
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5009] =>      5009 nucs 'mol-32-1f21-169983_5009'

Score:        4877
Aligned:      5019        nucs
Identic:      4993 ( 99%) nucs =>      1832 ( 99%)      3161 (100%)
Gaps:           20 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810691,229812533] EXCISED REGION [229820837,229824002]
 second seq =>  [        1,     1835] EXCISED REGION [     1836,     5009]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810691 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGAATCATTGTGGATCCTTGCACCACTATT 229810750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGAATCATTGTGGATCCTTGCACCACTATT 60

229810751 GAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGCAGGAGAAG 229810810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGCAGGAGAAG 120

229810811 AACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGCAACAT 229810870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGCAACAT 180

229810871 AGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGCAGAGC 229810930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGCAGAGC 240

229810931 CACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAGGCCAC 229810990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAGGCCAC 300

229810991 TGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCCCATGA 229811050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCCCATGA 360

229811051 GTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGTTAATG 229811110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGTTAATG 420

229811111 GAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATATCATTC 229811170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATATCATTC 480

229811171 TGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTAGCA 229811230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTAGCA 540

229811231 TGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTCATC 229811290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTCATC 600

229811291 CCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCCATC 229811350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCCATC 660

229811351 CATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCCATC 229811410
          ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCCATC 712

229811411 CATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACTAGT 229811470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 CATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACTAGT 772

229811471 AAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCTATT 229811530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 AAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCTATT 832

229811531 CCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAA 229811590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 CCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAA 892

229811591 TCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAGCCC 229811650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAGCCC 952

229811651 TAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGCTAT 229811710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 TAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGCTAT 1012

229811711 CATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCCCAG 229811770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 CATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCCCAG 1072

229811771 TTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCATTT 229811830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCATTT 1132

229811831 ATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGGGTA 229811890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 ATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGGGTA 1192

229811891 TAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCCATG 229811950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 TAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCCATG 1252

229811951 AAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAATGAGGCTATAAGGA 229812010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1253 AAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAATGAGGCTATAAGGA 1312

229812011 AAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCCTAA 229812070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 AAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCCTAA 1372

229812071 AATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTG 229812130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 AATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTG 1432

229812131 GAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCT 229812190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1433 GAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCT 1492

229812191 CCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTAATT 229812250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 CCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTAATT 1552

229812251 TTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCT 229812310
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 TTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCT 1612

229812311 GACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATC 229812370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 GACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATC 1672

229812371 ACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATAC 229812430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 ACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATAC 1732

229812431 AACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAAC 229812490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 AACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAAC 1792

229812491 TTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 TTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1835

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1836 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1895

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1955

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 2015

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2075

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2135

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2195

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2255

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2315

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2375

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2435

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2495

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2555

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2615

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2675

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2735

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2795

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2855

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2915

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2975

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 3035

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3095

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3155

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3215

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3274

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3334

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3394

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3454

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3514

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3574

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3634

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     3635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3694

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 3754

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 3814

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 3874

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 3934

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 3994

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 4054

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 4114

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 4174

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 4234

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 4294

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 4354

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTC 229823406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4355 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTC 4414

229823407 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 229823466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 4474

229823467 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 229823526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4475 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 4534

229823527 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 229823586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4535 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 4594

229823587 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 229823646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4595 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 4654

229823647 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 229823706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4655 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 4714

229823707 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 229823766
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4715 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCT-AAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 4773

229823767 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 229823826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4774 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 4833

229823827 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 229823886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4834 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 4893

229823887 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 229823946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4894 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 4953

229823947 CAGGACAGTGATCCATTAAGTCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTA 229824002
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4954 CAGGACAGTGATCCATTAAATCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTA 5009

Alignment time is 5.11557 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3382] =>      3382 nucs 'mol-32-1f63-161453_3382'

Score:        3307
Aligned:      3391        nucs
Identic:      3376 (100%) nucs =>      1785 ( 99%)      1591 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810738,229812533] EXCISED REGION [229820837,229822429]
 second seq =>  [        1,     1788] EXCISED REGION [     1789,     3382]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810738 TTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCA 229810797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCA 60

229810798 TGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTT 229810857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTT 120

229810858 TTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTT 229810917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTT 180

229810918 CATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTAC 229810977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTAC 240

229810978 CTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAA 229811037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAA 300

229811038 TGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAA 229811097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAA 360

229811098 CTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATA 229811157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATA 420

229811158 GAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCA 229811217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCA 480

229811218 TGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGT 229811277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGT 540

229811278 TCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAA 229811337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAA 600

229811338 CCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCCACCCAT 229811397
          |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCCACCCAT 652

229811398 CCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTA 229811457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 CCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTA 712

229811458 TCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCC 229811517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 TCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCC 772

229811518 CCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATT 229811577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 CCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATT 832

229811578 TTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTA 229811637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 TTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTA 892

229811638 TACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTT 229811697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTT 952

229811698 TATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAA 229811757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 TATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAA 1012

229811758 CCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAA 229811817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 CCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAA 1072

229811818 AATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATA 229811877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 AATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATA 1132

229811878 GGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTC 229811937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 GGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTC 1192

229811938 TAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAAT 229811997
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1193 TAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAAT 1252

229811998 GAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAA 229812057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 GAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAA 1312

229812058 GGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCT 229812117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 GGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCT 1372

229812118 GTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGG 229812177
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1373 GTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGG 1432

229812178 TTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTG 229812237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 TTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTG 1492

229812238 CACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTG 229812297
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 CACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTG 1552

229812298 GTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 229812357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 GTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 1612

229812358 GGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTT 229812417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 GGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTT 1672

229812418 CTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTT 229812477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 CTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTT 1732

229812478 TTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 TTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1788

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1789 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1848

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1908

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1968

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2028

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2088

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2148

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2208

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2268

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2328

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2388

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2448

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2508

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2568

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2628

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2688

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2748

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2808

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2868

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2928

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2988

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3048

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3108

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3168

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3227

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3287

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3347

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACT 229822429
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACT 3382

Alignment time is 3.4097 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5016] =>      5016 nucs 'mol-32-20fa-113725_5016'

Score:        4860
Aligned:      5030        nucs
Identic:      4999 ( 99%) nucs =>      1848 ( 99%)      3151 ( 99%)
Gaps:           24 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810671,229812533] EXCISED REGION [229820837,229823993]
 second seq =>  [        1,     1851] EXCISED REGION [     1852,     5016]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810671 GAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGAATCATTG 229810730
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||
        1 GAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA----GGCAGAATCATTG 56

229810731 TGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCC 229810790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       57 TGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCC 116

229810791 ATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAG 229810850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      117 ATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAG 176

229810851 CATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGA 229810910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      177 CATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGA 236

229810911 GTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACA 229810970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      237 GTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACA 296

229810971 ATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGT 229811030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      297 ATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGT 356

229811031 ATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGC 229811090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 ATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGC 416

229811091 TCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTT 229811150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 TCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTT 476

229811151 TAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCC 229811210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 TAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCC 536

229811211 TGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAA 229811270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 TGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAA 596

229811271 TCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACC 229811330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 TCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACC 656

229811331 CACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACC 229811390
          ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||
      657 CACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACC 708

229811391 CACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATG 229811450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      709 CACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATG 768

229811451 GAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCC 229811510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 GAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCC 828

229811511 CTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGC 229811570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      829 CTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGC 888

229811571 TTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATAT 229811630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 TTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATAT 948

229811631 CTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACA 229811690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 CTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACA 1008

229811691 TTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAG 229811750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 TTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAG 1068

229811751 GGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCT 229811810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 GGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCT 1128

229811811 TACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATAC 229811870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 TACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATAC 1188

229811871 TGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCT 229811930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 TGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCT 1248

229811931 TATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCA 229811990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1249 TATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTA 1308

229811991 TGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTG 229812050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 TGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTG 1368

229812051 AATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTC 229812110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 AATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTC 1428

229812111 TCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCC 229812170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1429 TCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCC 1488

229812171 TTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCT 229812230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 TTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCT 1548

229812231 GCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGC 229812290
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 GCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGC 1608

229812291 CTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGG 229812350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 CTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGG 1668

229812351 GATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATAT 229812410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 GATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATAT 1728

229812411 ATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTT 229812470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 ATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTT 1788

229812471 CACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGC 229812530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 CACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGC 1848

229812531 CCA 229812533
          |||
     1849 CCA 1851

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1852 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1911

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1971

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 2031

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2091

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2151

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2211

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2271

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2331

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2391

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2451

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2511

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2571

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2631

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2691

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2751

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2811

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2871

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2931

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2991

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 3051

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3111

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3171

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3231

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3290

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3350

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3410

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3470

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3530

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3590

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3650

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     3651 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3710

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 3770

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 3830

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 3890

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 3950

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 4010

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 4070

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 4130

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 4190

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 4250

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 4310

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 4370

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTC 229823406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4371 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTC 4430

229823407 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 229823466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 4490

229823467 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 229823526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 4550

229823527 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 229823586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 4610

229823587 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 229823646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 4670

229823647 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 229823706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 4730

229823707 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 229823766
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCT-AAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 4789

229823767 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 229823826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4790 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 4849

229823827 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 229823886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4850 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 4909

229823887 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 229823946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4910 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 4969

229823947 CAGGACAGTGATCCATTAAGTCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGG 229823993
          |||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||
     4970 CAGGACAGTGATCCATTAAATCTACCAAAAAGCGGCGGGACTCAAGG 5016

Alignment time is 5.02353 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2381] =>      2381 nucs 'mol-32-20fa-142351_2381'

Score:        2298
Aligned:      2382        nucs
Identic:      2367 ( 99%) nucs =>       414 (100%)      1953 ( 99%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229812118,229812533] EXCISED REGION [229820837,229822792]
 second seq =>  [        1,      416] EXCISED REGION [      417,     2381]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229812118 GTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGG 229812177
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
        1 GTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGG 60

229812178 TTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTG 229812237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTG 120

229812238 CACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTG 229812297
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTG 180

229812298 GTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 229812357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 240

229812358 GGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTT 229812417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTT 300

229812418 CTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTT 229812477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTT 360

229812478 TTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 416

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      417 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 476

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 536

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 596

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 656

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 716

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      717 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTACGTTTGTCTAC 776

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 836

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 896

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 956

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 1016

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 1076

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 1136

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 1196

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 1256

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 1316

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 1376

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 1436

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 1496

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 1556

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 1616

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 1676

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 1736

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 1796

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 1855

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 1915

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 1975

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 2035

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 2095

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 2155

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 2215

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     2216 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 2275

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 2335

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCA 229822792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCA 2381

Alignment time is 2.40546 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     4151] =>      4151 nucs 'mol-32-2105-029425_4151'

Score:        4030
Aligned:      4161        nucs
Identic:      4136 ( 99%) nucs =>      1330 ( 99%)      2806 (100%)
Gaps:           20 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229811192,229812533] EXCISED REGION [229820837,229823645]
 second seq =>  [        1,     1333] EXCISED REGION [     1334,     4151]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229811192 AGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACAT 229811251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACAT 60

229811252 GAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTC 229811311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTC 120

229811312 ACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCC 229811371
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||
      121 ACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCC 172

229811372 ACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAA 229811431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      173 ACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAA 232

229811432 AAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAA 229811491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      233 AAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAA 292

229811492 AATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAAC 229811551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      293 AATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAAC 352

229811552 AACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCA 229811611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      353 AACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCA 412

229811612 CTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATAT 229811671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      413 CTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATAT 472

229811672 ACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCT 229811731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      473 ACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCT 532

229811732 AGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCT 229811791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      533 AGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCT 592

229811792 GTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAG 229811851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 GTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAG 652

229811852 CAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACA 229811911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 CAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACA 712

229811912 GGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGC 229811971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 GGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGC 772

229811972 TATAATTACAAAGGTATCATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATT 229812031
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TATAATTACAAAGGTATTATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATT 832

229812032 TTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTT 229812091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 TTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTT 892

229812092 TTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTG 229812151
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TTTTTTTTT-GATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTG 951

229812152 GTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTA 229812211
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 GTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTA 1011

229812212 GCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGG 229812271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1012 GCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGG 1071

229812272 TTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCT 229812331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 TTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCT 1131

229812332 CGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATC 229812391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 CGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATC 1191

229812392 ATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCT 229812451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 ATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCT 1251

229812452 TAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTA 229812511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 TAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTA 1311

229812512 GTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          ||||||||||||||||||||||
     1312 GTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1333

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1334 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1393

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1453

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1454 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1513

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 1573

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 1633

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 1693

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 1753

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 1813

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 1873

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 1933

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 1993

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2053

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2113

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2173

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2233

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2293

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2353

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2413

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2473

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2533

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 2593

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 2653

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2654 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 2713

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 2772

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 2832

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 2892

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 2952

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3012

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3072

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3132

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     3133 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3192

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 3252

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3253 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 3312

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3313 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 3372

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 3432

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 3492

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3493 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 3552

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3553 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 3612

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3613 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 3672

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3673 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 3732

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 3792

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 3852

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTC 229823406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3853 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTC 3912

229823407 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 229823466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3913 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 3972

229823467 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 229823526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3973 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 4032

229823527 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 229823586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4033 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 4092

229823587 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAG 229823645
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4093 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAG 4151

Alignment time is 4.15081 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2825] =>      2825 nucs 'mol-32-220d-051490_2825'

Score:        2754
Aligned:      2834        nucs
Identic:      2821 (100%) nucs =>      1588 ( 99%)      1233 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810934,229812533] EXCISED REGION [229820837,229822070]
 second seq =>  [        1,     1591] EXCISED REGION [     1592,     2825]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810934 CATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGT 229810993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGT 60

229810994 TAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTC 229811053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTC 120

229811054 TTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAA 229811113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAA 180

229811114 CCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGG 229811173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGG 240

229811174 TGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGG 229811233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGG 300

229811234 GCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCT 229811293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCT 360

229811294 CCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCCATCCAT 229811353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCCATCCAT 420

229811354 CCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCCATCCAT 229811413
          |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCCATCCAT 472

229811414 CCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAA 229811473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      473 CCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAA 532

229811474 GGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCA 229811533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      533 GGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCA 592

229811534 TTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCA 229811593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 TTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCA 652

229811594 TGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAA 229811653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 TGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAA 712

229811654 GTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGCTATCAT 229811713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 GTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGCTATCAT 772

229811714 CTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTT 229811773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 CTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTT 832

229811774 TGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCATTTATT 229811833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 TGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCATTTATT 892

229811834 TAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAG 229811893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAG 952

229811894 TAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAG 229811953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 TAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAG 1012

229811954 ATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAG 229812013
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1013 ATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAG 1072

229812014 TATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAAT 229812073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAAT 1132

229812074 CGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAG 229812133
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 CGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTT-GATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAG 1191

229812134 TGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCT 229812193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1192 TGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCT 1251

229812194 GTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTA 229812253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 GTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTA 1311

229812254 TTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGAC 229812313
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 TTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGAC 1371

229812314 CTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACG 229812373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 CTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACG 1431

229812374 CCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATACAAC 229812433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 CCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATACAAC 1491

229812434 AGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTT 229812493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 AGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTT 1551

229812494 TTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 TTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1591

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1592 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1651

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1711

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1771

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 1831

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 1891

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 1951

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2011

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2071

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2131

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2191

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2251

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2311

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2371

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2431

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2491

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2551

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2611

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2671

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2731

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2791

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAAT 229822070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAAT 2825

Alignment time is 2.81598 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     4422] =>      4422 nucs 'mol-32-22b2-092444_4422'

Score:        4301
Aligned:      4432        nucs
Identic:      4407 ( 99%) nucs =>      1794 ( 99%)      2613 (100%)
Gaps:           20 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810728,229812533] EXCISED REGION [229820837,229823452]
 second seq =>  [        1,     1797] EXCISED REGION [     1798,     4422]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810728 TTGTGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCA 229810787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCA 60

229810788 GCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTT 229810847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTT 120

229810848 CAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGT 229810907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGT 180

229810908 GGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAAT 229810967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAAT 240

229810968 ACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTC 229811027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTC 300

229811028 TGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAG 229811087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAG 360

229811088 TGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTC 229811147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTC 420

229811148 TTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTC 229811207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTC 480

229811208 TCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAAT 229811267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAAT 540

229811268 AAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCC 229811327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCC 600

229811328 ACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTC 229811387
          |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||
      601 ACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTC 652

229811388 ACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTC 229811447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 ACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTC 712

229811448 ATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTAT 229811507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 ATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTAT 772

229811508 TCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTA 229811567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTA 832

229811568 GGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCA 229811627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 GGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCA 892

229811628 TATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTT 229811687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTT 952

229811688 ACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCC 229811747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 ACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCC 1012

229811748 CAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATA 229811807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 CAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATA 1072

229811808 TCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCA 229811867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCA 1132

229811868 TACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGA 229811927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 TACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGA 1192

229811928 GCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTA 229811987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 GCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTA 1252

229811988 TCATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAA 229812047
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TTATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAA 1312

229812048 GTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGA 229812107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     1313 GTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTT-GATGGA 1371

229812108 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCT 229812167
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1372 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCC 1431

229812168 GCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCA 229812227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 GCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCA 1491

229812228 CCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTT 229812287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1492 CCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTT 1551

229812288 GGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGC 229812347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 GGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGC 1611

229812348 TGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAA 229812407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 TGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAA 1671

229812408 TATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAG 229812467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 TATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAG 1731

229812468 GTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTC 229812527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 GTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTC 1791

229812528 AGCCCA 229812533
          ||||||
     1792 AGCCCA 1797

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1798 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1857

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1917

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1977

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2037

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2097

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2157

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2217

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2277

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2337

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2397

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2457

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2517

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2577

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2637

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2697

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2757

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2817

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2877

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2937

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2997

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3057

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3117

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3177

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3236

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3296

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3356

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3416

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3476

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3536

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3596

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     3597 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3656

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 3716

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 3776

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 3836

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 3896

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 3956

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 4016

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 4076

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 4136

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 4196

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 4256

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 4316

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTC 229823406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4317 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTC 4376

229823407 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAA 229823452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAA 4422

Alignment time is 4.41693 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3441] =>      3441 nucs 'mol-32-2383-004069_3441'

Score:        3326
Aligned:      3443        nucs
Identic:      3425 ( 99%) nucs =>       576 ( 99%)      2849 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229811954,229812533] EXCISED REGION [229820837,229823689]
 second seq =>  [        1,      579] EXCISED REGION [      580,     3441]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229811954 ATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAG 229812013
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
        1 ATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAG 60

229812014 TATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAAT 229812073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAAT 120

229812074 CGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAG 229812133
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTT-GATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAG 179

229812134 TGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCT 229812193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      180 TGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCT 239

229812194 GTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTA 229812253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 GTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTA 299

229812254 TTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGAC 229812313
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 TTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGAC 359

229812314 CTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACG 229812373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 CTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACG 419

229812374 CCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATACAAC 229812433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 CCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATACAAC 479

229812434 AGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTT 229812493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 AGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTT 539

229812494 TTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 579

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      580 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 639

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      640 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 699

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      700 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 759

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      760 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 819

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 879

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 939

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 999

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 1059

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 1119

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 1179

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 1239

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 1299

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 1359

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 1419

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 1479

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 1539

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 1599

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 1659

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 1719

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 1779

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 1839

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 1899

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 1959

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 2018

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 2078

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2079 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 2138

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGGGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 2198

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 2258

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2259 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 2318

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 2378

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     2379 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 2438

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2439 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 2498

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2499 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 2558

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 2618

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2619 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 2678

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2679 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 2738

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2739 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 2798

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2799 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 2858

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2859 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 2918

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2919 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 2978

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2979 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 3038

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3039 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 3098

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTC 229823406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3099 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTC 3158

229823407 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 229823466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3159 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 3218

229823467 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 229823526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3219 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 3278

229823527 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 229823586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3279 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 3338

229823587 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 229823646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3339 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 3398

229823647 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATC 229823689
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3399 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATC 3441

Alignment time is 3.46004 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3552] =>      3552 nucs 'mol-32-2869-003018_3552'

Score:        3463
Aligned:      3554        nucs
Identic:      3540 (100%) nucs =>       422 (100%)      3118 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229812110,229812533] EXCISED REGION [229820837,229823958]
 second seq =>  [        1,      424] EXCISED REGION [      425,     3552]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229812110 CTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGC 229812169
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
        1 CTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGC 60

229812170 CTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACC 229812229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACC 120

229812230 TGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGG 229812289
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGG 180

229812290 CCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 229812349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 240

229812350 GGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATA 229812409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATA 300

229812410 TATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGT 229812469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGT 360

229812470 TCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAG 229812529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAG 420

229812530 CCCA 229812533
          ||||
      421 CCCA 424

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      425 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 484

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 544

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 604

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 664

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 724

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 784

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 844

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 904

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 964

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 1024

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 1084

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 1144

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 1204

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 1264

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 1324

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 1384

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 1444

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 1504

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 1564

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 1624

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 1684

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 1744

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 1804

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 1863

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 1923

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 1983

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 2043

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 2103

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 2163

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 2223

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG------GTGTGTGTGTGTGT 229822688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||
     2224 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 2283

229822689 GTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCTGG 229822748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 GTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCTGG 2343

229822749 AGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTCTG 229822808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 AGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTCTG 2403

229822809 TTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTTTG 229822868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 TTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTTTG 2463

229822869 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGACCT 229822928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGACCT 2523

229822929 CAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCACG 229822988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 CAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCACG 2583

229822989 CCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAACA 229823048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 CCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAACA 2643

229823049 AGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGGGC 229823108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 AGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGGGC 2703

229823109 CTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACGGG 229823168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 CTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACGGG 2763

229823169 TATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGAAG 229823228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 TATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGAAG 2823

229823229 GCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCTCA 229823288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 GCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCTCA 2883

229823289 TTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAGAT 229823348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 TTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAGAT 2943

229823349 GTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTCAA 229823408
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2944 GTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTCAA 3003

229823409 GACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTGTG 229823468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 GACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTGTG 3063

229823469 GTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAGAG 229823528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 GTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAGAG 3123

229823529 ATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAATT 229823588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 ATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAATT 3183

229823589 ATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT 229823648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 ATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT 3243

229823649 CACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAGTC 229823708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 CACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAGTC 3303

229823709 TGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTATA 229823768
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 TGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCT-AAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTATA 3362

229823769 CCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAATT 229823828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 CCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAATT 3422

229823829 AATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATAGA 229823888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 AATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATAGA 3482

229823889 AAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTGCA 229823948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 AAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTGCA 3542

229823949 GGACAGTGAT 229823958
          ||||||||||
     3543 GGACAGTGAT 3552

Alignment time is 3.59879 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     8366] =>      8366 nucs 'mol-32-287f-023717_8366'

Score:        8128
Aligned:      8376        nucs
Identic:      8342 (100%) nucs =>       414 (100%)      7928 (100%)
Gaps:           18 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229812118,229812533] EXCISED REGION [229820837,229828788]
 second seq =>  [        1,      416] EXCISED REGION [      417,     8366]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229812118 GTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGG 229812177
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
        1 GTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGG 60

229812178 TTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTG 229812237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTG 120

229812238 CACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTG 229812297
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTG 180

229812298 GTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 229812357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 240

229812358 GGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTT 229812417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTT 300

229812418 CTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTT 229812477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTT 360

229812478 TTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 416

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      417 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 476

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 536

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 596

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 656

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 716

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 776

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 836

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 896

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 956

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 1016

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 1076

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 1136

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 1196

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 1256

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 1316

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 1376

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 1436

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 1496

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 1556

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 1616

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 1676

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 1736

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 1796

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 1855

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 1915

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 1975

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 2035

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 2095

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 2155

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 2215

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG------GTGTGTGTGTGTGT 229822688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||
     2216 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 2275

229822689 GTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCTGG 229822748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 GTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCTGG 2335

229822749 AGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTCTG 229822808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 AGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTCTG 2395

229822809 TTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTTTG 229822868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTTTG 2455

229822869 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGACCT 229822928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGACCT 2515

229822929 CAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCACG 229822988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 CAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCACG 2575

229822989 CCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAACA 229823048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 CCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAACA 2635

229823049 AGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGGGC 229823108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 AGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGGGC 2695

229823109 CTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACGGG 229823168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 CTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACGGG 2755

229823169 TATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGAAG 229823228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 TATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGAAG 2815

229823229 GCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCTCA 229823288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 GCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCTCA 2875

229823289 TTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAGAT 229823348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 TTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAGAT 2935

229823349 GTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTCAA 229823408
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2936 GTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTCAA 2995

229823409 GACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTGTG 229823468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 GACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTGTG 3055

229823469 GTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAGAG 229823528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 GTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAGAG 3115

229823529 ATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAATT 229823588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 ATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAATT 3175

229823589 ATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT 229823648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 ATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT 3235

229823649 CACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAGTC 229823708
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 CACTTGATCCCGGGATGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAGTC 3295

229823709 TGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTATA 229823768
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 TGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCT-AAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTATA 3354

229823769 CCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAATT 229823828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 CCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAATT 3414

229823829 AATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATAGA 229823888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 AATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATAGA 3474

229823889 AAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTGCA 229823948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 AAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTGCA 3534

229823949 GGACAGTGATCCATTAAGTCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAAGA 229824008
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 GGACAGTGATCCATTAAATCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAAGA 3594

229824009 GGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTCCC 229824068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 GGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTCCC 3654

229824069 TAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCGAG 229824128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 TAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCGAG 3714

229824129 TCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGAGG 229824188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 TCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGAGG 3774

229824189 TCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGCTT 229824248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 TCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGCTT 3834

229824249 CTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTCCA 229824308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 CTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTCCA 3894

229824309 GCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGGCT 229824368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 GCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGGCT 3954

229824369 CATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAG 229824428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 CATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAG 4014

229824429 TTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAG 229824488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 TTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAG 4074

229824489 CCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATC 229824548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 CCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATC 4134

229824549 ACTTGAATCTGCGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCT 229824608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 ACTTGAATCTGCGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCT 4194

229824609 GGGCGACAGTGCAAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACATATATATAT 229824668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 GGGCGACAGTGCAAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACATATATATAT 4254

229824669 ATAGAGAGAGAGCCAAGTTAAAAGGGGAGTGGGGCAAGAAACCCTCTTTACCAGAGGACT 229824728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 ATAGAGAGAGAGCCAAGTTAAAAGGGGAGTGGGGCAAGAAACCCTCTTTACCAGAGGACT 4314

229824729 GGAAGAGAAAGCACTCTAGAAGCCAGTGGGTGTGAGCACATTCAAGTCACCGGGTTTGAG 229824788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 GGAAGAGAAAGCACTCTAGAAGCCAGTGGGTGTGAGCACATTCAAGTCACCGGGTTTGAG 4374

229824789 ATGATGGGTCCGTGGCAGCTGTTTATTCCCTTCCATCACTGGGATGTCCATCTTGGGCGG 229824848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 ATGATGGGTCCGTGGCAGCTGTTTATTCCCTTCCATCACTGGGATGTCCATCTTGGGCGG 4434

229824849 CTTCAAGTTTGCTGGATCTCTAGTCATGTGGTTGGCCTGGGCATGGATCAGTTCCACTGG 229824908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 CTTCAAGTTTGCTGGATCTCTAGTCATGTGGTTGGCCTGGGCATGGATCAGTTCCACTGG 4494

229824909 AGAGGGCTTCTGGGCTCCTTGGTAGGCCTGGGTGGCAAAACTTCCAGAATCATCCTTCTG 229824968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 AGAGGGCTTCTGGGCTCCTTGGTAGGCCTGGGTGGCAAAACTTCCAGAATCATCCTTCTG 4554

229824969 AAGGGATCTCGGTCCAAAGAGGCTCCACTTATCTGACAAGTTTCTGTCCTTATCTCCACT 229825028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 AAGGGATCTCGGTCCAAAGAGGCTCCACTTATCTGACAAGTTTCTGTCCTTATCTCCACT 4614

229825029 TCCAGAATCCATGGTGCTGGGATTTGGGCCAGGTAAAGCTGTGGAAGAACCAGAAGTGAA 229825088
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4615 TCCAGAATCCATGGTGCTGGGAGTTGGGCCAGGTAAAGCTGTGGAAGAACCAGAAGTGAA 4674

229825089 CCAGCCTCTGGGTCTCTGCTCAGGGGAAGAGTGAGGAGTGCAGCTTGGGGCTGACTGGGC 229825148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4675 CCAGCCTCTGGGTCTCTGCTCAGGGGAAGAGTGAGGAGTGCAGCTTGGGGCTGACTGGGC 4734

229825149 TGATGCAGGCTGCCTCTCTTCTCTTGTTCTCTCTCCACTCTGTAGCTTTAGTTGGTGGAG 229825208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 TGATGCAGGCTGCCTCTCTTCTCTTGTTCTCTCTCCACTCTGTAGCTTTAGTTGGTGGAG 4794

229825209 CACTTCCGCCACTCGAAGGTACTTGGTCTCCTCTGCGGTGAGGCCCTTGTGTGGTGTGTA 229825268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4795 CACTTCCGCCACTCGAAGGTACTTGGTCTCCTCTGCGGTGAGGCCCTTGTGTGGTGTGTA 4854

229825269 GCCAGCACCTCTCAACCCTGCCTGTCGCCCAAAATGCTGAGTACTTTCCTGGGTCTGTTT 229825328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4855 GCCAGCACCTCTCAACCCTGCCTGTCGCCCAAAATGCTGAGTACTTTCCTGGGTCTGTTT 4914

229825329 TGTGAACAGAGAATTCATGATGATATGGGTAGCTTTAGACTTCACCACTGGGACTGTGTC 229825388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4915 TGTGAACAGAGAATTCATGATGATATGGGTAGCTTTAGACTTCACCACTGGGACTGTGTC 4974

229825389 ACACTGTCAATGACAGGGTCATGGCAGGGGCGGGTAGGCTGGTCTCTCCTTCCTCCTCCT 229825448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4975 ACACTGTCAATGACAGGGTCATGGCAGGGGCGGGTAGGCTGGTCTCTCCTTCCTCCTCCT 5034

229825449 TGGTGAGGCACTGATACTTGCACTCTGGAATCACTGGCTTCCAGTGGACGCTGCCCGTGT 229825508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5035 TGGTGAGGCACTGATACTTGCACTCTGGAATCACCGGCTTCCAGTGGACGCTGCCCGTGT 5094

229825509 CCGATGGAGGAGTCATGGGCACAGGGTCCTCGAGGGCATCATCATAGCTGGATGCCCAGC 229825568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5095 CCGATGGAGGAGTCATGGGCACAGGGTCCTCGAGGGCATCATCATAGCTGGATGCCCAGC 5154

229825569 AGTTTATCCTGATGGGCAGGGACATCTTTCCTAGAAGCCCACCCAGCCTCAAGAGCAGGC 229825628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5155 AGTTTATCCTGATGGGCAGGGACATCTTTCCTAGAAGCCCACCCAGCCTCAAGAGCAGGC 5214

229825629 ACTTCTGGTTGTGTTGAAGCCAGTGAAAGACTGGGACCCAGGTGCTTTTTCCATATATAT 229825688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5215 ACTTCTGGTTGTGTTGAAGCCAGTGAAAGACTGGGACCCAGGTGCTTTTTCCATATATAT 5274

229825689 AGAATTCTGAGCTGAGTCCCTCCCACCACAGTGAAATGATGTAATGACTAAGCTGACAGA 229825748
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5275 AGAATTCTGAGCTGAGTCCCTGCCACCACAGTGAAATGATGTAATGACTAAGCTGACAGA 5334

229825749 TGTTAATGAGGAACACAGTGCAGCAGCTGCAAATTAGCAAAGCTTCCCAGGAAGAGTGCA 229825808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5335 TGTTAATGAGGAACACAGTGCAGCAGCTGCAAATTAGCAAAGCTTCCCAGGAAGAGTGCA 5394

229825809 TCCAGAGGTTCTGCTATCCTGCTGCTGCTGCTGCTGGGCTGCCTGCGGCCTGGAGTCCAG 229825868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5395 TCCAGAGGTTCTGCTATCCTGCTGCTGCTGCTGCTGGGCTGCCTGCGGCCTGGAGTCCGG 5454

229825869 CGCTAAAGAGGTTCTGAGGGCCCACGTCTCCCGAGAGGCTGTGACGCAGTCTGGACTGAA 229825928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5455 CGCTAAAGAGGTTCTGAGGGCCCACGTCTCCCGAGAGGCTGTGACGCAGTCTGGACTGAA 5514

229825929 GGCATGGTGAGAGCAGTGGCAACACCGAAGGTCTCCAGGACCCAGCAGACAACACTGCCC 229825988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5515 GGCATGGTGAGAGCAGTGGCAACACCGAAGGTCTCCAGGACCCAGCAGACAACACTGCCC 5574

229825989 CCCTGCTATGGTTTTGAAGTGTCTTTTTCTGTACTCAGCCCTTACGTGGTTGCTATAAAC 229826048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5575 CCCTGCTATGGTTTTGAAGTGTCTTTTTCTGTACTCAGCCCTTACGTGGTTGCTATAAAC 5634

229826049 ATTAGACTATTTTTTAAAGTAGTTACAAATGGTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTG 229826108
          |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||
     5635 ATTAGACTATTTTTTAAAGTAGTTACAAATG--------GTTTGTTTGTTTGTTTGTTTG 5686

229826109 TTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTACGATCTCGGC 229826168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5687 TTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTACGATCTCGGC 5746

229826169 TCACTGTAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGC 229826228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5747 TCACTGTAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGC 5806

229826229 TGGGATTACAAGCACCCCCGCCACCGACCGCACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 229826288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5807 TGGGATTACAAGCACCCCCGCCACCGACCGCACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 5866

229826289 GACAGGGTTTCATCACGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCACC 229826348
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5867 GACAGGGTTTCATCACATTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCACC 5926

229826349 CACCTCGGCCTCCCAAAGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGCT 229826408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5927 CACCTCGGCCTCCCAAAGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGCT 5986

229826409 CAATAGAAACATTTTTTTTTAAGTTTCTGCTGTAAAAAAATATATTTCTGTTGAGCCTAG 229826468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5987 CAATAGAAACATTTTTTTTTAAGTTTCTGCTGTAAAAAAATATATTTCTGTTGAGCCTAG 6046

229826469 GAGGTGGAGGTTGCAGTGAACCAAGATTACACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGT 229826528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6047 GAGGTGGAGGTTGCAGTGAACCAAGATTACACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGT 6106

229826529 GAGACCCTGTCTCCAAAAAAAGAAAGTTTCTGTTGGGGGAGAAGAGCTTGGAGGGTCATA 229826588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6107 GAGACCCTGTCTCCAAAAAAAGAAAGTTTCTGTTGGGGGAGAAGAGCTTGGAGGGTCATA 6166

229826589 CTCTGCCATTGTGCTGACGTTGCTGTATTTGTTTTTACATTCAAACTTTCTTTTGTAATA 229826648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6167 CTCTGCCATTGTGCTGACGTTGCTGTATTTGTTTTTACATTCAAACTTTCTTTTGTAATA 6226

229826649 AAATATATCTTGAAAAGCATCAGTGGTGGTGTGGCTTTATTCATTTTTAGTTTGAGAATA 229826708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6227 AAATATATCTTGAAAAGCATCAGTGGTGGTGTGGCTTTATTCATTTTTAGTTTGAGAATA 6286

229826709 TGCACATTTTCTTCCTAATATTTGGCAGTTTGAAATAATCAAAAGGCTCAGGACCCAGTT 229826768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6287 TGCACATTTTCTTCCTAATATTTGGCAGTTTGAAATAATCAAAAGGCTCAGGACCCAGTT 6346

229826769 AAGAGAGTTTATTCAAGTGCACTGTCAGGGTGGCCATCTCAGGACACGTGGACACCAAAG 229826828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6347 AAGAGAGTTTATTCAAGTGCACTGTCAGGGTGGCCATCTCAGGACACGTGGACACCAAAG 6406

229826829 AATGGTGATTGGTGCTCCTGGTGTCCTGGTGTGGGGAAAAGTGAGGGCTGCTTATGAGGT 229826888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6407 AATGGTGATTGGTGCTCCTGGTGTCCTGGTGTGGGGAAAAGTGAGGGCTGCTTATGAGGT 6466

229826889 CAAAAATGGAAGTGTTGAATGGAATCACAGCATTTTCCATAGAGAGGCTAACATGCAGAT 229826948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6467 CAAAAATGGAAGTGTTGAATGGAATCACAGCATTTTCCATAGAGAGGCTAACATGCAGAT 6526

229826949 ATAAGATTTGATTGGCTACTATCGATTCCACGCTAAGGGGGTGGCTTAACATCCTATTGT 229827008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6527 ATAAGATTTGATTGGCTACTATCGATTCCACGCTAAGGGGGTGGCTTAACATCCTATTGT 6586

229827009 AGGGAGATAACAACCACAAGGTCTCCAGCATCATTTTGTGTAGGTTTGAATGAAGAATGG 229827068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6587 AGGGAGATAACAACCACAAGGTCTCCAGCATCATTTTGTGTAGGTTTGAATGAAGAATGG 6646

229827069 GAAGTCTGGTTGGCATGTAACATCTCAACACAAAAGTCAGGAAGCAATGGTCATGCACCA 229827128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6647 GAAGTCTGGTTGGCATGTAACATCTCAACACAAAAGTCAGGAAGCAATGGTCATGCACCA 6706

229827129 GAGGAAAAGAACGGTCATGTTATATGACTCAGTTTGCAGGGCTTAACTTTTATTCTTAGC 229827188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6707 GAGGAAAAGAACGGTCATGTTATATGACTCAGTTTGCAGGGCTTAACTTTTATTCTTAGC 6766

229827189 ACAGTACATTTGGAAGGTGCTAAAATTTTATCTCTTTTCACATACGGCAGGCGGATACAT 229827248
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6767 ACAGTACATTTGGAAGGTGCTAAAATTTTCTCTCTTTTCACATACGGCAGGCGGATACAT 6826

229827249 CAGTGTCCCAGGCGGGGCTGGCTATGCTTTAGAGTACTGGCTGTCCCTGTGTTCTCTACT 229827308
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     6827 CAGTGTCCCAGGCGGGGCTGGCTATGCTTTAGAGTACTGGCTGTCCCTGTGGTCTCTACT 6886

229827309 GTCTATCAAGTGGTACCCAATCTCCTACCACAAAGGGCTCGAGGTTTTCAGCCAGACAAC 229827368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6887 GTCTATCAAGTGGTACCCAATCTCCTACCACAAAGGGCTCGAGGTTTTCAGCCAGACAAC 6946

229827369 AGTGTGTGTGCCTTGATTTGCAGCTCAGATAAATATCTTCTCATAGTCAGTTCAGCTGAA 229827428
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6947 AGTGTGTGTGCCTTTATTTGCAGCTCAGATAAATATCTTCTCATAGTCAGTTCAGCTGAA 7006

229827429 AAACATTTATTGAGTACTATATGTCAAGTACGGCAGAACACATGGGGGTATAACTGAGGA 229827488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7007 AAACATTTATTGAGTACTATATGTCAAGTACGGCAGAACACATGGGGGTATAACTGAGGA 7066

229827489 CATAGAGGATCCATGCTAGAGGAATGTACTTCCAGTGAGAGAACAGACGGTAGGCAAACA 229827548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7067 CATAGAGGATCCATGCTAGAGGAATGTACTTCCAGTGAGAGAACAGACGGTAGGCAAACA 7126

229827549 ATTTTAGGACAATGGGGAGCTGCCATGATGGAGGCATGTAGATGGTCCTGTGGGAGCACA 229827608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7127 ATTTTAGGACAATGGGGAGCTGCCATGATGGAGGCATGTAGATGGTCCTGTGGGAGCACA 7186

229827609 GAGCAGGAACTTCCTGGAACTGAGCATTTTTGTTTGTTTGTTTGAGACAAGGTCTTACTC 229827668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7187 GAGCAGGAACTTCCTGGAACTGAGCATTTTTGTTTGTTTGTTTGAGACAAGGTCTTACTC 7246

229827669 TGTTGCCCAGGCTAGATGCAGTGGTGCCATCACAGCTCACTGTAACCTCCAACTCCTGGG 229827728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7247 TGTTGCCCAGGCTAGATGCAGTGGTGCCATCACAGCTCACTGTAACCTCCAACTCCTGGG 7306

229827729 CTCAAGCGATCCTTCTGCCTTAGTGTCCTGAGTAGCTAGGAATACAGGCATGCACCACCA 229827788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7307 CTCAAGCGATCCTTCTGCCTTAGTGTCCTGAGTAGCTAGGAATACAGGCATGCACCACCA 7366

229827789 CACCTGGATAATTTTTAAAATTTTCTGCCGACAGAGGGTCTCACTATATTGCCCAGGCTG 229827848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7367 CACCTGGATAATTTTTAAAATTTTCTGCCGACAGAGGGTCTCACTATATTGCCCAGGCTG 7426

229827849 GTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGAAATCCTTTTATCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGAATGA 229827908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7427 GTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGAAATCCTTTTATCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGAATGA 7486

229827909 CAGGAGTAAGTCACCGGCCTCAGCCCTGGGAGCTGAGTCTTGATGAGAAGTTAGCTAAAT 229827968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7487 CAGGAGTAAGTCACCGGCCTCAGCCCTGGGAGCTGAGTCTTGATGAGAAGTTAGCTAAAT 7546

229827969 GAAGAAGGAAGGGCCACCAGATGAAAAATTCATAACAAAGCCTGAATGAAAACTCGGGAT 229828028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7547 GAAGAAGGAAGGGCCACCAGATGAAAAATTCATAACAAAGCCTGAATGAAAACTCGGGAT 7606

229828029 TTCGGAGTCCTGGTCCAGTGTTTTTCTTACTTATCTGGGTTTTCAGAATCTCGTCTAGAA 229828088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7607 TTCGGAGTCCTGGTCCAGTGTTTTTCTTACTTATCTGGGTTTTCAGAATCTCGTCTAGAA 7666

229828089 GAGACTCATATTCTTGTTTAATCTGGCAGGGCTTTTTTTCTTGTAAGGTTTGTTGGGAAA 229828148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7667 GAGACTCATATTCTTGTTTAATCTGGCAGGGCTTTTTTTCTTGTAAGGTTTGTTGGGAAA 7726

229828149 TGAGGTATTTTGACCTGCTTGACTGATTCACCTACTAAAAGGATTATATAGTCACTGCTC 229828208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7727 TGAGGTATTTTGACCTGCTTGACTGATTCACCTACTAAAAGGATTATATAGTCACTGCTC 7786

229828209 TAGAAAACCACTTCCTCAGTGAGAATGTGGTCCCGTAGATTGTGCGTCCTGGTTTTTCAC 229828268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7787 TAGAAAACCACTTCCTCAGTGAGAATGTGGTCCCGTAGATTGTGCGTCCTGGTTTTTCAC 7846

229828269 ACATTATTATCATTCTTTTTTGTTTGTTTGTTTCAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAG 229828328
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7847 ACATTATTATCATTCTTTTTTTTTTGTTTGTTTCAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAG 7906

229828329 GCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAA 229828388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7907 GCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAA 7966

229828389 TTCTCATGTCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCATGCCCAGCT 229828448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7967 TTCTCATGTCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCATGCCCAGCT 8026

229828449 AATTTTTAAATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACT 229828508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8027 AATTTTTAAATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACT 8086

229828509 CCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAG 229828568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     8087 CCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAG 8146

229828569 CCGCCACACCCAGCCTATTATTTATTATTCTAACCTGTGTTCCAACACACTTCAATGACC 229828628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8147 CCGCCACACCCAGCCTATTATTTATTATTCTAACCTGTGTTCCAACACACTTCAATGACC 8206

229828629 TGCTTGTTGAATGGCTTTCAGAAGGGAGGCTTTGCCTTTCTTCCTGGGATAGAGTCATCT 229828688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8207 TGCTTGTTGAATGGCTTTCAGAAGGGAGGCTTTGCCTTTCTTCCTGGGATAGAGTCATCT 8266

229828689 GAGTTTGTCTTGGCTCAGTTCTAAGTGACTGGTCTCTTTACCTGTCATCCCCATTGCCAG 229828748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8267 GAGTTTGTCTTGGCTCAGTTCTAAGTGACTGGTCTCTTTACCTGTCATCCCCATTGCCAG 8326

229828749 CTTAGATCTAGGCAGCATCCCATGAGACTCAATCCTTCCT 229828788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8327 CTTAGATCTAGGCAGCATCCCATGAGACTCAATCCTTCCT 8366

Alignment time is 8.34846 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     4015] =>      4015 nucs 'mol-32-2895-002021_4015'

Score:        3904
Aligned:      4024        nucs
Identic:      4000 ( 99%) nucs =>      1734 ( 99%)      2266 ( 99%)
Gaps:           19 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810789,229812533] EXCISED REGION [229820837,229823105]
 second seq =>  [        1,     1737] EXCISED REGION [     1738,     4015]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810789 CCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTC 229810848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTC 60

229810849 AGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTG 229810908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTG 120

229810909 GAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATA 229810968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATA 180

229810969 CAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCT 229811028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCT 240

229811029 GTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGT 229811088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGT 300

229811089 GCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCT 229811148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCT 360

229811149 TTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCT 229811208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCT 420

229811209 CCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATA 229811268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATA 480

229811269 AATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCA 229811328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCA 540

229811329 CCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCA 229811388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||
      541 CCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCA 592

229811389 CCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCA 229811448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 CCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCA 652

229811449 TGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATT 229811508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 TGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATT 712

229811509 CCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAG 229811568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 CCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAG 772

229811569 GCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCAT 229811628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 GCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCAT 832

229811629 ATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTA 229811688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 ATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTA 892

229811689 CATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCC 229811748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 CATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCC 952

229811749 AGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATAT 229811808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 AGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATAT 1012

229811809 CTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCAT 229811868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 CTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCAT 1072

229811869 ACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAG 229811928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 ACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAG 1132

229811929 CTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTAT 229811988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 CTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTAT 1192

229811989 CATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAG 229812048
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 TATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAG 1252

229812049 TGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAG 229812108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAG 1312

229812109 TCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTG 229812168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1313 TCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCG 1372

229812169 CCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCAC 229812228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 CCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCAC 1432

229812229 CTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTG 229812288
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1433 CTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTG 1492

229812289 GCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCT 229812348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 GCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCT 1552

229812349 GGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAAT 229812408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 GGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAAT 1612

229812409 ATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGG 229812468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 ATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGG 1672

229812469 TTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCA 229812528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 TTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCA 1732

229812529 GCCCA 229812533
          |||||
     1733 GCCCA 1737

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1738 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1797

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1857

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1917

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 1977

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2037

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2097

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2157

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2217

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2277

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2337

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2397

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2457

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2517

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2577

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2637

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2697

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2757

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2817

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2877

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2937

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 2997

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3057

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3117

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3176

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3236

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3296

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3356

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3416

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3476

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3536

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     3537 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3596

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 3656

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 3716

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 TGTCTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 3776

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 3836

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 3896

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 3956

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAG 229823105
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAG 4015

Alignment time is 4.01238 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3071] =>      3071 nucs 'mol-32-29df-043472_3071'

Score:        2999
Aligned:      3072        nucs
Identic:      3058 (100%) nucs =>       231 (100%)      2827 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229812303,229812533] EXCISED REGION [229820837,229823667]
 second seq =>  [        1,      231] EXCISED REGION [      232,     3071]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229812303 GAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGC 229812362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGC 60

229812363 GAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTA 229812422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTA 120

229812423 CCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTT 229812482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTT 180

229812483 CAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 231

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      232 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 291

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      292 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 351

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      352 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTCGACAGTGTGCTTATA 411

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      412 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 471

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      472 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 531

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      532 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 591

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      592 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 651

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      652 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 711

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      712 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 771

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 831

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 891

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 951

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 1011

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 1071

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 1131

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 1191

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 1251

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 1311

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 1371

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 1431

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 1491

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 1551

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 1611

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 1670

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 1730

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 1790

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 1850

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 1910

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 1970

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 2030

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     2031 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 2090

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 2150

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 2210

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 2270

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 2330

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 2390

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 2450

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 2510

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 2570

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 2630

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 2690

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 2750

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTC 229823406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2751 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTC 2810

229823407 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 229823466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 2870

229823467 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 229823526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 2930

229823527 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 229823586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 2990

229823587 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 229823646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 3050

229823647 ATCACTTGATCCCGGGAGGCA 229823667
          |||||||||||||||||||||
     3051 ATCACTTGATCCCGGGAGGCA 3071

Alignment time is 3.08306 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2884] =>      2884 nucs 'mol-32-2b08-129936_2884'

Score:        2812
Aligned:      2892        nucs
Identic:      2879 (100%) nucs =>      1834 ( 99%)      1045 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810688,229812533] EXCISED REGION [229820837,229821882]
 second seq =>  [        2,     1838] EXCISED REGION [     1839,     2884]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810688 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGAATCATTGTGGATCCTTGCACCACT 229810747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        2 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGAATCATTGTGGATCCTTGCACCACT 61

229810748 ATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGCAGGAG 229810807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       62 ATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGCAGGAG 121

229810808 AAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGCAA 229810867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      122 AAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGCAA 181

229810868 CATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGCAG 229810927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      182 CATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGCAG 241

229810928 AGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAGGC 229810987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      242 AGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAGGC 301

229810988 CACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCCCA 229811047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      302 CACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCCCA 361

229811048 TGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGTTA 229811107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      362 TGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGTTA 421

229811108 ATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATATCA 229811167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      422 ATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATATCA 481

229811168 TTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTA 229811227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      482 TTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTA 541

229811228 GCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTC 229811287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      542 GCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTC 601

229811288 ATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCC 229811347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      602 ATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCC 661

229811348 ATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCC 229811407
          |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      662 ATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCC 713

229811408 ATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACT 229811467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 ATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACT 773

229811468 AGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCT 229811527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 AGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCT 833

229811528 ATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGG 229811587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 ATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGG 893

229811588 CAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAG 229811647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 CAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAG 953

229811648 CCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGC 229811707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 CCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGC 1013

229811708 TATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCC 229811767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 TATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCC 1073

229811768 CAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCA 229811827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 CAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCA 1133

229811828 TTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGG 229811887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 TTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGG 1193

229811888 GTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCC 229811947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 GTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCC 1253

229811948 ATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAATGAGGCTATAA 229812007
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1254 ATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAATGAGGCTATAA 1313

229812008 GGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCC 229812067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 GGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCC 1373

229812068 TAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGG 229812127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     1374 TAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTT-GATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGG 1432

229812128 CTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGTGAT 229812187
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1433 CTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGTTCAAGTGAT 1492

229812188 TCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTA 229812247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 TCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTA 1552

229812248 ATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACT 229812307
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 ATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACT 1612

229812308 CCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCC 229812367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 CCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCC 1672

229812368 ATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATA 229812427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 ATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATA 1732

229812428 TACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTG 229812487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 TACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTG 1792

229812488 AACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 AACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1838

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1839 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1898

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1958

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 2018

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2078

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2079 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2138

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2198

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2258

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2259 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2318

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2378

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2438

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2439 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2498

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2499 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2558

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2618

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2619 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2678

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2679 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2738

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2739 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2798

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2799 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2858

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCC 229821882
          ||||||||||||||||||||||||||
     2859 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCC 2884

Alignment time is 2.88741 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     8939] =>      8939 nucs 'mol-32-2b34-043387_8939'

Score:        8714
Aligned:      8957        nucs
Identic:      8921 (100%) nucs =>      1690 ( 99%)      7231 (100%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810833,229812533] EXCISED REGION [229820837,229828088]
 second seq =>  [        1,     1693] EXCISED REGION [     1694,     8939]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810833 AAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGC 229810892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGC 60

229810893 ACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGC 229810952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGC 120

229810953 ACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATC 229811012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATC 180

229811013 ACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAA 229811072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAA 240

229811073 CTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGG 229811132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGG 300

229811133 AATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCA 229811192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCA 360

229811193 GATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATG 229811252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATG 420

229811253 AATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCA 229811312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCA 480

229811313 CACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCA 229811372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||
      481 CACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCA 532

229811373 CACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAA 229811432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      533 CACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAA 592

229811433 AATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAA 229811492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 AATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAA 652

229811493 ATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACA 229811552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 ATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACA 712

229811553 ACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCAC 229811612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 ACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCAC 772

229811613 TGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATA 229811672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATA 832

229811673 CATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTA 229811732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 CATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTA 892

229811733 GCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTG 229811792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 GCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTG 952

229811793 TGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGC 229811852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 TGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGC 1012

229811853 AGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAG 229811912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 AGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAG 1072

229811913 GTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCT 229811972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 GTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCT 1132

229811973 ATAATTACAAAGGTATCATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTT 229812032
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 ATAATTACAAAGGTATTATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTT 1192

229812033 TAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTT 229812092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 TAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTT 1252

229812093 TTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGG 229812152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGG 1312

229812153 TTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAG 229812212
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 TTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAG 1372

229812213 CTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGT 229812272
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1373 CTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGT 1432

229812273 TTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTC 229812332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 TTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTC 1492

229812333 GGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCA 229812392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 GGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCA 1552

229812393 TAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTT 229812452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 TAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTT 1612

229812453 AAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAG 229812512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 AAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAG 1672

229812513 TCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          |||||||||||||||||||||
     1673 TCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1693

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1694 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1753

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1754 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGGTTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1813

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1873

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 1933

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 1993

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2053

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2113

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2173

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2233

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2293

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2353

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2413

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2473

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2533

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2593

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2653

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2654 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2713

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2773

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2774 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2833

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2893

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2894 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 2953

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2954 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3013

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3014 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3073

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3074 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3132

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3192

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3252

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3253 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3312

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3313 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3372

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3432

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3492

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--GTGTGTGTGTGTGTGTGT 229822692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||
     3493 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3552

229822693 GTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCTGGAGTG 229822752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3553 GTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCTGGAGTG 3612

229822753 CAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTCTGTTTC 229822812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3613 CAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTCTGTTTC 3672

229822813 AGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTTTGTATT 229822872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3673 AGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTTTGTATT 3732

229822873 TTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGACCTCAAA 229822932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 TTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGACCTCAAA 3792

229822933 TGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCACGCCCA 229822992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 TGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCACGCCCA 3852

229822993 GCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAACAAGAT 229823052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3853 GCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAACAAGAT 3912

229823053 GTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGGGCCTCT 229823112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3913 GTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGGGCCTCT 3972

229823113 CTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACGGGTATT 229823172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3973 CTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACGGGTATT 4032

229823173 TGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGAAGGCAG 229823232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4033 TGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGAAGGCAG 4092

229823233 TTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCTCATTTT 229823292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4093 TTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCTCATTTT 4152

229823293 GGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAGATGTTT 229823352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4153 GGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAGATGTTT 4212

229823353 CAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTCAAGACT 229823412
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4213 CAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTCAAGACT 4272

229823413 ATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTGTGGTGG 229823472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4273 ATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTGTGGTGG 4332

229823473 CTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAGAGATCA 229823532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4333 CTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAGAGATCA 4392

229823533 AGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAATTATCT 229823592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4393 AGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAATTATCT 4452

229823593 GGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACT 229823652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4453 GGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACT 4512

229823653 TGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAGTCTGGT 229823712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4513 TGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAGTCTGGT 4572

229823713 GACAGAGCGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTATACCAA 229823772
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4573 GACAGAGCGAGACTCCGTCT-AAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTATACCAA 4631

229823773 ATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAATTAATC 229823832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4632 ATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAATTAATC 4691

229823833 TCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATAGAAAGA 229823892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4692 TCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATAGAAAGA 4751

229823893 GGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTGCAGGAC 229823952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4752 GGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTGCAGGAC 4811

229823953 AGTGATCCATTAAGTCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAAGAGGGT 229824012
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4812 AGTGATCCATTAAATCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAAGAGGGT 4871

229824013 CCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTCCCTAAG 229824072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4872 CCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTCCCTAAG 4931

229824073 TGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCGAGTCAG 229824132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4932 TGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCGAGTCAG 4991

229824133 TGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGAGGTCCC 229824192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4992 TGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGAGGTCCC 5051

229824193 CCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGCTTCTTC 229824252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5052 CCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGCTTCTTC 5111

229824253 CACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTCCAGCTC 229824312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5112 CACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTCCAGCTC 5171

229824313 TGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGGCTCATT 229824372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5172 TGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGGCTCATT 5231

229824373 CCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCA 229824432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5232 CCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCA 5291

229824433 AGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAG 229824492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5292 AGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAG 5351

229824493 GCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTT 229824552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5352 GCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTT 5411

229824553 GAATCTGCGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGC 229824612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5412 GAATCTGCGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGC 5471

229824613 GACAGTGCAAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACATATATATATATAG 229824672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5472 GACAGTGCAAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACATATATATATATAG 5531

229824673 AGAGAGAGCCAAGTTAAAAGGGGAGTGGGGCAAGAAACCCTCTTTACCAGAGGACTGGAA 229824732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5532 AGAGAGAGCCAAGTTAAAAGGGGAGTGGGGCAAGAAACCCTCTTTACCAGAGGACTGGAA 5591

229824733 GAGAAAGCACTCTAGAAGCCAGTGGGTGTGAGCACATTCAAGTCACCGGGTTTGAGATGA 229824792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5592 GAGAAAGCACTCTAGAAGCCAGTGGGTGTGAGCACATTCAAGTCACCGGGTTTGAGATGA 5651

229824793 TGGGTCCGTGGCAGCTGTTTATTCCCTTCCATCACTGGGATGTCCATCTTGGGCGGCTTC 229824852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5652 TGGGTCCGTGGCAGCTGTTTATTCCCTTCCATCACTGGGATGTCCATCTTGGGCGGCTTC 5711

229824853 AAGTTTGCTGGATCTCTAGTCATGTGGTTGGCCTGGGCATGGATCAGTTCCACTGGAGAG 229824912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5712 AAGTTTGCTGGATCTCTAGTCATGTGGTTGGCCTGGGCATGGATCAGTTCCACTGGAGAG 5771

229824913 GGCTTCTGGGCTCCTTGGTAGGCCTGGGTGGCAAAACTTCCAGAATCATCCTTCTGAAGG 229824972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5772 GGCTTCTGGGCTCCTTGGTAGGCCTGGGTGGCAAAACTTCCAGAATCATCCTTCTGAAGG 5831

229824973 GATCTCGGTCCAAAGAGGCTCCACTTATCTGACAAGTTTCTGTCCTTATCTCCACTTCCA 229825032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5832 GATCTCGGTCCAAAGAGGCTCCACTTATCTGACAAGTTTCTGTCCTTATCTCCACTTCCA 5891

229825033 GAATCCATGGTGCTGGGATTTGGGCCAGGTAAAGCTGTGGAAGAACCAGAAGTGAACCAG 229825092
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5892 GAATCCATGGTGCTGGGAGTTGGGCCAGGTAAAGCTGTGGAAGAACCAGAAGTGAACCAG 5951

229825093 CCTCTGGGTCTCTGCTCAGGGGAAGAGTGAGGAGTGCAGCTTGGGGCTGACTGGGCTGAT 229825152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5952 CCTCTGGGTCTCTGCTCAGGGGAAGAGTGAGGAGTGCAGCTTGGGGCTGACTGGGCTGAT 6011

229825153 GCAGGCTGCCTCTCTTCTCTTGTTCTCTCTCCACTCTGTAGCTTTAGTTGGTGGAGCACT 229825212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6012 GCAGGCTGCCTCTCTTCTCTTGTTCTCTCTCCACTCTGTAGCTTTAGTTGGTGGAGCACT 6071

229825213 TCCGCCACTCGAAGGTACTTGGTCTCCTCTGCGGTGAGGCCCTTGTGTGGTGTGTAGCCA 229825272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6072 TCCGCCACTCGAAGGTACTTGGTCTCCTCTGCGGTGAGGCCCTTGTGTGGTGTGTAGCCA 6131

229825273 GCACCTCTCAACCCTGCCTGTCGCCCAAAATGCTGAGTACTTTCCTGGGTCTGTTTTGTG 229825332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6132 GCACCTCTCAACCCTGCCTGTCGCCCAAAATGCTGAGTACTTTCCTGGGTCTGTTTTGTG 6191

229825333 AACAGAGAATTCATGATGATATGGGTAGCTTTAGACTTCACCACTGGGACTGTGTCACAC 229825392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6192 AACAGAGAATTCATGATGATATGGGTAGCTTTAGACTTCACCACTGGGACTGTGTCACAC 6251

229825393 TGTCAATGACAGGGTCATGGCAGGGGCGGGTAGGCTGGTCTCTCCTTCCTCCTCCTTGGT 229825452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6252 TGTCAATGACAGGGTCATGGCAGGGGCGGGTAGGCTGGTCTCTCCTTCCTCCTCCTTGGT 6311

229825453 GAGGCACTGATACTTGCACTCTGGAATCACTGGCTTCCAGTGGACGCTGCCCGTGTCCGA 229825512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6312 GAGGCACTGATACTTGCACTCTGGAATCACTGGCTTCCAGTGGACGCTGCCCGTGTCCGA 6371

229825513 TGGAGGAGTCATGGGCACAGGGTCCTCGAGGGCATCATCATAGCTGGATGCCCAGCAGTT 229825572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6372 TGGAGGAGTCATGGGCACAGGGTCCTCGAGGGCATCATCATAGCTGGATGCCCAGCAGTT 6431

229825573 TATCCTGATGGGCAGGGACATCTTTCCTAGAAGCCCACCCAGCCTCAAGAGCAGGCACTT 229825632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6432 TATCCTGATGGGCAGGGACATCTTTCCTAGAAGCCCACCCAGCCTCAAGAGCAGGCACTT 6491

229825633 CTGGTTGTGTTGAAGCCAGTGAAAGACTGGGACCCAGGTGCTTTTTCCATATATATAGAA 229825692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6492 CTGGTTGTGTTGAAGCCAGTGAAAGACTGGGACCCAGGTGCTTTTTCCATATATATAGAA 6551

229825693 TTCTGAGCTGAGTCCCTCCCACCACAGTGAAATGATGTAATGACTAAGCTGACAGATGTT 229825752
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6552 TTCTGAGCTGAGTCCCTGCCACCACAGTGAAATGATGTAATGACTAAGCTGACAGATGTT 6611

229825753 AATGAGGAACACAGTGCAGCAGCTGCAAATTAGCAAAGCTTCCCAGGAAGAGTGCATCCA 229825812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6612 AATGAGGAACACAGTGCAGCAGCTGCAAATTAGCAAAGCTTCCCAGGAAGAGTGCATCCA 6671

229825813 GAGGTTCTGCTATCCTGCTGCTGCTGCTGCTGGGCTGCCTGCGGCCTGGAGTCCAGCGCT 229825872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     6672 GAGGTTCTGCTATCCTGCTGCTGCTGCTGCTGGGCTGCCTGCGGCCTGGAGTCCGGCGCT 6731

229825873 AAAGAGGTTCTGAGGGCCCACGTCTCCCGAGAGGCTGTGACGCAGTCTGGACTGAAGGCA 229825932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6732 AAAGAGGTTCTGAGGGCCCACGTCTCCCGAGAGGCTGTGACGCAGTCTGGACTGAAGGCA 6791

229825933 TGGTGAGAGCAGTGGCAACACCGAAGGTCTCCAGGACCCAGCAGACAACACTGCCCCCCT 229825992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6792 TGGTGAGAGCAGTGGCAACACCGAAGGTCTCCAGGACCCAGCAGACAACACTGCCCCCCT 6851

229825993 GCTATGGTTTTGAAGTGTCTTTTTCTGTACTCAGCCCTTACGTGGTTGCTATAAACATTA 229826052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6852 GCTATGGTTTTGAAGTGTCTTTTTCTGTACTCAGCCCTTACGTGGTTGCTATAAACATTA 6911

229826053 GACTATTTTTTAAAGTAGTTACAAATGGTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTT 229826112
          |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||
     6912 GACTATTTTTTAAAGTAGTTACAAATG--------GTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTT 6963

229826113 TTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTACGATCTCGGCTCAC 229826172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6964 TTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTACGATCTCGGCTCAC 7023

229826173 TGTAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGG 229826232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7024 TGTAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGG 7083

229826233 ATTACAAGCACCCCCGCCACCGACCGCACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACA 229826292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7084 ATTACAAGCACCCCCGCCACCGACCGCACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACA 7143

229826293 GGGTTTCATCACGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCACCCACC 229826352
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7144 GGGTTTCATCACATTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCACCCACC 7203

229826353 TCGGCCTCCCAAAGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGCTCAAT 229826412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7204 TCGGCCTCCCAAAGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGCTCAAT 7263

229826413 AGAAACATTTTTTTTTAAGTTTCTGCTGTAAAAAAATATATTTCTGTTGAGCCTAGGAGG 229826472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7264 AGAAACATTTTTTTTTAAGTTTCTGCTGTAAAAAAATATATTTCTGTTGAGCCTAGGAGG 7323

229826473 TGGAGGTTGCAGTGAACCAAGATTACACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGA 229826532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7324 TGGAGGTTGCAGTGAACCAAGATTACACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGA 7383

229826533 CCCTGTCTCCAAAAAAAGAAAGTTTCTGTTGGGGGAGAAGAGCTTGGAGGGTCATACTCT 229826592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7384 CCCTGTCTCCAAAAAAAGAAAGTTTCTGTTGGGGGAGAAGAGCTTGGAGGGTCATACTCT 7443

229826593 GCCATTGTGCTGACGTTGCTGTATTTGTTTTTACATTCAAACTTTCTTTTGTAATAAAAT 229826652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7444 GCCATTGTGCTGACGTTGCTGTATTTGTTTTTACATTCAAACTTTCTTTTGTAATAAAAT 7503

229826653 ATATCTTGAAAAGCATCAGTGGTGGTGTGGCTTTATTCATTTTTAGTTTGAGAATATGCA 229826712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7504 ATATCTTGAAAAGCATCAGTGGTGGTGTGGCTTTATTCATTTTTAGTTTGAGAATATGCA 7563

229826713 CATTTTCTTCCTAATATTTGGCAGTTTGAAATAATCAAAAGGCTCAGGACCCAGTTAAGA 229826772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7564 CATTTTCTTCCTAATATTTGGCAGTTTGAAATAATCAAAAGGCTCAGGACCCAGTTAAGA 7623

229826773 GAGTTTATTCAAGTGCACTGTCAGGGTGGCCATCTCAGGACACGTGGACACCAAAGAATG 229826832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7624 GAGTTTATTCAAGTGCACTGTCAGGGTGGCCATCTCAGGACACGTGGACACCAAAGAATG 7683

229826833 GTGATTGGTGCTCCTGGTGTCCTGGTGTGGGGAAAAGTGAGGGCTGCTTATGAGGTCAAA 229826892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7684 GTGATTGGTGCTCCTGGTGTCCTGGTGTGGGGAAAAGTGAGGGCTGCTTATGAGGTCAAA 7743

229826893 AATGGAAGTGTTGAATGGAATCACAGCATTTTCCATAGAGAGGCTAACATGCAGATATAA 229826952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7744 AATGGAAGTGTTGAATGGAATCACAGCATTTTCCATAGAGAGGCTAACATGCAGATATAA 7803

229826953 GATTTGATTGGCTACTATCGATTCCACGCTAAGGGGGTGGCTTAACATCCTATTGTAGGG 229827012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7804 GATTTGATTGGCTACTATCGATTCCACGCTAAGGGGGTGGCTTAACATCCTATTGTAGGG 7863

229827013 AGATAACAACCACAAGGTCTCCAGCATCATTTTGTGTAGGTTTGAATGAAGAATGGGAAG 229827072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7864 AGATAACAACCACAAGGTCTCCAGCATCATTTTGTGTAGGTTTGAATGAAGAATGGGAAG 7923

229827073 TCTGGTTGGCATGTAACATCTCAACACAAAAGTCAGGAAGCAATGGTCATGCACCAGAGG 229827132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7924 TCTGGTTGGCATGTAACATCTCAACACAAAAGTCAGGAAGCAATGGTCATGCACCAGAGG 7983

229827133 AAAAGAACGGTCATGTTATATGACTCAGTTTGCAGGGCTTAACTTTTATTCTTAGCACAG 229827192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7984 AAAAGAACGGTCATGTTATATGACTCAGTTTGCAGGGCTTAACTTTTATTCTTAGCACAG 8043

229827193 TACATTTGGAAGGTGCTAAAATTTTATCTCTTTTCACATACGGCAGGCGGATACATCAGT 229827252
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8044 TACATTTGGAAGGTGCTAAAATTTTCTCTCTTTTCACATACGGCAGGCGGATACATCAGT 8103

229827253 GTCCCAGGCGGGGCTGGCTATGCTTTAGAGTACTGGCTGTCCCTGTGTTCTCTACTGTCT 229827312
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     8104 GTCCCAGGCGGGGCTGGCTATGCTTTAGAGTACTGGCTGTCCCTGTGGTCTCTACTGTCT 8163

229827313 ATCAAGTGGTACCCAATCTCCTACCACAAAGGGCTCGAGGTTTTCAGCCAGACAACAGTG 229827372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8164 ATCAAGTGGTACCCAATCTCCTACCACAAAGGGCTCGAGGTTTTCAGCCAGACAACAGTG 8223

229827373 TGTGTGCCTTGATTTGCAGCTCAGATAAATATCTTCTCATAGTCAGTTCAGCTGAAAAAC 229827432
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8224 TGTGTGCCTTTATTTGCAGCTCAGATAAATATCTTCTCATAGTCAGTTCAGCTGAAAAAC 8283

229827433 ATTTATTGAGTACTATATGTCAAGTACGGCAGAACACATGGGGGTATAACTGAGGACATA 229827492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8284 ATTTATTGAGTACTATATGTCAAGTACGGCAGAACACATGGGGGTATAACTGAGGACATA 8343

229827493 GAGGATCCATGCTAGAGGAATGTACTTCCAGTGAGAGAACAGACGGTAGGCAAACAATTT 229827552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8344 GAGGATCCATGCTAGAGGAATGTACTTCCAGTGAGAGAACAGACGGTAGGCAAACAATTT 8403

229827553 TAGGACAATGGGGAGCTGCCATGATGGAGGCATGTAGATGGTCCTGTGGGAGCACAGAGC 229827612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8404 TAGGACAATGGGGAGCTGCCATGATGGAGGCATGTAGATGGTCCTGTGGGAGCACAGAGC 8463

229827613 AGGAACTTCCTGGAACTGAGCATTTTTGTTTGTTTGTTTGAGACAAGGTCTTACTCTGTT 229827672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8464 AGGAACTTCCTGGAACTGAGCATTTTTGTTTGTTTGTTTGAGACAAGGTCTTACTCTGTT 8523

229827673 GCCCAGGCTAGATGCAGTGGTGCCATCACAGCTCACTGTAACCTCCAACTCCTGGGCTCA 229827732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8524 GCCCAGGCTAGATGCAGTGGTGCCATCACAGCTCACTGTAACCTCCAACTCCTGGGCTCA 8583

229827733 AGCGATCCTTCTGCCTTAGTGTCCTGAGTAGCTAGGAATACAGGCATGCACCACCACACC 229827792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8584 AGCGATCCTTCTGCCTTAGTGTCCTGAGTAGCTAGGAATACAGGCATGCACCACCACACC 8643

229827793 TGGATAATTTTTAAAATTTTCTGCCGACAGAGGGTCTCACTATATTGCCCAGGCTGGTCT 229827852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8644 TGGATAATTTTTAAAATTTTCTGCCGACAGAGGGTCTCACTATATTGCCCAGGCTGGTCT 8703

229827853 CAAACTCCTGGCCTCAAGAAATCCTTTTATCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGAATGACAGG 229827912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8704 CAAACTCCTGGCCTCAAGAAATCCTTTTATCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGAATGACAGG 8763

229827913 AGTAAGTCACCGGCCTCAGCCCTGGGAGCTGAGTCTTGATGAGAAGTTAGCTAAATGAAG 229827972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8764 AGTAAGTCACCGGCCTCAGCCCTGGGAGCTGAGTCTTGATGAGAAGTTAGCTAAATGAAG 8823

229827973 AAGGAAGGGCCACCAGATGAAAAATTCATAACAAAGCCTGAATGAAAACTCGGGATTTCG 229828032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8824 AAGGAAGGGCCACCAGATGAAAAATTCATAACAAAGCCTGAATGAAAACTCGGGATTTCG 8883

229828033 GAGTCCTGGTCCAGTGTTTTTCTTACTTATCTGGGTTTTCAGAATCTCGTCTAGAA 229828088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8884 GAGTCCTGGTCCAGTGTTTTTCTTACTTATCTGGGTTTTCAGAATCTCGTCTAGAA 8939

Alignment time is 8.84817 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2829] =>      2829 nucs 'mol-32-2e4c-113828_2829'

Score:        2768
Aligned:      2830        nucs
Identic:      2817 (100%) nucs =>       231 (100%)      2586 ( 99%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229812303,229812533] EXCISED REGION [229820837,229823425]
 second seq =>  [        1,      231] EXCISED REGION [      232,     2829]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229812303 GAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGC 229812362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGC 60

229812363 GAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTA 229812422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTA 120

229812423 CCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTT 229812482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTT 180

229812483 CAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 231

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      232 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 291

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      292 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 351

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      352 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 411

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      412 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 471

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      472 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 531

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      532 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 591

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      592 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 651

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      652 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 711

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      712 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 771

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 831

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 891

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 951

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 1011

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 1071

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 1131

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 1191

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 1251

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 1311

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 1371

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 1431

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 1491

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 1551

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 1611

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 1670

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 1730

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 1790

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 1850

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 1910

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 1970

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 2030

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     2031 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 2090

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 2150

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 2210

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 2270

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 2330

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 2390

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 2450

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 2510

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 2570

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 2630

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 2690

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 2750

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTC 229823406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2751 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTC 2810

229823407 AAGACTATAATCTAACTGT 229823425
          |||||||||||||||||||
     2811 AAGACTATAATCTAACTGT 2829

Alignment time is 2.84733 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2549] =>      2549 nucs 'mol-32-2fd8-039082_2549'

Score:        2488
Aligned:      2557        nucs
Identic:      2545 (100%) nucs =>      1783 ( 99%)       762 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810740,229812533] EXCISED REGION [229820837,229821599]
 second seq =>  [        1,     1786] EXCISED REGION [     1787,     2549]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810740 GCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATG 229810799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATG 60

229810800 AGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTT 229810859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTT 120

229810860 TCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCA 229810919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCA 180

229810920 TGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCT 229810979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCT 240

229810980 GTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATG 229811039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATG 300

229811040 ACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACT 229811099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACT 360

229811100 GTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGA 229811159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGA 420

229811160 GTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATG 229811219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATG 480

229811220 CTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTC 229811279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTC 540

229811280 ATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACC 229811339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACC 600

229811340 ATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCC 229811399
          |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCC 652

229811400 ATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATC 229811459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 ATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATC 712

229811460 TTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCC 229811519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 TTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCC 772

229811520 AGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTT 229811579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 AGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTT 832

229811580 CTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATA 229811639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 CTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATA 892

229811640 CTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTA 229811699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 CTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTA 952

229811700 TAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACC 229811759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 TAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACC 1012

229811760 TTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAA 229811819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 TTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAA 1072

229811820 TTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGG 229811879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGG 1132

229811880 TGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTA 229811939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 TGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTA 1192

229811940 GTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAATGA 229811999
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1193 GTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAATGA 1252

229812000 GGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGG 229812059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 GGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGG 1312

229812060 AATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGT 229812119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 AATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGT 1372

229812120 CGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTT 229812179
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1373 CGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGTT 1432

229812180 CAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCA 229812239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 CAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCA 1492

229812240 CCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGT 229812299
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 CCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGT 1552

229812300 CTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 229812359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 CTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 1612

229812360 CGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCT 229812419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 CGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCT 1672

229812420 TTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTT 229812479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 TTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTT 1732

229812480 CTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 CTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1786

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1787 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1846

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1906

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1966

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2026

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2086

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2146

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2206

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2266

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2326

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2386

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2446

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2506

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTA 229821599
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTA 2549

Alignment time is 2.56684 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3928] =>      3928 nucs 'mol-32-2fd8-118743_3928'

Score:        3832
Aligned:      3925        nucs
Identic:      3910 (100%) nucs =>       273 (100%)      3637 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229812261,229812533] EXCISED REGION [229820837,229824480]
 second seq =>  [        7,      279] EXCISED REGION [      280,     3928]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229812261 TAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGA 229812320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        7 TAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGA 66

229812321 TCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCC 229812380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       67 TCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCC 126

229812381 AAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTA 229812440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      127 AAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTA 186

229812441 AAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGT 229812500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      187 AAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGT 246

229812501 TTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
      247 TTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 279

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      280 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 339

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      340 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 399

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      400 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 459

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      460 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 519

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      520 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 579

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      580 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 639

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      640 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 699

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      700 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 759

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      760 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 819

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 879

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 939

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 999

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 1059

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 1119

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 1179

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 1239

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 1299

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 1359

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 1419

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 1479

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 1539

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 1599

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 1659

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 1718

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 1778

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 1838

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1839 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGTATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 1898

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 1958

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 2018

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 2078

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG------GTGTGTGTGTGTGT 229822688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||
     2079 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 2138

229822689 GTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCTGG 229822748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 GTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCTGG 2198

229822749 AGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTCTG 229822808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 AGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTCTG 2258

229822809 TTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTTTG 229822868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2259 TTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTTTG 2318

229822869 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGACCT 229822928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGACCT 2378

229822929 CAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCACG 229822988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 CAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCACG 2438

229822989 CCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAACA 229823048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2439 CCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAACA 2498

229823049 AGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGGGC 229823108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2499 AGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGGGC 2558

229823109 CTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACGGG 229823168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 CTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACGGG 2618

229823169 TATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGAAG 229823228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2619 TATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGAAG 2678

229823229 GCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCTCA 229823288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2679 GCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCTCA 2738

229823289 TTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAGAT 229823348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2739 TTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAGAT 2798

229823349 GTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTCAA 229823408
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2799 GTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTCAA 2858

229823409 GACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTGTG 229823468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2859 GACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTGTG 2918

229823469 GTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAGAG 229823528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2919 GTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAGAG 2978

229823529 ATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAATT 229823588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2979 ATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAATT 3038

229823589 ATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT 229823648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3039 ATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT 3098

229823649 CACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAGTC 229823708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3099 CACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAGTC 3158

229823709 TGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTATA 229823768
          ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3159 TGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCT--AAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTATA 3216

229823769 CCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAATT 229823828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 CCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAATT 3276

229823829 AATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATAGA 229823888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 AATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATAGA 3336

229823889 AAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTGCA 229823948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 AAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTGCA 3396

229823949 GGACAGTGATCCATTAAGTCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAAGA 229824008
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 GGACAGTGATCCATTAAATCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAAGA 3456

229824009 GGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTCCC 229824068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 GGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTCCC 3516

229824069 TAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCGAG 229824128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 TAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCGAG 3576

229824129 TCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGAGG 229824188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 TCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGAGG 3636

229824189 TCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGCTT 229824248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 TCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGCTT 3696

229824249 CTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTCCA 229824308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 CTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTCCA 3756

229824309 GCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGGCT 229824368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 GCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGGCT 3816

229824369 CATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAG 229824428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 CATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAG 3876

229824429 TTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACA 229824480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 TTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACA 3928

Alignment time is 4.0503 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3154] =>      3154 nucs 'mol-32-2fd8-227791_3154'

Score:        3082
Aligned:      3162        nucs
Identic:      3149 (100%) nucs =>      1790 ( 99%)      1359 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810732,229812533] EXCISED REGION [229820837,229822196]
 second seq =>  [        1,     1794] EXCISED REGION [     1795,     3154]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810732 GGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCA 229810791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCA 60

229810792 TTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGC 229810851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGC 120

229810852 ATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAG 229810911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAG 180

229810912 TAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAA 229810971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAA 240

229810972 TTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTA 229811031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTA 300

229811032 TCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCT 229811091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCT 360

229811092 CAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTT 229811151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTT 420

229811152 AAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCT 229811211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCT 480

229811212 GAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAAT 229811271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAAT 540

229811272 CTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCC 229811331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCC 600

229811332 ACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCC 229811391
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
      601 ACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCC 652

229811392 ACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGG 229811451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 ACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGG 712

229811452 AGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCC 229811511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 AGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCC 772

229811512 TATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCT 229811571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCT 832

229811572 TTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATC 229811631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 TTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATC 892

229811632 TGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACAT 229811691
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      893 TGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCACTTTCATATACATAGATAATCTTTTACAT 952

229811692 TATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGG 229811751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 TATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGG 1012

229811752 GGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTT 229811811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 GGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTT 1072

229811812 ACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACT 229811871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 ACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACT 1132

229811872 GTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTT 229811931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 GTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTT 1192

229811932 ATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCAT 229811991
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1193 ATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTAT 1252

229811992 GTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGA 229812051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 GTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGA 1312

229812052 ATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCT 229812111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 ATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCT 1372

229812112 CACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCT 229812171
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1373 CACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCT 1432

229812172 TCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTG 229812231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 TCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTG 1492

229812232 CCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCC 229812291
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 CCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCC 1552

229812292 TGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGG 229812351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 TGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGG 1612

229812352 ATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATA 229812411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 ATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATA 1672

229812412 TAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTC 229812471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 TAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTC 1732

229812472 ACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCC 229812531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 ACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCC 1792

229812532 CA 229812533
          ||
     1793 CA 1794

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1795 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1854

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1914

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1974

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2034

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2094

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2154

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2214

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2274

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2334

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2394

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2454

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2514

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2574

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2634

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2694

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2754

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2814

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2874

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2934

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2994

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3054

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3114

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTC 229822196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTC 3154

Alignment time is 3.1359 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2157] =>      2157 nucs 'mol-32-2fee-131636_2157'

Score:        2096
Aligned:      2165        nucs
Identic:      2153 ( 99%) nucs =>      1780 ( 99%)       373 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810743,229812533] EXCISED REGION [229820837,229821210]
 second seq =>  [        1,     1783] EXCISED REGION [     1784,     2157]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810743 CCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGC 229810802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGC 60

229810803 AGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCA 229810862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCA 120

229810863 GGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGG 229810922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGG 180

229810923 AGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTT 229810982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTT 240

229810983 TAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACC 229811042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACC 300

229811043 TCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTT 229811102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTT 360

229811103 TGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTA 229811162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTA 420

229811163 TATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTG 229811222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTG 480

229811223 GATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATC 229811282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATC 540

229811283 CACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATC 229811342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATC 600

229811343 CATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATC 229811402
          ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATC 652

229811403 CATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTT 229811462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 CATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTT 712

229811463 TTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGG 229811522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 TTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGG 772

229811523 ACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTT 229811582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 ACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTT 832

229811583 GGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTC 229811642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 GGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTC 892

229811643 AGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAG 229811702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 AGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAG 952

229811703 ATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTA 229811762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 ATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTA 1012

229811763 TTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTC 229811822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 TTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTC 1072

229811823 ACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGC 229811882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 ACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGC 1132

229811883 CAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTG 229811942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 CAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTG 1192

229811943 ATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAATGAGGC 229812002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1193 ATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAATGAGGC 1252

229812003 TATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAAT 229812062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAAT 1312

229812063 TTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGC 229812122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 TTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGC 1372

229812123 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAA 229812182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1373 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGTTCAA 1432

229812183 GTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCT 229812242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 GTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCT 1492

229812243 GGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTT 229812302
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 GGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTT 1552

229812303 GAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGC 229812362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 GAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGC 1612

229812363 GAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTA 229812422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 GAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTA 1672

229812423 CCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTT 229812482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 CCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTT 1732

229812483 CAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 CAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1783

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1784 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1843

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1903

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1963

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2023

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2083

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2143

229821197 TTGACAGTGTTCCA 229821210
          ||||||||||||||
     2144 TTGACAGTGTTCCA 2157

Alignment time is 2.14269 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3715] =>      3715 nucs 'mol-32-2fee-246689_3715'

Score:        3615
Aligned:      3724        nucs
Identic:      3701 ( 99%) nucs =>      1795 ( 99%)      1906 ( 99%)
Gaps:           19 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810728,229812533] EXCISED REGION [229820837,229822744]
 second seq =>  [        1,     1798] EXCISED REGION [     1799,     3715]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810728 TTGTGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCA 229810787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCA 60

229810788 GCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTT 229810847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTT 120

229810848 CAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGT 229810907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGT 180

229810908 GGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAAT 229810967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAAT 240

229810968 ACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTC 229811027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTC 300

229811028 TGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAG 229811087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAG 360

229811088 TGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTC 229811147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTC 420

229811148 TTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTC 229811207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTC 480

229811208 TCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAAT 229811267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAAT 540

229811268 AAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCC 229811327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCC 600

229811328 ACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTC 229811387
          |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||
      601 ACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTC 652

229811388 ACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTC 229811447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 ACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTC 712

229811448 ATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTAT 229811507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 ATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTAT 772

229811508 TCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTA 229811567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTA 832

229811568 GGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCA 229811627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 GGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCA 892

229811628 TATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTT 229811687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTT 952

229811688 ACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCC 229811747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 ACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCC 1012

229811748 CAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATA 229811807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 CAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATA 1072

229811808 TCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCA 229811867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCA 1132

229811868 TACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGA 229811927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 TACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGA 1192

229811928 GCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTA 229811987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 GCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTA 1252

229811988 TCATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAA 229812047
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TTATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAA 1312

229812048 GTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGA 229812107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 GTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGA 1372

229812108 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCT 229812167
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1373 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCC 1432

229812168 GCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCA 229812227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 GCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCA 1492

229812228 CCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTT 229812287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1493 CCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTT 1552

229812288 GGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGC 229812347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 GGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGC 1612

229812348 TGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAA 229812407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 TGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAA 1672

229812408 TATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAG 229812467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 TATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAG 1732

229812468 GTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTC 229812527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 GTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTC 1792

229812528 AGCCCA 229812533
          ||||||
     1793 AGCCCA 1798

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1799 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1858

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1918

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1978

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2038

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2098

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2158

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2218

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2278

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2338

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2398

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2458

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2518

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2578

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2638

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2698

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2758

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2818

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2878

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2938

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2998

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3058

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3118

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3178

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3237

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3297

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3357

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3417

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3477

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3537

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3597

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     3598 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3657

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGG 229822744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGG 3715

Alignment time is 3.60262 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3677] =>      3677 nucs 'mol-32-301a-070164_3677'

Score:        3594
Aligned:      3678        nucs
Identic:      3663 (100%) nucs =>      1132 (100%)      2531 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229811399,229812533] EXCISED REGION [229820837,229823369]
 second seq =>  [        1,     1135] EXCISED REGION [     1136,     3677]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229811399 CATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTAT 229811458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTAT 60

229811459 CTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCC 229811518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCC 120

229811519 CAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTT 229811578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTT 180

229811579 TCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTAT 229811638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTAT 240

229811639 ACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTT 229811698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTT 300

229811699 ATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAAC 229811758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAAC 360

229811759 CTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAA 229811818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAA 420

229811819 ATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAG 229811878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAG 480

229811879 GTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCT 229811938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCT 540

229811939 AGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAATG 229811998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      541 AGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAATG 600

229811999 AGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAG 229812058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAG 660

229812059 GAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTG 229812118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTG 720

229812119 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGT 229812178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      721 TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGT 780

229812179 TCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGC 229812238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGC 840

229812239 ACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGG 229812298
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGG 900

229812299 TCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 229812358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 960

229812359 GCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTC 229812418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTC 1020

229812419 TTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTT 229812478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTT 1080

229812479 TCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1135

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1136 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1195

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1255

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1315

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 1375

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 1435

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 1495

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 1555

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 1615

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 1675

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 1735

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 1795

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 1855

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 1915

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 1975

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2035

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2095

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2155

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2215

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2275

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2335

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 2395

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 2455

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 2515

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 2574

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 2634

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 2694

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 2754

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 2814

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 2874

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 2934

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     2935 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 2994

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 3054

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 3114

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 3174

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 3234

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 3294

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 3354

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 3414

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 3474

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 3534

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 3594

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 3654

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGA 229823369
          |||||||||||||||||||||||
     3655 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGA 3677

Alignment time is 3.63435 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     6103] =>      6103 nucs 'mol-32-3046-234823_6103'

Score:        5931
Aligned:      6114        nucs
Identic:      6081 ( 99%) nucs =>      1794 ( 99%)      4287 (100%)
Gaps:           26 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810728,229812533] EXCISED REGION [229820837,229825129]
 second seq =>  [        1,     1797] EXCISED REGION [     1798,     6103]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810728 TTGTGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCA 229810787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCA 60

229810788 GCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTT 229810847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTT 120

229810848 CAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGT 229810907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGT 180

229810908 GGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAAT 229810967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAAT 240

229810968 ACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTC 229811027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTC 300

229811028 TGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAG 229811087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAG 360

229811088 TGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTC 229811147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTC 420

229811148 TTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTC 229811207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTC 480

229811208 TCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAAT 229811267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAAT 540

229811268 AAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCC 229811327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCC 600

229811328 ACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTC 229811387
          |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||
      601 ACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTC 652

229811388 ACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTC 229811447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 ACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTC 712

229811448 ATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTAT 229811507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 ATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTAT 772

229811508 TCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTA 229811567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTA 832

229811568 GGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCA 229811627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 GGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCA 892

229811628 TATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTT 229811687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTT 952

229811688 ACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCC 229811747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 ACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCC 1012

229811748 CAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATA 229811807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 CAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATA 1072

229811808 TCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCA 229811867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCA 1132

229811868 TACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGA 229811927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 TACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGA 1192

229811928 GCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTA 229811987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 GCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTA 1252

229811988 TCATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAA 229812047
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TTATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAA 1312

229812048 GTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGA 229812107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     1313 GTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTT-GATGGA 1371

229812108 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCT 229812167
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1372 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCC 1431

229812168 GCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCA 229812227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 GCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCA 1491

229812228 CCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTT 229812287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1492 CCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTT 1551

229812288 GGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGC 229812347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 GGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGC 1611

229812348 TGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAA 229812407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 TGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAA 1671

229812408 TATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAG 229812467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 TATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAG 1731

229812468 GTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTC 229812527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 GTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTC 1791

229812528 AGCCCA 229812533
          ||||||
     1792 AGCCCA 1797

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1798 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1857

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1917

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1977

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2037

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2097

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2157

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2217

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2277

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2337

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2397

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2457

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2517

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2577

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2637

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2697

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2757

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2817

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2877

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2937

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2997

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3057

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3117

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3177

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3236

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3296

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3356

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3416

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3476

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3536

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3596

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     3597 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3656

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 3716

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 3776

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 3836

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 3896

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 3956

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 4016

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 4076

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 4136

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 4196

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 4256

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 4316

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTC 229823406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4317 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTC 4376

229823407 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 229823466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 4436

229823467 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 229823526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 4496

229823527 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 229823586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 4556

229823587 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 229823646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 4616

229823647 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 229823706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 4676

229823707 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 229823766
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCT-AAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 4735

229823767 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 229823826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 4795

229823827 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 229823886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 4855

229823887 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 229823946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 4915

229823947 CAGGACAGTGATCCATTAAGTCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAA 229824006
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4916 CAGGACAGTGATCCATTAAATCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAA 4975

229824007 GAGGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTC 229824066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4976 GAGGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTC 5035

229824067 CCTAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCG 229824126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5036 CCTAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCG 5095

229824127 AGTCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGA 229824186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5096 AGTCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGA 5155

229824187 GGTCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGC 229824246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 GGTCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGC 5215

229824247 TTCTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTC 229824306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5216 TTCTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTC 5275

229824307 CAGCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGG 229824366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5276 CAGCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGG 5335

229824367 CTCATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 229824426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5336 CTCATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 5395

229824427 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 229824486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5396 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 5455

229824487 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 229824546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5456 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 5515

229824547 TCACTTGAATCTGCGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGC 229824606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5516 TCACTTGAATCTGCGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGC 5575

229824607 CTGGGCGACAGTGCAAGACTCCATCT-----CAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACATA 229824661
          ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||
     5576 CTGGGCGACAGTGCAAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACATA 5635

229824662 TATATATATAGAGAGAGAGCCAAGTTAAAAGGGGAGTGGGGCAAGAAACCCTCTTTACCA 229824721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5636 TATATATATAGAGAGAGAGCCAAGTTAAAAGGGGAGTGGGGCAAGAAACCCTCTTTACCA 5695

229824722 GAGGACTGGAAGAGAAAGCACTCTAGAAGCCAGTGGGTGTGAGCACATTCAAGTCACCGG 229824781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5696 GAGGACTGGAAGAGAAAGCACTCTAGAAGCCAGTGGGTGTGAGCACATTCAAGTCACCGG 5755

229824782 GTTTGAGATGATGGGTCCGTGGCAGCTGTTTATTCCCTTCCATCACTGGGATGTCCATCT 229824841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5756 GTTTGAGATGATGGGTCCGTGGCAGCTGTTTATTCCCTTCCATCACTGGGATGTCCATCT 5815

229824842 TGGGCGGCTTCAAGTTTGCTGGATCTCTAGTCATGTGGTTGGCCTGGGCATGGATCAGTT 229824901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5816 TGGGCGGCTTCAAGTTTGCTGGATCTCTAGTCATGTGGTTGGCCTGGGCATGGATCAGTT 5875

229824902 CCACTGGAGAGGGCTTCTGGGCTCCTTGGTAGGCCTGGGTGGCAAAACTTCCAGAATCAT 229824961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5876 CCACTGGAGAGGGCTTCTGGGCTCCTTGGTAGGCCTGGGTGGCAAAACTTCCAGAATCAT 5935

229824962 CCTTCTGAAGGGATCTCGGTCCAAAGAGGCTCCACTTATCTGACAAGTTTCTGTCCTTAT 229825021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5936 CCTTCTGAAGGGATCTCGGTCCAAAGAGGCTCCACTTATCTGACAAGTTTCTGTCCTTAT 5995

229825022 CTCCACTTCCAGAATCCATGGTGCTGGGATTTGGGCCAGGTAAAGCTGTGGAAGAACCAG 229825081
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5996 CTCCACTTCCAGAATCCATGGTGCTGGGAGTTGGGCCAGGTAAAGCTGTGGAAGAACCAG 6055

229825082 AAGTGAACCAGCCTCTGGGTCTCTGCTCAGGGGAAGAGTGAGGAGTGC 229825129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6056 AAGTGAACCAGCCTCTGGGTCTCTGCTCAGGGGAAGAGTGAGGAGTGC 6103

Alignment time is 5.91076 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3630] =>      3630 nucs 'mol-32-3143-112195_3630'

Score:        3555
Aligned:      3639        nucs
Identic:      3624 (100%) nucs =>      1767 ( 99%)      1857 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810756,229812533] EXCISED REGION [229820837,229822695]
 second seq =>  [        1,     1770] EXCISED REGION [     1771,     3630]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810756 AGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCA 229810815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCA 60

229810816 AAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTT 229810875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTT 120

229810876 AACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCA 229810935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCA 180

229810936 TATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTA 229810995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTA 240

229810996 GTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTT 229811055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTT 300

229811056 GATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACC 229811115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACC 360

229811116 AAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTG 229811175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTG 420

229811176 GCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGC 229811235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGC 480

229811236 AAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCC 229811295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCC 540

229811296 ATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCC 229811355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCC 600

229811356 ATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCC 229811415
          |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCC 652

229811416 ATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGG 229811475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 ATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGG 712

229811476 AGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATT 229811535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 AGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATT 772

229811536 AGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATG 229811595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 AGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATG 832

229811596 TTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGT 229811655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 TTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGT 892

229811656 TTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCT 229811715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCT 952

229811716 TTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTG 229811775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 TTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTG 1012

229811776 GGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTA 229811835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 GGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTA 1072

229811836 ACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTA 229811895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 ACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTA 1132

229811896 GTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGAT 229811955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 GTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGAT 1192

229811956 TAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTA 229812015
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1193 TAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTA 1252

229812016 TTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCG 229812075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCG 1312

229812076 GCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTG 229812135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 GCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTG 1372

229812136 CAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGT 229812195
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1373 CAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGT 1432

229812196 CTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATT 229812255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 CTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATT 1492

229812256 TTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCT 229812315
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 TTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCT 1552

229812316 CATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCC 229812375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 CATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCC 1612

229812376 TGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATACAACAG 229812435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 TGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATACAACAG 1672

229812436 CAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTT 229812495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 CAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTT 1732

229812496 CTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 CTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1770

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1771 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1830

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1890

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1950

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2010

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2070

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2130

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2190

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2250

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2310

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2370

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2430

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2490

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2550

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2610

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2670

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2730

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2790

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2791 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2850

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2910

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2970

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3030

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3090

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3150

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3209

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3269

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3329

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3389

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3449

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3450 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3509

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3569

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 229822694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3629

229822695 G 229822695
          |
     3630 G 3630

Alignment time is 3.54557 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3345] =>      3345 nucs 'mol-32-314e-139603_3345'

Score:        3274
Aligned:      3347        nucs
Identic:      3333 (100%) nucs =>       227 (100%)      3106 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229812307,229812533] EXCISED REGION [229820837,229823946]
 second seq =>  [        1,      227] EXCISED REGION [      228,     3345]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229812307 TCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGC 229812366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGC 60

229812367 CATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCAT 229812426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCAT 120

229812427 ATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGT 229812486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGT 180

229812487 GAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 227

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      228 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 287

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      288 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 347

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      348 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 407

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      408 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 467

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      468 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 527

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      528 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 587

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      588 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 647

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      648 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 707

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      708 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 767

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      768 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 827

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      828 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 887

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      888 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 947

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      948 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 1007

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1008 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 1067

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1068 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 1127

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1128 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 1187

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1188 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 1247

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1248 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 1307

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 1367

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 1427

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 1487

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 1547

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 1607

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 1666

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 1726

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 1786

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 1846

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 1906

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 1966

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 2026

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     2027 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 2086

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 2146

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 2206

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 2266

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 2326

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 2386

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 2446

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 2506

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 2566

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 2626

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 2686

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 2746

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTC 229823406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2747 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTC 2806

229823407 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 229823466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 2866

229823467 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 229823526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 2926

229823527 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 229823586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 2986

229823587 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 229823646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 3046

229823647 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 229823706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 3106

229823707 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 229823766
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCT-AAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 3165

229823767 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 229823826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 3225

229823827 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 229823886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 3285

229823887 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 229823946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 3345

Alignment time is 3.33537 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2053] =>      2053 nucs 'mol-32-3159-218950_2053'

Score:        2018
Aligned:      2055        nucs
Identic:      2050 (100%) nucs =>       210 (100%)      1840 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229812324,229812533] EXCISED REGION [229820837,229822679]
 second seq =>  [        1,      210] EXCISED REGION [      211,     2053]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229812324 ACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAA 229812383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAA 60

229812384 TCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAA 229812443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAA 120

229812444 ATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTC 229812503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTC 180

229812504 TGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          ||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 210

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      211 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 270

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      271 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 330

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      331 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 390

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      391 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 450

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      451 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 510

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      511 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 570

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      571 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 630

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      631 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 690

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      691 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 750

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      751 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 810

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      811 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 870

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      871 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 930

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      931 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 990

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      991 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 1050

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1051 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 1110

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1111 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 1170

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1171 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 1230

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     1231 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTC-TTTTT 1289

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 1349

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 1409

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 1469

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 1529

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 1589

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 1648

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 1708

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 1768

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1769 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 1828

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 1888

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 1948

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 2008

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTG 229822679
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTG 2053

Alignment time is 2.04432 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2336] =>      2336 nucs 'mol-32-3164-198666_2336'

Score:        2240
Aligned:      2339        nucs
Identic:      2321 ( 99%) nucs =>      1831 ( 99%)       490 (100%)
Gaps:           14 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810689,229812533] EXCISED REGION [229820837,229821327]
 second seq =>  [        9,     1845] EXCISED REGION [     1846,     2336]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810689 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGC---AGAATCATTGTGGATCCTTGCACCA 229810745
          ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||
        9 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAG--AAAAGAATCATTGTGGATCCTTGCACCA 66

229810746 CTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGCAGG 229810805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       67 CTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGCAGG 126

229810806 AGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGC 229810865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      127 AGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGC 186

229810866 AACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGC 229810925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      187 AACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGC 246

229810926 AGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAG 229810985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      247 AGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAG 306

229810986 GCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCC 229811045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      307 GCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCC 366

229811046 CATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGT 229811105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      367 CATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGT 426

229811106 TAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATAT 229811165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      427 TAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATAT 486

229811166 CATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGAT 229811225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      487 CATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGAT 546

229811226 TAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCAC 229811285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 TAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCAC 606

229811286 TCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCAT 229811345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      607 TCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCAT 666

229811346 CCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCAT 229811405
          |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 CCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCAT 718

229811406 CCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTA 229811465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 CCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTA 778

229811466 CTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACT 229811525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 CTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACT 838

229811526 CTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGT 229811585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 CTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGT 898

229811586 GGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGG 229811645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 GGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGG 958

229811646 AGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATA 229811705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 AGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATA 1018

229811706 GCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTT 229811765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 GCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTT 1078

229811766 CCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACT 229811825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 CCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACT 1138

229811826 CATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAG 229811885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 CATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAG 1198

229811886 GGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATG 229811945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 GGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATG 1258

229811946 CCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAATGAGGCTAT 229812005
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1259 CCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAATGAGGCTAT 1318

229812006 AAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTG 229812065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 AAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTG 1378

229812066 CCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCA 229812125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     1379 CCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTT-GATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCA 1437

229812126 GGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGTG 229812185
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1438 GGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGTTCAAGTG 1497

229812186 ATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGC 229812245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 ATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGC 1557

229812246 TAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAA 229812305
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAA 1617

229812306 CTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAG 229812365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 CTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAG 1677

229812366 CCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCA 229812425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCA 1737

229812426 TATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAG 229812485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAG 1797

229812486 TGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1845

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1846 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1905

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1965

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 2025

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2085

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2145

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2205

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2265

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2325

229821317 TGCTCAAATCT 229821327
          |||||||||||
     2326 TGCTCAAATCT 2336

Alignment time is 2.33479 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     9019] =>      9019 nucs 'mol-32-317a-005785_9019'

Score:        8770
Aligned:      9033        nucs
Identic:      8987 ( 99%) nucs =>      1835 ( 99%)      7152 (100%)
Gaps:           33 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810688,229812533] EXCISED REGION [229820837,229828008]
 second seq =>  [        5,     1842] EXCISED REGION [     1843,     9019]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810688 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGAATCATTGTGGATCCTTGCACCACT 229810747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        5 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGAATCATTGTGGATCCTTGCACCACT 64

229810748 ATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGCAGGAG 229810807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       65 ATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGCAGGAG 124

229810808 AAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGCAA 229810867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      125 AAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGCAA 184

229810868 CATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGCAG 229810927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      185 CATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGCAG 244

229810928 AGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAGGC 229810987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      245 AGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAGGC 304

229810988 CACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCCCA 229811047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      305 CACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCCCA 364

229811048 TGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGTTA 229811107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      365 TGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGTTA 424

229811108 ATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATATCA 229811167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      425 ATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATATCA 484

229811168 TTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTA 229811227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 TTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTA 544

229811228 GCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTC 229811287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 GCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTC 604

229811288 ATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCC 229811347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 ATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCC 664

229811348 ATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCC 229811407
          |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 ATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCC 716

229811408 ATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACT 229811467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 ATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACT 776

229811468 AGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCT 229811527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 AGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCT 836

229811528 ATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGG 229811587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 ATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGG 896

229811588 CAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAG 229811647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 CAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAG 956

229811648 CCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGC 229811707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 CCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGC 1016

229811708 TATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCC 229811767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 TATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCC 1076

229811768 CAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCA 229811827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 CAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCA 1136

229811828 TTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGG 229811887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 TTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGG 1196

229811888 GTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCC 229811947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 GTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCC 1256

229811948 ATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAATGAGGCTATAA 229812007
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1257 ATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAATGAGGCTATAA 1316

229812008 GGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCC 229812067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 GGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCC 1376

229812068 TAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGG 229812127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGG 1436

229812128 CTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGTGAT 229812187
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1437 CTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGTTCAAGTGAT 1496

229812188 TCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTA 229812247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 TCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTA 1556

229812248 ATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACT 229812307
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 ATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACT 1616

229812308 CCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCC 229812367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 CCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCC 1676

229812368 ATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATA 229812427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 ATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATA 1736

229812428 TACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTG 229812487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 TACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTG 1796

229812488 AACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 AACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1842

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1843 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1902

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1962

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 2022

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2082

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2142

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2202

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2262

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2322

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2382

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2442

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2502

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2562

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2622

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2682

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2742

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2802

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2862

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2922

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2982

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 3042

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3102

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3162

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3222

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3281

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3341

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3401

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3461

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3521

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3581

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3641

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     3642 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3701

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 3761

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 3821

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 3881

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 3941

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 4001

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 4061

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 4121

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 4181

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 4241

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4242 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 4301

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 4361

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTC 229823406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4362 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTC 4421

229823407 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 229823466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 4481

229823467 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 229823526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 4541

229823527 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 229823586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 4601

229823587 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 229823646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 4661

229823647 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 229823706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 4721

229823707 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 229823766
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCT-AAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 4780

229823767 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 229823826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 4840

229823827 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 229823886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 4900

229823887 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 229823946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 4960

229823947 CAGGACAGTGATCCATTAAGTCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAA 229824006
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 CAGGACAGTGATCCATTAAATCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAA 5020

229824007 GAGGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTC 229824066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 GAGGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTC 5080

229824067 CCTAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCG 229824126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 CCTAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCG 5140

229824127 AGTCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGA 229824186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 AGTCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGA 5200

229824187 GGTCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGC 229824246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 GGTCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGC 5260

229824247 TTCTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTC 229824306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 TTCTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTC 5320

229824307 CAGCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGG 229824366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 CAGCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGG 5380

229824367 CTCATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 229824426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 CTCATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 5440

229824427 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 229824486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 5500

229824487 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 229824546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5501 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 5560

229824547 TCACTTGAATCTGCGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGC 229824606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 TCACTTGAATCTGCGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGC 5620

229824607 CTGGGCGACAGTGCAAGACTCCATCT-----CAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACATA 229824661
          ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||
     5621 CTGGGCGACAGTGCAAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACATA 5680

229824662 TATATATATAGAGAGAGAGCCAAGTTAAAAGGGGAGTGGGGCAAGAAACCCTCTTTACCA 229824721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5681 TATATATATAGAGAGAGAGCCAAGTTAAAAGGGGAGTGGGGCAAGAAACCCTCTTTACCA 5740

229824722 GAGGACTGGAAGAGAAAGCACTCTAGAAGCCAGTGGGTGTGAGCACATTCAAGTCACCGG 229824781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5741 GAGGACTGGAAGAGAAAGCACTCTAGAAGCCAGTGGGTGTGAGCACATTCAAGTCACCGG 5800

229824782 GTTTGAGATGATGGGTCCGTGGCAGCTGTTTATTCCCTTCCATCACTGGGATGTCCATCT 229824841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5801 GTTTGAGATGATGGGTCCGTGGCAGCTGTTTATTCCCTTCCATCACTGGGATGTCCATCT 5860

229824842 TGGGCGGCTTCAAGTTTGCTGGATCTCTAGTCATGTGGTTGGCCTGGGCATGGATCAGTT 229824901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5861 TGGGCGGCTTCAAGTTTGCTGGATCTCTAGTCATGTGGTTGGCCTGGGCATGGATCAGTT 5920

229824902 CCACTGGAGAGGGCTTCTGGGCTCCTTGGTAGGCCTGGGTGGCAAAACTTCCAGAATCAT 229824961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5921 CCACTGGAGAGGGCTTCTGGGCTCCTTGGTAGGCCTGGGTGGCAAAACTTCCAGAATCAT 5980

229824962 CCTTCTGAAGGGATCTCGGTCCAAAGAGGCTCCACTTATCTGACAAGTTTCTGTCCTTAT 229825021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5981 CCTTCTGAAGGGATCTCGGTCCAAAGAGGCTCCACTTATCTGACAAGTTTCTGTCCTTAT 6040

229825022 CTCCACTTCCAGAATCCATGGTGCTGGGATTTGGGCCAGGTAAAGCTGTGGAAGAACCAG 229825081
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6041 CTCCACTTCCAGAATCCATGGTGCTGGGAGTTGGGCCAGGTAAAGCTGTGGAAGAACCAG 6100

229825082 AAGTGAACCAGCCTCTGGGTCTCTGCTCAGGGGAAGAGTGAGGAGTGCAGCTTGGGGCTG 229825141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6101 AAGTGAACCAGCCTCTGGGTCTCTGCTCAGGGGAAGAGTGAGGAGTGCAGCTTGGGGCTG 6160

229825142 ACTGGGCTGATGCAGGCTGCCTCTCTTCTCTTGTTCTCTCTCCACTCTGTAGCTTTAGTT 229825201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6161 ACTGGGCTGATGCAGGCTGCCTCTCTTCTCTTGTTCTCTCTCCACTCTGTAGCTTTAGTT 6220

229825202 GGTGGAGCACTTCCGCCACTCGAAGGTACTTGGTCTCCTCTGCGGTGAGGCCCTTGTGTG 229825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6221 GGTGGAGCACTTCCGCCACTCGAAGGTACTTGGTCTCCTCTGCGGTGAGGCCCTTGTGTG 6280

229825262 GTGTGTAGCCAGCACCTCTCAACCCTGCCTGTCGCCCAAAATGCTGAGTACTTTCCTGGG 229825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6281 GTGTGTAGCCAGCACCTCTCAACCCTGCCTGTCGCCCAAAATGCTGAGTACTTTCCTGGG 6340

229825322 TCTGTTTTGTGAACAGAGAATTCATGATGATATGGGTAGCTTTAGACTTCACCACTGGGA 229825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6341 TCTGTTTTGTGAACAGAGAATTCATGATGATATGGGTAGCTTTAGACTTCACCACTGGGA 6400

229825382 CTGTGTCACACTGTCAATGACAGGGTCATGGCAGGGGCGGGTAGGCTGGTCTCTCCTTCC 229825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6401 CTGTGTCACACTGTCAATGACAGGGTCATGGCAGGGGCGGGTAGGCTGGTCTCTCCTTCC 6460

229825442 TCCTCCTTGGTGAGGCACTGATACTTGCACTCTGGAATCACTGGCTTCCAGTGGACGCTG 229825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6461 TCCTCCTTGGTGAGGCACTGATACTTGCACTCTGGAATCACTGGCTTCCAGTGGACGCTG 6520

229825502 CCCGTGTCCGATGGAGGAGTCATGGGCACAGGGTCCTCGAGGGCATCATCATAGCTGGAT 229825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6521 CCCGTGTCCGATGGAGGAGTCATGGGCACAGGGTCCTCGAGGGCATCATCATAGCTGGAT 6580

229825562 GCCCAGCAGTTTATCCTGATGGGCAGGGACATCTTTCCTAGAAGCCCACCCAGCCTCAAG 229825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6581 GCCCAGCAGTTTATCCTGATGGGCAGGGACATCTTTCCTAGAAGCCCACCCAGCCTCAAG 6640

229825622 AGCAGGCACTTCTGGTTGTGTTGAAGCCAGTGAAAGACTGGGACCCAGGTGCTTTTTCCA 229825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6641 AGCAGGCACTTCTGGTTGTGTTGAAGCCAGTGAAAGACTGGGACCCAGGTGCTTTTTCCA 6700

229825682 TATATATAGAATTCTGAGCTGAGTCCCTCCCACCACAGTGAAATGATGTAATGACTAAGC 229825741
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     6701 TATATATAGAATTCTGAGCTGAGTCCCTGCCACCACAGTGAAATGATGTAATGACTAAGC 6760

229825742 TGACAGATGTTAATGAGGAACACAGTGCAGCAGCTGCAAATTAGCAAAGCTTCCCAGGAA 229825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6761 TGACAGATGTTAATGAGGAACACAGTGCAGCAGCTGCAAATTAGCAAAGCTTCCCAGGAA 6820

229825802 GAGTGCATCCAGAGGTTCTGCTATCCTGCTGCTGCTGCTGCTGGGCTGCCTGCGGCCTGG 229825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6821 GAGTGCATCCAGAGGTTCTGCTATCCTGCTGCTGCTGCTGCTGGGCTGCCTGCGGCCTGG 6880

229825862 AGTCCAGCGCTAAAGAGGTTCTGAGGGCCCACGTCTCCCGAGAGGCTGTGACGCAGTCTG 229825921
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6881 AGTCCGGCGCTAAAGAGGTTCTGAGGGCCCACGTCTCCCGAGAGGCTGTGACGCAGTCTG 6940

229825922 GACTGAAGGCATGGTGAGAGCAGTGGCAACACCGAAGGTCTCCAGGACCCAGCAGACAAC 229825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6941 GACTGAAGGCATGGTGAGAGCAGTGGCAACACCGAAGGTCTCCAGGACCCAGCAGACAAC 7000

229825982 ACTGCCCCCCTGCTATGGTTTTGAAGTGTCTTTTTCTGTACTCAGCCCTTACGTGGTTGC 229826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7001 ACTGCCCCCCTGCTATGGTTTTGAAGTGTCTTTTTCTGTACTCAGCCCTTACGTGGTTGC 7060

229826042 TATAAACATTAGACTATTTTTTAAAGTAGTTACAAATGGTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGT 229826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||
     7061 TATAAACATTAGACTATTTTTTAAAGTAGTTACAAATG--------GTTTGTTTGTTTGT 7112

229826102 TTGTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTACGA 229826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7113 TTGTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTACGA 7172

229826162 TCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCC 229826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7173 TCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCC 7232

229826222 GAGTAGCTGGGATTACAAGCACCCCCGCCACCGACCGCACCCAGCTAATTTTTGTATTTT 229826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7233 GAGTAGCTGGGATTACAAGCACCCCCGCCACCGACCGCACCCAGCTAATTTTTGTATTTT 7292

229826282 TAGTAGAGACAGGGTTTCATCACGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTG 229826341
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7293 TAGTAGAGACAGGGTTTCATCACATTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTG 7352

229826342 ATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCAACCTCCACCTC 229826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7353 ATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCAACCTCCACCTC 7412

229826402 CTGGGCTCAATAGAAACATTTTTTTTTAAGTTTCTGCTGTAAAAAAATATATTTCTGTTG 229826461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7413 CTGGGCTCAATAGAAACATTTTTTTTTAAGTTTCTGCTGTAAAAAAATATATTTCTGTTG 7472

229826462 AGCCTAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAACCAAGATTACACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTG 229826521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7473 AGCCTAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAACCAAGATTACACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTG 7532

229826522 ACAGAGTGAGACCCTGTCTCCAAAAAAAGAAAGTTTCTGTTGGGGGAGAAGAGCTTGGAG 229826581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7533 ACAGAGTGAGACCCTGTCTCCAAAAAAAGAAAGTTTCTGTTGGGGGAGAAGAGCTTGGAG 7592

229826582 GGTCATACTCTGCCATTGTGCTGACGTTGCTGTATTTGTTTTTACATTCAAACTTTCTTT 229826641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7593 GGTCATACTCTGCCATTGTGCTGACGTTGCTGTATTTGTTTTTACATTCAAACTTTCTTT 7652

229826642 TGTAATAAAATATATCTTGAAAAGCATCAGTGGTGGTGTGGCTTTATTCATTTTTAGTTT 229826701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7653 TGTAATAAAATATATCTTGAAAAGCATCAGTGGTGGTGTGGCTTTATTCATTTTTAGTTT 7712

229826702 GAGAATATGCACATTTTCTTCCTAATATTTGGCAGTTTGAAATAATCAAAAGGCTCAGGA 229826761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7713 GAGAATATGCACATTTTCTTCCTAATATTTGGCAGTTTGAAATAATCAAAAGGCTCAGGA 7772

229826762 CCCAGTTAAGAGAGTTTATTCAAGTGCACTGTCAGGGTGGCCATCTCAGGACACGTGGAC 229826821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7773 CCCAGTTAAGAGAGTTTATTCAAGTGCACTGTCAGGGTGGCCATCTCAGGACACGTGGAC 7832

229826822 ACCAAAGAATGGTGATTGGTGCTCCTGGTGTCCTGGTGTGGGGAAAAGTGAGGGCTGCTT 229826881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7833 ACCAAAGAATGGTGATTGGTGCTCCTGGTGTCCTGGTGTGGGGAAAAGTGAGGGCTGCTT 7892

229826882 ATGAGGTCAAAAATGGAAGTGTTGAATGGAATCACAGCATTTTCCATAGAGAGGCTAACA 229826941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7893 ATGAGGTCAAAAATGGAAGTGTTGAATGGAATCACAGCATTTTCCATAGAGAGGCTAACA 7952

229826942 TGCAGATATAAGATTTGATTGGCTACTATCGATTCCACGCTAAGGGGGTGGCTTAACATC 229827001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7953 TGCAGATATAAGATTTGATTGGCTACTATCGATTCCACGCTAAGGGGGTGGCTTAACATC 8012

229827002 CTATTGTAGGGAGATAACAACCACAAGGTCTCCAGCATCATTTTGTGTAGGTTTGAATGA 229827061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8013 CTATTGTAGGGAGATAACAACCACAAGGTCTCCAGCATCATTTTGTGTAGGTTTGAATGA 8072

229827062 AGAATGGGAAGTCTGGTTGGCATGTAACATCTCAACACAAAAGTCAGGAAGCAATGGTCA 229827121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8073 AGAATGGGAAGTCTGGTTGGCATGTAACATCTCAACACAAAAGTCAGGAAGCAATGGTCA 8132

229827122 TGCACCAGAGGAAAAGAACGGTCATGTTATATGACTCAGTTTGCAGGGCTTAACTTTTAT 229827181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8133 TGCACCAGAGGAAAAGAACGGTCATGTTATATGACTCAGTTTGCAGGGCTTAACTTTTAT 8192

229827182 TCTTAGCACAGTACATTTGGAAGGTGCTAAAATTTTATCTCTTTTCACATACGGCAGGCG 229827241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     8193 TCTTAGCACAGTACATTTGGAAGGTGCTAAAATTTTCTCTCTTTTCACATACGGCAGGCG 8252

229827242 GATACATCAGTGTCCCAGGCGGGGCTGGCTATGCTTTAGAGTACTGGCTGTCCCTGTGTT 229827301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     8253 GATACATCAGTGTCCCAGGCGGGGCTGGCTATGCTTTAGAGTACTGGCTGTCCCTGTGGT 8312

229827302 CTCTACTGTCTATCAAGTGGTACCCAATCTCCTACCACAAAGGGCTCGAGGTTTTCAGCC 229827361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8313 CTCTACTGTCTATCAAGTGGTACCCAATCTCCTACCACAAAGGGCTCGAGGTTTTCAGCC 8372

229827362 AGACAACAGTGTGTGTGCCTTGATTTGCAGCTCAGATAAATATCTTCTCATAGTCAGTTC 229827421
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8373 AGACAACAGTGTGTGTGCCTTTATTTGCAGCTCAGATAAATATCTTCTCATAGTCAGTTC 8432

229827422 AGCTGAAAAACATTTATTGAGTACTATATGTCAAGTACGGCAGAACACATGGGGGTATAA 229827481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8433 AGCTGAAAAACATTTATTGAGTACTATATGTCAAGTACGGCAGAACACATGGGGGTATAA 8492

229827482 CTGAGGACATAGAGGATCCATGCTAGAGGAATGTACTTCCAGTGAGAGAACAGACGGTAG 229827541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8493 CTGAGGACATAGAGGATCCATGCTAGAGGAATGTACTTCCAGTGAGAGAACAGACGGTAG 8552

229827542 GCAAACAATTTTAGGACAATGGGGAGCTGCCATGATGGAGGCATGTAGATGGTCCTGTGG 229827601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8553 GCAAACAATTTTAGGACAATGGGGAGCTGCCATGATGGAGGCATGTAGATGGTCCTGTGG 8612

229827602 GAGCACAGAGCAGGAACTTCCTGGAACTGAGCATTTTTGTTTGTTTGTTTGAGACAAGGT 229827661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8613 GAGCACAGAGCAGGAACTTCCTGGAACTGAGCATTTTTGTTTGTTTGTTTGAGACAAGGT 8672

229827662 CTTACTCTGTTGCCCAGGCTAGATGCAGTGGTGCCATCACAGCTCACTGTAACCTCCAAC 229827721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8673 CTTACTCTGTTGCCCAGGCTAGATGCAGTGGTGCCATCACAGCTCACTGTAACCTCCAAC 8732

229827722 TCCTGGGCTCAAGCGATCCTTCTGCCTTAGTGTCCTGAGTAGCTAGGAATACAGGCATGC 229827781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8733 TCCTGGGCTCAAGCGATCCTTCTGCCTTAGTGTCCTGAGTAGCTAGGAATACAGGCATGC 8792

229827782 ACCACCACACCTGGATAATTTTTAAAATTTTCTGCCGACAGAGGGTCTCACTATATTGCC 229827841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8793 ACCACCACACCTGGATAATTTTTAAAATTTTCTGCCGACAGAGGGTCTCACTATATTGCC 8852

229827842 CAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGAAATCCTTTTATCTTGACCTCCCAAAGTGCT 229827901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8853 CAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGAAATCCTTTTATCTTGACCTCCCAAAGTGCT 8912

229827902 GGAATGACAGGAGTAAGTCACCGGCCTCAGCCCTGGGAGCTGAGTCTTGATGAGAAGTTA 229827961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8913 GGAATGACAGGAGTAAGTCACCGGCCTCAGCCCTGGGAGCTGAGTCTTGATGAGAAGTTA 8972

229827962 GCTAAATGAAGAAGGAAGGGCCACCAGATGAAAAATTCATAACAAAG 229828008
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8973 GCTAAATGAAGAAGGAAGGGCCACCAGATGAAAAATTCATAACAAAG 9019

Alignment time is 9.34361 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3144] =>      3144 nucs 'mol-32-317a-195862_3144'

Score:        3070
Aligned:      3152        nucs
Identic:      3138 (100%) nucs =>      1791 ( 99%)      1347 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810732,229812533] EXCISED REGION [229820837,229822184]
 second seq =>  [        1,     1796] EXCISED REGION [     1797,     3144]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810732 GGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCA 229810791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCA 60

229810792 TTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGC 229810851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGC 120

229810852 ATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAG 229810911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAG 180

229810912 TAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAA 229810971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAA 240

229810972 TTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTA 229811031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTA 300

229811032 TCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCT 229811091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCT 360

229811092 CAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTT 229811151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTT 420

229811152 AAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCT 229811211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCT 480

229811212 GAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAAT 229811271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAAT 540

229811272 CTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCC 229811331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCC 600

229811332 ACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCC 229811391
          |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||
      601 ACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCC 652

229811392 ACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGG 229811451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 ACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGG 712

229811452 AGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCC 229811511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 AGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCC 772

229811512 TATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCT 229811571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCT 832

229811572 TTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATC 229811631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 TTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATC 892

229811632 TGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACAT 229811691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACAT 952

229811692 TATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGG 229811751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 TATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGG 1012

229811752 GGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTT 229811811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 GGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTT 1072

229811812 ACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACT 229811871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 ACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACT 1132

229811872 GTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTT 229811931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 GTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTT 1192

229811932 ATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCAT 229811991
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1193 ATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTAT 1252

229811992 GTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGA 229812051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 GTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGA 1312

229812052 ATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTT--GATGGAGT 229812109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||
     1313 ATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGT 1372

229812110 CTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGC 229812169
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1373 CTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGC 1432

229812170 CTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACC 229812229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 CTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACC 1492

229812230 TGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGG 229812289
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1493 TGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGG 1552

229812290 CCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 229812349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 CCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTG 1612

229812350 GGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATA 229812409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 GGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATA 1672

229812410 TATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGT 229812469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 TATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGT 1732

229812470 TCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAG 229812529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 TCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAG 1792

229812530 CCCA 229812533
          ||||
     1793 CCCA 1796

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1797 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1856

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1916

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1976

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2036

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2096

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2156

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2216

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2276

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2336

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2396

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2456

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2516

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2576

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2636

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2696

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2756

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2816

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2876

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2936

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2996

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3056

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3116

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTC 229822184
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTC 3144

Alignment time is 3.1164 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3957] =>      3957 nucs 'mol-32-3185-209678_3957'

Score:        3853
Aligned:      3959        nucs
Identic:      3942 (100%) nucs =>       420 (100%)      3522 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229812112,229812533] EXCISED REGION [229820837,229824363]
 second seq =>  [        1,      422] EXCISED REGION [      423,     3957]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229812112 CACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCT 229812171
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
        1 CACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCT 60

229812172 TCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTG 229812231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTG 120

229812232 CCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCC 229812291
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCC 180

229812292 TGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGG 229812351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGG 240

229812352 ATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATA 229812411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATA 300

229812412 TAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTC 229812471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTC 360

229812472 ACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCC 229812531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCC 420

229812532 CA 229812533
          ||
      421 CA 422

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      423 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 482

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      483 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 542

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      543 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 602

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      603 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 662

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      663 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 722

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 782

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 842

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 902

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 962

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 1022

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 1082

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 1142

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 1202

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 1262

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 1322

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 1382

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 1442

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 1502

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 1562

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 1622

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 1682

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 1742

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 1802

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 1861

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 1921

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 1981

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 2041

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 2101

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 2161

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 2221

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     2222 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 2281

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 2341

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 2401

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 2461

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 2521

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 2581

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 2641

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2642 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 2701

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2702 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 2761

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2762 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 2821

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2822 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 2881

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2882 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 2941

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTC 229823406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2942 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTC 3001

229823407 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 229823466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3002 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 3061

229823467 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 229823526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3062 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 3121

229823527 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 229823586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3122 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 3181

229823587 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 229823646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3182 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 3241

229823647 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 229823706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 3301

229823707 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 229823766
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3302 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCT-AAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 3360

229823767 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 229823826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 3420

229823827 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 229823886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 3480

229823887 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 229823946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 3540

229823947 CAGGACAGTGATCCATTAAGTCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAA 229824006
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CAGGACAGTGATCCATTAAATCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAA 3600

229824007 GAGGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTC 229824066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GAGGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTC 3660

229824067 CCTAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCG 229824126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CCTAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCG 3720

229824127 AGTCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGA 229824186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AGTCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGA 3780

229824187 GGTCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGC 229824246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGTCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGC 3840

229824247 TTCTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTC 229824306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTCTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTC 3900

229824307 CAGCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGG 229824363
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CAGCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGG 3957

Alignment time is 4.07966 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     4077] =>      4077 nucs 'mol-32-3190-161395_4077'

Score:        3967
Aligned:      4087        nucs
Identic:      4063 ( 99%) nucs =>      1794 ( 99%)      2269 ( 99%)
Gaps:           20 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810728,229812533] EXCISED REGION [229820837,229823107]
 second seq =>  [        1,     1797] EXCISED REGION [     1798,     4077]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810728 TTGTGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCA 229810787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCA 60

229810788 GCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTT 229810847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTT 120

229810848 CAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGT 229810907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGT 180

229810908 GGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAAT 229810967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAAT 240

229810968 ACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTC 229811027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTC 300

229811028 TGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAG 229811087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAG 360

229811088 TGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTC 229811147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTC 420

229811148 TTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTC 229811207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTC 480

229811208 TCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAAT 229811267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAAT 540

229811268 AAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCC 229811327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCC 600

229811328 ACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTC 229811387
          |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||
      601 ACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTC 652

229811388 ACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTC 229811447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 ACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTC 712

229811448 ATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTAT 229811507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 ATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTAT 772

229811508 TCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTA 229811567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTA 832

229811568 GGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCA 229811627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 GGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCA 892

229811628 TATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTT 229811687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTT 952

229811688 ACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCC 229811747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 ACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCC 1012

229811748 CAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATA 229811807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 CAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATA 1072

229811808 TCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCA 229811867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCA 1132

229811868 TACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGA 229811927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 TACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGA 1192

229811928 GCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTA 229811987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 GCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTA 1252

229811988 TCATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAA 229812047
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TTATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAA 1312

229812048 GTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGA 229812107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     1313 GTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTT-GATGGA 1371

229812108 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCT 229812167
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1372 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCC 1431

229812168 GCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCA 229812227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 GCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCA 1491

229812228 CCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTT 229812287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1492 CCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTT 1551

229812288 GGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGC 229812347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 GGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGC 1611

229812348 TGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAA 229812407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 TGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAA 1671

229812408 TATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAG 229812467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 TATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAG 1731

229812468 GTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTC 229812527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 GTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTC 1791

229812528 AGCCCA 229812533
          ||||||
     1792 AGCCCA 1797

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1798 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1857

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1917

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1977

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2037

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2097

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2157

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2217

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2277

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2337

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2397

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2457

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2517

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2577

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2637

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2697

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2757

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2817

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2877

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2937

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2997

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3057

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3117

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3177

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3236

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3296

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3356

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3416

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3476

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3536

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3596

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     3597 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3656

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 3716

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 3776

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 3836

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 3896

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 3956

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 4016

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 4076

229823107 G 229823107
          |
     4077 G 4077

Alignment time is 3.97541 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5503] =>      5503 nucs 'mol-32-3306-085775_5503'

Score:        5348
Aligned:      5514        nucs
Identic:      5485 ( 99%) nucs =>      1787 ( 99%)      3698 (100%)
Gaps:           21 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810736,229812533] EXCISED REGION [229820837,229824542]
 second seq =>  [        1,     1790] EXCISED REGION [     1791,     5503]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810736 CCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGG 229810795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGG 60

229810796 CATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTG 229810855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTG 120

229810856 TTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAAC 229810915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAAC 180

229810916 TTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCT 229810975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCT 240

229810976 ACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCT 229811035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCT 300

229811036 AATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAAT 229811095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAAT 360

229811096 AACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAA 229811155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAA 420

229811156 TAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAAT 229811215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAAT 480

229811216 CATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCT 229811275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCT 540

229811276 GTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCC 229811335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCC 600

229811336 AACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCCACCC 229811395
          |||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||
      601 AACCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCCACCC 652

229811396 ATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCT 229811455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 ATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCT 712

229811456 TATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATT 229811515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 TATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATT 772

229811516 CCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTA 229811575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 CCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTA 832

229811576 TTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGAT 229811635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 TTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGAT 892

229811636 TATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATT 229811695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATT 952

229811696 TTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTT 229811755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 TTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTT 1012

229811756 AACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAG 229811815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 AACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAG 1072

229811816 AAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTA 229811875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 AAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTA 1132

229811876 TAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATAT 229811935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 TAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATAT 1192

229811936 TCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGA 229811995
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1193 TCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGA 1252

229811996 ATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTT 229812055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 ATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTT 1312

229812056 AAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACT 229812115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 AAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACT 1372

229812116 CTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCA 229812175
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1373 CTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCA 1432

229812176 GGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 229812235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 GGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCAC 1492

229812236 TGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGC 229812295
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 TGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGC 1552

229812296 TGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 229812355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 TGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 1612

229812356 CAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAAT 229812415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 CAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAAT 1672

229812416 TTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACAT 229812475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 TTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACAT 1732

229812476 TTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 TTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1790

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1791 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGATTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1850

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1910

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1970

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2030

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2090

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2150

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2151 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTCTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2210

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2270

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2330

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2390

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2450

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2510

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2570

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2630

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2690

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2750

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2810

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2870

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2930

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2990

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3050

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3110

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3170

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3229

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3289

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3349

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3409

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3469

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3470 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3529

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3530 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3589

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     3590 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3649

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3650 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 3709

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3710 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 3769

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3770 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 3829

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3830 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 3889

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3890 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 3949

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3950 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 4009

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4010 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 4069

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4070 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 4129

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4130 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 4189

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4190 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 4249

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4250 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 4309

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTC 229823406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4310 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTC 4369

229823407 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 229823466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4370 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 4429

229823467 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 229823526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4430 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 4489

229823527 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 229823586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4490 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 4549

229823587 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 229823646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4550 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 4609

229823647 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 229823706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4610 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 4669

229823707 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 229823766
          ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4670 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCT--AAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 4727

229823767 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 229823826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4728 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 4787

229823827 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 229823886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4788 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 4847

229823887 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 229823946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4848 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 4907

229823947 CAGGACAGTGATCCATTAAGTCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAA 229824006
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4908 CAGGACAGTGATCCATTAAATCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAA 4967

229824007 GAGGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTC 229824066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4968 GAGGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTC 5027

229824067 CCTAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCG 229824126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5028 CCTAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCG 5087

229824127 AGTCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGA 229824186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5088 AGTCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGA 5147

229824187 GGTCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGC 229824246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5148 GGTCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGC 5207

229824247 TTCTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTC 229824306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5208 TTCTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTC 5267

229824307 CAGCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGG 229824366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5268 CAGCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGG 5327

229824367 CTCATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 229824426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5328 CTCATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 5387

229824427 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 229824486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5388 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 5447

229824487 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGG 229824542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5448 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGG 5503

Alignment time is 5.36447 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3844] =>      3844 nucs 'mol-32-3306-206797_3844'

Score:        3733
Aligned:      3853        nucs
Identic:      3829 ( 99%) nucs =>      1778 ( 99%)      2051 ( 99%)
Gaps:           20 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810745,229812533] EXCISED REGION [229820837,229822889]
 second seq =>  [        1,     1782] EXCISED REGION [     1783,     3844]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810745 ACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGCAG 229810804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGCAG 60

229810805 GAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGG 229810864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGG 120

229810865 CAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAG 229810924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAG 180

229810925 CAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTA 229810984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTA 240

229810985 GGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTC 229811044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTC 300

229811045 CCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTG 229811104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTG 360

229811105 TTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATA 229811164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATA 420

229811165 TCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGA 229811224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGA 480

229811225 TTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCA 229811284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCA 540

229811285 CTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCA 229811344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCA 600

229811345 TCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCA 229811404
          ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCA 652

229811405 TCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTT 229811464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 TCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTT 712

229811465 ACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGAC 229811524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 ACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGAC 772

229811525 TCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGG 229811584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGG 832

229811585 TGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAG 229811644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 TGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAG 892

229811645 GAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGAT 229811704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 GAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGAT 952

229811705 AGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATT 229811764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 AGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATT 1012

229811765 TCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCAC 229811824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 TCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCAC 1072

229811825 TCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCA 229811884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCA 1132

229811885 GGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGAT 229811944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 GGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGAT 1192

229811945 GCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAATGAGGCTA 229812004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1193 GCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAATGAGGCTA 1252

229812005 TAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTT 229812064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTT 1312

229812065 GCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTT-GATGGAGTCTCACTCTGTCGCC 229812123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     1313 GCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCC 1372

229812124 CAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAG 229812183
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1373 CAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGTTCAAG 1432

229812184 TGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTG 229812243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 TGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTG 1492

229812244 GCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTG 229812303
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 GCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTG 1552

229812304 AACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCG 229812363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 AACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCG 1612

229812364 AGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTAC 229812423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 AGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTAC 1672

229812424 CATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTC 229812483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 CATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTC 1732

229812484 AGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 AGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1782

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1783 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1842

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1902

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1962

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2022

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2082

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2142

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2202

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2262

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2322

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2382

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2442

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2502

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2562

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2622

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2682

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2742

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2802

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2862

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2922

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2982

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3042

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3102

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3162

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3221

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3281

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3341

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3401

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3461

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3521

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3581

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     3582 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3641

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 3701

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 3761

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 3821

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGT 229822889
          |||||||||||||||||||||||
     3822 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGT 3844

Alignment time is 3.71403 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     6449] =>      6449 nucs 'mol-32-3306-217151_6449'

Score:        6294
Aligned:      6452        nucs
Identic:      6427 (100%) nucs =>      1834 ( 99%)      4593 (100%)
Gaps:           18 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810688,229812533] EXCISED REGION [229820837,229825435]
 second seq =>  [        9,     1845] EXCISED REGION [     1846,     6449]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810688 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGAATCATTGTGGATCCTTGCACCACT 229810747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        9 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGAATCATTGTGGATCCTTGCACCACT 68

229810748 ATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGCAGGAG 229810807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       69 ATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGCAGGAG 128

229810808 AAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGCAA 229810867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      129 AAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGCAA 188

229810868 CATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGCAG 229810927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      189 CATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGCAG 248

229810928 AGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAGGC 229810987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      249 AGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAGGC 308

229810988 CACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCCCA 229811047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      309 CACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCCCA 368

229811048 TGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGTTA 229811107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      369 TGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGTTA 428

229811108 ATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATATCA 229811167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      429 ATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATATCA 488

229811168 TTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTA 229811227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      489 TTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTA 548

229811228 GCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTC 229811287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      549 GCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTC 608

229811288 ATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCC 229811347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      609 ATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCC 668

229811348 ATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCC 229811407
          |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      669 ATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCC 720

229811408 ATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACT 229811467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACT 780

229811468 AGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCT 229811527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCT 840

229811528 ATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGG 229811587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGG 900

229811588 CAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAG 229811647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAG 960

229811648 CCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGC 229811707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGC 1020

229811708 TATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCC 229811767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCC 1080

229811768 CAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCA 229811827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCA 1140

229811828 TTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGG 229811887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGG 1200

229811888 GTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCC 229811947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCC 1260

229811948 ATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAATGAGGCTATAA 229812007
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1261 ATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAATGAGGCTATAA 1320

229812008 GGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCC 229812067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCC 1380

229812068 TAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGG 229812127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTT-GATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGG 1439

229812128 CTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGTGAT 229812187
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1440 CTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGTTCAAGTGAT 1499

229812188 TCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTA 229812247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTA 1559

229812248 ATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACT 229812307
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACT 1619

229812308 CCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCC 229812367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCC 1679

229812368 ATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATA 229812427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 ATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATA 1739

229812428 TACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTG 229812487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTG 1799

229812488 AACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1845

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1846 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1905

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1965

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 2025

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2085

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2145

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2205

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2265

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2325

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2385

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2445

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2505

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2565

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2625

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2685

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2745

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2805

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2865

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2925

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2985

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 3045

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3105

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3165

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3225

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3284

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3344

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3404

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3464

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3524

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3584

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3644

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG-----GTGTGTGTGTGTGTG 229822689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||
     3645 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 3704

229822690 TGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCTGGA 229822749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 TGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCTGGA 3764

229822750 GTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTCTGT 229822809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 GTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTCTGT 3824

229822810 TTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTTTGT 229822869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 TTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTTTGT 3884

229822870 ATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGACCTC 229822929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 ATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGACCTC 3944

229822930 AAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCACGC 229822989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 AAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCACGC 4004

229822990 CCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAACAA 229823049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 CCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAACAA 4064

229823050 GATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGGGCC 229823109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 GATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGGGCC 4124

229823110 TCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACGGGT 229823169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 TCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACGGGT 4184

229823170 ATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGAAGG 229823229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 ATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGAAGG 4244

229823230 CAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCTCAT 229823289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 CAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCTCAT 4304

229823290 TTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAGATG 229823349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 TTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAGATG 4364

229823350 TTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTCAAG 229823409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4365 TTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTCAAG 4424

229823410 ACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTGTGG 229823469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4425 ACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTGTGG 4484

229823470 TGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAGAGA 229823529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4485 TGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAGAGA 4544

229823530 TCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAATTA 229823589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4545 TCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAATTA 4604

229823590 TCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATC 229823649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4605 TCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATC 4664

229823650 ACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAGTCT 229823709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4665 ACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAGTCT 4724

229823710 GGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTATAC 229823769
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4725 GGTGACAGAGCGAGACTCCGTCT-AAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTATAC 4783

229823770 CAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAATTA 229823829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4784 CAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAATTA 4843

229823830 ATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATAGAA 229823889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4844 ATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATAGAA 4903

229823890 AGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTGCAG 229823949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4904 AGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTGCAG 4963

229823950 GACAGTGATCCATTAAGTCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAAGAG 229824009
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4964 GACAGTGATCCATTAAATCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAAGAG 5023

229824010 GGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTCCCT 229824069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5024 GGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTCCCT 5083

229824070 AAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCGAGT 229824129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5084 AAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCGAGT 5143

229824130 CAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGAGGT 229824189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5144 CAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGAGGT 5203

229824190 CCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGCTTC 229824249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5204 CCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGCTTC 5263

229824250 TTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTCCAG 229824309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5264 TTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTCCAG 5323

229824310 CTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGGCTC 229824369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5324 CTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGGCTC 5383

229824370 ATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGT 229824429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5384 ATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGT 5443

229824430 TCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 229824489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5444 TCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC 5503

229824490 CAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCA 229824549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5504 CAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCA 5563

229824550 CTTGAATCTGCGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTG 229824609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5564 CTTGAATCTGCGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTG 5623

229824610 GGCGACAGTGCAAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACATATATATATA 229824669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5624 GGCGACAGTGCAAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACATATATATATA 5683

229824670 TAGAGAGAGAGCCAAGTTAAAAGGGGAGTGGGGCAAGAAACCCTCTTTACCAGAGGACTG 229824729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5684 TAGAGAGAGAGCCAAGTTAAAAGGGGAGTGGGGCAAGAAACCCTCTTTACCAGAGGACTG 5743

229824730 GAAGAGAAAGCACTCTAGAAGCCAGTGGGTGTGAGCACATTCAAGTCACCGGGTTTGAGA 229824789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5744 GAAGAGAAAGCACTCTAGAAGCCAGTGGGTGTGAGCACATTCAAGTCACCGGGTTTGAGA 5803

229824790 TGATGGGTCCGTGGCAGCTGTTTATTCCCTTCCATCACTGGGATGTCCATCTTGGGCGGC 229824849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5804 TGATGGGTCCGTGGCAGCTGTTTATTCCCTTCCATCACTGGGATGTCCATCTTGGGCGGC 5863

229824850 TTCAAGTTTGCTGGATCTCTAGTCATGTGGTTGGCCTGGGCATGGATCAGTTCCACTGGA 229824909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5864 TTCAAGTTTGCTGGATCTCTAGTCATGTGGTTGGCCTGGGCATGGATCAGTTCCACTGGA 5923

229824910 GAGGGCTTCTGGGCTCCTTGGTAGGCCTGGGTGGCAAAACTTCCAGAATCATCCTTCTGA 229824969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5924 GAGGGCTTCTGGGCTCCTTGGTAGGCCTGGGTGGCAAAACTTCCAGAATCATCCTTCTGA 5983

229824970 AGGGATCTCGGTCCAAAGAGGCTCCACTTATCTGACAAGTTTCTGTCCTTATCTCCACTT 229825029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5984 AGGGATCTCGGTCCAAAGAGGCTCCACTTATCTGACAAGTTTCTGTCCTTATCTCCACTT 6043

229825030 CCAGAATCCATGGTGCTGGGATTTGGGCCAGGTAAAGCTGTGGAAGAACCAGAAGTGAAC 229825089
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6044 CCAGAATCCATGGTGCTGGGAGTTGGGCCAGGTAAAGCTGTGGAAGAACCAGAAGTGAAC 6103

229825090 CAGCCTCTGGGTCTCTGCTCAGGGGAAGAGTGAGGAGTGCAGCTTGGGGCTGACTGGGCT 229825149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6104 CAGCCTCTGGGTCTCTGCTCAGGGGAAGAGTGAGGAGTGCAGCTTGGGGCTGACTGGGCT 6163

229825150 GATGCAGGCTGCCTCTCTTCTCTTGTTCTCTCTCCACTCTGTAGCTTTAGTTGGTGGAGC 229825209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6164 GATGCAGGCTGCCTCTCTTCTCTTGTTCTCTCTCCACTCTGTAGCTTTAGTTGGTGGAGC 6223

229825210 ACTTCCGCCACTCGAAGGTACTTGGTCTCCTCTGCGGTGAGGCCCTTGTGTGGTGTGTAG 229825269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6224 ACTTCCGCCACTCGAAGGTACTTGGTCTCCTCTGCGGTGAGGCCCTTGTGTGGTGTGTAG 6283

229825270 CCAGCACCTCTCAACCCTGCCTGTCGCCCAAAATGCTGAGTACTTTCCTGGGTCTGTTTT 229825329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6284 CCAGCACCTCTCAACCCTGCCTGTCGCCCAAAATGCTGAGTACTTTCCTGGGTCTGTTTT 6343

229825330 GTGAACAGAGAATTCATGATGATATGGGTAGCTTTAGACTTCACCACTGGGACTGTGTCA 229825389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6344 GTGAACAGAGAATTCATGATGATATGGGTAGCTTTAGACTTCACCACTGGGACTGTGTCA 6403

229825390 CACTGTCAATGACAGGGTCATGGCAGGGGCGGGTAGGCTGGTCTCT 229825435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6404 CACTGTCAATGACAGGGTCATGGCAGGGGCGGGTAGGCTGGTCTCT 6449

Alignment time is 6.22073 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3262] =>      3262 nucs 'mol-32-3327-000664_3262'

Score:        3187
Aligned:      3271        nucs
Identic:      3256 (100%) nucs =>      1762 ( 99%)      1494 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810761,229812533] EXCISED REGION [229820837,229822332]
 second seq =>  [        1,     1765] EXCISED REGION [     1766,     3262]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810761 CCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAG 229810820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAG 60

229810821 TGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTT 229810880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTT 120

229810881 AACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTA 229810940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTA 180

229810941 TTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATT 229811000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATT 240

229811001 ATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATAT 229811060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATAT 300

229811061 CTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGC 229811120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGC 360

229811121 ACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCAC 229811180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCAC 420

229811181 AGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTT 229811240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTT 480

229811241 CTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCC 229811300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCC 540

229811301 TCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA 229811360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA 600

229811361 TCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCA 229811420
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 --------CCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCA 652

229811421 AACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCA 229811480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 AACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCA 712

229811481 GGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATA 229811540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 GGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATA 772

229811541 TAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGT 229811600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGT 832

229811601 ATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCT 229811660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 ATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCT 892

229811661 CATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCG 229811720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 CATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCG 952

229811721 TATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGAC 229811780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 TATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGAC 1012

229811781 ATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAA 229811840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 ATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAA 1072

229811841 TACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAA 229811900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAA 1132

229811901 GCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATG 229811960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 GCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATG 1192

229811961 TGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTG 229812020
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 TGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTG 1252

229812021 ACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATC 229812080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 ACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATC 1312

229812081 ATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 229812140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 ATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 1372

229812141 GTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAG 229812200
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 GTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAG 1432

229812201 CTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAG 229812260
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1433 CTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAA 1492

229812261 TAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGA 229812320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 TAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGA 1552

229812321 TCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCC 229812380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 TCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCC 1612

229812381 AAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTA 229812440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 AAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTA 1672

229812441 AAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGT 229812500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 AAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGT 1732

229812501 TTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 TTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1765

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1766 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1825

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1885

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1945

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2005

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2065

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2125

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2185

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2245

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2305

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2365

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2425

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2485

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2545

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2605

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2665

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2725

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2785

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2845

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2905

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2965

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3025

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3085

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3145

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3204

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTT 229822332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTT 3262

Alignment time is 3.22638 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5893] =>      5893 nucs 'mol-32-338a-077976_5893'

Score:        5761
Aligned:      5903        nucs
Identic:      5877 (100%) nucs =>      1795 ( 99%)      4082 (100%)
Gaps:           20 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810728,229812533] EXCISED REGION [229820837,229824923]
 second seq =>  [        1,     1798] EXCISED REGION [     1799,     5893]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810728 TTGTGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCA 229810787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCA 60

229810788 GCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTT 229810847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTT 120

229810848 CAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGT 229810907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGT 180

229810908 GGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAAT 229810967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAAT 240

229810968 ACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTC 229811027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTC 300

229811028 TGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAG 229811087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAG 360

229811088 TGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTC 229811147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTC 420

229811148 TTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTC 229811207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTC 480

229811208 TCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAAT 229811267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAAT 540

229811268 AAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCC 229811327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCC 600

229811328 ACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTC 229811387
          |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||
      601 ACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTC 652

229811388 ACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTC 229811447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 ACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTC 712

229811448 ATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTAT 229811507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 ATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTAT 772

229811508 TCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTA 229811567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTA 832

229811568 GGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCA 229811627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 GGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCA 892

229811628 TATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTT 229811687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTT 952

229811688 ACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCC 229811747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 ACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCC 1012

229811748 CAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATA 229811807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 CAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATA 1072

229811808 TCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCA 229811867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCA 1132

229811868 TACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGA 229811927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 TACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGA 1192

229811928 GCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTA 229811987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 GCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTA 1252

229811988 TCATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAA 229812047
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TTATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAA 1312

229812048 GTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGA 229812107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 GTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGA 1372

229812108 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCT 229812167
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1373 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCC 1432

229812168 GCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCA 229812227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 GCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCA 1492

229812228 CCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTT 229812287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1493 CCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTT 1552

229812288 GGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGC 229812347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 GGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGC 1612

229812348 TGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAA 229812407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 TGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAA 1672

229812408 TATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAG 229812467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 TATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAG 1732

229812468 GTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTC 229812527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 GTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTC 1792

229812528 AGCCCA 229812533
          ||||||
     1793 AGCCCA 1798

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1799 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1858

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1918

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1978

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2038

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2098

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2158

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2218

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2278

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2338

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2398

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2458

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2518

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2578

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2638

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2698

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2758

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2818

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2878

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2938

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2998

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3058

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3118

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3178

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3237

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3297

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3357

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3417

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3477

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3537

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3597

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     3598 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3657

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 3717

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 3777

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 3837

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 3897

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 3957

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 4017

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 4077

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 4137

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 4197

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 4257

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 4317

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTC 229823406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4318 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTC 4377

229823407 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 229823466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 4437

229823467 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 229823526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 4497

229823527 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 229823586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 4557

229823587 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 229823646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 4617

229823647 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 229823706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 4677

229823707 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 229823766
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCT-AAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 4736

229823767 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 229823826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 4796

229823827 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 229823886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 4856

229823887 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 229823946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 4916

229823947 CAGGACAGTGATCCATTAAGTCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAA 229824006
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 CAGGACAGTGATCCATTAAATCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAA 4976

229824007 GAGGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTC 229824066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 GAGGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTC 5036

229824067 CCTAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCG 229824126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 CCTAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCG 5096

229824127 AGTCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGA 229824186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 AGTCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGA 5156

229824187 GGTCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGC 229824246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 GGTCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGC 5216

229824247 TTCTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTC 229824306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 TTCTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTC 5276

229824307 CAGCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGG 229824366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 CAGCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGG 5336

229824367 CTCATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 229824426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 CTCATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 5396

229824427 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 229824486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 5456

229824487 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 229824546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 5516

229824547 TCACTTGAATCTGCGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGC 229824606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 TCACTTGAATCTGCGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGC 5576

229824607 CTGGGCGACAGTGCAAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACATATATAT 229824666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 CTGGGCGACAGTGCAAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACATATATAT 5636

229824667 ATATAGAGAGAGAGCCAAGTTAAAAGGGGAGTGGGGCAAGAAACCCTCTTTACCAGAGGA 229824726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 ATATAGAGAGAGAGCCAAGTTAAAAGGGGAGTGGGGCAAGAAACCCTCTTTACCAGAGGA 5696

229824727 CTGGAAGAGAAAGCACTCTAGAAGCCAGTGGGTGTGAGCACATTCAAGTCACCGGGTTTG 229824786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 CTGGAAGAGAAAGCACTCTAGAAGCCAGTGGGTGTGAGCACATTCAAGTCACCGGGTTTG 5756

229824787 AGATGATGGGTCCGTGGCAGCTGTTTATTCCCTTCCATCACTGGGATGTCCATCTTGGGC 229824846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 AGATGATGGGTCCGTGGCAGCTGTTTATTCCCTTCCATCACTGGGATGTCCATCTTGGGC 5816

229824847 GGCTTCAAGTTTGCTGGATCTCTAGTCATGTGGTTGGCCTGGGCATGGATCAGTTCCACT 229824906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 GGCTTCAAGTTTGCTGGATCTCTAGTCATGTGGTTGGCCTGGGCATGGATCAGTTCCACT 5876

229824907 GGAGAGGGCTTCTGGGC 229824923
          |||||||||||||||||
     5877 GGAGAGGGCTTCTGGGC 5893

Alignment time is 5.79261 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3465] =>      3465 nucs 'mol-32-3395-066030_3465'

Score:        3390
Aligned:      3474        nucs
Identic:      3459 (100%) nucs =>      1795 ( 99%)      1664 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810728,229812533] EXCISED REGION [229820837,229822502]
 second seq =>  [        1,     1798] EXCISED REGION [     1799,     3465]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810728 TTGTGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCA 229810787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCA 60

229810788 GCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTT 229810847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTT 120

229810848 CAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGT 229810907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGT 180

229810908 GGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAAT 229810967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAAT 240

229810968 ACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTC 229811027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTC 300

229811028 TGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAG 229811087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAG 360

229811088 TGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTC 229811147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTC 420

229811148 TTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTC 229811207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTC 480

229811208 TCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAAT 229811267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAAT 540

229811268 AAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCC 229811327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCC 600

229811328 ACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTC 229811387
          |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||
      601 ACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTC 652

229811388 ACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTC 229811447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 ACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTC 712

229811448 ATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTAT 229811507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 ATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTAT 772

229811508 TCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTA 229811567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTA 832

229811568 GGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCA 229811627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 GGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCA 892

229811628 TATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTT 229811687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTT 952

229811688 ACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCC 229811747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 ACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCC 1012

229811748 CAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATA 229811807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 CAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATA 1072

229811808 TCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCA 229811867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCA 1132

229811868 TACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGA 229811927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 TACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGA 1192

229811928 GCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTA 229811987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 GCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTA 1252

229811988 TCATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAA 229812047
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TTATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAA 1312

229812048 GTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGA 229812107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 GTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGA 1372

229812108 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCT 229812167
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1373 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCC 1432

229812168 GCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCA 229812227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 GCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCA 1492

229812228 CCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTT 229812287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1493 CCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTT 1552

229812288 GGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGC 229812347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 GGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGC 1612

229812348 TGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAA 229812407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 TGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAA 1672

229812408 TATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAG 229812467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 TATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAG 1732

229812468 GTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTC 229812527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 GTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTC 1792

229812528 AGCCCA 229812533
          ||||||
     1793 AGCCCA 1798

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1799 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1858

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1918

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1978

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2038

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2098

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2158

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2218

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2278

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2338

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2398

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2458

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2518

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2578

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2638

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2698

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2758

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2818

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2878

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2938

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2998

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3058

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3118

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3178

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3237

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3297

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3357

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3417

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATAC 229822502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATAC 3465

Alignment time is 3.451 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5313] =>      5313 nucs 'mol-32-3395-097086_5313'

Score:        5144
Aligned:      5323        nucs
Identic:      5292 ( 99%) nucs =>      1784 ( 99%)      3508 (100%)
Gaps:           23 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810738,229812533] EXCISED REGION [229820837,229824350]
 second seq =>  [        1,     1791] EXCISED REGION [     1792,     5313]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810738 TTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCA 229810797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATTGGCA 60

229810798 TGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTT 229810857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTT 120

229810858 TTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTT 229810917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTT 180

229810918 CATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTAC 229810977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTAC 240

229810978 CTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAA 229811037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAA 300

229811038 TGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAA 229811097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAA 360

229811098 CTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATA 229811157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATA 420

229811158 GAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCA 229811217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCA 480

229811218 TGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGT 229811277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGT 540

229811278 TCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAA 229811337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAA 600

229811338 CCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCCACCCAT 229811397
          |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCCACCCAT 652

229811398 CCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTA 229811457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 CCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTA 712

229811458 TCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCC 229811517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 TCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCC 772

229811518 CCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATT 229811577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 CCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATT 832

229811578 TTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTA 229811637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 TTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTA 892

229811638 TACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTT 229811697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTT 952

229811698 TATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAA 229811757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 TATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAA 1012

229811758 CCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAA 229811817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 CCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAA 1072

229811818 AATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATA 229811877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 AATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATA 1132

229811878 GGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTC 229811937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 GGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTC 1192

229811938 TAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAAT 229811997
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1193 TAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAAT 1252

229811998 GAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAA 229812057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 GAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAA 1312

229812058 GGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTT---GATGGAGTCTCAC 229812114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||
     1313 GGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCAC 1372

229812115 TCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCC 229812174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1373 TCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCC 1432

229812175 AGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCA 229812234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 AGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCA 1492

229812235 CTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGG 229812294
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1493 CTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTCGGCCTGG 1552

229812295 CTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 229812354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 CTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 1612

229812355 ACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAA 229812414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 ACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAA 1672

229812415 TTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACA 229812474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 TTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACA 1732

229812475 TTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 TTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1791

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1792 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1851

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1911

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1971

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2031

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2091

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2151

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2211

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2271

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2331

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2391

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2451

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2511

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2571

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2631

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2691

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2751

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2811

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCCTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2871

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2931

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2991

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3051

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3111

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3171

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3230

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3290

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3350

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3410

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3470

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3530

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3590

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     3591 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3650

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 3710

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 3770

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 3830

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 3890

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 3950

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 4010

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 4070

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 4130

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 4190

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 4250

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 4310

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTC 229823406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4311 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTC 4370

229823407 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 229823466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 4430

229823467 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 229823526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 4490

229823527 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 229823586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 4550

229823587 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 229823646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 4610

229823647 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 229823706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 4670

229823707 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 229823766
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCT-AAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 4729

229823767 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 229823826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4730 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 4789

229823827 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 229823886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4790 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 4849

229823887 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 229823946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4850 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 4909

229823947 CAGGACAGTGATCCATTAAGTCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAA 229824006
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4910 CAGGACAGTGATCCATTAAATCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAA 4969

229824007 GAGGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTC 229824066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4970 GAGGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTC 5029

229824067 CCTAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCG 229824126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5030 CCTAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCG 5089

229824127 AGTCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGA 229824186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5090 AGTCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGA 5149

229824187 GGTCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGC 229824246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5150 GGTCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGC 5209

229824247 TTCTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTC 229824306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5210 TTCTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTC 5269

229824307 CAGCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTC 229824350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5270 CAGCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTC 5313

Alignment time is 5.44433 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     8010] =>      8010 nucs 'mol-32-33a0-000089_8010'

Score:        7782
Aligned:      8020        nucs
Identic:      7982 (100%) nucs =>       710 (100%)      7272 (100%)
Gaps:           25 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229811821,229812533] EXCISED REGION [229820837,229828128]
 second seq =>  [        1,      713] EXCISED REGION [      714,     8010]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229811821 TCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGT 229811880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGT 60

229811881 GCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAG 229811940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAG 120

229811941 TGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAATGAG 229812000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      121 TGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAATGAG 180

229812001 GCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGA 229812060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGA 240

229812061 ATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTC 229812120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTC 300

229812121 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTTC 229812180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      301 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGTTC 360

229812181 AAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCAC 229812240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCAC 420

229812241 CTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTC 229812300
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTC 480

229812301 TTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 229812360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 540

229812361 GCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTT 229812420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTT 600

229812421 TACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTC 229812480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTC 660

229812481 TTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 713

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      714 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 773

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 833

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 893

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 953

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 1013

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 1073

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 1133

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 1193

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 1253

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 1313

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 1373

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 1433

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 1493

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 1553

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 1613

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 1673

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 1733

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 1793

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 1853

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 1913

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 1973

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 2033

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 2093

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 2152

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 2212

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 2272

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 2332

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 2392

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 2452

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 2512

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     2513 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 2572

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 2632

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 2692

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 2752

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 2812

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 2872

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 2932

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 2992

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 3052

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 3112

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 3172

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 3232

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTC 229823406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3233 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTC 3292

229823407 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 229823466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 3352

229823467 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 229823526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 3412

229823527 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 229823586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 3472

229823587 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 229823646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 3532

229823647 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 229823706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 3592

229823707 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 229823766
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCT-AAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 3651

229823767 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 229823826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 3711

229823827 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 229823886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 3771

229823887 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 229823946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 3831

229823947 CAGGACAGTGATCCATTAAGTCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAA 229824006
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 CAGGACAGTGATCCATTAAATCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAA 3891

229824007 GAGGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTC 229824066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 GAGGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTC 3951

229824067 CCTAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCG 229824126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 CCTAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCG 4011

229824127 AGTCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGA 229824186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4012 AGTCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGA 4071

229824187 GGTCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGC 229824246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4072 GGTCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGC 4131

229824247 TTCTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTC 229824306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4132 TTCTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTC 4191

229824307 CAGCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGG 229824366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4192 CAGCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGG 4251

229824367 CTCATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 229824426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 CTCATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 4311

229824427 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 229824486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4312 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 4371

229824487 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 229824546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4372 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 4431

229824547 TCACTTGAATCTGCGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGC 229824606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 TCACTTGAATCTGCGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGC 4491

229824607 CTGGGCGACAGTGCAAGACTCCATCT-----CAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACATA 229824661
          ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||
     4492 CTGGGCGACAGTGCAAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACATA 4551

229824662 TATATATATAGAGAGAGAGCCAAGTTAAAAGGGGAGTGGGGCAAGAAACCCTCTTTACCA 229824721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4552 TATATATATAGAGAGAGAGCCAAGTTAAAAGGGGAGTGGGGCAAGAAACCCTCTTTACCA 4611

229824722 GAGGACTGGAAGAGAAAGCACTCTAGAAGCCAGTGGGTGTGAGCACATTCAAGTCACCGG 229824781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 GAGGACTGGAAGAGAAAGCACTCTAGAAGCCAGTGGGTGTGAGCACATTCAAGTCACCGG 4671

229824782 GTTTGAGATGATGGGTCCGTGGCAGCTGTTTATTCCCTTCCATCACTGGGATGTCCATCT 229824841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4672 GTTTGAGATGATGGGTCCGTGGCAGCTGTTTATTCCCTTCCATCACTGGGATGTCCATCT 4731

229824842 TGGGCGGCTTCAAGTTTGCTGGATCTCTAGTCATGTGGTTGGCCTGGGCATGGATCAGTT 229824901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4732 TGGGCGGCTTCAAGTTTGCTGGATCTCTAGTCATGTGGTTGGCCTGGGCATGGATCAGTT 4791

229824902 CCACTGGAGAGGGCTTCTGGGCTCCTTGGTAGGCCTGGGTGGCAAAACTTCCAGAATCAT 229824961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4792 CCACTGGAGAGGGCTTCTGGGCTCCTTGGTAGGCCTGGGTGGCAAAACTTCCAGAATCAT 4851

229824962 CCTTCTGAAGGGATCTCGGTCCAAAGAGGCTCCACTTATCTGACAAGTTTCTGTCCTTAT 229825021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4852 CCTTCTGAAGGGATCTCGGTCCAAAGAGGCTCCACTTATCTGACAAGTTTCTGTCCTTAT 4911

229825022 CTCCACTTCCAGAATCCATGGTGCTGGGATTTGGGCCAGGTAAAGCTGTGGAAGAACCAG 229825081
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4912 CTCCACTTCCAGAATCCATGGTGCTGGGAGTTGGGCCAGGTAAAGCTGTGGAAGAACCAG 4971

229825082 AAGTGAACCAGCCTCTGGGTCTCTGCTCAGGGGAAGAGTGAGGAGTGCAGCTTGGGGCTG 229825141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4972 AAGTGAACCAGCCTCTGGGTCTCTGCTCAGGGGAAGAGTGAGGAGTGCAGCTTGGGGCTG 5031

229825142 ACTGGGCTGATGCAGGCTGCCTCTCTTCTCTTGTTCTCTCTCCACTCTGTAGCTTTAGTT 229825201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5032 ACTGGGCTGATGCAGGCTGCCTCTCTTCTCTTGTTCTCTCTCCACTCTGTAGCTTTAGTT 5091

229825202 GGTGGAGCACTTCCGCCACTCGAAGGTACTTGGTCTCCTCTGCGGTGAGGCCCTTGTGTG 229825261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5092 GGTGGAGCACTTCCGCCACTCGAAGGTACTTGGTCTCCTCTGCGGTGAGGCCCTTGTGTG 5151

229825262 GTGTGTAGCCAGCACCTCTCAACCCTGCCTGTCGCCCAAAATGCTGAGTACTTTCCTGGG 229825321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5152 GTGTGTAGCCAGCACCTCTCAACCCTGCCTGTCGCCCAAAATGCTGAGTACTTTCCTGGG 5211

229825322 TCTGTTTTGTGAACAGAGAATTCATGATGATATGGGTAGCTTTAGACTTCACCACTGGGA 229825381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5212 TCTGTTTTGTGAACAGAGAATTCATGATGATATGGGTAGCTTTAGACTTCACCACTGGGA 5271

229825382 CTGTGTCACACTGTCAATGACAGGGTCATGGCAGGGGCGGGTAGGCTGGTCTCTCCTTCC 229825441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5272 CTGTGTCACACTGTCAATGACAGGGTCATGGCAGGGGCGGGTAGGCTGGTCTCTCCTTCC 5331

229825442 TCCTCCTTGGTGAGGCACTGATACTTGCACTCTGGAATCACTGGCTTCCAGTGGACGCTG 229825501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5332 TCCTCCTTGGTGAGGCACTGATACTTGCACTCTGGAATCACTGGCTTCCAGTGGACGCTG 5391

229825502 CCCGTGTCCGATGGAGGAGTCATGGGCACAGGGTCCTCGAGGGCATCATCATAGCTGGAT 229825561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5392 CCCGTGTCCGATGGAGGAGTCATGGGCACAGGGTCCTCGAGGGCATCATCATAGCTGGAT 5451

229825562 GCCCAGCAGTTTATCCTGATGGGCAGGGACATCTTTCCTAGAAGCCCACCCAGCCTCAAG 229825621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5452 GCCCAGCAGTTTATCCTGATGGGCAGGGACATCTTTCCTAGAAGCCCACCCAGCCTCAAG 5511

229825622 AGCAGGCACTTCTGGTTGTGTTGAAGCCAGTGAAAGACTGGGACCCAGGTGCTTTTTCCA 229825681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5512 AGCAGGCACTTCTGGTTGTGTTGAAGCCAGTGAAAGACTGGGACCCAGGTGCTTTTTCCA 5571

229825682 TATATATAGAATTCTGAGCTGAGTCCCTCCCACCACAGTGAAATGATGTAATGACTAAGC 229825741
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5572 TATATATAGAATTCTGAGCTGAGTCCCTGCCACCACAGTGAAATGATGTAATGACTAAGC 5631

229825742 TGACAGATGTTAATGAGGAACACAGTGCAGCAGCTGCAAATTAGCAAAGCTTCCCAGGAA 229825801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5632 TGACAGATGTTAATGAGGAACACAGTGCAGCAGCTGCAAATTAGCAAAGCTTCCCAGGAA 5691

229825802 GAGTGCATCCAGAGGTTCTGCTATCCTGCTGCTGCTGCTGCTGGGCTGCCTGCGGCCTGG 229825861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5692 GAGTGCATCCAGAGGTTCTGCTATCCTGCTGCTGCTGCTGCTGGGCTGCCTGCGGCCTGG 5751

229825862 AGTCCAGCGCTAAAGAGGTTCTGAGGGCCCACGTCTCCCGAGAGGCTGTGACGCAGTCTG 229825921
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5752 AGTCCGGCGCTAAAGAGGTTCTGAGGGCCCACGTCTCCCGAGAGGCTGTGACGCAGTCTG 5811

229825922 GACTGAAGGCATGGTGAGAGCAGTGGCAACACCGAAGGTCTCCAGGACCCAGCAGACAAC 229825981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5812 GACTGAAGGCATGGTGAGAGCAGTGGCAACACCGAAGGTCTCCAGGACCCAGCAGACAAC 5871

229825982 ACTGCCCCCCTGCTATGGTTTTGAAGTGTCTTTTTCTGTACTCAGCCCTTACGTGGTTGC 229826041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5872 ACTGCCCCCCTGCTATGGTTTTGAAGTGTCTTTTTCTGTACTCAGCCCTTACGTGGTTGC 5931

229826042 TATAAACATTAGACTATTTTTTAAAGTAGTTACAAATGGTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGT 229826101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||
     5932 TATAAACATTAGACTATTTTTTAAAGTAGTTACAAATG--------GTTTGTTTGTTTGT 5983

229826102 TTGTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTACGA 229826161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5984 TTGTTTGTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTACGA 6043

229826162 TCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCC 229826221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6044 TCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCC 6103

229826222 GAGTAGCTGGGATTACAAGCACCCCCGCCACCGACCGCACCCAGCTAATTTTTGTATTTT 229826281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6104 GAGTAGCTGGGATTACAAGCACCCCCGCCACCGACCGCACCCAGCTAATTTTTGTATTTT 6163

229826282 TAGTAGAGACAGGGTTTCATCACGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTG 229826341
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6164 TAGTAGAGACAGGGTTTCATCACATTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTG 6223

229826342 ATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCAACCTCCACCTC 229826401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6224 ATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCAACCTCCACCTC 6283

229826402 CTGGGCTCAATAGAAACATTTTTTTTTAAGTTTCTGCTGTAAAAAAATATATTTCTGTTG 229826461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6284 CTGGGCTCAATAGAAACATTTTTTTTTAAGTTTCTGCTGTAAAAAAATATATTTCTGTTG 6343

229826462 AGCCTAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAACCAAGATTACACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTG 229826521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6344 AGCCTAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAACCAAGATTACACCACTGCTCTCCAGCCTGGGTG 6403

229826522 ACAGAGTGAGACCCTGTCTCCAAAAAAAGAAAGTTTCTGTTGGGGGAGAAGAGCTTGGAG 229826581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6404 ACAGAGTGAGACCCTGTCTCCAAAAAAAGAAAGTTTCTGTTGGGGGAGAAGAGCTTGGAG 6463

229826582 GGTCATACTCTGCCATTGTGCTGACGTTGCTGTATTTGTTTTTACATTCAAACTTTCTTT 229826641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6464 GGTCATACTCTGCCATTGTGCTGACGTTGCTGTATTTGTTTTTACATTCAAACTTTCTTT 6523

229826642 TGTAATAAAATATATCTTGAAAAGCATCAGTGGTGGTGTGGCTTTATTCATTTTTAGTTT 229826701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6524 TGTAATAAAATATATCTTGAAAAGCATCAGTGGTGGTGTGGCTTTATTCATTTTTAGTTT 6583

229826702 GAGAATATGCACATTTTCTTCCTAATATTTGGCAGTTTGAAATAATCAAAAGGCTCAGGA 229826761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6584 GAGAATATGCACATTTTCTTCCTAATATTTGGCAGTTTGAAATAATCAAAAGGCTCAGGA 6643

229826762 CCCAGTTAAGAGAGTTTATTCAAGTGCACTGTCAGGGTGGCCATCTCAGGACACGTGGAC 229826821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6644 CCCAGTTAAGAGAGTTTATTCAAGTGCACTGTCAGGGTGGCCATCTCAGGACACGTGGAC 6703

229826822 ACCAAAGAATGGTGATTGGTGCTCCTGGTGTCCTGGTGTGGGGAAAAGTGAGGGCTGCTT 229826881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6704 ACCAAAGAATGGTGATTGGTGCTCCTGGTGTCCTGGTGTGGGGAAAAGTGAGGGCTGCTT 6763

229826882 ATGAGGTCAAAAATGGAAGTGTTGAATGGAATCACAGCATTTTCCATAGAGAGGCTAACA 229826941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6764 ATGAGGTCAAAAATGGAAGTGTTGAATGGAATCACAGCATTTTCCATAGAGAGGCTAACA 6823

229826942 TGCAGATATAAGATTTGATTGGCTACTATCGATTCCACGCTAAGGGGGTGGCTTAACATC 229827001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6824 TGCAGATATAAGATTTGATTGGCTACTATCGATTCCACGCTAAGGGGGTGGCTTAACATC 6883

229827002 CTATTGTAGGGAGATAACAACCACAAGGTCTCCAGCATCATTTTGTGTAGGTTTGAATGA 229827061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6884 CTATTGTAGGGAGATAACAACCACAAGGTCTCCAGCATCATTTTGTGTAGGTTTGAATGA 6943

229827062 AGAATGGGAAGTCTGGTTGGCATGTAACATCTCAACACAAAAGTCAGGAAGCAATGGTCA 229827121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6944 AGAATGGGAAGTCTGGTTGGCATGTAACATCTCAACACAAAAGTCAGGAAGCAATGGTCA 7003

229827122 TGCACCAGAGGAAAAGAACGGTCATGTTATATGACTCAGTTTGCAGGGCTTAACTTTTAT 229827181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7004 TGCACCAGAGGAAAAGAACGGTCATGTTATATGACTCAGTTTGCAGGGCTTAACTTTTAT 7063

229827182 TCTTAGCACAGTACATTTGGAAGGTGCTAAAATTTTATCTCTTTTCACATACGGCAGGCG 229827241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     7064 TCTTAGCACAGTACATTTGGAAGGTGCTAAAATTTTCTCTCTTTTCACATACGGCAGGCG 7123

229827242 GATACATCAGTGTCCCAGGCGGGGCTGGCTATGCTTTAGAGTACTGGCTGTCCCTGTGTT 229827301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     7124 GATACATCAGTGTCCCAGGCGGGGCTGGCTATGCTTTAGAGTACTGGCTGTCCCTGTGGT 7183

229827302 CTCTACTGTCTATCAAGTGGTACCCAATCTCCTACCACAAAGGGCTCGAGGTTTTCAGCC 229827361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7184 CTCTACTGTCTATCAAGTGGTACCCAATCTCCTACCACAAAGGGCTCGAGGTTTTCAGCC 7243

229827362 AGACAACAGTGTGTGTGCCTTGATTTGCAGCTCAGATAAATATCTTCTCATAGTCAGTTC 229827421
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7244 AGACAACAGTGTGTGTGCCTTTATTTGCAGCTCAGATAAATATCTTCTCATAGTCAGTTC 7303

229827422 AGCTGAAAAACATTTATTGAGTACTATATGTCAAGTACGGCAGAACACATGGGGGTATAA 229827481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7304 AGCTGAAAAACATTTATTGAGTACTATATGTCAAGTACGGCAGAACACATGGGGGTATAA 7363

229827482 CTGAGGACATAGAGGATCCATGCTAGAGGAATGTACTTCCAGTGAGAGAACAGACGGTAG 229827541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7364 CTGAGGACATAGAGGATCCATGCTAGAGGAATGTACTTCCAGTGAGAGAACAGACGGTAG 7423

229827542 GCAAACAATTTTAGGACAATGGGGAGCTGCCATGATGGAGGCATGTAGATGGTCCTGTGG 229827601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7424 GCAAACAATTTTAGGACAATGGGGAGCTGCCATGATGGAGGCATGTAGATGGTCCTGTGG 7483

229827602 GAGCACAGAGCAGGAACTTCCTGGAACTGAGCATTTTTGTTTGTTTGTTTGAGACAAGGT 229827661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7484 GAGCACAGAGCAGGAACTTCCTGGAACTGAGCATTTTTGTTTGTTTGTTTGAGACAAGGT 7543

229827662 CTTACTCTGTTGCCCAGGCTAGATGCAGTGGTGCCATCACAGCTCACTGTAACCTCCAAC 229827721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7544 CTTACTCTGTTGCCCAGGCTAGATGCAGTGGTGCCATCACAGCTCACTGTAACCTCCAAC 7603

229827722 TCCTGGGCTCAAGCGATCCTTCTGCCTTAGTGTCCTGAGTAGCTAGGAATACAGGCATGC 229827781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7604 TCCTGGGCTCAAGCGATCCTTCTGCCTTAGTGTCCTGAGTAGCTAGGAATACAGGCATGC 7663

229827782 ACCACCACACCTGGATAATTTTTAAAATTTTCTGCCGACAGAGGGTCTCACTATATTGCC 229827841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7664 ACCACCACACCTGGATAATTTTTAAAATTTTCTGCCGACAGAGGGTCTCACTATATTGCC 7723

229827842 CAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGAAATCCTTTTATCTTGACCTCCCAAAGTGCT 229827901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7724 CAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGAAATCCTTTTATCTTGACCTCCCAAAGTGCT 7783

229827902 GGAATGACAGGAGTAAGTCACCGGCCTCAGCCCTGGGAGCTGAGTCTTGATGAGAAGTTA 229827961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7784 GGAATGACAGGAGTAAGTCACCGGCCTCAGCCCTGGGAGCTGAGTCTTGATGAGAAGTTA 7843

229827962 GCTAAATGAAGAAGGAAGGGCCACCAGATGAAAAATTCATAACAAAGCCTGAATGAAAAC 229828021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7844 GCTAAATGAAGAAGGAAGGGCCACCAGATGAAAAATTCATAACAAAGCCTGAATGAAAAC 7903

229828022 TCGGGATTTCGGAGTCCTGGTCCAGTGTTTTTCTTACTTATCTGGGTTTTCAGAATCTCG 229828081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7904 TCGGGATTTCGGAGTCCTGGTCCAGTGTTTTTCTTACTTATCTGGGTTTTCAGAATCTCG 7963

229828082 TCTAGAAGAGACTCATATTCTTGTTTAATCTGGCAGGGCTTTTTTTC 229828128
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7964 TCTAGAAGAGACTCATATTCTTGTTTAATCTGGCAGGGCTTTTTTTC 8010

Alignment time is 7.75286 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2770] =>      2770 nucs 'mol-32-3403-143122_2770'

Score:        2698
Aligned:      2778        nucs
Identic:      2765 (100%) nucs =>      1968 ( 99%)       797 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810555,229812533] EXCISED REGION [229820837,229821634]
 second seq =>  [        1,     1972] EXCISED REGION [     1973,     2770]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810555 GCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCGTGAACCCGG 229810614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCGTGAACCCGG 60

229810615 GAGGCGGAGCTTGCCGTGAGCCCAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGC 229810674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGCGGAGCTTGCCGTGAGCCCAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGC 120

229810675 GAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-GGCAGAATCATTGTGG 229810733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
      121 GAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGAATCATTGTGG 180

229810734 ATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATT 229810793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAGCCATT 240

229810794 GGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCAT 229810853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCAT 300

229810854 TGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTA 229810913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTA 360

229810914 ACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATT 229810973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATT 420

229810974 CTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATC 229811033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATC 480

229811034 CTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCA 229811093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCA 540

229811094 ATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAA 229811153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAA 600

229811154 AATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGA 229811213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGA 660

229811214 ATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCT 229811273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCT 720

229811274 CTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCAC 229811333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCAC 780

229811334 CCAACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCCAC 229811393
          |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||
      781 CCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCCAC 832

229811394 CCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAG 229811453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 CCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAG 892

229811454 CTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTA 229811513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 CTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTA 952

229811514 TTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTT 229811573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 TTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTT 1012

229811574 TATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTG 229811633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 TATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTG 1072

229811634 ATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTA 229811693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 ATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTA 1132

229811694 TTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGG 229811753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 TTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGG 1192

229811754 TTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTAC 229811813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 TTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTAC 1252

229811814 AGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGT 229811873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 AGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGT 1312

229811874 TATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTAT 229811933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 TATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTAT 1372

229811934 ATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGT 229811993
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1373 ATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGT 1432

229811994 GAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAAT 229812053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 GAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAAT 1492

229812054 TTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCA 229812113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 TTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCA 1552

229812114 CTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTC 229812173
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1553 CTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTC 1612

229812174 CAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCC 229812233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 CAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCC 1672

229812234 ACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTG 229812293
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 ACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTG 1732

229812294 GCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 229812353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 GCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 1792

229812354 TACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATA 229812413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 TACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATA 1852

229812414 ATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCAC 229812473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 ATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCAC 1912

229812474 ATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 ATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1972

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1973 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 2032

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 2092

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 2152

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2212

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2272

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2332

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2392

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2452

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2512

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2572

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2632

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2692

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2752

229821617 TCATTTTGTTCATCCATT 229821634
          ||||||||||||||||||
     2753 TCATTTTGTTCATCCATT 2770

Alignment time is 3.01616 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     4223] =>      4223 nucs 'mol-32-34a8-060428_4223'

Score:        4116
Aligned:      4232        nucs
Identic:      4210 ( 99%) nucs =>      1717 ( 99%)      2493 (100%)
Gaps:           18 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810806,229812533] EXCISED REGION [229820837,229823331]
 second seq =>  [        1,     1721] EXCISED REGION [     1722,     4223]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810806 AGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGC 229810865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTCAGCATTGTTTTTCAGGC 60

229810866 AACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGC 229810925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTGGAGTAACTTCATGGAGC 120

229810926 AGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAG 229810985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATACAATTCTACCTGTTTAG 180

229810986 GCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCC 229811045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCTGTATCCTAATGACCTCC 240

229811046 CATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGT 229811105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGTGCTCAATAACTGTTTGT 300

229811106 TAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATAT 229811165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCTTTTAAAATAGAGTATAT 360

229811166 CATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGAT 229811225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCTCCTGAATCATGCTGGAT 420

229811226 TAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCAC 229811285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATAAATCTCTGTTCATCCAC 480

229811286 TCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCAT 229811345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCACCCACCCAACCATCCAT 540

229811346 CCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCAT 229811405
          |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCACCCACCCATCCATCCAT 592

229811406 CCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTA 229811465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 CCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCATGGAGCTTATCTTTTTA 652

229811466 CTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACT 229811525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 CTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATTCCCTATTCCCCAGGACT 712

229811526 CTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGT 229811585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 CTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAGGCTTTTATTTTCTTGGT 772

229811586 GGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGG 229811645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 GGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCATATCTGATTATACTCAGG 832

229811646 AGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATA 229811705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 AGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTACATTATTTTTATAGATA 892

229811706 GCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTT 229811765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 GCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCCAGGGGTTAACCTTATTT 952

229811766 CCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACT 229811825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 CCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATATCTTACAGAAAATTCACT 1012

229811826 CATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAG 229811885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 CATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCATACTGTTATAGGTGCCAG 1072

229811886 GGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATG 229811945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 GGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAGCTTATATTCTAGTGATG 1132

229811946 CCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATCATGTGAATGAGGCTAT 229812005
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1133 CCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTATTATGTGAATGAGGCTAT 1192

229812006 AAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTG 229812065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 AAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAGTGAATTTAAGGAATTTG 1252

229812066 CCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTT-GATGGAGTCTCACTCTGTCGCCC 229812124
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     1253 CCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCACTCTGTCGCCC 1312

229812125 AGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGT 229812184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1313 AGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCGCCTTCCAGGTTCAAGT 1372

229812185 GATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGG 229812244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 GATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACTGCACCTGG 1432

229812245 CTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGA 229812304
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 CTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTGGCCTGGCTGGTCTTGA 1492

229812305 ACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGA 229812364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 ACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGCGA 1552

229812365 GCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACC 229812424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 GCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAATATATAATTTCTTTACC 1612

229812425 ATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCA 229812484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 ATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGGTTCACATTTTTCTTCA 1672

229812485 GTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 229812533
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 GTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCAGCCCA 1721

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1722 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1781

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1841

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1901

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 1961

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2021

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2081

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2141

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2201

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2261

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2321

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2381

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2441

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2501

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2561

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2621

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2681

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2741

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2801

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2861

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2921

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 2981

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3041

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3101

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3160

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3220

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3280

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3340

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3400

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3460

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3520

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG------GTGTGTGTGTGTGT 229822688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||
     3521 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3580

229822689 GTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCTGG 229822748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 GTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCTGG 3640

229822749 AGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTCTG 229822808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 AGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTCTG 3700

229822809 TTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTTTG 229822868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 TTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTTTG 3760

229822869 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGACCT 229822928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGACCT 3820

229822929 CAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCACG 229822988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 CAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCACG 3880

229822989 CCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAACA 229823048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 CCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAACA 3940

229823049 AGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGGGC 229823108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 AGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGGGC 4000

229823109 CTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACGGG 229823168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 CTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACGGG 4060

229823169 TATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGAAG 229823228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 TATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGAAG 4120

229823229 GCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCTCA 229823288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 GCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCTCA 4180

229823289 TTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTT 229823331
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 TTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTT 4223

Alignment time is 4.1046 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3346] =>      3346 nucs 'mol-32-34a8-173674_3346'

Score:        3251
Aligned:      3357        nucs
Identic:      3340 ( 99%) nucs =>      1852 ( 99%)      1488 (100%)
Gaps:           13 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810669,229812533] EXCISED REGION [229820837,229822326]
 second seq =>  [        1,     1855] EXCISED REGION [     1856,     3346]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810669 CAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGAATCAT 229810728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
        1 CAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-GGCAGAATCAT 59

229810729 TGTGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAG 229810788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       60 TGTGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCAG 119

229810789 CCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTC 229810848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 CCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTTC 179

229810849 AGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTG 229810908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 AGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGTG 239

229810909 GAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATA 229810968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 GAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAATA 299

229810969 CAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCT 229811028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 CAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTCT 359

229811029 GTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGT 229811088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 GTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAGT 419

229811089 GCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCT 229811148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 GCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTCT 479

229811149 TTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCT 229811208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTCT 539

229811209 CCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATA 229811268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 CCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAATA 599

229811269 AATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCA 229811328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 AATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCCA 659

229811329 CCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTCA 229811388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||
      660 CCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTCA 711

229811389 CCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCA 229811448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      712 CCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTCA 771

229811449 TGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATT 229811508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 TGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTATT 831

229811509 CCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAG 229811568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 CCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTAG 891

229811569 GCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCAT 229811628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 GCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCAT 951

229811629 ATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTA 229811688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 ATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTTA 1011

229811689 CATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCC 229811748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 CATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCCC 1071

229811749 AGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATAT 229811808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 AGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATAT 1131

229811809 CTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCAT 229811868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 CTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCAT 1191

229811869 ACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAG 229811928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 ACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGAG 1251

229811929 CTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTAT 229811988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 CTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTAT 1311

229811989 CATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAG 229812048
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 TATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAAG 1371

229812049 TGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAG 229812108
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     1372 TGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTT-GATGGAG 1430

229812109 TCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCTG 229812168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1431 TCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCG 1490

229812169 CCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCAC 229812228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 CCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCAC 1550

229812229 CTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTG 229812288
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1551 CTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTTG 1610

229812289 GCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCT 229812348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 GCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCT 1670

229812349 GGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAAT 229812408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 GGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAAT 1730

229812409 ATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGG 229812468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 ATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAGG 1790

229812469 TTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCA 229812528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 TTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTCA 1850

229812529 GCCCA 229812533
          |||||
     1851 GCCCA 1855

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1856 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1915

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1975

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 2035

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2095

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2155

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2215

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2275

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2335

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2395

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2455

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2515

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2575

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2635

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2695

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2755

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2815

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2875

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2935

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2995

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 3055

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3115

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3175

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3235

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3294

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAA 229822326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAA 3346

Alignment time is 3.24749 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [229802533,229830836] =>     28304 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5973] =>      5973 nucs 'mol-32-34d4-121364_5973'

Score:        5822
Aligned:      5983        nucs
Identic:      5952 ( 99%) nucs =>      1795 ( 99%)      4157 (100%)
Gaps:           25 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [229810728,229812533] EXCISED REGION [229820837,229824998]
 second seq =>  [        1,     1798] EXCISED REGION [     1799,     5973]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      8303 nucs [229812534,229820836]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [229812534,229812537] to [229820837,229820840]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [229812534,229812535] to [229820835,229820836]
 second seq =>         0 nucs

229810728 TTGTGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCA 229810787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTGGATCCTTGCACCACTATTGAATGAGCTTCCCAGAGGAGCAGTCAGATCCACAGCA 60

229810788 GCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTT 229810847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCATTGGCATGAGCAGGAGAAGAACCAAAAAGTGTTTCGTTGTTAAGCCACTGAGATTT 120

229810848 CAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGT 229810907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCATTGTTTTTCAGGCAACATAGCTTAACTTAACCCGAAGAGCACATTGGCTTTTTGT 180

229810908 GGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAAT 229810967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAGTAACTTCATGGAGCAGAGCCACCATATTATTCTAGACATGCACACAGGAGAGAAAT 240

229810968 ACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTC 229811027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAATTCTACCTGTTTAGGCCACTGTTAGTATTATGTTTTTAATCACAACCAACTGGTTC 300

229811028 TGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAG 229811087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTATCCTAATGACCTCCCATGAGTCTTGATATCTCATTTGAGAACTATTCAATAGCAAG 360

229811088 TGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTC 229811147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCTCAATAACTGTTTGTTAATGGAACCAAGGCACAGTAAAGTGGAATGACCTATCTCTC 420

229811148 TTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTC 229811207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTAAAATAGAGTATATCATTCTGGTGGCCACAGCCCTCTGCCAGATTTCATAATTTTC 480

229811208 TCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAAT 229811267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTGAATCATGCTGGATTAGCATGGGCAAGTTCTTTGATACATGAATAAATGATCAAAT 540

229811268 AAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCC 229811327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATCTCTGTTCATCCACTCATCCCTCCATCCCTCTTTCCCTTCACACTTCTCTCCATCC 600

229811328 ACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCACCCACACACCCACTCACTC 229811387
          |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||
      601 ACCCACCCAACCATCCATCCATCCATCCATCCA--------CCCACACACCCACTCACTC 652

229811388 ACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTC 229811447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 ACCCACCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCAAACAGGAAAAAAAATATATCTGCCTTC 712

229811448 ATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTAT 229811507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 ATGGAGCTTATCTTTTTACTAGTAAAGGAGCCAGGGGAATAAAAAATTTTAATTTCTTAT 772

229811508 TCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTA 229811567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 TCCCTATTCCCCAGGACTCTATTCCATTAGATATAGTTTCTAACAACATGTGAAAAATTA 832

229811568 GGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCA 229811627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 GGCTTTTATTTTCTTGGTGGCAATCATGTTTGTATCATGACTCACTGATACTATACCCCA 892

229811628 TATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTT 229811687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TATCTGATTATACTCAGGAGCCCTAAGTTTCCTCATTTTCATATACATAGATAATCTTTT 952

229811688 ACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCC 229811747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 ACATTATTTTTATAGATAGCTATCATCTTTTCGTATGCCCTGCTAGCTGAGTTTTATTCC 1012

229811748 CAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATA 229811807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 CAGGGGTTAACCTTATTTCCCAGTTTTGGGGACATTTTACTTCTGTGTCTAAATGACATA 1072

229811808 TCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCA 229811867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TCTTACAGAAAATTCACTCATTTATTTAACAAATACTTCTAGAGCAGCAATTATGCACCA 1132

229811868 TACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGA 229811927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 TACTGTTATAGGTGCCAGGGGTATAGTAGTGAAGCAAATAGACAGGTCTGCCCTCATGGA 1192

229811928 GCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTA 229811987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 GCTTATATTCTAGTGATGCCATGAAGATTAATGTGCCATCCAGCTATAATTACAAAGGTA 1252

229811988 TCATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAA 229812047
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TTATGTGAATGAGGCTATAAGGAAAGTATTTTGACCAAATTATTTTAATGCTAGTTAAAA 1312

229812048 GTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGA 229812107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 GTGAATTTAAGGAATTTGCCTAAAATCGGCATCATAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGA 1372

229812108 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCT 229812167
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1373 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTTGGTTCACTGCAACCTCC 1432

229812168 GCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCA 229812227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 GCCTTCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCA 1492

229812228 CCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTT 229812287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1493 CCTGCCACTGCACCTGGCTAATTTTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACGAAATATCTT 1552

229812288 GGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGC 229812347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 GGCCTGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGC 1612

229812348 TGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAA 229812407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 TGGGATTACAGGCGCGAGCCATCACGCCTGGCCAAATCAGCATCATAATTTAAACATAAA 1672

229812408 TATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAG 229812467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 TATATAATTTCTTTACCATATACAACAGCAGTAAAAATGTTGCTTAAAAAGTTGGTACAG 1732

229812468 GTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTC 229812527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 GTTCACATTTTTCTTCAGTGAACTTTTTCTGGTTTCTGTAATTAGTCCTATTAAGACGTC 1792

229812528 AGCCCA 229812533
          ||||||
     1793 AGCCCA 1798

EXCISED REGION

229820837 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCCTGATCCCTTGACC 229820896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1799 TTGTATTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGCCAGAATAGTCTTGATCCCTTGACC 1858

229820897 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 229820956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TTGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCTCACCTG 1918

229820957 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 229821016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 GCCTCTTTTGTTGCTTTTAAGATCCTCTTTTTGTCTTTGGCTTTTGACAGTGTGCTTATA 1978

229821017 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 229821076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 ATGTGTCTAGGTGTGGGTATTTTGGTGTTTGTCCTAACAGTGTTCATTGAGTTTCTTGGA 2038

229821077 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 229821136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TTTGTATATTTATATCTTCTATGAAAGTCAGGAAGTTTTTTACCATTATTTCTTCAAATA 2098

229821137 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 229821196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTCTTTTGCTCCTTTTTCCCTTTTCCTTCTGGAACTCTCATAATGTGTATGTTTGTCTAC 2158

229821197 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 229821256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TTGACAGTGTTCCACAGGTCCCTTAGACTCTACACTTTTTGCGTTCTTTTTTTTTTCTTT 2218

229821257 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 229821316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTCTCACACTTGATGACTTCAATGATTCTATCTTTAAGTTGGCTGATTCATTTTTCTGCC 2278

229821317 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 229821376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TGCTCAAATCTACTGTTGGACCCTATAGTTAATTTTTTCATTTCAATTATTTTATTTATT 2338

229821377 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 229821436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TTCAGTTCCAAAATTTGTCTTGTTCTTTTTAGATATTTTTTATTTCTTTATTGATAATCT 2398

229821437 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 229821496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CTTTCTCTCTCTCGTTCTCTCTCTGTTTTATAGAGTTGGGGTCTCACTCTGTCACCCAGG 2458

229821497 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 229821556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GTGGAGTGTAGTGGTACAATCATAGCTCAGTGCAGCCTCAACTTCTGGGCTCAAGTGATC 2518

229821557 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 229821616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TTCCCACCTCAGCCTCCCAAATAGCTGAGATTACAGGCATGTACCCCTGTACCTGACTTC 2578

229821617 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 229821676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TCATTTTGTTCATCCATTGTTATACTGATTTCCTTTATTTTTTTTGTGTCTTTCTTTAAT 2638

229821677 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 229821736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 GATTTGATCATACTTTAAACCGTTTTTTTAAAACCTTTGTCTAGTAACTCCAATTTCTGT 2698

229821737 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 229821796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 CCTTCCTCCAGGATGGTTTCTGTCAATTAACCTTGGTCCTTTGAATTAGTCATATTTTTG 2758

229821797 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 229821856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TATTTTTTTGTATGCCTTGTGATTTTTCACTGAAAACTAGACATTTGATTACTACAATGT 2818

229821857 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 229821916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GGTAACTCTGAAAATCAGATTCTCCCCTTCACCAGGATTTTCTGGCTCCTTTTCTTTTTT 2878

229821917 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 229821976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TTTTCTTTCTGTTATTGAAGTCTATAGTAGCCTGTTTGTTTAGTGACATTCCCAAGCTAT 2938

229821977 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 229822036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 ATTTCAAATACTATATTTTTTGTTGACATGGTAACTAAAGTCTCTGTTCCTTAGCTTGAG 2998

229822037 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 229822096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TTCAGCTAGTGTTTTGACGGAGAATTCCTTGAATGCTAGGAGCTGTCCTACTCTTTGCAA 3058

229822097 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 229822156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 ATTGACTCTGTGCTTGGGATTTCCTTCAACTCCATGCTAGGCTTGCACTGTGTCTAGGGA 3118

229822157 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 229822216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TCAGTCTAAGGTGAAAGCTTAGGTTTTCTCAGGTCTTTTCTGAGCATGCATCTTGTTCTG 3178

229822217 GGCATG--GACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 229822274
          |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 GGCAT-TTGACATGTCTGTCAAAATTCCCCATTTACTTTTGAGTGTCCTAATTTCCCAGA 3237

229822275 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 229822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GAAACTCTACACAGATTTTGCCTTAGGTAGTCTGTTATATGTTGACCTGTAATCTTTTCT 3297

229822335 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 229822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 CCCAGGCATCTTAGGGTTGTTATTTTGGTTTGCAATATTTTTTAGCTTTTTTTGGCCTCA 3357

229822395 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 229822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 GTCCTGAGTTAGGCAAAGCAGAGAGAAAATCAACTTGCATCAATTTTTCTGTGTTAGCCC 3417

229822455 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 229822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 CTATACAGGTTAGAATAGAAATGTGGCTCAGACAAATGTGACATATACAATAACTTGCAA 3477

229822515 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 229822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 ATAAAGTCTGCTCTGATCCCTCCAGAATTGGGGAAATGGTCTTGCACTGGGAACTTGGGC 3537

229822575 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 229822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 CATTGCCTCATCAGCATCAATCACTACTGCTTTCAGATAGCTGTGACATAGGAGAGGGGT 3597

229822635 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAG--------GTGTGTGTGTGT 229822686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
     3598 GGGGCAAAGACATCTAGAATCACCTCAAAACCTTCTACAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 3657

229822687 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 229822746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 GTGTGTGTGGGTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGGGTCTCGCCCTATTGCCCAGGCT 3717

229822747 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 229822806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 GGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCAGGTTCTAGTGATTC 3777

229822807 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 229822866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TGTTTCAGCCTCCTGAGTAGTTGGGACCACAGGCACGTGACATCATGCCCTGCTAATTTT 3837

229822867 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 229822926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAGCTTCTGAC 3897

229822927 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 229822986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 CTCAAATGATCTGCCTGCCTCAGCCTTCCAAAGTATTGGGATTACAAGTGTGAGCCACCA 3957

229822987 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 229823046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 CGCCCAGCCCTTCTACATTTTTTTTTATTTTTGGAAGTAGTAAGGATTTTTATTGTCAAA 4017

229823047 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 229823106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 CAAGATGTCATAATAGAAGACACAAATAAATTAATTGTTCTGATAATTTTAGACTCCAGG 4077

229823107 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 229823166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 GCCTCTCTATGGAAAGGTCAGCTTCTTATGCAGACAAGATACTATCCAAAACCAAAAACG 4137

229823167 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 229823226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 GGTATTTGAGACGGTGTTCAAGACAATGACTGAACTTGTCCACAGTGAGGAGAAATAAGA 4197

229823227 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 229823286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 AGGCAGTTTCCCTATTTCCTTTCCTCAGTGAGGTTATGTGTTGCATAAAGGGAGGTGGCT 4257

229823287 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 229823346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 CATTTTGGTGAAAAATGCTTTCATACAGAAAAGTTTGAATTCTTTTACCTCCCCTTGTAG 4317

229823347 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACATGAACCTC 229823406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4318 ATGTTTCAGGCTCTGAACAAGGAAATCAAAATACGGTAACACTGGCTTCACGTGAACCTC 4377

229823407 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 229823466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 AAGACTATAATCTAACTGTACCTACCATCTTCTTTACTTTAGAAAAGTTTAGGCTGGGTG 4437

229823467 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 229823526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 TGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGCCTCGTCAAG 4497

229823527 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 229823586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 AGATCAAGACGATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAACACACAAAAA 4557

229823587 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 229823646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 TTATCTGGGTGTGGTAGCACTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGA 4617

229823647 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 229823706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 ATCACTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAG 4677

229823707 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTAAAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 229823766
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 TCTGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCT-AAAAAAAAAAAATGTTTAACGTCCATTTACCTA 4736

229823767 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 229823826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 TACCAAATCAGTAGACTGAATTTTCTCTCTTAGTAAGTTTTTAACCAAATTGGAGTTAAA 4796

229823827 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 229823886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 TTAATCTCATTTTAAAGTGCAAGGAAAGCTTTGCAAGACTAGTGTTTGTTCTGTGGCATA 4856

229823887 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 229823946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 GAAAGAGGAGCATGCCTCCCCTGGCACTGACTTAAGAGGCCCCACATGAAGAACTGGCTG 4916

229823947 CAGGACAGTGATCCATTAAGTCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAA 229824006
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 CAGGACAGTGATCCATTAAATCTACCAAAAAGCGGGGGGACTCAAGGTTCAGCCTAGAAA 4976

229824007 GAGGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTC 229824066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 GAGGGTCCCTGCCAAGTCTGGCTTTTACCTGTACCCAGGTCCCAAACAGATCTTGGGTTC 5036

229824067 CCTAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCG 229824126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 CCTAAGTGACAAGGCTGGAGCACAGTGCCAGTCGTCAAGAGGGCCAGAGTCATCTCAGCG 5096

229824127 AGTCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGA 229824186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 AGTCAGTGAGCATCTCTTAAAGTTCTTATCTAGGGTAAATGATGAAAAACTAGGTAATGA 5156

229824187 GGTCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGC 229824246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 GGTCCCCCACACATCACTGCCGAAGTGATATAGTCTAGCTTTAAAGCAGTACAAAATGGC 5216

229824247 TTCTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTC 229824306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 TTCTTCCACACAACAAGGGCAAGCTTTGTACTAATGTTTCTCAAACACCAATAATGTCTC 5276

229824307 CAGCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGG 229824366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 CAGCTCTGGCCTCTAATTAACAGGTTTTTAAAAATATACCTTTCTGACCAGGCATGGTGG 5336

229824367 CTCATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 229824426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 CTCATTCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGTCAAGGAGGGCGGATCACCTGAGGTCAGG 5396

229824427 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 229824486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 AGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATT 5456

229824487 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 229824546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 AGCCAGGCGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 5516

229824547 TCACTTGAATCTGCGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGC 229824606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 TCACTTGAATCTGCGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGC 5576

229824607 CTGGGCGACAGTGCAAGACTCCATCT-----CAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACATA 229824661
          ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||
     5577 CTGGGCGACAGTGCAAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACATA 5636

229824662 TATATATATAGAGAGAGAGCCAAGTTAAAAGGGGAGTGGGGCAAGAAACCCTCTTTACCA 229824721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 TATATATATAGAGAGAGAGCCAAGTTAAAAGGGGAGTGGGGCAAGAAACCCTCTTTACCA 5696

229824722 GAGGACTGGAAGAGAAAGCACTCTAGAAGCCAGTGGGTGTGAGCACATTCAAGTCACCGG 229824781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 GAGGACTGGAAGAGAAAGCACTCTAGAAGCCAGTGGGTGTGAGCACATTCAAGTCACCGG 5756

229824782 GTTTGAGATGATGGGTCCGTGGCAGCTGTTTATTCCCTTCCATCACTGGGATGTCCATCT 229824841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 GTTTGAGATGATGGGTCCGTGGCAGCTGTTTATTCCCTTCCATCACTGGGATGTCCATCT 5816

229824842 TGGGCGGCTTCAAGTTTGCTGGATCTCTAGTCATGTGGTTGGCCTGGGCATGGATCAGTT 229824901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 TGGGCGGCTTCAAGTTTGCTGGATCTCTAGTCATGTGGTTGGCCTGGGCATGGATCAGTT 5876

229824902 CCACTGGAGAGGGCTTCTGGGCTCCTTGGTAGGCCTGGGTGGCAAAACTTCCAGAATCAT 229824961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 CCACTGGAGAGGGCTTCTGGGCTCCTTGGTAGGCCTGGGTGGCAAAACTTCCAGAATCAT 5936

229824962 CCTTCTGAAGGGATCTCGGTCCAAAGAGGCTCCACTT 229824998
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 CCTTCTGAAGGGATCTCGGTCCAAAGAGGCTCCACTT 5973

Alignment time is 5.85553 s

