
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2672] =>      2672 nucs 'mol-32-1e7c-222753_2672'

Score:        2661
Aligned:      2672        nucs
Identic:      2671 (100%) nucs =>       803 (100%)      1868 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31442548,31443350] EXCISED REGION [31444865,31446733]
 second seq =>  [       1,     803] EXCISED REGION [     804,    2672]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31442548 CCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACA 31442607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACA 60

 31442608 AAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGC 31442667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGC 120

 31442668 ATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTC 31442727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTC 180

 31442728 CCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCAC 31442787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCAC 240

 31442788 CCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCC 31442847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCC 300

 31442848 TAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCG 31442907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCG 360

 31442908 CCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTC 31442967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTC 420

 31442968 ATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTAT 31443027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTAT 480

 31443028 TTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAG 31443087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAG 540

 31443088 GGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGT 31443147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGT 600

 31443148 GTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATC 31443207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATC 660

 31443208 CCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTG 31443267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTG 720

 31443268 GCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGA 31443327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGA 780

 31443328 TGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 31443350
          |||||||||||||||||||||||
      781 TGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 803

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      804 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 863

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      864 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 923

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      924 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 983

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 1043

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1044 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 1103

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1104 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 1163

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 1223

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 1283

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 1343

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 1403

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 1463

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 1523

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 1583

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 1643

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 1703

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 1763

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 1823

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 31445944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1824 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 1883

 31445945 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 31446004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 1943

 31446005 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 31446064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 2003

 31446065 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 31446124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 2063

 31446125 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 31446184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 2123

 31446185 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 31446244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 2183

 31446245 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 31446304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 2243

 31446305 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 31446364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 2303

 31446365 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 31446424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 2363

 31446425 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 31446484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 2423

 31446485 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 31446544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 2483

 31446545 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 31446604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 2543

 31446605 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 31446664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 2603

 31446665 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 31446724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 2663

 31446725 AGTGTCAGG 31446733
          |||||||||
     2664 AGTGTCAGG 2672

Alignment time is 2.12684 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    4315] =>      4315 nucs 'mol-32-1eea-076477_4315'

Score:        4314
Aligned:      4314        nucs
Identic:      4314 (100%) nucs =>       176 (100%)      4138 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31439027,31439202] EXCISED REGION [31439204,31443341]
 second seq =>  [       1,     176] EXCISED REGION [     178,    4315]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31439203,31439203]
 second seq =>         1 nucs [177,177]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [175,176] to [176,177]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31439027 CATTGGGCCACACTCCTTCACACAGAGGTCAAAGGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCAT 31439086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATTGGGCCACACTCCTTCACACAGAGGTCAAAGGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCAT 60

 31439087 AGGTCTTTAATTAGAAACAGAGGAAGTCAGGATTTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAA 31439146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTCTTTAATTAGAAACAGAGGAAGTCAGGATTTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAA 120

 31439147 ACTTTACCAGCTAAATTGAAGAATCCCTGTTACTAAAAGTCTGTGTCATTGCACTT 31439202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTTTACCAGCTAAATTGAAGAATCCCTGTTACTAAAAGTCTGTGTCATTGCACTT 176

EXCISED REGION

 31439204 GGGAGGGCGGGCCCAGTGGCACACATGTGTGACGTGGCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGA 31439263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      178 GGGAGGGCGGGCCCAGTGGCACACATGTGTGACGTGGCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGA 237

 31439264 AGAGTAGGAGCTACTGGAGAACCATGATGCATGACGCAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTG 31439323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      238 AGAGTAGGAGCTACTGGAGAACCATGATGCATGACGCAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTG 297

 31439324 GCCATGTCTTTCTCAGCCGTCCTGGGAGCTTTCAGGATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTT 31439383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 GCCATGTCTTTCTCAGCCGTCCTGGGAGCTTTCAGGATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTT 357

 31439384 CCTCCTAAGGCAAAAAATTTATACCACTTTTTTTTTTCCCAATCCAGATGCAAAACCAAA 31439443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 CCTCCTAAGGCAAAAAATTTATACCACTTTTTTTTTTCCCAATCCAGATGCAAAACCAAA 417

 31439444 AACTCAAATCCAACTGTTCTCAGTCAAGTGAAAGCATTCCAAGACCTCAGAAATGCTCAC 31439503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 AACTCAAATCCAACTGTTCTCAGTCAAGTGAAAGCATTCCAAGACCTCAGAAATGCTCAC 477

 31439504 TCACCAAAGACCATTTTCCTGACTTGTAATTTGGTCAGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGT 31439563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 TCACCAAAGACCATTTTCCTGACTTGTAATTTGGTCAGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGT 537

 31439564 TCCGGGTGGTCCAGTTTCCTCTGGGAACTCCGTAGGTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGT 31439623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 TCCGGGTGGTCCAGTTTCCTCTGGGAACTCCGTAGGTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGT 597

 31439624 TTTCTGCTTGCCTAGGAGTTCCAGGGCAACTGAACTTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCG 31439683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 TTTCTGCTTGCCTAGGAGTTCCAGGGCAACTGAACTTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCG 657

 31439684 CTCAGCTGCAGAAGGTCGTTTGGAAAACCTAATTAGAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACAC 31439743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 CTCAGCTGCAGAAGGTCGTTTGGAAAACCTAATTAGAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACAC 717

 31439744 CAGGAGTTGGCCCTGGCAGGCCTGTGTGGAGGTGGAGGCGATTACATTTTGATCCCTAGT 31439803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 CAGGAGTTGGCCCTGGCAGGCCTGTGTGGAGGTGGAGGCGATTACATTTTGATCCCTAGT 777

 31439804 ATATCTGCCTTAGAAAGATGCTGGACTTAAAATTTCAAACCATTTCATAATGATTTATAC 31439863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 ATATCTGCCTTAGAAAGATGCTGGACTTAAAATTTCAAACCATTTCATAATGATTTATAC 837

 31439864 ATTTTTTAATAAGTGCCATTAGATCTCCTTCCACCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCC 31439923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 ATTTTTTAATAAGTGCCATTAGATCTCCTTCCACCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCC 897

 31439924 TCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTG 31439983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 TCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTG 957

 31439984 ATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCT 31440043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 ATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCT 1017

 31440044 TCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAG 31440103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 TCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAG 1077

 31440104 GGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTG 31440163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 GGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTG 1137

 31440164 GGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCC 31440223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 GGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCC 1197

 31440224 AACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTT 31440283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 AACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTT 1257

 31440284 TTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGCTAATTC 31440343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGCTAATTC 1317

 31440344 ACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCC 31440403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 ACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCC 1377

 31440404 AGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGT 31440463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 AGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGT 1437

 31440464 GTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCT 31440523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 GTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCT 1497

 31440524 GCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCT 31440583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCT 1557

 31440584 TTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTAT 31440643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTAT 1617

 31440644 TCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATAATTTTT 31440703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATAATTTTT 1677

 31440704 TTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGC 31440763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 TTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGC 1737

 31440764 TCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGC 31440823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGC 1797

 31440824 TGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGA 31440883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGA 1857

 31440884 TTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCG 31440943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCG 1917

 31440944 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATA 31441003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATA 1977

 31441004 TTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGT 31441063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 TTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGT 2037

 31441064 CTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTT 31441123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 CTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTT 2097

 31441124 GTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACT 31441183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 GTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACT 2157

 31441184 AGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATG 31441243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 AGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATG 2217

 31441244 GGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAG 31441303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 GGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAG 2277

 31441304 AGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTT 31441363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 AGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTT 2337

 31441364 CCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACC 31441423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 CCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACC 2397

 31441424 AATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTC 31441483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 AATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTC 2457

 31441484 ACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTG 31441543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 ACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTG 2517

 31441544 GAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGA 31441603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGA 2577

 31441604 TTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCC 31441663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 TTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCC 2637

 31441664 AAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCT 31441723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 AAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCT 2697

 31441724 CTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGT 31441783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 CTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGT 2757

 31441784 GCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCA 31441843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 GCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCA 2817

 31441844 GACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGC 31441903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGC 2877

 31441904 AGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAG 31441963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 AGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAG 2937

 31441964 TAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTA 31442023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTA 2997

 31442024 TGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCAT 31442083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCAT 3057

 31442084 TTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTA 31442143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 TTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTA 3117

 31442144 GCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTAT 31442203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 GCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTAT 3177

 31442204 TTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAA 31442263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 TTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAA 3237

 31442264 CTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTG 31442323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 CTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTG 3297

 31442324 CCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTA 31442383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTA 3357

 31442384 TGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCA 31442443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 TGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCA 3417

 31442444 TACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGAT 31442503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 TACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGAT 3477

 31442504 GGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAA 31442563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 GGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAA 3537

 31442564 AAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTC 31442623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 AAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTC 3597

 31442624 AGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGA 31442683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 AGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGA 3657

 31442684 GGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGC 31442743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 GGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGC 3717

 31442744 ACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGAC 31442803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 ACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGAC 3777

 31442804 TCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCT 31442863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCT 3837

 31442864 GGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTC 31442923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 GGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTC 3897

 31442924 ATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAA 31442983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 ATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAA 3957

 31442984 AGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTT 31443043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 AGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTT 4017

 31443044 CTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTC 31443103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 CTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTC 4077

 31443104 CACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGC 31443163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 CACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGC 4137

 31443164 AAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 31443223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 AAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG 4197

 31443224 CCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAAC 31443283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 CCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAAC 4257

 31443284 CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGT 31443341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGT 4315

Alignment time is 3.32862 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    7976] =>      7976 nucs 'mol-32-1f0b-166267_7976'

Score:        7895
Aligned:      7984        nucs
Identic:      7971 (100%) nucs =>      3457 (100%)      4514 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31439893,31443350] EXCISED REGION [31444865,31449388]
 second seq =>  [       1,    3458] EXCISED REGION [    3459,    7976]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31439893 TCCACCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAG 31439952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCACCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAG 60

 31439953 TAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTA 31440012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTA 120

 31440013 ATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAG 31440072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAG 180

 31440073 GAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTC 31440132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTC 240

 31440133 AAATGAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTG 31440192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATGAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTG 300

 31440193 TGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCA 31440252
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAACTCCCCCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCA 360

 31440253 CAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAG 31440312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAG 420

 31440313 AAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGG 31440372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGG 480

 31440373 AGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGG 31440432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGG 540

 31440433 GTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGG 31440492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGG 600

 31440493 CTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGC 31440552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGC 660

 31440553 ACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATAT 31440612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATAT 720

 31440613 TTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTT 31440672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTT 780

 31440673 TTTCAACTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGC 31440732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTCAACTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGC 840

 31440733 CCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAA 31440792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAA 900

 31440793 ACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCT 31440852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCT 960

 31440853 GGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAA 31440912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAA 1020

 31440913 ACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGT 31440972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGT 1080

 31440973 GAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTAC 31441032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTAC 1140

 31441033 ATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTG 31441092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTG 1200

 31441093 AATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATG 31441152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATG 1260

 31441153 CCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGG 31441212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGG 1320

 31441213 GAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAA 31441272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAA 1380

 31441273 TTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTT 31441332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTT 1440

 31441333 ATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATT 31441392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATT 1500

 31441393 TCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGG 31441452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGG 1560

 31441453 GAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGC 31441512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGC 1620

 31441513 AGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTC 31441572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTC 1680

 31441573 CAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCT 31441632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCT 1740

 31441633 ATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAG 31441692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAG 1800

 31441693 TTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGT 31441752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGT 1860

 31441753 CTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGC 31441812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGC 1920

 31441813 ACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATA 31441872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATA 1980

 31441873 GATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCA 31441932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCA 2040

 31441933 CCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGG 31441992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGG 2100

 31441993 AAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCT 31442052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCT 2160

 31442053 CTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACT 31442112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACT 2220

 31442113 GTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAA 31442172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAA 2280

 31442173 ATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGT 31442232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGT 2340

 31442233 GTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGT 31442292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGT 2400

 31442293 TCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATC 31442352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATC 2460

 31442353 TTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATT 31442412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATT 2520

 31442413 GAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTG 31442472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTG 2580

 31442473 TAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTG 31442532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTG 2640

 31442533 ACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAAT 31442592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAAT 2700

 31442593 TTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCT 31442652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCT 2760

 31442653 GCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATG 31442712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATG 2820

 31442713 CAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGT 31442772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGT 2880

 31442773 TTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGA 31442832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGA 2940

 31442833 CCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTG 31442892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTG 3000

 31442893 GTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGG 31442952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGG 3060

 31442953 TCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAA 31443012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAA 3120

 31443013 AGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCA 31443072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCA 3180

 31443073 TCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTG 31443132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTG 3240

 31443133 AAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGG 31443192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGG 3300

 31443193 CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAG 31443252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAG 3360

 31443253 ATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGT 31443312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGT 3420

 31443313 AGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 31443350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 3458

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3459 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 3518

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3519 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 3578

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3579 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 3638

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3639 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 3698

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3699 TCTC-AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 3757

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 3817

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 3877

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3878 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 3937

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 3997

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 4057

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 4117

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 4177

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4178 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 4237

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4238 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 4297

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4298 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 4357

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4358 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 4417

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4418 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 4477

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 31445944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4478 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 4537

 31445945 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 31446004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4538 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 4597

 31446005 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 31446064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4598 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 4657

 31446065 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 31446124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4658 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 4717

 31446125 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 31446184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4718 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 4777

 31446185 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 31446244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4778 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 4837

 31446245 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 31446304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4838 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 4897

 31446305 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 31446364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4898 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 4957

 31446365 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 31446424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4958 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 5017

 31446425 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 31446484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5018 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 5077

 31446485 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 31446544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5078 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 5137

 31446545 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 31446604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5138 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 5197

 31446605 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 31446664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5198 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 5257

 31446665 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 31446724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5258 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 5317

 31446725 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 31446784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5318 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 5377

 31446785 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 31446844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5378 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 5437

 31446845 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 31446904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5438 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 5497

 31446905 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 31446964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5498 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 5557

 31446965 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 31447024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5558 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 5617

 31447025 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 31447084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5618 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 5677

 31447085 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 31447144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5678 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 5737

 31447145 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 31447204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5738 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 5797

 31447205 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 31447264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5798 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 5857

 31447265 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 31447324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5858 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 5917

 31447325 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 31447384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5918 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 5977

 31447385 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 31447444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5978 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 6037

 31447445 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 31447504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6038 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 6097

 31447505 TGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAG 31447564
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     6098 TGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCC---TTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAG 6154

 31447565 ATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAC 31447624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6155 ATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAC 6214

 31447625 CTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATA 31447684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6215 CTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATA 6274

 31447685 AGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTT 31447744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6275 AGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTT 6334

 31447745 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGA 31447804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6335 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGA 6394

 31447805 CCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTT 31447864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6395 CCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTT 6454

 31447865 TCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTC 31447924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6455 TCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTC 6514

 31447925 CAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGA 31447984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6515 CAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGA 6574

 31447985 CCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATA 31448044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6575 CCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATA 6634

 31448045 TTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAA 31448104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6635 TTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAA 6694

 31448105 GTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGTTACTTAATAGA 31448164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6695 GTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGTTACTTAATAGA 6754

 31448165 TATTTGGAGATTTTCTTGACTCGGAAACTAGGAGTCTTTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAAT 31448224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6755 TATTTGGAGATTTTCTTGACTCGGAAACTAGGAGTCTTTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAAT 6814

 31448225 AGATAATCAACATTCCCCTACTGGGGAGAAACAAGGTGGGAGAATGAATACAACCTATGC 31448284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6815 AGATAATCAACATTCCCCTACTGGGGAGAAACAAGGTGGGAGAATGAATACAACCTATGC 6874

 31448285 TCCCCTAGGAAGGTTTTAAGAATTTTATTTTGTGTTTCTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTGC 31448344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6875 TCCCCTAGGAAGGTTTTAAGAATTTTATTTTGTGTTTCTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTGC 6934

 31448345 ATAAGAGATTAAGGAAATACACAGCTACTTTATAAGAGACTCCTTAAGAAAGAGATGGAG 31448404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6935 ATAAGAGATTAAGGAAATACACAGCTACTTTATAAGAGACTCCTTAAGAAAGAGATGGAG 6994

 31448405 GCAGGACCAAGGAATGCACAAAGGATGGGGTATTTTGCCATAAAAAGTAACTGCAATACA 31448464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6995 GCAGGACCAAGGAATGCACAAAGGATGGGGTATTTTGCCATAAAAAGTAACTGCAATACA 7054

 31448465 CTGAATGTGTCCCCCAAAATTCATGGTTTTAAAAAATTAAATAACTGCTTTTATTGAGAT 31448524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7055 CTGAATGTGTCCCCCAAAATTCATGGTTTTAAAAAATTAAATAACTGCTTTTATTGAGAT 7114

 31448525 ATAATTTGATGTTTTGATATGCATATGTATTGGGAAATGATTACTATAGTCAGGCTAATT 31448584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7115 ATAATTTGATGTTTTGATATGCATATGTATTGGGAAATGATTACTATAGTCAGGCTAATT 7174

 31448585 AACATATCCATTACCTCACATAATTACCTTATTTTTGTAATGAGAACACTTAAGATTCAC 31448644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7175 AACATATCCATTACCTCACATAATTACCTTATTTTTGTAATGAGAACACTTAAGATTCAC 7234

 31448645 TGTCTTAGCAAATTTCGAGTATACAATGCAGCATTATTAGCTATAGTCACCATGATGTAC 31448704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7235 TGTCTTAGCAAATTTCGAGTATACAATGCAGCATTATTAGCTATAGTCACCATGATGTAC 7294

 31448705 ATTAGATTTCTAGAAGCTACTTCATCTCAAATAAATGAAAGTTTATACCTTTTGACTAAC 31448764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7295 ATTAGATTTCTAGAAGCTACTTCATCTCAAATAAATGAAAGTTTATACCTTTTGACTAAC 7354

 31448765 GTCTCCATTTCTCCCAGCTCTCAGCCCCTAGAAGCTGTAGAGATCCATGTTTTCGCAAAT 31448824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7355 GTCTCCATTTCTCCCAGCTCTCAGCCCCTAGAAGCTGTAGAGATCCATGTTTTCGCAAAT 7414

 31448825 GACAGGATTTAGAATTTCCTTCTTTTTTAAAGCTGAATAATATTCCAGTG--TGTGTGTG 31448882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||
     7415 GACAGGATTTAGAATTTCCTTCTTTTTTAAAGCTGAATAATATTCCAGTGTATGTGTGTG 7474

 31448883 TGTGTGTGTGTATCACACACACATGCATCTATGTATTATCTATCTATCCATCTATTCTAT 31448942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7475 TGTGTGTGTGTATCACACACACATGCATCTATGTATTATCTATCTATCCATCTATTCTAT 7534

 31448943 CTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTCTCTATCTAGCAATTTCTTTAT 31449002
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||
     7535 CTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTA----TCTATCTAGCAATTTCTTTAT 7590

 31449003 CCATTTACCTGTTGACAGACACAGATTGTTTCCACATCTTGGTTAGTGTGAATAATGCTG 31449062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7591 CCATTTACCTGTTGACAGACACAGATTGTTTCCACATCTTGGTTAGTGTGAATAATGCTG 7650

 31449063 CAATGAACATGGGAGTGTAGCTATCTCTTCAATATACTGATTTTATTTTCTATAACTTTG 31449122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7651 CAATGAACATGGGAGTGTAGCTATCTCTTCAATATACTGATTTTATTTTCTATAACTTTG 7710

 31449123 TAATATACTTTGGGATTGAGAAGTGTGATGCCTCCAGCTTCATTCTTTTTTTTCTCGAGA 31449182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7711 TAATATACTTTGGGATTGAGAAGTGTGATGCCTCCAGCTTCATTCTTTTTTTTCTCGAGA 7770

 31449183 CTGCTTTGGCTATTCAGGATCGCTTGTTGTTCCATACAAATTTTATGATTATATTTTCCA 31449242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7771 CTGCTTTGGCTATTCAGGATCGCTTGTTGTTCCATACAAATTTTATGATTATATTTTCCA 7830

 31449243 TTTCTGTGAAAATTACCACTAGAATTTTGATGGGCATTGTGTTGAATCTCTGGATAACTC 31449302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7831 TTTCTGTGAAAATTACCACTAGAATTTTGATGGGCATTGTGTTGAATCTCTGGATAACTC 7890

 31449303 TGGGTTGTATGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAGTCCACAAACACAGAATATCTT 31449362
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     7891 TGGGTTGTATGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAGTCCACAAACACAGAATTTCTT 7950

 31449363 TCCATTTGTGTCTTCTTCAATTCCTT 31449388
          ||||||||||||||||||||||||||
     7951 TCCATTTGTGTCTTCTTCAATTCCTT 7976

Alignment time is 6.09903 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3476] =>      3476 nucs 'mol-32-1f0b-166267_3476'

Score:        3475
Aligned:      3475        nucs
Identic:      3475 (100%) nucs =>       328 (100%)      3147 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31439893,31440220] EXCISED REGION [31440222,31443368]
 second seq =>  [       1,     328] EXCISED REGION [     330,    3476]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31440221,31440221]
 second seq =>         1 nucs [329,329]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [327,330] to [328,331]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31440219,31440220] to [31440222,31440223]
 second seq =>         2 nucs [327,328] to [330,331]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31439893 TCCACCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAG 31439952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCACCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAG 60

 31439953 TAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTA 31440012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTA 120

 31440013 ATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAG 31440072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAG 180

 31440073 GAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTC 31440132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTC 240

 31440133 AAATGAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTG 31440192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATGAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTG 300

 31440193 TGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAACTCC 31440220
          ||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAACTCC 328

EXCISED REGION

 31440222 CCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTT 31440281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      330 CCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTT 389

 31440282 TTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGCTAAT 31440341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      390 TTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGCTAAT 449

 31440342 TCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGG 31440401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      450 TCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGG 509

 31440402 CCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAA 31440461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      510 CCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAA 569

 31440462 GTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATC 31440521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      570 GTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATC 629

 31440522 CTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAAT 31440581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      630 CTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAAT 689

 31440582 CTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGT 31440641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      690 CTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGT 749

 31440642 ATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATAATTT 31440701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 ATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATAATTT 809

 31440702 TTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCA 31440761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 TTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCA 869

 31440762 GCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTA 31440821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 GCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTA 929

 31440822 GCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAG 31440881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 GCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAG 989

 31440882 GATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCT 31440941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 GATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCT 1049

 31440942 CGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATA 31441001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 CGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATA 1109

 31441002 TATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAA 31441061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 TATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAA 1169

 31441062 GTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAAT 31441121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 GTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAAT 1229

 31441122 TTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTA 31441181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 TTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTA 1289

 31441182 CTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGA 31441241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 CTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGA 1349

 31441242 TGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCT 31441301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 TGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCT 1409

 31441302 AGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTC 31441361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 AGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTC 1469

 31441362 TTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGA 31441421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 TTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGA 1529

 31441422 CCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTG 31441481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 CCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTG 1589

 31441482 TCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACT 31441541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 TCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACT 1649

 31441542 TGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCT 31441601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 TGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCT 1709

 31441602 GATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCT 31441661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 GATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCT 1769

 31441662 CCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAG 31441721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 CCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAG 1829

 31441722 CTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCT 31441781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 CTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCT 1889

 31441782 GTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCC 31441841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 GTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCC 1949

 31441842 CAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACA 31441901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 CAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACA 2009

 31441902 GCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAA 31441961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 GCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAA 2069

 31441962 AGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTC 31442021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 AGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTC 2129

 31442022 TATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCC 31442081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 TATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCC 2189

 31442082 ATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAAT 31442141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 ATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAAT 2249

 31442142 TAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTT 31442201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 TAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTT 2309

 31442202 ATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCG 31442261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 ATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCG 2369

 31442262 AACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGC 31442321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 AACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGC 2429

 31442322 TGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTC 31442381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 TGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTC 2489

 31442382 TATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAAT 31442441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 TATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAAT 2549

 31442442 CATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGG 31442501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 CATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGG 2609

 31442502 ATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACT 31442561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 ATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACT 2669

 31442562 AAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTC 31442621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 AAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTC 2729

 31442622 TCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGA 31442681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 TCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGA 2789

 31442682 GAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGG 31442741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 GAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGG 2849

 31442742 GCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTG 31442801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 GCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTG 2909

 31442802 ACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCAC 31442861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 ACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCAC 2969

 31442862 CTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCT 31442921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 CTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCT 3029

 31442922 TCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTAT 31442981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 TCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTAT 3089

 31442982 AAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTC 31443041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 AAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTC 3149

 31443042 TTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCT 31443101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 TTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCT 3209

 31443102 TCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTG 31443161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 TCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTG 3269

 31443162 GCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 31443221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 GCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 3329

 31443222 GGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAA 31443281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 GGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAA 3389

 31443282 ACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGT 31443341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 ACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGT 3449

 31443342 CCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGG 31443368
          |||||||||||||||||||||||||||
     3450 CCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGG 3476

Alignment time is 2.70626 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    5230] =>      5230 nucs 'mol-32-1f58-089918_5230'

Score:        5219
Aligned:      5230        nucs
Identic:      5229 (100%) nucs =>      4181 (100%)      1048 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443359,31447539] EXCISED REGION [31447542,31448590]
 second seq =>  [       1,    4181] EXCISED REGION [    4182,    5230]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [31447540,31447541]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [31447540,31447558] to [31447542,31447560]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31447540,31447540] to [31447541,31447541]
 second seq =>         0 nucs

 31443359 CTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGC 31443418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGC 60

 31443419 CACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACA 31443478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACA 120

 31443479 GGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTA 31443538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTA 180

 31443539 AGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACC 31443598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACC 240

 31443599 CCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAAC 31443658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAAC 300

 31443659 ATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAG 31443718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAG 360

 31443719 AACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAA 31443778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAA 420

 31443779 AGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAG 31443838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAG 480

 31443839 GGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTG 31443898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTG 540

 31443899 CCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAA 31443958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAA 600

 31443959 GGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCA 31444018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCA 660

 31444019 AAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGG 31444078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGG 720

 31444079 ATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATAC 31444138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATAC 780

 31444139 CGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTA 31444198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTA 840

 31444199 TAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGAC 31444258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGAC 900

 31444259 TGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTC 31444318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTC 960

 31444319 CAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTG 31444378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTG 1020

 31444379 GAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTT 31444438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTT 1080

 31444439 ATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGC 31444498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGC 1140

 31444499 TATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGC 31444558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGC 1200

 31444559 CTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTC 31444618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTC 1260

 31444619 ATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTG 31444678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTG 1320

 31444679 GTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTT 31444738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTT 1380

 31444739 ATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGC 31444798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGC 1440

 31444799 ATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCC 31444858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCC 1500

 31444859 AGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTG 31444918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTG 1560

 31444919 AACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCC 31444978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCC 1620

 31444979 TGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAG 31445038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAG 1680

 31445039 TCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAG 31445098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAG 1740

 31445099 ACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTG 31445158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTG 1800

 31445159 TAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAG 31445218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAG 1860

 31445219 GCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACA 31445278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACA 1920

 31445279 AAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGC 31445338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGC 1980

 31445339 AGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTA 31445398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTA 2040

 31445399 CTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTT 31445458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTT 2100

 31445459 TATGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATG 31445518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TATGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATG 2160

 31445519 ACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCA 31445578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCA 2220

 31445579 GCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATT 31445638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATT 2280

 31445639 TTAAATATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTT 31445698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTAAATATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTT 2340

 31445699 CAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCT 31445758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCT 2400

 31445759 GAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCT 31445818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCT 2460

 31445819 AACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTC 31445878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTC 2520

 31445879 TGAATATATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGT 31445938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGAATATATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGT 2580

 31445939 AGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATA 31445998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATA 2640

 31445999 GAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAA 31446058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAA 2700

 31446059 CGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACAT 31446118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACAT 2760

 31446119 AAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAG 31446178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAG 2820

 31446179 CAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCA 31446238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCA 2880

 31446239 GGAGGGTATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACA 31446298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GGAGGGTATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACA 2940

 31446299 TTTTCTTGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTA 31446358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTTCTTGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTA 3000

 31446359 ATGTCCCACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAG 31446418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATGTCCCACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAG 3060

 31446419 AGGAGATGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGAC 31446478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGGAGATGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGAC 3120

 31446479 CTCTCTAGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGT 31446538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTCTCTAGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGT 3180

 31446539 CTGGAGAGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTT 31446598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTGGAGAGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTT 3240

 31446599 GGCACAGCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTA 31446658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGCACAGCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTA 3300

 31446659 GATGTCTAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGAC 31446718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GATGTCTAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGAC 3360

 31446719 TTAGAGAGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGT 31446778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTAGAGAGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGT 3420

 31446779 CGGCCCCATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGAC 31446838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CGGCCCCATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGAC 3480

 31446839 TCAGAGACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTT 31446898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCAGAGACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTT 3540

 31446899 GCTGAGCATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTT 31446958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GCTGAGCATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTT 3600

 31446959 ATTACATTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAA 31447018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATTACATTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAA 3660

 31447019 TTCTGCTCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCT 31447078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTCTGCTCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCT 3720

 31447079 TCTCATTTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTC 31447138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCTCATTTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTC 3780

 31447139 CCAGCTGTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGT 31447198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CCAGCTGTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGT 3840

 31447199 AGTCAGATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTC 31447258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGTCAGATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTC 3900

 31447259 ACAAATCTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACT 31447318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ACAAATCTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACT 3960

 31447319 GCCTGTTTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGG 31447378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GCCTGTTTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGG 4020

 31447379 CTTATGGCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGG 31447438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CTTATGGCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGG 4080

 31447439 CTTTCAAAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCT 31447498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTTTCAAAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCT 4140

 31447499 AAACTGTGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCC 31447539
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AAACTGTGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCC 4181

EXCISED REGION

 31447542 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAGATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTG 31447601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAGATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTG 4241

 31447602 GCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTT 31447661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4242 GCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTT 4301

 31447662 ATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATAAGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACG 31447721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 ATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATAAGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACG 4361

 31447722 TGCCACCATGCCCAACTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAG 31447781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 TGCCACCATGCCCAACTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAG 4421

 31447782 CCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTT 31447841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 CCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTT 4481

 31447842 TTATTTCTTTATAGCCTGGGCTTTCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCT 31447901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 TTATTTCTTTATAGCCTGGGCTTTCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCT 4541

 31447902 CTGCTTAGGGAAATGCAACCCTCCAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTT 31447961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 CTGCTTAGGGAAATGCAACCCTCCAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTT 4601

 31447962 TCCTAACTTCTGTTTCAATGTGACCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAG 31448021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 TCCTAACTTCTGTTTCAATGTGACCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAG 4661

 31448022 TGTTCTGGCTTTTACTACAAATATTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGT 31448081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 TGTTCTGGCTTTTACTACAAATATTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGT 4721

 31448082 CTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAAGTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCA 31448141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 CTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAAGTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCA 4781

 31448142 CCTGAATATAGTTACTTAATAGATATTTGGAGATTTTCTTGACTCGGAAACTAGGAGTCT 31448201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4782 CCTGAATATAGTTACTTAATAGATATTTGGAGATTTTCTTGACTCGGAAACTAGGAGTCT 4841

 31448202 TTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAATAGATAATCAACATTCCCCTACTGGGGAGAAACAAGGT 31448261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4842 TTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAATAGATAATCAACATTCCCCTACTGGGGAGAAACAAGGT 4901

 31448262 GGGAGAATGAATACAACCTATGCTCCCCTAGGAAGGTTTTAAGAATTTTATTTTGTGTTT 31448321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4902 GGGAGAATGAATACAACCTATGCTCCCCTAGGAAGGTTTTAAGAATTTTATTTTGTGTTT 4961

 31448322 CTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTGCATAAGAGATTAAGGAAATACACAGCTACTTTATAAGA 31448381
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4962 CTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTGCATAAGAGATTAAGGAAATACACCGCTACTTTATAAGA 5021

 31448382 GACTCCTTAAGAAAGAGATGGAGGCAGGACCAAGGAATGCACAAAGGATGGGGTATTTTG 31448441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5022 GACTCCTTAAGAAAGAGATGGAGGCAGGACCAAGGAATGCACAAAGGATGGGGTATTTTG 5081

 31448442 CCATAAAAAGTAACTGCAATACACTGAATGTGTCCCCCAAAATTCATGGTTTTAAAAAAT 31448501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5082 CCATAAAAAGTAACTGCAATACACTGAATGTGTCCCCCAAAATTCATGGTTTTAAAAAAT 5141

 31448502 TAAATAACTGCTTTTATTGAGATATAATTTGATGTTTTGATATGCATATGTATTGGGAAA 31448561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5142 TAAATAACTGCTTTTATTGAGATATAATTTGATGTTTTGATATGCATATGTATTGGGAAA 5201

 31448562 TGATTACTATAGTCAGGCTAATTAACATA 31448590
          |||||||||||||||||||||||||||||
     5202 TGATTACTATAGTCAGGCTAATTAACATA 5230

Alignment time is 4.01725 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    5598] =>      5598 nucs 'mol-32-1f58-131015_5598'

Score:        5551
Aligned:      5603        nucs
Identic:      5595 (100%) nucs =>      1001 (100%)      4594 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31442350,31443350] EXCISED REGION [31444865,31449464]
 second seq =>  [       1,    1001] EXCISED REGION [    1002,    5598]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31442350 ATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTC 31442409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTC 60

 31442410 ATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCT 31442469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCT 120

 31442470 TTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCC 31442529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCC 180

 31442530 CTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGAC 31442589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGAC 240

 31442590 AATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAG 31442649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAG 300

 31442650 TCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACG 31442709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACG 360

 31442710 ATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTG 31442769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTG 420

 31442770 GGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGC 31442829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGC 480

 31442830 TGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCT 31442889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCT 540

 31442890 GTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCC 31442949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCC 600

 31442950 GGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTG 31443009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTG 660

 31443010 TAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTG 31443069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTG 720

 31443070 GCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAG 31443129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAG 780

 31443130 GTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAG 31443189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAG 840

 31443190 TGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAG 31443249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAG 900

 31443250 GAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA 31443309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA 960

 31443310 AGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 31443350
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 1001

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 1061

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 1121

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 1181

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 1241

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 1301

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 1361

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 1421

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 1481

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 1541

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 1601

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 1661

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 1721

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 1781

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 1841

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 1901

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 1961

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 2021

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 31445944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2022 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 2081

 31445945 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 31446004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 2141

 31446005 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 31446064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 2201

 31446065 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 31446124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 2261

 31446125 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 31446184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 2321

 31446185 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 31446244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 2381

 31446245 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 31446304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 2441

 31446305 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 31446364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 2501

 31446365 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 31446424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 2561

 31446425 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 31446484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 2621

 31446485 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 31446544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 2681

 31446545 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 31446604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 2741

 31446605 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 31446664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 2801

 31446665 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 31446724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 2861

 31446725 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 31446784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 2921

 31446785 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 31446844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 2981

 31446845 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 31446904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 3041

 31446905 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 31446964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 3101

 31446965 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 31447024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 3161

 31447025 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 31447084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 3221

 31447085 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 31447144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 3281

 31447145 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 31447204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 3341

 31447205 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 31447264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 3401

 31447265 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 31447324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 3461

 31447325 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 31447384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 3521

 31447385 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 31447444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 3581

 31447445 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 31447504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 3641

 31447505 TGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAG 31447564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     3642 TGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAG 3700

 31447565 ATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAC 31447624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 ATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAC 3760

 31447625 CTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATA 31447684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 CTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATA 3820

 31447685 AGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTT 31447744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 AGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTT 3880

 31447745 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGA 31447804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGA 3940

 31447805 CCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTT 31447864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 CCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTT 4000

 31447865 TCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTC 31447924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 TCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTC 4060

 31447925 CAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGA 31447984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 CAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGA 4120

 31447985 CCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATA 31448044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 CCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATA 4180

 31448045 TTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAA 31448104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 TTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAA 4240

 31448105 GTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGTTACTTAATAGA 31448164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 GTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGTTACTTAATAGA 4300

 31448165 TATTTGGAGATTTTCTTGACTCGGAAACTAGGAGTCTTTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAAT 31448224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 TATTTGGAGATTTTCTTGACTCGGAAACTAGGAGTCTTTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAAT 4360

 31448225 AGATAATCAACATTCCCCTACTGGGGAGAAACAAGGTGGGAGAATGAATACAACCTATGC 31448284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 AGATAATCAACATTCCCCTACTGGGGAGAAACAAGGTGGGAGAATGAATACAACCTATGC 4420

 31448285 TCCCCTAGGAAGGTTTTAAGAATTTTATTTTGTGTTTCTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTGC 31448344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 TCCCCTAGGAAGGTTTTAAGAATTTTATTTTGTGTTTCTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTGC 4480

 31448345 ATAAGAGATTAAGGAAATACACAGCTACTTTATAAGAGACTCCTTAAGAAAGAGATGGAG 31448404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 ATAAGAGATTAAGGAAATACACAGCTACTTTATAAGAGACTCCTTAAGAAAGAGATGGAG 4540

 31448405 GCAGGACCAAGGAATGCACAAAGGATGGGGTATTTTGCCATAAAAAGTAACTGCAATACA 31448464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 GCAGGACCAAGGAATGCACAAAGGATGGGGTATTTTGCCATAAAAAGTAACTGCAATACA 4600

 31448465 CTGAATGTGTCCCCCAAAATTCATGGTTTTAAAAAATTAAATAACTGCTTTTATTGAGAT 31448524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 CTGAATGTGTCCCCCAAAATTCATGGTTTTAAAAAATTAAATAACTGCTTTTATTGAGAT 4660

 31448525 ATAATTTGATGTTTTGATATGCATATGTATTGGGAAATGATTACTATAGTCAGGCTAATT 31448584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 ATAATTTGATGTTTTGATATGCATATGTATTGGGAAATGATTACTATAGTCAGGCTAATT 4720

 31448585 AACATATCCATTACCTCACATAATTACCTTATTTTTGTAATGAGAACACTTAAGATTCAC 31448644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 AACATATCCATTACCTCACATAATTACCTTATTTTTGTAATGAGAACACTTAAGATTCAC 4780

 31448645 TGTCTTAGCAAATTTCGAGTATACAATGCAGCATTATTAGCTATAGTCACCATGATGTAC 31448704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 TGTCTTAGCAAATTTCGAGTATACAATGCAGCATTATTAGCTATAGTCACCATGATGTAC 4840

 31448705 ATTAGATTTCTAGAAGCTACTTCATCTCAAATAAATGAAAGTTTATACCTTTTGACTAAC 31448764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 ATTAGATTTCTAGAAGCTACTTCATCTCAAATAAATGAAAGTTTATACCTTTTGACTAAC 4900

 31448765 GTCTCCATTTCTCCCAGCTCTCAGCCCCTAGAAGCTGTAGAGATCCATGTTTTCGCAAAT 31448824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 GTCTCCATTTCTCCCAGCTCTCAGCCCCTAGAAGCTGTAGAGATCCATGTTTTCGCAAAT 4960

 31448825 GACAGGATTTAGAATTTCCTTCTTTTTTAAAGCTGAATAATATTCCAGTG--TGTGTGTG 31448882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||
     4961 GACAGGATTTAGAATTTCCTTCTTTTTTAAAGCTGAATAATATTCCAGTGTATGTGTGTG 5020

 31448883 TGTGTGTGTGTATCACACACACATGCATCTATGTATTATCTATCTATCCATCTATTCTAT 31448942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 TGTGTGTGTGTATCACACACACATGCATCTATGTATTATCTATCTATCCATCTATTCTAT 5080

 31448943 CTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTCTCTATCTAGCAATTTCTTTAT 31449002
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||
     5081 CTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTA----TCTATCTAGCAATTTCTTTAT 5136

 31449003 CCATTTACCTGTTGACAGACACAGATTGTTTCCACATCTTGGTTAGTGTGAATAATGCTG 31449062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 CCATTTACCTGTTGACAGACACAGATTGTTTCCACATCTTGGTTAGTGTGAATAATGCTG 5196

 31449063 CAATGAACATGGGAGTGTAGCTATCTCTTCAATATACTGATTTTATTTTCTATAACTTTG 31449122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 CAATGAACATGGGAGTGTAGCTATCTCTTCAATATACTGATTTTATTTTCTATAACTTTG 5256

 31449123 TAATATACTTTGGGATTGAGAAGTGTGATGCCTCCAGCTTCATTCTTTTTTTTCTCGAGA 31449182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5257 TAATATACTTTGGGATTGAGAAGTGTGATGCCTCCAGCTTCATTCTTTTTTTTCTCGAGA 5316

 31449183 CTGCTTTGGCTATTCAGGATCGCTTGTTGTTCCATACAAATTTTATGATTATATTTTCCA 31449242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5317 CTGCTTTGGCTATTCAGGATCGCTTGTTGTTCCATACAAATTTTATGATTATATTTTCCA 5376

 31449243 TTTCTGTGAAAATTACCACTAGAATTTTGATGGGCATTGTGTTGAATCTCTGGATAACTC 31449302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5377 TTTCTGTGAAAATTACCACTAGAATTTTGATGGGCATTGTGTTGAATCTCTGGATAACTC 5436

 31449303 TGGGTTGTATGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAGTCCACAAACACAGAATATCTT 31449362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5437 TGGGTTGTATGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAGTCCACAAACACAGAATATCTT 5496

 31449363 TCCATTTGTGTCTTCTTCAATTCCTTTCATCAATATCTTATAGTTTTCTATGTAATAGAT 31449422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5497 TCCATTTGTGTCTTCTTCAATTCCTTTCATCAATATCTTATAGTTTTCTATGTAATAGAT 5556

 31449423 CTTTCACCTCCTTGTTTAAATATACTTCTAAATACTTTATTA 31449464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5557 CTTTCACCTCCTTGTTTAAATATACTTCTAAATACTTTATTA 5598

Alignment time is 4.34824 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2259] =>      2259 nucs 'mol-32-206b-020348_2259'

Score:        2259
Aligned:      2259        nucs
Identic:      2259 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443361,31445619]
 second seq =>  [       1,    2259]

 31443361 GAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCA 31443420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCA 60

 31443421 CTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACAGG 31443480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACAGG 120

 31443481 AAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTAAG 31443540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTAAG 180

 31443541 AATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCC 31443600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCC 240

 31443601 CATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACAT 31443660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACAT 300

 31443661 GAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAA 31443720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAA 360

 31443721 CTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAG 31443780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAG 420

 31443781 GCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGG 31443840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGG 480

 31443841 CTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCC 31443900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCC 540

 31443901 TGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGG 31443960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGG 600

 31443961 AAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAA 31444020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAA 660

 31444021 AGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGAT 31444080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGAT 720

 31444081 GTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCG 31444140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCG 780

 31444141 GAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATA 31444200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATA 840

 31444201 GCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTG 31444260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTG 900

 31444261 TGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCA 31444320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCA 960

 31444321 GGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGA 31444380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGA 1020

 31444381 GATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTAT 31444440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTAT 1080

 31444441 TTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTA 31444500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTA 1140

 31444501 TTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCT 31444560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCT 1200

 31444561 GTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCAT 31444620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCAT 1260

 31444621 TTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGT 31444680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGT 1320

 31444681 CACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTAT 31444740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTAT 1380

 31444741 ACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCAT 31444800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCAT 1440

 31444801 AACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAG 31444860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAG 1500

 31444861 CACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAA 31444920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAA 1560

 31444921 CAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTG 31444980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTG 1620

 31444981 TGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTC 31445040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTC 1680

 31445041 TGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGAC 31445100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGAC 1740

 31445101 CCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTA 31445160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTA 1800

 31445161 GTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGC 31445220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGC 1860

 31445221 CAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAA 31445280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAA 1920

 31445281 AAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAG 31445340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAG 1980

 31445341 GAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACT 31445400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACT 2040

 31445401 CCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTA 31445460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTA 2100

 31445461 TGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGAC 31445520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGAC 2160

 31445521 TCTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGC 31445580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGC 2220

 31445581 CTTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCC 31445619
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCC 2259

Alignment time is 1.5416 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2067] =>      2067 nucs 'mol-32-220d-001142_2067'

Score:        2067
Aligned:      2067        nucs
Identic:      2067 (100%) nucs =>      1633 (100%)       434 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443476,31445108] EXCISED REGION [31445110,31445543]
 second seq =>  [       1,    1633] EXCISED REGION [    1634,    2067]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31445109,31445109]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31445109,31445123] to [31445110,31445124]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31443476 ACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAA 31443535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAA 60

 31443536 CTAAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCT 31443595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCT 120

 31443596 ACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTC 31443655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTC 180

 31443656 AACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAG 31443715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAG 240

 31443716 GAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTC 31443775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTC 300

 31443776 CAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGA 31443835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGA 360

 31443836 AAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCT 31443895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCT 420

 31443896 TTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGG 31443955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGG 480

 31443956 GAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGG 31444015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGG 540

 31444016 TCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTG 31444075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTG 600

 31444076 GGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACA 31444135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACA 660

 31444136 TACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATG 31444195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATG 720

 31444196 GTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATG 31444255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATG 780

 31444256 GACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAA 31444315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAA 840

 31444316 TTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAG 31444375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAG 900

 31444376 TTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAA 31444435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAA 960

 31444436 CTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATG 31444495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATG 1020

 31444496 TGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAA 31444555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAA 1080

 31444556 GGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTC 31444615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTC 1140

 31444616 CTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTT 31444675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTT 1200

 31444676 GTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAA 31444735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAA 1260

 31444736 CTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATT 31444795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATT 1320

 31444796 TGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGT 31444855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGT 1380

 31444856 CCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGC 31444915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGC 1440

 31444916 CTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATG 31444975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATG 1500

 31444976 GCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAG 31445035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAG 1560

 31445036 GAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGT 31445095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGT 1620

 31445096 GAGACCCTGTCTC 31445108
          |||||||||||||
     1621 GAGACCCTGTCTC 1633

EXCISED REGION

 31445110 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 31445169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 1693

 31445170 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 31445229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 1753

 31445230 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 31445289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 1813

 31445290 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 31445349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 1873

 31445350 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 31445409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 1933

 31445410 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 31445469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 1993

 31445470 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 31445529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 2053

 31445530 TCTGGACCACCTGG 31445543
          ||||||||||||||
     2054 TCTGGACCACCTGG 2067

Alignment time is 1.61716 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2143] =>      2143 nucs 'mol-32-22de-004813_2143'

Score:        2143
Aligned:      2143        nucs
Identic:      2143 (100%) nucs =>      1887 (100%)       256 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443222,31445108] EXCISED REGION [31445110,31445365]
 second seq =>  [       1,    1887] EXCISED REGION [    1888,    2143]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31445109,31445109]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31445109,31445123] to [31445110,31445124]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31443222 GGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAA 31443281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAA 60

 31443282 ACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGT 31443341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGT 120

 31443342 CCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCA 31443401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCA 180

 31443402 GTGAGCTGAGATCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAA 31443461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGAGCTGAGATCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAA 240

 31443462 AAAAAATAAAAAAGACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACC 31443521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAAATAAAAAAGACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACC 300

 31443522 ACTTCTCATAGGAACTAAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCA 31443581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTTCTCATAGGAACTAAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCA 360

 31443582 TTCATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGT 31443641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGT 420

 31443642 GGGGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCAC 31443701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCAC 480

 31443702 AGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTT 31443761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTT 540

 31443762 TCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGG 31443821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGG 600

 31443822 AATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTT 31443881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTT 660

 31443882 CTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTT 31443941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTT 720

 31443942 GATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTT 31444001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTT 780

 31444002 CTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAAC 31444061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAAC 840

 31444062 CATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCA 31444121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCA 900

 31444122 TCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACAC 31444181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACAC 960

 31444182 GCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTA 31444241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTA 1020

 31444242 GGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTT 31444301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTT 1080

 31444302 CTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATC 31444361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATC 1140

 31444362 CAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCC 31444421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCC 1200

 31444422 TGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATC 31444481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATC 1260

 31444482 AATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCA 31444541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCA 1320

 31444542 CCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTA 31444601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTA 1380

 31444602 TCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTA 31444661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTA 1440

 31444662 AGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTG 31444721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTG 1500

 31444722 TATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATG 31444781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATG 1560

 31444782 CAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGG 31444841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGG 1620

 31444842 CTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGG 31444901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGG 1680

 31444902 AATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATT 31444961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATT 1740

 31444962 AGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGA 31445021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGA 1800

 31445022 TCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGC 31445081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGC 1860

 31445082 CTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTC 31445108
          |||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTC 1887

EXCISED REGION

 31445110 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 31445169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 1947

 31445170 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 31445229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 2007

 31445230 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 31445289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 2067

 31445290 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 31445349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 2127

 31445350 TTGAACCCGGGAGGTG 31445365
          ||||||||||||||||
     2128 TTGAACCCGGGAGGTG 2143

Alignment time is 1.66573 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2143] =>      2143 nucs 'mol-32-2383-182655_2143'

Score:        2143
Aligned:      2143        nucs
Identic:      2143 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443351,31445493]
 second seq =>  [       1,    2143]

 31443351 TTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGA 31443410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGA 60

 31443411 GATCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAA 31443470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAA 120

 31443471 AAAAGACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCAT 31443530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAGACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCAT 180

 31443531 AGGAACTAAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGG 31443590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGAACTAAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGG 240

 31443591 GATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAA 31443650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAA 300

 31443651 ATTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCAT 31443710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCAT 360

 31443711 TCAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGA 31443770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGA 420

 31443771 TCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTA 31443830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTA 480

 31443831 TCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTAC 31443890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTAC 540

 31443891 GTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACT 31443950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACT 600

 31443951 GATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCAT 31444010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCAT 660

 31444011 TTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAAT 31444070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAAT 720

 31444071 AGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGC 31444130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGC 780

 31444131 AAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCT 31444190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCT 840

 31444191 ACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGG 31444250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGG 900

 31444251 GTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCC 31444310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCC 960

 31444311 AAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGC 31444370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGC 1020

 31444371 CTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAG 31444430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAG 1080

 31444431 AGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGC 31444490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGC 1140

 31444491 ACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAA 31444550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAA 1200

 31444551 CAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATG 31444610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATG 1260

 31444611 TCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCAT 31444670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCAT 1320

 31444671 TGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAA 31444730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAA 1380

 31444731 CAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAA 31444790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAA 1440

 31444791 GCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCT 31444850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCT 1500

 31444851 GTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGA 31444910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGA 1560

 31444911 TCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAG 31444970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAG 1620

 31444971 TAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAG 31445030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAG 1680

 31445031 CCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAAT 31445090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAAT 1740

 31445091 AGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAG 31445150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAG 1800

 31445151 GCCAGGTGTAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGAT 31445210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCAGGTGTAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGAT 1860

 31445211 TGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTA 31445270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTA 1920

 31445271 AAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAG 31445330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAG 1980

 31445331 GCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACG 31445390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACG 2040

 31445391 CCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTAT 31445450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTAT 2100

 31445451 TATAATTTTATGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAA 31445493
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TATAATTTTATGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAA 2143

Alignment time is 1.4624 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3560] =>      3560 nucs 'mol-32-23ba-041320_3560'

Score:        3559
Aligned:      3559        nucs
Identic:      3559 (100%) nucs =>      3296 (100%)       263 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443817,31447112] EXCISED REGION [31447114,31447376]
 second seq =>  [       1,    3296] EXCISED REGION [    3298,    3560]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31447113,31447113]
 second seq =>         1 nucs [3297,3297]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31447112,31447112] to [31447114,31447114]
 second seq =>         1 nucs [3296,3296] to [3298,3298]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31443817 AGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTT 31443876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTT 60

 31443877 CTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTC 31443936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTC 120

 31443937 TTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAA 31443996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAA 180

 31443997 AACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACC 31444056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACC 240

 31444057 TAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGA 31444116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGA 300

 31444117 TTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCC 31444176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCC 360

 31444177 TACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGT 31444236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGT 420

 31444237 CCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAG 31444296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAG 480

 31444297 TTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATT 31444356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATT 540

 31444357 GGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAA 31444416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAA 600

 31444417 ATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCA 31444476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCA 660

 31444477 TGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCA 31444536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCA 720

 31444537 GCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAG 31444596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAG 780

 31444597 AACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATT 31444656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATT 840

 31444657 GCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACC 31444716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACC 900

 31444717 CGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTG 31444776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTG 960

 31444777 GAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGT 31444836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGT 1020

 31444837 GATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGC 31444896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGC 1080

 31444897 CCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAA 31444956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAA 1140

 31444957 AAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGG 31445016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGG 1200

 31445017 GAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCT 31445076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCT 1260

 31445077 CCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAA 31445136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAA 1320

 31445137 CTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAAC 31445196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAAC 1380

 31445197 CAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAA 31445256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAA 1440

 31445257 CCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCC 31445316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCC 1500

 31445317 CAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGT 31445376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGT 1560

 31445377 GAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAA 31445436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAA 1620

 31445437 AAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTG 31445496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTG 1680

 31445497 CAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAG 31445556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAG 1740

 31445557 AGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAG 31445616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAG 1800

 31445617 TCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTG 31445676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTG 1860

 31445677 GTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACT 31445736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACT 1920

 31445737 GTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTAT 31445796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTAT 1980

 31445797 TTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAAC 31445856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAAC 2040

 31445857 TGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGG 31445916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGG 2100

 31445917 GAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCC 31445976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCC 2160

 31445977 TTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTT 31446036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTT 2220

 31446037 TTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGT 31446096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGT 2280

 31446097 AAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAA 31446156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAA 2340

 31446157 ATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAAC 31446216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAAC 2400

 31446217 AATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAG 31446276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAG 2460

 31446277 CTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTC 31446336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTC 2520

 31446337 GATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCT 31446396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCT 2580

 31446397 CCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCT 31446456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCT 2640

 31446457 CTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTC 31446516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTC 2700

 31446517 AAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACA 31446576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACA 2760

 31446577 CACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTG 31446636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTG 2820

 31446637 TTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCT 31446696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCT 2880

 31446697 CGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGG 31446756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGG 2940

 31446757 GGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGT 31446816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGT 3000

 31446817 GACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTG 31446876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTG 3060

 31446877 GCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACA 31446936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACA 3120

 31446937 TCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCT 31446996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCT 3180

 31446997 CCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTA 31447056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTA 3240

 31447057 CCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCC 31447112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCC 3296

EXCISED REGION

 31447114 CTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTC 31447173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTC 3357

 31447174 CAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCA 31447233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 CAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCA 3417

 31447234 ATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTT 31447293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 ATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTT 3477

 31447294 CTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATA 31447353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 CTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATA 3537

 31447354 GCCACATCCATTTGTTTACGTAT 31447376
          |||||||||||||||||||||||
     3538 GCCACATCCATTTGTTTACGTAT 3560

Alignment time is 2.76847 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    6592] =>      6592 nucs 'mol-32-288a-025820_6592'

Score:        6548
Aligned:      6592        nucs
Identic:      6588 (100%) nucs =>      5068 (100%)      1520 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31438280,31443350] EXCISED REGION [31444865,31446385]
 second seq =>  [       1,    5071] EXCISED REGION [    5072,    6592]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31438280 GTGTGGGCCATAAAATAAACCGAGAGTTTGCCTTTTGGGAGCGTAGAAACATGTCACGAG 31438339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTGGGCCATAAAATAAACCGAGAGTTTGCCTTTTGGGAGCGTAGAAACATGTCACGAG 60

 31438340 TTCTAACACTTCCACACTCATAGAACTAAAGCCTCCCAAGTAGGAAAAAACTCCACTTCC 31438399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTAACACTTCCACACTCATAGAACTAAAGCCTCCCAAGTAGGAAAAAACTCCACTTCC 120

 31438400 AGAGGGTACTTAACTCTCTATTCGGACCAAGCTATTACTTGAAGCTTCTCCCTTTTATTT 31438459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAGGGTACTTAACTCTCTATTCGGACCAAGCTATTACTTGAAGCTTCTCCCTTTTATTT 180

 31438460 CAGAAACTTCTTGCATTTATTTGATTTAGTTCTAAAGACGTGAAGTGTTATGGAATAAAT 31438519
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGAAACTTCTTGCATTTATTTGATTTGGTTCTAAAGACGTGAAGTGTTATGGAATAAAT 240

 31438520 TTGCTTACGGTGATGGATGGGCATTTTCACAACCCAGGGCCTTGCTTCTAAAGCATTTTT 31438579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGCTTACGGTGATGGATGGGCATTTTCACAACCCAGGGCCTTGCTTCTAAAGCATTTTT 300

 31438580 ATGACCACTTGATATCACCAAACAGTGAAACAGCATAGGACACCAATCAATGAGGTGCAT 31438639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGACCACTTGATATCACCAAACAGTGAAACAGCATAGGACACCAATCAATGAGGTGCAT 360

 31438640 ATTCTTCTCAGGTGGCAGAGAGATTAGGTGGCCTGTTTAAAAGTGCCCAACAGGCTGGAT 31438699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCTTCTCAGGTGGCAGAGAGATTAGGTGGCCTGTTTAAAAGTGCCCAACAGGCTGGAT 420

 31438700 GCGGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACCAGAGGTCAGGAGCTTG 31438759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCGGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACCAGAGGTCAGGAGCTTG 480

 31438760 AGACCAGCCTGACCAACATGGCAAAACCCTGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 31438819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGACCAGCCTGACCAACATGGCAAAACCCTGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 540

 31438820 GTGTGGTGGCAGCTGCCTATAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCATGAGAATCGCTT 31438879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGTGGTGGCAGCTGCCTATAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCATGAGAATCGCTT 600

 31438880 GAACCCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGC 31438939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAACCCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGC 660

 31438940 AAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAACCAAAAATAAACCTGCTCAGC 31438999
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGCCTGGGCAACAGAGCGTGACTCCATCTCAAAAAAAACCAAAAATAAACCTGCTCAGC 720

 31439000 AAACCAGTGACAGGCAAATTGAGATGCCATTGGGCCACACTCCTTCACACAGAGGTCAAA 31439059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAACCAGTGACAGGCAAATTGAGATGCCATTGGGCCACACTCCTTCACACAGAGGTCAAA 780

 31439060 GGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCATAGGTCTTTAATTAGAAACAGAGGAAGTCAGGAT 31439119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCATAGGTCTTTAATTAGAAACAGAGGAAGTCAGGAT 840

 31439120 TTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAAACTTTACCAGCTAAATTGAAGAATCCCTGTTAC 31439179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAAACTTTACCAGCTAAATTGAAGAATCCCTGTTAC 900

 31439180 TAAAAGTCTGTGTCATTGCACTTCGGGAGGGCGGGCCCAGTGGCACACATGTGTGACGTG 31439239
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAAAGTCTGTGTCATTGCACTTTGGGAGGGCGGGCCCAGTGGCACACATGTGTGACGTG 960

 31439240 GCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGAAGAGTAGGAGCTACTGGAGAACCATGATGCATGACG 31439299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGAAGAGTAGGAGCTACTGGAGAACCATGATGCATGACG 1020

 31439300 CAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCCATGTCTTTCTCAGCCGTCCTGGGAGCTTTCAGG 31439359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCCATGTCTTTCTCAGCCGTCCTGGGAGCTTTCAGG 1080

 31439360 ATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCTCCTAAGGCAAAAAATTTATACCACTTTTTTTTT 31439419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCTCCTAAGGCAAAAAATTTATACCACTTTTTTTTT 1140

 31439420 TCCCAATCCAGATGCAAAACCAAAAACTCAAATCCAACTGTTCTCAGTCAAGTGAAAGCA 31439479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCCCAATCCAGATGCAAAACCAAAAACTCAAATCCAACTGTTCTCAGTCAAGTGAAAGCA 1200

 31439480 TTCCAAGACCTCAGAAATGCTCACTCACCAAAGACCATTTTCCTGACTTGTAATTTGGTC 31439539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCCAAGACCTCAGAAATGCTCACTCACCAAAGACCATTTTCCTGACTTGTAATTTGGTC 1260

 31439540 AGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCCGGGTGGTCCAGTTTCCTCTGGGAACTCCGTAGG 31439599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCCGGGTGGTCCAGTTTCCTCTGGGAACTCCGTAGG 1320

 31439600 TTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCTTGCCTAGGAGTTCCAGGGCAACTGAACT 31439659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCTTGCCTAGGAGTTCCAGGGCAACTGAACT 1380

 31439660 TGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTGCAGAAGGTCGTTTGGAAAACCTAATTAG 31439719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTGCAGAAGGTCGTTTGGAAAACCTAATTAG 1440

 31439720 AGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTTGGCCCTGGCAGGCCTGTGTGGAGGTGGA 31439779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTTGGCCCTGGCAGGCCTGTGTGGAGGTGGA 1500

 31439780 GGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGCCTTAGAAAGATGCTGGACTTAAAATTTC 31439839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGCCTTAGAAAGATGCTGGACTTAAAATTTC 1560

 31439840 AAACCATTTCATAATGATTTATACATTTTTTAATAAGTGCCATTAGATCTCCTTCCACCT 31439899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAACCATTTCATAATGATTTATACATTTTTTAATAAGTGCCATTAGATCTCCTTCCACCT 1620

 31439900 TTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTTG 31439959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTTG 1680

 31439960 TTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGAA 31440019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGAA 1740

 31440020 GTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTGA 31440079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTGA 1800

 31440080 GCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGAA 31440139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGAA 1860

 31440140 CAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAGT 31440199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAGT 1920

 31440200 TAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCACT 31440259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCACT 1980

 31440260 AACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAG 31440319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAG 2040

 31440320 AAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTGA 31440379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTGA 2100

 31440380 GAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCTC 31440439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCTC 2160

 31440440 TGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCCC 31440499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCCC 2220

 31440500 CTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCCT 31440559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCCT 2280

 31440560 GGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCCT 31440619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCCT 2340

 31440620 TTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAAC 31440679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAAC 2400

 31440680 TATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGTT 31440739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGTT 2460

 31440740 GGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATTC 31440799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATTC 2520

 31440800 TCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAAT 31440859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAAT 2580

 31440860 TTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCCG 31440919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCCG 2640

 31440920 ACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCAC 31440979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCAC 2700

 31440980 TGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCATA 31441039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCATA 2760

 31441040 TATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGTG 31441099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGTG 2820

 31441100 AACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGTG 31441159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGTG 2880

 31441160 GAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCCA 31441219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCCA 2940

 31441220 GGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGAG 31441279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGAG 3000

 31441280 AAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAAT 31441339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAAT 3060

 31441340 GTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTAT 31441399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTAT 3120

 31441400 GTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGTG 31441459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGTG 3180

 31441460 TGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGTG 31441519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGTG 3240

 31441520 ACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGACA 31441579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGACA 3300

 31441580 GCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACCT 31441639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACCT 3360

 31441640 TGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCATT 31441699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCATT 3420

 31441700 GACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTTG 31441759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTTG 3480

 31441760 CCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTCT 31441819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTCT 3540

 31441820 GACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTCA 31441879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTCA 3600

 31441880 CCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAGC 31441939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAGC 3660

 31441940 TGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCAT 31441999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCAT 3720

 31442000 GCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGTA 31442059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGTA 3780

 31442060 GGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTTC 31442119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTTC 3840

 31442120 CAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCTT 31442179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCTT 3900

 31442180 TTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCA 31442239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCA 3960

 31442240 GGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCAT 31442299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCAT 4020

 31442300 ATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATT 31442359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATT 4080

 31442360 CTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATT 31442419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATT 4140

 31442420 TCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAG 31442479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAG 4200

 31442480 TTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGA 31442539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGA 4260

 31442540 AGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCC 31442599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCC 4320

 31442600 ACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTG 31442659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTG 4380

 31442660 GGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGC 31442719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGC 4440

 31442720 TTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTT 31442779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTT 4500

 31442780 TGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTC 31442839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTC 4560

 31442840 GTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCA 31442899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCA 4620

 31442900 AGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGT 31442959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGT 4680

 31442960 CTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAG 31443019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAG 4740

 31443020 AGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATAT 31443079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATAT 4800

 31443080 CTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGA 31443139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGA 4860

 31443140 CCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGC 31443199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGC 4920

 31443200 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGA 31443259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGA 4980

 31443260 CCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGG 31443319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGG 5040

 31443320 CGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 31443350
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 5071

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5072 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 5131

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5132 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 5191

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5192 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 5251

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5252 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 5311

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5312 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 5371

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5372 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 5431

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5432 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 5491

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5492 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 5551

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5552 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 5611

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5612 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 5671

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5672 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 5731

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5732 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 5791

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5792 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 5851

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5852 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 5911

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5912 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 5971

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5972 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 6031

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6032 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 6091

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 31445944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     6092 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 6151

 31445945 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 31446004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6152 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 6211

 31446005 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 31446064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6212 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 6271

 31446065 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 31446124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6272 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 6331

 31446125 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 31446184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6332 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 6391

 31446185 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 31446244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6392 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 6451

 31446245 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 31446304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6452 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 6511

 31446305 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 31446364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6512 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 6571

 31446365 CACTGAGTCACAGTCTCCTCC 31446385
          |||||||||||||||||||||
     6572 CACTGAGTCACAGTCTCCTCC 6592

Alignment time is 5.03453 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2499] =>      2499 nucs 'mol-32-288a-063018_2499'

Score:        2499
Aligned:      2499        nucs
Identic:      2499 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31440970,31443468]
 second seq =>  [       1,    2499]

 31440970 CGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCT 31441029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCT 60

 31441030 TACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCAC 31441089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCAC 120

 31441090 CTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAG 31441149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAG 180

 31441150 ATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTT 31441209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTT 240

 31441210 GGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAG 31441269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAG 300

 31441270 CAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTAT 31441329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTAT 360

 31441330 TTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTA 31441389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTA 420

 31441390 ATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTC 31441449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTC 480

 31441450 TGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCC 31441509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCC 540

 31441510 TGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACT 31441569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACT 600

 31441570 TTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCA 31441629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCA 660

 31441630 GCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTT 31441689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTT 720

 31441690 TAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCC 31441749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCC 780

 31441750 TGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTT 31441809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTT 840

 31441810 GGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGG 31441869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGG 900

 31441870 ATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAG 31441929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAG 960

 31441930 CCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGA 31441989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGA 1020

 31441990 AGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCA 31442049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCA 1080

 31442050 TCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGT 31442109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGT 1140

 31442110 ACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACA 31442169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACA 1200

 31442170 CAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGA 31442229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGA 1260

 31442230 TGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGA 31442289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGA 1320

 31442290 TGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGA 31442349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGA 1380

 31442350 ATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTC 31442409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTC 1440

 31442410 ATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCT 31442469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCT 1500

 31442470 TTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCC 31442529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCC 1560

 31442530 CTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGAC 31442589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGAC 1620

 31442590 AATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAG 31442649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAG 1680

 31442650 TCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACG 31442709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACG 1740

 31442710 ATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTG 31442769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTG 1800

 31442770 GGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGC 31442829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGC 1860

 31442830 TGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCT 31442889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCT 1920

 31442890 GTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCC 31442949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCC 1980

 31442950 GGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTG 31443009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTG 2040

 31443010 TAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTG 31443069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTG 2100

 31443070 GCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAG 31443129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAG 2160

 31443130 GTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAG 31443189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAG 2220

 31443190 TGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAG 31443249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAG 2280

 31443250 GAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA 31443309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA 2340

 31443310 AGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGA 31443369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGA 2400

 31443370 GAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCACTGCACTCC 31443429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCACTGCACTCC 2460

 31443430 AACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAT 31443468
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAT 2499

Alignment time is 1.70589 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2166] =>      2166 nucs 'mol-32-29b3-036835_2166'

Score:        2155
Aligned:      2166        nucs
Identic:      2165 (100%) nucs =>      1055 (100%)      1110 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31444054,31445108] EXCISED REGION [31445110,31446220]
 second seq =>  [       1,    1055] EXCISED REGION [    1056,    2166]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31445109,31445109]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31446207,31446207]
 second seq =>         1 nucs [2153,2153]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31445109,31445123] to [31445110,31445124]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31444054 ACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGG 31444113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGG 60

 31444114 TGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACT 31444173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACT 120

 31444174 TCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAG 31444233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAG 180

 31444234 GGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTT 31444293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTT 240

 31444294 AAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCC 31444353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCC 300

 31444354 ATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACT 31444413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACT 360

 31444414 AAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAA 31444473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAA 420

 31444474 GCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGAC 31444533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGAC 480

 31444534 TCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTT 31444593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTT 540

 31444594 GAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCC 31444653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCC 600

 31444654 ATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTG 31444713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTG 660

 31444714 ACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAA 31444773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAA 720

 31444774 TTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGG 31444833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGG 780

 31444834 TGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTG 31444893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTG 840

 31444894 AGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATA 31444953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATA 900

 31444954 CAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAG 31445013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAG 960

 31445014 TGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGT 31445073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGT 1020

 31445074 GCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTC 31445108
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTC 1055

EXCISED REGION

 31445110 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 31445169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 1115

 31445170 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 31445229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 1175

 31445230 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 31445289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 1235

 31445290 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 31445349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 1295

 31445350 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 31445409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 1355

 31445410 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 31445469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 1415

 31445470 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 31445529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 1475

 31445530 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 31445589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 1535

 31445590 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 31445649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 1595

 31445650 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 31445709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 1655

 31445710 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 31445769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 1715

 31445770 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 31445829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 1775

 31445830 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 31445889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 1835

 31445890 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 31445949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 1895

 31445950 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 31446009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 1955

 31446010 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 31446069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 2015

 31446070 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 31446129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 2075

 31446130 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 31446189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 2135

 31446190 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATC 31446220
          |||||||||||||||||.|||||||||||||
     2136 TTTGCTATAGGACACAGACAAAAAAACAATC 2166

Alignment time is 1.68465 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    9409] =>      9409 nucs 'mol-32-29c9-002654_9409'

Score:        9307
Aligned:      9412        nucs
Identic:      9400 (100%) nucs =>      9098 (100%)       302 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31434243,31443350] EXCISED REGION [31444865,31445166]
 second seq =>  [       1,    9107] EXCISED REGION [    9108,    9409]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31434243 GAGCTGTTTTTCACATGTTTGTTGACTGGCCCTGCTTTACCTCATGCAAAGGCCATCACC 31434302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGCTGTTTTTCACATGTTTGTTGACTGGCCCTGCTTTACCTCATGCAAAGGCCATCACC 60

 31434303 AGCTTGTGAATTCTGGTTCTTTTTTTAAAAATGTCTATTGTCAAGTCTATGATTTCAGAT 31434362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCTTGTGAATTCTGGTTCTTTTTTTAAAAATGTCTATTGTCAAGTCTATGATTTCAGAT 120

 31434363 ATGATATTCTGCCTGCACATGGCCCATATTGGTGACAAATCAGAGAAGGTATTTTCATGT 31434422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGATATTCTGCCTGCACATGGCCCATATTGGTGACAAATCAGAGAAGGTATTTTCATGT 180

 31434423 ATAGCATTTGGCCCAACCAACCCAGGTTTAGGTACCATCAGTCTCTTGAATGTATAAACA 31434482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAGCATTTGGCCCAACCAACCCAGGTTTAGGTACCATCAGTCTCTTGAATGTATAAACA 240

 31434483 GACTGAATTCATAAACTCCTACTGAAACTAACATGCTTTGTAAGTAGAAAACAAAATCAG 31434542
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACTGAATTCATAAACCCCTACTGAAACTAACATGCTTTGTAAGTAGAAAACAAAATCAG 300

 31434543 GATCATGAATTGGCTGGTTTTATTTTTTCTAGTGGCTATTTGCTGATTCTTGGCCTTAAA 31434602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATCATGAATTGGCTGGTTTTATTTTTTCTAGTGGCTATTTGCTGATTCTTGGCCTTAAA 360

 31434603 TGATAACATCTTTTTTTTGCATGTCATTTGATCATTCATTCGTTCAGCTTTCACCAAACA 31434662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATAACATCTTTTTTTTGCATGTCATTTGATCATTCATTCGTTCAGCTTTCACCAAACA 420

 31434663 CTTGTTATGTGGGATTTCCTGTGACGCTTTACAAGCTGGCCCCAAACTGTGCCTCCAGCC 31434722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTGTTATGTGGGATTTCCTGTGACGCTTTACAAGCTGGCCCCAAACTGTGCCTCCAGCC 480

 31434723 TGGTCTCCCACACATCCCTGTCATGTCCCTGCACCCACCTAGCACATTTAATCTCTGGCA 31434782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGTCTCCCACACATCCCTGTCATGTCCCTGCACCCACCTAGCACATTTAATCTCTGGCA 540

 31434783 CACCTGCAGTATACGGATGAATAAGACATGGTCCCTGTCCCTCAACTTCTTGCAGTCTGG 31434842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACCTGCAGTATACGGATGAATAAGACATGGTCCCTGTCCCTCAACTTCTTGCAGTCTGG 600

 31434843 AGACAGTAACAGCCAGGCATCGGTCTTTTTGAGATAATAAAGCGTATGGTGACATTTGAC 31434902
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      601 AGACAGTAACAGCCAGGCATCGGTCTTTTTGAGATAATAAAACGTATGGTGACATTTGAC 660

 31434903 CTAGGTCTTGAAGGACACAGAGCAGGTAAGCGACAGGTGTAAAGCCCTGAGTTGGTGAGC 31434962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTAGGTCTTGAAGGACACAGAGCAGGTAAGCGACAGGTGTAAAGCCCTGAGTTGGTGAGC 720

 31434963 GGGGAGGTCAGGGAGATCAAGGAGGGAGTGCCTGCCTCATGGGGACTAACTGGCAAGAAG 31435022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGGAGGTCAGGGAGATCAAGGAGGGAGTGCCTGCCTCATGGGGACTAACTGGCAAGAAG 780

 31435023 TGGGGCTGGAGAGACAGCTCCCCGCCCAGGCCTGCCTAAGTGCTCTGTGATCAGCTGTTA 31435082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGGGCTGGAGAGACAGCTCCCCGCCCAGGCCTGCCTAAGTGCTCTGTGATCAGCTGTTA 840

 31435083 GAGGTCCTAGTTACTGCCTGTGACATTCCTGCCATGCTGCCTCTTCAATGTGCCCAGATT 31435142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGGTCCTAGTTACTGCCTGTGACATTCCTGCCATGCTGCCTCTTCAATGTGCCCAGATT 900

 31435143 CCCAGGTCACGCTCCTTCAGCCACCTTTCATGACTTGCTGCTAAGGTGGAAGGGAAAACC 31435202
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCCAGGTCACACTCCTTCAGCCACCTTTCATGACTTGCTGCTAAGGTGGAAGGGAAAACC 960

 31435203 CAGAACTTTGTTCTTGGGGGGTAGCGAGGGAGTTGCCAAAGGCTGTTTATTTGTCTTCCT 31435262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGAACTTTGTTCTTGGGGGGTAGCGAGGGAGTTGCCAAAGGCTGTTTATTTGTCTTCCT 1020

 31435263 TTTGACTTTCAATCAAACCACATGTAACTGCTCCCTGGATCCCTGCTCAGGTGTGCAGCA 31435322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGACTTTCAATCAAACCACATGTAACTGCTCCCTGGATCCCTGCTCAGGTGTGCAGCA 1080

 31435323 GACCTTGCTGTGCACGAGTCTCATGCCTGGCGTGGACTAGCCTCGCCAGAGACTCCTGTC 31435382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GACCTTGCTGTGCACGAGTCTCATGCCTGGCGTGGACTAGCCTCGCCAGAGACTCCTGTC 1140

 31435383 TGAGCCCTCAAAAAAGTCTGCAGCACACGTCTAAAAATAGGTAAGCGAAGAAGCCCAGAC 31435442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAGCCCTCAAAAAAGTCTGCAGCACACGTCTAAAAATAGGTAAGCGAAGAAGCCCAGAC 1200

 31435443 TCAGGGAGAAATGCTCTTACCAGGCCCCAGAAAAGCCAGCTGTATCAAGTTCAGGCCTCT 31435502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCAGGGAGAAATGCTCTTACCAGGCCCCAGAAAAGCCAGCTGTATCAAGTTCAGGCCTCT 1260

 31435503 TCCCCGCCAAGCCACAGGGTCGTGAGAGACTTCCCATCTTGGCTTTCGGAGTTGGGAAAG 31435562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCCCCGCCAAGCCACAGGGTCGTGAGAGACTTCCCATCTTGGCTTTCGGAGTTGGGAAAG 1320

 31435563 GAGGGGAGGAAGTGGAGAGGCAGGATGTGGTGGAGGGGCTGCGTGCTGCCTGCAGGGCTG 31435622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGGGGAGGAAGTGGAGAGGCAGGATGTGGTGGAGGGGCTGCGTGCTGCCTGCAGGGCTG 1380

 31435623 GAGTCTCAAAGCAGGAATCCTCCGAAGGACGTTTTGAACAGCCGGTTAGGCGCACATGCG 31435682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGTCTCAAAGCAGGAATCCTCCGAAGGACGTTTTGAACAGCCGGTTAGGCGCACATGCG 1440

 31435683 CGTACACACACGCACACACACACACACACACACGCACGCACGCACGCGCACGTGCAGAGC 31435742
          |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CGTACACACAC--ACACACACACACACACACACGCACGCACGCACGCGCACGTGCAGAGC 1498

 31435743 CCCCAAACAGCCTATTGGCTTTGGTTTCCTTCAGTGAAATCTGGGATCAAGAATAATCTC 31435802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 CCCCAAACAGCCTATTGGCTTTGGTTTCCTTCAGTGAAATCTGGGATCAAGAATAATCTC 1558

 31435803 ATCTGGGGTGGCCAGCCACTCTGGACTCACGGTTTCCAGGGTCTTCTGAGTATATACAAC 31435862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 ATCTGGGGTGGCCAGCCACTCTGGACTCACGGTTTCCAGGGTCTTCTGAGTATATACAAC 1618

 31435863 CATCCTCCAGACTGCAAAAAACACGATATTTACTCTGACAAAGCCACAAGAGCCCCAGGT 31435922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 CATCCTCCAGACTGCAAAAAACACGATATTTACTCTGACAAAGCCACAAGAGCCCCAGGT 1678

 31435923 TTATGTCCATGAAAGATCAGACAGAATCCAGAGCAGCGACTCATCAGTGGTGACTGACAA 31435982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TTATGTCCATGAAAGATCAGACAGAATCCAGAGCAGCGACTCATCAGTGGTGACTGACAA 1738

 31435983 CCTGATGTGCAACTAATGTGTGAGTCCCTTTTCTGACCCTTCTGTGTCAGTATGTCTTTC 31436042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 CCTGATGTGCAACTAATGTGTGAGTCCCTTTTCTGACCCTTCTGTGTCAGTATGTCTTTC 1798

 31436043 CTCTGCCCTTCCATCTGTTTAGTGGGTCCACTGTGGGGTGAGACAGTTTTGTTGCAGGGG 31436102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CTCTGCCCTTCCATCTGTTTAGTGGGTCCACTGTGGGGTGAGACAGTTTTGTTGCAGGGG 1858

 31436103 ACTTGGGTCCAGCTGGCTGGAATTATCATAGGTTTCATTCCTGATTTGGTGTGTTCTAGG 31436162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 ACTTGGGTCCAGCTGGCTGGAATTATCATAGGTTTCATTCCTGATTTGGTGTGTTCTAGG 1918

 31436163 ATGGAAAAGACACTTCCTCTTTGCTTCTGACCTCTTTCCAGAACAAATAAAAACACACAC 31436222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ATGGAAAAGACACTTCCTCTTTGCTTCTGACCTCTTTCCAGAACAAATAAAAACACACAC 1978

 31436223 CAAAAAGCCACTCCCGGGAAGATGAAACAACATAGTCACCCCTGGATCCCCAGGGGCAAC 31436282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CAAAAAGCCACTCCCGGGAAGATGAAACAACATAGTCACCCCTGGATCCCCAGGGGCAAC 2038

 31436283 TTCAGAGGGCTTCCATTAGCAGGGTGGATGAGCTATTTTCCCAGGATATTAAATGTGAGA 31436342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TTCAGAGGGCTTCCATTAGCAGGGTGGATGAGCTATTTTCCCAGGATATTAAATGTGAGA 2098

 31436343 AGCTTTGAGCATGTATCTGGTGAGTCACACCAGTGTTTTAGAGTCTGACAAGGATCGTTA 31436402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 AGCTTTGAGCATGTATCTGGTGAGTCACACCAGTGTTTTAGAGTCTGACAAGGATCGTTA 2158

 31436403 CTGAAATACATAATGCAACCATCATCAGCATATGGGGACTCATACATTGTAGAGATACTG 31436462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CTGAAATACATAATGCAACCATCATCAGCATATGGGGACTCATACATTGTAGAGATACTG 2218

 31436463 ATCTGCTCTACCCTTTTAAGTCTTCATGCAACTAAAGGGGAAGATCCCCTCAAATAGGTT 31436522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 ATCTGCTCTACCCTTTTAAGTCTTCATGCAACTAAAGGGGAAGATCCCCTCAAATAGGTT 2278

 31436523 GTTCTCTTTCCTAACCCTAAGAAGAGTCTTTCTTTAAAATAAGTTCTCCTGTATGACTGT 31436582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GTTCTCTTTCCTAACCCTAAGAAGAGTCTTTCTTTAAAATAAGTTCTCCTGTATGACTGT 2338

 31436583 AAGATAGGATTGATGGGAAAGGAAGGGACAAGGAATTAGTATTTTCTGAGTGACTACTGG 31436642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AAGATAGGATTGATGGGAAAGGAAGGGACAAGGAATTAGTATTTTCTGAGTGACTACTGG 2398

 31436643 ATTCCAGCTCATGAATGGCCAGGGAAATGGCATTCTCACCTGAGCAGGGCTCCTCCATTA 31436702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ATTCCAGCTCATGAATGGCCAGGGAAATGGCATTCTCACCTGAGCAGGGCTCCTCCATTA 2458

 31436703 GACTAGTGTAGGAAGCCCAAGGGGAGGATGGCACATGGTTAGGACTCGCCCAGGGACCAG 31436762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GACTAGTGTAGGAAGCCCAAGGGGAGGATGGCACATGGTTAGGACTCGCCCAGGGACCAG 2518

 31436763 GCACAGTGGCTCAGGTCTGTAATCATAACAACTTTGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATTATA 31436822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 GCACAGTGGCTCAGGTCTGTAATCATAACAACTTTGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATTATA 2578

 31436823 TGAGCCTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTGCTTCTACAAAAAA 31436882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TGAGCCTAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTGCTTCTACAAAAAA 2638

 31436883 TAGAAACTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCGTTACTTGTGGGGCTGAAGT 31436942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TAGAAACTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCGTTACTTGTGGGGCTGAAGT 2698

 31436943 GGAAGGATCATTTGAGCCCAGGAGGTAGAGACTGCAGTGAGCAGTGATAACACCATTGTG 31437002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GGAAGGATCATTTGAGCCCAGGAGGTAGAGACTGCAGTGAGCAGTGATAACACCATTGTG 2758

 31437003 CTCCAGCTTGGGTGACAGAGTGAGATCCTGTTTCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAGCTCGGG 31437062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 CTCCAGCTTGGGTGACAGAGTGAGATCCTGTTTCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAGCTCGGG 2818

 31437063 GTAGTGGTAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCAGAAGGATC 31437122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GTAGTGGTAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCAGAAGGATC 2878

 31437123 ACTTGAGTTCAGGAGTTCAGGAGACCAGCCTGGGCATCATGGTGAGACCTCATCTCTAAA 31437182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 ACTTGAGTTCAGGAGTTCAGGAGACCAGCCTGGGCATCATGGTGAGACCTCATCTCTAAA 2938

 31437183 AAAAAAAAAAAG--AAAAAAAAAAAAAAAGACAAGCCTAAAGTCACACCGCCCAGTTCAT 31437240
          |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 AAAAAAAAAAA-AAAAAAAAAAAAAAAAAGACAAGCCTAAAGTCACACCGCCCAGTTCAT 2997

 31437241 ATTCTAATTCTGTCACCTACAAGCAATGTGGCTTTGGGAAAATTGTTTAATCTCTTTGCA 31437300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 ATTCTAATTCTGTCACCTACAAGCAATGTGGCTTTGGGAAAATTGTTTAATCTCTTTGCA 3057

 31437301 ACTCAATGTCCTCACTAAAATGGGAGAATTGAATGGAGATTTCTCAAAACTAAAAATAGG 31437360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 ACTCAATGTCCTCACTAAAATGGGAGAATTGAATGGAGATTTCTCAAAACTAAAAATAGG 3117

 31437361 ACTACCATTCAATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCTACCAAGAGGAAAAGAAATCAAT 31437420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 ACTACCATTCAATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCTACCAAGAGGAAAAGAAATCAAT 3177

 31437421 ATAACAAATAAATACCTGCACTTGCATGTTTATTGCAGCACTATTCAATACCACAAAGAC 31437480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 ATAACAAATAAATACCTGCACTTGCATGTTTATTGCAGCACTATTCAATACCACAAAGAC 3237

 31437481 ATCAAATCAACCTAAGAGCCCATCTTTGGACAAATGGATAAAGAAAATGTGCTGTATATA 31437540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 ATCAAATCAACCTAAGAGCCCATCTTTGGACAAATGGATAAAGAAAATGTGCTGTATATA 3297

 31437541 TACATAATGGAATATTATTCAGCCATAAAAAAGAATGAAATCCTGACATTTGCAGCAACA 31437600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TACATAATGGAATATTATTCAGCCATAAAAAAGAATGAAATCCTGACATTTGCAGCAACA 3357

 31437601 TGGCTGGAAGTGAAGGTCATTATCTTAAGTGAAATAAGCCAGTCACAAAAAGATTAATAC 31437660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 TGGCTGGAAGTGAAGGTCATTATCTTAAGTGAAATAAGCCAGTCACAAAAAGATTAATAC 3417

 31437661 CACATATTCTCACTGACACGTGGGAGCTAAAAAATCTGATCACATGGAGATAGAGAATGA 31437720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CACATATTCTCACTGACACGTGGGAGCTAAAAAATCTGATCACATGGAGATAGAGAATGA 3477

 31437721 AAAGATGGAGAACAGAGACCAGGTGGGGTGAGTGGCAGGGTCAGGGAGAGGTTGAAGAGA 31437780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 AAAGATGGAGAACAGAGACCAGGTGGGGTGAGTGGCAGGGTCAGGGAGAGGTTGAAGAGA 3537

 31437781 AGTGGGCTAAAGGCTACAAGCCTACAGTTAGATAGAAGGAGTAAATCCAGCATTTGATAG 31437840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 AGTGGGCTAAAGGCTACAAGCCTACAGTTAGATAGAAGGAGTAAATCCAGCATTTGATAG 3597

 31437841 CAGTAGAGTAGGGTGGCTATAGTTTAACAAAAGTATATTATACTTGGGCGATGGACACCC 31437900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 CAGTAGAGTAGGGTGGCTATAGTTTAACAAAAGTATATTATACTTGGGCGATGGACACCC 3657

 31437901 TAAACACCCTGTCTTGATCACTCCACATTATATACATGTAACAAAATTTCACATGTACCC 31437960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 TAAACACCCTGTCTTGATCACTCCACATTATATACATGTAACAAAATTTCACATGTACCC 3717

 31437961 CACAAATGTGTACACATAATGTAAAAAATTAAAAAAATAAGATAAAATGGGAGGACTGAA 31438020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 CACAAATGTGTACACATAATGTAAAAAATTAAAAAAATAAGATAAAATGGGAGGACTGAA 3777

 31438021 TTCCCTGTCCCATGGGTTCCTGTGAATTGAATGAGCTCACACACTAGGACTTGGCACAGT 31438080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TTCCCTGTCCCATGGGTTCCTGTGAATTGAATGAGCTCACACACTAGGACTTGGCACAGT 3837

 31438081 GCCTGGCATAGAATAAGTGCTCAATGAATGCTAACTTCCCCTCCTGCTGTCAGCATCATT 31438140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 GCCTGGCATAGAATAAGTGCTCAATGAATGCTAACTTCCCCTCCTGCTGTCAGCATCATT 3897

 31438141 TACAACCAATAGACCTGAAAACGTCTGATGTTAATTAAACACCTTGATTCATTTGGAAAG 31438200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 TACAACCAATAGACCTGAAAACGTCTGATGTTAATTAAACACCTTGATTCATTTGGAAAG 3957

 31438201 ATTGATCTGGCATTAATCGGAACTACTGTACAAAAACGATGACTTCTTTGGATGCATATT 31438260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 ATTGATCTGGCATTAATCGGAACTACTGTACAAAAACGATGACTTCTTTGGATGCATATT 4017

 31438261 TTTTGGGAAAAGGCCCAAAGTGTGGGCCATAAAATAAACCGAGAGTTTGCCTTTTGGGAG 31438320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 TTTTGGGAAAAGGCCCAAAGTGTGGGCCATAAAATAAACCGAGAGTTTGCCTTTTGGGAG 4077

 31438321 CGTAGAAACATGTCACGAGTTCTAACACTTCCACACTCATAGAACTAAAGCCTCCCAAGT 31438380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 CGTAGAAACATGTCACGAGTTCTAACACTTCCACACTCATAGAACTAAAGCCTCCCAAGT 4137

 31438381 AGGAAAAAACTCCACTTCCAGAGGGTACTTAACTCTCTATTCGGACCAAGCTATTACTTG 31438440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 AGGAAAAAACTCCACTTCCAGAGGGTACTTAACTCTCTATTCGGACCAAGCTATTACTTG 4197

 31438441 AAGCTTCTCCCTTTTATTTCAGAAACTTCTTGCATTTATTTGATTTAGTTCTAAAGACGT 31438500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4198 AAGCTTCTCCCTTTTATTTCAGAAACTTCTTGCATTTATTTGATTTGGTTCTAAAGACGT 4257

 31438501 GAAGTGTTATGGAATAAATTTGCTTACGGTGATGGATGGGCATTTTCACAACCCAGGGCC 31438560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 GAAGTGTTATGGAATAAATTTGCTTACGGTGATGGATGGGCATTTTCACAACCCAGGGCC 4317

 31438561 TTGCTTCTAAAGCATTTTTATGACCACTTGATATCACCAAACAGTGAAACAGCATAGGAC 31438620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 TTGCTTCTAAAGCATTTTTATGACCACTTGATATCACCAAACAGTGAAACAGCATAGGAC 4377

 31438621 ACCAATCAATGAGGTGCATATTCTTCTCAGGTGGCAGAGAGATTAGGTGGCCTGTTTAAA 31438680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 ACCAATCAATGAGGTGCATATTCTTCTCAGGTGGCAGAGAGATTAGGTGGCCTGTTTAAA 4437

 31438681 AGTGCCCAACAGGCTGGATGCGGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATC 31438740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 AGTGCCCAACAGGCTGGATGCGGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATC 4497

 31438741 ACCAGAGGTCAGGAGCTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGCAAAACCCTGTCTGTACTAA 31438800
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 ACCTGAGGTCAGGAGCTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGCAAAACCCTGTCTGTACTAA 4557

 31438801 AAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGCTGCCTATAATCCCAGCTACTTGAGAGGC 31438860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 AAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGCTGCCTATAATCCCAGCTACTTGAGAGGC 4617

 31438861 TGAGGCATGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACC 31438920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 TGAGGCATGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACC 4677

 31438921 ATTGCACTCCAGCCTGGGCAAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAACC 31438980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4678 ATTGCACTCCAGCCTGGGCAAGCCTGGGCAACAGAGCGTGACTCCATCTCAAAAAAAACC 4737

 31438981 AAAAATAAACCTGCTCAGCAAACCAGTGACAGGCAAATTGAGATGCCATTGGGCCACACT 31439040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 AAAAATAAACCTGCTCAGCAAACCAGTGACAGGCAAATTGAGATGCCATTGGGCCACACT 4797

 31439041 CCTTCACACAGAGGTCAAAGGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCATAGGTCTTTAATTAG 31439100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 CCTTCACACAGAGGTCAAAGGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCATAGGTCTTTAATTAG 4857

 31439101 AAACAGAGGAAGTCAGGATTTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAAACTTTACCAGCTAA 31439160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 AAACAGAGGAAGTCAGGATTTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAAACTTTACCAGCTAA 4917

 31439161 ATTGAAGAATCCCTGTTACTAAAAGTCTGTGTCATTGCACTTCGGGAGGGCGGGCCCAGT 31439220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     4918 ATTGAAGAATCCCTGTTACTAAAAGTCTGTGTCATTGCACTTTGGGAGGGCGGGCCCAGT 4977

 31439221 GGCACACATGTGTGACGTGGCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGAAGAGTAGGAGCTACTGG 31439280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 GGCACACATGTGTGACGTGGCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGAAGAGTAGGAGCTACTGG 5037

 31439281 AGAACCATGATGCATGACGCAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCCATGTCTTTCTCAGC 31439340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 AGAACCATGATGCATGACGCAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCCATGTCTTTCTCAGC 5097

 31439341 CGTCCTGGGAGCTTTCAGGATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCTCCTAAGGCAAAAAA 31439400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 CGTCCTGGGAGCTTTCAGGATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCTCCTAAGGCAAAAAA 5157

 31439401 TTTATACCACTTTTTTTTTTCCCAATCCAGATGCAAAACCAAAAACTCAAATCCAACTGT 31439460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 TTTATACCACTTTTTTTTTTCCCAATCCAGATGCAAAACCAAAAACTCAAATCCAACTGT 5217

 31439461 TCTCAGTCAAGTGAAAGCATTCCAAGACCTCAGAAATGCTCACTCACCAAAGACCATTTT 31439520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 TCTCAGTCAAGTGAAAGCATTCCAAGACCTCAGAAATGCTCACTCACCAAAGACCATTTT 5277

 31439521 CCTGACTTGTAATTTGGTCAGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCCGGGTGGTCCAGTTT 31439580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 CCTGACTTGTAATTTGGTCAGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCCGGGTGGTCCAGTTT 5337

 31439581 CCTCTGGGAACTCCGTAGGTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCTTGCCTAGGA 31439640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 CCTCTGGGAACTCCGTAGGTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCTTGCCTAGGA 5397

 31439641 GTTCCAGGGCAACTGAACTTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTGCAGAAGGTC 31439700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 GTTCCAGGGCAACTGAACTTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTGCAGAAGGTC 5457

 31439701 GTTTGGAAAACCTAATTAGAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTTGGCCCTGGC 31439760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 GTTTGGAAAACCTAATTAGAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTTGGCCCTGGC 5517

 31439761 AGGCCTGTGTGGAGGTGGAGGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGCCTTAGAAAG 31439820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 AGGCCTGTGTGGAGGTGGAGGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGCCTTAGAAAG 5577

 31439821 ATGCTGGACTTAAAATTTCAAACCATTTCATAATGATTTATACATTTTTTAATAAGTGCC 31439880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 ATGCTGGACTTAAAATTTCAAACCATTTCATAATGATTTATACATTTTTTAATAAGTGCC 5637

 31439881 ATTAGATCTCCTTCCACCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCC 31439940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 ATTAGATCTCCTTCCACCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCC 5697

 31439941 TAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAA 31440000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 TAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAA 5757

 31440001 TGCGTTCTTCTAATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGC 31440060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 TGCGTTCTTCTAATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGC 5817

 31440061 AATTTGGTTGAGGAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGA 31440120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 AATTTGGTTGAGGAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGA 5877

 31440121 TAGAAATTGCTCAAATGAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAA 31440180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 TAGAAATTGCTCAAATGAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAA 5937

 31440181 AAACATCTGTTGTGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTG 31440240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 AAACATCTGTTGTGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTG 5997

 31440241 TTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGT 31440300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 TTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGT 6057

 31440301 TTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAGG 31440360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 TTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAGG 6117

 31440361 CCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACA 31440420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 CCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACA 6177

 31440421 AGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTG 31440480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 AGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTG 6237

 31440481 GGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAA 31440540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 GGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAA 6297

 31440541 ACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACC 31440600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 ACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACC 6357

 31440601 CCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAG 31440660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 CCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAG 6417

 31440661 AAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTT 31440720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 AAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTT 6477

 31440721 CGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCC 31440780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6478 CGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCC 6537

 31440781 TCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGC 31440840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6538 TCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGC 6597

 31440841 ACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCA 31440900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6598 ACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCA 6657

 31440901 GTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGG 31440960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6658 GTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGG 6717

 31440961 GATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGG 31441020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6718 GATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGG 6777

 31441021 CAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTAT 31441080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6778 CAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTAT 6837

 31441081 CCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGA 31441140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6838 CCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGA 6897

 31441141 CAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTG 31441200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6898 CAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTG 6957

 31441201 TCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACA 31441260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6958 TCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACA 7017

 31441261 ACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTA 31441320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7018 ACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTA 7077

 31441321 GGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTG 31441380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7078 GGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTG 7137

 31441381 CTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAA 31441440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7138 CTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAA 7197

 31441441 GATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTG 31441500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7198 GATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTG 7257

 31441501 GAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCT 31441560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7258 GAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCT 7317

 31441561 GCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAA 31441620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7318 GCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAA 7377

 31441621 TGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCA 31441680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7378 TGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCA 7437

 31441681 AATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTC 31441740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7438 AATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTC 7497

 31441741 ATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTT 31441800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7498 ATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTT 7557

 31441801 GCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTG 31441860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7558 GCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTG 7617

 31441861 TCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTC 31441920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7618 TCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTC 7677

 31441921 AGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACT 31441980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7678 AGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACT 7737

 31441981 GGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATT 31442040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7738 GGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATT 7797

 31442041 GATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGA 31442100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7798 GATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGA 7857

 31442101 AGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCT 31442160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7858 AGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCT 7917

 31442161 TTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATAT 31442220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7918 TTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATAT 7977

 31442221 TGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGC 31442280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7978 TGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGC 8037

 31442281 ACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACG 31442340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8038 ACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACG 8097

 31442341 GGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAG 31442400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8098 GGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAG 8157

 31442401 AAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGA 31442460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8158 AAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGA 8217

 31442461 AGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTC 31442520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8218 AGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTC 8277

 31442521 CTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAA 31442580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8278 CTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAA 8337

 31442581 AAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTG 31442640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8338 AAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTG 8397

 31442641 TCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCT 31442700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8398 TCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCT 8457

 31442701 CAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCAC 31442760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8458 CAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCAC 8517

 31442761 CCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACT 31442820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8518 CCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACT 8577

 31442821 GGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGA 31442880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8578 GGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGA 8637

 31442881 CTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATG 31442940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8638 CTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATG 8697

 31442941 GGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTG 31443000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8698 GGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTG 8757

 31443001 GGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGC 31443060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8758 GGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGC 8817

 31443061 ATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGT 31443120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8818 ATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGT 8877

 31443121 GAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGC 31443180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8878 GAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGC 8937

 31443181 CGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCA 31443240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8938 CGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCA 8997

 31443241 CGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAA 31443300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8998 CGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAA 9057

 31443301 TACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 31443350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9058 TACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 9107

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9108 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 9167

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9168 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 9227

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9228 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 9287

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9288 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 9347

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9348 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 9407

 31445165 CT 31445166
          ||
     9408 CT 9409

Alignment time is 7.20845 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2869] =>      2869 nucs 'mol-32-2b08-119444_2869'

Score:        2858
Aligned:      2869        nucs
Identic:      2868 (100%) nucs =>       204 (100%)      2664 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443147,31443350] EXCISED REGION [31444865,31447529]
 second seq =>  [       1,     204] EXCISED REGION [     205,    2869]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31443147 TGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAAT 31443206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAAT 60

 31443207 CCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCT 31443266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCT 120

 31443267 GGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTG 31443326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTG 180

 31443327 ATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 31443350
          ||||||||||||||||||||||||
      181 ATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 204

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      205 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 264

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      265 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 324

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      325 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 384

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 444

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 504

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      505 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 564

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 624

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 684

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 744

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 804

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 864

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 924

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 984

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 1044

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 1104

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 1164

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 1224

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 31445944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1225 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 1284

 31445945 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 31446004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 1344

 31446005 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 31446064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 1404

 31446065 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 31446124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 1464

 31446125 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 31446184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 1524

 31446185 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 31446244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 1584

 31446245 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 31446304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 1644

 31446305 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 31446364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 1704

 31446365 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 31446424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 1764

 31446425 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 31446484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 1824

 31446485 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 31446544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 1884

 31446545 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 31446604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 1944

 31446605 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 31446664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 2004

 31446665 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 31446724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 2064

 31446725 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 31446784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 2124

 31446785 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 31446844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 2184

 31446845 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 31446904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 2244

 31446905 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 31446964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 2304

 31446965 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 31447024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 2364

 31447025 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 31447084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 2424

 31447085 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 31447144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 2484

 31447145 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 31447204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 2544

 31447205 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 31447264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 2604

 31447265 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 31447324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 2664

 31447325 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 31447384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 2724

 31447385 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 31447444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 2784

 31447445 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 31447504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 2844

 31447505 TGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTT 31447529
          |||||||||||||||||||||||||
     2845 TGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTT 2869

Alignment time is 2.21128 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    7328] =>      7328 nucs 'mol-32-2e20-050885_7328'

Score:        7284
Aligned:      7328        nucs
Identic:      7324 (100%) nucs =>      4676 (100%)      2648 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31438672,31443350] EXCISED REGION [31444865,31447513]
 second seq =>  [       1,    4679] EXCISED REGION [    4680,    7328]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31438672 CTGTTTAAAAGTGCCCAACAGGCTGGATGCGGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGT 31438731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGTTTAAAAGTGCCCAACAGGCTGGATGCGGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGT 60

 31438732 GGGCGGATCACCAGAGGTCAGGAGCTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGCAAAACCCTGT 31438791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGCGGATCACCAGAGGTCAGGAGCTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGCAAAACCCTGT 120

 31438792 CTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGCTGCCTATAATCCCAGCTAC 31438851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGCTGCCTATAATCCCAGCTAC 180

 31438852 TTGAGAGGCTGAGGCATGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGAGCCAA 31438911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGAGAGGCTGAGGCATGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGAGCCAA 240

 31438912 GATTGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCA 31438971
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      241 GATTGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAAGCCTGGGCAACAGAGCGTGACTCCATCTCA 300

 31438972 AAAAAAACCAAAAATAAACCTGCTCAGCAAACCAGTGACAGGCAAATTGAGATGCCATTG 31439031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAAAACCAAAAATAAACCTGCTCAGCAAACCAGTGACAGGCAAATTGAGATGCCATTG 360

 31439032 GGCCACACTCCTTCACACAGAGGTCAAAGGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCATAGGTC 31439091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCCACACTCCTTCACACAGAGGTCAAAGGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCATAGGTC 420

 31439092 TTTAATTAGAAACAGAGGAAGTCAGGATTTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAAACTTT 31439151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTAATTAGAAACAGAGGAAGTCAGGATTTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAAACTTT 480

 31439152 ACCAGCTAAATTGAAGAATCCCTGTTACTAAAAGTCTGTGTCATTGCACTTCGGGAGGGC 31439211
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      481 ACCAGCTAAATTGAAGAATCCCTGTTACTAAAAGTCTGTGTCATTGCACTTTGGGAGGGC 540

 31439212 GGGCCCAGTGGCACACATGTGTGACGTGGCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGAAGAGTAGG 31439271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGCCCAGTGGCACACATGTGTGACGTGGCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGAAGAGTAGG 600

 31439272 AGCTACTGGAGAACCATGATGCATGACGCAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCCATGTC 31439331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGCTACTGGAGAACCATGATGCATGACGCAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCCATGTC 660

 31439332 TTTCTCAGCCGTCCTGGGAGCTTTCAGGATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCTCCTAA 31439391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTCTCAGCCGTCCTGGGAGCTTTCAGGATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCTCCTAA 720

 31439392 GGCAAAAAATTTATACCACTTTTTTTTTTCCCAATCCAGATGCAAAACCAAAAACTCAAA 31439451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGCAAAAAATTTATACCACTTTTTTTTTTCCCAATCCAGATGCAAAACCAAAAACTCAAA 780

 31439452 TCCAACTGTTCTCAGTCAAGTGAAAGCATTCCAAGACCTCAGAAATGCTCACTCACCAAA 31439511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCAACTGTTCTCAGTCAAGTGAAAGCATTCCAAGACCTCAGAAATGCTCACTCACCAAA 840

 31439512 GACCATTTTCCTGACTTGTAATTTGGTCAGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCCGGGTG 31439571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GACCATTTTCCTGACTTGTAATTTGGTCAGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCCGGGTG 900

 31439572 GTCCAGTTTCCTCTGGGAACTCCGTAGGTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCT 31439631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTCCAGTTTCCTCTGGGAACTCCGTAGGTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCT 960

 31439632 TGCCTAGGAGTTCCAGGGCAACTGAACTTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTG 31439691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCCTAGGAGTTCCAGGGCAACTGAACTTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTG 1020

 31439692 CAGAAGGTCGTTTGGAAAACCTAATTAGAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTT 31439751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGAAGGTCGTTTGGAAAACCTAATTAGAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTT 1080

 31439752 GGCCCTGGCAGGCCTGTGTGGAGGTGGAGGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGC 31439811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCCCTGGCAGGCCTGTGTGGAGGTGGAGGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGC 1140

 31439812 CTTAGAAAGATGCTGGACTTAAAATTTCAAACCATTTCATAATGATTTATACATTTTTTA 31439871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTAGAAAGATGCTGGACTTAAAATTTCAAACCATTTCATAATGATTTATACATTTTTTA 1200

 31439872 ATAAGTGCCATTAGATCTCCTTCCACCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAG 31439931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATAAGTGCCATTAGATCTCCTTCCACCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAG 1260

 31439932 CTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGC 31439991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGC 1320

 31439992 ATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACA 31440051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACA 1380

 31440052 ATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTC 31440111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTC 1440

 31440112 CAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAA 31440171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAA 1500

 31440172 TATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCT 31440231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCT 1560

 31440232 CTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTT 31440291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTT 1620

 31440292 GTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAA 31440351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAA 1680

 31440352 TGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCT 31440411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCT 1740

 31440412 TGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGA 31440471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGA 1800

 31440472 TCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTG 31440531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTG 1860

 31440532 TAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACAC 31440591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACAC 1920

 31440592 ATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAA 31440651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAA 1980

 31440652 GCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAG 31440711
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAACTATATTTATACATATATAATTTTTTTTTTGAG 2040

 31440712 ATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACA 31440771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACA 2100

 31440772 ATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTA 31440831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTA 2160

 31440832 CAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCA 31440891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCA 2220

 31440892 TGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCA 31440951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCA 2280

 31440952 AAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGA 31441011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGA 2340

 31441012 GCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTT 31441071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTT 2400

 31441072 TTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCA 31441131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCA 2460

 31441132 ATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCA 31441191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCA 2520

 31441192 TCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTA 31441251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTA 2580

 31441252 CTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCAT 31441311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCAT 2640

 31441312 ATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCT 31441371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCT 2700

 31441372 TCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAA 31441431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAA 2760

 31441432 GAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAG 31441491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAG 2820

 31441492 ATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTAT 31441551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTAT 2880

 31441552 CTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAA 31441611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAA 2940

 31441612 AGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGC 31441671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGC 3000

 31441672 CACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTC 31441731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTC 3060

 31441732 AGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGAT 31441791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGAT 3120

 31441792 TTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCC 31441851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCC 3180

 31441852 CCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACT 31441911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACT 3240

 31441912 TCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAA 31441971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAA 3300

 31441972 CACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCAC 31442031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCAC 3360

 31442032 AATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTC 31442091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTC 3420

 31442092 TAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGAT 31442151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGAT 3480

 31442152 GAACTAGCTTTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTC 31442211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GAACTAGCTTTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTC 3540

 31442212 TCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTT 31442271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTT 3600

 31442272 GCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAAT 31442331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAAT 3660

 31442332 CCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATG 31442391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATG 3720

 31442392 TGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATT 31442451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATT 3780

 31442452 CTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAG 31442511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAG 3840

 31442512 CAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCA 31442571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCA 3900

 31442572 TATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATG 31442631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATG 3960

 31442632 ATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTT 31442691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTT 4020

 31442692 TGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGAC 31442751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGAC 4080

 31442752 TAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCC 31442811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCC 4140

 31442812 AGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAG 31442871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAG 4200

 31442872 GCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAG 31442931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAG 4260

 31442932 GAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATAC 31442991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATAC 4320

 31442992 CTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGT 31443051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGT 4380

 31443052 ACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATG 31443111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATG 4440

 31443112 GCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACA 31443171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACA 4500

 31443172 GGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATG 31443231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATG 4560

 31443232 GGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTC 31443291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTC 4620

 31443292 TACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 31443350
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 4679

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 4739

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 4799

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 4859

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 4919

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 4979

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 5039

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 5099

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 5159

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 5219

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 5279

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 5339

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 5399

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 5459

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 5519

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 5579

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 5639

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 5699

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 31445944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5700 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 5759

 31445945 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 31446004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 5819

 31446005 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 31446064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 5879

 31446065 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 31446124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 5939

 31446125 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 31446184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 5999

 31446185 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 31446244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 6059

 31446245 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 31446304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 6119

 31446305 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 31446364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 6179

 31446365 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 31446424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 6239

 31446425 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 31446484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 6299

 31446485 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 31446544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 6359

 31446545 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 31446604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 6419

 31446605 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 31446664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 6479

 31446665 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 31446724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 6539

 31446725 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 31446784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 6599

 31446785 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 31446844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 6659

 31446845 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 31446904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 6719

 31446905 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 31446964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 6779

 31446965 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 31447024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6780 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 6839

 31447025 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 31447084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6840 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 6899

 31447085 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 31447144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6900 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 6959

 31447145 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 31447204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6960 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 7019

 31447205 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 31447264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7020 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 7079

 31447265 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 31447324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7080 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 7139

 31447325 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 31447384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7140 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 7199

 31447385 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 31447444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7200 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 7259

 31447445 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 31447504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7260 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 7319

 31447505 TGCTCCAGT 31447513
          |||||||||
     7320 TGCTCCAGT 7328

Alignment time is 5.54107 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2649] =>      2649 nucs 'mol-32-2e20-050885_2649'

Score:        2648
Aligned:      2648        nucs
Identic:      2648 (100%) nucs =>      1055 (100%)      1593 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31444865,31445919] EXCISED REGION [31445921,31447513]
 second seq =>  [       1,    1055] EXCISED REGION [    1057,    2649]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31445920,31445920]
 second seq =>         1 nucs [1056,1056]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31445918,31445919] to [31445919,31445920]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 60

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 120

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 180

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 240

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 300

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 360

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 420

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 480

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 540

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 600

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 660

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 720

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 780

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 840

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 900

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 960

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 1020

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAA 31445919
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAA 1055

EXCISED REGION

 31445921 TAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTAT 31445980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 TAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTAT 1116

 31445981 TGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCA 31446040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 TGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCA 1176

 31446041 ATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAAC 31446100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 ATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAAC 1236

 31446101 TGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTG 31446160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 TGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTG 1296

 31446161 TCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATC 31446220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 TCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATC 1356

 31446221 TTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTAT 31446280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 TTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTAT 1416

 31446281 TCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATT 31446340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 TCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATT 1476

 31446341 CTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAA 31446400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 CTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAA 1536

 31446401 GTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGG 31446460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 GTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGG 1596

 31446461 ATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGA 31446520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 ATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGA 1656

 31446521 GGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACG 31446580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 GGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACG 1716

 31446581 CAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCT 31446640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 CAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCT 1776

 31446641 GCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGA 31446700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 GCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGA 1836

 31446701 GCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGC 31446760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 GCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGC 1896

 31446761 TGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACG 31446820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 TGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACG 1956

 31446821 CCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTG 31446880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 CCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTG 2016

 31446881 GCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCA 31446940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 GCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCA 2076

 31446941 GCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAA 31447000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 GCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAA 2136

 31447001 ATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCAT 31447060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 ATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCAT 2196

 31447061 ATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCC 31447120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 ATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCC 2256

 31447121 AACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCT 31447180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 AACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCT 2316

 31447181 ATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTAT 31447240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 ATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTAT 2376

 31447241 AATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATT 31447300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 AATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATT 2436

 31447301 TGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACAT 31447360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 TGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACAT 2496

 31447361 CCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATT 31447420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 CCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATT 2556

 31447421 GTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACA 31447480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 GTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACA 2616

 31447481 TTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTCCAGT 31447513
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 TTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTCCAGT 2649

Alignment time is 2.04078 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3808] =>      3808 nucs 'mol-32-2ee6-084348_3808'

Score:        3807
Aligned:      3807        nucs
Identic:      3807 (100%) nucs =>      2531 (100%)      1276 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443538,31446068] EXCISED REGION [31446070,31447345]
 second seq =>  [       1,    2531] EXCISED REGION [    2533,    3808]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31446069,31446069]
 second seq =>         1 nucs [2532,2532]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2531,2532] to [2532,2533]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31446068,31446068] to [31446070,31446070]
 second seq =>         1 nucs [2531,2531] to [2533,2533]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31443538 AAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTAC 31443597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTAC 60

 31443598 CCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAA 31443657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAA 120

 31443658 CATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGA 31443717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGA 180

 31443718 GAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCA 31443777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCA 240

 31443778 AAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAA 31443837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAA 300

 31443838 GGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTT 31443897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTT 360

 31443898 GCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGA 31443957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGA 420

 31443958 AGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTC 31444017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTC 480

 31444018 AAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGG 31444077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGG 540

 31444078 GATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATA 31444137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATA 600

 31444138 CCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGT 31444197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGT 660

 31444198 ATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGA 31444257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGA 720

 31444258 CTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATT 31444317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATT 780

 31444318 CCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTT 31444377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTT 840

 31444378 GGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACT 31444437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACT 900

 31444438 TATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTG 31444497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTG 960

 31444498 CTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGG 31444557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGG 1020

 31444558 CCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCT 31444617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCT 1080

 31444618 CATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGT 31444677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGT 1140

 31444678 GGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACT 31444737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACT 1200

 31444738 TATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTG 31444797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTG 1260

 31444798 CATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCC 31444857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCC 1320

 31444858 CAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCT 31444917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCT 1380

 31444918 GAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGC 31444977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGC 1440

 31444978 CTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGA 31445037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGA 1500

 31445038 GTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGA 31445097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGA 1560

 31445098 GACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGT 31445157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGT 1620

 31445158 GTAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGA 31445217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGA 1680

 31445218 GGCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAC 31445277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAC 1740

 31445278 AAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGG 31445337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGG 1800

 31445338 CAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGT 31445397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGT 1860

 31445398 ACTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATT 31445457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATT 1920

 31445458 TTATGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCAT 31445517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTATGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCAT 1980

 31445518 GACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTC 31445577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTC 2040

 31445578 AGCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTAT 31445637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTAT 2100

 31445638 TTTAAATATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATT 31445697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTAAATATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATT 2160

 31445698 TCAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATC 31445757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATC 2220

 31445758 TGAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATC 31445817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATC 2280

 31445818 TAACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACT 31445877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACT 2340

 31445878 CTGAATATATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGG 31445937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTGAATATATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGG 2400

 31445938 TAGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAAT 31445997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAAT 2460

 31445998 AGAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGA 31446057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGA 2520

 31446058 ACGTTTGCATC 31446068
          |||||||||||
     2521 ACGTTTGCATC 2531

EXCISED REGION

 31446070 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 31446129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 2592

 31446130 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 31446189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 2652

 31446190 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 31446249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 2712

 31446250 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 31446309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 2772

 31446310 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 31446369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 2832

 31446370 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 31446429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 2892

 31446430 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 31446489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 2952

 31446490 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 31446549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 3012

 31446550 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 31446609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 3072

 31446610 AGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCG 31446669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 AGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCG 3132

 31446670 GCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGT 31446729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 GCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGT 3192

 31446730 CAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGT 31446789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 CAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGT 3252

 31446790 CCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTG 31446849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3253 CCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTG 3312

 31446850 ACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCC 31446909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3313 ACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCC 3372

 31446910 AGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCT 31446969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 AGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCT 3432

 31446970 CACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCT 31447029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 CACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCT 3492

 31447030 CCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTG 31447089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3493 CCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTG 3552

 31447090 CCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTAT 31447149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3553 CCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTAT 3612

 31447150 TTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAG 31447209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3613 TTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAG 3672

 31447210 TTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCA 31447269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3673 TTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCA 3732

 31447270 GTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTA 31447329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 GTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTA 3792

 31447330 TAAATAAAGTTTTATT 31447345
          ||||||||||||||||
     3793 TAAATAAAGTTTTATT 3808

Alignment time is 2.93382 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    6065] =>      6065 nucs 'mol-32-2ef1-070895_6065'

Score:        6065
Aligned:      6065        nucs
Identic:      6065 (100%) nucs =>      3664 (100%)      2401 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31441445,31445108] EXCISED REGION [31445110,31447510]
 second seq =>  [       1,    3664] EXCISED REGION [    3665,    6065]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31445109,31445109]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31445109,31445123] to [31445110,31445124]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31441445 ATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGC 31441504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGC 60

 31441505 TTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCT 31441564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCT 120

 31441565 TGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGAT 31441624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGAT 180

 31441625 TTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATG 31441684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATG 240

 31441685 CAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTG 31441744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTG 300

 31441745 GGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTG 31441804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTG 360

 31441805 ATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCA 31441864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCA 420

 31441865 GCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGC 31441924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGC 480

 31441925 TACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCT 31441984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCT 540

 31441985 GGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGATA 31442044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGATA 600

 31442045 CCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGC 31442104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGC 660

 31442105 TGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTC 31442164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTC 720

 31442165 ACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCC 31442224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCC 780

 31442225 AACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGA 31442284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGA 840

 31442285 GGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAA 31442344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAA 900

 31442345 ACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGA 31442404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGA 960

 31442405 TGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCT 31442464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCT 1020

 31442465 AAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGG 31442524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGG 1080

 31442525 GGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGG 31442584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGG 1140

 31442585 AGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAG 31442644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAG 1200

 31442645 CAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGG 31442704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGG 1260

 31442705 CCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAG 31442764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAG 1320

 31442765 AGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGA 31442824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGA 1380

 31442825 GGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCG 31442884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCG 1440

 31442885 GCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCC 31442944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCC 1500

 31442945 CACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCA 31443004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCA 1560

 31443005 ATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGG 31443064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGG 1620

 31443065 TGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAG 31443124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAG 1680

 31443125 GGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAG 31443184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAG 1740

 31443185 CTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAG 31443244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAG 1800

 31443245 GTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACA 31443304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACA 1860

 31443305 AAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGG 31443364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGG 1920

 31443365 CAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCACTGC 31443424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCACTGC 1980

 31443425 ACTCCAACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACAGGAAGA 31443484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTCCAACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACAGGAAGA 2040

 31443485 GAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTAAGAATA 31443544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTAAGAATA 2100

 31443545 AGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCCATG 31443604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCCATG 2160

 31443605 GCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATGAGA 31443664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATGAGA 2220

 31443665 CTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGA 31443724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGA 2280

 31443725 TATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCA 31443784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCA 2340

 31443785 AAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCT 31443844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCT 2400

 31443845 GCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGAC 31443904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGAC 2460

 31443905 TTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGT 31443964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGT 2520

 31443965 AGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTA 31444024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTA 2580

 31444025 CAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGC 31444084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGC 2640

 31444085 AGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGT 31444144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGT 2700

 31444145 GCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCT 31444204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCT 2760

 31444205 ATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAA 31444264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAA 2820

 31444265 AAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAA 31444324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAA 2880

 31444325 GAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATG 31444384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATG 2940

 31444385 AACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGC 31444444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGC 3000

 31444445 CATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAA 31444504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAA 3060

 31444505 TATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTT 31444564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTT 3120

 31444565 TCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGT 31444624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGT 3180

 31444625 TGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACT 31444684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACT 3240

 31444685 GGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAG 31444744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAG 3300

 31444745 TGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACT 31444804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACT 3360

 31444805 AAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACT 31444864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACT 3420

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 3480

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 3540

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 3600

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 3660

 31445105 TCTC 31445108
          ||||
     3661 TCTC 3664

EXCISED REGION

 31445110 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 31445169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 3724

 31445170 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 31445229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 3784

 31445230 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 31445289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3785 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 3844

 31445290 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 31445349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3845 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 3904

 31445350 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 31445409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 3964

 31445410 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 31445469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 4024

 31445470 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 31445529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 4084

 31445530 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 31445589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 4144

 31445590 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 31445649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4145 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 4204

 31445650 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 31445709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 4264

 31445710 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 31445769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 4324

 31445770 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 31445829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 4384

 31445830 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 31445889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 4444

 31445890 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 31445949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 4504

 31445950 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 31446009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 4564

 31446010 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 31446069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 4624

 31446070 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 31446129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 4684

 31446130 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 31446189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4685 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 4744

 31446190 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 31446249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 4804

 31446250 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 31446309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4805 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 4864

 31446310 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 31446369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4865 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 4924

 31446370 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 31446429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4925 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 4984

 31446430 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 31446489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4985 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 5044

 31446490 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 31446549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5045 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 5104

 31446550 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 31446609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5105 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 5164

 31446610 AGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCG 31446669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5165 AGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCG 5224

 31446670 GCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGT 31446729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5225 GCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGT 5284

 31446730 CAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGT 31446789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5285 CAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGT 5344

 31446790 CCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTG 31446849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5345 CCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTG 5404

 31446850 ACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCC 31446909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5405 ACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCC 5464

 31446910 AGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCT 31446969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5465 AGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCT 5524

 31446970 CACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCT 31447029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5525 CACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCT 5584

 31447030 CCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTG 31447089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5585 CCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTG 5644

 31447090 CCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTAT 31447149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5645 CCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTAT 5704

 31447150 TTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAG 31447209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5705 TTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAG 5764

 31447210 TTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCA 31447269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5765 TTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCA 5824

 31447270 GTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTA 31447329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5825 GTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTA 5884

 31447330 TAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGC 31447389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5885 TAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGC 5944

 31447390 ATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCC 31447449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5945 ATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCC 6004

 31447450 TAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTC 31447509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6005 TAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTC 6064

 31447510 C 31447510
          |
     6065 C 6065

Alignment time is 4.60275 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    4761] =>      4761 nucs 'mol-32-2f07-029589_4761'

Score:        4761
Aligned:      4761        nucs
Identic:      4761 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31438681,31443441]
 second seq =>  [       1,    4761]

 31438681 AGTGCCCAACAGGCTGGATGCGGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATC 31438740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTGCCCAACAGGCTGGATGCGGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATC 60

 31438741 ACCAGAGGTCAGGAGCTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGCAAAACCCTGTCTGTACTAA 31438800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCAGAGGTCAGGAGCTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGCAAAACCCTGTCTGTACTAA 120

 31438801 AAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGCTGCCTATAATCCCAGCTACTTGAGAGGC 31438860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGCTGCCTATAATCCCAGCTACTTGAGAGGC 180

 31438861 TGAGGCATGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACC 31438920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAGGCATGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACC 240

 31438921 ATTGCACTCCAGCCTGGGCAAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAACC 31438980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTGCACTCCAGCCTGGGCAAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAACC 300

 31438981 AAAAATAAACCTGCTCAGCAAACCAGTGACAGGCAAATTGAGATGCCATTGGGCCACACT 31439040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAATAAACCTGCTCAGCAAACCAGTGACAGGCAAATTGAGATGCCATTGGGCCACACT 360

 31439041 CCTTCACACAGAGGTCAAAGGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCATAGGTCTTTAATTAG 31439100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTTCACACAGAGGTCAAAGGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCATAGGTCTTTAATTAG 420

 31439101 AAACAGAGGAAGTCAGGATTTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAAACTTTACCAGCTAA 31439160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAACAGAGGAAGTCAGGATTTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAAACTTTACCAGCTAA 480

 31439161 ATTGAAGAATCCCTGTTACTAAAAGTCTGTGTCATTGCACTTCGGGAGGGCGGGCCCAGT 31439220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTGAAGAATCCCTGTTACTAAAAGTCTGTGTCATTGCACTTCGGGAGGGCGGGCCCAGT 540

 31439221 GGCACACATGTGTGACGTGGCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGAAGAGTAGGAGCTACTGG 31439280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCACACATGTGTGACGTGGCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGAAGAGTAGGAGCTACTGG 600

 31439281 AGAACCATGATGCATGACGCAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCCATGTCTTTCTCAGC 31439340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAACCATGATGCATGACGCAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCCATGTCTTTCTCAGC 660

 31439341 CGTCCTGGGAGCTTTCAGGATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCTCCTAAGGCAAAAAA 31439400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CGTCCTGGGAGCTTTCAGGATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCTCCTAAGGCAAAAAA 720

 31439401 TTTATACCACTTTTTTTTTTCCCAATCCAGATGCAAAACCAAAAACTCAAATCCAACTGT 31439460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTATACCACTTTTTTTTTTCCCAATCCAGATGCAAAACCAAAAACTCAAATCCAACTGT 780

 31439461 TCTCAGTCAAGTGAAAGCATTCCAAGACCTCAGAAATGCTCACTCACCAAAGACCATTTT 31439520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTCAGTCAAGTGAAAGCATTCCAAGACCTCAGAAATGCTCACTCACCAAAGACCATTTT 840

 31439521 CCTGACTTGTAATTTGGTCAGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCCGGGTGGTCCAGTTT 31439580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTGACTTGTAATTTGGTCAGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCCGGGTGGTCCAGTTT 900

 31439581 CCTCTGGGAACTCCGTAGGTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCTTGCCTAGGA 31439640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTCTGGGAACTCCGTAGGTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCTTGCCTAGGA 960

 31439641 GTTCCAGGGCAACTGAACTTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTGCAGAAGGTC 31439700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTCCAGGGCAACTGAACTTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTGCAGAAGGTC 1020

 31439701 GTTTGGAAAACCTAATTAGAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTTGGCCCTGGC 31439760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTTGGAAAACCTAATTAGAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTTGGCCCTGGC 1080

 31439761 AGGCCTGTGTGGAGGTGGAGGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGCCTTAGAAAG 31439820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGCCTGTGTGGAGGTGGAGGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGCCTTAGAAAG 1140

 31439821 ATGCTGGACTTAAAATTTCAAACCATTTCATAATGATTTATACATTTTTTAATAAGTGCC 31439880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGCTGGACTTAAAATTTCAAACCATTTCATAATGATTTATACATTTTTTAATAAGTGCC 1200

 31439881 ATTAGATCTCCTTCCACCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCC 31439940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTAGATCTCCTTCCACCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCC 1260

 31439941 TAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAA 31440000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAA 1320

 31440001 TGCGTTCTTCTAATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGC 31440060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCGTTCTTCTAATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGC 1380

 31440061 AATTTGGTTGAGGAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGA 31440120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATTTGGTTGAGGAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGA 1440

 31440121 TAGAAATTGCTCAAATGAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAA 31440180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAGAAATTGCTCAAATGAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAA 1500

 31440181 AAACATCTGTTGTGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTG 31440240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAACATCTGTTGTGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTG 1560

 31440241 TTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGT 31440300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGT 1620

 31440301 TTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAGG 31440360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAGG 1680

 31440361 CCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACA 31440420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACA 1740

 31440421 AGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTG 31440480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTG 1800

 31440481 GGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAA 31440540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAA 1860

 31440541 ACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACC 31440600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACC 1920

 31440601 CCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAG 31440660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAG 1980

 31440661 AAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTT 31440720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTT 2040

 31440721 CGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCC 31440780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCC 2100

 31440781 TCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGC 31440840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGC 2160

 31440841 ACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCA 31440900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCA 2220

 31440901 GTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGG 31440960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGG 2280

 31440961 GATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGG 31441020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGG 2340

 31441021 CAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTAT 31441080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTAT 2400

 31441081 CCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGA 31441140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGA 2460

 31441141 CAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTG 31441200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTG 2520

 31441201 TCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACA 31441260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACA 2580

 31441261 ACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTA 31441320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTA 2640

 31441321 GGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTG 31441380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTG 2700

 31441381 CTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAA 31441440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAA 2760

 31441441 GATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTG 31441500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTG 2820

 31441501 GAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCT 31441560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCT 2880

 31441561 GCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAA 31441620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAA 2940

 31441621 TGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCA 31441680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCA 3000

 31441681 AATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTC 31441740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTC 3060

 31441741 ATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTT 31441800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTT 3120

 31441801 GCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTG 31441860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTG 3180

 31441861 TCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTC 31441920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTC 3240

 31441921 AGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACT 31441980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACT 3300

 31441981 GGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATT 31442040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATT 3360

 31442041 GATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGA 31442100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGA 3420

 31442101 AGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCT 31442160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCT 3480

 31442161 TTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATAT 31442220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATAT 3540

 31442221 TGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGC 31442280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGC 3600

 31442281 ACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACG 31442340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACG 3660

 31442341 GGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAG 31442400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAG 3720

 31442401 AAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGA 31442460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGA 3780

 31442461 AGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTC 31442520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTC 3840

 31442521 CTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAA 31442580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAA 3900

 31442581 AAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTG 31442640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTG 3960

 31442641 TCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCT 31442700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCT 4020

 31442701 CAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCAC 31442760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCAC 4080

 31442761 CCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACT 31442820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACT 4140

 31442821 GGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGA 31442880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGA 4200

 31442881 CTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATG 31442940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATG 4260

 31442941 GGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTG 31443000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTG 4320

 31443001 GGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGC 31443060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGC 4380

 31443061 ATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGT 31443120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGT 4440

 31443121 GAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGC 31443180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGC 4500

 31443181 CGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCA 31443240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCA 4560

 31443241 CGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAA 31443300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAA 4620

 31443301 TACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCT 31443360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCT 4680

 31443361 GAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCA 31443420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCA 4740

 31443421 CTGCACTCCAACCTGGGTGAC 31443441
          |||||||||||||||||||||
     4741 CTGCACTCCAACCTGGGTGAC 4761

Alignment time is 3.19247 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3100] =>      3100 nucs 'mol-32-2f07-029723_3100'

Score:        3100
Aligned:      3100        nucs
Identic:      3100 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443479,31446578]
 second seq =>  [       1,    3100]

 31443479 GGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTA 31443538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTA 60

 31443539 AGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACC 31443598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACC 120

 31443599 CCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAAC 31443658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAAC 180

 31443659 ATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAG 31443718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAG 240

 31443719 AACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAA 31443778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAA 300

 31443779 AGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAG 31443838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAG 360

 31443839 GGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTG 31443898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTG 420

 31443899 CCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAA 31443958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAA 480

 31443959 GGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCA 31444018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCA 540

 31444019 AAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGG 31444078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGG 600

 31444079 ATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATAC 31444138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATAC 660

 31444139 CGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTA 31444198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTA 720

 31444199 TAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGAC 31444258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGAC 780

 31444259 TGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTC 31444318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTC 840

 31444319 CAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTG 31444378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTG 900

 31444379 GAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTT 31444438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTT 960

 31444439 ATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGC 31444498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGC 1020

 31444499 TATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGC 31444558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGC 1080

 31444559 CTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTC 31444618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTC 1140

 31444619 ATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTG 31444678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTG 1200

 31444679 GTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTT 31444738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTT 1260

 31444739 ATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGC 31444798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGC 1320

 31444799 ATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCC 31444858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCC 1380

 31444859 AGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTG 31444918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTG 1440

 31444919 AACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCC 31444978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCC 1500

 31444979 TGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAG 31445038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAG 1560

 31445039 TCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAG 31445098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAG 1620

 31445099 ACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTG 31445158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTG 1680

 31445159 TAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAG 31445218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAG 1740

 31445219 GCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACA 31445278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACA 1800

 31445279 AAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGC 31445338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGC 1860

 31445339 AGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTA 31445398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTA 1920

 31445399 CTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTT 31445458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTT 1980

 31445459 TATGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATG 31445518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATG 2040

 31445519 ACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCA 31445578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCA 2100

 31445579 GCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATT 31445638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATT 2160

 31445639 TTAAATATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTT 31445698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTAAATATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTT 2220

 31445699 CAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCT 31445758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCT 2280

 31445759 GAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCT 31445818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCT 2340

 31445819 AACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTC 31445878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTC 2400

 31445879 TGAATATATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGT 31445938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGAATATATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGT 2460

 31445939 AGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATA 31445998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATA 2520

 31445999 GAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAA 31446058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAA 2580

 31446059 CGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACAT 31446118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACAT 2640

 31446119 AAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAG 31446178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAG 2700

 31446179 CAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCA 31446238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCA 2760

 31446239 GGAGGGTATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACA 31446298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGAGGGTATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACA 2820

 31446299 TTTTCTTGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTA 31446358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTTCTTGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTA 2880

 31446359 ATGTCCCACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAG 31446418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATGTCCCACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAG 2940

 31446419 AGGAGATGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGAC 31446478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGGAGATGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGAC 3000

 31446479 CTCTCTAGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGT 31446538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTCTCTAGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGT 3060

 31446539 CTGGAGAGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACA 31446578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTGGAGAGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACA 3100

Alignment time is 2.09275 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3479] =>      3479 nucs 'mol-32-2f12-028835_3479'

Score:        3469
Aligned:      3480        nucs
Identic:      3479 (100%) nucs =>      2928 (100%)       551 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31440423,31443350] EXCISED REGION [31444865,31445416]
 second seq =>  [       1,    2928] EXCISED REGION [    2929,    3479]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31440423 TCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGG 31440482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGG 60

 31440483 CATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAAAC 31440542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAAAC 120

 31440543 CTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACCCC 31440602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACCCC 180

 31440603 AGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAA 31440662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAA 240

 31440663 GATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCG 31440722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCG 300

 31440723 CTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTC 31440782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTC 360

 31440783 CCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCAC 31440842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCAC 420

 31440843 CACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGT 31440902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGT 480

 31440903 CTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 31440962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 540

 31440963 TTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGGCA 31441022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGGCA 600

 31441023 GATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCC 31441082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCC 660

 31441083 ATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGACA 31441142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGACA 720

 31441143 GTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTGTC 31441202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTGTC 780

 31441203 AGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACAAC 31441262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACAAC 840

 31441263 TGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGG 31441322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGG 900

 31441323 CAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCT 31441382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCT 960

 31441383 TTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGA 31441442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGA 1020

 31441443 TAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGA 31441502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGA 1080

 31441503 GCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGC 31441562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGC 1140

 31441563 CTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATG 31441622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATG 1200

 31441623 ATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAA 31441682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAA 1260

 31441683 TGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCAT 31441742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCAT 1320

 31441743 TGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGC 31441802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGC 1380

 31441803 TGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTC 31441862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTC 1440

 31441863 CAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAG 31441922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAG 1500

 31441923 GCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGG 31441982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGG 1560

 31441983 CTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGA 31442042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGA 1620

 31442043 TACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAG 31442102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAG 1680

 31442103 GCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTT 31442162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTT 1740

 31442163 TCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTG 31442222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTG 1800

 31442223 CCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCAC 31442282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCAC 1860

 31442283 GAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGG 31442342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGG 1920

 31442343 AAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAA 31442402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAA 1980

 31442403 GATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAG 31442462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAG 2040

 31442463 CTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCT 31442522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCT 2100

 31442523 GGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAA 31442582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAA 2160

 31442583 GGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTC 31442642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTC 2220

 31442643 AGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCA 31442702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCA 2280

 31442703 GGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCC 31442762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCC 2340

 31442763 AGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGG 31442822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGG 2400

 31442823 GAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACT 31442882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACT 2460

 31442883 CGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGG 31442942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGG 2520

 31442943 CCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGG 31443002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGG 2580

 31443003 CAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCAT 31443062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCAT 2640

 31443063 GGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGA 31443122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGA 2700

 31443123 AGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCG 31443182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCG 2760

 31443183 AGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACG 31443242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACG 2820

 31443243 AGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATA 31443302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATA 2880

 31443303 CAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 31443350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 2928

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 2988

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 3048

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 3108

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 3168

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 TCTC-AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 3227

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 3287

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 3347

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 3407

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 3467

 31445405 CCTGGGCAACAA 31445416
          ||||||||||||
     3468 CCTGGGCAACAA 3479

Alignment time is 2.70614 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    7947] =>      7947 nucs 'mol-32-2fd8-163207_7947'

Score:        7878
Aligned:      7954        nucs
Identic:      7943 (100%) nucs =>      3433 (100%)      4510 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31439918,31443350] EXCISED REGION [31444865,31449383]
 second seq =>  [       1,    3433] EXCISED REGION [    3434,    7947]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31439918 TAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAG 31439977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAG 60

 31439978 TCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTG 31440037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTG 120

 31440038 CTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGA 31440097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGA 180

 31440098 AAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGAACAATTTGCATTTACTCTC 31440157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGAACAATTTGCATTTACTCTC 240

 31440158 CTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAAC 31440217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAAC 300

 31440218 TCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGT 31440277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGT 360

 31440278 TTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGC 31440337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGC 420

 31440338 TAATTCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAG 31440397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAATTCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAG 480

 31440398 CAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTG 31440457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTG 540

 31440458 AGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCAT 31440517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCAT 600

 31440518 TATCCTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAG 31440577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATCCTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAG 660

 31440578 GAATCTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAAC 31440637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAATCTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAAC 720

 31440638 CTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATA 31440697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATA 780

 31440698 ATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTAT 31440757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTAT 840

 31440758 CTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCA 31440817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCA 900

 31440818 AGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAA 31440877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAA 960

 31440878 ACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCC 31440937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCC 1020

 31440938 ACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAA 31440997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAA 1080

 31440998 TATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAA 31441057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAA 1140

 31441058 CGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGG 31441117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGG 1200

 31441118 TAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAG 31441177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAG 1260

 31441178 ATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTAT 31441237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTAT 1320

 31441238 CAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAG 31441297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAG 1380

 31441298 ATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGT 31441357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGT 1440

 31441358 TTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACT 31441417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACT 1500

 31441418 AAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAA 31441477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAA 1560

 31441478 GCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAAC 31441537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAAC 1620

 31441538 CACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCA 31441597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCA 1680

 31441598 GTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGT 31441657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGT 1740

 31441658 CTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAG 31441717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAG 1800

 31441718 CAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAA 31441777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAA 1860

 31441778 TTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGG 31441837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGG 1920

 31441838 GCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCAT 31441897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCAT 1980

 31441898 CACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAG 31441957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAG 2040

 31441958 GAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAG 31442017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAG 2100

 31442018 TGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGAT 31442077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGAT 2160

 31442078 CTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCC 31442137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCC 2220

 31442138 AAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTAT 31442197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTAT 2280

 31442198 TTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGG 31442257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGG 2340

 31442258 GCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGT 31442317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGT 2400

 31442318 TTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGA 31442377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGA 2460

 31442378 ACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAAT 31442437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAAT 2520

 31442438 GAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGG 31442497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGG 2580

 31442498 AAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTG 31442557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTG 2640

 31442558 CACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAG 31442617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAG 2700

 31442618 TCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAG 31442677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAG 2760

 31442678 GAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCC 31442737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCC 2820

 31442738 TTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGC 31442797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGC 2880

 31442798 ACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCAT 31442857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCAT 2940

 31442858 TCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGC 31442917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGC 3000

 31442918 ACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTG 31442977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTG 3060

 31442978 CTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACA 31443037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACA 3120

 31443038 GTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGC 31443097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGC 3180

 31443098 TGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCA 31443157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCA 3240

 31443158 TGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTT 31443217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTT 3300

 31443218 GGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGG 31443277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGG 3360

 31443278 TGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTA 31443337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTA 3420

 31443338 TAGTCCCAGCTAC 31443350
          |||||||||||||
     3421 TAGTCCCAGCTAC 3433

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3434 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 3493

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3494 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 3553

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3554 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 3613

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3614 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 3673

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3674 TCTC-AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 3732

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 3792

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 3852

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3853 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 3912

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3913 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 3972

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3973 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 4032

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4033 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 4092

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4093 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 4152

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4153 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 4212

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4213 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 4272

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4273 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 4332

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4333 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 4392

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4393 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 4452

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 31445944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4453 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 4512

 31445945 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 31446004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4513 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 4572

 31446005 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 31446064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4573 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 4632

 31446065 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 31446124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4633 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 4692

 31446125 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 31446184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4693 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 4752

 31446185 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 31446244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4753 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 4812

 31446245 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 31446304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4813 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 4872

 31446305 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 31446364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4873 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 4932

 31446365 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 31446424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4933 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 4992

 31446425 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 31446484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4993 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 5052

 31446485 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 31446544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5053 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 5112

 31446545 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 31446604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5113 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 5172

 31446605 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 31446664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5173 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 5232

 31446665 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 31446724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5233 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 5292

 31446725 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 31446784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5293 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 5352

 31446785 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 31446844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5353 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 5412

 31446845 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 31446904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5413 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 5472

 31446905 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 31446964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5473 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 5532

 31446965 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 31447024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5533 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 5592

 31447025 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 31447084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5593 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 5652

 31447085 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 31447144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5653 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 5712

 31447145 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 31447204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5713 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 5772

 31447205 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 31447264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5773 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 5832

 31447265 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 31447324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5833 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 5892

 31447325 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 31447384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5893 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 5952

 31447385 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 31447444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5953 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 6012

 31447445 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 31447504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6013 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 6072

 31447505 TGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAG 31447564
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||
     6073 TGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAG 6130

 31447565 ATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAC 31447624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6131 ATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAC 6190

 31447625 CTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATA 31447684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6191 CTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATA 6250

 31447685 AGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTT 31447744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6251 AGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTT 6310

 31447745 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGA 31447804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6311 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGA 6370

 31447805 CCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTT 31447864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6371 CCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTT 6430

 31447865 TCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTC 31447924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6431 TCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTC 6490

 31447925 CAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGA 31447984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6491 CAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGA 6550

 31447985 CCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATA 31448044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6551 CCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATA 6610

 31448045 TTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAA 31448104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6611 TTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAA 6670

 31448105 GTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGTTACTTAATAGA 31448164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6671 GTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGTTACTTAATAGA 6730

 31448165 TATTTGGAGATTTTCTTGACTCGGAAACTAGGAGTCTTTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAAT 31448224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6731 TATTTGGAGATTTTCTTGACTCGGAAACTAGGAGTCTTTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAAT 6790

 31448225 AGATAATCAACATTCCCCTACTGGGGAGAAACAAGGTGGGAGAATGAATACAACCTATGC 31448284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6791 AGATAATCAACATTCCCCTACTGGGGAGAAACAAGGTGGGAGAATGAATACAACCTATGC 6850

 31448285 TCCCCTAGGAAGGTTTTAAGAATTTTATTTTGTGTTTCTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTGC 31448344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6851 TCCCCTAGGAAGGTTTTAAGAATTTTATTTTGTGTTTCTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTGC 6910

 31448345 ATAAGAGATTAAGGAAATACACAGCTACTTTATAAGAGACTCCTTAAGAAAGAGATGGAG 31448404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6911 ATAAGAGATTAAGGAAATACACAGCTACTTTATAAGAGACTCCTTAAGAAAGAGATGGAG 6970

 31448405 GCAGGACCAAGGAATGCACAAAGGATGGGGTATTTTGCCATAAAAAGTAACTGCAATACA 31448464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6971 GCAGGACCAAGGAATGCACAAAGGATGGGGTATTTTGCCATAAAAAGTAACTGCAATACA 7030

 31448465 CTGAATGTGTCCCCCAAAATTCATGGTTTTAAAAAATTAAATAACTGCTTTTATTGAGAT 31448524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7031 CTGAATGTGTCCCCCAAAATTCATGGTTTTAAAAAATTAAATAACTGCTTTTATTGAGAT 7090

 31448525 ATAATTTGATGTTTTGATATGCATATGTATTGGGAAATGATTACTATAGTCAGGCTAATT 31448584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7091 ATAATTTGATGTTTTGATATGCATATGTATTGGGAAATGATTACTATAGTCAGGCTAATT 7150

 31448585 AACATATCCATTACCTCACATAATTACCTTATTTTTGTAATGAGAACACTTAAGATTCAC 31448644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7151 AACATATCCATTACCTCACATAATTACCTTATTTTTGTAATGAGAACACTTAAGATTCAC 7210

 31448645 TGTCTTAGCAAATTTCGAGTATACAATGCAGCATTATTAGCTATAGTCACCATGATGTAC 31448704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7211 TGTCTTAGCAAATTTCGAGTATACAATGCAGCATTATTAGCTATAGTCACCATGATGTAC 7270

 31448705 ATTAGATTTCTAGAAGCTACTTCATCTCAAATAAATGAAAGTTTATACCTTTTGACTAAC 31448764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7271 ATTAGATTTCTAGAAGCTACTTCATCTCAAATAAATGAAAGTTTATACCTTTTGACTAAC 7330

 31448765 GTCTCCATTTCTCCCAGCTCTCAGCCCCTAGAAGCTGTAGAGATCCATGTTTTCGCAAAT 31448824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7331 GTCTCCATTTCTCCCAGCTCTCAGCCCCTAGAAGCTGTAGAGATCCATGTTTTCGCAAAT 7390

 31448825 GACAGGATTTAGAATTTCCTTCTTTTTTAAAGCTGAATAATATTCCAGTG--TGTGTGTG 31448882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||
     7391 GACAGGATTTAGAATTTCCTTCTTTTTTAAAGCTGAATAATATTCCAGTGTATGTGTGTG 7450

 31448883 TGTGTGTGTGTATCACACACACATGCATCTATGTATTATCTATCTATCCATCTATTCTAT 31448942
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7451 TATGTGTGTGTATCACACACACATGCATCTATGTATTATCTATCTATCCATCTATTCTAT 7510

 31448943 CTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTCTCTATCTAGCAATTTCTTTAT 31449002
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||
     7511 CTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTA----TCTATCTAGCAATTTCTTTAT 7566

 31449003 CCATTTACCTGTTGACAGACACAGATTGTTTCCACATCTTGGTTAGTGTGAATAATGCTG 31449062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7567 CCATTTACCTGTTGACAGACACAGATTGTTTCCACATCTTGGTTAGTGTGAATAATGCTG 7626

 31449063 CAATGAACATGGGAGTGTAGCTATCTCTTCAATATACTGATTTTATTTTCTATAACTTTG 31449122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7627 CAATGAACATGGGAGTGTAGCTATCTCTTCAATATACTGATTTTATTTTCTATAACTTTG 7686

 31449123 TAATATACTTTGGGATTGAGAAGTGTGATGCCTCCAGCTTCATTCTTTTTTTTCTCGAGA 31449182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7687 TAATATACTTTGGGATTGAGAAGTGTGATGCCTCCAGCTTCATTCTTTTTTTTCTCGAGA 7746

 31449183 CTGCTTTGGCTATTCAGGATCGCTTGTTGTTCCATACAAATTTTATGATTATATTTTCCA 31449242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7747 CTGCTTTGGCTATTCAGGATCGCTTGTTGTTCCATACAAATTTTATGATTATATTTTCCA 7806

 31449243 TTTCTGTGAAAATTACCACTAGAATTTTGATGGGCATTGTGTTGAATCTCTGGATAACTC 31449302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7807 TTTCTGTGAAAATTACCACTAGAATTTTGATGGGCATTGTGTTGAATCTCTGGATAACTC 7866

 31449303 TGGGTTGTATGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAGTCCACAAACACAGAATATCTT 31449362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7867 TGGGTTGTATGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAGTCCACAAACACAGAATATCTT 7926

 31449363 TCCATTTGTGTCTTCTTCAAT 31449383
          |||||||||||||||||||||
     7927 TCCATTTGTGTCTTCTTCAAT 7947

Alignment time is 6.01431 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3451] =>      3451 nucs 'mol-32-2fd8-163207_3451'

Score:        3451
Aligned:      3451        nucs
Identic:      3451 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31439918,31443368]
 second seq =>  [       1,    3451]

 31439918 TAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAG 31439977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAG 60

 31439978 TCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTG 31440037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTG 120

 31440038 CTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGA 31440097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGA 180

 31440098 AAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGAACAATTTGCATTTACTCTC 31440157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGAACAATTTGCATTTACTCTC 240

 31440158 CTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAAC 31440217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAAC 300

 31440218 TCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGT 31440277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGT 360

 31440278 TTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGC 31440337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGC 420

 31440338 TAATTCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAG 31440397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAATTCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAG 480

 31440398 CAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTG 31440457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTG 540

 31440458 AGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCAT 31440517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCAT 600

 31440518 TATCCTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAG 31440577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATCCTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAG 660

 31440578 GAATCTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAAC 31440637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAATCTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAAC 720

 31440638 CTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATA 31440697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATA 780

 31440698 ATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTAT 31440757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTAT 840

 31440758 CTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCA 31440817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCA 900

 31440818 AGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAA 31440877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAA 960

 31440878 ACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCC 31440937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCC 1020

 31440938 ACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAA 31440997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAA 1080

 31440998 TATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAA 31441057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAA 1140

 31441058 CGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGG 31441117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGG 1200

 31441118 TAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAG 31441177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAG 1260

 31441178 ATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTAT 31441237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTAT 1320

 31441238 CAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAG 31441297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAG 1380

 31441298 ATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGT 31441357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGT 1440

 31441358 TTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACT 31441417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACT 1500

 31441418 AAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAA 31441477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAA 1560

 31441478 GCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAAC 31441537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAAC 1620

 31441538 CACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCA 31441597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCA 1680

 31441598 GTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGT 31441657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGT 1740

 31441658 CTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAG 31441717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAG 1800

 31441718 CAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAA 31441777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAA 1860

 31441778 TTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGG 31441837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGG 1920

 31441838 GCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCAT 31441897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCAT 1980

 31441898 CACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAG 31441957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAG 2040

 31441958 GAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAG 31442017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAG 2100

 31442018 TGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGAT 31442077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGAT 2160

 31442078 CTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCC 31442137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCC 2220

 31442138 AAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTAT 31442197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTAT 2280

 31442198 TTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGG 31442257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGG 2340

 31442258 GCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGT 31442317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGT 2400

 31442318 TTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGA 31442377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGA 2460

 31442378 ACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAAT 31442437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAAT 2520

 31442438 GAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGG 31442497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGG 2580

 31442498 AAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTG 31442557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTG 2640

 31442558 CACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAG 31442617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAG 2700

 31442618 TCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAG 31442677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAG 2760

 31442678 GAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCC 31442737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCC 2820

 31442738 TTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGC 31442797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGC 2880

 31442798 ACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCAT 31442857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCAT 2940

 31442858 TCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGC 31442917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGC 3000

 31442918 ACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTG 31442977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTG 3060

 31442978 CTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACA 31443037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACA 3120

 31443038 GTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGC 31443097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGC 3180

 31443098 TGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCA 31443157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCA 3240

 31443158 TGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTT 31443217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTT 3300

 31443218 GGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGG 31443277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGG 3360

 31443278 TGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTA 31443337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTA 3420

 31443338 TAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGG 31443368
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGG 3451

Alignment time is 2.29831 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    4121] =>      4121 nucs 'mol-32-2fee-225055_4121'

Score:        4110
Aligned:      4121        nucs
Identic:      4120 (100%) nucs =>      1676 (100%)      2444 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443433,31445108] EXCISED REGION [31445110,31447554]
 second seq =>  [       1,    1676] EXCISED REGION [    1677,    4121]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31445109,31445109]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31445362,31445362]
 second seq =>         1 nucs [1929,1929]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31445109,31445123] to [31445110,31445124]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31443433 CTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACAGGAAGAGAGGGGGG 31443492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACAGGAAGAGAGGGGGG 60

 31443493 GAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTAAGAATAAGAATTCA 31443552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTAAGAATAAGAATTCA 120

 31443553 CTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAAT 31443612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAAT 180

 31443613 GCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTGA 31443672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTGA 240

 31443673 AGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAAG 31443732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAAG 300

 31443733 CACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACA 31443792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACA 360

 31443793 TTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAG 31443852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAG 420

 31443853 ACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAG 31443912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAG 480

 31443913 GCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGA 31443972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGA 540

 31443973 CCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGC 31444032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGC 600

 31444033 ACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAA 31444092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAA 660

 31444093 GTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTAC 31444152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTAC 720

 31444153 ACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCT 31444212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCT 780

 31444213 CAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACC 31444272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACC 840

 31444273 CACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCA 31444332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCA 900

 31444333 GCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGG 31444392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGG 960

 31444393 AACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCT 31444452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCT 1020

 31444453 ATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGC 31444512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGC 1080

 31444513 TCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTT 31444572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTT 1140

 31444573 GATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTA 31444632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTA 1200

 31444633 ATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCC 31444692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCC 1260

 31444693 ACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCAC 31444752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCAC 1320

 31444753 TGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAG 31444812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAG 1380

 31444813 AAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGG 31444872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGG 1440

 31444873 CTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAA 31444932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAA 1500

 31444933 ATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCC 31444992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCC 1560

 31444993 CAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGT 31445052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGT 1620

 31445053 GAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTC 31445108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTC 1676

EXCISED REGION

 31445110 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 31445169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 1736

 31445170 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 31445229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 1796

 31445230 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 31445289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 1856

 31445290 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 31445349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 1916

 31445350 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 31445409
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TTGAACCCGGGAAGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 1976

 31445410 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 31445469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 2036

 31445470 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 31445529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 2096

 31445530 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 31445589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 2156

 31445590 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 31445649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 2216

 31445650 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 31445709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 2276

 31445710 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 31445769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 2336

 31445770 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 31445829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 2396

 31445830 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 31445889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 2456

 31445890 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 31445949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 2516

 31445950 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 31446009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 2576

 31446010 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 31446069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 2636

 31446070 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 31446129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 2696

 31446130 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 31446189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 2756

 31446190 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 31446249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 2816

 31446250 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 31446309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 2876

 31446310 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 31446369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 2936

 31446370 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 31446429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 2996

 31446430 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 31446489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 3056

 31446490 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 31446549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 3116

 31446550 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 31446609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 3176

 31446610 AGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCG 31446669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 AGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCG 3236

 31446670 GCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGT 31446729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 GCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGT 3296

 31446730 CAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGT 31446789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 CAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGT 3356

 31446790 CCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTG 31446849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 CCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTG 3416

 31446850 ACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCC 31446909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 ACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCC 3476

 31446910 AGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCT 31446969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 AGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCT 3536

 31446970 CACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCT 31447029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 CACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCT 3596

 31447030 CCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTG 31447089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 CCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTG 3656

 31447090 CCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTAT 31447149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 CCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTAT 3716

 31447150 TTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAG 31447209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 TTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAG 3776

 31447210 TTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCA 31447269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 TTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCA 3836

 31447270 GTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTA 31447329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 GTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTA 3896

 31447330 TAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGC 31447389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 TAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGC 3956

 31447390 ATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCC 31447449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 ATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCC 4016

 31447450 TAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTC 31447509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 TAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTC 4076

 31447510 CAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTT 31447554
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 CAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTT 4121

Alignment time is 3.17569 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2408] =>      2408 nucs 'mol-32-2ff9-283977_2408'

Score:        2387
Aligned:      2409        nucs
Identic:      2407 (100%) nucs =>       106 (100%)      2301 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443245,31443350] EXCISED REGION [31444865,31447167]
 second seq =>  [       1,     106] EXCISED REGION [     107,    2408]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31443245 GTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACA 31443304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACA 60

 31443305 AAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 31443350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 106

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      107 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 166

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      167 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 226

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      227 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 286

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      287 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 346

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      347 TCTC-AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 405

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      406 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 465

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      466 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 525

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      526 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 585

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      586 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 645

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      646 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 705

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      706 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 765

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      766 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 825

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      826 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 885

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      886 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 945

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      946 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 1005

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1006 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 1065

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1066 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 1125

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 31445944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1126 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 1185

 31445945 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 31446004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1186 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 1245

 31446005 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 31446064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1246 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 1305

 31446065 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 31446124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1306 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 1365

 31446125 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 31446184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1366 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 1425

 31446185 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 31446244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 1485

 31446245 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 31446304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 1545

 31446305 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 31446364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 1605

 31446365 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 31446424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 1665

 31446425 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 31446484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 1725

 31446485 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 31446544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 1785

 31446545 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 31446604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 1845

 31446605 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 31446664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 1905

 31446665 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 31446724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 1965

 31446725 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 31446784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 2025

 31446785 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 31446844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 2085

 31446845 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 31446904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 2145

 31446905 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 31446964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 2205

 31446965 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 31447024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 2265

 31447025 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 31447084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 2325

 31447085 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 31447144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 2385

 31447145 GTTATTTCCACACGGAACTCCAC 31447167
          |||||||||||||||||||||||
     2386 GTTATTTCCACACGGAACTCCAC 2408

Alignment time is 1.86564 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    4639] =>      4639 nucs 'mol-32-3025-068512_4639'

Score:        4629
Aligned:      4640        nucs
Identic:      4639 (100%) nucs =>      3752 (100%)       887 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31439599,31443350] EXCISED REGION [31444865,31445752]
 second seq =>  [       1,    3752] EXCISED REGION [    3753,    4639]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31439599 GTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCTTGCCTAGGAGTTCCAGGGCAACTGAAC 31439658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCTTGCCTAGGAGTTCCAGGGCAACTGAAC 60

 31439659 TTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTGCAGAAGGTCGTTTGGAAAACCTAATTA 31439718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTGCAGAAGGTCGTTTGGAAAACCTAATTA 120

 31439719 GAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTTGGCCCTGGCAGGCCTGTGTGGAGGTGG 31439778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTTGGCCCTGGCAGGCCTGTGTGGAGGTGG 180

 31439779 AGGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGCCTTAGAAAGATGCTGGACTTAAAATTT 31439838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGCCTTAGAAAGATGCTGGACTTAAAATTT 240

 31439839 CAAACCATTTCATAATGATTTATACATTTTTTAATAAGTGCCATTAGATCTCCTTCCACC 31439898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAACCATTTCATAATGATTTATACATTTTTTAATAAGTGCCATTAGATCTCCTTCCACC 300

 31439899 TTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTT 31439958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTT 360

 31439959 GTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGA 31440018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGA 420

 31440019 AGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTG 31440078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTG 480

 31440079 AGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGA 31440138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGA 540

 31440139 ACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAG 31440198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAG 600

 31440199 TTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCAC 31440258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCAC 660

 31440259 TAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAA 31440318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAA 720

 31440319 GAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTG 31440378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTG 780

 31440379 AGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCT 31440438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCT 840

 31440439 CTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCC 31440498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCC 900

 31440499 CCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCC 31440558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCC 960

 31440559 TGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCC 31440618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCC 1020

 31440619 TTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAA 31440678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAA 1080

 31440679 CTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGT 31440738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGT 1140

 31440739 TGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATT 31440798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATT 1200

 31440799 CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAA 31440858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAA 1260

 31440859 TTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCC 31440918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCC 1320

 31440919 GACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCA 31440978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCA 1380

 31440979 CTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCAT 31441038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCAT 1440

 31441039 ATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGT 31441098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGT 1500

 31441099 GAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGT 31441158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGT 1560

 31441159 GGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCC 31441218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCC 1620

 31441219 AGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGA 31441278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGA 1680

 31441279 GAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAA 31441338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAA 1740

 31441339 TGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTA 31441398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTA 1800

 31441399 TGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGT 31441458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGT 1860

 31441459 GTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGT 31441518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGT 1920

 31441519 GACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGAC 31441578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGAC 1980

 31441579 AGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACC 31441638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACC 2040

 31441639 TTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCAT 31441698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCAT 2100

 31441699 TGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTT 31441758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTT 2160

 31441759 GCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTC 31441818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTC 2220

 31441819 TGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTC 31441878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTC 2280

 31441879 ACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAG 31441938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAG 2340

 31441939 CTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCA 31441998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCA 2400

 31441999 TGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGT 31442058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGT 2460

 31442059 AGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTT 31442118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTT 2520

 31442119 CCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCT 31442178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCT 2580

 31442179 TTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCC 31442238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCC 2640

 31442239 AGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCA 31442298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCA 2700

 31442299 TATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAAT 31442358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAAT 2760

 31442359 TCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAAT 31442418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAAT 2820

 31442419 TTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCA 31442478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCA 2880

 31442479 GTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGG 31442538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGG 2940

 31442539 AAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACC 31442598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACC 3000

 31442599 CACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGT 31442658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGT 3060

 31442659 GGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGG 31442718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGG 3120

 31442719 CTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGT 31442778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGT 3180

 31442779 TTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGT 31442838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGT 3240

 31442839 CGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTC 31442898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTC 3300

 31442899 AAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCG 31442958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCG 3360

 31442959 TCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAA 31443018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAA 3420

 31443019 GAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATA 31443078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATA 3480

 31443079 TCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGG 31443138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGG 3540

 31443139 ACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACG 31443198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACG 3600

 31443199 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAG 31443258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAG 3660

 31443259 ACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAG 31443318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAG 3720

 31443319 GCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 31443350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 3752

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 3812

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 3872

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 3932

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 3992

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 TCTC-AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 4051

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4052 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 4111

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4112 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 4171

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4172 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 4231

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4232 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 4291

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4292 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 4351

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4352 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 4411

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4412 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 4471

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4472 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 4531

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4532 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 4591

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTA 31445752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4592 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTA 4639

Alignment time is 3.5392 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3045] =>      3045 nucs 'mol-32-3143-151907_3045'

Score:        3033
Aligned:      3044        nucs
Identic:      3043 (100%) nucs =>       894 (100%)      2149 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443752,31444645] EXCISED REGION [31444647,31446796]
 second seq =>  [       1,     894] EXCISED REGION [     896,    3045]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31444646,31444646]
 second seq =>         1 nucs [895,895]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31444646,31444646] to [31444647,31444647]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31443752 AACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTC 31443811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTC 60

 31443812 CAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCC 31443871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCC 120

 31443872 TCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTC 31443931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTC 180

 31443932 TACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTT 31443991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTT 240

 31443992 ATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAAT 31444051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAAT 300

 31444052 GTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTA 31444111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTA 360

 31444112 GGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAA 31444171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAA 420

 31444172 CTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCC 31444231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCC 480

 31444232 AGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACC 31444291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACC 540

 31444292 TTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAAC 31444351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAAC 600

 31444352 CCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTA 31444411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTA 660

 31444412 CTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAG 31444471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAG 720

 31444472 AAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTG 31444531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTG 780

 31444532 ACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCT 31444591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCT 840

 31444592 TTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTT 31444645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTT 894

EXCISED REGION

 31444647 AGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGAT 31444706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 AGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGAT 955

 31444707 GGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTG 31444766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 GGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTG 1015

 31444767 CAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAG 31444826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 CAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAG 1075

 31444827 GACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGA 31444886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 GACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGA 1135

 31444887 TCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACA 31444946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 TCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACA 1195

 31444947 AAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAG 31445006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 AAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAG 1255

 31445007 GCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTG 31445066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 GCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTG 1315

 31445067 CCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGA 31445126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 CCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGA 1375

 31445127 TACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCAC 31445186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 TACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCAC 1435

 31445187 TTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAA 31445246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAA 1495

 31445247 CATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCA 31445306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 CATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCA 1555

 31445307 CCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGA 31445366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 CCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGA 1615

 31445367 GGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACT 31445426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 GGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACT 1675

 31445427 CTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTG 31445486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 CTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTG 1735

 31445487 TTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGAC 31445546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 TTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGAC 1795

 31445547 CTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGT 31445606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 CTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGT 1855

 31445607 TGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGTGCATATAAATATAATGA 31445666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 TGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGTGCATATAAATATAATGA 1915

 31445667 GCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCTTTA 31445726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 GCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCTTTA 1975

 31445727 AAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTAATT 31445786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 AAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTAATT 2035

 31445787 CTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTA 31445846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTA 2095

 31445847 CTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTTCCTAACATTTCCTGATT 31445906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 CTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTTCCTAACATTTCCTGATT 2155

 31445907 GATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGG 31445966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 GATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGG 2215

 31445967 AATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCA 31446026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 AATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCA 2275

 31446027 AAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGTGCA 31446086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 AAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGTGCA 2335

 31446087 ACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACTCCT 31446146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 ACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACTCCT 2395

 31446147 TTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACACAG 31446206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACACAG 2455

 31446207 GCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTACATTACGTTTCAGAGAG 31446266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 GCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTACATTACGTTTCAGAGAG 2515

 31446267 AAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAGAATCACCTACTCTATTT 31446326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 AAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAGAATCACCTACTCTATTT 2575

 31446327 AAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTGAGTCACAGTCTCCTCCC 31446386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 AAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTGAGTCACAGTCTCCTCCC 2635

 31446387 TGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTAATGAATTCTGAAACATG 31446446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 TGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTAATGAATTCTGAAACATG 2695

 31446447 ACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATCCACTCTGACAGCACATA 31446506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 ACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATCCACTCTGACAGCACATA 2755

 31446507 CATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAATGTAATTAGAAAGCAAT 31446566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 CATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAATGTAATTAGAAAGCAAT 2815

 31446567 TTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGG 31446626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 TTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGG 2875

 31446627 GCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCGGCTCAGTGATCCTCGTC 31446686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 GCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCGGCTCAGTGATCCTCGTC 2935

 31446687 CTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGG 31446746
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2936 CTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTATCAGGTGCTGTCTGCTGG 2995

 31446747 GAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGTCCCACAT 31446796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 GAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGTCCCACAT 3045

Alignment time is 2.36181 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2516] =>      2516 nucs 'mol-32-3143-173356_2516'

Score:        2516
Aligned:      2516        nucs
Identic:      2516 (100%) nucs =>         7 (100%)      2509 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443285,31443291] EXCISED REGION [31443461,31445969]
 second seq =>  [       1,       7] EXCISED REGION [       8,    2516]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       169 nucs [31443292,31443460]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31443460,31443460]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31443285 CCGTCTC 31443291
          |||||||
        1 CCGTCTC 7

EXCISED REGION

 31443461 AAAAAAATAAAAAAGACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAAC 31443520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        8 AAAAAAATAAAAAAGACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAAC 67

 31443521 CACTTCTCATAGGAACTAAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCC 31443580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       68 CACTTCTCATAGGAACTAAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCC 127

 31443581 ATTCATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAG 31443640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      128 ATTCATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAG 187

 31443641 TGGGGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCA 31443700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      188 TGGGGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCA 247

 31443701 CAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCT 31443760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      248 CAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCT 307

 31443761 TTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAG 31443820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      308 TTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAG 367

 31443821 GAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCT 31443880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      368 GAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCT 427

 31443881 TCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCT 31443940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      428 TCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCT 487

 31443941 TGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACT 31444000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      488 TGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACT 547

 31444001 TCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAA 31444060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 TCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAA 607

 31444061 CCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTC 31444120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      608 CCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTC 667

 31444121 ATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACA 31444180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      668 ATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACA 727

 31444181 CGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCT 31444240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      728 CGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCT 787

 31444241 AGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCT 31444300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      788 AGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCT 847

 31444301 TCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGAT 31444360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      848 TCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGAT 907

 31444361 CCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCC 31444420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      908 CCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCC 967

 31444421 CTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGAT 31444480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 CTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGAT 1027

 31444481 CAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTC 31444540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1028 CAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTC 1087

 31444541 ACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACT 31444600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 ACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACT 1147

 31444601 ATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTT 31444660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 ATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTT 1207

 31444661 AAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTT 31444720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 AAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTT 1267

 31444721 GTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAAT 31444780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 GTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAAT 1327

 31444781 GCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATG 31444840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 GCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATG 1387

 31444841 GCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAG 31444900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 GCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAG 1447

 31444901 GAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAAT 31444960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 GAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAAT 1507

 31444961 TAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGG 31445020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 TAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGG 1567

 31445021 ATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAG 31445080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 ATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAG 1627

 31445081 CCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTAT 31445140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 CCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTAT 1687

 31445141 GGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAG 31445200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 GGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAG 1747

 31445201 ACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCC 31445260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 ACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCC 1807

 31445261 ATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGC 31445320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 ATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGC 1867

 31445321 TACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGC 31445380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 TACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGC 1927

 31445381 CGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAA 31445440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 CGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAA 1987

 31445441 AAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAAT 31445500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 AAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAAT 2047

 31445501 GTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGAC 31445560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 GTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGAC 2107

 31445561 TAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCT 31445620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 TAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCT 2167

 31445621 AGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTT 31445680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 AGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTT 2227

 31445681 TACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCG 31445740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 TACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCG 2287

 31445741 TATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCA 31445800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 TATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCA 2347

 31445801 TCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGA 31445860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 TCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGA 2407

 31445861 ATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAA 31445920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 ATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAA 2467

 31445921 TAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGGAAT 31445969
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 TAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGGAAT 2516

Alignment time is 1.94749 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    7567] =>      7567 nucs 'mol-32-3164-170905_7567'

Score:        7512
Aligned:      7567        nucs
Identic:      7562 (100%) nucs =>      6143 (100%)      1419 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31437204,31443350] EXCISED REGION [31444865,31446284]
 second seq =>  [       1,    6147] EXCISED REGION [    6148,    7567]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31437204 AAAAAAGACAAGCCTAAAGTCACACCGCCCAGTTCATATTCTAATTCTGTCACCTACAAG 31437263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAAGACAAGCCTAAAGTCACACCGCCCAGTTCATATTCTAATTCTGTCACCTACAAG 60

 31437264 CAATGTGGCTTTGGGAAAATTGTTTAATCTCTTTGCAACTCAATGTCCTCACTAAAATGG 31437323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATGTGGCTTTGGGAAAATTGTTTAATCTCTTTGCAACTCAATGTCCTCACTAAAATGG 120

 31437324 GAGAATTGAATGGAGATTTCTCAAAACTAAAAATAGGACTACCATTCAATCCAGCAATCC 31437383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAATTGAATGGAGATTTCTCAAAACTAAAAATAGGACTACCATTCAATCCAGCAATCC 180

 31437384 CACTACTGGGTATCTACCAAGAGGAAAAGAAATCAATATAACAAATAAATACCTGCACTT 31437443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACTACTGGGTATCTACCAAGAGGAAAAGAAATCAATATAACAAATAAATACCTGCACTT 240

 31437444 GCATGTTTATTGCAGCACTATTCAATACCACAAAGACATCAAATCAACCTAAGAGCCCAT 31437503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCATGTTTATTGCAGCACTATTCAATACCACAAAGACATCAAATCAACCTAAGAGCCCAT 300

 31437504 CTTTGGACAAATGGATAAAGAAAATGTGCTGTATATATACATAATGGAATATTATTCAGC 31437563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTGGACAAATGGATAAAGAAAATGTGCTGTATATATACATAATGGAATATTATTCAGC 360

 31437564 CATAAAAAAGAATGAAATCCTGACATTTGCAGCAACATGGCTGGAAGTGAAGGTCATTAT 31437623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATAAAAAAGAATGAAATCCTGACATTTGCAGCAACATGGCTGGAAGTGAAGGTCATTAT 420

 31437624 CTTAAGTGAAATAAGCCAGTCACAAAAAGATTAATACCACATATTCTCACTGACACGTGG 31437683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTAAGTGAAATAAGCCAGTCACAAAAAGATTAATACCACATATTCTCACTGACACGTGG 480

 31437684 GAGCTAAAAAATCTGATCACATGGAGATAGAGAATGAAAAGATGGAGAACAGAGACCAGG 31437743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGCTAAAAAATCTGATCACATGGAGATAGAGAATGAAAAGATGGAGAACAGAGACCAGG 540

 31437744 TGGGGTGAGTGGCAGGGTCAGGGAGAGGTTGAAGAGAAGTGGGCTAAAGGCTACAAGCCT 31437803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGGGTGAGTGGCAGGGTCAGGGAGAGGTTGAAGAGAAGTGGGCTAAAGGCTACAAGCCT 600

 31437804 ACAGTTAGATAGAAGGAGTAAATCCAGCATTTGATAGCAGTAGAGTAGGGTGGCTATAGT 31437863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAGTTAGATAGAAGGAGTAAATCCAGCATTTGATAGCAGTAGAGTAGGGTGGCTATAGT 660

 31437864 TTAACAAAAGTATATTATACTTGGGCGATGGACACCCTAAACACCCTGTCTTGATCACTC 31437923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAACAAAAGTATATTATACTTGGGCGATGGACACCCTAAACACCCTGTCTTGATCACTC 720

 31437924 CACATTATATACATGTAACAAAATTTCACATGTACCCCACAAATGTGTACACATAATGTA 31437983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACATTATATACATGTAACAAAATTTCACATGTACCCCACAAATGTGTACACATAATGTA 780

 31437984 AAAAATTAAAAAAATAAGATAAAATGGGAGGACTGAATTCCCTGTCCCATGGGTTCCTGT 31438043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAAATTAAAAAAATAAGATAAAATGGGAGGACTGAATTCCCTGTCCCATGGGTTCCTGT 840

 31438044 GAATTGAATGAGCTCACACACTAGGACTTGGCACAGTGCCTGGCATAGAATAAGTGCTCA 31438103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAATTGAATGAGCTCACACACTAGGACTTGGCACAGTGCCTGGCATAGAATAAGTGCTCA 900

 31438104 ATGAATGCTAACTTCCCCTCCTGCTGTCAGCATCATTTACAACCAATAGACCTGAAAACG 31438163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGAATGCTAACTTCCCCTCCTGCTGTCAGCATCATTTACAACCAATAGACCTGAAAACG 960

 31438164 TCTGATGTTAATTAAACACCTTGATTCATTTGGAAAGATTGATCTGGCATTAATCGGAAC 31438223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTGATGTTAATTAAACACCTTGATTCATTTGGAAAGATTGATCTGGCATTAATCGGAAC 1020

 31438224 TACTGTACAAAAACGATGACTTCTTTGGATGCATATTTTTTGGGAAAAGGCCCAAAGTGT 31438283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACTGTACAAAAACGATGACTTCTTTGGATGCATATTTTTTGGGAAAAGGCCCAAAGTGT 1080

 31438284 GGGCCATAAAATAAACCGAGAGTTTGCCTTTTGGGAGCGTAGAAACATGTCACGAGTTCT 31438343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGGCCATAAAATAAACCGAGAGTTTGCCTTTTGGGAGCGTAGAAACATGTCACGAGTTCT 1140

 31438344 AACACTTCCACACTCATAGAACTAAAGCCTCCCAAGTAGGAAAAAACTCCACTTCCAGAG 31438403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACACTTCCACACTCATAGAACTAAAGCCTCCCAAGTAGGAAAAAACTCCACTTCCAGAG 1200

 31438404 GGTACTTAACTCTCTATTCGGACCAAGCTATTACTTGAAGCTTCTCCCTTTTATTTCAGA 31438463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGTACTTAACTCTCTATTCGGACCAAGCTATTACTTGAAGCTTCTCCCTTTTATTTCAGA 1260

 31438464 AACTTCTTGCATTTATTTGATTTAGTTCTAAAGACGTGAAGTGTTATGGAATAAATTTGC 31438523
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AACTTCTTGCATTTATTTGATTTGGTTCTAAAGACGTGAAGTGTTATGGAATAAATTTGC 1320

 31438524 TTACGGTGATGGATGGGCATTTTCACAACCCAGGGCCTTGCTTCTAAAGCATTTTTATGA 31438583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTACGGTGATGGATGGGCATTTTCACAACCCAGGGCCTTGCTTCTAAAGCATTTTTATGA 1380

 31438584 CCACTTGATATCACCAAACAGTGAAACAGCATAGGACACCAATCAATGAGGTGCATATTC 31438643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCACTTGATATCACCAAACAGTGAAACAGCATAGGACACCAATCAATGAGGTGCATATTC 1440

 31438644 TTCTCAGGTGGCAGAGAGATTAGGTGGCCTGTTTAAAAGTGCCCAACAGGCTGGATGCGG 31438703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTCTCAGGTGGCAGAGAGATTAGGTGGCCTGTTTAAAAGTGCCCAACAGGCTGGATGCGG 1500

 31438704 TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACCAGAGGTCAGGAGCTTGAGAC 31438763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACCAGAGGTCAGGAGCTTGAGAC 1560

 31438764 CAGCCTGACCAACATGGCAAAACCCTGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGT 31438823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGCCTGACCAACATGGCAAAACCCTGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGT 1620

 31438824 GGTGGCAGCTGCCTATAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCATGAGAATCGCTTGAAC 31438883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGTGGCAGCTGCCTATAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCATGAGAATCGCTTGAAC 1680

 31438884 CCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAAGC 31438943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAAGC 1740

 31438944 CTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAACCAAAAATAAACCTGCTCAGCAAAC 31439003
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGGGCAACAGAGCGTGACTCCATCTCAAAAAAAACCAAAAATAAACCTGCTCAGCAAAC 1800

 31439004 CAGTGACAGGCAAATTGAGATGCCATTGGGCCACACTCCTTCACACAGAGGTCAAAGGAA 31439063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGTGACAGGCAAATTGAGATGCCATTGGGCCACACTCCTTCACACAGAGGTCAAAGGAA 1860

 31439064 GGAGCTGGCCATCCTCTGCCCATAGGTCTTTAATTAGAAACAGAGGAAGTCAGGATTTTT 31439123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGAGCTGGCCATCCTCTGCCCATAGGTCTTTAATTAGAAACAGAGGAAGTCAGGATTTTT 1920

 31439124 TATCCACTTGAGAAAAACATGAAACTTTACCAGCTAAATTGAAGAATCCCTGTTACTAAA 31439183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATCCACTTGAGAAAAACATGAAACTTTACCAGCTAAATTGAAGAATCCCTGTTACTAAA 1980

 31439184 AGTCTGTGTCATTGCACTTCGGGAGGGCGGGCCCAGTGGCACACATGTGTGACGTGGCTG 31439243
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTCTGTGTCATTGCACTTTGGGAGGGCGGGCCCAGTGGCACACATGTGTGACGTGGCTG 2040

 31439244 TCCAGTCACACTGGTTGTGAAGAGTAGGAGCTACTGGAGAACCATGATGCATGACGCAGA 31439303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCCAGTCACACTGGTTGTGAAGAGTAGGAGCTACTGGAGAACCATGATGCATGACGCAGA 2100

 31439304 AGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCCATGTCTTTCTCAGCCGTCCTGGGAGCTTTCAGGATGG 31439363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCCATGTCTTTCTCAGCCGTCCTGGGAGCTTTCAGGATGG 2160

 31439364 TCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCTCCTAAGGCAAAAAATTTATACCACTTTTTTTTTTCCC 31439423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCTCCTAAGGCAAAAAATTTATACCACTTTTTTTTTTCCC 2220

 31439424 AATCCAGATGCAAAACCAAAAACTCAAATCCAACTGTTCTCAGTCAAGTGAAAGCATTCC 31439483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATCCAGATGCAAAACCAAAAACTCAAATCCAACTGTTCTCAGTCAAGTGAAAGCATTCC 2280

 31439484 AAGACCTCAGAAATGCTCACTCACCAAAGACCATTTTCCTGACTTGTAATTTGGTCAGTT 31439543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGACCTCAGAAATGCTCACTCACCAAAGACCATTTTCCTGACTTGTAATTTGGTCAGTT 2340

 31439544 ATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCCGGGTGGTCCAGTTTCCTCTGGGAACTCCGTAGGTTTC 31439603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCCGGGTGGTCCAGTTTCCTCTGGGAACTCCGTAGGTTTC 2400

 31439604 ATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCTTGCCTAGGAGTTCCAGGGCAACTGAACTTGCT 31439663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCTTGCCTAGGAGTTCCAGGGCAACTGAACTTGCT 2460

 31439664 GAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTGCAGAAGGTCGTTTGGAAAACCTAATTAGAGTT 31439723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTGCAGAAGGTCGTTTGGAAAACCTAATTAGAGTT 2520

 31439724 CCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTTGGCCCTGGCAGGCCTGTGTGGAGGTGGAGGCG 31439783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTTGGCCCTGGCAGGCCTGTGTGGAGGTGGAGGCG 2580

 31439784 ATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGCCTTAGAAAGATGCTGGACTTAAAATTTCAAAC 31439843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGCCTTAGAAAGATGCTGGACTTAAAATTTCAAAC 2640

 31439844 CATTTCATAATGATTTATACATTTTTTAATAAGTGCCATTAGATCTCCTTCCACCTTTCA 31439903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CATTTCATAATGATTTATACATTTTTTAATAAGTGCCATTAGATCTCCTTCCACCTTTCA 2700

 31439904 GGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAG 31439963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAG 2760

 31439964 TTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGAAGTAT 31440023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGAAGTAT 2820

 31440024 GCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTGAGCAC 31440083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTGAGCAC 2880

 31440084 ATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGAACAAT 31440143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGAACAAT 2940

 31440144 TTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAGTTAAG 31440203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAGTTAAG 3000

 31440204 GTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCACTAACT 31440263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCACTAACT 3060

 31440264 AAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGC 31440323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGC 3120

 31440324 ACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTGAGAAT 31440383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTGAGAAT 3180

 31440384 GTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGAC 31440443
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTGAAAGTGAAAAGCATGCCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGAC 3240

 31440444 AATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCCCCTAC 31440503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCCCCTAC 3300

 31440504 CCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTT 31440563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTT 3360

 31440564 GTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCCTTTCA 31440623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCCTTTCA 3420

 31440624 GAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAACTATA 31440683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAACTATA 3480

 31440684 TATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAG 31440743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAG 3540

 31440744 TGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATTCTCCT 31440803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATTCTCCT 3600

 31440804 GCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTG 31440863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTG 3660

 31440864 TATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCCGACCT 31440923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCCGACCT 3720

 31440924 CAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCACTGCA 31440983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCACTGCA 3780

 31440984 CCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCATATATT 31441043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCATATATT 3840

 31441044 GTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGTGAACA 31441103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGTGAACA 3900

 31441104 TTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAA 31441163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAA 3960

 31441164 GCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGA 31441223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGA 4020

 31441224 GCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGAGAAGC 31441283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGAGAAGC 4080

 31441284 TCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAATGTCA 31441343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAATGTCA 4140

 31441344 GTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTATGTCC 31441403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTATGTCC 4200

 31441404 CTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGTGTGGG 31441463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGTGTGGG 4260

 31441464 CTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTC 31441523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTC 4320

 31441524 TCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGACAGCTG 31441583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGACAGCTG 4380

 31441584 ATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACCTTGAC 31441643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACCTTGAC 4440

 31441644 TTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCATTGACC 31441703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCATTGACC 4500

 31441704 AAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCC 31441763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCC 4560

 31441764 TCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTCTGACA 31441823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTCTGACA 4620

 31441824 TCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTCACCAG 31441883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTCACCAG 4680

 31441884 GGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAGCTGGG 31441943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAGCTGGG 4740

 31441944 TCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCATGCAG 31442003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCATGCAG 4800

 31442004 GGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGTAGGGA 31442063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGTAGGGA 4860

 31442064 GATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTTCCAAC 31442123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTTCCAAC 4920

 31442124 CACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCTTTTCC 31442183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCTTTTCC 4980

 31442184 AAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGT 31442243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGT 5040

 31442244 GTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCATATGT 31442303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCATATGT 5100

 31442304 GCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATTCTAC 31442363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATTCTAC 5160

 31442364 CATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATTTCCC 31442423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATTTCCC 5220

 31442424 ACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGA 31442483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGA 5280

 31442484 TATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAA 31442543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAA 5340

 31442544 GGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTC 31442603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTC 5400

 31442604 CACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCC 31442663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCC 5460

 31442664 AGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAG 31442723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAG 5520

 31442724 CCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGT 31442783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGT 5580

 31442784 TCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGA 31442843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGA 5640

 31442844 GGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCC 31442903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCC 5700

 31442904 TTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTA 31442963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTA 5760

 31442964 GTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGT 31443023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 GTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGT 5820

 31443024 TTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGG 31443083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGG 5880

 31443084 GGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTG 31443143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 GGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTG 5940

 31443144 ATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGT 31443203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 ATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGT 6000

 31443204 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCAT 31443263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCAT 6060

 31443264 CCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTG 31443323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTG 6120

 31443324 GTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 31443350
          |||||||||||||||||||||||||||
     6121 GTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 6147

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6148 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 6207

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6208 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 6267

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6268 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 6327

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6328 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 6387

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6388 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 6447

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6448 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 6507

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6508 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 6567

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6568 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 6627

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6628 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 6687

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6688 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 6747

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6748 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 6807

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6808 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 6867

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6868 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 6927

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6928 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 6987

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6988 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 7047

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7048 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 7107

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7108 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 7167

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 31445944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7168 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 7227

 31445945 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 31446004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7228 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 7287

 31446005 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 31446064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7288 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 7347

 31446065 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 31446124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7348 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 7407

 31446125 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 31446184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7408 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 7467

 31446185 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 31446244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7468 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 7527

 31446245 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCAT 31446284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7528 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCAT 7567

Alignment time is 5.71641 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2753] =>      2753 nucs 'mol-32-3164-237223_2753'

Score:        2753
Aligned:      2753        nucs
Identic:      2753 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443567,31446319]
 second seq =>  [       1,    2753]

 31443567 AATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGC 31443626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGC 60

 31443627 CCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCA 31443686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCA 120

 31443687 TACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTT 31443746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTT 180

 31443747 GACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGA 31443806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGA 240

 31443807 CAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTT 31443866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTT 300

 31443867 CCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCG 31443926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCG 360

 31443927 CAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTT 31443986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTT 420

 31443987 TTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATA 31444046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATA 480

 31444047 TAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGC 31444106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGC 540

 31444107 TGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGG 31444166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGG 600

 31444167 TTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTT 31444226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTT 660

 31444227 AACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTT 31444286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTT 720

 31444287 GTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCA 31444346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCA 780

 31444347 AAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAA 31444406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAA 840

 31444407 CCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATA 31444466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATA 900

 31444467 TGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATA 31444526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATA 960

 31444527 CAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCA 31444586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCA 1020

 31444587 CTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTA 31444646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTA 1080

 31444647 AGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGAT 31444706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGAT 1140

 31444707 GGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTG 31444766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTG 1200

 31444767 CAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAG 31444826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAG 1260

 31444827 GACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGA 31444886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGA 1320

 31444887 TCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACA 31444946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACA 1380

 31444947 AAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAG 31445006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAG 1440

 31445007 GCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTG 31445066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTG 1500

 31445067 CCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGA 31445126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGA 1560

 31445127 TACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCAC 31445186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCAC 1620

 31445187 TTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAA 31445246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAA 1680

 31445247 CATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCA 31445306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCA 1740

 31445307 CCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGA 31445366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGA 1800

 31445367 GGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACT 31445426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACT 1860

 31445427 CTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTG 31445486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAATATCCTTCATGTGTCTG 1920

 31445487 TTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGAC 31445546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGAC 1980

 31445547 CTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGT 31445606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGT 2040

 31445607 TGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGTGCATATAAATATAATGA 31445666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGTGCATATAAATATAATGA 2100

 31445667 GCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCTTTA 31445726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCTTTA 2160

 31445727 AAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTAATT 31445786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTAATT 2220

 31445787 CTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTA 31445846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTA 2280

 31445847 CTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTTCCTAACATTTCCTGATT 31445906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTTCCTAACATTTCCTGATT 2340

 31445907 GATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGG 31445966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGG 2400

 31445967 AATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCA 31446026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCA 2460

 31446027 AAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGTGCA 31446086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGTGCA 2520

 31446087 ACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACTCCT 31446146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACTCCT 2580

 31446147 TTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACACAG 31446206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACACAG 2640

 31446207 GCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTACATTACGTTTCAGAGAG 31446266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTACATTACGTTTCAGAGAG 2700

 31446267 AAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAGAATCACCTAC 31446319
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAGAATCACCTAC 2753

Alignment time is 1.84756 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3264] =>      3264 nucs 'mol-32-316f-035965_3264'

Score:        3254
Aligned:      3265        nucs
Identic:      3264 (100%) nucs =>      1765 (100%)      1499 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443344,31445108] EXCISED REGION [31445110,31446609]
 second seq =>  [       1,    1765] EXCISED REGION [    1766,    3264]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31445109,31445109]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31445109,31445123] to [31445110,31445124]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31443344 CAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGT 31443403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGT 60

 31443404 GAGCTGAGATCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAA 31443463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGCTGAGATCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAA 120

 31443464 AAAATAAAAAAGACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCAC 31443523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAATAAAAAAGACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCAC 180

 31443524 TTCTCATAGGAACTAAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATT 31443583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTCATAGGAACTAAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATT 240

 31443584 CATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGG 31443643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGG 300

 31443644 GGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAG 31443703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAG 360

 31443704 TCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTC 31443763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTC 420

 31443764 CATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAA 31443823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAA 480

 31443824 TTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCT 31443883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCT 540

 31443884 TTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGA 31443943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGA 600

 31443944 TGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCT 31444003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCT 660

 31444004 TGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCA 31444063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCA 720

 31444064 TTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATC 31444123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATC 780

 31444124 ATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGC 31444183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGC 840

 31444184 CTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGG 31444243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGG 900

 31444244 TTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCT 31444303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCT 960

 31444304 TGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCA 31444363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCA 1020

 31444364 GAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTG 31444423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTG 1080

 31444424 ACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAA 31444483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAA 1140

 31444484 TGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACC 31444543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACC 1200

 31444544 AGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATC 31444603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATC 1260

 31444604 CCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAG 31444663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAG 1320

 31444664 TCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTA 31444723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTA 1380

 31444724 TGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCA 31444783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCA 1440

 31444784 ATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCT 31444843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCT 1500

 31444844 CACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAA 31444903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAA 1560

 31444904 TTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAG 31444963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAG 1620

 31444964 CTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATC 31445023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATC 1680

 31445024 CCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCT 31445083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCT 1740

 31445084 GGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTC 31445108
          |||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTC 1765

EXCISED REGION

 31445110 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 31445169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 1825

 31445170 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 31445229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 1885

 31445230 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 31445289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 1945

 31445290 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 31445349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 2005

 31445350 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 31445409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 2065

 31445410 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 31445469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 2125

 31445470 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 31445529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 2185

 31445530 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 31445589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 2245

 31445590 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 31445649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 2305

 31445650 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 31445709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 2365

 31445710 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 31445769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 2425

 31445770 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 31445829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 2485

 31445830 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 31445889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 2545

 31445890 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 31445949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 2605

 31445950 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 31446009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     2606 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGT-CCAAGA 2664

 31446010 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 31446069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 2724

 31446070 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 31446129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 2784

 31446130 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 31446189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 2844

 31446190 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 31446249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 2904

 31446250 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 31446309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 2964

 31446310 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 31446369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 3024

 31446370 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 31446429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 3084

 31446430 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 31446489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 3144

 31446490 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 31446549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 3204

 31446550 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 31446609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 3264

Alignment time is 2.46848 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3929] =>      3929 nucs 'mol-32-3185-155857_3929'

Score:        3928
Aligned:      3928        nucs
Identic:      3928 (100%) nucs =>      1531 (100%)      2397 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443592,31445122] EXCISED REGION [31445124,31447520]
 second seq =>  [       1,    1531] EXCISED REGION [    1533,    3929]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31445123,31445123]
 second seq =>         1 nucs [1532,1532]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31445109,31445123] to [31445110,31445124]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31445122,31445122] to [31445124,31445124]
 second seq =>         1 nucs [1531,1531] to [1533,1533]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31443592 ATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAA 31443651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAA 60

 31443652 TTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATT 31443711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATT 120

 31443712 CAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGAT 31443771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGAT 180

 31443772 CCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTAT 31443831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTAT 240

 31443832 CAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACG 31443891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACG 300

 31443892 TTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTG 31443951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTG 360

 31443952 ATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATT 31444011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATT 420

 31444012 TTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATA 31444071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATA 480

 31444072 GCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCA 31444131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCA 540

 31444132 AACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTA 31444191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTA 600

 31444192 CATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGG 31444251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGG 660

 31444252 TATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCA 31444311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCA 720

 31444312 AAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCC 31444371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCC 780

 31444372 TGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGA 31444431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGA 840

 31444432 GTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCA 31444491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCA 900

 31444492 CATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAAC 31444551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAAC 960

 31444552 AAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGT 31444611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGT 1020

 31444612 CCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATT 31444671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATT 1080

 31444672 GGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAAC 31444731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAAC 1140

 31444732 AAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAG 31444791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAG 1200

 31444792 CATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTG 31444851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTG 1260

 31444852 TAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGAT 31444911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGAT 1320

 31444912 CAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGT 31444971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGT 1380

 31444972 AATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGC 31445031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGC 1440

 31445032 CCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATA 31445091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATA 1500

 31445092 GAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAA 31445122
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAA 1531

EXCISED REGION

 31445124 AGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAG 31445183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 AGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAG 1592

 31445184 CACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGAC 31445243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 CACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGAC 1652

 31445244 CAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGG 31445303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 CAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGG 1712

 31445304 GCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGG 31445363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 GCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGG 1772

 31445364 TGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAA 31445423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 TGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAA 1832

 31445424 ACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAATATCCTTCATGTGT 31445483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 ACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAATATCCTTCATGTGT 1892

 31445484 CTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGG 31445543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 CTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGG 1952

 31445544 GACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAG 31445603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 GACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAG 2012

 31445604 AGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGTGCATATAAATATAA 31445663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 AGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGTGCATATAAATATAA 2072

 31445664 TGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCT 31445723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 TGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCT 2132

 31445724 TTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTA 31445783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 TTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTA 2192

 31445784 ATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGA 31445843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 ATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGA 2252

 31445844 TTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTTCCTAACATTTCCTG 31445903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 TTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTTCCTAACATTTCCTG 2312

 31445904 ATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTTATAATTCTAAGTC 31445963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 ATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTTATAATTCTAAGTC 2372

 31445964 AGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATA 31446023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 AGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATA 2432

 31446024 TCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGT 31446083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 TCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGT 2492

 31446084 GCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACT 31446143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 GCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACT 2552

 31446144 CCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACA 31446203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 CCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACA 2612

 31446204 CAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTACATTACGTTTCAGA 31446263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 CAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTACATTACGTTTCAGA 2672

 31446264 GAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAGAATCACCTACTCTA 31446323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 GAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAGAATCACCTACTCTA 2732

 31446324 TTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTGAGTCACAGTCTCCT 31446383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 TTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTGAGTCACAGTCTCCT 2792

 31446384 CCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTAATGAATTCTGAAAC 31446443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 CCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTAATGAATTCTGAAAC 2852

 31446444 ATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATCCACTCTGACAGCAC 31446503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 ATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATCCACTCTGACAGCAC 2912

 31446504 ATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAATGTAATTAGAAAGC 31446563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 ATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAATGTAATTAGAAAGC 2972

 31446564 AATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTCAGCCTCCTTCTGGC 31446623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 AATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTCAGCCTCCTTCTGGC 3032

 31446624 GGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCGGCTCAGTGATCCTC 31446683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 GGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCGGCTCAGTGATCCTC 3092

 31446684 GTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGTCAGGTGCTGTCTGC 31446743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 GTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGTCAGGTGCTGTCTGC 3152

 31446744 TGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGTCCCACATGGCCTCC 31446803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 TGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGTCCCACATGGCCTCC 3212

 31446804 GGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTGACATGAGCGGCCCA 31446863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 GGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTGACATGAGCGGCCCA 3272

 31446864 ACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCCAGAGGACAAAGAGA 31446923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 ACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCCAGAGGACAAAGAGA 3332

 31446924 ATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCTCACAAATTTTTCCT 31446983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3333 ATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCTCACAAATTTTTCCT 3392

 31446984 CATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCTCCATTTGTCTCTGC 31447043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3393 CATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCTCCATTTGTCTCTGC 3452

 31447044 GTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTGCCCTCGATACTGTA 31447103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 GTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTGCCCTCGATACTGTA 3512

 31447104 ATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTATTTCCACACGGAACT 31447163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 ATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTATTTCCACACGGAACT 3572

 31447164 CCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAGTTTTCCAAATATAT 31447223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 CCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAGTTTTCCAAATATAT 3632

 31447224 AGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCAGTGGTTTCTCATGG 31447283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 AGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCAGTGGTTTCTCATGG 3692

 31447284 TCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTATAAATAAAGTTTTA 31447343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 TCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTATAAATAAAGTTTTA 3752

 31447344 TTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGCATTTGTGCTATGAT 31447403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 TTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGCATTTGTGCTATGAT 3812

 31447404 AGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCCTAAAATACTATTTG 31447463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 AGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCCTAAAATACTATTTG 3872

 31447464 GCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTCCAGTTTTCCTT 31447520
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 GCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTCCAGTTTTCCTT 3929

Alignment time is 2.96767 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    5149] =>      5149 nucs 'mol-32-321f-079051_5149'

Score:        5128
Aligned:      5150        nucs
Identic:      5148 (100%) nucs =>      1562 (100%)      3586 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443547,31445108] EXCISED REGION [31445110,31448697]
 second seq =>  [       1,    1562] EXCISED REGION [    1563,    5149]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31445109,31445109]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31448367,31448367]
 second seq =>         1 nucs [4819,4819]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31445109,31445123] to [31445110,31445124]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31443547 AATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCCATGGC 31443606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCCATGGC 60

 31443607 CCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATGAGACT 31443666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATGAGACT 120

 31443667 TGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATA 31443726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATA 180

 31443727 TTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAA 31443786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAA 240

 31443787 AAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGC 31443846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGC 300

 31443847 AAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTT 31443906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTT 360

 31443907 AGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAG 31443966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAG 420

 31443967 AAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACA 31444026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACA 480

 31444027 GTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAG 31444086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAG 540

 31444087 TCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGC 31444146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGC 600

 31444147 ACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTAT 31444206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTAT 660

 31444207 TGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAA 31444266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAA 720

 31444267 AGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGA 31444326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGA 780

 31444327 AGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAA 31444386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAA 840

 31444387 CTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCA 31444446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCA 900

 31444447 TTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATA 31444506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATA 960

 31444507 TCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTC 31444566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTC 1020

 31444567 ACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTG 31444626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTG 1080

 31444627 CCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGG 31444686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGG 1140

 31444687 ACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTG 31444746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTG 1200

 31444747 TATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAA 31444806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAA 1260

 31444807 ACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTT 31444866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTT 1320

 31444867 GGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACAT 31444926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACAT 1380

 31444927 GGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTG 31444986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTG 1440

 31444987 TAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGC 31445046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGC 1500

 31445047 TGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTC 31445106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTC 1560

 31445107 TC 31445108
          ||
     1561 TC 1562

EXCISED REGION

 31445110 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 31445169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 1622

 31445170 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 31445229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 1682

 31445230 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 31445289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 1742

 31445290 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 31445349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 1802

 31445350 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 31445409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 1862

 31445410 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 31445469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 1922

 31445470 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 31445529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 1982

 31445530 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 31445589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 2042

 31445590 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 31445649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 2102

 31445650 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 31445709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 2162

 31445710 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 31445769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 2222

 31445770 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 31445829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 2282

 31445830 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 31445889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 2342

 31445890 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 31445949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 2402

 31445950 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 31446009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 2462

 31446010 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 31446069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 2522

 31446070 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 31446129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 2582

 31446130 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 31446189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 2642

 31446190 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 31446249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 2702

 31446250 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 31446309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 2762

 31446310 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 31446369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 2822

 31446370 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 31446429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 2882

 31446430 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 31446489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 2942

 31446490 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 31446549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 3002

 31446550 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 31446609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 3062

 31446610 AGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCG 31446669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 AGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCG 3122

 31446670 GCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGT 31446729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 GCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGT 3182

 31446730 CAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGT 31446789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 CAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGT 3242

 31446790 CCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTG 31446849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 CCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTG 3302

 31446850 ACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCC 31446909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 ACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCC 3362

 31446910 AGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCT 31446969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 AGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCT 3422

 31446970 CACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCT 31447029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 CACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCT 3482

 31447030 CCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTG 31447089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 CCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTG 3542

 31447090 CCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTAT 31447149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 CCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTAT 3602

 31447150 TTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAG 31447209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 TTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAG 3662

 31447210 TTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCA 31447269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 TTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCA 3722

 31447270 GTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTA 31447329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 GTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTA 3782

 31447330 TAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGC 31447389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 TAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGC 3842

 31447390 ATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCC 31447449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 ATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCC 3902

 31447450 TAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTC 31447509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 TAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTC 3962

 31447510 CAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAGATAGA 31447569
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     3963 CAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAGATAGA 4021

 31447570 GTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCA 31447629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4022 GTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCA 4081

 31447630 CCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATAAGTAC 31447689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4082 CCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATAAGTAC 4141

 31447690 ACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTTTTGTA 31447749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4142 ACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTTTTGTA 4201

 31447750 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCG 31447809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4202 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCG 4261

 31447810 TGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTTTCATG 31447869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4262 TGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTTTCATG 4321

 31447870 CTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTCCAGGC 31447929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4322 CTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTCCAGGC 4381

 31447930 CCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGACCTCC 31447989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4382 CCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGACCTCC 4441

 31447990 CCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATATTAAT 31448049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4442 CCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATATTAAT 4501

 31448050 CAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAAGTTAT 31448109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4502 CAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAAGTTAT 4561

 31448110 GTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGTTACTTAATAGATATTT 31448169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4562 GTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGTTACTTAATAGATATTT 4621

 31448170 GGAGATTTTCTTGACTCGGAAACTAGGAGTCTTTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAATAGATA 31448229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4622 GGAGATTTTCTTGACTCGGAAACTAGGAGTCTTTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAATAGATA 4681

 31448230 ATCAACATTCCCCTACTGGGGAGAAACAAGGTGGGAGAATGAATACAACCTATGCTCCCC 31448289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4682 ATCAACATTCCCCTACTGGGGAGAAACAAGGTGGGAGAATGAATACAACCTATGCTCCCC 4741

 31448290 TAGGAAGGTTTTAAGAATTTTATTTTGTGTTTCTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTGCATAAG 31448349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4742 TAGGAAGGTTTTAAGAATTTTATTTTGTGTTTCTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTGCATAAG 4801

 31448350 AGATTAAGGAAATACACAGCTACTTTATAAGAGACTCCTTAAGAAAGAGATGGAGGCAGG 31448409
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4802 AGATTAAGGAAATACACCGCTACTTTATAAGAGACTCCTTAAGAAAGAGATGGAGGCAGG 4861

 31448410 ACCAAGGAATGCACAAAGGATGGGGTATTTTGCCATAAAAAGTAACTGCAATACACTGAA 31448469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4862 ACCAAGGAATGCACAAAGGATGGGGTATTTTGCCATAAAAAGTAACTGCAATACACTGAA 4921

 31448470 TGTGTCCCCCAAAATTCATGGTTTTAAAAAATTAAATAACTGCTTTTATTGAGATATAAT 31448529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4922 TGTGTCCCCCAAAATTCATGGTTTTAAAAAATTAAATAACTGCTTTTATTGAGATATAAT 4981

 31448530 TTGATGTTTTGATATGCATATGTATTGGGAAATGATTACTATAGTCAGGCTAATTAACAT 31448589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4982 TTGATGTTTTGATATGCATATGTATTGGGAAATGATTACTATAGTCAGGCTAATTAACAT 5041

 31448590 ATCCATTACCTCACATAATTACCTTATTTTTGTAATGAGAACACTTAAGATTCACTGTCT 31448649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5042 ATCCATTACCTCACATAATTACCTTATTTTTGTAATGAGAACACTTAAGATTCACTGTCT 5101

 31448650 TAGCAAATTTCGAGTATACAATGCAGCATTATTAGCTATAGTCACCAT 31448697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5102 TAGCAAATTTCGAGTATACAATGCAGCATTATTAGCTATAGTCACCAT 5149

Alignment time is 3.90666 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    7199] =>      7199 nucs 'mol-32-322a-080014_7199'

Score:        7167
Aligned:      7202        nucs
Identic:      7198 (100%) nucs =>      6750 (100%)       448 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31442184,31448937] EXCISED REGION [31448946,31449393]
 second seq =>  [       1,    6751] EXCISED REGION [    6752,    7199]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [31448938,31448945]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        35 nucs [31448938,31448972] to [31448946,31448980]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [31448933,31448937] to [31448946,31448950]
 second seq =>         5 nucs [6747,6751] to [6752,6756]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [31448938,31448941] to [31448942,31448945]
 second seq =>         0 nucs

 31442184 AAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGT 31442243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGT 60

 31442244 GTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCATATGT 31442303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCATATGT 120

 31442304 GCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATTCTAC 31442363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATTCTAC 180

 31442364 CATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATTTCCC 31442423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATTTCCC 240

 31442424 ACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGA 31442483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGA 300

 31442484 TATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAA 31442543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAA 360

 31442544 GGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTC 31442603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTC 420

 31442604 CACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCC 31442663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCC 480

 31442664 AGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAG 31442723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAG 540

 31442724 CCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGT 31442783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGT 600

 31442784 TCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGA 31442843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGA 660

 31442844 GGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCC 31442903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCC 720

 31442904 TTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTA 31442963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTA 780

 31442964 GTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGT 31443023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGT 840

 31443024 TTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGG 31443083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGG 900

 31443084 GGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTG 31443143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTG 960

 31443144 ATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGT 31443203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGT 1020

 31443204 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCAT 31443263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCAT 1080

 31443264 CCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTG 31443323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTG 1140

 31443324 GTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACC 31443383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACC 1200

 31443384 CAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAG 31443443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAG 1260

 31443444 AGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCC 31443503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCC 1320

 31443504 AGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTAAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGC 31443563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTAAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGC 1380

 31443564 AAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCA 31443623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCA 1440

 31443624 GGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAA 31443683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAA 1500

 31443684 CCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCT 31443743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCT 1560

 31443744 CTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTT 31443803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTT 1620

 31443804 AGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGAC 31443863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGAC 1680

 31443864 TTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTA 31443923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTA 1740

 31443924 CCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAA 31443983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAA 1800

 31443984 GTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGT 31444043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGT 1860

 31444044 ATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATG 31444103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATG 1920

 31444104 TGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACA 31444163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACA 1980

 31444164 TGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAA 31444223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAA 2040

 31444224 CTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCT 31444283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCT 2100

 31444284 GTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAA 31444343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAA 2160

 31444344 GCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCA 31444403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCA 2220

 31444404 TAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGAC 31444463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGAC 2280

 31444464 ATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGAC 31444523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGAC 2340

 31444524 ATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAG 31444583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAG 2400

 31444584 GCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCT 31444643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCT 2460

 31444644 TTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGT 31444703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGT 2520

 31444704 GATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATA 31444763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATA 2580

 31444764 CTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAG 31444823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAG 2640

 31444824 TAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGC 31444883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGC 2700

 31444884 AGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCT 31444943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCT 2760

 31444944 ACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAG 31445003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAG 2820

 31445004 GAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATC 31445063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATC 2880

 31445064 TTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAA 31445123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAA 2940

 31445124 AGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAG 31445183
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 -GATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAG 2999

 31445184 CACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGAC 31445243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAAACCAGCCTGAC 3059

 31445244 CAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGG 31445303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGG 3119

 31445304 GCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGG 31445363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTTTGAACCCGGGAGG 3179

 31445364 TGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAA 31445423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCAACAAGACTGAA 3239

 31445424 ACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAATATCCTTCATGTGT 31445483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 ACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAATATCCTTCATGTGT 3299

 31445484 CTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGG 31445543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 CTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGGTCTGGACCACCTGG 3359

 31445544 GACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAG 31445603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTTGACAAAATCAAAAG 3419

 31445604 AGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGTGCATATAAATATAA 31445663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 AGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGTGCATATAAATATAA 3479

 31445664 TGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCT 31445723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTAAAGCCATTTCTTCT 3539

 31445724 TTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTA 31445783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGATTCTAAATTTTACTA 3599

 31445784 ATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGA 31445843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 ATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAAAGAAAAGGGAAAGA 3659

 31445844 TTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTTCCTAACATTTCCTG 31445903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTTCCTAACATTTCCTG 3719

 31445904 ATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTTATAATTCTAAGTC 31445963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 ATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTTATAATTCTAAGTC 3779

 31445964 AGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATA 31446023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 AGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATA 3839

 31446024 TCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGT 31446083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGT 3899

 31446084 GCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACT 31446143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 GCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACT 3959

 31446144 CCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACA 31446203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 CCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACA 4019

 31446204 CAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTACATTACGTTTCAGA 31446263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 CAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTACATTACGTTTCAGA 4079

 31446264 GAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAGAATCACCTACTCTA 31446323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 GAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAGAATCACCTACTCTA 4139

 31446324 TTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTGAGTCACAGTCTCCT 31446383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTGAGTCACAGTCTCCT 4199

 31446384 CCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTAATGAATTCTGAAAC 31446443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 CCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTAATGAATTCTGAAAC 4259

 31446444 ATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATCCACTCTGACAGCAC 31446503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 ATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATCCACTCTGACAGCAC 4319

 31446504 ATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAATGTAATTAGAAAGC 31446563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 ATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAATGTAATTAGAAAGC 4379

 31446564 AATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTCAGCCTCCTTCTGGC 31446623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 AATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTCAGCCTCCTTCTGGC 4439

 31446624 GGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCGGCTCAGTGATCCTC 31446683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 GGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCGGCTCAGTGATCCTC 4499

 31446684 GTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGTCAGGTGCTGTCTGC 31446743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 GTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGTCAGGTGCTGTCTGC 4559

 31446744 TGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGTCCCACATGGCCTCC 31446803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 TGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGTCCCACATGGCCTCC 4619

 31446804 GGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTGACATGAGCGGCCCA 31446863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 GGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTGACATGAGCGGCCCA 4679

 31446864 ACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCCAGAGGACAAAGAGA 31446923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 ACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCCAGAGGACAAAGAGA 4739

 31446924 ATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCTCACAAATTTTTCCT 31446983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 ATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCTCACAAATTTTTCCT 4799

 31446984 CATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCTCCATTTGTCTCTGC 31447043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 CATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCTCCATTTGTCTCTGC 4859

 31447044 GTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTGCCCTCGATACTGTA 31447103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 GTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTGCCCTCGATACTGTA 4919

 31447104 ATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTATTTCCACACGGAACT 31447163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 ATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTATTTCCACACGGAACT 4979

 31447164 CCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAGTTTTCCAAATATAT 31447223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 CCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAGTTTTCCAAATATAT 5039

 31447224 AGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCAGTGGTTTCTCATGG 31447283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 AGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCAGTGGTTTCTCATGG 5099

 31447284 TCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTATAAATAAAGTTTTA 31447343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 TCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTATAAATAAAGTTTTA 5159

 31447344 TTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGCATTTGTGCTATGAT 31447403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 TTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGCATTTGTGCTATGAT 5219

 31447404 AGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCCTAAAATACTATTTG 31447463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 AGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCCTAAAATACTATTTG 5279

 31447464 GCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTCCAGTTTTCCTTTCT 31447523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 GCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTCCAGTTTTCCTTTCT 5339

 31447524 GGTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAGATAGAGTCTCGCTCTGTCG 31447583
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||
     5340 GGTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT--CGAGATAGAGTCTCGCTCTGTCG 5397

 31447584 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGGTTCAA 31447643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGGTTCAA 5457

 31447644 GCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATAAGTACACCCAAACGGTAGT 31447703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 GCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATAAGTACACCCAAACGGTAGT 5517

 31447704 ATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAT 31447763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 ATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAT 5577

 31447764 GGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCT 31447823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 GGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCT 5637

 31447824 CGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTTTCATGCTGTCGTGCCTTGG 31447883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 CGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTTTCATGCTGTCGTGCCTTGG 5697

 31447884 CTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTCCAGGCCCATTTCAGGGGGA 31447943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 CTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTCCAGGCCCATTTCAGGGGGA 5757

 31447944 CCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGACCTCCCCTCACTTTTTACT 31448003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 CCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGACCTCCCCTCACTTTTTACT 5817

 31448004 TCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATATTAATCAGTATCCTATTGC 31448063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 TCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATATTAATCAGTATCCTATTGC 5877

 31448064 TTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAAGTTATGTCTTATCCATCTT 31448123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 TTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAAGTTATGTCTTATCCATCTT 5937

 31448124 TAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGTTACTTAATAGATATTTGGAGATTTTCTTGA 31448183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 TAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGTTACTTAATAGATATTTGGAGATTTTCTTGA 5997

 31448184 CTCGGAAACTAGGAGTCTTTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAATAGATAATCAACATTCCCCT 31448243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 CTCGGAAACTAGGAGTCTTTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAATAGATAATCAACATTCCCCT 6057

 31448244 ACTGGGGAGAAACAAGGTGGGAGAATGAATACAACCTATGCTCCCCTAGGAAGGTTTTAA 31448303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 ACTGGGGAGAAACAAGGTGGGAGAATGAATACAACCTATGCTCCCCTAGGAAGGTTTTAA 6117

 31448304 GAATTTTATTTTGTGTTTCTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTGCATAAGAGATTAAGGAAATA 31448363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 GAATTTTATTTTGTGTTTCTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTGCATAAGAGATTAAGGAAATA 6177

 31448364 CACAGCTACTTTATAAGAGACTCCTTAAGAAAGAGATGGAGGCAGGACCAAGGAATGCAC 31448423
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 CACCGCTACTTTATAAGAGACTCCTTAAGAAAGAGATGGAGGCAGGACCAAGGAATGCAC 6237

 31448424 AAAGGATGGGGTATTTTGCCATAAAAAGTAACTGCAATACACTGAATGTGTCCCCCAAAA 31448483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 AAAGGATGGGGTATTTTGCCATAAAAAGTAACTGCAATACACTGAATGTGTCCCCCAAAA 6297

 31448484 TTCATGGTTTTAAAAAATTAAATAACTGCTTTTATTGAGATATAATTTGATGTTTTGATA 31448543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 TTCATGGTTTTAAAAAATTAAATAACTGCTTTTATTGAGATATAATTTGATGTTTTGATA 6357

 31448544 TGCATATGTATTGGGAAATGATTACTATAGTCAGGCTAATTAACATATCCATTACCTCAC 31448603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 TGCATATGTATTGGGAAATGATTACTATAGTCAGGCTAATTAACATATCCATTACCTCAC 6417

 31448604 ATAATTACCTTATTTTTGTAATGAGAACACTTAAGATTCACTGTCTTAGCAAATTTCGAG 31448663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 ATAATTACCTTATTTTTGTAATGAGAACACTTAAGATTCACTGTCTTAGCAAATTTCGAG 6477

 31448664 TATACAATGCAGCATTATTAGCTATAGTCACCATGATGTACATTAGATTTCTAGAAGCTA 31448723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6478 TATACAATGCAGCATTATTAGCTATAGTCACCATGATGTACATTAGATTTCTAGAAGCTA 6537

 31448724 CTTCATCTCAAATAAATGAAAGTTTATACCTTTTGACTAACGTCTCCATTTCTCCCAGCT 31448783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6538 CTTCATCTCAAATAAATGAAAGTTTATACCTTTTGACTAACGTCTCCATTTCTCCCAGCT 6597

 31448784 CTCAGCCCCTAGAAGCTGTAGAGATCCATGTTTTCGCAAATGACAGGATTTAGAATTTCC 31448843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6598 CTCAGCCCCTAGAAGCTGTAGAGATCCATGTTTTCGCAAATGACAGGATTTAGAATTTCC 6657

 31448844 TTCTTTTTTAAAGCTGAATAATATTCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCACACACA 31448903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6658 TTCTTTTTTAAAGCTGAATAATATTCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCACACACA 6717

 31448904 CATGCATCTATGTATTATCTATCTATCCATCTAT 31448937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6718 CATGCATCTATGTATTATCTATCTATCCATCTAT 6751

EXCISED REGION

 31448946 TCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTCTCTATCTAGCAATTTCTTTATCCA 31449005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6752 TCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTCTCTATCTAGCAATTTCTTTATCCA 6811

 31449006 TTTACCTGTTGACAGACACAGATTGTTTCCACATCTTGGTTAGTGTGAATAATGCTGCAA 31449065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6812 TTTACCTGTTGACAGACACAGATTGTTTCCACATCTTGGTTAGTGTGAATAATGCTGCAA 6871

 31449066 TGAACATGGGAGTGTAGCTATCTCTTCAATATACTGATTTTATTTTCTATAACTTTGTAA 31449125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6872 TGAACATGGGAGTGTAGCTATCTCTTCAATATACTGATTTTATTTTCTATAACTTTGTAA 6931

 31449126 TATACTTTGGGATTGAGAAGTGTGATGCCTCCAGCTTCATTCTTTTTTTTCTCGAGACTG 31449185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6932 TATACTTTGGGATTGAGAAGTGTGATGCCTCCAGCTTCATTCTTTTTTTTCTCGAGACTG 6991

 31449186 CTTTGGCTATTCAGGATCGCTTGTTGTTCCATACAAATTTTATGATTATATTTTCCATTT 31449245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6992 CTTTGGCTATTCAGGATCGCTTGTTGTTCCATACAAATTTTATGATTATATTTTCCATTT 7051

 31449246 CTGTGAAAATTACCACTAGAATTTTGATGGGCATTGTGTTGAATCTCTGGATAACTCTGG 31449305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7052 CTGTGAAAATTACCACTAGAATTTTGATGGGCATTGTGTTGAATCTCTGGATAACTCTGG 7111

 31449306 GTTGTATGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAGTCCACAAACACAGAATATCTTTCC 31449365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7112 GTTGTATGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAGTCCACAAACACAGAATATCTTTCC 7171

 31449366 ATTTGTGTCTTCTTCAATTCCTTTCATC 31449393
          ||||||||||||||||||||||||||||
     7172 ATTTGTGTCTTCTTCAATTCCTTTCATC 7199

Alignment time is 5.38649 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    4998] =>      4998 nucs 'mol-32-32fb-194963_4998'

Score:        4929
Aligned:      5003        nucs
Identic:      4993 (100%) nucs =>        83 (100%)      4910 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443268,31443350] EXCISED REGION [31444865,31449781]
 second seq =>  [       1,      83] EXCISED REGION [      84,    4998]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31443268 GCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGA 31443327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGA 60

 31443328 TGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 31443350
          |||||||||||||||||||||||
       61 TGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 83

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       84 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 143

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      144 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 203

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      204 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 263

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      264 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 323

 31445105 TCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTG 31445163
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      324 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTG 383

 31445164 GCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAG 31445223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      384 GCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAG 443

 31445224 GAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAA 31445283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      444 GAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAA 503

 31445284 TTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAG 31445343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      504 TTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAG 563

 31445344 AATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCA 31445403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      564 AATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCA 623

 31445404 GCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGG 31445463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      624 GCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGG 683

 31445464 GATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCT 31445523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      684 GATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCT 743

 31445524 TCTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTT 31445583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      744 TCTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTT 803

 31445584 TATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAA 31445643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      804 TATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAA 863

 31445644 TATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCA 31445703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      864 TATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCA 923

 31445704 TAATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTT 31445763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      924 TAATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTT 983

 31445764 CAAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACAT 31445823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      984 CAAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACAT 1043

 31445824 ATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAAT 31445883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1044 ATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAAT 1103

 31445884 ATATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCAT 31445943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1104 ATATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCAT 1163

 31445944 TATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTC 31446003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1164 TATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTC 1223

 31446004 CCAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTT 31446063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1224 CCAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTT 1283

 31446064 GCATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATG 31446123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1284 GCATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATG 1343

 31446124 TGGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGG 31446183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1344 TGGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGG 1403

 31446184 AGAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGG 31446243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1404 AGAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGG 1463

 31446244 GTATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTC 31446303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1464 GTATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTC 1523

 31446304 TTGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTC 31446363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1524 TTGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTC 1583

 31446364 CCACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAG 31446423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1584 CCACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAG 1643

 31446424 ATGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTC 31446483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1644 ATGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTC 1703

 31446484 TAGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGA 31446543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 TAGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGA 1763

 31446544 GAGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCAC 31446603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 GAGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCAC 1823

 31446604 AGCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGT 31446663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 AGCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGT 1883

 31446664 CTAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGA 31446723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 CTAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGA 1943

 31446724 GAGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCC 31446783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 GAGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCC 2003

 31446784 CCATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGA 31446843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 CCATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGA 2063

 31446844 GACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGA 31446903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 GACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGA 2123

 31446904 GCATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTAC 31446963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 GCATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTAC 2183

 31446964 ATTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTG 31447023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 ATTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTG 2243

 31447024 CTCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCA 31447083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 CTCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCA 2303

 31447084 TTTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGC 31447143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 TTTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGC 2363

 31447144 TGTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCA 31447203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 TGTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCA 2423

 31447204 GATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAA 31447263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 GATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAA 2483

 31447264 TCTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTG 31447323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 TCTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTG 2543

 31447324 TTTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTAT 31447383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 TTTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTAT 2603

 31447384 GGCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTC 31447443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 GGCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTC 2663

 31447444 AAAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACT 31447503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 AAAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACT 2723

 31447504 GTGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGA 31447563
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2724 GTGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGA 2782

 31447564 GATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAA 31447623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 GATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAA 2842

 31447624 CCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAAT 31447683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2843 CCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAAT 2902

 31447684 AAGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTT 31447743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2903 AAGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTT 2962

 31447744 TTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTG 31447803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 TTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTG 3022

 31447804 ACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCT 31447863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3023 ACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCT 3082

 31447864 TTCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCT 31447923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3083 TTCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCT 3142

 31447924 CCAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTG 31447983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3143 CCAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTG 3202

 31447984 ACCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAAT 31448043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3203 ACCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAAT 3262

 31448044 ATTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGA 31448103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3263 ATTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGA 3322

 31448104 AGTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGTTACTTAATAG 31448163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3323 AGTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGTTACTTAATAG 3382

 31448164 ATATTTGGAGATTTTCTTGACTCGGAAACTAGGAGTCTTTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAA 31448223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3383 ATATTTGGAGATTTTCTTGACTCGGAAACTAGGAGTCTTTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAA 3442

 31448224 TAGATAATCAACATTCCCCTACTGGGGAGAAACAAGGTGGGAGAATGAATACAACCTATG 31448283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3443 TAGATAATCAACATTCCCCTACTGGGGAGAAACAAGGTGGGAGAATGAATACAACCTATG 3502

 31448284 CTCCCCTAGGAAGGTTTTAAGAATTTTATTTTGTGTTTCTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTG 31448343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3503 CTCCCCTAGGAAGGTTTTAAGAATTTTATTTTGTGTTTCTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTG 3562

 31448344 CATAAGAGATTAAGGAAATACACAGCTACTTTATAAGAGACTCCTTAAGAAAGAGATGGA 31448403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3563 CATAAGAGATTAAGGAAATACACAGCTACTTTATAAGAGACTCCTTAAGAAAGAGATGGA 3622

 31448404 GGCAGGACCAAGGAATGCACAAAGGATGGGGTATTTTGCCATAAAAAGTAACTGCAATAC 31448463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3623 GGCAGGACCAAGGAATGCACAAAGGATGGGGTATTTTGCCATAAAAAGTAACTGCAATAC 3682

 31448464 ACTGAATGTGTCCCCCAAAATTCATGGTTTTAAAAAATTAAATAACTGCTTTTATTGAGA 31448523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3683 ACTGAATGTGTCCCCCAAAATTCATGGTTTTAAAAAATTAAATAACTGCTTTTATTGAGA 3742

 31448524 TATAATTTGATGTTTTGATATGCATATGTATTGGGAAATGATTACTATAGTCAGGCTAAT 31448583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3743 TATAATTTGATGTTTTGATATGCATATGTATTGGGAAATGATTACTATAGTCAGGCTAAT 3802

 31448584 TAACATATCCATTACCTCACATAATTACCTTATTTTTGTAATGAGAACACTTAAGATTCA 31448643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3803 TAACATATCCATTACCTCACATAATTACCTTATTTTTGTAATGAGAACACTTAAGATTCA 3862

 31448644 CTGTCTTAGCAAATTTCGAGTATACAATGCAGCATTATTAGCTATAGTCACCATGATGTA 31448703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3863 CTGTCTTAGCAAATTTCGAGTATACAATGCAGCATTATTAGCTATAGTCACCATGATGTA 3922

 31448704 CATTAGATTTCTAGAAGCTACTTCATCTCAAATAAATGAAAGTTTATACCTTTTGACTAA 31448763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3923 CATTAGATTTCTAGAAGCTACTTCATCTCAAATAAATGAAAGTTTATACCTTTTGACTAA 3982

 31448764 CGTCTCCATTTCTCCCAGCTCTCAGCCCCTAGAAGCTGTAGAGATCCATGTTTTCGCAAA 31448823
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3983 CGTCTCCATTTCTCCCAGCTCTCAGCCCCTAGAAGCTGTAGAGATCCATATTTTCGCAAA 4042

 31448824 TGACAGGATTTAGAATTTCCTTCTTTTTTAAAGCTGAATAATATTCCAGTG--TGTGTGT 31448881
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||
     4043 TGACAGGATTTAGAATTTCCTTCTTTTTTAAAGCTGAATAATATTCCAGTGTATGTGTGT 4102

 31448882 GTGTGTGTGTGTATCACACACACATGCATCTATGTATTATCTATCTATCCATCTATTCTA 31448941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4103 GTGTGTGTGTGTATCACACACACATGCATCTATGTATTATCTATCTATCCATCTATTCTA 4162

 31448942 TCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTCTCTATCTAGCAATTTCTTTA 31449001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||
     4163 TCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTA----TCTATCTAGCAATTTCTTTA 4218

 31449002 TCCATTTACCTGTTGACAGACACAGATTGTTTCCACATCTTGGTTAGTGTGAATAATGCT 31449061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 TCCATTTACCTGTTGACAGACACAGATTGTTTCCACATCTTGGTTAGTGTGAATAATGCT 4278

 31449062 GCAATGAACATGGGAGTGTAGCTATCTCTTCAATATACTGATTTTATTTTCTATAACTTT 31449121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4279 GCAATGAACATGGGAGTGTAGCTATCTCTTCAATATACTGATTTTATTTTCTATAACTTT 4338

 31449122 GTAATATACTTTGGGATTGAGAAGTGTGATGCCTCCAGCTTCATTCTTTTTTTTCTCGAG 31449181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4339 GTAATATACTTTGGGATTGAGAAGTGTGATGCCTCCAGCTTCATTCTTTTTTTTCTCGAG 4398

 31449182 ACTGCTTTGGCTATTCAGGATCGCTTGTTGTTCCATACAAATTTTATGATTATATTTTCC 31449241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 ACTGCTTTGGCTATTCAGGATCGCTTGTTGTTCCATACAAATTTTATGATTATATTTTCC 4458

 31449242 ATTTCTGTGAAAATTACCACTAGAATTTTGATGGGCATTGTGTTGAATCTCTGGATAACT 31449301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 ATTTCTGTGAAAATTACCACTAGAATTTTGATGGGCATTGTGTTGAATCTCTGGATAACT 4518

 31449302 CTGGGTTGTATGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAGTCCACAAACACAGAATATCT 31449361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 CTGGGTTGTATGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAGTCCACAAACACAGAATATCT 4578

 31449362 TTCCATTTGTGTCTTCTTCAATTCCTTTCATCAATATCTTATAGTTTTCTATGTAATAGA 31449421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 TTCCATTTGTGTCTTCTTCAATTCCTTTCATCAATATCTTATAGTTTTCTATGTAATAGA 4638

 31449422 TCTTTCACCTCCTTGTTTAAATATACTTCTAAATACTTTATTATTTTTTATGCTATTATA 31449481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 TCTTTCACCTCCTTGTTTAAATATACTTCTAAATACTTTATTATTTTTTATGCTATTATA 4698

 31449482 AATGAGATTTTTTATTGATTTCCTTTTTGGATAATTTGTTGCCGGTGTAAAGAAACACTA 31449541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4699 AATGAGATTTTTTATTGATTTCCTTTTTGGATAATTTGTTGCCGGTGTAAAGAAACACTA 4758

 31449542 CTGATTTCTGCATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTGAATTTATTAGTTCTAACAG 31449601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 CTGATTTCTGCATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTGAATTTATTAGTTCTAACAG 4818

 31449602 TTTTTTATAGAGTCTTTAGGGTTCTGTACATATATAATCATATCATTTGCAAACAGAGAT 31449661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 TTTTTTATAGAGTCTTTAGGGTTCTGTACATATATAATCATATCATTTGCAAACAGAGAT 4878

 31449662 AATTTTACTTCTTTCTTTTTTATTTGGATGCCTTTTATTTCTTTTTCTTGTCTAATCACT 31449721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 AATTTTACTTCTTTCTTTTTTATTTGGATGCCTTTTATTTCTTTTTCTTGTCTAATCACT 4938

 31449722 CTGGCGAGAACTTTTAGTACTATGTTGAATAGAAGTCATAGTGTGGACATTCATGTACCA 31449781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 CTGGCGAGAACTTTTAGTACTATGTTGAATAGAAGTCATAGTGTGGACATTCATGTACCA 4998

Alignment time is 3.78252 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,   10870] =>     10870 nucs 'mol-32-3311-155420_10870'

Score:       10782
Aligned:     10876        nucs
Identic:     10865 (100%) nucs =>      8604 (100%)      2261 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31434737,31443350] EXCISED REGION [31444865,31447126]
 second seq =>  [       1,    8608] EXCISED REGION [    8609,   10870]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31434737 TCCCTGTCATGTCCCTGCACCCACCTAGCACATTTAATCTCTGGCACACCTGCAGTATAC 31434796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCCTGTCATGTCCCTGCACCCACCTAGCACATTTAATCTCTGGCACACCTGCAGTATAC 60

 31434797 GGATGAATAAGACATGGTCCCTGTCCCTCAACTTCTTGCAGTCTGGAGACAGTAACAGCC 31434856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGATGAATAAGACATGGTCCCTGTCCCTCAACTTCTTGCAGTCTGGAGACAGTAACAGCC 120

 31434857 AGGCATCGGTCTTTTTGAGATAATAAAGCGTATGGTGACATTTGACCTAGGTCTTGAAGG 31434916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGCATCGGTCTTTTTGAGATAATAAAGCGTATGGTGACATTTGACCTAGGTCTTGAAGG 180

 31434917 ACACAGAGCAGGTAAGCGACAGGTGTAAAGCCCTGAGTTGGTGAGCGGGGAGGTCAGGGA 31434976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACACAGAGCAGGTAAGCGACAGGTGTAAAGCCCTGAGTTGGTGAGCGGGGAGGTCAGGGA 240

 31434977 GATCAAGGAGGGAGTGCCTGCCTCATGGGGACTAACTGGCAAGAAGTGGGGCTGGAGAGA 31435036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATCAAGGAGGGAGTGCCTGCCTCATGGGGACTAACTGGCAAGAAGTGGGGCTGGAGAGA 300

 31435037 CAGCTCCCCGCCCAGGCCTGCCTAAGTGCTCTGTGATCAGCTGTTAGAGGTCCTAGTTAC 31435096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGCTCCCCGCCCAGGCCTGCCTAAGTGCTCTGTGATCAGCTGTTAGAGGTCCTAGTTAC 360

 31435097 TGCCTGTGACATTCCTGCCATGCTGCCTCTTCAATGTGCCCAGATTCCCAGGTCACGCTC 31435156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      361 TGCCTGTGACATTCCTGCCATGCTGCCTCTTCAATGTGCCCAGATTCCCAGGTCACACTC 420

 31435157 CTTCAGCCACCTTTCATGACTTGCTGCTAAGGTGGAAGGGAAAACCCAGAACTTTGTTCT 31435216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTCAGCCACCTTTCATGACTTGCTGCTAAGGTGGAAGGGAAAACCCAGAACTTTGTTCT 480

 31435217 TGGGGGGTAGCGAGGGAGTTGCCAAAGGCTGTTTATTTGTCTTCCTTTTGACTTTCAATC 31435276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGGGGGTAGCGAGGGAGTTGCCAAAGGCTGTTTATTTGTCTTCCTTTTGACTTTCAATC 540

 31435277 AAACCACATGTAACTGCTCCCTGGATCCCTGCTCAGGTGTGCAGCAGACCTTGCTGTGCA 31435336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAACCACATGTAACTGCTCCCTGGATCCCTGCTCAGGTGTGCAGCAGACCTTGCTGTGCA 600

 31435337 CGAGTCTCATGCCTGGCGTGGACTAGCCTCGCCAGAGACTCCTGTCTGAGCCCTCAAAAA 31435396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CGAGTCTCATGCCTGGCGTGGACTAGCCTCGCCAGAGACTCCTGTCTGAGCCCTCAAAAA 660

 31435397 AGTCTGCAGCACACGTCTAAAAATAGGTAAGCGAAGAAGCCCAGACTCAGGGAGAAATGC 31435456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTCTGCAGCACACGTCTAAAAATAGGTAAGCGAAGAAGCCCAGACTCAGGGAGAAATGC 720

 31435457 TCTTACCAGGCCCCAGAAAAGCCAGCTGTATCAAGTTCAGGCCTCTTCCCCGCCAAGCCA 31435516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTTACCAGGCCCCAGAAAAGCCAGCTGTATCAAGTTCAGGCCTCTTCCCCGCCAAGCCA 780

 31435517 CAGGGTCGTGAGAGACTTCCCATCTTGGCTTTCGGAGTTGGGAAAGGAGGGGAGGAAGTG 31435576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGGGTCGTGAGAGACTTCCCATCTTGGCTTTCGGAGTTGGGAAAGGAGGGGAGGAAGTG 840

 31435577 GAGAGGCAGGATGTGGTGGAGGGGCTGCGTGCTGCCTGCAGGGCTGGAGTCTCAAAGCAG 31435636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGAGGCAGGATGTGGTGGAGGGGCTGCGTGCTGCCTGCAGGGCTGGAGTCTCAAAGCAG 900

 31435637 GAATCCTCCGAAGGACGTTTTGAACAGCCGGTTAGGCGCACATGCGCGTACACACACGCA 31435696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
      901 GAATCCTCCGAAGGACGTTTTGAACAGCCGGTTAGGCGCACATGCGCGTACACACAC--- 957

 31435697 CACACACACACACACACACGCACGCACGCACGCGCACGTGCAGAGCCCCCAAACAGCCTA 31435756
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 -ACACACACACACACACACGCACGCACGCACGCGCACGTGCAGAGCCCCCAAACAGCCTA 1016

 31435757 TTGGCTTTGGTTTCCTTCAGTGAAATCTGGGATCAAGAATAATCTCATCTGGGGTGGCCA 31435816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 TTGGCTTTGGTTTCCTTCAGTGAAATCTGGGATCAAGAATAATCTCATCTGGGGTGGCCA 1076

 31435817 GCCACTCTGGACTCACGGTTTCCAGGGTCTTCTGAGTATATACAACCATCCTCCAGACTG 31435876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 GCCACTCTGGACTCACGGTTTCCAGGGTCTTCTGAGTATATACAACCATCCTCCAGACTG 1136

 31435877 CAAAAAACACGATATTTACTCTGACAAAGCCACAAGAGCCCCAGGTTTATGTCCATGAAA 31435936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 CAAAAAACACGATATTTACTCTGACAAAGCCACAAGAGCCCCAGGTTTATGTCCATGAAA 1196

 31435937 GATCAGACAGAATCCAGAGCAGCGACTCATCAGTGGTGACTGACAACCTGATGTGCAACT 31435996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 GATCAGACAGAATCCAGAGCAGCGACTCATCAGTGGTGACTGACAACCTGATGTGCAACT 1256

 31435997 AATGTGTGAGTCCCTTTTCTGACCCTTCTGTGTCAGTATGTCTTTCCTCTGCCCTTCCAT 31436056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 AATGTGTGAGTCCCTTTTCTGACCCTTCTGTGTCAGTATGTCTTTCCTCTGCCCTTCCAT 1316

 31436057 CTGTTTAGTGGGTCCACTGTGGGGTGAGACAGTTTTGTTGCAGGGGACTTGGGTCCAGCT 31436116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 CTGTTTAGTGGGTCCACTGTGGGGTGAGACAGTTTTGTTGCAGGGGACTTGGGTCCAGCT 1376

 31436117 GGCTGGAATTATCATAGGTTTCATTCCTGATTTGGTGTGTTCTAGGATGGAAAAGACACT 31436176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 GGCTGGAATTATCATAGGTTTCATTCCTGATTTGGTGTGTTCTAGGATGGAAAAGACACT 1436

 31436177 TCCTCTTTGCTTCTGACCTCTTTCCAGAACAAATAAAAACACACACCAAAAAGCCACTCC 31436236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 TCCTCTTTGCTTCTGACCTCTTTCCAGAACAAATAAAAACACACACCAAAAAGCCACTCC 1496

 31436237 CGGGAAGATGAAACAACATAGTCACCCCTGGATCCCCAGGGGCAACTTCAGAGGGCTTCC 31436296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 CGGGAAGATGAAACAACATAGTCACCCCTGGATCCCCAGGGGCAACTTCAGAGGGCTTCC 1556

 31436297 ATTAGCAGGGTGGATGAGCTATTTTCCCAGGATATTAAATGTGAGAAGCTTTGAGCATGT 31436356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 ATTAGCAGGGTGGATGAGCTATTTTCCCAGGATATTAAATGTGAGAAGCTTTGAGCATGT 1616

 31436357 ATCTGGTGAGTCACACCAGTGTTTTAGAGTCTGACAAGGATCGTTACTGAAATACATAAT 31436416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 ATCTGGTGAGTCACACCAGTGTTTTAGAGTCTGACAAGGATCGTTACTGAAATACATAAT 1676

 31436417 GCAACCATCATCAGCATATGGGGACTCATACATTGTAGAGATACTGATCTGCTCTACCCT 31436476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 GCAACCATCATCAGCATATGGGGACTCATACATTGTAGAGATACTGATCTGCTCTACCCT 1736

 31436477 TTTAAGTCTTCATGCAACTAAAGGGGAAGATCCCCTCAAATAGGTTGTTCTCTTTCCTAA 31436536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 TTTAAGTCTTCATGCAACTAAAGGGGAAGATCCCCTCAAATAGGTTGTTCTCTTTCCTAA 1796

 31436537 CCCTAAGAAGAGTCTTTCTTTAAAATAAGTTCTCCTGTATGACTGTAAGATAGGATTGAT 31436596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 CCCTAAGAAGAGTCTTTCTTTAAAATAAGTTCTCCTGTATGACTGTAAGATAGGATTGAT 1856

 31436597 GGGAAAGGAAGGGACAAGGAATTAGTATTTTCTGAGTGACTACTGGATTCCAGCTCATGA 31436656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 GGGAAAGGAAGGGACAAGGAATTAGTATTTTCTGAGTGACTACTGGATTCCAGCTCATGA 1916

 31436657 ATGGCCAGGGAAATGGCATTCTCACCTGAGCAGGGCTCCTCCATTAGACTAGTGTAGGAA 31436716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 ATGGCCAGGGAAATGGCATTCTCACCTGAGCAGGGCTCCTCCATTAGACTAGTGTAGGAA 1976

 31436717 GCCCAAGGGGAGGATGGCACATGGTTAGGACTCGCCCAGGGACCAGGCACAGTGGCTCAG 31436776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 GCCCAAGGGGAGGATGGCACATGGTTAGGACTCGCCCAGGGACCAGGCACAGTGGCTCAG 2036

 31436777 GTCTGTAATCATAACAACTTTGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATTATATGAGCCTAGGAGTT 31436836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 GTCTGTAATCATAACAACTTTGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATTATATGAGCCTAGGAGTT 2096

 31436837 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTGCTTCTACAAAAAATAGAAACTAGCTGG 31436896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 CGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTGCTTCTACAAAAAATAGAAACTAGCTGG 2156

 31436897 GCGTGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCGTTACTTGTGGGGCTGAAGTGGAAGGATCATTTG 31436956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 GCGTGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCGTTACTTGTGGGGCTGAAGTGGAAGGATCATTTG 2216

 31436957 AGCCCAGGAGGTAGAGACTGCAGTGAGCAGTGATAACACCATTGTGCTCCAGCTTGGGTG 31437016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 AGCCCAGGAGGTAGAGACTGCAGTGAGCAGTGATAACACCATTGTGCTCCAGCTTGGGTG 2276

 31437017 ACAGAGTGAGATCCTGTTTCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAGCTCGGGGTAGTGGTAGTGGC 31437076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 ACAGAGTGAGATCCTGTTTCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAGCTCGGGGTAGTGGTAGTGGC 2336

 31437077 TCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCAGAAGGATCACTTGAGTTCAGGA 31437136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 TCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCAGAAGGATCACTTGAGTTCAGGA 2396

 31437137 GTTCAGGAGACCAGCCTGGGCATCATGGTGAGACCTCATCTCTAAAAAAAAAAAAAAGAA 31437196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     2397 GTTCAGGAGACCAGCCTGGGCATCATGGTGAGACCTCATCTCTAAAAAAAAAAAAAA-AA 2455

 31437197 AAAAAAAAAAAAAGACAAGCCTAAAGTCACACCGCCCAGTTCATATTCTAATTCTGTCAC 31437256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 AAAAAAAAAAAAAGACAAGCCTAAAGTCACACCGCCCAGTTCATATTCTAATTCTGTCAC 2515

 31437257 CTACAAGCAATGTGGCTTTGGGAAAATTGTTTAATCTCTTTGCAACTCAATGTCCTCACT 31437316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 CTACAAGCAATGTGGCTTTGGGAAAATTGTTTAATCTCTTTGCAACTCAATGTCCTCACT 2575

 31437317 AAAATGGGAGAATTGAATGGAGATTTCTCAAAACTAAAAATAGGACTACCATTCAATCCA 31437376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 AAAATGGGAGAATTGAATGGAGATTTCTCAAAACTAAAAATAGGACTACCATTCAATCCA 2635

 31437377 GCAATCCCACTACTGGGTATCTACCAAGAGGAAAAGAAATCAATATAACAAATAAATACC 31437436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 GCAATCCCACTACTGGGTATCTACCAAGAGGAAAAGAAATCAATATAACAAATAAATACC 2695

 31437437 TGCACTTGCATGTTTATTGCAGCACTATTCAATACCACAAAGACATCAAATCAACCTAAG 31437496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 TGCACTTGCATGTTTATTGCAGCACTATTCAATACCACAAAGACATCAAATCAACCTAAG 2755

 31437497 AGCCCATCTTTGGACAAATGGATAAAGAAAATGTGCTGTATATATACATAATGGAATATT 31437556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 AGCCCATCTTTGGACAAATGGATAAAGAAAATGTGCTGTATATATACATAATGGAATATT 2815

 31437557 ATTCAGCCATAAAAAAGAATGAAATCCTGACATTTGCAGCAACATGGCTGGAAGTGAAGG 31437616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 ATTCAGCCATAAAAAAGAATGAAATCCTGACATTTGCAGCAACATGGCTGGAAGTGAAGG 2875

 31437617 TCATTATCTTAAGTGAAATAAGCCAGTCACAAAAAGATTAATACCACATATTCTCACTGA 31437676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 TCATTATCTTAAGTGAAATAAGCCAGTCACAAAAAGATTAATACCACATATTCTCACTGA 2935

 31437677 CACGTGGGAGCTAAAAAATCTGATCACATGGAGATAGAGAATGAAAAGATGGAGAACAGA 31437736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 CACGTGGGAGCTAAAAAATCTGATCACATGGAGATAGAGAATGAAAAGATGGAGAACAGA 2995

 31437737 GACCAGGTGGGGTGAGTGGCAGGGTCAGGGAGAGGTTGAAGAGAAGTGGGCTAAAGGCTA 31437796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 GACCAGGTGGGGTGAGTGGCAGGGTCAGGGAGAGGTTGAAGAGAAGTGGGCTAAAGGCTA 3055

 31437797 CAAGCCTACAGTTAGATAGAAGGAGTAAATCCAGCATTTGATAGCAGTAGAGTAGGGTGG 31437856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 CAAGCCTACAGTTAGATAGAAGGAGTAAATCCAGCATTTGATAGCAGTAGAGTAGGGTGG 3115

 31437857 CTATAGTTTAACAAAAGTATATTATACTTGGGCGATGGACACCCTAAACACCCTGTCTTG 31437916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 CTATAGTTTAACAAAAGTATATTATACTTGGGCGATGGACACCCTAAACACCCTGTCTTG 3175

 31437917 ATCACTCCACATTATATACATGTAACAAAATTTCACATGTACCCCACAAATGTGTACACA 31437976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 ATCACTCCACATTATATACATGTAACAAAATTTCACATGTACCCCACAAATGTGTACACA 3235

 31437977 TAATGTAAAAAATTAAAAAAATAAGATAAAATGGGAGGACTGAATTCCCTGTCCCATGGG 31438036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 TAATGTAAAAAATTAAAAAAATAAGATAAAATGGGAGGACTGAATTCCCTGTCCCATGGG 3295

 31438037 TTCCTGTGAATTGAATGAGCTCACACACTAGGACTTGGCACAGTGCCTGGCATAGAATAA 31438096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 TTCCTGTGAATTGAATGAGCTCACACACTAGGACTTGGCACAGTGCCTGGCATAGAATAA 3355

 31438097 GTGCTCAATGAATGCTAACTTCCCCTCCTGCTGTCAGCATCATTTACAACCAATAGACCT 31438156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 GTGCTCAATGAATGCTAACTTCCCCTCCTGCTGTCAGCATCATTTACAACCAATAGACCT 3415

 31438157 GAAAACGTCTGATGTTAATTAAACACCTTGATTCATTTGGAAAGATTGATCTGGCATTAA 31438216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 GAAAACGTCTGATGTTAATTAAACACCTTGATTCATTTGGAAAGATTGATCTGGCATTAA 3475

 31438217 TCGGAACTACTGTACAAAAACGATGACTTCTTTGGATGCATATTTTTTGGGAAAAGGCCC 31438276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 TCGGAACTACTGTACAAAAACGATGACTTCTTTGGATGCATATTTTTTGGGAAAAGGCCC 3535

 31438277 AAAGTGTGGGCCATAAAATAAACCGAGAGTTTGCCTTTTGGGAGCGTAGAAACATGTCAC 31438336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 AAAGTGTGGGCCATAAAATAAACCGAGAGTTTGCCTTTTGGGAGCGTAGAAACATGTCAC 3595

 31438337 GAGTTCTAACACTTCCACACTCATAGAACTAAAGCCTCCCAAGTAGGAAAAAACTCCACT 31438396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 GAGTTCTAACACTTCCACACTCATAGAACTAAAGCCTCCCAAGTAGGAAAAAACTCCACT 3655

 31438397 TCCAGAGGGTACTTAACTCTCTATTCGGACCAAGCTATTACTTGAAGCTTCTCCCTTTTA 31438456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 TCCAGAGGGTACTTAACTCTCTATTCGGACCAAGCTATTACTTGAAGCTTCTCCCTTTTA 3715

 31438457 TTTCAGAAACTTCTTGCATTTATTTGATTTAGTTCTAAAGACGTGAAGTGTTATGGAATA 31438516
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3716 TTTCAGAAACTTCTTGCATTTATTTGATTTGGTTCTAAAGACGTGAAGTGTTATGGAATA 3775

 31438517 AATTTGCTTACGGTGATGGATGGGCATTTTCACAACCCAGGGCCTTGCTTCTAAAGCATT 31438576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 AATTTGCTTACGGTGATGGATGGGCATTTTCACAACCCAGGGCCTTGCTTCTAAAGCATT 3835

 31438577 TTTATGACCACTTGATATCACCAAACAGTGAAACAGCATAGGACACCAATCAATGAGGTG 31438636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 TTTATGACCACTTGATATCACCAAACAGTGAAACAGCATAGGACACCAATCAATGAGGTG 3895

 31438637 CATATTCTTCTCAGGTGGCAGAGAGATTAGGTGGCCTGTTTAAAAGTGCCCAACAGGCTG 31438696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 CATATTCTTCTCAGGTGGCAGAGAGATTAGGTGGCCTGTTTAAAAGTGCCCAACAGGCTG 3955

 31438697 GATGCGGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACCAGAGGTCAGGAGC 31438756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 GATGCGGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACCAGAGGTCAGGAGC 4015

 31438757 TTGAGACCAGCCTGACCAACATGGCAAAACCCTGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGC 31438816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 TTGAGACCAGCCTGACCAACATGGCAAAACCCTGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGC 4075

 31438817 TGGGTGTGGTGGCAGCTGCCTATAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCATGAGAATCG 31438876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 TGGGTGTGGTGGCAGCTGCCTATAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCATGAGAATCG 4135

 31438877 CTTGAACCCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCATTGCACTCCAGCCTG 31438936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 CTTGAACCCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCATTGCACTCCAGCCTG 4195

 31438937 GGCAAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAACCAAAAATAAACCTGCTC 31438996
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 GGCAAGCCTGGGCAACAGAGCGTGACTCCATCTCAAAAAAAACCAAAAATAAACCTGCTC 4255

 31438997 AGCAAACCAGTGACAGGCAAATTGAGATGCCATTGGGCCACACTCCTTCACACAGAGGTC 31439056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 AGCAAACCAGTGACAGGCAAATTGAGATGCCATTGGGCCACACTCCTTCACACAGAGGTC 4315

 31439057 AAAGGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCATAGGTCTTTAATTAGAAACAGAGGAAGTCAG 31439116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 AAAGGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCATAGGTCTTTAATTAGAAACAGAGGAAGTCAG 4375

 31439117 GATTTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAAACTTTACCAGCTAAATTGAAGAATCCCTGT 31439176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 GATTTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAAACTTTACCAGCTAAATTGAAGAATCCCTGT 4435

 31439177 TACTAAAAGTCTGTGTCATTGCACTTCGGGAGGGCGGGCCCAGTGGCACACATGTGTGAC 31439236
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 TACTAAAAGTCTGTGTCATTGCACTTTGGGAGGGCGGGCCCAGTGGCACACATGTGTGAC 4495

 31439237 GTGGCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGAAGAGTAGGAGCTACTGGAGAACCATGATGCATG 31439296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 GTGGCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGAAGAGTAGGAGCTACTGGAGAACCATGATGCATG 4555

 31439297 ACGCAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCCATGTCTTTCTCAGCCGTCCTGGGAGCTTTC 31439356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 ACGCAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCCATGTCTTTCTCAGCCGTCCTGGGAGCTTTC 4615

 31439357 AGGATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCTCCTAAGGCAAAAAATTTATACCACTTTTTT 31439416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 AGGATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCTCCTAAGGCAAAAAATTTATACCACTTTTTT 4675

 31439417 TTTTCCCAATCCAGATGCAAAACCAAAAACTCAAATCCAACTGTTCTCAGTCAAGTGAAA 31439476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4676 TTTTCCCAATCCAGATGCAAAACCAAAAACTCAAATCCAACTGTTCTCAGTCAAGTGAAA 4735

 31439477 GCATTCCAAGACCTCAGAAATGCTCACTCACCAAAGACCATTTTCCTGACTTGTAATTTG 31439536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 GCATTCCAAGACCTCAGAAATGCTCACTCACCAAAGACCATTTTCCTGACTTGTAATTTG 4795

 31439537 GTCAGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCCGGGTGGTCCAGTTTCCTCTGGGAACTCCGT 31439596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 GTCAGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCCGGGTGGTCCAGTTTCCTCTGGGAACTCCGT 4855

 31439597 AGGTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCTTGCCTAGGAGTTCCAGGGCAACTGA 31439656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 AGGTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCTTGCCTAGGAGTTCCAGGGCAACTGA 4915

 31439657 ACTTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTGCAGAAGGTCGTTTGGAAAACCTAAT 31439716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4916 ACTTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTGCAGAAGGTCGTTTGGAAAACCTAAT 4975

 31439717 TAGAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTTGGCCCTGGCAGGCCTGTGTGGAGGT 31439776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4976 TAGAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTTGGCCCTGGCAGGCCTGTGTGGAGGT 5035

 31439777 GGAGGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGCCTTAGAAAGATGCTGGACTTAAAAT 31439836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5036 GGAGGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGCCTTAGAAAGATGCTGGACTTAAAAT 5095

 31439837 TTCAAACCATTTCATAATGATTTATACATTTTTTAATAAGTGCCATTAGATCTCCTTCCA 31439896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5096 TTCAAACCATTTCATAATGATTTATACATTTTTTAATAAGTGCCATTAGATCTCCTTCCA 5155

 31439897 CCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGG 31439956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 CCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGG 5215

 31439957 TTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTT 31440016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5216 TTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTT 5275

 31440017 GAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGC 31440076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5276 GAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGC 5335

 31440077 TGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAAT 31440136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5336 TGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAAT 5395

 31440137 GAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAA 31440196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5396 GAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAA 5455

 31440197 AGTTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGC 31440256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5456 AGTTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGC 5515

 31440257 ACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAA 31440316
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     5516 ACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTT-GTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAA 5574

 31440317 AAGAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGAT 31440376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5575 AAGAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGAT 5634

 31440377 TGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTC 31440436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5635 TGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTC 5694

 31440437 CTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGT 31440496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5695 CTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGT 5754

 31440497 CCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAG 31440556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5755 CCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAG 5814

 31440557 CCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCT 31440616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5815 CCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCT 5874

 31440617 CCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTC 31440676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5875 CCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTC 5934

 31440677 AACTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAG 31440736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5935 AACTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAG 5994

 31440737 GTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAA 31440796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5995 GTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAA 6054

 31440797 TTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCT 31440856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6055 TTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCT 6114

 31440857 AATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTC 31440916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6115 AATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTC 6174

 31440917 CCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGC 31440976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6175 CCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGC 6234

 31440977 CACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTC 31441036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6235 CACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTC 6294

 31441037 ATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATA 31441096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6295 ATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATA 6354

 31441097 GTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAA 31441156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6355 GTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAA 6414

 31441157 GTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGC 31441216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6415 GTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGC 6474

 31441217 CCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGT 31441276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6475 CCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGT 6534

 31441277 GAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCA 31441336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6535 GAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCA 6594

 31441337 AATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCAT 31441396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6595 AATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCAT 6654

 31441397 TATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGT 31441456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6655 TATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGT 6714

 31441457 GTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGA 31441516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6715 GTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGA 6774

 31441517 GTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGG 31441576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6775 GTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGG 6834

 31441577 ACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGA 31441636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6835 ACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGA 6894

 31441637 CCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCC 31441696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6895 CCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCC 6954

 31441697 ATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCC 31441756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6955 ATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCC 7014

 31441757 TTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACAT 31441816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7015 TTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACAT 7074

 31441817 TCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATG 31441876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7075 TCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATG 7134

 31441877 TCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAG 31441936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7135 TCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAG 7194

 31441937 AGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAAT 31441996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7195 AGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAAT 7254

 31441997 CATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGT 31442056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7255 CATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGT 7314

 31442057 GTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGG 31442116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7315 GTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGG 7374

 31442117 TTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATAT 31442176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7375 TTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATAT 7434

 31442177 CTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGC 31442236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7435 CTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGC 7494

 31442237 CCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCT 31442296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7495 CCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCT 7554

 31442297 CATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTA 31442356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7555 CATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTA 7614

 31442357 ATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAA 31442416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7615 ATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAA 7674

 31442417 ATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGG 31442476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7675 ATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGG 7734

 31442477 CAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACAC 31442536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7735 CAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACAC 7794

 31442537 GGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCA 31442596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7795 GGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCA 7854

 31442597 CCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCT 31442656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7855 CCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCT 7914

 31442657 GTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGA 31442716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7915 GTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGA 7974

 31442717 GGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTAT 31442776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7975 GGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTAT 8034

 31442777 GTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTC 31442836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8035 GTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTC 8094

 31442837 GTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGT 31442896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8095 GTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGT 8154

 31442897 TCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTC 31442956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8155 TCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTC 8214

 31442957 CGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAA 31443016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8215 CGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAA 8274

 31443017 AAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTA 31443076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8275 AAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTA 8334

 31443077 TATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAG 31443136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8335 TATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAG 8394

 31443137 GGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCA 31443196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8395 GGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCA 8454

 31443197 CGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCG 31443256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8455 CGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCG 8514

 31443257 AGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCC 31443316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8515 AGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCC 8574

 31443317 AGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 31443350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8575 AGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 8608

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8609 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 8668

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8669 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 8728

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8729 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 8788

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8789 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 8848

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8849 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 8908

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8909 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 8968

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8969 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 9028

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9029 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 9088

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9089 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 9148

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9149 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 9208

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9209 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 9268

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9269 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 9328

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9329 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 9388

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9389 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 9448

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9449 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 9508

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9509 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 9568

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9569 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 9628

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 31445944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     9629 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 9688

 31445945 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 31446004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9689 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 9748

 31446005 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 31446064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9749 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 9808

 31446065 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 31446124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9809 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 9868

 31446125 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 31446184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9869 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 9928

 31446185 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 31446244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9929 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 9988

 31446245 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 31446304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9989 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 10048

 31446305 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 31446364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10049 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 10108

 31446365 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 31446424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10109 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 10168

 31446425 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 31446484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10169 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 10228

 31446485 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 31446544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10229 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 10288

 31446545 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 31446604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10289 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 10348

 31446605 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 31446664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10349 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 10408

 31446665 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 31446724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10409 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 10468

 31446725 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 31446784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10469 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 10528

 31446785 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 31446844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10529 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 10588

 31446845 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 31446904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10589 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 10648

 31446905 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 31446964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10649 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 10708

 31446965 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 31447024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10709 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 10768

 31447025 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 31447084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10769 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 10828

 31447085 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCAT 31447126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10829 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCAT 10870

Alignment time is 8.07766 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2262] =>      2262 nucs 'mol-32-3311-155420_2262'

Score:        2261
Aligned:      2261        nucs
Identic:      2261 (100%) nucs =>      1055 (100%)      1206 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31444865,31445919] EXCISED REGION [31445921,31447126]
 second seq =>  [       1,    1055] EXCISED REGION [    1057,    2262]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31445920,31445920]
 second seq =>         1 nucs [1056,1056]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31445918,31445919] to [31445919,31445920]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 60

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 120

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 180

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 240

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 300

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 360

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 420

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 480

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 540

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 600

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 660

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 720

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 780

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 840

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 900

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 960

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 1020

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAA 31445919
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAA 1055

EXCISED REGION

 31445921 TAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTAT 31445980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 TAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTAT 1116

 31445981 TGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCA 31446040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 TGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCA 1176

 31446041 ATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAAC 31446100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 ATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAAC 1236

 31446101 TGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTG 31446160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 TGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTG 1296

 31446161 TCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATC 31446220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 TCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATC 1356

 31446221 TTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTAT 31446280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 TTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTAT 1416

 31446281 TCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATT 31446340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 TCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATT 1476

 31446341 CTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAA 31446400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 CTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAA 1536

 31446401 GTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGG 31446460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 GTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGG 1596

 31446461 ATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGA 31446520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 ATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGA 1656

 31446521 GGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACG 31446580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 GGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACG 1716

 31446581 CAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCT 31446640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 CAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCT 1776

 31446641 GCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGA 31446700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 GCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGA 1836

 31446701 GCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGC 31446760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 GCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGC 1896

 31446761 TGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACG 31446820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 TGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACG 1956

 31446821 CCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTG 31446880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 CCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTG 2016

 31446881 GCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCA 31446940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 GCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCA 2076

 31446941 GCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAA 31447000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 GCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAA 2136

 31447001 ATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCAT 31447060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 ATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCAT 2196

 31447061 ATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCC 31447120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 ATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCC 2256

 31447121 AACCAT 31447126
          ||||||
     2257 AACCAT 2262

Alignment time is 1.7206 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    6976] =>      6976 nucs 'mol-32-3332-072701_6976'

Score:        6933
Aligned:      6977        nucs
Identic:      6973 (100%) nucs =>      4502 (100%)      2471 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31438847,31443350] EXCISED REGION [31444865,31447337]
 second seq =>  [       1,    4504] EXCISED REGION [    4505,    6976]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31438847 GCTACTTGAGAGGCTGAGGCATGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGA 31438906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTACTTGAGAGGCTGAGGCATGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGA 60

 31438907 GCCAAGATTGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCA 31438966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
       61 GCCAAGATTGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAAGCCTGGGCAACAGAGCGTGACTCCA 120

 31438967 TCTCAAAAAAAACCAAAAATAAACCTGCTCAGCAAACCAGTGACAGGCAAATTGAGATGC 31439026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTCAAAAAAAACCAAAAATAAACCTGCTCAGCAAACCAGTGACAGGCAAATTGAGATGC 180

 31439027 CATTGGGCCACACTCCTTCACACAGAGGTCAAAGGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCAT 31439086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTGGGCCACACTCCTTCACACAGAGGTCAAAGGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCAT 240

 31439087 AGGTCTTTAATTAGAAACAGAGGAAGTCAGGATTTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAA 31439146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGTCTTTAATTAGAAACAGAGGAAGTCAGGATTTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAA 300

 31439147 ACTTTACCAGCTAAATTGAAGAATCCCTGTTACTAAAAGTCTGTGTCATTGCACTTCGGG 31439206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      301 ACTTTACCAGCTAAATTGAAGAATCCCTGTTACTAAAAGTCTGTGTCATTGCACTTTGGG 360

 31439207 AGGGCGGGCCCAGTGGCACACATGTGTGACGTGGCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGAAGA 31439266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGGCGGGCCCAGTGGCACACATGTGTGACGTGGCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGAAGA 420

 31439267 GTAGGAGCTACTGGAGAACCATGATGCATGACGCAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCC 31439326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTAGGAGCTACTGGAGAACCATGATGCATGACGCAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCC 480

 31439327 ATGTCTTTCTCAGCCGTCCTGGGAGCTTTCAGGATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCT 31439386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGTCTTTCTCAGCCGTCCTGGGAGCTTTCAGGATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCT 540

 31439387 CCTAAGGCAAAAAATTTATACCACTTTTTTTTTTCCCAATCCAGATGCAAAACCAAAAAC 31439446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTAAGGCAAAAAATTTATACCACTTTTTTTTTTCCCAATCCAGATGCAAAACCAAAAAC 600

 31439447 TCAAATCCAACTGTTCTCAGTCAAGTGAAAGCATTCCAAGACCTCAGAAATGCTCACTCA 31439506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCAAATCCAACTGTTCTCAGTCAAGTGAAAGCATTCCAAGACCTCAGAAATGCTCACTCA 660

 31439507 CCAAAGACCATTTTCCTGACTTGTAATTTGGTCAGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCC 31439566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCAAAGACCATTTTCCTGACTTGTAATTTGGTCAGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCC 720

 31439567 GGGTGGTCCAGTTTCCTCTGGGAACTCCGTAGGTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTT 31439626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGTGGTCCAGTTTCCTCTGGGAACTCCGTAGGTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTT 780

 31439627 CTGCTTGCCTAGGAGTTCCAGGGCAACTGAACTTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTC 31439686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGCTTGCCTAGGAGTTCCAGGGCAACTGAACTTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTC 840

 31439687 AGCTGCAGAAGGTCGTTTGGAAAACCTAATTAGAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAG 31439746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCTGCAGAAGGTCGTTTGGAAAACCTAATTAGAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAG 900

 31439747 GAGTTGGCCCTGGCAGGCCTGTGTGGAGGTGGAGGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATA 31439806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGTTGGCCCTGGCAGGCCTGTGTGGAGGTGGAGGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATA 960

 31439807 TCTGCCTTAGAAAGATGCTGGACTTAAAATTTCAAACCATTTCATAATGATTTATACATT 31439866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTGCCTTAGAAAGATGCTGGACTTAAAATTTCAAACCATTTCATAATGATTTATACATT 1020

 31439867 TTTTAATAAGTGCCATTAGATCTCCTTCCACCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCA 31439926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTAATAAGTGCCATTAGATCTCCTTCCACCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCA 1080

 31439927 TACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATT 31439986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATT 1140

 31439987 CCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCG 31440046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCG 1200

 31440047 GAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGA 31440106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGA 1260

 31440107 CCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGG 31440166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGG 1320

 31440167 AAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAAC 31440226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAAC 1380

 31440227 TTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTT 31440286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTT 1440

 31440287 GTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACC 31440346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACC 1500

 31440347 ATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGT 31440406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGT 1560

 31440407 CAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTC 31440466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTC 1620

 31440467 AGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCT 31440526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCT 1680

 31440527 CTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTT 31440586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTT 1740

 31440587 CACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCA 31440646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCA 1800

 31440647 TTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATAATTTTTTTT 31440706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATAATTTTTTTT 1860

 31440707 TTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCA 31440766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCA 1920

 31440767 TGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 31440826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 1980

 31440827 GACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTT 31440886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTT 2040

 31440887 CTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCC 31440946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCC 2100

 31440947 TCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTG 31441006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTG 2160

 31441007 AAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTG 31441066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTG 2220

 31441067 GACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTC 31441126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTC 2280

 31441127 AACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGA 31441186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGA 2340

 31441187 TTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGA 31441246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGA 2400

 31441247 TTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGC 31441306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGC 2460

 31441307 TCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCT 31441366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCT 2520

 31441367 TCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAAT 31441426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAAT 2580

 31441427 TAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACT 31441486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACT 2640

 31441487 TGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAG 31441546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAG 2700

 31441547 CTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTT 31441606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTT 2760

 31441607 GCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAG 31441666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAG 2820

 31441667 CAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTG 31441726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTG 2880

 31441727 GGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCC 31441786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCC 2940

 31441787 AAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGAC 31441846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGAC 3000

 31441847 GATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGG 31441906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGG 3060

 31441907 TCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAG 31441966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAG 3120

 31441967 GCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGA 31442026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGA 3180

 31442027 TCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTC 31442086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTC 3240

 31442087 CCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCA 31442146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCA 3300

 31442147 CTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTT 31442206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTT 3360

 31442207 GTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTT 31442266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTT 3420

 31442267 GGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCT 31442326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCT 3480

 31442327 GAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGC 31442386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGC 3540

 31442387 CAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATAC 31442446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATAC 3600

 31442447 AGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGT 31442506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGT 3660

 31442507 TGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAG 31442566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAG 3720

 31442567 GAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGT 31442626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGT 3780

 31442627 TGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGC 31442686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGC 3840

 31442687 TGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACC 31442746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACC 3900

 31442747 AAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCA 31442806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCA 3960

 31442807 CCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGT 31442866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGT 4020

 31442867 TATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATG 31442926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATG 4080

 31442927 GGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGG 31442986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGG 4140

 31442987 AATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTG 31443046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTG 4200

 31443047 GCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCAC 31443106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCAC 4260

 31443107 TCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAG 31443166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAG 4320

 31443167 AGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCG 31443226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCG 4380

 31443227 AGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCC 31443286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCC 4440

 31443287 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAG 31443346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAG 4500

 31443347 CTAC 31443350
          ||||
     4501 CTAC 4504

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 4564

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 4624

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 4684

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4685 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 4744

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 TCTC-AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 4803

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4804 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 4863

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4864 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 4923

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4924 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 4983

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4984 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 5043

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5044 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 5103

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5104 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 5163

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5164 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 5223

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5224 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 5283

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5284 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 5343

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5344 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 5403

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5404 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 5463

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5464 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 5523

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 31445944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5524 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 5583

 31445945 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 31446004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5584 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 5643

 31446005 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 31446064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5644 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 5703

 31446065 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 31446124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5704 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 5763

 31446125 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 31446184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5764 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 5823

 31446185 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 31446244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5824 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 5883

 31446245 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 31446304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5884 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 5943

 31446305 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 31446364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5944 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 6003

 31446365 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 31446424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6004 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 6063

 31446425 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 31446484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6064 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 6123

 31446485 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 31446544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6124 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 6183

 31446545 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 31446604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6184 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 6243

 31446605 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 31446664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6244 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 6303

 31446665 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 31446724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6304 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 6363

 31446725 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 31446784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6364 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 6423

 31446785 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 31446844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6424 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 6483

 31446845 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 31446904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6484 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 6543

 31446905 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 31446964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6544 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 6603

 31446965 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 31447024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6604 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 6663

 31447025 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 31447084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6664 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 6723

 31447085 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 31447144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6724 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 6783

 31447145 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 31447204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6784 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 6843

 31447205 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 31447264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6844 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 6903

 31447265 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 31447324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6904 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 6963

 31447325 TTTTATAAATAAA 31447337
          |||||||||||||
     6964 TTTTATAAATAAA 6976

Alignment time is 5.26477 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2472] =>      2472 nucs 'mol-32-3332-072701_2472'

Score:        2461
Aligned:      2472        nucs
Identic:      2471 (100%) nucs =>       244 (100%)      2227 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31444865,31445108] EXCISED REGION [31445110,31447337]
 second seq =>  [       1,     244] EXCISED REGION [     245,    2472]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31445109,31445109]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31445920,31445920]
 second seq =>         1 nucs [1055,1055]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31445109,31445123] to [31445110,31445124]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 60

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 120

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 180

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 240

 31445105 TCTC 31445108
          ||||
      241 TCTC 244

EXCISED REGION

 31445110 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 31445169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      245 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 304

 31445170 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 31445229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      305 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 364

 31445230 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 31445289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      365 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 424

 31445290 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 31445349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      425 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 484

 31445350 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 31445409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 544

 31445410 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 31445469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 604

 31445470 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 31445529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 664

 31445530 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 31445589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 724

 31445590 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 31445649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 784

 31445650 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 31445709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 844

 31445710 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 31445769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 904

 31445770 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 31445829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 964

 31445830 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 31445889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 1024

 31445890 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 31445949
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1025 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 1084

 31445950 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 31446009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 1144

 31446010 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 31446069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 1204

 31446070 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 31446129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 1264

 31446130 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 31446189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 1324

 31446190 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 31446249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 1384

 31446250 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 31446309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 1444

 31446310 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 31446369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 1504

 31446370 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 31446429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 1564

 31446430 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 31446489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 1624

 31446490 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 31446549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 1684

 31446550 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 31446609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 1744

 31446610 AGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCG 31446669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 AGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCG 1804

 31446670 GCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGT 31446729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 GCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGT 1864

 31446730 CAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGT 31446789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 CAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGT 1924

 31446790 CCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTG 31446849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 CCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTG 1984

 31446850 ACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCC 31446909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 ACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCC 2044

 31446910 AGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCT 31446969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 AGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCT 2104

 31446970 CACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCT 31447029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 CACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCT 2164

 31447030 CCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTG 31447089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 CCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTG 2224

 31447090 CCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTAT 31447149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 CCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTAT 2284

 31447150 TTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAG 31447209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 TTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAG 2344

 31447210 TTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCA 31447269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 TTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCA 2404

 31447270 GTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTA 31447329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 GTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTA 2464

 31447330 TAAATAAA 31447337
          ||||||||
     2465 TAAATAAA 2472

Alignment time is 1.88501 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    7621] =>      7621 nucs 'mol-32-3395-188611_7621'

Score:        7564
Aligned:      7586        nucs
Identic:      7584 (100%) nucs =>      3057 (100%)      4527 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31442052,31445108] EXCISED REGION [31445110,31449638]
 second seq =>  [       1,    3057] EXCISED REGION [    3058,    7585]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31445109,31445109]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31448367,31448367]
 second seq =>         1 nucs [6314,6314]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31445109,31445123] to [31445110,31445124]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31442052 TCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTAC 31442111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTAC 60

 31442112 TGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACA 31442171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACA 120

 31442172 AATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATG 31442231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATG 180

 31442232 TGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATG 31442291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATG 240

 31442292 TTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAAT 31442351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAAT 300

 31442352 CTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCAT 31442411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCAT 360

 31442412 TGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTT 31442471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTT 420

 31442472 GTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCT 31442531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCT 480

 31442532 GACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAA 31442591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAA 540

 31442592 TTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTC 31442651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTC 600

 31442652 TGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGAT 31442711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGAT 660

 31442712 GCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGG 31442771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGG 720

 31442772 TTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTG 31442831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTG 780

 31442832 ACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGT 31442891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGT 840

 31442892 GGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGG 31442951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGG 900

 31442952 GTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTA 31443011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTA 960

 31443012 AAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGC 31443071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGC 1020

 31443072 ATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGT 31443131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGT 1080

 31443132 GAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTG 31443191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTG 1140

 31443192 GCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGA 31443251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGA 1200

 31443252 GATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAG 31443311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAG 1260

 31443312 TAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31443371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 1320

 31443372 ATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCACTGCACTCCAA 31443431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCACTGCACTCCAA 1380

 31443432 CCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACAGGAAGAGAGGGGG 31443491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACAGGAAGAGAGGGGG 1440

 31443492 GGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTAAGAATAAGAATTC 31443551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTAAGAATAAGAATTC 1500

 31443552 ACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAA 31443611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAA 1560

 31443612 TGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTG 31443671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTG 1620

 31443672 AAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAA 31443731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAA 1680

 31443732 GCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAAC 31443791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAAC 1740

 31443792 ATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAA 31443851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAA 1800

 31443852 GACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCA 31443911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCA 1860

 31443912 GGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAG 31443971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAG 1920

 31443972 ACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAG 31444031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAG 1980

 31444032 CACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATA 31444091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATA 2040

 31444092 AGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTA 31444151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTA 2100

 31444152 CACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTC 31444211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTC 2160

 31444212 TCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTAC 31444271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTAC 2220

 31444272 CCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTC 31444331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTC 2280

 31444332 AGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTG 31444391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTG 2340

 31444392 GAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTC 31444451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTC 2400

 31444452 TATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTG 31444511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTG 2460

 31444512 CTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTT 31444571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTT 2520

 31444572 TGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACT 31444631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACT 2580

 31444632 AATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGC 31444691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGC 2640

 31444692 CACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCA 31444751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCA 2700

 31444752 CTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATA 31444811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATA 2760

 31444812 GAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAG 31444871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAG 2820

 31444872 GCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGA 31444931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGA 2880

 31444932 AATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATC 31444991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATC 2940

 31444992 CCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAG 31445051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAG 3000

 31445052 TGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTC 31445108
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTC 3057

EXCISED REGION

 31445110 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 31445169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 3117

 31445170 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 31445229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 3177

 31445230 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 31445289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 3237

 31445290 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 31445349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 3297

 31445350 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 31445409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 3357

 31445410 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 31445469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 3417

 31445470 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 31445529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 3477

 31445530 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 31445589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 3537

 31445590 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 31445649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 3597

 31445650 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 31445709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 3657

 31445710 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 31445769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 3717

 31445770 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 31445829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 3777

 31445830 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 31445889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 3837

 31445890 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 31445949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 3897

 31445950 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 31446009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 3957

 31446010 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 31446069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 4017

 31446070 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 31446129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 4077

 31446130 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 31446189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 4137

 31446190 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 31446249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 4197

 31446250 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 31446309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 4257

 31446310 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 31446369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 4317

 31446370 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 31446429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 4377

 31446430 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 31446489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 4437

 31446490 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 31446549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 4497

 31446550 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 31446609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 4557

 31446610 AGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCG 31446669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 AGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCG 4617

 31446670 GCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGT 31446729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 GCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGT 4677

 31446730 CAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGT 31446789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 CAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGT 4737

 31446790 CCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTG 31446849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 CCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTG 4797

 31446850 ACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCC 31446909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 ACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCC 4857

 31446910 AGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCT 31446969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 AGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCT 4917

 31446970 CACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCT 31447029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 CACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCT 4977

 31447030 CCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTG 31447089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 CCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTG 5037

 31447090 CCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTAT 31447149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 CCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTAT 5097

 31447150 TTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAG 31447209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 TTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAG 5157

 31447210 TTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCA 31447269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 TTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCA 5217

 31447270 GTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTA 31447329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 GTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTA 5277

 31447330 TAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGC 31447389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 TAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGC 5337

 31447390 ATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCC 31447449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 ATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCC 5397

 31447450 TAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTC 31447509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 TAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTC 5457

 31447510 CAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAGATAGA 31447569
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     5458 CAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAGATAGA 5516

 31447570 GTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCA 31447629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 GTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCA 5576

 31447630 CCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATAAGTAC 31447689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 CCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATAAGTAC 5636

 31447690 ACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTTTTGTA 31447749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 ACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTTTTGTA 5696

 31447750 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCG 31447809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCG 5756

 31447810 TGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTTTCATG 31447869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 TGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTTTCATG 5816

 31447870 CTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTCCAGGC 31447929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 CTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTCCAGGC 5876

 31447930 CCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGACCTCC 31447989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 CCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGACCTCC 5936

 31447990 CCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATATTAAT 31448049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 CCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATATTAAT 5996

 31448050 CAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAAGTTAT 31448109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 CAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAAGTTAT 6056

 31448110 GTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGTTACTTAATAGATATTT 31448169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 GTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGTTACTTAATAGATATTT 6116

 31448170 GGAGATTTTCTTGACTCGGAAACTAGGAGTCTTTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAATAGATA 31448229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 GGAGATTTTCTTGACTCGGAAACTAGGAGTCTTTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAATAGATA 6176

 31448230 ATCAACATTCCCCTACTGGGGAGAAACAAGGTGGGAGAATGAATACAACCTATGCTCCCC 31448289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 ATCAACATTCCCCTACTGGGGAGAAACAAGGTGGGAGAATGAATACAACCTATGCTCCCC 6236

 31448290 TAGGAAGGTTTTAAGAATTTTATTTTGTGTTTCTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTGCATAAG 31448349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 TAGGAAGGTTTTAAGAATTTTATTTTGTGTTTCTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTGCATAAG 6296

 31448350 AGATTAAGGAAATACACAGCTACTTTATAAGAGACTCCTTAAGAAAGAGATGGAGGCAGG 31448409
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 AGATTAAGGAAATACACCGCTACTTTATAAGAGACTCCTTAAGAAAGAGATGGAGGCAGG 6356

 31448410 ACCAAGGAATGCACAAAGGATGGGGTATTTTGCCATAAAAAGTAACTGCAATACACTGAA 31448469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 ACCAAGGAATGCACAAAGGATGGGGTATTTTGCCATAAAAAGTAACTGCAATACACTGAA 6416

 31448470 TGTGTCCCCCAAAATTCATGGTTTTAAAAAATTAAATAACTGCTTTTATTGAGATATAAT 31448529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 TGTGTCCCCCAAAATTCATGGTTTTAAAAAATTAAATAACTGCTTTTATTGAGATATAAT 6476

 31448530 TTGATGTTTTGATATGCATATGTATTGGGAAATGATTACTATAGTCAGGCTAATTAACAT 31448589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 TTGATGTTTTGATATGCATATGTATTGGGAAATGATTACTATAGTCAGGCTAATTAACAT 6536

 31448590 ATCCATTACCTCACATAATTACCTTATTTTTGTAATGAGAACACTTAAGATTCACTGTCT 31448649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 ATCCATTACCTCACATAATTACCTTATTTTTGTAATGAGAACACTTAAGATTCACTGTCT 6596

 31448650 TAGCAAATTTCGAGTATACAATGCAGCATTATTAGCTATAGTCACCATGATGTACATTAG 31448709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 TAGCAAATTTCGAGTATACAATGCAGCATTATTAGCTATAGTCACCATGATGTACATTAG 6656

 31448710 ATTTCTAGAAGCTACTTCATCTCAAATAAATGAAAGTTTATACCTTTTGACTAACGTCTC 31448769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 ATTTCTAGAAGCTACTTCATCTCAAATAAATGAAAGTTTATACCTTTTGACTAACGTCTC 6716

 31448770 CATTTCTCCCAGCTCTCAGCCCCTAGAAGCTGTAGAGATCCATGTTTTCGCAAATGACAG 31448829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 CATTTCTCCCAGCTCTCAGCCCCTAGAAGCTGTAGAGATCCATGTTTTCGCAAATGACAG 6776

 31448830 GATTTAGAATTTCCTTCTTTTTTAAAGCTGAATAATATTCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGT 31448889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 GATTTAGAATTTCCTTCTTTTTTAAAGCTGAATAATATTCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGT 6836

 31448890 GTGTATCACACACACATGCATCTATGTATTATCTATCTATCCATCTATTCTATCTATCTA 31448949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 GTGTATCACACACACATGCATCTATGTATTATCTATCTATCCATCTATTCTATCTATCTA 6896

 31448950 TCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTCTCTATCTAGCAATTTCTTTATCCATTTA 31449009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 TCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTCTCTATCTAGCAATTTCTTTATCCATTTA 6956

 31449010 CCTGTTGACAGACACAGATTGTTTCCACATCTTGGTTAGTGTGAATAATGCTGCAATGAA 31449069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 CCTGTTGACAGACACAGATTGTTTCCACATCTTGGTTAGTGTGAATAATGCTGCAATGAA 7016

 31449070 CATGGGAGTGTAGCTATCTCTTCAATATACTGATTTTATTTTCTATAACTTTGTAATATA 31449129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 CATGGGAGTGTAGCTATCTCTTCAATATACTGATTTTATTTTCTATAACTTTGTAATATA 7076

 31449130 CTTTGGGATTGAGAAGTGTGATGCCTCCAGCTTCATTCTTTTTTTTCTCGAGACTGCTTT 31449189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 CTTTGGGATTGAGAAGTGTGATGCCTCCAGCTTCATTCTTTTTTTTCTCGAGACTGCTTT 7136

 31449190 GGCTATTCAGGATCGCTTGTTGTTCCATACAAATTTTATGATTATATTTTCCATTTCTGT 31449249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 GGCTATTCAGGATCGCTTGTTGTTCCATACAAATTTTATGATTATATTTTCCATTTCTGT 7196

 31449250 GAAAATTACCACTAGAATTTTGATGGGCATTGTGTTGAATCTCTGGATAACTCTGGGTTG 31449309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 GAAAATTACCACTAGAATTTTGATGGGCATTGTGTTGAATCTCTGGATAACTCTGGGTTG 7256

 31449310 TATGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAGTCCACAAACACAGAATATCTTTCCATTT 31449369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 TATGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCCAGTCCACAAACACAGAATATCTTTCCATTT 7316

 31449370 GTGTCTTCTTCAATTCCTTTCATCAATATCTTATAGTTTTCTATGTAATAGATCTTTCAC 31449429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7317 GTGTCTTCTTCAATTCCTTTCATCAATATCTTATAGTTTTCTATGTAATAGATCTTTCAC 7376

 31449430 CTCCTTGTTTAAATATACTTCTAAATACTTTATTATTTTTTATGCTATTATAAATGAGAT 31449489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 CTCCTTGTTTAAATATACTTCTAAATACTTTATTATTTTTTATGCTATTATAAATGAGAT 7436

 31449490 TTTTTATTGATTTCCTTTTTGGATAATTTGTTGCCGGTGTAAAGAAACACTACTGATTTC 31449549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7437 TTTTTATTGATTTCCTTTTTGGATAATTTGTTGCCGGTGTAAAGAAACACTACTGATTTC 7496

 31449550 TGCATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTGAATTTATTAGTTCTAACAGTTTTTTAT 31449609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7497 TGCATGTTGATTTTGTATCCTGCAACTTTACTGAATTTATTAGTTCTAACAGTTTTTTAT 7556

 31449610 AGAGTCTTTAGGGTTCTGTACATATATAA 31449638
          |||||||||||||||||||||||||||||
     7557 AGAGTCTTTAGGGTTCTGTACATATATAA 7585

Alignment time is 5.70513 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3230] =>      3230 nucs 'mol-32-33a0-141844_3230'

Score:        3229
Aligned:      3229        nucs
Identic:      3229 (100%) nucs =>        12 (100%)      3217 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443409,31443420] EXCISED REGION [31443422,31446638]
 second seq =>  [       1,      12] EXCISED REGION [      14,    3230]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31443421,31443421]
 second seq =>         1 nucs [13,13]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [13,13] to [14,14]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31443409 GAGATCGCGCCA 31443420
          ||||||||||||
        1 GAGATCGCGCCA 12

EXCISED REGION

 31443422 TGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACAGGA 31443481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       14 TGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACAGGA 73

 31443482 AGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTAAGA 31443541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       74 AGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTAAGA 133

 31443542 ATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCC 31443601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      134 ATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCC 193

 31443602 ATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATG 31443661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      194 ATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATG 253

 31443662 AGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAAC 31443721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      254 AGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAAC 313

 31443722 TGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGG 31443781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      314 TGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGG 373

 31443782 CCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGC 31443841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      374 CCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGC 433

 31443842 TCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCT 31443901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      434 TCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCT 493

 31443902 GACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGA 31443961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      494 GACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGA 553

 31443962 AGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAA 31444021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      554 AGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAA 613

 31444022 GTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATG 31444081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      614 GTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATG 673

 31444082 TGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGG 31444141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      674 TGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGG 733

 31444142 AGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAG 31444201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      734 AGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAG 793

 31444202 CCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGT 31444261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      794 CCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGT 853

 31444262 GAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAG 31444321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      854 GAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAG 913

 31444322 GAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAG 31444381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      914 GAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAG 973

 31444382 ATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATT 31444441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      974 ATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATT 1033

 31444442 TGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTAT 31444501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1034 TGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTAT 1093

 31444502 TAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTG 31444561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1094 TAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTG 1153

 31444562 TTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATT 31444621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1154 TTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATT 1213

 31444622 TGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTC 31444681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1214 TGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTC 1273

 31444682 ACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATA 31444741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1274 ACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATA 1333

 31444742 CAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATA 31444801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1334 CAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATA 1393

 31444802 ACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGC 31444861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 ACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGC 1453

 31444862 ACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAAC 31444921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1454 ACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAAC 1513

 31444922 AACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGT 31444981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 AACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGT 1573

 31444982 GCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCT 31445041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 GCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCT 1633

 31445042 GAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACC 31445101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 GAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACC 1693

 31445102 CTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAG 31445161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 CTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAG 1753

 31445162 TGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCC 31445221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 TGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCC 1813

 31445222 AGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAA 31445281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 AGGAGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAA 1873

 31445282 AATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGG 31445341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 AATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGG 1933

 31445342 AGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTC 31445401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 AGAATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTC 1993

 31445402 CAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTAT 31445461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 CAGCCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTAT 2053

 31445462 GGGATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACT 31445521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 GGGATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACT 2113

 31445522 CTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCC 31445581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 CTTCTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCC 2173

 31445582 TTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTA 31445641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 TTTATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTA 2233

 31445642 AATATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAG 31445701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 AATATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAG 2293

 31445702 CATAATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAG 31445761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 CATAATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAG 2353

 31445762 TTCAAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAAC 31445821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 TTCAAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAAC 2413

 31445822 ATATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGA 31445881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 ATATGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGA 2473

 31445882 ATATATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGC 31445941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 ATATATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGC 2533

 31445942 ATTATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAG 31446001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 ATTATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAG 2593

 31446002 TCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGT 31446061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 TCCCAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGT 2653

 31446062 TTGCATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAA 31446121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2654 TTGCATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAA 2713

 31446122 TGTGGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAG 31446181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 TGTGGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAG 2773

 31446182 GGAGAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGA 31446241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2774 GGAGAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGA 2833

 31446242 GGGTATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTT 31446301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 GGGTATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTT 2893

 31446302 TCTTGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATG 31446361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2894 TCTTGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATG 2953

 31446362 TCCCACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGG 31446421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2954 TCCCACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGG 3013

 31446422 AGATGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTC 31446481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3014 AGATGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTC 3073

 31446482 TCTAGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTG 31446541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3074 TCTAGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTG 3133

 31446542 GAGAGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGC 31446601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3134 GAGAGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGC 3193

 31446602 ACAGCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTT 31446638
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3194 ACAGCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTT 3230

Alignment time is 2.47438 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    9396] =>      9396 nucs 'mol-32-33ab-118786_9396'

Score:        9331
Aligned:      9397        nucs
Identic:      9391 (100%) nucs =>      6107 (100%)      3284 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31437240,31443350] EXCISED REGION [31444865,31448150]
 second seq =>  [       1,    6111] EXCISED REGION [    6112,    9396]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31437240 TATTCTAATTCTGTCACCTACAAGCAATGTGGCTTTGGGAAAATTGTTTAATCTCTTTGC 31437299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTCTAATTCTGTCACCTACAAGCAATGTGGCTTTGGGAAAATTGTTTAATCTCTTTGC 60

 31437300 AACTCAATGTCCTCACTAAAATGGGAGAATTGAATGGAGATTTCTCAAAACTAAAAATAG 31437359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACTCAATGTCCTCACTAAAATGGGAGAATTGAATGGAGATTTCTCAAAACTAAAAATAG 120

 31437360 GACTACCATTCAATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCTACCAAGAGGAAAAGAAATCAA 31437419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACTACCATTCAATCCAGCAATCCCACTACTGGGTATCTACCAAGAGGAAAAGAAATCAA 180

 31437420 TATAACAAATAAATACCTGCACTTGCATGTTTATTGCAGCACTATTCAATACCACAAAGA 31437479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATAACAAATAAATACCTGCACTTGCATGTTTATTGCAGCACTATTCAATACCACAAAGA 240

 31437480 CATCAAATCAACCTAAGAGCCCATCTTTGGACAAATGGATAAAGAAAATGTGCTGTATAT 31437539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATCAAATCAACCTAAGAGCCCATCTTTGGACAAATGGATAAAGAAAATGTGCTGTATAT 300

 31437540 ATACATAATGGAATATTATTCAGCCATAAAAAAGAATGAAATCCTGACATTTGCAGCAAC 31437599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATACATAATGGAATATTATTCAGCCATAAAAAAGAATGAAATCCTGACATTTGCAGCAAC 360

 31437600 ATGGCTGGAAGTGAAGGTCATTATCTTAAGTGAAATAAGCCAGTCACAAAAAGATTAATA 31437659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGGCTGGAAGTGAAGGTCATTATCTTAAGTGAAATAAGCCAGTCACAAAAAGATTAATA 420

 31437660 CCACATATTCTCACTGACACGTGGGAGCTAAAAAATCTGATCACATGGAGATAGAGAATG 31437719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCACATATTCTCACTGACACGTGGGAGCTAAAAAATCTGATCACATGGAGATAGAGAATG 480

 31437720 AAAAGATGGAGAACAGAGACCAGGTGGGGTGAGTGGCAGGGTCAGGGAGAGGTTGAAGAG 31437779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAGATGGAGAACAGAGACCAGGTGGGGTGAGTGGCAGGGTCAGGGAGAGGTTGAAGAG 540

 31437780 AAGTGGGCTAAAGGCTACAAGCCTACAGTTAGATAGAAGGAGTAAATCCAGCATTTGATA 31437839
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGTGGGCTAAAGGCTACAAGCCTACAGTTAGATAGAAGGAGTAAATCCAGCATTTGATA 600

 31437840 GCAGTAGAGTAGGGTGGCTATAGTTTAACAAAAGTATATTATACTTGGGCGATGGACACC 31437899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCAGTAGAGTAGGGTGGCTATAGTTTAACAAAAGTATATTATACTTGGGCGATGGACACC 660

 31437900 CTAAACACCCTGTCTTGATCACTCCACATTATATACATGTAACAAAATTTCACATGTACC 31437959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTAAACACCCTGTCTTGATCACTCCACATTATATACATGTAACAAAATTTCACATGTACC 720

 31437960 CCACAAATGTGTACACATAATGTAAAAAATTAAAAAAATAAGATAAAATGGGAGGACTGA 31438019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCACAAATGTGTACACATAATGTAAAAAATTAAAAAAATAAGATAAAATGGGAGGACTGA 780

 31438020 ATTCCCTGTCCCATGGGTTCCTGTGAATTGAATGAGCTCACACACTAGGACTTGGCACAG 31438079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTCCCTGTCCCATGGGTTCCTGTGAATTGAATGAGCTCACACACTAGGACTTGGCACAG 840

 31438080 TGCCTGGCATAGAATAAGTGCTCAATGAATGCTAACTTCCCCTCCTGCTGTCAGCATCAT 31438139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCCTGGCATAGAATAAGTGCTCAATGAATGCTAACTTCCCCTCCTGCTGTCAGCATCAT 900

 31438140 TTACAACCAATAGACCTGAAAACGTCTGATGTTAATTAAACACCTTGATTCATTTGGAAA 31438199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTACAACCAATAGACCTGAAAACGTCTGATGTTAATTAAACACCTTGATTCATTTGGAAA 960

 31438200 GATTGATCTGGCATTAATCGGAACTACTGTACAAAAACGATGACTTCTTTGGATGCATAT 31438259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATTGATCTGGCATTAATCGGAACTACTGTACAAAAACGATGACTTCTTTGGATGCATAT 1020

 31438260 TTTTTGGGAAAAGGCCCAAAGTGTGGGCCATAAAATAAACCGAGAGTTTGCCTTTTGGGA 31438319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTTGGGAAAAGGCCCAAAGTGTGGGCCATAAAATAAACCGAGAGTTTGCCTTTTGGGA 1080

 31438320 GCGTAGAAACATGTCACGAGTTCTAACACTTCCACACTCATAGAACTAAAGCCTCCCAAG 31438379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCGTAGAAACATGTCACGAGTTCTAACACTTCCACACTCATAGAACTAAAGCCTCCCAAG 1140

 31438380 TAGGAAAAAACTCCACTTCCAGAGGGTACTTAACTCTCTATTCGGACCAAGCTATTACTT 31438439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGGAAAAAACTCCACTTCCAGAGGGTACTTAACTCTCTATTCGGACCAAGCTATTACTT 1200

 31438440 GAAGCTTCTCCCTTTTATTTCAGAAACTTCTTGCATTTATTTGATTTAGTTCTAAAGACG 31438499
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1201 GAAGCTTCTCCCTTTTATTTCAGAAACTTCTTGCATTTATTTGATTTGGTTCTAAAGACG 1260

 31438500 TGAAGTGTTATGGAATAAATTTGCTTACGGTGATGGATGGGCATTTTCACAACCCAGGGC 31438559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAAGTGTTATGGAATAAATTTGCTTACGGTGATGGATGGGCATTTTCACAACCCAGGGC 1320

 31438560 CTTGCTTCTAAAGCATTTTTATGACCACTTGATATCACCAAACAGTGAAACAGCATAGGA 31438619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTGCTTCTAAAGCATTTTTATGACCACTTGATATCACCAAACAGTGAAACAGCATAGGA 1380

 31438620 CACCAATCAATGAGGTGCATATTCTTCTCAGGTGGCAGAGAGATTAGGTGGCCTGTTTAA 31438679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACCAATCAATGAGGTGCATATTCTTCTCAGGTGGCAGAGAGATTAGGTGGCCTGTTTAA 1440

 31438680 AAGTGCCCAACAGGCTGGATGCGGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGAT 31438739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGTGCCCAACAGGCTGGATGCGGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGAT 1500

 31438740 CACCAGAGGTCAGGAGCTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGCAAAACCCTGTCTGTACTA 31438799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CACCAGAGGTCAGGAGCTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGCAAAACCCTGTCTGTACTA 1560

 31438800 AAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGCTGCCTATAATCCCAGCTACTTGAGAGG 31438859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGCTGCCTATAATCCCAGCTACTTGAGAGG 1620

 31438860 CTGAGGCATGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCAC 31438919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGAGGCATGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCAC 1680

 31438920 CATTGCACTCCAGCCTGGGCAAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAC 31438979
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1681 CATTGCACTCCAGCCTGGGCAAGCCTGGGCAACAGAGCGTGACTCCATCTCAAAAAAAAC 1740

 31438980 CAAAAATAAACCTGCTCAGCAAACCAGTGACAGGCAAATTGAGATGCCATTGGGCCACAC 31439039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAAAAATAAACCTGCTCAGCAAACCAGTGACAGGCAAATTGAGATGCCATTGGGCCACAC 1800

 31439040 TCCTTCACACAGAGGTCAAAGGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCATAGGTCTTTAATTA 31439099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCTTCACACAGAGGTCAAAGGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCATAGGTCTTTAATTA 1860

 31439100 GAAACAGAGGAAGTCAGGATTTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAAACTTTACCAGCTA 31439159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAAACAGAGGAAGTCAGGATTTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAAACTTTACCAGCTA 1920

 31439160 AATTGAAGAATCCCTGTTACTAAAAGTCTGTGTCATTGCACTTCGGGAGGGCGGGCCCAG 31439219
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1921 AATTGAAGAATCCCTGTTACTAAAAGTCTGTGTCATTGCACTTTGGGAGGGCGGGCCCAG 1980

 31439220 TGGCACACATGTGTGACGTGGCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGAAGAGTAGGAGCTACTG 31439279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGCACACATGTGTGACGTGGCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGAAGAGTAGGAGCTACTG 2040

 31439280 GAGAACCATGATGCATGACGCAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCCATGTCTTTCTCAG 31439339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAGAACCATGATGCATGACGCAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCCATGTCTTTCTCAG 2100

 31439340 CCGTCCTGGGAGCTTTCAGGATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCTCCTAAGGCAAAAA 31439399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCGTCCTGGGAGCTTTCAGGATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCTCCTAAGGCAAAAA 2160

 31439400 ATTTATACCACTTTTTTTTTTCCCAATCCAGATGCAAAACCAAAAACTCAAATCCAACTG 31439459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATTTATACCACTTTTTTTTTTCCCAATCCAGATGCAAAACCAAAAACTCAAATCCAACTG 2220

 31439460 TTCTCAGTCAAGTGAAAGCATTCCAAGACCTCAGAAATGCTCACTCACCAAAGACCATTT 31439519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCTCAGTCAAGTGAAAGCATTCCAAGACCTCAGAAATGCTCACTCACCAAAGACCATTT 2280

 31439520 TCCTGACTTGTAATTTGGTCAGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCCGGGTGGTCCAGTT 31439579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCCTGACTTGTAATTTGGTCAGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCCGGGTGGTCCAGTT 2340

 31439580 TCCTCTGGGAACTCCGTAGGTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCTTGCCTAGG 31439639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCCTCTGGGAACTCCGTAGGTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCTTGCCTAGG 2400

 31439640 AGTTCCAGGGCAACTGAACTTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTGCAGAAGGT 31439699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGTTCCAGGGCAACTGAACTTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTGCAGAAGGT 2460

 31439700 CGTTTGGAAAACCTAATTAGAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTTGGCCCTGG 31439759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CGTTTGGAAAACCTAATTAGAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTTGGCCCTGG 2520

 31439760 CAGGCCTGTGTGGAGGTGGAGGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGCCTTAGAAA 31439819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAGGCCTGTGTGGAGGTGGAGGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGCCTTAGAAA 2580

 31439820 GATGCTGGACTTAAAATTTCAAACCATTTCATAATGATTTATACATTTTTTAATAAGTGC 31439879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GATGCTGGACTTAAAATTTCAAACCATTTCATAATGATTTATACATTTTTTAATAAGTGC 2640

 31439880 CATTAGATCTCCTTCCACCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCC 31439939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CATTAGATCTCCTTCCACCTTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCC 2700

 31439940 CTAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTA 31439999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTAAGGGCCCAAGTAGGTTGTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTA 2760

 31440000 ATGCGTTCTTCTAATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATG 31440059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATGCGTTCTTCTAATTTGAAGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATG 2820

 31440060 CAATTTGGTTGAGGAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGG 31440119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAATTTGGTTGAGGAGCTGAGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGG 2880

 31440120 ATAGAAATTGCTCAAATGAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGA 31440179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATAGAAATTGCTCAAATGAACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGA 2940

 31440180 AAAACATCTGTTGTGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTT 31440239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAAACATCTGTTGTGAAAGTTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTT 3000

 31440240 GTTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTG 31440299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTTTTGTACAGCACAGCACTAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTG 3060

 31440300 TTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAG 31440359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAG 3120

 31440360 GCCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAAC 31440419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GCCACCACTGTGGAGATTGAGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAAC 3180

 31440420 AAGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCT 31440479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAGTCAGTGGAGGGTTCCTCTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCT 3240

 31440480 GGGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATA 31440539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGGCATCCCAGGGCTGTCCCCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATA 3300

 31440540 AACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCAC 31440599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AACCTCAGAAAGCACAGCCTGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCAC 3360

 31440600 CCCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAA 31440659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CCCAGTCTAATATTTCTCCTTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAA 3420

 31440660 GAAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTT 31440719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GAAGATAGTTTTTTTTCAACTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTT 3480

 31440720 TCGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGC 31440779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCGCTCCTGTTGCCCAGGTTGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGC 3540

 31440780 CTCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGG 31440839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTCCCAGGTCCAAACAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGG 3600

 31440840 CACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTC 31440899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTC 3660

 31440900 AGTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 31440959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGTCTAGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 3720

 31440960 GGATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGG 31441019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GGATTATAGACGTGAGCCACTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGG 3780

 31441020 GCAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTA 31441079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GCAGATTTCTTACATTCATATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTA 3840

 31441080 TCCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAG 31441139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TCCATCCCACCTGAATAGTGAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAG 3900

 31441140 ACAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACT 31441199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ACAGTTTGAGATGCCAAGTGGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACT 3960

 31441200 GTCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACAC 31441259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GTCAGTTCTTGGGGAGCCCAGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACAC 4020

 31441260 AACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATT 31441319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AACTGCATAGCAATTGTGAGAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATT 4080

 31441320 AGGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATT 31441379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AGGCAGGTATTTTATCAAATGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATT 4140

 31441380 GCTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAA 31441439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GCTTTTTCTAATTTCATTATGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAA 4200

 31441440 AGATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGT 31441499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AGATAATGTCTGGGAGTGTGTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGT 4260

 31441500 GGAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGC 31441559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GGAGCTTTCCTGCAGGAGTGACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGC 4320

 31441560 TGCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCA 31441619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGCCTTGACTTTCCAGGACAGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCA 4380

 31441620 ATGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCC 31441679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ATGATTTTCAGCTATGACCTTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCC 4440

 31441680 AAATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGT 31441739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AAATGCAGTTTAGTTCCATTGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGT 4500

 31441740 CATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTT 31441799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CATTGGGTCCTGTCTCCTTGCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTT 4560

 31441800 TGCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGT 31441859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TGCTGATCTTGGCACATTCTGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGT 4620

 31441860 GTCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCT 31441919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GTCCAGCTGGATAGATGTCACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCT 4680

 31441920 CAGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAAC 31441979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CAGGCTACAGCCACCAGAGCTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAAC 4740

 31441980 TGGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGAT 31442039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TGGCTGGAGAAGGAAATCATGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGAT 4800

 31442040 TGATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTG 31442099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TGATACCTCATCTCTGTGTAGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTG 4860

 31442100 AAGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGC 31442159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AAGGCTGTGTACTGTGGTTCCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGC 4920

 31442160 TTTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATA 31442219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TTTTCACACACAAATATCTTTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATA 4980

 31442220 TTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTG 31442279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TTGCCAACGATGTGTGCCCAGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTG 5040

 31442280 CACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAAC 31442339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CACGAGGAGATGTTCCTCATATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAAC 5100

 31442340 GGGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGA 31442399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GGGAAACTGAATCTTTAATTCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGA 5160

 31442400 GAAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTG 31442459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GAAGATGCTCATTGAAAATTTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTG 5220

 31442460 AAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGT 31442519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AAGCTAAGCTTTGTAGGCAGTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGT 5280

 31442520 CCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGA 31442579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CCTGGGGTCCCTGACACGGAAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGA 5340

 31442580 AAAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCT 31442639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AAAGGAGGACAATTTCACCCACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCT 5400

 31442640 GTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTC 31442699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GTCAGCAGAGTCTGCCTGTGGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTC 5460

 31442700 TCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCA 31442759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TCAGGCCACGATGCAGAGGCTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCA 5520

 31442760 CCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAAC 31442819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CCCAGAGCTGGGTTTATGTTTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAAC 5580

 31442820 TGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTG 31442879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TGGGAGGAGCTGACCTCGTCGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTG 5640

 31442880 ACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCAT 31442939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 ACTCGGCCCTGTGGTGTTCAAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCAT 5700

 31442940 GGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCT 31442999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GGGCCCACCCGGGTCTCCGTCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCT 5760

 31443000 GGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAG 31443059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 GGGCAATTTGTAAAGAAAAGAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAG 5820

 31443060 CATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGG 31443119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CATGGTGCTGGCATCTATATCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGG 5880

 31443120 TGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGG 31443179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TGAAGGGGAGGTGAAAGGGACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGG 5940

 31443180 CCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATC 31443239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 CCGAGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATC 6000

 31443240 ACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAA 31443299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 ACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAA 6060

 31443300 ATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 31443350
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 ATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 6111

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6112 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 6171

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6172 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 6231

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6232 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 6291

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6292 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 6351

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6352 TCTC-AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 6410

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6411 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 6470

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6471 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 6530

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6531 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 6590

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6591 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 6650

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6651 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 6710

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6711 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 6770

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6771 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 6830

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6831 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 6890

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6891 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 6950

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6951 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 7010

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7011 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 7070

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7071 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 7130

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 31445944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7131 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 7190

 31445945 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 31446004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7191 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 7250

 31446005 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 31446064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7251 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 7310

 31446065 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 31446124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7311 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 7370

 31446125 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 31446184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7371 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 7430

 31446185 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 31446244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7431 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 7490

 31446245 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 31446304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7491 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 7550

 31446305 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 31446364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7551 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 7610

 31446365 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 31446424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7611 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 7670

 31446425 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 31446484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7671 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 7730

 31446485 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 31446544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7731 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 7790

 31446545 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 31446604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7791 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 7850

 31446605 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 31446664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7851 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 7910

 31446665 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 31446724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7911 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 7970

 31446725 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 31446784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7971 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 8030

 31446785 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 31446844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8031 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 8090

 31446845 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 31446904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8091 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 8150

 31446905 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 31446964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8151 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 8210

 31446965 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 31447024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8211 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 8270

 31447025 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 31447084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8271 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 8330

 31447085 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 31447144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8331 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 8390

 31447145 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 31447204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8391 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 8450

 31447205 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 31447264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8451 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 8510

 31447265 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 31447324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8511 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 8570

 31447325 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 31447384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8571 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 8630

 31447385 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 31447444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8631 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 8690

 31447445 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 31447504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8691 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 8750

 31447505 TGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAG 31447564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8751 TGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAG 8810

 31447565 ATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAC 31447624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8811 ATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAC 8870

 31447625 CTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATA 31447684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8871 CTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATA 8930

 31447685 AGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTT 31447744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8931 AGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTT 8990

 31447745 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGA 31447804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8991 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGA 9050

 31447805 CCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTT 31447864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9051 CCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTT 9110

 31447865 TCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTC 31447924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9111 TCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTC 9170

 31447925 CAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGA 31447984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9171 CAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGA 9230

 31447985 CCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATA 31448044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9231 CCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATA 9290

 31448045 TTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAA 31448104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9291 TTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAA 9350

 31448105 GTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATAT 31448150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9351 GTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATAT 9396

Alignment time is 7.03874 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3285] =>      3285 nucs 'mol-32-33ab-118786_3285'

Score:        3274
Aligned:      3285        nucs
Identic:      3284 (100%) nucs =>       244 (100%)      3040 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31444865,31445108] EXCISED REGION [31445110,31448150]
 second seq =>  [       1,     244] EXCISED REGION [     245,    3285]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31445109,31445109]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [31445920,31445920]
 second seq =>         1 nucs [1055,1055]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31445109,31445123] to [31445110,31445124]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 60

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 120

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 180

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 240

 31445105 TCTC 31445108
          ||||
      241 TCTC 244

EXCISED REGION

 31445110 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 31445169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      245 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 304

 31445170 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 31445229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      305 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 364

 31445230 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 31445289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      365 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 424

 31445290 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 31445349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      425 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 484

 31445350 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 31445409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 544

 31445410 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 31445469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 604

 31445470 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 31445529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 664

 31445530 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 31445589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 724

 31445590 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 31445649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 784

 31445650 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 31445709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 844

 31445710 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 31445769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 904

 31445770 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 31445829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 964

 31445830 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 31445889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 1024

 31445890 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 31445949
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1025 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 1084

 31445950 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 31446009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 1144

 31446010 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 31446069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 1204

 31446070 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 31446129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 1264

 31446130 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 31446189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 1324

 31446190 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 31446249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 1384

 31446250 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 31446309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 1444

 31446310 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 31446369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 1504

 31446370 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 31446429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 1564

 31446430 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 31446489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 1624

 31446490 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 31446549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 1684

 31446550 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 31446609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 1744

 31446610 AGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCG 31446669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 AGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCG 1804

 31446670 GCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGT 31446729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 GCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGT 1864

 31446730 CAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGT 31446789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 CAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGT 1924

 31446790 CCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTG 31446849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 CCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTG 1984

 31446850 ACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCC 31446909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 ACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCC 2044

 31446910 AGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCT 31446969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 AGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCT 2104

 31446970 CACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCT 31447029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 CACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCT 2164

 31447030 CCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTG 31447089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 CCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTG 2224

 31447090 CCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTAT 31447149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 CCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTAT 2284

 31447150 TTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAG 31447209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 TTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAG 2344

 31447210 TTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCA 31447269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 TTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCA 2404

 31447270 GTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTA 31447329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 GTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTA 2464

 31447330 TAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGC 31447389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 TAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGC 2524

 31447390 ATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCC 31447449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 ATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCC 2584

 31447450 TAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTC 31447509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 TAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTC 2644

 31447510 CAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAGATAGA 31447569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 CAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAGATAGA 2704

 31447570 GTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCA 31447629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 GTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCA 2764

 31447630 CCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATAAGTAC 31447689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 CCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATAAGTAC 2824

 31447690 ACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTTTTGTA 31447749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 ACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTTTTGTA 2884

 31447750 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCG 31447809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCG 2944

 31447810 TGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTTTCATG 31447869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 TGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTTTCATG 3004

 31447870 CTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTCCAGGC 31447929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 CTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTCCAGGC 3064

 31447930 CCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGACCTCC 31447989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 CCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGACCTCC 3124

 31447990 CCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATATTAAT 31448049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 CCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATATTAAT 3184

 31448050 CAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAAGTTAT 31448109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 CAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAAGTTAT 3244

 31448110 GTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATAT 31448150
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 GTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATAT 3285

Alignment time is 2.48857 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3697] =>      3697 nucs 'mol-32-33b6-164490_3697'

Score:        3651
Aligned:      3701        nucs
Identic:      3694 (100%) nucs =>        64 (100%)      3630 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443287,31443350] EXCISED REGION [31444865,31448501]
 second seq =>  [       1,      64] EXCISED REGION [      65,    3697]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31443287 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAG 31443346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGGCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAG 60

 31443347 CTAC 31443350
          ||||
       61 CTAC 64

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       65 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 124

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      125 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 184

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      185 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 244

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      245 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 304

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      305 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 364

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      365 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 424

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      425 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 484

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 544

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 604

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 664

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 724

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      725 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTC 784

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 844

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 904

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 964

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 1024

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 1084

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 31445944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1085 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 1144

 31445945 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 31446004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 1204

 31446005 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 31446064
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 CAAGAAAGTACATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 1264

 31446065 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 31446124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 1324

 31446125 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 31446184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 1384

 31446185 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 31446244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 1444

 31446245 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 31446304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 1504

 31446305 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 31446364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 1564

 31446365 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 31446424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 1624

 31446425 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 31446484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 1684

 31446485 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 31446544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 1744

 31446545 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 31446604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 1804

 31446605 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 31446664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 1864

 31446665 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 31446724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 1924

 31446725 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 31446784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 1984

 31446785 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 31446844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 2044

 31446845 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 31446904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 2104

 31446905 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 31446964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 2164

 31446965 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 31447024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 2224

 31447025 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 31447084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 2284

 31447085 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 31447144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 2344

 31447145 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 31447204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 2404

 31447205 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 31447264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 2464

 31447265 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 31447324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 2524

 31447325 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 31447384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 2584

 31447385 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 31447444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 2644

 31447445 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 31447504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 2704

 31447505 TGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAG 31447564
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||
     2705 TGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCC----TTTTTTTTTTTTTTTTTCGAG 2760

 31447565 ATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAC 31447624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAC 2820

 31447625 CTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATA 31447684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATA 2880

 31447685 AGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTT 31447744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTT 2940

 31447745 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGA 31447804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGA 3000

 31447805 CCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTT 31447864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTT 3060

 31447865 TCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTC 31447924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTC 3120

 31447925 CAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGA 31447984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGA 3180

 31447985 CCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATA 31448044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATA 3240

 31448045 TTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAA 31448104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAA 3300

 31448105 GTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGTTACTTAATAGA 31448164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGTTACTTAATAGA 3360

 31448165 TATTTGGAGATTTTCTTGACTCGGAAACTAGGAGTCTTTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAAT 31448224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TATTTGGAGATTTTCTTGACTCGGAAACTAGGAGTCTTTTCTTCCAGTGGCTTCCAGAAT 3420

 31448225 AGATAATCAACATTCCCCTACTGGGGAGAAACAAGGTGGGAGAATGAATACAACCTATGC 31448284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGATAATCAACATTCCCCTACTGGGGAGAAACAAGGTGGGAGAATGAATACAACCTATGC 3480

 31448285 TCCCCTAGGAAGGTTTTAAGAATTTTATTTTGTGTTTCTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTGC 31448344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCCCCTAGGAAGGTTTTAAGAATTTTATTTTGTGTTTCTTGTTTTGTTTTGTTCTTGTGC 3540

 31448345 ATAAGAGATTAAGGAAATACACAGCTACTTTATAAGAGACTCCTTAAGAAAGAGATGGAG 31448404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATAAGAGATTAAGGAAATACACAGCTACTTTATAAGAGACTCCTTAAGAAAGAGATGGAG 3600

 31448405 GCAGGACCAAGGAATGCACAAAGGATGGGGTATTTTGCCATAAAAAGTAACTGCAATACA 31448464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GCAGGACCAAGGAATGCACAAAGGATGGGGTATTTTGCCATAAAAAGTAACTGCAATACA 3660

 31448465 CTGAATGTGTCCCCCAAAATTCATGGTTTTAAAAAAT 31448501
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTGAATGTGTCCCCCAAAATTCATGGTTTTAAAAAAT 3697

Alignment time is 2.82641 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    2459] =>      2459 nucs 'mol-32-3403-175899_2459'

Score:        2459
Aligned:      2459        nucs
Identic:      2459 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31442180,31444638]
 second seq =>  [       1,    2459]

 31442180 TTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCA 31442239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCCA 60

 31442240 GGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCAT 31442299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCAT 120

 31442300 ATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATT 31442359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAATT 180

 31442360 CTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATT 31442419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAATT 240

 31442420 TCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAG 31442479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCAG 300

 31442480 TTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGA 31442539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGGA 360

 31442540 AGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCC 31442599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACCC 420

 31442600 ACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTG 31442659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGTG 480

 31442660 GGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGC 31442719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGGC 540

 31442720 TTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTT 31442779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGTT 600

 31442780 TGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTC 31442839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGTC 660

 31442840 GTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCA 31442899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTCA 720

 31442900 AGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGT 31442959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCGT 780

 31442960 CTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAG 31443019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAAG 840

 31443020 AGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATAT 31443079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATAT 900

 31443080 CTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGA 31443139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGGA 960

 31443140 CCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGC 31443199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACGC 1020

 31443200 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGA 31443259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGA 1080

 31443260 CCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGG 31443319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAGG 1140

 31443320 CGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTG 31443379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTG 1200

 31443380 AACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGTG 31443439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGTG 1260

 31443440 ACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGA 31443499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGA 1320

 31443500 TGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTAAGAATAAGAATTCACTCACTC 31443559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTAAGAATAAGAATTCACTCACTC 1380

 31443560 CTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGC 31443619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGC 1440

 31443620 ACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAA 31443679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAA 1500

 31443680 CAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTC 31443739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTC 1560

 31443740 TTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCT 31443799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCT 1620

 31443800 AGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACC 31443859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACC 1680

 31443860 TGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCT 31443919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCT 1740

 31443920 CTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACAT 31443979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACAT 1800

 31443980 CTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGT 31444039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGT 1860

 31444040 GTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTT 31444099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTT 1920

 31444100 AATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACC 31444159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACC 1980

 31444160 TACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTG 31444219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTG 2040

 31444220 CAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGT 31444279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGT 2100

 31444280 ACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGG 31444339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGG 2160

 31444340 AAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCC 31444399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCC 2220

 31444400 CTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATG 31444459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATG 2280

 31444460 TGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCT 31444519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCT 2340

 31444520 CGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGA 31444579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGA 2400

 31444580 GGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAA 31444638
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAA 2459

Alignment time is 1.62073 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    8595] =>      8595 nucs 'mol-32-3487-118405_8595'

Score:        8527
Aligned:      8601        nucs
Identic:      8591 (100%) nucs =>      5309 (100%)      3282 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31438039,31443350] EXCISED REGION [31444865,31448153]
 second seq =>  [       1,    5312] EXCISED REGION [    5313,    8595]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1514 nucs [31443351,31444864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [31443351,31443368] to [31444865,31444882]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31443351,31443351] to [31444864,31444864]
 second seq =>         0 nucs

 31438039 CCTGTGAATTGAATGAGCTCACACACTAGGACTTGGCACAGTGCCTGGCATAGAATAAGT 31438098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGTGAATTGAATGAGCTCACACACTAGGACTTGGCACAGTGCCTGGCATAGAATAAGT 60

 31438099 GCTCAATGAATGCTAACTTCCCCTCCTGCTGTCAGCATCATTTACAACCAATAGACCTGA 31438158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTCAATGAATGCTAACTTCCCCTCCTGCTGTCAGCATCATTTACAACCAATAGACCTGA 120

 31438159 AAACGTCTGATGTTAATTAAACACCTTGATTCATTTGGAAAGATTGATCTGGCATTAATC 31438218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAACGTCTGATGTTAATTAAACACCTTGATTCATTTGGAAAGATTGATCTGGCATTAATC 180

 31438219 GGAACTACTGTACAAAAACGATGACTTCTTTGGATGCATATTTTTTGGGAAAAGGCCCAA 31438278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAACTACTGTACAAAAACGATGACTTCTTTGGATGCATATTTTTTGGGAAAAGGCCCAA 240

 31438279 AGTGTGGGCCATAAAATAAACCGAGAGTTTGCCTTTTGGGAGCGTAGAAACATGTCACGA 31438338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTGTGGGCCATAAAATAAACCGAGAGTTTGCCTTTTGGGAGCGTAGAAACATGTCACGA 300

 31438339 GTTCTAACACTTCCACACTCATAGAACTAAAGCCTCCCAAGTAGGAAAAAACTCCACTTC 31438398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTCTAACACTTCCACACTCATAGAACTAAAGCCTCCCAAGTAGGAAAAAACTCCACTTC 360

 31438399 CAGAGGGTACTTAACTCTCTATTCGGACCAAGCTATTACTTGAAGCTTCTCCCTTTTATT 31438458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGAGGGTACTTAACTCTCTATTCGGACCAAGCTATTACTTGAAGCTTCTCCCTTTTATT 420

 31438459 TCAGAAACTTCTTGCATTTATTTGATTTAGTTCTAAAGACGTGAAGTGTTATGGAATAAA 31438518
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAGAAACTTCTTGCATTTATTTGATTTGGTTCTAAAGACGTGAAGTGTTATGGAATAAA 480

 31438519 TTTGCTTACGGTGATGGATGGGCATTTTCACAACCCAGGGCCTTGCTTCTAAAGCATTTT 31438578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGCTTACGGTGATGGATGGGCATTTTCACAACCCAGGGCCTTGCTTCTAAAGCATTTT 540

 31438579 TATGACCACTTGATATCACCAAACAGTGAAACAGCATAGGACACCAATCAATGAGGTGCA 31438638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATGACCACTTGATATCACCAAACAGTGAAACAGCATAGGACACCAATCAATGAGGTGCA 600

 31438639 TATTCTTCTCAGGTGGCAGAGAGATTAGGTGGCCTGTTTAAAAGTGCCCAACAGGCTGGA 31438698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATTCTTCTCAGGTGGCAGAGAGATTAGGTGGCCTGTTTAAAAGTGCCCAACAGGCTGGA 660

 31438699 TGCGGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACCAGAGGTCAGGAGCTT 31438758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCGGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACCAGAGGTCAGGAGCTT 720

 31438759 GAGACCAGCCTGACCAACATGGCAAAACCCTGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCTG 31438818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGACCAGCCTGACCAACATGGCAAAACCCTGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCTG 780

 31438819 GGTGTGGTGGCAGCTGCCTATAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCATGAGAATCGCT 31438878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGTGTGGTGGCAGCTGCCTATAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCATGAGAATCGCT 840

 31438879 TGAACCCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCATTGCACTCCAGCCTGGG 31438938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAACCCGGGAGGCAGATGTTGCAGTGAGCCAAGATTGCACCATTGCACTCCAGCCTGGG 900

 31438939 CAAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAACCAAAAATAAACCTGCTCAG 31438998
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAAGCCTGGGCAACAGAGCGTGACTCCATCTCAAAAAAAACCAAAAATAAACCTGCTCAG 960

 31438999 CAAACCAGTGACAGGCAAATTGAGATGCCATTGGGCCACACTCCTTCACACAGAGGTCAA 31439058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAAACCAGTGACAGGCAAATTGAGATGCCATTGGGCCACACTCCTTCACACAGAGGTCAA 1020

 31439059 AGGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCATAGGTCTTTAATTAGAAACAGAGGAAGTCAGGA 31439118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGAAGGAGCTGGCCATCCTCTGCCCATAGGTCTTTAATTAGAAACAGAGGAAGTCAGGA 1080

 31439119 TTTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAAACTTTACCAGCTAAATTGAAGAATCCCTGTTA 31439178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTTTATCCACTTGAGAAAAACATGAAACTTTACCAGCTAAATTGAAGAATCCCTGTTA 1140

 31439179 CTAAAAGTCTGTGTCATTGCACTTCGGGAGGGCGGGCCCAGTGGCACACATGTGTGACGT 31439238
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTAAAAGTCTGTGTCATTGCACTTTGGGAGGGCGGGCCCAGTGGCACACATGTGTGACGT 1200

 31439239 GGCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGAAGAGTAGGAGCTACTGGAGAACCATGATGCATGAC 31439298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGCTGTCCAGTCACACTGGTTGTGAAGAGTAGGAGCTACTGGAGAACCATGATGCATGAC 1260

 31439299 GCAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCCATGTCTTTCTCAGCCGTCCTGGGAGCTTTCAG 31439358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCAGAAGATCAGGGGCAGGGCCCTGGCCATGTCTTTCTCAGCCGTCCTGGGAGCTTTCAG 1320

 31439359 GATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCTCCTAAGGCAAAAAATTTATACCACTTTTTTTT 31439418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATGGTCATCCTTCTTCTGTTCTTTCCTCCTAAGGCAAAAAATTTATACCACTTTTTTTT 1380

 31439419 TTCCCAATCCAGATGCAAAACCAAAAACTCAAATCCAACTGTTCTCAGTCAAGTGAAAGC 31439478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCCCAATCCAGATGCAAAACCAAAAACTCAAATCCAACTGTTCTCAGTCAAGTGAAAGC 1440

 31439479 ATTCCAAGACCTCAGAAATGCTCACTCACCAAAGACCATTTTCCTGACTTGTAATTTGGT 31439538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTCCAAGACCTCAGAAATGCTCACTCACCAAAGACCATTTTCCTGACTTGTAATTTGGT 1500

 31439539 CAGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCCGGGTGGTCCAGTTTCCTCTGGGAACTCCGTAG 31439598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGTTATCACTGGTTTTAGGAAGGTTCCGGGTGGTCCAGTTTCCTCTGGGAACTCCGTAG 1560

 31439599 GTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCTTGCCTAGGAGTTCCAGGGCAACTGAAC 31439658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTTTCATGGTTTCTGTTTCCAGAGTTTTCTGCTTGCCTAGGAGTTCCAGGGCAACTGAAC 1620

 31439659 TTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTGCAGAAGGTCGTTTGGAAAACCTAATTA 31439718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTGCTGAGAAGGTGAGCACCCACCGCTCAGCTGCAGAAGGTCGTTTGGAAAACCTAATTA 1680

 31439719 GAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTTGGCCCTGGCAGGCCTGTGTGGAGGTGG 31439778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAGTTCCTCCCCCTTTTTTTAACACCAGGAGTTGGCCCTGGCAGGCCTGTGTGGAGGTGG 1740

 31439779 AGGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGCCTTAGAAAGATGCTGGACTTAAAATTT 31439838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGGCGATTACATTTTGATCCCTAGTATATCTGCCTTAGAAAGATGCTGGACTTAAAATTT 1800

 31439839 CAAACCATTTCATAATGATTTATACATTTTTTAATAAGTGCCATTAGATCTCCTTCCACC 31439898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAACCATTTCATAATGATTTATACATTTTTTAATAAGTGCCATTAGATCTCCTTCCACC 1860

 31439899 TTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTT 31439958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTCAGGTGTCAGAACTGCTAAGCCTCATACAGCTTCTTCCCTAAGGGCCCAAGTAGGTT 1920

 31439959 GTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGA 31440018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTTAGTTGGGTGGGTTGAGTCTCTGATTCCTGCATACTTTAATGCGTTCTTCTAATTTGA 1980

 31440019 AGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTG 31440078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTATGCAAACTAGGTTTGCTCCCTTCGGAACAATCCCATGCAATTTGGTTGAGGAGCTG 2040

 31440079 AGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGA 31440138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGCACATTTCACAGCAAGAAAATAGGGACCGTCCAAAAGGGATAGAAATTGCTCAAATGA 2100

 31440139 ACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAG 31440198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACAATTTGCATTTACTCTCCTCCTGGGGAAAAATATATTGAAAAACATCTGTTGTGAAAG 2160

 31440199 TTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCAC 31440258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTAAGGTATAATCTTCAACTCCTCCAACTTTCTCTGTCCTTGTTTTGTACAGCACAGCAC 2220

 31440259 TAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAA 31440318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAACTAAAGGCAACGTGGTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAAAAAAGAAAAAA 2280

 31440319 GAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTG 31440378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAAGCACACACAGAGAGGCTAATTCACCATAAATGGTCCAGGCCACCACTGTGGAGATTG 2340

 31440379 AGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCT 31440438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGAATGTGAAAGTGAAAAGCAGGCCAGTCAGCTTGTAGAACAAGTCAGTGGAGGGTTCCT 2400

 31440439 CTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCC 31440498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTGACAATGGAACTGGTTGAGAAGTGTCAGCGATCACACCTGGGCATCCCAGGGCTGTCC 2460

 31440499 CCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCC 31440558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCTACCCAGAGAAGGCCATTATCCTGCTCTCTGTAATAATAAACCTCAGAAAGCACAGCC 2520

 31440559 TGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCC 31440618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGGTTGTCTAAATGAGCAGGAATCTTTTCACACATTTCCACCCCAGTCTAATATTTCTCC 2580

 31440619 TTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAA 31440678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTCAGAGGTAAGAAGAACCTGTATTCATTGAAGCTAAGAAGAAGATAGTTTTTTTTCAA 2640

 31440679 CTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGT 31440738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTATATATATACATATATAATTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGT 2700

 31440739 TGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATT 31440798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGGAGTGCAATGGCACTATCTCAGCTCATGACAATCTTTGCCTCCCAGGTCCAAACAATT 2760

 31440799 CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAA 31440858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCAGGCACCACCATGCCTGGCTAA 2820

 31440859 TTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCC 31440918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGATTTCTCCATGTTGGTCAGTCTAGTCTCAAACTCCC 2880

 31440919 GACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCA 31440978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GACCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGACGTGAGCCA 2940

 31440979 CTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCAT 31441038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTGCACCCAGCCTAAAAAATATATATTGAAGGAGCACAAGGGCAGATTTCTTACATTCAT 3000

 31441039 ATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGT 31441098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATATTGTGTAATGAAGTAACGAAGTCTGGACTTTTAGTGTATCCATCCCACCTGAATAGT 3060

 31441099 GAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGT 31441158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GAACATTGTACCCAACAGGTAATTTGTCAACCAATAAGAAGACAGTTTGAGATGCCAAGT 3120

 31441159 GGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCC 31441218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGAAAGCCACCTCTTGGAGATTACTAGATTCCATCTTTACTGTCAGTTCTTGGGGAGCCC 3180

 31441219 AGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGA 31441278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGGGAGCTCACATGGGTATCAGATGGGATTTTACTCCACACAACTGCATAGCAATTGTGA 3240

 31441279 GAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAA 31441338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GAAGCTCAGGCAATACCAGATCTAGAGCTCCATATTCAATTAGGCAGGTATTTTATCAAA 3300

 31441339 TGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTA 31441398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGTCAGTGTACAAGTCAGTTTTCTTCCTTCCCTTCAGAATTGCTTTTTCTAATTTCATTA 3360

 31441399 TGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGT 31441458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGTCCCTAGCCTTGGCACTAAGACCAATTAGAAGAGAATAAAGATAATGTCTGGGAGTGT 3420

 31441459 GTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGT 31441518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GTGGGCTGAACAGATAAAAGCTGTCACTTGCAGATCACAGTGGAGCTTTCCTGCAGGAGT 3480

 31441519 GACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGAC 31441578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GACTCTCCTGAATCCAAACCACTTGGAGCTTATCTATAGGCTGCCTTGACTTTCCAGGAC 3540

 31441579 AGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACC 31441638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGCTGATAGACCTGCTTCAGTCTGATTTGCAAAAGTATGCAATGATTTTCAGCTATGACC 3600

 31441639 TTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCAT 31441698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTGACTTGTCTCTTCCTGTCTCTCCAAGCAGGCCACTCTCCAAATGCAGTTTAGTTCCAT 3660

 31441699 TGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTT 31441758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TGACCAAAGATGTTAGAAGCAAGCTCTGGGCTCAGACCTGTCATTGGGTCCTGTCTCCTT 3720

 31441759 GCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTC 31441818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GCCCCTCAGGATGGAGGAATTCTGTGCCAAGATTTTATCTTTGCTGATCTTGGCACATTC 3780

 31441819 TGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTC 31441878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGACATCCTGCATGTGTGGGCCCCAGACGATCCCCAACTGTGTCCAGCTGGATAGATGTC 3840

 31441879 ACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAG 31441938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ACCAGGGAAAACCTCTCATCACAGCAGGTCACTTCCTTTCTCAGGCTACAGCCACCAGAG 3900

 31441939 CTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCA 31441998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CTGGGTCAACTGGGGCTAGGAAAAGTAGGCCAACACAGAACTGGCTGGAGAAGGAAATCA 3960

 31441999 TGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGT 31442058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TGCAGGGCTTATTTAGAAGTGTCTATGATCCACAATGAGATTGATACCTCATCTCTGTGT 4020

 31442059 AGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTT 31442118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGGGAGATTTTGGAATGATCTCCATTTCCCTTCTAATTCTGAAGGCTGTGTACTGTGGTT 4080

 31442119 CCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCT 31442178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CCAACCACGTAATTCACCCAAATTAGCACTGATGAACTAGCTTTTCACACACAAATATCT 4140

 31442179 TTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCC 31442238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTTCCAAGCATCAGCGTATTTTTATTTTGTGTCTCCAAATATTGCCAACGATGTGTGCCC 4200

 31442239 AGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCA 31442298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AGGGTGTGGATATAGCAGGGCCGAACTTGGGTTGCCATCTGCACGAGGAGATGTTCCTCA 4260

 31442299 TATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAAT 31442358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TATGTGCTCCTTCGCCAGTTTGCTGCCTGAAATCCTTGAACGGGAAACTGAATCTTTAAT 4320

 31442359 TCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAAT 31442418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TCTACCATCTGATATAAGAACTCTATGCCAATGTGATGGGAGAAGATGCTCATTGAAAAT 4380

 31442419 TTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCA 31442478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TTCCCACCAAGATTTCAATGAATCATACAGATTCTTGCCTGAAGCTAAGCTTTGTAGGCA 4440

 31442479 GTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGG 31442538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GTTGATATTGGGGATGGGGAAGGATGGTTGAAGCAGGAGGTCCTGGGGTCCCTGACACGG 4500

 31442539 AAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACC 31442598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AAGAAGGTGCCTGGAAGTGCACTAAAAGGAGCATATAGAGAAAAGGAGGACAATTTCACC 4560

 31442599 CACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGT 31442658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CACTCCACAAAGTGCTGAGTCTCTCAGTTGATGATTCTCCTGTCAGCAGAGTCTGCCTGT 4620

 31442659 GGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGG 31442718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GGGCCAGGCATCTTGGAAGGAGAGAGGCTGCTTTGCTCCTCTCAGGCCACGATGCAGAGG 4680

 31442719 CTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGT 31442778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CTTAGCCTCCCAAGCTTCCTTGGGCACCAAGACTAGCAGCACCCAGAGCTGGGTTTATGT 4740

 31442779 TTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGT 31442838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTGGTTCACCCTGAACTGCACTGACTCACCCCCAGCAGAACTGGGAGGAGCTGACCTCGT 4800

 31442839 CGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTC 31442898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CGTGAGGCCTAGTTCTCATTCACCTGGTTATAGGCGCAGTGACTCGGCCCTGTGGTGTTC 4860

 31442899 AAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCG 31442958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AAGCCTTCGCCAATGATGCACCTTCATGGGCAGGAATCCATGGGCCCACCCGGGTCTCCG 4920

 31442959 TCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAA 31443018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TCTTAGTTCATTTGTGTTGCTATAAAGGAATACCTGAGGCTGGGCAATTTGTAAAGAAAA 4980

 31443019 GAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATA 31443078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GAGGTTTATTTCACTTACAGTTCTTCTGGCTGTACAGAAAGCATGGTGCTGGCATCTATA 5040

 31443079 TCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGG 31443138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TCTGGGGAGGGCCTCAGGCTGCTTCCACTCATGGCAGAGGGTGAAGGGGAGGTGAAAGGG 5100

 31443139 ACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACG 31443198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 ACCTGATGTGTAGAGATCATGTGGCAAGAGACAGGAAGAGGCCGAGCTCAGTGGCTCACG 5160

 31443199 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAG 31443258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAG 5220

 31443259 ACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAG 31443318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAGTAGCCAG 5280

 31443319 GCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 31443350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GCGTGGTGATGGGTACCTATAGTCCCAGCTAC 5312

EXCISED REGION

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5313 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 5372

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5373 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 5432

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5433 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 5492

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5493 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 5552

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5553 TCTC--AAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 5610

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5611 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 5670

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5671 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 5730

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5731 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 5790

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5791 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 5850

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5851 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 5910

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5911 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 5970

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5971 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 6030

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6031 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 6090

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6091 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 6150

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6151 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 6210

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6211 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 6270

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6271 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 6330

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 31445944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     6331 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 6390

 31445945 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 31446004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6391 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 6450

 31446005 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 31446064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6451 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 6510

 31446065 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 31446124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6511 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 6570

 31446125 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 31446184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6571 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 6630

 31446185 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 31446244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6631 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 6690

 31446245 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 31446304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6691 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 6750

 31446305 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 31446364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6751 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 6810

 31446365 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 31446424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6811 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 6870

 31446425 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 31446484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6871 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 6930

 31446485 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 31446544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6931 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 6990

 31446545 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 31446604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6991 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 7050

 31446605 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 31446664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7051 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 7110

 31446665 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 31446724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7111 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 7170

 31446725 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 31446784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7171 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 7230

 31446785 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 31446844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7231 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 7290

 31446845 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 31446904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7291 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 7350

 31446905 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 31446964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7351 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 7410

 31446965 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 31447024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7411 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 7470

 31447025 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 31447084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7471 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 7530

 31447085 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 31447144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7531 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 7590

 31447145 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 31447204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7591 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 7650

 31447205 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 31447264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7651 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 7710

 31447265 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 31447324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7711 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 7770

 31447325 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 31447384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7771 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 7830

 31447385 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 31447444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7831 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 7890

 31447445 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 31447504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7891 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 7950

 31447505 TGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGAG 31447564
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||
     7951 TGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCC----TTTTTTTTTTTTTTTTTCGAG 8006

 31447565 ATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAC 31447624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8007 ATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAC 8066

 31447625 CTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATA 31447684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8067 CTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTATTTCCCGAGTAGCTGGGAAATA 8126

 31447685 AGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTT 31447744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8127 AGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTGCCACCATGCCCAACTAATTTT 8186

 31447745 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGA 31447804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8187 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGA 8246

 31447805 CCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTT 31447864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8247 CCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTTATTTCTTTATAGCCTGGGCTT 8306

 31447865 TCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTC 31447924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8307 TCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCTGCTTAGGGAAATGCAACCCTC 8366

 31447925 CAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGA 31447984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8367 CAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTCCTAACTTCTGTTTCAATGTGA 8426

 31447985 CCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATA 31448044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8427 CCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTGTTCTGGCTTTTACTACAAATA 8486

 31448045 TTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAA 31448104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8487 TTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCTCTAAGCTCCTTAAAGGCAGAA 8546

 31448105 GTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGT 31448153
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8547 GTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACCTGAATATAGT 8595

Alignment time is 6.47272 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3283] =>      3283 nucs 'mol-32-3487-118405_3283'

Score:        3261
Aligned:      3285        nucs
Identic:      3282 (100%) nucs =>      2672 (100%)       610 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31444865,31447539] EXCISED REGION [31447544,31448153]
 second seq =>  [       1,    2673] EXCISED REGION [    2674,    3283]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [31447540,31447543]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [31447540,31447556] to [31447544,31447560]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [31447540,31447541] to [31447542,31447543]
 second seq =>         0 nucs

 31444865 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 31444924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAAC 60

 31444925 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 31444984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCC 120

 31444985 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 31445044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAG 180

 31445045 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 31445104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTG 240

 31445105 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 31445164
          ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCAAAAAAAAAAAAAA--GATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGG 298

 31445165 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 31445224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 CTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGG 358

 31445225 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 31445284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 AGTTCAAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 418

 31445285 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 31445344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 TAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGA 478

 31445345 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 31445404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 ATCGTTTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAG 538

 31445405 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 31445464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 CCTGGGCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGG 598

 31445465 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 31445524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 ATCAATATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTT 658

 31445525 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 31445584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 CTTGGTCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTT 718

 31445585 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 31445644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 ATCTTGACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAAT 778

 31445645 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 31445704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 ATTGTGCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCAT 838

 31445705 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 31445764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 AATTAAAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTC 898

 31445765 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 31445824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 AAGATTCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATA 958

 31445825 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 31445884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 TGGAAAGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATA 1018

 31445885 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 31445944
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1019 TATTTCCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAGTAAATATGCCCAAATGGTAGCATT 1078

 31445945 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 31446004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 ATATTTATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCC 1138

 31446005 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 31446064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 CAAGAAAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTG 1198

 31446065 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 31446124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CATCTCAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGT 1258

 31446125 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 31446184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 GGCAAATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGA 1318

 31446185 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 31446244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 GAATGTTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGG 1378

 31446245 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 31446304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 TATTACATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCT 1438

 31446305 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 31446364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TGCAGAATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCC 1498

 31446365 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 31446424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 CACTGAGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGA 1558

 31446425 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 31446484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TGTTAATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCT 1618

 31446485 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 31446544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 AGATCCACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAG 1678

 31446545 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 31446604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AGCAATGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACA 1738

 31446605 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 31446664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GCCTCAGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTC 1798

 31446665 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 31446724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TAGCGGCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAG 1858

 31446725 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 31446784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 AGTGTCAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCC 1918

 31446785 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 31446844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CATGTCCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAG 1978

 31446845 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 31446904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 ACCTGACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAG 2038

 31446905 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 31446964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CATCCAGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACA 2098

 31446965 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 31447024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTGCTCACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGC 2158

 31447025 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 31447084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TCCCTCCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCAT 2218

 31447085 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 31447144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTCTGCCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCT 2278

 31447145 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 31447204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GTTATTTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAG 2338

 31447205 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 31447264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 ATTAGTTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAAT 2398

 31447265 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 31447324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CTTCAGTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGT 2458

 31447325 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 31447384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TTTTATAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATG 2518

 31447385 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 31447444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 GCTGCATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCA 2578

 31447445 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 31447504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 AAGCCTAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTG 2638

 31447505 TGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCC 31447539
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TGCTCCAGTTTTCCTTTCTGGTTTTCTTTCTTTCC 2673

EXCISED REGION

 31447544 TTTTTTTTTTTTTTTTTCGAGATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 31447603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 TTTTTTTTTTTTTTTTTCGAGATAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 2733

 31447604 GCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTAT 31447663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 GCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCAGCTACTTAT 2793

 31447664 TTCCCGAGTAGCTGGGAAATAAGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTG 31447723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 TTCCCGAGTAGCTGGGAAATAAGTACACCCAAACGGTAGTATTGGGACTACAGGCACGTG 2853

 31447724 CCACCATGCCCAACTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCC 31447783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 CCACCATGCCCAACTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTGCAACACGTTAGCC 2913

 31447784 AGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTT 31447843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 AGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCCCCCAAAGTGGTTTT 2973

 31447844 ATTTCTTTATAGCCTGGGCTTTCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCT 31447903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 ATTTCTTTATAGCCTGGGCTTTCATGCTGTCGTGCCTTGGCTTTCATTAATACACTCTCT 3033

 31447904 GCTTAGGGAAATGCAACCCTCCAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTC 31447963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 GCTTAGGGAAATGCAACCCTCCAGGCCCATTTCAGGGGGACCCTCTGCATGGAGACTTTC 3093

 31447964 CTAACTTCTGTTTCAATGTGACCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTG 31448023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 CTAACTTCTGTTTCAATGTGACCTCCCCTCACTTTTTACTTCGCTATGGCATGTTGAGTG 3153

 31448024 TTCTGGCTTTTACTACAAATATTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCT 31448083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 TTCTGGCTTTTACTACAAATATTAATCAGTATCCTATTGCTTCTCCTCTCACCCCAGTCT 3213

 31448084 CTAAGCTCCTTAAAGGCAGAAGTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACC 31448143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 CTAAGCTCCTTAAAGGCAGAAGTTATGTCTTATCCATCTTTAAATCTCCCCAGGGTCACC 3273

 31448144 TGAATATAGT 31448153
          ||||||||||
     3274 TGAATATAGT 3283

Alignment time is 2.50393 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    3051] =>      3051 nucs 'mol-32-34d4-024422_3051'

Score:        3051
Aligned:      3051        nucs
Identic:      3051 (100%) nucs =>      1664 (100%)      1387 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443445,31445108] EXCISED REGION [31445111,31446497]
 second seq =>  [       1,    1664] EXCISED REGION [    1665,    3051]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [31445109,31445110]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [31445109,31445122] to [31445111,31445124]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31445109,31445109] to [31445110,31445110]
 second seq =>         0 nucs

 31443445 GCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCA 31443504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAGACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCA 60

 31443505 GGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTAAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCA 31443564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATAGGAACTAAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCA 120

 31443565 AGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAG 31443624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGGATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAG 180

 31443625 GCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAAC 31443684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAATTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAAC 240

 31443685 CATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTC 31443744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATACCTAAACCACCACAGTCTCCATTCAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTC 300

 31443745 TTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTA 31443804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGATCCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTA 360

 31443805 GACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACT 31443864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTATCAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACT 420

 31443865 TTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTAC 31443924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACGTTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTAC 480

 31443925 CGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAG 31443984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTGATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAG 540

 31443985 TTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTA 31444044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATTTTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTA 600

 31444045 TATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGT 31444104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATAAATGTACCTAAACCATTGAAATAGCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGT 660

 31444105 GCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACAT 31444164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCAAACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACAT 720

 31444165 GGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAAC 31444224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTACATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAAC 780

 31444225 TTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTG 31444284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGGTATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTG 840

 31444285 TTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAG 31444344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCAAAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAG 900

 31444345 CAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCAT 31444404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCCTGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCAT 960

 31444405 AACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACA 31444464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGAGTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACA 1020

 31444465 TATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACA 31444524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCACATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACA 1080

 31444525 TACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGG 31444584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAACAAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGG 1140

 31444585 CACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTT 31444644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGTCCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTT 1200

 31444645 TAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTG 31444704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATTGGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTG 1260

 31444705 ATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATAC 31444764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAACAAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATAC 1320

 31444765 TGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGT 31444824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAGCATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGT 1380

 31444825 AGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCA 31444884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTGTAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCA 1440

 31444885 GATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTA 31444944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGATCAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTA 1500

 31444945 CAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGG 31445004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGTAATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGG 1560

 31445005 AGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCT 31445064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCT 1620

 31445065 TGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTC 31445108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTC 1664

EXCISED REGION

 31445111 AAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCACG 31445170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 AAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCACG 1724

 31445171 CCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCA 31445230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 CCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCA 1784

 31445231 AAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCA 31445290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 AAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCA 1844

 31445291 GGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTT 31445350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 GGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGTT 1904

 31445351 TGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGGG 31445410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 TGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGGG 1964

 31445411 CAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAAT 31445470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 CAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAAT 2024

 31445471 ATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGGT 31445530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 ATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGGT 2084

 31445531 CTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTTG 31445590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 CTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTTG 2144

 31445591 ACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGTG 31445650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 ACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGTG 2204

 31445651 CATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTAA 31445710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 CATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTAA 2264

 31445711 AGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGATT 31445770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 AGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGATT 2324

 31445771 CTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAAA 31445830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 CTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAAA 2384

 31445831 GAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTTC 31445890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 GAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTTC 2444

 31445891 CTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTT 31445950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 CTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATTT 2504

 31445951 ATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGAA 31446010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 ATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGAA 2564

 31446011 AGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCTC 31446070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 AGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCTC 2624

 31446071 AGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAAA 31446130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 AGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAAA 2684

 31446131 TTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATGT 31446190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 TTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATGT 2744

 31446191 TTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTAC 31446250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 TTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTAC 2804

 31446251 ATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAGA 31446310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 ATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAGA 2864

 31446311 ATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTGA 31446370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 ATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTGA 2924

 31446371 GTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTAA 31446430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 GTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTAA 2984

 31446431 TGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATCC 31446490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 TGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATCC 3044

 31446491 ACTCTGA 31446497
          |||||||
     3045 ACTCTGA 3051

Alignment time is 2.31719 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31433350,31454864] =>     21515 nucs '10 dna:chromosome chromosome:GRCh37:10:1:135534747:1'
Second seq [       1,    4158] =>      4158 nucs 'mol-32-34d4-041652_4158'

Score:        4158
Aligned:      4158        nucs
Identic:      4158 (100%) nucs =>      1757 (100%)      2401 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31443352,31445108] EXCISED REGION [31445110,31447510]
 second seq =>  [       1,    1757] EXCISED REGION [    1758,    4158]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [31445109,31445109]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31445109,31445123] to [31445110,31445124]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31443352 TGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAG 31443411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAG 60

 31443412 ATCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAA 31443471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCGCGCCACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAA 120

 31443472 AAAGACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATA 31443531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGACAGGAAGAGAGGGGGGGAGGAGATGCCAGGCTCTTTTAAACAACCACTTCTCATA 180

 31443532 GGAACTAAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGG 31443591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAACTAAGAATAAGAATTCACTCACTCCTGCAAGAATGGCACCAAGCCATTCATGAGGG 240

 31443592 ATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAA 31443651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCTACCCCCATGGCCCAAATGCCCCGCACCAGGCCCCACCCCCAACAGTGGGGATAAAA 300

 31443652 TTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATT 31443711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCAACATGAGACTTGGTGAAGACAAACAAACCATACCTAAACCACCACAGTCTCCATT 360

 31443712 CAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGAT 31443771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAGGAGAACTGATATTGAAGCACAGTCTTCTCTTGACCCAACCACCCTTTCCATCAGAT 420

 31443772 CCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTAT 31443831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTCCAAAGGCCAAAAAAACATTTAGCTAGTTAGACAGTCCAGAAAGAGGAATTTCTTAT 480

 31443832 CAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACG 31443891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGAAAGGGCTCTGCAAGAAGACCAACCTGACTTTCCCCCTCCTTCTCTTCTTTACTACG 540

 31443892 TTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTG 31443951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTTTGCCTGACTTAGCCAGGCAAGCTCTTACCGCAGTCTACTCTTCTTGATGGCACTG 600

 31443952 ATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATT 31444011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGGGAAGGAAGTAGAAGAGACCCACATCTAAGTTTTCTTATAAAAACTTCTTGATCATT 660

 31444012 TTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATA 31444071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGGTCAAAAGTACAGTGAGCACATGGTGTGTATATAAATGTACCTAAACCATTGAAATA 720

 31444072 GCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCA 31444131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTGGGGATGTGCAGTCATAAGTCACTTAATGTGCTGTTAGGTGATTTCATCATTGTGCA 780

 31444132 AACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTA 31444191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACATACCGGAGTGCACTTACACAAACCTACATGGTTGAACTTCCTACACGCCTAGGCTA 840

 31444192 CATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGG 31444251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATGGTATAGCCTATTGTTCTCAGGCTGCAAACTTAACCCAGGGTCCCTAGGTTTTTGGG 900

 31444252 TATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCA 31444311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATGGACTGTGAAAAAGTACCCACTAGTACCTGTTGTACCTTAAGTTCTTCTTGTTTCCA 960

 31444312 AAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCC 31444371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAATTCCAGGAAGAAGCTCAGCCCTGGAAAAGCAAAAACCCATTGGATCCAGAGGTGCC 1020

 31444372 TGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGA 31444431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGAGTTGGAGATGAACTTTGGAACTTCCCTCATAACCGTACTAAAATCCCTGACCAGAGA 1080

 31444432 GTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCA 31444491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTAACTTATTTGCCATTTTCTATACATGTGACATATGTAGAAGCATGATCAATGACAGCA 1140

 31444492 CATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAAC 31444551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATGTGCTATTAATATCTTGCTCCATCTCGACATACAGTGACTCAGCTCACCAGGCCAAC 1200

 31444552 AAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGT 31444611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAAGGCCTGTTTTCACCTTTGATTGGAGGAGGCACTCCTTTGAGAACTATCCCCCATGT 1260

 31444612 CCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATT 31444671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTCCTCATTTGTTGCCACTAATAAAATCCCTTTAAGTCCCCATTGCTTAAGTCCCCATT 1320

 31444672 GGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAAC 31444731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTTGTGGTCACTGGACTGCCACCTGCCATGTGATGGCACTGACCCGTTGTATGGGTAAC 1380

 31444732 AAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAG 31444791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAACTTATACAGTGTATCACTGTCCTGGATACTGCAGGCAATTGGAATGCAATGCTAAG 1440

 31444792 CATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTG 31444851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATTTGCATAACTAAACATAGAAAAGGTACAGTAGGACTAGGTGTGATGGCTCACACCTG 1500

 31444852 TAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGAT 31444911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGTCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCAGTTGAGCCCAGGAATTTGAGAT 1560

 31444912 CAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGT 31444971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGCCTGAACAACATGGAGAAATGCAGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGAGT 1620

 31444972 AATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGC 31445031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATGGCCTGTGCCTGTAATCCCAGTTACTGAGGAGGCTAAAGTGGGAGGATCCCTTGAGC 1680

 31445032 CCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATA 31445091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCAGGAGTCTGAGGCTGCAGTGAGTCATGATCTTGCCTCTGTGCTCCAGCCTGGGCAATA 1740

 31445092 GAGTGAGACCCTGTCTC 31445108
          |||||||||||||||||
     1741 GAGTGAGACCCTGTCTC 1757

EXCISED REGION

 31445110 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 31445169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 AAAAAAAAAAAAAAAGATACAGTAAAACTATGGTATTATAGGCCAGGTGTAGTGGCTCAC 1817

 31445170 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 31445229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 GCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAACCAAGACAGGTGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTC 1877

 31445230 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 31445289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 AAAACCAGCCTGACCAACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCC 1937

 31445290 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 31445349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 AGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGT 1997

 31445350 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 31445409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 TTGAACCCGGGAGGTGAGGGTTGCAGTGAGCCGGGATCACGCCACTGTACTCCAGCCTGG 2057

 31445410 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 31445469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 GCAACAAGACTGAAACTCTTGTCTCAAAAAAAAAATGGTATTATAATTTTATGGGATCAA 2117

 31445470 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 31445529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 TATCCTTCATGTGTCTGTTATTAACTGCAATGTTGTTATACAGTGCATGACTCTTCTTGG 2177

 31445530 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 31445589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 TCTGGACCACCTGGGACCTGGTTGAAGAGACTAGATACCAGCTAGTTCAGCCTTTATCTT 2237

 31445590 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 31445649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 GACAAAATCAAAAGAGTTGCCAGAAAGTCCTAGAATCGCCAGTTGTATTTTAAATATTGT 2297

 31445650 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 31445709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 GCATATAAATATAATGAGCAGTATTTGGTTTTACTACCATCATTTATTTCAGCATAATTA 2357

 31445710 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 31445769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 AAGCCATTTCTTCTTTAAAAATTGACTGTCGTATTTATATTTATAATCTGAGTTCAAGAT 2417

 31445770 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 31445829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 TCTAAATTTTACTAATTCTTTTACTATTTCATCTTTTAAAAAATTATCTAACATATGGAA 2477

 31445830 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 31445889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 AGAAAAGGGAAAGATTACTCATTTAACTGGAATCATGTTTGAAACACTCTGAATATATTT 2537

 31445890 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 31445949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 CCTAACATTTCCTGATTGATTGCCTGGGAAATAAATATGCCCAAATGGTAGCATTATATT 2597

 31445950 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 31446009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 TATAATTCTAAGTCAGGAATATTTCCCTTATTGCTCTGCCTCTGAAATAGAGTCCCAAGA 2657

 31446010 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 31446069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 AAGTGCATAAAATATCAAAATAGTGTTTTCAATATCTGCCAAACCTGAACGTTTGCATCT 2717

 31446070 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 31446129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 CAGAAAGCAAATGTGCAACTAGTGAGTAAACTGCCTCTTTGTCAAACATAAATGTGGCAA 2777

 31446130 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 31446189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 ATTCTAAGGCAACTCCTTTTCGACTAAATTGTCTCAGCATGCAGAGCAGCAGGGAGAATG 2837

 31446190 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 31446249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2838 TTTGCTATAGGACACAGGCAAAAAAACAATCTTTATGTTATTTTTTCCAGGAGGGTATTA 2897

 31446250 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 31446309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2898 CATTACGTTTCAGAGAGAAATGATGAGCTATTCATGATGAAATGGCACATTTTCTTGCAG 2957

 31446310 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 31446369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2958 AATCACCTACTCTATTTAAATGTGTTCGATTCTTTAGAAGGTGTCCCTAATGTCCCACTG 3017

 31446370 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 31446429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 AGTCACAGTCTCCTCCCTGCCTCCTCTCCAAGTTCTTCCTTCCTAGCAGAGGAGATGTTA 3077

 31446430 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 31446489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3078 ATGAATTCTGAAACATGACTCCTTGCTCTGGATGTCCACGTAGCCTGACCTCTCTAGATC 3137

 31446490 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 31446549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 CACTCTGACAGCACATACATGCTTTTCAAGAGGCACAATTTTGTCTTGTCTGGAGAGCAA 3197

 31446550 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 31446609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 TGTAATTAGAAAGCAATTTGGCCCACACACGCAGCTTCCATGGTCACTTGGCACAGCCTC 3257

 31446610 AGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCG 31446669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3258 AGCCTCCTTCTGGCGGGGCTGGTTTTGTTCTGCTTTGGCTGGCCTCCTAGATGTCTAGCG 3317

 31446670 GCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGT 31446729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3318 GCTCAGTGATCCTCGTCCTCGCTTGCTCGGAGCCCAGGCTTGGCCAGACTTAGAGAGTGT 3377

 31446730 CAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGT 31446789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3378 CAGGTGCTGTCTGCTGGGAAGCCGTGGGGGCTGCACTGGAGCCCCACGTCGGCCCCATGT 3437

 31446790 CCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTG 31446849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3438 CCCACATGGCCTCCGGACATGTGCGGTGACGCCTCTGCACAAAAGAGACTCAGAGACCTG 3497

 31446850 ACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCC 31446909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3498 ACATGAGCGGCCCAACCACTCTGTCTGGCTGGCTTCCTTGACTTTATTTGCTGAGCATCC 3557

 31446910 AGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCT 31446969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3558 AGAGGACAAAGAGAATCCGGTGGCACATCCAGCCCCCCAGATCTCCCTTATTACATTGCT 3617

 31446970 CACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCT 31447029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3618 CACAAATTTTTCCTCATCCCCCAGGCTCCAAATTGGCAGTGATCTTTAATTCTGCTCCCT 3677

 31447030 CCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTG 31447089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3678 CCATTTGTCTCTGCGTCCAACAAGTTACCATATCCTACACATTTGGCCTTCTCATTTCTG 3737

 31447090 CCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTAT 31447149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3738 CCCTCGATACTGTAATTCAGGCCTCTTATCCAACCATTGTAACAGCCTCCCAGCTGTTAT 3797

 31447150 TTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAG 31447209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3798 TTCCACACGGAACTCCACTTCCTCCAATTCTATTATAGCATTTCCCGGTAGTCAGATTAG 3857

 31447210 TTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCA 31447269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3858 TTTTCCAAATATATAGCATTGGCAATGTTATAATATCATCCTCCTGCTCACAAATCTTCA 3917

 31447270 GTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTA 31447329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3918 GTGGTTTCTCATGGTCTATAGTTTCTTTATTTGTGCGTTCTGGCCCACTGCCTGTTTTTA 3977

 31447330 TAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGC 31447389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3978 TAAATAAAGTTTTATTGGAACATAGCCACATCCATTTGTTTACGTATGGCTTATGGCTGC 4037

 31447390 ATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCC 31447449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4038 ATTTGTGCTATGATAGCTGAGTTGAGTCATTGTGACAGAGACCACATGGCTTTCAAAGCC 4097

 31447450 TAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTC 31447509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4098 TAAAATACTATTTGGCCTTTTACAGAAAACATTTGCTGGCCTCTGCTCTAAACTGTGCTC 4157

 31447510 C 31447510
          |
     4158 C 4158

Alignment time is 3.16153 s

