
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5397] =>      5397 nucs 'mol-32-1f0b-193077_5397'

Score:        5189
Aligned:      5401        nucs
Identic:      5376 (100%) nucs =>      2172 ( 99%)      3204 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189770692,189772885] EXCISED REGION [189772901,189776107]
 second seq =>  [        1,     2185] EXCISED REGION [     2191,     5397]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [189772886,189772900]
 second seq =>         5 nucs [2186,2190]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189772885,189772885] to [189772900,189772900]
 second seq =>         1 nucs [2186,2186] to [2191,2191]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2186,2186] to [2190,2190]

189770692 AAGTGAGCTTACAGGTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCA 189770751
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGTGAGCTTACACGTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCA 60

189770752 CAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTA 189770811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTA 120

189770812 AAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTAC 189770871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTAC 180

189770872 ATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAAATGGCC 189770931
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
      181 ATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAA-TGGCC 239

189770932 GGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCAC 189770991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 GGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCAC 299

189770992 GAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAAT 189771051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 GAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAAT 359

189771052 ACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGT 189771111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 ACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGT 419

189771112 TAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACT 189771171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 TAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACT 479

189771172 GCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAA 189771231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 GCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAA 539

189771232 ATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAAC 189771291
          ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||
      540 ATAAATAAATAAATAAATAAATAA--------GCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAAC 591

189771292 TCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACC 189771351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      592 TCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACC 651

189771352 CTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTT 189771411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      652 CTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTT 711

189771412 CGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCAC 189771471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      712 CGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCAC 771

189771472 CACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGG 189771531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 CACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGG 831

189771532 ATTACAGGCATACGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 189771591
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 ATTACAGGCATATGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 891

189771592 TCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGGCCT 189771651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      892 TCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGGCCT 951

189771652 CCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGC 189771711
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      952 CCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGC 1011

189771712 TATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTC 189771771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 TATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTC 1071

189771772 TGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACA 189771831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 TGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACA 1131

189771832 TTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTCGTCA 189771891
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1132 TTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTGGTCA 1191

189771892 ATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTT 189771951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 ATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTT 1251

189771952 CTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTGTCTGGT 189772011
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1252 CTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTTTCTGGT 1311

189772012 ACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCACACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGA 189772071
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1312 ACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCAGACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGA 1371

189772072 AGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCT 189772131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 AGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCT 1431

189772132 CTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGA 189772191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 CTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGA 1491

189772192 CATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAG 189772251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 CATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAG 1551

189772252 GACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACCGA 189772311
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1552 GACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACTGA 1611

189772312 GTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTAAAGTCTGTAAAAATCA 189772371
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1612 GTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTGAAGTCTGTAAAAATCA 1671

189772372 GTATGAGAGTGTATACCTCATACTTTTTTCGACAATTAGAAAATACAATGCAAATAAAGT 189772431
          ||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1672 GTATGAGAGTGTATGCCTCATACTTGTTTCGACAATTAGAAAATACAATACAAATAAAGT 1731

189772432 ACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTAT 189772491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 ACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTAT 1791

189772492 ATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACACGGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAAT 189772551
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1792 ATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACACAGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAAT 1851

189772552 TTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTC 189772611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 TTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTC 1911

189772612 AGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTG 189772671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 AGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTG 1971

189772672 CTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGA 189772731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 CTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGA 2031

189772732 GCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCT 189772791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 GCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCT 2091

189772792 GTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATT 189772851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 GTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATT 2151

189772852 AAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGATTATTCTT 189772885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 AAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGATTATTCTT 2185

EXCISED REGION

189772901 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 189772960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 2250

189772961 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 189773020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 2310

189773021 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 189773080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 2370

189773081 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 189773140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 2430

189773141 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 189773200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 2490

189773201 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 189773260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 2550

189773261 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 189773320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 2610

189773321 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 189773380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 2670

189773381 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 189773440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 2730

189773441 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 189773500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 2790

189773501 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 189773560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2791 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 2850

189773561 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 189773620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 2910

189773621 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 189773680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 2970

189773681 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 189773740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 3030

189773741 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 189773800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 3090

189773801 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 189773860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 3150

189773861 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 189773920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 3210

189773921 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 189773980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 3270

189773981 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 189774040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 3330

189774041 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 189774100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 3390

189774101 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 189774160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 3450

189774161 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 189774220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 3510

189774221 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 189774280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 3570

189774281 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 189774340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 3630

189774341 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 189774400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 3690

189774401 GAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 189774460
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 AAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 3750

189774461 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 189774520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 3810

189774521 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 189774580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 3870

189774581 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 189774640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 3930

189774641 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 189774700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 3990

189774701 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 189774760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 4050

189774761 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 189774820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 4110

189774821 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 189774880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 4170

189774881 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 189774940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 4230

189774941 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 189775000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 4290

189775001 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 189775060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 4350

189775061 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 189775120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 4410

189775121 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 189775180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4411 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 4470

189775181 TACGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 189775240
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4471 TATGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 4530

189775241 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 189775300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4531 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 4590

189775301 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCG 189775360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4591 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCG 4650

189775361 CTTAAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAA 189775420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4651 CTTAAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAA 4710

189775421 ATTATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCAT 189775480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4711 ATTATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCAT 4770

189775481 GCCCTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTA 189775540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4771 GCCCTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTA 4830

189775541 GGGCTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGGTCTTGAA 189775600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4831 GGGCTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGCTCTTGAA 4890

189775601 TTGGAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCC 189775660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4891 TTGGAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCC 4950

189775661 TAGAGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATT 189775720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4951 TAGAGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATT 5010

189775721 GTAACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATAT 189775780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5011 GTAACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATAT 5070

189775781 GCTGTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCC 189775840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5071 GCTGTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCC 5130

189775841 AAAAAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTT 189775900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5131 AAAAAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTT 5190

189775901 TCTATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTT 189775960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5191 TCTATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTT 5250

189775961 GCTCTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAA 189776020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5251 GCTCTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAA 5310

189776021 ACATGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTGGATTATATTCCTGTGTGTGTGTATGT 189776080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5311 ACATGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTGGATTATATTCCTGTGTGTGTGTATGT 5370

189776081 GTGTATGTATACAATATTTTATATTTG 189776107
          |||||||||||||||||||||||||||
     5371 GTGTATGTATACAATATTTTATATTTG 5397

Alignment time is 5.16887 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2305] =>      2305 nucs 'mol-32-1f63-001363_2305'

Score:        2162
Aligned:      2305        nucs
Identic:      2292 ( 99%) nucs =>       750 (100%)      1542 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189770472,189771222] EXCISED REGION [189771231,189772784]
 second seq =>  [        1,      751] EXCISED REGION [      752,     2305]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [189771223,189771230]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        33 nucs [189771223,189771255] to [189771231,189771263]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [189771223,189771226] to [189771227,189771230]
 second seq =>         0 nucs

189770472 AATCGTATGAGTTTTGAAATTGCACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCATGTAAA 189770531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATCGTATGAGTTTTGAAATTGCACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCATGTAAA 60

189770532 TAAATTATATAAAACAAGTTTATAAACATATATGCATGTATAATTATTTGTTCTTCTAAT 189770591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAATTATATAAAACAAGTTTATAAACATATATGCATGTATAATTATTTGTTCTTCTAAT 120

189770592 CCATATTCCTTACTTTATTATCTTATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGT 189770651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCATATTCCTTACTTTATTATCTTATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGT 180

189770652 AATATAAATTTTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACAGGTATGC 189770711
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      181 AATATAAATTTTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACACGTATGC 240

189770712 TATTAAAAAACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTAT 189770771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATTAAAAAACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTAT 300

189770772 GTTATTATTTCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTC 189770831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTATTATTTCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTC 360

189770832 TCTATCAATAAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACA 189770891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTATCAATAAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACA 420

189770892 TTAAATAGGAAAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAAATGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCT 189770951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAAATAGGAAAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAAATGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCT 480

189770952 GTAATCCCAGCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACC 189771011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAATCCCAGCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACC 540

189771012 ATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGT 189771071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGT 600

189771072 GGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAAC 189771131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAAC 660

189771132 CCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACA 189771191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACA 720

189771192 GAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAATG 189771222
          |||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAATG 751

EXCISED REGION

189771231 AATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAA 189771290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 AATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAA 811

189771291 CTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTAC 189771350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      812 CTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTAC 871

189771351 CCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTT 189771410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      872 CCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTT 931

189771411 TCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCA 189771470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 TCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCA 991

189771471 CCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 189771530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 CCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 1051

189771531 GATTACAGGCATACGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTT 189771590
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 GATTACAGGCATATGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTT 1111

189771591 CTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGGCC 189771650
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1112 CTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGGCC 1171

189771651 TCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTTTG 189771710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1172 TCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTTTG 1231

189771711 CTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCT 189771770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 CTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCT 1291

189771771 CTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATAC 189771830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 CTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATAC 1351

189771831 ATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTCGTC 189771890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1352 ATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTGGTC 1411

189771891 AATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATT 189771950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 AATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATT 1471

189771951 TCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTGTCTGG 189772010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1472 TCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTTTCTGG 1531

189772011 TACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCACACAGCAGAGAGCAGAGAGAGG 189772070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1532 TACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCAGACAGCAGAGAGCAGAGAGAGG 1591

189772071 AAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCC 189772130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 AAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCC 1651

189772131 TCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGG 189772190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 TCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGG 1711

189772191 ACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTA 189772250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 ACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTA 1771

189772251 GGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACCG 189772310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1772 GGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACTG 1831

189772311 AGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTAAAGTCTGTAAAAATC 189772370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1832 AGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTGAAGTCTGTAAAAATC 1891

189772371 AGTATGAGAGTGTATACCTCATACTTTTTTCGACAATTAGAAAATACAATGCAAATAAAG 189772430
          |||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1892 AGTATGAGAGTGTATGCCTCATACTTGTTTCGACAATTAGAAAATACAATACAAATAAAG 1951

189772431 TACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTA 189772490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 TACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTA 2011

189772491 TATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACACGGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAA 189772550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2012 TATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACACAGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAA 2071

189772551 TTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTT 189772610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTT 2131

189772611 CAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCT 189772670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 CAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCT 2191

189772671 GCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAG 189772730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 GCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAG 2251

189772731 AGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATAT 189772784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 AGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATAT 2305

Alignment time is 2.22059 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3302] =>      3302 nucs 'mol-32-208c-019305_3302'

Score:        3290
Aligned:      3301        nucs
Identic:      3300 (100%) nucs =>       320 (100%)      2980 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189774863,189775182] EXCISED REGION [189775184,189778164]
 second seq =>  [        1,      320] EXCISED REGION [      322,     3302]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [189775183,189775183]
 second seq =>         1 nucs [321,321]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

189774863 AAATTCAATGTAATTAATACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACAT 189774922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATTCAATGTAATTAATACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACAT 60

189774923 ACTGTCAGTGTAGACTGAAAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATA 189774982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTGTCAGTGTAGACTGAAAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATA 120

189774983 CCCTAAATTCTACAGGCAGGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAA 189775042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCTAAATTCTACAGGCAGGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAA 180

189775043 AGGAAAAGGAAAAGGAAAGATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGAC 189775102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGAAAAGGAAAAGGAAAGATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGAC 240

189775103 TAGAGCTAATGAAGATTATTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAAT 189775162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGAGCTAATGAAGATTATTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAAT 300

189775163 TAGTCCAGCAATATTTTTTA 189775182
          ||||||||||||||||||||
      301 TAGTCCAGCAATATTTTTTA 320

EXCISED REGION

189775184 GGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGACAC 189775243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      322 GGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGACAC 381

189775244 AGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTTTAA 189775303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      382 AGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTTTAA 441

189775304 GAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCGCTT 189775363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      442 GAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCGCTT 501

189775364 AAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAAATT 189775423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      502 AAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAAATT 561

189775424 ATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCATGCC 189775483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      562 ATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCATGCC 621

189775484 CTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTAGGG 189775543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      622 CTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTAGGG 681

189775544 CTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGGTCTTGAATTG 189775603
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      682 CTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGCTCTTGAATTG 741

189775604 GAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCCTAG 189775663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      742 GAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCCTAG 801

189775664 AGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATTGTA 189775723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      802 AGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATTGTA 861

189775724 ACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATATGCT 189775783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      862 ACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATATGCT 921

189775784 GTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCCAAA 189775843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      922 GTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCCAAA 981

189775844 AAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTTTCT 189775903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      982 AAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTTTCT 1041

189775904 ATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTTGCT 189775963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1042 ATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTTGCT 1101

189775964 CTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAAACA 189776023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1102 CTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAAACA 1161

189776024 TGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTGGATTATATTCCTGTGTGTGTGTATGTGTG 189776083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1162 TGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTGGATTATATTCCTGTGTGTGTGTATGTGTG 1221

189776084 TATGTATACAATATTTTATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAAGAATTTAATTTTGCA 189776143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1222 TATGTATACAATATTTTATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAAGAATTTAATTTTGCA 1281

189776144 ATTACTGATTTTCCTGAGATCCTAAAGGGTTAATGTGCTTTTGGAATTTTCTCTGGGTTT 189776203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1282 ATTACTGATTTTCCTGAGATCCTAAAGGGTTAATGTGCTTTTGGAATTTTCTCTGGGTTT 1341

189776204 TTGGCTTTGTTTTGTTGGTTGGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATTCAG 189776263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1342 TTGGCTTTGTTTTGTTGGTTGGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATTCAG 1401

189776264 GGGGTACATATACACACACAACACAACATGCATTTATCCATTCATCTTGTCATGACCACT 189776323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1402 GGGGTACATATACACACACAACACAACATGCATTTATCCATTCATCTTGTCATGACCACT 1461

189776324 TAGGTTGATTCCACCTTGTAGCTATTATGAATAATGCTGCTATAAACATTTTATACAAAT 189776383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1462 TAGGTTGATTCCACCTTGTAGCTATTATGAATAATGCTGCTATAAACATTTTATACAAAT 1521

189776384 ATCTATTCAGGTGTTCGCTTTCATTACTTTTAGGTATGTGCACAGAAGTTGAATTGCTGG 189776443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1522 ATCTATTCAGGTGTTCGCTTTCATTACTTTTAGGTATGTGCACAGAAGTTGAATTGCTGG 1581

189776444 CTCATATGCTAATTCTATAATTATTTGAGCAAACAAATTATTCGAGGAAACATACACTTT 189776503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1582 CTCATATGCTAATTCTATAATTATTTGAGCAAACAAATTATTCGAGGAAACATACACTTT 1641

189776504 CTACAGTGGCTGCCTAATTTTACTGTCCTACCAGCAATGCACAAGGCTGCTAAATTCTTC 189776563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1642 CTACAGTGGCTGCCTAATTTTACTGTCCTACCAGCAATGCACAAGGCTGCTAAATTCTTC 1701

189776564 ACATTAGTGCCAACATTTGTTTTCCATTTGTTTTTCTTCTTATAATAGCAATCCACTTGT 189776623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 ACATTAGTGCCAACATTTGTTTTCCATTTGTTTTTCTTCTTATAATAGCAATCCACTTGT 1761

189776624 GAAGTGGTATCTCATTTTGCTTTGATTTGCATTTCCTTAATGATTAATAACACTGAATAT 189776683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 GAAGTGGTATCTCATTTTGCTTTGATTTGCATTTCCTTAATGATTAATAACACTGAATAT 1821

189776684 CTTTTCATGTGCTTATTGAACATTTATGTATTTTTCTGTGTTTTTTCCTGGTAAGAACAT 189776743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 CTTTTCATGTGCTTATTGAACATTTATGTATTTTTCTGTGTTTTTTCCTGGTAAGAACAT 1881

189776744 TTGTTGAGAGAAAATGTTCAATATTTGCACTAAAAGATTAGCAGTCTTTGTGGATTTTAT 189776803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 TTGTTGAGAGAAAATGTTCAATATTTGCACTAAAAGATTAGCAGTCTTTGTGGATTTTAT 1941

189776804 ATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAATAATTTAATTTTGCAATTACTGATTTTCCTGAGA 189776863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 ATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAATAATTTAATTTTGCAATTACTGATTTTCCTGAGA 2001

189776864 TCTTAAAGGGTTAATATGCTTTTGGAATTTTCTCTGGGTTTTTTGGTTTGTTTTTTTGGT 189776923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 TCTTAAAGGGTTAATATGCTTTTGGAATTTTCTCTGGGTTTTTTGGTTTGTTTTTTTGGT 2061

189776924 TTGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATTCAGGGGATACATGTGCAGGTTT 189776983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 TTGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATTCAGGGGATACATGTGCAGGTTT 2121

189776984 TTTTTCATGGGTATATTGTGTGATGCTGAGGTTTATGGCATGGAGGTAGTGGATTATTCT 189777043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 TTTTTCATGGGTATATTGTGTGATGCTGAGGTTTATGGCATGGAGGTAGTGGATTATTCT 2181

189777044 CAGGTAATGAGAATAGTACCCAATAGGTAGTTTTCCAATCCATGCCCCACTTCCTCCTTC 189777103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 CAGGTAATGAGAATAGTACCCAATAGGTAGTTTTCCAATCCATGCCCCACTTCCTCCTTC 2241

189777104 TCTCATCTAGTAGTCTGCAGTGTCTACTGTTTCCATGTTTATGTCCACATATATATACTC 189777163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 TCTCATCTAGTAGTCTGCAGTGTCTACTGTTTCCATGTTTATGTCCACATATATATACTC 2301

189777164 TATGGTTTTGGAGAACTGATCACTAAAATTGTTTGCCCTTTTGAAAAATAGGTTGTTTGG 189777223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 TATGGTTTTGGAGAACTGATCACTAAAATTGTTTGCCCTTTTGAAAAATAGGTTGTTTGG 2361

189777224 GTTTTTGTGTTGCTGATAACCTATAGGAGCTTTTTTTATATATTCTAAATATTAACTCTT 189777283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 GTTTTTGTGTTGCTGATAACCTATAGGAGCTTTTTTTATATATTCTAAATATTAACTCTT 2421

189777284 TATAAGATATACGATTAGCAAATATGTTCTCTCATTCCATGTGTTGCCTTTTCACTCTGT 189777343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 TATAAGATATACGATTAGCAAATATGTTCTCTCATTCCATGTGTTGCCTTTTCACTCTGT 2481

189777344 TTTTAGTATCCTTTAAAAAATGTTGATCAAGTCCAATATATCTAATTTTTCTTATATTAC 189777403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 TTTTAGTATCCTTTAAAAAATGTTGATCAAGTCCAATATATCTAATTTTTCTTATATTAC 2541

189777404 CTGTGCTTTTGATATTCTTTCAAGAAGTAATTATTGCCAAATCGAATGACATGAATAATT 189777463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 CTGTGCTTTTGATATTCTTTCAAGAAGTAATTATTGCCAAATCGAATGACATGAATAATT 2601

189777464 TTCCCTATTTTTAAAGATTTTTATACTTTTAACTTTTATGCTTAAACTTTAAAATATTTT 189777523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 TTCCCTATTTTTAAAGATTTTTATACTTTTAACTTTTATGCTTAAACTTTAAAATATTTT 2661

189777524 GAGTTTTCTGTATATAAGGAAAAGACTCATATTTCTTATTTTGCATGTGGTTATATCATT 189777583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 GAGTTTTCTGTATATAAGGAAAAGACTCATATTTCTTATTTTGCATGTGGTTATATCATT 2721

189777584 TTCCATTTCTGAGAAGATTGCTATTTTCCTTATTGAATGTTCTTGTCACTTTTGTTGAAA 189777643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 TTCCATTTCTGAGAAGATTGCTATTTTCCTTATTGAATGTTCTTGTCACTTTTGTTGAAA 2781

189777644 ACCCTTTGACCATATATGTGAGGTTTTATTTCTGGGCTCTCTATTCAGCTTCATTGGTCT 189777703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 ACCCTTTGACCATATATGTGAGGTTTTATTTCTGGGCTCTCTATTCAGCTTCATTGGTCT 2841

189777704 ATATGTTTTTCTTTATGCCAGTAATTCACTGTTTTGATTACTATAACAACTTTGTAGTAA 189777763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 ATATGTTTTTCTTTATGCCAGTAATTCACTGTTTTGATTACTATAACAACTTTGTAGTAA 2901

189777764 GTATTGAAATCATGAAGTGAGAGTACTCCAACTTTGTTATTTATTTTCAGTATTGTTAAG 189777823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 GTATTGAAATCATGAAGTGAGAGTACTCCAACTTTGTTATTTATTTTCAGTATTGTTAAG 2961

189777824 GTTACCTGGGTCCCTTAAGAATCCAAATGAACTTTAGGAAGAATGTTTCTATTTCTGCAA 189777883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 GTTACCTGGGTCCCTTAAGAATCCAAATGAACTTTAGGAAGAATGTTTCTATTTCTGCAA 3021

189777884 ACATTATCCTTGGGATTTGATAGAAATTGCATTGAATCTGTAGAATGCATTTGGTCATGC 189777943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 ACATTATCCTTGGGATTTGATAGAAATTGCATTGAATCTGTAGAATGCATTTGGTCATGC 3081

189777944 TCACAATATTAAGTCTTTCCATCTATGAGCACAAATGTCTTTGAGCTTGTGTCTTCTTTA 189778003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 TCACAATATTAAGTCTTTCCATCTATGAGCACAAATGTCTTTGAGCTTGTGTCTTCTTTA 3141

189778004 GTTACTTTCACCAACATTTTGTAATTTTCAATGTACAAGTATTTTATCTCCTTAAGTTTT 189778063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 GTTACTTTCACCAACATTTTGTAATTTTCAATGTACAAGTATTTTATCTCCTTAAGTTTT 3201

189778064 TTCTAGGTATTTTATTCTTTTTATTTTTATATAAAATGGACTTTTTTCTTATTTTTATTT 189778123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 TTCTAGGTATTTTATTCTTTTTATTTTTATATAAAATGGACTTTTTTCTTATTTTTATTT 3261

189778124 TTATTGTTACTATACAGAAATACAACTTTTTTGTTAATATT 189778164
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 TTATTGTTACTATACAGAAATACAACTTTTTTGTTAATATT 3302

Alignment time is 3.14076 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5459] =>      5459 nucs 'mol-32-20fa-105157_5459'

Score:        5317
Aligned:      5460        nucs
Identic:      5447 (100%) nucs =>      3302 (100%)      2145 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189777513,189780823] EXCISED REGION [189780831,189782978]
 second seq =>  [        1,     3311] EXCISED REGION [     3312,     5459]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [189780824,189780830]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [189780824,189780842] to [189780831,189780849]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [189780824,189780826] to [189780828,189780830]
 second seq =>         0 nucs

189777513 TAAAATATTTTGAGTTTTCTGTATATAAGGAAAAGACTCATATTTCTTATTTTGCATGTG 189777572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAAATATTTTGAGTTTTCTGTATATAAGGAAAAGACTCATATTTCTTATTTTGCATGTG 60

189777573 GTTATATCATTTTCCATTTCTGAGAAGATTGCTATTTTCCTTATTGAATGTTCTTGTCAC 189777632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTATATCATTTTCCATTTCTGAGAAGATTGCTATTTTCCTTATTGAATGTTCTTGTCAC 120

189777633 TTTTGTTGAAAACCCTTTGACCATATATGTGAGGTTTTATTTCTGGGCTCTCTATTCAGC 189777692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTGTTGAAAACCCTTTGACCATATATGTGAGGTTTTATTTCTGGGCTCTCTATTCAGC 180

189777693 TTCATTGGTCTATATGTTTTTCTTTATGCCAGTAATTCACTGTTTTGATTACTATAACAA 189777752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCATTGGTCTATATGTTTTTCTTTATGCCAGTAATTCACTGTTTTGATTACTATAACAA 240

189777753 CTTTGTAGTAAGTATTGAAATCATGAAGTGAGAGTACTCCAACTTTGTTATTTATTTTCA 189777812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTGTAGTAAGTATTGAAATCATGAAGTGAGAGTACTCCAACTTTGTTATTTATTTTCA 300

189777813 GTATTGTTAAGGTTACCTGGGTCCCTTAAGAATCCAAATGAACTTTAGGAAGAATGTTTC 189777872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTATTGTTAAGGTTACCTGGGTCCCTTAAGAATCCAAATGAACTTTAGGAAGAATGTTTC 360

189777873 TATTTCTGCAAACATTATCCTTGGGATTTGATAGAAATTGCATTGAATCTGTAGAATGCA 189777932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATTTCTGCAAACATTATCCTTGGGATTTGATAGAAATTGCATTGAATCTGTAGAATGCA 420

189777933 TTTGGTCATGCTCACAATATTAAGTCTTTCCATCTATGAGCACAAATGTCTTTGAGCTTG 189777992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTGGTCATGCTCACAATATTAAGTCTTTCCATCTATGAGCACAAATGTCTTTGAGCTTG 480

189777993 TGTCTTCTTTAGTTACTTTCACCAACATTTTGTAATTTTCAATGTACAAGTATTTTATCT 189778052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTCTTCTTTAGTTACTTTCACCAACATTTTGTAATTTTCAATGTACAAGTATTTTATCT 540

189778053 CCTTAAGTTTTTTCTAGGTATTTTATTCTTTTTATTTTTATATAAAATGGACTTTTTTCT 189778112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTTAAGTTTTTTCTAGGTATTTTATTCTTTTTATTTTTATATAAAATGGACTTTTTTCT 600

189778113 TATTTTTATTTTTATTGTTACTATACAGAAATACAACTTTTTTGTTAATATTGTATCATG 189778172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATTTTTATTTTTATTGTTACTATACAGAAATACAACTTTTTTGTTAATATTGTATCATG 660

189778173 CAACATTGTTGAATTTTTAAATTTGTTCTAACAGTTTGGTTTTTTGTGGACCTTTGAGTT 189778232
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAACATTGTTGAATTTTTAAATTTGTTCCAACAGTTTGGTTTTTTGTGGACCTTTGAGTT 720

189778233 TTTTTCGTACAGCATCATGCCATCTCTGAACAGAAATCATTTTACTTTTTCTTTCCAATT 189778292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTTCGTACAGCATCATGCCATCTCTGAACAGAAATCATTTTACTTTTTCTTTCCAATT 780

189778293 TAATTGCCTTTTACTTTTGTTTCTTTCTGAATTTCTGTGACTATAACTTTCAATACCGTG 189778352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAATTGCCTTTTACTTTTGTTTCTTTCTGAATTTCTGTGACTATAACTTTCAATACCGTG 840

189778353 TTAGAAACTTTCCATATTGTGTTACTGAACTGGTGAAAGCAGGCATCCTTATCTTCTTCC 189778412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAGAAACTTTCCATATTGTGTTACTGAACTGGTGAAAGCAGGCATCCTTATCTTCTTCC 900

189778413 TTTTCCTAGCATAAAAGCTTTCAGAATTTTATCATTGCATATGATATTACCTGTAGGCTT 189778472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTCCTAGCATAAAAGCTTTCAGAATTTTATCATTGCATATGATATTACCTGTAGGCTT 960

189778473 CTCATATATGTTCATTATTATAATGAAAAAGTTTCCTTGTAATCCTGGTATGTTGGGCAT 189778532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCATATATGTTCATTATTATAATGAAAAAGTTTCCTTGTAATCCTGGTATGTTGGGCAT 1020

189778533 TAAAAAAAACACAAAAGTGAACTAAATTTTGTCAAATGCTTTATCTAATAAACTACCTTT 189778592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAAAAAAACACAAAAGTGAACTAAATTTTGTCAAATGCTTTATCTAATAAACTACCTTT 1080

189778593 CTGTCTGATTACATGCTTTGCTTGATTTTTAATCTTATTAAGTGTTTTTACATCAGTCTT 189778652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGTCTGATTACATGCTTTGCTTGATTTTTAATCTTATTAAGTGTTTTTACATCAGTCTT 1140

189778653 ACTGCTTATCAGTCTATCCTGGAGAATATTTCGTATGTTCTCAAAAAAAACCCCATAATT 189778712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACTGCTTATCAGTCTATCCTGGAGAATATTTCGTATGTTCTCAAAAAAAACCCCATAATT 1200

189778713 TTCTGTTGGTGAAGTAATTACAAATACCATCTTATGTTAGTTAGTAGTTTATTATTATTA 189778772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCTGTTGGTGAAGTAATTACAAATACCATCTTATGTTAGTTAGTAGTTTATTATTATTA 1260

189778773 TATAGTGCAGCCACTCTGGATTCTGATTTTTCTCTAAGGGGGTTGTGTTCATTGCTGCTT 189778832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATAGTGCAGCCACTCTGGATTCTGATTTTTCTCTAAGGGGGTTGTGTTCATTGCTGCTT 1320

189778833 TACTTGTTTCTTTGTTTAGTAATTTGCCTGGATTCCATTTGTGAATTGTGCCTTTCTCAC 189778892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TACTTGTTTCTTTGTTTAGTAATTTGCCTGGATTCCATTTGTGAATTGTGCCTTTCTCAC 1380

189778893 AGAGTAAAAATGCCAATGTCACTGATTATTTTTTATTATTCTTGTTTTAACTTTAAGTTT 189778952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAGTAAAAATGCCAATGTCACTGATTATTTTTTATTATTCTTGTTTTAACTTTAAGTTT 1440

189778953 GTTTTCCTGCGGGTCACTTCAGTGTCAGTACAAATTAGTGGTCGGTTCATGATTTGTGGT 189779012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTTTCCTGCGGGTCACTTCAGTGTCAGTACAAATTAGTGGTCGGTTCATGATTTGTGGT 1500

189779013 TGACTTTAAATACCATGAACAAGTAAAGTTTCCATTCTCTGCTGATAAATCTTGTTTAGG 189779072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGACTTTAAATACCATGAACAAGTAAAGTTTCCATTCTCTGCTGATAAATCTTGTTTAGG 1560

189779073 ATGGAACTACAATAAAAAATTAGGAAGTTTACATATCTAATTTGATTTCTGCTCTCCTTC 189779132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGGAACTACAATAAAAAATTAGGAAGTTTACATATCTAATTTGATTTCTGCTCTCCTTC 1620

189779133 AGGCCCTCTCTATCCCCTCTGCGTATGTGCACGGCTTCAAGTTTAGCTGAGGAAGTTTAG 189779192
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1621 AGGCCCTCTCTATCCCCTCTGCGTATGTGCACGGCTTCAAGTTTAGCTGTGGAAGTTTAG 1680

189779193 ATTGCAAGACCACTCCCAAATCTCTCCTATGTAGCCTTATTTGTTCATGCAGCATTCCAG 189779252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTGCAAGACCACTCCCAAATCTCTCCTATGTAGCCTTATTTGTTCATGCAGCATTCCAG 1740

189779253 ACTGCCAGCGATATATAGCATCTCGTAGACGCTCCTTTTTACTTTTTCATTTCCCAGATT 189779312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTGCCAGCGATATATAGCATCTCGTAGACGCTCCTTTTTACTTTTTCATTTCCCAGATT 1800

189779313 TCCCTGTTAAGCTTCAGCGCAGTCTGCCTGGTTGTTACTTTCCCCAACCAGGACTGCAAT 189779372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCCTGTTAAGCTTCAGCGCAGTCTGCCTGGTTGTTACTTTCCCCAACCAGGACTGCAAT 1860

189779373 AGGAGAATTACTGTGATGGCCCTTTCCCCTTTTGTTTGCCACTGATATTATTACATTTTC 189779432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGGAGAATTACTGTGATGGCCCTTTCCCCTTTTGTTTGCCACTGATATTATTACATTTTC 1920

189779433 AGGCAATTCCTCAGCCATGAGATTATTTTCATTCTTCACTACAAATCAAGCAAGCACACC 189779492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGGCAATTCCTCAGCCATGAGATTATTTTCATTCTTCACTACAAATCAAGCAAGCACACC 1980

189779493 TCAGCAGCAGAGATGCCAGTTTTCATAGCTTGTCCTTCCCTGACAGGAATTCTAAACACA 189779552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCAGCAGCAGAGATGCCAGTTTTCATAGCTTGTCCTTCCCTGACAGGAATTCTAAACACA 2040

189779553 CAGAGTGAGGTGTAGGAGAGTAAGGAAAGGTCCTGCTAAGAATGCTATGACTCCCATGGT 189779612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGAGTGAGGTGTAGGAGAGTAAGGAAAGGTCCTGCTAAGAATGCTATGACTCCCATGGT 2100

189779613 TCTTACCCAAGGTATAGTAGTTTTTCTTGAATAAATGCTTTTTAGTTTGTTGTGTTCTTT 189779672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCTTACCCAAGGTATAGTAGTTTTTCTTGAATAAATGCTTTTTAGTTTGTTGTGTTCTTT 2160

189779673 TAGTCAATTTCCAGAATTCTTTTCTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTGAAATGGAGTTTC 189779732
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     2161 TAGTCAATTTCCAGAATTCTTTTCTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTT-GAAATGGAGTTTC 2219

189779733 ATTTTGTCGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCTTCTCACTGCAGCCTCCACCTC 189779792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 ATTTTGTCGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCTTCTCACTGCAGCCTCCACCTC 2279

189779793 CTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCCTCCTGAGCAGCTGGGATTACAGGTGCCCA 189779852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCCTCCTGAGCAGCTGGGATTACAGGTGCCCA 2339

189779853 CCACCATGCCAGCCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTTGGCCA 189779912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2340 CCACCATGCCAGCCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCACCGTGTTGGCCA 2399

189779913 GGCACGTCTCGAACTACTAACCTCAGGTGATCCGCCACCCTCGGCCTCCGAAAGTACTGG 189779972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 GGCACGTCTCGAACTACTAACCTCAGGTGATCCGCCACCCTCGGCCTCCGAAAGTACTGG 2459

189779973 GATTACAGGCCTGAGCCACTGCACCCGGCCAATATCCGGCCAGTTTCTGGAGTTCTGAAA 189780032
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2460 GATTACAGGCCTGAGCCACTGCACCTGGCCAATATCCAGCCAGTTTCTGGAGTTCTGAAA 2519

189780033 TGGTTGTTTTTGACAACTTGGTCTGGTTTGATAATTCTGTTCTGAGATACAAAATTGTCC 189780092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TGGTTGTTTTTGACAACTTGGTCTGGTTTGATAATTCTGTTCTGAGATACAAAATTGTCC 2579

189780093 AACCCTTCGCCTCACTAATCCAGAAGTCCTGTCAAAACACCAGCTAAAACACACTTGAAA 189780152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2580 AACCCTTCGCCTCACTAATCCAGAAGTCCTGTCAAAACACCAGCTAAAATACACTTGAAA 2639

189780153 TATTCCATTTCATCACCAAAGAAAGGGAAGTAATCTCAAATTTGTATTATCCTCAGCTTC 189780212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TATTCCATTTCATCACCAAAGAAAGGGAAGTAATCTCAAATTTGTATTATCCTCAGCTTC 2699

189780213 ACAGAACTAAAGTATCTTACACTGAGTTAACACAACTGACATCTTTTAATCATAGGTGAG 189780272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ACAGAACTAAAGTATCTTACACTGAGTTAACACAACTGACATCTTTTAATCATAGGTGAG 2759

189780273 GGATTCATGACAAAGTGAAGATTTAGTGATATTAAAGATAGAACTATAAATATTGCATTA 189780332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 GGATTCATGACAAAGTGAAGATTTAGTGATATTAAAGATAGAACTATAAATATTGCATTA 2819

189780333 CAGTATTAGAGACAATAATTATAATAACTATTTTTACTAGTGCTCAAATGTACTTTAATT 189780392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CAGTATTAGAGACAATAATTATAATAACTATTTTTACTAGTGCTCAAATGTACTTTAATT 2879

189780393 GAATAATGTCACATTGGCTCTGGATATTACTGAAATAACATGAAATAAGGAAGATAGGAA 189780452
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2880 GAATAATGTCACATTGGCTCTGGATATTACTGAAATAACATGAAAGAAGGAAGATAGGAA 2939

189780453 TATAAACTACAGAGAATGCACATTAAAGCATCAAGTCAAAAGTTTTTTTTTTT-AATTTA 189780511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     2940 TATAAACTACAGAGAATGCACATTAAAGCATCAAGTCAAAAGTTTTTTTTTTTTAATTTA 2999

189780512 GAAGGCAAATCTTTGTGACTCAGAGACAATAAAAGAACCAATCAAGAGGCCGGTGGCTCA 189780571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 GAAGGCAAATCTTTGTGACTCAGAGACAATAAAAGAACCAATCAAGAGGCCGGTGGCTCA 3059

189780572 CGCATGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGCGGGGCAGATCACAAGGTCAAGAGATGG 189780631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CGCATGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGCGGGGCAGATCACAAGGTCAAGAGATGG 3119

189780632 AAAACATTTTGGCCAAATGGTGAAACCCCGTCTCTCCTAAAAATACAAAAATTAGCTGAG 189780691
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 AAATCATTTTGGCCAAATGGTGAAACCCCGTCTCTCCTAAAAATACAAAAATTAGCTGAG 3179

189780692 CATGGTGGCGCACACCTGTAGTCCCAGTTACTCAGGAGGCTGAGGCAAGAGAATCACTTG 189780751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CATGGTGGCGCACACCTGTAGTCCCAGTTACTCAGGAGGCTGAGGCAAGAGAATCACTTG 3239

189780752 AACCTAGGAGGCAGAGGGTACAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGCGA 189780811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 AACCTAGGAGGCAGAGGGTACAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGCGA 3299

189780812 CAGAGCAAGAAT 189780823
          ||||||||||||
     3300 CAGAGCAAGAAT 3311

EXCISED REGION

189780831 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAATCTTCTTGATTTTGCTTTAAAAAGAAAATAAATTTAA 189780890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAATCTTCTTGATTTTGCTTTAAAAAGAAAATAAATTTAA 3371

189780891 ACTGCAACAGTAGTTGTTTTAACATTATATAGTTTAGGAAACTCTAATTTTAAAGTATAC 189780950
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 ACTGCAACAGTAGTTGTTTTAATATTATATAGTTTAGGAAACTCTAATTTTAAAGTATAC 3431

189780951 ATGGTTCAACTATGTAAATAAAATGAATAATACTGAACACAGAGGGTATTTCCTATAAAG 189781010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 ATGGTTCAACTATGTAAATAAAATGAATAATACTGAACACAGAGGGTATTTCCTATAAAG 3491

189781011 AGCAACTACAACTCAGCTCTGAATACTTTTCCTCAGGCAAGAGGCCTGTCACACTATTAG 189781070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 AGCAACTACAACTCAGCTCTGAATACTTTTCCTCAGGCAAGAGGCCTGTCACACTATTAG 3551

189781071 AGAGATCTGATTATTTTATGAGAAGACAGTAAGTCAGATCTTTAAAATGTGAAATGTCCT 189781130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 AGAGATCTGATTATTTTATGAGAAGACAGTAAGTCAGATCTTTAAAATGTGAAATGTCCT 3611

189781131 GAAAAAAATGCATTACATGTATATTTCTAAGTGTGTATATATAGATACACACATACTTAA 189781190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 GAAAAAAATGCATTACATGTATATTTCTAAGTGTGTATATATAGATACACACATACTTAA 3671

189781191 CCAGATTTTACACCTCTAATATAGACATGTATATATTTTTTCGAGCAGCTTCAAAAACAT 189781250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 CCAGATTTTACACCTCTAATATAGACATGTATATATTTTTTCGAGCAGCTTCAAAAACAT 3731

189781251 GTATCCTCATGAACATCTCAATGTCATGTAGTCAATGAAATTGAACTGTAACATTTTAGA 189781310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 GTATCCTCATGAACATCTCAATGTCATGTAGTCAATGAAATTGAACTGTAACATTTTAGA 3791

189781311 CAGCTGTCAAAATCAGCTCAATCCAAATTATGAGTTAGCATAATATTAGGTTTTACATTC 189781370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3792 CAGCTGTCAAAATCAGCTCAATCCAAATTATGAGTTAGCATAATATTAGGTTTTACATTC 3851

189781371 CTCAAGAAATAAGGCAGAATGACTTATTGATAAATAAAAATTAGTCAGTTTTTATAACCA 189781430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 CTCAAGAAATAAGGCAGAATGACTTATTGATAAATAAAAATTAGTCAGTTTTTATAACCA 3911

189781431 ATTTATAAGAATATTGTTAAATGGAAGAATTTTCGATAAAATTATTAGAATAAATACCAC 189781490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 ATTTATAAGAATATTGTTAAATGGAAGAATTTTCGATAAAATTATTAGAATAAATACCAC 3971

189781491 TTAGCTATATCATCTCCAAAATAGAGGTTTAAGTTAAAGAAACCACCTAATAAAACAAAC 189781550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 TTAGCTATATCATCTCCAAAATAGAGGTTTAAGTTAAAGAAACCACCTAATAAAACAAAC 4031

189781551 ATTTGTTAAACTTTTACTATGTTCCAGGCACTCTGCTAAACAACAGACATATAAATGTGA 189781610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 ATTTGTTAAACTTTTACTATGTTCCAGGCACTCTGCTAAACAACAGACATATAAATGTGA 4091

189781611 AAAGGCCATGGTTAATGAGATGTATAGTACTGCATATGTTTTTTAAAAAAAATATTCTTT 189781670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4092 AAAGGCCATGGTTAATGAGATGTATAGTACTGCATATGTTTTTTTAAAAAAATATTCTTT 4151

189781671 TGTGTATACATATACTGCAGACAGAGGAAGAAAGTCGTTTAAATTTTCAATAGTGTGATT 189781730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 TGTGTATACATATACTGCAGACAGAGGAAGAAAGTCGTTTAAATTTTCAATAGTGTGATT 4211

189781731 AGGCAAGGCATTTCAAGAACAATTCTATTTCTGGTAATTTATTTTTCATTGATAATTAGA 189781790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 AGGCAAGGCATTTCAAGAACAATTCTATTTCTGGTAATTTATTTTTCATTGATAATTAGA 4271

189781791 GTTATAGGCAAGAAGGTTGTTACAAGAAACTTATTCATAATATAGATATGTAATTTAATA 189781850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4272 GTTATAGGCAAGAAGGTTGTTACAAGAAACTTATTCATAATATAGATATGTAATTTAATA 4331

189781851 TTCAACATGGAAAAATTTATGAACTGCATAAATAAGATTGAACACGCTGACATTAAAATT 189781910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4332 TTCAACATGGAAAAATTTATGAACTGCATAAATAAGATTGAACACGCTGACATTAAAATT 4391

189781911 ATGCTTTCAGGTACATTAAATGATAAATAAATATTCACAATAATATTGTGAGGTGAACAC 189781970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4392 ATGCTTTCAGGTACATTAAATGATAAATAAATATTCACAATAATATTGTGAGGTGAACAC 4451

189781971 AGTGTGTAAATATATAAACAGTGTGATTCCTACTTGATGTTTTTATAGAAAAGTAGATAA 189782030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4452 AGTGTGTAAATATATAAACAGTGTGATTCCTACTTGATGTTTTTATAGAAAAGTAGATAA 4511

189782031 GGGAGTATGAAGAAATGTGGGTGGAATTATAGATAGATAAGTAAACATATAGATATGGAT 189782090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4512 GGGAGTATGAAGAAATGTGGGTGGAATTATAGATAGATAAGTAAACATATAGATATGGAT 4571

189782091 AGAGTAAGCAGCCATTACAAATATTTTGTTGTATATCTGATTCATATGATTATATAAGAT 189782150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4572 AGAGTAAGCAGCCATTACAAATATTTTGTTGTATATCTGATTCATATGATTATATAAGAT 4631

189782151 TTCTTTCTTTATACACTTCTGGAATGTTTAAATGTTTATATGGAGATTCCATATTAAATT 189782210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4632 TTCTTTCTTTATACACTTCTGGAATGTTTAAATGTTTATATGGAGATTCCATATTAAATT 4691

189782211 CCTAATCAGAACATAAAATTAAAGACCTTTCTCTGGCTACCTACTCTCTAGCCCACTTCC 189782270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4692 CCTAATCAGAACATAAAATTAAAGACCTTTCTCTGGCTACCTACTCTCTAGCCCACTTCC 4751

189782271 TCATTCTGTGAGAGTTATATGCTTCCTTTGAATTCAGTACCCGCATAAACATCTTTGCAT 189782330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4752 TCATTCTGTGAGAGTTATATGCTTCCTTTGAATTCAGTACCCGCATAAACATCTTTGCAT 4811

189782331 TAAAAATAATCATAAGTGATCATGACTTTATCACCTTTAAGAAACTGTAACCTCTTGAAA 189782390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4812 TAAAAATAATCATAAGTGATCATGACTTTATCACCTTTAAGAAACTGTAACCTCTTGAAA 4871

189782391 AGCAGAAATCTTTTAAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGGGTTGT 189782450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4872 AGCAGAAATCTTTTAAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGGGTTGT 4931

189782451 TTGATTTTTATTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTTGTAGATTCTGAATGTTAGACCTTTGCC 189782510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4932 TTGATTTTTATTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTTGTAGATTCTGAATGTTAGACCTTTGCC 4991

189782511 AGATGGATAGATTGCAGAAATTTTCTTCTATTCTGTAGGTTACCTGTTCACTATGATGGT 189782570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4992 AGATGGATAGATTGCAGAAATTTTCTTCTATTCTGTAGGTTACCTGTTCACTATGATGGT 5051

189782571 AGTTTATTTTGCTATGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCAATTTTGGC 189782630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5052 AGTTTATTTTGCTATGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATTTGTCAATTTTGGC 5111

189782631 TTTTGTTGCCATTGCTTTTGGTGCTTGAGTCATGAAGTCTTTACCCATGCTTATGTCCTG 189782690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     5112 TTTTGTTGCCATTGCTTTTGGTGCTTGAGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCTTATGTCCTG 5171

189782691 AATGATATTGCCTAGGTTTTCTTCCAGGGTTTTTATGGTTTTAGGTCTTACATTTAAGTC 189782750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5172 AATGATATTGCCTAGGTTTTCTTCCAGGGTTTTTATGGTTTTAGGTCTTACATTTAAGTC 5231

189782751 TTTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAAGGGGTCCAGTTTCAGTTT 189782810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5232 TTTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAAGGGGTCCAGTTTCAGTTT 5291

189782811 TCTGCTTATGACTAGCCAGTTTTTGCAGCACCATTTATTAAATAGGGAATCTTTTCTACA 189782870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5292 TCTGCTTATGACTAGCCAGTTTTTGCAGCACCATTTATTAAATAGGGAATCTTTTCTACA 5351

189782871 TTGCTTGATTTTTGTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATGGTTGTAGATGTGTGGTGTTATTT 189782930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5352 TTGCTTGATTTTTGTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATGGTTGTAGATGTGTGGTGTTATTT 5411

189782931 CTGAGGCCTCTGTTCTGTTCCATTGGGCTATATACCTGTTTTGATACC 189782978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5412 CTGAGGCCTCTGTTCTGTTCCATTGGGCTATATACCTGTTTTGATACC 5459

Alignment time is 5.09596 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2384] =>      2384 nucs 'mol-32-2105-036244_2384'

Score:        2351
Aligned:      2384        nucs
Identic:      2381 (100%) nucs =>      1599 (100%)       782 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189777583,189779181] EXCISED REGION [189779183,189779967]
 second seq =>  [        1,     1599] EXCISED REGION [     1601,     2384]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [189779182,189779182]
 second seq =>         1 nucs [1600,1600]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [189779705,189779705]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189779181,189779181] to [189779183,189779183]
 second seq =>         1 nucs [1599,1599] to [1601,1601]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

189777583 TTTCCATTTCTGAGAAGATTGCTATTTTCCTTATTGAATGTTCTTGTCACTTTTGTTGAA 189777642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCCATTTCTGAGAAGATTGCTATTTTCCTTATTGAATGTTCTTGTCACTTTTGTTGAA 60

189777643 AACCCTTTGACCATATATGTGAGGTTTTATTTCTGGGCTCTCTATTCAGCTTCATTGGTC 189777702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACCCTTTGACCATATATGTGAGGTTTTATTTCTGGGCTCTCTATTCAGCTTCATTGGTC 120

189777703 TATATGTTTTTCTTTATGCCAGTAATTCACTGTTTTGATTACTATAACAACTTTGTAGTA 189777762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATATGTTTTTCTTTATGCCAGTAATTCACTGTTTTGATTACTATAACAACTTTGTAGTA 180

189777763 AGTATTGAAATCATGAAGTGAGAGTACTCCAACTTTGTTATTTATTTTCAGTATTGTTAA 189777822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTATTGAAATCATGAAGTGAGAGTACTCCAACTTTGTTATTTATTTTCAGTATTGTTAA 240

189777823 GGTTACCTGGGTCCCTTAAGAATCCAAATGAACTTTAGGAAGAATGTTTCTATTTCTGCA 189777882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTTACCTGGGTCCCTTAAGAATCCAAATGAACTTTAGGAAGAATGTTTCTATTTCTGCA 300

189777883 AACATTATCCTTGGGATTTGATAGAAATTGCATTGAATCTGTAGAATGCATTTGGTCATG 189777942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACATTATCCTTGGGATTTGATAGAAATTGCATTGAATCTGTAGAATGCATTTGGTCATG 360

189777943 CTCACAATATTAAGTCTTTCCATCTATGAGCACAAATGTCTTTGAGCTTGTGTCTTCTTT 189778002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCACAATATTAAGTCTTTCCATCTATGAGCACAAATGTCTTTGAGCTTGTGTCTTCTTT 420

189778003 AGTTACTTTCACCAACATTTTGTAATTTTCAATGTACAAGTATTTTATCTCCTTAAGTTT 189778062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTTACTTTCACCAACATTTTGTAATTTTCAATGTACAAGTATTTTATCTCCTTAAGTTT 480

189778063 TTTCTAGGTATTTTATTCTTTTTATTTTTATATAAAATGGACTTTTTTCTTATTTTTATT 189778122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTCTAGGTATTTTATTCTTTTTATTTTTATATAAAATGGACTTTTTTCTTATTTTTATT 540

189778123 TTTATTGTTACTATACAGAAATACAACTTTTTTGTTAATATTGTATCATGCAACATTGTT 189778182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTATTGTTACTATACAGAAATACAACTTTTTTGTTAATATTGTATCATGCAACATTGTT 600

189778183 GAATTTTTAAATTTGTTCTAACAGTTTGGTTTTTTGTGGACCTTTGAGTTTTTTTCGTAC 189778242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAATTTTTAAATTTGTTCTAACAGTTTGGTTTTTTGTGGACCTTTGAGTTTTTTTCGTAC 660

189778243 AGCATCATGCCATCTCTGAACAGAAATCATTTTACTTTTTCTTTCCAATTTAATTGCCTT 189778302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCATCATGCCATCTCTGAACAGAAATCATTTTACTTTTTCTTTCCAATTTAATTGCCTT 720

189778303 TTACTTTTGTTTCTTTCTGAATTTCTGTGACTATAACTTTCAATACCGTGTTAGAAACTT 189778362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTACTTTTGTTTCTTTCTGAATTTCTGTGACTATAACTTTCAATACCGTGTTAGAAACTT 780

189778363 TCCATATTGTGTTACTGAACTGGTGAAAGCAGGCATCCTTATCTTCTTCCTTTTCCTAGC 189778422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCATATTGTGTTACTGAACTGGTGAAAGCAGGCATCCTTATCTTCTTCCTTTTCCTAGC 840

189778423 ATAAAAGCTTTCAGAATTTTATCATTGCATATGATATTACCTGTAGGCTTCTCATATATG 189778482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATAAAAGCTTTCAGAATTTTATCATTGCATATGATATTACCTGTAGGCTTCTCATATATG 900

189778483 TTCATTATTATAATGAAAAAGTTTCCTTGTAATCCTGGTATGTTGGGCATTAAAAAAAAC 189778542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCATTATTATAATGAAAAAGTTTCCTTGTAATCCTGGTATGTTGGGCATTAAAAAAAAC 960

189778543 ACAAAAGTGAACTAAATTTTGTCAAATGCTTTATCTAATAAACTACCTTTCTGTCTGATT 189778602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACAAAAGTGAACTAAATTTTGTCAAATGCTTTATCTAATAAACTACCTTTCTGTCTGATT 1020

189778603 ACATGCTTTGCTTGATTTTTAATCTTATTAAGTGTTTTTACATCAGTCTTACTGCTTATC 189778662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACATGCTTTGCTTGATTTTTAATCTTATTAAGTGTTTTTACATCAGTCTTACTGCTTATC 1080

189778663 AGTCTATCCTGGAGAATATTTCGTATGTTCTCAAAAAAAACCCCATAATTTTCTGTTGGT 189778722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGTCTATCCTGGAGAATATTTCGTATGTTCTCAAAAAAAACCCCATAATTTTCTGTTGGT 1140

189778723 GAAGTAATTACAAATACCATCTTATGTTAGTTAGTAGTTTATTATTATTATATAGTGCAG 189778782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAGTAATTACAAATACCATCTTATGTTAGTTAGTAGTTTATTATTATTATATAGTGCAG 1200

189778783 CCACTCTGGATTCTGATTTTTCTCTAAGGGGGTTGTGTTCATTGCTGCTTTACTTGTTTC 189778842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCACTCTGGATTCTGATTTTTCTCTAAGGGGGTTGTGTTCATTGCTGCTTTACTTGTTTC 1260

189778843 TTTGTTTAGTAATTTGCCTGGATTCCATTTGTGAATTGTGCCTTTCTCACAGAGTAAAAA 189778902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTGTTTAGTAATTTGCCTGGATTCCATTTGTGAATTGTGCCTTTCTCACAGAGTAAAAA 1320

189778903 TGCCAATGTCACTGATTATTTTTTATTATTCTTGTTTTAACTTTAAGTTTGTTTTCCTGC 189778962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCCAATGTCACTGATTATTTTTTATTATTCTTGTTTTAACTTTAAGTTTGTTTTCCTGC 1380

189778963 GGGTCACTTCAGTGTCAGTACAAATTAGTGGTCGGTTCATGATTTGTGGTTGACTTTAAA 189779022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGTCACTTCAGTGTCAGTACAAATTAGTGGTCGGTTCATGATTTGTGGTTGACTTTAAA 1440

189779023 TACCATGAACAAGTAAAGTTTCCATTCTCTGCTGATAAATCTTGTTTAGGATGGAACTAC 189779082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACCATGAACAAGTAAAGTTTCCATTCTCTGCTGATAAATCTTGTTTAGGATGGAACTAC 1500

189779083 AATAAAAAATTAGGAAGTTTACATATCTAATTTGATTTCTGCTCTCCTTCAGGCCCTCTC 189779142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATAAAAAATTAGGAAGTTTACATATCTAATTTGATTTCTGCTCTCCTTCAGGCCCTCTC 1560

189779143 TATCCCCTCTGCGTATGTGCACGGCTTCAAGTTTAGCTG 189779181
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATCCCCTCTGCGTATGTGCACGGCTTCAAGTTTAGCTG 1599

EXCISED REGION

189779183 GGAAGTTTAGATTGCAAGACCACTCCCAAATCTCTCCTATGTAGCCTTATTTGTTCATGC 189779242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 GGAAGTTTAGATTGCAAGACCACTCCCAAATCTCTCCTATGTAGCCTTATTTGTTCATGC 1660

189779243 AGCATTCCAGACTGCCAGCGATATATAGCATCTCGTAGACGCTCCTTTTTACTTTTTCAT 189779302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 AGCATTCCAGACTGCCAGCGATATATAGCATCTCGTAGACGCTCCTTTTTACTTTTTCAT 1720

189779303 TTCCCAGATTTCCCTGTTAAGCTTCAGCGCAGTCTGCCTGGTTGTTACTTTCCCCAACCA 189779362
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 TTCCCAGATTTCCCTGTTAAGCTCCAGCGCAGTCTGCCTGGTTGTTACTTTCCCCAACCA 1780

189779363 GGACTGCAATAGGAGAATTACTGTGATGGCCCTTTCCCCTTTTGTTTGCCACTGATATTA 189779422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 GGACTGCAATAGGAGAATTACTGTGATGGCCCTTTCCCCTTTTGTTTGCCACTGATATTA 1840

189779423 TTACATTTTCAGGCAATTCCTCAGCCATGAGATTATTTTCATTCTTCACTACAAATCAAG 189779482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 TTACATTTTCAGGCAATTCCTCAGCCATGAGATTATTTTCATTCTTCACTACAAATCAAG 1900

189779483 CAAGCACACCTCAGCAGCAGAGATGCCAGTTTTCATAGCTTGTCCTTCCCTGACAGGAAT 189779542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 CAAGCACACCTCAGCAGCAGAGATGCCAGTTTTCATAGCTTGTCCTTCCCTGACAGGAAT 1960

189779543 TCTAAACACACAGAGTGAGGTGTAGGAGAGTAAGGAAAGGTCCTGCTAAGAATGCTATGA 189779602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 TCTAAACACACAGAGTGAGGTGTAGGAGAGTAAGGAAAGGTCCTGCTAAGAATGCTATGA 2020

189779603 CTCCCATGGTTCTTACCCAAGGTATAGTAGTTTTTCTTGAATAAATGCTTTTTAGTTTGT 189779662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 CTCCCATGGTTCTTACCCAAGGTATAGTAGTTTTTCTTGAATAAATGCTTTTTAGTTTGT 2080

189779663 TGTGTTCTTTTAGTCAATTTCCAGAATTCTTTTCTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTGAA 189779722
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2081 TGTGTTCTTTTAGTCAATTTCCAGAATTCTTTTCTTTTTTCC-TTTTTTTTTTTTTTGAA 2139

189779723 ATGGAGTTTCATTTTGTCGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCTTCTCACTGCAG 189779782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 ATGGAGTTTCATTTTGTCGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCTTCTCACTGCAG 2199

189779783 CCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCCTCCTGAGCAGCTGGGATTA 189779842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 CCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCCTCCTGAGCAGCTGGGATTA 2259

189779843 CAGGTGCCCACCACCATGCCAGCCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACC 189779902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2260 CAGGTGCCCACCACCATGCCAGCCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCACC 2319

189779903 GTGTTGGCCAGGCACGTCTCGAACTACTAACCTCAGGTGATCCGCCACCCTCGGCCTCCG 189779962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 GTGTTGGCCAGGCACGTCTCGAACTACTAACCTCAGGTGATCCGCCACCCTCGGCCTCCG 2379

189779963 AAAGT 189779967
          |||||
     2380 AAAGT 2384

Alignment time is 2.26972 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3076] =>      3076 nucs 'mol-32-21f7-028608_3076'

Score:        2912
Aligned:      3077        nucs
Identic:      3062 (100%) nucs =>      1625 (100%)      1437 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189769595,189771222] EXCISED REGION [189771231,189772679]
 second seq =>  [        1,     1627] EXCISED REGION [     1628,     3076]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [189771223,189771230]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        33 nucs [189771223,189771255] to [189771231,189771263]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [189771223,189771226] to [189771227,189771230]
 second seq =>         0 nucs

189769595 CATTTTTGTTTATTAAATTGTATGGCATTGAACTTTAGGAACACTTACATGTCAAAGCTT 189769654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATTTTTGTTTATTAAATTGTATGGCATTGAACTTTAGGAACACTTACATGTCAAAGCTT 60

189769655 ATTAAGAGGGAAAATAACCAGTCTAGGTGTCATATAGATGTCCATCAAACTATCATCACA 189769714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTAAGAGGGAAAATAACCAGTCTAGGTGTCATATAGATGTCCATCAAACTATCATCACA 120

189769715 CCTCCACTTTGCATTTTAGGTTGATAATTTAGCATCAACATAGAGGACTTTGATGACAAA 189769774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTCCACTTTGCATTTTAGGTTGATAATTTAGCATCAACATAGAGGACTTTGATGACAAA 180

189769775 CAATTTCAGGGAGTGAAACTGGCAAAGAACATAAGGTATTCTTTTTCAAGTTTAACACCT 189769834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAATTTCAGGGAGTGAAACTGGCAAAGAACATAAGGTATTCTTTTTCAAGTTTAACACCT 240

189769835 TACCGTGATGTTTGACTTCAAATATAAATGTAGCTACAGTGTAATAAAAAAACAATTTTT 189769894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACCGTGATGTTTGACTTCAAATATAAATGTAGCTACAGTGTAATAAAAAAACAATTTTT 300

189769895 TCAGTTGTTTACTATCTCTTCTCTTTATACATTAGAAACTTCCAATTTCTTTAATTTCAC 189769954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAGTTGTTTACTATCTCTTCTCTTTATACATTAGAAACTTCCAATTTCTTTAATTTCAC 360

189769955 ATTTAAAGGAAGTTTTGATATGAAGAATTGAAGATACAGATATGAAAGTACAATAGTCAG 189770014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTAAAGGAAGTTTTGATATGAAGAATTGAAGATACAGATATGAAAGTACAATAGTCAG 420

189770015 TTTCAGCATTTTTAATTGCCAGTCTGTTTCTCTTATGTTACAATTTTCAGGCCATTTTTA 189770074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCAGCATTTTTAATTGCCAGTCTGTTTCTCTTATGTTACAATTTTCAGGCCATTTTTA 480

189770075 GGCCTTTCCAAATTACTAAATGCATTAAATGTTACCTGATCTGCTTTTTTTCATTGCTAC 189770134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCCTTTCCAAATTACTAAATGCATTAAATGTTACCTGATCTGCTTTTTTTCATTGCTAC 540

189770135 CTATTTTTTTAAGTAATGCTGTCTTTATGATTTCTTTTTTGCCCATGTGCATATTCTCTT 189770194
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      541 CTATTTTTTTAAGTAATGCTGTCTTTATGATTTCTTTTTTGCCCACGTGCATATTCTCTT 600

189770195 ATTTCACTGTAGGAATGGTGAAACTCTGGATCTAGAATTTAACTATATCCAATTTTCATG 189770254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTCACTGTAGGAATGGTGAAACTCTGGATCTAGAATTTAACTATATCCAATTTTCATG 660

189770255 AGAGTAAAAATGTATATTATTCTATTAAAGCTCTATAAAGACTAAATTTGCATCCCTCCA 189770314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAGTAAAAATGTATATTATTCTATTAAAGCTCTATAAAGACTAAATTTGCATCCCTCCA 720

189770315 AAAAATGTAAAGTAGCAATGTCATCACTCTTGCACATCCTCTTTGAAACTTCGTTTTCAT 189770374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAAATGTAAAGTAGCAATGTCATCACTCTTGCACATCCTCTTTGAAACTTCGTTTTCAT 780

189770375 CATCTGTGAAATTTTTTTGTGTTTTTTTTCTCTGCTTTATCAAATTACGTTCTCAGGTCA 189770434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATCTGTGAAATTTTTTTGTGTTTTTTTTCTCTGCTTTATCAAATTACGTTCTCAGGTCA 840

189770435 GTCAACAATTGAAATTGCGTACAACTTGGCATGATCTAATCGTATGAGTTTTGAAATTGC 189770494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCAACAATTGAAATTGCGTACAACTTGGCATGATCTAATCGTATGAGTTTTGAAATTGC 900

189770495 ACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCATGTAAATAAATTATATAAAACAAGTTTAT 189770554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCATGTAAATAAATTATATAAAACAAGTTTAT 960

189770555 AAACATATATGCATGTATAATTATTTGTTCTTCTAATCCATATTCCTTACTTTATTATCT 189770614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAACATATATGCATGTATAATTATTTGTTCTTCTAATCCATATTCCTTACTTTATTATCT 1020

189770615 TATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAAATTTTTTAAAGCAATC 189770674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAAATTTTTTAAAGCAATC 1080

189770675 CTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACAGGTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTCT 189770734
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACACGTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTCT 1140

189770735 TCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGCA 189770794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGCA 1200

189770795 TAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATCA 189770854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATCA 1260

189770855 TCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTCT 189770914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTCT 1320

189770915 TAAAAAAAAAAATGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATGC 189770974
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAAAAAAAAA-TGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATGC 1379

189770975 TGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACC 189771034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACC 1439

189771035 CCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCA 189771094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCA 1499

189771095 GCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGA 189771154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGA 1559

189771155 GCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATA 189771214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATA 1619

189771215 AATGAATG 189771222
          ||||||||
     1620 AATGAATG 1627

EXCISED REGION

189771231 AATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAA 189771290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 AATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAA 1687

189771291 CTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTAC 189771350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 CTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTAC 1747

189771351 CCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTT 189771410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 CCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTT 1807

189771411 TCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCA 189771470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 TCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCA 1867

189771471 CCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 189771530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 CCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 1927

189771531 GATTACAGGCATACGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTT 189771590
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 GATTACAGGCATATGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTT 1987

189771591 CTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGGCC 189771650
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1988 CTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGGCC 2047

189771651 TCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTTTG 189771710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2048 TCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTTTG 2107

189771711 CTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCT 189771770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 CTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCT 2167

189771771 CTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATAC 189771830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 CTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATAC 2227

189771831 ATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTCGTC 189771890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2228 ATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTGGTC 2287

189771891 AATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATT 189771950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 AATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATT 2347

189771951 TCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTGTCTGG 189772010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2348 TCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTTTCTGG 2407

189772011 TACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCACACAGCAGAGAGCAGAGAGAGG 189772070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2408 TACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCAGACAGCAGAGAGCAGAGAGAGG 2467

189772071 AAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCC 189772130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 AAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCC 2527

189772131 TCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGG 189772190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 TCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGG 2587

189772191 ACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTA 189772250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 ACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTA 2647

189772251 GGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACCG 189772310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2648 GGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACTG 2707

189772311 AGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTAAAGTCTGTAAAAATC 189772370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2708 AGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTGAAGTCTGTAAAAATC 2767

189772371 AGTATGAGAGTGTATACCTCATACTTTTTTCGACAATTAGAAAATACAATGCAAATAAAG 189772430
          |||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2768 AGTATGAGAGTGTATGCCTCATACTTGTTTCGACAATTAGAAAATACAATACAAATAAAG 2827

189772431 TACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTA 189772490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 TACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTA 2887

189772491 TATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACACGGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAA 189772550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2888 TATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACACAGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAA 2947

189772551 TTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTT 189772610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 TTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTT 3007

189772611 CAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCT 189772670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 CAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCT 3067

189772671 GCTATACCC 189772679
          |||||||||
     3068 GCTATACCC 3076

Alignment time is 3.17274 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5402] =>      5402 nucs 'mol-32-2291-094493_5402'

Score:        5148
Aligned:      5403        nucs
Identic:      5370 ( 99%) nucs =>      1410 (100%)      3960 ( 99%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189766482,189767898] EXCISED REGION [189767907,189771886]
 second seq =>  [        1,     1417] EXCISED REGION [     1418,     5393]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [189767899,189767906]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        50 nucs [189767899,189767948] to [189767907,189767956]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [189767897,189767898] to [189767907,189767908]
 second seq =>         2 nucs [1416,1417] to [1418,1419]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [189767899,189767902] to [189767903,189767906]
 second seq =>         0 nucs

189766482 TATGATAGCTAAATTTTCATACCCATATTTCTACTCAAACACTGGTGGATACTTCACTAA 189766541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGATAGCTAAATTTTCATACCCATATTTCTACTCAAACACTGGTGGATACTTCACTAA 60

189766542 TCTAAATCATTTGGCAAGAATGCAGAATTTATATTTAATATGATCCTGTTGTTGTATCAC 189766601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTAAATCATTTGGCAAGAATGCAGAATTTATATTTAATATGATCCTGTTGTTGTATCAC 120

189766602 TAATAGTAGGGTGTGGTATCATTTCTCTCTCATTAAATGGATATTGAGTGGATTAATAGT 189766661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATAGTAGGGTGTGGTATCATTTCTCTCTCATTAAATGGATATTGAGTGGATTAATAGT 180

189766662 ATTTTTAAAGCCAAAACTCAAGCTACCAATTTTCAGCTTCTATTTTTAAAGGTATTTAAA 189766721
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATTTAAAGCCAAAACTCAAGCTACCAATTTTCAGCTTCTATTTTTAAAGGTATTTAAA 240

189766722 ATTTATTTGTTTTAAGAAAAAATGTTTGTGAAATATTTAAATTTTAAATAAAGGTATTTA 189766781
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTATTTGTTTTAAGAAAAAATGTTTGTGAAATATTTAAATTTTAAATAAAGGTATTTA 300

189766782 AAAATTATTTAATAATGGCCTACTATATACCAAGCACTGGTTACAGAGGATAATTTATAC 189766841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAATTATTTAATAATGGCCTACTATATACCAAGCACTGGTTACAGAGGATAATTTATAC 360

189766842 AATGTCCTACTGGTTACAGAGGATAATTTATGCAATGCCCATACTTTCATAGAGCTTACC 189766901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGTCCTACTGGTTACAGAGGATAATTTATGCAATGCCCATACTTTCATAGAGCTTACC 420

189766902 TTCTAATGTAGGAAGATATGTGTATGTTTTTATATCTGTATGTTTGTGTTGCGTTTGTGT 189766961
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
      421 TTCTAATGTAGGAAGATATGTGTATGTTTTTATATCTATATGTTTGTGTTGTGTTTGTGT 480

189766962 CTATGTATATCTATATCCACATCTGTATCTATGGATGTTGAATGAAAAAGTCAGGGTAAA 189767021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTATGTATATCTATATCCACATCTGTATCTATGGATGTTGAATGAAAAAGTCAGGGTAAA 540

189767022 GGGTGAAGAAGGGTGGAAACGCCAGGGTGCATTGTGAGATATGCTAGTGTCAACAGTTAT 189767081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGTGAAGAAGGGTGGAAACGCCAGGGTGCATTGTGAGATATGCTAGTGTCAACAGTTAT 600

189767082 AATTGCTCATGTATTGTGCCCATGTATAAATAAATATAATGATATTTAGTGTAGTATTAA 189767141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATTGCTCATGTATTGTGCCCATGTATAAATAAATATAATGATATTTAGTGTAGTATTAA 660

189767142 CATTAATAGCAAAATATGAAAAATATCCTAAATGCCCATCAGTATGAAACTAGTTAGCTA 189767201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATTAATAGCAAAATATGAAAAATATCCTAAATGCCCATCAGTATGAAACTAGTTAGCTA 720

189767202 AATGTCAATGAAATAAAATATAACACAACATAATAAAATGGTGAATTTTCTATTTATGTA 189767261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      721 AATGTCAATGAAATAAAATATAACACAACATAATAAAACGGTGAATTTTCTATTTATGTA 780

189767262 ACAAAATGGAAAGTATATAAGCTACATTAATAAATGAAAAGGCAAAGAGCAGATTATTCA 189767321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAAAATGGAAAGTATATAAGCTACATTAATAAATGAAAAGGCAAAGAGCAGATTATTCA 840

189767322 ATATTTTATGCCATAATCTGCCAAAAAAACTAATATCCACTGAACTATTTATCTAGACTT 189767381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATATTTTATGCCATAATCTGCCAAAAAAACTAATATCCACTGAACTATTTATCTAGACTT 900

189767382 TTAGAGGGAAACATAAGAAGTAAAATAATAGCAGTGGTTATCAGCTTGCAAGATAAAGTA 189767441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTAGAGGGAAACATAAGAAGTAAAATAATAGCAGTGGTTATCAGCTTGCAAGATAAAGTA 960

189767442 TCTTATATAGGTATCAATATTTCACTGCATATGCCTTTTTCTACTTTTTGATTTGAGAAT 189767501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTATATAGGTATCAATATTTCACTGCATATGCCTTTTTCTACTTTTTGATTTGAGAAT 1020

189767502 CATGAGAATATTCTGTAATACCTATTCAGAAAATTGTATTAAAATGTCATTACATGATGC 189767561
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1021 CATGAGAATATTCTGTAATACCTATTCAGAAAATTGTATTAAAATGTCATTACATGATGT 1080

189767562 GTTAGGCCATTCCCATATTGTTATAAAGAAACACCTGAGACTGCTCGGGTGTGGTGGCTC 189767621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTAGGCCATTCCCATATTGTTATAAAGAAACACCTGAGACTGCTCGGGTGTGGTGGCTC 1140

189767622 ACGCCTATAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCCAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTTGGGAAT 189767681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACGCCTATAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCCAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTTGGGAAT 1200

189767682 TCAAGACCAGTCTGACCAACATGGTCTCTACTAAAAATACAAAAAGTTAGCCAAGTGTGG 189767741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1201 TCAAGACCAGTCTGACCAACATGGTCTCTACTAAAAATACGAAAAGTTAGCCAAGTGTGG 1260

189767742 TGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTCCAACCT 189767801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTCCAACCT 1320

189767802 GAGAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCAAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAG 189767861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCAAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAG 1380

189767862 ATCGAGCTCTGTTTCAAAAAAAAAAGAAAGGAGAGAA 189767898
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCGAGCTCTGTTTCAAAAAAAAAAGAAAGGAGAGAA 1417

EXCISED REGION

189767907 AAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAAAGAAAAGA 189767966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 AAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAAAGAAAAGA 1477

189767967 AAGAAAGGGAAGGAAGGAAGGG-----AGGAAGGAAAGAAAGGTCCTGAGACAGAGTTAT 189768021
          |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 AAGAAAGGGAAGGAAGGAAGG-AAGGAAGGAAGGAAAGAAAGGTCCTGAGACAGAGTTAT 1536

189768022 TTAGAAAGAAAAGAAAGAGGTTCAGTTGGCTCATGGTTCCACATGCTGTACAGAATGCAT 189768081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 TTAGAAAGAAAAGAAAGAGGTTCAGTTGGCTCATGGTTCCACATGCTGTACAGAATGCAT 1596

189768082 GGCTGGGAGGCCTCAGGAAATTTACAGTCATGGCAGAAGGCAAAGGGGCAGTGAGCCATC 189768141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 GGCTGGGAGGCCTCAGGAAATTTACAGTCATGGCAGAAGGCAAAGGGGCAGTGAGCCATC 1656

189768142 TCACATGGAAGAGCAGCAGCAAGATGGGGTGACATGCTACATACTTCTACACAACCAGAT 189768201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1657 TCACATGGAAGAGCAGCAGCAAGATGGGGTGACATGCTACATACTTTTACACAACCAGAT 1716

189768202 GTCATGAGAATTCACTCACTATCACAAGAACAGCACCAAGAGAATGGTGCTAAAGCAGTC 189768261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 GTCATGAGAATTCACTCACTATCACAAGAACAGCACCAAGAGAATGGTGCTAAAGCAGTC 1776

189768262 ATAAGAAATTGTCCCCATGATCTAATCAACTCTCTCCAGGCCCCAACTCTAACATTGGGA 189768321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 ATAAGAAATTGTCCCCATGATCTAATCAACTCTCTCCAGGCCCCAACTCTAACATTGGGA 1836

189768322 ATTACAATTTGACATGAGATTTGGGTGAGAACACAGATCCAAGCCAATCTCATTTAAAAA 189768381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 ATTACAATTTGACATGAGATTTGGGTGAGAACACAGATCCAAGCCAATCTCATTTAAAAA 1896

189768382 TGTTCTGATGGGCTTACACCGGTGTATTGGGTTCAGAGAGACCAGATGGGATAGTAGCAT 189768441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 TGTTCTGATGGGCTTACACCGGTGTATTGGGTTCAGAGAGACCAGATGGGATAGTAGCAT 1956

189768442 AGTGTTTGTTTTGAAATATGAGGGAGTTAACCATGTGTATGTTAAGAAGAGGTTTTCACA 189768501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 AGTGTTTGTTTTGAAATATGAGGGAGTTAACCATGTGTATGTTAAGAAGAGGTTTTCACA 2016

189768502 TTCAGGATACATTTAAGAAGCCATTAAAAGAGTTAGCAAACTATAGCTCTTGGTTGAAAC 189768561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 TTCAGGATACATTTAAGAAGCCATTAAAAGAGTTAGCAAACTATAGCTCTTGGTTGAAAC 2076

189768562 CATAACTTTGTCTAAATTTTTGTAAATAAGATTTCATTGGAACACAGCTATACCCATTCT 189768621
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 CATAACTTTGTCTAAATTTTTGTAAATCAGATTTCATTGGAACACAGCTATACCCATTCT 2136

189768622 TTTACATATTGTCTAGTGCTGCTTTCACATTGTAATAGTAGAGTTGAGTGGTTATAGCAA 189768681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 TTTACATATTGTCTAGTGCTGCTTTCACATTGTAATAGTAGAGTTGAGTGGTTATAGCAA 2196

189768682 TGGTTATATTGCATACAAAGACTATAACACTTAGAATATTCCCCTTTAGAGAAAACATTT 189768741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 TGGTTATATTGCATACAAAGACTATAACACTTAGAATATTCCCCTTTAGAGAAAACATTT 2256

189768742 GCTGGTTCCTCATATAGACCAGAGGATTTTCCAATGAACAGCTTGCGTGGTATTAAATAA 189768801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 GCTGGTTCCTCATATAGACCAGAGGATTTTCCAATGAACAGCTTGCGTGGTATTAAATAA 2316

189768802 TGATGAGAGTAAAGGATAACACTGCCATTTTTAGCCTGAGCAACTAGCAAATTTGAAATT 189768861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 TGATGAGAGTAAAGGATAACACTGCCATTTTTAGCCTGAGCAACTAGCAAATTTGAAATT 2376

189768862 TGAATTACCATTTACTGCCATTTATTGAAACATGGATCACTTAGAATGCAACAAAGTCAG 189768921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 TGAATTACCATTTACTGCCATTTATTGAAACATGGATCACTTAGAATGCAACAAAGTCAG 2436

189768922 GGTGATGAAGACTAAAAGATTCAGTAGAATATAGGATAATTCCCTGAGTATGTCTGCAAG 189768981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 GGTGATGAAGACTAAAAGATTCAGTAGAATATAGGATAATTCCCTGAGTATGTCTGCAAG 2496

189768982 ACTACGTGTCCACAGATCCCAGTTTGAGAAACAGTTGTGTAGTAGGATATGAGGAGTAGG 189769041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 ACTACGTGTCCACAGATCCCAGTTTGAGAAACAGTTGTGTAGTAGGATATGAGGAGTAGG 2556

189769042 ATAGGAGGAGGGTAATTCTAAAGTTCTAAAACTAACAAACCTTTGACCAAATTGTTTAAA 189769101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 ATAGGAGGAGGGTAATTCTAAAGTTCTAAAACTAACAAACCTTTGACCAAATTGTTTAAA 2616

189769102 CTTTCTGATTCTTGACTTTCTCACAAATAAAATCATATGTTCATCTTGGTAATCACTGGC 189769161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 CTTTCTGATTCTTGACTTTCTCACAAATAAAATCATATGTTCATCTTGGTAATCACTGGC 2676

189769162 CTTTTTCTAAACAAAATTCTGTGAAAGAGTTATGAAAATTTTACTACATGCATACAAATT 189769221
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 CTTTTTCTAAACAAAATTCCGTGAAAGAGTTATGAAAATTTTACTACATGCATACAAATT 2736

189769222 CATTAGGTGTTCCTTTTAAGGGGTTTAAAGTTAAAGAATGATGCAGGGTAATCTACTTAA 189769281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 CATTAGGTGTTCCTTTTAAGGGGTTTAAAGTTAAAGAATGATGCAGGGTAATCTACTTAA 2796

189769282 AATAACAGGTAATCTGCCCACTGAAGGTCTTAAGGTAGATGTTAATAAATGATTGTGAAA 189769341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 AATAACAGGTAATCTGCCCACTGAAGGTCTTAAGGTAGATGTTAATAAATGATTGTGAAA 2856

189769342 TGAATGAATCAGTTTGCTACAATTTGCACATTACATGCTATTATATTCATAAAAGAATGG 189769401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2857 TGAATGAATCAGTTTGCTACAATTTGCACATTACATGCTATTATATCCATAAAAGAATGG 2916

189769402 GAAATTAATATTCATATATATTTGTCATTTACATCTT-TTTGAAATCCATATAATGCAAT 189769460
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     2917 GAAATTAATATTCATATATGTTTGTCATTTACATCTTATTTGAAATCCATATAATGCAAT 2976

189769461 TCTATTTCAGTATAAAATAGCTTAGTTAATATATCACTATGTATATTTTGTATAAATATA 189769520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 TCTATTTCAGTATAAAATAGCTTAGTTAATATATCACTATGTATATTTTGTATAAATATA 3036

189769521 AAAGCATAATACACATAGAAATGTCACACATACATTTGCTTTTGATTCAAATAAAGATAT 189769580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 AAAGCATAATACACATAGAAATGTCACACATACATTTGCTTTTGATTCAAATAAAGATAT 3096

189769581 CATAAAAAATTTAACATTTTTGTTTATTAAATTGTATGGCATTGAACTTTAGGAACACTT 189769640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 CATAAAAAATTTAACATTTTTGTTTATTAAATTGTATGGCATTGAACTTTAGGAACACTT 3156

189769641 ACATGTCAAAGCTTATTAAGAGGGAAAATAACCAGTCTAGGTGTCATATAGATGTCCATC 189769700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 ACATGTCAAAGCTTATTAAGAGGGAAAATAACCAGTCTAGGTGTCATATAGATGTCCATC 3216

189769701 AAACTATCATCACACCTCCACTTTGCATTTTAGGTTGATAATTTAGCATCAACATAGAGG 189769760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 AAACTATCATCACACCTCCACTTTGCATTTTAGGTTGATAATTTAGCATCAACATAGAGG 3276

189769761 ACTTTGATGACAAACAATTTCAGGGAGTGAAACTGGCAAAGAACATAAGGTATTCTTTTT 189769820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 ACTTTGATGACAAACAATTTCAGGGAGTGAAACTGGCAAAGAACATAAGGTATTCTTTTT 3336

189769821 CAAGTTTAACACCTTACCGTGATGTTTGACTTCAAATATAAATGTAGCTACAGTGTAATA 189769880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 CAAGTTTAACACCTTACCGTGATGTTTGACTTCAAATATAAATGTAGCTACAGTGTAATA 3396

189769881 AAAAAACAATTTTTTCAGTTGTTTACTATCTCTTCTCTTTATACATTAGAAACTTCCAAT 189769940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 AAAAAACAATTTTTTCAGTTGTTTACTATCTCTTCTCTTTATACATTAGAAACTTCCAAT 3456

189769941 TTCTTTAATTTCACATTTAAAGGAAGTTTTGATATGAAGAATTGAAGATACAGATATGAA 189770000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 TTCTTTAATTTCACATTTAAAGGAAGTTTTGATATGAAGAATTGAAGATACAGATATGAA 3516

189770001 AGTACAATAGTCAGTTTCAGCATTTTTAATTGCCAGTCTGTTTCTCTTATGTTACAATTT 189770060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 AGTACAATAGTCAGTTTCAGCATTTTTAATTGCCAGTCTGTTTCTCTTATGTTACAATTT 3576

189770061 TCAGGCCATTTTTAGGCCTTTCCAAATTACTAAATGCATTAAATGTTACCTGATCTGCTT 189770120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 TCAGGCCATTTTTAGGCCTTTCCAAATTACTAAATGCATTAAATGTTACCTGATCTGCTT 3636

189770121 TTTTTCATTGCTACCTATTTTTTTAAGTAATGCTGTCTTTATGATTTCTTTTTTGCCCAT 189770180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3637 TTTTTCATTGCTACCTATTTTTTTAAGTAATGCTGTCTTTATGATTTCTTTTTTGCCCAC 3696

189770181 GTGCATATTCTCTTATTTCACTGTAGGAATGGTGAAACTCTGGATCTAGAATTTAACTAT 189770240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 GTGCATATTCTCTTATTTCACTGTAGGAATGGTGAAACTCTGGATCTAGAATTTAACTAT 3756

189770241 ATCCAATTTTCATGAGAGTAAAAATGTATATTATTCTATTAAAGCTCTATAAAGACTAAA 189770300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 ATCCAATTTTCATGAGAGTAAAAATGTATATTATTCTATTAAAGCTCTATAAAGACTAAA 3816

189770301 TTTGCATCCCTCCAAAAAATGTAAAGTAGCAATGTCATCACTCTTGCACATCCTCTTTGA 189770360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 TTTGCATCCCTCCAAAAAATGTAAAGTAGCAATGTCATCACTCTTGCACATCCTCTTTGA 3876

189770361 AACTTCGTTTTCATCATCTGTGAAATTTTTTTGTGTTTTTTTTCTCTGCTTTATCAAATT 189770420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 AACTTCGTTTTCATCATCTGTGAAATTTTTTTGTGTTTTTTTTCTCTGCTTTATCAAATT 3936

189770421 ACGTTCTCAGGTCAGTCAACAATTGAAATTGCGTACAACTTGGCATGATCTAATCGTATG 189770480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 ACGTTCTCAGGTCAGTCAACAATTGAAATTGCGTACAACTTGGCATGATCTAATCGTATG 3996

189770481 AGTTTTGAAATTGCACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCATGTAAATAAATTATA 189770540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 AGTTTTGAAATTGCACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCATGTAAATAAATTATA 4056

189770541 TAAAACAAGTTTATAAACATATATGCATGTATAATTATTTGTTCTTCTAATCCATATTCC 189770600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 TAAAACAAGTTTATAAACATATATGCATGTATAATTATTTGTTCTTCTAATCCATATTCC 4116

189770601 TTACTTTATTATCTTATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAAAT 189770660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 TTACTTTATTATCTTATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAAAT 4176

189770661 TTTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACAGGTATGCTATTAAAAA 189770720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4177 TTTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACACGTATGCTATTAAAAA 4236

189770721 ACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATT 189770780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 ACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATT 4296

189770781 TCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAAT 189770840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 TCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAAT 4356

189770841 AAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGG 189770900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 AAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGG 4416

189770901 AAAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAAATGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCA 189770960
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 AAAACAGCCTTTCTT-AAAAAAAAAATGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCA 4475

189770961 GCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCT 189771020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4476 GCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCT 4535

189771021 AACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGG 189771080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 AACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGG 4595

189771081 CGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGC 189771140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 CGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGC 4655

189771141 GGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGAC 189771200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 GGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGAC 4715

189771201 TCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAA 189771260
          ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||
     4716 TCGGTCTCAAAATAAATGAATG--------AATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAA 4767

189771261 TAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGAC 189771320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 TAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGAC 4827

189771321 CCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCA 189771380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4828 CCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCA 4887

189771381 GAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAG 189771440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 GAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAG 4947

189771441 GCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAA 189771500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4948 GCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAA 5007

189771501 TTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACCATGCCTGGCT 189771560
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5008 TTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATATGCCACCATGCCTGGCT 5067

189771561 AATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTC 189771620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5068 AATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTC 5127

189771621 CCGACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCC 189771680
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5128 CCGACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCC 5187

189771681 ACCGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACA 189771740
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5188 ACCGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACA 5247

189771741 TATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGC 189771800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5248 TATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGC 5307

189771801 AGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCA 189771860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5308 AGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCA 5367

189771861 CGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTT 189771886
          ||||||||||||||||||||||||||
     5368 CGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTT 5393

Alignment time is 5.09349 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3001] =>      3001 nucs 'mol-32-285e-004685_3001'

Score:        2847
Aligned:      3004        nucs
Identic:      2984 ( 99%) nucs =>      1664 ( 99%)      1320 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189771202,189772885] EXCISED REGION [189772901,189774220]
 second seq =>  [        1,     1676] EXCISED REGION [     1682,     3001]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [189772886,189772900]
 second seq =>         5 nucs [1677,1681]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189772885,189772885] to [189772900,189772900]
 second seq =>         1 nucs [1677,1677] to [1682,1682]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1677,1677] to [1681,1681]

189771202 CGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAT 189771261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
        1 CGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA------ 54

189771262 AAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACC 189771321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       55 --GCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACC 112

189771322 CCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAG 189771381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      113 CCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAG 172

189771382 AAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGG 189771441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      173 AAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGG 232

189771442 CTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAAT 189771501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      233 CTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAAT 292

189771502 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACCATGCCTGGCTA 189771561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      293 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATATGCCACCATGCCTGGCTA 352

189771562 ATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCC 189771621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      353 ATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCC 412

189771622 CGACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCA 189771681
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      413 CGACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCA 472

189771682 CCGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACAT 189771741
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      473 CCGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACAT 532

189771742 ATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCA 189771801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      533 ATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCA 592

189771802 GTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCAC 189771861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 GTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCAC 652

189771862 GGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTCGTCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGA 189771921
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 GGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTGGTCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGA 712

189771922 CTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAG 189771981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 CTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAG 772

189771982 ATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTGTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGG 189772041
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 ATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTTTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGG 832

189772042 AGCCTCACACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGT 189772101
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 AGCCTCAGACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGT 892

189772102 CACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCT 189772161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 CACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCT 952

189772162 CCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAA 189772221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 CCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAA 1012

189772222 TCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAA 189772281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 TCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAA 1072

189772282 TAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACCGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTC 189772341
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACTGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTC 1132

189772342 ACTGATACGCAGTAAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTATACCTCATACTTTTTTC 189772401
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||
     1133 ACTGATACGCAGTGAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTATGCCTCATACTTGTTTC 1192

189772402 GACAATTAGAAAATACAATGCAAATAAAGTACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTT 189772461
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 GACAATTAGAAAATACAATACAAATAAAGTACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTT 1252

189772462 TTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACA 189772521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACA 1312

189772522 CGGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTT 189772581
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 CAGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTT 1372

189772582 TGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATG 189772641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 TGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATG 1432

189772642 AGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAA 189772701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 AGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAA 1492

189772702 GGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGAT 189772761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 GGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGAT 1552

189772762 GGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGAACT 189772821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 GGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGAACT 1612

189772822 GTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGATTAT 189772881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 GTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGATTAT 1672

189772882 TCTT 189772885
          ||||
     1673 TCTT 1676

EXCISED REGION

189772901 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 189772960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 1741

189772961 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 189773020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 1801

189773021 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 189773080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 1861

189773081 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 189773140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 1921

189773141 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 189773200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 1981

189773201 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 189773260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 2041

189773261 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 189773320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 2101

189773321 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 189773380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 2161

189773381 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 189773440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 2221

189773441 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 189773500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 2281

189773501 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 189773560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 2341

189773561 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 189773620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 2401

189773621 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 189773680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 2461

189773681 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 189773740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 2521

189773741 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 189773800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 2581

189773801 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 189773860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 2641

189773861 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 189773920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2642 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 2701

189773921 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 189773980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2702 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 2761

189773981 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 189774040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2762 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 2821

189774041 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 189774100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2822 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 2881

189774101 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 189774160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2882 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 2941

189774161 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 189774220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2942 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 3001

Alignment time is 2.84035 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,    10749] =>     10749 nucs 'mol-32-2afd-101961_10749'

Score:       10409
Aligned:     10753        nucs
Identic:     10716 (100%) nucs =>      4641 ( 99%)      6075 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189768215,189772885] EXCISED REGION [189772901,189778981]
 second seq =>  [        1,     4663] EXCISED REGION [     4669,    10749]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [189772886,189772900]
 second seq =>         5 nucs [4664,4668]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189772885,189772885] to [189772900,189772900]
 second seq =>         1 nucs [4664,4664] to [4669,4669]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4664,4664] to [4668,4668]

189768215 ACTCACTATCACAAGAACAGCACCAAGAGAATGGTGCTAAAGCAGTCATAAGAAATTGTC 189768274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTCACTATCACAAGAACAGCACCAAGAGAATGGTGCTAAAGCAGTCATAAGAAATTGTC 60

189768275 CCCATGATCTAATCAACTCTCTCCAGGCCCCAACTCTAACATTGGGAATTACAATTTGAC 189768334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCATGATCTAATCAACTCTCTCCAGGCCCCAACTCTAACATTGGGAATTACAATTTGAC 120

189768335 ATGAGATTTGGGTGAGAACACAGATCCAAGCCAATCTCATTTAAAAATGTTCTGATGGGC 189768394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGAGATTTGGGTGAGAACACAGATCCAAGCCAATCTCATTTAAAAATGTTCTGATGGGC 180

189768395 TTACACCGGTGTATTGGGTTCAGAGAGACCAGATGGGATAGTAGCATAGTGTTTGTTTTG 189768454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTACACCGGTGTATTGGGTTCAGAGAGACCAGATGGGATAGTAGCATAGTGTTTGTTTTG 240

189768455 AAATATGAGGGAGTTAACCATGTGTATGTTAAGAAGAGGTTTTCACATTCAGGATACATT 189768514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATATGAGGGAGTTAACCATGTGTATGTTAAGAAGAGGTTTTCACATTCAGGATACATT 300

189768515 TAAGAAGCCATTAAAAGAGTTAGCAAACTATAGCTCTTGGTTGAAACCATAACTTTGTCT 189768574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAGAAGCCATTAAAAGAGTTAGCAAACTATAGCTCTTGGTTGAAACCATAACTTTGTCT 360

189768575 AAATTTTTGTAAATAAGATTTCATTGGAACACAGCTATACCCATTCTTTTACATATTGTC 189768634
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAATTTTTGTAAATCAGATTTCATTGGAACACAGCTATACCCATTCTTTTACATATTGTC 420

189768635 TAGTGCTGCTTTCACATTGTAATAGTAGAGTTGAGTGGTTATAGCAATGGTTATATTGCA 189768694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGTGCTGCTTTCACATTGTAATAGTAGAGTTGAGTGGTTATAGCAATGGTTATATTGCA 480

189768695 TACAAAGACTATAACACTTAGAATATTCCCCTTTAGAGAAAACATTTGCTGGTTCCTCAT 189768754
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACAAAGACTATAACGCTTAGAATATTCCCCTTTAGAGAAAACATTTGCTGGTTCCTCAT 540

189768755 ATAGACCAGAGGATTTTCCAATGAACAGCTTGCGTGGTATTAAATAATGATGAGAGTAAA 189768814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAGACCAGAGGATTTTCCAATGAACAGCTTGCGTGGTATTAAATAATGATGAGAGTAAA 600

189768815 GGATAACACTGCCATTTTTAGCCTGAGCAACTAGCAAATTTGAAATTTGAATTACCATTT 189768874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGATAACACTGCCATTTTTAGCCTGAGCAACTAGCAAATTTGAAATTTGAATTACCATTT 660

189768875 ACTGCCATTTATTGAAACATGGATCACTTAGAATGCAACAAAGTCAGGGTGATGAAGACT 189768934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTGCCATTTATTGAAACATGGATCACTTAGAATGCAACAAAGTCAGGGTGATGAAGACT 720

189768935 AAAAGATTCAGTAGAATATAGGATAATTCCCTGAGTATGTCTGCAAGACTACGTGTCCAC 189768994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAAGATTCAGTAGAATATAGGATAATTCCCTGAGTATGTCTGCAAGACTACGTGTCCAC 780

189768995 AGATCCCAGTTTGAGAAACAGTTGTGTAGTAGGATATGAGGAGTAGGATAGGAGGAGGGT 189769054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGATCCCAGTTTGAGAAACAGTTGTGTAGTAGGATATGAGGAGTAGGATAGGAGGAGGGT 840

189769055 AATTCTAAAGTTCTAAAACTAACAAACCTTTGACCAAATTGTTTAAACTTTCTGATTCTT 189769114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATTCTAAAGTTCTAAAACTAACAAACCTTTGACCAAATTGTTTAAACTTTCTGATTCTT 900

189769115 GACTTTCTCACAAATAAAATCATATGTTCATCTTGGTAATCACTGGCCTTTTTCTAAACA 189769174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GACTTTCTCACAAATAAAATCATATGTTCATCTTGGTAATCACTGGCCTTTTTCTAAACA 960

189769175 AAATTCTGTGAAAGAGTTATGAAAATTTTACTACATGCATACAAATTCATTAGGTGTTCC 189769234
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAATTCCGTGAAAGAGTTATGAAAATTTTACTACATGCATACAAATTCATTAGGTGTTCC 1020

189769235 TTTTAAGGGGTTTAAAGTTAAAGAATGATGCAGGGTAATCTACTTAAAATAACAGGTAAT 189769294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTAAGGGGTTTAAAGTTAAAGAATGATGCAGGGTAATCTACTTAAAATAACAGGTAAT 1080

189769295 CTGCCCACTGAAGGTCTTAAGGTAGATGTTAATAAATGATTGTGAAATGAATGAATCAGT 189769354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGCCCACTGAAGGTCTTAAGGTAGATGTTAATAAATGATTGTGAAATGAATGAATCAGT 1140

189769355 TTGCTACAATTTGCACATTACATGCTATTATATTCATAAAAGAATGGGAAATTAATATTC 189769414
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTGCTACAATTTGCACATTACATGCTATTATATCCATAAAAGAATGGGAAATTAATATTC 1200

189769415 ATATATATTTGTCATTTACATCTT-TTTGAAATCCATATAATGCAATTCTATTTCAGTAT 189769473
          ||||||.||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATATATGTTTGTCATTTACATCTTATTTGAAATCCATATAATGCAATTCTATTTCAGTAT 1260

189769474 AAAATAGCTTAGTTAATATATCACTATGTATATTTTGTATAAATATAAAAGCATAATACA 189769533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAATAGCTTAGTTAATATATCACTATGTATATTTTGTATAAATATAAAAGCATAATACA 1320

189769534 CATAGAAATGTCACACATACATTTGCTTTTGATTCAAATAAAGATATCATAAAAAATTTA 189769593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATAGAAATGTCACACATACATTTGCTTTTGATTCAAATAAAGATATCATAAAAAATTTA 1380

189769594 ACATTTTTGTTTATTAAATTGTATGGCATTGAACTTTAGGAACACTTACATGTCAAAGCT 189769653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACATTTTTGTTTATTAAATTGTATGGCATTGAACTTTAGGAACACTTACATGTCAAAGCT 1440

189769654 TATTAAGAGGGAAAATAACCAGTCTAGGTGTCATATAGATGTCCATCAAACTATCATCAC 189769713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TATTAAGAGGGAAAATAACCAGTCTAGGTGTCATATAGATGTCCATCAAACTATCATCAC 1500

189769714 ACCTCCACTTTGCATTTTAGGTTGATAATTTAGCATCAACATAGAGGACTTTGATGACAA 189769773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACCTCCACTTTGCATTTTAGGTTGATAATTTAGCATCAACATAGAGGACTTTGATGACAA 1560

189769774 ACAATTTCAGGGAGTGAAACTGGCAAAGAACATAAGGTATTCTTTTTCAAGTTTAACACC 189769833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAATTTCAGGGAGTGAAACTGGCAAAGAACATAAGGTATTCTTTTTCAAGTTTAACACC 1620

189769834 TTACCGTGATGTTTGACTTCAAATATAAATGTAGCTACAGTGTAATAAAAAAACAATTTT 189769893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTACCGTGATGTTTGACTTCAAATATAAATGTAGCTACAGTGTAATAAAAAAACAATTTT 1680

189769894 TTCAGTTGTTTACTATCTCTTCTCTTTATACATTAGAAACTTCCAATTTCTTTAATTTCA 189769953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCAGTTGTTTACTATCTCTTCTCTTTATACATTAGAAACTTCCAATTTCTTTAATTTCA 1740

189769954 CATTTAAAGGAAGTTTTGATATGAAGAATTGAAGATACAGATATGAAAGTACAATAGTCA 189770013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CATTTAAAGGAAGTTTTGATATGAAGAATTGAAGATACAGATATGAAAGTACAATAGTCA 1800

189770014 GTTTCAGCATTTTTAATTGCCAGTCTGTTTCTCTTATGTTACAATTTTCAGGCCATTTTT 189770073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTTTCAGCATTTTTAATTGCCAGTCTGTTTCTCTTATGTTACAATTTTCAGGCCATTTTT 1860

189770074 AGGCCTTTCCAAATTACTAAATGCATTAAATGTTACCTGATCTGCTTTTTTTCATTGCTA 189770133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGGCCTTTCCAAATTACTAAATGCATTAAATGTTACCTGATCTGCTTTTTTTCATTGCTA 1920

189770134 CCTATTTTTTTAAGTAATGCTGTCTTTATGATTTCTTTTTTGCCCATGTGCATATTCTCT 189770193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1921 CCTATTTTTTTAAGTAATGCTGTCTTTATGATTTCTTTTTTGCCCACGTGCATATTCTCT 1980

189770194 TATTTCACTGTAGGAATGGTGAAACTCTGGATCTAGAATTTAACTATATCCAATTTTCAT 189770253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATTTCACTGTAGGAATGGTGAAACTCTGGATCTAGAATTTAACTATATCCAATTTTCAT 2040

189770254 GAGAGTAAAAATGTATATTATTCTATTAAAGCTCTATAAAGACTAAATTTGCATCCCTCC 189770313
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAGAGTAAATATGTATATTATTCTATTAAAGCTCTATAAAGACTAAATTTGCATCCCTCC 2100

189770314 AAAAAATGTAAAGTAGCAATGTCATCACTCTTGCACATCCTCTTTGAAACTTCGTTTTCA 189770373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAAAATGTAAAGTAGCAATGTCATCACTCTTGCACATCCTCTTTGAAACTTCGTTTTCA 2160

189770374 TCATCTGTGAAATTTTTTTGTGTTTTTTTTCTCTGCTTTATCAAATTACGTTCTCAGGTC 189770433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCATCTGTGAAATTTTTTTGTGTTTTTTTTCTCTGCTTTATCAAATTACGTTCTCAGGTC 2220

189770434 AGTCAACAATTGAAATTGCGTACAACTTGGCATGATCTAATCGTATGAGTTTTGAAATTG 189770493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGTCAACAATTGAAATTGCGTACAACTTGGCATGATCTAATCGTATGAGTTTTGAAATTG 2280

189770494 CACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCATGTAAATAAATTATATAAAACAAGTTTA 189770553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCATGTAAATAAATTATATAAAACAAGTTTA 2340

189770554 TAAACATATATGCATGTATAATTATTTGTTCTTCTAATCCATATTCCTTACTTTATTATC 189770613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAAACATATATGCATGTATAATTATTTGTTCTTCTAATCCATATTCCTTACTTTATTATC 2400

189770614 TTATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAAATTTTTTAAAGCAAT 189770673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAAATTTTTTAAAGCAAT 2460

189770674 CCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACAGGTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTC 189770733
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACACGTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTC 2520

189770734 TTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGC 189770793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGC 2580

189770794 ATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATC 189770853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATC 2640

189770854 ATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTC 189770913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTC 2700

189770914 TTAAAAAAAAAAATGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATG 189770973
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTAAAAAAAAAA-TGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATG 2759

189770974 CTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAAC 189771033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAAC 2819

189771034 CCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCC 189771093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCC 2879

189771094 AGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTG 189771153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTG 2939

189771154 AGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAAT 189771213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 AGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAAT 2999

189771214 AAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAA 189771273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||
     3000 AAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA--------GCCAAACCAA 3051

189771274 GTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAA 189771333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 GTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAA 3111

189771334 ACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTA 189771393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 ACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTA 3171

189771394 TTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAAT 189771453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 TTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAAT 3231

189771454 GGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCA 189771513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 GGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCA 3291

189771514 GCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTT 189771573
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3292 GCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATATGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTT 3351

189771574 TAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTA 189771633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3352 TAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTA 3411

189771634 ATGCACCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCC 189771693
          ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3412 ATGCGCCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCC 3471

189771694 TCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTAT 189771753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3472 TCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTAT 3531

189771754 TTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAG 189771813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3532 TTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAG 3591

189771814 TGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATAT 189771873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3592 TGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATAT 3651

189771874 TAAGGATTGCCTTCGTCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTG 189771933
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 TAAGGATTGCCTTGGTCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTG 3711

189771934 AACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTG 189771993
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 AACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCCGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTG 3771

189771994 GCAAATCAGGTGTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCACACAG 189772053
          |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3772 GCAAATCAGGTTTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCAGACAG 3831

189772054 CAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCAT 189772113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 CAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCAT 3891

189772114 TAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAAC 189772173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 TAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAAC 3951

189772174 ATATGAATTCTGTGAGGACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATT 189772233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 ATATGAATTCTGTGAGGACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATT 4011

189772234 TAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTA 189772293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4012 TAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTA 4071

189772294 TATAATGCAGTGTACCGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAG 189772353
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4072 TATAATGCAGTGTACTGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAG 4131

189772354 TAAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTATACCTCATACTTTTTTCGACAATTAGAAA 189772413
          |.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||
     4132 TGAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTATGCCTCATACTTGTTTCGACAATTAGAAA 4191

189772414 ATACAATGCAAATAAAGTACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTG 189772473
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4192 ATACAATACAAATAAAGTACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTG 4251

189772474 AGCTACAGCTATGGTTATATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACACGGAAACACATA 189772533
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4252 AGCTACAGCTATGGTTATATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACACAGAAACACATA 4311

189772534 GTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAA 189772593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4312 GTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAA 4371

189772594 AGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGC 189772653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4372 AGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGC 4431

189772654 AAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTA 189772713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 AAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTA 4491

189772714 AGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTG 189772773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4492 AGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTG 4551

189772774 AGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATA 189772833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4552 AGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATA 4611

189772834 GTGTACTATTTTAATATTAAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGATTATTCTT 189772885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 GTGTACTATTTTAATATTAAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGATTATTCTT 4663

EXCISED REGION

189772901 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 189772960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4669 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 4728

189772961 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 189773020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 4788

189773021 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 189773080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4789 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 4848

189773081 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 189773140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 4908

189773141 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 189773200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4909 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 4968

189773201 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 189773260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4969 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 5028

189773261 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 189773320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5029 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 5088

189773321 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 189773380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5089 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATAG 5148

189773381 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 189773440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5149 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 5208

189773441 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 189773500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5209 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 5268

189773501 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 189773560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5269 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 5328

189773561 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 189773620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5329 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 5388

189773621 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 189773680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5389 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 5448

189773681 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 189773740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5449 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 5508

189773741 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 189773800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5509 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 5568

189773801 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 189773860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5569 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 5628

189773861 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 189773920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5629 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 5688

189773921 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 189773980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5689 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 5748

189773981 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 189774040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5749 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 5808

189774041 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 189774100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5809 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 5868

189774101 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 189774160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5869 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 5928

189774161 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 189774220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5929 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 5988

189774221 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 189774280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5989 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 6048

189774281 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 189774340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6049 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 6108

189774341 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 189774400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6109 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 6168

189774401 GAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 189774460
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6169 AAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 6228

189774461 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 189774520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6229 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 6288

189774521 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 189774580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6289 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 6348

189774581 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 189774640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6349 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 6408

189774641 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 189774700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6409 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 6468

189774701 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 189774760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6469 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 6528

189774761 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 189774820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6529 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 6588

189774821 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 189774880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6589 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 6648

189774881 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 189774940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6649 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 6708

189774941 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 189775000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6709 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 6768

189775001 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 189775060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6769 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 6828

189775061 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 189775120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6829 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 6888

189775121 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 189775180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6889 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 6948

189775181 TACGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 189775240
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6949 TATGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 7008

189775241 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 189775300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7009 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 7068

189775301 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCG 189775360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7069 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCG 7128

189775361 CTTAAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAA 189775420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7129 CTTAAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAA 7188

189775421 ATTATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCAT 189775480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7189 ATTATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCAT 7248

189775481 GCCCTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTA 189775540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7249 GCCCTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTA 7308

189775541 GGGCTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGGTCTTGAA 189775600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     7309 GGGCTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGCTCTTGAA 7368

189775601 TTGGAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCC 189775660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7369 TTGGAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCC 7428

189775661 TAGAGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATT 189775720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7429 TAGAGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATT 7488

189775721 GTAACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATAT 189775780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7489 GTAACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATAT 7548

189775781 GCTGTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCC 189775840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7549 GCTGTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCC 7608

189775841 AAAAAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTT 189775900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7609 AAAAAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTT 7668

189775901 TCTATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTT 189775960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7669 TCTATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTT 7728

189775961 GCTCTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAA 189776020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7729 GCTCTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAA 7788

189776021 ACATGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTGGATTATATTCCTGTGTGTGTGTATGT 189776080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7789 ACATGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTGGATTATATTCCTGTGTGTGTGTATGT 7848

189776081 GTGTATGTATACAATATTTTATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAAGAATTTAATTTT 189776140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7849 GTGTATGTATACAATATTTTATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAAGAATTTAATTTT 7908

189776141 GCAATTACTGATTTTCCTGAGATCCTAAAGGGTTAATGTGCTTTTGGAATTTTCTCTGGG 189776200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7909 GCAATTACTGATTTTCCTGAGATCCTAAAGGGTTAATGTGCTTTTGGAATTTTCTCTGGG 7968

189776201 TTTTTGGCTTTGTTTTGTTGGTTGGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATT 189776260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7969 TTTTTGGCTTTGTTTTGTTGGTTGGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATT 8028

189776261 CAGGGGGTACATATACACACACAACACAACATGCATTTATCCATTCATCTTGTCATGACC 189776320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8029 CAGGGGGTACATATACACACACAACACAACATGCATTTATCCATTCATCTTGTCATGACC 8088

189776321 ACTTAGGTTGATTCCACCTTGTAGCTATTATGAATAATGCTGCTATAAACATTTTATACA 189776380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8089 ACTTAGGTTGATTCCACCTTGTAGCTATTATGAATAATGCTGCTATAAACATTTTATACA 8148

189776381 AATATCTATTCAGGTGTTCGCTTTCATTACTTTTAGGTATGTGCACAGAAGTTGAATTGC 189776440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8149 AATATCTATTCAGGTGTTCGCTTTCATTACTTTTAGGTATGTGCACAGAAGTTGAATTGC 8208

189776441 TGGCTCATATGCTAATTCTATAATTATTTGAGCAAACAAATTATTCGAGGAAACATACAC 189776500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8209 TGGCTCATATGCTAATTCTATAATTATTTGAGCAAACAAATTATTCGAGGAAACATACAC 8268

189776501 TTTCTACAGTGGCTGCCTAATTTTACTGTCCTACCAGCAATGCACAAGGCTGCTAAATTC 189776560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8269 TTTCTACAGTGGCTGCCTAATTTTACTGTCCTACCAGCAATGCACAAGGCTGCTAAATTC 8328

189776561 TTCACATTAGTGCCAACATTTGTTTTCCATTTGTTTTTCTTCTTATAATAGCAATCCACT 189776620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8329 TTCACATTAGTGCCAACATTTGTTTTCCATTTGTTTTTCTTCTTATAATAGCAATCCACT 8388

189776621 TGTGAAGTGGTATCTCATTTTGCTTTGATTTGCATTTCCTTAATGATTAATAACACTGAA 189776680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8389 TGTGAAGTGGTATCTCATTTTGCTTTGATTTGCATTTCCTTAATGATTAATAACACTGAA 8448

189776681 TATCTTTTCATGTGCTTATTGAACATTTATGTATTTTTCTGTGTTTTTTCCTGGTAAGAA 189776740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8449 TATCTTTTCATGTGCTTATTGAACATTTATGTATTTTTCTGTGTTTTTTCCTGGTAAGAA 8508

189776741 CATTTGTTGAGAGAAAATGTTCAATATTTGCACTAAAAGATTAGCAGTCTTTGTGGATTT 189776800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8509 CATTTGTTGAGAGAAAATGTTCAATATTTGCACTAAAAGATTAGCAGTCTTTGTGGATTT 8568

189776801 TATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAATAATTTAATTTTGCAATTACTGATTTTCCTG 189776860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8569 TATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAATAATTTAATTTTGCAATTACTGATTTTCCTG 8628

189776861 AGATCTTAAAGGGTTAATATGCTTTTGGAATTTTCTCTGGGTTTTTTGGTTTGTTTTTTT 189776920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8629 AGATCTTAAAGGGTTAATATGCTTTTGGAATTTTCTCTGGGTTTTTTGGTTTGTTTTTTT 8688

189776921 GGTTTGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATTCAGGGGATACATGTGCAGG 189776980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8689 GGTTTGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATTCAGGGGATACATGTGCAGG 8748

189776981 TTTTTTTTCATGGGTATATTGTGTGATGCTGAGGTTTATGGCATGGAGGTAGTGGATTAT 189777040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8749 TTTTTTTTCATGGGTATATTGTGTGATGCTGAGGTTTATGGCATGGAGGTAGTGGATTAT 8808

189777041 TCTCAGGTAATGAGAATAGTACCCAATAGGTAGTTTTCCAATCCATGCCCCACTTCCTCC 189777100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8809 TCTCAGGTAATGAGAATAGTACCCAATAGGTAGTTTTCCAATCCATGCCCCACTTCCTCC 8868

189777101 TTCTCTCATCTAGTAGTCTGCAGTGTCTACTGTTTCCATGTTTATGTCCACATATATATA 189777160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8869 TTCTCTCATCTAGTAGTCTGCAGTGTCTACTGTTTCCATGTTTATGTCCACATATATATA 8928

189777161 CTCTATGGTTTTGGAGAACTGATCACTAAAATTGTTTGCCCTTTTGAAAAATAGGTTGTT 189777220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8929 CTCTATGGTTTTGGAGAACTGATCACTAAAATTGTTTGCCCTTTTGAAAAATAGGTTGTT 8988

189777221 TGGGTTTTTGTGTTGCTGATAACCTATAGGAGCTTTTTTTATATATTCTAAATATTAACT 189777280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8989 TGGGTTTTTGTGTTGCTGATAACCTATAGGAGCTTTTTTTATATATTCTAAATATTAACT 9048

189777281 CTTTATAAGATATACGATTAGCAAATATGTTCTCTCATTCCATGTGTTGCCTTTTCACTC 189777340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9049 CTTTATAAGATATACGATTAGCAAATATGTTCTCTCATTCCATGTGTTGCCTTTTCACTC 9108

189777341 TGTTTTTAGTATCCTTTAAAAAATGTTGATCAAGTCCAATATATCTAATTTTTCTTATAT 189777400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9109 TGTTTTTAGTATCCTTTAAAAAATGTTGATCAAGTCCAATATATCTAATTTTTCTTATAT 9168

189777401 TACCTGTGCTTTTGATATTCTTTCAAGAAGTAATTATTGCCAAATCGAATGACATGAATA 189777460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9169 TACCTGTGCTTTTGATATTCTTTCAAGAAGTAATTATTGCCAAATCGAATGACATGAATA 9228

189777461 ATTTTCCCTATTTTTAAAGATTTTTATACTTTTAACTTTTATGCTTAAACTTTAAAATAT 189777520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9229 ATTTTCCCTATTTTTAAAGATTTTTATACTTTTAACTTTTATGCTTAAACTTTAAAATAT 9288

189777521 TTTGAGTTTTCTGTATATAAGGAAAAGACTCATATTTCTTATTTTGCATGTGGTTATATC 189777580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9289 TTTGAGTTTTCTGTATATAAGGAAAAGACTCATATTTCTTATTTTGCATGTGGTTATATC 9348

189777581 ATTTTCCATTTCTGAGAAGATTGCTATTTTCCTTATTGAATGTTCTTGTCACTTTTGTTG 189777640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9349 ATTTTCCATTTCTGAGAAGATTGCTATTTTCCTTATTGAATGTTCTTGTCACTTTTGTTG 9408

189777641 AAAACCCTTTGACCATATATGTGAGGTTTTATTTCTGGGCTCTCTATTCAGCTTCATTGG 189777700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9409 AAAACCCTTTGACCATATATGTGAGGTTTTATTTCTGGGCTCTCTATTCAGCTTCATTGG 9468

189777701 TCTATATGTTTTTCTTTATGCCAGTAATTCACTGTTTTGATTACTATAACAACTTTGTAG 189777760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9469 TCTATATGTTTTTCTTTATGCCAGTAATTCACTGTTTTGATTACTATAACAACTTTGTAG 9528

189777761 TAAGTATTGAAATCATGAAGTGAGAGTACTCCAACTTTGTTATTTATTTTCAGTATTGTT 189777820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9529 TAAGTATTGAAATCATGAAGTGAGAGTACTCCAACTTTGTTATTTATTTTCAGTATTGTT 9588

189777821 AAGGTTACCTGGGTCCCTTAAGAATCCAAATGAACTTTAGGAAGAATGTTTCTATTTCTG 189777880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9589 AAGGTTACCTGGGTCCCTTAAGAATCCAAATGAACTTTAGGAAGAATGTTTCTATTTCTG 9648

189777881 CAAACATTATCCTTGGGATTTGATAGAAATTGCATTGAATCTGTAGAATGCATTTGGTCA 189777940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9649 CAAACATTATCCTTGGGATTTGATAGAAATTGCATTGAATCTGTAGAATGCATTTGGTCA 9708

189777941 TGCTCACAATATTAAGTCTTTCCATCTATGAGCACAAATGTCTTTGAGCTTGTGTCTTCT 189778000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9709 TGCTCACAATATTAAGTCTTTCCATCTATGAGCACAAATGTCTTTGAGCTTGTGTCTTCT 9768

189778001 TTAGTTACTTTCACCAACATTTTGTAATTTTCAATGTACAAGTATTTTATCTCCTTAAGT 189778060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9769 TTAGTTACTTTCACCAACATTTTGTAATTTTCAATGTACAAGTATTTTATCTCCTTAAGT 9828

189778061 TTTTTCTAGGTATTTTATTCTTTTTATTTTTATATAAAATGGACTTTTTTCTTATTTTTA 189778120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9829 TTTTTCTAGGTATTTTATTCTTTTTATTTTTATATAAAATGGACTTTTTTCTTATTTTTA 9888

189778121 TTTTTATTGTTACTATACAGAAATACAACTTTTTTGTTAATATTGTATCATGCAACATTG 189778180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9889 TTTTTATTGTTACTATACAGAAATACAACTTTTTTGTTAATATTGTATCATGCAACATTG 9948

189778181 TTGAATTTTTAAATTTGTTCTAACAGTTTGGTTTTTTGTGGACCTTTGAGTTTTTTTCGT 189778240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9949 TTGAATTTTTAAATTTGTTCTAACAGTTTGGTTTTTTGTGGACCTTTGAGTTTTTTTCGT 10008

189778241 ACAGCATCATGCCATCTCTGAACAGAAATCATTTTACTTTTTCTTTCCAATTTAATTGCC 189778300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10009 ACAGCATCATGCCATCTCTGAACAGAAATCATTTTACTTTTTCTTTCCAATTTAATTGCC 10068

189778301 TTTTACTTTTGTTTCTTTCTGAATTTCTGTGACTATAACTTTCAATACCGTGTTAGAAAC 189778360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10069 TTTTACTTTTGTTTCTTTCTGAATTTCTGTGACTATAACTTTCAATACCGTGTTAGAAAC 10128

189778361 TTTCCATATTGTGTTACTGAACTGGTGAAAGCAGGCATCCTTATCTTCTTCCTTTTCCTA 189778420
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10129 TTTCTATATTGTGTTACTGAACTGGTGAAAGCAGGCATCCTTATCTTCTTCCTTTTCCTA 10188

189778421 GCATAAAAGCTTTCAGAATTTTATCATTGCATATGATATTACCTGTAGGCTTCTCATATA 189778480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10189 GCATAAAAGCTTTCAGAATTTTATCATTGCATATGATATTACCTGTAGGCTTCTCATATA 10248

189778481 TGTTCATTATTATAATGAAAAAGTTTCCTTGTAATCCTGGTATGTTGGGCATTAAAAAAA 189778540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10249 TGTTCATTATTATAATGAAAAAGTTTCCTTGTAATCCTGGTATGTTGGGCATTAAAAAAA 10308

189778541 ACACAAAAGTGAACTAAATTTTGTCAAATGCTTTATCTAATAAACTACCTTTCTGTCTGA 189778600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10309 ACACAAAAGTGAACTAAATTTTGTCAAATGCTTTATCTAATAAACTACCTTTCTGTCTGA 10368

189778601 TTACATGCTTTGCTTGATTTTTAATCTTATTAAGTGTTTTTACATCAGTCTTACTGCTTA 189778660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10369 TTACATGCTTTGCTTGATTTTTAATCTTATTAAGTGTTTTTACATCAGTCTTACTGCTTA 10428

189778661 TCAGTCTATCCTGGAGAATATTTCGTATGTTCTCAAAAAAAACCCCATAATTTTCTGTTG 189778720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10429 TCAGTCTATCCTGGAGAATATTTCGTATGTTCTCAAAAAAAACCCCATAATTTTCTGTTG 10488

189778721 GTGAAGTAATTACAAATACCATCTTATGTTAGTTAGTAGTTTATTATTATTATATAGTGC 189778780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10489 GTGAAGTAATTACAAATACCATCTTATGTTAGTTAGTAGTTTATTATTATTATATAGTGC 10548

189778781 AGCCACTCTGGATTCTGATTTTTCTCTAAGGGGGTTGTGTTCATTGCTGCTTTACTTGTT 189778840
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10549 AGCCACACTGGATTCTGATTTTTCTCTAAGGGGGTTGTGTTCATTGCTGCTTTACTTGTT 10608

189778841 TCTTTGTTTAGTAATTTGCCTGGATTCCATTTGTGAATTGTGCCTTTCTCACAGAGTAAA 189778900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10609 TCTTTGTTTAGTAATTTGCCTGGATTCCATTTGTGAATTGTGCCTTTCTCACAGAGTAAA 10668

189778901 AATGCCAATGTCACTGATTATTTTTTATTATTCTTGTTTTAACTTTAAGTTTGTTTTCCT 189778960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10669 AATGCCAATGTCACTGATTATTTTTTATTATTCTTGTTTTAACTTTAAGTTTGTTTTCCT 10728

189778961 GCGGGTCACTTCAGTGTCAGT 189778981
          |||||||||||||||||||||
    10729 GCGGGTCACTTCAGTGTCAGT 10749

Alignment time is 9.87047 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     6049] =>      6049 nucs 'mol-32-2b34-021101_6049'

Score:        4636
Aligned:      4801        nucs
Identic:      4786 (100%) nucs =>      1635 ( 99%)      3151 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189771239,189772885] EXCISED REGION [189772901,189776054]
 second seq =>  [      203,     1849] EXCISED REGION [     1855,     5008]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [189772886,189772900]
 second seq =>         5 nucs [1850,1854]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189772885,189772885] to [189772900,189772900]
 second seq =>         1 nucs [1850,1850] to [1855,1855]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1850,1850] to [1854,1854]

189771239 AATAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTT 189771298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      203 AATAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTT 262

189771299 TCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTC 189771358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      263 TCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTC 322

189771359 AGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACA 189771418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      323 AGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACA 382

189771419 GAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCC 189771478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      383 GAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCC 442

189771479 TCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAG 189771538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      443 TCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAG 502

189771539 GCATACGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGT 189771598
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      503 GCATATGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGT 562

189771599 TGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGGCCTCCAAAGT 189771658
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      563 TGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGGCCTCCAAAGT 622

189771659 GCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAAT 189771718
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      623 GCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAAT 682

189771719 TTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACT 189771778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      683 TTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACT 742

189771779 TGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGT 189771838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      743 TGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGT 802

189771839 CTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTCGTCAATTTCTA 189771898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      803 CTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTGGTCAATTTCTA 862

189771899 CTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAG 189771958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      863 CTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAG 922

189771959 TTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTGTCTGGTACTAATT 189772018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      923 TTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTTTCTGGTACTAATT 982

189772019 TGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCACACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAAC 189772078
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      983 TGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCAGACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAAC 1042

189772079 TGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTT 189772138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1043 TGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTT 1102

189772139 AATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAAT 189772198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1103 AATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAAT 1162

189772199 ATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTT 189772258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1163 ATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTT 1222

189772259 CAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACCGAGTAAGAG 189772318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1223 CAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACTGAGTAAGAG 1282

189772319 TATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTAAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAG 189772378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1283 TATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTGAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAG 1342

189772379 AGTGTATACCTCATACTTTTTTCGACAATTAGAAAATACAATGCAAATAAAGTACTTTAG 189772438
          |||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1343 AGTGTATGCCTCATACTTGTTTCGACAATTAGAAAATACAATACAAATAAAGTACTTTAG 1402

189772439 CAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACA 189772498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 CAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACA 1462

189772499 ATATAAAAACTATTTCATGAACACGGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACA 189772558
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 ATATAAAAACTATTTCATGAACACAGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACA 1522

189772559 GTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCT 189772618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 GTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCT 1582

189772619 TCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACC 189772678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 TCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACC 1642

189772679 CCCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTC 189772738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 CCCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTC 1702

189772739 CATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGC 189772798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 CATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGC 1762

189772799 ACCGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAAC 189772858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 ACCGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAAC 1822

189772859 TGTCTAGTACCCCTTAAGATTATTCTT 189772885
          |||||||||||||||||||||||||||
     1823 TGTCTAGTACCCCTTAAGATTATTCTT 1849

EXCISED REGION

189772901 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 189772960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 1914

189772961 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 189773020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 1974

189773021 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 189773080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 2034

189773081 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 189773140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 2094

189773141 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 189773200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 2154

189773201 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 189773260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 2214

189773261 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 189773320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 2274

189773321 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 189773380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 2334

189773381 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 189773440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 2394

189773441 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 189773500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 2454

189773501 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 189773560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 2514

189773561 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 189773620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 2574

189773621 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 189773680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 2634

189773681 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 189773740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 2694

189773741 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 189773800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 2754

189773801 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 189773860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 2814

189773861 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 189773920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 2874

189773921 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 189773980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 2934

189773981 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 189774040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 2994

189774041 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 189774100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 3054

189774101 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 189774160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 3114

189774161 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 189774220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 3174

189774221 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 189774280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 3234

189774281 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 189774340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 3294

189774341 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 189774400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 3354

189774401 GAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 189774460
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 AAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 3414

189774461 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 189774520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 3474

189774521 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 189774580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 3534

189774581 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 189774640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 3594

189774641 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 189774700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 3654

189774701 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 189774760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 3714

189774761 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 189774820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 3774

189774821 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 189774880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 3834

189774881 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 189774940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 3894

189774941 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 189775000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 3954

189775001 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 189775060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 4014

189775061 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 189775120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 4074

189775121 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 189775180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 4134

189775181 TACGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 189775240
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 TATGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 4194

189775241 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 189775300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 4254

189775301 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCG 189775360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCG 4314

189775361 CTTAAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAA 189775420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 CTTAAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAA 4374

189775421 ATTATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCAT 189775480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 ATTATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCAT 4434

189775481 GCCCTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTA 189775540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 GCCCTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTA 4494

189775541 GGGCTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGGTCTTGAA 189775600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4495 GGGCTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGCTCTTGAA 4554

189775601 TTGGAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCC 189775660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 TTGGAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCC 4614

189775661 TAGAGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATT 189775720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4615 TAGAGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATT 4674

189775721 GTAACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATAT 189775780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4675 GTAACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATAT 4734

189775781 GCTGTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCC 189775840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 GCTGTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCC 4794

189775841 AAAAAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTT 189775900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4795 AAAAAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTT 4854

189775901 TCTATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTT 189775960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4855 TCTATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTT 4914

189775961 GCTCTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAA 189776020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4915 GCTCTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAA 4974

189776021 ACATGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTG 189776054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4975 ACATGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTG 5008

Alignment time is 5.77731 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     7731] =>      7731 nucs 'mol-32-2b3f-057919_7731'

Score:        7512
Aligned:      7735        nucs
Identic:      7709 (100%) nucs =>      3242 ( 99%)      4467 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189769621,189772885] EXCISED REGION [189772901,189777370]
 second seq =>  [        1,     3256] EXCISED REGION [     3262,     7731]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [189772886,189772900]
 second seq =>         5 nucs [3257,3261]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189772885,189772885] to [189772900,189772900]
 second seq =>         1 nucs [3257,3257] to [3262,3262]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3257,3257] to [3261,3261]

189769621 ATTGAACTTTAGGAACACTTACATGTCAAAGCTTATTAAGAGGGAAAATAACCAGTCTAG 189769680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTGAACTTTAGGAACACTTACATGTCAAAGCTTATTAAGAGGGAAAATAACCAGTCTAG 60

189769681 GTGTCATATAGATGTCCATCAAACTATCATCACACCTCCACTTTGCATTTTAGGTTGATA 189769740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGTCATATAGATGTCCATCAAACTATCATCACACCTCCACTTTGCATTTTAGGTTGATA 120

189769741 ATTTAGCATCAACATAGAGGACTTTGATGACAAACAATTTCAGGGAGTGAAACTGGCAAA 189769800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTAGCATCAACATAGAGGACTTTGATGACAAACAATTTCAGGGAGTGAAACTGGCAAA 180

189769801 GAACATAAGGTATTCTTTTTCAAGTTTAACACCTTACCGTGATGTTTGACTTCAAATATA 189769860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAACATAAGGTATTCTTTTTCAAGTTTAACACCTTACCGTGATGTTTGACTTCAAATATA 240

189769861 AATGTAGCTACAGTGTAATAAAAAAACAATTTTTTCAGTTGTTTACTATCTCTTCTCTTT 189769920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATGTAGCTACAGTGTAATAAAAAAACAATTTTTTCAGTTGTTTACTATCTCTTCTCTTT 300

189769921 ATACATTAGAAACTTCCAATTTCTTTAATTTCACATTTAAAGGAAGTTTTGATATGAAGA 189769980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATACATTAGAAACTTCCAATTTCTTTAATTTCACATTTAAAGGAAGTTTTGATATGAAGA 360

189769981 ATTGAAGATACAGATATGAAAGTACAATAGTCAGTTTCAGCATTTTTAATTGCCAGTCTG 189770040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTGAAGATACAGATATGAAAGTACAATAGTCAGTTTCAGCATTTTTAATTGCCAGTCTG 420

189770041 TTTCTCTTATGTTACAATTTTCAGGCCATTTTTAGGCCTTTCCAAATTACTAAATGCATT 189770100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCTCTTATGTTACAATTTTCAGGCCATTTTTAGGCCTTTCCAAATTACTAAATGCATT 480

189770101 AAATGTTACCTGATCTGCTTTTTTTCATTGCTACCTATTTTTTTAAGTAATGCTGTCTTT 189770160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATGTTACCTGATCTGCTTTTTTTCATTGCTACCTATTTTTTTAAGTAATGCTGTCTTT 540

189770161 ATGATTTCTTTTTTGCCCATGTGCATATTCTCTTATTTCACTGTAGGAATGGTGAAACTC 189770220
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGATTTCTTTTTTGCCCACGTGCATATTCTCTTATTTCACTGTAGGAATGGTGAAACTC 600

189770221 TGGATCTAGAATTTAACTATATCCAATTTTCATGAGAGTAAAAATGTATATTATTCTATT 189770280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGATCTAGAATTTAACTATATCCAATTTTCATGAGAGTAAAAATGTATATTATTCTATT 660

189770281 AAAGCTCTATAAAGACTAAATTTGCATCCCTCCAAAAAATGTAAAGTAGCAATGTCATCA 189770340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAGCTCTATAAAGACTAAATTTGCATCCCTCCAAAAAATGTAAAGTAGCAATGTCATCA 720

189770341 CTCTTGCACATCCTCTTTGAAACTTCGTTTTCATCATCTGTGAAATTTTTTTGTGTTTTT 189770400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCTTGCACATCCTCTTTGAAACTTCGTTTTCATCATCTGTGAAATTTTTTTGTGTTTTT 780

189770401 TTTCTCTGCTTTATCAAATTACGTTCTCAGGTCAGTCAACAATTGAAATTGCGTACAACT 189770460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTCTCTGCTTTATCAAATTACGTTCTCAGGTCAGTCAACAATTGAAATTGCGTACAACT 840

189770461 TGGCATGATCTAATCGTATGAGTTTTGAAATTGCACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTT 189770520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGCATGATCTAATCGTATGAGTTTTGAAATTGCACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTT 900

189770521 GTGCATGTAAATAAATTATATAAAACAAGTTTATAAACATATATGCATGTATAATTATTT 189770580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGCATGTAAATAAATTATATAAAACAAGTTTATAAACATATATGCATGTATAATTATTT 960

189770581 GTTCTTCTAATCCATATTCCTTACTTTATTATCTTATGTATAAATTATGTAAAGATAGCA 189770640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTCTTCTAATCCATATTCCTTACTTTATTATCTTATGTATAAATTATGTAAAGATAGCA 1020

189770641 TCAGAATATGTAATATAAATTTTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCT 189770700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCAGAATATGTAATATAAATTTTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCT 1080

189770701 TACAGGTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACA 189770760
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TACACGTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACA 1140

189770761 GAAATATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATG 189770820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAATATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATG 1200

189770821 AAATACTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTT 189770880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAATACTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTT 1260

189770881 TTATCAAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAAATGGCCGGACACGGT 189770940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     1261 TTATCAAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAA-TGGCCGGACACGGT 1319

189770941 GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGG 189771000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGG 1379

189771001 AAATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAAT 189771060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 AAATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAAT 1439

189771061 TATCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGA 189771120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TATCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGA 1499

189771121 ATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAG 189771180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 ATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAG 1559

189771181 CCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAA 189771240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAA 1619

189771241 TAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTC 189771300
          |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TAAATAAATAAATAA--------GCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTC 1671

189771301 CATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAG 189771360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 CATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAG 1731

189771361 GTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGA 189771420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 GTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGA 1791

189771421 GTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTC 189771480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 GTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTC 1851

189771481 CACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGC 189771540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 CACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGC 1911

189771541 ATACGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTG 189771600
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 ATATGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTG 1971

189771601 GTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGC 189771660
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1972 GTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGC 2031

189771661 TGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTT 189771720
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 TGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTT 2091

189771721 ACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTG 189771780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 ACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTG 2151

189771781 CTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCT 189771840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 CTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCT 2211

189771841 ACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTCGTCAATTTCTACT 189771900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2212 ACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTGGTCAATTTCTACT 2271

189771901 GCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTT 189771960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 GCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTT 2331

189771961 CTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTGTCTGGTACTAATTTG 189772020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2332 CTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTTTCTGGTACTAATTTG 2391

189772021 CAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCACACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTG 189772080
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 CAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCAGACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTG 2451

189772081 TCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAA 189772140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 TCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAA 2511

189772141 TTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATAT 189772200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 TTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATAT 2571

189772201 GGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCA 189772260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 GGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCA 2631

189772261 AAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACCGAGTAAGAGTA 189772320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2632 AAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACTGAGTAAGAGTA 2691

189772321 TGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTAAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAG 189772380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2692 TGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTGAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAG 2751

189772381 TGTATACCTCATACTTTTTTCGACAATTAGAAAATACAATGCAAATAAAGTACTTTAGCA 189772440
          |||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2752 TGTATGCCTCATACTTGTTTCGACAATTAGAAAATACAATACAAATAAAGTACTTTAGCA 2811

189772441 GGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAAT 189772500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 GGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAAT 2871

189772501 ATAAAAACTATTTCATGAACACGGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGT 189772560
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 ATAAAAACTATTTCATGAACACAGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGT 2931

189772561 ATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTC 189772620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 ATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTC 2991

189772621 CCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCC 189772680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 CCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCC 3051

189772681 CAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCA 189772740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 CAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCA 3111

189772741 TCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCAC 189772800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 TCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCAC 3171

189772801 CGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACTG 189772860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 CGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACTG 3231

189772861 TCTAGTACCCCTTAAGATTATTCTT 189772885
          |||||||||||||||||||||||||
     3232 TCTAGTACCCCTTAAGATTATTCTT 3256

EXCISED REGION

189772901 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 189772960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 3321

189772961 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 189773020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 3381

189773021 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 189773080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 3441

189773081 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 189773140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 3501

189773141 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 189773200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 3561

189773201 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 189773260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 3621

189773261 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 189773320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 3681

189773321 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 189773380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 3741

189773381 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 189773440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 3801

189773441 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 189773500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 3861

189773501 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 189773560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 3921

189773561 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 189773620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 3981

189773621 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 189773680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 4041

189773681 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 189773740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 4101

189773741 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 189773800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 4161

189773801 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 189773860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 4221

189773861 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 189773920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4222 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 4281

189773921 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 189773980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 4341

189773981 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 189774040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 4401

189774041 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 189774100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 4461

189774101 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 189774160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 4521

189774161 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 189774220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 4581

189774221 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 189774280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 4641

189774281 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 189774340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 4701

189774341 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 189774400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 4761

189774401 GAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 189774460
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 AAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 4821

189774461 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 189774520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 4881

189774521 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 189774580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4882 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 4941

189774581 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 189774640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4942 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 5001

189774641 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 189774700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5002 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 5061

189774701 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 189774760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5062 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 5121

189774761 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 189774820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5122 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 5181

189774821 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 189774880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5182 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 5241

189774881 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 189774940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5242 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 5301

189774941 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 189775000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5302 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 5361

189775001 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 189775060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5362 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 5421

189775061 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 189775120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5422 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 5481

189775121 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 189775180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5482 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 5541

189775181 TACGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 189775240
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5542 TATGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 5601

189775241 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 189775300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5602 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 5661

189775301 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCG 189775360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5662 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCG 5721

189775361 CTTAAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAA 189775420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5722 CTTAAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAA 5781

189775421 ATTATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCAT 189775480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5782 ATTATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCAT 5841

189775481 GCCCTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTA 189775540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5842 GCCCTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTA 5901

189775541 GGGCTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGGTCTTGAA 189775600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     5902 GGGCTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGCTCTTGAA 5961

189775601 TTGGAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCC 189775660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5962 TTGGAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCC 6021

189775661 TAGAGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATT 189775720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6022 TAGAGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATT 6081

189775721 GTAACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATAT 189775780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6082 GTAACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATAT 6141

189775781 GCTGTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCC 189775840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6142 GCTGTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCC 6201

189775841 AAAAAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTT 189775900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6202 AAAAAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTT 6261

189775901 TCTATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTT 189775960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6262 TCTATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTT 6321

189775961 GCTCTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAA 189776020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6322 GCTCTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAA 6381

189776021 ACATGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTGGATTATATTCCTGTGTGTGTGTATGT 189776080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6382 ACATGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTGGATTATATTCCTGTGTGTGTGTATGT 6441

189776081 GTGTATGTATACAATATTTTATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAAGAATTTAATTTT 189776140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6442 GTGTATGTATACAATATTTTATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAAGAATTTAATTTT 6501

189776141 GCAATTACTGATTTTCCTGAGATCCTAAAGGGTTAATGTGCTTTTGGAATTTTCTCTGGG 189776200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6502 GCAATTACTGATTTTCCTGAGATCCTAAAGGGTTAATGTGCTTTTGGAATTTTCTCTGGG 6561

189776201 TTTTTGGCTTTGTTTTGTTGGTTGGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATT 189776260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6562 TTTTTGGCTTTGTTTTGTTGGTTGGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATT 6621

189776261 CAGGGGGTACATATACACACACAACACAACATGCATTTATCCATTCATCTTGTCATGACC 189776320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6622 CAGGGGGTACATATACACACACAACACAACATGCATTTATCCATTCATCTTGTCATGACC 6681

189776321 ACTTAGGTTGATTCCACCTTGTAGCTATTATGAATAATGCTGCTATAAACATTTTATACA 189776380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6682 ACTTAGGTTGATTCCACCTTGTAGCTATTATGAATAATGCTGCTATAAACATTTTATACA 6741

189776381 AATATCTATTCAGGTGTTCGCTTTCATTACTTTTAGGTATGTGCACAGAAGTTGAATTGC 189776440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6742 AATATCTATTCAGGTGTTCGCTTTCATTACTTTTAGGTATGTGCACAGAAGTTGAATTGC 6801

189776441 TGGCTCATATGCTAATTCTATAATTATTTGAGCAAACAAATTATTCGAGGAAACATACAC 189776500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6802 TGGCTCATATGCTAATTCTATAATTATTTGAGCAAACAAATTATTCGAGGAAACATACAC 6861

189776501 TTTCTACAGTGGCTGCCTAATTTTACTGTCCTACCAGCAATGCACAAGGCTGCTAAATTC 189776560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6862 TTTCTACAGTGGCTGCCTAATTTTACTGTCCTACCAGCAATGCACAAGGCTGCTAAATTC 6921

189776561 TTCACATTAGTGCCAACATTTGTTTTCCATTTGTTTTTCTTCTTATAATAGCAATCCACT 189776620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6922 TTCACATTAGTGCCAACATTTGTTTTCCATTTGTTTTTCTTCTTATAATAGCAATCCACT 6981

189776621 TGTGAAGTGGTATCTCATTTTGCTTTGATTTGCATTTCCTTAATGATTAATAACACTGAA 189776680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6982 TGTGAAGTGGTATCTCATTTTGCTTTGATTTGCATTTCCTTAATGATTAATAACACTGAA 7041

189776681 TATCTTTTCATGTGCTTATTGAACATTTATGTATTTTTCTGTGTTTTTTCCTGGTAAGAA 189776740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7042 TATCTTTTCATGTGCTTATTGAACATTTATGTATTTTTCTGTGTTTTTTCCTGGTAAGAA 7101

189776741 CATTTGTTGAGAGAAAATGTTCAATATTTGCACTAAAAGATTAGCAGTCTTTGTGGATTT 189776800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7102 CATTTGTTGAGAGAAAATGTTCAATATTTGCACTAAAAGATTAGCAGTCTTTGTGGATTT 7161

189776801 TATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAATAATTTAATTTTGCAATTACTGATTTTCCTG 189776860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7162 TATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAATAATTTAATTTTGCAATTACTGATTTTCCTG 7221

189776861 AGATCTTAAAGGGTTAATATGCTTTTGGAATTTTCTCTGGGTTTTTTGGTTTGTTTTTTT 189776920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7222 AGATCTTAAAGGGTTAATATGCTTTTGGAATTTTCTCTGGGTTTTTTGGTTTGTTTTTTT 7281

189776921 GGTTTGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATTCAGGGGATACATGTGCAGG 189776980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7282 GGTTTGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATTCAGGGGATACATGTGCAGG 7341

189776981 TTTTTTTTCATGGGTATATTGTGTGATGCTGAGGTTTATGGCATGGAGGTAGTGGATTAT 189777040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7342 TTTTTTTTCATGGGTATATTGTGTGATGCTGAGGTTTATGGCATGGAGGTAGTGGATTAT 7401

189777041 TCTCAGGTAATGAGAATAGTACCCAATAGGTAGTTTTCCAATCCATGCCCCACTTCCTCC 189777100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7402 TCTCAGGTAATGAGAATAGTACCCAATAGGTAGTTTTCCAATCCATGCCCCACTTCCTCC 7461

189777101 TTCTCTCATCTAGTAGTCTGCAGTGTCTACTGTTTCCATGTTTATGTCCACATATATATA 189777160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7462 TTCTCTCATCTAGTAGTCTGCAGTGTCTACTGTTTCCATGTTTATGTCCACATATATATA 7521

189777161 CTCTATGGTTTTGGAGAACTGATCACTAAAATTGTTTGCCCTTTTGAAAAATAGGTTGTT 189777220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7522 CTCTATGGTTTTGGAGAACTGATCACTAAAATTGTTTGCCCTTTTGAAAAATAGGTTGTT 7581

189777221 TGGGTTTTTGTGTTGCTGATAACCTATAGGAGCTTTTTTTATATATTCTAAATATTAACT 189777280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7582 TGGGTTTTTGTGTTGCTGATAACCTATAGGAGCTTTTTTTATATATTCTAAATATTAACT 7641

189777281 CTTTATAAGATATACGATTAGCAAATATGTTCTCTCATTCCATGTGTTGCCTTTTCACTC 189777340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7642 CTTTATAAGATATACGATTAGCAAATATGTTCTCTCATTCCATGTGTTGCCTTTTCACTC 7701

189777341 TGTTTTTAGTATCCTTTAAAAAATGTTGAT 189777370
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     7702 TGTTTTTAGTATCCTTTAAAAAATGTTGAT 7731

Alignment time is 7.18703 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     6240] =>      6240 nucs 'mol-32-2f3e-112519_6240'

Score:        5886
Aligned:      6254        nucs
Identic:      6205 ( 99%) nucs =>      2735 ( 99%)      3470 ( 99%)
Gaps:           24 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189766425,189769177] EXCISED REGION [189769182,189772676]
 second seq =>  [        1,     2749] EXCISED REGION [     2754,     6240]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [189769178,189769181]
 second seq =>         4 nucs [2750,2753]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189769178,189769178] to [189769181,189769181]
 second seq =>         1 nucs [2750,2750] to [2753,2753]

189766425 ACCAACAGTGATAGGTAAAGTTTATTTTTTAATTCAAGATGCCTACAGGTTATGCCCTAT 189766484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCAACAGTGATAGGTAAAGTTTATTTTTTAATTCAAGATGCCTACAGGTTATGCCCTAT 60

189766485 GATAGCTAAATTTTCATACCCATATTTCTACTCAAACACTGGTGGATACTTCACTAATCT 189766544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATAGCTAAATTTTCATACCCATATTTCTACTCAAACACTGGTGGATACTTCACTAATCT 120

189766545 AAATCATTTGGCAAGAATGCAGAATTTATATTTAATATGATCCTGTTGTTGTATCACTAA 189766604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATCATTTGGCAAGAATGCAGAATTTATATTTAATATGATCCTGTTGTTGTATCACTAA 180

189766605 TAGTAGGGTGTGGTATCATTTCTCTCTCATTAAATGGATATTGAGTGGATTAATAGTATT 189766664
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      181 TAGTAGGGTGTGGTATCATTTCTCTCTCATTAAATGGATATTGAGTGGATTAATAGTATA 240

189766665 TTTAAAGCCAAAACTCAAGCTACCAATTTTCAGCTTCTATTTTTAAAGGTATTTAAAATT 189766724
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      241 TTTAAAGCCAAAACTCAAGCTACCAATTTTCAGCTTCTATTTTTAAAGGTATTTAAAATG 300

189766725 TATTTGTTTTAAGAAAAAATGTTTGTGAAATATTTAAATTTTAAATAAAGGTATTTAAAA 189766784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTTGTTTTAAGAAAAAATGTTTGTGAAATATTTAAATTTTAAATAAAGGTATTTAAAA 360

189766785 ATTATTTAATAATGGCCTACTATATACCAAGCACTGGTTACAGAGGATAATTTATACAAT 189766844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTATTTAATAATGGCCTACTATATACCAAGCACTGGTTACAGAGGATAATTTATACAAT 420

189766845 GTCCTACTGGTTACAGAGGATAATTTATGCAATGCCCATACTTTCATAGAGCTTACCTTC 189766904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCCTACTGGTTACAGAGGATAATTTATGCAATGCCCATACTTTCATAGAGCTTACCTTC 480

189766905 TAATGTAGGAAGATATGTGTATGTTTTTATATCTGTATGTTTGTGTTGCGTTTGTGTCTA 189766964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||
      481 TAATGTAGGAAGATATGTGTATGTTTTTATATCTATATGTTTGTGTTGTGTTTGTGTCTA 540

189766965 TGTATATCTATATCCACATCTGTATCTATGGATGTTGAATGAAAAAGTCAGGGTAAAGGG 189767024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTATATCTATATCCACATCTGTATCTATGGATGTTGAATGAAAAAGTCAGGGTAAAGGG 600

189767025 TGAAGAAGGGTGGAAACGCCAGGGTGCATTGTGAGATATGCTAGTGTCAACAGTTATAAT 189767084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAAGAAGGGTGGAAACGCCAGGGTGCATTGTGAGATATGCTAGTGTCAACAGTTATAAT 660

189767085 TGCTCATGTATTGTGCCCATGTATAAATAAATATAATGATATTTAGTGTAGTATTAACAT 189767144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCTCATGTATTGTGCCCATGTATAAATAAATATAATGATATTTAGTGTAGTATTAACAT 720

189767145 TAATAGCAAAATATGAAAAATATCCTAAATGCCCATCAGTATGAAACTAGTTAGCTAAAT 189767204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAATAGCAAAATATGAAAAATATCCTAAATGCCCATCAGTATGAAACTAGTTAGCTAAAT 780

189767205 GTCAATGAAATAAAATATAACACAACATAATAAAATGGTGAATTTTCTATTTATGTAACA 189767264
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      781 GTCAATGAAATAAAATATAACACAACATAATAAAACGGTGAATTTTCTATTTATGTAACA 840

189767265 AAATGGAAAGTATATAAGCTACATTAATAAATGAAAAGGCAAAGAGCAGATTATTCAATA 189767324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATGGAAAGTATATAAGCTACATTAATAAATGAAAAGGCAAAGAGCAGATTATTCAATA 900

189767325 TTTTATGCCATAATCTGCCAAAAAAACTAATATCCACTGAACTATTTATCTAGACTTTTA 189767384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTATGCCATAATCTGCCAAAAAAACTAATATCCACTGAACTATTTATCTAGACTTTTA 960

189767385 GAGGGAAACATAAGAAGTAAAATAATAGCAGTGGTTATCAGCTTGCAAGATAAAGTATCT 189767444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGGGAAACATAAGAAGTAAAATAATAGCAGTGGTTATCAGCTTGCAAGATAAAGTATCT 1020

189767445 TATATAGGTATCAATATTTCACTGCATATGCCTTTTTCTACTTTTTGATTTGAGAATCAT 189767504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATATAGGTATCAATATTTCACTGCATATGCCTTTTTCTACTTTTTGATTTGAGAATCAT 1080

189767505 GAGAATATTCTGTAATACCTATTCAGAAAATTGTATTAAAATGTCATTACATGATGCGTT 189767564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1081 GAGAATATTCTGTAATACCTATTCAGAAAATTGTATTAAAATGTCATTACATGATGTGTT 1140

189767565 AGGCCATTCCCATATTGTTATAAAGAAACACCTGAGACTGCTCGGGTGTGGTGGCTCACG 189767624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGCCATTCCCATATTGTTATAAAGAAACACCTGAGACTGCTCGGGTGTGGTGGCTCACG 1200

189767625 CCTATAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCCAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTTGGGAATTCA 189767684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTATAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCCAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTTGGGAATTCA 1260

189767685 AGACCAGTCTGACCAACATGGTCTCTACTAAAAATACAAAAAGTTAGCCAAGTGTGGTGG 189767744
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1261 AGACCAGTCTGACCAACATGGTCTCTACTAAAAATACGAAAAGTTAGCCAAGTGTGGTGG 1320

189767745 CGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTCCAACCTGAG 189767804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTCCAACCTGAG 1380

189767805 AGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCAAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGATC 189767864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCAAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGATC 1440

189767865 GAGCTCTGTTTCAAAAAAAAAAGAAAGGAGAGAAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAA 189767924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAGCTCTGTTTCAAAAAAAAAAGAAAGGAGAGAAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAA 1500

189767925 GGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAAAGAAAAGAAAGAAAGGGAAGGAAGGA 189767984
          ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAA--------AAAGAAAAGAAAGAAAGGGAAGGAAGGA 1552

189767985 AGGG-----AGGAAGGAAAGAAAGGTCCTGAGACAGAGTTATTTAGAAAGAAAAGAAAGA 189768039
          |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 AGG-AAGGAAGGAAGGAAAGAAAGGTCCTGAGACAGAGTTATTTAGAAAGAAAAGAAAGA 1611

189768040 GGTTCAGTTGGCTCATGGTTCCACATGCTGTACAGAATGCATGGCTGGGAGGCCTCAGGA 189768099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 GGTTCAGTTGGCTCATGGTTCCACATGCTGTACAGAATGCATGGCTGGGAGGCCTCAGGA 1671

189768100 AATTTACAGTCATGGCAGAAGGCAAAGGGGCAGTGAGCCATCTCACATGGAAGAGCAGCA 189768159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 AATTTACAGTCATGGCAGAAGGCAAAGGGGCAGTGAGCCATCTCACATGGAAGAGCAGCA 1731

189768160 GCAAGATGGGGTGACATGCTACATACTTCTACACAACCAGATGTCATGAGAATTCACTCA 189768219
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 GCAAGATGGGGTGACATGCTACATACTTTTACACAACCAGATGTCATGAGAATTCACTCA 1791

189768220 CTATCACAAGAACAGCACCAAGAGAATGGTGCTAAAGCAGTCATAAGAAATTGTCCCCAT 189768279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 CTATCACAAGAACAGCACCAAGAGAATGGTGCTAAAGCAGTCATAAGAAATTGTCCCCAT 1851

189768280 GATCTAATCAACTCTCTCCAGGCCCCAACTCTAACATTGGGAATTACAATTTGACATGAG 189768339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 GATCTAATCAACTCTCTCCAGGCCCCAACTCTAACATTGGGAATTACAATTTGACATGAG 1911

189768340 ATTTGGGTGAGAACACAGATCCAAGCCAATCTCATTTAAAAATGTTCTGATGGGCTTACA 189768399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 ATTTGGGTGAGAACACAGATCCAAGCCAATCTCATTTAAAAATGTTCTGATGGGCTTACA 1971

189768400 CCGGTGTATTGGGTTCAGAGAGACCAGATGGGATAGTAGCATAGTGTTTGTTTTGAAATA 189768459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 CCGGTGTATTGGGTTCAGAGAGACCAGATGGGATAGTAGCATAGTGTTTGTTTTGAAATA 2031

189768460 TGAGGGAGTTAACCATGTGTATGTTAAGAAGAGGTTTTCACATTCAGGATACATTTAAGA 189768519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 TGAGGGAGTTAACCATGTGTATGTTAAGAAGAGGTTTTCACATTCAGGATACATTTAAGA 2091

189768520 AGCCATTAAAAGAGTTAGCAAACTATAGCTCTTGGTTGAAACCATAACTTTGTCTAAATT 189768579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 AGCCATTAAAAGAGTTAGCAAACTATAGCTCTTGGTTGAAACCATAACTTTGTCTAAATT 2151

189768580 TTTGTAAATAAGATTTCATTGGAACACAGCTATACCCATTCTTTTACATATTGTCTAGTG 189768639
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 TTTGTAAATCAGATTTCATTGGAACACAGCTATACCCATTCTTTTACATATTGTCTAGTG 2211

189768640 CTGCTTTCACATTGTAATAGTAGAGTTGAGTGGTTATAGCAATGGTTATATTGCATACAA 189768699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 CTGCTTTCACATTGTAATAGTAGAGTTGAGTGGTTATAGCAATGGTTATATTGCATACAA 2271

189768700 AGACTATAACACTTAGAATATTCCCCTTTAGAGAAAACATTTGCTGGTTCCTCATATAGA 189768759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 AGACTATAACACTTAGAATATTCCCCTTTAGAGAAAACATTTGCTGGTTCCTCATATAGA 2331

189768760 CCAGAGGATTTTCCAATGAACAGCTTGCGTGGTATTAAATAATGATGAGAGTAAAGGATA 189768819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 CCAGAGGATTTTCCAATGAACAGCTTGCGTGGTATTAAATAATGATGAGAGTAAAGGATA 2391

189768820 ACACTGCCATTTTTAGCCTGAGCAACTAGCAAATTTGAAATTTGAATTACCATTTACTGC 189768879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 ACACTGCCATTTTTAGCCTGAGCAACTAGCAAATTTGAAATTTGAATTACCATTTACTGC 2451

189768880 CATTTATTGAAACATGGATCACTTAGAATGCAACAAAGTCAGGGTGATGAAGACTAAAAG 189768939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 CATTTATTGAAACATGGATCACTTAGAATGCAACAAAGTCAGGGTGATGAAGACTAAAAG 2511

189768940 ATTCAGTAGAATATAGGATAATTCCCTGAGTATGTCTGCAAGACTACGTGTCCACAGATC 189768999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 ATTCAGTAGAATATAGGATAATTCCCTGAGTATGTCTGCAAGACTACGTGTCCACAGATC 2571

189769000 CCAGTTTGAGAAACAGTTGTGTAGTAGGATATGAGGAGTAGGATAGGAGGAGGGTAATTC 189769059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 CCAGTTTGAGAAACAGTTGTGTAGTAGGATATGAGGAGTAGGATAGGAGGAGGGTAATTC 2631

189769060 TAAAGTTCTAAAACTAACAAACCTTTGACCAAATTGTTTAAACTTTCTGATTCTTGACTT 189769119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 TAAAGTTCTAAAACTAACAAACCTTTGACCAAATTGTTTAAACTTTCTGATTCTTGACTT 2691

189769120 TCTCACAAATAAAATCATATGTTCATCTTGGTAATCACTGGCCTTTTTCTAAACAAAA 189769177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 TCTCACAAATAAAATCATATGTTCATCTTGGTAATCACTGGCCTTTTTCTAAACAAAA 2749

EXCISED REGION

189769182 GTGAAAGAGTTATGAAAATTTTACTACATGCATACAAATTCATTAGGTGTTCCTTTTAAG 189769241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 GTGAAAGAGTTATGAAAATTTTACTACATGCATACAAATTCATTAGGTGTTCCTTTTAAG 2813

189769242 GGGTTTAAAGTTAAAGAATGATGCAGGGTAATCTACTTAAAATAACAGGTAATCTGCCCA 189769301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 GGGTTTAAAGTTAAAGAATGATGCAGGGTAATCTACTTAAAATAACAGGTAATCTGCCCA 2873

189769302 CTGAAGGTCTTAAGGTAGATGTTAATAAATGATTGTGAAATGAATGAATCAGTTTGCTAC 189769361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 CTGAAGGTCTTAAGGTAGATGTTAATAAATGATTGTGAAATGAATGAATCAGTTTGCTAC 2933

189769362 AATTTGCACATTACATGCTATTATATTCATAAAAGAATGGGAAATTAATATTCATATATA 189769421
          ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2934 AATTTGCACATTACATGCTATTATATCCATAAAAGAATGGGAAATTAATATTCATATATG 2993

189769422 TTTGTCATTTACATCTT-TTTGAAATCCATATAATGCAATTCTATTTCAGTATAAAATAG 189769480
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 TTTGTCATTTACATCTTATTTGAAATCCATATAATGCAATTCTATTTCAGTATAAAATAG 3053

189769481 CTTAGTTAATATATCACTATGTATATTTTGTATAAATATAAAAGCATAATACACATAGAA 189769540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 CTTAGTTAATATATCACTATGTATATTTTGTATAAATATAAAAGCATAATACACATAGAA 3113

189769541 ATGTCACACATACATTTGCTTTTGATTCAAATAAAGATATCATAAAAAATTTAACATTTT 189769600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 ATGTCACACATACATTTGCTTTTGATTCAAATAAAGATATCATAAAAAATTTAACATTTT 3173

189769601 TGTTTATTAAATTGTATGGCATTGAACTTTAGGAACACTTACATGTCAAAGCTTATTAAG 189769660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 TGTTTATTAAATTGTATGGCATTGAACTTTAGGAACACTTACATGTCAAAGCTTATTAAG 3233

189769661 AGGGAAAATAACCAGTCTAGGTGTCATATAGATGTCCATCAAACTATCATCACACCTCCA 189769720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 AGGGAAAATAACCAGTCTAGGTGTCATATAGATGTCCATCAAACTATCATCACACCTCCA 3293

189769721 CTTTGCATTTTAGGTTGATAATTTAGCATCAACATAGAGGACTTTGATGACAAACAATTT 189769780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 CTTTGCATTTTAGGTTGATAATTTAGCATCAACATAGAGGACTTTGATGACAAACAATTT 3353

189769781 CAGGGAGTGAAACTGGCAAAGAACATAAGGTATTCTTTTTCAAGTTTAACACCTTACCGT 189769840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 CAGGGAGTGAAACTGGCAAAGAACATAAGGTATTCTTTTTCAAGTTTAACACCTTACCGT 3413

189769841 GATGTTTGACTTCAAATATAAATGTAGCTACAGTGTAATAAAAAAACAATTTTTTCAGTT 189769900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 GATGTTTGACTTCAAATATAAATGTAGCTACAGTGTAATAAAAAAACAATTTTTTCAGTT 3473

189769901 GTTTACTATCTCTTCTCTTTATACATTAGAAACTTCCAATTTCTTTAATTTCACATTTAA 189769960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 GTTTACTATCTCTTCTCTTTATACATTAGAAACTTCCAATTTCTTTAATTTCACATTTAA 3533

189769961 AGGAAGTTTTGATATGAAGAATTGAAGATACAGATATGAAAGTACAATAGTCAGTTTCAG 189770020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 AGGAAGTTTTGATATGAAGAATTGAAGATACAGATATGAAAGTACAATAGTCAGTTTCAG 3593

189770021 CATTTTTAATTGCCAGTCTGTTTCTCTTATGTTACAATTTTCAGGCCATTTTTAGGCCTT 189770080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 CATTTTTAATTGCCAGTCTGTTTCTCTTATGTTACAATTTTCAGGCCATTTTTAGGCCTT 3653

189770081 TCCAAATTACTAAATGCATTAAATGTTACCTGATCTGCTTTTTTTCATTGCTACCTATTT 189770140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 TCCAAATTACTAAATGCATTAAATGTTACCTGATCTGCTTTTTTTCATTGCTACCTATTT 3713

189770141 TTTTAAGTAATGCTGTCTTTATGATTTCTTTTTTGCCCATGTGCATATTCTCTTATTTCA 189770200
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3714 TTTTAAGTAATGCTGTCTTTATGATTTCTTTTTTGCCCACGTGCATATTCTCTTATTTCA 3773

189770201 CTGTAGGAATGGTGAAACTCTGGATCTAGAATTTAACTATATCCAATTTTCATGAGAGTA 189770260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 CTGTAGGAATGGTGAAACTCTGGATCTAGAATTTAACTATATCCAATTTTCATGAGAGTA 3833

189770261 AAAATGTATATTATTCTATTAAAGCTCTATAAAGACTAAATTTGCATCCCTCCAAAAAAT 189770320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 AAAATGTATATTATTCTATTAAAGCTCTATAAAGACTAAATTTGCATCCCTCCAAAAAAT 3893

189770321 GTAAAGTAGCAATGTCATCACTCTTGCACATCCTCTTTGAAACTTCGTTTTCATCATCTG 189770380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 GTAAAGTAGCAATGTCATCACTCTTGCACATCCTCTTTGAAACTTCGTTTTCATCATCTG 3953

189770381 TGAAATTTTTTTGTGTTTTTTTTCTCTGCTTTATCAAATTACGTTCTCAGGTCAGTCAAC 189770440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 TGAAATTTTTTTGTGTTTTTTTTCTCTGCTTTATCAAATTACGTTCTCAGGTCAGTCAAC 4013

189770441 AATTGAAATTGCGTACAACTTGGCATGATCTAATCGTATGAGTTTTGAAATTGCACCTGT 189770500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 AATTGAAATTGCGTACAACTTGGCATGATCTAATCGTATGAGTTTTGAAATTGCACCTGT 4073

189770501 GTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCATGTAAATAAATTATATAAAACAAGTTTATAAACAT 189770560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 GTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCATGTAAATAAATTATATAAAACAAGTTTATAAACAT 4133

189770561 ATATGCATGTATAATTATTTGTTCTTCTAATCCATATTCCTTACTTTATTATCTTATGTA 189770620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 ATATGCATGTATAATTATTTGTTCTTCTAATCCATATTCCTTACTTTATTATCTTATGTA 4193

189770621 TAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAAATTTTTTAAAGCAATCCTGCCC 189770680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 TAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAAATTTTTTAAAGCAATCCTGCCC 4253

189770681 ACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACAGGTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTCTTCATCC 189770740
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 ACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACACGTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTCTTCATCC 4313

189770741 TCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGCATAACTG 189770800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 TCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGCATAACTG 4373

189770801 TCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATCATCAATA 189770860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 TCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATCATCAATA 4433

189770861 ATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTCTTAAAAA 189770920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     4434 ATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTCTT-AAAA 4492

189770921 AAAAAATGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATGCTGAGGC 189770980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 AAAAAATGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATGCTGAGGC 4552

189770981 GGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCTTCT 189771040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 GGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCTTCT 4612

189771041 CTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACT 189771100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 CTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACT 4672

189771101 CAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAG 189771160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 CAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAG 4732

189771161 ATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAA 189771220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 ATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAA 4792

189771221 TGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAG 189771280
          ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 TG--------AATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAG 4844

189771281 AGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGC 189771340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4845 AGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGC 4904

189771341 ATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGT 189771400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4905 ATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGT 4964

189771401 TGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGA 189771460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4965 TGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGA 5024

189771461 TCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 189771520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5025 TCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 5084

189771521 AAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGA 189771580
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5085 AAGTAGCTGGGATTACAGGCATATGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGA 5144

189771581 GACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCACC 189771640
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     5145 GACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCGCC 5204

189771641 CGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCTCCTTCC 189771700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5205 CGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCCTTCC 5264

189771701 AGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATT 189771760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5265 AGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATT 5324

189771761 ACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGC 189771820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5325 ACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGC 5384

189771821 ATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGAT 189771880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5385 ATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGAT 5444

189771881 TGCCTTCGTCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACA 189771940
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5445 TGCCTTGGTCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACA 5504

189771941 AACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATC 189772000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5505 AACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATC 5564

189772001 AGGTGTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCACACAGCAGAGAG 189772060
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5565 AGGTTTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCAGACAGCAGAGAG 5624

189772061 CAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAA 189772120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5625 CAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAA 5684

189772121 GCCTCTATCCTCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAA 189772180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5685 GCCTCTATCCTCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAA 5744

189772181 TTCTGTGAGGACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTT 189772240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5745 TTCTGTGAGGACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTT 5804

189772241 TACTATTTTAGGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATG 189772300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5805 TACTATTTTAGGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATG 5864

189772301 CAGTGTACCGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTAAAGTC 189772360
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     5865 CAGTGTACTGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTGAAGTC 5924

189772361 TGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTATACCTCATACTTTTTTCGACAATTAGAAAATACAAT 189772420
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     5925 TGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTATGCCTCATACTTGTTTCGACAATTAGAAAATACAAT 5984

189772421 GCAAATAAAGTACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACA 189772480
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5985 ACAAATAAAGTACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACA 6044

189772481 GCTATGGTTATATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACACGGAAACACATAGTTAAAC 189772540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6045 GCTATGGTTATATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACACAGAAACACATAGTTAAAC 6104

189772541 TATTTGAGAATTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTAC 189772600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6105 TATTTGAGAATTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTAC 6164

189772601 CCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATC 189772660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6165 CCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATC 6224

189772661 CTTGCTTTCTGCTATA 189772676
          ||||||||||||||||
     6225 CTTGCTTTCTGCTATA 6240

Alignment time is 5.9047 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5072] =>      5072 nucs 'mol-32-2fee-326281_5072'

Score:        4875
Aligned:      5076        nucs
Identic:      5052 (100%) nucs =>      2578 ( 99%)      2474 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189770286,189772885] EXCISED REGION [189772901,189775376]
 second seq =>  [        1,     2591] EXCISED REGION [     2597,     5072]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [189772886,189772900]
 second seq =>         5 nucs [2592,2596]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189772885,189772885] to [189772900,189772900]
 second seq =>         1 nucs [2592,2592] to [2597,2597]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2592,2592] to [2596,2596]

189770286 TCTATAAAGACTAAATTTGCATCCCTCCAAAAAATGTAAAGTAGCAATGTCATCACTCTT 189770345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTATAAAGACTAAATTTGCATCCCTCCAAAAAATGTAAAGTAGCAATGTCATCACTCTT 60

189770346 GCACATCCTCTTTGAAACTTCGTTTTCATCATCTGTGAAATTTTTTTGTGTTTTTTTTCT 189770405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCACATCCTCTTTGAAACTTCGTTTTCATCATCTGTGAAATTTTTTTGTGTTTTTTTTCT 120

189770406 CTGCTTTATCAAATTACGTTCTCAGGTCAGTCAACAATTGAAATTGCGTACAACTTGGCA 189770465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGCTTTATCAAATTACGTTCTCAGGTCAGTCAACAATTGAAATTGCGTACAACTTGGCA 180

189770466 TGATCTAATCGTATGAGTTTTGAAATTGCACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCA 189770525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGATCTAATCGTATGAGTTTTGAAATTGCACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCA 240

189770526 TGTAAATAAATTATATAAAACAAGTTTATAAACATATATGCATGTATAATTATTTGTTCT 189770585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTAAATAAATTATATAAAACAAGTTTATAAACATATATGCATGTATAATTATTTGTTCT 300

189770586 TCTAATCCATATTCCTTACTTTATTATCTTATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGA 189770645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTAATCCATATTCCTTACTTTATTATCTTATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGA 360

189770646 ATATGTAATATAAATTTTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACAG 189770705
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      361 ATATGTAATATAAATTTTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACAC 420

189770706 GTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAAT 189770765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAAT 480

189770766 ATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATA 189770825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATA 540

189770826 CTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATC 189770885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATC 600

189770886 AAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAAATGGCCGGACACGGTGGCTC 189770945
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
      601 AAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAA-TGGCCGGACACGGTGGCTC 659

189770946 ACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATC 189771005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 ACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATC 719

189771006 GAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCC 189771065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCC 779

189771066 GGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGC 189771125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGC 839

189771126 GTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGG 189771185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGG 899

189771186 GCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAAT 189771245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAAT 959

189771246 AAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTC 189771305
          ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AAATAAATAA--------GCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTC 1011

189771306 CTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAAC 189771365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 CTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAAC 1071

189771366 CAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTT 189771425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 CAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTT 1131

189771426 GCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCT 189771485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 GCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCT 1191

189771486 CCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACG 189771545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1192 CCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATATG 1251

189771546 CCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAG 189771605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 CCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAG 1311

189771606 GCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGA 189771665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1312 GCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGA 1371

189771666 TTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATA 189771725
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 TTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATA 1431

189771726 TTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTT 189771785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 TTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTT 1491

189771786 AGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCAC 189771845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 AGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCAC 1551

189771846 ATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTCGTCAATTTCTACTGCTAT 189771905
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1552 ATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTGGTCAATTTCTACTGCTAT 1611

189771906 TACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGA 189771965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 TACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGA 1671

189771966 GGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTGTCTGGTACTAATTTGCAGAT 189772025
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1672 GGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTTTCTGGTACTAATTTGCAGAT 1731

189772026 TGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCACACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAG 189772085
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 TGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCAGACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAG 1791

189772086 TTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAATTACC 189772145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 TTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAATTACC 1851

189772146 TGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATATGGAGT 189772205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 TGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATATGGAGT 1911

189772206 CCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCAAAAAT 189772265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 CCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCAAAAAT 1971

189772266 TGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACCGAGTAAGAGTATGGGC 189772325
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1972 TGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACTGAGTAAGAGTATGGGC 2031

189772326 TCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTAAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTAT 189772385
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 TCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTGAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTAT 2091

189772386 ACCTCATACTTTTTTCGACAATTAGAAAATACAATGCAAATAAAGTACTTTAGCAGGACC 189772445
          .||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2092 GCCTCATACTTGTTTCGACAATTAGAAAATACAATACAAATAAAGTACTTTAGCAGGACC 2151

189772446 TGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAATATAAA 189772505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 TGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAATATAAA 2211

189772506 AACTATTTCATGAACACGGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGTATTTG 189772565
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 AACTATTTCATGAACACAGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGTATTTG 2271

189772566 GTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTAT 189772625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 GTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTAT 2331

189772626 CAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCCCAAAC 189772685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 CAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCCCAAAC 2391

189772686 TACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCATCGGA 189772745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 TACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCATCGGA 2451

189772746 AACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCACCGTCA 189772805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 AACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCACCGTCA 2511

189772806 GTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACTGTCTAG 189772865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 GTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACTGTCTAG 2571

189772866 TACCCCTTAAGATTATTCTT 189772885
          ||||||||||||||||||||
     2572 TACCCCTTAAGATTATTCTT 2591

EXCISED REGION

189772901 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 189772960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 2656

189772961 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 189773020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 2716

189773021 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 189773080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 2776

189773081 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 189773140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 2836

189773141 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 189773200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 2896

189773201 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 189773260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 2956

189773261 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 189773320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 3016

189773321 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 189773380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 3076

189773381 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 189773440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3077 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 3136

189773441 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 189773500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 3196

189773501 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 189773560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 3256

189773561 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 189773620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 3316

189773621 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 189773680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 3376

189773681 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 189773740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3377 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 3436

189773741 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 189773800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3437 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 3496

189773801 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 189773860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3497 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 3556

189773861 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 189773920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3557 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 3616

189773921 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 189773980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3617 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 3676

189773981 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 189774040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3677 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 3736

189774041 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 189774100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3737 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 3796

189774101 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 189774160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3797 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 3856

189774161 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 189774220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3857 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 3916

189774221 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 189774280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3917 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 3976

189774281 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 189774340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3977 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 4036

189774341 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 189774400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4037 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 4096

189774401 GAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 189774460
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4097 AAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 4156

189774461 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 189774520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 4216

189774521 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 189774580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 4276

189774581 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 189774640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 4336

189774641 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 189774700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4337 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 4396

189774701 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 189774760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4397 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 4456

189774761 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 189774820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4457 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 4516

189774821 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 189774880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4517 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 4576

189774881 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 189774940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4577 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 4636

189774941 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 189775000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4637 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 4696

189775001 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 189775060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4697 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 4756

189775061 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 189775120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4757 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 4816

189775121 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 189775180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4817 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 4876

189775181 TACGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 189775240
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4877 TATGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 4936

189775241 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 189775300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4937 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 4996

189775301 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCG 189775360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4997 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCG 5056

189775361 CTTAAAAGAACTTAAG 189775376
          ||||||||||||||||
     5057 CTTAAAAGAACTTAAG 5072

Alignment time is 4.79191 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     3440] =>      3440 nucs 'mol-32-2ff9-029826_3440'

Score:        3253
Aligned:      3443        nucs
Identic:      3420 ( 99%) nucs =>      1684 ( 99%)      1736 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189771180,189772885] EXCISED REGION [189772901,189774637]
 second seq =>  [        1,     1698] EXCISED REGION [     1704,     3440]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [189772886,189772900]
 second seq =>         5 nucs [1699,1703]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189772885,189772885] to [189772900,189772900]
 second seq =>         1 nucs [1699,1699] to [1704,1704]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1699,1699] to [1703,1703]

189771180 GCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAA 189771239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAA 60

189771240 ATAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTT 189771299
          ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAAATAAATAAATAA--------GCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTT 112

189771300 CCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCA 189771359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      113 CCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCA 172

189771360 GGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAG 189771419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      173 GGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAG 232

189771420 AGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCT 189771479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      233 AGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCT 292

189771480 CCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGG 189771539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      293 CCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGG 352

189771540 CATACGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTT 189771599
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      353 CATATGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTT 412

189771600 GGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGGCCTCCAAAGTG 189771659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      413 GGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGGCCTCCAAAGTG 472

189771660 CTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATT 189771719
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      473 CTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATT 532

189771720 TACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTT 189771779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      533 TACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTT 592

189771780 GCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTC 189771839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 GCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTC 652

189771840 TACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTCGTCAATTTCTAC 189771899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      653 TACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTGGTCAATTTCTAC 712

189771900 TGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGT 189771959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 TGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGT 772

189771960 TCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTGTCTGGTACTAATTT 189772019
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      773 TCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTTTCTGGTACTAATTT 832

189772020 GCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCACACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACT 189772079
          ||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      833 GCAGATTGCCATCTTCCTCTGGAGCCTCAGACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACT 892

189772080 GTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTA 189772139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 GTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTA 952

189772140 ATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATA 189772199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 ATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATA 1012

189772200 TGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTC 189772259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 TGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTC 1072

189772260 AAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACCGAGTAAGAGT 189772319
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1073 AAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACTGAGTAAGAGT 1132

189772320 ATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTAAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGA 189772379
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1133 ATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTGAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGA 1192

189772380 GTGTATACCTCATACTTTTTTCGACAATTAGAAAATACAATGCAAATAAAGTACTTTAGC 189772439
          ||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1193 GTGTATGCCTCATACTTGTTTCGACAATTAGAAAATACAATACAAATAAAGTACTTTAGC 1252

189772440 AGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAA 189772499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 AGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAA 1312

189772500 TATAAAAACTATTTCATGAACACGGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAG 189772559
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 TATAAAAACTATTTCATGAACACAGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAG 1372

189772560 TATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTT 189772619
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 TATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCCACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTT 1432

189772620 CCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCC 189772679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 CCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCC 1492

189772680 CCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCC 189772739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 CCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCC 1552

189772740 ATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCA 189772799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 ATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCA 1612

189772800 CCGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACT 189772859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 CCGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACT 1672

189772860 GTCTAGTACCCCTTAAGATTATTCTT 189772885
          ||||||||||||||||||||||||||
     1673 GTCTAGTACCCCTTAAGATTATTCTT 1698

EXCISED REGION

189772901 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 189772960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1704 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 1763

189772961 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 189773020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1764 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 1823

189773021 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 189773080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1824 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 1883

189773081 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 189773140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1884 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 1943

189773141 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 189773200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1944 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 2003

189773201 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 189773260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2004 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 2063

189773261 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 189773320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2064 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 2123

189773321 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 189773380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2124 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 2183

189773381 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 189773440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2184 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 2243

189773441 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 189773500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 2303

189773501 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 189773560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 2363

189773561 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 189773620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 2423

189773621 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 189773680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 2483

189773681 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 189773740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2484 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 2543

189773741 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 189773800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 2603

189773801 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 189773860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 2663

189773861 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 189773920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 2723

189773921 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 189773980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 2783

189773981 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 189774040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 2843

189774041 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 189774100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 2903

189774101 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 189774160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 2963

189774161 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 189774220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 3023

189774221 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 189774280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 3083

189774281 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 189774340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 3143

189774341 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 189774400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 3203

189774401 GAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 189774460
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 AAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 3263

189774461 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 189774520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 3323

189774521 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 189774580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 3383

189774581 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTG 189774637
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTG 3440

Alignment time is 3.2974 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     7565] =>      7565 nucs 'mol-32-3025-190645_7565'

Score:        7335
Aligned:      7569        nucs
Identic:      7542 (100%) nucs =>      2764 ( 99%)      4778 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189770099,189772885] EXCISED REGION [189772901,189777682]
 second seq =>  [        1,     2778] EXCISED REGION [     2784,     7565]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [189772886,189772900]
 second seq =>         5 nucs [2779,2783]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189772885,189772885] to [189772900,189772900]
 second seq =>         1 nucs [2779,2779] to [2784,2784]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2779,2779] to [2783,2783]

189770099 TTAAATGTTACCTGATCTGCTTTTTTTCATTGCTACCTATTTTTTTAAGTAATGCTGTCT 189770158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTAAATGTTACCTGATCTGCTTTTTTTCATTGCTACCTATTTTTTTAAGTAATGCTGTCT 60

189770159 TTATGATTTCTTTTTTGCCCATGTGCATATTCTCTTATTTCACTGTAGGAATGGTGAAAC 189770218
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATGATTTCTTTTTTGCCCACGTGCATATTCTCTTATTTCACTGTAGGAATGGTGAAAC 120

189770219 TCTGGATCTAGAATTTAACTATATCCAATTTTCATGAGAGTAAAAATGTATATTATTCTA 189770278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTGGATCTAGAATTTAACTATATCCAATTTTCATGAGAGTAAAAATGTATATTATTCTA 180

189770279 TTAAAGCTCTATAAAGACTAAATTTGCATCCCTCCAAAAAATGTAAAGTAGCAATGTCAT 189770338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAAAGCTCTATAAAGACTAAATTTGCATCCCTCCAAAAAATGTAAAGTAGCAATGTCAT 240

189770339 CACTCTTGCACATCCTCTTTGAAACTTCGTTTTCATCATCTGTGAAATTTTTTTGTGTTT 189770398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACTCTTGCACATCCTCTTTGAAACTTCGTTTTCATCATCTGTGAAATTTTTTTGTGTTT 300

189770399 TTTTTCTCTGCTTTATCAAATTACGTTCTCAGGTCAGTCAACAATTGAAATTGCGTACAA 189770458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTCTCTGCTTTATCAAATTACGTTCTCAGGTCAGTCAACAATTGAAATTGCGTACAA 360

189770459 CTTGGCATGATCTAATCGTATGAGTTTTGAAATTGCACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTG 189770518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTGGCATGATCTAATCGTATGAGTTTTGAAATTGCACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTG 420

189770519 TTGTGCATGTAAATAAATTATATAAAACAAGTTTATAAACATATATGCATGTATAATTAT 189770578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGTGCATGTAAATAAATTATATAAAACAAGTTTATAAACATATATGCATGTATAATTAT 480

189770579 TTGTTCTTCTAATCCATATTCCTTACTTTATTATCTTATGTATAAATTATGTAAAGATAG 189770638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTTCTTCTAATCCATATTCCTTACTTTATTATCTTATGTATAAATTATGTAAAGATAG 540

189770639 CATCAGAATATGTAATATAAATTTTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAG 189770698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATCAGAATATGTAATATAAATTTTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAG 600

189770699 CTTACAGGTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAA 189770758
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTACACGTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAA 660

189770759 CAGAAATATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAA 189770818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGAAATATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAA 720

189770819 TGAAATACTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTAT 189770878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAAATACTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTAT 780

189770879 TTTTATCAAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAAATGGCCGGACACG 189770938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
      781 TTTTATCAAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAA-TGGCCGGACACG 839

189770939 GTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCA 189770998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCA 899

189770999 GGAAATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAA 189771058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GGAAATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAA 959

189771059 ATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGA 189771118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 ATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGA 1019

189771119 GAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCC 189771178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCC 1079

189771179 AGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATA 189771238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATA 1139

189771239 AATAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTT 189771298
          |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AATAAATAAATAAATAA--------GCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTT 1191

189771299 TCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTC 189771358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 TCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTC 1251

189771359 AGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACA 189771418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 AGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACA 1311

189771419 GAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCC 189771478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 GAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCC 1371

189771479 TCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAG 189771538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 TCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAG 1431

189771539 GCATACGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGT 189771598
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 GCATATGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGT 1491

189771599 TGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGGCCTCCAAAGT 189771658
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1492 TGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGGCCTCCAAAGT 1551

189771659 GCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAAT 189771718
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1552 GCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAAT 1611

189771719 TTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACT 189771778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 TTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACT 1671

189771779 TGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGT 189771838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 TGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGT 1731

189771839 CTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTCGTCAATTTCTA 189771898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1732 CTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTGGTCAATTTCTA 1791

189771899 CTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAG 189771958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 CTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAG 1851

189771959 TTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTGTCTGGTACTAATT 189772018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1852 TTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTTTCTGGTACTAATT 1911

189772019 TGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCACACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAAC 189772078
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1912 TGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCAGACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAAC 1971

189772079 TGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTT 189772138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 TGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTT 2031

189772139 AATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAAT 189772198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 AATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAAT 2091

189772199 ATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTT 189772258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 ATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTT 2151

189772259 CAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACCGAGTAAGAG 189772318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2152 CAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACTGAGTAAGAG 2211

189772319 TATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTAAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAG 189772378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2212 TATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTGAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAG 2271

189772379 AGTGTATACCTCATACTTTTTTCGACAATTAGAAAATACAATGCAAATAAAGTACTTTAG 189772438
          |||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2272 AGTGTATGCCTCATACTTGTTTCGACAATTAGAAAATACAATACAAATAAAGTACTTTAG 2331

189772439 CAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACA 189772498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 CAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACA 2391

189772499 ATATAAAAACTATTTCATGAACACGGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACA 189772558
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 ATATAAAAACTATTTCATGAACACAGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACA 2451

189772559 GTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCT 189772618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 GTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCT 2511

189772619 TCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACC 189772678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 TCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACC 2571

189772679 CCCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTC 189772738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 CCCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTC 2631

189772739 CATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGC 189772798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 CATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGC 2691

189772799 ACCGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAAC 189772858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 ACCGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAAC 2751

189772859 TGTCTAGTACCCCTTAAGATTATTCTT 189772885
          |||||||||||||||||||||||||||
     2752 TGTCTAGTACCCCTTAAGATTATTCTT 2778

EXCISED REGION

189772901 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 189772960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 2843

189772961 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 189773020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 2903

189773021 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 189773080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 2963

189773081 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 189773140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 3023

189773141 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 189773200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 3083

189773201 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 189773260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 3143

189773261 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 189773320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 3203

189773321 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 189773380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 3263

189773381 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 189773440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 3323

189773441 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 189773500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 3383

189773501 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 189773560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 3443

189773561 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 189773620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 3503

189773621 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 189773680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 3563

189773681 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 189773740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 3623

189773741 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 189773800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 3683

189773801 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 189773860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 3743

189773861 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 189773920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 3803

189773921 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 189773980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3804 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 3863

189773981 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 189774040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3864 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 3923

189774041 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 189774100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 3983

189774101 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 189774160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 4043

189774161 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 189774220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 4103

189774221 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 189774280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 4163

189774281 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 189774340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4164 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 4223

189774341 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 189774400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 4283

189774401 GAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 189774460
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 AAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 4343

189774461 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 189774520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4344 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 4403

189774521 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 189774580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4404 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 4463

189774581 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 189774640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4464 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 4523

189774641 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 189774700
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4524 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCATACTCTGTT 4583

189774701 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 189774760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4584 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 4643

189774761 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 189774820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4644 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 4703

189774821 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 189774880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4704 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 4763

189774881 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 189774940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4764 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 4823

189774941 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 189775000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4824 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 4883

189775001 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 189775060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4884 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 4943

189775061 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 189775120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4944 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 5003

189775121 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 189775180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5004 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 5063

189775181 TACGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 189775240
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5064 TATGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 5123

189775241 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 189775300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5124 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 5183

189775301 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCG 189775360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5184 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCG 5243

189775361 CTTAAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAA 189775420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5244 CTTAAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAA 5303

189775421 ATTATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCAT 189775480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5304 ATTATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCAT 5363

189775481 GCCCTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTA 189775540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5364 GCCCTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTA 5423

189775541 GGGCTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGGTCTTGAA 189775600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     5424 GGGCTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGCTCTTGAA 5483

189775601 TTGGAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCC 189775660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5484 TTGGAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCC 5543

189775661 TAGAGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATT 189775720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5544 TAGAGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATT 5603

189775721 GTAACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATAT 189775780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5604 GTAACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATAT 5663

189775781 GCTGTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCC 189775840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5664 GCTGTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCC 5723

189775841 AAAAAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTT 189775900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5724 AAAAAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTT 5783

189775901 TCTATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTT 189775960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5784 TCTATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTT 5843

189775961 GCTCTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAA 189776020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5844 GCTCTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAA 5903

189776021 ACATGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTGGATTATATTCCTGTGTGTGTGTATGT 189776080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5904 ACATGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTGGATTATATTCCTGTGTGTGTGTATGT 5963

189776081 GTGTATGTATACAATATTTTATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAAGAATTTAATTTT 189776140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5964 GTGTATGTATACAATATTTTATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAAGAATTTAATTTT 6023

189776141 GCAATTACTGATTTTCCTGAGATCCTAAAGGGTTAATGTGCTTTTGGAATTTTCTCTGGG 189776200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6024 GCAATTACTGATTTTCCTGAGATCCTAAAGGGTTAATGTGCTTTTGGAATTTTCTCTGGG 6083

189776201 TTTTTGGCTTTGTTTTGTTGGTTGGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATT 189776260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6084 TTTTTGGCTTTGTTTTGTTGGTTGGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATT 6143

189776261 CAGGGGGTACATATACACACACAACACAACATGCATTTATCCATTCATCTTGTCATGACC 189776320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6144 CAGGGGGTACATATACACACACAACACAACATGCATTTATCCATTCATCTTGTCATGACC 6203

189776321 ACTTAGGTTGATTCCACCTTGTAGCTATTATGAATAATGCTGCTATAAACATTTTATACA 189776380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6204 ACTTAGGTTGATTCCACCTTGTAGCTATTATGAATAATGCTGCTATAAACATTTTATACA 6263

189776381 AATATCTATTCAGGTGTTCGCTTTCATTACTTTTAGGTATGTGCACAGAAGTTGAATTGC 189776440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6264 AATATCTATTCAGGTGTTCGCTTTCATTACTTTTAGGTATGTGCACAGAAGTTGAATTGC 6323

189776441 TGGCTCATATGCTAATTCTATAATTATTTGAGCAAACAAATTATTCGAGGAAACATACAC 189776500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6324 TGGCTCATATGCTAATTCTATAATTATTTGAGCAAACAAATTATTCGAGGAAACATACAC 6383

189776501 TTTCTACAGTGGCTGCCTAATTTTACTGTCCTACCAGCAATGCACAAGGCTGCTAAATTC 189776560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6384 TTTCTACAGTGGCTGCCTAATTTTACTGTCCTACCAGCAATGCACAAGGCTGCTAAATTC 6443

189776561 TTCACATTAGTGCCAACATTTGTTTTCCATTTGTTTTTCTTCTTATAATAGCAATCCACT 189776620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6444 TTCACATTAGTGCCAACATTTGTTTTCCATTTGTTTTTCTTCTTATAATAGCAATCCACT 6503

189776621 TGTGAAGTGGTATCTCATTTTGCTTTGATTTGCATTTCCTTAATGATTAATAACACTGAA 189776680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6504 TGTGAAGTGGTATCTCATTTTGCTTTGATTTGCATTTCCTTAATGATTAATAACACTGAA 6563

189776681 TATCTTTTCATGTGCTTATTGAACATTTATGTATTTTTCTGTGTTTTTTCCTGGTAAGAA 189776740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6564 TATCTTTTCATGTGCTTATTGAACATTTATGTATTTTTCTGTGTTTTTTCCTGGTAAGAA 6623

189776741 CATTTGTTGAGAGAAAATGTTCAATATTTGCACTAAAAGATTAGCAGTCTTTGTGGATTT 189776800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6624 CATTTGTTGAGAGAAAATGTTCAATATTTGCACTAAAAGATTAGCAGTCTTTGTGGATTT 6683

189776801 TATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAATAATTTAATTTTGCAATTACTGATTTTCCTG 189776860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6684 TATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAATAATTTAATTTTGCAATTACTGATTTTCCTG 6743

189776861 AGATCTTAAAGGGTTAATATGCTTTTGGAATTTTCTCTGGGTTTTTTGGTTTGTTTTTTT 189776920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6744 AGATCTTAAAGGGTTAATATGCTTTTGGAATTTTCTCTGGGTTTTTTGGTTTGTTTTTTT 6803

189776921 GGTTTGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATTCAGGGGATACATGTGCAGG 189776980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6804 GGTTTGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATTCAGGGGATACATGTGCAGG 6863

189776981 TTTTTTTTCATGGGTATATTGTGTGATGCTGAGGTTTATGGCATGGAGGTAGTGGATTAT 189777040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6864 TTTTTTTTCATGGGTATATTGTGTGATGCTGAGGTTTATGGCATGGAGGTAGTGGATTAT 6923

189777041 TCTCAGGTAATGAGAATAGTACCCAATAGGTAGTTTTCCAATCCATGCCCCACTTCCTCC 189777100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6924 TCTCAGGTAATGAGAATAGTACCCAATAGGTAGTTTTCCAATCCATGCCCCACTTCCTCC 6983

189777101 TTCTCTCATCTAGTAGTCTGCAGTGTCTACTGTTTCCATGTTTATGTCCACATATATATA 189777160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6984 TTCTCTCATCTAGTAGTCTGCAGTGTCTACTGTTTCCATGTTTATGTCCACATATATATA 7043

189777161 CTCTATGGTTTTGGAGAACTGATCACTAAAATTGTTTGCCCTTTTGAAAAATAGGTTGTT 189777220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7044 CTCTATGGTTTTGGAGAACTGATCACTAAAATTGTTTGCCCTTTTGAAAAATAGGTTGTT 7103

189777221 TGGGTTTTTGTGTTGCTGATAACCTATAGGAGCTTTTTTTATATATTCTAAATATTAACT 189777280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7104 TGGGTTTTTGTGTTGCTGATAACCTATAGGAGCTTTTTTTATATATTCTAAATATTAACT 7163

189777281 CTTTATAAGATATACGATTAGCAAATATGTTCTCTCATTCCATGTGTTGCCTTTTCACTC 189777340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7164 CTTTATAAGATATACGATTAGCAAATATGTTCTCTCATTCCATGTGTTGCCTTTTCACTC 7223

189777341 TGTTTTTAGTATCCTTTAAAAAATGTTGATCAAGTCCAATATATCTAATTTTTCTTATAT 189777400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7224 TGTTTTTAGTATCCTTTAAAAAATGTTGATCAAGTCCAATATATCTAATTTTTCTTATAT 7283

189777401 TACCTGTGCTTTTGATATTCTTTCAAGAAGTAATTATTGCCAAATCGAATGACATGAATA 189777460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7284 TACCTGTGCTTTTGATATTCTTTCAAGAAGTAATTATTGCCAAATCGAATGACATGAATA 7343

189777461 ATTTTCCCTATTTTTAAAGATTTTTATACTTTTAACTTTTATGCTTAAACTTTAAAATAT 189777520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7344 ATTTTCCCTATTTTTAAAGATTTTTATACTTTTAACTTTTATGCTTAAACTTTAAAATAT 7403

189777521 TTTGAGTTTTCTGTATATAAGGAAAAGACTCATATTTCTTATTTTGCATGTGGTTATATC 189777580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7404 TTTGAGTTTTCTGTATATAAGGAAAAGACTCATATTTCTTATTTTGCATGTGGTTATATC 7463

189777581 ATTTTCCATTTCTGAGAAGATTGCTATTTTCCTTATTGAATGTTCTTGTCACTTTTGTTG 189777640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7464 ATTTTCCATTTCTGAGAAGATTGCTATTTTCCTTATTGAATGTTCTTGTCACTTTTGTTG 7523

189777641 AAAACCCTTTGACCATATATGTGAGGTTTTATTTCTGGGCTC 189777682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7524 AAAACCCTTTGACCATATATGTGAGGTTTTATTTCTGGGCTC 7565

Alignment time is 7.07535 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     8259] =>      8259 nucs 'mol-32-30f6-111015_8259'

Score:        7844
Aligned:      8270        nucs
Identic:      8219 ( 99%) nucs =>      4034 ( 99%)      4185 ( 99%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189763849,189767898] EXCISED REGION [189767907,189772115]
 second seq =>  [        1,     4054] EXCISED REGION [     4055,     8259]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [189767899,189767906]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        50 nucs [189767899,189767948] to [189767907,189767956]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [189767897,189767898] to [189767907,189767908]
 second seq =>         2 nucs [4053,4054] to [4055,4056]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [189767899,189767902] to [189767903,189767906]
 second seq =>         0 nucs

189763849 GAGTCTAACTCTTGTTACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGTGATCTCGGCTCACTGCAA 189763908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGTCTAACTCTTGTTACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGTGATCTCGGCTCACTGCAA 60

189763909 CTTCTGCCTCCCGGTTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTAC 189763968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTCTGCCTCCCGGTTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTAC 120

189763969 AGGCATGTGCCAACATGCCCGGCTAATTTTGTATTTTTTTAGTAGAGATGGGATTTCACC 189764028
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGCATGTGCCAACATGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTTTAGTAGAGATGGGATTTCACC 180

189764029 ATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTGGCCTCAAGTGATCCGCCTGCCTCTGCCTCACAAA 189764088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTGGCCTCAAGTGATCCGCCTGCCTCTGCCTCACAAA 240

189764089 ATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCAGATATTCTTCTAGGGTTCTAGGCACT 189764148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCAGATATTCTTCTAGGGTTCTAGGCACT 300

189764149 AGGCCCAGCCATTCTTCTAGGGTTCTCATAGTTTTATGTCTTATATTTAAATATTTAATC 189764208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGCCCAGCCATTCTTCTAGGGTTCTCATAGTTTTATGTCTTATATTTAAATATTTAATC 360

189764209 TATCGAGTTGATTTCTGCATATGGTAAAAGGAATGGGTCCAGTTTCAATCTTCTGCATAT 189764268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATCGAGTTGATTTCTGCATATGGTAAAAGGAATGGGTCCAGTTTCAATCTTCTGCATAT 420

189764269 GGCTAGCCTGTTATCCCAGCACTATTTATTGAATTGGGAGTGCTTTGTTCATTGCCTGTT 189764328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCTAGCCTGTTATCCCAGCACTATTTATTGAATTGGGAGTGCTTTGTTCATTGCCTGTT 480

189764329 TTATTGACTTTGTCAAAGATCAGATGGTGGTAGGTTTGTGGCTTTATTTATTTATTTATT 189764388
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGTTGACTTTGTCAAAGATCAGATGGTGGTAGGTTTGTGGCTTTATTTATTTATTTATT 540

189764389 TATT----ACTTGTTCCATTGGTCTATGTGCCTGTTTTTGTACCACTACTATGCTGTGTT 189764444
          ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATTTATTACTTGTTCCATTGGTCTATGTGCCTGTTTTTGTACCACTACTATGCTGTGTT 600

189764445 GGTTACTGTAGCCTTACAGTATAGTTTGAAGTAGGGTAATATGATGTCTCTGGCTTTGTT 189764504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTTACTGTAGCCTTACAGTATAGTTTGAAGTAGGGTAATATGATGTCTCTGGCTTTGTT 660

189764505 CTTTTTGCATAGGATCGCTTGGGTTATTCAGGTTCTGTTTTGCTTCCATTTGACTTTAGA 189764564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTTTGCATAGGATCGCTTGGGTTATTCAGGTTCTGTTTTGCTTCCATTTGACTTTAGA 720

189764565 ATAGTTTTTTCTAATTCTTTGAAAAATGATGTTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATGAAAT 189764624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATAGTTTTTTCTAATTCTTTGAAAAATGATGTTGGTAGTTTGATAGGAATAGCATGAAAT 780

189764625 CTGTAAGTTGCTTTGGGCAGTATGGCCATTTTTAAAATATTGATGATTTCTATCCATAAG 189764684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGTAAGTTGCTTTGGGCAGTATGGCCATTTTTAAAATATTGATGATTTCTATCCATAAG 840

189764685 CATGGAATGTTATTCCACTTGTTTTTGTTATCTCTGATTTCTTTTGTTTTTAGTTCCGTT 189764744
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      841 CATGGAATGTTATTCCACTTGTTTTTGTTATCTCTGATTTCTTTTGTCTTTAGTTCCGTT 900

189764745 TATGTGATAAATTATATTTATTGATTTCCATATGTTAAACTAACCTTGCATCCCAGGAAT 189764804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATGTGATAAATTATATTTATTGATTTCCATATGTTAAACTAACCTTGCATCCCAGGAAT 960

189764805 AAAGTTTACCTAAATGTGGTGTATCGACTTTTTGATGTGTTACTAGATGTGATTTGCTAG 189764864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      961 AAAGTTTACCTAAATGTGGTGTATCGACTTTTTGATGTGTTACTAGATTTGATTTGCTAG 1020

189764865 TATTTTGTTGAGAATTTTTGCATCTATGTTCATCAAGGATAGTAGCCTGACTTTTTTTCT 189764924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATTTTGTTGAGAATTTTTGCATCTATGTTCATCAAGGATAGTAGCCTGACTTTTTTTCT 1080

189764925 TTTTATCTCTCTCAGTTTTTGGTATCTGAATGATACTGGTCTCTTAGAATGAGTTAGGGA 189764984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTATCTCTCTCAGTTTTTGGTATCTGAATGATACTGGTCTCTTAGAATGAGTTAGGGA 1140

189764985 GGAGTCCCTCCTTCTCACGTTTCTGAAATAATTTTAGTAAGACTGGTACCAGCTCTTCTT 189765044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAGTCCCTCCTTCTCACGTTTCTGAAATAATTTTAGTAAGACTGGTACCAGCTCTTCTT 1200

189765045 TATACATCTGGTAGAATTCGGACTGTGAATTCATCTGTTCCAGAGCTTTTCCTTCTTGGT 189765104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATACATCTGGTAGAATTCGGACTGTGAATTCATCTGTTCCAGAGCTTTTCCTTCTTGGT 1260

189765105 AGGTGTTTTATAACTGATTGAATTTTGGAACTTATTCTTGGTCTGCTCAGTATTTTTATG 189765164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGGTGTTTTATAACTGATTGAATTTTGGAACTTATTCTTGGTCTGCTCAGTATTTTTATG 1320

189765165 TCTTCCTGGTCCAATCTTGAGCAGTTGTATGTTTCCAGGAATTTATCATTTTTTTCCGGG 189765224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTTCCTGGTCCAATCTTGAGCAGTTGTATGTTTCCAGGAATTTATCATTTTTTTCCGGG 1380

189765225 TTTTCTAGTTGTTGTCCAGAGTGTTCATAAAAGCCTCTCAGGGATTTTTGTATTTCTGTG 189765284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTCTAGTTGTTGTCCAGAGTGTTCATAAAAGCCTCTCAGGGATTTTTGTATTTCTGTG 1440

189765285 GCATCAGTGGTAATGTCACTTGTGTCATTTCTCATTATGTTTATTTGGATCTTCTTTTTT 189765344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCATCAGTGGTAATGTCACTTGTGTCATTTCTCATTATGTTTATTTGGATCTTCTTTTTT 1500

189765345 TCTTTATTAATCTGG-TGGTGGTCTATAAATCTGATCTATTCTTTCATAAAAACAACTTT 189765403
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTTTATTAATCTGGATGGTGGTCTATAAATCTGATCTATTCTTTCATAAAAACAACTTT 1560

189765404 TATTTTTGTTGATTTTTCCCTATGGATTTTTGCACTACAATTTCTTTCAGGTCAGCTGAT 189765463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATTTTTGTTGATTTTTCCCTATGGATTTTTGCACTACAATTTCTTTCAGGTCAGCTGAT 1620

189765464 TTTGGTGGTTTATTTTCTTCTACTAGCTTTGGGCTTGGTTTGCTCTTGGTTTTTCTAGTT 189765523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTGGTGGTTTATTTTCTTCTACTAGCTTTGGGCTTGGTTTGCTCTTGGTTTTTCTAGTT 1680

189765524 CCTCTAGGTGTGATATTAAGTTATTAACTTGAGATTTTTCTAACTTCTTGATGTAATTAT 189765583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCTCTAGGTGTGATATTAAGTTATTAACTTGAGATTTTTCTAACTTCTTGATGTAATTAT 1740

189765584 GTAGTGCTATAAACATTTCTCTTAATGCTGCTTTAGCTGTGTCCCAGAGATTCTAGAATG 189765643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTAGTGCTATAAACATTTCTCTTAATGCTGCTTTAGCTGTGTCCCAGAGATTCTAGAATG 1800

189765644 TTTTGCCTTTGCTTTTTTGTTTAAAATAATTATTTTGATTTCTGCCTCAATTTTTTTTAT 189765703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTGCCTTTGCTTTTTTGTTTAAAATAATTATTTTGATTTCTGCCTCAATTTTTTTTAT 1860

189765704 GCAGAAGTAATTCAAGAGCAGGTTGTTTAATTTCCATGGATCTGCTTAATTCTCCATGGA 189765763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCAGAAGTAATTCAAGAGCAGGTTGTTTAATTTCCATGGATCTGCTTAATTCTCCATGGA 1920

189765764 TGTGTTTGGAGAATGCCAGTGTACTAGATGGTCTGTTCTCCCTTGGTGGGCAAAGCTCTT 189765823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     1921 TGTGTTTGGAGAATGCCAGTGTACTAGATGGTCTGTTCTCCCTTGGTGG-CAAAGCTCTT 1979

189765824 CCTGGCTACATCTAGTAGGCCATCTTGGCTCTTCCCCTCCCCATTTTTTGGGGGAGGATA 189765883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1980 CCTGGCTACATCTAGTAGGCCATCTTGGCTCTTCCCCTCCCCATTTTTGGGGGGAGGATA 2039

189765884 TTGTTTATTTGGTGCTACATAAATTACTAGAAATAGCAACATATTAGAATCTCTGGAACA 189765943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||
     2040 TTGTTTATTTGGTGCTACATAAATTACTAGAAATAGCAACATATTAGAATTTCTGAAACA 2099

189765944 CAGCTAAAGCAGCATTAAGAGGAAAATTTATAGCACTACATGATTACACCAAGAAGTTAA 189766003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 CAGCTAAAGCAGCATTAAGAGGAAAATTTATAGCACTACATGATTACACCAAGAAGTTAA 2159

189766004 AAAAATCTCAAGTTAATATTTTTATGGGGTTTTAAAGTGTATTGGTGGAAAAAATGCTCT 189766063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AAAAATCTCAAGTTAATATTTTTATGGGGTTTTAAAGTGTATTGGTGGAAAAAATGCTCT 2219

189766064 AAAAATACATCCATAAAAAGAAAATATACTTTTGGCTTTATTTCTCAAATGTATGTAGTA 189766123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AAAAATACATCCATAAAAAGAAAATATACTTTTGGCTTTATTTCTCAAATGTATGTAGTA 2279

189766124 TACAGCATAGTATTCTTTTAATGGAAAAAAACTATATATATATATGTATATATATACATA 189766183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TACAGCATAGTATTCTTTTAATGGAAAAAAACTATATATATATATGTATATATATACATA 2339

189766184 TATACATATATATATAGCTATGTGTAAACTCACATACTTCTTATCTTGAATTAAATTATT 189766243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TATACATATATATATAGCTATGTGTAAACTCACATACTTCTTATCTTGAATTAAATTATT 2399

189766244 CATTTTATAATGGTTTAAGAAATTTAAAACATAGGCCTATGTATAAACTCCCATTGCTCA 189766303
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CATTTTATAATTGTTTAAGAAATTTAAAACATAGGCCTATGTATAAACTCCCATTGCTCA 2459

189766304 TAAAGATATACAACCAAAGCTAATTTAAAAATAAATTATAAACACTATAAAATTAATATT 189766363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TAAAGATATACAACCAAAGCTAATTTAAAAATAAATTATAAACACTATAAAATTAATATT 2519

189766364 ATTCAAATTACCAACATTAATTTAATGTCAGAAATAATATTTTAAGGACATAATTGAATT 189766423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ATTCAAATTACCAACATTAATTTAATGTCAGAAATAATATTTTAAGGACATAATTGAATT 2579

189766424 AACCAACAGTGATAGGTAAAGTTTATTTTTTAATTCAAGATGCCTACAGGTTATGCCCTA 189766483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 AACCAACAGTGATAGGTAAAGTTTATTTTTTAATTCAAGATGCCTACAGGTTATGCCCTA 2639

189766484 TGATAGCTAAATTTTCATACCCATATTTCTACTCAAACACTGGTGGATACTTCACTAATC 189766543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TGATAGCTAAATTTTCATACCCATATTTCTACTCAAACACTGGTGGATACTTCACTAATC 2699

189766544 TAAATCATTTGGCAAGAATGCAGAATTTATATTTAATATGATCCTGTTGTTGTATCACTA 189766603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TAAATCATTTGGCAAGAATGCAGAATTTATATTTAATATGATCCTGTTGTTGTATCACTA 2759

189766604 ATAGTAGGGTGTGGTATCATTTCTCTCTCATTAAATGGATATTGAGTGGATTAATAGTAT 189766663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 ATAGTAGGGTGTGGTATCATTTCTCTCTCATTAAATGGATATTGAGTGGATTAATAGTAT 2819

189766664 TTTTAAAGCCAAAACTCAAGCTACCAATTTTCAGCTTCTATTTTTAAAGGTATTTAAAAT 189766723
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 ATTTAAAGCCAAAACTCAAGCTACCAATTTTCAGCTTCTATTTTTAAAGGTATTTAAAAT 2879

189766724 TTATTTGTTTTAAGAAAAAATGTTTGTGAAATATTTAAATTTTAAATAAAGGTATTTAAA 189766783
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 GTATTTGTTTTAAGAAAAAATGTTTGTGAAATATTTAAATTTTAAATAAAGGTATTTAAA 2939

189766784 AATTATTTAATAATGGCCTACTATATACCAAGCACTGGTTACAGAGGATAATTTATACAA 189766843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 AATTATTTAATAATGGCCTACTATATACCAAGCACTGGTTACAGAGGATAATTTATACAA 2999

189766844 TGTCCTACTGGTTACAGAGGATAATTTATGCAATGCCCATACTTTCATAGAGCTTACCTT 189766903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TGTCCTACTGGTTACAGAGGATAATTTATGCAATGCCCATACTTTCATAGAGCTTACCTT 3059

189766904 CTAATGTAGGAAGATATGTGTATGTTTTTATATCTGTATGTTTGTGTTGCGTTTGTGTCT 189766963
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||
     3060 CTAATGTAGGAAGATATGTGTATGTTTTTATATCTATATGTTTGTGTTGTGTTTGTGTCT 3119

189766964 ATGTATATCTATATCCACATCTGTATCTATGGATGTTGAATGAAAAAGTCAGGGTAAAGG 189767023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 ATGTATATCTATATCCACATCTGTATCTATGGATGTTGAATGAAAAAGTCAGGGTAAAGG 3179

189767024 GTGAAGAAGGGTGGAAACGCCAGGGTGCATTGTGAGATATGCTAGTGTCAACAGTTATAA 189767083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GTGAAGAAGGGTGGAAACGCCAGGGTGCATTGTGAGATATGCTAGTGTCAACAGTTATAA 3239

189767084 TTGCTCATGTATTGTGCCCATGTATAAATAAATATAATGATATTTAGTGTAGTATTAACA 189767143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TTGCTCATGTATTGTGCCCATGTATAAATAAATATAATGATATTTAGTGTAGTATTAACA 3299

189767144 TTAATAGCAAAATATGAAAAATATCCTAAATGCCCATCAGTATGAAACTAGTTAGCTAAA 189767203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TTAATAGCAAAATATGAAAAATATCCTAAATGCCCATCAGTATGAAACTAGTTAGCTAAA 3359

189767204 TGTCAATGAAATAAAATATAACACAACATAATAAAATGGTGAATTTTCTATTTATGTAAC 189767263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3360 TGTCAATGAAATAAAATATAACACAACATAATAAAACGGTGAATTTTCTATTTATGTAAC 3419

189767264 AAAATGGAAAGTATATAAGCTACATTAATAAATGAAAAGGCAAAGAGCAGATTATTCAAT 189767323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 AAAATGGAAAGTATATAAGCTACATTAATAAATGAAAAGGCAAAGAGCAGATTATTCAAT 3479

189767324 ATTTTATGCCATAATCTGCCAAAAAAACTAATATCCACTGAACTATTTATCTAGACTTTT 189767383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 ATTTTATGCCATAATCTGCCAAAAAAACTAATATCCACTGAACTATTTATCTAGACTTTT 3539

189767384 AGAGGGAAACATAAGAAGTAAAATAATAGCAGTGGTTATCAGCTTGCAAGATAAAGTATC 189767443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AGAGGGAAACATAAGAAGTAAAATAATAGCAGTGGTTATCAGCTTGCAAGATAAAGTATC 3599

189767444 TTATATAGGTATCAATATTTCACTGCATATGCCTTTTTCTACTTTTTGATTTGAGAATCA 189767503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TTATATAGGTATCAATATTTCACTGCATATGCCTTTTTCTACTTTTTGATTTGAGAATCA 3659

189767504 TGAGAATATTCTGTAATACCTATTCAGAAAATTGTATTAAAATGTCATTACATGATGCGT 189767563
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3660 TGAGAATATTCTGTAATACCTATTCAGAAAATTGTATTAAAATGTCATTACATGATGTGT 3719

189767564 TAGGCCATTCCCATATTGTTATAAAGAAACACCTGAGACTGCTCGGGTGTGGTGGCTCAC 189767623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TAGGCCATTCCCATATTGTTATAAAGAAACACCTGAGACTGCTCGGGTGTGGTGGCTCAC 3779

189767624 GCCTATAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCCAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTTGGGAATTC 189767683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 GCCTATAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCCAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTTGGGAATTC 3839

189767684 AAGACCAGTCTGACCAACATGGTCTCTACTAAAAATACAAAAAGTTAGCCAAGTGTGGTG 189767743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3840 AAGACCAGTCTGACCAACATGGTCTCTACTAAAAATACGAAAAGTTAGCCAAGTGTGGTG 3899

189767744 GCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTCCAACCTGA 189767803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 GCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTCCAACCTGA 3959

189767804 GAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCAAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAT 189767863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 GAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCAAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAT 4019

189767864 CGAGCTCTGTTTCAAAAAAAAAAGAAAGGAGAGAA 189767898
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 CGAGCTCTGTTTCAAAAAAAAAAGAAAGGAGAGAA 4054

EXCISED REGION

189767907 AAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAAAGAAAAGA 189767966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 AAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAAAGAAAAGA 4114

189767967 AAGAAAGGGAAGGAAGGAAGGG-----AGGAAGGAAAGAAAGGTCCTGAGACAGAGTTAT 189768021
          |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 AAGAAAGGGAAGGAAGGAAGG-AAGGAAGGAAGGAAAGAAAGGTCCTGAGACAGAGTTAT 4173

189768022 TTAGAAAGAAAAGAAAGAGGTTCAGTTGGCTCATGGTTCCACATGCTGTACAGAATGCAT 189768081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4174 TTAGAAAGAAAAGAAAGAGGTTCAGTTGGCTCATGGTTCCACATGCTGTACAGAATGCAT 4233

189768082 GGCTGGGAGGCCTCAGGAAATTTACAGTCATGGCAGAAGGCAAAGGGGCAGTGAGCCATC 189768141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4234 GGCTGGGAGGCCTCAGGAAATTTACAGTCATGGCAGAAGGCAAAGGGGCAGTGAGCCATC 4293

189768142 TCACATGGAAGAGCAGCAGCAAGATGGGGTGACATGCTACATACTTCTACACAACCAGAT 189768201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4294 TCACATGGAAGAGCAGCAGCAAGATGGGGTGACATGCTACATACTTTTACACAACCAGAT 4353

189768202 GTCATGAGAATTCACTCACTATCACAAGAACAGCACCAAGAGAATGGTGCTAAAGCAGTC 189768261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4354 GTCATGAGAATTCACTCACTATCACAAGAACAGCACCAAGAGAATGGTGCTAAAGCAGTC 4413

189768262 ATAAGAAATTGTCCCCATGATCTAATCAACTCTCTCCAGGCCCCAACTCTAACATTGGGA 189768321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4414 ATAAGAAATTGTCCCCATGATCTAATCAACTCTCTCCAGGCCCCAACTCTAACATTGGGA 4473

189768322 ATTACAATTTGACATGAGATTTGGGTGAGAACACAGATCCAAGCCAATCTCATTTAAAAA 189768381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4474 ATTACAATTTGACATGAGATTTGGGTGAGAACACAGATCCAAGCCAATCTCATTTAAAAA 4533

189768382 TGTTCTGATGGGCTTACACCGGTGTATTGGGTTCAGAGAGACCAGATGGGATAGTAGCAT 189768441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4534 TGTTCTGATGGGCTTACACCGGTGTATTGGGTTCAGAGAGACCAGATGGGATAGTAGCAT 4593

189768442 AGTGTTTGTTTTGAAATATGAGGGAGTTAACCATGTGTATGTTAAGAAGAGGTTTTCACA 189768501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4594 AGTGTTTGTTTTGAAATATGAGGGAGTTAACCATGTGTATGTTAAGAAGAGGTTTTCACA 4653

189768502 TTCAGGATACATTTAAGAAGCCATTAAAAGAGTTAGCAAACTATAGCTCTTGGTTGAAAC 189768561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4654 TTCAGGATACATTTAAGAAGCCATTAAAAGAGTTAGCAAACTATAGCTCTTGGTTGAAAC 4713

189768562 CATAACTTTGTCTAAATTTTTGTAAATAAGATTTCATTGGAACACAGCTATACCCATTCT 189768621
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4714 CATAACTTTGTCTAAATTTTTGTAAATCAGATTTCATTGGAACACAGCTATACCCATTCT 4773

189768622 TTTACATATTGTCTAGTGCTGCTTTCACATTGTAATAGTAGAGTTGAGTGGTTATAGCAA 189768681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4774 TTTACATATTGTCTAGTGCTGCTTTCACATTGTAATAGTAGAGTTGAGTGGTTATAGCAA 4833

189768682 TGGTTATATTGCATACAAAGACTATAACACTTAGAATATTCCCCTTTAGAGAAAACATTT 189768741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4834 TGGTTATATTGCATACAAAGACTATAACACTTAGAATATTCCCCTTTAGAGAAAACATTT 4893

189768742 GCTGGTTCCTCATATAGACCAGAGGATTTTCCAATGAACAGCTTGCGTGGTATTAAATAA 189768801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4894 GCTGGTTCCTCATATAGACCAGAGGATTTTCCAATGAACAGCTTGCGTGGTATTAAATAA 4953

189768802 TGATGAGAGTAAAGGATAACACTGCCATTTTTAGCCTGAGCAACTAGCAAATTTGAAATT 189768861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4954 TGATGAGAGTAAAGGATAACACTGCCATTTTTAGCCTGAGCAACTAGCAAATTTGAAATT 5013

189768862 TGAATTACCATTTACTGCCATTTATTGAAACATGGATCACTTAGAATGCAACAAAGTCAG 189768921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5014 TGAATTACCATTTACTGCCATTTATTGAAACATGGATCACTTAGAATGCAACAAAGTCAG 5073

189768922 GGTGATGAAGACTAAAAGATTCAGTAGAATATAGGATAATTCCCTGAGTATGTCTGCAAG 189768981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5074 GGTGATGAAGACTAAAAGATTCAGTAGAATATAGGATAATTCCCTGAGTATGTCTGCAAG 5133

189768982 ACTACGTGTCCACAGATCCCAGTTTGAGAAACAGTTGTGTAGTAGGATATGAGGAGTAGG 189769041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5134 ACTACGTGTCCACAGATCCCAGTTTGAGAAACAGTTGTGTAGTAGGATATGAGGAGTAGG 5193

189769042 ATAGGAGGAGGGTAATTCTAAAGTTCTAAAACTAACAAACCTTTGACCAAATTGTTTAAA 189769101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5194 ATAGGAGGAGGGTAATTCTAAAGTTCTAAAACTAACAAACCTTTGACCAAATTGTTTAAA 5253

189769102 CTTTCTGATTCTTGACTTTCTCACAAATAAAATCATATGTTCATCTTGGTAATCACTGGC 189769161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5254 CTTTCTGATTCTTGACTTTCTCACAAATAAAATCATATGTTCATCTTGGTAATCACTGGC 5313

189769162 CTTTTTCTAAACAAAATTCTGTGAAAGAGTTATGAAAATTTTACTACATGCATACAAATT 189769221
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5314 CTTTTTCTAAACAAAATTCCGTGAAAGAGTTATGAAAATTTTACTACATGCATACAAATT 5373

189769222 CATTAGGTGTTCCTTTTAAGGGGTTTAAAGTTAAAGAATGATGCAGGGTAATCTACTTAA 189769281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5374 CATTAGGTGTTCCTTTTAAGGGGTTTAAAGTTAAAGAATGATGCAGGGTAATCTACTTAA 5433

189769282 AATAACAGGTAATCTGCCCACTGAAGGTCTTAAGGTAGATGTTAATAAATGATTGTGAAA 189769341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5434 AATAACAGGTAATCTGCCCACTGAAGGTCTTAAGGTAGATGTTAATAAATGATTGTGAAA 5493

189769342 TGAATGAATCAGTTTGCTACAATTTGCACATTACATGCTATTATATTCATAAAAGAATGG 189769401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     5494 TGAATGAATCAGTTTGCTACAATTTGCACATTACATGCTATTATATCCATAAAAGAATGG 5553

189769402 GAAATTAATATTCATATATATTTGTCATTTACATCTT-TTTGAAATCCATATAATGCAAT 189769460
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     5554 GAAATTAATATTCATATATGTTTGTCATTTACATCTTATTTGAAATCCATATAATGCAAT 5613

189769461 TCTATTTCAGTATAAAATAGCTTAGTTAATATATCACTATGTATATTTTGTATAAATATA 189769520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5614 TCTATTTCAGTATAAAATAGCTTAGTTAATATATCACTATGTATATTTTGTATAAATATA 5673

189769521 AAAGCATAATACACATAGAAATGTCACACATACATTTGCTTTTGATTCAAATAAAGATAT 189769580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5674 AAAGCATAATACACATAGAAATGTCACACATACATTTGCTTTTGATTCAAATAAAGATAT 5733

189769581 CATAAAAAATTTAACATTTTTGTTTATTAAATTGTATGGCATTGAACTTTAGGAACACTT 189769640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5734 CATAAAAAATTTAACATTTTTGTTTATTAAATTGTATGGCATTGAACTTTAGGAACACTT 5793

189769641 ACATGTCAAAGCTTATTAAGAGGGAAAATAACCAGTCTAGGTGTCATATAGATGTCCATC 189769700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5794 ACATGTCAAAGCTTATTAAGAGGGAAAATAACCAGTCTAGGTGTCATATAGATGTCCATC 5853

189769701 AAACTATCATCACACCTCCACTTTGCATTTTAGGTTGATAATTTAGCATCAACATAGAGG 189769760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5854 AAACTATCATCACACCTCCACTTTGCATTTTAGGTTGATAATTTAGCATCAACATAGAGG 5913

189769761 ACTTTGATGACAAACAATTTCAGGGAGTGAAACTGGCAAAGAACATAAGGTATTCTTTTT 189769820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5914 ACTTTGATGACAAACAATTTCAGGGAGTGAAACTGGCAAAGAACATAAGGTATTCTTTTT 5973

189769821 CAAGTTTAACACCTTACCGTGATGTTTGACTTCAAATATAAATGTAGCTACAGTGTAATA 189769880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5974 CAAGTTTAACACCTTACCGTGATGTTTGACTTCAAATATAAATGTAGCTACAGTGTAATA 6033

189769881 AAAAAACAATTTTTTCAGTTGTTTACTATCTCTTCTCTTTATACATTAGAAACTTCCAAT 189769940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6034 AAAAAACAATTTTTTCAGTTGTTTACTATCTCTTCTCTTTATACATTAGAAACTTCCAAT 6093

189769941 TTCTTTAATTTCACATTTAAAGGAAGTTTTGATATGAAGAATTGAAGATACAGATATGAA 189770000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6094 TTCTTTAATTTCACATTTAAAGGAAGTTTTGATATGAAGAATTGAAGATACAGATATGAA 6153

189770001 AGTACAATAGTCAGTTTCAGCATTTTTAATTGCCAGTCTGTTTCTCTTATGTTACAATTT 189770060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6154 AGTACAATAGTCAGTTTCAGCATTTTTAATTGCCAGTCTGTTTCTCTTATGTTACAATTT 6213

189770061 TCAGGCCATTTTTAGGCCTTTCCAAATTACTAAATGCATTAAATGTTACCTGATCTGCTT 189770120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6214 TCAGGCCATTTTTAGGCCTTTCCAAATTACTAAATGCATTAAATGTTACCTGATCTGCTT 6273

189770121 TTTTTCATTGCTACCTATTTTTTTAAGTAATGCTGTCTTTATGATTTCTTTTTTGCCCAT 189770180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     6274 TTTTTCATTGCTACCTATTTTTTTAAGTAATGCTGTCTTTATGATTTCTTTTTTGCCCAC 6333

189770181 GTGCATATTCTCTTATTTCACTGTAGGAATGGTGAAACTCTGGATCTAGAATTTAACTAT 189770240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6334 GTGCATATTCTCTTATTTCACTGTAGGAATGGTGAAACTCTGGATCTAGAATTTAACTAT 6393

189770241 ATCCAATTTTCATGAGAGTAAAAATGTATATTATTCTATTAAAGCTCTATAAAGACTAAA 189770300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6394 ATCCAATTTTCATGAGAGTAAAAATGTATATTATTCTATTAAAGCTCTATAAAGACTAAA 6453

189770301 TTTGCATCCCTCCAAAAAATGTAAAGTAGCAATGTCATCACTCTTGCACATCCTCTTTGA 189770360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6454 TTTGCATCCCTCCAAAAAATGTAAAGTAGCAATGTCATCACTCTTGCACATCCTCTTTGA 6513

189770361 AACTTCGTTTTCATCATCTGTGAAATTTTTTTGTGTTTTTTTTCTCTGCTTTATCAAATT 189770420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6514 AACTTCGTTTTCATCATCTGTGAAATTTTTTTGTGTTTTTTTTCTCTGCTTTATCAAATT 6573

189770421 ACGTTCTCAGGTCAGTCAACAATTGAAATTGCGTACAACTTGGCATGATCTAATCGTATG 189770480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6574 ACGTTCTCAGGTCAGTCAACAATTGAAATTGCGTACAACTTGGCATGATCTAATCGTATG 6633

189770481 AGTTTTGAAATTGCACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCATGTAAATAAATTATA 189770540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6634 AGTTTTGAAATTGCACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCATGTAAATAAATTATA 6693

189770541 TAAAACAAGTTTATAAACATATATGCATGTATAATTATTTGTTCTTCTAATCCATATTCC 189770600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6694 TAAAACAAGTTTATAAACATATATGCATGTATAATTATTTGTTCTTCTAATCCATATTCC 6753

189770601 TTACTTTATTATCTTATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAAAT 189770660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6754 TTACTTTATTATCTTATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAAAT 6813

189770661 TTTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACAGGTATGCTATTAAAAA 189770720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     6814 TTTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACACGTATGCTATTAAAAA 6873

189770721 ACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATT 189770780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6874 ACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATT 6933

189770781 TCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAAT 189770840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6934 TCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAAT 6993

189770841 AAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGG 189770900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6994 AAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGG 7053

189770901 AAAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAAATGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCA 189770960
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7054 AAAACAGCCTTTCTT-AAAAAAAAAATGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCA 7112

189770961 GCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCT 189771020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7113 GCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCT 7172

189771021 AACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGG 189771080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7173 AACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGG 7232

189771081 CGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGC 189771140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7233 CGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGC 7292

189771141 GGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGAC 189771200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7293 GGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGAC 7352

189771201 TCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAA 189771260
          ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||
     7353 TCGGTCTCAAAATAAATGAATG--------AATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAA 7404

189771261 TAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGAC 189771320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7405 TAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGAC 7464

189771321 CCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCA 189771380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7465 CCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCA 7524

189771381 GAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAG 189771440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7525 GAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAG 7584

189771441 GCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAA 189771500
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7585 GCTGGAGTGCAATGGCACGGTCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAA 7644

189771501 TTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACCATGCCTGGCT 189771560
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     7645 TTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATATGCCACCATGCCTGGCT 7704

189771561 AATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTC 189771620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7705 AATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTC 7764

189771621 CCGACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCC 189771680
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7765 CCGACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCC 7824

189771681 ACCGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACA 189771740
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7825 ACCGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACA 7884

189771741 TATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGC 189771800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7885 TATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGC 7944

189771801 AGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCA 189771860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7945 AGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCA 8004

189771861 CGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTCGTCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAG 189771920
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     8005 CGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTGGTCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAG 8064

189771921 ACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAA 189771980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8065 ACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAA 8124

189771981 GATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTGTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTG 189772040
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8125 GATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTTTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTG 8184

189772041 GAGCCTCACACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTG 189772100
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8185 GAGCCTCAGACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTG 8244

189772101 TCACTAGTATCATTA 189772115
          |||||||||||||||
     8245 TCACTAGTATCATTA 8259

Alignment time is 7.80209 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5657] =>      5657 nucs 'mol-32-3159-172848_5657'

Score:        5449
Aligned:      5661        nucs
Identic:      5636 (100%) nucs =>      2442 ( 99%)      3194 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189770422,189772885] EXCISED REGION [189772901,189776097]
 second seq =>  [        1,     2455] EXCISED REGION [     2461,     5657]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [189772886,189772900]
 second seq =>         5 nucs [2456,2460]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189772885,189772885] to [189772900,189772900]
 second seq =>         1 nucs [2456,2456] to [2461,2461]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2456,2456] to [2460,2460]

189770422 CGTTCTCAGGTCAGTCAACAATTGAAATTGCGTACAACTTGGCATGATCTAATCGTATGA 189770481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGTTCTCAGGTCAGTCAACAATTGAAATTGCGTACAACTTGGCATGATCTAATCGTATGA 60

189770482 GTTTTGAAATTGCACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCATGTAAATAAATTATAT 189770541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTTTGAAATTGCACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCATGTAAATAAATTATAT 120

189770542 AAAACAAGTTTATAAACATATATGCATGTATAATTATTTGTTCTTCTAATCCATATTCCT 189770601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAACAAGTTTATAAACATATATGCATGTATAATTATTTGTTCTTCTAATCCATATTCCT 180

189770602 TACTTTATTATCTTATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAAATT 189770661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACTTTATTATCTTATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAAATT 240

189770662 TTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACAGGTATGCTATTAAAAAA 189770721
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      241 TTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACACGTATGCTATTAAAAAA 300

189770722 CTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATTT 189770781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATTT 360

189770782 CATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAATA 189770841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAATA 420

189770842 AGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGGA 189770901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGGA 480

189770902 AAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAAATGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAG 189770961
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAA-TGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAG 539

189770962 CACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCTA 189771021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 CACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCTA 599

189771022 ACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGC 189771081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 ACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGC 659

189771082 GCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCG 189771141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCG 719

189771142 GAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACT 189771201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACT 779

189771202 CGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAT 189771261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
      780 CGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA------ 833

189771262 AAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACC 189771321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 --GCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACC 891

189771322 CCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAG 189771381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 CCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAG 951

189771382 AAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGG 189771441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 AAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGG 1011

189771442 CTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAAT 189771501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 CTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAAT 1071

189771502 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACCATGCCTGGCTA 189771561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1072 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATATGCCACCATGCCTGGCTA 1131

189771562 ATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCC 189771621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 ATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCC 1191

189771622 CGACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCA 189771681
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 CGACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCA 1251

189771682 CCGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACAT 189771741
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 CCGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACAT 1311

189771742 ATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCA 189771801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 ATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCA 1371

189771802 GTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCAC 189771861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 GTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCAC 1431

189771862 GGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTCGTCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGA 189771921
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 GGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTGGTCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGA 1491

189771922 CTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAG 189771981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 CTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAG 1551

189771982 ATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTGTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGG 189772041
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 ATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTTTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGG 1611

189772042 AGCCTCACACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGT 189772101
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 AGCCTCAGACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGT 1671

189772102 CACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCT 189772161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 CACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCT 1731

189772162 CCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAA 189772221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 CCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAA 1791

189772222 TCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAA 189772281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 TCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAA 1851

189772282 TAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACCGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTC 189772341
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 TAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACTGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTC 1911

189772342 ACTGATACGCAGTAAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTATACCTCATACTTTTTTC 189772401
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||
     1912 ACTGATACGCAGTGAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTATGCCTCATACTTGTTTC 1971

189772402 GACAATTAGAAAATACAATGCAAATAAAGTACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTT 189772461
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 GACAATTAGAAAATACAATACAAATAAAGTACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTT 2031

189772462 TTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACA 189772521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 TTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACA 2091

189772522 CGGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTT 189772581
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 CAGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTT 2151

189772582 TGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATG 189772641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 TGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATG 2211

189772642 AGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAA 189772701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 AGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAA 2271

189772702 GGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGAT 189772761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 GGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGAT 2331

189772762 GGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGAACT 189772821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 GGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGAACT 2391

189772822 GTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGATTAT 189772881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 GTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGATTAT 2451

189772882 TCTT 189772885
          ||||
     2452 TCTT 2455

EXCISED REGION

189772901 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 189772960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 2520

189772961 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 189773020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 2580

189773021 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 189773080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 2640

189773081 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 189773140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 2700

189773141 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 189773200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 2760

189773201 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 189773260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 2820

189773261 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 189773320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 2880

189773321 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 189773380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 2940

189773381 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 189773440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 3000

189773441 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 189773500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 3060

189773501 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 189773560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 3120

189773561 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 189773620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 3180

189773621 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 189773680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 3240

189773681 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 189773740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 3300

189773741 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 189773800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 3360

189773801 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 189773860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 3420

189773861 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 189773920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 3480

189773921 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 189773980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 3540

189773981 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 189774040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 3600

189774041 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 189774100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 3660

189774101 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 189774160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 3720

189774161 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 189774220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 3780

189774221 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 189774280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 3840

189774281 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 189774340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 3900

189774341 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 189774400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 3960

189774401 GAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 189774460
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 4020

189774461 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 189774520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 4080

189774521 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 189774580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 4140

189774581 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 189774640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 4200

189774641 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 189774700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 4260

189774701 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 189774760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 4320

189774761 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 189774820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 4380

189774821 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 189774880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 4440

189774881 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 189774940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 4500

189774941 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 189775000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 4560

189775001 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 189775060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 4620

189775061 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 189775120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 4680

189775121 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 189775180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 4740

189775181 TACGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 189775240
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TATGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 4800

189775241 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 189775300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 4860

189775301 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCG 189775360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCG 4920

189775361 CTTAAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAA 189775420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CTTAAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAA 4980

189775421 ATTATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCAT 189775480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 ATTATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCAT 5040

189775481 GCCCTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTA 189775540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GCCCTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTA 5100

189775541 GGGCTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGGTCTTGAA 189775600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     5101 GGGCTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGCTCTTGAA 5160

189775601 TTGGAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCC 189775660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TTGGAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCC 5220

189775661 TAGAGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATT 189775720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TAGAGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATT 5280

189775721 GTAACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATAT 189775780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GTAACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATAT 5340

189775781 GCTGTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCC 189775840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 GCTGTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCC 5400

189775841 AAAAAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTT 189775900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 AAAAAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTT 5460

189775901 TCTATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTT 189775960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TCTATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTT 5520

189775961 GCTCTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAA 189776020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GCTCTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAA 5580

189776021 ACATGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTGGATTATATTCCTGTGTGTGTGTATGT 189776080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 ACATGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTGGATTATATTCCTGTGTGTGTGTATGT 5640

189776081 GTGTATGTATACAATAT 189776097
          |||||||||||||||||
     5641 GTGTATGTATACAATAT 5657

Alignment time is 5.28773 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2440] =>      2440 nucs 'mol-32-3164-014064_2440'

Score:        2265
Aligned:      2441        nucs
Identic:      2425 ( 99%) nucs =>       785 (100%)      1640 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189770435,189771222] EXCISED REGION [189771231,189772883]
 second seq =>  [        1,      787] EXCISED REGION [      788,     2440]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [189771223,189771230]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        33 nucs [189771223,189771255] to [189771231,189771263]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [189771223,189771226] to [189771227,189771230]
 second seq =>         0 nucs

189770435 GTCAACAATTGAAATTGCGTACAACTTGGCATGATCTAATCGTATGAGTTTTGAAATTGC 189770494
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
        1 GTCAACAATTGAAATTGCGTACAACTTGGCATGATCTAATCGTATGAGTTTTGGAATTGC 60

189770495 ACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCATGTAAATAAATTATATAAAACAAGTTTAT 189770554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCTGTGTTTTAGCTAAAAATTTGTTGTGCATGTAAATAAATTATATAAAACAAGTTTAT 120

189770555 AAACATATATGCATGTATAATTATTTGTTCTTCTAATCCATATTCCTTACTTTATTATCT 189770614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAACATATATGCATGTATAATTATTTGTTCTTCTAATCCATATTCCTTACTTTATTATCT 180

189770615 TATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAAATTTTTTAAAGCAATC 189770674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAAATTTTTTAAAGCAATC 240

189770675 CTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACAGGTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTCT 189770734
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACACGTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTCT 300

189770735 TCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGCA 189770794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGCA 360

189770795 TAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATCA 189770854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATCA 420

189770855 TCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTCT 189770914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTCT 480

189770915 TAAAAAAAAAAATGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATGC 189770974
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAAAAAAAAA-TGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATGC 539

189770975 TGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACC 189771034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACC 599

189771035 CCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCA 189771094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 CCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCA 659

189771095 GCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGA 189771154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGA 719

189771155 GCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATA 189771214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATA 779

189771215 AATGAATG 189771222
          ||||||||
      780 AATGAATG 787

EXCISED REGION

189771231 AATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAA 189771290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      788 AATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAA 847

189771291 CTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTAC 189771350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      848 CTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCCACTAC 907

189771351 CCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTT 189771410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      908 CCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTT 967

189771411 TCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCA 189771470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 TCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCA 1027

189771471 CCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 189771530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1028 CCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 1087

189771531 GATTACAGGCATACGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTT 189771590
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 GATTACAGGCATATGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTT 1147

189771591 CTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGGCC 189771650
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1148 CTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGGCC 1207

189771651 TCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTTTG 189771710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1208 TCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTTTG 1267

189771711 CTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCT 189771770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 CTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCT 1327

189771771 CTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATAC 189771830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 CTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATAC 1387

189771831 ATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTCGTC 189771890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1388 ATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTGGTC 1447

189771891 AATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATT 189771950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 AATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATT 1507

189771951 TCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTGTCTGG 189772010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1508 TCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTTTCTGG 1567

189772011 TACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCACACAGCAGAGAGCAGAGAGAGG 189772070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1568 TACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCAGACAGCAGAGAGCAGAGAGAGG 1627

189772071 AAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCC 189772130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 AAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCC 1687

189772131 TCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGG 189772190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 TCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGG 1747

189772191 ACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTA 189772250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 ACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTA 1807

189772251 GGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACCG 189772310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1808 GGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACTG 1867

189772311 AGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTAAAGTCTGTAAAAATC 189772370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1868 AGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTGAAGTCTGTAAAAATC 1927

189772371 AGTATGAGAGTGTATACCTCATACTTTTTTCGACAATTAGAAAATACAATGCAAATAAAG 189772430
          |||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1928 AGTATGAGAGTGTATGCCTCATACTTGTTTCGACAATTAGAAAATACAATACAAATAAAG 1987

189772431 TACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTA 189772490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 TACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTA 2047

189772491 TATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACACGGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAA 189772550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2048 TATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACACAGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAA 2107

189772551 TTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTT 189772610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 TTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTT 2167

189772611 CAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCT 189772670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 CAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCT 2227

189772671 GCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAG 189772730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 GCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAG 2287

189772731 AGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGC 189772790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 AGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGC 2347

189772791 TGTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATAT 189772850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 TGTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATAT 2407

189772851 TAAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGATTATTC 189772883
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 TAAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGATTATTC 2440

Alignment time is 2.35633 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2307] =>      2307 nucs 'mol-32-3235-191142_2307'

Score:        2132
Aligned:      2311        nucs
Identic:      2289 ( 99%) nucs =>      2265 ( 99%)        24 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189770599,189772885] EXCISED REGION [189772901,189772924]
 second seq =>  [        1,     2278] EXCISED REGION [     2284,     2307]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [189772886,189772900]
 second seq =>         5 nucs [2279,2283]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189772885,189772885] to [189772900,189772900]
 second seq =>         1 nucs [2279,2279] to [2284,2284]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2279,2279] to [2283,2283]

189770599 CCTTACTTTATTATCTTATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAA 189770658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTTACTTTATTATCTTATGTATAAATTATGTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAA 60

189770659 ATTTTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACAGGTATGCTATTAAA 189770718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
       61 ATTTTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACACGTATGCTATTAAA 120

189770719 AAACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTA 189770778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTA 180

189770779 TTTCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCA 189770838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCA 240

189770839 ATAAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATA 189770898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATA 300

189770899 GGAAAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAAATGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCC 189770958
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGAAAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAA-TGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCC 359

189770959 CAGCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGG 189771018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 CAGCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGG 419

189771019 CTAACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCG 189771078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 CTAACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCG 479

189771079 GGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAG 189771138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 GGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAG 539

189771139 GCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAG 189771198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAG 599

189771199 ACTCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 189771258
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
      600 ACTCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA--- 656

189771259 AATAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTG 189771318
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 -----GCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTG 711

189771319 ACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTC 189771378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      712 ACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTC 771

189771379 CAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCC 189771438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 CAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCC 831

189771439 AGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGC 189771498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 AGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGC 891

189771499 AATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACCATGCCTGG 189771558
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      892 AATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATATGCCACCATGCCTGG 951

189771559 CTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAAC 189771618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 CTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAAC 1011

189771619 TCCCGACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAG 189771678
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 TCCCGACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAG 1071

189771679 CCACCGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATA 189771738
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 CCACCGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATA 1131

189771739 CATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTA 189771798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 CATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTA 1191

189771799 GCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTG 189771858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 GCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTG 1251

189771859 CACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTCGTCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCAT 189771918
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 CACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTGGTCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCAT 1311

189771919 AGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTAT 189771978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 AGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTAT 1371

189771979 AAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTGTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTC 189772038
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 AAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTTTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTC 1431

189772039 TGGAGCCTCACACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAG 189772098
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 TGGAGCCTCAGACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAG 1491

189772099 TGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCA 189772158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 TGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCA 1551

189772159 CCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGAT 189772218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 CCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGAT 1611

189772219 AAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATC 189772278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 AAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATC 1671

189772279 TAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACCGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGAC 189772338
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1672 TAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACTGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGAC 1731

189772339 TTCACTGATACGCAGTAAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTATACCTCATACTTTT 189772398
          ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|
     1732 TTCACTGATACGCAGTGAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTATGCCTCATACTTGT 1791

189772399 TTCGACAATTAGAAAATACAATGCAAATAAAGTACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTAC 189772458
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 TTCGACAATTAGAAAATACAATACAAATAAAGTACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTAC 1851

189772459 GTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAATATAAAAACTATTTCATGA 189772518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 GTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAATATAAAAACTATTTCATGA 1911

189772519 ACACGGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTG 189772578
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 ACACAGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTG 1971

189772579 CTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAG 189772638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 CTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAG 2031

189772639 ATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTC 189772698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 ATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTC 2091

189772699 CAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATA 189772758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 CAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATA 2151

189772759 GATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGA 189772818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 GATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGA 2211

189772819 ACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGAT 189772878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 ACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGAT 2271

189772879 TATTCTT 189772885
          |||||||
     2272 TATTCTT 2278

EXCISED REGION

189772901 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAA 189772924
          ||||||||||||||||||||||||
     2284 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAA 2307

Alignment time is 2.22765 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     4668] =>      4668 nucs 'mol-32-3327-005561_4668'

Score:        4471
Aligned:      4672        nucs
Identic:      4648 ( 99%) nucs =>      2201 ( 99%)      2447 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189770663,189772885] EXCISED REGION [189772901,189775349]
 second seq =>  [        1,     2214] EXCISED REGION [     2220,     4668]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [189772886,189772900]
 second seq =>         5 nucs [2215,2219]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189772885,189772885] to [189772900,189772900]
 second seq =>         1 nucs [2215,2215] to [2220,2220]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2215,2215] to [2219,2219]

189770663 TTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACAGGTATGCTATTAAAAAAC 189770722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
        1 TTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTAGAAAAGTGAGCTTACACGTATGCTATTAAAAAAC 60

189770723 TACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATTTC 189770782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTCCCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATTTC 120

189770783 ATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAATAA 189770842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATATTTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAATAA 180

189770843 GCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGGAA 189770902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCAAAAATATCATCAATAATTTTTCTTACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGGAA 240

189770903 AACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAAATGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGC 189770962
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAA-TGGCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGC 299

189770963 ACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCTAA 189771022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 ACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCTAA 359

189771023 CACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGCG 189771082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 CACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGCG 419

189771083 CCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGG 189771142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 CCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGG 479

189771143 AGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTC 189771202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 AGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTC 539

189771203 GGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATA 189771262
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
      540 GGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA------- 592

189771263 AGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCC 189771322
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 -GCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCC 651

189771323 CCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGA 189771382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      652 CCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGA 711

189771383 AATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGC 189771442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      712 AATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGC 771

189771443 TGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATT 189771502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 TGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATT 831

189771503 CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACCATGCCTGGCTAA 189771562
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      832 CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATATGCCACCATGCCTGGCTAA 891

189771563 TTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCC 189771622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 TTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCC 951

189771623 GACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCAC 189771682
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 GACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCAC 1011

189771683 CGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATA 189771742
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 CGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATA 1071

189771743 TATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAG 189771802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 TATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAG 1131

189771803 TATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACG 189771862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 TATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACG 1191

189771863 GTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTCGTCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGAC 189771922
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 GTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTGGTCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGAC 1251

189771923 TAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGA 189771982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 TAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGA 1311

189771983 TCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTGTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGA 189772042
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 TCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTTTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGA 1371

189772043 GCCTCACACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTC 189772102
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 GCCTCAGACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTC 1431

189772103 ACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTC 189772162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 ACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTC 1491

189772163 CAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAAT 189772222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 CAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAAT 1551

189772223 CATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAAT 189772282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 CATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAAT 1611

189772283 AAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACCGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCA 189772342
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 AAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACTGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCA 1671

189772343 CTGATACGCAGTAAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTATACCTCATACTTTTTTCG 189772402
          ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
     1672 CTGATACGCAGTGAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTATGCCTCATACTTGTTTCG 1731

189772403 ACAATTAGAAAATACAATGCAAATAAAGTACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTT 189772462
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 ACAATTAGAAAATACAATACAAATAAAGTACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTT 1791

189772463 TCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACAC 189772522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 TCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACAC 1851

189772523 GGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTT 189772582
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 AGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTT 1911

189772583 GAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGA 189772642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 GAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGA 1971

189772643 GTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAAG 189772702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 GTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAAG 2031

189772703 GCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGATG 189772762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 GCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGATG 2091

189772763 GTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGAACTG 189772822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 GTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGAACTG 2151

189772823 TAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGATTATT 189772882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 TAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGATTATT 2211

189772883 CTT 189772885
          |||
     2212 CTT 2214

EXCISED REGION

189772901 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 189772960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 2279

189772961 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 189773020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 2339

189773021 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 189773080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 2399

189773081 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 189773140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 2459

189773141 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 189773200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 2519

189773201 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 189773260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 2579

189773261 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 189773320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 2639

189773321 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 189773380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 2699

189773381 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 189773440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 2759

189773441 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 189773500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 2819

189773501 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 189773560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 2879

189773561 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 189773620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 2939

189773621 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 189773680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 2999

189773681 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 189773740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 3059

189773741 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 189773800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 3119

189773801 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 189773860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 3179

189773861 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 189773920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 3239

189773921 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 189773980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 3299

189773981 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 189774040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 3359

189774041 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 189774100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 3419

189774101 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 189774160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 3479

189774161 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 189774220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 3539

189774221 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 189774280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 3599

189774281 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 189774340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 3659

189774341 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 189774400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 3719

189774401 GAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 189774460
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 AAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 3779

189774461 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 189774520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 3839

189774521 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 189774580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 3899

189774581 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 189774640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 3959

189774641 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 189774700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 4019

189774701 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 189774760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 4079

189774761 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 189774820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 4139

189774821 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 189774880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 4199

189774881 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 189774940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 4259

189774941 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 189775000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 4319

189775001 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 189775060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 4379

189775061 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 189775120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 4439

189775121 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 189775180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 4499

189775181 TACGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 189775240
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 TATGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 4559

189775241 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 189775300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 4619

189775301 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTT 189775349
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTT 4668

Alignment time is 4.47315 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2442] =>      2442 nucs 'mol-32-3403-048954_2442'

Score:        2267
Aligned:      2446        nucs
Identic:      2424 ( 99%) nucs =>      2355 ( 99%)        69 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189770509,189772885] EXCISED REGION [189772901,189772969]
 second seq =>  [        1,     2368] EXCISED REGION [     2374,     2442]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [189772886,189772900]
 second seq =>         5 nucs [2369,2373]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189772885,189772885] to [189772900,189772900]
 second seq =>         1 nucs [2369,2369] to [2374,2374]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2369,2369] to [2373,2373]

189770509 TAAAAATTTGTTGTGCATGTAAATAAATTATATAAAACAAGTTTATAAACATATATGCAT 189770568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAAAATTTGTTGTGCATGTAAATAAATTATATAAAACAAGTTTATAAACATATATGCAT 60

189770569 GTATAATTATTTGTTCTTCTAATCCATATTCCTTACTTTATTATCTTATGTATAAATTAT 189770628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTATAATTATTTGTTCTTCTAATCCATATTCCTTACTTTATTATCTTATGTATAAATTAT 120

189770629 GTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAAATTTTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTA 189770688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTAAAGATAGCATCAGAATATGTAATATAAATTTTTTAAAGCAATCCTGCCCACACTCTA 180

189770689 GAAAAGTGAGCTTACAGGTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTC 189770748
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAAAGTGAGCTTACACGTATGCTATTAAAAAACTACTTATCCTCTTCATCCTCTAGGTC 240

189770749 CCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATAT 189770808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCACAAGCAACAGAAATATGTATGTTATTATTTCATAAGTAAAGCATAACTGTCTTATAT 300

189770809 TTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCT 189770868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAAAAACAATGAAATACTTTTCTCTATCAATAAGCAAAAATATCATCAATAATTTTTCT 360

189770869 TACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAAATG 189770928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
      361 TACATTTTATTTTTATCAAAACATTAAATAGGAAAACAGCCTTTCTTAAAAAAAAAA-TG 419

189770929 GCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGAT 189770988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 GCCGGACACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTCGGGATGCTGAGGCGGGTGGAT 479

189770989 CACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAA 189771048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 CACGAGGTCAGGAAATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCTTCTCTATTAAA 539

189771049 AATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGC 189771108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 AATACAAAAAATTATCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGC 599

189771109 TGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCC 189771168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 TGTTAGAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCC 659

189771169 ACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAA 189771228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 ACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAA 719

189771229 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACAT 189771288
          |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||
      720 TAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA--------GCCAAACCAAGTATTAGAGTAACAT 771

189771289 AACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACT 189771348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 AACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACT 831

189771349 ACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTG 189771408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 ACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTG 891

189771409 TTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCT 189771468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 TTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCT 951

189771469 CACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCT 189771528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 CACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCT 1011

189771529 GGGATTACAGGCATACGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGT 189771588
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 GGGATTACAGGCATATGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGT 1071

189771589 TTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGG 189771648
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1072 TTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGG 1131

189771649 CCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTT 189771708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1132 CCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTT 1191

189771709 TGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTG 189771768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 TGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTG 1251

189771769 CTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGAT 189771828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 CTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGAT 1311

189771829 ACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTCG 189771888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1312 ACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTGG 1371

189771889 TCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTA 189771948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 TCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTA 1431

189771949 TTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTGTCT 189772008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1432 TTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTTTCT 1491

189772009 GGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCACACAGCAGAGAGCAGAGAGA 189772068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1492 GGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCAGACAGCAGAGAGCAGAGAGA 1551

189772069 GGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTAT 189772128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 GGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTAT 1611

189772129 CCTCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGA 189772188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 CCTCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGA 1671

189772189 GGACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTT 189772248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 GGACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTT 1731

189772249 TAGGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTAC 189772308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 TAGGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTAC 1791

189772309 CGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTAAAGTCTGTAAAAA 189772368
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1792 TGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACGCAGTGAAGTCTGTAAAAA 1851

189772369 TCAGTATGAGAGTGTATACCTCATACTTTTTTCGACAATTAGAAAATACAATGCAAATAA 189772428
          |||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
     1852 TCAGTATGAGAGTGTATGCCTCATACTTGTTTCGACAATTAGAAAATACAATACAAATAA 1911

189772429 AGTACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGT 189772488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 AGTACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGT 1971

189772489 TATATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACACGGAAACACATAGTTAAACTATTTGAG 189772548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1972 TATATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACACAGAAACACATAGTTAAACTATTTGAG 2031

189772549 AATTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTT 189772608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 AATTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTT 2091

189772609 TTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTT 189772668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 TTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTT 2151

189772669 CTGCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAG 189772728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 CTGCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAG 2211

189772729 AGAGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGG 189772788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 AGAGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGG 2271

189772789 GCTGTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAAT 189772848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 GCTGTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAAT 2331

189772849 ATTAAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGATTATTCTT 189772885
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 ATTAAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGATTATTCTT 2368

EXCISED REGION

189772901 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 189772960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 2433

189772961 TGGAAAATT 189772969
          |||||||||
     2434 TGGAAAATT 2442

Alignment time is 2.94282 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     2033] =>      2033 nucs 'mol-32-3403-056614_2033'

Score:        1879
Aligned:      2036        nucs
Identic:      2016 ( 99%) nucs =>      1674 ( 99%)       342 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189771192,189772885] EXCISED REGION [189772901,189773242]
 second seq =>  [        1,     1686] EXCISED REGION [     1692,     2033]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [189772886,189772900]
 second seq =>         5 nucs [1687,1691]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189772885,189772885] to [189772900,189772900]
 second seq =>         1 nucs [1687,1687] to [1692,1692]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1687,1687] to [1691,1691]

189771192 GAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA 189771251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGCAAGACTCGGTCTCAAAATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA 60

189771252 ATAAATAAATAAGCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTAT 189771311
          ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAA--------GCCAAACCAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTAT 112

189771312 TCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGT 189771371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      113 TCTCTTGACCCCCGTACCCTAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGT 172

189771372 ATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCAT 189771431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      173 ATCCTTCCAGAAATTTTTGTTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCAT 232

189771432 GTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGG 189771491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      233 GTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGG 292

189771492 TTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACCA 189771551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      293 TTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATATGCCACCA 352

189771552 TGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGT 189771611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      353 TGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGT 412

189771612 CTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCACCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAG 189771671
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      413 CTCGAACTCCCGACCTCAGGTAATGCGCCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAG 472

189771672 GCATGAGCCACCGTGCCCGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACT 189771731
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      473 GCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACT 532

189771732 TCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTT 189771791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      533 TCTCATACATATATCTAGTTATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTT 592

189771792 ACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAA 189771851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 ACACTTAGCAGTATGTCAAAAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAA 652

189771852 ATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTCGTCAATTTCTACTGCTATTACAGG 189771911
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      653 ATAGCTGCACGGTTTCTCATATTAAGGATTGCCTTGGTCAATTTCTACTGCTATTACAGG 712

189771912 ATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGA 189771971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 ATATCATAGACTAGATGGCTTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGA 772

189771972 GAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTGTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCAT 189772031
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      773 GAAGTATAAGATCAAGGTGCTGGCAAATCAGGTTTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCAT 832

189772032 CTTCTTCTGGAGCCTCACACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTT 189772091
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 CTTCTTCTGGAGCCTCAGACAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTT 892

189772092 CTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAATTACCTGCCAA 189772151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 CTTATAGTGTCACTAGTATCATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAATTACCTGCCAA 952

189772152 AGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATATGGAGTCCATAG 189772211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 AGTACCACCTCCAAAATTTAACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATATGGAGTCCATAG 1012

189772212 TAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCAAAAATTGCAAA 189772271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 TAACGATAAATCATAAGTAATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCAAAAATTGCAAA 1072

189772272 TAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACCGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGA 189772331
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1073 TAATATCTAATAAATGTTCTTATATAATGCAGTGTACTGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGA 1132

189772332 TTCAGACTTCACTGATACGCAGTAAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTATACCTCA 189772391
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1133 TTCAGACTTCACTGATACGCAGTGAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTATGCCTCA 1192

189772392 TACTTTTTTCGACAATTAGAAAATACAATGCAAATAAAGTACTTTAGCAGGACCTGGAAT 189772451
          |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 TACTTGTTTCGACAATTAGAAAATACAATACAAATAAAGTACTTTAGCAGGACCTGGAAT 1252

189772452 ATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAATATAAAAACTAT 189772511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 ATACTACGTTTTCAATAATGTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAATATAAAAACTAT 1312

189772512 TTCATGAACACGGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGTATTTGGTAGTC 189772571
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 TTCATGAACACAGAAACACATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGTATTTGGTAGTC 1372

189772572 ATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAG 189772631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 ATCATTGCTTTGAATCCTACAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAG 1432

189772632 GCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCCCAAACTACCAC 189772691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 GCCCTAGATGAGTATCACCTGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCCCAAACTACCAC 1492

189772692 CAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCATCGGAAACTGA 189772751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 CAGTCTCCAAGGCTCCCATGTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCATCGGAAACTGA 1552

189772752 CAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCACCGTCAGTCACT 189772811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 CAGGATAGATGGTATATTTGTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCACCGTCAGTCACT 1612

189772812 TGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACTGTCTAGTACCCC 189772871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 TGTGGGAACTGTAGCCTAAATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACTGTCTAGTACCCC 1672

189772872 TTAAGATTATTCTT 189772885
          ||||||||||||||
     1673 TTAAGATTATTCTT 1686

EXCISED REGION

189772901 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 189772960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 1751

189772961 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 189773020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 1811

189773021 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 189773080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 1871

189773081 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 189773140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 1931

189773141 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 189773200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 1991

189773201 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTC 189773242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTC 2033

Alignment time is 1.96533 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5447] =>      5447 nucs 'mol-32-3492-020502_5447'

Score:        5402
Aligned:      5446        nucs
Identic:      5442 (100%) nucs =>       565 (100%)      4877 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189773836,189774400] EXCISED REGION [189774402,189779282]
 second seq =>  [        1,      565] EXCISED REGION [      567,     5447]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [189774401,189774401]
 second seq =>         1 nucs [566,566]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189774400,189774400] to [189774401,189774401]
 second seq =>         3 nucs [566,568] to [567,569]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

189773836 TATTAATGTCAGCCTGTGGGACACTAAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCT 189773895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTAATGTCAGCCTGTGGGACACTAAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCT 60

189773896 AATCTGCAAAACTGTAAGATAATACATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTT 189773955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATCTGCAAAACTGTAAGATAATACATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTT 120

189773956 TTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGACTAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTAT 189774015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGACTAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTAT 180

189774016 GCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGAAATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGG 189774075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGAAATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGG 240

189774076 AAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGGGGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAAC 189774135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGGGGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAAC 300

189774136 AGACTATTAGTAGAAAAGTAGACATCAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTA 189774195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGACTATTAGTAGAAAAGTAGACATCAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTA 360

189774196 AAGGAGCATTATGAAGAAATCATAAATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAG 189774255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGGAGCATTATGAAGAAATCATAAATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAG 420

189774256 AATATTACCACAAATCTGGACATTAAGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAG 189774315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATATTACCACAAATCTGGACATTAAGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAG 480

189774316 AAACATATTATTAGAAACTGAAGGAAGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAG 189774375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAACATATTATTAGAAACTGAAGGAAGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAG 540

189774376 TAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 189774400
          |||||||||||||||||||||||||
      541 TAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 565

EXCISED REGION

189774402 AAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAGC 189774461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      567 AAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAGC 626

189774462 TGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTTT 189774521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      627 TGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTTT 686

189774522 TGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAAG 189774581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      687 TGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAAG 746

189774582 GGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGAC 189774641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 GGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGAC 806

189774642 TATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTTT 189774701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      807 TATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTTT 866

189774702 TAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAGA 189774761
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      867 TGAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAGA 926

189774762 AGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTAT 189774821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 AGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTAT 986

189774822 ATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAATA 189774881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 ATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAATA 1046

189774882 CAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGAA 189774941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 CAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGAA 1106

189774942 AGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCAG 189775001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 AGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCAG 1166

189775002 GAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAAG 189775061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 GAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAAG 1226

189775062 ATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTAT 189775121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 ATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTAT 1286

189775122 TTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTTT 189775181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 TTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTTT 1346

189775182 ACGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGAC 189775241
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 ATGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGAC 1406

189775242 ACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTTT 189775301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 ACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTTT 1466

189775302 AAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCGC 189775361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 AAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCGC 1526

189775362 TTAAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAAA 189775421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 TTAAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAAA 1586

189775422 TTATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCATG 189775481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 TTATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCATG 1646

189775482 CCCTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTAG 189775541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 CCCTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTAG 1706

189775542 GGCTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGGTCTTGAAT 189775601
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1707 GGCTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGCTCTTGAAT 1766

189775602 TGGAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCCT 189775661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 TGGAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCCT 1826

189775662 AGAGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATTG 189775721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 AGAGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATTG 1886

189775722 TAACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATATG 189775781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 TAACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATATG 1946

189775782 CTGTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCCA 189775841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 CTGTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCCA 2006

189775842 AAAAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTTT 189775901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 AAAAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTTT 2066

189775902 CTATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTTG 189775961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 CTATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTTG 2126

189775962 CTCTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAAA 189776021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 CTCTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAAA 2186

189776022 CATGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTGGATTATATTCCTGTGTGTGTGTATGTG 189776081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 CATGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTGGATTATATTCCTGTGTGTGTGTATGTG 2246

189776082 TGTATGTATACAATATTTTATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAAGAATTTAATTTTG 189776141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 TGTATGTATACAATATTTTATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAAGAATTTAATTTTG 2306

189776142 CAATTACTGATTTTCCTGAGATCCTAAAGGGTTAATGTGCTTTTGGAATTTTCTCTGGGT 189776201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 CAATTACTGATTTTCCTGAGATCCTAAAGGGTTAATGTGCTTTTGGAATTTTCTCTGGGT 2366

189776202 TTTTGGCTTTGTTTTGTTGGTTGGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATTC 189776261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 TTTTGGCTTTGTTTTGTTGGTTGGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATTC 2426

189776262 AGGGGGTACATATACACACACAACACAACATGCATTTATCCATTCATCTTGTCATGACCA 189776321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 AGGGGGTACATATACACACACAACACAACATGCATTTATCCATTCATCTTGTCATGACCA 2486

189776322 CTTAGGTTGATTCCACCTTGTAGCTATTATGAATAATGCTGCTATAAACATTTTATACAA 189776381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 CTTAGGTTGATTCCACCTTGTAGCTATTATGAATAATGCTGCTATAAACATTTTATACAA 2546

189776382 ATATCTATTCAGGTGTTCGCTTTCATTACTTTTAGGTATGTGCACAGAAGTTGAATTGCT 189776441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 ATATCTATTCAGGTGTTCGCTTTCATTACTTTTAGGTATGTGCACAGAAGTTGAATTGCT 2606

189776442 GGCTCATATGCTAATTCTATAATTATTTGAGCAAACAAATTATTCGAGGAAACATACACT 189776501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 GGCTCATATGCTAATTCTATAATTATTTGAGCAAACAAATTATTCGAGGAAACATACACT 2666

189776502 TTCTACAGTGGCTGCCTAATTTTACTGTCCTACCAGCAATGCACAAGGCTGCTAAATTCT 189776561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 TTCTACAGTGGCTGCCTAATTTTACTGTCCTACCAGCAATGCACAAGGCTGCTAAATTCT 2726

189776562 TCACATTAGTGCCAACATTTGTTTTCCATTTGTTTTTCTTCTTATAATAGCAATCCACTT 189776621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 TCACATTAGTGCCAACATTTGTTTTCCATTTGTTTTTCTTCTTATAATAGCAATCCACTT 2786

189776622 GTGAAGTGGTATCTCATTTTGCTTTGATTTGCATTTCCTTAATGATTAATAACACTGAAT 189776681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 GTGAAGTGGTATCTCATTTTGCTTTGATTTGCATTTCCTTAATGATTAATAACACTGAAT 2846

189776682 ATCTTTTCATGTGCTTATTGAACATTTATGTATTTTTCTGTGTTTTTTCCTGGTAAGAAC 189776741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 ATCTTTTCATGTGCTTATTGAACATTTATGTATTTTTCTGTGTTTTTTCCTGGTAAGAAC 2906

189776742 ATTTGTTGAGAGAAAATGTTCAATATTTGCACTAAAAGATTAGCAGTCTTTGTGGATTTT 189776801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 ATTTGTTGAGAGAAAATGTTCAATATTTGCACTAAAAGATTAGCAGTCTTTGTGGATTTT 2966

189776802 ATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAATAATTTAATTTTGCAATTACTGATTTTCCTGA 189776861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 ATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAATAATTTAATTTTGCAATTACTGATTTTCCTGA 3026

189776862 GATCTTAAAGGGTTAATATGCTTTTGGAATTTTCTCTGGGTTTTTTGGTTTGTTTTTTTG 189776921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 GATCTTAAAGGGTTAATATGCTTTTGGAATTTTCTCTGGGTTTTTTGGTTTGTTTTTTTG 3086

189776922 GTTTGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATTCAGGGGATACATGTGCAGGT 189776981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 GTTTGTTGATTGGTTTTAATTTCAACTTTTATTTTAAATTCAGGGGATACATGTGCAGGT 3146

189776982 TTTTTTTCATGGGTATATTGTGTGATGCTGAGGTTTATGGCATGGAGGTAGTGGATTATT 189777041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 TTTTTTTCATGGGTATATTGTGTGATGCTGAGGTTTATGGCATGGAGGTAGTGGATTATT 3206

189777042 CTCAGGTAATGAGAATAGTACCCAATAGGTAGTTTTCCAATCCATGCCCCACTTCCTCCT 189777101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 CTCAGGTAATGAGAATAGTACCCAATAGGTAGTTTTCCAATCCATGCCCCACTTCCTCCT 3266

189777102 TCTCTCATCTAGTAGTCTGCAGTGTCTACTGTTTCCATGTTTATGTCCACATATATATAC 189777161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 TCTCTCATCTAGTAGTCTGCAGTGTCTACTGTTTCCATGTTTATGTCCACATATATATAC 3326

189777162 TCTATGGTTTTGGAGAACTGATCACTAAAATTGTTTGCCCTTTTGAAAAATAGGTTGTTT 189777221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 TCTATGGTTTTGGAGAACTGATCACTAAAATTGTTTGCCCTTTTGAAAAATAGGTTGTTT 3386

189777222 GGGTTTTTGTGTTGCTGATAACCTATAGGAGCTTTTTTTATATATTCTAAATATTAACTC 189777281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 GGGTTTTTGTGTTGCTGATAACCTATAGGAGCTTTTTTTATATATTCTAAATATTAACTC 3446

189777282 TTTATAAGATATACGATTAGCAAATATGTTCTCTCATTCCATGTGTTGCCTTTTCACTCT 189777341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 TTTATAAGATATACGATTAGCAAATATGTTCTCTCATTCCATGTGTTGCCTTTTCACTCT 3506

189777342 GTTTTTAGTATCCTTTAAAAAATGTTGATCAAGTCCAATATATCTAATTTTTCTTATATT 189777401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 GTTTTTAGTATCCTTTAAAAAATGTTGATCAAGTCCAATATATCTAATTTTTCTTATATT 3566

189777402 ACCTGTGCTTTTGATATTCTTTCAAGAAGTAATTATTGCCAAATCGAATGACATGAATAA 189777461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 ACCTGTGCTTTTGATATTCTTTCAAGAAGTAATTATTGCCAAATCGAATGACATGAATAA 3626

189777462 TTTTCCCTATTTTTAAAGATTTTTATACTTTTAACTTTTATGCTTAAACTTTAAAATATT 189777521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 TTTTCCCTATTTTTAAAGATTTTTATACTTTTAACTTTTATGCTTAAACTTTAAAATATT 3686

189777522 TTGAGTTTTCTGTATATAAGGAAAAGACTCATATTTCTTATTTTGCATGTGGTTATATCA 189777581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 TTGAGTTTTCTGTATATAAGGAAAAGACTCATATTTCTTATTTTGCATGTGGTTATATCA 3746

189777582 TTTTCCATTTCTGAGAAGATTGCTATTTTCCTTATTGAATGTTCTTGTCACTTTTGTTGA 189777641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 TTTTCCATTTCTGAGAAGATTGCTATTTTCCTTATTGAATGTTCTTGTCACTTTTGTTGA 3806

189777642 AAACCCTTTGACCATATATGTGAGGTTTTATTTCTGGGCTCTCTATTCAGCTTCATTGGT 189777701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 AAACCCTTTGACCATATATGTGAGGTTTTATTTCTGGGCTCTCTATTCAGCTTCATTGGT 3866

189777702 CTATATGTTTTTCTTTATGCCAGTAATTCACTGTTTTGATTACTATAACAACTTTGTAGT 189777761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 CTATATGTTTTTCTTTATGCCAGTAATTCACTGTTTTGATTACTATAACAACTTTGTAGT 3926

189777762 AAGTATTGAAATCATGAAGTGAGAGTACTCCAACTTTGTTATTTATTTTCAGTATTGTTA 189777821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 AAGTATTGAAATCATGAAGTGAGAGTACTCCAACTTTGTTATTTATTTTCAGTATTGTTA 3986

189777822 AGGTTACCTGGGTCCCTTAAGAATCCAAATGAACTTTAGGAAGAATGTTTCTATTTCTGC 189777881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 AGGTTACCTGGGTCCCTTAAGAATCCAAATGAACTTTAGGAAGAATGTTTCTATTTCTGC 4046

189777882 AAACATTATCCTTGGGATTTGATAGAAATTGCATTGAATCTGTAGAATGCATTTGGTCAT 189777941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4047 AAACATTATCCTTGGGATTTGATAGAAATTGCATTGAATCTGTAGAATGCATTTGGTCAT 4106

189777942 GCTCACAATATTAAGTCTTTCCATCTATGAGCACAAATGTCTTTGAGCTTGTGTCTTCTT 189778001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4107 GCTCACAATATTAAGTCTTTCCATCTATGAGCACAAATGTCTTTGAGCTTGTGTCTTCTT 4166

189778002 TAGTTACTTTCACCAACATTTTGTAATTTTCAATGTACAAGTATTTTATCTCCTTAAGTT 189778061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4167 TAGTTACTTTCACCAACATTTTGTAATTTTCAATGTACAAGTATTTTATCTCCTTAAGTT 4226

189778062 TTTTCTAGGTATTTTATTCTTTTTATTTTTATATAAAATGGACTTTTTTCTTATTTTTAT 189778121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4227 TTTTCTAGGTATTTTATTCTTTTTATTTTTATATAAAATGGACTTTTTTCTTATTTTTAT 4286

189778122 TTTTATTGTTACTATACAGAAATACAACTTTTTTGTTAATATTGTATCATGCAACATTGT 189778181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4287 TTTTATTGTTACTATACAGAAATACAACTTTTTTGTTAATATTGTATCATGCAACATTGT 4346

189778182 TGAATTTTTAAATTTGTTCTAACAGTTTGGTTTTTTGTGGACCTTTGAGTTTTTTTCGTA 189778241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4347 TGAATTTTTAAATTTGTTCTAACAGTTTGGTTTTTTGTGGACCTTTGAGTTTTTTTCGTA 4406

189778242 CAGCATCATGCCATCTCTGAACAGAAATCATTTTACTTTTTCTTTCCAATTTAATTGCCT 189778301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4407 CAGCATCATGCCATCTCTGAACAGAAATCATTTTACTTTTTCTTTCCAATTTAATTGCCT 4466

189778302 TTTACTTTTGTTTCTTTCTGAATTTCTGTGACTATAACTTTCAATACCGTGTTAGAAACT 189778361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4467 TTTACTTTTGTTTCTTTCTGAATTTCTGTGACTATAACTTTCAATACCGTGTTAGAAACT 4526

189778362 TTCCATATTGTGTTACTGAACTGGTGAAAGCAGGCATCCTTATCTTCTTCCTTTTCCTAG 189778421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4527 TTCCATATTGTGTTACTGAACTGGTGAAAGCAGGCATCCTTATCTTCTTCCTTTTCCTAG 4586

189778422 CATAAAAGCTTTCAGAATTTTATCATTGCATATGATATTACCTGTAGGCTTCTCATATAT 189778481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4587 CATAAAAGCTTTCAGAATTTTATCATTGCATATGATATTACCTGTAGGCTTCTCATATAT 4646

189778482 GTTCATTATTATAATGAAAAAGTTTCCTTGTAATCCTGGTATGTTGGGCATTAAAAAAAA 189778541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4647 GTTCATTATTATAATGAAAAAGTTTCCTTGTAATCCTGGTATGTTGGGCATTAAAAAAAA 4706

189778542 CACAAAAGTGAACTAAATTTTGTCAAATGCTTTATCTAATAAACTACCTTTCTGTCTGAT 189778601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4707 CACAAAAGTGAACTAAATTTTGTCAAATGCTTTATCTAATAAACTACCTTTCTGTCTGAT 4766

189778602 TACATGCTTTGCTTGATTTTTAATCTTATTAAGTGTTTTTACATCAGTCTTACTGCTTAT 189778661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4767 TACATGCTTTGCTTGATTTTTAATCTTATTAAGTGTTTTTACATCAGTCTTACTGCTTAT 4826

189778662 CAGTCTATCCTGGAGAATATTTCGTATGTTCTCAAAAAAAACCCCATAATTTTCTGTTGG 189778721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4827 CAGTCTATCCTGGAGAATATTTCGTATGTTCTCAAAAAAAACCCCATAATTTTCTGTTGG 4886

189778722 TGAAGTAATTACAAATACCATCTTATGTTAGTTAGTAGTTTATTATTATTATATAGTGCA 189778781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4887 TGAAGTAATTACAAATACCATCTTATGTTAGTTAGTAGTTTATTATTATTATATAGTGCA 4946

189778782 GCCACTCTGGATTCTGATTTTTCTCTAAGGGGGTTGTGTTCATTGCTGCTTTACTTGTTT 189778841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4947 GCCACTCTGGATTCTGATTTTTCTCTAAGGGGGTTGTGTTCATTGCTGCTTTACTTGTTT 5006

189778842 CTTTGTTTAGTAATTTGCCTGGATTCCATTTGTGAATTGTGCCTTTCTCACAGAGTAAAA 189778901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5007 CTTTGTTTAGTAATTTGCCTGGATTCCATTTGTGAATTGTGCCTTTCTCACAGAGTAAAA 5066

189778902 ATGCCAATGTCACTGATTATTTTTTATTATTCTTGTTTTAACTTTAAGTTTGTTTTCCTG 189778961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5067 ATGCCAATGTCACTGATTATTTTTTATTATTCTTGTTTTAACTTTAAGTTTGTTTTCCTG 5126

189778962 CGGGTCACTTCAGTGTCAGTACAAATTAGTGGTCGGTTCATGATTTGTGGTTGACTTTAA 189779021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5127 CGGGTCACTTCAGTGTCAGTACAAATTAGTGGTCGGTTCATGATTTGTGGTTGACTTTAA 5186

189779022 ATACCATGAACAAGTAAAGTTTCCATTCTCTGCTGATAAATCTTGTTTAGGATGGAACTA 189779081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5187 ATACCATGAACAAGTAAAGTTTCCATTCTCTGCTGATAAATCTTGTTTAGGATGGAACTA 5246

189779082 CAATAAAAAATTAGGAAGTTTACATATCTAATTTGATTTCTGCTCTCCTTCAGGCCCTCT 189779141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5247 CAATAAAAAATTAGGAAGTTTACATATCTAATTTGATTTCTGCTCTCCTTCAGGCCCTCT 5306

189779142 CTATCCCCTCTGCGTATGTGCACGGCTTCAAGTTTAGCTGAGGAAGTTTAGATTGCAAGA 189779201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5307 CTATCCCCTCTGCGTATGTGCACGGCTTCAAGTTTAGCTGTGGAAGTTTAGATTGCAAGA 5366

189779202 CCACTCCCAAATCTCTCCTATGTAGCCTTATTTGTTCATGCAGCATTCCAGACTGCCAGC 189779261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5367 CCACTCCCAAATCTCTCCTATGTAGCCTTATTTGTTCATGCAGCATTCCAGACTGCCAGC 5426

189779262 GATATATAGCATCTCGTAGAC 189779282
          |||||||||||||||||||||
     5427 GATATATAGCATCTCGTAGAC 5447

Alignment time is 5.17347 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [189761448,189787761] =>     26314 nucs '1 dna:chromosome chromosome:GRCh37:1:1:249250621:1'
Second seq [        1,     5004] =>      5004 nucs 'mol-32-34be-156705_5004'

Score:        4807
Aligned:      4997        nucs
Identic:      4974 (100%) nucs =>      1715 ( 99%)      3259 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [189771151,189772885] EXCISED REGION [189772901,189776162]
 second seq =>  [        4,     1730] EXCISED REGION [     1736,     4997]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        15 nucs [189772886,189772900]
 second seq =>         5 nucs [1731,1735]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [189772885,189772885] to [189772900,189772900]
 second seq =>         1 nucs [1731,1731] to [1736,1736]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1731,1731] to [1735,1735]

189771151 GTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAA 189771210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        4 GTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCGGTCTCAA 63

189771211 AATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGCCAAAC 189771270
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||
       64 AATAAATGAATGAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAA--------GCCAAAC 115

189771271 CAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCC 189771330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      116 CAAGTATTAGAGTAACATAACTCAGTTTTCCATTCCTCTATTCTCTTGACCCCCGTACCC 175

189771331 TAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTG 189771390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      176 TAAACTCAGCATCCTACTACCCTCCTTCAGGTAACCAATGTATCCTTCCAGAAATTTTTG 235

189771391 TTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGC 189771450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      236 TTATTGTTGTTGTTGTTGTTTCGAGACAGAGTTTTGCTCATGTTGCCCAGGCTGGAGTGC 295

189771451 AATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCC 189771510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      296 AATGGCACGATCTCAGCTCACCACAGCCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCC 355

189771511 TCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTAT 189771570
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      356 TCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATATGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTAT 415

189771571 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAG 189771630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      416 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAG 475

189771631 GTAATGCACCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCCG 189771690
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      476 GTAATGCGCCCGTCTTGGCCTCCAAAGTGCTGAGATTGCAGGCATGAGCCACCGTGCCTG 535

189771691 GCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGT 189771750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 GCCTCCTTCCAGAAATTTTGCTATGAATTTACATATTTACTTCTCATACATATATCTAGT 595

189771751 TATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAA 189771810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 TATTTCCATTACATATTGCTCTGCAACTTGCTTTTAGTTTTACACTTAGCAGTATGTCAA 655

189771811 AAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCA 189771870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 AAGTGTTTGCATGTGGATACATTTAAGTCTACCACATTCAAATAGCTGCACGGTTTCTCA 715

189771871 TATTAAGGATTGCCTTCGTCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGC 189771930
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 TATTAAGGATTGCCTTGGTCAATTTCTACTGCTATTACAGGATATCATAGACTAGATGGC 775

189771931 TTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTG 189771990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 TTGAACAACAAACATCTATTTCTCACAGTTCTGGAGGCTGAGAAGTATAAGATCAAGGTG 835

189771991 CTGGCAAATCAGGTGTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCACA 189772050
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      836 CTGGCAAATCAGGTTTCTGGTACTAATTTGCAGATTGCCATCTTCTTCTGGAGCCTCAGA 895

189772051 CAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTAT 189772110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 CAGCAGAGAGCAGAGAGAGGAAGTAAACTGTCCAGTTTCTTCTTATAGTGTCACTAGTAT 955

189772111 CATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTT 189772170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 CATTAATGAAGCCTCTATCCTCTGACTTAATTACCTGCCAAAGTACCACCTCCAAAATTT 1015

189772171 AACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTA 189772230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 AACATATGAATTCTGTGAGGACATAAATATGGAGTCCATAGTAACGATAAATCATAAGTA 1075

189772231 ATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTC 189772290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 ATTTAAGTTTTACTATTTTAGGACATTTCAAAAATTGCAAATAATATCTAATAAATGTTC 1135

189772291 TTATATAATGCAGTGTACCGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACG 189772350
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 TTATATAATGCAGTGTACTGAGTAAGAGTATGGGCTCCAGATTCAGACTTCACTGATACG 1195

189772351 CAGTAAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTATACCTCATACTTTTTTCGACAATTAG 189772410
          ||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||
     1196 CAGTGAAGTCTGTAAAAATCAGTATGAGAGTGTATGCCTCATACTTGTTTCGACAATTAG 1255

189772411 AAAATACAATGCAAATAAAGTACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAAT 189772470
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 AAAATACAATACAAATAAAGTACTTTAGCAGGACCTGGAATATACTACGTTTTCAATAAT 1315

189772471 GTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACACGGAAACAC 189772530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1316 GTGAGCTACAGCTATGGTTATATTCACAATATAAAAACTATTTCATGAACACAGAAACAC 1375

189772531 ATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTA 189772590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 ATAGTTAAACTATTTGAGAATTTCTACAGTATTTGGTAGTCATCATTGCTTTGAATCCTA 1435

189772591 CAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACC 189772650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 CAAAGCCTACCCAGGTTTTTCAGTGGCTTCCCTATCAGAAGGCCCTAGATGAGTATCACC 1495

189772651 TGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCAT 189772710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 TGCAAAGATCCTTGCTTTCTGCTATACCCCCAAACTACCACCAGTCTCCAAGGCTCCCAT 1555

189772711 GTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTT 189772770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 GTAAGCCCCACTTCACAGAGAGCCTTTCCATCGGAAACTGACAGGATAGATGGTATATTT 1615

189772771 GTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAA 189772830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 GTGAGGGCAAATATCTGGGCTGTAATGCACCGTCAGTCACTTGTGGGAACTGTAGCCTAA 1675

189772831 ATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGATTATTCTT 189772885
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 ATAGTGTACTATTTTAATATTAAATAACTGTCTAGTACCCCTTAAGATTATTCTT 1730

EXCISED REGION

189772901 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 189772960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 AGTAATTAATTAATGCAAAAACAATTATTAATATATTGCTATTATTACACACATTTTGCA 1795

189772961 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 189773020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 TGGAAAATTTATGTGAGAAATTATACTTTTTAAGGATATTTTATAGATATATAAGTAGTC 1855

189773021 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 189773080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 AGGTGTCTTATAGTAGTTTTAAGATACCATTTCATTTGGGGTGAGGACAGGCTTTTTTGT 1915

189773081 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 189773140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TTTTCTCTATTGCAAGGAACCTTAACATTGTCATATTGAAGTAAACTGTCTCATTTATTT 1975

189773141 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 189773200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 AGTTGCTTTTAATTGTTTTTTAACCTTTTTACTATTTTTAAATCAGTTTTACTATGATGT 2035

189773201 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 189773260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 TCCTATTTGTTGCTTTTTTAAAATTTATTTTTCTCATGATTCCTAGCTCTTTAAAAATTA 2095

189773261 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 189773320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 GTGAATGGAAGTCTTTCAGCAGTTTTGGATAATAAGTTGACATCATGTCATCAGTTGTTT 2155

189773321 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 189773380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 CTGCTTCCATTTCTGTATCTTCCTATTCTGGGCTCTGTTTTAGGTAGAATTCTAAGATGG 2215

189773381 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 189773440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 CCCCATGATATTTATTCTCTGTTGTTAGTACCATAATTATATAATGTGTATGGCAAAAGG 2275

189773441 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 189773500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 GATTTTGTGCTTTTATTTAAGCTCGCTTATCAGTTAACCTTAAGATACGGAGATTATTCA 2335

189773501 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 189773560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 CATAGGCCAGACATTTACATGAACACACTAAAAGTAGAGTTTTCTGGGGTCACAGAGAGA 2395

189773561 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 189773620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 AAGTCAGAGGTAGGAAGCATGATGGAAATTTGACATGAGACATCCTGCTACAGACTATGG 2455

189773621 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 189773680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 CATGAGAAAGCATGTGAGAGAGCCTGTGAGAAGGCGCATGGCCCAGAACTGCAAGTAGCC 2515

189773681 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 189773740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 AGGAGCTGAGAGTGTTTTCCAGTTCACAGCCAGCAAGAAAAAGGAGTCTGCATTCCTACC 2575

189773741 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 189773800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 ACAGCAAGGAACTAAATTCTCACAACTAGCTGAATGAGCTTGTTAGCAAATATTTATCCA 2635

189773801 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 189773860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 GAATCTCTAAGTAAGAATCCAGTTTGGCCATATCTTATTAATGTCAGCCTGTGGGACACT 2695

189773861 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 189773920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 AAGAAGAGAATCTTGTGGAGAACACCTCGATTGCTAATCTGCAAAACTGTAAGATAATAC 2755

189773921 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 189773980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 ATGGTTTTAAGCTTCTAAGTATATGGTAATTTGTTTTGCAAATTTGCAGCAATAGAAGAC 2815

189773981 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 189774040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 TAATACAGAGTTTGTTACCAAGAGTTGGGTACTATGCTTAAGAATATCTAAAAATGTGGA 2875

189774041 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 189774100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 AATGGCTTTGTAGTCAGGAAGTAGGTGGATGCTGGAAGAAAATTTGAAAAAAAAGTTTGG 2935

189774101 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 189774160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 GGAGACTACTAGAAAAATCACAGATTTCCTCAAACAGACTATTAGTAGAAAAGTAGACAT 2995

189774161 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 189774220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 CAAAGACCATGCTGGTGAGGGCTCAGAAGAAAGTAAAGGAGCATTATGAAGAAATCATAA 3055

189774221 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 189774280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 ATTGCCTAACAGAAAGCTTAAATCACAATGAACAGAATATTACCACAAATCTGGACATTA 3115

189774281 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 189774340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 AGAACATTGCCAATGATGGCTCAGAAGGAAGTAAGAAACATATTATTAGAAACTGAAGGA 3175

189774341 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 189774400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 AGGAATCATTTTGTTTTATAGTGGCAGAATCTTAGTAACATTGTGTTCTCCAGTTATTTG 3235

189774401 GAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 189774460
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 AAAAGCTAAACTTGTGAGTGATGAACCTGGGTATATAGCTAAAAAGATTTCTGAACAAAG 3295

189774461 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 189774520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 CTGGTTTCTTCTTACTGCTCATGGTATAAAGCAACAGAGGAGAGAAAATCGAGAGGACTT 3355

189774521 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 189774580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 TTGAGCAGAAATAAGCCAGGATATAATATTTTATAAATCTCAGACTCTTCTGATGGCAAA 3415

189774581 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 189774640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 GGGCCAAAAGTCAAAAGTTGCTGCCGAAAGTTTGTTATAGAGAAAAGGCTGAGTGTGTGA 3475

189774641 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 189774700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 CTATGATAATCTTTTGCTGAGATCTCAGAAAGACCAAAAGGTTAGAGTGCACACTCTGTT 3535

189774701 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 189774760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 TTAAGAGATTAAGGATATTTTTCAGAGTTCTTCTCAATGAAATCAGGGAACCTCTAGGAG 3595

189774761 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 189774820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 AAGGTAAAAGGTGTTGTCCCTCTGCCAACTGAACAGAAGCCAAAAATATAATATAAATTA 3655

189774821 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 189774880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 TATCAGACAAACATGTAGATATGGCTTATGTCTAATAAAATAAAATTCAATGTAATTAAT 3715

189774881 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 189774940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 ACAATACCCCAAAATTCTTGAGAAATTTATTGAAGTAGACATACTGTCAGTGTAGACTGA 3775

189774941 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 189775000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 AAGGGACAGAGAGAGTACCAAACGAAGGAAGGCTACTAGATACCCTAAATTCTACAGGCA 3835

189775001 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 189775060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 GGAAGCAAACTGATAAAACCACTCAGCTGTAATGCTACAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAA 3895

189775061 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 189775120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 GATGACTCAGCAGATGGAGTCAAAATCCCAGTGGCCAAAGACTAGAGCTAATGAAGATTA 3955

189775121 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 189775180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 TTTGCAGACTTTGAACTCTAATTGAAGAAATATTGCTGGAATTAGTCCAGCAATATTTTT 4015

189775181 TACGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 189775240
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 TATGGTTGAAAAATAGTGATATACTTCGAATGTTTGTCACTAACAAAATAAAAGATTTGA 4075

189775241 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 189775300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 CACAGAAAATCACAATGCAAAATAATTGTGTTATTCACAAGCTATAATATTTACAATGTT 4135

189775301 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCG 189775360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 TAAGAGAAAGGGCTCCTGTCATCTTAGGCACCTTCATGAAAATAAAGTTCTTTTCATTCG 4195

189775361 CTTAAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAA 189775420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 CTTAAAAGAACTTAAGCAAAAGTTGTGTGACGTACACATTCTTTACTCATTTTAAATTAA 4255

189775421 ATTATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCAT 189775480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 ATTATATGCAACATTATTTAAAGATAATAGCATAATTTAAATGTGAGGACCTGCTTGCAT 4315

189775481 GCCCTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTA 189775540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 GCCCTTTGATAGGCTCAAGTAAGAGACTATTATAGGAAGGTGCCCTTGAAGGGCTCCGTA 4375

189775541 GGGCTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGGTCTTGAA 189775600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4376 GGGCTCCAGTATAACCTCAACCTACCACACATGGCCATCACTCGGAAATTAGCTCTTGAA 4435

189775601 TTGGAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCC 189775660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 TTGGAAGGAGCACTAGAAAAGTATGTGTTTAAAATACACTGGAATGAATAATTTTTTTCC 4495

189775661 TAGAGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATT 189775720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 TAGAGTATTTTTAACTTTGTTTAATTGTGGTAAAATAGTCATAATGTAAAATTTACTATT 4555

189775721 GTAACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATAT 189775780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 GTAACCATTTTTAAATTTACAATTCAGGGCATTATGTATATTCACAACATTTTTGAATAT 4615

189775781 GCTGTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCC 189775840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 GCTGTTAGCACCATCCATCTCTAGAACATTTTTATCATTTCGAACTGAAAATTTACACCC 4675

189775841 AAAAAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTT 189775900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4676 AAAAAACAGTAAATCTTCATCCCTCTCTCTTCCCAGTATCTGGTAAACACTATTCTACTT 4735

189775901 TCTATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTT 189775960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 TCTATCTCTATGTATTTGCCTTTTCTATGTACCTCAGATAAGTAAAATTATGCAATATTT 4795

189775961 GCTCTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAA 189776020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4796 GCTCTTTCTTTGTGGCTAATTTCACTTAGCATAATGTTTTCAAGGTTCATCCATGTTAAA 4855

189776021 ACATGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTGGATTATATTCCTGTGTGTGTGTATGT 189776080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 ACATGTATTAGAAGTTTATTCCTTTTAAAGTCTGGATTATATTCCTGTGTGTGTGTATGT 4915

189776081 GTGTATGTATACAATATTTTATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAAGAATTTAATTTT 189776140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4916 GTGTATGTATACAATATTTTATATTTGTGTGCAAAACTGAATTCTAAAGAATTTAATTTT 4975

189776141 GCAATTACTGATTTTCCTGAGA 189776162
          ||||||||||||||||||||||
     4976 GCAATTACTGATTTTCCTGAGA 4997

Alignment time is 4.79233 s

