
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3638] =>      3638 nucs 'mol-32-1e71-037038_3638'

Score:        3574
Aligned:      3640        nucs
Identic:      3634 (100%) nucs =>      3290 (100%)       344 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40790928,40794223] EXCISED REGION [40795243,40795586]
 second seq =>  [       1,    3294] EXCISED REGION [    3295,    3638]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1019 nucs [40794224,40795242]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        38 nucs [40794224,40794261] to [40795243,40795280]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [40794223,40794223] to [40795243,40795243]
 second seq =>         1 nucs [3294,3294] to [3295,3295]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40790928 AAATTATTTACATATTTATTGTCTGTTTTCTGTAACTAATAATAACTGGCATTTATTAAG 40790987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATTATTTACATATTTATTGTCTGTTTTCTGTAACTAATAATAACTGGCATTTATTAAG 60

 40790988 CACATGCCACGTGCTGAATATTGTTACAAGTACTACATTTTCTCACTTAACCTCATAAGT 40791047
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACATGCCACGTGCCGAATATTGTTACAAGTACTACATTTTCTCACTTAACCTCATAAGT 120

 40791048 AGTATAGGTATTATTTCCATTTTACAGAAGAAATTGCAGGTTCATGAAAGCAAGAACTTT 40791107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTATAGGTATTATTTCCATTTTACAGAAGAAATTGCAGGTTCATGAAAGCAAGAACTTT 180

 40791108 GTCCATCTTGTTTTACTGCTATATCTCTAACACATGGAACAGTGTTTGGGATATAGTAGT 40791167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCCATCTTGTTTTACTGCTATATCTCTAACACATGGAACAGTGTTTGGGATATAGTAGT 240

 40791168 TGCAAAAAATTTTTTTTGTTGGTTGGATAGATGAATGAAAAACTCCCAAATTGACGTTTC 40791227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCAAAAAATTTTTTTTGTTGGTTGGATAGATGAATGAAAAACTCCCAAATTGACGTTTC 300

 40791228 TACCTCTGACATCTCCCCATAAACATAGATTTATAGATGTAATCACCTACTTAACAGCTC 40791287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACCTCTGACATCTCCCCATAAACATAGATTTATAGATGTAATCACCTACTTAACAGCTC 360

 40791288 CACTTGGATTTCTAAATAAGCATTTAAATTACCCCATAACTCTTTTTTTTTTTTTTTAGA 40791347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACTTGGATTTCTAAATAAGCATTTAAATTACCCCATAACTCTTTTTTTTTTTTTTTAGA 420

 40791348 CAGGATCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACCGCAAC 40791407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGGATCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACCGCAAC 480

 40791408 CTCCACCTCCCAGGCTGAACCAATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATA 40791467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCCACCTCCCAGGCTGAACCAATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATA 540

 40791468 GGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTAATTTTAGTGGAGACGGGGTTTCACCAT 40791527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTAATTTTAGTGGAGACGGGGTTTCACCAT 600

 40791528 GTTGGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCGGGCTCCCAA 40791587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTGGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCGGGCTCCCAA 660

 40791588 ACTGCTGGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCCCAGCCCCTGCCCCGTAACTCTTAACTT 40791647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTGCTGGGATTACAGGTATGAGCCACTGTGCCCAGCCCCTGCCCCGTAACTCTTAACTT 720

 40791648 CTTAACTTCCCCCCTCCCCAAACCTGTTTTGTTCCCATTTCTCTCATATTAGGAAATGGC 40791707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTAACTTCCCCCCTCCCCAAACCTGTTTTGTTCCCATTTCTCTCATATTAGGAAATGGC 780

 40791708 ATCATCATAAGCCCAGGAGTACAGACTGGAAACCTAGGCCTTGCCTGTGGCCACTCCCAT 40791767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCATCATAAGCCCAGGAGTACAGACTGGAAACCTAGGCCTTGCCTGTGGCCACTCCCAT 840

 40791768 TCTCATTCCCCACATCCAACTCTGCGGCAAGGCCTGTTGATTCTACCTCTGATTGTGTCT 40791827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTCATTCCCCACATCCAACTCTGCGGCAAGGCCTGTTGATTCTACCTCTGATTGTGTCT 900

 40791828 TGAATCTGTTGCTTCTCTTTTTCTCCACTGTCACTTCAGCCTCATTCTCCGTAATCTTTC 40791887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAATCTGTTGCTTCTCTTTTTCTCCACTGTCACTTCAGCCTCATTCTCCGTAATCTTTC 960

 40791888 CTCTGCACGCCACACTTGCCTGCAAGCATCCACTCTTGTCTCTCTACAAGCTATTTGCCC 40791947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCTGCACGCCACACTTGCCTGCAAGCATCCACTCTTGTCTCTCTACAAGCTATTTGCCC 1020

 40791948 ACGTAGCAGCCAGATTGGAGCCACGTACATTTTAGAGGTGTGCTGAAGAATAGGCGCCAA 40792007
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACGTAGCAGCCAGATTGGAGCCACATACATTTTAGAGGTGTGCTGAAGAATAGGCGCCAA 1080

 40792008 GGAGAAAAACCAGGAAGAAAACCAGTATTTGGTACCCTTACCTTGAAAAAGGTATTCATA 40792067
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGAGAAAAACCAGGAAGAAAACCAGTATTTTGTACCCTTACCTTGAAAAAGGTATTCATA 1140

 40792068 TATTTTTTCCTTTTCTAAAAAATGTTCATGTTTCTTTGAGCATTTATTGTCTGATTTTAC 40792127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATTTTTTCCTTTTCTAAAAAATGTTCATGTTTCTTTGAGCATTTATTGTCTGATTTTAC 1200

 40792128 CCCTTTTTAGCATCTATAGAAGCCACATTAATCTTTTTTTACTCCAGCCTTTCTTGGACT 40792187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCTTTTTAGCATCTATAGAAGCCACATTAATCTTTTTTTACTCCAGCCTTTCTTGGACT 1260

 40792188 TTCCCGGCTTTGTGCTTCTCTATCTAGGTGAGTTTTTATCGATAGCTTCAAGTGTCCTCT 40792247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCCCGGCTTTGTGCTTCTCTATCTAGGTGAGTTTTTATCGATAGCTTCAAGTGTCCTCT 1320

 40792248 TCCCCTCCTCACAGAGGAAATGCAGTCTTCAGCATCTGAGAGGCCTCTTAGAAGTATTTT 40792307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCCCTCCTCACAGAGGAAATGCAGTCTTCAGCATCTGAGAGGCCTCTTAGAAGTATTTT 1380

 40792308 TGCTCAGGCCGGGTGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCG 40792367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCTCAGGCCGGGTGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCG 1440

 40792368 GGTGGCTCACTTGAGGTCAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACGGCGAAACCCCAAC 40792427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGTGGCTCACTTGAGGTCAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACGGCGAAACCCCAAC 1500

 40792428 TCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCTGTGATCCCAGCTAC 40792487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCTGTGATCCCAGCTAC 1560

 40792488 CTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGA 40792547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGA 1620

 40792548 GATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAA 40792607
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATTGCGCCACTGCACTCCAGGCTGGGCGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAA 1680

 40792608 AAAAAAAAAAAAAGAAGTATTTTTGCTTATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAA 40792667
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAAAAAAAAAA-GAAGTATTTTTGCTTATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAA 1739

 40792668 ATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAG 40792727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAG 1799

 40792728 GACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATAT 40792787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATAT 1859

 40792788 GAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAAC 40792847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAAC 1919

 40792848 AGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAA 40792907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAA 1979

 40792908 TTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGC 40792967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGC 2039

 40792968 TCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTG 40793027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTG 2099

 40793028 ACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCC 40793087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCC 2159

 40793088 AGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCC 40793147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCC 2219

 40793148 AGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATA 40793207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATA 2279

 40793208 TATACTTATATACATTACATACATTTATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTG 40793267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TATACTTATATACATTACATACATTTATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTG 2339

 40793268 CAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTT 40793327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTT 2399

 40793328 TGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACA 40793387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACA 2459

 40793388 TAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATT 40793447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATT 2519

 40793448 TCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCC 40793507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCC 2579

 40793508 TCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTA 40793567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTA 2639

 40793568 CTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCC 40793627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCC 2699

 40793628 CCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCC 40793687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCC 2759

 40793688 CAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAA 40793747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAA 2819

 40793748 CTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCT 40793807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCT 2879

 40793808 TTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGA 40793867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGA 2939

 40793868 TATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCAT 40793927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCAT 2999

 40793928 TGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTT 40793987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTT 3059

 40793988 TTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCAC 40794047
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TTTTTT-GAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCAC 3118

 40794048 TGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGG 40794107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGG 3178

 40794108 ACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTC 40794167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 ACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTC 3238

 40794168 ACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCG 40794223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 ACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCG 3294

EXCISED REGION

 40795243 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 40795302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 3354

 40795303 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 40795362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 3414

 40795363 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 40795422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 3474

 40795423 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 40795482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 3534

 40795483 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 40795542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 3594

 40795543 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAG 40795586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAG 3638

Alignment time is 3.98133 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2213] =>      2213 nucs 'mol-32-1f0b-057719_2213'

Score:        2213
Aligned:      2213        nucs
Identic:      2213 (100%) nucs =>       754 (100%)      1459 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40794241,40794994] EXCISED REGION [40794996,40796454]
 second seq =>  [       1,     754] EXCISED REGION [     755,    2213]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [40794995,40794995]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [40794995,40795004] to [40794996,40795005]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40794241 GATTACAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGTCATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAG 40794300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTACAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGTCATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAG 60

 40794301 GACTTTTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTTAGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCT 40794360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACTTTTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTTAGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCT 120

 40794361 CAGTCCCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGGAGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAG 40794420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGTCCCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGGAGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAG 180

 40794421 GGACTCCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAGGCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTT 40794480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGACTCCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAGGCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTT 240

 40794481 CTCTGCTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCACACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCA 40794540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCTGCTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCACACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCA 300

 40794541 CCAACCAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTGATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAAC 40794600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCAACCAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTGATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAAC 360

 40794601 TGGGACATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGTCATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAAT 40794660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGGACATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGTCATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAAT 420

 40794661 ATCGGCAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTTAGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATA 40794720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCGGCAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTTAGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATA 480

 40794721 TATTAACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGACTACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTA 40794780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATTAACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGACTACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTA 540

 40794781 CTTATATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTTATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCAT 40794840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTATATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTTATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCAT 600

 40794841 AACCACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCATTCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGAC 40794900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACCACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCATTCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGAC 660

 40794901 GTGAAGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTGGGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGT 40794960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGAAGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTGGGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGT 720

 40794961 AGCAGAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTAC 40794994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCAGAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTAC 754

EXCISED REGION

 40794996 TTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCT 40795055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      755 TTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCT 814

 40795056 TGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCAAG 40795115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      815 TGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCAAG 874

 40795116 TAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGA 40795175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      875 TAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGA 934

 40795176 GACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCGCC 40795235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      935 GACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCGCC 994

 40795236 CACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATG 40795295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      995 CACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATG 1054

 40795296 TCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGA 40795355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1055 TCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGA 1114

 40795356 CACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTA 40795415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 CACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTA 1174

 40795416 ATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTC 40795475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 ATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTC 1234

 40795476 ACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATC 40795535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 ACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATC 1294

 40795536 AGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATG 40795595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 AGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATG 1354

 40795596 ATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAAT 40795655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 ATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAAT 1414

 40795656 CATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGA 40795715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 CATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGA 1474

 40795716 CATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGG 40795775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 CATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGG 1534

 40795776 AAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCT 40795835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 AAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCT 1594

 40795836 CCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCT 40795895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 CCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCT 1654

 40795896 AAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCT 40795955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 AAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCT 1714

 40795956 GCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTC 40796015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 GCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTC 1774

 40796016 TCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAAT 40796075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 TCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAAT 1834

 40796076 TCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAAT 40796135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 TCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAAT 1894

 40796136 AGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAAT 40796195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 AGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAAT 1954

 40796196 GGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAA 40796255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 GGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAA 2014

 40796256 TGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTA 40796315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 TGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTA 2074

 40796316 GAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGC 40796375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 GAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGC 2134

 40796376 GGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGT 40796435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 GGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGT 2194

 40796436 CAGGAGTTCGAGACCAGCC 40796454
          |||||||||||||||||||
     2195 CAGGAGTTCGAGACCAGCC 2213

Alignment time is 1.75585 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    4626] =>      4626 nucs 'mol-32-2081-076942_4626'

Score:        4582
Aligned:      4626        nucs
Identic:      4622 (100%) nucs =>      3322 (100%)      1300 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40790898,40794223] EXCISED REGION [40795243,40796542]
 second seq =>  [       1,    3326] EXCISED REGION [    3327,    4626]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1019 nucs [40794224,40795242]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        38 nucs [40794224,40794261] to [40795243,40795280]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [40794223,40794223] to [40795243,40795243]
 second seq =>         1 nucs [3326,3326] to [3327,3327]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40790898 GTTTTCTTCATGGCATGTATTATTATTCTGAAATTATTTACATATTTATTGTCTGTTTTC 40790957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTTTCTTCATGGCATGTATTATTATTCTGAAATTATTTACATATTTATTGTCTGTTTTC 60

 40790958 TGTAACTAATAATAACTGGCATTTATTAAGCACATGCCACGTGCTGAATATTGTTACAAG 40791017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
       61 TGTAACTAATAATAACTGGCATTTATTAAGCACATGCCACGTGCCGAATATTGTTACAAG 120

 40791018 TACTACATTTTCTCACTTAACCTCATAAGTAGTATAGGTATTATTTCCATTTTACAGAAG 40791077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACTACATTTTCTCACTTAACCTCATAAGTAGTATAGGTATTATTTCCATTTTACAGAAG 180

 40791078 AAATTGCAGGTTCATGAAAGCAAGAACTTTGTCCATCTTGTTTTACTGCTATATCTCTAA 40791137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATTGCAGGTTCATGAAAGCAAGAACTTTGTCCATCTTGTTTTACTGCTATATCTCTAA 240

 40791138 CACATGGAACAGTGTTTGGGATATAGTAGTTGCAAAAAATTTTTTTTGTTGGTTGGATAG 40791197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACATGGAACAGTGTTTGGGATATAGTAGTTGCAAAAAATTTTTTTTGTTGGTTGGATAG 300

 40791198 ATGAATGAAAAACTCCCAAATTGACGTTTCTACCTCTGACATCTCCCCATAAACATAGAT 40791257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGAATGAAAAACTCCCAAATTGACGTTTCTACCTCTGACATCTCCCCATAAACATAGAT 360

 40791258 TTATAGATGTAATCACCTACTTAACAGCTCCACTTGGATTTCTAAATAAGCATTTAAATT 40791317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATAGATGTAATCACCTACTTAACAGCTCCACTTGGATTTCTAAATAAGCATTTAAATT 420

 40791318 ACCCCATAACTCTTTTTTTTTTTTTTTAGACAGGATCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAG 40791377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCCCATAACTCTTTTTTTTTTTTTTTAGACAGGATCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAG 480

 40791378 TGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCACCTCCCAGGCTGAACCAATTCTCCT 40791437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCACCTCCCAGGCTGAACCAATTCTCCT 540

 40791438 GCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTT 40791497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGTGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTT 600

 40791498 GTAATTTTAGTGGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACC 40791557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTAATTTTAGTGGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACC 660

 40791558 TCAGGTGATCTGCCCATCTCGGGCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTATGAGCCACTGT 40791617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAGGTGATCTGCCCATCTCGGGCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTATGAGCCACTGT 720

 40791618 GCCCAGCCCCTGCCCCGTAACTCTTAACTTCTTAACTTCCCCCCTCCCCAAACCTGTTTT 40791677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCCCAGCCCCTGCCCCGTAACTCTTAACTTCTTAACTTCCCCCCTCCCCAAACCTGTTTT 780

 40791678 GTTCCCATTTCTCTCATATTAGGAAATGGCATCATCATAAGCCCAGGAGTACAGACTGGA 40791737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTCCCATTTCTCTCATATTAGGAAATGGCATCATCATAAGCCCAGGAGTACAGACTGGA 840

 40791738 AACCTAGGCCTTGCCTGTGGCCACTCCCATTCTCATTCCCCACATCCAACTCTGCGGCAA 40791797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACCTAGGCCTTGCCTGTGGCCACTCCCATTCTCATTCCCCACATCCAACTCTGCGGCAA 900

 40791798 GGCCTGTTGATTCTACCTCTGATTGTGTCTTGAATCTGTTGCTTCTCTTTTTCTCCACTG 40791857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGCCTGTTGATTCTACCTCTGATTGTGTCTTGAATCTGTTGCTTCTCTTTTTCTCCACTG 960

 40791858 TCACTTCAGCCTCATTCTCCGTAATCTTTCCTCTGCACGCCACACTTGCCTGCAAGCATC 40791917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCACTTCAGCCTCATTCTCCGTAATCTTTCCTCTGCACGCCACACTTGCCTGCAAGCATC 1020

 40791918 CACTCTTGTCTCTCTACAAGCTATTTGCCCACGTAGCAGCCAGATTGGAGCCACGTACAT 40791977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1021 CACTCTTGTCTCTCTACAAGCTATTTGCCCACGTAGCAGCCAGATTGGAGCCACATACAT 1080

 40791978 TTTAGAGGTGTGCTGAAGAATAGGCGCCAAGGAGAAAAACCAGGAAGAAAACCAGTATTT 40792037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTAGAGGTGTGCTGAAGAATAGGCGCCAAGGAGAAAAACCAGGAAGAAAACCAGTATTT 1140

 40792038 GGTACCCTTACCTTGAAAAAGGTATTCATATATTTTTTCCTTTTCTAAAAAATGTTCATG 40792097
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTACCCTTACCTTGAAAAAGGTATTCATATATTTTTTCCTTTTCTAAAAAATGTTCATG 1200

 40792098 TTTCTTTGAGCATTTATTGTCTGATTTTACCCCTTTTTAGCATCTATAGAAGCCACATTA 40792157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTCTTTGAGCATTTATTGTCTGATTTTACCCCTTTTTAGCATCTATAGAAGCCACATTA 1260

 40792158 ATCTTTTTTTACTCCAGCCTTTCTTGGACTTTCCCGGCTTTGTGCTTCTCTATCTAGGTG 40792217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATCTTTTTTTACTCCAGCCTTTCTTGGACTTTCCCGGCTTTGTGCTTCTCTATCTAGGTG 1320

 40792218 AGTTTTTATCGATAGCTTCAAGTGTCCTCTTCCCCTCCTCACAGAGGAAATGCAGTCTTC 40792277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGTTTTTATCGATAGCTTCAAGTGTCCTCTTCCCCTCCTCACAGAGGAAATGCAGTCTTC 1380

 40792278 AGCATCTGAGAGGCCTCTTAGAAGTATTTTTGCTCAGGCCGGGTGCGGTGGCTCACACCT 40792337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGCATCTGAGAGGCCTCTTAGAAGTATTTTTGCTCAGGCCGGGTGCGGTGGCTCACACCT 1440

 40792338 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGCTCACTTGAGGTCAGAAGTTTGAGA 40792397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGCTCACTTGAGGTCAGAAGTTTGAGA 1500

 40792398 CCAGCCTGGCCAACACGGCGAAACCCCAACTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGC 40792457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCAGCCTGGCCAACACGGCGAAACCCCAACTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGC 1560

 40792458 GTGGTGGCACATGCCTGTGATCCCAGCTACCTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGA 40792517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTGGTGGCACATGCCTGTGATCCCAGCTACCTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGA 1620

 40792518 ACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGA 40792577
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1621 ACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGGCTGGGCGA 1680

 40792578 CAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTATTTTTGCTTAT 40792637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTATTTTTGCTTAT 1740

 40792638 GTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGT 40792697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGT 1800

 40792698 AGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTG 40792757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTG 1860

 40792758 AATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTT 40792817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTT 1920

 40792818 TTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTG 40792877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTG 1980

 40792878 CTTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTA 40792937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTA 2040

 40792938 CATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTT 40792997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTT 2100

 40792998 TTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGC 40793057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGC 2160

 40793058 TAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAG 40793117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAG 2220

 40793118 CGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTT 40793177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTT 2280

 40793178 ATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATACATTTATAT 40793237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATACATTTATAT 2340

 40793238 GTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTG 40793297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTG 2400

 40793298 TGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAG 40793357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAG 2460

 40793358 CTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAAT 40793417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAAT 2520

 40793418 ATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAAC 40793477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAAC 2580

 40793478 ATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGA 40793537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGA 2640

 40793538 CAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAG 40793597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAG 2700

 40793598 AATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCT 40793657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCT 2760

 40793658 GTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCA 40793717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCA 2820

 40793718 GCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTT 40793777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTT 2880

 40793778 CCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCA 40793837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCA 2940

 40793838 TATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCA 40793897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCA 3000

 40793898 CACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTA 40793957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTA 3060

 40793958 TCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGG 40794017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGG 3120

 40794018 CTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGAT 40794077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGAT 3180

 40794078 TCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTA 40794137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTA 3240

 40794138 ATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCC 40794197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCC 3300

 40794198 CGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCG 40794223
          ||||||||||||||||||||||||||
     3301 CGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCG 3326

EXCISED REGION

 40795243 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 40795302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 3386

 40795303 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 40795362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 3446

 40795363 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 40795422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 3506

 40795423 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 40795482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 3566

 40795483 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 40795542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 3626

 40795543 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 40795602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 3686

 40795603 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 40795662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 3746

 40795663 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 40795722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 3806

 40795723 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 40795782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 3866

 40795783 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 40795842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 3926

 40795843 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 40795902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 3986

 40795903 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 40795962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 4046

 40795963 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 40796022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4047 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 4106

 40796023 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 40796082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4107 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 4166

 40796083 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 40796142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4167 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 4226

 40796143 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 40796202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4227 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 4286

 40796203 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 40796262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4287 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 4346

 40796263 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 40796322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4347 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 4406

 40796323 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 40796382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4407 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 4466

 40796383 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 40796442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4467 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 4526

 40796443 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 40796502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4527 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 4586

 40796503 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGG 40796542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4587 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGG 4626

Alignment time is 3.58077 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    5210] =>      5210 nucs 'mol-32-20fa-032230_5210'

Score:        5129
Aligned:      5206        nucs
Identic:      5199 (100%) nucs =>      2218 (100%)      2981 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40792002,40794223] EXCISED REGION [40795243,40798226]
 second seq =>  [       1,    2222] EXCISED REGION [    2223,    5206]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1019 nucs [40794224,40795242]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        38 nucs [40794224,40794261] to [40795243,40795280]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [40794223,40794223] to [40795243,40795243]
 second seq =>         1 nucs [2222,2222] to [2223,2223]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40792002 CGCCAAGGAGAAAAACCAGGAAGAAAACCAGTATTTGGTACCCTTACCTTGAAAAAGGTA 40792061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
        1 CGCCAAGGAGAAAAACCAGGAAGAAAACCAGTATTTTGTACCCTTACCTTGAAAAAGGTA 60

 40792062 TTCATATATTTTTTCCTTTTCTAAAAAATGTTCATGTTTCTTTGAGCATTTATTGTCTGA 40792121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCATATATTTTTTCCTTTTCTAAAAAATGTTCATGTTTCTTTGAGCATTTATTGTCTGA 120

 40792122 TTTTACCCCTTTTTAGCATCTATAGAAGCCACATTAATCTTTTTTTACTCCAGCCTTTCT 40792181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTACCCCTTTTTAGCATCTATAGAAGCCACATTAATCTTTTTTTACTCCAGCCTTTCT 180

 40792182 TGGACTTTCCCGGCTTTGTGCTTCTCTATCTAGGTGAGTTTTTATCGATAGCTTCAAGTG 40792241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGACTTTCCCGGCTTTGTGCTTCTCTATCTAGGTGAGTTTTTATCGATAGCTTCAAGTG 240

 40792242 TCCTCTTCCCCTCCTCACAGAGGAAATGCAGTCTTCAGCATCTGAGAGGCCTCTTAGAAG 40792301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCTCTTCCCCTCCTCACAGAGGAAATGCAGTCTTCAGCATCTGAGAGGCCTCTTAGAAG 300

 40792302 TATTTTTGCTCAGGCCGGGTGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 40792361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTTTTGCTCAGGCCGGGTGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 360

 40792362 GAGGCGGGTGGCTCACTTGAGGTCAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACGGCGAAAC 40792421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGGCGGGTGGCTCACTTGAGGTCAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACGGCGAAAC 420

 40792422 CCCAACTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCTGTGATCCC 40792481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCAACTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCTGTGATCCC 480

 40792482 AGCTACCTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTG 40792541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCTACCTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTG 540

 40792542 AGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAA 40792601
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGGCTGGGCGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAA 600

 40792602 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTATTTTTGCTTATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCA 40792661
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTTTGCTTATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCA 660

 40792662 TGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGA 40792721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGA 720

 40792722 AAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGAT 40792781
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATAGGACGCAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGAT 780

 40792782 CTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGG 40792841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGG 840

 40792842 GAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTAT 40792901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTAT 900

 40792902 AGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTTC 40792961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTTC 960

 40792962 TAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACT 40793021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACT 1020

 40793022 CCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCA 40793081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCA 1080

 40793082 ACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGC 40793141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGC 1140

 40793142 CCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTG 40793201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTG 1200

 40793202 TTTATATATACTTATATACATTACATACATTTATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCA 40793261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTATATATACTTATATACATTACATACATTTATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCA 1260

 40793262 ACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACA 40793321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACA 1320

 40793322 GCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGG 40793381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGG 1380

 40793382 GCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATATGATAAAATATATCCATAATCTG 40793441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATATGATAAAATATATCCATAATCTG 1440

 40793442 ACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCCA 40793501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCCA 1500

 40793502 ACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCT 40793561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCT 1560

 40793562 CCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCG 40793621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCG 1620

 40793622 TAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTC 40793681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTC 1680

 40793682 ATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGC 40793741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGC 1740

 40793742 TCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCA 40793801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCA 1800

 40793802 GTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAAC 40793861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAAC 1860

 40793862 ACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCA 40793921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCA 1920

 40793922 CAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTT 40793981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTT 1980

 40793982 TTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCA 40794041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCA 2040

 40794042 ACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTA 40794101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTA 2100

 40794102 GCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAG 40794161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAG 2160

 40794162 GGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCT 40794221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCT 2220

 40794222 CG 40794223
          ||
     2221 CG 2222

EXCISED REGION

 40795243 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 40795302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 2282

 40795303 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 40795362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 2342

 40795363 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 40795422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 2402

 40795423 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 40795482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 2462

 40795483 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 40795542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 2522

 40795543 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 40795602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 2582

 40795603 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 40795662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 2642

 40795663 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 40795722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 2702

 40795723 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 40795782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 2762

 40795783 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 40795842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 2822

 40795843 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 40795902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 2882

 40795903 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 40795962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 2942

 40795963 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 40796022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 3002

 40796023 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 40796082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 3062

 40796083 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 40796142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 3122

 40796143 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 40796202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 3182

 40796203 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 40796262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 3242

 40796263 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 40796322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 3302

 40796323 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 40796382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 3362

 40796383 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 40796442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 3422

 40796443 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 40796502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 3482

 40796503 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 40796562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3483 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 3542

 40796563 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 40796622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 3602

 40796623 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 40796682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 3662

 40796683 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 40796742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 3722

 40796743 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 40796802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 3782

 40796803 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 40796862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 3842

 40796863 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 40796922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 3902

 40796923 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 40796982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 3962

 40796983 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 40797042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 4022

 40797043 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 40797102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 4082

 40797103 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 40797162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4083 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 4142

 40797163 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTA 40797222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTA 4202

 40797223 TTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGA 40797282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4203 TTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTTTTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGA 4262

 40797283 GTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTC 40797342
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4263 GTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCCTGCTCACTGCAACCTC 4322

 40797343 CGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGC 40797402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 CGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGC 4382

 40797403 CACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGC 40797462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4383 CACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGC 4442

 40797463 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGAGAT 40797522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGAGAT 4502

 40797523 TACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTTCTCCTGGTC 40797582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 TACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTTCTCCTGGTC 4562

 40797583 CTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAG 40797642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4563 CTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAG 4622

 40797643 CATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGCCAGGCACCA 40797702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4623 CATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGCCAGGCACCA 4682

 40797703 GCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCTGCCCAGGAA 40797762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4683 GCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCTGCCCAGGAA 4742

 40797763 GAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCTTAGCCCCAT 40797822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4743 GAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCTTAGCCCCAT 4802

 40797823 GTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGGACACAACTG 40797882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4803 GTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGGACACAACTG 4862

 40797883 CATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGAACAAGGAAA 40797942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4863 CATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGAACAAGGAAA 4922

 40797943 ATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTAACCAGAGGC 40798002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4923 ATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTAACCAGAGGC 4982

 40798003 GGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTTTAGCAGGCA 40798062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4983 GGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTTTAGCAGGCA 5042

 40798063 ACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGCAACTGACTT 40798122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5043 ACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGCAACTGACTT 5102

 40798123 CAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATG 40798182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5103 CAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATG 5162

 40798183 AGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTT 40798226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5163 AGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTT 5206

Alignment time is 3.9111 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2269] =>      2269 nucs 'mol-32-20fa-032230_2269'

Score:        2226
Aligned:      2259        nucs
Identic:      2256 (100%) nucs =>        36 (100%)      2220 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40792002,40792037] EXCISED REGION [40792039,40794261]
 second seq =>  [       1,      36] EXCISED REGION [      38,    2260]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [40792038,40792038]
 second seq =>         1 nucs [37,37]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [40792038,40792038] to [40792039,40792039]
 second seq =>         3 nucs [34,36] to [35,37]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40792002 CGCCAAGGAGAAAAACCAGGAAGAAAACCAGTATTT 40792037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGCCAAGGAGAAAAACCAGGAAGAAAACCAGTATTT 36

EXCISED REGION

 40792039 GTACCCTTACCTTGAAAAAGGTATTCATATATTTTTTCCTTTTCTAAAAAATGTTCATGT 40792098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       38 GTACCCTTACCTTGAAAAAGGTATTCATATATTTTTTCCTTTTCTAAAAAATGTTCATGT 97

 40792099 TTCTTTGAGCATTTATTGTCTGATTTTACCCCTTTTTAGCATCTATAGAAGCCACATTAA 40792158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       98 TTCTTTGAGCATTTATTGTCTGATTTTACCCCTTTTTAGCATCTATAGAAGCCACATTAA 157

 40792159 TCTTTTTTTACTCCAGCCTTTCTTGGACTTTCCCGGCTTTGTGCTTCTCTATCTAGGTGA 40792218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      158 TCTTTTTTTACTCCAGCCTTTCTTGGACTTTCCCGGCTTTGTGCTTCTCTATCTAGGTGA 217

 40792219 GTTTTTATCGATAGCTTCAAGTGTCCTCTTCCCCTCCTCACAGAGGAAATGCAGTCTTCA 40792278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      218 GTTTTTATCGATAGCTTCAAGTGTCCTCTTCCCCTCCTCACAGAGGAAATGCAGTCTTCA 277

 40792279 GCATCTGAGAGGCCTCTTAGAAGTATTTTTGCTCAGGCCGGGTGCGGTGGCTCACACCTG 40792338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      278 GCATCTGAGAGGCCTCTTAGAAGTATTTTTGCTCAGGCCGGGTGCGGTGGCTCACACCTG 337

 40792339 TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGCTCACTTGAGGTCAGAAGTTTGAGAC 40792398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      338 TAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGCTCACTTGAGGTCAGAAGTTTGAGAC 397

 40792399 CAGCCTGGCCAACACGGCGAAACCCCAACTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCG 40792458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      398 CAGCCTGGCCAACACGGCGAAACCCCAACTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCG 457

 40792459 TGGTGGCACATGCCTGTGATCCCAGCTACCTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAA 40792518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      458 TGGTGGCACATGCCTGTGATCCCAGCTACCTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAA 517

 40792519 CCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGAC 40792578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      518 CCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGGCTGGGCGAC 577

 40792579 AGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTATTTTTGCTTATG 40792638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      578 AGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTTTTGCTTATG 637

 40792639 TTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGTA 40792698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      638 TTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGTA 697

 40792699 GCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTGA 40792758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      698 GCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACGCAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTGA 757

 40792759 ATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTTT 40792818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      758 ATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTTT 817

 40792819 TCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTGC 40792878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      818 TCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTGC 877

 40792879 TTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTAC 40792938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      878 TTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTAC 937

 40792939 ATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTTT 40792998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      938 ATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTTT 997

 40792999 TCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGCT 40793058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 TCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGCT 1057

 40793059 AACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGC 40793118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 AACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGC 1117

 40793119 GACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTTA 40793178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 GACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTTA 1177

 40793179 TAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATACATTTATATG 40793238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 TAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATACATTTATATG 1237

 40793239 TGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTGT 40793298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 TGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTGT 1297

 40793299 GGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGC 40793358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 GGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGC 1357

 40793359 TCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATA 40793418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 TCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATA 1417

 40793419 TGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAACA 40793478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 TGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAACA 1477

 40793479 TACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGAC 40793538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 TACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGAC 1537

 40793539 AGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAGA 40793598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 AGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAGA 1597

 40793599 ATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTG 40793658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 ATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTG 1657

 40793659 TTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAG 40793718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 TTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAG 1717

 40793719 CTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTC 40793778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 CTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTC 1777

 40793779 CCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCAT 40793838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 CCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCAT 1837

 40793839 ATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCAC 40793898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 ATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCAC 1897

 40793899 ACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTAT 40793958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 ACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTAT 1957

 40793959 CATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGC 40794018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 CATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGC 2017

 40794019 TGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATT 40794078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATT 2077

 40794079 CTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAA 40794138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 CTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAA 2137

 40794139 TTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCC 40794198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 TTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCC 2197

 40794199 GACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCA 40794258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 GACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCA 2257

 40794259 CCG 40794261
          |||
     2258 CCG 2260

Alignment time is 1.70375 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3069] =>      3069 nucs 'mol-32-211b-064739_3069'

Score:        3047
Aligned:      3069        nucs
Identic:      3067 (100%) nucs =>      1932 (100%)      1135 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40792291,40794223] EXCISED REGION [40795243,40796377]
 second seq =>  [       1,    1934] EXCISED REGION [    1935,    3069]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1019 nucs [40794224,40795242]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        38 nucs [40794224,40794261] to [40795243,40795280]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [40794223,40794223] to [40795243,40795243]
 second seq =>         1 nucs [1934,1934] to [1935,1935]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40792291 CCTCTTAGAAGTATTTTTGCTCAGGCCGGGTGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAC 40792350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCTTAGAAGTATTTTTGCTCAGGCCGGGTGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAC 60

 40792351 TTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGCTCACTTGAGGTCAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAA 40792410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGCTCACTTGAGGTCAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAA 120

 40792411 CACGGCGAAACCCCAACTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATG 40792470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACGGCGAAACCCCAACTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATG 180

 40792471 CCTGTGATCCCAGCTACCTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGG 40792530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTGTGATCCCAGCTACCTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGG 240

 40792531 AGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTC 40792590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      241 AGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGGCTGGGCGACAGAGTGAGACTC 300

 40792591 TGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTATTTTTGCTTATGTTGCTTACAGCT 40792650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTATTTTTGCTTATGTTGCTTACAGCT 360

 40792651 TTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGTAGCAACTATGCTG 40792710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGTAGCAACTATGCTG 420

 40792711 TGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTGAATGGGGGGCCAT 40792770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTGAATGGGGGGCCAT 480

 40792771 ATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTTTTCTGCCCCTCCC 40792830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTTTTCTGCCCCTCCC 540

 40792831 CATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTGCTTTTTAAACAAA 40792890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTGCTTTTTAAACAAA 600

 40792891 ATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTACATTTAATTTTGA 40792950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTACATTTAATTTTGA 660

 40792951 AAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTTTTCAACTTTCTGC 40793010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTTTTCAACTTTCTGC 720

 40793011 CTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGCTAACTCTCTGGGC 40793070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGCTAACTCTCTGGGC 780

 40793071 TGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGCGACCAGAGGCAG 40793130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGCGACCAGAGGCAG 840

 40793131 GAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTTATAGCCAGTGGGA 40793190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTTATAGCCAGTGGGA 900

 40793191 GAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATACATTTATATGTGTGTGTAGCAT 40793250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATACATTTATATGTGTGTGTAGCAT 960

 40793251 TAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACAC 40793310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACAC 1020

 40793311 CTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCTCAGGAATTCAA 40793370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCTCAGGAATTCAA 1080

 40793371 GACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATATGATAAAATATA 40793430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATATGATAAAATATA 1140

 40793431 TCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAACATACCTTTCACCC 40793490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAACATACCTTTCACCC 1200

 40793491 TGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGACAGCCAGAGAGGG 40793550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGACAGCCAGAGAGGG 1260

 40793551 CTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAGAATCCACCACACT 40793610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAGAATCCACCACACT 1320

 40793611 GTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACT 40793670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACT 1380

 40793671 CTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCAT 40793730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCAT 1440

 40793731 GCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCC 40793790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCC 1500

 40793791 ATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGC 40793850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGC 1560

 40793851 TTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTTGACCTTT 40793910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTTGACCTTT 1620

 40793911 ATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTG 40793970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTG 1680

 40793971 TCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-GAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGT 40794029
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGT 1740

 40794030 GGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCG 40794089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCG 1800

 40794090 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTT 40794149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTT 1860

 40794150 TTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTG 40794209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTG 1920

 40794210 ATCCACCCACCTCG 40794223
          ||||||||||||||
     1921 ATCCACCCACCTCG 1934

EXCISED REGION

 40795243 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 40795302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 1994

 40795303 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 40795362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 2054

 40795363 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 40795422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 2114

 40795423 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 40795482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 2174

 40795483 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 40795542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 2234

 40795543 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 40795602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 2294

 40795603 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 40795662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 2354

 40795663 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 40795722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 2414

 40795723 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 40795782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 2474

 40795783 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 40795842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 2534

 40795843 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 40795902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 2594

 40795903 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 40795962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 2654

 40795963 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 40796022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 2714

 40796023 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 40796082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2715 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 2774

 40796083 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 40796142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 2834

 40796143 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 40796202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 2894

 40796203 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 40796262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 2954

 40796263 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 40796322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 3014

 40796323 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGG 40796377
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGG 3069

Alignment time is 2.26651 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2221] =>      2221 nucs 'mol-32-229c-006891_2221'

Score:        2220
Aligned:      2220        nucs
Identic:      2220 (100%) nucs =>       124 (100%)      2096 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40794029,40794152] EXCISED REGION [40794154,40796249]
 second seq =>  [       1,     124] EXCISED REGION [     126,    2221]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [40794153,40794153]
 second seq =>         1 nucs [125,125]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [40794151,40794152] to [40794154,40794155]
 second seq =>         2 nucs [123,124] to [126,127]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40794029 TGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTC 40794088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTC 60

 40794089 GGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATT 40794148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATT 120

 40794149 TTTA 40794152
          ||||
      121 TTTA 124

EXCISED REGION

 40794154 TAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCC 40794213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      126 TAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCC 185

 40794214 ACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGT 40794273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 ACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGT 245

 40794274 CATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACTTTTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTT 40794333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 CATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACTTTTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTT 305

 40794334 AGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGTCCCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGG 40794393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 AGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGTCCCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGG 365

 40794394 AGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGACTCCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAG 40794453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 AGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGACTCCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAG 425

 40794454 GCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCTGCTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCA 40794513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 GCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCTGCTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCA 485

 40794514 CACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAACCAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTG 40794573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 CACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAACCAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTG 545

 40794574 ATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGGACATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGT 40794633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 ATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGGACATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGT 605

 40794634 CATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAATATCGGCAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTT 40794693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 CATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAATATCGGCAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTT 665

 40794694 AGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATTAACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGAC 40794753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 AGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATTAACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGAC 725

 40794754 TACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTATATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTT 40794813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 TACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTATATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTT 785

 40794814 ATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACCACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCAT 40794873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 ATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACCACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCAT 845

 40794874 TCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGAAGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTG 40794933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 TCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGAAGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTG 905

 40794934 GGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAGAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTA 40794993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 GGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAGAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTA 965

 40794994 CTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGAT 40795053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 CTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGAT 1025

 40795054 CTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCA 40795113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 CTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCA 1085

 40795114 AGTAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTA 40795173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 AGTAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTA 1145

 40795174 GAGACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCG 40795233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 GAGACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCG 1205

 40795234 CCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGA 40795293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 CCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGA 1265

 40795294 TGTCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCT 40795353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 TGTCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCT 1325

 40795354 GACACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCG 40795413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 GACACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCG 1385

 40795414 TAATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATT 40795473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 TAATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATT 1445

 40795474 TCACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTA 40795533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 TCACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTA 1505

 40795534 TCAGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAA 40795593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 TCAGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAA 1565

 40795594 TGATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTA 40795653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 TGATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTA 1625

 40795654 ATCATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAA 40795713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 ATCATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAA 1685

 40795714 GACATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGG 40795773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 GACATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGG 1745

 40795774 GGAAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCT 40795833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 GGAAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCT 1805

 40795834 CTCCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATC 40795893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 CTCCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATC 1865

 40795894 CTAAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAG 40795953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CTAAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAG 1925

 40795954 CTGCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTT 40796013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 CTGCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTT 1985

 40796014 TCTCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTA 40796073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 TCTCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTA 2045

 40796074 ATTCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGA 40796133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 ATTCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGA 2105

 40796134 ATAGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAA 40796193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 ATAGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAA 2165

 40796194 ATGGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAA 40796249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 ATGGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAA 2221

Alignment time is 1.64325 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2922] =>      2922 nucs 'mol-32-22b2-071256_2922'

Score:        2900
Aligned:      2922        nucs
Identic:      2920 (100%) nucs =>      1118 (100%)      1802 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40793106,40794223] EXCISED REGION [40795243,40797046]
 second seq =>  [       1,    1118] EXCISED REGION [    1119,    2922]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1019 nucs [40794224,40795242]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        38 nucs [40794224,40794261] to [40795243,40795280]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [40794223,40794223] to [40795243,40795243]
 second seq =>         1 nucs [1118,1118] to [1119,1119]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40793106 AGGTTTCCATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATC 40793165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGTTTCCATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATC 60

 40793166 CGGCTGGGCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTAC 40793225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGGCTGGGCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTAC 120

 40793226 ATACATTTATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAA 40793285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATACATTTATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAA 180

 40793286 TCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGA 40793345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGA 240

 40793346 GGATCACTTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCT 40793405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGATCACTTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCT 300

 40793406 AAAAAAAAAAATATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCAT 40793465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAAAAAAAATATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCAT 360

 40793466 AGGAAAGTCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACC 40793525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGAAAGTCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACC 420

 40793526 ACCTCTGCAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAG 40793585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCTCTGCAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAG 480

 40793586 AATGAAGCCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCC 40793645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATGAAGCCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCC 540

 40793646 ACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCT 40793705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCT 600

 40793706 GGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCC 40793765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCC 660

 40793766 TGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGT 40793825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGT 720

 40793826 GTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTC 40793885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTC 780

 40793886 TGATAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTA 40793945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGATAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTA 840

 40793946 TTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTC 40794005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTC 900

 40794006 TCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTG 40794065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTG 960

 40794066 GGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCAC 40794125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCAC 1020

 40794126 CACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATG 40794185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATG 1080

 40794186 GTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCG 40794223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCG 1118

EXCISED REGION

 40795243 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 40795302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1119 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 1178

 40795303 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 40795362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1179 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 1238

 40795363 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 40795422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1239 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 1298

 40795423 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 40795482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1299 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 1358

 40795483 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 40795542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1359 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 1418

 40795543 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 40795602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1419 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 1478

 40795603 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 40795662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1479 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 1538

 40795663 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 40795722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1539 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 1598

 40795723 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 40795782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1599 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 1658

 40795783 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 40795842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1659 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 1718

 40795843 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 40795902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 1778

 40795903 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 40795962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 1838

 40795963 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 40796022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 1898

 40796023 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 40796082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 1958

 40796083 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 40796142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 2018

 40796143 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 40796202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 2078

 40796203 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 40796262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2079 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 2138

 40796263 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 40796322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 2198

 40796323 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 40796382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 2258

 40796383 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 40796442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2259 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 2318

 40796443 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 40796502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 2378

 40796503 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 40796562
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGCCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 2438

 40796563 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 40796622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2439 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 2498

 40796623 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 40796682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2499 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 2558

 40796683 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 40796742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 2618

 40796743 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 40796802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2619 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 2678

 40796803 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 40796862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2679 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 2738

 40796863 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 40796922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2739 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 2798

 40796923 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 40796982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2799 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 2858

 40796983 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 40797042
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2859 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACACGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 2918

 40797043 GGAG 40797046
          ||||
     2919 GGAG 2922

Alignment time is 2.15949 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    4856] =>      4856 nucs 'mol-32-2af2-041737_4856'

Score:        4855
Aligned:      4855        nucs
Identic:      4855 (100%) nucs =>       909 (100%)      3946 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40794693,40795601] EXCISED REGION [40795603,40799548]
 second seq =>  [       1,     909] EXCISED REGION [     911,    4856]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [40795602,40795602]
 second seq =>         1 nucs [910,910]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [40795598,40795601] to [40795603,40795606]
 second seq =>         4 nucs [906,909] to [911,914]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40794693 TAGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATTAACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGA 40794752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATTAACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGA 60

 40794753 CTACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTATATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCT 40794812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTATATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCT 120

 40794813 TATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACCACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCA 40794872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACCACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCA 180

 40794873 TTCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGAAGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGT 40794932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGAAGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGT 240

 40794933 GGGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAGAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTT 40794992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAGAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTT 300

 40794993 ACTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGA 40795052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGA 360

 40795053 TCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTC 40795112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTC 420

 40795113 AAGTAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGT 40795172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGTAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGT 480

 40795173 AGAGACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCC 40795232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAGACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCC 540

 40795233 GCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAG 40795292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAG 600

 40795293 ATGTCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGC 40795352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGTCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGC 660

 40795353 TGACACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGC 40795412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGACACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGC 720

 40795413 GTAATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCAT 40795472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTAATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCAT 780

 40795473 TTCACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACT 40795532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACT 840

 40795533 ATCAGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGA 40795592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCAGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGA 900

 40795593 ATGATGACA 40795601
          |||||||||
      901 ATGATGACA 909

EXCISED REGION

 40795603 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 40795662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 970

 40795663 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 40795722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 1030

 40795723 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 40795782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 1090

 40795783 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 40795842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 1150

 40795843 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 40795902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 1210

 40795903 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 40795962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 1270

 40795963 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 40796022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 1330

 40796023 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 40796082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 1390

 40796083 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 40796142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 1450

 40796143 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 40796202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 1510

 40796203 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 40796262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 1570

 40796263 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 40796322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 1630

 40796323 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 40796382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 1690

 40796383 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 40796442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 1750

 40796443 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 40796502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 1810

 40796503 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 40796562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 1870

 40796563 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 40796622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 1930

 40796623 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 40796682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 1990

 40796683 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 40796742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 2050

 40796743 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 40796802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 2110

 40796803 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 40796862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 2170

 40796863 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 40796922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 2230

 40796923 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 40796982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 2290

 40796983 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 40797042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 2350

 40797043 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 40797102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 2410

 40797103 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 40797162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 2470

 40797163 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTA 40797222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTA 2530

 40797223 TTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGA 40797282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 TTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGA 2590

 40797283 GTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTC 40797342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 GTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTC 2650

 40797343 CGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGC 40797402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 CGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGC 2710

 40797403 CACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGC 40797462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 CACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGC 2770

 40797463 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGAGAT 40797522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGAGAT 2830

 40797523 TACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTTCTCCTGGTC 40797582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 TACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTTCTCCTGGTC 2890

 40797583 CTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAG 40797642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 CTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAG 2950

 40797643 CATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGCCAGGCACCA 40797702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 CATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGCCAGGCACCA 3010

 40797703 GCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCTGCCCAGGAA 40797762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 GCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCTGCCCAGGAA 3070

 40797763 GAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCTTAGCCCCAT 40797822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 GAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCTTAGCCCCAT 3130

 40797823 GTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGGACACAACTG 40797882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 GTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGGACACAACTG 3190

 40797883 CATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGAACAAGGAAA 40797942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 CATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGAACAAGGAAA 3250

 40797943 ATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTAACCAGAGGC 40798002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 ATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTAACCAGAGGC 3310

 40798003 GGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTTTAGCAGGCA 40798062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 GGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTTTAGCAGGCA 3370

 40798063 ACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGCAACTGACTT 40798122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3371 ACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGCAACTGACTT 3430

 40798123 CAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATG 40798182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 CAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATG 3490

 40798183 AGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTTTGTGTGTCATCTTGC 40798242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 AGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTTTGTGTGTCATCTTGC 3550

 40798243 TGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGTGATGGCTGA 40798302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3551 TGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGTGATGGCTGA 3610

 40798303 GCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTGATACTCTCA 40798362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 GCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTGATACTCTCA 3670

 40798363 TAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCACCTGACAGTA 40798422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3671 TAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCACCTGACAGTA 3730

 40798423 AAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAAAAATTCAGGCTGGACGTGGTGGCTCACG 40798482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3731 AAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAAAAATTCAGGCTGGACGTGGTGGCTCACG 3790

 40798483 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTCA 40798542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3791 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTCA 3850

 40798543 AGACCAACCTAGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTTGCCAGG 40798602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3851 AGACCAACCTAGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTTGCCAGG 3910

 40798603 TGTGATGGTGTGCGACTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTG 40798662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3911 TGTGATGGTGTGCGACTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTG 3970

 40798663 AACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCGCCACTGCACTCCAGCCTAGGCA 40798722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3971 AACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCGCCACTGCACTCCAGCCTAGGCA 4030

 40798723 ACAAGAGCAAACCTCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAGCATATTTTCAATGGCTGTATAATAT 40798782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4031 ACAAGAGCAAACCTCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAGCATATTTTCAATGGCTGTATAATAT 4090

 40798783 CCTTTTATAGTGAATATACAGTATTTGGATAACTACTTTTCTATAACTGAGTCTCTAGTC 40798842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4091 CCTTTTATAGTGAATATACAGTATTTGGATAACTACTTTTCTATAACTGAGTCTCTAGTC 4150

 40798843 CATTTCTGTTGTTTTCTACTATAAATGGACCTTTTGGTCCTGAGTGGGCTATTGGGAAGT 40798902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4151 CATTTCTGTTGTTTTCTACTATAAATGGACCTTTTGGTCCTGAGTGGGCTATTGGGAAGT 4210

 40798903 CCATCTGCCAGGCCAGAACTGTGGCTAGGACATTTTAATTGACTGCAACTAATCACCTTC 40798962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4211 CCATCTGCCAGGCCAGAACTGTGGCTAGGACATTTTAATTGACTGCAACTAATCACCTTC 4270

 40798963 AGGTCACTCACGTTTCCAATTCTGACAAAAGTTTTCCTTGTTCTTCTGATTCGTAGGCAG 40799022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4271 AGGTCACTCACGTTTCCAATTCTGACAAAAGTTTTCCTTGTTCTTCTGATTCGTAGGCAG 4330

 40799023 GTATTTGCAGGTTAAAGGTTTGGGTTGAGAAGGACACAGGGAACTTGCTGGTATGATGGA 40799082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4331 GTATTTGCAGGTTAAAGGTTTGGGTTGAGAAGGACACAGGGAACTTGCTGGTATGATGGA 4390

 40799083 AGTATCTGTGTTTGGCTGGGTCAGTGGAGTCAGAGTGTTCACTGTTACACCTTGGAACTG 40799142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4391 AGTATCTGTGTTTGGCTGGGTCAGTGGAGTCAGAGTGTTCACTGTTACACCTTGGAACTG 4450

 40799143 AGACTGCTTGATGCGGACAATGTTCAGACATTTGTTTATGCACCAAAATGTACACCTAAC 40799202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4451 AGACTGCTTGATGCGGACAATGTTCAGACATTTGTTTATGCACCAAAATGTACACCTAAC 4510

 40799203 ATTTGTGCATTTTACTGTAGGTAAAGTCATTAAAGTTGGTGTCTTTGAAAGCTGGGCTGA 40799262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4511 ATTTGTGCATTTTACTGTAGGTAAAGTCATTAAAGTTGGTGTCTTTGAAAGCTGGGCTGA 4570

 40799263 GGGATTGGCTTTTGGGTGAATAAGGACGAGGCTGTCTGTGGAGCTCACCCAGGGGTTGCT 40799322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4571 GGGATTGGCTTTTGGGTGAATAAGGACGAGGCTGTCTGTGGAGCTCACCCAGGGGTTGCT 4630

 40799323 GGGCTGCCACAGGAGAGCTTGACCTCATTCATTCAACAGATATCTCATGGACCCAACTGT 40799382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4631 GGGCTGCCACAGGAGAGCTTGACCTCATTCATTCAACAGATATCTCATGGACCCAACTGT 4690

 40799383 GGGTGGTGCAGTCTCCACAGCTGCATCCCTGCAGGCCCCCGAACAAAACTGAAGGTGGTC 40799442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4691 GGGTGGTGCAGTCTCCACAGCTGCATCCCTGCAGGCCCCCGAACAAAACTGAAGGTGGTC 4750

 40799443 TCAGCTGCATGGAGTTCTCATTTTAGTGAGGGAGACAGGCAGTAAACAAGCATGTAATAT 40799502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4751 TCAGCTGCATGGAGTTCTCATTTTAGTGAGGGAGACAGGCAGTAAACAAGCATGTAATAT 4810

 40799503 TCTGGAGCAAGAAGGGCTGGAAAAATACTTCCAGGGATAGAGAAGA 40799548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4811 TCTGGAGCAAGAAGGGCTGGAAAAATACTTCCAGGGATAGAGAAGA 4856

Alignment time is 3.5795 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2122] =>      2122 nucs 'mol-32-2ee6-084736_2122'

Score:        2089
Aligned:      2111        nucs
Identic:      2109 (100%) nucs =>      1188 (100%)       921 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40795243,40796430] EXCISED REGION [40796431,40797353]
 second seq =>  [      10,    1197] EXCISED REGION [    1200,    2122]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1198,1199]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40795243 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 40795302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       10 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 69

 40795303 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 40795362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       70 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 129

 40795363 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 40795422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      130 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 189

 40795423 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 40795482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      190 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 249

 40795483 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 40795542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      250 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 309

 40795543 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 40795602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 369

 40795603 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 40795662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 429

 40795663 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 40795722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 489

 40795723 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 40795782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 549

 40795783 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 40795842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 609

 40795843 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 40795902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 669

 40795903 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 40795962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 729

 40795963 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 40796022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 789

 40796023 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 40796082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 849

 40796083 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 40796142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 909

 40796143 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 40796202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 969

 40796203 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 40796262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 1029

 40796263 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 40796322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 1089

 40796323 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 40796382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 1149

 40796383 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCAC 40796430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCAC 1197

EXCISED REGION

 40796431 GAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAG 40796490
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAG 1259

 40796491 ACAAAAATCAGCCGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAG 40796550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ACAAAAATCAGCCGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAG 1319

 40796551 GCAGAAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTG 40796610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GCAGAAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTG 1379

 40796611 CACTCCAGCCTGAGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAG 40796670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CACTCCAGCCTGAGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAG 1439

 40796671 AATGACTTTCCTCTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGA 40796730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AATGACTTTCCTCTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGA 1499

 40796731 GGAGCCTTCCAGCTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGA 40796790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GGAGCCTTCCAGCTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGA 1559

 40796791 CTTGCCAGCCCACCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTT 40796850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CTTGCCAGCCCACCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTT 1619

 40796851 TGAAGCTCTCACAGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCAT 40796910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TGAAGCTCTCACAGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCAT 1679

 40796911 CCAGATAAGAGAGGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAA 40796970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CCAGATAAGAGAGGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAA 1739

 40796971 ACTTCCTTCTCAGCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTG 40797030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ACTTCCTTCTCAGCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTG 1799

 40797031 CAGTCCTCAGGTGGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCT 40797090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CAGTCCTCAGGTGGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCT 1859

 40797091 GCTGTTTCTTTCCCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCT 40797150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GCTGTTTCTTTCCCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCT 1919

 40797151 GCTCCTTCCCTACCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAG 40797210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GCTCCTTCCCTACCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAG 1979

 40797211 AGGGAGAGGGTATTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTT 40797270
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1980 AGGGAGAGGGTATTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTTTTTTTTTTTTATTT 2039

 40797271 TTTTGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCT 40797330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TTTTGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCT 2099

 40797331 CACTGCAACCTCCGCTTCTTGGG 40797353
          |||||||||||||||||||||||
     2100 CACTGCAACCTCCGCTTCTTGGG 2122

Alignment time is 1.60529 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    9653] =>      9653 nucs 'mol-32-2fd8-106445_9653'

Score:        9631
Aligned:      9653        nucs
Identic:      9651 (100%) nucs =>       342 (100%)      9309 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40793631,40793972] EXCISED REGION [40793974,40803284]
 second seq =>  [       1,     342] EXCISED REGION [     343,    9653]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [40793973,40793973]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [40797978,40797978]
 second seq =>         1 nucs [4347,4347]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        21 nucs [40793973,40793993] to [40793974,40793994]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40793631 GCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAG 40793690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAG 60

 40793691 CCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTT 40793750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTT 120

 40793751 GGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTT 40793810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTT 180

 40793811 GGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATAT 40793870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATAT 240

 40793871 AAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGT 40793930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGT 300

 40793931 AGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTGTC 40793972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTGTC 342

EXCISED REGION

 40793974 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCG 40794033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      343 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCG 402

 40794034 CCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCT 40794093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      403 CCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCT 462

 40794094 CCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAG 40794153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      463 CCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAG 522

 40794154 TAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCC 40794213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      523 TAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCC 582

 40794214 ACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGT 40794273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      583 ACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGT 642

 40794274 CATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACTTTTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTT 40794333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      643 CATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACTTTTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTT 702

 40794334 AGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGTCCCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGG 40794393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      703 AGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGTCCCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGG 762

 40794394 AGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGACTCCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAG 40794453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      763 AGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGACTCCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAG 822

 40794454 GCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCTGCTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCA 40794513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      823 GCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCTGCTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCA 882

 40794514 CACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAACCAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTG 40794573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      883 CACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAACCAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTG 942

 40794574 ATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGGACATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGT 40794633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      943 ATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGGACATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGT 1002

 40794634 CATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAATATCGGCAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTT 40794693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1003 CATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAATATCGGCAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTT 1062

 40794694 AGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATTAACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGAC 40794753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1063 AGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATTAACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGAC 1122

 40794754 TACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTATATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTT 40794813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 TACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTATATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTT 1182

 40794814 ATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACCACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCAT 40794873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1183 ATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACCACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCAT 1242

 40794874 TCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGAAGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTG 40794933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1243 TCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGAAGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTG 1302

 40794934 GGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAGAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTA 40794993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1303 GGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAGAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTA 1362

 40794994 CTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGAT 40795053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1363 CTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGAT 1422

 40795054 CTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCA 40795113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1423 CTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCA 1482

 40795114 AGTAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTA 40795173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 AGTAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTA 1542

 40795174 GAGACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCG 40795233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 GAGACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCG 1602

 40795234 CCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGA 40795293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 CCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGA 1662

 40795294 TGTCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCT 40795353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 TGTCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCT 1722

 40795354 GACACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCG 40795413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 GACACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCG 1782

 40795414 TAATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATT 40795473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 TAATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATT 1842

 40795474 TCACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTA 40795533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 TCACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTA 1902

 40795534 TCAGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAA 40795593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 TCAGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAA 1962

 40795594 TGATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTA 40795653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 TGATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTA 2022

 40795654 ATCATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAA 40795713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 ATCATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAA 2082

 40795714 GACATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGG 40795773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 GACATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGG 2142

 40795774 GGAAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCT 40795833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 GGAAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCT 2202

 40795834 CTCCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATC 40795893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 CTCCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATC 2262

 40795894 CTAAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAG 40795953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 CTAAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAG 2322

 40795954 CTGCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTT 40796013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 CTGCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTT 2382

 40796014 TCTCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTA 40796073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 TCTCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTA 2442

 40796074 ATTCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGA 40796133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 ATTCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGA 2502

 40796134 ATAGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAA 40796193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 ATAGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAA 2562

 40796194 ATGGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGG 40796253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 ATGGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGG 2622

 40796254 AATGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCG 40796313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 AATGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCG 2682

 40796314 TAGAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGC 40796373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 TAGAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGC 2742

 40796374 GCGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAG 40796433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 GCGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAG 2802

 40796434 GTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACA 40796493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 GTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACA 2862

 40796494 AAAATCAGCCGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCA 40796553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 AAAATCAGCCGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCA 2922

 40796554 GAAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCAC 40796613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 GAAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCAC 2982

 40796614 TCCAGCCTGAGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAAT 40796673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 TCCAGCCTGAGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAAT 3042

 40796674 GACTTTCCTCTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGA 40796733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 GACTTTCCTCTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGA 3102

 40796734 GCCTTCCAGCTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTT 40796793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 GCCTTCCAGCTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTT 3162

 40796794 GCCAGCCCACCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGA 40796853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 GCCAGCCCACCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGA 3222

 40796854 AGCTCTCACAGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCA 40796913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 AGCTCTCACAGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCA 3282

 40796914 GATAAGAGAGGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACT 40796973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 GATAAGAGAGGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACT 3342

 40796974 TCCTTCTCAGCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAG 40797033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 TCCTTCTCAGCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAG 3402

 40797034 TCCTCAGGTGGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCT 40797093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 TCCTCAGGTGGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCT 3462

 40797094 GTTTCTTTCCCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCT 40797153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 GTTTCTTTCCCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCT 3522

 40797154 CCTTCCCTACCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGG 40797213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 CCTTCCCTACCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGG 3582

 40797214 GAGAGGGTATTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTT 40797273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 GAGAGGGTATTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTT 3642

 40797274 TGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCAC 40797333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 TGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCAC 3702

 40797334 TGCAACCTCCGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACA 40797393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 TGCAACCTCCGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACA 3762

 40797394 GGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCTCCATGT 40797453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 GGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCTCCATGT 3822

 40797454 TGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAG 40797513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 TGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAG 3882

 40797514 TACTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTT 40797573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 TACTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTT 3942

 40797574 CTCCTGGTCCTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCT 40797633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 CTCCTGGTCCTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCT 4002

 40797634 GACTCCGAGCATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGC 40797693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 GACTCCGAGCATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGC 4062

 40797694 CAGGCACCAGCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCT 40797753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 CAGGCACCAGCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCT 4122

 40797754 GCCCAGGAAGAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCT 40797813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 GCCCAGGAAGAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCT 4182

 40797814 TAGCCCCATGTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGG 40797873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 TAGCCCCATGTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGG 4242

 40797874 ACACAACTGCATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGA 40797933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4243 ACACAACTGCATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGA 4302

 40797934 ACAAGGAAAATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTA 40797993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4303 ACAAGGAAAATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGGGAAGGTTGCGTGGTA 4362

 40797994 ACCAGAGGCGGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTT 40798053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 ACCAGAGGCGGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTT 4422

 40798054 TAGCAGGCAACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGC 40798113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 TAGCAGGCAACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGC 4482

 40798114 AACTGACTTCAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCT 40798173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4483 AACTGACTTCAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCT 4542

 40798174 ACTACGATGAGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTTTGTGTG 40798233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 ACTACGATGAGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTTTGTGTG 4602

 40798234 TCATCTTGCTGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGT 40798293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 TCATCTTGCTGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGT 4662

 40798294 GATGGCTGAGCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTG 40798353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4663 GATGGCTGAGCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTG 4722

 40798354 ATACTCTCATAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCAC 40798413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 ATACTCTCATAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCAC 4782

 40798414 CTGACAGTAAAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAAAAATTCAGGCTGGACGTGG 40798473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4783 CTGACAGTAAAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAAAAATTCAGGCTGGACGTGG 4842

 40798474 TGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATCACTTGAGGCC 40798533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4843 TGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATCACTTGAGGCC 4902

 40798534 AAGAGTTCAAGACCAACCTAGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAA 40798593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4903 AAGAGTTCAAGACCAACCTAGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAA 4962

 40798594 TTTGCCAGGTGTGATGGTGTGCGACTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAG 40798653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4963 TTTGCCAGGTGTGATGGTGTGCGACTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAG 5022

 40798654 AATCTCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCGCCACTGCACTCCA 40798713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5023 AATCTCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCGCCACTGCACTCCA 5082

 40798714 GCCTAGGCAACAAGAGCAAACCTCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAGCATATTTTCAATGGCT 40798773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5083 GCCTAGGCAACAAGAGCAAACCTCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAGCATATTTTCAATGGCT 5142

 40798774 GTATAATATCCTTTTATAGTGAATATACAGTATTTGGATAACTACTTTTCTATAACTGAG 40798833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5143 GTATAATATCCTTTTATAGTGAATATACAGTATTTGGATAACTACTTTTCTATAACTGAG 5202

 40798834 TCTCTAGTCCATTTCTGTTGTTTTCTACTATAAATGGACCTTTTGGTCCTGAGTGGGCTA 40798893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5203 TCTCTAGTCCATTTCTGTTGTTTTCTACTATAAATGGACCTTTTGGTCCTGAGTGGGCTA 5262

 40798894 TTGGGAAGTCCATCTGCCAGGCCAGAACTGTGGCTAGGACATTTTAATTGACTGCAACTA 40798953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5263 TTGGGAAGTCCATCTGCCAGGCCAGAACTGTGGCTAGGACATTTTAATTGACTGCAACTA 5322

 40798954 ATCACCTTCAGGTCACTCACGTTTCCAATTCTGACAAAAGTTTTCCTTGTTCTTCTGATT 40799013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5323 ATCACCTTCAGGTCACTCACGTTTCCAATTCTGACAAAAGTTTTCCTTGTTCTTCTGATT 5382

 40799014 CGTAGGCAGGTATTTGCAGGTTAAAGGTTTGGGTTGAGAAGGACACAGGGAACTTGCTGG 40799073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5383 CGTAGGCAGGTATTTGCAGGTTAAAGGTTTGGGTTGAGAAGGACACAGGGAACTTGCTGG 5442

 40799074 TATGATGGAAGTATCTGTGTTTGGCTGGGTCAGTGGAGTCAGAGTGTTCACTGTTACACC 40799133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5443 TATGATGGAAGTATCTGTGTTTGGCTGGGTCAGTGGAGTCAGAGTGTTCACTGTTACACC 5502

 40799134 TTGGAACTGAGACTGCTTGATGCGGACAATGTTCAGACATTTGTTTATGCACCAAAATGT 40799193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5503 TTGGAACTGAGACTGCTTGATGCGGACAATGTTCAGACATTTGTTTATGCACCAAAATGT 5562

 40799194 ACACCTAACATTTGTGCATTTTACTGTAGGTAAAGTCATTAAAGTTGGTGTCTTTGAAAG 40799253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5563 ACACCTAACATTTGTGCATTTTACTGTAGGTAAAGTCATTAAAGTTGGTGTCTTTGAAAG 5622

 40799254 CTGGGCTGAGGGATTGGCTTTTGGGTGAATAAGGACGAGGCTGTCTGTGGAGCTCACCCA 40799313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5623 CTGGGCTGAGGGATTGGCTTTTGGGTGAATAAGGACGAGGCTGTCTGTGGAGCTCACCCA 5682

 40799314 GGGGTTGCTGGGCTGCCACAGGAGAGCTTGACCTCATTCATTCAACAGATATCTCATGGA 40799373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5683 GGGGTTGCTGGGCTGCCACAGGAGAGCTTGACCTCATTCATTCAACAGATATCTCATGGA 5742

 40799374 CCCAACTGTGGGTGGTGCAGTCTCCACAGCTGCATCCCTGCAGGCCCCCGAACAAAACTG 40799433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5743 CCCAACTGTGGGTGGTGCAGTCTCCACAGCTGCATCCCTGCAGGCCCCCGAACAAAACTG 5802

 40799434 AAGGTGGTCTCAGCTGCATGGAGTTCTCATTTTAGTGAGGGAGACAGGCAGTAAACAAGC 40799493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5803 AAGGTGGTCTCAGCTGCATGGAGTTCTCATTTTAGTGAGGGAGACAGGCAGTAAACAAGC 5862

 40799494 ATGTAATATTCTGGAGCAAGAAGGGCTGGAAAAATACTTCCAGGGATAGAGAAGAGGGGC 40799553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5863 ATGTAATATTCTGGAGCAAGAAGGGCTGGAAAAATACTTCCAGGGATAGAGAAGAGGGGC 5922

 40799554 AGTAAATCATATATAAAAAGGTCCTGAAGTGGCCCTTTCAGACCATGTCATTGGAGTGGA 40799613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5923 AGTAAATCATATATAAAAAGGTCCTGAAGTGGCCCTTTCAGACCATGTCATTGGAGTGGA 5982

 40799614 GAGAGCAAGAGGAAAATGGCAGGGGGTGAGGACAGAGTGGGCACGGCCCAGAGGAAGCAG 40799673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5983 GAGAGCAAGAGGAAAATGGCAGGGGGTGAGGACAGAGTGGGCACGGCCCAGAGGAAGCAG 6042

 40799674 CTGAGGGAGCGCTGGAAAGCCCTTGGCTTTAAGTCTCAGCTCTGAGCAGAGTGACATGAT 40799733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6043 CTGAGGGAGCGCTGGAAAGCCCTTGGCTTTAAGTCTCAGCTCTGAGCAGAGTGACATGAT 6102

 40799734 CTGACTTGCATTTTGGAAGGGTCACTGTGGCTGCTGAGGGGAACAGCCTTTGGGAGGTGA 40799793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6103 CTGACTTGCATTTTGGAAGGGTCACTGTGGCTGCTGAGGGGAACAGCCTTTGGGAGGTGA 6162

 40799794 GGGTAGCAACAGGGAGGTCAGCAGGAGGGCCACTGCAGTGATCTGGATGAAGGACCATGG 40799853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6163 GGGTAGCAACAGGGAGGTCAGCAGGAGGGCCACTGCAGTGATCTGGATGAAGGACCATGG 6222

 40799854 CTTGGACAAGGGCCATGGTCAGGGGTGGTGAGACGTAAAGGAATCCTGTGGGTTTGCTGA 40799913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6223 CTTGGACAAGGGCCATGGTCAGGGGTGGTGAGACGTAAAGGAATCCTGTGGGTTTGCTGA 6282

 40799914 TGGACTGAGTGTGGGGTCTGGGCGAGGGAGGAGCCAGAGGTGACTCCGAGGTTTAGGCTG 40799973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6283 TGGACTGAGTGTGGGGTCTGGGCGAGGGAGGAGCCAGAGGTGACTCCGAGGTTTAGGCTG 6342

 40799974 AGCATCGGGAGAATGGAGGTGTCATTTCTGGATCCGGGTAGTACTATGGTAGGAGTGGCT 40800033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6343 AGCATCGGGAGAATGGAGGTGTCATTTCTGGATCCGGGTAGTACTATGGTAGGAGTGGCT 6402

 40800034 TTGAGGAGAAGGTGAAGAGCTTTGCTCCTCATGGGGTACATGTTAGAGGCTCACCTGGAG 40800093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6403 TTGAGGAGAAGGTGAAGAGCTTTGCTCCTCATGGGGTACATGTTAGAGGCTCACCTGGAG 6462

 40800094 CTGTCAGAAAGCCATTAGCTATGGGAATCTGGATATGGTGGGAGAGAGCTGGCCTAGAGC 40800153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6463 CTGTCAGAAAGCCATTAGCTATGGGAATCTGGATATGGTGGGAGAGAGCTGGCCTAGAGC 6522

 40800154 CATGAAGCTCAGACCCTCCTGAAGACGGAGGCTTGGCTGCTTGGAGAACACGTAGTAGAG 40800213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6523 CATGAAGCTCAGACCCTCCTGAAGACGGAGGCTTGGCTGCTTGGAGAACACGTAGTAGAG 6582

 40800214 AATGCTTTTTCTTTCCTCCTTGGCTCTCTCTTGGCAGAAGGTGATGAGCCTGGCTCCAGT 40800273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6583 AATGCTTTTTCTTTCCTCCTTGGCTCTCTCTTGGCAGAAGGTGATGAGCCTGGCTCCAGT 6642

 40800274 CTGCTGGCGAACTCCCCTCTGATGGAGGATGCTCCACAGAGGCTGCGGTGGCAGGCCCAC 40800333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6643 CTGCTGGCGAACTCCCCTCTGATGGAGGATGCTCCACAGAGGCTGCGGTGGCAGGCCCAC 6702

 40800334 CTGGAGTTCACCCATAACCACGATGTGGGGGATCTCACCTGGGACAAGATTGCCGTCTCC 40800393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6703 CTGGAGTTCACCCATAACCACGATGTGGGGGATCTCACCTGGGACAAGATTGCCGTCTCC 6762

 40800394 CTACCCCGCTCTGAGAAGCTCCGCTCCCTGGTGCTGGCCGGCATCCCACATGGCATGAGG 40800453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6763 CTACCCCGCTCTGAGAAGCTCCGCTCCCTGGTGCTGGCCGGCATCCCACATGGCATGAGG 6822

 40800454 CCACAGGTAAGGTGGCCACAGGGACCCACAGGGTGTTGAGAGGGTCCTGGCCCCATGATC 40800513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6823 CCACAGGTAAGGTGGCCACAGGGACCCACAGGGTGTTGAGAGGGTCCTGGCCCCATGATC 6882

 40800514 AGGTGTCACGAGAAAGACTGAGTGCCCTTGCGGCTCCCTTCCCTCAGCTGTGGATGCGGC 40800573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6883 AGGTGTCACGAGAAAGACTGAGTGCCCTTGCGGCTCCCTTCCCTCAGCTGTGGATGCGGC 6942

 40800574 TCTCTGGGGCCCTGCAGAAGAAGAGGAACTCTGAGCTGTCCTACCGCGAGATTGTGAAGA 40800633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6943 TCTCTGGGGCCCTGCAGAAGAAGAGGAACTCTGAGCTGTCCTACCGCGAGATTGTGAAGA 7002

 40800634 ACAGCTCCAACGATGAGACCATCGCTGCCAAGCAGGTGAGGCCGGTGGCACTGTGCAGGA 40800693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7003 ACAGCTCCAACGATGAGACCATCGCTGCCAAGCAGGTGAGGCCGGTGGCACTGTGCAGGA 7062

 40800694 AGAGCTGGAGGCTGTGTGGGCTCGCAGGAGAGAGGGAGCCTGCCTGGGGTTCTTAGAGTG 40800753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7063 AGAGCTGGAGGCTGTGTGGGCTCGCAGGAGAGAGGGAGCCTGCCTGGGGTTCTTAGAGTG 7122

 40800754 TGCCCTTGTTGTGGGGTAGGGGAGGATATTTGCTCCTTCCTTGGTCCTCTGCAGGCCAAA 40800813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7123 TGCCCTTGTTGTGGGGTAGGGGAGGATATTTGCTCCTTCCTTGGTCCTCTGCAGGCCAAA 7182

 40800814 GAAAGAATTGTCCAAAAGGCCATCAGTGCTGTGGAAGGGCTTGGAGATGGGGTTCCCAAG 40800873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7183 GAAAGAATTGTCCAAAAGGCCATCAGTGCTGTGGAAGGGCTTGGAGATGGGGTTCCCAAG 7242

 40800874 CCCGGGTCCACTTCAGGAACAGATGGGGACTCTAAATATAGACTCCAGGCCTCGGGCCAC 40800933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7243 CCCGGGTCCACTTCAGGAACAGATGGGGACTCTAAATATAGACTCCAGGCCTCGGGCCAC 7302

 40800934 ACGTTTTCAGGTGGTCTGGCATGAAGTTTCCCAGCTGGATTTGATGTCCCGGCTCCACAC 40800993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7303 ACGTTTTCAGGTGGTCTGGCATGAAGTTTCCCAGCTGGATTTGATGTCCCGGCTCCACAC 7362

 40800994 TGGCTGGGAGCTGACCCTGAAGGGAGGAGGGTGACCTTGATCAGGAACACAAGGAATCCC 40801053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7363 TGGCTGGGAGCTGACCCTGAAGGGAGGAGGGTGACCTTGATCAGGAACACAAGGAATCCC 7422

 40801054 CATTTCTGGGGGAGAAGCCCGCCTGGGGTCTGCCTCCCTCCCAGGGTGTCACAAGGTCTT 40801113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7423 CATTTCTGGGGGAGAAGCCCGCCTGGGGTCTGCCTCCCTCCCAGGGTGTCACAAGGTCTT 7482

 40801114 GTTATTGTGGGTGCCGATGGCTGCCTGACAGATCGAGAAGGACCTGCTCCGCACCATGCC 40801173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7483 GTTATTGTGGGTGCCGATGGCTGCCTGACAGATCGAGAAGGACCTGCTCCGCACCATGCC 7542

 40801174 CAGCAACGCCTGCTTCGCCAGCATGGGTAGCATCGGGGTGCCCCGCCTGCGCAGGGTGCT 40801233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7543 CAGCAACGCCTGCTTCGCCAGCATGGGTAGCATCGGGGTGCCCCGCCTGCGCAGGGTGCT 7602

 40801234 CCGGGCCCTGGCCTGGCTCTACCCAGAGATCGGCTACTGCCAGGGCACCGGCATGGTGAG 40801293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7603 CCGGGCCCTGGCCTGGCTCTACCCAGAGATCGGCTACTGCCAGGGCACCGGCATGGTGAG 7662

 40801294 CACAGCCCCAGAAAGGGCAGTGGCAGCCCCAGGACCCCCTCCAGGACCCTAACAAGGAGT 40801353
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     7663 CACAGCCCCAGAAAGGGCAGTGGCAGCACCAGGACCCCCTCCAGGACCCTAACAAGGAGT 7722

 40801354 GGCCTCCCGCTACGGGGCAGTAGCCCCAGGGCCTCCTCCAGGACCCCTAACAAGGAGTGG 40801413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7723 GGCCTCCCGCTACGGGGCAGTAGCCCCAGGGCCTCCTCCAGGACCCCTAACAAGGAGTGG 7782

 40801414 CCTCCCACTCCGGGGCGTCCCCAAGGAGATCGGGGCAGCTGCACGTTATGCAAGCAGAGG 40801473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7783 CCTCCCACTCCGGGGCGTCCCCAAGGAGATCGGGGCAGCTGCACGTTATGCAAGCAGAGG 7842

 40801474 CGCTCCCCAAGGGATGTGAAAGTGAGGCAGGCCAAGGAAAGCAGCCCAGGGAAGGCCTGG 40801533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7843 CGCTCCCCAAGGGATGTGAAAGTGAGGCAGGCCAAGGAAAGCAGCCCAGGGAAGGCCTGG 7902

 40801534 GTTCCAGCATGCGTGCCCCCCAAGAGGCTTTTGCTAATTGGTCTCCCTAGGGTAGGGGCA 40801593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7903 GTTCCAGCATGCGTGCCCCCCAAGAGGCTTTTGCTAATTGGTCTCCCTAGGGTAGGGGCA 7962

 40801594 CCTTTTCTAATCTGCACAAAGACCTGGGTAGAAGGCCCTTGTCCCTGTGCCCTGGCCAGG 40801653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7963 CCTTTTCTAATCTGCACAAAGACCTGGGTAGAAGGCCCTTGTCCCTGTGCCCTGGCCAGG 8022

 40801654 TGGCCGCCTGCCTCCTGCTGTTCCTGGAGGAGGAGGACGCCTTCTGGATGATGTCTGCCA 40801713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8023 TGGCCGCCTGCCTCCTGCTGTTCCTGGAGGAGGAGGACGCCTTCTGGATGATGTCTGCCA 8082

 40801714 TCATCGAGGACCTGCTCCCCGCCTCCTACTTCAGCACCACCCTGCTGGGTGTCCAGACTG 40801773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8083 TCATCGAGGACCTGCTCCCCGCCTCCTACTTCAGCACCACCCTGCTGGGTGTCCAGACTG 8142

 40801774 ACCAGCGGGTCCTGCGCCACCTCATTGTCCAGTACCTGCCTCGCCTGGACAAGCTGCTCC 40801833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8143 ACCAGCGGGTCCTGCGCCACCTCATTGTCCAGTACCTGCCTCGCCTGGACAAGCTGCTCC 8202

 40801834 AGGAGCATGACATTGGTAAGGCGCCCCTGAGCCACTGGCTCCCATTCTGCAGCTTGGAGG 40801893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8203 AGGAGCATGACATTGGTAAGGCGCCCCTGAGCCACTGGCTCCCATTCTGCAGCTTGGAGG 8262

 40801894 ACTCAGGCGGGTGGCCGAGTGGGGATAGGGCACAGCCCCCCAACCATGGTCTTTGTCGCT 40801953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8263 ACTCAGGCGGGTGGCCGAGTGGGGATAGGGCACAGCCCCCCAACCATGGTCTTTGTCGCT 8322

 40801954 CTTTTGTTCTCTGGTGTTCCCTGCCCCCTCCCCTCCTTTGCTCTTAAGCAGGGAGGACCT 40802013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8323 CTTTTGTTCTCTGGTGTTCCCTGCCCCCTCCCCTCCTTTGCTCTTAAGCAGGGAGGACCT 8382

 40802014 TGCTGCAGTTCCGGGGAGGGAGGTTTCCACCACCTCCTCCCCAGCGGCTTTGGCTCCTGT 40802073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8383 TGCTGCAGTTCCGGGGAGGGAGGTTTCCACCACCTCCTCCCCAGCGGCTTTGGCTCCTGT 8442

 40802074 GTTTACAGAGCTGTCCCTGATCACACTGCACTGGTTCCTCACGGCCTTCGCCAGCGTGGT 40802133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8443 GTTTACAGAGCTGTCCCTGATCACACTGCACTGGTTCCTCACGGCCTTCGCCAGCGTGGT 8502

 40802134 GGACATCAAGCTGCTCCTGCGCATCTGGGACCTGTTTTTCTACGAGGGCTCCCGGGTGCT 40802193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8503 GGACATCAAGCTGCTCCTGCGCATCTGGGACCTGTTTTTCTACGAGGGCTCCCGGGTGCT 8562

 40802194 GTTCCAGCTCACGCTGGGCATGCTGCACCTCAAGGTGCTCCACGGCCCCACTTCAGGCTG 40802253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8563 GTTCCAGCTCACGCTGGGCATGCTGCACCTCAAGGTGCTCCACGGCCCCACTTCAGGCTG 8622

 40802254 AGGAGTAGGCACCCGAGATGGGGGGCAGGGGAGCAAGAGACCTCCCTGGGCCAGGCAAGA 40802313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8623 AGGAGTAGGCACCCGAGATGGGGGGCAGGGGAGCAAGAGACCTCCCTGGGCCAGGCAAGA 8682

 40802314 CCAGCCCCCTGGCCCCTGACAACTGTGCCAAGGCAAACGGGTCCCTGAGGATGGGGGTTG 40802373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8683 CCAGCCCCCTGGCCCCTGACAACTGTGCCAAGGCAAACGGGTCCCTGAGGATGGGGGTTG 8742

 40802374 GGGTCAGCTCAGTGCCACGTCCCTGCAATGACAACCTTCTTCCCCCATCCTGCCCTGGCA 40802433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8743 GGGTCAGCTCAGTGCCACGTCCCTGCAATGACAACCTTCTTCCCCCATCCTGCCCTGGCA 8802

 40802434 TGGCCCAGGAGGAAGAGCTGATCCAGTCAGAGAACTCGGCCTCCATCTTCAACACGCTAT 40802493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8803 TGGCCCAGGAGGAAGAGCTGATCCAGTCAGAGAACTCGGCCTCCATCTTCAACACGCTAT 8862

 40802494 CGGATATCCCGTCGCAGATGGAGGACGCGGAGCTGCTTCTGGGGGTGGCCATGCGGCTGG 40802553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8863 CGGATATCCCGTCGCAGATGGAGGACGCGGAGCTGCTTCTGGGGGTGGCCATGCGGCTGG 8922

 40802554 CCGGCTCCCTCACCGATGTGGCCGTGGAGACTCAGCGCCGCAAGCACCTGGCCTATCTCA 40802613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8923 CCGGCTCCCTCACCGATGTGGCCGTGGAGACTCAGCGCCGCAAGCACCTGGCCTATCTCA 8982

 40802614 TTGCAGACCAGGGCCAGCTCCTGGGGGCCGGCACCCTCACCAACCTCTCTCAGGTGGCCC 40802673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8983 TTGCAGACCAGGGCCAGCTCCTGGGGGCCGGCACCCTCACCAACCTCTCTCAGGTGGCCC 9042

 40802674 AGGATGGGGGGCCGCACCTTGACCCACAGCACACGGGGAGGAGGGGTCACCTTGAAGTTC 40802733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9043 AGGATGGGGGGCCGCACCTTGACCCACAGCACACGGGGAGGAGGGGTCACCTTGAAGTTC 9102

 40802734 AGAGCGCGGGGGCTGCGGAAAACAAACCAGCCCTTCCTGCTCTGCCCCCCAGCCTGGCCC 40802793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9103 AGAGCGCGGGGGCTGCGGAAAACAAACCAGCCCTTCCTGCTCTGCCCCCCAGCCTGGCCC 9162

 40802794 AGTCAGACCACAGCTGTGGGGTGATCCAGGCCTCCTCAGGCTTTGTGCACCTCAGGTTCT 40802853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9163 AGTCAGACCACAGCTGTGGGGTGATCCAGGCCTCCTCAGGCTTTGTGCACCTCAGGTTCT 9222

 40802854 GATCCTGGCACGGTTTGGGAGGAAGGCAGACCCAGCTCTGATTATCTGTTTTCAATTCTT 40802913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9223 GATCCTGGCACGGTTTGGGAGGAAGGCAGACCCAGCTCTGATTATCTGTTTTCAATTCTT 9282

 40802914 GGAGCCAGCGTCAGAGGCTATTTCAGATGAGACAGTATAAGCCAAGGGCTGGTGGGTTCT 40802973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9283 GGAGCCAGCGTCAGAGGCTATTTCAGATGAGACAGTATAAGCCAAGGGCTGGTGGGTTCT 9342

 40802974 CTTCCTCCCGGGGCCAGGACCACCCTGACCCACTCCTCTTGGTGCAGGTTGTTCGCCGCA 40803033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9343 CTTCCTCCCGGGGCCAGGACCACCCTGACCCACTCCTCTTGGTGCAGGTTGTTCGCCGCA 9402

 40803034 GGACCCAGCGGAGGAAGTCCACCATCACTGCTCTGCTCTTCGGTGAGAGCTCTGCGAGTG 40803093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9403 GGACCCAGCGGAGGAAGTCCACCATCACTGCTCTGCTCTTCGGTGAGAGCTCTGCGAGTG 9462

 40803094 CCAGGCAGTGTGGGCATGCGGGAGTCTGTCCTCACGCTCATGTGGACGTGGAGCTTCCTC 40803153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9463 CCAGGCAGTGTGGGCATGCGGGAGTCTGTCCTCACGCTCATGTGGACGTGGAGCTTCCTC 9522

 40803154 CTCGGGGGCCTGGAGTGGGCTGTGGTCACCATGGTTCTCTGGGCCTCCTAGGGGAGGATG 40803213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9523 CTCGGGGGCCTGGAGTGGGCTGTGGTCACCATGGTTCTCTGGGCCTCCTAGGGGAGGATG 9582

 40803214 ACCTGGAGGCACTCAAGGCCAAGAACATCAAGCAGACGGAACTGGTGGCTGACCTCCGGG 40803273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9583 ACCTGGAGGCACTCAAGGCCAAGAACATCAAGCAGACGGAACTGGTGGCTGACCTCCGGG 9642

 40803274 AAGCCATCCTG 40803284
          |||||||||||
     9643 AAGCCATCCTG 9653

Alignment time is 7.38842 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    4642] =>      4642 nucs 'mol-32-2ff9-229591_4642'

Score:        4620
Aligned:      4642        nucs
Identic:      4640 (100%) nucs =>      1370 (100%)      3270 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40792621,40793990] EXCISED REGION [40793996,40797267]
 second seq =>  [       1,    1370] EXCISED REGION [    1371,    4642]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [40793991,40793995]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40792621 GAAGTATTTTTGCTTATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAA 40792680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAGTATTTTTGCTTATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAA 60

 40792681 ACCATCTCTGTAGTAGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGG 40792740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCATCTCTGTAGTAGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGG 120

 40792741 ACAGGAGGACCAGAGTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAG 40792800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGGAGGACCAGAGTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAG 180

 40792801 GAAATGGACAGAACCTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTA 40792860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAATGGACAGAACCTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTA 240

 40792861 AGATCTGACCTTCTGTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGC 40792920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGATCTGACCTTCTGTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGC 300

 40792921 AAACTAGGGAGTATGTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTC 40792980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAACTAGGGAGTATGTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTC 360

 40792981 CTAAATCAATCCTGTTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGC 40793040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAAATCAATCCTGTTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGC 420

 40793041 AGCCACCCTGACGTGGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTT 40793100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCCACCCTGACGTGGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTT 480

 40793101 CAGGAAGGTTTCCATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTC 40793160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGGAAGGTTTCCATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTC 540

 40793161 ACATCCGGCTGGGCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATAC 40793220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACATCCGGCTGGGCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATAC 600

 40793221 ATTACATACATTTATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATC 40793280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTACATACATTTATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATC 660

 40793281 CAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 40793340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGG 720

 40793341 CAGGAGGATCACTTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTG 40793400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGGAGGATCACTTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTG 780

 40793401 TCTCTAAAAAAAAAAATATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCC 40793460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTCTAAAAAAAAAAATATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCC 840

 40793461 ACCATAGGAAAGTCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCA 40793520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCATAGGAAAGTCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCA 900

 40793521 CCACCACCTCTGCAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCA 40793580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCACCACCTCTGCAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCA 960

 40793581 CTGAGAATGAAGCCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTT 40793640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGAGAATGAAGCCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTT 1020

 40793641 CTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGC 40793700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGC 1080

 40793701 CTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTT 40793760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTT 1140

 40793761 CTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCT 40793820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCT 1200

 40793821 CAGGTGTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTC 40793880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGGTGTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTC 1260

 40793881 TCTTCTGATAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACA 40793940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTTCTGATAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACA 1320

 40793941 ATCTATTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 40793990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATCTATTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 1370

EXCISED REGION

 40793996 AGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCT 40794055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 AGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCT 1430

 40794056 CTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 40794115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 CTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 1490

 40794116 CACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTT 40794175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 CACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTT 1550

 40794176 GGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGT 40794235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 GGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGT 1610

 40794236 GCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGTCATCTGATTCTCTAATGTAAGG 40794295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 GCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGTCATCTGATTCTCTAATGTAAGG 1670

 40794296 GTCAGGACTTTTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTTAGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGG 40794355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 GTCAGGACTTTTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTTAGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGG 1730

 40794356 GTGCTCAGTCCCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGGAGGACAGCCAAGATCAGGAAAG 40794415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 GTGCTCAGTCCCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGGAGGACAGCCAAGATCAGGAAAG 1790

 40794416 GGGAGGGACTCCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAGGCCTCCACAGCCAGATGTAGCT 40794475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 GGGAGGGACTCCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAGGCCTCCACAGCCAGATGTAGCT 1850

 40794476 GATTTCTCTGCTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCACACTTTTACTCTGCCCTTTCAG 40794535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 GATTTCTCTGCTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCACACTTTTACTCTGCCCTTTCAG 1910

 40794536 AACCACCAACCAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTGATGAGGAGTCTTTCTCATGCTC 40794595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 AACCACCAACCAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTGATGAGGAGTCTTTCTCATGCTC 1970

 40794596 TCAACTGGGACATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGTCATTTTTCTAGGCTGTAATGGA 40794655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 TCAACTGGGACATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGTCATTTTTCTAGGCTGTAATGGA 2030

 40794656 TGAATATCGGCAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTTAGTATACCTCAATGAGGAGGGT 40794715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 TGAATATCGGCAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTTAGTATACCTCAATGAGGAGGGT 2090

 40794716 CCATATATTAACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGACTACTAATTGCCTGATACTTATT 40794775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 CCATATATTAACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGACTACTAATTGCCTGATACTTATT 2150

 40794776 GAGTACTTATATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTTATTTGCATCAGCTCACGTAATC 40794835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 GAGTACTTATATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTTATTTGCATCAGCTCACGTAATC 2210

 40794836 CTCATAACCACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCATTCTATCGAAAAGAAAACTGATA 40794895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 CTCATAACCACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCATTCTATCGAAAAGAAAACTGATA 2270

 40794896 CAGACGTGAAGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTGGGCACAGGCCCACTCTGCTACA 40794955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 CAGACGTGAAGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTGGGCACAGGCCCACTCTGCTACA 2330

 40794956 CGAGTAGCAGAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTACTTTTTTTTTTTGAGACAGAGT 40795015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 CGAGTAGCAGAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTACTTTTTTTTTTTGAGACAGAGT 2390

 40795016 CTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGC 40795075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 CTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGC 2450

 40795076 CTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGCGATTACAGGGATG 40795135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 CTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGCGATTACAGGGATG 2510

 40795136 CATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGGTG 40795195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 CATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGGTG 2570

 40795196 GCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTG 40795255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 GCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTG 2630

 40795256 CTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTACTTTTAATCATGGT 40795315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 CTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTACTTTTAATCATGGT 2690

 40795316 GCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGGTTGTTCTGCCACA 40795375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 GCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGGTTGTTCTGCCACA 2750

 40795376 GCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGCACTGGGTTCCATT 40795435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 GCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGCACTGGGTTCCATT 2810

 40795436 CCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGTGGGGTTACATGGT 40795495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 CCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGTGGGGTTACATGGT 2870

 40795496 GTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCTCCTAGGCTTATTT 40795555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 GTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCTCCTAGGCTTATTT 2930

 40795556 TCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACATGACATGCTTTTTA 40795615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 TCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACATGACATGCTTTTTA 2990

 40795616 AAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAGCTCATAGTTCTGA 40795675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 AAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAGCTCATAGTTCTGA 3050

 40795676 GGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAAATTCCATTCTCTT 40795735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 GGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAAATTCCATTCTCTT 3110

 40795736 CACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGGTTCTGCCATCTGG 40795795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 CACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGGTTCTGCCATCTGG 3170

 40795796 TTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTTGGGTACCAAAGCC 40795855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 TTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTTGGGTACCAAAGCC 3230

 40795856 TCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTGGCTTGGCCAGTGT 40795915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 TCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTGGCTTGGCCAGTGT 3290

 40795916 GTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACAGGAGCTATTTTTG 40795975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 GTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACAGGAGCTATTTTTG 3350

 40795976 CCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGCTCCTTTGAAGTGG 40796035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 CCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGCTCCTTTGAAGTGG 3410

 40796036 TGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCCGATTTATCTAGAA 40796095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 TGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCCGATTTATCTAGAA 3470

 40796096 TTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCTGTTATGGACCAGG 40796155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 TTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCTGTTATGGACCAGG 3530

 40796156 ATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAAGTAAATTTTTCTT 40796215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 ATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAAGTAAATTTTTCTT 3590

 40796216 CAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACTTGTCTTGAAATCT 40796275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 CAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACTTGTCTTGAAATCT 3650

 40796276 TTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAGAGCCTTTAATTCT 40796335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 TTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAGAGCCTTTAATTCT 3710

 40796336 GTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCTTGTAATC 40796395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 GTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCTTGTAATC 3770

 40796396 CCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCT 40796455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 CCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCT 3830

 40796456 GGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGCCGGGTGTGGTGGT 40796515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 GGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGCCGGGTGTGGTGGT 3890

 40796516 GCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCTCTTGAACCCAGGA 40796575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 GCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCTCTTGAACCCAGGA 3950

 40796576 GGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGGTGACCAAGCG 40796635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 GGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGGTGACCAAGCG 4010

 40796636 AGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCTCTTTTCTCTTCTA 40796695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 AGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCTCTTTTCTCTTCTA 4070

 40796696 ACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAGCTCTAAGATAGCA 40796755
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 ACAGGACAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAGCTCTAAGATAGCA 4130

 40796756 GGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCACCAGCACAATGTC 40796815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 GGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCACCAGCACAATGTC 4190

 40796816 AGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCACAGAGGAGCCAGAG 40796875
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 GGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCACAGAGGAGCCAGAG 4250

 40796876 GGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGAGGTGGAGATGGTA 40796935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 GGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGAGGTGGAGATGGTA 4310

 40796936 GGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCAGCTCTGCTCTCTA 40796995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 GGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCAGCTCTGCTCTCTA 4370

 40796996 GCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGTGGAGAAAGAGGCC 40797055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 GCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGTGGAGAAAGAGGCC 4430

 40797056 GGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTCCCCTCTTCTCCAG 40797115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 GGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTCCCCTCTTCTCCAG 4490

 40797116 AAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTACCCAGCACGCTTG 40797175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 AAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTACCCAGCACGCTTG 4550

 40797176 AGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTATTTCCTGATTTGA 40797235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 AGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTATTTCCTGATTTGA 4610

 40797236 ATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTA 40797267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 ATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTA 4642

Alignment time is 3.44913 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    5181] =>      5181 nucs 'mol-32-300f-003511_5181'

Score:        5132
Aligned:      5178        nucs
Identic:      5173 (100%) nucs =>      1598 (100%)      3575 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40792624,40794223] EXCISED REGION [40795243,40798820]
 second seq =>  [       6,    1603] EXCISED REGION [    1604,    5181]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1019 nucs [40794224,40795242]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        38 nucs [40794224,40794261] to [40795243,40795280]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [40794223,40794223] to [40795243,40795243]
 second seq =>         1 nucs [1603,1603] to [1604,1604]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40792624 GTATTTTTGCTTATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACC 40792683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        6 GTATTTTTGCTTATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACC 65

 40792684 ATCTCTGTAGTAGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACA 40792743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       66 ATCTCTGTAGTAGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACA 125

 40792744 GGAGGACCAGAGTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAA 40792803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      126 GGAGGACCAGAGTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAA 185

 40792804 ATGGACAGAACCTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGA 40792863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 ATGGACAGAACCTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGA 245

 40792864 TCTGACCTTCTGTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAA 40792923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 TCTGACCTTCTGTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAA 305

 40792924 CTAGGGAGTATGTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTA 40792983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 CTAGGGAGTATGTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTA 365

 40792984 AATCAATCCTGTTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGC 40793043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 AATCAATCCTGTTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGC 425

 40793044 CACCCTGACGTGGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAG 40793103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 CACCCTGACGTGGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAG 485

 40793104 GAAGGTTTCCATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACA 40793163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 GAAGGTTTCCATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACA 545

 40793164 TCCGGCTGGGCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATT 40793223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 TCCGGCTGGGCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATT 605

 40793224 ACATACATTTATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAG 40793283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 ACATACATTTATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAG 665

 40793284 AATCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAG 40793343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 AATCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAG 725

 40793344 GAGGATCACTTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCT 40793403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 GAGGATCACTTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCT 785

 40793404 CTAAAAAAAAAAATATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACC 40793463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 CTAAAAAAAAAAATATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACC 845

 40793464 ATAGGAAAGTCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCA 40793523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 ATAGGAAAGTCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCA 905

 40793524 CCACCTCTGCAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTG 40793583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 CCACCTCTGCAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTG 965

 40793584 AGAATGAAGCCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTC 40793643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 AGAATGAAGCCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTC 1025

 40793644 CCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTG 40793703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 CCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTG 1085

 40793704 CTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTC 40793763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 CTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTC 1145

 40793764 CCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAG 40793823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 CCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAG 1205

 40793824 GTGTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCT 40793883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 GTGTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCT 1265

 40793884 TCTGATAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATC 40793943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 TCTGATAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATC 1325

 40793944 TATTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAG 40794003
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||
     1326 TATTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT--GAGATGGAG 1383

 40794004 TCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCC 40794063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 TCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCC 1443

 40794064 TGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCC 40794123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 TGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCC 1503

 40794124 ACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGA 40794183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 ACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGA 1563

 40794184 TGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCG 40794223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 TGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCG 1603

EXCISED REGION

 40795243 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 40795302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 1663

 40795303 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 40795362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 1723

 40795363 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 40795422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 1783

 40795423 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 40795482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 1843

 40795483 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 40795542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 1903

 40795543 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 40795602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 1963

 40795603 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 40795662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 2023

 40795663 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 40795722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 2083

 40795723 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 40795782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 2143

 40795783 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 40795842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 2203

 40795843 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 40795902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 2263

 40795903 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 40795962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 2323

 40795963 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 40796022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 2383

 40796023 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 40796082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 2443

 40796083 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 40796142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 2503

 40796143 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 40796202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 2563

 40796203 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 40796262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 2623

 40796263 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 40796322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 2683

 40796323 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 40796382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 2743

 40796383 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 40796442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 2803

 40796443 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 40796502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 2863

 40796503 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 40796562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 2923

 40796563 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 40796622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 2983

 40796623 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 40796682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 3043

 40796683 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 40796742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3044 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 3103

 40796743 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 40796802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 3163

 40796803 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 40796862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 3223

 40796863 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 40796922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 3283

 40796923 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 40796982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 3343

 40796983 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 40797042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 3403

 40797043 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 40797102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 3463

 40797103 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 40797162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 3523

 40797163 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTA 40797222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTA 3583

 40797223 TTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGA 40797282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3584 TTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTTTTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGA 3643

 40797283 GTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTC 40797342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 GTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTC 3703

 40797343 CGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGC 40797402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 CGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGC 3763

 40797403 CACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGC 40797462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3764 CACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGC 3823

 40797463 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGAGAT 40797522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3824 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGAGAT 3883

 40797523 TACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTTCTCCTGGTC 40797582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3884 TACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTTCTCCTGGTC 3943

 40797583 CTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAG 40797642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3944 CTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAG 4003

 40797643 CATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGCCAGGCACCA 40797702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4004 CATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGCCAGGCACCA 4063

 40797703 GCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCTGCCCAGGAA 40797762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4064 GCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCTGCCCAGGAA 4123

 40797763 GAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCTTAGCCCCAT 40797822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4124 GAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCTTAGCCCCAT 4183

 40797823 GTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGGACACAACTG 40797882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4184 GTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGGACACAACTG 4243

 40797883 CATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGAACAAGGAAA 40797942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4244 CATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGAACAAGGAAA 4303

 40797943 ATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTAACCAGAGGC 40798002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4304 ATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTAACCAGAGGC 4363

 40798003 GGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTTTAGCAGGCA 40798062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4364 GGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTTTAGCAGGCA 4423

 40798063 ACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGCAACTGACTT 40798122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4424 ACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGCAACTGACTT 4483

 40798123 CAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATG 40798182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4484 CAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATG 4543

 40798183 AGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTTTGTGTGTCATCTTGC 40798242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4544 AGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTGTGTGTGTCATCTTGC 4603

 40798243 TGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGTGATGGCTGA 40798302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4604 TGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGTGATGGCTGA 4663

 40798303 GCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTGATACTCTCA 40798362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4664 GCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTGATACTCTCA 4723

 40798363 TAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCACCTGACAGTA 40798422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4724 TAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCACCTGACAGTA 4783

 40798423 AAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAAAAATTCAGGCTGGACGTGGTGGCTCACG 40798482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4784 AAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAAAAATTCAGGCTGGACGTGGTGGCTCACG 4843

 40798483 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTCA 40798542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4844 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTCA 4903

 40798543 AGACCAACCTAGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTTGCCAGG 40798602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4904 AGACCAACCTAGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTTGCCAGG 4963

 40798603 TGTGATGGTGTGCGACTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTG 40798662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4964 TGTGATGGTGTGCGACTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTG 5023

 40798663 AACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCGCCACTGCACTCCAGCCTAGGCA 40798722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5024 AACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCGCCACTGCACTCCAGCCTAGGCA 5083

 40798723 ACAAGAGCAAACCTCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAGCATATTTTCAATGGCTGTATAATAT 40798782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5084 ACAAGAGCAAACCTCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAGCATATTTTCAATGGCTGTATAATAT 5143

 40798783 CCTTTTATAGTGAATATACAGTATTTGGATAACTACTT 40798820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5144 CCTTTTATAGTGAATATACAGTATTTGGATAACTACTT 5181

Alignment time is 4.4312 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3322] =>      3322 nucs 'mol-32-301a-061117_3322'

Score:        3322
Aligned:      3322        nucs
Identic:      3322 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40794005,40797326]
 second seq =>  [       1,    3322]

 40794005 CTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCT 40794064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCT 60

 40794065 GGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCA 40794124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCA 120

 40794125 CCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGAT 40794184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGAT 180

 40794185 GGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 40794244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT 240

 40794245 ACAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGTCATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACT 40794304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGTCATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACT 300

 40794305 TTTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTTAGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGT 40794364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTTAGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGT 360

 40794365 CCCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGGAGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGAC 40794424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGGAGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGAC 420

 40794425 TCCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAGGCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCT 40794484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAGGCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCT 480

 40794485 GCTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCACACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAA 40794544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCACACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAA 540

 40794545 CCAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTGATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGG 40794604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTGATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGG 600

 40794605 ACATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGTCATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAATATCG 40794664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGTCATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAATATCG 660

 40794665 GCAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTTAGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATT 40794724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTTAGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATT 720

 40794725 AACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGACTACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTA 40794784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGACTACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTA 780

 40794785 TATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTTATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACC 40794844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTTATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACC 840

 40794845 ACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCATTCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGA 40794904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCATTCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGA 900

 40794905 AGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTGGGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCA 40794964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTGGGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCA 960

 40794965 GAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTACTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTG 40795024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTACTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTG 1020

 40795025 TCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGT 40795084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGT 1080

 40795085 TCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCAT 40795144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCAT 1140

 40795145 GCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTG 40795204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTG 1200

 40795205 GTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 40795264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 1260

 40795265 CAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGAT 40795324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGAT 1320

 40795325 GAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGC 40795384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGC 1380

 40795385 CATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCC 40795444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCC 1440

 40795445 ATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGG 40795504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGG 1500

 40795505 CAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTG 40795564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTG 1560

 40795565 TAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTA 40795624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTA 1620

 40795625 GCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCC 40795684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCC 1680

 40795685 TATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAA 40795744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAA 1740

 40795745 CCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCA 40795804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCA 1800

 40795805 GGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACA 40795864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACA 1860

 40795865 GTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGG 40795924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGG 1920

 40795925 GCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACAC 40795984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACAC 1980

 40795985 TTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGAT 40796044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGAT 2040

 40796045 TTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACA 40796104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACA 2100

 40796105 CCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACT 40796164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACT 2160

 40796165 GTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAG 40796224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAG 2220

 40796225 GTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCAC 40796284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCAC 2280

 40796285 ATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGA 40796344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGA 2340

 40796345 AGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTT 40796404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTT 2400

 40796405 TGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATAT 40796464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATAT 2460

 40796465 GGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGCCGGGTGTGGTGGTGCAACCCTG 40796524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGCCGGGTGTGGTGGTGCAACCCTG 2520

 40796525 TAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGT 40796584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGT 2580

 40796585 TGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGGTGACCAAGCGAGACTCTGT 40796644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGGTGACCAAGCGAGACTCTGT 2640

 40796645 CTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCTCTTTTCTCTTCTAACAGGGCAG 40796704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCTCTTTTCTCTTCTAACAGGGCAG 2700

 40796705 ATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAGCTCTAAGATAGCAGGATAGGAG 40796764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAGCTCTAAGATAGCAGGATAGGAG 2760

 40796765 ACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCACCAGCACAATGTCAGGTAGAGG 40796824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCACCAGCACAATGTCAGGTAGAGG 2820

 40796825 CAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCACAGAGGAGCCAGAGGGATGGAAG 40796884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCACAGAGGAGCCAGAGGGATGGAAG 2880

 40796885 GTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGAGGTGGAGATGGTAGGGAAGGCT 40796944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGAGGTGGAGATGGTAGGGAAGGCT 2940

 40796945 TCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCAGCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTC 40797004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCAGCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTC 3000

 40797005 CTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGTGGAGAAAGAGGCCGGAAGATGA 40797064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGTGGAGAAAGAGGCCGGAAGATGA 3060

 40797065 AGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTCCCCTCTTCTCCAGAAATTTGCT 40797124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTCCCCTCTTCTCCAGAAATTTGCT 3120

 40797125 GATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTACCCAGCACGCTTGAGATGGGCC 40797184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTACCCAGCACGCTTGAGATGGGCC 3180

 40797185 AGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTATTTCCTGATTTGAATTTTGCCT 40797244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTATTTCCTGATTTGAATTTTGCCT 3240

 40797245 CTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGC 40797304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGC 3300

 40797305 TGGAGCGCAATGGCACGATCCT 40797326
          ||||||||||||||||||||||
     3301 TGGAGCGCAATGGCACGATCCT 3322

Alignment time is 2.16969 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2600] =>      2600 nucs 'mol-32-3143-194236_2600'

Score:        2600
Aligned:      2600        nucs
Identic:      2600 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40794013,40796612]
 second seq =>  [       1,    2600]

 40794013 CCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAA 40794072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAA 60

 40794073 GTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCC 40794132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCC 120

 40794133 AGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAA 40794192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAA 180

 40794193 TCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 40794252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 240

 40794253 GAGCCACCGGGCCCAGCCTGTCATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACTTTTTCCCC 40794312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGCCACCGGGCCCAGCCTGTCATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACTTTTTCCCC 300

 40794313 CACTGTTGTGTCCCAGCTCTTAGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGTCCCCATTT 40794372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACTGTTGTGTCCCAGCTCTTAGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGTCCCCATTT 360

 40794373 GCTGATGAATGAATGAGTGGGAGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGACTCCTGAGT 40794432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTGATGAATGAATGAGTGGGAGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGACTCCTGAGT 420

 40794433 GGGCCTTCCCAGCCCCTTCAGGCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCTGCTACAAG 40794492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGCCTTCCCAGCCCCTTCAGGCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCTGCTACAAG 480

 40794493 CAGCCTGCAGGTGCTCTGTCACACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAACCAAACCC 40794552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGCCTGCAGGTGCTCTGTCACACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAACCAAACCC 540

 40794553 CTGCCTCTGGGGCCGATGGTGATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGGACATGTTA 40794612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGCCTCTGGGGCCGATGGTGATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGGACATGTTA 600

 40794613 TGTGGAACCATACACAGTTGTCATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAATATCGGCAATTTA 40794672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTGGAACCATACACAGTTGTCATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAATATCGGCAATTTA 660

 40794673 ATATGGTTCAACATAGTTTTTAGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATTAACAATAA 40794732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATGGTTCAACATAGTTTTTAGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATTAACAATAA 720

 40794733 CTTTCTAAAAATTTTTAGGACTACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTATATGTGTC 40794792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTTCTAAAAATTTTTAGGACTACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTATATGTGTC 780

 40794793 AGGCAGTGTGCTAAAGGCCTTATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACCACAGTAAG 40794852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGCAGTGTGCTAAAGGCCTTATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACCACAGTAAG 840

 40794853 GCATAGGTATTATTATTCCATTCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGAAGTAAACT 40794912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCATAGGTATTATTATTCCATTCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGAAGTAAACT 900

 40794913 TGCCCACGGTTATAACAAGTGGGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAGAGCTAGG 40794972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCCCACGGTTATAACAAGTGGGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAGAGCTAGG 960

 40794973 ATTGGACTGGAGATGTCTTTACTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAG 40795032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTGGACTGGAGATGTCTTTACTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAG 1020

 40795033 GCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAA 40795092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAA 1080

 40795093 TTCTTGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCT 40795152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCTTGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCT 1140

 40795153 AATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAA 40795212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAA 1200

 40795213 CTCCTGGCCTCAAGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTG 40795272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCCTGGCCTCAAGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTG 1260

 40795273 AGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTG 40795332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTG 1320

 40795333 AGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAG 40795392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAG 1380

 40795393 GCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCT 40795452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCT 1440

 40795453 GGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTT 40795512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTT 1500

 40795513 TGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAAT 40795572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAAT 1560

 40795573 GAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTC 40795632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTC 1620

 40795633 TCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCAC 40795692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCAC 1680

 40795693 ATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAA 40795752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAA 1740

 40795753 CCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTC 40795812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTC 1800

 40795813 TGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAA 40795872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAA 1860

 40795873 TGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGC 40795932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGC 1920

 40795933 AGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGT 40795992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGT 1980

 40795993 CTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCT 40796052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCT 2040

 40796053 TTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATT 40796112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATT 2100

 40796113 CCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTC 40796172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTC 2160

 40796173 TGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGT 40796232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGT 2220

 40796233 AAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTC 40796292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTC 2280

 40796293 GTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAG 40796352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAG 2340

 40796353 GAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGC 40796412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGC 2400

 40796413 CGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAAC 40796472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAAC 2460

 40796473 CCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGCCGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCA 40796532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGCCGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCA 2520

 40796533 GCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGA 40796592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGA 2580

 40796593 GCTGAGATTGCACCACTGCA 40796612
          ||||||||||||||||||||
     2581 GCTGAGATTGCACCACTGCA 2600

Alignment time is 1.70153 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2238] =>      2238 nucs 'mol-32-3164-201708_2238'

Score:        2238
Aligned:      2238        nucs
Identic:      2238 (100%) nucs =>       745 (100%)      1493 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40794250,40794994] EXCISED REGION [40794996,40796488]
 second seq =>  [       1,     745] EXCISED REGION [     746,    2238]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [40794995,40794995]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [40794995,40795004] to [40794996,40795005]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40794250 CGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGTCATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACTTTTTC 40794309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGTCATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACTTTTTC 60

 40794310 CCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTTAGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGTCCCCA 40794369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTTAGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGTCCCCA 120

 40794370 TTTGCTGATGAATGAATGAGTGGGAGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGACTCCTG 40794429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGCTGATGAATGAATGAGTGGGAGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGACTCCTG 180

 40794430 AGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAGGCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCTGCTAC 40794489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAGGCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCTGCTAC 240

 40794490 AAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCACACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAACCAAA 40794549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCACACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAACCAAA 300

 40794550 CCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTGATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGGACATG 40794609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTGATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGGACATG 360

 40794610 TTATGTGGAACCATACACAGTTGTCATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAATATCGGCAAT 40794669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATGTGGAACCATACACAGTTGTCATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAATATCGGCAAT 420

 40794670 TTAATATGGTTCAACATAGTTTTTAGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATTAACAA 40794729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAATATGGTTCAACATAGTTTTTAGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATTAACAA 480

 40794730 TAACTTTCTAAAAATTTTTAGGACTACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTATATGT 40794789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAACTTTCTAAAAATTTTTAGGACTACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTATATGT 540

 40794790 GTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTTATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACCACAGT 40794849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTTATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACCACAGT 600

 40794850 AAGGCATAGGTATTATTATTCCATTCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGAAGTAA 40794909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGGCATAGGTATTATTATTCCATTCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGAAGTAA 660

 40794910 ACTTGCCCACGGTTATAACAAGTGGGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAGAGCT 40794969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTTGCCCACGGTTATAACAAGTGGGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAGAGCT 720

 40794970 AGGATTGGACTGGAGATGTCTTTAC 40794994
          |||||||||||||||||||||||||
      721 AGGATTGGACTGGAGATGTCTTTAC 745

EXCISED REGION

 40794996 TTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCT 40795055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      746 TTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCT 805

 40795056 TGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCAAG 40795115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      806 TGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCAAG 865

 40795116 TAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGA 40795175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      866 TAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGA 925

 40795176 GACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCGCC 40795235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      926 GACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCGCC 985

 40795236 CACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATG 40795295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      986 CACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATG 1045

 40795296 TCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGA 40795355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1046 TCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGA 1105

 40795356 CACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTA 40795415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1106 CACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTA 1165

 40795416 ATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTC 40795475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1166 ATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTC 1225

 40795476 ACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATC 40795535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1226 ACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATC 1285

 40795536 AGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATG 40795595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1286 AGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATG 1345

 40795596 ATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAAT 40795655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1346 ATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAAT 1405

 40795656 CATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGA 40795715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1406 CATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGA 1465

 40795716 CATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGG 40795775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1466 CATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGG 1525

 40795776 AAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCT 40795835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1526 AAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCT 1585

 40795836 CCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCT 40795895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1586 CCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCT 1645

 40795896 AAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCT 40795955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1646 AAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCT 1705

 40795956 GCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTC 40796015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 GCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTC 1765

 40796016 TCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAAT 40796075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 TCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAAT 1825

 40796076 TCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAAT 40796135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 TCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAAT 1885

 40796136 AGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAAT 40796195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 AGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAAT 1945

 40796196 GGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAA 40796255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 GGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAA 2005

 40796256 TGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTA 40796315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 TGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTA 2065

 40796316 GAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGC 40796375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 GAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGC 2125

 40796376 GGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGT 40796435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 GGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGT 2185

 40796436 CAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAA 40796488
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 CAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAA 2238

Alignment time is 1.71472 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2417] =>      2417 nucs 'mol-32-317a-142141_2417'

Score:        2417
Aligned:      2417        nucs
Identic:      2417 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40794161,40796577]
 second seq =>  [       1,    2417]

 40794161 GGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACC 40794220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACC 60

 40794221 TCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGTCATCTGA 40794280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGTCATCTGA 120

 40794281 TTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACTTTTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTTAGAAGCT 40794340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACTTTTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTTAGAAGCT 180

 40794341 GCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGTCCCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGGAGGACAG 40794400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGTCCCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGGAGGACAG 240

 40794401 CCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGACTCCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAGGCCTCCA 40794460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGACTCCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAGGCCTCCA 300

 40794461 CAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCTGCTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCACACTTTT 40794520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCTGCTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCACACTTTT 360

 40794521 ACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAACCAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTGATGAGGA 40794580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAACCAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTGATGAGGA 420

 40794581 GTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGGACATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGTCATTTTT 40794640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGGACATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGTCATTTTT 480

 40794641 CTAGGCTGTAATGGATGAATATCGGCAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTTAGTATAC 40794700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTAGGCTGTAATGGATGAATATCGGCAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTTAGTATAC 540

 40794701 CTCAATGAGGAGGGTCCATATATTAACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGACTACTAAT 40794760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCAATGAGGAGGGTCCATATATTAACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGACTACTAAT 600

 40794761 TGCCTGATACTTATTGAGTACTTATATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTTATTTGCA 40794820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCCTGATACTTATTGAGTACTTATATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTTATTTGCA 660

 40794821 TCAGCTCACGTAATCCTCATAACCACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCATTCTATCG 40794880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAGCTCACGTAATCCTCATAACCACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCATTCTATCG 720

 40794881 AAAAGAAAACTGATACAGACGTGAAGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTGGGCACAG 40794940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAAGAAAACTGATACAGACGTGAAGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTGGGCACAG 780

 40794941 GCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAGAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTACTTTTTT 40795000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAGAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTACTTTTTT 840

 40795001 TTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCTTGGCT 40795060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCTTGGCT 900

 40795061 CACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCT 40795120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCT 960

 40795121 GCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAG 40795180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAG 1020

 40795181 GGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCGCCCACCT 40795240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCGCCCACCT 1080

 40795241 CAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTT 40795300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTT 1140

 40795301 ACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGT 40795360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGT 1200

 40795361 GGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGA 40795420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGA 1260

 40795421 GCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGG 40795480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGG 1320

 40795481 GTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCT 40795540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCT 1380

 40795541 CTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGAC 40795600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGAC 1440

 40795601 ATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCC 40795660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCC 1500

 40795661 AGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTA 40795720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTA 1560

 40795721 AAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCA 40795780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCA 1620

 40795781 GGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCAT 40795840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCAT 1680

 40795841 TTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACT 40795900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACT 1740

 40795901 TGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCA 40795960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCA 1800

 40795961 CAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACA 40796020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACA 1860

 40796021 GCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTC 40796080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTC 1920

 40796081 CCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTT 40796140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTT 1980

 40796141 CTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAA 40796200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAA 2040

 40796201 AAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAA 40796260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAA 2100

 40796261 CTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTG 40796320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTG 2160

 40796321 AGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGG 40796380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGG 2220

 40796381 CTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGA 40796440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGA 2280

 40796441 GTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCA 40796500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCA 2340

 40796501 GCCGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAAT 40796560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCCGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAAT 2400

 40796561 CTCTTGAACCCAGGAGG 40796577
          |||||||||||||||||
     2401 CTCTTGAACCCAGGAGG 2417

Alignment time is 2.19513 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3500] =>      3500 nucs 'mol-32-3185-116625_3500'

Score:        3444
Aligned:      3508        nucs
Identic:      3494 (100%) nucs =>      1745 ( 99%)      1749 (100%)
Gaps:           13 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40792470,40794223] EXCISED REGION [40795243,40796991]
 second seq =>  [       1,    1751] EXCISED REGION [    1752,    3500]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1019 nucs [40794224,40795242]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        38 nucs [40794224,40794261] to [40795243,40795280]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [40794223,40794223] to [40795243,40795243]
 second seq =>         1 nucs [1751,1751] to [1752,1752]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40792470 GCCTGTGATCCCAGCTACCTG---GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAG 40792526
          ||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTGTGATCCCAGCTAC---TCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAG 57

 40792527 GTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAG 40792586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
       58 GTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGGCTGGGCGACAGAGTGAG 117

 40792587 ACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA--GAAGTATTTTTGCTTATGTTGCTT 40792644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
      118 ACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTATTTTTGCTTATGTTGCTT 177

 40792645 ACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGTAGCAACT 40792704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      178 ACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGTAGCAACT 237

 40792705 ATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTGAATGGGG 40792764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      238 ATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTGAATGGGG 297

 40792765 GGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTTTTCTGCC 40792824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 GGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTTTTCTGCC 357

 40792825 CCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTGCTTTTTA 40792884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 CCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTGCTTTTTA 417

 40792885 AACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTACATTTAA 40792944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 AACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTACATTTAA 477

 40792945 TTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTTTTCAACT 40793004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 TTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTTTTCAACT 537

 40793005 TTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGCTAACTCT 40793064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 TTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGCTAACTCT 597

 40793065 CTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGCGACCAG 40793124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 CTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGCGACCAG 657

 40793125 AGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTTATAGCCA 40793184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 AGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTTATAGCCA 717

 40793185 GTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATACATTTATATGTGTGTG 40793244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 GTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATACATTTATATGTGTGTG 777

 40793245 TAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGGC 40793304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 TAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGGC 837

 40793305 TCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCTCAGGA 40793364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 TCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCTCAGGA 897

 40793365 ATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATATGATAA 40793424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 ATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATATGATAA 957

 40793425 AATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAACATACCTT 40793484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 AATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAACATACCTT 1017

 40793485 TCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGACAGCCAG 40793544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 TCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGACAGCCAG 1077

 40793545 AGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAGAATCCAC 40793604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 AGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAGAATCCAC 1137

 40793605 CACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCT 40793664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 CACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCT 1197

 40793665 CCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTT 40793724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 CCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTT 1257

 40793725 CAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAG 40793784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 CAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAG 1317

 40793785 GTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCTA 40793844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 GTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCTA 1377

 40793845 AAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTTG 40793904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 AAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTTG 1437

 40793905 ACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCCA 40793964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCCA 1497

 40793965 ATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAAT 40794024
          |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 ATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTT-----GAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAAT 1552

 40794025 GCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTG 40794084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 GCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTG 1612

 40794085 CCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTG 40794144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 CCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTG 1672

 40794145 TATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTC 40794204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 TATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTC 1732

 40794205 AGGTGATCCACCCACCTCG 40794223
          |||||||||||||||||||
     1733 AGGTGATCCACCCACCTCG 1751

EXCISED REGION

 40795243 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 40795302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 1811

 40795303 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 40795362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 1871

 40795363 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 40795422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 1931

 40795423 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 40795482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 1991

 40795483 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 40795542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 2051

 40795543 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 40795602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 2111

 40795603 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 40795662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 2171

 40795663 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 40795722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 2231

 40795723 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 40795782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 2291

 40795783 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 40795842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 2351

 40795843 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 40795902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 2411

 40795903 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 40795962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 2471

 40795963 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 40796022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 2531

 40796023 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 40796082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 2591

 40796083 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 40796142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 2651

 40796143 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 40796202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 2711

 40796203 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 40796262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 2771

 40796263 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 40796322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 2831

 40796323 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 40796382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 2891

 40796383 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 40796442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 2951

 40796443 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 40796502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 3011

 40796503 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 40796562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 3071

 40796563 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 40796622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 3131

 40796623 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 40796682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 3191

 40796683 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 40796742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 3251

 40796743 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 40796802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 3311

 40796803 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 40796862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 3371

 40796863 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 40796922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 3431

 40796923 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 40796982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 3491

 40796983 GCTCTGCTC 40796991
          |||||||||
     3492 GCTCTGCTC 3500

Alignment time is 2.62286 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3187] =>      3187 nucs 'mol-32-3190-259003_3187'

Score:        3143
Aligned:      3187        nucs
Identic:      3183 (100%) nucs =>        15 (100%)      3168 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40794209,40794223] EXCISED REGION [40795243,40798414]
 second seq =>  [       1,      15] EXCISED REGION [      16,    3187]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1019 nucs [40794224,40795242]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        38 nucs [40794224,40794261] to [40795243,40795280]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [40794223,40794223] to [40795243,40795243]
 second seq =>         1 nucs [15,15] to [16,16]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40794209 GATCCACCCACCTCG 40794223
          |||||||||||||||
        1 GATCCACCCACCTCG 15

EXCISED REGION

 40795243 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 40795302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       16 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 75

 40795303 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 40795362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       76 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 135

 40795363 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 40795422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      136 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 195

 40795423 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 40795482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      196 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 255

 40795483 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 40795542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      256 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 315

 40795543 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 40795602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      316 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 375

 40795603 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 40795662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      376 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 435

 40795663 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 40795722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      436 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 495

 40795723 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 40795782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      496 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 555

 40795783 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 40795842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      556 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 615

 40795843 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 40795902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 675

 40795903 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 40795962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 735

 40795963 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 40796022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      736 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 795

 40796023 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 40796082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 855

 40796083 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 40796142
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 GATCTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 915

 40796143 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 40796202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 975

 40796203 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 40796262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 1035

 40796263 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 40796322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 1095

 40796323 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 40796382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 1155

 40796383 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 40796442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 1215

 40796443 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 40796502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 1275

 40796503 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 40796562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 1335

 40796563 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 40796622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 1395

 40796623 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 40796682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 1455

 40796683 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 40796742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 1515

 40796743 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 40796802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 1575

 40796803 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 40796862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 1635

 40796863 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 40796922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 1695

 40796923 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 40796982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 1755

 40796983 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 40797042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 1815

 40797043 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 40797102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 1875

 40797103 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 40797162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 1935

 40797163 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTA 40797222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTA 1995

 40797223 TTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGA 40797282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1996 TTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTTTTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGA 2055

 40797283 GTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTC 40797342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 GTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTC 2115

 40797343 CGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGC 40797402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 CGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGC 2175

 40797403 CACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGC 40797462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2176 CACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGC 2235

 40797463 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGAGAT 40797522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGAGAT 2295

 40797523 TACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTTCTCCTGGTC 40797582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 TACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTTCTCCTGGTC 2355

 40797583 CTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAG 40797642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 CTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAG 2415

 40797643 CATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGCCAGGCACCA 40797702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 CATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGCCAGGCACCA 2475

 40797703 GCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCTGCCCAGGAA 40797762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 GCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCTGCCCAGGAA 2535

 40797763 GAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCTTAGCCCCAT 40797822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 GAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCTTAGCCCCAT 2595

 40797823 GTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGGACACAACTG 40797882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 GTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGGACACAACTG 2655

 40797883 CATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGAACAAGGAAA 40797942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 CATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGAACAAGGAAA 2715

 40797943 ATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTAACCAGAGGC 40798002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 ATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTAACCAGAGGC 2775

 40798003 GGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTTTAGCAGGCA 40798062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 GGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTTTAGCAGGCA 2835

 40798063 ACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGCAACTGACTT 40798122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 ACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGCAACTGACTT 2895

 40798123 CAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATG 40798182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 CAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATG 2955

 40798183 AGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTTTGTGTGTCATCTTGC 40798242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2956 AGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTGTGTGTGTCATCTTGC 3015

 40798243 TGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGTGATGGCTGA 40798302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 TGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGTGATGGCTGA 3075

 40798303 GCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTGATACTCTCA 40798362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 GCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTGATACTCTCA 3135

 40798363 TAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCACC 40798414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 TAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCACC 3187

Alignment time is 2.36554 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    7358] =>      7358 nucs 'mol-32-322a-183722_7358'

Score:        7237
Aligned:      7362        nucs
Identic:      7349 (100%) nucs =>      1644 (100%)      5705 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40792575,40794223] EXCISED REGION [40795243,40800954]
 second seq =>  [       1,    1645] EXCISED REGION [    1646,    7358]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1019 nucs [40794224,40795242]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        38 nucs [40794224,40794261] to [40795243,40795280]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [40794223,40794223] to [40795243,40795243]
 second seq =>         1 nucs [1645,1645] to [1646,1646]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40792575 CGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTATTTTTGCT 40792634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||.|||||||||
        1 CGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA--GAAGAATTTTTGCT 58

 40792635 TATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGT 40792694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       59 TATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGT 118

 40792695 AGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGA 40792754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      119 AGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGA 178

 40792755 GTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAAC 40792814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 GTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAAC 238

 40792815 CTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCT 40792874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 CTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCT 298

 40792875 GTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTAT 40792934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 GTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTAT 358

 40792935 GTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTG 40792994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 GTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTG 418

 40792995 TTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGT 40793054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 TTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGT 478

 40793055 GGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCA 40793114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 GGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCA 538

 40793115 TAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGC 40793174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 TAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGC 598

 40793175 TTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATACATTTA 40793234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATACATTTA 658

 40793235 TATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGG 40793294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 TATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGG 718

 40793295 GTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTT 40793354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 GTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTT 778

 40793355 AAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAA 40793414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 AAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAA 838

 40793415 AATATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTC 40793474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 AATATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTC 898

 40793475 AACATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCA 40793534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 AACATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCA 958

 40793535 AGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCC 40793594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 AGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCC 1018

 40793595 CAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAG 40793654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 CAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAG 1078

 40793655 GCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTT 40793714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 GCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTT 1138

 40793715 GCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCC 40793774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 GCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCC 1198

 40793775 TTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAAC 40793834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAAC 1258

 40793835 CCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCT 40793894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCT 1318

 40793895 CCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGT 40793954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 CCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGT 1378

 40793955 TTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACC 40794014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||
     1379 TTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT--GAGATGGAGTCTCTGTCACC 1436

 40794015 AGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGT 40794074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 AGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGT 1496

 40794075 GATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAG 40794134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 GATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAG 1556

 40794135 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATC 40794194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATC 1616

 40794195 TCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCG 40794223
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1617 TCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCG 1645

EXCISED REGION

 40795243 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 40795302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1646 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 1705

 40795303 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 40795362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 1765

 40795363 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 40795422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 1825

 40795423 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 40795482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 1885

 40795483 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 40795542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 1945

 40795543 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 40795602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 2005

 40795603 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 40795662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 2065

 40795663 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 40795722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 2125

 40795723 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 40795782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 2185

 40795783 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 40795842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 2245

 40795843 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 40795902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 2305

 40795903 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 40795962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 2365

 40795963 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 40796022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 2425

 40796023 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 40796082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 2485

 40796083 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 40796142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 2545

 40796143 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 40796202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 2605

 40796203 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 40796262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 2665

 40796263 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 40796322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 2725

 40796323 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 40796382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 2785

 40796383 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 40796442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 2845

 40796443 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 40796502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 2905

 40796503 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 40796562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 2965

 40796563 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 40796622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 3025

 40796623 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 40796682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 3085

 40796683 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 40796742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 3145

 40796743 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 40796802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 3205

 40796803 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 40796862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 3265

 40796863 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 40796922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 3325

 40796923 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 40796982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 3385

 40796983 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 40797042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 3445

 40797043 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 40797102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 3505

 40797103 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 40797162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 3565

 40797163 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTA 40797222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTA 3625

 40797223 TTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGA 40797282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3626 TTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTTTTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGA 3685

 40797283 GTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTC 40797342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 GTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTC 3745

 40797343 CGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGC 40797402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 CGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGC 3805

 40797403 CACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGAT-GGGTTTCTCCATGTTGGCCAGG 40797461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||.||||||||||||||
     3806 CACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGG 3865

 40797462 CTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGAGA 40797521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 CTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGAGA 3925

 40797522 TTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTTCTCCTGGT 40797581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 TTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTTCTCCTGGT 3985

 40797582 CCTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGA 40797641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 CCTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGA 4045

 40797642 GCATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGCCAGGCACC 40797701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 GCATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGCCAGGCACC 4105

 40797702 AGCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCTGCCCAGGA 40797761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 AGCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCTGCCCAGGA 4165

 40797762 AGAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCTTAGCCCCA 40797821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 AGAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCTTAGCCCCA 4225

 40797822 TGTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGGACACAACT 40797881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 TGTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGGACACAACT 4285

 40797882 GCATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGAACAAGGAA 40797941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 GCATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGAACAAGGAA 4345

 40797942 AATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTAACCAGAGG 40798001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 AATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTAACCAGAGG 4405

 40798002 CGGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTTTAGCAGGC 40798061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 CGGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTTTAGCAGGC 4465

 40798062 AACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGCAACTGACT 40798121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 AACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGCAACTGACT 4525

 40798122 TCAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGAT 40798181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 TCAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGAT 4585

 40798182 GAGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTTTGTGTGTCATCTTG 40798241
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     4586 GAGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTGTGTGTGTCATCTTG 4645

 40798242 CTGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGTGATGGCTG 40798301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 CTGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGTGATGGCTG 4705

 40798302 AGCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTGATACTCTC 40798361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 AGCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTGATACTCTC 4765

 40798362 ATAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCACCTGACAGT 40798421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 ATAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCACCTGACAGT 4825

 40798422 AAAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAAAAATTCAGGCTGGACGTGGTGGCTCAC 40798481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 AAAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAAAAATTCAGGCTGGACGTGGTGGCTCAC 4885

 40798482 GCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTC 40798541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 GCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTC 4945

 40798542 AAGACCAACCTAGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTTGCCAG 40798601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 AAGACCAACCTAGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTTGCCAG 5005

 40798602 GTGTGATGGTGTGCGACTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTT 40798661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 GTGTGATGGTGTGCGACTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTT 5065

 40798662 GAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCGCCACTGCACTCCAGCCTAGGC 40798721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 GAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCGCCACTGCACTCCAGCCTAGGC 5125

 40798722 AACAAGAGCAAACCTCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAGCATATTTTCAATGGCTGTATAATA 40798781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 AACAAGAGCAAACCTCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAGCATATTTTCAATGGCTGTATAATA 5185

 40798782 TCCTTTTATAGTGAATATACAGTATTTGGATAACTACTTTTCTATAACTGAGTCTCTAGT 40798841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 TCCTTTTATAGTGAATATACAGTATTTGGATAACTACTTTTCTATAACTGAGTCTCTAGT 5245

 40798842 CCATTTCTGTTGTTTTCTACTATAAATGGACCTTTTGGTCCTGAGTGGGCTATTGGGAAG 40798901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 CCATTTCTGTTGTTTTCTACTATAAATGGACCTTTTGGTCCTGAGTGGGCTATTGGGAAG 5305

 40798902 TCCATCTGCCAGGCCAGAACTGTGGCTAGGACATTTTAATTGACTGCAACTAATCACCTT 40798961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 TCCATCTGCCAGGCCAGAACTGTGGCTAGGACATTTTAATTGACTGCAACTAATCACCTT 5365

 40798962 CAGGTCACTCACGTTTCCAATTCTGACAAAAGTTTTCCTTGTTCTTCTGATTCGTAGGCA 40799021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 CAGGTCACTCACGTTTCCAATTCTGACAAAAGTTTTCCTTGTTCTTCTGATTCGTAGGCA 5425

 40799022 GGTATTTGCAGGTTAAAGGTTTGGGTTGAGAAGGACACAGGGAACTTGCTGGTATGATGG 40799081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 GGTATTTGCAGGTTAAAGGTTTGGGTTGAGAAGGACACAGGGAACTTGCTGGTATGATGG 5485

 40799082 AAGTATCTGTGTTTGGCTGGGTCAGTGGAGTCAGAGTGTTCACTGTTACACCTTGGAACT 40799141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 AAGTATCTGTGTTTGGCTGGGTCAGTGGAGTCAGAGTGTTCACTGTTACACCTTGGAACT 5545

 40799142 GAGACTGCTTGATGCGGACAATGTTCAGACATTTGTTTATGCACCAAAATGTACACCTAA 40799201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 GAGACTGCTTGATGCGGACAATGTTCAGACATTTGTTTATGCACCAAAATGTACACCTAA 5605

 40799202 CATTTGTGCATTTTACTGTAGGTAAAGTCATTAAAGTTGGTGTCTTTGAAAGCTGGGCTG 40799261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 CATTTGTGCATTTTACTGTAGGTAAAGTCATTAAAGTTGGTGTCTTTGAAAGCTGGGCTG 5665

 40799262 AGGGATTGGCTTTTGGGTGAATAAGGACGAGGCTGTCTGTGGAGCTCACCCAGGGGTTGC 40799321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 AGGGATTGGCTTTTGGGTGAATAAGGACGAGGCTGTCTGTGGAGCTCACCCAGGGGTTGC 5725

 40799322 TGGGCTGCCACAGGAGAGCTTGACCTCATTCATTCAACAGATATCTCATGGACCCAACTG 40799381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 TGGGCTGCCACAGGAGAGCTTGACCTCATTCATTCAACAGATATCTCATGGACCCAACTG 5785

 40799382 TGGGTGGTGCAGTCTCCACAGCTGCATCCCTGCAGGCCCCCGAACAAAACTGAAGGTGGT 40799441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 TGGGTGGTGCAGTCTCCACAGCTGCATCCCTGCAGGCCCCCGAACAAAACTGAAGGTGGT 5845

 40799442 CTCAGCTGCATGGAGTTCTCATTTTAGTGAGGGAGACAGGCAGTAAACAAGCATGTAATA 40799501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 CTCAGCTGCATGGAGTTCTCATTTTAGTGAGGGAGACAGGCAGTAAACAAGCATGTAATA 5905

 40799502 TTCTGGAGCAAGAAGGGCTGGAAAAATACTTCCAGGGATAGAGAAGAGGGGCAGTAAATC 40799561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 TTCTGGAGCAAGAAGGGCTGGAAAAATACTTCCAGGGATAGAGAAGAGGGGCAGTAAATC 5965

 40799562 ATATATAAAAAGGTCCTGAAGTGGCCCTTTCAGACCATGTCATTGGAGTGGAGAGAGCAA 40799621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5966 ATATATAAAAAGGTCCTGAAGTGGCCCTTTCAGACCATGTCATTGGAGTGGAGAGAGCAA 6025

 40799622 GAGGAAAATGGCAGGGGGTGAGGACAGAGTGGGCACGGCCCAGAGGAAGCAGCTGAGGGA 40799681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6026 GAGGAAAATGGCAGGGGGTGAGGACAGAGTGGGCACGGCCCAGAGGAAGCAGCTGAGGGA 6085

 40799682 GCGCTGGAAAGCCCTTGGCTTTAAGTCTCAGCTCTGAGCAGAGTGACATGATCTGACTTG 40799741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6086 GCGCTGGAAAGCCCTTGGCTTTAAGTCTCAGCTCTGAGCAGAGTGACATGATCTGACTTG 6145

 40799742 CATTTTGGAAGGGTCACTGTGGCTGCTGAGGGGAACAGCCTTTGGGAGGTGAGGGTAGCA 40799801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6146 CATTTTGGAAGGGTCACTGTGGCTGCTGAGGGGAACAGCCTTTGGGAGGTGAGGGTAGCA 6205

 40799802 ACAGGGAGGTCAGCAGGAGGGCCACTGCAGTGATCTGGATGAAGGACCATGGCTTGGACA 40799861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 ACAGGGAGGTCAGCAGGAGGGCCACTGCAGTGATCTGGATGAAGGACCATGGCTTGGACA 6265

 40799862 AGGGCCATGGTCAGGGGTGGTGAGACGTAAAGGAATCCTGTGGGTTTGCTGATGGACTGA 40799921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 AGGGCCATGGTCAGGGGTGGTGAGACGTAAAGGAATCCTGTGGGTTTGCTGATGGACTGA 6325

 40799922 GTGTGGGGTCTGGGCGAGGGAGGAGCCAGAGGTGACTCCGAGGTTTAGGCTGAGCATCGG 40799981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6326 GTGTGGGGTCTGGGCGAGGGAGGAGCCAGAGGCGACTCCGAGGTTTAGGCTGAGCATCGG 6385

 40799982 GAGAATGGAGGTGTCATTTCTGGATCCGGGTAGTACTATGGTAGGAGTGGCTTTGAGGAG 40800041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 GAGAATGGAGGTGTCATTTCTGGATCCGGGTAGTACTATGGTAGGAGTGGCTTTGAGGAG 6445

 40800042 AAGGTGAAGAGCTTTGCTCCTCATGGGGTACATGTTAGAGGCTCACCTGGAGCTGTCAGA 40800101
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6446 AAGGTGAAGAGCTTTGCTCCTCATGGGGTGCATGTTAGAGGCTCACCTGGAGCTGTCAGA 6505

 40800102 AAGCCATTAGCTATGGGAATCTGGATATGGTGGGAGAGAGCTGGCCTAGAGCCATGAAGC 40800161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6506 AAGCCATTAGCTATGGGAATCTGGATATGGTGGGAGAGAGCTGGCCTAGAGCCATGAAGC 6565

 40800162 TCAGACCCTCCTGAAGACGGAGGCTTGGCTGCTTGGAGAACACGTAGTAGAGAATGCTTT 40800221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6566 TCAGACCCTCCTGAAGACGGAGGCTTGGCTGCTTGGAGAACACGTAGTAGAGAATGCTTT 6625

 40800222 TTCTTTCCTCCTTGGCTCTCTCTTGGCAGAAGGTGATGAGCCTGGCTCCAGTCTGCTGGC 40800281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6626 TTCTTTCCTCCTTGGCTCTCTCTTGGCAGAAGGTGATGAGCCTGGCTCCAGTCTGCTGGC 6685

 40800282 GAACTCCCCTCTGATGGAGGATGCTCCACAGAGGCTGCGGTGGCAGGCCCACCTGGAGTT 40800341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6686 GAACTCCCCTCTGATGGAGGATGCTCCACAGAGGCTGCGGTGGCAGGCCCACCTGGAGTT 6745

 40800342 CACCCATAACCACGATGTGGGGGATCTCACCTGGGACAAGATTGCCGTCTCCCTACCCCG 40800401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6746 CACCCATAACCACGATGTGGGGGATCTCACCTGGGACAAGATTGCCGTCTCCCTACCCCG 6805

 40800402 CTCTGAGAAGCTCCGCTCCCTGGTGCTGGCCGGCATCCCACATGGCATGAGGCCACAGGT 40800461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6806 CTCTGAGAAGCTCCGCTCCCTGGTGCTGGCCGGCATCCCACATGGCATGAGGCCACAGGT 6865

 40800462 AAGGTGGCCACAGGGACCCACAGGGTGTTGAGAGGGTCCTGGCCCCATGATCAGGTGTCA 40800521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6866 AAGGTGGCCACAGGGACCCACAGGGTGTTGAGAGGGTCCTGGCCCCATGATCAGGTATCA 6925

 40800522 CGAGAAAGACTGAGTGCCCTTGCGGCTCCCTTCCCTCAGCTGTGGATGCGGCTCTCTGGG 40800581
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6926 CGAGAAAGACTGAGTGCCCTTGTGGCTCCCTTCCCTCAGCTGTGGATGCGGCTCTCTGGG 6985

 40800582 GCCCTGCAGAAGAAGAGGAACTCTGAGCTGTCCTACCGCGAGATTGTGAAGAACAGCTCC 40800641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6986 GCCCTGCAGAAGAAGAGGAACTCTGAGCTGTCCTACCGCGAGATTGTGAAGAACAGCTCC 7045

 40800642 AACGATGAGACCATCGCTGCCAAGCAGGTGAGGCCGGTGGCACTGTGCAGGAAGAGCTGG 40800701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7046 AACGATGAGACCATCGCTGCCAAGCAGGTGAGGCCGGTGGCACTGTGCAGGAAGAGCTGG 7105

 40800702 AGGCTGTGTGGGCTCGCAGGAGAGAGGGAGCCTGCCTGGGGTTCTTAGAGTGTGCCCTTG 40800761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7106 AGGCTGTGTGGGCTCGCAGGAGAGAGGGAGCCTGCCTGGGGTTCTTAGAGTGTGCCCTTG 7165

 40800762 TTGTGGGGTAGGGGAGGATATTTGCTCCTTCCTTGGTCCTCTGCAGGCCAAAGAAAGAAT 40800821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7166 TTGTGGGGTAGGGGAGGATATTTGCTCCTTCCTTGGTCCTCTGCAGGCCAAAGAAAGAAT 7225

 40800822 TGTCCAAAAGGCCATCAGTGCTGTGGAAGGGCTTGGAGATGGGGTTCCCAAGCCCGGGTC 40800881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7226 TGTCCAAAAGGCCATCAGTGCTGTGGAAGGGCTTGGAGATGGGGTTCCCAAGCCCGGGTC 7285

 40800882 CACTTCAGGAACAGATGGGGACTCTAAATATAGACTCCAGGCCTCGGGCCACACGTTTTC 40800941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7286 CACTTCAGGAACAGATGGGGACTCTAAATATAGACTCCAGGCCTCGGGCCACACGTTTTC 7345

 40800942 AGGTGGTCTGGCA 40800954
          |||||||||||||
     7346 AGGTGGTCTGGCA 7358

Alignment time is 5.45305 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,   10508] =>     10508 nucs 'mol-32-32f0-203788_10508'

Score:       10508
Aligned:     10508        nucs
Identic:     10508 (100%) nucs =>      1329 (100%)      9179 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40792644,40793972] EXCISED REGION [40793974,40803152]
 second seq =>  [       1,    1329] EXCISED REGION [    1330,   10508]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [40793973,40793973]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        21 nucs [40793973,40793993] to [40793974,40793994]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40792644 TACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGTAGCAAC 40792703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGTAGCAAC 60

 40792704 TATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTGAATGGG 40792763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTGAATGGG 120

 40792764 GGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTTTTCTGC 40792823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTTTTCTGC 180

 40792824 CCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTGCTTTTT 40792883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTGCTTTTT 240

 40792884 AAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTACATTTA 40792943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTACATTTA 300

 40792944 ATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTTTTCAAC 40793003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTTTTCAAC 360

 40793004 TTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGCTAACTC 40793063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGCTAACTC 420

 40793064 TCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGCGACCA 40793123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGCGACCA 480

 40793124 GAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTTATAGCC 40793183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTTATAGCC 540

 40793184 AGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATACATTTATATGTGTGT 40793243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATACATTTATATGTGTGT 600

 40793244 GTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGG 40793303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGG 660

 40793304 CTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCTCAGG 40793363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCTCAGG 720

 40793364 AATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATATGATA 40793423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATATGATA 780

 40793424 AAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAACATACCT 40793483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAACATACCT 840

 40793484 TTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGACAGCCA 40793543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGACAGCCA 900

 40793544 GAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAGAATCCA 40793603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAGAATCCA 960

 40793604 CCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCC 40793663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCC 1020

 40793664 TCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTT 40793723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTT 1080

 40793724 TCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCA 40793783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCA 1140

 40793784 GGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCT 40793843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCT 1200

 40793844 AAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTT 40793903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTT 1260

 40793904 GACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCC 40793963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCC 1320

 40793964 AATTCTGTC 40793972
          |||||||||
     1321 AATTCTGTC 1329

EXCISED REGION

 40793974 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCG 40794033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCG 1389

 40794034 CCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCT 40794093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 CCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCT 1449

 40794094 CCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAG 40794153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 CCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAG 1509

 40794154 TAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCC 40794213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 TAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCC 1569

 40794214 ACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGT 40794273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 ACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGT 1629

 40794274 CATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACTTTTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTT 40794333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 CATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACTTTTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTT 1689

 40794334 AGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGTCCCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGG 40794393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 AGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGTCCCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGG 1749

 40794394 AGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGACTCCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAG 40794453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 AGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGACTCCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAG 1809

 40794454 GCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCTGCTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCA 40794513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 GCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCTGCTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCA 1869

 40794514 CACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAACCAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTG 40794573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 CACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAACCAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTG 1929

 40794574 ATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGGACATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGT 40794633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 ATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGGACATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGT 1989

 40794634 CATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAATATCGGCAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTT 40794693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 CATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAATATCGGCAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTT 2049

 40794694 AGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATTAACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGAC 40794753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 AGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATTAACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGAC 2109

 40794754 TACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTATATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTT 40794813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 TACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTATATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTT 2169

 40794814 ATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACCACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCAT 40794873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 ATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACCACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCAT 2229

 40794874 TCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGAAGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTG 40794933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 TCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGAAGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTG 2289

 40794934 GGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAGAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTA 40794993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 GGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAGAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTA 2349

 40794994 CTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGAT 40795053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 CTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGAT 2409

 40795054 CTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCA 40795113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 CTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCA 2469

 40795114 AGTAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTA 40795173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 AGTAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTA 2529

 40795174 GAGACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCG 40795233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 GAGACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCG 2589

 40795234 CCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGA 40795293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 CCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGA 2649

 40795294 TGTCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCT 40795353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 TGTCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCT 2709

 40795354 GACACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCG 40795413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 GACACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCG 2769

 40795414 TAATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATT 40795473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 TAATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATT 2829

 40795474 TCACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTA 40795533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 TCACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTA 2889

 40795534 TCAGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAA 40795593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 TCAGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAA 2949

 40795594 TGATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTA 40795653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 TGATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTA 3009

 40795654 ATCATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAA 40795713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 ATCATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAA 3069

 40795714 GACATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGG 40795773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 GACATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGG 3129

 40795774 GGAAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCT 40795833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 GGAAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCT 3189

 40795834 CTCCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATC 40795893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 CTCCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATC 3249

 40795894 CTAAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAG 40795953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 CTAAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAG 3309

 40795954 CTGCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTT 40796013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 CTGCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTT 3369

 40796014 TCTCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTA 40796073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 TCTCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTA 3429

 40796074 ATTCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGA 40796133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 ATTCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGA 3489

 40796134 ATAGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAA 40796193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 ATAGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAA 3549

 40796194 ATGGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGG 40796253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 ATGGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGG 3609

 40796254 AATGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCG 40796313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 AATGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCG 3669

 40796314 TAGAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGC 40796373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 TAGAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGC 3729

 40796374 GCGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAG 40796433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 GCGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAG 3789

 40796434 GTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACA 40796493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 GTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACA 3849

 40796494 AAAATCAGCCGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCA 40796553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3850 AAAATCAGCCGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCA 3909

 40796554 GAAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCAC 40796613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3910 GAAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCAC 3969

 40796614 TCCAGCCTGAGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAAT 40796673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3970 TCCAGCCTGAGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAAT 4029

 40796674 GACTTTCCTCTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGA 40796733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4030 GACTTTCCTCTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGA 4089

 40796734 GCCTTCCAGCTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTT 40796793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 GCCTTCCAGCTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTT 4149

 40796794 GCCAGCCCACCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGA 40796853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4150 GCCAGCCCACCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGA 4209

 40796854 AGCTCTCACAGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCA 40796913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4210 AGCTCTCACAGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCA 4269

 40796914 GATAAGAGAGGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACT 40796973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 GATAAGAGAGGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACT 4329

 40796974 TCCTTCTCAGCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAG 40797033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 TCCTTCTCAGCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAG 4389

 40797034 TCCTCAGGTGGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCT 40797093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 TCCTCAGGTGGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCT 4449

 40797094 GTTTCTTTCCCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCT 40797153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4450 GTTTCTTTCCCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCT 4509

 40797154 CCTTCCCTACCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGG 40797213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4510 CCTTCCCTACCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGG 4569

 40797214 GAGAGGGTATTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTT 40797273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4570 GAGAGGGTATTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTT 4629

 40797274 TGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCAC 40797333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4630 TGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCAC 4689

 40797334 TGCAACCTCCGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACA 40797393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4690 TGCAACCTCCGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACA 4749

 40797394 GGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCTCCATGT 40797453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4750 GGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCTCCATGT 4809

 40797454 TGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAG 40797513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4810 TGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAG 4869

 40797514 TACTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTT 40797573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4870 TACTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTT 4929

 40797574 CTCCTGGTCCTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCT 40797633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4930 CTCCTGGTCCTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCT 4989

 40797634 GACTCCGAGCATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGC 40797693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4990 GACTCCGAGCATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGC 5049

 40797694 CAGGCACCAGCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCT 40797753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5050 CAGGCACCAGCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCT 5109

 40797754 GCCCAGGAAGAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCT 40797813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5110 GCCCAGGAAGAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCT 5169

 40797814 TAGCCCCATGTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGG 40797873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5170 TAGCCCCATGTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGG 5229

 40797874 ACACAACTGCATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGA 40797933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5230 ACACAACTGCATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGA 5289

 40797934 ACAAGGAAAATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTA 40797993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5290 ACAAGGAAAATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTA 5349

 40797994 ACCAGAGGCGGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTT 40798053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5350 ACCAGAGGCGGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTT 5409

 40798054 TAGCAGGCAACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGC 40798113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5410 TAGCAGGCAACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGC 5469

 40798114 AACTGACTTCAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCT 40798173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5470 AACTGACTTCAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCT 5529

 40798174 ACTACGATGAGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTTTGTGTG 40798233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5530 ACTACGATGAGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTTTGTGTG 5589

 40798234 TCATCTTGCTGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGT 40798293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5590 TCATCTTGCTGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGT 5649

 40798294 GATGGCTGAGCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTG 40798353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5650 GATGGCTGAGCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTG 5709

 40798354 ATACTCTCATAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCAC 40798413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5710 ATACTCTCATAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCAC 5769

 40798414 CTGACAGTAAAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAAAAATTCAGGCTGGACGTGG 40798473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5770 CTGACAGTAAAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAAAAATTCAGGCTGGACGTGG 5829

 40798474 TGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATCACTTGAGGCC 40798533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5830 TGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATCACTTGAGGCC 5889

 40798534 AAGAGTTCAAGACCAACCTAGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAA 40798593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5890 AAGAGTTCAAGACCAACCTAGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAA 5949

 40798594 TTTGCCAGGTGTGATGGTGTGCGACTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAG 40798653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5950 TTTGCCAGGTGTGATGGTGTGCGACTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAG 6009

 40798654 AATCTCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCGCCACTGCACTCCA 40798713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6010 AATCTCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCGCCACTGCACTCCA 6069

 40798714 GCCTAGGCAACAAGAGCAAACCTCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAGCATATTTTCAATGGCT 40798773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6070 GCCTAGGCAACAAGAGCAAACCTCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAGCATATTTTCAATGGCT 6129

 40798774 GTATAATATCCTTTTATAGTGAATATACAGTATTTGGATAACTACTTTTCTATAACTGAG 40798833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6130 GTATAATATCCTTTTATAGTGAATATACAGTATTTGGATAACTACTTTTCTATAACTGAG 6189

 40798834 TCTCTAGTCCATTTCTGTTGTTTTCTACTATAAATGGACCTTTTGGTCCTGAGTGGGCTA 40798893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6190 TCTCTAGTCCATTTCTGTTGTTTTCTACTATAAATGGACCTTTTGGTCCTGAGTGGGCTA 6249

 40798894 TTGGGAAGTCCATCTGCCAGGCCAGAACTGTGGCTAGGACATTTTAATTGACTGCAACTA 40798953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6250 TTGGGAAGTCCATCTGCCAGGCCAGAACTGTGGCTAGGACATTTTAATTGACTGCAACTA 6309

 40798954 ATCACCTTCAGGTCACTCACGTTTCCAATTCTGACAAAAGTTTTCCTTGTTCTTCTGATT 40799013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6310 ATCACCTTCAGGTCACTCACGTTTCCAATTCTGACAAAAGTTTTCCTTGTTCTTCTGATT 6369

 40799014 CGTAGGCAGGTATTTGCAGGTTAAAGGTTTGGGTTGAGAAGGACACAGGGAACTTGCTGG 40799073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6370 CGTAGGCAGGTATTTGCAGGTTAAAGGTTTGGGTTGAGAAGGACACAGGGAACTTGCTGG 6429

 40799074 TATGATGGAAGTATCTGTGTTTGGCTGGGTCAGTGGAGTCAGAGTGTTCACTGTTACACC 40799133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6430 TATGATGGAAGTATCTGTGTTTGGCTGGGTCAGTGGAGTCAGAGTGTTCACTGTTACACC 6489

 40799134 TTGGAACTGAGACTGCTTGATGCGGACAATGTTCAGACATTTGTTTATGCACCAAAATGT 40799193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6490 TTGGAACTGAGACTGCTTGATGCGGACAATGTTCAGACATTTGTTTATGCACCAAAATGT 6549

 40799194 ACACCTAACATTTGTGCATTTTACTGTAGGTAAAGTCATTAAAGTTGGTGTCTTTGAAAG 40799253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6550 ACACCTAACATTTGTGCATTTTACTGTAGGTAAAGTCATTAAAGTTGGTGTCTTTGAAAG 6609

 40799254 CTGGGCTGAGGGATTGGCTTTTGGGTGAATAAGGACGAGGCTGTCTGTGGAGCTCACCCA 40799313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6610 CTGGGCTGAGGGATTGGCTTTTGGGTGAATAAGGACGAGGCTGTCTGTGGAGCTCACCCA 6669

 40799314 GGGGTTGCTGGGCTGCCACAGGAGAGCTTGACCTCATTCATTCAACAGATATCTCATGGA 40799373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6670 GGGGTTGCTGGGCTGCCACAGGAGAGCTTGACCTCATTCATTCAACAGATATCTCATGGA 6729

 40799374 CCCAACTGTGGGTGGTGCAGTCTCCACAGCTGCATCCCTGCAGGCCCCCGAACAAAACTG 40799433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6730 CCCAACTGTGGGTGGTGCAGTCTCCACAGCTGCATCCCTGCAGGCCCCCGAACAAAACTG 6789

 40799434 AAGGTGGTCTCAGCTGCATGGAGTTCTCATTTTAGTGAGGGAGACAGGCAGTAAACAAGC 40799493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6790 AAGGTGGTCTCAGCTGCATGGAGTTCTCATTTTAGTGAGGGAGACAGGCAGTAAACAAGC 6849

 40799494 ATGTAATATTCTGGAGCAAGAAGGGCTGGAAAAATACTTCCAGGGATAGAGAAGAGGGGC 40799553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6850 ATGTAATATTCTGGAGCAAGAAGGGCTGGAAAAATACTTCCAGGGATAGAGAAGAGGGGC 6909

 40799554 AGTAAATCATATATAAAAAGGTCCTGAAGTGGCCCTTTCAGACCATGTCATTGGAGTGGA 40799613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6910 AGTAAATCATATATAAAAAGGTCCTGAAGTGGCCCTTTCAGACCATGTCATTGGAGTGGA 6969

 40799614 GAGAGCAAGAGGAAAATGGCAGGGGGTGAGGACAGAGTGGGCACGGCCCAGAGGAAGCAG 40799673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6970 GAGAGCAAGAGGAAAATGGCAGGGGGTGAGGACAGAGTGGGCACGGCCCAGAGGAAGCAG 7029

 40799674 CTGAGGGAGCGCTGGAAAGCCCTTGGCTTTAAGTCTCAGCTCTGAGCAGAGTGACATGAT 40799733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7030 CTGAGGGAGCGCTGGAAAGCCCTTGGCTTTAAGTCTCAGCTCTGAGCAGAGTGACATGAT 7089

 40799734 CTGACTTGCATTTTGGAAGGGTCACTGTGGCTGCTGAGGGGAACAGCCTTTGGGAGGTGA 40799793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7090 CTGACTTGCATTTTGGAAGGGTCACTGTGGCTGCTGAGGGGAACAGCCTTTGGGAGGTGA 7149

 40799794 GGGTAGCAACAGGGAGGTCAGCAGGAGGGCCACTGCAGTGATCTGGATGAAGGACCATGG 40799853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7150 GGGTAGCAACAGGGAGGTCAGCAGGAGGGCCACTGCAGTGATCTGGATGAAGGACCATGG 7209

 40799854 CTTGGACAAGGGCCATGGTCAGGGGTGGTGAGACGTAAAGGAATCCTGTGGGTTTGCTGA 40799913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7210 CTTGGACAAGGGCCATGGTCAGGGGTGGTGAGACGTAAAGGAATCCTGTGGGTTTGCTGA 7269

 40799914 TGGACTGAGTGTGGGGTCTGGGCGAGGGAGGAGCCAGAGGTGACTCCGAGGTTTAGGCTG 40799973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7270 TGGACTGAGTGTGGGGTCTGGGCGAGGGAGGAGCCAGAGGTGACTCCGAGGTTTAGGCTG 7329

 40799974 AGCATCGGGAGAATGGAGGTGTCATTTCTGGATCCGGGTAGTACTATGGTAGGAGTGGCT 40800033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7330 AGCATCGGGAGAATGGAGGTGTCATTTCTGGATCCGGGTAGTACTATGGTAGGAGTGGCT 7389

 40800034 TTGAGGAGAAGGTGAAGAGCTTTGCTCCTCATGGGGTACATGTTAGAGGCTCACCTGGAG 40800093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7390 TTGAGGAGAAGGTGAAGAGCTTTGCTCCTCATGGGGTACATGTTAGAGGCTCACCTGGAG 7449

 40800094 CTGTCAGAAAGCCATTAGCTATGGGAATCTGGATATGGTGGGAGAGAGCTGGCCTAGAGC 40800153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7450 CTGTCAGAAAGCCATTAGCTATGGGAATCTGGATATGGTGGGAGAGAGCTGGCCTAGAGC 7509

 40800154 CATGAAGCTCAGACCCTCCTGAAGACGGAGGCTTGGCTGCTTGGAGAACACGTAGTAGAG 40800213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7510 CATGAAGCTCAGACCCTCCTGAAGACGGAGGCTTGGCTGCTTGGAGAACACGTAGTAGAG 7569

 40800214 AATGCTTTTTCTTTCCTCCTTGGCTCTCTCTTGGCAGAAGGTGATGAGCCTGGCTCCAGT 40800273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7570 AATGCTTTTTCTTTCCTCCTTGGCTCTCTCTTGGCAGAAGGTGATGAGCCTGGCTCCAGT 7629

 40800274 CTGCTGGCGAACTCCCCTCTGATGGAGGATGCTCCACAGAGGCTGCGGTGGCAGGCCCAC 40800333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7630 CTGCTGGCGAACTCCCCTCTGATGGAGGATGCTCCACAGAGGCTGCGGTGGCAGGCCCAC 7689

 40800334 CTGGAGTTCACCCATAACCACGATGTGGGGGATCTCACCTGGGACAAGATTGCCGTCTCC 40800393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7690 CTGGAGTTCACCCATAACCACGATGTGGGGGATCTCACCTGGGACAAGATTGCCGTCTCC 7749

 40800394 CTACCCCGCTCTGAGAAGCTCCGCTCCCTGGTGCTGGCCGGCATCCCACATGGCATGAGG 40800453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7750 CTACCCCGCTCTGAGAAGCTCCGCTCCCTGGTGCTGGCCGGCATCCCACATGGCATGAGG 7809

 40800454 CCACAGGTAAGGTGGCCACAGGGACCCACAGGGTGTTGAGAGGGTCCTGGCCCCATGATC 40800513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7810 CCACAGGTAAGGTGGCCACAGGGACCCACAGGGTGTTGAGAGGGTCCTGGCCCCATGATC 7869

 40800514 AGGTGTCACGAGAAAGACTGAGTGCCCTTGCGGCTCCCTTCCCTCAGCTGTGGATGCGGC 40800573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7870 AGGTGTCACGAGAAAGACTGAGTGCCCTTGCGGCTCCCTTCCCTCAGCTGTGGATGCGGC 7929

 40800574 TCTCTGGGGCCCTGCAGAAGAAGAGGAACTCTGAGCTGTCCTACCGCGAGATTGTGAAGA 40800633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7930 TCTCTGGGGCCCTGCAGAAGAAGAGGAACTCTGAGCTGTCCTACCGCGAGATTGTGAAGA 7989

 40800634 ACAGCTCCAACGATGAGACCATCGCTGCCAAGCAGGTGAGGCCGGTGGCACTGTGCAGGA 40800693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7990 ACAGCTCCAACGATGAGACCATCGCTGCCAAGCAGGTGAGGCCGGTGGCACTGTGCAGGA 8049

 40800694 AGAGCTGGAGGCTGTGTGGGCTCGCAGGAGAGAGGGAGCCTGCCTGGGGTTCTTAGAGTG 40800753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8050 AGAGCTGGAGGCTGTGTGGGCTCGCAGGAGAGAGGGAGCCTGCCTGGGGTTCTTAGAGTG 8109

 40800754 TGCCCTTGTTGTGGGGTAGGGGAGGATATTTGCTCCTTCCTTGGTCCTCTGCAGGCCAAA 40800813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8110 TGCCCTTGTTGTGGGGTAGGGGAGGATATTTGCTCCTTCCTTGGTCCTCTGCAGGCCAAA 8169

 40800814 GAAAGAATTGTCCAAAAGGCCATCAGTGCTGTGGAAGGGCTTGGAGATGGGGTTCCCAAG 40800873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8170 GAAAGAATTGTCCAAAAGGCCATCAGTGCTGTGGAAGGGCTTGGAGATGGGGTTCCCAAG 8229

 40800874 CCCGGGTCCACTTCAGGAACAGATGGGGACTCTAAATATAGACTCCAGGCCTCGGGCCAC 40800933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8230 CCCGGGTCCACTTCAGGAACAGATGGGGACTCTAAATATAGACTCCAGGCCTCGGGCCAC 8289

 40800934 ACGTTTTCAGGTGGTCTGGCATGAAGTTTCCCAGCTGGATTTGATGTCCCGGCTCCACAC 40800993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8290 ACGTTTTCAGGTGGTCTGGCATGAAGTTTCCCAGCTGGATTTGATGTCCCGGCTCCACAC 8349

 40800994 TGGCTGGGAGCTGACCCTGAAGGGAGGAGGGTGACCTTGATCAGGAACACAAGGAATCCC 40801053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8350 TGGCTGGGAGCTGACCCTGAAGGGAGGAGGGTGACCTTGATCAGGAACACAAGGAATCCC 8409

 40801054 CATTTCTGGGGGAGAAGCCCGCCTGGGGTCTGCCTCCCTCCCAGGGTGTCACAAGGTCTT 40801113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8410 CATTTCTGGGGGAGAAGCCCGCCTGGGGTCTGCCTCCCTCCCAGGGTGTCACAAGGTCTT 8469

 40801114 GTTATTGTGGGTGCCGATGGCTGCCTGACAGATCGAGAAGGACCTGCTCCGCACCATGCC 40801173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8470 GTTATTGTGGGTGCCGATGGCTGCCTGACAGATCGAGAAGGACCTGCTCCGCACCATGCC 8529

 40801174 CAGCAACGCCTGCTTCGCCAGCATGGGTAGCATCGGGGTGCCCCGCCTGCGCAGGGTGCT 40801233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8530 CAGCAACGCCTGCTTCGCCAGCATGGGTAGCATCGGGGTGCCCCGCCTGCGCAGGGTGCT 8589

 40801234 CCGGGCCCTGGCCTGGCTCTACCCAGAGATCGGCTACTGCCAGGGCACCGGCATGGTGAG 40801293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8590 CCGGGCCCTGGCCTGGCTCTACCCAGAGATCGGCTACTGCCAGGGCACCGGCATGGTGAG 8649

 40801294 CACAGCCCCAGAAAGGGCAGTGGCAGCCCCAGGACCCCCTCCAGGACCCTAACAAGGAGT 40801353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8650 CACAGCCCCAGAAAGGGCAGTGGCAGCCCCAGGACCCCCTCCAGGACCCTAACAAGGAGT 8709

 40801354 GGCCTCCCGCTACGGGGCAGTAGCCCCAGGGCCTCCTCCAGGACCCCTAACAAGGAGTGG 40801413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8710 GGCCTCCCGCTACGGGGCAGTAGCCCCAGGGCCTCCTCCAGGACCCCTAACAAGGAGTGG 8769

 40801414 CCTCCCACTCCGGGGCGTCCCCAAGGAGATCGGGGCAGCTGCACGTTATGCAAGCAGAGG 40801473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8770 CCTCCCACTCCGGGGCGTCCCCAAGGAGATCGGGGCAGCTGCACGTTATGCAAGCAGAGG 8829

 40801474 CGCTCCCCAAGGGATGTGAAAGTGAGGCAGGCCAAGGAAAGCAGCCCAGGGAAGGCCTGG 40801533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8830 CGCTCCCCAAGGGATGTGAAAGTGAGGCAGGCCAAGGAAAGCAGCCCAGGGAAGGCCTGG 8889

 40801534 GTTCCAGCATGCGTGCCCCCCAAGAGGCTTTTGCTAATTGGTCTCCCTAGGGTAGGGGCA 40801593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8890 GTTCCAGCATGCGTGCCCCCCAAGAGGCTTTTGCTAATTGGTCTCCCTAGGGTAGGGGCA 8949

 40801594 CCTTTTCTAATCTGCACAAAGACCTGGGTAGAAGGCCCTTGTCCCTGTGCCCTGGCCAGG 40801653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8950 CCTTTTCTAATCTGCACAAAGACCTGGGTAGAAGGCCCTTGTCCCTGTGCCCTGGCCAGG 9009

 40801654 TGGCCGCCTGCCTCCTGCTGTTCCTGGAGGAGGAGGACGCCTTCTGGATGATGTCTGCCA 40801713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9010 TGGCCGCCTGCCTCCTGCTGTTCCTGGAGGAGGAGGACGCCTTCTGGATGATGTCTGCCA 9069

 40801714 TCATCGAGGACCTGCTCCCCGCCTCCTACTTCAGCACCACCCTGCTGGGTGTCCAGACTG 40801773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9070 TCATCGAGGACCTGCTCCCCGCCTCCTACTTCAGCACCACCCTGCTGGGTGTCCAGACTG 9129

 40801774 ACCAGCGGGTCCTGCGCCACCTCATTGTCCAGTACCTGCCTCGCCTGGACAAGCTGCTCC 40801833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9130 ACCAGCGGGTCCTGCGCCACCTCATTGTCCAGTACCTGCCTCGCCTGGACAAGCTGCTCC 9189

 40801834 AGGAGCATGACATTGGTAAGGCGCCCCTGAGCCACTGGCTCCCATTCTGCAGCTTGGAGG 40801893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9190 AGGAGCATGACATTGGTAAGGCGCCCCTGAGCCACTGGCTCCCATTCTGCAGCTTGGAGG 9249

 40801894 ACTCAGGCGGGTGGCCGAGTGGGGATAGGGCACAGCCCCCCAACCATGGTCTTTGTCGCT 40801953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9250 ACTCAGGCGGGTGGCCGAGTGGGGATAGGGCACAGCCCCCCAACCATGGTCTTTGTCGCT 9309

 40801954 CTTTTGTTCTCTGGTGTTCCCTGCCCCCTCCCCTCCTTTGCTCTTAAGCAGGGAGGACCT 40802013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9310 CTTTTGTTCTCTGGTGTTCCCTGCCCCCTCCCCTCCTTTGCTCTTAAGCAGGGAGGACCT 9369

 40802014 TGCTGCAGTTCCGGGGAGGGAGGTTTCCACCACCTCCTCCCCAGCGGCTTTGGCTCCTGT 40802073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9370 TGCTGCAGTTCCGGGGAGGGAGGTTTCCACCACCTCCTCCCCAGCGGCTTTGGCTCCTGT 9429

 40802074 GTTTACAGAGCTGTCCCTGATCACACTGCACTGGTTCCTCACGGCCTTCGCCAGCGTGGT 40802133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9430 GTTTACAGAGCTGTCCCTGATCACACTGCACTGGTTCCTCACGGCCTTCGCCAGCGTGGT 9489

 40802134 GGACATCAAGCTGCTCCTGCGCATCTGGGACCTGTTTTTCTACGAGGGCTCCCGGGTGCT 40802193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9490 GGACATCAAGCTGCTCCTGCGCATCTGGGACCTGTTTTTCTACGAGGGCTCCCGGGTGCT 9549

 40802194 GTTCCAGCTCACGCTGGGCATGCTGCACCTCAAGGTGCTCCACGGCCCCACTTCAGGCTG 40802253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9550 GTTCCAGCTCACGCTGGGCATGCTGCACCTCAAGGTGCTCCACGGCCCCACTTCAGGCTG 9609

 40802254 AGGAGTAGGCACCCGAGATGGGGGGCAGGGGAGCAAGAGACCTCCCTGGGCCAGGCAAGA 40802313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9610 AGGAGTAGGCACCCGAGATGGGGGGCAGGGGAGCAAGAGACCTCCCTGGGCCAGGCAAGA 9669

 40802314 CCAGCCCCCTGGCCCCTGACAACTGTGCCAAGGCAAACGGGTCCCTGAGGATGGGGGTTG 40802373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9670 CCAGCCCCCTGGCCCCTGACAACTGTGCCAAGGCAAACGGGTCCCTGAGGATGGGGGTTG 9729

 40802374 GGGTCAGCTCAGTGCCACGTCCCTGCAATGACAACCTTCTTCCCCCATCCTGCCCTGGCA 40802433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9730 GGGTCAGCTCAGTGCCACGTCCCTGCAATGACAACCTTCTTCCCCCATCCTGCCCTGGCA 9789

 40802434 TGGCCCAGGAGGAAGAGCTGATCCAGTCAGAGAACTCGGCCTCCATCTTCAACACGCTAT 40802493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9790 TGGCCCAGGAGGAAGAGCTGATCCAGTCAGAGAACTCGGCCTCCATCTTCAACACGCTAT 9849

 40802494 CGGATATCCCGTCGCAGATGGAGGACGCGGAGCTGCTTCTGGGGGTGGCCATGCGGCTGG 40802553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9850 CGGATATCCCGTCGCAGATGGAGGACGCGGAGCTGCTTCTGGGGGTGGCCATGCGGCTGG 9909

 40802554 CCGGCTCCCTCACCGATGTGGCCGTGGAGACTCAGCGCCGCAAGCACCTGGCCTATCTCA 40802613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9910 CCGGCTCCCTCACCGATGTGGCCGTGGAGACTCAGCGCCGCAAGCACCTGGCCTATCTCA 9969

 40802614 TTGCAGACCAGGGCCAGCTCCTGGGGGCCGGCACCCTCACCAACCTCTCTCAGGTGGCCC 40802673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9970 TTGCAGACCAGGGCCAGCTCCTGGGGGCCGGCACCCTCACCAACCTCTCTCAGGTGGCCC 10029

 40802674 AGGATGGGGGGCCGCACCTTGACCCACAGCACACGGGGAGGAGGGGTCACCTTGAAGTTC 40802733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10030 AGGATGGGGGGCCGCACCTTGACCCACAGCACACGGGGAGGAGGGGTCACCTTGAAGTTC 10089

 40802734 AGAGCGCGGGGGCTGCGGAAAACAAACCAGCCCTTCCTGCTCTGCCCCCCAGCCTGGCCC 40802793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10090 AGAGCGCGGGGGCTGCGGAAAACAAACCAGCCCTTCCTGCTCTGCCCCCCAGCCTGGCCC 10149

 40802794 AGTCAGACCACAGCTGTGGGGTGATCCAGGCCTCCTCAGGCTTTGTGCACCTCAGGTTCT 40802853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10150 AGTCAGACCACAGCTGTGGGGTGATCCAGGCCTCCTCAGGCTTTGTGCACCTCAGGTTCT 10209

 40802854 GATCCTGGCACGGTTTGGGAGGAAGGCAGACCCAGCTCTGATTATCTGTTTTCAATTCTT 40802913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10210 GATCCTGGCACGGTTTGGGAGGAAGGCAGACCCAGCTCTGATTATCTGTTTTCAATTCTT 10269

 40802914 GGAGCCAGCGTCAGAGGCTATTTCAGATGAGACAGTATAAGCCAAGGGCTGGTGGGTTCT 40802973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10270 GGAGCCAGCGTCAGAGGCTATTTCAGATGAGACAGTATAAGCCAAGGGCTGGTGGGTTCT 10329

 40802974 CTTCCTCCCGGGGCCAGGACCACCCTGACCCACTCCTCTTGGTGCAGGTTGTTCGCCGCA 40803033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10330 CTTCCTCCCGGGGCCAGGACCACCCTGACCCACTCCTCTTGGTGCAGGTTGTTCGCCGCA 10389

 40803034 GGACCCAGCGGAGGAAGTCCACCATCACTGCTCTGCTCTTCGGTGAGAGCTCTGCGAGTG 40803093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10390 GGACCCAGCGGAGGAAGTCCACCATCACTGCTCTGCTCTTCGGTGAGAGCTCTGCGAGTG 10449

 40803094 CCAGGCAGTGTGGGCATGCGGGAGTCTGTCCTCACGCTCATGTGGACGTGGAGCTTCCT 40803152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10450 CCAGGCAGTGTGGGCATGCGGGAGTCTGTCCTCACGCTCATGTGGACGTGGAGCTTCCT 10508

Alignment time is 7.63497 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2063] =>      2063 nucs 'mol-32-32fb-079188_2063'

Score:        2062
Aligned:      2062        nucs
Identic:      2062 (100%) nucs =>      2008 (100%)        54 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40795248,40797255] EXCISED REGION [40797257,40797310]
 second seq =>  [       1,    2008] EXCISED REGION [    2010,    2063]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [40797256,40797256]
 second seq =>         1 nucs [2009,2009]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        11 nucs [2008,2018] to [2009,2019]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [40797255,40797255] to [40797257,40797257]
 second seq =>         1 nucs [2008,2008] to [2010,2010]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40795248 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTACTTTTA 40795307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTACTTTTA 60

 40795308 ATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGGTTGTT 40795367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGGTTGTT 120

 40795368 CTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGCACTGG 40795427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGCACTGG 180

 40795428 GTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGTGGGGT 40795487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGTGGGGT 240

 40795488 TACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCTCCTAG 40795547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCTCCTAG 300

 40795548 GCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACATGACAT 40795607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACATGACAT 360

 40795608 GCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAGCTCAT 40795667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAGCTCAT 420

 40795668 AGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAAATTCC 40795727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAAATTCC 480

 40795728 ATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGGTTCTG 40795787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGGTTCTG 540

 40795788 CCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTTGGGTA 40795847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTTGGGTA 600

 40795848 CCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTGGCTTG 40795907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTGGCTTG 660

 40795908 GCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACAGGAGC 40795967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACAGGAGC 720

 40795968 TATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGCTCCTT 40796027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGCTCCTT 780

 40796028 TGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCCGATTT 40796087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCCGATTT 840

 40796088 ATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCTGTTAT 40796147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCTGTTAT 900

 40796148 GGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAAGTAAA 40796207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAAGTAAA 960

 40796208 TTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACTTGTCT 40796267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACTTGTCT 1020

 40796268 TGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAGAGCCT 40796327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAGAGCCT 1080

 40796328 TTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGC 40796387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGC 1140

 40796388 TTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAG 40796447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAG 1200

 40796448 ACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGCCGGGT 40796507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGCCGGGT 1260

 40796508 GTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCTCTTGA 40796567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCTCTTGA 1320

 40796568 ACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGGTG 40796627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGGTG 1380

 40796628 ACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCTCTTTT 40796687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCTCTTTT 1440

 40796688 CTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAGCTCTA 40796747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAGCTCTA 1500

 40796748 AGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCACCAGC 40796807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCACCAGC 1560

 40796808 ACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCACAGAGG 40796867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCACAGAGG 1620

 40796868 AGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGAGGTGG 40796927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGAGGTGG 1680

 40796928 AGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCAGCTCT 40796987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCAGCTCT 1740

 40796988 GCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGTGGAGA 40797047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGTGGAGA 1800

 40797048 AAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTCCCCTC 40797107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTCCCCTC 1860

 40797108 TTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTACCCAG 40797167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTACCCAG 1920

 40797168 CACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTATTTCC 40797227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTATTTCC 1980

 40797228 TGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCT 40797255
          ||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCT 2008

EXCISED REGION

 40797257 TTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGC 40797310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 TTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGC 2063

Alignment time is 1.55477 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2014] =>      2014 nucs 'mol-32-3327-014662_2014'

Score:        2014
Aligned:      2014        nucs
Identic:      2014 (100%) nucs =>        39 (100%)      1975 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40794185,40794223] EXCISED REGION [40795243,40797217]
 second seq =>  [       1,      39] EXCISED REGION [      40,    2014]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1019 nucs [40794224,40795242]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        38 nucs [40794224,40794261] to [40795243,40795280]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [40794223,40794223] to [40795243,40795243]
 second seq =>         1 nucs [39,39] to [40,40]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40794185 GGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCG 40794223
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCG 39

EXCISED REGION

 40795243 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 40795302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       40 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 99

 40795303 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 40795362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      100 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 159

 40795363 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 40795422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      160 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 219

 40795423 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 40795482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      220 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 279

 40795483 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 40795542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      280 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 339

 40795543 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 40795602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      340 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 399

 40795603 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 40795662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      400 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 459

 40795663 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 40795722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      460 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 519

 40795723 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 40795782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      520 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 579

 40795783 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 40795842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      580 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 639

 40795843 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 40795902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      640 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 699

 40795903 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 40795962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      700 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 759

 40795963 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 40796022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      760 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 819

 40796023 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 40796082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 879

 40796083 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 40796142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 939

 40796143 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 40796202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 999

 40796203 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 40796262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 1059

 40796263 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 40796322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 1119

 40796323 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 40796382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 1179

 40796383 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 40796442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 1239

 40796443 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 40796502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 1299

 40796503 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 40796562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 1359

 40796563 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 40796622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 1419

 40796623 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 40796682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 1479

 40796683 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 40796742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 1539

 40796743 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 40796802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 1599

 40796803 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 40796862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 1659

 40796863 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 40796922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 1719

 40796923 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 40796982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 1779

 40796983 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 40797042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 1839

 40797043 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 40797102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 1899

 40797103 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 40797162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 1959

 40797163 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGA 40797217
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGA 2014

Alignment time is 1.51258 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    5071] =>      5071 nucs 'mol-32-338a-204647_5071'

Score:        4995
Aligned:      5072        nucs
Identic:      5065 (100%) nucs =>      1753 (100%)      3312 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40792468,40794223] EXCISED REGION [40795243,40798558]
 second seq =>  [       1,    1755] EXCISED REGION [    1756,    5071]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1019 nucs [40794224,40795242]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        38 nucs [40794224,40794261] to [40795243,40795280]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [40794223,40794223] to [40795243,40795243]
 second seq =>         1 nucs [1755,1755] to [1756,1756]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40792468 ATGCCTGTGATCCCAGCTACCTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGG 40792527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGCCTGTGATCCCAGCTACCTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGG 60

 40792528 TGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGA 40792587
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
       61 TGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGGCTGGGCGACAGAGTGAGA 120

 40792588 CTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTATTTTTGCTTATGTTGCTTACA 40792647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||.||||||||||||||||||||||
      121 CTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-AAGAATTTTTGCTTATGTTGCTTACA 179

 40792648 GCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGTAGCAACTATG 40792707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 GCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGTAGCAACTATG 239

 40792708 CTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTGAATGGGGGGC 40792767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 CTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTGAATGGGGGGC 299

 40792768 CATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTTTTCTGCCCCT 40792827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 CATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTTTTCTGCCCCT 359

 40792828 CCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTGCTTTTTAAAC 40792887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 CCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTGCTTTTTAAAC 419

 40792888 AAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTACATTTAATTT 40792947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 AAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTACATTTAATTT 479

 40792948 TGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTTTTCAACTTTC 40793007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTTTTCAACTTTC 539

 40793008 TGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGCTAACTCTCTG 40793067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGCTAACTCTCTG 599

 40793068 GGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGCGACCAGAGG 40793127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 GGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGCGACCAGAGG 659

 40793128 CAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTTATAGCCAGTG 40793187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTTATAGCCAGTG 719

 40793188 GGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATACATTTATATGTGTGTGTAG 40793247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATACATTTATATGTGTGTGTAG 779

 40793248 CATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCA 40793307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCA 839

 40793308 CACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCTCAGGAATT 40793367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCTCAGGAATT 899

 40793368 CAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATATGATAAAAT 40793427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATATGATAAAAT 959

 40793428 ATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAACATACCTTTCA 40793487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 ATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAACATACCTTTCA 1019

 40793488 CCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGACAGCCAGAGA 40793547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGACAGCCAGAGA 1079

 40793548 GGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAGAATCCACCAC 40793607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 GGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAGAATCCACCAC 1139

 40793608 ACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCC 40793667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 ACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCC 1199

 40793668 ACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAG 40793727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAG 1259

 40793728 CATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTA 40793787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTA 1319

 40793788 GCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCTAAAG 40793847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCTAAAG 1379

 40793848 AGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTTGACC 40793907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 AGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTTGACC 1439

 40793908 TTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCCAATT 40793967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCCAATT 1499

 40793968 CTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCA 40794027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCA 1559

 40794028 GTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 40794087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCT 1619

 40794088 CGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTAT 40794147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTAT 1679

 40794148 TTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGG 40794207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGG 1739

 40794208 TGATCCACCCACCTCG 40794223
          ||||||||||||||||
     1740 TGATCCACCCACCTCG 1755

EXCISED REGION

 40795243 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 40795302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 1815

 40795303 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 40795362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 1875

 40795363 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 40795422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 1935

 40795423 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 40795482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 1995

 40795483 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 40795542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 2055

 40795543 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 40795602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 2115

 40795603 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 40795662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 2175

 40795663 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 40795722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 2235

 40795723 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 40795782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 2295

 40795783 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 40795842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 2355

 40795843 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 40795902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 2415

 40795903 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 40795962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 2475

 40795963 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 40796022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 2535

 40796023 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 40796082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 2595

 40796083 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 40796142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 2655

 40796143 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 40796202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 2715

 40796203 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 40796262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 2775

 40796263 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 40796322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 2835

 40796323 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 40796382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 2895

 40796383 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 40796442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 2955

 40796443 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 40796502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 3015

 40796503 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 40796562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 3075

 40796563 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 40796622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 3135

 40796623 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 40796682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 3195

 40796683 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 40796742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3196 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 3255

 40796743 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 40796802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 3315

 40796803 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 40796862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 3375

 40796863 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 40796922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 3435

 40796923 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 40796982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 3495

 40796983 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 40797042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3496 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 3555

 40797043 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 40797102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3556 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 3615

 40797103 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 40797162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3616 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 3675

 40797163 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTA 40797222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3676 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTA 3735

 40797223 TTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGA 40797282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3736 TTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTTTTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGA 3795

 40797283 GTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTC 40797342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3796 GTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTC 3855

 40797343 CGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGC 40797402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3856 CGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGC 3915

 40797403 CACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGC 40797462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3916 CACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGC 3975

 40797463 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGAGAT 40797522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3976 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGAGAT 4035

 40797523 TACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTTCTCCTGGTC 40797582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4036 TACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTTCTCCTGGTC 4095

 40797583 CTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAG 40797642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4096 CTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAG 4155

 40797643 CATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGCCAGGCACCA 40797702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4156 CATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGCCAGGCACCA 4215

 40797703 GCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCTGCCCAGGAA 40797762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4216 GCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCTGCCCAGGAA 4275

 40797763 GAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCTTAGCCCCAT 40797822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4276 GAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCTTAGCCCCAT 4335

 40797823 GTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGGACACAACTG 40797882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4336 GTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGGACACAACTG 4395

 40797883 CATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGAACAAGGAAA 40797942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4396 CATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGAACAAGGAAA 4455

 40797943 ATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTAACCAGAGGC 40798002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4456 ATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTAACCAGAGGC 4515

 40798003 GGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTTTAGCAGGCA 40798062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4516 GGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTTTAGCAGGCA 4575

 40798063 ACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGCAACTGACTT 40798122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4576 ACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGCAACTGACTT 4635

 40798123 CAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATG 40798182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4636 CAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATG 4695

 40798183 AGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTTTGTGTGTCATCTTGC 40798242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4696 AGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTGTGTGTGTCATCTTGC 4755

 40798243 TGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGTGATGGCTGA 40798302
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4756 TGATGTTCTTTGAGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGTGATGGCTGA 4815

 40798303 GCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTGATACTCTCA 40798362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4816 GCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTGATACTCTCA 4875

 40798363 TAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCACCTGACAGTA 40798422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4876 TAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCACCTGACAGTA 4935

 40798423 AAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAAAAATTCAGGCTGGACGTGGTGGCTCACG 40798482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4936 AAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAAAAATTCAGGCTGGACGTGGTGGCTCACG 4995

 40798483 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTCA 40798542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4996 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTCA 5055

 40798543 AGACCAACCTAGCTAA 40798558
          ||||||||||||||||
     5056 AGACCAACCTAGCTAA 5071

Alignment time is 3.79418 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    6339] =>      6339 nucs 'mol-32-3395-111588_6339'

Score:        6339
Aligned:      6339        nucs
Identic:      6339 (100%) nucs =>      1344 (100%)      4995 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40792629,40793972] EXCISED REGION [40793974,40798968]
 second seq =>  [       1,    1344] EXCISED REGION [    1345,    6339]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [40793973,40793973]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        21 nucs [40793973,40793993] to [40793974,40793994]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40792629 TTTGCTTATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTC 40792688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGCTTATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTC 60

 40792689 TGTAGTAGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGG 40792748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTAGTAGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGG 120

 40792749 ACCAGAGTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGA 40792808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCAGAGTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGA 180

 40792809 CAGAACCTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGA 40792868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGAACCTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGA 240

 40792869 CCTTCTGTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGG 40792928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTCTGTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGG 300

 40792929 GAGTATGTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCA 40792988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGTATGTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCA 360

 40792989 ATCCTGTTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCC 40793048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCCTGTTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCC 420

 40793049 TGACGTGGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGG 40793108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGACGTGGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGG 480

 40793109 TTTCCATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGG 40793168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCCATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGG 540

 40793169 CTGGGCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATA 40793228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGGGCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATA 600

 40793229 CATTTATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCT 40793288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATTTATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCT 660

 40793289 GGCTGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGA 40793348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCTGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGA 720

 40793349 TCACTTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAA 40793408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCACTTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAA 780

 40793409 AAAAAAAATATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGG 40793468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAAAAAATATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGG 840

 40793469 AAAGTCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACC 40793528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAGTCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACC 900

 40793529 TCTGCAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAAT 40793588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTGCAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAAT 960

 40793589 GAAGCCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACC 40793648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAAGCCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACC 1020

 40793649 ATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGC 40793708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGC 1080

 40793709 TGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGG 40793768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGG 1140

 40793769 ATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTC 40793828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTC 1200

 40793829 CCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGA 40793888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGA 1260

 40793889 TAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTT 40793948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTT 1320

 40793949 CTGTGTTTATCATCCAATTCTGTC 40793972
          ||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGTGTTTATCATCCAATTCTGTC 1344

EXCISED REGION

 40793974 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCG 40794033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCG 1404

 40794034 CCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCT 40794093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 CCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCT 1464

 40794094 CCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAG 40794153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 CCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAG 1524

 40794154 TAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCC 40794213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 TAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCC 1584

 40794214 ACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGT 40794273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 ACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGT 1644

 40794274 CATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACTTTTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTT 40794333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 CATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACTTTTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTT 1704

 40794334 AGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGTCCCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGG 40794393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 AGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGTCCCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGG 1764

 40794394 AGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGACTCCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAG 40794453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 AGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGACTCCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAG 1824

 40794454 GCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCTGCTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCA 40794513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 GCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCTGCTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCA 1884

 40794514 CACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAACCAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTG 40794573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 CACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAACCAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTG 1944

 40794574 ATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGGACATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGT 40794633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 ATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGGACATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGT 2004

 40794634 CATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAATATCGGCAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTT 40794693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 CATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAATATCGGCAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTT 2064

 40794694 AGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATTAACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGAC 40794753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 AGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATTAACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGAC 2124

 40794754 TACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTATATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTT 40794813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 TACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTATATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTT 2184

 40794814 ATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACCACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCAT 40794873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 ATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACCACAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCAT 2244

 40794874 TCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGAAGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTG 40794933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 TCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGAAGTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTG 2304

 40794934 GGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAGAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTA 40794993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 GGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAGAGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTA 2364

 40794994 CTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGAT 40795053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 CTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGAT 2424

 40795054 CTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCA 40795113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 CTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCA 2484

 40795114 AGTAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTA 40795173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 AGTAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTA 2544

 40795174 GAGACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCG 40795233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 GAGACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCG 2604

 40795234 CCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGA 40795293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 CCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGA 2664

 40795294 TGTCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCT 40795353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 TGTCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCT 2724

 40795354 GACACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCG 40795413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 GACACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCG 2784

 40795414 TAATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATT 40795473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 TAATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATT 2844

 40795474 TCACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTA 40795533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 TCACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTA 2904

 40795534 TCAGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAA 40795593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 TCAGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAA 2964

 40795594 TGATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTA 40795653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 TGATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTA 3024

 40795654 ATCATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAA 40795713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 ATCATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAA 3084

 40795714 GACATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGG 40795773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 GACATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGG 3144

 40795774 GGAAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCT 40795833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 GGAAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCT 3204

 40795834 CTCCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATC 40795893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 CTCCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATC 3264

 40795894 CTAAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAG 40795953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 CTAAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAG 3324

 40795954 CTGCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTT 40796013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 CTGCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTT 3384

 40796014 TCTCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTA 40796073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 TCTCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTA 3444

 40796074 ATTCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGA 40796133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 ATTCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGA 3504

 40796134 ATAGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAA 40796193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 ATAGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAA 3564

 40796194 ATGGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGG 40796253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 ATGGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGG 3624

 40796254 AATGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCG 40796313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 AATGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCG 3684

 40796314 TAGAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGC 40796373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 TAGAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGC 3744

 40796374 GCGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAG 40796433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 GCGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAG 3804

 40796434 GTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACA 40796493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 GTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACA 3864

 40796494 AAAATCAGCCGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCA 40796553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 AAAATCAGCCGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCA 3924

 40796554 GAAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCAC 40796613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 GAAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCAC 3984

 40796614 TCCAGCCTGAGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAAT 40796673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 TCCAGCCTGAGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAAT 4044

 40796674 GACTTTCCTCTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGA 40796733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 GACTTTCCTCTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGA 4104

 40796734 GCCTTCCAGCTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTT 40796793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 GCCTTCCAGCTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTT 4164

 40796794 GCCAGCCCACCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGA 40796853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 GCCAGCCCACCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGA 4224

 40796854 AGCTCTCACAGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCA 40796913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 AGCTCTCACAGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCA 4284

 40796914 GATAAGAGAGGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACT 40796973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 GATAAGAGAGGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACT 4344

 40796974 TCCTTCTCAGCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAG 40797033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4345 TCCTTCTCAGCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAG 4404

 40797034 TCCTCAGGTGGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCT 40797093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4405 TCCTCAGGTGGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCT 4464

 40797094 GTTTCTTTCCCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCT 40797153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 GTTTCTTTCCCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCT 4524

 40797154 CCTTCCCTACCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGG 40797213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 CCTTCCCTACCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGG 4584

 40797214 GAGAGGGTATTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTT 40797273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 GAGAGGGTATTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTT 4644

 40797274 TGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCAC 40797333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 TGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCAC 4704

 40797334 TGCAACCTCCGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACA 40797393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 TGCAACCTCCGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACA 4764

 40797394 GGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCTCCATGT 40797453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 GGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCTCCATGT 4824

 40797454 TGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAG 40797513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4825 TGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAG 4884

 40797514 TACTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTT 40797573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4885 TACTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTT 4944

 40797574 CTCCTGGTCCTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCT 40797633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4945 CTCCTGGTCCTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCT 5004

 40797634 GACTCCGAGCATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGC 40797693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5005 GACTCCGAGCATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGC 5064

 40797694 CAGGCACCAGCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCT 40797753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5065 CAGGCACCAGCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCT 5124

 40797754 GCCCAGGAAGAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCT 40797813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5125 GCCCAGGAAGAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCT 5184

 40797814 TAGCCCCATGTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGG 40797873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5185 TAGCCCCATGTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGG 5244

 40797874 ACACAACTGCATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGA 40797933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5245 ACACAACTGCATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGA 5304

 40797934 ACAAGGAAAATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTA 40797993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5305 ACAAGGAAAATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTA 5364

 40797994 ACCAGAGGCGGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTT 40798053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5365 ACCAGAGGCGGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTT 5424

 40798054 TAGCAGGCAACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGC 40798113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5425 TAGCAGGCAACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGC 5484

 40798114 AACTGACTTCAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCT 40798173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5485 AACTGACTTCAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCT 5544

 40798174 ACTACGATGAGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTTTGTGTG 40798233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5545 ACTACGATGAGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTTTGTGTG 5604

 40798234 TCATCTTGCTGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGT 40798293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5605 TCATCTTGCTGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGT 5664

 40798294 GATGGCTGAGCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTG 40798353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5665 GATGGCTGAGCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTG 5724

 40798354 ATACTCTCATAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCAC 40798413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5725 ATACTCTCATAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCAC 5784

 40798414 CTGACAGTAAAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAAAAATTCAGGCTGGACGTGG 40798473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5785 CTGACAGTAAAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAAAAATTCAGGCTGGACGTGG 5844

 40798474 TGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATCACTTGAGGCC 40798533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5845 TGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATCACTTGAGGCC 5904

 40798534 AAGAGTTCAAGACCAACCTAGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAA 40798593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5905 AAGAGTTCAAGACCAACCTAGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAA 5964

 40798594 TTTGCCAGGTGTGATGGTGTGCGACTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAG 40798653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5965 TTTGCCAGGTGTGATGGTGTGCGACTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAG 6024

 40798654 AATCTCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCGCCACTGCACTCCA 40798713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6025 AATCTCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCGCCACTGCACTCCA 6084

 40798714 GCCTAGGCAACAAGAGCAAACCTCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAGCATATTTTCAATGGCT 40798773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6085 GCCTAGGCAACAAGAGCAAACCTCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAGCATATTTTCAATGGCT 6144

 40798774 GTATAATATCCTTTTATAGTGAATATACAGTATTTGGATAACTACTTTTCTATAACTGAG 40798833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6145 GTATAATATCCTTTTATAGTGAATATACAGTATTTGGATAACTACTTTTCTATAACTGAG 6204

 40798834 TCTCTAGTCCATTTCTGTTGTTTTCTACTATAAATGGACCTTTTGGTCCTGAGTGGGCTA 40798893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6205 TCTCTAGTCCATTTCTGTTGTTTTCTACTATAAATGGACCTTTTGGTCCTGAGTGGGCTA 6264

 40798894 TTGGGAAGTCCATCTGCCAGGCCAGAACTGTGGCTAGGACATTTTAATTGACTGCAACTA 40798953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6265 TTGGGAAGTCCATCTGCCAGGCCAGAACTGTGGCTAGGACATTTTAATTGACTGCAACTA 6324

 40798954 ATCACCTTCAGGTCA 40798968
          |||||||||||||||
     6325 ATCACCTTCAGGTCA 6339

Alignment time is 4.70695 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    7548] =>      7548 nucs 'mol-32-3395-178202_7548'

Score:        7450
Aligned:      7549        nucs
Identic:      7540 (100%) nucs =>      2624 (100%)      4916 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40791596,40794223] EXCISED REGION [40795243,40800163]
 second seq =>  [       1,    2627] EXCISED REGION [    2628,    7548]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1019 nucs [40794224,40795242]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        38 nucs [40794224,40794261] to [40795243,40795280]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [40794223,40794223] to [40795243,40795243]
 second seq =>         1 nucs [2627,2627] to [2628,2628]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40791596 GATTACAGGTATGAGCCACTGTGCCCAGCCCCTGCCCCGTAACTCTTAACTTCTTAACTT 40791655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTACAGGTATGAGCCACTGTGCCCAGCCCCTGCCCCGTAACTCTTAACTTCTTAACTT 60

 40791656 CCCCCCTCCCCAAACCTGTTTTGTTCCCATTTCTCTCATATTAGGAAATGGCATCATCAT 40791715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCCCCTCCCCAAACCTGTTTTGTTCCCATTTCTCTCATATTAGGAAATGGCATCATCAT 120

 40791716 AAGCCCAGGAGTACAGACTGGAAACCTAGGCCTTGCCTGTGGCCACTCCCATTCTCATTC 40791775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGCCCAGGAGTACAGACTGGAAACCTAGGCCTTGCCTGTGGCCACTCCCATTCTCATTC 180

 40791776 CCCACATCCAACTCTGCGGCAAGGCCTGTTGATTCTACCTCTGATTGTGTCTTGAATCTG 40791835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCACATCCAACTCTGCGGCAAGGCCTGTTGATTCTACCTCTGATTGTGTCTTGAATCTG 240

 40791836 TTGCTTCTCTTTTTCTCCACTGTCACTTCAGCCTCATTCTCCGTAATCTTTCCTCTGCAC 40791895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGCTTCTCTTTTTCTCCACTGTCACTTCAGCCTCATTCTCCGTAATCTTTCCTCTGCAC 300

 40791896 GCCACACTTGCCTGCAAGCATCCACTCTTGTCTCTCTACAAGCTATTTGCCCACGTAGCA 40791955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCCACACTTGCCTGCAAGCATCCACTCTTGTCTCTCTACAAGCTATTTGCCCACGTAGCA 360

 40791956 GCCAGATTGGAGCCACGTACATTTTAGAGGTGTGCTGAAGAATAGGCGCCAAGGAGAAAA 40792015
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCAGATTGGAGCCACATACATTTTAGAGGTGTGCTGAAGAATAGGCGCCAAGGAGAAAA 420

 40792016 ACCAGGAAGAAAACCAGTATTTGGTACCCTTACCTTGAAAAAGGTATTCATATATTTTTT 40792075
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCAGGAAGAAAACCAGTATTTTGTACCCTTACCTTGAAAAAGGTATTCATATATTTTTT 480

 40792076 CCTTTTCTAAAAAATGTTCATGTTTCTTTGAGCATTTATTGTCTGATTTTACCCCTTTTT 40792135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTTTTCTAAAAAATGTTCATGTTTCTTTGAGCATTTATTGTCTGATTTTACCCCTTTTT 540

 40792136 AGCATCTATAGAAGCCACATTAATCTTTTTTTACTCCAGCCTTTCTTGGACTTTCCCGGC 40792195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCATCTATAGAAGCCACATTAATCTTTTTTTACTCCAGCCTTTCTTGGACTTTCCCGGC 600

 40792196 TTTGTGCTTCTCTATCTAGGTGAGTTTTTATCGATAGCTTCAAGTGTCCTCTTCCCCTCC 40792255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTGTGCTTCTCTATCTAGGTGAGTTTTTATCGATAGCTTCAAGTGTCCTCTTCCCCTCC 660

 40792256 TCACAGAGGAAATGCAGTCTTCAGCATCTGAGAGGCCTCTTAGAAGTATTTTTGCTCAGG 40792315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCACAGAGGAAATGCAGTCTTCAGCATCTGAGAGGCCTCTTAGAAGTATTTTTGCTCAGG 720

 40792316 CCGGGTGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGCTC 40792375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCGGGTGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGCTC 780

 40792376 ACTTGAGGTCAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACGGCGAAACCCCAACTCTACTAA 40792435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTTGAGGTCAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACGGCGAAACCCCAACTCTACTAA 840

 40792436 AAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCTGTGATCCCAGCTACCTGGGAGG 40792495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCTGTGATCCCAGCTACCTGGGAGG 900

 40792496 CTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGC 40792555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGC 960

 40792556 CACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 40792615
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACTGCACTCCAGGCTGGGCGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1020

 40792616 AAAAAGAAGTATTTTTGCTTATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGT 40792675
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAA-GAAGTATTTTTGCTTATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGT 1079

 40792676 AGAAAACCATCTCTGTAGTAGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGG 40792735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AGAAAACCATCTCTGTAGTAGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGG 1139

 40792736 ACAGGACAGGAGGACCAGAGTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGAC 40792795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 ACAGGACAGGAGGACCAGAGTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGAC 1199

 40792796 CACAGGAAATGGACAGAACCTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTA 40792855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CACAGGAAATGGACAGAACCTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTA 1259

 40792856 TAGTAAGATCTGACCTTCTGTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGA 40792915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TAGTAAGATCTGACCTTCTGTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGA 1319

 40792916 TTAGCAAACTAGGGAGTATGTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAA 40792975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TTAGCAAACTAGGGAGTATGTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAA 1379

 40792976 GGTTCCTAAATCAATCCTGTTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGG 40793035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GGTTCCTAAATCAATCCTGTTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGG 1439

 40793036 AGGGCAGCCACCCTGACGTGGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCT 40793095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AGGGCAGCCACCCTGACGTGGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCT 1499

 40793096 GCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAAC 40793155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAAC 1559

 40793156 AATTCACATCCGGCTGGGCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTA 40793215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AATTCACATCCGGCTGGGCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTA 1619

 40793216 TATACATTACATACATTTATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCT 40793275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TATACATTACATACATTTATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCT 1679

 40793276 ATATCCAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGC 40793335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 ATATCCAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGC 1739

 40793336 TGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGA 40793395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGA 1799

 40793396 CCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTG 40793455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTG 1859

 40793456 TTCCCACCATAGGAAAGTCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTAT 40793515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TTCCCACCATAGGAAAGTCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTAT 1919

 40793516 GTCCACCACCACCTCTGCAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCA 40793575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GTCCACCACCACCTCTGCAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCA 1979

 40793576 GCTCACTGAGAATGAAGCCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGT 40793635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GCTCACTGAGAATGAAGCCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGT 2039

 40793636 GTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCT 40793695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCT 2099

 40793696 CCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGC 40793755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGC 2159

 40793756 TGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCT 40793815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCT 2219

 40793816 TTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATC 40793875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATC 2279

 40793876 CCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTA 40793935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTA 2339

 40793936 TCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG 40793995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG 2399

 40793996 AGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCT 40794055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCT 2459

 40794056 CTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 40794115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 CTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 2519

 40794116 CACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTT 40794175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 CACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTT 2579

 40794176 GGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCG 40794223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCG 2627

EXCISED REGION

 40795243 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 40795302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2628 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 2687

 40795303 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 40795362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2688 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 2747

 40795363 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 40795422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2748 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 2807

 40795423 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 40795482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 2867

 40795483 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 40795542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 2927

 40795543 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 40795602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 2987

 40795603 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 40795662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 3047

 40795663 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 40795722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 3107

 40795723 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 40795782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 3167

 40795783 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 40795842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 3227

 40795843 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 40795902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 3287

 40795903 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 40795962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 3347

 40795963 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 40796022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 3407

 40796023 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 40796082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 3467

 40796083 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 40796142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 3527

 40796143 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 40796202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 3587

 40796203 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 40796262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 3647

 40796263 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 40796322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 3707

 40796323 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 40796382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 3767

 40796383 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 40796442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 3827

 40796443 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 40796502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 3887

 40796503 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 40796562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 3947

 40796563 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 40796622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 4007

 40796623 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 40796682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 4067

 40796683 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 40796742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 4127

 40796743 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 40796802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4128 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 4187

 40796803 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 40796862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4188 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 4247

 40796863 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 40796922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4248 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 4307

 40796923 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 40796982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4308 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 4367

 40796983 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 40797042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4368 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 4427

 40797043 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 40797102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4428 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 4487

 40797103 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 40797162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4488 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 4547

 40797163 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTA 40797222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4548 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTA 4607

 40797223 TTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGA 40797282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4608 TTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTTTTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGA 4667

 40797283 GTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTC 40797342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4668 GTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTC 4727

 40797343 CGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGC 40797402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4728 CGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGC 4787

 40797403 CACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGC 40797462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4788 CACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGC 4847

 40797463 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGAGAT 40797522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4848 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGAGAT 4907

 40797523 TACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTTCTCCTGGTC 40797582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4908 TACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCTCTGCATTTTCTTGATTGTTCTCCTGGTC 4967

 40797583 CTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAG 40797642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4968 CTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAG 5027

 40797643 CATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGCCAGGCACCA 40797702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5028 CATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACACGCAGGTATAGCAGTTAGCCAGGCACCA 5087

 40797703 GCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCTGCCCAGGAA 40797762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5088 GCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGGGGACCCAGCTCTGCAGGCTGCCCAGGAA 5147

 40797763 GAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCTTAGCCCCAT 40797822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5148 GAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTCCCCACCAGAGATGGTATCTTAGCCCCAT 5207

 40797823 GTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGGACACAACTG 40797882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5208 GTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTATGCTCTCAGTATTATAGGGACACAACTG 5267

 40797883 CATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGAACAAGGAAA 40797942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5268 CATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTATCTTTGACCTCTGAGAAGAACAAGGAAA 5327

 40797943 ATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTAACCAGAGGC 40798002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5328 ATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTTCAGAGAAGGTTGCGTGGTAACCAGAGGC 5387

 40798003 GGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTTTAGCAGGCA 40798062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5388 GGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCCCGAAGGCTGGGTGGGATTTTAGCAGGCA 5447

 40798063 ACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGCAACTGACTT 40798122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5448 ACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGCCCCCAACTAGGGGACAGGCAACTGACTT 5507

 40798123 CAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATG 40798182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5508 CAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATG 5567

 40798183 AGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTTTGTGTGTCATCTTGC 40798242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5568 AGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAACTTGAGCCCCTTGTGTGTGTCATCTTGC 5627

 40798243 TGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGTGATGGCTGA 40798302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5628 TGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTGACTGAATTACTCGGCCTGTGATGGCTGA 5687

 40798303 GCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTGATACTCTCA 40798362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5688 GCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGACAGAGTGTATCTGAGGGTGATACTCTCA 5747

 40798363 TAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCACCTGACAGTA 40798422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5748 TAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGATAAATTTTACTGATCCTCACCTGACAGTA 5807

 40798423 AAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAAAAATTCAGGCTGGACGTGGTGGCTCACG 40798482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5808 AAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAAAAATTCAGGCTGGACGTGGTGGCTCACG 5867

 40798483 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTCA 40798542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5868 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGATGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTCA 5927

 40798543 AGACCAACCTAGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTTGCCAGG 40798602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5928 AGACCAACCTAGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTTGCCAGG 5987

 40798603 TGTGATGGTGTGCGACTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTG 40798662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5988 TGTGATGGTGTGCGACTGTAATCCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTG 6047

 40798663 AACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCGCCACTGCACTCCAGCCTAGGCA 40798722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6048 AACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACTGCGCCACTGCACTCCAGCCTAGGCA 6107

 40798723 ACAAGAGCAAACCTCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAGCATATTTTCAATGGCTGTATAATAT 40798782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6108 ACAAGAGCAAACCTCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAGCATATTTTCAATGGCTGTATAATAT 6167

 40798783 CCTTTTATAGTGAATATACAGTATTTGGATAACTACTTTTCTATAACTGAGTCTCTAGTC 40798842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6168 CCTTTTATAGTGAATATACAGTATTTGGATAACTACTTTTCTATAACTGAGTCTCTAGTC 6227

 40798843 CATTTCTGTTGTTTTCTACTATAAATGGACCTTTTGGTCCTGAGTGGGCTATTGGGAAGT 40798902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6228 CATTTCTGTTGTTTTCTACTATAAATGGACCTTTTGGTCCTGAGTGGGCTATTGGGAAGT 6287

 40798903 CCATCTGCCAGGCCAGAACTGTGGCTAGGACATTTTAATTGACTGCAACTAATCACCTTC 40798962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6288 CCATCTGCCAGGCCAGAACTGTGGCTAGGACATTTTAATTGACTGCAACTAATCACCTTC 6347

 40798963 AGGTCACTCACGTTTCCAATTCTGACAAAAGTTTTCCTTGTTCTTCTGATTCGTAGGCAG 40799022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6348 AGGTCACTCACGTTTCCAATTCTGACAAAAGTTTTCCTTGTTCTTCTGATTCGTAGGCAG 6407

 40799023 GTATTTGCAGGTTAAAGGTTTGGGTTGAGAAGGACACAGGGAACTTGCTGGTATGATGGA 40799082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6408 GTATTTGCAGGTTAAAGGTTTGGGTTGAGAAGGACACAGGGAACTTGCTGGTATGATGGA 6467

 40799083 AGTATCTGTGTTTGGCTGGGTCAGTGGAGTCAGAGTGTTCACTGTTACACCTTGGAACTG 40799142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6468 AGTATCTGTGTTTGGCTGGGTCAGTGGAGTCAGAGTGTTCACTGTTACACCTTGGAACTG 6527

 40799143 AGACTGCTTGATGCGGACAATGTTCAGACATTTGTTTATGCACCAAAATGTACACCTAAC 40799202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6528 AGACTGCTTGATGCGGACAATGTTCAGACATTTGTTTATGCACCAAAATGTACACCTAAC 6587

 40799203 ATTTGTGCATTTTACTGTAGGTAAAGTCATTAAAGTTGGTGTCTTTGAAAGCTGGGCTGA 40799262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6588 ATTTGTGCATTTTACTGTAGGTAAAGTCATTAAAGTTGGTGTCTTTGAAAGCTGGGCTGA 6647

 40799263 GGGATTGGCTTTTGGGTGAATAAGGACGAGGCTGTCTGTGGAGCTCACCCAGGGGTTGCT 40799322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6648 GGGATTGGCTTTTGGGTGAATAAGGACGAGGCTGTCTGTGGAGCTCACCCAGGGGTTGCT 6707

 40799323 GGGCTGCCACAGGAGAGCTTGACCTCATTCATTCAACAGATATCTCATGGACCCAACTGT 40799382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6708 GGGCTGCCACAGGAGAGCTTGACCTCATTCATTCAACAGATATCTCATGGACCCAACTGT 6767

 40799383 GGGTGGTGCAGTCTCCACAGCTGCATCCCTGCAGGCCCCCGAACAAAACTGAAGGTGGTC 40799442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6768 GGGTGGTGCAGTCTCCACAGCTGCATCCCTGCAGGCCCCCGAACAAAACTGAAGGTGGTC 6827

 40799443 TCAGCTGCATGGAGTTCTCATTTTAGTGAGGGAGACAGGCAGTAAACAAGCATGTAATAT 40799502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6828 TCAGCTGCATGGAGTTCTCATTTTAGTGAGGGAGACAGGCAGTAAACAAGCATGTAATAT 6887

 40799503 TCTGGAGCAAGAAGGGCTGGAAAAATACTTCCAGGGATAGAGAAGAGGGGCAGTAAATCA 40799562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6888 TCTGGAGCAAGAAGGGCTGGAAAAATACTTCCAGGGATAGAGAAGAGGGGCAGTAAATCA 6947

 40799563 TATATAAAAAGGTCCTGAAGTGGCCCTTTCAGACCATGTCATTGGAGTGGAGAGAGCAAG 40799622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6948 TATATAAAAAGGTCCTGAAGTGGCCCTTTCAGACCATGTCATTGGAGTGGAGAGAGCAAG 7007

 40799623 AGGAAAATGGCAGGGGGTGAGGACAGAGTGGGCACGGCCCAGAGGAAGCAGCTGAGGGAG 40799682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7008 AGGAAAATGGCAGGGGGTGAGGACAGAGTGGGCACGGCCCAGAGGAAGCAGCTGAGGGAG 7067

 40799683 CGCTGGAAAGCCCTTGGCTTTAAGTCTCAGCTCTGAGCAGAGTGACATGATCTGACTTGC 40799742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7068 CGCTGGAAAGCCCTTGGCTTTAAGTCTCAGCTCTGAGCAGAGTGACATGATCTGACTTGC 7127

 40799743 ATTTTGGAAGGGTCACTGTGGCTGCTGAGGGGAACAGCCTTTGGGAGGTGAGGGTAGCAA 40799802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7128 ATTTTGGAAGGGTCACTGTGGCTGCTGAGGGGAACAGCCTTTGGGAGGTGAGGGTAGCAA 7187

 40799803 CAGGGAGGTCAGCAGGAGGGCCACTGCAGTGATCTGGATGAAGGACCATGGCTTGGACAA 40799862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7188 CAGGGAGGTCAGCAGGAGGGCCACTGCAGTGATCTGGATGAAGGACCATGGCTTGGACAA 7247

 40799863 GGGCCATGGTCAGGGGTGGTGAGACGTAAAGGAATCCTGTGGGTTTGCTGATGGACTGAG 40799922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7248 GGGCCATGGTCAGGGGTGGTGAGACGTAAAGGAATCCTGTGGGTTTGCTGATGGACTGAG 7307

 40799923 TGTGGGGTCTGGGCGAGGGAGGAGCCAGAGGTGACTCCGAGGTTTAGGCTGAGCATCGGG 40799982
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     7308 TGTGGGGTCTGGGCGAGGGAGGAGCCAGAGGCGACTCCGAGGTTTAGGCTGAGCATCGGG 7367

 40799983 AGAATGGAGGTGTCATTTCTGGATCCGGGTAGTACTATGGTAGGAGTGGCTTTGAGGAGA 40800042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7368 AGAATGGAGGTGTCATTTCTGGATCCGGGTAGTACTATGGTAGGAGTGGCTTTGAGGAGA 7427

 40800043 AGGTGAAGAGCTTTGCTCCTCATGGGGTACATGTTAGAGGCTCACCTGGAGCTGTCAGAA 40800102
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     7428 AGGTGAAGAGCTTTGCTCCTCATGGGGTGCATGTTAGAGGCTCACCTGGAGCTGTCAGAA 7487

 40800103 AGCCATTAGCTATGGGAATCTGGATATGGTGGGAGAGAGCTGGCCTAGAGCCATGAAGCT 40800162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7488 AGCCATTAGCTATGGGAATCTGGATATGGTGGGAGAGAGCTGGCCTAGAGCCATGAAGCT 7547

 40800163 C 40800163
          |
     7548 C 7548

Alignment time is 5.61426 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2674] =>      2674 nucs 'mol-32-3395-178202_2674'

Score:        2632
Aligned:      2665        nucs
Identic:      2662 (100%) nucs =>       376 (100%)      2286 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40791596,40791971] EXCISED REGION [40791973,40794261]
 second seq =>  [       1,     376] EXCISED REGION [     378,    2665]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [40791972,40791972]
 second seq =>         1 nucs [377,377]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [40792597,40792597]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40791596 GATTACAGGTATGAGCCACTGTGCCCAGCCCCTGCCCCGTAACTCTTAACTTCTTAACTT 40791655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTACAGGTATGAGCCACTGTGCCCAGCCCCTGCCCCGTAACTCTTAACTTCTTAACTT 60

 40791656 CCCCCCTCCCCAAACCTGTTTTGTTCCCATTTCTCTCATATTAGGAAATGGCATCATCAT 40791715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCCCCTCCCCAAACCTGTTTTGTTCCCATTTCTCTCATATTAGGAAATGGCATCATCAT 120

 40791716 AAGCCCAGGAGTACAGACTGGAAACCTAGGCCTTGCCTGTGGCCACTCCCATTCTCATTC 40791775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGCCCAGGAGTACAGACTGGAAACCTAGGCCTTGCCTGTGGCCACTCCCATTCTCATTC 180

 40791776 CCCACATCCAACTCTGCGGCAAGGCCTGTTGATTCTACCTCTGATTGTGTCTTGAATCTG 40791835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCACATCCAACTCTGCGGCAAGGCCTGTTGATTCTACCTCTGATTGTGTCTTGAATCTG 240

 40791836 TTGCTTCTCTTTTTCTCCACTGTCACTTCAGCCTCATTCTCCGTAATCTTTCCTCTGCAC 40791895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGCTTCTCTTTTTCTCCACTGTCACTTCAGCCTCATTCTCCGTAATCTTTCCTCTGCAC 300

 40791896 GCCACACTTGCCTGCAAGCATCCACTCTTGTCTCTCTACAAGCTATTTGCCCACGTAGCA 40791955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCCACACTTGCCTGCAAGCATCCACTCTTGTCTCTCTACAAGCTATTTGCCCACGTAGCA 360

 40791956 GCCAGATTGGAGCCAC 40791971
          ||||||||||||||||
      361 GCCAGATTGGAGCCAC 376

EXCISED REGION

 40791973 TACATTTTAGAGGTGTGCTGAAGAATAGGCGCCAAGGAGAAAAACCAGGAAGAAAACCAG 40792032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      378 TACATTTTAGAGGTGTGCTGAAGAATAGGCGCCAAGGAGAAAAACCAGGAAGAAAACCAG 437

 40792033 TATTTGGTACCCTTACCTTGAAAAAGGTATTCATATATTTTTTCCTTTTCTAAAAAATGT 40792092
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      438 TATTTTGTACCCTTACCTTGAAAAAGGTATTCATATATTTTTTCCTTTTCTAAAAAATGT 497

 40792093 TCATGTTTCTTTGAGCATTTATTGTCTGATTTTACCCCTTTTTAGCATCTATAGAAGCCA 40792152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      498 TCATGTTTCTTTGAGCATTTATTGTCTGATTTTACCCCTTTTTAGCATCTATAGAAGCCA 557

 40792153 CATTAATCTTTTTTTACTCCAGCCTTTCTTGGACTTTCCCGGCTTTGTGCTTCTCTATCT 40792212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      558 CATTAATCTTTTTTTACTCCAGCCTTTCTTGGACTTTCCCGGCTTTGTGCTTCTCTATCT 617

 40792213 AGGTGAGTTTTTATCGATAGCTTCAAGTGTCCTCTTCCCCTCCTCACAGAGGAAATGCAG 40792272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      618 AGGTGAGTTTTTATCGATAGCTTCAAGTGTCCTCTTCCCCTCCTCACAGAGGAAATGCAG 677

 40792273 TCTTCAGCATCTGAGAGGCCTCTTAGAAGTATTTTTGCTCAGGCCGGGTGCGGTGGCTCA 40792332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      678 TCTTCAGCATCTGAGAGGCCTCTTAGAAGTATTTTTGCTCAGGCCGGGTGCGGTGGCTCA 737

 40792333 CACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGCTCACTTGAGGTCAGAAGTT 40792392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      738 CACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGCTCACTTGAGGTCAGAAGTT 797

 40792393 TGAGACCAGCCTGGCCAACACGGCGAAACCCCAACTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGC 40792452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      798 TGAGACCAGCCTGGCCAACACGGCGAAACCCCAACTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGC 857

 40792453 CAGGCGTGGTGGCACATGCCTGTGATCCCAGCTACCTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCG 40792512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      858 CAGGCGTGGTGGCACATGCCTGTGATCCCAGCTACCTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCG 917

 40792513 CTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTG 40792572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      918 CTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGGCTG 977

 40792573 GGCGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTATTTTTG 40792632
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 GGCGACAGAGTGAGACTCTGTCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTATTTTTG 1036

 40792633 CTTATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTA 40792692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1037 CTTATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCCATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTA 1096

 40792693 GTAGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCA 40792752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1097 GTAGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAGAAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCA 1156

 40792753 GAGTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGA 40792812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1157 GAGTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGATCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGA 1216

 40792813 ACCTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTT 40792872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1217 ACCTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGGGGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTT 1276

 40792873 CTGTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGT 40792932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 CTGTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTATAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGT 1336

 40792933 ATGTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCC 40792992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 ATGTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTTCTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCC 1396

 40792993 TGTTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGAC 40793052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 TGTTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTACTCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGAC 1456

 40793053 GTGGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTC 40793112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 GTGGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCCAACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTC 1516

 40793113 CATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGG 40793172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 CATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTGCCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGG 1576

 40793173 GCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATACATT 40793232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 GCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGTGTTTATATATACTTATATACATTACATACATT 1636

 40793233 TATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCT 40793292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 TATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTCAACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCT 1696

 40793293 GGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCAC 40793352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 GGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCAC 1756

 40793353 TTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAA 40793412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 TTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAA 1816

 40793413 AAAATATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAG 40793472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 AAAATATGATAAAATATATCCATAATCTGACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAG 1876

 40793473 TCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTG 40793532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 TCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCCAACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTG 1936

 40793533 CAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAG 40793592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 CAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCCTCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAG 1996

 40793593 CCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTC 40793652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 CCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTCGTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTC 2056

 40793653 AGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCC 40793712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 AGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCTCATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCC 2116

 40793713 TTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCT 40793772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 TTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTGCTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCT 2176

 40793773 CCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTA 40793832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 CCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTCAGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTA 2236

 40793833 ACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGT 40793892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 ACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAACACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGT 2296

 40793893 CTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGT 40793952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 CTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTCACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGT 2356

 40793953 GTTTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCA 40794012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 GTTTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCA 2416

 40794013 CCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAA 40794072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 CCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTCAACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAA 2476

 40794073 GTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCC 40794132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 GTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCC 2536

 40794133 AGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAA 40794192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 AGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAA 2596

 40794193 TCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 40794252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 TCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT 2656

 40794253 GAGCCACCG 40794261
          |||||||||
     2657 GAGCCACCG 2665

Alignment time is 2.03552 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    3877] =>      3877 nucs 'mol-32-33b6-093262_3877'

Score:        3828
Aligned:      3872        nucs
Identic:      3868 (100%) nucs =>      1621 (100%)      2247 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40792601,40794223] EXCISED REGION [40795243,40797491]
 second seq =>  [       8,    1628] EXCISED REGION [    1629,    3877]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1019 nucs [40794224,40795242]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        38 nucs [40794224,40794261] to [40795243,40795280]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [40794223,40794223] to [40795243,40795243]
 second seq =>         1 nucs [1628,1628] to [1629,1629]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40792601 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTATTTTTGCTTATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCC 40792660
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        8 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-AAGTATTTTTGCTTATGTTGCTTACAGCTTTCATGTTCC 66

 40792661 ATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAG 40792720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       67 ATGGTAAATGTCTGTAGAAAACCATCTCTGTAGTAGTAGCAACTATGCTGTGTTGTTAAG 126

 40792721 AAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGA 40792780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      127 AAAATAGGACACAGGACAGGACAGGAGGACCAGAGTGAATGGGGGGCCATATCCCTCTGA 186

 40792781 TCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGG 40792840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      187 TCTATATGAAGAGACCACAGGAAATGGACAGAACCTTTTCTGCCCCTCCCCATAGATGGG 246

 40792841 GGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTA 40792900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      247 GGAAAACAGGGTGTATAGTAAGATCTGACCTTCTGTGCTTTTTAAACAAAATTTGCCTTA 306

 40792901 TAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTT 40792960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      307 TAGGAAATTGTAAGATTAGCAAACTAGGGAGTATGTACATTTAATTTTGAAAAATTCTTT 366

 40792961 CTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTAC 40793020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      367 CTAGAGCTCCTCAAAGGTTCCTAAATCAATCCTGTTTTTCAACTTTCTGCCTCTCAGTAC 426

 40793021 TCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCC 40793080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      427 TCCTGTGACAACAGGAGGGCAGCCACCCTGACGTGGCTAACTCTCTGGGCTGTTCCTGCC 486

 40793081 AACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTG 40793140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      487 AACTCCCAGATGGCTGCTTTCAGGAAGGTTTCCATAGCGACCAGAGGCAGGAAAAACCTG 546

 40793141 CCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGT 40793200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 CCCACCCAGCTTAACAATTCACATCCGGCTGGGCTTTATAGCCAGTGGGAGAAGTGGCGT 606

 40793201 GTTTATATATACTTATATACATTACATACATTTATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTC 40793260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      607 GTTTATATATACTTATATACATTACATACATTTATATGTGTGTGTAGCATTAAAGAGCTC 666

 40793261 AACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCAC 40793320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 AACCCTGCAGACTCTATATCCAGAATCTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCAC 726

 40793321 AGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTG 40793380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 AGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTAAGCTCAGGAATTCAAGACCAGCCTG 786

 40793381 GGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATATGATAAAATATATCCATAATCT 40793440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 GGCAACATAGAGGGACCTTGTCTCTAAAAAAAAAAATATGATAAAATATATCCATAATCT 846

 40793441 GACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCC 40793500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 GACCATTTCTCAGTGTTCCCACCATAGGAAAGTCAACATACCTTTCACCCTGACTAATCC 906

 40793501 AACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCC 40793560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 AACAGCCTCCTCTATGTCCACCACCACCTCTGCAAGACAGCCAGAGAGGGCTCAGAGCCC 966

 40793561 TCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTC 40793620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 TCCCCTACTTTCCCAGCTCACTGAGAATGAAGCCCAGAATCCACCACACTGTGAGGCCTC 1026

 40793621 GTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCT 40793680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 GTAGTCCCCTGCTGTGTCTTCTCCCACCATTCAGGCTGTTTCCTCCCACTCTTTCCTTCT 1086

 40793681 CATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTG 40793740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 CATTCCCCAGCCCCTCCAGCCTGCTGGCTGCCTTGCAGCTGTTTCAGCATGCCCAGTGTG 1146

 40793741 CTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTC 40793800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 CTCCCAACTTGGGGCTGCTTCTCCCTGGATCTCCTTTCCCTCAGGTAGCCATGAGCCCTC 1206

 40793801 AGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAA 40793860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 AGTTCCTTTTGGTCTTTGCTCAGGTGTCCCTAACCCATATTCTAAAGAGCTTCTCCTGAA 1266

 40793861 CACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTC 40793920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 CACTTGATATAAATCCCCTCTCTTCTGATAGTCTCCACACCTTGACCTTTATTTTTCCTC 1326

 40793921 ACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTT 40793980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 ACAGCATTGTAGTTATCACAATCTATTTCTGTGTTTATCATCCAATTCTGTCTTTTTTTT 1386

 40793981 TTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTC 40794040
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 TTTTTTTTTTTTT-GAGATGGAGTCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCCATCTC 1445

 40794041 AACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGT 40794100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 AACTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGT 1505

 40794101 AGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACA 40794160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 AGCTGGGACTACAGGCACACGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGGACA 1565

 40794161 GGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACC 40794220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 GGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACC 1625

 40794221 TCG 40794223
          |||
     1626 TCG 1628

EXCISED REGION

 40795243 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 40795302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTAC 1688

 40795303 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 40795362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 TTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGG 1748

 40795363 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 40795422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 TTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGC 1808

 40795423 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 40795482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 ACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGT 1868

 40795483 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 40795542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 GGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCT 1928

 40795543 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 40795602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 CCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACAT 1988

 40795603 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 40795662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 GACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAG 2048

 40795663 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 40795722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 CTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAA 2108

 40795723 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 40795782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 ATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGG 2168

 40795783 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 40795842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 TTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTT 2228

 40795843 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 40795902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 GGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTG 2288

 40795903 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 40795962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 GCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACA 2348

 40795963 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 40796022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 GGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGC 2408

 40796023 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 40796082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 TCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCC 2468

 40796083 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 40796142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 GATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCT 2528

 40796143 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 40796202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 GTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAA 2588

 40796203 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 40796262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 GTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACT 2648

 40796263 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 40796322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 TGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAG 2708

 40796323 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 40796382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 AGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCT 2768

 40796383 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 40796442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 CATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGT 2828

 40796443 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 40796502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 TCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGC 2888

 40796503 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 40796562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 CGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCT 2948

 40796563 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 40796622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTG 3008

 40796623 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 40796682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 AGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAAATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCT 3068

 40796683 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 40796742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 CTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGGACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAG 3128

 40796743 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 40796802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 CTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGATTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCA 3188

 40796803 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 40796862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 CCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGGACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCAC 3248

 40796863 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 40796922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 AGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTTTTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGA 3308

 40796923 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 40796982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 GGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGCTGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCA 3368

 40796983 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 40797042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 GCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCTCCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGT 3428

 40797043 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 40797102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 GGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCATGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTC 3488

 40797103 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 40797162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 CCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGGAGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTA 3548

 40797163 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTA 40797222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 CCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTAATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTA 3608

 40797223 TTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTATTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGA 40797282
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3609 TTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTCTTTTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGA 3668

 40797283 GTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTC 40797342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 GTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAATGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTC 3728

 40797343 CGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGC 40797402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 CGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGC 3788

 40797403 CACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGC 40797462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3789 CACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGC 3848

 40797463 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATC 40797491
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3849 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATC 3877

Alignment time is 2.87767 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    5085] =>      5085 nucs 'mol-32-33f8-130496_5085'

Score:        5084
Aligned:      5084        nucs
Identic:      5084 (100%) nucs =>        26 (100%)      5058 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40794229,40794254] EXCISED REGION [40795275,40800332]
 second seq =>  [       1,      26] EXCISED REGION [      28,    5085]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1020 nucs [40794255,40795274]
 second seq =>         1 nucs [27,27]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [40795274,40795274]
 second seq =>         1 nucs [27,27]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [27,28] to [28,29]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [40794255,40794255] to [40795274,40795274]
 second seq =>         0 nucs

 40794229 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGA 40794254
          ||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGA 26

EXCISED REGION

 40795275 CCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAG 40795334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       28 CCACCGCGCCCAGCCAAGATGTCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAG 87

 40795335 CCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGC 40795394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       88 CCCACTCCCTCCCAAAGCTGACACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGC 147

 40795395 TCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGG 40795454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      148 TCCAAGCCAGCAGGAGGCGTAATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGG 207

 40795455 TGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTG 40795514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      208 TGGCCATGTGTCCGTCATTTCACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTG 267

 40795515 GGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGA 40795574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      268 GGAGTCCATTTGGAAACTATCAGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGA 327

 40795575 ATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTC 40795634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      328 ATGTGTTGTAAGGATTGAATGATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTC 387

 40795635 TTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACAT 40795694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      388 TTTAATGTAAAAATATGTAATCATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACAT 447

 40795695 ATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACC 40795754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      448 ATATTTTACACTGAAGGAAGACATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACC 507

 40795755 AGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTG 40795814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      508 AGGATGGCTGGCCTGTTGGGGAAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTG 567

 40795815 GAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATG 40795874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      568 GAAGCAGGAGGGAGCGTCTCTCCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATG 627

 40795875 TTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAG 40795934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      628 TTCTGCTGTGGCCTTTATCCTAAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAG 687

 40795935 AGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCT 40795994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      688 AGGCCGGGACACAGCTGAGCTGCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCT 747

 40795995 TTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTT 40796054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      748 TTAAAGAGAACTGGGATTTTCTCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTT 807

 40796055 TTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCC 40796114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      808 TTTGCTTCTCACTTACCTAATTCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCC 867

 40796115 ATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTG 40796174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      868 ATGGCAGATAGCATGGAGAATAGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTG 927

 40796175 AATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAA 40796234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      928 AATTCTCATTGTGTGAAAAATGGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAA 987

 40796235 ATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGT 40796294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      988 ATATGATTTCAAAAACCGGAATGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGT 1047

 40796295 TGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGA 40796354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1048 TGTCACCTACTTCCTTTCGTAGAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGA 1107

 40796355 AGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCG 40796414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1108 AGTAAAGGCTTGGCCGGGCGCGGTGGCTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCG 1167

 40796415 AGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCC 40796474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1168 AGGCCGGCGGGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCC 1227

 40796475 CGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGCCGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGC 40796534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1228 CGTCTCTACTAAAAAGACAAAAATCAGCCGGGTGTGGTGGTGCAACCCTGTAGTCCCAGC 1287

 40796535 TACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGC 40796594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 TACTCGGGAGGCCGAGGCAGAAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGC 1347

 40796595 TGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAA 40796654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 TGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGAGGTGACCAAGCGAGACTCTGTCTAAAAAAAA 1407

 40796655 ATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCTCTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGG 40796714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 ATAAAAATAAAAATAGAATGACTTTCCTCTTTTCTCTTCTAACAGGGCAGATGATTCTGG 1467

 40796715 ACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAGCTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGA 40796774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 ACCAGATGAAGCCTGAGGAGCCTTCCAGCTCTAAGATAGCAGGATAGGAGACTTCTAAGA 1527

 40796775 TTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCACCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGG 40796834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 TTGGAGCTGCAGAAGACTTGCCAGCCCACCAGCACAATGTCAGGTAGAGGCAGGGGCTGG 1587

 40796835 ACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCACAGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTT 40796894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 ACTTGGAAACGGGGTTTGAAGCTCTCACAGAGGAGCCAGAGGGATGGAAGGTGGCTTGTT 1647

 40796895 TTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGAGGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGC 40796954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 TTCCATAAAACACCATCCAGATAAGAGAGGTGGAGATGGTAGGGAAGGCTTCTGGCTGGC 1707

 40796955 TGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCAGCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCT 40797014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 TGAGAAAGTTATTAAAACTTCCTTCTCAGCTCTGCTCTCTAGCTCTCCTCCTCCAGCTCT 1767

 40797015 CCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGTGGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCA 40797074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 CCAACCCGCAGATCTGCAGTCCTCAGGTGGAGAAAGAGGCCGGAAGATGAAGTTTGGTCA 1827

 40797075 TGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTCCCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGG 40797134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 TGTTTTGTAATGTGCTGCTGTTTCTTTCCCCTCTTCTCCAGAAATTTGCTGATTTCTAGG 1887

 40797135 AGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTACCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTA 40797194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 AGGTTTCTTTCACTCTGCTCCTTCCCTACCCAGCACGCTTGAGATGGGCCAGTCCCTTTA 1947

 40797195 ATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTATTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTC 40797254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 ATGCTGGTGCTCTTAGAGGGAGAGGGTATTTCCTGATTTGAATTTTGCCTCTGCATTTTC 2007

 40797255 TATTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAA 40797314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 TATTTTTTTTTTATTTTTTTGAGGCAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAA 2067

 40797315 TGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTC 40797374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 TGGCACGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCTTCTTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTC 2127

 40797375 CCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTA 40797434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 CCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTA 2187

 40797435 GAGATGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGC 40797494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 GAGATGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGC 2247

 40797495 CCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCT 40797554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 CCACCTCGGCCTCCCAAAGTACTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGCCT 2307

 40797555 CTGCATTTTCTTGATTGTTCTCCTGGTCCTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCT 40797614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 CTGCATTTTCTTGATTGTTCTCCTGGTCCTCTTTGGTTTTAGGAAGCCATACACCTGCCT 2367

 40797615 GTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAGCATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACA 40797674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 GTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAGCATATGGCCCCAGGAGATCTTGGCCAAGTACA 2427

 40797675 CGCAGGTATAGCAGTTAGCCAGGCACCAGCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGG 40797734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 CGCAGGTATAGCAGTTAGCCAGGCACCAGCCTGCTGTGCTCCCACGCTGTGGTATGAAGG 2487

 40797735 GGACCCAGCTCTGCAGGCTGCCCAGGAAGAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTC 40797794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 GGACCCAGCTCTGCAGGCTGCCCAGGAAGAGGTGGCCAACTCACACAGGGTTATGAGTTC 2547

 40797795 CCCACCAGAGATGGTATCTTAGCCCCATGTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTA 40797854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 CCCACCAGAGATGGTATCTTAGCCCCATGTTTCCTGTGTGAATCAACCACTGTGGCACTA 2607

 40797855 TGCTCTCAGTATTATAGGGACACAACTGCATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTA 40797914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 TGCTCTCAGTATTATAGGGACACAACTGCATAAAACATGTTTCTTGCCTTGATTTTATTA 2667

 40797915 TCTTTGACCTCTGAGAAGAACAAGGAAAATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTT 40797974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 TCTTTGACCTCTGAGAAGAACAAGGAAAATAGAAGGTTGAGAAATTGCTAGAAGAAGGTT 2727

 40797975 CAGAGAAGGTTGCGTGGTAACCAGAGGCGGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCC 40798034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 CAGAGAAGGTTGCGTGGTAACCAGAGGCGGCTTTTGGAAGAGTAGCCTTTGATCTGAGCC 2787

 40798035 CGAAGGCTGGGTGGGATTTTAGCAGGCAACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGC 40798094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 CGAAGGCTGGGTGGGATTTTAGCAGGCAACCCTGTGGGTGGCATCTTTCAGACCTGAGGC 2847

 40798095 CCCCAACTAGGGGACAGGCAACTGACTTCAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCA 40798154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 CCCCAACTAGGGGACAGGCAACTGACTTCAACCTCATCCTGATTCTAGAAGGAAGAGTCA 2907

 40798155 GCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATGAGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAA 40798214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 GCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATGAGTTTGGTTTCCGTGTGTACAAGGAAGGTAAA 2967

 40798215 CTTGAGCCCCTTTTGTGTGTCATCTTGCTGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTG 40798274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 CTTGAGCCCCTTTTGTGTGTCATCTTGCTGATGTTCTTTGGGGAGGACTCCGCTCCCTTG 3027

 40798275 ACTGAATTACTCGGCCTGTGATGGCTGAGCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGA 40798334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 ACTGAATTACTCGGCCTGTGATGGCTGAGCTCTGATGCGTCAGGGTTCCAGATTTAAGGA 3087

 40798335 CAGAGTGTATCTGAGGGTGATACTCTCATAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGAT 40798394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 CAGAGTGTATCTGAGGGTGATACTCTCATAAGTATGGGAGACTTCTGCTTTTTTTGAGAT 3147

 40798395 AAATTTTACTGATCCTCACCTGACAGTAAAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAA 40798454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 AAATTTTACTGATCCTCACCTGACAGTAAAAGCAATCGTGTTCACTGTAGAGAAGTTGAA 3207

 40798455 AAATTCAGGCTGGACGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGT 40798514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 AAATTCAGGCTGGACGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGT 3267

 40798515 GGATGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTCAAGACCAACCTAGCTAACATGGTGAAACCCCAT 40798574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 GGATGGATCACTTGAGGCCAAGAGTTCAAGACCAACCTAGCTAACATGGTGAAACCCCAT 3327

 40798575 CTCTACTAAAAATACAAAATTTGCCAGGTGTGATGGTGTGCGACTGTAATCCCAGCTACT 40798634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 CTCTACTAAAAATACAAAATTTGCCAGGTGTGATGGTGTGCGACTGTAATCCCAGCTACT 3387

 40798635 CAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAG 40798694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 CAGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAG 3447

 40798695 ACTGCGCCACTGCACTCCAGCCTAGGCAACAAGAGCAAACCTCTGTCTCAAAAAAGAAAA 40798754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 ACTGCGCCACTGCACTCCAGCCTAGGCAACAAGAGCAAACCTCTGTCTCAAAAAAGAAAA 3507

 40798755 AAGCATATTTTCAATGGCTGTATAATATCCTTTTATAGTGAATATACAGTATTTGGATAA 40798814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 AAGCATATTTTCAATGGCTGTATAATATCCTTTTATAGTGAATATACAGTATTTGGATAA 3567

 40798815 CTACTTTTCTATAACTGAGTCTCTAGTCCATTTCTGTTGTTTTCTACTATAAATGGACCT 40798874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 CTACTTTTCTATAACTGAGTCTCTAGTCCATTTCTGTTGTTTTCTACTATAAATGGACCT 3627

 40798875 TTTGGTCCTGAGTGGGCTATTGGGAAGTCCATCTGCCAGGCCAGAACTGTGGCTAGGACA 40798934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 TTTGGTCCTGAGTGGGCTATTGGGAAGTCCATCTGCCAGGCCAGAACTGTGGCTAGGACA 3687

 40798935 TTTTAATTGACTGCAACTAATCACCTTCAGGTCACTCACGTTTCCAATTCTGACAAAAGT 40798994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 TTTTAATTGACTGCAACTAATCACCTTCAGGTCACTCACGTTTCCAATTCTGACAAAAGT 3747

 40798995 TTTCCTTGTTCTTCTGATTCGTAGGCAGGTATTTGCAGGTTAAAGGTTTGGGTTGAGAAG 40799054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 TTTCCTTGTTCTTCTGATTCGTAGGCAGGTATTTGCAGGTTAAAGGTTTGGGTTGAGAAG 3807

 40799055 GACACAGGGAACTTGCTGGTATGATGGAAGTATCTGTGTTTGGCTGGGTCAGTGGAGTCA 40799114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 GACACAGGGAACTTGCTGGTATGATGGAAGTATCTGTGTTTGGCTGGGTCAGTGGAGTCA 3867

 40799115 GAGTGTTCACTGTTACACCTTGGAACTGAGACTGCTTGATGCGGACAATGTTCAGACATT 40799174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 GAGTGTTCACTGTTACACCTTGGAACTGAGACTGCTTGATGCGGACAATGTTCAGACATT 3927

 40799175 TGTTTATGCACCAAAATGTACACCTAACATTTGTGCATTTTACTGTAGGTAAAGTCATTA 40799234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 TGTTTATGCACCAAAATGTACACCTAACATTTGTGCATTTTACTGTAGGTAAAGTCATTA 3987

 40799235 AAGTTGGTGTCTTTGAAAGCTGGGCTGAGGGATTGGCTTTTGGGTGAATAAGGACGAGGC 40799294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 AAGTTGGTGTCTTTGAAAGCTGGGCTGAGGGATTGGCTTTTGGGTGAATAAGGACGAGGC 4047

 40799295 TGTCTGTGGAGCTCACCCAGGGGTTGCTGGGCTGCCACAGGAGAGCTTGACCTCATTCAT 40799354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 TGTCTGTGGAGCTCACCCAGGGGTTGCTGGGCTGCCACAGGAGAGCTTGACCTCATTCAT 4107

 40799355 TCAACAGATATCTCATGGACCCAACTGTGGGTGGTGCAGTCTCCACAGCTGCATCCCTGC 40799414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 TCAACAGATATCTCATGGACCCAACTGTGGGTGGTGCAGTCTCCACAGCTGCATCCCTGC 4167

 40799415 AGGCCCCCGAACAAAACTGAAGGTGGTCTCAGCTGCATGGAGTTCTCATTTTAGTGAGGG 40799474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4168 AGGCCCCCGAACAAAACTGAAGGTGGTCTCAGCTGCATGGAGTTCTCATTTTAGTGAGGG 4227

 40799475 AGACAGGCAGTAAACAAGCATGTAATATTCTGGAGCAAGAAGGGCTGGAAAAATACTTCC 40799534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 AGACAGGCAGTAAACAAGCATGTAATATTCTGGAGCAAGAAGGGCTGGAAAAATACTTCC 4287

 40799535 AGGGATAGAGAAGAGGGGCAGTAAATCATATATAAAAAGGTCCTGAAGTGGCCCTTTCAG 40799594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 AGGGATAGAGAAGAGGGGCAGTAAATCATATATAAAAAGGTCCTGAAGTGGCCCTTTCAG 4347

 40799595 ACCATGTCATTGGAGTGGAGAGAGCAAGAGGAAAATGGCAGGGGGTGAGGACAGAGTGGG 40799654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 ACCATGTCATTGGAGTGGAGAGAGCAAGAGGAAAATGGCAGGGGGTGAGGACAGAGTGGG 4407

 40799655 CACGGCCCAGAGGAAGCAGCTGAGGGAGCGCTGGAAAGCCCTTGGCTTTAAGTCTCAGCT 40799714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 CACGGCCCAGAGGAAGCAGCTGAGGGAGCGCTGGAAAGCCCTTGGCTTTAAGTCTCAGCT 4467

 40799715 CTGAGCAGAGTGACATGATCTGACTTGCATTTTGGAAGGGTCACTGTGGCTGCTGAGGGG 40799774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 CTGAGCAGAGTGACATGATCTGACTTGCATTTTGGAAGGGTCACTGTGGCTGCTGAGGGG 4527

 40799775 AACAGCCTTTGGGAGGTGAGGGTAGCAACAGGGAGGTCAGCAGGAGGGCCACTGCAGTGA 40799834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 AACAGCCTTTGGGAGGTGAGGGTAGCAACAGGGAGGTCAGCAGGAGGGCCACTGCAGTGA 4587

 40799835 TCTGGATGAAGGACCATGGCTTGGACAAGGGCCATGGTCAGGGGTGGTGAGACGTAAAGG 40799894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 TCTGGATGAAGGACCATGGCTTGGACAAGGGCCATGGTCAGGGGTGGTGAGACGTAAAGG 4647

 40799895 AATCCTGTGGGTTTGCTGATGGACTGAGTGTGGGGTCTGGGCGAGGGAGGAGCCAGAGGT 40799954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4648 AATCCTGTGGGTTTGCTGATGGACTGAGTGTGGGGTCTGGGCGAGGGAGGAGCCAGAGGT 4707

 40799955 GACTCCGAGGTTTAGGCTGAGCATCGGGAGAATGGAGGTGTCATTTCTGGATCCGGGTAG 40800014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4708 GACTCCGAGGTTTAGGCTGAGCATCGGGAGAATGGAGGTGTCATTTCTGGATCCGGGTAG 4767

 40800015 TACTATGGTAGGAGTGGCTTTGAGGAGAAGGTGAAGAGCTTTGCTCCTCATGGGGTACAT 40800074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 TACTATGGTAGGAGTGGCTTTGAGGAGAAGGTGAAGAGCTTTGCTCCTCATGGGGTACAT 4827

 40800075 GTTAGAGGCTCACCTGGAGCTGTCAGAAAGCCATTAGCTATGGGAATCTGGATATGGTGG 40800134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4828 GTTAGAGGCTCACCTGGAGCTGTCAGAAAGCCATTAGCTATGGGAATCTGGATATGGTGG 4887

 40800135 GAGAGAGCTGGCCTAGAGCCATGAAGCTCAGACCCTCCTGAAGACGGAGGCTTGGCTGCT 40800194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 GAGAGAGCTGGCCTAGAGCCATGAAGCTCAGACCCTCCTGAAGACGGAGGCTTGGCTGCT 4947

 40800195 TGGAGAACACGTAGTAGAGAATGCTTTTTCTTTCCTCCTTGGCTCTCTCTTGGCAGAAGG 40800254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4948 TGGAGAACACGTAGTAGAGAATGCTTTTTCTTTCCTCCTTGGCTCTCTCTTGGCAGAAGG 5007

 40800255 TGATGAGCCTGGCTCCAGTCTGCTGGCGAACTCCCCTCTGATGGAGGATGCTCCACAGAG 40800314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5008 TGATGAGCCTGGCTCCAGTCTGCTGGCGAACTCCCCTCTGATGGAGGATGCTCCACAGAG 5067

 40800315 GCTGCGGTGGCAGGCCCA 40800332
          ||||||||||||||||||
     5068 GCTGCGGTGGCAGGCCCA 5085

Alignment time is 3.76111 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [40784223,40805242] =>     21020 nucs '22 dna:chromosome chromosome:GRCh37:22:1:51304566:1'
Second seq [       1,    2191] =>      2191 nucs 'mol-32-34be-004633_2191'

Score:        2181
Aligned:      2192        nucs
Identic:      2191 (100%) nucs =>       809 (100%)      1382 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [40794186,40794994] EXCISED REGION [40794996,40796378]
 second seq =>  [       1,     809] EXCISED REGION [     810,    2191]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [40794995,40794995]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        10 nucs [40794995,40795004] to [40794996,40795005]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 40794186 GTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 40794245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTCAATCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 60

 40794246 CAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGTCATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACTT 40794305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGGCGTGAGCCACCGGGCCCAGCCTGTCATCTGATTCTCTAATGTAAGGGTCAGGACTT 120

 40794306 TTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTTAGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGTC 40794365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCCCCCACTGTTGTGTCCCAGCTCTTAGAAGCTGCCTGGCTCTTAGGGGTGCTCAGTC 180

 40794366 CCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGGAGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGACT 40794425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCATTTGCTGATGAATGAATGAGTGGGAGGACAGCCAAGATCAGGAAAGGGGAGGGACT 240

 40794426 CCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAGGCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCTG 40794485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTGAGTGGGCCTTCCCAGCCCCTTCAGGCCTCCACAGCCAGATGTAGCTGATTTCTCTG 300

 40794486 CTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCACACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAAC 40794545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTACAAGCAGCCTGCAGGTGCTCTGTCACACTTTTACTCTGCCCTTTCAGAACCACCAAC 360

 40794546 CAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTGATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGGA 40794605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAACCCCTGCCTCTGGGGCCGATGGTGATGAGGAGTCTTTCTCATGCTCTCAACTGGGA 420

 40794606 CATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGTCATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAATATCGG 40794665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATGTTATGTGGAACCATACACAGTTGTCATTTTTCTAGGCTGTAATGGATGAATATCGG 480

 40794666 CAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTTAGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATTA 40794725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAATTTAATATGGTTCAACATAGTTTTTAGTATACCTCAATGAGGAGGGTCCATATATTA 540

 40794726 ACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGACTACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTAT 40794785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAATAACTTTCTAAAAATTTTTAGGACTACTAATTGCCTGATACTTATTGAGTACTTAT 600

 40794786 ATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTTATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACCA 40794845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGTGTCAGGCAGTGTGCTAAAGGCCTTATTTGCATCAGCTCACGTAATCCTCATAACCA 660

 40794846 CAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCATTCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGAA 40794905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGTAAGGCATAGGTATTATTATTCCATTCTATCGAAAAGAAAACTGATACAGACGTGAA 720

 40794906 GTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTGGGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAG 40794965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTAAACTTGCCCACGGTTATAACAAGTGGGCACAGGCCCACTCTGCTACACGAGTAGCAG 780

 40794966 AGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTAC 40794994
          |||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGCTAGGATTGGACTGGAGATGTCTTTAC 809

EXCISED REGION

 40794996 TTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCT 40795055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 TTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCT 869

 40795056 TGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCAAG 40795115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 TGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCTCAAG 929

 40795116 TAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGA 40795175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 TAGCTGCGATTACAGGGATGCATCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGA 989

 40795176 GACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCGCC 40795235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 GACAGGGTTTCACCATGGTGGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCGCC 1049

 40795236 CACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATG 40795295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 CACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCAAGATG 1109

 40795296 TCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGA 40795355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 TCTTTACTTTTAATCATGGTGCAGAGGATGAGCGCTGAGCCCACTCCCTCCCAAAGCTGA 1169

 40795356 CACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTA 40795415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 CACGTGGTTGTTCTGCCACAGCCATTTGCCATCTCAGGCTCCAAGCCAGCAGGAGGCGTA 1229

 40795416 ATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTC 40795475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 ATAGAGCACTGGGTTCCATTCCCAGGGCCATCTAGCTGGTGGCCATGTGTCCGTCATTTC 1289

 40795476 ACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGGAGTCCATTTGGAAACTATC 40795535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     1290 ACAGGGTGGGGTTACATGGTGTGGCAGGGCAAAGTTTTGGG-GTCCATTTGGAAACTATC 1348

 40795536 AGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATG 40795595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1349 AGTCTCTCCTAGGCTTATTTTCTGTTGTGTAAGGAATGAATGTGTTGTAAGGATTGAATG 1408

 40795596 ATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAAT 40795655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 ATGACATGACATGCTTTTTAAAATTTCTAGCTCAGTCTCTTTAATGTAAAAATATGTAAT 1468

 40795656 CATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGA 40795715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1469 CATCCAGCTCATAGTTCTGAGGGAAACCCTATATCACATATATTTTACACTGAAGGAAGA 1528

 40795716 CATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGG 40795775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 CATTAAAATTCCATTCTCTTCACACAGAACCAACCAACCAGGATGGCTGGCCTGTTGGGG 1588

 40795776 AAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCT 40795835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1589 AAGCAGGTTCTGCCATCTGGTTCTCAGCAGGCATGTCTGGAAGCAGGAGGGAGCGTCTCT 1648

 40795836 CCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCT 40795895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 CCCATTTGGGTACCAAAGCCTCTGTAACAGTCAGGAATGTTCTGCTGTGGCCTTTATCCT 1708

 40795896 AAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCT 40795955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 AAACTTGGCTTGGCCAGTGTGTGTCTGGGGCAGGAGCAGAGGCCGGGACACAGCTGAGCT 1768

 40795956 GCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTC 40796015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1769 GCCCACAGGAGCTATTTTTGCCCCCACACTTGTATGTCTTTAAAGAGAACTGGGATTTTC 1828

 40796016 TCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAAT 40796075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 TCACAGCTCCTTTGAAGTGGTGGTTTGATTTTCCTCTTTTTTGCTTCTCACTTACCTAAT 1888

 40796076 TCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAAT 40796135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 TCTTCCCGATTTATCTAGAATTCCCAACACCAGAATTCCATGGCAGATAGCATGGAGAAT 1948

 40796136 AGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAAT 40796195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 AGGTTCTGTTATGGACCAGGATAACAACTGTCATTTCTGAATTCTCATTGTGTGAAAAAT 2008

 40796196 GGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAA 40796255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 GGCAAAAGTAAATTTTTCTTCAGTGCCAGGTTTAGGTAAATATGATTTCAAAAACCGGAA 2068

 40796256 TGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTA 40796315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 TGTAACTTGTCTTGAAATCTTTCAACCACATCTCCTCGTTGTCACCTACTTCCTTTCGTA 2128

 40796316 GAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGC 40796375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 GAGTGAGAGCCTTTAATTCTGTGGTTAGAAGTAAAAGGAAGTAAAGGCTTGGCCGGGCGC 2188

 40796376 GGT 40796378
          |||
     2189 GGT 2191

Alignment time is 1.63632 s

