
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10472480,10493779] =>     21300 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2751] =>      2751 nucs 'mol-32-1f16-140552_2751'

Score:        2751
Aligned:      2751        nucs
Identic:      2751 (100%) nucs =>       110 (100%)      2641 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10482041,10482150] EXCISED REGION [10482152,10484792]
 second seq =>  [       1,     110] EXCISED REGION [     111,    2751]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [10482151,10482151]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [10482151,10482164] to [10482152,10482165]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10482041 GGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTAAGCCCAGGAGATGGAGGTTGCAGTGACCCA 10482100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTAAGCCCAGGAGATGGAGGTTGCAGTGACCCA 60

 10482101 TGACCACACCACTGTACTCCAGCCTCGGTGATAAAGCAAAACCCTGTCTC 10482150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGACCACACCACTGTACTCCAGCCTCGGTGATAAAGCAAAACCCTGTCTC 110

EXCISED REGION

 10482152 AAAAAAAAAAAAAATAGTGGCAGCAATTACTACCATTGAGTGTGCCTGACCCCTGGACCC 10482211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      111 AAAAAAAAAAAAAATAGTGGCAGCAATTACTACCATTGAGTGTGCCTGACCCCTGGACCC 170

 10482212 CTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAG 10482271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      171 CTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAG 230

 10482272 TGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGAATTCAGGTGGTTCCTCCTGTC 10482331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      231 TGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGAATTCAGGTGGTTCCTCCTGTC 290

 10482332 TCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCACCACGCCCCACTAATTTTTTGT 10482391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      291 TCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCACCACGCCCCACTAATTTTTTGT 350

 10482392 ATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGCTGGTCTCAAAACTCCAGGGCT 10482451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      351 ATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGCTGGTCTCAAAACTCCAGGGCT 410

 10482452 CAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGAAGCCACT 10482511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      411 CAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGAAGCCACT 470

 10482512 ACCCCCTGGCCAGCAGTGCGTGCTGTTTGTACTGAGAGAAACCAGATGTTACCTCTCAGC 10482571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      471 ACCCCCTGGCCAGCAGTGCGTGCTGTTTGTACTGAGAGAAACCAGATGTTACCTCTCAGC 530

 10482572 ACCAGTGGTGAATTTGCTTTGCACCCCAGTCTTCAAAAGGTTTCTGGTGGGGGTGCCTCT 10482631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      531 ACCAGTGGTGAATTTGCTTTGCACCCCAGTCTTCAAAAGGTTTCTGGTGGGGGTGCCTCT 590

 10482632 GTGTGCTGCGCAGCAGGTGTAGAGGTTAAGAAAGGTCAGAGCTTCTCAAACTAACCTGTT 10482691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      591 GTGTGCTGCGCAGCAGGTGTAGAGGTTAAGAAAGGTCAGAGCTTCTCAAACTAACCTGTT 650

 10482692 ACAACTCCCCCACTCCCACCACCACCCCCGAGATTTTGAAAAAATGTAGATTCTGATTCG 10482751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      651 ACAACTCCCCCACTCCCACCACCACCCCCGAGATTTTGAAAAAATGTAGATTCTGATTCG 710

 10482752 GTAGAATCCTGAAAATGGCTCTTCGTGGGGTGGAGCCCCATGTTCTGCATTTCTATCTTT 10482811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      711 GTAGAATCCTGAAAATGGCTCTTCGTGGGGTGGAGCCCCATGTTCTGCATTTCTATCTTT 770

 10482812 TTTTTGAGACAAGGTCTCATTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGTGGCACTATCATGG 10482871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      771 TTTTTGAGACAAGGTCTCATTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGTGGCACTATCATGG 830

 10482872 CTCACTGCAGCCTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCCTCCCAACTCAGCCTCCTGGCTAG 10482931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      831 CTCACTGCAGCCTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCCTCCCAACTCAGCCTCCTGGCTAG 890

 10482932 CTGGGACTCCAGGTGCACACCGCCACGCCTGGCTAATTTCTAAACTTTTTGTAGAGATGA 10482991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      891 CTGGGACTCCAGGTGCACACCGCCACGCCTGGCTAATTTCTAAACTTTTTGTAGAGATGA 950

 10482992 GCTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGATCTTCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCGCCT 10483051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      951 GCTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGATCTTCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCGCCT 1010

 10483052 CAGCCTCCCAAGTGCTGAGACCACAGGCATGAGCCACCACGCCTGGCCCTGGGCCCCAAT 10483111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 CAGCCTCCCAAGTGCTGAGACCACAGGCATGAGCCACCACGCCTGGCCCTGGGCCCCAAT 1070

 10483112 CTTGGCTCCGCCACAAATTCAGCCTTACTTCACAAGTTAGTTAACCTCTATGTGCGTATT 10483171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 CTTGGCTCCGCCACAAATTCAGCCTTACTTCACAAGTTAGTTAACCTCTATGTGCGTATT 1130

 10483172 TTCTCCTCTATATAAAAGGGATGATGATAACACCCACCTCACAGAGCCGTCTTCCCGACT 10483231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 TTCTCCTCTATATAAAAGGGATGATGATAACACCCACCTCACAGAGCCGTCTTCCCGACT 1190

 10483232 AAACACAAGGCACTTGCACCAGAGCCACCACACACTGAGCACTATGTAAGGTTTACTGTT 10483291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 AAACACAAGGCACTTGCACCAGAGCCACCACACACTGAGCACTATGTAAGGTTTACTGTT 1250

 10483292 TATTACCTGCCTCCTAAAGAGAGGCTGCCAAACAATTCTGAGTGTGGAAGGAGGTGGAAA 10483351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 TATTACCTGCCTCCTAAAGAGAGGCTGCCAAACAATTCTGAGTGTGGAAGGAGGTGGAAA 1310

 10483352 GAGGGGTTTTGCCCTTAGCCAAGTCAGTCCTGTTCAGTCTAACCACTAAAAGGGACAGAT 10483411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 GAGGGGTTTTGCCCTTAGCCAAGTCAGTCCTGTTCAGTCTAACCACTAAAAGGGACAGAT 1370

 10483412 CTGGTGGCTTCTTTGAGGTAGAAATTATAGGCCCCTAATGATGTCTGCCACAACTCTGCT 10483471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 CTGGTGGCTTCTTTGAGGTAGAAATTATAGGCCCCTAATGATGTCTGCCACAACTCTGCT 1430

 10483472 TTACTGGGGACACAAAGGTGTGTTATACAGACAAGGGTCAGACAAGGAAACAGGAGTTTT 10483531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 TTACTGGGGACACAAAGGTGTGTTATACAGACAAGGGTCAGACAAGGAAACAGGAGTTTT 1490

 10483532 GTTTTCACTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTTTCCCAGCTGGAGTGCAGGGCGCGATCTCG 10483591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 GTTTTCACTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTTTCCCAGCTGGAGTGCAGGGCGCGATCTCG 1550

 10483592 GCTCACTGCAACCTCTACCTCCCTAGTTCACGCAGTTCTCCTGCTTCAACCTCCTGAATA 10483651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 GCTCACTGCAACCTCTACCTCCCTAGTTCACGCAGTTCTCCTGCTTCAACCTCCTGAATA 1610

 10483652 GCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACAG 10483711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 GCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACAG 1670

 10483712 GGTTTCCCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCCGCCT 10483771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 GGTTTCCCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCCGCCT 1730

 10483772 CAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGA 10483831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 CAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGA 1790

 10483832 TTGCCAAGCAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGA 10483891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 TTGCCAAGCAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGA 1850

 10483892 TGTGGAGCCCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGC 10483951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 TGTGGAGCCCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGC 1910

 10483952 GAATGCGTCTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGT 10484011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 GAATGCGTCTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGT 1970

 10484012 GTAACAAACCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAAT 10484071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 GTAACAAACCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAAT 2030

 10484072 TCTGTGGGTCATGAATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTG 10484131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 TCTGTGGGTCATGAATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTG 2090

 10484132 TCTGCTCCACAATGTCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATG 10484191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 TCTGCTCCACAATGTCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATG 2150

 10484192 GCTCGGGGGCGTGGAGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTG 10484251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 GCTCGGGGGCGTGGAGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTG 2210

 10484252 GGACCTCAGCTAGGGCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAG 10484311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 GGACCTCAGCTAGGGCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAG 2270

 10484312 GCCAGAGAAACATCTTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACAC 10484371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 GCCAGAGAAACATCTTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACAC 2330

 10484372 GTGGCTTTTAAAAACCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTATAGCCATCCAAAATCG 10484431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 GTGGCTTTTAAAAACCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTATAGCCATCCAAAATCG 2390

 10484432 GTTCCAAGCAAGCCGCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTT 10484491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 GTTCCAAGCAAGCCGCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTT 2450

 10484492 GATGGGGGAGTATGAGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACATTGTTCTTGCCATC 10484551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 GATGGGGGAGTATGAGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACATTGTTCTTGCCATC 2510

 10484552 TTCGTAAATTACAGTCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAAAATCTGTTACATAGCA 10484611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 TTCGTAAATTACAGTCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAAAATCTGTTACATAGCA 2570

 10484612 GAGTTGGGAACCGGCACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCATATAGTATATATACTA 10484671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 GAGTTGGGAACCGGCACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCATATAGTATATATACTA 2630

 10484672 CTAGCTAACATTGAGAGCATATGCCAGGCTCTGTAACTCATTGAATGCTCGCAGCACCCT 10484731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 CTAGCTAACATTGAGAGCATATGCCAGGCTCTGTAACTCATTGAATGCTCGCAGCACCCT 2690

 10484732 CTGAAGTAAGCACTATTACTATCCCTAATTTAGAGATGAAGCACACTGATATTAAGTAAT 10484791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 CTGAAGTAAGCACTATTACTATCCCTAATTTAGAGATGAAGCACACTGATATTAAGTAAT 2750

 10484792 T 10484792
          |
     2751 T 2751

Alignment time is 2.22562 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10472480,10493779] =>     21300 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    4156] =>      4156 nucs 'mol-32-1f63-177965_4156'

Score:        3969
Aligned:      4158        nucs
Identic:      4140 (100%) nucs =>      1518 (100%)      2622 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10480958,10482480] EXCISED REGION [10483780,10486412]
 second seq =>  [       1,    1521] EXCISED REGION [    1522,    4156]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1299 nucs [10482481,10483779]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        22 nucs [10482481,10482502] to [10483780,10483801]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [10482480,10482480] to [10483780,10483780]
 second seq =>         1 nucs [1521,1521] to [1522,1522]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10480958 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTTGGCTCATTGCAAGCTCCACCTCCCGGGT 10481017
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGGTCTTGGCTCATTGCAAGCTCCACCTCCCGGGT 60

 10481018 TCACACCATTCTCCCACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCAC 10481077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCACACCATTCTCCCACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCAC 120

 10481078 TCCTGGCTTATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATG 10481137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCTGGCTTATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATG 180

 10481138 GTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 10481197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 240

 10481198 GGCGTGAGCCACCGTATTTTAAAATTTTGTTTAGAGATGTGGTCTTGCTATGATGCCCAG 10481257
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCGTGAGCCACTGTATTTTAAAATTTTGTTTAGAGATGTGGTCTTGCTATGATGCCCAG 300

 10481258 GCTGATGTCAAACACCTGGACTCAAGCAATCCTCGTGCCTCGACCTCCCAAGGTGCTGGG 10481317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTGATGTCAAACACCTGGACTCAAGCAATCCTCGTGCCTCGACCTCCCAAGGTGCTGGG 360

 10481318 ATTATAGGCAGGAGCCACCGTGCCCTGCTACCAACTTTTTAAACTCTGCCTAGATGTGAG 10481377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTATAGGCAGGAGCCACCGTGCCCTGCTACCAACTTTTTAAACTCTGCCTAGATGTGAG 420

 10481378 TACTTCGCTAGATCAGCCCCCACGCACCCCTCCTGCCCTCCCTGTACATTTAAGAGAAGC 10481437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACTTCGCTAGATCAGCCCCCACGCACCCCTCCTGCCCTCCCTGTACATTTAAGAGAAGC 480

 10481438 CCGAGTAGCCGCACGTGACGGGATTTTTCTTTAAGGCTTGTCAAAGGCACTGTTCGAGGG 10481497
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      481 CCGAGTAGCCGCACGTGACGGGATTTTTCTTTAAGGCGTGTCAAAGGCACTGTTCGAGGG 540

 10481498 GGATCTTTTCACCTGGCTCTGAGGCTGAGGGATGGACACTGCTGGAATGGAGAGAGAACA 10481557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGATCTTTTCACCTGGCTCTGAGGCTGAGGGATGGACACTGCTGGAATGGAGAGAGAACA 600

 10481558 GCAAGAGGTCAGAGGCTAAGTGTCAAAGGGCCCACGATGTTTCAAACAGTAATGATCAGA 10481617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCAAGAGGTCAGAGGCTAAGTGTCAAAGGGCCCACGATGTTTCAAACAGTAATGATCAGA 660

 10481618 AGGGAATCCACTCAGCCCCTTTCCGCTTACCTTCCAAAAAGCTGTGAGTGGTGGAGTTTG 10481677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGGAATCCACTCAGCCCCTTTCCGCTTACCTTCCAAAAAGCTGTGAGTGGTGGAGTTTG 720

 10481678 GTTTCAAATCCAGCCCTCCTTGCTTACTAGCTGTTAGACTTTGGGGAAATTATTTACTAT 10481737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTTCAAATCCAGCCCTCCTTGCTTACTAGCTGTTAGACTTTGGGGAAATTATTTACTAT 780

 10481738 CTGTGTTCTCAGTTTTCTCATTTGTAAAATGGGAAATAATAGCACCTGTGTCCTTGAGGC 10481797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGTGTTCTCAGTTTTCTCATTTGTAAAATGGGAAATAATAGCACCTGTGTCCTTGAGGC 840

 10481798 TACTTTGGGGATTCAGCAAGGGAAGATAGAGCAGTGCCTGGCACATAGTAAATACCTACA 10481857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TACTTTGGGGATTCAGCAAGGGAAGATAGAGCAGTGCCTGGCACATAGTAAATACCTACA 900

 10481858 CCAGTGGCAGCAAGGCTGGGTGCGCTGGCTCACACCGTAAGCCCAGCACTTTGGAAGGCC 10481917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAGTGGCAGCAAGGCTGGGTGCGCTGGCTCACACCGTAAGCCCAGCACTTTGGAAGGCC 960

 10481918 GAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGAC 10481977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGAC 1020

 10481978 CCCCATCTCTACAAAAAATAAAAATTAGCTGGGCGCAGTGGTGCACACCTATGATCCCAG 10482037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCCCATCTCTACAAAAAATAAAAATTAGCTGGGCGCAGTGGTGCACACCTATGATCCCAG 1080

 10482038 CTAGGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTAAGCCCAGGAGATGGAGGTTGCAGTGAC 10482097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTAGGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTAAGCCCAGGAGATGGAGGTTGCAGTGAC 1140

 10482098 CCATGACCACACCACTGTACTCCAGCCTCGGTGATAAAGCAAAACCCTGTCTCAAAAAAA 10482157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCATGACCACACCACTGTACTCCAGCCTCGGTGATAAAGCAAAACCCTGTCTCAAAAAAA 1200

 10482158 AAAAAAAATAGTGGCAGCAATTACTACCATTGAGTGTGCCTGACCCCTGGACCCCTGGAG 10482217
          ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAAAA--TAGTGGCAGCAATTACTACCATTGAGTGTGCCTGACCCCTGGACCCCTGGAG 1258

 10482218 CAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATTC 10482277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATTC 1318

 10482278 AATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGAATTCAGGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCC 10482337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 AATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGAATTCAGGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCC 1378

 10482338 TCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCACCACGCCCCACTAATTTTTTGTATTTTT 10482397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 TCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCACCACGCCCCACTAATTTTTTGTATTTTT 1438

 10482398 TGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGCTGGTCTCAAAACTCCAGGGCTCAAGTG 10482457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGCTGGTCTCAAAACTCCAGGGCTCAAGTG 1498

 10482458 ATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCC 10482480
          |||||||||||||||||||||||
     1499 ATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCC 1521

EXCISED REGION

 10483780 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAG 10483839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1522 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAG 1581

 10483840 CAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGC 10483899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1582 CAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGC 1641

 10483900 CCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGT 10483959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1642 CCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGT 1701

 10483960 CTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAA 10484019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 CTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAA 1761

 10484020 CCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGG 10484079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 CCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGG 1821

 10484080 TCATGAATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCC 10484139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 TCATGAATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCC 1881

 10484140 ACAATGTCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGG 10484199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 ACAATGTCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGG 1941

 10484200 GCGTGGAGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCA 10484259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 GCGTGGAGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCA 2001

 10484260 GCTAGGGCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAGGCCAGAGA 10484319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 GCTAGGGCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAGGCCAGAGA 2061

 10484320 AACATCTTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACACGTGGCTTT 10484379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 AACATCTTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACACGTGGCTTT 2121

 10484380 TAAAAACCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTATAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAG 10484439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2122 TAAAAACCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTAGAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAG 2181

 10484440 CAAGCCGCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTTGATGGGGG 10484499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 CAAGCCGCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTTGATGGGGG 2241

 10484500 AGTATGAGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACATTGTTCTTGCCATCTTCGTAAA 10484559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 AGTATGAGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACATTGTTCTTGCCATCTTCGTAAA 2301

 10484560 TTACAGTCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAAAATCTGTTACATAGCAGAGTTGGG 10484619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 TTACAGTCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAAAATCTGTTACATAGCAGAGTTGGG 2361

 10484620 AACCGGCACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCATATAGTATATATACTACTAGCTAA 10484679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 AACCGGCACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCATATAGTATATATACTACTAGCTAA 2421

 10484680 CATTGAGAGCATATGCCAGGCTCTGTAACTCATTGAATGCTCGCAGCACCCTCTGAAGTA 10484739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 CATTGAGAGCATATGCCAGGCTCTGTAACTCATTGAATGCTCGCAGCACCCTCTGAAGTA 2481

 10484740 AGCACTATTACTATCCCTAATTTAGAGATGAAGCACACTGATATTAAGTAATTCGTCCAA 10484799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 AGCACTATTACTATCCCTAATTTAGAGATGAAGCACACTGATATTAAGTAATTCGTCCAA 2541

 10484800 GGTCAGAGCTACTGAAGAACTGGAATTGAACCCCAGAGATCTGGTGCCAGAGTCCATACA 10484859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 GGTCAGAGCTACTGAAGAACTGGAATTGAACCCCAGAGATCTGGTGCCAGAGTCCATACA 2601

 10484860 CTTAATCATGAAACTGACCTGTCGGCGTGCACAGTTCATCGCCCCACTCATTCAGTCATT 10484919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 CTTAATCATGAAACTGACCTGTCGGCGTGCACAGTTCATCGCCCCACTCATTCAGTCATT 2661

 10484920 CGGCATGTTTATGGTACACCTACCATGTGCCAAGCATTGTGCTAGGTACCCTCTGTC-GG 10484978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     2662 CGGCATGTTTATGGTACACCTACCATGTGCCAAGCATTGTGCTAGGTACCCTCTGTCAGG 2721

 10484979 GGTGAGAGAAGTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTTACAGGATACATATAATATTTAACG 10485038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2722 GGTGAGAGAAGTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTTACAGAATACATATAATATTTAACG 2781

 10485039 ATAATTATTTTTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAAACCTATGAAATGGAGATTGATTTT 10485098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 ATAATTATTTTTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAAACCTATGAAATGGAGATTGATTTT 2841

 10485099 TTTTTTTTTTTTTGAGATGTAGTCTCACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATC 10485158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 TTTTTTTTTTTTTGAGATGTAGTCTCACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATC 2901

 10485159 TTGGCTCACTACGACCTCCGCCTCCTGGGCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTTAGT 10485218
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 TTGGCTCACTACGACCTCTGCCTCCTGGGCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTTAGT 2961

 10485219 AGCTGAGATTACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAT 10485278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 AGCTGAGATTACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAT 3021

 10485279 GGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCACAAACTCCTGACCTCGGGTGATCCACCCGC 10485338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3022 GGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCACAAATTCCTGACCTCGGGTGATCCACCCGC 3081

 10485339 CTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAGCCAAGATTGAT 10485398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 CTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAGCCAAGATTGAT 3141

 10485399 TTTTGTATTGACATTTTACAGTGCAG-TTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGTGGG 10485457
          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3142 TTTTGTATTGACATTTTACAGTGCAGTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTTTTGTGGG 3201

 10485458 GAAAAGAAAGATCAGATTGTTACTGTGTTTGTGTAGAAAGAAGTAGACATAAGAGACTCC 10485517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 GAAAAGAAAGATCAGATTGTTACTGTGTTTGTGTAGAAAGAAGTAGACATAAGAGACTCC 3261

 10485518 ATTTTGTTTTGTACTAAGAGAAATTCTTCTGCCTTGAGATGCTGTTAATCTGTAACCTTA 10485577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 ATTTTGTTTTGTACTAAGAGAAATTCTTCTGCCTTGAGATGCTGTTAATCTGTAACCTTA 3321

 10485578 CCCCCAACCCTGTGCTCTCCGAAACATGTGCTGTGTCAACTCAGGGTTAAATGGATTAAG 10485637
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3322 CCCCCAACCCTGTGCTCTCCGAAACATGTGCCGTGTCAACTCAGGGTTAAATGGATTAAG 3381

 10485638 GGCTGTGCAAGATGTGCTTTGTTAAACAGACGCTTGAAGGCAGCATGCTCGTTAAGAGTC 10485697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 GGCTGTGCAAGATGTGCTTTGTTAAACAGACGCTTGAAGGCAGCATGCTCGTTAAGAGTC 3441

 10485698 ATCACCACTCCCTAATGTGTCCGGAATTGGTGGGTTCTTGGTCTCACTAGCTCCAAGAAT 10485757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 ATCACCACTCCCTAATGTGTCCGGAATTGGTGGGTTCTTGGTCTCACTAGCTCCAAGAAT 3501

 10485758 GAAGCCGCGGACCCTCGCGGTGAGTGTTACAGCTCTTAAGGTGGCGCATCTGGAGTTTGT 10485817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 GAAGCCGCGGACCCTCGCGGTGAGTGTTACAGCTCTTAAGGTGGCGCATCTGGAGTTTGT 3561

 10485818 TCCTTCTGATGTTCGGATGTGTTCGGAGTTTCTTCCTTCTCGTGGGCTCGTGGTCTCACT 10485877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3562 TCCTTCTGATGTTCGGATGTGTTCGGAGTTTCTTCCTTCTGGTGGGCTCGTGGTCTCACT 3621

 10485878 GGCTCAGGAGTGAAGCTGCAGATCTTCGCGGTGAGTGTTACAGCTCATAAAAGCAGCGTG 10485937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 GGCTCAGGAGTGAAGCTGCAGATCTTCGCGGTGAGTGTTACAGCTCATAAAAGCAGCGTG 3681

 10485938 GACCCAAAGAGTGAGCAGTAACAAGATTTATTGCAAAGAACAAAACTGCCACAGCGTGGA 10485997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 GACCCAAAGAGTGAGCAGTAACAAGATTTATTGCAAAGAACAAAACTGCCACAGCGTGGA 3741

 10485998 AGGGAACCCAAGCGGGTTGCCACTGCTGGCTTGGGCAGCCTGCTTTTATTCTCTTATCTG 10486057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 AGGGAACCCAAGCGGGTTGCCACTGCTGGCTTGGGCAGCCTGCTTTTATTCTCTTATCTG 3801

 10486058 GCCCCACCCACGTCCTGCTGATTGGTAGAGCCCAGTGGTCTGTTTTGACAGGGCGCTGAC 10486117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 GCCCCACCCACGTCCTGCTGATTGGTAGAGCCCAGTGGTCTGTTTTGACAGGGCGCTGAC 3861

 10486118 TGGTGCGTTTACAATCCCTGAGCTAGACACAAAGGTTCTCCAAGGCCCCACCAGAGTAGC 10486177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3862 TGGTGCGTTTACAATCCCTGAGCTAGACACAAAGGTTCTCCAAGGCCCTACCAGAGTAGC 3921

 10486178 TAGATACAGAGTGTCGATTGGTGCATTCACAAACCCTGGGCTAAACAAAGGGTGCTGATT 10486237
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 TAGATACAGAGTGTCGACTGGTGCATTCACAAACCCTGGGCTAAACAAAGGGTGCTGATT 3981

 10486238 GGTGTATTTACAAACCTTGAGCTAGATACAGAGTGCCGATTGGTGTATTTATAATCCCTG 10486297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3982 GGTGTATTTACAAACCTTGAGCTAGATACAGAGTGCCGATTGGTATATTTATAATCCCTG 4041

 10486298 AGCTAGACATAAAGGTTCTCCTCCTCCCCACCAGACTCAGGAGCCCAGCTGGCTTCACCC 10486357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4042 AGCTAGACATAAAGGTTCTCCTCCTCCCCACCAGACTCAGGATCCCAGCTGGCTTCACCC 4101

 10486358 AGTGGATCCTGCACCAGGCTGCAGGTGGAGCTGCCTGCCAGTCCTGCGCCATGCG 10486412
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 AGTGGATCCTGCACCAGGCTGCAGGTGGAGCTGCCTGCCAGTCCTGCGCCATGCG 4156

Alignment time is 3.39705 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10472480,10493779] =>     21300 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3744] =>      3744 nucs 'mol-32-2081-097745_3744'

Score:        3743
Aligned:      3743        nucs
Identic:      3743 (100%) nucs =>       652 (100%)      3091 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10480796,10481447] EXCISED REGION [10481449,10484539]
 second seq =>  [       1,     652] EXCISED REGION [     654,    3744]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [10481448,10481448]
 second seq =>         1 nucs [653,653]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [10481447,10481447] to [10481449,10481449]
 second seq =>         1 nucs [652,652] to [654,654]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10480796 CTAAGAGTTGCCTAAGAGGAGCGAGCAGCGCCTGTGCCTCGACAGCTGGTGTCTACAGTG 10480855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTAAGAGTTGCCTAAGAGGAGCGAGCAGCGCCTGTGCCTCGACAGCTGGTGTCTACAGTG 60

 10480856 TGACCTCTGACCTCTCGGCTAATGTCAGTGAAGGAGACAATTTTCATTAAATCACCAACT 10480915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGACCTCTGACCTCTCGGCTAATGTCAGTGAAGGAGACAATTTTCATTAAATCACCAACT 120

 10480916 TTTAATTTATTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGC 10480975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTAATTTATTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGC 180

 10480976 AGTGGCGTGGTCTTGGCTCATTGCAAGCTCCACCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCCACC 10481035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTGGCGTGGTCTTGGCTCATTGCAAGCTCCACCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCCACC 240

 10481036 TCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACTCCTGGCTTATTTTTTTG 10481095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACTCCTGGCTTATTTTTTTG 300

 10481096 TATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCT 10481155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCT 360

 10481156 TGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTATT 10481215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTATT 420

 10481216 TTAAAATTTTGTTTAGAGATGTGGTCTTGCTATGATGCCCAGGCTGATGTCAAACACCTG 10481275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAAAATTTTGTTTAGAGATGTGGTCTTGCTATGATGCCCAGGCTGATGTCAAACACCTG 480

 10481276 GACTCAAGCAATCCTCGTGCCTCGACCTCCCAAGGTGCTGGGATTATAGGCAGGAGCCAC 10481335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACTCAAGCAATCCTCGTGCCTCGACCTCCCAAGGTGCTGGGATTATAGGCAGGAGCCAC 540

 10481336 CGTGCCCTGCTACCAACTTTTTAAACTCTGCCTAGATGTGAGTACTTCGCTAGATCAGCC 10481395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CGTGCCCTGCTACCAACTTTTTAAACTCTGCCTAGATGTGAGTACTTCGCTAGATCAGCC 600

 10481396 CCCACGCACCCCTCCTGCCCTCCCTGTACATTTAAGAGAAGCCCGAGTAGCC 10481447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCACGCACCCCTCCTGCCCTCCCTGTACATTTAAGAGAAGCCCGAGTAGCC 652

EXCISED REGION

 10481449 CACGTGACGGGATTTTTCTTTAAGGCTTGTCAAAGGCACTGTTCGAGGGGGATCTTTTCA 10481508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 CACGTGACGGGATTTTTCTTTAAGGCTTGTCAAAGGCACTGTTCGAGGGGGATCTTTTCA 713

 10481509 CCTGGCTCTGAGGCTGAGGGATGGACACTGCTGGAATGGAGAGAGAACAGCAAGAGGTCA 10481568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 CCTGGCTCTGAGGCTGAGGGATGGACACTGCTGGAATGGAGAGAGAACAGCAAGAGGTCA 773

 10481569 GAGGCTAAGTGTCAAAGGGCCCACGATGTTTCAAACAGTAATGATCAGAAGGGAATCCAC 10481628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 GAGGCTAAGTGTCAAAGGGCCCACGATGTTTCAAACAGTAATGATCAGAAGGGAATCCAC 833

 10481629 TCAGCCCCTTTCCGCTTACCTTCCAAAAAGCTGTGAGTGGTGGAGTTTGGTTTCAAATCC 10481688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 TCAGCCCCTTTCCGCTTACCTTCCAAAAAGCTGTGAGTGGTGGAGTTTGGTTTCAAATCC 893

 10481689 AGCCCTCCTTGCTTACTAGCTGTTAGACTTTGGGGAAATTATTTACTATCTGTGTTCTCA 10481748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 AGCCCTCCTTGCTTACTAGCTGTTAGACTTTGGGGAAATTATTTACTATCTGTGTTCTCA 953

 10481749 GTTTTCTCATTTGTAAAATGGGAAATAATAGCACCTGTGTCCTTGAGGCTACTTTGGGGA 10481808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 GTTTTCTCATTTGTAAAATGGGAAATAATAGCACCTGTGTCCTTGAGGCTACTTTGGGGA 1013

 10481809 TTCAGCAAGGGAAGATAGAGCAGTGCCTGGCACATAGTAAATACCTACACCAGTGGCAGC 10481868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 TTCAGCAAGGGAAGATAGAGCAGTGCCTGGCACATAGTAAATACCTACACCAGTGGCAGC 1073

 10481869 AAGGCTGGGTGCGCTGGCTCACACCGTAAGCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGAGG 10481928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 AAGGCTGGGTGCGCTGGCTCACACCGTAAGCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGAGG 1133

 10481929 ACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTA 10481988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 ACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTA 1193

 10481989 CAAAAAATAAAAATTAGCTGGGCGCAGTGGTGCACACCTATGATCCCAGCTAGGTGGCAG 10482048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 CAAAAAATAAAAATTAGCTGGGCGCAGTGGTGCACACCTATGATCCCAGCTAGGTGGCAG 1253

 10482049 GCTGAGGTGGGAGGATCGCTTAAGCCCAGGAGATGGAGGTTGCAGTGACCCATGACCACA 10482108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 GCTGAGGTGGGAGGATCGCTTAAGCCCAGGAGATGGAGGTTGCAGTGACCCATGACCACA 1313

 10482109 CCACTGTACTCCAGCCTCGGTGATAAAGCAAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATAG 10482168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 CCACTGTACTCCAGCCTCGGTGATAAAGCAAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATAG 1373

 10482169 TGGCAGCAATTACTACCATTGAGTGTGCCTGACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTT 10482228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TGGCAGCAATTACTACCATTGAGTGTGCCTGACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTT 1433

 10482229 TTTTTTTAGACTGGGTCTTGCTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACTGCTC 10482288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 TTTTTTTAGACTGGGTCTTGCTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACTGCTC 1493

 10482289 ACTGCAACTTTGAACTCCCCGAATTCAGGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGC 10482348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 ACTGCAACTTTGAACTCCCCGAATTCAGGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGC 1553

 10482349 TGGTTCTACGGGCATGTGCCACCACGCCCCACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAA 10482408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 TGGTTCTACGGGCATGTGCCACCACGCCCCACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAA 1613

 10482409 GGTCTCACCATGTTGTCTAGGCTGGTCTCAAAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCC 10482468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 GGTCTCACCATGTTGTCTAGGCTGGTCTCAAAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCC 1673

 10482469 ACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGAAGCCACTACCCCCTGGCCAGCAGT 10482528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 ACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGAAGCCACTACCCCCTGGCCAGCAGT 1733

 10482529 GCGTGCTGTTTGTACTGAGAGAAACCAGATGTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAATTTGC 10482588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 GCGTGCTGTTTGTACTGAGAGAAACCAGATGTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAATTTGC 1793

 10482589 TTTGCACCCCAGTCTTCAAAAGGTTTCTGGTGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAGCAGG 10482648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 TTTGCACCCCAGTCTTCAAAAGGTTTCTGGTGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAGCAGG 1853

 10482649 TGTAGAGGTTAAGAAAGGTCAGAGCTTCTCAAACTAACCTGTTACAACTCCCCCACTCCC 10482708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 TGTAGAGGTTAAGAAAGGTCAGAGCTTCTCAAACTAACCTGTTACAACTCCCCCACTCCC 1913

 10482709 ACCACCACCCCCGAGATTTTGAAAAAATGTAGATTCTGATTCGGTAGAATCCTGAAAATG 10482768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 ACCACCACCCCCGAGATTTTGAAAAAATGTAGATTCTGATTCGGTAGAATCCTGAAAATG 1973

 10482769 GCTCTTCGTGGGGTGGAGCCCCATGTTCTGCATTTCTATCTTTTTTTTGAGACAAGGTCT 10482828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 GCTCTTCGTGGGGTGGAGCCCCATGTTCTGCATTTCTATCTTTTTTTTGAGACAAGGTCT 2033

 10482829 CATTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGTGGCACTATCATGGCTCACTGCAGCCTCAAC 10482888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 CATTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGTGGCACTATCATGGCTCACTGCAGCCTCAAC 2093

 10482889 CTCCTGGGCTCAGGTGATCCTCCCAACTCAGCCTCCTGGCTAGCTGGGACTCCAGGTGCA 10482948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 CTCCTGGGCTCAGGTGATCCTCCCAACTCAGCCTCCTGGCTAGCTGGGACTCCAGGTGCA 2153

 10482949 CACCGCCACGCCTGGCTAATTTCTAAACTTTTTGTAGAGATGAGCTCTCCCTATGTTGCC 10483008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 CACCGCCACGCCTGGCTAATTTCTAAACTTTTTGTAGAGATGAGCTCTCCCTATGTTGCC 2213

 10483009 CAGGCTGATCTTCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGTGCTG 10483068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 CAGGCTGATCTTCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGTGCTG 2273

 10483069 AGACCACAGGCATGAGCCACCACGCCTGGCCCTGGGCCCCAATCTTGGCTCCGCCACAAA 10483128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 AGACCACAGGCATGAGCCACCACGCCTGGCCCTGGGCCCCAATCTTGGCTCCGCCACAAA 2333

 10483129 TTCAGCCTTACTTCACAAGTTAGTTAACCTCTATGTGCGTATTTTCTCCTCTATATAAAA 10483188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 TTCAGCCTTACTTCACAAGTTAGTTAACCTCTATGTGCGTATTTTCTCCTCTATATAAAA 2393

 10483189 GGGATGATGATAACACCCACCTCACAGAGCCGTCTTCCCGACTAAACACAAGGCACTTGC 10483248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 GGGATGATGATAACACCCACCTCACAGAGCCGTCTTCCCGACTAAACACAAGGCACTTGC 2453

 10483249 ACCAGAGCCACCACACACTGAGCACTATGTAAGGTTTACTGTTTATTACCTGCCTCCTAA 10483308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 ACCAGAGCCACCACACACTGAGCACTATGTAAGGTTTACTGTTTATTACCTGCCTCCTAA 2513

 10483309 AGAGAGGCTGCCAAACAATTCTGAGTGTGGAAGGAGGTGGAAAGAGGGGTTTTGCCCTTA 10483368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 AGAGAGGCTGCCAAACAATTCTGAGTGTGGAAGGAGGTGGAAAGAGGGGTTTTGCCCTTA 2573

 10483369 GCCAAGTCAGTCCTGTTCAGTCTAACCACTAAAAGGGACAGATCTGGTGGCTTCTTTGAG 10483428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 GCCAAGTCAGTCCTGTTCAGTCTAACCACTAAAAGGGACAGATCTGGTGGCTTCTTTGAG 2633

 10483429 GTAGAAATTATAGGCCCCTAATGATGTCTGCCACAACTCTGCTTTACTGGGGACACAAAG 10483488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 GTAGAAATTATAGGCCCCTAATGATGTCTGCCACAACTCTGCTTTACTGGGGACACAAAG 2693

 10483489 GTGTGTTATACAGACAAGGGTCAGACAAGGAAACAGGAGTTTTGTTTTCACTTTTGAGAC 10483548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 GTGTGTTATACAGACAAGGGTCAGACAAGGAAACAGGAGTTTTGTTTTCACTTTTGAGAC 2753

 10483549 AGTCTCACTCTGTTTCCCAGCTGGAGTGCAGGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTA 10483608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 AGTCTCACTCTGTTTCCCAGCTGGAGTGCAGGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTA 2813

 10483609 CCTCCCTAGTTCACGCAGTTCTCCTGCTTCAACCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGC 10483668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 CCTCCCTAGTTCACGCAGTTCTCCTGCTTCAACCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGC 2873

 10483669 CCACCACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCGTGTTGGC 10483728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 CCACCACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCGTGTTGGC 2933

 10483729 CAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAGTGCT 10483788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 CAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAGTGCT 2993

 10483789 GGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAGCAAAGAGAC 10483848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 GGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAGCAAAGAGAC 3053

 10483849 TTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGCCCATCATTT 10483908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 TTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGCCCATCATTT 3113

 10483909 TGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGTCTGCTCACT 10483968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 TGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGTCTGCTCACT 3173

 10483969 CTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAACCACCCCAA 10484028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 CTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAACCACCCCAA 3233

 10484029 AGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGGTCATGAATC 10484088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 AGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGGTCATGAATC 3293

 10484089 TGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCCACAATGTCT 10484148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 TGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCCACAATGTCT 3353

 10484149 GGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGGGCGTGGAGT 10484208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 GGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGGGCGTGGAGT 3413

 10484209 GTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCAGCTAGGGCT 10484268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 GTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCAGCTAGGGCT 3473

 10484269 ATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAGGCCAGAGAAACATCTTG 10484328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 ATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAGGCCAGAGAAACATCTTG 3533

 10484329 TTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACACGTGGCTTTTAAAAACCC 10484388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 TTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACACGTGGCTTTTAAAAACCC 3593

 10484389 AGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTATAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAGCAAGCCGCA 10484448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 AGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTATAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAGCAAGCCGCA 3653

 10484449 AGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTTGATGGGGGAGTATGAGG 10484508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 AGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTTGATGGGGGAGTATGAGG 3713

 10484509 TTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACATT 10484539
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 TTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACATT 3744

Alignment time is 3.0661 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10472480,10493779] =>     21300 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3915] =>      3915 nucs 'mol-32-20fa-017955_3915'

Score:        3871
Aligned:      3915        nucs
Identic:      3911 (100%) nucs =>      3513 (100%)       398 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10481464,10484976] EXCISED REGION [10484977,10485378]
 second seq =>  [       1,    3513] EXCISED REGION [    3515,    3915]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3514,3514]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [10485095,10485095]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10481464 TTCTTTAAGGCTTGTCAAAGGCACTGTTCGAGGGGGATCTTTTCACCTGGCTCTGAGGCT 10481523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCTTTAAGGCTTGTCAAAGGCACTGTTCGAGGGGGATCTTTTCACCTGGCTCTGAGGCT 60

 10481524 GAGGGATGGACACTGCTGGAATGGAGAGAGAACAGCAAGAGGTCAGAGGCTAAGTGTCAA 10481583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGGATGGACACTGCTGGAATGGAGAGAGAACAGCAAGAGGTCAGAGGCTAAGTGTCAA 120

 10481584 AGGGCCCACGATGTTTCAAACAGTAATGATCAGAAGGGAATCCACTCAGCCCCTTTCCGC 10481643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGGCCCACGATGTTTCAAACAGTAATGATCAGAAGGGAATCCACTCAGCCCCTTTCCGC 180

 10481644 TTACCTTCCAAAAAGCTGTGAGTGGTGGAGTTTGGTTTCAAATCCAGCCCTCCTTGCTTA 10481703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTACCTTCCAAAAAGCTGTGAGTGGTGGAGTTTGGTTTCAAATCCAGCCCTCCTTGCTTA 240

 10481704 CTAGCTGTTAGACTTTGGGGAAATTATTTACTATCTGTGTTCTCAGTTTTCTCATTTGTA 10481763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAGCTGTTAGACTTTGGGGAAATTATTTACTATCTGTGTTCTCAGTTTTCTCATTTGTA 300

 10481764 AAATGGGAAATAATAGCACCTGTGTCCTTGAGGCTACTTTGGGGATTCAGCAAGGGAAGA 10481823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATGGGAAATAATAGCACCTGTGTCCTTGAGGCTACTTTGGGGATTCAGCAAGGGAAGA 360

 10481824 TAGAGCAGTGCCTGGCACATAGTAAATACCTACACCAGTGGCAGCAAGGCTGGGTGCGCT 10481883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGAGCAGTGCCTGGCACATAGTAAATACCTACACCAGTGGCAGCAAGGCTGGGTGCGCT 420

 10481884 GGCTCACACCGTAAGCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCCAG 10481943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCTCACACCGTAAGCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCCAG 480

 10481944 GAGTCTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAATT 10482003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGTCTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAATT 540

 10482004 AGCTGGGCGCAGTGGTGCACACCTATGATCCCAGCTAGGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGA 10482063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCTGGGCGCAGTGGTGCACACCTATGATCCCAGCTAGGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGA 600

 10482064 TCGCTTAAGCCCAGGAGATGGAGGTTGCAGTGACCCATGACCACACCACTGTACTCCAGC 10482123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCGCTTAAGCCCAGGAGATGGAGGTTGCAGTGACCCATGACCACACCACTGTACTCCAGC 660

 10482124 CTCGGTGATAAAGCAAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATAGTGGCAGCAATTACTA 10482183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCGGTGATAAAGCAAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATAGTGGCAGCAATTACTA 720

 10482184 CCATTGAGTGTGCCTGACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGG 10482243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCATTGAGTGTGCCTGACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGG 780

 10482244 TCTTGCTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAAC 10482303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTGCTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAAC 840

 10482304 TCCCCGAATTCAGGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCAT 10482363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCCCGAATTCAGGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCAT 900

 10482364 GTGCCACCACGCCCCACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTG 10482423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGCCACCACGCCCCACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTG 960

 10482424 TCTAGGCTGGTCTCAAAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCCCAA 10482483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTAGGCTGGTCTCAAAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCCCAA 1020

 10482484 AGTGCTGGGATTACAGGCAGAAGCCACTACCCCCTGGCCAGCAGTGCGTGCTGTTTGTAC 10482543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTGCTGGGATTACAGGCAGAAGCCACTACCCCCTGGCCAGCAGTGCGTGCTGTTTGTAC 1080

 10482544 TGAGAGAAACCAGATGTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAATTTGCTTTGCACCCCAGTCT 10482603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGAGAGAAACCAGATGTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAATTTGCTTTGCACCCCAGTCT 1140

 10482604 TCAAAAGGTTTCTGGTGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAGCAGGTGTAGAGGTTAAGAA 10482663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCAAAAGGTTTCTGGTGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAGCAGGTGTAGAGGTTAAGAA 1200

 10482664 AGGTCAGAGCTTCTCAAACTAACCTGTTACAACTCCCCCACTCCCACCACCACCCCCGAG 10482723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGTCAGAGCTTCTCAAACTAACCTGTTACAACTCCCCCACTCCCACCACCACCCCCGAG 1260

 10482724 ATTTTGAAAAAATGTAGATTCTGATTCGGTAGAATCCTGAAAATGGCTCTTCGTGGGGTG 10482783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTTTGAAAAAATGTAGATTCTGATTCGGTAGAATCCTGAAAATGGCTCTTCGTGGGGTG 1320

 10482784 GAGCCCCATGTTCTGCATTTCTATCTTTTTTTTGAGACAAGGTCTCATTCTGTGGCCCAG 10482843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGCCCCATGTTCTGCATTTCTATCTTTTTTTTGAGACAAGGTCTCATTCTGTGGCCCAG 1380

 10482844 GCTGGAGTGCAGTGTGGCACTATCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCTGGGCTCAGGT 10482903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCTGGAGTGCAGTGTGGCACTATCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCTGGGCTCAGGT 1440

 10482904 GATCCTCCCAACTCAGCCTCCTGGCTAGCTGGGACTCCAGGTGCACACCGCCACGCCTGG 10482963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATCCTCCCAACTCAGCCTCCTGGCTAGCTGGGACTCCAGGTGCACACCGCCACGCCTGG 1500

 10482964 CTAATTTCTAAACTTTTTGTAGAGATGAGCTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGATCTTCAA 10483023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTAATTTCTAAACTTTTTGTAGAGATGAGCTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGATCTTCAA 1560

 10483024 CTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGTGCTGAGACCACAGGCATGA 10483083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGTGCTGAGACCACAGGCATGA 1620

 10483084 GCCACCACGCCTGGCCCTGGGCCCCAATCTTGGCTCCGCCACAAATTCAGCCTTACTTCA 10483143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCCACCACGCCTGGCCCTGGGCCCCAATCTTGGCTCCGCCACAAATTCAGCCTTACTTCA 1680

 10483144 CAAGTTAGTTAACCTCTATGTGCGTATTTTCTCCTCTATATAAAAGGGATGATGATAACA 10483203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAGTTAGTTAACCTCTATGTGCGTATTTTCTCCTCTATATAAAAGGGATGATGATAACA 1740

 10483204 CCCACCTCACAGAGCCGTCTTCCCGACTAAACACAAGGCACTTGCACCAGAGCCACCACA 10483263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCCACCTCACAGAGCCGTCTTCCCGACTAAACACAAGGCACTTGCACCAGAGCCACCACA 1800

 10483264 CACTGAGCACTATGTAAGGTTTACTGTTTATTACCTGCCTCCTAAAGAGAGGCTGCCAAA 10483323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CACTGAGCACTATGTAAGGTTTACTGTTTATTACCTGCCTCCTAAAGAGAGGCTGCCAAA 1860

 10483324 CAATTCTGAGTGTGGAAGGAGGTGGAAAGAGGGGTTTTGCCCTTAGCCAAGTCAGTCCTG 10483383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAATTCTGAGTGTGGAAGGAGGTGGAAAGAGGGGTTTTGCCCTTAGCCAAGTCAGTCCTG 1920

 10483384 TTCAGTCTAACCACTAAAAGGGACAGATCTGGTGGCTTCTTTGAGGTAGAAATTATAGGC 10483443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCAGTCTAACCACTAAAAGGGACAGATCTGGTGGCTTCTTTGAGGTAGAAATTATAGGC 1980

 10483444 CCCTAATGATGTCTGCCACAACTCTGCTTTACTGGGGACACAAAGGTGTGTTATACAGAC 10483503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCCTAATGATGTCTGCCACAACTCTGCTTTACTGGGGACACAAAGGTGTGTTATACAGAC 2040

 10483504 AAGGGTCAGACAAGGAAACAGGAGTTTTGTTTTCACTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTTT 10483563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGGGTCAGACAAGGAAACAGGAGTTTTGTTTTCACTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTTT 2100

 10483564 CCCAGCTGGAGTGCAGGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCTAGTTCACG 10483623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCCAGCTGGAGTGCAGGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCTAGTTCACG 2160

 10483624 CAGTTCTCCTGCTTCAACCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTACGCCCG 10483683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAGTTCTCCTGCTTCAACCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTACGCCCG 2220

 10483684 GCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAA 10483743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAA 2280

 10483744 CTCCTGACCTCAAATGATCCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACG 10483803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTCCTGACCTCAAATGATCCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACG 2340

 10483804 AGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAGCAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTT 10483863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAGCAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTT 2400

 10483864 GCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGCCCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAG 10483923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGCCCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAG 2460

 10483924 CCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGTCTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTA 10483983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGTCTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTA 2520

 10483984 TGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAACCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAA 10484043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAACCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAA 2580

 10484044 ATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGGTCATGAATCTGGAAAGAGCATGGT 10484103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGGTCATGAATCTGGAAAGAGCATGGT 2640

 10484104 GGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCCACAATGTCTGGGGCCTCAGCTAGG 10484163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCCACAATGTCTGGGGCCTCAGCTAGG 2700

 10484164 AGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGGGCGTGGAGTGTCCTCTCTCATTCA 10484223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGGGCGTGGAGTGTCCTCTCTCATTCA 2760

 10484224 TCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCAGCTAGGGCTATGAGCTGGAAAAAG 10484283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCAGCTAGGGCTATGAGCTGGAAAAAG 2820

 10484284 TTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAGGCCAGAGAAACATCTTGTTTGTTGGCCCAGGG 10484343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAGGCCAGAGAAACATCTTGTTTGTTGGCCCAGGG 2880

 10484344 TTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACACGTGGCTTTTAAAAACCCAGCTGTGAATGTTAC 10484403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACACGTGGCTTTTAAAAACCCAGCTGTGAATGTTAC 2940

 10484404 ATGGCAGGATTATAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAGCAAGCCGCAAGTCCCCCAGACTCA 10484463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATGGCAGGATTATAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAGCAAGCCGCAAGTCCCCCAGACTCA 3000

 10484464 AGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTTGATGGGGGAGTATGAGGTTCTAGAAAAGCACA 10484523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTTGATGGGGGAGTATGAGGTTCTAGAAAAGCACA 3060

 10484524 TGGATCAGGAGACATTGTTCTTGCCATCTTCGTAAATTACAGTCTGCCACATATGCTGCC 10484583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGGATCAGGAGACATTGTTCTTGCCATCTTCGTAAATTACAGTCTGCCACATATGCTGCC 3120

 10484584 CCTGAAAAGGAAAATCTGTTACATAGCAGAGTTGGGAACCGGCACTATTTGGGGCTTTTC 10484643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCTGAAAAGGAAAATCTGTTACATAGCAGAGTTGGGAACCGGCACTATTTGGGGCTTTTC 3180

 10484644 CTGAGGGTCTCATATAGTATATATACTACTAGCTAACATTGAGAGCATATGCCAGGCTCT 10484703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTGAGGGTCTCATATAGTATATATACTACTAGCTAACATTGAGAGCATATGCCAGGCTCT 3240

 10484704 GTAACTCATTGAATGCTCGCAGCACCCTCTGAAGTAAGCACTATTACTATCCCTAATTTA 10484763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTAACTCATTGAATGCTCGCAGCACCCTCTGAAGTAAGCACTATTACTATCCCTAATTTA 3300

 10484764 GAGATGAAGCACACTGATATTAAGTAATTCGTCCAAGGTCAGAGCTACTGAAGAACTGGA 10484823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAGATGAAGCACACTGATATTAAGTAATTCGTCCAAGGTCAGAGCTACTGAAGAACTGGA 3360

 10484824 ATTGAACCCCAGAGATCTGGTGCCAGAGTCCATACACTTAATCATGAAACTGACCTGTCG 10484883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATTGAACCCCAGAGATCTGGTGCCAGAGTCCATACACTTAATCATGAAACTGACCTGTCG 3420

 10484884 GCGTGCACAGTTCATCGCCCCACTCATTCAGTCATTCGGCATGTTTATGGTACACCTACC 10484943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCGTGCACAGTTCATCGCCCCACTCATTCAGTCATTCGGCATGTTTATGGTACACCTACC 3480

 10484944 ATGTGCCAAGCATTGTGCTAGGTACCCTCTGTC 10484976
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATGTGCCAAGCATTGTGCTAGGTACCCTCTGTC 3513

EXCISED REGION

 10484977 GGGGTGAGAGAAGTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTTACAGGATACATATAATATTTAA 10485036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3515 GGGGTGAGAGAAGTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTTACAGAATACATATAATATTTAA 3574

 10485037 CGATAATTATTTTTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAAACCTATGAAATGGAGATTGATT 10485096
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     3575 CGATAATTATTTTTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAAACCTATGAAATGGAGATTGA-T 3633

 10485097 TTTTTTTTTTTTTTTGAGATGTAGTCTCACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGA 10485156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 TTTTTTTTTTTTTTTGAGATGTAGTCTCACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGA 3693

 10485157 TCTTGGCTCACTACGACCTCCGCCTCCTGGGCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTTA 10485216
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 TCTTGGCTCACTACGACCTCTGCCTCCTGGGCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTTA 3753

 10485217 GTAGCTGAGATTACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAG 10485276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 GTAGCTGAGATTACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAG 3813

 10485277 ATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCACAAACTCCTGACCTCGGGTGATCCACCC 10485336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3814 ATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCACAAATTCCTGACCTCGGGTGATCCACCC 3873

 10485337 GCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCAC 10485378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 GCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCAC 3915

Alignment time is 3.20055 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10472480,10493779] =>     21300 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3781] =>      3781 nucs 'mol-32-22c8-030786_3781'

Score:        3725
Aligned:      3780        nucs
Identic:      3775 (100%) nucs =>       228 (100%)      3547 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10481550,10481777] EXCISED REGION [10481779,10485329]
 second seq =>  [       1,     228] EXCISED REGION [     230,    3781]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [10481778,10481778]
 second seq =>         1 nucs [229,229]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3428,3428]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [228,228] to [229,229]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10481550 AGAGAACAGCAAGAGGTCAGAGGCTAAGTGTCAAAGGGCCCACGATGTTTCAAACAGTAA 10481609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGAACAGCAAGAGGTCAGAGGCTAAGTGTCAAAGGGCCCACGATGTTTCAAACAGTAA 60

 10481610 TGATCAGAAGGGAATCCACTCAGCCCCTTTCCGCTTACCTTCCAAAAAGCTGTGAGTGGT 10481669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGATCAGAAGGGAATCCACTCAGCCCCTTTCCGCTTACCTTCCAAAAAGCTGTGAGTGGT 120

 10481670 GGAGTTTGGTTTCAAATCCAGCCCTCCTTGCTTACTAGCTGTTAGACTTTGGGGAAATTA 10481729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAGTTTGGTTTCAAATCCAGCCCTCCTTGCTTACTAGCTGTTAGACTTTGGGGAAATTA 180

 10481730 TTTACTATCTGTGTTCTCAGTTTTCTCATTTGTAAAATGGGAAATAAT 10481777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTACTATCTGTGTTCTCAGTTTTCTCATTTGTAAAATGGGAAATAAT 228

EXCISED REGION

 10481779 GCACCTGTGTCCTTGAGGCTACTTTGGGGATTCAGCAAGGGAAGATAGAGCAGTGCCTGG 10481838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      230 GCACCTGTGTCCTTGAGGCTACTTTGGGGATTCAGCAAGGGAAGATAGAGCAGTGCCTGG 289

 10481839 CACATAGTAAATACCTACACCAGTGGCAGCAAGGCTGGGTGCGCTGGCTCACACCGTAAG 10481898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      290 CACATAGTAAATACCTACACCAGTGGCAGCAAGGCTGGGTGCGCTGGCTCACACCGTAAG 349

 10481899 CCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGACCAGC 10481958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      350 CCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGACCAGC 409

 10481959 CTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAATTAGCTGGGCGCAGTGG 10482018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      410 CTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAATTAGCTGGGCGCAGTGG 469

 10482019 TGCACACCTATGATCCCAGCTAGGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTAAGCCCAGG 10482078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      470 TGCACACCTATGATCCCAGCTAGGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTAAGCCCAGG 529

 10482079 AGATGGAGGTTGCAGTGACCCATGACCACACCACTGTACTCCAGCCTCGGTGATAAAGCA 10482138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      530 AGATGGAGGTTGCAGTGACCCATGACCACACCACTGTACTCCAGCCTCGGTGATAAAGCA 589

 10482139 AAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATAGTGGCAGCAATTACTACCATTGAGTGTGCCT 10482198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      590 AAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATAGTGGCAGCAATTACTACCATTGAGTGTGCCT 649

 10482199 GACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCTCTTGCCCA 10482258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      650 GACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCTCTTGCCCA 709

 10482259 GGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGAATTCAGGT 10482318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      710 GGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGAATTCAGGT 769

 10482319 GGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCACCACGCCCC 10482378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      770 GGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCACCACGCCCC 829

 10482379 ACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGCTGGTCTCA 10482438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      830 ACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGCTGGTCTCA 889

 10482439 AAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 10482498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      890 AAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACC 949

 10482499 GGCAGAAGCCACTACCCCCTGGCCAGCAGTGCGTGCTGTTTGTACTGAGAGAAACCAGAT 10482558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      950 GGCAGAAGCCACTACCCCCTGGCCAGCAGTGCGTGCTGTTTGTACTGAGAGAAACCAGAT 1009

 10482559 GTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAATTTGCTTTGCACCCCAGTCTTCAAAAGGTTTCTGG 10482618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 GTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAATTTGCTTTGCACCCCAGTCTTCAAAAGGTTTCTGG 1069

 10482619 TGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAGCAGGTGTAGAGGTTAAGAAAGGTCAGAGCTTCTC 10482678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 TGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAGCAGGTGTAGAGGTTAAGAAAGGTCAGAGCTTCTC 1129

 10482679 AAACTAACCTGTTACAACTCCCCCACTCCCACCACCACCCCCGAGATTTTGAAAAAATGT 10482738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 AAACTAACCTGTTACAACTCCCCCACTCCCACCACCACCCCCGAGATTTTGAAAAAATGT 1189

 10482739 AGATTCTGATTCGGTAGAATCCTGAAAATGGCTCTTCGTGGGGTGGAGCCCCATGTTCTG 10482798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 AGATTCTGATTCGGTAGAATCCTGAAAATGGCTCTTCGTGGGGTGGAGCCCCATGTTCTG 1249

 10482799 CATTTCTATCTTTTTTTTGAGACAAGGTCTCATTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGT 10482858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 CATTTCTATCTTTTTTTTGAGACAAGGTCTCATTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGT 1309

 10482859 GGCACTATCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCCTCCCAACTCA 10482918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 GGCACTATCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCCTCCCAACTCA 1369

 10482919 GCCTCCTGGCTAGCTGGGACTCCAGGTGCACACCGCCACGCCTGGCTAATTTCTAAACTT 10482978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 GCCTCCTGGCTAGCTGGGACTCCAGGTGCACACCGCCACGCCTGGCTAATTTCTAAACTT 1429

 10482979 TTTGTAGAGATGAGCTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGATCTTCAACTCCTGGGCTCAAGC 10483038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 TTTGTAGAGATGAGCTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGATCTTCAACTCCTGGGCTCAAGC 1489

 10483039 GATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGTGCTGAGACCACAGGCATGAGCCACCACGCCTGGC 10483098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 GATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGTGCTGAGACCACAGGCATGAGCCACCACGCCTGGC 1549

 10483099 CCTGGGCCCCAATCTTGGCTCCGCCACAAATTCAGCCTTACTTCACAAGTTAGTTAACCT 10483158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 CCTGGGCCCCAATCTTGGCTCCGCCACAAATTCAGCCTTACTTCACAAGTTAGTTAACCT 1609

 10483159 CTATGTGCGTATTTTCTCCTCTATATAAAAGGGATGATGATAACACCCACCTCACAGAGC 10483218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 CTATGTGCGTATTTTCTCCTCTATATAAAAGGGATGATGATAACACCCACCTCACAGAGC 1669

 10483219 CGTCTTCCCGACTAAACACAAGGCACTTGCACCAGAGCCACCACACACTGAGCACTATGT 10483278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 CGTCTTCCCGACTAAACACAAGGCACTTGCACCAGAGCCACCACACACTGAGCACTATGT 1729

 10483279 AAGGTTTACTGTTTATTACCTGCCTCCTAAAGAGAGGCTGCCAAACAATTCTGAGTGTGG 10483338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 AAGGTTTACTGTTTATTACCTGCCTCCTAAAGAGAGGCTGCCAAACAATTCTGAGTGTGG 1789

 10483339 AAGGAGGTGGAAAGAGGGGTTTTGCCCTTAGCCAAGTCAGTCCTGTTCAGTCTAACCACT 10483398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 AAGGAGGTGGAAAGAGGGGTTTTGCCCTTAGCCAAGTCAGTCCTGTTCAGTCTAACCACT 1849

 10483399 AAAAGGGACAGATCTGGTGGCTTCTTTGAGGTAGAAATTATAGGCCCCTAATGATGTCTG 10483458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 AAAAGGGACAGATCTGGTGGCTTCTTTGAGGTAGAAATTATAGGCCCCTAATGATGTCTG 1909

 10483459 CCACAACTCTGCTTTACTGGGGACACAAAGGTGTGTTATACAGACAAGGGTCAGACAAGG 10483518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 CCACAACTCTGCTTTACTGGGGACACAAAGGTGTGTTATACAGACAAGGGTCAGACAAGG 1969

 10483519 AAACAGGAGTTTTGTTTTCACTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTTTCCCAGCTGGAGTGCA 10483578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 AAACAGGAGTTTTGTTTTCACTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTTTCCCAGCTGGAGTGCA 2029

 10483579 GGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCTAGTTCACGCAGTTCTCCTGCTTC 10483638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 GGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCTAGTTCACGCAGTTCTCCTGCTTC 2089

 10483639 AACCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATT 10483698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 AACCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATT 2149

 10483699 TTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAAT 10483758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 TTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAAT 2209

 10483759 GATCCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGG 10483818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 GATCCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGG 2269

 10483819 CCAAGCAGAAGGATTGCCAAGCAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGT 10483878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 CCAAGCAGAAGGATTGCCAAGCAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGT 2329

 10483879 TCTTTGAGGCAGATGTGGAGCCCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGT 10483938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 TCTTTGAGGCAGATGTGGAGCCCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGT 2389

 10483939 TCAGCATGCGGGCGAATGCGTCTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGC 10483998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 TCAGCATGCGGGCGAATGCGTCTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGC 2449

 10483999 TGCGGACTGGTGTGTAACAAACCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAA 10484058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 TGCGGACTGGTGTGTAACAAACCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAA 2509

 10484059 ATTTTCTTCTAATTCTGTGGGTCATGAATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGG 10484118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 ATTTTCTTCTAATTCTGTGGGTCATGAATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGG 2569

 10484119 CAGAGGCAGCTTGTCTGCTCCACAATGTCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAG 10484178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 CAGAGGCAGCTTGTCTGCTCCACAATGTCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAG 2629

 10484179 GGGTGGCACCATGGCTCGGGGGCGTGGAGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGC 10484238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 GGGTGGCACCATGGCTCGGGGGCGTGGAGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGC 2689

 10484239 TGGCTGTTGGCTGGGACCTCAGCTAGGGCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCAT 10484298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 TGGCTGTTGGCTGGGACCTCAGCTAGGGCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCAT 2749

 10484299 CACATGGCCTCAGGCCAGAGAAACATCTTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGG 10484358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 CACATGGCCTCAGGCCAGAGAAACATCTTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGG 2809

 10484359 CAGAAGCACACACGTGGCTTTTAAAAACCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTATAG 10484418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 CAGAAGCACACACGTGGCTTTTAAAAACCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTATAG 2869

 10484419 CCATCCAAAATCGGTTCCAAGCAAGCCGCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTA 10484478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 CCATCCAAAATCGGTTCCAAGCAAGCCGCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTA 2929

 10484479 GACTCTACCTCTTGATGGGGGAGTATGAGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACAT 10484538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 GACTCTACCTCTTGATGGGGGAGTATGAGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACAT 2989

 10484539 TGTTCTTGCCATCTTCGTAAATTACAGTCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAAAAT 10484598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 TGTTCTTGCCATCTTCGTAAATTACAGTCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAAAAT 3049

 10484599 CTGTTACATAGCAGAGTTGGGAACCGGCACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCATAT 10484658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 CTGTTACATAGCAGAGTTGGGAACCGGCACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCATAT 3109

 10484659 AGTATATATACTACTAGCTAACATTGAGAGCATATGCCAGGCTCTGTAACTCATTGAATG 10484718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 AGTATATATACTACTAGCTAACATTGAGAGCATATGCCAGGCTCTGTAACTCATTGAATG 3169

 10484719 CTCGCAGCACCCTCTGAAGTAAGCACTATTACTATCCCTAATTTAGAGATGAAGCACACT 10484778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 CTCGCAGCACCCTCTGAAGTAAGCACTATTACTATCCCTAATTTAGAGATGAAGCACACT 3229

 10484779 GATATTAAGTAATTCGTCCAAGGTCAGAGCTACTGAAGAACTGGAATTGAACCCCAGAGA 10484838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 GATATTAAGTAATTCGTCCAAGGTCAGAGCTACTGAAGAACTGGAATTGAACCCCAGAGA 3289

 10484839 TCTGGTGCCAGAGTCCATACACTTAATCATGAAACTGACCTGTCGGCGTGCACAGTTCAT 10484898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 TCTGGTGCCAGAGTCCATACACTTAATCATGAAACTGACCTGTCGGCGTGCACAGTTCAT 3349

 10484899 CGCCCCACTCATTCAGTCATTCGGCATGTTTATGGTACACCTACCATGTGCCAAGCATTG 10484958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 CGCCCCACTCATTCAGTCATTCGGCATGTTTATGGTACACCTACCATGTGCCAAGCATTG 3409

 10484959 TGCTAGGTACCCTCTGTC-GGGGTGAGAGAAGTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTTACA 10485017
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 TGCTAGGTACCCTCTGTCAGGGGTGAGAGAAGTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTTACA 3469

 10485018 GGATACATATAATATTTAACGATAATTATTTTTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAAACC 10485077
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3470 GAATACATATAATATTTAACGATAATTATTTTTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAAACC 3529

 10485078 TATGAAATGGAGATTGATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGTAGTCTCACTGTCACCCAGG 10485137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3530 TATGAAATGGAGATTGATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGTAGTCTCACTGTCACCCAGG 3589

 10485138 CTGGAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTACGACCTCCGCCTCCTGGGCAAGCGATTC 10485197
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3590 CTGGAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTACGACCTCTGCCTCCTGGGCAAGCGATTC 3649

 10485198 TCCTGCCTCAGCCTCCTTAGTAGCTGAGATTACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCTAAT 10485257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3650 TCCTGCCTCAGCCTCCTTAGTAGCTGAGATTACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCTAAT 3709

 10485258 TTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCACAAACTCCT 10485317
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3710 TTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCACAAATTCCT 3769

 10485318 GACCTCGGGTGA 10485329
          ||||||||||||
     3770 GACCTCGGGTGA 3781

Alignment time is 2.99043 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10472480,10493779] =>     21300 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3592] =>      3592 nucs 'mol-32-2af2-028698_3592'

Score:        3480
Aligned:      3580        nucs
Identic:      3566 (100%) nucs =>      3219 (100%)       347 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10479248,10482480] EXCISED REGION [10483780,10484126]
 second seq =>  [      21,    3245] EXCISED REGION [    3246,    3592]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1299 nucs [10482481,10483779]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        22 nucs [10482481,10482502] to [10483780,10483801]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [10482480,10482480] to [10483780,10483780]
 second seq =>         1 nucs [3245,3245] to [3246,3246]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10479248 GTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGACTGGTCTTGAACTCCTGACC 10479307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       21 GTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGACTGGTCTTGAACTCCTGACC 80

 10479308 TCGTGATCCGCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATGACAGGCGTGAGCCACCGCGC 10479367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       81 TCGTGATCCGCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATGACAGGCGTGAGCCACCGCGC 140

 10479368 CTGGCCTAACCATCAGTTTTTCATTTACCCACATTGATATGAATGAAAATCTATCCGCGT 10479427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      141 CTGGCCTAACCATCAGTTTTTCATTTACCCACATTGATATGAATGAAAATCTATCCGCGT 200

 10479428 CACCAGGGGCAGATCACTAATCTCTGGCCGTGCGTTTTGTGCTCAGGACTCCTGGCGGCG 10479487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      201 CACCAGGGGCAGATCACTAATCTCTGGCCGTGCGTTTTGTGCTCAGGACTCCTGGCGGCG 260

 10479488 GGCAGTCAGCACTGGGGTCCAGGCTGGCATTCCCATGCCCTGTTTTACCACTGCCCTCTC 10479547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      261 GGCAGTCAGCACTGGGGTCCAGGCTGGCATTCCCATGCCCTGTTTTACCACTGCCCTCTC 320

 10479548 CTTCTATGACGGGTACAGACATGAGATGCTTCCAGCCAGCCTCATCCAGGTAAGCCTGTG 10479607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      321 CTTCTATGACGGGTACAGACATGAGATGCTTCCAGCCAGCCTCATCCAGGTAAGCCTGTG 380

 10479608 GAGCAGGGATTAACCTGGCTGGCCCCTCGGGGGCGTGCGCCATGGACTGTCCTGACCAAC 10479667
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      381 GAGCAGGGATTAACCTGGCTGGCCCCTGGGGGGCGTGCGCCATGGACTGTCCTGACCAAC 440

 10479668 CTACTCTCTCGTTTCCTAGGCTCAGCGGGATTACTTCGGGGCTCACACCTATGAACTCTT 10479727
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      441 CTACTCTCTCATTTCCTAGGCTCAGCGGGATTACTTCGGGGCTCACACCTATGAACTCTT 500

 10479728 GGCCAAACCAGGGCAGTTTATCCACACCAACTGGACAGGCCATGGTGGCACCGTGTCATC 10479787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      501 GGCCAAACCAGGGCAGTTTATCCACACCAACTGGACAGGCCATGGTGGCACCGTGTCATC 560

 10479788 CTCGTCATACAATGCCTGATCATGCTGCTCCTGTCACCCTCCACGATTCCACAGACCAGG 10479847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      561 CTCGTCATACAATGCCTGATCATGCTGCTCCTGTCACCCTCCACGATTCCACAGACCAGG 620

 10479848 ACATTCCATGTGCCTCATGGCACTGCCACCTGGCCCTTTGCCCTATTTTCTGTTCAGTTT 10479907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      621 ACATTCCATGTGCCTCATGGCACTGCCACCTGGCCCTTTGCCCTATTTTCTGTTCAGTTT 680

 10479908 TTTAAAAGTGTTGTAAGAGACTCCTGAGGAAGACACACAGTTTATTTGTAAAGTAGCTCT 10479967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      681 TTTAAAAGTGTTGTAAGAGACTCCTGAGGAAGACACACAGTTTATTTGTAAAGTAGCTCT 740

 10479968 GTGAGAGCCACCATGCCCTCTGCCCTTGCCTCTTGGGACTGACCAGGAGCTGCTCATGTG 10480027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      741 GTGAGAGCCACCATGCCCTCTGCCCTTGCCTCTTGGGACTGACCAGGAGCTGCTCATGTG 800

 10480028 CGTGAGAGTGGGAACCATCTCCTTGCGGCAGTGGCTTCCGCGTGCCCCGTGTGCTGGTGC 10480087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      801 CGTGAGAGTGGGAACCATCTCCTTGCGGCAGTGGCTTCCGCGTGCCCCGTGTGCTGGTGC 860

 10480088 GGTTCCCATCACGCAGACAGGAAGGGTGTTTGCGCACTCTGATCAACTGGAACCTCTGTA 10480147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      861 GGTTCCCATCACGCAGACAGGAAGGGTGTTTGCGCACTCTGATCAACTGGAACCTCTGTA 920

 10480148 TCATGCGGCTGAATTCCCTTTTTCCTTTACTCAATAAAAGCTACATCAGACTGATGCTCT 10480207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      921 TCATGCGGCTGAATTCCCTTTTTCCTTTACTCAATAAAAGCTACATCAGACTGATGCTCT 980

 10480208 TTCTCCAGATTCTTAGTCTCACCTCGGCCACATGGAGCCATTATCCCCATTGGCAGAAAG 10480267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      981 TTCTCCAGATTCTTAGTCTCACCTCGGCCACATGGAGCCATTATCCCCATTGGCAGAAAG 1040

 10480268 ATTTTTCTTTAAAAAAAAAGACTAGAATAACACAAGAAACCACATTTAGGATTATGCTTC 10480327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1041 ATTTTTCTTTAAAAAAAAAGACTAGAATAACACAAGAAACCACATTTAGGATTATGCTTC 1100

 10480328 ACTCAGAGGAGGCAGGCAGGGAGGACACACCAGGGGCTTTAATACACTGGGCATGTTTTC 10480387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1101 ACTCAGAGGAGGCAGGCAGGGAGGACACACCAGGGGCTTTAATACACTGGGCATGTTTTC 1160

 10480388 TTTCTCCAATTGGGCAATGGGTACATGGACGTTCACTGTAACGTGCTTTTTCTTTCGTCT 10480447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1161 TTTCTCCAATTGGGCAATGGGTACATGGACGTTCACTGTAACGTGCTTTTTCTTTCGTCT 1220

 10480448 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTCCTGGCAAGCTGTGCGTGACATTCTTTATGGCTT 10480507
          |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1221 TTTTTTTTTTTTTTTTTTT----GCTCCTGGCAAGCTGTGCGTGACATTCTTTATGGCTT 1276

 10480508 TTTGTATGTCAAATACTTCATACTAAACTTTCTAGAGAATTAAACTTTAATGATGGGCTC 10480567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 TTTGTATGTCAAATACTTCATACTAAACTTTCTAGAGAATTAAACTTTAATGATGGGCTC 1336

 10480568 AGCTTGGTCTGATTTATTTCCTTTCCCACACCTGTCTCTACTTGCTCTAAGCCAGGCCCA 10480627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 AGCTTGGTCTGATTTATTTCCTTTCCCACACCTGTCTCTACTTGCTCTAAGCCAGGCCCA 1396

 10480628 GGGATTTTGAACAAGCTAAGCCGGCTCCTTAAACTAGGCTTTTCACTTTATCTTACTTAC 10480687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 GGGATTTTGAACAAGCTAAGCCGGCTCCTTAAACTAGGCTTTTCACTTTATCTTACTTAC 1456

 10480688 TCAGAGAAGATAAAACCTGCCAGTGATATTGTTGTGTGGCCTGGGGCCAGTGTGACTGTT 10480747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 TCAGAGAAGATAAAACCTGCCAGTGATATTGTTGTGTGGCCTGGGGCCAGTGTGACTGTT 1516

 10480748 CCCTGCAGCGGTTTGACTTCATGATGATTTCCCTGGAGTGTTAAAGTCCTAAGAGTTGCC 10480807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 CCCTGCAGCGGTTTGACTTCATGATGATTTCCCTGGAGTGTTAAAGTCCTAAGAGTTGCC 1576

 10480808 TAAGAGGAGCGAGCAGCGCCTGTGCCTCGACAGCTGGTGTCTACAGTGTGACCTCTGACC 10480867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1577 TAAGAGGAGCGAGCAGCGCCTGTGCCTCGACAGCTGGTGTCTACAGTGTGACCTCTGATC 1636

 10480868 TCTCGGCTAATGTCAGTGAAGGAGACAATTTTCATTAAATCACCAACTTTTAATTTATTT 10480927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 TCTCGGCTAATGTCAGTGAAGGAGACAATTTTCATTAAATCACCAACTTTTAATTTATTT 1696

 10480928 TTCTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTC 10480987
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1697 TTCTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGGTC 1756

 10480988 TTGGCTCATTGCAAGCTCCACCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCCACCTCAGCCTCCAGA 10481047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 TTGGCTCATTGCAAGCTCCACCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCCACCTCAGCCTCCAGA 1816

 10481048 GTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACTCCTGGCTTATTTTTTTGTATTTTTAGTAG 10481107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 GTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACTCCTGGCTTATTTTTTTGTATTTTTAGTAG 1876

 10481108 AGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCC 10481167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 AGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCC 1936

 10481168 ACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTATTTTAAAATTTTGT 10481227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1937 ACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTATTTTAAAATTTTGT 1996

 10481228 TTAGAGATGTGGTCTTGCTATGATGCCCAGGCTGATGTCAAACACCTGGACTCAAGCAAT 10481287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 TTAGAGATGTGGTCTTGCTATGATGCCCAGGCTGATGTCAAACACCTGGACTCAAGCAAT 2056

 10481288 CCTCGTGCCTCGACCTCCCAAGGTGCTGGGATTATAGGCAGGAGCCACCGTGCCCTGCTA 10481347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 CCTCGTGCCTCGACCTCCCAAGGTGCTGGGATTATAGGCAGGAGCCACCGTGCCCTGCTA 2116

 10481348 CCAACTTTTTAAACTCTGCCTAGATGTGAGTACTTCGCTAGATCAGCCCCCACGCACCCC 10481407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 CCAACTTTTTAAACTCTGCCTAGATGTGAGTACTTCGCTAGATCAGCCCCCACGCACCCC 2176

 10481408 TCCTGCCCTCCCTGTACATTTAAGAGAAGCCCGAGTAGCCGCACGTGACGGGATTTTTCT 10481467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 TCCTGCCCTCCCTGTACATTTAAGAGAAGCCCGAGTAGCCGCACGTGACGGGATTTTTCT 2236

 10481468 TTAAGGCTTGTCAAAGGCACTGTTCGAGGGGGATCTTTTCACCTGGCTCTGAGGCTGAGG 10481527
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 TTAAGGCGTGTCAAAGGCACTGTTCGAGGGGGATCTTTTCACCTGGCTCTGAGGCTGAGG 2296

 10481528 GATGGACACTGCTGGAATGGAGAGAGAACAGCAAGAGGTCAGAGGCTAAGTGTCAAAGGG 10481587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 GATGGACACTGCTGGAATGGAGAGAGAACAGCAAGAGGTCAGAGGCTAAGTGTCAAAGGG 2356

 10481588 CCCACGATGTTTCAAACAGTAATGATCAGAAGGGAATCCACTCAGCCCCTTTCCGCTTAC 10481647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 CCCACGATGTTTCAAACAGTAATGATCAGAAGGGAATCCACTCAGCCCCTTTCCGCTTAC 2416

 10481648 CTTCCAAAAAGCTGTGAGTGGTGGAGTTTGGTTTCAAATCCAGCCCTCCTTGCTTACTAG 10481707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 CTTCCAAAAAGCTGTGAGTGGTGGAGTTTGGTTTCAAATCCAGCCCTCCTTGCTTACTAG 2476

 10481708 CTGTTAGACTTTGGGGAAATTATTTACTATCTGTGTTCTCAGTTTTCTCATTTGTAAAAT 10481767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 CTGTTAGACTTTGGGGAAATTATTTACTATCTGTGTTCTCAGTTTTCTCATTTGTAAAAT 2536

 10481768 GGGAAATAATAGCACCTGTGTCCTTGAGGCTACTTTGGGGATTCAGCAAGGGAAGATAGA 10481827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 GGGAAATAATAGCACCTGTGTCCTTGAGGCTACTTTGGGGATTCAGCAAGGGAAGATAGA 2596

 10481828 GCAGTGCCTGGCACATAGTAAATACCTACACCAGTGGCAGCAAGGCTGGGTGCGCTGGCT 10481887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 GCAGTGCCTGGCACATAGTAAATACCTACACCAGTGGCAGCAAGGCTGGGTGCGCTGGCT 2656

 10481888 CACACCGTAAGCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGT 10481947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 CACACCGTAAGCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGT 2716

 10481948 CTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAATTAGCT 10482007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 CTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAATTAGCT 2776

 10482008 GGGCGCAGTGGTGCACACCTATGATCCCAGCTAGGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGC 10482067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 GGGCGCAGTGGTGCACACCTATGATCCCAGCTAGGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGC 2836

 10482068 TTAAGCCCAGGAGATGGAGGTTGCAGTGACCCATGACCACACCACTGTACTCCAGCCTCG 10482127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 TTAAGCCCAGGAGATGGAGGTTGCAGTGACCCATGACCACACCACTGTACTCCAGCCTCG 2896

 10482128 GTGATAAAGCAAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATAGTGGCAGCAATTACTACCAT 10482187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||
     2897 GTGATAAAGCAAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAA----TAGTGGCAGCAATTACTACCAT 2952

 10482188 TGAGTGTGCCTGACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTT 10482247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 TGAGTGTGCCTGACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTT 3012

 10482248 GCTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCC 10482307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 GCTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCC 3072

 10482308 CGAATTCAGGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGC 10482367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 CGAATTCAGGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGC 3132

 10482368 CACCACGCCCCACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTA 10482427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 CACCACGCCCCACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTA 3192

 10482428 GGCTGGTCTCAAAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCC 10482480
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 GGCTGGTCTCAAAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCC 3245

EXCISED REGION

 10483780 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAG 10483839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAG 3305

 10483840 CAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGC 10483899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 CAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGC 3365

 10483900 CCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGT 10483959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 CCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGT 3425

 10483960 CTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAA 10484019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 CTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAA 3485

 10484020 CCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGG 10484079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 CCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGG 3545

 10484080 TCATGAATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCA 10484126
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 TCATGAATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCA 3592

Alignment time is 2.80248 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10472480,10493779] =>     21300 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2600] =>      2600 nucs 'mol-32-301a-137282_2600'

Score:        2534
Aligned:      2600        nucs
Identic:      2594 (100%) nucs =>       137 (100%)      2457 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10482808,10482944] EXCISED REGION [10482946,10485407]
 second seq =>  [       1,     137] EXCISED REGION [     139,    2600]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [10482945,10482945]
 second seq =>         1 nucs [138,138]
ALTERNATIVE REGION(S): 3
 first  seq =>         1 nucs [10485324,10485324]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [10482944,10482944] to [10482946,10482946]
 second seq =>         1 nucs [137,137] to [139,139]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10482808 CTTTTTTTTGAGACAAGGTCTCATTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGTGGCACTATC 10482867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTTTTTTTGAGACAAGGTCTCATTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGTGGCACTATC 60

 10482868 ATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCCTCCCAACTCAGCCTCCTGG 10482927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCCTCCCAACTCAGCCTCCTGG 120

 10482928 CTAGCTGGGACTCCAGG 10482944
          |||||||||||||||||
      121 CTAGCTGGGACTCCAGG 137

EXCISED REGION

 10482946 GCACACCGCCACGCCTGGCTAATTTCTAAACTTTTTGTAGAGATGAGCTCTCCCTATGTT 10483005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      139 GCACACCGCCACGCCTGGCTAATTTCTAAACTTTTTGTAGAGATGAGCTCTCCCTATGTT 198

 10483006 GCCCAGGCTGATCTTCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGTG 10483065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      199 GCCCAGGCTGATCTTCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGTG 258

 10483066 CTGAGACCACAGGCATGAGCCACCACGCCTGGCCCTGGGCCCCAATCTTGGCTCCGCCAC 10483125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      259 CTGAGACCACAGGCATGAGCCACCACGCCTGGCCCTGGGCCCCAATCTTGGCTCCGCCAC 318

 10483126 AAATTCAGCCTTACTTCACAAGTTAGTTAACCTCTATGTGCGTATTTTCTCCTCTATATA 10483185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      319 AAATTCAGCCTTACTTCACAAGTTAGTTAACCTCTATGTGCGTATTTTCTCCTCTATATA 378

 10483186 AAAGGGATGATGATAACACCCACCTCACAGAGCCGTCTTCCCGACTAAACACAAGGCACT 10483245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      379 AAAGGGATGATGATAACACCCACCTCACAGAGCCGTCTTCCCGACTAAACACAAGGCACT 438

 10483246 TGCACCAGAGCCACCACACACTGAGCACTATGTAAGGTTTACTGTTTATTACCTGCCTCC 10483305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      439 TGCACCAGAGCCACCACACACTGAGCACTATGTAAGGTTTACTGTTTATTACCTGCCTCC 498

 10483306 TAAAGAGAGGCTGCCAAACAATTCTGAGTGTGGAAGGAGGTGGAAAGAGGGGTTTTGCCC 10483365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      499 TAAAGAGAGGCTGCCAAACAATTCTGAGTGTGGAAGGAGGTGGAAAGAGGGGTTTTGCCC 558

 10483366 TTAGCCAAGTCAGTCCTGTTCAGTCTAACCACTAAAAGGGACAGATCTGGTGGCTTCTTT 10483425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      559 TTAGCCAAGTCAGTCCTGTTCAGTCTAACCACTAAAAGGGACAGATCTGGTGGCTTCTTT 618

 10483426 GAGGTAGAAATTATAGGCCCCTAATGATGTCTGCCACAACTCTGCTTTACTGGGGACACA 10483485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      619 GAGGTAGAAATTATAGGCCCCTAATGATGTCTGCCACAACTCTGCTTTACTGGGGACACA 678

 10483486 AAGGTGTGTTATACAGACAAGGGTCAGACAAGGAAACAGGAGTTTTGTTTTCACTTTTGA 10483545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 AAGGTGTGTTATACAGACAAGGGTCAGACAAGGAAACAGGAGTTTTGTTTTCACTTTTGA 738

 10483546 GACAGTCTCACTCTGTTTCCCAGCTGGAGTGCAGGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCT 10483605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 GACAGTCTCACTCTGTTTCCCAGCTGGAGTGCAGGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCT 798

 10483606 CTACCTCCCTAGTTCACGCAGTTCTCCTGCTTCAACCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGG 10483665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 CTACCTCCCTAGTTCACGCAGTTCTCCTGCTTCAACCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGG 858

 10483666 TGCCCACCACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCGTGTT 10483725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 TGCCCACCACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCGTGTT 918

 10483726 GGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAGT 10483785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 GGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAGT 978

 10483786 GCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAGCAAAGA 10483845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 GCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAGCAAAGA 1038

 10483846 GACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGCCCATCA 10483905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 GACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGCCCATCA 1098

 10483906 TTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGTCTGCTC 10483965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 TTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGTCTGCTC 1158

 10483966 ACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAACCACCC 10484025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 ACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAACCACCC 1218

 10484026 CAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGGTCATGA 10484085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 CAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGGTCATGA 1278

 10484086 ATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCCACAATG 10484145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 ATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCCACAATG 1338

 10484146 TCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGGGCGTGG 10484205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 TCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGGGCGTGG 1398

 10484206 AGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCAGCTAGG 10484265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 AGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCAGCTAGG 1458

 10484266 GCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAGGCCAGAGAAACATC 10484325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 GCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAGGCCAGAGAAACATC 1518

 10484326 TTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACACGTGGCTTTTAAAAA 10484385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 TTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACACGTGGCTTTTAAAAA 1578

 10484386 CCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTATAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAGCAAGCC 10484445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 CCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTATAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAGCAAGCC 1638

 10484446 GCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTTGATGGGGGAGTATG 10484505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 GCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTTGATGGGGGAGTATG 1698

 10484506 AGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACATTGTTCTTGCCATCTTCGTAAATTACAG 10484565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 AGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACATTGTTCTTGCCATCTTCGTAAATTACAG 1758

 10484566 TCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAAAATCTGTTACATAGCAGAGTTGGGAACCGG 10484625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 TCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAAAATCTGTTACATAGCAGAGTTGGGAACCGG 1818

 10484626 CACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCATATAGTATATATACTACTAGCTAACATTGA 10484685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 CACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCATATAGTATATATACTACTAGCTAACATTGA 1878

 10484686 GAGCATATGCCAGGCTCTGTAACTCATTGAATGCTCGCAGCACCCTCTGAAGTAAGCACT 10484745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 GAGCATATGCCAGGCTCTGTAACTCATTGAATGCTCGCAGCACCCTCTGAAGTAAGCACT 1938

 10484746 ATTACTATCCCTAATTTAGAGATGAAGCACACTGATATTAAGTAATTCGTCCAAGGTCAG 10484805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1939 ATTACTATCCCTAATTTAGAGATGAAGCACACTGATATGAAGTAATTCGTCCAAGGTCAG 1998

 10484806 AGCTACTGAAGAACTGGAATTGAACCCCAGAGATCTGGTGCCAGAGTCCATACACTTAAT 10484865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 AGCTACTGAAGAACTGGAATTGAACCCCAGAGATCTGGTGCCAGAGTCCATACACTTAAT 2058

 10484866 CATGAAACTGACCTGTCGGCGTGCACAGTTCATCGCCCCACTCATTCAGTCATTCGGCAT 10484925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 CATGAAACTGACCTGTCGGCGTGCACAGTTCATCGCCCCACTCATTCAGTCATTCGGCAT 2118

 10484926 GTTTATGGTACACCTACCATGTGCCAAGCATTGTGCTAGGTACCCTCTGTC-GGGGTGAG 10484984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     2119 GTTTATGGTACACCTACCATGTGCCAAGCATTGTGCTAGGTACCCTCTGTCAGGGGTGAG 2178

 10484985 AGAAGTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTTACAGGATACATATAATATTTAACGATAATT 10485044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2179 AGAAGTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTTACAGAATACATATAATATTTAACGATAATT 2238

 10485045 ATTTTTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAAACCTATGAAATGGAGATTGATTTTTTTTTT 10485104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 ATTTTTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAAACCTATGAAATGGAGATTGATTTTTTTTTT 2298

 10485105 TTTTTTTGAGATGTAGTCTCACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTTGGCT 10485164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 TTTTTTTGAGATGTAGTCTCACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTTGGCT 2358

 10485165 CACTACGACCTCCGCCTCCTGGGCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTTAGTAGCTGA 10485224
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 CACTACGACCTCTGCCTCCTGGGCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTTAGTAGCTGA 2418

 10485225 GATTACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTT 10485284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 GATTACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTT 2478

 10485285 TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCACAAACTCCTGACCTCGGGTGATCCACCCGCCTCGGC 10485344
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||| ||||||||||||||||||||
     2479 TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCACAAATTCCTGACCTC-GGTGATCCACCCGCCTCGGC 2537

 10485345 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAGCCAAGATTGATTTTTGT 10485404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAGCCAAGATTGATTTTTGT 2597

 10485405 ATT 10485407
          |||
     2598 ATT 2600

Alignment time is 2.04008 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10472480,10493779] =>     21300 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    7377] =>      7377 nucs 'mol-32-3025-265496_7377'

Score:        7169
Aligned:      7367        nucs
Identic:      7349 (100%) nucs =>      7228 (100%)       121 ( 99%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10480485,10487728] EXCISED REGION [10487741,10487861]
 second seq =>  [       1,    7245] EXCISED REGION [    7256,    7377]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        12 nucs [10487729,10487740]
 second seq =>        10 nucs [7246,7255]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [10487729,10487729] to [10487741,10487741]
 second seq =>         1 nucs [7245,7245] to [7255,7255]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [10487729,10487729] to [10487740,10487740]
 second seq =>         0 nucs

 10480485 GTGCGTGACATTCTTTATGGCTTTTTGTATGTCAAATACTTCATACTAAACTTTCTAGAG 10480544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGCGTGACATTCTTTATGGCTTTTTGTATGTCAAATACTTCATACTAAACTTTCTAGAG 60

 10480545 AATTAAACTTTAATGATGGGCTCAGCTTGGTCTGATTTATTTCCTTTCCCACACCTGTCT 10480604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTAAACTTTAATGATGGGCTCAGCTTGGTCTGATTTATTTCCTTTCCCACACCTGTCT 120

 10480605 CTACTTGCTCTAAGCCAGGCCCAGGGATTTTGAACAAGCTAAGCCGGCTCCTTAAACTAG 10480664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTACTTGCTCTAAGCCAGGCCCAGGGATTTTGAACAAGCTAAGCCGGCTCCTTAAACTAG 180

 10480665 GCTTTTCACTTTATCTTACTTACTCAGAGAAGATAAAACCTGCCAGTGATATTGTTGTGT 10480724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTTTTCACTTTATCTTACTTACTCAGAGAAGATAAAACCTGCCAGTGATATTGTTGTGT 240

 10480725 GGCCTGGGGCCAGTGTGACTGTTCCCTGCAGCGGTTTGACTTCATGATGATTTCCCTGGA 10480784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCCTGGGGCCAGTGTGACTGTTCCCTGCAGCGGTTTGACTTCATGATGATTTCCCTGGA 300

 10480785 GTGTTAAAGTCCTAAGAGTTGCCTAAGAGGAGCGAGCAGCGCCTGTGCCTCGACAGCTGG 10480844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGTTAAAGTCCTAAGAGTTGCCTAAGAGGAGCGAGCAGCGCCTGTGCCTCGACAGCTGG 360

 10480845 TGTCTACAGTGTGACCTCTGACCTCTCGGCTAATGTCAGTGAAGGAGACAATTTTCATTA 10480904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTCTACAGTGTGACCTCTGACCTCTCGGCTAATGTCAGTGAAGGAGACAATTTTCATTA 420

 10480905 AATCACCAACTTTTAATTTATTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCA 10480964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATCACCAACTTTTAATTTATTTTTCTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCA 480

 10480965 GGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTTGGCTCATTGCAAGCTCCACCTCCCGGGTTCACACC 10481024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTTGGCTCATTGCAAGCTCCACCTCCCGGGTTCACACC 540

 10481025 ATTCTCCCACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACTCCTGGC 10481084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTCTCCCACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACTCCTGGC 600

 10481085 TTATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATGGTCTTGA 10481144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATGGTCTTGA 660

 10481145 TCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGA 10481204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGA 720

 10481205 GCCACCGTATTTTAAAATTTTGTTTAGAGATGTGGTCTTGCTATGATGCCCAGGCTGATG 10481264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCACCGTATTTTAAAATTTTGTTTAGAGATGTGGTCTTGCTATGATGCCCAGGCTGATG 780

 10481265 TCAAACACCTGGACTCAAGCAATCCTCGTGCCTCGACCTCCCAAGGTGCTGGGATTATAG 10481324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAAACACCTGGACTCAAGCAATCCTCGTGCCTCGACCTCCCAAGGTGCTGGGATTATAG 840

 10481325 GCAGGAGCCACCGTGCCCTGCTACCAACTTTTTAAACTCTGCCTAGATGTGAGTACTTCG 10481384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCAGGAGCCACCGTGCCCTGCTACCAACTTTTTAAACTCTGCCTAGATGTGAGTACTTCG 900

 10481385 CTAGATCAGCCCCCACGCACCCCTCCTGCCCTCCCTGTACATTTAAGAGAAGCCCGAGTA 10481444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTAGATCAGCCCCCACGCACCCCTCCTGCCCTCCCTGTACATTTAAGAGAAGCCCGAGTA 960

 10481445 GCCGCACGTGACGGGATTTTTCTTTAAGGCTTGTCAAAGGCACTGTTCGAGGGGGATCTT 10481504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCGCACGTGACGGGATTTTTCTTTAAGGCTTGTCAAAGGCACTGTTCGAGGGGGATCTT 1020

 10481505 TTCACCTGGCTCTGAGGCTGAGGGATGGACACTGCTGGAATGGAGAGAGAACAGCAAGAG 10481564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCACCTGGCTCTGAGGCTGAGGGATGGACACTGCTGGAATGGAGAGAGAACAGCAAGAG 1080

 10481565 GTCAGAGGCTAAGTGTCAAAGGGCCCACGATGTTTCAAACAGTAATGATCAGAAGGGAAT 10481624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCAGAGGCTAAGTGTCAAAGGGCCCACGATGTTTCAAACAGTAATGATCAGAAGGGAAT 1140

 10481625 CCACTCAGCCCCTTTCCGCTTACCTTCCAAAAAGCTGTGAGTGGTGGAGTTTGGTTTCAA 10481684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCACTCAGCCCCTTTCCGCTTACCTTCCAAAAAGCTGTGAGTGGTGGAGTTTGGTTTCAA 1200

 10481685 ATCCAGCCCTCCTTGCTTACTAGCTGTTAGACTTTGGGGAAATTATTTACTATCTGTGTT 10481744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATCCAGCCCTCCTTGCTTACTAGCTGTTAGACTTTGGGGAAATTATTTACTATCTGTGTT 1260

 10481745 CTCAGTTTTCTCATTTGTAAAATGGGAAATAATAGCACCTGTGTCCTTGAGGCTACTTTG 10481804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCAGTTTTCTCATTTGTAAAATGGGAAATAATAGCACCTGTGTCCTTGAGGCTACTTTG 1320

 10481805 GGGATTCAGCAAGGGAAGATAGAGCAGTGCCTGGCACATAGTAAATACCTACACCAGTGG 10481864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGGATTCAGCAAGGGAAGATAGAGCAGTGCCTGGCACATAGTAAATACCTACACCAGTGG 1380

 10481865 CAGCAAGGCTGGGTGCGCTGGCTCACACCGTAAGCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGG 10481924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGCAAGGCTGGGTGCGCTGGCTCACACCGTAAGCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGG 1440

 10481925 GAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATC 10481984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATC 1500

 10481985 TCTACAAAAAATAAAAATTAGCTGGGCGCAGTGGTGCACACCTATGATCCCAGCTAGGTG 10482044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTACAAAAAATAAAAATTAGCTGGGCGCAGTGGTGCACACCTATGATCCCAGCTAGGTG 1560

 10482045 GCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTAAGCCCAGGAGATGGAGGTTGCAGTGACCCATGAC 10482104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTAAGCCCAGGAGATGGAGGTTGCAGTGACCCATGAC 1620

 10482105 CACACCACTGTACTCCAGCCTCGGTGATAAAGCAAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAA 10482164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACACCACTGTACTCCAGCCTCGGTGATAAAGCAAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAA 1680

 10482165 ATAGTGGCAGCAATTACTACCATTGAGTGTGCCTGACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGT 10482224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATAGTGGCAGCAATTACTACCATTGAGTGTGCCTGACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGT 1740

 10482225 GGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACT 10482284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACT 1800

 10482285 GCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGAATTCAGGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAG 10482344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGAATTCAGGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAG 1860

 10482345 TCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCACCACGCCCCACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAG 10482404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCACCACGCCCCACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAG 1920

 10482405 ACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGCTGGTCTCAAAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGC 10482464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGCTGGTCTCAAAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGC 1980

 10482465 TCCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGAAGCCACTACCCCCTGGCCAG 10482524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGAAGCCACTACCCCCTGGCCAG 2040

 10482525 CAGTGCGTGCTGTTTGTACTGAGAGAAACCAGATGTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAAT 10482584
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGTTCGTGCTGTTTGTACTGAGAGAAACCAGATGTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAAT 2100

 10482585 TTGCTTTGCACCCCAGTCTTCAAAAGGTTTCTGGTGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAG 10482644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGCTTTGCACCCCAGTCTTCAAAAGGTTTCTGGTGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAG 2160

 10482645 CAGGTGTAGAGGTTAAGAAAGGTCAGAGCTTCTCAAACTAACCTGTTACAACTCCCCCAC 10482704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAGGTGTAGAGGTTAAGAAAGGTCAGAGCTTCTCAAACTAACCTGTTACAACTCCCCCAC 2220

 10482705 TCCCACCACCACCCCCGAGATTTTGAAAAAATGTAGATTCTGATTCGGTAGAATCCTGAA 10482764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCCCACCACCACCCCCGAGATTTTGAAAAAATGTAGATTCTGATTCGGTAGAATCCTGAA 2280

 10482765 AATGGCTCTTCGTGGGGTGGAGCCCCATGTTCTGCATTTCTATCTTTTTTTTGAGACAAG 10482824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATGGCTCTTCGTGGGGTGGAGCCCCATGTTCTGCATTTCTATCTTTTTTTTGAGACAAG 2340

 10482825 GTCTCATTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGTGGCACTATCATGGCTCACTGCAGCCT 10482884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTCTCATTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGTGGCACTATCATGGCTCACTGCAGCCT 2400

 10482885 CAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCCTCCCAACTCAGCCTCCTGGCTAGCTGGGACTCCAGG 10482944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCCTCCCAACTCAGCCTCCTGGCTAGCTGGGACTCCAGG 2460

 10482945 TGCACACCGCCACGCCTGGCTAATTTCTAAACTTTTTGTAGAGATGAGCTCTCCCTATGT 10483004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGCACACCGCCACGCCTGGCTAATTTCTAAACTTTTTGTAGAGATGAGCTCTCCCTATGT 2520

 10483005 TGCCCAGGCTGATCTTCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGT 10483064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGCCCAGGCTGATCTTCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGT 2580

 10483065 GCTGAGACCACAGGCATGAGCCACCACGCCTGGCCCTGGGCCCCAATCTTGGCTCCGCCA 10483124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GCTGAGACCACAGGCATGAGCCACCACGCCTGGCCCTGGGCCCCAATCTTGGCTCCGCCA 2640

 10483125 CAAATTCAGCCTTACTTCACAAGTTAGTTAACCTCTATGTGCGTATTTTCTCCTCTATAT 10483184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAAATTCAGCCTTACTTCACAAGTTAGTTAACCTCTATGTGCGTATTTTCTCCTCTATAT 2700

 10483185 AAAAGGGATGATGATAACACCCACCTCACAGAGCCGTCTTCCCGACTAAACACAAGGCAC 10483244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAAGGGATGATGATAACACCCACCTCACAGAGCCGTCTTCCCGACTAAACACAAGGCAC 2760

 10483245 TTGCACCAGAGCCACCACACACTGAGCACTATGTAAGGTTTACTGTTTATTACCTGCCTC 10483304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGCACCAGAGCCACCACACACTGAGCACTATGTAAGGTTTACTGTTTATTACCTGCCTC 2820

 10483305 CTAAAGAGAGGCTGCCAAACAATTCTGAGTGTGGAAGGAGGTGGAAAGAGGGGTTTTGCC 10483364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTAAAGAGAGGCTGCCAAACAATTCTGAGTGTGGAAGGAGGTGGAAAGAGGGGTTTTGCC 2880

 10483365 CTTAGCCAAGTCAGTCCTGTTCAGTCTAACCACTAAAAGGGACAGATCTGGTGGCTTCTT 10483424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTTAGCCAAGTCAGTCCTGTTCAGTCTAACCACTAAAAGGGACAGATCTGGTGGCTTCTT 2940

 10483425 TGAGGTAGAAATTATAGGCCCCTAATGATGTCTGCCACAACTCTGCTTTACTGGGGACAC 10483484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGAGGTAGAAATTATAGGCCCCTAATGATGTCTGCCACAACTCTGCTTTACTGGGGACAC 3000

 10483485 AAAGGTGTGTTATACAGACAAGGGTCAGACAAGGAAACAGGAGTTTTGTTTTCACTTTTG 10483544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAAGGTGTGTTATACAGACAAGGGTCAGACAAGGAAACAGGAGTTTTGTTTTCACTTTTG 3060

 10483545 AGACAGTCTCACTCTGTTTCCCAGCTGGAGTGCAGGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACC 10483604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGACAGTCTCACTCTGTTTCCCAGCTGGAGTGCAGGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACC 3120

 10483605 TCTACCTCCCTAGTTCACGCAGTTCTCCTGCTTCAACCTCCTGAATAGCTGGGATTACAG 10483664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCTACCTCCCTAGTTCACGCAGTTCTCCTGCTTCAACCTCCTGAATAGCTGGGATTACAG 3180

 10483665 GTGCCCACCACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCGTGT 10483724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTGCCCACCACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCGTGT 3240

 10483725 TGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAG 10483784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAG 3300

 10483785 TGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAGCAAAG 10483844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAGCAAAG 3360

 10483845 AGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGCCCATC 10483904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGCCCATC 3420

 10483905 ATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGTCTGCT 10483964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGTCTGCT 3480

 10483965 CACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAACCACC 10484024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAACCACC 3540

 10484025 CCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGGTCATG 10484084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGGTCATG 3600

 10484085 AATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCCACAAT 10484144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCCACAAT 3660

 10484145 GTCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGGGCGTG 10484204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GTCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGGGCGTG 3720

 10484205 GAGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCAGCTAG 10484264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GAGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCAGCTAG 3780

 10484265 GGCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAGGCCAGAGAAACAT 10484324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAGGCCAGAGAAACAT 3840

 10484325 CTTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACACGTGGCTTTTAAAA 10484384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACACGTGGCTTTTAAAA 3900

 10484385 ACCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTATAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAGCAAGC 10484444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ACCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTATAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAGCAAGC 3960

 10484445 CGCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTTGATGGGGGAGTAT 10484504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CGCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTTGATGGGGGAGTAT 4020

 10484505 GAGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACATTGTTCTTGCCATCTTCGTAAATTACA 10484564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GAGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACATTGTTCTTGCCATCTTCGTAAATTACA 4080

 10484565 GTCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAAAATCTGTTACATAGCAGAGTTGGGAACCG 10484624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GTCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAAAATCTGTTACATAGCAGAGTTGGGAACCG 4140

 10484625 GCACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCATATAGTATATATACTACTAGCTAACATTG 10484684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GCACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCATATAGTATATATACTACTAGCTAACATTG 4200

 10484685 AGAGCATATGCCAGGCTCTGTAACTCATTGAATGCTCGCAGCACCCTCTGAAGTAAGCAC 10484744
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4201 AGAGCATATGCCAGGCTCTGTAACTCATTGAATGCCCGCAGCACCCTCTGAAGTAAGCAC 4260

 10484745 TATTACTATCCCTAATTTAGAGATGAAGCACACTGATATTAAGTAATTCGTCCAAGGTCA 10484804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TATTACTATCCCTAATTTAGAGATGAAGCACACTGATATTAAGTAATTCGTCCAAGGTCA 4320

 10484805 GAGCTACTGAAGAACTGGAATTGAACCCCAGAGATCTGGTGCCAGAGTCCATACACTTAA 10484864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GAGCTACTGAAGAACTGGAATTGAACCCCAGAGATCTGGTGCCAGAGTCCATACACTTAA 4380

 10484865 TCATGAAACTGACCTGTCGGCGTGCACAGTTCATCGCCCCACTCATTCAGTCATTCGGCA 10484924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TCATGAAACTGACCTGTCGGCGTGCACAGTTCATCGCCCCACTCATTCAGTCATTCGGCA 4440

 10484925 TGTTTATGGTACACCTACCATGTGCCAAGCATTGTGCTAGGTACCCTCTGTC-GGGGTGA 10484983
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     4441 TGTTTATGGTACACCTACCATGTGCCAAGCATTGTGCTAGGTACCCTCTGTCAGGGGTGA 4500

 10484984 GAGAAGTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTTACAGGATACATATAATATTTAACGATAAT 10485043
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4501 GAGAAGTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTTACAGAATACATATAATATTTAACGATAAT 4560

 10485044 TATTTTTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAAACCTATGAAATGGAGATTGATTTTTTTTT 10485103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TATTTTTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAAACCTATGAAATGGAGATTGATTTTTTTTT 4620

 10485104 TTTTTTTTGAGATGTAGTCTCACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTTGGC 10485163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTTTTTTTGAGATGTAGTCTCACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTTGGC 4680

 10485164 TCACTACGACCTCCGCCTCCTGGGCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTTAGTAGCTG 10485223
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TCACTACGACCTCTGCCTCCTGGGCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTTAGTAGCTG 4740

 10485224 AGATTACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGT 10485283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AGATTACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGT 4800

 10485284 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCACAAACTCCTGACCTCGGGTGATCCACCCGCCTCGG 10485343
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCACAAATTCCTGACCTCGGGTGATCCACCCGCCTCGG 4860

 10485344 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAGCCAAGATTGATTTTTG 10485403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAGCCAAGATTGATTTTTG 4920

 10485404 TATTGACATTTTACAGTGCAGTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGTGGGGAAAAG 10485463
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4921 TATTGACATTTTACAGTGCAGTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTTTTGTGGGGAAAAG 4980

 10485464 AAAGATCAGATTGTTACTGTGTTTGTGTAGAAAGAAGTAGACATAAGAGACTCCATTTTG 10485523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AAAGATCAGATTGTTACTGTGTTTGTGTAGAAAGAAGTAGACATAAGAGACTCCATTTTG 5040

 10485524 TTTTGTACTAAGAGAAATTCTTCTGCCTTGAGATGCTGTTAATCTGTAACCTTACCCCCA 10485583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TTTTGTACTAAGAGAAATTCTTCTGCCTTGAGATGCTGTTAATCTGTAACCTTACCCCCA 5100

 10485584 ACCCTGTGCTCTCCGAAACATGTGCTGTGTCAACTCAGGGTTAAATGGATTAAGGGCTGT 10485643
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 ACCCTGTGCTCTCCGAAACATGTGCCGTGTCAACTCAGGGTTAAATGGATTAAGGGCTGT 5160

 10485644 GCAAGATGTGCTTTGTTAAACAGACGCTTGAAGGCAGCATGCTCGTTAAGAGTCATCACC 10485703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GCAAGATGTGCTTTGTTAAACAGACGCTTGAAGGCAGCATGCTCGTTAAGAGTCATCACC 5220

 10485704 ACTCCCTAATGTGTCCGGAATTGGTGGGTTCTTGGTCTCACTAGCTCCAAGAATGAAGCC 10485763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ACTCCCTAATGTGTCCGGAATTGGTGGGTTCTTGGTCTCACTAGCTCCAAGAATGAAGCC 5280

 10485764 GCGGACCCTCGCGGTGAGTGTTACAGCTCTTAAGGTGGCGCATCTGGAGTTTGTTCCTTC 10485823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GCGGACCCTCGCGGTGAGTGTTACAGCTCTTAAGGTGGCGCATCTGGAGTTTGTTCCTTC 5340

 10485824 TGATGTTCGGATGTGTTCGGAGTTTCTTCCTTCTCGTGGGCTCGTGGTCTCACTGGCTCA 10485883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5341 TGATGTTCGGATGTGTTCGGAGTTTCTTCCTTCTGGTGGGCTCGTGGTCTCACTGGCTCA 5400

 10485884 GGAGTGAAGCTGCAGATCTTCGCGGTGAGTGTTACAGCTCATAAAAGCAGCGTGGACCCA 10485943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GGAGTGAAGCTGCAGATCTTCGCGGTGAGTGTTACAGCTCATAAAAGCAGCGTGGACCCA 5460

 10485944 AAGAGTGAGCAGTAACAAGATTTATTGCAAAGAACAAAACTGCCACAGCGTGGAAGGGAA 10486003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AAGAGTGAGCAGTAACAAGATTTATTGCAAAGAACAAAACTGCCACAGCGTGGAAGGGAA 5520

 10486004 CCCAAGCGGGTTGCCACTGCTGGCTTGGGCAGCCTGCTTTTATTCTCTTATCTGGCCCCA 10486063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CCCAAGCGGGTTGCCACTGCTGGCTTGGGCAGCCTGCTTTTATTCTCTTATCTGGCCCCA 5580

 10486064 CCCACGTCCTGCTGATTGGTAGAGCCCAGTGGTCTGTTTTGACAGGGCGCTGACTGGTGC 10486123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 CCCACGTCCTGCTGATTGGTAGAGCCCAGTGGTCTGTTTTGACAGGGCGCTGACTGGTGC 5640

 10486124 GTTTACAATCCCTGAGCTAGACACAAAGGTTCTCCAAGGCCCCACCAGAGTAGCTAGATA 10486183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     5641 GTTTACAATCCCTGAGCTAGACACAAAGGTTCTCCAAGGCCCTACCAGAGTAGCTAGATA 5700

 10486184 CAGAGTGTCGATTGGTGCATTCACAAACCCTGGGCTAAACAAAGGGTGCTGATTGGTGTA 10486243
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 CAGAGTGTCGACTGGTGCATTCACAAACCCTGGGCTAAACAAAGGGTGCTGATTGGTGTA 5760

 10486244 TTTACAAACCTTGAGCTAGATACAGAGTGCCGATTGGTGTATTTATAATCCCTGAGCTAG 10486303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5761 TTTACAAACCTTGAGCTAGATACAGAGTGCCGATTGGTATATTTATAATCCCTGAGCTAG 5820

 10486304 ACATAAAGGTTCTCCTCCTCCCCACCAGACTCAGGAGCCCAGCTGGCTTCACCCAGTGGA 10486363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 ACATAAAGGTTCTCCTCCTCCCCACCAGACTCAGGAGCCCAGCTGGCTTCACCCAGTGGA 5880

 10486364 TCCTGCACCAGGCTGCAGGTGGAGCTGCCTGCCAGTCCTGCGCCATGCGCCCACACTCCC 10486423
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5881 TCCTGCACCAGGCTGCAGGTGGAGCTGCCTGCCAGTCCTGCGCCATGCGCCCACACTCCT 5940

 10486424 CAGCCCTTGGGTGGTCGATGGGACTGGGCGCCGTGGAGCAGGGGGCCACGCTCATCGGGG 10486483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 CAGCCCTTGGGTGGTCGATGGGACTGGGCGCCGTGGAGCAGGGGGCCACGCTCATCGGGG 6000

 10486484 AGGCTCGGGCCACACAGGAGCCCACGGAGTGGGTGGGAGGCTCAGGCATGGCGGGCTGCA 10486543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 AGGCTCGGGCCACACAGGAGCCCACGGAGTGGGTGGGAGGCTCAGGCATGGCGGGCTGCA 6060

 10486544 GGTCCCGAGCCCTGCCCCACAGGAAGGCAGCTAAGGCCCAGTGAGAAATCGAGTGCAGCG 10486603
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6061 GGTCCCGAGCCCTGCCCCACAGGAAGGCAGCTAAGGCCCAGTGAGAAATCGAGCGCAGCG 6120

 10486604 CCGGTGGGCTGGCACTGCTGGGGGACCCAGTACACCCTCCGCAGCCGCTGGCCTGGGTGC 10486663
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6121 CCGGTGGGCTGGCACTGCTGGGGGACCCAGTACACCCTCCGCAGCCGCTGGCCCGGGTGC 6180

 10486664 TAAGCCCCTCATTGCCCTGGGCGGGCAGGGCCAGCCGGCTGCTCCGAGTGCGGGGCCCGC 10486723
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TAAGCCCCTCATTGCCCCGGGCGGGCAGGGCCAGCCGGCTGCTCCGAGTGCGGGGCCCGC 6240

 10486724 CAAGCCCACGCCCACCCGGAACTCCAGCTGGCCCGCAAGCGCCGCGCGCAGCCCTGGTTC 10486783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 CAAGCCCACGCCCACCCGGAACTCCAGCTGGCCCGCAAGCGCCGCGCGCAGCCCTGGTTC 6300

 10486784 CCGCTTGCGCCTCTCCCTCCACACCTCCCTGCAAGCTGAGGGAGCCGGCTCTGGCCTTGG 10486843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 CCGCTTGCGCCTCTCCCTCCACACCTCCCTGCAAGCTGAGGGAGCCGGCTCTGGCCTTGG 6360

 10486844 CCAGCCCAGAAAGGGGCTCCCACAGTGCAGCGGTGGGCTGAAGGGCTCCTCAAGTGCCAC 10486903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 CCAGCCCAGAAAGGGGCTCCCACAGTGCAGCGGTGGGCTGAAGGGCTCCTCAAGTGCCAC 6420

 10486904 CAAAGTAGGAGCCCAGGCAGAGGAGGTGCCGAGAGCGAGCGAGGGCTTTAGGACTGCCAG 10486963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 CAAAGTAGGAGCCCAGGCAGAGGAGGTGCCGAGAGCGAGCGAGGGCTTTAGGACTGCCAG 6480

 10486964 CACGCTGTCACCTCTCACTAATCTCAAGTACCCAGGGACAGAAACACTGCGGAAGGCCGC 10487023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CACGCTGTCACCTCTCACTAATCTCAAGTACCCAGGGACAGAAACACTGCGGAAGGCCGC 6540

 10487024 AGGGACCTCTGCCTAGGAAAGCCAGGTATTGTCCAAGGTTTCTCCCCATGTGATAGTCTG 10487083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 AGGGACCTCTGCCTAGGAAAGCCAGGTATTGTCCAAGGTTTCTCCCCATGTGATAGTCTG 6600

 10487084 AAATATGGCCTCGTGGGAGGGAAAGACCTGACCGTCCCCCAGCCCGACACCCGTAAAGGG 10487143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 AAATATGGCCTCGTGGGAGGGAAAGACCTGACCGTCCCCCAGCCCGACACCCGTAAAGGG 6660

 10487144 TCTGTGCTGAGGAGGATTAGTAAAAGAGGAAGGAACGCCTCTTGCAGTTGAGACGAGAGG 10487203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 TCTGTGCTGAGGAGGATTAGTAAAAGAGGAAGGAACGCCTCTTGCAGTTGAGACGAGAGG 6720

 10487204 AAGGCATCTGTCTCCTGCCCGTCCCTGGGCAATGGAATGTCTCAGTATAAAACCCGATTG 10487263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 AAGGCATCTGTCTCCTGCCCGTCCCTGGGCAATGGAATGTCTCAGTATAAAACCCGATTG 6780

 10487264 TATGTTCCATCTACTGAGATAGGGGAAAACCGCCTTAGGGCTGGAGGTGGGACAGGCGGG 10487323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 TATGTTCCATCTACTGAGATAGGGGAAAACCGCCTTAGGGCTGGAGGTGGGACAGGCGGG 6840

 10487324 CAGCAATACTGCTCTTCAAGGCATTGAGATGTTTATGTGTACACATATCTAAAGCACAGC 10487383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 CAGCAATACTGCTCTTCAAGGCATTGAGATGTTTATGTGTACACATATCTAAAGCACAGC 6900

 10487384 ACTTAATTCTTTACCTTATCTATGGTGCAGAGACCTTTGTTCAAGTGTTTATCTGCTGAC 10487443
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 ACTTAATTCTTTACCTTATCTATGATGCAGAGACCTTTGTTCAAGTGTTTATCTGCTGAC 6960

 10487444 CTTCTCTCCACTATTATCCTATGATCCTGCCACATCCCCCTCTCCGAGAAACACCCAAGA 10487503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 CTTCTCTCCACTATTATCCTATGATCCTGCCACATCCCCCTCTCCGAGAAACACCCAAGA 7020

 10487504 ATGATCAATAAATACTAAGGGAATTCAGGCCGGCGGGATCCTCCATATGCTGAACGCTGG 10487563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 ATGATCAATAAATACTAAGGGAATTCAGGCCGGCGGGATCCTCCATATGCTGAACGCTGG 7080

 10487564 TCCCCTGGGCCCCCTTATTTCTTTCTCTATACTTTGTCTCTGTGTCTTTTTCTTTTCCAA 10487623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 TCCCCTGGGCCCCCTTATTTCTTTCTCTATACTTTGTCTCTGTGTCTTTTTCTTTTCCAA 7140

 10487624 GTCTCTCGTTCCACCTAACGAGAAACACCCACAGGTGTGGAGGGGCAACCCACCCCTTCA 10487683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 GTCTCTCGTTCCACCTAACGAGAAACACCCACAGGTGTGGAGGGGCAACCCACCCCTTCA 7200

 10487684 AGTTTCGCTCTTGTTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGCACGATCTC 10487728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 AGTTTCGCTCTTGTTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGCACGATCTC 7245

EXCISED REGION

 10487741 AACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT 10487800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7256 AACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATT 7315

 10487801 ACAGGCATGCACCACTACGCCTGGCTAA-TTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTC 10487859
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     7316 ACAGGCATGCACCACTACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTC 7375

 10487860 CA 10487861
          ||
     7376 CA 7377

Alignment time is 5.6871 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10472480,10493779] =>     21300 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    3369] =>      3369 nucs 'mol-32-303b-055467_3369'

Score:        3359
Aligned:      3370        nucs
Identic:      3369 (100%) nucs =>      1171 (100%)      2198 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10479276,10480446] EXCISED REGION [10480451,10482649]
 second seq =>  [       1,    1171] EXCISED REGION [    1172,    3369]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [10480447,10480450]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        20 nucs [10480447,10480466] to [10480451,10480470]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [10480447,10480448] to [10480449,10480450]
 second seq =>         0 nucs

 10479276 ATGTTGGCTAGACTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCAGCCTTCCAA 10479335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTTGGCTAGACTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCAGCCTTCCAA 60

 10479336 AGTGCTGGGATGACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTAACCATCAGTTTTTCATTTAC 10479395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTGCTGGGATGACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTAACCATCAGTTTTTCATTTAC 120

 10479396 CCACATTGATATGAATGAAAATCTATCCGCGTCACCAGGGGCAGATCACTAATCTCTGGC 10479455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCACATTGATATGAATGAAAATCTATCCGCGTCACCAGGGGCAGATCACTAATCTCTGGC 180

 10479456 CGTGCGTTTTGTGCTCAGGACTCCTGGCGGCGGGCAGTCAGCACTGGGGTCCAGGCTGGC 10479515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CGTGCGTTTTGTGCTCAGGACTCCTGGCGGCGGGCAGTCAGCACTGGGGTCCAGGCTGGC 240

 10479516 ATTCCCATGCCCTGTTTTACCACTGCCCTCTCCTTCTATGACGGGTACAGACATGAGATG 10479575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTCCCATGCCCTGTTTTACCACTGCCCTCTCCTTCTATGACGGGTACAGACATGAGATG 300

 10479576 CTTCCAGCCAGCCTCATCCAGGTAAGCCTGTGGAGCAGGGATTAACCTGGCTGGCCCCTC 10479635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTCCAGCCAGCCTCATCCAGGTAAGCCTGTGGAGCAGGGATTAACCTGGCTGGCCCCTC 360

 10479636 GGGGGCGTGCGCCATGGACTGTCCTGACCAACCTACTCTCTCGTTTCCTAGGCTCAGCGG 10479695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGGGCGTGCGCCATGGACTGTCCTGACCAACCTACTCTCTCGTTTCCTAGGCTCAGCGG 420

 10479696 GATTACTTCGGGGCTCACACCTATGAACTCTTGGCCAAACCAGGGCAGTTTATCCACACC 10479755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATTACTTCGGGGCTCACACCTATGAACTCTTGGCCAAACCAGGGCAGTTTATCCACACC 480

 10479756 AACTGGACAGGCCATGGTGGCACCGTGTCATCCTCGTCATACAATGCCTGATCATGCTGC 10479815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACTGGACAGGCCATGGTGGCACCGTGTCATCCTCGTCATACAATGCCTGATCATGCTGC 540

 10479816 TCCTGTCACCCTCCACGATTCCACAGACCAGGACATTCCATGTGCCTCATGGCACTGCCA 10479875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCTGTCACCCTCCACGATTCCACAGACCAGGACATTCCATGTGCCTCATGGCACTGCCA 600

 10479876 CCTGGCCCTTTGCCCTATTTTCTGTTCAGTTTTTTAAAAGTGTTGTAAGAGACTCCTGAG 10479935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTGGCCCTTTGCCCTATTTTCTGTTCAGTTTTTTAAAAGTGTTGTAAGAGACTCCTGAG 660

 10479936 GAAGACACACAGTTTATTTGTAAAGTAGCTCTGTGAGAGCCACCATGCCCTCTGCCCTTG 10479995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAGACACACAGTTTATTTGTAAAGTAGCTCTGTGAGAGCCACCATGCCCTCTGCCCTTG 720

 10479996 CCTCTTGGGACTGACCAGGAGCTGCTCATGTGCGTGAGAGTGGGAACCATCTCCTTGCGG 10480055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCTTGGGACTGACCAGGAGCTGCTCATGTGCGTGAGAGTGGGAACCATCTCCTTGCGG 780

 10480056 CAGTGGCTTCCGCGTGCCCCGTGTGCTGGTGCGGTTCCCATCACGCAGACAGGAAGGGTG 10480115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGTGGCTTCCGCGTGCCCCGTGTGCTGGTGCGGTTCCCATCACGCAGACAGGAAGGGTG 840

 10480116 TTTGCGCACTCTGATCAACTGGAACCTCTGTATCATGCGGCTGAATTCCCTTTTTCCTTT 10480175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTGCGCACTCTGATCAACTGGAACCTCTGTATCATGCGGCTGAATTCCCTTTTTCCTTT 900

 10480176 ACTCAATAAAAGCTACATCAGACTGATGCTCTTTCTCCAGATTCTTAGTCTCACCTCGGC 10480235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTCAATAAAAGCTACATCAGACTGATGCTCTTTCTCCAGATTCTTAGTCTCACCTCGGC 960

 10480236 CACATGGAGCCATTATCCCCATTGGCAGAAAGATTTTTCTTTAAAAAAAAAGACTAGAAT 10480295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACATGGAGCCATTATCCCCATTGGCAGAAAGATTTTTCTTTAAAAAAAAAGACTAGAAT 1020

 10480296 AACACAAGAAACCACATTTAGGATTATGCTTCACTCAGAGGAGGCAGGCAGGGAGGACAC 10480355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACACAAGAAACCACATTTAGGATTATGCTTCACTCAGAGGAGGCAGGCAGGGAGGACAC 1080

 10480356 ACCAGGGGCTTTAATACACTGGGCATGTTTTCTTTCTCCAATTGGGCAATGGGTACATGG 10480415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACCAGGGGCTTTAATACACTGGGCATGTTTTCTTTCTCCAATTGGGCAATGGGTACATGG 1140

 10480416 ACGTTCACTGTAACGTGCTTTTTCTTTCGTC 10480446
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACGTTCACTGTAACGTGCTTTTTCTTTCGTC 1171

EXCISED REGION

 10480451 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTCCTGGCAAGCTGTGCGTGACATTCTTTATGGCTTTTT 10480510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTCCTGGCAAGCTGTGCGTGACATTCTTTATGGCTTTTT 1231

 10480511 GTATGTCAAATACTTCATACTAAACTTTCTAGAGAATTAAACTTTAATGATGGGCTCAGC 10480570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 GTATGTCAAATACTTCATACTAAACTTTCTAGAGAATTAAACTTTAATGATGGGCTCAGC 1291

 10480571 TTGGTCTGATTTATTTCCTTTCCCACACCTGTCTCTACTTGCTCTAAGCCAGGCCCAGGG 10480630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 TTGGTCTGATTTATTTCCTTTCCCACACCTGTCTCTACTTGCTCTAAGCCAGGCCCAGGG 1351

 10480631 ATTTTGAACAAGCTAAGCCGGCTCCTTAAACTAGGCTTTTCACTTTATCTTACTTACTCA 10480690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 ATTTTGAACAAGCTAAGCCGGCTCCTTAAACTAGGCTTTTCACTTTATCTTACTTACTCA 1411

 10480691 GAGAAGATAAAACCTGCCAGTGATATTGTTGTGTGGCCTGGGGCCAGTGTGACTGTTCCC 10480750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 GAGAAGATAAAACCTGCCAGTGATATTGTTGTGTGGCCTGGGGCCAGTGTGACTGTTCCC 1471

 10480751 TGCAGCGGTTTGACTTCATGATGATTTCCCTGGAGTGTTAAAGTCCTAAGAGTTGCCTAA 10480810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 TGCAGCGGTTTGACTTCATGATGATTTCCCTGGAGTGTTAAAGTCCTAAGAGTTGCCTAA 1531

 10480811 GAGGAGCGAGCAGCGCCTGTGCCTCGACAGCTGGTGTCTACAGTGTGACCTCTGACCTCT 10480870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 GAGGAGCGAGCAGCGCCTGTGCCTCGACAGCTGGTGTCTACAGTGTGACCTCTGACCTCT 1591

 10480871 CGGCTAATGTCAGTGAAGGAGACAATTTTCATTAAATCACCAACTTTTAATTTATTTTTC 10480930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 CGGCTAATGTCAGTGAAGGAGACAATTTTCATTAAATCACCAACTTTTAATTTATTTTTC 1651

 10480931 TTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTTG 10480990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 TTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTTG 1711

 10480991 GCTCATTGCAAGCTCCACCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCCACCTCAGCCTCCAGAGTA 10481050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 GCTCATTGCAAGCTCCACCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCCACCTCAGCCTCCAGAGTA 1771

 10481051 GCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACTCCTGGCTTATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 10481110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 GCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACTCCTGGCTTATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 1831

 10481111 CGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACC 10481170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 CGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACC 1891

 10481171 TCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTATTTTAAAATTTTGTTTA 10481230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 TCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTATTTTAAAATTTTGTTTA 1951

 10481231 GAGATGTGGTCTTGCTATGATGCCCAGGCTGATGTCAAACACCTGGACTCAAGCAATCCT 10481290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 GAGATGTGGTCTTGCTATGATGCCCAGGCTGATGTCAAACACCTGGACTCAAGCAATCCT 2011

 10481291 CGTGCCTCGACCTCCCAAGGTGCTGGGATTATAGGCAGGAGCCACCGTGCCCTGCTACCA 10481350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 CGTGCCTCGACCTCCCAAGGTGCTGGGATTATAGGCAGGAGCCACCGTGCCCTGCTACCA 2071

 10481351 ACTTTTTAAACTCTGCCTAGATGTGAGTACTTCGCTAGATCAGCCCCCACGCACCCCTCC 10481410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 ACTTTTTAAACTCTGCCTAGATGTGAGTACTTCGCTAGATCAGCCCCCACGCACCCCTCC 2131

 10481411 TGCCCTCCCTGTACATTTAAGAGAAGCCCGAGTAGCCGCACGTGACGGGATTTTTCTTTA 10481470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 TGCCCTCCCTGTACATTTAAGAGAAGCCCGAGTAGCCGCACGTGACGGGATTTTTCTTTA 2191

 10481471 AGGCTTGTCAAAGGCACTGTTCGAGGGGGATCTTTTCACCTGGCTCTGAGGCTGAGGGAT 10481530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 AGGCTTGTCAAAGGCACTGTTCGAGGGGGATCTTTTCACCTGGCTCTGAGGCTGAGGGAT 2251

 10481531 GGACACTGCTGGAATGGAGAGAGAACAGCAAGAGGTCAGAGGCTAAGTGTCAAAGGGCCC 10481590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 GGACACTGCTGGAATGGAGAGAGAACAGCAAGAGGTCAGAGGCTAAGTGTCAAAGGGCCC 2311

 10481591 ACGATGTTTCAAACAGTAATGATCAGAAGGGAATCCACTCAGCCCCTTTCCGCTTACCTT 10481650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 ACGATGTTTCAAACAGTAATGATCAGAAGGGAATCCACTCAGCCCCTTTCCGCTTACCTT 2371

 10481651 CCAAAAAGCTGTGAGTGGTGGAGTTTGGTTTCAAATCCAGCCCTCCTTGCTTACTAGCTG 10481710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 CCAAAAAGCTGTGAGTGGTGGAGTTTGGTTTCAAATCCAGCCCTCCTTGCTTACTAGCTG 2431

 10481711 TTAGACTTTGGGGAAATTATTTACTATCTGTGTTCTCAGTTTTCTCATTTGTAAAATGGG 10481770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 TTAGACTTTGGGGAAATTATTTACTATCTGTGTTCTCAGTTTTCTCATTTGTAAAATGGG 2491

 10481771 AAATAATAGCACCTGTGTCCTTGAGGCTACTTTGGGGATTCAGCAAGGGAAGATAGAGCA 10481830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 AAATAATAGCACCTGTGTCCTTGAGGCTACTTTGGGGATTCAGCAAGGGAAGATAGAGCA 2551

 10481831 GTGCCTGGCACATAGTAAATACCTACACCAGTGGCAGCAAGGCTGGGTGCGCTGGCTCAC 10481890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 GTGCCTGGCACATAGTAAATACCTACACCAGTGGCAGCAAGGCTGGGTGCGCTGGCTCAC 2611

 10481891 ACCGTAAGCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTG 10481950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 ACCGTAAGCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTG 2671

 10481951 AGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAATTAGCTGGG 10482010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 AGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAATTAGCTGGG 2731

 10482011 CGCAGTGGTGCACACCTATGATCCCAGCTAGGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTA 10482070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 CGCAGTGGTGCACACCTATGATCCCAGCTAGGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTA 2791

 10482071 AGCCCAGGAGATGGAGGTTGCAGTGACCCATGACCACACCACTGTACTCCAGCCTCGGTG 10482130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 AGCCCAGGAGATGGAGGTTGCAGTGACCCATGACCACACCACTGTACTCCAGCCTCGGTG 2851

 10482131 ATAAAGCAAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATAGTGGCAGCAATTACTACCATTGA 10482190
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 ATAAAGCAAAACCCTGTCTC-AAAAAAAAAAAAAATAGTGGCAGCAATTACTACCATTGA 2910

 10482191 GTGTGCCTGACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCT 10482250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 GTGTGCCTGACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCT 2970

 10482251 CTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGA 10482310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 CTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGA 3030

 10482311 ATTCAGGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCAC 10482370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 ATTCAGGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCAC 3090

 10482371 CACGCCCCACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGC 10482430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 CACGCCCCACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGC 3150

 10482431 TGGTCTCAAAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTG 10482490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 TGGTCTCAAAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTG 3210

 10482491 GGATTACAGGCAGAAGCCACTACCCCCTGGCCAGCAGTGCGTGCTGTTTGTACTGAGAGA 10482550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 GGATTACAGGCAGAAGCCACTACCCCCTGGCCAGCAGTGCGTGCTGTTTGTACTGAGAGA 3270

 10482551 AACCAGATGTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAATTTGCTTTGCACCCCAGTCTTCAAAAG 10482610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 AACCAGATGTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAATTTGCTTTGCACCCCAGTCTTCAAAAG 3330

 10482611 GTTTCTGGTGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAGCAGGT 10482649
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 GTTTCTGGTGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAGCAGGT 3369

Alignment time is 2.65741 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10472480,10493779] =>     21300 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2915] =>      2915 nucs 'mol-32-303b-131667_2915'

Score:        2903
Aligned:      2914        nucs
Identic:      2913 (100%) nucs =>      2786 (100%)       127 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10482191,10484976] EXCISED REGION [10484977,10485104]
 second seq =>  [       1,    2786] EXCISED REGION [    2788,    2915]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2787,2787]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [10485019,10485019]
 second seq =>         1 nucs [2830,2830]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10482191 GTGTGCCTGACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCT 10482250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTGCCTGACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCT 60

 10482251 CTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGA 10482310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGA 120

 10482311 ATTCAGGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCAC 10482370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTCAGGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCAC 180

 10482371 CACGCCCCACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGC 10482430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACGCCCCACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGC 240

 10482431 TGGTCTCAAAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTG 10482490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGTCTCAAAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTG 300

 10482491 GGATTACAGGCAGAAGCCACTACCCCCTGGCCAGCAGTGCGTGCTGTTTGTACTGAGAGA 10482550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGATTACAGGCAGAAGCCACTACCCCCTGGCCAGCAGTGCGTGCTGTTTGTACTGAGAGA 360

 10482551 AACCAGATGTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAATTTGCTTTGCACCCCAGTCTTCAAAAG 10482610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACCAGATGTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAATTTGCTTTGCACCCCAGTCTTCAAAAG 420

 10482611 GTTTCTGGTGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAGCAGGTGTAGAGGTTAAGAAAGGTCAG 10482670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTTCTGGTGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAGCAGGTGTAGAGGTTAAGAAAGGTCAG 480

 10482671 AGCTTCTCAAACTAACCTGTTACAACTCCCCCACTCCCACCACCACCCCCGAGATTTTGA 10482730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCTTCTCAAACTAACCTGTTACAACTCCCCCACTCCCACCACCACCCCCGAGATTTTGA 540

 10482731 AAAAATGTAGATTCTGATTCGGTAGAATCCTGAAAATGGCTCTTCGTGGGGTGGAGCCCC 10482790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAATGTAGATTCTGATTCGGTAGAATCCTGAAAATGGCTCTTCGTGGGGTGGAGCCCC 600

 10482791 ATGTTCTGCATTTCTATCTTTTTTTTGAGACAAGGTCTCATTCTGTGGCCCAGGCTGGAG 10482850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGTTCTGCATTTCTATCTTTTTTTTGAGACAAGGTCTCATTCTGTGGCCCAGGCTGGAG 660

 10482851 TGCAGTGTGGCACTATCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCCTC 10482910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCAGTGTGGCACTATCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCCTC 720

 10482911 CCAACTCAGCCTCCTGGCTAGCTGGGACTCCAGGTGCACACCGCCACGCCTGGCTAATTT 10482970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCAACTCAGCCTCCTGGCTAGCTGGGACTCCAGGTGCACACCGCCACGCCTGGCTAATTT 780

 10482971 CTAAACTTTTTGTAGAGATGAGCTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGATCTTCAACTCCTGG 10483030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTAAACTTTTTGTAGAGATGAGCTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGATCTTCAACTCCTGG 840

 10483031 GCTCAAGCGATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGTGCTGAGACCACAGGCATGAGCCACCA 10483090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTCAAGCGATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGTGCTGAGACCACAGGCATGAGCCACCA 900

 10483091 CGCCTGGCCCTGGGCCCCAATCTTGGCTCCGCCACAAATTCAGCCTTACTTCACAAGTTA 10483150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CGCCTGGCCCTGGGCCCCAATCTTGGCTCCGCCACAAATTCAGCCTTACTTCACAAGTTA 960

 10483151 GTTAACCTCTATGTGCGTATTTTCTCCTCTATATAAAAGGGATGATGATAACACCCACCT 10483210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTAACCTCTATGTGCGTATTTTCTCCTCTATATAAAAGGGATGATGATAACACCCACCT 1020

 10483211 CACAGAGCCGTCTTCCCGACTAAACACAAGGCACTTGCACCAGAGCCACCACACACTGAG 10483270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACAGAGCCGTCTTCCCGACTAAACACAAGGCACTTGCACCAGAGCCACCACACACTGAG 1080

 10483271 CACTATGTAAGGTTTACTGTTTATTACCTGCCTCCTAAAGAGAGGCTGCCAAACAATTCT 10483330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACTATGTAAGGTTTACTGTTTATTACCTGCCTCCTAAAGAGAGGCTGCCAAACAATTCT 1140

 10483331 GAGTGTGGAAGGAGGTGGAAAGAGGGGTTTTGCCCTTAGCCAAGTCAGTCCTGTTCAGTC 10483390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGTGTGGAAGGAGGTGGAAAGAGGGGTTTTGCCCTTAGCCAAGTCAGTCCTGTTCAGTC 1200

 10483391 TAACCACTAAAAGGGACAGATCTGGTGGCTTCTTTGAGGTAGAAATTATAGGCCCCTAAT 10483450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAACCACTAAAAGGGACAGATCTGGTGGCTTCTTTGAGGTAGAAATTATAGGCCCCTAAT 1260

 10483451 GATGTCTGCCACAACTCTGCTTTACTGGGGACACAAAGGTGTGTTATACAGACAAGGGTC 10483510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATGTCTGCCACAACTCTGCTTTACTGGGGACACAAAGGTGTGTTATACAGACAAGGGTC 1320

 10483511 AGACAAGGAAACAGGAGTTTTGTTTTCACTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTTTCCCAGCT 10483570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGACAAGGAAACAGGAGTTTTGTTTTCACTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTTTCCCAGCT 1380

 10483571 GGAGTGCAGGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCTAGTTCACGCAGTTCT 10483630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGAGTGCAGGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCTAGTTCACGCAGTTCT 1440

 10483631 CCTGCTTCAACCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTACGCCCGGCTAATT 10483690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCTGCTTCAACCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTACGCCCGGCTAATT 1500

 10483691 TTTGTATTTTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGA 10483750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTGTATTTTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGA 1560

 10483751 CCTCAAATGATCCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACC 10483810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCTCAAATGATCCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACC 1620

 10483811 ATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAGCAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGG 10483870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAGCAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGG 1680

 10483871 TTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGCCCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAG 10483930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGCCCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAG 1740

 10483931 CACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGTCTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTC 10483990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGTCTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTC 1800

 10483991 ACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAACCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCA 10484050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAACCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCA 1860

 10484051 CCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGGTCATGAATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGAC 10484110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGGTCATGAATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGAC 1920

 10484111 GGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCCACAATGTCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTC 10484170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCCACAATGTCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTC 1980

 10484171 GAGAGCAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGGGCGTGGAGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCG 10484230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAGAGCAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGGGCGTGGAGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCG 2040

 10484231 GTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCAGCTAGGGCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGT 10484290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCAGCTAGGGCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGT 2100

 10484291 GGCCTCATCACATGGCCTCAGGCCAGAGAAACATCTTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCAC 10484350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGCCTCATCACATGGCCTCAGGCCAGAGAAACATCTTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCAC 2160

 10484351 TAAGGAGGCAGAAGCACACACGTGGCTTTTAAAAACCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAG 10484410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAAGGAGGCAGAAGCACACACGTGGCTTTTAAAAACCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAG 2220

 10484411 GATTATAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAGCAAGCCGCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCA 10484470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GATTATAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAGCAAGCCGCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCA 2280

 10484471 GAGGATTAGACTCTACCTCTTGATGGGGGAGTATGAGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCA 10484530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAGGATTAGACTCTACCTCTTGATGGGGGAGTATGAGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCA 2340

 10484531 GGAGACATTGTTCTTGCCATCTTCGTAAATTACAGTCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAA 10484590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGAGACATTGTTCTTGCCATCTTCGTAAATTACAGTCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAA 2400

 10484591 AGGAAAATCTGTTACATAGCAGAGTTGGGAACCGGCACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGG 10484650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGGAAAATCTGTTACATAGCAGAGTTGGGAACCGGCACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGG 2460

 10484651 TCTCATATAGTATATATACTACTAGCTAACATTGAGAGCATATGCCAGGCTCTGTAACTC 10484710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTCATATAGTATATATACTACTAGCTAACATTGAGAGCATATGCCAGGCTCTGTAACTC 2520

 10484711 ATTGAATGCTCGCAGCACCCTCTGAAGTAAGCACTATTACTATCCCTAATTTAGAGATGA 10484770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTGAATGCTCGCAGCACCCTCTGAAGTAAGCACTATTACTATCCCTAATTTAGAGATGA 2580

 10484771 AGCACACTGATATTAAGTAATTCGTCCAAGGTCAGAGCTACTGAAGAACTGGAATTGAAC 10484830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGCACACTGATATTAAGTAATTCGTCCAAGGTCAGAGCTACTGAAGAACTGGAATTGAAC 2640

 10484831 CCCAGAGATCTGGTGCCAGAGTCCATACACTTAATCATGAAACTGACCTGTCGGCGTGCA 10484890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCCAGAGATCTGGTGCCAGAGTCCATACACTTAATCATGAAACTGACCTGTCGGCGTGCA 2700

 10484891 CAGTTCATCGCCCCACTCATTCAGTCATTCGGCATGTTTATGGTACACCTACCATGTGCC 10484950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAGTTCATCGCCCCACTCATTCAGTCATTCGGCATGTTTATGGTACACCTACCATGTGCC 2760

 10484951 AAGCATTGTGCTAGGTACCCTCTGTC 10484976
          ||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGCATTGTGCTAGGTACCCTCTGTC 2786

EXCISED REGION

 10484977 GGGGTGAGAGAAGTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTTACAGGATACATATAATATTTAA 10485036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2788 GGGGTGAGAGAAGTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTTACAGAATACATATAATATTTAA 2847

 10485037 CGATAATTATTTTTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAAACCTATGAAATGGAGATTGATT 10485096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 CGATAATTATTTTTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAAACCTATGAAATGGAGATTGATT 2907

 10485097 TTTTTTTT 10485104
          ||||||||
     2908 TTTTTTTT 2915

Alignment time is 2.30364 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10472480,10493779] =>     21300 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2776] =>      2776 nucs 'mol-32-3190-280513_2776'

Score:        2721
Aligned:      2776        nucs
Identic:      2771 (100%) nucs =>        25 (100%)      2746 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10482504,10482528] EXCISED REGION [10482530,10485279]
 second seq =>  [       1,      25] EXCISED REGION [      27,    2776]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [10482529,10482529]
 second seq =>         1 nucs [26,26]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [10485095,10485095]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [25,25] to [26,26]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10482504 AAGCCACTACCCCCTGGCCAGCAGT 10482528
          |||||||||||||||||||||||||
        1 AAGCCACTACCCCCTGGCCAGCAGT 25

EXCISED REGION

 10482530 CGTGCTGTTTGTACTGAGAGAAACCAGATGTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAATTTGCT 10482589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       27 CGTGCTGTTTGTACTGAGAGAAACCAGATGTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAATTTGCT 86

 10482590 TTGCACCCCAGTCTTCAAAAGGTTTCTGGTGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAGCAGGT 10482649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       87 TTGCACCCCAGTCTTCAAAAGGTTTCTGGTGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAGCAGGT 146

 10482650 GTAGAGGTTAAGAAAGGTCAGAGCTTCTCAAACTAACCTGTTACAACTCCCCCACTCCCA 10482709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      147 GTAGAGGTTAAGAAAGGTCAGAGCTTCTCAAACTAACCTGTTACAACTCCCCCACTCCCA 206

 10482710 CCACCACCCCCGAGATTTTGAAAAAATGTAGATTCTGATTCGGTAGAATCCTGAAAATGG 10482769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      207 CCACCACCCCCGAGATTTTGAAAAAATGTAGATTCTGATTCGGTAGAATCCTGAAAATGG 266

 10482770 CTCTTCGTGGGGTGGAGCCCCATGTTCTGCATTTCTATCTTTTTTTTGAGACAAGGTCTC 10482829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      267 CTCTTCGTGGGGTGGAGCCCCATGTTCTGCATTTCTATCTTTTTTTTGAGACAAGGTCTC 326

 10482830 ATTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGTGGCACTATCATGGCTCACTGCAGCCTCAACC 10482889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      327 ATTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGTGGCACTATCATGGCTCACTGCAGCCTCAACC 386

 10482890 TCCTGGGCTCAGGTGATCCTCCCAACTCAGCCTCCTGGCTAGCTGGGACTCCAGGTGCAC 10482949
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      387 TCCTGGGCTCAGGTGCTCCTCCCAACTCAGCCTCCTGGCTAGCTGGGACTCCAGGTGCAC 446

 10482950 ACCGCCACGCCTGGCTAATTTCTAAACTTTTTGTAGAGATGAGCTCTCCCTATGTTGCCC 10483009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      447 ACCGCCACGCCTGGCTAATTTCTAAACTTTTTGTAGAGATGAGCTCTCCCTATGTTGCCC 506

 10483010 AGGCTGATCTTCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGTGCTGA 10483069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      507 AGGCTGATCTTCAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGTGCTGA 566

 10483070 GACCACAGGCATGAGCCACCACGCCTGGCCCTGGGCCCCAATCTTGGCTCCGCCACAAAT 10483129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      567 GACCACAGGCATGAGCCACCACGCCTGGCCCTGGGCCCCAATCTTGGCTCCGCCACAAAT 626

 10483130 TCAGCCTTACTTCACAAGTTAGTTAACCTCTATGTGCGTATTTTCTCCTCTATATAAAAG 10483189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      627 TCAGCCTTACTTCACAAGTTAGTTAACCTCTATGTGCGTATTTTCTCCTCTATATAAAAG 686

 10483190 GGATGATGATAACACCCACCTCACAGAGCCGTCTTCCCGACTAAACACAAGGCACTTGCA 10483249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      687 GGATGATGATAACACCCACCTCACAGAGCCGTCTTCCCGACTAAACACAAGGCACTTGCA 746

 10483250 CCAGAGCCACCACACACTGAGCACTATGTAAGGTTTACTGTTTATTACCTGCCTCCTAAA 10483309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 CCAGAGCCACCACACACTGAGCACTATGTAAGGTTTACTGTTTATTACCTGCCTCCTAAA 806

 10483310 GAGAGGCTGCCAAACAATTCTGAGTGTGGAAGGAGGTGGAAAGAGGGGTTTTGCCCTTAG 10483369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      807 GAGAGGCTGCCAAACAATTCTGAGTGTGGAAGGAGGTGGAAAGAGGGGTTTTGCCCTTAG 866

 10483370 CCAAGTCAGTCCTGTTCAGTCTAACCACTAAAAGGGACAGATCTGGTGGCTTCTTTGAGG 10483429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      867 CCAAGTCAGTCCTGTTCAGTCTAACCACTAAAAGGGACAGATCTGGTGGCTTCTTTGAGG 926

 10483430 TAGAAATTATAGGCCCCTAATGATGTCTGCCACAACTCTGCTTTACTGGGGACACAAAGG 10483489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 TAGAAATTATAGGCCCCTAATGATGTCTGCCACAACTCTGCTTTACTGGGGACACAAAGG 986

 10483490 TGTGTTATACAGACAAGGGTCAGACAAGGAAACAGGAGTTTTGTTTTCACTTTTGAGACA 10483549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 TGTGTTATACAGACAAGGGTCAGACAAGGAAACAGGAGTTTTGTTTTCACTTTTGAGACA 1046

 10483550 GTCTCACTCTGTTTCCCAGCTGGAGTGCAGGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTAC 10483609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 GTCTCACTCTGTTTCCCAGCTGGAGTGCAGGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTAC 1106

 10483610 CTCCCTAGTTCACGCAGTTCTCCTGCTTCAACCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGCC 10483669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 CTCCCTAGTTCACGCAGTTCTCCTGCTTCAACCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGCC 1166

 10483670 CACCACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCGTGTTGGCC 10483729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 CACCACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCGTGTTGGCC 1226

 10483730 AGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAGTGCTG 10483789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 AGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAGTGCTG 1286

 10483790 GGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAGCAAAGAGACT 10483849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 GGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAGCAAAGAGACT 1346

 10483850 TTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGCCCATCATTTT 10483909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 TTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGCCCATCATTTT 1406

 10483910 GGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGTCTGCTCACTC 10483969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 GGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGTCTGCTCACTC 1466

 10483970 TGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAACCACCCCAAA 10484029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 TGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAACCACCCCAAA 1526

 10484030 GTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGGTCATGAATCT 10484089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 GTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGGTCATGAATCT 1586

 10484090 GGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCCACAATGTCTG 10484149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 GGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCCACAATGTCTG 1646

 10484150 GGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGGGCGTGGAGTG 10484209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 GGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGGGCGTGGAGTG 1706

 10484210 TCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCAGCTAGGGCTA 10484269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 TCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCAGCTAGGGCTA 1766

 10484270 TGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAGGCCAGAGAAACATCTTGT 10484329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 TGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAGGCCAGAGAAACATCTTGT 1826

 10484330 TTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACACGTGGCTTTTAAAAACCCA 10484389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 TTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACACGTGGCTTTTAAAAACCCA 1886

 10484390 GCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTATAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAGCAAGCCGCAA 10484449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 GCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTATAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAGCAAGCCGCAA 1946

 10484450 GTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTTGATGGGGGAGTATGAGGT 10484509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 GTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTTGATGGGGGAGTATGAGGT 2006

 10484510 TCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACATTGTTCTTGCCATCTTCGTAAATTACAGTCTG 10484569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 TCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACATTGTTCTTGCCATCTTCGTAAATTACAGTCTG 2066

 10484570 CCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAAAATCTGTTACATAGCAGAGTTGGGAACCGGCACT 10484629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 CCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAAAATCTGTTACATAGCAGAGTTGGGAACCGGCACT 2126

 10484630 ATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCATATAGTATATATACTACTAGCTAACATTGAGAGC 10484689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 ATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCATATAGTATATATACTACTAGCTAACATTGAGAGC 2186

 10484690 ATATGCCAGGCTCTGTAACTCATTGAATGCTCGCAGCACCCTCTGAAGTAAGCACTATTA 10484749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 ATATGCCAGGCTCTGTAACTCATTGAATGCTCGCAGCACCCTCTGAAGTAAGCACTATTA 2246

 10484750 CTATCCCTAATTTAGAGATGAAGCACACTGATATTAAGTAATTCGTCCAAGGTCAGAGCT 10484809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 CTATCCCTAATTTAGAGATGAAGCACACTGATATTAAGTAATTCGTCCAAGGTCAGAGCT 2306

 10484810 ACTGAAGAACTGGAATTGAACCCCAGAGATCTGGTGCCAGAGTCCATACACTTAATCATG 10484869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 ACTGAAGAACTGGAATTGAACCCCAGAGATCTGGTGCCAGAGTCCATACACTTAATCATG 2366

 10484870 AAACTGACCTGTCGGCGTGCACAGTTCATCGCCCCACTCATTCAGTCATTCGGCATGTTT 10484929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 AAACTGACCTGTCGGCGTGCACAGTTCATCGCCCCACTCATTCAGTCATTCGGCATGTTT 2426

 10484930 ATGGTACACCTACCATGTGCCAAGCATTGTGCTAGGTACCCTCTGTC-GGGGTGAGAGAA 10484988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     2427 ATGGTACACCTACCATGTGCCAAGCATTGTGCTAGGTACCCTCTGTCAGGGGTGAGAGAA 2486

 10484989 GTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTTACAGGATACATATAATATTTAACGATAATTATTT 10485048
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2487 GTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTTACAGAATACATATAATATTTAACGATAATTATTT 2546

 10485049 TTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAAACCTATGAAATGGAGATTGATTTTTTTTTTTTTT 10485108
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     2547 TTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAAACCTATGAAATGGAGATTGA-TTTTTTTTTTTTT 2605

 10485109 TTTGAGATGTAGTCTCACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACT 10485168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 TTTGAGATGTAGTCTCACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACT 2665

 10485169 ACGACCTCCGCCTCCTGGGCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTTAGTAGCTGAGATT 10485228
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 ACGACCTCTGCCTCCTGGGCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTTAGTAGCTGAGATT 2725

 10485229 ACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATG 10485279
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 ACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATG 2776

Alignment time is 2.21054 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10472480,10493779] =>     21300 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2902] =>      2902 nucs 'mol-32-3403-034097_2902'

Score:        2826
Aligned:      2905        nucs
Identic:      2897 (100%) nucs =>      2009 (100%)       888 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10480466,10482480] EXCISED REGION [10483780,10484669]
 second seq =>  [       1,    2013] EXCISED REGION [    2014,    2902]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1299 nucs [10482481,10483779]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        22 nucs [10482481,10482502] to [10483780,10483801]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [10482480,10482480] to [10483780,10483780]
 second seq =>         1 nucs [2013,2013] to [2014,2014]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 10480466 TTTTTGCTCCTGGCAAGCTGTGCGTGACATTCTTTATGGCTTTTTGTATGTCAAATACTT 10480525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTGCTCCTGGCAAGCTGTGCGTGACATTCTTTATGGCTTTTTGTATGTCAAATACTT 60

 10480526 CATACTAAACTTTCTAGAGAATTAAACTTTAATGATGGGCTCAGCTTGGTCTGATTTATT 10480585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATACTAAACTTTCTAGAGAATTAAACTTTAATGATGGGCTCAGCTTGGTCTGATTTATT 120

 10480586 TCCTTTCCCACACCTGTCTCTACTTGCTCTAAGCCAGGCCCAGGGATTTTGAACAAGCTA 10480645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCTTTCCCACACCTGTCTCTACTTGCTCTAAGCCAGGCCCAGGGATTTTGAACAAGCTA 180

 10480646 AGCCGGCTCCTTAAACTAGGCTTTTCACTTTATCTTACTTACTCAGAGAAGATAAAACCT 10480705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCCGGCTCCTTAAACTAGGCTTTTCACTTTATCTTACTTACTCAGAGAAGATAAAACCT 240

 10480706 GCCAGTGATATTGTTGTGTGGCCTGGGGCCAGTGTGACTGTTCCCTGCAGCGGTTTGACT 10480765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCAGTGATATTGTTGTGTGGCCTGGGGCCAGTGTGACTGTTCCCTGCAGCGGTTTGACT 300

 10480766 TCATGATGATTTCCCTGGAGTGTTAAAGTCCTAAGAGTTGCCTAAGAGGAGCGAGCAGCG 10480825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCATGATGATTTCCCTGGAGTGTTAAAGTCCTAAGAGTTGCCTAAGAGGAGCGAGCAGCG 360

 10480826 CCTGTGCCTCGACAGCTGGTGTCTACAGTGTGACCTCTGACCTCTCGGCTAATGTCAGTG 10480885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      361 CCTGTGCCTCGACAGCTGGTGTCTACAGTGTGACCTCTGATCTCTCGGCTAATGTCAGTG 420

 10480886 AAGGAGACAATTTTCATTAAATCACCAACTTTTAATTTATTTTTCTTTTTTTTGAGACAG 10480945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGGAGACAATTTTCATTAAATCACCAACTTTTAATTTATTTTTCTTTTTTTTGAGACAG 480

 10480946 AGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTTGGCTCATTGCAAGCTC 10481005
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      481 AGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGGTCTTGGCTCATTGCAAGCTC 540

 10481006 CACCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCCACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGT 10481065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCCACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGT 600

 10481066 GCCCGCCACCACTCCTGGCTTATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATG 10481125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCCGCCACCACTCCTGGCTTATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATG 660

 10481126 TTGGTCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGT 10481185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGGTCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGT 720

 10481186 GCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTATTTTAAAATTTTGTTTAGAGATGTGGTCTTGC 10481245
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTATTTTAAAATTTTGTTTAGAGATGTGGTCTTGC 780

 10481246 TATGATGCCCAGGCTGATGTCAAACACCTGGACTCAAGCAATCCTCGTGCCTCGACCTCC 10481305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATGATGCCCAGGCTGATGTCAAACACCTGGACTCAAGCAATCCTCGTGCCTCGACCTCC 840

 10481306 CAAGGTGCTGGGATTATAGGCAGGAGCCACCGTGCCCTGCTACCAACTTTTTAAACTCTG 10481365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAGGTGCTGGGATTATAGGCAGGAGCCACCGTGCCCTGCTACCAACTTTTTAAACTCTG 900

 10481366 CCTAGATGTGAGTACTTCGCTAGATCAGCCCCCACGCACCCCTCCTGCCCTCCCTGTACA 10481425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTAGATGTGAGTACTTCGCTAGATCAGCCCCCACGCACCCCTCCTGCCCTCCCTGTACA 960

 10481426 TTTAAGAGAAGCCCGAGTAGCCGCACGTGACGGGATTTTTCTTTAAGGCTTGTCAAAGGC 10481485
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      961 TTTAAGAGAAGCCCGAGTAGCCGCACGTGACGGGATTTTTCTTTAAGGCGTGTCAAAGGC 1020

 10481486 ACTGTTCGAGGGGGATCTTTTCACCTGGCTCTGAGGCTGAGGGATGGACACTGCTGGAAT 10481545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTGTTCGAGGGGGATCTTTTCACCTGGCTCTGAGGCTGAGGGATGGACACTGCTGGAAT 1080

 10481546 GGAGAGAGAACAGCAAGAGGTCAGAGGCTAAGTGTCAAAGGGCCCACGATGTTTCAAACA 10481605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGAGAGAGAACAGCAAGAGGTCAGAGGCTAAGTGTCAAAGGGCCCACGATGTTTCAAACA 1140

 10481606 GTAATGATCAGAAGGGAATCCACTCAGCCCCTTTCCGCTTACCTTCCAAAAAGCTGTGAG 10481665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTAATGATCAGAAGGGAATCCACTCAGCCCCTTTCCGCTTACCTTCCAAAAAGCTGTGAG 1200

 10481666 TGGTGGAGTTTGGTTTCAAATCCAGCCCTCCTTGCTTACTAGCTGTTAGACTTTGGGGAA 10481725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGGTGGAGTTTGGTTTCAAATCCAGCCCTCCTTGCTTACTAGCTGTTAGACTTTGGGGAA 1260

 10481726 ATTATTTACTATCTGTGTTCTCAGTTTTCTCATTTGTAAAATGGGAAATAATAGCACCTG 10481785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTATTTACTATCTGTGTTCTCAGTTTTCTCATTTGTAAAATGGGAAATAATAGCACCTG 1320

 10481786 TGTCCTTGAGGCTACTTTGGGGATTCAGCAAGGGAAGATAGAGCAGTGCCTGGCACATAG 10481845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTCCTTGAGGCTACTTTGGGGATTCAGCAAGGGAAGATAGAGCAGTGCCTGGCACATAG 1380

 10481846 TAAATACCTACACCAGTGGCAGCAAGGCTGGGTGCGCTGGCTCACACCGTAAGCCCAGCA 10481905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAATACCTACACCAGTGGCAGCAAGGCTGGGTGCGCTGGCTCACACCGTAAGCCCAGCA 1440

 10481906 CTTTGGAAGGCCGAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGACCAGCCTGGGCA 10481965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTTGGAAGGCCGAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGACCAGCCTGGGCA 1500

 10481966 ACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAATTAGCTGGGCGCAGTGGTGCACAC 10482025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAATTAGCTGGGCGCAGTGGTGCACAC 1560

 10482026 CTATGATCCCAGCTAGGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTAAGCCCAGGAGATGGA 10482085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTATGATCCCAGCTAGGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTAAGCCCAGGAGATGGA 1620

 10482086 GGTTGCAGTGACCCATGACCACACCACTGTACTCCAGCCTCGGTGATAAAGCAAAACCCT 10482145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGTTGCAGTGACCCATGACCACACCACTGTACTCCAGCCTCGGTGATAAAGCAAAACCCT 1680

 10482146 GTCTCAAAAAAAAAAAAAAATAGTGGCAGCAATTACTACCATTGAGTGTGCCTGACCCCT 10482205
          ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTCTCAAAAAAAAAAAAA--TAGTGGCAGCAATTACTACCATTGAGTGTGCCTGACCCCT 1738

 10482206 GGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCTCTTGCCCAGGCTGGA 10482265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCTCTTGCCCAGGCTGGA 1798

 10482266 GTGCAGTGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGAATTCAGGTGGTTCCT 10482325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GTGCAGTGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGAATTCAGGTGGTTCCT 1858

 10482326 CCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCACCACGCCCCACTAATT 10482385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCACCACGCCCCACTAATT 1918

 10482386 TTTTGTATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGCTGGTCTCAAAACTCC 10482445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TTTTGTATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGCTGGTCTCAAAACTCC 1978

 10482446 AGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCC 10482480
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCC 2013

EXCISED REGION

 10483780 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAG 10483839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2014 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAG 2073

 10483840 CAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGC 10483899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 CAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGC 2133

 10483900 CCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGT 10483959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2134 CCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGT 2193

 10483960 CTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAA 10484019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2194 CTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAA 2253

 10484020 CCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGG 10484079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 CCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGG 2313

 10484080 TCATGAATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCC 10484139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 TCATGAATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCC 2373

 10484140 ACAATGTCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGG 10484199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 ACAATGTCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGG 2433

 10484200 GCGTGGAGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCA 10484259
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 GCGTGGAGTGTCCTCTCTCA-TCATCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCA 2492

 10484260 GCTAGGGCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAGGCCAGAGA 10484319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 GCTAGGGCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAGGCCAGAGA 2552

 10484320 AACATCTTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACACGTGGCTTT 10484379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 AACATCTTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACACGTGGCTTT 2612

 10484380 TAAAAACCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTATAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAG 10484439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2613 TAAAAACCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTAGAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAG 2672

 10484440 CAAGCCGCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTTGATGGGGG 10484499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 CAAGCCGCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTTGATGGGGG 2732

 10484500 AGTATGAGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACATTGTTCTTGCCATCTTCGTAAA 10484559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 AGTATGAGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACATTGTTCTTGCCATCTTCGTAAA 2792

 10484560 TTACAGTCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAAAATCTGTTACATAGCAGAGTTGGG 10484619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 TTACAGTCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAAAATCTGTTACATAGCAGAGTTGGG 2852

 10484620 AACCGGCACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCATATAGTATATATAC 10484669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 AACCGGCACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCATATAGTATATATAC 2902

Alignment time is 2.28346 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10472480,10493779] =>     21300 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    9768] =>      9768 nucs 'mol-32-340e-119461_9768'

Score:        9693
Aligned:      9772        nucs
Identic:      9764 (100%) nucs =>      3248 (100%)      6516 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10475583,10478830] EXCISED REGION [10478836,10485358]
 second seq =>  [       1,    3248] EXCISED REGION [    3249,    9768]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [10478831,10478835]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [10478831,10478842] to [10478836,10478847]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [10478831,10478832] to [10478834,10478835]
 second seq =>         0 nucs

 10475583 TCTCCCCCTCTAACAGGAAGGGTTTGCCTCATAGCCTGTTGCACCAGTCATCTTACAAAG 10475642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCCCCCTCTAACAGGAAGGGTTTGCCTCATAGCCTGTTGCACCAGTCATCTTACAAAG 60

 10475643 CTTCCTTCTAGAAATGCTAAGTCATCCTGTGTGTGCATTTGGGCCAGGAGAGAGGTAGCT 10475702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTCCTTCTAGAAATGCTAAGTCATCCTGTGTGTGCATTTGGGCCAGGAGAGAGGTAGCT 120

 10475703 GCTTTTGTGTGTTTGGAGTAGGGTTAGCAGTCTCAAGCCATAGCTGCTCCTCTTTCCTCA 10475762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTTTTGTGTGTTTGGAGTAGGGTTAGCAGTCTCAAGCCATAGCTGCTCCTCTTTCCTCA 180

 10475763 GAAATAAAGTCCTCTGTTAGTTCCCTGAGATTTTACTTCATTTTGTCTATGGGGGAAAAA 10475822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAATAAAGTCCTCTGTTAGTTCCCTGAGATTTTACTTCATTTTGTCTATGGGGGAAAAA 240

 10475823 GTGGTTAAAGAGTCATTTATTCTAACTATAAGTTGTCAGTTGAGCAAGTCTTTTATAAGG 10475882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGGTTAAAGAGTCATTTATTCTAACTATAAGTTGTCAGTTGAGCAAGTCTTTTATAAGG 300

 10475883 AATACTTTCTGAAAATACTAAATGTCTTAATATTAAAATACTACATTGACTTTTTAATTC 10475942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATACTTTCTGAAAATACTAAATGTCTTAATATTAAAATACTACATTGACTTTTTAATTC 360

 10475943 AAATGAAGTAAAGTGGTTAAACTTGAATGATTACGGCTATACTGAAAACCGTAAAATATA 10476002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAATGAAGTAAAGTGGTTAAACTTGAATGATTACGGCTATACTGAAAACCGTAAAATATA 420

 10476003 AAAACCTAACATTTTTTTGAGAGGTGAGTCCGTAAATGTGACTTATCAATGTAAAATCTT 10476062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAACCTAACATTTTTTTGAGAGGTGAGTCCGTAAATGTGACTTATCAATGTAAAATCTT 480

 10476063 CAAAAAAAAAAATTAAGGTCCTCTAAATTGAATTTGAAATTTTACTCATGGACCAACACT 10476122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAAAAAAAAAATTAAGGTCCTCTAAATTGAATTTGAAATTTTACTCATGGACCAACACT 540

 10476123 GAGTATTCTACATAACAGTGGTTTTTATTTTATTTTACTGGTTTTAGAGACAGGGTCTCA 10476182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGTATTCTACATAACAGTGGTTTTTATTTTATTTTACTGGTTTTAGAGACAGGGTCTCA 600

 10476183 CTGTGTTGCCCAGGCTGGAGAGCAGTGGTGTGATCATGGCTCACTGTAGCCTTGAACTCC 10476242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGTGTTGCCCAGGCTGGAGAGCAGTGGTGTGATCATGGCTCACTGTAGCCTTGAACTCC 660

 10476243 TGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTGCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTTAGCC 10476302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTGCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTTAGCC 720

 10476303 ACCTTGCCCAGCCATAACAGTGGTTTCTATCTCTTCATTTTCCCTCAAAACTCCCTTTTG 10476362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACCTTGCCCAGCCATAACAGTGGTTTCTATCTCTTCATTTTCCCTCAAAACTCCCTTTTG 780

 10476363 AATTTCATGTTAATCTTTGTGATTGAATACTCATGTTTGTATTGGAAGATTGTCTTAAGA 10476422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATTTCATGTTAATCTTTGTGATTGAATACTCATGTTTGTATTGGAAGATTGTCTTAAGA 840

 10476423 GTTTTAGTTATCAAATTAACTGTTTAGAGCTTCTTATAAAAGTTCCTTCCGATCCATGTC 10476482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTTTAGTTATCAAATTAACTGTTTAGAGCTTCTTATAAAAGTTCCTTCCGATCCATGTC 900

 10476483 AACTTTTGTGGCCTAAGGTTGAAACTTTCAGCTCTTTGTATAAACAGACTTTCCTGCTCC 10476542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACTTTTGTGGCCTAAGGTTGAAACTTTCAGCTCTTTGTATAAACAGACTTTCCTGCTCC 960

 10476543 ACCTTTCTTCTGGTTGCTGTGCGAACTTTGGTAATTTTCATGCGCATCCGTGTGAAAAGA 10476602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACCTTTCTTCTGGTTGCTGTGCGAACTTTGGTAATTTTCATGCGCATCCGTGTGAAAAGA 1020

 10476603 CCACCAAACAGGCTTTGTGTGAGCAATAAAGCTTTTTAATCACCTGGGTGCAGGCAGGTT 10476662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCACCAAACAGGCTTTGTGTGAGCAATAAAGCTTTTTAATCACCTGGGTGCAGGCAGGTT 1080

 10476663 GAGTCCGAAGAGTCAGCGAAGGGAGATAGGGGTGGGGCCATTTTATAGGATTTGGGCAGG 10476722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGTCCGAAGAGTCAGCGAAGGGAGATAGGGGTGGGGCCATTTTATAGGATTTGGGCAGG 1140

 10476723 TAGTGGAAAATTACAGTCAAAGGGGGTTTTTCTCTTACGGGCAGGGCCGAGGGGTCACAA 10476782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGTGGAAAATTACAGTCAAAGGGGGTTTTTCTCTTACGGGCAGGGCCGAGGGGTCACAA 1200

 10476783 GGTGCTCAGTTGGGGAGGTTCTGAGCCAGGAGAAGGAATGTCACAAGGTTAATCGCTCAG 10476842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGTGCTCAGTTGGGGAGGTTCTGAGCCAGGAGAAGGAATGTCACAAGGTTAATCGCTCAG 1260

 10476843 TTAAGGTGGGGCAGGAACAAATCACAATGGTGGAATGTCATCAGTAAAGGCAGGAACCAG 10476902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTAAGGTGGGGCAGGAACAAATCACAATGGTGGAATGTCATCAGTAAAGGCAGGAACCAG 1320

 10476903 CCATTTTCACTTCTTTTGTGATTCTTCACTTGCTTCAGGCCATCTGGATGTATACATGCA 10476962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCATTTTCACTTCTTTTGTGATTCTTCACTTGCTTCAGGCCATCTGGATGTATACATGCA 1380

 10476963 GGTCACAGGGGATATGATAGTTTAGCTTGGGCTCAGAGGCCTGACAGTAATCTGTTTCCT 10477022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGTCACAGGGGATATGATAGTTTAGCTTGGGCTCAGAGGCCTGACAGTAATCTGTTTCCT 1440

 10477023 CTTCCCGATCTCCCCATGTAGGAGAAGCTGTCTTTGCTCGGTGCTTATCATCTCTGAAGG 10477082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTCCCGATCTCCCCATGTAGGAGAAGCTGTCTTTGCTCGGTGCTTATCATCTCTGAAGG 1500

 10477083 ATGAGAGAATTCAAGCTAGCAAAAAGCTGAAGGGTCCCCAGAAGTTCCAGTTTGATGGTG 10477142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGAGAGAATTCAAGCTAGCAAAAAGCTGAAGGGTCCCCAGAAGTTCCAGTTTGATGGTG 1560

 10477143 ATAAGAAATCATTCCTGGAGGACATTCGGAAGGTGGGACACAGTCCCTGGCAGTGGTCTT 10477202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATAAGAAATCATTCCTGGAGGACATTCGGAAGGTGGGACACAGTCCCTGGCAGTGGTCTT 1620

 10477203 TGTTGGTCCTGCGGAAGGCAGTGGGGGTGGGGGTTGTGGTGGGAGAACACTCGAGGCCAC 10477262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTTGGTCCTGCGGAAGGCAGTGGGGGTGGGGGTTGTGGTGGGAGAACACTCGAGGCCAC 1680

 10477263 AGGATGGCAGGTGGAATGAAGTTCAGCCTTGACTTGGATCTTGACTTACAATGTTTTCCT 10477322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGATGGCAGGTGGAATGAAGTTCAGCCTTGACTTGGATCTTGACTTACAATGTTTTCCT 1740

 10477323 AGAATATTGGCCCTTCTGGGATCTCCACTGCTGATGAGAATAAGACTGGTAGACATAAGG 10477382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGAATATTGGCCCTTCTGGGATCTCCACTGCTGATGAGAATAAGACTGGTAGACATAAGG 1800

 10477383 CGGTCACTCTCCTAATGGCAATCCTAGTAGGTCTCTGTGTCACTCTTTAGGCACTCTACG 10477442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CGGTCACTCTCCTAATGGCAATCCTAGTAGGTCTCTGTGTCACTCTTTAGGCACTCTACG 1860

 10477443 CTTCCAAGATCATCTCTTACGCTCAAGGCTTTATGCTGCTAAGGCAGGCAGCCACCGAGT 10477502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTCCAAGATCATCTCTTACGCTCAAGGCTTTATGCTGCTAAGGCAGGCAGCCACCGAGT 1920

 10477503 TTGGCTGGACTCTCAATTATGGTGGCATCGCCCTGATGTGGAGAGGGGGCTGCATCATTA 10477562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGGCTGGACTCTCAATTATGGTGGCATCGCCCTGATGTGGAGAGGGGGCTGCATCATTA 1980

 10477563 GAAGGTAAGTGAGAGGCAGCCCAGGGTCCGACGGGAAGGACTCACACGGCTGTGCAGAAG 10477622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAAGGTAAGTGAGAGGCAGCCCAGGGTCCGACGGGAAGGACTCACACGGCTGTGCAGAAG 2040

 10477623 TGCGATCTTAGGACACTTAGCTTGAGCAGTTTCCAGGGATGGGCACTTAGCCCCATCACT 10477682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGCGATCTTAGGACACTTAGCTTGAGCAGTTTCCAGGGATGGGCACTTAGCCCCATCACT 2100

 10477683 GGACACTGGCACAAGATAGGCTTAGATTATGTGGTTCCCTTCTTCACTGTACCTCAGTTG 10477742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGACACTGGCACAAGATAGGCTTAGATTATGTGGTTCCCTTCTTCACTGTACCTCAGTTG 2160

 10477743 CTGTAACTAGATTGTCCACACTACACCTTTTTTTTTCTTTTGAGACCAAGTTTCGCTCTT 10477802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTGTAACTAGATTGTCCACACTACACCTTTTTTTTTCTTTTGAGACCAAGTTTCGCTCTT 2220

 10477803 ATTGCCCAAACTGGAGTGCCATGATGCGATCTTGACTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGG 10477862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATTGCCCAAACTGGAGTGCCATGATGCGATCTTGACTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGG 2280

 10477863 TTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCGTCCTAAGTAACTGGGATTACAAGGGCACGCCACCA 10477922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCGTCCTAAGTAACTGGGATTACAAGGGCACGCCACCA 2340

 10477923 TGTCCGGCTAATTCTTTTGTATTTGTAGTGGAAACAGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGCT 10477982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGTCCGGCTAATTCTTTTGTATTTGTAGTGGAAACAGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGCT 2400

 10477983 GGTCTCGAACTCCTTGCCTTGGGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 10478042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGTCTCGAACTCCTTGCCTTGGGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 2460

 10478043 ACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCTCCGCATTACACCTACTACACTACACCTTTTAAAG 10478102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCTCCGCATTACACCTACTACACTACACCTTTTAAAG 2520

 10478103 TACTTCTGTGAACTATCGTGCCCTCTGGCCTTGCCTCTTGGGAATTTTGCTCTGTATTTT 10478162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TACTTCTGTGAACTATCGTGCCCTCTGGCCTTGCCTCTTGGGAATTTTGCTCTGTATTTT 2580

 10478163 CATTGAAAATGCCAAATCATAGAAAACGTAGCATTTCTACACATGACGTTACATCGTTCT 10478222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CATTGAAAATGCCAAATCATAGAAAACGTAGCATTTCTACACATGACGTTACATCGTTCT 2640

 10478223 CATGTTGGCTGAAGATTCATTTGATGAATCTGATTTTTCTGAAGTAGATGATTCTGGTGA 10478282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CATGTTGGCTGAAGATTCATTTGATGAATCTGATTTTTCTGAAGTAGATGATTCTGGTGA 2700

 10478283 TTCAGATGATTCTAATATTAGTTCTCTTTAGAAATAACGCCAAGAATAGTTTTTATATTT 10478342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTCAGATGATTCTAATATTAGTTCTCTTTAGAAATAACGCCAAGAATAGTTTTTATATTT 2760

 10478343 TATTTTCATATTGAAAATCGTCAGATTTTCTTCAGCCTCAAAAAGCGTGTTTATGTAAAA 10478402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TATTTTCATATTGAAAATCGTCAGATTTTCTTCAGCCTCAAAAAGCGTGTTTATGTAAAA 2820

 10478403 TTAAATGAGCGCTGGCAGCGAGCTGCACTTTTTTTCTAAACAGGAAAAGGGTTAACAGCT 10478462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTAAATGAGCGCTGGCAGCGAGCTGCACTTTTTTTCTAAACAGGAAAAGGGTTAACAGCT 2880

 10478463 TGAAGAAATGAGAAATGTAACTTTGTTTCACTAGGGTATACATCGGCTTCCAGCTTACTT 10478522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGAAGAAATGAGAAATGTAACTTTGTTTCACTAGGGTATACATCGGCTTCCAGCTTACTT 2940

 10478523 CCCTGTTAGAGTTAAGATTCATTGCATTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCC 10478582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCCTGTTAGAGTTAAGATTCATTGCATTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCC 3000

 10478583 CAGCGTTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCCAGACCATCCTGG 10478642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGCGTTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCCAGACCATCCTGG 3060

 10478643 CTAACACGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGTTGTAGTGGTGC 10478702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTAACACGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGTTGTAGTGGTGC 3120

 10478703 GTGCCTGTAATCCCAGCTACTGGCGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGG 10478762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTGCCTGTAATCCCAGCTACTGGCGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGG 3180

 10478763 TGGAGGTTGCTGTGAGCTGAGATCGTGCCACTCCACTCCAGCCTGGTGACAAAGCGGGAC 10478822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGGAGGTTGCTGTGAGCTGAGATCGTGCCACTCCACTCCAGCCTGGTGACAAAGCGGGAC 3240

 10478823 TCCGTCTC 10478830
          ||||||||
     3241 TCCGTCTC 3248

EXCISED REGION

 10478836 AAAAAAAAAAAAGACTCATTGCTTTTTTCCCCCCTTGATTATTTCAGTGTATTCCTAGGA 10478895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 AAAAAAAAAAAAGACTCATTGCTTTTTTCCCCCCTTGATTATTTCAGTGTATTCCTAGGA 3308

 10478896 AAGATAAAGGATGCATTTGATCGAAACCCGGAACTTCAGAACCTCCTACTGGACGACTTC 10478955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 AAGATAAAGGATGCATTTGATCGAAACCCGGAACTTCAGAACCTCCTACTGGACGACTTC 3368

 10478956 TTTAAGTCAGCTGTTGAAAACTGCCAGGTATGTAGCCTAGGGCTGGTGCCATGGTTACTC 10479015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 TTTAAGTCAGCTGTTGAAAACTGCCAGGTATGTAGCCTAGGGCTGGTGCCATGGTTACTC 3428

 10479016 TACCTCCCTGGGGCCATCAGTTGTGATGTTTGGTTTTTTGTTTTTTTTTTTTGGTTTTTT 10479075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 TACCTCCCTGGGGCCATCAGTTGTGATGTTTGGTTTTTTGTTTTTTTTTTTTGGTTTTTT 3488

 10479076 GTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCATGATCTTG 10479135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 GTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCATGATCTTG 3548

 10479136 GCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCCCAGCCTTCCTAAGT 10479195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 GCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCCCAGCCTTCCTAAGT 3608

 10479196 AGCTGGGACTACAGGTGTGCCAACATACCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTT 10479255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 AGCTGGGACTACAGGTGTGCCAACATACCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTT 3668

 10479256 AGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGACTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATC 10479315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 AGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGACTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATC 3728

 10479316 CGCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATGACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTA 10479375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 CGCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATGACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCCTA 3788

 10479376 ACCATCAGTTTTTCATTTACCCACATTGATATGAATGAAAATCTATCCGCGTCACCAGGG 10479435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 ACCATCAGTTTTTCATTTACCCACATTGATATGAATGAAAATCTATCCGCGTCACCAGGG 3848

 10479436 GCAGATCACTAATCTCTGGCCGTGCGTTTTGTGCTCAGGACTCCTGGCGGCGGGCAGTCA 10479495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 GCAGATCACTAATCTCTGGCCGTGCGTTTTGTGCTCAGGACTCCTGGCGGCGGGCAGTCA 3908

 10479496 GCACTGGGGTCCAGGCTGGCATTCCCATGCCCTGTTTTACCACTGCCCTCTCCTTCTATG 10479555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 GCACTGGGGTCCAGGCTGGCATTCCCATGCCCTGTTTTACCACTGCCCTCTCCTTCTATG 3968

 10479556 ACGGGTACAGACATGAGATGCTTCCAGCCAGCCTCATCCAGGTAAGCCTGTGGAGCAGGG 10479615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 ACGGGTACAGACATGAGATGCTTCCAGCCAGCCTCATCCAGGTAAGCCTGTGGAGCAGGG 4028

 10479616 ATTAACCTGGCTGGCCCCTCGGGGGCGTGCGCCATGGACTGTCCTGACCAACCTACTCTC 10479675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 ATTAACCTGGCTGGCCCCTCGGGGGCGTGCGCCATGGACTGTCCTGACCAACCTACTCTC 4088

 10479676 TCGTTTCCTAGGCTCAGCGGGATTACTTCGGGGCTCACACCTATGAACTCTTGGCCAAAC 10479735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4089 TCGTTTCCTAGGCTCAGCGGGATTACTTCGGGGCTCACACCTATGAACTCTTGGCCAAAC 4148

 10479736 CAGGGCAGTTTATCCACACCAACTGGACAGGCCATGGTGGCACCGTGTCATCCTCGTCAT 10479795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4149 CAGGGCAGTTTATCCACACCAACTGGACAGGCCATGGTGGCACCGTGTCATCCTCGTCAT 4208

 10479796 ACAATGCCTGATCATGCTGCTCCTGTCACCCTCCACGATTCCACAGACCAGGACATTCCA 10479855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4209 ACAATGCCTGATCATGCTGCTCCTGTCACCCTCCACGATTCCACAGACCAGGACATTCCA 4268

 10479856 TGTGCCTCATGGCACTGCCACCTGGCCCTTTGCCCTATTTTCTGTTCAGTTTTTTAAAAG 10479915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4269 TGTGCCTCATGGCACTGCCACCTGGCCCTTTGCCCTATTTTCTGTTCAGTTTTTTAAAAG 4328

 10479916 TGTTGTAAGAGACTCCTGAGGAAGACACACAGTTTATTTGTAAAGTAGCTCTGTGAGAGC 10479975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4329 TGTTGTAAGAGACTCCTGAGGAAGACACACAGTTTATTTGTAAAGTAGCTCTGTGAGAGC 4388

 10479976 CACCATGCCCTCTGCCCTTGCCTCTTGGGACTGACCAGGAGCTGCTCATGTGCGTGAGAG 10480035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4389 CACCATGCCCTCTGCCCTTGCCTCTTGGGACTGACCAGGAGCTGCTCATGTGCGTGAGAG 4448

 10480036 TGGGAACCATCTCCTTGCGGCAGTGGCTTCCGCGTGCCCCGTGTGCTGGTGCGGTTCCCA 10480095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4449 TGGGAACCATCTCCTTGCGGCAGTGGCTTCCGCGTGCCCCGTGTGCTGGTGCGGTTCCCA 4508

 10480096 TCACGCAGACAGGAAGGGTGTTTGCGCACTCTGATCAACTGGAACCTCTGTATCATGCGG 10480155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4509 TCACGCAGACAGGAAGGGTGTTTGCGCACTCTGATCAACTGGAACCTCTGTATCATGCGG 4568

 10480156 CTGAATTCCCTTTTTCCTTTACTCAATAAAAGCTACATCAGACTGATGCTCTTTCTCCAG 10480215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4569 CTGAATTCCCTTTTTCCTTTACTCAATAAAAGCTACATCAGACTGATGCTCTTTCTCCAG 4628

 10480216 ATTCTTAGTCTCACCTCGGCCACATGGAGCCATTATCCCCATTGGCAGAAAGATTTTTCT 10480275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4629 ATTCTTAGTCTCACCTCGGCCACATGGAGCCATTATCCCCATTGGCAGAAAGATTTTTCT 4688

 10480276 TTAAAAAAAAAGACTAGAATAACACAAGAAACCACATTTAGGATTATGCTTCACTCAGAG 10480335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4689 TTAAAAAAAAAGACTAGAATAACACAAGAAACCACATTTAGGATTATGCTTCACTCAGAG 4748

 10480336 GAGGCAGGCAGGGAGGACACACCAGGGGCTTTAATACACTGGGCATGTTTTCTTTCTCCA 10480395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4749 GAGGCAGGCAGGGAGGACACACCAGGGGCTTTAATACACTGGGCATGTTTTCTTTCTCCA 4808

 10480396 ATTGGGCAATGGGTACATGGACGTTCACTGTAACGTGCTTTTTCTTTCGTCTTTTTTTTT 10480455
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||
     4809 ATTGGGCAATGGGTACATGGACGTTCACTGTAACGTGCTTTTTCTTTCGTC--TTTTTTT 4866

 10480456 TTTTTTTTTTTTTTTGCTCCTGGCAAGCTGTGCGTGACATTCTTTATGGCTTTTTGTATG 10480515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 TTTTTTTTTTTTTTTGCTCCTGGCAAGCTGTGCGTGACATTCTTTATGGCTTTTTGTATG 4926

 10480516 TCAAATACTTCATACTAAACTTTCTAGAGAATTAAACTTTAATGATGGGCTCAGCTTGGT 10480575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 TCAAATACTTCATACTAAACTTTCTAGAGAATTAAACTTTAATGATGGGCTCAGCTTGGT 4986

 10480576 CTGATTTATTTCCTTTCCCACACCTGTCTCTACTTGCTCTAAGCCAGGCCCAGGGATTTT 10480635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 CTGATTTATTTCCTTTCCCACACCTGTCTCTACTTGCTCTAAGCCAGGCCCAGGGATTTT 5046

 10480636 GAACAAGCTAAGCCGGCTCCTTAAACTAGGCTTTTCACTTTATCTTACTTACTCAGAGAA 10480695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 GAACAAGCTAAGCCGGCTCCTTAAACTAGGCTTTTCACTTTATCTTACTTACTCAGAGAA 5106

 10480696 GATAAAACCTGCCAGTGATATTGTTGTGTGGCCTGGGGCCAGTGTGACTGTTCCCTGCAG 10480755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 GATAAAACCTGCCAGTGATATTGTTGTGTGGCCTGGGGCCAGTGTGACTGTTCCCTGCAG 5166

 10480756 CGGTTTGACTTCATGATGATTTCCCTGGAGTGTTAAAGTCCTAAGAGTTGCCTAAGAGGA 10480815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 CGGTTTGACTTCATGATGATTTCCCTGGAGTGTTAAAGTCCTAAGAGTTGCCTAAGAGGA 5226

 10480816 GCGAGCAGCGCCTGTGCCTCGACAGCTGGTGTCTACAGTGTGACCTCTGACCTCTCGGCT 10480875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 GCGAGCAGCGCCTGTGCCTCGACAGCTGGTGTCTACAGTGTGACCTCTGACCTCTCGGCT 5286

 10480876 AATGTCAGTGAAGGAGACAATTTTCATTAAATCACCAACTTTTAATTTATTTTTCTTTTT 10480935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 AATGTCAGTGAAGGAGACAATTTTCATTAAATCACCAACTTTTAATTTATTTTTCTTTTT 5346

 10480936 TTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTTGGCTCA 10480995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 TTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTTGGCTCA 5406

 10480996 TTGCAAGCTCCACCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCCACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGG 10481055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 TTGCAAGCTCCACCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCCACCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGG 5466

 10481056 GACTACAGGTGCCCGCCACCACTCCTGGCTTATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGG 10481115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 GACTACAGGTGCCCGCCACCACTCCTGGCTTATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGG 5526

 10481116 TTTCACCATGTTGGTCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTCGGC 10481175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 TTTCACCATGTTGGTCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTCGGC 5586

 10481176 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTATTTTAAAATTTTGTTTAGAGAT 10481235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTATTTTAAAATTTTGTTTAGAGAT 5646

 10481236 GTGGTCTTGCTATGATGCCCAGGCTGATGTCAAACACCTGGACTCAAGCAATCCTCGTGC 10481295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 GTGGTCTTGCTATGATGCCCAGGCTGATGTCAAACACCTGGACTCAAGCAATCCTCGTGC 5706

 10481296 CTCGACCTCCCAAGGTGCTGGGATTATAGGCAGGAGCCACCGTGCCCTGCTACCAACTTT 10481355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 CTCGACCTCCCAAGGTGCTGGGATTATAGGCAGGAGCCACCGTGCCCTGCTACCAACTTT 5766

 10481356 TTAAACTCTGCCTAGATGTGAGTACTTCGCTAGATCAGCCCCCACGCACCCCTCCTGCCC 10481415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 TTAAACTCTGCCTAGATGTGAGTACTTCGCTAGATCAGCCCCCACGCACCCCTCCTGCCC 5826

 10481416 TCCCTGTACATTTAAGAGAAGCCCGAGTAGCCGCACGTGACGGGATTTTTCTTTAAGGCT 10481475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 TCCCTGTACATTTAAGAGAAGCCCGAGTAGCCGCACGTGACGGGATTTTTCTTTAAGGCT 5886

 10481476 TGTCAAAGGCACTGTTCGAGGGGGATCTTTTCACCTGGCTCTGAGGCTGAGGGATGGACA 10481535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 TGTCAAAGGCACTGTTCGAGGGGGATCTTTTCACCTGGCTCTGAGGCTGAGGGATGGACA 5946

 10481536 CTGCTGGAATGGAGAGAGAACAGCAAGAGGTCAGAGGCTAAGTGTCAAAGGGCCCACGAT 10481595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 CTGCTGGAATGGAGAGAGAACAGCAAGAGGTCAGAGGCTAAGTGTCAAAGGGCCCACGAT 6006

 10481596 GTTTCAAACAGTAATGATCAGAAGGGAATCCACTCAGCCCCTTTCCGCTTACCTTCCAAA 10481655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 GTTTCAAACAGTAATGATCAGAAGGGAATCCACTCAGCCCCTTTCCGCTTACCTTCCAAA 6066

 10481656 AAGCTGTGAGTGGTGGAGTTTGGTTTCAAATCCAGCCCTCCTTGCTTACTAGCTGTTAGA 10481715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 AAGCTGTGAGTGGTGGAGTTTGGTTTCAAATCCAGCCCTCCTTGCTTACTAGCTGTTAGA 6126

 10481716 CTTTGGGGAAATTATTTACTATCTGTGTTCTCAGTTTTCTCATTTGTAAAATGGGAAATA 10481775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 CTTTGGGGAAATTATTTACTATCTGTGTTCTCAGTTTTCTCATTTGTAAAATGGGAAATA 6186

 10481776 ATAGCACCTGTGTCCTTGAGGCTACTTTGGGGATTCAGCAAGGGAAGATAGAGCAGTGCC 10481835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 ATAGCACCTGTGTCCTTGAGGCTACTTTGGGGATTCAGCAAGGGAAGATAGAGCAGTGCC 6246

 10481836 TGGCACATAGTAAATACCTACACCAGTGGCAGCAAGGCTGGGTGCGCTGGCTCACACCGT 10481895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 TGGCACATAGTAAATACCTACACCAGTGGCAGCAAGGCTGGGTGCGCTGGCTCACACCGT 6306

 10481896 AAGCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGACC 10481955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 AAGCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGACC 6366

 10481956 AGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAATTAGCTGGGCGCAG 10482015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 AGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAATTAGCTGGGCGCAG 6426

 10482016 TGGTGCACACCTATGATCCCAGCTAGGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTAAGCCC 10482075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 TGGTGCACACCTATGATCCCAGCTAGGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTAAGCCC 6486

 10482076 AGGAGATGGAGGTTGCAGTGACCCATGACCACACCACTGTACTCCAGCCTCGGTGATAAA 10482135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 AGGAGATGGAGGTTGCAGTGACCCATGACCACACCACTGTACTCCAGCCTCGGTGATAAA 6546

 10482136 GCAAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATAGTGGCAGCAATTACTACCATTGAGTGTG 10482195
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 GCAAAACCCTGTCTC-AAAAAAAAAAAAAATAGTGGCAGCAATTACTACCATTGAGTGTG 6605

 10482196 CCTGACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCTCTTGC 10482255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6606 CCTGACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCTCTTGC 6665

 10482256 CCAGGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGAATTCA 10482315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6666 CCAGGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGAATTCA 6725

 10482316 GGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCACCACGC 10482375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6726 GGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCACCACGC 6785

 10482376 CCCACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGCTGGTC 10482435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6786 CCCACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGCTGGTC 6845

 10482436 TCAAAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATT 10482495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6846 TCAAAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGGATT 6905

 10482496 ACAGGCAGAAGCCACTACCCCCTGGCCAGCAGTGCGTGCTGTTTGTACTGAGAGAAACCA 10482555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6906 ACAGGCAGAAGCCACTACCCCCTGGCCAGCAGTGCGTGCTGTTTGTACTGAGAGAAACCA 6965

 10482556 GATGTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAATTTGCTTTGCACCCCAGTCTTCAAAAGGTTTC 10482615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6966 GATGTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAATTTGCTTTGCACCCCAGTCTTCAAAAGGTTTC 7025

 10482616 TGGTGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAGCAGGTGTAGAGGTTAAGAAAGGTCAGAGCTT 10482675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7026 TGGTGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAGCAGGTGTAGAGGTTAAGAAAGGTCAGAGCTT 7085

 10482676 CTCAAACTAACCTGTTACAACTCCCCCACTCCCACCACCACCCCCGAGATTTTGAAAAAA 10482735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7086 CTCAAACTAACCTGTTACAACTCCCCCACTCCCACCACCACCCCCGAGATTTTGAAAAAA 7145

 10482736 TGTAGATTCTGATTCGGTAGAATCCTGAAAATGGCTCTTCGTGGGGTGGAGCCCCATGTT 10482795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7146 TGTAGATTCTGATTCGGTAGAATCCTGAAAATGGCTCTTCGTGGGGTGGAGCCCCATGTT 7205

 10482796 CTGCATTTCTATCTTTTTTTTGAGACAAGGTCTCATTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAG 10482855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7206 CTGCATTTCTATCTTTTTTTTGAGACAAGGTCTCATTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAG 7265

 10482856 TGTGGCACTATCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCCTCCCAAC 10482915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7266 TGTGGCACTATCATGGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCTGGGCTCAGGTGATCCTCCCAAC 7325

 10482916 TCAGCCTCCTGGCTAGCTGGGACTCCAGGTGCACACCGCCACGCCTGGCTAATTTCTAAA 10482975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7326 TCAGCCTCCTGGCTAGCTGGGACTCCAGGTGCACACCGCCACGCCTGGCTAATTTCTAAA 7385

 10482976 CTTTTTGTAGAGATGAGCTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGATCTTCAACTCCTGGGCTCA 10483035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7386 CTTTTTGTAGAGATGAGCTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGATCTTCAACTCCTGGGCTCA 7445

 10483036 AGCGATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGTGCTGAGACCACAGGCATGAGCCACCACGCCT 10483095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7446 AGCGATCCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAGTGCTGAGACCACAGGCATGAGCCACCACGCCT 7505

 10483096 GGCCCTGGGCCCCAATCTTGGCTCCGCCACAAATTCAGCCTTACTTCACAAGTTAGTTAA 10483155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7506 GGCCCTGGGCCCCAATCTTGGCTCCGCCACAAATTCAGCCTTACTTCACAAGTTAGTTAA 7565

 10483156 CCTCTATGTGCGTATTTTCTCCTCTATATAAAAGGGATGATGATAACACCCACCTCACAG 10483215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7566 CCTCTATGTGCGTATTTTCTCCTCTATATAAAAGGGATGATGATAACACCCACCTCACAG 7625

 10483216 AGCCGTCTTCCCGACTAAACACAAGGCACTTGCACCAGAGCCACCACACACTGAGCACTA 10483275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7626 AGCCGTCTTCCCGACTAAACACAAGGCACTTGCACCAGAGCCACCACACACTGAGCACTA 7685

 10483276 TGTAAGGTTTACTGTTTATTACCTGCCTCCTAAAGAGAGGCTGCCAAACAATTCTGAGTG 10483335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7686 TGTAAGGTTTACTGTTTATTACCTGCCTCCTAAAGAGAGGCTGCCAAACAATTCTGAGTG 7745

 10483336 TGGAAGGAGGTGGAAAGAGGGGTTTTGCCCTTAGCCAAGTCAGTCCTGTTCAGTCTAACC 10483395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7746 TGGAAGGAGGTGGAAAGAGGGGTTTTGCCCTTAGCCAAGTCAGTCCTGTTCAGTCTAACC 7805

 10483396 ACTAAAAGGGACAGATCTGGTGGCTTCTTTGAGGTAGAAATTATAGGCCCCTAATGATGT 10483455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7806 ACTAAAAGGGACAGATCTGGTGGCTTCTTTGAGGTAGAAATTATAGGCCCCTAATGATGT 7865

 10483456 CTGCCACAACTCTGCTTTACTGGGGACACAAAGGTGTGTTATACAGACAAGGGTCAGACA 10483515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7866 CTGCCACAACTCTGCTTTACTGGGGACACAAAGGTGTGTTATACAGACAAGGGTCAGACA 7925

 10483516 AGGAAACAGGAGTTTTGTTTTCACTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTTTCCCAGCTGGAGT 10483575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7926 AGGAAACAGGAGTTTTGTTTTCACTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTTTCCCAGCTGGAGT 7985

 10483576 GCAGGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCTAGTTCACGCAGTTCTCCTGC 10483635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7986 GCAGGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCTAGTTCACGCAGTTCTCCTGC 8045

 10483636 TTCAACCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTACGCCCGGCTAATTTTTGT 10483695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8046 TTCAACCTCCTGAATAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTACGCCCGGCTAATTTTTGT 8105

 10483696 ATTTTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCA 10483755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8106 ATTTTAGTAGAGACAGGGTTTCCCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCA 8165

 10483756 AATGATCCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCC 10483815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8166 AATGATCCACCCGCCTCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCC 8225

 10483816 TGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAGCAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACA 10483875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8226 TGGCCAAGCAGAAGGATTGCCAAGCAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACA 8285

 10483876 CGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGCCCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGC 10483935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8286 CGTTCTTTGAGGCAGATGTGGAGCCCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGC 8345

 10483936 TGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGTCTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGT 10483995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8346 TGTTCAGCATGCGGGCGAATGCGTCTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGT 8405

 10483996 TGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAACCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATT 10484055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8406 TGCTGCGGACTGGTGTGTAACAAACCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATT 8465

 10484056 TAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGGTCATGAATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGG 10484115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8466 TAAATTTTCTTCTAATTCTGTGGGTCATGAATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGG 8525

 10484116 AGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCCACAATGTCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAG 10484175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8526 AGGCAGAGGCAGCTTGTCTGCTCCACAATGTCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAG 8585

 10484176 CAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGGGCGTGGAGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGA 10484235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8586 CAGGGGTGGCACCATGGCTCGGGGGCGTGGAGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGA 8645

 10484236 TGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCAGCTAGGGCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCT 10484295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8646 TGCTGGCTGTTGGCTGGGACCTCAGCTAGGGCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCT 8705

 10484296 CATCACATGGCCTCAGGCCAGAGAAACATCTTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGG 10484355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8706 CATCACATGGCCTCAGGCCAGAGAAACATCTTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGG 8765

 10484356 AGGCAGAAGCACACACGTGGCTTTTAAAAACCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTA 10484415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8766 AGGCAGAAGCACACACGTGGCTTTTAAAAACCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTA 8825

 10484416 TAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAGCAAGCCGCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGA 10484475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8826 TAGCCATCCAAAATCGGTTCCAAGCAAGCCGCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGA 8885

 10484476 TTAGACTCTACCTCTTGATGGGGGAGTATGAGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGA 10484535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8886 TTAGACTCTACCTCTTGATGGGGGAGTATGAGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGA 8945

 10484536 CATTGTTCTTGCCATCTTCGTAAATTACAGTCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAA 10484595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8946 CATTGTTCTTGCCATCTTCGTAAATTACAGTCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAA 9005

 10484596 AATCTGTTACATAGCAGAGTTGGGAACCGGCACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCA 10484655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9006 AATCTGTTACATAGCAGAGTTGGGAACCGGCACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCA 9065

 10484656 TATAGTATATATACTACTAGCTAACATTGAGAGCATATGCCAGGCTCTGTAACTCATTGA 10484715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9066 TATAGTATATATACTACTAGCTAACATTGAGAGCATATGCCAGGCTCTGTAACTCATTGA 9125

 10484716 ATGCTCGCAGCACCCTCTGAAGTAAGCACTATTACTATCCCTAATTTAGAGATGAAGCAC 10484775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9126 ATGCTCGCAGCACCCTCTGAAGTAAGCACTATTACTATCCCTAATTTAGAGATGAAGCAC 9185

 10484776 ACTGATATTAAGTAATTCGTCCAAGGTCAGAGCTACTGAAGAACTGGAATTGAACCCCAG 10484835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9186 ACTGATATTAAGTAATTCGTCCAAGGTCAGAGCTACTGAAGAACTGGAATTGAACCCCAG 9245

 10484836 AGATCTGGTGCCAGAGTCCATACACTTAATCATGAAACTGACCTGTCGGCGTGCACAGTT 10484895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9246 AGATCTGGTGCCAGAGTCCATACACTTAATCATGAAACTGACCTGTCGGCGTGCACAGTT 9305

 10484896 CATCGCCCCACTCATTCAGTCATTCGGCATGTTTATGGTACACCTACCATGTGCCAAGCA 10484955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9306 CATCGCCCCACTCATTCAGTCATTCGGCATGTTTATGGTACACCTACCATGTGCCAAGCA 9365

 10484956 TTGTGCTAGGTACCCTCTGTC-GGGGTGAGAGAAGTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTT 10485014
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9366 TTGTGCTAGGTACCCTCTGTCAGGGGTGAGAGAAGTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTT 9425

 10485015 ACAGGATACATATAATATTTAACGATAATTATTTTTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAA 10485074
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9426 ACAGAATACATATAATATTTAACGATAATTATTTTTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAA 9485

 10485075 ACCTATGAAATGGAGATTGATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGTAGTCTCACTGTCACCC 10485134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9486 ACCTATGAAATGGAGATTGATTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGTAGTCTCACTGTCACCC 9545

 10485135 AGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTACGACCTCCGCCTCCTGGGCAAGCGA 10485194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     9546 AGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTACGACCTCTGCCTCCTGGGCAAGCGA 9605

 10485195 TTCTCCTGCCTCAGCCTCCTTAGTAGCTGAGATTACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCT 10485254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9606 TTCTCCTGCCTCAGCCTCCTTAGTAGCTGAGATTACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCT 9665

 10485255 AATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCACAAACT 10485314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     9666 AATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCACAAATT 9725

 10485315 CCTGACCTCGGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 10485358
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9726 CCTGACCTC-GGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 9768

Alignment time is 7.54205 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10472480,10493779] =>     21300 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    5784] =>      5784 nucs 'mol-32-34be-059261_5784'

Score:        5701
Aligned:      5773        nucs
Identic:      5764 (100%) nucs =>      3487 (100%)      2277 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10476954,10480446] EXCISED REGION [10480452,10482731]
 second seq =>  [       1,    3487] EXCISED REGION [    3488,    5767]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [10480447,10480451]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [10480447,10480465] to [10480452,10480470]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [10480447,10480448] to [10480450,10480451]
 second seq =>         0 nucs

 10476954 ATACATGCAGGTCACAGGGGATATGATAGTTTAGCTTGGGCTCAGAGGCCTGACAGTAAT 10477013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATACATGCAGGTCACAGGGGATATGATAGTTTAGCTTGGGCTCAGAGGCCTGACAGTAAT 60

 10477014 CTGTTTCCTCTTCCCGATCTCCCCATGTAGGAGAAGCTGTCTTTGCTCGGTGCTTATCAT 10477073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGTTTCCTCTTCCCGATCTCCCCATGTAGGAGAAGCTGTCTTTGCTCGGTGCTTATCAT 120

 10477074 CTCTGAAGGATGAGAGAATTCAAGCTAGCAAAAAGCTGAAGGGTCCCCAGAAGTTCCAGT 10477133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCTGAAGGATGAGAGAATTCAAGCTAGCAAAAAGCTGAAGGGTCCCCAGAAGTTCCAGT 180

 10477134 TTGATGGTGATAAGAAATCATTCCTGGAGGACATTCGGAAGGTGGGACACAGTCCCTGGC 10477193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGATGGTGATAAGAAATCATTCCTGGAGGACATTCGGAAGGTGGGACACAGTCCCTGGC 240

 10477194 AGTGGTCTTTGTTGGTCCTGCGGAAGGCAGTGGGGGTGGGGGTTGTGGTGGGAGAACACT 10477253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTGGTCTTTGTTGGTCCTGCGGAAGGCAGTGGGGGTGGGGGTTGTGGTGGGAGAACACT 300

 10477254 CGAGGCCACAGGATGGCAGGTGGAATGAAGTTCAGCCTTGACTTGGATCTTGACTTACAA 10477313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGAGGCCACAGGATGGCAGGTGGAATGAAGTTCAGCCTTGACTTGGATCTTGACTTACAA 360

 10477314 TGTTTTCCTAGAATATTGGCCCTTCTGGGATCTCCACTGCTGATGAGAATAAGACTGGTA 10477373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTTTTCCTAGAATATTGGCCCTTCTGGGATCTCCACTGCTGATGAGAATAAGACTGGTA 420

 10477374 GACATAAGGCGGTCACTCTCCTAATGGCAATCCTAGTAGGTCTCTGTGTCACTCTTTAGG 10477433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACATAAGGCGGTCACTCTCCTAATGGCAATCCTAGTAGGTCTCTGTGTCACTCTTTAGG 480

 10477434 CACTCTACGCTTCCAAGATCATCTCTTACGCTCAAGGCTTTATGCTGCTAAGGCAGGCAG 10477493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACTCTACGCTTCCAAGATCATCTCTTACGCTCAAGGCTTTATGCTGCTAAGGCAGGCAG 540

 10477494 CCACCGAGTTTGGCTGGACTCTCAATTATGGTGGCATCGCCCTGATGTGGAGAGGGGGCT 10477553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCACCGAGTTTGGCTGGACTCTCAATTATGGTGGCATCGCCCTGATGTGGAGAGGGGGCT 600

 10477554 GCATCATTAGAAGGTAAGTGAGAGGCAGCCCAGGGTCCGACGGGAAGGACTCACACGGCT 10477613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCATCATTAGAAGGTAAGTGAGAGGCAGCCCAGGGTCCGACGGGAAGGACTCACACGGCT 660

 10477614 GTGCAGAAGTGCGATCTTAGGACACTTAGCTTGAGCAGTTTCCAGGGATGGGCACTTAGC 10477673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGCAGAAGTGCGATCTTAGGACACTTAGCTTGAGCAGTTTCCAGGGATGGGCACTTAGC 720

 10477674 CCCATCACTGGACACTGGCACAAGATAGGCTTAGATTATGTGGTTCCCTTCTTCACTGTA 10477733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCATCACTGGACACTGGCACAAGATAGGCTTAGATTATGTGGTTCCCTTCTTCACTGTA 780

 10477734 CCTCAGTTGCTGTAACTAGATTGTCCACACTACACCTTTTTTTTTCTTTTGAGACCAAGT 10477793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTCAGTTGCTGTAACTAGATTGTCCACACTACACCTTTTTTTTTCTTTTGAGACCAAGT 840

 10477794 TTCGCTCTTATTGCCCAAACTGGAGTGCCATGATGCGATCTTGACTCACTGCAACCTCTG 10477853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCGCTCTTATTGCCCAAACTGGAGTGCCATGATGCGATCTTGACTCACTGCAACCTCTG 900

 10477854 CCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCGTCCTAAGTAACTGGGATTACAAGGGC 10477913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCGTCCTAAGTAACTGGGATTACAAGGGC 960

 10477914 ACGCCACCATGTCCGGCTAATTCTTTTGTATTTGTAGTGGAAACAGGGTTTCACCATGTT 10477973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACGCCACCATGTCCGGCTAATTCTTTTGTATTTGTAGTGGAAACAGGGTTTCACCATGTT 1020

 10477974 AGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTTGCCTTGGGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGT 10478033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTTGCCTTGGGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGT 1080

 10478034 GCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCTCCGCATTACACCTACTACACTACAC 10478093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCTCCGCATTACACCTACTACACTACAC 1140

 10478094 CTTTTAAAGTACTTCTGTGAACTATCGTGCCCTCTGGCCTTGCCTCTTGGGAATTTTGCT 10478153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTTTAAAGTACTTCTGTGAACTATCGTGCCCTCTGGCCTTGCCTCTTGGGAATTTTGCT 1200

 10478154 CTGTATTTTCATTGAAAATGCCAAATCATAGAAAACGTAGCATTTCTACACATGACGTTA 10478213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGTATTTTCATTGAAAATGCCAAATCATAGAAAACGTAGCATTTCTACACATGACGTTA 1260

 10478214 CATCGTTCTCATGTTGGCTGAAGATTCATTTGATGAATCTGATTTTTCTGAAGTAGATGA 10478273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATCGTTCTCATGTTGGCTGAAGATTCATTTGATGAATCTGATTTTTCTGAAGTAGATGA 1320

 10478274 TTCTGGTGATTCAGATGATTCTAATATTAGTTCTCTTTAGAAATAACGCCAAGAATAGTT 10478333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCTGGTGATTCAGATGATTCTAATATTAGTTCTCTTTAGAAATAACGCCAAGAATAGTT 1380

 10478334 TTTATATTTTATTTTCATATTGAAAATCGTCAGATTTTCTTCAGCCTCAAAAAGCGTGTT 10478393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTATATTTTATTTTCATATTGAAAATCGTCAGATTTTCTTCAGCCTCAAAAAGCGTGTT 1440

 10478394 TATGTAAAATTAAATGAGCGCTGGCAGCGAGCTGCACTTTTTTTCTAAACAGGAAAAGGG 10478453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TATGTAAAATTAAATGAGCGCTGGCAGCGAGCTGCACTTTTTTTCTAAACAGGAAAAGGG 1500

 10478454 TTAACAGCTTGAAGAAATGAGAAATGTAACTTTGTTTCACTAGGGTATACATCGGCTTCC 10478513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTAACAGCTTGAAGAAATGAGAAATGTAACTTTGTTTCACTAGGGTATACATCGGCTTCC 1560

 10478514 AGCTTACTTCCCTGTTAGAGTTAAGATTCATTGCATTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCACAC 10478573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCTTACTTCCCTGTTAGAGTTAAGATTCATTGCATTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCACAC 1620

 10478574 CTGTAATCCCAGCGTTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCCAGA 10478633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGTAATCCCAGCGTTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCCAGA 1680

 10478634 CCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGTTG 10478693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGTTG 1740

 10478694 TAGTGGTGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTGGCGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAA 10478753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAGTGGTGCGTGCCTGTAATCCCAGCTACTGGCGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAA 1800

 10478754 CCTGGGAGGTGGAGGTTGCTGTGAGCTGAGATCGTGCCACTCCACTCCAGCCTGGTGACA 10478813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCTGGGAGGTGGAGGTTGCTGTGAGCTGAGATCGTGCCACTCCACTCCAGCCTGGTGACA 1860

 10478814 AAGCGGGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGACTCATTGCTTTTTTCCCCCCTTGA 10478873
          |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGCGGGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAA---GACTCATTGCTTTTTTCCCCCCTTGA 1917

 10478874 TTATTTCAGTGTATTCCTAGGAAAGATAAAGGATGCATTTGATCGAAACCCGGAACTTCA 10478933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TTATTTCAGTGTATTCCTAGGAAAGATAAAGGATGCATTTGATCGAAACCCGGAACTTCA 1977

 10478934 GAACCTCCTACTGGACGACTTCTTTAAGTCAGCTGTTGAAAACTGCCAGGTATGTAGCCT 10478993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 GAACCTCCTACTGGACGACTTCTTTAAGTCAGCTGTTGAAAACTGCCAGGTATGTAGCCT 2037

 10478994 AGGGCTGGTGCCATGGTTACTCTACCTCCCTGGGGCCATCAGTTGTGATGTTTGGTTTTT 10479053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 AGGGCTGGTGCCATGGTTACTCTACCTCCCTGGGGCCATCAGTTGTGATGTTTGGTTTTT 2097

 10479054 TGTTTTTTTTTTTTGGTTTTTTGTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCT 10479113
          ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TGTTTTTTTTTT--GGTTTTTTGTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCT 2155

 10479114 GGAGTACAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTC 10479173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 GGAGTACAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTC 2215

 10479174 TCCTGCCCCAGCCTTCCTAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCAACATACCTGGCTAATT 10479233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 TCCTGCCCCAGCCTTCCTAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCCAACATACCTGGCTAATT 2275

 10479234 TTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGACTGGTC 10479293
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TTTTTTTTTTTTT-GTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCTAGACTGGTC 2334

 10479294 TTGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATGACAGGC 10479353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 TTGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATGACAGGC 2394

 10479354 GTGAGCCACCGCGCCTGGCCTAACCATCAGTTTTTCATTTACCCACATTGATATGAATGA 10479413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 GTGAGCCACCGCGCCTGGCCTAACCATCAGTTTTTCATTTACCCACATTGATATGAATGA 2454

 10479414 AAATCTATCCGCGTCACCAGGGGCAGATCACTAATCTCTGGCCGTGCGTTTTGTGCTCAG 10479473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 AAATCTATCCGCGTCACCAGGGGCAGATCACTAATCTCTGGCCGTGCGTTTTGTGCTCAG 2514

 10479474 GACTCCTGGCGGCGGGCAGTCAGCACTGGGGTCCAGGCTGGCATTCCCATGCCCTGTTTT 10479533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 GACTCCTGGCGGCGGGCAGTCAGCACTGGGGTCCAGGCTGGCATTCCCATGCCCTGTTTT 2574

 10479534 ACCACTGCCCTCTCCTTCTATGACGGGTACAGACATGAGATGCTTCCAGCCAGCCTCATC 10479593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 ACCACTGCCCTCTCCTTCTATGACGGGTACAGACATGAGATGCTTCCAGCCAGCCTCATC 2634

 10479594 CAGGTAAGCCTGTGGAGCAGGGATTAACCTGGCTGGCCCCTCGGGGGCGTGCGCCATGGA 10479653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 CAGGTAAGCCTGTGGAGCAGGGATTAACCTGGCTGGCCCCTCGGGGGCGTGCGCCATGGA 2694

 10479654 CTGTCCTGACCAACCTACTCTCTCGTTTCCTAGGCTCAGCGGGATTACTTCGGGGCTCAC 10479713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 CTGTCCTGACCAACCTACTCTCTCGTTTCCTAGGCTCAGCGGGATTACTTCGGGGCTCAC 2754

 10479714 ACCTATGAACTCTTGGCCAAACCAGGGCAGTTTATCCACACCAACTGGACAGGCCATGGT 10479773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 ACCTATGAACTCTTGGCCAAACCAGGGCAGTTTATCCACACCAACTGGACAGGCCATGGT 2814

 10479774 GGCACCGTGTCATCCTCGTCATACAATGCCTGATCATGCTGCTCCTGTCACCCTCCACGA 10479833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 GGCACCGTGTCATCCTCGTCATACAATGCCTGATCATGCTGCTCCTGTCACCCTCCACGA 2874

 10479834 TTCCACAGACCAGGACATTCCATGTGCCTCATGGCACTGCCACCTGGCCCTTTGCCCTAT 10479893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 TTCCACAGACCAGGACATTCCATGTGCCTCATGGCACTGCCACCTGGCCCTTTGCCCTAT 2934

 10479894 TTTCTGTTCAGTTTTTTAAAAGTGTTGTAAGAGACTCCTGAGGAAGACACACAGTTTATT 10479953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 TTTCTGTTCAGTTTTTTAAAAGTGTTGTAAGAGACTCCTGAGGAAGACACACAGTTTATT 2994

 10479954 TGTAAAGTAGCTCTGTGAGAGCCACCATGCCCTCTGCCCTTGCCTCTTGGGACTGACCAG 10480013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 TGTAAAGTAGCTCTGTGAGAGCCACCATGCCCTCTGCCCTTGCCTCTTGGGACTGACCAG 3054

 10480014 GAGCTGCTCATGTGCGTGAGAGTGGGAACCATCTCCTTGCGGCAGTGGCTTCCGCGTGCC 10480073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 GAGCTGCTCATGTGCGTGAGAGTGGGAACCATCTCCTTGCGGCAGTGGCTTCCGCGTGCC 3114

 10480074 CCGTGTGCTGGTGCGGTTCCCATCACGCAGACAGGAAGGGTGTTTGCGCACTCTGATCAA 10480133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 CCGTGTGCTGGTGCGGTTCCCATCACGCAGACAGGAAGGGTGTTTGCGCACTCTGATCAA 3174

 10480134 CTGGAACCTCTGTATCATGCGGCTGAATTCCCTTTTTCCTTTACTCAATAAAAGCTACAT 10480193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 CTGGAACCTCTGTATCATGCGGCTGAATTCCCTTTTTCCTTTACTCAATAAAAGCTACAT 3234

 10480194 CAGACTGATGCTCTTTCTCCAGATTCTTAGTCTCACCTCGGCCACATGGAGCCATTATCC 10480253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 CAGACTGATGCTCTTTCTCCAGATTCTTAGTCTCACCTCGGCCACATGGAGCCATTATCC 3294

 10480254 CCATTGGCAGAAAGATTTTTCTTTAAAAAAAAAGACTAGAATAACACAAGAAACCACATT 10480313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 CCATTGGCAGAAAGATTTTTCTTTAAAAAAAAAGACTAGAATAACACAAGAAACCACATT 3354

 10480314 TAGGATTATGCTTCACTCAGAGGAGGCAGGCAGGGAGGACACACCAGGGGCTTTAATACA 10480373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 TAGGATTATGCTTCACTCAGAGGAGGCAGGCAGGGAGGACACACCAGGGGCTTTAATACA 3414

 10480374 CTGGGCATGTTTTCTTTCTCCAATTGGGCAATGGGTACATGGACGTTCACTGTAACGTGC 10480433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 CTGGGCATGTTTTCTTTCTCCAATTGGGCAATGGGTACATGGACGTTCACTGTAACGTGC 3474

 10480434 TTTTTCTTTCGTC 10480446
          |||||||||||||
     3475 TTTTTCTTTCGTC 3487

EXCISED REGION

 10480452 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTCCTGGCAAGCTGTGCGTGACATTCTTTATGGCTTTTTG 10480511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTCCTGGCAAGCTGTGCGTGACATTCTTTATGGCTTTTTG 3547

 10480512 TATGTCAAATACTTCATACTAAACTTTCTAGAGAATTAAACTTTAATGATGGGCTCAGCT 10480571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 TATGTCAAATACTTCATACTAAACTTTCTAGAGAATTAAACTTTAATGATGGGCTCAGCT 3607

 10480572 TGGTCTGATTTATTTCCTTTCCCACACCTGTCTCTACTTGCTCTAAGCCAGGCCCAGGGA 10480631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 TGGTCTGATTTATTTCCTTTCCCACACCTGTCTCTACTTGCTCTAAGCCAGGCCCAGGGA 3667

 10480632 TTTTGAACAAGCTAAGCCGGCTCCTTAAACTAGGCTTTTCACTTTATCTTACTTACTCAG 10480691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 TTTTGAACAAGCTAAGCCGGCTCCTTAAACTAGGCTTTTCACTTTATCTTACTTACTCAG 3727

 10480692 AGAAGATAAAACCTGCCAGTGATATTGTTGTGTGGCCTGGGGCCAGTGTGACTGTTCCCT 10480751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 AGAAGATAAAACCTGCCAGTGATATTGTTGTGTGGCCTGGGGCCAGTGTGACTGTTCCCT 3787

 10480752 GCAGCGGTTTGACTTCATGATGATTTCCCTGGAGTGTTAAAGTCCTAAGAGTTGCCTAAG 10480811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 GCAGCGGTTTGACTTCATGATGATTTCCCTGGAGTGTTAAAGTCCTAAGAGTTGCCTAAG 3847

 10480812 AGGAGCGAGCAGCGCCTGTGCCTCGACAGCTGGTGTCTACAGTGTGACCTCTGACCTCTC 10480871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 AGGAGCGAGCAGCGCCTGTGCCTCGACAGCTGGTGTCTACAGTGTGACCTCTGACCTCTC 3907

 10480872 GGCTAATGTCAGTGAAGGAGACAATTTTCATTAAATCACCAACTTTTAATTTATTTTTCT 10480931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 GGCTAATGTCAGTGAAGGAGACAATTTTCATTAAATCACCAACTTTTAATTTATTTTTCT 3967

 10480932 TTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTTGG 10480991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 TTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGGTCTTGG 4027

 10480992 CTCATTGCAAGCTCCACCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCCACCTCAGCCTCCAGAGTAG 10481051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 CTCATTGCAAGCTCCACCTCCCGGGTTCACACCATTCTCCCACCTCAGCCTCCAGAGTAG 4087

 10481052 CTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACTCCTGGCTTATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAC 10481111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 CTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCACTCCTGGCTTATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAC 4147

 10481112 GGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCT 10481171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 GGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCT 4207

 10481172 CGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTATTTTAAAATTTTGTTTAG 10481231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 CGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTATTTTAAAATTTTGTTTAG 4267

 10481232 AGATGTGGTCTTGCTATGATGCCCAGGCTGATGTCAAACACCTGGACTCAAGCAATCCTC 10481291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 AGATGTGGTCTTGCTATGATGCCCAGGCTGATGTCAAACACCTGGACTCAAGCAATCCTC 4327

 10481292 GTGCCTCGACCTCCCAAGGTGCTGGGATTATAGGCAGGAGCCACCGTGCCCTGCTACCAA 10481351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 GTGCCTCGACCTCCCAAGGTGCTGGGATTATAGGCAGGAGCCACCGTGCCCTGCTACCAA 4387

 10481352 CTTTTTAAACTCTGCCTAGATGTGAGTACTTCGCTAGATCAGCCCCCACGCACCCCTCCT 10481411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 CTTTTTAAACTCTGCCTAGATGTGAGTACTTCGCTAGATCAGCCCCCACGCACCCCTCCT 4447

 10481412 GCCCTCCCTGTACATTTAAGAGAAGCCCGAGTAGCCGCACGTGACGGGATTTTTCTTTAA 10481471
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4448 GCCCTCCCTGTACATTTAAGAGAAGCCCGAGTAGCCGCACGTGACAGGATTTTTCTTTAA 4507

 10481472 GGCTTGTCAAAGGCACTGTTCGAGGGGGATCTTTTCACCTGGCTCTGAGGCTGAGGGATG 10481531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 GGCTTGTCAAAGGCACTGTTCGAGGGGGATCTTTTCACCTGGCTCTGAGGCTGAGGGATG 4567

 10481532 GACACTGCTGGAATGGAGAGAGAACAGCAAGAGGTCAGAGGCTAAGTGTCAAAGGGCCCA 10481591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 GACACTGCTGGAATGGAGAGAGAACAGCAAGAGGTCAGAGGCTAAGTGTCAAAGGGCCCA 4627

 10481592 CGATGTTTCAAACAGTAATGATCAGAAGGGAATCCACTCAGCCCCTTTCCGCTTACCTTC 10481651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 CGATGTTTCAAACAGTAATGATCAGAAGGGAATCCACTCAGCCCCTTTCCGCTTACCTTC 4687

 10481652 CAAAAAGCTGTGAGTGGTGGAGTTTGGTTTCAAATCCAGCCCTCCTTGCTTACTAGCTGT 10481711
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 CAAAAAGTTGTGAGTGGTGGAGTTTGGTTTCAAATCCAGCCCTCCTTGCTTACTAGCTGT 4747

 10481712 TAGACTTTGGGGAAATTATTTACTATCTGTGTTCTCAGTTTTCTCATTTGTAAAATGGGA 10481771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 TAGACTTTGGGGAAATTATTTACTATCTGTGTTCTCAGTTTTCTCATTTGTAAAATGGGA 4807

 10481772 AATAATAGCACCTGTGTCCTTGAGGCTACTTTGGGGATTCAGCAAGGGAAGATAGAGCAG 10481831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 AATAATAGCACCTGTGTCCTTGAGGCTACTTTGGGGATTCAGCAAGGGAAGATAGAGCAG 4867

 10481832 TGCCTGGCACATAGTAAATACCTACACCAGTGGCAGCAAGGCTGGGTGCGCTGGCTCACA 10481891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 TGCCTGGCACATAGTAAATACCTACACCAGTGGCAGCAAGGCTGGGTGCGCTGGCTCACA 4927

 10481892 CCGTAAGCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTGA 10481951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 CCGTAAGCCCAGCACTTTGGAAGGCCGAGGTGGGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTCTGA 4987

 10481952 GACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAATTAGCTGGGC 10482011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 GACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCCCATCTCTACAAAAAATAAAAATTAGCTGGGC 5047

 10482012 GCAGTGGTGCACACCTATGATCCCAGCTAGGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTAA 10482071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 GCAGTGGTGCACACCTATGATCCCAGCTAGGTGGCAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTAA 5107

 10482072 GCCCAGGAGATGGAGGTTGCAGTGACCCATGACCACACCACTGTACTCCAGCCTCGGTGA 10482131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5108 GCCCAGGAGATGGAGGTTGCAGTGACCCATGACCACACCACTGTACTCCAGCCTCGGTGA 5167

 10482132 TAAAGCAAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATAGTGGCAGCAATTACTACCATTGAG 10482191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5168 TAAAGCAAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAATAGTGGCAGCAATTACTACCATTGAG 5227

 10482192 TGTGCCTGACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCTC 10482251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5228 TGTGCCTGACCCCTGGACCCCTGGAGCAGTGGTGGTTTTTTTTTAGACTGGGTCTTGCTC 5287

 10482252 TTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGAA 10482311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5288 TTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATTCAATCACTGCTCACTGCAACTTTGAACTCCCCGAA 5347

 10482312 TTCAGGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTCGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCACC 10482371
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5348 TTCAGGTGGTTCCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGACGCTGGTTCTACGGGCATGTGCCACC 5407

 10482372 ACGCCCCACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGCT 10482431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5408 ACGCCCCACTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAAGGTCTCACCATGTTGTCTAGGCT 5467

 10482432 GGTCTCAAAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGG 10482491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5468 GGTCTCAAAACTCCAGGGCTCAAGTGATGCTGCTCCCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGG 5527

 10482492 GATTACAGGCAGAAGCCACTACCCCCTGGCCAGCAGTGCGTGCTGTTTGTACTGAGAGAA 10482551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5528 GATTACAGGCAGAAGCCACTACCCCCTGGCCAGCAGTGCGTGCTGTTTGTACTGAGAGAA 5587

 10482552 ACCAGATGTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAATTTGCTTTGCACCCCAGTCTTCAAAAGG 10482611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5588 ACCAGATGTTACCTCTCAGCACCAGTGGTGAATTTGCTTTGCACCCCAGTCTTCAAAAGG 5647

 10482612 TTTCTGGTGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAGCAGGTGTAGAGGTTAAGAAAGGTCAGA 10482671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5648 TTTCTGGTGGGGGTGCCTCTGTGTGCTGCGCAGCAGGTGTAGAGGTTAAGAAAGGTCAGA 5707

 10482672 GCTTCTCAAACTAACCTGTTACAACTCCCCCACTCCCACCACCACCCCCGAGATTTTGAA 10482731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5708 GCTTCTCAAACTAACCTGTTACAACTCCCCCACTCCCACCACCACCCCCGAGATTTTGAA 5767

Alignment time is 4.5577 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [10472480,10493779] =>     21300 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [       1,    2250] =>      2250 nucs 'mol-32-34be-131281_2250'

Score:        2195
Aligned:      2250        nucs
Identic:      2245 (100%) nucs =>      2038 (100%)       207 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [10483054,10485094] EXCISED REGION [10485098,10485305]
 second seq =>  [       1,    2042] EXCISED REGION [    2043,    2250]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [10485095,10485097]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [10485095,10485108] to [10485098,10485111]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [10485095,10485095] to [10485097,10485097]
 second seq =>         0 nucs

 10483054 GCCTCCCAAGTGCTGAGACCACAGGCATGAGCCACCACGCCTGGCCCTGGGCCCCAATCT 10483113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
        1 GCCTCCCAAGTGCTGAGACCACAGGCATGAGCCACCACGCCTGGCCCTGGGCCCTAATCT 60

 10483114 TGGCTCCGCCACAAATTCAGCCTTACTTCACAAGTTAGTTAACCTCTATGTGCGTATTTT 10483173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGCTCCGCCACAAATTCAGCCTTACTTCACAAGTTAGTTAACCTCTATGTGCGTATTTT 120

 10483174 CTCCTCTATATAAAAGGGATGATGATAACACCCACCTCACAGAGCCGTCTTCCCGACTAA 10483233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCCTCTATATAAAAGGGATGATGATAACACCCACCTCACAGAGCCGTCTTCCCGACTAA 180

 10483234 ACACAAGGCACTTGCACCAGAGCCACCACACACTGAGCACTATGTAAGGTTTACTGTTTA 10483293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACACAAGGCACTTGCACCAGAGCCACCACACACTGAGCACTATGTAAGGTTTACTGTTTA 240

 10483294 TTACCTGCCTCCTAAAGAGAGGCTGCCAAACAATTCTGAGTGTGGAAGGAGGTGGAAAGA 10483353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTACCTGCCTCCTAAAGAGAGGCTGCCAAACAATTCTGAGTGTGGAAGGAGGTGGAAAGA 300

 10483354 GGGGTTTTGCCCTTAGCCAAGTCAGTCCTGTTCAGTCTAACCACTAAAAGGGACAGATCT 10483413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGGTTTTGCCCTTAGCCAAGTCAGTCCTGTTCAGTCTAACCACTAAAAGGGACAGATCT 360

 10483414 GGTGGCTTCTTTGAGGTAGAAATTATAGGCCCCTAATGATGTCTGCCACAACTCTGCTTT 10483473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTGGCTTCTTTGAGGTAGAAATTATAGGCCCCTAATGATGTCTGCCACAACTCTGCTTT 420

 10483474 ACTGGGGACACAAAGGTGTGTTATACAGACAAGGGTCAGACAAGGAAACAGGAGTTTTGT 10483533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTGGGGACACAAAGGTGTGTTATACAGACAAGGGTCAGACAAGGAAACAGGAGTTTTGT 480

 10483534 TTTCACTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTTTCCCAGCTGGAGTGCAGGGCGCGATCTCGGC 10483593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCACTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTTTCCCAGCTGGAGTGCAGGGCGCGATCTCGGC 540

 10483594 TCACTGCAACCTCTACCTCCCTAGTTCACGCAGTTCTCCTGCTTCAACCTCCTGAATAGC 10483653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCACTGCAACCTCTACCTCCCTAGTTCACGCAGTTCTCCTGCTTCAACCTCCTGAATAGC 600

 10483654 TGGGATTACAGGTGCCCACCACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACAGGG 10483713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGGATTACAGGTGCCCACCACTACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACAGGG 660

 10483714 TTTCCCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCCGCCTCA 10483773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTCCCCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCCGCCTCA 720

 10483774 GCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATT 10483833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCATGCCTGGCCAAGCAGAAGGATT 780

 10483834 GCCAAGCAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATG 10483893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCAAGCAAAGAGACTTTAGGGAAGGATTTGCAGGGGTTACACGTTCTTTGAGGCAGATG 840

 10483894 TGGAGCCCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGA 10483953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGAGCCCATCATTTTGGAAGGGGTGGGAGCCTTCAGCACGCTGTTCAGCATGCGGGCGA 900

 10483954 ATGCGTCTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGT 10484013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGCGTCTGCTCACTCTGTTAAATCTTGTATGCTGTCACAGTTGCTGCGGACTGGTGTGT 960

 10484014 AACAAACCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTC 10484073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACAAACCACCCCAAAGTCAGTGGTGTAAAATAATCACCATTTAAATTTTCTTCTAATTC 1020

 10484074 TGTGGGTCATGAATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTC 10484133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTGGGTCATGAATCTGGAAAGAGCATGGTGGGGGACGGGGGAGGCAGAGGCAGCTTGTC 1080

 10484134 TGCTCCACAATGTCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATGGC 10484193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCTCCACAATGTCTGGGGCCTCAGCTAGGAGGACTCGAGAGCAGGGGTGGCACCATGGC 1140

 10484194 TCGGGGGCGTGGAGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGG 10484253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCGGGGGCGTGGAGTGTCCTCTCTCATTCATCTCGCGGTGGATGCTGGCTGTTGGCTGGG 1200

 10484254 ACCTCAGCTAGGGCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAGGC 10484313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCTCAGCTAGGGCTATGAGCTGGAAAAAGTTCATGTGGCCTCATCACATGGCCTCAGGC 1260

 10484314 CAGAGAAACATCTTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACACGT 10484373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGAGAAACATCTTGTTTGTTGGCCCAGGGTTCTCACTAAGGAGGCAGAAGCACACACGT 1320

 10484374 GGCTTTTAAAAACCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTATAGCCATCCAAAATCGGT 10484433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGCTTTTAAAAACCCAGCTGTGAATGTTACATGGCAGGATTATAGCCATCCAAAATCGGT 1380

 10484434 TCCAAGCAAGCCGCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTTGA 10484493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCAAGCAAGCCGCAAGTCCCCCAGACTCAAGGGGCAGAGGATTAGACTCTACCTCTTGA 1440

 10484494 TGGGGGAGTATGAGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACATTGTTCTTGCCATCTT 10484553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGGGGAGTATGAGGTTCTAGAAAAGCACATGGATCAGGAGACATTGTTCTTGCCATCTT 1500

 10484554 CGTAAATTACAGTCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAAAATCTGTTACATAGCAGA 10484613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CGTAAATTACAGTCTGCCACATATGCTGCCCCTGAAAAGGAAAATCTGTTACATAGCAGA 1560

 10484614 GTTGGGAACCGGCACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCATATAGTATATATACTACT 10484673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1561 GTTGGGAACCGGCACTATTTGGGGCTTTTCCTGAGGGTCTCATATAGTATATGTACTACT 1620

 10484674 AGCTAACATTGAGAGCATATGCCAGGCTCTGTAACTCATTGAATGCTCGCAGCACCCTCT 10484733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGCTAACATTGAGAGCATATGCCAGGCTCTGTAACTCATTGAATGCTCGCAGCACCCTCT 1680

 10484734 GAAGTAAGCACTATTACTATCCCTAATTTAGAGATGAAGCACACTGATATTAAGTAATTC 10484793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAAGTAAGCACTATTACTATCCCTAATTTAGAGATGAAGCACACTGATATTAAGTAATTC 1740

 10484794 GTCCAAGGTCAGAGCTACTGAAGAACTGGAATTGAACCCCAGAGATCTGGTGCCAGAGTC 10484853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTCCAAGGTCAGAGCTACTGAAGAACTGGAATTGAACCCCAGAGATCTGGTGCCAGAGTC 1800

 10484854 CATACACTTAATCATGAAACTGACCTGTCGGCGTGCACAGTTCATCGCCCCACTCATTCA 10484913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CATACACTTAATCATGAAACTGACCTGTCGGCGTGCACAGTTCATCGCCCCACTCATTCA 1860

 10484914 GTCATTCGGCATGTTTATGGTACACCTACCATGTGCCAAGCATTGTGCTAGGTACCCTCT 10484973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTCATTCGGCATGTTTATGGTACACCTACCATGTGCCAAGCATTGTGCTAGGTACCCTCT 1920

 10484974 GTC-GGGGTGAGAGAAGTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTTACAGGATACATATAATAT 10485032
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1921 GTCAGGGGTGAGAGAAGTCCAAAGTCCTGACCTCATGTGCTTACAGAATACATATAATAT 1980

 10485033 TTAACGATAATTATTTTTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAAACCTATGAAATGGAGATT 10485092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTAACGATAATTATTTTTAAATTTTTATCTTCTCTTGAATAAACCTATGAAATGGAGATT 2040

 10485093 GA 10485094
          ||
     2041 GA 2042

EXCISED REGION

 10485098 TTTTTTTTTTTTTTGAGATGTAGTCTCACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGAT 10485157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 TTTTTTTTTTTTTTGAGATGTAGTCTCACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGAT 2102

 10485158 CTTGGCTCACTACGACCTCCGCCTCCTGGGCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTTAG 10485217
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 CTTGGCTCACTACGACCTCTGCCTCCTGGGCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTTAG 2162

 10485218 TAGCTGAGATTACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 10485277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 TAGCTGAGATTACAGGCGTGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 2222

 10485278 TGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGG 10485305
          ||||||||||||||||||||||||||||
     2223 TGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGG 2250

Alignment time is 1.76406 s

