Details for gene set TRANSCRIPTION_FROM_RNA_POLYMERASE_II

Table: GSEA Results Summary

Dataset	ttttaaa_collapsed
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	TRANSCRIPTION_FROM_RNA_POLYMERASE_II_PROMOTER
Enrichment Score (ES)	0.10365952
Normalized Enrichment Score (NES)	1.854345
Nominal p-value	0.005964215
FDR q-value	0.5614485
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	ZFHX3	5	3.699	0.0034	Yes
2	CREB5	47	3.699	0.0015	Yes
3	MED13	86	3.699	-0.0000	Yes
4	TFAP2B	87	3.699	0.0041	Yes
5	NKX2-8	95	3.699	0.0073	Yes
6	PPARA	129	3.699	0.0065	Yes
7	UHRF1	144	3.699	0.0086	Yes
8	HMGB1	176	3.699	0.0081	Yes
9	CBFB	197	3.699	0.0093	Yes
10	NEUROD2	218	3.398	0.0105	Yes
11	TBP	238	3.398	0.0118	Yes
12	ZNF148	301	3.398	0.0067	Yes
13	KLF9	327	3.222	0.0072	Yes
14	MED23	344	3.222	0.0090	Yes
15	FOSL2	365	3.222	0.0101	Yes
16	ZMYND11	404	3.097	0.0086	Yes
17	MXD4	409	3.097	0.0122	Yes
18	PLAGL1	411	3.097	0.0162	Yes
19	AFF4	436	3.000	0.0168	Yes
20	SMAD3	444	3.000	0.0199	Yes
21	ELP4	519	2.854	0.0131	Yes
22	HCFC1	533	2.854	0.0153	Yes
23	TCF7L2	538	2.854	0.0189	Yes
24	FOXK2	550	2.796	0.0214	Yes
25	SMARCAL1	551	2.796	0.0256	Yes
26	DEK	553	2.796	0.0296	Yes
27	GLIS3	569	2.796	0.0315	Yes
28	MYEF2	572	2.796	0.0354	Yes
29	KLF12	573	2.796	0.0395	Yes
30	SNAI2	598	2.745	0.0401	Yes
31	MED26	629	2.699	0.0398	Yes
32	FOXD3	653	2.658	0.0406	Yes
33	SMARCC2	709	2.585	0.0365	Yes
34	SOX12	724	2.553	0.0386	Yes
35	BMP6	755	2.523	0.0383	Yes
36	NRIP1	761	2.523	0.0417	Yes
37	MAF	764	2.523	0.0456	Yes
38	NCOR1	782	2.495	0.0472	Yes
39	RYBP	789	2.495	0.0505	Yes
40	SQSTM1	797	2.469	0.0536	Yes
41	HOXD13	833	2.444	0.0525	Yes
42	EPAS1	847	2.420	0.0548	Yes
43	ABCA2	889	2.357	0.0528	Yes
44	MED17	895	2.357	0.0562	Yes
45	HSF2	900	2.357	0.0598	Yes
46	JARID1A	905	2.357	0.0634	Yes
47	MLL	945	2.319	0.0617	Yes
48	MBD1	947	2.301	0.0658	Yes
49	POLR2D	1067	2.181	0.0522	Yes
50	ELF5	1088	2.155	0.0534	Yes
51	TIAL1	1186	2.086	0.0430	Yes
52	NR6A1	1200	2.076	0.0453	Yes
53	TMF1	1239	2.046	0.0438	Yes
54	SMARCB1	1242	2.046	0.0476	Yes
55	IKZF3	1278	2.018	0.0466	Yes
56	MAX	1288	2.009	0.0494	Yes
57	KLF5	1300	1.991	0.0519	Yes
58	ZNF238	1363	1.951	0.0469	Yes
59	SOX18	1370	1.943	0.0501	Yes
60	ZNF143	1420	1.907	0.0470	Yes
61	STAT2	1422	1.907	0.0510	Yes
62	PAWR	1424	1.900	0.0550	Yes
63	MECP2	1452	1.880	0.0552	Yes
64	UBP1	1467	1.873	0.0572	Yes
65	HNF4G	1498	1.854	0.0569	Yes
66	GTF2F2	1538	1.830	0.0553	Yes
67	MNX1	1574	1.813	0.0542	Yes
68	NR2F2	1583	1.801	0.0572	Yes
69	VEZF1	1631	1.780	0.0544	Yes
70	KCNIP3	1656	1.770	0.0549	Yes
71	TNFRSF1A	1661	1.765	0.0585	Yes
72	SOX30	1662	1.765	0.0627	Yes
73	NPAS2	1678	1.760	0.0646	Yes
74	YBX1	1679	1.760	0.0688	Yes
75	MAZ	1682	1.760	0.0726	Yes
76	ERF	1720	1.735	0.0713	Yes
77	TWIST1	1727	1.731	0.0746	Yes
78	SREBF2	1732	1.726	0.0781	Yes
79	FUBP1	1763	1.717	0.0778	Yes
80	RUVBL1	1829	1.682	0.0723	Yes
81	DTX1	1843	1.674	0.0745	Yes
82	ARID4A	1851	1.670	0.0776	Yes
83	NFKB1	1863	1.662	0.0802	Yes
84	STAT3	1897	1.642	0.0794	Yes
85	MED1	1944	1.616	0.0767	Yes
86	NRF1	1955	1.613	0.0794	Yes
87	MLLT1	2000	1.588	0.0770	Yes
88	MYCN	2018	1.582	0.0786	Yes
89	SKIL	2051	1.572	0.0780	Yes
90	TCF15	2101	1.547	0.0749	Yes
91	LITAF	2140	1.529	0.0734	Yes
92	SOX5	2169	1.514	0.0734	Yes
93	LRRFIP1	2186	1.506	0.0751	Yes
94	TCEB3	2189	1.506	0.0790	Yes
95	MYO6	2209	1.495	0.0804	Yes
96	SP1	2229	1.487	0.0817	Yes
97	TCFL5	2265	1.469	0.0806	Yes
98	CDX2	2316	1.454	0.0773	Yes
99	BRD8	2354	1.437	0.0760	Yes
100	EID1	2362	1.434	0.0791	Yes
101	HMGB2	2411	1.418	0.0761	Yes
102	SAP18	2416	1.416	0.0797	Yes
103	HIRA	2457	1.398	0.0779	Yes
104	ZMIZ2	2471	1.392	0.0801	Yes
105	ABL1	2521	1.373	0.0770	Yes
106	ZNF281	2528	1.373	0.0802	Yes
107	HOXC6	2532	1.371	0.0840	Yes
108	DR1	2564	1.357	0.0835	Yes
109	MKL2	2578	1.351	0.0857	Yes
110	MED4	2587	1.347	0.0887	Yes
111	ECD	2616	1.335	0.0887	Yes
112	THRA	2642	1.328	0.0891	Yes
113	CITED2	2647	1.324	0.0927	Yes
114	PPARGC1A	2671	1.317	0.0934	Yes
115	GMEB2	2679	1.313	0.0966	Yes
116	NFATC3	2748	1.289	0.0906	Yes
117	FOXO3	2778	1.279	0.0904	Yes
118	THRAP3	2805	1.271	0.0907	Yes
119	MYC	2825	1.263	0.0920	Yes
120	RXRA	2838	1.260	0.0944	Yes
121	CREG1	2884	1.244	0.0919	Yes
122	ZFP161	2902	1.240	0.0935	Yes
123	PAX3	2921	1.234	0.0950	Yes
124	NFIX	2942	1.226	0.0962	Yes
125	CRTC1	2998	1.212	0.0921	Yes
126	MED30	3008	1.209	0.0950	Yes
127	FOXO4	3025	1.204	0.0967	Yes
128	TRAK1	3136	1.171	0.0845	Yes
129	SP2	3164	1.162	0.0846	Yes
130	NFRKB	3184	1.157	0.0860	Yes
131	POLR2C	3189	1.156	0.0895	Yes
132	CEBPG	3197	1.153	0.0927	Yes
133	NR3C1	3202	1.151	0.0962	Yes
134	GTF2H1	3212	1.149	0.0991	Yes
135	GATA2	3228	1.145	0.1010	Yes
136	VHL	3239	1.143	0.1037	Yes
137	SNF8	3280	1.130	0.1019	No
138	TRPS1	3324	1.119	0.0996	No
139	TFAP2A	3328	1.118	0.1033	No
140	ATF6	3409	1.095	0.0956	No
141	ELK1	3443	1.085	0.0948	No
142	TCEB3B	3451	1.082	0.0979	No
143	DNMT1	3541	1.058	0.0888	No
144	NUFIP1	3559	1.053	0.0905	No
145	NR5A2	3581	1.044	0.0915	No
146	PBX3	3597	1.040	0.0934	No
147	RUNX3	3603	1.038	0.0968	No
148	APEX1	3646	1.026	0.0947	No
149	HLF	3673	1.019	0.0950	No
150	RB1	3686	1.014	0.0974	No
151	NFYC	3776	0.987	0.0883	No
152	UBN1	3781	0.986	0.0919	No
153	SMAD2	3807	0.981	0.0923	No
154	TCF7	3809	0.980	0.0963	No
155	SNW1	3869	0.965	0.0917	No
156	FOXO1	3889	0.959	0.0930	No
157	IKBKAP	3895	0.958	0.0964	No
158	RNF14	3933	0.946	0.0951	No
159	MYF5	3955	0.940	0.0961	No
160	POU2AF1	3998	0.931	0.0940	No
161	ASH1L	4070	0.912	0.0876	No
162	E2F3	4076	0.910	0.0910	No
163	TCF19	4171	0.886	0.0812	No
164	MDM2	4206	0.878	0.0803	No
165	ELF2	4235	0.870	0.0803	No
166	ZFPM2	4340	0.848	0.0689	No
167	MNAT1	4356	0.843	0.0708	No
168	HTATSF1	4369	0.841	0.0732	No
169	GFI1	4431	0.827	0.0683	No
170	KLF11	4448	0.825	0.0701	No
171	RNF4	4458	0.823	0.0729	No
172	CCNK	4472	0.821	0.0751	No
173	CHD1	4491	0.816	0.0766	No
174	SMARCA5	4500	0.813	0.0796	No
175	MYF6	4578	0.791	0.0722	No
176	BRIP1	4584	0.790	0.0757	No
177	POLR2B	4699	0.762	0.0628	No
178	COPS2	4724	0.755	0.0634	No
179	ZNF254	4732	0.754	0.0665	No
180	ARNTL	4737	0.753	0.0701	No
181	TRIM24	4762	0.748	0.0707	No
182	PHF21A	4863	0.720	0.0599	No
183	BRCA1	4870	0.719	0.0632	No
184	TCF12	4928	0.703	0.0589	No
185	CDK7	4949	0.698	0.0601	No
186	PRDM4	5022	0.682	0.0535	No
187	MAML2	5031	0.681	0.0565	No
188	TARBP1	5085	0.665	0.0527	No
189	MED20	5107	0.659	0.0538	No
190	CHD2	5113	0.657	0.0572	No
191	BPTF	5118	0.656	0.0607	No
192	TRIP13	5136	0.653	0.0624	No
193	NFE2L3	5193	0.639	0.0582	No
194	ZEB1	5200	0.638	0.0615	No
195	TFDP1	5235	0.631	0.0606	No
196	TGIF1	5250	0.628	0.0626	No
197	GATA3	5256	0.627	0.0661	No
198	POU1F1	5261	0.625	0.0696	No
199	NCOA6	5292	0.618	0.0693	No
200	JAZF1	5348	0.606	0.0653	No
201	ATF7IP	5378	0.600	0.0651	No
202	CTCF	5463	0.581	0.0568	No
203	SP4	5485	0.576	0.0578	No
204	HDAC8	5492	0.574	0.0611	No
205	ZNF189	5531	0.566	0.0596	No
206	BCL6	5532	0.566	0.0637	No
207	MEIS2	5657	0.534	0.0494	No
208	TAF5	5689	0.527	0.0489	No
209	TFAP2C	5709	0.523	0.0503	No
210	PRKAR1A	5736	0.517	0.0506	No
211	POU4F1	5764	0.510	0.0507	No
212	TCEAL1	5816	0.501	0.0473	No
213	EPC1	5826	0.499	0.0501	No
214	SMARCC1	5861	0.491	0.0492	No
215	TBX3	5887	0.482	0.0496	No
216	CIAO1	5936	0.474	0.0466	No
217	TCERG1	5947	0.472	0.0493	No
218	E2F6	6126	0.430	0.0269	No
219	YY1	6161	0.420	0.0260	No
220	RREB1	6162	0.420	0.0302	No
221	BLZF1	6178	0.415	0.0321	No
222	SNAPC3	6219	0.405	0.0303	No
223	ETV1	6252	0.392	0.0297	No
224	HEXIM1	6337	0.370	0.0213	No
225	STAT1	6387	0.357	0.0182	No
226	ZNF345	6498	0.323	0.0060	No
227	ELL2	6501	0.322	0.0098	No
228	TAF2	6520	0.317	0.0113	No
229	POU4F2	6552	0.308	0.0108	No
230	MED14	6556	0.305	0.0146	No
231	ID4	6600	0.292	0.0123	No
232	MTF1	6642	0.278	0.0104	No
233	TAF5L	6715	0.253	0.0038	No
234	HIF1A	6741	0.242	0.0042	No
235	PRDM1	6801	0.216	-0.0004	No
236	TARDBP	6819	0.209	0.0012	No
237	ELF1	6820	0.209	0.0054	No
238	NFAT5	6871	0.168	0.0021	No
239	CCNT2	6901	0.147	0.0019	No
240	ZBTB38	6906	0.137	0.0055	No