGGGTATGTCTTTATAACAGTGTG 5069

229377723 AGAACAGACTAATACAAAAGGTAAAAATATTTTCTGTCTTGCTCTTTACAGACAAAGGTC 229377782
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5070 AGAACAGACTAATACAAAAGGTAAAAATGTTTTCTGTCTTGCTCTTTACAGACAAAGGTC 5129

229377783 ACCAATCCTTGCTCTAGACAGCGGCAGGCTGCTAGGGCCTATCTGTTGCCCTGATGTAGG 229377842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5130 ACCAATCCTTGCTCTAGACAGCGGCAGGCTGCTAGGGCCTATCTGTTGCCCTGATGTAGG 5189

229377843 CCCCAGTAGTTTCCCTAACATTCACATCACCAAAGCTGTCTGCTGCTTTTTGAGGAGAGG 229377902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5190 CCCCAGTAGTTTCCCTAACATTCACATCACCAAAGCTGTCTGCTGCTTTTTGAGGAGAGG 5249

229377903 TATGGAGAGGTTAGGAATGTGGGAGAGGGGGACTTATTGGAGGAACAAGTGAGACAGAGA 229377962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5250 TATGGAGAGGTTAGGAATGTGGGAGAGGGGGACTTATTGGAGGAACAAGTGAGACAGAGA 5309

229377963 TGAAGGCAATTTAAAGTCTTCAGAAAAAGAGAAGGGTAAGATGACAACAAGAATGAAAAG 229378022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5310 TGAAGGCAATTTAAAGTCTTCAGAAAAAGAGAAGGGTAAGATGACAACAAGAATGAAAAG 5369

229378023 AAAAGAAAGAGAGAAAGCATCTCAAAAAATGCATAAATTTATAAGCATATATAATTAGAT 229378082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5370 AAAAGAAAGAGAGAAAGCATCTCAAAAAATGCATAAATTTATAAGCATATATAATTAGAT 5429

229378083 ATAAAAAATTACGATTCTAACATAAAGTTTTAGCTAATGCTTAAATCAGAACACATCTGT 229378142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5430 ATAAAAAATTACGATTCTAACATAAAGTTTTAGCTAATGCTTAAATCAGAACACATCTGT 5489

229378143 TACAGGCCAACAGGCATATAAAAATTAGAATAACAATAGTAAGTCACCTTGGATTTCTAT 229378202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5490 TACAGGCCAACAGGCATATAAAAATTAGAATAACAATAGTAAGTCACCTTGGATTTCTAT 5549

229378203 AGGTCTTTTCTTCCAGTAAGTTCAAAGCCTTTCCTTCTAATCTCTCATCTACTTATATAA 229378262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5550 AGGTCTTTTCTTCCAGTAAGTTCAAAGCCTTTCCTTCTAATCTCTCATCTACTTATATAA 5609

229378263 AATTTATGAGAACTGTT 229378279
          |||||||||||||||||
     5610 AATTTATGAGAACTGTT 5626

Alignment time is 4.16559 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     8334] =>      8334 nucs 'mol-32-3395-129477_8334'

Score:        8149
Aligned:      8349        nucs
Identic:      8321 (100%) nucs =>      1058 (100%)      7263 (100%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229372329,229373388] EXCISED REGION [229373763,229381051]
 second seq =>  [        1,     1059] EXCISED REGION [     1060,     8334]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [229373389,229373762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229372329 TCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCA 229372388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCA 60

229372389 GTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAA 229372448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAA 120

229372449 AACAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTA 229372508
          || |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AA-AAAAAAAAAAAAAGGCTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTA 179

229372509 TTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATA 229372568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 TTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATA 239

229372569 GATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAA 229372628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 GATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAA 299

229372629 AAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTA 229372688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 AAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTA 359

229372689 AAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGA 229372748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 AAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGA 419

229372749 CAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTG 229372808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 CAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTG 479

229372809 GAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAA 229372868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 GAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAA 539

229372869 ACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATG 229372928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 ACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATG 599

229372929 AATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATA 229372988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 AATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATA 659

229372989 GTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTG 229373048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTG 719

229373049 GCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTA 229373108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTA 779

229373109 TTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACA 229373168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACA 839

229373169 AGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTT 229373228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 AGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTT 899

229373229 GAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAG 229373288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAG 959

229373289 GTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCA 229373348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCA 1019

229373349 AAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 229373388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 AAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 1059

EXCISED REGION

229373763 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 229373822
          ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 CATCCATTCTGAAATGCTGT---AAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 1116

229373823 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 229373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 1176

229373883 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 229373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 1236

229373943 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 229374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 1296

229374003 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 229374062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 1356

229374063 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 229374122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 1416

229374123 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 229374182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 1476

229374183 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 229374242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 1536

229374243 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 229374302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 1596

229374303 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 229374362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 1656

229374363 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 229374422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 1716

229374423 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 229374482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 1776

229374483 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 229374542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 1836

229374543 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 229374602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1837 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTGAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 1896

229374603 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 229374662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 1956

229374663 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 229374722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 2016

229374723 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 229374782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 2076

229374783 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 229374842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 2136

229374843 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 229374902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 2196

229374903 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 229374962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 2256

229374963 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 229375022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 2316

229375023 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 229375082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 2376

229375083 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 229375142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 2436

229375143 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 229375202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 2496

229375203 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 229375262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 2556

229375263 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 229375322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 2616

229375323 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 229375382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 2676

229375383 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 229375442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 2736

229375443 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 229375502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 2796

229375503 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 229375562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 2856

229375563 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 229375622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 2916

229375623 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 229375682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 2976

229375683 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 229375742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 3036

229375743 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 229375802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 3096

229375803 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 229375862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 3156

229375863 GGAAACAGTACGAGACTGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGG 229375922
          ||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||
     3157 GGAAACAGTACGAGACTGCCTC-----------AAAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGG 3205

229375923 GCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGTGGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGT 229375982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 GCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGTGGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGT 3265

229375983 CTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATCAATGAGATCTTACCAATATCTCTGAAC 229376042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 CTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATCAATGAGATCTTACCAATATCTCTGAAC 3325

229376043 CCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGCTAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCC 229376102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 CCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGCTAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCC 3385

229376103 ACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGTGAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGA 229376162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 ACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGTGAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGA 3445

229376163 GAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAATTAGACACTTTCAGCACCTAACATACA 229376222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 GAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAATTAGACACTTTCAGCACCTAACATACA 3505

229376223 GGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAGTACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCA 229376282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 GGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAGTACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCA 3565

229376283 GCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAGCTGTTCTCAAAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTT 229376342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 GCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAGCTGTTCTCAAAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTT 3625

229376343 TTGCTATTGTCCTGAAGTAGCAATCCCATGATGGAAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCG 229376402
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 TTGCTATTGTCCTGCAGTAGCAATCCCATGATGGAAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCG 3685

229376403 TGGCTACATTATAATGGACTTGGTGAGCATGCACTGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAG 229376462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 TGGCTACATTATAATGGACTTGGTGAGCATGCACTGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAG 3745

229376463 TGGACATAGGGGCCCATCAACCCTGCTCCAGCCAGCACCTGGTCAGAGTCACTAACTACA 229376522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 TGGACATAGGGGCCCATCAACCCTGCTCCAGCCAGCACCTGGTCAGAGTCACTAACTACA 3805

229376523 ACAATGACACCATGGGGACCCCTGGGGCTGCTGTCTGTGGGGCTTTGTATCTTGGCCAGT 229376582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3806 ACAATGACACCATGGGGACCCCTGGGGCTGCTGTCTGTGGGGCTTTGTATCTTGGCCAGT 3865

229376583 AAAGCCATCCTAAGGTCAGGGCCAAAACCAGAAGCAGAGGGGGCCCGGCCTCAGCTAACA 229376642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 AAAGCCATCCTAAGGTCAGGGCCAAAACCAGAAGCAGAGGGGGCCCGGCCTCAGCTAACA 3925

229376643 ATACTGTGGGGAAGTTCAGCGAGGCTGTCAGCCCCCTCCAGCCCCCAGTCACTCTTGAAG 229376702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 ATACTGTGGGGAAGTTCAGCGAGGCTGTCAGCCCCCTCCAGCCCCCAGTCACTCTTGAAG 3985

229376703 GGTTGTGACAGTCACCCCCTGCTGCTGGCTCTGAAACTACCCTCCCACCCACCCCCCTCA 229376762
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 GGTTGTGACAGTCACCCCTTGCTGCTGGCTCTGAAACTACCCTCCCACCCACCCCCCTCA 4045

229376763 ACTGACTCCTTTAGGGACTGCTTACCCACATAAAAACAAAGAAATTTTTCTTTTTTCCCC 229376822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 ACTGACTCCTTTAGGGACTGCTTACCCACATAAAAACAAAGAAATTTTTCTTTTTTCCCC 4105

229376823 AAAGTAGGTAAATATGGATGTGAAAAGTGGGCAGTGGTCCAAAAGGAAAAATGATGAACG 229376882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 AAAGTAGGTAAATATGGATGTGAAAAGTGGGCAGTGGTCCAAAAGGAAAAATGATGAACG 4165

229376883 ACTAGAGGCCTGTGCTTAGAGCTGTCCACCCACTGCAAGTGTTTGGCAGGGCCCTGGAGT 229376942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 ACTAGAGGCCTGTGCTTAGAGCTGTCCACCCACTGCAAGTGTTTGGCAGGGCCCTGGAGT 4225

229376943 CTAGGCACTTCCATTTTGTTTCCCAAGTGACCATGATTGGTCAATACCTAGGATATCTTT 229377002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 CTAGGCACTTCCATTTTGTTTCCCAAGTGACCATGATTGGTCAATACCTAGGATATCTTT 4285

229377003 TCTTTAAATGCTTGATAATGAACATACCTGTACCTACCCATCATCATCCTTAGAAAACAC 229377062
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4286 TCTTTAAATGCTTGATAATGAACATACCTGTACCTGCCCATCATCATCCTTAGAAAACAC 4345

229377063 CACTTTACCAAAAGAGAGAAGGGGGTGATTATTCGTCCCCTAAAGAAGGAACTCCTGAAG 229377122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 CACTTTACCAAAAGAGAGAAGGGGGTGATTATTCGTCCCCTAAAGAAGGAACTCCTGAAG 4405

229377123 CCCCCTTTAAGTATTAACTTGTCTCCTATACCTGGTTTTGAGTGGTTTATTGAGATAAGA 229377182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 CCCCCTTTAAGTATTAACTTGTCTCCTATACCTGGTTTTGAGTGGTTTATTGAGATAAGA 4465

229377183 TCCCAGGCCAAATCAGGGCCCTGAACAGTCCCCTAGACTAGGGGGCCCAACAAACTATGG 229377242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 TCCCAGGCCAAATCAGGGCCCTGAACAGTCCCCTAGACTAGGGGGCCCAACAAACTATGG 4525

229377243 CCCAAGGGCCTTTTTATAAATAAAGTTTTATTGAAACGCAGACACTCCCATTTGTTAACT 229377302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 CCCAAGGGCCTTTTTATAAATAAAGTTTTATTGAAACGCAGACACTCCCATTTGTTAACT 4585

229377303 ATTGTCTATGGCTGCTTTTGTGCCACAGTAGCAGATGCGAGGAGTTGTGAAAAAGGTCAC 229377362
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4586 ATTGTCTATGGCTGCTTTTGTGCCACAGTAGCAGATGCGAGGAGTTGTGAAGAAGGTCAC 4645

229377363 ATGACCTGCAAAGTTGATAAGGTTTGGCTCCATGTCCCCACCCACATCCCATCTCAAGTT 229377422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 ATGACCTGCAAAGTTGATAAGGTTTGGCTCCATGTCCCCACCCACATCCCATCTCAAGTT 4705

229377423 GTGATCCTTAGTGTTGAAGGAGGGAGGTGACTGGACAATGGGAGCGGACTTCCCACTTGC 229377482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 GTGATCCTTAGTGTTGAAGGAGGGAGGTGACTGGACAATGGGAGCGGACTTCCCACTTGC 4765

229377483 TATTCTCGTGATAGCATTCTCATTAGACCTGGTGGTTTGAAAGTGTGCAGCACCTCCCAC 229377542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 TATTCTCGTGATAGCATTCTCATTAGACCTGGTGGTTTGAAAGTGTGCAGCACCTCCCAC 4825

229377543 CCCCACCTCCTGCTCTGCCATGTGAAGATGTGCCTGCCTCCCCTTCGCCTTCCGCCGTGA 229377602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 CCCCACCTCCTGCTCTGCCATGTGAAGATGTGCCTGCCTCCCCTTCGCCTTCCGCCGTGA 4885

229377603 TTGTAAGCTTCCTGAGGCCTCCCTAGTCATGCCTTCTGTTCAGCCTGCAGAACTGTGACT 229377662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 TTGTAAGCTTCCTGAGGCCTCCCTAGTCATGCCTTCTGTTCAGCCTGCAGAACTGTGACT 4945

229377663 CAAGTAAACCTCTTTCCTTCATTAATTACCCAGTCTCGGGTATGTCTTTATAACAGTGTG 229377722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 CAAGTAAACCTCTTTCCTTCATTAATTACCCAGTCTCGGGTATGTCTTTATAACAGTGTG 5005

229377723 AGAACAGACTAATACAAAAGGTAAAAATATTTTCTGTCTTGCTCTTTACAGACAAAGGTC 229377782
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 AGAACAGACTAATACAAAAGGTAAAAATGTTTTCTGTCTTGCTCTTTACAGACAAAGGTC 5065

229377783 ACCAATCCTTGCTCTAGACAGCGGCAGGCTGCTAGGGCCTATCTGTTGCCCTGATGTAGG 229377842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 ACCAATCCTTGCTCTAGACAGCGGCAGGCTGCTAGGGCCTATCTGTTGCCCTGATGTAGG 5125

229377843 CCCCAGTAGTTTCCCTAACATTCACATCACCAAAGCTGTCTGCTGCTTTTTGAGGAGAGG 229377902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 CCCCAGTAGTTTCCCTAACATTCACATCACCAAAGCTGTCTGCTGCTTTTTGAGGAGAGG 5185

229377903 TATGGAGAGGTTAGGAATGTGGGAGAGGGGGACTTATTGGAGGAACAAGTGAGACAGAGA 229377962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 TATGGAGAGGTTAGGAATGTGGGAGAGGGGGACTTATTGGAGGAACAAGTGAGACAGAGA 5245

229377963 TGAAGGCAATTTAAAGTCTTCAGAAAAAGAGAAGGGTAAGATGACAACAAGAATGAAAAG 229378022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 TGAAGGCAATTTAAAGTCTTCAGAAAAAGAGAAGGGTAAGATGACAACAAGAATGAAAAG 5305

229378023 AAAAGAAAGAGAGAAAGCATCTCAAAAAATGCATAAATTTATAAGCATATATAATTAGAT 229378082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 AAAAGAAAGAGAGAAAGCATCTCAAAAAATGCATAAATTTATAAGCATATATAATTAGAT 5365

229378083 ATAAAAAATTACGATTCTAACATAAAGTTTTAGCTAATGCTTAAATCAGAACACATCTGT 229378142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 ATAAAAAATTACGATTCTAACATAAAGTTTTAGCTAATGCTTAAATCAGAACACATCTGT 5425

229378143 TACAGGCCAACAGGCATATAAAAATTAGAATAACAATAGTAAGTCACCTTGGATTTCTAT 229378202
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 TACGGGCCAACAGGCATATAAAAATTAGAATAACAATAGTAAGTCACCTTGGATTTCTAT 5485

229378203 AGGTCTTTTCTTCCAGTAAGTTCAAAGCCTTTCCTTCTAATCTCTCATCTACTTATATAA 229378262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 AGGTCTTTTCTTCCAGTAAGTTCAAAGCCTTTCCTTCTAATCTCTCATCTACTTATATAA 5545

229378263 AATTTATGAGAACTGTTCTCATTTAACAGATGAGAAAACAGGATAAACTACAACAAAATT 229378322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 AATTTATGAGAACTGTTCTCATTTAACAGATGAGAAAACAGGATAAACTACAACAAAATT 5605

229378323 GGATTTGAGGTTTCTTAACTTCAGATGACCATATGATTTTTCATCTAATAACCAGTGCTC 229378382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 GGATTTGAGGTTTCTTAACTTCAGATGACCATATGATTTTTCATCTAATAACCAGTGCTC 5665

229378383 CTTTTGTGAGCAAATAGGGGAGGGTGCAATTAATAATTACACTTGGACAACAGGTGGAAG 229378442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 CTTTTGTGAGCAAATAGGGGAGGGTGCAATTAATAATTACACTTGGACAACAGGTGGAAG 5725

229378443 CCAAAACTGTCCCAGGCACACATTAATTCTCACTTTAATAATCTGTGTTCCACAGAGAAA 229378502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 CCAAAACTGTCCCAGGCACACATTAATTCTCACTTTAATAATCTGTGTTCCACAGAGAAA 5785

229378503 ATAGAATTAGGAAAGTTCATTTGTATGATTTTCAGCAAGTCAAATATCCACAAACTTACT 229378562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 ATAGAATTAGGAAAGTTCATTTGTATGATTTTCAGCAAGTCAAATATCCACAAACTTACT 5845

229378563 TCGTGGGAGTTTAGAATGTAAGAAACAGAGAAATGAGGTTGTTGTATAGAAATTTCACAA 229378622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 TCGTGGGAGTTTAGAATGTAAGAAACAGAGAAATGAGGTTGTTGTATAGAAATTTCACAA 5905

229378623 GCCTAGCCAGGCATGGTGGCATGCACCTGTAGTCCCAGCTATTTGGTAGACTGAGGCAAG 229378682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 GCCTAGCCAGGCATGGTGGCATGCACCTGTAGTCCCAGCTATTTGGTAGACTGAGGCAAG 5965

229378683 AGAACTGCTTGAGTTAGGAATCTTGAGGCTGCAGTGAGCTATGATTGTGCCACTGCACTC 229378742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5966 AGAACTGCTTGAGTTAGGAATCTTGAGGCTGCAGTGAGCTATGATTGTGCCACTGCACTC 6025

229378743 CAGCGTGGATGACAGAGCAAGACCCCATCTCTAAAAAGAAAAAGAAAAAAAGAAACTTCA 229378802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6026 CAGCGTGGATGACAGAGCAAGACCCCATCTCTAAAAAGAAAAAGAAAAAAAGAAACTTCA 6085

229378803 CAAGCTCAGAATTCTAGGAAGCAGCTGAGCTGCCCACCTCTAGTCCTGGGGCCTCAAAGC 229378862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6086 CAAGCTCAGAATTCTAGGAAGCAGCTGAGCTGCCCACCTCTAGTCCTGGGGCCTCAAAGC 6145

229378863 TATTAGCTTATCAACTTGTCATTAGGGCCAAAGCAGGAAGAGTTCTGAGGAGGAAAGGGA 229378922
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     6146 TATTAGCTTATCAACTTGTCATTAGGACCAAAGCAGGAAGAGTTCTGAGGAGGAAAGGGA 6205

229378923 AGGGAGGTGGGAAGCAATACCTATAGCCAAAGGTGCTCTGAAAGCCACAGAGAATCTGGC 229378982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 AGGGAGGTGGGAAGCAATACCTATAGCCAAAGGTGCTCTGAAAGCCACAGAGAATCTGGC 6265

229378983 CTAAATGGGGAGACCAGGCCCAGATCTCAAAGCCTGTGTTCTTCCATGAAAAGGTGGAAC 229379042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 CTAAATGGGGAGACCAGGCCCAGATCTCAAAGCCTGTGTTCTTCCATGAAAAGGTGGAAC 6325

229379043 AGTGGAAACTGATTATTCAAATACCTCTCATGCTTTGGCAGAGAGAGGAAGGAGGGAGAC 229379102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6326 AGTGGAAACTGATTATTCAAATACCTCTCATGCTTTGGCAGAGAGAGGAAGGAGGGAGAC 6385

229379103 AGGAGGGGAGGGTTATCATTAGCCTTTGTTGGCTATTCATCTTTCTGTCATACAGGAGAC 229379162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 AGGAGGGGAGGGTTATCATTAGCCTTTGTTGGCTATTCATCTTTCTGTCATACAGGAGAC 6445

229379163 AGCTTATAAATGTTGGATGAATGAATGATTGATTGAATGTATTTCCCTGCGCAAACTTAA 229379222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6446 AGCTTATAAATGTTGGATGAATGAATGATTGATTGAATGTATTTCCCTGCGCAAACTTAA 6505

229379223 ATTGACTTATTAGCTTCAAATATTGGAATAGCATTTGTAGACACAAACCAAGATTTCAGA 229379282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6506 ATTGACTTATTAGCTTCAAATATTGGAATAGCATTTGTAGACACAAACCAAGATTTCAGA 6565

229379283 CGGCTCCACTACTTGTACTGGATTCCTCCACTTCAGTCCAGATCCCTCTCCCAAGTCCTG 229379342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6566 CGGCTCCACTACTTGTACTGGATTCCTCCACTTCAGTCCAGATCCCTCTCCCAAGTCCTG 6625

229379343 TAAAATTAGAATAACATAATATGTGTATAATTATATTACAGTGTTGATGCGATGATTTAA 229379402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6626 TAAAATTAGAATAACATAATATGTGTATAATTATATTACAGTGTTGATGCGATGATTTAA 6685

229379403 AGAGTTAACATATATAGGGTGCGTAGGATAATACCTGCCCTACTGTAACCATCATATAGG 229379462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6686 AGAGTTAACATATATAGGGTGCGTAGGATAATACCTGCCCTACTGTAACCATCATATAGG 6745

229379463 TGGATATGATGATAATGGTGGTGGTAGTAAAGGTGGTGGTTAAGGCAGAGGGGAGGTGGT 229379522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6746 TGGATATGATGATAATGGTGGTGGTAGTAAAGGTGGTGGTTAAGGCAGAGGGGAGGTGGT 6805

229379523 GATGGTGGTAATGAAGGTGGTGAAGGCGATGGTTGTAATTGTATTGGCAGTGGTAGTGGT 229379582
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     6806 GATGGTGGTAATGAAGGTGGTGAAGGCGATGGTTGTAATTGTATTGGCAGTGGTAGTGGC 6865

229379583 GATAAAATCCAAGCACCATAAAACAATTTCAAAAAGTCTAACATACATGCAATTGGAGTC 229379642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6866 GATAAAATCCAAGCACCATAAAACAATTTCAAAAAGTCTAACATACATGCAATTGGAGTC 6925

229379643 CCAGGAAGAATAAAAAACGAAGAATAGGTTGAAGCTCAGTAATTCCAGGGGGAGAAAAAA 229379702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6926 CCAGGAAGAATAAAAAACGAAGAATAGGTTGAAGCTCAGTAATTCCAGGGGGAGAAAAAA 6985

229379703 GAAATAGGACAGGAGAAATATCTGAGACATAGTACTCAAGAATTTTCTAACATTAGACAA 229379762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6986 GAAATAGGACAGGAGAAATATCTGAGACATAGTACTCAAGAATTTTCTAACATTAGACAA 7045

229379763 AAACAACAAAACCATAGGTCCTAGTTCAGAAAACCCTAAGTAGGATCAACACAAAGAAAA 229379822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7046 AAACAACAAAACCATAGGTCCTAGTTCAGAAAACCCTAAGTAGGATCAACACAAAGAAAA 7105

229379823 ATACACCCGAACATTAGAGTCAAAGTGCTGAGAACTCAAAGATAAAGAGAAATCTTCCAG 229379882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7106 ATACACCCGAACATTAGAGTCAAAGTGCTGAGAACTCAAAGATAAAGAGAAATCTTCCAG 7165

229379883 GCAGCCAGAAAAAAATTACTTATATAGGATAAAAAGGGATAATAATTATAGTTGCCTTAT 229379942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7166 GCAGCCAGAAAAAAATTACTTATATAGGATAAAAAGGGATAATAATTATAGTTGCCTTAT 7225

229379943 TGGCAGAAATCATGGAAGCCAGTAGGCAATGGAGAGAGAGCTTTACAAGACTGTAAGAGA 229380002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7226 TGGCAGAAATCATGGAAGCCAGTAGGCAATGGAGAGAGAGCTTTACAAGACTGTAAGAGA 7285

229380003 AAATCCTGTCAACCTAGAATTCTATACCAAGCAAAAATGTCTTTTAAAAATGAAGGCAAA 229380062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7286 AAATCCTGTCAACCTAGAATTCTATACCAAGCAAAAATGTCTTTTAAAAATGAAGGCAAA 7345

229380063 ATAAAGATTTTTTTCAAACAATCAAAAGCTGAGATAATGTATTGCTGTCATGCTCTACAG 229380122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7346 ATAAAGATTTTTTTCAAACAATCAAAAGCTGAGATAATGTATTGCTGTCATGCTCTACAG 7405

229380123 AAATGTTCAATTGTAGCAGGACGAGCCGCAGACAAAACCTGTCAGACACCAAGTTGTAGA 229380182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7406 AAATGTTCAATTGTAGCAGGACGAGCCGCAGACAAAACCTGTCAGACACCAAGTTGTAGA 7465

229380183 AGGAAGGGCTTTATTCAGCTGGGAGCATTGGCAAGCTACTGCCTTAAAATCCGAGCTTCT 229380242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7466 AGGAAGGGCTTTATTCAGCTGGGAGCATTGGCAAGCTACTGCCTTAAAATCCGAGCTTCT 7525

229380243 CGAGTGCACAATTTCTGTCCCTTTTAAGGGCTCACAACACTAAAGATTTCACATGAAAGG 229380302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7526 CGAGTGCACAATTTCTGTCCCTTTTAAGGGCTCACAACACTAAAGATTTCACATGAAAGG 7585

229380303 GTCATGATTGATTGAGCAATCTAGGGGATACGTGACAGGGGTTTCATACACTGGTAGTCA 229380362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7586 GTCATGATTGATTGAGCAATCTAGGGGATACGTGACAGGGGTTTCATACACTGGTAGTCA 7645

229380363 GAGAGAAACAGAACAGAGCAGGGAGTTTCACAATGTTCTTTTATACAATACCTGAAATCT 229380422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7646 GAGAGAAACAGAACAGAGCAGGGAGTTTCACAATGTTCTTTTATACAATACCTGAAATCT 7705

229380423 ATGGGTAACATCGGGTTCTAAGTCATGAGTTGATTTTTAACTACTAGGTTTAGGCCAGGC 229380482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7706 ATGGGTAACATCGGGTTCTAAGTCATGAGTTGATTTTTAACTACTAGGTTTAGGCCAGGC 7765

229380483 AGGCCCAGGCCTGGTTTTGGGACTGGCGCTGGGCTGCCTGTCTTTGATTTCACTTCCTTG 229380542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7766 AGGCCCAGGCCTGGTTTTGGGACTGGCGCTGGGCTGCCTGTCTTTGATTTCACTTCCTTG 7825

229380543 TTTTTTTTCTTTTTTCTTAAAACAGGTACTGAGTATAAAACAATATAAAACAATATGAGA 229380602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7826 TTTTTTTTCTTTTTTCTTAAAACAGGTACTGAGTATAAAACAATATAAAACAATATGAGA 7885

229380603 GGGTCTCTCTCCTCCCTCACAATAAAGTTCTTCAGGGAGAAGAAAAATGATACCAAGTAG 229380662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7886 GGGTCTCTCTCCTCCCTCACAATAAAGTTCTTCAGGGAGAAGAAAAATGATACCAAGTAG 7945

229380663 AATGTGGGATCTCAAAAAGAAGAAAAAAGGAAGAAAAAGAGTGCCCAATGTGATAAATAC 229380722
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7946 AATGTAGGATCTCAAAAAGAAGAAAAAAGGAAGAAAAAGAGTGCCCAATGTGATAAATAC 8005

229380723 ATAGGTAAATGAAAAAAAAAAAAAAGACAACATCGTGTTCTTCCAGATATAATTTTTTGT 229380782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     8006 ATAGGTAAATGAAAAAAAAAAAAAAGACAACATCATGTTCTTCCAGATATAATTTTTTGT 8065

229380783 TACCTAAAGCAGGGATCATAAACTACAGCCCACAGGATAAATCCTGCCTGCTGCCTATTT 229380842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8066 TACCTAAAGCAGGGATCATAAACTACAGCCCACAGGATAAATCCTGCCTGCTGCCTATTT 8125

229380843 TTGTAAATAAAAATATTTTGGAACACAGCCATGCTCACTTATTTCCGTCTTATCTATGGC 229380902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8126 TTGTAAATAAAAATATTTTGGAACACAGCCATGCTCACTTATTTCCGTCTTATCTATGGC 8185

229380903 TGCTTTTGTGCTATAAGAGTAAGGTTAAGTAGTTGCAATAGAGACTGTATAGAGTGAAAA 229380962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8186 TGCTTTTGTGCTATAAGAGTAAGGTTAAGTAGTTGCAATAGAGACTGTATAGAGTGAAAA 8245

229380963 ATATTTACTATCTAGCTCAGAAAGTTTGCCAACCTCTGGTCTAAATGTATTGTGGGGGCT 229381022
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     8246 ATATTTACTATCTAGCTCAGAAAGTTTGCCAACCTCTGGTCTAAATGTAGTGTGGGGGCT 8305

229381023 GAGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATGCCA 229381051
          |||||||||||||||||||||||||||||
     8306 GAGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATGCCA 8334

Alignment time is 6.12331 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     4059] =>      4059 nucs 'mol-32-3487-046423_4059'

Score:        3989
Aligned:      4074        nucs
Identic:      4054 (100%) nucs =>      1137 (100%)      2917 ( 99%)
Gaps:           18 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229372251,229373388] EXCISED REGION [229373763,229376695]
 second seq =>  [        1,     1140] EXCISED REGION [     1141,     4059]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [229373389,229373762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229372251 AGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTG 229372310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTG 60

229372311 GTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATT 229372370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATT 120

229372371 GGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAG 229372430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAG 180

229372431 AGTGAGACTCCTTCTCAAAAC---AAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGG 229372487
          ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTGAGACTCCTTCTCAAAA-AAAAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGG 239

229372488 AATATACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTT 229372547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 AATATACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTT 299

229372548 CTATAAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAA 229372607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 CTATAAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAA 359

229372608 CTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTA 229372667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 CTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTA 419

229372668 TTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAAC 229372727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 TTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAAC 479

229372728 AGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGA 229372787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 AGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGA 539

229372788 GCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTT 229372847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTT 599

229372848 GACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAG 229372907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAG 659

229372908 GTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTC 229372967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTC 719

229372968 ACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAG 229373027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 ACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAG 779

229373028 GTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGAC 229373087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGAC 839

229373088 CAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCT 229373147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCT 899

229373148 TGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGG 229373207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGG 959

229373208 GTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCA 229373267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCA 1019

229373268 GGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATT 229373327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATT 1079

229373328 CACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAA 229373387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAA 1139

229373388 G 229373388
          |
     1140 G 1140

EXCISED REGION

229373763 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 229373822
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATCCATTCTGAAATGCTGT--AAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 1198

229373823 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 229373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 1258

229373883 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 229373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 1318

229373943 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 229374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 1378

229374003 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 229374062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 1438

229374063 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 229374122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 1498

229374123 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 229374182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 1558

229374183 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 229374242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 1618

229374243 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 229374302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 1678

229374303 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 229374362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 1738

229374363 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 229374422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 1798

229374423 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 229374482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 1858

229374483 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 229374542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 1918

229374543 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 229374602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1919 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTGAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 1978

229374603 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 229374662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 2038

229374663 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 229374722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 2098

229374723 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 229374782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 2158

229374783 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 229374842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 2218

229374843 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 229374902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 2278

229374903 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 229374962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 2338

229374963 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 229375022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 2398

229375023 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 229375082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 2458

229375083 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 229375142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 2518

229375143 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 229375202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 2578

229375203 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 229375262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 2638

229375263 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 229375322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 2698

229375323 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 229375382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 2758

229375383 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 229375442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 2818

229375443 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 229375502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 2878

229375503 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 229375562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 2938

229375563 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 229375622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 2998

229375623 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 229375682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 3058

229375683 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 229375742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 3118

229375743 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 229375802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 3178

229375803 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 229375862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 3238

229375863 GGAAACAGTACGAGACTGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGG 229375922
          ||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||
     3239 GGAAACAGTACGAGACTGCCTC------------AAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGG 3286

229375923 GCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGTGGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGT 229375982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 GCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGTGGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGT 3346

229375983 CTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATCAATGAGATCTTACCAATATCTCTGAAC 229376042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 CTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATCAATGAGATCTTACCAATATCTCTGAAC 3406

229376043 CCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGCTAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCC 229376102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 CCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGCTAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCC 3466

229376103 ACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGTGAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGA 229376162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 ACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGTGAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGA 3526

229376163 GAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAATTAGACACTTTCAGCACCTAACATACA 229376222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3527 GAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAATTAGACACTTTCAGCACCTAACATACA 3586

229376223 GGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAGTACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCA 229376282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3587 GGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAGTACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCA 3646

229376283 GCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAGCTGTTCTCAAAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTT 229376342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3647 GCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAGCTGTTCTCAAAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTT 3706

229376343 TTGCTATTGTCCTGAAGTAGCAATCCCATGATGGAAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCG 229376402
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3707 TTGCTATTGTCCTGCAGTAGCAATCCCATGATGGAAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCG 3766

229376403 TGGCTACATTATAATGGACTTGGTGAGCATGCACTGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAG 229376462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 TGGCTACATTATAATGGACTTGGTGAGCATGCACTGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAG 3826

229376463 TGGACATAGGGGCCCATCAACCCTGCTCCAGCCAGCACCTGGTCAGAGTCACTAACTACA 229376522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 TGGACATAGGGGCCCATCAACCCTGCTCCAGCCAGCACCTGGTCAGAGTCACTAACTACA 3886

229376523 ACAATGACACCATGGGGACCCCTGGGGCTGCTGTCTGTGGGGCTTTGTATCTTGGCCAGT 229376582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3887 ACAATGACACCATGGGGACCCCTGGGGCTGCTGTCTGTGGGGCTTTGTATCTTGGCCAGT 3946

229376583 AAAGCCATCCTAAGGTCAGGGCCAAAACCAGAAGCAGAGGGGGCCCGGCCTCAGCTAACA 229376642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 AAAGCCATCCTAAGGTCAGGGCCAAAACCAGAAGCAGAGGGGGCCCGGCCTCAGCTAACA 4006

229376643 ATACTGTGGGGAAGTTCAGCGAGGCTGTCAGCCCCCTCCAGCCCCCAGTCACT 229376695
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4007 ATACTGTGGGGAAGTTCAGCGAGGCTGTCAGCCCCCTCCAGCCCCCAGTCACT 4059

Alignment time is 2.9894 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3910] =>      3910 nucs 'mol-32-3492-035420_3910'

Score:        3807
Aligned:      3915        nucs
Identic:      3897 (100%) nucs =>      3099 (100%)       798 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229370279,229373388] EXCISED REGION [229373763,229374563]
 second seq =>  [        6,     3112] EXCISED REGION [     3113,     3910]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [229373389,229373762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229370279 AGGGGTTAGGTGGACTGGGCACCAGCACCTTAACCCTGGGGGTAGAGATAGATTTCTGGC 229370338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        6 AGGGGTTAGGTGGACTGGGCACCAGCACCTTAACCCTGGGGGTAGAGATAGATTTCTGGC 65

229370339 TTTTAGGAGTGAAGTTGATTTTAGAGTATAAAATGCTGCCCCCACCCCATTCCAGGGCTG 229370398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       66 TTTTAGGAGTGAAGTTGATTTTAGAGTATAAAATGCTGCCCCCACCCCATTCCAGGGCTG 125

229370399 CTGGGTGTAAAAGGAAAAGAAATCTTGGGACCCCAAAATCACTAAGCCAAAGGGAAAAGT 229370458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      126 CTGGGTGTAAAAGGAAAAGAAATCTTGGGACCCCAAAATCACTAAGCCAAAGGGAAAAGT 185

229370459 CAAGCTGGGAGCTGCTTAGGGCAAACCTGCCTCCCATTCTACTCCTGAAAATGATAGCTA 229370518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 CAAGCTGGGAGCTGCTTAGGGCAAACCTGCCTCCCATTCTACTCCTGAAAATGATAGCTA 245

229370519 CTAAGATCTTTTTTAAAAGCTACAAACCTCCCTCACAAGGCATTTCCTTACGGACAAAGG 229370578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 CTAAGATCTTTTTTAAAAGCTACAAACCTCCCTCACAAGGCATTTCCTTACGGACAAAGG 305

229370579 ACAGACAGAACTCGAAGTCATCCCTCTGCTCACTGAGATAAATGCATATCTGATTGCCTC 229370638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 ACAGACAGAACTCGAAGTCATCCCTCTGCTCACTGAGATAAATGCATATCTGATTGCCTC 365

229370639 CTTTGGAAAGGCTAATCAGAAACTCAAAAGAATGCAACCATTTTGTCTCTTATCTACCTA 229370698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 CTTTGGAAAGGCTAATCAGAAACTCAAAAGAATGCAACCATTTTGTCTCTTATCTACCTA 425

229370699 TAACCTGGAAGCCCCCTCCTCACTTCGAGTTGTCCGGCCTTCCCGTACAGAACCAATGAC 229370758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 TAACCTGGAAGCCCCCTCCTCACTTCGAGTTGTCCGGCCTTCCCGTACAGAACCAATGAC 485

229370759 GGAGTGGGAAGATGATCTTCCCCTGGAATTTGGACATCCAGTGGCCAAACTCCTCTTCGA 229370818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 GGAGTGGGAAGATGATCTTCCCCTGGAATTTGGACATCCAGTGGCCAAACTCCTCTTCGA 545

229370819 CTGCCCCGCAGCCGAATACCTCTCAGTGCTCAGACATTCTCCTCTTTCTCTGCCGTGCCT 229370878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 CTGCCCCGCAGCCGAATACCTCTCAGTGCTCAGACATTCTCCTCTTTCTCTGCCGTGCCT 605

229370879 TTCTGCCATTCGTCTGCTTGTCTCCTTGTCTCCTTGTCTGCTTCTGGAGCCTGGGGTTTG 229370938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 TTCTGCCATTCGTCTGCTTGTCTCCTTGTCTCCTTGTCTGCTTCTGGAGCCTGGGGTTTG 665

229370939 GGGTTTATATGGGTACAGGATGGCCAAAAGGCAACCTTTTGGGTGTGAAAACAGGAATCC 229370998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 GGGTTTATATGGGTACAGGATGGCCAAAAGGCAACCTTTTGGGTGTGAAAACAGGAATCC 725

229370999 CTGTCCTCCTTTAGGGTCACGGGTATCTGGGCTTCAGGGTGGGGGCCTTTGCCGGAGAAC 229371058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 CTGTCCTCCTTTAGGGTCACGGGTATCTGGGCTTCAGGGTGGGGGCCTTTGCCGGAGAAC 785

229371059 CGCCCTCTTCTACCCAGTGTTTCCCTGTCTCCTGTCCGTATCACCAGCAGATGGTGCCTA 229371118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 CGCCCTCTTCTACCCAGTGTTTCCCTGTCTCCTGTCCGTATCACCAGCAGATGGTGCCTA 845

229371119 CTTTTTTAAAGCCATCATCTTATCTTCTAGCTGTACCTATTTTTTTAAATATATGTTTTA 229371178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 CTTTTTTAAAGCCATCATCTTATCTTCTAGCTGTACCTATTTTTTTAAATATATGTTTTA 905

229371179 TTTCAACAGCTTTTGGGATACAAGTGGTTTTTGGTTACATGGATGAATTGTCTAGTGGTG 229371238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 TTTCAACAGCTTTTGGGATACAAGTGGTTTTTGGTTACATGGATGAATTGTCTAGTGGTG 965

229371239 AAGTCTGAGATTTTGCTACACTCTTCACCCGAGTGACCCCAGTAGTGTACATTGTATCTA 229371298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 AAGTCTGAGATTTTGCTACACTCTTCACCCGAGTGACCCCAGTAGTGTACATTGTATCTA 1025

229371299 ATATGTAGTTTTTTTATCCTTTATCCCCTCCCACCCTGTATCTATTTTTAATTGCTTTGT 229371358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 ATATGTAGTTTTTTTATCCTTTATCCCCTCCCACCCTGTATCTATTTTTAATTGCTTTGT 1085

229371359 GAACTAAGGCAAATGTGATAAAGAGGCATCTGATGTACCTGCTTCTAGCATACAAGAAAA 229371418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 GAACTAAGGCAAATGTGATAAAGAGGCATCTGATGTACCTGCTTCTAGCATACAAGAAAA 1145

229371419 CATATTTCTTGAGCATGCTGTTACATGCTTGACACTTTATATACACTATTTCATTTAACA 229371478
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 CATATTTCTTGAGCATGCTATTACATGCTTGACACTTTATATACACTATTTCATTTAACA 1205

229371479 TCCCAACAATCCTAAAACCTGGGTTTTGTTATTGAAGAACCCAAGGCTCTGAGAGTTAAC 229371538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 TCCCAACAATCCTAAAACCTGGGTTTTGTTATTGAAGAACCCAAGGCTCTGAGAGTTAAC 1265

229371539 TAACTTGCCCAAGGTCACACAGTTAGCAAGTTGTGTGGGCAGGATATAAGCCCAGTCTGG 229371598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 TAACTTGCCCAAGGTCACACAGTTAGCAAGTTGTGTGGGCAGGATATAAGCCCAGTCTGG 1325

229371599 CTGCAAAGCTATGTTCTTTACACTGTAACTTACTCCTGAAGGAAGGAGGCTTAAAAATAA 229371658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 CTGCAAAGCTATGTTCTTTACACTGTAACTTACTCCTGAAGGAAGGAGGCTTAAAAATAA 1385

229371659 TCCATGCAGAATTTGTATCAGCTTGATATGTGTGCCTTATTATTATTATTATTATTATTA 229371718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
     1386 TCCATGCAGAATTTGTATCAGCTTGATATGTGTGCCTTATTATTATTATTATTATT---- 1441

229371719 TTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGGGGCGTAATCTCGGCTC 229371778
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 --TTGAGACGGAGTCTTACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGGGGCGTAATCTCGGCTC 1499

229371779 ACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTG 229371838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 ACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTG 1559

229371839 GGATTATGGGCGCCCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAAGGT 229371898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GGATTATGGGCGCCCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAAGGT 1619

229371899 TTCACCGGGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCGATCTGCCCACCTTGG 229371958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TTCACCGGGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCGATCTGCCCACCTTGG 1679

229371959 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGATTGCCATATTATTTT 229372018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGATTGCCATATTATTTT 1739

229372019 AATAGAATAGGATAGGACAAAACTTAGAAGGTATTGGATACCATTTTCCCTGTTGAAGGA 229372078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 AATAGAATAGGATAGGACAAAACTTAGAAGGTATTGGATACCATTTTCCCTGTTGAAGGA 1799

229372079 GTATTGGTAAGACACCGTCAAAGAGAAATGCACCGCGTACACACGAAGAGGAACCATTTG 229372138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1800 GTATTGGTAAGACACCGTCAAAGAGAAATGCACCACGTACACACGAAGAGGAACCATTTG 1859

229372139 TAGGTGGTACATAAAAGGGTAAAAAATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCC 229372198
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1860 TAGGTGGTACATAAAAGGGTGAAAAATAGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCC 1919

229372199 AGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCAC--AAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTG 229372256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACCTAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTG 1979

229372257 GCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTG 229372316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTG 2039

229372317 CATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAG 229372376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAG 2099

229372377 GCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAG 229372436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAG 2159

229372437 ACTCCTTCTCAAAAC--AAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATAC 229372494
          ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ACTCCTTCTCAAAA-AAAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATAC 2218

229372495 CCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAA 229372554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAA 2278

229372555 ATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACA 229372614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 ATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACA 2338

229372615 AAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAG 229372674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAG 2398

229372675 AAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAA 229372734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 AAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAA 2458

229372735 CTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGA 229372794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGA 2518

229372795 TACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTA 229372854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTA 2578

229372855 CCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATA 229372914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATA 2638

229372915 CTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAA 229372974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 CTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAA 2698

229372975 GTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATA 229373034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATA 2758

229373035 TTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTT 229373094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTT 2818

229373095 ATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCC 229373154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 ATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCC 2878

229373155 CACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAG 229373214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAG 2938

229373215 GATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTAT 229373274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTAT 2998

229373275 CTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTG 229373334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 CTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTG 3058

229373335 GTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 229373388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 GTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 3112

EXCISED REGION

229373763 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 229373822
          ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 CATCCATTCTGAAATGCTGT---AAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 3169

229373823 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 229373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 3229

229373883 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 229373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 3289

229373943 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 229374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 3349

229374003 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 229374062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 3409

229374063 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 229374122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 3469

229374123 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 229374182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3470 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 3529

229374183 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 229374242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3530 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 3589

229374243 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 229374302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3590 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 3649

229374303 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 229374362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3650 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 3709

229374363 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 229374422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3710 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 3769

229374423 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 229374482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3770 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 3829

229374483 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 229374542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3830 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 3889

229374543 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCA 229374563
          |||||||||||||||||||||
     3890 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCA 3910

Alignment time is 2.82738 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     7000] =>      7000 nucs 'mol-32-349d-182632_7000'

Score:        6844
Aligned:      7022        nucs
Identic:      6987 (100%) nucs =>      4280 (100%)      2707 ( 99%)
Gaps:           27 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229369093,229373388] EXCISED REGION [229373763,229376484]
 second seq =>  [        2,     4291] EXCISED REGION [     4292,     7000]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [229373389,229373762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229369093 CCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTA----TTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCG 229369148
          ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||
        2 CCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTT----GTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCG 57

229369149 TTTTAGCCGGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAA 229369208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       58 TTTTAGCCGGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAA 117

229369209 GTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCACATCCCTCTTAAAGAACCTAAAA 229369268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      118 GTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCACATCCCTCTTAAAGAACCTAAAA 177

229369269 TTGGTCTTTGGAGATGTCCTTTCAGGATTTTGCATTTCTCATGACCAGATGACCGGACCT 229369328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      178 TTGGTCTTTGGAGATGTCCTTTCAGGATTTTGCATTTCTCATGACCAGATGACCGGACCT 237

229369329 TGACTCTTGGCCCAACCAGTCCTGCGGACCCACCCAGAAGCAGACTTAGTGCACAAGGAC 229369388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      238 TGACTCTTGGCCCAACCAGTCCTGCGGACCCACCCAGAAGCAGACTTAGTGCACAAGGAC 297

229369389 CATTTTCCACATCCCTATGATTGCATCCCCAACCAATCAGCCGCATCTGTTCCCCTCGCC 229369448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 CATTTTCCACATCCCTATGATTGCATCCCCAACCAATCAGCCGCATCTGTTCCCCTCGCC 357

229369449 CCCTGCCAGCCAAGTAACCCTTGAAAAACCTAGCCTCAGAATTTTCCGGGAGGTCGACTT 229369508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 CCCTGCCAGCCAAGTAACCCTTGAAAAACCTAGCCTCAGAATTTTCCGGGAGGTCGACTT 417

229369509 GAGTAATATCTTCATCTCCCACATGGTGTGGCCAGCCTCATGTCAATTAAACTCTTTCTT 229369568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 GAGTAATATCTTCATCTCCCACATGGTGTGGCCAGCCTCATGTCAATTAAACTCTTTCTT 477

229369569 TATTGCAATGCCATGGTGTCATTGAATTGGTTTTGTCTGTGCCGTCGGCAGGAAGAACCC 229369628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 TATTGCAATGCCATGGTGTCATTGAATTGGTTTTGTCTGTGCCGTCGGCAGGAAGAACCC 537

229369629 ATCAGGTGATTACAATATCATTATCAGAAACAAGAGGAATGGGGAGGGGAGCCAGCAACT 229369688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 ATCAGGTGATTACAATATCATTATCAGAAACAAGAGGAATGGGGAGGGGAGCCAGCAACT 597

229369689 GAAATTGGATGATTCATTTCAGAATGCTAAATGGACCTCTGAAGGGACATTGGCTTGGAG 229369748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 GAAATTGGATGATTCATTTCAGAATGCTAAATGGACCTCTGAAGGGACATTGGCTTGGAG 657

229369749 ATCTGGCACTTTAGCTCAGGGGAGAAGTCAGATTTGGAAACCAAGGTGGCAGGCATGATG 229369808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 ATCTGGCACTTTAGCTCAGGGGAGAAGTCAGATTTGGAAACCAAGGTGGCAGGCATGATG 717

229369809 GGAGAGAGCAGGGATGCCCTCCAACAGTGAGAGGATGTGGCTTATCTGGGACTGTCACAG 229369868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 GGAGAGAGCAGGGATGCCCTCCAACAGTGAGAGGATGTGGCTTATCTGGGACTGTCACAG 777

229369869 TACTGTGGCTATTATCTGAAACTGTCTCCCCAAAGACACTGTAAATCCTGCTCTCCAGTA 229369928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 TACTGTGGCTATTATCTGAAACTGTCTCCCCAAAGACACTGTAAATCCTGCTCTCCAGTA 837

229369929 GTATTCCATGTTCTGAATGGCACTAGTGTTTAACCTTGGGTGAAAACGTGTTCCTTTTTC 229369988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 GTATTCCATGTTCTGAATGGCACTAGTGTTTAACCTTGGGTGAAAACGTGTTCCTTTTTC 897

229369989 CTATCAAGTCCGTATTTGAAGACTTGATTGGCAATGACTGCTCCTAACTAGGCAAGCTGG 229370048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 CTATCAAGTCCGTATTTGAAGACTTGATTGGCAATGACTGCTCCTAACTAGGCAAGCTGG 957

229370049 CACCTTCTTGATGTCAGTCCCTTTTAGCGAATGTGTACACACTGGTAGGGGGCAGAGGGG 229370108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 CACCTTCTTGATGTCAGTCCCTTTTAGCGAATGTGTACACACTGGTAGGGGGCAGAGGGG 1017

229370109 AAAAGACAGGAAAAAGAAAAGTGCTGAGAATTCCAGGTCACCCACTGCAGCACAAGCTGG 229370168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 AAAAGACAGGAAAAAGAAAAGTGCTGAGAATTCCAGGTCACCCACTGCAGCACAAGCTGG 1077

229370169 CTACCTTTTCTCTGGCAGTTGTTGTTAAGAGCATTTTCCAGCACCCTGAAGTTTTCATCC 229370228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 CTACCTTTTCTCTGGCAGTTGTTGTTAAGAGCATTTTCCAGCACCCTGAAGTTTTCATCC 1137

229370229 CCCATTGTTCAGCCACCCATTTCTAAAGAGTTAGCATAATAAGTGGGATCAGGGGTTAGG 229370288
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1138 CCCATTGTTCAGCCACCCATTTCTAAAGAGTTAGCATAATAAGTGGGATTAGGGGTTAGG 1197

229370289 TGGACTGGGCACCAGCACCTTAACCCTGGGGGTAGAGATAGATTTCTGGCTTTTAGGAGT 229370348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TGGACTGGGCACCAGCACCTTAACCCTGGGGGTAGAGATAGATTTCTGGCTTTTAGGAGT 1257

229370349 GAAGTTGATTTTAGAGTATAAAATGCTGCCCCCACCCCATTCCAGGGCTGCTGGGTGTAA 229370408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 GAAGTTGATTTTAGAGTATAAAATGCTGCCCCCACCCCATTCCAGGGCTGCTGGGTGTAA 1317

229370409 AAGGAAAAGAAATCTTGGGACCCCAAAATCACTAAGCCAAAGGGAAAAGTCAAGCTGGGA 229370468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 AAGGAAAAGAAATCTTGGGACCCCAAAATCACTAAGCCAAAGGGAAAAGTCAAGCTGGGA 1377

229370469 GCTGCTTAGGGCAAACCTGCCTCCCATTCTACTCCTGAAAATGATAGCTACTAAGATCTT 229370528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 GCTGCTTAGGGCAAACCTGCCTCCCATTCTACTCCTGAAAATGATAGCTACTAAGATCTT 1437

229370529 TTTTAAAAGCTACAAACCTCCCTCACAAGGCATTTCCTTACGGACAAAGGACAGACAGAA 229370588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TTTTAAAAGCTACAAACCTCCCTCACAAGGCATTTCCTTACGGACAAAGGACAGACAGAA 1497

229370589 CTCGAAGTCATCCCTCTGCTCACTGAGATAAATGCATATCTGATTGCCTCCTTTGGAAAG 229370648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 CTCGAAGTCATCCCTCTGCTCACTGAGATAAATGCATATCTGATTGCCTCCTTTGGAAAG 1557

229370649 GCTAATCAGAAACTCAAAAGAATGCAACCATTTTGTCTCTTATCTACCTATAACCTGGAA 229370708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 GCTAATCAGAAACTCAAAAGAATGCAACCATTTTGTCTCTTATCTACCTATAACCTGGAA 1617

229370709 GCCCCCTCCTCACTTCGAGTTGTCCGGCCTTCCCGTACAGAACCAATGACGGAGTGGGAA 229370768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 GCCCCCTCCTCACTTCGAGTTGTCCGGCCTTCCCGTACAGAACCAATGACGGAGTGGGAA 1677

229370769 GATGATCTTCCCCTGGAATTTGGACATCCAGTGGCCAAACTCCTCTTCGACTGCCCCGCA 229370828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 GATGATCTTCCCCTGGAATTTGGACATCCAGTGGCCAAACTCCTCTTCGACTGCCCCGCA 1737

229370829 GCCGAATACCTCTCAGTGCTCAGACATTCTCCTCTTTCTCTGCCGTGCCTTTCTGCCATT 229370888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GCCGAATACCTCTCAGTGCTCAGACATTCTCCTCTTTCTCTGCCGTGCCTTTCTGCCATT 1797

229370889 CGTCTGCTTGTCTCCTTGTCTCCTTGTCTGCTTCTGGAGCCTGGGGTTTGGGGTTTATAT 229370948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 CGTCTGCTTGTCTCCTTGTCTCCTTGTCTGCTTCTGGAGCCTGGGGTTTGGGGTTTATAT 1857

229370949 GGGTACAGGATGGCCAAAAGGCAACCTTTTGGGTGTGAAAACAGGAATCCCTGTCCTCCT 229371008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 GGGTACAGGATGGCCAAAAGGCAACCTTTTGGGTGTGAAAACAGGAATCCCTGTCCTCCT 1917

229371009 TTAGGGTCACGGGTATCTGGGCTTCAGGGTGGGGGCCTTTGCCGGAGAACCGCCCTCTTC 229371068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TTAGGGTCACGGGTATCTGGGCTTCAGGGTGGGGGCCTTTGCCGGAGAACCGCCCTCTTC 1977

229371069 TACCCAGTGTTTCCCTGTCTCCTGTCCGTATCACCAGCAGATGGTGCCTACTTTTTTAAA 229371128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 TACCCAGTGTTTCCCTGTCTCCTGTCCGTATCACCAGCAGATGGTGCCTACTTTTTTAAA 2037

229371129 GCCATCATCTTATCTTCTAGCTGTACCTATTTTTTTAAATATATGTTTTATTTCAACAGC 229371188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 GCCATCATCTTATCTTCTAGCTGTACCTATTTTTTTAAATATATGTTTTATTTCAACAGC 2097

229371189 TTTTGGGATACAAGTGGTTTTTGGTTACATGGATGAATTGTCTAGTGGTGAAGTCTGAGA 229371248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TTTTGGGATACAAGTGGTTTTTGGTTACATGGATGAATTGTCTAGTGGTGAAGTCTGAGA 2157

229371249 TTTTGCTACACTCTTCACCCGAGTGACCCCAGTAGTGTACATTGTATCTAATATGTAGTT 229371308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TTTTGCTACACTCTTCACCCGAGTGACCCCAGTAGTGTACATTGTATCTAATATGTAGTT 2217

229371309 TTTTTATCCTTTATCCCCTCCCACCCTGTATCTATTTTTAATTGCTTTGTGAACTAAGGC 229371368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TTTTTATCCTTTATCCCCTCCCACCCTGTATCTATTTTTAATTGCTTTGTGAACTAAGGC 2277

229371369 AAATGTGATAAAGAGGCATCTGATGTACCTGCTTCTAGCATACAAGAAAACATATTTCTT 229371428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 AAATGTGATAAAGAGGCATCTGATGTACCTGCTTCTAGCATACAAGAAAACATATTTCTT 2337

229371429 GAGCATGCTGTTACATGCTTGACACTTTATATACACTATTTCATTTAACATCCCAACAAT 229371488
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 GAGCATGCTATTACATGCTTGACACTTTATATACACTATTTCATTTAACATCCCAACAAT 2397

229371489 CCTAAAACCTGGGTTTTGTTATTGAAGAACCCAAGGCTCTGAGAGTTAACTAACTTGCCC 229371548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 CCTAAAACCTGGGTTTTGTTATTGAAGAACCCAAGGCTCTGAGAGTTAACTAACTTGCCC 2457

229371549 AAGGTCACACAGTTAGCAAGTTGTGTGGGCAGGATATAAGCCCAGTCTGGCTGCAAAGCT 229371608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 AAGGTCACACAGTTAGCAAGTTGTGTGGGCAGGATATAAGCCCAGTCTGGCTGCAAAGCT 2517

229371609 ATGTTCTTTACACTGTAACTTACTCCTGAAGGAAGGAGGCTTAAAAATAATCCATGCAGA 229371668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 ATGTTCTTTACACTGTAACTTACTCCTGAAGGAAGGAGGCTTAAAAATAATCCATGCAGA 2577

229371669 ATTTGTATCAGCTTGATATGTGTGCCTTATTATTATTATTATTATTATTATTTTGAGACG 229371728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||
     2578 ATTTGTATCAGCTTGATATGTGTGCCTTATTATTATTATTATTATT------TTGAGACG 2631

229371729 GAGTCTTACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGGGGCGTAATCTCGGCTCACTGCAACCT 229371788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 GAGTCTTACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGGGGCGTAATCTCGGCTCACTGCAACCT 2691

229371789 CCACCTCCTGGGTTCAAGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTATGGG 229371848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 CCACCTCCTGGGTTCAAGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTATGGG 2751

229371849 CGCCCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACCGGGT 229371908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 CGCCCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACCGGGT 2811

229371909 TGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAG 229371968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 TGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGCGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAG 2871

229371969 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGATTGCCATATTATTTTAATAGAATAG 229372028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGGATTGCCATATTATTTTAATAGAATAG 2931

229372029 GATAGGACAAAACTTAGAAGGTATTGGATACCATTTTCCCTGTTGAAGGAGTATTGGTAA 229372088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 GATAGGACAAAACTTAGAAGGTATTGGATACCATTTTCCCTGTTGAAGGAGTATTGGTAA 2991

229372089 GACACCGTCAAAGAGAAATGCACCGCGTACACACGAAGAGGAACCATTTGTAGGTGGTAC 229372148
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 GACACCGTCAAAGAGAAATGCACCACGTACACACGAAGAGGAACCATTTGTAGGTGGTAC 3051

229372149 ATAAAAGGGTAAAAAATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG 229372208
          ||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 ATAAAAGGGTGAAAAATAGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG 3111

229372209 GAGGCCGAGGTGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 229372268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 GAGGCCGAGGTGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG 3171

229372269 AAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGT 229372328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 AAACCCTGGCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGT 3231

229372329 TCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCA 229372388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 TCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCA 3291

229372389 GTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAA 229372448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3292 GTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAA 3351

229372449 AACAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTA 229372508
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3352 AAAAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTA 3411

229372509 TTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATA 229372568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3412 TTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATA 3471

229372569 GATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAA 229372628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3472 GATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAA 3531

229372629 AAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTA 229372688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3532 AAGCAACATTAATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTA 3591

229372689 AAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGA 229372748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3592 AAATCATATTAACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGA 3651

229372749 CAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTG 229372808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 CAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTG 3711

229372809 GAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAA 229372868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 GAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAA 3771

229372869 ACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATG 229372928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 ACATACACCTATACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATG 3831

229372929 AATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATA 229372988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 AATGCATGTGTCCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATA 3891

229372989 GTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTG 229373048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 GTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTG 3951

229373049 GCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTA 229373108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 GCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTA 4011

229373109 TTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACA 229373168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4012 TTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACA 4071

229373169 AGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTT 229373228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4072 AGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTT 4131

229373229 GAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAG 229373288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4132 GAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAG 4191

229373289 GTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCA 229373348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4192 GTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCA 4251

229373349 AAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 229373388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 AAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 4291

EXCISED REGION

229373763 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 229373822
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4292 CATCCATTCTGAAATGCTGT--AAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 4349

229373823 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 229373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4350 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 4409

229373883 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 229373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4410 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 4469

229373943 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 229374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4470 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 4529

229374003 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 229374062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4530 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 4589

229374063 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 229374122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4590 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 4649

229374123 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 229374182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4650 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 4709

229374183 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 229374242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4710 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 4769

229374243 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 229374302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4770 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 4829

229374303 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 229374362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4830 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 4889

229374363 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 229374422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4890 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 4949

229374423 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 229374482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4950 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 5009

229374483 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 229374542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5010 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 5069

229374543 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 229374602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5070 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTGAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 5129

229374603 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 229374662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5130 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 5189

229374663 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 229374722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5190 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 5249

229374723 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 229374782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5250 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 5309

229374783 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 229374842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5310 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 5369

229374843 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 229374902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5370 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 5429

229374903 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 229374962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5430 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 5489

229374963 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 229375022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5490 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 5549

229375023 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 229375082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5550 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 5609

229375083 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 229375142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5610 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 5669

229375143 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 229375202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5670 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 5729

229375203 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 229375262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5730 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 5789

229375263 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 229375322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5790 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 5849

229375323 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 229375382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5850 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 5909

229375383 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 229375442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5910 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 5969

229375443 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 229375502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5970 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 6029

229375503 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 229375562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6030 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 6089

229375563 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 229375622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6090 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 6149

229375623 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 229375682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6150 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 6209

229375683 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 229375742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6210 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 6269

229375743 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 229375802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6270 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 6329

229375803 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 229375862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6330 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 6389

229375863 GGAAACAGTACGAGACTGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGG 229375922
          ||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||
     6390 GGAAACAGTACGAGACTGCCTC-----------AAAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGG 6438

229375923 GCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGTGGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGT 229375982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6439 GCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGTGGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGT 6498

229375983 CTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATCAATGAGATCTTACCAATATCTCTGAAC 229376042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 CTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATCAATGAGATCTTACCAATATCTCTGAAC 6558

229376043 CCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGCTAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCC 229376102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 CCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGCTAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCC 6618

229376103 ACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGTGAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGA 229376162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6619 ACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGTGAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGA 6678

229376163 GAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAATTAGACACTTTCAGCACCTAACATACA 229376222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6679 GAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAATTAGACACTTTCAGCACCTAACATACA 6738

229376223 GGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAGTACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCA 229376282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6739 GGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAGTACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCA 6798

229376283 GCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAGCTGTTCTCAAAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTT 229376342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6799 GCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAGCTGTTCTCAAAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTT 6858

229376343 TTGCTATTGTCCTGAAGTAGCAATCCCATGATGGAAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCG 229376402
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6859 TTGCTATTGTCCTGCAGTAGCAATCCCATGATGGAAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCG 6918

229376403 TGGCTACATTATAATGGACTTGGTGAGCATGCACTGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAG 229376462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6919 TGGCTACATTATAATGGACTTGGTGAGCATGCACTGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAG 6978

229376463 TGGACATAGGGGCCCATCAACC 229376484
          ||||||||||||||||||||||
     6979 TGGACATAGGGGCCCATCAACC 7000

Alignment time is 5.06888 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2709] =>      2709 nucs 'mol-32-349d-182632_2709'

Score:        2676
Aligned:      2711        nucs
Identic:      2707 (100%) nucs =>      2119 (100%)       588 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229373763,229375884] EXCISED REGION [229375896,229376484]
 second seq =>  [        1,     2120] EXCISED REGION [     2121,     2709]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        11 nucs [229375885,229375895]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [229375885,229375898] to [229375896,229375909]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [229375885,229375889] to [229375891,229375895]
 second seq =>         0 nucs

229373763 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 229373822
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||
        1 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAA--GTATTTAATGGCATGAAAAAT 58

229373823 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 229373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       59 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 118

229373883 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 229373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      119 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 178

229373943 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 229374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 238

229374003 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 229374062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 298

229374063 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 229374122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 358

229374123 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 229374182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 418

229374183 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 229374242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 478

229374243 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 229374302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 538

229374303 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 229374362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 598

229374363 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 229374422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 658

229374423 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 229374482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 718

229374483 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 229374542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 778

229374543 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 229374602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      779 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTGAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 838

229374603 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 229374662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 898

229374663 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 229374722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 958

229374723 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 229374782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 1018

229374783 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 229374842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 1078

229374843 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 229374902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 1138

229374903 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 229374962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 1198

229374963 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 229375022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 1258

229375023 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 229375082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 1318

229375083 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 229375142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 1378

229375143 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 229375202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 1438

229375203 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 229375262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 1498

229375263 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 229375322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 1558

229375323 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 229375382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 1618

229375383 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 229375442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 1678

229375443 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 229375502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 1738

229375503 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 229375562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAAAGAAC 1798

229375563 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 229375622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CAATCAGGAGAGAGTGGGCAAATGAGAATAGTTCTCACTTTGGGCTGGGCACAGTGGCTT 1858

229375623 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 229375682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 ATGCCGATAATCCCAGCACTTTGGGAAACCAAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGT 1918

229375683 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 229375742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TTGAGATGAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 1978

229375743 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 229375802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CAGGCTTGATGGGGCACACCTGTAGTCCCAGCTATTTAGGAGGCTGAGACAGGAGAATCG 2038

229375803 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 229375862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCGGAGGTGGTGCCATTGCACTCCAGCCTG 2098

229375863 GGAAACAGTACGAGACTGCCTC 229375884
          ||||||||||||||||||||||
     2099 GGAAACAGTACGAGACTGCCTC 2120

EXCISED REGION

229375896 AAAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGGGCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGT 229375955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 AAAAAAAAAAAAAAGTTATCACTTTGGGCTGTGGGTTTCAGGCTACTTTGGCTTGAAGGT 2180

229375956 GGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGTCTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATC 229376015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 GGGGTTTCACCTGGGACCCATCCCTGTCTGCTTAGAATTTCTCTGCCTCCTGTTTCTATC 2240

229376016 AATGAGATCTTACCAATATCTCTGAACCCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGC 229376075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 AATGAGATCTTACCAATATCTCTGAACCCATGATGTTCCCTCCATATGCTCGTCAGGTGC 2300

229376076 TAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCCACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGT 229376135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 TAACCTACAGTATTAATACTTCAGTCCACTGTGGGTTAAATAGGTATATGTGAGCTGGGT 2360

229376136 GAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGAGAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAA 229376195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 GAGACCTGACCGCAATTGTTTCTAGGAGAGTACATTCCAGGATCCAAACAGTTGGCTTAA 2420

229376196 TTAGACACTTTCAGCACCTAACATACAGGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAG 229376255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 TTAGACACTTTCAGCACCTAACATACAGGTAATTGAGAATTGCCTTTACACAGCTTTCAG 2480

229376256 TACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCAGCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAGCTGTTCTC 229376315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 TACATTGAAATTGTTTAATCACAGCCAGCAATGAGGATTCCTCAAAGAAGAGCTGTTCTC 2540

229376316 AAAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTTTTGCTATTGTCCTGAAGTAGCAATCCCATGATG 229376375
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2541 AAAGTTTCCATTGTGAAGAGCCCCTTTTTGCTATTGTCCTGCAGTAGCAATCCCATGATG 2600

229376376 GAAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCGTGGCTACATTATAATGGACTTGGTGAGCATGCA 229376435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 GAAACAGAGAGCCAAAAAAAAAGATCGTGGCTACATTATAATGGACTTGGTGAGCATGCA 2660

229376436 CTGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAGTGGACATAGGGGCCCATCAACC 229376484
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 CTGACCTTACTTGCTCTTTAGGGTGAGTGGACATAGGGGCCCATCAACC 2709

Alignment time is 1.96281 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2156] =>      2156 nucs 'mol-32-34b3-173324_2156'

Score:        2120
Aligned:      2161        nucs
Identic:      2154 (100%) nucs =>      1153 (100%)      1001 ( 99%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229372235,229373388] EXCISED REGION [229373763,229374769]
 second seq =>  [        1,     1154] EXCISED REGION [     1155,     2156]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [229373389,229373762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229372235 TCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAA 229372294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTACAAATACAA 60

229372295 AAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGG 229372354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCGG 120

229372355 GAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACT 229372414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACT 180

229372415 CCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAACAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAA 229372474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      181 CCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAA 240

229372475 TAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGA 229372534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGTTGTATAAAATCTTGA 300

229372535 AAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGA 229372594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGAGAAGATATAAAAAGA 360

229372595 CATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTG 229372654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTAATATTATATGTGGTG 420

229372655 TCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAA 229372714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTAACTTATTAAAAGAAA 480

229372715 TATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTT 229372774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCATATGTCAGTGGAGTT 540

229372775 TAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCT 229372834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATTTTTTTGTTGTTTCCT 600

229372835 TGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATA 229372894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTATACTCTGACCCAATA 660

229372895 ATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACA 229372954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGTCCACGGAAGGACACA 720

229372955 CACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTAC 229373014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCAAAATAAGTCAATTAC 780

229373015 CTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCT 229373074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGCCTTCCATGATTTCCT 840

229373075 ATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAAC 229373134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAGCTCACAGTTCCAAAC 900

229373135 AGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACA 229373194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGTTAGGGACTCTGCACA 960

229373195 TTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGG 229373254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAGAATTAATTGCCCTGG 1020

229373255 GAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAA 229373314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTTTCAAAGAGTAATAAA 1080

229373315 ACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCT 229373374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAGGGATTGTTAAGTGCT 1140

229373375 GTGACTTAAGAAAG 229373388
          ||||||||||||||
     1141 GTGACTTAAGAAAG 1154

EXCISED REGION

229373763 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 229373822
          ||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 CATCCATTCTGAAATGCTGT-----AAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 1209

229373823 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 229373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 1269

229373883 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 229373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 1329

229373943 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 229374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 1389

229374003 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 229374062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 1449

229374063 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 229374122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 1509

229374123 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 229374182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 1569

229374183 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 229374242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 1629

229374243 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 229374302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 1689

229374303 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 229374362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 1749

229374363 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 229374422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 1809

229374423 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 229374482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 1869

229374483 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 229374542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 1929

229374543 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 229374602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1930 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTGAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 1989

229374603 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 229374662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 2049

229374663 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 229374722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 2109

229374723 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCC 229374769
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCC 2156

Alignment time is 1.56894 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229363388,229383762] =>     20375 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3022] =>      3022 nucs 'mol-32-34c9-011010_3022'

Score:        2967
Aligned:      3024        nucs
Identic:      3018 (100%) nucs =>      1227 (100%)      1791 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229372160,229373388] EXCISED REGION [229373763,229375557]
 second seq =>  [        2,     1229] EXCISED REGION [     1230,     3022]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       374 nucs [229373389,229373762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

229372160 AAAAATAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGT 229372219
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        2 AAAAATAGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGT 61

229372220 GGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCT 229372279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       62 GGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCT 121

229372280 CTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTC 229372339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      122 CTACTACAAATACAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTTCCAGCTACTC 181

229372340 AGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGA 229372399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      182 AGGAGGCTAAGGCGGGAGAATCGCTTGAATTGGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGA 241

229372400 TCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAACAAAAAAAA 229372459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
      242 TCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGAGGAAAGAGTGAGACTCCTTCTCAAAA-AAAAAAAA 300

229372460 AAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGT 229372519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAAGGTTAAAAAATAATTATAAAAGGAATATACCCAGAGTTTTTTTATTAGAAAGTGT 360

229372520 TGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGA 229372579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTATAAAATCTTGAAAGTAGAATAGTTCTATAAAATGTATTATCTATAGATCAGTAAGA 420

229372580 GAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTA 229372639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAGATATAAAAAGACATATTTTTAAAACTAAACAAAATGAAAATGGAAAAGCAACATTA 480

229372640 ATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTA 229372699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATATTATATGTGGTGTCAAATTAGCTTATTAAAAGAAATATAAAATCTAAAATCATATTA 540

229372700 ACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCA 229372759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTTATTAAAAGAAATATAAAACCTAACAGAAAAACTAAAATTAGAGGACAGAAATACCA 600

229372760 TATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATT 229372819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATGTCAGTGGAGTTTAAAGCAACTGGAGCTGTGATACACCGCTGATTGGAGTGTAAATT 660

229372820 TTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTA 229372879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTTGTTGTTTCCTTGAGAAACTATTTGACGTTACCTACTCAAACTAAACATACACCTA 720

229372880 TACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGT 229372939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACTCTGACCCAATAATCCCACCCCTAGGTAAATACTCAAAACAAAATGAATGCATGTGT 780

229372940 CCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCA 229372999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCACGGAAGGACACACACCTGCGCATTCACACCAAGTGTATTTACAATAGTCAAAAACCA 840

229373000 AAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGC 229373059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATAAGTCAATTACCTGTTAACCATAGGTAGATATTTTCGGTCTCTTGGCTTTTAAAGC 900

229373060 CTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAG 229373119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTCCATGATTTCCTATTGTTTTCTGACCAATTTTATTTCTTGTTCCTATTACCTAAAAG 960

229373120 CTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGT 229373179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCACAGTTCCAAACAGGTGAGATTCCTTGGTCCCCACTGGATGTGACAAGGAAATATGT 1020

229373180 TAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAG 229373239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGGGACTCTGCACATTCGGGCAGCTGGGTCAAAGGATGGACAAACCTTGAGGGTTAGAG 1080

229373240 AATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTT 229373299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTAATTGCCCTGGGAAGGTCTCTGCAGGTTTATCTGCCTGGAGCGAGGTGTTTACCTT 1140

229373300 TCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAG 229373359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCAAAGAGTAATAAAACCTGGATCCATTCACTTTGGTTTTGAATGGCCAAAACAATCCAG 1200

229373360 GGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 229373388
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGATTGTTAAGTGCTGTGACTTAAGAAAG 1229

EXCISED REGION

229373763 CATCCATTCTGAAATGCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 229373822
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 CATCCATTCTGAAATGCTGT--AAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTAATGGCATGAAAAAT 1287

229373823 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 229373882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 GTTCACAACCCATTGTTTAATGAAGAACAAATTATAAACAATATGCAAAGTGTGTGAATA 1347

229373883 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 229373942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 TATAGGTACTGTACATGTGCACACATATGTGTAATGTCAAAGACAGAATTACAACAAATT 1407

229373943 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 229374002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 TTGTTATAGATCTCATTGACTTTTATTGGCGATGAATCAGGGCAGCCTCCATTCTACAAA 1467

229374003 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 229374062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 ATAGAATGAGAGCTTCCACCAGGCAATGGCAGAACCGTGGGTTTTGTAAGGTAGAAACAA 1527

229374063 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 229374122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 GGAATAGAACAGTAGGAAAAAACTGATTAGTTAACATCAGGTTACTTCAGGTTGCTTTTG 1587

229374123 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 229374182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 TAATAAGGGTTAAAGCAGAGGGGACTTCCTTATATACTGCTGACTCAGGAAGGCTGGAAT 1647

229374183 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 229374242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 CTCCTGTTTGCAGGAAAACTTGGTCTGTTTTGGAAATCTATCTGCTTCTTTAAAGTTTTA 1707

229374243 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 229374302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 GTCTGATTATGTGGCATTTAGCATGAGCAACTTCATTTTGATTTGGTCTGGTCTATTGGA 1767

229374303 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 229374362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 GCCTAGTGCAGGAACTCAGTCTAAGACAATGGCCTCTCATAATTTTTGTTTAATGATAGA 1827

229374363 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 229374422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 AAAACACTGGAAGCCTATATTACCAAACTGGTGGGAATATGGGATATTTAAATTTTCTTC 1887

229374423 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGAATACTCATTACTGCTGGATTAA 229374482
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1888 CTTCTGCTTATCTATGTTTTCTAAGTTTTCAAAAATGGATACTCATTACTGCTGGATTAA 1947

229374483 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 229374542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 GAAAAAGAATAAACATTATTATATTTAATAACACAAAGGAGCAAACTGAGAACTGGATGC 2007

229374543 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTAAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 229374602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2008 AGCTTGGTAGTTGCCCGGGCAGGACACTGTCCCAAGCTGAGCTCCTCCCCAACATCCCTC 2067

229374603 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 229374662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 AGGCCCAGAGCCAGCCCTTCCTCCTCCCGAGCGCCCTGCCCTGGGATTCTCAGACCTTGA 2127

229374663 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 229374722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 AAGCCACAAGTCTTGAAAGTCTCTGAAGGAAGAGACAGGGAGCAAATGGAGTTTCTGATG 2187

229374723 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 229374782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 CTTCTCCCAGGCAGGTGGGATCATGATGCAGGATTTTTCTTGGCCCCTTTGTGGGACTCA 2247

229374783 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 229374842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 CAATGGTGGATCCCCATCTACTTGGCCCACTGTACTCAGCCCCTTGCAAGAGGGAGCACA 2307

229374843 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 229374902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 TGAGCAAGCAAGTGCAGGATCCAGCTGGCCGCTCCAGGCACTAGCAGGAGCAAGCTCCAT 2367

229374903 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 229374962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 GCAGGGCCCATGGCCAGACCAGGCATGAGTAAATGAGTGTGGGATCCAGCTGGCTGCTCT 2427

229374963 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 229375022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 GGGTGCCAGCAGGAGCAAGCTCCATGTGGGGCCTGTGGCAGCGCCTAGGTGGGGGCACCC 2487

229375023 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 229375082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 ACAACCCCAAAACCCCAGAGGGAGTGTTACAGTGCTCTCTTAGTTCCCCCATCTGCAGAC 2547

229375083 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 229375142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 AGTTATGTGTTAGCAGCTCAGTTGGCCATTTGTCTTGCCACACGGGGCAGCTGCTCTTCA 2607

229375143 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 229375202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 CCAGCAAGGGCAAAGGGCCAGTGTGATGGACTTTCTGGGTACCCACACTTGGTGGGTCCC 2667

229375203 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 229375262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 AAGCTCTTGTCTGGTGTCCAAGAAGAATGAGATCACATGGATGAACTGAAGGATGGTGAA 2727

229375263 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 229375322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 GGCGGAGAATTTTATTAAGCAATGAAAACGACTCTCAGTGGAGAGGGGAGCTGGAAAAGG 2787

229375323 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 229375382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 GATGGGAAGGGCAGGTCACCTTCCACAAAGTCAGATTGTCTCTTCCCAGAATTCAAGCCA 2847

229375383 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 229375442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 TCTCTCTCCAAAGTCAAGCCGTCTCTCTTGAAGTCTGGCCATCTCCCCCAAAGTTCAGCC 2907

229375443 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 229375502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 ATCTGTCTCTACCAACTGAGTCTGGAGTCTTTATAGGCACAGGATGGGAGTGGGGTGGGC 2967

229375503 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAA 229375557
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 CGTAGGTAGTTTTGGAAAAGGCAACATTCAACTGGTAAAAAGACATTATTCATAA 3022

Alignment time is 2.19394 s

