
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [130367774,130388654] =>     20881 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2465] =>      2465 nucs 'mol-32-1e71-079970_2465'

Score:        2465
Aligned:      2465        nucs
Identic:      2465 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [130375948,130378412]
 second seq =>  [        1,     2465]

130375948 CCCAGATTACAGGTCTTCTAGACTTAAATTCTAATGGGAACATTGTAAATTTGACTCTTC 130376007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCAGATTACAGGTCTTCTAGACTTAAATTCTAATGGGAACATTGTAAATTTGACTCTTC 60

130376008 GGGAAATATTTTAAATAGTGGGAGCTCTTTCTCTTCCCTAACAATTTCCAACTCTGGCAC 130376067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGAAATATTTTAAATAGTGGGAGCTCTTTCTCTTCCCTAACAATTTCCAACTCTGGCAC 120

130376068 AGCTGCTCAATGTGAAGTTTGTAATTTCTCCTTCCTTCCCAGAAGTACTTTTGGCTCAGC 130376127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCTGCTCAATGTGAAGTTTGTAATTTCTCCTTCCTTCCCAGAAGTACTTTTGGCTCAGC 180

130376128 TTAATCTATTATGCCTTTGCAGTCGCCATTGAATGCCTCTAGTCCATGCAGAGTGGAATT 130376187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAATCTATTATGCCTTTGCAGTCGCCATTGAATGCCTCTAGTCCATGCAGAGTGGAATT 240

130376188 GAGAACTGAAGTTGGACTTCCGTCATCCTTGGGGTATGAAGATAGGATAGGAATTGATCC 130376247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGAACTGAAGTTGGACTTCCGTCATCCTTGGGGTATGAAGATAGGATAGGAATTGATCC 300

130376248 GATTCTGGTTGGTTGTTGAGACAAGAATAACTTGGCCTCTCCTCATGTGTGAGTACTGTG 130376307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATTCTGGTTGGTTGTTGAGACAAGAATAACTTGGCCTCTCCTCATGTGTGAGTACTGTG 360

130376308 GGCAGACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTGCATGTAACCGCATGTGGTCTTACACATA 130376367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCAGACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTGCATGTAACCGCATGTGGTCTTACACATA 420

130376368 TTTGAGGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAATAAAGACTCAGC 130376427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTGAGGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAATAAAGACTCAGC 480

130376428 ATGTTTCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGT 130376487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGTTTCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGT 540

130376488 ATTATTATTACCATTTTAACGATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCT 130376547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTATTATTACCATTTTAACGATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCT 600

130376548 TAAAATCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCT 130376607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAAATCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCT 660

130376608 ATGCTTTAAAAAATAATCACTACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGA 130376667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGCTTTAAAAAATAATCACTACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGA 720

130376668 GGTACAGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAAT 130376727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTACAGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAAT 780

130376728 GGACAAGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGT 130376787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGACAAGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGT 840

130376788 TCTTGTAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAG 130376847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTTGTAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAG 900

130376848 GGTACAAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTA 130376907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGTACAAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTA 960

130376908 AGGAGCTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAATTATACAGAGGA 130376967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGAGCTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAATTATACAGAGGA 1020

130376968 CTTGGAGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAAAAGTAATCATT 130377027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTGGAGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAAAAGTAATCATT 1080

130377028 CAGCACCATAAAGCATTAGATGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGA 130377087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGCACCATAAAGCATTAGATGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGA 1140

130377088 GAAAACATCCAGTATTGTGATTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGA 130377147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAAACATCCAGTATTGTGATTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGA 1200

130377148 GAAAATGATGTTTTGTTGTGTTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTA 130377207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAAAATGATGTTTTGTTGTGTTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTA 1260

130377208 TAGCATTTACAAAGAAGGTACTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAACATCA 130377267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGCATTTACAAAGAAGGTACTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAACATCA 1320

130377268 CAAAATGACTTCTATTGTTGGATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCT 130377327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAAATGACTTCTATTGTTGGATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCT 1380

130377328 TCCTATGTGGCACTCCCTGACCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGC 130377387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCTATGTGGCACTCCCTGACCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGC 1440

130377388 CACTAATTAACCATGTGACCTTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTC 130377447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACTAATTAACCATGTGACCTTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTC 1500

130377448 ACTTATAAAATGTGGGAGTTGCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTT 130377507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTTATAAAATGTGGGAGTTGCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTT 1560

130377508 TTGTGTTTTTAAAACGTATTTTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATT 130377567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTGTGTTTTTAAAACGTATTTTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATT 1620

130377568 GTAAAAATGTTAAAGAATACCAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAG 130377627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTAAAAATGTTAAAGAATACCAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAG 1680

130377628 ATACAAATTATATTTGTAGCATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTCATATA 130377687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATACAAATTATATTTGTAGCATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTCATATA 1740

130377688 GATACATGTAGTTTCTGGGGTTATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTATTGTT 130377747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GATACATGTAGTTTCTGGGGTTATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTATTGTT 1800

130377748 CCACAAGTCAATTTTTGTTTCCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTA 130377807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCACAAGTCAATTTTTGTTTCCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTA 1860

130377808 CATATAAATCTATTTCATTCTTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACCATCAT 130377867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATATAAATCTATTTCATTCTTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACCATCAT 1920

130377868 TTGTTTAGCTATTTTTCACTGATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAGCACAGTTCTGC 130377927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGTTTAGCTATTTTTCACTGATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAGCACAGTTCTGC 1980

130377928 AGTGGACAGCCTTGGGCATCTCCTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTTTAGGGTATATTA 130377987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTGGACAGCCTTGGGCATCTCCTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTTTAGGGTATATTA 2040

130377988 TTTGATGTGGAATTGCTAGGCTTTAACATTTCAGTTTTATTCCACACTGTCAAATTGCTC 130378047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTGATGTGGAATTGCTAGGCTTTAACATTTCAGTTTTATTCCACACTGTCAAATTGCTC 2100

130378048 TCTAAACTACTAGTGCCAATTTACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACAAGTTGATCAACA 130378107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTAAACTACTAGTGCCAATTTACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACAAGTTGATCAACA 2160

130378108 CTCGATATGGTCAGACATTTTCATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAAGTTATCTCTGGT 130378167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTCGATATGGTCAGACATTTTCATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAAGTTATCTCTGGT 2220

130378168 AACTTGGAAAGGTAAACGTTTTTTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCATTTCCTGTTTGCT 130378227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AACTTGGAAAGGTAAACGTTTTTTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCATTTCCTGTTTGCT 2280

130378228 GGTCAGTTGCTCATTATATCCCTTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTTTATATTTTTGGT 130378287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGTCAGTTGCTCATTATATCCCTTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTTTATATTTTTGGT 2340

130378288 ATTGATATGAAGGATTATACTTTCTATATTCATATAAGTGCATATGTCAATAACTATAAA 130378347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTGATATGAAGGATTATACTTTCTATATTCATATAAGTGCATATGTCAATAACTATAAA 2400

130378348 ATTATATACAAATTATAATTATGTTATAGAATACAATTTCATTTAACTTTGCTTGTGGCG 130378407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTATATACAAATTATAATTATGTTATAGAATACAATTTCATTTAACTTTGCTTGTGGCG 2460

130378408 AATAC 130378412
          |||||
     2461 AATAC 2465

Alignment time is 1.61952 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [130367774,130388654] =>     20881 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2833] =>      2833 nucs 'mol-32-229c-050710_2833'

Score:        2832
Aligned:      2832        nucs
Identic:      2832 (100%) nucs =>      1425 (100%)      1407 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [130375620,130377044] EXCISED REGION [130377046,130378452]
 second seq =>  [        1,     1425] EXCISED REGION [     1427,     2833]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [130377045,130377045]
 second seq =>         1 nucs [1426,1426]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1426,1426] to [1427,1427]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

130375620 TATGAGAACATGATCTCTGAATGCTGTCTTCTACACGACCCTCTTCCTGTGTCCTCTCTA 130375679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGAGAACATGATCTCTGAATGCTGTCTTCTACACGACCCTCTTCCTGTGTCCTCTCTA 60

130375680 GGAGTGGGTGCCCATGTGCACTGCAGTGACCTTTTCTTCTCTCTAGTCTTCTTTGAAAGC 130375739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAGTGGGTGCCCATGTGCACTGCAGTGACCTTTTCTTCTCTCTAGTCTTCTTTGAAAGC 120

130375740 TTGTTTTCTCTGGTTGTTTTTCTTCGAACAGACTTGATATAGAAATTCACACTGTGGTGT 130375799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTTTTCTCTGGTTGTTTTTCTTCGAACAGACTTGATATAGAAATTCACACTGTGGTGT 180

130375800 GAATGGATAAAAACAACTTAATACTGTACCCCTTATGAGGTATTTGCATTTTAACGAAGA 130375859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATGGATAAAAACAACTTAATACTGTACCCCTTATGAGGTATTTGCATTTTAACGAAGA 240

130375860 CCAGCCACTCAATTTGGAGACATACGTTCTTCTTTTTAAATTTCCATCCCAATAATCAAT 130375919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAGCCACTCAATTTGGAGACATACGTTCTTCTTTTTAAATTTCCATCCCAATAATCAAT 300

130375920 CTGTTTTTCAGAAACTTATGCACAAAGTCCCAGATTACAGGTCTTCTAGACTTAAATTCT 130375979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGTTTTTCAGAAACTTATGCACAAAGTCCCAGATTACAGGTCTTCTAGACTTAAATTCT 360

130375980 AATGGGAACATTGTAAATTTGACTCTTCGGGAAATATTTTAAATAGTGGGAGCTCTTTCT 130376039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGGGAACATTGTAAATTTGACTCTTCGGGAAATATTTTAAATAGTGGGAGCTCTTTCT 420

130376040 CTTCCCTAACAATTTCCAACTCTGGCACAGCTGCTCAATGTGAAGTTTGTAATTTCTCCT 130376099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTCCCTAACAATTTCCAACTCTGGCACAGCTGCTCAATGTGAAGTTTGTAATTTCTCCT 480

130376100 TCCTTCCCAGAAGTACTTTTGGCTCAGCTTAATCTATTATGCCTTTGCAGTCGCCATTGA 130376159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTTCCCAGAAGTACTTTTGGCTCAGCTTAATCTATTATGCCTTTGCAGTCGCCATTGA 540

130376160 ATGCCTCTAGTCCATGCAGAGTGGAATTGAGAACTGAAGTTGGACTTCCGTCATCCTTGG 130376219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGCCTCTAGTCCATGCAGAGTGGAATTGAGAACTGAAGTTGGACTTCCGTCATCCTTGG 600

130376220 GGTATGAAGATAGGATAGGAATTGATCCGATTCTGGTTGGTTGTTGAGACAAGAATAACT 130376279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTATGAAGATAGGATAGGAATTGATCCGATTCTGGTTGGTTGTTGAGACAAGAATAACT 660

130376280 TGGCCTCTCCTCATGTGTGAGTACTGTGGGCAGACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTG 130376339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGCCTCTCCTCATGTGTGAGTACTGTGGGCAGACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTG 720

130376340 CATGTAACCGCATGTGGTCTTACACATATTTGAGGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCT 130376399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATGTAACCGCATGTGGTCTTACACATATTTGAGGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCT 780

130376400 GAAAGATGGGCAATAATAAAGACTCAGCATGTTTCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGT 130376459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAAGATGGGCAATAATAAAGACTCAGCATGTTTCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGT 840

130376460 ATCCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGTATTATTATTACCATTTTAACGATGAAGAAACA 130376519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGTATTATTATTACCATTTTAACGATGAAGAAACA 900

130376520 GAATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGA 130376579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGA 960

130376580 TTTGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCTATGCTTTAAAAAATAATCACTACAATATACTA 130376639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCTATGCTTTAAAAAATAATCACTACAATATACTA 1020

130376640 CTTTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTACAGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAA 130376699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTACAGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAA 1080

130376700 GCTTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGC 130376759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGC 1140

130376760 CCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGC 130376819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGC 1200

130376820 AACGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTC 130376879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTC 1260

130376880 TCTCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAAT 130376939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAAT 1320

130376940 GAAAATATTTTCAGAATTATACAGAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAAC 130376999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAAAATATTTTCAGAATTATACAGAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAAC 1380

130377000 AGAAACATATTTAATAAAAGTAATCATTCAGCACCATAAAGCATT 130377044
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAAACATATTTAATAAAAGTAATCATTCAGCACCATAAAGCATT 1425

EXCISED REGION

130377046 GATGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAAACATCCAGTATTGT 130377105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 GATGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAAACATCCAGTATTGT 1486

130377106 GATTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTTGTTG 130377165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 GATTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTTGTTG 1546

130377166 TGTTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAGAAGG 130377225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 TGTTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAGAAGG 1606

130377226 TACTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAACATCACAAAATGACTTCTATTGT 130377285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 TACTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAACATCACAAAATGACTTCTATTGT 1666

130377286 TGGATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACTCCCT 130377345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 TGGATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACTCCCT 1726

130377346 GACCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACTAATTAACCATGTGA 130377405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 GACCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACTAATTAACCATGTGA 1786

130377406 CCTTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTGGGAG 130377465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 CCTTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTGGGAG 1846

130377466 TTGCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTA 130377525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 TTGCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTA 1906

130377526 TTTTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAAGAAT 130377585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 TTTTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAAGAAT 1966

130377586 ACCAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAGATACAAATTATATTTGTA 130377645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 ACCAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAGATACAAATTATATTTGTA 2026

130377646 GCATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTCATATAGATACATGTAGTTTCTGG 130377705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 GCATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTCATATAGATACATGTAGTTTCTGG 2086

130377706 GGTTATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTTTTGT 130377765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 GGTTATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTTTTGT 2146

130377766 TTCCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTACATATAAATCTATTTCAT 130377825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 TTCCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTACATATAAATCTATTTCAT 2206

130377826 TCTTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACCATCATTTGTTTAGCTATTTTTCA 130377885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 TCTTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACCATCATTTGTTTAGCTATTTTTCA 2266

130377886 CTGATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAGCACAGTTCTGCAGTGGACAGCCTTGGGCA 130377945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 CTGATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAGCACAGTTCTGCAGTGGACAGCCTTGGGCA 2326

130377946 TCTCCTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTTTAGGGTATATTATTTGATGTGGAATTGCTA 130378005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 TCTCCTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTTTAGGGTATATTATTTGATGTGGAATTGCTA 2386

130378006 GGCTTTAACATTTCAGTTTTATTCCACACTGTCAAATTGCTCTCTAAACTACTAGTGCCA 130378065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 GGCTTTAACATTTCAGTTTTATTCCACACTGTCAAATTGCTCTCTAAACTACTAGTGCCA 2446

130378066 ATTTACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACAAGTTGATCAACACTCGATATGGTCAGACAT 130378125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 ATTTACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACAAGTTGATCAACACTCGATATGGTCAGACAT 2506

130378126 TTTCATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAAGTTATCTCTGGTAACTTGGAAAGGTAAACG 130378185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 TTTCATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAAGTTATCTCTGGTAACTTGGAAAGGTAAACG 2566

130378186 TTTTTTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCATTTCCTGTTTGCTGGTCAGTTGCTCATTATA 130378245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 TTTTTTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCATTTCCTGTTTGCTGGTCAGTTGCTCATTATA 2626

130378246 TCCCTTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTTTATATTTTTGGTATTGATATGAAGGATTAT 130378305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 TCCCTTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTTTATATTTTTGGTATTGATATGAAGGATTAT 2686

130378306 ACTTTCTATATTCATATAAGTGCATATGTCAATAACTATAAAATTATATACAAATTATAA 130378365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 ACTTTCTATATTCATATAAGTGCATATGTCAATAACTATAAAATTATATACAAATTATAA 2746

130378366 TTATGTTATAGAATACAATTTCATTTAACTTTGCTTGTGGCGAATACCAAACAGAACTTA 130378425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 TTATGTTATAGAATACAATTTCATTTAACTTTGCTTGTGGCGAATACCAAACAGAACTTA 2806

130378426 AAAATTCTCAATTCTGTCAAATTTATC 130378452
          |||||||||||||||||||||||||||
     2807 AAAATTCTCAATTCTGTCAAATTTATC 2833

Alignment time is 2.12489 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [130367774,130388654] =>     20881 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2875] =>      2875 nucs 'mol-32-29a8-024316_2875'

Score:        2875
Aligned:      2875        nucs
Identic:      2875 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [130375533,130378407]
 second seq =>  [        1,     2875]

130375533 TCTAGAGAGCTTAGATTGCCTTGGTACATAAAGAAGTAAGTAGAATGCATTTTTTTTATT 130375592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTAGAGAGCTTAGATTGCCTTGGTACATAAAGAAGTAAGTAGAATGCATTTTTTTTATT 60

130375593 AACCTGCTTTGTAAATAAATGTCCTTGTATGAGAACATGATCTCTGAATGCTGTCTTCTA 130375652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACCTGCTTTGTAAATAAATGTCCTTGTATGAGAACATGATCTCTGAATGCTGTCTTCTA 120

130375653 CACGACCCTCTTCCTGTGTCCTCTCTAGGAGTGGGTGCCCATGTGCACTGCAGTGACCTT 130375712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACGACCCTCTTCCTGTGTCCTCTCTAGGAGTGGGTGCCCATGTGCACTGCAGTGACCTT 180

130375713 TTCTTCTCTCTAGTCTTCTTTGAAAGCTTGTTTTCTCTGGTTGTTTTTCTTCGAACAGAC 130375772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTTCTCTCTAGTCTTCTTTGAAAGCTTGTTTTCTCTGGTTGTTTTTCTTCGAACAGAC 240

130375773 TTGATATAGAAATTCACACTGTGGTGTGAATGGATAAAAACAACTTAATACTGTACCCCT 130375832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGATATAGAAATTCACACTGTGGTGTGAATGGATAAAAACAACTTAATACTGTACCCCT 300

130375833 TATGAGGTATTTGCATTTTAACGAAGACCAGCCACTCAATTTGGAGACATACGTTCTTCT 130375892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATGAGGTATTTGCATTTTAACGAAGACCAGCCACTCAATTTGGAGACATACGTTCTTCT 360

130375893 TTTTAAATTTCCATCCCAATAATCAATCTGTTTTTCAGAAACTTATGCACAAAGTCCCAG 130375952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTAAATTTCCATCCCAATAATCAATCTGTTTTTCAGAAACTTATGCACAAAGTCCCAG 420

130375953 ATTACAGGTCTTCTAGACTTAAATTCTAATGGGAACATTGTAAATTTGACTCTTCGGGAA 130376012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTACAGGTCTTCTAGACTTAAATTCTAATGGGAACATTGTAAATTTGACTCTTCGGGAA 480

130376013 ATATTTTAAATAGTGGGAGCTCTTTCTCTTCCCTAACAATTTCCAACTCTGGCACAGCTG 130376072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATATTTTAAATAGTGGGAGCTCTTTCTCTTCCCTAACAATTTCCAACTCTGGCACAGCTG 540

130376073 CTCAATGTGAAGTTTGTAATTTCTCCTTCCTTCCCAGAAGTACTTTTGGCTCAGCTTAAT 130376132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCAATGTGAAGTTTGTAATTTCTCCTTCCTTCCCAGAAGTACTTTTGGCTCAGCTTAAT 600

130376133 CTATTATGCCTTTGCAGTCGCCATTGAATGCCTCTAGTCCATGCAGAGTGGAATTGAGAA 130376192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTATTATGCCTTTGCAGTCGCCATTGAATGCCTCTAGTCCATGCAGAGTGGAATTGAGAA 660

130376193 CTGAAGTTGGACTTCCGTCATCCTTGGGGTATGAAGATAGGATAGGAATTGATCCGATTC 130376252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGAAGTTGGACTTCCGTCATCCTTGGGGTATGAAGATAGGATAGGAATTGATCCGATTC 720

130376253 TGGTTGGTTGTTGAGACAAGAATAACTTGGCCTCTCCTCATGTGTGAGTACTGTGGGCAG 130376312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGTTGGTTGTTGAGACAAGAATAACTTGGCCTCTCCTCATGTGTGAGTACTGTGGGCAG 780

130376313 ACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTGCATGTAACCGCATGTGGTCTTACACATATTTGA 130376372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTGCATGTAACCGCATGTGGTCTTACACATATTTGA 840

130376373 GGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAATAAAGACTCAGCATGTT 130376432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAATAAAGACTCAGCATGTT 900

130376433 TCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGTATTAT 130376492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGTATTAT 960

130376493 TATTACCATTTTAACGATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCTTAAAA 130376552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATTACCATTTTAACGATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCTTAAAA 1020

130376553 TCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCTATGCT 130376612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCTATGCT 1080

130376613 TTAAAAAATAATCACTACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTAC 130376672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTAAAAAATAATCACTACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTAC 1140

130376673 AGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAATGGACA 130376732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAATGGACA 1200

130376733 AGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTTG 130376792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTTG 1260

130376793 TAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTAC 130376852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTAC 1320

130376853 AAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTAAGGAG 130376912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTAAGGAG 1380

130376913 CTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAATTATACAGAGGACTTGG 130376972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAATTATACAGAGGACTTGG 1440

130376973 AGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAAAAGTAATCATTCAGCA 130377032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAAAAGTAATCATTCAGCA 1500

130377033 CCATAAAGCATTAGATGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAAA 130377092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCATAAAGCATTAGATGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAAA 1560

130377093 CATCCAGTATTGTGATTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAAA 130377152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATCCAGTATTGTGATTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAAA 1620

130377153 TGATGTTTTGTTGTGTTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGCA 130377212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGATGTTTTGTTGTGTTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGCA 1680

130377213 TTTACAAAGAAGGTACTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAACATCACAAAA 130377272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTACAAAGAAGGTACTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAACATCACAAAA 1740

130377273 TGACTTCTATTGTTGGATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCTA 130377332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGACTTCTATTGTTGGATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCTA 1800

130377333 TGTGGCACTCCCTGACCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACTA 130377392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTGGCACTCCCTGACCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACTA 1860

130377393 ATTAACCATGTGACCTTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTTA 130377452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTAACCATGTGACCTTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTTA 1920

130377453 TAAAATGTGGGAGTTGCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGTG 130377512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAAAATGTGGGAGTTGCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGTG 1980

130377513 TTTTTAAAACGTATTTTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAAA 130377572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTTTAAAACGTATTTTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAAA 2040

130377573 AATGTTAAAGAATACCAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAGATACA 130377632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATGTTAAAGAATACCAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAGATACA 2100

130377633 AATTATATTTGTAGCATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTCATATAGATAC 130377692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATTATATTTGTAGCATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTCATATAGATAC 2160

130377693 ATGTAGTTTCTGGGGTTATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTATTGTTCCACA 130377752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGTAGTTTCTGGGGTTATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTATTGTTCCACA 2220

130377753 AGTCAATTTTTGTTTCCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTACATAT 130377812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGTCAATTTTTGTTTCCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTACATAT 2280

130377813 AAATCTATTTCATTCTTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACCATCATTTGTT 130377872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAATCTATTTCATTCTTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACCATCATTTGTT 2340

130377873 TAGCTATTTTTCACTGATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAGCACAGTTCTGCAGTGG 130377932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAGCTATTTTTCACTGATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAGCACAGTTCTGCAGTGG 2400

130377933 ACAGCCTTGGGCATCTCCTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTTTAGGGTATATTATTTGA 130377992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACAGCCTTGGGCATCTCCTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTTTAGGGTATATTATTTGA 2460

130377993 TGTGGAATTGCTAGGCTTTAACATTTCAGTTTTATTCCACACTGTCAAATTGCTCTCTAA 130378052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGTGGAATTGCTAGGCTTTAACATTTCAGTTTTATTCCACACTGTCAAATTGCTCTCTAA 2520

130378053 ACTACTAGTGCCAATTTACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACAAGTTGATCAACACTCGA 130378112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTACTAGTGCCAATTTACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACAAGTTGATCAACACTCGA 2580

130378113 TATGGTCAGACATTTTCATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAAGTTATCTCTGGTAACTT 130378172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TATGGTCAGACATTTTCATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAAGTTATCTCTGGTAACTT 2640

130378173 GGAAAGGTAAACGTTTTTTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCATTTCCTGTTTGCTGGTCA 130378232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GGAAAGGTAAACGTTTTTTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCATTTCCTGTTTGCTGGTCA 2700

130378233 GTTGCTCATTATATCCCTTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTTTATATTTTTGGTATTGA 130378292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTTGCTCATTATATCCCTTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTTTATATTTTTGGTATTGA 2760

130378293 TATGAAGGATTATACTTTCTATATTCATATAAGTGCATATGTCAATAACTATAAAATTAT 130378352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TATGAAGGATTATACTTTCTATATTCATATAAGTGCATATGTCAATAACTATAAAATTAT 2820

130378353 ATACAAATTATAATTATGTTATAGAATACAATTTCATTTAACTTTGCTTGTGGCG 130378407
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATACAAATTATAATTATGTTATAGAATACAATTTCATTTAACTTTGCTTGTGGCG 2875

Alignment time is 1.94098 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [130367774,130388654] =>     20881 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2706] =>      2706 nucs 'mol-32-2edb-085051_2706'

Score:        2706
Aligned:      2706        nucs
Identic:      2706 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [130375922,130378627]
 second seq =>  [        1,     2706]

130375922 GTTTTTCAGAAACTTATGCACAAAGTCCCAGATTACAGGTCTTCTAGACTTAAATTCTAA 130375981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTTTTCAGAAACTTATGCACAAAGTCCCAGATTACAGGTCTTCTAGACTTAAATTCTAA 60

130375982 TGGGAACATTGTAAATTTGACTCTTCGGGAAATATTTTAAATAGTGGGAGCTCTTTCTCT 130376041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGGAACATTGTAAATTTGACTCTTCGGGAAATATTTTAAATAGTGGGAGCTCTTTCTCT 120

130376042 TCCCTAACAATTTCCAACTCTGGCACAGCTGCTCAATGTGAAGTTTGTAATTTCTCCTTC 130376101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCCTAACAATTTCCAACTCTGGCACAGCTGCTCAATGTGAAGTTTGTAATTTCTCCTTC 180

130376102 CTTCCCAGAAGTACTTTTGGCTCAGCTTAATCTATTATGCCTTTGCAGTCGCCATTGAAT 130376161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTCCCAGAAGTACTTTTGGCTCAGCTTAATCTATTATGCCTTTGCAGTCGCCATTGAAT 240

130376162 GCCTCTAGTCCATGCAGAGTGGAATTGAGAACTGAAGTTGGACTTCCGTCATCCTTGGGG 130376221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCTCTAGTCCATGCAGAGTGGAATTGAGAACTGAAGTTGGACTTCCGTCATCCTTGGGG 300

130376222 TATGAAGATAGGATAGGAATTGATCCGATTCTGGTTGGTTGTTGAGACAAGAATAACTTG 130376281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATGAAGATAGGATAGGAATTGATCCGATTCTGGTTGGTTGTTGAGACAAGAATAACTTG 360

130376282 GCCTCTCCTCATGTGTGAGTACTGTGGGCAGACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTGCA 130376341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCTCTCCTCATGTGTGAGTACTGTGGGCAGACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTGCA 420

130376342 TGTAACCGCATGTGGTCTTACACATATTTGAGGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCTGA 130376401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTAACCGCATGTGGTCTTACACATATTTGAGGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCTGA 480

130376402 AAGATGGGCAATAATAAAGACTCAGCATGTTTCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGTAT 130376461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGATGGGCAATAATAAAGACTCAGCATGTTTCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGTAT 540

130376462 CCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGTATTATTATTACCATTTTAACGATGAAGAAACAGA 130376521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGTATTATTATTACCATTTTAACGATGAAGAAACAGA 600

130376522 ATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGATT 130376581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGATT 660

130376582 TGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCTATGCTTTAAAAAATAATCACTACAATATACTACT 130376641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCTATGCTTTAAAAAATAATCACTACAATATACTACT 720

130376642 TTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTACAGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAAGC 130376701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTACAGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAAGC 780

130376702 TTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGCCC 130376761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGCCC 840

130376762 AGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGCAA 130376821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGCAA 900

130376822 CGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTCTC 130376881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTCTC 960

130376882 TCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAATGA 130376941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAATGA 1020

130376942 AAATATTTTCAGAATTATACAGAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAACAG 130377001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAATATTTTCAGAATTATACAGAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAACAG 1080

130377002 AAACATATTTAATAAAAGTAATCATTCAGCACCATAAAGCATTAGATGAAGTCTATTGTG 130377061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAACATATTTAATAAAAGTAATCATTCAGCACCATAAAGCATTAGATGAAGTCTATTGTG 1140

130377062 AATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAAACATCCAGTATTGTGATTACCAAGGTAATT 130377121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAAACATCCAGTATTGTGATTACCAAGGTAATT 1200

130377122 TGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTTGTTGTGTTCCATTCTACAGG 130377181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTTGTTGTGTTCCATTCTACAGG 1260

130377182 GGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAGAAGGTACTGGTCTAATAATC 130377241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAGAAGGTACTGGTCTAATAATC 1320

130377242 CCAAAATGACAATCCCAGTAACATCACAAAATGACTTCTATTGTTGGATGGAACAAGTGG 130377301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAAAATGACAATCCCAGTAACATCACAAAATGACTTCTATTGTTGGATGGAACAAGTGG 1380

130377302 GAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACTCCCTGACCTGGGAGACCACA 130377361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACTCCCTGACCTGGGAGACCACA 1440

130377362 GGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACTAATTAACCATGTGACCTTGAAACAGTCACT 130377421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACTAATTAACCATGTGACCTTGAAACAGTCACT 1500

130377422 CAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTGGGAGTTGCAGGAGAGTCCCT 130377481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTGGGAGTTGCAGGAGAGTCCCT 1560

130377482 GCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTATTTTTAAAAATTTCAC 130377541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTATTTTTAAAAATTTCAC 1620

130377542 AAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAAGAATACCAAAATCCCCATTC 130377601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAAGAATACCAAAATCCCCATTC 1680

130377602 AGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAGATACAAATTATATTTGTAGCATCATTTTCCAGAC 130377661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAGATACAAATTATATTTGTAGCATCATTTTCCAGAC 1740

130377662 AATTGTTATGTATCTGTAGTCATATAGATACATGTAGTTTCTGGGGTTATTTTAAAAATA 130377721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATTGTTATGTATCTGTAGTCATATAGATACATGTAGTTTCTGGGGTTATTTTAAAAATA 1800

130377722 TATGATATCAAACTGTGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTTTTGTTTCCATTGAACAGCAT 130377781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TATGATATCAAACTGTGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTTTTGTTTCCATTGAACAGCAT 1860

130377782 GTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTACATATAAATCTATTTCATTCTTTTTAACTGCTAC 130377841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTACATATAAATCTATTTCATTCTTTTTAACTGCTAC 1920

130377842 ATAGTATGCATATACAGTACCATCATTTGTTTAGCTATTTTTCACTGATAAGTATTTGTT 130377901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATAGTATGCATATACAGTACCATCATTTGTTTAGCTATTTTTCACTGATAAGTATTTGTT 1980

130377902 TACAAATAATCATAGCACAGTTCTGCAGTGGACAGCCTTGGGCATCTCCTTGTATGCATG 130377961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TACAAATAATCATAGCACAGTTCTGCAGTGGACAGCCTTGGGCATCTCCTTGTATGCATG 2040

130377962 TGCAAGTGTTTCTTTAGGGTATATTATTTGATGTGGAATTGCTAGGCTTTAACATTTCAG 130378021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGCAAGTGTTTCTTTAGGGTATATTATTTGATGTGGAATTGCTAGGCTTTAACATTTCAG 2100

130378022 TTTTATTCCACACTGTCAAATTGCTCTCTAAACTACTAGTGCCAATTTACACACCTGCTG 130378081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTATTCCACACTGTCAAATTGCTCTCTAAACTACTAGTGCCAATTTACACACCTGCTG 2160

130378082 GCAGTTTCATTACAAGTTGATCAACACTCGATATGGTCAGACATTTTCATTTGCCAGTCT 130378141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCAGTTTCATTACAAGTTGATCAACACTCGATATGGTCAGACATTTTCATTTGCCAGTCT 2220

130378142 TATGGATGAAGAAAGTTATCTCTGGTAACTTGGAAAGGTAAACGTTTTTTCCTATGTTTC 130378201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TATGGATGAAGAAAGTTATCTCTGGTAACTTGGAAAGGTAAACGTTTTTTCCTATGTTTC 2280

130378202 TTATCCATTTGCATTTCCTGTTTGCTGGTCAGTTGCTCATTATATCCCTTGTCCATTCAT 130378261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTATCCATTTGCATTTCCTGTTTGCTGGTCAGTTGCTCATTATATCCCTTGTCCATTCAT 2340

130378262 TAGAATGGATTGTTTATATTTTTGGTATTGATATGAAGGATTATACTTTCTATATTCATA 130378321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAGAATGGATTGTTTATATTTTTGGTATTGATATGAAGGATTATACTTTCTATATTCATA 2400

130378322 TAAGTGCATATGTCAATAACTATAAAATTATATACAAATTATAATTATGTTATAGAATAC 130378381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAAGTGCATATGTCAATAACTATAAAATTATATACAAATTATAATTATGTTATAGAATAC 2460

130378382 AATTTCATTTAACTTTGCTTGTGGCGAATACCAAACAGAACTTAAAAATTCTCAATTCTG 130378441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATTTCATTTAACTTTGCTTGTGGCGAATACCAAACAGAACTTAAAAATTCTCAATTCTG 2520

130378442 TCAAATTTATCTATTTTATATGATTTCTGCATTTTGAGTCTTGCTTAAAAAGTCTTTTTC 130378501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCAAATTTATCTATTTTATATGATTTCTGCATTTTGAGTCTTGCTTAAAAAGTCTTTTTC 2580

130378502 CTCTCTGAAATTATTTCTACTATATTTTCTTCTAATAACTTATAGTTTTGCTTTTTTATA 130378561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTCTCTGAAATTATTTCTACTATATTTTCTTCTAATAACTTATAGTTTTGCTTTTTTATA 2640

130378562 GAACTCCTTAATCCACTGGGAATTTATGTTTATTTTGTGAGGAAGGGATCTCCATCTCCA 130378621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GAACTCCTTAATCCACTGGGAATTTATGTTTATTTTGTGAGGAAGGGATCTCCATCTCCA 2700

130378622 GCTGAG 130378627
          ||||||
     2701 GCTGAG 2706

Alignment time is 1.83499 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [130367774,130388654] =>     20881 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2748] =>      2748 nucs 'mol-32-2f12-059755_2748'

Score:        2748
Aligned:      2748        nucs
Identic:      2748 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [130375223,130377970]
 second seq =>  [        1,     2748]

130375223 GCAGGGCTTAAAACCTAGATGATGGGTTGATAGGTGCAGCAAACCACCATGGCACATTTA 130375282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCAGGGCTTAAAACCTAGATGATGGGTTGATAGGTGCAGCAAACCACCATGGCACATTTA 60

130375283 TACCTGTGTAACAAACCTGCACGTTCAGCACGTGTATCTCAGAACTTAGAGAAAAAAAAA 130375342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACCTGTGTAACAAACCTGCACGTTCAGCACGTGTATCTCAGAACTTAGAGAAAAAAAAA 120

130375343 TTAAGATGGGTTGTTGTTTTTGGTGGAAGATGGGGAGATATGTTCATCATATGAATCATC 130375402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAAGATGGGTTGTTGTTTTTGGTGGAAGATGGGGAGATATGTTCATCATATGAATCATC 180

130375403 AGTTGGAGTGGAGTCTTTCAAGAAAAATATAATGCACAAATACTCTTTATTGAATTTCTG 130375462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTTGGAGTGGAGTCTTTCAAGAAAAATATAATGCACAAATACTCTTTATTGAATTTCTG 240

130375463 GGAAATATTCTAGGAAATTAGCCCACAACCAACTAACGTAATTCCCTCTAACAGGAATAT 130375522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAAATATTCTAGGAAATTAGCCCACAACCAACTAACGTAATTCCCTCTAACAGGAATAT 300

130375523 GTCCAATGAATCTAGAGAGCTTAGATTGCCTTGGTACATAAAGAAGTAAGTAGAATGCAT 130375582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCCAATGAATCTAGAGAGCTTAGATTGCCTTGGTACATAAAGAAGTAAGTAGAATGCAT 360

130375583 TTTTTTTATTAACCTGCTTTGTAAATAAATGTCCTTGTATGAGAACATGATCTCTGAATG 130375642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTTTATTAACCTGCTTTGTAAATAAATGTCCTTGTATGAGAACATGATCTCTGAATG 420

130375643 CTGTCTTCTACACGACCCTCTTCCTGTGTCCTCTCTAGGAGTGGGTGCCCATGTGCACTG 130375702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGTCTTCTACACGACCCTCTTCCTGTGTCCTCTCTAGGAGTGGGTGCCCATGTGCACTG 480

130375703 CAGTGACCTTTTCTTCTCTCTAGTCTTCTTTGAAAGCTTGTTTTCTCTGGTTGTTTTTCT 130375762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGTGACCTTTTCTTCTCTCTAGTCTTCTTTGAAAGCTTGTTTTCTCTGGTTGTTTTTCT 540

130375763 TCGAACAGACTTGATATAGAAATTCACACTGTGGTGTGAATGGATAAAAACAACTTAATA 130375822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCGAACAGACTTGATATAGAAATTCACACTGTGGTGTGAATGGATAAAAACAACTTAATA 600

130375823 CTGTACCCCTTATGAGGTATTTGCATTTTAACGAAGACCAGCCACTCAATTTGGAGACAT 130375882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGTACCCCTTATGAGGTATTTGCATTTTAACGAAGACCAGCCACTCAATTTGGAGACAT 660

130375883 ACGTTCTTCTTTTTAAATTTCCATCCCAATAATCAATCTGTTTTTCAGAAACTTATGCAC 130375942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACGTTCTTCTTTTTAAATTTCCATCCCAATAATCAATCTGTTTTTCAGAAACTTATGCAC 720

130375943 AAAGTCCCAGATTACAGGTCTTCTAGACTTAAATTCTAATGGGAACATTGTAAATTTGAC 130376002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGTCCCAGATTACAGGTCTTCTAGACTTAAATTCTAATGGGAACATTGTAAATTTGAC 780

130376003 TCTTCGGGAAATATTTTAAATAGTGGGAGCTCTTTCTCTTCCCTAACAATTTCCAACTCT 130376062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTCGGGAAATATTTTAAATAGTGGGAGCTCTTTCTCTTCCCTAACAATTTCCAACTCT 840

130376063 GGCACAGCTGCTCAATGTGAAGTTTGTAATTTCTCCTTCCTTCCCAGAAGTACTTTTGGC 130376122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCACAGCTGCTCAATGTGAAGTTTGTAATTTCTCCTTCCTTCCCAGAAGTACTTTTGGC 900

130376123 TCAGCTTAATCTATTATGCCTTTGCAGTCGCCATTGAATGCCTCTAGTCCATGCAGAGTG 130376182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAGCTTAATCTATTATGCCTTTGCAGTCGCCATTGAATGCCTCTAGTCCATGCAGAGTG 960

130376183 GAATTGAGAACTGAAGTTGGACTTCCGTCATCCTTGGGGTATGAAGATAGGATAGGAATT 130376242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAATTGAGAACTGAAGTTGGACTTCCGTCATCCTTGGGGTATGAAGATAGGATAGGAATT 1020

130376243 GATCCGATTCTGGTTGGTTGTTGAGACAAGAATAACTTGGCCTCTCCTCATGTGTGAGTA 130376302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATCCGATTCTGGTTGGTTGTTGAGACAAGAATAACTTGGCCTCTCCTCATGTGTGAGTA 1080

130376303 CTGTGGGCAGACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTGCATGTAACCGCATGTGGTCTTAC 130376362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGTGGGCAGACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTGCATGTAACCGCATGTGGTCTTAC 1140

130376363 ACATATTTGAGGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAATAAAGAC 130376422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACATATTTGAGGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAATAAAGAC 1200

130376423 TCAGCATGTTTCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGTATGAGA 130376482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCAGCATGTTTCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGTATGAGA 1260

130376483 TAGGTATTATTATTACCATTTTAACGATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTAAATAAA 130376542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGGTATTATTATTACCATTTTAACGATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTAAATAAA 1320

130376543 TTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTGATCCAC 130376602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTGATCCAC 1380

130376603 AACCTATGCTTTAAAAAATAATCACTACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGGTAGATA 130376662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACCTATGCTTTAAAAAATAATCACTACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGGTAGATA 1440

130376663 GATGAGGTACAGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTAGAAATA 130376722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATGAGGTACAGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTAGAAATA 1500

130376723 AGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCA 130376782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCA 1560

130376783 AGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTCATGTTG 130376842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTCATGTTG 1620

130376843 TGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTATTTCAAT 130376902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTATTTCAAT 1680

130376903 TATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAATTATACA 130376962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAATTATACA 1740

130376963 GAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAAAAGTAA 130377022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAAAAGTAA 1800

130377023 TCATTCAGCACCATAAAGCATTAGATGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACAC 130377082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCATTCAGCACCATAAAGCATTAGATGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACAC 1860

130377083 ACAGAGAAAACATCCAGTATTGTGATTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGG 130377142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACAGAGAAAACATCCAGTATTGTGATTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGG 1920

130377143 TTGGAGAAAATGATGTTTTGTTGTGTTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGC 130377202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGGAGAAAATGATGTTTTGTTGTGTTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGC 1980

130377203 CTGTATAGCATTTACAAAGAAGGTACTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAA 130377262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTGTATAGCATTTACAAAGAAGGTACTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAA 2040

130377263 CATCACAAAATGACTTCTATTGTTGGATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAA 130377322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATCACAAAATGACTTCTATTGTTGGATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAA 2100

130377323 TGGCTTCCTATGTGGCACTCCCTGACCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGT 130377382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGGCTTCCTATGTGGCACTCCCTGACCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGT 2160

130377383 TCTGCCACTAATTAACCATGTGACCTTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTT 130377442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTGCCACTAATTAACCATGTGACCTTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTT 2220

130377443 TTCTCACTTATAAAATGTGGGAGTTGCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTT 130377502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCTCACTTATAAAATGTGGGAGTTGCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTT 2280

130377503 TTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTATTTTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTC 130377562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTATTTTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTC 2340

130377563 TCATTGTAAAAATGTTAAAGAATACCAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTT 130377622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCATTGTAAAAATGTTAAAGAATACCAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTT 2400

130377623 CTGAGATACAAATTATATTTGTAGCATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTC 130377682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTGAGATACAAATTATATTTGTAGCATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTC 2460

130377683 ATATAGATACATGTAGTTTCTGGGGTTATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTA 130377742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATATAGATACATGTAGTTTCTGGGGTTATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTA 2520

130377743 TTGTTCCACAAGTCAATTTTTGTTTCCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGT 130377802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTGTTCCACAAGTCAATTTTTGTTTCCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGT 2580

130377803 CAGTACATATAAATCTATTTCATTCTTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACC 130377862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAGTACATATAAATCTATTTCATTCTTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACC 2640

130377863 ATCATTTGTTTAGCTATTTTTCACTGATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAGCACAGT 130377922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATCATTTGTTTAGCTATTTTTCACTGATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAGCACAGT 2700

130377923 TCTGCAGTGGACAGCCTTGGGCATCTCCTTGTATGCATGTGCAAGTGT 130377970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCTGCAGTGGACAGCCTTGGGCATCTCCTTGTATGCATGTGCAAGTGT 2748

Alignment time is 1.89101 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [130367774,130388654] =>     20881 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2800] =>      2800 nucs 'mol-32-2fd8-053424_2800'

Score:        2800
Aligned:      2800        nucs
Identic:      2800 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [130375577,130378376]
 second seq =>  [        1,     2800]

130375577 ATGCATTTTTTTTATTAACCTGCTTTGTAAATAAATGTCCTTGTATGAGAACATGATCTC 130375636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGCATTTTTTTTATTAACCTGCTTTGTAAATAAATGTCCTTGTATGAGAACATGATCTC 60

130375637 TGAATGCTGTCTTCTACACGACCCTCTTCCTGTGTCCTCTCTAGGAGTGGGTGCCCATGT 130375696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAATGCTGTCTTCTACACGACCCTCTTCCTGTGTCCTCTCTAGGAGTGGGTGCCCATGT 120

130375697 GCACTGCAGTGACCTTTTCTTCTCTCTAGTCTTCTTTGAAAGCTTGTTTTCTCTGGTTGT 130375756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCACTGCAGTGACCTTTTCTTCTCTCTAGTCTTCTTTGAAAGCTTGTTTTCTCTGGTTGT 180

130375757 TTTTCTTCGAACAGACTTGATATAGAAATTCACACTGTGGTGTGAATGGATAAAAACAAC 130375816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTCTTCGAACAGACTTGATATAGAAATTCACACTGTGGTGTGAATGGATAAAAACAAC 240

130375817 TTAATACTGTACCCCTTATGAGGTATTTGCATTTTAACGAAGACCAGCCACTCAATTTGG 130375876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAATACTGTACCCCTTATGAGGTATTTGCATTTTAACGAAGACCAGCCACTCAATTTGG 300

130375877 AGACATACGTTCTTCTTTTTAAATTTCCATCCCAATAATCAATCTGTTTTTCAGAAACTT 130375936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGACATACGTTCTTCTTTTTAAATTTCCATCCCAATAATCAATCTGTTTTTCAGAAACTT 360

130375937 ATGCACAAAGTCCCAGATTACAGGTCTTCTAGACTTAAATTCTAATGGGAACATTGTAAA 130375996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGCACAAAGTCCCAGATTACAGGTCTTCTAGACTTAAATTCTAATGGGAACATTGTAAA 420

130375997 TTTGACTCTTCGGGAAATATTTTAAATAGTGGGAGCTCTTTCTCTTCCCTAACAATTTCC 130376056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTGACTCTTCGGGAAATATTTTAAATAGTGGGAGCTCTTTCTCTTCCCTAACAATTTCC 480

130376057 AACTCTGGCACAGCTGCTCAATGTGAAGTTTGTAATTTCTCCTTCCTTCCCAGAAGTACT 130376116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACTCTGGCACAGCTGCTCAATGTGAAGTTTGTAATTTCTCCTTCCTTCCCAGAAGTACT 540

130376117 TTTGGCTCAGCTTAATCTATTATGCCTTTGCAGTCGCCATTGAATGCCTCTAGTCCATGC 130376176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTGGCTCAGCTTAATCTATTATGCCTTTGCAGTCGCCATTGAATGCCTCTAGTCCATGC 600

130376177 AGAGTGGAATTGAGAACTGAAGTTGGACTTCCGTCATCCTTGGGGTATGAAGATAGGATA 130376236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAGTGGAATTGAGAACTGAAGTTGGACTTCCGTCATCCTTGGGGTATGAAGATAGGATA 660

130376237 GGAATTGATCCGATTCTGGTTGGTTGTTGAGACAAGAATAACTTGGCCTCTCCTCATGTG 130376296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAATTGATCCGATTCTGGTTGGTTGTTGAGACAAGAATAACTTGGCCTCTCCTCATGTG 720

130376297 TGAGTACTGTGGGCAGACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTGCATGTAACCGCATGTGG 130376356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAGTACTGTGGGCAGACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTGCATGTAACCGCATGTGG 780

130376357 TCTTACACATATTTGAGGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAAT 130376416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTACACATATTTGAGGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAAT 840

130376417 AAAGACTCAGCATGTTTCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGT 130376476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAGACTCAGCATGTTTCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGT 900

130376477 ATGAGATAGGTATTATTATTACCATTTTAACGATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTA 130376536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGAGATAGGTATTATTATTACCATTTTAACGATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTA 960

130376537 AATAAATTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTG 130376596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATAAATTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTG 1020

130376597 ATCCACAACCTATGCTTTAAAAAATAATCACTACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGG 130376656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATCCACAACCTATGCTTTAAAAAATAATCACTACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGG 1080

130376657 TAGATAGATGAGGTACAGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTA 130376716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGATAGATGAGGTACAGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTA 1140

130376717 GAAATAAGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCA 130376776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAATAAGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCA 1200

130376777 GAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTC 130376836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTC 1260

130376837 ATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTAT 130376896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTAT 1320

130376897 TTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAAT 130376956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAAT 1380

130376957 TATACAGAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAA 130377016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATACAGAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAA 1440

130377017 AAGTAATCATTCAGCACCATAAAGCATTAGATGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGT 130377076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGTAATCATTCAGCACCATAAAGCATTAGATGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGT 1500

130377077 GCACACACAGAGAAAACATCCAGTATTGTGATTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAAT 130377136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCACACACAGAGAAAACATCCAGTATTGTGATTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAAT 1560

130377137 AGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTTGTTGTGTTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTG 130377196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTTGTTGTGTTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTG 1620

130377197 TTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAGAAGGTACTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCC 130377256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAGAAGGTACTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCC 1680

130377257 CAGTAACATCACAAAATGACTTCTATTGTTGGATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAA 130377316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGTAACATCACAAAATGACTTCTATTGTTGGATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAA 1740

130377317 TGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACTCCCTGACCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAAT 130377376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACTCCCTGACCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAAT 1800

130377377 TCTAGTTCTGCCACTAATTAACCATGTGACCTTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGC 130377436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTAGTTCTGCCACTAATTAACCATGTGACCTTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGC 1860

130377437 TCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTGGGAGTTGCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGT 130377496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTGGGAGTTGCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGT 1920

130377497 CACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTATTTTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGAT 130377556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTATTTTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGAT 1980

130377557 CTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAAGAATACCAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATC 130377616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAAGAATACCAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATC 2040

130377617 TCTCTTCTGAGATACAAATTATATTTGTAGCATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCT 130377676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTCTTCTGAGATACAAATTATATTTGTAGCATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCT 2100

130377677 GTAGTCATATAGATACATGTAGTTTCTGGGGTTATTTTAAAAATATATGATATCAAACTG 130377736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTAGTCATATAGATACATGTAGTTTCTGGGGTTATTTTAAAAATATATGATATCAAACTG 2160

130377737 TGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTTTTGTTTCCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTT 130377796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTTTTGTTTCCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTT 2220

130377797 TCATGTCAGTACATATAAATCTATTTCATTCTTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATAC 130377856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCATGTCAGTACATATAAATCTATTTCATTCTTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATAC 2280

130377857 AGTACCATCATTTGTTTAGCTATTTTTCACTGATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAG 130377916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGTACCATCATTTGTTTAGCTATTTTTCACTGATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAG 2340

130377917 CACAGTTCTGCAGTGGACAGCCTTGGGCATCTCCTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTTT 130377976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CACAGTTCTGCAGTGGACAGCCTTGGGCATCTCCTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTTT 2400

130377977 AGGGTATATTATTTGATGTGGAATTGCTAGGCTTTAACATTTCAGTTTTATTCCACACTG 130378036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGGGTATATTATTTGATGTGGAATTGCTAGGCTTTAACATTTCAGTTTTATTCCACACTG 2460

130378037 TCAAATTGCTCTCTAAACTACTAGTGCCAATTTACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACAA 130378096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCAAATTGCTCTCTAAACTACTAGTGCCAATTTACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACAA 2520

130378097 GTTGATCAACACTCGATATGGTCAGACATTTTCATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAAG 130378156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTTGATCAACACTCGATATGGTCAGACATTTTCATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAAG 2580

130378157 TTATCTCTGGTAACTTGGAAAGGTAAACGTTTTTTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCATT 130378216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTATCTCTGGTAACTTGGAAAGGTAAACGTTTTTTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCATT 2640

130378217 TCCTGTTTGCTGGTCAGTTGCTCATTATATCCCTTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTTT 130378276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCCTGTTTGCTGGTCAGTTGCTCATTATATCCCTTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTTT 2700

130378277 ATATTTTTGGTATTGATATGAAGGATTATACTTTCTATATTCATATAAGTGCATATGTCA 130378336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATATTTTTGGTATTGATATGAAGGATTATACTTTCTATATTCATATAAGTGCATATGTCA 2760

130378337 ATAACTATAAAATTATATACAAATTATAATTATGTTATAG 130378376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATAACTATAAAATTATATACAAATTATAATTATGTTATAG 2800

Alignment time is 2.13429 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [130367774,130388654] =>     20881 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2810] =>      2810 nucs 'mol-32-3030-184067_2810'

Score:        2810
Aligned:      2810        nucs
Identic:      2810 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [130375652,130378461]
 second seq =>  [        1,     2810]

130375652 ACACGACCCTCTTCCTGTGTCCTCTCTAGGAGTGGGTGCCCATGTGCACTGCAGTGACCT 130375711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACACGACCCTCTTCCTGTGTCCTCTCTAGGAGTGGGTGCCCATGTGCACTGCAGTGACCT 60

130375712 TTTCTTCTCTCTAGTCTTCTTTGAAAGCTTGTTTTCTCTGGTTGTTTTTCTTCGAACAGA 130375771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCTTCTCTCTAGTCTTCTTTGAAAGCTTGTTTTCTCTGGTTGTTTTTCTTCGAACAGA 120

130375772 CTTGATATAGAAATTCACACTGTGGTGTGAATGGATAAAAACAACTTAATACTGTACCCC 130375831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTGATATAGAAATTCACACTGTGGTGTGAATGGATAAAAACAACTTAATACTGTACCCC 180

130375832 TTATGAGGTATTTGCATTTTAACGAAGACCAGCCACTCAATTTGGAGACATACGTTCTTC 130375891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATGAGGTATTTGCATTTTAACGAAGACCAGCCACTCAATTTGGAGACATACGTTCTTC 240

130375892 TTTTTAAATTTCCATCCCAATAATCAATCTGTTTTTCAGAAACTTATGCACAAAGTCCCA 130375951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTTAAATTTCCATCCCAATAATCAATCTGTTTTTCAGAAACTTATGCACAAAGTCCCA 300

130375952 GATTACAGGTCTTCTAGACTTAAATTCTAATGGGAACATTGTAAATTTGACTCTTCGGGA 130376011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATTACAGGTCTTCTAGACTTAAATTCTAATGGGAACATTGTAAATTTGACTCTTCGGGA 360

130376012 AATATTTTAAATAGTGGGAGCTCTTTCTCTTCCCTAACAATTTCCAACTCTGGCACAGCT 130376071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATATTTTAAATAGTGGGAGCTCTTTCTCTTCCCTAACAATTTCCAACTCTGGCACAGCT 420

130376072 GCTCAATGTGAAGTTTGTAATTTCTCCTTCCTTCCCAGAAGTACTTTTGGCTCAGCTTAA 130376131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTCAATGTGAAGTTTGTAATTTCTCCTTCCTTCCCAGAAGTACTTTTGGCTCAGCTTAA 480

130376132 TCTATTATGCCTTTGCAGTCGCCATTGAATGCCTCTAGTCCATGCAGAGTGGAATTGAGA 130376191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTATTATGCCTTTGCAGTCGCCATTGAATGCCTCTAGTCCATGCAGAGTGGAATTGAGA 540

130376192 ACTGAAGTTGGACTTCCGTCATCCTTGGGGTATGAAGATAGGATAGGAATTGATCCGATT 130376251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTGAAGTTGGACTTCCGTCATCCTTGGGGTATGAAGATAGGATAGGAATTGATCCGATT 600

130376252 CTGGTTGGTTGTTGAGACAAGAATAACTTGGCCTCTCCTCATGTGTGAGTACTGTGGGCA 130376311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGGTTGGTTGTTGAGACAAGAATAACTTGGCCTCTCCTCATGTGTGAGTACTGTGGGCA 660

130376312 GACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTGCATGTAACCGCATGTGGTCTTACACATATTTG 130376371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTGCATGTAACCGCATGTGGTCTTACACATATTTG 720

130376372 AGGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAATAAAGACTCAGCATGT 130376431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAATAAAGACTCAGCATGT 780

130376432 TTCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGTATTA 130376491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGTATTA 840

130376492 TTATTACCATTTTAACGATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCTTAAA 130376551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTATTACCATTTTAACGATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCTTAAA 900

130376552 ATCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCTATGC 130376611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCTATGC 960

130376612 TTTAAAAAATAATCACTACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTA 130376671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTAAAAAATAATCACTACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTA 1020

130376672 CAGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAATGGAC 130376731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAATGGAC 1080

130376732 AAGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTT 130376791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTT 1140

130376792 GTAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTA 130376851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTA 1200

130376852 CAAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTAAGGA 130376911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTAAGGA 1260

130376912 GCTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAATTATACAGAGGACTTG 130376971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAATTATACAGAGGACTTG 1320

130376972 GAGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAAAAGTAATCATTCAGC 130377031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAAAAGTAATCATTCAGC 1380

130377032 ACCATAAAGCATTAGATGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAA 130377091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACCATAAAGCATTAGATGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAA 1440

130377092 ACATCCAGTATTGTGATTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAA 130377151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACATCCAGTATTGTGATTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAA 1500

130377152 ATGATGTTTTGTTGTGTTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGC 130377211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGATGTTTTGTTGTGTTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGC 1560

130377212 ATTTACAAAGAAGGTACTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAACATCACAAA 130377271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTTACAAAGAAGGTACTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAACATCACAAA 1620

130377272 ATGACTTCTATTGTTGGATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCT 130377331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATGACTTCTATTGTTGGATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCT 1680

130377332 ATGTGGCACTCCCTGACCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACT 130377391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATGTGGCACTCCCTGACCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACT 1740

130377392 AATTAACCATGTGACCTTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTT 130377451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATTAACCATGTGACCTTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTT 1800

130377452 ATAAAATGTGGGAGTTGCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGT 130377511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATAAAATGTGGGAGTTGCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGT 1860

130377512 GTTTTTAAAACGTATTTTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAA 130377571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTTTTAAAACGTATTTTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAA 1920

130377572 AAATGTTAAAGAATACCAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAGATAC 130377631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAATGTTAAAGAATACCAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAGATAC 1980

130377632 AAATTATATTTGTAGCATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTCATATAGATA 130377691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAATTATATTTGTAGCATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTCATATAGATA 2040

130377692 CATGTAGTTTCTGGGGTTATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTATTGTTCCAC 130377751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATGTAGTTTCTGGGGTTATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTATTGTTCCAC 2100

130377752 AAGTCAATTTTTGTTTCCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTACATA 130377811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGTCAATTTTTGTTTCCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTACATA 2160

130377812 TAAATCTATTTCATTCTTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACCATCATTTGT 130377871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAAATCTATTTCATTCTTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACCATCATTTGT 2220

130377872 TTAGCTATTTTTCACTGATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAGCACAGTTCTGCAGTG 130377931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTAGCTATTTTTCACTGATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAGCACAGTTCTGCAGTG 2280

130377932 GACAGCCTTGGGCATCTCCTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTTTAGGGTATATTATTTG 130377991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GACAGCCTTGGGCATCTCCTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTTTAGGGTATATTATTTG 2340

130377992 ATGTGGAATTGCTAGGCTTTAACATTTCAGTTTTATTCCACACTGTCAAATTGCTCTCTA 130378051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATGTGGAATTGCTAGGCTTTAACATTTCAGTTTTATTCCACACTGTCAAATTGCTCTCTA 2400

130378052 AACTACTAGTGCCAATTTACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACAAGTTGATCAACACTCG 130378111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AACTACTAGTGCCAATTTACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACAAGTTGATCAACACTCG 2460

130378112 ATATGGTCAGACATTTTCATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAAGTTATCTCTGGTAACT 130378171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATATGGTCAGACATTTTCATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAAGTTATCTCTGGTAACT 2520

130378172 TGGAAAGGTAAACGTTTTTTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCATTTCCTGTTTGCTGGTC 130378231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGGAAAGGTAAACGTTTTTTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCATTTCCTGTTTGCTGGTC 2580

130378232 AGTTGCTCATTATATCCCTTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTTTATATTTTTGGTATTG 130378291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGTTGCTCATTATATCCCTTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTTTATATTTTTGGTATTG 2640

130378292 ATATGAAGGATTATACTTTCTATATTCATATAAGTGCATATGTCAATAACTATAAAATTA 130378351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATATGAAGGATTATACTTTCTATATTCATATAAGTGCATATGTCAATAACTATAAAATTA 2700

130378352 TATACAAATTATAATTATGTTATAGAATACAATTTCATTTAACTTTGCTTGTGGCGAATA 130378411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TATACAAATTATAATTATGTTATAGAATACAATTTCATTTAACTTTGCTTGTGGCGAATA 2760

130378412 CCAAACAGAACTTAAAAATTCTCAATTCTGTCAAATTTATCTATTTTATA 130378461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CCAAACAGAACTTAAAAATTCTCAATTCTGTCAAATTTATCTATTTTATA 2810

Alignment time is 2.33403 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [130367774,130388654] =>     20881 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2765] =>      2765 nucs 'mol-32-3046-243148_2765'

Score:        2765
Aligned:      2765        nucs
Identic:      2765 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [130375610,130378374]
 second seq =>  [        1,     2765]

130375610 AATGTCCTTGTATGAGAACATGATCTCTGAATGCTGTCTTCTACACGACCCTCTTCCTGT 130375669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATGTCCTTGTATGAGAACATGATCTCTGAATGCTGTCTTCTACACGACCCTCTTCCTGT 60

130375670 GTCCTCTCTAGGAGTGGGTGCCCATGTGCACTGCAGTGACCTTTTCTTCTCTCTAGTCTT 130375729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTCCTCTCTAGGAGTGGGTGCCCATGTGCACTGCAGTGACCTTTTCTTCTCTCTAGTCTT 120

130375730 CTTTGAAAGCTTGTTTTCTCTGGTTGTTTTTCTTCGAACAGACTTGATATAGAAATTCAC 130375789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTTGAAAGCTTGTTTTCTCTGGTTGTTTTTCTTCGAACAGACTTGATATAGAAATTCAC 180

130375790 ACTGTGGTGTGAATGGATAAAAACAACTTAATACTGTACCCCTTATGAGGTATTTGCATT 130375849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTGTGGTGTGAATGGATAAAAACAACTTAATACTGTACCCCTTATGAGGTATTTGCATT 240

130375850 TTAACGAAGACCAGCCACTCAATTTGGAGACATACGTTCTTCTTTTTAAATTTCCATCCC 130375909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAACGAAGACCAGCCACTCAATTTGGAGACATACGTTCTTCTTTTTAAATTTCCATCCC 300

130375910 AATAATCAATCTGTTTTTCAGAAACTTATGCACAAAGTCCCAGATTACAGGTCTTCTAGA 130375969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATAATCAATCTGTTTTTCAGAAACTTATGCACAAAGTCCCAGATTACAGGTCTTCTAGA 360

130375970 CTTAAATTCTAATGGGAACATTGTAAATTTGACTCTTCGGGAAATATTTTAAATAGTGGG 130376029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTAAATTCTAATGGGAACATTGTAAATTTGACTCTTCGGGAAATATTTTAAATAGTGGG 420

130376030 AGCTCTTTCTCTTCCCTAACAATTTCCAACTCTGGCACAGCTGCTCAATGTGAAGTTTGT 130376089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCTCTTTCTCTTCCCTAACAATTTCCAACTCTGGCACAGCTGCTCAATGTGAAGTTTGT 480

130376090 AATTTCTCCTTCCTTCCCAGAAGTACTTTTGGCTCAGCTTAATCTATTATGCCTTTGCAG 130376149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATTTCTCCTTCCTTCCCAGAAGTACTTTTGGCTCAGCTTAATCTATTATGCCTTTGCAG 540

130376150 TCGCCATTGAATGCCTCTAGTCCATGCAGAGTGGAATTGAGAACTGAAGTTGGACTTCCG 130376209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCGCCATTGAATGCCTCTAGTCCATGCAGAGTGGAATTGAGAACTGAAGTTGGACTTCCG 600

130376210 TCATCCTTGGGGTATGAAGATAGGATAGGAATTGATCCGATTCTGGTTGGTTGTTGAGAC 130376269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCATCCTTGGGGTATGAAGATAGGATAGGAATTGATCCGATTCTGGTTGGTTGTTGAGAC 660

130376270 AAGAATAACTTGGCCTCTCCTCATGTGTGAGTACTGTGGGCAGACAAGCTCATATGTCCC 130376329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGAATAACTTGGCCTCTCCTCATGTGTGAGTACTGTGGGCAGACAAGCTCATATGTCCC 720

130376330 CTCACATGTGCATGTAACCGCATGTGGTCTTACACATATTTGAGGCTAAGGATATTGTGG 130376389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCACATGTGCATGTAACCGCATGTGGTCTTACACATATTTGAGGCTAAGGATATTGTGG 780

130376390 GGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAATAAAGACTCAGCATGTTTCAGACACTGTGCTAAA 130376449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAATAAAGACTCAGCATGTTTCAGACACTGTGCTAAA 840

130376450 GGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGTATTATTATTACCATTTTAACGA 130376509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGTATTATTATTACCATTTTAACGA 900

130376510 TGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTTAA 130376569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTTAA 960

130376570 GAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCTATGCTTTAAAAAATAATCACTA 130376629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCTATGCTTTAAAAAATAATCACTA 1020

130376630 CAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTACAGTATTCCAAACTGAAG 130376689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTACAGTATTCCAAACTGAAG 1080

130376690 AGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGGAC 130376749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGGAC 1140

130376750 ACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGAAA 130376809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGAAA 1200

130376810 GAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAAGA 130376869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAAGA 1260

130376870 ATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCAGA 130376929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCAGA 1320

130376930 AAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAATTATACAGAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGACTA 130376989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAATTATACAGAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGACTA 1380

130376990 AAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAAAAGTAATCATTCAGCACCATAAAGCATTAGATG 130377049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAAAAGTAATCATTCAGCACCATAAAGCATTAGATG 1440

130377050 AAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAAACATCCAGTATTGTGATT 130377109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAAACATCCAGTATTGTGATT 1500

130377110 ACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTTGTTGTGTT 130377169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTTGTTGTGTT 1560

130377170 CCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAGAAGGTACT 130377229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAGAAGGTACT 1620

130377230 GGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAACATCACAAAATGACTTCTATTGTTGGA 130377289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAACATCACAAAATGACTTCTATTGTTGGA 1680

130377290 TGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACTCCCTGACC 130377349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACTCCCTGACC 1740

130377350 TGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACTAATTAACCATGTGACCTT 130377409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACTAATTAACCATGTGACCTT 1800

130377410 GAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTGGGAGTTGC 130377469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTGGGAGTTGC 1860

130377470 AGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTATTTT 130377529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTATTTT 1920

130377530 TAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAAGAATACCA 130377589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAAGAATACCA 1980

130377590 AAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAGATACAAATTATATTTGTAGCAT 130377649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAGATACAAATTATATTTGTAGCAT 2040

130377650 CATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTCATATAGATACATGTAGTTTCTGGGGTT 130377709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTCATATAGATACATGTAGTTTCTGGGGTT 2100

130377710 ATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTTTTGTTTCC 130377769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTTTTGTTTCC 2160

130377770 ATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTACATATAAATCTATTTCATTCTT 130377829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTACATATAAATCTATTTCATTCTT 2220

130377830 TTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACCATCATTTGTTTAGCTATTTTTCACTGA 130377889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACCATCATTTGTTTAGCTATTTTTCACTGA 2280

130377890 TAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAGCACAGTTCTGCAGTGGACAGCCTTGGGCATCTC 130377949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAGCACAGTTCTGCAGTGGACAGCCTTGGGCATCTC 2340

130377950 CTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTTTAGGGTATATTATTTGATGTGGAATTGCTAGGCT 130378009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTTTAGGGTATATTATTTGATGTGGAATTGCTAGGCT 2400

130378010 TTAACATTTCAGTTTTATTCCACACTGTCAAATTGCTCTCTAAACTACTAGTGCCAATTT 130378069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTAACATTTCAGTTTTATTCCACACTGTCAAATTGCTCTCTAAACTACTAGTGCCAATTT 2460

130378070 ACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACAAGTTGATCAACACTCGATATGGTCAGACATTTTC 130378129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACAAGTTGATCAACACTCGATATGGTCAGACATTTTC 2520

130378130 ATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAAGTTATCTCTGGTAACTTGGAAAGGTAAACGTTTT 130378189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAAGTTATCTCTGGTAACTTGGAAAGGTAAACGTTTT 2580

130378190 TTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCATTTCCTGTTTGCTGGTCAGTTGCTCATTATATCCC 130378249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCATTTCCTGTTTGCTGGTCAGTTGCTCATTATATCCC 2640

130378250 TTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTTTATATTTTTGGTATTGATATGAAGGATTATACTT 130378309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTTTATATTTTTGGTATTGATATGAAGGATTATACTT 2700

130378310 TCTATATTCATATAAGTGCATATGTCAATAACTATAAAATTATATACAAATTATAATTAT 130378369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCTATATTCATATAAGTGCATATGTCAATAACTATAAAATTATATACAAATTATAATTAT 2760

130378370 GTTAT 130378374
          |||||
     2761 GTTAT 2765

Alignment time is 1.78898 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [130367774,130388654] =>     20881 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     3636] =>      3636 nucs 'mol-32-310c-199792_3636'

Score:        3636
Aligned:      3636        nucs
Identic:      3636 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [130375782,130379417]
 second seq =>  [        1,     3636]

130375782 AAATTCACACTGTGGTGTGAATGGATAAAAACAACTTAATACTGTACCCCTTATGAGGTA 130375841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATTCACACTGTGGTGTGAATGGATAAAAACAACTTAATACTGTACCCCTTATGAGGTA 60

130375842 TTTGCATTTTAACGAAGACCAGCCACTCAATTTGGAGACATACGTTCTTCTTTTTAAATT 130375901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGCATTTTAACGAAGACCAGCCACTCAATTTGGAGACATACGTTCTTCTTTTTAAATT 120

130375902 TCCATCCCAATAATCAATCTGTTTTTCAGAAACTTATGCACAAAGTCCCAGATTACAGGT 130375961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCATCCCAATAATCAATCTGTTTTTCAGAAACTTATGCACAAAGTCCCAGATTACAGGT 180

130375962 CTTCTAGACTTAAATTCTAATGGGAACATTGTAAATTTGACTCTTCGGGAAATATTTTAA 130376021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTCTAGACTTAAATTCTAATGGGAACATTGTAAATTTGACTCTTCGGGAAATATTTTAA 240

130376022 ATAGTGGGAGCTCTTTCTCTTCCCTAACAATTTCCAACTCTGGCACAGCTGCTCAATGTG 130376081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAGTGGGAGCTCTTTCTCTTCCCTAACAATTTCCAACTCTGGCACAGCTGCTCAATGTG 300

130376082 AAGTTTGTAATTTCTCCTTCCTTCCCAGAAGTACTTTTGGCTCAGCTTAATCTATTATGC 130376141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGTTTGTAATTTCTCCTTCCTTCCCAGAAGTACTTTTGGCTCAGCTTAATCTATTATGC 360

130376142 CTTTGCAGTCGCCATTGAATGCCTCTAGTCCATGCAGAGTGGAATTGAGAACTGAAGTTG 130376201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTTGCAGTCGCCATTGAATGCCTCTAGTCCATGCAGAGTGGAATTGAGAACTGAAGTTG 420

130376202 GACTTCCGTCATCCTTGGGGTATGAAGATAGGATAGGAATTGATCCGATTCTGGTTGGTT 130376261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACTTCCGTCATCCTTGGGGTATGAAGATAGGATAGGAATTGATCCGATTCTGGTTGGTT 480

130376262 GTTGAGACAAGAATAACTTGGCCTCTCCTCATGTGTGAGTACTGTGGGCAGACAAGCTCA 130376321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTGAGACAAGAATAACTTGGCCTCTCCTCATGTGTGAGTACTGTGGGCAGACAAGCTCA 540

130376322 TATGTCCCCTCACATGTGCATGTAACCGCATGTGGTCTTACACATATTTGAGGCTAAGGA 130376381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATGTCCCCTCACATGTGCATGTAACCGCATGTGGTCTTACACATATTTGAGGCTAAGGA 600

130376382 TATTGTGGGGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAATAAAGACTCAGCATGTTTCAGACACT 130376441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATTGTGGGGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAATAAAGACTCAGCATGTTTCAGACACT 660

130376442 GTGCTAAAGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGTATTATTATTACCAT 130376501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGCTAAAGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGTATTATTATTACCAT 720

130376502 TTTAACGATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCTTAAAATCACAAAGA 130376561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTAACGATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCTTAAAATCACAAAGA 780

130376562 AAATTTAAGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCTATGCTTTAAAAAAT 130376621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATTTAAGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCTATGCTTTAAAAAAT 840

130376622 AATCACTACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTACAGTATTCCA 130376681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATCACTACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTACAGTATTCCA 900

130376682 AACTGAAGAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAATGGACAAGATGTGCT 130376741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACTGAAGAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAATGGACAAGATGTGCT 960

130376742 TTAGGGACACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGT 130376801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTAGGGACACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGT 1020

130376802 AGAGGAAAGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGA 130376861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAGGAAAGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGA 1080

130376862 TCCAAAGAATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGG 130376921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCAAAGAATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGG 1140

130376922 TTTTCAGAAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAATTATACAGAGGACTTGGAGATAAGTG 130376981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTCAGAAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAATTATACAGAGGACTTGGAGATAAGTG 1200

130376982 AAAGACTAAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAAAAGTAATCATTCAGCACCATAAAGC 130377041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAGACTAAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAAAAGTAATCATTCAGCACCATAAAGC 1260

130377042 ATTAGATGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAAACATCCAGTA 130377101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTAGATGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAAACATCCAGTA 1320

130377102 TTGTGATTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTT 130377161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGTGATTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTT 1380

130377162 GTTGTGTTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAG 130377221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTGTGTTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAG 1440

130377222 AAGGTACTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAACATCACAAAATGACTTCTA 130377281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGGTACTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAACATCACAAAATGACTTCTA 1500

130377282 TTGTTGGATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACT 130377341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTGTTGGATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACT 1560

130377342 CCCTGACCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACTAATTAACCAT 130377401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCCTGACCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACTAATTAACCAT 1620

130377402 GTGACCTTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTG 130377461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTGACCTTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTG 1680

130377462 GGAGTTGCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAA 130377521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGAGTTGCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAA 1740

130377522 CGTATTTTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAA 130377581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CGTATTTTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAA 1800

130377582 GAATACCAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAGATACAAATTATATT 130377641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAATACCAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAGATACAAATTATATT 1860

130377642 TGTAGCATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTCATATAGATACATGTAGTTT 130377701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTAGCATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTCATATAGATACATGTAGTTT 1920

130377702 CTGGGGTTATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTT 130377761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGGGGTTATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTT 1980

130377762 TTGTTTCCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTACATATAAATCTATT 130377821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTGTTTCCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTACATATAAATCTATT 2040

130377822 TCATTCTTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACCATCATTTGTTTAGCTATTT 130377881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCATTCTTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACCATCATTTGTTTAGCTATTT 2100

130377882 TTCACTGATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAGCACAGTTCTGCAGTGGACAGCCTTG 130377941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTCACTGATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAGCACAGTTCTGCAGTGGACAGCCTTG 2160

130377942 GGCATCTCCTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTTTAGGGTATATTATTTGATGTGGAATT 130378001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGCATCTCCTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTTTAGGGTATATTATTTGATGTGGAATT 2220

130378002 GCTAGGCTTTAACATTTCAGTTTTATTCCACACTGTCAAATTGCTCTCTAAACTACTAGT 130378061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCTAGGCTTTAACATTTCAGTTTTATTCCACACTGTCAAATTGCTCTCTAAACTACTAGT 2280

130378062 GCCAATTTACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACAAGTTGATCAACACTCGATATGGTCAG 130378121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCCAATTTACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACAAGTTGATCAACACTCGATATGGTCAG 2340

130378122 ACATTTTCATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAAGTTATCTCTGGTAACTTGGAAAGGTA 130378181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACATTTTCATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAAGTTATCTCTGGTAACTTGGAAAGGTA 2400

130378182 AACGTTTTTTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCATTTCCTGTTTGCTGGTCAGTTGCTCAT 130378241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AACGTTTTTTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCATTTCCTGTTTGCTGGTCAGTTGCTCAT 2460

130378242 TATATCCCTTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTTTATATTTTTGGTATTGATATGAAGGA 130378301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TATATCCCTTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTTTATATTTTTGGTATTGATATGAAGGA 2520

130378302 TTATACTTTCTATATTCATATAAGTGCATATGTCAATAACTATAAAATTATATACAAATT 130378361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTATACTTTCTATATTCATATAAGTGCATATGTCAATAACTATAAAATTATATACAAATT 2580

130378362 ATAATTATGTTATAGAATACAATTTCATTTAACTTTGCTTGTGGCGAATACCAAACAGAA 130378421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATAATTATGTTATAGAATACAATTTCATTTAACTTTGCTTGTGGCGAATACCAAACAGAA 2640

130378422 CTTAAAAATTCTCAATTCTGTCAAATTTATCTATTTTATATGATTTCTGCATTTTGAGTC 130378481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTTAAAAATTCTCAATTCTGTCAAATTTATCTATTTTATATGATTTCTGCATTTTGAGTC 2700

130378482 TTGCTTAAAAAGTCTTTTTCCTCTCTGAAATTATTTCTACTATATTTTCTTCTAATAACT 130378541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTGCTTAAAAAGTCTTTTTCCTCTCTGAAATTATTTCTACTATATTTTCTTCTAATAACT 2760

130378542 TATAGTTTTGCTTTTTTATAGAACTCCTTAATCCACTGGGAATTTATGTTTATTTTGTGA 130378601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TATAGTTTTGCTTTTTTATAGAACTCCTTAATCCACTGGGAATTTATGTTTATTTTGTGA 2820

130378602 GGAAGGGATCTCCATCTCCAGCTGAGTCTATGTGTGTTTACGTGTGTGTATACACATATA 130378661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGAAGGGATCTCCATCTCCAGCTGAGTCTATGTGTGTTTACGTGTGTGTATACACATATA 2880

130378662 TATGTTTTATATATACATGTATATTTACATGTAATACATATTTATTCACAAATATTCTTA 130378721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TATGTTTTATATATACATGTATATTTACATGTAATACATATTTATTCACAAATATTCTTA 2940

130378722 CCAATCATGAAATGTCCTAACATTTACTGAAGCGTACATCATCTCCCCACTAATTAGAGA 130378781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCAATCATGAAATGTCCTAACATTTACTGAAGCGTACATCATCTCCCCACTAATTAGAGA 3000

130378782 CACTTCTTTATTAATCATATAATGAATTTCCTTTTATTTACATGGATCTGGTTTATGATC 130378841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CACTTCTTTATTAATCATATAATGAATTTCCTTTTATTTACATGGATCTGGTTTATGATC 3060

130378842 CTATGTTCTGTTTCACTGACCTCGTTGGCTATTCCTGTGTCAATACTATATTGTCTGAAT 130378901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTATGTTCTGTTTCACTGACCTCGTTGGCTATTCCTGTGTCAATACTATATTGTCTGAAT 3120

130378902 AAACTGTAAGTTTCTAACATACTTTGATGTCTGATAGACTAAATCATTTTTTGGTTTCCT 130378961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAACTGTAAGTTTCTAACATACTTTGATGTCTGATAGACTAAATCATTTTTTGGTTTCCT 3180

130378962 TTTCCAAAATTGTCTTGACTATTTTCATACAATTTCTTTTCTTGGTGAATTTTAGAATCA 130379021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTCCAAAATTGTCTTGACTATTTTCATACAATTTCTTTTCTTGGTGAATTTTAGAATCA 3240

130379022 GCTTCAAATTCTGTAAATATTCCTACCTAGGTTTTGATTGTAATTGAATTTAATATAAAG 130379081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GCTTCAAATTCTGTAAATATTCCTACCTAGGTTTTGATTGTAATTGAATTTAATATAAAG 3300

130379082 AATAATTTGGATAGAAATGACATTTCTATAACAGTGATTCATCCCATCCAGGAACATTAT 130379141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AATAATTTGGATAGAAATGACATTTCTATAACAGTGATTCATCCCATCCAGGAACATTAT 3360

130379142 AAGTCTCTTGATTTATTAAGTTCTTCTTTTAAGACCTTCAGTAAAGTTTAGAATTTCCTT 130379201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAGTCTCTTGATTTATTAAGTTCTTCTTTTAAGACCTTCAGTAAAGTTTAGAATTTCCTT 3420

130379202 AGACAGGTCTCGAATATGTCTTCTTAGGTTTATTCAGGCTTGAATGTGTTTTATTACATT 130379261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGACAGGTCTCGAATATGTCTTCTTAGGTTTATTCAGGCTTGAATGTGTTTTATTACATT 3480

130379262 TCTTCCTAAGTATTTCATTACATTTTTCCTACTGTGATTTTTTTTTCCTGTTACATTTTC 130379321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCTTCCTAAGTATTTCATTACATTTTTCCTACTGTGATTTTTTTTTCCTGTTACATTTTC 3540

130379322 AAATCTGTTGCTTCATTTATTTTATTTTTTCAAGAAATATTACTTGGGTGCCCACAATAT 130379381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAATCTGTTGCTTCATTTATTTTATTTTTTCAAGAAATATTACTTGGGTGCCCACAATAT 3600

130379382 GCCAGACATTGTGTTTGGCCCTGGGGATTAAAATGG 130379417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GCCAGACATTGTGTTTGGCCCTGGGGATTAAAATGG 3636

Alignment time is 2.34379 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [130367774,130388654] =>     20881 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2206] =>      2206 nucs 'mol-32-32fb-066758_2206'

Score:        2206
Aligned:      2206        nucs
Identic:      2206 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [130376449,130378654]
 second seq =>  [        1,     2206]

130376449 AGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGTATTATTATTACCATTTTAACG 130376508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGTATTATTATTACCATTTTAACG 60

130376509 ATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTTA 130376568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTTA 120

130376569 AGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCTATGCTTTAAAAAATAATCACT 130376628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCTATGCTTTAAAAAATAATCACT 180

130376629 ACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTACAGTATTCCAAACTGAA 130376688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTACAGTATTCCAAACTGAA 240

130376689 GAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGGA 130376748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGGA 300

130376749 CACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGAA 130376808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGAA 360

130376809 AGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAAG 130376868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAAG 420

130376869 AATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCAG 130376928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCAG 480

130376929 AAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAATTATACAGAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGACT 130376988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAATTATACAGAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGACT 540

130376989 AAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAAAAGTAATCATTCAGCACCATAAAGCATTAGAT 130377048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAAAAGTAATCATTCAGCACCATAAAGCATTAGAT 600

130377049 GAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAAACATCCAGTATTGTGAT 130377108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAAACATCCAGTATTGTGAT 660

130377109 TACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTTGTTGTGT 130377168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTTGTTGTGT 720

130377169 TCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAGAAGGTAC 130377228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAGAAGGTAC 780

130377229 TGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAACATCACAAAATGACTTCTATTGTTGG 130377288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAACATCACAAAATGACTTCTATTGTTGG 840

130377289 ATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACTCCCTGAC 130377348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACTCCCTGAC 900

130377349 CTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACTAATTAACCATGTGACCT 130377408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACTAATTAACCATGTGACCT 960

130377409 TGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTGGGAGTTG 130377468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTGGGAGTTG 1020

130377469 CAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTATTT 130377528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTATTT 1080

130377529 TTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAAGAATACC 130377588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAAGAATACC 1140

130377589 AAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAGATACAAATTATATTTGTAGCA 130377648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAGATACAAATTATATTTGTAGCA 1200

130377649 TCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTCATATAGATACATGTAGTTTCTGGGGT 130377708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTCATATAGATACATGTAGTTTCTGGGGT 1260

130377709 TATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTTTTGTTTC 130377768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTTTTGTTTC 1320

130377769 CATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTACATATAAATCTATTTCATTCT 130377828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTACATATAAATCTATTTCATTCT 1380

130377829 TTTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACCATCATTTGTTTAGCTATTTTTCACTG 130377888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACCATCATTTGTTTAGCTATTTTTCACTG 1440

130377889 ATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAGCACAGTTCTGCAGTGGACAGCCTTGGGCATCT 130377948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATAGCACAGTTCTGCAGTGGACAGCCTTGGGCATCT 1500

130377949 CCTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTTTAGGGTATATTATTTGATGTGGAATTGCTAGGC 130378008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTTTAGGGTATATTATTTGATGTGGAATTGCTAGGC 1560

130378009 TTTAACATTTCAGTTTTATTCCACACTGTCAAATTGCTCTCTAAACTACTAGTGCCAATT 130378068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTAACATTTCAGTTTTATTCCACACTGTCAAATTGCTCTCTAAACTACTAGTGCCAATT 1620

130378069 TACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACAAGTTGATCAACACTCGATATGGTCAGACATTTT 130378128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACAAGTTGATCAACACTCGATATGGTCAGACATTTT 1680

130378129 CATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAAGTTATCTCTGGTAACTTGGAAAGGTAAACGTTT 130378188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAAGTTATCTCTGGTAACTTGGAAAGGTAAACGTTT 1740

130378189 TTTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCATTTCCTGTTTGCTGGTCAGTTGCTCATTATATCC 130378248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCATTTCCTGTTTGCTGGTCAGTTGCTCATTATATCC 1800

130378249 CTTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTTTATATTTTTGGTATTGATATGAAGGATTATACT 130378308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTTTATATTTTTGGTATTGATATGAAGGATTATACT 1860

130378309 TTCTATATTCATATAAGTGCATATGTCAATAACTATAAAATTATATACAAATTATAATTA 130378368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTCTATATTCATATAAGTGCATATGTCAATAACTATAAAATTATATACAAATTATAATTA 1920

130378369 TGTTATAGAATACAATTTCATTTAACTTTGCTTGTGGCGAATACCAAACAGAACTTAAAA 130378428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTTATAGAATACAATTTCATTTAACTTTGCTTGTGGCGAATACCAAACAGAACTTAAAA 1980

130378429 ATTCTCAATTCTGTCAAATTTATCTATTTTATATGATTTCTGCATTTTGAGTCTTGCTTA 130378488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTCTCAATTCTGTCAAATTTATCTATTTTATATGATTTCTGCATTTTGAGTCTTGCTTA 2040

130378489 AAAAGTCTTTTTCCTCTCTGAAATTATTTCTACTATATTTTCTTCTAATAACTTATAGTT 130378548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAAGTCTTTTTCCTCTCTGAAATTATTTCTACTATATTTTCTTCTAATAACTTATAGTT 2100

130378549 TTGCTTTTTTATAGAACTCCTTAATCCACTGGGAATTTATGTTTATTTTGTGAGGAAGGG 130378608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGCTTTTTTATAGAACTCCTTAATCCACTGGGAATTTATGTTTATTTTGTGAGGAAGGG 2160

130378609 ATCTCCATCTCCAGCTGAGTCTATGTGTGTTTACGTGTGTGTATAC 130378654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATCTCCATCTCCAGCTGAGTCTATGTGTGTTTACGTGTGTGTATAC 2206

Alignment time is 1.77561 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [130367774,130388654] =>     20881 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2305] =>      2305 nucs 'mol-32-3311-002355_2305'

Score:        2305
Aligned:      2305        nucs
Identic:      2305 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [130375608,130377912]
 second seq =>  [        1,     2305]

130375608 TAAATGTCCTTGTATGAGAACATGATCTCTGAATGCTGTCTTCTACACGACCCTCTTCCT 130375667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAATGTCCTTGTATGAGAACATGATCTCTGAATGCTGTCTTCTACACGACCCTCTTCCT 60

130375668 GTGTCCTCTCTAGGAGTGGGTGCCCATGTGCACTGCAGTGACCTTTTCTTCTCTCTAGTC 130375727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGTCCTCTCTAGGAGTGGGTGCCCATGTGCACTGCAGTGACCTTTTCTTCTCTCTAGTC 120

130375728 TTCTTTGAAAGCTTGTTTTCTCTGGTTGTTTTTCTTCGAACAGACTTGATATAGAAATTC 130375787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTTTGAAAGCTTGTTTTCTCTGGTTGTTTTTCTTCGAACAGACTTGATATAGAAATTC 180

130375788 ACACTGTGGTGTGAATGGATAAAAACAACTTAATACTGTACCCCTTATGAGGTATTTGCA 130375847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACACTGTGGTGTGAATGGATAAAAACAACTTAATACTGTACCCCTTATGAGGTATTTGCA 240

130375848 TTTTAACGAAGACCAGCCACTCAATTTGGAGACATACGTTCTTCTTTTTAAATTTCCATC 130375907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTAACGAAGACCAGCCACTCAATTTGGAGACATACGTTCTTCTTTTTAAATTTCCATC 300

130375908 CCAATAATCAATCTGTTTTTCAGAAACTTATGCACAAAGTCCCAGATTACAGGTCTTCTA 130375967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCAATAATCAATCTGTTTTTCAGAAACTTATGCACAAAGTCCCAGATTACAGGTCTTCTA 360

130375968 GACTTAAATTCTAATGGGAACATTGTAAATTTGACTCTTCGGGAAATATTTTAAATAGTG 130376027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACTTAAATTCTAATGGGAACATTGTAAATTTGACTCTTCGGGAAATATTTTAAATAGTG 420

130376028 GGAGCTCTTTCTCTTCCCTAACAATTTCCAACTCTGGCACAGCTGCTCAATGTGAAGTTT 130376087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAGCTCTTTCTCTTCCCTAACAATTTCCAACTCTGGCACAGCTGCTCAATGTGAAGTTT 480

130376088 GTAATTTCTCCTTCCTTCCCAGAAGTACTTTTGGCTCAGCTTAATCTATTATGCCTTTGC 130376147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAATTTCTCCTTCCTTCCCAGAAGTACTTTTGGCTCAGCTTAATCTATTATGCCTTTGC 540

130376148 AGTCGCCATTGAATGCCTCTAGTCCATGCAGAGTGGAATTGAGAACTGAAGTTGGACTTC 130376207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTCGCCATTGAATGCCTCTAGTCCATGCAGAGTGGAATTGAGAACTGAAGTTGGACTTC 600

130376208 CGTCATCCTTGGGGTATGAAGATAGGATAGGAATTGATCCGATTCTGGTTGGTTGTTGAG 130376267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CGTCATCCTTGGGGTATGAAGATAGGATAGGAATTGATCCGATTCTGGTTGGTTGTTGAG 660

130376268 ACAAGAATAACTTGGCCTCTCCTCATGTGTGAGTACTGTGGGCAGACAAGCTCATATGTC 130376327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAAGAATAACTTGGCCTCTCCTCATGTGTGAGTACTGTGGGCAGACAAGCTCATATGTC 720

130376328 CCCTCACATGTGCATGTAACCGCATGTGGTCTTACACATATTTGAGGCTAAGGATATTGT 130376387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCTCACATGTGCATGTAACCGCATGTGGTCTTACACATATTTGAGGCTAAGGATATTGT 780

130376388 GGGGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAATAAAGACTCAGCATGTTTCAGACACTGTGCTA 130376447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAATAAAGACTCAGCATGTTTCAGACACTGTGCTA 840

130376448 AAGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGTATTATTATTACCATTTTAAC 130376507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTGTATGAGATAGGTATTATTATTACCATTTTAAC 900

130376508 GATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTT 130376567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTTAAATAAATTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTT 960

130376568 AAGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCTATGCTTTAAAAAATAATCAC 130376627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTTGATCCACAACCTATGCTTTAAAAAATAATCAC 1020

130376628 TACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTACAGTATTCCAAACTGA 130376687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTACAGTATTCCAAACTGA 1080

130376688 AGAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGG 130376747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCTAGAAATAAGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGG 1140

130376748 ACACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGA 130376807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGA 1200

130376808 AAGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAA 130376867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAA 1260

130376868 GAATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCA 130376927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTATTTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCA 1320

130376928 GAAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAATTATACAGAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGAC 130376987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAATTATACAGAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGAC 1380

130376988 TAAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAAAAGTAATCATTCAGCACCATAAAGCATTAGA 130377047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATAAAAGTAATCATTCAGCACCATAAAGCATTAGA 1440

130377048 TGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAAACATCCAGTATTGTGA 130377107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAAACATCCAGTATTGTGA 1500

130377108 TTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTTGTTGTG 130377167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTTGTTGTG 1560

130377168 TTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAGAAGGTA 130377227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAGAAGGTA 1620

130377228 CTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAACATCACAAAATGACTTCTATTGTTG 130377287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATCCCAGTAACATCACAAAATGACTTCTATTGTTG 1680

130377288 GATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACTCCCTGA 130377347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACTCCCTGA 1740

130377348 CCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACTAATTAACCATGTGACC 130377407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACTAATTAACCATGTGACC 1800

130377408 TTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTGGGAGTT 130377467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTGGGAGTT 1860

130377468 GCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTATT 130377527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTATT 1920

130377528 TTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAAGAATAC 130377587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAAGAATAC 1980

130377588 CAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAGATACAAATTATATTTGTAGC 130377647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCATCTCTCTTCTGAGATACAAATTATATTTGTAGC 2040

130377648 ATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTCATATAGATACATGTAGTTTCTGGGG 130377707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATCTGTAGTCATATAGATACATGTAGTTTCTGGGG 2100

130377708 TTATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTTTTGTTT 130377767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTATTTTAAAAATATATGATATCAAACTGTGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTTTTGTTT 2160

130377768 CCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTACATATAAATCTATTTCATTC 130377827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATTTTCATGTCAGTACATATAAATCTATTTCATTC 2220

130377828 TTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACCATCATTTGTTTAGCTATTTTTCACT 130377887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATACAGTACCATCATTTGTTTAGCTATTTTTCACT 2280

130377888 GATAAGTATTTGTTTACAAATAATC 130377912
          |||||||||||||||||||||||||
     2281 GATAAGTATTTGTTTACAAATAATC 2305

Alignment time is 2.20003 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [130367774,130388654] =>     20881 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     3282] =>      3282 nucs 'mol-32-34be-170241_3282'

Score:        2157
Aligned:      2157        nucs
Identic:      2157 (100%) nucs =>      2144 (100%)        13 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [130375807,130377950] EXCISED REGION [130378588,130378600]
 second seq =>  [       26,     2169] EXCISED REGION [     3249,     3261]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       637 nucs [130377951,130378587]
 second seq =>      1079 nucs [2170,3248]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>      5403 nucs [130377951,130383353]
 second seq =>      1071 nucs [2170,3240]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [130377951,130377951] to [130378588,130378588]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

130375807 TAAAAACAACTTAATACTGTACCCCTTATGAGGTATTTGCATTTTAACGAAGACCAGCCA 130375866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       26 TAAAAACAACTTAATACTGTACCCCTTATGAGGTATTTGCATTTTAACGAAGACCAGCCA 85

130375867 CTCAATTTGGAGACATACGTTCTTCTTTTTAAATTTCCATCCCAATAATCAATCTGTTTT 130375926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       86 CTCAATTTGGAGACATACGTTCTTCTTTTTAAATTTCCATCCCAATAATCAATCTGTTTT 145

130375927 TCAGAAACTTATGCACAAAGTCCCAGATTACAGGTCTTCTAGACTTAAATTCTAATGGGA 130375986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      146 TCAGAAACTTATGCACAAAGTCCCAGATTACAGGTCTTCTAGACTTAAATTCTAATGGGA 205

130375987 ACATTGTAAATTTGACTCTTCGGGAAATATTTTAAATAGTGGGAGCTCTTTCTCTTCCCT 130376046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      206 ACATTGTAAATTTGACTCTTCGGGAAATATTTTAAATAGTGGGAGCTCTTTCTCTTCCCT 265

130376047 AACAATTTCCAACTCTGGCACAGCTGCTCAATGTGAAGTTTGTAATTTCTCCTTCCTTCC 130376106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      266 AACAATTTCCAACTCTGGCACAGCTGCTCAATGTGAAGTTTGTAATTTCTCCTTCCTTCC 325

130376107 CAGAAGTACTTTTGGCTCAGCTTAATCTATTATGCCTTTGCAGTCGCCATTGAATGCCTC 130376166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      326 CAGAAGTACTTTTGGCTCAGCTTAATCTATTATGCCTTTGCAGTCGCCATTGAATGCCTC 385

130376167 TAGTCCATGCAGAGTGGAATTGAGAACTGAAGTTGGACTTCCGTCATCCTTGGGGTATGA 130376226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      386 TAGTCCATGCAGAGTGGAATTGAGAACTGAAGTTGGACTTCCGTCATCCTTGGGGTATGA 445

130376227 AGATAGGATAGGAATTGATCCGATTCTGGTTGGTTGTTGAGACAAGAATAACTTGGCCTC 130376286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      446 AGATAGGATAGGAATTGATCCGATTCTGGTTGGTTGTTGAGACAAGAATAACTTGGCCTC 505

130376287 TCCTCATGTGTGAGTACTGTGGGCAGACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTGCATGTAA 130376346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      506 TCCTCATGTGTGAGTACTGTGGGCAGACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTGCATGTAA 565

130376347 CCGCATGTGGTCTTACACATATTTGAGGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCTGAAAGAT 130376406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      566 CCGCATGTGGTCTTACACATATTTGAGGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCTGAAAGAT 625

130376407 GGGCAATAATAAAGACTCAGCATGTTTCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGTATCCTCA 130376466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      626 GGGCAATAATAAAGACTCAGCATGTTTCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGTATCCTCA 685

130376467 AAACCTTTGTATGAGATAGGTATTATTATTACCATTTTAACGATGAAGAAACAGAATCTC 130376526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      686 AAACCTTTGTATGAGATAGGTATTATTATTACCATTTTAACGATGAAGAAACAGAATCTC 745

130376527 AGATATGTTAAATAAATTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGATTTGTAC 130376586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      746 AGATATGTTAAATAAATTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGATTTGTAC 805

130376587 CTCAGTCTTGATCCACAACCTATGCTTTAAAAAATAATCACTACAATATACTACTTTGCA 130376646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      806 CTCAGTCTTGATCCACAACCTATGCTTTAAAAAATAATCACTACAATATACTACTTTGCA 865

130376647 TAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTACAGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAAGCTTGAA 130376706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      866 TAGGAGTAGGTAGATAGATGAGGTACAGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAAGCTTGAA 925

130376707 CAATGTCCTAGAAATAAGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGCCCAGTCC 130376766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      926 CAATGTCCTAGAAATAAGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGCCCAGTCC 985

130376767 AGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGCAACGGTT 130376826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      986 AGTGTAACCAGAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGCAACGGTT 1045

130376827 GTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTCTCTCCTT 130376886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1046 GTCTGGGGTCATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTCTCTCCTT 1105

130376887 TATCTAGTATTTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAATGAAAATA 130376946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1106 TATCTAGTATTTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAATGAAAATA 1165

130376947 TTTTCAGAATTATACAGAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAACAGAAACA 130377006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1166 TTTTCAGAATTATACAGAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAACAGAAACA 1225

130377007 TATTTAATAAAAGTAATCATTCAGCACCATAAAGCATTAGATGAAGTCTATTGTGAATTG 130377066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1226 TATTTAATAAAAGTAATCATTCAGCACCATAAAGCATTAGATGAAGTCTATTGTGAATTG 1285

130377067 TTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAAACATCCAGTATTGTGATTACCAAGGTAATTTGTCT 130377126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1286 TTTTCCCTGTGCACACACAGAGAAAACATCCAGTATTGTGATTACCAAGGTAATTTGTCT 1345

130377127 TAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTTGTTGTGTTCCATTCTACAGGGGCCA 130377186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1346 TAAGGTTAATAGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTTGTTGTGTTCCATTCTACAGGGGCCA 1405

130377187 AAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAGAAGGTACTGGTCTAATAATCCCAAA 130377246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1406 AAAGGTTCTGTTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAGAAGGTACTGGTCTAATAATCCCAAA 1465

130377247 ATGACAATCCCAGTAACATCACAAAATGACTTCTATTGTTGGATGGAACAAGTGGGAATC 130377306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1466 ATGACAATCCCAGTAACATCACAAAATGACTTCTATTGTTGGATGGAACAAGTGGGAATC 1525

130377307 TAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACTCCCTGACCTGGGAGACCACAGGCCT 130377366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1526 TAGGTAATAATGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACTCCCTGACCTGGGAGACCACAGGCCT 1585

130377367 GGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACTAATTAACCATGTGACCTTGAAACAGTCACTCAGTT 130377426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1586 GGACTCCAATTCTAGTTCTGCCACTAATTAACCATGTGACCTTGAAACAGTCACTCAGTT 1645

130377427 GCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTGGGAGTTGCAGGAGAGTCCCTGCCTG 130377486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1646 GCTCTTGAGCTCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTGGGAGTTGCAGGAGAGTCCCTGCCTG 1705

130377487 CCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTATTTTTAAAAATTTCACAAGTA 130377546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 CCTTCCTTGTCACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTATTTTTAAAAATTTCACAAGTA 1765

130377547 TTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAAGAATACCAAAATCCCCATTCAGCTC 130377606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 TTATGTGGATCTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAAGAATACCAAAATCCCCATTCAGCTC 1825

130377607 CCACTTCATCTCTCTTCTGAGATACAAATTATATTTGTAGCATCATTTTCCAGACAATTG 130377666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 CCACTTCATCTCTCTTCTGAGATACAAATTATATTTGTAGCATCATTTTCCAGACAATTG 1885

130377667 TTATGTATCTGTAGTCATATAGATACATGTAGTTTCTGGGGTTATTTTAAAAATATATGA 130377726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 TTATGTATCTGTAGTCATATAGATACATGTAGTTTCTGGGGTTATTTTAAAAATATATGA 1945

130377727 TATCAAACTGTGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTTTTGTTTCCATTGAACAGCATGTCTT 130377786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 TATCAAACTGTGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTTTTGTTTCCATTGAACAGCATGTCTT 2005

130377787 GGGGATATTTTCATGTCAGTACATATAAATCTATTTCATTCTTTTTAACTGCTACATAGT 130377846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 GGGGATATTTTCATGTCAGTACATATAAATCTATTTCATTCTTTTTAACTGCTACATAGT 2065

130377847 ATGCATATACAGTACCATCATTTGTTTAGCTATTTTTCACTGATAAGTATTTGTTTACAA 130377906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 ATGCATATACAGTACCATCATTTGTTTAGCTATTTTTCACTGATAAGTATTTGTTTACAA 2125

130377907 ATAATCATAGCACAGTTCTGCAGTGGACAGCCTTGGGCATCTCC 130377950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 ATAATCATAGCACAGTTCTGCAGTGGACAGCCTTGGGCATCTCC 2169

EXCISED REGION

130378588 TGTTTATTTTGTG 130378600
          |||||||||||||
     3249 TGTTTATTTTGTG 3261

Alignment time is 2.51709 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [130367774,130388654] =>     20881 nucs 'X dna:chromosome chromosome:GRCh37:X:1:155270560:1'
Second seq [        1,     2157] =>      2157 nucs 'mol-32-34d4-034745_2157'

Score:        2157
Aligned:      2157        nucs
Identic:      2157 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [130376296,130378452]
 second seq =>  [        1,     2157]

130376296 GTGAGTACTGTGGGCAGACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTGCATGTAACCGCATGTG 130376355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGAGTACTGTGGGCAGACAAGCTCATATGTCCCCTCACATGTGCATGTAACCGCATGTG 60

130376356 GTCTTACACATATTTGAGGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAA 130376415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTCTTACACATATTTGAGGCTAAGGATATTGTGGGGGGATTGCTGAAAGATGGGCAATAA 120

130376416 TAAAGACTCAGCATGTTTCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTG 130376475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAAGACTCAGCATGTTTCAGACACTGTGCTAAAGGAGCTATGTATCCTCAAAACCTTTG 180

130376476 TATGAGATAGGTATTATTATTACCATTTTAACGATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTT 130376535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATGAGATAGGTATTATTATTACCATTTTAACGATGAAGAAACAGAATCTCAGATATGTT 240

130376536 AAATAAATTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTT 130376595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATAAATTGCTTAAAATCACAAAGAAAATTTAAGAGACTGGGATTTGTACCTCAGTCTT 300

130376596 GATCCACAACCTATGCTTTAAAAAATAATCACTACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAG 130376655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATCCACAACCTATGCTTTAAAAAATAATCACTACAATATACTACTTTGCATAGGAGTAG 360

130376656 GTAGATAGATGAGGTACAGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCT 130376715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTAGATAGATGAGGTACAGTATTCCAAACTGAAGAGAGATACAAGCTTGAACAATGTCCT 420

130376716 AGAAATAAGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACC 130376775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAAATAAGAATGGACAAGATGTGCTTTAGGGACACTAAGTAGCCCAGTCCAGTGTAACC 480

130376776 AGAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGT 130376835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAGGCAAGAGTTCTTGTAGGGCAGTAGAGGAAAGAATTCCTGCAACGGTTGTCTGGGGT 540

130376836 CATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTA 130376895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATGTTGTGGAGGGTACAAATGTTGATCCAAAGAATAGCTTCTCTCTCCTTTATCTAGTA 600

130376896 TTTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAA 130376955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTCAATTATTAAGGAGCTAAAGAGGTTTTCAGAAAGTATAAATGAAAATATTTTCAGAA 660

130376956 TTATACAGAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATA 130377015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTATACAGAGGACTTGGAGATAAGTGAAAGACTAAAGTCCTAACAGAAACATATTTAATA 720

130377016 AAAGTAATCATTCAGCACCATAAAGCATTAGATGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTG 130377075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGTAATCATTCAGCACCATAAAGCATTAGATGAAGTCTATTGTGAATTGTTTTCCCTG 780

130377076 TGCACACACAGAGAAAACATCCAGTATTGTGATTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAA 130377135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCACACACAGAGAAAACATCCAGTATTGTGATTACCAAGGTAATTTGTCTTAAGGTTAA 840

130377136 TAGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTTGTTGTGTTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCT 130377195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGATGGTTGGAGAAAATGATGTTTTGTTGTGTTCCATTCTACAGGGGCCAAAAGGTTCT 900

130377196 GTTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAGAAGGTACTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATC 130377255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTTTGGCCTGTATAGCATTTACAAAGAAGGTACTGGTCTAATAATCCCAAAATGACAATC 960

130377256 CCAGTAACATCACAAAATGACTTCTATTGTTGGATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATA 130377315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCAGTAACATCACAAAATGACTTCTATTGTTGGATGGAACAAGTGGGAATCTAGGTAATA 1020

130377316 ATGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACTCCCTGACCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAA 130377375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGGAAATGGCTTCCTATGTGGCACTCCCTGACCTGGGAGACCACAGGCCTGGACTCCAA 1080

130377376 TTCTAGTTCTGCCACTAATTAACCATGTGACCTTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAG 130377435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCTAGTTCTGCCACTAATTAACCATGTGACCTTGAAACAGTCACTCAGTTGCTCTTGAG 1140

130377436 CTCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTGGGAGTTGCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTG 130377495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCAGTTTTCTCACTTATAAAATGTGGGAGTTGCAGGAGAGTCCCTGCCTGCCTTCCTTG 1200

130377496 TCACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTATTTTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGA 130377555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCACTTTTTCTTTTGTGTTTTTAAAACGTATTTTTAAAAATTTCACAAGTATTATGTGGA 1260

130377556 TCTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAAGAATACCAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCAT 130377615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTTTTCTCATTGTAAAAATGTTAAAGAATACCAAAATCCCCATTCAGCTCCCACTTCAT 1320

130377616 CTCTCTTCTGAGATACAAATTATATTTGTAGCATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATC 130377675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCTCTTCTGAGATACAAATTATATTTGTAGCATCATTTTCCAGACAATTGTTATGTATC 1380

130377676 TGTAGTCATATAGATACATGTAGTTTCTGGGGTTATTTTAAAAATATATGATATCAAACT 130377735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTAGTCATATAGATACATGTAGTTTCTGGGGTTATTTTAAAAATATATGATATCAAACT 1440

130377736 GTGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTTTTGTTTCCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATT 130377795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTGTGTATTGTTCCACAAGTCAATTTTTGTTTCCATTGAACAGCATGTCTTGGGGATATT 1500

130377796 TTCATGTCAGTACATATAAATCTATTTCATTCTTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATA 130377855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCATGTCAGTACATATAAATCTATTTCATTCTTTTTAACTGCTACATAGTATGCATATA 1560

130377856 CAGTACCATCATTTGTTTAGCTATTTTTCACTGATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATA 130377915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAGTACCATCATTTGTTTAGCTATTTTTCACTGATAAGTATTTGTTTACAAATAATCATA 1620

130377916 GCACAGTTCTGCAGTGGACAGCCTTGGGCATCTCCTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTT 130377975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCACAGTTCTGCAGTGGACAGCCTTGGGCATCTCCTTGTATGCATGTGCAAGTGTTTCTT 1680

130377976 TAGGGTATATTATTTGATGTGGAATTGCTAGGCTTTAACATTTCAGTTTTATTCCACACT 130378035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGGGTATATTATTTGATGTGGAATTGCTAGGCTTTAACATTTCAGTTTTATTCCACACT 1740

130378036 GTCAAATTGCTCTCTAAACTACTAGTGCCAATTTACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACA 130378095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTCAAATTGCTCTCTAAACTACTAGTGCCAATTTACACACCTGCTGGCAGTTTCATTACA 1800

130378096 AGTTGATCAACACTCGATATGGTCAGACATTTTCATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAA 130378155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGTTGATCAACACTCGATATGGTCAGACATTTTCATTTGCCAGTCTTATGGATGAAGAAA 1860

130378156 GTTATCTCTGGTAACTTGGAAAGGTAAACGTTTTTTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCAT 130378215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTTATCTCTGGTAACTTGGAAAGGTAAACGTTTTTTCCTATGTTTCTTATCCATTTGCAT 1920

130378216 TTCCTGTTTGCTGGTCAGTTGCTCATTATATCCCTTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTT 130378275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCCTGTTTGCTGGTCAGTTGCTCATTATATCCCTTGTCCATTCATTAGAATGGATTGTT 1980

130378276 TATATTTTTGGTATTGATATGAAGGATTATACTTTCTATATTCATATAAGTGCATATGTC 130378335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATATTTTTGGTATTGATATGAAGGATTATACTTTCTATATTCATATAAGTGCATATGTC 2040

130378336 AATAACTATAAAATTATATACAAATTATAATTATGTTATAGAATACAATTTCATTTAACT 130378395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATAACTATAAAATTATATACAAATTATAATTATGTTATAGAATACAATTTCATTTAACT 2100

130378396 TTGCTTGTGGCGAATACCAAACAGAACTTAAAAATTCTCAATTCTGTCAAATTTATC 130378452
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGCTTGTGGCGAATACCAAACAGAACTTAAAAATTCTCAATTCTGTCAAATTTATC 2157

Alignment time is 1.40559 s

