Mitochondrial Genome Variation in Eastern Asia and the Peopling of Japan

Table 2.

Frequency (in Percentage) of Each Haplogroup in Each Group of Populations

Group
JPN
RYU
AIN
Ch1
Ch2
Ch3
Ch4
Ch5
Ch6
CA1
CA2
TWA
MAN
ITE
FIU
ALU
KAM
CHU
TUV
BUR
KOR
TIB
SAK
FIL
IND
SAB
Sample
1312
50
51
213
435
32
72
757
67
204
93
208
98
46
38
56
91
60
36
40
537
65
20
32
40
34
L2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5 - - -
M/N 1.3 18 1.96 3.29 1.61 - 4.17 5.55 - 1.96 1.08 2.4 1.02 - 2.63 - - - - 25 5.96 9.23 - 6.25 10 17.6
I/W/N - - - - - - - - - 2.45 - - - - 2.63 - - - - - 0.37 - - - - -
A1 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.67 - - 0.19 - - - - -
A1a 2.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.54 - - - - -
A1b 4.57 2 3.92 5.16 7.36 - 5.56 2.77 7.46 6.86 2.15 0.48 3.06 6.52 - 1.79 3.3 - 5.56 5 2.98 6.15 - - - -
A1b1 0.15 - - 0.47 0.46 - 1.39 0.92 - - - - - - - - - - - - 0.74 - - - - -
A2a - - - - - - - - - - - - - - - - - 10 - - - - - - - -
A2b - - - - - - - - - - - - - - - 3.57 2.2 50 - - 0.37 3.08 - - - -
N9a 4.57 - - 3.76 1.38 - 6.94 2.91 - 1.96 - - - - - - - - - - 3.91 - - - 2.5 -
N9b 2.13 2 2 - - - - 0.13 - - - - - - - - - - - - 0.19 - - - - -
Y 0.38 - 21.6 3.29 1.38 - - 0.53 - 0.49 - 0.96 - 4.35 - 7.14 9.89 - - - 2.23 - - 3.13 2.5 2.94
HV 0.91 4 - 0.47 1.84 - - 1.85 - 13.7 20.5 - 18.4 - 36.79 - 1.1 - 2.78 5 1.12 - - 3.13 5 -
JT - - - 2.82 1.15 - - - - 5.4 8.61 - 19.4 - 23.65 - - - - - - - - - - -
UK - - - - 1.38 - - 0.39 - 10.3 5.39 - 25.5 - 10.52 - - - 2.78 - - - - - 5 -
R9a 0.08 - - 1.88 0.69 - - 1.85 - - - 7.69 - - - - - - - - - - - 3.13 - 2.94
R11 - - - 0.94 0.46 12.5 - 1.85 - 0.49 - - - - - - - - - - - - - - - -
B 1.3 - - 0.47 1.84 - 4.17 1.19 - 0.98 1.08 - - - - - - - - - - - - 3.13 - 2.94
B4 0.76 2 - 1.88 2.53 9.38 1.39 1.98 5.97 1.96 1.08 - - - - - - - - 2.5 0.74 1.54 - - - -
B4a 0.84 - - 2.35 1.61 - 1.39 4.36 - 0.49 1.08 14.9 - - - - - - 2.78 - 0.56 - - - - -
B4a1 0.84 2 - - - - - - - - - 0.48 - - - - - - - - 0.56 - - - - -
B4a2 - - - 0.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
B4a3 - - - 0.47 - 15.6 2.78 1.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
B4b 0.53 - - 1.88 1.61 - 6.94 1.72 - - - 4.33 - - - - - - 11.1 - 0.74 - - - - -
B4b1 2.13 2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.56 - - - - -
B4c1 1.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.74 - - - - -
B4c1b 0.61 - - 1.88 - - - 1.06 - - - 4.81 - - - - - - - - 0.56 - - - - -
B4c2 0.08 - - - - - - 1.19 - 0.49 - - - - - - - - - - - - - - - -
B4f 0.3 4 2 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.38 - - - - -
B5 - - - - - - - 0.13 - - - 0.48 - - - - - - - - - - - - - -
B5a - - - 1.88 0.69 - 1.39 6.74 5.97 0.98 1.08 6.25 - - - - - - - - - - - 3.13 - 11.8
B5a1 0.61 - - 0.47 1.38 - - - - 0.49 1.08 - - - - - - - - - 3.54 - - - - -
B5b 0.3 2 - - 1.38 - - 0.4 - 0.49 - - - - - - - - - - 0.19 - - 12.5 - -
B5b1 0.99 - - - - - - 0.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
B5b2 2.29 - - 0.47 1.15 - 1.39 0.26 - 0.49 - - - - - - - - - - 0.93 - - - - -
B5b3 0.08 - - - - - - 0.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
F 0.23 - - 0.94 2.3 - - 2.25 1.49 1.96 2.15 1.92 - - - - - - - - 0.37 1.54 - - - 2.94
F1a 0.15 - - 0.47 1.61 15.6 4.17 4.62 1.49 - 1.08 - - - - - - - - - 0.74 - - 12.5 35 2.94
F1a1 1.52 - - 2.82 1.84 15.6 2.78 7.93 - 1.47 - 7.21 - - - - - - - - 1.12 - - - 5 -
F1b 3.13 2 2 2.82 2.99 - 2.78 1.19 2.99 3.92 - - 1.02 - - - - - 8.33 5 2.05 - - - - -
F1c - - - 1.41 1.15 - 1.39 0.4 - 0.49 - - - - - - - - - - 0.19 1.54 - - - -
F2 - - - 0.47 0.46 3.13 6.94 0.4 - - - - - - 5.26 - - - - - - - - - - -
F2a 0.15 - - 0.47 0.92 - 1.39 0.79 7.46 - - - - - - - - - - - 0.19 - - - - -
F2a1 0.08 - - - - - - 0.66 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.5 -
F3 0.08 - - - 0.46 - - 0.53 - - - - - - - - - - - - 0.19 - - - - -
F4 - - - 0.47 - - - 0.92 - - - - - - - - - - - - - - - 3.13 2.5 14.7
F4b - - - - - - - 0.13 - - - 10.1 - - - - - - - - - - - - - -
M 0.38 2 3.92 - - - - 0.26 - 0.49 - - - - - - - - - - 0.19 - - - - -
M (PNG) - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 10 -
M5/D4a/G1 0.46 - 13.7 0.94 0.23 18.8 - 0.26 - 0.49 2.15 - - - - - - 3.33 - 2.5 1.68 - 5 - 2.5 2.94
M7a 7.39 12 15.7 - 0.23 - - 0.53 4.48 - - - - - - - - - - 2.5 3.35 - - 6.25 - -
M7a1 0.08 14 - 1.41 1.38 - 1.39 2.25 - 0.98 - 0.48 - - - - - - - - - - - 3.13 - -
M7b - - - 0.47 0.46 - 1.39 2.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
M7b1 0.08 - - 2.35 2.99 - - 5.02 - 0.49 - 12 - - - - - - - - 0.56 - - - 2.5 -
M7b2 4.73 8 3.92 0.47 0.69 - 1.39 0.13 - - - - 1.02 - - - - - - - 2.79 - - - - -
M7c 0.76 2 - 1.88 2.07 - 2.78 2.51 - 1.96 - 4.33 - - - - - - - 2.5 3.72 3.08 - 18.8 2.5 20.6
M8 0.15 - - 0.47 - - - 0.13 - - - - - - - - - 1.67 - - 0.37 - - - - -
M8a 1.22 - - 4.23 0.92 - 4.17 1.59 - 1.47 - - - - - - - - - 2.5 1.68 - - - - -
M8a2 - - - - 0.23 - - - - - 1.08 - - 13 - - 20.9 1.67 2.78 - 0.37 - - - - -
C - - - 1.41 6.67 - 2.78 4.1 7.46 3.92 9.68 - 12.2 - - 16.1 26.4 5 16.7 10 0.37 1.54 - - - -
C1 0.3 - - - 0.46 - - - - - 1.08 - - - - - - - - - - - - - - -
C4a 0.08 - - 0.47 0.92 - - - - 0.98 1.08 - 4.08 - - - - - 13.9 - 0.37 - - - - -
C5 0.08 - - - 0.23 - - - - 1.96 2.15 - 1.02 - - - - - 2.78 - 0.74 - - - - -
Z 1.3 - - 2.35 2.76 - 4.17 0.53 10.4 0.49 9.68 - - 6.52 - - 8.79 - - - 1.49 9.23 - - - -
G 0.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.37 - - - - -
G1a1/D 2.13 - 5.88 - 0.23 - - 0.4 - - - - - - - - - - - - 2.05 - 10 - - -
G2a 1.68 4 - 1.88 - - - 0.26 - 0.49 - - - - - - - - 2.78 5 1.86 - - - - -
G2a1 2.52 - 3.92 5.16 0.92 - 1.39 0.66 - 7.35 1.08 - 6.12 - - - - - 5.56 - 1.49 - - - - -
G5 - - - - - - - - - - - - - 69.6 - 67.9 27.5 6.67 - - - - - - - -
M9 - - - - - - 2.78 1.59 2.99 - - - - - - - - - - - - - - - - -
M9a 2.44 4 1.96 5.63 1.61 - 1.39 1.98 - 2.45 1.08 - - - - - - - - 5 3.17 10.8 - - - -
M10 1.3 - - 2.35 1.84 - - 1.72 - 0.49 1.08 - - - - - - - - 2.5 4.66 7.69 - - - 2.94
M12 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.19 6.15 - - - -
D 0.08 - - 0.47 0.46 - 1.39 0.26 - - - - 2.04 - - - - - - - 0.19 - - - - -
D4 18.9 2 7.84 12.7 20.9 6.25 1.39 6.74 16.4 11.3 18.3 13.5 3.06 - 18.4 - - 1.67 13.9 17.5 18.4 12.3 - 18.8 7.5 11.8
D4a 7.39 - 1.96 4.23 - - 1.39 0.92 - 2.45 1.08 0.48 - - - - - 11.7 - - 5.77 - 80 - - -
D4a1 0.53 4 - 0.94 1.38 - 2.78 1.06 - - - - - - - - - - - - 2.42 1.54 - - - -
D4b 2.36 6 - 1.41 1.61 - 1.39 0.92 - 0.98 3.23 - 1.02 - - 3.57 - 6.67 2.78 2.5 0.93 18.5 - - - -
D4d 2.67 - - 0.94 0.69 3.13 - - - 1.96 1.08 - - - - - - - 2.78 2.5 0.93 - - - - -
D4k 0.15 - - - 1.15 - 1.39 0.13 22.4 - - - - - - - - - - - 0.19 3.08 - - - -
D4n 0.61 - 3.92 - 0.23 - 1.39 - 2.99 - - - - - - - - - - - 0.19 - - - 2.5 -
D5 3.73 2 - 1.88 3.22 - 4.17 2.64 - 0.98 - 6.25 1.02 - - - - - - 2.5 2.98 1.54 - 3.13 2.5 2.94
D5a
1.07
-
3.92
1.41
3.91
-
4.17
1.59
-
0.49
-
-
-
-
-
-
-
-
2.78
-
0.56
1.54
-
-
-
-

This Article

  1. Genome Res. 14: 1832-1850

Preprint Server



Current Issue

  1. February 2026, 36 (2)
  1. Current Issue
  1. Alert me to new issues of Genome Research