BLASTN 2.2.23+ Query= ERCC-00002_genbank |92111308|gb|DQ459430.1| Synthetic construct microarray control MC28 mRNA, complete sequence Length=1134 Subject= ERCC-00002 Length=1061 Score = 1919 bits (1039), Expect = 0.0 Identities = 1055/1062 (99%), Gaps = 3/1062 (0%) Strand=Plus/Plus Query 69 TCCAGATTACTTCCATTTCCGCCCAAGCTGCTCACAGTATACGGGCGTCGGCATCCAGAC 128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TCCAGATTACTTCCATTTCCGCCCAAGCTGCTCACAGTATACGGGCGTCGGCATCCAGAC 60 Query 129 CGTCGGCTGATCGTAGTTTTACTAGGCTAGACTAGCGTACGAGCACTATGGTCAGTAATT 188 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CGTCGGCTGATCGTGGTTTTACTAGGCTAGACTAGCGTACGAGCACTATGGTCAGTAATT 120 Query 189 CCTGGAGGAATAGGTACCAAGaaaaaaaCGAACCTTTGGGTTCCAGAGCTGTACGGTCGC 248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CCTGGAGGAATAGGTACCAAGAAAAAAACGAACCTTTGGGTTCCAGAGCTGTACGGTCGC 180 Query 249 ACTGAACTCGGATAGGTCTCAGAAAAACGAAATATAGGCTTACGGTAGGTCCGAATGGCA 308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ACTGAACTCGGATAGGTCTCAGAAAAACGAAATATAGGCTTACGGTAGGTCCGAATGGCA 240 Query 309 CAAAGCTTGTTCCGTTAGCTGGCATAAGATTCCATGCCTAGATGTGATACACGTTTCTGG 368 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CAAAGCTTGTTCCGTTAGCTGGCATAAGATTCCATGCCTAGATGTGATACACGTTTCTGG 300 Query 369 AAACTGCCTCGTCATGCGACTGTTCCCCGGGGTCAGGGCCGCTGGTATTTGCTGTAAAGA 428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 AAACTGCCTCGTCATGCGACTGTTCCCCGGGGTCAGGGCCGCTGGTATTTGCTGTAAAGA 360 Query 429 GGGGCGTTGAGTCCGTCCGACTTCACTGCCCCCTTTCAGCCTTTTGGGTCCTGTATCCCA 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GGGGCGTTGAGTCCGTCCGACTTCACTGCCCCCTTTCAGCCTTTTGGGTCCTGTATCCCA 420 Query 489 ATTCTCAGAGGTCCCGCCGTACGCTGAGGACCACCTGAAACGGGCATCGTCGCTCTTCGT 548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 ATTCTCAGAGGTCCCGCCGTACGCTGAGGACCACCTGAAACGGGCATCGTCGCTCTTCGT 480 Query 549 TGTTCGTCGACTTCTAGTGTGGAGACGAATTGCCAGAATTATTAACTGCGCAGTTAGGGC 608 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TGTTCGTCGACTTCTAGTGTGGAGACGAATTGCCAGAATTATTAACTGCGCAGTTAGGGC 540 Query 609 AGCGTCTGCGGAAGTTTGCTGCGGTTTCCGCCTTGACCGCGGGAAGGAGACATAACGATA 668 |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 AGCGTCTGAGGAAGTTTGCTGCGGTTTC-GCCTTGACCGCGGGAAGGAGACATAACGATA 599 Query 669 GCGACTCTGTCTCAGCGGATCTGCATATGTTTGCAGCATACTTTAG-TGGGCCTTGGCTT 727 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 600 GCGACTCTGTCTCAGGGGATCTGCATATGTTTGCAGCATACTTTAGGTGGGCCTTGGCTT 659 Query 728 CCTTCCGCAGTCAAAACCGCGCAATTATCCCCGTCCTGATTTACTGGACTCGCAACGTGG 787 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 CCTTCCGCAGTCAAAACCGCGCAATTATCCCCGTCCTGATTTACTGGACTCGCAACGTGG 719 Query 788 GTCCATCAGTTGTCCGTATACCAAGACGTCTAAGGGCGGTGTACACCCTTTTGAGCAATG 847 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 GTCCATCAGTTGTCCGTATACCAAGACGTCTAAGGGCGGTGTACACCCTTTTGAGCAATG 779 Query 848 ATTGCACAACCTGCGATCACCTTATACAGAATTATCAATCAAGCTCCCCGAGGAGCGGAC 907 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 ATTGCACAACCTGCGATCACCTTATACAGAATTATCAATCAAGCTCCCCGAGGAGCGGAC 839 Query 908 TTGTAAGGACCGCTGCTTTCGCTCGGGTCTGCGGGTTATAGCTTTTCAGTC-CGACGGGC 966 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 840 TTGTAAGGACCGCCGCTTTCGCTCGGGTCTGCGGGTTATAGCTTTTCAGTCTCGACGGGC 899 Query 967 TAGCACACATCTGGTTGACTAGGCGCATAGTCGCCATTCACAGATTTGCTCGGCAATCAG 1026 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 TAGCACACATCTGGTTGACTAGGCGCATAGTCGCCATTCACAGATTTGCTCGGCAATCAG 959 Query 1027 TACTGGTAGGCGTTAGACCCCGTGACTCGTGGCTGAACGGCCGTACAACTCGACAGCCGG 1086 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 960 TACTGGTAGGCGTTAGACCCCGTGACTCGTGGCTGAACGGCCGTACAACTCGACAGCCGG 1019 Query 1087 TGCTTGCGTTTTACCCTTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1020 TGCTTGCGTTTTACCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1061 Query= ERCC-00003_genbank |103488731|gb|DQ516784.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-67 genomic sequence Length=1000 Subject= ERCC-00003 Length=1023 Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0 Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CAGCAGCGATTAAGGCAGAGGCGTTTGTATCTGCCATTATAAAGAAGTTTCCTCCAGCAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CAGCAGCGATTAAGGCAGAGGCGTTTGTATCTGCCATTATAAAGAAGTTTCCTCCAGCAA 60 Query 61 CTCCTTTCTTAATTCCAAACTTAGCTTCAGTTATAAATTCCCCTCCCATGATTGGGATTT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CTCCTTTCTTAATTCCAAACTTAGCTTCAGTTATAAATTCCCCTCCCATGATTGGGATTT 120 Query 121 TATAAACTTTTCTTCCATATAATTCATCTTTCTTCTCATAACCGTCTCCGAAAAACTTCA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TATAAACTTTTCTTCCATATAATTCATCTTTCTTCTCATAACCGTCTCCGAAAAACTTCA 180 Query 181 ACTTAAATCCAACCTTTAACTGCTCATCAGCCATGTCTCCCATAGCATCAAAAATAGCAG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ACTTAAATCCAACCTTTAACTGCTCATCAGCCATGTCTCCCATAGCATCAAAAATAGCAG 240 Query 241 TTGTTGGACATGTTAAGACACACTGCCCCAATCTCTCTAACATTTGATGCTCTAACTCTG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TTGTTGGACATGTTAAGACACACTGCCCCAATCTCTCTAACATTTGATGCTCTAACTCTG 300 Query 301 ACTTTTTAGGGTGGCATATCTGTATTATAAATCCTGGTCTTCCATCTGGTGTTTTTGATG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ACTTTTTAGGGTGGCATATCTGTATTATAAATCCTGGTCTTCCATCTGGTGTTTTTGATG 360 Query 361 GAGGGACATATTTCTCAATTCCTGCTTCTGCTGGACACATTATAACTGAACAACCAAAAC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GAGGGACATATTTCTCAATTCCTGCTTCTGCTGGACACATTATAACTGAACAACCAAAAC 420 Query 421 CTGTTGCCTCTGTAGCTGCAATCTTAGCCCACTTCTTTGTAGCTGCTGTTATTAAAACTC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CTGTTGCCTCTGTAGCTGCAATCTTAGCCCACTTCTTTGTAGCTGCTGTTATTAAAACTC 480 Query 481 TTGAAACCCATATTGGGAATGCTTCTGCAAATGTATCTTCAATATATACTCCATTTATTT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TTGAAACCCATATTGGGAATGCTTCTGCAAATGTATCTTCAATATATACTCCATTTATTT 540 Query 541 CCATAGTTTCCCTCCATTAAGATTTTAACAATTATAGTTTATCTTAGGGGCTATTAATAT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CCATAGTTTCCCTCCATTAAGATTTTAACAATTATAGTTTATCTTAGGGGCTATTAATAT 600 Query 601 CTTATCATTTGGtttttaatattcgataaatccataaataaaaatatatcaacaataatt 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 CTTATCATTTGGTTTTTAATATTCGATAAATCCATAAATAAAAATATATCAACAATAATT 660 Query 661 ttaaataatctaagtataggtaatataacaattaaaaaGATTTAGAGGGATAGAATTGAA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 TTAAATAATCTAAGTATAGGTAATATAACAATTAAAAAGATTTAGAGGGATAGAATTGAA 720 Query 721 CGGCATTAGGAGAATTGTTTTAGATATATTGAAGCCGCATGAGCCAAAAATAACAGATAT 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 CGGCATTAGGAGAATTGTTTTAGATATATTGAAGCCGCATGAGCCAAAAATAACAGATAT 780 Query 781 GGCATTAAAATTAACATCATTATCAAACATTGATGGGGTTAATATTACAGTCTATGAAAT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 GGCATTAAAATTAACATCATTATCAAACATTGATGGGGTTAATATTACAGTCTATGAAAT 840 Query 841 AGATAAAGAGACTGAGAATGTTAAAGTTACAATTGAAGGGAATAATTTAGATTTTGATGA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 AGATAAAGAGACTGAGAATGTTAAAGTTACAATTGAAGGGAATAATTTAGATTTTGATGA 900 Query 901 GATTCAGGAAATTATTGAAAGTTTGGGAGGGACTATTCACAGTATAGATGAGGTTGTTGC 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 GATTCAGGAAATTATTGAAAGTTTGGGAGGGACTATTCACAGTATAGATGAGGTTGTTGC 960 Query 961 AGGTAAAAAGATTATTGAAGAAGTTAGAACACCACAAGAT 1000 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 961 AGGTAAAAAGATTATTGAAGA-GTTAGAACACCACAAGAT 999 Query= ERCC-00004_genbank |103488699|gb|DQ516752.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-500-35 genomic sequence Length=500 Subject= ERCC-00004 Length=523 Score = 917 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 499/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TCTTGCTTCAACAATAACGTCTCTTTCAGAAGGCATTGGTATCTTTTCCCCACTTCCAAG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TCTTGCTTCAACAATAACGTCTCTTTCAGAAGGCATTGGTATCTTTTCCCCACTTCCAAG 60 Query 61 CATTTTTTCAACTAATCTTATGTTATTAACCATTTCCTTAAATTCTTCTGGGTCTGCTGA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CATTTTTTCAACTAATCTTATGTTATTAACCATTTCCTTAAATTCTTCTGGGTCTGCTGA 120 Query 121 CAAAGCATGATCAGGACCTTCCATATTTTTATCTAAGGTAAAGTGCTTCTCAATAACATC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CAAAGCATGATCAGGACCTTCCATATTTTTATCTAAGGTAAAGTGCTTCTCAATAACATC 180 Query 181 CGCTCCTAAGGCAACAGAAACTACTGGGGCGAGTATTCCCAATGTATGGTCAGAATATCC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CGCTCCTAAGGCAACAGAAACTACTGGGGCGAGTATTCCCAATGTATGGTCAGAATATCC 240 Query 241 CACAGGGATATTGAATATACTTTTCAAGGTTTTAATAGCGTTTAAATTGACATCTTCATA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CACAGGGATATTGAATATACTTTTCAAGGTTTTAATAGCGTTTAAATTGACATCTTCATA 300 Query 301 AGGGGTTGGGTAAGATGAAATACAATGCAATAAAATAATATCCCTGCATCCATTATTTTC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 AGGGGTTGGGTAAGATGAAATACAATGCAATAAAATAATATCCCTGCATCCATTATTTTC 360 Query 361 TAAAACTTTAACTGCTTCCCAAATTTCCCCAATATCAGACATTCCTGTAGATAAAATCAC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TAAAACTTTAACTGCTTCCCAAATTTCCCCAATATCAGACATTCCTGTAGATAAAATCAC 420 Query 421 CGGCTTGCCTGTTTTTGCCACTTTTTCTAATAAGGGATAAAAGGTTAAATCACCAGAGGC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CGGCTTGCCTGTTTTTGCCACTTTTTCTAATAAGGGATAAAAGGTTAAATCACCAGAGGC 480 Query 481 AATTTTAAATGCAGGCACAT 500 |||||||||| ||||||||| Sbjct 481 AATTTTAAAT-CAGGCACAT 499 Query= ERCC-00007_genbank |116733904|gb|EF011068.1| Synthetic construct spike-in microarray control hypothetical protein (ysdC) gene, complete cds Length=1121 Score = 2052 bits (1111), Expect = 0.0 Identities = 1111/1111 (100%), Gaps = 0/1111 (0%) Strand=Plus/Plus Query 10 TTTATTGGTACGTAATTTCGTCAACCGTTTTTCGGTCTAACTTCTTAATGACTTCTGTAA 69 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TTTATTGGTACGTAATTTCGTCAACCGTTTTTCGGTCTAACTTCTTAATGACTTCTGTAA 60 Query 70 TTAACTTTACCGCGTTTTCATAATCATCACGATGCAGCATGGCCGCGTGCGTATGAATGT 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TTAACTTTACCGCGTTTTCATAATCATCACGATGCAGCATGGCCGCGTGCGTATGAATGT 120 Query 130 AGCGGGTTGCAATGGTAATGGACAGCGCAGGAACGCCATTTGCCGTCAAATGGATGGCAC 189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AGCGGGTTGCAATGGTAATGGACAGCGCAGGAACGCCATTTGCCGTCAAATGGATGGCAC 180 Query 190 CCGAATCAGTTCCGCCGCCGGCAATGGCATCAAATTGGTACGGAATGCCGGCTTCCTCCG 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CCGAATCAGTTCCGCCGCCGGCAATGGCATCAAATTGGTACGGAATGCCGGCTTCCTCCG 240 Query 250 CAGTGGCTACAACTGCATCGCGCAAACCTTTGTGAGAGACCATGGATGCATCGTAAACGA 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CAGTGGCTACAACTGCATCGCGCAAACCTTTGTGAGAGACCATGGATGCATCGTAAACGA 300 Query 310 TAATCTGCGGGCCTTTGCCCATTTTGCTCTGCGCTTCCTTCTCGGAAATGCCAGGCGTGT 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TAATCTGCGGGCCTTTGCCCATTTTGCTCTGCGCTTCCTTCTCGGAAATGCCAGGCGTGT 360 Query 370 CTCCTGCTATCCCTACATCAACACCAAACGCAATATCAGGCTGAATGGTGTGTGCAGCCG 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CTCCTGCTATCCCTACATCAACACCAAACGCAATATCAGGCTGAATGGTGTGTGCAGCCG 420 Query 430 TTTTCGCTCCCCTCAGCCCGACTTCCTCCTGCACGGTTCCGACGCCATACACTATATTTG 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TTTTCGCTCCCCTCAGCCCGACTTCCTCCTGCACGGTTCCGACGCCATACACTATATTTG 480 Query 490 GATGATCTGTGTTTTGTAAGTTTCTTAACACATCAATAGCAATCGCACAGCCGATGCGGT 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GATGATCTGTGTTTTGTAAGTTTCTTAACACATCAATAGCAATCGCACAGCCGATGCGGT 540 Query 550 TGTCCCAGGCCTTTGCGAGTAGGAATTTTTCATTGTTCATGACCGTAAATTCAAAATGCG 609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TGTCCCAGGCCTTTGCGAGTAGGAATTTTTCATTGTTCATGACCGTAAATTCAAAATGCG 600 Query 610 GAACGATCATATCTCCCGGAAGTACACCCCACTCCAAGGCTTCTTCCCGGCTTGAAGCTC 669 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GAACGATCATATCTCCCGGAAGTACACCCCACTCCAAGGCTTCTTCCCGGCTTGAAGCTC 660 Query 670 CAATATCAATAAACATGTCTTTTATTTCCACTGAtttttttCTTGCTTCAGGAGACAAAA 729 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CAATATCAATAAACATGTCTTTTATTTCCACTGATTTTTTTCTTGCTTCAGGAGACAAAA 720 Query 730 TATGAGGCGGCTTAGATCCGATAACCCCTGTGATTTCTCCtttttttGTGACAATGGTGA 789 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 TATGAGGCGGCTTAGATCCGATAACCCCTGTGATTTCTCCTTTTTTTGTGACAATGGTGA 780 Query 790 CGCGCTGAGCAAGCATAACCTGAGCCCACCAGCCGCCAACGGTTTGAAAACGGATAAAGC 849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 CGCGCTGAGCAAGCATAACCTGAGCCCACCAGCCGCCAACGGTTTGAAAACGGATAAAGC 840 Query 850 CTTTATCTGTGATTTGTGTCACCATAAAGCCGACTTCATCCAAATGTCCGGCGATCATAA 909 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 CTTTATCTGTGATTTGTGTCACCATAAAGCCGACTTCATCCAAATGTCCGGCGATCATAA 900 Query 910 TTTTCGGGCCGTTTTCTGCACCAGttttttttGCAATTAAACTGCCCAGGCGATCTGTTG 969 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 TTTTCGGGCCGTTTTCTGCACCAGTTTTTTTTGCAATTAAACTGCCCAGGCGATCTGTTG 960 Query 970 TCACCTCATCAGCAAATGGTTCTATGTATGATTTCATCACTTGCCTTACTTCTCTTTCAT 1029 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 TCACCTCATCAGCAAATGGTTCTATGTATGATTTCATCACTTGCCTTACTTCTCTTTCAT 1020 Query 1030 TGCCCGGTATGCCTTTTGCATCTGTTAAATCTTTCAGCATGGTCAATGTTTCATCTAATT 1089 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 TGCCCGGTATGCCTTTTGCATCTGTTAAATCTTTCAGCATGGTCAATGTTTCATCTAATT 1080 Query 1090 TTGCCATGTTCCAAACCCTCCTTGAGCTCGG 1120 ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 TTGCCATGTTCCAAACCCTCCTTGAGCTCGG 1111 Query= ERCC-00009_genbank |110339337|gb|DQ668364.1| Synthetic construct clone TagJ microarray control Length=960 Subject= ERCC-00009 Length=984 Score = 1773 bits (960), Expect = 0.0 Identities = 960/960 (100%), Gaps = 0/960 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 CAATGATAGGCTAGTCTCGCGCAGTACATGGTAGTTCAGCCAATAGATGCCTAGTACGCT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 984 CAATGATAGGCTAGTCTCGCGCAGTACATGGTAGTTCAGCCAATAGATGCCTAGTACGCT 925 Query 61 GACGGCATTCAGAGTACGCTGATCGGCTTATGACGTATGTGACGCAGCTCTTAGCGCAAT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 924 GACGGCATTCAGAGTACGCTGATCGGCTTATGACGTATGTGACGCAGCTCTTAGCGCAAT 865 Query 121 GTATGTGCTGTTATCGAAGCCTATGGCTGAGTATGTAACGCTATGGCGTGCTAGTCGTCT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 864 GTATGTGCTGTTATCGAAGCCTATGGCTGAGTATGTAACGCTATGGCGTGCTAGTCGTCT 805 Query 181 CATATACGTCTGATGACCTCGTATCATGTTATAGGGCTGCGAACTGTCGATGATGGTCAC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 804 CATATACGTCTGATGACCTCGTATCATGTTATAGGGCTGCGAACTGTCGATGATGGTCAC 745 Query 241 GACTCTGTCGATAGCTGTGTGACTCATTCAGAAGGTGTGCAGCCTATATGATACGCAGTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 744 GACTCTGTCGATAGCTGTGTGACTCATTCAGAAGGTGTGCAGCCTATATGATACGCAGTC 685 Query 301 GCATCCTATCTTACGTGTCAGTACTATGTGTGAGTGCTCCGCCCTAGTGCTGATGTATGC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 684 GCATCCTATCTTACGTGTCAGTACTATGTGTGAGTGCTCCGCCCTAGTGCTGATGTATGC 625 Query 361 CCCATAGTGCTCAGTGGAGTCTCTCTTAGCATAGTGTCCGCTCATACATTAGATGGACGG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 624 CCCATAGTGCTCAGTGGAGTCTCTCTTAGCATAGTGTCCGCTCATACATTAGATGGACGG 565 Query 421 CTCATTAGTATCATCGTCGGCTGATATAGGTCGTGGCTCCCTGTATATCGAGGTGAGTCT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 564 CTCATTAGTATCATCGTCGGCTGATATAGGTCGTGGCTCCCTGTATATCGAGGTGAGTCT 505 Query 481 ATCTGGATCAACGTCGCACTATGATGTGCAAAGTGTCGTCCATGTATAGACAGTGCGCGT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 504 ATCTGGATCAACGTCGCACTATGATGTGCAAAGTGTCGTCCATGTATAGACAGTGCGCGT 445 Query 541 ATCATATAGGATGCGGCGATCTCATACAGCGTTACGGTCGCTGCGTACTGTATAAGGATG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 444 ATCATATAGGATGCGGCGATCTCATACAGCGTTACGGTCGCTGCGTACTGTATAAGGATG 385 Query 601 CTCTGTGAACTGTCATCGGTCCGATCAATTAGTCTAGTGTGCGTTATTCAGATCGAGTGA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 384 CTCTGTGAACTGTCATCGGTCCGATCAATTAGTCTAGTGTGCGTTATTCAGATCGAGTGA 325 Query 661 GTACATGATTCGTCAGTGTGGATCAATTACAGTTAGGCCGCTGACACATTAGTAACGTCG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 324 GTACATGATTCGTCAGTGTGGATCAATTACAGTTAGGCCGCTGACACATTAGTAACGTCG 265 Query 721 GCAAGCACTTAGTCGTGTCGTAAGCCAGTGTGTCGTGTCTTAGACGACTGTGTGTGATTC 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 264 GCAAGCACTTAGTCGTGTCGTAAGCCAGTGTGTCGTGTCTTAGACGACTGTGTGTGATTC 205 Query 781 TCGAGCGATTTATACATCCGTGACAGCGTTTATAGTGTGCTGACAGACTGGTTGGTTATC 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 204 TCGAGCGATTTATACATCCGTGACAGCGTTTATAGTGTGCTGACAGACTGGTTGGTTATC 145 Query 841 CAATGATCGACCTGGAGTCTAATATCTGACCACGCCTTGTAATCGTATGACACGCGCTTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 144 CAATGATCGACCTGGAGTCTAATATCTGACCACGCCTTGTAATCGTATGACACGCGCTTG 85 Query 901 ACACGACTGAATCCAGCTTAAGAGCCCTGCAACGCGATATACAGGCGCTGCTACCGATAT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 84 ACACGACTGAATCCAGCTTAAGAGCCCTGCAACGCGATATACAGGCGCTGCTACCGATAT 25 Query= ERCC-00012_genbank |114976952|gb|DQ883670.2| Synthetic construct clone NISTag29 external RNA control sequence Length=1000 Subject= ERCC-00012 Length=994 Score = 1836 bits (994), Expect = 0.0 Identities = 994/994 (100%), Gaps = 0/994 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CGAGAGATGTTTGTAGGTGCGGAATGTGTGCGGTCTACCTTAGCTGTAGTGTGCGATGAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CGAGAGATGTTTGTAGGTGCGGAATGTGTGCGGTCTACCTTAGCTGTAGTGTGCGATGAA 60 Query 61 CCTACACACAACGTGGTATAGTGGCCGATCTTAGAGTGATCCTATCACTCCTTACGCACC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CCTACACACAACGTGGTATAGTGGCCGATCTTAGAGTGATCCTATCACTCCTTACGCACC 120 Query 121 AGAAGGGATCTGCATACCAGGCGGAGAACTTGGAAGGCGGCTAGATCACTGAATTGCGGG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AGAAGGGATCTGCATACCAGGCGGAGAACTTGGAAGGCGGCTAGATCACTGAATTGCGGG 180 Query 181 AATCGGCATTTCGCATTCTTAGGATCTAAACCTTAGACCTCCGCGTGCGATTGCACCTGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 AATCGGCATTTCGCATTCTTAGGATCTAAACCTTAGACCTCCGCGTGCGATTGCACCTGC 240 Query 241 TTGGTACAGAGTTACAAGCCCCCCGCACTTTCTTTGCGGTCGTTAAGAGGGAAATCGCCC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TTGGTACAGAGTTACAAGCCCCCCGCACTTTCTTTGCGGTCGTTAAGAGGGAAATCGCCC 300 Query 301 AATTAGCAGAGTGTCAGGTGTTACGCGCGATTGAGCCGTCAGAAGAATCGATAGAGCCGC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 AATTAGCAGAGTGTCAGGTGTTACGCGCGATTGAGCCGTCAGAAGAATCGATAGAGCCGC 360 Query 361 GTCGGGACCTTGATGGTATCTCTGCCTCAGCTAACCTGCTAGGTCCGTCCCCTGGGGATG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GTCGGGACCTTGATGGTATCTCTGCCTCAGCTAACCTGCTAGGTCCGTCCCCTGGGGATG 420 Query 421 ATCAGGACTGCGGATAGTAAATTGCGGGTTTGAAGCCGGACTTGCCGCCTAGGCAAAGCA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 ATCAGGACTGCGGATAGTAAATTGCGGGTTTGAAGCCGGACTTGCCGCCTAGGCAAAGCA 480 Query 481 CAAAAACATCGGACATGTAGAAGTCTCATCGAACTCCTTTCCCGTTCATGCAGATACTTC 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 CAAAAACATCGGACATGTAGAAGTCTCATCGAACTCCTTTCCCGTTCATGCAGATACTTC 540 Query 541 AACTGTGACTAGTGGGGTTCGGGAGCACCCGCACTACTTCATTCTTGGCGGTGGGCCACT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 AACTGTGACTAGTGGGGTTCGGGAGCACCCGCACTACTTCATTCTTGGCGGTGGGCCACT 600 Query 601 TTATGTGACTGTACATGGGACTTCTACTCATACCAATGTAAAGTATAGTTAACGCCCTGT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TTATGTGACTGTACATGGGACTTCTACTCATACCAATGTAAAGTATAGTTAACGCCCTGT 660 Query 661 CCACTCTACTCAGGCGTAATCATCGCGGAAGGCTATCCACAGCCCATCAGCGGTCTACAT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CCACTCTACTCAGGCGTAATCATCGCGGAAGGCTATCCACAGCCCATCAGCGGTCTACAT 720 Query 721 GTCCCAGCAGATTCACCTGTCCTGCGGGTCCGCGTCACAGCCTATTCTGAGGCTCTAAAG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GTCCCAGCAGATTCACCTGTCCTGCGGGTCCGCGTCACAGCCTATTCTGAGGCTCTAAAG 780 Query 781 ACTATGCGAACCAGGTGTCCCAGTCGATCAGACGACGAAGTCGGGAAGGAAGCATGGATA 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 ACTATGCGAACCAGGTGTCCCAGTCGATCAGACGACGAAGTCGGGAAGGAAGCATGGATA 840 Query 841 CCAAAAAGGCTTTATATACTGGGTTATCCTAGGGGATGTTTTTACCGGACTGGTCAGCCT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 CCAAAAAGGCTTTATATACTGGGTTATCCTAGGGGATGTTTTTACCGGACTGGTCAGCCT 900 Query 901 CGGTGCGCTCGGCCTAGGCGCTTACTGCATGGGGGCTGTGGGCAATTTGGTATTTCTCAG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CGGTGCGCTCGGCCTAGGCGCTTACTGCATGGGGGCTGTGGGCAATTTGGTATTTCTCAG 960 Query 961 GACTATGGACaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 994 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 GACTATGGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 994 Query= ERCC-00013_genbank |116733893|gb|EF011062.1| Synthetic construct spike-in microarray control methionine aminopeptidase (map) gene, partial cds Length=794 Subject= ERCC-00013 Length=808 Score = 1437 bits (778), Expect = 0.0 Identities = 783/785 (99%), Gaps = 1/785 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ACCGAGCTCAGATGTGAAGGATCTTCTTGGAGGATTaaaaaaaTGATTATCTGTAAAACC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ACCGAGCTCAGATGTGAAGGATCTTCTTGGAGGATTAAAAAAATGATTATCTGTAAAACC 60 Query 61 CCACGTGAACTTGGTATCATGCGGGAAGCAGGGCGAATCGTGGCTTTAACTCATGAAGAG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CCACGTGAACTTGGTATCATGCGGGAAGCAGGGCGAATCGTGGCTTTAACTCATGAAGAG 120 Query 121 TTAAAAAAGCACATTAAACCAGGAATCTCGACAAAAGAATTGGATCAAATTGCCGAACGT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TTAAAAAAGCACATTAAACCAGGAATCTCGACAAAAGAATTGGATCAAATTGCCGAACGT 180 Query 181 TTTATTAAGAAGCAGGGTGCAATCCCATCTTTTAAGGGGTATAATGGGTTTCGCGGGAGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TTTATTAAGAAGCAGGGTGCAATCCCATCTTTTAAGGGGTATAATGGGTTTCGCGGGAGC 240 Query 241 ATTTGCGTATCAGTTAATGAAGAACTCGTTCACGGCATACCTGGCAGCAGGGTGCTGAAG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 ATTTGCGTATCAGTTAATGAAGAACTCGTTCACGGCATACCTGGCAGCAGGGTGCTGAAG 300 Query 301 GACGGTGACATCATCAGTATTGATATCGGTGCTAAATTAAATGGTTATCATGGTGACTCT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GACGGTGACATCATCAGTATTGATATCGGTGCTAAATTAAATGGTTATCATGGTGACTCT 360 Query 361 GCATGGACATATCCGGTAGGAAACATCAGCGATGATGACAAAAAACTTCTGGAAGTGACA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GCATGGACATATCCGGTAGGAAACATCAGCGATGATGACAAAAAACTTCTGGAAGTGACA 420 Query 421 GAGGAGTCTTTATATAAAGGCTTGCAGGAAGCAAAACCAGGTGAACGTTTGTCGAATATT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GAGGAGTCTTTATATAAAGGCTTGCAGGAAGCAAAACCAGGTGAACGTTTGTCGAATATT 480 Query 481 TCCCACGCAATACAAACGTATGTCGAAAATGAGCAGTTTTCAGTTGTTAGGGAGTATGTC 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TCCCACGCAATACAAACGTATGTCGAAAATGAGCAGTTTTCAGTTGTTAGGGAGTATGTC 540 Query 541 GGACATGGTGTTGGTCAAGACTTGCATGAGGACCCGCAAATTCCTCATTACGGTCCGCCC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GGACATGGTGTTGGTCAAGACTTGCATGAGGACCCGCAAATTCCTCATTACGGTCCGCCC 600 Query 601 AACAAAGGACCACGGCTTAAACCTGGCATGGTTCTCGCTATTGAACCTATGGTGAACGCT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 AACAAAGGACCACGGCTTAAACCTGGCATGGTTCTCGCTATTGAACCTATGGTGAACGCT 660 Query 661 GGCAGCCGCTACGTGAAAACATTGGCTGATAACTGGACGGTTGTAACGGTAGATGGGAAA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 GGCAGCCGCTACGTGAAAACATTGGCTGATAACTGGACGGTTGTAACGGTAGATGGGAAA 720 Query 721 AAGTGTGCTCATTTTGAACATACGATTGCGATTACGGAAACGGTTTTTGATATACTGACG 780 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| Sbjct 721 AAGTGTGCTCATTTTGAACATACGATTGCGATTACGGAAACGGGTTTTGAT-TACTGACG 779 Query 781 AGAGT 785 ||||| Sbjct 780 AGAGT 784 Query= ERCC-00014_genbank |112819960|gb|DQ875385.1| Synthetic construct microarray control DAP gene, complete sequence Length=1937 Subject= ERCC-00014 Length=1957 Score = 3567 bits (1931), Expect = 0.0 Identities = 1936/1938 (99%), Gaps = 1/1938 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 AAAAGAAGAAGGAAAGTAGAGGAGATCAAGATGTCAAACGAAACAATTAAATTAGTCATT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1957 AAAAGAAGAAGGAAAGTAGAGGAGATCAAGATGTCAAACGAAACAATTAAATTAGTCATT 1898 Query 61 GCGGGACCGCGTGGAAGAATGGGGCAGGAAGCTGTTAAATTGGCAGAACGAACACCACAT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1897 GCGGGACCGCGTGGAAGAATGGGGCAGGAAGCTGTTAAATTGGCAGAACGAACACCACAT 1838 Query 121 TTTGACCTTGTAGGGGCCATAGACCATACATACGATCAGCAAAAATTATCTGATGTGATG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1837 TTTGACCTTGTAGGGGCCATAGACCATACATACGATCAGCAAAAATTATCTGATGTGATG 1778 Query 181 CCTGTTGAGTCAGATGCTTTCATTTACACAGATATCCATGCCTGTTTTACAGAAACACAA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1777 CCTGTTGAGTCAGATGCTTTCATTTACACAGATATCCATGCCTGTTTTACAGAAACACAA 1718 Query 241 CCGGATGTCTTGATTGATTTAACAACGCCCGAAATCGGAAAAGTACATACAAAAATTGCA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1717 CCGGATGTCTTGATTGATTTAACAACGCCCGAAATCGGAAAAGTACATACAAAAATTGCA 1658 Query 301 TTAGAGCACGGAGTCCGTCCAGTTGTCGGAACAACCGGTTTCTCAGAAGCTGATTTAAAA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1657 TTAGAGCACGGAGTCCGTCCAGTTGTCGGAACAACCGGTTTCTCAGAAGCTGATTTAAAA 1598 Query 361 GAGCTCACATCTTTAACAGAAGAAAAAGGGATCGGAGCCATCATCGCGCCAAATTTTGCG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1597 GAGCTCACATCTTTAACAGAAGAAAAAGGGATCGGAGCCATCATCGCGCCAAATTTTGCG 1538 Query 421 CTCGGTGCGATACTGATGATGAAATTTTCAAAAATGGCTGCCAACTATTTTGAGGATGTT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1537 CTCGGTGCGATACTGATGATGAAATTTTCAAAAATGGCTGCCAACTATTTTGAGGATGTT 1478 Query 481 GAGATTATTGAGCTTCATCATGACCAGAAGCTTGACGCACCAAGCGGAACTGCGCTTAAA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1477 GAGATTATTGAGCTTCATCATGACCAGAAGCTTGACGCACCAAGCGGAACTGCGCTTAAA 1418 Query 541 ACAGCGGAAATGATTTCAGAAGTCCGTAAAGAAAAGCAGCAAGGACATCCGGATGAAAAA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1417 ACAGCGGAAATGATTTCAGAAGTCCGTAAAGAAAAGCAGCAAGGACATCCGGATGAAAAA 1358 Query 601 GAAATTCTCCCAGGAGCAAGAGGAGCGGAGCAAAACGGTATTCGCTTGCACAGCGTCCGT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1357 GAAATTCTCCCAGGAGCAAGAGGAGCGGAGCAAAACGGTATTCGCTTGCACAGCGTCCGT 1298 Query 661 CTTCCGGGACTGATCGCGCATCAGGAGGTCATGTTCGGCATGGATGGCCAAACGCTTCAG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1297 CTTCCGGGACTGATCGCGCATCAGGAGGTCATGTTCGGCATGGATGGCCAAACGCTTCAG 1238 Query 721 ATACGCCATGATTCTTATAACCGTGCTTCTTTCATGTCAGGCGTTAAACTGTCAGTCGAA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1237 ATACGCCATGATTCTTATAACCGTGCTTCTTTCATGTCAGGCGTTAAACTGTCAGTCGAA 1178 Query 781 CAAGTCATGAAGATTGATCAGCTTGTGTATGGTTTAGAAAATATCATTGATTAGACGGGG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1177 CAAGTCATGAAGATTGATCAGCTTGTGTATGGTTTAGAAAATATCATTGATTAGACGGGG 1118 Query 841 GGATAAACAATGAAAATTGCTTTGATCGCGCATGACAAGAAAAAACAGGATATGGTTCAA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1117 GGATAAACAATGAAAATTGCTTTGATCGCGCATGACAAGAAAAAACAGGATATGGTTCAA 1058 Query 901 TTTACGACTGCCTATCGGGATATTTTAAAGAATCATGATCTATACGCAACCGGAACCACA 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1057 TTTACGACTGCCTATCGGGATATTTTAAAGAATCATGATCTATACGCAACCGGAACCACA 998 Query 961 GGGTTGAAAATTCATGAGGCGACAGGTCTTCAAATTGAACGTTTTCAATCCGGCCCTTTA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 997 GGGTTGAAAATTCATGAGGCGACAGGTCTTCAAATTGAACGTTTTCAATCCGGCCCTTTA 938 Query 1021 GGGGGAGACCAGCAAATCGGTGCACTGATCGCTGCCAATGCACTCGATCTTGTCAttttt 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 937 GGGGGAGACCAGCAAATCGGTGCACTGATCGCTGCCAATGCACTCGATCTTGTCATTTTT 878 Query 1081 ttGCGCGACCCGCTGACCGCGCAGCCGCATGAACCGGATGTCTCGGCATTAATCCGTTTA 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 877 TTGCGCGACCCGCTGACCGCGCAGCCGCATGAACCGGATGTCTCGGCATTAATCCGTTTA 818 Query 1141 TGTGATGTGTATTCCATTCCGCTCGCCACAAATATGGGTACTGCGGAAATTCTTGTGCGC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 817 TGTGATGTGTATTCCATTCCGCTCGCCACAAATATGGGTACTGCGGAAATTCTTGTGCGC 758 Query 1201 ACACTTGATGAAGGTGTTTTCGAATTCCGTGACCTTCTTCGGGGAGAAGAGCCGAATGTA 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 757 ACACTTGATGAAGGTGTTTTCGAATTCCGTGACCTTCTTCGGGGAGAAGAGCCGAATGTA 698 Query 1261 TAATGCTGACGTTCTTGCTTTTGGCGCCCACAGTGATGATGTCGAGATCGGAATGGGCGG 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 697 TAATGCTGACGTTCTTGCTTTTGGCGCCCACAGTGATGATGTCGAGATCGGAATGGGCGG 638 Query 1321 CACAATAGCGAAGTTTGTCAAACAGGaaaaaaaaGTAATGATATGCGATTTGACAGAAGC 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 637 CACAATAGCGAAGTTTGTCAAACAGGAAAAAAAAGTAATGATATGCGATTTGACAGAAGC 578 Query 1381 GGAACTCTCTTCTAACGGTACGGTCAGTTTGCGTAAAGAAGAAGCAGCTGAAGCAGCCCG 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 577 GGAACTCTCTTCTAACGGTACGGTCAGTTTGCGTAAAGAAGAAGCAGCTGAAGCAGCCCG 518 Query 1441 CATATTAGGCGCAGATAAAAGAATTCAGCTAACGCTTCCAGACCGCGGCCTAATAATGAG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 517 CATATTAGGCGCAGATAAAAGAATTCAGCTAACGCTTCCAGACCGCGGCCTAATAATGAG 458 Query 1501 TGATCAGGCAATTCGGTCAATTGTCACTGTCATCAGAATCTGTCGGCCAAAAGCGGTTTT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 457 TGATCAGGCAATTCGGTCAATTGTCACTGTCATCAGAATCTGTCGGCCAAAAGCGGTTTT 398 Query 1561 TATGCCGTATAAAAAGGATCGCCATCCGGATCACGGCAATGCGGCTGCACTGGTGGAAGA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 397 TATGCCGTATAAAAAGGATCGCCATCCGGATCACGGCAATGCGGCTGCACTGGTGGAAGA 338 Query 1621 AGCGATCTTTTCCGCCGGAATCCATAAATATAAAGACGAAAAAAGCCTTCCGGCGCATAA 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 337 AGCGATCTTTTCCGCCGGAATCCATAAATATAAAGACGAAAAAAGCCTTCCGGCGCATAA 278 Query 1681 AGTCAGCAAGGTTTACTATTATATGATAAATGGTTTTCATCAGCCGGATTTTGTTATTGA 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 277 AGTCAGCAAGGTTTACTATTATATGATAAATGGTTTTCATCAGCCGGATTTTGTTATTGA 218 Query 1741 TATCTCGGATACAATAGAGGCAAAGAAACAAAGCCTCAACGCCTACAAAAGCCAGTTTAT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 217 TATCTCGGATACAATAGAGGCAAAGAAACAAAGCCTCAACGCCTACAAAAGCCAGTTTAT 158 Query 1801 CCCGTCAAAGGATTCCGTTTCTACTCCTCTGACGAATGGGTATATTGAAATCGTTGAAGC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 157 CCCGTCAAAGGATTCCGTTTCTACTCCTCTGACGAATGGGTATATTGAAATCGTTGAAGC 98 Query 1861 GAGAGAAAAGCTTTACGGTAAAGAAGCGGGCGTGGAGTATGCCGAAG-TTTCTTTTCCAA 1919 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 97 GAGAGAAAAGCTTTACGGTAAAGAAGCGGGCGTGGAGTATGCCGAAGGTTTCTTTTCCAA 38 Query 1920 ACGGATGCTGATGCTTGA 1937 ||||||||||| |||||| Sbjct 37 ACGGATGCTGAAGCTTGA 20 Query= ERCC-00016_genbank |114976930|gb|DQ883664.2| Synthetic construct clone NISTag23 external RNA control sequence Length=850 Subject= ERCC-00016 Length=844 Score = 1559 bits (844), Expect = 0.0 Identities = 844/844 (100%), Gaps = 0/844 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GTTGTAACGAATGTTAATTTAGGAGGCAAGAGTTTGTGGGCGCGGACTTGCAGCTCGTAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GTTGTAACGAATGTTAATTTAGGAGGCAAGAGTTTGTGGGCGCGGACTTGCAGCTCGTAA 60 Query 61 CGCTCTAAAAGGGTTATGCCGCTGAGGCGGGACCATAGTCAGGAAGTTTGTCCGATCCGC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CGCTCTAAAAGGGTTATGCCGCTGAGGCGGGACCATAGTCAGGAAGTTTGTCCGATCCGC 120 Query 121 TCCAGTTGTCAAGAGTAGAGGATTTCGTGTTCGCCGATACTGCCGAAAACGTCATACCGA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TCCAGTTGTCAAGAGTAGAGGATTTCGTGTTCGCCGATACTGCCGAAAACGTCATACCGA 180 Query 181 AGCAATTCTGTCGTCACTCTGTATGTCCGTGCCCCACCTTCGAGTATGAGTTTTAAAGTT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 AGCAATTCTGTCGTCACTCTGTATGTCCGTGCCCCACCTTCGAGTATGAGTTTTAAAGTT 240 Query 241 CGTGCAGAGACATAGCTCGCGCACTCCCTGTGTGATGCCGGTCGGCCGACACATGCTTCA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CGTGCAGAGACATAGCTCGCGCACTCCCTGTGTGATGCCGGTCGGCCGACACATGCTTCA 300 Query 301 ATGTGCCTTGAACTTGCATTCGAAAGAATGTCCTTATCTTGATCGGCCATTGTAATGCAA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATGTGCCTTGAACTTGCATTCGAAAGAATGTCCTTATCTTGATCGGCCATTGTAATGCAA 360 Query 361 CGCTCTCCTTTCATTGACACGAGGTTCGTAGATGGCTGTTACTCGCGGACGTTAAATAAA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CGCTCTCCTTTCATTGACACGAGGTTCGTAGATGGCTGTTACTCGCGGACGTTAAATAAA 420 Query 421 ACTATCAGCGTCAGCGGATTAGGAGGCTTACGGGGGAACCTACAATTGTTCGCCGCATGG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 ACTATCAGCGTCAGCGGATTAGGAGGCTTACGGGGGAACCTACAATTGTTCGCCGCATGG 480 Query 481 TCCGAAGGCGCCATGTCCCTCAGCGGAGCGACAACAATTACTACTGGAGCTATTGTAAAT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TCCGAAGGCGCCATGTCCCTCAGCGGAGCGACAACAATTACTACTGGAGCTATTGTAAAT 540 Query 541 ACGCAGCAACAAGCGTCCAGACATTTGCCGCTGACCTCCAGTCGCATGGACGGGGGAGAA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 ACGCAGCAACAAGCGTCCAGACATTTGCCGCTGACCTCCAGTCGCATGGACGGGGGAGAA 600 Query 601 CAGCTGGAGCAATGCATCATTCGCTGAGGGACATCCAATCACGGAATCAAGGAAGAATTA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 CAGCTGGAGCAATGCATCATTCGCTGAGGGACATCCAATCACGGAATCAAGGAAGAATTA 660 Query 661 CCAATTTTACCTGTAACGAAACCAATTTATTACTGACGCAGAGTGAATCACATCTATAGC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CCAATTTTACCTGTAACGAAACCAATTTATTACTGACGCAGAGTGAATCACATCTATAGC 720 Query 721 GGTTACGACCCTCCAGAGTGATCCGACGGCGATGTGTCTTTGACCCCCGTGTGACTGGTG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GGTTACGACCCTCCAGAGTGATCCGACGGCGATGTGTCTTTGACCCCCGTGTGACTGGTG 780 Query 781 TTCCTGTCGTATCCGCAACATGTTTACTCATCACTACGTTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TTCCTGTCGTATCCGCAACATGTTTACTCATCACTACGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 840 Query 841 aaaa 844 |||| Sbjct 841 AAAA 844 Query= ERCC-00017_genbank |92111298|gb|DQ459420.1| Synthetic construct microarray control MC09 mRNA, complete sequence Length=1143 Subject= ERCC-00017 Length=1136 Score = 2071 bits (1121), Expect = 0.0 Identities = 1133/1138 (99%), Gaps = 4/1138 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GAGAACTGAAAGTGAGTCCCAACGAGAGAGGTGCATCTGTCCAGTGAGAGCTGACTGTCT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GAGAACTGAAAGTGAGTCCCAACGAGAGAGGTGCATCTGTCCAGTGAGAGCTGACTGTCT 60 Query 61 GCGACAACACTAGTCGGTCCAGGCATGGATTTCGCGACCTCACAACTTAAGGAGGCGGTA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GCGACAACACTAGTCGGTCCAGGCATGGATTTCGCGACCTCACAACTTAAGGAGGCGGTA 120 Query 121 AATCAGATGACAGCGCGACCCTGTAATGGGTGACCTGCTAGTGGAGGTGGCGCGGTGTCC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AATCAGATGACAGCGCGACCCTGTAATGGGTGACCTGCTAGTGGAGGTGGCGCGGTGTCC 180 Query 181 CAGATACAAGGATCTCGATGTAGTACCCTCACATAACTTTGCTCCCTGAAATAACATTCG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CAGATACAAGGATCTCGATGTAGTACCCTCACATAACTTTGCTCCCTGAAATAACATTCG 240 Query 241 ATCACTCTAATGAATCCCTTAAGCCAGGAGCGTTAGTGTCAAACGCAACGCCCCGGGTTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 ATCACTCTAATGAATCCCTTAAGCCAGGAGCGTTAGTGTCAAACGCAACGCCCCGGGTTC 300 Query 301 ATGATCCTGGATGGCTGGTCGAACCAGGGAGATGTCACTCTAATAGGTGCCAAATGTACC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATGATCCTGGATGGCTGGTCGAACCAGGGAGATGTCACTCTAATAGGTGCCAAATGTACC 360 Query 361 GCAGAACCTCGTAGGCGTTCGCCCAATTGGACCCGAGGTCATAATGTAGACGGGCACGCT 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 361 GCAGAACCTCGTAGGCGTTCGCCCAATTGGACCCGAGGT-ATAATGTAGACGGGCACGCT 419 Query 421 GACTGGGCAAAAGATTACAATCCCAGTTACCATACAGTC-CCC-GTCAGGATCGGGGCAT 478 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct 420 GACTGGGCAAAAGATTACAATCCCAGTTACCATACAGTCGCCCGGTCAGGATCGGGGCAT 479 Query 479 GAAGGCAATATGTTGGCGCATCCCAGTCTTTCCGTAGAAACAGTGGCTAACGACGGAGAT 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 GAAGGCAATATGTTGGCGCATCCCAGTCTTTCCGTAGAAACAGTGGCTAACGACGGAGAT 539 Query 539 ACTGCCGGGCAAGAAACCTTGACCAAGTATGCGCGCCTTGTGAGTCTCCATGGACTTGCT 598 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 ACTGCCGGGCAAGAAACCTTGACCAAGTATGCGCGCCTTGTGAGTCTCCATGGACTTGCT 599 Query 599 GCACCTACAAATCCGGAAGGGCGCTTATAGTGCTTGCTAGCACTCCCTGGAATATCTTAA 658 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 GCACCTACAAATCCGGAAGGGCGCTTATAGTGCTTGCTAGCACTCCCTGGAATATCTTAA 659 Query 659 TCCCGCCAGCTCATGGGACGGGAGGAATGTGTTAGACCATAAACAGAGGGCTGGCCAACA 718 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 TCCCGCCAGCTCATGGGACGGGAGGAATGTGTTAGACCATAAACAGAGGGCTGGCCAACA 719 Query 719 ATCAGAGGGAAGTAAGCCCCGCAAAAGGATTCTGCGGGAACCGAATTACACAACGTAAGG 778 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 ATCAGAGGGAAGTAAGCCCCGCAAAAGGATTCTGCGGGAACCGAATTACACAACGTAAGG 779 Query 779 ACGTACCTGCTCCTACCCCCGAACCACTGTCAATACGATAATGCGCCCAAAACGAGGGAT 838 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 ACGTACCTGCTCCTACCCCCGAACCACTGTCAATACGATAATGCGCCCAAAACGAGGGAT 839 Query 839 CGAGACGGTCGGAGTGGCAGTCCAGCTTAAACAGGTGCTCGCCGAAACTAGCTGGCCAGG 898 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 CGAGACGGTCGGAGTGGCAGTCCAGCTTAAACAGGTGCTCGCCGAAACTAGCTGGCCAGG 899 Query 899 GTGAGGCATGGATTCAAAGCCCAACGACCGAAGAAAGTTCCGACATACAATTACTCGGCT 958 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 GTGAGGCATGGATTCAAAGCC-AACGACCGAAGAAAGTTCCGACATACAATTACTCGGCT 958 Query 959 TTTGGCAATACCCAGGCGAGAGGTAAGCCCAAGCCATACCGGGAATGACCTGAGATCCAC 1018 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 959 TTTGGCAATACCCAGGCGAGAGGTAAGCCCAAGCCATACCGGGAATGACCTGAGATCCAC 1018 Query 1019 TTAGTAAGTCTTACGAGATGATCCCGACCCAGGACTGGAGCTAGGCGGTTGTGCAAGTAA 1078 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1019 TTAGTAAGTCTTACGAGATGATCCCGACCCAGGACTGGAGCTAGGCGGTTGCGCAAGTAA 1078 Query 1079 CTTCATCATGTATCGCTGGGGAATAATGTTCCTGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1079 CTTCATCATGTATCGCTGGGGAATAATGTTCCTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1136 Query= ERCC-00018_genbank |116733899|gb|EF011065.1| Synthetic construct spike-in microarray control hypothetical protein (yurP) gene, complete cds Length=1013 Subject= ERCC-00018 Length=1032 Score = 1860 bits (1007), Expect = 0.0 Identities = 1009/1010 (99%), Gaps = 0/1010 (0%) Strand=Plus/Plus Query 4 GAGCTCAGTGAAGGATTTGAGTCAGGCCACAGCAAAAGTAAATCGTGAGGTTCAAGCTTT 63 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GAGCTCAGTGAAGGATTTGAGTCAGGCCACAGCAAAAGTAAATCGTGAGGTTCAAGCTTT 60 Query 64 CTTGCAGGATTTGAAAGGGAAAACCATTGATCATGTATTCTTTGTCGCATGCGGAGGGTC 123 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CTTGCAGGATTTGAAAGGGAAAACCATTGATCATGTATTCTTTGTCGCATGCGGAGGGTC 120 Query 124 TTCTGCCATTATGTATCCGAGTAAGTATGTGTTTGACAGAGAGTCAAAATCAATAAACTC 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TTCTGCCATTATGTATCCGAGTAAGTATGTGTTTGACAGAGAGTCAAAATCAATAAACTC 180 Query 184 CGATCTCTACAGCGCCAACGAATTTATTCAGCGCAACCCTGTTCAGCTTGGTGAAAAGTC 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CGATCTCTACAGCGCCAACGAATTTATTCAGCGCAACCCTGTTCAGCTTGGTGAAAAGTC 240 Query 244 TCTTGTTATTTTGTGCTCGCATTCGGGAAATACCCCGGAGACAGTCAAAGCTGCTGCGTT 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TCTTGTTATTTTGTGCTCGCATTCGGGAAATACCCCGGAGACAGTCAAAGCTGCTGCGTT 300 Query 304 TGCAAGGGGCAAGGGCGCACTTACGATTGCGATGACGTTTAAACCGGAGTCTCCTTTAGC 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TGCAAGGGGCAAGGGCGCACTTACGATTGCGATGACGTTTAAACCGGAGTCTCCTTTAGC 360 Query 364 GCAGGAAGCGCAATATGTTGCCCAGTACGATTGGGGTGATGAGGCGCTTGCGATCAATAC 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GCAGGAAGCGCAATATGTTGCCCAGTACGATTGGGGTGATGAGGCGCTTGCGATCAATAC 420 Query 424 AAACTATGGCGTTTTGTATCAAATCGTTTTTGGAACCCTGCAAGTATTAGAAAACAATAC 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 AAACTATGGCGTTTTGTATCAAATCGTTTTTGGAACCCTGCAAGTATTAGAAAACAATAC 480 Query 484 GAAATTTGAGCAAGCAATTGAAGGCTTAGATCAATTGCAGGCTGTATATGAAAAAGCCCT 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GAAATTTGAGCAAGCAATTGAAGGCTTAGATCAATTGCAGGCTGTATATGAAAAAGCCCT 540 Query 544 TAAGCAGGAAGCTGACAACGCCAAGCAATTTGCAAAAGCCCATGAAAAAGAAAGCATTAT 603 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TAAGCAGGAAGCTGACAACGCCAAGCAATTTGCAAAAGCCCATGAAAAAGAAAGCATTAT 600 Query 604 TTATACCATGGCAAGCGGTGCAAACTACGGTGTCGCTTACTCCTACAGCATCTGCATTCT 663 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TTATACCATGGCAAGCGGTGCAAACTACGGTGTCGCTTACTCCTACAGCATCTGCATTCT 660 Query 664 CATGGAAATGCAATGGATTCATTCCCACGCCATTCATGCCGGAGAATATTTTCACGGACC 723 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CATGGAAATGCAATGGATTCATTCCCACGCCATTCATGCCGGAGAATATTTTCACGGACC 720 Query 724 GTTTGAAATTATTGATGAATCCGTGCCGTTTATCATCCTGCTCGGTTTAGATGAAACAAG 783 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GTTTGAAATTATTGATGAATCCGTGCCGTTTATCATCCTGCTCGGTTTAGATGAAACAAG 780 Query 784 ACCTCTTGAAGAGCGGGCGCTTACCTTCTCGAAAAAGTATGGCAAAAAGCTCACTGTGCT 843 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 ACCTCTTGAAGAGCGGGCGCTTACCTTCTCGAAAAAGTATGGCAAAAAGCTCACTGTGCT 840 Query 844 TGATGCTGCATCTTACGACTTCACTGCAATTGACGATTCAGTTAAAGGCTATCTTGCTCC 903 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 TGATGCTGCATCTTACGACTTCACTGCAATTGACGATTCAGTTAAAGGCTATCTTGCTCC 900 Query 904 GCTCGTTCTCAATCGTGTGCTGAGAAGCTATGCAGACGAGCTGGCAGAGGAGAGAAATCA 963 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 GCTCGTTCTCAATCGTGTGCTGAGAAGCTATGCAGACGAGCTGGCAGAGGAGAGAAATCA 960 Query 964 TCCTTTATCTCATATAAGATACATGTGGAAAGTTGAGTATTGAATTCTGG 1013 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 TCCTTTATCTCATAGAAGATACATGTGGAAAGTTGAGTATTGAATTCTGG 1010 Query= ERCC-00019_genbank |114975628|gb|DQ883651.2| Synthetic construct clone NISTag10 external RNA control sequence Length=650 Subject= ERCC-00019 Length=644 Score = 1190 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 644/644 (100%), Gaps = 0/644 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CTTTAATGGTTGTACATACTTGACGGATTGCAGTGAGTGTATTCCCGTCCCATCGTATGG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CTTTAATGGTTGTACATACTTGACGGATTGCAGTGAGTGTATTCCCGTCCCATCGTATGG 60 Query 61 GTAACCCATAGGGGCGTGTCATTCAGCACTTCGGATAGTGTTTGACCGCGTCGCTCCCAT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GTAACCCATAGGGGCGTGTCATTCAGCACTTCGGATAGTGTTTGACCGCGTCGCTCCCAT 120 Query 121 GTCGCCTTTCAGGAGAAATAGTACAGGCTGCTGGCTCATGTTTCCTTCTACGCTGCACTT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GTCGCCTTTCAGGAGAAATAGTACAGGCTGCTGGCTCATGTTTCCTTCTACGCTGCACTT 180 Query 181 GCGGGCATAGAGGTCGGTTGCGATCTATATTCGGAGATAACTATTCACCCAGCGCCACTC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GCGGGCATAGAGGTCGGTTGCGATCTATATTCGGAGATAACTATTCACCCAGCGCCACTC 240 Query 241 GAATATCCCCTCTTCTGAGCAAGAGGCCAATAAATGCTCAAAAACGAGCGATTGTCCAAC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GAATATCCCCTCTTCTGAGCAAGAGGCCAATAAATGCTCAAAAACGAGCGATTGTCCAAC 300 Query 301 GACATAAAGGGAGACTGTAAGGTCCTAGCGCTCTGTCTGTTAGTGAGAGCCCTAGGTAAA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GACATAAAGGGAGACTGTAAGGTCCTAGCGCTCTGTCTGTTAGTGAGAGCCCTAGGTAAA 360 Query 361 CACGGTCGTTATCCCCTAGAGCGTGAAGCGGCTGTAGATATCTCTGAATCTTCGACCTTG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CACGGTCGTTATCCCCTAGAGCGTGAAGCGGCTGTAGATATCTCTGAATCTTCGACCTTG 420 Query 421 GTGTAGATGGGGCTAGGTCAAAAAGCGGTAGCGATTAGCACTTGTATACACTCTCCCCCT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GTGTAGATGGGGCTAGGTCAAAAAGCGGTAGCGATTAGCACTTGTATACACTCTCCCCCT 480 Query 481 ACTAAGTATGTAAGGCCTGACCGGAGATTTGTCCATGCTCACCAGGACCGATAGTTGGGC 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 ACTAAGTATGTAAGGCCTGACCGGAGATTTGTCCATGCTCACCAGGACCGATAGTTGGGC 540 Query 541 CCCGGTAATCTTGCCGCCGTAGGGAGTACGAGCAGTGCACCGTTGAAACAAGCACAGGAG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CCCGGTAATCTTGCCGCCGTAGGGAGTACGAGCAGTGCACCGTTGAAACAAGCACAGGAG 600 Query 601 GTATGAAGCATCAGACCTGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 644 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GTATGAAGCATCAGACCTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 644 Query= ERCC-00022_genbank |116662509|gb|DQ855004.2| Synthetic construct clone AG019.0111 external RNA control sequence Length=727 Subject= ERCC-00022 Length=751 Score = 1343 bits (727), Expect = 0.0 Identities = 727/727 (100%), Gaps = 0/727 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CCCGGGCCAATTGCCTCTATAACTAGAGCTGAGCCCACCATTAAAGCGATTTTTTCGCAC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CCCGGGCCAATTGCCTCTATAACTAGAGCTGAGCCCACCATTAAAGCGATTTTTTCGCAC 60 Query 61 TTAGCCGTAATAAATATAATGATCCCGCGGTGTAGTAATTCTACGGAATGCACGGAATGT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TTAGCCGTAATAAATATAATGATCCCGCGGTGTAGTAATTCTACGGAATGCACGGAATGT 120 Query 121 CATAAGCAGAAGGACGTGATGTGCAACCTACTCCCCTTTCCCAAGTAAATGTACGGGAAT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CATAAGCAGAAGGACGTGATGTGCAACCTACTCCCCTTTCCCAAGTAAATGTACGGGAAT 180 Query 181 TATCGTTTCGTTACCGACAACCATGGGGCCACGTGGCCAGTTTGCCCCTATTAGGTGGAT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TATCGTTTCGTTACCGACAACCATGGGGCCACGTGGCCAGTTTGCCCCTATTAGGTGGAT 240 Query 241 AGGCACTGAGTACAGAATATATAAAGCGTGACGGATGAAAACGCACCCATTGTCACCGAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 AGGCACTGAGTACAGAATATATAAAGCGTGACGGATGAAAACGCACCCATTGTCACCGAT 300 Query 301 TGTGACTAGTTGACCCTATCACCCCTACTGTGTTCAGACGTCGTTCTACTAAAGGCCCGT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TGTGACTAGTTGACCCTATCACCCCTACTGTGTTCAGACGTCGTTCTACTAAAGGCCCGT 360 Query 361 GCCGCCGGAAGCTCATTTAAAAAGAACTCGTAAGTAAGCCGGCGACATATCTAGCAAAAC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GCCGCCGGAAGCTCATTTAAAAAGAACTCGTAAGTAAGCCGGCGACATATCTAGCAAAAC 420 Query 421 ATAGTCCCCCTTCTGCTCAGAGGTTATCCATAAGTGACTTACCAGATGGAGTGCCAAGGT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 ATAGTCCCCCTTCTGCTCAGAGGTTATCCATAAGTGACTTACCAGATGGAGTGCCAAGGT 480 Query 481 ACAGACCTCCCTCCCAACTGGTTCCTGCAGGACGTTGCTATATCACTTCTGGCCGTCCTT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 ACAGACCTCCCTCCCAACTGGTTCCTGCAGGACGTTGCTATATCACTTCTGGCCGTCCTT 540 Query 541 ATGGGTTACCCCTCGCGAGTGCCATCGCATCGACTGACACACCTGCATTCTATTTTATGC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 ATGGGTTACCCCTCGCGAGTGCCATCGCATCGACTGACACACCTGCATTCTATTTTATGC 600 Query 601 TCTACTGACGGCGACGAGTTTTTTGTAGCGTCGATCGCGGAGTTAAGGTCATTGGGGAAT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TCTACTGACGGCGACGAGTTTTTTGTAGCGTCGATCGCGGAGTTAAGGTCATTGGGGAAT 660 Query 661 AGAACCATAGCGCTTGGGTTTGTGACTTTCTCCCTAGATACGCGTTTGCTGACTGCGCTA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 AGAACCATAGCGCTTGGGTTTGTGACTTTCTCCCTAGATACGCGTTTGCTGACTGCGCTA 720 Query 721 CATGGAT 727 ||||||| Sbjct 721 CATGGAT 727 Query= ERCC-00023_genbank |103488691|gb|DQ516744.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-250-27 genomic sequence Length=250 Subject= ERCC-00023 Length=273 Score = 462 bits (250), Expect = 3e-135 Identities = 250/250 (100%), Gaps = 0/250 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TGCCTTCAAGTATTACGATGAATTGGCTGAGTTTTGTAAAAGGCATAACATCCCATTTCT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TGCCTTCAAGTATTACGATGAATTGGCTGAGTTTTGTAAAAGGCATAACATCCCATTTCT 60 Query 61 CCCTCTACCAACAATCTCAGAAATTCATCCAGATTTAGAGAAGGATAGGACAGTAGATGA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CCCTCTACCAACAATCTCAGAAATTCATCCAGATTTAGAGAAGGATAGGACAGTAGATGA 120 Query 121 TGACGTAAAGAATAAAGTTGTCAAATATTTGGGATATGAAGGGGTTTATAATTACAAAAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TGACGTAAAGAATAAAGTTGTCAAATATTTGGGATATGAAGGGGTTTATAATTACAAAAA 180 Query 181 TCTTCTTTTATATTTGGCAAATAGGTTTGGAAATTTAAATGTTGAGTATGAAGAACCAAG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TCTTCTTTTATATTTGGCAAATAGGTTTGGAAATTTAAATGTTGAGTATGAAGAACCAAG 240 Query 241 ACCAATGCCA 250 |||||||||| Sbjct 241 ACCAATGCCA 250 Query= ERCC-00024_genbank |116662503|gb|DQ854993.2| Synthetic construct clone AG005.0110 external RNA control sequence Length=512 Subject= ERCC-00024 Length=536 Score = 946 bits (512), Expect = 0.0 Identities = 512/512 (100%), Gaps = 0/512 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ACGGAGGAGCTTTGGCATACTAGGCTAGCGAATCTGCAACTAACGCAAGTTACATCCTAG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ACGGAGGAGCTTTGGCATACTAGGCTAGCGAATCTGCAACTAACGCAAGTTACATCCTAG 60 Query 61 CTAGCGAAGGGCGTCCCAATTTTCGCTAACCCGACGCGACGCATAAAAAGCGAGAATAAC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CTAGCGAAGGGCGTCCCAATTTTCGCTAACCCGACGCGACGCATAAAAAGCGAGAATAAC 120 Query 121 GCCTAAGGGATGTACAATGGATGTTGATTATGCCTTCGGGAATGAGGGATGATTTGCGAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GCCTAAGGGATGTACAATGGATGTTGATTATGCCTTCGGGAATGAGGGATGATTTGCGAA 180 Query 181 AAACAAGTCAATACCTAACCAAATCCGCTAATGGACACCCGTAATCGTGCCCAAGTTTAA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 AAACAAGTCAATACCTAACCAAATCCGCTAATGGACACCCGTAATCGTGCCCAAGTTTAA 240 Query 241 CTGGTCGGTAGGTGGCAGGCAAAGCGCTAGTATCCCTAGGCGCGACACTATAAGTTTACA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CTGGTCGGTAGGTGGCAGGCAAAGCGCTAGTATCCCTAGGCGCGACACTATAAGTTTACA 300 Query 301 ACTGCGAGAATTGACACTATGAGCGCGCATACTGGGGCCAGAATAGGCAATACCATGTGC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ACTGCGAGAATTGACACTATGAGCGCGCATACTGGGGCCAGAATAGGCAATACCATGTGC 360 Query 361 GTCCCTGTGTGAACAGCTCGCGGCCATCAGAAGTTGGGATTGACGCATGATCTTGATCGA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GTCCCTGTGTGAACAGCTCGCGGCCATCAGAAGTTGGGATTGACGCATGATCTTGATCGA 420 Query 421 GCATACGGCTTCCACCAACCCATAGTACTTGGTAACTATAGCAATCAAGCACGCGTGAGC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GCATACGGCTTCCACCAACCCATAGTACTTGGTAACTATAGCAATCAAGCACGCGTGAGC 480 Query 481 ACAACGCTATCCAAATTACTACATTAACTGGA 512 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 ACAACGCTATCCAAATTACTACATTAACTGGA 512 Query= ERCC-00025_genbank |114977058|gb|DQ883689.2| Synthetic construct clone NISTag48 external RNA control sequence Length=2000 Subject= ERCC-00025 Length=1994 Score = 3677 bits (1991), Expect = 0.0 Identities = 1993/1994 (99%), Gaps = 0/1994 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGGGTCCATTATAGTGCAGGCGTGGTAAAGTAGCATTAGAACCCTACTACTTAGCCCGCG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GGGGTCCATTATAGTGCAGGCGTGGTAAAGTAGCATTAGAACCCTACTACTTAGCCCGCG 60 Query 61 CAACTCGTCCTATTAAAAGTCGGAAGGATTAGGGAAGTTAACCTCCGTTAGGGCCTCATT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CAACTCGTCCTATTAAAAGTCGGAAGGATTAGGGAAGTTAACCTCCGTTAGGGCCTCATT 120 Query 121 GGCGCGCCTCCACGTATCTGTATTCCCGTGTCCCGACTGGCTAATAAGAGATATGGTGCA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GGCGCGCCTCCACGTATCTGTATTCCCGTGTCCCGACTGGCTAATAAGAGATATGGTGCA 180 Query 181 GCGTGAACGCGGACCGAACTCCGGTGTGCGCCGGTTCATGTTACTCGAAAAATAGACCCT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GCGTGAACGCGGACCGAACTCCGGTGTGCGCCGGTTCATGTTACTCGAAAAATAGACCCT 240 Query 241 ACTTGCGCCATGTCATCTTTCACTACGGGGTAGTCTCTCGGCCAGGCTTTGAATCGCCTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 ACTTGCGCCATGTCATCTTTCACTACGGGGTAGTCTCTCGGCCAGGCTTTGAATCGCCTC 300 Query 301 ATCCGCTTCTCAATGGTTCTGTCCTGACCTCTGGAGTTAATCTTCGTCTCATAGAGTAAC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATCCGCTTCTCAATGGTTCTGTCCTGACCTCTGGAGTTAATCTTCGTCTCATAGAGTAAC 360 Query 361 CAGGCGACGCACCACGCCTAGTTGGTACCACCACTAGAAGCCCGGTTCGCTGGCTCAGTG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CAGGCGACGCACCACGCCTAGTTGGTACCACCACTAGAAGCCCGGTTCGCTGGCTCAGTG 420 Query 421 CTAATATTCTGGAGGTCAGCCGACAGGTCACATGAGCCTACTCGTCTCGTCAAACACCCG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CTAATATTCTGGAGGTCAGCCGACAGGTCACATGAGCCTACTCGTCTCGTCAAACACCCG 480 Query 481 CCTAGCCATGATTAACAAATACAGTGATTAAGTGTGTTTTGACCCTAGTGTTAGGTCGCT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 CCTAGCCATGATTAACAAATACAGTGATTAAGTGTGTTTTGACCCTAGTGTTAGGTCGCT 540 Query 541 GGTACTTAGCAAGGGGAGTTGCATATGTGGTCTCTGTTTCGGGTTATATCTATCATTTAC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GGTACTTAGCAAGGGGAGTTGCATATGTGGTCTCTGTTTCGGGTTATATCTATCATTTAC 600 Query 601 TTGACACCCTATTGGTTTATCACAGTCCTTCCACACGACCATACGCGTTGTAAGAATACC 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TTGACACCCTATTGGTTTATCACAGTCCTTCCACACGACCATACGCGTTGTAAGAATACC 660 Query 661 CTCTAGCGTTGGAGAGAATAAGTTCGATGTTCAATTCACAAAACCGAGCAAAGGCTTGTC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CTCTAGCGTTGGAGAGAATAAGTTCGATGTTCAATTCACAAAACCGAGCAAAGGCTTGTC 720 Query 721 GACAGCTTCTACTAGTATTCACTACCAAAACGCGTACCGACTTTAGGGCGGTAGAGAGAT 780 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GACAGCTTCTACTAGTATTCACTACCAAAACGCGTACCGACTTTAGGGCGGTAGAGAGAA 780 Query 781 TTGCCATTGCCACGAGGTTCCCCAGAATACAGGGTCCAGGCGGCCCCCAGCATCGGAGTG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TTGCCATTGCCACGAGGTTCCCCAGAATACAGGGTCCAGGCGGCCCCCAGCATCGGAGTG 840 Query 841 CCTGAACTGGCGGGGATGCCCAAGATTGTAGAGGGCCTAACGAGTTTGATACGCCCGGGA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 CCTGAACTGGCGGGGATGCCCAAGATTGTAGAGGGCCTAACGAGTTTGATACGCCCGGGA 900 Query 901 CTACGGGGCATTGTCTGCCGCGTCTGTTTCAGGTAAACGATCAACCGGAGACCAGGTTAT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CTACGGGGCATTGTCTGCCGCGTCTGTTTCAGGTAAACGATCAACCGGAGACCAGGTTAT 960 Query 961 TCCCATGTCGGTCCCCAGGCTTATACTGCGGAGATAGGCTGATGATGGTAGGTGCCTTGC 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 TCCCATGTCGGTCCCCAGGCTTATACTGCGGAGATAGGCTGATGATGGTAGGTGCCTTGC 1020 Query 1021 TCTAGCAAAAACGCGCACAGCTTATGAGCATAGCGGCTGGGCGTAGGTCAGAGAGGGTAT 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 TCTAGCAAAAACGCGCACAGCTTATGAGCATAGCGGCTGGGCGTAGGTCAGAGAGGGTAT 1080 Query 1081 GTAAGATCTCTCCTCTATCGGTGTGCGTCTACTCTGCCCCCTTCGACACAAATGTACATC 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 GTAAGATCTCTCCTCTATCGGTGTGCGTCTACTCTGCCCCCTTCGACACAAATGTACATC 1140 Query 1141 GCGGGAAACGGATACGCCTTACGCCCCAAGGTTTAGCGTATCAAAAAATGCAACGATTCC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 GCGGGAAACGGATACGCCTTACGCCCCAAGGTTTAGCGTATCAAAAAATGCAACGATTCC 1200 Query 1201 GATGTCGAACCTTGGATAGGAGCGACCGATTACGTGTTAATTGGCCCTGTACCTTTCTGG 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 GATGTCGAACCTTGGATAGGAGCGACCGATTACGTGTTAATTGGCCCTGTACCTTTCTGG 1260 Query 1261 TCCGTTGATTATCACTCATCCCCAGGTTGTTATGGTCTACCGTGGAAGCCTCGTCAATGA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 TCCGTTGATTATCACTCATCCCCAGGTTGTTATGGTCTACCGTGGAAGCCTCGTCAATGA 1320 Query 1321 ATACTTTGAGCGCGATTGAAGTGTTCCGCTACATCGCGGCTATCATTAAAAATTCCCCTT 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 ATACTTTGAGCGCGATTGAAGTGTTCCGCTACATCGCGGCTATCATTAAAAATTCCCCTT 1380 Query 1381 TAACAAAGGTTGTGGACGTCAACGGCCCTGCAGTAGCGTTCCTTGGACCCGGTTCGAGTA 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1381 TAACAAAGGTTGTGGACGTCAACGGCCCTGCAGTAGCGTTCCTTGGACCCGGTTCGAGTA 1440 Query 1441 CCCAGAGCAGACTACGTATATATCCAAGTGGTTATGTCCGACGGCATTTTGCCAGGTTAG 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1441 CCCAGAGCAGACTACGTATATATCCAAGTGGTTATGTCCGACGGCATTTTGCCAGGTTAG 1500 Query 1501 TATCTTCGGCAATGAGTTGCGTCTACGGCTAATCGAGAGCACTTGTCAGTACGCGCAATT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 TATCTTCGGCAATGAGTTGCGTCTACGGCTAATCGAGAGCACTTGTCAGTACGCGCAATT 1560 Query 1561 ACTACATGGAGTGTATTCGTTTTGAGCGCTGATACAGTTCTCCTATCAAGGTCGCAAAAG 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 ACTACATGGAGTGTATTCGTTTTGAGCGCTGATACAGTTCTCCTATCAAGGTCGCAAAAG 1620 Query 1621 GTTGTCTAGAAAAGGGCCGTGCGCGCAGTCTACTGCTACCGGCGACTTTACGACGAAGTT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1621 GTTGTCTAGAAAAGGGCCGTGCGCGCAGTCTACTGCTACCGGCGACTTTACGACGAAGTT 1680 Query 1681 AGGCATCAGACGACCACATGACGGAGAATTACGTACGCCACTTCAGACGTTCTGCCTGCG 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1681 AGGCATCAGACGACCACATGACGGAGAATTACGTACGCCACTTCAGACGTTCTGCCTGCG 1740 Query 1741 TGCTCTGCAATATAGGCGTAGCAACGAAGCTCGGTCGTGAACTGCTATAGGAATAGCCTG 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1741 TGCTCTGCAATATAGGCGTAGCAACGAAGCTCGGTCGTGAACTGCTATAGGAATAGCCTG 1800 Query 1801 ATACGAGCGCACAACAAGAACGAACCAGCGAAACTACCCAGATAACATCGCTCCCCGGCA 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1801 ATACGAGCGCACAACAAGAACGAACCAGCGAAACTACCCAGATAACATCGCTCCCCGGCA 1860 Query 1861 TTACTCTGACGGGGGTTGTCACTAGGCTGGTGGGTCCTTTCGCCTCTCATGTCAATTCCC 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1861 TTACTCTGACGGGGGTTGTCACTAGGCTGGTGGGTCCTTTCGCCTCTCATGTCAATTCCC 1920 Query 1921 TTTGTTGGGCTGCTTGGAAGTACTGATACTAGAGTAGCCTAGTAATACCTaaaaaaaaaa 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1921 TTTGTTGGGCTGCTTGGAAGTACTGATACTAGAGTAGCCTAGTAATACCTAAAAAAAAAA 1980 Query 1981 aaaaaaaaaaaaaa 1994 |||||||||||||| Sbjct 1981 AAAAAAAAAAAAAA 1994 Query= ERCC-00028_genbank |92111297|gb|DQ459419.1| Synthetic construct microarray control MC08 mRNA, complete sequence Length=1147 Subject= ERCC-00028 Length=1130 Score = 2037 bits (1103), Expect = 0.0 Identities = 1126/1135 (99%), Gaps = 9/1135 (0%) Strand=Plus/Plus Query 6 AAGTATTCCATTCCGGCTCATGGTCCCGGCTAGACCTGCAAGATCGAAGGTACTCAATGA 65 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5 AAGTATTCCATTCCGGCTCATGGTCCCGGCTAGACCTGCAAGATCGAAGGTACTCAATGA 64 Query 66 CACCAGTGACTGAGCGGTCAGCCCGGAAATAGCCAGAAATGTTACCATCCCCGCATGTTA 125 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 65 CACCAGTGACTGAGCGGTCAGCCCGGAAATAGCCAGAAATGTTACCATCCCCGCATGTTA 124 Query 126 CACAAACGTCGGGCTGACGAAACCCATGAGAACCTATGGTGAATAGACAGTAAACGAGCG 185 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 125 CACAAACGTCGGGCTGACGAAACCCATGAGAACCTATGGTGAATAGACAGTAAACGAGCG 184 Query 186 CAAAGGCGTGCTGCCAAGGGCTCCCCACCGAATGTAGAACTGATCTGATCTTCCGTGACA 245 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 185 CAAAGGCGTGCTGCCAAGGGCT-CCCACCGAATGTAGAACTGATCTGAT-TTCCGTGACA 242 Query 246 GGGAAACGCAATGCGAGGTTCCGCAAGTCCACCTATAATCTGTGACCGCTCGTAGAACAT 305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 243 GGGAAACGCAATGCGAGGTTCCGCAAGTCCACCTATAATCTGTGACCGCTCGTAGAACAT 302 Query 306 GGTTAGGGGCCTGATTCAGTTAAATCAAGCCACCTCTGACAGAACGACGAGTCAGTGGAA 365 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 303 GGTTA-GGGCCTGATTCAGTTAAATCAAGCCACCTCTGACAGAACGACGAGTCAGTGGAA 361 Query 366 TCGACTTCACACACCTCAGAGTCCACTCACGTGCTGTAAGTCAAAACCCAGTGAACTTCT 425 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 362 TCGACTT--CACACCTCAGAGTCCACTCACGTGCTGTAAGTCAAAACCCAGTGAACTTCT 419 Query 426 CAACCGTGTAGCGCTCCTAGAACATTCAGGCGCCACTGAGGGGCATATGGATGAAGCGTG 485 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 CAACCGTGTAGCGCTCCTAGAACATTCAGGCGCCACTGAGGGGCATATGGATGAAGCGTG 479 Query 486 ATACGAATTACCTCCAACGAATGCCAGCTGGGAGGAGGATAGGGACTATGTCTTCGTCAA 545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 ATACGAATTACCTCCAACGAATGCCAGCTGGGAGGAGGATAGGGACTATGTCTTCGTCAA 539 Query 546 TGCTCCCGTCAAATGCCTTTCTAAATACCTTTTCGACCTCTCTGTGTGGAATGGGGTCTA 605 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 TGCTCCCGTCAAATGCCTTTCTAAATACCTTTTCGACCTCTCTGTGTGGAATGGGGTCTA 599 Query 606 GAACCAAGGACTAAAGCGGTGCACGAGGCCCTTTGGATATGTCCTTCTTGGGAGGGCCCA 665 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 GAACCAAGGACTAAAGCGGTGCACGAGGCCCTTTGGATATGTCCTTCTTGGGAGGGCCCA 659 Query 666 CAGCCAAAGCCACCCATCACAGCTGGAATCTAATCTTGTGACCCAGTATTAACCGTGAGA 725 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 CAGCCAAAGCCACCCATCACAGCTGGAATCTAATCTTGTGACCCAGTATTAACCGTGAGA 719 Query 726 TCTACACAACCGACAAGCGCTAGCTTCCTCCCCGGTCAAGTAGTAATGCCGGGATGACTT 785 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 TCTACACAACCGACAAGCGCTAGCTTCCTCCCCGGTCAAGTAGTAATGCCGGGATGACTT 779 Query 786 TGCGTGTCCTATAGCGATCGAGCCCTCGAATTCACGTCGTCAAAGTGGAATGATCAGATT 845 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 TGCGTGTCCTATAGCGATCGAGCCCTCGAATTCACGTCGTCAAAGTGGAATGATCAGATT 839 Query 846 AAAGGGCTGTCGGGAGGGATGTGTAGGCCACTAACACCCCTCTGCACGAACTATAGATAC 905 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 AAAGGGCTGTCGGGAGGGATGTGTAGGCCACTAACACCCCTCTGCACGAACTATAGATAC 899 Query 906 GTCTTTCATCGGTACGCTCGAAAGCGCAGGTGGCTCCCAAATCGTGGGGAGTTAATCGAG 965 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 GTCTTTCATCGGTACGCTCGAAAGCGCAGGTGGCTCCCAAATCGTGGGGAGTTAATCGAG 959 Query 966 CTGCGGATTGGTCCCCACGCCTTACGGCAGCGAACATAATCCCGCTGATGTGAAGTCGAT 1025 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 960 CTGCGGATTGGTCCCCACGCCTTACGGCAGCGAACATAATCCCGCTGATGTGAAGTCGAT 1019 Query 1026 CTACAAGGTAAACAACGGGGAATATAATTCAGTTGAACCGGTGTGGAGCCTGCACTTGGA 1085 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1020 CTACAAGGTAAACAACGGGGAATATAATTCAGTTGAACCGGTGTGGAGCCTGCACTTGGA 1079 Query 1086 ACGACTGCATAAGGGACCCAACAGCCCCTCATaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1140 ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1080 ACG-CTGCATAAGGGACCCAACAGCCCC--A-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1130 Query= ERCC-00031_genbank |92111309|gb|DQ459431.1| Synthetic construct microarray control MC30 mRNA, complete sequence Length=1140 Subject= ERCC-00031 Length=1138 Score = 2026 bits (1097), Expect = 0.0 Identities = 1128/1141 (98%), Gaps = 9/1141 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGGAGAAAAGCTTCTTGCCTAGTTACAGCACGAAGATTGGGACCCATCGATCAGCGCCTC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GGGAGAAAAGCTTCTTGCCTAGTTACAGCACGAAGATTGGGACCCATCGATCAGCGCCTC 60 Query 61 CGTGCAATGGCGCCTTGGTGACACTCTCTAAAATGCAGTCGGTAGCGGGGCATGTAGTTA 120 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CGTGCAATGGCGCCTTGGT-ACACTCTCTAAAATGCAGTCGGTAGCGGGGCATGTAGTTA 119 Query 121 CTGCGGTGATATTAAGCTAGTGAGTAACCTT-TATCGAACTGTCTACCAAATTGATGTAT 179 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 CTGCGGTGATATTAAGCTAGTGAGTAACCTTATATCGAACTGTCTACCAAATTGATGTAT 179 Query 180 CTACATTAGCCGTACGATGAGACAATGAACCGTGTCTACGCTCGGGAGCATTACCCCTAT 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 CTACATTAGCCGTACGATGAGACAATGAACCGTGTCTACGCTCGGGAGCATTACCCCTA- 238 Query 240 TCATGAGCCTACAAGCACCTGACTAGACCAGGAGACAACTTGAGCGAGACACTAGCGAGA 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 239 TCATGAGCCTACAAGCACCTGACTAGACCAGGAGACAACTTGAGCGAGACACTAGCGAGA 298 Query 300 GGTGCCGATATAAGGTACA-TGTTGCGGATGCTCAACATCGCATTTTTATCCCCTGGCGG 358 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 299 GGTGCCGATATAAGGTACATTGTTGCGGATG-TCAACATCGCATTTTTATCCCCTGGCGG 357 Query 359 GATGCAACTAACACCAGTAATGTCGTTCTCCACGACCCCCTACCCGAAAACTTACTCGTA 418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 358 GATGCAACTAACACCAGTAATGTCGTTCTCCACGACCCCCTACCCGAAAACTTACTCGTA 417 Query 419 TGAGTACTTTCGCGACGACTCGGCTGTGTAGTTTCCAAGCAGGCCCCTGGCTAGACCCAT 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 418 TGAGTACTTTCGCGACGACTCGGCTGTGTAGTTTCCAAGCAGGCCCCTGGCTAGACCCAT 477 Query 479 TTGTACCACGCGGAGGATCATC-GAATCCATAATCGGCCACAAACTAGCCGGCTGGAAAC 537 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 478 TTGTACCACGCGGAGGATCATCGGAATCCATAATCGGCCACAAACTAGCCGGCTGGAAAC 537 Query 538 CTTGTGATATCATGAACGAGGAGTAAGAGCTGGTTAGTGAATCACCTTGAGGGCGAGGAA 597 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 538 CTTGTGATATCATGAACGAGGAGTAAGAGCTGGTTAGTGAATCACCTTGAGGGCGAGGAA 597 Query 598 CACAACAATTCTGCGGGTTAGCAGGAAGGTTAGGGAACTCGCTCATAGCATATTAGTACC 657 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 598 CACAACAATTCTGCGGGTTAGCAGGAAGGTTAGGGAACTCGCTCATAGCATATTAGTACC 657 Query 658 GCTATCTCCTTTCCTTGGCGCGATATCTCCCAAAGTTAGGCT-ATTCTGCCGCCTGTGAT 716 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 658 GCTATCTCCTTTCCTTGGCGCGACATCTCCCAAAGTTAGGCTGATTCTGCCGCCTGTGAT 717 Query 717 CGCTATCCTTATTTGTGGCAGAATATGTCGATGCAAAAAACCTTAATTCGTGCTTCATAC 776 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 718 CGCTATCCTTATTTGTGGCAGAATATGTCGATGCAAAAAACCTTAATTCGTGCTTCATAC 777 Query 777 ATCATCCCCGAGAACTCCACGGCTCCACTACCGCTTATCACGCGTGGGTGCTAAATGATA 836 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 778 ATCATCCCCGAGAACTCCACGGCTCCACTCCCGCTTATCACGCGTGGGTGCTAAATGATA 837 Query 837 CGAAGTGTGGCAGTCTATGTTAACTTGGAGCATCA-ATTTATTTCTGTTCACGGATTAAG 895 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 838 CGAAGTGTGGCAGTCTATGTTAACTTGGAGCATCATATTTATTTCTGTTCACGGATGAAG 897 Query 896 GCCTATATCAATGATCATTAAAGACATTCCGTCATCGGCTACATGCAAAGAGGCTTTTCC 955 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 GCCTATATCAATGATCATTAAAGACATTCCGTCATCGGCTACATGCAAAGAGGCTTTTCC 957 Query 956 ACCCTGTTTCGGTGATTCAGGTGTCGAGCGACCATTATCTGTCGGCTCATCATCGAACCG 1015 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 958 ACCCTGTTTCGGTGATTCAGGTGTCGAGCGACCATTATCTGTCGGCTCATCACCGAACCG 1017 Query 1016 GCCGT-ATAGAGTCTTCGCATCAGGTTACACCATGTCGACTGATAGTAACTGTGGTTCGA 1074 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1018 GCCGTGATAGAGTCTTCGCATCAGGTTACACCATGTCGACTGATAGTAACTGTGGTTCGA 1077 Query 1075 GTTATGCGTGTTGACACACCGTTGAGGCGCCCTATTTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1078 GTTATGCGTGTTGACACACCGTTGAGGCGCCCTATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1137 Query 1135 a 1135 | Sbjct 1138 A 1138 Query= ERCC-00033_genbank |103488743|gb|DQ516796.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-2000-79 genomic sequence Length=2000 Subject= ERCC-00033 Length=2022 Score = 3694 bits (2000), Expect = 0.0 Identities = 2000/2000 (100%), Gaps = 0/2000 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GCACGCCCTATTTAACTGGAAACCTTCCAAGATTCGGAGAGCATATAAGTTGGGCCGAAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GCACGCCCTATTTAACTGGAAACCTTCCAAGATTCGGAGAGCATATAAGTTGGGCCGAAA 60 Query 61 GCTCAGCTGTGAGCTTTGCAAACTCTGTCTTAGGAGCTAAGACAAATAGAGAAGGTGGGC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GCTCAGCTGTGAGCTTTGCAAACTCTGTCTTAGGAGCTAAGACAAATAGAGAAGGTGGGC 120 Query 121 CATCAGCATTAGCAGCTGCAATTATTGGAAAAACACCATATTATGGATATCACTTAGATG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CATCAGCATTAGCAGCTGCAATTATTGGAAAAACACCATATTATGGATATCACTTAGATG 180 Query 181 AAAATAGAAAGACAACACATATCATTGAGTTAGATGGACAATTAATCTCTAACTTTAAAT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 AAAATAGAAAGACAACACATATCATTGAGTTAGATGGACAATTAATCTCTAACTTTAAAT 240 Query 241 ATGGAGAGAGTTTTTATGGAGCTTTAGGTTACTTAGTTGGGAAGATTGTTAAGAATGGCA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 ATGGAGAGAGTTTTTATGGAGCTTTAGGTTACTTAGTTGGGAAGATTGTTAAGAATGGCA 300 Query 301 TTCCATATTTTGAAAATCTATATAAATTAAATCCAAATAACGATAATTTAAAATCCTTGG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TTCCATATTTTGAAAATCTATATAAATTAAATCCAAATAACGATAATTTAAAATCCTTGG 360 Query 361 GAGCTGCAATGGCTGCAAGTGGTGGTATCGCCTTATATCACGCAAAAAACTTGACAGCTG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GAGCTGCAATGGCTGCAAGTGGTGGTATCGCCTTATATCACGCAAAAAACTTGACAGCTG 420 Query 421 AATGCAGAGTTAAAGAAGTTGTTAATGATAAAATTGAAAAGATATCTATTGGAGTTGAGG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 AATGCAGAGTTAAAGAAGTTGTTAATGATAAAATTGAAAAGATATCTATTGGAGTTGAGG 480 Query 481 AGATAAAGGAAGCTTATGAAAAATTAAATACAACAAATGAAGAGCCAGATTTAATTTGTA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 AGATAAAGGAAGCTTATGAAAAATTAAATACAACAAATGAAGAGCCAGATTTAATTTGTA 540 Query 541 TTGGTTGCCCTCACTGCAGTTTAATGGaaattaaaaaaattgctgaacttttaaaaaata 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TTGGTTGCCCTCACTGCAGTTTAATGGAAATTAAAAAAATTGCTGAACTTTTAAAAAATA 600 Query 601 aaaaatTGAATGCTGATTTATGGGTTTGCTGCTCTCTTCATATTAAAGCAATAGCAGATA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 AAAAATTGAATGCTGATTTATGGGTTTGCTGCTCTCTTCATATTAAAGCAATAGCAGATA 660 Query 661 GAATGGGATATACAAAGATTATTGAAAAAGCTGGTGGAAAGGTAGTTAAAGACACCTGTA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 GAATGGGATATACAAAGATTATTGAAAAAGCTGGTGGAAAGGTAGTTAAAGACACCTGTA 720 Query 721 TGGTTGTTTCTCCAATTGAGGATTTAGGTTATAAAAGAGTTGCAACAAACTCTGGAAAAG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 TGGTTGTTTCTCCAATTGAGGATTTAGGTTATAAAAGAGTTGCAACAAACTCTGGAAAAG 780 Query 781 CTGCTGTTTATCTACCAAGCTTTTGTAAGAGTGAAGTAATTTTTGGAGATATTGAGGAAT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 CTGCTGTTTATCTACCAAGCTTTTGTAAGAGTGAAGTAATTTTTGGAGATATTGAGGAAT 840 Query 841 TGTTAAAAGGGAGATAATGCTGAATCCAATAATCTTATTTTTGGCTATTATTTTTGATAG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 TGTTAAAAGGGAGATAATGCTGAATCCAATAATCTTATTTTTGGCTATTATTTTTGATAG 900 Query 901 AATCATTGGGGAGTTGCCAGAGAGTATTCATCCAACGGTTTGGATAGGGAAGTTGATAGC 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 AATCATTGGGGAGTTGCCAGAGAGTATTCATCCAACGGTTTGGATAGGGAAGTTGATAGC 960 Query 961 TTTTTTAGAGAACATATTTAAATCTACAAATTGCAAAAATAAATATAGAGATTTTTTGTT 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 TTTTTTAGAGAACATATTTAAATCTACAAATTGCAAAAATAAATATAGAGATTTTTTGTT 1020 Query 1021 TGGCTCACTAACAACATTTATTACTCTATTAGTTGTGGGAGTTATAGCtttttttGTTGA 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 TGGCTCACTAACAACATTTATTACTCTATTAGTTGTGGGAGTTATAGCTTTTTTTGTTGA 1080 Query 1081 TAAATGCATAATGCTGTTACCATTTCCTTTAAACTATATTATCTATGGTTTTTTGTTATC 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 TAAATGCATAATGCTGTTACCATTTCCTTTAAACTATATTATCTATGGTTTTTTGTTATC 1140 Query 1141 AACAACTATTGGCTACAAATCATTATTCGAATTCTGCAAAAAGCCGATTGAATATATAAA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 AACAACTATTGGCTACAAATCATTATTCGAATTCTGCAAAAAGCCGATTGAATATATAAA 1200 Query 1201 AAATGGTGATTTAGAGGGAGCAAGGAAAGCTGTTCAGCATATAGTTAGCAGAGATGCCTC 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 AAATGGTGATTTAGAGGGAGCAAGGAAAGCTGTTCAGCATATAGTTAGCAGAGATGCCTC 1260 Query 1261 AAAGTTGGATAAAGAGCATGTATTATCGGCTGCAGTAGAGAGCTTATCCGAGAACATAAC 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 AAAGTTGGATAAAGAGCATGTATTATCGGCTGCAGTAGAGAGCTTATCCGAGAACATAAC 1320 Query 1321 AGACAGTATAATTGGAGCTTTATTCTATGCTATATTTTTTGGTTTGCCTGGAGCCTTTGT 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 AGACAGTATAATTGGAGCTTTATTCTATGCTATATTTTTTGGTTTGCCTGGAGCCTTTGT 1380 Query 1381 TTATAGGGCGATAAATACATTAGATGCAATGATTGGTTATAAAAATGAGAAATATCTATG 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1381 TTATAGGGCGATAAATACATTAGATGCAATGATTGGTTATAAAAATGAGAAATATCTATG 1440 Query 1441 GTATGGGAAGTTAGCAGCAAGGTTGGATGATATTGCCAATTTTATTCCTTCAAGAATAGC 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1441 GTATGGGAAGTTAGCAGCAAGGTTGGATGATATTGCCAATTTTATTCCTTCAAGAATAGC 1500 Query 1501 AGGGATTTTGCTAATAATTACTGCCCCATTTTATAAAGGAGATGTTAAAAAGGCAATATA 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 AGGGATTTTGCTAATAATTACTGCCCCATTTTATAAAGGAGATGTTAAAAAGGCAATATA 1560 Query 1561 TGGGTTTTTAAAAGAAGCTAATAAGGTTCCATCACCAAACTCTGGTTATACAATGGCTAC 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 TGGGTTTTTAAAAGAAGCTAATAAGGTTCCATCACCAAACTCTGGTTATACAATGGCTAC 1620 Query 1621 ATTGGCAAATGCATTAAATATAACTTTGGAGAAGATAGGATATTATAAACTTGGTAGTGG 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1621 ATTGGCAAATGCATTAAATATAACTTTGGAGAAGATAGGATATTATAAACTTGGTAGTGG 1680 Query 1681 GAAAATAGATGTTGAAAAATCTTTAAACGCTTTTAAGGCAGTTGATTATACAGTCGTTGT 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1681 GAAAATAGATGTTGAAAAATCTTTAAACGCTTTTAAGGCAGTTGATTATACAGTCGTTGT 1740 Query 1741 GTTTTTAATTATTTATACTTTAATTTGGTGGATAACATGATAAGTAAAGCTTATTACACT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1741 GTTTTTAATTATTTATACTTTAATTTGGTGGATAACATGATAAGTAAAGCTTATTACACT 1800 Query 1801 ACAGAGATTCCAGAGGATAGATTTGAAGCTCTGAGTTGTATTAAAGATAGTCAAAAACCT 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1801 ACAGAGATTCCAGAGGATAGATTTGAAGCTCTGAGTTGTATTAAAGATAGTCAAAAACCT 1860 Query 1861 CTTAAAATTATATTACTTGGAGGAGTTGATAGTGGTAAAACAACATTAGCTACTTTTTTG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1861 CTTAAAATTATATTACTTGGAGGAGTTGATAGTGGTAAAACAACATTAGCTACTTTTTTG 1920 Query 1921 GCAAATGAGCTTTTAAACTTAGGATTTAAAGTTGCTATAGTCGATAGTGATGTAGGGCAG 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1921 GCAAATGAGCTTTTAAACTTAGGATTTAAAGTTGCTATAGTCGATAGTGATGTAGGGCAG 1980 Query 1981 AAGAGCATTTTACCTCCAGC 2000 |||||||||||||||||||| Sbjct 1981 AAGAGCATTTTACCTCCAGC 2000 Query= ERCC-00034_genbank |110586147|gb|DQ855001.1| Synthetic construct clone AG012.1111 external RNA control sequence Length=996 Subject= ERCC-00034 Length=1019 Score = 1805 bits (977), Expect = 0.0 Identities = 990/996 (99%), Gaps = 1/996 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGTATTACCCAGCACTCGTATGGCGCCCCATCGTTGTATCAGCAGGAGCATATGTTGCTC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GGTATTACCCAGCACTCGTATGGCGCCCCATCGTTGTATCAGCAGGAGCATATGTTGCTC 60 Query 61 TTGATTGTATCACTTCGCGAGAAAGACCCCTTGAATACACGAGCTGCCGTCCGGATAACG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TTGATTGTATCACTTCGCGAGAAAGACCCCTTGAATACACGAGCTGCCGTCCGGATAACG 120 Query 121 ATGTAATAGCCTATGGAGGGGAAGTAGTCATGTCTGCGGACTATTGGTAAGAGCACCGCC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ATGTAATAGCCTATGGAGGGGAAGTAGTCATGTCTGCGGACTATTGGTAAGAGCACCGCC 180 Query 181 TCGTCGTACGTGGACACGAAGCTGTTCGGCCGCACGCAAGTACCTCCCACTTAGAAAGCG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TCGTCGTACGTGGACACGAAGCTGTTCGGCCGCACGCAAGTACCTCCCACTTAGAAAGCG 240 Query 241 AATAACCCAACGACCGTGTTCAACCCTGGCCGTCTCTCAACCAGGTATGCAATCAACGAC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 AATAACCCAACGACCGTGTTCAACCCTGGCCGTCTCTCAACCAGGTATGCAATCAACGAC 300 Query 301 ATTGGCCCAGATGTAGGGCCGTCTTGGTGGATTGAAACTCGGATCGATCACGTATGGTCT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATTGGCCCAGATGTAGGGCCGTCTTGGTGGATTGAAACTCGGATCGATCACGTATGGTCT 360 Query 361 AGACCTTATACAACACCTGTGCGTGCGTCTGCGTCTGGCGATGGTGGGTAGCGGTCCGGA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 AGACCTTATACAACACCTGTGCGTGCGTCTGCGTCTGGCGATGGTGGGTAGCGGTCCGGA 420 Query 421 CCACGATCGTACTGTAGGCGGCCCAAATGCGGATCTTTAGGTTGACCGATTGTACATCTC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CCACGATCGTACTGTAGGCGGCCCAAATGCGGATCTTTAGGTTGACCGATTGTACATCTC 480 Query 481 GCCATAGCCCTTTTCGTCACAACCTTTATAAAAGGGGTCAGGCCACTGTGTGAATCAGAT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GCCATAGCCCTTTTCGTCACAACCTTTATAAAAGGGGTCAGGCCACTGTGTGAATCAGAT 540 Query 541 GGCAAGCCCGTATCCGTATAGAAACATACGTTTCTCTGGCCACGACCAATAATTATGCAC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GGCAAGCCCGTATCCGTATAGAAACATACGTTTCTCTGGCCACGACCAATAATTATGCAC 600 Query 601 TGTTGGCTccccccccGGGTCTACGGAGAACATTAGATATCGACCTAATATCCTGATAGC 660 ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TGTTGGCTCGGAAGC-GGGTCTACGGAGAACATTAGATATCGACCTAATATCCTGATAGC 659 Query 661 TAGCTTTCCCGAGGATAGGCGAGGATGGGCGTGCTAGACACAGGAGCATTGCATCACATG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 TAGCTTTCCCGAGGATAGGCGAGGATGGGCGTGCTAGACACAGGAGCATTGCATCACATG 719 Query 721 AATAAAGGGCTACGTACGCAGCGGCGTTAAGACAGACTTAGACTGATCACTATGAAATGA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 AATAAAGGGCTACGTACGCAGCGGCGTTAAGACAGACTTAGACTGATCACTATGAAATGA 779 Query 781 TAGACACCATGTCGCAATTTGCTCCCTCACTCATATCGTTGTATCATAAAGTTGATCCTA 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 TAGACACCATGTCGCAATTTGCTCCCTCACTCATATCGTTGTATCATAAAGTTGATCCTA 839 Query 841 ATCACAAACCGAGTAACGAGCCAGACTAATCCGGAACATTCGTAAGCGATAGTGGTTGGC 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 ATCACAAACCGAGTAACGAGCCAGACTAATCCGGAACATTCGTAAGCGATAGTGGTTGGC 899 Query 901 TCCTCCCGGTCGCCGAACTGATATCATAGCTAAGTATGCTGGCCTCGGTTAACCGCGAAG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 TCCTCCCGGTCGCCGAACTGATATCATAGCTAAGTATGCTGGCCTCGGTTAACCGCGAAG 959 Query 961 GCATATACAATGGATTCGCTGTCCGCGTAGCAATAT 996 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 960 GCATATACAATGGATTCGCTGTCCGCGTAGCAATAT 995 Query= ERCC-00035_genbank |92111291|gb|DQ459413.1| Synthetic construct microarray control MC02 mRNA, complete sequence Length=1136 Subject= ERCC-00035 Length=1130 Score = 2065 bits (1118), Expect = 0.0 Identities = 1127/1131 (99%), Gaps = 2/1131 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGGAGAGGTATCGTAAAGGTGAATCCTGTGGCTGTAGGAAGCAGTTCATATGACCAACGG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GGGAGAGGTATCGTAAAGGTGAATCCTGTGGCTGTAGGAAGCAGTTCATATGACCAACGG 60 Query 61 GCGCCCTAGGGTATACTCCAGAATCGAATGTTACCAGAAAATAGGGGAACTGGTCGCTCC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GCGCCCTAGGGTATACTCCAGAATCGAATGTTACCAGAAAATAGGGGAACTGGTCGCTCC 120 Query 121 TAGGTAAGGTTGCCTGTCCCCGCACTGTACGAAGGTCCGGTCAACGGAAGCAGGCACACG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TAGGTAAGGTTGCCTGTCCCCGCACTGTACGAAGGTCCGGTCAACGGAAGCAGGCACACG 180 Query 181 CGCTATCTGAGTCCAAATACTTGATCCGGCCGGAAAATTAGAGGTGACGGCTTCCCACTA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CGCTATCTGAGTCCAAATACTTGATCCGGCCGGAAAATTAGAGGTGACGGCTTCCCACTA 240 Query 241 CTGATCTCACTGACGTGCAATCATCCTGTGTCCGGAGCAATGACAGTGTCCAGTCTGTTA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CTGATCTCACTGACGTGCAATCATCCTGTGTCCGGAGCAATGACAGTGTCCAGTCTGTTA 300 Query 301 TGGACGAGCTGGACGATTCACAGATAAGGACAGTCGCCCGGATACCGCAAACTAAATCTT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TGGACGAGCTGGACGATTCACAGATAAGGACAGTCGCCCGGATACCGCAAACTAAATCTT 360 Query 361 GCCTGCCTCCGAGGGTGTGTGAAGGATAACTGTCGCCCTTAAGTAAAGATCTACCATTCG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GCCTGCCTCCGAGGGTGTGTGAAGGATAACTGTCGCCCTTAAGTAAAGATCTACCATTCG 420 Query 421 CCGGGGCAACGCGGCTCTCTGATGCTACGACCAAAGTGGTTGACATTACGCCAGTAATGG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CCGGGGCAACGCGGCTCTCTGATGCTACGACCAAAGTGGTTGACATTACGCCAGTAATGG 480 Query 481 ACTAAGGTTGAATTTGAGCGGATGGGCTCAACTGCGTCGTAACCGGTAGATACAGGGCAT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 ACTAAGGTTGAATTTGAGCGGATGGGCTCAACTGCGTCGTAACCGGTAGATACAGGGCAT 540 Query 541 ACGAGCCTCCCTATTTAACGGCATCATCCCGCGTAGTGCTGGTCAACCCGACTGTCTATT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 541 ACGAGCCTCCCTATTTAACGGCATCATCCCGCGTAGTGCTGGTCAACC-GACTGTCTATT 599 Query 601 GAAGTCAGGTTTCGGCTACATCAGCTGGAACGTTCCCGTAGCTACTATAATCAGGCAATC 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 GAAGTCAGGTTTCGGCTACATCAGCTGGAACGTTCCCGTAGCTACTATAATCAGGCAATC 659 Query 661 TGTCCCGAAGAGCCCACACCCTGACTTGGCCGTAAGGGAGCCCTAAATCAGTTAAATACG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 TGTCCCGAAGAGCCCACACCCTGACTTGGCCGTAAGGGAGCCCTAAATCAGTTAAATACG 719 Query 721 GGGAAGGAGTCTCGCCCTCCGGGTGATCCATCTTATTTACCAAAGAACATGTC-ACGCCT 779 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 720 GGGAAGGAGTCTCGCCCTCCGGGTGATCCATCTTATTTACCAAAGAACATGTCCACGCCT 779 Query 780 GTGGGCTCTGAAGATGGGCGACACATGTCTACCCTGGCATAACGCCCAGCTTGATAAGAG 839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 GTGGGCTCTGAAGATGGGCGACACATGTCTACCCTGGCATAACGCCCAGCTTGATAAGAG 839 Query 840 TGAAACGACCCATCTGACACAGGCCGGCATAGAAGACCAGCGCAATGCGAGGGCCACACA 899 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 TGAAACGACCCATCTGACACAGGCCGGCATAGAAGACCAGCGCAATGCGAGGGCCACACA 899 Query 900 TAGGAGTGTGAAAATCTACATCAACATACTTCGGCCGTGGCTGAACCAGGGAGTGCTTGT 959 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 900 TAGGAGTGTGAAAATCTACATCAACATACTTCGGCCGTGGCTGAACGAGGGAGTGCTTGT 959 Query 960 ACAATCCCGTTGTTTGGTGTGGCAGATTCCGGGAAATGAGCAAACGCTTCTCCCATGAAC 1019 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 960 ACAATCCCGTTGTTTGGTGTGGCAGATTCCGGGAAATGAGCAAACGCTTCTCCCATGAAC 1019 Query 1020 ACACTCACAGCCATAAGTCCTACCTTGCTAACATCGCCCCGAATGCAGAGCCACCTACTG 1079 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1020 ACACTCACAGCCATAAGTCCTACCTTGCTAACATCGCCCCGAATGCAGAGCCACCTACTG 1079 Query 1080 GGGTTGTCTGAGAATACTCCATGGGTCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1130 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1080 GGGTTGTCTGAGAACACTCCATGGGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1130 Query= ERCC-00039_genbank |114975660|gb|DQ883656.2| Synthetic construct clone NISTag15 external RNA control sequence Length=750 Subject= ERCC-00039 Length=740 Score = 1367 bits (740), Expect = 0.0 Identities = 740/740 (100%), Gaps = 0/740 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GAGCATGGCCTAACTGAATGCGCCTGCAGTATCTTTCTTAGTATATCAAGATCCGTAATA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GAGCATGGCCTAACTGAATGCGCCTGCAGTATCTTTCTTAGTATATCAAGATCCGTAATA 60 Query 61 TAACGGTTTGCGCGACTACGGTTACCGTCTTTATAAGTGAACAAAACCGGCTACCAGCAT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TAACGGTTTGCGCGACTACGGTTACCGTCTTTATAAGTGAACAAAACCGGCTACCAGCAT 120 Query 121 GTCGTATTTCGCCACCCATATAAACCCCACTTCGTCCTCAAGGAATCCAAAAGTCGGACG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GTCGTATTTCGCCACCCATATAAACCCCACTTCGTCCTCAAGGAATCCAAAAGTCGGACG 180 Query 181 GCGTGGCTTGTCATCTTCGTCAGAAGGTTCGAAACCAGTAAAAAGACGCGATAGATAGGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GCGTGGCTTGTCATCTTCGTCAGAAGGTTCGAAACCAGTAAAAAGACGCGATAGATAGGC 240 Query 241 CTAAGTGGGCCTCCCCTTTGCCAAAATCACGACGAAGTGACTAGTGCAGGCGTCGTATAC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CTAAGTGGGCCTCCCCTTTGCCAAAATCACGACGAAGTGACTAGTGCAGGCGTCGTATAC 300 Query 301 TTACTCCTCATGTTCAGCCCACGCTGCATTGGTAGGCTGTTAGAAGCCGTGACCGAACAG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TTACTCCTCATGTTCAGCCCACGCTGCATTGGTAGGCTGTTAGAAGCCGTGACCGAACAG 360 Query 361 GGTATGATGACCTCGCCATGGGCACCCTTGTATTCTCGGGGGCGGATGTAGAAATCAAAG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GGTATGATGACCTCGCCATGGGCACCCTTGTATTCTCGGGGGCGGATGTAGAAATCAAAG 420 Query 421 CTGTTTACTAACCATGTACTGTCCTAAGAGATTGGCTGTGACCGGTCCCGGACACTGCGT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CTGTTTACTAACCATGTACTGTCCTAAGAGATTGGCTGTGACCGGTCCCGGACACTGCGT 480 Query 481 CAACGCAGGTCGCTCACGATCGGCGTGCGCATTTTCGTGAATCATGTATAGTGGTTCTCG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 CAACGCAGGTCGCTCACGATCGGCGTGCGCATTTTCGTGAATCATGTATAGTGGTTCTCG 540 Query 541 TTAGATACACATGTAAGCTGAATGGGGCCCTACCCAACCGGTTGGGTCTATAAGGCAGAT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TTAGATACACATGTAAGCTGAATGGGGCCCTACCCAACCGGTTGGGTCTATAAGGCAGAT 600 Query 601 GTGCGACGCACCTATTGGTAGGCCAATCTTATGGTTTGCCTCTTGTACTGAGGGTACCGC 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GTGCGACGCACCTATTGGTAGGCCAATCTTATGGTTTGCCTCTTGTACTGAGGGTACCGC 660 Query 661 AGAGGTCCACTGGTTAGCTCACACTATGATCTAGGAGCAGTTGGGCGGTAAACGGCaaaa 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 AGAGGTCCACTGGTTAGCTCACACTATGATCTAGGAGCAGTTGGGCGGTAAACGGCAAAA 720 Query 721 aaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 740 |||||||||||||||||||| Sbjct 721 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 740 Query= ERCC-00040_genbank |114976678|gb|DQ883661.2| Synthetic construct clone NISTag20 external RNA control sequence Length=750 Subject= ERCC-00040 Length=744 Score = 1369 bits (741), Expect = 0.0 Identities = 743/744 (99%), Gaps = 0/744 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 AACTACGATCCCATGAGAACACCTGTAGATACTCAGGTCTCCGCGGACCTACGCCGCGGA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 AACTACGATCCCATGAGAACACCTGTAGATACTCAGGTCTCCGCGGACCTACGCCGCGGA 60 Query 61 CGATGATAAAGTCCGAGAAACCACCGGATTGCCCCAACAGACGGCCTAGCCCATCGAACT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CGATGATAAAGTCCGAGAAACCACCGGATTGCCCCAACAGACGGCCTAGCCCATCGAACT 120 Query 121 AGGGAAATGAACTATATCGTAACCAAGCCGGGTAGCTGCGGTGGTGCTAGACTAGATGTT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AGGGAAATGAACTATATCGTAACCAAGCCGGGTAGCTGCGGTGGTGCTAGACTAGATGTT 180 Query 181 AGCGTTCAGTCGAGCTGTTACGTGTAACGCCATTGAGACCCTTACCCTTTACCGGTCGGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 AGCGTTCAGTCGAGCTGTTACGTGTAACGCCATTGAGACCCTTACCCTTTACCGGTCGGC 240 Query 241 GGATACGTCCAGCTTCGTCACTGCGTTCGAGCCTTCTACACGATCCAAGTTACCAGCGCA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GGATACGTCCAGCTTCGTCACTGCGTTCGAGCCTTCTACACGATCCAAGTTACCAGCGCA 300 Query 301 GTTTAAGGTACGTCGCTTCGACCAGAACGAGAGTTCGCAGCAAGGGGGAGGAGTTGGATT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GTTTAAGGTACGTCGCTTCGACCAGAACGAGAGTTCGCAGCAAGGGGGAGGAGTTGGATT 360 Query 361 CTTAGGGAATGAGGCTGAACCTAACTCCTCGCTACATTCCTATTGTTTTCCCGATCGGCT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CTTAGGGAATGAGGCTGAACCTAACTCCTCGCTACATTCCTATTGTTTTCCCGATCGGCT 420 Query 421 TCATCGGGACGCCGGAGACCGCACCTTTGCCCGTTTAAGCTCGGACGGGATGCCACGGTT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TCATCGGGACGCCGGAGACCGCACCTTTGCCCGTTTAAGCTCGGACGGGATGCCACGGTT 480 Query 481 CTGTTCCACAACCCGGTCGGAGCACACCCTCACTATGCTGCGTCTATGCCTTCCGGGTGG 540 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 CTGTTCCACAACCCGGTCGGAGCACACCCTCTCTATGCTGCGTCTATGCCTTCCGGGTGG 540 Query 541 TTGAGGTGAGCCATGTGGTCTTAGAATCCGGTTGTATTAGACAGTATTGTGCTTGACGTC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TTGAGGTGAGCCATGTGGTCTTAGAATCCGGTTGTATTAGACAGTATTGTGCTTGACGTC 600 Query 601 GTGGTATCGGGTGGTTGTGAAGGATACAGATATTCTATGGGCAGCGATGGGGCTTCCTCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GTGGTATCGGGTGGTTGTGAAGGATACAGATATTCTATGGGCAGCGATGGGGCTTCCTCA 660 Query 661 GTCCGTCTACGGCCCACCAGACAAACAACTCGGGATACAAATTGAGCACCCGCGGACCGG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 GTCCGTCTACGGCCCACCAGACAAACAACTCGGGATACAAATTGAGCACCCGCGGACCGG 720 Query 721 aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 744 |||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 744 Query= ERCC-00041_genbank |116733906|gb|EF011069.1| Synthetic construct spike-in microarray control O-sialoglycoprotein endopeptidase (gcp) gene, complete cds Length=1101 Subject= ERCC-00041 Length=1122 Score = 2032 bits (1100), Expect = 0.0 Identities = 1100/1100 (100%), Gaps = 0/1100 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2 CCGAGCTCAAGATGCGTTAATTATGTGGGTGACGATAAATGAGTGAGCAAAAAGACATGT 61 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CCGAGCTCAAGATGCGTTAATTATGTGGGTGACGATAAATGAGTGAGCAAAAAGACATGT 60 Query 62 ACGTATTAGGAATTGAAACAAGCTGTGATGAGACTGCTGCAGCTATTGTGAAAAACGGGA 121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ACGTATTAGGAATTGAAACAAGCTGTGATGAGACTGCTGCAGCTATTGTGAAAAACGGGA 120 Query 122 AAGAGATCATTTCAAACGTAGTAGCCTCTCAAATTGAAAGCCATAAGCGCTTCGGAGGCG 181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AAGAGATCATTTCAAACGTAGTAGCCTCTCAAATTGAAAGCCATAAGCGCTTCGGAGGCG 180 Query 182 TTGTTCCGGAAATTGCTTCAAGACATCATGTTGAACAAATCACTTTGGTTATAGAAGAGG 241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TTGTTCCGGAAATTGCTTCAAGACATCATGTTGAACAAATCACTTTGGTTATAGAAGAGG 240 Query 242 CGTTTCGCAAAGCTGGCATGACGTATAGTGATATTGATGCGATTGCAGTAACAGAAGGTC 301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CGTTTCGCAAAGCTGGCATGACGTATAGTGATATTGATGCGATTGCAGTAACAGAAGGTC 300 Query 302 CGGGACTGGTGGGAGCGCTTCTTATCGGAGTGAATGCCGCTAAAGCATTGAGCTTTGCAT 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CGGGACTGGTGGGAGCGCTTCTTATCGGAGTGAATGCCGCTAAAGCATTGAGCTTTGCAT 360 Query 362 ATAACATTCCGTTAGTAGGCGTTCATCATATAGCCGGTCATATATACGCGAACCGTCTTG 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 ATAACATTCCGTTAGTAGGCGTTCATCATATAGCCGGTCATATATACGCGAACCGTCTTG 420 Query 422 TAGAAGACATCGTGTTCCCGGCACTGGCATTGGTCGTTTCAGGAGGCCATACAGAACTGG 481 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TAGAAGACATCGTGTTCCCGGCACTGGCATTGGTCGTTTCAGGAGGCCATACAGAACTGG 480 Query 482 TTTATATGAAGGAACATGGATCATTTGAAGTCATTGGGGAAACCCTTGATGATGCGGCAG 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TTTATATGAAGGAACATGGATCATTTGAAGTCATTGGGGAAACCCTTGATGATGCGGCAG 540 Query 542 GAGAAGCCTACGACAAAGTGGCGCGGACGATGGGATTGCCATATCCGGGTGGACCGCAAA 601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GAGAAGCCTACGACAAAGTGGCGCGGACGATGGGATTGCCATATCCGGGTGGACCGCAAA 600 Query 602 TTGACAAGCTAGCTGAAAAAGGGAATGACAATATTCCGCTTCCTCGCGCATGGCTTGAAG 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TTGACAAGCTAGCTGAAAAAGGGAATGACAATATTCCGCTTCCTCGCGCATGGCTTGAAG 660 Query 662 AAGGCTCTTACAACTTCAGCTTTAGCGGATTGAAGTCTGCGGTGATCAATACGCTTCATA 721 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 AAGGCTCTTACAACTTCAGCTTTAGCGGATTGAAGTCTGCGGTGATCAATACGCTTCATA 720 Query 722 ATGCATCCCAAAAAGGGCAAGAGATTGCTCCGGAAGATTTGTCTGCCAGTTTCCAAAATA 781 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 ATGCATCCCAAAAAGGGCAAGAGATTGCTCCGGAAGATTTGTCTGCCAGTTTCCAAAATA 780 Query 782 GTGTGATCGATGTCTTGGTAACCAAAACGGCGCGCGCGGCAAAGGAATATGATGTCAAAC 841 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 GTGTGATCGATGTCTTGGTAACCAAAACGGCGCGCGCGGCAAAGGAATATGATGTCAAAC 840 Query 842 AGGTCCTTTTAGCCGGAGGAGTAGCTGCAAACAGAGGCCTCAGAGCTGCATTAGAAAAGG 901 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 AGGTCCTTTTAGCCGGAGGAGTAGCTGCAAACAGAGGCCTCAGAGCTGCATTAGAAAAGG 900 Query 902 AATTTGCCCAGCATGAAGGGATTACGCTTGTCATTCCTCCATTAGCTTTATGCACGGATA 961 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 AATTTGCCCAGCATGAAGGGATTACGCTTGTCATTCCTCCATTAGCTTTATGCACGGATA 960 Query 962 ATGCTGCGATGATTGCTGCTGCTGGTACAATTGCTTTTGAAAAAGGAATTCGCGGTGCAT 1021 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 ATGCTGCGATGATTGCTGCTGCTGGTACAATTGCTTTTGAAAAAGGAATTCGCGGTGCAT 1020 Query 1022 ATGATATGAATGGCCAGCCCGGCCTTGAATTGACTTCTTATCAAAGTCTCACGAGATAAT 1081 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 ATGATATGAATGGCCAGCCCGGCCTTGAATTGACTTCTTATCAAAGTCTCACGAGATAAT 1080 Query 1082 AGCGTGAGACTCCCGGGTAC 1101 |||||||||||||||||||| Sbjct 1081 AGCGTGAGACTCCCGGGTAC 1100 Query= ERCC-00042_genbank |103488730|gb|DQ516783.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-66 genomic sequence Length=1000 Subject= ERCC-00042 Length=1023 Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0 Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ACCAACTCTGGCCTTTGTGTTGCTATTCCCCAAGCACACAATCCAGTATAACATCTTCCA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ACCAACTCTGGCCTTTGTGTTGCTATTCCCCAAGCACACAATCCAGTATAACATCTTCCA 60 Query 61 CAAACTCTACAGCCAAGAGCAACCATTGCAGCAGTTCCAATATAGACAGCATCTGCTCCT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CAAACTCTACAGCCAAGAGCAACCATTGCAGCAGTTCCAATATAGACAGCATCTGCTCCT 120 Query 121 AAAGCTATAGCCTTAAATACATCTGCTGAACATCTGATTCCTCCACTTGCTATGATGCTA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AAAGCTATAGCCTTAAATACATCTGCTGAACATCTGATTCCTCCACTTGCTATGATGCTA 180 Query 181 ATTTCATTTCTCAAACCTTCCTCTCTCAATCTTTGATCTACTGCGGCAATAGCCATTTCT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ATTTCATTTCTCAAACCTTCCTCTCTCAATCTTTGATCTACTGCGGCAATAGCCATTTCT 240 Query 241 ATTGGGATTCCAACATGGTCTCTGAATACCTTTGGTGCTGCCCCTGTCCCTCCTTTATAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 ATTGGGATTCCAACATGGTCTCTGAATACCTTTGGTGCTGCCCCTGTCCCTCCTTTATAT 300 Query 301 CCATCTATAACAACTGCGTCAGCATCACTTGTTGCTATTCCAACAGCAATAGCTGGAGCA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CCATCTATAACAACTGCGTCAGCATCACTTGTTGCTATTCCAACAGCAATAGCTGGAGCA 360 Query 361 TTATGGACAGCTGCAATTTTAACAAACACTGGCTTTTTCCATCTTGTTGCTTCTTTCAAA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TTATGGACAGCTGCAATTTTAACAAACACTGGCTTTTTCCATCTTGTTGCTTCTTTCAAA 420 Query 421 CTTCTAACTAATTGAGCTAAATCCTCAATTGAGTAAATGTCATGGTGAGGAGCTGGTGAG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CTTCTAACTAATTGAGCTAAATCCTCAATTGAGTAAATGTCATGGTGAGGAGCTGGTGAG 480 Query 481 ATAGCATCACTTCCCTCAGGAATCATTCTTGTTGCTGAAATTTCTGCTGTAACCTTCTCT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 ATAGCATCACTTCCCTCAGGAATCATTCTTGTTGCTGAAATTTCTGCTGTAACCTTCTCT 540 Query 541 CCAGGTAAGTGCCCTCCAATTCCAGGCTTAGCTCCCTGCCCTATTTTAATCTCTATTGCA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CCAGGTAAGTGCCCTCCAATTCCAGGCTTAGCTCCCTGCCCTATTTTAATCTCTATTGCA 600 Query 601 GAACCTTTCATAAGATACTCTTCATTAACTCCAAATCTTCCACTTGCAACTTGGGTAATT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GAACCTTTCATAAGATACTCTTCATTAACTCCAAATCTTCCACTTGCAACTTGGGTAATT 660 Query 661 ATGTGGTCTGCATAAGGGTAGAGAGCTTTTGGCAATCCTCCTTCACCAGTTCCCATGAAT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 ATGTGGTCTGCATAAGGGTAGAGAGCTTTTGGCAATCCTCCTTCACCAGTTCCCATGAAT 720 Query 721 GTTCCACATTCTTTAACTGCCTTAGCAAATGATAGGTGAGCGTTTAAAGACAAAGCTCCA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GTTCCACATTCTTTAACTGCCTTAGCAAATGATAGGTGAGCGTTTAAAGACAAAGCTCCA 780 Query 781 TAAGACATATGGGCAATCATTATTGGGGTATCTAACTTTAAGTTTGGAGCTAtttttgtt 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TAAGACATATGGGCAATCATTATTGGGGTATCTAACTTTAAGTTTGGAGCTATTTTTGTT 840 Query 841 tttaacttagcttttttAATCTTCTTGCCATCAATCTCTTCTTCAACAAATTCAAACTCT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 TTTAACTTAGCTTTTTTAATCTTCTTGCCATCAATCTCTTCTTCAACAAATTCAAACTCT 900 Query 901 AACTGCTTTGGTTTTTTACCAATGTAAGTTCTTAATTCCATTGGCTCTCTCAATGGGTCG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 AACTGCTTTGGTTTTTTACCAATGTAAGTTCTTAATTCCATTGGCTCTCTCAATGGGTCG 960 Query 961 ATGGATGGGTTTGTAACTTGGCATGCATCTAAAACAATCT 1000 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 961 ATGGATGGGTTTGTAACTTGG-ATGCATCTAAAACAATCT 999 Query= ERCC-00043_genbank |103488734|gb|DQ516787.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-70 genomic sequence Length=1000 Subject= ERCC-00043 Length=1023 Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0 Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 AATACCTTTACAAATGCTTTAACAAGAGGAAATTGTGTTTTTGCCAATTTAAGACCTAAT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 AATACCTTTACAAATGCTTTAACAAGAGGAAATTGTGTTTTTGCCAATTTAAGACCTAAT 60 Query 61 TTAATAGTTAAACCATTAACCTTAGTTGTTCCAAGGCATAATATAGAGAGTGAGATACAG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TTAATAGTTAAACCATTAACCTTAGTTGTTCCAAGGCATAATATAGAGAGTGAGATACAG 120 Query 121 GATGAGCTATTTCAGGGAGTTATTCAGTATGCAGTTGCCAAGGCAGTTGCTGATTTAGAT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GATGAGCTATTTCAGGGAGTTATTCAGTATGCAGTTGCCAAGGCAGTTGCTGATTTAGAT 180 Query 181 TTAGATGAAGATTTAAAGGTTGTTGTCTCTGTTAATGTCCCAGAGGTTCCAATAACCAAT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TTAGATGAAGATTTAAAGGTTGTTGTCTCTGTTAATGTCCCAGAGGTTCCAATAACCAAT 240 Query 241 TTAAATAAAAGAAAACTCTTCCAATACTTCTATGCCTCAGCAAAGTTAGCTATAAACAGA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TTAAATAAAAGAAAACTCTTCCAATACTTCTATGCCTCAGCAAAGTTAGCTATAAACAGA 300 Query 301 GCTTTAAATGAATATCCTTCAAAAGAGAAGGTAAAGAAAGAGAAATATAGAGCTTTGCAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GCTTTAAATGAATATCCTTCAAAAGAGAAGGTAAAGAAAGAGAAATATAGAGCTTTGCAT 360 Query 361 CCATTAGTTGGATTTAGGGATGTTAGATTGGAGTATCCTCCATATCTACAAATTGCTTTG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CCATTAGTTGGATTTAGGGATGTTAGATTGGAGTATCCTCCATATCTACAAATTGCTTTG 420 Query 421 GATGTCCCAACTATGGAGAATTTGGAATTTTTGTTACAAACAATTCCAAATAGCGACCAC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GATGTCCCAACTATGGAGAATTTGGAATTTTTGTTACAAACAATTCCAAATAGCGACCAC 480 Query 481 ATCATCTTAGAGGCTGGAACACCACTAATTAAAAAGTTTGGTTTAGAGGTTATTGAAATA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 ATCATCTTAGAGGCTGGAACACCACTAATTAAAAAGTTTGGTTTAGAGGTTATTGAAATA 540 Query 541 ATGAGAGAATATTTTGATGGCTTTATTGTTGCTGATTTAAAAACCTTAGACACTGGAAGG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 ATGAGAGAATATTTTGATGGCTTTATTGTTGCTGATTTAAAAACCTTAGACACTGGAAGG 600 Query 601 GTTGAGGTAAGATTGGCATTTGAAGCAACAGCTAATGCAGTGGCAATAAGTGGAGTAGCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GTTGAGGTAAGATTGGCATTTGAAGCAACAGCTAATGCAGTGGCAATAAGTGGAGTAGCA 660 Query 661 CCAAAATCAACAATAATTAAAGCTATCCACGAATGTCAAAAATGTGGTTTAATCAGCTAT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CCAAAATCAACAATAATTAAAGCTATCCACGAATGTCAAAAATGTGGTTTAATCAGCTAT 720 Query 721 TTGGATATGATGAACGTCTCTGAACCTCAAAAATTATATGATTCATTAAAATTAAAGCCA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 TTGGATATGATGAACGTCTCTGAACCTCAAAAATTATATGATTCATTAAAATTAAAGCCA 780 Query 781 GATGTTGTTATCTTGCATAGAGGGATTGATGAGGAGACATTTGGAATTAAAAAGGAATGG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 GATGTTGTTATCTTGCATAGAGGGATTGATGAGGAGACATTTGGAATTAAAAAGGAATGG 840 Query 841 AAATTTAAGGAAAACTGCTTATTAGCAATTGCTGGAGGAGTTGGTGTGGAGAATGTTGAA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 AAATTTAAGGAAAACTGCTTATTAGCAATTGCTGGAGGAGTTGGTGTGGAGAATGTTGAA 900 Query 901 GAGCTTTTAAAAGAATATCAAATATTAATCGTTGGTAGAGCAATTACAAAATCAAAAGAC 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 GAGCTTTTAAAAGAATATCAAATATTAATCGTTGGTAGAGCAATTACAAAATCAAAAGAC 960 Query 961 CCAGGAAGAGTAATTAGGATGTTTATAAACAAGATGGGTT 1000 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 961 CCAGGAAGAGTAATTAGGAT-TTTATAAACAAGATGGGTT 999 Query= ERCC-00044_genbank |92111302|gb|DQ459424.1| Synthetic construct microarray control MC19 mRNA, complete sequence Length=1140 Subject= ERCC-00044 Length=1156 Score = 2008 bits (1087), Expect = 0.0 Identities = 1106/1114 (99%), Gaps = 6/1114 (0%) Strand=Plus/Plus Query 4 AGATAGTGACTAGGGTAAATGCCAAGCCGTCTTATAAAAGCGGTAGCGAGAGATCTTAGA 63 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 AGATAGTGACTAGGGTAAATGCCAAGCCGTCTTATAAAAGCGGTAGCGAGAGATCTTAGA 60 Query 64 ACTCCCGGGCGAACGCCCCAACTTATGCGATGTCCAGCCCCAAACGGTTGATTAGATCGG 123 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ACTCCCGG-CGAACGCCCCAACTTATGCGATGTCCAGCCCCAAACGGTTGATTAGATCGG 119 Query 124 TAGCTCCCGAACTAAGAGACCCTAAACGCTATCCGTGGACTGTGTAGGTAGGCCGTCGTC 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 TAGCTCCCGAACTAAGAGACCCTAAACGCTATCCGTGGACTGTGTAGGTAGGCCGTCGTC 179 Query 184 CTAAGTGGCCTCGTGAACTAACGCCTGCTGCTATGTCCCAATGAAGGGTACATGCCCTCT 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 CTAAGTGGCCTCGTGAACTAACGCCTGCTGCTATGTCCCAATGAAGGGTACATGCCCTCT 239 Query 244 TCCCGTACTACGCCGATACAAAGTCCCGAACGAGCTTACGAAATATAGCGCTTAACCATG 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 240 TCCCGTACTACGCCGATACAAAGTCCCGAACGAGCTTACGAAATATAGCGCTTAACCATG 299 Query 304 GG-CCACCATAGGTGCCTGGTACAGACGTGTCAGACGAGCCCTCGGCTAGCTCATAATTG 362 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 300 GGGCCACCATAGGTGCCTGGTACAGACGTGTCAGACGAGCCCTCGGCTAGCTCATAATTG 359 Query 363 CGGCCGTTCATATAAACCTCAGCGTCTGGTCATGTCTGTTACCACAACGCTCCCGGTTCT 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 360 CGGCCGTTCATATAAACCTCAGCGTCTGGTCATGTCTGT-ACCACAACGCTCCCGGTTCT 418 Query 423 TCGACGCTCAGTTCGGTACCCAAGATAGCGGACTCTCAAAGAACGATTCAGTAGTCGC-G 481 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 419 TCGACGCTCAGTTCGGTACCCAAGATAGCGGACTCTCAAAGAACGATTCAGTAGTCGCCG 478 Query 482 TACCCATGTAGGCCTTAAGAGGTCTAATTAGCTCTAGGAAACACAACGCCGGGATTTGGG 541 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 479 TACCCATGTAGGCCTTAAGAGGTCTAATTAGCTCTAGGAAACACAACCCCGGGATTTGGG 538 Query 542 ATACGCCACCAACACGATATCCAGCCGCATCGCACGCGTCGAAGTCCTCCGTGCTTGTGT 601 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 539 ATACGCCACCAACACGA-ATCCAGCCGCATCGCACGCGTCGAAGTCCTCCGTGCTTGTGT 597 Query 602 GAGTCGACACATAGGATCGGGCACGGAGAGATCGGCGGTTGAAGTATGGAGCGTAGGTCT 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 598 GAGTCGACACATAGGATCGGGCACGGAGAGATCGGCGGTTGAAGTATGGAGCGTAGGTCT 657 Query 662 CGATCTCGTACAAAACGACTATGACCATTGGGCGTTGTACTCATTATCGTTACGATTTTA 721 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 658 CGATCTCGTACAAAACGACTATGACCATTGGGCGTTGTACTCATTATCGTTACGATTTTA 717 Query 722 CGGTGGCAAACGAAGCTACCAAGTAGATGCCGACGTCGAGTGGATCCACGCAGTCCGAGA 781 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 718 CGGTGGCAAACGAAGCTACCAAGTAGATGCCGACGTCGAGTGGATCCACGCAGTCCGAGA 777 Query 782 CAGCGCCACACTCGCTGTAGAGGGTTTCAATCCGACTAAGACGGCGGGATCTACTACTTC 841 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 778 CAGCGC-ACACTCGCTGTAGAGGGTTTCAATCCGACTAAGACGGCGGGATCTACTACTTC 836 Query 842 TGCGAGTTTAGATTAACTGTATCTCCCGAATGCGCGTTCTAAAACCCTGACGTGATGGGA 901 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 837 TGCGAGTTTAGATTAACTGTATCTCCCGAATGCGCGTTCTAAAACCCTGACGTGATGGGA 896 Query 902 CGGGTGAAGCACCAGGTTTTCGCCGGTTAGGTAAGGTAAAAATATGACCTTACCCTACGT 961 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 897 CGGGTGAAGCACCGGGTTTTCGCCGGTTAGGTAAGGTAAAAATATGACCTTACCCTACGT 956 Query 962 TGATTGTGGTCATTACAGCAAGAGGTGGGTTATAACGCAATCTATGTTCGCATGCTATGT 1021 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 957 TGATTGTGGTCATTACAGCAAGAGGTGGGTTATAACGCAATCTATGTTCGCATGCTATGT 1016 Query 1022 TATTTGACCCCTGCGGTAAGATTATTCACTCGTCATGGATAACCGGATAATCCCGTATAA 1081 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1017 TATTTGACCCCTGCGGTAAGATTATTCACTCGTCATGGATAACCGGATAATCCCGTATAA 1076 Query 1082 CCTGTGGGTATTATAGGCGACAATTCGaaaaaaa 1115 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1077 CCTGTGGGTATTATAGGCGACAATTCGAAAAAAA 1110 Query= ERCC-00046_genbank |103488695|gb|DQ516748.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-500-31 genomic sequence Length=500 Subject= ERCC-00046 Length=522 Score = 911 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 498/500 (99%), Gaps = 2/500 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATCTCCTCTAACTTTGGAGAGGTAGGAATGGGAGTATTTGCACTTGTGGTAACGGTATTT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATCTCCTCTAACTTTGGAGAGGTAGGAATGGGAGTATTTGCACTTGTGGTAACGGTATTT 60 Query 61 GCATTATTGATGGTTTTTACTATGTTGGGTATGCTGTTCGATTTCTTAAAGGACTGAATA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GCATTATTGATGGTTTTTACTATGTTGGGTATGCTGTTCGATTTCTTAAAGGACTGAATA 120 Query 121 TTCGGTGGCAGTATGGGATTTCTAAAAATAATGTTAAGAATTTTTTGCTGGTTTTTTGCG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 121 TTCGGTGGCAGTATGGGATTTCTAAAAATAATGTTAAGAA-TTTTTGCTGGTTTTTTGCG 179 Query 181 ACGTTGGTGTTGTATTCTATAGCTCCATTATGGCCGTTATATGGAATCATTGGAGTGCCA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 ACGTTGGTGTTGTATTCTATAGCTCCATTATGGCCGTTATATGGAATCATTGGAGTGCCA 239 Query 241 GTAATTCTACCACGCCTTATATTTAAAGACAAAAAGAAGTGTCTAACAACAACATCCACA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 240 GTAATTCTACCACGCCTTATATTTAAAGACAAAAAGAAGTGTCTAACAACAACATCCACA 299 Query 301 CTACTACTCCTTGTCATATTTCTTCCTGAATTGCTGATTCTTATTGGATTTCTGATATTT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 300 CTACTACTCCTTGTCATATTTCTTCCTGAATTGCTGATTCTTATTGGATTTCTGATATTT 359 Query 361 CCTATTGTTATGGGCTATTACATCTCTAAGGAATTGGTGAAGTAAAATGGTGAAGCTTAT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 CCTATTGTTATGGGCTATTACATCTCTAAGGAATTGGTGAAGTAAAATGGTGAAGCTTAT 419 Query 421 GAATTTGTGGAGTGAGAGGATTAAAGATAGGGAAGTTGTTGAAGTTATTGGCTGTGAGAG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 GAATTTGTGGAGTGAGAGGATTAAAGATAGGGAAGTTGTTGAAGTTATTGGCTGTGAGAG 479 Query 481 AGTGCCATTGAATGAAACGT 500 ||||||||||||| |||||| Sbjct 480 AGTGCCATTGAAT-AAACGT 498 Query= ERCC-00048_genbank |114976955|gb|DQ883671.2| Synthetic construct clone NISTag30 external RNA control sequence Length=1000 Subject= ERCC-00048 Length=992 Score = 1832 bits (992), Expect = 0.0 Identities = 992/992 (100%), Gaps = 0/992 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TCTGTAAATCCCGTAAACGAGTAGTACGAATCCGGACTTGAATACACGCGTCAATCCCTT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TCTGTAAATCCCGTAAACGAGTAGTACGAATCCGGACTTGAATACACGCGTCAATCCCTT 60 Query 61 TTATATCCTAGAATGGACCGTGTGGACGGCAACTCAGAGATAACGCATATCTATGTGCTC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TTATATCCTAGAATGGACCGTGTGGACGGCAACTCAGAGATAACGCATATCTATGTGCTC 120 Query 121 GCTTGCCCATCAAAGAAGAGACGGCGACCAAACGGACGACATATAGTGACATGGTCAACC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GCTTGCCCATCAAAGAAGAGACGGCGACCAAACGGACGACATATAGTGACATGGTCAACC 180 Query 181 CGTACGCCTGCTTCGTAAGCCGACGGTCCTTTGAAGAGGCTGGCGAATCATGTCGTTTGT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CGTACGCCTGCTTCGTAAGCCGACGGTCCTTTGAAGAGGCTGGCGAATCATGTCGTTTGT 240 Query 241 GCTTACTATTACATGCTAGCTTGGTTGGGGCATCTCGGGACAACGTCTATGTACAATAAA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GCTTACTATTACATGCTAGCTTGGTTGGGGCATCTCGGGACAACGTCTATGTACAATAAA 300 Query 301 CACAAAGCCGCGTAGTTATCTTCCGCGAGTTCCGCCCAATACATTGGCGGTGACTTGAGA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CACAAAGCCGCGTAGTTATCTTCCGCGAGTTCCGCCCAATACATTGGCGGTGACTTGAGA 360 Query 361 CCGCTAAAATGCACATAGAAGCCTCAAACATGGTAAGACTATAGATAAGCGGCGCGAAAA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CCGCTAAAATGCACATAGAAGCCTCAAACATGGTAAGACTATAGATAAGCGGCGCGAAAA 420 Query 421 CACGGCATTTGGAATGATGTGTACTGGGAATAAGACGACGTCGCTATGGCCTCTCCGGAA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CACGGCATTTGGAATGATGTGTACTGGGAATAAGACGACGTCGCTATGGCCTCTCCGGAA 480 Query 481 GGCGGTGTATGTGCCAAGCGATGTTTCATTAATGTAACGGACAGGTCGCTGAGGTGGCTT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GGCGGTGTATGTGCCAAGCGATGTTTCATTAATGTAACGGACAGGTCGCTGAGGTGGCTT 540 Query 541 TCGTTGGGGGCGCCGTCTTTGGGGGAGATTGCGTCAATTTTGACTGTCAGATCAGCGACT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TCGTTGGGGGCGCCGTCTTTGGGGGAGATTGCGTCAATTTTGACTGTCAGATCAGCGACT 600 Query 601 AGATTTTAGGCAGATTAGTGTGCCACCTGAATCAATAGAACAATATCAGTTATGGCGGTG 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 AGATTTTAGGCAGATTAGTGTGCCACCTGAATCAATAGAACAATATCAGTTATGGCGGTG 660 Query 661 CAGTATACTATACAATGGGTTGGGCGCATCTGCATGTCTCATGCTGTCATGGCAATCGAC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CAGTATACTATACAATGGGTTGGGCGCATCTGCATGTCTCATGCTGTCATGGCAATCGAC 720 Query 721 CTCTAGTCTGGGGTGATCCGAGGCGCTTCTCTTATTAGGAATAGTGCAGGACCCGAAACC 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 CTCTAGTCTGGGGTGATCCGAGGCGCTTCTCTTATTAGGAATAGTGCAGGACCCGAAACC 780 Query 781 GCCATAGGGAAAGGGTGAGCGAGGTAGCAGCGTAATAATTCGCGGTGGGCAGGAAATGCT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 GCCATAGGGAAAGGGTGAGCGAGGTAGCAGCGTAATAATTCGCGGTGGGCAGGAAATGCT 840 Query 841 TAGTGTTCTGTCTCAAGACCTAAGCGACAGCGTGACCTTGTTTCACTTACCTCTGAAGCT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 TAGTGTTCTGTCTCAAGACCTAAGCGACAGCGTGACCTTGTTTCACTTACCTCTGAAGCT 900 Query 901 CTTCGACGTTATAGATATTGGCATCCCTAAACAACGAGTACCTTGTGCTACGACAGAAAA 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CTTCGACGTTATAGATATTGGCATCCCTAAACAACGAGTACCTTGTGCTACGACAGAAAA 960 Query 961 GTGACCTGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 992 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 GTGACCTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 992 Query= ERCC-00051_genbank |103488687|gb|DQ516740.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-250-23 genomic sequence Length=250 Subject= ERCC-00051 Length=274 Score = 462 bits (250), Expect = 3e-135 Identities = 250/250 (100%), Gaps = 0/250 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TTACAATAGATGCGTTTAGAGTAGCTGGGGGAATTTTGCTCTTTAAAATAGCTTGGGACA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TTACAATAGATGCGTTTAGAGTAGCTGGGGGAATTTTGCTCTTTAAAATAGCTTGGGACA 60 Query 61 TGCTTCACGCAGAAATTCCAAAAACAAAGCACAAACCAGATGAAAGATTAGACCTTGAAG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TGCTTCACGCAGAAATTCCAAAAACAAAGCACAAACCAGATGAAAGATTAGACCTTGAAG 120 Query 121 ATATTGATAGTATAGTTTATGTCCCATTGGCTATTCCTTTAATCTCTGGCCCTGGAGCTA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ATATTGATAGTATAGTTTATGTCCCATTGGCTATTCCTTTAATCTCTGGCCCTGGAGCTA 180 Query 181 TAACAACAACCATGATTTTGATTAGCAAAACCCAGAGTATCTTAGAGAAAGGGGTTGTTG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TAACAACAACCATGATTTTGATTAGCAAAACCCAGAGTATCTTAGAGAAAGGGGTTGTTG 240 Query 241 TTCTCTCTAT 250 |||||||||| Sbjct 241 TTCTCTCTAT 250 Query= ERCC-00053_genbank |103488732|gb|DQ516785.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-68 genomic sequence Length=1000 Subject= ERCC-00053 Length=1023 Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0 Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ACATCTGTATAAAAAACACTACAGGGTGGTAACATGGTTCTATATAAAATTAGAAGATCA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ACATCTGTATAAAAAACACTACAGGGTGGTAACATGGTTCTATATAAAATTAGAAGATCA 60 Query 61 AAAAACGATCCCTGTCCATCAATACCTTCAGCGGTAATTATAGGATATTCTGTTGGATTA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AAAAACGATCCCTGTCCATCAATACCTTCAGCGGTAATTATAGGATATTCTGTTGGATTA 120 Query 121 AAATTAATTACTGGACATGGAGCTCAGAGCTTAAGCAATATGGCTGGTTCTTATGCTGGA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AAATTAATTACTGGACATGGAGCTCAGAGCTTAAGCAATATGGCTGGTTCTTATGCTGGA 180 Query 181 AAGGAATTGGGAATTTACGCAATGAATAATGGTTATGAATTTAAGGATATTAAAGATATT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 AAGGAATTGGGAATTTACGCAATGAATAATGGTTATGAATTTAAGGATATTAAAGATATT 240 Query 241 GAAAGATTTCTTAACCAGTTAGATTTTGCAAAGATAGAGATGAATGAGGAAGAGGATGAA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GAAAGATTTCTTAACCAGTTAGATTTTGCAAAGATAGAGATGAATGAGGAAGAGGATGAA 300 Query 301 ATTATAGTAAAGATATCAAAATGCAATCTCTGCCCAAAGAGAATTTGTGGCTATGAATTT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATTATAGTAAAGATATCAAAATGCAATCTCTGCCCAAAGAGAATTTGTGGCTATGAATTT 360 Query 361 GAAGGAACAGCATGCCCTTGGGGAGGATTGTTAATTGGATTTATAAGTGAAACTTTAAAG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GAAGGAACAGCATGCCCTTGGGGAGGATTGTTAATTGGATTTATAAGTGAAACTTTAAAG 420 Query 421 TATAATTTAGGCTACCAAATGAATTTAAAGCCAGCTGAAACATGTATTATTAAATTAAAG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TATAATTTAGGCTACCAAATGAATTTAAAGCCAGCTGAAACATGTATTATTAAATTAAAG 480 Query 481 AAGAAATAAAACTTATCTAATATTAAAAAACTCCAAAATCTCATAAGGATGCTTTAATAC 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 AAGAAATAAAACTTATCTAATATTAAAAAACTCCAAAATCTCATAAGGATGCTTTAATAC 540 Query 541 AATAACATCCTCCAACTCCATCAATTTTCTTGTATTTTCAGCATCTATCTTTCTAACCCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 AATAACATCCTCCAACTCCATCAATTTTCTTGTATTTTCAGCATCTATCTTTCTAACCCT 600 Query 601 CATCTTAATCTCTTTTCCCTCAATTATTGCATTATAAGGGCAAACTTTTTTACAATTTCC 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 CATCTTAATCTCTTTTCCCTCAATTATTGCATTATAAGGGCAAACTTTTTTACAATTTCC 660 Query 661 ACATCCTAAGCATTTAGATAATAATATCTCAACAAAATTATCCCTCTTAACTATAGCTCC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 ACATCCTAAGCATTTAGATAATAATATCTCAACAAAATTATCCCTCTTAACTATAGCTCC 720 Query 721 ATTTGGACAGACGTTTATACATTTTAAACAGAGTTTGCATTTCTTTTTATCAATTGCATA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 ATTTGGACAGACGTTTATACATTTTAAACAGAGTTTGCATTTCTTTTTATCAATTGCATA 780 Query 781 AGGAAGTTTTGTTGTTACAATCCCAGCTTTATAATCAACTGGAACTATTAAAGATTTAAC 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 AGGAAGTTTTGTTGTTACAATCCCAGCTTTATAATCAACTGGAACTATTAAAGATTTAAC 840 Query 841 AAATCCTTTCCCTGCCTGAGCTATAGCATTTGTTACTAAGCTATCTGCAATGCCATTAAC 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 AAATCCTTTCCCTGCCTGAGCTATAGCATTTGTTACTAAGCTATCTGCAATGCCATTAAC 900 Query 901 AACCTTAGCAACGGTATTTCCAGTAGCTGGTGAGCAAATTAAATAATCATACTTTCCTAA 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 AACCTTAGCAACGGTATTTCCAGTAGCTGGTGAGCAAATTAAATAATCATACTTTCCTAA 960 Query 961 GCTCAATCTTCCAGTGATTGGTGATGAGTAAGGATGTTCT 1000 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 961 GCTCAATCTTCCAGTGATTG-TGATGAGTAAGGATGTTCT 999 Query= ERCC-00054_genbank |103488678|gb|DQ516731.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-250-14 genomic sequence Length=250 Subject= ERCC-00054 Length=274 Score = 462 bits (250), Expect = 3e-135 Identities = 250/250 (100%), Gaps = 0/250 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GATAAAATTGGTTTTGTCTTTCAGCAATTCAACTTAATTCCTTTATTAACTGCCTTAGAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GATAAAATTGGTTTTGTCTTTCAGCAATTCAACTTAATTCCTTTATTAACTGCCTTAGAA 60 Query 61 AATGTTGAACTTCCACTGATTTTTAAATATAGGGGAGCAATgagcggagaagagaggagg 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AATGTTGAACTTCCACTGATTTTTAAATATAGGGGAGCAATGAGCGGAGAAGAGAGGAGG 120 Query 121 aagagagctttagaatgcttaaagatggcagagttggaggagagaTTTGCCAATCACAAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AAGAGAGCTTTAGAATGCTTAAAGATGGCAGAGTTGGAGGAGAGATTTGCCAATCACAAA 180 Query 181 CCAAATCAGTTGAGTGGAGGGCAACAACAGAGAGTTGCTATAGCGAGGGCTTTGGCAAAC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CCAAATCAGTTGAGTGGAGGGCAACAACAGAGAGTTGCTATAGCGAGGGCTTTGGCAAAC 240 Query 241 AACCCACCAA 250 |||||||||| Sbjct 241 AACCCACCAA 250 Query= ERCC-00057_genbank |110339339|gb|DQ668366.1| Synthetic construct clone TagQ microarray control Length=1000 Subject= ERCC-00057 Length=1021 Score = 1847 bits (1000), Expect = 0.0 Identities = 1000/1000 (100%), Gaps = 0/1000 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 CTAGTGCATCCTCGTGGCATCATGCGTCTCCTCAGTAGGTCTGCGACTGATCCTAGTGCA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 CTAGTGCATCCTCGTGGCATCATGCGTCTCCTCAGTAGGTCTGCGACTGATCCTAGTGCA 962 Query 61 ATGCGTCTGAGCCTGAGCTACAGCGATATAGCCTGGATTGTGAGCGTATTTGCTGTCAGA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 ATGCGTCTGAGCCTGAGCTACAGCGATATAGCCTGGATTGTGAGCGTATTTGCTGTCAGA 902 Query 121 ACCTCAGCTCATCATGTATGATGCTGTACCATCCTGCGATACTGAAGATGCACCGCTATA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 ACCTCAGCTCATCATGTATGATGCTGTACCATCCTGCGATACTGAAGATGCACCGCTATA 842 Query 181 ATGCGAGGCTCTCCGCTAAAGTGGAAGCTGCTCGTTCTCAATGCGAGCGAGTCGAATCCA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 ATGCGAGGCTCTCCGCTAAAGTGGAAGCTGCTCGTTCTCAATGCGAGCGAGTCGAATCCA 782 Query 241 ATGCCGTAGCTGCGATAACGATGCCGCTGACTCTACGGTAATGCACGATCCTCTACATTG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 ATGCCGTAGCTGCGATAACGATGCCGCTGACTCTACGGTAATGCACGATCCTCTACATTG 722 Query 301 ATAGCAGATAGTCTAACGGGATAGCATAGGTGCAAGGCTCCTAGCATGTAGTCACAGGTG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 ATAGCAGATAGTCTAACGGGATAGCATAGGTGCAAGGCTCCTAGCATGTAGTCACAGGTG 662 Query 361 CTCAGATATAGTCATCGCTGCAATCAGCTAGTCATCTTGTCAGGATGCTACTCACTGCGT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CTCAGATATAGTCATCGCTGCAATCAGCTAGTCATCTTGTCAGGATGCTACTCACTGCGT 602 Query 421 GCAGAAGATTCGCACGACTTCAGAGGATGGCACTCGTCATTAGAGTGATGTTCTCGGATC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GCAGAAGATTCGCACGACTTCAGAGGATGGCACTCGTCATTAGAGTGATGTTCTCGGATC 542 Query 481 GACACTGCTGGTCTGCGAATGACTCGCATTCACTAACATGGAGCATCGTTATCTAAAGGG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GACACTGCTGGTCTGCGAATGACTCGCATTCACTAACATGGAGCATCGTTATCTAAAGGG 482 Query 541 GATGCACGTTATCGTCGAGTGGCCGTCATGTCTATGCAGTGCGGCCTATGTCTCATTAGC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GATGCACGTTATCGTCGAGTGGCCGTCATGTCTATGCAGTGCGGCCTATGTCTCATTAGC 422 Query 601 GAGTCGTATGTATCATGTCGGGCTCGAATGTTGCACACGTCTGCGTAATGGTGACCGCTA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GAGTCGTATGTATCATGTCGGGCTCGAATGTTGCACACGTCTGCGTAATGGTGACCGCTA 362 Query 661 GTCCCACATGGTGCTTCGTAGCCACAAATGTCGTTAGGTAGACCGACGTTATCGCGCTAT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GTCCCACATGGTGCTTCGTAGCCACAAATGTCGTTAGGTAGACCGACGTTATCGCGCTAT 302 Query 721 ACCCGATGTCAACGCGAGTTAGACCGTATCGTCCCCAGTGCCCTAAGATGGTCAAGCGTG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ACCCGATGTCAACGCGAGTTAGACCGTATCGTCCCCAGTGCCCTAAGATGGTCAAGCGTG 242 Query 781 CTCCTACGTTAGTATCAGTTTCCCTATTGGTACGTCTGGCGTACTTCTGAAACGTGATGG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CTCCTACGTTAGTATCAGTTTCCCTATTGGTACGTCTGGCGTACTTCTGAAACGTGATGG 182 Query 841 GCGGCTGGTTACCCGTATATGGGCTCGGTTGACCTCTATTGGGCGTTGTTGACCCGAATT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GCGGCTGGTTACCCGTATATGGGCTCGGTTGACCTCTATTGGGCGTTGTTGACCCGAATT 122 Query 901 CGGTATCCTCGTCGTTAAATGGCGAACGTCGTCTGCTATAGGCAAACGTCTGTCGGTCAT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CGGTATCCTCGTCGTTAAATGGCGAACGTCGTCTGCTATAGGCAAACGTCTGTCGGTCAT 62 Query 961 GGCAAATGTTACTCGTGTGTGCAAGAAATTACTCGCTGTC 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GGCAAATGTTACTCGTGTGTGCAAGAAATTACTCGCTGTC 22 Query= ERCC-00058_genbank |92111296|gb|DQ459418.1| Synthetic construct microarray control MC07 mRNA, complete sequence Length=1140 Subject= ERCC-00058 Length=1136 Score = 2041 bits (1105), Expect = 0.0 Identities = 1130/1140 (99%), Gaps = 9/1140 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGGAGAGTAGGGCCCACTTGTCGATTCGTTTGACTAAACATGGAGAAAGCATCCGAGGGT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GGGAGAGTAGGGCCCACTTGTCGATTCGTTTGACTAAACATGGAGAAAGCATCCGAGGGT 60 Query 61 GGGCAGATCCGCCTAAGCAAGGTACCATTTAATCCCGGTCCCACGAAAGAGTTAACCTAT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GGGCAGATCCGCCTAAGCAAGGTACCATTTAATCCCGGTCCCACGAAAGAGTTAACCTAT 120 Query 121 ACGCTCAGATGGCGCCATGGTGCGTTCGGAGCCAC-TTCTGCGAATTGTCCACCACTGCC 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ACGCTCAGATGGCGCCATGGTGCGTTCGGAGCCACTTTCTGCGAATTGTCCACCACTGCC 180 Query 180 CTCTCGTGTGATGATCAACATACTATCTTCTGCGGATGACCACCACTCACG-GTGTAGGT 238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 181 CTCTCGTGTGATGATCAACATACTATCTTCTGCGGA-GACCACCACTCACGTGTGTAGGT 239 Query 239 GAGCCATGTTGAATCCATCAGGCACCCGTCCCGGCGTATGAGCGTCTGGAGGCTCACCAA 298 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 240 GAGCCATGTTGAATCCATCAGGCACCCGTCCCGGCGTATGAGCGTCTGGAGGCTCACCAA 299 Query 299 CAAAACTTACATAAGACCGGAACTCGAGAGTCTGGCATCATCGTGAACAGGGGCACGAGA 358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 300 CAAAACTTACATAAGACCGGAACTCGAGAGTCTGGCATCATCGTGAACAGAGGCACGAGA 359 Query 359 GTGAGTCTGTGAGTCCTGACTGAGCATGTCTCGAAAACTGTGATAGATTAAGCCATGGAC 418 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 GTGAG-CTGTGAGTCCTGACTGAGCATGTCTCGAAAACTGTGATAGATTAAGCCATGGAC 418 Query 419 CAAGGACCAAGAGATCGACGGGCTTGGATATTGCCGCAAGGCTGAAGGTAACACCTTCAG 478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 419 CAAGGACCAAGAGATCGACGGGCTTGGATATTGCCGCAAGGCTGAAGGTAACACCTTCAG 478 Query 479 CTTCAAAATGCTTGAATACTCAGCCGTCCATCACTTCGACCGGGGTTAAGCTAAGATCTG 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 479 CTTCAAAATGCTTGAATACTCAGCCGTCCATCACTTCGACCGGGGTTAAGCTAAGATCTG 538 Query 539 GTGAGCGGTAGCCCGTCAAACGAATTGGCATCGGACAAGACAAATCAACCAAAGAATCTA 598 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 539 GTG-GCGGTAGCCCGTCAAACGAATTGGCATCGGACAAGACAAATCAACCAAAGAATCTA 597 Query 599 CGGTTGCCATGCCATGGTCTGCGTAACGACACCCGAGGTCCTTTTTATGGCGCCAGGCAT 658 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 598 CGGTTGCCATGCCATGGTCTGCGTAACGACACCCGAGGTCCTTTTTATGGCGCCAGGCAT 657 Query 659 CGACGCTGTAAAACCCTTCCGTTGTCCTGAGCAGGTTATAACGACATCAAGCGACAGCGA 718 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 658 CGACGCTGTAAAACCCTTCCGTTGTCCTGAGCAGGTTATAACGACATCAAGCGACAGCGA 717 Query 719 CAAAGAAGGCGGGAAAACTGTGGACTCCCGGCTATGTCAAATACGCTGAGTCACCCAACA 778 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 718 CAAAGAAGGCGGGAAAACTGTGGACTCCCGGCTATGTCAAATACGCTGAGTCACCCAACA 777 Query 779 GAAACGTTATCCGCTTGG-AAACGAATACATGGAAAGTGGGGCCGGTCGGATCACCAAGA 837 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 778 GAAACGTTATCCGCTTGGCAAACGAATACATGGAAAGTGGGGCCGGTCGGATCACCAAGA 837 Query 838 TAAGTGGTGTCACGAATAGCCCTCGCTTGCTCTAATCATGGGATGGTACATCGTCATTGC 897 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 838 TAAGTGGTGTCACGAATAGCCCTCGCTTGCTCTAATCATGGGATGGTACATCGTCATTGC 897 Query 898 TATTGGATGCAAGACGAATCCTG-CAACAGCCCTCCGGACTCAGTAGGTCCATGGATTTA 956 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 TATTGGATGCAAGACGAATCCTGGCAACAGCCCTCCGGACTCAGTAGGTCCATGGATTTA 957 Query 957 ACTACAACAGGAAGCCGGTCAACTGTGGAAGACTACCAGTATTCGAGCTGGAATAAAGAG 1016 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 958 ACTACAACAGGAAGCCGGTCAACTGTGGAAGACTACCAGTATTCGAGCTGGA-TAAAGAG 1016 Query 1017 GCTCGGCACCATGGTATAGATGTAATAGGAACCATGAAACTCCC-TGTCGCAAGCACTAA 1075 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1017 GCTCGGCACCATGGTATAGATGTAATAGGAACCATGAAACTCCCATGTCGCAAGCACTAA 1076 Query 1076 CAGAGCTGTAACCTCCCTCCATTAGCGGTAATCGGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1135 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1077 CAGAGCTGTAACCTCCCTCCATTAGCGGTAATCGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1136 Query= ERCC-00059_genbank |110339329|gb|DQ668356.1| Synthetic construct clone TagA microarray control Length=501 Subject= ERCC-00059 Length=525 Score = 926 bits (501), Expect = 0.0 Identities = 501/501 (100%), Gaps = 0/501 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 ATTTGATCGTAACTCGGGTGACCAATGACCATATACGGCGTATTAAGGTTGTACCCTCGG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 525 ATTTGATCGTAACTCGGGTGACCAATGACCATATACGGCGTATTAAGGTTGTACCCTCGG 466 Query 61 TCTCAACTTGTCGTATGGGACTTTCAAGTACCTTAGCTCGTCGGACGCTTTAGATGACTT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 465 TCTCAACTTGTCGTATGGGACTTTCAAGTACCTTAGCTCGTCGGACGCTTTAGATGACTT 406 Query 121 ATCCATAGTCCTAAGTCCGGCGCCGGTTAAGCCGCTATTAGCGTGTGTGGACTCTCTCTA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 405 ATCCATAGTCCTAAGTCCGGCGCCGGTTAAGCCGCTATTAGCGTGTGTGGACTCTCTCTA 346 Query 181 GGAGCGGCTTCGCACAAATTACTGCTCAATCCTAGATACGTTGCGCTCTTTGGTAAACGG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 345 GGAGCGGCTTCGCACAAATTACTGCTCAATCCTAGATACGTTGCGCTCTTTGGTAAACGG 286 Query 241 CTCAGATCTTAGCACTCGTGCAGTTCTACGATGGCAAGTCGTGCCTCGTTCTCGTGTAGA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 285 CTCAGATCTTAGCACTCGTGCAGTTCTACGATGGCAAGTCGTGCCTCGTTCTCGTGTAGA 226 Query 301 ATATCAGCTAATAGGGTCGGCTCAACAGTGTATCCGGTGGACAAGCACTGACACGCGATG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 225 ATATCAGCTAATAGGGTCGGCTCAACAGTGTATCCGGTGGACAAGCACTGACACGCGATG 166 Query 361 ACGTTCGTCAAGAGTCGCATAATCTCAGAATCCGTACAGCCGCATCGGGTTCACGGCTAT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 165 ACGTTCGTCAAGAGTCGCATAATCTCAGAATCCGTACAGCCGCATCGGGTTCACGGCTAT 106 Query 421 AAAACAGCGTCATCAGCGTAGGGTATCGCTTCGCGTGTCATGACTTGGGCCACGTCTCTC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 105 AAAACAGCGTCATCAGCGTAGGGTATCGCTTCGCGTGTCATGACTTGGGCCACGTCTCTC 46 Query 481 TCTCGCACATTAGGCTAGATT 501 ||||||||||||||||||||| Sbjct 45 TCTCGCACATTAGGCTAGATT 25 Query= ERCC-00060_genbank |103488710|gb|DQ516763.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-500-46 genomic sequence Length=500 Subject= ERCC-00060 Length=523 Score = 917 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 499/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATCGACAATAAACAAAGAAATAGAACTTTTAACACCAGAAGGAAAAATATTTTTGAAGAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATCGACAATAAACAAAGAAATAGAACTTTTAACACCAGAAGGAAAAATATTTTTGAAGAA 60 Query 61 AATTGGTTATGTTGATTACTATGAGGCAGGTAGTTTAAAATTAGCTGAAGAAACAGCAAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AATTGGTTATGTTGATTACTATGAGGCAGGTAGTTTAAAATTAGCTGAAGAAACAGCAAA 120 Query 121 AAGAGATGAGGACGTTATTATATTAAAAAATCATGGAGTAGTTTGTTTAGGTAAAGATTT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AAGAGATGAGGACGTTATTATATTAAAAAATCATGGAGTAGTTTGTTTAGGTAAAGATTT 180 Query 181 GATAGATGCATATATAAAAGTGGAGGTTTTAGAAGAACAAGCTAAACTTACACTTTTAAA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GATAGATGCATATATAAAAGTGGAGGTTTTAGAAGAACAAGCTAAACTTACACTTTTAAA 240 Query 241 CCTTCTTGTAAAGAAATAGTGGGGATTTTTAAATTTATTTAACTCTTTCTAATTCACTAA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CCTTCTTGTAAAGAAATAGTGGGGATTTTTAAATTTATTTAACTCTTTCTAATTCACTAA 300 Query 301 CAATACTCCAAATTTGTGTTCTTGTGTGAAGTGGCATGTTTGGGTCGTTGCTAATCTCAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CAATACTCCAAATTTGTGTTCTTGTGTGAAGTGGCATGTTTGGGTCGTTGCTAATCTCAT 360 Query 361 CTAAGATGTGGATTGCTGTTGCACTTCTAACGATTGGCTCCTCCCCCTCTTTTAAAACAG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CTAAGATGTGGATTGCTGTTGCACTTCTAACGATTGGCTCCTCCCCCTCTTTTAAAACAG 420 Query 421 CTTCTTTAGCCTTTTCAGCAGCAGCTCTAATGTTTCTTGGAACGGTTGTATCGTTAATTA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CTTCTTTAGCCTTTTCAGCAGCAGCTCTAATGTTTCTTGGAACGGTTGTATCGTTAATTA 480 Query 481 TCTCATCCAACATCAAAGCA 500 |||||||||| ||||||||| Sbjct 481 TCTCATCCAA-ATCAAAGCA 499 Query= ERCC-00061_genbank |92111304|gb|DQ459426.1| Synthetic construct microarray control MC22 mRNA, complete sequence Length=1147 Subject= ERCC-00061 Length=1136 Score = 2034 bits (1101), Expect = 0.0 Identities = 1131/1143 (98%), Gaps = 12/1143 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGAG-AGCTTGGCAAACACTACCGGGCATAGAT--A-A-GCGGGGCCAAGCATGCCGACA 55 |||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GGAGAAGCTTGGCAAACACTACCGGGCATAGATAAAGACGCGGGGCCAAGCATGCCGACA 60 Query 56 TTGGGATACTTCCATGTTACGAGGGGGCATGGAGGCGCAGCTATCCCACCCTCGTGCGCA 115 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TTGGGATACTTCCATGTTAC---GGGGCATGGAGGCGCAGCTATCCCACCCTCGTGCGCA 117 Query 116 AGATGGACAACCGAGCGCGGTAGTAATCGCGAACTGCCAGGCACTTATTGTAGAGGTGAA 175 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 118 AGATGGACAACCGAGCGCGGTAGTAATCGCGAACTGCCAGGCACTTATTGTAGAGGTGAA 177 Query 176 TCGCTAACTAACTCGGTGTAAGTTTCCGTCGATGAACAGGCATCGGAGAGGGCTCTACGG 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 178 TCGCTAACTAACTCGGTGTAAGTTTCCGTCGATGAACAGGCATCGGAGAGGGCTCTACGG 237 Query 236 GCCACCCAGTAGTGACGTCAGGAGTGCATAAGGAAGCAGATTGACCGTGGCGCAGACTCG 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 238 GCCACCCAGTAGTGACGTCAGGAGTGCATAAGGAAGCAGATTGACCGTGGCGCAGACTCG 297 Query 296 CGATATGAATAAGACTCTAGGGGGTGTACAATTGATCGTTGCGTACTGGAATCGTGCGAC 355 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 298 CGATATGAATAAGACTCTAGGGGGTGTACAATTGATCGTTGCGTAC-GGAATCGTGCGAC 356 Query 356 CTCAAAAGTTAAGCGCGAGGGTCACCTTGCTCCGCGCGAGCAGCCTTTGTCCAGGCCTAG 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 357 CTCAAAAGTTAAGCGCGAGGGTCACCTTGCTCCGCGCGAGCAGCCTTTGTCCAGGCCTAG 416 Query 416 TCCTTGCATTCGACCTATCGCACCGAGCGTCTCACCCAGCTAGTACGAAATTAACTGATA 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 417 TCCTTGCATTCGACCTATCGCACCGAGCGTCTCACCCAGCTAGTACGAAATTAACTGATA 476 Query 476 GAGATGGTTAACCCCCTCAGAGCGACTGGTTTAAGTCTAGGACCGGACAAACGGTACGAT 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 477 GAGATGGTTAACCCCCTCAGAGCGACTGGTTTAAGTCTAGGACCGGACAAACGGTACGAT 536 Query 536 TACGTCTTAGCATCAAGTGGTGCCTGATCTCGTGATAGACAACGTGAGAGTATTTGGATG 595 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 537 TACGTCTTAGCATCAAGTGGTGCCTGATCTCGTGATAGACAACGTGAGAGTATTTGGATG 596 Query 596 TATGGCTAGTTACGCAGAGCATGTGGCATTATTCTCATGTTTTGCGGCGGAGCGACTCAA 655 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 597 TATGGCTAGTTACGCAGAGCATGTGGCATTATTCTCATGTTTTGCGGCGGAGCGACTCAA 656 Query 656 TTTATCCGAACCATGGGAGATCGTCATTCTTGTGGTGCaaaaaaaTCACGGGCCCTGATA 715 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 657 TTTATCCGAACCATGGGAGATCGTCATTCTTGTGGTGCAAAAAAATCACGGGCCCTGATA 716 Query 716 CTGGTCGAAGTTGCGCCCTATGCTTACACGGCGCACGCCGCGGTGGAGCGATCGAGACCT 775 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 717 CTGGTCGAAGTTGCGCCCTATGCTTACACGGCGCACGCCGCGGTGGAGCGATCGAGACCT 776 Query 776 CTCGGATCTGAAATAAACCCGCAACGTGAGGTAGTGTTACGCATACATTCGCCCACGCTA 835 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 777 CTCGGATCTGAAATAAACCCGCAACGTGAGGTAGTGTTACGCATACATTCGCCCACGCTA 836 Query 836 GTCACTGATGCGTTGTATTTCTCGGAGTCTTTACCATGAGAATTGGCATATGGAAATCCT 895 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 837 ---ACTGATGCGTTGTATTTCTCGGAGTCTTTACCATGAGAATTGGCATATGGAAATCCT 893 Query 896 GTCATACCACGGGTCGATACTTGTTCTCCGTCTGAAGCGAACAACGAAGCATGTTGACCG 955 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 894 GTCATACCACGGGTCGATACTTGTTCTCCGTCTGAAGCGAACAACGAAGCATGTTGACCG 953 Query 956 TCTAAGATGATTTTTCCGACAGAGTGACGCATATAACACCTCTGGTCTTACAATGATTCG 1015 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 954 TCTAAGATGATTTTTCCGACAGAGTGACGCATATAACACCTCTGGTCTTACAATGATTCG 1013 Query 1016 AAGACACGTGAGACGCACTAGAGGCTTAACCTGGCAGATTGTGATCTCCGATGGTAATGA 1075 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1014 AAGACACGTGAGACGCACTAGAGGCTTAACCTGGCAGATTGTGATCTCCGATGGTAATGA 1073 Query 1076 AGTCGCCGTACTATCTCTTACTTGCATGACGCGACTACCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1135 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1074 AGTCGCCGTACTATCTCTTACTTGCATGACGCGACTACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1133 Query 1136 aaa 1138 ||| Sbjct 1134 AAA 1136 Query= ERCC-00062_genbank |103488733|gb|DQ516786.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-69 genomic sequence Length=1000 Subject= ERCC-00062 Length=1023 Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0 Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ACTATTGGAGAGAAAGATATCAGCCAGACCTATTTAGTAGCTCCACAGGCGCTAATAAAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ACTATTGGAGAGAAAGATATCAGCCAGACCTATTTAGTAGCTCCACAGGCGCTAATAAAA 60 Query 61 GAGGCAGTATCATTAATTGGAAAGAGTGCTGTTGAGGGGATGATTAGAAGAAGTTCAAAT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GAGGCAGTATCATTAATTGGAAAGAGTGCTGTTGAGGGGATGATTAGAAGAAGTTCAAAT 120 Query 121 AAATTATTCAAATAATCATAATAAAGTAATACTTATACTGAATATTCGAAATTATTATTT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AAATTATTCAAATAATCATAATAAAGTAATACTTATACTGAATATTCGAAATTATTATTT 180 Query 181 TGGAATTTTACAATATAGGTGATATTATGGCATTAAAATTCACCATTGAAGAGTTATCAA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TGGAATTTTACAATATAGGTGATATTATGGCATTAAAATTCACCATTGAAGAGTTATCAA 240 Query 241 ATCAAAAAAGAGATACATTAGGAAGAAATATTGACGTAACTGTTTTTAGATTAATAAGAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 ATCAAAAAAGAGATACATTAGGAAGAAATATTGACGTAACTGTTTTTAGATTAATAAGAT 300 Query 301 TTATGGATTTGGAAAGATATTTAGGAAGAGGGGCTCATGGAGTTATTTACGAATGTGGAA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TTATGGATTTGGAAAGATATTTAGGAAGAGGGGCTCATGGAGTTATTTACGAATGTGGAA 360 Query 361 GAGAGCTTGGACTGGCATTAAATCCAAAAACTGTTGAAGATGTAGTTAAGTTTTGTGAGG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GAGAGCTTGGACTGGCATTAAATCCAAAAACTGTTGAAGATGTAGTTAAGTTTTGTGAGG 420 Query 421 AATATAAAATTGGAAAGGTGGAGATAGTTAATAAAGAGCCATTGTAAATTAGGGTTTATG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 AATATAAAATTGGAAAGGTGGAGATAGTTAATAAAGAGCCATTGTAAATTAGGGTTTATG 480 Query 481 AATGTATCTCTTGTTCTGGACTTCCTGAGGTTGGAGAGACATTATGTTGGTTTGAAGGAG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 AATGTATCTCTTGTTCTGGACTTCCTGAGGTTGGAGAGACATTATGTTGGTTTGAAGGAG 540 Query 541 GCTTTATTGCTGGATGCTTAGAAAAAATATTAAACAAGAGAGTTAGAGTGAAAGAAACTC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GCTTTATTGCTGGATGCTTAGAAAAAATATTAAACAAGAGAGTTAGAGTGAAAGAAACTC 600 Query 601 ACTGTGCAGGTTTGGGGCATGATTTCTGTCAGTTTGAGGTAAAAGTCCTTTAATGATATT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 ACTGTGCAGGTTTGGGGCATGATTTCTGTCAGTTTGAGGTAAAAGTCCTTTAATGATATT 660 Query 661 TTTTCATCTCATTTATTATATATTCTAAAGCTTCAAAACCCTCTTTTCTATGTCTTGCAA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 TTTTCATCTCATTTATTATATATTCTAAAGCTTCAAAACCCTCTTTTCTATGTCTTGCAA 720 Query 721 AAACGGCTATTGAAGCAATCCTCTCCCCAATACTTAAAAATCCAGTGTTGTGGTAAAATA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 AAACGGCTATTGAAGCAATCCTCTCCCCAATACTTAAAAATCCAGTGTTGTGGTAAAATA 780 Query 781 AGATATCAATAACATCAAACTTATTTTTTGCCTCCTCAATAACTAACTTCAACTTTTCTA 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 AGATATCAATAACATCAAACTTATTTTTTGCCTCCTCAATAACTAACTTCAACTTTTCTA 840 Query 841 AGATGTCTTCATCTATCTTCATTCCTTTTGATGGAACTTTTTCTCCATCTTTTAAATCAT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 AGATGTCTTCATCTATCTTCATTCCTTTTGATGGAACTTTTTCTCCATCTTTTAAATCAT 900 Query 901 ACTCCCTAACAAATCCATTGAAAGTTACAATACATCCAAATTTCCCTTTGTATTTTTCAA 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 ACTCCCTAACAAATCCATTGAAAGTTACAATACATCCAAATTTCCCTTTGTATTTTTCAA 960 Query 961 TACATTCATCCATCTTTTTGCAAAACTCTTCATACTCGTT 1000 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 961 TACATTCATCCATCTTTTTG-AAAACTCTTCATACTCGTT 999 Query= ERCC-00067_genbank |114975645|gb|DQ883653.2| Synthetic construct clone NISTag12 external RNA control sequence Length=650 Subject= ERCC-00067 Length=644 Score = 1190 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 644/644 (100%), Gaps = 0/644 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GCCGTACTTACACCCTACGTTGCTGATCTCGGCGCTCGTACATTTACACTTGTAGTTGAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GCCGTACTTACACCCTACGTTGCTGATCTCGGCGCTCGTACATTTACACTTGTAGTTGAA 60 Query 61 GGTCGGGCGATGAGGCGTTCGTTTGGCCAACCTCGTTACATTGCACAAATGCCGGATTTG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GGTCGGGCGATGAGGCGTTCGTTTGGCCAACCTCGTTACATTGCACAAATGCCGGATTTG 120 Query 121 GCTACTATATATACTCCCTGATCAAGGGTCGAGTTGTCTGTGCATTAGCTCGGAGCTAAT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GCTACTATATATACTCCCTGATCAAGGGTCGAGTTGTCTGTGCATTAGCTCGGAGCTAAT 180 Query 181 GAGCACGTCGGTCACGGACACTGCGAAGCACGACGAAATGGCTCTCATTGCGATTGTGGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GAGCACGTCGGTCACGGACACTGCGAAGCACGACGAAATGGCTCTCATTGCGATTGTGGC 240 Query 241 CCTTGTTGCAGACAATTGTCAGGCGGGACGGGCCAGGAATGACAATAGAACATTAATCTA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CCTTGTTGCAGACAATTGTCAGGCGGGACGGGCCAGGAATGACAATAGAACATTAATCTA 300 Query 301 ATTTACAATTTGACGCCATGACGTATTAAACATTCGGGCATGCAAATCACCGATTTTAAG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATTTACAATTTGACGCCATGACGTATTAAACATTCGGGCATGCAAATCACCGATTTTAAG 360 Query 361 ATCCCCTGTACGGCTGCGTCCACACTAGCATGATGTAAATCGATTTGGCGGTGACCGCTG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 ATCCCCTGTACGGCTGCGTCCACACTAGCATGATGTAAATCGATTTGGCGGTGACCGCTG 420 Query 421 ATCCTTAACAAAAGGGGGTGGTTCAAATGTAAAACAAGTAGGTGCGAGCAAACGTCTGGT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 ATCCTTAACAAAAGGGGGTGGTTCAAATGTAAAACAAGTAGGTGCGAGCAAACGTCTGGT 480 Query 481 GCTCTAATGGCAAACATCTGCAATCAGCGAACCTCGCGGTATGGCAACTCACTAATTGTC 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GCTCTAATGGCAAACATCTGCAATCAGCGAACCTCGCGGTATGGCAACTCACTAATTGTC 540 Query 541 CGTGCGACGACAAATTACCGAGGGAGGCACTTATGAGTTATCTTCGCTGTGATATCTCCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CGTGCGACGACAAATTACCGAGGGAGGCACTTATGAGTTATCTTCGCTGTGATATCTCCT 600 Query 601 TCGACTAGCGCGGTCAGTCCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 644 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TCGACTAGCGCGGTCAGTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 644 Query= ERCC-00069_genbank |92111299|gb|DQ459421.1| Synthetic construct microarray control MC10 mRNA, complete sequence Length=1139 Subject= ERCC-00069 Length=1137 Score = 2002 bits (1084), Expect = 0.0 Identities = 1125/1142 (98%), Gaps = 14/1142 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGGAGAAGTACCAAGATCAGACTCCCGAGACATAAGGGGTGTGCACGGCATGGATGTGTC 60 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GGGAGAAGTACCAATATCAGACTCCCGAGACATAAGGGGTGTGCACGGCATGGATGTGTC 60 Query 61 GCTAACCTCCTGGTCCTATAAAGGCAACACTCATGGCACCGTGTGCTGAAGGCTCCAAAC 120 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GCTAACCTCCTGGTCCTATAAA-GCAACACTCATGGCACCGTGTGCTGAAGGCTCCAAAC 119 Query 121 GGGTCGATACCAGAAGGGTCGATTC-TTCTTCCAATACATTGTCGGTGTCAATGCTGGAG 179 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 GGGTCGATACCAGAAGGGTCGATTCTTTCTTCCAATACATTGTCGGTGTCAATGCTGGAG 179 Query 180 GCCCAGGAGGACGAAATCCTCGGTCAGGTTGTTACTTGAAGGGTTCAACACGAGCTCAAA 239 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 GCCCAGGA-GACGAAATCCTCGGTCAGGTTGTTACTTGAAGGGTTCAACACGAGCTCAAA 238 Query 240 TTTGTCCAGGGGTGGTCACCAGCGGGTCTCGAACAGAGGTGAAACGGGATAAATACCCGA 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 239 TTTGTCCAGGGGTGGTCACCAGCGGGTCTCGAACAGAGGTGAAACGGGATAAATACCCGA 298 Query 300 AACATTCATAACCCTGCCAGTCATTATAAGCAAGCCGCTGACTTGGACACCACAACGTGT 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 299 AACATTCATAACCCTGCCAGTCATTATAAGCAAGCCGCTGACTTGGACACCACAACGTGT 358 Query 360 GGAACCTCAGGTAAGCTGGTCCGGGAATCTTGGTCGCGAAGCGACCCCATTGAGTAGGCA 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 359 GGAACCTCAGGTAAGCTGGTCCGGGAATCTTGGTCGCGAAGCGACCCCATTGAGTAGGCA 418 Query 420 ATCCAAACCCTGCAAACAATAGGTGGCCATCCGGTCAAATAATGTGGGAGATGCGCACAT 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 419 ATCCAAACCCTGCAAACAATAGGTGGCCATCCGGTCAAATAATGTGGGAGATGCGCACAT 478 Query 480 CATGAGAGCGACGTATTGAACTCAAGGGACGGTGGTCCCCAGGAGAGGGATTACCACATG 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 479 CATGAGAGCGACGTATTGAACTCAAGGGACGGTGGTCCC-AGGAGAGGGATTACCACATG 537 Query 540 TTGAAGCTCTTTCAAATCGATTATCCCAATCGGCGCACTGTAAGGTAACCAACCGCAACT 599 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 538 TTGAAGCTCTTTCAAATCGATTATCCCAATCTGCGCACTGTAAGGTAACCAACCGCAA-T 596 Query 600 AATCCCCAGAACACTGCCCTGGTATCCATCGATTTGGAAGTC-AGACTCTAGTGATGCCG 658 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 597 AATCCCCAGAACACTGCCCTGGTATCCATCGATTTGGAAGTCCAGACTCTAGTGATGCCG 656 Query 659 GCTGGTCGCGACAAGAAAACATAATTCGCAAAGGGCCCCTGTCTCATTTGGCGTCTTGTA 718 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 657 GCTGGTCGCGACAAGAAAACATAATTCGCAAAGGGCCCCTGTCTCATTTGGCGTCTTGTA 716 Query 719 CCCAAACATCATACTTGGGAGGGTGTTGCGGCCGCATATCAACGACTAGAGGCCGTCAGA 778 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 717 CCCAAACATCATACTTGGGAGGGTGTTGCGGCCGCATATCAACGACTAGAGGCCGTCAGA 776 Query 779 ATGAGTCTTCAACACATATCGCTGAAGAAATGTCACTCCCCTGGTGGCTGATATAGAAAC 838 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 777 ATGAGTCTTCAACACATATCGCTGAAGAAATGTCACTCCCATGGTGGCTGATATAGAAAC 836 Query 839 ATATCCTCGCGGACTTCATCGCCGGGCACAAGGCTACAAGATGGACCTGGAACGCCGTGT 898 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 837 ATATCCTCGCGGACTTCATCGCCGGGCACAAGGCTACAAGATGGAC-TGGAACGCCGTGT 895 Query 899 CAACCTCGTAACAACTCCCCATGCAATTCACTCACCGAGTAGCCTATAATGGGGAATGTA 958 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 896 CAACCTCGTAACAACTCCCCATGCAATTCACTCACCGAGTAGCCTATAATGGGGAATGTA 955 Query 959 GACGGGGCCCTATCTCAAATGTGTGCACCTCTATCCCCACCAAGTATAGTCGACTTAAGG 1018 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 956 GACGGGGCCCTATCTCAAATGTGTGCACCTCTATCCCCACCAAGTATAGTCGACTTAAGG 1015 Query 1019 GCGGATCAAATGGCGCGCTGCCATACAAATCCGGTTCCAA---TGACTCAT----AGTAC 1071 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 1016 GCGGATCAAATGGCGCGCTGCCATACAAATCCGGTTCCAAGCATGACTCATGGGCAGTAC 1075 Query 1072 GCCGGTTAGTGGGAAATACGGCTGTCAAACGCTGGTCCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1076 GCCGGTTAGTGGGAAATACGGCTGTCAAACGCTGGTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1135 Query 1132 aa 1133 || Sbjct 1136 AA 1137 Query= ERCC-00071_genbank |114975649|gb|DQ883654.2| Synthetic construct clone NISTag13 external RNA control sequence Length=650 Subject= ERCC-00071 Length=642 Score = 1186 bits (642), Expect = 0.0 Identities = 642/642 (100%), Gaps = 0/642 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CATGCGAGAGGCCTTGAGCCGTTGGCCGATCGCATACAGAGACTATTGCATCAAGGTAAC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CATGCGAGAGGCCTTGAGCCGTTGGCCGATCGCATACAGAGACTATTGCATCAAGGTAAC 60 Query 61 ACTTATTAATCCCCATCGTCATAATCGCTAGATTCTAGGTATTTCGGATCTTCCTAGTTA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ACTTATTAATCCCCATCGTCATAATCGCTAGATTCTAGGTATTTCGGATCTTCCTAGTTA 120 Query 121 TCAGAAACATGTTAATTGGGCTCGGGCGTCTGCGCCAGGCCTTCGTAGTCCATACCACGA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TCAGAAACATGTTAATTGGGCTCGGGCGTCTGCGCCAGGCCTTCGTAGTCCATACCACGA 180 Query 181 TCTGTATTTTGCACCTTTCGCTATGCTGAGGTTGTTGACATAAGGATTAACTGCTGTGGT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TCTGTATTTTGCACCTTTCGCTATGCTGAGGTTGTTGACATAAGGATTAACTGCTGTGGT 240 Query 241 GTGTCATACTCGGCTACCTCCTGGTTTGGCGTCAAACAACTTCCAAGATTATCTCATACT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GTGTCATACTCGGCTACCTCCTGGTTTGGCGTCAAACAACTTCCAAGATTATCTCATACT 300 Query 301 ATAAAAAGACGACATGCACCGCCGTCCTTAAGTGCTTACGACAGAGGGTCGTTATCTCTC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATAAAAAGACGACATGCACCGCCGTCCTTAAGTGCTTACGACAGAGGGTCGTTATCTCTC 360 Query 361 TCGGTCTCGGTGCGCCTCTTCACGGAGCAGCATGACCTGCTAACCTGCATCAGCCAATGT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TCGGTCTCGGTGCGCCTCTTCACGGAGCAGCATGACCTGCTAACCTGCATCAGCCAATGT 420 Query 421 CCCGTCTCGAGCTGGCCTACGGATGCGTGAGCAAAGGTGCTAACTCTTTTCATAACCCGG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CCCGTCTCGAGCTGGCCTACGGATGCGTGAGCAAAGGTGCTAACTCTTTTCATAACCCGG 480 Query 481 AGATGAACTACCACGCTTCCTGCGTGGGTCCCGCGAAAACGAAGCAAGGAGATTCTTCGC 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 AGATGAACTACCACGCTTCCTGCGTGGGTCCCGCGAAAACGAAGCAAGGAGATTCTTCGC 540 Query 541 GACCTGGCCCATTCACTACATAACAGAGTTAAGACTTAGATCAGCGAGCAGGTGTACGCC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GACCTGGCCCATTCACTACATAACAGAGTTAAGACTTAGATCAGCGAGCAGGTGTACGCC 600 Query 601 CCGGACCTTGGGCTACTTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 642 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 CCGGACCTTGGGCTACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 642 Query= ERCC-00073_genbank |110339331|gb|DQ668358.1| Synthetic construct clone TagC microarray control Length=579 Subject= ERCC-00073 Length=603 Score = 1070 bits (579), Expect = 0.0 Identities = 579/579 (100%), Gaps = 0/579 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TGTGATAATTTCGACGAGGCGTTACATATTCTGAGAGGGGTGATTAAGTCTGCTTCGGCC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TGTGATAATTTCGACGAGGCGTTACATATTCTGAGAGGGGTGATTAAGTCTGCTTCGGCC 60 Query 61 TGGGATGGTCTGTCTACGTGTGCGTAGTTCTGTCATAGCGTCGAGGATTCTGAACCTGTC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TGGGATGGTCTGTCTACGTGTGCGTAGTTCTGTCATAGCGTCGAGGATTCTGAACCTGTC 120 Query 121 CATAGTATCCTGTAAGCGTCCAATGTACCTATATCGTGGACCCAAAGTCGATACGTCCGA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CATAGTATCCTGTAAGCGTCCAATGTACCTATATCGTGGACCCAAAGTCGATACGTCCGA 180 Query 181 TTAAGCGACGTTGGTCTAGGTAACGAATTATACCCTCGGGTTACGAATTATGGCTGTGCC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TTAAGCGACGTTGGTCTAGGTAACGAATTATACCCTCGGGTTACGAATTATGGCTGTGCC 240 Query 241 TAACGAATCTGGGACGTGCCTAAGTAATCTGGTCCGCGACTAAGATGTACGGTGATCGTG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TAACGAATCTGGGACGTGCCTAAGTAATCTGGTCCGCGACTAAGATGTACGGTGATCGTG 300 Query 301 GACGCTTGACCGGACTTATGCGTCGCCTTCCGAGTTATTGGATGGCGTTCCGTCCTATTG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GACGCTTGACCGGACTTATGCGTCGCCTTCCGAGTTATTGGATGGCGTTCCGTCCTATTG 360 Query 361 GATACTATTCCGTGCGTGTGCGACACGTTCCGAGCATATGCTAACAGTTCCGTCACTATG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GATACTATTCCGTGCGTGTGCGACACGTTCCGAGCATATGCTAACAGTTCCGTCACTATG 420 Query 421 TAACGCTTGACGTAGATTGCTATCAGGTTACGATGACTGCTAAGCCATTACGCGACATTC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TAACGCTTGACGTAGATTGCTATCAGGTTACGATGACTGCTAAGCCATTACGCGACATTC 480 Query 481 TGCAAAGTTACGTCGCATTCTCTCACGTTACGGCTGATTCTCTAGGCTTACGCGCATGAG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TGCAAAGTTACGTCGCATTCTCTCACGTTACGGCTGATTCTCTAGGCTTACGCGCATGAG 540 Query 541 CTCTAGGTTCCGGGTACTATCGAACGTGTCATTGGTACT 579 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CTCTAGGTTCCGGGTACTATCGAACGTGTCATTGGTACT 579 Query= ERCC-00074_genbank |103488701|gb|DQ516754.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-500-37 genomic sequence Length=500 Subject= ERCC-00074 Length=522 Score = 917 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 499/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TGGACATTAATTAGGGCTGAAAGCCCTAACTTAATGGACGGGAGGTATCCCAATAGGAGG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TGGACATTAATTAGGGCTGAAAGCCCTAACTTAATGGACGGGAGGTATCCCAATAGGAGG 60 Query 61 TTTCCTCCTATGGTTTTCAAAACAATCACCATCATGCTATTAATGATATTAAAATCCCAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TTTCCTCCTATGGTTTTCAAAACAATCACCATCATGCTATTAATGATATTAAAATCCCAA 120 Query 121 CTATACCAAAGAATATCCCAATTATCCATAAAACTGTAACTAAGTGAGGCTCTCTCATTG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CTATACCAAAGAATATCCCAATTATCCATAAAACTGTAACTAAGTGAGGCTCTCTCATTG 180 Query 181 GTTTATACTTCAATATAAGCCTTGGTAGGGATAGATAGCCACCTATATAGTATAGCTTCC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GTTTATACTTCAATATAAGCCTTGGTAGGGATAGATAGCCACCTATATAGTATAGCTTCC 240 Query 241 CATCTTCTTTGAGAGTTGTTGGTTTATGCTCATCCCTACTCATAACCCCAGCACTTAGAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CATCTTCTTTGAGAGTTGTTGGTTTATGCTCATCCCTACTCATAACCCCAGCACTTAGAT 300 Query 301 ATTTTAAAGAGGCATCTATCACATAAGGCATCATTATAACTAAAAATGGGATATATTCCT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATTTTAAAGAGGCATCTATCACATAAGGCATCATTATAACTAAAAATGGGATATATTCCT 360 Query 361 TATAAACTACTGCTAAGACAGCTAAGAAAGCTCCAATTGGTAGAGTTCCAACATCTCCTG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TATAAACTACTGCTAAGACAGCTAAGAAAGCTCCAATTGGTAGAGTTCCAACATCTCCTG 420 Query 421 GAAAAACCTTTGCTGGATATTTGTTAAATATCAATAGCCCTAAATAGGATGCAGAGAATA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GAAAAACCTTTGCTGGATATTTGTTAAATATCAATAGCCCTAAATAGGATGCAGAGAATA 480 Query 481 TCAAAGCGGATAAAAATCCA 500 |||||||||| ||||||||| Sbjct 481 TCAAAGCGGA-AAAAATCCA 499 Query= ERCC-00075_genbank |103488725|gb|DQ516778.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-61 genomic sequence Length=1000 Subject= ERCC-00075 Length=1023 Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0 Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TCCTACACGTTCCCTCATCTGAAACCATACAACTACCAACTGGATTTAATGGAGTGCAAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TCCTACACGTTCCCTCATCTGAAACCATACAACTACCAACTGGATTTAATGGAGTGCAAA 60 Query 61 CCGTTCCAAACAATGGGCAGTCAGTTGGCAGTTTCTCTCCTCTCAAAATCTTATCACATA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CCGTTCCAAACAATGGGCAGTCAGTTGGCAGTTTCTCTCCTCTCAAAATCTTATCACATA 120 Query 121 TACAACCTTTAGGAATTTTCTCTTTAATCTCTGGAATATCCTCATGCTCATAGATGTCAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TACAACCTTTAGGAATTTTCTCTTTAATCTCTGGAATATCCTCATGCTCATAGATGTCAA 180 Query 181 ATTTCTTATACTTCTCCCTCAATCCAAAACCACCATTTTTAACAACTGGGAAACCTCTCC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ATTTCTTATACTTCTCCCTCAATCCAAAACCACCATTTTTAACAACTGGGAAACCTCTCC 240 Query 241 AAGGAACATCTATGCTTTCAAAAACTTCATTTATTATTTTTTGAGCTAAAACATTACCTT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 AAGGAACATCTATGCTTTCAAAAACTTCATTTATTATTTTTTGAGCTAAAACATTACCTT 300 Query 301 CTGGCTTAACTGCTCTAATATATTCATTTTCAACCTTTGCCTCTCCACTGATGACTTGCT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CTGGCTTAACTGCTCTAATATATTCATTTTCAACCTTTGCCTCTCCACTGATGACTTGCT 360 Query 361 TTAAAATCATTATTATAGCCATTAACACATCTATTGGCTCAAAGCCAGCAACAACCATTG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TTAAAATCATTATTATAGCCATTAACACATCTATTGGCTCAAAGCCAGCAACAACCATTG 420 Query 421 GAGCTTTGTATTTTTCACACAACCCATAATAAGGCTTTAATCCGGTGATTGTTGAAACAT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GAGCTTTGTATTTTTCACACAACCCATAATAAGGCTTTAATCCGGTGATTGTTGAAACAT 480 Query 481 GTCCTGGGCATATAAATGCATCTAAATAAACTCCCTCATTTAACAAGAACTCCATAACTG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GTCCTGGGCATATAAATGCATCTAAATAAACTCCCTCATTTAACAAGAACTCCATAACTG 540 Query 541 GAGGAGTCTGCCTGTGGCAATTTAGGATAAAGAAGTTATTAACATCTTTATTTTTTAAAC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GAGGAGTCTGCCTGTGGCAATTTAGGATAAAGAAGTTATTAACATCTTTATTTTTTAAAC 600 Query 601 TTATTAGTTCAGCCCCAGTAGTTGGAGCAGTGGTTTCAAAACCTATTGCCACAAAAACAA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TTATTAGTTCAGCCCCAGTAGTTGGAGCAGTGGTTTCAAAACCTATTGCCACAAAAACAA 660 Query 661 ACTTCTTATCTCTCTCCTTCTTAGCCATCTTTACTGCTTCACTTATACTATAGACAATTC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 ACTTCTTATCTCTCTCCTTCTTAGCCATCTTTACTGCTTCACTTATACTATAGACAATTC 720 Query 721 TAACATCACAACCCTCAGATTGCTTTTCCATCAAAGATTTTTCACTTCCCGGCACTCTAT 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 TAACATCACAACCCTCAGATTGCTTTTCCATCAAAGATTTTTCACTTCCCGGCACTCTAT 780 Query 781 ACATATCTCCAAGAGTGGTTATTACATATCCATTGTCAGCTAAATATATGGCTGTATCTA 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 ACATATCTCCAAGAGTGGTTATTACATATCCATTGTCAGCTAAATATATGGCTGTATCTA 840 Query 841 TCTCTTTTTGAGTTGTTACACAAACTGGACAACCCGGCCCTGGAACAACGGTTATATTCT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 TCTCTTTTTGAGTTGTTACACAAACTGGACAACCCGGCCCTGGAACAACGGTTATATTCT 900 Query 901 CTGGCAGAACATCCCTAATCCCATACTTACAGATTGTGTGCTCATGACTTCCACAGACGT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CTGGCAGAACATCCCTAATCCCATACTTACAGATTGTGTGCTCATGACTTCCACAGACGT 960 Query 961 GCATAATCTTTAATTTATCTATCTTCTCAGCAAGTTTGTT 1000 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 961 GCATAATCTTTAATTTATCT-TCTTCTCAGCAAGTTTGTT 999 Query= ERCC-00076_genbank |114975623|gb|DQ883650.2| Synthetic construct clone NISTag9 external RNA control sequence Length=650 Subject= ERCC-00076 Length=642 Score = 1181 bits (639), Expect = 0.0 Identities = 642/643 (99%), Gaps = 1/643 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CTCCTCATGTGAGCGGATCACTATCTACAGCTGGTAATACTCTCAGAATTTCTAACTACC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CTCCTCATGTGAGCGGATCACTATCTACAGCTGGTAATACTCTCAGAATTTCTAACTACC 60 Query 61 AGTCGTAAAGTAGGCGAGCGTTGGTTGGTTCCTCTTGAAGCGAGAGAACCAAGGTGCTGG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AGTCGTAAAGTAGGCGAGCGTTGGTTGGTTCCTCTTGAAGCGAGAGAACCAAGGTGCTGG 120 Query 121 CTATTGTCCGCCCCGTCTACGGCTAACGCGGGGTTCTGCCATCCCGGTTTAGCGCAGAAT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CTATTGTCCGCCCCGTCTACGGCTAACGCGGGGTTCTGCCATCCCGGTTTAGCGCAGAAT 180 Query 181 AGTATTAGTCGGTCAGTGGACCCCCTCCTGAATATCTATACTTAGCGGCGGATTACCCGG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 AGTATTAGTCGGTCAGTGGACCCCCTCCTGAATATCTATACTTAGCGGCGGATTACCCGG 240 Query 241 CCCTCTTCATTGTCGAAAGATTGGGAACCGCCCTCTGGCTGTCACGCCCCCAGGCCCTAG 300 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CCCTCTTCATTGTCGAAAGATTGGGAACCG-CCTCTGGCTGTCACGCCCCCAGGCCCTAG 299 Query 301 GTGAGGTACTATGTGAGGTATTTTTTCAATGTTAGATCATCTATGTAGTGGATCTGAGAG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 300 GTGAGGTACTATGTGAGGTATTTTTTCAATGTTAGATCATCTATGTAGTGGATCTGAGAG 359 Query 361 ATCACGTGGACCAAAGCTGATTGATTACGGGACTGGCCGTAAGTGCTGCCCGCGAGTAGA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 ATCACGTGGACCAAAGCTGATTGATTACGGGACTGGCCGTAAGTGCTGCCCGCGAGTAGA 419 Query 421 TCGTCTAGATCCGGCTAAAATTCCCTGCGGTGCCTTAGCCACCACTCCTACGACGGGCCG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 TCGTCTAGATCCGGCTAAAATTCCCTGCGGTGCCTTAGCCACCACTCCTACGACGGGCCG 479 Query 481 CATCTTGGTTATTCTCGCTAGACACGGTTCGGGAAGTGGAGCATCGTTAGCTGCCAAGAT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 CATCTTGGTTATTCTCGCTAGACACGGTTCGGGAAGTGGAGCATCGTTAGCTGCCAAGAT 539 Query 541 GTGTATGTTGTCGCCACTCTCGCACCGTTTTTATAGTCGTTCTATTAGAGATGGTTGCAC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 GTGTATGTTGTCGCCACTCTCGCACCGTTTTTATAGTCGTTCTATTAGAGATGGTTGCAC 599 Query 601 ATGGGCGTTTCTCATCGGTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 643 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 ATGGGCGTTTCTCATCGGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 642 Query= ERCC-00077_genbank |103488689|gb|DQ516742.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-250-25 genomic sequence Length=250 Subject= ERCC-00077 Length=273 Score = 462 bits (250), Expect = 3e-135 Identities = 250/250 (100%), Gaps = 0/250 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 AGTTTTTTCACCTTATGACTTCTCATTCCATACGAAAGACAGATGGTTTGCTCCCAATGA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 AGTTTTTTCACCTTATGACTTCTCATTCCATACGAAAGACAGATGGTTTGCTCCCAATGA 60 Query 61 ACCCAGAGGGAGTTAAGGTTGATGATTCCCAAGTCCAACATGGAGTTATGCCTATAACGT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ACCCAGAGGGAGTTAAGGTTGATGATTCCCAAGTCCAACATGGAGTTATGCCTATAACGT 120 Query 121 CATGTTGGACAGACCCCTGTATTGAGCAGACTTAACTTATACTGATATACAGCTAAAATT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CATGTTGGACAGACCCCTGTATTGAGCAGACTTAACTTATACTGATATACAGCTAAAATT 180 Query 181 TGAACAACAAATCTCTTAAATTTATTGTTGAGAATAAAAAGGATACTATCTTATCCAATA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TGAACAACAAATCTCTTAAATTTATTGTTGAGAATAAAAAGGATACTATCTTATCCAATA 240 Query 241 TTGTATTTCC 250 |||||||||| Sbjct 241 TTGTATTTCC 250 Query= ERCC-00078_genbank |114976964|gb|DQ883673.2| Synthetic construct clone NISTag32 external RNA control sequence Length=1000 Subject= ERCC-00078 Length=993 Score = 1834 bits (993), Expect = 0.0 Identities = 993/993 (100%), Gaps = 0/993 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGGGAATTGGATTTGCAGAGCATATTAGCAAGTTAACGCCGATCACTCTCCGGCAGTTGC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GGGGAATTGGATTTGCAGAGCATATTAGCAAGTTAACGCCGATCACTCTCCGGCAGTTGC 60 Query 61 TCCATTAAATACGGGCCTTCGCAATCGCGTGTTGTTACACATAATGCCGGTATCCATCTA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TCCATTAAATACGGGCCTTCGCAATCGCGTGTTGTTACACATAATGCCGGTATCCATCTA 120 Query 121 CTATCGCCGCCAGGTGCAAGAAATGCATATCCCGGCCTACCCCCTTAGCAATCGACATTT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CTATCGCCGCCAGGTGCAAGAAATGCATATCCCGGCCTACCCCCTTAGCAATCGACATTT 180 Query 181 GTCTTTGCTGGACGCGCATGATTGAGTTATACGGAACTTCGCAAAAGTATTCCCTTTGTG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GTCTTTGCTGGACGCGCATGATTGAGTTATACGGAACTTCGCAAAAGTATTCCCTTTGTG 240 Query 241 GTCCGTGCGCCATGCTCCTCTGGGCGTAGCTTACAAGGACTAGGCCGTAGCCTGTAATTA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GTCCGTGCGCCATGCTCCTCTGGGCGTAGCTTACAAGGACTAGGCCGTAGCCTGTAATTA 300 Query 301 GGGAACCGAGCACCAGAGAATCAGGGTCACAGTGTGTGGTAGACGAAATGATCGTGGGCT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GGGAACCGAGCACCAGAGAATCAGGGTCACAGTGTGTGGTAGACGAAATGATCGTGGGCT 360 Query 361 GAGGGAATTAGGAGGCGCCGGTCCAATAGTCGATAACACCTGACGGAAGTACGGCTGCAG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GAGGGAATTAGGAGGCGCCGGTCCAATAGTCGATAACACCTGACGGAAGTACGGCTGCAG 420 Query 421 GATCTAATCATATAGTTCAGAATTGCACGCGCGTCTAAGAACGGACCAGTGTAGACACAA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GATCTAATCATATAGTTCAGAATTGCACGCGCGTCTAAGAACGGACCAGTGTAGACACAA 480 Query 481 TACAACTTAAGCGCAGATCTGAGAGAGGGGTGCACAATCCAGGCAAAGTCCGTTAGAAGG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TACAACTTAAGCGCAGATCTGAGAGAGGGGTGCACAATCCAGGCAAAGTCCGTTAGAAGG 540 Query 541 TCAACCTTGTGGGTGCAGCGCTTTGCTCCTAAAGATTCGCTCCTCGGGAGCGACGCGACT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TCAACCTTGTGGGTGCAGCGCTTTGCTCCTAAAGATTCGCTCCTCGGGAGCGACGCGACT 600 Query 601 GCTAGGGACTGGTAAAACGTTGGGCGCTGTCCAAGGTACCCTCAGTCTGTATTTCATGCC 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GCTAGGGACTGGTAAAACGTTGGGCGCTGTCCAAGGTACCCTCAGTCTGTATTTCATGCC 660 Query 661 CTCAAATATGCAATCCCGACCCGGAGCCGGCTTTAGATTTATAGCAGAGGGTCTCCGAGG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CTCAAATATGCAATCCCGACCCGGAGCCGGCTTTAGATTTATAGCAGAGGGTCTCCGAGG 720 Query 721 ACTGTAATGTCTTTTGCGAGACAGGAAAGGTTGGGCGGTGTACGTCACCTCTACGGTCGA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 ACTGTAATGTCTTTTGCGAGACAGGAAAGGTTGGGCGGTGTACGTCACCTCTACGGTCGA 780 Query 781 GGCTTGGGTGTATCATGGAGTAATCTATATTCCTTACACGCTTGCTTGCTCCTACCATAC 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 GGCTTGGGTGTATCATGGAGTAATCTATATTCCTTACACGCTTGCTTGCTCCTACCATAC 840 Query 841 AACCACGCAGTCATTACGCGTACATATACCAGCAATTCTTCTACGGACCGTTAGGAAGAA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 AACCACGCAGTCATTACGCGTACATATACCAGCAATTCTTCTACGGACCGTTAGGAAGAA 900 Query 901 AATGAACGGAGTGGCTGGCCCATAATTTCGCACCCGAAGCTACTGGTCGGACCCATCAGC 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 AATGAACGGAGTGGCTGGCCCATAATTTCGCACCCGAAGCTACTGGTCGGACCCATCAGC 960 Query 961 GCGTGTCGTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 993 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 GCGTGTCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 993 Query= ERCC-00079_genbank |114975640|gb|DQ883652.2| Synthetic construct clone NISTag11 external RNA control sequence Length=650 Subject= ERCC-00079 Length=644 Score = 1190 bits (644), Expect = 0.0 Identities = 644/644 (100%), Gaps = 0/644 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GATGTTGGAGTTAACGGAGACCCGCCATCGTTTACGAAACAGGTCGCAGATAAATGTGGA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GATGTTGGAGTTAACGGAGACCCGCCATCGTTTACGAAACAGGTCGCAGATAAATGTGGA 60 Query 61 GCAGATTTACGTTGAGGGCCTTCTGGGGACCCAAAGGATGAACGGGGTGTTGTTTCAGAG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GCAGATTTACGTTGAGGGCCTTCTGGGGACCCAAAGGATGAACGGGGTGTTGTTTCAGAG 120 Query 121 CGAATAGAGCGATCACCAACGCGCACGTCTCTTTTTAAGATTGAGCGGCTAGGTGTTTCC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CGAATAGAGCGATCACCAACGCGCACGTCTCTTTTTAAGATTGAGCGGCTAGGTGTTTCC 180 Query 181 TACAGTAACTCAATTAGCGTGAGCCAAAGGGCGGAGCCACGGGCCAGTAAGCTATTTAGG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TACAGTAACTCAATTAGCGTGAGCCAAAGGGCGGAGCCACGGGCCAGTAAGCTATTTAGG 240 Query 241 GTTTACATGGCTCGATACCGAAACGTGACCGGTACGACGTTCATTTCCTCTGCTTTGGAG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GTTTACATGGCTCGATACCGAAACGTGACCGGTACGACGTTCATTTCCTCTGCTTTGGAG 300 Query 301 TTATCAATTCGTGACCCCGATCATCCAGTCCAGAAGTCGCGGCCCGAAGATCAAAGACGC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TTATCAATTCGTGACCCCGATCATCCAGTCCAGAAGTCGCGGCCCGAAGATCAAAGACGC 360 Query 361 TACTGACTTGGACTGGTACGAGAGCCCGAGAGTTTAGTGTGCGCACCCCACGTATTTTTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TACTGACTTGGACTGGTACGAGAGCCCGAGAGTTTAGTGTGCGCACCCCACGTATTTTTT 420 Query 421 CGCGTCGATCATGCTTAGATTTTAACAACCCGCGGGCCGAAGTTTGATAAGCGTGTTCTA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CGCGTCGATCATGCTTAGATTTTAACAACCCGCGGGCCGAAGTTTGATAAGCGTGTTCTA 480 Query 481 GATTGGAACTTACCACTGTTAAATACACGACGCCCATCTCCAAATCGCACGCAACAGGGG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GATTGGAACTTACCACTGTTAAATACACGACGCCCATCTCCAAATCGCACGCAACAGGGG 540 Query 541 GCTTCCACCAGATACTCCCCAGGACAGGTGGAGATACCAACCACGAAGGAGGTCTCGTGC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GCTTCCACCAGATACTCCCCAGGACAGGTGGAGATACCAACCACGAAGGAGGTCTCGTGC 600 Query 601 TGAGCCTTCGTCGATATACCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 644 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TGAGCCTTCGTCGATATACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 644 Query= ERCC-00081_genbank |110586078|gb|DQ854991.1| Synthetic construct clone AG002.0011 external RNA control sequence Length=509 Subject= ERCC-00081 Length=534 Score = 929 bits (503), Expect = 0.0 Identities = 508/510 (99%), Gaps = 1/510 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TTTATGCGGGGTGTTGTTGATAAGACTTCCTAGGCACGCGGACCAAGCACGTTAAAGGGA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TTTATGCGGGGTGTTGTTGATAAGACTTCCTAGGCACGCGGACCAAGCACGTTAAAGGGA 60 Query 61 GGTTCGCTCGATCAAGAGATCCATACAGCAGGCTCCTATCAGTCTATCTGACGCCAGTTG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GGTTCGCTCGATCAAGAGATCCATACAGCAGGCTCCTATCAGTCTATCTGACGCCAGTTG 120 Query 121 CCATTGGACGGGATGTCGAGGGTTTGCGGTGGGGAACGACCATACTTACTGTCATTACGA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CCATTGGACGGGATGTCGAGGGTTTGCGGTGGGGAACGACCATACTTACTGTCATTACGA 180 Query 181 CGTGCGGGGAAATTGAGGTTAAGTTGTTTGCCACCCTACAATAACGAAGAATTTAGCCAC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CGTGCGGGGAAATTGAGGTTAAGTTGTTTGCCACCCTACAATAACGAAGAATTTAGCCAC 240 Query 241 CGGTTGGCG-TAGAGTTGTCAAGACGTTGGCGTGATGGGATGAACGTCGCTTAAACGTTG 299 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CAGTTGGCGTTAGAGTTGTCAAGACGTTGGCGTGATGGGATGAACGTCGCTTAAACGTTG 300 Query 300 GTTCAGGGCTCCATATATACATCTGCCGTGCCCCCCTTAATCTCCATACAGACCCCCCAG 359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GTTCAGGGCTCCATATATACATCTGCCGTGCCCCCCTTAATCTCCATACAGACCCCCCAG 360 Query 360 GCGGAATGATAAGTCGATACCAGGACAATGACGGCTTCAACGTTTTCACTTTCCGCAGGT 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GCGGAATGATAAGTCGATACCAGGACAATGACGGCTTCAACGTTTTCACTTTCCGCAGGT 420 Query 420 GGCGACCCTCTAGTTGCACGCTGGTACATCAGACACGTACACACGCGCAGTGGGGTGTAA 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GGCGACCCTCTAGTTGCACGCTGGTACATCAGACACGTACACACGCGCAGTGGGGTGTAA 480 Query 480 TCAAGCAGGACCATAACTGATAGTTCACCA 509 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TCAAGCAGGACCATAACTGATAGTTCACCA 510 Query= ERCC-00083_genbank |103488727|gb|DQ516780.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-63 genomic sequence Length=1000 Subject= ERCC-00083 Length=1022 Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0 Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GAGTTTATAGTCtttttttGATTGCCTCAACTAATGCCTCCTTTGTAGGAGCTCCAATAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GAGTTTATAGTCTTTTTTTGATTGCCTCAACTAATGCCTCCTTTGTAGGAGCTCCAATAA 60 Query 61 ACTCAACATCCCCATTTATTACAATTGTTGGAACTGCCATTATCCCATATTCCATTGCCT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ACTCAACATCCCCATTTATTACAATTGTTGGAACTGCCATTATCCCATATTCCATTGCCT 120 Query 121 TTTGAGGATTCTCCATAACGTTTATGTATTCTACTTCAACAGCATCCGGCATTTCATTTG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TTTGAGGATTCTCCATAACGTTTATGTATTCTACTTCAACAGCATCCGGCATTTCATTTG 180 Query 181 CTACCTCTTCAACAACTCTTTTAGCTGCAGGACAGTGAGGACACATTGGTGATGTAAAAA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CTACCTCTTCAACAACTCTTTTAGCTGCAGGACAGTGAGGACACATTGGTGATGTAAAAA 240 Query 241 GCTCTATCTTTACCTTTGACATACTAACACCttaaaaacctcttaagtttataataaaaa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GCTCTATCTTTACCTTTGACATACTAACACCTTAAAAACCTCTTAAGTTTATAATAAAAA 300 Query 301 ttttatccaaatttttataaatagttttccaaaaatagaatattaaattataGGCTAAAA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TTTTATCCAAATTTTTATAAATAGTTTTCCAAAAATAGAATATTAAATTATAGGCTAAAA 360 Query 361 ATTAATGACCACATGTCCAAACTTGTCTGAAGTGTTCAATTGCTTCAACAATATCCTTCA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 ATTAATGACCACATGTCCAAACTTGTCTGAAGTGTTCAATTGCTTCAACAATATCCTTCA 420 Query 421 ATTTCTCTGGTGGGAAAGCTACAACAACTTCTTCTGGCTTAATTCCAGCGTATTTTCTTG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 ATTTCTCTGGTGGGAAAGCTACAACAACTTCTTCTGGCTTAATTCCAGCGTATTTTCTTG 480 Query 481 AACCGTTACAACCTAAAGTCATGTTAGGAGCTTTTCTTGTATAAACTGCCGCTACAGCAT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 AACCGTTACAACCTAAAGTCATGTTAGGAGCTTTTCTTGTATAAACTGCCGCTACAGCAT 540 Query 541 CAGCACACAATGACTGAATTCCTGAGAAATCTGCCTGGAATCTTCCACCTTTATGGTAGA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CAGCACACAATGACTGAATTCCTGAGAAATCTGCCTGGAATCTTCCACCTTTATGGTAGA 600 Query 601 GTATTGCTTGAACTAACCTCAACGCATATAATGGCTCTCCAATAAATACAATTGAGTCTG 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GTATTGCTTGAACTAACCTCAACGCATATAATGGCTCTCCAATAAATACAATTGAGTCTG 660 Query 661 GAATGAAGTCGGTTTCATCTAATGGAGCATAGACTGTTGCATAAATTTCCTCTTCAACTT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 GAATGAAGTCGGTTTCATCTAATGGAGCATAGACTGTTGCATAAATTTCCTCTTCAACTT 720 Query 721 TTGGTATTGCATCAACTGtttttttAGCTGCCTCTTCATCTTTAAAGTTTCCTAATTTGA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 TTGGTATTGCATCAACTGTTTTTTTAGCTGCCTCTTCATCTTTAAAGTTTCCTAATTTGA 780 Query 781 CATATAATTTTCCTGTTGCTAATGGTTCTGGTGGGTTTCTAAAGACCCCCATTGCATAAG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 CATATAATTTTCCTGTTGCTAATGGTTCTGGTGGGTTTCTAAAGACCCCCATTGCATAAG 840 Query 841 CTCCTCCCTTACAGAGGTGTTTATCAACTGTTGCATATAAtttttttCTTTCTAATCTTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 CTCCTCCCTTACAGAGGTGTTTATCAACTGTTGCATATAATTTTTTTCTTTCTAATCTTG 900 Query 901 CCATTTGAATCATTTCACAGTGTCTTTTTTCTTCGTCTAATGTTTCATAGCCTTCTGGAA 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CCATTTGAATCATTTCACAGTGTCTTTTTTCTTCGTCTAATGTTTCATAGCCTTCTGGAA 960 Query 961 TTTCTTCCTTTGATTTTGCCAATTTTACAGCGACAAATGG 1000 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 961 TTTCTTCCTTTGATTTTGCCA-TTTTACAGCGACAAATGG 999 Query= ERCC-00084_genbank |114976998|gb|DQ883682.2| Synthetic construct clone NISTag41 external RNA control sequence Length=1000 Subject= ERCC-00084 Length=994 Score = 1836 bits (994), Expect = 0.0 Identities = 994/994 (100%), Gaps = 0/994 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GCGAATTGTCTGGGGCCTCGTTGTGACTATCCTATTACGGGGATCTCAGGTGTGGTATCC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GCGAATTGTCTGGGGCCTCGTTGTGACTATCCTATTACGGGGATCTCAGGTGTGGTATCC 60 Query 61 CTGGTTGAGACATTGGACTAGTGTAATTGACAGTCATCGTATGCGGGATACCTCAAGTTG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CTGGTTGAGACATTGGACTAGTGTAATTGACAGTCATCGTATGCGGGATACCTCAAGTTG 120 Query 121 TATTCGAGGGCTTATCGGTGATACTGTGTAATCCCTTCGGCGAAAGATGTATGCGTGAGC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TATTCGAGGGCTTATCGGTGATACTGTGTAATCCCTTCGGCGAAAGATGTATGCGTGAGC 180 Query 181 ATTAAATTTACGTGTTTCCTATATCGGACGCCTAATCTTTACCCGAGAAAGATATCTCTG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ATTAAATTTACGTGTTTCCTATATCGGACGCCTAATCTTTACCCGAGAAAGATATCTCTG 240 Query 241 TAAGTTTTCAAGCAACCGCGTCCTAATGTATATAACTTGGATCATCAGATAGGCCCATTA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TAAGTTTTCAAGCAACCGCGTCCTAATGTATATAACTTGGATCATCAGATAGGCCCATTA 300 Query 301 CACTCTTCGGTGCTGCCGATATCCGACGAGCGGGCTTTTCGACTTGATCAGCGCTGTGGG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CACTCTTCGGTGCTGCCGATATCCGACGAGCGGGCTTTTCGACTTGATCAGCGCTGTGGG 360 Query 361 TAGAGCTTGGATAAGCGAGGTCAGTCAAGCGATTCGTTGCCTCCGGGTCCCACGTAGATC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TAGAGCTTGGATAAGCGAGGTCAGTCAAGCGATTCGTTGCCTCCGGGTCCCACGTAGATC 420 Query 421 GTTTGCCTGCATTTTATAGGTAGTGGCCTGCGTTCGCACTCCGAGGCACTGGGAACGATC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GTTTGCCTGCATTTTATAGGTAGTGGCCTGCGTTCGCACTCCGAGGCACTGGGAACGATC 480 Query 481 CTACCAACATAACGGTCGAACTCGGTGTCGGATGACCCGGACGGGACGCCCGCGCTCACA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 CTACCAACATAACGGTCGAACTCGGTGTCGGATGACCCGGACGGGACGCCCGCGCTCACA 540 Query 541 CAGGTATCTGGCGTGTACACCCGAATCGGCGGGGCTCGGCGACACAAAATGCTTCTAACT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CAGGTATCTGGCGTGTACACCCGAATCGGCGGGGCTCGGCGACACAAAATGCTTCTAACT 600 Query 601 CGCTGTGAATCTACTGCAGAACTATGGGTTTGCTAGCGCGCCGGTATCTACCAGCAAAAC 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 CGCTGTGAATCTACTGCAGAACTATGGGTTTGCTAGCGCGCCGGTATCTACCAGCAAAAC 660 Query 661 ATAGGAGCGTGGCCGAAACTGGGTCACTGAGTGGAATATATCCGAGTGCAGCTGCCATTA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 ATAGGAGCGTGGCCGAAACTGGGTCACTGAGTGGAATATATCCGAGTGCAGCTGCCATTA 720 Query 721 GTGGGGCGGTATCGGGCGTGATTGAAGGTAGGCTAACATTAGTCATCTGGTAGGGCATAT 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GTGGGGCGGTATCGGGCGTGATTGAAGGTAGGCTAACATTAGTCATCTGGTAGGGCATAT 780 Query 781 TTTACAAACGGTCTAGGCTGCGGTTCAGATAGGGACTGATATACTTGATGTGCCCCCGTT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TTTACAAACGGTCTAGGCTGCGGTTCAGATAGGGACTGATATACTTGATGTGCCCCCGTT 840 Query 841 CTTCAGCGTGCAGCTATGCAGCGACAGACGTTTGGAGCCTTAATCAAGTACGCATCGGAG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 CTTCAGCGTGCAGCTATGCAGCGACAGACGTTTGGAGCCTTAATCAAGTACGCATCGGAG 900 Query 901 CATACGGTCACTGGGGCATTTGCAGTGAAATTAACCATCCCCGTTCCCGCTTCTCAGTTG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CATACGGTCACTGGGGCATTTGCAGTGAAATTAACCATCCCCGTTCCCGCTTCTCAGTTG 960 Query 961 CAGGGTGGGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 994 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 CAGGGTGGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 994 Query= ERCC-00085_genbank |114976949|gb|DQ883669.2| Synthetic construct clone NISTag28 external RNA control sequence Length=850 Subject= ERCC-00085 Length=844 Score = 1559 bits (844), Expect = 0.0 Identities = 844/844 (100%), Gaps = 0/844 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GATTCAGCCTGACGTACATAGACGAGATAGGGTAAGCCTATTGCAAACCTCCGCTTTGCT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GATTCAGCCTGACGTACATAGACGAGATAGGGTAAGCCTATTGCAAACCTCCGCTTTGCT 60 Query 61 ACTACAAGGACCTCGGAAGTGTGGAGAATCGAACCTACAATTTTGCCAGGATCACGCCGG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ACTACAAGGACCTCGGAAGTGTGGAGAATCGAACCTACAATTTTGCCAGGATCACGCCGG 120 Query 121 TTATCTCTTGCAATTCCTAAGATGGAGGATAGTTTTGGAACCCAATATCCCCAGCCTACG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TTATCTCTTGCAATTCCTAAGATGGAGGATAGTTTTGGAACCCAATATCCCCAGCCTACG 180 Query 181 GTTTAGGTGCAAGAATAGAGCGTACCAGGCGTCGCCCGCGGCCTTATGTAGTCTGTATTG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GTTTAGGTGCAAGAATAGAGCGTACCAGGCGTCGCCCGCGGCCTTATGTAGTCTGTATTG 240 Query 241 TTGAATTAGCCTTCTTCAGAGGGCCTAACGCCAGCACAACATGCTTACCTGGCTAATTGA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TTGAATTAGCCTTCTTCAGAGGGCCTAACGCCAGCACAACATGCTTACCTGGCTAATTGA 300 Query 301 CTAAGTGCTACGGTACACAACGACTACGTACGTAGCACACAGTTGAGGTTATCTCTGAGC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CTAAGTGCTACGGTACACAACGACTACGTACGTAGCACACAGTTGAGGTTATCTCTGAGC 360 Query 361 GCCCCGTTAGAACTGAGGGCTCAATTATAGTACCTTAACTGCGTTGCGCTGTCATGGGAA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GCCCCGTTAGAACTGAGGGCTCAATTATAGTACCTTAACTGCGTTGCGCTGTCATGGGAA 420 Query 421 GGTATTTTAATACGGATTCATTACCGCTCCACCGGCAGCGTTCCGTTACATCCAACTAGG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GGTATTTTAATACGGATTCATTACCGCTCCACCGGCAGCGTTCCGTTACATCCAACTAGG 480 Query 481 TGGACAAACCTGCTCATTCAAGGGCGCCTCCATCGCAGGGTTGCAATTTATTTTCTAGCT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TGGACAAACCTGCTCATTCAAGGGCGCCTCCATCGCAGGGTTGCAATTTATTTTCTAGCT 540 Query 541 AGAGGTGTAACCATGCCGGCAGCGAACGTCCGCACTAGCAGGTACACAATCAGGCATCGA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 AGAGGTGTAACCATGCCGGCAGCGAACGTCCGCACTAGCAGGTACACAATCAGGCATCGA 600 Query 601 ACATGTACTCATTAGTTCCGAATTATAAGTCGGATACTTGCCTTAAGTCGCATCTGAATC 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 ACATGTACTCATTAGTTCCGAATTATAAGTCGGATACTTGCCTTAAGTCGCATCTGAATC 660 Query 661 ATAGCCGCTCCATTGCCGAGTAGACGGGATCTGCTGTAGAATGGTAATCAGTCTTACCCG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 ATAGCCGCTCCATTGCCGAGTAGACGGGATCTGCTGTAGAATGGTAATCAGTCTTACCCG 720 Query 721 TGGGGTCGTTCTGCCCGAGTGCTGCATTCCGCCTACGCGCGGTATTCAACAAGGGTAATC 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 TGGGGTCGTTCTGCCCGAGTGCTGCATTCCGCCTACGCGCGGTATTCAACAAGGGTAATC 780 Query 781 CCTCCGACAACCCTCAGTGTTATCATCCGCGTCAAGGGGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 CCTCCGACAACCCTCAGTGTTATCATCCGCGTCAAGGGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 840 Query 841 aaaa 844 |||| Sbjct 841 AAAA 844 Query= ERCC-00086_genbank |103488738|gb|DQ516791.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-74 genomic sequence Length=1000 Subject= ERCC-00086 Length=1020 Score = 1825 bits (988), Expect = 0.0 Identities = 996/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TTTCTCTTGACTTTTTCCATAACTTCCCTAATTGTTCTATAATTCYCTTTCAAAGAGTCC 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1 TTTCTCTTGACTTTTTCCATAACTTCCCTAATTGTTCTATAATTCTCTTTCAAAGAGTCC 60 Query 61 TTATCATAACCAAATACATAAACTCTAACTCTATTTCCTTTTGATTCTATTGTGCAATCA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TTATCATAACCAAATACATAAACTCTAACTCTATTTCCTTTTGATTCTATTGTGCAATCA 120 Query 121 ATGTCCATCCTTGATAATCTCTCACAAAGCTCCAAAAGCTCTTCATCACAACTCACTTTT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ATGTCCATCCTTGATAATCTCTCACAAAGCTCCAAAAGCTCTTCATCACAACTCACTTTT 180 Query 181 GATGAAATAATCTTTCTCATAGTATCACCAAAATAATAAAGTAAATTTATAAATTACCAT 240 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 181 GATGAAATAATCTTTCTCATAGTATCGCCAAAATAATAAAGTAAATTTACAAATTACCAT 240 Query 241 AGCTTATATAATAAAGTTTTGCATGAACAAAAATGTTGTGGTGATATATCATGGACGAAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 AGCTTATATAATAAAGTTTTGCATGAACAAAAATGTTGTGGTGATATATCATGGACGAAT 300 Query 301 TTGAAATGATAAAGAGAAACACATCTGAAATTATCAGCGAGGAAGAGTTAAGAGAGGTTT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TTGAAATGATAAAGAGAAACACATCTGAAATTATCAGCGAGGAAGAGTTAAGAGAGGTTT 360 Query 361 TaaaaaaaGATGAAAAATCTGCTTACATAGGTTTTGAACCAAGTGGTAAAATACATTTAG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TAAAAAAAGATGAAAAATCTGCTTACATAGGTTTTGAACCAAGTGGTAAAATACATTTAG 420 Query 421 GGCATTATCTCCAAATAAAAAAGATGATTGATTTACAAAATGCTGGATTTGATATAATTA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GGCATTATCTCCAAATAAAAAAGATGATTGATTTACAAAATGCTGGATTTGATATAATTA 480 Query 481 TATTGTTGGCTGATTTACACGCCTATTTAAACCAGAAAGGAGAGTTGGATGAGATTAGAA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TATTGTTGGCTGATTTACACGCCTATTTAAACCAGAAAGGAGAGTTGGATGAGATTAGAA 540 Query 541 AAATAGGAGATTATAACAAAAAAGTTTTTGAAGCAATGGGGTTAAAGGCAAAATATGTTT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 AAATAGGAGATTATAACAAAAAAGTTTTTGAAGCAATGGGGTTAAAGGCAAAATATGTTT 600 Query 601 ATGGAAGTGAATTCCAGCTTGATAAGGATTATACACTGAATGTCTATAGATTGGCTTTAA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 ATGGAAGTGAATTCCAGCTTGATAAGGATTATACACTGAATGTCTATAGATTGGCTTTAA 660 Query 661 AAACTACCTTAAAAAGAGCAAGAAGGAGTATGGAACTTATAGCAAGAGAGGATGAAAATC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 AAACTACCTTAAAAAGAGCAAGAAGGAGTATGGAACTTATAGCAAGAGAGGATGAAAATC 720 Query 721 CAAAGGTTGCTGAAGTTATCTATCCAATAATGCAGGTTAATGATATTCATTATTTAGGCG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 CAAAGGTTGCTGAAGTTATCTATCCAATAATGCAGGTTAATGATATTCATTATTTAGGCG 780 Query 781 TTGATGTTGCAGTTGGAGGGATGGAGCAGAGAAAAATACACATGTTAGCAAGGGAGCTTT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TTGATGTTGCAGTTGGAGGGATGGAGCAGAGAAAAATACACATGTTAGCAAGGGAGCTTT 840 Query 841 TACCAAAAAAGGTTGTTTGTATTCACAACCCTGTCTTAACGGGTTTGGATGGAGAAGGAA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 TACCAAAAAAGGTTGTTTGTATTCACAACCCTGTCTTAACGGGTTTGGATGGAGAAGGAA 900 Query 901 AGATGAGTTCTTCAAAAGGGAATTTTATAGCTGTTGATGACTCTCCAGAAGAGATTAGGG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 AGATGAGTTCTTCAAAAGGGAATTTTATAGCTGTTGATGACTCTCCAGAAGAGATTAGGG 960 Query 961 CTAAGATAAAGAAAGCATACTGCCCAGCTGGAGTTGTTGA 1000 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 961 CTAAGATAAAGAAAGCATAC-GCCCAGCTGGAGTTGTTGA 999 Query= ERCC-00092_genbank |92111303|gb|DQ459425.1| Synthetic construct microarray control MC20 mRNA, complete sequence Length=1131 Subject= ERCC-00092 Length=1124 Score = 2023 bits (1095), Expect = 0.0 Identities = 1117/1126 (99%), Gaps = 7/1126 (0%) Strand=Plus/Plus Query 4 AGATGTATATATGATGTCCTTGGACGGGGTGGCGCAGTCTTACTGCAAGAGAGCGGACAG 63 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1 AGATGTATATATGATGTCCTTGGACGGGGTGGCGCAGTATTACTGCAAGAGAGCGGACAG 60 Query 64 ATTAGTGTGTTGG-GCCGACACATCAAAGGTTCGTCCGGGGACCGATCTGCAGCCTACGG 122 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ATTAGTGTGTTGGAGCCGACACATCAAAGGTTCGTCCGGGGACCGATCTGCAGCCTACGG 120 Query 123 GACATTTATCCGTAAAAGCATGGCGCTGTTTCGTACTTATCGGAGGCCAGGTATCGTCGC 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GACATTTATCCGTAAAAGCATGGCGCTGTTTCGTACTTATCGGAGGCCAGGTATCGTCGC 180 Query 183 GGCGAGTCTCCCCGACGACGGAGATGGGCGTTACTATCTGGGCCGTCTCGTACTCTGTTA 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GGCGAGTCTCCCCGACGACGGAGATGGGCGTTACTATCTGGGCCGTCTCGTACTCTGTTA 240 Query 243 CTTGGCACAGATGCGAGCCCTCGTAATGTGCATCAGCTAAGGGCGATATTATAATGCGAC 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CTTGGCACAGATGCGAGCCCTCGTAATGTGCATCAGCTAAGGGCGATATTATAATGCGAC 300 Query 303 GTTTGTACGGACTCGTTACTAACGTGTTGGACGCTAGTGGAATATGTGTCGTTGGTTAGC 362 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GTTTGTACGGATTCGTTACTAACGTGTTGGACGCTAGTGGAATATGTGTCGTTGGTTAGC 360 Query 363 CTACCCATGGCTTTCGCGGCGAC-CATGCTTAGACTCTTTCAAAACTTCGGTGAAGTTCA 421 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CTACCCATGGCTTTCGCGGCGACACATGCTTAGACTCTTTCAAAACTTCGGTGAAGTTCA 420 Query 422 CTCAAGCCGCGGAGCGCCGTCGTAATTCACTAGGGATGGCGG-ACCCG-GCCCGTCCGAT 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 421 CTCAAGCCGCGGAGCGCCGTCGTAATTCACTAGGGATGGCGGTACCCGTGCCCGTCCGAT 480 Query 480 TCGTAGCAACCTGCATCACGATTTTGTCTTCGGGCGACTTATCAGATACGGTAATGTAAA 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TCGTAGCAACCTGCATCACGATTTTGTCTTCGGGCGACTTATCAGATACGGTAATGTAAA 540 Query 540 TACCTGGCATTTGGGCACTTCTGTGC-TTTAAGCGGGAAAGATCGCGAGGGCCCGCTATT 598 |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TACCTGGCATTTGGGCACTTCT-TGCGTTTAAGCGGGAAAGATCGCGAGGGCCCGCTATT 599 Query 599 TGCGATACTTCCCATGTCGGTGCCGTCGCCTCTATGTACTCGGAGACGTTAATGCAGAGG 658 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 TGCGATACTTCCCATGTCGGTGCCGTCGCCTCTATGTACTCGGAGACGTTAATGCAGAGG 659 Query 659 CTAAGGACAATTTACCATGACTCGGTAATCCGTTCGTCAAGCAGGTAGCTCGAGTCTCCC 718 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 CTAAGGACAATTTACCATGACTCGGTAATCCGTTCGTCAAGCAGGTAGCTCGAGTCTCCC 719 Query 719 CACGGACACGTAGTGGGTTTGTAACGATCGATACCGAGTCTTTTTGTCTAGTAGAACCAA 778 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 CACGGACACGTAGTGGGTTTGTAACGATCGATACCGAGTCTTTTTGTCTAGTAGAACCAA 779 Query 779 CCAACGCATTAAGGAGTTCACTAGCACATCTTTGCGACCCGATCGTCCGTGTGTCGCGTA 838 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 CCAAC-CATTAAGGAGTTCACTAGCACATCTTTGCGACCCGATCGTCCGTGTGTCGCGTA 838 Query 839 ATACTTTTGTTATGACGAGACATACGCTCAAGCCCTGGGTAGCTAGTCGCGGAGGCACGT 898 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 839 ATACTTTTGTTATGACGAGACATACGCTCAAGCCCTGGGTAGCTAGTCGCGGAGGCACGT 898 Query 899 TACCGCGCACAACCCCTATTCGTTTACATGTACATCGCATCTGAGGTAGTACACTTCCGG 958 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 899 TACCGCGCACAACCCCTATTCGTTTACATGTACATCGCATCTGAGGTAGTACACTTCCGG 958 Query 959 CGTACGTGAGTATTTGCGCGTAATAAGCGCGTGTTTAGCTGATCCCCTCTCGTATCGAGG 1018 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 959 CGTACGTGAGTATTTGCGCGTAATAAGCGCGTGTTTAGCTGATCCCCTCTCGTATCGAGG 1018 Query 1019 TTAAGGCAGATTAGTGCCCAGTAATTGCGtttttttGTCGTTGTCGCAGAACGCGATTTG 1078 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1019 TTAAGGCAGATTAGTGCCCAGTAATTGCGTTTTTTTGTCGTTGTCGCAGAACGCGATTTG 1078 Query 1079 CTCCGAAAGCTTTAAGCCGTGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1079 CTCCGAAAGCTTTAAGCCGTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1124 Query= ERCC-00095_genbank |103488706|gb|DQ516759.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-500-42 genomic sequence Length=500 Subject= ERCC-00095 Length=521 Score = 911 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 498/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TTGATGATGATACTTAACCAAACCTACCACTAATGTAGTCATCTGTCTCCTTCTTCTGTG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TTGATGATGATACTTAACCAAACCTACCACTAATGTAGTCATCTGTCTCCTTCTTCTGTG 60 Query 61 GATTTAGGAATATCTGCTCTGTCTCTCCAAACTCAATTAATTTCCCCATTAAGAAAAAGG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GATTTAGGAATATCTGCTCTGTCTCTCCAAACTCAATTAATTTCCCCATTAAGAAAAAGG 120 Query 121 CAGTGTAATCAGAAACCCTACTTGCCTGCTGCATGTTGTGGGTAACAACAACAATCGTAT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CAGTGTAATCAGAAACCCTACTTGCCTGCTGCATGTTGTGGGTAACAACAACAATCGTAT 180 Query 181 AATCTTTAGCTAACTCAACCATTAACTCCTCTATCTTTAATGTGGAGATAGGGTCTAAGG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 AATCTTTAGCTAACTCAACCATTAACTCCTCTATCTTTAATGTGGAGATAGGGTCTAAGG 240 Query 241 CAGATGTTGGTTCATCCATCAATAAAACCTCTGGCTTAACTGCTATCGCTCTCGCTATAC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CAGATGTTGGTTCATCCATCAATAAAACCTCTGGCTTAACTGCTATCGCTCTCGCTATAC 300 Query 301 ATAACCTCTGCTGTTGTCCTCCAGAGAGAGATAAAGCGTTTTTATGCAGTTCATCTTTAA 360 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATAACCTCTGCTGTTGTCCTCCAGAGAGAGATAGAGCGTTTTTATGCAGTTCATCTTTAA 360 Query 361 CCTCATCCCACAAAGCCGCTTTCTTTAAAGCCCACTCAACAATCTTATCCAATTCTTTTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CCTCATCCCACAAAGCCGCTTTCTTTAAAGCCCACTCAACAATCTTATCCAATTCTTTTT 420 Query 421 TATCCTTAATTCCATGAATTCTTGGGCCAAATGCAACATTATCATAGATGCTCATAGCAA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TATCCTTAATTCCATGAATTCTTGGGCCAAATGCAACATTATCATAGATGCTCATAGCAA 480 Query 481 AAGGATTTGGCTTTTGAAAT 500 |||||||||| ||||||||| Sbjct 481 AAGGATTTGG-TTTTGAAAT 499 Query= ERCC-00096_genbank |92111307|gb|DQ459429.1| Synthetic construct microarray control MC27 mRNA, complete sequence Length=1119 Subject= ERCC-00096 Length=1107 Score = 2036 bits (1102), Expect = 0.0 Identities = 1107/1109 (99%), Gaps = 2/1109 (0%) Strand=Plus/Plus Query 4 AGATAAAACGAATAGCTCGTAACCAAACATGCACAGCGGTCAAACAGTATGTCCCAAGGG 63 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 AGATAAAACGAATAGCTCGTAACCAAACATGCACAGCGGTCAAACAGTATGTCCCAAGGG 60 Query 64 GACTTAAGCGCGGTGGCCTCCCCTATCCCCTACGAGGCTACCCGGATCGATGACGCGCAA 123 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 61 GACTTAAGCGCGGTGGCCTCCCCTATCCCCTACGAGGCTACCCGGATCGATGACGCG-AA 119 Query 124 TTGGGGACATTCAAATGAGCATCCTAGTCACCGCGTTTAAAATGAACCTGCCGGCTGATC 183 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 TTGGGGACATTCAAATGAGCATCCTAGTCACCGCGTTTAAAATGAACCTGCCGGCTGATC 179 Query 184 GTTTTTAGGATATTGTGAGTAATATAGATTGGCGCTAGTAGATCACAGAACAACCGCCGC 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 GTTTTTAGGATATTGTGAGTAATATAGATTGGCGCTAGTAGATCACAGAACAACCGCCGC 239 Query 244 ATACGGCCGATTGTCGCAGCCCGGGTCGATTATAACAACGGTGCAATCTCAGCTAAACCG 303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 240 ATACGGCCGATTGTCGCAGCCCGGGTCGATTATAACAACGGTGCAATCTCAGCTAAACCG 299 Query 304 ACGCAGTTTTGCTCCTTGGATTCTGAGCCCGGGCATCGCCCCTCGTTTATGAACTAGCCT 363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 300 ACGCAGTTTTGCTCCTTGGATTCTGAGCCCGGGCATCGCCCCTCGTTTATGAACTAGCCT 359 Query 364 ATCGCAGACGGTATCAACAGGAACATCCTCGTGTTAGATATTGAGGCTGCTTCGTGTCGG 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 ATCGCAGACGGTATCAACAGGAACATCCTCGTGTTAGATATTGAGGCTGCTTCGTGTCGG 419 Query 424 CACGAAGTGTCTTCCGATGCAGTGTCCAGTCATGACCTCGATCCATCGCGTATAGGGACG 483 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 CACGAAGTGTCTTCCGATGCAGTGTCCAGTCATGACCTCGATCCATCGCGTATAGGGACG 479 Query 484 CCCCCTGCTCGCGTTACTGCCAAGCGAGCGTGGTGTGGTGCCCCCGACCTACAACTTGCG 543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 CCCCCTGCTCGCGTTACTGCCAAGCGAGCGTGGTGTGGTGCCCCCGACCTACAACTTGCG 539 Query 544 CCAATTATCCGAGCTGGTAGACGACCAGCGCTGACGAGCTGGCGCAATGATGACCTAATT 603 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 CCAATTAT-CGAGCTGGTAGACGACCAGCGCTGACGAGCTGGCGCAATGATGACCTAATT 598 Query 604 GGCGCACAGTACTAGGCATCGTCATCCAATGCGACGAGTCCTACACTATCTTGGATATGA 663 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 599 GGCGCACAGTACTAGGCATCGTCATCCAATGCGACGAGTCCTACACTATCTTGGATATGA 658 Query 664 TATGGCGCACTACACATGCTAGCCGCTGGGGAGATTAGCTCGAGTTGCCCCTTTGCCCGA 723 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 659 TATGGCGCACTACACATGCTAGCCGCTGGGGAGATTAGCTCGAGTTGCCCCTTTGCCCGA 718 Query 724 TCCCGGAAGATACGCTCTAAGCTCGGCAATCGCTCTTGCCGTGCGAGATGCTAGCAAAAA 783 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 719 TCCCGGAAGATACGCTCTAAGCTCGGCAATCGCTCTTGCCGTGCGAGATGCTAGCAAAAA 778 Query 784 GGTGTACTTCTCAGCGGAGCAGAAAGATCATGTTTATTGGAAGCATCAACCTGTGCCGTC 843 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 779 GGTGTACTTCTCAGCGGAGCAGAAAGATCATGTTTATTGGAAGCATCAACCTGTGCCGTC 838 Query 844 TTGTTAACTTGTCATATCGCGCACGTAGTAGCCTAGAGCGCCAGGGGCGGAAATTCGCCT 903 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 839 TTGTTAACTTGTCATATCGCGCACGTAGTAGCCTAGAGCGCCAGGGGCGGAAATTCGCCT 898 Query 904 GAAAAGTTTTGCCGGCGCACAAGCACGATCGGCTCCTAATAGGAGGTGAATTAGATAGGG 963 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 899 GAAAAGTTTTGCCGGCGCACAAGCACGATCGGCTCCTAATAGGAGGTGAATTAGATAGGG 958 Query 964 AAAAGATCGGGATGCTACTAGTTTACTGCGTCACGCTGAGGGACTCATCCTGGGCTACAA 1023 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 959 AAAAGATCGGGATGCTACTAGTTTACTGCGTCACGCTGAGGGACTCATCCTGGGCTACAA 1018 Query 1024 TCCTATTGCCGAGATAGTATTTCTTAGCTTCCTGAGGGAGGTCAATTTGAATGTGGTTAT 1083 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1019 TCCTATTGCCGAGATAGTATTTCTTAGCTTCCTGAGGGAGGTCAATTTGAATGTGGTTAT 1078 Query 1084 ATGCGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1112 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1079 ATGCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1107 Query= ERCC-00097_genbank |103488705|gb|DQ516758.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-500-41 genomic sequence Length=500 Subject= ERCC-00097 Length=523 Score = 911 bits (493), Expect = 0.0 Identities = 498/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CCTTCATAATACCACCAAAATACCAATTCGAAAGTTTTAGCATATTCAAACAATATAAAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CCTTCATAATACCACCAAAATACCAATTCGAAAGTTTTAGCATATTCAAACAATATAAAA 60 Query 61 TCTTCAGATTGGACATTAATTGGGACTGAAAGTCCCAACTTAATGGACGTGTGGTATCCA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TCTTCAGATTGGACATTAATTGGGACTGAAAGTCCCAACTTAATGGACGTGTGGTATCCA 120 Query 121 CACCATAAAGGGGCTACGCCCCTCTTGGGATACTCCCCTAATATTGCTAATTTACACCTC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CACCATAAAGGGGCTACGCCCCTCTTGGGATACTCCCCTAATATTGCTAATTTACACCTC 180 Query 181 CGAGCATAAGCGAGGAGGTGTTAGGTTTTGATGAACCTTTTACTAAAAGGTTCATACCAA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CGAGCATAAGCGAGGAGGTGTTAGGTTTTGATGAACCTTTTACTAAAAGGTTCATACCAA 240 Query 241 TAGGAGGTTTCCTCCTATGGTAGTTAAATGTACATTGGATATTCCTTTCTACTCTTTGAC 300 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TAGGAGGTTTCCCCCTATGGTAGTTAAATGTACATTGGATATTCCTTTCTACTCTTTGAC 300 Query 301 ATCATCTTTAAATGTTGCTCTGCCAGTTCTTTAAGTTTGTTTTCAATAGCTTCAGCCTCT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATCATCTTTAAATGTTGCTCTGCCAGTTCTTTAAGTTTGTTTTCAATAGCTTCAGCCTCT 360 Query 361 TTGATGAGATTTTCAATATTTACATTTAGATTGAACATTTTATTCAAAACCTCTAATAGA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TTGATGAGATTTTCAATATTTACATTTAGATTGAACATTTTATTCAAAACCTCTAATAGA 420 Query 421 TTAGcccccccTCTTGGGTCTGGTCTAATTCCAACAGTTTCAGCCAACAAACCAATAGCA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TTAGCCCCCCCTCTTGGGTCTGGTCTAATTCCAACAGTTTCAGCCAACAAACCAATAGCA 480 Query 481 TCAAACCCATTGTCATGGCA 500 |||||||||| ||||||||| Sbjct 481 TCAAACCCAT-GTCATGGCA 499 Query= ERCC-00098_genbank |92111293|gb|DQ459415.1| Synthetic construct microarray control MC04 mRNA, complete sequence Length=1146 Subject= ERCC-00098 Length=1143 Score = 2065 bits (1118), Expect = 0.0 Identities = 1137/1145 (99%), Gaps = 6/1145 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGAGAGTCGCAATTACATCGGTTCCTGTCCCGTAGAGGCTGGAAGGGGCATAAGAAGCAG 60 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GGAG-GTCGCAATTACATCGGTTCCTGTCCCGTAGAGGCTGGAAGGGGCATAAGAAGCAG 59 Query 61 TGATACCAACGCTCTCCCCCGCGCGTCTCGTGAGAGCAGACCATGAACATCGCAGAGGAG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 60 TGATACCAACGCTCTCCCCCGCGCGTCTCGTGAGAGCAGACCATGAACATCGCAGAGGAG 119 Query 121 AATCCTGCATGACTGAATGCGCAGAGCAACTGTCACCACGTGGTTAATGAGAAGGCAGAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 AATCCTGCATGACTGAATGCGCAGAGCAACTGTCACCACGTGGTTAATGAGAAGGCAGAA 179 Query 181 CTCAACAGACAGCTCTGGATCTGCTGCATCCCAGGGCAAGAATCAGGAAAGCAGATGCAG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 CTCAACAGACAGCTCTGGATCTGCTGCATCCCAGGGCAAGAATCAGGAAAGCAGATGCAG 239 Query 241 TAACCATAGGCACGTGAAAATGCTCCCGGCCACACTTTGGAGCTATTACCATGGTCGGGC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 240 TAACCATAGGCACGTGAAAATGCTCCCGGCCACACTTTGGAGCTATTACCATGGTCGGGC 299 Query 301 CCAAACATAAGTGGACAGCTAGAACGATTTCTCAAGCCTGGCAACGTGGGTTAGAACTCC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 300 CCAAACATAAGTGGACAGCTAGAACGATTTCTCAAGCCTGGCAACGTGGGTTAGAACTCC 359 Query 361 AACCCCTCGCACGTAGTATGGCGCTGGAGTAAAGAGCGCTCTGTTAGCAAGCGACCAGTC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 AACCCCTCGCACGTAGTATGGCGCTGGAGTAAAGAGCGCTCTGTTAGCAAGCGACCAGTC 419 Query 421 TCCCGAAAGTACAGGATGTGCATGTTCTAACCAAAGGGTCGCAGGGACGATGATT-CTAG 479 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 420 TCCCGAAAGTACAGGATGTGCATGTTCTAACCAAAGGGTCGCAGGGACGATGATTGCTAG 479 Query 480 TAGCTTGACAAGGCTATCCTAGTCATCCTGAATCCGGCCTATCAAAGGAATGCGTGGCAG 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 TAGCTTGACAAGGCTATCCTAGTCATCCTGAATCCGGCCTATCAAAGGAATGCGTGGCAG 539 Query 540 GTCAAGTGACGAGAGTGGAAGAGCTTCCCGTTGACAAGCGGCAAGTAGACTGTGCCTACC 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 GTCAAGTGACGAGAGTGGAAGAGCTTCCCGTTGACAAGCGGCAAGTAGACTGTGCCTACC 599 Query 600 CGGGCTTTCCAGACCTAAGATATCTGCACTCAGCAGAGTGTTGTGTTCGGGGCAGCAGTG 659 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 CGGGCTTTCCAGACCTAAGATATCTGCATTCAGCAGAGTGTTGTGTTCGGGGCAGCAGTG 659 Query 660 TGCCTTCATTCGTCAACTGGAGCCTAAGGCCCCAAACTCGATCATTGATGACTACTCGAC 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 TGCCTTCATTCGTCAACTGGAGCCTAAGGCCCCAAACTCGATCATTGATGACTACTCGAC 719 Query 720 AAAAGAGGGTGGTATACAGAAAGAGGCTTGTGTCGCCGGAAACGCTTATCCGCACAGTAA 779 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 AAAAGAGGGTGGTATACAGAAAGAGGCTTGTGTCGCCGGAAACGCTTATCCGCACAGTAA 779 Query 780 AACCTCCCCAGATGACCTTCTCCCTCATAATCACTTAATCTG-GC--AGGAGGCAGGCTG 836 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct 780 AACCTCCCCAGATGACCTTCTCCCTCATAATCACTTAATCTGAGCGCAGGAGGCAGGCTG 839 Query 837 TATTAATTCCGGCCTCCAACCGGACCGTGGAACGACGCGACCAAGTGGTCGACGGGACAT 896 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 TATTAATTCCGGCCTCCAACCGGACCGTGGAACGACGCGACCAAGTGGTCGACGGGACAT 899 Query 897 GCCCCAGTATTTGGCCGTTCTGCCGATTCTCAGCTAGCAAACCAAGATCGTACTACGTAC 956 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 GCCC-AGTATTTGGCCGTTCTGCCGATTCTCAGCTAGCAAACCAAGATCGTACTACGTAC 958 Query 957 GCGCCTGGATAGATCGACGGCTGTTTAATAAGAGTCACTCCAGGCCTGTGCTAGGATCAG 1016 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 959 GCGCCTGGATAGATCGACGGCTGTTTAATAAGAGTCACTCCAGGCCTGTGCTAGGATCAG 1018 Query 1017 GGCGACCATGCCAAATATCAACTCAAGGACAAGTTGACGCCTGCCTTCTGGGGTATGGAT 1076 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1019 GGCGACCATGCCAAATATCAACTCAAGGACAAGTTGACGCCTGCCTTCTGGGGTATGGAT 1078 Query 1077 CAAAAGCCCACGTTACCATGTAAGACCGTGTGGATCTTCGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1136 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1079 CAAAAGCCCACGTTACCATGTAAGACCGTGTGGATTTTCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1138 Query 1137 aaaaa 1141 ||||| Sbjct 1139 AAAAA 1143 Query= ERCC-00099_genbank |112819962|gb|DQ875387.1| Synthetic construct microarray control PHE gene, complete sequence Length=1330 Subject= ERCC-00099 Length=1350 Score = 2444 bits (1323), Expect = 0.0 Identities = 1328/1330 (99%), Gaps = 2/1330 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 GGGGATGCAAATGAAAGAGGAGACATTTTATCTTGTCCGTGAAGATGTATTGCCCGATGC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1350 GGGGATGCAAATGAAAGAGGAGACATTTTATCTTGTCCGTGAAGATGTATTGCCCGATGC 1291 Query 61 AATGAGAAAAACATTAGAAGTCAAAAAGCTGCTTGATCGaaaaaaaGCAGATTCAGTAGC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1290 AATGAGAAAAACATTAGAAGTCAAAAAGCTGCTTGATCGAAAAAAAGCAGATTCAGTAGC 1231 Query 121 AGATGCCGTTCAAAAGGTCGATTTAAGTAGAAGTGCGTTTTATAAATACAGGGATGCTGT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1230 AGATGCCGTTCAAAAGGTCGATTTAAGTAGAAGTGCGTTTTATAAATACAGGGATGCTGT 1171 Query 181 TTTTCCATTCTACACCATGGTAAAAGAACAAATTATCACACTTTTCTTTCATTTGGAGGA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1170 TTTTCCATTCTACACCATGGTAAAAGAACAAATTATCACACTTTTCTTTCATTTGGAGGA 1111 Query 241 TAGGTCAGGTGCGTTATCTCAGCTTCTTCAGGCGGTAGCTGATTCTGGAAGCAACGTTCT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1110 TAGGTCAGGTGCGTTATCTCAGCTTCTTCAGGCGGTAGCTGATTCTGGAAGCAACGTTCT 1051 Query 301 TTCCATTCACCAGACCATTCCGCTTCAAGGCAGAGCAAATGTGACACTGTCTATCAGTAC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1050 TTCCATTCACCAGACCATTCCGCTTCAAGGCAGAGCAAATGTGACACTGTCTATCAGTAC 991 Query 361 GTCGGCAATGGAAGAAGACATTCATACATTAATGAATAAGCTCAGGAAGTTTGATTTTGT 420 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 990 GTCGGC-ATGGAAGAAGACATTCATACATTAATGAATAAGCTCAGGAAGTTTGATTTTGT 932 Query 421 AGAAAAGGTTGAAATATTAGGTTCAGGTGCATAAGGGAGAGAAAATCGTCATGAAAGTCG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 931 AGAAAAGGTTGAAATATTAGGTTCAGGTGCATAAGGGAGAGAAAATCGTCATGAAAGTCG 872 Query 481 GTTATTTAGGTCCAGCAGCTACATTTACACATCTAGCAGTCAGTTCTTGTTTTCAAAACG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 871 GTTATTTAGGTCCAGCAGCTACATTTACACATCTAGCAGTCAGTTCTTGTTTTCAAAACG 812 Query 541 GCGCCGAACATGTTGCTTACCGCACCATTCCGGAGTGTATAGATGCAGCCGTTGCAGGCG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 811 GCGCCGAACATGTTGCTTACCGCACCATTCCGGAGTGTATAGATGCAGCCGTTGCAGGCG 752 Query 601 AAGTTGATTTTGCTTTTGTTCCTTTGGAAAATGCTTTAGAAGGATCTGTTAATCTAACAA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 751 AAGTTGATTTTGCTTTTGTTCCTTTGGAAAATGCTTTAGAAGGATCTGTTAATCTAACAA 692 Query 661 TAGACTATTTAATACATGAACAGCCTTTGCCAATCGTGGGTGAAATGACGTTGCCGATTC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 691 TAGACTATTTAATACATGAACAGCCTTTGCCAATCGTGGGTGAAATGACGTTGCCGATTC 632 Query 721 ACCAGCACTTGCTCGTCCATCCCTCAAGAGAGAATGCATGGAAAGAGCTCGACAAAATTT 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 631 ACCAGCACTTGCTCGTCCATCCCTCAAGAGAGAATGCATGGAAAGAGCTCGACAAAATTT 572 Query 781 ACTCACATTCACACGCGATTGCGCAATGCCATAAATTTCTTCATCGACACTTTCCTTCCG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 571 ACTCACATTCACACGCGATTGCGCAATGCCATAAATTTCTTCATCGACACTTTCCTTCCG 512 Query 841 TTCCATATGAATACGCCAATTCTACCGGGGCGGCAGCAAAGTTTGTCAGTGACCATCCCG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 511 TTCCATATGAATACGCCAATTCTACCGGGGCGGCAGCAAAGTTTGTCAGTGACCATCCCG 452 Query 901 AGCTGAATATCGGGGTCATTGCCAATGATATGGCAGCTTCTACATACGAATTAAAAATCG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 451 AGCTGAATATCGGGGTCATTGCCAATGATATGGCAGCTTCTACATACGAATTAAAAATCG 392 Query 961 TGAAACGGGATATACAGGATTATAGGGACAATCATACAAGATTTGTTATCCTGTCTCCCG 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 391 TGAAACGGGATATACAGGATTATAGGGACAATCATACAAGATTTGTTATCCTGTCTCCCG 332 Query 1021 ATGAAAACATATCTTTTGAAGTGAATTCAAAATTGAGCTCTAGGCCCAAAACGACCTTAA 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 331 ATGAAAACATATCTTTTGAAGTGAATTCAAAATTGAGCTCTAGGCCCAAAACGACCTTAA 272 Query 1081 TGGTCATGCTGCCGCAGGATGATCAGTCCGGGGCGCTGCATAGAGTGCTGTCTGCATTTT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 271 TGGTCATGCTGCCGCAGGATGATCAGTCCGGGGCGCTGCATAGAGTGCTGTCTGCATTTT 212 Query 1141 CTTGGAGAAATTTAAACCTGTCAAAAATTGAGTCACGTCCGACTAAAACCGGATTAGGCC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 211 CTTGGAGAAATTTAAACCTGTCAAAAATTGAGTCACGTCCGACTAAAACCGGATTAGGCC 152 Query 1201 ATTATTTCTTTATTATTGATATTGAGAAAGCGTTTGATGATGTATTGATTCCAGGGGCCA 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 151 ATTATTTCTTTATTATTGATATTGAGAAAGCGTTTGATGATGTATTGATTCCAGGGGCCA 92 Query 1261 TGCAGGAGCTTGAAGCACTCGGCTGCAAAGTGAGGCTTCTGGGTGCATACCAGTCTTACC 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 91 TGCAGGAGCTTGAAGCACTCGGCTGCAAAGTGAGGCTTCTGGGTGCATAC-AGTCTTACC 33 Query 1321 AATTATAAAA 1330 |||||||||| Sbjct 32 AATTATAAAA 23 Query= ERCC-00104_genbank |103488762|gb|DQ516815.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-2000-98 genomic sequence Length=2000 Subject= ERCC-00104 Length=2022 Score = 3677 bits (1991), Expect = 0.0 Identities = 1997/2000 (99%), Gaps = 0/2000 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TGCAATCTCTTCAACAGCCTCTGCTAAGTATTCTGCAGCTGCTCTGCTAACTCTCTCAGC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TGCAATCTCTTCAACAGCCTCTGCTAAGTATTCTGCAGCTGCTCTGCTAACTCTCTCAGC 60 Query 61 ACCAGCCTTTTTCAATATTCTCTCAAATGGTGCAACTGGAAGCTCAGCCATAATACCACC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ACCAGCCTTTTTCAATATTCTCTCAAATGGTGCAACTGGAAGCTCAGCCATAATACCACC 120 Query 121 TCACAATAGATTTCCAATAAATACTGTTATAAAATCCTTTATTTAAACTTTTCGGTCATT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TCACAATAGATTTCCAATAAATACTGTTATAAAATCCTTTATTTAAACTTTTCGGTCATT 180 Query 181 TTCATTTTTTGTGAAAGTCTTTGGAAAATTTTCCCACACATAAAGAAGGTATTAAAAAGT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TTCATTTTTTGTGAAAGTCTTTGGAAAATTTTCCCACACATAAAGAAGGTATTAAAAAGT 240 Query 241 GTGACACTAAAATTATAAAAAACACTATTTATAATGTATGTCACAAATTTAAAATATAAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GTGACACTAAAATTATAAAAAACACTATTTATAATGTATGTCACAAATTTAAAATATAAT 300 Query 301 TTTATGAAAGATAGATAAACATAAATTAATAGAGTTTAATTGTGATATTTATGATAATTA 360 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TTTATGAAAGATAGATAAACATAAATTGGTAGAGTTTAATTGTGATATTTATGATAATTA 360 Query 361 CTATAGCTTCGGGTAAAGGAGGGGTTGGAAAAACTACAACATCAGCATCTTTAGCAGTAG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CTATAGCTTCGGGTAAAGGAGGGGTTGGAAAAACTACAACATCAGCATCTTTAGCAGTAG 420 Query 421 CACTTGCTAAATTGGGAAAAAAGGTTTTAGCTATTGATGGAGACATATCAATGGCTAATT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CACTTGCTAAATTGGGAAAAAAGGTTTTAGCTATTGATGGAGACATATCAATGGCTAATT 480 Query 481 TAGGGATTCTATTCAATATGGAAAAGAAAAAACCCTCTTTACATGAAGTTTTGAGTGAAG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TAGGGATTCTATTCAATATGGAAAAGAAAAAACCCTCTTTACATGAAGTTTTGAGTGAAG 540 Query 541 AGGCAGATGTTAGGGATGCAATTTACAAACATAAAACTGGAGTTTATGTATTGCCAACGA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 AGGCAGATGTTAGGGATGCAATTTACAAACATAAAACTGGAGTTTATGTATTGCCAACGA 600 Query 601 GTTTGTCTTTAGAAGGTTATAAGAAATCAGATATTGATTTACTTCCAGATGTGGTTAATG 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GTTTGTCTTTAGAAGGTTATAAGAAATCAGATATTGATTTACTTCCAGATGTGGTTAATG 660 Query 661 AGGTAGCTGATGATTTTGATTATGTAATTATAGATGCTCCAGCTGGGTTAAATAGAGAAA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 AGGTAGCTGATGATTTTGATTATGTAATTATAGATGCTCCAGCTGGGTTAAATAGAGAAA 720 Query 721 TGGCTACTCATTTAGCTATTGCTGATAAACTTTTACTTGTTGTCACCCCAGAGATGTTCT 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 TGGCTACTCATTTAGCTATTGCTGATAAACTTTTACTTGTTGTCACCCCAGAGATGTTCT 780 Query 781 CAATTATTGACGCTGTTAGATTAAAAGAAAGTGCTGAAATGGCTGGAACACCTTTAATGG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 CAATTATTGACGCTGTTAGATTAAAAGAAAGTGCTGAAATGGCTGGAACACCTTTAATGG 840 Query 841 GTGTTGTGTTAAATAGGGTTGGTAGAGATTTTGGTGAAATGGGTAGAGATGAGATTGAAA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 GTGTTGTGTTAAATAGGGTTGGTAGAGATTTTGGTGAAATGGGTAGAGATGAGATTGAAA 900 Query 901 TGTTAATAAAAGGTAAAGTTTTAGTTGAAGTCCCTGAAGATGAAAATGTTAGGTCAGCAG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 TGTTAATAAAAGGTAAAGTTTTAGTTGAAGTCCCTGAAGATGAAAATGTTAGGTCAGCAG 960 Query 961 CTTTAAAAAAGATGAGTGTTATTGAATATAGAAAGAATTCTCCAGCTTCTCAAGCTTATA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 CTTTAAAAAAGATGAGTGTTATTGAATATAGAAAGAATTCTCCAGCTTCTCAAGCTTATA 1020 Query 1021 TGAAGTTAGCTTCAATAATAGCAGGAGTTCCTATTTACATTGAAGATGAAATTAAAATAA 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 TGAAGTTAGCTTCAATAATAGCAGGAGTTCCTATTTACATTGAAGATGAAATTAAAATAA 1080 Query 1081 TAAGGAAAGAAAGCTTTATAGATAAAATTAAGAGATTATTTAGGATGTATTAATTATCTT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 TAAGGAAAGAAAGCTTTATAGATAAAATTAAGAGATTATTTAGGATGTATTAATTATCTT 1140 Query 1141 GATTTAAAAATTTTAATTATCATCCTTTTCCAAATAAACCGTATATGTTGGGAACGCCCT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 GATTTAAAAATTTTAATTATCATCCTTTTCCAAATAAACCGTATATGTTGGGAACGCCCT 1200 Query 1201 CTCAATGAACCTTTCAGTAAAAGCTTCACCAAAAATGGATGCATCATCTCGCTTTGCTCG 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 CTCAATGAACCTTTCAGTAAAAGCTTCACCAAAAATGGATGCATCATCTCGCTTTGCTCG 1260 Query 1261 ATGATGCCTCTTAGTTATCTTTCTCCAAATAAACAGTATATGTTGGGAATGCCATCTCTA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 ATGATGCCTCTTAGTTATCTTTCTCCAAATAAACAGTATATGTTGGGAATGCCATCTCTA 1320 Query 1321 TCCCTTCTTTTTCAAATTCCTCTTTTATCTTCAAATTTATTTCATCAACGGCATTTAAAT 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 TCCCTTCTTTTTCAAATTCCTCTTTTATCTTCAAATTTATTTCATCAACGGCATTTAAAT 1380 Query 1381 AGTAATCAAATCCCATGTTTCTAACAAAGTATTCTACCCTCAAATTTAAACTCCAATCTC 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1381 AGTAATCAAATCCCATGTTTCTAACAAAGTATTCTACCCTCAAATTTAAACTCCAATCTC 1440 Query 1441 CATATTCCCTAAAATGCACTCTATATGGAGGGAGAGTAGCTGGATGATTTTCAACAATCT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1441 CATATTCCCTAAAATGCACTCTATATGGAGGGAGAGTAGCTGGATGATTTTCAACAATCT 1500 Query 1501 CTTTTATTATCTCCTTAGCCCTCTTAATTTTCTCTACCGGTGTGTTATAAGTTAAACCGA 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 CTTTTATTATCTCCTTAGCCCTCTTAATTTTCTCTACCGGTGTGTTATAAGTTAAACCGA 1560 Query 1561 TAGTCATTAAAACCCTTCTTCTATCTCTAACTGTTAAGTTTTCAATGGCTGAATCCAACA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 TAGTCATTAAAACCCTTCTTCTATCTCTAACTGTTAAGTTTTCAATGGCTGAATCCAACA 1620 Query 1621 ATTCTGAGTTTGGGATAGTTATTAAAGTGTAATCAAAAGTTCTAATTCGTGTGCTTCTTA 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1621 ATTCTGAGTTTGGGATAGTTATTAAAGTGTAATCAAAAGTTCTAATTCGTGTGCTTCTTA 1680 Query 1681 TTCCAATCTCCTCTACAATCCCTTCAGCCCCTTTAACTTTAACCCAATGGCCTAAACTAA 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1681 TTCCAATCTCCTCTACAATCCCTTCAGCCCCTTTAACTTTAACCCAATGGCCTAAACTAA 1740 Query 1741 AGGGTTTGTCAATCAATATTAAAATCCCAGCAATGAAGTTTTTTATGGTGTCTTGCATAG 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1741 AGGGTTTGTCAATCAATATTAAAATCCCAGCAATGAAGTTTTTTATGGTGTCTTGCATAG 1800 Query 1801 CCAAAGCTAAAGCTAAACCCCCTACTCCTAAACCAGCCAATAAAGCAGTGATATCATAAC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1801 CCAAAGCTAAAGCTAAACCCCCTACTCCTAAACCAGCCAATAAAGCAGTGATATCATAAC 1860 Query 1861 CAACAGAGCTTAAAGCCGTTAATATACCAAGAAGTATTGTTAATATCTTTACAACTTTTT 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1861 CAACAGAGCTTAAAGCCGTTAATATACCAAGAAGTATTGTTAATATCTTTACAACTTTTT 1920 Query 1921 TCAATGGCTTTATTATGTGTTCGTCCAACTCTGTTTCTGTCTTTTCGGTTAATGGAATTA 1980 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1921 TCAATGGCTTTATTATGTGTTCGTCCAACTCTGTTTCTGTCTTTTCGGTCAATGGAATTA 1980 Query 1981 GGTAGTGTTCAAATATCCCA 2000 |||||||||||||||||||| Sbjct 1981 GGTAGTGTTCAAATATCCCA 2000 Query= ERCC-00108_genbank |110339338|gb|DQ668365.1| Synthetic construct clone TagO microarray control Length=998 Subject= ERCC-00108 Length=1022 Score = 1844 bits (998), Expect = 0.0 Identities = 998/998 (100%), Gaps = 0/998 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CTCTGTGTCATGATCGTGAGTTGTCGCAGTGTCTGTACCAATACTCTGGTGGAGCTATAT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CTCTGTGTCATGATCGTGAGTTGTCGCAGTGTCTGTACCAATACTCTGGTGGAGCTATAT 60 Query 61 AAGCCGCTGTTGCGTAAATCAACGGCATGATCCCTATGACCGCGTCATGCTAACTGATAC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AAGCCGCTGTTGCGTAAATCAACGGCATGATCCCTATGACCGCGTCATGCTAACTGATAC 120 Query 121 ACGCTGCTCGAACAGTGATACGCACACTGATAACTATGCGCAGACGCTTGAAACGATGTG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ACGCTGCTCGAACAGTGATACGCACACTGATAACTATGCGCAGACGCTTGAAACGATGTG 180 Query 181 ACATCGCTTCTAGAGTATGAGCCGCAATGCACGACTGATACTCGATATGAGCAGCAGTCG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ACATCGCTTCTAGAGTATGAGCCGCAATGCACGACTGATACTCGATATGAGCAGCAGTCG 240 Query 241 GCTATGATTTGCAATGCTTGCAGTATGTATCCTGATCGTGCGTGCGATGTCTGATAATAC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GCTATGATTTGCAATGCTTGCAGTATGTATCCTGATCGTGCGTGCGATGTCTGATAATAC 300 Query 301 GCTCGCATGATATGTATTGCGCTCAGATGCTGGAGATATGCCATGCGTGCTGTCAGTATG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GCTCGCATGATATGTATTGCGCTCAGATGCTGGAGATATGCCATGCGTGCTGTCAGTATG 360 Query 361 CCATGTATGCTGATATGTCGCGATCTATGTGGTGACTATGAGATCCATGTGATGACGTTG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CCATGTATGCTGATATGTCGCGATCTATGTGGTGACTATGAGATCCATGTGATGACGTTG 420 Query 421 CAGTCTCTGTGACCTTATCGACGCGCATGTGAGCCTATAGACAGCGATGTGAGCACTCTC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CAGTCTCTGTGACCTTATCGACGCGCATGTGAGCCTATAGACAGCGATGTGAGCACTCTC 480 Query 481 ATCTGCGGATCAGTCTATCCTCGCTGATGCTCAGTGATACACGCTGATGCACGTAGTGAG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 ATCTGCGGATCAGTCTATCCTCGCTGATGCTCAGTGATACACGCTGATGCACGTAGTGAG 540 Query 541 CATCCTGTGCTCGCATATACCGCTGCTGCACTGATATGAGCCAGTGCTGCTGCTCTCTAC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CATCCTGTGCTCGCATATACCGCTGCTGCACTGATATGAGCCAGTGCTGCTGCTCTCTAC 600 Query 601 GGAGTGTGCTCGGCTATAACAGCGAGTGCTACGCCTAAACTGGCTGTCTAGCACTGTAGC 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GGAGTGTGCTCGGCTATAACAGCGAGTGCTACGCCTAAACTGGCTGTCTAGCACTGTAGC 660 Query 661 TGGTGCATGTACTCGACTGCCGCTGCATCTACTATAAGACTCTGACATTAGCGTATAGGC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 TGGTGCATGTACTCGACTGCCGCTGCATCTACTATAAGACTCTGACATTAGCGTATAGGC 720 Query 721 TGATACATTAGCTCGGATGCTATCAGCTTGCGCCTATTATATGCCTGACGCGGGATCTAT 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 TGATACATTAGCTCGGATGCTATCAGCTTGCGCCTATTATATGCCTGACGCGGGATCTAT 780 Query 781 CAGAACGACTCGGTAGCTCATATACTGGATCACGGTGCCACAACATGCTACACGAGGTCT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 CAGAACGACTCGGTAGCTCATATACTGGATCACGGTGCCACAACATGCTACACGAGGTCT 840 Query 841 CAGACTCTATCCCGTGGACTCAACGTGCATCTGCTATGCTGAGCGCGTATCTGTGTACCT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 CAGACTCTATCCCGTGGACTCAACGTGCATCTGCTATGCTGAGCGCGTATCTGTGTACCT 900 Query 901 GTCCGATGCTCTGATCTACACTGCCGTGATCGTTATATGACGAGACTGTGCGCTCATAGC 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 GTCCGATGCTCTGATCTACACTGCCGTGATCGTTATATGACGAGACTGTGCGCTCATAGC 960 Query 961 CGACACTGTGCTCGATAAGACCACGCTGTGCGGATATA 998 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 CGACACTGTGCTCGATAAGACCACGCTGTGCGGATATA 998 Query= ERCC-00109_genbank |110586144|gb|DQ854998.1| Synthetic construct clone AG009.1100 external RNA control sequence Length=511 Subject= ERCC-00109 Length=536 Score = 939 bits (508), Expect = 0.0 Identities = 511/512 (99%), Gaps = 1/512 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TAGCGGAGTGTCAAATTTCGGAAGGGGGCCATAATGTTTCTTTACAATCGCACCAGTTAG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TAGCGGAGTGTCAAATTTCGGAAGGGGGCCATAATGTTTCTTTACAATCGCACCAGTTAG 60 Query 61 CGTGGCGTATACCATGTTGTTAACAGCGCCATAAGTGCCTGATCCGCGGGCAAAACTACG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CGTGGCGTATACCATGTTGTTAACAGCGCCATAAGTGCCTGATCCGCGGGCAAAACTACG 120 Query 121 CAACACTGTGACTGGGTGCTAGGTCGACGAACAACTGACGCAACTAGATCATGGGAGTGC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CAACACTGTGACTGGGTGCTAGGTCGACGAACAACTGACGCAACTAGATCATGGGAGTGC 180 Query 181 CCCAAGTAAAAATTGTGTGTCAGGGCAACAAGTGACGATAGCGCGCGTAAATGGTATCAT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CCCAAGTAAAAATTGTGTGTCAGGGCAACAAGTGACGATAGCGCGCGTAAATGGTATCAT 240 Query 241 GATTGTGACCTCGGTATCTCTTGTACAGTTTACGTCGACGCGAAGTCTGATCACGTTTAA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GATTGTGACCTCGGTATCTCTTGTACAGTTTACGTCGACGCGAAGTCTGATCACGTTTAA 300 Query 301 CTAGCTCAGGGGTATTAAATAACCGAAAGGTTCATGTGGATGTGTGAACTTGCAGACAGA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CTAGCTCAGGGGTATTAAATAACCGAAAGGTTCATGTGGATGTGTGAACTTGCAGACAGA 360 Query 361 ATGACCCATAGTCCTTTACCCAGGTAGCTGAGGGCGACGCACTTGACCATCCGAATCAAA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 ATGACCCATAGTCCTTTACCCAGGTAGCTGAGGGCGACGCACTTGACCATCCGAATCAAA 420 Query 421 CTGAGAGATCGAAATAGCCTCACCCTTGAACCTACAAAGCTCACTTTAGCCCGTTAAGTT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CTGAGAGATCGAAATAGCCTCACCCTTGAACCTACAAAGCTCACTTTAGCCCGTTAAGTT 480 Query 481 GTCGAAATCACTAGATCAGAAGTCTCC-ACTC 511 ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 481 GTCGAAATCACTAGATCAGAAGTCTCCCACTC 512 Query= ERCC-00111_genbank |114977037|gb|DQ883685.2| Synthetic construct clone NISTag44 external RNA control sequence Length=1000 Subject= ERCC-00111 Length=994 Score = 1836 bits (994), Expect = 0.0 Identities = 994/994 (100%), Gaps = 0/994 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GCCCTAAGTTCCGGTCCGCAATTTCGTTTCGTTGGGACGCTTGAAGCGCAAGTAGAAAAC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GCCCTAAGTTCCGGTCCGCAATTTCGTTTCGTTGGGACGCTTGAAGCGCAAGTAGAAAAC 60 Query 61 GAGATAGGGTGTCCCATCTAAACCGCCGTGCCAATAGCTTTAAAGGCCAGGAAACATTTA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GAGATAGGGTGTCCCATCTAAACCGCCGTGCCAATAGCTTTAAAGGCCAGGAAACATTTA 120 Query 121 ATATCCCTAACAAGCACGGTCCACCAACGGCATTACGACTTTACGAGTTCGCAGAACAAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ATATCCCTAACAAGCACGGTCCACCAACGGCATTACGACTTTACGAGTTCGCAGAACAAA 180 Query 181 GACTTTGCAACTGCAGGGGAGCCCTTCGATGCATCCGAATGAGGGCGAGCGTCGCAGATT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GACTTTGCAACTGCAGGGGAGCCCTTCGATGCATCCGAATGAGGGCGAGCGTCGCAGATT 240 Query 241 AACTTCGAGCAGTTAACCAGGCAAGGATATTTCCGGCATCAAGCGTTTCTCCCTACTAAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 AACTTCGAGCAGTTAACCAGGCAAGGATATTTCCGGCATCAAGCGTTTCTCCCTACTAAT 300 Query 301 ATCCTTCCTTATGTCCCGCATTAAACAGCACTCAGCATCTCAAACAATCACAAAACAACC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATCCTTCCTTATGTCCCGCATTAAACAGCACTCAGCATCTCAAACAATCACAAAACAACC 360 Query 361 CACCTCATCGTTGACCAGATGATAACGTGGGACATTATCTTTGGGCAATACCACCAAAAT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CACCTCATCGTTGACCAGATGATAACGTGGGACATTATCTTTGGGCAATACCACCAAAAT 420 Query 421 CGTTCTTTATGGGGTATCGCTCTTAAGCAGCGCACTTCTGCATAACTATGCCATACAGTT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CGTTCTTTATGGGGTATCGCTCTTAAGCAGCGCACTTCTGCATAACTATGCCATACAGTT 480 Query 481 AGGTGCTACCATGAACATCCCGAGCTGCGTTGCATGTATCGGGTATGCCCAAGACCATAC 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 AGGTGCTACCATGAACATCCCGAGCTGCGTTGCATGTATCGGGTATGCCCAAGACCATAC 540 Query 541 CTCCAATGCTGCAGGGGTTAAATTCTCCGTTCTCGTCTAATCTAAGAGAATTGTATAGCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CTCCAATGCTGCAGGGGTTAAATTCTCCGTTCTCGTCTAATCTAAGAGAATTGTATAGCT 600 Query 601 TGCAGGCTAACATCCTGGGTCCAACCCCACATTGTAACTTCGCTGATTCCCACCACTAAT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TGCAGGCTAACATCCTGGGTCCAACCCCACATTGTAACTTCGCTGATTCCCACCACTAAT 660 Query 661 TTCTAGGGTTAGTGAAGGTTCGATACATCGCGCATTGGGGGTCTCGGTCAAGAGGAGCGC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 TTCTAGGGTTAGTGAAGGTTCGATACATCGCGCATTGGGGGTCTCGGTCAAGAGGAGCGC 720 Query 721 GTAAGTAAAGACGCCTATCTTCCAGTTTGATCGGGAAACTACCCGAGGGGGATGGTGCTC 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GTAAGTAAAGACGCCTATCTTCCAGTTTGATCGGGAAACTACCCGAGGGGGATGGTGCTC 780 Query 781 AATTGGGCCTCGTCTGAACACAAGAGAGATCGCACGCGGAAACCGTTAACGCAAGAATAT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 AATTGGGCCTCGTCTGAACACAAGAGAGATCGCACGCGGAAACCGTTAACGCAAGAATAT 840 Query 841 ACAGCATATGGCATGTAAGCGAAATAACATCCTCCCACTGGGTGCACAGCGAATTAGTAT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 ACAGCATATGGCATGTAAGCGAAATAACATCCTCCCACTGGGTGCACAGCGAATTAGTAT 900 Query 901 CATAGTAGAATTAAGCGAGATCCATGACGTCACCGCTACTCAATCATCATCCACGTCTCG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CATAGTAGAATTAAGCGAGATCCATGACGTCACCGCTACTCAATCATCATCCACGTCTCG 960 Query 961 CGTCATACCCaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 994 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 CGTCATACCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 994 Query= ERCC-00112_genbank |92111300|gb|DQ459422.1| Synthetic construct microarray control MC14 mRNA, complete sequence Length=1137 Subject= ERCC-00112 Length=1136 Score = 2002 bits (1084), Expect = 0.0 Identities = 1123/1139 (98%), Gaps = 14/1139 (1%) Strand=Plus/Plus Query 4 AGATGCCTGGATAGGTTCAAGTTACGTTTACACCGTTCCCACCCCACTAACCACGACCTT 63 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 AGATGCCTGGATAGGTTCAAGTTACGTTTACACCGTTCCCACCCCACTAACCACGACCTT 60 Query 64 TCTCGCCTTTGTTTTACCAACGCCGGCTAACAGCGTCGGGCCCAGCTAATATTGTTAAGG 123 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TCTCGCCTTTGTTTTACCAACGCCGGCTAACAG-GTCGGGCCCAGCTAATATTGTTAAGG 119 Query 124 CAGGCGTTCTGTACTTACTCGATCGTTCATAGCCCC-CGACATAGTTTTTAGTCATTACG 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 CAGGCGTTCTGTACTTACTCGATCGTTCATAGCCCCACGACATAGTTTTTAGTCATTACG 179 Query 183 TAGCCGTTATAGAAACTCACCTGTTGTAGGAGGTTACAACCAGATCGTCTTAGCTTATGG 242 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 180 TAGCCGTTATAGAAACTCACCTGTTGTAGAAGGTTACAACCAGATCGTCTTA-CTTATGG 238 Query 243 CATGCTGGCGTAGACAGGT-CCAATTTGCGGCCAGTACTCGGATGTTCGTGGACTGATCT 301 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 239 CATGCTGGCGTAGACAGGTGCCAATTTGCGGCCAGTACTCGGATGTTCGTGGACTGATCT 298 Query 302 GGTCCTCTGTTCCCCTGGTGAAAACGTCGCTTCACTCCGGTAAGGGCGAATGTAATGACC 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 299 GGTCCTCTGTTCCCCTGGTGAAAACGTCGCTTCACTCCGGTAAGGGCGAATGTAATGACC 358 Query 362 GTATTCTAAGGTACAGATCTACACTATGTGCGGGCGAATAGA-TCGGGCCCGTAGCGGGG 420 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 359 GTATTCTAAGGTACGGATCTACACTATGTGCGGGCGAATAGACTCGGGCCCGTAGCGGGG 418 Query 421 AGCAAATACTTGATCGCAATCTCTGACGTCAACTGATGTCGC-GAGA---CTG-GCACCC 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| Sbjct 419 AGCAAATACTTGATCGCAATCTCTGACGTCAACTGATGTCGCGGAGACTGCTGCGCACCC 478 Query 476 AATAGGTACCACTAACGTCCGTGTGATTTT-ACCGGTAGGAATAAACACCGTCTTATACA 534 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 479 AATAGGTACCACTAACGTCCGTGTGATTTTAACCGGTAGGAATAAACACCGTCTTATACA 538 Query 535 GCTACGTTTTTCGATTTACTACCGAGCCGTTTGCGAGAACATATGGATTGGGAAATAGGC 594 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 539 GCTACGTTTTTCGATTTACTACCGAGCCGTTTGCGAGAACATATGGATTGGGAAATAGGC 598 Query 595 TCGAGTCCACATACAGCCTACGGTAAGTTGCT-GGCTCGCAATTCTATCCGGGTTTGTGA 653 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 599 TCGAGTCCACATACAGCCTACGGTAAGTTGCTAGGCTCGCAATTCTATCCGGGTTTGTGA 658 Query 654 GTCTTAGTTGTGCTCCGGCTTTTGAATGAGCATACTCATGAAAGCGCTGCTTACTATGAT 713 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 659 GTCTTAGTTGTGCTCCGGCTTTTGAATGAGCATACTCATGAAAGCGCTGC-TACTATGAT 717 Query 714 AAGAGTACACGTACAGGTCTCGCCCGATTGGATTATGGCGAGCTGCCGCATTGACGGACA 773 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 718 AAGAGTACACGTACAGGTCTCGCCCGATTGGATTATGGCGAGCTGCCGCATTGACGGACA 777 Query 774 TACCTTTGAACGTAATCGCGCACGAGTGCGGATTAAGATTCTCCGCTTCAATCATGCAAT 833 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 778 TACCTTTGAACGTAATCGCGCACGAGTGCGGATTAAGATTCTCCGCTTCAATCATGCAAT 837 Query 834 GTGGTACAGCTGACTATCATTGACACCAAGCCGCTTGCAGGTATCGCCTGTCGGATAAGT 893 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 838 GTGGTACAGCTGACTATCATTGACACCAAGCCGCTTGCAGGTATCGCCTGTCGGATAAGT 897 Query 894 TAAGAGTGAGACGAAGAGTATTCATCGAGCGCCAGGTAAGATAGTGCCACTCTAAGCATC 953 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 TAAGAGTGAGACGAAGAGTATTCATCGAGCGCCAGGTAAGATAGTGCCACTCTAAGCATC 957 Query 954 GGTATCTAGCTTTAGTAACCTTCTCGATGGGGAATACACCTCTGCTTAACGGTCTTAATA 1013 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 958 GGTATCTAGCTTTAGTAACCTTCTCGATGGGGAATACACCTCTGCTTAACGGTCTTAATA 1017 Query 1014 ATTGACGCG-CTTGGACGTAGTACTCTGCAGTGCCTAAACTCATAGTAAACGATCTGGTA 1072 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1018 ATTGACGCGTCTTGGACGTAGTACTCTGCAGTGCCTAAACTCATAGTAAACGATCTGGTA 1077 Query 1073 GGTCCTTTTACACACGGTTTTTATCGCTTAGTGCTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1131 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1078 GGTCCTTTTACACACGGTTTTTATCGCTTAGTGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1136 Query= ERCC-00113_genbank |114976925|gb|DQ883663.2| Synthetic construct clone NISTag22 external RNA control sequence Length=850 Subject= ERCC-00113 Length=840 Score = 1537 bits (832), Expect = 0.0 Identities = 840/843 (99%), Gaps = 3/843 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ACACCGGCGCACGCCACAGGCGTCATACTTCCCAAGAAGCGGCCATAGCCCAGATGCGAG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ACACCGGCGCACGCCACAGGCGTCATACTTCCCAAGAAGCGGCCATAGCCCAGATGCGAG 60 Query 61 GTGGAAAAGTCACACTAGAGCGACACCAACATCGTTACGCTTACACACCGGACGCTTGGA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GTGGAAAAGTCACACTAGAGCGACACCAACATCGTTACGCTTACACACCGGACGCTTGGA 120 Query 121 TCAGTGGGAAGTGCTCACGCGCGGAGCCCACTGGGCGAACAGCAACGTTATAACGGCCAC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TCAGTGGGAAGTGCTCACGCGCGGAGCCCACTGGGCGAACAGCAACGTTATAACGGCCAC 180 Query 181 TCAGTGGTTCGTCACGCGCAGCCCCGGGTTCGTCCCCTATAAGGGCCTAGTACCTTTCGA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TCAGTGGTTCGTCACGCGCAGCCCCGGGTTCGTCCCCTATAAGGGCCTAGTACCTTTCGA 240 Query 241 GCCCCGCGCGTACTAGGCAGATAAGAACCCTCCAGCTCGGGGCCTCAAACCGATATTCCA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GCCCCGCGCGTACTAGGCAGATAAGAACCCTCCAGCTCGGGGCCTCAAACCGATATTCCA 300 Query 301 TGTGGGCCAACTGCCATGTTGTGTCCAGTCGCTATCGGAGTAGCCGCGCTGGTGCCACAC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TGTGGGCCAACTGCCATGTTGTGTCCAGTCGCTATCGGAGTAGCCGCGCTGGTGCCACAC 360 Query 361 GACTACAACCCTCGTAATAGGGCTGCGTGCGTCCTAAATACACTCGCTGTTGAGATACTA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GACTACAACCCTCGTAATAGGGCTGCGTGCGTCCTAAATACACTCGCTGTTGAGATACTA 420 Query 421 AAATTATCTGTGGATTGCCGGCATTGAGCCCACGGTAAACCCCAAATACATAAGTGTATA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 AAATTATCTGTGGATTGCCGGCATTGAGCCCACGGTAAACCCCAAATACATAAGTGTATA 480 Query 481 ATGTCTCGGACCCGTCGCAACGGTTGTTAATATGACAGGCCGCTAAAGACGTTCTACTCC 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 ATGTCTCGGACCCGTCGCAACGGTTGTTAATATGACAGGCCGCTAAAGACGTTCTACTCC 540 Query 541 GCCATATGAGATAATATCCTTATCTTGAGACGCATAGCAAATGTAGGAGAGAGAGGTTAA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GCCATATGAGATAATATCCTTATCTTGAGACGCATAGCAAATGTAGGAGAGAGAGGTTAA 600 Query 601 TAAGGCCTAGCCTAAAGGTTCTTGCAGAGCAACATCATATACCCTGTAGAACCCGACTTT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TAAGGCCTAGCCTAAAGGTTCTTGCAGAGCAACATCATATACCCTGTAGAACCCGACTTT 660 Query 661 TGGGTTTAGGGGCCTGCCGTCAGCTACAATTCATGCTTGAAGGTTTCACTAGATCGTGTT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 TGGGTTTAGGGGCCTGCCGTCAGCTACAATTCATGCTTGAAGGTTTCACTAGATCGTGTT 720 Query 721 ATGGACGATGACTATAGTGTAACAGGTGCAGAGCTTAACTTTGGACACATGACACTCAGT 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 ATGGACGATGACTATAGTGTAACAGGTGCAGAGCTTAACTTTGGACACATGACACTCAGT 780 Query 781 TCTGTACCAACTAGGAAGAGCGCCGGGGTAGAAGAATGGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 840 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 781 TCTGTACCAACTAGGAAGAGCGCCGGGGTAGAAGAAT---AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 837 Query 841 aaa 843 ||| Sbjct 838 AAA 840 Query= ERCC-00116_genbank |110339340|gb|DQ668367.1| Synthetic construct clone TagIN microarray control Length=1969 Subject= ERCC-00116 Length=1991 Score = 3637 bits (1969), Expect = 0.0 Identities = 1969/1969 (100%), Gaps = 0/1969 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 AAGCGTTCACAGCTCGGCAATACCTGTGACGAGCTGCTCGCAAGATTTACGCAGTGTGGC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1991 AAGCGTTCACAGCTCGGCAATACCTGTGACGAGCTGCTCGCAAGATTTACGCAGTGTGGC 1932 Query 61 TATACTTGACAGTGATGGCGCTTACTTCAGATGTATGGGTGATACTTCGCTATATGGGTG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1931 TATACTTGACAGTGATGGCGCTTACTTCAGATGTATGGGTGATACTTCGCTATATGGGTG 1872 Query 121 GTCACTTCTCTATGGCGCGTGACAATGTACTATGGAGCGGTCAATGTCAGTACGGATCGC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1871 GTCACTTCTCTATGGCGCGTGACAATGTACTATGGAGCGGTCAATGTCAGTACGGATCGC 1812 Query 181 GTCGATCTAGGTGACTACGCACGCCTCTGGAGTAAATCGAGTGCTCCGTGCGAAATACGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1811 GTCGATCTAGGTGACTACGCACGCCTCTGGAGTAAATCGAGTGCTCCGTGCGAAATACGC 1752 Query 241 GGTCATCGTGCGAATAACCGAGTCATCGTGAGTAGTATGAACGTGTCGTGTTATGCAGCG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1751 GGTCATCGTGCGAATAACCGAGTCATCGTGAGTAGTATGAACGTGTCGTGTTATGCAGCG 1692 Query 301 GTATGTCGTGCTATAATGGCGTCTGTCGTGCTCATAAGGTTCCTCTGATGTGCTAGACGT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1691 GTATGTCGTGCTATAATGGCGTCTGTCGTGCTCATAAGGTTCCTCTGATGTGCTAGACGT 1632 Query 361 GTCCATCGAGCTGCATAGCTATACTTCGAGTCACTTGGGATACTTCGATAGCGTTGTGAA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1631 GTCCATCGAGCTGCATAGCTATACTTCGAGTCACTTGGGATACTTCGATAGCGTTGTGAA 1572 Query 421 TAGTGTCGTAGGCTCTCGGGCACGTTGTTAAACTGTTGCCGCCAATTCAAGATTAGTCCA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1571 TAGTGTCGTAGGCTCTCGGGCACGTTGTTAAACTGTTGCCGCCAATTCAAGATTAGTCCA 1512 Query 481 GCTCGTACTATCGAATACACCATCGTCGTATCGAATAATCGCACCTCGTAGGAGTCAGTT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1511 GCTCGTACTATCGAATACACCATCGTCGTATCGAATAATCGCACCTCGTAGGAGTCAGTT 1452 Query 541 GCCACTCGTTGATAGTCAACCAAGCTCGTTAGATAGTAGCCCAGATCCTACGAGATGAGC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1451 GCCACTCGTTGATAGTCAACCAAGCTCGTTAGATAGTAGCCCAGATCCTACGAGATGAGC 1392 Query 601 TACGTAACTACAGTGATAGCATATAGGGTACGCTAGAATGCCAGGTCGTAGTCGAATTAG 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1391 TACGTAACTACAGTGATAGCATATAGGGTACGCTAGAATGCCAGGTCGTAGTCGAATTAG 1332 Query 661 TCAGGTTGGATGTCTACTAGTTGACTTGGAGTATGCCATGAAGACTCGTCCCTCGATATC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1331 TCAGGTTGGATGTCTACTAGTTGACTTGGAGTATGCCATGAAGACTCGTCCCTCGATATC 1272 Query 721 AATACTCGTCCGCAGGTGAACACTGTAGTCGGTGCTAGTGCCCACTTCTCGGTATGTGTC 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1271 AATACTCGTCCGCAGGTGAACACTGTAGTCGGTGCTAGTGCCCACTTCTCGGTATGTGTC 1212 Query 781 CTCAATTATCGAGTAGGATTCTAATCAATCGTCGCGGCTCACTAATTGTCTGCGGTGGCT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1211 CTCAATTATCGAGTAGGATTCTAATCAATCGTCGCGGCTCACTAATTGTCTGCGGTGGCT 1152 Query 841 ACTAATGGTTACGGTGCCTGACTAATCGTGTAGGTGTCTAATACATCGTGATACGGGCGA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1151 ACTAATGGTTACGGTGCCTGACTAATCGTGTAGGTGTCTAATACATCGTGATACGGGCGA 1092 Query 901 TATAATGCTCGATACGGCAAATATAGCTCCGTCCGGTGGATCCAGATCGCAGGGTATCGC 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1091 TATAATGCTCGATACGGCAAATATAGCTCCGTCCGGTGGATCCAGATCGCAGGGTATCGC 1032 Query 961 ATCGACAGACCTGGTATCGTCGTGACGAACGTGCTACTCGCTTATCGGGCCTGCTACATC 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1031 ATCGACAGACCTGGTATCGTCGTGACGAACGTGCTACTCGCTTATCGGGCCTGCTACATC 972 Query 1021 AGTGGCGATGTTCGTAACCCTTAGCCGATCTTCTTACTTACGAGGCTACTATTCGATCAA 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 971 AGTGGCGATGTTCGTAACCCTTAGCCGATCTTCTTACTTACGAGGCTACTATTCGATCAA 912 Query 1081 ACTCGCCTATCTGGTAATAACTGCGGTGATCTGGTAGCCACTACGTGCGCCTGGTAGCAA 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 911 ACTCGCCTATCTGGTAATAACTGCGGTGATCTGGTAGCCACTACGTGCGCCTGGTAGCAA 852 Query 1141 ATACGGCGAGCTGGTATCACTATCGGCTCAGTGGTCCGACATAGTGCCCAGTGGTTCGCA 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 851 ATACGGCGAGCTGGTATCACTATCGGCTCAGTGGTCCGACATAGTGCCCAGTGGTTCGCA 792 Query 1201 TAACTGCCGCTGGGTCCAATATAACACGCAGTCGTCAATCATACGAGCCGATGGTCAGCA 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 791 TAACTGCCGCTGGGTCCAATATAACACGCAGTCGTCAATCATACGAGCCGATGGTCAGCA 732 Query 1261 ATAGCGCCTGTGGTGACACTATGCCACCTCTGGTCTAATATAGCGCCCTGTGGTCGTATA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 731 ATAGCGCCTGTGGTGACACTATGCCACCTCTGGTCTAATATAGCGCCCTGTGGTCGTATA 672 Query 1321 ATCGAGCGCGTAATCGTATATCCGACTGTAGGTGCGTAACTCGCGACTAGGTGGCTCTAA 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 671 ATCGAGCGCGTAATCGTATATCCGACTGTAGGTGCGTAACTCGCGACTAGGTGGCTCTAA 612 Query 1381 TCTGCGTTGGTTGTCGCTCACAGTGTCTGGTGTTCGATACCCGGATCGGGTTCCGTAATC 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 611 TCTGCGTTGGTTGTCGCTCACAGTGTCTGGTGTTCGATACCCGGATCGGGTTCCGTAATC 552 Query 1441 TTGGCATCGAGGTTTCGTACATGTCACGCGGTCTCGTTCATTCTCGGTGGTGCTCAGTAC 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 551 TTGGCATCGAGGTTTCGTACATGTCACGCGGTCTCGTTCATTCTCGGTGGTGCTCAGTAC 492 Query 1501 ATCCAGTGGTGAGTCGCTACATCACACGGTGATCCGGCTAAACCTCTGGGCATCCGTATT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 491 ATCCAGTGGTGAGTCGCTACATCACACGGTGATCCGGCTAAACCTCTGGGCATCCGTATT 432 Query 1561 AAGCGACATTCCTACGACTTATCAGCACGTCCTACGGTATAACAAGGCGTGCTACGGTCT 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 431 AAGCGACATTCCTACGACTTATCAGCACGTCCTACGGTATAACAAGGCGTGCTACGGTCT 372 Query 1621 AACGACGCTGGTAGCAGTCTATCAGATCGCTAGTACGAGTTAGAGATGCTTAGTACGCCT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 371 AACGACGCTGGTAGCAGTCTATCAGATCGCTAGTACGAGTTAGAGATGCTTAGTACGCCT 312 Query 1681 TCGAATCTATGATGCTCGTGCTCACGCGATGCACTCGGATTATGGCACATGCACTCGCGT 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 311 TCGAATCTATGATGCTCGTGCTCACGCGATGCACTCGGATTATGGCACATGCACTCGCGT 252 Query 1741 AATGACGCTGCATCGCTCAGTATGATCCATGAGCGCCGTGAATGACGCATGAGCCTCGTA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 251 AATGACGCTGCATCGCTCAGTATGATCCATGAGCGCCGTGAATGACGCATGAGCCTCGTA 192 Query 1801 TCGAGTGCATGAGCTGTCTTTCACATGATACATCGCTCTAAATCATCATGCGACAGTCTC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 191 TCGAGTGCATGAGCTGTCTTTCACATGATACATCGCTCTAAATCATCATGCGACAGTCTC 132 Query 1861 GACAGCAGCTCAGCATCTATGCATCATGTGCCTCACTAGGACATCATGCTCGACTCTGAG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 131 GACAGCAGCTCAGCATCTATGCATCATGTGCCTCACTAGGACATCATGCTCGACTCTGAG 72 Query 1921 ACACTGATCGAGCATTAAGACTCTAGAGCGGCCGCCGACTAGTGAGCTC 1969 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 71 ACACTGATCGAGCATTAAGACTCTAGAGCGGCCGCCGACTAGTGAGCTC 23 Query= ERCC-00117_genbank |92111290|gb|DQ459412.1| Synthetic construct microarray control MC01 mRNA, complete sequence Length=1143 Subject= ERCC-00117 Length=1136 Score = 2036 bits (1102), Expect = 0.0 Identities = 1129/1140 (99%), Gaps = 10/1140 (0%) Strand=Plus/Plus Query 4 AGATACTATCAGGCGCCTATGGGCAAATCTGGCCTCCAAACTCCGAGTGTCACCGAACCG 63 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 AGATACTATCAGGCGCCTATGGGCAAATCTGGCCTCCAAACTCCGAGTGTCACCGAACCG 60 Query 64 TAGGAAATTCCTT-CCCAAGCGTGTGCAATACTCGTAGCACACCGGGATAAATAGGAAGG 122 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TAGGAAATTCCTTCCCCAAGCGTGTGCAATACTCGTAGCACACCGGGATAAATAGGAAGG 120 Query 123 AAACATCCGCGGGTCTTACGGTGAAGCTGTGGGACCGCTTCTGTACACGGCGTCCAATCA 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AAACATCCGCGGGTCTTACGGTGAAGCTGTGGGACCGCTTCTGTACACGGCGTCCAATCA 180 Query 183 AGGGGCTTGGCATTTGGCCCCAGATC-AAAGTGTTGAACCACAAACGACTCTATCGGTGA 241 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 AGGGGCTTGGCATTTGG-CCCAGATCGAAAGTGTTGAACCACAAACGACTCTATCGGTGA 239 Query 242 CGCCTCCAAGCGCGAAACTCCAGGCATTGGGGAACCGCAGAAAGATGTTCCGCTAGACCG 301 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 240 CGCCTCCAAGCGCGAAACTCCAGGCAATGGGGAACCGCAGAAAGATGTTCCGCTAGACCG 299 Query 302 CATTAATACCACATCTGGGCTTAGAAGCCCCTCGGTGCTCCAGGGAGGACGGATCGGAAT 361 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 300 CATTAATACCACATCTGGGCTTAGAAGCCCCTCGGTGCTCCAGGGAGGACGGATCGGAAT 359 Query 362 TAAACGTGATATGGAACTTTAACTGAT-AGGCCTTGCCCTTACTAATGGCGCGTTGTAAC 420 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 TAAACGTGATATGGAACTTTAACTGATCAGGCCTTGCCCTTACTAATGGCGCGTTGTAAC 419 Query 421 GGGCCTTGAGGGCAATGTCACTATTGAGGCACCCGTTCGACCCTCAGAGATATACCATTC 480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 GGGCCTTGAGGG-AATGTCACTATTGAGGCACCCGTTCGACCCTCAGAGATATACCATTC 478 Query 481 CGCCTATTGTAGCTCTCCTCGTACCACAGTCTTGCAAATACTGTCATAGCTATGGAACCG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 479 CGCCTATTGTAGCTCTCCTCGTACCACAGTCTTGCAAATACTGTCATAGCTATGGAACCG 538 Query 541 CCCCGACGCCGGGATTATGGCCTCTCATGGACTCAGTGTGATCAGAACCTGCTCG-GTGG 599 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 539 CCCCGACGCCGGGATTATGGCCTCTCATGGACTCAGTGTGATCAGAACCTGCTCGAGTGG 598 Query 600 GGACTGGATGCAGAGCTGATCTCTGTAGTGTGTTGTGTCGCGGGAGCACCACCGG-TGAC 658 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 599 GGACTGGATGCAGAGCTGATCTCTGTAGTGTGTTGTGTCGCGGGAGCACCACCGGATGAC 658 Query 659 AACCGCCATATTCCAGTGCCCAAATACTCACTGGTAACGGCTTGAACTCATGCTAATTCC 718 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 659 AACCGCCATATTCCAGTGCCCAAATACTCACTGGTAACGGCTTGAACTCATGCTAATTCC 718 Query 719 ATTATAGTTCTTTAAACATAAGCTTTGCCCTCGGGGCCCATCCCCTGAACCATGCGGTGA 778 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 719 ATTATAGTTCTTTAAACATAAGCTTTGCCCTCGGGGCCCATCCCCTGAACCATGCGGTGA 778 Query 779 GTCACGTACGCAGACCTGAAAATTAAAGATCCGGACAGGCCCGACCTTAGCCAAGGGTAA 838 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 779 GTCACGTACGCAGACCTGAAAATTAAAGATCCGGACAGGCCCGACCTTAGCCAAGGGTAA 838 Query 839 GAACCGCTGTCACTTAGTGAACATCCTATCCAGTGCCGTGCAGCATCGTCTACGGTCCGG 898 |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 839 GAACCGCT-TCACTTAGTGAACATCCTATCCAGT-CCGTGCAGCATCGTCTACGGTCCGG 896 Query 899 GCTTCTGCCGAAAGGTCCATTAAACAGACAGAAGGATAAATGGCTCCAGCGGATACGCGC 958 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 897 GCTTCTGCCGAAAGGTCCATTAAACAGACAGAAGGATAAATGGCTCCAGCGGATACGCGC 956 Query 959 ATATTCGGTTATCGCAGTTACCGTGCAAAACTGCATCCCCGCTGGGATAAGCACATGAGA 1018 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 957 ATATTCGGTTATCGCAGTTACCGTGCAAAACTGCATCCCCGCTGGGATAAGCACATGAGA 1016 Query 1019 TGGACAAGGCTTCCTATGA-TGATTCCAAAGAACATTGCCCGACGACCGAGCCTTCAGGT 1077 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1017 TGGACAAGGCTTCCTATGAGTGATTCCAAAGAACATTGCCCGACGACCGAGCCTTCAGGT 1076 Query 1078 AATCCACGAGACATATGCTAACCAGTGGTGCCATGGaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1077 AATCCACGAGACATATGCTAACCAGTGGTGCCATGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1136 Query= ERCC-00120_genbank |110586090|gb|DQ854992.1| Synthetic construct clone AG003.0011 external RNA control sequence Length=512 Subject= ERCC-00120 Length=536 Score = 941 bits (509), Expect = 0.0 Identities = 511/512 (99%), Gaps = 0/512 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGCGTCTCACCTGGCTTGATTCAGTTAATGGAGCACTTGTGGGAGTGCCGCGACACAACA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GGCGTCTCACCTGGCTTGATTCAGTTAATGGAGCACTTGTGGGAGTGCCGCGACACAACA 60 Query 61 TCCGCTAGCCTCAGTCGAATGACAAGTTAGAACAAGAGTGGGGCCGATCTCTGCAAACTC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TCCGCTAGCCTCAGTCGAATGACAAGTTAGAACAGGAGTGGGGCCGATCTCTGCAAACTC 120 Query 121 CTATTGTCAGGGGTGGTGGACGGTATAGGGTTTTGCGCCTACCTGAATGCAAGGGCTTAC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CTATTGTCAGGGGTGGTGGACGGTATAGGGTTTTGCGCCTACCTGAATGCAAGGGCTTAC 180 Query 181 CTCCAACGGCTTAGATGTGCCTAGAAGGTACGCCCTTCAGTCAAGACCGGCCCGGCGTTA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CTCCAACGGCTTAGATGTGCCTAGAAGGTACGCCCTTCAGTCAAGACCGGCCCGGCGTTA 240 Query 241 GTTAAAGCAGGCTTGTCACACATCACGTAGTTCCTGCTGCGTTTTAAGTCATTAGCTCCC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GTTAAAGCAGGCTTGTCACACATCACGTAGTTCCTGCTGCGTTTTAAGTCATTAGCTCCC 300 Query 301 AGTAACCCATCAACCATTACCGTATAGACTTATCCGAGTGTGATCAAATAACGCTGAGCC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 AGTAACCCATCAACCATTACCGTATAGACTTATCCGAGTGTGATCAAATAACGCTGAGCC 360 Query 361 TTATGATCCTCGTCGACCCAACAACCGCCGGATATACGTTGGGATATAAACGAAACACGT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TTATGATCCTCGTCGACCCAACAACCGCCGGATATACGTTGGGATATAAACGAAACACGT 420 Query 421 ACCGCGCGAGTGACACGCGTTGACGTTACATGGTAAACTCGTAGCCAACCTTAACATTCC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 ACCGCGCGAGTGACACGCGTTGACGTTACATGGTAAACTCGTAGCCAACCTTAACATTCC 480 Query 481 CTGCACTATGTTAGTGCGTACAACATTAAGGG 512 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 CTGCACTATGTTAGTGCGTACAACATTAAGGG 512 Query= ERCC-00123_genbank |103488729|gb|DQ516782.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-65 genomic sequence Length=1000 Subject= ERCC-00123 Length=1022 Score = 1807 bits (978), Expect = 0.0 Identities = 993/1000 (99%), Gaps = 2/1000 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TTAAGAGAGGAATAATTActtttttcatcttacccaccaagttttagttttcttattctt 60 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TTAAGAGAGGAATAATTAC-TTTTTCATCTTACCCACCAAGTTTTAGTTTTCTTATTCTT 59 Query 61 tcatttaatttttcGACCTCCTCCTTTGTTAATCTTGTAGCTTTTTTAACCTCCTCCAAT 120 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 60 TCACTTAATTTTTCGACCTCCTCCTTTGTTAATCTTGTAGCTTTTTTAACCTCCTCCAAT 119 Query 121 TCTTTTTGTAACATTATTACTTTAATCCCCAGTATTATGTTGAGGAGTATGCTAATAGCC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 TCTTTTTGTAACATTATTACTTTAATCCCCAGTATTATGTTGAGGAGTATGCTAATAGCC 179 Query 181 ACAATTATATACAAAATCATCCTTATCTCCTCCCGAACAATCCTTTAATAAACTTAGATA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 ACAATTATATACAAAATCATCCTTATCTCCTCCCGAACAATCCTTTAATAAACTTAGATA 239 Query 241 TGAATGATTCTTTCTTCTTCTTAAGTTGTGCTTCATATTTAGCTCCAATTAACTTAGCTG 300 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 240 TGAATGATTCTTTCTTCTTCTCAAGTTGTGCTTCATATTTAGCTCCAATTAACTTAGCTG 299 Query 301 CTATCTCCATGATTGCTTGAGCGGCTGGAGAATCTGGATACATAATAACGAGAGGTGTTC 360 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 300 CTATCTCCATGACTGCTTGAGCGGCTGGAGAATCTGGATACATAATAACGAGAGGTGTTC 359 Query 361 CAAATGCAGCTGCCTTCCTAACATGAGGGTCCTCTGGAACAACACCTATAACAGGAACTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 CAAATGCAGCTGCCTTCCTAACATGAGGGTCCTCTGGAACAACACCTATAACAGGAACTT 419 Query 421 CTAAAATTGTCTCTATAGCTTTAACCCCCAACTCTGTACTCTCATTTGAAACCCTATTAA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 CTAAAATTGTCTCTATAGCTTTAACCCCCAACTCTGTACTCTCATTTGAAACCCTATTAA 479 Query 481 CAATAGCCCCAATGATGTCAGTTCCCAATCTTTTTGTTATAGCGATAATTTTTAATGCAT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 CAATAGCCCCAATGATGTCAGTTCCCAATCTTTTTGTTATAGCGATAATTTTTAATGCAT 539 Query 541 CTGATATTGAGGATATCTCTGGATTTACAACGACAATTAAACCATCTGCTGATGATATTG 600 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 CTGATATTGGGGATATCTCTGGATTTACAACGACAATTAAACCATCTGCTGATGATATTG 599 Query 601 CTATTAAAGTCTCTTTTCCAATACCTGCTGGACAGTCAATAATTAAAATCTCAACTAAAT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 CTATTAAAGTCTCTTTTCCAATACCTGCTGGACAGTCAATAATTAAAATCTCAACTAAAT 659 Query 661 CATGTATTGCCTTTAAAACTTCCTCAAGTTTTTCTGGTTTAGCTCTTCTGAACTTTTCTA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 CATGTATTGCCTTTAAAACTTCCTCAAGTTTTTCTGGTTTAGCTCTTCTGAACTTTTCTA 719 Query 721 ATGAAACACCTGCTGGAATAACTAAAACTCCTTCAGGACCTTCATAAATTGCGTCCTTTA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 ATGAAACACCTGCTGGAATAACTAAAACTCCTTCAGGACCTTCATAAATTGCGTCCTTTA 779 Query 781 TATCTGCTTTACCAGCCAACACATCGTTTAAGGTTACTGGCTTTCCTTCTAACCCCATGA 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 TATCTGCTTTACCAGCCAACACATCGTTTAAGGTTACTGGCTTTCCTTCTAACCCCATGA 839 Query 841 TAAGCTCTAAGTTTGCCATTGCTATATCAGCGTCCAAAACAGCCACtttttttCCAAATT 900 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 TAGGCTCTAAGTTTGCCATTGCTATATCAGCGTCCAAAACAGCCACTTTTTTTCCAAATT 899 Query 901 TTGCAAGAGCCACAGCAAGATTTGCAGATATCGTTGTCTTTCCAGTACCTCCTTTTCCAG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 TTGCAAGAGCCACAGCAAGATTTGCAGATATCGTTGTCTTTCCAGTACCTCCTTTTCCAG 959 Query 961 ATGCTATCGCGATAGCTATTGCCATTAATGTCACCATTCT 1000 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 960 ATGCTATCGCGATAGCTATT-CCATTAATGTCACCATTCT 998 Query= ERCC-00126_genbank |92111305|gb|DQ459427.1| Synthetic construct microarray control MC25 mRNA, complete sequence Length=1124 Subject= ERCC-00126 Length=1118 Score = 1962 bits (1062), Expect = 0.0 Identities = 1107/1125 (98%), Gaps = 17/1125 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGAGA-CGACCGCGCATTAGTCAATCATATAGTTCGATAAATGAGACGTCACGGATTTGA 59 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GGAGACCGACCGCGCATTAGTCAATCATATAGTTCGATAAATGAGACGTCACGGATTTGA 60 Query 60 GTATCATTTGCTAGAACTGCTTACCTATCTAAACGCTCAGGTATGCCTGCGCTGAGACTC 119 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GTATCATTTGCTAGAACTGCTTACCTATCTAAACGCTCAGGTATGCCTGCGCTGAGACTC 120 Query 120 AGCATCTCAATGTGACCGAGCTTGTGACTCCGCA---TCC--C--TATACCCATCGGCCC 172 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| Sbjct 121 AGCATCTCAATGTGACCGAGCTTGTGACTCCGCATCCTCCTGCAATATACCCATCGGCCC 180 Query 173 TCACGGGGTAACGTAGCTCTTCTGCGTACACCTGGCTAGAGGGTCCTTACCGGCTGTAAG 232 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TCACGGGGTAACGTAGCTCTTCTGCGTACACCTGGCTAGAGGGTCCTTACCGGCTGTAAG 240 Query 233 CTCACTACAATCCAGGTACAGAGTGCGTTAACCGGCCATTAGAGGGCCGCTACACCCGTC 292 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CTCACTACAATCCAGGTACAGAGTGCGTTAACCGGCCATTAGAGGGCCGCTACACCCGTC 300 Query 293 AGAATTTAAACGTATGGGCGGCGAAGCGCGATAATGGTTAGACGCTTCTTGCAGGGGTCA 352 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || Sbjct 301 AGAATTTAAACGTATGGGCGGCGAAGCGCGATAATGGTTAGAC-CTTCTTGCAGGGG-CA 358 Query 353 AATAACGATTTTGCGACTGCCCCTTTAAGATGGAGAATGGACAAACGCTCATTCCTAGTG 412 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 359 AATAACGATTTTGCGACTGCCCCTTTAAGATGGAGAATGGACAAACGCTCATTCCTAGTG 418 Query 413 AGGACATCGACATCGTTACGATGCAACGTCGAGTGGCGGCATAACACTTGGCTCGGTCCT 472 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 419 AGGACATCGACATCGTTACGATGCAACGTCGAGTGGCGGCATAACACTTGGCTCGGTCCT 478 Query 473 ACCCGCGACAGTGCAACAAAAACAGTTGCTCTACATTCGCTATGCATTTTAACGGATATG 532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 479 ACCCGCGACAGTGCAACAAAAACAGTTGCTCTACATTCGCTATGCATTTTAACGGATATG 538 Query 533 CCTTTGCCCCCCGTCCGTCATG-ACGAAAAGTTTGGCTATGCGCGGAACATTATGCCGGA 591 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 539 CCTTTGCCCCCCGTCCGTCATGGACGAAAAGTTTGGCTATGCGCGGAACATTATGCCGGA 598 Query 592 TTACTCGTTATCGCTGGGTAATCGTCCGTTGGGCCCGCTCTTACGCGATCAGTGCCGTTA 651 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 599 TTACTCGTTATCGCTGGGTAATCGTCCGTTGGGCCCGCTCTTACGCGATCAGTGCCGTTA 658 Query 652 GCACATGCGCGAATAGGGCGGATTCCGAAAGCATGTGCCAAATTCCCCATGACCCTGTTC 711 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 659 GCACATGCGCGAATAGGGCGGATTCCGAAAGCATGTGCCAAATTCCCCATGACCCTGTTC 718 Query 712 CAGGTGAG-TGACACTATCAGTCGAAGTTGTTTGCTTAACCAGGAAAAACGCTGTTTCTC 770 |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 719 CAGGTGAGCTGACACTATCAGTCGAAGTTGTTTCCTTAACCAGGAAAAACGCTGTTTCTC 778 Query 771 CGTTTGCTTGTACCATGGGGGCAGGGAATTCTTCGAGCGCGCGAATGTATACACTATTAT 830 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 779 CGTTTGCTTGTACCATGGGGGCAGGGAATTCTTCGAGCGCGCGAATGTATACACTATTAT 838 Query 831 CTCATGTGCATGTCCAGAGCGGGCTAACCTAATATACCTGGTCGCATCCGTCCGAGATCA 890 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 839 CTCATGTGCATGTCCAGAGCGGGCTAACCTAATATACCTGGTCGCATC-GTCCGAGATCA 897 Query 891 GTTGGGAATAGCGGAGCGGATACGCCTGGAACGCTGGGGCGTGCCAGTAAACTTACTGTT 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 GTTGGGAATAGCGGAGCGGATACGCCTGGAACGCTGGGGCGTGCCAGTAAACTTACTGTT 957 Query 951 CTCCAGTTCCTCCATCATGTTCCGTCTAATCCGGAGATGTGTAGCTGCATTGTGCTCCGT 1010 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 958 CTCCAGTTCCTCCATCATGTTCCGTCTAATCCGGAGATGTGTAGCTGCATTGTGCTCCGT 1017 Query 1011 TGCGGTACTCCTCGACTTGCCAGGTGCCATATGGGCTACTGGCGAGAGGAAATTTGCTTT 1070 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1018 TGCGGTACTCCTCGACT-G---GGTGCCATATGGGCTACTGGCGAGAGGAAATTTGCTTT 1073 Query 1071 TGTGTATTTAGGCCCGTGGCACCTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1115 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1074 TGTGTATTTAGGCCCGTGGCACCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1118 Query= ERCC-00128_genbank |92111306|gb|DQ459428.1| Synthetic construct microarray control MC26 mRNA, complete sequence Length=1134 Subject= ERCC-00128 Length=1133 Score = 2021 bits (1094), Expect = 0.0 Identities = 1123/1135 (98%), Gaps = 10/1135 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGGAGAACCTAAAAGCCATGAATCAAGCGCTTATGGATTCGTTTGCAGCGAAGTGAGGCC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GGGAGAACCTAAAAGCCATGAATCAAGCGCTTATGGATTCGTTTGCAGCGAAGTGAGGCC 60 Query 61 ATTCCCGCTTACATTAAAGACGTCCTATGAGGTTCGGAGGTGCCTGGCACCCTTGGCCGC 120 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ATTCCCGCTTACATTAAAGACGTCCTATGA-GTTCGGAGGTGCCTGGCACCCTTGGCCGC 119 Query 121 GGTTGTATACTAACTGCTGACGCAAGCATAAGGAGTCAGGTTGATGGTACATCTTCACTT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 GGTTGTATACTAACTGCTGACGCAAGCATAAGGAGTCAGGTTGATGGTACATCTTCACTT 179 Query 181 GCACACCCATAGCGCCAAGAAGAACCACTGTTAGCTTGACAGGGGATAAGTCCATGGTTC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 GCACACCCATAGCGCCAAGAAGAACCACTGTTAGCTTGACAGGGGATAAGTCCATGGTTC 239 Query 241 GTCCGGGTTAGATTAGATGTTGCCTAGGCGACTTTAAGTGAACCAGATTATGTATGGACG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 240 GTCCGGGTTAGATTAGATGTTGCCTAGGCGACTTTAAGTGAACCAGATTATGTATGGACG 299 Query 301 CGCAATAGATATGACACTTATTAATACCCGTACTGGTTTGGACACGGTATGGATCATAAC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 300 CGCAATAGATATGACACTTATTAATACCCGTACTGGTTTGGACACGGTATGGATCATAAC 359 Query 361 TAGTCTTGCCTACATCAAGAGACCTGCACTCTCCTGTTGCGACGGTAGCAGACTCTACAT 420 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 TAGTATTGCCTACATCAAGAGACCTGCACTCTCCTGTTGCGACGGTAGCAGACTCTACAT 419 Query 421 TGGCCAATCATGTCCTCTGTTAATCCAGCCAGAATATGCCAATTGAGGCGAGGGAACTGG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 TGGCCAATCATGTCCTCTGTTAATCCAGCCAGAATATGCCAATTGAGGCGAGGGAACTGG 479 Query 481 GATTGTCCCGTAGAACCTATACCATGTAATGGTTGTTAAGCTTCGATTCATCGGGAGTTG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 GATTGTCCCGTAGAACCTATACCATGTAATGGTTGTTAAGCTTCGATTCATCGGGAGTTG 539 Query 541 CGCGTGCTGATGTCTCAGATATAGCACGCAGCTGCGCACGTCTCTATCGTAAGTCCGAGT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 CGCGTGCTGATGTCTCAGATATAGCACGCAGCTGCGCACGTCTCTATCGTAAGTCCGAGT 599 Query 601 ATGCTTGCACTTGGTCAATTACAAGTTCGAACAGAGAGCGGGTGGAGGGCTATAGCTTTG 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 ATGCTTGCACTTGGTCAATTACAAGTTCGAACAGAGAGCGGGTGGAGGGCTATAGCTTTG 659 Query 661 CTGTAGCGATCCAATCGAGGCCAGTCTCTGCGGCCAAGTTACGCCTGAAAATTCCGATAG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 CTGTAGCGATCCAATCGAGGCCAGTCTCTGCGGCCAAGTTACGCCTGAAAATTCCGATAG 719 Query 721 GTGGCTCTCGTACCGCGATGCGGGTACCCCGCCGGCTTTTCTATCACTATGCTTCGCAGA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 GTGGCTCTCGTACCGCGATGCGGGTACCCCGCCGGCTTTTCTATCACTATGCTTCGCAGA 779 Query 781 TCAAACTTCTCCTGCGCGCCACGAGTGCAGGTAATCGCACTTAGAAGTAACTATGCCTAT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 TCAAACTTCTCCTGCGCGCCACGAGTGCAGGTAATCGCACTTAGAAGTAACTATGCCTAT 839 Query 841 CATAACCCTGTACGCGGAGTAATTCCATGAACCGGCTTTGAAACGGATTACCGATCCTAT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 CATAACCCTGTACGCGGAGTAATTCCATGAACCGGCTTTGAAACGGATTACCGATCCTAT 899 Query 901 CTGTTTGCTGTTTGGAGTGTGTATCCATGGTGATTGCAGGCACACTAAAATTGGCCTGAG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 CTGTTTGCTGTTTGGAGTGTGTATCCATGGTGATTGCAGGCACACTAAAATTGGCCTGAG 959 Query 961 GA--TC-T-----GGCATGGACCGCGTCCGTTGAATAATGCATAATATCGCATTGAGCGA 1012 || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 960 GAACTCCTTTTCTGGCATGGACCGCGTCCGTTGAATAATGCATAATATCGCATTGAGCGA 1019 Query 1013 TCACTGCGTCTTCTGTACGGTCGGACCCCTTGTTGATCAACGAACTAACTACGCGTTTAA 1072 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1020 TCACTGCGTCTTCTGTACGGTCGGACCCCTTGTTGATCAACGAACTAACTACGCGTTTAA 1079 Query 1073 GATAGCGGACAGCCTATTCAATTCTCACTCTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 1127 | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1080 GGTAGCGGACAGCCTATTCAATTCTCACTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1133 Query= ERCC-00130_genbank |116733912|gb|EF011072.1| Synthetic construct spike-in microarray control hypothetical protein (ynbA) gene, partial cds Length=1046 Subject= ERCC-00130 Length=1059 Score = 1916 bits (1037), Expect = 0.0 Identities = 1037/1037 (100%), Gaps = 0/1037 (0%) Strand=Plus/Plus Query 10 GCATTTTGAAAATTCTATGGAAGAGCTAGCATCTCTGACGAAAACAGCAGACGGAAAAGT 69 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GCATTTTGAAAATTCTATGGAAGAGCTAGCATCTCTGACGAAAACAGCAGACGGAAAAGT 60 Query 70 ACTGACCAGCGTCACACAAAAACGGAACAGGGCTGACGCCGCTACATATATAGGAAAAGG 129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ACTGACCAGCGTCACACAAAAACGGAACAGGGCTGACGCCGCTACATATATAGGAAAAGG 120 Query 130 GAAGGTAGAAGAGCTGAAGGCACTCGTGGAAGAGCTTGAAGCTGATCTCCTCATCTTTAA 189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GAAGGTAGAAGAGCTGAAGGCACTCGTGGAAGAGCTTGAAGCTGATCTCCTCATCTTTAA 180 Query 190 TGATGAACTGTCGCCAAGTCAGCTGAAGTCATTGGCAACAGCAATTGAAGTGAAGATGAT 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TGATGAACTGTCGCCAAGTCAGCTGAAGTCATTGGCAACAGCAATTGAAGTGAAGATGAT 240 Query 250 TGACCGCACGCAATTGATATTAGATATTTTTGCAAAGCGGGCGAGAACGAGAGAAGGCAA 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TGACCGCACGCAATTGATATTAGATATTTTTGCAAAGCGGGCGAGAACGAGAGAAGGCAA 300 Query 310 ACTTCAAATTGAGCTGGCTCAGCTGCAATATGCACTGCCGCGTCTGACGGGACAAGGGAT 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ACTTCAAATTGAGCTGGCTCAGCTGCAATATGCACTGCCGCGTCTGACGGGACAAGGGAT 360 Query 370 CAACCTTTCCCGGCAAGGCGGAGGAATTGGGGCAAGAGGTCCCGGGGAAACGAAACTGGA 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CAACCTTTCCCGGCAAGGCGGAGGAATTGGGGCAAGAGGTCCCGGGGAAACGAAACTGGA 420 Query 430 AACCGACCGCCGCCATATCAGAAATCGCATTCATGAAATCAACACACAGCTTTCCACTGT 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 AACCGACCGCCGCCATATCAGAAATCGCATTCATGAAATCAACACACAGCTTTCCACTGT 480 Query 490 CATTCGCCATAGAAGCCGATACCGTGAAAGAAGAAAGAAAAACGGTGTGCTTCAAATTGC 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 CATTCGCCATAGAAGCCGATACCGTGAAAGAAGAAAGAAAAACGGTGTGCTTCAAATTGC 540 Query 550 GCTTGTCGGCTATACAAACGCAGGGAAATCAACATGGTTCAACCGCCTGACGAGTGCTGA 609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GCTTGTCGGCTATACAAACGCAGGGAAATCAACATGGTTCAACCGCCTGACGAGTGCTGA 600 Query 610 CAGCTATGAAGAAGACCTCCTGTTTGCCACGCTGGACCCGATGACCAGAAAAATGGTCCT 669 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 CAGCTATGAAGAAGACCTCCTGTTTGCCACGCTGGACCCGATGACCAGAAAAATGGTCCT 660 Query 670 GCCAAGCGGCTACAGTGTTCTTCTTTCAGATACAGTAGGATTTATTCAGGATCTTCCGAC 729 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 GCCAAGCGGCTACAGTGTTCTTCTTTCAGATACAGTAGGATTTATTCAGGATCTTCCGAC 720 Query 730 GACATTGATTGCTGCATTCCGCTCAACGCTTGAGGAAGTAAAAGAAGCGGATTTAATTCT 789 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GACATTGATTGCTGCATTCCGCTCAACGCTTGAGGAAGTAAAAGAAGCGGATTTAATTCT 780 Query 790 GCATTTAATTGATTCTTCAAATGAGGATTATGCGGGACATGAAAAAACAGTGCTTCGGCT 849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 GCATTTAATTGATTCTTCAAATGAGGATTATGCGGGACATGAAAAAACAGTGCTTCGGCT 840 Query 850 GCTTGAGGAGCTTGAAGCAGATGATATCCCGATGCTGACGGCTTACAATAAACGTGATCA 909 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 GCTTGAGGAGCTTGAAGCAGATGATATCCCGATGCTGACGGCTTACAATAAACGTGATCA 900 Query 910 AAAACTGCCTGATTTTATACCGACCGCCGGAAGGGATCACATTATGGTCAGTGCGAAATT 969 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 AAAACTGCCTGATTTTATACCGACCGCCGGAAGGGATCACATTATGGTCAGTGCGAAATT 960 Query 970 TGAGGACGACGCTGCAGCCTTTAAAGAAGCGATTCAGCGCTATTTGCGCCAAGAACTGTT 1029 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 TGAGGACGACGCTGCAGCCTTTAAAGAAGCGATTCAGCGCTATTTGCGCCAAGAACTGTT 1020 Query 1030 AACGTCTTGAATTCTGG 1046 ||||||||||||||||| Sbjct 1021 AACGTCTTGAATTCTGG 1037 Query= ERCC-00131_genbank |116662508|gb|DQ855003.2| Synthetic construct clone AG016.1110 external RNA control sequence Length=747 Subject= ERCC-00131 Length=771 Score = 1369 bits (741), Expect = 0.0 Identities = 745/747 (99%), Gaps = 0/747 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CGCCGGATAAAGGCTTCTTCGGTACTATACAAGTTGTCTACGCACATTTGCCTTGGGTAT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CGCCGGATAAAGGCTTCTTCGGTACTATACAAGTTGTCTACGCACATTTGCCTTGGGTAT 60 Query 61 TAAACTCTAGTAGGAGCGAAACTTGACATATCAAACCTCTCTGGAGAGGCATCTCCCAGA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TAAACTCTAGTAGGAGCGAAACTTGACATATCAAACCTCTCTGGAGAGGCATCTCCCAGA 120 Query 121 CATTACGGATGATCAGGTCTCAGCGAATCTTAGCTGTGCGGATAATTTGTGGCCCGCACA 180 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CATTACGGATGATCAGGTCTCAGCGAATCCTAGCTGTGCGGATAATTTGTGGCCCGCACA 180 Query 181 ACCGCAAGACACCGCCGTGTCTATTCCACAAACTTCGACATATCAATAACGCAGTAACAA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ACCGCAAGACACCGCCGTGTCTATTCCACAAACTTCGACATATCAATAACGCAGTAACAA 240 Query 241 CGTTAAGTAGGGGGACAGGCAGTGCGTCCTAAGGGGCTTGAGGTCGCCCGATTCGCGATC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CGTTAAGTAGGGGGACAGGCAGTGCGTCCTAAGGGGCTTGAGGTCGCCCGATTCGCGATC 300 Query 301 TAATCTTAACAGACGAGGTGGCGTAAGATGTACCTCGTTCAATCTAAGTATGAATTTGTC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TAATCTTAACAGACGAGGTGGCGTAAGATGTACCTCGTTCAATCTAAGTATGAATTTGTC 360 Query 361 CGCTGGGTAATGGTGGAATTAAAGAACATGCGTAAAACGACCTCGTTGTAATTTGGGTCG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CGCTGGGTAATGGTGGAATTAAAGAACATGCGTAAAACGACCTCGTTGTAATTTGGGTCG 420 Query 421 GCCCGTCTCGGCAAATTTGCCCTTGCAGTGAAGCTCGGATTGGATGTCTCGTAAGGAATA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GCCCGTCTCGGCAAATTTGCCCTTGCAGTGAAGCTCGGATTGGATGTCTCGTAAGGAATA 480 Query 481 CTTATTGCGGGTGGTACGCAAATTCGCAACCATGTGAAGTAATGTGAGCGTACTTCACCT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 CTTATTGCGGGTGGTACGCAAATTCGCAACCATGTGAAGTAATGTGAGCGTACTTCACCT 540 Query 541 GCTCCGGTACAAGCCGCCATGTGCTCATGTTGGGAACCTCCTGCGTAACAACCGGACGCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GCTCCGGTACAAGCCGCCATGTGCTCATGTTGGGAACCTCCTGCGTAACAACCGGACGCT 600 Query 601 TGCGAAAGTCATTCCCCTATCGGTACACTATTGGAAAACATGACAAACGTATAATGCGTG 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TGCGAAAGTCATTCCCCTATCGGTACACTATTGGAAAACATGACAAACGTATAATGCGTG 660 Query 661 ATGACCGCAACAGATGTAAGTGCACCAACTAGTATTGGCTCCTGTCCACATGGTCGGGTT 720 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 ATGACCGCAACAGGTGTAAGTGCACCAACTAGTATTGGCTCCTGTCCACATGGTCGGGTT 720 Query 721 TTCCGCCCCCAAACATGCAAACATCCG 747 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 TTCCGCCCCCAAACATGCAAACATCCG 747 Query= ERCC-00134_genbank |103488686|gb|DQ516739.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-250-22 genomic sequence Length=250 Subject= ERCC-00134 Length=274 Score = 457 bits (247), Expect = 1e-133 Identities = 249/250 (99%), Gaps = 0/250 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 AGGCTTTGTTATTGGTATTGACTTACAACCAGTTAAGCCATTTGAATATGATAATGTAGT 60 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 AGGCTTTGTTATTGGTATTGACTTACAAACAGTTAAGCCATTTGAATATGATAATGTAGT 60 Query 61 TGCAATAAAAGGAGATTTCACCTTAGAAGAAAATTTGAACAAAATTAGAGAGCTAATTCC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TGCAATAAAAGGAGATTTCACCTTAGAAGAAAATTTGAACAAAATTAGAGAGCTAATTCC 120 Query 121 AAATGATGaaaaaaaGGTGGATGTGGTTATAAGTGACGCCTCCCCTAATATAAGCGGTTA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AAATGATGAAAAAAAGGTGGATGTGGTTATAAGTGACGCCTCCCCTAATATAAGCGGTTA 180 Query 181 TTGGGATATAGACCACGCTCGTTCAATAGATTTAGTAACTACTGCCTTACAAATAGCTAC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TTGGGATATAGACCACGCTCGTTCAATAGATTTAGTAACTACTGCCTTACAAATAGCTAC 240 Query 241 TGAGATGCTA 250 |||||||||| Sbjct 241 TGAGATGCTA 250 Query= ERCC-00136_genbank |116733895|gb|EF011063.1| Synthetic construct spike-in microarray control DNA-directed RNA polymerase alpha subunit (rpoA) gene, complete cds Length=1020 Subject= ERCC-00136 Length=1033 Score = 1834 bits (993), Expect = 0.0 Identities = 1005/1011 (99%), Gaps = 0/1011 (0%) Strand=Plus/Plus Query 10 TTTCGACGTTTTGAAGGAGGGTTTTAAGTAATGATCGAGATTGAAAAACCAAAAATCGAA 69 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TTTCGACGTTTTGAAGGAGGGTTTTAAGTAATGATCGAGATTGAAAAACCAAAAATCGAA 60 Query 70 ACGGTTGAAATCAGCGACGATGCCAAATTTGGTAAGTTTGTCGTAGAGCCACTTGAGCGT 129 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ACGGTTGAAATCAGCGACGATGCCGAATTTGGTAAGTTTGTCGTAGAGCCACTTGAGCGT 120 Query 130 GGATATGGTACAACTCTGGGTAACTCCTTACGTCGTATCCTCTTATCCTCACTCCCTGGT 189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GGATATGGTACAACTCTGGGTAACTCCTTACGTCGTATCCTCTTATCCTCACTCCCTGGT 180 Query 190 GCCGCTGTAACATCAATCCAGATAGATGGTGTACTGCACGAATTCTCGACAATTGAAGGC 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GCCGCTGTAACATCAATCCAGATAGATGGTGTACTGCACGAATTCTCGACAATTGAAGGC 240 Query 250 GTTGTGGAAGATGTTACAACGATTATCTTACACATTAAAAAGCTTGCATTGAAAATCTAC 309 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GTTGTGGAAGATGTTACAACGATTATCTTACACATTAAAAAGCTTGCATTGAAAATCTAC 300 Query 310 TCTGATGAAGAGAAGACGCTAGAAATTGATGTACAGGGTGAAGGAACTGTAACGGCAGCT 369 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TCTGATGAAGAGAAGACGCTAGAAATTGATGTACAGGGTGAAGGAACTGTAACGGCAGCT 360 Query 370 GATATTACACACGATAGTGATGTAGAGATCTTAAATCCTGATCTTCATATCGCGACTCTT 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GATATTACACACGATAGTGATGTAGAGATCTTAAATCCTGATCTTCATATCGCGACTCTT 420 Query 430 GGTGAGAATGCGAGTTTCCGAGTTCGCCTTACTGCTCAAAGAGGACGTGGGTATACGCCT 489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GGTGAGAATGCGAGTTTCCGAGTTCGCCTTACTGCTCAAAGAGGACGTGGGTATACGCCT 480 Query 490 GCTGACGCAAACAAGAGAGACGATCAGCCAATCGGCGTGATTCCGATCGATTCTATCTAT 549 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GCTGACGCAAACAAGAGAGGCGATCAGCCAATCGGCGTGATTCCGATCGATTCTATCTAT 540 Query 550 ACGCCAGTTTCTCGTGTATCTTATCAGGTAGAGAACACTCGTGTAGGCCAAGTTGCAAAC 609 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 ACGCCAGTTTCCCGTGTATCTTATCAGGTAGAGAACACTCGTGTAGGCCAAGTTGCAAAC 600 Query 610 TATGATAAACTTACACTTGATGTTTGGACTGATGGAAGCACTGGACCGAAAGAAGCAATT 669 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TATGATAAACTTACACTTGATGTTTGGACTGATGGAAGCACTGGACCGAAAGAAGCAATT 660 Query 670 GCGCTTGGTTCAAAGATTTTAACTGAACACCTTAATATATTCGTTGGTTTAACTGACGAA 729 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 661 GCGCTTGGTTCAAAGATTTTAACTGAACACCTTAATATATTCGCTGGTTTAACTGACGAA 720 Query 730 GCTCAACATGCTGAAATCATGGTTGAAAAAGAAGAAGATCAAAAAGAGAAAGTTCTTGAA 789 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GCTCAACATGCTGAAATCATGGTTGAAGAAGAAGAAGATCAAAAAGAGAAAGTTCTTGAA 780 Query 790 ATGACAATTGAAGAATTGGATCTTTCTGTTCGTTCTTACAACTGCTTAAAGCGTGCGGGT 849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 ATGACAATTGAAGAATTGGATCTTTCTGTTCGTTCTTACAACTGCTTAAAGCGTGCGGGT 840 Query 850 ATTAACACGGTTCAAGAGCTTGCGAACAAGACGGAAGAAGATATGATGAAAGTTCGAAAT 909 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 ATTAACACGGTTCAAGAGCTTGCGAACAAGACGGAAGAAGATATGATGAAAGTTCGAAAT 900 Query 910 CTAGGACGCAAATCACTTGAAGAAGTGAAAGCGAAACTAGAAGAACTTGGACTCGGACTT 969 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CTAGGACGCAAATCACTTGAAGAAGTGAAAGCGAGACTAGAAGAACTTGGACTCGGACTT 960 Query 970 CGCAAAGACGATTGACTAGTTTCCCTTGTGAACTAGGATTTTCCCGGGTAC 1020 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 CGCAAAGACGATTGACTAGTTTCCCTTGTGAACTAGGATTTTCCCGGGTAC 1011 Query= ERCC-00137_genbank |116662507|gb|DQ855000.2| Synthetic construct clone AG011.0011 external RNA control sequence Length=513 Subject= ERCC-00137 Length=537 Score = 942 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 512/513 (99%), Gaps = 0/513 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CAAAGCAAACCTAATGAAGCCAGACACGAGATCACAGAAAATCGCTGACTATCCCGAGTG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CAAAGCAAACCTAATGAAGCCAGACACGAGATCACAGAAAATCGCTGACTATCCCGAGTG 60 Query 61 CGCGGCGAGCTACAATCCAAGATGATTATTTTTTCACGACCGGGCGCTGGTCAGGTATAT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CGCGGCGAGCTACAATCCAAGATGATTATTTTTTCACGACCGGGCGCTGGTCAGGTATAT 120 Query 121 CGCTGGTACAGATGGCGGCAAGCATCGTTGTCACCACTTCCTTCACGATTTCCGTTAGAG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CGCTGGTACAGATGGCGGCAAGCATCGTTGTCACCACTTCCTTCACGATTTCCGTTAGAG 180 Query 181 CCGAGTGGTACAGCACGTACGTTATATATGGGAGTACGGACATGCTTCCCACCTCGTCAG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CCGAGTGGTACAGCACGTACGTTATATATGGGAGTACGGACATGCTTCCCACCTCGTCAG 240 Query 241 CCAAGATGATAGATACCCGTAGCGTGATGGTCTTATAGCTGCTCTGATGGACTTCGAAAG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CCAAGATGATAGATACCCGTAGCGTGATGGTCTTATAGCTGCTCTGATGGACTTCGAAAG 300 Query 301 ATCACCGTGCAGCTATTCAAAAAAGCAGCCGGGGAAAAGGTGGTCTCGCCCGAAAGCCAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATCACCGTGCAGCTATTCAAAAAAGCAGCCGGGGAAAAGGTGGTCTCGCCCGAAAGCCAT 360 Query 361 GACCTCCGATCACTCCTGGCCGGTAGTCGGTTTATTGCATATTGTACAATTGCGCGCGCG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 361 GACCTCCGATCACTCCTGGCCGGTAGTCGGTTTATTGCATATTGTACAGTTGCGCGCGCG 420 Query 421 GCAGGTCACATCCCCCTGGTTAAATAGAGGCACGAGCGCTCGTTTTTGGGTGATCAATAT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GCAGGTCACATCCCCCTGGTTAAATAGAGGCACGAGCGCTCGTTTTTGGGTGATCAATAT 480 Query 481 GGCTTACCCCCGAGAGAGTTGTGAGCTTGCACG 513 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GGCTTACCCCCGAGAGAGTTGTGAGCTTGCACG 513 Query= ERCC-00138_genbank |103488724|gb|DQ516777.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-60 genomic sequence Length=1000 Subject= ERCC-00138 Length=1024 Score = 1836 bits (994), Expect = 0.0 Identities = 998/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CCTGCTAAAAGAGGTTGGTTGTATAAGATTTGGAGAATTTATCTTAGCCTCTGGTaaaaa 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2 CCTGCTAAAAGAGGTTGGTTGTATAAGATTTGGAGAATTTATCTTAGCCTCTGGTAAAAA 61 Query 61 aaGTAACTACTACATAGACATaaaaaaaGCCACCACAAACCCAGAAATTTTAAAGTTAGT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 62 AAGTAACTACTACATAGACATAAAAAAAGCCACCACAAACCCAGAAATTTTAAAGTTAGT 121 Query 121 TGGAGAAATTATTGCTGAGCAAATAAAGGATGAAGATGTAAAAGTTGCTGGAGTAGAGCT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 122 TGGAGAAATTATTGCTGAGCAAATAAAGGATGAAGATGTAAAAGTTGCTGGAGTAGAGCT 181 Query 181 TGGTTCTGTCCCTATAGCTACAGCTGTCTCAATTATTGCTCAAAAACCACTATTAATTGT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 182 TGGTTCTGTCCCTATAGCTACAGCTGTCTCAATTATTGCTCAAAAACCACTATTAATTGT 241 Query 241 TAGAAAGAAACCTAAGGATTACGGAACTAAAAATAAGATAGAAGGAGAGCTAAAAGAAGG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 242 TAGAAAGAAACCTAAGGATTACGGAACTAAAAATAAGATAGAAGGAGAGCTAAAAGAAGG 301 Query 301 AGATAAGGTTGTTATTGTGGAGGATGTTACTACAACTGGAGGAAGTGTGCTAAAGGCAGT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 302 AGATAAGGTTGTTATTGTGGAGGATGTTACTACAACTGGAGGAAGTGTGCTAAAGGCAGT 361 Query 361 TAAAGAGATTAGGGAAAATGGTGGAATTGTTGATAAAGTTTTTGTTGTTGTTGATAGGTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 362 TAAAGAGATTAGGGAAAATGGTGGAATTGTTGATAAAGTTTTYGTTGTTGTTGATAGGTT 421 Query 421 AGAAGGAGCTAAAGAAAACCTACAAAAAGAGAATGTTGAATTAATCCCATTAGTTACTGT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 422 AGAAGGAGCTAAAGAAAACCTACAAAAAGAGAATGTTGAATTAATCCCATTAGTTACTGT 481 Query 481 TAAGGAGCTACAATCCACTCAATAAATCTAAAAACCTCTTAGTCCATAGGGGAAACCCCT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 482 TAAGGAGCTACAATCCACTCAATAAATCTAAAAACCTCTTAGTCCATAGGGGAAACCCCT 541 Query 541 ATTGGGATACTCCCCGTCCATTAAGTTGCTCCTTTCAGGAGCAATTAATGTCCATTTTAA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 542 ATTGGGATACTCCCCGTCCATTAAGTTGCTCCTTTCAGGAGCAATTAATGTCCATTTTAA 601 Query 601 GCTTATAATCCACTCAATAAATCTAAAAACTTCTTAGTTTTCTCTTTTTTAACCTTACCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 602 GCTTATAATCCACTCAATAAATCTAAAAACTTCTTAGTTTTCTCTTTTTTAACCTTACCA 661 Query 661 AATTTCTCTAATTTGCTAACATCTACATTTTTATCCTTTAAAATTTCTTTTATTGGTTCT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 662 AATTTCTCTAATTTGCTAACATCTACATTTTTATCCTTTAAAATTTCTTTTATTGGTTCT 721 Query 721 ATGAGTGCAAtttttttAAGTAAGTCTTCAATATCCTTCTTTTTGAAGTTAAATCTTTCC 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 722 ATGAGTGCAATTTTTTTAAGTAAGTCTTCAATATCCTTCTTTTTGAAGTTAAATCTTTCC 781 Query 781 ACAGCATCCCAGTCGTGAATTAAGTATAAAGCAACTCCACCAATGTTCTTTAAAGGAATC 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 782 ACAGCATCCCAGTCGTGAATTAAGTATAAAGCAACTCCACCAATGTTCTTTAAAGGAATC 841 Query 841 TGATATTTTGGCAACTCCTCCTCCAATTTAAATTTTAAATCTAAAACATCCACACAATTA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 842 TGATATTTTGGCAACTCCTCCTCCAATTTAAATTTTAAATCTAAAACATCCACACAATTA 901 Query 901 ATCCCATCAACACTCATCCAAGATAAAAATCCTCTCTGTGGAGTAATCATAATAGATGGG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 902 ATCCCATCAACACTCATCCAAGATAAAAATCCTCTCTGTGGAGTAATCATAATAGATGGG 961 Query 961 AACAAATTACTCCTTGCCCTCTCATCTGGTGTTTTGTAGA 1000 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 962 AACAAATTACTCCTTGCCCT-TCATCTGGTGTTTTGTAGA 1000 Query= ERCC-00142_genbank |114975604|gb|DQ883646.2| Synthetic construct clone NISTag5 external RNA control sequence Length=500 Subject= ERCC-00142 Length=493 Score = 905 bits (490), Expect = 0.0 Identities = 492/493 (99%), Gaps = 0/493 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CACCTGTCACATTTCCAATCGGCTCCAGGAAGAGAGAAGTGACGGCTTGATCCTGTAGTA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CACCTGTCACATTTCCAATCGGCTCCAGGAAGAGAGAAGTGACGGCTTGATCCTGTAGTA 60 Query 61 ATCCGGGATCGACTTAAGGGGTGCAGCGACCACGGCGGATCGGGCGTCGCAATAGTCCTC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ATCCGGGATCGACTTAAGGGGTGCAGCGACCACGGCGGATCGGGCGTCGCAATAGTCCTC 120 Query 121 CTGTTAGGAGGGTCCTTCTAATGTTAACGCCCGAATATTAGTCATATTTTGCTAGCGCCT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CTGTTAGGAGGGTCCTTCTAATGTTAACGCCCGAATATTAGTCATATTTTGCTAGCGCCT 180 Query 181 ATCAGCGTAAGATATGATTTAAGTTACACCAGGAGAGTAGCGAGATAGAACCACTCGTTG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ATCAGCGTAAGATATGATTTAAGTTACACCAGGAGAGTAGCGAGATAGAACCACTCGTTG 240 Query 241 GATCGGTCTTTCTTAATTGACTACTATCAGATCCGGCGCATGGCGCTGAGGTCAAACTAC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GATCGGTCTTTCTTAATTGACTACTATCAGATCCGGCGCATGGCGCTGAGGTCAAACTAC 300 Query 301 ATTACAGGCCCTGGTTTCCGTGGGTCAGCGCAAGTACAGGCGAGCAGATACAACCTTCCG 360 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATTACAGGCCCTGGTTTCCATGGGTCAGCGCAAGTACAGGCGAGCAGATACAACCTTCCG 360 Query 361 GAGACTTCGCCTCCACACACCGGAGACCCTAACCGTACCCAAATGTAACTAGCGCCTCTG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GAGACTTCGCCTCCACACACCGGAGACCCTAACCGTACCCAAATGTAACTAGCGCCTCTG 420 Query 421 GTGTGAGCTTACTAGAAAGTAGGCCGGGCCGGTCGACAGGAGGTTGCGCCaaaaaaaaaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GTGTGAGCTTACTAGAAAGTAGGCCGGGCCGGTCGACAGGAGGTTGCGCCAAAAAAAAAA 480 Query 481 aaaaaaaaaaaaa 493 ||||||||||||| Sbjct 481 AAAAAAAAAAAAA 493 Query= ERCC-00143_genbank |110339335|gb|DQ668362.1| Synthetic construct clone TagG microarray control Length=760 Subject= ERCC-00143 Length=784 Score = 1404 bits (760), Expect = 0.0 Identities = 760/760 (100%), Gaps = 0/760 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGCAGCGTAGGTATCGACTCTCACTGTGGAGTCGTCTATGATGTCGTGGAGTCCTCTCA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGCAGCGTAGGTATCGACTCTCACTGTGGAGTCGTCTATGATGTCGTGGAGTCCTCTCA 60 Query 61 GAGTGCTGTAGGTCCTCATAGGTCGTGCTGTCTCTCTACACGCGTGCGTGAGTCTACATT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GAGTGCTGTAGGTCCTCATAGGTCGTGCTGTCTCTCTACACGCGTGCGTGAGTCTACATT 120 Query 121 TCTGCGAGTTGGTGCTCTCACTGCGGTGTCAGTGATCTCTCCGCGTGTGACATGAGTCTA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TCTGCGAGTTGGTGCTCTCACTGCGGTGTCAGTGATCTCTCCGCGTGTGACATGAGTCTA 180 Query 181 GCTTCGCGGTCATGGTCTATCCCAGCGATGGATGAGACTACTCTGTACTAGATGGTCATG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GCTTCGCGGTCATGGTCTATCCCAGCGATGGATGAGACTACTCTGTACTAGATGGTCATG 240 Query 241 CCTGCGAATGAGTCGTCAGTGCCCACAATGTCTCGATAGTGCGCCGAATGTGTCTGTAAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CCTGCGAATGAGTCGTCAGTGCCCACAATGTCTCGATAGTGCGCCGAATGTGTCTGTAAT 300 Query 301 GCCTCGAATGTGTAATCGTCAACTCGTATGTGAAGTGCTAGGCTAGTATTGACATCTACG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GCCTCGAATGTGTAATCGTCAACTCGTATGTGAAGTGCTAGGCTAGTATTGACATCTACG 360 Query 361 GGCGGCTATTGACGAACTCTCCGGTATATGCTCTACATCTGCAGGGAATTGCCGACCATA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GGCGGCTATTGACGAACTCTCCGGTATATGCTCTACATCTGCAGGGAATTGCCGACCATA 420 Query 421 TATGGGTCTTGCTGATACGCTAGGGTGCTTGCTACTTAGATAGGCGTCTTGGCCGCTATT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TATGGGTCTTGCTGATACGCTAGGGTGCTTGCTACTTAGATAGGCGTCTTGGCCGCTATT 480 Query 481 CGCGGCGTGTCTCAGAATATGCGCGACGTGTCTGGTATATGGCGACTGTGTCCGTCTATA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 CGCGGCGTGTCTCAGAATATGCGCGACGTGTCTGGTATATGGCGACTGTGTCCGTCTATA 540 Query 541 CGCATACTGGTCCACATATAGACATACTTCCACGACATGACAAAGCGTGCTCCTACATAG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CGCATACTGGTCCACATATAGACATACTTCCACGACATGACAAAGCGTGCTCCTACATAG 600 Query 601 CACGAGCGTCTCCTAAATAGATCCGGTCTTATCGCTGAATGTCTAGGATTCTCGTCAATG 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 CACGAGCGTCTCCTAAATAGATCCGGTCTTATCGCTGAATGTCTAGGATTCTCGTCAATG 660 Query 661 ATCTACGATCCTCGCTAAGTATTCAGCCACCTCGTATAGTATTCGCGCACCTGAGGATTT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 ATCTACGATCCTCGCTAAGTATTCAGCCACCTCGTATAGTATTCGCGCACCTGAGGATTT 720 Query 721 ATTCACCTGACTCGCGTATAATATGCCGTCACCTAGTCTA 760 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 ATTCACCTGACTCGCGTATAATATGCCGTCACCTAGTCTA 760 Query= ERCC-00144_genbank |116662504|gb|DQ854995.2| Synthetic construct clone AG006.1100 external RNA control sequence Length=514 Subject= ERCC-00144 Length=538 Score = 950 bits (514), Expect = 0.0 Identities = 514/514 (100%), Gaps = 0/514 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 AGCTAGGATAAATTGACCCGTATGAACTGTTGCCGGCTCGGAAATGTTAAGGCTCTGCGC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 AGCTAGGATAAATTGACCCGTATGAACTGTTGCCGGCTCGGAAATGTTAAGGCTCTGCGC 60 Query 61 ACGCACTTTATCATTCGCAGCCTGTTCTGTCAGCGGGTCAGCCTAGGTTACGGTGGAACC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ACGCACTTTATCATTCGCAGCCTGTTCTGTCAGCGGGTCAGCCTAGGTTACGGTGGAACC 120 Query 121 ACTCGGTATCGTGCAGACAGGGATCGTAAGGCGATCCAGCCGGTATACCTTAGTCACATA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ACTCGGTATCGTGCAGACAGGGATCGTAAGGCGATCCAGCCGGTATACCTTAGTCACATA 180 Query 181 TACTATCGTAATATTGGCGGTTGCTGACAAGTAAATACGGCTAAACCGGTCGTTGACCAA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TACTATCGTAATATTGGCGGTTGCTGACAAGTAAATACGGCTAAACCGGTCGTTGACCAA 240 Query 241 CCACTCTCGCGGGGGTCATAAATATCACTGAGCCCGGGAAGTACCCCGTGACAGACATAC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CCACTCTCGCGGGGGTCATAAATATCACTGAGCCCGGGAAGTACCCCGTGACAGACATAC 300 Query 301 GAAAAGCGTGATAACGTATTCGTAGGTATTATTTCCGTTAGCTGGAGGTAAAGGGGTTCT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GAAAAGCGTGATAACGTATTCGTAGGTATTATTTCCGTTAGCTGGAGGTAAAGGGGTTCT 360 Query 361 GGTCCTAGCCGTGTTATGTCTATTTATGAGATGGTAAGCTCGTCACCAACTCGTCACGCG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GGTCCTAGCCGTGTTATGTCTATTTATGAGATGGTAAGCTCGTCACCAACTCGTCACGCG 420 Query 421 ATCGAAATAGCTTGGACTAATGTCCGGCACATAATCAAGTCTACATCAATCATGAATGGT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 ATCGAAATAGCTTGGACTAATGTCCGGCACATAATCAAGTCTACATCAATCATGAATGGT 480 Query 481 TTCTGATTTGCTACCATCAGATATCATGTGAGCA 514 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TTCTGATTTGCTACCATCAGATATCATGTGAGCA 514 Query= ERCC-00145_genbank |112819961|gb|DQ875386.1| Synthetic construct microarray control LYS gene, complete sequence Length=1018 Subject= ERCC-00145 Length=1042 Score = 1881 bits (1018), Expect = 0.0 Identities = 1018/1018 (100%), Gaps = 0/1018 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ACTGTCCTTTCATCCATAAGCGGAGAAAGAGGGAATGACATTGTTCTTACACGGCACAAG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ACTGTCCTTTCATCCATAAGCGGAGAAAGAGGGAATGACATTGTTCTTACACGGCACAAG 60 Query 61 CAGACAAAATCAACATGGTCATTTAGAAATCGGAGGTGTGGATGCTCTCTATTTAGCGGA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CAGACAAAATCAACATGGTCATTTAGAAATCGGAGGTGTGGATGCTCTCTATTTAGCGGA 120 Query 121 GAAATATGGTACACCTCTTTACGTATATGATGTGGCTTTAATACGTGAGCGTGCTAAAAG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GAAATATGGTACACCTCTTTACGTATATGATGTGGCTTTAATACGTGAGCGTGCTAAAAG 180 Query 181 CTTTAAGCAGGCGTTTATTTCTGCAGGGCTGAAAGCACAGGTGGCATATGCGAGCAAAGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CTTTAAGCAGGCGTTTATTTCTGCAGGGCTGAAAGCACAGGTGGCATATGCGAGCAAAGC 240 Query 241 ATTCTCATCAGTCGCAATGATTCAGCTCGCTGAGGAAGAGGGACTTTCTTTAGATGTCGT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 ATTCTCATCAGTCGCAATGATTCAGCTCGCTGAGGAAGAGGGACTTTCTTTAGATGTCGT 300 Query 301 ATCCGGAGGAGAGCTATATACGGCTGTTGCAGCAGGCTTTCCGGCAGAACGCATCCACTT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATCCGGAGGAGAGCTATATACGGCTGTTGCAGCAGGCTTTCCGGCAGAACGCATCCACTT 360 Query 361 TCATGGAAACAATAAGAGCAGGGAAGAACTGCGGATGGCGCTTGAGCACCGCATCGGCTG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TCATGGAAACAATAAGAGCAGGGAAGAACTGCGGATGGCGCTTGAGCACCGCATCGGCTG 420 Query 421 CATTGTGGTGGATAATTTCTATGAAATCGCGCTTCTTGAAGACCTATGTAAAGAAACGGG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CATTGTGGTGGATAATTTCTATGAAATCGCGCTTCTTGAAGACCTATGTAAAGAAACGGG 480 Query 481 TCACTCCATCGATGTTCTTCTTCGGATCACGCCCGGAGTAGAAGCGCATACGCATGACTA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TCACTCCATCGATGTTCTTCTTCGGATCACGCCCGGAGTAGAAGCGCATACGCATGACTA 540 Query 541 CATTACAACGGGCCAGGAAGATTCAAAGTTTGGTTTCGATCTTCATAACGGACAAACTGA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CATTACAACGGGCCAGGAAGATTCAAAGTTTGGTTTCGATCTTCATAACGGACAAACTGA 600 Query 601 ACGGGCCATTGAACAAGTATTACAATCGGAACACATTCAGCTGCTGGGTGTCCATTGCCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 ACGGGCCATTGAACAAGTATTACAATCGGAACACATTCAGCTGCTGGGTGTCCATTGCCA 660 Query 661 TATCGGCTCGCAAATCTTTGATACGGCCGGTTTTGTGTTAGCAGCGGAAAAAATCTTCAA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 TATCGGCTCGCAAATCTTTGATACGGCCGGTTTTGTGTTAGCAGCGGAAAAAATCTTCAA 720 Query 721 AAAACTAGACGAATGGAGAGATTCATATTCATTTGTATCCAAGGTGCTGAATCTTGGAGG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 AAAACTAGACGAATGGAGAGATTCATATTCATTTGTATCCAAGGTGCTGAATCTTGGAGG 780 Query 781 AGGTTTCGGCATTCGTTATACGGAAGATGATGAACCGCTTCATGCCACTGAATACGTTGA 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 AGGTTTCGGCATTCGTTATACGGAAGATGATGAACCGCTTCATGCCACTGAATACGTTGA 840 Query 841 AAAAATTATCGAAGCTGTGAAAGAAAATGCTTCCCGTTACGGTTTTGACATTCCGGAAAT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 AAAAATTATCGAAGCTGTGAAAGAAAATGCTTCCCGTTACGGTTTTGACATTCCGGAAAT 900 Query 901 TTGGATCGAACCGGGCCGTTCTCTCGTGGGAGACGCAGGCACAACTCTTTATACGGTTGG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 TTGGATCGAACCGGGCCGTTCTCTCGTGGGAGACGCAGGCACAACTCTTTATACGGTTGG 960 Query 961 CTCTCAAAAAGAAGTGGATAAGCTGTACAATCGTTTCATCATTCGGCGTGCGAATTAA 1018 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 CTCTCAAAAAGAAGTGGATAAGCTGTACAATCGTTTCATCATTCGGCGTGCGAATTAA 1018 Query= ERCC-00147_genbank |103488737|gb|DQ516790.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-73 genomic sequence Length=1000 Subject= ERCC-00147 Length=1023 Score = 1834 bits (993), Expect = 0.0 Identities = 998/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CCTTGCTTAACCTTAATCTTGCCTTATTACAATATTTTTAGaaaaataaaaagtaaaaat 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CCTTGCTTAACCTTAATCTTGCCTTATTACAATATTTTTAGAAAAATAAAAAGTAAAAAT 60 Query 61 aaaaGCAAATCCTTAATCTTTGGTGATATTGATGGAGAGGTATGAAATCCCTAAAGAGAT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AAAAGCAAATCCTTAATCTTTGGTGATATTGATGGAGAGGTATGAAATCCCTAAAGAGAT 120 Query 121 TGGAGAAATAATGTTTGGCTTGTTGTCTCCAGATTACATAAGACAGATGTCAGTTGCTAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TGGAGAAATAATGTTTGGCTTGTTGTCTCCAGATTACATAAGACAGATGTCAGTTGCTAA 180 Query 181 GATAGTTACACCAGACACTTATGATGAAGATGGTTATCCAATAGATGGAGGTTTAATGGA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GATAGTTACACCAGACACTTATGATGAAGATGGTTATCCAATAGATGGAGGTTTAATGGA 240 Query 241 CACAAGATTGGGAGTTATAGACCCAGGTTTAGTTTGCAAAACATGTGGAGGAAGGATTGG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CACAAGATTGGGAGTTATAGACCCAGGTTTAGTTTGCAAAACATGTGGAGGAAGGATTGG 300 Query 301 AGAGTGTCCAGGGCATTTTGGGCATATAGAGTTGGCTAAACCAGTAATTCATATAGGATT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 AGAGTGTCCAGGGCATTTTGGGCATATAGAGTTGGCTAAACCAGTAATTCATATAGGATT 360 Query 361 TGCCAAAACAATATACAAGATATTGAAGGCAGTTTGCCCACACTGTGGAAGAGTAGCAAT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TGCCAAAACAATATACAAGATATTGAAGGCAGTTTGCCCACACTGTGGAAGAGTAGCAAT 420 Query 421 AAGTGAAACTAAGAGGAAAGAAATTTTGGAAAAGATGGAAAAATTAGAGAGAGATGGAGG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 AAGTGAAACTAAGAGGAAAGAAATTTTGGAAAAGATGGAAAAATTAGAGAGAGATGGAGG 480 Query 481 AAACAAGTGGGAGGTTTGTGAAGAGGTTTATAAAGAAGCTTCAAAAGTTACAATCTGCCC 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 AAACAAGTGGGAGGTTTGTGAAGAGGTTTATAAAGAAGCTTCAAAAGTTACAATCTGCCC 540 Query 541 ACACTGTGGAGAGATAAAGTATGATATAAAGTTTGAGAAACCAACAACCTACTACAGAAT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 ACACTGTGGAGAGATAAAGTATGATATAAAGTTTGAGAAACCAACAACCTACTACAGAAT 600 Query 601 TGATGGAAATGAGGAAAAAACATTAACTCCATCAGATGTTAGAGAGATTTTAGAGAAGAT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TGATGGAAATGAGGAAAAAACATTAACTCCATCAGATGTTAGAGAGATTTTAGAGAAGAT 660 Query 661 TCCAGATGAAGATTGTATCTTACTCGGCTTAAACCCAGAGGTTGCAAGGCCAGAGTGGAT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 TCCAGATGAAGATTGTATCTTACTCGGCTTAAACCCAGAGGTTGCAAGGCCAGAGTGGAT 720 Query 721 GGTTCTCACCGTTTTGCCAGTTCCACCAGTAACTGTAAGGCCATCAATTACCTTGGAAAC 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GGTTCTCACCGTTTTGCCAGTTCCACCAGTAACTGTAAGGCCATCAATTACCTTGGAAAC 780 Query 781 TGGAGAGAGAAGTGAAGACGATTTAACTCACAAGTTAGTTGATATCATCAGAATCAACAA 840 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TGGAGAGAGAAGTGAAGACGATTTAACCCACAAGTTAGTTGATATCATCAGAATCAACAA 840 Query 841 TAGATTAGAGGAGAATATAGAAGGAGGAGCACCAAACTTAATTATTGAGGATTTATGGAA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 TAGATTAGAGGAGAATATAGAAGGAGGAGCACCAAACTTAATTATTGAGGATTTATGGAA 900 Query 901 TCTGTTGCAGTATCACGTAAATACCTACTTCGATAACGAAGCTCCAGGTATTCCACCAGC 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 TCTGTTGCAGTATCACGTAAATACCTACTTCGATAACGAAGCTCCAGGTATTCCACCAGC 960 Query 961 TAAGCACAGAAGTGGAAGACCATTAAAAACCTTAGCTCAG 1000 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 961 TAAGCACAGAAGTGGAAGAC-ATTAAAAACCTTAGCTCAG 999 Query= ERCC-00148_genbank |114975574|gb|DQ883642.2| Synthetic construct clone NISTag1 external RNA control sequence Length=500 Subject= ERCC-00148 Length=494 Score = 913 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 494/494 (100%), Gaps = 0/494 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CATCTCCATTTGGTCACGTTTACAACCGGAGTAGACGGCCATAGCAGGAGGGGTGTGCGA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CATCTCCATTTGGTCACGTTTACAACCGGAGTAGACGGCCATAGCAGGAGGGGTGTGCGA 60 Query 61 CAGGCAGGAAGCTCTCGCGGGGTCCAAGCATTGCTGCAATGGGCGTCCTTGCTCGATGTT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CAGGCAGGAAGCTCTCGCGGGGTCCAAGCATTGCTGCAATGGGCGTCCTTGCTCGATGTT 120 Query 121 GACCCGAAGCTCTAACTGCATTTCAAGTCCGAATCTCTAGATATCTCGAGAGCCAATGGT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GACCCGAAGCTCTAACTGCATTTCAAGTCCGAATCTCTAGATATCTCGAGAGCCAATGGT 180 Query 181 TAAGGAAGGGGCGTCAATTTTGCGCGGACACGCTGCAGGATGTAATGATTAAGCCGTAGT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TAAGGAAGGGGCGTCAATTTTGCGCGGACACGCTGCAGGATGTAATGATTAAGCCGTAGT 240 Query 241 TGAATTTATGGAGCGGTGCCCCGGGAAAGGTATAAATCGGAGGCAGGGGTTTACGGCGTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TGAATTTATGGAGCGGTGCCCCGGGAAAGGTATAAATCGGAGGCAGGGGTTTACGGCGTC 300 Query 301 AGGATAGTTCATAGCGTACGCAGAACGAGAACAAGTGAGACGTGTATAGTTGCCATGCTG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 AGGATAGTTCATAGCGTACGCAGAACGAGAACAAGTGAGACGTGTATAGTTGCCATGCTG 360 Query 361 AGTAGACCTGGCGTCTACCCCTCCAAACGCATTCTTATTGGCAAATGGAAGTAGCTTCCA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 AGTAGACCTGGCGTCTACCCCTCCAAACGCATTCTTATTGGCAAATGGAAGTAGCTTCCA 420 Query 421 CAGTTTGTAACAAGCCGTGCCTGCGCATGTTATTTACCAATGGAGAATCGaaaaaaaaaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CAGTTTGTAACAAGCCGTGCCTGCGCATGTTATTTACCAATGGAGAATCGAAAAAAAAAA 480 Query 481 aaaaaaaaaaaaaa 494 |||||||||||||| Sbjct 481 AAAAAAAAAAAAAA 494 Query= ERCC-00150_genbank |114976669|gb|DQ883659.2| Synthetic construct clone NISTag18 external RNA control sequence Length=750 Subject= ERCC-00150 Length=743 Score = 1373 bits (743), Expect = 0.0 Identities = 743/743 (100%), Gaps = 0/743 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 AGCTTGATGTGACATCACGTCCCAATCAATTTGGTTTTACTCCCCTCGATTATGCGGAGT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 AGCTTGATGTGACATCACGTCCCAATCAATTTGGTTTTACTCCCCTCGATTATGCGGAGT 60 Query 61 TATCAGTAAGAGCGGGTACCGTTCTGCTGAATGCACTATGAGGGCGACCCTTGATCTTCA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TATCAGTAAGAGCGGGTACCGTTCTGCTGAATGCACTATGAGGGCGACCCTTGATCTTCA 120 Query 121 TTCGTTCCATAGATGCAAATACCCGGGTACTAGTTGGCGAAGTTTGGCTAAAGATTGCCC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TTCGTTCCATAGATGCAAATACCCGGGTACTAGTTGGCGAAGTTTGGCTAAAGATTGCCC 180 Query 181 ACTTACTAGGTGACTGTTAACTAGAAAGTTGCATGAGGCTGGTAAGTGAGGGGCTCAGTG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ACTTACTAGGTGACTGTTAACTAGAAAGTTGCATGAGGCTGGTAAGTGAGGGGCTCAGTG 240 Query 241 AAACAGGATACACCGTACCGTGACGATTCCCGTGTGGGCTTGACATTCAGCCAGCCTCCC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 AAACAGGATACACCGTACCGTGACGATTCCCGTGTGGGCTTGACATTCAGCCAGCCTCCC 300 Query 301 GCTTGTACAGAGGCAGACTGTCCGATGCCTAGTATGTTCACTATACGATTTCTTGGGCTA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GCTTGTACAGAGGCAGACTGTCCGATGCCTAGTATGTTCACTATACGATTTCTTGGGCTA 360 Query 361 GCTAGGTGTCTTGACCCCATATTCCAAAGATCCGAACCTGCTTGTACTTATCAGTACGAG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GCTAGGTGTCTTGACCCCATATTCCAAAGATCCGAACCTGCTTGTACTTATCAGTACGAG 420 Query 421 TTGATGCTCTTGGGGTACCTATTTTTTGATCCGATAGTATTGGTTCTGGCGTGTTCTCGT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TTGATGCTCTTGGGGTACCTATTTTTTGATCCGATAGTATTGGTTCTGGCGTGTTCTCGT 480 Query 481 AACCCCGGGCACTAGATTATGGTGAATGGTGTGTACACACTACTTGACGGGGCGTTACCA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 AACCCCGGGCACTAGATTATGGTGAATGGTGTGTACACACTACTTGACGGGGCGTTACCA 540 Query 541 TTTTCAGGTGGGCACAAATAGCTAAAGCCTCGTCCGCATTACGCCCCATGGCTCACGTCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TTTTCAGGTGGGCACAAATAGCTAAAGCCTCGTCCGCATTACGCCCCATGGCTCACGTCT 600 Query 601 CAGAGGAGGCTAGCTCGAGGTCACCCATAAGGGATTACGGAGTTACACCCATAGTAACAG 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 CAGAGGAGGCTAGCTCGAGGTCACCCATAAGGGATTACGGAGTTACACCCATAGTAACAG 660 Query 661 ACGGAAATTGTTGATAACAGATAGTTAATACGCCTTGGCTGAGGAGACCAACGGACTTCa 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 ACGGAAATTGTTGATAACAGATAGTTAATACGCCTTGGCTGAGGAGACCAACGGACTTCA 720 Query 721 aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 743 ||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 743 Query= ERCC-00154_genbank |110586143|gb|DQ854997.1| Synthetic construct clone AG009.0011 external RNA control sequence Length=512 Subject= ERCC-00154 Length=537 Score = 931 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 508/510 (99%), Gaps = 0/510 (0%) Strand=Plus/Plus Query 3 CTAGATCAGAAGTCTCCCACTCGAGACTAATCTTGGACTATCTATGAGCACCTATTGCGC 62 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4 CTAGATCAGAAGTCTCCCACTCGAGACTAATCTTGGACTATCTATGAGCACCTATTGCGC 63 Query 63 TGTGGAAGATTGCCCCTAGGTCTCTGGCGGCTCCGATTGCGGGATGAACTGGTTGGTCCG 122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 64 TGTGGAAGATTGCCCCTAGGTCTCTGGCGGCTCCGATTGCGGGATGAACTGGTTGGTCCG 123 Query 123 AGGAGGCATATAGGAAACGATGGGCACGCGCTATTCAGACGTTATTTGGTATGGAGTAAG 182 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 124 AGGAGGCATATAGGAAACGATGGGCACGCGCTATTCAGACGTTATTTGGTATGGAGTAAG 183 Query 183 AGGCCGGAAACTGGGCTCGATTGATGGATACTGATCAGTCAACTCAAGCGAGGATATCCA 242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 184 AGGCCGGAAACTGGGCTCGATTGATGGATACTGATCAGTCAACTCAAGCGAGGATATCCA 243 Query 243 TACCCACCGACGGTATGGTCATTAATACCCAGTATTGACTAGTCGGAGGTCTAATTTGGA 302 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 244 TACCCACCGACGGTATGGTCATTAATACCCAGTATTGACTAGTCGGAGGTCTAATTTGGA 303 Query 303 ACGTATTCCGCCGCACACACGAGATTCACTTACATGGACGTGAAGATTGATCGCCGGGCG 362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 304 ACGTATTCCGCCGCACACACGAGATTCACTTACATGGACGTGAAGATTGATCGCCGGGCG 363 Query 363 ACTATTATTGCACGACCTTCGCCTGCCCTCAGCTGCGCCCTTTTTGTCCACGGCGCGGGC 422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct 364 ACTATTATTGCACGACCTTCGCCTGCCCTCAGCTGCGCCCTTTTTGTCCACGACGCAGGC 423 Query 423 TGGACCAAGCAGCCGAGGCTGCGCTCCGGCATCAAAGTCCACGAGTTACAGCCAGCGGGT 482 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 424 TGGACCAAGCAGCCGAGGCTGCGCTCCGGCATCAAAGTCCACGAGTTACAGCCAGCGGGT 483 Query 483 TTTAAGGGGGTATTAGCATCTCGAGTGAGT 512 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 484 TTTAAGGGGGTATTAGCATCTCGAGTGAGT 513 Query= ERCC-00156_genbank |114975588|gb|DQ883643.2| Synthetic construct clone NISTag2 external RNA control sequence Length=500 Subject= ERCC-00156 Length=494 Score = 913 bits (494), Expect = 0.0 Identities = 494/494 (100%), Gaps = 0/494 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CACAAGAATCCCTGCTAGCTGAAGGAGGGTCAAACTATAACACCTTTAGCATTCGTACAG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CACAAGAATCCCTGCTAGCTGAAGGAGGGTCAAACTATAACACCTTTAGCATTCGTACAG 60 Query 61 GCAGGCTAAGTGAATACTAACCCACCGGCAGCCCGTTGTAGTAACGTTGACCCCTGGCTC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GCAGGCTAAGTGAATACTAACCCACCGGCAGCCCGTTGTAGTAACGTTGACCCCTGGCTC 120 Query 121 GGAGACATTTGGTGTTGCCTAGTACTAGGTGACTGGTACCGATTCATAGGTTCGCCATTC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GGAGACATTTGGTGTTGCCTAGTACTAGGTGACTGGTACCGATTCATAGGTTCGCCATTC 180 Query 181 TCTTATCGAGAGCCCGAGGTAGACTATCTTCCAGATGATGCCATACGTTCACTCAATCGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TCTTATCGAGAGCCCGAGGTAGACTATCTTCCAGATGATGCCATACGTTCACTCAATCGC 240 Query 241 GCGGCATGCACGGTGGGGCTACGAACTTGCTATCCATAGGCTCTAGATGTGGTAGAAATA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GCGGCATGCACGGTGGGGCTACGAACTTGCTATCCATAGGCTCTAGATGTGGTAGAAATA 300 Query 301 TGCTGCAGGGGTTCTGTCGAATTTGCTCGGCAACCGTGGCCGTGTATGCTTTCATATCCC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TGCTGCAGGGGTTCTGTCGAATTTGCTCGGCAACCGTGGCCGTGTATGCTTTCATATCCC 360 Query 361 GGCGGTGTGATCTAGCCTTCTCGCCATATGAGGGCGCTGAGCATAGACCCAAACCCGACT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GGCGGTGTGATCTAGCCTTCTCGCCATATGAGGGCGCTGAGCATAGACCCAAACCCGACT 420 Query 421 AGTCGAATCTTAGGGTTGTATGCTAGAACGGCATGGTATAAGCCGTGCTCaaaaaaaaaa 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 AGTCGAATCTTAGGGTTGTATGCTAGAACGGCATGGTATAAGCCGTGCTCAAAAAAAAAA 480 Query 481 aaaaaaaaaaaaaa 494 |||||||||||||| Sbjct 481 AAAAAAAAAAAAAA 494 Query= ERCC-00157_genbank |110586151|gb|DQ839618.1| Synthetic construct clone AG090.1111 external RNA control sequence Length=995 Subject= ERCC-00157 Length=1019 Score = 1821 bits (986), Expect = 0.0 Identities = 992/995 (99%), Gaps = 0/995 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGTCTTTGTCACCTCCGTCAATTTGTATTAGAACCCGTGAAGGCCCAAGTAACAGGCCCA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GGTCTTTGTCACCTCCGTCAATTTGTATTAGAACCCGTGAAGGCCCAAGTAACAGGCCCA 60 Query 61 GGGTTAACATGTACGGAACATACTCCTTCCACGGAAGATTGGGGATGAAAGTTGATACCC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GGGTTAACATGTACGGAACATACTCCTTCCACGGAAGATTGGGGATGAAAGTTGATACCC 120 Query 121 AAACTTCATTAACACAAAGGCGATGTGGGCCGAGTACTGTGCTTACACCAACAGGGCGGC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AAACTTCATTAACACAAAGGCGATGTGGGCCGAGTACTGTGCTTACACCAACAGGGCGGC 180 Query 181 TCAACTGGGTTGGTAGCCAGCACTAGCTTATTCACAATTAAGGCCGTATGCATTCTACTG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TCAACTGGGTTGGTAGCCAGCACTAGCTTATTCACAATTAAGGCCGTATGCATTCTACTG 240 Query 241 CTTATCCGGTGGTGATTGCAGCCAGGGCGGAAGTGAACACGCTTGTACGATGTGTTTGCA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CTTATCCGGTGGTGATTGCAGCCAGGGCGGAAGTGAACACGCTTGTACGATGTGTTTGCA 300 Query 301 TAAGCGGTTACCACAGGCGCTACTCTCGTCGATAGCCGACTACTAATATTCAGCCGGCGC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TAAGCGGTTACCACAGGCGCTACTCTCGTCGATAGCCGACTACTAATATTCAGCCGGCGC 360 Query 361 CGGTAGATAGCGAGGCTTTGGGGGTAGCTTTAAGTGCGGTCTAGGCTCAGTTGACGATAC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CGGTAGATAGCGAGGCTTTGGGGGTAGCTTTAAGTGCGGTCTAGGCTCAGTTGACGATAC 420 Query 421 TTACTTAGGCAGGGTTACAACCCTTATGATGGGGTATGAGGCACGTGGCCATTCATCCGG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TTACTTAGGCAGGGTTACAACCCTTATGATGGGGTATGAGGCACGTGGCCATTCATCCGG 480 Query 481 ACCCGATGCTGTCGTGCTTCTCGTTGGCAATAGCGCGGATTAGTACAGGTGACTAGTTCA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 ACCCGATGCTGTCGTGCTTCTCGTTGGCAATAGCGCGGATTAGTACAGGTGACTAGTTCA 540 Query 541 GCTGTTGTTCGGATTCCAAGTAAGCTCGCATAGAGCTGGACTTCTCGGAACGGTCCTGAC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GCTGTTGTTCGGATTCCAAGTAAGCTCGCATAGAGCTGGACTTCTCGGAACGGTCCTGAC 600 Query 601 GCATTCCTGCATCAATACGCGGCACCGGGGGTCCGATAGCATCTCGCCTTAGATCCGGCG 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GCATTCCTGCATCAATACGCGGCACCGGGGGTCCGATAGCATCTCGCCTTAGATCCGGCG 660 Query 661 GGGGATACTTGGTCAAAGCTCACTACGGGACTAGAGTGGCTAGTGCAGATGCGCAGCGCA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 GGGGATACTTGGTCAAAGCTCACTACGGGACTAGAGTGGCTAGTGCAGATGCGCAGCGCA 720 Query 721 GATATGCTATACGAGATGAGCTTCAAATTCATGGAGTTATGACGATATAACGCTAGGATC 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GATATGCTATACGAGATGAGCTTCAAATTCATGGAGTTATGACGATATAACGCTAGGATC 780 Query 781 TGACGCGGTGACACCGGTCGTGTGACAACTGGGCTTTAAGTGAGGCATCAGAAGTATACT 840 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TGACGCAGTGACACCGGTCGTGTGACAACTGGGCTTTAAGTGAGGCATCAGAAGTATACT 840 Query 841 TTTAATGGTGCCGCTCCCAAATCCCCGATCTTGCCACGATTGCCTAAGCCGTCATGTTAG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 TTTAATGGTGCCGCTCCCAAATCCCCGATCTTGCCACGATTGCCTAAGCCGTCATGTTAG 900 Query 901 AGGCGGTCACAGCAAACCCCCACTTTACCGGTTCGATGATTATACGATGCCGGAGCGAAC 960 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 AGGCGGTCACAGCAAACCCTCAGTTTACCGGTTCGATGATTATACGATGCCGGAGCGAAC 960 Query 961 GACTACGCTCGAAGTTTGGTTATCTAGAGCACGTC 995 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 GACTACGCTCGAAGTTTGGTTATCTAGAGCACGTC 995 Query= ERCC-00158_genbank |103488742|gb|DQ516795.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-78 genomic sequence Length=1000 Subject= ERCC-00158 Length=1027 Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0 Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TTTCAACAGATCATGGAACTACGGGAGAAATAAACATTTGGATAGAAAATGTAACATTTA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 7 TTTCAACAGATCATGGAACTACGGGAGAAATAAACATTTGGATAGAAAATGTAACATTTA 66 Query 61 AAAATGATGCAAAATCATATTCCTTTAATTTAACGAATCTTAATATATGGGCAGTAAATA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 67 AAAATGATGCAAAATCATATTCCTTTAATTTAACGAATCTTAATATATGGGCAGTAAATA 126 Query 121 AATCTGCTTATGAGTTGTATTGGAATCCATTTAACAAATCTATCTGGATAGATGGGAGTA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 127 AATCTGCTTATGAGTTGTATTGGAATCCATTTAACAAATCTATCTGGATAGATGGGAGTA 186 Query 181 ATTACACTATAACTCCAAATATTGACATACCTCCAGGAGAAGTATGGAACTCTAAAACCT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 187 ATTACACTATAACTCCAAATATTGACATACCTCCAGGAGAAGTATGGAACTCTAAAACCT 246 Query 241 ACAACTTCACATTTAGTGGAGTTCCAATCGTTTGGGCAAACTGCTCATTTACACTGTCaa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 247 ACAACTTCACATTTAGTGGAGTTCCAATCGTTTGGGCAAACTGCTCATTTACACTGTCAA 306 Query 301 aaaaaGATTATATCCTTTTAAATGAAGTAAGTCAAATAGGAAGTTCCTATGTTGTTGTTG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 307 AAAAAGATTATATCCTTTTAAATGAAGTAAGTCAAATAGGAAGTTCCTATGTTGTTGTTG 366 Query 361 AGGAGATTTATGTTGTGGGTAGTTATTTGATTAAGGTGACTAAGCATATTGTTCCGGATG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 367 AGGAGATTTATGTTGTGGGTAGTTATTTGATTAAGGTGACTAAGCATATTGTTCCGGATG 426 Query 421 CGGATGGGACTTATGATATTTATATAGTTGTGGAGAATATTGGTAGTGTGAAGACTCCTG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 427 CGGATGGGACTTATGATATTTATATAGTTGTGGAGAATATTGGTAGTGTGAAGACTCCTG 486 Query 481 AGTATGTGTATGTTTATGATTTGATTCCTAAGAACTTCACCGTCTCAGATGAGTGGGTTA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 487 AGTATGTGTATGTTTATGATTTGATTCCTAAGAACTTCACCGTCTCAGATGAGTGGGTTA 546 Query 541 ATCAATCAAGTATGTTGATTGCTGAAGGAAATCACACCATTACAACAAATCCAAGGTATA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 547 ATCAATCAAGTATGTTGATTGCTGAAGGAAATCACACCATTACAACAAATCCAAGGTATA 606 Query 601 ATTTAAGCATGTGGTGGGCGTTACATGCAATATATCCAGGAGCAGATGGGGACGGTAACT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 607 ATTTAAGCATGTGGTGGGCGTTACATGCAATATATCCAGGAGCAGATGGGGACGGTAACT 666 Query 661 GGAACGACACTGCTGAAATACTTGCAAATAAAACAGTAGTCATACACTACAAACTAAACG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 667 GGAACGACACTGCTGAAATACTTGCAAATAAAACAGTAGTCATACACTACAAACTAAACG 726 Query 721 GAACTGGCGAATTCTACCCAAGCGACGCATTTATCGTTGGTATCGACCCTACAAACTCAC 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 727 GAACTGGCGAATTCTACCCAAGCGACGCATTTATCGTTGGTATCGACCCTACAAACTCAC 786 Query 781 TACTACCAACAACCTCACCAAAAATAACAACAGTAGCCGGAACAGTAGAAAACAACTTTG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 787 TACTACCAACAACCTCACCAAAAATAACAACAGTAGCCGGAACAGTAGAAAACAACTTTG 846 Query 841 AGATATTTTTAATACTGATAAACGTTATCTTTGGATTAGGTATATTAACAAAGAGGAATA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 847 AGATATTTTTAATACTGATAAACGTTATCTTTGGATTAGGTATATTAACAAAGAGGAATA 906 Query 901 TAAGGAATAATAAATAAAGTTGGGGGATGATGATGAAGAGATTTGCATTACTCTTTATTT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 907 TAAGGAATAATAAATAAAGTTGGGGGATGATGATGAAGAGATTTGCATTACTCTTTATTT 966 Query 961 TCCTTGCATTTATAACACCAACTTTTGCAGATGTTGAGGA 1000 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 967 TCCTTGCATTTATAACACCA-CTTTTGCAGATGTTGAGGA 1005 Query= ERCC-00160_genbank |114976664|gb|DQ883658.2| Synthetic construct clone NISTag17 external RNA control sequence Length=750 Subject= ERCC-00160 Length=743 Score = 1367 bits (740), Expect = 0.0 Identities = 743/744 (99%), Gaps = 1/744 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TCCTTGGTTTGAAATCAAATTACTATAGATTGCATGCAGAAGTAGGGCTTTACAAGTTTG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TCCTTGGTTTGAAATCAAATTACTATAGATTGCATGCAGAAGTAGGGCTTTACAAGTTTG 60 Query 61 TTCCTAATTCCGTTGAACAATAGCGAATGTATGATGGTCGGTCATTGCCGCAACCCTGAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TTCCTAATTCCGTTGAACAATAGCGAATGTATGATGGTCGGTCATTGCCGCAACCCTGAA 120 Query 121 GCAGTGAGCGTGGTTGAGTAACCACGTACTAGAAGTCCAAGGATGGTTGCAGTAGCTAGC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GCAGTGAGCGTGGTTGAGTAACCACGTACTAGAAGTCCAAGGATGGTTGCAGTAGCTAGC 180 Query 181 TCAATTGCCATTGCTGGAATAGTGTCGGTAAACCACGCACCGGGGAGCCGCGTTTCGTTG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TCAATTGCCATTGCTGGAATAGTGTCGGTAAACCACGCACCGGGGAGCCGCGTTTCGTTG 240 Query 241 CGATAACCTCATATAGTCCCAGTCTCGGACGCGAGCACCTGCAGCGTAATTAATAAGGTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CGATAACCTCATATAGTCCCAGTCTCGGACGCGAGCACCTGCAGCGTAATTAATAAGGTC 300 Query 301 AGGCTATGATTCACCACCGTGTAGGAGTTATGCGCCTTATCGCGAAGGTAGTTACTCTTG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 AGGCTATGATTCACCACCGTGTAGGAGTTATGCGCCTTATCGCGAAGGTAGTTACTCTTG 360 Query 361 CCAGTGGGCATGAAATTGCGAGCTTGCCCTAGTAGCGTTAGTACCGTCATAAGCCACTCT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CCAGTGGGCATGAAATTGCGAGCTTGCCCTAGTAGCGTTAGTACCGTCATAAGCCACTCT 420 Query 421 AAGAGATCGAAATTTTATACAGTAGTACTAACCAGCAGACCTGCAATATCAAAGTTATAA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 AAGAGATCGAAATTTTATACAGTAGTACTAAC-AGCAGACCTGCAATATCAAAGTTATAA 479 Query 481 GCGCGTCGACACGCCTCGTCTAAGAAAAACTACTTCCATTAAAGTTCGAGGACAAATGCG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 GCGCGTCGACACGCCTCGTCTAAGAAAAACTACTTCCATTAAAGTTCGAGGACAAATGCG 539 Query 541 GTCTGATTCAGTCCTATAGCGAGGCCATTGCAGTGTGGTCTGCCGTGGTCGGCTCGATAA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 GTCTGATTCAGTCCTATAGCGAGGCCATTGCAGTGTGGTCTGCCGTGGTCGGCTCGATAA 599 Query 601 TACCATGATAACTACTGACTGCGCAGTTGTAGCGACCGCAATGGGGAGTGTGTGTTCTTT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 TACCATGATAACTACTGACTGCGCAGTTGTAGCGACCGCAATGGGGAGTGTGTGTTCTTT 659 Query 661 ATTTCAACTGCGTGGCTTATCCTACTTAGGAGTTGTGGATACCAGATTATCTCGCGGTGG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 ATTTCAACTGCGTGGCTTATCCTACTTAGGAGTTGTGGATACCAGATTATCTCGCGGTGG 719 Query 721 aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 744 |||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 743 Query= ERCC-00162_genbank |103488697|gb|DQ516750.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-500-33 genomic sequence Length=500 Subject= ERCC-00162 Length=523 Score = 917 bits (496), Expect = 0.0 Identities = 499/500 (99%), Gaps = 1/500 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CTCCACAGATTCCCATGTGTCCAATTCTGAATATCTTTCCAGCTAAGTGCTTCTGCCCAC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CTCCACAGATTCCCATGTGTCCAATTCTGAATATCTTTCCAGCTAAGTGCTTCTGCCCAC 60 Query 61 CAGCAACAACTATGTTGTATTTGTTGCTTAATATACCTCTAAATTTGCTATCTTCAATGC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CAGCAACAACTATGTTGTATTTGTTGCTTAATATACCTCTAAATTTGCTATCTTCAATGC 120 Query 121 CTTCTGGATATTTTGCTGATGTAACTGTTACTGACCTTGCCCTCTCCTTGGCAAACAACT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CTTCTGGATATTTTGCTGATGTAACTGTTACTGACCTTGCCCTCTCCTTGGCAAACAACT 180 Query 181 CTATTCCCATTGCCTCCAAACCAGCCCTTGTTGCTTTTGCTAATCTCTCATGTCTTTTAA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CTATTCCCATTGCCTCCAAACCAGCCCTTGTTGCTTTTGCTAATCTCTCATGTCTTTTAA 240 Query 241 CCCTATTCTCGATTCCTTCCTCTAAAACTAAATCTAATGCAACATTTAAGGCATAGGTTA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CCCTATTCTCGATTCCTTCCTCTAAAACTAAATCTAATGCAACATTTAAGGCATAGGTTA 300 Query 301 AATTAACTGATGGTGTGTATGGGGTTTGTTTTTTCTCTTCATAGTATTTTTTATAAGCCA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 AATTAACTGATGGTGTGTATGGGGTTTGTTTTTTCTCTTCATAGTATTTTTTATAAGCCA 360 Query 361 ATAAATCTAAGTAGAAACCAACTTTGTCATCATTCTTCTTAATAACTTCCCATGCCTTTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 ATAAATCTAAGTAGAAACCAACTTTGTCATCATTCTTCTTAATAACTTCCCATGCCTTTT 420 Query 421 CACTGACTGTTATTGCAGCCAATCCTGGTGGAGCTGCCAAACATTTTTGAGAACCAGTAA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CACTGACTGTTATTGCAGCCAATCCTGGTGGAGCTGCCAAACATTTTTGAGAACCAGTAA 480 Query 481 CACAGATATCTATGTGGAAT 500 |||||||||| ||||||||| Sbjct 481 CACAGATATC-ATGTGGAAT 499 Query= ERCC-00163_genbank |110339332|gb|DQ668359.1| Synthetic construct clone TagD microarray control Length=519 Subject= ERCC-00163 Length=543 Score = 942 bits (510), Expect = 0.0 Identities = 516/519 (99%), Gaps = 0/519 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATAGACTAGCCTGCCGGTCAATAACTGATGACGCGGAGTCAACCTGATAACCCATAGCGG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATAGACTAGCCTGCCGGTCAATAACTGATGACGCGGAGTCAACCTGATAACCCATAGCGG 60 Query 61 AACAGTCTAACCTACGCGAGATACGTCTTACCGCACATAGGTAACCTATTCGTGACTAGC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AACAGTCTAACCTACGCGAGATACGTCTTACCGCACATAGGTAACCTATTCGTGACTAGC 120 Query 121 AGGCCTTATTCCGGTGCTATGAGTATCTTACCTGGTCTAGGTATCTAATTCGTGAGTCGG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 121 AGGCCTTATTCCGGTGCTATGAGTATCTTACCTGGTCTAGGTATCTAATTCGTGGGTCGG 180 Query 181 GTACTACATTCGTGCGATGGGTCCTCGCTTCGTCTATGAGGTCTCGTCTTCGTGAGTGCA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GTACTACATTCGTGCGATGGGTCCTCGCTTCGTCTATGAGGTCTCGTCTTCGTGAGTGCA 240 Query 241 ATGTATCCGAAGTCGTAGTGATAATATGGAACTAGGCGCGATTTGACGAACGTATGCCGC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 ATGTATCCGAAGTCGTAGTGATAATATGGAACTAGGCGCGATTTGACGAACGTATGCCGC 300 Query 301 ATATTCGGAACGTCGCCTGGAAATTCGCCACCTAGATCGAAATTATCGGAACTCGTCGCT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATATTCGGAACGTCGCCTGGAAATTCGCCACCTAGATCGAAATTATCGGAACTCGTCGCT 360 Query 361 TATTTACGAACCTTGGGAGCCGTTCCTAAAGCTGAGTCTGGTTTCTTATTAGCGAGGAGC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TATTTACGAACCTTGGGAGCCGTTCCTAAAGCTGAGTCTGGTTTCTTATTAGCGAGGAGC 420 Query 421 ATTTCGTGAATACTGAGCCGAATATCGTAAGACATCCGCGAGCGACTGTAAACTAATCGG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 ATTTCGTGAATACTGAGCCGAATATCGTAAGACACCCGCGAGCGACTGTAAACTAATCGG 480 Query 481 GGAACTTATTATAGAGCCGGTCCAGGTCTTGAACGACGT 519 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GGAACTTATTATAGGGCCGGTCCAGGTCTTGAACGACGT 519 Query= ERCC-00164_genbank |103488726|gb|DQ516779.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-62 genomic sequence Length=1000 Subject= ERCC-00164 Length=1022 Score = 1812 bits (981), Expect = 0.0 Identities = 994/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 AGGAGCTCCAGTAGTTTTCCCCTCAAAAATTCCTGATAAGATTTCAACTTTATCCTCTTC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 AGGAGCTCCAGTAGTTTTCCCCTCAAAAATTCCTGATAAGATTTCAACTTTATCCTCTTC 60 Query 61 TTTTCTTGGTGTTGAGAAGATGCTCTGCCCTGGTCTTCTCCTGTCAAGCTCTTTTTGGAT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TTTTCTTGGTGTTGAGAAGATGCTCTGCCCTGGTCTTCTCCTGTCAAGCTCTTTTTGGAT 120 Query 121 ATCCTCTTCAGATAAAGGCAGATTAGCTGGACATCCATCAACAACTGCTCCAACAGCCTT 180 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ATCCTCTTCAGATAAAGGCAGATTAGTTGGACATCCATCAACAACTGCTCCAACAGCCTT 180 Query 181 TCCATGACTTTCTCCAAAAACTGTAACTCTAAACATATCCCCATAGGTGTTCATTAATGT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TCCATGACTTTCTCCAAAAACTGTAACTCTAAACATATCCCCATAGGTGTTCATTAATGT 240 Query 241 CACCaaaaatttttaattgcttagttttacatttaaaataaaaattaaaatagtcaaaaa 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CACCAAAAATTTTTAATTGCTTAGTTTTACATTTAAAATAAAAATTAAAATAGTCAAAAA 300 Query 301 ataaaaaaGGTTTATCTGTAGAGAACATCCAAGTGTGCTGGTTCCTTAACTTTAACTTTC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATAAAAAAGGTTTATCTGTAGAGAACATCCAAGTGTGCTGGTTCCTTAACTTTAACTTTC 360 Query 361 TTTTTCTCCATAATCTTCTCAACTGCCTTTCTAAAGTCATCCATTGTTACATAGTCCCTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TTTTTCTCCATAATCTTCTCAACTGCCTTTCTAAAGTCATCCATTGTTACATAGTCCCTT 420 Query 421 AACTCCCTAATTGCATTCATCCCTGCCTCTGTGCAGATTGCCTTTAACTCAGCCCCTACA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 AACTCCCTAATTGCATTCATCCCTGCCTCTGTGCAGATTGCCTTTAACTCAGCCCCTACA 480 Query 481 CATCCTTCAGTCATCTTAGCTATTTCTTCTAAATTGACATCTTCCGCTAAATTCATCTTT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 CATCCTTCAGTCATCTTAGCTATTTCTTCTAAATTGACATCTTCCGCTAAATTCATCTTT 540 Query 541 CTTGTATGAATCTTCAATATCTCCAATCTACCCTTCTCATCAGGAGCTGGGACTTCTATG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CTTGTATGAATCTTCAATATCTCCAATCTACCCTTCTCATCAGGAGCTGGGACTTCTATG 600 Query 601 ATTCTATCAAATCTTCCAGGTCTTAATATTGCAGGGTCTAAAATGTCAGGTCTGTTTGTG 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | Sbjct 601 ATTCTATCAAATCTTCCAGGTCTTAATATTGCAGGGTCTAAAATGTCAGGCCTGTTTGCG 660 Query 661 GCCCCAATTATCTTAACATCTCCCCTTGCATCGAATCCATCCATCTCTGCCAACAACTGC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 GCCCCAATTATCTTAACATCTCCCCTTGCATCGAATCCATCCATCTCTGCCAACAACTGC 720 Query 721 ATTAATGTTCTCTGAACTTCCCTATCTCCACCAGTTAAAGCGTCTGTTCTCTTTGCTGCA 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 ATTAATGTTCTCTGAACTTCCCTATCTCCACCAGTTAAAGCGTCTGTTCTCTTTGCTGCA 780 Query 781 ATAGCATCAATCTCATCTATGAATATGATTGAAGGAGCTTTTTCTTTAGCCAATTTGAAT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 ATAGCATCAATCTCATCTATGAATATGATTGAAGGAGCTTTTTCTTTAGCCAATTTGAAT 840 Query 841 ATATCTTTAACTAACGAAGCCCCCTCTCCAATAAACTTCTTAACCAATTCAGAACCAACA 900 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 ATATCTTTAACTAACGGAGCCCCCTCTCCAATAAACTTCTTAACCAATTCAGAACCAACA 900 Query 901 ACTCTTATAAAGGTAGCATTTGTTTCTGTAGCAACAGCTTTAGCTAATAATGTCTTTCCA 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 ACTCTTATAAAGGTAGCATTTGTTTCTGTAGCAACAGCTTTAGCTAATAATGTCTTTCCA 960 Query 961 GTTCCTGGTGGTCCGTAAAGCAGAATACCTTTTGGTGGTT 1000 ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 961 GTTCCTGGTGGCCCGTAAAG-AGAATACCTTTTGGTGGTT 999 Query= ERCC-00165_genbank |110339336|gb|DQ668363.1| Synthetic construct clone TagH microarray control Length=848 Subject= ERCC-00165 Length=872 Score = 1567 bits (848), Expect = 0.0 Identities = 848/848 (100%), Gaps = 0/848 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GATATGCGTTACGTGAGTCTGATAGCAGTTCACTACCTGGATATCTGATCCACTAGCTCG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GATATGCGTTACGTGAGTCTGATAGCAGTTCACTACCTGGATATCTGATCCACTAGCTCG 60 Query 61 ATCATGCTCACCCATAGTTTATCTGCATCACTCGTACTGAAATGCTCACATCGCAGGTAG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 ATCATGCTCACCCATAGTTTATCTGCATCACTCGTACTGAAATGCTCACATCGCAGGTAG 120 Query 121 AGCAGCATCGTAGAGCGTCAAGCTGCATCCTAGCGTCATGAGTCATAGTACCTCATGCTC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 AGCAGCATCGTAGAGCGTCAAGCTGCATCCTAGCGTCATGAGTCATAGTACCTCATGCTC 180 Query 181 ACGTGATCTACCCTAGCTGACCGCTAATGACGGCAGTGCAACCTGAGATACCGACGGCAT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ACGTGATCTACCCTAGCTGACCGCTAATGACGGCAGTGCAACCTGAGATACCGACGGCAT 240 Query 241 ACTGTCGTCAACGTCAGGCAATGTGTCCGAACGGCGAGCTACGTCGCCTCACGGAGTAAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 ACTGTCGTCAACGTCAGGCAATGTGTCCGAACGGCGAGCTACGTCGCCTCACGGAGTAAT 300 Query 301 CGCGTCCCTCTAGGTATAGTGCCGTCGGTTCAGGTCATATGTCGCGGGTTCTGCACATAT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CGCGTCCCTCTAGGTATAGTGCCGTCGGTTCAGGTCATATGTCGCGGGTTCTGCACATAT 360 Query 361 CACGGACGTATCGCTATCAGACGGACGCTCTCGGACCTAAACCGTAGCTCTCGGCAAGAT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CACGGACGTATCGCTATCAGACGGACGCTCTCGGACCTAAACCGTAGCTCTCGGCAAGAT 420 Query 421 CGTCCTCGTCTCGAATATAGCGCCCTAGTGCTGCAAATGTCACCGCTATCTCGTAAGGGG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CGTCCTCGTCTCGAATATAGCGCCCTAGTGCTGCAAATGTCACCGCTATCTCGTAAGGGG 480 Query 481 TCCGTCTGTTGAGTTAGGCCTCCTCTCGTTGGATGTGAGCTCGGTTGCTTGGATGGTGCA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TCCGTCTGTTGAGTTAGGCCTCCTCTCGTTGGATGTGAGCTCGGTTGCTTGGATGGTGCA 540 Query 541 GCTTACTTCGCGTACCTGCTGTTTGCATCAGTCCTCTGCATCTATAATCGCGTATCTCTC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GCTTACTTCGCGTACCTGCTGTTTGCATCAGTCCTCTGCATCTATAATCGCGTATCTCTC 600 Query 601 TCTAGTAGACCATATAGCCATCTAAGCGCTCGATATTCCACCTAAGTGGCGCCTATTGAA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TCTAGTAGACCATATAGCCATCTAAGCGCTCGATATTCCACCTAAGTGGCGCCTATTGAA 660 Query 661 CTAAGTGGCAGCCGAATGGACTATCGCTCCTCGATATGTACGGATAGGCCACGGCATGTA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CTAAGTGGCAGCCGAATGGACTATCGCTCCTCGATATGTACGGATAGGCCACGGCATGTA 720 Query 721 CGAGCATAAGCCGAACTGCACGAGCATACCCGACACTGATCTGAGAGTCGCTTAAATCAT 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 CGAGCATAAGCCGAACTGCACGAGCATACCCGACACTGATCTGAGAGTCGCTTAAATCAT 780 Query 781 CTGCGTGTCTTAGAGCTTATCGCCATGTCTGTCAACTGTACTGTCATCCTGTAACTGTAG 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 CTGCGTGTCTTAGAGCTTATCGCCATGTCTGTCAACTGTACTGTCATCCTGTAACTGTAG 840 Query 841 CGTATGTG 848 |||||||| Sbjct 841 CGTATGTG 848 Query= ERCC-00168_genbank |103488723|gb|DQ516776.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-59 genomic sequence Length=1000 Subject= ERCC-00168 Length=1024 Score = 1825 bits (988), Expect = 0.0 Identities = 997/1001 (99%), Gaps = 2/1001 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 CCAATGAACTCAGCTATTCTTCTTAACAAATAACTTTCTCCAGAAAATTCAAATGTATCA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CCAATGAACTCAGCTATTCTTCTTAACAAATAACTTTCTCCAGAAAATTCAAATGTATCA 60 Query 61 TCTTCAGGATTCCACCTAAAAACATCATGTAATATAATATCATCAATTTTTGGGTCGTAT 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TCTTCAGGATTCCACCTAAAAACATCATGTAATATAATATCATCAATTTTTGGGTCGTAT 120 Query 121 TCAACAATCTCAGTTATACTCTTAGTTCTTCTAACAAATCTTCCTTTATAAATCAATCTA 180 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TCAACAATCTCAGTTATACTCTCAGTTCTTCTAACAAATCTTCCTTTATAAATCAATCTA 180 Query 181 ACCTGCATACATATGGCATTTAGTTGTTCAAGCATAATCTTTGGAATGTTCATTGGTTCA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ACCTGCATACATATGGCATTTAGTTGTTCAAGCATAATCTTTGGAATGTTCATTGGTTCA 240 Query 241 GCATTCAACCTCCTTATAACTGCCTCTGGGGATTTTGCGTGTATCGTTGATAACGCCAAA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 GCATTCAACCTCCTTATAACTGCCTCTGGGGATTTTGCGTGTATCGTTGATAACGCCAAA 300 Query 301 TGTCCTGTAGTTATTGCTTGAAATAATATCTTCGCCTCCTCACCTCTAACCTCTCCAACA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TGTCCTGTAGTTATTGCTTGAAATAATATCTTCGCCTCCTCACCTCTAACCTCTCCAACA 360 Query 361 ATTAAATAATCTGGTCTTTGCCTTAAAGCCGCTTTTAATAAATCCATCATAGTTATTTCA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 ATTAAATAATCTGGTCTTTGCCTTAAAGCCGCTTTTAATAAATCCATCATAGTTATTTCA 420 Query 421 TATTCTTCTCCACCGAATCCACTTCTTGTAGTTCCAGCAATCCAGTTTTCATGATACAAC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TATTCTTCTCCACCGAATCCACTTCTTGTAGTTCCAGCAATCCAGTTTTCATGATACAAC 480 Query 481 CTAATTTCTGGAGTATCCTCAATAGATACGATTTTCATTTGAGGAGGGATGAAAAGAGAG 540 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 481 CTAATTTCTGGAGTATCCTCAATAGATACGATTTTCATTTGAGGAAGGATGAAAAGAGAG 540 Query 541 AATGCATTTAAAAGGGTGGTTTTTCCAGTAGCTACCTCTCCAGCAACCATAATAGAATTT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 AATGCATTTAAAAGGGTGGTTTTTCCAGTAGCTACCTCTCCAGCAACCATAATAGAATTT 600 Query 601 TTATATTCAATGAGTAACCAAAGATATGCAAGCATCTCTGGAGAAATACTCCCATATCTT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 TTATATTCAATGAGTAACCAAAGATATGCAAGCATCTCTGGAGAAATACTCCCATATCTT 660 Query 661 ATTAAATCTGTTGGCAATATAGGAGTGTGTGTGAATTTTCTTATTGTAAATGTTGAACCA 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 ATTAAATCTGTTGGCAATATAGGAGTGTGTGTGAATTTTCTTATTGTAAATGTTGAACCA 720 Query 721 TATCT-GAGATATCCCTTCCAAGGGTTACATTTAGCCTGCTACCATCTGGGAGAGAACCA 779 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 TATCTTGAGATATCCCTTCCAAGGGTTACATTTAGCCTGCTACCATCTGGGAGAGAACCA 780 Query 780 TCCACTATTGGATTAGCCAATGTTAAAGATTTTCCACACCTTTGGGCTAAGGATATACAA 839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TCCACTATTGGATTAGCCAATGTTAAAGATTTTCCACACCTTTGGGCTAAGGATATACAA 840 Query 840 AACGAGTCTAATTCTTCATCAGTTTCAAATTTTATATTTGTCTTTAAATGTTCGTATTTT 899 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 AACGAGTCTAATTCTTCATCAGTTTCAAATTTTATATTTGTCTTTAAATGTTCGTATTTT 900 Query 900 CTATGAAACACATACACTGGCTTTCCAACACCTGTGCAACTGATATCCTCCAAATTCTCA 959 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CTATGAAACACATACACTGGCTTTCCAACACCTGTGCAACTGATATCCTCCAAATTCTCA 960 Query 960 TCTTTCATAAGAGCATCTATTTTCCCATATCCAATGAGGTA 1000 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 961 TCTTTCATAAGAGCATCTATTT-CCCATATCCAATGAGGTA 1000 Query= ERCC-00170_genbank |103488720|gb|DQ516773.1| Methanocaldococcus jannaschii spike-in control MJ-1000-56 genomic sequence Length=1000 Subject= ERCC-00170 Length=1023 Score = 1840 bits (996), Expect = 0.0 Identities = 999/1000 (99%), Gaps = 1/1000 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TATTGGTGGAGGGGCACAAGTTGCTGAAGTTGCGAGAGGGGCGATAAGTGAGGCAGACAG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TATTGGTGGAGGGGCACAAGTTGCTGAAGTTGCGAGAGGGGCGATAAGTGAGGCAGACAG 60 Query 61 GCATAATATAAGAGGGGAGAGAATTAGCGTAGATACTCTTCCAATAGTTGGTGAAGAAAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GCATAATATAAGAGGGGAGAGAATTAGCGTAGATACTCTTCCAATAGTTGGTGAAGAAAA 120 Query 121 TTTATATGAGGCTGTTAAAGCTGTAGCAACTCTTCCACGAGTAGGAATTTTAGTTTTAGC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TTTATATGAGGCTGTTAAAGCTGTAGCAACTCTTCCACGAGTAGGAATTTTAGTTTTAGC 180 Query 181 TGGCTCTTTAATGGGAGGGAAGATAACTGAAGCAGTTAAAGAATTAAAGGAAAAGACTGG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TGGCTCTTTAATGGGAGGGAAGATAACTGAAGCAGTTAAAGAATTAAAGGAAAAGACTGG 240 Query 241 CATTCCCGTGATAAGCTTAAAGATGTTTGGCTCTGTTCCTAAGGTTGCTGATTTGGTTGT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CATTCCCGTGATAAGCTTAAAGATGTTTGGCTCTGTTCCTAAGGTTGCTGATTTGGTTGT 300 Query 301 TGGAGACCCATTGCAGGCAGGGGTTTTAGCTGTTATGGCTATTGCTGAAACAGCAAAATT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TGGAGACCCATTGCAGGCAGGGGTTTTAGCTGTTATGGCTATTGCTGAAACAGCAAAATT 360 Query 361 TGATATAAATAAGGTTAAAGGTAGGGTGCTATAAAGATAATTTAATAATTTTTGATGAAA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TGATATAAATAAGGTTAAAGGTAGGGTGCTATAAAGATAATTTAATAATTTTTGATGAAA 420 Query 421 CCGAAGCGTTAGCTTTGGGTTATGAAACTCCATGATTTTCATTTAATTTTTTCCTATTAA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CCGAAGCGTTAGCTTTGGGTTATGAAACTCCATGATTTTCATTTAATTTTTTCCTATTAA 480 Query 481 TTTTCTCCTAAAAAGTTTCTTTAACATAAATAAGGTTAAAGGGAGAGCTCTATGATTGTC 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TTTTCTCCTAAAAAGTTTCTTTAACATAAATAAGGTTAAAGGGAGAGCTCTATGATTGTC 540 Query 541 TTCAAAAATACAAAGATTATTGATGTATATACTGGAGAGGTTGTTAAAGGAAATGTTGCA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TTCAAAAATACAAAGATTATTGATGTATATACTGGAGAGGTTGTTAAAGGAAATGTTGCA 600 Query 601 GTTGAGAGGGATAAAATATCCTTTGTGGATTTAAATGATGAAATTGATAAGATAATTGAA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GTTGAGAGGGATAAAATATCCTTTGTGGATTTAAATGATGAAATTGATAAGATAATTGAA 660 Query 661 AAAATAAAGGAGGATGTTAAAGTTATTGACTTAAAAGGAAAATATTTATCTCCAACATTT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 AAAATAAAGGAGGATGTTAAAGTTATTGACTTAAAAGGAAAATATTTATCTCCAACATTT 720 Query 721 ATAGATGGGCATATACATATAGAATCTTCCCATCTCATCCCATCAGAGTTTGAGAAATTT 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 ATAGATGGGCATATACATATAGAATCTTCCCATCTCATCCCATCAGAGTTTGAGAAATTT 780 Query 781 GTATTAAAAAGCGGAGTTAGCAAAGTAGTTATAGACCCGCATGAAATAGCAAATATTGCT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 GTATTAAAAAGCGGAGTTAGCAAAGTAGTTATAGACCCGCATGAAATAGCAAATATTGCT 840 Query 841 GGAAAAGAAGGAATTTTGTTTATGTTGAATGATGCCAAAATTTTAGATGTCTATGTTATG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 GGAAAAGAAGGAATTTTGTTTATGTTGAATGATGCCAAAATTTTAGATGTCTATGTTATG 900 Query 901 CTTCCTTCCTGTGTTCCAGCTACAAACTTAGAAACAAGTGGAGCTGAGATTACAGCAGAG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CTTCCTTCCTGTGTTCCAGCTACAAACTTAGAAACAAGTGGAGCTGAGATTACAGCAGAG 960 Query 961 AATATTGAAGAACTCATTCTTTTAGATAATGTCTTAGGTT 1000 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 961 AATATTGAAGAACTCATTCTTTT-GATAATGTCTTAGGTT 999 Query= ERCC-00171_genbank |110586107|gb|DQ854994.1| Synthetic construct clone AG006.0011 external RNA control sequence Length=506 Subject= ERCC-00171 Length=505 Score = 889 bits (481), Expect = 0.0 Identities = 481/481 (100%), Gaps = 0/481 (0%) Strand=Plus/Plus Query 26 CTGGAGATTGTCTCGTACGGTTAAGAGCCTCCGCCCGTCTCTGGGACTATGGACGGGCAC 85 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CTGGAGATTGTCTCGTACGGTTAAGAGCCTCCGCCCGTCTCTGGGACTATGGACGGGCAC 60 Query 86 GCTCATATCAGGCTATATTTGGTCCGGGTTATTATCGTCGCGGTTACCGTAATACTTCAG 145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GCTCATATCAGGCTATATTTGGTCCGGGTTATTATCGTCGCGGTTACCGTAATACTTCAG 120 Query 146 ATCAGTTAAGTAGGGCCATATGCCTCGGGAATAAGCTGACGGTGACAAGGTTTCCCCCTA 205 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ATCAGTTAAGTAGGGCCATATGCCTCGGGAATAAGCTGACGGTGACAAGGTTTCCCCCTA 180 Query 206 ATCGAGACGCTGCAATAACACAGGGGCATACAGTAACCAGGCAAGAGTTCAATCGCTTAG 265 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 ATCGAGACGCTGCAATAACACAGGGGCATACAGTAACCAGGCAAGAGTTCAATCGCTTAG 240 Query 266 TTTCGTGGCGGGATTTGAGGAAAACTGCGACTGTTCTTTAACCAAACATCCGTGCGATTC 325 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TTTCGTGGCGGGATTTGAGGAAAACTGCGACTGTTCTTTAACCAAACATCCGTGCGATTC 300 Query 326 GTGCCACTCGTAGACGGCATCTCACAGTCACTGAAGGCTATTAAAGAGTTAGCACCCACC 385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GTGCCACTCGTAGACGGCATCTCACAGTCACTGAAGGCTATTAAAGAGTTAGCACCCACC 360 Query 386 ATTGGATGAAGCCCAGGATAAGTGAcccccccGGACCTTGGAGTTTCATGCTAATCAAAG 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 ATTGGATGAAGCCCAGGATAAGTGACCCCCCCGGACCTTGGAGTTTCATGCTAATCAAAG 420 Query 446 AAGAGCTAATCCGACGTAAAGTTGCGGCGTTGATTACGCAGGATTGCGACCAAAGAACGA 505 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 AAGAGCTAATCCGACGTAAAGTTGCGGCGTTGATTACGCAGGATTGCGACCAAAGAACGA 480 Query 506 G 506 | Sbjct 481 G 481