
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2034] =>      2034 nucs 'mol-32-1e7c-024523_2034'

Score:        1968
Aligned:      2034        nucs
Identic:      2028 (100%) nucs =>      1203 (100%)       825 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31314324,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319783]
 second seq =>  [       1,    1204] EXCISED REGION [    1205,    2034]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31314324 TTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAG 31314383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAG 60

 31314384 CTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTATGT 31314443
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
       61 CTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTACGT 120

 31314444 GCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTT 31314503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTT 180

 31314504 CCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAG 31314563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAG 240

 31314564 GCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATT 31314623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATT 300

 31314624 CAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATA 31314683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATA 360

 31314684 CTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAA 31314743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAA 420

 31314744 AATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCT 31314803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCT 480

 31314804 GAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCG 31314863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCG 540

 31314864 CTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCT 31314923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCT 600

 31314924 CAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCA 31314983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCA 660

 31314984 GCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGA 31315043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGA 720

 31315044 AATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCA 31315103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCA 780

 31315104 ACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAG 31315163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAG 840

 31315164 TAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGA 31315223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGA 900

 31315224 CAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAG 31315283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAG 960

 31315284 TGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTAT 31315343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTAT 1020

 31315344 AAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAA 31315403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAA 1080

 31315404 ATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAG 31315463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAG 1140

 31315464 GCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGG 31315523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGG 1200

 31315524 GTAC 31315527
          ||||
     1201 GTAC 1204

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1205 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 1264

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 1324

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 1384

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1385 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 1444

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1445 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 1504

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 1564

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 1624

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1625 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 1684

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 1744

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 31319553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 1804

 31319554 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 31319613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 1864

 31319614 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 31319673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 1924

 31319674 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 31319733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 1984

 31319734 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGG 31319783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGG 2034

Alignment time is 2.71743 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3228] =>      3228 nucs 'mol-32-1f00-087500_3228'

Score:        3140
Aligned:      3230        nucs
Identic:      3221 (100%) nucs =>      2628 (100%)       593 ( 99%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31312897,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319551]
 second seq =>  [       1,    2630] EXCISED REGION [    2631,    3228]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31312897 TCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACT 31312956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACT 60

 31312957 GCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGT 31313016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGT 120

 31313017 TGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTT 31313076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTT 180

 31313077 TTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTC 31313136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTC 240

 31313137 TGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGG 31313196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGG 300

 31313197 GTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACT 31313256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACT 360

 31313257 GCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTG 31313316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTG 420

 31313317 GTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTA 31313376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTA 480

 31313377 CAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTAT 31313436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTAT 540

 31313437 TGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTT 31313496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTT 600

 31313497 CTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTG 31313556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTG 660

 31313557 TTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGT 31313616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGT 720

 31313617 GCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGAC 31313676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGAC 780

 31313677 CCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACACACACACACACACA 31313736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACACACACACACACACA 840

 31313737 CACACAAATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGT 31313796
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACA--AATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGT 898

 31313797 GTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTT-AATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAG 31313855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
      899 GTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTAATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAG 958

 31313856 ATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAA 31313915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 ATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAA 1018

 31313916 TTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGA 31313975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 TTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGA 1078

 31313976 GGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACT 31314035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 GGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACT 1138

 31314036 TAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTT 31314095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTT 1198

 31314096 CACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTC 31314155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTC 1258

 31314156 CTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTT 31314215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTT 1318

 31314216 CTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTT 31314275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 CTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTT 1378

 31314276 ACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTG 31314335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 ACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTG 1438

 31314336 TTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACA 31314395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACA 1498

 31314396 GAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTATGTGCTGGTCCCTGA 31314455
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1499 GAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTACGTGCTGGTCCCTGA 1558

 31314456 AATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGA 31314515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 AATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGA 1618

 31314516 AGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCT 31314575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 AGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCT 1678

 31314576 CCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCT 31314635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCT 1738

 31314636 CACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTT 31314695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 CACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTT 1798

 31314696 TACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAAC 31314755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAAC 1858

 31314756 TTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAG 31314815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAG 1918

 31314816 GCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAG 31314875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAG 1978

 31314876 GAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCA 31314935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 GAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCA 2038

 31314936 CTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGG 31314995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGG 2098

 31314996 CCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCAC 31315055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCAC 2158

 31315056 GCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATT 31315115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATT 2218

 31315116 TTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAAT 31315175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAAT 2278

 31315176 TTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTAT 31315235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTAT 2338

 31315236 AAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCG 31315295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCG 2398

 31315296 CTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCAC 31315355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCAC 2458

 31315356 CAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAG 31315415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAG 2518

 31315416 AAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCC 31315475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 AAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCC 2578

 31315476 ATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 31315527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 2630

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2631 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 2690

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 2750

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 2810

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2811 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 2870

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2871 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 2930

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 2990

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 3050

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3051 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 3110

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 3170

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACAT 31319551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACAT 3228

Alignment time is 4.8387 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6328] =>      6328 nucs 'mol-32-1f0b-048273_6328'

Score:        6163
Aligned:      6330        nucs
Identic:      6314 (100%) nucs =>      5434 (100%)       880 ( 99%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31310084,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319838]
 second seq =>  [       1,    5443] EXCISED REGION [    5444,    6328]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31310084 CCATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAATGTTATCCCTCCCCTAACCCCCAACGCCCCG 31310143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAATGTTATCCCTCCCCTAACCCCCAACGCCCCG 60

 31310144 GCAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCCCTCCCTATGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAACTCC 31310203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCCCTCCCTATGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAACTCC 120

 31310204 CACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTGAGAA 31310263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTGAGAA 180

 31310264 TGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTAAAGAACATGAACTCATCCTTTTTTGGA 31310323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTAAAGAACATGAACTCATCCTTTTTTGGA 240

 31310324 ATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAATAGAGATATCATTACCACTTCCTTTTT 31310383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAATAGAGATATCATTACCACTTCCTTTTT 300

 31310384 AATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAGTAC 31310443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAGTAC 360

 31310444 AAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGAGAG 31310503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGAGAG 420

 31310504 AGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTT 31310563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTT 480

 31310564 CCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCATATTGGGAAACACTTTTACTGATAAAT 31310623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCATATTGGGAAACACTTTTACTGATAAAT 540

 31310624 TAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAG 31310683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAG 600

 31310684 TAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCA 31310743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCA 660

 31310744 GAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAAC 31310803
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTCACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAAC 720

 31310804 ACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCAGGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGA 31310863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCAGGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGA 780

 31310864 GAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGT 31310923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGT 840

 31310924 GCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTG 31310983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTG 900

 31310984 CCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCC 31311043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCC 960

 31311044 AAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCA 31311103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCA 1020

 31311104 CCTCATCCCTACGTGCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTAC 31311163
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTCATCCCTACATGCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTAC 1080

 31311164 CCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAA 31311223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAA 1140

 31311224 TTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAA 31311283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAA 1200

 31311284 TCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGC 31311343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGC 1260

 31311344 CTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAA 31311403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAA 1320

 31311404 AGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATG 31311463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATG 1380

 31311464 TTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATA 31311523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATA 1440

 31311524 ATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATAC 31311583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATAC 1500

 31311584 AAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATA 31311643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATA 1560

 31311644 AATACTTAGAGGGATTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTT 31311703
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATACTTAGAGGGGTTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTT 1620

 31311704 CCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTT 31311763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTT 1680

 31311764 TTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGT 31311823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGT 1740

 31311824 TATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATT 31311883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATT 1800

 31311884 GCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGAT 31311943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGAT 1860

 31311944 AAACAAACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGG 31312003
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAACAGACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGG 1920

 31312004 CTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTC 31312063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTC 1980

 31312064 CAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGATCTTTCCCCCAGC 31312123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1981 CAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGCTCTTTCCCCCAGC 2040

 31312124 TGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACA 31312183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACA 2100

 31312184 CACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAAC 31312243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAAC 2160

 31312244 ACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTC 31312303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTC 2220

 31312304 ACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTC 31312363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTC 2280

 31312364 TTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAA 31312423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAA 2340

 31312424 AGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAA 31312483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAA 2400

 31312484 AGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTG 31312543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTG 2460

 31312544 TTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGA 31312603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGA 2520

 31312604 ACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAG 31312663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAG 2580

 31312664 TAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAA 31312723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAA 2640

 31312724 CTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTT 31312783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTT 2700

 31312784 GGGGACAAATTTCACCCCCACTCCTTATCCTTCTTGTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGAT 31312843
          ||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2701 GGGGACAAATTTCACCCCGACTCCTTATCCTTCTTCTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGAT 2760

 31312844 CTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCAC 31312903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCAC 2820

 31312904 CTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATAT 31312963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATAT 2880

 31312964 CCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAG 31313023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAG 2940

 31313024 ATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTG 31313083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTG 3000

 31313084 CTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCC 31313143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCC 3060

 31313144 CAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAG 31313203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAG 3120

 31313204 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCG 31313263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCG 3180

 31313264 GCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGA 31313323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGA 3240

 31313324 ACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCAT 31313383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCAT 3300

 31313384 GAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATAT 31313443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATAT 3360

 31313444 ATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAG 31313503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAG 3420

 31313504 TGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAAT 31313563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAAT 3480

 31313564 AATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACA 31313623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACA 3540

 31313624 CACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATT 31313683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATT 3600

 31313684 CATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACACACACACACACACACACACAA 31313743
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |
     3601 CATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACACACACACACACACACACA--A 3658

 31313744 ATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTC 31313803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 ATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTC 3718

 31313804 TGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTT-AATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCT 31313862
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTAATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCT 3778

 31313863 AACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGAC 31313922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 AACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGAC 3838

 31313923 ATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGT 31313982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 ATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGT 3898

 31313983 TGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGA 31314042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGA 3958

 31314043 ATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTA 31314102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 ATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTA 4018

 31314103 TTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTG 31314162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 TTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTG 4078

 31314163 CAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTT 31314222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 CAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTT 4138

 31314223 TGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACA 31314282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 TGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACA 4198

 31314283 TCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTT 31314342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 TCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTT 4258

 31314343 TACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAA 31314402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAA 4318

 31314403 GTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTATGTGCTGGTCCCTGAAATATCA 31314462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4319 GTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTACGTGCTGGTCCCTGAAATATCA 4378

 31314463 CTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTG 31314522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 CTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTG 4438

 31314523 ATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATC 31314582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 ATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATC 4498

 31314583 ATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATC 31314642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 ATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATC 4558

 31314643 TTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGC 31314702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 TTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGC 4618

 31314703 CAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAA 31314762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 CAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAA 4678

 31314763 ACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTG 31314822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 ACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTG 4738

 31314823 ATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGT 31314882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 ATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGT 4798

 31314883 GGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCAC 31314942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 GGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCAC 4858

 31314943 TCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGAC 31315002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 TCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGAC 4918

 31315003 GTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCAC 31315062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 GTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCAC 4978

 31315063 TAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCT 31315122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 TAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCT 5038

 31315123 TGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAA 31315182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 TGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAA 5098

 31315183 ATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATT 31315242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 ATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATT 5158

 31315243 AGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAG 31315302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 AGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAG 5218

 31315303 AAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAA 31315362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 AAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAA 5278

 31315363 AAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAG 31315422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 AAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAG 5338

 31315423 CCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACAC 31315482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 CCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACAC 5398

 31315483 AGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 31315527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 AGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 5443

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5444 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 5503

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5504 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 5563

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5564 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 5623

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5624 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 5683

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5684 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 5743

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5744 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 5803

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5804 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 5863

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5864 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 5923

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5924 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 5983

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 31319553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5984 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 6043

 31319554 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 31319613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6044 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 6103

 31319614 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 31319673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6104 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 6163

 31319674 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 31319733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6164 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 6223

 31319734 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 31319793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6224 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 6283

 31319794 CCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGCCCA 31319838
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6284 CCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGCCCA 6328

Alignment time is 8.78165 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2866] =>      2866 nucs 'mol-32-1f16-088990_2866'

Score:        2741
Aligned:      2842        nucs
Identic:      2832 (100%) nucs =>      1621 (100%)      1211 ( 99%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31313906,31315527] EXCISED REGION [31318954,31320173]
 second seq =>  [      27,    1648] EXCISED REGION [    1649,    2866]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31313906 TGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAAT 31313965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       27 TGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAAT 86

 31313966 AATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTT 31314025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       87 AATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTT 146

 31314026 AGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCT 31314085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      147 AGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCT 206

 31314086 CTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAA 31314145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      207 CTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAA 266

 31314146 TCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTAT 31314205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      267 TCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTAT 326

 31314206 TGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGT 31314265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      327 TGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGT 386

 31314266 TTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTT 31314325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      387 TTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTT 446

 31314326 CTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCT 31314385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      447 CTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCT 506

 31314386 TTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTATGTGC 31314445
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      507 TTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTACGTGC 566

 31314446 TGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCC 31314505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      567 TGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCC 626

 31314506 ATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGC 31314565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      627 ATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGC 686

 31314566 TGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCA 31314625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      687 TGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCA 746

 31314626 GAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACT 31314685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 GAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACT 806

 31314686 GTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAA 31314745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      807 GTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAA 866

 31314746 TGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGA 31314805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      867 TGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGA 926

 31314806 ATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCT 31314865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 ATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCT 986

 31314866 GAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCA 31314925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 GAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCA 1046

 31314926 GAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGC 31314985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 GAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGC 1106

 31314986 TCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAA 31315045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 TCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAA 1166

 31315046 TATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAAC 31315105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 TATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAAC 1226

 31315106 TTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTA 31315165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 TTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTA 1286

 31315166 ATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACA 31315225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 ATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACA 1346

 31315226 AACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTG 31315285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 AACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTG 1406

 31315286 AGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAA 31315345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 AGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAA 1466

 31315346 GAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAAT 31315405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 GAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAAT 1526

 31315406 TTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGC 31315465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 TTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGC 1586

 31315466 ACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGT 31315525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 ACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGT 1646

 31315526 AC 31315527
          ||
     1647 AC 1648

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1649 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 1708

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 1768

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1769 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 1828

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1829 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 1888

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1889 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 1948

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 2008

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 2068

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2069 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 2128

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 2188

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 31319553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 2248

 31319554 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 31319613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 2308

 31319614 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 31319673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 2368

 31319674 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 31319733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 2428

 31319734 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 31319793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 2488

 31319794 CCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGCCCACCTCAAATCCCAGCT 31319853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 CCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGCCCACCTCAAATCCCAGCT 2548

 31319854 ACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGACTCGCTTGAATCTGAGTGAGAGATCATGGTGAAATGA 31319913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 ACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGACTCGCTTGAATCTGAGTGAGAGATCATGGTGAAATGA 2608

 31319914 GATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGTAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAA 31319973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||  |||||||||
     2609 GATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGTAACAAGAGCGAAACCCCGTCT--AAAAAAAAA 2666

 31319974 AAAAAAAAAAAGAACCACAACCACAAAACAGAATTTTAGACCAATATCCTTGATGAACAT 31320033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 AAAAAAAAAAAGAACCACAACCACAAAACAGAATTTTAGACCAATATCCTTGATGAACAT 2726

 31320034 TGATACAGAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACCGAATCCAGCAGCACATTAAAAAGCT 31320093
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 TGATACAAAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACCGAATCCAGCAGCACATTAAAAAGCT 2786

 31320094 TGATCCATCATGATCAAGTGGGCATCATCCCTGGGATGCAAGGCTGGTTCAATATATGCA 31320153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 TGATCCATCATGATCAAGTGGGCATCATCCCTGGGATGCAAGGCTGGTTCAATATATGCA 2846

 31320154 AATCAATAAATGTAATCCAG 31320173
          ||||||||||||||||||||
     2847 AATCAATAAATGTAATCCAG 2866

Alignment time is 4.26012 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2144] =>      2144 nucs 'mol-32-2081-051930_2144'

Score:        2078
Aligned:      2144        nucs
Identic:      2138 (100%) nucs =>      1310 (100%)       828 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31314217,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319786]
 second seq =>  [       1,    1311] EXCISED REGION [    1312,    2144]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31314217 TCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTA 31314276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTA 60

 31314277 CATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGT 31314336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGT 120

 31314337 TTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAG 31314396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAG 180

 31314397 AAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTATGTGCTGGTCCCTGAA 31314456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      181 AAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTACGTGCTGGTCCCTGAA 240

 31314457 ATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAA 31314516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAA 300

 31314517 GAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTC 31314576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTC 360

 31314577 CAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTC 31314636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTC 420

 31314637 ACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTT 31314696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTT 480

 31314697 ACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACT 31314756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACT 540

 31314757 TATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGG 31314816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGG 600

 31314817 CCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGG 31314876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGG 660

 31314877 AAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCAC 31314936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCAC 720

 31314937 TTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGC 31314996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGC 780

 31314997 CTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACG 31315056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACG 840

 31315057 CGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTT 31315116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTT 900

 31315117 TTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATT 31315176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATT 960

 31315177 TAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATA 31315236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATA 1020

 31315237 AGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGC 31315296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGC 1080

 31315297 TTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACC 31315356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACC 1140

 31315357 AGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGA 31315416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGA 1200

 31315417 AAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCA 31315476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCA 1260

 31315477 TAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 31315527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 1311

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1312 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 1371

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 1431

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 1491

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1492 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 1551

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1552 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 1611

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 1671

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 1731

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1732 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 1791

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 1851

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 31319553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 1911

 31319554 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 31319613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 1971

 31319614 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 31319673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 2031

 31319674 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 31319733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 2091

 31319734 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGA 31319786
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGA 2144

Alignment time is 3.47349 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5781] =>      5781 nucs 'mol-32-20fa-119374_5781'

Score:        5636
Aligned:      5783        nucs
Identic:      5768 (100%) nucs =>      5342 (100%)       426 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31310177,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319383]
 second seq =>  [       1,    5351] EXCISED REGION [    5352,    5781]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31310177 GTCCATGTGTTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTT 31310236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCCATGTGTTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTT 60

 31310237 TCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTA 31310296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTA 120

 31310297 AAGAACATGAACTCATCCTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAA 31310356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGAACATGAACTCATCCTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAA 180

 31310357 TAGAGATATCATTACCACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCT 31310416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGAGATATCATTACCACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCT 240

 31310417 AATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTC 31310476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTC 300

 31310477 TTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCA 31310536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCA 360

 31310537 TTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCA 31310596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCA 420

 31310597 TATTGGGAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAG 31310656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTGGGAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAG 480

 31310657 TTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACT 31310716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACT 540

 31310717 CTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTA 31310776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTA 600

 31310777 CACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCA 31310836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCA 660

 31310837 GGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGG 31310896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGG 720

 31310897 AGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGC 31310956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGC 780

 31310957 TGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGA 31311016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGA 840

 31311017 AAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTC 31311076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTC 900

 31311077 TCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACGTGCTGTTTTCTCTCACAAAA 31311136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      901 TCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACATGCTGTTTTCTCTCACAAAA 960

 31311137 TTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTC 31311196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTC 1020

 31311197 TAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGG 31311256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGG 1080

 31311257 CAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGT 31311316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGT 1140

 31311317 CTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTT 31311376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTT 1200

 31311377 GAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGG 31311436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGG 1260

 31311437 CTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATG 31311496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATG 1320

 31311497 GTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTG 31311556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTG 1380

 31311557 GCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTG 31311616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTG 1440

 31311617 TCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGATTTTTTTTATCCCTCACTT 31311676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1441 TCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGGTTTTTTTTATCCCTCACTT 1500

 31311677 ATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATA 31311736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATA 1560

 31311737 TTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACAT 31311796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACAT 1620

 31311797 CAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCG 31311856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCG 1680

 31311857 AGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGT 31311916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGT 1740

 31311917 TAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAAACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTT 31311976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAGACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTT 1800

 31311977 ATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCA 31312036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCA 1860

 31312037 CCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCT 31312096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCT 1920

 31312097 CACTTTCCAGCAGATCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCA 31312156
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACTTTCCAGCAGCTCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCA 1980

 31312157 AAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCA 31312216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCA 2040

 31312217 GGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTG 31312276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTG 2100

 31312277 AAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATG 31312336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATG 2160

 31312337 TGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGA 31312396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGA 2220

 31312397 CATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACA 31312456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACA 2280

 31312457 CTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAA 31312516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAA 2340

 31312517 ACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAA 31312576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAA 2400

 31312577 TACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCC 31312636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCC 2460

 31312637 TGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGT 31312696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGT 2520

 31312697 CTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACC 31312756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACC 2580

 31312757 TCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCCACTCCTTATCCTTC 31312816
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2581 TCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCGACTCCTTATCCTTC 2640

 31312817 TTGTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTAT 31312876
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTCTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTAT 2700

 31312877 TTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAAT 31312936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAAT 2760

 31312937 TCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGT 31312996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGT 2820

 31312997 AGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGT 31313056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGT 2880

 31313057 ATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTT 31313116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTT 2940

 31313117 TTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCA 31313176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCA 3000

 31313177 TTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGG 31313236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGG 3060

 31313237 GATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATT 31313296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATT 3120

 31313297 TTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGC 31313356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGC 3180

 31313357 CTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTT 31313416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTT 3240

 31313417 AAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTT 31313476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTT 3300

 31313477 TTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGT 31313536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGT 3360

 31313537 AGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATT 31313596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATT 3420

 31313597 GAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTA 31313656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTA 3480

 31313657 ATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATA 31313716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATA 3540

 31313717 CATACACACACACACACACACACACAAATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAG 31313776
          ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CATACACACACACACACACACACA--AATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAG 3598

 31313777 CAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTT--AATGC 31313834
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||
     3599 CAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTAATGC 3658

 31313835 TTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACC 31313894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACC 3718

 31313895 CAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAA 31313954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 CAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAA 3778

 31313955 CATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAG 31314014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 CATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAG 3838

 31314015 TCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAA 31314074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAA 3898

 31314075 AAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCA 31314134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 AAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCA 3958

 31314135 CTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATA 31314194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 CTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATA 4018

 31314195 GGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCT 31314254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 GGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCT 4078

 31314255 GCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTAT 31314314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 GCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTAT 4138

 31314315 AATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTAT 31314374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 AATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTAT 4198

 31314375 ATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTA 31314434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 ATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTA 4258

 31314435 TGTTTATGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGA 31314494
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TGTTTACGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGA 4318

 31314495 TCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAG 31314554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAG 4378

 31314555 ATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTG 31314614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 ATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTG 4438

 31314615 TCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGT 31314674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 TCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGT 4498

 31314675 CAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAA 31314734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 CAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAA 4558

 31314735 CAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACAT 31314794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 CAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACAT 4618

 31314795 ATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCAT 31314854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 ATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCAT 4678

 31314855 CTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCA 31314914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 CTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCA 4738

 31314915 ACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGG 31314974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 ACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGG 4798

 31314975 CCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGG 31315034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 CCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGG 4858

 31315035 AGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGG 31315094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 AGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGG 4918

 31315095 TGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTAT 31315154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 TGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTAT 4978

 31315155 GAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAG 31315214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 GAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAG 5038

 31315215 TAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAAT 31315274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 TAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAAT 5098

 31315275 TATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAA 31315334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 TATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAA 5158

 31315335 ACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTT 31315394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 ACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTT 5218

 31315395 AGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAAT 31315454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 AGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAAT 5278

 31315455 GTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACT 31315514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 GTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACT 5338

 31315515 GCAGCCCGGGTAC 31315527
          |||||||||||||
     5339 GCAGCCCGGGTAC 5351

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5352 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 5411

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5412 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 5471

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5472 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 5531

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5532 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 5591

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5592 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 5651

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5652 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 5711

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5712 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 5771

 31319374 GGAGTGAAAG 31319383
          ||||||||||
     5772 GGAGTGAAAG 5781

Alignment time is 8.19244 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3929] =>      3929 nucs 'mol-32-2291-033527_3929'

Score:        3830
Aligned:      3931        nucs
Identic:      3921 (100%) nucs =>      3257 (100%)       664 ( 99%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31312266,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319622]
 second seq =>  [       1,    3260] EXCISED REGION [    3261,    3929]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31312266 CCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCA 31312325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCA 60

 31312326 CTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTA 31312385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTA 120

 31312386 GATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGA 31312445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGA 180

 31312446 GACAGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAA 31312505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACAGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAA 240

 31312506 AAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAA 31312565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAA 300

 31312566 GCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTT 31312625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTT 360

 31312626 GTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATG 31312685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATG 420

 31312686 TTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTG 31312745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTG 480

 31312746 TGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCCACT 31312805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      481 TGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCGACT 540

 31312806 CCTTATCCTTCTTGTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTAT 31312865
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTTATCCTTCTTCTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTAT 600

 31312866 AATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATG 31312925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATG 660

 31312926 AGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCC 31312985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCC 720

 31312986 TAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCT 31313045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCT 780

 31313046 TGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATT 31313105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATT 840

 31313106 ATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATG 31313165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATG 900

 31313166 ATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCT 31313225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCT 960

 31313226 TGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTA 31313285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTA 1020

 31313286 GAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTG 31313345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTG 1080

 31313346 CTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTG 31313405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTG 1140

 31313406 CCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAG 31313465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAG 1200

 31313466 ATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTT 31313525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTT 1260

 31313526 CAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGC 31313585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGC 1320

 31313586 TGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATG 31313645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATG 1380

 31313646 TACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGA 31313705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGA 1440

 31313706 GTATACACATACATACACACACACACACACACACACAAATGACAAGCTAGCTATGCATTG 31313765
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||
     1441 GTATACACATACATACACACACACACACACACACA--AATGACAAGCTAGCTATGCATTG 1498

 31313766 TAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTT 31313825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTT 1558

 31313826 TTTTAATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTAC 31313885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TTTTAATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTAC 1618

 31313886 TAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAAT 31313945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAAT 1678

 31313946 CAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCA 31314005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCA 1738

 31314006 GTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGC 31314065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGC 1798

 31314066 AGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGAT 31314125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 AGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGAT 1858

 31314126 GTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAA 31314185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAA 1918

 31314186 TTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAAT 31314245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAAT 1978

 31314246 TACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTT 31314305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTT 2038

 31314306 TCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAG 31314365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAG 2098

 31314366 TTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAAT 31314425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAAT 2158

 31314426 GTCTGGGTATGTTTATGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCA 31314485
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GTCTGGGTATGTTTACGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCA 2218

 31314486 GATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAG 31314545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 GATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAG 2278

 31314546 CCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCG 31314605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 CCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCG 2338

 31314606 TGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCC 31314665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCC 2398

 31314666 TTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGC 31314725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGC 2458

 31314726 AATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTC 31314785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTC 2518

 31314786 ACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGC 31314845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGC 2578

 31314846 CACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACT 31314905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACT 2638

 31314906 GATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTG 31314965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 GATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTG 2698

 31314966 GTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAG 31315025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAG 2758

 31315026 AAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCT 31315085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 AAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCT 2818

 31315086 GCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAA 31315145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAA 2878

 31315146 AGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTA 31315205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 AGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTA 2938

 31315206 ATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAA 31315265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAA 2998

 31315266 TACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATA 31315325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATA 3058

 31315326 AAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGG 31315385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGG 3118

 31315386 ATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGAT 31315445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 ATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGAT 3178

 31315446 GGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTA 31315505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTA 3238

 31315506 AGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 31315527
          ||||||||||||||||||||||
     3239 AGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 3260

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3261 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 3320

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 3380

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3381 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 3440

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3441 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 3500

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3501 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 3560

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3561 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 3620

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3621 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 3680

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3681 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 3740

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3741 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 3800

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 31319553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3801 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 3860

 31319554 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 31319613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3861 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 3920

 31319614 TAAAAACCG 31319622
          |||||||||
     3921 TAAAAACCG 3929

Alignment time is 5.79256 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2598] =>      2598 nucs 'mol-32-238e-035501_2598'

Score:        2539
Aligned:      2600        nucs
Identic:      2592 (100%) nucs =>      2402 (100%)       190 ( 99%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31313123,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319145]
 second seq =>  [       1,    2406] EXCISED REGION [    2407,    2598]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31313123 ACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAA 31313182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAA 60

 31313183 GCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTAC 31313242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTAC 120

 31313243 AGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCA 31313302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCA 180

 31313303 TGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCA 31313362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCA 240

 31313363 AAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTT 31313422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTT 300

 31313423 TAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTC 31313482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTC 360

 31313483 TTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTT 31313542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTT 420

 31313543 TACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACA 31313602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACA 480

 31313603 TAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACA 31313662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACA 540

 31313663 AGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACA 31313722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACA 600

 31313723 CACACACACACACACACACAAATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTC 31313782
          ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACACACACACACACACA--AATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTC 658

 31313783 TCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTT---AATGCTTAGC 31313839
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||
      659 TCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGCTTAGC 718

 31313840 TGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAG 31313899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 TGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAG 778

 31313900 AAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTT 31313959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 AAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTT 838

 31313960 TAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAG 31314019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 TAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAG 898

 31314020 CAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAG 31314079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 CAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAG 958

 31314080 GGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTC 31314139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 GGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTC 1018

 31314140 CCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAA 31314199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 CCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAA 1078

 31314200 AGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTT 31314259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 AGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTT 1138

 31314260 TAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCC 31314319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCC 1198

 31314320 TAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTC 31314379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTC 1258

 31314380 AAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTT 31314439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 AAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTT 1318

 31314440 ATGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGA 31314499
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 ACGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGA 1378

 31314500 CCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTA 31314559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 CCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTA 1438

 31314560 GGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGT 31314619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 GGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGT 1498

 31314620 TATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAA 31314679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAA 1558

 31314680 GATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACT 31314739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACT 1618

 31314740 TCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTG 31314799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTG 1678

 31314800 TCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTG 31314859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTG 1738

 31314860 ATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCT 31314919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 ATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCT 1798

 31314920 GGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCA 31314979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCA 1858

 31314980 CCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAAC 31315039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAAC 1918

 31315040 TGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTT 31315099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTT 1978

 31315100 GTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATT 31315159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 GTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATT 2038

 31315160 TGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAAT 31315219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAAT 2098

 31315220 AAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTT 31315279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 AAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTT 2158

 31315280 TTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTT 31315339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTT 2218

 31315340 TTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGA 31315399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGA 2278

 31315400 GCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAG 31315459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAG 2338

 31315460 GCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGC 31315519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGC 2398

 31315520 CCGGGTAC 31315527
          ||||||||
     2399 CCGGGTAC 2406

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2407 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 2466

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 2526

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 2586

 31319134 GGCACAAGAATT 31319145
          ||||||||||||
     2587 GGCACAAGAATT 2598

Alignment time is 4.14859 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7450] =>      7450 nucs 'mol-32-2874-122902_7450'

Score:        7296
Aligned:      7454        nucs
Identic:      7438 (100%) nucs =>      7183 (100%)       255 ( 99%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31308334,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319211]
 second seq =>  [       1,    7192] EXCISED REGION [    7193,    7450]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31308334 AATTATCATCTTAACCAGTTGTAAGTATGTGATTTAGTAGCACTAAATACACTCACAACA 31308393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTATCATCTTAACCAGTTGTAAGTATGTGATTTAGTAGCACTAAATACACTCACAACA 60

 31308394 TTGTGTGGCTATCACCAGTATCCATACCCAAAATGTTTTCATCATCTGTAACGAAAACTC 31308453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTGTGGCTATCACCAGTATCCATACCCAAAATGTTTTCATCATCTGTAACGAAAACTC 120

 31308454 TATGTCCACTACTCCCTTTCCTTCCACCTCCCAGCCCCTGGTAACCTCTACTCTATTTCC 31308513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATGTCCACTACTCCCTTTCCTTCCACCTCCCAGCCCCTGGTAACCTCTACTCTATTTCC 180

 31308514 TGTCTCTTTGAATTTGCCTGTTCTAGGTACATCATATAAGTATAATTTTACAATATTTAT 31308573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTCTCTTTGAATTTGCCTGTTCTAGGTACATCATATAAGTATAATTTTACAATATTTAT 240

 31308574 CCTGTGTCTGGCTTCTTGTACTATGCATGTTTTCAAGGACCATCCATGTTGTAGCATATA 31308633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTGTGTCTGGCTTCTTGTACTATGCATGTTTTCAAGGACCATCCATGTTGTAGCATATA 300

 31308634 TCAAAATTTCATTCATGTTTATGGCAGAATAATATACTATCATGCGCATATTCCCTTTAT 31308693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAAAATTTCATTCATGTTTATGGCAGAATAATATACTATCATGCGCATATTCCCTTTAT 360

 31308694 GTGTTGGTGGGCATTTGAATTGTTTCCACATTTTGCCCATTGTGAATAATGCTATGAACA 31308753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGTTGGTGGGCATTTGAATTGTTTCCACATTTTGCCCATTGTGAATAATGCTATGAACA 420

 31308754 TCAGTGCACAAATGTGTTTGAGTCCCTGCTTTTAATTCTTTTGGATATACACCTAGGAGT 31308813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAGTGCACAAATGTGTTTGAGTCCCTGCTTTTAATTCTTTTGGATATACACCTAGGAGT 480

 31308814 GAAATTGGTGGGTCATATGGTAGTTCTATTTGAACTGTTTAAGAAATTGCCACATTGTTT 31308873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAATTGGTGGGTCATATGGTAGTTCTATTTGAACTGTTTAAGAAATTGCCACATTGTTT 540

 31308874 TCTACATAAAATGTACCATTTTGGATTCTCCCCAGCACTTATGAGGCTTCCAATTTCTCC 31308933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTACATAAAATGTACCATTTTGGATTCTCCCCAGCACTTATGAGGCTTCCAATTTCTCC 600

 31308934 ACGTCCTTGCCAACACCTGCCATTTTCCCTTTTTAAAAATTATAGCCATCCTAGTAGGTG 31308993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACGTCCTTGCCAACACCTGCCATTTTCCCTTTTTAAAAATTATAGCCATCCTAGTAGGTG 660

 31308994 TGATGTGCTATCCATGGTCATTTTGACTTGCATTTTTCTAATGATTAATAATGTTAAGCA 31309053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGATGTGCTATCCATGGTCATTTTGACTTGCATTTTTCTAATGATTAATAATGTTAAGCA 720

 31309054 TCTTTTCATGGGTATATTGGACGTTTGTATATCATACTTGGTGAAATGTCTATTCATGTC 31309113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTTTTCATGGGTATATTGGACGTTTGTATATCATACTTGGTGAAATGTCTATTCATGTC 780

 31309114 CTTCATCTACTTTTTAATCTAGTTGTTTGACTTTTTGTTGTTGAGTTGTAGGAGTTTTTA 31309173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTCATCTACTTTTTAATCTAGTTGTTTGACTTTTTGTTGTTGAGTTGTAGGAGTTTTTA 840

 31309174 AAATATAAATTTTGAGTATCCATCACTTATTAAGTATATAACTTATAAATATTTTCTCCC 31309233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATATAAATTTTGAGTATCCATCACTTATTAAGTATATAACTTATAAATATTTTCTCCC 900

 31309234 ATTCAGTAGGCTGTCTTTTTACATTACTTTCAGCAATGTTGTAGTTTTAAGTATATGAGT 31309293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTCAGTAGGCTGTCTTTTTACATTACTTTCAGCAATGTTGTAGTTTTAAGTATATGAGT 960

 31309294 CTTTTACTTCTTTCTTTAGATTTATCATAAGTATTTAATTTCTAATTAGTTAAGATTTAT 31309353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTTTACTTCTTTCTTTAGATTTATCATAAGTATTTAATTTCTAATTAGTTAAGATTTAT 1020

 31309354 TCCTAAGTACTCCTAAGTATTTAATTACTAAATACTAAGTATTTAGTAATAAACATAAAC 31309413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCTAAGTACTCCTAAGTATTTAATTACTAAATACTAAGTATTTAGTAATAAACATAAAC 1080

 31309414 CTTGTTTAGATTTGTTCTTAAGTATTTTAGTGACTATTATACACAGCTTTTCTTTTCTTT 31309473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTGTTTAGATTTGTTCTTAAGTATTTTAGTGACTATTATACACAGCTTTTCTTTTCTTT 1140

 31309474 TCTTTTTTTTTTTCTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCTGTGG 31309533
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTTTTTTTTTT-CTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCTGTGG 1199

 31309534 CATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGC 31309593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGC 1259

 31309594 CTCCTGAATAACTGGGATTACAGGCACCCGCCACCTCGCCTGGCTAATTTATTTTTTATT 31309653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CTCCTGAATAACTGGGATTACAGGCACCCGCCACCTCGCCTGGCTAATTTATTTTTTATT 1319

 31309654 TTTTTATTTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCT 31309713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TTTTTATTTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCT 1379

 31309714 GACCTCAGGTGATCTGCCTATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGAGGTGAGCCA 31309773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GACCTCAGGTGATCTGCCTATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGAGGTGAGCCA 1439

 31309774 CCGCGCCTGGCTGCATTGCTTTTCTTTATTTCCTTTTTGGATTGCTTATTGCTGGTATAT 31309833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CCGCGCCTGGCTGCATTGCTTTTCTTTATTTCCTTTTTGGATTGCTTATTGCTGGTATAT 1499

 31309834 TGCAGCAAACTTAATATTTGTGTTGATCTTGTACCCTGAAACTTTGCTGAATTTGTTTAC 31309893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TGCAGCAAACTTAATATTTGTGTTGATCTTGTACCCTGAAACTTTGCTGAATTTGTTTAC 1559

 31309894 TAGCTCTAGTAGCTTCCTTACAAATTCTGTGGAATTCTCTTTTTAAAAATTTTTTTTTCC 31309953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     1560 TAGCTCTAGTAGCTTCCTTACAAATTCTGTGGAATTCTCTTTTTAAAAATTTTTTTT-CC 1618

 31309954 TCTAGTTCATTGGTTTTTCTTTCTTCTTCTTATTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGAT 31310013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TCTAGTTCATTGGTTTTTCTTTCTTCTTCTTATTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGAT 1678

 31310014 ACATGTGTAGAATGTGCGGGTTTGTTACATAGCTATACACGTGCCATGGTGGTTTGCTGT 31310073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 ACATGTGTAGAATGTGCGGGTTTGTTACATAGCTATACACGTGCCATGGTGGTTTGCTGT 1738

 31310074 ACCCATCAACCCATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAATGTTATCCCTCCCCTAACCCC 31310133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 ACCCATCAACCCATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAATGTTATCCCTCCCCTAACCCC 1798

 31310134 CAACGCCCCGGCAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCCCTCCCTATGTCCATGTGTTCTCATT 31310193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CAACGCCCCGGCAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCCCTCCCTATGTCCATGTGTTCTCATT 1858

 31310194 GTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGT 31310253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGT 1918

 31310254 TTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTAAAGAACATGAACTCATC 31310313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTAAAGAACATGAACTCATC 1978

 31310314 CTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAATAGAGATATCATTACCA 31310373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAATAGAGATATCATTACCA 2038

 31310374 CTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGAA 31310433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGAA 2098

 31310434 CTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGACC 31310493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGACC 2158

 31310494 CTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAG 31310553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAG 2218

 31310554 TCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCATATTGGGAAACACTTTT 31310613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCATATTGGGAAACACTTTT 2278

 31310614 ACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAG 31310673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 ACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAG 2338

 31310674 GTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTG 31310733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTG 2398

 31310734 CCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCA 31310793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCA 2458

 31310794 CAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCAGGATGCGACTACCTATT 31310853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCAGGATGCGACTACCTATT 2518

 31310854 AAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGAC 31310913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 AAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGAC 2578

 31310914 TGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATT 31310973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATT 2638

 31310974 TAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGAAAACATTGGGTATGTTA 31311033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGAAAACATTGGGTATGTTA 2698

 31311034 TCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATTT 31311093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATTT 2758

 31311094 TTACCAAGCACCTCATCCCTACGTGCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTG 31311153
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TTACCAAGCACCTCATCCCTACATGCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTG 2818

 31311154 AGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATG 31311213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATG 2878

 31311214 AATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCA 31311273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 AATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCA 2938

 31311274 AGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAG 31311333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 AGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAG 2998

 31311334 ACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAG 31311393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 ACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAG 3058

 31311394 CCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTC 31311453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTC 3118

 31311454 TTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCAC 31311513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCAC 3178

 31311514 TGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCC 31311573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCC 3238

 31311574 TCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATA 31311633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 TCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATA 3298

 31311634 ACCTTCTATAAATACTTAGAGGGATTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCA 31311693
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 ACCTTCTATAAATACTTAGAGGGGTTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCA 3358

 31311694 AAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGACC 31311753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 AAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGACC 3418

 31311754 CTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAATGTTCATTGATGT 31311813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 CTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAATGTTCATTGATGT 3478

 31311814 ATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCA 31311873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 ATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCA 3538

 31311874 GTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTACTTAGAAAATA 31311933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 GTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTACTTAGAAAATA 3598

 31311934 TTTCCTGGATAAACAAACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGG 31311993
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TTTCCTGGATAAACAGACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGG 3658

 31311994 AATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCATATAATGTCACTG 31312053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 AATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCATATAATGTCACTG 3718

 31312054 GGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGATCT 31312113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3719 GGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGCTCT 3778

 31312114 TTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGA 31312173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGA 3838

 31312174 GAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCT 31312233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 GAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCT 3898

 31312234 ACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACC 31312293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 ACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACC 3958

 31312294 AGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGA 31312353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 AGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGA 4018

 31312354 AAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGA 31312413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 AAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGA 4078

 31312414 CATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCATTCCTGATGATT 31312473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 CATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCATTCCTGATGATT 4138

 31312474 TAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAG 31312533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 TAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAG 4198

 31312534 TAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTT 31312593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 TAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTT 4258

 31312594 CCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAA 31312653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 CCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAA 4318

 31312654 CCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATT 31312713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 CCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATT 4378

 31312714 TAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGT 31312773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 TAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGT 4438

 31312774 TCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCCACTCCTTATCCTTCTTGTCTGCTTTGCTTTC 31312833
          ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||
     4439 TCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCGACTCCTTATCCTTCTTCTCTGCTTTGCTTTC 4498

 31312834 TTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTT 31312893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 TTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTT 4558

 31312894 CCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCC 31312953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 CCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCC 4618

 31312954 ACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATT 31313013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 ACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATT 4678

 31313014 TGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCT 31313073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 TGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCT 4738

 31313074 TTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCG 31313133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 TTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCG 4798

 31313134 CTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCC 31313193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 CTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCC 4858

 31313194 TGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACC 31313253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 TGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACC 4918

 31313254 ACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGG 31313313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 ACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGG 4978

 31313314 CTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGA 31313373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 CTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGA 5038

 31313374 TTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAG 31313433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 TTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAG 5098

 31313434 TATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCA 31313493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 TATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCA 5158

 31313494 TTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAG 31313553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 TTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAG 5218

 31313554 GTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTG 31313613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 GTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTG 5278

 31313614 AGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAAC 31313673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 AGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAAC 5338

 31313674 GACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACACACACACACAC 31313733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 GACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACACACACACACAC 5398

 31313734 ACACACACAAATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTT 31313793
          |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 ACACACA--AATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTT 5456

 31313794 TGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTT--AATGCTTAGCTGTTATTCACAT 31313851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||
     5457 TGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTAATGCTTAGCTGTTATTCACAT 5516

 31313852 GAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAG 31313911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 GAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAG 5576

 31313912 CCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGT 31313971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 CCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGT 5636

 31313972 CGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGA 31314031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 CGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGA 5696

 31314032 AACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTA 31314091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 AACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTA 5756

 31314092 CCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTT 31314151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 CCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTT 5816

 31314152 GTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCT 31314211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 GTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCT 5876

 31314212 GTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGA 31314271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 GTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGA 5936

 31314272 ACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATT 31314331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 ACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATT 5996

 31314332 TTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATG 31314391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 TTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATG 6056

 31314392 GACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTATGTGCTGGTCC 31314451
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     6057 GACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTACGTGCTGGTCC 6116

 31314452 CTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTC 31314511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 CTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTC 6176

 31314512 CTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATG 31314571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 CTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATG 6236

 31314572 TGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAAT 31314631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 TGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAAT 6296

 31314632 AGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGAC 31314691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 AGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGAC 6356

 31314692 CTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAG 31314751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 CTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAG 6416

 31314752 TAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGT 31314811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 TAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGT 6476

 31314812 GAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCA 31314871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 GAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCA 6536

 31314872 GAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTC 31314931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 GAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTC 6596

 31314932 CTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAG 31314991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 CTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAG 6656

 31314992 GGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGG 31315051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 GGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGG 6716

 31315052 CCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAA 31315111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 CCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAA 6776

 31315112 CATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTT 31315171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 CATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTT 6836

 31315172 AAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTT 31315231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 AAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTT 6896

 31315232 TTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAA 31315291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 TTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAA 6956

 31315292 TTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTA 31315351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 TTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTA 7016

 31315352 GCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTT 31315411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 GCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTT 7076

 31315412 TGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCT 31315471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 TGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCT 7136

 31315472 CTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 31315527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 CTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 7192

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     7193 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 7252

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7253 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 7312

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     7313 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 7372

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     7373 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 7432

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCA 31319211
          ||||||||||||||||||
     7433 GCACTCCAGCCTGAACCA 7450

Alignment time is 10.1527 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7713] =>      7713 nucs 'mol-32-2874-130275_7713'

Score:        7561
Aligned:      7717        nucs
Identic:      7702 (100%) nucs =>      7612 (100%)        90 ( 99%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31307903,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319044]
 second seq =>  [       1,    7622] EXCISED REGION [    7623,    7713]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31307903 ATGTTCATTTGTATTTTGATATACATTGCCTATTTTCCTTTGTAGAACTTATACCAATTT 31307962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTTCATTTGTATTTTGATATACATTGCCTATTTTCCTTTGTAGAACTTATACCAATTT 60

 31307963 ATATTCCAAAGATTATATGAACATGCCTATTTTCCCACAGCTTAACAACATACTGTGTTA 31308022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATTCCAAAGATTATATGAACATGCCTATTTTCCCACAGCTTAACAACATACTGTGTTA 120

 31308023 TTTTAATTTTGACATTTGTCAATGGTAGCTTAAGAAATGGTATCTCATTATAATTTTAAT 31308082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTAATTTTGACATTTGTCAATGGTAGCTTAAGAAATGGTATCTCATTATAATTTTAAT 180

 31308083 TTGCATTATTTCTATTGTGGGGGAGGTTGAACATTTTTCATGCAGTTAAAGCCTCAAGTT 31308142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGCATTATTTCTATTGTGGGGGAGGTTGAACATTTTTCATGCAGTTAAAGCCTCAAGTT 240

 31308143 AACACACTGTTCTATAGATTTGTTGTAGATGACCAACATTTCACAGACTATATATCACGA 31308202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACACACTGTTCTATAGATTTGTTGTAGATGACCAACATTTCACAGACTATATATCACGA 300

 31308203 CATTCACATAAAATTTTCTGCAAAAATTATGTTGTATCATATATTTGCCCCTTTTGGCAA 31308262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATTCACATAAAATTTTCTGCAAAAATTATGTTGTATCATATATTTGCCCCTTTTGGCAA 360

 31308263 TTCATAAAAAAGCCTCTGAGAAAAGAAATTCCTTGAAATGTTTTATTGTGGAAAAAATAT 31308322
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      361 TTCATAAAAAAGCCTCTGAGAAAAGAAATTCCTTGAAATGTTTTATTGTGGAAAAAAAAT 420

 31308323 ATATATAACATAATTATCATCTTAACCAGTTGTAAGTATGTGATTTAGTAGCACTAAATA 31308382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATATATAACATAATTATCATCTTAACCAGTTGTAAGTATGTGATTTAGTAGCACTAAATA 480

 31308383 CACTCACAACATTGTGTGGCTATCACCAGTATCCATACCCAAAATGTTTTCATCATCTGT 31308442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACTCACAACATTGTGTGGCTATCACCAGTATCCATACCCAAAATGTTTTCATCATCTGT 540

 31308443 AACGAAAACTCTATGTCCACTACTCCCTTTCCTTCCACCTCCCAGCCCCTGGTAACCTCT 31308502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACGAAAACTCTATGTCCACTACTCCCTTTCCTTCCACCTCCCAGCCCCTGGTAACCTCT 600

 31308503 ACTCTATTTCCTGTCTCTTTGAATTTGCCTGTTCTAGGTACATCATATAAGTATAATTTT 31308562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTCTATTTCCTGTCTCTTTGAATTTGCCTGTTCTAGGTACATCATATAAGTATAATTTT 660

 31308563 ACAATATTTATCCTGTGTCTGGCTTCTTGTACTATGCATGTTTTCAAGGACCATCCATGT 31308622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAATATTTATCCTGTGTCTGGCTTCTTGTACTATGCATGTTTTCAAGGACCATCCATGT 720

 31308623 TGTAGCATATATCAAAATTTCATTCATGTTTATGGCAGAATAATATACTATCATGCGCAT 31308682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTAGCATATATCAAAATTTCATTCATGTTTATGGCAGAATAATATACTATCATGCGCAT 780

 31308683 ATTCCCTTTATGTGTTGGTGGGCATTTGAATTGTTTCCACATTTTGCCCATTGTGAATAA 31308742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTCCCTTTATGTGTTGGTGGGCATTTGAATTGTTTCCACATTTTGCCCATTGTGAATAA 840

 31308743 TGCTATGAACATCAGTGCACAAATGTGTTTGAGTCCCTGCTTTTAATTCTTTTGGATATA 31308802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCTATGAACATCAGTGCACAAATGTGTTTGAGTCCCTGCTTTTAATTCTTTTGGATATA 900

 31308803 CACCTAGGAGTGAAATTGGTGGGTCATATGGTAGTTCTATTTGAACTGTTTAAGAAATTG 31308862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACCTAGGAGTGAAATTGGTGGGTCATATGGTAGTTCTATTTGAACTGTTTAAGAAATTG 960

 31308863 CCACATTGTTTTCTACATAAAATGTACCATTTTGGATTCTCCCCAGCACTTATGAGGCTT 31308922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCACATTGTTTTCTACATAAAATGTACCATTTTGGATTCTCCCCAGCACTTATGAGGCTT 1020

 31308923 CCAATTTCTCCACGTCCTTGCCAACACCTGCCATTTTCCCTTTTTAAAAATTATAGCCAT 31308982
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCAATTTCTCCGCGTCCTTGCCAACACCTGCCATTTTCCCTTTTTAAAAATTATAGCCAT 1080

 31308983 CCTAGTAGGTGTGATGTGCTATCCATGGTCATTTTGACTTGCATTTTTCTAATGATTAAT 31309042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTAGTAGGTGTGATGTGCTATCCATGGTCATTTTGACTTGCATTTTTCTAATGATTAAT 1140

 31309043 AATGTTAAGCATCTTTTCATGGGTATATTGGACGTTTGTATATCATACTTGGTGAAATGT 31309102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATGTTAAGCATCTTTTCATGGGTATATTGGACGTTTGTATATCATACTTGGTGAAATGT 1200

 31309103 CTATTCATGTCCTTCATCTACTTTTTAATCTAGTTGTTTGACTTTTTGTTGTTGAGTTGT 31309162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTATTCATGTCCTTCATCTACTTTTTAATCTAGTTGTTTGACTTTTTGTTGTTGAGTTGT 1260

 31309163 AGGAGTTTTTAAAATATAAATTTTGAGTATCCATCACTTATTAAGTATATAACTTATAAA 31309222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGGAGTTTTTAAAATATAAATTTTGAGTATCCATCACTTATTAAGTATATAACTTATAAA 1320

 31309223 TATTTTCTCCCATTCAGTAGGCTGTCTTTTTACATTACTTTCAGCAATGTTGTAGTTTTA 31309282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATTTTCTCCCATTCAGTAGGCTGTCTTTTTACATTACTTTCAGCAATGTTGTAGTTTTA 1380

 31309283 AGTATATGAGTCTTTTACTTCTTTCTTTAGATTTATCATAAGTATTTAATTTCTAATTAG 31309342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTATATGAGTCTTTTACTTCTTTCTTTAGATTTATCATAAGTATTTAATTTCTAATTAG 1440

 31309343 TTAAGATTTATTCCTAAGTACTCCTAAGTATTTAATTACTAAATACTAAGTATTTAGTAA 31309402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTAAGATTTATTCCTAAGTACTCCTAAGTATTTAATTACTAAATACTAAGTATTTAGTAA 1500

 31309403 TAAACATAAACCTTGTTTAGATTTGTTCTTAAGTATTTTAGTGACTATTATACACAGCTT 31309462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAAACATAAACCTTGTTTAGATTTGTTCTTAAGTATTTTAGTGACTATTATACACAGCTT 1560

 31309463 TTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTCTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTG 31309522
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTT-CTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTG 1619

 31309523 GAGTGCTGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGAGTTCAAGTGATTCT 31309582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GAGTGCTGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGAGTTCAAGTGATTCT 1679

 31309583 CCTGCCTCAGCCTCCTGAATAACTGGGATTACAGGCACCCGCCACCTCGCCTGGCTAATT 31309642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CCTGCCTCAGCCTCCTGAATAACTGGGATTACAGGCACCCGCCACCTCGCCTGGCTAATT 1739

 31309643 TATTTTTTATTTTTTTATTTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGT 31309702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TATTTTTTATTTTTTTATTTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGT 1799

 31309703 CTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACA 31309762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACA 1859

 31309763 GAGGTGAGCCACCGCGCCTGGCTGCATTGCTTTTCTTTATTTCCTTTTTGGATTGCTTAT 31309822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GAGGTGAGCCACCGCGCCTGGCTGCATTGCTTTTCTTTATTTCCTTTTTGGATTGCTTAT 1919

 31309823 TGCTGGTATATTGCAGCAAACTTAATATTTGTGTTGATCTTGTACCCTGAAACTTTGCTG 31309882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TGCTGGTATATTGCAGCAAACTTAATATTTGTGTTGATCTTGTACCCTGAAACTTTGCTG 1979

 31309883 AATTTGTTTACTAGCTCTAGTAGCTTCCTTACAAATTCTGTGGAATTCTCTTTTTAAAAA 31309942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 AATTTGTTTACTAGCTCTAGTAGCTTCCTTACAAATTCTGTGGAATTCTCTTTTTAAAAA 2039

 31309943 TTTTTTTTTCCTCTAGTTCATTGGTTTTTCTTTCTTCTTCTTATTTTTTATTATACTTTA 31310002
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TTTTTTTT-CCTCTAGTTCATTGGTTTTTCTTTCTTCTTCTTATTTTTTATTATACTTTA 2098

 31310003 AGTTCTAGGATACATGTGTAGAATGTGCGGGTTTGTTACATAGCTATACACGTGCCATGG 31310062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 AGTTCTAGGATACATGTGTAGAATGTGCGGGTTTGTTACATAGCTATACACGTGCCATGG 2158

 31310063 TGGTTTGCTGTACCCATCAACCCATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAATGTTATCCCT 31310122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TGGTTTGCTGTACCCATCAACCCATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAATGTTATCCCT 2218

 31310123 CCCCTAACCCCCAACGCCCCGGCAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCCCTCCCTATGTCCAT 31310182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CCCCTAACCCCCAACGCCCCGGCAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCCCTCCCTATGTCCAT 2278

 31310183 GTGTTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTTTCTGTT 31310242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GTGTTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTTTCTGTT 2338

 31310243 CCTGTGTTAGTTTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTAAAGAAC 31310302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CCTGTGTTAGTTTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTAAAGAAC 2398

 31310303 ATGAACTCATCCTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAATAGAGA 31310362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ATGAACTCATCCTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAATAGAGA 2458

 31310363 TATCATTACCACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCTAATAGC 31310422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TATCATTACCACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCTAATAGC 2518

 31310423 TCTGGTTGGAACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTCTTGTCT 31310482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TCTGGTTGGAACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTCTTGTCT 2578

 31310483 TGTTCCTGACCCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCATTCAAT 31310542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TGTTCCTGACCCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCATTCAAT 2638

 31310543 TTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCATATTGG 31310602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCATATTGG 2698

 31310603 GAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGAA 31310662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGAA 2758

 31310663 TGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACTCTGACA 31310722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACTCTGACA 2818

 31310723 GTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTACACTTT 31310782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTACACTTT 2878

 31310783 AGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCAGGATGC 31310842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 AGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCAGGATGC 2938

 31310843 GACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGGAGGACC 31310902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGGAGGACC 2998

 31310903 AGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCATT 31310962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 AGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCATT 3058

 31310963 AAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGAAAACAT 31311022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGAAAACAT 3118

 31311023 TGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGTA 31311082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGTA 3178

 31311083 CCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACGTGCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCAA 31311142
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3179 CCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACATGCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCAA 3238

 31311143 GCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAA 31311202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 GCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAA 3298

 31311203 ACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGG 31311262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 ACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGG 3358

 31311263 TAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGT 31311322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGT 3418

 31311323 GGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGAT 31311382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 GGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGAT 3478

 31311383 TTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGT 31311442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGT 3538

 31311443 GTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGT 31311502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 GTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGT 3598

 31311503 CAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCC 31311562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 CAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCC 3658

 31311563 TTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTC 31311622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTC 3718

 31311623 TGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGATTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAG 31311682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3719 TGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGGTTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAG 3778

 31311683 GTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGCT 31311742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 GTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGCT 3838

 31311743 CTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAATG 31311802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 CTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAATG 3898

 31311803 TTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTT 31311862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTT 3958

 31311863 TGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTA 31311922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTA 4018

 31311923 CTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAAACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAA 31311982
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 CTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAGACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAA 4078

 31311983 CAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCATA 31312042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 CAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCATA 4138

 31312043 TAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTT 31312102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 TAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTT 4198

 31312103 CCAGCAGATCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTA 31312162
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 CCAGCAGCTCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTA 4258

 31312163 AAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTC 31312222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 AAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTC 4318

 31312223 CAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAG 31312282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 CAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAG 4378

 31312283 GCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGACC 31312342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 GCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGACC 4438

 31312343 AAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGTA 31312402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 AAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGTA 4498

 31312403 GATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCAT 31312462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 GATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCAT 4558

 31312463 TCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTCT 31312522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 TCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTCT 4618

 31312523 TTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACATC 31312582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 TTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACATC 4678

 31312583 AAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGT 31312642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 AAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGT 4738

 31312643 GCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAG 31312702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 GCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAG 4798

 31312703 ACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGTG 31312762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 ACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGTG 4858

 31312763 CCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCCACTCCTTATCCTTCTTGTCT 31312822
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||
     4859 CCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCGACTCCTTATCCTTCTTCTCT 4918

 31312823 GCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTCT 31312882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 GCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTCT 4978

 31312883 ATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGT 31312942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 ATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGT 5038

 31312943 CTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACT 31313002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 CTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACT 5098

 31313003 CAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTT 31313062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 CAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTT 5158

 31313063 TTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAG 31313122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 TTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAG 5218

 31313123 ACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAA 31313182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 ACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAA 5278

 31313183 GCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTAC 31313242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 GCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTAC 5338

 31313243 AGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCA 31313302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 AGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCA 5398

 31313303 TGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCA 31313362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 TGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCA 5458

 31313363 AAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTT 31313422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 AAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTT 5518

 31313423 TAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTC 31313482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 TAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTC 5578

 31313483 TTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTT 31313542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 TTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTT 5638

 31313543 TACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACA 31313602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 TACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACA 5698

 31313603 TAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACA 31313662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 TAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACA 5758

 31313663 AGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACA 31313722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 AGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACA 5818

 31313723 CACACACACACACACACACAAATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTC 31313782
          ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 CACACACACACACACACA--AATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTC 5876

 31313783 TCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTT-AATGCTTAGCTG 31313841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     5877 TCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTAATGCTTAGCTG 5936

 31313842 TTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAA 31313901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 TTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAA 5996

 31313902 GAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTA 31313961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 GAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTA 6056

 31313962 AAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCA 31314021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 AAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCA 6116

 31314022 ACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGG 31314081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 ACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGG 6176

 31314082 TTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCC 31314141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 TTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCC 6236

 31314142 ACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAG 31314201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 ACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAG 6296

 31314202 TTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTA 31314261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 TTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTA 6356

 31314262 GGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTA 31314321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 GGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTA 6416

 31314322 ATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAA 31314381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 ATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAA 6476

 31314382 AGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTAT 31314441
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     6477 AGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTAC 6536

 31314442 GTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACC 31314501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 GTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACC 6596

 31314502 TTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGG 31314561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 TTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGG 6656

 31314562 AGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTA 31314621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 AGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTA 6716

 31314622 TTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGA 31314681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 TTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGA 6776

 31314682 TACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTC 31314741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 TACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTC 6836

 31314742 AAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTC 31314801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 AAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTC 6896

 31314802 CTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGAT 31314861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 CTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGAT 6956

 31314862 CGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGG 31314921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 CGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGG 7016

 31314922 CTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACC 31314981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 CTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACC 7076

 31314982 CAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTG 31315041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 CAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTG 7136

 31315042 GAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGT 31315101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 GAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGT 7196

 31315102 CAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTG 31315161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 CAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTG 7256

 31315162 AGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAA 31315221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 AGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAA 7316

 31315222 GACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTT 31315281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7317 GACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTT 7376

 31315282 AGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTT 31315341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 AGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTT 7436

 31315342 ATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGC 31315401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7437 ATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGC 7496

 31315402 AAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGC 31315461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7497 AAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGC 7556

 31315462 AGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCC 31315521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7557 AGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCC 7616

 31315522 GGGTAC 31315527
          ||||||
     7617 GGGTAC 7622

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     7623 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 7682

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATG 31319044
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     7683 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATG 7713

Alignment time is 10.5574 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    9099] =>      9099 nucs 'mol-32-287f-085503_9099'

Score:        8934
Aligned:      9103        nucs
Identic:      9086 (100%) nucs =>      9034 (100%)        52 ( 98%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31306480,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319006]
 second seq =>  [       1,    9046] EXCISED REGION [    9047,    9099]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31306480 ACCCAATATTCCAGAATAAAGAAAACTCACGTAGGTGTATATGATCTCTTCTGTAATTTT 31306539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCCAATATTCCAGAATAAAGAAAACTCACGTAGGTGTATATGATCTCTTCTGTAATTTT 60

 31306540 CCAAAAATTTCCCTTTAGTTCTTCAATGTAGATATTTTCTACTGACCCACCTTCCAAAAC 31306599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAAAAATTTCCCTTTAGTTCTTCAATGTAGATATTTTCTACTGACCCACCTTCCAAAAC 120

 31306600 ATGAATCTTCTGTACAGTTGTGTCAAATTTAATATTTAATCCACCTATTGAGTTCCTAGA 31306659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGAATCTTCTGTACAGTTGTGTCAAATTTAATATTTAATCCACCTATTGAGTTCCTAGA 180

 31306660 TTAAATGTTTATTTTTACATTCTAGATTTTCAACTTGATTGTTCTAATTGTTTAGCTTTA 31306719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAAATGTTTATTTTTACATTCTAGATTTTCAACTTGATTGTTCTAATTGTTTAGCTTTA 240

 31306720 TTTTACCATCATGTCTTCTATTTTATTAAACATGTTTTTAATAGTCATTTTAAAGCCCGT 31306779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTACCATCATGTCTTCTATTTTATTAAACATGTTTTTAATAGTCATTTTAAAGCCCGT 300

 31306780 TTATGAAAACTCAGTTGTCTGGATCACTTTTAGATTTATTCCTATTGTTTATTTTCTGTT 31306839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATGAAAACTCAGTTGTCTGGATCACTTTTAGATTTATTCCTATTGTTTATTTTCTGTT 360

 31306840 CTATTCTTTCTCTTTTGGAAGAAAAGAATAATTGTATGGCAGACATTGTGTATGAAATAT 31306899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTATTCTTTCTCTTTTGGAAGAAAAGAATAATTGTATGGCAGACATTGTGTATGAAATAT 420

 31306900 TGACATCTTTCTCTATGAGTTTAGCTTGTGACAGTCAGAATAGGGAAAATTACCCTATTC 31306959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGACATCTTTCTCTATGAGTTTAGCTTGTGACAGTCAGAATAGGGAAAATTACCCTATTC 480

 31306960 CAATCAGGGATTAAACAGTTTTAAGGTTGTGTTTCAGACTTTGTAATGCTTGGTCTATTT 31307019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAATCAGGGATTAAACAGTTTTAAGGTTGTGTTTCAGACTTTGTAATGCTTGGTCTATTT 540

 31307020 GTGTTTTCTCTAATTCCTAGGTTGTGATTCTAAGGGATCCCAAATGAAAACTTGGGGTGT 31307079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTGTTTTCTCTAATTCCTAGGTTGTGATTCTAAGGGATCCCAAATGAAAACTTGGGGTGT 600

 31307080 TTATCGCTGTCCGTCTTTCTTGAGAGGCCCTTAACTTCATTGAAAAATATCTTCCTAGCA 31307139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATCGCTGTCCGTCTTTCTTGAGAGGCCCTTAACTTCATTGAAAAATATCTTCCTAGCA 660

 31307140 TTGTGAGACTGCCAAAAGCTTTGAACTTCTTGGCTCCCACTCTCTTCTAAGCTTCTCTTG 31307199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGTGAGACTGCCAAAAGCTTTGAACTTCTTGGCTCCCACTCTCTTCTAAGCTTCTCTTG 720

 31307200 TTCTAAGCTTCTCTTGAAGGACAAGCTTCTCTTGTTTCTTCTATGCTGTCGAAATCAGGA 31307259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTAAGCTTCTCTTGAAGGACAAGCTTCTCTTGTTTCTTCTATGCTGTCGAAATCAGGA 780

 31307260 ATCAGCAAATGCTTCAAGGGGAAAAGCTGCATATTTTCAGTCTCACATCTGCTTCCTTTC 31307319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCAGCAAATGCTTCAAGGGGAAAAGCTGCATATTTTCAGTCTCACATCTGCTTCCTTTC 840

 31307320 TCTTAGCTCCTCAACTCCTGGATATCTTAGTGGCCCTGAACTCCACCTTTTTTTCTCACT 31307379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTTAGCTCCTCAACTCCTGGATATCTTAGTGGCCCTGAACTCCACCTTTTTTTCTCACT 900

 31307380 AGATCTTGAGATTGCTAAAAGCTGTCCTCTGTTTCTTAGCAGCCTGTTTTTCTCCTTTTC 31307439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGATCTTGAGATTGCTAAAAGCTGTCCTCTGTTTCTTAGCAGCCTGTTTTTCTCCTTTTC 960

 31307440 TCAGCTTCTTTGCCTGTACAATTTTGAGTCATCTCAGTTTCCTGTCTCCTAAGGATCTTG 31307499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCAGCTTCTTTGCCTGTACAATTTTGAGTCATCTCAGTTTCCTGTCTCCTAAGGATCTTG 1020

 31307500 GCCCTTCAAGTTCTGGCTACCTTGGTAATCCTCTGTTGCCTTCAAATTTCTTTTTAATCT 31307559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCCCTTCAAGTTCTGGCTACCTTGGTAATCCTCTGTTGCCTTCAAATTTCTTTTTAATCT 1080

 31307560 AATTATTCTAGTTGTTATTAGTGGGAGGTTTGGTCTGCTATAAATTAATCCCTGTCACAA 31307619
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTATTCTAGTTGTTATTAGTGGGGGGTTTGGTCTGCTATAAATTAATCCCTGTCACAA 1140

 31307620 ATGGAATGCCTTTTTCCTTTTCTTTTTTTTTTCAGCTACATAGTATACCATTGTATAGCT 31307679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGGAATGCCTTTTTCCTTTTCTTTTTTTTTTCAGCTACATAGTATACCATTGTATAGCT 1200

 31307680 ATTCTAAAATTTCTTTATGCAGGACCTAGTTATGGATACTTAGGTTGTTTCCAATGTTTA 31307739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTCTAAAATTTCTTTATGCAGGACCTAGTTATGGATACTTAGGTTGTTTCCAATGTTTA 1260

 31307740 CTATTGCAAAGCATAAAGCAGTAACTTATATGTACATTATAAATTGTATAATTAATGGTA 31307799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTATTGCAAAGCATAAAGCAGTAACTTATATGTACATTATAAATTGTATAATTAATGGTA 1320

 31307800 ACTTCGTATGTACATAATTCTATGTGCATTATCTATACAGTTGCACACATATACAAATAT 31307859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTTCGTATGTACATAATTCTATGTGCATTATCTATACAGTTGCACACATATACAAATAT 1380

 31307860 ATATAAAACAAAGTCTTAGAATAAAATTGCTTAATCAAAGGGAATGTTCATTTGTATTTT 31307919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATATAAAACAAAGTCTTAGAATAAAATTGCTTAATCAAAGGGAATGTTCATTTGTATTTT 1440

 31307920 GATATACATTGCCTATTTTCCTTTGTAGAACTTATACCAATTTATATTCCAAAGATTATA 31307979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATATACATTGCCTATTTTCCTTTGTAGAACTTATACCAATTTATATTCCAAAGATTATA 1500

 31307980 TGAACATGCCTATTTTCCCACAGCTTAACAACATACTGTGTTATTTTAATTTTGACATTT 31308039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGAACATGCCTATTTTCCCACAGCTTAACAACATACTGTGTTATTTTAATTTTGACATTT 1560

 31308040 GTCAATGGTAGCTTAAGAAATGGTATCTCATTATAATTTTAATTTGCATTATTTCTATTG 31308099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTCAATGGTAGCTTAAGAAATGGTATCTCATTATAATTTTAATTTGCATTATTTCTATTG 1620

 31308100 TGGGGGAGGTTGAACATTTTTCATGCAGTTAAAGCCTCAAGTTAACACACTGTTCTATAG 31308159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGGGGAGGTTGAACATTTTTCATGCAGTTAAAGCCTCAAGTTAACACACTGTTCTATAG 1680

 31308160 ATTTGTTGTAGATGACCAACATTTCACAGACTATATATCACGACATTCACATAAAATTTT 31308219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTTGTTGTAGATGACCAACATTTCACAGACTATATATCACGACATTCACATAAAATTTT 1740

 31308220 CTGCAAAAATTATGTTGTATCATATATTTGCCCCTTTTGGCAATTCATAAAAAAGCCTCT 31308279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGCAAAAATTATGTTGTATCATATATTTGCCCCTTTTGGCAATTCATAAAAAAGCCTCT 1800

 31308280 GAGAAAAGAAATTCCTTGAAATGTTTTATTGTGGAAAAAATATATATATAACATAATTAT 31308339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1801 GAGAAAAGAAATTCCTTGAAATGTTTTATTGTGGAAAAAAAATATATATAACATAATTAT 1860

 31308340 CATCTTAACCAGTTGTAAGTATGTGATTTAGTAGCACTAAATACACTCACAACATTGTGT 31308399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATCTTAACCAGTTGTAAGTATGTGATTTAGTAGCACTAAATACACTCACAACATTGTGT 1920

 31308400 GGCTATCACCAGTATCCATACCCAAAATGTTTTCATCATCTGTAACGAAAACTCTATGTC 31308459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGCTATCACCAGTATCCATACCCAAAATGTTTTCATCATCTGTAACGAAAACTCTATGTC 1980

 31308460 CACTACTCCCTTTCCTTCCACCTCCCAGCCCCTGGTAACCTCTACTCTATTTCCTGTCTC 31308519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CACTACTCCCTTTCCTTCCACCTCCCAGCCCCTGGTAACCTCTACTCTATTTCCTGTCTC 2040

 31308520 TTTGAATTTGCCTGTTCTAGGTACATCATATAAGTATAATTTTACAATATTTATCCTGTG 31308579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTGAATTTGCCTGTTCTAGGTACATCATATAAGTATAATTTTACAATATTTATCCTGTG 2100

 31308580 TCTGGCTTCTTGTACTATGCATGTTTTCAAGGACCATCCATGTTGTAGCATATATCAAAA 31308639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTGGCTTCTTGTACTATGCATGTTTTCAAGGACCATCCATGTTGTAGCATATATCAAAA 2160

 31308640 TTTCATTCATGTTTATGGCAGAATAATATACTATCATGCGCATATTCCCTTTATGTGTTG 31308699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTCATTCATGTTTATGGCAGAATAATATACTATCATGCGCATATTCCCTTTATGTGTTG 2220

 31308700 GTGGGCATTTGAATTGTTTCCACATTTTGCCCATTGTGAATAATGCTATGAACATCAGTG 31308759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTGGGCATTTGAATTGTTTCCACATTTTGCCCATTGTGAATAATGCTATGAACATCAGTG 2280

 31308760 CACAAATGTGTTTGAGTCCCTGCTTTTAATTCTTTTGGATATACACCTAGGAGTGAAATT 31308819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CACAAATGTGTTTGAGTCCCTGCTTTTAATTCTTTTGGATATACACCTAGGAGTGAAATT 2340

 31308820 GGTGGGTCATATGGTAGTTCTATTTGAACTGTTTAAGAAATTGCCACATTGTTTTCTACA 31308879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGTGGGTCATATGGTAGTTCTATTTGAACTGTTTAAGAAATTGCCACATTGTTTTCTACA 2400

 31308880 TAAAATGTACCATTTTGGATTCTCCCCAGCACTTATGAGGCTTCCAATTTCTCCACGTCC 31308939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAAAATGTACCATTTTGGATTCTCCCCAGCACTTATGAGGCTTCCAATTTCTCCACGTCC 2460

 31308940 TTGCCAACACCTGCCATTTTCCCTTTTTAAAAATTATAGCCATCCTAGTAGGTGTGATGT 31308999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTGCCAACACCTGCCATTTTCCCTTTTTAAAAATTATAGCCATCCTAGTAGGTGTGATGT 2520

 31309000 GCTATCCATGGTCATTTTGACTTGCATTTTTCTAATGATTAATAATGTTAAGCATCTTTT 31309059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCTATCCATGGTCATTTTGACTTGCATTTTTCTAATGATTAATAATGTTAAGCATCTTTT 2580

 31309060 CATGGGTATATTGGACGTTTGTATATCATACTTGGTGAAATGTCTATTCATGTCCTTCAT 31309119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CATGGGTATATTGGACGTTTGTATATCATACTTGGTGAAATGTCTATTCATGTCCTTCAT 2640

 31309120 CTACTTTTTAATCTAGTTGTTTGACTTTTTGTTGTTGAGTTGTAGGAGTTTTTAAAATAT 31309179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTACTTTTTAATCTAGTTGTTTGACTTTTTGTTGTTGAGTTGTAGGAGTTTTTAAAATAT 2700

 31309180 AAATTTTGAGTATCCATCACTTATTAAGTATATAACTTATAAATATTTTCTCCCATTCAG 31309239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAATTTTGAGTATCCATCACTTATTAAGTATATAACTTATAAATATTTTCTCCCATTCAG 2760

 31309240 TAGGCTGTCTTTTTACATTACTTTCAGCAATGTTGTAGTTTTAAGTATATGAGTCTTTTA 31309299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TAGGCTGTCTTTTTACATTACTTTCAGCAATGTTGTAGTTTTAAGTATATGAGTCTTTTA 2820

 31309300 CTTCTTTCTTTAGATTTATCATAAGTATTTAATTTCTAATTAGTTAAGATTTATTCCTAA 31309359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTTCTTTCTTTAGATTTATCATAAGTATTTAATTTCTAATTAGTTAAGATTTATTCCTAA 2880

 31309360 GTACTCCTAAGTATTTAATTACTAAATACTAAGTATTTAGTAATAAACATAAACCTTGTT 31309419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTACTCCTAAGTATTTAATTACTAAATACTAAGTATTTAGTAATAAACATAAACCTTGTT 2940

 31309420 TAGATTTGTTCTTAAGTATTTTAGTGACTATTATACACAGCTTTTCTTTTCTTTTCTTTT 31309479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAGATTTGTTCTTAAGTATTTTAGTGACTATTATACACAGCTTTTCTTTTCTTTTCTTTT 3000

 31309480 TTTTTTTCTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCATGAT 31309539
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTTTTT-CTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCATGAT 3059

 31309540 CTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTG 31309599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTG 3119

 31309600 AATAACTGGGATTACAGGCACCCGCCACCTCGCCTGGCTAATTTATTTTTTATTTTTTTA 31309659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 AATAACTGGGATTACAGGCACCCGCCACCTCGCCTGGCTAATTTATTTTTTATTTTTTTA 3179

 31309660 TTTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTC 31309719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TTTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTC 3239

 31309720 AGGTGATCTGCCTATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGAGGTGAGCCACCGCGC 31309779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 AGGTGATCTGCCTATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGAGGTGAGCCACCGCGC 3299

 31309780 CTGGCTGCATTGCTTTTCTTTATTTCCTTTTTGGATTGCTTATTGCTGGTATATTGCAGC 31309839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 CTGGCTGCATTGCTTTTCTTTATTTCCTTTTTGGATTGCTTATTGCTGGTATATTGCAGC 3359

 31309840 AAACTTAATATTTGTGTTGATCTTGTACCCTGAAACTTTGCTGAATTTGTTTACTAGCTC 31309899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 AAACTTAATATTTGTGTTGATCTTGTACCCTGAAACTTTGCTGAATTTGTTTACTAGCTC 3419

 31309900 TAGTAGCTTCCTTACAAATTCTGTGGAATTCTCTTTTTAAAAATTTTTTTTTCCTCTAGT 31309959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     3420 TAGTAGCTTCCTTACAAATTCTGTGGAATTCTCTTTTTAAAAATTTTTTTT-CCTCTAGT 3478

 31309960 TCATTGGTTTTTCTTTCTTCTTCTTATTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGATACATGT 31310019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TCATTGGTTTTTCTTTCTTCTTCTTATTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGATACATGT 3538

 31310020 GTAGAATGTGCGGGTTTGTTACATAGCTATACACGTGCCATGGTGGTTTGCTGTACCCAT 31310079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 GTAGAATGTGCGGGTTTGTTACATAGCTATACACGTGCCATGGTGGTTTGCTGTACCCAT 3598

 31310080 CAACCCATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAATGTTATCCCTCCCCTAACCCCCAACGC 31310139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 CAACCCATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAATGTTATCCCTCCCCTAACCCCCAACGC 3658

 31310140 CCCGGCAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCCCTCCCTATGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAA 31310199
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3659 CCCGGCAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCCCTCCCTATGTCCATGTGTTCTCGTTGTTCAA 3718

 31310200 CTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTG 31310259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 CTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTG 3778

 31310260 AGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTAAAGAACATGAACTCATCCTTTTT 31310319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 AGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTAAAGAACATGAACTCATCCTTTTT 3838

 31310320 TGGAATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAATAGAGATATCATTACCACTTCCT 31310379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TGGAATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAATAGAGATATCATTACCACTTCCT 3898

 31310380 TTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCA 31310439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCA 3958

 31310440 GTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAG 31310499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAG 4018

 31310500 AGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCA 31310559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 AGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCA 4078

 31310560 TCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCATATTGGGAAACACTTTTACTGAT 31310619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 TCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCATATTGGGAAACACTTTTACTGAT 4138

 31310620 AAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTT 31310679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 AAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTT 4198

 31310680 AGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTT 31310739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTT 4258

 31310740 TTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAAC 31310799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAAC 4318

 31310800 AAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCAGGATGCGACTACCTATTAAAATG 31310859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 AAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCAGGATGCGACTACCTATTAAAATG 4378

 31310860 CTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCT 31310919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 CTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCT 4438

 31310920 ACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATTTAATAC 31310979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 ACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATTTAATAC 4498

 31310980 TTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCT 31311039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 TTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCT 4558

 31311040 TGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCA 31311099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 TGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCA 4618

 31311100 AGCACCTCATCCCTACGTGCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTA 31311159
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 AGCACCTCATCCCTACATGCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTA 4678

 31311160 TTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAA 31311219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 TTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAA 4738

 31311220 ACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGC 31311279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 ACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGC 4798

 31311280 GAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTC 31311339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 GAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTC 4858

 31311340 CAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAG 31311399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 CAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAG 4918

 31311400 TCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCA 31311459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 TCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCA 4978

 31311460 TATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAG 31311519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 TATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAG 5038

 31311520 AATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAAT 31311579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 AATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAAT 5098

 31311580 ATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTC 31311639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 ATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTC 5158

 31311640 TATAAATACTTAGAGGGATTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGG 31311699
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 TATAAATACTTAGAGGGGTTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGG 5218

 31311700 CCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCT 31311759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 CCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCT 5278

 31311760 TCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAATGTTCATTGATGTATTTAT 31311819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 TCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAATGTTCATTGATGTATTTAT 5338

 31311820 TTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTG 31311879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 TTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTG 5398

 31311880 TATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCT 31311939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 TATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCT 5458

 31311940 GGATAAACAAACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTA 31311999
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 GGATAAACAGACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTA 5518

 31312000 TTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCATATAATGTCACTGGGACTC 31312059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 TTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCATATAATGTCACTGGGACTC 5578

 31312060 TCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGATCTTTCCCC 31312119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     5579 TCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGCTCTTTCCCC 5638

 31312120 CAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAG 31312179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 CAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAG 5698

 31312180 GACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGG 31312239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 GACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGG 5758

 31312240 CAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCA 31312299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 CAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCA 5818

 31312300 GGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCA 31312359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 GGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCA 5878

 31312360 ATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGG 31312419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 ATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGG 5938

 31312420 AGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAA 31312479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 AGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAA 5998

 31312480 AGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAA 31312539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 AGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAA 6058

 31312540 CTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGT 31312599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 CTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGT 6118

 31312600 TAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCA 31312659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 TAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCA 6178

 31312660 ACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTA 31312719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 ACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTA 6238

 31312720 TGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAG 31312779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 TGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAG 6298

 31312780 TGTTGGGGACAAATTTCACCCCCACTCCTTATCCTTCTTGTCTGCTTTGCTTTCTTCCAC 31312839
          ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     6299 TGTTGGGGACAAATTTCACCCCGACTCCTTATCCTTCTTCTCTGCTTTGCTTTCTTCCAC 6358

 31312840 TGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCC 31312899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 TGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCC 6418

 31312900 CCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCT 31312959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 CCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCT 6478

 31312960 ATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGA 31313019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 ATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGA 6538

 31313020 ATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTC 31313079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 ATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTC 6598

 31313080 TGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGT 31313139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 TGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGT 6658

 31313140 TGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTT 31313199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 TGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTT 6718

 31313200 CAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCG 31313259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 CAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCG 6778

 31313260 CCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTT 31313319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 CCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTT 6838

 31313320 TTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAG 31313379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 TTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAG 6898

 31313380 GCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGA 31313439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6899 GCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGA 6958

 31313440 ATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTT 31313499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6959 ATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTT 7018

 31313500 ACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTC 31313559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7019 ACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTC 7078

 31313560 AAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCA 31313619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7079 AAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCA 7138

 31313620 CACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCA 31313679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7139 CACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCA 7198

 31313680 AATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACACACACACACACACACAC 31313739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7199 AATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACACACACACACACACACAC 7258

 31313740 ACAAATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTG 31313799
          |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7259 A--AATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTG 7316

 31313800 ACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTT--AATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGAT 31313857
          ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||
     7317 ACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTAATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGAT 7376

 31313858 TTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATT 31313917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 TTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATT 7436

 31313918 TTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGG 31313977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7437 TTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGG 7496

 31313978 CTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTA 31314037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7497 CTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTA 7556

 31314038 GTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCA 31314097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7557 GTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCA 7616

 31314098 CCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCT 31314157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7617 CCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCT 7676

 31314158 CCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCT 31314217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7677 CCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCT 7736

 31314218 CTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTAC 31314277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7737 CTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTAC 7796

 31314278 ATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTT 31314337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7797 ATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTT 7856

 31314338 TTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGA 31314397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7857 TTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGA 7916

 31314398 AACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTATGTGCTGGTCCCTGAAA 31314457
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     7917 AACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTACGTGCTGGTCCCTGAAA 7976

 31314458 TATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAG 31314517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7977 TATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAG 8036

 31314518 AGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCC 31314577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8037 AGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCC 8096

 31314578 AGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCA 31314637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8097 AGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCA 8156

 31314638 CAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTA 31314697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8157 CAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTA 8216

 31314698 CCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTT 31314757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8217 CCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTT 8276

 31314758 ATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGC 31314817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8277 ATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGC 8336

 31314818 CACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGA 31314877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8337 CACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGA 8396

 31314878 AGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACT 31314937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8397 AGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACT 8456

 31314938 TCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCC 31314997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8457 TCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCC 8516

 31314998 TAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGC 31315057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8517 TAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGC 8576

 31315058 GGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTT 31315117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8577 GGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTT 8636

 31315118 TGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATTT 31315177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8637 TGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATTT 8696

 31315178 AAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAA 31315237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8697 AAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAA 8756

 31315238 GAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCT 31315297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8757 GAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCT 8816

 31315298 TTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCA 31315357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8817 TTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCA 8876

 31315358 GAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAA 31315417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8877 GAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAA 8936

 31315418 AACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCAT 31315477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8937 AACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCAT 8996

 31315478 AACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 31315527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8997 AACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 9046

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCA 31319006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     9047 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCA 9099

Alignment time is 12.4688 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7253] =>      7253 nucs 'mol-32-2af2-069568_7253'

Score:        7077
Aligned:      7257        nucs
Identic:      7239 (100%) nucs =>      6415 (100%)       824 ( 99%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31309102,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319782]
 second seq =>  [       1,    6424] EXCISED REGION [    6425,    7253]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31309102 TCTATTCATGTCCTTCATCTACTTTTTAATCTAGTTGTTTGACTTTTTGTTGTTGAGTTG 31309161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTATTCATGTCCTTCATCTACTTTTTAATCTAGTTGTTTGACTTTTTGTTGTTGAGTTG 60

 31309162 TAGGAGTTTTTAAAATATAAATTTTGAGTATCCATCACTTATTAAGTATATAACTTATAA 31309221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGGAGTTTTTAAAATATAAATTTTGAGTATCCATCACTTATTAAGTATATAACTTATAA 120

 31309222 ATATTTTCTCCCATTCAGTAGGCTGTCTTTTTACATTACTTTCAGCAATGTTGTAGTTTT 31309281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATTTTCTCCCATTCAGTAGGCTGTCTTTTTACATTACTTTCAGCAATGTTGTAGTTTT 180

 31309282 AAGTATATGAGTCTTTTACTTCTTTCTTTAGATTTATCATAAGTATTTAATTTCTAATTA 31309341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGTATATGAGTCTTTTACTTCTTTCTTTAGATTTATCATAAGTATTTAATTTCTAATTA 240

 31309342 GTTAAGATTTATTCCTAAGTACTCCTAAGTATTTAATTACTAAATACTAAGTATTTAGTA 31309401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTAAGATTTATTCCTAAGTACTCCTAAGTATTTAATTACTAAATACTAAGTATTTAGTA 300

 31309402 ATAAACATAAACCTTGTTTAGATTTGTTCTTAAGTATTTTAGTGACTATTATACACAGCT 31309461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAAACATAAACCTTGTTTAGATTTGTTCTTAAGTATTTTAGTGACTATTATACACAGCT 360

 31309462 TTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTCTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCT 31309521
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTT-CTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCT 419

 31309522 GGAGTGCTGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGAGTTCAAGTGATTC 31309581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 GGAGTGCTGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGAGTTCAAGTGATTC 479

 31309582 TCCTGCCTCAGCCTCCTGAATAACTGGGATTACAGGCACCCGCCACCTCGCCTGGCTAAT 31309641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TCCTGCCTCAGCCTCCTGAATAACTGGGATTACAGGCACCCGCCACCTCGCCTGGCTAAT 539

 31309642 TTATTTTTTATTTTTTTATTTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAG 31309701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TTATTTTTTATTTTTTTATTTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAG 599

 31309702 TCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTAC 31309761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 TCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTAC 659

 31309762 AGAGGTGAGCCACCGCGCCTGGCTGCATTGCTTTTCTTTATTTCCTTTTTGGATTGCTTA 31309821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 AGAGGTGAGCCACCGCGCCTGGCTGCATTGCTTTTCTTTATTTCCTTTTTGGATTGCTTA 719

 31309822 TTGCTGGTATATTGCAGCAAACTTAATATTTGTGTTGATCTTGTACCCTGAAACTTTGCT 31309881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TTGCTGGTATATTGCAGCAAACTTAATATTTGTGTTGATCTTGTACCCTGAAACTTTGCT 779

 31309882 GAATTTGTTTACTAGCTCTAGTAGCTTCCTTACAAATTCTGTGGAATTCTCTTTTTAAAA 31309941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GAATTTGTTTACTAGCTCTAGTAGCTTCCTTACAAATTCTGTGGAATTCTCTTTTTAAAA 839

 31309942 ATTTTTTTTTCCTCTAGTTCATTGGTTTTTCTTTCTTCTTCTTATTTTTTATTATACTTT 31310001
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 ATTTTTTTT-CCTCTAGTTCATTGGTTTTTCTTTCTTCTTCTTATTTTTTATTATACTTT 898

 31310002 AAGTTCTAGGATACATGTGTAGAATGTGCGGGTTTGTTACATAGCTATACACGTGCCATG 31310061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 AAGTTCTAGGATACATGTGTAGAATGTGCGGGTTTGTTACATAGCTATACACGTGCCATG 958

 31310062 GTGGTTTGCTGTACCCATCAACCCATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAATGTTATCCC 31310121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 GTGGTTTGCTGTACCCATCAACCCATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAATGTTATCCC 1018

 31310122 TCCCCTAACCCCCAACGCCCCGGCAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCCCTCCCTATGTCCA 31310181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 TCCCCTAACCCCCAACGCCCCGGCAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCCCTCCCTATGTCCA 1078

 31310182 TGTGTTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTTTCTGT 31310241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 TGTGTTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTTTCTGT 1138

 31310242 TCCTGTGTTAGTTTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTAAAGAA 31310301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TCCTGTGTTAGTTTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTAAAGAA 1198

 31310302 CATGAACTCATCCTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAATAGAG 31310361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CATGAACTCATCCTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAATAGAG 1258

 31310362 ATATCATTACCACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCTAATAG 31310421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 ATATCATTACCACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCTAATAG 1318

 31310422 CTCTGGTTGGAACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTCTTGTC 31310481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 CTCTGGTTGGAACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTCTTGTC 1378

 31310482 TTGTTCCTGACCCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCATTCAA 31310541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 TTGTTCCTGACCCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCATTCAA 1438

 31310542 TTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCATATTG 31310601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCATATTG 1498

 31310602 GGAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGA 31310661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GGAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGA 1558

 31310662 ATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACTCTGAC 31310721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 ATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACTCTGAC 1618

 31310722 AGTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTACACTT 31310781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 AGTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTACACTT 1678

 31310782 TAGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCAGGATG 31310841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TAGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCAGGATG 1738

 31310842 CGACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGGAGGAC 31310901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 CGACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGGAGGAC 1798

 31310902 CAGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCAT 31310961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CAGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCAT 1858

 31310962 TAAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGAAAACA 31311021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TAAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGAAAACA 1918

 31311022 TTGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGT 31311081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TTGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGT 1978

 31311082 ACCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACGTGCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCA 31311141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1979 ACCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACATGCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCA 2038

 31311142 AGCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAA 31311201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AGCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAA 2098

 31311202 AACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCG 31311261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 AACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCG 2158

 31311262 GTAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAG 31311321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GTAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAG 2218

 31311322 TGGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGA 31311381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TGGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGA 2278

 31311382 TTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAG 31311441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAG 2338

 31311442 TGTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGG 31311501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TGTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGG 2398

 31311502 TCAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTC 31311561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TCAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTC 2458

 31311562 CTTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCT 31311621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CTTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCT 2518

 31311622 CTGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGATTTTTTTTATCCCTCACTTATTTA 31311681
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2519 CTGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGGTTTTTTTTATCCCTCACTTATTTA 2578

 31311682 GGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGC 31311741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 GGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGC 2638

 31311742 TCTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAAT 31311801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TCTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAAT 2698

 31311802 GTTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCT 31311861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GTTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCT 2758

 31311862 TTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGT 31311921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGT 2818

 31311922 ACTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAAACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTA 31311981
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 ACTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAGACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTA 2878

 31311982 ACAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCAT 31312041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 ACAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCAT 2938

 31312042 ATAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTT 31312101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ATAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTT 2998

 31312102 TCCAGCAGATCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTT 31312161
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TCCAGCAGCTCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTT 3058

 31312162 AAAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCT 31312221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 AAAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCT 3118

 31312222 CCAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATA 31312281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 CCAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATA 3178

 31312282 GGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGAC 31312341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGAC 3238

 31312342 CAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGT 31312401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 CAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGT 3298

 31312402 AGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCA 31312461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 AGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCA 3358

 31312462 TTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTC 31312521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTC 3418

 31312522 TTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACAT 31312581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACAT 3478

 31312582 CAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGG 31312641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 CAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGG 3538

 31312642 TGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGA 31312701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 TGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGA 3598

 31312702 GACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGT 31312761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 GACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGT 3658

 31312762 GCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCCACTCCTTATCCTTCTTGTC 31312821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||
     3659 GCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCGACTCCTTATCCTTCTTCTC 3718

 31312822 TGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTC 31312881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTC 3778

 31312882 TATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTG 31312941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTG 3838

 31312942 TCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCAC 31313001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCAC 3898

 31313002 TCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTT 31313061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTT 3958

 31313062 TTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGA 31313121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGA 4018

 31313122 GACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACA 31313181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 GACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACA 4078

 31313182 AGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTA 31313241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 AGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTA 4138

 31313242 CAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCC 31313301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 CAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCC 4198

 31313302 ATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCC 31313361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 ATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCC 4258

 31313362 AAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGT 31313421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 AAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGT 4318

 31313422 TTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCT 31313481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCT 4378

 31313482 CTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTT 31313541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 CTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTT 4438

 31313542 TTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAAC 31313601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 TTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAAC 4498

 31313602 ATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGAC 31313661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 ATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGAC 4558

 31313662 AAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATAC 31313721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 AAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATAC 4618

 31313722 ACACACACACACACACACACAAATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATT 31313781
          |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 ACACACACACACACACACA--AATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATT 4676

 31313782 CTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTT--AATGCTTAGC 31313839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||
     4677 CTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTAATGCTTAGC 4736

 31313840 TGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAG 31313899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 TGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAG 4796

 31313900 AAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTT 31313959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 AAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTT 4856

 31313960 TAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAG 31314019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 TAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAG 4916

 31314020 CAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAG 31314079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 CAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAG 4976

 31314080 GGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTC 31314139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 GGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTC 5036

 31314140 CCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAA 31314199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 CCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAA 5096

 31314200 AGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTT 31314259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 AGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTT 5156

 31314260 TAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCC 31314319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 TAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCC 5216

 31314320 TAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTC 31314379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 TAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTC 5276

 31314380 AAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTT 31314439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 AAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTT 5336

 31314440 ATGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGA 31314499
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 ACGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGA 5396

 31314500 CCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTA 31314559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 CCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTA 5456

 31314560 GGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGT 31314619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 GGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGT 5516

 31314620 TATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAA 31314679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 TATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAA 5576

 31314680 GATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACT 31314739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 GATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACT 5636

 31314740 TCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTG 31314799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 TCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTG 5696

 31314800 TCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTG 31314859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 TCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTG 5756

 31314860 ATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCT 31314919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 ATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCT 5816

 31314920 GGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCA 31314979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 GGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCA 5876

 31314980 CCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAAC 31315039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 CCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAAC 5936

 31315040 TGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTT 31315099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 TGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTT 5996

 31315100 GTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATT 31315159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 GTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATT 6056

 31315160 TGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAAT 31315219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 TGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAAT 6116

 31315220 AAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTT 31315279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 AAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTT 6176

 31315280 TTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTT 31315339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 TTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTT 6236

 31315340 TTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGA 31315399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 TTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGA 6296

 31315400 GCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAG 31315459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 GCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAG 6356

 31315460 GCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGC 31315519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 GCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGC 6416

 31315520 CCGGGTAC 31315527
          ||||||||
     6417 CCGGGTAC 6424

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6425 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 6484

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6485 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 6544

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6545 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 6604

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6605 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 6664

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6665 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 6724

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6725 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 6784

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6785 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 6844

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6845 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 6904

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6905 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 6964

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 31319553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6965 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 7024

 31319554 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 31319613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7025 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 7084

 31319614 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 31319673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7085 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 7144

 31319674 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 31319733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7145 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 7204

 31319734 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATG 31319782
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7205 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATG 7253

Alignment time is 9.54547 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7211] =>      7211 nucs 'mol-32-2f28-024996_7211'

Score:        7033
Aligned:      7215        nucs
Identic:      7196 (100%) nucs =>      6392 (100%)       804 ( 99%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31309125,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319762]
 second seq =>  [       1,    6402] EXCISED REGION [    6403,    7211]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31309125 TTTTAATCTAGTTGTTTGACTTTTTGTTGTTGAGTTGTAGGAGTTTTTAAAATATAAATT 31309184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTAATCTAGTTGTTTGACTTTTTGTTGTTGAGTTGTAGGAGTTTTTAAAATATAAATT 60

 31309185 TTGAGTATCCATCACTTATTAAGTATATAACTTATAAATATTTTCTCCCATTCAGTAGGC 31309244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGAGTATCCATCACTTATTAAGTATATAACTTATAAATATTTTCTCCCATTCAGTAGGC 120

 31309245 TGTCTTTTTACATTACTTTCAGCAATGTTGTAGTTTTAAGTATATGAGTCTTTTACTTCT 31309304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTCTTTTTACATTACTTTCAGCAATGTTGTAGTTTTAAGTATATGAGTCTTTTACTTCT 180

 31309305 TTCTTTAGATTTATCATAAGTATTTAATTTCTAATTAGTTAAGATTTATTCCTAAGTACT 31309364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTTTAGATTTATCATAAGTATTTAATTTCTAATTAGTTAAGATTTATTCCTAAGTACT 240

 31309365 CCTAAGTATTTAATTACTAAATACTAAGTATTTAGTAATAAACATAAACCTTGTTTAGAT 31309424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTAAGTATTTAATTACTAAATACTAAGTATTTAGTAATAAACATAAACCTTGTTTAGAT 300

 31309425 TTGTTCTTAAGTATTTTAGTGACTATTATACACAGCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTT 31309484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTTCTTAAGTATTTTAGTGACTATTATACACAGCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTT 360

 31309485 TTCTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCATGATCTCGG 31309544
          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 T-CTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCATGATCTCGG 419

 31309545 CTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAATAA 31309604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 CTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAATAA 479

 31309605 CTGGGATTACAGGCACCCGCCACCTCGCCTGGCTAATTTATTTTTTATTTTTTTATTTTT 31309664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 CTGGGATTACAGGCACCCGCCACCTCGCCTGGCTAATTTATTTTTTATTTTTTTATTTTT 539

 31309665 TAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTG 31309724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTG 599

 31309725 ATCTGCCTATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGAGGTGAGCCACCGCGCCTGGC 31309784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 ATCTGCCTATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGAGGTGAGCCACCGCGCCTGGC 659

 31309785 TGCATTGCTTTTCTTTATTTCCTTTTTGGATTGCTTATTGCTGGTATATTGCAGCAAACT 31309844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TGCATTGCTTTTCTTTATTTCCTTTTTGGATTGCTTATTGCTGGTATATTGCAGCAAACT 719

 31309845 TAATATTTGTGTTGATCTTGTACCCTGAAACTTTGCTGAATTTGTTTACTAGCTCTAGTA 31309904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TAATATTTGTGTTGATCTTGTACCCTGAAACTTTGCTGAATTTGTTTACTAGCTCTAGTA 779

 31309905 GCTTCCTTACAAATTCTGTGGAATTCTCTTTTTAAAAATTTTTTTTTCCTCTAGTTCATT 31309964
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
      780 GCTTCCTTACAAATTCTGTGGAATTCTCTTTTTAAAAATTTTTTTT-CCTCTAGTTCATT 838

 31309965 GGTTTTTCTTTCTTCTTCTTATTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGATACATGTGTAGA 31310024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 GGTTTTTCTTTCTTCTTCTTATTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGATACATGTGTAGA 898

 31310025 ATGTGCGGGTTTGTTACATAGCTATACACGTGCCATGGTGGTTTGCTGTACCCATCAACC 31310084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 ATGTGCGGGTTTGTTACATAGCTATACACGTGCCATGGTGGTTTGCTGTACCCATCAACC 958

 31310085 CATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAATGTTATCCCTCCCCTAACCCCCAACGCCCCGG 31310144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 CATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAATGTTATCCCTCCCCTAACCCCCAACGCCCCGG 1018

 31310145 CAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCCCTCCCTATGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAACTCCC 31310204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 CAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCCCTCCCTATGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAACTCCC 1078

 31310205 ACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTGAGAAT 31310264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 ACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTGAGAAT 1138

 31310265 GATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTAAAGAACATGAACTCATCCTTTTTTGGAA 31310324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 GATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTAAAGAACATGAACTCATCCTTTTTTGGAA 1198

 31310325 TTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAATAGAGATATCATTACCACTTCCTTTTTA 31310384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAATAGAGATATCATTACCACTTCCTTTTTA 1258

 31310385 ATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAGTACA 31310444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 ATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAGTACA 1318

 31310445 AGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGAGAGA 31310504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 AGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGAGAGA 1378

 31310505 GTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTC 31310564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 GTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTC 1438

 31310565 CCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCATATTGGGAAACACTTTTACTGATAAATT 31310624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 CCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCATATTGGGAAACACTTTTACTGATAAATT 1498

 31310625 AAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGT 31310684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 AAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGT 1558

 31310685 AACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCAG 31310744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 AACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCAG 1618

 31310745 AGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAACA 31310804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 AGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAACA 1678

 31310805 CAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCAGGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGAG 31310864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCAGGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGAG 1738

 31310865 AATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGTG 31310924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 AATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGTG 1798

 31310925 CAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTGC 31310984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTGC 1858

 31310985 CTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCCA 31311044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCCA 1918

 31311045 AAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCAC 31311104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 AAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCAC 1978

 31311105 CTCATCCCTACGTGCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTACC 31311164
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CTCATCCCTACATGCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTACC 2038

 31311165 CTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAAT 31311224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAAT 2098

 31311225 TGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAAT 31311284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAAT 2158

 31311285 CTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGCC 31311344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGCC 2218

 31311345 TTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAA 31311404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAA 2278

 31311405 GAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATGT 31311464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATGT 2338

 31311465 TCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATAA 31311524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATAA 2398

 31311525 TTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATACA 31311584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATACA 2458

 31311585 AAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATAA 31311644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATAA 2518

 31311645 ATACTTAGAGGGATTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTC 31311704
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ATACTTAGAGGGGTTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTC 2578

 31311705 CCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTTT 31311764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTTT 2638

 31311765 TTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGTT 31311824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGTT 2698

 31311825 ATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTG 31311884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 ATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTG 2758

 31311885 CCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGATA 31311944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 CCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGATA 2818

 31311945 AACAAACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGGC 31312004
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AACAGACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGGC 2878

 31312005 TCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTCC 31312064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTCC 2938

 31312065 AGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGATCTTTCCCCCAGCT 31312124
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2939 AGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGCTCTTTCCCCCAGCT 2998

 31312125 GGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACAC 31312184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 GGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACAC 3058

 31312185 ACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAACA 31312244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 ACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAACA 3118

 31312245 CACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCA 31312304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 CACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCA 3178

 31312305 CTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCT 31312364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCT 3238

 31312365 TCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAA 31312424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 TCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAA 3298

 31312425 GGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAA 31312484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 GGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAA 3358

 31312485 GAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGT 31312544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 GAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGT 3418

 31312545 TTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAA 31312604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAA 3478

 31312605 CTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGT 31312664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 CTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGT 3538

 31312665 AAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAAC 31312724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 AAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAAC 3598

 31312725 TTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTG 31312784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTG 3658

 31312785 GGGACAAATTTCACCCCCACTCCTTATCCTTCTTGTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATC 31312844
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3659 GGGACAAATTTCACCCCGACTCCTTATCCTTCTTCTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATC 3718

 31312845 TCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACC 31312904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACC 3778

 31312905 TTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATC 31312964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATC 3838

 31312965 CCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGA 31313024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 CCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGA 3898

 31313025 TAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGC 31313084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGC 3958

 31313085 TCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCC 31313144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCC 4018

 31313145 AGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGC 31313204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 AGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGC 4078

 31313205 AATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGG 31313264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 AATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGG 4138

 31313265 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAA 31313324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAA 4198

 31313325 CTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATG 31313384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 CTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATG 4258

 31313385 AGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATA 31313444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 AGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATA 4318

 31313445 TTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGT 31313504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGT 4378

 31313505 GTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATA 31313564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 GTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATA 4438

 31313565 ATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACAC 31313624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 ATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACAC 4498

 31313625 ACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTC 31313684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 ACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTC 4558

 31313685 ATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACACACACACACACACACACACAAA 31313744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||
     4559 ATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACACACACACACACACACACA--AA 4616

 31313745 TGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCT 31313804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 TGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCT 4676

 31313805 GTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTT---AATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTC 31313861
          |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 GTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTC 4736

 31313862 TAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGA 31313921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 TAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGA 4796

 31313922 CATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAG 31313981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 CATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAG 4856

 31313982 TTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAG 31314041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 TTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAG 4916

 31314042 AATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGT 31314101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 AATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGT 4976

 31314102 ATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTT 31314161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 ATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTT 5036

 31314162 GCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTT 31314221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 GCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTT 5096

 31314222 TTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATAC 31314281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 TTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATAC 5156

 31314282 ATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGT 31314341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 ATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGT 5216

 31314342 TTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACA 31314401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 TTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACA 5276

 31314402 AGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTATGTGCTGGTCCCTGAAATATC 31314461
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5277 AGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTACGTGCTGGTCCCTGAAATATC 5336

 31314462 ACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTT 31314521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 ACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTT 5396

 31314522 GATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGAT 31314581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 GATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGAT 5456

 31314582 CATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAAT 31314641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 CATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAAT 5516

 31314642 CTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAG 31314701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 CTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAG 5576

 31314702 CCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAA 31314761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 CCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAA 5636

 31314762 AACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACT 31314821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 AACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACT 5696

 31314822 GATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAG 31314881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 GATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAG 5756

 31314882 TGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCA 31314941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 TGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCA 5816

 31314942 CTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGA 31315001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 CTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGA 5876

 31315002 CGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCA 31315061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 CGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCA 5936

 31315062 CTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGC 31315121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 CTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGC 5996

 31315122 TTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAA 31315181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 TTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAA 6056

 31315182 AATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAAT 31315241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 AATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAAT 6116

 31315242 TAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGA 31315301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 TAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGA 6176

 31315302 GAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAA 31315361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 GAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAA 6236

 31315362 AAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACA 31315421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 AAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACA 6296

 31315422 GCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACA 31315481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 GCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACA 6356

 31315482 CAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 31315527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 CAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 6402

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6403 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 6462

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6463 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 6522

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6523 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 6582

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6583 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 6642

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6643 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 6702

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6703 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 6762

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6763 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 6822

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6823 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 6882

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6883 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 6942

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 31319553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6943 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 7002

 31319554 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 31319613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7003 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 7062

 31319614 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 31319673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7063 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 7122

 31319674 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 31319733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7123 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 7182

 31319734 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCG 31319762
          |||||||||||||||||||||||||||||
     7183 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCG 7211

Alignment time is 10.1065 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7419] =>      7419 nucs 'mol-32-2fc2-171767_7419'

Score:        7284
Aligned:      7420        nucs
Identic:      7406 (100%) nucs =>      6328 (100%)      1078 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31308101,31314440] EXCISED REGION [31314444,31315521]
 second seq =>  [       1,    6338] EXCISED REGION [    6342,    7419]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [31314441,31314443]
 second seq =>         3 nucs [6339,6341]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [31314441,31314441] to [31314443,31314443]
 second seq =>         1 nucs [6339,6339] to [6341,6341]

 31308101 GGGGGAGGTTGAACATTTTTCATGCAGTTAAAGCCTCAAGTTAACACACTGTTCTATAGA 31308160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGGGAGGTTGAACATTTTTCATGCAGTTAAAGCCTCAAGTTAACACACTGTTCTATAGA 60

 31308161 TTTGTTGTAGATGACCAACATTTCACAGACTATATATCACGACATTCACATAAAATTTTC 31308220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGTTGTAGATGACCAACATTTCACAGACTATATATCACGACATTCACATAAAATTTTC 120

 31308221 TGCAAAAATTATGTTGTATCATATATTTGCCCCTTTTGGCAATTCATAAAAAAGCCTCTG 31308280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCAAAAATTATGTTGTATCATATATTTGCCCCTTTTGGCAATTCATAAAAAAGCCTCTG 180

 31308281 AGAAAAGAAATTCCTTGAAATGTTTTATTGTGGAAAAAATATATATATAACATAATTATC 31308340
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      181 AGAAAAGAAATTCCTTGAAATGTTTTATTGTGGAAAAAAAATATATATAACATAATTATC 240

 31308341 ATCTTAACCAGTTGTAAGTATGTGATTTAGTAGCACTAAATACACTCACAACATTGTGTG 31308400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCTTAACCAGTTGTAAGTATGTGATTTAGTAGCACTAAATACACTCACAACATTGTGTG 300

 31308401 GCTATCACCAGTATCCATACCCAAAATGTTTTCATCATCTGTAACGAAAACTCTATGTCC 31308460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTATCACCAGTATCCATACCCAAAATGTTTTCATCATCTGTAACGAAAACTCTATGTCC 360

 31308461 ACTACTCCCTTTCCTTCCACCTCCCAGCCCCTGGTAACCTCTACTCTATTTCCTGTCTCT 31308520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTACTCCCTTTCCTTCCACCTCCCAGCCCCTGGTAACCTCTACTCTATTTCCTGTCTCT 420

 31308521 TTGAATTTGCCTGTTCTAGGTACATCATATAAGTATAATTTTACAATATTTATCCTGTGT 31308580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGAATTTGCCTGTTCTAGGTACATCATATAAGTATAATTTTACAATATTTATCCTGTGT 480

 31308581 CTGGCTTCTTGTACTATGCATGTTTTCAAGGACCATCCATGTTGTAGCATATATCAAAAT 31308640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGGCTTCTTGTACTATGCATGTTTTCAAGGACCATCCATGTTGTAGCATATATCAAAAT 540

 31308641 TTCATTCATGTTTATGGCAGAATAATATACTATCATGCGCATATTCCCTTTATGTGTTGG 31308700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCATTCATGTTTATGGCAGAATAATATACTATCATGCGCATATTCCCTTTATGTGTTGG 600

 31308701 TGGGCATTTGAATTGTTTCCACATTTTGCCCATTGTGAATAATGCTATGAACATCAGTGC 31308760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGGCATTTGAATTGTTTCCACATTTTGCCCATTGTGAATAATGCTATGAACATCAGTGC 660

 31308761 ACAAATGTGTTTGAGTCCCTGCTTTTAATTCTTTTGGATATACACCTAGGAGTGAAATTG 31308820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAAATGTGTTTGAGTCCCTGCTTTTAATTCTTTTGGATATACACCTAGGAGTGAAATTG 720

 31308821 GTGGGTCATATGGTAGTTCTATTTGAACTGTTTAAGAAATTGCCACATTGTTTTCTACAT 31308880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGGGTCATATGGTAGTTCTATTTGAACTGTTTAAGAAATTGCCACATTGTTTTCTACAT 780

 31308881 AAAATGTACCATTTTGGATTCTCCCCAGCACTTATGAGGCTTCCAATTTCTCCACGTCCT 31308940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAATGTACCATTTTGGATTCTCCCCAGCACTTATGAGGCTTCCAATTTCTCCACGTCCT 840

 31308941 TGCCAACACCTGCCATTTTCCCTTTTTAAAAATTATAGCCATCCTAGTAGGTGTGATGTG 31309000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCCAACACCTGCCATTTTCCCTTTTTAAAAATTATAGCCATCCTAGTAGGTGTGATGTG 900

 31309001 CTATCCATGGTCATTTTGACTTGCATTTTTCTAATGATTAATAATGTTAAGCATCTTTTC 31309060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTATCCATGGTCATTTTGACTTGCATTTTTCTAATGATTAATAATGTTAAGCATCTTTTC 960

 31309061 ATGGGTATATTGGACGTTTGTATATCATACTTGGTGAAATGTCTATTCATGTCCTTCATC 31309120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGGGTATATTGGACGTTTGTATATCATACTTGGTGAAATGTCTATTCATGTCCTTCATC 1020

 31309121 TACTTTTTAATCTAGTTGTTTGACTTTTTGTTGTTGAGTTGTAGGAGTTTTTAAAATATA 31309180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACTTTTTAATCTAGTTGTTTGACTTTTTGTTGTTGAGTTGTAGGAGTTTTTAAAATATA 1080

 31309181 AATTTTGAGTATCCATCACTTATTAAGTATATAACTTATAAATATTTTCTCCCATTCAGT 31309240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTTTGAGTATCCATCACTTATTAAGTATATAACTTATAAATATTTTCTCCCATTCAGT 1140

 31309241 AGGCTGTCTTTTTACATTACTTTCAGCAATGTTGTAGTTTTAAGTATATGAGTCTTTTAC 31309300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGCTGTCTTTTTACATTACTTTCAGCAATGTTGTAGTTTTAAGTATATGAGTCTTTTAC 1200

 31309301 TTCTTTCTTTAGATTTATCATAAGTATTTAATTTCTAATTAGTTAAGATTTATTCCTAAG 31309360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCTTTCTTTAGATTTATCATAAGTATTTAATTTCTAATTAGTTAAGATTTATTCCTAAG 1260

 31309361 TACTCCTAAGTATTTAATTACTAAATACTAAGTATTTAGTAATAAACATAAACCTTGTTT 31309420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TACTCCTAAGTATTTAATTACTAAATACTAAGTATTTAGTAATAAACATAAACCTTGTTT 1320

 31309421 AGATTTGTTCTTAAGTATTTTAGTGACTATTATACACAGCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTT 31309480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGATTTGTTCTTAAGTATTTTAGTGACTATTATACACAGCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTT 1380

 31309481 TTTTTTCTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCATGATC 31309540
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTT-CTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCATGATC 1439

 31309541 TCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGA 31309600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGA 1499

 31309601 ATAACTGGGATTACAGGCACCCGCCACCTCGCCTGGCTAATTTATTTTTTATTTTTTTAT 31309660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 ATAACTGGGATTACAGGCACCCGCCACCTCGCCTGGCTAATTTATTTTTTATTTTTTTAT 1559

 31309661 TTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCA 31309720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCA 1619

 31309721 GGTGATCTGCCTATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGAGGTGAGCCACCGCGCC 31309780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GGTGATCTGCCTATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGAGGTGAGCCACCGCGCC 1679

 31309781 TGGCTGCATTGCTTTTCTTTATTTCCTTTTTGGATTGCTTATTGCTGGTATATTGCAGCA 31309840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TGGCTGCATTGCTTTTCTTTATTTCCTTTTTGGATTGCTTATTGCTGGTATATTGCAGCA 1739

 31309841 AACTTAATATTTGTGTTGATCTTGTACCCTGAAACTTTGCTGAATTTGTTTACTAGCTCT 31309900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 AACTTAATATTTGTGTTGATCTTGTACCCTGAAACTTTGCTGAATTTGTTTACTAGCTCT 1799

 31309901 AGTAGCTTCCTTACAAATTCTGTGGAATTCTCTTTTTAAAAATTTTTTTTTCCTCTAGTT 31309960
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     1800 AGTAGCTTCCTTACAAATTCTGTGGAATTCTCTTTTTAAAAATTTTTTTT-CCTCTAGTT 1858

 31309961 CATTGGTTTTTCTTTCTTCTTCTTATTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGATACATGTG 31310020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CATTGGTTTTTCTTTCTTCTTCTTATTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGATACATGTG 1918

 31310021 TAGAATGTGCGGGTTTGTTACATAGCTATACACGTGCCATGGTGGTTTGCTGTACCCATC 31310080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TAGAATGTGCGGGTTTGTTACATAGCTATACACGTGCCATGGTGGTTTGCTGTACCCATC 1978

 31310081 AACCCATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAATGTTATCCCTCCCCTAACCCCCAACGCC 31310140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AACCCATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAATGTTATCCCTCCCCTAACCCCCAACGCC 2038

 31310141 CCGGCAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCCCTCCCTATGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAAC 31310200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CCGGCAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCCCTCCCTATGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAAC 2098

 31310201 TCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTGA 31310260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTGA 2158

 31310261 GAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTAAAGAACATGAACTCATCCTTTTTT 31310320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTAAAGAACATGAACTCATCCTTTTTT 2218

 31310321 GGAATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAATAGAGATATCATTACCACTTCCTT 31310380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 GGAATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAATAGAGATATCATTACCACTTCCTT 2278

 31310381 TTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAG 31310440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAG 2338

 31310441 TACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGA 31310500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGA 2398

 31310501 GAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCAT 31310560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCAT 2458

 31310561 CTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCATATTGGGAAACACTTTTACTGATA 31310620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCATATTGGGAAACACTTTTACTGATA 2518

 31310621 AATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTA 31310680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 AATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTA 2578

 31310681 GAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTT 31310740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 GAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTT 2638

 31310741 TCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACA 31310800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACA 2698

 31310801 AACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCAGGATGCGACTACCTATTAAAATGC 31310860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 AACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCAGGATGCGACTACCTATTAAAATGC 2758

 31310861 TGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTA 31310920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTA 2818

 31310921 CGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATTTAATACT 31310980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATTTAATACT 2878

 31310981 TTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTT 31311040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTT 2938

 31311041 GCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAA 31311100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAA 2998

 31311101 GCACCTCATCCCTACGTGCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTAT 31311160
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 GCACCTCATCCCTACATGCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTAT 3058

 31311161 TACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAA 31311220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 TACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAA 3118

 31311221 CAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCG 31311280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 CAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCG 3178

 31311281 AAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCC 31311340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 AAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCC 3238

 31311341 AGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGT 31311400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 AGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGT 3298

 31311401 CAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCAT 31311460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 CAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCAT 3358

 31311461 ATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGA 31311520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 ATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGA 3418

 31311521 ATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATA 31311580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 ATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATA 3478

 31311581 TACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCT 31311640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCT 3538

 31311641 ATAAATACTTAGAGGGATTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGC 31311700
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 ATAAATACTTAGAGGGGTTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGC 3598

 31311701 CTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTT 31311760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 CTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTT 3658

 31311761 CTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAATGTTCATTGATGTATTTATT 31311820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 CTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAATGTTCATTGATGTATTTATT 3718

 31311821 TGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGT 31311880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGT 3778

 31311881 ATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTG 31311940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 ATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTG 3838

 31311941 GATAAACAAACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTAT 31312000
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 GATAAACAGACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTAT 3898

 31312001 TGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCATATAATGTCACTGGGACTCT 31312060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCATATAATGTCACTGGGACTCT 3958

 31312061 CTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGATCTTTCCCCC 31312120
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3959 CTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGCTCTTTCCCCC 4018

 31312121 AGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGG 31312180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 AGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGG 4078

 31312181 ACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGC 31312240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 ACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGC 4138

 31312241 AACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAG 31312300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 AACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAG 4198

 31312301 GTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAA 31312360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 GTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAA 4258

 31312361 TTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGGA 31312420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGGA 4318

 31312421 GAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAA 31312480
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 GAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGATAGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAA 4378

 31312481 GAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAAC 31312540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 GAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAAC 4438

 31312541 TTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTT 31312600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 TTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTT 4498

 31312601 AGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAA 31312660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 AGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAA 4558

 31312661 CAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTAT 31312720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 CAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTAT 4618

 31312721 GAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGT 31312780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 GAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGT 4678

 31312781 GTTGGGGACAAATTTCACCCCCACTCCTTATCCTTCTTGTCTGCTTTGCTTTCTTCCACT 31312840
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4679 GTTGGGGACAAATTTCACCCCGACTCCTTATCCTTCTTCTCTGCTTTGCTTTCTTCCACT 4738

 31312841 GATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCC 31312900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 GATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCC 4798

 31312901 CACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTA 31312960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 CACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTA 4858

 31312961 TATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAA 31313020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 TATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAA 4918

 31313021 TAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCT 31313080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 TAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCT 4978

 31313081 GTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTT 31313140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 GTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTT 5038

 31313141 GCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTC 31313200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 GCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTC 5098

 31313201 AAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGC 31313260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 AAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGC 5158

 31313261 CCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTT 31313320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 CCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTT 5218

 31313321 TGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGG 31313380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 TGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGG 5278

 31313381 CATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAA 31313440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 CATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAA 5338

 31313441 TATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTA 31313500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 TATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTA 5398

 31313501 CAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCA 31313560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 CAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCA 5458

 31313561 AATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCAC 31313620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 AATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCAC 5518

 31313621 ACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAA 31313680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 ACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAA 5578

 31313681 ATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACACACACACACACACACACA 31313740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 ATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACACACACACACACACACACA 5638

 31313741 CAAATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGA 31313800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 --AATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGA 5696

 31313801 CTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTT--AATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATT 31313858
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||
     5697 CTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTAATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATT 5756

 31313859 TTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTT 31313918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 TTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTT 5816

 31313919 TGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGC 31313978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 TGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGC 5876

 31313979 TAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAG 31314038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 TAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAG 5936

 31314039 TAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCAC 31314098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 TAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCAC 5996

 31314099 CGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTC 31314158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 CGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTC 6056

 31314159 CTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTC 31314218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 CTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTC 6116

 31314219 TTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACA 31314278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 TTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACA 6176

 31314279 TACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTT 31314338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 TACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTT 6236

 31314339 TGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAA 31314398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 TGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAA 6296

 31314399 ACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTA 31314440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 ACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTA 6338

EXCISED REGION

 31314444 GCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTT 31314503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6342 GCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTT 6401

 31314504 CCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAG 31314563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6402 CCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAG 6461

 31314564 GCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATT 31314623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6462 GCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATT 6521

 31314624 CAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATA 31314683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6522 CAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATA 6581

 31314684 CTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAA 31314743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6582 CTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAA 6641

 31314744 AATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCT 31314803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6642 AATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCT 6701

 31314804 GAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCG 31314863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6702 GAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCG 6761

 31314864 CTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCT 31314923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6762 CTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCT 6821

 31314924 CAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCA 31314983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6822 CAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCA 6881

 31314984 GCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGA 31315043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6882 GCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGA 6941

 31315044 AATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCA 31315103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6942 AATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCA 7001

 31315104 ACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAG 31315163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7002 ACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAG 7061

 31315164 TAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGA 31315223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7062 TAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGA 7121

 31315224 CAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAG 31315283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7122 CAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAG 7181

 31315284 TGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTAT 31315343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7182 TGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTAT 7241

 31315344 AAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAA 31315403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7242 AAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAA 7301

 31315404 ATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAG 31315463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7302 ATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAG 7361

 31315464 GCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCC 31315521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7362 GCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCC 7419

Alignment time is 10.2919 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7551] =>      7551 nucs 'mol-32-2fe3-145357_7551'

Score:        7375
Aligned:      7555        nucs
Identic:      7537 (100%) nucs =>      6663 (100%)       874 ( 99%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31308854,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319832]
 second seq =>  [       1,    6672] EXCISED REGION [    6673,    7551]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31308854 AAGAAATTGCCACATTGTTTTCTACATAAAATGTACCATTTTGGATTCTCCCCAGCACTT 31308913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGAAATTGCCACATTGTTTTCTACATAAAATGTACCATTTTGGATTCTCCCCAGCACTT 60

 31308914 ATGAGGCTTCCAATTTCTCCACGTCCTTGCCAACACCTGCCATTTTCCCTTTTTAAAAAT 31308973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGAGGCTTCCAATTTCTCCACGTCCTTGCCAACACCTGCCATTTTCCCTTTTTAAAAAT 120

 31308974 TATAGCCATCCTAGTAGGTGTGATGTGCTATCCATGGTCATTTTGACTTGCATTTTTCTA 31309033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAGCCATCCTAGTAGGTGTGATGTGCTATCCATGGTCATTTTGACTTGCATTTTTCTA 180

 31309034 ATGATTAATAATGTTAAGCATCTTTTCATGGGTATATTGGACGTTTGTATATCATACTTG 31309093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGATTAATAATGTTAAGCATCTTTTCATGGGTATATTGGACGTTTGTATATCATACTTG 240

 31309094 GTGAAATGTCTATTCATGTCCTTCATCTACTTTTTAATCTAGTTGTTTGACTTTTTGTTG 31309153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGAAATGTCTATTCATGTCCTTCATCTACTTTTTAATCTAGTTGTTTGACTTTTTGTTG 300

 31309154 TTGAGTTGTAGGAGTTTTTAAAATATAAATTTTGAGTATCCATCACTTATTAAGTATATA 31309213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGAGTTGTAGGAGTTTTTAAAATATAAATTTTGAGTATCCATCACTTATTAAGTATATA 360

 31309214 ACTTATAAATATTTTCTCCCATTCAGTAGGCTGTCTTTTTACATTACTTTCAGCAATGTT 31309273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTTATAAATATTTTCTCCCATTCAGTAGGCTGTCTTTTTACATTACTTTCAGCAATGTT 420

 31309274 GTAGTTTTAAGTATATGAGTCTTTTACTTCTTTCTTTAGATTTATCATAAGTATTTAATT 31309333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTAGTTTTAAGTATATGAGTCTTTTACTTCTTTCTTTAGATTTATCATAAGTATTTAATT 480

 31309334 TCTAATTAGTTAAGATTTATTCCTAAGTACTCCTAAGTATTTAATTACTAAATACTAAGT 31309393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTAATTAGTTAAGATTTATTCCTAAGTACTCCTAAGTATTTAATTACTAAATACTAAGT 540

 31309394 ATTTAGTAATAAACATAAACCTTGTTTAGATTTGTTCTTAAGTATTTTAGTGACTATTAT 31309453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTAGTAATAAACATAAACCTTGTTTAGATTTGTTCTTAAGTATTTTAGTGACTATTAT 600

 31309454 ACACAGCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTCTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCA 31309513
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      601 ACACAGCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTT-CTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCA 659

 31309514 CCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGAGTTCA 31309573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGAGTTCA 719

 31309574 AGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAATAACTGGGATTACAGGCACCCGCCACCTCGCC 31309633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 AGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAATAACTGGGATTACAGGCACCCGCCACCTCGCC 779

 31309634 TGGCTAATTTATTTTTTATTTTTTTATTTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGC 31309693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TGGCTAATTTATTTTTTATTTTTTTATTTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGC 839

 31309694 CAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTATCTCGGCCTCCCAAAGTGCT 31309753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTATCTCGGCCTCCCAAAGTGCT 899

 31309754 GAGATTACAGAGGTGAGCCACCGCGCCTGGCTGCATTGCTTTTCTTTATTTCCTTTTTGG 31309813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GAGATTACAGAGGTGAGCCACCGCGCCTGGCTGCATTGCTTTTCTTTATTTCCTTTTTGG 959

 31309814 ATTGCTTATTGCTGGTATATTGCAGCAAACTTAATATTTGTGTTGATCTTGTACCCTGAA 31309873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 ATTGCTTATTGCTGGTATATTGCAGCAAACTTAATATTTGTGTTGATCTTGTACCCTGAA 1019

 31309874 ACTTTGCTGAATTTGTTTACTAGCTCTAGTAGCTTCCTTACAAATTCTGTGGAATTCTCT 31309933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ACTTTGCTGAATTTGTTTACTAGCTCTAGTAGCTTCCTTACAAATTCTGTGGAATTCTCT 1079

 31309934 TTTTAAAAATTTTTTTTTCCTCTAGTTCATTGGTTTTTCTTTCTTCTTCTTATTTTTTAT 31309993
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TTTTAAAAATTTTTTTT-CCTCTAGTTCATTGGTTTTTCTTTCTTCTTCTTATTTTTTAT 1138

 31309994 TATACTTTAAGTTCTAGGATACATGTGTAGAATGTGCGGGTTTGTTACATAGCTATACAC 31310053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TATACTTTAAGTTCTAGGATACATGTGTAGAATGTGCGGGTTTGTTACATAGCTATACAC 1198

 31310054 GTGCCATGGTGGTTTGCTGTACCCATCAACCCATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAAT 31310113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 GTGCCATGGTGGTTTGCTGTACCCATCAACCCATCATCTACATTAGGTATTTCTCCTAAT 1258

 31310114 GTTATCCCTCCCCTAACCCCCAACGCCCCGGCAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCCCTCCC 31310173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 GTTATCCCTCCCCTAACCCCCAACGCCCCGGCAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCCCTCCC 1318

 31310174 TATGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGG 31310233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TATGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGG 1378

 31310234 TTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCT 31310293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 TTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCT 1438

 31310294 GTAAAGAACATGAACTCATCCTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGT 31310353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 GTAAAGAACATGAACTCATCCTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGT 1498

 31310354 GAATAGAGATATCATTACCACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTT 31310413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GAATAGAGATATCATTACCACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTT 1558

 31310414 TCTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCA 31310473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TCTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCA 1618

 31310474 TTCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGT 31310533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TTCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGT 1678

 31310534 CCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTAT 31310593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTAT 1738

 31310594 TCATATTGGGAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAA 31310653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TCATATTGGGAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAA 1798

 31310654 CAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTG 31310713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTG 1858

 31310714 ACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCT 31310773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 ACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCT 1918

 31310774 TTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAA 31310833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAA 1978

 31310834 GCAGGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGA 31310893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 GCAGGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGA 2038

 31310894 GGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGT 31310953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 GGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGT 2098

 31310954 GGCTGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATA 31311013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 GGCTGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATA 2158

 31311014 TGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTT 31311073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTT 2218

 31311074 CTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACGTGCTGTTTTCTCTCACA 31311133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2219 CTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACATGCTGTTTTCTCTCACA 2278

 31311134 AAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAA 31311193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 AAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAA 2338

 31311194 GTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAAT 31311253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAAT 2398

 31311254 TGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAG 31311313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAG 2458

 31311314 TGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTT 31311373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTT 2518

 31311374 CTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCG 31311433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 CTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCG 2578

 31311434 TGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAA 31311493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAA 2638

 31311494 ATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACA 31311553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 ATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACA 2698

 31311554 TTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTT 31311613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTT 2758

 31311614 TTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGATTTTTTTTATCCCTCA 31311673
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2759 TTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGGTTTTTTTTATCCCTCA 2818

 31311674 CTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCA 31311733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 CTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCA 2878

 31311734 ATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGA 31311793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 ATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGA 2938

 31311794 CATCAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGG 31311853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 CATCAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGG 2998

 31311854 GCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATA 31311913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 GCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATA 3058

 31311914 TGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAAACTCATAAATATGCTGATGGAAAA 31311973
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3059 TGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAGACTCATAAATATGCTGATGGAAAA 3118

 31311974 GTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAA 31312033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAA 3178

 31312034 GCACCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGG 31312093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GCACCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGG 3238

 31312094 CCTCACTTTCCAGCAGATCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTT 31312153
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 CCTCACTTTCCAGCAGCTCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTT 3298

 31312154 GCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATT 31312213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 GCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATT 3358

 31312214 TCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAA 31312273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAA 3418

 31312274 TTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCC 31312333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 TTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCC 3478

 31312334 ATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGT 31312393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 ATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGT 3538

 31312394 AGACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAAT 31312453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 AGACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAAT 3598

 31312454 ACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAAC 31312513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 ACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAAC 3658

 31312514 AAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAG 31312573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 AAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAG 3718

 31312574 AAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCAC 31312633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 AAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCAC 3778

 31312634 CCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTC 31312693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 CCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTC 3838

 31312694 AGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAA 31312753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 AGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAA 3898

 31312754 ACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCCACTCCTTATCC 31312813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3899 ACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCGACTCCTTATCC 3958

 31312814 TTCTTGTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATT 31312873
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TTCTTCTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATT 4018

 31312874 TATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGG 31312933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 TATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGG 4078

 31312934 AATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATAT 31312993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 AATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATAT 4138

 31312994 AGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTT 31313053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 AGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTT 4198

 31313054 TGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTAT 31313113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 TGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTAT 4258

 31313114 TTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGC 31313173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGC 4318

 31313174 TCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGC 31313233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGC 4378

 31313234 TGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGG 31313293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 TGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGG 4438

 31313294 ATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTC 31313353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 ATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTC 4498

 31313354 AGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTAT 31313413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 AGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTAT 4558

 31313414 TTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGAT 31313473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 TTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGAT 4618

 31313474 TTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAA 31313533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 TTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAA 4678

 31313534 TGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAG 31313593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 TGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAG 4738

 31313594 ATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACA 31313653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 ATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACA 4798

 31313654 CTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACAC 31313713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 CTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACAC 4858

 31313714 ATACATACACACACACACACACACACACAAATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTA 31313773
          |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 ATACATACACACACACACACACACACA--AATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTA 4916

 31313774 TAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTT--AA 31313831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||
     4917 TAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTAA 4976

 31313832 TGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAA 31313891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 TGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAA 5036

 31313892 ACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATT 31313951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 ACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATT 5096

 31313952 GAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTT 31314011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 GAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTT 5156

 31314012 GAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAA 31314071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 GAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAA 5216

 31314072 AAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTT 31314131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 AAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTT 5276

 31314132 CCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCA 31314191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 CCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCA 5336

 31314192 ATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCT 31314251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 ATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCT 5396

 31314252 GCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTC 31314311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 GCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTC 5456

 31314312 TATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATAT 31314371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 TATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATAT 5516

 31314372 TATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGG 31314431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 TATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGG 5576

 31314432 GTATGTTTATGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAA 31314491
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 GTATGTTTACGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAA 5636

 31314492 GGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTG 31314551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 GGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTG 5696

 31314552 TAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGG 31314611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 TAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGG 5756

 31314612 CTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTA 31314671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 CTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTA 5816

 31314672 TGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGAC 31314731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 TGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGAC 5876

 31314732 AAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTA 31314791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 AAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTA 5936

 31314792 CATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCAT 31314851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 CATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCAT 5996

 31314852 CATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGT 31314911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 CATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGT 6056

 31314912 TCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACA 31314971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 TCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACA 6116

 31314972 TGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTG 31315031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 TGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTG 6176

 31315032 GGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGG 31315091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 GGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGG 6236

 31315092 TGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTAC 31315151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 TGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTAC 6296

 31315152 TATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACT 31315211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 TATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACT 6356

 31315212 AAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAG 31315271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 AAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAG 6416

 31315272 AATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGA 31315331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 AATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGA 6476

 31315332 CAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATT 31315391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 CAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATT 6536

 31315392 TTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGG 31315451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 TTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGG 6596

 31315452 AATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGAC 31315511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 AATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGAC 6656

 31315512 ACTGCAGCCCGGGTAC 31315527
          ||||||||||||||||
     6657 ACTGCAGCCCGGGTAC 6672

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6673 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 6732

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6733 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 6792

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6793 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCATGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 6852

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6853 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 6912

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6913 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 6972

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6973 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 7032

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7033 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 7092

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     7093 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 7152

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7153 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 7212

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 31319553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7213 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 7272

 31319554 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 31319613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7273 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 7332

 31319614 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 31319673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7333 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 7392

 31319674 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 31319733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7393 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 7452

 31319734 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 31319793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7453 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 7512

 31319794 CCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGG 31319832
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7513 CCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGG 7551

Alignment time is 10.0818 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    7185] =>      7185 nucs 'mol-32-2ff9-163516_7185'

Score:        7070
Aligned:      7182        nucs
Identic:      7171 (100%) nucs =>      5445 (100%)      1726 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31308361,31313815] EXCISED REGION [31313816,31315542]
 second seq =>  [       1,    5451] EXCISED REGION [    5455,    7181]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [5452,5454]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        14 nucs [5452,5465] to [5455,5468]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [5452,5452] to [5454,5454]

 31308361 TGTGATTTAGTAGCACTAAATACACTCACAACATTGTGTGGCTATCACCAGTATCCATAC 31308420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTGATTTAGTAGCACTAAATACACTCACAACATTGTGTGGCTATCACCAGTATCCATAC 60

 31308421 CCAAAATGTTTTCATCATCTGTAACGAAAACTCTATGTCCACTACTCCCTTTCCTTCCAC 31308480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAAAATGTTTTCATCATCTGTAACGAAAACTCTATGTCCACTACTCCCTTTCCTTCCAC 120

 31308481 CTCCCAGCCCCTGGTAACCTCTACTCTATTTCCTGTCTCTTTGAATTTGCCTGTTCTAGG 31308540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCCCAGCCCCTGGTAACCTCTACTCTATTTCCTGTCTCTTTGAATTTGCCTGTTCTAGG 180

 31308541 TACATCATATAAGTATAATTTTACAATATTTATCCTGTGTCTGGCTTCTTGTACTATGCA 31308600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACATCATATAAGTATAATTTTACAATATTTATCCTGTGTCTGGCTTCTTGTACTATGCA 240

 31308601 TGTTTTCAAGGACCATCCATGTTGTAGCATATATCAAAATTTCATTCATGTTTATGGCAG 31308660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTTTTCAAGGACCATCCATGTTGTAGCATATATCAAAATTTCATTCATGTTTATGGCAG 300

 31308661 AATAATATACTATCATGCGCATATTCCCTTTATGTGTTGGTGGGCATTTGAATTGTTTCC 31308720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATAATATACTATCATGCGCATATTCCCTTTATGTGTTGGTGGGCATTTGAATTGTTTCC 360

 31308721 ACATTTTGCCCATTGTGAATAATGCTATGAACATCAGTGCACAAATGTGTTTGAGTCCCT 31308780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACATTTTGCCCATTGTGAATAATGCTATGAACATCAGTGCACAAATGTGTTTGAGTCCCT 420

 31308781 GCTTTTAATTCTTTTGGATATACACCTAGGAGTGAAATTGGTGGGTCATATGGTAGTTCT 31308840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTTTTAATTCTTTTGGATATACACCTAGGAGTGAAATTGGTGGGTCATATGGTAGTTCT 480

 31308841 ATTTGAACTGTTTAAGAAATTGCCACATTGTTTTCTACATAAAATGTACCATTTTGGATT 31308900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTGAACTGTTTAAGAAATTGCCACATTGTTTTCTACATAAAATGTACCATTTTGGATT 540

 31308901 CTCCCCAGCACTTATGAGGCTTCCAATTTCTCCACGTCCTTGCCAACACCTGCCATTTTC 31308960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCCCCAGCACTTATGAGGCTTCCAATTTCTCCACGTCCTTGCCAACACCTGCCATTTTC 600

 31308961 CCTTTTTAAAAATTATAGCCATCCTAGTAGGTGTGATGTGCTATCCATGGTCATTTTGAC 31309020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTTTTTAAAAATTATAGCCATCCTAGTAGGTGTGATGTGCTATCCATGGTCATTTTGAC 660

 31309021 TTGCATTTTTCTAATGATTAATAATGTTAAGCATCTTTTCATGGGTATATTGGACGTTTG 31309080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGCATTTTTCTAATGATTAATAATGTTAAGCATCTTTTCATGGGTATATTGGACGTTTG 720

 31309081 TATATCATACTTGGTGAAATGTCTATTCATGTCCTTCATCTACTTTTTAATCTAGTTGTT 31309140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATATCATACTTGGTGAAATGTCTATTCATGTCCTTCATCTACTTTTTAATCTAGTTGTT 780

 31309141 TGACTTTTTGTTGTTGAGTTGTAGGAGTTTTTAAAATATAAATTTTGAGTATCCATCACT 31309200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGACTTTTTGTTGTTGAGTTGTAGGAGTTTTTAAAATATAAATTTTGAGTATCCATCACT 840

 31309201 TATTAAGTATATAACTTATAAATATTTTCTCCCATTCAGTAGGCTGTCTTTTTACATTAC 31309260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATTAAGTATATAACTTATAAATATTTTCTCCCATTCAGTAGGCTGTCTTTTTACATTAC 900

 31309261 TTTCAGCAATGTTGTAGTTTTAAGTATATGAGTCTTTTACTTCTTTCTTTAGATTTATCA 31309320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTCAGCAATGTTGTAGTTTTAAGTATATGAGTCTTTTACTTCTTTCTTTAGATTTATCA 960

 31309321 TAAGTATTTAATTTCTAATTAGTTAAGATTTATTCCTAAGTACTCCTAAGTATTTAATTA 31309380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAGTATTTAATTTCTAATTAGTTAAGATTTATTCCTAAGTACTCCTAAGTATTTAATTA 1020

 31309381 CTAAATACTAAGTATTTAGTAATAAACATAAACCTTGTTTAGATTTGTTCTTAAGTATTT 31309440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTAAATACTAAGTATTTAGTAATAAACATAAACCTTGTTTAGATTTGTTCTTAAGTATTT 1080

 31309441 TAGTGACTATTATACACAGCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTCTTTTGAGATGGAG 31309500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     1081 TAGTGACTATTATACACAGCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTT-CTTTTGAGATGGAG 1139

 31309501 TCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCG 31309560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCG 1199

 31309561 CCTCCAGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAATAACTGGGATTACAGGCAC 31309620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CCTCCAGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAATAACTGGGATTACAGGCAC 1259

 31309621 CCGCCACCTCGCCTGGCTAATTTATTTTTTATTTTTTTATTTTTTAGTAGAGATGGAGTT 31309680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CCGCCACCTCGCCTGGCTAATTTATTTTTTATTTTTTTATTTTTTAGTAGAGATGGAGTT 1319

 31309681 TCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTATCTCGGC 31309740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTATCTCGGC 1379

 31309741 CTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGAGGTGAGCCACCGCGCCTGGCTGCATTGCTTTTCTTT 31309800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGAGGTGAGCCACCGCGCCTGGCTGCATTGCTTTTCTTT 1439

 31309801 ATTTCCTTTTTGGATTGCTTATTGCTGGTATATTGCAGCAAACTTAATATTTGTGTTGAT 31309860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 ATTTCCTTTTTGGATTGCTTATTGCTGGTATATTGCAGCAAACTTAATATTTGTGTTGAT 1499

 31309861 CTTGTACCCTGAAACTTTGCTGAATTTGTTTACTAGCTCTAGTAGCTTCCTTACAAATTC 31309920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CTTGTACCCTGAAACTTTGCTGAATTTGTTTACTAGCTCTAGTAGCTTCCTTACAAATTC 1559

 31309921 TGTGGAATTCTCTTTTTAAAAATTTTTTTTTCCTCTAGTTCATTGGTTTTTCTTTCTTCT 31309980
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TGTGGAATTCTCTTTTTAAAAATTTTTTTT-CCTCTAGTTCATTGGTTTTTCTTTCTTCT 1618

 31309981 TCTTATTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGATACATGTGTAGAATGTGCGGGTTTGTTA 31310040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TCTTATTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGATACATGTGTAGAATGTGCGGGTTTGTTA 1678

 31310041 CATAGCTATACACGTGCCATGGTGGTTTGCTGTACCCATCAACCCATCATCTACATTAGG 31310100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CATAGCTATACACGTGCCATGGTGGTTTGCTGTACCCATCAACCCATCATCTACATTAGG 1738

 31310101 TATTTCTCCTAATGTTATCCCTCCCCTAACCCCCAACGCCCCGGCAGGCCCTGGTATGTG 31310160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TATTTCTCCTAATGTTATCCCTCCCCTAACCCCCAACGCCCCGGCAGGCCCTGGTATGTG 1798

 31310161 ATGTTTCCCTCCCTATGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAAC 31310220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 ATGTTTCCCTCCCTATGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAAC 1858

 31310221 ATGCGTTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTT 31310280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 ATGCGTTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTT 1918

 31310281 CATCCATGCCCCTGTAAAGAACATGAACTCATCCTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAA 31310340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CATCCATGCCCCTGTAAAGAACATGAACTCATCCTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAA 1978

 31310341 TCATATCACCTGTGAATAGAGATATCATTACCACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTA 31310400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TCATATCACCTGTGAATAGAGATATCATTACCACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTA 2038

 31310401 TTTCTTTTACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTA 31310460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TTTCTTTTACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTA 2098

 31310461 GTGAAAGCGGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAG 31310520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 GTGAAAGCGGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAG 2158

 31310521 CATTGAGTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTG 31310580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CATTGAGTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTG 2218

 31310581 AGGAACAAGCTATTCATATTGGGAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGT 31310640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 AGGAACAAGCTATTCATATTGGGAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGT 2278

 31310641 TTAAAATGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAG 31310700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TTAAAATGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAG 2338

 31310701 ATTTCAATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTC 31310760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 ATTTCAATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTC 2398

 31310761 AATCAATTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTT 31310820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 AATCAATTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTT 2458

 31310821 CTCCATTATATAAGCAGGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGG 31310880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CTCCATTATATAAGCAGGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGG 2518

 31310881 TATTGTTAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGC 31310940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TATTGTTAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGC 2578

 31310941 AGTGATTTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGG 31311000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 AGTGATTTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGG 2638

 31311001 CGAGAAGATAATATGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGT 31311060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 CGAGAAGATAATATGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGT 2698

 31311061 ATCTTCTTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACGTGCT 31311120
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2699 ATCTTCTTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACATGCT 2758

 31311121 GTTTTCTCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATA 31311180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GTTTTCTCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATA 2818

 31311181 GGTAACTGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGA 31311240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GGTAACTGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGA 2878

 31311241 GTTGTTATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAAT 31311300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GTTGTTATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAAT 2938

 31311301 GCTCAACCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAG 31311360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GCTCAACCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAG 2998

 31311361 ATGATGGGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCT 31311420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 ATGATGGGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCT 3058

 31311421 GTTTATTTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGT 31311480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 GTTTATTTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGT 3118

 31311481 GAAGGTTAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGG 31311540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GAAGGTTAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGG 3178

 31311541 CAGCCATGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCT 31311600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CAGCCATGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCT 3238

 31311601 TAATTTGAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGATTT 31311660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3239 TAATTTGAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGGTTT 3298

 31311661 TTTTTATCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCT 31311720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TTTTTATCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCT 3358

 31311721 AAACTATTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACA 31311780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 AAACTATTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACA 3418

 31311781 ATTCTTGGCATGACATCAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATAT 31311840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 ATTCTTGGCATGACATCAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATAT 3478

 31311841 AAGCTTTATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAG 31311900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 AAGCTTTATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAG 3538

 31311901 TGCTTTGAATATATGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAAACTCATAAATA 31311960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3539 TGCTTTGAATATATGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAGACTCATAAATA 3598

 31311961 TGCTGATGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAAT 31312020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TGCTGATGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAAT 3658

 31312021 TATCTCTTTTGAAGCACCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCC 31312080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TATCTCTTTTGAAGCACCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCC 3718

 31312081 TCTTTCCTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGATCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCT 31312140
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TCTTTCCTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGCTCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCT 3778

 31312141 AGGCTTACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAG 31312200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 AGGCTTACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAG 3838

 31312201 CACCAGCAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCC 31312260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 CACCAGCAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCC 3898

 31312261 TCTGGCCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGAT 31312320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TCTGGCCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGAT 3958

 31312321 GCCCACTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAA 31312380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 GCCCACTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAA 4018

 31312381 GTGTAGATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCA 31312440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 GTGTAGATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCA 4078

 31312441 AAAGAGACAGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATA 31312500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 AAAGAGACAGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATA 4138

 31312501 GACAAAAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCC 31312560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 GACAAAAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCC 4198

 31312561 AAGAAGCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAA 31312620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AAGAAGCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAA 4258

 31312621 GCTTTGTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTC 31312680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 GCTTTGTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTC 4318

 31312681 CAATGTTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAAC 31312740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 CAATGTTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAAC 4378

 31312741 ACGTGTGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCC 31312800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 ACGTGTGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCC 4438

 31312801 CCACTCCTTATCCTTCTTGTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATAT 31312860
          |.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 CGACTCCTTATCCTTCTTCTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATAT 4498

 31312861 TTTATAATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATT 31312920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 TTTATAATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATT 4558

 31312921 CCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACT 31312980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 CCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACT 4618

 31312981 GTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTG 31313040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 GTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTG 4678

 31313041 AACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTA 31313100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 AACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTA 4738

 31313101 CTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATG 31313160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 CTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATG 4798

 31313161 GCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAG 31313220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 GCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAG 4858

 31313221 CCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTT 31313280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 CCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTT 4918

 31313281 TAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTG 31313340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 TAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTG 4978

 31313341 ATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGC 31313400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 ATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGC 5038

 31313401 CTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTT 31313460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 CTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTT 5098

 31313461 TCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATG 31313520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 TCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATG 5158

 31313521 CTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTT 31313580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 CTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTT 5218

 31313581 TTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACAC 31313640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 TTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACAC 5278

 31313641 AAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACA 31313700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 AAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACA 5338

 31313701 TGTGAGTATACACATACATACACACACACACACACACACACAAATGACAAGCTAGCTATG 31313760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||
     5339 TGTGAGTATACACATACATACACACACACACACACACACA--AATGACAAGCTAGCTATG 5396

 31313761 CATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGC 31313815
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 CATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGC 5451

EXCISED REGION

 31313816 TTTTTTTTTTTTTTAATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTC 31313875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5455 TTTTTTTTTTTTTTAATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTC 5514

 31313876 AGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAA 31313935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5515 AGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAA 5574

 31313936 ACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCA 31313995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5575 ACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCA 5634

 31313996 AAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGT 31314055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5635 AAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGT 5694

 31314056 CTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAA 31314115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5695 CTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAA 5754

 31314116 TTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCAC 31314175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5755 TTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCAC 5814

 31314176 TGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCC 31314235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5815 TGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCC 5874

 31314236 AAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGC 31314295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5875 AAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGC 5934

 31314296 AGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACA 31314355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5935 AGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACA 5994

 31314356 GTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGC 31314415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5995 GTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGC 6054

 31314416 CAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTATGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGT 31314475
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6055 CAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTACGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGT 6114

 31314476 GGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTG 31314535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6115 GGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTG 6174

 31314536 TTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTT 31314595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6175 TTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTT 6234

 31314596 CCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATAT 31314655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6235 CCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATAT 6294

 31314656 GAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAG 31314715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6295 GAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAG 6354

 31314716 GCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTG 31314775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6355 GCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTG 6414

 31314776 TCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCA 31314835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6415 TCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCA 6474

 31314836 CTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGA 31314895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6475 CTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGA 6534

 31314896 ATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTC 31314955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6535 ATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTC 6594

 31314956 CCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGC 31315015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6595 CCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGC 6654

 31315016 ACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCAT 31315075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6655 ACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCAT 6714

 31315076 AGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACAT 31315135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6715 AGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACAT 6774

 31315136 AATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATT 31315195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6775 AATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATT 6834

 31315196 AATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAA 31315255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6835 AATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAA 6894

 31315256 AAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGAT 31315315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6895 AAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGAT 6954

 31315316 GATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGC 31315375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6955 GATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGC 7014

 31315376 TAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACG 31315435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7015 TAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACG 7074

 31315436 TGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATT 31315495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7075 TGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATT 7134

 31315496 TGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTACGGTGGCTCACGCCTG 31315542
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7135 TGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTACGGTGGCTCACGCCTG 7181

Alignment time is 9.87109 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    2466] =>      2466 nucs 'mol-32-3004-006690_2466'

Score:        2397
Aligned:      2463        nucs
Identic:      2457 (100%) nucs =>      1672 (100%)       785 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31313855,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319743]
 second seq =>  [       1,    1673] EXCISED REGION [    1674,    2463]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31313855 GATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCA 31313914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCA 60

 31313915 ATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGG 31313974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGG 120

 31313975 AGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAAC 31314034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAAC 180

 31314035 TTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCT 31314094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCT 240

 31314095 TCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTT 31314154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTT 300

 31314155 CCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTT 31314214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTT 360

 31314215 TCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACT 31314274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACT 420

 31314275 TACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTT 31314334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTT 480

 31314335 GTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGAC 31314394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGAC 540

 31314395 AGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTATGTGCTGGTCCCTG 31314454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      541 AGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTACGTGCTGGTCCCTG 600

 31314455 AAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTG 31314514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTG 660

 31314515 AAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGC 31314574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGC 720

 31314575 TCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGC 31314634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGC 780

 31314635 TCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTT 31314694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTT 840

 31314695 TTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAA 31314754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAA 900

 31314755 CTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAA 31314814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAA 960

 31314815 GGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAA 31314874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAA 1020

 31314875 GGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTC 31314934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTC 1080

 31314935 ACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGG 31314994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGG 1140

 31314995 GCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCA 31315054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCA 1200

 31315055 CGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACAT 31315114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACAT 1260

 31315115 TTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAA 31315174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAA 1320

 31315175 TTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTA 31315234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTA 1380

 31315235 TAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTC 31315294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTC 1440

 31315295 GCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCA 31315354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCA 1500

 31315355 CCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGA 31315414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGA 1560

 31315415 GAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTC 31315474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTC 1620

 31315475 CATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 31315527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 1673

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1674 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 1733

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 1793

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 1853

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1854 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 1913

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1914 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 1973

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 2033

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 2093

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2094 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 2153

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 2213

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 31319553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 2273

 31319554 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 31319613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 2333

 31319614 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 31319673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 2393

 31319674 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 31319733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 2453

 31319734 CAGGTGGATC 31319743
          ||||||||||
     2454 CAGGTGGATC 2463

Alignment time is 3.88687 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    3199] =>      3199 nucs 'mol-32-316f-149563_3199'

Score:        3105
Aligned:      3205        nucs
Identic:      3191 (100%) nucs =>      2581 (100%)       610 ( 99%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31312940,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319568]
 second seq =>  [       1,    2584] EXCISED REGION [    2585,    3199]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31312940 TGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGC 31312999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGC 60

 31313000 ACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATT 31313059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATT 120

 31313060 TTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTG 31313119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTG 180

 31313120 GAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTA 31313179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTA 240

 31313180 CAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGAT 31313239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGAT 300

 31313240 TACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTG 31313299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTG 360

 31313300 CCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTC 31313359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTC 420

 31313360 CCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAA 31313419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAA 480

 31313420 GTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTT 31313479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTT 540

 31313480 CTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGC 31313539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGC 600

 31313540 TTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAA 31313599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAA 660

 31313600 ACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATG 31313659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATG 720

 31313660 ACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACAT 31313719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACAT 780

 31313720 ACACACACACACACACACACACAAATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAA 31313779
          |||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACACACACACACACACA------AATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAA 834

 31313780 TTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTT--AATGCTTA 31313837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||
      835 TTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTAATGCTTA 894

 31313838 GCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAA 31313897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 GCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAA 954

 31313898 AGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACAT 31313957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 AGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACAT 1014

 31313958 TTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCT 31314017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 TTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCT 1074

 31314018 AGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAA 31314077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 AGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAA 1134

 31314078 AGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTC 31314137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 AGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTC 1194

 31314138 TCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGA 31314197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 TCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGA 1254

 31314198 AAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCC 31314257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 AAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCC 1314

 31314258 TTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAAT 31314317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 TTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAAT 1374

 31314318 CCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATT 31314377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 CCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATT 1434

 31314378 TCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGT 31314437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 TCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGT 1494

 31314438 TTATGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCA 31314497
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 TTACGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCA 1554

 31314498 GACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATC 31314557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 GACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATC 1614

 31314558 TAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCT 31314617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 TAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCT 1674

 31314618 GTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAA 31314677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 GTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAA 1734

 31314678 AAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAA 31314737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 AAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAA 1794

 31314738 CTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATC 31314797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 CTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATC 1854

 31314798 TGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTC 31314857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 TGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTC 1914

 31314858 TGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACT 31314917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 TGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACT 1974

 31314918 CTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCC 31314977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 CTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCC 2034

 31314978 CACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGA 31315037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 CACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGA 2094

 31315038 ACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGG 31315097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 ACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGG 2154

 31315098 TTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAA 31315157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAA 2214

 31315158 TTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAA 31315217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 TTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAA 2274

 31315218 ATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTAT 31315277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 ATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTAT 2334

 31315278 TTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACT 31315337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 TTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACT 2394

 31315338 TTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGG 31315397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 TTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGG 2454

 31315398 GAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTG 31315457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 GAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTG 2514

 31315458 AGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCA 31315517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 AGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCA 2574

 31315518 GCCCGGGTAC 31315527
          ||||||||||
     2575 GCCCGGGTAC 2584

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2585 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 2644

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 2704

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 2764

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2765 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 2824

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2825 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 2884

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 2944

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 3004

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3005 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 3064

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 3124

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 31319553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 3184

 31319554 CTGTGAGGAATTGGA 31319568
          |||||||||||||||
     3185 CTGTGAGGAATTGGA 3199

Alignment time is 4.93911 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5623] =>      5623 nucs 'mol-32-3185-010691_5623'

Score:        5445
Aligned:      5629        nucs
Identic:      5609 (100%) nucs =>      4376 (100%)      1233 ( 99%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31311143,31315527] EXCISED REGION [31318954,31320196]
 second seq =>  [       1,    4384] EXCISED REGION [    4385,    5623]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31311143 GCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAA 31311202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAA 60

 31311203 ACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGG 31311262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGG 120

 31311263 TAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGT 31311322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGT 180

 31311323 GGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGAT 31311382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGAT 240

 31311383 TTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGT 31311442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGT 300

 31311443 GTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGT 31311502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGT 360

 31311503 CAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCC 31311562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCC 420

 31311563 TTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTC 31311622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTC 480

 31311623 TGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGATTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAG 31311682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      481 TGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGGTTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAG 540

 31311683 GTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGCT 31311742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGCT 600

 31311743 CTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAATG 31311802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAATG 660

 31311803 TTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTT 31311862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTT 720

 31311863 TGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTA 31311922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTA 780

 31311923 CTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAAACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAA 31311982
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAGACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAA 840

 31311983 CAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCATA 31312042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCATA 900

 31312043 TAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTT 31312102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTT 960

 31312103 CCAGCAGATCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTA 31312162
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCAGCAGCTCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTA 1020

 31312163 AAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTC 31312222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTC 1080

 31312223 CAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAG 31312282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAG 1140

 31312283 GCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGACC 31312342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGACC 1200

 31312343 AAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGTA 31312402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGTA 1260

 31312403 GATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCAT 31312462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCAT 1320

 31312463 TCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTCT 31312522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTCT 1380

 31312523 TTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACATC 31312582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACATC 1440

 31312583 AAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGT 31312642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGT 1500

 31312643 GCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAG 31312702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAG 1560

 31312703 ACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGTG 31312762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGTG 1620

 31312763 CCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCCACTCCTTATCCTTCTTGTCT 31312822
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||
     1621 CCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCGACTCCTTATCCTTCTTCTCT 1680

 31312823 GCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTCT 31312882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTCT 1740

 31312883 ATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGT 31312942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGT 1800

 31312943 CTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACT 31313002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACT 1860

 31313003 CAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTT 31313062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTT 1920

 31313063 TTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAG 31313122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAG 1980

 31313123 ACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAA 31313182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAA 2040

 31313183 GCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTAC 31313242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTAC 2100

 31313243 AGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCA 31313302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCA 2160

 31313303 TGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCA 31313362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCA 2220

 31313363 AAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTT 31313422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTT 2280

 31313423 TAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTC 31313482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTC 2340

 31313483 TTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTT 31313542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTT 2400

 31313543 TACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACA 31313602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACA 2460

 31313603 TAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACA 31313662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACA 2520

 31313663 AGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACA 31313722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACA 2580

 31313723 CACACACACACACACACACAAATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTC 31313782
          ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CACACACACACACACACA--AATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTC 2638

 31313783 TCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTT-AATGCTTAGCTG 31313841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     2639 TCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTAATGCTTAGCTG 2698

 31313842 TTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAA 31313901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAA 2758

 31313902 GAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTA 31313961
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 GAAATAGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTA 2818

 31313962 AAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCA 31314021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCA 2878

 31314022 ACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGG 31314081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 ACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGG 2938

 31314082 TTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCC 31314141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCC 2998

 31314142 ACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAG 31314201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 ACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAG 3058

 31314202 TTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTA 31314261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 TTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTA 3118

 31314262 GGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTA 31314321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTA 3178

 31314322 ATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAA 31314381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 ATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAA 3238

 31314382 AGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTAT 31314441
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3239 AGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTAC 3298

 31314442 GTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACC 31314501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 GTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACC 3358

 31314502 TTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGG 31314561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGG 3418

 31314562 AGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTA 31314621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTA 3478

 31314622 TTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGA 31314681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGA 3538

 31314682 TACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTC 31314741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 TACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTC 3598

 31314742 AAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTC 31314801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 AAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTC 3658

 31314802 CTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGAT 31314861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 CTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGAT 3718

 31314862 CGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGG 31314921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 CGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGG 3778

 31314922 CTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACC 31314981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 CTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACC 3838

 31314982 CAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTG 31315041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 CAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTG 3898

 31315042 GAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGT 31315101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 GAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGT 3958

 31315102 CAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTG 31315161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 CAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTG 4018

 31315162 AGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAA 31315221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 AGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAA 4078

 31315222 GACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTT 31315281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 GACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTT 4138

 31315282 AGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTT 31315341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 AGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTT 4198

 31315342 ATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGC 31315401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 ATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGC 4258

 31315402 AAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGC 31315461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 AAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGC 4318

 31315462 AGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCC 31315521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 AGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCC 4378

 31315522 GGGTAC 31315527
          ||||||
     4379 GGGTAC 4384

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4385 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 4444

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 4504

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 4564

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4565 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 4624

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4625 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 4684

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4685 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 4744

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 4804

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4805 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 4864

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4865 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 4924

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 31319553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4925 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 4984

 31319554 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 31319613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4985 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 5044

 31319614 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 31319673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5045 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 5104

 31319674 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 31319733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5105 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 5164

 31319734 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 31319793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5165 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 5224

 31319794 CCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGCCCACCTCAAATCCCAGCT 31319853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5225 CCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGCCCACCTCAAATCCCAGCT 5284

 31319854 ACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGACTCGCTTGAATCTGAGTGAGAGATCATGGTGAAATGA 31319913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5285 ACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGACTCGCTTGAATCTGAGTGAGAGATCATGGTGAAATGA 5344

 31319914 GATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGTAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAA 31319973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5345 GATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGTAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAA 5404

 31319974 AAAAAAAAAAAGAACCACAACCACAAAACAGAATTTTAGACCAATATCCTTGATGAACAT 31320033
          ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5405 AAAAAAAA----AACCACAACCACAAAACAGAATTTTAGACCAATATCCTTGATGAACAT 5460

 31320034 TGATACAGAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACCGAATCCAGCAGCACATTAAAAAGCT 31320093
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TGATACAAAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACCGAATCCAGCAGCACATTAAAAAGCT 5520

 31320094 TGATCCATCATGATCAAGTGGGCATCATCCCTGGGATGCAAGGCTGGTTCAATATATGCA 31320153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TGATCCATCATGATCAAGTGGGCATCATCCCTGGGATGCAAGGCTGGTTCAATATATGCA 5580

 31320154 AATCAATAAATGTAATCCAGCATATAAACAGAACCAAAGACAA 31320196
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AATCAATAAATGTAATCCAGCATATAAACAGAACCAAAGACAA 5623

Alignment time is 8.03124 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6029] =>      6029 nucs 'mol-32-3306-220935_6029'

Score:        5862
Aligned:      6031        nucs
Identic:      6014 (100%) nucs =>      5163 (100%)       851 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31310355,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319809]
 second seq =>  [       1,    5173] EXCISED REGION [    5174,    6029]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31310355 AATAGAGATATCATTACCACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTT 31310414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATAGAGATATCATTACCACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTT 60

 31310415 CTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCAT 31310474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCAT 120

 31310475 TCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTC 31310534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTC 180

 31310535 CATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATT 31310594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATT 240

 31310595 CATATTGGGAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAAC 31310654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATATTGGGAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAAC 300

 31310655 AGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGA 31310714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGA 360

 31310715 CTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTT 31310774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTT 420

 31310775 TACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAG 31310834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAG 480

 31310835 CAGGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAG 31310894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAG 540

 31310895 GGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTG 31310954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTG 600

 31310955 GCTGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATAT 31311014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATAT 660

 31311015 GAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTC 31311074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTC 720

 31311075 TCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACGTGCTGTTTTCTCTCACAA 31311134
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      721 TCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACATGCTGTTTTCTCTCACAA 780

 31311135 AATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAG 31311194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAG 840

 31311195 TCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATT 31311254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATT 900

 31311255 GGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGT 31311314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGT 960

 31311315 GTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTC 31311374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTC 1020

 31311375 TTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGT 31311434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGT 1080

 31311435 GGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAA 31311494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAA 1140

 31311495 TGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACAT 31311554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACAT 1200

 31311555 TGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTT 31311614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTT 1260

 31311615 TGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGATTTTTTTTATCCCTCAC 31311674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1261 TGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGGTTTTTTTTATCCCTCAC 1320

 31311675 TTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAA 31311734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAA 1380

 31311735 TATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGAC 31311794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGAC 1440

 31311795 ATCAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGG 31311854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGG 1500

 31311855 CGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATAT 31311914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATAT 1560

 31311915 GTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAAACTCATAAATATGCTGATGGAAAAG 31311974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1561 GTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAGACTCATAAATATGCTGATGGAAAAG 1620

 31311975 TTATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAG 31312034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAG 1680

 31312035 CACCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGC 31312094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CACCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGC 1740

 31312095 CTCACTTTCCAGCAGATCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTG 31312154
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTCACTTTCCAGCAGCTCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTG 1800

 31312155 CAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTT 31312214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTT 1860

 31312215 CAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAAT 31312274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAAT 1920

 31312275 TGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCA 31312334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCA 1980

 31312335 TGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTA 31312394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTA 2040

 31312395 GACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATA 31312454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATA 2100

 31312455 CACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACA 31312514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACA 2160

 31312515 AAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGA 31312574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGA 2220

 31312575 AATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACC 31312634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACC 2280

 31312635 CCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCA 31312694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCA 2340

 31312695 GTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAA 31312754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAA 2400

 31312755 CCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCCACTCCTTATCCT 31312814
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2401 CCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCGACTCCTTATCCT 2460

 31312815 TCTTGTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTT 31312874
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTTCTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTT 2520

 31312875 ATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGA 31312934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGA 2580

 31312935 ATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATA 31312994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATA 2640

 31312995 GTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTT 31313054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTT 2700

 31313055 GTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATT 31313114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATT 2760

 31313115 TTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCT 31313174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCT 2820

 31313175 CATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCT 31313234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCT 2880

 31313235 GGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGA 31313294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGA 2940

 31313295 TTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCA 31313354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCA 3000

 31313355 GCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATT 31313414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATT 3060

 31313415 TTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATT 31313474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATT 3120

 31313475 TTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAAT 31313534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAAT 3180

 31313535 GTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGA 31313594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGA 3240

 31313595 TTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACAC 31313654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACAC 3300

 31313655 TAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACA 31313714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACA 3360

 31313715 TACATACACACACACACACACACACACAAATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTAT 31313774
          ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TACATACACACACACACACACACACA--AATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTAT 3418

 31313775 AGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTT--AAT 31313832
          |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||  |||
     3419 AGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGCGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTAAT 3478

 31313833 GCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAA 31313892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 GCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAA 3538

 31313893 CCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTG 31313952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 CCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTG 3598

 31313953 AACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTG 31314012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 AACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTG 3658

 31314013 AGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAA 31314072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 AGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAA 3718

 31314073 AAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTC 31314132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 AAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTC 3778

 31314133 CACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAA 31314192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 CACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAA 3838

 31314193 TAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTG 31314252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 TAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTG 3898

 31314253 CTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCT 31314312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 CTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCT 3958

 31314313 ATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATT 31314372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 ATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATT 4018

 31314373 ATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGG 31314432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 ATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGG 4078

 31314433 TATGTTTATGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAG 31314492
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 TATGTTTACGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAG 4138

 31314493 GATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGT 31314552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 GATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGT 4198

 31314553 AGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGC 31314612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGC 4258

 31314613 TGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTAT 31314672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTAT 4318

 31314673 GTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACA 31314732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 GTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACA 4378

 31314733 AACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTAC 31314792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 AACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTAC 4438

 31314793 ATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATC 31314852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 ATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATC 4498

 31314853 ATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTT 31314912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 ATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTT 4558

 31314913 CAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACAT 31314972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 CAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACAT 4618

 31314973 GGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGG 31315032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 GGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGG 4678

 31315033 GGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGT 31315092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 GGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGT 4738

 31315093 GGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACT 31315152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 GGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACT 4798

 31315153 ATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTA 31315212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 ATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTA 4858

 31315213 AGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGA 31315272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 AGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGA 4918

 31315273 ATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGAC 31315332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 ATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGAC 4978

 31315333 AAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTT 31315392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 AAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTT 5038

 31315393 TTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGA 31315452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 TTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGA 5098

 31315453 ATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACA 31315512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 ATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACA 5158

 31315513 CTGCAGCCCGGGTAC 31315527
          |||||||||||||||
     5159 CTGCAGCCCGGGTAC 5173

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5174 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 5233

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 5293

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 5353

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5354 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 5413

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5414 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 5473

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5474 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 5533

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5534 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 5593

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5594 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 5653

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5654 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 5713

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 31319553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5714 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 5773

 31319554 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 31319613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5774 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 5833

 31319614 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 31319673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5834 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 5893

 31319674 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 31319733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5894 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 5953

 31319734 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 31319793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5954 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 6013

 31319794 CCTCTACTAAAAATAC 31319809
          ||||||||||||||||
     6014 CCTCTACTAAAAATAC 6029

Alignment time is 8.37776 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    5869] =>      5869 nucs 'mol-32-33a0-182136_5869'

Score:        5678
Aligned:      5871        nucs
Identic:      5851 (100%) nucs =>      4998 (100%)       853 ( 99%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31310518,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319811]
 second seq =>  [       1,    5011] EXCISED REGION [    5012,    5869]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31310518 TAGCATTGAGTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGA 31310577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGCATTGAGTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGA 60

 31310578 CTGAGGAACAAGCTATTCATATTGGGAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATG 31310637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGAGGAACAAGCTATTCATATTGGGAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATG 120

 31310638 AGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATT 31310697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATT 180

 31310698 TAGATTTCAATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAAT 31310757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGATTTCAATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAAT 240

 31310758 TTCAATCAATTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGC 31310817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCAATCAATTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGC 300

 31310818 TTTCTCCATTATATAAGCAGGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGG 31310877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCTCCATTATATAAGCAGGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGG 360

 31310878 TGGTATTGTTAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTC 31310937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGTATTGTTAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTC 420

 31310938 TGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAA 31310997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAA 480

 31310998 AGGCGAGAAGATAATATGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGAT 31311057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGCGAGAAGATAATATGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGAT 540

 31311058 TGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACGT 31311117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      541 TGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACAT 600

 31311118 GCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTT 31311177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTT 660

 31311178 ATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTC 31311237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTC 720

 31311238 AGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTA 31311297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTA 780

 31311298 AATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCC 31311357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCC 840

 31311358 CAGATGATGGGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAA 31311417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGATGATGGGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAA 900

 31311418 TCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTT 31311477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTT 960

 31311478 GGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTG 31311537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTG 1020

 31311538 TGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGAT 31311597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGAT 1080

 31311598 TCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGA 31311657
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1081 TCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGG 1140

 31311658 TTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTT 31311717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTT 1200

 31311718 TCTAAACTATTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTC 31311777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTAAACTATTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTC 1260

 31311778 ACAATTCTTGGCATGACATCAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAA 31311837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACAATTCTTGGCATGACATCAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAA 1320

 31311838 TATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAA 31311897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAA 1380

 31311898 CAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAAACTCATAA 31311957
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1381 CAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAGACTCATAA 1440

 31311958 ATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAA 31312017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAA 1500

 31312018 AATTATCTCTTTTGAAGCACCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCT 31312077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATTATCTCTTTTGAAGCACCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCT 1560

 31312078 GCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGATCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTAC 31312137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGCTCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTAC 1620

 31312138 CCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAG 31312197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAG 1680

 31312198 CAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAA 31312257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAA 1740

 31312258 TCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCT 31312317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCT 1800

 31312318 GATGCCCACTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATT 31312377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GATGCCCACTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATT 1860

 31312378 AAAGTGTAGATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAG 31312437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAGTGTAGATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAG 1920

 31312438 GCAAAAGAGACAGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAA 31312497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCAAAAGAGACAGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAA 1980

 31312498 ATAGACAAAAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATT 31312557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATAGACAAAAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATT 2040

 31312558 TCCAAGAAGCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTT 31312617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCCAAGAAGCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTT 2100

 31312618 AAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGT 31312677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGT 2160

 31312678 TTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCA 31312737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCA 2220

 31312738 AACACGTGTGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCA 31312797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AACACGTGTGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCA 2280

 31312798 CCCCCACTCCTTATCCTTCTTGTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATA 31312857
          ||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCCCGACTCCTTATCCTTCTTCTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATA 2340

 31312858 TATTTTATAATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAA 31312917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TATTTTATAATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAA 2400

 31312918 ATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACA 31312977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACA 2460

 31312978 ACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAG 31313037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAG 2520

 31313038 TTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATT 31313097
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTGAACTTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATT 2580

 31313098 TTACTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTG 31313157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTACTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTG 2640

 31313158 ATGGCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCT 31313217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGGCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCT 2700

 31313218 CAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTAT 31313277
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2701 CAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCAGCTAATTTTTGTAT 2760

 31313278 TTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAG 31313337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAG 2820

 31313338 GTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCT 31313397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCT 2880

 31313398 GGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCT 31313457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCT 2940

 31313458 TTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCT 31313517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCT 3000

 31313518 ATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATT 31313577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATT 3060

 31313578 GTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACA 31313637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACA 3120

 31313638 CACAAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGC 31313697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CACAAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGC 3180

 31313698 ACATGTGAGTATACACATACATACACACACACACACACACACACAAATGACAAGCTAGCT 31313757
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||
     3181 ACATGTGAGTATACACATACATACACACACACACACACACACA--AATGACAAGCTAGCT 3238

 31313758 ATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTT 31313817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 ATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTT 3298

 31313818 TTTTTTTTTTTT---AATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGT 31313874
          ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TTTTTTTTTTTTTTTAATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGT 3358

 31313875 CAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCA 31313934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 CAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCA 3418

 31313935 AACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTC 31313994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTC 3478

 31313995 AAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTG 31314054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 AAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTG 3538

 31314055 TCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTA 31314114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 TCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTA 3598

 31314115 ATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCA 31314174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 ATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCA 3658

 31314175 CTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGC 31314234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 CTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGC 3718

 31314235 CAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTG 31314294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 CAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTG 3778

 31314295 CAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGAC 31314354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 CAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGAC 3838

 31314355 AGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAG 31314414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 AGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAG 3898

 31314415 CCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTATGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTG 31314474
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 CCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTACGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTG 3958

 31314475 TGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTT 31314534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTT 4018

 31314535 GTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTT 31314594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 GTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTT 4078

 31314595 TCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATA 31314654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 TCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATA 4138

 31314655 TGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTA 31314714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 TGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTA 4198

 31314715 GGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTT 31314774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 GGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTT 4258

 31314775 GTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCC 31314834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 GTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCC 4318

 31314835 ACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAG 31314894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 ACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAG 4378

 31314895 AATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATT 31314954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 AATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATT 4438

 31314955 CCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTG 31315014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 CCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTG 4498

 31315015 CACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCA 31315074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 CACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCA 4558

 31315075 TAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACA 31315134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 TAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACA 4618

 31315135 TAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTAT 31315194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 TAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTAT 4678

 31315195 TAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAA 31315254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 TAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAA 4738

 31315255 AAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGA 31315314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 AAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGA 4798

 31315315 TGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAG 31315374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 TGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAG 4858

 31315375 CTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTAC 31315434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 CTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTAC 4918

 31315435 GTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGAT 31315494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4919 GTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCCCCATAACACAGAGGATAGGAT 4978

 31315495 TTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 31315527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 TTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 5011

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5012 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 5071

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5072 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 5131

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5132 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 5191

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5192 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 5251

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5252 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 5311

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5312 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 5371

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5372 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 5431

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5432 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 5491

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5492 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 5551

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 31319553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5552 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 5611

 31319554 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 31319613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5612 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 5671

 31319614 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 31319673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5672 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 5731

 31319674 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 31319733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5732 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 5791

 31319734 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 31319793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5792 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 5851

 31319794 CCTCTACTAAAAATACAA 31319811
          ||||||||||||||||||
     5852 CCTCTACTAAAAATACAA 5869

Alignment time is 8.32854 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6848] =>      6848 nucs 'mol-32-33b6-001332_6848'

Score:        6684
Aligned:      6851        nucs
Identic:      6835 (100%) nucs =>      6011 (100%)       824 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31309507,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319782]
 second seq =>  [       1,    6019] EXCISED REGION [    6020,    6848]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31309507 TCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCA 31309566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCA 60

 31309567 GAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAATAACTGGGATTACAGGCACCCGCCA 31309626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAATAACTGGGATTACAGGCACCCGCCA 120

 31309627 CCTCGCCTGGCTAATTTATTTTTTATTTTTTTATTTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCA 31309686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTCGCCTGGCTAATTTATTTTTTATTTTTTTATTTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCA 180

 31309687 TGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTATCTCGGCCTCCCA 31309746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTATCTCGGCCTCCCA 240

 31309747 AAGTGCTGAGATTACAGAGGTGAGCCACCGCGCCTGGCTGCATTGCTTTTCTTTATTTCC 31309806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGTGCTGAGATTACAGAGGTGAGCCACCGCGCCTGGCTGCATTGCTTTTCTTTATTTCC 300

 31309807 TTTTTGGATTGCTTATTGCTGGTATATTGCAGCAAACTTAATATTTGTGTTGATCTTGTA 31309866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTGGATTGCTTATTGCTGGTATATTGCAGCAAACTTAATATTTGTGTTGATCTTGTA 360

 31309867 CCCTGAAACTTTGCTGAATTTGTTTACTAGCTCTAGTAGCTTCCTTACAAATTCTGTGGA 31309926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCTGAAACTTTGCTGAATTTGTTTACTAGCTCTAGTAGCTTCCTTACAAATTCTGTGGA 420

 31309927 ATTCTCTTTTTAAAAATTTTTTTTTCCTCTAGTTCATTGGTTTTTCTTTCTTCTTCTTAT 31309986
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTCTCTTTTTAAAAATTTTTTTT-CCTCTAGTTCATTGGTTTTTCTTTCTTCTTCTTAT 479

 31309987 TTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGATACATGTGTAGAATGTGCGGGTTTGTTACATAGC 31310046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGATACATGTGTAGAATGTGCGGGTTTGTTACATAGC 539

 31310047 TATACACGTGCCATGGTGGTTTGCTGTACCCATCAACCCATCATCTACATTAGGTATTTC 31310106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TATACACGTGCCATGGTGGTTTGCTGTACCCATCAACCCATCATCTACATTAGGTATTTC 599

 31310107 TCCTAATGTTATCCCTCCCCTAACCCCCAACGCCCCGGCAGGCCCTGGTATGTGATGTTT 31310166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 TCCTAATGTTATCCCTCCCCTAACCCCCAACGCCCCGGCAGGCCCTGGTATGTGATGTTT 659

 31310167 CCCTCCCTATGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGT 31310226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CCCTCCCTATGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGT 719

 31310227 TGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCA 31310286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCA 779

 31310287 TGCCCCTGTAAAGAACATGAACTCATCCTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAATCATAT 31310346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TGCCCCTGTAAAGAACATGAACTCATCCTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAATCATAT 839

 31310347 CACCTGTGAATAGAGATATCATTACCACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTT 31310406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CACCTGTGAATAGAGATATCATTACCACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTT 899

 31310407 TTACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAA 31310466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TTACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAA 959

 31310467 GCGGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGA 31310526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GCGGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGA 1019

 31310527 GTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAAC 31310586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAAC 1079

 31310587 AAGCTATTCATATTGGGAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAA 31310646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AAGCTATTCATATTGGGAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAA 1139

 31310647 TGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCA 31310706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCA 1199

 31310707 ATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAA 31310766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAA 1259

 31310767 TTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCAT 31310826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCAT 1319

 31310827 TATATAAGCAGGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGT 31310886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TATATAAGCAGGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGT 1379

 31310887 TAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGAT 31310946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGAT 1439

 31310947 TTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAA 31311006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAA 1499

 31311007 GATAATATGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTC 31311066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GATAATATGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTC 1559

 31311067 TTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACGTGCTGTTTTC 31311126
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1560 TTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACATGCTGTTTTC 1619

 31311127 TCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAAC 31311186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAAC 1679

 31311187 TGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTT 31311246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTT 1739

 31311247 ATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAA 31311306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAA 1799

 31311307 CCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATG 31311366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATG 1859

 31311367 GGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTAT 31311426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTAT 1919

 31311427 TTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGT 31311486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGT 1979

 31311487 TAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCA 31311546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCA 2039

 31311547 TGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTT 31311606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTT 2099

 31311607 GAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGATTTTTTTTA 31311666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2100 GAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGGTTTTTTTTA 2159

 31311667 TCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTA 31311726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTA 2219

 31311727 TTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTT 31311786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTT 2279

 31311787 GGCATGACATCAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTT 31311846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GGCATGACATCAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTT 2339

 31311847 TATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTT 31311906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTT 2399

 31311907 GAATATATGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAAACTCATAAATATGCTGA 31311966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2400 GAATATATGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAGACTCATAAATATGCTGA 2459

 31311967 TGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTC 31312026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTC 2519

 31312027 TTTTGAAGCACCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTC 31312086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TTTTGAAGCACCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTC 2579

 31312087 CTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGATCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTT 31312146
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGCTCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTT 2639

 31312147 ACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAG 31312206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 ACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAG 2699

 31312207 CAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGC 31312266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGC 2759

 31312267 CAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCAC 31312326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCAC 2819

 31312327 TGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAG 31312386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAG 2879

 31312387 ATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAG 31312446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 ATATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAG 2939

 31312447 ACAGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAA 31312506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 ACAGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAA 2999

 31312507 AACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAG 31312566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 AACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAG 3059

 31312567 CTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTG 31312626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CTGATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTG 3119

 31312627 TTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGT 31312686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGT 3179

 31312687 TAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGT 31312746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGT 3239

 31312747 GTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCCACTC 31312806
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3240 GTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCGACTC 3299

 31312807 CTTATCCTTCTTGTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATA 31312866
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 CTTATCCTTCTTCTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATA 3359

 31312867 ATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGA 31312926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 ATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGA 3419

 31312927 GGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCT 31312986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 GGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCT 3479

 31312987 AGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTT 31313046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 AGCATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTT 3539

 31313047 GGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTA 31313106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 GGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTA 3599

 31313107 TTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGA 31313166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGA 3659

 31313167 TCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTT 31313226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 TCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTT 3719

 31313227 GAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAG 31313286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 GAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAG 3779

 31313287 AGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGC 31313346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 AGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGC 3839

 31313347 TTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGC 31313406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGC 3899

 31313407 CTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGA 31313466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 CTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGA 3959

 31313467 TTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTC 31313526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 TTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTC 4019

 31313527 AAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCT 31313586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 AAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCT 4079

 31313587 GAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGT 31313646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 GAACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGT 4139

 31313647 ACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAG 31313706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 ACATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAG 4199

 31313707 TATACACATACATACACACACACACACACACACACAAATGACAAGCTAGCTATGCATTGT 31313766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
     4200 TATACACATACATACACACACACACACACACACA--AATGACAAGCTAGCTATGCATTGT 4257

 31313767 AGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTT 31313826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 AGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTT 4317

 31313827 TTT-AATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTAC 31313885
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 TTTTAATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTAC 4377

 31313886 TAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAAT 31313945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 TAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAAT 4437

 31313946 CAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCA 31314005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 CAAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCA 4497

 31314006 GTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGC 31314065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 GTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGC 4557

 31314066 AGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGAT 31314125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 AGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGAT 4617

 31314126 GTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAA 31314185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 GTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAA 4677

 31314186 TTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAAT 31314245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 TTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAAT 4737

 31314246 TACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTT 31314305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 TACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTT 4797

 31314306 TCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAG 31314365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 TCCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAG 4857

 31314366 TTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAAT 31314425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 TTATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAAT 4917

 31314426 GTCTGGGTATGTTTATGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCA 31314485
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 GTCTGGGTATGTTTACGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCA 4977

 31314486 GATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAG 31314545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 GATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAG 5037

 31314546 CCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCG 31314605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 CCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCG 5097

 31314606 TGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCC 31314665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 TGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCC 5157

 31314666 TTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGC 31314725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 TTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGC 5217

 31314726 AATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTC 31314785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 AATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTC 5277

 31314786 ACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGC 31314845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 ACTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGC 5337

 31314846 CACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACT 31314905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 CACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACT 5397

 31314906 GATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTG 31314965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 GATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTG 5457

 31314966 GTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAG 31315025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 GTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAG 5517

 31315026 AAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCT 31315085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 AAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCT 5577

 31315086 GCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAA 31315145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 GCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAA 5637

 31315146 AGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTA 31315205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 AGTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTA 5697

 31315206 ATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAA 31315265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 ATAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAA 5757

 31315266 TACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATA 31315325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 TACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATA 5817

 31315326 AAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGG 31315385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 AAAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGG 5877

 31315386 ATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGAT 31315445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 ATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGAT 5937

 31315446 GGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTA 31315505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 GGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTA 5997

 31315506 AGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 31315527
          ||||||||||||||||||||||
     5998 AGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 6019

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6020 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 6079

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6080 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 6139

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6140 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 6199

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6200 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 6259

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6260 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 6319

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6320 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 6379

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6380 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 6439

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6440 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 6499

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6500 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 6559

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 31319553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6560 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 6619

 31319554 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 31319613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6620 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 6679

 31319614 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 31319673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6680 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 6739

 31319674 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 31319733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6740 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 6799

 31319734 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATG 31319782
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6800 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATG 6848

Alignment time is 9.56757 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    8322] =>      8322 nucs 'mol-32-340e-156040_8322'

Score:        8084
Aligned:      8319        nucs
Identic:      8296 (100%) nucs =>      7025 (100%)      1271 ( 99%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31308489,31315527] EXCISED REGION [31318954,31320231]
 second seq =>  [       1,    7037] EXCISED REGION [    7038,    8314]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31308489 CCCTGGTAACCTCTACTCTATTTCCTGTCTCTTTGAATTTGCCTGTTCTAGGTACATCAT 31308548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCTGGTAACCTCTACTCTATTTCCTGTCTCTTTGAATTTGCCTGTTCTAGGTACATCAT 60

 31308549 ATAAGTATAATTTTACAATATTTATCCTGTGTCTGGCTTCTTGTACTATGCATGTTTTCA 31308608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAAGTATAATTTTACAATATTTATCCTGTGTCTGGCTTCTTGTACTATGCATGTTTTCA 120

 31308609 AGGACCATCCATGTTGTAGCATATATCAAAATTTCATTCATGTTTATGGCAGAATAATAT 31308668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGACCATCCATGTTGTAGCATATATCAAAATTTCATTCATGTTTATGGCAGAATAATAT 180

 31308669 ACTATCATGCGCATATTCCCTTTATGTGTTGGTGGGCATTTGAATTGTTTCCACATTTTG 31308728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTATCATGCGCATATTCCCTTTATGTGTTGGTGGGCATTTGAATTGTTTCCACATTTTG 240

 31308729 CCCATTGTGAATAATGCTATGAACATCAGTGCACAAATGTGTTTGAGTCCCTGCTTTTAA 31308788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCATTGTGAATAATGCTATGAACATCAGTGCACAAATGTGTTTGAGTCCCTGCTTTTAA 300

 31308789 TTCTTTTGGATATACACCTAGGAGTGAAATTGGTGGGTCATATGGTAGTTCTATTTGAAC 31308848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCTTTTGGATATACACCTAGGAGTGAAATTGGTGGGTCATATGGTAGTTCTATTTGAAC 360

 31308849 TGTTTAAGAAATTGCCACATTGTTTTCTACATAAAATGTACCATTTTGGATTCTCCCCAG 31308908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTTTAAGAAATTGCCACATTGTTTTCTACATAAAATGTACCATTTTGGATTCTCCCCAG 420

 31308909 CACTTATGAGGCTTCCAATTTCTCCACGTCCTTGCCAACACCTGCCATTTTCCCTTTTTA 31308968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACTTATGAGGCTTCCAATTTCTCCACGTCCTTGCCAACACCTGCCATTTTCCCTTTTTA 480

 31308969 AAAATTATAGCCATCCTAGTAGGTGTGATGTGCTATCCATGGTCATTTTGACTTGCATTT 31309028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAATTATAGCCATCCTAGTAGGTGTGATGTGCTATCCATGGTCATTTTGACTTGCATTT 540

 31309029 TTCTAATGATTAATAATGTTAAGCATCTTTTCATGGGTATATTGGACGTTTGTATATCAT 31309088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTAATGATTAATAATGTTAAGCATCTTTTCATGGGTATATTGGACGTTTGTATATCAT 600

 31309089 ACTTGGTGAAATGTCTATTCATGTCCTTCATCTACTTTTTAATCTAGTTGTTTGACTTTT 31309148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTTGGTGAAATGTCTATTCATGTCCTTCATCTACTTTTTAATCTAGTTGTTTGACTTTT 660

 31309149 TGTTGTTGAGTTGTAGGAGTTTTTAAAATATAAATTTTGAGTATCCATCACTTATTAAGT 31309208
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTTGTTGAGTTGTTGGAGTTTTTAAAATATAAATTTTGAGTATCCATCACTTATTAAGT 720

 31309209 ATATAACTTATAAATATTTTCTCCCATTCAGTAGGCTGTCTTTTTACATTACTTTCAGCA 31309268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATATAACTTATAAATATTTTCTCCCATTCAGTAGGCTGTCTTTTTACATTACTTTCAGCA 780

 31309269 ATGTTGTAGTTTTAAGTATATGAGTCTTTTACTTCTTTCTTTAGATTTATCATAAGTATT 31309328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGTTGTAGTTTTAAGTATATGAGTCTTTTACTTCTTTCTTTAGATTTATCATAAGTATT 840

 31309329 TAATTTCTAATTAGTTAAGATTTATTCCTAAGTACTCCTAAGTATTTAATTACTAAATAC 31309388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAATTTCTAATTAGTTAAGATTTATTCCTAAGTACTCCTAAGTATTTAATTACTAAATAC 900

 31309389 TAAGTATTTAGTAATAAACATAAACCTTGTTTAGATTTGTTCTTAAGTATTTTAGTGACT 31309448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAGTATTTAGTAATAAACATAAACCTTGTTTAGATTTGTTCTTAAGTATTTTAGTGACT 960

 31309449 ATTATACACAGCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTCTTTTGAGATGGAGTCTCACTC 31309508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
      961 ATTATACACAGCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTT-CTTTTGAGATGGAGTCTCACTC 1019

 31309509 TGTCACCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGA 31309568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TGTCACCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCAGA 1079

 31309569 GTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAATAACTGGGATTACAGGCACCCGCCACC 31309628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 GTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAATAACTGGGATTACAGGCACCCGCCACC 1139

 31309629 TCGCCTGGCTAATTTATTTTTTATTTTTTTATTTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATG 31309688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TCGCCTGGCTAATTTATTTTTTATTTTTTTATTTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATG 1199

 31309689 TTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTATCTCGGCCTCCCAAA 31309748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTGGCCAGGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTATCTCGGCCTCCCAAA 1259

 31309749 GTGCTGAGATTACAGAGGTGAGCCACCGCGCCTGGCTGCATTGCTTTTCTTTATTTCCTT 31309808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GTGCTGAGATTACAGAGGTGAGCCACCGCGCCTGGCTGCATTGCTTTTCTTTATTTCCTT 1319

 31309809 TTTGGATTGCTTATTGCTGGTATATTGCAGCAAACTTAATATTTGTGTTGATCTTGTACC 31309868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TTTGGATTGCTTATTGCTGGTATATTGCAGCAAACTTAATATTTGTGTTGATCTTGTACC 1379

 31309869 CTGAAACTTTGCTGAATTTGTTTACTAGCTCTAGTAGCTTCCTTACAAATTCTGTGGAAT 31309928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CTGAAACTTTGCTGAATTTGTTTACTAGCTCTAGTAGCTTCCTTACAAATTCTGTGGAAT 1439

 31309929 TCTCTTTTTAAAAATTTTTTTTTCCTCTAGTTCATTGGTTTTTCTTTCTTCTTCTTATTT 31309988
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TCTCTTTTTAAAAATTTTTTTT-CCTCTAGTTCATTGGTTTTTCTTTCTTCTTCTTATTT 1498

 31309989 TTTATTATACTTTAAGTTCTAGGATACATGTGTAGAATGTGCGGGTTTGTTACATAGCTA 31310048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TTTATTATACTTTAAGTTCTAGGATACATGTGTAGAATGTGCGGGTTTGTTACATAGCTA 1558

 31310049 TACACGTGCCATGGTGGTTTGCTGTACCCATCAACCCATCATCTACATTAGGTATTTCTC 31310108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TACACGTGCCATGGTGGTTTGCTGTACCCATCAACCCATCATCTACATTAGGTATTTCTC 1618

 31310109 CTAATGTTATCCCTCCCCTAACCCCCAACGCCCCGGCAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCC 31310168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 CTAATGTTATCCCTCCCCTAACCCCCAACGCCCCGGCAGGCCCTGGTATGTGATGTTTCC 1678

 31310169 CTCCCTATGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTG 31310228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CTCCCTATGTCCATGTGTTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTG 1738

 31310229 TTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATG 31310288
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTCAGTTTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATG 1798

 31310289 CCCCTGTAAAGAACATGAACTCATCCTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAATCATATCA 31310348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CCCCTGTAAAGAACATGAACTCATCCTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAATCATATCA 1858

 31310349 CCTGTGAATAGAGATATCATTACCACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTT 31310408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CCTGTGAATAGAGATATCATTACCACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTT 1918

 31310409 ACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGC 31310468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGAACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGC 1978

 31310469 GGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGT 31310528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 GGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGACCCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGT 2038

 31310529 ATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAA 31310588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 ATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAAGTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAA 2098

 31310589 GCTATTCATATTGGGAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATG 31310648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 GCTATTCATATTGGGAAACACTTTTACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATG 2158

 31310649 TCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAAT 31310708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TCTAACAGTTAGAATGAAAATTCAGGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAAT 2218

 31310709 CTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATT 31310768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CTTTGACTCTGACAGTTTGACTCTGCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATT 2278

 31310769 CCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTA 31310828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 CCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTCACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTA 2338

 31310829 TATAAGCAGGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTA 31310888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TATAAGCAGGATGCGACTACCTATTAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTA 2398

 31310889 ACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTT 31310948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGACTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTT 2458

 31310949 GTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGA 31311008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GTGGTGGCTGCATTAAATCAAAATTTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGA 2518

 31311009 TAATATGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTT 31311068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TAATATGAAAACATTGGGTATGTTATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTT 2578

 31311069 CACTTCTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACGTGCTGTTTTCTC 31311128
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2579 CACTTCTCTCAGTACCCACTAATTTTTACCAAGCACCTCATCCCTACATGCTGTTTTCTC 2638

 31311129 TCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTG 31311188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TCACAAAATTCCAAGCAAGACTCTGAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTG 2698

 31311189 AGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTAT 31311248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 AGAAAGTCTAGAAAACAAAATGATGAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTAT 2758

 31311249 AAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACC 31311308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 AAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGCAAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACC 2818

 31311309 AGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGG 31311368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCAGACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGG 2878

 31311369 CACTTCTTGAAGATTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTT 31311428
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CACTTCTTGAAGGTTTAGTCATAAGCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTT 2938

 31311429 AATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTA 31311488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 AATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGTCTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTA 2998

 31311489 AACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATG 31311548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 AACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCACTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATG 3058

 31311549 CCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGA 31311608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCCCTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGA 3118

 31311609 ACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGATTTTTTTTATC 31311668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3119 ACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAATAACCTTCTATAAATACTTAGAGGGGTTTTTTTTATC 3178

 31311669 CCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATT 31311728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTCAAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATT 3238

 31311729 CCCCAATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGG 31311788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 CCCCAATATTTGCTCTCCCATGACCCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGG 3298

 31311789 CATGACATCAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTA 31311848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 CATGACATCAAATGTTCATTGATGTATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTA 3358

 31311849 TGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGA 31311908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTCAGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGA 3418

 31311909 ATATATGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAAACTCATAAATATGCTGATG 31311968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3419 ATATATGTTAGGTACTTAGAAAATATTTCCTGGATAAACAGACTCATAAATATGCTGATG 3478

 31311969 GAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTT 31312028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 GAAAAGTTATTTAACAATCAAAGGGAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTT 3538

 31312029 TTGAAGCACCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCT 31312088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 TTGAAGCACCCATATAATGTCACTGGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCT 3598

 31312089 GTTGGCCTCACTTTCCAGCAGATCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTAC 31312148
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 GTTGGCCTCACTTTCCAGCAGCTCTTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTAC 3658

 31312149 ATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCA 31312208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 ATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAGAGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCA 3718

 31312209 GAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCA 31312268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 GAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTCTACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCA 3778

 31312269 AGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTG 31312328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 AGGAATTGAAATAGGCTTATTGACCAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTG 3838

 31312329 CAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGAT 31312388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 CAGCCATGTGGACCAAGAATGAGGAAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGAT 3898

 31312389 ATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGAC 31312448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 ATTGTAGACATGTAGATAGCATAGACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGAC 3958

 31312449 AGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAA 31312508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 AGAATACACTTCATTCCTGATGATTTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAA 4018

 31312509 CAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCT 31312568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 CAAACAAAACTTCTTTGCCACTCAGTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCT 4078

 31312569 GATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTT 31312628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 GATAGAAATACATCAAAACTTTGTTCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTT 4138

 31312629 AGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTA 31312688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 AGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAAACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTA 4198

 31312689 AACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGT 31312748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AACTCAGTCTTGAGACTAAGGCATTTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGT 4258

 31312749 ATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCCACTCCT 31312808
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4259 ATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTGTTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCGACTCCT 4318

 31312809 TATCCTTCTTGTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAAT 31312868
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TATCCTTCTTCTCTGCTTTGCTTTCTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAAT 4378

 31312869 TTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGG 31312928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 TTATTTATTTGTCTATTGTCTGTTTCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGG 4438

 31312929 GCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAG 31312988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 GCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTCCACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAG 4498

 31312989 CATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGG 31313048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 CATATAGTAGCACTCAGTAAATATTTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGG 4558

 31313049 TGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATT 31313108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 TGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTCTTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATT 4618

 31313109 ATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATC 31313168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 ATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATC 4678

 31313169 TTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGA 31313228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 TTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGA 4738

 31313229 GTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAG 31313288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 GTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAG 4798

 31313289 ACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTT 31313348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 ACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTT 4858

 31313349 GCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCT 31313408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 GCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCT 4918

 31313409 TGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATT 31313468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 TGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCAGTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATT 4978

 31313469 TTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAA 31313528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 TTGATTTTTTTCTCTTTTATACTCATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAA 5038

 31313529 AAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGA 31313588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 AAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAAGGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGA 5098

 31313589 ACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTAC 31313648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 ACCAGATTGAAACATAGTCTATGTGAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTAC 5158

 31313649 ATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTA 31313708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 ATACACTAATGACAAGCTATGCAACGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTA 5218

 31313709 TACACATACATACACACACACACACACACACACAAATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAG 31313768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
     5219 TACACATACATACACACACACACACACACACA--AATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAG 5276

 31313769 TTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTT 31313828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 TTTTATAGCAATTCTCACTGTAGTTTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTT 5336

 31313829 T--AATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACT 31313886
          |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 TTTAATGCTTAGCTGTTATTCACATGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACT 5396

 31313887 AGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATC 31313946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 AGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGAGCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATC 5456

 31313947 AAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAG 31314006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 AAATTGAACATTTTAAAATAATGGTCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAG 5516

 31314007 TGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCA 31314066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 TGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTGAAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCA 5576

 31314067 GGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATG 31314126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 GGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTTACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATG 5636

 31314127 TTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAAT 31314186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 TTTTTCCACTCTCCCACAATCTCTTGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAAT 5696

 31314187 TTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATT 31314246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 TTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCCTGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATT 5756

 31314247 ACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTT 31314306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 ACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTGAACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTT 5816

 31314307 CCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGT 31314366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 CCCTCTATAATCCTAATTTCTAATTTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGT 5876

 31314367 TATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATG 31314426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 TATATTATATTTCAAAGCTTTTATGGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATG 5936

 31314427 TCTGGGTATGTTTATGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAG 31314486
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 TCTGGGTATGTTTACGTGCTGGTCCCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAG 5996

 31314487 ATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGC 31314546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 ATGAAGGATCAGACCTTCCATGCTCCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGC 6056

 31314547 CAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGT 31314606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 CAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGATGTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGT 6116

 31314607 GATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCT 31314666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 GATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAATAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCT 6176

 31314667 TTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCA 31314726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 TTTTATGTCAAAAGATACTGTAGACCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCA 6236

 31314727 ATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCA 31314786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 ATGACAAACAACTTCAAAATGCTAGTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCA 6296

 31314787 CTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCC 31314846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 CTCTACATATCTGTCCTGAATCAGTGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCC 6356

 31314847 ACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTG 31314906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 ACCATCATCTCTGATCGCTGAAGCAGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTG 6416

 31314907 ATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGG 31314966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 ATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGTCCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGG 6476

 31314967 TCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGA 31315026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 TCACATGGCCCCACCCAGCTCCAAGGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGA 6536

 31315027 AGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTG 31315086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 AGGTGGGGAGAACTGGAAATATTGGCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTG 6596

 31315087 CACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAA 31315146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 CACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTAACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAA 6656

 31315147 GTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAA 31315206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 GTTACTATGAATTTGAGTAATACTTAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAA 6716

 31315207 TAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAAT 31315266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 TAACTAAGTAAATAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAAT 6776

 31315267 ACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAA 31315326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 ACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAAATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAA 6836

 31315327 AAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGA 31315386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 AAAGACAAACTTTTTATAAGAATTAGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGA 6896

 31315387 TTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATG 31315446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 TTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATG 6956

 31315447 GCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAA 31315506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 GCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGCTCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAA 7016

 31315507 GAGACACTGCAGCCCGGGTAC 31315527
          |||||||||||||||||||||
     7017 GAGACACTGCAGCCCGGGTAC 7037

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     7038 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 7097

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7098 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 7157

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     7158 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 7217

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     7218 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 7277

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7278 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 7337

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7338 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 7397

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7398 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 7457

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     7458 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 7517

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7518 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 7577

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 31319553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7578 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 7637

 31319554 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 31319613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7638 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 7697

 31319614 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 31319673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7698 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 7757

 31319674 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 31319733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7758 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 7817

 31319734 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 31319793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7818 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCA 7877

 31319794 CCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGCCCACCTCAAATCCCAGCT 31319853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7878 CCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGCCCACCTCAAATCCCAGCT 7937

 31319854 ACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGACTCGCTTGAATCTGAGTGAGAGATCATGGTGAAATGA 31319913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7938 ACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGACTCGCTTGAATCTGAGTGAGAGATCATGGTGAAATGA 7997

 31319914 GATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGTAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAA 31319973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7998 GATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGTAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAA 8057

 31319974 AAAAAAAAAAAGAACCACAACCACAAAACAGAATTTTAGACCAATATCCTTGATGAACAT 31320033
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8058 AAAAAAAAAAA-AACCACAACCACAAAACAGAATTTTAGACCAATATCCTTGATGAACAT 8116

 31320034 TGATACAGAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACCGAATCCAGCAGCACATTAAAAAGCT 31320093
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8117 TGATACAAAAATCCTCAATAAAATACTGGCAAACCGAATCCAGCAGCACATTAAAAAGCT 8176

 31320094 TGATCCATCATGATCAAGTGGGCATCATCCCTGGGATGCAAGGCTGGTTCAATATATGCA 31320153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8177 TGATCCATCATGATCAAGTGGGCATCATCCCTGGGATGCAAGGCTGGTTCAATATATGCA 8236

 31320154 AATCAATAAATGTAATCCAGCATATAAACAGAACCAAAGACAAAAACCACATGATTATCT 31320213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8237 AATCAATAAATGTAATCCAGCATATAAACAGAACCAAAGACAAAAACCACATGATTATCT 8296

 31320214 CAATAGATGCAGAAAAGG 31320231
          ||||||||||||||||||
     8297 CAATAGATGCAGAAAAGG 8314

Alignment time is 11.4846 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [31305527,31328953] =>     23427 nucs '7 dna:chromosome chromosome:GRCh37:7:1:159138663:1'
Second seq [       1,    6143] =>      6143 nucs 'mol-32-34a8-069017_6143'

Score:        5987
Aligned:      6145        nucs
Identic:      6129 (100%) nucs =>      5326 (100%)       803 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [31310193,31315527] EXCISED REGION [31318954,31319761]
 second seq =>  [       1,    5335] EXCISED REGION [    5336,    6143]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3426 nucs [31315528,31318953]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [31315528,31315542] to [31318954,31318968]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 31310193 TGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAG 31310252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGTTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAG 60

 31310253 TTTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTAAAGAACATGAACTCAT 31310312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTACTGAGAATGATGGTTTTCCAGCTTCATCCATGCCCCTGTAAAGAACATGAACTCAT 120

 31310313 CCTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAATAGAGATATCATTACC 31310372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTTTTTTGGAATTTTCTACATATAGAATCATATCACCTGTGAATAGAGATATCATTACC 180

 31310373 ACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGA 31310432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTTCCTTTTTAATTTGAATGGCTTTTATTTCTTTTACCTTTCTAATAGCTCTGGTTGGA 240

 31310433 ACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGAC 31310492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTTCCAGTACAAGGTTGAATAGTAGTAGTGAAAGCGGGCATTCTTGTCTTGTTCCTGAC 300

 31310493 CCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAA 31310552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTAGAGAGAGAGTTTTCAGTCTTTTAGCATTGAGTATGGTCCATTCAATTTTGTTTTAA 360

 31310553 GTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCATATTGGGAAACACTTT 31310612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCAGCATCTTCCCAACTTATTTGACTGAGGAACAAGCTATTCATATTGGGAAACACTTT 420

 31310613 TACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCA 31310672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACTGATAAATTAAGACCTGAAATGAGTTTAAAATGTCTAACAGTTAGAATGAAAATTCA 480

 31310673 GGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCT 31310732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTGTTTAGAGTAACACAGGGCATTTAGATTTCAATCTTTGACTCTGACAGTTTGACTCT 540

 31310733 GCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTC 31310792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCATTTTTCAGAGAGCCATTGAATTTCAATCAATTCCTCTTTACACTTTAGTTCAGTTC 600

 31310793 ACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCAGGATGCGACTACCTAT 31310852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAAAACAAACACAAGAAATATAGCTTTCTCCATTATATAAGCAGGATGCGACTACCTAT 660

 31310853 TAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGA 31310912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAAATGCTGAGAATGACTTGTAGGTGGTATTGTTAACAGAGGGAGGACCAGAGGGAAGA 720

 31310913 CTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAAT 31310972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGTCCTACGTGCAGCTTGGTGTTCTGCAGTGATTTGTGGTGGCTGCATTAAATCAAAAT 780

 31310973 TTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGAAAACATTGGGTATGTT 31311032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAATACTTTGCCTTTTAGGGAGAAAGGCGAGAAGATAATATGAAAACATTGGGTATGTT 840

 31311033 ATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATT 31311092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCCTCTTGCCAAAGAATTATTGATTGTATCTTCTTCACTTCTCTCAGTACCCACTAATT 900

 31311093 TTTACCAAGCACCTCATCCCTACGTGCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCT 31311152
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTACCAAGCACCTCATCCCTACATGCTGTTTTCTCTCACAAAATTCCAAGCAAGACTCT 960

 31311153 GAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGAT 31311212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGTCTATTACCCTCTCTACACTTTATAGGTAACTGAGAAAGTCTAGAAAACAAAATGAT 1020

 31311213 GAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGC 31311272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAATAAAACAATTGGCTGAAAACTCAGAGTTGTTATAAAATTGGCAGCGGTAAGATAAGC 1080

 31311273 AAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCA 31311332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGGAGCGAAATCTTGCAGTGGTTAAATGCTCAACCAGGAGTGTCTGAGTGGCCTCATCA 1140

 31311333 GACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAA 31311392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GACTCTCCAGCCTTGCGGGCAACCCCAGATGATGGGCACTTCTTGAAGATTTAGTCATAA 1200

 31311393 GCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGT 31311452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCCTAAGTCAAAGAAAGTTTTACAATCTGTTTATTTAATCGTGGCTCAGTGTTGTCATGT 1260

 31311453 CTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCA 31311512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTTGCATATGTTCTAGCTACATTTGGTGAAGGTTAAACAAATGGTGGGTCAGAGGGTCA 1320

 31311513 CTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCC 31311572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGAAAGAATAATTGTCATTCCTTGTGGCAGCCATGCCACATTGGCTTCCTTGTGTCTCC 1380

 31311573 CTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAAT 31311632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTCAAATATACAAAGCACATTGGATTCTTAATTTGAACTTTTTGTCCCTCTGCTTAAAAT 1440

 31311633 AACCTTCTATAAATACTTAGAGGGATTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTC 31311692
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACCTTCTATAAATACTTAGAGGGGTTTTTTTTATCCCTCACTTATTTAGGTCTCTGCTC 1500

 31311693 AAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGAC 31311752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAGAGGCCTTCCCTAGCTCTTCTTTCTAAACTATTCCCCAATATTTGCTCTCCCATGAC 1560

 31311753 CCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAATGTTCATTGATG 31311812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCTGCCTTCTTTTTCTTTACAGGTCACAATTCTTGGCATGACATCAAATGTTCATTGATG 1620

 31311813 TATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTC 31311872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TATTTATTTGTTATCTGTTCACCAATATAAGCTTTATGAGGGCGAGGCTTTGTTTTGTTC 1680

 31311873 AGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTACTTAGAAAAT 31311932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGTGCTGTATTGCCAACATTTTAAACAGTGCTTTGAATATATGTTAGGTACTTAGAAAAT 1740

 31311933 ATTTCCTGGATAAACAAACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGG 31311992
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTTCCTGGATAAACAGACTCATAAATATGCTGATGGAAAAGTTATTTAACAATCAAAGG 1800

 31311993 GAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCATATAATGTCACT 31312052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAATTTATTGGCTCAATGAAATTAAAATTATCTCTTTTGAAGCACCCATATAATGTCACT 1860

 31312053 GGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGATC 31312112
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1861 GGGACTCTCTCCAGTCCCCAGCTCTGCCTCTTTCCTGTTGGCCTCACTTTCCAGCAGCTC 1920

 31312113 TTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAG 31312172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTCCCCCAGCTGGTCCCTGGCTACCCTAGGCTTACATCTTGCAAAGTTAAAACATCCAG 1980

 31312173 AGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTC 31312232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGAAGAGGACACACCTCTTTCCCAGCAGCACCAGCAGAATTTCAGGGCTCCAGTGGCTTC 2040

 31312233 TACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGAC 31312292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TACTGGGCAACACACCTGAACCAAATCCTCTGGCCAAGGAATTGAAATAGGCTTATTGAC 2100

 31312293 CAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGG 31312352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGGCCAGGTCACTTCTCCCCTCCTGATGCCCACTGCAGCCATGTGGACCAAGAATGAGG 2160

 31312353 AAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGTAGATAGCATAG 31312412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAGGCAATTCTTCAAAGAAAAATTAAAGTGTAGATATTGTAGACATGTAGATAGCATAG 2220

 31312413 ACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCATTCCTGATGAT 31312472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACATGGGAGAAAGGATGCCCCGAAGGCAAAAGAGACAGAATACACTTCATTCCTGATGAT 2280

 31312473 TTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCA 31312532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTAAAAAAGAAAGAGAAAAACAAAAATAGACAAAAACAAACAAAACTTCTTTGCCACTCA 2340

 31312533 GTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGT 31312592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTAACAACTTGTTTAGGTCCTCATTTCCAAGAAGCTGATAGAAATACATCAAAACTTTGT 2400

 31312593 TCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAA 31312652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCCAAGTTAGAACTCTTGTCTTTTTAAAGCTTTGTTAGCACCCCTGAGGTGCTAATGGAA 2460

 31312653 ACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCAT 31312712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACCATCAACAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCAATGTTAAACTCAGTCTTGAGACTAAGGCAT 2520

 31312713 TTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTG 31312772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTAGCTATGAACTTCTGCCTTTTCAAACACGTGTGTATGAAACCTCTGTGCCAGGAACTG 2580

 31312773 TTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCCACTCCTTATCCTTCTTGTCTGCTTTGCTTT 31312832
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||
     2581 TTCCAAGTGTTGGGGACAAATTTCACCCCGACTCCTTATCCTTCTTCTCTGCTTTGCTTT 2640

 31312833 CTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTT 31312892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTTCCACTGATCTCTGTCTCTAATATATTTTATAATTTATTTATTTGTCTATTGTCTGTT 2700

 31312893 TCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTC 31312952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCCCTCCCCACCTTTCAGGATGTAAATTCCATGAGGGCAGGAATTCTTGTCTCTTTTGTC 2760

 31312953 CACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATAT 31313012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CACTGCTATATCCCCAGAGGCCACAACTGTGCCTAGCATATAGTAGCACTCAGTAAATAT 2820

 31313013 TTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTC 31313072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTGTTGAATAGATAAATGTGATAAGTTGAACCTTGGTGGTTTGTATTTTTTTCTGTACTC 2880

 31313073 TTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTC 31313132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTTTTCTGTGCTCTGTATTTTATTTTACTATTATTATTATTTTTTGGAGACGTAGTCTC 2940

 31313133 GCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTC 31313192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGTGATGGCATGATCTTGGCTCATTACAAGCCCTGCCTC 3000

 31313193 CTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCAC 31313252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCAC 3060

 31313253 CACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAG 31313312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CACTGCGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTTGCCATGTTGGTCAG 3120

 31313313 GCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGG 31313372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GCTGGTTTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCGGGG 3180

 31313373 ATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCA 31313432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTGTGCCTTGTATTTTAAAGTTTAGTATTTCA 3240

 31313433 GTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTC 31313492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTATTGAATATATTCTGCTCATTCTTTTTCTAGATTTTGATTTTTTTCTCTTTTATACTC 3300

 31313493 ATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAA 31313552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATTTCTTACAGTGTTTTTAACTTCTATGCTTTTCAAAAGAATGTAGCTTTTACCTAAAAA 3360

 31313553 GGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGT 31313612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGTGTTCAAATAATCTTCTGATATTGTTTTTGCTGAACCAGATTGAAACATAGTCTATGT 3420

 31313613 GAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAA 31313672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GAGTGCACACACACAGATGTACACACACAAATGTACATACACTAATGACAAGCTATGCAA 3480

 31313673 CGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACACACACACACA 31313732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CGACCCAAATTCATTGAAACACAGCACATGTGAGTATACACATACATACACACACACACA 3540

 31313733 CACACACACAAATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGT 31313792
          ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CACACACA--AATGACAAGCTAGCTATGCATTGTAGTTTTATAGCAATTCTCACTGTAGT 3598

 31313793 TTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTT--AATGCTTAGCTGTTATTCACA 31313850
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||
     3599 TTGTGTGACTCTGTGATCAGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTAATGCTTAGCTGTTATTCACA 3658

 31313851 TGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGA 31313910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TGAAGATTTTCTAACTTGCTTTGTCAGTTTTGTACTAGAAAACCCAAAGAAGAAATGGGA 3718

 31313911 GCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGG 31313970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 GCCAATTTTGACATATAAAAATCAAACACTTAAATCAAATTGAACATTTTAAAATAATGG 3778

 31313971 TCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTG 31314030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TCGGAGGCTAGTTGTGGCTTTCTCAAAGGCTCCCAGTGTTTGAGTCTAGCAACTTAGTTG 3838

 31314031 AAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTT 31314090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 AAACTTAGTAGAATCTTCTGTGTGTCTCACTCAGCAGGGAAAAAAAAAGGGTTCTCTTTT 3898

 31314091 ACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCT 31314150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 ACCTTCACCGTATTTCTGTTTTTAATTGATGAGATGTTTTTCCACTCTCCCACAATCTCT 3958

 31314151 TGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCC 31314210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TGTTCCTCCTTGCAAAAGCCTTCACTGCTGCCTAATTTTCAATAGGAAAAGTTATTGTCC 4018

 31314211 TGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTG 31314270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 TGTTTCTCTTTTTGTCACAGCTGCCAAATTAGAATTACTCTGCTGCCTTTAGGGTTTGTG 4078

 31314271 AACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAAT 31314330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 AACTTACATACATCAGTATATTTGCAGTCTTCTTTTCCCTCTATAATCCTAATTTCTAAT 4138

 31314331 TTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTAT 31314390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 TTTTGTTTTGTTTACTCTTTTGACAGTAATTTTAGTTATATTATATTTCAAAGCTTTTAT 4198

 31314391 GGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTATGTGCTGGTC 31314450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4199 GGACAGAAACAAGTTATAAATAAGCCAATTAAAATGTCTGGGTATGTTTACGTGCTGGTC 4258

 31314451 CCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCT 31314510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 CCTGAAATATCACTAGGGATGTTGTGGAGGACTCAGATGAAGGATCAGACCTTCCATGCT 4318

 31314511 CCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGAT 31314570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 CCTGAAGAGTTGATAGTAATATTTGTTGAATGAAGCCAGTGTAGATCTAGGAGGCTGGAT 4378

 31314571 GTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAA 31314630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 GTGCTCCAGATCATCCTGTCCTTTTCCAGGGATCGTGATGGCTGTCTGTTATTCAGAAAA 4438

 31314631 TAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGA 31314690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 TAGCTCACAATCTTTTTTCAAATATGAGAAGCTCCTTTTTATGTCAAAAGATACTGTAGA 4498

 31314691 CCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTA 31314750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 CCTTTTACCAGCCAGGATAGGGTAGGCTATGTGGCAATGACAAACAACTTCAAAATGCTA 4558

 31314751 GTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAG 31314810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 GTAACTTATAAAACCATCAGTTTTGTCTCTAGGTCACTCTACATATCTGTCCTGAATCAG 4618

 31314811 TGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGC 31314870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 TGAAGGCCACTGATCATTGTGGCCACTCTGGCAGCCACCATCATCTCTGATCGCTGAAGC 4678

 31314871 AGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGT 31314930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 AGAAGGAAGAGTGGAATGCTGGAGAATCTCTCACTGATAGTTCAACTCTGGCTCAGAAGT 4738

 31314931 CCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAA 31314990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 CCTCACTTCCACTCACAACTCATTCCCCAAAGCTGGTCACATGGCCCCACCCAGCTCCAA 4798

 31314991 GGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTG 31315050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 GGGGGCCTAGACGTGCAACCCTTGCACAGGCTCAGAAGGTGGGGAGAACTGGAAATATTG 4858

 31315051 GCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTA 31315110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 GCCACGCGGCACTAATGCGCATCATAGAGGTGCCTGCACGGTGGTGGTTGTCAACTTTTA 4918

 31315111 ACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACT 31315170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 ACATTTTTGGCTTGAGAAAATACATAATGATAAAAAGTTACTATGAATTTGAGTAATACT 4978

 31315171 TAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTT 31315230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 TAAATTTAAAAAATTATATTGTATTAATCATATTAATAACTAAGTAAATAAGACAAACTT 5038

 31315231 TTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAA 31315290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 TTTATAAGAATTAGCACCAGGAAAAAAATAGTTAATACTAGAATTATTTTTAGTGAGCAA 5098

 31315291 ATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATT 31315350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 ATTCGCTTTGAGAAAACAGCCTGATGATTCTTATAAAAAGACAAACTTTTTATAAGAATT 5158

 31315351 AGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCT 31315410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 AGCACCAGAAAAAAAAACAAACAGCTAATACTAGGATTATTTTTAGGGAGCAAATTTGCT 5218

 31315411 TTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGC 31315470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 TTGAGAAAACAGCCTGATGATTACGTGGAGGGGATGGCAGGAATGTGAGGCAGGCACTGC 5278

 31315471 TCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 31315527
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 TCTCCATAACACAGAGGATAGGATTTGGAGGTTTAAGAGACACTGCAGCCCGGGTAC 5335

EXCISED REGION

 31318954 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGACGGATCACTTGAGG 31319013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5336 GGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGACGGATCACTTGAGG 5395

 31319014 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 31319073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5396 TCAGGGGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAACATACAA 5455

 31319074 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCAAGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 31319133
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5456 AAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATGCACGCGTGTGATCCCAGCTACTTGGGAGACTGA 5515

 31319134 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACT 31319193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5516 GGCACAAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGTGCCACT 5575

 31319194 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCTGCT 31319253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5576 GCACTCCAGCCTGAACCAGTACTTTATGTGAAGGGGAGAACACCCTGAATTGGGTCAGCT 5635

 31319254 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 31319313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5636 TCTCCAGGTATACAAAGGATTTCTTGAAGTAATACAAGATGATTGAATATTATACTGATG 5695

 31319314 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 31319373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5696 GACAATCTCAAAGTATAAATTTACCACCACTGCAAGTGAAAATCCCTATGAGATTTTTCG 5755

 31319374 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAGAGTAAGTGCTA 31319433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5756 GGAGTGAAAGGTAGGTGAGATCAATAAAATTATTTTTTAAATAACACAAAGTAAGTGCTA 5815

 31319434 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 31319493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5816 GCTGCTCAATAGCATTTTGGGGTTAAGCACGTAACATGCATTATCTTATTTAATCCTTAA 5875

 31319494 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 31319553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5876 AAAATTTTAAGTTCAAATTTAGGCTTAGAAAGTTTAAATAATTTTTCAAGGGTCACATGG 5935

 31319554 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 31319613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5936 CTGTGAGGAATTGGAACTCCAACATAGATCTGAAGGCCTTGTTCCAAAACCTGAGATTTT 5995

 31319614 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 31319673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5996 TAAAAACCGTGCTGTATATTGCAAAAGCAACAGCTATTTTAATTTTTTGTATTAAGAATA 6055

 31319674 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 31319733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6056 TCTAGAGCCGGCCAGGCAGGTGACTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 6115

 31319734 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTC 31319761
          ||||||||||||||||||||||||||||
     6116 CAGGTGGATCTCCTGAGGTCAGGAGTTC 6143

Alignment time is 8.55174 s

