
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [35745597,35768790] =>     23194 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    2918] =>      2918 nucs 'mol-32-287f-090909_2918'

Score:        2784
Aligned:      2864        nucs
Identic:      2851 (100%) nucs =>       256 (100%)      2595 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [35755341,35755597] EXCISED REGION [35758791,35761393]
 second seq =>  [       1,     257] EXCISED REGION [     316,    2918]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3193 nucs [35755598,35758790]
 second seq =>        58 nucs [258,315]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [258,258] to [316,316]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 35755341 AAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACATGCGCCACCATGC 35755400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACATGCGCCACCATGC 60

 35755401 CCTGCTAATTTTGTATTTTTAGTTGAGATGTGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGTCTCG 35755460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTGCTAATTTTGTATTTTTAGTTGAGATGTGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGTCTCG 120

 35755461 AACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTATGGGAT 35755520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTATGGGAT 180

 35755521 TACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGACTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTGGCACTGTTGCC 35755580
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGGCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTGGCACTGTTGCC 240

 35755581 CAGGCTGGAGTGCAGTG 35755597
          |||||||||||||||||
      241 CAGGCTGGAGTGCAGTG 257

EXCISED REGION

 35758791 AGCCTCCCGGGTAGCTGGGATTACAGGTGCA----TGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTG 35758846
          |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||
      316 AGCCTCCCGGGTAGCTGGGATTACAGG----CGCCTGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTG 371

 35758847 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTAGTCTCGAACTACTGACTT 35758906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      372 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTAGTCTCGAACTACTGACTT 431

 35758907 CAAGTGACCCACCCACATCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTACTGCA 35758966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      432 CAAGTGACCCACCCACATCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTACTGCA 491

 35758967 TCGGGCTTTCATCATATCCTTATGAAACGCTTATGAATTAGACATTATTATTTTCATTTT 35759026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      492 TCGGGCTTTCATCATATCCTTATGAAACGCTTATGAATTAGACATTATTATTTTCATTTT 551

 35759027 ACATAGGAGGAGAAAGGAGATGCAGGAAGATAATAACTTCCCTAAATTCTTTTTTTTTTT 35759086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      552 ACATAGGAGGAGAAAGGAGATGCAGGAAGATAATAACTTCCCTAAATTCTTTTTTTTTTT 611

 35759087 TAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGGATCTCGGCTCACG 35759146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      612 TAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGGATCTCGGCTCACG 671

 35759147 GCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTGGGA 35759206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      672 GCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTGGGA 731

 35759207 TTATAAGCATGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 35759266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      732 TTATAAGCATGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 791

 35759267 CACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCCGCCTCAGCC 35759326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 CACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCCGCCTCAGCC 851

 35759327 TCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCCTAAATTCTTAAAGGT 35759386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 TCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCCTAAATTCTTAAAGGT 911

 35759387 GATAAGGAGTGGAGACAGAATTCAAATTCAGGAAAGTTTCAAAGTCCATGCTTGCTTTTT 35759446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 GATAAGGAGTGGAGACAGAATTCAAATTCAGGAAAGTTTCAAAGTCCATGCTTGCTTTTT 971

 35759447 CAATTATATTAAACAATGCCAAGTTCCTTGCATATTCCAAGCATTTATTGGGCACCTGTT 35759506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 CAATTATATTAAACAATGCCAAGTTCCTTGCATATTCCAAGCATTTATTGGGCACCTGTT 1031

 35759507 GGTTGCACAAGAGTATAGACTGCCTGTCACCAAATGATGCAAAATAATTTAGGAGCCTGT 35759566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 GGTTGCACAAGAGTATAGACTGCCTGTCACCAAATGATGCAAAATAATTTAGGAGCCTGT 1091

 35759567 TTTGACAGTCACAAGATGGAGGTCCTGTACATTAGGCAGAAAAGTATGCAGCTAGGCAGC 35759626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 TTTGACAGTCACAAGATGGAGGTCCTGTACATTAGGCAGAAAAGTATGCAGCTAGGCAGC 1151

 35759627 CTAGTAGGCATTTTAGAATTGTCTGATAAACCGAGCCACTTAGCAACAATATATTTCTAG 35759686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 CTAGTAGGCATTTTAGAATTGTCTGATAAACCGAGCCACTTAGCAACAATATATTTCTAG 1211

 35759687 TTCACCTAATTTTTTGGGTTCTGCCCAAAGGCTGGTGACTCATGAGACAGATATTCCGCA 35759746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 TTCACCTAATTTTTTGGGTTCTGCCCAAAGGCTGGTGACTCATGAGACAGATATTCCGCA 1271

 35759747 CTCTGTGTACATGAGAAAGAAGTCAGTAAGGTGAGGAAGAAGCAGAAGAGATGGGTAACG 35759806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 CTCTGTGTACATGAGAAAGAAGTCAGTAAGGTGAGGAAGAAGCAGAAGAGATGGGTAACG 1331

 35759807 AAGGCCTGGATTCACGAAAACTGTTTAATGGCCATGGTATTATGAAAATCCTGATACCAG 35759866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 AAGGCCTGGATTCACGAAAACTGTTTAATGGCCATGGTATTATGAAAATCCTGATACCAG 1391

 35759867 CCAACTCTTGAGTGTTAAATAATGAGAGTCAGTTTATTAGTTATATTTGGACAGATCTGG 35759926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 CCAACTCTTGAGTGTTAAATAATGAGAGTCAGTTTATTAGTTATATTTGGACAGATCTGG 1451

 35759927 TTTTTTGCTTTATTTTTATAAATAATGTTCTAAGAAATATATTTTATTTAATTTACTTAT 35759986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1452 TTTTTTGCTTTATTTTTATAAATAATGTTCTAAGAAATTTATTTTATTTAATTTACTTAT 1511

 35759987 GGCATATTTAAACATTTTTTGGCAAATAAAAATTGTGTATATTCATGATGTACAACATGT 35760046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 GGCATATTTAAACATTTTTTGGCAAATAAAAATTGTGTATATTCATGATGTACAACATGT 1571

 35760047 GTTGATAGACGTACTCATTGTGGAATGGCTAAATCAAGCTAATTAACAAATCCATTACCT 35760106
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 GTTGATAGATGTACTCATTGTGGAATGGCTAAATCAAGCTAATTAACAAATCCATTACCT 1631

 35760107 CAAATATATACCCATTACCGCAAATACTTATTTTTTTGTGTGGTAAGAACAACTAAAATC 35760166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 CAAATATATACCCATTACCGCAAATACTTATTTTTTTGTGTGGTAAGAACAACTAAAATC 1691

 35760167 TACTCTCTTAGCAATTTTCAAGCATATATATATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTT 35760226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 TACTCTCTTAGCAATTTTCAAGCATATATATATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTT 1751

 35760227 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGCAATCTTGGCTCACT 35760286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGCAATCTTGGCTCACT 1811

 35760287 GCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGA 35760346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 GCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGA 1871

 35760347 TTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 35760406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 TTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 1931

 35760407 ACCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCAAACCCCTGACCTCAGATGACCCACCTGCCTCAGCCT 35760466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 ACCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCAAACCCCTGACCTCAGATGACCCACCTGCCTCAGCCT 1991

 35760467 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCTGGCCTCAAGTATATATTTTTA 35760526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCTGGCCTCAAGTATATATTTTTA 2051

 35760527 ACTATAGTCACCATATAGTATAATAGATCTCCTGCACTTATTCCTGCTGTCTAACTGAAA 35760586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 ACTATAGTCACCATATAGTATAATAGATCTCCTGCACTTATTCCTGCTGTCTAACTGAAA 2111

 35760587 TTTTGTATCCTTTGGCCAAAATCTTCCAATTCTTTCTCTCTCATCCCCTGGTAACCACCA 35760646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 TTTTGTATCCTTTGGCCAAAATCTTCCAATTCTTTCTCTCTCATCCCCTGGTAACCACCA 2171

 35760647 TTCTGCTACTTCTACAAGCTTGACTTTTTTAGATGCCACACATAAGTGAGATTAAGCAGT 35760706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TTCTGCTACTTCTACAAGCTTGACTTTTTTAGATGCCACACATAAGTGAGATTAAGCAGT 2231

 35760707 ATTTGTTTTTCTGTGCCTGGCTTATTTCACTTTGCATAATGTCCTCCAGGTCCATCTATG 35760766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2232 ATTTGTTTTTCTGTGCCTGGCTTATTTCACTTAGCATAATGTCCTCCAGGTCCATCTATG 2291

 35760767 TTGCTGCAAATGACAGGATTTCCTTATTTTTTAAGGCTGAACAGTATTCCATTGTGTGTG 35760826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 TTGCTGCAAATGACAGGATTTCCTTATTTTTTAAGGCTGAACAGTATTCCATTGTGTGTG 2351

 35760827 TGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTATATCTCACATTTTCTTTATTCATTCATCCA 35760886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 TGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTATATCTCACATTTTCTTTATTCATTCATCCA 2411

 35760887 TTGGCATACATGTAGGCTGTTTCCATGTCTTGGCTATGGTGAATAATGCTGCAATGGATA 35760946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 TTGGCATACATGTAGGCTGTTTCCATGTCTTGGCTATGGTGAATAATGCTGCAATGGATA 2471

 35760947 TGGGAGTACAGATACCTTGACATGCAGATATCATTTCCTTTGGATATATACCCAGAAGTG 35761006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 TGGGAGTACAGATACCTTGACATGCAGATATCATTTCCTTTGGATATATACCCAGAAGTG 2531

 35761007 GATTATTGGATCATATGGTAGTTCCATTCAAAAATTTTTAAGGAACCTCCATACTATTTT 35761066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 GATTATTGGATCATATGGTAGTTCCATTCAAAAATTTTTAAGGAACCTCCATACTATTTT 2591

 35761067 CCAAAATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACTGACAGTGTACAGGGTTTTTCTCCACATC 35761126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 CCAAAATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACTGACAGTGTACAGGGTTTTTCTCCACATC 2651

 35761127 CTTGCCAATGCTTATCTCGCTTTTTGATAATAATCATTCTGACAGGTGTGAGGTGATATC 35761186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 CTTGCCAATGCTTATCTCGCTTTTTGATAATAATCATTCTGACAGGTGTGAGGTGATATC 2711

 35761187 TCATGGTAGTTTTAATTCACATTTCCCTGATGATTAGTGATGTTGAACATTTTTTTCACA 35761246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 TCATGGTAGTTTTAATTCACATTTCCCTGATGATTAGTGATGTTGAACATTTTTTTCACA 2771

 35761247 TACCAGTTAGCTATTTGCATGTCTTTTTCTTTTGTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGA 35761306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 TACCAGTTAGCTATTTGCATGTCTTTTTCTTTTGTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGA 2831

 35761307 CAGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCT 35761366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 CAGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCT 2891

 35761367 CCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCC 35761393
          |.|||||||||||||||||||||||||
     2892 CTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCC 2918

Alignment time is 4.05428 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [35745597,35768790] =>     23194 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    3678] =>      3678 nucs 'mol-32-30f6-233814_3678'

Score:        3523
Aligned:      3625        nucs
Identic:      3610 (100%) nucs =>        21 (100%)      3589 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [35755577,35755597] EXCISED REGION [35758791,35762390]
 second seq =>  [       1,      21] EXCISED REGION [      80,    3678]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3193 nucs [35755598,35758790]
 second seq =>        58 nucs [22,79]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [22,22] to [80,80]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 35755577 TGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 35755597
          |||||||||||||||||||||
        1 TGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 21

EXCISED REGION

 35758791 AGCCTCCCGGGTAGCTGGGATTACAGGTGCA----TGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTG 35758846
          |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||
       80 AGCCTCCCGGGTAGCTGGGATTACAGG----CGCCTGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTG 135

 35758847 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTAGTCTCGAACTACTGACTT 35758906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      136 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTAGTCTCGAACTACTGACTT 195

 35758907 CAAGTGACCCACCCACATCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTACTGCA 35758966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      196 CAAGTGACCCACCCACATCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTACTGCA 255

 35758967 TCGGGCTTTCATCATATCCTTATGAAACGCTTATGAATTAGACATTATTATTTTCATTTT 35759026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      256 TCGGGCTTTCATCATATCCTTATGAAACGCTTATGAATTAGACATTATTATTTTCATTTT 315

 35759027 ACATAGGAGGAGAAAGGAGATGCAGGAAGATAATAACTTCCCTAAATTCTTTTTTTTTTT 35759086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      316 ACATAGGAGGAGAAAGGAGATGCAGGAAGATAATAACTTCCCTAAATTCTTTTTTTTTTT 375

 35759087 TAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGGATCTCGGCTCACG 35759146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      376 TAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGGATCTCGGCTCACG 435

 35759147 GCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTGGGA 35759206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      436 GCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTGGGA 495

 35759207 TTATAAGCATGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 35759266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      496 TTATAAGCATGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 555

 35759267 CACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCCGCCTCAGCC 35759326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      556 CACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCCGCCTCAGCC 615

 35759327 TCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCCTAAATTCTTAAAGGT 35759386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 TCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCCTAAATTCTTAAAGGT 675

 35759387 GATAAGGAGTGGAGACAGAATTCAAATTCAGGAAAGTTTCAAAGTCCATGCTTGCTTTTT 35759446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 GATAAGGAGTGGAGACAGAATTCAAATTCAGGAAAGTTTCAAAGTCCATGCTTGCTTTTT 735

 35759447 CAATTATATTAAACAATGCCAAGTTCCTTGCATATTCCAAGCATTTATTGGGCACCTGTT 35759506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      736 CAATTATATTAAACAATGCCAAGTTCCTTGCATATTCCAAGCATTTATTGGGCACCTGTT 795

 35759507 GGTTGCACAAGAGTATAGACTGCCTGTCACCAAATGATGCAAAATAATTTAGGAGCCTGT 35759566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 GGTTGCACAAGAGTATAGACTGCCTGTCACCAAATGATGCAAAATAATTTAGGAGCCTGT 855

 35759567 TTTGACAGTCACAAGATGGAGGTCCTGTACATTAGGCAGAAAAGTATGCAGCTAGGCAGC 35759626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 TTTGACAGTCACAAGATGGAGGTCCTGTACATTAGGCAGAAAAGTATGCAGCTAGGCAGC 915

 35759627 CTAGTAGGCATTTTAGAATTGTCTGATAAACCGAGCCACTTAGCAACAATATATTTCTAG 35759686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 CTAGTAGGCATTTTAGAATTGTCTGATAAACCGAGCCACTTAGCAACAATATATTTCTAG 975

 35759687 TTCACCTAATTTTTTGGGTTCTGCCCAAAGGCTGGTGACTCATGAGACAGATATTCCGCA 35759746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 TTCACCTAATTTTTTGGGTTCTGCCCAAAGGCTGGTGACTCATGAGACAGATATTCCGCA 1035

 35759747 CTCTGTGTACATGAGAAAGAAGTCAGTAAGGTGAGGAAGAAGCAGAAGAGATGGGTAACG 35759806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 CTCTGTGTACATGAGAAAGAAGTCAGTAAGGTGAGGAAGAAGCAGAAGAGATGGGTAACG 1095

 35759807 AAGGCCTGGATTCACGAAAACTGTTTAATGGCCATGGTATTATGAAAATCCTGATACCAG 35759866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 AAGGCCTGGATTCACGAAAACTGTTTAATGGCCATGGTATTATGAAAATCCTGATACCAG 1155

 35759867 CCAACTCTTGAGTGTTAAATAATGAGAGTCAGTTTATTAGTTATATTTGGACAGATCTGG 35759926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 CCAACTCTTGAGTGTTAAATAATGAGAGTCAGTTTATTAGTTATATTTGGACAGATCTGG 1215

 35759927 TTTTTTGCTTTATTTTTATAAATAATGTTCTAAGAAATATATTTTATTTAATTTACTTAT 35759986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1216 TTTTTTGCTTTATTTTTATAAATAATGTTCTAAGAAATTTATTTTATTTAATTTACTTAT 1275

 35759987 GGCATATTTAAACATTTTTTGGCAAATAAAAATTGTGTATATTCATGATGTACAACATGT 35760046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 GGCATATTTAAACATTTTTTGGCAAATAAAAATTGTGTATATTCATGATGTACAACATGT 1335

 35760047 GTTGATAGACGTACTCATTGTGGAATGGCTAAATCAAGCTAATTAACAAATCCATTACCT 35760106
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 GTTGATAGATGTACTCATTGTGGAATGGCTAAATCAAGCTAATTAACAAATCCATTACCT 1395

 35760107 CAAATATATACCCATTACCGCAAATACTTATTTTTTTGTGTGGTAAGAACAACTAAAATC 35760166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 CAAATATATACCCATTACCGCAAATACTTATTTTTTTGTGTGGTAAGAACAACTAAAATC 1455

 35760167 TACTCTCTTAGCAATTTTCAAGCATATATATATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTT 35760226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 TACTCTCTTAGCAATTTTCAAGCATATATATATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTT 1515

 35760227 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGCAATCTTGGCTCACT 35760286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGCAATCTTGGCTCACT 1575

 35760287 GCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGA 35760346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 GCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGA 1635

 35760347 TTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 35760406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 TTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 1695

 35760407 ACCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCAAACCCCTGACCTCAGATGACCCACCTGCCTCAGCCT 35760466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 ACCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCAAACCCCTGACCTCAGATGACCCACCTGCCTCAGCCT 1755

 35760467 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCTGGCCTCAAGTATATATTTTTA 35760526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCTGGCCTCAAGTATATATTTTTA 1815

 35760527 ACTATAGTCACCATATAGTATAATAGATCTCCTGCACTTATTCCTGCTGTCTAACTGAAA 35760586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 ACTATAGTCACCATATAGTATAATAGATCTCCTGCACTTATTCCTGCTGTCTAACTGAAA 1875

 35760587 TTTTGTATCCTTTGGCCAAAATCTTCCAATTCTTTCTCTCTCATCCCCTGGTAACCACCA 35760646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 TTTTGTATCCTTTGGCCAAAATCTTCCAATTCTTTCTCTCTCATCCCCTGGTAACCACCA 1935

 35760647 TTCTGCTACTTCTACAAGCTTGACTTTTTTAGATGCCACACATAAGTGAGATTAAGCAGT 35760706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 TTCTGCTACTTCTACAAGCTTGACTTTTTTAGATGCCACACATAAGTGAGATTAAGCAGT 1995

 35760707 ATTTGTTTTTCTGTGCCTGGCTTATTTCACTTTGCATAATGTCCTCCAGGTCCATCTATG 35760766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1996 ATTTGTTTTTCTGTGCCTGGCTTATTTCACTTAGCATAATGTCCTCCAGGTCCATCTATG 2055

 35760767 TTGCTGCAAATGACAGGATTTCCTTATTTTTTAAGGCTGAACAGTATTCCATTGTGTGTG 35760826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 TTGCTGCAAATGACAGGATTTCCTTATTTTTTAAGGCTGAACAGTATTCCATTGTGTGTG 2115

 35760827 TGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTATATCTCACATTTTCTTTATTCATTCATCCA 35760886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 TGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTATATCTCACATTTTCTTTATTCATTCATCCA 2175

 35760887 TTGGCATACATGTAGGCTGTTTCCATGTCTTGGCTATGGTGAATAATGCTGCAATGGATA 35760946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 TTGGCATACATGTAGGCTGTTTCCATGTCTTGGCTATGGTGAATAATGCTGCAATGGATA 2235

 35760947 TGGGAGTACAGATACCTTGACATGCAGATATCATTTCCTTTGGATATATACCCAGAAGTG 35761006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 TGGGAGTACAGATACCTTGACATGCAGATATCATTTCCTTTGGATATATACCCAGAAGTG 2295

 35761007 GATTATTGGATCATATGGTAGTTCCATTCAAAAATTTTTAAGGAACCTCCATACTATTTT 35761066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 GATTATTGGATCATATGGTAGTTCCATTCAAAAATTTTTAAGGAACCTCCATACTATTTT 2355

 35761067 CCAAAATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACTGACAGTGTACAGGGTTTTTCTCCACATC 35761126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 CCAAAATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACTGACAGTGTACAGGGTTTTTCTCCACATC 2415

 35761127 CTTGCCAATGCTTATCTCGCTTTTTGATAATAATCATTCTGACAGGTGTGAGGTGATATC 35761186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 CTTGCCAATGCTTATCTCGCTTTTTGATAATAATCATTCTGACAGGTGTGAGGTGATATC 2475

 35761187 TCATGGTAGTTTTAATTCACATTTCCCTGATGATTAGTGATGTTGAACATTTTTTTCACA 35761246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 TCATGGTAGTTTTAATTCACATTTCCCTGATGATTAGTGATGTTGAACATTTTTTTCACA 2535

 35761247 TACCAGTTAGCTATTTGCATGTCTTTTTCTTTTGTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGA 35761306
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     2536 TACCAGTTAGCTATTTGCATGTCTTTTTCTTTTGTTTTTC-TTTTTTTTTTTTTTTGAGA 2594

 35761307 CAGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCT 35761366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 CAGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCT 2654

 35761367 CCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGAATACAAG 35761426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 CCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGAATACAAG 2714

 35761427 CGCCCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTTTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCAGGT 35761486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 CGCCCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTTTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCAGGT 2774

 35761487 TGGCCCGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCATGC 35761546
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 TGGCCCGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCATGC 2834

 35761547 TACTTGCATGTCTTCTTTTGAGCAATGTCTTTTCAGGCCCTTGTCCACTTATCTGATGTA 35761606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 TACTTGCATGTCTTCTTTTGAGCAATGTCTTTTCAGGCCCTTGTCCACTTATCTGATGTA 2894

 35761607 GGGGTCGTGAATATTTTCTCCCATTCCGTAGGTTGTCTCTTTACCTTTTTTTTTTTTTTC 35761666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 GGGGTCGTGAATATTTTCTCCCATTCCGTAGGTTGTCTCTTTACCTTTTTTTTTTTTTTC 2954

 35761667 CAGACGAGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTAAAGTGGCACAATCACGGTCACTAC 35761726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 CAGACGAGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTAAAGTGGCACAATCACGGTCACTAC 3014

 35761727 AGCCTCAACTGTCTGAGCTCAAGTGATTCTCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACC 35761786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 AGCCTCAACTGTCTGAGCTCAAGTGATTCTCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACC 3074

 35761787 ACAGGCGTGTGCTATCATGCCCAGCTAATTTTTTGATTTTTTTGTAGAGTTGAACTCTCA 35761846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3075 ACAGGCGTGTGCTATCATGCCCAGCTAATTTTTTGATTTTTTTGTAGAGTTGAACTCTCA 3134

 35761847 CTAAGTCACCCAGTTTAGTCTCGAACTCCTGAGCCCAAGCAATCTTCCCACCTAGGACTG 35761906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3135 CTAAGTCACCCAGTTTAGTCTCGAACTCCTGAGCCCAAGCAATCTTCCCACCTAGGACTG 3194

 35761907 TCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCAGAAACTCTACGTTTGAT 35761966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3195 TCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCAGAAACTCTACGTTTGAT 3254

 35761967 TCTAACCACAGCAGCTTAGCAGCTGAGGACAAACTGTTGGGATATTTTGGTCTCAGTCAA 35762026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 TCTAACCACAGCAGCTTAGCAGCTGAGGACAAACTGTTGGGATATTTTGGTCTCAGTCAA 3314

 35762027 TGGCAGCCAGGTTACCAACCCTGACAAGATACAAGTTTTCTTCGTTGGGTTCCTGGTACA 35762086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 TGGCAGCCAGGTTACCAACCCTGACAAGATACAAGTTTTCTTCGTTGGGTTCCTGGTACA 3374

 35762087 AAAGTCAACCTTTTCAGTTAGTTATGAATGAAAGGGCATGAAGATTGTGCTATTAGTTTA 35762146
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3375 AAAGTCAACCTTTTCAGTTACTTATGAATGAAAGGGCATGAAGATTGTGCTATTAGTTTA 3434

 35762147 TCCTGAAGGTCAATCTTCAAAAATACTGGTTCAACATGGATTTGGATATTATTAATATAA 35762206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3435 TCCTGAAGGTCAATCTTCAAAAATACTGGTTCAACATGGATTTGGATATTATTAATATAA 3494

 35762207 ATTTATGGCTTAAAGAGGACAAAAGGTGTTTTTTTGGGTTCCTTTACAGAGATATTTAGT 35762266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3495 ATTTATGGCTTAAAGAGGACAAAAGGTGTTTTTTTGGGTTCCTTTACAGAGATATTTAGT 3554

 35762267 GAGGGAACAAGGCACTTAGTCATCTTTGCTATGACAGGTTAAATACAAGGTGTACTGGGA 35762326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3555 GAGGGAACAAGGCACTTAGTCATCTTTGCTATGACAGGTTAAATACAAGGTGTACTGGGA 3614

 35762327 ACATGTAAGAGGGTGACTTAACTCAGCCATTGGGGGGTCAGGAGAAGTGTTCCTAAGGAA 35762386
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3615 ACATGTAAGAGGGTGACTTAACTCGGCCATTGGGGGGTCAGGAGAAGTGTTCCTAAGGAA 3674

 35762387 GTGA 35762390
          ||||
     3675 GTGA 3678

Alignment time is 5.13454 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [35745597,35768790] =>     23194 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    6869] =>      6869 nucs 'mol-32-3164-276939_6869'

Score:        6691
Aligned:      6817        nucs
Identic:      6799 (100%) nucs =>       160 ( 99%)      6639 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [35755437,35755597] EXCISED REGION [35758791,35765442]
 second seq =>  [       1,     161] EXCISED REGION [     220,    6869]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3193 nucs [35755598,35758790]
 second seq =>        58 nucs [162,219]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [162,162] to [220,220]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 35755437 CTCCATATTGGTCAGGCTGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCT 35755496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCCATATTGGTCAGGCTGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCT 60

 35755497 CCAAAAGTGCTGGGATTATGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGACTTTTTTTTT 35755556
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
       61 CCAAAAGTGCTGGGATTATGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGGCTTTTTTTTT 120

 35755557 GAGACAGAGTCTGGCACTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 35755597
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGACAGAGTCTGGCACTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 161

EXCISED REGION

 35758791 AGCCTCCCGGGTAGCTGGGATTACAGGTGCA----TGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTG 35758846
          |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||
      220 AGCCTCCCGGGTAGCTGGGATTACAGG----CGCCTGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTG 275

 35758847 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTAGTCTCGAACTACTGACTT 35758906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      276 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTAGTCTCGAACTACTGACTT 335

 35758907 CAAGTGACCCACCCACATCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTACTGCA 35758966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      336 CAAGTGACCCACCCACATCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTACTGCA 395

 35758967 TCGGGCTTTCATCATATCCTTATGAAACGCTTATGAATTAGACATTATTATTTTCATTTT 35759026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      396 TCGGGCTTTCATCATATCCTTATGAAACGCTTATGAATTAGACATTATTATTTTCATTTT 455

 35759027 ACATAGGAGGAGAAAGGAGATGCAGGAAGATAATAACTTCCCTAAATTCTTTTTTTTTTT 35759086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      456 ACATAGGAGGAGAAAGGAGATGCAGGAAGATAATAACTTCCCTAAATTCTTTTTTTTTTT 515

 35759087 TAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGGATCTCGGCTCACG 35759146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      516 TAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGGATCTCGGCTCACG 575

 35759147 GCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTGGGA 35759206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      576 GCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTGGGA 635

 35759207 TTATAAGCATGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 35759266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      636 TTATAAGCATGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 695

 35759267 CACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCCGCCTCAGCC 35759326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      696 CACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCCGCCTCAGCC 755

 35759327 TCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCCTAAATTCTTAAAGGT 35759386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      756 TCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCCTAAATTCTTAAAGGT 815

 35759387 GATAAGGAGTGGAGACAGAATTCAAATTCAGGAAAGTTTCAAAGTCCATGCTTGCTTTTT 35759446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 GATAAGGAGTGGAGACAGAATTCAAATTCAGGAAAGTTTCAAAGTCCATGCTTGCTTTTT 875

 35759447 CAATTATATTAAACAATGCCAAGTTCCTTGCATATTCCAAGCATTTATTGGGCACCTGTT 35759506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 CAATTATATTAAACAATGCCAAGTTCCTTGCATATTCCAAGCATTTATTGGGCACCTGTT 935

 35759507 GGTTGCACAAGAGTATAGACTGCCTGTCACCAAATGATGCAAAATAATTTAGGAGCCTGT 35759566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 GGTTGCACAAGAGTATAGACTGCCTGTCACCAAATGATGCAAAATAATTTAGGAGCCTGT 995

 35759567 TTTGACAGTCACAAGATGGAGGTCCTGTACATTAGGCAGAAAAGTATGCAGCTAGGCAGC 35759626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 TTTGACAGTCACAAGATGGAGGTCCTGTACATTAGGCAGAAAAGTATGCAGCTAGGCAGC 1055

 35759627 CTAGTAGGCATTTTAGAATTGTCTGATAAACCGAGCCACTTAGCAACAATATATTTCTAG 35759686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 CTAGTAGGCATTTTAGAATTGTCTGATAAACCGAGCCACTTAGCAACAATATATTTCTAG 1115

 35759687 TTCACCTAATTTTTTGGGTTCTGCCCAAAGGCTGGTGACTCATGAGACAGATATTCCGCA 35759746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 TTCACCTAATTTTTTGGGTTCTGCCCAAAGGCTGGTGACTCATGAGACAGATATTCCGCA 1175

 35759747 CTCTGTGTACATGAGAAAGAAGTCAGTAAGGTGAGGAAGAAGCAGAAGAGATGGGTAACG 35759806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 CTCTGTGTACATGAGAAAGAAGTCAGTAAGGTGAGGAAGAAGCAGAAGAGATGGGTAACG 1235

 35759807 AAGGCCTGGATTCACGAAAACTGTTTAATGGCCATGGTATTATGAAAATCCTGATACCAG 35759866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 AAGGCCTGGATTCACGAAAACTGTTTAATGGCCATGGTATTATGAAAATCCTGATACCAG 1295

 35759867 CCAACTCTTGAGTGTTAAATAATGAGAGTCAGTTTATTAGTTATATTTGGACAGATCTGG 35759926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 CCAACTCTTGAGTGTTAAATAATGAGAGTCAGTTTATTAGTTATATTTGGACAGATCTGG 1355

 35759927 TTTTTTGCTTTATTTTTATAAATAATGTTCTAAGAAATATATTTTATTTAATTTACTTAT 35759986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1356 TTTTTTGCTTTATTTTTATAAATAATGTTCTAAGAAATTTATTTTATTTAATTTACTTAT 1415

 35759987 GGCATATTTAAACATTTTTTGGCAAATAAAAATTGTGTATATTCATGATGTACAACATGT 35760046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 GGCATATTTAAACATTTTTTGGCAAATAAAAATTGTGTATATTCATGATGTACAACATGT 1475

 35760047 GTTGATAGACGTACTCATTGTGGAATGGCTAAATCAAGCTAATTAACAAATCCATTACCT 35760106
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 GTTGATAGATGTACTCATTGTGGAATGGCTAAATCAAGCTAATTAACAAATCCATTACCT 1535

 35760107 CAAATATATACCCATTACCGCAAATACTTATTTTTTTGTGTGGTAAGAACAACTAAAATC 35760166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 CAAATATATACCCATTACCGCAAATACTTATTTTTTTGTGTGGTAAGAACAACTAAAATC 1595

 35760167 TACTCTCTTAGCAATTTTCAAGCATATATATATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTT 35760226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 TACTCTCTTAGCAATTTTCAAGCATATATATATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTT 1655

 35760227 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGCAATCTTGGCTCACT 35760286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGCAATCTTGGCTCACT 1715

 35760287 GCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGA 35760346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 GCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGA 1775

 35760347 TTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 35760406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 TTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 1835

 35760407 ACCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCAAACCCCTGACCTCAGATGACCCACCTGCCTCAGCCT 35760466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 ACCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCAAACCCCTGACCTCAGATGACCCACCTGCCTCAGCCT 1895

 35760467 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCTGGCCTCAAGTATATATTTTTA 35760526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCTGGCCTCAAGTATATATTTTTA 1955

 35760527 ACTATAGTCACCATATAGTATAATAGATCTCCTGCACTTATTCCTGCTGTCTAACTGAAA 35760586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 ACTATAGTCACCATATAGTATAATAGATCTCCTGCACTTATTCCTGCTGTCTAACTGAAA 2015

 35760587 TTTTGTATCCTTTGGCCAAAATCTTCCAATTCTTTCTCTCTCATCCCCTGGTAACCACCA 35760646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 TTTTGTATCCTTTGGCCAAAATCTTCCAATTCTTTCTCTCTCATCCCCTGGTAACCACCA 2075

 35760647 TTCTGCTACTTCTACAAGCTTGACTTTTTTAGATGCCACACATAAGTGAGATTAAGCAGT 35760706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 TTCTGCTACTTCTACAAGCTTGACTTTTTTAGATGCCACACATAAGTGAGATTAAGCAGT 2135

 35760707 ATTTGTTTTTCTGTGCCTGGCTTATTTCACTTTGCATAATGTCCTCCAGGTCCATCTATG 35760766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2136 ATTTGTTTTTCTGTGCCTGGCTTATTTCACTTAGCATAATGTCCTCCAGGTCCATCTATG 2195

 35760767 TTGCTGCAAATGACAGGATTTCCTTATTTTTTAAGGCTGAACAGTATTCCATTGTGTGTG 35760826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 TTGCTGCAAATGACAGGATTTCCTTATTTTTTAAGGCTGAACAGTATTCCATTGTGTGTG 2255

 35760827 TGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTATATCTCACATTTTCTTTATTCATTCATCCA 35760886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 TGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTATATCTCACATTTTCTTTATTCATTCATCCA 2315

 35760887 TTGGCATACATGTAGGCTGTTTCCATGTCTTGGCTATGGTGAATAATGCTGCAATGGATA 35760946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 TTGGCATACATGTAGGCTGTTTCCATGTCTTGGCTATGGTGAATAATGCTGCAATGGATA 2375

 35760947 TGGGAGTACAGATACCTTGACATGCAGATATCATTTCCTTTGGATATATACCCAGAAGTG 35761006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 TGGGAGTACAGATACCTTGACATGCAGATATCATTTCCTTTGGATATATACCCAGAAGTG 2435

 35761007 GATTATTGGATCATATGGTAGTTCCATTCAAAAATTTTTAAGGAACCTCCATACTATTTT 35761066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 GATTATTGGATCATATGGTAGTTCCATTCAAAAATTTTTAAGGAACCTCCATACTATTTT 2495

 35761067 CCAAAATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACTGACAGTGTACAGGGTTTTTCTCCACATC 35761126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 CCAAAATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACTGACAGTGTACAGGGTTTTTCTCCACATC 2555

 35761127 CTTGCCAATGCTTATCTCGCTTTTTGATAATAATCATTCTGACAGGTGTGAGGTGATATC 35761186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 CTTGCCAATGCTTATCTCGCTTTTTGATAATAATCATTCTGACAGGTGTGAGGTGATATC 2615

 35761187 TCATGGTAGTTTTAATTCACATTTCCCTGATGATTAGTGATGTTGAACATTTTTTTCACA 35761246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 TCATGGTAGTTTTAATTCACATTTCCCTGATGATTAGTGATGTTGAACATTTTTTTCACA 2675

 35761247 TACCAGTTAGCTATTTGCATGTCTTTTTCTTTTGTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGA 35761306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 TACCAGTTAGCTATTTGCATGTCTTTTTCTTTTGTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGA 2735

 35761307 CAGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCT 35761366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 CAGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCT 2795

 35761367 CCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGAATACAAG 35761426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 CCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGAATACAAG 2855

 35761427 CGCCCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTTTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCAGGT 35761486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 CGCCCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTTTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCAGGT 2915

 35761487 TGGCCCGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCATGC 35761546
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 TGGCCCGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCATGC 2975

 35761547 TACTTGCATGTCTTCTTTTGAGCAATGTCTTTTCAGGCCCTTGTCCACTTATCTGATGTA 35761606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 TACTTGCATGTCTTCTTTTGAGCAATGTCTTTTCAGGCCCTTGTCCACTTATCTGATGTA 3035

 35761607 GGGGTCGTGAATATTTTCTCCCATTCCGTAGGTTGTCTCTTTACCTTTTTTTTTTTTTTC 35761666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 GGGGTCGTGAATATTTTCTCCCATTCCGTAGGTTGTCTCTTTACCTTTTTTTTTTTTTTC 3095

 35761667 CAGACGAGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTAAAGTGGCACAATCACGGTCACTAC 35761726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 CAGACGAGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTAAAGTGGCACAATCACGGTCACTAC 3155

 35761727 AGCCTCAACTGTCTGAGCTCAAGTGATTCTCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACC 35761786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 AGCCTCAACTGTCTGAGCTCAAGTGATTCTCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACC 3215

 35761787 ACAGGCGTGTGCTATCATGCCCAGCTAATTTTTTGATTTTTTTGTAGAGTTGAACTCTCA 35761846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 ACAGGCGTGTGCTATCATGCCCAGCTAATTTTTTGATTTTTTTGTAGAGTTGAACTCTCA 3275

 35761847 CTAAGTCACCCAGTTTAGTCTCGAACTCCTGAGCCCAAGCAATCTTCCCACCTAGGACTG 35761906
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 CTAAGTCACCCAGTTTGGTCTCGAACTCCTGAGCCCAAGCAATCTTCCCACCTAGGACTG 3335

 35761907 TCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCAGAAACTCTACGTTTGAT 35761966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 TCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCAGAAACTCTACGTTTGAT 3395

 35761967 TCTAACCACAGCAGCTTAGCAGCTGAGGACAAACTGTTGGGATATTTTGGTCTCAGTCAA 35762026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 TCTAACCACAGCAGCTTAGCAGCTGAGGACAAACTGTTGGGATATTTTGGTCTCAGTCAA 3455

 35762027 TGGCAGCCAGGTTACCAACCCTGACAAGATACAAGTTTTCTTCGTTGGGTTCCTGGTACA 35762086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 TGGCAGCCAGGTTACCAACCCTGACAAGATACAAGTTTTCTTCGTTGGGTTCCTGGTACA 3515

 35762087 AAAGTCAACCTTTTCAGTTAGTTATGAATGAAAGGGCATGAAGATTGTGCTATTAGTTTA 35762146
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 AAAGTCAACCTTTTCAGTTACTTATGAATGAAAGGGCATGAAGATTGTGCTATTAGTTTA 3575

 35762147 TCCTGAAGGTCAATCTTCAAAAATACTGGTTCAACATGGATTTGGATATTATTAATATAA 35762206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 TCCTGAAGGTCAATCTTCAAAAATACTGGTTCAACATGGATTTGGATATTATTAATATAA 3635

 35762207 ATTTATGGCTTAAAGAGGACAAAAGGTGTTTTTTTGGGTTCCTTTACAGAGATATTTAGT 35762266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 ATTTATGGCTTAAAGAGGACAAAAGGTGTTTTTTTGGGTTCCTTTACAGAGATATTTAGT 3695

 35762267 GAGGGAACAAGGCACTTAGTCATCTTTGCTATGACAGGTTAAATACAAGGTGTACTGGGA 35762326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 GAGGGAACAAGGCACTTAGTCATCTTTGCTATGACAGGTTAAATACAAGGTGTACTGGGA 3755

 35762327 ACATGTAAGAGGGTGACTTAACTCAGCCATTGGGGGGTCAGGAGAAGTGTTCCTAAGGAA 35762386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 ACATGTAAGAGGGTGACTTAACTCAGCCATTGGGGGGTCAGGAGAAGTGTTCCTAAGGAA 3815

 35762387 GTGATGTCTAAGTGAGGTAGGCAGTACCTTGGCAAAAAAAACCTTGAAGTTAAGAGTGCA 35762446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 GTGATGTCTAAGTGAGGTAGGCAGTACCTTGGCAAAAAAAACCTTGAAGTTAAGAGTGCA 3875

 35762447 TATGAGAAATGAAGGTATGTCCACCTGGCTGGCAAATGGAGTCTAAGATAGGGCAGTGAT 35762506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 TATGAGAAATGAAGGTATGTCCACCTGGCTGGCAAATGGAGTCTAAGATAGGGCAGTGAT 3935

 35762507 GATAAAGATACAGGAAGATGCTAGATCTGGAAGGGCCTTCTAAAAAGAATGACAATATAA 35762566
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 GATAAAGATATAGGAAGATGCTAGATCTGGAAGGGCCTTCTAAAAAGAATGACAATATAA 3995

 35762567 ATTTATTGTACAAATGGAGACTTTACTGAGAGTGAAACCAGGCAATATTAATACTTAGGT 35762626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 ATTTATTGTACAAATGGAGACTTTACTGAGAGTGAAACCAGGCAATATTAATACTTAGGT 4055

 35762627 AGGGACAACAGATATAAACCAGGCTATTCTCAGCAAATCAGAAATTATGGTCACCCTACT 35762686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 AGGGACAACAGATATAAACCAGGCTATTCTCAGCAAATCAGAAATTATGGTCACCCTACT 4115

 35762687 TGTAAGTCACATTCAGGTGCTTAGACTTTCAGTGAAAGCATAGAGTATGTATCTTCTACA 35762746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 TGTAAGTCACATTCAGGTGCTTAGACTTTCAGTGAAAGCATAGAGTATGTATCTTCTACA 4175

 35762747 TTTTGCCTAAGTGACTTCATTCTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAG 35762806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 TTTTGCCTAAGTGACTTCATTCTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAG 4235

 35762807 GCTGGAGTACAGCGGCACGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCCAGGTTCACGCCA 35762866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 GCTGGAGTACAGCGGCACGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCCAGGTTCACGCCA 4295

 35762867 TTCTTCTTCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCCGGCT 35762926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4296 TTCTTCTTCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCCGGCT 4355

 35762927 AATTTTTTGTATTTTTAGTTGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGATC 35762986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4356 AATTTTTTGTATTTTTAGTTGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGATC 4415

 35762987 TCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGC 35763046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4416 TCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGC 4475

 35763047 CACTGCACCCAGCCAGTGACTTCATTTTTACTTTTGCCTTTACTTACTCATTTCACAAGT 35763106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4476 CACTGCACCCAGCCAGTGACTTCATTTTTACTTTTGCCTTTACTTACTCATTTCACAAGT 4535

 35763107 ATTTGAGGATACACTTCAGAGCACTGAGGTTACAAAGACAACAGTGTCTGTCCTCAAGGT 35763166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 ATTTGAGGATACACTTCAGAGCACTGAGGTTACAAAGACAACAGTGTCTGTCCTCAAGGT 4595

 35763167 CTGTCTAGGTAAGACACACAGCCAAATAAACAATTCTAATACAGTTATACAGTTTTAGTT 35763226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 CTGTCTAGGTAAGACACACAGCCAAATAAACAATTCTAATACAGTTATACAGTTTTAGTT 4655

 35763227 CTGACACCTCCAATGAGCTGTAGACTTGTATTTGTCATTTCCAGTCAGAATGCAAAACAC 35763286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 CTGACACCTCCAATGAGCTGTAGACTTGTATTTGTCATTTCCAGTCAGAATGCAAAACAC 4715

 35763287 AGATCCAAAACAGAACTTTCAATTTCTCCTCCAAATCTATTCTTCCTTCAGCTGGTCGTG 35763346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4716 AGATCCAAAACAGAACTTTCAATTTCTCCTCCAAATCTATTCTTCCTTCAGCTGGTCGTG 4775

 35763347 TAAGTGATGCCACTATCACATCCACTTAAGACAAAAACCCAGAGGAGTACTGCCTTAATC 35763406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4776 TAAGTGATGCCACTATCACATCCACTTAAGACAAAAACCCAGAGGAGTACTGCCTTAATC 4835

 35763407 AGTAATCAGTGTTACCCTTCTTCTCACTGTGCATGTTAATTTTGCCACATCTTTTTTTTT 35763466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4836 AGTAATCAGTGTTACCCTTCTTCTCACTGTGCATGTTAATTTTGCCACATCTTTTTTTTT 4895

 35763467 TTTTTTTTTTTGGTACAGTGTCTCACTCTGTCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATA 35763526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4896 TTTTTTTTTTTGGTACAGTGTCTCACTCTGTCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATA 4955

 35763527 CTGGGTCAATGCAGCCTCAACCCTCTGGGCTGAAGTGATCCTCTCACCTCAGCCTCCTAA 35763586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4956 CTGGGTCAATGCAGCCTCAACCCTCTGGGCTGAAGTGATCCTCTCACCTCAGCCTCCTAA 5015

 35763587 GTAGCTGGGACTACAGGCATGCGCCACTACACCTGGCTAATTTTTGCAATTTTTGTAGAG 35763646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5016 GTAGCTGGGACTACAGGCATGCGCCACTACACCTGGCTAATTTTTGCAATTTTTGTAGAG 5075

 35763647 ACGAAGTTTCACCATGTTGCCCAGTTCTCATGCCTCCTTGAACTCCTGAACTCAAGTGAT 35763706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5076 ACGAAGTTTCACCATGTTGCCCAGTTCTCATGCCTCCTTGAACTCCTGAACTCAAGTGAT 5135

 35763707 CTGCCTACCTTGGCTTCCCAAAATGCAGGGATCCCAGGTGTGAGGCACCGTGTCCTGCCC 35763766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5136 CTGCCTACCTTGGCTTCCCAAAATGCAGGGATCCCAGGTGTGAGGCACCGTGTCCTGCCC 5195

 35763767 TCTCCACATCTTTCTTAAGCACACTGACTAAATTGGTCTAAGTAGAGCCTAACATCAACT 35763826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5196 TCTCCACATCTTTCTTAAGCACACTGACTAAATTGGTCTAAGTAGAGCCTAACATCAACT 5255

 35763827 GAAGGGAGAGGGTAATTTCCAGGTAGTTGAATGCTATGATTTTTGTTTTTTTGTTTTTGA 35763886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5256 GAAGGGAGAGGGTAATTTCCAGGTAGTTGAATGCTATGATTTTTGTTTTTTTGTTTTTGA 5315

 35763887 GACAGACTCTTGCTCTGTTGAACAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATTTCAGCTCACTGCA 35763946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5316 GACAGACTCTTGCTCTGTTGAACAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATTTCAGCTCACTGCA 5375

 35763947 ACCTCCACCTCCAGGGTTCAAGCAATTCTTGCGCCTCCCAAGAAGCTGGGATTACAGGCA 35764006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5376 ACCTCCACCTCCAGGGTTCAAGCAATTCTTGCGCCTCCCAAGAAGCTGGGATTACAGGCA 5435

 35764007 TGCGCCACCACACCCAGCTAATTGTTGCATTTTTAGCAGAGATGGGTTTTCGCCATGTTG 35764066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5436 TGCGCCACCACACCCAGCTAATTGTTGCATTTTTAGCAGAGATGGGTTTTCGCCATGTTG 5495

 35764067 CCCAGGCTGATCTTGAACTACTGGCCTCAAATGATCCATCTGCCTTGGCCTCCCAAACTG 35764126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5496 CCCAGGCTGATCTTGAACTACTGGCCTCAAATGATCCATCTGCCTTGGCCTCCCAAACTG 5555

 35764127 CTGGGATTACAGGAATGAGCCACTGTGCCTGGCCCCTGAATGCTATGTTTTTAACGACTA 35764186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5556 CTGGGATTACAGGAATGAGCCACTGTGCCTGGCCCCTGAATGCTATGTTTTTAACGACTA 5615

 35764187 GATCTCAGTATTATGTGGGACTAATTTTTCTACAGTATTACAACACTGATTACTGATATT 35764246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5616 GATCTCAGTATTATGTGGGACTAATTTTTCTACAGTATTACAACACTGATTACTGATATT 5675

 35764247 CATTGTTGACAATCATGACATCCAGATCTGGATATTTGCCTTAGCCAGTCTCAAAATTTG 35764306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5676 CATTGTTGACAATCATGACATCCAGATCTGGATATTTGCCTTAGCCAGTCTCAAAATTTG 5735

 35764307 AGTTTCAATGACAAAGACACAGATATGTCCTAAATGACTGACCCCACTTCCACTATGTGA 35764366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5736 AGTTTCAATGACAAAGACACAGATATGTCCTAAATGACTGACCCCACTTCCACTATGTGA 5795

 35764367 AGTTGAGAGTGGTTGTAAAGCTGTACAGCTATAGGTGAAACACTAATGTTAATCAACTAT 35764426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5796 AGTTGAGAGTGGTTGTAAAGCTGTACAGCTATAGGTGAAACACTAATGTTAATCAACTAT 5855

 35764427 CTGTTGAACAACTACCATGTAAAAGGACAATTTATGCCTTAGAGAGCAATTTAAAATTTT 35764486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5856 CTGTTGAACAACTACCATGTAAAAGGACAATTTATGCCTTAGAGAGCAATTTAAAATTTT 5915

 35764487 TTTAGAGATGGGGGTCTCGATACGTTGCCTAGACTGGTCTCAAACTTGGGCTCAATCCAT 35764546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5916 TTTAGAGATGGGGGTCTCGATACGTTGCCTAGACTGGTCTCAAACTTGGGCTCAATCCAT 5975

 35764547 CCTCCTGCCTCAGTCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGTACACACCACTTCACCAGGCAA 35764606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5976 CCTCCTGCCTCAGTCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGTACACACCACTTCACCAGGCAA 6035

 35764607 AGGGCAATTTTAATATTTCTACCATCCATTCTCCACACAGCTGCCACAGTGATTTTTTTT 35764666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||
     6036 AGGGCAATTTTAATATTTCTACCATCCATTCTCCACACAGCTGCCACAGTGA--TTTTTT 6093

 35764667 TTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGCAGTTTCACTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGTAGTGGCA 35764726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6094 TTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGCAGTTTCACTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGTAGTGGCA 6153

 35764727 CAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTACCTCAGCCT 35764786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6154 CAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTACCTCAGCCT 6213

 35764787 CCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCGTCACAATGCCCAGCTAATTTTTTTTGTATTTT 35764846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6214 CCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCGTCACAATGCCCAGCTAATTTTTTTTGTATTTT 6273

 35764847 TAGTAGAGATGAGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTTCTAACCTCAAGTG 35764906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6274 TAGTAGAGATGAGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTTCTAACCTCAAGTG 6333

 35764907 ATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGATGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCTCCCAGC 35764966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6334 ATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGATGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCTCCCAGC 6393

 35764967 CCACAGTGATCCTTTTACAGCAAAGCTACTCCTTTGCTCTCAACCCTTCGTCATATTCTG 35765026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6394 CCACAGTGATCCTTTTACAGCAAAGCTACTCCTTTGCTCTCAACCCTTCGTCATATTCTG 6453

 35765027 TCACTTCCCAATAAAATCCAAACCTTACCAGATGATACATGATCTGCCTTGATTTCCATC 35765086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6454 TCACTTCCCAATAAAATCCAAACCTTACCAGATGATACATGATCTGCCTTGATTTCCATC 6513

 35765087 TAATTTCTCTCATTTGCTGTGCTCCAGCCACACTGGTCTTGCCCTTTCTCCATGCCAAAC 35765146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6514 TAATTTCTCTCATTTGCTGTGCTCCAGCCACACTGGTCTTGCCCTTTCTCCATGCCAAAC 6573

 35765147 AAATCCCCATTTCAGGGTCACTGCACTTGCTGCTTCTCTTCTAGGATAGTTTCCCTCTAG 35765206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6574 AAATCCCCATTTCAGGGTCACTGCACTTGCTGCTTCTCTTCTAGGATAGTTTCCCTCTAG 6633

 35765207 AAATCCATGTTGCTCCTTCTCTCATTAAATGATCAGATATTTATGTGCCTCCTTAGCTAA 35765266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6634 AAATCCATGTTGCTCCTTCTCTCATTAAATGATCAGATATTTATGTGCCTCCTTAGCTAA 6693

 35765267 GAGGCCTTCCTTATCTACCCTAACTAAGAGAATCCCCATATCACTCTTATCCTTTTATCC 35765326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6694 GAGGCCTTCCTTATCTACCCTAACTAAGAGAATCCCCATATCACTCTTATCCTTTTATCC 6753

 35765327 TGATTTATTTTTCCATAAAACTTGCCACATTACTGGGCATTATCTATCATTTAGTAATGT 35765386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6754 TGATTTATTTTTCCATAAAACTTGCCACATTACTGGGCATTATCTATCATTTAGTAATGT 6813

 35765387 GTATATTGCTTATTGACAGTCTTCCCTACTATAATATGAGCTCCATGAGGCAGAGA 35765442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6814 GTATATTGCTTATTGACAGTCTTCCCTACTATAATATGAGCTCCATGAGGCAGAGA 6869

Alignment time is 9.15051 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [35745597,35768790] =>     23194 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    2791] =>      2791 nucs 'mol-32-317a-017527_2791'

Score:        2646
Aligned:      2739        nucs
Identic:      2724 ( 99%) nucs =>       235 (100%)      2489 ( 99%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [35755362,35755597] EXCISED REGION [35758791,35761289]
 second seq =>  [       1,     236] EXCISED REGION [     295,    2791]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3193 nucs [35755598,35758790]
 second seq =>        58 nucs [237,294]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [237,237] to [295,295]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 35755362 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACATGCGCCACCATGCCCTGCTAATTTTGTATTTTTA 35755421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACATGCGCCACCATGCCCTGCTAATTTTGTATTTTTA 60

 35755422 GTTGAGATGTGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATC 35755481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTGAGATGTGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATC 120

 35755482 CGCCCACCTTGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTATGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGC 35755541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CGCCCACCTTGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTATGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGC 180

 35755542 CCGGACTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTGGCACTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 35755597
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCGGGCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTGGCACTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 236

EXCISED REGION

 35758791 AGCCTCCCGGGTAGCTGGGATTACAGGTGCA----TGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTG 35758846
          |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||
      295 AGCCTCCCGGGTAGCTGGGATTACAGG----CGCCTGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTG 350

 35758847 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTAGTCTCGAACTACTGACTT 35758906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      351 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTAGTCTCGAACTACTGACTT 410

 35758907 CAAGTGACCCACCCACATCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTACTGCA 35758966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      411 CAAGTGACCCACCCACATCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTACTGCA 470

 35758967 TCGGGCTTTCATCATATCCTTATGAAACGCTTATGAATTAGACATTATTATTTTCATTTT 35759026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      471 TCGGGCTTTCATCATATCCTTATGAAACGCTTATGAATTAGACATTATTATTTTCATTTT 530

 35759027 ACATAGGAGGAGAAAGGAGATGCAGGAAGATAATAACTTCCCTAAATTCTTTTTTTTTTT 35759086
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||
      531 ACATAGGAGGAGAAAGGAGATGCAGGAAGATAATAACTTCCCTAAATTC--TTTTTTTTT 588

 35759087 TAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGGATCTCGGCTCACG 35759146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      589 TAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGGATCTCGGCTCACG 648

 35759147 GCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTGGGA 35759206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      649 GCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTGGGA 708

 35759207 TTATAAGCATGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 35759266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      709 TTATAAGCATGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 768

 35759267 CACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCCGCCTCAGCC 35759326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 CACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCCGCCTCAGCC 828

 35759327 TCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCCTAAATTCTTAAAGGT 35759386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      829 TCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCCTAAATTCTTAAAGGT 888

 35759387 GATAAGGAGTGGAGACAGAATTCAAATTCAGGAAAGTTTCAAAGTCCATGCTTGCTTTTT 35759446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 GATAAGGAGTGGAGACAGAATTCAAATTCAGGAAAGTTTCAAAGTCCATGCTTGCTTTTT 948

 35759447 CAATTATATTAAACAATGCCAAGTTCCTTGCATATTCCAAGCATTTATTGGGCACCTGTT 35759506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 CAATTATATTAAACAATGCCAAGTTCCTTGCATATTCCAAGCATTTATTGGGCACCTGTT 1008

 35759507 GGTTGCACAAGAGTATAGACTGCCTGTCACCAAATGATGCAAAATAATTTAGGAGCCTGT 35759566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 GGTTGCACAAGAGTATAGACTGCCTGTCACCAAATGATGCAAAATAATTTAGGAGCCTGT 1068

 35759567 TTTGACAGTCACAAGATGGAGGTCCTGTACATTAGGCAGAAAAGTATGCAGCTAGGCAGC 35759626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 TTTGACAGTCACAAGATGGAGGTCCTGTACATTAGGCAGAAAAGTATGCAGCTAGGCAGC 1128

 35759627 CTAGTAGGCATTTTAGAATTGTCTGATAAACCGAGCCACTTAGCAACAATATATTTCTAG 35759686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 CTAGTAGGCATTTTAGAATTGTCTGATAAACCGAGCCACTTAGCAACAATATATTTCTAG 1188

 35759687 TTCACCTAATTTTTTGGGTTCTGCCCAAAGGCTGGTGACTCATGAGACAGATATTCCGCA 35759746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 TTCACCTAATTTTTTGGGTTCTGCCCAAAGGCTGGTGACTCATGAGACAGATATTCCGCA 1248

 35759747 CTCTGTGTACATGAGAAAGAAGTCAGTAAGGTGAGGAAGAAGCAGAAGAGATGGGTAACG 35759806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 CTCTGTGTACATGAGAAAGAAGTCAGTAAGGTGAGGAAGAAGCAGAAGAGATGGGTAACG 1308

 35759807 AAGGCCTGGATTCACGAAAACTGTTTAATGGCCATGGTATTATGAAAATCCTGATACCAG 35759866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 AAGGCCTGGATTCACGAAAACTGTTTAATGGCCATGGTATTATGAAAATCCTGATACCAG 1368

 35759867 CCAACTCTTGAGTGTTAAATAATGAGAGTCAGTTTATTAGTTATATTTGGACAGATCTGG 35759926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 CCAACTCTTGAGTGTTAAATAATGAGAGTCAGTTTATTAGTTATATTTGGACAGATCTGG 1428

 35759927 TTTTTTGCTTTATTTTTATAAATAATGTTCTAAGAAATATATTTTATTTAATTTACTTAT 35759986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1429 TTTTTTGCTTTATTTTTATAAATAATGTTCTAAGAAATTTATTTTATTTAATTTACTTAT 1488

 35759987 GGCATATTTAAACATTTTTTGGCAAATAAAAATTGTGTATATTCATGATGTACAACATGT 35760046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 GGCATATTTAAACATTTTTTGGCAAATAAAAATTGTGTATATTCATGATGTACAACATGT 1548

 35760047 GTTGATAGACGTACTCATTGTGGAATGGCTAAATCAAGCTAATTAACAAATCCATTACCT 35760106
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 GTTGATAGATGTACTCATTGTGGAATGGCTAAATCAAGCTAATTAACAAATCCATTACCT 1608

 35760107 CAAATATATACCCATTACCGCAAATACTTATTTTTTTGTGTGGTAAGAACAACTAAAATC 35760166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 CAAATATATACCCATTACCGCAAATACTTATTTTTTTGTGTGGTAAGAACAACTAAAATC 1668

 35760167 TACTCTCTTAGCAATTTTCAAGCATATATATATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTT 35760226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 TACTCTCTTAGCAATTTTCAAGCATATATATATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTT 1728

 35760227 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGCAATCTTGGCTCACT 35760286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGCAATCTTGGCTCACT 1788

 35760287 GCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGA 35760346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 GCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGA 1848

 35760347 TTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 35760406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 TTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 1908

 35760407 ACCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCAAACCCCTGACCTCAGATGACCCACCTGCCTCAGCCT 35760466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 ACCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCAAACCCCTGACCTCAGATGACCCACCTGCCTCAGCCT 1968

 35760467 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCTGGCCTCAAGTATATATTTTTA 35760526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCTGGCCTCAAGTATATATTTTTA 2028

 35760527 ACTATAGTCACCATATAGTATAATAGATCTCCTGCACTTATTCCTGCTGTCTAACTGAAA 35760586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 ACTATAGTCACCATATAGTATAATAGATCTCCTGCACTTATTCCTGCTGTCTAACTGAAA 2088

 35760587 TTTTGTATCCTTTGGCCAAAATCTTCCAATTCTTTCTCTCTCATCCCCTGGTAACCACCA 35760646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 TTTTGTATCCTTTGGCCAAAATCTTCCAATTCTTTCTCTCTCATCCCCTGGTAACCACCA 2148

 35760647 TTCTGCTACTTCTACAAGCTTGACTTTTTTAGATGCCACACATAAGTGAGATTAAGCAGT 35760706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 TTCTGCTACTTCTACAAGCTTGACTTTTTTAGATGCCACACATAAGTGAGATTAAGCAGT 2208

 35760707 ATTTGTTTTTCTGTGCCTGGCTTATTTCACTTTGCATAATGTCCTCCAGGTCCATCTATG 35760766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2209 ATTTGTTTTTCTGTGCCTGGCTTATTTCACTTAGCATAATGTCCTCCAGGTCCATCTATG 2268

 35760767 TTGCTGCAAATGACAGGATTTCCTTATTTTTTAAGGCTGAACAGTATTCCATTGTGTGTG 35760826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 TTGCTGCAAATGACAGGATTTCCTTATTTTTTAAGGCTGAACAGTATTCCATTGTGTGTG 2328

 35760827 TGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTATATCTCACATTTTCTTTATTCATTCATCCA 35760886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 TGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTATATCTCACATTTTCTTTATTCATTCATCCA 2388

 35760887 TTGGCATACATGTAGGCTGTTTCCATGTCTTGGCTATGGTGAATAATGCTGCAATGGATA 35760946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 TTGGCATACATGTAGGCTGTTTCCATGTCTTGGCTATGGTGAATAATGCTGCAATGGATA 2448

 35760947 TGGGAGTACAGATACCTTGACATGCAGATATCATTTCCTTTGGATATATACCCAGAAGTG 35761006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 TGGGAGTACAGATACCTTGACATGCAGATATCATTTCCTTTGGATATATACCCAGAAGTG 2508

 35761007 GATTATTGGATCATATGGTAGTTCCATTCAAAAATTTTTAAGGAACCTCCATACTATTTT 35761066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 GATTATTGGATCATATGGTAGTTCCATTCAAAAATTTTTAAGGAACCTCCATACTATTTT 2568

 35761067 CCAAAATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACTGACAGTGTACAGGGTTTTTCTCCACATC 35761126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 CCAAAATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACTGACAGTGTACAGGGTTTTTCTCCACATC 2628

 35761127 CTTGCCAATGCTTATCTCGCTTTTTGATAATAATCATTCTGACAGGTGTGAGGTGATATC 35761186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 CTTGCCAATGCTTATCTCGCTTTTTGATAATAATCATTCTGACAGGTGTGAGGTGATATC 2688

 35761187 TCATGGTAGTTTTAATTCACATTTCCCTGATGATTAGTGATGTTGAACATTTTTTTCACA 35761246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 TCATGGTAGTTTTAATTCACATTTCCCTGATGATTAGTGATGTTGAACATTTTTTTCACA 2748

 35761247 TACCAGTTAGCTATTTGCATGTCTTTTTCTTTTGTTTTTCTTT 35761289
          ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 TACCAGTTGGCTATTTGCATGTCTTTTTCTTTTGTTTTTCTTT 2791

Alignment time is 3.75428 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [35745597,35768790] =>     23194 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    4077] =>      4077 nucs 'mol-32-3306-150412_4077'

Score:        3896
Aligned:      4020        nucs
Identic:      4003 (100%) nucs =>       158 ( 99%)      3845 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [35755439,35755597] EXCISED REGION [35758791,35762646]
 second seq =>  [       5,     163] EXCISED REGION [     222,    4077]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3193 nucs [35755598,35758790]
 second seq =>        58 nucs [164,221]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [164,164] to [222,222]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 35755439 CCATATTGGTCAGGCTGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCC 35755498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        5 CCATATTGGTCAGGCTGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCC 64

 35755499 AAAAGTGCTGGGATTATGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGACTTTTTTTTTGA 35755558
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
       65 AAAAGTGCTGGGATTATGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGGCTTTTTTTTTGA 124

 35755559 GACAGAGTCTGGCACTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 35755597
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      125 GACAGAGTCTGGCACTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 163

EXCISED REGION

 35758791 AGCCTCCCGGGTAGCTGGGATTACAGGTGCA----TGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTG 35758846
          |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||
      222 AGCCTCCCGGGTAGCTGGGATTACAGG----CGCCTGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTG 277

 35758847 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTAGTCTCGAACTACTGACTT 35758906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      278 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTAGTCTCGAACTACTGACTT 337

 35758907 CAAGTGACCCACCCACATCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTACTGCA 35758966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      338 CAAGTGACCCACCCACATCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTACTGCA 397

 35758967 TCGGGCTTTCATCATATCCTTATGAAACGCTTATGAATTAGACATTATTATTTTCATTTT 35759026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      398 TCGGGCTTTCATCATATCCTTATGAAACGCTTATGAATTAGACATTATTATTTTCATTTT 457

 35759027 ACATAGGAGGAGAAAGGAGATGCAGGAAGATAATAACTTCCCTAAATTCTTTTTTTTTTT 35759086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      458 ACATAGGAGGAGAAAGGAGATGCAGGAAGATAATAACTTCCCTAAATTCTTTTTTTTTTT 517

 35759087 TAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGGATCTCGGCTCACG 35759146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      518 TAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGGATCTCGGCTCACG 577

 35759147 GCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTGGGA 35759206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      578 GCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTGGGA 637

 35759207 TTATAAGCATGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 35759266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      638 TTATAAGCATGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 697

 35759267 CACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCCGCCTCAGCC 35759326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      698 CACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCCGCCTCAGCC 757

 35759327 TCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCCTAAATTCTTAAAGGT 35759386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      758 TCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCCTAAATTCTTAAAGGT 817

 35759387 GATAAGGAGTGGAGACAGAATTCAAATTCAGGAAAGTTTCAAAGTCCATGCTTGCTTTTT 35759446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      818 GATAAGGAGTGGAGACAGAATTCAAATTCAGGAAAGTTTCAAAGTCCATGCTTGCTTTTT 877

 35759447 CAATTATATTAAACAATGCCAAGTTCCTTGCATATTCCAAGCATTTATTGGGCACCTGTT 35759506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      878 CAATTATATTAAACAATGCCAAGTTCCTTGCATATTCCAAGCATTTATTGGGCACCTGTT 937

 35759507 GGTTGCACAAGAGTATAGACTGCCTGTCACCAAATGATGCAAAATAATTTAGGAGCCTGT 35759566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      938 GGTTGCACAAGAGTATAGACTGCCTGTCACCAAATGATGCAAAATAATTTAGGAGCCTGT 997

 35759567 TTTGACAGTCACAAGATGGAGGTCCTGTACATTAGGCAGAAAAGTATGCAGCTAGGCAGC 35759626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 TTTGACAGTCACAAGATGGAGGTCCTGTACATTAGGCAGAAAAGTATGCAGCTAGGCAGC 1057

 35759627 CTAGTAGGCATTTTAGAATTGTCTGATAAACCGAGCCACTTAGCAACAATATATTTCTAG 35759686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 CTAGTAGGCATTTTAGAATTGTCTGATAAACCGAGCCACTTAGCAACAATATATTTCTAG 1117

 35759687 TTCACCTAATTTTTTGGGTTCTGCCCAAAGGCTGGTGACTCATGAGACAGATATTCCGCA 35759746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 TTCACCTAATTTTTTGGGTTCTGCCCAAAGGCTGGTGACTCATGAGACAGATATTCCGCA 1177

 35759747 CTCTGTGTACATGAGAAAGAAGTCAGTAAGGTGAGGAAGAAGCAGAAGAGATGGGTAACG 35759806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 CTCTGTGTACATGAGAAAGAAGTCAGTAAGGTGAGGAAGAAGCAGAAGAGATGGGTAACG 1237

 35759807 AAGGCCTGGATTCACGAAAACTGTTTAATGGCCATGGTATTATGAAAATCCTGATACCAG 35759866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 AAGGCCTGGATTCACGAAAACTGTTTAATGGCCATGGTATTATGAAAATCCTGATACCAG 1297

 35759867 CCAACTCTTGAGTGTTAAATAATGAGAGTCAGTTTATTAGTTATATTTGGACAGATCTGG 35759926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 CCAACTCTTGAGTGTTAAATAATGAGAGTCAGTTTATTAGTTATATTTGGACAGATCTGG 1357

 35759927 TTTTTTGCTTTATTTTTATAAATAATGTTCTAAGAAATATATTTTATTTAATTTACTTAT 35759986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1358 TTTTTTGCTTTATTTTTATAAATAATGTTCTAAGAAATTTATTTTATTTAATTTACTTAT 1417

 35759987 GGCATATTTAAACATTTTTTGGCAAATAAAAATTGTGTATATTCATGATGTACAACATGT 35760046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 GGCATATTTAAACATTTTTTGGCAAATAAAAATTGTGTATATTCATGATGTACAACATGT 1477

 35760047 GTTGATAGACGTACTCATTGTGGAATGGCTAAATCAAGCTAATTAACAAATCCATTACCT 35760106
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 GTTGATAGATGTACTCATTGTGGAATGGCTAAATCAAGCTAATTAACAAATCCATTACCT 1537

 35760107 CAAATATATACCCATTACCGCAAATACTTATTTTTTTGTGTGGTAAGAACAACTAAAATC 35760166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 CAAATATATACCCATTACCGCAAATACTTATTTTTTTGTGTGGTAAGAACAACTAAAATC 1597

 35760167 TACTCTCTTAGCAATTTTCAAGCATATATATATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTT 35760226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 TACTCTCTTAGCAATTTTCAAGCATATATATATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTT 1657

 35760227 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGCAATCTTGGCTCACT 35760286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGCAATCTTGGCTCACT 1717

 35760287 GCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGA 35760346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 GCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGA 1777

 35760347 TTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 35760406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 TTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 1837

 35760407 ACCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCAAACCCCTGACCTCAGATGACCCACCTGCCTCAGCCT 35760466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 ACCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCAAACCCCTGACCTCAGATGACCCACCTGCCTCAGCCT 1897

 35760467 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCTGGCCTCAAGTATATATTTTTA 35760526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCTGGCCTCAAGTATATATTTTTA 1957

 35760527 ACTATAGTCACCATATAGTATAATAGATCTCCTGCACTTATTCCTGCTGTCTAACTGAAA 35760586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 ACTATAGTCACCATATAGTATAATAGATCTCCTGCACTTATTCCTGCTGTCTAACTGAAA 2017

 35760587 TTTTGTATCCTTTGGCCAAAATCTTCCAATTCTTTCTCTCTCATCCCCTGGTAACCACCA 35760646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TTTTGTATCCTTTGGCCAAAATCTTCCAATTCTTTCTCTCTCATCCCCTGGTAACCACCA 2077

 35760647 TTCTGCTACTTCTACAAGCTTGACTTTTTTAGATGCCACACATAAGTGAGATTAAGCAGT 35760706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 TTCTGCTACTTCTACAAGCTTGACTTTTTTAGATGCCACACATAAGTGAGATTAAGCAGT 2137

 35760707 ATTTGTTTTTCTGTGCCTGGCTTATTTCACTTTGCATAATGTCCTCCAGGTCCATCTATG 35760766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2138 ATTTGTTTTTCTGTGCCTGGCTTATTTCACTTAGCATAATGTCCTCCAGGTCCATCTATG 2197

 35760767 TTGCTGCAAATGACAGGATTTCCTTATTTTTTAAGGCTGAACAGTATTCCATTGTGTGTG 35760826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TTGCTGCAAATGACAGGATTTCCTTATTTTTTAAGGCTGAACAGTATTCCATTGTGTGTG 2257

 35760827 TGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTATATCTCACATTTTCTTTATTCATTCATCCA 35760886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 TGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTATATCTCACATTTTCTTTATTCATTCATCCA 2317

 35760887 TTGGCATACATGTAGGCTGTTTCCATGTCTTGGCTATGGTGAATAATGCTGCAATGGATA 35760946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 TTGGCATACATGTAGGCTGTTTCCATGTCTTGGCTATGGTGAATAATGCTGCAATGGATA 2377

 35760947 TGGGAGTACAGATACCTTGACATGCAGATATCATTTCCTTTGGATATATACCCAGAAGTG 35761006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 TGGGAGTACAGATACCTTGACATGCAGATATCATTTCCTTTGGATATATACCCAGAAGTG 2437

 35761007 GATTATTGGATCATATGGTAGTTCCATTCAAAAATTTTTAAGGAACCTCCATACTATTTT 35761066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 GATTATTGGATCATATGGTAGTTCCATTCAAAAATTTTTAAGGAACCTCCATACTATTTT 2497

 35761067 CCAAAATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACTGACAGTGTACAGGGTTTTTCTCCACATC 35761126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 CCAAAATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACTGACAGTGTACAGGGTTTTTCTCCACATC 2557

 35761127 CTTGCCAATGCTTATCTCGCTTTTTGATAATAATCATTCTGACAGGTGTGAGGTGATATC 35761186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 CTTGCCAATGCTTATCTCGCTTTTTGATAATAATCATTCTGACAGGTGTGAGGTGATATC 2617

 35761187 TCATGGTAGTTTTAATTCACATTTCCCTGATGATTAGTGATGTTGAACATTTTTTTCACA 35761246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 TCATGGTAGTTTTAATTCACATTTCCCTGATGATTAGTGATGTTGAACATTTTTTTCACA 2677

 35761247 TACCAGTTAGCTATTTGCATGTCTTTTTCTTTTGTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGA 35761306
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     2678 TACCAGTTAGCTATTTGCATGTCTTTTTCTTTTGTTTTTC-TTTTTTTTTTTTTTTGAGA 2736

 35761307 CAGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCT 35761366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 CAGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCT 2796

 35761367 CCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGAATACAAG 35761426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 CCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGAATACAAG 2856

 35761427 CGCCCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTTTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCAGGT 35761486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 CGCCCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTTTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCAGGT 2916

 35761487 TGGCCCGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCATGC 35761546
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 TGGCCCGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCATGC 2976

 35761547 TACTTGCATGTCTTCTTTTGAGCAATGTCTTTTCAGGCCCTTGTCCACTTATCTGATGTA 35761606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 TACTTGCATGTCTTCTTTTGAGCAATGTCTTTTCAGGCCCTTGTCCACTTATCTGATGTA 3036

 35761607 GGGGTCGTGAATATTTTCTCCCATTCCGTAGGTTGTCTCTTTACC-TTTTTTTTTTTTTT 35761665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     3037 GGGGTCGTGAATATTTTCTCCCATTCCGTAGGTTGTCTCTTTACCTTTTTTTTTTTTTTT 3096

 35761666 CCAGACGAGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTAAAGTGGCACAATCACGGTCACTA 35761725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 CCAGACGAGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTAAAGTGGCACAATCACGGTCACTA 3156

 35761726 CAGCCTCAACTGTCTGAGCTCAAGTGATTCTCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAC 35761785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 CAGCCTCAACTGTCTGAGCTCAAGTGATTCTCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAC 3216

 35761786 CACAGGCGTGTGCTATCATGCCCAGCTAATTTTTTGATTTTTTTGTAGAGTTGAACTCTC 35761845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 CACAGGCGTGTGCTATCATGCCCAGCTAATTTTTTGATTTTTTTGTAGAGTTGAACTCTC 3276

 35761846 ACTAAGTCACCCAGTTTAGTCTCGAACTCCTGAGCCCAAGCAATCTTCCCACCTAGGACT 35761905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 ACTAAGTCACCCAGTTTAGTCTCGAACTCCTGAGCCCAAGCAATCTTCCCACCTAGGACT 3336

 35761906 GTCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCAGAAACTCTACGTTTGA 35761965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 GTCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCAGAAACTCTACGTTTGA 3396

 35761966 TTCTAACCACAGCAGCTTAGCAGCTGAGGACAAACTGTTGGGATATTTTGGTCTCAGTCA 35762025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 TTCTAACCACAGCAGCTTAGCAGCTGAGGACAAACTGTTGGGATATTTTGGTCTCAGTCA 3456

 35762026 ATGGCAGCCAGGTTACCAACCCTGACAAGATACAAGTTTTCTTCGTTGGGTTCCTGGTAC 35762085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 ATGGCAGCCAGGTTACCAACCCTGACAAGATACAAGTTTTCTTCGTTGGGTTCCTGGTAC 3516

 35762086 AAAAGTCAACCTTTTCAGTTAGTTATGAATGAAAGGGCATGAAGATTGTGCTATTAGTTT 35762145
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 AAAAGTCAACCTTTTCAGTTACTTATGAATGAAAGGGCATGAAGATTGTGCTATTAGTTT 3576

 35762146 ATCCTGAAGGTCAATCTTCAAAAATACTGGTTCAACATGGATTTGGATATTATTAATATA 35762205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 ATCCTGAAGGTCAATCTTCAAAAATACTGGTTCAACATGGATTTGGATATTATTAATATA 3636

 35762206 AATTTATGGCTTAAAGAGGACAAAAGGTGTTTTTTTGGGTTCCTTTACAGAGATATTTAG 35762265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 AATTTATGGCTTAAAGAGGACAAAAGGTGTTTTTTTGGGTTCCTTTACAGAGATATTTAG 3696

 35762266 TGAGGGAACAAGGCACTTAGTCATCTTTGCTATGACAGGTTAAATACAAGGTGTACTGGG 35762325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 TGAGGGAACAAGGCACTTAGTCATCTTTGCTATGACAGGTTAAATACAAGGTGTACTGGG 3756

 35762326 AACATGTAAGAGGGTGACTTAACTCAGCCATTGGGGGGTCAGGAGAAGTGTTCCTAAGGA 35762385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 AACATGTAAGAGGGTGACTTAACTCAGCCATTGGGGGGTCAGGAGAAGTGTTCCTAAGGA 3816

 35762386 AGTGATGTCTAAGTGAGGTAGGCAGTACCTTGGCAAAAAAAACCTTGAAGTTAAGAGTGC 35762445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 AGTGATGTCTAAGTGAGGTAGGCAGTACCTTGGCAAAAAAAACCTTGAAGTTAAGAGTGC 3876

 35762446 ATATGAGAAATGAAGGTATGTCCACCTGGCTGGCAAATGGAGTCTAAGATAGGGCAGTGA 35762505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 ATATGAGAAATGAAGGTATGTCCACCTGGCTGGCAAATGGAGTCTAAGATAGGGCAGTGA 3936

 35762506 TGATAAAGATACAGGAAGATGCTAGATCTGGAAGGGCCTTCTAAAAAGAATGACAATATA 35762565
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 TGATAAAGATATAGGAAGATGCTAGATCTGGAAGGGCCTTCTAAAAAGAATGACAATATA 3996

 35762566 AATTTATTGTACAAATGGAGACTTTACTGAGAGTGAAACCAGGCAATATTAATACTTAGG 35762625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 AATTTATTGTACAAATGGAGACTTTACTGAGAGTGAAACCAGGCAATATTAATACTTAGG 4056

 35762626 TAGGGACAACAGATATAAACC 35762646
          |||||||||||||||||||||
     4057 TAGGGACAACAGATATAAACC 4077

Alignment time is 5.91307 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [35745597,35768790] =>     23194 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    4423] =>      4423 nucs 'mol-32-3403-083586_4423'

Score:        4246
Aligned:      4370        nucs
Identic:      4353 (100%) nucs =>       243 (100%)      4110 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [35755354,35755597] EXCISED REGION [35758791,35762911]
 second seq =>  [       1,     244] EXCISED REGION [     303,    4423]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3193 nucs [35755598,35758790]
 second seq =>        58 nucs [245,302]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [245,245] to [303,303]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 35755354 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACATGCGCCACCATGCCCTGCTAATTTTG 35755413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACATGCGCCACCATGCCCTGCTAATTTTG 60

 35755414 TATTTTTAGTTGAGATGTGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGTCTCGAACTCCTGACCTC 35755473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTTTTAGTTGAGATGTGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGTCTCGAACTCCTGACCTC 120

 35755474 AGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTATGGGATTACAGGCGTGAGC 35755533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTATGGGATTACAGGCGTGAGC 180

 35755534 CACCATGCCCGGACTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTGGCACTGTTGCCCAGGCTGGAGTGC 35755593
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACCATGCCCGGGCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTGGCACTGTTGCCCAGGCTGGAGTGC 240

 35755594 AGTG 35755597
          ||||
      241 AGTG 244

EXCISED REGION

 35758791 AGCCTCCCGGGTAGCTGGGATTACAGGTGCA----TGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTG 35758846
          |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||
      303 AGCCTCCCGGGTAGCTGGGATTACAGG----CGCCTGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTG 358

 35758847 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTAGTCTCGAACTACTGACTT 35758906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTAGTCTCGAACTACTGACTT 418

 35758907 CAAGTGACCCACCCACATCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTACTGCA 35758966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 CAAGTGACCCACCCACATCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTACTGCA 478

 35758967 TCGGGCTTTCATCATATCCTTATGAAACGCTTATGAATTAGACATTATTATTTTCATTTT 35759026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 TCGGGCTTTCATCATATCCTTATGAAACGCTTATGAATTAGACATTATTATTTTCATTTT 538

 35759027 ACATAGGAGGAGAAAGGAGATGCAGGAAGATAATAACTTCCCTAAATTCTTTTTTTTTTT 35759086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 ACATAGGAGGAGAAAGGAGATGCAGGAAGATAATAACTTCCCTAAATTCTTTTTTTTTTT 598

 35759087 TAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGGATCTCGGCTCACG 35759146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGGATCTCGGCTCACG 658

 35759147 GCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTGGGA 35759206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 GCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTGGGA 718

 35759207 TTATAAGCATGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 35759266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 TTATAAGCATGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 778

 35759267 CACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCCGCCTCAGCC 35759326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 CACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCCGCCTCAGCC 838

 35759327 TCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCCTAAATTCTTAAAGGT 35759386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 TCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCCTAAATTCTTAAAGGT 898

 35759387 GATAAGGAGTGGAGACAGAATTCAAATTCAGGAAAGTTTCAAAGTCCATGCTTGCTTTTT 35759446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 GATAAGGAGTGGAGACAGAATTCAAATTCAGGAAAGTTTCAAAGTCCATGCTTGCTTTTT 958

 35759447 CAATTATATTAAACAATGCCAAGTTCCTTGCATATTCCAAGCATTTATTGGGCACCTGTT 35759506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 CAATTATATTAAACAATGCCAAGTTCCTTGCATATTCCAAGCATTTATTGGGCACCTGTT 1018

 35759507 GGTTGCACAAGAGTATAGACTGCCTGTCACCAAATGATGCAAAATAATTTAGGAGCCTGT 35759566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 GGTTGCACAAGAGTATAGACTGCCTGTCACCAAATGATGCAAAATAATTTAGGAGCCTGT 1078

 35759567 TTTGACAGTCACAAGATGGAGGTCCTGTACATTAGGCAGAAAAGTATGCAGCTAGGCAGC 35759626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 TTTGACAGTCACAAGATGGAGGTCCTGTACATTAGGCAGAAAAGTATGCAGCTAGGCAGC 1138

 35759627 CTAGTAGGCATTTTAGAATTGTCTGATAAACCGAGCCACTTAGCAACAATATATTTCTAG 35759686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 CTAGTAGGCATTTTAGAATTGTCTGATAAACCGAGCCACTTAGCAACAATATATTTCTAG 1198

 35759687 TTCACCTAATTTTTTGGGTTCTGCCCAAAGGCTGGTGACTCATGAGACAGATATTCCGCA 35759746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TTCACCTAATTTTTTGGGTTCTGCCCAAAGGCTGGTGACTCATGAGACAGATATTCCGCA 1258

 35759747 CTCTGTGTACATGAGAAAGAAGTCAGTAAGGTGAGGAAGAAGCAGAAGAGATGGGTAACG 35759806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CTCTGTGTACATGAGAAAGAAGTCAGTAAGGTGAGGAAGAAGCAGAAGAGATGGGTAACG 1318

 35759807 AAGGCCTGGATTCACGAAAACTGTTTAATGGCCATGGTATTATGAAAATCCTGATACCAG 35759866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 AAGGCCTGGATTCACGAAAACTGTTTAATGGCCATGGTATTATGAAAATCCTGATACCAG 1378

 35759867 CCAACTCTTGAGTGTTAAATAATGAGAGTCAGTTTATTAGTTATATTTGGACAGATCTGG 35759926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 CCAACTCTTGAGTGTTAAATAATGAGAGTCAGTTTATTAGTTATATTTGGACAGATCTGG 1438

 35759927 TTTTTTGCTTTATTTTTATAAATAATGTTCTAAGAAATATATTTTATTTAATTTACTTAT 35759986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1439 TTTTTTGCTTTATTTTTATAAATAATGTTCTAAGAAATTTATTTTATTTAATTTACTTAT 1498

 35759987 GGCATATTTAAACATTTTTTGGCAAATAAAAATTGTGTATATTCATGATGTACAACATGT 35760046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GGCATATTTAAACATTTTTTGGCAAATAAAAATTGTGTATATTCATGATGTACAACATGT 1558

 35760047 GTTGATAGACGTACTCATTGTGGAATGGCTAAATCAAGCTAATTAACAAATCCATTACCT 35760106
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GTTGATAGATGTACTCATTGTGGAATGGCTAAATCAAGCTAATTAACAAATCCATTACCT 1618

 35760107 CAAATATATACCCATTACCGCAAATACTTATTTTTTTGTGTGGTAAGAACAACTAAAATC 35760166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 CAAATATATACCCATTACCGCAAATACTTATTTTTTTGTGTGGTAAGAACAACTAAAATC 1678

 35760167 TACTCTCTTAGCAATTTTCAAGCATATATATATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTT 35760226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TACTCTCTTAGCAATTTTCAAGCATATATATATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTT 1738

 35760227 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGCAATCTTGGCTCACT 35760286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGCAATCTTGGCTCACT 1798

 35760287 GCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGA 35760346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGA 1858

 35760347 TTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 35760406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 1918

 35760407 ACCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCAAACCCCTGACCTCAGATGACCCACCTGCCTCAGCCT 35760466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ACCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCAAACCCCTGACCTCAGATGACCCACCTGCCTCAGCCT 1978

 35760467 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCTGGCCTCAAGTATATATTTTTA 35760526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCTGGCCTCAAGTATATATTTTTA 2038

 35760527 ACTATAGTCACCATATAGTATAATAGATCTCCTGCACTTATTCCTGCTGTCTAACTGAAA 35760586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 ACTATAGTCACCATATAGTATAATAGATCTCCTGCACTTATTCCTGCTGTCTAACTGAAA 2098

 35760587 TTTTGTATCCTTTGGCCAAAATCTTCCAATTCTTTCTCTCTCATCCCCTGGTAACCACCA 35760646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTTTGTATCCTTTGGCCAAAATCTTCCAATTCTTTCTCTCTCATCCCCTGGTAACCACCA 2158

 35760647 TTCTGCTACTTCTACAAGCTTGACTTTTTTAGATGCCACACATAAGTGAGATTAAGCAGT 35760706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TTCTGCTACTTCTACAAGCTTGACTTTTTTAGATGCCACACATAAGTGAGATTAAGCAGT 2218

 35760707 ATTTGTTTTTCTGTGCCTGGCTTATTTCACTTTGCATAATGTCCTCCAGGTCCATCTATG 35760766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2219 ATTTGTTTTTCTGTGCCTGGCTTATTTCACTTAGCATAATGTCCTCCAGGTCCATCTATG 2278

 35760767 TTGCTGCAAATGACAGGATTTCCTTATTTTTTAAGGCTGAACAGTATTCCATTGTGTGTG 35760826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TTGCTGCAAATGACAGGATTTCCTTATTTTTTAAGGCTGAACAGTATTCCATTGTGTGTG 2338

 35760827 TGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTATATCTCACATTTTCTTTATTCATTCATCCA 35760886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTATATCTCACATTTTCTTTATTCATTCATCCA 2398

 35760887 TTGGCATACATGTAGGCTGTTTCCATGTCTTGGCTATGGTGAATAATGCTGCAATGGATA 35760946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TTGGCATACATGTAGGCTGTTTCCATGTCTTGGCTATGGTGAATAATGCTGCAATGGATA 2458

 35760947 TGGGAGTACAGATACCTTGACATGCAGATATCATTTCCTTTGGATATATACCCAGAAGTG 35761006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TGGGAGTACAGATACCTTGACATGCAGATATCATTTCCTTTGGATATATACCCAGAAGTG 2518

 35761007 GATTATTGGATCATATGGTAGTTCCATTCAAAAATTTTTAAGGAACCTCCATACTATTTT 35761066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 GATTATTGGATCATATGGTAGTTCCATTCAAAAATTTTTAAGGAACCTCCATACTATTTT 2578

 35761067 CCAAAATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACTGACAGTGTACAGGGTTTTTCTCCACATC 35761126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CCAAAATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACTGACAGTGTACAGGGTTTTTCTCCACATC 2638

 35761127 CTTGCCAATGCTTATCTCGCTTTTTGATAATAATCATTCTGACAGGTGTGAGGTGATATC 35761186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 CTTGCCAATGCTTATCTCGCTTTTTGATAATAATCATTCTGACAGGTGTGAGGTGATATC 2698

 35761187 TCATGGTAGTTTTAATTCACATTTCCCTGATGATTAGTGATGTTGAACATTTTTTTCACA 35761246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TCATGGTAGTTTTAATTCACATTTCCCTGATGATTAGTGATGTTGAACATTTTTTTCACA 2758

 35761247 TACCAGTTAGCTATTTGCATGTCTTTTTCTTTTGTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGA 35761306
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     2759 TACCAGTTAGCTATTTGCATGTCTTTTTCTTTTGTTTTTC-TTTTTTTTTTTTTTTGAGA 2817

 35761307 CAGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCT 35761366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 CAGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCT 2877

 35761367 CCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGAATACAAG 35761426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 CCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGAATACAAG 2937

 35761427 CGCCCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTTTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCAGGT 35761486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 CGCCCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTTTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCAGGT 2997

 35761487 TGGCCCGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCATGC 35761546
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TGGCCCGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCATGC 3057

 35761547 TACTTGCATGTCTTCTTTTGAGCAATGTCTTTTCAGGCCCTTGTCCACTTATCTGATGTA 35761606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 TACTTGCATGTCTTCTTTTGAGCAATGTCTTTTCAGGCCCTTGTCCACTTATCTGATGTA 3117

 35761607 GGGGTCGTGAATATTTTCTCCCATTCCGTAGGTTGTCTCTTTACC-TTTTTTTTTTTTTT 35761665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     3118 GGGGTCGTGAATATTTTCTCCCATTCCGTAGGTTGTCTCTTTACCTTTTTTTTTTTTTTT 3177

 35761666 CCAGACGAGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTAAAGTGGCACAATCACGGTCACTA 35761725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 CCAGACGAGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTAAAGTGGCACAATCACGGTCACTA 3237

 35761726 CAGCCTCAACTGTCTGAGCTCAAGTGATTCTCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAC 35761785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 CAGCCTCAACTGTCTGAGCTCAAGTGATTCTCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAC 3297

 35761786 CACAGGCGTGTGCTATCATGCCCAGCTAATTTTTTGATTTTTTTGTAGAGTTGAACTCTC 35761845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CACAGGCGTGTGCTATCATGCCCAGCTAATTTTTTGATTTTTTTGTAGAGTTGAACTCTC 3357

 35761846 ACTAAGTCACCCAGTTTAGTCTCGAACTCCTGAGCCCAAGCAATCTTCCCACCTAGGACT 35761905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 ACTAAGTCACCCAGTTTAGTCTCGAACTCCTGAGCCCAAGCAATCTTCCCACCTAGGACT 3417

 35761906 GTCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCAGAAACTCTACGTTTGA 35761965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 GTCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCAGAAACTCTACGTTTGA 3477

 35761966 TTCTAACCACAGCAGCTTAGCAGCTGAGGACAAACTGTTGGGATATTTTGGTCTCAGTCA 35762025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 TTCTAACCACAGCAGCTTAGCAGCTGAGGACAAACTGTTGGGATATTTTGGTCTCAGTCA 3537

 35762026 ATGGCAGCCAGGTTACCAACCCTGACAAGATACAAGTTTTCTTCGTTGGGTTCCTGGTAC 35762085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 ATGGCAGCCAGGTTACCAACCCTGACAAGATACAAGTTTTCTTCGTTGGGTTCCTGGTAC 3597

 35762086 AAAAGTCAACCTTTTCAGTTAGTTATGAATGAAAGGGCATGAAGATTGTGCTATTAGTTT 35762145
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 AAAAGTCAACCTTTTCAGTTACTTATGAATGAAAGGGCATGAAGATTGTGCTATTAGTTT 3657

 35762146 ATCCTGAAGGTCAATCTTCAAAAATACTGGTTCAACATGGATTTGGATATTATTAATATA 35762205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 ATCCTGAAGGTCAATCTTCAAAAATACTGGTTCAACATGGATTTGGATATTATTAATATA 3717

 35762206 AATTTATGGCTTAAAGAGGACAAAAGGTGTTTTTTTGGGTTCCTTTACAGAGATATTTAG 35762265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 AATTTATGGCTTAAAGAGGACAAAAGGTGTTTTTTTGGGTTCCTTTACAGAGATATTTAG 3777

 35762266 TGAGGGAACAAGGCACTTAGTCATCTTTGCTATGACAGGTTAAATACAAGGTGTACTGGG 35762325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TGAGGGAACAAGGCACTTAGTCATCTTTGCTATGACAGGTTAAATACAAGGTGTACTGGG 3837

 35762326 AACATGTAAGAGGGTGACTTAACTCAGCCATTGGGGGGTCAGGAGAAGTGTTCCTAAGGA 35762385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 AACATGTAAGAGGGTGACTTAACTCAGCCATTGGGGGGTCAGGAGAAGTGTTCCTAAGGA 3897

 35762386 AGTGATGTCTAAGTGAGGTAGGCAGTACCTTGGCAAAAAAAACCTTGAAGTTAAGAGTGC 35762445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 AGTGATGTCTAAGTGAGGTAGGCAGTACCTTGGCAAAAAAAACCTTGAAGTTAAGAGTGC 3957

 35762446 ATATGAGAAATGAAGGTATGTCCACCTGGCTGGCAAATGGAGTCTAAGATAGGGCAGTGA 35762505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 ATATGAGAAATGAAGGTATGTCCACCTGGCTGGCAAATGGAGTCTAAGATAGGGCAGTGA 4017

 35762506 TGATAAAGATACAGGAAGATGCTAGATCTGGAAGGGCCTTCTAAAAAGAATGACAATATA 35762565
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 TGATAAAGATATAGGAAGATGCTAGATCTGGAAGGGCCTTCTAAAAAGAATGACAATATA 4077

 35762566 AATTTATTGTACAAATGGAGACTTTACTGAGAGTGAAACCAGGCAATATTAATACTTAGG 35762625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 AATTTATTGTACAAATGGAGACTTTACTGAGAGTGAAACCAGGCAATATTAATACTTAGG 4137

 35762626 TAGGGACAACAGATATAAACCAGGCTATTCTCAGCAAATCAGAAATTATGGTCACCCTAC 35762685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 TAGGGACAACAGATATAAACCAGGCTATTCTCAGCAAATCAGAAATTATGGTCACCCTAC 4197

 35762686 TTGTAAGTCACATTCAGGTGCTTAGACTTTCAGTGAAAGCATAGAGTATGTATCTTCTAC 35762745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 TTGTAAGTCACATTCAGGTGCTTAGACTTTCAGTGAAAGCATAGAGTATGTATCTTCTAC 4257

 35762746 ATTTTGCCTAAGTGACTTCATTCTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCA 35762805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 ATTTTGCCTAAGTGACTTCATTCTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCA 4317

 35762806 GGCTGGAGTACAGCGGCACGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCCAGGTTCACGCC 35762865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 GGCTGGAGTACAGCGGCACGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCCAGGTTCACGCC 4377

 35762866 ATTCTTCTTCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCA 35762911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 ATTCTTCTTCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCA 4423

Alignment time is 6.43896 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [35745597,35768790] =>     23194 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    9576] =>      9576 nucs 'mol-32-3492-181445_9576'

Score:        9323
Aligned:      9530        nucs
Identic:      9503 (100%) nucs =>      2171 (100%)      7332 (100%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [35753421,35755597] EXCISED REGION [35758791,35766138]
 second seq =>  [       1,    2173] EXCISED REGION [    2232,    9576]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3193 nucs [35755598,35758790]
 second seq =>        58 nucs [2174,2231]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2174,2174] to [2232,2232]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 35753421 TGAAAGGCCTGAACAAGCCATTAACATCCTTCCTTTTCTGTACTCCCAGGCTAGTGCAAC 35753480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAAAGGCCTGAACAAGCCATTAACATCCTTCCTTTTCTGTACTCCCAGGCTAGTGCAAC 60

 35753481 GGTGGTTTCAGGAGTGGTACTGGCCTTAACCATTATTTCCTCATATCTCCTACCCCCTCC 35753540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTGGTTTCAGGAGTGGTACTGGCCTTAACCATTATTTCCTCATATCTCCTACCCCCTCC 120

 35753541 TATTAATATTTTGGATGCTTTCTAATCACTGCCCAGCAGATTCTGACCTAGAGCACTTTT 35753600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTAATATTTTGGATGCTTTCTAATCACTGCCCAGCAGATTCTGACCTAGAGCACTTTT 180

 35753601 CCTATGTCTATGTCCATAACTAGCCATTTTCCAAGGAAGAGTTGCTGCATGTACTTATGA 35753660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTATGTCTATGTCCATAACTAGCCATTTTCCAAGGAAGAGTTGCTGCATGTACTTATGA 240

 35753661 CTAAAGGCCAGAAGAAATCTTTTTATTTTTTGTTTGCCCTGGACAGGTTGAGAGTCCTAT 35753720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAAAGGCCAGAAGAAATCTTTTTATTTTTTGTTTGCCCTGGACAGGTTGAGAGTCCTAT 300

 35753721 GATCCCTTCCTCCCCATCCCACTGATACTCCACTCCCACTTTCAAAAAGTATTCCATTTT 35753780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATCCCTTCCTCCCCATCCCACTGATACTCCACTCCCACTTTCAAAAAGTATTCCATTTT 360

 35753781 CTGAGTTGACACAATGGCCCTCAGGTTGCCTTGAATTACTTATCTTCCCTATTATTAGTA 35753840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGAGTTGACACAATGGCCCTCAGGTTGCCTTGAATTACTTATCTTCCCTATTATTAGTA 420

 35753841 ATAGTAGTAGTAGTATTATACTTTAAATTCTAGGGTACATGTGCACAATGTCCAGGTTTA 35753900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAGTAGTAGTAGTATTATACTTTAAATTCTAGGGTACATGTGCACAATGTCCAGGTTTA 480

 35753901 TTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTTTGCTGCACCCATTAACTCGTCATTTACATT 35753960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTTTGCTGCACCCATTAACTCGTCATTTACATT 540

 35753961 AGGTATTTCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCATCCCCCCACCCCACGACAGGCGCTGATGT 35754020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGTATTTCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCATCCCCCCACCCCACGACAGGCGCTGATGT 600

 35754021 GTGATGTTCCCAGCCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCAATTTCCACCTATGAGTGAG 35754080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGATGTTCCCAGCCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCAATTTCCACCTATGAGTGAG 660

 35754081 AACATGCGATGTTTGGTTTTCTGTCCTTGCGATATTTGCTCAGAATGATGGTTTCCAGCT 35754140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACATGCGATGTTTGGTTTTCTGTCCTTGCGATATTTGCTCAGAATGATGGTTTCCAGCT 720

 35754141 TCATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTCTTATGGCTGCATAGTATTCCA 35754200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTCTTATGGCTGCATAGTATTCCA 780

 35754201 TAGTGTATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCAATTACTTATCTTCTTATATGTACTT 35754260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGTGTATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCAATTACTTATCTTCTTATATGTACTT 840

 35754261 ACTGGTTCTTCTGCTTGAAGCCCAGTATCTGTGTTAATTTGTATATCTCTATATTACTTT 35754320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTGGTTCTTCTGCTTGAAGCCCAGTATCTGTGTTAATTTGTATATCTCTATATTACTTT 900

 35754321 GTATCAACAAAGCACCATGTTCATAGCAGATACTAAAAATATTTGTTGATAATGTCACAC 35754380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTATCAACAAAGCACCATGTTCATAGCAGATACTAAAAATATTTGTTGATAATGTCACAC 960

 35754381 CACCAAATGGATAAGCTAAGGGTAGCATAGCTGACTTTCTAGAAGAGAATGAAGTAAGCT 35754440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACCAAATGGATAAGCTAAGGGTAGCATAGCTGACTTTCTAGAAGAGAATGAAGTAAGCT 1020

 35754441 TTATTTTTATATCAAAGTTGCTATCAGTTACCAGGGAGATGCAAACCAGTAAAGGGTCAT 35754500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTATTTTTATATCAAAGTTGCTATCAGTTACCAGGGAGATGCAAACCAGTAAAGGGTCAT 1080

 35754501 ACTATAATTGTTGCTAACACTTGAATTCATCTCTTTAGACTTATTTTCCCTCATATTTCA 35754560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACTATAATTGTTGCTAACACTTGAATTCATCTCTTTAGACTTATTTTCCCTCATATTTCA 1140

 35754561 TCATCTGTTCCTTTTTCTCTTCCTCTTCATTATTACAACACTTTTCTTTTGTCTTTCCTT 35754620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCATCTGTTCCTTTTTCTCTTCCTCTTCATTATTACAACACTTTTCTTTTGTCTTTCCTT 1200

 35754621 ATTCAATGACCTGATTTGTCAGTGATCAAATTCTAAAAATTTCCCTCAATCTGAACTTCT 35754680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTCAATGACCTGATTTGTCAGTGATCAAATTCTAAAAATTTCCCTCAATCTGAACTTCT 1260

 35754681 AGTGAACTTCGATCCATGTTTATACTGAAATTTCAGATCCAAAAAGTCTTTCCTTTACCC 35754740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTGAACTTCGATCCATGTTTATACTGAAATTTCAGATCCAAAAAGTCTTTCCTTTACCC 1320

 35754741 CACCCTCCTTCACTTGGTGCAGTGTAGCAACAGGTGCACCTTGGACCGTAATTGAGGAAC 35754800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACCCTCCTTCACTTGGTGCAGTGTAGCAACAGGTGCACCTTGGACCGTAATTGAGGAAC 1380

 35754801 TTTCACTGGACTCTTGTGAATTTGCACCATCCAGTGGCTGAAATTGCTAACTGCATCCTC 35754860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTCACTGGACTCTTGTGAATTTGCACCATCCAGTGGCTGAAATTGCTAACTGCATCCTC 1440

 35754861 TGAAAAAAGGCAGTGGGCACAAATAAAAAAATGTAAAATGGGGGCTGGGCGCGGTGACTC 35754920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAAAAAAGGCAGTGGGCACAAATAAAAAAATGTAAAATGGGGGCTGGGCGCGGTGACTC 1500

 35754921 ACTCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATT 35754980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATT 1560

 35754981 GAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAATACAAAAAATTAGCT 35755040
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     1561 GAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACCCCGTCTT-ACTAAAAATACAAAAAATTAGCT 1619

 35755041 GGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTACTCCTAGCTACTCAGGAGCCTGAGGCAGGAGAATCAC 35755100
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTACTCCCAGCTACTCAGGAGCCTGAGGCAGGAGAATCAC 1679

 35755101 TTGAACCAGGTAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 35755160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TTGAACCAGGTAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 1739

 35755161 GTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACAGTTTGGCCTCCTCTTCTAG 35755220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACAGTTTGGCCTCCTCTTCTAG 1799

 35755221 CTGTTGTGGTATCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGAAGTTTCGCTCTTGTT 35755280
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     1800 CTGTTGTGGTATCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---GAGACGAAGTTTCGCTCTTGTT 1856

 35755281 GCCCAGGCTGGAACGCAACGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAATCTCCGCCTCCTGGGTTC 35755340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 GCCCAGGCTGGAACGCAACGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAATCTCCGCCTCCTGGGTTC 1916

 35755341 AAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACATGCGCCACCATGC 35755400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 AAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACATGCGCCACCATGC 1976

 35755401 CCTGCTAATTTTGTATTTTTAGTTGAGATGTGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGTCTCG 35755460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 CCTGCTAATTTTGTATTTTTAGTTGAGATGTGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGTCTCG 2036

 35755461 AACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTATGGGAT 35755520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 AACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTATGGGAT 2096

 35755521 TACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGACTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTGGCACTGTTGCC 35755580
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGGCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTGGCACTGTTGCC 2156

 35755581 CAGGCTGGAGTGCAGTG 35755597
          |||||||||||||||||
     2157 CAGGCTGGAGTGCAGTG 2173

EXCISED REGION

 35758791 AGCCTCCCGGGTAGCTGGGATTACAGGTGCA----TGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTG 35758846
          |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||
     2232 AGCCTCCCGGGTAGCTGGGATTACAGG----CGCCTGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTG 2287

 35758847 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTAGTCTCGAACTACTGACTT 35758906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTAGTCTCGAACTACTGACTT 2347

 35758907 CAAGTGACCCACCCACATCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTACTGCA 35758966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 CAAGTGACCCACCCACATCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCTACTGCA 2407

 35758967 TCGGGCTTTCATCATATCCTTATGAAACGCTTATGAATTAGACATTATTATTTTCATTTT 35759026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 TCGGGCTTTCATCATATCCTTATGAAACGCTTATGAATTAGACATTATTATTTTCATTTT 2467

 35759027 ACATAGGAGGAGAAAGGAGATGCAGGAAGATAATAACTTCCCTAAATTCTTTTTTTTTTT 35759086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 ACATAGGAGGAGAAAGGAGATGCAGGAAGATAATAACTTCCCTAAATTCTTTTTTTTTTT 2527

 35759087 TAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGGATCTCGGCTCACG 35759146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 TAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGGGATCTCGGCTCACG 2587

 35759147 GCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTGGGA 35759206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 GCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGTTGGGA 2647

 35759207 TTATAAGCATGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 35759266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 TTATAAGCATGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTATATTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 2707

 35759267 CACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCCGCCTCAGCC 35759326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 CACCATGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCCGCCTCAGCC 2767

 35759327 TCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCCTAAATTCTTAAAGGT 35759386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 TCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCCTAAATTCTTAAAGGT 2827

 35759387 GATAAGGAGTGGAGACAGAATTCAAATTCAGGAAAGTTTCAAAGTCCATGCTTGCTTTTT 35759446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 GATAAGGAGTGGAGACAGAATTCAAATTCAGGAAAGTTTCAAAGTCCATGCTTGCTTTTT 2887

 35759447 CAATTATATTAAACAATGCCAAGTTCCTTGCATATTCCAAGCATTTATTGGGCACCTGTT 35759506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 CAATTATATTAAACAATGCCAAGTTCCTTGCATATTCCAAGCATTTATTGGGCACCTGTT 2947

 35759507 GGTTGCACAAGAGTATAGACTGCCTGTCACCAAATGATGCAAAATAATTTAGGAGCCTGT 35759566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 GGTTGCACAAGAGTATAGACTGCCTGTCACCAAATGATGCAAAATAATTTAGGAGCCTGT 3007

 35759567 TTTGACAGTCACAAGATGGAGGTCCTGTACATTAGGCAGAAAAGTATGCAGCTAGGCAGC 35759626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 TTTGACAGTCACAAGATGGAGGTCCTGTACATTAGGCAGAAAAGTATGCAGCTAGGCAGC 3067

 35759627 CTAGTAGGCATTTTAGAATTGTCTGATAAACCGAGCCACTTAGCAACAATATATTTCTAG 35759686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 CTAGTAGGCATTTTAGAATTGTCTGATAAACCGAGCCACTTAGCAACAATATATTTCTAG 3127

 35759687 TTCACCTAATTTTTTGGGTTCTGCCCAAAGGCTGGTGACTCATGAGACAGATATTCCGCA 35759746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 TTCACCTAATTTTTTGGGTTCTGCCCAAAGGCTGGTGACTCATGAGACAGATATTCCGCA 3187

 35759747 CTCTGTGTACATGAGAAAGAAGTCAGTAAGGTGAGGAAGAAGCAGAAGAGATGGGTAACG 35759806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 CTCTGTGTACATGAGAAAGAAGTCAGTAAGGTGAGGAAGAAGCAGAAGAGATGGGTAACG 3247

 35759807 AAGGCCTGGATTCACGAAAACTGTTTAATGGCCATGGTATTATGAAAATCCTGATACCAG 35759866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 AAGGCCTGGATTCACGAAAACTGTTTAATGGCCATGGTATTATGAAAATCCTGATACCAG 3307

 35759867 CCAACTCTTGAGTGTTAAATAATGAGAGTCAGTTTATTAGTTATATTTGGACAGATCTGG 35759926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 CCAACTCTTGAGTGTTAAATAATGAGAGTCAGTTTATTAGTTATATTTGGACAGATCTGG 3367

 35759927 TTTTTTGCTTTATTTTTATAAATAATGTTCTAAGAAATATATTTTATTTAATTTACTTAT 35759986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3368 TTTTTTGCTTTATTTTTATAAATAATGTTCTAAGAAATTTATTTTATTTAATTTACTTAT 3427

 35759987 GGCATATTTAAACATTTTTTGGCAAATAAAAATTGTGTATATTCATGATGTACAACATGT 35760046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 GGCATATTTAAACATTTTTTGGCAAATAAAAATTGTGTATATTCATGATGTACAACATGT 3487

 35760047 GTTGATAGACGTACTCATTGTGGAATGGCTAAATCAAGCTAATTAACAAATCCATTACCT 35760106
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 GTTGATAGATGTACTCATTGTGGAATGGCTAAATCAAGCTAATTAACAAATCCATTACCT 3547

 35760107 CAAATATATACCCATTACCGCAAATACTTATTTTTTTGTGTGGTAAGAACAACTAAAATC 35760166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 CAAATATATACCCATTACCGCAAATACTTATTTTTTTGTGTGGTAAGAACAACTAAAATC 3607

 35760167 TACTCTCTTAGCAATTTTCAAGCATATATATATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTT 35760226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 TACTCTCTTAGCAATTTTCAAGCATATATATATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTT 3667

 35760227 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGCAATCTTGGCTCACT 35760286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 TGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGCAATCTTGGCTCACT 3727

 35760287 GCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGA 35760346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 GCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGA 3787

 35760347 TTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 35760406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 TTACAGGCATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTC 3847

 35760407 ACCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCAAACCCCTGACCTCAGATGACCCACCTGCCTCAGCCT 35760466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 ACCATGTGGGCCAGGCTGGTCTCAAACCCCTGACCTCAGATGACCCACCTGCCTCAGCCT 3907

 35760467 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCTGGCCTCAAGTATATATTTTTA 35760526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCTGGCCTCAAGTATATATTTTTA 3967

 35760527 ACTATAGTCACCATATAGTATAATAGATCTCCTGCACTTATTCCTGCTGTCTAACTGAAA 35760586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 ACTATAGTCACCATATAGTATAATAGATCTCCTGCACTTATTCCTGCTGTCTAACTGAAA 4027

 35760587 TTTTGTATCCTTTGGCCAAAATCTTCCAATTCTTTCTCTCTCATCCCCTGGTAACCACCA 35760646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 TTTTGTATCCTTTGGCCAAAATCTTCCAATTCTTTCTCTCTCATCCCCTGGTAACCACCA 4087

 35760647 TTCTGCTACTTCTACAAGCTTGACTTTTTTAGATGCCACACATAAGTGAGATTAAGCAGT 35760706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 TTCTGCTACTTCTACAAGCTTGACTTTTTTAGATGCCACACATAAGTGAGATTAAGCAGT 4147

 35760707 ATTTGTTTTTCTGTGCCTGGCTTATTTCACTTTGCATAATGTCCTCCAGGTCCATCTATG 35760766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4148 ATTTGTTTTTCTGTGCCTGGCTTATTTCACTTAGCATAATGTCCTCCAGGTCCATCTATG 4207

 35760767 TTGCTGCAAATGACAGGATTTCCTTATTTTTTAAGGCTGAACAGTATTCCATTGTGTGTG 35760826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 TTGCTGCAAATGACAGGATTTCCTTATTTTTTAAGGCTGAACAGTATTCCATTGTGTGTG 4267

 35760827 TGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTATATCTCACATTTTCTTTATTCATTCATCCA 35760886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 TGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCTATATCTCACATTTTCTTTATTCATTCATCCA 4327

 35760887 TTGGCATACATGTAGGCTGTTTCCATGTCTTGGCTATGGTGAATAATGCTGCAATGGATA 35760946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 TTGGCATACATGTAGGCTGTTTCCATGTCTTGGCTATGGTGAATAATGCTGCAATGGATA 4387

 35760947 TGGGAGTACAGATACCTTGACATGCAGATATCATTTCCTTTGGATATATACCCAGAAGTG 35761006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 TGGGAGTACAGATACCTTGACATGCAGATATCATTTCCTTTGGATATATACCCAGAAGTG 4447

 35761007 GATTATTGGATCATATGGTAGTTCCATTCAAAAATTTTTAAGGAACCTCCATACTATTTT 35761066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 GATTATTGGATCATATGGTAGTTCCATTCAAAAATTTTTAAGGAACCTCCATACTATTTT 4507

 35761067 CCAAAATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACTGACAGTGTACAGGGTTTTTCTCCACATC 35761126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 CCAAAATGGCTGTACTAATTTACATTCCCACTGACAGTGTACAGGGTTTTTCTCCACATC 4567

 35761127 CTTGCCAATGCTTATCTCGCTTTTTGATAATAATCATTCTGACAGGTGTGAGGTGATATC 35761186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 CTTGCCAATGCTTATCTCGCTTTTTGATAATAATCATTCTGACAGGTGTGAGGTGATATC 4627

 35761187 TCATGGTAGTTTTAATTCACATTTCCCTGATGATTAGTGATGTTGAACATTTTTTTCACA 35761246
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 TCATGGTAGTTTTAATTCACACTTCCCTGATGATTAGTGATGTTGAACATTTTTTTCACA 4687

 35761247 TACCAGTTAGCTATTTGCATGTCTTTTTCTTTTGTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGA 35761306
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     4688 TACCAGTTAGCTATTTGCATGTCTTTTTCTTTTGTTTTTC-TTTTTTTTTTTTTTTGAGA 4746

 35761307 CAGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCT 35761366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 CAGAGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCT 4806

 35761367 CCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGAATACAAG 35761426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 CCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGAATACAAG 4866

 35761427 CGCCCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTTTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCAGGT 35761486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 CGCCCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTTTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCAGGT 4926

 35761487 TGGCCCGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCATGC 35761546
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 TGGCCCGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCATGC 4986

 35761547 TACTTGCATGTCTTCTTTTGAGCAATGTCTTTTCAGGCCCTTGTCCACTTATCTGATGTA 35761606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 TACTTGCATGTCTTCTTTTGAGCAATGTCTTTTCAGGCCCTTGTCCACTTATCTGATGTA 5046

 35761607 GGGGTCGTGAATATTTTCTCCCATTCCGTAGGTTGTCTCTTTACC-TTTTTTTTTTTTTT 35761665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     5047 GGGGTCGTGAATATTTTCTCCCATTCCGTAGGTTGTCTCTTTACCTTTTTTTTTTTTTTT 5106

 35761666 CCAGACGAGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTAAAGTGGCACAATCACGGTCACTA 35761725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 CCAGACGAGGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTAAAGTGGCACAATCACGGTCACTA 5166

 35761726 CAGCCTCAACTGTCTGAGCTCAAGTGATTCTCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAC 35761785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 CAGCCTCAACTGTCTGAGCTCAAGTGATTCTCCTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAC 5226

 35761786 CACAGGCGTGTGCTATCATGCCCAGCTAATTTTTTGATTTTTTTGTAGAGTTGAACTCTC 35761845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 CACAGGCGTGTGCTATCATGCCCAGCTAATTTTTTGATTTTTTTGTAGAGTTGAACTCTC 5286

 35761846 ACTAAGTCACCCAGTTTAGTCTCGAACTCCTGAGCCCAAGCAATCTTCCCACCTAGGACT 35761905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 ACTAAGTCACCCAGTTTAGTCTCGAACTCCTGAGCCCAAGCAATCTTCCCACCTAGGACT 5346

 35761906 GTCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCAGAAACTCTACGTTTGA 35761965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 GTCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCAGGCCAGAAACTCTACGTTTGA 5406

 35761966 TTCTAACCACAGCAGCTTAGCAGCTGAGGACAAACTGTTGGGATATTTTGGTCTCAGTCA 35762025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 TTCTAACCACAGCAGCTTAGCAGCTGAGGACAAACTGTTGGGATATTTTGGTCTCAGTCA 5466

 35762026 ATGGCAGCCAGGTTACCAACCCTGACAAGATACAAGTTTTCTTCGTTGGGTTCCTGGTAC 35762085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 ATGGCAGCCAGGTTACCAACCCTGACAAGATACAAGTTTTCTTCGTTGGGTTCCTGGTAC 5526

 35762086 AAAAGTCAACCTTTTCAGTTAGTTATGAATGAAAGGGCATGAAGATTGTGCTATTAGTTT 35762145
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 AAAAGTCAACCTTTTCAGTTACTTATGAATGAAAGGGCATGAAGATTGTGCTATTAGTTT 5586

 35762146 ATCCTGAAGGTCAATCTTCAAAAATACTGGTTCAACATGGATTTGGATATTATTAATATA 35762205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 ATCCTGAAGGTCAATCTTCAAAAATACTGGTTCAACATGGATTTGGATATTATTAATATA 5646

 35762206 AATTTATGGCTTAAAGAGGACAAAAGGTGTTTTTTTGGGTTCCTTTACAGAGATATTTAG 35762265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 AATTTATGGCTTAAAGAGGACAAAAGGTGTTTTTTTGGGTTCCTTTACAGAGATATTTAG 5706

 35762266 TGAGGGAACAAGGCACTTAGTCATCTTTGCTATGACAGGTTAAATACAAGGTGTACTGGG 35762325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 TGAGGGAACAAGGCACTTAGTCATCTTTGCTATGACAGGTTAAATACAAGGTGTACTGGG 5766

 35762326 AACATGTAAGAGGGTGACTTAACTCAGCCATTGGGGGGTCAGGAGAAGTGTTCCTAAGGA 35762385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 AACATGTAAGAGGGTGACTTAACTCAGCCATTGGGGGGTCAGGAGAAGTGTTCCTAAGGA 5826

 35762386 AGTGATGTCTAAGTGAGGTAGGCAGTACCTTGGCAAAAAAAACCTTGAAGTTAAGAGTGC 35762445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 AGTGATGTCTAAGTGAGGTAGGCAGTACCTTGGCAAAAAAAACCTTGAAGTTAAGAGTGC 5886

 35762446 ATATGAGAAATGAAGGTATGTCCACCTGGCTGGCAAATGGAGTCTAAGATAGGGCAGTGA 35762505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 ATATGAGAAATGAAGGTATGTCCACCTGGCTGGCAAATGGAGTCTAAGATAGGGCAGTGA 5946

 35762506 TGATAAAGATACAGGAAGATGCTAGATCTGGAAGGGCCTTCTAAAAAGAATGACAATATA 35762565
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 TGATAAAGATATAGGAAGATGCTAGATCTGGAAGGGCCTTCTAAAAAGAATGACAATATA 6006

 35762566 AATTTATTGTACAAATGGAGACTTTACTGAGAGTGAAACCAGGCAATATTAATACTTAGG 35762625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 AATTTATTGTACAAATGGAGACTTTACTGAGAGTGAAACCAGGCAATATTAATACTTAGG 6066

 35762626 TAGGGACAACAGATATAAACCAGGCTATTCTCAGCAAATCAGAAATTATGGTCACCCTAC 35762685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 TAGGGACAACAGATATAAACCAGGCTATTCTCAGCAAATCAGAAATTATGGTCACCCTAC 6126

 35762686 TTGTAAGTCACATTCAGGTGCTTAGACTTTCAGTGAAAGCATAGAGTATGTATCTTCTAC 35762745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 TTGTAAGTCACATTCAGGTGCTTAGACTTTCAGTGAAAGCATAGAGTATGTATCTTCTAC 6186

 35762746 ATTTTGCCTAAGTGACTTCATTCTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCA 35762805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 ATTTTGCCTAAGTGACTTCATTCTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCA 6246

 35762806 GGCTGGAGTACAGCGGCACGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCCAGGTTCACGCC 35762865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 GGCTGGAGTACAGCGGCACGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCCAGGTTCACGCC 6306

 35762866 ATTCTTCTTCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCCGGC 35762925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 ATTCTTCTTCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCACCACGCCCGGC 6366

 35762926 TAATTTTTTGTATTTTTAGTTGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGAT 35762985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 TAATTTTTTGTATTTTTAGTTGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGAT 6426

 35762986 CTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAG 35763045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 CTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAG 6486

 35763046 CCACTGCACCCAGCCAGTGACTTCATTTTTACTTTTGCCTTTACTTACTCATTTCACAAG 35763105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 CCACTGCACCCAGCCAGTGACTTCATTTTTACTTTTGCCTTTACTTACTCATTTCACAAG 6546

 35763106 TATTTGAGGATACACTTCAGAGCACTGAGGTTACAAAGACAACAGTGTCTGTCCTCAAGG 35763165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 TATTTGAGGATACACTTCAGAGCACTGAGGTTACAAAGACAACAGTGTCTGTCCTCAAGG 6606

 35763166 TCTGTCTAGGTAAGACACACAGCCAAATAAACAATTCTAATACAGTTATACAGTTTTAGT 35763225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 TCTGTCTAGGTAAGACACACAGCCAAATAAACAATTCTAATACAGTTATACAGTTTTAGT 6666

 35763226 TCTGACACCTCCAATGAGCTGTAGACTTGTATTTGTCATTTCCAGTCAGAATGCAAAACA 35763285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 TCTGACACCTCCAATGAGCTGTAGACTTGTATTTGTCATTTCCAGTCAGAATGCAAAACA 6726

 35763286 CAGATCCAAAACAGAACTTTCAATTTCTCCTCCAAATCTATTCTTCCTTCAGCTGGTCGT 35763345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 CAGATCCAAAACAGAACTTTCAATTTCTCCTCCAAATCTATTCTTCCTTCAGCTGGTCGT 6786

 35763346 GTAAGTGATGCCACTATCACATCCACTTAAGACAAAAACCCAGAGGAGTACTGCCTTAAT 35763405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 GTAAGTGATGCCACTATCACATCCACTTAAGACAAAAACCCAGAGGAGTACTGCCTTAAT 6846

 35763406 CAGTAATCAGTGTTACCCTTCTTCTCACTGTGCATGTTAATTTTGCCACATCTTTTTTTT 35763465
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     6847 CAGTAATCAGTGTTACCCTTCTTCTCACTGTGCATGTTAATTTTGCCACATC-TTTTTTT 6905

 35763466 TTTTTTTTTTTTGGTACAGTGTCTCACTCTGTCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGAT 35763525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6906 TTTTTTTTTTTTGGTACAGTGTCTCACTCTGTCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGAT 6965

 35763526 ACTGGGTCAATGCAGCCTCAACCCTCTGGGCTGAAGTGATCCTCTCACCTCAGCCTCCTA 35763585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6966 ACTGGGTCAATGCAGCCTCAACCCTCTGGGCTGAAGTGATCCTCTCACCTCAGCCTCCTA 7025

 35763586 AGTAGCTGGGACTACAGGCATGCGCCACTACACCTGGCTAATTTTTGCAATTTTTGTAGA 35763645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7026 AGTAGCTGGGACTACAGGCATGCGCCACTACACCTGGCTAATTTTTGCAATTTTTGTAGA 7085

 35763646 GACGAAGTTTCACCATGTTGCCCAGTTCTCATGCCTCCTTGAACTCCTGAACTCAAGTGA 35763705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7086 GACGAAGTTTCACCATGTTGCCCAGTTCTCATGCCTCCTTGAACTCCTGAACTCAAGTGA 7145

 35763706 TCTGCCTACCTTGGCTTCCCAAAATGCAGGGATCCCAGGTGTGAGGCACCGTGTCCTGCC 35763765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7146 TCTGCCTACCTTGGCTTCCCAAAATGCAGGGATCCCAGGTGTGAGGCACCGTGTCCTGCC 7205

 35763766 CTCTCCACATCTTTCTTAAGCACACTGACTAAATTGGTCTAAGTAGAGCCTAACATCAAC 35763825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7206 CTCTCCACATCTTTCTTAAGCACACTGACTAAATTGGTCTAAGTAGAGCCTAACATCAAC 7265

 35763826 TGAAGGGAGAGGGTAATTTCCAGGTAGTTGAATGCTATGATTTTTGTTTTTTTGTTTTTG 35763885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7266 TGAAGGGAGAGGGTAATTTCCAGGTAGTTGAATGCTATGATTTTTGTTTTTTTGTTTTTG 7325

 35763886 AGACAGACTCTTGCTCTGTTGAACAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATTTCAGCTCACTGC 35763945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7326 AGACAGACTCTTGCTCTGTTGAACAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATTTCAGCTCACTGC 7385

 35763946 AACCTCCACCTCCAGGGTTCAAGCAATTCTTGCGCCTCCCAAGAAGCTGGGATTACAGGC 35764005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7386 AACCTCCACCTCCAGGGTTCAAGCAATTCTTGCGCCTCCCAAGAAGCTGGGATTACAGGC 7445

 35764006 ATGCGCCACCACACCCAGCTAATTGTTGCATTTTTAGCAGAGATGGGTTTTCGCCATGTT 35764065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7446 ATGCGCCACCACACCCAGCTAATTGTTGCATTTTTAGCAGAGATGGGTTTTCGCCATGTT 7505

 35764066 GCCCAGGCTGATCTTGAACTACTGGCCTCAAATGATCCATCTGCCTTGGCCTCCCAAACT 35764125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7506 GCCCAGGCTGATCTTGAACTACTGGCCTCAAATGATCCATCTGCCTTGGCCTCCCAAACT 7565

 35764126 GCTGGGATTACAGGAATGAGCCACTGTGCCTGGCCCCTGAATGCTATGTTTTTAACGACT 35764185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7566 GCTGGGATTACAGGAATGAGCCACTGTGCCTGGCCCCTGAATGCTATGTTTTTAACGACT 7625

 35764186 AGATCTCAGTATTATGTGGGACTAATTTTTCTACAGTATTACAACACTGATTACTGATAT 35764245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7626 AGATCTCAGTATTATGTGGGACTAATTTTTCTACAGTATTACAACACTGATTACTGATAT 7685

 35764246 TCATTGTTGACAATCATGACATCCAGATCTGGATATTTGCCTTAGCCAGTCTCAAAATTT 35764305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7686 TCATTGTTGACAATCATGACATCCAGATCTGGATATTTGCCTTAGCCAGTCTCAAAATTT 7745

 35764306 GAGTTTCAATGACAAAGACACAGATATGTCCTAAATGACTGACCCCACTTCCACTATGTG 35764365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7746 GAGTTTCAATGACAAAGACACAGATATGTCCTAAATGACTGACCCCACTTCCACTATGTG 7805

 35764366 AAGTTGAGAGTGGTTGTAAAGCTGTACAGCTATAGGTGAAACACTAATGTTAATCAACTA 35764425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7806 AAGTTGAGAGTGGTTGTAAAGCTGTACAGCTATAGGTGAAACACTAATGTTAATCAACTA 7865

 35764426 TCTGTTGAACAACTACCATGTAAAAGGACAATTTATGCCTTAGAGAGCAATTTAAAATTT 35764485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7866 TCTGTTGAACAACTACCATGTAAAAGGACAATTTATGCCTTAGAGAGCAATTTAAAATTT 7925

 35764486 TTTTAGAGATGGGGGTCTCGATACGTTGCCTAGACTGGTCTCAAACTTGGGCTCAATCCA 35764545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7926 TTTTAGAGATGGGGGTCTCGATACGTTGCCTAGACTGGTCTCAAACTTGGGCTCAATCCA 7985

 35764546 TCCTCCTGCCTCAGTCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGTACACACCACTTCACCAGGCA 35764605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7986 TCCTCCTGCCTCAGTCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGTACACACCACTTCACCAGGCA 8045

 35764606 AAGGGCAATTTTAATATTTCTACCATCCATTCTCCACACAGCTGCCACAGTGATTTTTTT 35764665
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||
     8046 AAGGGCAATTTTAATATTTCTACCATCCATTCTCCACACAGCTGCCACAGTGA--TTTTT 8103

 35764666 TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGCAGTTTCACTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGTAGTGGC 35764725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8104 TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGCAGTTTCACTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGTAGTGGC 8163

 35764726 ACAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTACCTCAGCC 35764785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8164 ACAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTACCTCAGCC 8223

 35764786 TCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCGTCACAATGCCCAGCTAATTTTTTTTGTATTT 35764845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8224 TCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCGTCACAATGCCCAGCTAATTTTTTTTGTATTT 8283

 35764846 TTAGTAGAGATGAGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTTCTAACCTCAAGT 35764905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8284 TTAGTAGAGATGAGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTTCTAACCTCAAGT 8343

 35764906 GATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGATGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCTCCCAG 35764965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8344 GATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGATGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCTCCCAG 8403

 35764966 CCCACAGTGATCCTTTTACAGCAAAGCTACTCCTTTGCTCTCAACCCTTCGTCATATTCT 35765025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8404 CCCACAGTGATCCTTTTACAGCAAAGCTACTCCTTTGCTCTCAACCCTTCGTCATATTCT 8463

 35765026 GTCACTTCCCAATAAAATCCAAACCTTACCAGATGATACATGATCTGCCTTGATTTCCAT 35765085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8464 GTCACTTCCCAATAAAATCCAAACCTTACCAGATGATACATGATCTGCCTTGATTTCCAT 8523

 35765086 CTAATTTCTCTCATTTGCTGTGCTCCAGCCACACTGGTCTTGCCCTTTCTCCATGCCAAA 35765145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8524 CTAATTTCTCTCATTTGCTGTGCTCCAGCCACACTGGTCTTGCCCTTTCTCCATGCCAAA 8583

 35765146 CAAATCCCCATTTCAGGGTCACTGCACTTGCTGCTTCTCTTCTAGGATAGTTTCCCTCTA 35765205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8584 CAAATCCCCATTTCAGGGTCACTGCACTTGCTGCTTCTCTTCTAGGATAGTTTCCCTCTA 8643

 35765206 GAAATCCATGTTGCTCCTTCTCTCATTAAATGATCAGATATTTATGTGCCTCCTTAGCTA 35765265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8644 GAAATCCATGTTGCTCCTTCTCTCATTAAATGATCAGATATTTATGTGCCTCCTTAGCTA 8703

 35765266 AGAGGCCTTCCTTATCTACCCTAACTAAGAGAATCCCCATATCACTCTTATCCTTTTATC 35765325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8704 AGAGGCCTTCCTTATCTACCCTAACTAAGAGAATCCCCATATCACTCTTATCCTTTTATC 8763

 35765326 CTGATTTATTTTTCCATAAAACTTGCCACATTACTGGGCATTATCTATCATTTAGTAATG 35765385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8764 CTGATTTATTTTTCCATAAAACTTGCCACATTACTGGGCATTATCTATCATTTAGTAATG 8823

 35765386 TGTATATTGCTTATTGACAGTCTTCCCTACTATAATATGAGCTCCATGAGGCAGAGACTT 35765445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8824 TGTATATTGCTTATTGACAGTCTTCCCTACTATAATATGAGCTCCATGAGGCAGAGACTT 8883

 35765446 TGTTTTGTTCACTGCTGAATTCCCAGCACCTACAACAAGCCTACTCACTAAACATTTGTT 35765505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8884 TGTTTTGTTCACTGCTGAATTCCCAGCACCTACAACAAGCCTACTCACTAAACATTTGTT 8943

 35765506 GAATTAATCTTCAGGATACATCAAATGTAAAATATCCTATCATATATTTATTGATGTGAT 35765565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8944 GAATTAATCTTCAGGATACATCAAATGTAAAATATCCTATCATATATTTATTGATGTGAT 9003

 35765566 GCATAGGAAAATGTCTGGAAGGGTACATACCAAAATGTTAATTATTTATTTAACCTGGTG 35765625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9004 GCATAGGAAAATGTCTGGAAGGGTACATACCAAAATGTTAATTATTTATTTAACCTGGTG 9063

 35765626 GGAGGTGGTTTTTCTTTCCTTTTCTTTTCTTTTTGAGACAGAGTTTCGCTCTCGTTGCCC 35765685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9064 GGAGGTGGTTTTTCTTTCCTTTTCTTTTCTTTTTGAGACAGAGTTTCGCTCTCGTTGCCC 9123

 35765686 AGGCTGGAGTGGAATGGCAAGATCTTGGCTCATTGTAACCTCTGCCCCCAGGGTTCAAGC 35765745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9124 AGGCTGGAGTGGAATGGCAAGATCTTGGCTCATTGTAACCTCTGCCCCCAGGGTTCAAGC 9183

 35765746 GATTCTACTGCCTCAGCCTCCGGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACACCCGC 35765805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9184 GATTCTACTGCCTCAGCCTCCGGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTGCCACCACACCCGC 9243

 35765806 GTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTAGA 35765865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9244 GTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTAGA 9303

 35765866 ACTCCAGACCCTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTGCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCGTGA 35765925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9304 ACTCCAGACCCTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTGCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCGTGA 9363

 35765926 GCCACCGCGCCCGGCAGGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAATGAACTTGTATTATGC 35765985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9364 GCCACCGCGCCCGGCAGGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAATGAACTTGTATTATGC 9423

 35765986 ATATACCAAAAAAGAATGAAAGGGTTCACACAGGTATAAAGTGTAAGTGAATTCTAAAAA 35766045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     9424 ATATACCAAAAAAGAATGAAAGGGTTCACACAGGCATAAAGTGTAAGTGAATTCTAAAAA 9483

 35766046 AAGGTTGGGCAAATTTATCAAAGGCAGACTTCTAAATAGATGTAACAGTTATATAGTTCA 35766105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9484 AAGGTTGGGCAAATTTATCAAAGGCAGACTTCTAAATAGATGTAACAGTTATATAGTTCA 9543

 35766106 GATAAACCATGGTTTGAATTCCCTTCCCCAGTA 35766138
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     9544 GATAAACCATGGTTTGAATTCCCTTCCCCAGTA 9576

Alignment time is 13.2283 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [35745597,35768790] =>     23194 nucs '17 dna:chromosome chromosome:GRCh37:17:1:81195210:1'
Second seq [       1,    2339] =>      2339 nucs 'mol-32-3492-181445_2339'

Score:        2216
Aligned:      2289        nucs
Identic:      2275 ( 99%) nucs =>      2171 (100%)       104 ( 93%)
Gaps:           12 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [35753421,35755597] EXCISED REGION [35758791,35758898]
 second seq =>  [       1,    2173] EXCISED REGION [    2232,    2339]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3193 nucs [35755598,35758790]
 second seq =>        58 nucs [2174,2231]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2174,2174] to [2232,2232]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 35753421 TGAAAGGCCTGAACAAGCCATTAACATCCTTCCTTTTCTGTACTCCCAGGCTAGTGCAAC 35753480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAAAGGCCTGAACAAGCCATTAACATCCTTCCTTTTCTGTACTCCCAGGCTAGTGCAAC 60

 35753481 GGTGGTTTCAGGAGTGGTACTGGCCTTAACCATTATTTCCTCATATCTCCTACCCCCTCC 35753540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTGGTTTCAGGAGTGGTACTGGCCTTAACCATTATTTCCTCATATCTCCTACCCCCTCC 120

 35753541 TATTAATATTTTGGATGCTTTCTAATCACTGCCCAGCAGATTCTGACCTAGAGCACTTTT 35753600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTAATATTTTGGATGCTTTCTAATCACTGCCCAGCAGATTCTGACCTAGAGCACTTTT 180

 35753601 CCTATGTCTATGTCCATAACTAGCCATTTTCCAAGGAAGAGTTGCTGCATGTACTTATGA 35753660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTATGTCTATGTCCATAACTAGCCATTTTCCAAGGAAGAGTTGCTGCATGTACTTATGA 240

 35753661 CTAAAGGCCAGAAGAAATCTTTTTATTTTTTGTTTGCCCTGGACAGGTTGAGAGTCCTAT 35753720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAAAGGCCAGAAGAAATCTTTTTATTTTTTGTTTGCCCTGGACAGGTTGAGAGTCCTAT 300

 35753721 GATCCCTTCCTCCCCATCCCACTGATACTCCACTCCCACTTTCAAAAAGTATTCCATTTT 35753780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATCCCTTCCTCCCCATCCCACTGATACTCCACTCCCACTTTCAAAAAGTATTCCATTTT 360

 35753781 CTGAGTTGACACAATGGCCCTCAGGTTGCCTTGAATTACTTATCTTCCCTATTATTAGTA 35753840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGAGTTGACACAATGGCCCTCAGGTTGCCTTGAATTACTTATCTTCCCTATTATTAGTA 420

 35753841 ATAGTAGTAGTAGTATTATACTTTAAATTCTAGGGTACATGTGCACAATGTCCAGGTTTA 35753900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAGTAGTAGTAGTATTATACTTTAAATTCTAGGGTACATGTGCACAATGTCCAGGTTTA 480

 35753901 TTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTTTGCTGCACCCATTAACTCGTCATTTACATT 35753960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTTTGCTGCACCCATTAACTCGTCATTTACATT 540

 35753961 AGGTATTTCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCATCCCCCCACCCCACGACAGGCGCTGATGT 35754020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGTATTTCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCATCCCCCCACCCCACGACAGGCGCTGATGT 600

 35754021 GTGATGTTCCCAGCCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCAATTTCCACCTATGAGTGAG 35754080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGATGTTCCCAGCCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCAATTTCCACCTATGAGTGAG 660

 35754081 AACATGCGATGTTTGGTTTTCTGTCCTTGCGATATTTGCTCAGAATGATGGTTTCCAGCT 35754140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACATGCGATGTTTGGTTTTCTGTCCTTGCGATATTTGCTCAGAATGATGGTTTCCAGCT 720

 35754141 TCATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTCTTATGGCTGCATAGTATTCCA 35754200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTCTTATGGCTGCATAGTATTCCA 780

 35754201 TAGTGTATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCAATTACTTATCTTCTTATATGTACTT 35754260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGTGTATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCAATTACTTATCTTCTTATATGTACTT 840

 35754261 ACTGGTTCTTCTGCTTGAAGCCCAGTATCTGTGTTAATTTGTATATCTCTATATTACTTT 35754320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTGGTTCTTCTGCTTGAAGCCCAGTATCTGTGTTAATTTGTATATCTCTATATTACTTT 900

 35754321 GTATCAACAAAGCACCATGTTCATAGCAGATACTAAAAATATTTGTTGATAATGTCACAC 35754380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTATCAACAAAGCACCATGTTCATAGCAGATACTAAAAATATTTGTTGATAATGTCACAC 960

 35754381 CACCAAATGGATAAGCTAAGGGTAGCATAGCTGACTTTCTAGAAGAGAATGAAGTAAGCT 35754440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACCAAATGGATAAGCTAAGGGTAGCATAGCTGACTTTCTAGAAGAGAATGAAGTAAGCT 1020

 35754441 TTATTTTTATATCAAAGTTGCTATCAGTTACCAGGGAGATGCAAACCAGTAAAGGGTCAT 35754500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTATTTTTATATCAAAGTTGCTATCAGTTACCAGGGAGATGCAAACCAGTAAAGGGTCAT 1080

 35754501 ACTATAATTGTTGCTAACACTTGAATTCATCTCTTTAGACTTATTTTCCCTCATATTTCA 35754560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACTATAATTGTTGCTAACACTTGAATTCATCTCTTTAGACTTATTTTCCCTCATATTTCA 1140

 35754561 TCATCTGTTCCTTTTTCTCTTCCTCTTCATTATTACAACACTTTTCTTTTGTCTTTCCTT 35754620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCATCTGTTCCTTTTTCTCTTCCTCTTCATTATTACAACACTTTTCTTTTGTCTTTCCTT 1200

 35754621 ATTCAATGACCTGATTTGTCAGTGATCAAATTCTAAAAATTTCCCTCAATCTGAACTTCT 35754680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTCAATGACCTGATTTGTCAGTGATCAAATTCTAAAAATTTCCCTCAATCTGAACTTCT 1260

 35754681 AGTGAACTTCGATCCATGTTTATACTGAAATTTCAGATCCAAAAAGTCTTTCCTTTACCC 35754740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTGAACTTCGATCCATGTTTATACTGAAATTTCAGATCCAAAAAGTCTTTCCTTTACCC 1320

 35754741 CACCCTCCTTCACTTGGTGCAGTGTAGCAACAGGTGCACCTTGGACCGTAATTGAGGAAC 35754800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACCCTCCTTCACTTGGTGCAGTGTAGCAACAGGTGCACCTTGGACCGTAATTGAGGAAC 1380

 35754801 TTTCACTGGACTCTTGTGAATTTGCACCATCCAGTGGCTGAAATTGCTAACTGCATCCTC 35754860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTCACTGGACTCTTGTGAATTTGCACCATCCAGTGGCTGAAATTGCTAACTGCATCCTC 1440

 35754861 TGAAAAAAGGCAGTGGGCACAAATAAAAAAATGTAAAATGGGGGCTGGGCGCGGTGACTC 35754920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAAAAAAGGCAGTGGGCACAAATAAAAAAATGTAAAATGGGGGCTGGGCGCGGTGACTC 1500

 35754921 ACTCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATT 35754980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATT 1560

 35754981 GAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACCCCGTCTTTACTAAAAATACAAAAAATTAGCT 35755040
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     1561 GAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACCCCGTCTT-ACTAAAAATACAAAAAATTAGCT 1619

 35755041 GGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTACTCCTAGCTACTCAGGAGCCTGAGGCAGGAGAATCAC 35755100
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTACTCCCAGCTACTCAGGAGCCTGAGGCAGGAGAATCAC 1679

 35755101 TTGAACCAGGTAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 35755160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TTGAACCAGGTAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 1739

 35755161 GTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACAGTTTGGCCTCCTCTTCTAG 35755220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACAGTTTGGCCTCCTCTTCTAG 1799

 35755221 CTGTTGTGGTATCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGAAGTTTCGCTCTTGTT 35755280
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     1800 CTGTTGTGGTATCACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---GAGACGAAGTTTCGCTCTTGTT 1856

 35755281 GCCCAGGCTGGAACGCAACGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAATCTCCGCCTCCTGGGTTC 35755340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 GCCCAGGCTGGAACGCAACGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAATCTCCGCCTCCTGGGTTC 1916

 35755341 AAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACATGCGCCACCATGC 35755400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 AAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGACATGCGCCACCATGC 1976

 35755401 CCTGCTAATTTTGTATTTTTAGTTGAGATGTGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGTCTCG 35755460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 CCTGCTAATTTTGTATTTTTAGTTGAGATGTGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGTCTCG 2036

 35755461 AACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTATGGGAT 35755520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 AACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTATGGGAT 2096

 35755521 TACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGACTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTGGCACTGTTGCC 35755580
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGGCTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTGGCACTGTTGCC 2156

 35755581 CAGGCTGGAGTGCAGTG 35755597
          |||||||||||||||||
     2157 CAGGCTGGAGTGCAGTG 2173

EXCISED REGION

 35758791 AGCCTCCCGGGTAGCTGGGATTACAGGTGCA----TGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTG 35758846
          |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||
     2232 AGCCTCCCGGGTAGCTGGGATTACAGG----CGCCTGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTG 2287

 35758847 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTAGTCTCGAACT 35758898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCTAGGCTAGTCTCGAACT 2339

Alignment time is 3.79381 s

