[BEGIN]

REFERENCE HAIRPIN
*************************************************************************************************
ID                 : mmu-mir-297a-1
DESCRIPTION        : mmu-mir-297a-1 MI0000395 Mus musculus miR-297a-1 stem-loop
CHROMOSOME         : 7
SPAN               : 11543786 - 11543861
LENGTH             : 76
SEQUENCE           : ATATGTATGTATGTATGTATGTGTGCATGTGCATGTGCATGTATGCATATTGCATGTATATATTATGCATACATGT
OVERHANG THRESHOLD : 40%
*************************************************************************************************


TARGET
******************************
CATEGORY   : MATURE
ID         : mmu-miR-297a
ACCID      : MI0000395
PARENT     : mmu-mir-297a-1
CHROMOSOME : 7
START      : 11543786
STOP       : 11543861
OFFSET     : 15..36
SEQUENCE   : ATGTATGTGTGCATGTGCATGT
STRAND     : -
******************************



*** OTHER ***
____________________________________________________________________________
ATATGTATGTATGTATGTATGTGTGCATGTGCATGTGCATGTATGCATATTGCATGTATATATTATGCATACATGT REF                  7                    11543786 - 11543861  
              ATGTATGTGTGCATGTGCATGT                                         MATURE               7                    11543801 - 11543897  mmu-miR-297a         -                    
____________________________________________________________________________

                                                                        -SEQ-              -READ-        -CAT-      -TOTAL-       -TOT%-       -REST-      -REST%-        -ACT-       -ACT%-        -VAR-   -MISMATCH-   
.TATGTATGTATGTATGTATGT.......................................................   44262_0_0_0_0_0_4        OTHER            4        66.67            0         0.00            4        80.00                        21   
..ATGTATGTATGTATGTATGT.......................................................   30469_0_0_0_0_0_1        OTHER            1        16.67            0         0.00            1        20.00                        20   
.TATGTATGTATGTATGTATG........................................................   42670_1_0_0_0_0_0        OTHER            1        16.67            1       100.00            0         0.00                        20   
                                                                                                                 ----------                ----------                ----------   
                                                                                                                          6                         1                         5                                          
                                                                                                                                              (16.67)                   (83.33)                                       




((( SUMMARY )))

          -CAT-          -REST-           -ACT-         -TOTAL-        -TOTAL%-
     ----------      ----------      ----------      ----------      ----------
          OTHER               1               5               6         100.00%
                     ----------      ----------      ----------                
                              1               5               6                



[END]
