
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2675] =>      2675 nucs 'mol-32-1f16-095301_2675'

Score:        2653
Aligned:      2675        nucs
Identic:      2673 (100%) nucs =>       482 (100%)      2191 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109574445,109574926] EXCISED REGION [109574928,109577120]
 second seq =>  [        1,      482] EXCISED REGION [      484,     2675]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [109574927,109574927]
 second seq =>         1 nucs [483,483]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [109575127,109575127]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [482,482] to [483,483]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109574445 AGGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCC 109574504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCC 60

109574505 TTGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAG 109574564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAG 120

109574565 GCATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATG 109574624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATG 180

109574625 TTGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAA 109574684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAA 240

109574685 GTGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAA 109574744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAA 300

109574745 GGACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTT 109574804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTT 360

109574805 TAAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGT 109574864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGT 420

109574865 GGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGA 109574924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGA 480

109574925 TC 109574926
          ||
      481 TC 482

EXCISED REGION

109574928 AGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAGAAGATTAGCCA 109574987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      484 AGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAGATTAGCCA 543

109574988 GGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCA 109575047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 GGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCA 603

109575048 TGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTGGG 109575107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 TGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTGGG 663

109575108 CGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTCAA 109575167
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 CGACAGAGCGAGACTGTCT-AAAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTCAA 722

109575168 TTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAAT 109575227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 TTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAAT 782

109575228 GTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAG 109575287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 GTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAG 842

109575288 GTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCT 109575347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 GTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCT 902

109575348 GTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCT 109575407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 GTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCT 962

109575408 ATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCT 109575467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 ATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCT 1022

109575468 GAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAA 109575527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 GAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAA 1082

109575528 ATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGA 109575587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 ATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGA 1142

109575588 CAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAG 109575647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 CAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAG 1202

109575648 TGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAG 109575707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 TGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAG 1262

109575708 GAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAT 109575767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 GAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAT 1322

109575768 TAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 109575827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 TAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 1382

109575828 ATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCA 109575887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 ATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCA 1442

109575888 GCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAA 109575947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 GCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAA 1502

109575948 ATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGA 109576007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 ATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGA 1562

109576008 CGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTG 109576067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 CGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTG 1622

109576068 TGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCA 109576127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 TGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCA 1682

109576128 CACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGA 109576187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 CACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGA 1742

109576188 CCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAG 109576247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 CCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAG 1802

109576248 AATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGC 109576307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 AATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGC 1862

109576308 CAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACC 109576367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 CAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACC 1922

109576368 CTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAG 109576427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 CTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAG 1982

109576428 CTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAG 109576487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 CTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAG 2042

109576488 CCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAA 109576547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 CCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAA 2102

109576548 TAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAA 109576607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 TAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAA 2162

109576608 ATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTT 109576667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 ATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTT 2222

109576668 TGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACA 109576727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 TGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACA 2282

109576728 TGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTG 109576787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 TGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTG 2342

109576788 GAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGT 109576847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 GAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGT 2402

109576848 TGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCAT 109576907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 TGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCAT 2462

109576908 CTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCT 109576967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 CTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCT 2522

109576968 GCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATT 109577027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 GCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATT 2582

109577028 AGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATA 109577087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 AGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATA 2642

109577088 CTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGACAC 109577120
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 CTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGACAC 2675

Alignment time is 3.56275 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5444] =>      5444 nucs 'mol-32-1f58-007009_5444'

Score:        5390
Aligned:      5436        nucs
Identic:      5431 (100%) nucs =>       418 (100%)      5013 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109571914,109572331] EXCISED REGION [109572346,109577363]
 second seq =>  [        1,      418] EXCISED REGION [      429,     5444]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        14 nucs [109572332,109572345]
 second seq =>        10 nucs [419,428]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [109572331,109572333] to [109572345,109572347]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109572331,109572331] to [109572346,109572346]
 second seq =>         1 nucs [418,418] to [429,429]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [109572332,109572333] to [109572344,109572345]
 second seq =>         0 nucs

109571914 AGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCC 109571973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCC 60

109571974 GTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAG 109572033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAG 120

109572034 CACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGC 109572093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGC 180

109572094 CAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCA 109572153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCA 240

109572154 TGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTG 109572213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTG 300

109572214 AACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTG 109572273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTG 360

109572274 ACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 109572331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 418

EXCISED REGION

109572346 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 109572405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      429 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 488

109572406 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 109572465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      489 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 548

109572466 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 109572525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      549 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 608

109572526 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 109572585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      609 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 668

109572586 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 109572645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      669 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 728

109572646 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 109572705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      729 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 788

109572706 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 109572765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      789 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 848

109572766 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 109572825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 908

109572826 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 109572885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 968

109572886 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 109572945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 1028

109572946 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 109573005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 1088

109573006 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 109573065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 1148

109573066 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 109573125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 1208

109573126 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 109573185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 1268

109573186 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 109573245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 1328

109573246 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 109573305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 1388

109573306 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 109573365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 1448

109573366 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 109573425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 1508

109573426 AACATGGCATTCAAAAAACTTTATGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 109573485
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 AACATGGCATTCAAAAAACTTTACGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 1568

109573486 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 109573545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 1628

109573546 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 109573605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 1688

109573606 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 109573665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 1748

109573666 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 109573725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 1808

109573726 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 109573785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 1868

109573786 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 109573845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 1928

109573846 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 109573905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 1988

109573906 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 109573965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 2048

109573966 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 109574025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 2108

109574026 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 109574085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 2168

109574086 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 109574145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 2228

109574146 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 109574205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 2288

109574206 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 109574265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 2348

109574266 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 109574325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 2408

109574326 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 109574385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 2468

109574386 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 109574445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
     2469 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 2526

109574446 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 109574505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 2586

109574506 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 109574565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 2646

109574566 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 109574625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 2706

109574626 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAG 109574685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAG 2766

109574686 TGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAG 109574745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 TGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAG 2826

109574746 GACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTT 109574805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 GACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTT 2886

109574806 AAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTG 109574865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 AAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTG 2946

109574866 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGAT 109574925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGAT 3006

109574926 CGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAGAAGATTAGC 109574985
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3007 CCAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAGATTAGC 3066

109574986 CAGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGG 109575045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 CAGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGG 3126

109575046 CATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTG 109575105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 CATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTG 3186

109575106 GGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTC 109575165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 GGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTC 3246

109575166 AATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAA 109575225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 AATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAA 3306

109575226 ATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 109575285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 ATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 3366

109575286 AGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACC 109575345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 AGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACC 3426

109575346 CTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAG 109575405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 CTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAG 3486

109575406 CTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 109575465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 CTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 3546

109575466 CTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAA 109575525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 CTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAA 3606

109575526 AAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAA 109575585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 AAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAA 3666

109575586 GACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGC 109575645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 GACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGC 3726

109575646 AGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTC 109575705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 AGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTC 3786

109575706 AGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 109575765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 AGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 3846

109575766 ATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGA 109575825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 ATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGA 3906

109575826 GAATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTC 109575885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 GAATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTC 3966

109575886 CAGCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCT 109575945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 CAGCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCT 4026

109575946 AAATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCA 109576005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 AAATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCA 4086

109576006 GACGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATT 109576065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 GACGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATT 4146

109576066 TGTGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTC 109576125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 TGTGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTC 4206

109576126 CACACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAA 109576185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 CACACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAA 4266

109576186 GACCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTA 109576245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 GACCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTA 4326

109576246 AGAATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAG 109576305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 AGAATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAG 4386

109576306 GCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAA 109576365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 GCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAA 4446

109576366 CCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCC 109576425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 CCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCC 4506

109576426 AGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTG 109576485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 AGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTG 4566

109576486 AGCCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAA 109576545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 AGCCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAA 4626

109576546 AATAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATG 109576605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 AATAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATG 4686

109576606 AAATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTAT 109576665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 AAATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTAT 4746

109576666 TTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAA 109576725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 TTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAA 4806

109576726 CATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCC 109576785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 CATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCC 4866

109576786 TGGAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAG 109576845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 TGGAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAG 4926

109576846 GTTGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCC 109576905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 GTTGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCC 4986

109576906 ATCTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGC 109576965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 ATCTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGC 5046

109576966 CTGCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAA 109577025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 CTGCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAA 5106

109577026 TTAGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCA 109577085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 TTAGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCA 5166

109577086 TACTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGT 109577145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 TACTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGT 5226

109577146 TAGGAACTGAGCTGCACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGT 109577205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 TAGGAACTGAGCTGCACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGT 5286

109577206 CCCGCTCCTGTTAGATCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATAT 109577265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 CCCGCTCCTGTTAGATCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATAT 5346

109577266 GAGGGATCTAAACTGCAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAAT 109577325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 GAGGGATCTAAACTGCAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAAT 5406

109577326 GGTTTCCACCTCACCCCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCT 109577363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 GGTTTCCACCTCACCCCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCT 5444

Alignment time is 6.73301 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5241] =>      5241 nucs 'mol-32-22d3-004348_5241'

Score:        5164
Aligned:      5248        nucs
Identic:      5233 (100%) nucs =>      5131 (100%)       102 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109568090,109573231] EXCISED REGION [109575181,109575282]
 second seq =>  [        1,     5139] EXCISED REGION [     5140,     5241]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1949 nucs [109573232,109575180]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109573232,109573232] to [109575181,109575181]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109568090 GCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGTGGATTATGAGATCAGGA 109568149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGTGGATTATGAGATCAGGA 60

109568150 GTTTGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTA 109568209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTTGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTA 120

109568210 GCGGAGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT 109568269
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCAGAGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT 180

109568270 TGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCC 109568329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCC 240

109568330 TGGGCAATAGAGCCAGACTCCATCTCGGAAAAAGAAAAAAAAACTAACAAATAAAAAAAA 109568389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGGCAATAGAGCCAGACTCCATCTCGGAAAAAGAAAAAAAAACTAACAAATAAAAAAAA 300

109568390 GTGGCGCTAGGGTAAACAAGGGACAAACCACAGAAAAATAATTATACGACTCACTCAAAT 109568449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGGCGCTAGGGTAAACAAGGGACAAACCACAGAAAAATAATTATACGACTCACTCAAAT 360

109568450 ATTTAATGACATCAGACTACACAAATCCCTCTGCAGAGTAAGAATATGTCTGTCTCAGGA 109568509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTAATGACATCAGACTACACAAATCCCTCTGCAGAGTAAGAATATGTCTGTCTCAGGA 420

109568510 AACAGTAAATCACAAACTTATCTCCCAACACACCAGCTACCCAACTCCGCATGCTTTAGG 109568569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACAGTAAATCACAAACTTATCTCCCAACACACCAGCTACCCAACTCCGCATGCTTTAGG 480

109568570 TTTCCCTTTCCTATCTTCTGAGCTGACCACCATCCTCCTGTTCACAGACTTCGTCCAAAA 109568629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCCCTTTCCTATCTTCTGAGCTGACCACCATCCTCCTGTTCACAGACTTCGTCCAAAA 540

109568630 GAGGATACGGTAAAATAAGTTAAGATTTCCACTCACTAAATTCTTTTTTTTTTTTTAAAG 109568689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGGATACGGTAAAATAAGTTAAGATTTCCACTCACTAAATTCTTTTTTTTTTTTTAAAG 600

109568690 ACAGGGTCTTGCTCTGTCACCTAGGTTAGAGTGCAGTTGCATGACCATGGCCCACTGCAG 109568749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAGGGTCTTGCTCTGTCACCTAGGTTAGAGTGCAGTTGCATGACCATGGCCCACTGCAG 660

109568750 CCTTGACCTCCCAGGCTCAAGTGATCCTCCCGCTTCAGCCTTCCAAGTACCTGGGATGAC 109568809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTTGACCTCCCAGGCTCAAGTGATCCTCCCGCTTCAGCCTTCCAAGTACCTGGGATGAC 720

109568810 AGGTGTGTGCCACCGTACCCAGCTAATTTTTTATTTTACTTTTTGTAGAGACGGGATCTA 109568869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGTGTGTGCCACCGTACCCAGCTAATTTTTTATTTTACTTTTTGTAGAGACGGGATCTA 780

109568870 CCTATGTTGCCTAGGCTGCTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCTCGCCTCGGCAT 109568929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTATGTTGCCTAGGCTGCTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCTCGCCTCGGCAT 840

109568930 CCCAAAGTGTTGGGATTACAGGGATGAGCCACCGTGCCCACCTTTTTTTTTTTTTCAGGT 109568989
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
      841 CCCAAAGTGTTGGGATTACAGGGATGAGCCACCGTGCCCACCTTTTTTTTTTTT-CAGGT 899

109568990 TATCCGTGGAAACTACTCATTAAATTCTGATCATATCAGAACTGTCTCCCTAATATTATT 109569049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TATCCGTGGAAACTACTCATTAAATTCTGATCATATCAGAACTGTCTCCCTAATATTATT 959

109569050 CTTAGAGCACACTGATTAGTGATTTTAGCATTCCTCAAATCTTTAGACAATTCTTTTTTT 109569109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CTTAGAGCACACTGATTAGTGATTTTAGCATTCCTCAAATCTTTAGACAATTCTTTTTTT 1019

109569110 TATTTTTACTGCTCCTTGCAGAGCAGGCTACCCAATAGGCAGTGTGCCCAGAGTAGCCCT 109569169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TATTTTTACTGCTCCTTGCAGAGCAGGCTACCCAATAGGCAGTGTGCCCAGAGTAGCCCT 1079

109569170 TCAGGTAATTCTTACTAGCAAAAAAATGGCTTTTACTAATTTAACTCTCAGAAAAAAATA 109569229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TCAGGTAATTCTTACTAGCAAAAAAATGGCTTTTACTAATTTAACTCTCAGAAAAAAATA 1139

109569230 TTCCCTCCTCTGTAGGTTCTTAGAGGGCACATCACATATATCTCCATGTACCAACCACAC 109569289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TTCCCTCCTCTGTAGGTTCTTAGAGGGCACATCACATATATCTCCATGTACCAACCACAC 1199

109569290 AAACTTAATGCACAATTGGGACTATAATTTTCTAATATAGCTCAATATACCAATGATACT 109569349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AAACTTAATGCACAATTGGGACTATAATTTTCTAATATAGCTCAATATACCAATGATACT 1259

109569350 AAACATTGTATAGGCTTCATATTCAACATTCAATCTAAATATCAGTCCAGATATAAAGTT 109569409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 AAACATTGTATAGGCTTCATATTCAACATTCAATCTAAATATCAGTCCAGATATAAAGTT 1319

109569410 ACTCTGAATGGAATTTATGGCAATAGTCCCACTTTAAATAATAACTACAAGTTTAATGTT 109569469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 ACTCTGAATGGAATTTATGGCAATAGTCCCACTTTAAATAATAACTACAAGTTTAATGTT 1379

109569470 GCAGTCATTTTTGGTTAATAAAGCCTAAGAGAACTACATTCTTACAAATACATATTTTAT 109569529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GCAGTCATTTTTGGTTAATAAAGCCTAAGAGAACTACATTCTTACAAATACATATTTTAT 1439

109569530 ACTGACAGTTGAAGGTAACAGAAAATATGTCCTAATTAACTTAAAATTGGTTCAAGTTTT 109569589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 ACTGACAGTTGAAGGTAACAGAAAATATGTCCTAATTAACTTAAAATTGGTTCAAGTTTT 1499

109569590 CTTTTTAAAAAAAAACTAATTAAAAAAAGACAAGTTTTAATTCTATACCTTGAAATTCCC 109569649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CTTTTTAAAAAAAAACTAATTAAAAAAAGACAAGTTTTAATTCTATACCTTGAAATTCCC 1559

109569650 AGTAGAATAATATATTTTAATCACCCAACACAGAATTTTTTTTTTTTAAGGCAGAGTCTC 109569709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AGTAGAATAATATATTTTAATCACCCAACACAGAATTTTTTTTTTTTAAGGCAGAGTCTC 1619

109569710 CCTCTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGCAATCTCGGCTGGCTGCAACCTCCGCCTCCC 109569769
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GCTCTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGCAATCTCGGCTGGCTGCAACCTCCGCCTCCC 1679

109569770 AGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCACTT 109569829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCACTT 1739

109569830 ACACAACCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATGTTTGCCAGG 109569889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ACACAACCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATGTTTGCCAGG 1799

109569890 CTGGTCTCAAACTCTTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 109569949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CTGGTCTCAAACTCTTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 1859

109569950 TTACAGGCGTGAGCCACCAAGCCTGGCCCAGAATTTTAATTCTTATAAGCTTCACTGTTG 109570009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TTACAGGCGTGAGCCACCAAGCCTGGCCCAGAATTTTAATTCTTATAAGCTTCACTGTTG 1919

109570010 CTGAATACAGTATAAATATAGGCATAGGCACATGCTTGATGACTATATCTTAGAATTATT 109570069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CTGAATACAGTATAAATATAGGCATAGGCACATGCTTGATGACTATATCTTAGAATTATT 1979

109570070 CTCTTCTAACTCCCTTGTATTACTGAAACATTTATACAGGCTCCCAAAATCTTACCTCTG 109570129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CTCTTCTAACTCCCTTGTATTACTGAAACATTTATACAGGCTCCCAAAATCTTACCTCTG 2039

109570130 TAAGTGATATATACTGCATACTTTTTTTTTCCCCCAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCA 109570189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TAAGTGATATATACTGCATACTTTTTTTTTCCCCCAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCA 2099

109570190 GGCAAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGTTTACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTG 109570249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GGCAAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGTTTACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTG 2159

109570250 ATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATCACAGGTGCCTGCCACCACGCCCGGC 109570309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATCACAGGTGCCTGCCACCACGCCCGGC 2219

109570310 TAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATCTTGGCAGGGCTGGTCTTGAAC 109570369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATCTTGGCAGGGCTGGTCTTGAAC 2279

109570370 TCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGC 109570429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGC 2339

109570430 CACCATGCCCAGCTATATACATATTTTAAACATCTATTTCCTGTAATCCTAGCTACTTTG 109570489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CACCATGCCCAGCTATATACATATTTTAAACATCTATTTCCTGTAATCCTAGCTACTTTG 2399

109570490 GAAGGCTGAGGTGGGCAACATAGTGAGACCTTATCTCAAATAAATAAATAAATAACTATT 109570549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 GAAGGCTGAGGTGGGCAACATAGTGAGACCTTATCTCAAATAAATAAATAAATAACTATT 2459

109570550 CACCACAAAGTTAGAACTTTTCTCTAATTCAGGGAAACAGAATTCAATAATAATTACTTC 109570609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 CACCACAAAGTTAGAACTTTTCTCTAATTCAGGGAAACAGAATTCAATAATAATTACTTC 2519

109570610 TTCCCCTCTCCTCTGGGGGAGCTATAAATCTGCAAAAGATTTTAACAAGTTTAGGAACTA 109570669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TTCCCCTCTCCTCTGGGGGAGCTATAAATCTGCAAAAGATTTTAACAAGTTTAGGAACTA 2579

109570670 CTAAAATTATCTTTTAAAATGAGATGCACATATAATCATAATATGTGTTCAATAAATAAA 109570729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CTAAAATTATCTTTTAAAATGAGATGCACATATAATCATAATATGTGTTCAATAAATAAA 2639

109570730 TATTAGCTGAATTAACTTGAGATGTAAAGTCACTGAAGAAATGTCTCTACAAAAGTACAG 109570789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TATTAGCTGAATTAACTTGAGATGTAAAGTCACTGAAGAAATGTCTCTACAAAAGTACAG 2699

109570790 AACAGATGACTATGGTTTTGTTTGTTTGTCTGTTTTAGACAGGGTCTTACTCTGAGGCCC 109570849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 AACAGATGACTATGGTTTTGTTTGTTTGTCTGTTTTAGACAGGGTCTTACTCTGAGGCCC 2759

109570850 AGGCAGGAGTGCAGTGGCTGAATCATGGCTCACTGCAGCCTTGGCCTTCTGGGCTCAAGC 109570909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 AGGCAGGAGTGCAGTGGCTGAATCATGGCTCACTGCAGCCTTGGCCTTCTGGGCTCAAGC 2819

109570910 AATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCATGTGCCACTGGGCCCAG 109570969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCATGTGCCACTGGGCCCAG 2879

109570970 CTAATTTTTGTTGGG----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATTGGGTTTCGCC 109571025
          |||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CTAATTTTT------TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATTGGGTTTCGCC 2933

109571026 ATGTTGCCCAGGCTTAGTCTGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTC 109571085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2934 ATGTTGCCCAGGCTTAGTCTGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAACCCACCCGCCTC 2993

109571086 GACCTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGT 109571145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 GACCTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGT 3053

109571146 TTTTAATTGTTTTCAAAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCT 109571205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 TTTTAATTGTTTTCAAAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCT 3113

109571206 ATTTAGCCTAAGCATGTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGG 109571265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 ATTTAGCCTAAGCATGTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGG 3173

109571266 GGTTTCACCATGTTGGCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCA 109571325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 GGTTTCACCATGTTGGCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCA 3233

109571326 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTT 109571385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTT 3293

109571386 TTTAAAAAACATTTTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATAT 109571445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 TTTAAAAAACATTTTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATAT 3353

109571446 ATAATTTACCATCTTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATA 109571505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 ATAATTTACCATCTTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATA 3413

109571506 TTCCATCCTTGCCTTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAAT 109571565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 TTCCATCCTTGCCTTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAAT 3473

109571566 TGTGAATTTTCCTTTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGA 109571625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 TGTGAATTTTCCTTTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGA 3533

109571626 AATAAGAGTGTTCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATT 109571685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 AATAAGAGTGTTCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATT 3593

109571686 TTAGTCCTTAGATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGG 109571745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 TTAGTCCTTAGATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGG 3653

109571746 ACTCCTATTGATTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAA 109571805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 ACTCCTATTGATTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAA 3713

109571806 ATAAAATTATTTTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACT 109571865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 ATAAAATTATTTTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACT 3773

109571866 GCCGGGCGCAGTGGCTCATGGCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGAT 109571925
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 GCCGGGCGCAGTGGCTCATGGCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGAT 3833

109571926 CACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAA 109571985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 CACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAA 3893

109571986 AATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGG 109572045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 AATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGG 3953

109572046 CTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAA 109572105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 CTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAA 4013

109572106 ACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCC 109572165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 ACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCC 4073

109572166 CAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGC 109572225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 CAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGC 4133

109572226 AGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGAC 109572285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 AGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGAC 4193

109572286 TCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAA 109572345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 TCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAA 4253

109572346 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 109572405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 4313

109572406 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 109572465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 4373

109572466 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 109572525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 4433

109572526 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 109572585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 4493

109572586 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 109572645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 4553

109572646 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 109572705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 4613

109572706 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 109572765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 4673

109572766 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 109572825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 4733

109572826 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 109572885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 4793

109572886 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 109572945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 4853

109572946 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 109573005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 4913

109573006 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 109573065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 4973

109573066 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 109573125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 5033

109573126 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 109573185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 5093

109573186 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 109573231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 5139

EXCISED REGION

109575181 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 109575240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5140 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 5199

109575241 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 109575282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5200 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 5241

Alignment time is 6.60822 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2418] =>      2418 nucs 'mol-32-2378-010844_2418'

Score:        2386
Aligned:      2408        nucs
Identic:      2406 (100%) nucs =>       419 (100%)      1987 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109571912,109572331] EXCISED REGION [109572346,109574333]
 second seq =>  [        1,      420] EXCISED REGION [      431,     2418]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        14 nucs [109572332,109572345]
 second seq =>        10 nucs [421,430]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [109572331,109572333] to [109572345,109572347]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109572331,109572331] to [109572346,109572346]
 second seq =>         1 nucs [420,420] to [431,431]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [109572332,109572333] to [109572344,109572345]
 second seq =>         0 nucs

109571912 CGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACC 109571971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACC 60

109571972 CCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCC 109572031
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCGTCTCTACTAAAAGTACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCC 120

109572032 AGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTG 109572091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTG 180

109572092 GCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTG 109572151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTG 240

109572152 CATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACT 109572211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACT 300

109572212 TGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGG 109572271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGG 360

109572272 TGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 109572331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 420

EXCISED REGION

109572346 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 109572405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      431 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 490

109572406 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 109572465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 550

109572466 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 109572525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 610

109572526 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 109572585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 670

109572586 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 109572645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 730

109572646 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 109572705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 790

109572706 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 109572765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 850

109572766 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 109572825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 910

109572826 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 109572885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 970

109572886 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 109572945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 1030

109572946 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 109573005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 1090

109573006 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 109573065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 1150

109573066 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 109573125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 1210

109573126 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 109573185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 1270

109573186 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 109573245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 1330

109573246 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 109573305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 1390

109573306 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 109573365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 1450

109573366 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 109573425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 1510

109573426 AACATGGCATTCAAAAAACTTTATGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 109573485
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 AACATGGCATTCAAAAAACTTTACGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 1570

109573486 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 109573545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 1630

109573546 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 109573605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 1690

109573606 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 109573665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 1750

109573666 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 109573725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 1810

109573726 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 109573785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 1870

109573786 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 109573845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 1930

109573846 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 109573905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 1990

109573906 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 109573965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 2050

109573966 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 109574025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 2110

109574026 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 109574085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 2170

109574086 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 109574145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 2230

109574146 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 109574205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 2290

109574206 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 109574265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 2350

109574266 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 109574325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 2410

109574326 AGTAATAA 109574333
          ||||||||
     2411 AGTAATAA 2418

Alignment time is 3.38476 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2420] =>      2420 nucs 'mol-32-2383-079063_2420'

Score:        2386
Aligned:      2414        nucs
Identic:      2409 (100%) nucs =>       113 (100%)      2296 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109572219,109572331] EXCISED REGION [109572346,109574646]
 second seq =>  [        1,      113] EXCISED REGION [      124,     2420]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        14 nucs [109572332,109572345]
 second seq =>        10 nucs [114,123]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [109572331,109572333] to [109572345,109572347]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109572331,109572331] to [109572346,109572346]
 second seq =>         1 nucs [113,113] to [124,124]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [109572332,109572333] to [109572344,109572345]
 second seq =>         0 nucs

109572219 GGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGA 109572278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGA 60

109572279 GCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 109572331
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 113

EXCISED REGION

109572346 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 109572405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 183

109572406 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 109572465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      184 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 243

109572466 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 109572525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      244 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 303

109572526 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 109572585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 363

109572586 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 109572645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 423

109572646 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 109572705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 483

109572706 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 109572765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 543

109572766 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 109572825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 603

109572826 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 109572885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 663

109572886 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 109572945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 723

109572946 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 109573005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 783

109573006 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 109573065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 843

109573066 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 109573125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 903

109573126 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 109573185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 963

109573186 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 109573245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 1023

109573246 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 109573305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 1083

109573306 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 109573365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 1143

109573366 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 109573425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 1203

109573426 AACATGGCATTCAAAAAACTTTATGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 109573485
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 AACATGGCATTCAAAAAACTTTACGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 1263

109573486 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 109573545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 1323

109573546 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 109573605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 1383

109573606 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 109573665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 1443

109573666 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 109573725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 1503

109573726 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 109573785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 1563

109573786 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 109573845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 1623

109573846 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 109573905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 1683

109573906 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 109573965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 1743

109573966 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 109574025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 1803

109574026 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 109574085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 1863

109574086 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 109574145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 1923

109574146 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 109574205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 1983

109574206 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 109574265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 2043

109574266 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 109574325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 2103

109574326 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 109574385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 2163

109574386 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 109574445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||
     2164 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTC----TTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 2219

109574446 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 109574505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 2279

109574506 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 109574565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 2339

109574566 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 109574625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 2399

109574626 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACT 109574646
          |||||||||||||||||||||
     2400 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACT 2420

Alignment time is 3.05789 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5258] =>      5258 nucs 'mol-32-29be-019728_5258'

Score:        5150
Aligned:      5262        nucs
Identic:      5251 (100%) nucs =>       748 (100%)      4503 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109572483,109573231] EXCISED REGION [109575181,109579693]
 second seq =>  [        1,      749] EXCISED REGION [      750,     5258]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1949 nucs [109573232,109575180]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109573232,109573232] to [109575181,109575181]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109572483 GAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAA 109572542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAA 60

109572543 AATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATC 109572602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATC 120

109572603 ACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGC 109572662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGC 180

109572663 AGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCC 109572722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCC 240

109572723 AGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTT 109572782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTT 300

109572783 CATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATG 109572842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATG 360

109572843 GTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGG 109572902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGG 420

109572903 CTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGA 109572962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGA 480

109572963 GTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAA 109573022
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGGGAAACCATCCCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAA 540

109573023 TAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAA 109573082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAA 600

109573083 ACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTA 109573142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTA 660

109573143 TAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATC 109573202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATC 720

109573203 TCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 109573231
          |||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 749

EXCISED REGION

109575181 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 109575240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 809

109575241 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 109575300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 869

109575301 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 109575360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 929

109575361 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 109575420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 989

109575421 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 109575480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 1049

109575481 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 109575540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 1109

109575541 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 109575600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 1169

109575601 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 109575660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 1229

109575661 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 109575720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 1289

109575721 GCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAG 109575780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 GCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAG 1349

109575781 TGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCC 109575840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 TGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCC 1409

109575841 AGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAG 109575900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 AGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAG 1469

109575901 AATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCT 109575960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 AATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCT 1529

109575961 GGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCA 109576020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 GGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCA 1589

109576021 AAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTC 109576080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 AAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTC 1649

109576081 AACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAAT 109576140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 AACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAAT 1709

109576141 GAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCT 109576200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 GAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCT 1769

109576201 AGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGG 109576260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 AGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGG 1829

109576261 GACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGA 109576320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 GACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGA 1889

109576321 TCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAA 109576380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 TCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAA 1949

109576381 AAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 109576440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 AAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 2009

109576441 TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGC 109576500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGC 2069

109576501 CACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGA 109576560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 CACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGA 2129

109576561 AGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACA 109576620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 AGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACA 2189

109576621 AAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAG 109576680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 AAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAG 2249

109576681 TGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCA 109576740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 TGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCA 2309

109576741 TCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTAC 109576800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 TCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTAC 2369

109576801 TTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGG 109576860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2370 TTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGAAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGG 2429

109576861 GATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAA 109576920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 GATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAA 2489

109576921 ACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTG 109576980
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 ACTTAAATGTAGACTACCCCATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTG 2549

109576981 CAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGA 109577040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 CAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGA 2609

109577041 ACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGG 109577100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 ACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGG 2669

109577101 GTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGC 109577160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 GTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGC 2729

109577161 ACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGA 109577220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 ACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGA 2789

109577221 TCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTG 109577280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 TCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTG 2849

109577281 CAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACC 109577340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 CAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACC 2909

109577341 CCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCA 109577400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 CCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCA 2969

109577401 AAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTA 109577460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 AAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTA 3029

109577461 AAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGA 109577520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 AAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGA 3089

109577521 ATATAAACAGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAA 109577580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 ATATAAACAGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAA 3149

109577581 TATACAAAGGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGG 109577640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 TATACAAAGGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGG 3209

109577641 CTGAGATCGGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTC 109577700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 CTGAGATCGGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTC 3269

109577701 TCCAAAAAAAAAAAACAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTC 109577760
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 TCCAAAAAAAAAAAA-AATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTC 3328

109577761 AGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGTTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACA 109577820
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3329 AGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTATTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACA 3388

109577821 TTGCACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAGAAAAAAAAAAA 109577880
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||
     3389 TTGCACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAG--AAAAAAAAA 3446

109577881 AAAAAAAACCCCACACACACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGATT 109577940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 AAAAAAAACCCCACACACACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGATT 3506

109577941 ATCTCTGAAGAAAGGCATGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGGT 109578000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 ATCTCTGAAGAAAGGCATGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGGT 3566

109578001 TGAAGGAGACTTTTTTATTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAATA 109578060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 TGAAGGAGACTTTTTTATTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAATA 3626

109578061 TATATTCATGCATTACTTGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTAA 109578120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 TATATTCATGCATTACTTGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTAA 3686

109578121 ATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 109578180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 ATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 3746

109578181 GCAATCTTGGCTCATTGCAATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGCCTTGGCC 109578240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 GCAATCTTGGCTCATTGCAATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGCCTTGGCC 3806

109578241 TCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCATTTTTAGT 109578300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 TCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCATTTTTAGT 3866

109578301 AGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCC 109578360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 AGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCC 3926

109578361 ACCCACCTCGGTCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATGCCCAGCCAAT 109578420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 ACCCACCTCGGTCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATGCCCAGCCAAT 3986

109578421 TTTTAATTTTGTATCTTCTTTTTTTTTTTTTTAAGAGAAGGAGTCTTACTATGCTACCCA 109578480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 TTTTAATTTTGTATCTTCTTTTTTTTTTTTTTAAGAGAAGGAGTCTTACTATGCTACCCA 4046

109578481 GACTACAGTGTAGTTGCTATTGCCGGGCCTGTTCATAGCACACTACAGCCTCAAACTCCT 109578540
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4047 GACTACAGTGTAGTTGCTATTGCCAGGCCTGTTCATAGCACACTACAGCCTCAAACTCCT 4106

109578541 GCGCTCAAGCAATTCTTCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTAAGACTATAGACATATGCCA 109578600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4107 GCGCTCAAGCAATTCTTCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTAAGACTATAGACATATGCCA 4166

109578601 ACTTGCCTGGCTCAATTTTTAATTTTAAAGCAAAAAAGAACTATGAAAATGAAAAATATA 109578660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4167 ACTTGCCTGGCTCAATTTTTAATTTTAAAGCAAAAAAGAACTATGAAAATGAAAAATATA 4226

109578661 TACATATTAAAGGATTAGATCTCAAAGGTTTTAATCTATAAAGGTACCAACTAAAGTACA 109578720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4227 TACATATTAAAGGATTAGATCTCAAAGGTTTTAATCTATAAAGGTACCAACTAAAGTACA 4286

109578721 ATCCCCAAAACAGGATTAACTGCTTTGTTTACAATGCAAAAACTACTGGGTACTATTTTA 109578780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4287 ATCCCCAAAACAGGATTAACTGCTTTGTTTACAATGCAAAAACTACTGGGTACTATTTTA 4346

109578781 GGATCTTACATTCATTGTCTAATCGATCCTTACAAAAACCATTCTTCACCAGAAGATAGC 109578840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4347 GGATCTTACATTCATTGTCTAATCGATCCTTACAAAAACCATTCTTCACCAGAAGATAGC 4406

109578841 TTCTAGATCCCTTCCCACTCCCGTCATCCTCCTCTAAATATCTGTTAATCCCCCTCCTAA 109578900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4407 TTCTAGATCCCTTCCCACTCCCGTCATCCTCCTCTAAATATCTGTTAATCCCCCTCCTAA 4466

109578901 AGAACCCAAAATAGGCCAGGCGCGGTGGCTCACATCTGTAATCCCAGCACTATAGGAGCC 109578960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4467 AGAACCCAAAATAGGCCAGGCGCGGTGGCTCACATCTGTAATCCCAGCACTATAGGAGCC 4526

109578961 TGAGGCAGGTGGATCACAAAGTCAGGAGATCCAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAATC 109579020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4527 TGAGGCAGGTGGATCACAAAGTCAGGAGATCCAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAATC 4586

109579021 CCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCTTGGTAGCGTGCGCCTGTAGTCCCAG 109579080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4587 CCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCTTGGTAGCGTGCGCCTGTAGTCCCAG 4646

109579081 GAGGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGCACCACTGCACTACAGCCTGGGCGACTG 109579140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4647 GAGGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGCACCACTGCACTACAGCCTGGGCGACTG 4706

109579141 AGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACATAGTCCAGGCGCGGTGGCTCACACCT 109579200
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4707 AGCAAGACTCCGTCTC-AAAAAAAAAAAAAAACATAGTCCAGGCGCGGTGGCTCACACCT 4765

109579201 GTAATCTCACCACTTTGGAAGGCCGAGGCAAGCGGATCACGGGGTCAGCAGATCGAGACC 109579260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 GTAATCTCACCACTTTGGAAGGCCGAGGCAAGCGGATCACGGGGTCAGCAGATCGAGACC 4825

109579261 ATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAACAATACAAAAAATTAGCTGGGCGT 109579320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 ATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAACAATACAAAAAATTAGCTGGGCGT 4885

109579321 GGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCGTGAAC 109579380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 GGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCGTGAAC 4945

109579381 CCCGGGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTACAGCCTGGGGCGACA 109579440
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 CCCGGGGCGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTACAGCCTGGGGCGACA 5005

109579441 GAGTGAGACTCCATCTCAAAATAAATAAATAAATAAATAATAAAGCACAACACTCCAGGT 109579500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 GAGTGAGACTCCATCTCAAAATAAATAAATAAATAAATAATAAAGCACAACACTCCAGGT 5065

109579501 GTGGTCTGATCAAGAACTATATACAGTGAAACTAACAATTCCCATCATCTAGGCTCTTTA 109579560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 GTGGTCTGATCAAGAACTATATACAGTGAAACTAACAATTCCCATCATCTAGGCTCTTTA 5125

109579561 CAATGAATACACCTAAAATTTCTTTATATCATCATCTATTTGTGAAATGCTGTTTTTGCA 109579620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 CAATGAATACACCTAAAATTTCTTTATATCATCATCTATTTGTGAAATGCTGTTTTTGCA 5185

109579621 CTTCCCGGAATTTCATTTCCAAAGCTCTTCTTAAAGTTTCAAAGAAAATCGCCAGGTGCG 109579680
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 CTTCCAGGAATTTCATTTCCAAAGCTCTTCTTAAAGTTTCAAAGAAAATCGCCAGGTGCG 5245

109579681 GTGGCTCACGCCT 109579693
          |||||||||||||
     5246 GTGGCTCACGCCT 5258

Alignment time is 6.48883 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3328] =>      3328 nucs 'mol-32-2b08-064939_3328'

Score:        3253
Aligned:      3323        nucs
Identic:      3315 (100%) nucs =>       699 (100%)      2616 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109571632,109572331] EXCISED REGION [109572346,109574968]
 second seq =>  [        1,      700] EXCISED REGION [      711,     3328]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        14 nucs [109572332,109572345]
 second seq =>        10 nucs [701,710]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [109572331,109572333] to [109572345,109572347]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109572331,109572331] to [109572346,109572346]
 second seq =>         1 nucs [700,700] to [711,711]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [109572332,109572333] to [109572344,109572345]
 second seq =>         0 nucs

109571632 AGTGTTCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTC 109571691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTGTTCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTC 60

109571692 CTTAGATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCT 109571751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTAGATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCT 120

109571752 ATTGATTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAA 109571811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTGATTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAA 180

109571812 TTATTTTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGG 109571871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATTTTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGG 240

109571872 CGCAGTGGCTCATGGCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAG 109571931
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CGCAGTGGCTCATGGCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAG 300

109571932 GTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACA 109571991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACA 360

109571992 AACAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 109572051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 420

109572052 CTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTG 109572111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTG 480

109572112 TCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTA 109572171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTA 540

109572172 CTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTT 109572231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTT 600

109572232 TGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTC 109572291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTC 660

109572292 TCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 109572331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 700

EXCISED REGION

109572346 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 109572405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      711 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 770

109572406 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 109572465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      771 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 830

109572466 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 109572525
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      831 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTC-AAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 889

109572526 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 109572585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      890 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 949

109572586 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 109572645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      950 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 1009

109572646 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 109572705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 1069

109572706 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 109572765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 1129

109572766 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 109572825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 1189

109572826 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 109572885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 1249

109572886 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 109572945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 1309

109572946 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 109573005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 1369

109573006 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 109573065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 1429

109573066 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 109573125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 1489

109573126 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 109573185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 1549

109573186 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 109573245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 1609

109573246 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 109573305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 1669

109573306 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 109573365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 1729

109573366 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 109573425
          ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 GCATCTTTTCCTTT--AAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 1787

109573426 AACATGGCATTCAAAAAACTTTATGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 109573485
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 AACATGGCATTCAAAAAACTTTACGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 1847

109573486 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 109573545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 1907

109573546 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 109573605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 1967

109573606 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 109573665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 2027

109573666 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 109573725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 2087

109573726 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 109573785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 2147

109573786 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 109573845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 2207

109573846 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 109573905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 2267

109573906 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 109573965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2268 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 2327

109573966 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 109574025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 2387

109574026 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 109574085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2388 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 2447

109574086 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 109574145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 2507

109574146 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 109574205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 2567

109574206 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 109574265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 2627

109574266 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 109574325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2628 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 2687

109574326 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 109574385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2688 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 2747

109574386 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 109574445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
     2748 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 2805

109574446 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 109574505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 2865

109574506 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 109574565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 2925

109574566 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 109574625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 2985

109574626 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAG 109574685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAG 3045

109574686 TGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAG 109574745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 TGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAG 3105

109574746 GACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTT 109574805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 GACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTT 3165

109574806 AAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTG 109574865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 AAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTG 3225

109574866 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGAT 109574925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGAT 3285

109574926 CGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAA 109574968
          |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 CCAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAA 3328

Alignment time is 4.13499 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     4371] =>      4371 nucs 'mol-32-2b4a-077059_4371'

Score:        4237
Aligned:      4281        nucs
Identic:      4277 (100%) nucs =>       937 (100%)      3340 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109571394,109572331] EXCISED REGION [109572346,109575688]
 second seq =>  [       81,     1018] EXCISED REGION [     1029,     4371]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        14 nucs [109572332,109572345]
 second seq =>        10 nucs [1019,1028]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [109572331,109572333] to [109572345,109572347]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109572331,109572331] to [109572346,109572346]
 second seq =>         1 nucs [1018,1018] to [1029,1029]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [109572332,109572333] to [109572344,109572345]
 second seq =>         0 nucs

109571394 ACATTTTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTA 109571453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       81 ACATTTTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTA 140

109571454 CCATCTTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCC 109571513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      141 CCATCTTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCC 200

109571514 TTGCCTTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATT 109571573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      201 TTGCCTTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATT 260

109571574 TTCCTTTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAG 109571633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      261 TTCCTTTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAG 320

109571634 TGTTCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCT 109571693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      321 TGTTCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCT 380

109571694 TAGATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTAT 109571753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      381 TAGATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTAT 440

109571754 TGATTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATT 109571813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      441 TGATTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATT 500

109571814 ATTTTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCG 109571873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      501 ATTTTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCG 560

109571874 CAGTGGCTCATGGCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGT 109571933
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      561 CAGTGGCTCATGGCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGT 620

109571934 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAA 109571993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      621 CAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAA 680

109571994 CAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCT 109572053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      681 CAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCT 740

109572054 GGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTC 109572113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      741 GGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTC 800

109572114 TCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACT 109572173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      801 TCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACT 860

109572174 CAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTG 109572233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      861 CAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTG 920

109572234 CAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTC 109572293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      921 CAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTC 980

109572294 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 109572331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      981 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 1018

EXCISED REGION

109572346 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 109572405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 1088

109572406 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 109572465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 1148

109572466 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 109572525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 1208

109572526 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 109572585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 1268

109572586 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 109572645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 1328

109572646 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 109572705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 1388

109572706 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 109572765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 1448

109572766 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 109572825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 1508

109572826 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 109572885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 1568

109572886 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 109572945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 1628

109572946 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 109573005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 1688

109573006 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 109573065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 1748

109573066 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 109573125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 1808

109573126 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 109573185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 1868

109573186 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 109573245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 1928

109573246 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 109573305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 1988

109573306 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 109573365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 2048

109573366 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 109573425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 2108

109573426 AACATGGCATTCAAAAAACTTTATGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 109573485
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 AACATGGCATTCAAAAAACTTTACGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 2168

109573486 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 109573545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 2228

109573546 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 109573605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 2288

109573606 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 109573665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 2348

109573666 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 109573725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 2408

109573726 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 109573785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 2468

109573786 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 109573845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 2528

109573846 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 109573905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 2588

109573906 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 109573965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 2648

109573966 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 109574025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 2708

109574026 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 109574085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 2768

109574086 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 109574145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 2828

109574146 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 109574205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 2888

109574206 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 109574265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 2948

109574266 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 109574325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 3008

109574326 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 109574385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 3068

109574386 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 109574445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 3128

109574446 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 109574505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 3188

109574506 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 109574565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 3248

109574566 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 109574625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 3308

109574626 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAG 109574685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAG 3368

109574686 TGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAG 109574745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 TGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAG 3428

109574746 GACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTT 109574805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 GACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTT 3488

109574806 AAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTG 109574865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 AAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTG 3548

109574866 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGAT 109574925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGAT 3608

109574926 CGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAGAAGATTAGC 109574985
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3609 CCAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAGATTAGC 3668

109574986 CAGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGG 109575045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 CAGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGG 3728

109575046 CATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTG 109575105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 CATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTG 3788

109575106 GGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTC 109575165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 GGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTC 3848

109575166 AATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAA 109575225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 AATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAA 3908

109575226 ATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 109575285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 ATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 3968

109575286 AGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACC 109575345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 AGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACC 4028

109575346 CTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAG 109575405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 CTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAG 4088

109575406 CTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 109575465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4089 CTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 4148

109575466 CTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAA 109575525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4149 CTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAA 4208

109575526 AAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAA 109575585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4209 AAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAA 4268

109575586 GACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGC 109575645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4269 GACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGC 4328

109575646 AGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGC 109575688
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4329 AGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGC 4371

Alignment time is 5.74532 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3350] =>      3350 nucs 'mol-32-2e4c-024657_3350'

Score:        3295
Aligned:      3350        nucs
Identic:      3345 (100%) nucs =>       619 (100%)      2726 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109574507,109575127] EXCISED REGION [109575130,109577857]
 second seq =>  [        1,      621] EXCISED REGION [      622,     3350]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [109575128,109575129]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [109575128,109575141] to [109575130,109575143]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109575128,109575128] to [109575129,109575129]
 second seq =>         0 nucs

109574507 GACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGGC 109574566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGGC 60

109574567 ATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTT 109574626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTT 120

109574627 GCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAGT 109574686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAGT 180

109574687 GCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAGG 109574746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAGG 240

109574747 ACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTTA 109574806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTTA 300

109574807 AAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTGG 109574866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTGG 360

109574867 CTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGATC 109574926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGATC 420

109574927 GAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAGAAGATTAGCC 109574986
          .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      421 CAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAGATTAGCC 480

109574987 AGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGC 109575046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGC 540

109575047 ATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTGG 109575106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTGG 600

109575107 GCGACAGAGCGAGACTGTCTC 109575127
          |||||||||||||||||||||
      601 GCGACAGAGCGAGACTGTCTC 621

EXCISED REGION

109575130 AAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTCAATTAAGTCATGTAATGCAGAAAA 109575189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      622 AAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTCAATTAAGTCATGTAATGCAGAAAA 681

109575190 GGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGACCAGGCATGG 109575249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      682 GGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGACCAGGCATGG 741

109575250 TGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCA 109575309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      742 TGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCA 801

109575310 GGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACATAAA 109575369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      802 GGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACATAAA 861

109575370 TTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAA 109575429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      862 TTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAA 921

109575430 TATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCA 109575489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      922 TATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCA 981

109575490 GCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTAAATCTTCCA 109575549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      982 GCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTAAATCTTCCA 1041

109575550 TTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGTAGGACTAAG 109575609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1042 TTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGTAGGACTAAG 1101

109575610 TAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAG 109575669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1102 TAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAG 1161

109575670 CACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 109575729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1162 CACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCA 1221

109575730 AGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCA 109575789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1222 AGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCA 1281

109575790 CCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGGGGGCA 109575849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1282 CCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGGGGGCA 1341

109575850 GAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAGAATGAGACT 109575909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1342 GAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAGAATGAGACT 1401

109575910 CTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCTGGAGCATAT 109575969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1402 CTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCTGGAGCATAT 1461

109575970 AAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCAAAAAATATA 109576029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1462 AAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCAAAAAATATA 1521

109576030 GACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTCAACCTCAAT 109576089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1522 GACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTCAACCTCAAT 1581

109576090 AATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAATGAGTTACCC 109576149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1582 AATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAATGAGTTACCC 1641

109576150 ATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCTAGTTTTGGC 109576209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1642 ATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCTAGTTTTGGC 1701

109576210 AAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGGGACCAGATG 109576269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 AAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGGGACCAGATG 1761

109576270 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGT 109576329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGT 1821

109576330 CAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACAAA 109576389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 CAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACAAA 1881

109576390 AATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGG 109576449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 AATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGG 1941

109576450 AGAATTGCTTGAA-CCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGCCACTGCAC 109576508
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 AGAATTGCTTGAACCCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGCCACTGCAC 2001

109576509 TCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGAAGAATGTA 109576568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 TCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGAAGAATGTA 2061

109576569 AACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACAAAAATGTT 109576628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 AACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACAAAAATGTT 2121

109576629 GGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGA 109576688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 GGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGA 2181

109576689 TCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACT 109576748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 TCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACT 2241

109576749 AAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTACTTGGGAGG 109576808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 AAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTACTTGGGAGG 2301

109576809 CTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGATCACGC 109576868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 CTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGATCACGC 2361

109576869 CATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAAACTTAAAT 109576928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 CATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAAACTTAAAT 2421

109576929 GTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTGCAAATAAA 109576988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 GTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTGCAAATAAA 2481

109576989 AAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGAACTGTCCT 109577048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 AAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGAACTGTCCT 2541

109577049 TAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGGGTCCCCAA 109577108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 TAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGGGTCCCCAA 2601

109577109 CCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGCACAGCAGG 109577168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 CCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGCACAGCAGG 2661

109577169 AGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGATCAGCAGT 109577228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 AGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGATCAGCAGT 2721

109577229 GGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTGCAGTCTCC 109577288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 GGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTGCAGTCTCC 2781

109577289 TTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACCCCTGGTCT 109577348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 TTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACCCCTGGTCT 2841

109577349 GTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCAAAAGGGCT 109577408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 GTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCAAAAGGGCT 2901

109577409 GAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTAAAAAGGAA 109577468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 GAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTAAAAAGGAA 2961

109577469 AAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGAATATAAAC 109577528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 AAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGAATATAAAC 3021

109577529 AGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAATATACAAA 109577588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 AGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAATATACAAA 3081

109577589 GGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGGCTGAGATC 109577648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 GGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGGCTGAGATC 3141

109577649 GGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTCCAAAAA 109577708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3142 GGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCCCCAAAAA 3201

109577709 AAAAAAACAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCT 109577768
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 AAAAAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCT 3261

109577769 GAGGTGGGAGAATTGTTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACATTGCACTA 109577828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 GAGGTGGGAGAATTGTTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACATTGCACTA 3321

109577829 CTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGTAAG 109577857
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3322 CTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGTAAG 3350

Alignment time is 4.55157 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     4235] =>      4235 nucs 'mol-32-2f07-096828_4235'

Score:        4196
Aligned:      4235        nucs
Identic:      4229 (100%) nucs =>      4105 (100%)       124 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109569125,109573231] EXCISED REGION [109575181,109575304]
 second seq =>  [        1,     4111] EXCISED REGION [     4112,     4235]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1949 nucs [109573232,109575180]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109573232,109573232] to [109575181,109575181]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109569125 TTGCAGAGCAGGCTACCCAATAGGCAGTGTGCCCAGAGTAGCCCTTCAGGTAATTCTTAC 109569184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGCAGAGCAGGCTACCCAATAGGCAGTGTGCCCAGAGTAGCCCTTCAGGTAATTCTTAC 60

109569185 TAGCAAAAAAATGGCTTTTACTAATTTAACTCTCAGAAAAAAATATTCCCTCCTCTGTAG 109569244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGCAAAAAAATGGCTTTTACTAATTTAACTCTCAGAAAAAAATATTCCCTCCTCTGTAG 120

109569245 GTTCTTAGAGGGCACATCACATATATCTCCATGTACCAACCACACAAACTTAATGCACAA 109569304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTCTTAGAGGGCACATCACATATATCTCCATGTACCAACCACACAAACTTAATGCACAA 180

109569305 TTGGGACTATAATTTTCTAATATAGCTCAATATACCAATGATACTAAACATTGTATAGGC 109569364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGGGACTATAATTTTCTAATATAGCTCAATATACCAATGATACTAAACATTGTATAGGC 240

109569365 TTCATATTCAACATTCAATCTAAATATCAGTCCAGATATAAAGTTACTCTGAATGGAATT 109569424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCATATTCAACATTCAATCTAAATATCAGTCCAGATATAAAGTTACTCTGAATGGAATT 300

109569425 TATGGCAATAGTCCCACTTTAAATAATAACTACAAGTTTAATGTTGCAGTCATTTTTGGT 109569484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATGGCAATAGTCCCACTTTAAATAATAACTACAAGTTTAATGTTGCAGTCATTTTTGGT 360

109569485 TAATAAAGCCTAAGAGAACTACATTCTTACAAATACATATTTTATACTGACAGTTGAAGG 109569544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAATAAAGCCTAAGAGAACTACATTCTTACAAATACATATTTTATACTGACAGTTGAAGG 420

109569545 TAACAGAAAATATGTCCTAATTAACTTAAAATTGGTTCAAGTTTTCTTTTTAAAAAAAAA 109569604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAACAGAAAATATGTCCTAATTAACTTAAAATTGGTTCAAGTTTTCTTTTTAAAAAAAAA 480

109569605 CTAATTAAAAAAAGACAAGTTTTAATTCTATACCTTGAAATTCCCAGTAGAATAATATAT 109569664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTAATTAAAAAAAGACAAGTTTTAATTCTATACCTTGAAATTCCCAGTAGAATAATATAT 540

109569665 TTTAATCACCCAACACAGAATTTTTTTTTTTTAAGGCAGAGTCTCCCTCTGTTGCCCGGG 109569724
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      541 TTTAATCACCCAACACAGAATTTTTTTTTTTTAAGGCAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCGGG 600

109569725 CTGGAGTGCAGTGGCAATCTCGGCTGGCTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTC 109569784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGGAGTGCAGTGGCAATCTCGGCTGGCTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTC 660

109569785 TCTTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCACTTACACAACCGGCTAAT 109569844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCACTTACACAACCGGCTAAT 720

109569845 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCT 109569904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCT 780

109569905 TGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCC 109569964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCC 840

109569965 ACCAAGCCTGGCCCAGAATTTTAATTCTTATAAGCTTCACTGTTGCTGAATACAGTATAA 109570024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCAAGCCTGGCCCAGAATTTTAATTCTTATAAGCTTCACTGTTGCTGAATACAGTATAA 900

109570025 ATATAGGCATAGGCACATGCTTGATGACTATATCTTAGAATTATTCTCTTCTAACTCCCT 109570084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATATAGGCATAGGCACATGCTTGATGACTATATCTTAGAATTATTCTCTTCTAACTCCCT 960

109570085 TGTATTACTGAAACATTTATACAGGCTCCCAAAATCTTACCTCTGTAAGTGATATATACT 109570144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTATTACTGAAACATTTATACAGGCTCCCAAAATCTTACCTCTGTAAGTGATATATACT 1020

109570145 GCATACTTTTTTTTTCCCCCAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCAAGAGTGCAGTG 109570204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCATACTTTTTTTTTCCCCCAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCAAGAGTGCAGTG 1080

109570205 GTGCAATCTCGGTTTACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAG 109570264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTGCAATCTCGGTTTACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAG 1140

109570265 CCTCCCAAGTAGCTGGGATCACAGGTGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTT 109570324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTCCCAAGTAGCTGGGATCACAGGTGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTT 1200

109570325 TAGTAGAGATGGGGTTTCACCATCTTGGCAGGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGAT 109570384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGTAGAGATGGGGTTTCACCATCTTGGCAGGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGAT 1260

109570385 CCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCTA 109570444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCTA 1320

109570445 TATACATATTTTAAACATCTATTTCCTGTAATCCTAGCTACTTTGGAAGGCTGAGGTGGG 109570504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATACATATTTTAAACATCTATTTCCTGTAATCCTAGCTACTTTGGAAGGCTGAGGTGGG 1380

109570505 CAACATAGTGAGACCTTATCTCAAATAAATAAATAAATAACTATTCACCACAAAGTTAGA 109570564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAACATAGTGAGACCTTATCTCAAATAAATAAATAAATAACTATTCACCACAAAGTTAGA 1440

109570565 ACTTTTCTCTAATTCAGGGAAACAGAATTCAATAATAATTACTTCTTCCCCTCTCCTCTG 109570624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTTTTCTCTAATTCAGGGAAACAGAATTCAATAATAATTACTTCTTCCCCTCTCCTCTG 1500

109570625 GGGGAGCTATAAATCTGCAAAAGATTTTAACAAGTTTAGGAACTACTAAAATTATCTTTT 109570684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGGAGCTATAAATCTGCAAAAGATTTTAACAAGTTTAGGAACTACTAAAATTATCTTTT 1560

109570685 AAAATGAGATGCACATATAATCATAATATGTGTTCAATAAATAAATATTAGCTGAATTAA 109570744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAATGAGATGCACATATAATCATAATATGTGTTCAATAAATAAATATTAGCTGAATTAA 1620

109570745 CTTGAGATGTAAAGTCACTGAAGAAATGTCTCTACAAAAGTACAGAACAGATGACTATGG 109570804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTGAGATGTAAAGTCACTGAAGAAATGTCTCTACAAAAGTACAGAACAGATGACTATGG 1680

109570805 TTTTGTTTGTTTGTCTGTTTTAGACAGGGTCTTACTCTGAGGCCCAGGCAGGAGTGCAGT 109570864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTGTTTGTTTGTCTGTTTTAGACAGGGTCTTACTCTGAGGCCCAGGCAGGAGTGCAGT 1740

109570865 GGCTGAATCATGGCTCACTGCAGCCTTGGCCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCA 109570924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCTGAATCATGGCTCACTGCAGCCTTGGCCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCA 1800

109570925 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCATGTGCCACTGGGCCCAGCTAATTTTTGTTGGG 109570984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCATGTGCCACTGGGCCCAGCTAATTTTTGTTGGG 1860

109570985 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----GTAGAGATTGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTT 109571040
          ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATTGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTT 1920

109571041 AGTCTGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCT 109571100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGTCTGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCT 1980

109571101 GGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCA 109571160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCA 2040

109571161 AAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCAT 109571220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCAT 2100

109571221 GTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTG 109571280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTG 2160

109571281 GCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 109571340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCT 2220

109571341 GGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTT 109571400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTT 2280

109571401 TGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATCTT 109571460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATCTT 2340

109571461 CACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTT 109571520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTT 2400

109571521 TCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTT 109571580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTT 2460

109571581 AAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTT 109571640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTT 2520

109571641 TAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATAC 109571700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATAC 2580

109571701 AATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTAC 109571760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTAC 2640

109571761 CATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTA 109571820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTA 2700

109571821 GAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGC 109571880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGC 2760

109571881 TCATGGCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGT 109571940
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCATGGCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGT 2820

109571941 TCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTG 109572000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTG 2880

109572001 GCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGAT 109572060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGAT 2940

109572061 AACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTG 109572120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTG 3000

109572121 AAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAG 109572180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAG 3060

109572181 CTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAA 109572240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAA 3120

109572241 CCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAA 109572300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAA 3180

109572301 ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACCCGGGCG 109572360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACCCGGGCG 3240

109572361 TGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGC 109572420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGC 3300

109572421 CCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 109572480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 3360

109572481 GAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATA 109572540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATA 3420

109572541 AAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATA 109572600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATA 3480

109572601 TCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTG 109572660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTG 3540

109572661 GCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCC 109572720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCC 3600

109572721 CCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTAC 109572780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTAC 3660

109572781 TTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAA 109572840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAA 3720

109572841 TGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAA 109572900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAA 3780

109572901 GGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGAT 109572960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGAT 3840

109572961 GAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAA 109573020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAA 3900

109573021 AATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAA 109573080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAA 3960

109573081 AAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCAT 109573140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCAT 4020

109573141 TATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCA 109573200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCA 4080

109573201 TCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 109573231
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 4111

EXCISED REGION

109575181 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 109575240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4112 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 4171

109575241 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 109575300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4172 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 4231

109575301 TTGA 109575304
          ||||
     4232 TTGA 4235

Alignment time is 5.25686 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     6321] =>      6321 nucs 'mol-32-2f1d-126647_6321'

Score:        6230
Aligned:      6324        nucs
Identic:      6313 (100%) nucs =>      2375 (100%)      3938 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109572031,109574412] EXCISED REGION [109574418,109578359]
 second seq =>  [        1,     2377] EXCISED REGION [     2382,     6321]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [109574413,109574417]
 second seq =>         4 nucs [2378,2381]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        25 nucs [2375,2399] to [2379,2403]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [109574410,109574412] to [109574418,109574420]
 second seq =>         3 nucs [2375,2377] to [2382,2384]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109574413,109574413] to [109574417,109574417]
 second seq =>         2 nucs [2378,2379] to [2380,2381]

109572031 CAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCT 109572090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCT 60

109572091 GGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGT 109572150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGT 120

109572151 GCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCAC 109572210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCAC 180

109572211 TTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGG 109572270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGG 240

109572271 GTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAT 109572330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAT 300

109572331 AAATATTTTTTTAAAAAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACT 109572390
          |    |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 A----TTTTTTTAACAAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACT 356

109572391 CGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGA 109572450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 CGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGA 416

109572451 TCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAA 109572510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 TCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAA 476

109572511 GAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATAC 109572570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 GAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATAC 536

109572571 AAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGC 109572630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 AAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGC 596

109572631 AGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATG 109572690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 AGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATG 656

109572691 CCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAG 109572750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 CCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAG 716

109572751 AAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATAT 109572810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 AAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATAT 776

109572811 AAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTG 109572870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 AAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTG 836

109572871 TCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGA 109572930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGA 896

109572931 AGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTT 109572990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 AGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTT 956

109572991 TTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCG 109573050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 TTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCG 1016

109573051 GTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAAT 109573110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 GTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAAT 1076

109573111 ATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCT 109573170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 ATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCT 1136

109573171 TAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAAT 109573230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 TAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAAT 1196

109573231 CTTCCAAGTATTACAGAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACA 109573290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 CTTCCAAGTATTACAGAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACA 1256

109573291 AACAAAAATGCAGACAAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTG 109573350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 AACAAAAATGCAGACAAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTG 1316

109573351 CAACACAGGACTACTGCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTG 109573410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     1317 CAACACAGGACTACTGCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAA-GGAGAAAAAAACTG 1375

109573411 CTAGCTGTTTTTAATAACATGGCATTCAAAAAACTTTATGTTGCTGCCAGGTCATTTAAT 109573470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1376 CTAGCTGTTTTTAATAACATGGCATTCAAAAAACTTTACGTTGCTGCCAGGTCATTTAAT 1435

109573471 TTTAAATGTCCAGACCTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGG 109573530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TTTAAATGTCCAGACCTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGG 1495

109573531 GCCTCAATTTCTTCATTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCC 109573590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 GCCTCAATTTCTTCATTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCC 1555

109573591 TTCAAGTTTTATAATTTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGG 109573650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 TTCAAGTTTTATAATTTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGG 1615

109573651 AAACATCAAGAATATATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATA 109573710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 AAACATCAAGAATATATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATA 1675

109573711 AAGTCTGTTTAATAAGAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAAC 109573770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 AAGTCTGTTTAATAAGAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAAC 1735

109573771 AAAAGAAAAGCTCTTCTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAA 109573830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 AAAAGAAAAGCTCTTCTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAA 1795

109573831 CATGGGTGCAGCACGTGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACT 109573890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 CATGGGTGCAGCACGTGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACT 1855

109573891 TTAATTTACCTTCTGGAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAA 109573950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 TTAATTTACCTTCTGGAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAA 1915

109573951 GCAGGTGCAACTTTATATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACAT 109574010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 GCAGGTGCAACTTTATATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACAT 1975

109574011 GCATAAAATATCTCTGGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAG 109574070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 GCATAAAATATCTCTGGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAG 2035

109574071 GAAAACTAGATAAGAATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTT 109574130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 GAAAACTAGATAAGAATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTT 2095

109574131 TACCTATATAACAAACCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGA 109574190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 TACCTATATAACAAACCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGA 2155

109574191 TCACTATATACCCTTTTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAA 109574250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 TCACTATATACCCTTTTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAA 2215

109574251 AAATAATAAAACATAAATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAAC 109574310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 AAATAATAAAACATAAATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAAC 2275

109574311 TAATGCATATAATGAAGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCA 109574370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TAATGCATATAATGAAGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCA 2335

109574371 AGACCTCTTCTCAGATCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTT 109574412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 AGACCTCTTCTCAGATCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTT 2377

EXCISED REGION

109574418 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCA 109574477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCA 2441

109574478 GTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCTTGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCT 109574537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 GTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCTTGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCT 2501

109574538 CAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGGCATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGT 109574597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 CAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGGCATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGT 2561

109574598 TTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACA 109574657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 TTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACA 2621

109574658 GATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCT 109574717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 GATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCT 2681

109574718 GGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAGGACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAA 109574777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 GGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAGGACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAA 2741

109574778 ACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTTAAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGAT 109574837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 ACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTTAAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGAT 2801

109574838 AAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 109574897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 AAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 2861

109574898 CGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCC 109574957
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 CGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGATCCAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCC 2921

109574958 GTCTCTACTAAAAATACAGAAGATTAGCCAGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGC 109575017
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 GTCTCTACTAAAAATACAAAAGATTAGCCAGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGC 2981

109575018 TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGC 109575077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGC 3041

109575078 TGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTGGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAA 109575137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 TGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTGGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAA 3101

109575138 AAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTCAATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGA 109575197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 AAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTCAATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGA 3161

109575198 AAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCAC 109575257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 AAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCAC 3221

109575258 ACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCA 109575317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 ACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCA 3281

109575318 AGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAG 109575377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 AGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAG 3341

109575378 GCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTT 109575437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 GCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTT 3401

109575438 GAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGT 109575497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 GAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGT 3461

109575498 GACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAG 109575557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 GACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAG 3521

109575558 AAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACAC 109575617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 AAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACAC 3581

109575618 ACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGG 109575677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 ACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGG 3641

109575678 GAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTG 109575737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 GAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTG 3701

109575738 AAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAAT 109575797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 AAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAAT 3761

109575798 CCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGC 109575857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 CCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGC 3821

109575858 AGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCA 109575917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 AGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCA 3881

109575918 AAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCA 109575977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 AAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCA 3941

109575978 TCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTC 109576037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 TCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTC 4001

109576038 ACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTT 109576097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 ACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTT 4061

109576098 TATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGG 109576157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 TATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGG 4121

109576158 CCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGT 109576217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 CCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGT 4181

109576218 GGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCT 109576277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 GGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCT 4241

109576278 CATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGAT 109576337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4242 CATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGAT 4301

109576338 GGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCT 109576397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 GGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCT 4361

109576398 GGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGC 109576457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 GGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGC 4421

109576458 TTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTG 109576517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 TTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTG 4481

109576518 GCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGAC 109576577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 GCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGAC 4541

109576578 TGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCA 109576637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 TGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCA 4601

109576638 TGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAG 109576697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 TGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAG 4661

109576698 GTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACA 109576757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 GTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACA 4721

109576758 AAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAG 109576817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 AAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAG 4781

109576818 TAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCT 109576877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4782 TAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCT 4841

109576878 CTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTAC 109576937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4842 CTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTAC 4901

109576938 CCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCC 109576997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4902 CCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCC 4961

109576998 CTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAG 109577057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4962 CTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAG 5021

109577058 AATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGA 109577117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5022 AATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGA 5081

109577118 CACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGCACAGCAGGAGGTGAGCT 109577177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5082 CACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGCACAGCAGGAGGTGAGCT 5141

109577178 GCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGATCAGCAGTGGCATTAGA 109577237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5142 GCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGATCAGCAGTGGCATTAGA 5201

109577238 TTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTGCAGTCTCCTTATGTGAA 109577297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5202 TTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTGCAGTCTCCTTATGTGAA 5261

109577298 TCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACCCCTGGTCTGTGGAAAAA 109577357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5262 TCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACCCCTGGTCTGTGGAAAAA 5321

109577358 TTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCAAAAGGGCTGAGGACTGT 109577417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5322 TTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCAAAAGGGCTGAGGACTGT 5381

109577418 TGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTAAAAAGGAAAAGTGCATC 109577477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5382 TGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTAAAAAGGAAAAGTGCATC 5441

109577478 ACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGAATATAAACAGGCCCATT 109577537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5442 ACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGAATATAAACAGGCCCATT 5501

109577538 TATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAATATACAAAGGTCTGAGA 109577597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5502 TATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAATATACAAAGGTCTGAGA 5561

109577598 CCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGGCTGAGATCGGAGGATAG 109577657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5562 CCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGGCTGAGATCGGAGGATAG 5621

109577658 CTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTCCAAAAAAAAAAAACA 109577717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     5622 CTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTCCAAAAAAAAAAAA-A 5680

109577718 ATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGA 109577777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5681 ATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGA 5740

109577778 GAATTGTTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACATTGCACTACTGCACTCC 109577837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5741 GAATTGTTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACATTGCACTACTGCACTCC 5800

109577838 AGCCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCACACA 109577897
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     5801 AGCCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAG-AAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCACACA 5859

109577898 CACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGATTATCTCTGAAGAAAGGCA 109577957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5860 CACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGATTATCTCTGAAGAAAGGCA 5919

109577958 TGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGGTTGAAGGAGACTTTTTTA 109578017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5920 TGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGGTTGAAGGAGACTTTTTTA 5979

109578018 TTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAATATATATTCATGCATTACT 109578077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5980 TTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAATATATATTCATGCATTACT 6039

109578078 TGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTAAATTTTTTTTTTTTTTTT 109578137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6040 TGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTAAATTTTTTTTTTTTTTTT 6099

109578138 GAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCATTG 109578197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6100 GAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCATTG 6159

109578198 CAATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGCCTTGGCCTCCCGAGTAGCTGGGAT 109578257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6160 CAATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGCCTTGGCCTCCCGAGTAGCTGGGAT 6219

109578258 TACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACC 109578317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6220 TACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACC 6279

109578318 ATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATC 109578359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6280 ATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATC 6321

Alignment time is 7.8288 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5109] =>      5109 nucs 'mol-32-2fd8-075739_5109'

Score:        5025
Aligned:      5104        nucs
Identic:      5096 (100%) nucs =>       992 (100%)      4104 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109573417,109574409] EXCISED REGION [109574420,109578530]
 second seq =>  [        1,      993] EXCISED REGION [     1002,     5109]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [109574410,109574419]
 second seq =>         8 nucs [994,1001]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [109574410,109574412] to [109574420,109574422]
 second seq =>         2 nucs [992,993] to [1000,1001]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [109574410,109574411] to [109574418,109574419]
 second seq =>         1 nucs [994,994] to [1001,1001]

109573417 GTTTTTAATAACATGGCATTCAAAAAACTTTATGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAA 109573476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTTTTAATAACATGGCATTCAAAAAACTTTACGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAA 60

109573477 TGTCCAGACCTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCA 109573536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTCCAGACCTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCA 120

109573537 ATTTCTTCATTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAG 109573596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTCTTCATTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAG 180

109573597 TTTTATAATTTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACAT 109573656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTATAATTTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACAT 240

109573657 CAAGAATATATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCT 109573716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAGAATATATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCT 300

109573717 GTTTAATAAGAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGA 109573776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTTAATAAGAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGA 360

109573777 AAAGCTCTTCTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGG 109573836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAGCTCTTCTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGG 420

109573837 TGCAGCACGTGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATT 109573896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCAGCACGTGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATT 480

109573897 TACCTTCTGGAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGT 109573956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACCTTCTGGAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGT 540

109573957 GCAACTTTATATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAA 109574016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCAACTTTATATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAA 600

109574017 AATATCTCTGGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAAC 109574076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATATCTCTGGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAAC 660

109574077 TAGATAAGAATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTA 109574136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGATAAGAATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTA 720

109574137 TATAACAAACCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTA 109574196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATAACAAACCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTA 780

109574197 TATACCCTTTTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAA 109574256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATACCCTTTTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAA 840

109574257 TAAAACATAAATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGC 109574316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAAACATAAATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGC 900

109574317 ATATAATGAAGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCT 109574376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATATAATGAAGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCT 960

109574377 CTTCTCAGATCTGATTTGAATATCATTTCAATC 109574409
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTCTCAGATCTGATTTGAATATCATTTCAATC 993

EXCISED REGION

109574420 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGT 109574479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGT 1061

109574480 GGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCTTGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCA 109574539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 GGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCTTGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCA 1121

109574540 GCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGGCATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTT 109574599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 GCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGGCATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTT 1181

109574600 TTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGA 109574659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 TTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGA 1241

109574660 TATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGG 109574719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 TATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGG 1301

109574720 CCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAGGACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAAC 109574779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 CCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAGGACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAAC 1361

109574780 CCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTTAAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAA 109574839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 CCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTTAAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAA 1421

109574840 AAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCG 109574899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 AAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCG 1481

109574900 GAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGT 109574959
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 GAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGATCCAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGT 1541

109574960 CTCTACTAAAAATACAGAAGATTAGCCAGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTA 109575019
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 CTCTACTAAAAATACAAAAGATTAGCCAGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTA 1601

109575020 CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTG 109575079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTG 1661

109575080 AGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTGGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAA 109575139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 AGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTGGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAA 1721

109575140 AAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTCAATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAA 109575199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 AAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTCAATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAA 1781

109575200 AAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACAC 109575259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 AAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACAC 1841

109575260 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAG 109575319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAG 1901

109575320 ACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGC 109575379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 ACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGC 1961

109575380 ATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGA 109575439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 ATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGA 2021

109575440 ACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGA 109575499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 ACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGA 2081

109575500 CAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAA 109575559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 CAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAA 2141

109575560 ACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACAC 109575619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 ACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACAC 2201

109575620 ATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGA 109575679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 ATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGA 2261

109575680 GGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAA 109575739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 GGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAA 2321

109575740 ACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAATCC 109575799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 ACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAATCC 2381

109575800 CAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGCAG 109575859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 CAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGCAG 2441

109575860 TGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCAAA 109575919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 TGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCAAA 2501

109575920 AGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCATC 109575979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 AGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCATC 2561

109575980 TTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTCAC 109576039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 TTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTCAC 2621

109576040 AAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTTTA 109576099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 AAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTTTA 2681

109576100 TAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGGCC 109576159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 TAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGGCC 2741

109576160 TACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGTGG 109576219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 TACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGTGG 2801

109576220 GCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCTCA 109576279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 GCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCTCA 2861

109576280 TGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATGG 109576339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 TGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATGG 2921

109576340 AGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCTGG 109576399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 AGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCTGG 2981

109576400 ACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTT 109576459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 ACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTT 3041

109576460 GAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGC 109576519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 GAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGC 3101

109576520 AACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGACTG 109576579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 AACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGACTG 3161

109576580 ACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCATG 109576639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 ACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCATG 3221

109576640 ATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAGGT 109576699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 ATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAGGT 3281

109576700 CAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAA 109576759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 CAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAA 3341

109576760 ATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGTA 109576819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 ATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGTA 3401

109576820 GAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCTCT 109576879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 GAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCTCT 3461

109576880 GGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTACCC 109576939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 GGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTACCC 3521

109576940 AATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCCCT 109576999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 AATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCCCT 3581

109577000 GAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAGAA 109577059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 GAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAGAA 3641

109577060 TTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGACA 109577119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 TTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGACA 3701

109577120 CAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGCACAGCAGGAGGTGAGCTGC 109577179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 CAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGCACAGCAGGAGGTGAGCTGC 3761

109577180 AGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGATCAGCAGTGGCATTAGATT 109577239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 AGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGATCAGCAGTGGCATTAGATT 3821

109577240 CTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTGCAGTCTCCTTATGTGAATC 109577299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 CTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTGCAGTCTCCTTATGTGAATC 3881

109577300 TAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACCCCTGGTCTGTGGAAAAATT 109577359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 TAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACCCCTGGTCTGTGGAAAAATT 3941

109577360 TTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCAAAAGGGCTGAGGACTGTTG 109577419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 TTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCAAAAGGGCTGAGGACTGTTG 4001

109577420 CTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTAAAAAGGAAAAGTGCATCAC 109577479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 CTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTAAAAAGGAAAAGTGCATCAC 4061

109577480 AGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGAATATAAACAGGCCCATTTA 109577539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 AGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGAATATAAACAGGCCCATTTA 4121

109577540 TTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAATATACAAAGGTCTGAGACC 109577599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 TTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAATATACAAAGGTCTGAGACC 4181

109577600 GGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGGCTGAGATCGGAGGATAGCT 109577659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 GGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGGCTGAGATCGGAGGATAGCT 4241

109577660 TGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTCCAAAAAAAAAAAACAAT 109577719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4242 TGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAT 4301

109577720 TAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGA 109577779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 TAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGA 4361

109577780 ATTGTTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACATTGCACTACTGCACTCCAG 109577839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 ATTGTTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACATTGCACTACTGCACTCCAG 4421

109577840 CCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCACACACA 109577899
          ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||
     4422 CCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAG--AAAAAAAAAAAAAAAAACCCCACACACA 4479

109577900 CAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGATTATCTCTGAAGAAAGGCATG 109577959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4480 CAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGATTATCTCTGAAGAAAGGCATG 4539

109577960 GGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGGTTGAAGGAGACTTTTTTATT 109578019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4540 GGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGGTTGAAGGAGACTTTTTTATT 4599

109578020 TTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAATATATATTCATGCATTACTTG 109578079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4600 TTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAATATATATTCATGCATTACTTG 4659

109578080 TATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTAAATTTTTTTTTTTTTTTTGA 109578139
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     4660 TATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTAAA-TTTTTTTTTTTTTTTGA 4718

109578140 GACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCATTGCA 109578199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4719 GACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCATTGCA 4778

109578200 ATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGCCTTGGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTA 109578259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4779 ATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGCCTTGGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTA 4838

109578260 CAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCAT 109578319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4839 CAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCAT 4898

109578320 GTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGTCTCCCAA 109578379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4899 GTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGTCTCCCAA 4958

109578380 AATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATGCCCAGCCAATTTTTAATTTTGTATCTTCT 109578439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4959 AATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATGCCCAGCCAATTTTTAATTTTGTATCTTCT 5018

109578440 TTTTTTTTTTTTTAAGAGAAGGAGTCTTACTATGCTACCCAGACTACAGTGTAGTTGCTA 109578499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5019 TTTTTTTTTTTTTAAGAGAAGGAGTCTTACTATGCTACCCAGACTACAGTGTAGTTGCTA 5078

109578500 TTGCCGGGCCTGTTCATAGCACACTACAGCC 109578530
          |||||.|||||||||||||||||||||||||
     5079 TTGCCAGGCCTGTTCATAGCACACTACAGCC 5109

Alignment time is 6.65217 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     6662] =>      6662 nucs 'mol-32-301a-002464_6662'

Score:        6567
Aligned:      6663        nucs
Identic:      6651 (100%) nucs =>      3314 (100%)      3337 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109569917,109573231] EXCISED REGION [109575181,109578523]
 second seq =>  [        1,     3320] EXCISED REGION [     3321,     6662]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1949 nucs [109573232,109575180]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109573232,109573232] to [109575181,109575181]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109569917 ATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCAAGCCTGGC 109569976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCAAGCCTGGC 60

109569977 CCAGAATTTTAATTCTTATAAGCTTCACTGTTGCTGAATACAGTATAAATATAGGCATAG 109570036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGAATTTTAATTCTTATAAGCTTCACTGTTGCTGAATACAGTATAAATATAGGCATAG 120

109570037 GCACATGCTTGATGACTATATCTTAGAATTATTCTCTTCTAACTCCCTTGTATTACTGAA 109570096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCACATGCTTGATGACTATATCTTAGAATTATTCTCTTCTAACTCCCTTGTATTACTGAA 180

109570097 ACATTTATACAGGCTCCCAAAATCTTACCTCTGTAAGTGATATATACTGCATACTTTTTT 109570156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACATTTATACAGGCTCCCAAAATCTTACCTCTGTAAGTGATATATACTGCATACTTTTTT 240

109570157 TTTCCCCCAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCAAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGG 109570216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCCCCCAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCAAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGG 300

109570217 TTTACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCAAGTAG 109570276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCAAGTAG 360

109570277 CTGGGATCACAGGTGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGG 109570336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGGGATCACAGGTGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGG 420

109570337 GGTTTCACCATCTTGGCAGGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCA 109570396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTTTCACCATCTTGGCAGGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCA 480

109570397 GCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCTATATACATATTTT 109570456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCTATATACATATTTT 540

109570457 AAACATCTATTTCCTGTAATCCTAGCTACTTTGGAAGGCTGAGGTGGGCAACATAGTGAG 109570516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAACATCTATTTCCTGTAATCCTAGCTACTTTGGAAGGCTGAGGTGGGCAACATAGTGAG 600

109570517 ACCTTATCTCAAATAAATAAATAAATAACTATTCACCACAAAGTTAGAACTTTTCTCTAA 109570576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCTTATCTCAAATAAATAAATAAATAACTATTCACCACAAAGTTAGAACTTTTCTCTAA 660

109570577 TTCAGGGAAACAGAATTCAATAATAATTACTTCTTCCCCTCTCCTCTGGGGGAGCTATAA 109570636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCAGGGAAACAGAATTCAATAATAATTACTTCTTCCCCTCTCCTCTGGGGGAGCTATAA 720

109570637 ATCTGCAAAAGATTTTAACAAGTTTAGGAACTACTAAAATTATCTTTTAAAATGAGATGC 109570696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCTGCAAAAGATTTTAACAAGTTTAGGAACTACTAAAATTATCTTTTAAAATGAGATGC 780

109570697 ACATATAATCATAATATGTGTTCAATAAATAAATATTAGCTGAATTAACTTGAGATGTAA 109570756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACATATAATCATAATATGTGTTCAATAAATAAATATTAGCTGAATTAACTTGAGATGTAA 840

109570757 AGTCACTGAAGAAATGTCTCTACAAAAGTACAGAACAGATGACTATGGTTTTGTTTGTTT 109570816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTCACTGAAGAAATGTCTCTACAAAAGTACAGAACAGATGACTATGGTTTTGTTTGTTT 900

109570817 GTCTGTTTTAGACAGGGTCTTACTCTGAGGCCCAGGCAGGAGTGCAGTGGCTGAATCATG 109570876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTCTGTTTTAGACAGGGTCTTACTCTGAGGCCCAGGCAGGAGTGCAGTGGCTGAATCATG 960

109570877 GCTCACTGCAGCCTTGGCCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTA 109570936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTCACTGCAGCCTTGGCCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTA 1020

109570937 GCTGGGACCACAGGCATGTGCCACTGGGCCCAGCTAATTTTTGTTGGGTTTTTTTTTTTT 109570996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTGGGACCACAGGCATGTGCCACTGGGCCCAGCTAATTTTTGTTGGGTTTTTTTTTTTT 1080

109570997 TTTTTTTTTT-----GTAGAGATTGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTTAGTCTGACTGC 109571051
          ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATTGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTTAGTCTGACTGC 1140

109571052 TTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 109571111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 1200

109571112 CATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAACTTACTG 109571171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAACTTACTG 1260

109571172 AAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATGTGCCAACACG 109571231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATGTGCCAACACG 1320

109571232 CCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGATGGT 109571291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGATGGT 1380

109571292 CTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 109571351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 1440

109571352 CATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTTGAGGTTAATT 109571411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTTGAGGTTAATT 1500

109571412 TTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATCTTCACCATTTTTA 109571471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATCTTCACCATTTTTA 1560

109571472 TGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTTTCCTCTTTCCC 109571531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTTTCCTCTTTCCC 1620

109571532 TTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTAAAAAGTAAGT 109571591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTAAAAAGTAAGT 1680

109571592 TTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAATATAAGT 109571651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAATATAAGT 1740

109571652 ATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACAATTAACATAC 109571711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACAATTAACATAC 1800

109571712 ACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTACCATCTTAGTAA 109571771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTACCATCTTAGTAA 1860

109571772 ACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAGAAATCTAAGA 109571831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAGAAATCTAAGA 1920

109571832 TTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCTCATGGCTATA 109571891
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1921 TTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCTCATGGCTGTA 1980

109571892 ATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGC 109571951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGC 2040

109571952 CTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAG 109572011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAG 2100

109572012 TGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTC 109572071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTC 2160

109572072 AGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAA 109572131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAA 2220

109572132 ATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGA 109572191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGA 2280

109572192 GAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCG 109572251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCG 2340

109572252 CCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATA 109572311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATA 2400

109572312 AATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGC 109572371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGC 2460

109572372 ACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGG 109572431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGG 2520

109572432 AGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTT 109572491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTT 2580

109572492 CGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAAAATATATTG 109572551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAAAATATATTG 2640

109572552 ACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGC 109572611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGC 2700

109572612 TTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGAC 109572671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGAC 2760

109572672 CTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGA 109572731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGA 2820

109572732 GAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGT 109572791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGT 2880

109572792 GAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTG 109572851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTG 2940

109572852 TGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAA 109572911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAA 3000

109572912 GGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAAC 109572971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAAC 3060

109572972 CATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAATTA 109573031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAATTA 3120

109573032 AATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAG 109573091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAG 3180

109573092 GCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTA 109573151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTA 3240

109573152 TAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTCACACAAT 109573211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTCACACAAT 3300

109573212 AAAAACTGCTCTCTTTAATC 109573231
          ||||||||||||||||||||
     3301 AAAAACTGCTCTCTTTAATC 3320

EXCISED REGION

109575181 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 109575240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 3380

109575241 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 109575300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3381 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 3440

109575301 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 109575360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3441 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 3500

109575361 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 109575420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3501 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 3560

109575421 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 109575480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3561 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 3620

109575481 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 109575540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3621 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 3680

109575541 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 109575600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3681 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 3740

109575601 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 109575660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3741 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 3800

109575661 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 109575720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3801 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 3860

109575721 GCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAG 109575780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3861 GCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAG 3920

109575781 TGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCC 109575840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3921 TGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCC 3980

109575841 AGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAG 109575900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3981 AGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAG 4040

109575901 AATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCT 109575960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4041 AATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCT 4100

109575961 GGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCA 109576020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4101 GGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCA 4160

109576021 AAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTC 109576080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4161 AAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTC 4220

109576081 AACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAAT 109576140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4221 AACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAAT 4280

109576141 GAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCT 109576200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4281 GAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCT 4340

109576201 AGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGG 109576260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4341 AGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGG 4400

109576261 GACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGA 109576320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4401 GACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGA 4460

109576321 TCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAA 109576380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4461 TCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAA 4520

109576381 AAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 109576440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4521 AAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 4580

109576441 TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGC 109576500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4581 TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGC 4640

109576501 CACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGA 109576560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4641 CACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGA 4700

109576561 AGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACA 109576620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4701 AGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACA 4760

109576621 AAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAG 109576680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4761 AAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAG 4820

109576681 TGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCA 109576740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4821 TGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCA 4880

109576741 TCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTAC 109576800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4881 TCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTAC 4940

109576801 TTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGG 109576860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4941 TTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGAAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGG 5000

109576861 GATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAA 109576920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5001 GATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAA 5060

109576921 ACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTG 109576980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5061 ACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTG 5120

109576981 CAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGA 109577040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5121 CAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGA 5180

109577041 ACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGG 109577100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5181 ACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGG 5240

109577101 GTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGC 109577160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5241 GTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGC 5300

109577161 ACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGA 109577220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5301 ACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGA 5360

109577221 TCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTG 109577280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5361 TCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTG 5420

109577281 CAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACC 109577340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5421 CAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACC 5480

109577341 CCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCA 109577400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5481 CCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCA 5540

109577401 AAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTA 109577460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5541 AAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTA 5600

109577461 AAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGA 109577520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5601 AAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGA 5660

109577521 ATATAAACAGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAA 109577580
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5661 ATATAAGCAGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAA 5720

109577581 TATACAAAGGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGG 109577640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5721 TATACAAAGGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGG 5780

109577641 CTGAGATCGGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTC 109577700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5781 CTGAGATCGGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTC 5840

109577701 TCCAAAAAAAAAAAACAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTC 109577760
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5841 TCCAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTC 5900

109577761 AGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGTTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACA 109577820
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5901 AGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTATTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACA 5960

109577821 TTGCACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAGAAAAAAAAAAA 109577880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5961 TTGCACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAGAAAAAAAAAAA 6020

109577881 AAAAAAAACCCCACACACACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGATT 109577940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6021 AAAAAAAACCCCACACACACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGATT 6080

109577941 ATCTCTGAAGAAAGGCATGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGGT 109578000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6081 ATCTCTGAAGAAAGGCATGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGGT 6140

109578001 TGAAGGAGACTTTTTTATTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAATA 109578060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6141 TGAAGGAGACTTTTTTATTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAATA 6200

109578061 TATATTCATGCATTACTTGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTAA 109578120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6201 TATATTCATGCATTACTTGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTAA 6260

109578121 ATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 109578180
          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6261 A-TTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 6319

109578181 GCAATCTTGGCTCATTGCAATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGCCTTGGCC 109578240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6320 GCAATCTTGGCTCATTGCAATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGCCTTGGCC 6379

109578241 TCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCATTTTTAGT 109578300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6380 TCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCATTTTTAGT 6439

109578301 AGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCC 109578360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6440 AGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCC 6499

109578361 ACCCACCTCGGTCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATGCCCAGCCAAT 109578420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6500 ACCCACCTCGGTCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATGCCCAGCCAAT 6559

109578421 TTTTAATTTTGTATCTTCTTTTTTTTTTTTTTAAGAGAAGGAGTCTTACTATGCTACCCA 109578480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6560 TTTTAATTTTGTATCTTCTTTTTTTTTTTTTTAAGAGAAGGAGTCTTACTATGCTACCCA 6619

109578481 GACTACAGTGTAGTTGCTATTGCCGGGCCTGTTCATAGCACAC 109578523
          ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     6620 GACTACAGTGTAGTTGCTATTGCCAGGCCTGTTCATAGCACAC 6662

Alignment time is 8.23796 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3321] =>      3321 nucs 'mol-32-301a-002464_3321'

Score:        3305
Aligned:      3316        nucs
Identic:      3315 (100%) nucs =>      1068 (100%)      2247 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109569917,109570984] EXCISED REGION [109570985,109573232]
 second seq =>  [        1,     1068] EXCISED REGION [     1074,     3321]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         5 nucs [1069,1073]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        22 nucs [1069,1090] to [1074,1095]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1069,1070] to [1072,1073]

109569917 ATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCAAGCCTGGC 109569976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCAAGCCTGGC 60

109569977 CCAGAATTTTAATTCTTATAAGCTTCACTGTTGCTGAATACAGTATAAATATAGGCATAG 109570036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAGAATTTTAATTCTTATAAGCTTCACTGTTGCTGAATACAGTATAAATATAGGCATAG 120

109570037 GCACATGCTTGATGACTATATCTTAGAATTATTCTCTTCTAACTCCCTTGTATTACTGAA 109570096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCACATGCTTGATGACTATATCTTAGAATTATTCTCTTCTAACTCCCTTGTATTACTGAA 180

109570097 ACATTTATACAGGCTCCCAAAATCTTACCTCTGTAAGTGATATATACTGCATACTTTTTT 109570156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACATTTATACAGGCTCCCAAAATCTTACCTCTGTAAGTGATATATACTGCATACTTTTTT 240

109570157 TTTCCCCCAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCAAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGG 109570216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCCCCCAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCAAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGG 300

109570217 TTTACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCAAGTAG 109570276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCAAGTAG 360

109570277 CTGGGATCACAGGTGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGG 109570336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGGGATCACAGGTGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGG 420

109570337 GGTTTCACCATCTTGGCAGGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCA 109570396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTTTCACCATCTTGGCAGGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCA 480

109570397 GCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCTATATACATATTTT 109570456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCTATATACATATTTT 540

109570457 AAACATCTATTTCCTGTAATCCTAGCTACTTTGGAAGGCTGAGGTGGGCAACATAGTGAG 109570516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAACATCTATTTCCTGTAATCCTAGCTACTTTGGAAGGCTGAGGTGGGCAACATAGTGAG 600

109570517 ACCTTATCTCAAATAAATAAATAAATAACTATTCACCACAAAGTTAGAACTTTTCTCTAA 109570576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCTTATCTCAAATAAATAAATAAATAACTATTCACCACAAAGTTAGAACTTTTCTCTAA 660

109570577 TTCAGGGAAACAGAATTCAATAATAATTACTTCTTCCCCTCTCCTCTGGGGGAGCTATAA 109570636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCAGGGAAACAGAATTCAATAATAATTACTTCTTCCCCTCTCCTCTGGGGGAGCTATAA 720

109570637 ATCTGCAAAAGATTTTAACAAGTTTAGGAACTACTAAAATTATCTTTTAAAATGAGATGC 109570696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCTGCAAAAGATTTTAACAAGTTTAGGAACTACTAAAATTATCTTTTAAAATGAGATGC 780

109570697 ACATATAATCATAATATGTGTTCAATAAATAAATATTAGCTGAATTAACTTGAGATGTAA 109570756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACATATAATCATAATATGTGTTCAATAAATAAATATTAGCTGAATTAACTTGAGATGTAA 840

109570757 AGTCACTGAAGAAATGTCTCTACAAAAGTACAGAACAGATGACTATGGTTTTGTTTGTTT 109570816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTCACTGAAGAAATGTCTCTACAAAAGTACAGAACAGATGACTATGGTTTTGTTTGTTT 900

109570817 GTCTGTTTTAGACAGGGTCTTACTCTGAGGCCCAGGCAGGAGTGCAGTGGCTGAATCATG 109570876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTCTGTTTTAGACAGGGTCTTACTCTGAGGCCCAGGCAGGAGTGCAGTGGCTGAATCATG 960

109570877 GCTCACTGCAGCCTTGGCCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTA 109570936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTCACTGCAGCCTTGGCCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTA 1020

109570937 GCTGGGACCACAGGCATGTGCCACTGGGCCCAGCTAATTTTTGTTGGG 109570984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTGGGACCACAGGCATGTGCCACTGGGCCCAGCTAATTTTTGTTGGG 1068

EXCISED REGION

109570985 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATTGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTTAGTC 109571044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATTGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTTAGTC 1133

109571045 TGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCTGGGA 109571104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 TGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCTGGGA 1193

109571105 TTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAA 109571164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 TTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAA 1253

109571165 CTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATGTGC 109571224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 CTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATGTGC 1313

109571225 CAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCA 109571284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 CAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCA 1373

109571285 AGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 109571344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 AGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 1433

109571345 TTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTTGAG 109571404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 TTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTTGAG 1493

109571405 GTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATCTTCACC 109571464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 GTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATCTTCACC 1553

109571465 ATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTTTCCT 109571524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 ATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTTTCCT 1613

109571525 CTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTAAAA 109571584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 CTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTAAAA 1673

109571585 AGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAA 109571644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 AGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAA 1733

109571645 TATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACAATT 109571704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 TATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACAATT 1793

109571705 AACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTACCATC 109571764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 AACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTACCATC 1853

109571765 TTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAGAAA 109571824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 TTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAGAAA 1913

109571825 TCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCTCAT 109571884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 TCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCTCAT 1973

109571885 GGCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAA 109571944
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 GGCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAA 2033

109571945 GACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCA 109572004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 GACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCA 2093

109572005 GGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACC 109572064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 GGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACC 2153

109572065 TGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAA 109572124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 TGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAA 2213

109572125 TACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAA 109572184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 TACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAA 2273

109572185 GGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAA 109572244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 GGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAA 2333

109572245 GGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAA 109572304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 GGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAA 2393

109572305 ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACCCGGGCGTGGT 109572364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACCCGGGCGTGGT 2453

109572365 GGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAG 109572424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 GGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAG 2513

109572425 GAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGA 109572484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 GAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGA 2573

109572485 AAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAAAA 109572544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 AAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAAAA 2633

109572545 TATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCAC 109572604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 TATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCAC 2693

109572605 TGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAG 109572664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 TGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAG 2753

109572665 TGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAG 109572724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 TGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAG 2813

109572725 AAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCA 109572784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 AAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCA 2873

109572785 TGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGT 109572844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 TGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGT 2933

109572845 AGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCT 109572904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 AGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCT 2993

109572905 TACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGT 109572964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 TACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGT 3053

109572965 GGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATA 109573024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 GGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATA 3113

109573025 AAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAAC 109573084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 AAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAAC 3173

109573085 ACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATA 109573144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 ACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATA 3233

109573145 AACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTC 109573204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 AACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTC 3293

109573205 ACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCT 109573232
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3294 ACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCT 3321

Alignment time is 4.13619 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2350] =>      2350 nucs 'mol-32-303b-038807_2350'

Score:        2329
Aligned:      2351        nucs
Identic:      2349 (100%) nucs =>      1859 (100%)       490 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109572557,109574417] EXCISED REGION [109574420,109574909]
 second seq =>  [        1,     1860] EXCISED REGION [     1861,     2350]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [109574418,109574419]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [109574418,109574437] to [109574420,109574439]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109574418,109574418] to [109574419,109574419]
 second seq =>         0 nucs

109572557 GTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCT 109572616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCT 60

109572617 AACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACC 109572676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACC 120

109572677 CACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGA 109572736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGA 180

109572737 AGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAAT 109572796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAAT 240

109572797 GCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGT 109572856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGT 300

109572857 TGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATG 109572916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATG 360

109572917 TTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCT 109572976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCT 420

109572977 CAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGT 109573036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGT 480

109573037 TCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAA 109573096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAA 540

109573097 GAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTT 109573156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTT 600

109573157 ATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAA 109573216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAA 660

109573217 CTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACAGAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTAC 109573276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACAGAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTAC 720

109573277 AACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGACAAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAAT 109573336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGACAAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAAT 780

109573337 AAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACTGCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 109573396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
      781 AAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACTGCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAA- 839

109573397 GGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAATAACATGGCATTCAAAAAACTTTATGTTGCTG 109573456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      840 GGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAATAACATGGCATTCAAAAAACTTTACGTTGCTG 899

109573457 CCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGACCTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTC 109573516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGACCTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTC 959

109573517 ACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCATTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAAT 109573576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 ACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCATTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAAT 1019

109573577 TTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAATTTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAG 109573636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAATTTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAG 1079

109573637 TACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATATATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAA 109573696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATATATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAA 1139

109573697 GCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAAGAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCAC 109573756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAAGAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCAC 1199

109573757 TTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTTCTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCA 109573816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTTCTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCA 1259

109573817 CCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACGTGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCA 109573876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACGTGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCA 1319

109573877 ATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTGGAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAAT 109573936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 ATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTGGAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAAT 1379

109573937 AAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTATATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTG 109573996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 AAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTATATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTG 1439

109573997 TATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCTGGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGG 109574056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCTGGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGG 1499

109574057 TTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGAATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCC 109574116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGAATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCC 1559

109574117 CTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAACCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAA 109574176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAACCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAA 1619

109574177 TAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTTTTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCT 109574236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTTTTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCT 1679

109574237 ATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATAAATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGA 109574296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 ATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATAAATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGA 1739

109574297 AGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGAAGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTC 109574356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 AGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGAAGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTC 1799

109574357 TTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGATCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTT 109574416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGATCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTT 1859

109574417 C 109574417
          |
     1860 C 1860

EXCISED REGION

109574420 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGT 109574479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGT 1920

109574480 GGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCTTGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCA 109574539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCTTGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCA 1980

109574540 GCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGGCATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTT 109574599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGGCATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTT 2040

109574600 TTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGA 109574659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGA 2100

109574660 TATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGG 109574719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGG 2160

109574720 CCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAGGACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAAC 109574779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAGGACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAAC 2220

109574780 CCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTTAAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAA 109574839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTTAAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAA 2280

109574840 AAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCG 109574899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCG 2340

109574900 GAGGCGGGTG 109574909
          ||||||||||
     2341 GAGGCGGGTG 2350

Alignment time is 3.05204 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     7171] =>      7171 nucs 'mol-32-3046-256800_7171'

Score:        7085
Aligned:      7164        nucs
Identic:      7156 (100%) nucs =>      2011 (100%)      5145 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109570319,109572331] EXCISED REGION [109572346,109577496]
 second seq =>  [        1,     2013] EXCISED REGION [     2024,     7171]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        14 nucs [109572332,109572345]
 second seq =>        10 nucs [2014,2023]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [109572331,109572333] to [109572345,109572347]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109572331,109572331] to [109572346,109572346]
 second seq =>         1 nucs [2013,2013] to [2024,2024]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [109572332,109572333] to [109572344,109572345]
 second seq =>         0 nucs

109570319 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATCTTGGCAGGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCT 109570378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATCTTGGCAGGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCT 60

109570379 CGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCC 109570438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCC 120

109570439 CAGCTATATACATATTTTAAACATCTATTTCCTGTAATCCTAGCTACTTTGGAAGGCTGA 109570498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCTATATACATATTTTAAACATCTATTTCCTGTAATCCTAGCTACTTTGGAAGGCTGA 180

109570499 GGTGGGCAACATAGTGAGACCTTATCTCAAATAAATAAATAAATAACTATTCACCACAAA 109570558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTGGGCAACATAGTGAGACCTTATCTCAAATAAATAAATAAATAACTATTCACCACAAA 240

109570559 GTTAGAACTTTTCTCTAATTCAGGGAAACAGAATTCAATAATAATTACTTCTTCCCCTCT 109570618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTAGAACTTTTCTCTAATTCAGGGAAACAGAATTCAATAATAATTACTTCTTCCCCTCT 300

109570619 CCTCTGGGGGAGCTATAAATCTGCAAAAGATTTTAACAAGTTTAGGAACTACTAAAATTA 109570678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTCTGGGGGAGCTATAAATCTGCAAAAGATTTTAACAAGTTTAGGAACTACTAAAATTA 360

109570679 TCTTTTAAAATGAGATGCACATATAATCATAATATGTGTTCAATAAATAAATATTAGCTG 109570738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      361 TCTTTTAAAATGAGATGCACATATAATCATAATACGTGTTCAATAAATAAATATTAGCTG 420

109570739 AATTAACTTGAGATGTAAAGTCACTGAAGAAATGTCTCTACAAAAGTACAGAACAGATGA 109570798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATTAACTTGAGATGTAAAGTCACTGAAGAAATGTCTCTACAAAAGTACAGAACAGATGA 480

109570799 CTATGGTTTTGTTTGTTTGTCTGTTTTAGACAGGGTCTTACTCTGAGGCCCAGGCAGGAG 109570858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTATGGTTTTGTTTGTTTGTCTGTTTTAGACAGGGTCTTACTCTGAGGCCCAGGCAGGAG 540

109570859 TGCAGTGGCTGAATCATGGCTCACTGCAGCCTTGGCCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCC 109570918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCAGTGGCTGAATCATGGCTCACTGCAGCCTTGGCCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCC 600

109570919 ACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCATGTGCCACTGGGCCCAGCTAATTTTT 109570978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCATGTGCCACTGGGCCCAGCTAATTTTT 660

109570979 GTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATTGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGC 109571038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATTGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGC 720

109571039 TTAGTCTGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTG 109571098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAGTCTGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTG 780

109571099 CTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTT 109571158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTT 840

109571159 CAAAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGC 109571218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGC 900

109571219 ATGTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGT 109571278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGT 960

109571279 TGGCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTG 109571338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTG 1020

109571339 CTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATT 109571398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATT 1080

109571399 TTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATC 109571458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATC 1140

109571459 TTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCC 109571518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCC 1200

109571519 TTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCT 109571578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCT 1260

109571579 TTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTC 109571638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTC 1320

109571639 TTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGAT 109571698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGAT 1380

109571699 ACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATT 109571758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATT 1440

109571759 ACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTT 109571818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTT 1500

109571819 TAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTG 109571878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTG 1560

109571879 GCTCATGGCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGA 109571938
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCTCATGGCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGA 1620

109571939 GTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAAT 109571998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAAT 1680

109571999 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGG 109572058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGG 1740

109572059 ATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTAC 109572118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTAC 1800

109572119 TGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGA 109572178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGA 1860

109572179 AGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTG 109572238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTG 1920

109572239 AACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAAT 109572298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAAT 1980

109572299 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 109572331
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 2013

EXCISED REGION

109572346 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 109572405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 2083

109572406 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 109572465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 2143

109572466 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 109572525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 2203

109572526 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 109572585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 2263

109572586 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 109572645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 2323

109572646 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 109572705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 2383

109572706 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 109572765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 2443

109572766 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 109572825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 2503

109572826 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 109572885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 2563

109572886 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 109572945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 2623

109572946 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 109573005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 2683

109573006 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 109573065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 2743

109573066 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 109573125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 2803

109573126 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 109573185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 2863

109573186 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 109573245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 2923

109573246 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 109573305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 2983

109573306 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 109573365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 3043

109573366 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 109573425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3044 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 3103

109573426 AACATGGCATTCAAAAAACTTTATGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 109573485
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 AACATGGCATTCAAAAAACTTTACGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 3163

109573486 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 109573545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 3223

109573546 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 109573605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 3283

109573606 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 109573665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 3343

109573666 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 109573725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 3403

109573726 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 109573785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 3463

109573786 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 109573845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 3523

109573846 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 109573905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 3583

109573906 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 109573965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 3643

109573966 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 109574025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 3703

109574026 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 109574085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 3763

109574086 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 109574145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3764 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 3823

109574146 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 109574205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3824 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 3883

109574206 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 109574265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3884 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 3943

109574266 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 109574325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3944 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 4003

109574326 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 109574385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4004 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 4063

109574386 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 109574445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
     4064 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 4121

109574446 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 109574505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 4181

109574506 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 109574565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 4241

109574566 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 109574625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4242 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 4301

109574626 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAG 109574685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAG 4361

109574686 TGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAG 109574745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 TGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAG 4421

109574746 GACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTT 109574805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 GACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTT 4481

109574806 AAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTG 109574865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 AAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTG 4541

109574866 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGAT 109574925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGAT 4601

109574926 CGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAGAAGATTAGC 109574985
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4602 CCAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAGATTAGC 4661

109574986 CAGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGG 109575045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 CAGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGG 4721

109575046 CATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTG 109575105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 CATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTG 4781

109575106 GGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTC 109575165
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4782 GGCGACAGAGCGAGACTGTCTC-AAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTC 4840

109575166 AATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAA 109575225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 AATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAA 4900

109575226 ATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 109575285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 ATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 4960

109575286 AGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACC 109575345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 AGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACC 5020

109575346 CTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAG 109575405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 CTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAG 5080

109575406 CTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 109575465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 CTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 5140

109575466 CTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAA 109575525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 CTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAA 5200

109575526 AAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAA 109575585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 AAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAA 5260

109575586 GACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGC 109575645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 GACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGC 5320

109575646 AGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTC 109575705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 AGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTC 5380

109575706 AGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 109575765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 AGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 5440

109575766 ATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGA 109575825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 ATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGA 5500

109575826 GAATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTC 109575885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5501 GAATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTC 5560

109575886 CAGCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCT 109575945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 CAGCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCT 5620

109575946 AAATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCA 109576005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5621 AAATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCA 5680

109576006 GACGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATT 109576065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5681 GACGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATT 5740

109576066 TGTGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTC 109576125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5741 TGTGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTC 5800

109576126 CACACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAA 109576185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5801 CACACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAA 5860

109576186 GACCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTA 109576245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5861 GACCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTA 5920

109576246 AGAATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAG 109576305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5921 AGAATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAG 5980

109576306 GCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAA 109576365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5981 GCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAA 6040

109576366 CCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCC 109576425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6041 CCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCC 6100

109576426 AGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTG 109576485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6101 AGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTG 6160

109576486 AGCCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAA 109576545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6161 AGCCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAA 6220

109576546 AATAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATG 109576605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6221 AATAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATG 6280

109576606 AAATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTAT 109576665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6281 AAATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTAT 6340

109576666 TTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAA 109576725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6341 TTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAA 6400

109576726 CATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCC 109576785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6401 CATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCC 6460

109576786 TGGAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAG 109576845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6461 TGGAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAG 6520

109576846 GTTGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCC 109576905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6521 GTTGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCC 6580

109576906 ATCTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGC 109576965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6581 ATCTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGC 6640

109576966 CTGCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAA 109577025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6641 CTGCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAA 6700

109577026 TTAGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCA 109577085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6701 TTAGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCA 6760

109577086 TACTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGT 109577145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6761 TACTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGT 6820

109577146 TAGGAACTGAGCTGCACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGT 109577205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6821 TAGGAACTGAGCTGCACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGT 6880

109577206 CCCGCTCCTGTTAGATCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATAT 109577265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6881 CCCGCTCCTGTTAGATCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATAT 6940

109577266 GAGGGATCTAAACTGCAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAAT 109577325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6941 GAGGGATCTAAACTGCAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAAT 7000

109577326 GGTTTCCACCTCACCCCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAAC 109577385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7001 GGTTTCCACCTCACCCCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAAC 7060

109577386 CAGTACCTGGTGCCAAAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTA 109577445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7061 CAGTACCTGGTGCCAAAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTA 7120

109577446 TATCTATATATCCTAAAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATC 109577496
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7121 TATCTATATATCCTAAAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATC 7171

Alignment time is 9.0928 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     4800] =>      4800 nucs 'mol-32-3101-067549_4800'

Score:        4726
Aligned:      4803        nucs
Identic:      4796 (100%) nucs =>       763 (100%)      4033 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109572469,109573231] EXCISED REGION [109575181,109579219]
 second seq =>  [        1,      763] EXCISED REGION [      764,     4800]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1949 nucs [109573232,109575180]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109573232,109573232] to [109575181,109575181]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109572469 GCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAT 109572528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAT 60

109572529 ATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTT 109572588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTT 120

109572589 CATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAA 109572648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAA 180

109572649 TGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTC 109572708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTC 240

109572709 CTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGC 109572768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGC 300

109572769 CCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTA 109572828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTA 360

109572829 GCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAG 109572888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAG 420

109572889 GAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACT 109572948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACT 480

109572949 CTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAAT 109573008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAAT 540

109573009 AAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATT 109573068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATT 600

109573069 ATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTA 109573128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTA 660

109573129 GGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAA 109573188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAA 720

109573189 TCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 109573231
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 763

EXCISED REGION

109575181 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 109575240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      764 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 823

109575241 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 109575300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      824 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 883

109575301 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 109575360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      884 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 943

109575361 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 109575420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      944 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 1003

109575421 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 109575480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1004 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 1063

109575481 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 109575540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 1123

109575541 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 109575600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 1183

109575601 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 109575660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 1243

109575661 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 109575720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 1303

109575721 GCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAG 109575780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 GCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAG 1363

109575781 TGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCC 109575840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 TGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCC 1423

109575841 AGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAG 109575900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 AGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAG 1483

109575901 AATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCT 109575960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 AATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCT 1543

109575961 GGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCA 109576020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 GGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCA 1603

109576021 AAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTC 109576080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 AAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTC 1663

109576081 AACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAAT 109576140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 AACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAAT 1723

109576141 GAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCT 109576200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 GAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCT 1783

109576201 AGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGG 109576260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 AGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGG 1843

109576261 GACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGA 109576320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 GACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGA 1903

109576321 TCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAA 109576380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     1904 TCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGT-AAACCCTGTCTCTACTAA 1962

109576381 AAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 109576440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 AAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 2022

109576441 TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGC 109576500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGC 2082

109576501 CACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGA 109576560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 CACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGA 2142

109576561 AGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACA 109576620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 AGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACA 2202

109576621 AAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAG 109576680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 AAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAG 2262

109576681 TGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCA 109576740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 TGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCA 2322

109576741 TCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTAC 109576800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 TCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTAC 2382

109576801 TTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGG 109576860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2383 TTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGAAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGG 2442

109576861 GATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAA 109576920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 GATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAA 2502

109576921 ACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTG 109576980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 ACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTG 2562

109576981 CAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGA 109577040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 CAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGA 2622

109577041 ACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGG 109577100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 ACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGG 2682

109577101 GTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGC 109577160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 GTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGC 2742

109577161 ACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGA 109577220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 ACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGA 2802

109577221 TCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTG 109577280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 TCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTG 2862

109577281 CAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACC 109577340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 CAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACC 2922

109577341 CCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCA 109577400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 CCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCA 2982

109577401 AAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTA 109577460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 AAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTA 3042

109577461 AAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGA 109577520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 AAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGA 3102

109577521 ATATAAACAGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAA 109577580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 ATATAAACAGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAA 3162

109577581 TATACAAAGGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGG 109577640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 TATACAAAGGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGG 3222

109577641 CTGAGATCGGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTC 109577700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 CTGAGATCGGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTC 3282

109577701 TCCAAAAAAAAAAAACAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTC 109577760
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 TCCAAAAAAAAAAAA-AATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTC 3341

109577761 AGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGTTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACA 109577820
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 AGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTATTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACA 3401

109577821 TTGCACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAG-AAAAAAAAAA 109577879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     3402 TTGCACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAGAAAAAAAAAAA 3461

109577880 AAAAAAAAACCCCACACACACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGAT 109577939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 AAAAAAAAACCCCACACACACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGAT 3521

109577940 TATCTCTGAAGAAAGGCATGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGG 109577999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 TATCTCTGAAGAAAGGCATGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGG 3581

109578000 TTGAAGGAGACTTTTTTATTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAAT 109578059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 TTGAAGGAGACTTTTTTATTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAAT 3641

109578060 ATATATTCATGCATTACTTGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTA 109578119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 ATATATTCATGCATTACTTGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTA 3701

109578120 AATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 109578179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 AATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 3761

109578180 CGCAATCTTGGCTCATTGCAATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGCCTTGGC 109578239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 CGCAATCTTGGCTCATTGCAATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGCCTTGGC 3821

109578240 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCATTTTTAG 109578299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCATTTTTAG 3881

109578300 TAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATC 109578359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 TAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATC 3941

109578360 CACCCACCTCGGTCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATGCCCAGCCAA 109578419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 CACCCACCTCGGTCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATGCCCAGCCAA 4001

109578420 TTTTTAATTTTGTATCTTCTTTTTTTTTTTTTTAAGAGAAGGAGTCTTACTATGCTACCC 109578479
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 TTTTTAATTTTGTATCTTC-TTTTTTTTTTTTTAAGAGAAGGAGTCTTACTATGCTACCC 4060

109578480 AGACTACAGTGTAGTTGCTATTGCCGGGCCTGTTCATAGCACACTACAGCCTCAAACTCC 109578539
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 AGACTACAGTGTAGTTGCTATTGCCAGGCCTGTTCATAGCACACTACAGCCTCAAACTCC 4120

109578540 TGCGCTCAAGCAATTCTTCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTAAGACTATAGACATATGCC 109578599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 TGCGCTCAAGCAATTCTTCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTAAGACTATAGACATATGCC 4180

109578600 AACTTGCCTGGCTCAATTTTTAATTTTAAAGCAAAAAAGAACTATGAAAATGAAAAATAT 109578659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 AACTTGCCTGGCTCAATTTTTAATTTTAAAGCAAAAAAGAACTATGAAAATGAAAAATAT 4240

109578660 ATACATATTAAAGGATTAGATCTCAAAGGTTTTAATCTATAAAGGTACCAACTAAAGTAC 109578719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 ATACATATTAAAGGATTAGATCTCAAAGGTTTTAATCTATAAAGGTACCAACTAAAGTAC 4300

109578720 AATCCCCAAAACAGGATTAACTGCTTTGTTTACAATGCAAAAACTACTGGGTACTATTTT 109578779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 AATCCCCAAAACAGGATTAACTGCTTTGTTTACAATGCAAAAACTACTGGGTACTATTTT 4360

109578780 AGGATCTTACATTCATTGTCTAATCGATCCTTACAAAAACCATTCTTCACCAGAAGATAG 109578839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 AGGATCTTACATTCATTGTCTAATCGATCCTTACAAAAACCATTCTTCACCAGAAGATAG 4420

109578840 CTTCTAGATCCCTTCCCACTCCCGTCATCCTCCTCTAAATATCTGTTAATCCCCCTCCTA 109578899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 CTTCTAGATCCCTTCCCACTCCCGTCATCCTCCTCTAAATATCTGTTAATCCCCCTCCTA 4480

109578900 AAGAACCCAAAATAGGCCAGGCGCGGTGGCTCACATCTGTAATCCCAGCACTATAGGAGC 109578959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 AAGAACCCAAAATAGGCCAGGCGCGGTGGCTCACATCTGTAATCCCAGCACTATAGGAGC 4540

109578960 CTGAGGCAGGTGGATCACAAAGTCAGGAGATCCAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAAT 109579019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 CTGAGGCAGGTGGATCACAAAGTCAGGAGATCCAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAAT 4600

109579020 CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCTTGGTAGCGTGCGCCTGTAGTCCCA 109579079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCTTGGTAGCGTGCGCCTGTAGTCCCA 4660

109579080 GGAGGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGCACCACTGCACTACAGCCTGGGCGACT 109579139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 GGAGGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGCACCACTGCACTACAGCCTGGGCGACT 4720

109579140 GAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACATAGTCCAGGCGCGGTGGCTCACACC 109579199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 GAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACATAGTCCAGGCGCGGTGGCTCACACC 4780

109579200 TGTAATCTCACCACTTTGGA 109579219
          ||||||||||||||||||||
     4781 TGTAATCTCACCACTTTGGA 4800

Alignment time is 5.93766 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     7605] =>      7605 nucs 'mol-32-3164-002225_7605'

Score:        7449
Aligned:      7611        nucs
Identic:      7593 (100%) nucs =>      1596 (100%)      5997 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109571635,109573231] EXCISED REGION [109575181,109581192]
 second seq =>  [        1,     1597] EXCISED REGION [     1598,     7605]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1949 nucs [109573232,109575180]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109573232,109573232] to [109575181,109575181]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109571635 GTTCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTT 109571694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTT 60

109571695 AGATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATT 109571754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATT 120

109571755 GATTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTA 109571814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTA 180

109571815 TTTTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGC 109571874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGC 240

109571875 AGTGGCTCATGGCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTC 109571934
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTGGCTCATGGCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTC 300

109571935 AGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAC 109571994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAC 360

109571995 AAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTG 109572054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTG 420

109572055 GTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCT 109572114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCT 480

109572115 CTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTC 109572174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTC 540

109572175 AGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGC 109572234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGC 600

109572235 AGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCT 109572294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCT 660

109572295 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACC 109572354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACC 720

109572355 CGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGC 109572414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGC 780

109572415 TTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGG 109572474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGG 840

109572475 GCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTA 109572534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTA 900

109572535 GTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAA 109572594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAA 960

109572595 AAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCC 109572654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCC 1020

109572655 TTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCAT 109572714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCAT 1080

109572715 CCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAAT 109572774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAAT 1140

109572775 TCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATG 109572834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATG 1200

109572835 CACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAA 109572894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAA 1260

109572895 AAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAAT 109572954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAAT 1320

109572955 CAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATA 109573014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATA 1380

109573015 AAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAG 109573074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAG 1440

109573075 GAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCAC 109573134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCAC 1500

109573135 AGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCA 109573194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCA 1560

109573195 ATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 109573231
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 1597

EXCISED REGION

109575181 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 109575240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 1657

109575241 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 109575300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 1717

109575301 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 109575360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 1777

109575361 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 109575420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 1837

109575421 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 109575480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 1897

109575481 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 109575540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 1957

109575541 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 109575600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 2017

109575601 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 109575660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 2077

109575661 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 109575720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 2137

109575721 GCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAG 109575780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 GCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAG 2197

109575781 TGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCC 109575840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCC 2257

109575841 AGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAG 109575900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 AGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAG 2317

109575901 AATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCT 109575960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 AATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCT 2377

109575961 GGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCA 109576020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 GGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCA 2437

109576021 AAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTC 109576080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 AAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTC 2497

109576081 AACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAAT 109576140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 AACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAAT 2557

109576141 GAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCT 109576200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 GAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCT 2617

109576201 AGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGG 109576260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 AGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGG 2677

109576261 GACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGA 109576320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2678 GACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCGGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGA 2737

109576321 TCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAA 109576380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 TCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAA 2797

109576381 AAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 109576440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 AAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 2857

109576441 TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGC 109576500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGC 2917

109576501 CACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGA 109576560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 CACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGA 2977

109576561 AGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACA 109576620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 AGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACA 3037

109576621 AAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAG 109576680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 AAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAG 3097

109576681 TGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCA 109576740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 TGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCA 3157

109576741 TCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTAC 109576800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 TCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTAC 3217

109576801 TTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGG 109576860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3218 TTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGAAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGG 3277

109576861 GATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAA 109576920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 GATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAA 3337

109576921 ACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTG 109576980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 ACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTG 3397

109576981 CAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGA 109577040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 CAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGA 3457

109577041 ACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGG 109577100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 ACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGG 3517

109577101 GTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGC 109577160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 GTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGC 3577

109577161 ACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGA 109577220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 ACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGA 3637

109577221 TCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTG 109577280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 TCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTG 3697

109577281 CAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACC 109577340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3698 CAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACC 3757

109577341 CCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCA 109577400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 CCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCA 3817

109577401 AAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTA 109577460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 AAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTA 3877

109577461 AAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGA 109577520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3878 AAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAGTGAATGA 3937

109577521 ATATAAACAGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAA 109577580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 ATATAAACAGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAA 3997

109577581 TATACAAAGGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGG 109577640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 TATACAAAGGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGG 4057

109577641 CTGAGATCGGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTC 109577700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 CTGAGATCGGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTC 4117

109577701 TCCAAAAAAAAAAAACAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTC 109577760
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 TCCAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTC 4177

109577761 AGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGTTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACA 109577820
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4178 AGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTATTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACA 4237

109577821 TTGCACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAGAAAAAAAAAAA 109577880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     4238 TTGCACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAG-AAAAAAAAAA 4296

109577881 AAAAAAAACCCCACACACACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGATT 109577940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 AAAAAAAACCCCACACACACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGATT 4356

109577941 ATCTCTGAAGAAAGGCATGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGGT 109578000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 ATCTCTGAAGAAAGGCATGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGGT 4416

109578001 TGAAGGAGACTTTTTTATTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAATA 109578060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 TGAAGGAGACTTTTTTATTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAATA 4476

109578061 TATATTCATGCATTACTTGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTAA 109578120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 TATATTCATGCATTACTTGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTAA 4536

109578121 ATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 109578180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 ATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 4596

109578181 GCAATCTTGGCTCATTGCAATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGCCTTGGCC 109578240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 GCAATCTTGGCTCATTGCAATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGCCTTGGCC 4656

109578241 TCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCATTTTTAGT 109578300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 TCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCATTTTTAGT 4716

109578301 AGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCC 109578360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 AGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCC 4776

109578361 ACCCACCTCGGTCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATGCCCAGCCAAT 109578420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 ACCCACCTCGGTCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATGCCCAGCCAAT 4836

109578421 TTTTAATTTTGTATCTTCTTTTTTTTTTTTTTAAGAGAAGGAGTCTTACTATGCTACCCA 109578480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 TTTTAATTTTGTATCTTCTTTTTTTTTTTTTTAAGAGAAGGAGTCTTACTATGCTACCCA 4896

109578481 GACTACAGTGTAGTTGCTATTGCCGGGCCTGTTCATAGCACACTACAGCCTCAAACTCCT 109578540
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 GACTACAGTGTAGTTGCTATTGCCAGGCCTGTTCATAGCACACTACAGCCTCAAACTCCT 4956

109578541 GCGCTCAAGCAATTCTTCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTAAGACTATAGACATATGCCA 109578600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 GCGCTCAAGCAATTCTTCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTAAGACTATAGACATATGCCA 5016

109578601 ACTTGCCTGGCTCAATTTTTAATTTTAAAGCAAAAAAGAACTATGAAAATGAAAAATATA 109578660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 ACTTGCCTGGCTCAATTTTTAATTTTAAAGCAAAAAAGAACTATGAAAATGAAAAATATA 5076

109578661 TACATATTAAAGGATTAGATCTCAAAGGTTTTAATCTATAAAGGTACCAACTAAAGTACA 109578720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5077 TACATATTAAAGGATTAGATCTCAAAGGTTTTAATCTATAAAGGTACCAACTAAAGTACA 5136

109578721 ATCCCCAAAACAGGATTAACTGCTTTGTTTACAATGCAAAAACTACTGGGTACTATTTTA 109578780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 ATCCCCAAAACAGGATTAACTGCTTTGTTTACAATGCAAAAACTACTGGGTACTATTTTA 5196

109578781 GGATCTTACATTCATTGTCTAATCGATCCTTACAAAAACCATTCTTCACCAGAAGATAGC 109578840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 GGATCTTACATTCATTGTCTAATCGATCCTTACAAAAACCATTCTTCACCAGAAGATAGC 5256

109578841 TTCTAGATCCCTTCCCACTCCCGTCATCCTCCTCTAAATATCTGTTAATCCCCCTCCTAA 109578900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5257 TTCTAGATCCCTTCCCACTCCCGTCATCCTCCTCTAAATATCTGTTAATCCCCCTCCTAA 5316

109578901 AGAACCCAAAATAGGCCAGGCGCGGTGGCTCACATCTGTAATCCCAGCACTATAGGAGCC 109578960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5317 AGAACCCAAAATAGGCCAGGCGCGGTGGCTCACATCTGTAATCCCAGCACTATAGGAGCC 5376

109578961 TGAGGCAGGTGGATCACAAAGTCAGGAGATCCAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAATC 109579020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5377 TGAGGCAGGTGGATCACAAAGTCAGGAGATCCAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAATC 5436

109579021 CCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCTTGGTAGCGTGCGCCTGTAGTCCCAG 109579080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5437 CCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCTTGGTAGCGTGCGCCTGTAGTCCCAG 5496

109579081 GAGGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGCACCACTGCACTACAGCCTGGGCGACTG 109579140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5497 GAGGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGCACCACTGCACTACAGCCTGGGCGACTG 5556

109579141 AGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACATAGTCCAGGCGCGGTGGCTCACACCT 109579200
          ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5557 AGCAAGACTCCGTCTC---AAAAAAAAAAAAACATAGTCCAGGCGCGGTGGCTCACACCT 5613

109579201 GTAATCTCACCACTTTGGAAGGCCGAGGCAAGCGGATCACGGGGTCAGCAGATCGAGACC 109579260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5614 GTAATCTCACCACTTTGGAAGGCCGAGGCAAGCGGATCACGGGGTCAGCAGATCGAGACC 5673

109579261 ATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAACAATACAAAAAATTAGCTGGGCGT 109579320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5674 ATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAACAATACAAAAAATTAGCTGGGCGT 5733

109579321 GGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCGTGAAC 109579380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5734 GGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCGTGAAC 5793

109579381 CCCGGGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTACAGCCTGGGGCGACA 109579440
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5794 CCCGGGGCGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTACAGCCTGGGGCGACA 5853

109579441 GAGTGAGACTCCATCTCAAAATAAATAAATAAATAAATAATAAAGCACAACACTCCAGGT 109579500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5854 GAGTGAGACTCCATCTCAAAATAAATAAATAAATAAATAATAAAGCACAACACTCCAGGT 5913

109579501 GTGGTCTGATCAAGAACTATATACAGTGAAACTAACAATTCCCATCATCTAGGCTCTTTA 109579560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5914 GTGGTCTGATCAAGAACTATATACAGTGAAACTAACAATTCCCATCATCTAGGCTCTTTA 5973

109579561 CAATGAATACACCTAAAATTTCTTTATATCATCATCTATTTGTGAAATGCTGTTTTTGCA 109579620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5974 CAATGAATACACCTAAAATTTCTTTATATCATCATCTATTTGTGAAATGCTGTTTTTGCA 6033

109579621 CTTCCCGGAATTTCATTTCCAAAGCTCTTCTTAAAGTTTCAAAGAAAATCGCCAGGTGCG 109579680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6034 CTTCCCGGAATTTCATTTCCAAAGCTCTTCTTAAAGTTTCAAAGAAAATCGCCAGGTGCG 6093

109579681 GTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGT 109579740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6094 GTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGT 6153

109579741 TGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACCAAAAATACAAA 109579800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6154 TGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACCAAAAATACAAA 6213

109579801 ATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCGGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGA 109579860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6214 ATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCGGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGA 6273

109579861 GAATCACTTGAACCTGGAAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCCGACATCACGCCATCACACTCC 109579920
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6274 GAATCACTTGAACCTGGAAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCCGACATCACGCCATCGCACTCC 6333

109579921 AGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCGTCT--AAAAAAAAAAAAACAAAAAACAAAACAA 109579978
          ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||
     6334 AGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAACAAAACAA 6393

109579979 GACTGGGCGTGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGA 109580038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6394 GACTGGGCGTGGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGA 6453

109580039 TCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCACAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATATAAAAAA 109580098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6454 TCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCACAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATATAAAAAA 6513

109580099 TTAGCCGGGCTTGGTGGCGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAGAGGCTGAGGCAGGA 109580158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6514 TTAGCCGGGCTTGGTGGCGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAGAGGCTGAGGCAGGA 6573

109580159 GAATGGCATGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCC 109580218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6574 GAATGGCATGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCC 6633

109580219 AGCCTGGGGGACAGAGCGAGACCTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAACCCAAT 109580278
          ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||
     6634 AGCCTGGGGGACAGAGCGAGACCTCGTCTC--AAAAAAAAAAAAAAAAAACCAACCCAAT 6691

109580279 TCTATAAAATTTTCTCAAAAGATTTTATAAAAGGTTCCATTTTCTTTTTCATCACAACAA 109580338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6692 TCTATAAAATTTTCTCAAAAGATTTTATAAAAGGTTCCATTTTCTTTTTCATCACAACAA 6751

109580339 CAAGAGTCACAAAACATGGTACTTAGCCATAGGAAAAAAACATTATTTGAGTTACATATG 109580398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6752 CAAGAGTCACAAAACATGGTACTTAGCCATAGGAAAAAAACATTATTTGAGTTACATATG 6811

109580399 TCAAGCATACTACATAACTAGTAATTATAAATAGTATAAAATTTTTATGTCTTTTTGCTT 109580458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6812 TCAAGCATACTACATAACTAGTAATTATAAATAGTATAAAATTTTTATGTCTTTTTGCTT 6871

109580459 GTAGTACTATTTTTTTCTATCTTTCTTTCTTTCTCTCTCTTTGAGACTGGGTCTCACTGT 109580518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6872 GTAGTACTATTTTTTTCTATCTTTCTTTCTTTCTCTCTCTTTGAGACTGGGTCTCACTGT 6931

109580519 CTCCCAGGCTGGTAGAGCCTTGTCCACCCAGGCTCAAGTGATTCTCTCACCTCAGCCTCC 109580578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6932 CTCCCAGGCTGGTAGAGCCTTGTCCACCCAGGCTCAAGTGATTCTCTCACCTCAGCCTCC 6991

109580579 CCAGTAGCTAGGACCACAGGTGTGCACCACCACACTCAGCTAGCATTTTTTTTTTAATTG 109580638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6992 CCAGTAGCTAGGACCACAGGTGTGCACCACCACACTCAGCTAGCATTTTTTTTTTAATTG 7051

109580639 TTTGTAGACATGAGGTCTCACTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACGTCTGGGCTCAAGC 109580698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7052 TTTGTAGACATGAGGTCTCACTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACGTCTGGGCTCAAGC 7111

109580699 AATCCTCCCACCTCATCCTCCCAAAATGCTCGCATTACAGGTATGAGCCACCTCGCCCAG 109580758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7112 AATCCTCCCACCTCATCCTCCCAAAATGCTCGCATTACAGGTATGAGCCACCTCGCCCAG 7171

109580759 CCCAGTACTATTTCTCAGTTAAAACAGGATGTTGACTTGTAAAATGAGAACAAGCTCCTA 109580818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7172 CCCAGTACTATTTCTCAGTTAAAACAGGATGTTGACTTGTAAAATGAGAACAAGCTCCTA 7231

109580819 GCAGAGTGGCAAGCATGCAACTGGTGCTCAATAAATGTAAATTCCTTCCCTTCAGAGCTC 109580878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7232 GCAGAGTGGCAAGCATGCAACTGGTGCTCAATAAATGTAAATTCCTTCCCTTCAGAGCTC 7291

109580879 CTAGCCTTGGTAAGGACAATGTGTCAAAAGGACTGCTAATGAATTGCTGCGGGAGAGCTA 109580938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7292 CTAGCCTTGGTAAGGACAATGTGTCAAAAGGACTGCTAATGAATTGCTGCGGGAGAGCTA 7351

109580939 CTGTGCTGTGAAGTATAAAAATTTACTTTGGAATAAGCTTACTTATTTTTGAAAATATTT 109580998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7352 CTGTGCTGTGAAGTATAAAAATTTACTTTGGAATAAGCTTACTTATTTTTGAAAATATTT 7411

109580999 CAGTAATTTAAAAAATATCGAGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTT 109581058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7412 CAGTAATTTAAAAAATATCGAGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTT 7471

109581059 GGGAAGCCAAGGCAGGCAGGTCACTTGAGTCTAGGAGTTCAACACCAGCCTGGGCAACAT 109581118
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7472 GGGAAGCCAAGGCGGGCAGGTCACTTGAGTCTAGGAGTTCAACACCAGCCTGGGCAACAT 7531

109581119 GGCAAAACCCTATCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCAAGCACCTG 109581178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7532 GGCAAAACCCTATCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCAAGCACCTG 7591

109581179 TAGTCCTAGCTACT 109581192
          ||||||||||||||
     7592 TAGTCCTAGCTACT 7605

Alignment time is 9.81253 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     4183] =>      4183 nucs 'mol-32-3164-038176_4183'

Score:        4108
Aligned:      4185        nucs
Identic:      4178 (100%) nucs =>      2769 (100%)      1409 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109575098,109577869] EXCISED REGION [109577874,109579285]
 second seq =>  [        1,     2772] EXCISED REGION [     2773,     4183]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [109577870,109577873]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [109577870,109577884] to [109577874,109577888]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [109577870,109577871] to [109577872,109577873]
 second seq =>         0 nucs

109575098 CCAGCTTGGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCA 109575157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGCTTGGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCA 60

109575158 AGCTGCTCAATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGA 109575217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCTGCTCAATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGA 120

109575218 CACTAAAAATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTT 109575277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACTAAAAATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTT 180

109575278 GGGAGGCC-AGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGT 109575336
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGT 240

109575337 GGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTA 109575396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTA 300

109575397 TAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGT 109575456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGT 360

109575457 TGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTC 109575516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTC 420

109575517 CAAAAAAAAAAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATT 109575576
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAAAAAAAAA-TTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATT 479

109575577 ATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGG 109575636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 ATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGG 539

109575637 GCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGAT 109575696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGAT 599

109575697 CATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAA 109575756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 CATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAA 659

109575757 AATACAAAAATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCT 109575816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 AATACAAAAATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCT 719

109575817 GAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCC 109575876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCC 779

109575877 ACTACACTCCAGCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAA 109575936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 ACTACACTCCAGCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAA 839

109575937 AAAAAAGCTAAATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTC 109575996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 AAAAAAGCTAAATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTC 899

109575997 AAAATTCCAGACGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATAC 109576056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AAAATTCCAGACGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATAC 959

109576057 CAATATATTTGTGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACAT 109576116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CAATATATTTGTGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACAT 1019

109576117 GCTCACTTCCACACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAG 109576176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GCTCACTTCCACACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAG 1079

109576177 AAAAAAGAAGACCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATA 109576236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AAAAAAGAAGACCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATA 1139

109576237 CTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCA 109576296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCA 1199

109576297 CTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAAC 109576356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAAC 1259

109576357 ATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCC 109576416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCC 1319

109576417 TGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAG 109576476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAG 1379

109576477 GTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTG 109576536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTG 1439

109576537 TGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTT 109576596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTT 1499

109576597 GACAGCATGAAATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAA 109576656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GACAGCATGAAATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAA 1559

109576657 TCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAG 109576716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAG 1619

109576717 CCTGACCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTG 109576776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CCTGACCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTG 1679

109576777 GCACATGCCTGGAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAG 109576836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GCACATGCCTGGAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAG 1739

109576837 GAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAG 109576896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAG 1799

109576897 TGAAACTCCATCTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAG 109576956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TGAAACTCCATCTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAG 1859

109576957 AAACCTAGCCTGCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAAT 109577016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AAACCTAGCCTGCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAAT 1919

109577017 AGAGAAAAATTAGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATG 109577076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGAGAAAAATTAGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATG 1979

109577077 GTAAATTCATACTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCC 109577136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GTAAATTCATACTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCC 2039

109577137 ACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGCACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTAC 109577196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGCACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTAC 2099

109577197 TGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGATCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGAC 109577256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGATCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGAC 2159

109577257 CCTACATATGAGGGATCTAAACTGCAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTG 109577316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CCTACATATGAGGGATCTAAACTGCAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTG 2219

109577317 AGGTAGAATGGTTTCCACCTCACCCCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAG 109577376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AGGTAGAATGGTTTCCACCTCACCCCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAG 2279

109577377 TAAACCAACCAGTACCTGGTGCCAAAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACAC 109577436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TAAACCAACCAGTACCTGGTGCCAAAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACAC 2339

109577437 AGTGACGTATATCTATATATCCTAAAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATC 109577496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2340 AGTGACGTATATCTATATATCCTAAAAAGGAATAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATC 2399

109577497 AATAAATATTTGTTGAATGAATGAATATAAACAGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGC 109577556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AATAAATATTTGTTGAATGAATGAATATAAACAGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGC 2459

109577557 ATAATATCTCTGTGTCTAAATAAATATACAAAGGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATG 109577616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 ATAATATCTCTGTGTCTAAATAAATATACAAAGGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATG 2519

109577617 CCTATAACCCCAGCACTTGGGAGGCTGAGATCGGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAA 109577676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 CCTATAACCCCAGCACTTGGGAGGCTGAGATCGGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAA 2579

109577677 GGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTCCAAAAAAAAAAAACAATTAGCCAGGCGTGGTGGT 109577736
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     2580 GGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTCCAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGT 2639

109577737 GCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGTTTGAGTCTGGGT 109577796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGTTTGAGTCTGGGT 2699

109577797 GGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACATTGCACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGTAA 109577856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACATTGCACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGTAA 2759

109577857 GACCCTGTCTCAG 109577869
          |||||||||||||
     2760 GACCCTGTCTCAG 2772

EXCISED REGION

109577874 AAAAAAAAAAAAAAACCCCACACACACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAG 109577933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 AAAAAAAAAAAAAAACCCCACACACACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAG 2832

109577934 TGTGATTATCTCTGAAGAAAGGCATGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGA 109577993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 TGTGATTATCTCTGAAGAAAGGCATGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGA 2892

109577994 AAAGGGTTGAAGGAGACTTTTTTATTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACA 109578053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 AAAGGGTTGAAGGAGACTTTTTTATTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACA 2952

109578054 ACCAATATATATTCATGCATTACTTGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAA 109578113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 ACCAATATATATTCATGCATTACTTGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAA 3012

109578114 TTTTTAAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTG 109578173
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 TTTTTAAA-TTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTG 3071

109578174 CAGTGGCGCAATCTTGGCTCATTGCAATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGC 109578233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 CAGTGGCGCAATCTTGGCTCATTGCAATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGC 3131

109578234 CTTGGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCAT 109578293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 CTTGGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCAT 3191

109578294 TTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCCGACCTCAG 109578353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 TTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCCGACCTCAG 3251

109578354 GTGATCCACCCACCTCGGTCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATGCCC 109578413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 GTGATCCACCCACCTCGGTCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATGCCC 3311

109578414 AGCCAATTTTTAATTTTGTATCTTCTTTTTTTTTTTTTTAAGAGAAGGAGTCTTACTATG 109578473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 AGCCAATTTTTAATTTTGTATCTTCTTTTTTTTTTTTTTAAGAGAAGGAGTCTTACTATG 3371

109578474 CTACCCAGACTACAGTGTAGTTGCTATTGCCGGGCCTGTTCATAGCACACTACAGCCTCA 109578533
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3372 CTACCCAGACTACAGTGTAGTTGCTATTGCCAGGCCTGTTCATAGCACACTACAGCCTCA 3431

109578534 AACTCCTGCGCTCAAGCAATTCTTCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTAAGACTATAGACA 109578593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 AACTCCTGCGCTCAAGCAATTCTTCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTAAGACTATAGACA 3491

109578594 TATGCCAACTTGCCTGGCTCAATTTTTAATTTTAAAGCAAAAAAGAACTATGAAAATGAA 109578653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 TATGCCAACTTGCCTGGCTCAATTTTTAATTTTAAAGCAAAAAAGAACTATGAAAATGAA 3551

109578654 AAATATATACATATTAAAGGATTAGATCTCAAAGGTTTTAATCTATAAAGGTACCAACTA 109578713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 AAATATATACATATTAAAGGATTAGATCTCAAAGGTTTTAATCTATAAAGGTACCAACTA 3611

109578714 AAGTACAATCCCCAAAACAGGATTAACTGCTTTGTTTACAATGCAAAAACTACTGGGTAC 109578773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 AAGTACAATCCCCAAAACAGGATTAACTGCTTTGTTTACAATGCAAAAACTACTGGGTAC 3671

109578774 TATTTTAGGATCTTACATTCATTGTCTAATCGATCCTTACAAAAACCATTCTTCACCAGA 109578833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 TATTTTAGGATCTTACATTCATTGTCTAATCGATCCTTACAAAAACCATTCTTCACCAGA 3731

109578834 AGATAGCTTCTAGATCCCTTCCCACTCCCGTCATCCTCCTCTAAATATCTGTTAATCCCC 109578893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 AGATAGCTTCTAGATCCCTTCCCACTCCCGTCATCCTCCTCTAAATATCTGTTAATCCCC 3791

109578894 CTCCTAAAGAACCCAAAATAGGCCAGGCGCGGTGGCTCACATCTGTAATCCCAGCACTAT 109578953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3792 CTCCTAAAGAACCCAAAATAGGCCAGGCGCGGTGGCTCACATCTGTAATCCCAGCACTAT 3851

109578954 AGGAGCCTGAGGCAGGTGGATCACAAAGTCAGGAGATCCAGACCATCCTGGCCAACATGG 109579013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 AGGAGCCTGAGGCAGGTGGATCACAAAGTCAGGAGATCCAGACCATCCTGGCCAACATGG 3911

109579014 TGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCTTGGTAGCGTGCGCCTGTA 109579073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3912 TGAAATCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAACCGGGCTTGGTAGCGTGCGCCTGTA 3971

109579074 GTCCCAGGAGGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGCACCACTGCACTACAGCCTGG 109579133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 GTCCCAGGAGGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGCACCACTGCACTACAGCCTGG 4031

109579134 GCGACTGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACATAGTCCAGGCGCGGTGGCT 109579193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 GCGACTGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACATAGTCCAGGCGCGGTGGCT 4091

109579194 CACACCTGTAATCTCACCACTTTGGAAGGCCGAGGCAAGCGGATCACGGGGTCAGCAGAT 109579253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4092 CACACCTGTAATCTCACCACTTTGGAAGGCCGAGGCAAGCGGATCACGGGGTCAGCAGAT 4151

109579254 CGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCC 109579285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 CGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCC 4183

Alignment time is 5.2301 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3156] =>      3156 nucs 'mol-32-3185-125964_3156'

Score:        3134
Aligned:      3156        nucs
Identic:      3154 (100%) nucs =>       393 (100%)      2761 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109574534,109574926] EXCISED REGION [109574928,109577690]
 second seq =>  [        1,      393] EXCISED REGION [      395,     3156]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [109574927,109574927]
 second seq =>         1 nucs [394,394]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [109575128,109575128]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [393,393] to [394,394]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109574534 GCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGGCATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTT 109574593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGGCATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTT 60

109574594 GTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGC 109574653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGC 120

109574654 TACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGC 109574713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGC 180

109574714 ACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAGGACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATAT 109574773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAGGACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATAT 240

109574774 TCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTTAAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACA 109574833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTTAAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACA 300

109574834 TGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG 109574893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG 360

109574894 GAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGATC 109574926
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGATC 393

EXCISED REGION

109574928 AGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAGAAGATTAGCCA 109574987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      395 AGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAGATTAGCCA 454

109574988 GGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCA 109575047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      455 GGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCA 514

109575048 TGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTGGG 109575107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      515 TGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTGGG 574

109575108 CGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTCAA 109575167
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      575 CGACAGAGCGAGACTGTCTC-AAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTCAA 633

109575168 TTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAAT 109575227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      634 TTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAAT 693

109575228 GTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAG 109575287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      694 GTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAG 753

109575288 GTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCT 109575347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      754 GTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCT 813

109575348 GTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCT 109575407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      814 GTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCT 873

109575408 ATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCT 109575467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      874 ATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCT 933

109575468 GAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAA 109575527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      934 GAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAA 993

109575528 ATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGA 109575587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      994 ATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGA 1053

109575588 CAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAG 109575647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1054 CAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAG 1113

109575648 TGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAG 109575707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1114 TGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAG 1173

109575708 GAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAT 109575767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1174 GAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAT 1233

109575768 TAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 109575827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1234 TAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 1293

109575828 ATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCA 109575887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1294 ATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCA 1353

109575888 GCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAA 109575947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1354 GCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAA 1413

109575948 ATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGA 109576007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1414 ATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGA 1473

109576008 CGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTG 109576067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1474 CGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTG 1533

109576068 TGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCA 109576127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 TGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCA 1593

109576128 CACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGA 109576187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 CACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGA 1653

109576188 CCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAG 109576247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 CCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAG 1713

109576248 AATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGC 109576307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1714 AATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGC 1773

109576308 CAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACC 109576367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 CAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACC 1833

109576368 CTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAG 109576427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 CTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAG 1893

109576428 CTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAG 109576487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 CTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAG 1953

109576488 CCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAA 109576547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1954 CCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAA 2013

109576548 TAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAA 109576607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2014 TAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAA 2073

109576608 ATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTT 109576667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 ATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTT 2133

109576668 TGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACA 109576727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2134 TGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACA 2193

109576728 TGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTG 109576787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2194 TGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTG 2253

109576788 GAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGT 109576847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 GAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGT 2313

109576848 TGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCAT 109576907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 TGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCAT 2373

109576908 CTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCT 109576967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 CTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCT 2433

109576968 GCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATT 109577027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 GCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATT 2493

109577028 AGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATA 109577087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 AGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATA 2553

109577088 CTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTA 109577147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2554 CTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTA 2613

109577148 GGAACTGAGCTGCACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCC 109577207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 GGAACTGAGCTGCACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCC 2673

109577208 CGCTCCTGTTAGATCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGA 109577267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 CGCTCCTGTTAGATCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGA 2733

109577268 GGGATCTAAACTGCAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGG 109577327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 GGGATCTAAACTGCAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGG 2793

109577328 TTTCCACCTCACCCCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCA 109577387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 TTTCCACCTCACCCCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCA 2853

109577388 GTACCTGGTGCCAAAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATA 109577447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 GTACCTGGTGCCAAAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATA 2913

109577448 TCTATATATCCTAAAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTT 109577507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 TCTATATATCCTAAAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTT 2973

109577508 GTTGAATGAATGAATATAAACAGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCT 109577567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 GTTGAATGAATGAATATAAACAGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCT 3033

109577568 GTGTCTAAATAAATATACAAAGGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCC 109577627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 GTGTCTAAATAAATATACAAAGGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCC 3093

109577628 AGCACTTGGGAGGCTGAGATCGGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGC 109577687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 AGCACTTGGGAGGCTGAGATCGGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGC 3153

109577688 GAA 109577690
          |||
     3154 GAA 3156

Alignment time is 3.97205 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5443] =>      5443 nucs 'mol-32-3185-125965_5443'

Score:        5340
Aligned:      5436        nucs
Identic:      5424 (100%) nucs =>      3620 (100%)      1804 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109568706,109572331] EXCISED REGION [109572346,109574151]
 second seq =>  [        1,     3628] EXCISED REGION [     3639,     5443]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        14 nucs [109572332,109572345]
 second seq =>        10 nucs [3629,3638]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [109572331,109572333] to [109572345,109572347]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109572331,109572331] to [109572346,109572346]
 second seq =>         1 nucs [3628,3628] to [3639,3639]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [109572332,109572333] to [109572344,109572345]
 second seq =>         0 nucs

109568706 TCACCTAGGTTAGAGTGCAGTTGCATGACCATGGCCCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGGC 109568765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCACCTAGGTTAGAGTGCAGTTGCATGACCATGGCCCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGGC 60

109568766 TCAAGTGATCCTCCCGCTTCAGCCTTCCAAGTACCTGGGATGACAGGTGTGTGCCACCGT 109568825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAAGTGATCCTCCCGCTTCAGCCTTCCAAGTACCTGGGATGACAGGTGTGTGCCACCGT 120

109568826 ACCCAGCTAATTTTTTATTTTACTTTTTGTAGAGACGGGATCTACCTATGTTGCCTAGGC 109568885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCCAGCTAATTTTTTATTTTACTTTTTGTAGAGACGGGATCTACCTATGTTGCCTAGGC 180

109568886 TGCTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCTCGCCTCGGCATCCCAAAGTGTTGGGAT 109568945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCTCGCCTCGGCATCCCAAAGTGTTGGGAT 240

109568946 TACAGGGATGAGCCACCGTGCCCACCTTTTTTTTTTTTTCAGGTTATCCGTGGAAACTAC 109569005
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||
      241 TACAGGGATGAGCCACCGTGCCCACCTTTTTTTTTTT--CAGGTTATCCGTGGAAACTAC 298

109569006 TCATTAAATTCTGATCATATCAGAACTGTCTCCCTAATATTATTCTTAGAGCACACTGAT 109569065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 TCATTAAATTCTGATCATATCAGAACTGTCTCCCTAATATTATTCTTAGAGCACACTGAT 358

109569066 TAGTGATTTTAGCATTCCTCAAATCTTTAGACAATTCTTTTTTTTATTTTTACTGCTCCT 109569125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 TAGTGATTTTAGCATTCCTCAAATCTTTAGACAATTCTTTTTTTTATTTTTACTGCTCCT 418

109569126 TGCAGAGCAGGCTACCCAATAGGCAGTGTGCCCAGAGTAGCCCTTCAGGTAATTCTTACT 109569185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 TGCAGAGCAGGCTACCCAATAGGCAGTGTGCCCAGAGTAGCCCTTCAGGTAATTCTTACT 478

109569186 AGCAAAAAAATGGCTTTTACTAATTTAACTCTCAGAAAAAAATATTCCCTCCTCTGTAGG 109569245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 AGCAAAAAAATGGCTTTTACTAATTTAACTCTCAGAAAAAAATATTCCCTCCTCTGTAGG 538

109569246 TTCTTAGAGGGCACATCACATATATCTCCATGTACCAACCACACAAACTTAATGCACAAT 109569305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 TTCTTAGAGGGCACATCACATATATCTCCATGTACCAACCACACAAACTTAATGCACAAT 598

109569306 TGGGACTATAATTTTCTAATATAGCTCAATATACCAATGATACTAAACATTGTATAGGCT 109569365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TGGGACTATAATTTTCTAATATAGCTCAATATACCAATGATACTAAACATTGTATAGGCT 658

109569366 TCATATTCAACATTCAATCTAAATATCAGTCCAGATATAAAGTTACTCTGAATGGAATTT 109569425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 TCATATTCAACATTCAATCTAAATATCAGTCCAGATATAAAGTTACTCTGAATGGAATTT 718

109569426 ATGGCAATAGTCCCACTTTAAATAATAACTACAAGTTTAATGTTGCAGTCATTTTTGGTT 109569485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 ATGGCAATAGTCCCACTTTAAATAATAACTACAAGTTTAATGTTGCAGTCATTTTTGGTT 778

109569486 AATAAAGCCTAAGAGAACTACATTCTTACAAATACATATTTTATACTGACAGTTGAAGGT 109569545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 AATAAAGCCTAAGAGAACTACATTCTTACAAATACATATTTTATACTGACAGTTGAAGGT 838

109569546 AACAGAAAATATGTCCTAATTAACTTAAAATTGGTTCAAGTTTTCTTTTTAAAAAAAAAC 109569605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 AACAGAAAATATGTCCTAATTAACTTAAAATTGGTTCAAGTTTTCTTTTTAAAAAAAAAC 898

109569606 TAATTAAAAAAAGACAAGTTTTAATTCTATACCTTGAAATTCCCAGTAGAATAATATATT 109569665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 TAATTAAAAAAAGACAAGTTTTAATTCTATACCTTGAAATTCCCAGTAGAATAATATATT 958

109569666 TTAATCACCCAACACAGAATTTTTTTTTTTTAAGGCAGAGTCTCCCTCTGTTGCCCGGGC 109569725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      959 TTAATCACCCAACACAGAATTTTTTTTTTTTAAGGCAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCGGGC 1018

109569726 TGGAGTGCAGTGGCAATCTCGGCTGGCTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCT 109569785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 TGGAGTGCAGTGGCAATCTCGGCTGGCTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCT 1078

109569786 CTTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCACTTACACAACCGGCTAATT 109569845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 CTTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCACTTACACAACCGGCTAATT 1138

109569846 TTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTT 109569905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTT 1198

109569906 GACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCA 109569965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 GACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCA 1258

109569966 CCAAGCCTGGCCCAGAATTTTAATTCTTATAAGCTTCACTGTTGCTGAATACAGTATAAA 109570025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CCAAGCCTGGCCCAGAATTTTAATTCTTATAAGCTTCACTGTTGCTGAATACAGTATAAA 1318

109570026 TATAGGCATAGGCACATGCTTGATGACTATATCTTAGAATTATTCTCTTCTAACTCCCTT 109570085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TATAGGCATAGGCACATGCTTGATGACTATATCTTAGAATTATTCTCTTCTAACTCCCTT 1378

109570086 GTATTACTGAAACATTTATACAGGCTCCCAAAATCTTACCTCTGTAAGTGATATATACTG 109570145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 GTATTACTGAAACATTTATACAGGCTCCCAAAATCTTACCTCTGTAAGTGATATATACTG 1438

109570146 CATACTTTTTTTTTCCCCCAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCAAGAGTGCAGTGG 109570205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 CATACTTTTTTTTTCCCCCAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCAAGAGTGCAGTGG 1498

109570206 TGCAATCTCGGTTTACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGC 109570265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TGCAATCTCGGTTTACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGC 1558

109570266 CTCCCAAGTAGCTGGGATCACAGGTGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTT 109570325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 CTCCCAAGTAGCTGGGATCACAGGTGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTT 1618

109570326 AGTAGAGATGGGGTTTCACCATCTTGGCAGGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATC 109570385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 AGTAGAGATGGGGTTTCACCATCTTGGCAGGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATC 1678

109570386 CACCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCTAT 109570445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CACCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCTAT 1738

109570446 ATACATATTTTAAACATCTATTTCCTGTAATCCTAGCTACTTTGGAAGGCTGAGGTGGGC 109570505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 ATACATATTTTAAACATCTATTTCCTGTAATCCTAGCTACTTTGGAAGGCTGAGGTGGGC 1798

109570506 AACATAGTGAGACCTTATCTCAAATAAATAAATAAATAACTATTCACCACAAAGTTAGAA 109570565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 AACATAGTGAGACCTTATCTCAAATAAATAAATAAATAACTATTCACCACAAAGTTAGAA 1858

109570566 CTTTTCTCTAATTCAGGGAAACAGAATTCAATAATAATTACTTCTTCCCCTCTCCTCTGG 109570625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CTTTTCTCTAATTCAGGGAAACAGAATTCAATAATAATTACTTCTTCCCCTCTCCTCTGG 1918

109570626 GGGAGCTATAAATCTGCAAAAGATTTTAACAAGTTTAGGAACTACTAAAATTATCTTTTA 109570685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GGGAGCTATAAATCTGCAAAAGATTTTAACAAGTTTAGGAACTACTAAAATTATCTTTTA 1978

109570686 AAATGAGATGCACATATAATCATAATATGTGTTCAATAAATAAATATTAGCTGAATTAAC 109570745
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAATGAGATGCACATATAATCATAATACGTGTTCAATAAATAAATATTAGCTGAATTAAC 2038

109570746 TTGAGATGTAAAGTCACTGAAGAAATGTCTCTACAAAAGTACAGAACAGATGACTATGGT 109570805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TTGAGATGTAAAGTCACTGAAGAAATGTCTCTACAAAAGTACAGAACAGATGACTATGGT 2098

109570806 TTTGTTTGTTTGTCTGTTTTAGACAGGGTCTTACTCTGAGGCCCAGGCAGGAGTGCAGTG 109570865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTTGTTTGTTTGTCTGTTTTAGACAGGGTCTTACTCTGAGGCCCAGGCAGGAGTGCAGTG 2158

109570866 GCTGAATCATGGCTCACTGCAGCCTTGGCCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAG 109570925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GCTGAATCATGGCTCACTGCAGCCTTGGCCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAG 2218

109570926 CCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCATGTGCCACTGGGCCCAGCTAATTTTTGTTGGGT 109570985
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2219 CCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCATGTGCCCCTGGGCCCAGCTAATTTTTGTTGGGT 2278

109570986 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----GTAGAGATTGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTTA 109571041
          |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATTGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTTA 2338

109571042 GTCTGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCTG 109571101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GTCTGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCTG 2398

109571102 GGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAA 109571161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAA 2458

109571162 AAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATG 109571221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATG 2518

109571222 TGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGG 109571281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGG 2578

109571282 CCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTG 109571341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTG 2638

109571342 GGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTT 109571401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 GGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTT 2698

109571402 GAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATCTTC 109571461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATCTTC 2758

109571462 ACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTTT 109571521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 ACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTTT 2818

109571522 CCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTA 109571581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTA 2878

109571582 AAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTT 109571641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 AAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTT 2938

109571642 AAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACA 109571701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 AAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACA 2998

109571702 ATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTACC 109571761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 ATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTACC 3058

109571762 ATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAG 109571821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 ATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAG 3118

109571822 AAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCT 109571881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 AAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCT 3178

109571882 CATGGCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTT 109571941
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CATGGCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTT 3238

109571942 CAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGG 109572001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 CAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGG 3298

109572002 CCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATA 109572061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 CCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATA 3358

109572062 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGA 109572121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 ACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGA 3418

109572122 AAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGC 109572181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGC 3478

109572182 TAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAAC 109572241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAAC 3538

109572242 CAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAA 109572301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 CAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAA 3598

109572302 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 109572331
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 3628

EXCISED REGION

109572346 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 109572405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3639 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 3698

109572406 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 109572465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3699 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 3758

109572466 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 109572525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3759 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 3818

109572526 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 109572585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3819 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 3878

109572586 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 109572645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3879 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 3938

109572646 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 109572705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3939 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 3998

109572706 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 109572765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3999 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 4058

109572766 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 109572825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4059 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 4118

109572826 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 109572885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4119 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 4178

109572886 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 109572945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4179 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 4238

109572946 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 109573005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4239 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 4298

109573006 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 109573065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4299 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 4358

109573066 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 109573125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4359 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 4418

109573126 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 109573185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4419 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 4478

109573186 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 109573245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4479 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 4538

109573246 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 109573305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4539 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 4598

109573306 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 109573365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4599 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 4658

109573366 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 109573425
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4659 GCATCTTTTCCTTT-AAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 4717

109573426 AACATGGCATTCAAAAAACTTTATGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 109573485
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4718 AACATGGCATTCAAAAAACTTTACGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 4777

109573486 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 109573545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4778 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 4837

109573546 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 109573605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4838 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 4897

109573606 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 109573665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4898 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 4957

109573666 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 109573725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4958 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 5017

109573726 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 109573785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5018 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 5077

109573786 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 109573845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5078 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 5137

109573846 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 109573905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5138 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 5197

109573906 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 109573965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5198 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 5257

109573966 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 109574025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5258 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 5317

109574026 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 109574085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5318 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 5377

109574086 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 109574145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5378 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 5437

109574146 CCTGTA 109574151
          ||||||
     5438 CCTGTA 5443

Alignment time is 6.73565 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3006] =>      3006 nucs 'mol-32-321f-090068_3006'

Score:        2963
Aligned:      3007        nucs
Identic:      3003 (100%) nucs =>      2937 (100%)        66 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109575181,109578121] EXCISED REGION [109578124,109578189]
 second seq =>  [        1,     2940] EXCISED REGION [     2941,     3006]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [109578122,109578123]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [109578122,109578135] to [109578124,109578137]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109578122,109578122] to [109578123,109578123]
 second seq =>         0 nucs

109575181 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 109575240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 60

109575241 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 109575300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 120

109575301 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 109575360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 180

109575361 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 109575420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 240

109575421 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 109575480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 300

109575481 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 109575540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 360

109575541 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 109575600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 420

109575601 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 109575660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 480

109575661 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 109575720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 540

109575721 GCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAG 109575780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAG 600

109575781 TGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCC 109575840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCC 660

109575841 AGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAG 109575900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAG 720

109575901 AATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCT 109575960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCT 780

109575961 GGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCA 109576020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCA 840

109576021 AAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTC 109576080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTC 900

109576081 AACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAAT 109576140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAAT 960

109576141 GAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCT 109576200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCT 1020

109576201 AGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGG 109576260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGG 1080

109576261 GACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGA 109576320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGA 1140

109576321 TCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAA 109576380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAA 1200

109576381 AAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 109576440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 1260

109576441 TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGC 109576500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGC 1320

109576501 CACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGA 109576560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGA 1380

109576561 AGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACA 109576620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACA 1440

109576621 AAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAG 109576680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAG 1500

109576681 TGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCA 109576740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCA 1560

109576741 TCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTAC 109576800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTAC 1620

109576801 TTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGG 109576860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1621 TTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGAAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGG 1680

109576861 GATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAA 109576920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAA 1740

109576921 ACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTG 109576980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTG 1800

109576981 CAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGA 109577040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGA 1860

109577041 ACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGG 109577100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGG 1920

109577101 GTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGC 109577160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGC 1980

109577161 ACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGA 109577220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGA 2040

109577221 TCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTG 109577280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTG 2100

109577281 CAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACC 109577340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACC 2160

109577341 CCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCA 109577400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCA 2220

109577401 AAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTA 109577460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTA 2280

109577461 AAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGA 109577520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGA 2340

109577521 ATATAAACAGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAA 109577580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATATAAACAGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAA 2400

109577581 TATACAAAGGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGG 109577640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATACAAAGGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGG 2460

109577641 CTGAGATCGGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTC 109577700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTGAGATCGGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTC 2520

109577701 TCCAAAAAAAAAAAACAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTC 109577760
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCCAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTC 2580

109577761 AGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGTTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACA 109577820
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTATTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACA 2640

109577821 TTGCACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAGAAAAAAAAAAA 109577880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTGCACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAGAAAAAAAAAAA 2700

109577881 AAAAAAAACCCCACACACACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGATT 109577940
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAAAAA-CCCCACACACACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGATT 2759

109577941 ATCTCTGAAGAAAGGCATGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGGT 109578000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 ATCTCTGAAGAAAGGCATGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGGT 2819

109578001 TGAAGGAGACTTTTTTATTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAATA 109578060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TGAAGGAGACTTTTTTATTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAATA 2879

109578061 TATATTCATGCATTACTTGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTAA 109578120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TATATTCATGCATTACTTGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTAA 2939

109578121 A 109578121
          |
     2940 A 2940

EXCISED REGION

109578124 TTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCA 109578183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCA 3000

109578184 ATCTTG 109578189
          ||||||
     3001 ATCTTG 3006

Alignment time is 3.92734 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5272] =>      5272 nucs 'mol-32-322a-224678_5272'

Score:        5208
Aligned:      5274        nucs
Identic:      5268 (100%) nucs =>      2134 (100%)      3134 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109571097,109573231] EXCISED REGION [109575181,109578319]
 second seq =>  [        1,     2135] EXCISED REGION [     2136,     5272]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1949 nucs [109573232,109575180]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109573232,109573232] to [109575181,109575181]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109571097 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTT 109571156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTT 60

109571157 TTCAAAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAA 109571216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCAAAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAA 120

109571217 GCATGTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCAT 109571276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCATGTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCAT 180

109571277 GTTGGCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAG 109571336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTGGCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAG 240

109571337 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACA 109571396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACA 300

109571397 TTTTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCA 109571456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCA 360

109571457 TCTTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTG 109571516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTG 420

109571517 CCTTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTC 109571576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTC 480

109571577 CTTTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGT 109571636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGT 540

109571637 TCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAG 109571696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAG 600

109571697 ATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGA 109571756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGA 660

109571757 TTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATT 109571816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATT 720

109571817 TTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAG 109571876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAG 780

109571877 TGGCTCATGGCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAG 109571936
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGCTCATGGCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAG 840

109571937 GAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAA 109571996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAA 900

109571997 ATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGT 109572056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGT 960

109572057 GGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCT 109572116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCT 1020

109572117 ACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAG 109572176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAG 1080

109572177 GAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAG 109572236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAG 1140

109572237 TGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAA 109572296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAA 1200

109572297 ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACCCG 109572356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACCCG 1260

109572357 GGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTT 109572416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTT 1320

109572417 GAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGC 109572476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGC 1380

109572477 AACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGT 109572536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGT 1440

109572537 AATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAA 109572596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAA 1500

109572597 AATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTT 109572656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTT 1560

109572657 TCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCC 109572716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCC 1620

109572717 CTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTC 109572776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTC 1680

109572777 CTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCA 109572836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCA 1740

109572837 CAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAA 109572896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAA 1800

109572897 GCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCA 109572956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCA 1860

109572957 AGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAA 109573016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAA 1920

109573017 ATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGA 109573076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGA 1980

109573077 AAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAG 109573136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAG 2040

109573137 TCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAAT 109573196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAAT 2100

109573197 TCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 109573231
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 2135

EXCISED REGION

109575181 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 109575240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 2195

109575241 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 109575300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 2255

109575301 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 109575360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 2315

109575361 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 109575420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 2375

109575421 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 109575480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 2435

109575481 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 109575540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     2436 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCC-AAAAAAAAAATTACAAAACGTA 2494

109575541 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 109575600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 2554

109575601 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 109575660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 2614

109575661 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 109575720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 2674

109575721 GCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAG 109575780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 GCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAG 2734

109575781 TGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCC 109575840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 TGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCC 2794

109575841 AGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAG 109575900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 AGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAG 2854

109575901 AATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCT 109575960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 AATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCT 2914

109575961 GGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCA 109576020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 GGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCA 2974

109576021 AAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTC 109576080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 AAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTC 3034

109576081 AACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAAT 109576140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 AACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAAT 3094

109576141 GAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCT 109576200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 GAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCT 3154

109576201 AGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGG 109576260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 AGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGG 3214

109576261 GACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGA 109576320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 GACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGA 3274

109576321 TCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAA 109576380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 TCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAA 3334

109576381 AAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 109576440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 AAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 3394

109576441 TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGC 109576500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGC 3454

109576501 CACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGA 109576560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 CACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGA 3514

109576561 AGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACA 109576620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 AGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACA 3574

109576621 AAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAG 109576680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 AAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAG 3634

109576681 TGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCA 109576740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 TGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCA 3694

109576741 TCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTAC 109576800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 TCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTAC 3754

109576801 TTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGG 109576860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3755 TTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGAAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGG 3814

109576861 GATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAA 109576920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 GATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAA 3874

109576921 ACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTG 109576980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 ACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTG 3934

109576981 CAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGA 109577040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 CAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGA 3994

109577041 ACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGG 109577100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 ACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGG 4054

109577101 GTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGC 109577160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 GTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGC 4114

109577161 ACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGA 109577220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 ACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGA 4174

109577221 TCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTG 109577280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 TCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTG 4234

109577281 CAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACC 109577340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 CAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACC 4294

109577341 CCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCA 109577400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 CCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCA 4354

109577401 AAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTA 109577460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 AAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTA 4414

109577461 AAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGA 109577520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 AAAAGGAAAAGTGCATCACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGA 4474

109577521 ATATAAACAGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAA 109577580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4475 ATATAAACAGGCCCATTTATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAA 4534

109577581 TATACAAAGGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGG 109577640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4535 TATACAAAGGTCTGAGACCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGG 4594

109577641 CTGAGATCGGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTC 109577700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4595 CTGAGATCGGAGGATAGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTC 4654

109577701 TCCAAAAAAAAAAAACAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTC 109577760
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4655 TCCAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTC 4714

109577761 AGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGTTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACA 109577820
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4715 AGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTATTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACA 4774

109577821 TTGCACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAGAAAAAAAAAAA 109577880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4775 TTGCACTACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAGAAAAAAAAAAA 4834

109577881 AAAAAAAACCCCACACACACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGATT 109577940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4835 AAAAAAAACCCCACACACACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGATT 4894

109577941 ATCTCTGAAGAAAGGCATGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGGT 109578000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4895 ATCTCTGAAGAAAGGCATGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGGT 4954

109578001 TGAAGGAGACTTTTTTATTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAATA 109578060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4955 TGAAGGAGACTTTTTTATTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAATA 5014

109578061 TATATTCATGCATTACTTGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTAA 109578120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5015 TATATTCATGCATTACTTGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTAA 5074

109578121 ATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 109578180
          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5075 A-TTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 5133

109578181 GCAATCTTGGCTCATTGCAATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGCCTTGGCC 109578240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5134 GCAATCTTGGCTCATTGCAATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGCCTTGGCC 5193

109578241 TCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCATTTTTAGT 109578300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5194 TCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCATTTTTAGT 5253

109578301 AGAGACGGGGTTTCACCAT 109578319
          |||||||||||||||||||
     5254 AGAGACGGGGTTTCACCAT 5272

Alignment time is 6.55723 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2136] =>      2136 nucs 'mol-32-322a-224678_2136'

Score:        2135
Aligned:      2135        nucs
Identic:      2135 (100%) nucs =>       792 (100%)      1343 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109571097,109571888] EXCISED REGION [109571890,109573232]
 second seq =>  [        1,      792] EXCISED REGION [      794,     2136]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [109571889,109571889]
 second seq =>         1 nucs [793,793]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109571888,109571888] to [109571890,109571890]
 second seq =>         1 nucs [792,792] to [794,794]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109571097 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTT 109571156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTT 60

109571157 TTCAAAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAA 109571216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCAAAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAA 120

109571217 GCATGTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCAT 109571276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCATGTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCAT 180

109571277 GTTGGCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAG 109571336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTGGCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAG 240

109571337 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACA 109571396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACA 300

109571397 TTTTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCA 109571456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCA 360

109571457 TCTTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTG 109571516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTG 420

109571517 CCTTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTC 109571576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTC 480

109571577 CTTTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGT 109571636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGT 540

109571637 TCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAG 109571696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAG 600

109571697 ATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGA 109571756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGA 660

109571757 TTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATT 109571816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATT 720

109571817 TTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAG 109571876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAG 780

109571877 TGGCTCATGGCT 109571888
          ||||||||||||
      781 TGGCTCATGGCT 792

EXCISED REGION

109571890 TAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 109571949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      794 TAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 853

109571950 GCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGC 109572009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      854 GCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGC 913

109572010 AGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGG 109572069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      914 AGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGG 973

109572070 TCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAA 109572129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      974 TCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAA 1033

109572130 AAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAG 109572189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1034 AAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAG 1093

109572190 GAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTG 109572249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1094 GAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTG 1153

109572250 CGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAA 109572309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1154 CGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAA 1213

109572310 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGG 109572369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1214 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGG 1273

109572370 GCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGT 109572429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1274 GCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGT 1333

109572430 GGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGAC 109572489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1334 GGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGAC 1393

109572490 TTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAAAATATAT 109572549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 TTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAAAATATAT 1453

109572550 TGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCACTGGTA 109572609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1454 TGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCACTGGTA 1513

109572610 GCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACG 109572669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 GCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACG 1573

109572670 ACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAA 109572729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 ACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAA 1633

109572730 GAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGGT 109572789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 GAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGGT 1693

109572790 GTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGTAGTTT 109572849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 GTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGTAGTTT 1753

109572850 TGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAG 109572909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 TGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAG 1813

109572910 AAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAA 109572969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 AAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAA 1873

109572970 ACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAAT 109573029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 ACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAAT 1933

109573030 TAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAACACAAC 109573089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 TAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAACACAAC 1993

109573090 AGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATAAACCT 109573149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 AGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATAAACCT 2053

109573150 TATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTCACACA 109573209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 TATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTCACACA 2113

109573210 ATAAAAACTGCTCTCTTTAATCT 109573232
          |||||||||||||||||||||||
     2114 ATAAAAACTGCTCTCTTTAATCT 2136

Alignment time is 3.02528 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5748] =>      5748 nucs 'mol-32-32fb-064365_5748'

Score:        5670
Aligned:      5747        nucs
Identic:      5740 (100%) nucs =>      4193 (100%)      1547 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109574958,109579156] EXCISED REGION [109579157,109580704]
 second seq =>  [        1,     4197] EXCISED REGION [     4201,     5748]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [4198,4200]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        16 nucs [4198,4213] to [4201,4216]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4198,4198] to [4200,4200]

109574958 GTCTCTACTAAAAATACAGAAGATTAGCCAGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGC 109575017
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTCTACTAAAAATACAAAAGATTAGCCAGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGC 60

109575018 TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGC 109575077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGC 120

109575078 TGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTGGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAA 109575137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTGGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAA 180

109575138 AAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTCAATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGA 109575197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTCAATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGA 240

109575198 AAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCAC 109575257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCAC 300

109575258 ACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCA 109575317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCA 360

109575318 AGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAG 109575377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAG 420

109575378 GCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTT 109575437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTT 480

109575438 GAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGT 109575497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGT 540

109575498 GACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAG 109575557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAG 600

109575558 AAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACAC 109575617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACAC 660

109575618 ACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGG 109575677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGG 720

109575678 GAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTG 109575737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTG 780

109575738 AAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAAT 109575797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAAT 840

109575798 CCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGC 109575857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGC 900

109575858 AGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCA 109575917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCA 960

109575918 AAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCA 109575977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCA 1020

109575978 TCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTC 109576037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTC 1080

109576038 ACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTT 109576097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTT 1140

109576098 TATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGG 109576157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGG 1200

109576158 CCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGT 109576217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGT 1260

109576218 GGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCT 109576277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCT 1320

109576278 CATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGAT 109576337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGAT 1380

109576338 GGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCT 109576397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCT 1440

109576398 GGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGC 109576457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGC 1500

109576458 TTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTG 109576517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTG 1560

109576518 GCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGAC 109576577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGAC 1620

109576578 TGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCA 109576637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCA 1680

109576638 TGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAG 109576697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAG 1740

109576698 GTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACA 109576757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACA 1800

109576758 AAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAG 109576817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCCTGGAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAG 1860

109576818 TAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCT 109576877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCT 1920

109576878 CTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTAC 109576937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCCATCTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTAC 1980

109576938 CCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCC 109576997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGCCTGCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCC 2040

109576998 CTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAG 109577057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAATTAGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAG 2100

109577058 AATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGA 109577117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCATACTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGA 2160

109577118 CACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGCACAGCAGGAGGTGAGCT 109577177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGTTAGGAACTGAGCTGCACAGCAGGAGGTGAGCT 2220

109577178 GCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGATCAGCAGTGGCATTAGA 109577237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGTCCCGCTCCTGTTAGATCAGCAGTGGCATTAGA 2280

109577238 TTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTGCAGTCTCCTTATGTGAA 109577297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATATGAGGGATCTAAACTGCAGTCTCCTTATGTGAA 2340

109577298 TCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACCCCTGGTCTGTGGAAAAA 109577357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAATGGTTTCCACCTCACCCCTGGTCTGTGGAAAAA 2400

109577358 TTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCAAAAGGGCTGAGGACTGT 109577417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAACCAGTACCTGGTGCCAAAAGGGCTGAGGACTGT 2460

109577418 TGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTAAAAAGGAAAAGTGCATC 109577477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTATATCTATATATCCTAAAAAGGAAAAGTGCATC 2520

109577478 ACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGAATATAAACAGGCCCATT 109577537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACAGAATAGTACAGCTATCAATAAATATTTGTTGAATGAATGAATATAAACAGGCCCATT 2580

109577538 TATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAATATACAAAGGTCTGAGA 109577597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TATTTAAAAGGAGAGAGGCATAATATCTCTGTGTCTAAATAAATATACAAAGGTCTGAGA 2640

109577598 CCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGGCTGAGATCGGAGGATAG 109577657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCGGGCACAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCACTTGGGAGGCTGAGATCGGAGGATAG 2700

109577658 CTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTCCAAAAAAAAAAAACA 109577717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2701 CTTGAGCTCAGGAGTTCAAGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTCCAAAAAAAAAAAAAA 2760

109577718 ATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGA 109577777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAGGCCTGAGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGA 2820

109577778 GAATTGTTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACATTGCACTACTGCACTCC 109577837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAATTGTTTGAGTCTGGGTGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCAACATTGCACTACTGCACTCC 2880

109577838 AGCCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCACACA 109577897
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     2881 AGCCTGGGCAAAAGAGTAAGACCCTGTCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAA-CCCCACACA 2939

109577898 CACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGATTATCTCTGAAGAAAGGCA 109577957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CACAAGGTCTGGAATGTTGCATGCCAAACTGTTCAGTGTGATTATCTCTGAAGAAAGGCA 2999

109577958 TGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGGTTGAAGGAGACTTTTTTA 109578017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGGGATTGGGATGGAGGGCAGGGATCTAGGAGAAGAAAAGGGTTGAAGGAGACTTTTTTA 3059

109578018 TTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAATATATATTCATGCATTACT 109578077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TTTTTTACTCTTTGCAGTTTATCTGAAGAGTTAACAACCAATATATATTCATGCATTACT 3119

109578078 TGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTAAATTTTTTTTTTTTTTTT 109578137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     3120 TGTATGTTAATACATGCATTTCTCATATGAATACAATTTTTAAATTTTTTTTTTTTTTT- 3178

109578138 GAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCATTG 109578197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GAGACGGAGTCTTACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCATTG 3238

109578198 CAATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGCCTTGGCCTCCCGAGTAGCTGGGAT 109578257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 CAATCTCTGCCTCCTGGGCTCTAGTGATTCTCCTGCCTTGGCCTCCCGAGTAGCTGGGAT 3298

109578258 TACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACC 109578317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TACAGGCGCCCACCACCACACCCAGCTATTTTGCATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACC 3358

109578318 ATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGTCTCCC 109578377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 ATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGTCTCCC 3418

109578378 AAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATGCCCAGCCAATTTTTAATTTTGTATCTT 109578437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTATGCCCAGCCAATTTTTAATTTTGTATCTT 3478

109578438 CTTTTTTTTTTTTTTAAGAGAAGGAGTCTTACTATGCTACCCAGACTACAGTGTAGTTGC 109578497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 CTTTTTTTTTTTTTTAAGAGAAGGAGTCTTACTATGCTACCCAGACTACAGTGTAGTTGC 3538

109578498 TATTGCCGGGCCTGTTCATAGCACACTACAGCCTCAAACTCCTGCGCTCAAGCAATTCTT 109578557
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 TATTGCCAGGCCTGTTCATAGCACACTACAGCCTCAAACTCCTGCGCTCAAGCAATTCTT 3598

109578558 CTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTAAGACTATAGACATATGCCAACTTGCCTGGCTCAATT 109578617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 CTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTAAGACTATAGACATATGCCAACTTGCCTGGCTCAATT 3658

109578618 TTTAATTTTAAAGCAAAAAAGAACTATGAAAATGAAAAATATATACATATTAAAGGATTA 109578677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TTTAATTTTAAAGCAAAAAAGAACTATGAAAATGAAAAATATATACATATTAAAGGATTA 3718

109578678 GATCTCAAAGGTTTTAATCTATAAAGGTACCAACTAAAGTACAATCCCCAAAACAGGATT 109578737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 GATCTCAAAGGTTTTAATCTATAAAGGTACCAACTAAAGTACAATCCCCAAAACAGGATT 3778

109578738 AACTGCTTTGTTTACAATGCAAAAACTACTGGGTACTATTTTAGGATCTTACATTCATTG 109578797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 AACTGCTTTGTTTACAATGCAAAAACTACTGGGTACTATTTTAGGATCTTACATTCATTG 3838

109578798 TCTAATCGATCCTTACAAAAACCATTCTTCACCAGAAGATAGCTTCTAGATCCCTTCCCA 109578857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TCTAATCGATCCTTACAAAAACCATTCTTCACCAGAAGATAGCTTCTAGATCCCTTCCCA 3898

109578858 CTCCCGTCATCCTCCTCTAAATATCTGTTAATCCCCCTCCTAAAGAACCCAAAATAGGCC 109578917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 CTCCCGTCATCCTCCTCTAAATATCTGTTAATCCCCCTCCTAAAGAACCCAAAATAGGCC 3958

109578918 AGGCGCGGTGGCTCACATCTGTAATCCCAGCACTATAGGAGCCTGAGGCAGGTGGATCAC 109578977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 AGGCGCGGTGGCTCACATCTGTAATCCCAGCACTATAGGAGCCTGAGGCAGGTGGATCAC 4018

109578978 AAAGTCAGGAGATCCAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAAT 109579037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 AAAGTCAGGAGATCCAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCGTCTCTACTAAAAAT 4078

109579038 ACAAAAATTAGCCGGGCTTGGTAGCGTGCGCCTGTAGTCCCAGGAGGAGGTGAAGGTTGC 109579097
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 ACAAAAATTAACCGGGCTTGGTAGCGTGCGCCTGTAGTCCCAGGAGGAGGTGAAGGTTGC 4138

109579098 AGTGAGCCGAGATGGCACCACTGCACTACAGCCTGGGCGACTGAGCAAGACTCCGTCTC 109579156
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 AGTGAGCCGAGATGGCACCACTGCACTACAGCCTGGGCGACTGAGCAAGACTCCGTCTC 4197

EXCISED REGION

109579157 AAAAAAAAAAAAAAAACATAGTCCAGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCTCACCACTTT 109579216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAAAAAAAAAAAAAAACATAGTCCAGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCTCACCACTTT 4260

109579217 GGAAGGCCGAGGCAAGCGGATCACGGGGTCAGCAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGG 109579276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GGAAGGCCGAGGCAAGCGGATCACGGGGTCAGCAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGG 4320

109579277 TGAAACCCCGTCTCTACTAACAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCAGGCGCCTGT 109579336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGAAACCCCGTCTCTACTAACAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCAGGCGCCTGT 4380

109579337 AGTCCCAGCTACTCAGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCCGGGGCGGAGCTTG 109579396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGTCCCAGCTACTCAGGAGGCCGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCCGGGGCGGAGCTTG 4440

109579397 CAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTACAGCCTGGGGCGACAGAGTGAGACTCCATCT 109579456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTACAGCCTGGGGCGACAGAGTGAGACTCCATCT 4500

109579457 CAAAATAAATAAATAAATAAATAATAAAGCACAACACTCCAGGTGTGGTCTGATCAAGAA 109579516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CAAAATAAATAAATAAATAAATAATAAAGCACAACACTCCAGGTGTGGTCTGATCAAGAA 4560

109579517 CTATATACAGTGAAACTAACAATTCCCATCATCTAGGCTCTTTACAATGAATACACCTAA 109579576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CTATATACAGTGAAACTAACAATTCCCATCATCTAGGCTCTTTACAATGAATACACCTAA 4620

109579577 AATTTCTTTATATCATCATCTATTTGTGAAATGCTGTTTTTGCACTTCCCGGAATTTCAT 109579636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AATTTCTTTATATCATCATCTATTTGTGAAATGCTGTTTTTGCACTTCCCGGAATTTCAT 4680

109579637 TTCCAAAGCTCTTCTTAAAGTTTCAAAGAAAATCGCCAGGTGCGGTGGCTCACGCCTGTA 109579696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TTCCAAAGCTCTTCTTAAAGTTTCAAAGAAAATCGCCAGGTGCGGTGGCTCACGCCTGTA 4740

109579697 ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCA 109579756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCA 4800

109579757 GCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACCAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTGGT 109579816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACCAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTGGT 4860

109579817 GGCACATGCCGGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTG 109579876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GGCACATGCCGGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTG 4920

109579877 GAAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCCGACATCACGCCATCACACTCCAGCCTGGGCAACAAGA 109579936
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4921 GAAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCCGACATCACGCCATCGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGA 4980

109579937 GCAAAACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAACAAAAAACAAAACAAGACTGGGCGTGGTGGCTC 109579996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GCAAAACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAACAAAAAACAAAACAAGACTGGGCGTGGTGGCTC 5040

109579997 ACGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATC 109580056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 ACGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATC 5100

109580057 GAGACCACAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATATAAAAAATTAGCCGGGCTTGGTGGC 109580116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GAGACCACAGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATATAAAAAATTAGCCGGGCTTGGTGGC 5160

109580117 GGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCTGGG 109580176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCTGGG 5220

109580177 AGGCGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGGGACAGAGCG 109580236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AGGCGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGGGACAGAGCG 5280

109580237 AGACCTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAACCCAATTCTATAAAATTTTCTCAA 109580296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AGACCTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAACCCAATTCTATAAAATTTTCTCAA 5340

109580297 AAGATTTTATAAAAGGTTCCATTTTCTTTTTCATCACAACAACAAGAGTCACAAAACATG 109580356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AAGATTTTATAAAAGGTTCCATTTTCTTTTTCATCACAACAACAAGAGTCACAAAACATG 5400

109580357 GTACTTAGCCATAGGAAAAAAACATTATTTGAGTTACATATGTCAAGCATACTACATAAC 109580416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GTACTTAGCCATAGGAAAAAAACATTATTTGAGTTACATATGTCAAGCATACTACATAAC 5460

109580417 TAGTAATTATAAATAGTATAAAATTTTTATGTCTTTTTGCTTGTAGTACTATTTTTTTCT 109580476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TAGTAATTATAAATAGTATAAAATTTTTATGTCTTTTTGCTTGTAGTACTATTTTTTTCT 5520

109580477 ATCTTTCTTTCTTTCTCTCTCTTTGAGACTGGGTCTCACTGTCTCCCAGGCTGGTAGAGC 109580536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 ATCTTTCTTTCTTTCTCTCTCTTTGAGACTGGGTCTCACTGTCTCCCAGGCTGGTAGAGC 5580

109580537 CTTGTCCACCCAGGCTCAAGTGATTCTCTCACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTAGGACCACA 109580596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 CTTGTCCACCCAGGCTCAAGTGATTCTCTCACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTAGGACCACA 5640

109580597 GGTGTGCACCACCACACTCAGCTAGCATTTTTTTTTTAATTGTTTGTAGACATGAGGTCT 109580656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GGTGTGCACCACCACACTCAGCTAGCATTTTTTTTTTAATTGTTTGTAGACATGAGGTCT 5700

109580657 CACTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACGTCTGGGCTCAAGCAATCCT 109580704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 CACTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACGTCTGGGCTCAAGCAATCCT 5748

Alignment time is 7.37775 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3084] =>      3084 nucs 'mol-32-32fb-064520_3084'

Score:        3008
Aligned:      3078        nucs
Identic:      3070 (100%) nucs =>       421 (100%)      2649 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109571911,109572331] EXCISED REGION [109572346,109575002]
 second seq =>  [        1,      421] EXCISED REGION [      432,     3084]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        14 nucs [109572332,109572345]
 second seq =>        10 nucs [422,431]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [109572331,109572333] to [109572345,109572347]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109572331,109572331] to [109572346,109572346]
 second seq =>         1 nucs [421,421] to [432,432]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [109572332,109572333] to [109572344,109572345]
 second seq =>         0 nucs

109571911 CCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAAC 109571970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAAC 60

109571971 CCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCC 109572030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCC 120

109572031 CAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCT 109572090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCT 180

109572091 GGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGT 109572150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGT 240

109572151 GCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCAC 109572210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCAC 300

109572211 TTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGG 109572270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGG 360

109572271 GTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAT 109572330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAT 420

109572331 A 109572331
          |
      421 A 421

EXCISED REGION

109572346 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 109572405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      432 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 491

109572406 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 109572465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      492 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 551

109572466 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 109572525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      552 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 611

109572526 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 109572585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      612 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 671

109572586 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 109572645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      672 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 731

109572646 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 109572705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      732 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 791

109572706 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 109572765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 851

109572766 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 109572825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 911

109572826 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 109572885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 971

109572886 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 109572945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 1031

109572946 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 109573005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 1091

109573006 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 109573065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 1151

109573066 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 109573125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 1211

109573126 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 109573185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 1271

109573186 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 109573245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 1331

109573246 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 109573305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 1391

109573306 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 109573365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 1451

109573366 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 109573425
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 GCATCTTTTCCTTT-AAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 1510

109573426 AACATGGCATTCAAAAAACTTTATGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 109573485
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 AACATGGCATTCAAAAAACTTTACGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 1570

109573486 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 109573545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 1630

109573546 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 109573605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 1690

109573606 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 109573665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 1750

109573666 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 109573725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 1810

109573726 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 109573785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 1870

109573786 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 109573845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 1930

109573846 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 109573905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 1990

109573906 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 109573965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 2050

109573966 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 109574025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 2110

109574026 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 109574085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 2170

109574086 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 109574145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 2230

109574146 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 109574205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 2290

109574206 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 109574265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 2350

109574266 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 109574325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 2410

109574326 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 109574385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 2470

109574386 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 109574445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||
     2471 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTC---TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 2527

109574446 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 109574505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 2587

109574506 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 109574565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 2647

109574566 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 109574625
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2648 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTCTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 2707

109574626 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAG 109574685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAG 2767

109574686 TGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAG 109574745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 TGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAG 2827

109574746 GACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTT 109574805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 GACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTT 2887

109574806 AAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTG 109574865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 AAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTG 2947

109574866 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGAT 109574925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGAT 3007

109574926 CGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAGAAGATTAGC 109574985
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3008 CCAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAGATTAGC 3067

109574986 CAGGCGTGGTGACGGGC 109575002
          |||||||||||||||||
     3068 CAGGCGTGGTGACGGGC 3084

Alignment time is 3.97326 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3790] =>      3790 nucs 'mol-32-3306-004153_3790'

Score:        3746
Aligned:      3783        nucs
Identic:      3778 (100%) nucs =>      1235 (100%)      2543 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109571096,109572331] EXCISED REGION [109572346,109574892]
 second seq =>  [        1,     1236] EXCISED REGION [     1247,     3790]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        14 nucs [109572332,109572345]
 second seq =>        10 nucs [1237,1246]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [109572331,109572333] to [109572345,109572347]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109572331,109572331] to [109572346,109572346]
 second seq =>         1 nucs [1236,1236] to [1247,1247]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [109572332,109572333] to [109572344,109572345]
 second seq =>         0 nucs

109571096 GTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGT 109571155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGT 60

109571156 TTTCAAAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTA 109571215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCAAAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTA 120

109571216 AGCATGTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCA 109571275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCATGTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCA 180

109571276 TGTTGGCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAA 109571335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTTGGCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAA 240

109571336 GTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAAC 109571395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAAC 300

109571396 ATTTTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACC 109571455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACC 360

109571456 ATCTTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTT 109571515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCTTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTT 420

109571516 GCCTTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTT 109571575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCTTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTT 480

109571576 CCTTTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTG 109571635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTTTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTG 540

109571636 TTCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTA 109571695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTA 600

109571696 GATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTG 109571755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTG 660

109571756 ATTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTAT 109571815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTAT 720

109571816 TTTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCA 109571875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCA 780

109571876 GTGGCTCATGGCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCA 109571935
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGGCTCATGGCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCA 840

109571936 GGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACA 109571995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACA 900

109571996 AATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGG 109572055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGG 960

109572056 TGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTC 109572115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTC 1020

109572116 TACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCA 109572175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCA 1080

109572176 GGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCA 109572235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCA 1140

109572236 GTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTA 109572295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTA 1200

109572296 AATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 109572331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 1236

EXCISED REGION

109572346 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 109572405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 1306

109572406 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 109572465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 1366

109572466 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 109572525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 1426

109572526 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 109572585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 1486

109572586 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 109572645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 1546

109572646 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 109572705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 1606

109572706 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 109572765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 1666

109572766 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 109572825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 1726

109572826 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 109572885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 1786

109572886 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 109572945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 1846

109572946 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 109573005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 1906

109573006 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 109573065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 1966

109573066 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 109573125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 2026

109573126 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 109573185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 2086

109573186 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 109573245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 2146

109573246 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 109573305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 2206

109573306 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 109573365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 2266

109573366 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 109573425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 2326

109573426 AACATGGCATTCAAAAAACTTTATGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 109573485
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 AACATGGCATTCAAAAAACTTTACGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 2386

109573486 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 109573545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 2446

109573546 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 109573605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 2506

109573606 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 109573665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 2566

109573666 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 109573725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 2626

109573726 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 109573785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 2686

109573786 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 109573845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 2746

109573846 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 109573905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 2806

109573906 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 109573965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 2866

109573966 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 109574025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 2926

109574026 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 109574085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 2986

109574086 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 109574145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 3046

109574146 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 109574205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 3106

109574206 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 109574265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 3166

109574266 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 109574325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 3226

109574326 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 109574385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 3286

109574386 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 109574445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||
     3287 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTC---TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 3343

109574446 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 109574505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 3403

109574506 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 109574565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 3463

109574566 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 109574625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 3523

109574626 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAG 109574685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAG 3583

109574686 TGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAG 109574745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 TGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAG 3643

109574746 GACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTT 109574805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 GACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTT 3703

109574806 AAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTG 109574865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 AAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTG 3763

109574866 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTG 109574892
          |||||||||||||||||||||||||||
     3764 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTG 3790

Alignment time is 4.96566 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5952] =>      5952 nucs 'mol-32-3332-017670_5952'

Score:        5876
Aligned:      5946        nucs
Identic:      5938 (100%) nucs =>      1218 (100%)      4720 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109571113,109572331] EXCISED REGION [109572346,109577072]
 second seq =>  [        1,     1219] EXCISED REGION [     1230,     5952]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        14 nucs [109572332,109572345]
 second seq =>        10 nucs [1220,1229]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [109572331,109572333] to [109572345,109572347]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109572331,109572331] to [109572346,109572346]
 second seq =>         1 nucs [1219,1219] to [1230,1230]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [109572332,109572333] to [109572344,109572345]
 second seq =>         0 nucs

109571113 ATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAACTTACTGA 109571172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAACTTACTGA 60

109571173 AAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATGTGCCAACACGC 109571232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATGTGCCAACACGC 120

109571233 CCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGATGGTC 109571292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGATGGTC 180

109571293 TTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 109571352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 240

109571353 ATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTTGAGGTTAATTT 109571412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTTGAGGTTAATTT 300

109571413 TAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATCTTCACCATTTTTAT 109571472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATCTTCACCATTTTTAT 360

109571473 GTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTTTCCTCTTTCCCT 109571532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTTTCCTCTTTCCCT 420

109571533 TCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTAAAAAGTAAGTT 109571592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTAAAAAGTAAGTT 480

109571593 TTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAATATAAGTA 109571652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAATATAAGTA 540

109571653 TGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACAATTAACATACA 109571712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACAATTAACATACA 600

109571713 CTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTACCATCTTAGTAAA 109571772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTACCATCTTAGTAAA 660

109571773 CCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAGAAATCTAAGAT 109571832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAGAAATCTAAGAT 720

109571833 TAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCTCATGGCTATAA 109571892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      721 TAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCTCATGGCTGTAA 780

109571893 TCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCC 109571952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCC 840

109571953 TGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGT 109572012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGT 900

109572013 GGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCA 109572072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCA 960

109572073 GGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAA 109572132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAA 1020

109572133 TTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAG 109572192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAG 1080

109572193 AAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGC 109572252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGC 1140

109572253 CACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAA 109572312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAA 1200

109572313 ATAAATAAATAAATAAATA 109572331
          |||||||||||||||||||
     1201 ATAAATAAATAAATAAATA 1219

EXCISED REGION

109572346 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 109572405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 1289

109572406 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 109572465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 1349

109572466 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 109572525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 1409

109572526 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 109572585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 1469

109572586 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 109572645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 1529

109572646 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 109572705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 1589

109572706 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 109572765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 1649

109572766 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 109572825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 1709

109572826 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 109572885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 1769

109572886 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 109572945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 1829

109572946 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 109573005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 1889

109573006 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 109573065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 1949

109573066 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 109573125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 2009

109573126 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 109573185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 2069

109573186 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 109573245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 2129

109573246 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 109573305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 2189

109573306 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 109573365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 2249

109573366 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 109573425
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 GCATCTTTTCCTTT-AAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 2308

109573426 AACATGGCATTCAAAAAACTTTATGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 109573485
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 AACATGGCATTCAAAAAACTTTACGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 2368

109573486 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 109573545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 2428

109573546 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 109573605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 2488

109573606 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 109573665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 2548

109573666 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 109573725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 2608

109573726 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 109573785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 2668

109573786 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 109573845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 2728

109573846 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 109573905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 2788

109573906 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 109573965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 2848

109573966 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 109574025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2849 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 2908

109574026 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 109574085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2909 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 2968

109574086 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 109574145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2969 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 3028

109574146 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 109574205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3029 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 3088

109574206 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 109574265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3089 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 3148

109574266 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 109574325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3149 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 3208

109574326 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 109574385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3209 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 3268

109574386 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 109574445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||
     3269 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTC---TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 3325

109574446 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 109574505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 3385

109574506 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 109574565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 3445

109574566 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 109574625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 3505

109574626 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAG 109574685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAG 3565

109574686 TGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAG 109574745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 TGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAG 3625

109574746 GACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTT 109574805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 GACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTT 3685

109574806 AAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTG 109574865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 AAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTG 3745

109574866 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGAT 109574925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGAT 3805

109574926 CGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAGAAGATTAGC 109574985
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3806 CCAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAGATTAGC 3865

109574986 CAGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGG 109575045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 CAGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGG 3925

109575046 CATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTG 109575105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 CATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTG 3985

109575106 GGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTC 109575165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 GGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTC 4045

109575166 AATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAA 109575225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 AATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAA 4105

109575226 ATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 109575285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 ATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 4165

109575286 AGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACC 109575345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 AGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACC 4225

109575346 CTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAG 109575405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 CTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAG 4285

109575406 CTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 109575465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 CTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 4345

109575466 CTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAA 109575525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 CTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAA 4405

109575526 AAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAA 109575585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 AAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAA 4465

109575586 GACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGC 109575645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 GACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGC 4525

109575646 AGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTC 109575705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 AGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTC 4585

109575706 AGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 109575765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 AGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 4645

109575766 ATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGA 109575825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 ATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGA 4705

109575826 GAATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTC 109575885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 GAATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTC 4765

109575886 CAGCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCT 109575945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 CAGCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCT 4825

109575946 AAATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCA 109576005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 AAATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCA 4885

109576006 GACGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATT 109576065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 GACGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATT 4945

109576066 TGTGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTC 109576125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 TGTGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTC 5005

109576126 CACACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAA 109576185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 CACACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAA 5065

109576186 GACCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTA 109576245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 GACCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTA 5125

109576246 AGAATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAG 109576305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 AGAATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAG 5185

109576306 GCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAA 109576365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 GCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAA 5245

109576366 CCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCC 109576425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 CCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCC 5305

109576426 AGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTG 109576485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 AGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTG 5365

109576486 AGCCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAA 109576545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 AGCCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAA 5425

109576546 AATAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATG 109576605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 AATAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATG 5485

109576606 AAATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTAT 109576665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 AAATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTAT 5545

109576666 TTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAA 109576725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 TTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAA 5605

109576726 CATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCC 109576785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 CATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCC 5665

109576786 TGGAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAG 109576845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 TGGAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAG 5725

109576846 GTTGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCC 109576905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 GTTGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCC 5785

109576906 ATCTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGC 109576965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 ATCTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGC 5845

109576966 CTGCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAA 109577025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 CTGCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAA 5905

109577026 TTAGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAAT 109577072
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 TTAGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAAT 5952

Alignment time is 7.30583 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3677] =>      3677 nucs 'mol-32-3395-035495_3677'

Score:        3645
Aligned:      3678        nucs
Identic:      3675 (100%) nucs =>      2213 (100%)      1462 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109571017,109573231] EXCISED REGION [109575181,109576643]
 second seq =>  [        1,     2214] EXCISED REGION [     2215,     3677]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1949 nucs [109573232,109575180]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109573232,109573232] to [109575181,109575181]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109571017 GGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTTAGTCTGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCC 109571076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTTAGTCTGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCC 60

109571077 ACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGA 109571136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGA 120

109571137 GGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGC 109571196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGC 180

109571197 AATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATGTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAG 109571256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATGTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAG 240

109571257 TAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCG 109571316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCG 300

109571317 CCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAA 109571376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAA 360

109571377 AAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAAT 109571436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAAT 420

109571437 AATACATATATAATTTACCATCTTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAAT 109571496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATACATATATAATTTACCATCTTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAAT 480

109571497 AAATCTATATTCCATCCTTGCCTTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAA 109571556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATCTATATTCCATCCTTGCCTTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAA 540

109571557 AAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACT 109571616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACT 600

109571617 AGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTA 109571676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTA 660

109571677 TTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTC 109571736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTC 720

109571737 TCTATGTGGACTCCTATTGATTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAA 109571796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTATGTGGACTCCTATTGATTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAA 780

109571797 GGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACA 109571856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACA 840

109571857 TAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCTCATGGCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGG 109571916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCTCATGGCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGG 900

109571917 CAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTC 109571976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTC 960

109571977 TCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCAC 109572036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCAC 1020

109572037 TTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAA 109572096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAA 1080

109572097 CATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGC 109572156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGC 1140

109572157 CTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAAC 109572216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAAC 1200

109572217 CTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACA 109572276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACA 1260

109572277 GAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAT 109572336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAT 1320

109572337 TTTTTTAAAAAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAG 109572396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTTTAAAAAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAG 1380

109572397 GCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACAC 109572456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACAC 1440

109572457 CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGA 109572516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     1441 CACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAA-GAAAGA 1499

109572517 AAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGAT 109572576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 AAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGAT 1559

109572577 ATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATAT 109572636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATAT 1619

109572637 GATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTC 109572696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTC 1679

109572697 GCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGC 109572756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGC 1739

109572757 CTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCA 109572816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCA 1799

109572817 CCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCT 109572876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCT 1859

109572877 GCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGC 109572936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGC 1919

109572937 ACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATA 109572996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 ACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATA 1979

109572997 AAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACT 109573056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 AAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACT 2039

109573057 TAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGG 109573116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGG 2099

109573117 TTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAA 109573176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAA 2159

109573177 AGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 109573231
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 2214

EXCISED REGION

109575181 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 109575240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 2274

109575241 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 109575300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 2334

109575301 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 109575360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 2394

109575361 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 109575420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 2454

109575421 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 109575480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2455 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCGC 2514

109575481 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 109575540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 2574

109575541 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 109575600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 2634

109575601 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 109575660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 2694

109575661 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 109575720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 2754

109575721 GCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAG 109575780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 GCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAG 2814

109575781 TGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCC 109575840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 TGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCC 2874

109575841 AGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAG 109575900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 AGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAG 2934

109575901 AATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCT 109575960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 AATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCT 2994

109575961 GGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCA 109576020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 GGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCA 3054

109576021 AAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTC 109576080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 AAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTC 3114

109576081 AACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAAT 109576140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 AACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAAT 3174

109576141 GAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCT 109576200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 GAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCT 3234

109576201 AGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGG 109576260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 AGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGG 3294

109576261 GACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGA 109576320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 GACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGA 3354

109576321 TCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAA 109576380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 TCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAA 3414

109576381 AAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 109576440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 AAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 3474

109576441 TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGC 109576500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGC 3534

109576501 CACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGA 109576560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 CACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGA 3594

109576561 AGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACA 109576620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 AGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACA 3654

109576621 AAAATGTTGGTGAAGCATGATGG 109576643
          |||||||||||||||||||||||
     3655 AAAATGTTGGTGAAGCATGATGG 3677

Alignment time is 4.70863 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3120] =>      3120 nucs 'mol-32-33a0-025081_3120'

Score:        3057
Aligned:      3105        nucs
Identic:      3099 (100%) nucs =>      1974 (100%)      1125 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109570356,109572331] EXCISED REGION [109572346,109573471]
 second seq =>  [        6,     1984] EXCISED REGION [     1995,     3120]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        14 nucs [109572332,109572345]
 second seq =>        10 nucs [1985,1994]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [109572331,109572333] to [109572345,109572347]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109572331,109572331] to [109572346,109572346]
 second seq =>         1 nucs [1984,1984] to [1995,1995]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [109572332,109572333] to [109572344,109572345]
 second seq =>         0 nucs

109570356 GGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGA 109570415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        6 GGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGA 65

109570416 TTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCTATATACATATTTTAAACATCTATTTCCTGTAA 109570475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       66 TTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCTATATACATATTTTAAACATCTATTTCCTGTAA 125

109570476 TCCTAGCTACTTTGGAAGGCTGAGGTGGGCAACATAGTGAGACCTTATCTCAAATAAATA 109570535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      126 TCCTAGCTACTTTGGAAGGCTGAGGTGGGCAACATAGTGAGACCTTATCTCAAATAAATA 185

109570536 AATAAATAACTATTCACCACAAAGTTAGAACTTTTCTCTAATTCAGGGAAACAGAATTCA 109570595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 AATAAATAACTATTCACCACAAAGTTAGAACTTTTCTCTAATTCAGGGAAACAGAATTCA 245

109570596 ATAATAATTACTTCTTCCCCTCTCCTCTGGGGGAGCTATAAATCTGCAAAAGATTTTAAC 109570655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 ATAATAATTACTTCTTCCCCTCTCCTCTGGGGGAGCTATAAATCTGCAAAAGATTTTAAC 305

109570656 AAGTTTAGGAACTACTAAAATTATCTTTTAAAATGAGATGCACATATAATCATAATATGT 109570715
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      306 AAGTTTAGGAACTACTAAAATTATCTTTTAAAATGAGATGCACATATAATCATAATACGT 365

109570716 GTTCAATAAATAAATATTAGCTGAATTAACTTGAGATGTAAAGTCACTGAAGAAATGTCT 109570775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 GTTCAATAAATAAATATTAGCTGAATTAACTTGAGATGTAAAGTCACTGAAGAAATGTCT 425

109570776 CTACAAAAGTACAGAACAGATGACTATGGTTTTGTTTGTTTGTCTGTTTTAGACAGGGTC 109570835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 CTACAAAAGTACAGAACAGATGACTATGGTTTTGTTTGTTTGTCTGTTTTAGACAGGGTC 485

109570836 TTACTCTGAGGCCCAGGCAGGAGTGCAGTGGCTGAATCATGGCTCACTGCAGCCTTGGCC 109570895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 TTACTCTGAGGCCCAGGCAGGAGTGCAGTGGCTGAATCATGGCTCACTGCAGCCTTGGCC 545

109570896 TTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCATGT 109570955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 TTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCATGT 605

109570956 GCCACTGGGCCCAGCTAATTTTTGTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---GTAGAG 109571012
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||
      606 GCCACTGGGCCCAGCTAATTTTTGTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAG 665

109571013 ATTGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTTAGTCTGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCA 109571072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 ATTGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTTAGTCTGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCA 725

109571073 ATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCC 109571132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 ATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCC 785

109571133 CAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTG 109571192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 CAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTG 845

109571193 AAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATGTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCT 109571252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 AAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATGTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCT 905

109571253 TTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCA 109571312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 TTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCA 965

109571313 TCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCC 109571372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 TCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCC 1025

109571373 TTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATT 109571432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 TTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATT 1085

109571433 TAATAATACATATATAATTTACCATCTTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAAT 109571492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 TAATAATACATATATAATTTACCATCTTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAAT 1145

109571493 AAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATC 109571552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 AAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATC 1205

109571553 ACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCA 109571612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 ACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCA 1265

109571613 GACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAA 109571672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 GACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAA 1325

109571673 GGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGG 109571732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 GGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGG 1385

109571733 GGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTAT 109571792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 GGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTAT 1445

109571793 TAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAA 109571852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 TAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAA 1505

109571853 TACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCTCATGGCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCC 109571912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1506 TACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCTCATGGCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCC 1565

109571913 GAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCC 109571972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 GAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCC 1625

109571973 CGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCA 109572032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 CGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCA 1685

109572033 GCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGG 109572092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 GCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGG 1745

109572093 CCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGC 109572152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 CCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGC 1805

109572153 ATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTT 109572212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 ATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTT 1865

109572213 GAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGT 109572272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 GAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGT 1925

109572273 GACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 109572331
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 GACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 1984

EXCISED REGION

109572346 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 109572405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 2054

109572406 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 109572465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 2114

109572466 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 109572525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 2174

109572526 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 109572585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 2234

109572586 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 109572645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 2294

109572646 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 109572705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 2354

109572706 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 109572765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 2414

109572766 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 109572825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 2474

109572826 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 109572885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 2534

109572886 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 109572945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 2594

109572946 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 109573005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 2654

109573006 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 109573065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 2714

109573066 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 109573125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 2774

109573126 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 109573185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 2834

109573186 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 109573245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 2894

109573246 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 109573305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 2954

109573306 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 109573365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 3014

109573366 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 109573425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 3074

109573426 AACATGGCATTCAAAAAACTTTATGTTGCTGCCAGGTCATTTAATT 109573471
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3075 AACATGGCATTCAAAAAACTTTACGTTGCTGCCAGGTCATTTAATT 3120

Alignment time is 4.18464 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5304] =>      5304 nucs 'mol-32-33a0-027042_5304'

Score:        5230
Aligned:      5298        nucs
Identic:      5291 (100%) nucs =>       195 (100%)      5096 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109572137,109572331] EXCISED REGION [109572346,109577448]
 second seq =>  [        1,      195] EXCISED REGION [      206,     5304]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        14 nucs [109572332,109572345]
 second seq =>        10 nucs [196,205]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [109572331,109572333] to [109572345,109572347]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109572331,109572331] to [109572346,109572346]
 second seq =>         1 nucs [195,195] to [206,206]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [109572332,109572333] to [109572344,109572345]
 second seq =>         0 nucs

109572137 CCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAAT 109572196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAAT 60

109572197 CACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACT 109572256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACT 120

109572257 GTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAA 109572316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAA 180

109572317 ATAAATAAATAAATA 109572331
          |||||||||||||||
      181 ATAAATAAATAAATA 195

EXCISED REGION

109572346 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 109572405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      206 AAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA 265

109572406 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 109572465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      266 GAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACT 325

109572466 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 109572525
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      326 CCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTC-AAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAA 384

109572526 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 109572585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 AATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAA 444

109572586 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 109572645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 CTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATT 504

109572646 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 109572705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      505 AAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGAT 564

109572706 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 109572765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 CTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAG 624

109572766 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 109572825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 AGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCT 684

109572826 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 109572885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 TTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTA 744

109572886 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 109572945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 CAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGC 804

109572946 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 109573005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 ACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAA 864

109573006 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 109573065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 AATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACAC 924

109573066 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 109573125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 ATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAA 984

109573126 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 109573185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 CTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCAT 1044

109573186 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 109573245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 TAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACA 1104

109573246 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 109573305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 GAGTGCCTAACATGGAACAATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGAC 1164

109573306 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 109573365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 AAGAAGATGAAGTGTCATGAAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACT 1224

109573366 GCATCTTTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 109573425
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 GCATCTTTTCCTTT-AAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAAT 1283

109573426 AACATGGCATTCAAAAAACTTTATGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 109573485
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 AACATGGCATTCAAAAAACTTTACGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGAC 1343

109573486 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 109573545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 CTGCAGGAATATATATGTGATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCA 1403

109573546 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 109573605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 TTCATAAAGTAAGGGGATTCGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAAT 1463

109573606 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 109573665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 TTGCTTTAACTTACATTTCAATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATAT 1523

109573666 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 109573725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 ATAGAAAATATAAAGTCCGGGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAA 1583

109573726 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 109573785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 GAAGAAACAAAATAGATTTGCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTT 1643

109573786 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 109573845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 CTAACCAAAGCTCTGTCATGTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACG 1703

109573846 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 109573905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 TGCCCCTGCTTACTGTTGACAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTG 1763

109573906 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 109573965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 GAACTGTGAATGATTTTTGGCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTA 1823

109573966 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 109574025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 TATAACTATAAAAAGAAACTAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCT 1883

109574026 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 109574085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 GGAAAAAAATATAAGAAATTGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGA 1943

109574086 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 109574145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 ATAGAAATGGAATCTGTACAACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAA 2003

109574146 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 109574205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 CCTGTACATGTACCCCTGAACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTT 2063

109574206 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 109574265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 TTGAATTTTGTACCATGGACAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATA 2123

109574266 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 109574325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 AATAACAAATTTACATTTGCAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGA 2183

109574326 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 109574385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 AGTAATAATATTTCAAAGGAATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGA 2243

109574386 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 109574445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
     2244 TCTGATTTGAATATCATTTCAATCTTTCTTTC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACA 2301

109574446 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 109574505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 GGGTCTTGCTCTCAACACCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCT 2361

109574506 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 109574565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 TGACCACCTGAGCTGAAGAGATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGG 2421

109574566 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 109574625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 CATGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGT 2481

109574626 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAG 109574685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 TGCTCAGGCTGGTCTCCCACTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAG 2541

109574686 TGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAG 109574745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 TGCTGAGAACGCAGGCATAAGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAG 2601

109574746 GACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTT 109574805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 GACTAAGGTATGTGTGTTCTTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTT 2661

109574806 AAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTG 109574865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 AAAATTACTGAAGTACTAACAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTG 2721

109574866 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGAT 109574925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 GCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGAT 2781

109574926 CGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAGAAGATTAGC 109574985
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2782 CCAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAGATTAGC 2841

109574986 CAGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGG 109575045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 CAGGCGTGGTGACGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGG 2901

109575046 CATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTG 109575105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 CATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTG 2961

109575106 GGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTC 109575165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 GGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTC 3021

109575166 AATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAA 109575225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 AATTAAGTCATGTAATGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAA 3081

109575226 ATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 109575285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 ATGTAAAATGTAGACCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 3141

109575286 AGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACC 109575345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 AGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACC 3201

109575346 CTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAG 109575405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 CTGTCTCTACTAAAAATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAG 3261

109575406 CTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 109575465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 CTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 3321

109575466 CTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAA 109575525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 CTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAA 3381

109575526 AAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAA 109575585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 AAATTACAAAACGTAAATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAA 3441

109575586 GACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGC 109575645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 GACAAGGCACAAAGTAGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGC 3501

109575646 AGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTC 109575705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 AGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTC 3561

109575706 AGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 109575765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 AGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAA 3621

109575766 ATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGA 109575825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 ATTAGCTGGGCACAGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGA 3681

109575826 GAATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTC 109575885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 GAATCACTTGAACCCAGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTC 3741

109575886 CAGCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCT 109575945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 CAGCTTGGGCGACAGAATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCT 3801

109575946 AAATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCA 109576005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 AAATGGTTATTATCTGGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCA 3861

109576006 GACGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATT 109576065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 GACGAAAAATGAGCAAAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATT 3921

109576066 TGTGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTC 109576125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 TGTGAAAAGATGCTCAACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTC 3981

109576126 CACACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAA 109576185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 CACACACAGTAAAATGAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAA 4041

109576186 GACCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTA 109576245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 GACCCGATAATATCTAGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTA 4101

109576246 AGAATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAG 109576305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 AGAATGTAAACTGGGGACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAG 4161

109576306 GCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAA 109576365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 GCCAAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAA 4221

109576366 CCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCC 109576425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4222 CCCTGTCTCTACTAAAAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCC 4281

109576426 AGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTG 109576485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 AGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTG 4341

109576486 AGCCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAA 109576545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 AGCCGAGATCCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAA 4401

109576546 AATAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATG 109576605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 AATAAAAGTAAAAGAAGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATG 4461

109576606 AAATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTAT 109576665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 AAATTTTTACCTACAAAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTAT 4521

109576666 TTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAA 109576725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 TTTGGGAGGCCGAAGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAA 4581

109576726 CATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCC 109576785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 CATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTCGTGGCACATGCC 4641

109576786 TGGAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAG 109576845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 TGGAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGTAGAATCACCTGAACCCAGGAGGCGGAG 4701

109576846 GTTGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCC 109576905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 GTTGCAGTGAGCTGGGATCACGCCATTGCCCTCTGGCCTAGGCAACAAAAGTGAAACTCC 4761

109576906 ATCTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGC 109576965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 ATCTCAAATAAATAAACTTAAATGTAGACTACCCAATTCCAATTCTTATAGAAACCTAGC 4821

109576966 CTGCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAA 109577025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 CTGCAAAAATACTTGCAAATAAAAAATGTTCCCTGAAAATTTATTTGTAATAGAGAAAAA 4881

109577026 TTAGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCA 109577085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4882 TTAGAAATAAACTGAACTGTCCTTAATAGCAGAATTGGTAAATAAATTATGGTAAATTCA 4941

109577086 TACTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGT 109577145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4942 TACTATAAAACAGGGGTCCCCAACCCCCAGGACACAGACCAATACTGATCCACAGCCTGT 5001

109577146 TAGGAACTGAGCTGCACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGT 109577205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5002 TAGGAACTGAGCTGCACAGCAGGAGGTGAGCTGCAGACAAGGGAGCATTACTGTCTGAGT 5061

109577206 CCCGCTCCTGTTAGATCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATAT 109577265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5062 CCCGCTCCTGTTAGATCAGCAGTGGCATTAGATTCTCATAGGAGCACGGACCCTACATAT 5121

109577266 GAGGGATCTAAACTGCAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAAT 109577325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5122 GAGGGATCTAAACTGCAGTCTCCTTATGTGAATCTAATGCCTGTTGATCTGAGGTAGAAT 5181

109577326 GGTTTCCACCTCACCCCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAAC 109577385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5182 GGTTTCCACCTCACCCCTGGTCTGTGGAAAAATTTTCTTCTAGGAAGACAGTAAACCAAC 5241

109577386 CAGTACCTGGTGCCAAAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTA 109577445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5242 CAGTACCTGGTGCCAAAAGGGCTGAGGACTGTTGCTATAGAATACTAACACAGTGACGTA 5301

109577446 TAT 109577448
          |||
     5302 TAT 5304

Alignment time is 6.48149 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5958] =>      5958 nucs 'mol-32-340e-114878_5958'

Score:        5880
Aligned:      5961        nucs
Identic:      5952 (100%) nucs =>      5741 (100%)       211 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109567485,109573231] EXCISED REGION [109575181,109575391]
 second seq =>  [        1,     5747] EXCISED REGION [     5748,     5958]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1949 nucs [109573232,109575180]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109573232,109573232] to [109575181,109575181]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109567485 ACGCCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGCAGGAGGATCGCTTGAGCCCAGAAGT 109567544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACGCCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGCAGGAGGATCGCTTGAGCCCAGAAGT 60

109567545 TAGAAGTTACATACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCACACCTCTGAACAACAGAGGAA 109567604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGAAGTTACATACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCACACCTCTGAACAACAGAGGAA 120

109567605 GACCATGTCTCTAAACAAAACAAAACAAAAAATATATGTAGGCCCACAGGTTAGTGTTGT 109567664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACCATGTCTCTAAACAAAACAAAACAAAAAATATATGTAGGCCCACAGGTTAGTGTTGT 180

109567665 TTCCATTTCTTTACTTTTGGGTTGATTTTTTTGTTTATAACAAGAAATGCAAATGTCTAG 109567724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCCATTTCTTTACTTTTGGGTTGATTTTTTTGTTTATAACAAGAAATGCAAATGTCTAG 240

109567725 CAGACTAGAATGCTCTCATCAGCAGATGAGTACATTTTCTCCCTCAGCTAGAGGCCTGGG 109567784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGACTAGAATGCTCTCATCAGCAGATGAGTACATTTTCTCCCTCAGCTAGAGGCCTGGG 300

109567785 CATGGTGGCTCACACCTGTAGTTCCAGCACTTTGAGAGGTCGAGGTGGGAGGATCACATG 109567844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATGGTGGCTCACACCTGTAGTTCCAGCACTTTGAGAGGTCGAGGTGGGAGGATCACATG 360

109567845 AGCCCAGGAGTGCGAGACAAGCCTGGGCAACATGGCGAAACATGGTCTCTACCAAAAATA 109567904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCCCAGGAGTGCGAGACAAGCCTGGGCAACATGGCGAAACATGGTCTCTACCAAAAATA 420

109567905 TAACAATCAGCCAGCATGTGTGCCTGTAGTTCCAGTTACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAAG 109567964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAACAATCAGCCAGCATGTGTGCCTGTAGTTCCAGTTACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAAG 480

109567965 ATCACTGGAGCCCCAGAAGTTGAGGCTACAGTGAGCGGTGATCATACCACTGCACTCCAG 109568024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCACTGGAGCCCCAGAAGTTGAGGCTACAGTGAGCGGTGATCATACCACTGCACTCCAG 540

109568025 CCTGGGCGGTAGCGTGAGACTCTGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGGCTGGGCA 109568084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
      541 CCTGGGCGGTAGCGTGAGACTCTGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-GAAGGCTGGGCA 599

109568085 CAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGTGGATTATGAGAT 109568144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 CAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGTGGATTATGAGAT 659

109568145 CAGGAGTTTGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCACCTCTACTAAAAATACAAA 109568204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CAGGAGTTTGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCACCTCTACTAAAAATACAAA 719

109568205 AATTAGCGGAGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGG 109568264
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 AATTAGCAGAGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGG 779

109568265 AGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTC 109568324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 AGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTC 839

109568325 CAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACTCCATCTCGGAAAAAGAAAAAAAAACTAACAAATAAA 109568384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACTCCATCTCGGAAAAAGAAAAAAAAACTAACAAATAAA 899

109568385 AAAAAGTGGCGCTAGGGTAAACAAGGGACAAACCACAGAAAAATAATTATACGACTCACT 109568444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AAAAAGTGGCGCTAGGGTAAACAAGGGACAAACCACAGAAAAATAATTATACGACTCACT 959

109568445 CAAATATTTAATGACATCAGACTACACAAATCCCTCTGCAGAGTAAGAATATGTCTGTCT 109568504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CAAATATTTAATGACATCAGACTACACAAATCCCTCTGCAGAGTAAGAATATGTCTGTCT 1019

109568505 CAGGAAACAGTAAATCACAAACTTATCTCCCAACACACCAGCTACCCAACTCCGCATGCT 109568564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CAGGAAACAGTAAATCACAAACTTATCTCCCAACACACCAGCTACCCAACTCCGCATGCT 1079

109568565 TTAGGTTTCCCTTTCCTATCTTCTGAGCTGACCACCATCCTCCTGTTCACAGACTTCGTC 109568624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TTAGGTTTCCCTTTCCTATCTTCTGAGCTGACCACCATCCTCCTGTTCACAGACTTCGTC 1139

109568625 CAAAAGAGGATACGGTAAAATAAGTTAAGATTTCCACTCACTAAATTCTTTTTTTTTTTT 109568684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CAAAAGAGGATACGGTAAAATAAGTTAAGATTTCCACTCACTAAATTCTTTTTTTTTTTT 1199

109568685 TAAAGACAGGGTCTTGCTCTGTCACCTAGGTTAGAGTGCAGTTGCATGACCATGGCCCAC 109568744
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 -AAAGACAGGGTCTTGCTCTGTCACCTAGGTTAGAGTGCAGTTGCATGACCATGGCCCAC 1258

109568745 TGCAGCCTTGACCTCCCAGGCTCAAGTGATCCTCCCGCTTCAGCCTTCCAAGTACCTGGG 109568804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 TGCAGCCTTGACCTCCCAGGCTCAAGTGATCCTCCCGCTTCAGCCTTCCAAGTACCTGGG 1318

109568805 ATGACAGGTGTGTGCCACCGTACCCAGCTAATTTTTTATTTTACTTTTTGTAGAGACGGG 109568864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 ATGACAGGTGTGTGCCACCGTACCCAGCTAATTTTTTATTTTACTTTTTGTAGAGACGGG 1378

109568865 ATCTACCTATGTTGCCTAGGCTGCTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCTCGCCTC 109568924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 ATCTACCTATGTTGCCTAGGCTGCTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCTCGCCTC 1438

109568925 GGCATCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGGATGAGCCACCGTGCCCACCTTTTTTTTTTTTT 109568984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     1439 GGCATCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGGATGAGCCACCGTGCCCACCTTTTTTTTTTTT- 1497

109568985 CAGGTTATCCGTGGAAACTACTCATTAAATTCTGATCATATCAGAACTGTCTCCCTAATA 109569044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 CAGGTTATCCGTGGAAACTACTCATTAAATTCTGATCATATCAGAACTGTCTCCCTAATA 1557

109569045 TTATTCTTAGAGCACACTGATTAGTGATTTTAGCATTCCTCAAATCTTTAGACAATTCTT 109569104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TTATTCTTAGAGCACACTGATTAGTGATTTTAGCATTCCTCAAATCTTTAGACAATTCTT 1617

109569105 TTTTTTATTTTTACTGCTCCTTGCAGAGCAGGCTACCCAATAGGCAGTGTGCCCAGAGTA 109569164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TTTTTTATTTTTACTGCTCCTTGCAGAGCAGGCTACCCAATAGGCAGTGTGCCCAGAGTA 1677

109569165 GCCCTTCAGGTAATTCTTACTAGCAAAAAAATGGCTTTTACTAATTTAACTCTCAGAAAA 109569224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 GCCCTTCAGGTAATTCTTACTAGCAAAAAAATGGCTTTTACTAATTTAACTCTCAGAAAA 1737

109569225 AAATATTCCCTCCTCTGTAGGTTCTTAGAGGGCACATCACATATATCTCCATGTACCAAC 109569284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 AAATATTCCCTCCTCTGTAGGTTCTTAGAGGGCACATCACATATATCTCCATGTACCAAC 1797

109569285 CACACAAACTTAATGCACAATTGGGACTATAATTTTCTAATATAGCTCAATATACCAATG 109569344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 CACACAAACTTAATGCACAATTGGGACTATAATTTTCTAATATAGCTCAATATACCAATG 1857

109569345 ATACTAAACATTGTATAGGCTTCATATTCAACATTCAATCTAAATATCAGTCCAGATATA 109569404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 ATACTAAACATTGTATAGGCTTCATATTCAACATTCAATCTAAATATCAGTCCAGATATA 1917

109569405 AAGTTACTCTGAATGGAATTTATGGCAATAGTCCCACTTTAAATAATAACTACAAGTTTA 109569464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 AAGTTACTCTGAATGGAATTTATGGCAATAGTCCCACTTTAAATAATAACTACAAGTTTA 1977

109569465 ATGTTGCAGTCATTTTTGGTTAATAAAGCCTAAGAGAACTACATTCTTACAAATACATAT 109569524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 ATGTTGCAGTCATTTTTGGTTAATAAAGCCTAAGAGAACTACATTCTTACAAATACATAT 2037

109569525 TTTATACTGACAGTTGAAGGTAACAGAAAATATGTCCTAATTAACTTAAAATTGGTTCAA 109569584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TTTATACTGACAGTTGAAGGTAACAGAAAATATGTCCTAATTAACTTAAAATTGGTTCAA 2097

109569585 GTTTTCTTTTTAAAAAAAAACTAATTAAAAAAAGACAAGTTTTAATTCTATACCTTGAAA 109569644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 GTTTTCTTTTTAAAAAAAAACTAATTAAAAAAAGACAAGTTTTAATTCTATACCTTGAAA 2157

109569645 TTCCCAGTAGAATAATATATTTTAATCACCCAACACAGAATTTTTTTTTTTTAAGGCAGA 109569704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TTCCCAGTAGAATAATATATTTTAATCACCCAACACAGAATTTTTTTTTTTTAAGGCAGA 2217

109569705 GTCTCCCTCTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGCAATCTCGGCTGGCTGCAACCTCCGC 109569764
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 GTCTCGCTCTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGCAATCTCGGCTGGCTGCAACCTCCGC 2277

109569765 CTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGCGTG 109569824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 CTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGCGTG 2337

109569825 CACTTACACAACCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATGTTTG 109569884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 CACTTACACAACCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATGTTTG 2397

109569885 CCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGC 109569944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 CCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGC 2457

109569945 TGGGATTACAGGCGTGAGCCACCAAGCCTGGCCCAGAATTTTAATTCTTATAAGCTTCAC 109570004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 TGGGATTACAGGCGTGAGCCACCAAGCCTGGCCCAGAATTTTAATTCTTATAAGCTTCAC 2517

109570005 TGTTGCTGAATACAGTATAAATATAGGCATAGGCACATGCTTGATGACTATATCTTAGAA 109570064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 TGTTGCTGAATACAGTATAAATATAGGCATAGGCACATGCTTGATGACTATATCTTAGAA 2577

109570065 TTATTCTCTTCTAACTCCCTTGTATTACTGAAACATTTATACAGGCTCCCAAAATCTTAC 109570124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 TTATTCTCTTCTAACTCCCTTGTATTACTGAAACATTTATACAGGCTCCCAAAATCTTAC 2637

109570125 CTCTGTAAGTGATATATACTGCATACTTTTTTTTTCCCCCAGATGGAGTCTTGCTCTGTC 109570184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 CTCTGTAAGTGATATATACTGCATACTTTTTTTTTCCCCCAGATGGAGTCTTGCTCTGTC 2697

109570185 ACCCAGGCAAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGTTTACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTC 109570244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 ACCCAGGCAAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGTTTACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTC 2757

109570245 AAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATCACAGGTGCCTGCCACCACGC 109570304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 AAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATCACAGGTGCCTGCCACCACGC 2817

109570305 CCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATCTTGGCAGGGCTGGTCT 109570364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 CCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATCTTGGCAGGGCTGGTCT 2877

109570365 TGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCA 109570424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCA 2937

109570425 TGAGCCACCATGCCCAGCTATATACATATTTTAAACATCTATTTCCTGTAATCCTAGCTA 109570484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TGAGCCACCATGCCCAGCTATATACATATTTTAAACATCTATTTCCTGTAATCCTAGCTA 2997

109570485 CTTTGGAAGGCTGAGGTGGGCAACATAGTGAGACCTTATCTCAAATAAATAAATAAATAA 109570544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 CTTTGGAAGGCTGAGGTGGGCAACATAGTGAGACCTTATCTCAAATAAATAAATAAATAA 3057

109570545 CTATTCACCACAAAGTTAGAACTTTTCTCTAATTCAGGGAAACAGAATTCAATAATAATT 109570604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 CTATTCACCACAAAGTTAGAACTTTTCTCTAATTCAGGGAAACAGAATTCAATAATAATT 3117

109570605 ACTTCTTCCCCTCTCCTCTGGGGGAGCTATAAATCTGCAAAAGATTTTAACAAGTTTAGG 109570664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 ACTTCTTCCCCTCTCCTCTGGGGGAGCTATAAATCTGCAAAAGATTTTAACAAGTTTAGG 3177

109570665 AACTACTAAAATTATCTTTTAAAATGAGATGCACATATAATCATAATATGTGTTCAATAA 109570724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 AACTACTAAAATTATCTTTTAAAATGAGATGCACATATAATCATAATATGTGTTCAATAA 3237

109570725 ATAAATATTAGCTGAATTAACTTGAGATGTAAAGTCACTGAAGAAATGTCTCTACAAAAG 109570784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 ATAAATATTAGCTGAATTAACTTGAGATGTAAAGTCACTGAAGAAATGTCTCTACAAAAG 3297

109570785 TACAGAACAGATGACTATGGTTTTGTTTGTTTGTCTGTTTTAGACAGGGTCTTACTCTGA 109570844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TACAGAACAGATGACTATGGTTTTGTTTGTTTGTCTGTTTTAGACAGGGTCTTACTCTGA 3357

109570845 GGCCCAGGCAGGAGTGCAGTGGCTGAATCATGGCTCACTGCAGCCTTGGCCTTCTGGGCT 109570904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GGCCCAGGCAGGAGTGCAGTGGCTGAATCATGGCTCACTGCAGCCTTGGCCTTCTGGGCT 3417

109570905 CAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCATGTGCCACTGGG 109570964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCATGTGCCACTGGG 3477

109570965 CCCAGCTAATTTTTGTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---GTAGAGATTGGGTTT 109571021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||
     3478 CCCAGCTAATTTTTGTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATTGGGTTT 3537

109571022 CGCCATGTTGCCCAGGCTTAGTCTGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCG 109571081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 CGCCATGTTGCCCAGGCTTAGTCTGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCG 3597

109571082 CCTCGACCTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACT 109571141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 CCTCGACCTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACT 3657

109571142 TTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCC 109571201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 TTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAACTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCC 3717

109571202 AGCTATTTAGCCTAAGCATGTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAG 109571261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 AGCTATTTAGCCTAAGCATGTGCCAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAG 3777

109571262 GTGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGC 109571321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 GTGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGC 3837

109571322 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAAC 109571381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAAC 3897

109571382 TTTTTTTAAAAAACATTTTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATAC 109571441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 TTTTTTTAAAAAACATTTTTGAGGTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATAC 3957

109571442 ATATATAATTTACCATCTTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATC 109571501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 ATATATAATTTACCATCTTCACCATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATC 4017

109571502 TATATTCCATCCTTGCCTTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATG 109571561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 TATATTCCATCCTTGCCTTTCCTCTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATG 4077

109571562 TAATTGTGAATTTTCCTTTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTA 109571621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 TAATTGTGAATTTTCCTTTAAAAAGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTA 4137

109571622 AAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAG 109571681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 AAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAATATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAG 4197

109571682 TATTTTAGTCCTTAGATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTAT 109571741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 TATTTTAGTCCTTAGATACAATTAACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTAT 4257

109571742 GTGGACTCCTATTGATTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTT 109571801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 GTGGACTCCTATTGATTACCATCTTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTT 4317

109571802 AGAAATAAAATTATTTTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGA 109571861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 AGAAATAAAATTATTTTTAGAAATCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGA 4377

109571862 AACTGCCGGGCGCAGTGGCTCATGGCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGT 109571921
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 AACTGCCGGGCGCAGTGGCTCATGGCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGT 4437

109571922 GGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTAC 109571981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 GGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTAC 4497

109571982 TAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGG 109572041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 TAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGG 4557

109572042 GAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGA 109572101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 GAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGA 4617

109572102 TAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTG 109572161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 TAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTG 4677

109572162 GTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGG 109572221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 GTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGG 4737

109572222 AGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCG 109572281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 AGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCG 4797

109572282 AGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTT 109572341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 AGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTT 4857

109572342 TAAAAAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGA 109572401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 TAAAAAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGA 4917

109572402 GGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTG 109572461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 GGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTG 4977

109572462 CACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAA 109572521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 CACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAA 5037

109572522 AGAAAATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGA 109572581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 AGAAAATATTCTAGTAATAAAAATATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGA 5097

109572582 AAAACTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTT 109572641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 AAAACTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTT 5157

109572642 AATTAAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAA 109572701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 AATTAAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAA 5217

109572702 AGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGT 109572761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 AGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGT 5277

109572762 GCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACG 109572821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 GCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACG 5337

109572822 GTCTTTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAG 109572881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 GTCTTTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAG 5397

109572882 CCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAA 109572941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 CCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAA 5457

109572942 AAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAAT 109573001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 AAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAAT 5517

109573002 AAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAAC 109573061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 AAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAAC 5577

109573062 ACACATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAG 109573121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 ACACATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAG 5637

109573122 AGAACTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCT 109573181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 AGAACTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCT 5697

109573182 CCATTAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 109573231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 CCATTAATCTGCAATTCCATCTCACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 5747

EXCISED REGION

109575181 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 109575240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5748 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 5807

109575241 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 109575300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5808 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 5867

109575301 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 109575360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5868 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 5927

109575361 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGT 109575391
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     5928 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGT 5958

Alignment time is 7.59549 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     6876] =>      6876 nucs 'mol-32-3419-137469_6876'

Score:        6791
Aligned:      6880        nucs
Identic:      6867 (100%) nucs =>      5290 (100%)      1577 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109567934,109573231] EXCISED REGION [109575181,109576757]
 second seq =>  [        1,     5299] EXCISED REGION [     5300,     6876]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1949 nucs [109573232,109575180]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109573232,109573232] to [109575181,109575181]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109567934 TTCCAGTTACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAAGATCACTGGAGCCCCAGAAGTTGAGGCTAC 109567993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCCAGTTACTCAGGAGGCTGAGGTGGAAAGATCACTGGAGCCCCAGAAGTTGAGGCTAC 60

109567994 AGTGAGCGGTGATCATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGGTAGCGTGAGACTCTGCCTCA 109568053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTGAGCGGTGATCATACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGGTAGCGTGAGACTCTGCCTCA 120

109568054 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGGCTGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACT 109568113
          ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAAAAAAAAAAAAA---GAAGGCTGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACT 177

109568114 TTGGGAGGCTGAGACGGGTGGATTATGAGATCAGGAGTTTGAGGCCAGCCTGGCCAACAT 109568173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      178 TTGGGAGGCTGAGACGGGTGGATTATGAGATCAGGAGTTTGAGGCCAGCCTGGCCAACAT 237

109568174 GGTGAAACCCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCGGAGCGTGGTGGCACGCACCTG 109568233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      238 GGTGAAACCCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCAGAGCGTGGTGGCACGCACCTG 297

109568234 TAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGT 109568293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 TAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGT 357

109568294 TGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACTCCATC 109568353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 TGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACTCCATC 417

109568354 TCGGAAAAAGAAAAAAAAACTAACAAATAAAAAAAAGTGGCGCTAGGGTAAACAAGGGAC 109568413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 TCGGAAAAAGAAAAAAAAACTAACAAATAAAAAAAAGTGGCGCTAGGGTAAACAAGGGAC 477

109568414 AAACCACAGAAAAATAATTATACGACTCACTCAAATATTTAATGACATCAGACTACACAA 109568473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 AAACCACAGAAAAATAATTATACGACTCACTCAAATATTTAATGACATCAGACTACACAA 537

109568474 ATCCCTCTGCAGAGTAAGAATATGTCTGTCTCAGGAAACAGTAAATCACAAACTTATCTC 109568533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 ATCCCTCTGCAGAGTAAGAATATGTCTGTCTCAGGAAACAGTAAATCACAAACTTATCTC 597

109568534 CCAACACACCAGCTACCCAACTCCGCATGCTTTAGGTTTCCCTTTCCTATCTTCTGAGCT 109568593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 CCAACACACCAGCTACCCAACTCCGCATGCTTTAGGTTTCCCTTTCCTATCTTCTGAGCT 657

109568594 GACCACCATCCTCCTGTTCACAGACTTCGTCCAAAAGAGGATACGGTAAAATAAGTTAAG 109568653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 GACCACCATCCTCCTGTTCACAGACTTCGTCCAAAAGAGGATACGGTAAAATAAGTTAAG 717

109568654 ATTTCCACTCACTAAATTCTTTTTTTTTTTTTAAAGACAGGGTCTTGCTCTGTCACCTAG 109568713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 ATTTCCACTCACTAAATTCTTTTTTTTTTTTTAAAGACAGGGTCTTGCTCTGTCACCTAG 777

109568714 GTTAGAGTGCAGTTGCATGACCATGGCCCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCTCAAGTGA 109568773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 GTTAGAGTGCAGTTGCATGACCATGGCCCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCTCAAGTGA 837

109568774 TCCTCCCGCTTCAGCCTTCCAAGTACCTGGGATGACAGGTGTGTGCCACCGTACCCAGCT 109568833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 TCCTCCCGCTTCAGCCTTCCAAGTACCTGGGATGACAGGTGTGTGCCACCGTACCCAGCT 897

109568834 AATTTTTTATTTTACTTTTTGTAGAGACGGGATCTACCTATGTTGCCTAGGCTGCTCTCG 109568893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 AATTTTTTATTTTACTTTTTGTAGAGACGGGATCTACCTATGTTGCCTAGGCTGCTCTCG 957

109568894 AACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCTCGCCTCGGCATCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGGA 109568953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 AACTCCTGGGCTCAAGCAATCCTCTCGCCTCGGCATCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGGA 1017

109568954 TGAGCCACCGTGCCCACCTTTTTTTTTTTTTCAGGTTATCCGTGGAAACTACTCATTAAA 109569013
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     1018 TGAGCCACCGTGCCCACCTTTTTTTTTTTT-CAGGTTATCCGTGGAAACTACTCATTAAA 1076

109569014 TTCTGATCATATCAGAACTGTCTCCCTAATATTATTCTTAGAGCACACTGATTAGTGATT 109569073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 TTCTGATCATATCAGAACTGTCTCCCTAATATTATTCTTAGAGCACACTGATTAGTGATT 1136

109569074 TTAGCATTCCTCAAATCTTTAGACAATTCTTTTTTTTATTTTTACTGCTCCTTGCAGAGC 109569133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 TTAGCATTCCTCAAATCTTTAGACAATTCTTTTTTTTATTTTTACTGCTCCTTGCAGAGC 1196

109569134 AGGCTACCCAATAGGCAGTGTGCCCAGAGTAGCCCTTCAGGTAATTCTTACTAGCAAAAA 109569193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 AGGCTACCCAATAGGCAGTGTGCCCAGAGTAGCCCTTCAGGTAATTCTTACTAGCAAAAA 1256

109569194 AATGGCTTTTACTAATTTAACTCTCAGAAAAAAATATTCCCTCCTCTGTAGGTTCTTAGA 109569253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 AATGGCTTTTACTAATTTAACTCTCAGAAAAAAATATTCCCTCCTCTGTAGGTTCTTAGA 1316

109569254 GGGCACATCACATATATCTCCATGTACCAACCACACAAACTTAATGCACAATTGGGACTA 109569313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 GGGCACATCACATATATCTCCATGTACCAACCACACAAACTTAATGCACAATTGGGACTA 1376

109569314 TAATTTTCTAATATAGCTCAATATACCAATGATACTAAACATTGTATAGGCTTCATATTC 109569373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TAATTTTCTAATATAGCTCAATATACCAATGATACTAAACATTGTATAGGCTTCATATTC 1436

109569374 AACATTCAATCTAAATATCAGTCCAGATATAAAGTTACTCTGAATGGAATTTATGGCAAT 109569433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 AACATTCAATCTAAATATCAGTCCAGATATAAAGTTACTCTGAATGGAATTTATGGCAAT 1496

109569434 AGTCCCACTTTAAATAATAACTACAAGTTTAATGTTGCAGTCATTTTTGGTTAATAAAGC 109569493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 AGTCCCACTTTAAATAATAACTACAAGTTTAATGTTGCAGTCATTTTTGGTTAATAAAGC 1556

109569494 CTAAGAGAACTACATTCTTACAAATACATATTTTATACTGACAGTTGAAGGTAACAGAAA 109569553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 CTAAGAGAACTACATTCTTACAAATACATATTTTATACTGACAGTTGAAGGTAACAGAAA 1616

109569554 ATATGTCCTAATTAACTTAAAATTGGTTCAAGTTTTCTTTTTAAAAAAAAACTAATTAAA 109569613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 ATATGTCCTAATTAACTTAAAATTGGTTCAAGTTTTCTTTTTAAAAAAAAACTAATTAAA 1676

109569614 AAAAGACAAGTTTTAATTCTATACCTTGAAATTCCCAGTAGAATAATATATTTTAATCAC 109569673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 AAAAGACAAGTTTTAATTCTATACCTTGAAATTCCCAGTAGAATAATATATTTTAATCAC 1736

109569674 CCAACACAGAATTTTTTTTTTTTAAGGCAGAGTCTCCCTCTGTTGCCCGGGCTGGAGTGC 109569733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1737 CCAACACAGAATTTTTTTTTTTTAAGGCAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCGGGCTGGAGTGC 1796

109569734 AGTGGCAATCTCGGCTGGCTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTC 109569793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 AGTGGCAATCTCGGCTGGCTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTC 1856

109569794 AGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCACTTACACAACCGGCTAATTTTTTGTAT 109569853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 AGCCTCCTGGGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCACTTACACAACCGGCTAATTTTTTGTAT 1916

109569854 TTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGACCTCAG 109569913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGACCTCAG 1976

109569914 GTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCAAGCCT 109569973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 GTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCAAGCCT 2036

109569974 GGCCCAGAATTTTAATTCTTATAAGCTTCACTGTTGCTGAATACAGTATAAATATAGGCA 109570033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 GGCCCAGAATTTTAATTCTTATAAGCTTCACTGTTGCTGAATACAGTATAAATATAGGCA 2096

109570034 TAGGCACATGCTTGATGACTATATCTTAGAATTATTCTCTTCTAACTCCCTTGTATTACT 109570093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TAGGCACATGCTTGATGACTATATCTTAGAATTATTCTCTTCTAACTCCCTTGTATTACT 2156

109570094 GAAACATTTATACAGGCTCCCAAAATCTTACCTCTGTAAGTGATATATACTGCATACTTT 109570153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 GAAACATTTATACAGGCTCCCAAAATCTTACCTCTGTAAGTGATATATACTGCATACTTT 2216

109570154 TTTTTTCCCCCAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCAAGAGTGCAGTGGTGCAATCT 109570213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 TTTTTTCCCCCAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCAAGAGTGCAGTGGTGCAATCT 2276

109570214 CGGTTTACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCAAG 109570273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 CGGTTTACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCAAG 2336

109570274 TAGCTGGGATCACAGGTGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 109570333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 TAGCTGGGATCACAGGTGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 2396

109570334 TGGGGTTTCACCATCTTGGCAGGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCC 109570393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 TGGGGTTTCACCATCTTGGCAGGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCC 2456

109570394 TCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCTATATACATAT 109570453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCTATATACATAT 2516

109570454 TTTAAACATCTATTTCCTGTAATCCTAGCTACTTTGGAAGGCTGAGGTGGGCAACATAGT 109570513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TTTAAACATCTATTTCCTGTAATCCTAGCTACTTTGGAAGGCTGAGGTGGGCAACATAGT 2576

109570514 GAGACCTTATCTCAAATAAATAAATAAATAACTATTCACCACAAAGTTAGAACTTTTCTC 109570573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 GAGACCTTATCTCAAATAAATAAATAAATAACTATTCACCACAAAGTTAGAACTTTTCTC 2636

109570574 TAATTCAGGGAAACAGAATTCAATAATAATTACTTCTTCCCCTCTCCTCTGGGGGAGCTA 109570633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 TAATTCAGGGAAACAGAATTCAATAATAATTACTTCTTCCCCTCTCCTCTGGGGGAGCTA 2696

109570634 TAAATCTGCAAAAGATTTTAACAAGTTTAGGAACTACTAAAATTATCTTTTAAAATGAGA 109570693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 TAAATCTGCAAAAGATTTTAACAAGTTTAGGAACTACTAAAATTATCTTTTAAAATGAGA 2756

109570694 TGCACATATAATCATAATATGTGTTCAATAAATAAATATTAGCTGAATTAACTTGAGATG 109570753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TGCACATATAATCATAATATGTGTTCAATAAATAAATATTAGCTGAATTAACTTGAGATG 2816

109570754 TAAAGTCACTGAAGAAATGTCTCTACAAAAGTACAGAACAGATGACTATGGTTTTGTTTG 109570813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TAAAGTCACTGAAGAAATGTCTCTACAAAAGTACAGAACAGATGACTATGGTTTTGTTTG 2876

109570814 TTTGTCTGTTTTAGACAGGGTCTTACTCTGAGGCCCAGGCAGGAGTGCAGTGGCTGAATC 109570873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TTTGTCTGTTTTAGACAGGGTCTTACTCTGAGGCCCAGGCAGGAGTGCAGTGGCTGAATC 2936

109570874 ATGGCTCACTGCAGCCTTGGCCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAA 109570933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 ATGGCTCACTGCAGCCTTGGCCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAA 2996

109570934 GTAGCTGGGACCACAGGCATGTGCCACTGGGCCCAGCTAATTTTTGTTGGGTTTTTTTTT 109570993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 GTAGCTGGGACCACAGGCATGTGCCACTGGGCCCAGCTAATTTTTGTTGGGTTTTTTTTT 3056

109570994 TTTTTTTTTTTTT-----GTAGAGATTGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTTAGTCTGAC 109571048
          |||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATTGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTTAGTCTGAC 3116

109571049 TGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCTGGGATTAC 109571108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCTGGGATTAC 3176

109571109 AGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAACTTA 109571168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 AGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAACTTA 3236

109571169 CTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATGTGCCAAC 109571228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 CTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATGTGCCAAC 3296

109571229 ACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGAT 109571288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 ACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGAT 3356

109571289 GGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 109571348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 GGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 3416

109571349 AGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTTGAGGTTA 109571408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 AGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTTGAGGTTA 3476

109571409 ATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATCTTCACCATTT 109571468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 ATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATCTTCACCATTT 3536

109571469 TTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTTTCCTCTTT 109571528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTTTCCTCTTT 3596

109571529 CCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTAAAAAGTA 109571588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 CCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTAAAAAGTA 3656

109571589 AGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAATATA 109571648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 AGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAATATA 3716

109571649 AGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACAATTAACA 109571708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 AGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACAATTAACA 3776

109571709 TACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTACCATCTTAG 109571768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 TACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTACCATCTTAG 3836

109571769 TAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAGAAATCTA 109571828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 TAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAGAAATCTA 3896

109571829 AGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCTCATGGCT 109571888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 AGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCTCATGGCT 3956

109571889 ATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACC 109571948
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 GTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACC 4016

109571949 AGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCG 109572008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 AGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCG 4076

109572009 CAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAG 109572068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 CAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAG 4136

109572069 GTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACA 109572128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 GTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACA 4196

109572129 AAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCA 109572188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 AAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCA 4256

109572189 GGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTT 109572248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 GGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTT 4316

109572249 GCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAA 109572308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 GCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAA 4376

109572309 ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACCCGGGCGTGGTGGTG 109572368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACCCGGGCGTGGTGGTG 4436

109572369 GGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGG 109572428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 GGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGG 4496

109572429 TGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGA 109572488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4497 TGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACCCCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGA 4556

109572489 CTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAAAATATA 109572548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 CTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAAAATATA 4616

109572549 TTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCACTGGT 109572608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 TTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCACTGGT 4676

109572609 AGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAGTGAC 109572668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 AGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAGTGAC 4736

109572669 GACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGA 109572728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 GACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGA 4796

109572729 AGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGG 109572788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 AGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGG 4856

109572789 TGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGTAGTT 109572848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 TGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGTAGTT 4916

109572849 TTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACA 109572908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 TTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACA 4976

109572909 GAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGA 109572968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 GAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGA 5036

109572969 AACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAA 109573028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 AACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAA 5096

109573029 TTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAACACAA 109573088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 TTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAACACAA 5156

109573089 CAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATAAACC 109573148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 CAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATAAACC 5216

109573149 TTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTCACAC 109573208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 TTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTCACAC 5276

109573209 AATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 109573231
          |||||||||||||||||||||||
     5277 AATAAAAACTGCTCTCTTTAATC 5299

EXCISED REGION

109575181 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 109575240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5300 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 5359

109575241 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 109575300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5360 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 5419

109575301 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 109575360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5420 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 5479

109575361 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 109575420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5480 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 5539

109575421 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 109575480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5540 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 5599

109575481 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 109575540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5600 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 5659

109575541 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 109575600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5660 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 5719

109575601 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 109575660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5720 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 5779

109575661 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 109575720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5780 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 5839

109575721 GCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAG 109575780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5840 GCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCACAG 5899

109575781 TGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCC 109575840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5900 TGGCAGGCACCTGTAATCCCAGGTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCC 5959

109575841 AGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAG 109575900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5960 AGGGGGGCAGAGGTGGCAGTGAGTCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCTTGGGCGACAG 6019

109575901 AATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCT 109575960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6020 AATGAGACTCTGCCTCAAAAGGAAAAACAAAAACAAAAAAAAGCTAAATGGTTATTATCT 6079

109575961 GGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCA 109576020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6080 GGAGCATATAAATAGCATCTTCAAATCAATACCCTCAAAATTCCAGACGAAAAATGAGCA 6139

109576021 AAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTC 109576080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6140 AAAAATATAGACAATTCACAAAAGAACTATGAATACCAATATATTTGTGAAAAGATGCTC 6199

109576081 AACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAAT 109576140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6200 AACCTCAATAATAGTTTTATAACAAGGTACCAACATGCTCACTTCCACACACAGTAAAAT 6259

109576141 GAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCT 109576200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6260 GAGTTACCCATTTACGGCCTACCAGTTTTGAAAAAGAAAAAAGAAGACCCGATAATATCT 6319

109576201 AGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGG 109576260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6320 AGTTTTGGCAAGAGTGTGGGCAAATGCCTTCATATACTGTTGTTAAGAATGTAAACTGGG 6379

109576261 GACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGA 109576320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6380 GACCAGATGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGAGGCCAAGGCGGGCAGA 6439

109576321 TCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAA 109576380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6440 TCACAAGGTCAGGAGATGGAGACCATTCTGGCCAACATGGTAAAACCCTGTCTCTACTAA 6499

109576381 AAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 109576440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6500 AAACACAAAAATTAGCTGGACGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGC 6559

109576441 TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGC 109576500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6560 TGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCAGGGAGTCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCGTGC 6619

109576501 CACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGA 109576560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6620 CACTGCACTCCAGCCTGGCAACAGAGTGAGACTCTGTGTCAAAAAAATAAAAGTAAAAGA 6679

109576561 AGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACA 109576620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6680 AGAATGTAAACTGGGACTGACTTTTTGAGAGAATTTGACAGCATGAAATTTTTACCTACA 6739

109576621 AAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAG 109576680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6740 AAAATGTTGGTGAAGCATGATGGCTCATGCCAGTAATCCCAGTATTTTGGGAGGCCGAAG 6799

109576681 TGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCA 109576740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6800 TGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCA 6859

109576741 TCTCTACTAAAAATACA 109576757
          |||||||||||||||||
     6860 TCTCTACTAAAAATACA 6876

Alignment time is 8.90565 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2732] =>      2732 nucs 'mol-32-3487-142791_2732'

Score:        2721
Aligned:      2732        nucs
Identic:      2731 (100%) nucs =>      2178 (100%)       553 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109571053,109573231] EXCISED REGION [109575181,109575733]
 second seq =>  [        1,     2179] EXCISED REGION [     2180,     2732]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1949 nucs [109573232,109575180]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [109573232,109573232] to [109575181,109575181]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

109571053 TGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 109571112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 60

109571113 ATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAACTTACTGA 109571172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAACTTACTGA 120

109571173 AAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATGTGCCAACACGC 109571232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATGTGCCAACACGC 180

109571233 CCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGATGGTC 109571292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGATGGTC 240

109571293 TTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 109571352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 300

109571353 ATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTTGAGGTTAATTT 109571412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTTGAGGTTAATTT 360

109571413 TAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATCTTCACCATTTTTAT 109571472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATCTTCACCATTTTTAT 420

109571473 GTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTTTCCTCTTTCCCT 109571532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTTTCCTCTTTCCCT 480

109571533 TCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTAAAAAGTAAGTT 109571592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTAAAAAGTAAGTT 540

109571593 TTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAATATAAGTA 109571652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAATATAAGTA 600

109571653 TGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACAATTAACATACA 109571712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACAATTAACATACA 660

109571713 CTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTACCATCTTAGTAAA 109571772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTACCATCTTAGTAAA 720

109571773 CCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAGAAATCTAAGAT 109571832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAGAAATCTAAGAT 780

109571833 TAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCTCATGGCTATAA 109571892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      781 TAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCTCATGGCTGTAA 840

109571893 TCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCC 109571952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCC 900

109571953 TGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGT 109572012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCAGGCGCAGT 960

109572013 GGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCA 109572072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACCTGAGGTCA 1020

109572073 GGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAA 109572132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAA 1080

109572133 TTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAG 109572192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAAGGCAGGAG 1140

109572193 AAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGC 109572252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAAGGTTGCGC 1200

109572253 CACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAA 109572312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAAATAA 1260

109572313 ATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCA 109572372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACCCGGGCGTGGTGGTGGGCA 1320

109572373 CCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGA 109572432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAGGAGGTGGA 1380

109572433 GGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTC 109572492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTTC 1440

109572493 GTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAAAATATATTGA 109572552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAAAATATATTGA 1500

109572553 CTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCT 109572612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCACTGGTAGCT 1560

109572613 TTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACC 109572672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAGTGACGACC 1620

109572673 TACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAG 109572732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAGAAGAAGAG 1680

109572733 AAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTG 109572792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCATGGGTGTG 1740

109572793 AAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGT 109572852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGTAGTTTTGT 1800

109572853 GTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAG 109572912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCTTACAGAAG 1860

109572913 GATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACC 109572972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGTGGGAAACC 1920

109572973 ATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAA 109573032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAATTAA 1980

109573033 ATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGG 109573092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAACACAACAGG 2040

109573093 CCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTAT 109573152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATAAACCTTAT 2100

109573153 AGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTCACACAATA 109573212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTCACACAATA 2160

109573213 AAAACTGCTCTCTTTAATC 109573231
          |||||||||||||||||||
     2161 AAAACTGCTCTCTTTAATC 2179

EXCISED REGION

109575181 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 109575240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 TGCAGAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGAC 2239

109575241 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 109575300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 CAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCAC 2299

109575301 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 109575360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 TTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAA 2359

109575361 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 109575420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 ATACATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTG 2419

109575421 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 109575480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 AGGCAGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCAC 2479

109575481 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 109575540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 TGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTA 2539

109575541 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 109575600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 AATCTTCCATTCAACAGAAACTTGCCACAAACAATTATGTTAAAAGACAAGGCACAAAGT 2599

109575601 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 109575660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 AGGACTAAGTAAAACACACATAAAGAGTTAAATGGGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTG 2659

109575661 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 109575720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 TAATCCCAGCACATTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCAAGACCA 2719

109575721 GCCTGGCCAAGAT 109575733
          |||||||||||||
     2720 GCCTGGCCAAGAT 2732

Alignment time is 3.52755 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [109563231,109585180] =>     21950 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     9641] =>      9641 nucs 'mol-32-349d-153694_9641'

Score:        9460
Aligned:      9642        nucs
Identic:      9623 (100%) nucs =>      5069 (100%)      4554 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [109565909,109570984] EXCISED REGION [109570985,109575550]
 second seq =>  [        1,     5074] EXCISED REGION [     5082,     9641]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         7 nucs [5075,5081]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        22 nucs [5075,5096] to [5082,5103]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [5075,5077] to [5079,5081]

109565909 TATTACCTTATTAATACTTAACATTTCTTCGAAGGAGCTACAAACTTCACAGTATAATGA 109565968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTACCTTATTAATACTTAACATTTCTTCGAAGGAGCTACAAACTTCACAGTATAATGA 60

109565969 AATCATACCTCAGGAAAAGCATATCATCTGAAAACAGGCCATTTATGACTCCACTTTCCT 109566028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATCATACCTCAGGAAAAGCATATCATCTGAAAACAGGCCATTTATGACTCCACTTTCCT 120

109566029 TCTCCAGGGCCAGCATACTAATGTGAAGCTTCTTTGAATTCAGGAAGTCCAAAATTAGCT 109566088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTCCAGGGCCAGCATACTAATGTGAAGCTTCTTTGAATTCAGGAAGTCCAAAATTAGCT 180

109566089 TAATGATTTCAACCTCTTTTACATTCACTGTTTCTTCAGCCGTCATATTGATAGCCTAAA 109566148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATGATTTCAACCTCTTTTACATTCACTGTTTCTTCAGCCGTCATATTGATAGCCTAAA 240

109566149 TATGAAACAGAAAAACAATAAAGCTAGTCCTATTGATTTATTTCTAAGTTTAACTGCCTG 109566208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATGAAACAGAAAAACAATAAAGCTAGTCCTATTGATTTATTTCTAAGTTTAACTGCCTG 300

109566209 GCAACTACACATAACAGGTTTACTGGGAATCTTTAGTACACATATTCTGAAGTGAAGTTA 109566268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCAACTACACATAACAGGTTTACTGGGAATCTTTAGTACACATATTCTGAAGTGAAGTTA 360

109566269 ACTTAGTATTTATCAAAACCAAGTCGTTCTTTAATATGTGACAATGGTATGGCCATGATT 109566328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTTAGTATTTATCAAAACCAAGTCGTTCTTTAATATGTGACAATGGTATGGCCATGATT 420

109566329 TTTTAAAGTCCTTATCTTTGAAATACATATTGGAATAATTACAGATTAAATGATATAAAC 109566388
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      421 TTTTAAAGTCCTTATCTTTGAAATACATATTGGAATAATTACAGATTAAATGATATAAAG 480

109566389 TTTGTGATTTACATGAAAATAATAGAAGAGAAGAGTGGGAAGAGATAAAGATGAAACAAG 109566448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGTGATTTACATGAAAATAATAGAAGAGAAGAGTGGGAAGAGATAAAGATGAAACAAG 540

109566449 AATGATTATGGTTACTGAAGCAGGGTAATAGGTAAATGAGGGTTTATTATATAATCCTGT 109566508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATGATTATGGTTACTGAAGCAGGGTAATAGGTAAATGAGGGTTTATTATATAATCCTGT 600

109566509 CTACTCCTACATGTTTAAAATTTTCCATAATAGAGAATATTTTAAAAAGTCATTAATAAC 109566568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTACTCCTACATGTTTAAAATTTTCCATAATAGAGAATATTTTAAAAAGTCATTAATAAC 660

109566569 CAAACCATGTTTAGCTATGTCCCAAATACATTGTCCCAGGTATGCTCTAATACATTCACT 109566628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAACCATGTTTAGCTATGTCCCAAATACATTGTCCCAGGTATGCTCTAATACATTCACT 720

109566629 CAATAAGTACTTAATGCCTTTTCTCTGTGACAGACATGATTCTGTACTCAGGAGACATTG 109566688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAATAAGTACTTAATGCCTTTTCTCTGTGACAGACATGATTCTGTACTCAGGAGACATTG 780

109566689 GCCTTGCTTTAAGAAGCTTTAGTCTAGCAGTAATACCTAAATGATGACCTGGTCAGTACA 109566748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCTTGCTTTAAGAAGCTTTAGTCTAGCAGTAATACCTAAATGATGACCTGGTCAGTACA 840

109566749 GCGGAGCCAAACAAAACAAGGTTAGTTAAGATGTGCAACTTTAGGGCAGGTGTAGTGGCG 109566808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCGGAGCCAAACAAAACAAGGTTAGTTAAGATGTGCAACTTTAGGGCAGGTGTAGTGGCG 900

109566809 TACGCCTGTAATCCCTGTACTTTGGGAGGCCAAAGTGGAGGGACTGCTTGAGTTCAGGAG 109566868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACGCCTGTAATCCCTGTACTTTGGGAGGCCAAAGTGGAGGGACTGCTTGAGTTCAGGAG 960

109566869 TTCGAGACCAGCCTGGGAACCATGGCAAAACCACATCTGTACAAAAAAAATTAAAAAATT 109566928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCGAGACCAGCCTGGGAACCATGGCAAAACCACATCTGTACAAAAAAAATTAAAAAATT 1020

109566929 AGCAGGGCAAGATGGTGTGTGTCTATAGTCCCAGCACTCTGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT 109566988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCAGGGCAAGATGGTGTGTGTCTATAGTCCCAGCACTCTGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT 1080

109566989 CGCTTGAGCCCAGGAGATCAAGGCTGCAGTGAGCAAAGATCGTGCCACTGCACTACAGCC 109567048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CGCTTGAGCCCAGGAGATCAAGGCTGCAGTGAGCAAAGATCGTGCCACTGCACTACAGCC 1140

109567049 TGAGCAACAGAATTAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAGTGCAACTTTAGT 109567108
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAGCAACAGAATTAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAGTGCAACTTTAGT 1200

109567109 CATATGGGTAATATCAGTGATATTTCAATACTCTCTAAGCTTCCTTCTAACTCTTACCTG 109567168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATATGGGTAATATCAGTGATATTTCAATACTCTCTAAGCTTCCTTCTAACTCTTACCTG 1260

109567169 TAGGTCTGCTACAACTGAGCACATAATGCTCAGGTTATGAATCCATAAAGATTTAGACCT 109567228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGGTCTGCTACAACTGAGCACATAATGCTCAGGTTATGAATCCATAAAGATTTAGACCT 1320

109567229 GGGAGGACTATAAGATCATTTGTTCAACATTCTAATTTTACCAGTGAAGCCACACAAGTT 109567288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGGAGGACTATAAGATCATTTGTTCAACATTCTAATTTTACCAGTGAAGCCACACAAGTT 1380

109567289 AAATGGCCTAAACTGTTACAGTTTTCAAATGTTAAGGTTCAGAGCAATGCAAAATACCAC 109567348
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAATGGCCTAAACTGTTACAGTTTTCAAACGTTAAGGTTCAGAGCAATGCAAAATACCAC 1440

109567349 CACACTAGGGGAGTAGCCACAAAGAAACTTCATCAGATGAAACAGACTATAAGCATATCT 109567408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACACTAGGGGAGTAGCCACAAAGAAACTTCATCAGATGAAACAGACTATAAGCATATCT 1500

109567409 TTCTCACAGGACCAACTTATTCTAACCAAGCTTGCAGAAACATAAACATACACATGTGGA 109567468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCTCACAGGACCAACTTATTCTAACCAAGCTTGCAGAAACATAAACATACACATGTGGA 1560

109567469 CTGGGTGTAGTGACTCACGCCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGCAGGAGGATC 109567528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGGGTGTAGTGACTCACGCCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGCAGGAGGATC 1620

109567529 GCTTGAGCCCAGAAGTTAGAAGTTACATACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCACACCT 109567588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCTTGAGCCCAGAAGTTAGAAGTTACATACAGTGAGCTATGATCACACCACTGCACACCT 1680

109567589 CTGAACAACAGAGGAAGACCATGTCTCTAAACAAAACAAAACAAAAAATATATGTAGGCC 109567648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGAACAACAGAGGAAGACCATGTCTCTAAACAAAACAAAACAAAAAATATATGTAGGCC 1740

109567649 CACAGGTTAGTGTTGTTTCCATTTCTTTACTTTTGGGTTGATTTTTTTGTTTATAACAAG 109567708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACAGGTTAGTGTTGTTTCCATTTCTTTACTTTTGGGTTGATTTTTTTGTTTATAACAAG 1800

109567709 AAATGCAAATGTCTAGCAGACTAGAATGCTCTCATCAGCAGATGAGTACATTTTCTCCCT 109567768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAATGCAAATGTCTAGCAGACTAGAATGCTCTCATCAGCAGATGAGTACATTTTCTCCCT 1860

109567769 CAGCTAGAGGCCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAGTTCCAGCACTTTGAGAGGTCGAG 109567828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGCTAGAGGCCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAGTTCCAGCACTTTGAGAGGTCGAG 1920

109567829 GTGGGAGGATCACATGAGCCCAGGAGTGCGAGACAAGCCTGGGCAACATGGCGAAACATG 109567888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTGGGAGGATCACATGAGCCCAGGAGTGCGAGACAAGCCTGGGCAACATGGCGAAACATG 1980

109567889 GTCTCTACCAAAAATATAACAATCAGCCAGCATGTGTGCCTGTAGTTCCAGTTACTCAGG 109567948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTCTCTACCAAAAATATAACAATCAGCCAGCATGTGTGCCTGTAGTTCCAGTTACTCAGG 2040

109567949 AGGCTGAGGTGGAAAGATCACTGGAGCCCCAGAAGTTGAGGCTACAGTGAGCGGTGATCA 109568008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGGCTGAGGTGGAAAGATCACTGGAGCCCCAGAAGTTGAGGCTACAGTGAGCGGTGATCA 2100

109568009 TACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGGTAGCGTGAGACTCTGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAA 109568068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGGTAGCGTGAGACTCTGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAA 2160

109568069 AAAAGAAGGCTGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGAC 109568128
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAA-GAAGGCTGGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGAC 2219

109568129 GGGTGGATTATGAGATCAGGAGTTTGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCACCT 109568188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GGGTGGATTATGAGATCAGGAGTTTGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCACCT 2279

109568189 CTACTAAAAATACAAAAATTAGCGGAGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTT 109568248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CTACTAAAAATACAAAAATTAGCGGAGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTACTT 2339

109568249 GGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGA 109568308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGA 2399

109568309 TTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACTCCATCTCGGAAAAAGAAAAA 109568368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCCAGACTCCATCTCGGAAAAAGAAAAA 2459

109568369 AAAACTAACAAATAAAAAAAAGTGGCGCTAGGGTAAACAAGGGACAAACCACAGAAAAAT 109568428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 AAAACTAACAAATAAAAAAAAGTGGCGCTAGGGTAAACAAGGGACAAACCACAGAAAAAT 2519

109568429 AATTATACGACTCACTCAAATATTTAATGACATCAGACTACACAAATCCCTCTGCAGAGT 109568488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 AATTATACGACTCACTCAAATATTTAATGACATCAGACTACACAAATCCCTCTGCAGAGT 2579

109568489 AAGAATATGTCTGTCTCAGGAAACAGTAAATCACAAACTTATCTCCCAACACACCAGCTA 109568548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 AAGAATATGTCTGTCTCAGGAAACAGTAAATCACAAACTTATCTCCCAACACACCAGCTA 2639

109568549 CCCAACTCCGCATGCTTTAGGTTTCCCTTTCCTATCTTCTGAGCTGACCACCATCCTCCT 109568608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CCCAACTCCGCATGCTTTAGGTTTCCCTTTCCTATCTTCTGAGCTGACCACCATCCTCCT 2699

109568609 GTTCACAGACTTCGTCCAAAAGAGGATACGGTAAAATAAGTTAAGATTTCCACTCACTAA 109568668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GTTCACAGACTTCGTCCAAAAGAGGATACGGTAAAATAAGTTAAGATTTCCACTCACTAA 2759

109568669 ATTCTTTTTTTTTTTTTAAAGACAGGGTCTTGCTCTGTCACCTAGGTTAGAGTGCAGTTG 109568728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 ATTCTTTTTTTTTTTTTAAAGACAGGGTCTTGCTCTGTCACCTAGGTTAGAGTGCAGTTG 2819

109568729 CATGACCATGGCCCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCTCAAGTGATCCTCCCGCTTCAGC 109568788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CATGACCATGGCCCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGGCTCAAGTGATCCTCCCGCTTCAGC 2879

109568789 CTTCCAAGTACCTGGGATGACAGGTGTGTGCCACCGTACCCAGCTAATTTTTTATTTTAC 109568848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CTTCCAAGTACCTGGGATGACAGGTGTGTGCCACCGTACCCAGCTAATTTTTTATTTTAC 2939

109568849 TTTTTGTAGAGACGGGATCTACCTATGTTGCCTAGGCTGCTCTCGAACTCCTGGGCTCAA 109568908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TTTTTGTAGAGACGGGATCTACCTATGTTGCCTAGGCTGCTCTCGAACTCCTGGGCTCAA 2999

109568909 GCAATCCTCTCGCCTCGGCATCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGGATGAGCCACCGTGCCC 109568968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 GCAATCCTCTCGCCTCGGCATCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGGATGAGCCACCGTGCCC 3059

109568969 ACCTTTTTTTTTTTTTCAGGTTATCCGTGGAAACTACTCATTAAATTCTGATCATATCAG 109569028
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 ACCTTTTTTTTTTTT-CAGGTTATCCGTGGAAACTACTCATTAAATTCTGATCATATCAG 3118

109569029 AACTGTCTCCCTAATATTATTCTTAGAGCACACTGATTAGTGATTTTAGCATTCCTCAAA 109569088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 AACTGTCTCCCTAATATTATTCTTAGAGCACACTGATTAGTGATTTTAGCATTCCTCAAA 3178

109569089 TCTTTAGACAATTCTTTTTTTTATTTTTACTGCTCCTTGCAGAGCAGGCTACCCAATAGG 109569148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TCTTTAGACAATTCTTTTTTTTATTTTTACTGCTCCTTGCAGAGCAGGCTACCCAATAGG 3238

109569149 CAGTGTGCCCAGAGTAGCCCTTCAGGTAATTCTTACTAGCAAAAAAATGGCTTTTACTAA 109569208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 CAGTGTGCCCAGAGTAGCCCTTCAGGTAATTCTTACTAGCAAAAAAATGGCTTTTACTAA 3298

109569209 TTTAACTCTCAGAAAAAAATATTCCCTCCTCTGTAGGTTCTTAGAGGGCACATCACATAT 109569268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TTTAACTCTCAGAAAAAAATATTCCCTCCTCTGTAGGTTCTTAGAGGGCACATCACATAT 3358

109569269 ATCTCCATGTACCAACCACACAAACTTAATGCACAATTGGGACTATAATTTTCTAATATA 109569328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 ATCTCCATGTACCAACCACACAAACTTAATGCACAATTGGGACTATAATTTTCTAATATA 3418

109569329 GCTCAATATACCAATGATACTAAACATTGTATAGGCTTCATATTCAACATTCAATCTAAA 109569388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 GCTCAATATACCAATGATACTAAACATTGTATAGGCTTCATATTCAACATTCAATCTAAA 3478

109569389 TATCAGTCCAGATATAAAGTTACTCTGAATGGAATTTATGGCAATAGTCCCACTTTAAAT 109569448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TATCAGTCCAGATATAAAGTTACTCTGAATGGAATTTATGGCAATAGTCCCACTTTAAAT 3538

109569449 AATAACTACAAGTTTAATGTTGCAGTCATTTTTGGTTAATAAAGCCTAAGAGAACTACAT 109569508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 AATAACTACAAGTTTAATGTTGCAGTCATTTTTGGTTAATAAAGCCTAAGAGAACTACAT 3598

109569509 TCTTACAAATACATATTTTATACTGACAGTTGAAGGTAACAGAAAATATGTCCTAATTAA 109569568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TCTTACAAATACATATTTTATACTGACAGTTGAAGGTAACAGAAAATATGTCCTAATTAA 3658

109569569 CTTAAAATTGGTTCAAGTTTTCTTTTTAAAAAAAAACTAATTAAAAAAAGACAAGTTTTA 109569628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 CTTAAAATTGGTTCAAGTTTTCTTTTTAAAAAAAAACTAATTAAAAAAAGACAAGTTTTA 3718

109569629 ATTCTATACCTTGAAATTCCCAGTAGAATAATATATTTTAATCACCCAACACAGAATTTT 109569688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 ATTCTATACCTTGAAATTCCCAGTAGAATAATATATTTTAATCACCCAACACAGAATTTT 3778

109569689 TTTTTTTTAAGGCAGAGTCTCCCTCTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGCAATCTCGGC 109569748
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TTTTTTTTAAGGCAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCGGGCTGGAGTGCAGTGGCAATCTCGGC 3838

109569749 TGGCTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGC 109569808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TGGCTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGC 3898

109569809 TGGGATTACAGGCGTGCACTTACACAACCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 109569868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TGGGATTACAGGCGTGCACTTACACAACCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 3958

109569869 GGTTTCGCCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCT 109569928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GGTTTCGCCATGTTTGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCT 4018

109569929 CAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCAAGCCTGGCCCAGAATTTTAA 109569988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 CAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCAAGCCTGGCCCAGAATTTTAA 4078

109569989 TTCTTATAAGCTTCACTGTTGCTGAATACAGTATAAATATAGGCATAGGCACATGCTTGA 109570048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 TTCTTATAAGCTTCACTGTTGCTGAATACAGTATAAATATAGGCATAGGCACATGCTTGA 4138

109570049 TGACTATATCTTAGAATTATTCTCTTCTAACTCCCTTGTATTACTGAAACATTTATACAG 109570108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 TGACTATATCTTAGAATTATTCTCTTCTAACTCCCTTGTATTACTGAAACATTTATACAG 4198

109570109 GCTCCCAAAATCTTACCTCTGTAAGTGATATATACTGCATACTTTTTTTTTCCCCCAGAT 109570168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 GCTCCCAAAATCTTACCTCTGTAAGTGATATATACTGCATACTTTTTTTTTCCCCCAGAT 4258

109570169 GGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCAAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGTTTACTGCAACC 109570228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 GGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCAAGAGTGCAGTGGTGCAATCTCGGTTTACTGCAACC 4318

109570229 TCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATCACAG 109570288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTTCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATCACAG 4378

109570289 GTGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATC 109570348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 GTGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATC 4438

109570349 TTGGCAGGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAAT 109570408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 TTGGCAGGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAAT 4498

109570409 GCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCTATATACATATTTTAAACATCTATTT 109570468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 GCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCCAGCTATATACATATTTTAAACATCTATTT 4558

109570469 CCTGTAATCCTAGCTACTTTGGAAGGCTGAGGTGGGCAACATAGTGAGACCTTATCTCAA 109570528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 CCTGTAATCCTAGCTACTTTGGAAGGCTGAGGTGGGCAACATAGTGAGACCTTATCTCAA 4618

109570529 ATAAATAAATAAATAACTATTCACCACAAAGTTAGAACTTTTCTCTAATTCAGGGAAACA 109570588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 ATAAATAAATAAATAACTATTCACCACAAAGTTAGAACTTTTCTCTAATTCAGGGAAACA 4678

109570589 GAATTCAATAATAATTACTTCTTCCCCTCTCCTCTGGGGGAGCTATAAATCTGCAAAAGA 109570648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 GAATTCAATAATAATTACTTCTTCCCCTCTCCTCTGGGGGAGCTATAAATCTGCAAAAGA 4738

109570649 TTTTAACAAGTTTAGGAACTACTAAAATTATCTTTTAAAATGAGATGCACATATAATCAT 109570708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 TTTTAACAAGTTTAGGAACTACTAAAATTATCTTTTAAAATGAGATGCACATATAATCAT 4798

109570709 AATATGTGTTCAATAAATAAATATTAGCTGAATTAACTTGAGATGTAAAGTCACTGAAGA 109570768
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 AATACGTGTTCAATAAATAAATATTAGCTGAATTAACTTGAGATGTAAAGTCACTGAAGA 4858

109570769 AATGTCTCTACAAAAGTACAGAACAGATGACTATGGTTTTGTTTGTTTGTCTGTTTTAGA 109570828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 AATGTCTCTACAAAAGTACAGAACAGATGACTATGGTTTTGTTTGTTTGTCTGTTTTAGA 4918

109570829 CAGGGTCTTACTCTGAGGCCCAGGCAGGAGTGCAGTGGCTGAATCATGGCTCACTGCAGC 109570888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 CAGGGTCTTACTCTGAGGCCCAGGCAGGAGTGCAGTGGCTGAATCATGGCTCACTGCAGC 4978

109570889 CTTGGCCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACA 109570948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 CTTGGCCTTCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACA 5038

109570949 GGCATGTGCCACTGGGCCCAGCTAATTTTTGTTGGG 109570984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 GGCATGTGCCACTGGGCCCAGCTAATTTTTGTTGGG 5074

EXCISED REGION

109570985 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATTGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTTAGTC 109571044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5082 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATTGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTTAGTC 5141

109571045 TGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCTGGGA 109571104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5142 TGACTGCTTGAACTCCTGAGCTCAAGCAATCCACCCGCCTCGACCTCCAAAGTGCTGGGA 5201

109571105 TTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAA 109571164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5202 TTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCCAGAGGACTTTGTTTTTAATTGTTTTCAAAAA 5261

109571165 CTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATGTGC 109571224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5262 CTTACTGAAAAGGATGGAGCTGTGACTGAAGCAATCCAGCTATTTAGCCTAAGCATGTGC 5321

109571225 CAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCA 109571284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5322 CAACACGCCCAGCTAATTTTTTGTATCTTTAGTAGAGGTGGGGTTTCACCATGTTGGCCA 5381

109571285 AGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 109571344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5382 AGATGGTCTTGATCTCCTGATCTCGTCATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 5441

109571345 TTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTTGAG 109571404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5442 TTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTTAAAAAACTTTTTTTAAAAAACATTTTTGAG 5501

109571405 GTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATCTTCACC 109571464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5502 GTTAATTTTAATTAATTTAATATGTATTTAATAATACATATATAATTTACCATCTTCACC 5561

109571465 ATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTTTCCT 109571524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5562 ATTTTTATGTGTACAGTTCAACGGTAATAAATAAATCTATATTCCATCCTTGCCTTTCCT 5621

109571525 CTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTAAAA 109571584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5622 CTTTCCCTTCTGGCCTCTGGTTAAAATCACAAAAATGTAATTGTGAATTTTCCTTTAAAA 5681

109571585 AGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAA 109571644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5682 AGTAAGTTTTACTTATATCCAATATCCAGACTAGGTAAAGAAATAAGAGTGTTCTTTAAA 5741

109571645 TATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACAATT 109571704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5742 TATAAGTATGTCTGGAAACCAGCTAGAAGGTATTTAGTATTTTAGTCCTTAGATACAATT 5801

109571705 AACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTACCATC 109571764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5802 AACATACACTGAAATTAATTCCAGATGGGGTCTCTATGTGGACTCCTATTGATTACCATC 5861

109571765 TTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAGAAA 109571824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5862 TTAGTAAACCAAGATTAGAAGGATGTATTAAAGGGTTAGAAATAAAATTATTTTTAGAAA 5921

109571825 TCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCTCAT 109571884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5922 TCTAAGATTAAAGGTAAAATGTTAATAATACATAAGAAACTGCCGGGCGCAGTGGCTCAT 5981

109571885 GGCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAA 109571944
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5982 GGCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAA 6041

109571945 GACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCA 109572004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6042 GACCAGCCTGGCCGAGATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAACAAATTGGCCA 6101

109572005 GGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACC 109572064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6102 GGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATAACC 6161

109572065 TGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAA 109572124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6162 TGAGGTCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGATAAAACCCTGTCTCTACTGAAAA 6221

109572125 TACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAA 109572184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6222 TACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTAA 6281

109572185 GGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAA 109572244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6282 GGCAGGAGAAATCACTTGATTCTCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAACCAA 6341

109572245 GGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAATAA 109572304
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||
     6342 GGTTGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTC----TAAATAA 6397

109572305 ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAAAAAAATTACCCGGGCGTGGT 109572364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     6398 ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATATTTTTTTAACAAAATTACCCGGGCGTGGT 6457

109572365 GGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAG 109572424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6458 GGTGGGCACCTCTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAGCCCAG 6517

109572425 GAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGA 109572484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6518 GAGGTGGAGGCTGCAGTACACTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGA 6577

109572485 AAGACTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAAAA 109572544
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6578 AAGACTTCGTCTC-AAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATATTCTAGTAATAAAAA 6636

109572545 TATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCAC 109572604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6637 TATATTGACTCTGTGTATTTCCATACAAAGATATGGAAAAACTTCATGAAAAAATATCAC 6696

109572605 TGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAG 109572664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6697 TGGTAGCTTTCTAACCAAATATAAGCAGATATGATTTAATTAAATGTCCCTTTCTGGCAG 6756

109572665 TGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAG 109572724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6757 TGACGACCTACCCACAGGAGAACATGCCTCTCGCAAAAGATCTCCTTCATCCCTCCCCAG 6816

109572725 AAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCA 109572784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6817 AAGAAGAGAAGAAGAAACACAAGAAGAAACGCCTGGTGCAGAGCCCCAATTCCTACTTCA 6876

109572785 TGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGT 109572844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6877 TGGGTGTGAAATGCCCAGGATAATATAAATCACCACGGTCTTTAGCCATGCACAAATGGT 6936

109572845 AGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCT 109572904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6937 AGTTTTGTGTGTTGGCTGCTCCACTGTCCTCTGCCAGCCTACAGGAGGAAAAGCAAGGCT 6996

109572905 TACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGT 109572964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6997 TACAGAAGGATGTTCCTTCAGGAAGAAGCAGCACTAAAAGCACTCTGAATCAAGATGAGT 7056

109572965 GGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATA 109573024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7057 GGGAAACCATCTCAATAAGCACATTTTTGATAAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAAATA 7116

109573025 AAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAAC 109573084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7117 AAAATTAAATGTTCATCTGCAATGCGGTTACTTAAACACACATTATGAAGGAAAAAAAAC 7176

109573085 ACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATA 109573144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7177 ACAACAGGCCAAGAATTACTATAAATATAAGGTTAAGAGAACTAGGGCACAGTCATTATA 7236

109573145 AACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTC 109573204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7237 AACCTTATAGTTATGACAAAAGTGCTTAATAAAGGCTCCATTAATCTGCAATTCCATCTC 7296

109573205 ACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACAGAGTGCCTAACATGGAACA 109573264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7297 ACACAATAAAAACTGCTCTCTTTAATCTTCCAAGTATTACAGAGTGCCTAACATGGAACA 7356

109573265 ATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGACAAGAAGATGAAGTGTCATG 109573324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7357 ATAGTGCTTTACAACAGAACTTCACAAACAAAAATGCAGACAAGAAGATGAAGTGTCATG 7416

109573325 AAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACTGCATCTTTTCCTTTAAAAA 109573384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7417 AAGCTTTTCAATAAAATACCAAACTGCAACACAGGACTACTGCATCTTTTCCTTTAAAAA 7476

109573385 AAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAATAACATGGCATTCAAAAAAC 109573444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7477 AAAAAAAAAAAAGGAGAAAAAAACTGCTAGCTGTTTTTAATAACATGGCATTCAAAAAAC 7536

109573445 TTTATGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGACCTGCAGGAATATATATGTG 109573504
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7537 TTTACGTTGCTGCCAGGTCATTTAATTTTAAATGTCCAGACCTGCAGGAATATATATGTG 7596

109573505 ATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCATTCATAAAGTAAGGGGATT 109573564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7597 ATGTTGCAAGTCACTAACCTCTATGGGCCTCAATTTCTTCATTCATAAAGTAAGGGGATT 7656

109573565 CGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAATTTGCTTTAACTTACATTTC 109573624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7657 CGTTTGTCTAATTTCTATGATTTCCCTTCAAGTTTTATAATTTGCTTTAACTTACATTTC 7716

109573625 AATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATATATAGAAAATATAAAGTCCG 109573684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7717 AATATCAGAAAGTACATATTCTTGGGAAACATCAAGAATATATAGAAAATATAAAGTCCG 7776

109573685 GGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAAGAAGAAACAAAATAGATTT 109573744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7777 GGATAATCAGAAGCCTGTAATTAATAAAGTCTGTTTAATAAGAAGAAACAAAATAGATTT 7836

109573745 GCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTTCTAACCAAAGCTCTGTCAT 109573804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7837 GCATTAGATCACTTAAGCAAACAAACAAAAGAAAAGCTCTTCTAACCAAAGCTCTGTCAT 7896

109573805 GTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACGTGCCCCTGCTTACTGTTGA 109573864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7897 GTCTGCTAATCACCTAACATTTGTAACATGGGTGCAGCACGTGCCCCTGCTTACTGTTGA 7956

109573865 CAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTGGAACTGTGAATGATTTTTG 109573924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7957 CAGCAGTTCTCAATTTATCAATTACTTTAATTTACCTTCTGGAACTGTGAATGATTTTTG 8016

109573925 GCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTATATAACTATAAAAAGAAAC 109573984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8017 GCCAGAAGAAATAAATTATGTTTAAAGCAGGTGCAACTTTATATAACTATAAAAAGAAAC 8076

109573985 TAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCTGGAAAAAAATATAAGAAAT 109574044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8077 TAATATAAACTGTATGTTGTATACATGCATAAAATATCTCTGGAAAAAAATATAAGAAAT 8136

109574045 TGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGAATAGAAATGGAATCTGTAC 109574104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8137 TGGTGATACTGGTTGTATCCTAGAAGGAAAACTAGATAAGAATAGAAATGGAATCTGTAC 8196

109574105 AACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAACCTGTACATGTACCCCTGA 109574164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8197 AACAAAGCAGCCCTGTAACATGAGTTTACCTATATAACAAACCTGTACATGTACCCCTGA 8256

109574165 ACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTTTTGAATTTTGTACCATGGA 109574224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8257 ACCTAAAATGAATAGGAATGGGAAGATCACTATATACCCTTTTGAATTTTGTACCATGGA 8316

109574225 CAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATAAATAACAAATTTACATTTG 109574284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8317 CAAATATTACCTATTCAAAAAATTAAAAATAATAAAACATAAATAACAAATTTACATTTG 8376

109574285 CAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGAAGTAATAATATTTCAAAGG 109574344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8377 CAAACTACTAGAAGGAATTAGTAAACTAATGCATATAATGAAGTAATAATATTTCAAAGG 8436

109574345 AATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGATCTGATTTGAATATCATTT 109574404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8437 AATTTGTATTTCTTCCCCATAACCCAAGACCTCTTCTCAGATCTGATTTGAATATCATTT 8496

109574405 CAATCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTTGCTCTCAACACC 109574464
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8497 CAATCTTTCTTTC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGACAGGGTCTTGCTCTCAACACC 8555

109574465 AGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCTTGACCACCTGAGCTGAAGA 109574524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8556 AGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATCTTAGCTCACTGCAGCCTTGACCACCTGAGCTGAAGA 8615

109574525 GATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGGCATGCACCACCATACCTGG 109574584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8616 GATCCTCCCGCCTCAGCCTTCCCAGTAATTGGGACTACAGGCATGCACCACCATACCTGG 8675

109574585 CTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCCCA 109574644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8676 CTAATTTTTGTGTTTTTTGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCCCA 8735

109574645 CTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGAGAACGCAGGCATA 109574704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8736 CTCCTAGGCTACAGATATCTGCCAGCCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGAGAACGCAGGCATA 8795

109574705 AGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAGGACTAAGGTATGTGTGTTC 109574764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8796 AGCAACTGCACCTGGCCTCAATCTTTCTTTATGAGACTAAGGACTAAGGTATGTGTGTTC 8855

109574765 TTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTTAAAATTACTGAAGTACTAA 109574824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8856 TTTCCATATTCAAACCCAGAAATTTTTAAACAAGTATGTTTAAAATTACTGAAGTACTAA 8915

109574825 CAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA 109574884
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     8916 CAATTCACATGATAAAAACGATTTTCTGGCTAGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCA 8975

109574885 GCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGATCGAGACCATCCTGGCTAAC 109574944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     8976 GCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGTGGATCTCGAGGTCAGATCCAGACCATCCTGGCTAAC 9035

109574945 ACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAGAAGATTAGCCAGGCGTGGTGACGGGCGC 109575004
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     9036 ACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAGATTAGCCAGGCGTGGTGACGGGCGC 9095

109575005 CTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGTGGA 109575064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9096 CTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGTGGA 9155

109575065 GCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTGGGCGACAGAGCGAGACTGT 109575124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9156 GCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCAGCACTGCACTCCAGCTTGGGCGACAGAGCGAGACTGT 9215

109575125 CTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTCAATTAAGTCATGTAATGCA 109575184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9216 CTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATTTTCTTACTCAAGCTGCTCAATTAAGTCATGTAATGCA 9275

109575185 GAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGACCAGG 109575244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9276 GAAAAGGTAAAGAAAAAAAATTGTCAACTTTGACACTAAAAATGTAAAATGTAGACCAGG 9335

109575245 CATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCACTTGA 109575304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9336 CATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGTGGGCGGATCACTTGA 9395

109575305 GGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAAATAC 109575364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9396 GGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACGTGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAAATAC 9455

109575365 ATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGC 109575424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9456 ATAAATTAACCAGGCATGGTGGCATGTGCCTATAATCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGC 9515

109575425 AGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCA 109575484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9516 AGGAATATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCA 9575

109575485 CTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTAAATC 109575544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9576 CTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGACACTCTGTCCAAAAAAAAAAATTACAAAACGTAAATC 9635

109575545 TTCCAT 109575550
          ||||||
     9636 TTCCAT 9641

Alignment time is 11.7635 s

