[BEGIN]
REFERENCE HAIRPIN
*************************************************************************************************
ID : mmu-mir-297a-1
DESCRIPTION : mmu-mir-297a-1 MI0000395 Mus musculus miR-297a-1 stem-loop
CHROMOSOME : 7
SPAN : 11543786 - 11543861
LENGTH : 76
SEQUENCE : ATATGTATGTATGTATGTATGTGTGCATGTGCATGTGCATGTATGCATATTGCATGTATATATTATGCATACATGT
OVERHANG THRESHOLD : 40%
*************************************************************************************************
TARGET
******************************
CATEGORY : MATURE
ID : mmu-miR-297a
ACCID : MI0000395
PARENT : mmu-mir-297a-1
CHROMOSOME : 7
START : 11543786
STOP : 11543861
OFFSET : 15..36
SEQUENCE : ATGTATGTGTGCATGTGCATGT
STRAND : -
******************************
*** OTHER ***
____________________________________________________________________________
ATATGTATGTATGTATGTATGTGTGCATGTGCATGTGCATGTATGCATATTGCATGTATATATTATGCATACATGT REF 7 11543786 - 11543861
ATGTATGTGTGCATGTGCATGT MATURE 7 11543801 - 11543897 mmu-miR-297a -
____________________________________________________________________________
-SEQ- -READ- -CAT- -TOTAL- -TOT%- -REST- -REST%- -ACT- -ACT%- -VAR- -MISMATCH-
.TATGTATGTATGTATGTATGT....................................................... 44262_0_0_0_0_0_4 OTHER 4 66.67 0 0.00 4 80.00 21
..ATGTATGTATGTATGTATGT....................................................... 30469_0_0_0_0_0_1 OTHER 1 16.67 0 0.00 1 20.00 20
.TATGTATGTATGTATGTATG........................................................ 42670_1_0_0_0_0_0 OTHER 1 16.67 1 100.00 0 0.00 20
---------- ---------- ----------
6 1 5
(16.67) (83.33)
((( SUMMARY )))
-CAT- -REST- -ACT- -TOTAL- -TOTAL%-
---------- ---------- ---------- ---------- ----------
OTHER 1 5 6 100.00%
---------- ---------- ----------
1 5 6
[END]