CRE	BC	Set	Reads_DNA	Reads_RNA1	Reads_RNA2	Reads_RNA3	Reads_RNA4	Reads_RNA5	Reads_RNA6	Reads_RNA7	Reads_RNA8	Reads_RNA9	Reads_RNA10	Reads_RNA11	Reads_RNA12
Basal	ACTACCCCAGTT	2	173	NA	446	NA	190	130	15	17	69	44	18	51	70
Basal	ATATCCGTCTGT	2	522	641	419	607	378	408	94	89	186	64	62	96	200
Basal	CCCCCCTGAATG	1	4111	381	244	663	560	206	77	77	124	99	41	154	251
Basal	CCCCGTGTGTGA	1	3324	111	540	182	176	403	73	59	143	85	31	149	164
Basal	CCCGCGCGCCCA	2	247	160	37	NA	125	138	64	48	93	88	32	106	121
Basal	CCTCGTTCGTAA	2	495	734	445	544	321	420	225	113	163	174	88	298	142
Basal	CTTCCTGGATTC	1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
Basal	GCATAAGCAATC	1	2895	463	248	NA	318	225	105	38	84	51	44	143	193
Basal	GCCCCGCCCCGC	2	369	206	541	181	55	530	70	107	125	62	62	114	213
Basal	GTTCGATCCCCC	1	2075	368	387	501	199	458	35	82	119	57	29	50	70
Basal	TCCCCCTATACA	1	3470	283	384	242	158	304	88	122	177	105	66	98	197
Basal	TCTGGCCTTCTT	2	329	616	191	491	199	396	81	79	117	70	76	195	177
Basal	TCTTCTCTTTCA	2	318	993	294	375	567	383	214	148	172	108	38	169	275
Basal	TGGTCCAGTTGC	2	261	305	227	333	11	208	175	71	140	201	33	117	257
Hsp68	ATAACAGACGGA	2	290	794	857	930	711	457	221	87	273	153	70	280	365
Hsp68	ATCGCCCGGCGG	2	300	430	1342	671	1743	895	339	179	350	258	163	398	307
Hsp68	CCAAGGGTTTCA	1	1799	191	959	671	598	296	138	65	228	124	45	259	420
Hsp68	CCCCCGCTAAGA	2	218	383	1538	1654	1009	781	397	223	470	360	147	375	449
Hsp68	CGAGAGCGTCAC	1	1091	2	4	NA	NA	2	NA	1	NA	NA	NA	NA	NA
Hsp68	CTCGTCAGTCCC	1	1353	394	235	640	1137	257	351	135	273	87	52	247	488
Hsp68	GCGCCCGCATAA	2	168	336	947	683	612	758	336	128	453	460	87	509	303
Hsp68	GCGCGGGCTGTA	2	273	520	1350	321	700	1051	572	196	450	494	138	272	475
Hsp68	GGTTGCAGATGC	2	296	968	1860	1196	1515	1373	850	251	662	679	186	726	739
Hsp68	GTATTTTCACGC	1	2306	296	680	630	1560	940	336	165	324	341	92	288	542
Hsp68	TCCAGTCATTGT	1	2925	248	1887	1580	584	913	554	208	461	313	117	961	701
Hsp68	TGTCGTCTGTAT	2	250	637	1314	1629	1334	1023	644	273	515	665	194	721	1036
Hsp68	TTCCGAGGCGTC	2	184	506	1154	1192	1528	611	454	198	442	310	107	393	249
Hsp68	TTTTTTACCGTG	1	1786	474	470	403	1092	969	547	201	538	280	108	318	471
K	ACACCATGAGGA	2	462	529	659	800	271	207	112	74	101	61	40	91	236
K	ATTGCCCTCTAT	2	304	163	211	276	192	281	126	44	158	72	88	98	222
K	CATATTCCCCCA	1	1692	58	124	201	387	273	21	46	34	19	21	64	91
K	CCATGATCGCCA	2	352	207	305	341	350	175	65	45	104	153	18	119	150
K	CCGATAGTGTGC	2	290	368	569	215	NA	585	86	75	146	25	29	267	122
K	CTTTGTTATTCG	2	322	204	293	558	338	548	178	142	156	196	92	338	294
K	GGTTGTGGGCTT	1	1751	137	68	170	99	128	56	35	99	45	57	93	94
K	GTTATGGTCGGC	2	456	651	449	1100	609	370	91	115	133	189	66	406	127
K	TAACGGGGCCGA	1	3176	133	100	121	300	117	54	37	82	54	17	53	115
K	TCAAGGGCGGGA	1	3026	88	140	196	NA	52	14	13	22	11	14	23	36
K	TCATGCCCTCTA	1	3012	103	322	133	612	259	42	59	92	97	16	46	147
K	TCTCGCGCACCG	2	316	266	467	280	72	331	158	81	161	182	28	136	180
K	TTGATAGCTAAC	1	2589	82	204	11	415	150	12	50	63	66	51	70	176
KK	ACGATGATCGGG	1	3382	372	341	411	176	174	103	70	153	107	43	257	114
KK	ACGTCCCTCACC	1	3299	424	461	406	498	518	221	123	241	126	144	384	248
KK	AGCACTGGCGAA	1	3881	470	398	326	925	135	77	75	109	90	59	307	229
KK	AGTAACGCGCCG	1	3468	253	378	308	454	91	91	30	129	117	75	302	236
KK	ATCTTCAGACTC	1	2040	277	149	416	247	429	186	81	286	99	101	234	205
KK	ATGATCAAGAGG	2	233	112	654	780	603	223	154	66	263	174	81	386	292
KK	ATGCAGCGCGCG	2	266	337	350	308	567	308	140	71	156	133	105	223	147
KK	CTAAGACATTTA	2	294	517	584	480	766	413	193	82	263	190	91	662	641
KK	CTCCTAAGGATT	1	2689	547	231	590	297	701	221	114	254	251	92	460	258
KK	GTATTCGCCCCA	2	262	276	608	230	360	360	248	124	220	178	51	381	154
KK	GTCCGTAACATA	2	491	652	978	935	840	1238	427	234	589	622	204	1249	615
KK	TACCGGCCTTAC	2	354	543	1017	268	270	773	362	191	434	341	121	510	425
KK	TATCACGGAGGC	2	377	586	1253	864	484	660	381	217	638	411	148	604	296
KK	TCATTTCGGGAC	2	372	476	303	440	407	523	255	180	326	168	113	725	454
KKK	AAAAACAGCCAC	1	2425	1298	1339	249	327	146	171	120	289	190	96	394	180
KKK	AACAGCATTGGC	2	268	845	1237	641	786	295	608	296	656	430	183	625	334
KKK	ACTGAGCGTCAT	2	409	680	1745	1097	1651	856	725	432	909	576	486	1814	447
KKK	AGCAGAAGTGGG	2	301	826	1588	609	984	779	490	256	768	373	305	985	563
KKK	AGTTCATCCGCA	1	2933	758	1147	575	334	554	579	424	717	571	277	875	247
KKK	CACGTCACTAAA	1	3713	304	1561	553	353	535	795	484	949	634	180	839	239
KKK	CCCGCAATGCCT	2	417	616	1498	941	1893	1129	1344	878	1728	1199	507	2129	880
KKK	GAAAGTTATCTG	2	113	327	715	618	401	294	198	116	405	263	67	521	287
KKK	GCAGCTATTCCT	1	3321	620	577	660	1164	534	531	560	793	603	225	1524	486
KKK	GCCACGTGCTAG	2	567	922	1642	1106	486	385	496	315	753	438	278	1552	494
KKK	GCCGTAAGATAC	1	2967	1199	1191	621	633	987	809	396	861	373	273	967	463
KKK	TCCCCCGGGGCT	1	1655	291	639	197	271	485	447	297	740	470	134	904	312
KKK	TCCGAGAGCACG	2	466	1972	2115	1549	1786	1120	878	505	1245	694	613	2548	912
KKK	TCCGCGGCGGAC	2	429	800	1903	1356	1065	1588	1352	968	1858	1271	663	2492	956
KKK	TTGTCCCCATTT	2	263	1693	1676	756	825	1780	1384	840	1772	1068	447	3238	1096
KKKK	AAAGGACAATCG	2	213	1611	2126	910	928	407	698	570	638	526	319	657	418
KKKK	AAGGGGCGCCCG	1	1687	741	552	171	320	401	398	386	411	330	205	310	144
KKKK	AATTTTAGACCC	2	242	1751	1917	961	1636	1392	1488	1091	1588	840	639	1023	724
KKKK	ACAAAAACCAGG	2	277	1982	2688	1470	1640	519	623	446	593	579	505	1297	724
KKKK	AGAACAGTCAGA	2	257	2165	2739	1640	2343	665	843	685	756	841	527	1557	778
KKKK	AGACAGTAGGGA	2	237	2435	2454	1290	1302	476	800	640	717	689	667	1192	528
KKKK	ATATCTCTCCCT	1	1846	1027	992	624	1225	387	401	447	417	272	264	776	413
KKKK	ATGCGCGCTAAA	2	386	2456	2359	1208	803	1478	1536	1631	1538	1400	782	2035	769
KKKK	ATTCCTTATTGA	2	317	1909	2229	1450	1550	1157	1314	1134	1165	1436	746	2009	845
KKKK	CATACCACTTTC	1	2734	1251	960	898	915	1024	791	641	887	761	300	1037	702
KKKK	CTCGATGAGTGA	2	452	2364	2251	1325	1972	1764	1651	1500	1919	2018	1009	3435	1466
KKKK	GACGTGTAGCCG	1	3615	889	878	102	811	684	1235	870	1006	816	500	922	490
KKKK	GCGCACTGTTGC	2	516	3535	2380	1846	1602	2897	2642	1786	2387	2337	1084	3972	931
KKKK	GGTTACGTCTGA	2	199	1851	1125	978	1249	1204	1356	918	967	962	525	1695	693
KKKK	TCCAGTGGGGCT	1	2439	1381	981	363	1002	412	719	650	642	788	361	1499	763
KKKK	TCTTACACGGTC	1	2690	1113	1269	948	1361	913	892	667	846	722	472	1230	814
KKKK	TTAGCTTATCCA	2	260	2073	1299	1053	1061	842	1166	917	981	1207	554	1763	806
Kx5	AACGACTGATTC	2	356	3526	3043	2608	2620	1019	2142	1831	1283	1968	1580	1293	865
Kx5	AATTCCCCCCTA	2	110	1530	1515	923	1092	599	1194	1015	751	1030	482	491	262
Kx5	AGAGCACGTACA	1	3264	3335	1231	1751	1562	740	1122	1051	575	838	823	980	629
Kx5	AGATTTCGGATG	1	2756	2030	1257	1242	1774	524	1137	918	513	711	865	830	487
Kx5	AGCCACGCCGTA	2	449	4093	2232	1141	1764	1487	2713	2006	1433	1800	1943	1691	1385
Kx5	AGTACTCTAATA	2	322	3662	1968	638	3045	1304	2104	1825	1325	1511	1665	2128	1410
Kx5	ATCCGCGGAGGG	2	432	3239	2071	1624	1765	1614	2418	1967	1247	2017	1382	1775	777
Kx5	ATTCAAAATAGC	2	224	4483	2178	1185	2972	1921	2203	1984	1283	1694	1485	1682	1066
Kx5	CGCGTGTCCGTC	1	3386	2981	1931	1348	2224	1392	2242	1944	1099	1277	1259	1400	725
Kx5	GAGAAGGGGGAT	1	3185	1488	1314	1124	1552	781	992	1054	593	812	551	1043	579
Kx5	GCCTTATGAAGC	1	1520	1505	1317	417	1810	784	1206	881	592	945	603	665	345
Kx5	GGTTATTCTTTT	2	100	2268	691	803	1756	956	1298	1150	720	1046	827	1191	652
Kx5	TACGATGAAGGT	2	326	2213	1021	940	1503	1031	1876	1643	1014	1637	894	1272	1084
Kx5	TCCGCTGCATTT	2	363	2987	1607	935	2014	1710	2707	2355	1404	2107	1447	2609	1219
Kx5	TGAGGTACGCCA	1	3783	2999	1227	1815	2026	1317	1941	2165	1254	1624	1129	1626	1240
Kx5	TTTTTTTGTAGA	2	208	1164	838	1081	1403	1297	2157	2056	1138	1812	1120	2106	1091
Kx6	AAGACACAATAT	1	1659	1982	818	846	1180	521	809	858	316	681	474	390	424
Kx6	ACAGCAGTTGAC	2	477	4837	3020	3380	2872	1872	2575	2570	1046	2279	1891	1292	1442
Kx6	ACTATCCAACGA	2	448	6630	2439	3066	3664	1536	2807	2525	941	2140	2574	2523	1877
Kx6	ATAGACGTCAGG	2	352	6142	2744	1723	2798	1221	1690	1517	662	1309	1369	1117	1227
Kx6	CACTTTCATTTT	2	102	1368	564	567	702	942	1362	1180	535	1189	522	464	320
Kx6	CCATCCACACGC	2	302	3488	1136	2528	1886	1185	2019	2050	688	1529	902	1349	1053
Kx6	CCTTGTAAACGT	2	268	3244	1779	1278	2363	1704	3158	2716	1176	3213	1474	1899	1074
Kx6	CTATACGCGCAC	2	560	6900	2751	1716	4075	2742	3856	3747	1362	2638	2148	3120	1960
Kx6	GAACGTTGCGAT	1	3200	4252	725	439	1679	889	1484	1658	564	1456	740	539	636
Kx6	GCCTATTGGACC	1	2409	1868	339	571	1929	804	1555	1582	477	1187	1012	895	639
Kx6	GTCATACTTTTA	1	1931	2061	830	677	1166	958	1166	1189	530	990	887	992	677
Kx6	TAATGTCCGTTA	2	331	5401	1207	1575	2512	1703	3364	3147	1168	2873	1147	1242	1163
Kx6	TATCAGGACCAG	2	261	3385	1933	1511	1455	1601	1806	1790	732	1697	1003	867	962
Kx6	TATGGGGCCTCG	1	1888	1549	428	468	711	600	1006	1083	382	874	425	370	372
Kx6	TTCGAATCACAC	2	392	5619	2290	2417	5023	2534	3566	3527	1257	3092	2994	2689	1919
Kx6	TTTCAAAACGGC	1	1786	3164	1952	1451	1888	1101	1706	2064	700	1191	1069	885	603
SV40	ATCTTGCAAGTG	2	332	2817	7076	6137	5907	2916	2078	840	1880	1536	961	2551	1970
SV40	CAACGACGGTCT	2	199	1581	4111	3060	2758	1972	1164	491	1199	744	235	928	1070
SV40	CAGTGACGGGCG	1	2304	1663	4953	2948	3004	3211	1702	830	2074	1532	399	1100	1152
SV40	CCACATGGTTAA	1	2522	2081	5083	4156	3722	1859	1236	511	1392	920	539	2332	2059
SV40	CCCGCAAACAAG	1	3665	3267	7764	6351	5333	5742	3760	1148	3167	2417	922	3167	3292
SV40	CGCCGCGGGCCT	2	185	2642	3626	2449	3069	3238	2110	840	1801	1612	525	2076	1888
SV40	GAAGAAGAGAAC	2	170	2336	7382	5601	6809	2398	1764	591	1793	1201	489	1974	2700
SV40	GACGTTGAATCT	2	306	2098	5032	3997	5672	4355	2854	1124	2693	1812	659	2274	2240
SV40	GCCCTATGGGAG	1	2508	2017	4031	3395	3368	2877	2461	959	1969	1400	705	2344	1825
SV40	GCTAAGAAGGGC	2	197	2398	6856	4133	4614	2240	1498	546	1371	914	668	2605	2706
SV40	TACTTAATGCGG	1	2321	1403	3911	4104	2891	2783	2544	896	2127	1576	517	1225	1713
SV40	TATTTCCGATGG	2	282	2625	5105	5449	4796	3443	2497	1051	2293	1638	624	1938	2032
SV40	TTCAACCGGAGG	1	2350	1659	5156	4634	3925	1652	1114	501	1055	748	650	3196	1621