>Rhizobiales
(((Agroba_tum_UWa:0.970999996437997,Rhizob_etl_42:0.848327095829159):0.0188235893967543,Sinorh_mel_bac:1.07995578235989):0.0242679137574322,(Mesorh_lot_bac:1.02614867423652,Brucel_sui_133:1.27980139351931):0.0242679137574322);

>Bacillus
(((Bacill_sub_bac:0.985465960176425,Bacill_lic_145:1.17483686330403):0.40021395851877,Bacill_ant_Ame:1.88343054913068):0.107372622029885,(Bacill_cla_KSM:1.52739447089896,Bacill_hal_bac:1.38411882816769):0.107372622029885);

>Burkhoderia
(((Burkho_383_bac:0.243427331697273,Burkho_cen_105:0.218847812381743):0.278735909981338,(Burkho_mal_233:0.147682486720828,Burkho_tha_E26:0.161402702464658):0.368636738707955):0.619488837676053,Burkho_xen_LB4:0.619488837676053);

>Chlamydiales
((Chlamy_pne_AR3:1.29618888563072,(Chlamy_abo_3:0.647904590297894,(Chlamy_cav_bac:0.506146825536526,Chlamy_fel_C-5:0.592771444008965):0.0526583939853969):0.540959087906293):0.852526177459191,Chlamy_tra_bac:0.852526177459191);

>Clostridium
((Clostr_ace_bac:1.85972282618873,Clostr_tet_E88:1.60381274117597):0.736581277814409,((Clostr_per_bac:0.0360279548170725,Clostr_per_SM1:0.0620217635875823):1.00000001002476e-08,Clostr_per_131:0.0393384589592997):0.736581277814409);

>Corynebacterium
((Coryne_dip_bac:1.65238917285305,(Coryne_glu_bac:1.05203802569556,Coryne_eff_YS3:1.30981835770106):0.12778328759815):0.915078191536042,Coryne_jei_K41:0.915078191536042);

>Enterobacteria
(((Escher_col_K12:0.700366258307526,Salmon_typ_bac:0.802328970253029):0.43745971861748,Erwini_car_SCR:1.07933820682721):0.1051811881817,(Yersin_pes_KIM:1.10533504506503,Photor_lum_bac:1.32946999007549):0.1051811881817);

>Ehrlichia
((Ehrlic_can_Jak:0.425785827749892,Ehrlic_cha_Ark:0.364927502948928):0.446752704956391,(Ehrlic_rum_Gar:0.0178221527212428,Ehrlic_rum_Wel:0.0228877042211029):0.446752704956391);

>Pasteurellales
(((Haemop_inf_bac:1.20242084342779,Pasteu_mul_bac:1.39668539415481):1.00000001002476e-08,Mannhe_suc_MBE:1.4955094287342):0.861036091095694,Haemop_duc_350:0.861036091095694);

>Helicobacter
(Helico_aci_She:0.156787530070011,(Helico_pyl_J99:0.0996556803563319,(Helico_pyl_266:0.07177185424112,Helico_pyl_HPA:0.0717961136248972):0.0277290848624719):0.156787530070011);

>Lactobacillus
(((Lactob_aci_NCF:1.23748435217184,Lactob_joh_533:1.22718141194771):0.125784757905478,Lactob_del_bul:1.8573942583473):0.0444833403458375,(Lactob_pla_bac:1.8070179168519,Lactob_sal_UCC:1.88528980430564):0.0444833403458375);

>Mycobacaterium 
((Mycoba_MCS_bac:0.745336783456838,(Mycoba_avi_par:0.409703755988384,(Mycoba_tub_CDC:0.441136031687842,Mycoba_lep_bac:0.858401596438284):0.425254545896361):0.388797549470326):0.581940008568278,Nocard_far_IFM:0.581940008568278);

>Prochlorococcus
(((Prochl_mar_MIT:0.888783784569809,Synech_sp_WH8:1.75421162930064):1.2682912157702,Prochl_mar_CCM:1.59226732757047):0.0090325828693506,(Prochl_mar_MED:2.08515547135481,Prochl_mar_NAT:1.69058891006654):0.0090325828693506);

>Pseudomonas
(((Pseudo_ent_L48:0.498312610558339,Pseudo_put_KT2:0.636896657464956):0.191812559786385,(Pseudo_syr_bac:0.940196587446941,Pseudo_flu_PfO:0.638740986197723):0.15870440516775):0.485224074500642,Pseudo_aer_bac:0.485224074500642);

>Ralstonia
(((Ralsto_eut_JMP:0.750035151776927,Ralsto_met_CH3:0.877729810589433):0.321510093411379,Ralsto_sol_bac:0.720134804548902):0.674846299321158,(Bordet_par_bac:0.0188366571701717,Bordet_per_bac:0.0161259261413183):0.674846299321158);

>Rhodoseudomonas
((Rhodop_pal_Bis:0.528376072823433,(Rhodop_pal_CGA:0.571395846174543,(Rhodop_pal_BB5:0.395902113890912,Rhodop_pal_HaA:0.328056939923622):0.100809265498701):0.0675956782493226):0.450496415514926,Bradyr_jap_bac:0.450496415514926);

>Rickettsia
((Ricket_typ_wil:0.134648052807754,Ricket_pro_bac:0.13006478901729):0.169781339011484,((Ricket_fel_URR:0.142189647766731,Ricket_con_bac:0.118586545289004):0.0878057313089978,Ricket_bel_RML:1.03924228857406):0.169781339011484);

>Staphylococcus
(((Staphy_aur_N31:0.00932410122803281,Staphy_aur_MW2:0.0204409617203825):1.33916345699317,Staphy_epi_RP6:1.60908233850913):0.00937623800773868,(Staphy_hae_bac:1.32548584189407,Staphy_sap_bac:1.47118051432093):0.00937623800773868);

>Streptococcus
((Strept_pne_TIG:1.05186764013329,Strept_the_183:1.17131289287494):0.0675998103567444,((Strept_aga_260:1.21970471377337,Strept_pyo_bac:0.96905701933892):0.290700113663013,Strept_mut_bac:1.26467086572247):0.0675998103567444);

>Synechcoccus
(((Synech_605_bac:0.974229812906658,Synech_902_bac:1.34723645087989):1.00000001002476e-08,Synech_sp_WH8:0.98834266264072):0.349135237207878,(Synech_elo_630:1.35699997900963,Synech_PCC_bac:1.80227638840437):0.349135237207878);

>Vibrio
((Vibrio_cho_bac:1.2942621317854,((Vibrio_vul_CMC:0.0396045686270812,Vibrio_vul_YJ0:0.0366708586079046):0.998484516333321,Vibrio_par_bac:1.05029548315963):1.00000001002476e-08):0.784335958850841,Vibrio_fis_ES1:0.784335958850841);

>Xhanthomonas
(Xantho_cam_bac:0.406134133119449,((Xantho_cam_851:0.134080648562263,Xantho_cit_bac:0.140797021671727):0.136561630412093,Xantho_ory_311:0.302267478197763):0.406134133119449);