# Header
## MMP Supplementary Table 5: Parental SNVs
## $1 = chromosome
## $2 = coordinate
## $3 = reference allele
## $4 = reference allele percentage
## $5 = all MQ>=30 A:C:G:T
## $6 = all MQ>=30 A:C:G:T by percentage
# End Header
I	200948	a	0.237	38:1:1:16025	0.237:0.006:0.006:99.751
I	200949	c	0.191	1:31:0:16212	0.006:0.191:0.000:99.803
I	316117	t	0.057	0:0:20996:12	0.000:0.000:99.943:0.057
I	361325	c	0.005	21337:1:0:1	99.991:0.005:0.000:0.005
I	369897	t	0.243	6:13138:1:32	0.046:99.704:0.008:0.243
I	670239	c	1.307	1:12:2:903	0.109:1.307:0.218:98.366
I	670370	c	0.446	3:27:41:5978	0.050:0.446:0.678:98.826
I	670462	c	0.000	3:0:0:0	100.000:0.000:0.000:0.000
I	670464	t	0.000	1:0:0:0	100.000:0.000:0.000:0.000
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I	714648	g	1.252	2:8828:112:1	0.022:98.714:1.252:0.011
I	714649	c	1.356	3:120:8725:1	0.034:1.356:98.599:0.011
I	732640	t	0.076	0:2:22214:17	0.000:0.009:99.915:0.076
I	968803	g	0.016	4:18671:3:0	0.021:99.963:0.016:0.000
I	1028161	c	0.000	0:0:0:877	0.000:0.000:0.000:100.000
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I	1028196	c	0.116	0:2:0:1727	0.000:0.116:0.000:99.884
I	1100873	t	0.269	0:0:2967:8	0.000:0.000:99.731:0.269
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I	1142104	c	0.028	21341:6:2:0	99.963:0.028:0.009:0.000
I	1144364	c	4.113	0:303:7062:2	0.000:4.113:95.860:0.027
I	1144430	a	1.951	229:11506:2:0	1.951:98.032:0.017:0.000
I	1144435	c	1.709	11500:200:0:1	98.282:1.709:0.000:0.009
I	1144437	g	1.569	0:1:194:12167	0.000:0.008:1.569:98.423
I	1318207	c	2.517	1:65:0:2516	0.039:2.517:0.000:97.444
I	1335730	a	0.049	7:14421:2:1	0.049:99.931:0.014:0.007
I	1348039	g	0.000	0:1:0:83	0.000:1.190:0.000:98.810
I	1348040	t	0.000	0:3:0:0	0.000:100.000:0.000:0.000
I	1348044	g	0.704	1:140:1:0	0.704:98.592:0.704:0.000
I	1388460	c	1.205	0:1:0:82	0.000:1.205:0.000:98.795
I	1440203	g	4.184	0:0:10:229	0.000:0.000:4.184:95.816
I	1580681	a	1.449	3:0:204:0	1.449:0.000:98.551:0.000
I	1580682	t	0.629	156:1:1:1	98.113:0.629:0.629:0.629
I	1864005	t	0.013	5:15882:0:2	0.031:99.956:0.000:0.013
I	2379644	c	0.005	0:1:1:20226	0.000:0.005:0.005:99.990
I	2470151	a	0.266	31:1:1:11610	0.266:0.009:0.009:99.717
I	2579330	a	0.010	2:2:0:19800	0.010:0.010:0.000:99.980
I	2710698	t	0.051	8:21643:2:11	0.037:99.903:0.009:0.051
I	2713230	a	0.167	37:2:0:22176	0.167:0.009:0.000:99.824
I	2777374	c	0.016	0:2:12618:2	0.000:0.016:99.968:0.016
I	2889895	a	0.087	14:0:16088:3	0.087:0.000:99.894:0.019
I	3146646	c	0.164	0:23:0:14044	0.000:0.164:0.000:99.836
I	3259182	c	3.682	3:162:1:4234	0.068:3.682:0.023:96.227
I	3700304	a	2.390	580:2:23681:5	2.390:0.008:97.581:0.021
I	3885009	a	0.011	2:3:17839:2	0.011:0.017:99.961:0.011
I	3885021	a	0.005	1:0:19087:2	0.005:0.000:99.984:0.010
I	3935099	t	0.020	1:14905:0:3	0.007:99.973:0.000:0.020
I	3935122	a	0.140	19:13591:0:2	0.140:99.846:0.000:0.015
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I	4187037	c	0.775	0:1:0:128	0.000:0.775:0.000:99.225
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I	4345302	g	0.000	1:0:0:0	100.000:0.000:0.000:0.000
I	4359199	t	0.050	5:22066:2:11	0.023:99.918:0.009:0.050
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I	4503136	g	0.081	17280:2:14:0	99.907:0.012:0.081:0.000
I	4542355	g	1.053	373:2:4:1	98.158:0.526:1.053:0.263
I	4543768	g	0.309	14503:8:45:0	99.636:0.055:0.309:0.000
I	4544031	a	3.753	713:3:18108:175	3.753:0.016:95.310:0.921
I	4546400	g	0.898	1:25:15:1630	0.060:1.496:0.898:97.546
I	4719685	c	0.446	1:10:2231:1	0.045:0.446:99.465:0.045
I	5151869	g	3.221	8432:1:281:10	96.653:0.011:3.221:0.115
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I	5448372	a	0.000	0:2:2:22547	0.000:0.009:0.009:99.982
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I	6163210	t	0.008	24199:0:2:2	99.983:0.000:0.008:0.008
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I	11905378	t	0.008	4:12624:1:1	0.032:99.952:0.008:0.008
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